PT785274E - Substrato recombinante artificial (ragg 1) e agrecano nativo para estudar a actividade proteolitica de `agrecanase´ em sistemas de cultura de celulas - Google Patents
Substrato recombinante artificial (ragg 1) e agrecano nativo para estudar a actividade proteolitica de `agrecanase´ em sistemas de cultura de celulas Download PDFInfo
- Publication number
- PT785274E PT785274E PT96120949T PT96120949T PT785274E PT 785274 E PT785274 E PT 785274E PT 96120949 T PT96120949 T PT 96120949T PT 96120949 T PT96120949 T PT 96120949T PT 785274 E PT785274 E PT 785274E
- Authority
- PT
- Portugal
- Prior art keywords
- aggrecanase
- recombinant
- recombinant substrate
- substrate
- dna
- Prior art date
Links
- 239000000758 substrate Substances 0.000 title claims abstract description 68
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 title claims description 13
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 title description 5
- 108010003059 aggrecanase Proteins 0.000 claims abstract description 36
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 claims abstract description 25
- 230000007017 scission Effects 0.000 claims abstract description 25
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 17
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 14
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims abstract description 11
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 7
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 claims abstract description 6
- 101000999998 Homo sapiens Aggrecan core protein Proteins 0.000 claims abstract description 5
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims abstract description 5
- 102000043967 human ACAN Human genes 0.000 claims abstract description 5
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 claims abstract description 5
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 claims abstract description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims abstract description 4
- 229940123879 Aggrecanase inhibitor Drugs 0.000 claims abstract description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 claims abstract description 3
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 claims abstract description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 29
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims description 18
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 18
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 18
- 102000016611 Proteoglycans Human genes 0.000 claims description 10
- 108010067787 Proteoglycans Proteins 0.000 claims description 10
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 10
- 201000008482 osteoarthritis Diseases 0.000 claims description 6
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 6
- 239000013060 biological fluid Substances 0.000 claims description 4
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 claims description 3
- 210000001179 synovial fluid Anatomy 0.000 claims description 3
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 claims description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 2
- 239000012530 fluid Substances 0.000 claims description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 claims description 2
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 claims description 2
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 claims description 2
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 2
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 claims 1
- 230000001926 lymphatic effect Effects 0.000 claims 1
- 102000016284 Aggrecans Human genes 0.000 description 27
- 108010067219 Aggrecans Proteins 0.000 description 27
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 19
- SHGAZHPCJJPHSC-YCNIQYBTSA-N all-trans-retinoic acid Chemical compound OC(=O)\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C SHGAZHPCJJPHSC-YCNIQYBTSA-N 0.000 description 19
- 229930002330 retinoic acid Natural products 0.000 description 19
- 229960001727 tretinoin Drugs 0.000 description 19
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 13
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 11
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 10
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 10
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 9
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 8
- 208000005243 Chondrosarcoma Diseases 0.000 description 7
- 210000001612 chondrocyte Anatomy 0.000 description 7
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 7
- 239000000047 product Substances 0.000 description 7
- 210000000845 cartilage Anatomy 0.000 description 6
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 6
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 6
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 5
- 239000000020 Nitrocellulose Substances 0.000 description 5
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 5
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 5
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 5
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 5
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 5
- 229920001220 nitrocellulos Polymers 0.000 description 5
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 5
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 4
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N Gentamicin Chemical compound O1[C@H](C(C)NC)CC[C@@H](N)[C@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O[C@@H]2[C@@H]([C@@H](NC)[C@@](C)(O)CO2)O)[C@H](N)C[C@@H]1N CEAZRRDELHUEMR-URQXQFDESA-N 0.000 description 3
- 229930182566 Gentamicin Natural products 0.000 description 3
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 3
- 241000906034 Orthops Species 0.000 description 3
- 102000004142 Trypsin Human genes 0.000 description 3
- 108090000631 Trypsin Proteins 0.000 description 3
- 239000007857 degradation product Substances 0.000 description 3
- 229940088598 enzyme Drugs 0.000 description 3
- 229960002518 gentamicin Drugs 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 3
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 3
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 3
- 210000004898 n-terminal fragment Anatomy 0.000 description 3
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 125000006850 spacer group Chemical group 0.000 description 3
- 239000012588 trypsin Substances 0.000 description 3
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 2
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000010834 Extracellular Matrix Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010037362 Extracellular Matrix Proteins Proteins 0.000 description 2
- 229920002683 Glycosaminoglycan Polymers 0.000 description 2
- YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N Leu-Leu-Gly Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YOKVEHGYYQEQOP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 2
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N Thr-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O AQAMPXBRJJWPNI-JHEQGTHGSA-N 0.000 description 2
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010003246 arthritis Diseases 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 230000001925 catabolic effect Effects 0.000 description 2
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 210000002744 extracellular matrix Anatomy 0.000 description 2
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 2
- 108010063718 gamma-glutamylaspartic acid Proteins 0.000 description 2
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 2
- KXCLCNHUUKTANI-RBIYJLQWSA-N keratan Chemical group CC(=O)N[C@@H]1[C@@H](O)C[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O[C@@H]2[C@H](O[C@@H](O[C@H]3[C@H]([C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H](O)[C@@H]3O)O)[C@H](NC(C)=O)[C@H]2O)COS(O)(=O)=O)O[C@H](COS(O)(=O)=O)[C@@H]1O KXCLCNHUUKTANI-RBIYJLQWSA-N 0.000 description 2
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 2
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 2
- 108010029020 prolylglycine Proteins 0.000 description 2
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 2
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 2
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 2
- 239000012723 sample buffer Substances 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 2
- WCDDVEOXEIYWFB-VXORFPGASA-N (2s,3s,4r,5r,6r)-3-[(2s,3r,5s,6r)-3-acetamido-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-2-yl]oxy-4,5,6-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid Chemical compound CC(=O)N[C@@H]1C[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](C(O)=O)O[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O WCDDVEOXEIYWFB-VXORFPGASA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- DPNZTBKGAUAZQU-DLOVCJGASA-N Ala-Leu-His Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N DPNZTBKGAUAZQU-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- OYJCVIGKMXUVKB-GARJFASQSA-N Ala-Leu-Pro Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N OYJCVIGKMXUVKB-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- CUOMGDPDITUMIJ-HZZBMVKVSA-N Ala-Phe-Thr-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H]([C@H](O)C)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)N)CC1=CC=CC=C1 CUOMGDPDITUMIJ-HZZBMVKVSA-N 0.000 description 1
- IORKCNUBHNIMKY-CIUDSAMLSA-N Ala-Pro-Glu Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IORKCNUBHNIMKY-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- WQLDNOCHHRISMS-NAKRPEOUSA-N Ala-Pro-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O WQLDNOCHHRISMS-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N Ala-Ser Chemical compound C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CO)C([O-])=O IPWKGIFRRBGCJO-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N Ala-Thr-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- VRTOMXFZHGWHIJ-KZVJFYERSA-N Ala-Thr-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O VRTOMXFZHGWHIJ-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- YJHKTAMKPGFJCT-NRPADANISA-N Ala-Val-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YJHKTAMKPGFJCT-NRPADANISA-N 0.000 description 1
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- PNQWAUXQDBIJDY-GUBZILKMSA-N Arg-Glu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O PNQWAUXQDBIJDY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- WVNFNPGXYADPPO-BQBZGAKWSA-N Arg-Gly-Ser Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O WVNFNPGXYADPPO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 1
- OLVIPTLKNSAYRJ-YUMQZZPRSA-N Asn-Gly-Lys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](CC(=O)N)N OLVIPTLKNSAYRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- LGCVSPFCFXWUEY-IHPCNDPISA-N Asn-Trp-Tyr Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC3=CC=C(C=C3)O)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N LGCVSPFCFXWUEY-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- PDECQIHABNQRHN-GUBZILKMSA-N Asp-Glu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O PDECQIHABNQRHN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N Asp-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O JHFNSBBHKSZXKB-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N Asp-Gly-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SNDBKTFJWVEVPO-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- SPKCGKRUYKMDHP-GUDRVLHUSA-N Asp-Ile-Pro Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N SPKCGKRUYKMDHP-GUDRVLHUSA-N 0.000 description 1
- SPWXXPFDTMYTRI-IUKAMOBKSA-N Asp-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SPWXXPFDTMYTRI-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 1
- DPNWSMBUYCLEDG-CIUDSAMLSA-N Asp-Lys-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DPNWSMBUYCLEDG-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N Asp-Lys-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O DONWIPDSZZJHHK-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- JXGJJQJHXHXJQF-CIUDSAMLSA-N Asp-Met-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O JXGJJQJHXHXJQF-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- YUELDQUPTAYEGM-XIRDDKMYSA-N Asp-Trp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N YUELDQUPTAYEGM-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- 241000972773 Aulopiformes Species 0.000 description 1
- 102000029816 Collagenase Human genes 0.000 description 1
- 108060005980 Collagenase Proteins 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- XZWYTXMRWQJBGX-VXBMVYAYSA-N FLAG peptide Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 XZWYTXMRWQJBGX-VXBMVYAYSA-N 0.000 description 1
- GLWXKFRTOHKGIT-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O GLWXKFRTOHKGIT-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N Glu-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- SBYVDRJAXWSXQL-AVGNSLFASA-N Glu-Asn-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O SBYVDRJAXWSXQL-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N Glu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O JVSBYEDSSRZQGV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- KUTPGXNAAOQSPD-LPEHRKFASA-N Glu-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)C(=O)O KUTPGXNAAOQSPD-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- ITBHUUMCJJQUSC-LAEOZQHASA-N Glu-Ile-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)NCC(O)=O ITBHUUMCJJQUSC-LAEOZQHASA-N 0.000 description 1
- QDMVXRNLOPTPIE-WDCWCFNPSA-N Glu-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QDMVXRNLOPTPIE-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N Glu-Tyr-Lys Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O MFYLRRCYBBJYPI-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N Gly-Asn Chemical compound NCC(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O FUESBOMYALLFNI-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- LXXLEUBUOMCAMR-NKWVEPMBSA-N Gly-Asp-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC(=O)O)NC(=O)CN)C(=O)O LXXLEUBUOMCAMR-NKWVEPMBSA-N 0.000 description 1
- MOJKRXIRAZPZLW-WDSKDSINSA-N Gly-Glu-Ala Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O MOJKRXIRAZPZLW-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N Gly-Glu-Glu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O SOEATRRYCIPEHA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N Gly-Leu-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O CCBIBMKQNXHNIN-ZETCQYMHSA-N 0.000 description 1
- HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N Gly-Pro-Ser Chemical compound NCC(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O HAOUOFNNJJLVNS-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- WNGHUXFWEWTKAO-YUMQZZPRSA-N Gly-Ser-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)CN WNGHUXFWEWTKAO-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MAABHGXCIBEYQR-XVYDVKMFSA-N His-Asn-Ala Chemical compound C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N MAABHGXCIBEYQR-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 1
- SDTPKSOWFXBACN-GUBZILKMSA-N His-Glu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O SDTPKSOWFXBACN-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- HZWWOGWOBQBETJ-CUJWVEQBSA-N His-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)N)O HZWWOGWOBQBETJ-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N Ile-Leu-Thr Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)O)N PHRWFSFCNJPWRO-PPCPHDFISA-N 0.000 description 1
- JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N Ile-Ser-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O JHNJNTMTZHEDLJ-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- VGSPNSSCMOHRRR-BJDJZHNGSA-N Ile-Ser-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N VGSPNSSCMOHRRR-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- COWHUQXTSYTKQC-RWRJDSDZSA-N Ile-Thr-Glu Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N COWHUQXTSYTKQC-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- 108010065920 Insulin Lispro Proteins 0.000 description 1
- 102100034343 Integrase Human genes 0.000 description 1
- 229920000288 Keratan sulfate Polymers 0.000 description 1
- RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N L-isoleucyl-L-alanine Natural products CCC(C)C(N)C(=O)NC(C)C(O)=O RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N L-prolylglycine Chemical compound [O-]C(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCC[NH2+]1 RNKSNIBMTUYWSH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N Leu-Asp-Ser Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PVMPDMIKUVNOBD-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N Leu-His Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CNC=N1 XWOBNBRUDDUEEY-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- KWLWZYMNUZJKMZ-IHRRRGAJSA-N Leu-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KWLWZYMNUZJKMZ-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N Leu-Ser-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CO)C(=O)N1CCCC1C(O)=O SBANPBVRHYIMRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N Leu-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N)O LINKCQUOMUDLKN-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N Lys-Phe Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QCZYYEFXOBKCNQ-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- QBHGXFQJFPWJIH-XUXIUFHCSA-N Lys-Pro-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@@H](N)CCCCN QBHGXFQJFPWJIH-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- CTJUSALVKAWFFU-CIUDSAMLSA-N Lys-Ser-Cys Chemical compound C(CCN)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N CTJUSALVKAWFFU-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IOQWIOPSKJOEKI-SRVKXCTJSA-N Lys-Ser-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IOQWIOPSKJOEKI-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- YKBSXQFZWFXFIB-VOAKCMCISA-N Lys-Thr-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O YKBSXQFZWFXFIB-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- 102000002274 Matrix Metalloproteinases Human genes 0.000 description 1
- 108010000684 Matrix Metalloproteinases Proteins 0.000 description 1
- RKIIYGUHIQJCBW-SRVKXCTJSA-N Met-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O RKIIYGUHIQJCBW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- PBOUVYGPDSARIS-IUCAKERBSA-N Met-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C PBOUVYGPDSARIS-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- FNYBIOGBMWFQRJ-SRVKXCTJSA-N Met-Pro-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)N FNYBIOGBMWFQRJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N N-glycyl-L-proline Natural products NCC(=O)N1CCCC1C(O)=O KZNQNBZMBZJQJO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010079364 N-glycylalanine Proteins 0.000 description 1
- 101100342977 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) leu-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108091005804 Peptidases Proteins 0.000 description 1
- 102000035195 Peptidases Human genes 0.000 description 1
- QMMRHASQEVCJGR-UBHSHLNASA-N Phe-Ala-Pro Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1[C@@H](CCC1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 QMMRHASQEVCJGR-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- MSHZERMPZKCODG-ACRUOGEOSA-N Phe-Leu-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 MSHZERMPZKCODG-ACRUOGEOSA-N 0.000 description 1
- JDMKQHSHKJHAHR-UHFFFAOYSA-N Phe-Phe-Leu-Tyr Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(CC(C)C)NC(=O)C(NC(=O)C(N)CC=1C=CC=CC=1)CC1=CC=CC=C1 JDMKQHSHKJHAHR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IIEOLPMQYRBZCN-SRVKXCTJSA-N Phe-Ser-Cys Chemical compound N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O IIEOLPMQYRBZCN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SJRQWEDYTKYHHL-SLFFLAALSA-N Phe-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)NC(=O)[C@H](CC3=CC=CC=C3)N)C(=O)O SJRQWEDYTKYHHL-SLFFLAALSA-N 0.000 description 1
- HFZNNDWPHBRNPV-KZVJFYERSA-N Pro-Ala-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O HFZNNDWPHBRNPV-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- OCSACVPBMIYNJE-GUBZILKMSA-N Pro-Arg-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O OCSACVPBMIYNJE-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IHCXPSYCHXFXKT-DCAQKATOSA-N Pro-Arg-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IHCXPSYCHXFXKT-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- TUYWCHPXKQTISF-LPEHRKFASA-N Pro-Cys-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N2CCC[C@@H]2C(=O)O TUYWCHPXKQTISF-LPEHRKFASA-N 0.000 description 1
- FRKBNXCFJBPJOL-GUBZILKMSA-N Pro-Glu-Glu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O FRKBNXCFJBPJOL-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- HAAQQNHQZBOWFO-LURJTMIESA-N Pro-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 HAAQQNHQZBOWFO-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- UIMCLYYSUCIUJM-UWVGGRQHSA-N Pro-Gly-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@@H]1CCCN1 UIMCLYYSUCIUJM-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- STASJMBVVHNWCG-IHRRRGAJSA-N Pro-His-Leu Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)NC(=O)[C@H]1[NH2+]CCC1)C1=CN=CN1 STASJMBVVHNWCG-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- FMLRRBDLBJLJIK-DCAQKATOSA-N Pro-Leu-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 FMLRRBDLBJLJIK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- ZLXKLMHAMDENIO-DCAQKATOSA-N Pro-Lys-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O ZLXKLMHAMDENIO-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- SPLBRAKYXGOFSO-UNQGMJICSA-N Pro-Phe-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)NC(=O)[C@@H]2CCCN2)O SPLBRAKYXGOFSO-UNQGMJICSA-N 0.000 description 1
- CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- PCWLNNZTBJTZRN-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 PCWLNNZTBJTZRN-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- FDMKYQQYJKYCLV-GUBZILKMSA-N Pro-Pro-Ser Chemical compound OC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 FDMKYQQYJKYCLV-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- AIOWVDNPESPXRB-YTWAJWBKSA-N Pro-Thr-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@@H]2CCCN2)O AIOWVDNPESPXRB-YTWAJWBKSA-N 0.000 description 1
- DMNANGOFEUVBRV-GJZGRUSLSA-N Pro-Trp-Gly Chemical compound N([C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)NCC(=O)O)C(=O)[C@@H]1CCCN1 DMNANGOFEUVBRV-GJZGRUSLSA-N 0.000 description 1
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 1
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 1
- 108010092799 RNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 241000219061 Rheum Species 0.000 description 1
- VGNYHOBZJKWRGI-CIUDSAMLSA-N Ser-Asn-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO VGNYHOBZJKWRGI-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N Ser-Asp-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CO QPFJSHSJFIYDJZ-GHCJXIJMSA-N 0.000 description 1
- YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N Ser-Leu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YUJLIIRMIAGMCQ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 208000037065 Subacute sclerosing leukoencephalitis Diseases 0.000 description 1
- 206010042297 Subacute sclerosing panencephalitis Diseases 0.000 description 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N Thr-Cys Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O CUTPSEKWUPZFLV-WISUUJSJSA-N 0.000 description 1
- FIFDDJFLNVAVMS-RHYQMDGZSA-N Thr-Leu-Met Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O FIFDDJFLNVAVMS-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N Thr-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IJVNLNRVDUTWDD-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- BDGBHYCAZJPLHX-HJGDQZAQSA-N Thr-Lys-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O BDGBHYCAZJPLHX-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- XKWABWFMQXMUMT-HJGDQZAQSA-N Thr-Pro-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O XKWABWFMQXMUMT-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- MROIJTGJGIDEEJ-RCWTZXSCSA-N Thr-Pro-Pro Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N1[C@H](C(O)=O)CCC1 MROIJTGJGIDEEJ-RCWTZXSCSA-N 0.000 description 1
- VGNKUXWYFFDWDH-BEMMVCDISA-N Thr-Trp-Pro Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N3CCC[C@@H]3C(=O)O)N)O VGNKUXWYFFDWDH-BEMMVCDISA-N 0.000 description 1
- BEZTUFWTPVOROW-KJEVXHAQSA-N Thr-Tyr-Arg Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)N)O BEZTUFWTPVOROW-KJEVXHAQSA-N 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- UDCHKDYNMRJYMI-QEJZJMRPSA-N Trp-Glu-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O UDCHKDYNMRJYMI-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 1
- SCCKSNREWHMKOJ-SRVKXCTJSA-N Tyr-Asn-Ser Chemical compound N[C@@H](Cc1ccc(O)cc1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SCCKSNREWHMKOJ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SINRIKQYQJRGDQ-MEYUZBJRSA-N Tyr-Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 SINRIKQYQJRGDQ-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N Tyr-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N Tyr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 MFEVVAXTBZELLL-GGVZMXCHSA-N 0.000 description 1
- PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N Tyr-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O PWKMJDQXKCENMF-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 1
- 230000001464 adherent effect Effects 0.000 description 1
- 239000011543 agarose gel Substances 0.000 description 1
- 230000004931 aggregating effect Effects 0.000 description 1
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 1
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 1
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010050025 alpha-glutamyltryptophan Proteins 0.000 description 1
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 238000003277 amino acid sequence analysis Methods 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 108010052670 arginyl-glutamyl-glutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010069926 arginyl-glycyl-serine Proteins 0.000 description 1
- 108010060035 arginylproline Proteins 0.000 description 1
- 108010047857 aspartylglycine Proteins 0.000 description 1
- PXXJHWLDUBFPOL-UHFFFAOYSA-N benzamidine Chemical compound NC(=N)C1=CC=CC=C1 PXXJHWLDUBFPOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 1
- 210000004900 c-terminal fragment Anatomy 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 235000021466 carotenoid Nutrition 0.000 description 1
- 150000001747 carotenoids Chemical class 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 1
- 229960002424 collagenase Drugs 0.000 description 1
- 238000004040 coloring Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 210000002808 connective tissue Anatomy 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000151 cysteine group Chemical group N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 1
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 1
- 238000010217 densitometric analysis Methods 0.000 description 1
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 1
- 229940079919 digestives enzyme preparation Drugs 0.000 description 1
- 238000006471 dimerization reaction Methods 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000002532 enzyme inhibitor Substances 0.000 description 1
- DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N ethyl mercaptane Natural products CCS DNJIEGIFACGWOD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 1
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000012737 fresh medium Substances 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 108010057083 glutamyl-aspartyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 108010013768 glutamyl-aspartyl-proline Proteins 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940014041 hyaluronate Drugs 0.000 description 1
- 230000000984 immunochemical effect Effects 0.000 description 1
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 210000003127 knee Anatomy 0.000 description 1
- 239000010410 layer Substances 0.000 description 1
- 108010044311 leucyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 1
- 210000004880 lymph fluid Anatomy 0.000 description 1
- 108010038320 lysylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 230000009456 molecular mechanism Effects 0.000 description 1
- 238000004264 monolayer culture Methods 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 108010084525 phenylalanyl-phenylalanyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 238000002264 polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 230000002265 prevention Effects 0.000 description 1
- 108010020755 prolyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010070643 prolylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 235000019833 protease Nutrition 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 230000006337 proteolytic cleavage Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 1
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 1
- 235000019515 salmon Nutrition 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 238000007423 screening assay Methods 0.000 description 1
- 108010048397 seryl-lysyl-leucine Proteins 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 1
- 108010071097 threonyl-lysyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 238000003146 transient transfection Methods 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N β‐Mercaptoethanol Chemical compound OCCS DGVVWUTYPXICAM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C40—COMBINATORIAL TECHNOLOGY
- C40B—COMBINATORIAL CHEMISTRY; LIBRARIES, e.g. CHEMICAL LIBRARIES
- C40B40/00—Libraries per se, e.g. arrays, mixtures
- C40B40/02—Libraries contained in or displayed by microorganisms, e.g. bacteria or animal cells; Libraries contained in or displayed by vectors, e.g. plasmids; Libraries containing only microorganisms or vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
- C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
- C07K14/4701—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals not used
- C07K14/4725—Proteoglycans, e.g. aggreccan
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
- C12N15/1034—Isolating an individual clone by screening libraries
- C12N15/1037—Screening libraries presented on the surface of microorganisms, e.g. phage display, E. coli display
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/64—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue
- C12N9/6421—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from animal tissue from mammals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
- C12Q1/37—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving peptidase or proteinase
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/573—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for enzymes or isoenzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K2319/00—Fusion polypeptide
- C07K2319/01—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif
- C07K2319/02—Fusion polypeptide containing a localisation/targetting motif containing a signal sequence
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Zoology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Virology (AREA)
- Crystallography & Structural Chemistry (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Immobilizing And Processing Of Enzymes And Microorganisms (AREA)
Description
y—-- -,. - -
y—-- -,. - -Γ U
DESCRIÇÃO "SUBSTRATO RECOMBINANTE ARTIFICIAL (rAGG 1) E AGRECANO NATIVO PARA ESTUDAR A ACTIVIDADE PROTEOLÍTICA DE 'AGRECANASE' EM SISTEMAS DE CULTURA DE CÉLULAS " A presente invenção refere-se a um substrato recombinante artificial (rAGG 1) e agrecano nativo para o estudo da actividade proteolitica de "Agrecanase" em sistemas de cultura de células.
Os mecanismos de degradação de proteoglicano em tecido conjuntivo são complexos e envolvem múltiplos agentes e vias. Em estudos de investigação do catabolismo de agrecano, os sistemas experimentais utilizados incluíram culturas em monocamada de linhas celulares de condrócitos estabelecidas de condrócitos primários (Hughes CE, Caterson B, Fosang AJ, Roughley PJ, Mort JS. , Biochem. J. 1995; 305:799-804; Lark MW, Gordy JT, Weidner JR, et al., J. Biol. Chem. 1995; 270(6):2550-2556) e culturas de explantes utilizando cartilagem de uma variedade de sítios anatómicos e espécies animais (Flannery CR, Lark MW, Sandy JD, J. Biol. Chem. 1992; 267:1008-1014; Sandy JD, Brown HL, Lowther DA, Biochem Biophys Acta 1978;543:536-44; Tyler JA, Biochem. J. 1985; 225:493-507). A adição de citoquinas tais como IL-1 e TNF foram utilizadas extensivamente como agentes que promovem a degradação da matriz extracelular (Hughes CE et al., 1995; Morales TI, Roberts AB, Arch Biochem Biophys 1992; 293(1):79-84,-Fosang AJ, Tyler JA, Hardingham TE, Matrix 1991; 11:17-24). Em particular, estas duas citoquinas demonstraram ter como alvo o catabolismo de agrecano. Vários estudos levaram agora a um número de descobertas importantes que definiram sítios de clivagem específicos ao longo do núcleo da proteína de agrecano (Ilic MZ, Handley CJ, Robinson HC, Mok MT, Arch Biochem Biophys 1992; 294(1):115-22,- Loulakis P., Shrikhande A, Davis G, 1
y
Maniglia CA, Putative site(s) of enzymic cleavage. Biochem J 1992; 284:589-593; Sandy JD, Neame PJ, Boynton RE, Flannary CR, J. Biol. Chem. 1991; 266:8683-8685). No total parecem existir pelo menos sete sítios de clivagem e a análise da sequência de aminoácidos dos produtos de degradação do proteoglicano de cartilagem definiu dois sítios principais de clivagem proteolítica em agrecano, que ocorrem dentro do domínio interglobular (IGD) entre os resíduos de aminoácidos Asn341-Phe342 e Glu373-Ala374 (enumeração da sequência humana) (Doege KJ, Sasaki M, Kimura T, Yamada Y, J. Biol. Chem. 1991; 266:894-902). Um sítio de clivagem anterior gera um fragmento catabólico do terminal C (...DIPEN) consistindo no domínio G1 de 50-60 kDa que permanece no tecido complexado com hialuronato (Flannery CR, et al., 1992). Em estudos recentes Fosang et al. (Fosang AJ, Last K, Brown L, Jackson DC, Gardiner P, Trans. Orthop: Res. Soc. 1995; 20:122) também identificaram fragmentos do terminal N (FFG...) deste sítio de clivagem em fluidos sinoviais de doentes diagnosticados com uma variedade de diferentes artrites. De modo semelhante, Witt et al. (Witt M, Fosang AJ, Hughes CE, Hardingham TE, Trans. Orthop. Res. Soc. 1995;20:122) verificaram que estes fragmentos dos terminais N contendo glicosaminoglicano em amostras do meio de culturas controlo e IL-1 estimulavam culturas de explante porcino. Este último sítio de clivagem produz fragmentos do terminal N contendo glicosaminoglicano (ARG...) que aparecem como os principais produtos de degradação de agrecano isolados de fluido sinovial de doentes com artrite (Lohmander LS, Neame PJ, Sandy JD, Arth. Rheum. 1993;36:1214-1222) e são também encontrados em meios de culturas de explante de cartilagem tratados com IL-1 ou ácido retinóico (Hughes CE et al., 1995;Sandy JD, et al., 1991). W093/22429 revela novos materiais e métodos para a detecção, tratamento e prevenção de osteoartrite humana. Especificamente, é identificado o sítio de clivagem onde a agrecanase cliva o agrecano. A identificação deste sítio, bem como a natureza da enzima, facilita os 2 r~ ^ tratamentos específicos que bloqueiam ou diminuem a actividade da enzima. Outro aspecto de W093/22429 refere-se a métodos para detectar evidência de osteoartrite. Um estudo recente (Lark MW, et al., 1995) identificou o fragmento do terminal C (...EGE) em células de condrossarcoma de rato tratadas com ácido retinóico. A actividade proteolítica responsável por esta clivagem Glu373-Ala374 não foi identificada, mas parece ter especificidade para ligações peptídicas Glu-Xaa, em que Xaa é Ala, Gly ou Leu. Esta actividade, ainda não caracterizada, tem sido denominada 'agrecanase (Fosang AJ, Neame PJ, Las K, Hardingham TE-, Murphy G, Hamilton JA, J. Biol. Chem. 1991;267:19470-19474)'. Embora os sítios de clivagem dentro da molécula tenham sido bem caracterizados, muitos dos agentes responsáveis por gerar o maior número de diferentes produtos de degradação de proteoglicano permanecem não identificados. Os sistemas de cultura têm sido manipulados com uma variedade de agentes que aumentam o catabolismo de proteoglicano, esforços para descobrir o(s) agente (s) responsáveis pela sua quebra. Contudo, estes estudos não têm sido bem sucedidos na definição de qualquer agente responsável pela degradação de agrecano (Flannery CR, Sandy JD, Trans. Orthop. Res. Soc. 1993). Contudo, dados experimentais utilizando agrecano purificado e agrecano modificado como um substrato para preparações de enzima purificada produziram alguma informação sobre os sítios específicos de clivagem destas enzimas, mas este trabalho in vitro não ajudou directamente no esclarecimento do mecanismo ou da identidade dos agentes envolvidos na degradação de agrecano na cartilagem (Fosang AJ, et al. , 1992 ; Fosang AJ, Neame PJ, Hardingham TE , Murphy G, Hamilton JA, J. Biol. Chem. 1991;266:15579- •15582; Fosang AJ, Last K, Neame PJ, et al.,
Biochem. J. 1994; 304:347-351).
Em estudos prévios (Hughes CE, et al., 1995; Hughes CE, Caterson B, White RJ, Roughley PJ, Mort JS, J. Biol. Chem. 3
r 1992;267:16011-16014) desenvolvemos um número de anticorpos monoclonais específicos para os produtos (catabolitos de agregado de proteoglicano) que foram clivados por proteinases específicas. Estes anticorpos provaram ser úteis como ferramentas no estudo dos mecanismos de quebra de proteoglicano em sistemas de cultura de explante de cartilagem. O objectivo deste trabalho corrente foi o de refinar mais sistemas de cultura que ajudariam a facilitar a identificação dos agentes responsáveis pela clivagem de agrecano no sitio 374ARGSVI... no IGD de agrecano. Neste estudo, descrevemos o desenvolvimento de um sistema de cultura in vitro que nos permitiu estudar a actividade de 'agrecanase' contra um substrato recombinante artificial num sistema de cultura que não contém proteoglicanos endógenos inerentes e outros componentes extracelulares. A utilização de anticorpos com neoepitopos previamente caracterizados contra sítios chave de clivagem no IGD de agrecano facilitou a monitorização de produtos gerados através da acção proteolítica de 'agrecanase' no sistema.
Assim, uma realização da presente invenção é um substrato recombinante para sistemas de teste da Agrecanase in vitro, preferencialmente um substrato recombinante que contém um grupo de elementos estruturais compreendendo a) a sequência sinal de CD5, b) o epitopo-FLAG para detecção de Ml por anticorpo monoclonal, c) o domínio interglobular de agrecano humano, d) a região de charneira de IgGl humano, e) a região CH2 de IgGl humano e f) a região CH3 de IgGl humano.
Uma realização preferida da presente invenção é um substrato recombinante que possui a sequência de aminoácidos da Tabela 1 4
U ou partes desta, ou que possui a sequência de aminoamidas da Tabela 1 ou partes desta, em que o aminoácido 34 é mutado para Ala.
Outra realização da presente invenção é um ADN, codificando um substrato recombinante como acima descrito, preferencialmente um ADN que possui a sequência nucleotidica dos nucleótidos 2350 a 4114 da Tabela 2 ou partes desta, que possui a sequência nucleotidica dos nucleótidos 2350 a 4114 da Tabela 2 ou partes desta, em que o nucleótido 2448 é mutado para C, o nucleótido 2450 é mutado para C e o nucleótido 2451 é mutado para A; ou que híbrida em condições de severidade com o ADN apresentado na Tabela 2. A hibridação em condições de severidade de acordo com a invenção significa hibridação a uma temperatura de 20 a 25°C abaixo do ponto de fusão da sonda marcada numa solução de hibridação contendo 6 x SSC (ou alternativamente 6 x SSPE) , SDS a 0,5% e 100 pg/ml de ADN de esperma de salmão fragmentado, desnaturado (Sambrook et al.r "Molecular Cloning - A Laboratory Manual", Segunda Edição, 1989, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Volume 2, capítulo 9, páginas 9.52-9.55).
Outras realizações da presente invenção são um vectór contendo um fragmento de ADN com a sequência nucleotidica como acima descrita e uma célula hospedeira contendo o referido vector.
Outra realização da presente invenção é a utilização de um substrato recombinante como acima descrito num sistema de cultura celular para estudar a actividade de agrecanase, preferencialmente em que o referido sistema de cultura celular não possui proteoglicanos endógenos inerentes nem outros componentes extracelulares. 5
V
U t
Outra realização da presente invenção é a utilização de um substrato recombinante, como acima descrito, em que o estudo da actividade de agrecanase é realizado por detecção de produtos de clivagem através de anticorpos.
Outra realização da presente invenção é a utilização de um substrato recombinante, como acima descrito, para a detecção de novos sítios de clivagem enzimática no referido substrato.
Realizações adicionais da presente invenção são a utilização de um substrato recombinante, como acima descrito, para a purificação de agrecanase por meio de cromatografia de afinidade ou num sistema de clonagem funcional para o isolamento de ADNc de agrecanase.
Ainda outra realização da presente invenção é um método para monitorizar o início da progressão de osteoartrite, compreendendo o referido método ensaiar uma amostra de fluido biológico de um humano suspeito ou conhecido como sofrendo de osteoartrite, para a presença de agrecanase por meio do substrato recombinante, como acima descrito, em que o referido fluido biológico é seleccionado do grupo consistindo em fluido sinovial, urina, soro e fluido da linfa.
Uma realização adicional da presente invenção é um método, como acima descrito, em que o referido método é utilizado para seguir a progressão da doença para determinar a eficiência de um tratamento.
Outra realização da presente invenção é a utilização de um substrato recombinante, como acima descrito, para a pesquisa de um inibidor de agrecanase. 6
V yj L-Cj
Outra realização da presente invenção é um dispositivo de diagnóstico contendo um substrato recombinante, como acima descrito e anticorpos para a detecção de produtos de clivagem de agrecanase.
Em seguida a invenção é descrita em particular através dos exemplos, tabelas e figuras:
Tab. 1 Sequência de aminoácidos de rAGG-1
Aminoácidos 1-24: Sequência sinal de CD5
Aminoácidos 25-32: Sequência-FLAG
Aminoácidos 33-160: Domínio interglobular de agrecano
Humano
Aminoácidos 161-164:Sequência de espaçador Aminoácidos 165-179:Região de charneira de IgGl humano Aminoácidos 180-289:Região CH2 de IgGl humano Aminoácidos 290-396:Região CH3 de IgGl humano
Tab. 2 Sequência de nucleótidos do vector pCDM8-rAGG-1 para expressão eucariótica de rAGG-1
Fig. 1 Estrutura de rAGG-1 rAGG-1 consiste em: Sequência sinal de CD5: SS; epitopo-FLAG para detecção de Ml por anticorpo molecular: FLAG; domínio interglobular de agrecano humano: IGD; região de charneira de IgGl humano: H; região CH2 de IgGl humano: CH2; região CH3 de IgGl humano: CH3.
Fig. 2 Detecção de expressão de rAGG-1 em células COS com anticorpo monoclonal Ml.
Fig. 3 SDS-PAGE de rAGG-1 purificado. Pista A: Coloração com Coomassie; pista B: detecção por transferência de 7
Western com anticorpo monoclonal Ml e anti-soro anti-
IgG humano, pista C.
Fig. 4 Reactividade a BC-3 de rAGG-1 em meio de cultura de células de células de condrossarcoma de rato.
Pista A: rAGG-1 de uma cultura de células de condrossarcoma de rato não estimuladas não é detectado com anticorpo monoclonal BC-3 numa transferência de Western, enquanto que rAGG-1 de uma cultura de células estimuladas com ácido retinóico é detectado: pista B. Pista C: Uma transferência semelhante, após re- pesquisa com anticorpo monoclonal Ml. 0 fragmento reactivo BC-3 é aproximadamente 5,6 kD mais pequeno do que a banda de 72 kD original, indicando a clivagem de rAGG-1 no sitio de "Agrecanase".
Fig. 5 Estabelecimento um possível ensaio de pesquisa num formato de 96 poços (com tampa) para detectar actividade de "Agrecanase".
Materiais: O segundo anticorpo conjugado com fosfatase alcalina e o substrato utilizado em análise de transferência de Western foram obtidos de Promega como Protoblot Western blot AP system (número de catálogo W3920) . A nitrocelulose (tamanho do poro 0,2 μπι) foi obtida de Scleicher and Schuell. O anticorpo monoclonal Ml e o gel de afinidade Anti-FLAG Ml foram ambos obtidos da Kodak. O monoclonal Ig anti-humano foi obtido de Capell, Durham. Os anticorpos monoclonais BC-3, 2-B-6 e 3-B-3 foram preparados como fluido ascítico (Hughes CE, et al.r 1995). A linha celular Rx foi gentilmente cedida pelo Dr. Jim Kimura, Bone Research Center, Henry Ford Hospital, Detroit, MI.
Exemplo 1: Preparação da construção genética rAGGl 8 A construção genética para rAGGl codifica para a sequência sinal da glicoproteína de linfócito Tl/Leu-1 (CD5), o epitopo FLAG™ de oito aminoácidos de comprimento (Prickett KS, Amberg DC, Hopp TP, BioTechniques 1989; 7:580-589), o domínio interglobular de 127 aminoácidos de comprimento do agrecano de proteoglicano agregador da cartilagem grande humana (350t - 476G) (Doege KJ, et al., 1991), um espaçador de glicina de dois aminoácidos de comprimento e a região de charneira de IgGl humana, regiões constantes CH2 e CH3, originando assim uma proteína de fusão com uma massa molecular esperada de 41,059 d. Sequências de ADNc de agrecano que codificam o domínio interglobular foram amplificadas pela reacção da polimerase em cadeia após transcriptase reversa (RT-PCR) (Beverly SM, Current Protocols in Molecular Biology. Canadá: John Wiley and Sons, 1992) com oligonucleótidos sintéticos complementares a sequências que flanqueiam esta região e ARN total da cartilagem do joelho humana. O ARN total foi extraído a partir de tecido de cartilagem humana, obtidos a partir de cirurgia de substituição da articulação, de acordo com Adams et al (Adams ME, Huang DQ, Yao LY, Sandell LJ, Anal. Biochemistry 1992; 202:89-95).
Os oligonucleótidos foram construídos de modo a conter informação de sequência adicional em relação ao epitopo FLAG e ao espaçador g e para permitir a criação de sítios de clivagem por enzimas de restrição nas extremidades 5' e 3' dos segmentos de ADNc amplificados para facilitar inserção subsequente no vector de expressão CD5-IgGl, modificado de modo a conter o sítio Nhel na extremidade 3' (Aruffo A, Stamenkovic I, Melcick M, Underhill CB, Seed B, Cell 1990; 61:1303-1313). O iniciador que codifica o epitopo FLAG e o início do terminal amino do domínio interglobular e incluindo um sítio Nhel foi sintetizado com a seguinte sequência: —CGC GGG GCT AGC CGA CTA CAA GGA CGA CGA TGA CAA GAC AGG TGA AGA CTT TGT GGA C (SEQ ID NO: 1) . Um 9 p L·, ^^ iniciador em sentido contrário codificando a extremidade do terminal carboxilo do domínio interglobular, o espaçador G, um sítio do dador de ' separação contendo um sítio BamHl tinha a sequência: 5'-CGC GGG GGA TCC CCT CCC CCT GGC AAA TGC GGC TGC CC (SEQ ID NO: 2). 0 produto de PCR foi digerido com NheI e BamHI e ligado ao vector CD5-IgG cortado com NheI e BamHI (Aruffo A, et al., 1990).
Exemplo 2: Produção e Purificação de rAGG em células COS A construção foi transfectada em células COS via DEAE-dextrano (Hollenbaugh D, Aruffo A, Current protocols in molecular biology. Canadá: John Wiley and Sons, 1994). Doze horas após transfecção as células crescidas em DMEM, FCS a 10%, foram tratadas com tripsina, semeadas em placas frescas e deixadas a crescer durante cinco dias. No terceiro dia foi adicionado meio fresco e FCS a 10%. Os sobrenadantes foram recolhidos, centrifugados para remover células não aderentes e resíduos, reunidos e armazenados a 4°C. As proteínas de fusão foram purificadas por afinidade via gel de afinidade anti-FLAG™ Ml (Kodak, New Haven) de acordo com o protocolo dos fabricantes. Usualmente a produção foi de 1-5 μg de proteína de fusão por ml de sobrenadante de cultura.
Exemplo 3: Cultura de células de condrossarcoma de rato em agarose na presença ou ausência de ácido retinóico para estudos do catabolismo do substrato de IGD recombinante e agrecano nativo. Células de condrossarcoma de rato foram plaqueadas em frascos de 75 cm2 e mantidas em meio DMEM contendo FCS a 5% e gentamicina a 50 μg/ml. As monocamadas confluentes em frascos de 75 cm2 foram recolhidas por tratamento com tripsina (tripsina a 0,25% em DMEM contendo EDTA) durante 15-20 minutos a 37°C com agitação, 10
V
t seguido de digestão em colagenase a 0,05% em DMEM durante 1-2 horas. As células foram então ressuspendidas em DMEM a 4 x 106 células/ml. Placas de cultura de 24 poços foram 'revestidas' (200 μΐ/poço) com uma solução de agarose FMC Seaplaque a 1% (p/v) em DMEM e a agarose foi solidificada por incubação a 4°C durante 30 minutos (Aydelotte MB, Juttner KE, Conn. Tissue Res. 1988; 18:205-222). As placas foram então equilibradas a 37°C. A suspensão de células de condrócito de rato (descrita acima) foi diluída com uma solução de agarose Seaplaque a 2% em DMEM de modo a que a concentração celular final foi de 2 x 106 células/ml. Foram sobrepostos 200 μΐ (0,4 x 106 células) da suspensão celular em agarose sobre as rolhas de agarose previamente preparadas e imediatamente depois disto 50 μg de substrato de IGD recombinante (rAGGl) ou agrecano bovino nativo (A1D1) foram adicionados aos poços apropriados e misturados por agitação. As placas foram então incubadas a 4°C durante 15 minutos para solidificar a agarose. Foi então adicionado meio experimental (com ou sem ácido retinóico) a poços em triplicado contendo a construção de IGD recombinante, agrecano bovino nativo (A1D1) e células isoladas como se segue: Culturas controlo, DMEM + gentamicina (50 μg/ml) e culturas tratadas, DMEM + gentamicina (50 μg/ml) + ácido retinóico a IO-6 M (Hughes CE, et al., 1995). As culturas de células em agarose foram então mantidas a 37°C em CO2 a 5% durante 96 horas após as quais os meios e extractos de matriz agarose-célula foram ainda analisados.
Exemplo 4: Análise de meios experimentais de culturas em agarose de controlo e estimuladas por ácido retinóico
Os meios das culturas do substrato IGD recombinante e as culturas contendo apenas células foram dialisados exaustivamente contra H2O destilada, liofilizados e reconstituídos num volume 11
igual de tampão de amostra de SDS-PAGE contendo mercaptoetanol a 10% (v/v) . As amostras de meios das culturas de A1D1 e as culturas contendo apenas células foram dialisados contra Tris a 0,1 M, acetato de sódio a 50 mM, pH 6,5 e desglicosilados utilizando métodos previamente descritos (Hughes CE, et al., 1995). As amostras foram então dializadas exaustivamente contra H20 destilada, liofilizadas e reconstituídas num volume igual de tampão de amostra em SDS-PAGE. As amostras (volumes iguais/poço) foram então sujeitas a SDS-PAGE, transferidas para nitrocelulose e localizadas imunologicamente com anticorpos policlonais ou monoclonais utilizando procedimentos descritos abaixo.
Exemplo 5: Extracção da matriz agarose-célula de culturas controlo e estimuladas com ácido retinóico
As camadas superiores de agarose de culturas de substrato IGD recombinante, culturas de A1D1 de bovino e culturas contendo apenas células foram extraídas durante 24 horas a 4°C com cloreto de guanidina a 4 M contendo os seguintes inibidores enzimáticos: EDTA a 10 mM, cloridrato de benzamidina a 5 mM, ácido β-aminohexóico a 0,1 M e fluoreto de fenilmetanosulfonilo a 1 mM. 0 resíduo do gel de agarose foi removido por centrifugação e os sobrenadantes foram então processados para cada um dos substratos como descrito acima. As amostras (volumes iguais/poço) foram então sujeitas a SDS-PAGE, transferidas para nitrocelulose e localizadas imunologicamente com anticorpos policlonais e monoclonais utilizando procedimentos descritos abaixo.
Exemplo 6: Electroforese em gel de Poliacrilamida na Presença de SDS e .análise de Transferência de Western
As amostras contendo substrato IGD nativo recombinante e os seus catabolitos foram sujeitos a electroforese em géis em placa de 12
V í“ i
Lr
poliacrilamida a 10% em SDS utilizando procedimentos descritos por Laemmli (Laemmli UK, Nature 1970; 227:680-685). Após electroforese as proteínas fraccionadas foram transferidas electroforeticamente para nitrocelulose e localizadas imunologicamente com anticorpo monoclonal anti-FLAG ou imunoglobulina anti-humana ou anticorpo monoclonal BC-3 (todos a uma diluição de 1:1000) utilizando procedimentos previamente descritos (Hughes CE, et al., 1995). As amostras contendo A1D1 bovina nativa e seus catabolitos foram sujeitos a electroforese em géis de SDS-PAGE a 3-15% e transferidos para membranas de nitrocelulose para localização imunológica com uma diluição de 1:1000 de anticorpos monoclonais 3-B-3; 2-B-6 e BC-3. Em geral as transferências imunológicas foram incubadas com substrato durante 5-15 min à temperatura ambiente para atingir um desenvolvimento óptimo de cor.
Exemplo 7: Características da construção de IGD recombinante A transfecção da IGD recombinante em células COS resultou na expressão celular e subsequente excreção do produto de IGD recombinante no meio. A utilização de um gel de afinidade anti-FLAG Ml facilitou a sua purificação a partir de meios de células transfectadas. Um litro de meio de células COS transfectadas produziu 1-5 mg de substrato de IGD recombinante. Em condições de não redução este substrato de IGD recombinante formou agregados de grande peso molecular devido á presença de um número impar de resíduos de cisteína no domínio de imunoglobulina da molécula. Esta formação de agregado facilitou a imobilização do substrato de IGD recombinante nas culturas de agarose. Em condições de redução a construção de IGD recombinante ocorreu como dois componentes de peso molecular possuindo Mr estimados de 72 kDa e 39 kDa, como observado após separação em géis de SDS-PAGE a 10%. As razões para a ocorrência de duas formas do substrato de IGD recombinante são 13 p Lc, ^^ correntemente desconhecidas, contudo, ambos o monoclonal anti-Ml (reconhecendo um epitopo na região FLAG da construção) e o monoclonal anti-Ig (reconhecendo um epitopo na região de imunoglobulina da construção) localizaram imunologicamente ambas as formas da construção de IGD recombinante. A análise densitométrica de um gel corado com Coomassie da construção de IGD recombinante separada mostrou que a razão da banda de 72 kDa para a de 39 kDa foi de aproximadamente 10:1 (resultados não apresentados).
Exemplo 8: Análise Imunoquimica da construção recombinante de IGD de culturas em agarose tratadas com e sem ácido retinóico O substrato de IGD recombinante foi imobilizado em culturas de células em agarose contendo condrócitos de condrossarcoma de rato, com ou sem ácido retinóico, durante 96 horas. A análise do substrato de IGD recombinante e dos seus metabolitos no meio de cultura foi examinada por SDS-PAGE e análise por transferência de Western. A localização imunológica com anti-Ml (reconhecendo um epitopo no domínio FLAG no terminal N do substrato recombinante) não apresentou diferenças no padrão de metabolitos de rAGG-1 presentes no meio de qualquer das culturas controlo ou tratadas com ácido retinóico. Contudo, a localização imunológica com anti-Ig (reconhecendo um epitopo no domínio de imunoglobulina no terminal C do substrato recombinante) mostrou a presença de uma banda adicional migrando a 65 kDA sugerindo que tenha ocorrido catabolismo parcial do substrato recombinante não digerido de 72 kDa. Este resultado indica que o epitopo Ml (no terminal N) foi clivado a partir da forma de 72 kDa do substrato recombinante IGD para gerar um catabolito de 65 kDa. A ausência de coloração imunológica positiva para a banda a 72 kDa com anti-Ml confirma esta conclusão. De modo a verificar se esta clivagem da construção IGD ocorria no sítio de 'agrecanase' das 14
U amostras de meios de substrato recombinante de culturas de condrócito tratadas com e sem ácido retinóico foram examinadas por transferência imunológica com anticorpo monoclonal BC-3 (anti ARG...)· A localização imunológica com. BC-3 não apresentou reactividade em culturas sem ácido retinóico e apenas uma banda imunopositiva a 65 kDa nas culturas tratadas com ácido retinóico. Este resultado indica que ocorreu o catabolismo de 'agrecanase' da forma de 72kDa do substrato IGD recombinante. Contudo, não houve evidência que a isoforma de 39 kDa tenha sido catabolizada. A ausência de coloração imunológica com BC-3 para catabolitos de forma de 39 kDa positivos pode ser devida a esses catabolitos estarem presentes em concentrações mais baixas uma vez que havia dez vezes mais da forma 72 kDa na preparação de rAGG-1. De modo a confirmar que o catabolito de 65 kDa era derivado da forma de 72 kDa de rAGG-1 a transferência imunológica de BC-3 foi re-pesquisada com o anticorpo anti-Ml.
Exemplo 9: Análise de A1D1 bovino nativo de culturas em agarose tratadas com e sem ácido retinóico
Também avaliámos a utilização de um substrato nativo neste sistema de cultura para o comparar com substrato recombinante artificial. Agrecano bovino nativo (A1D1) foi misturado com agarose contendo condrócitos de rato tratados com e sem ácido retinóico. As culturas de células em agarose, sem A1D1 bovino adicionado, foram também analisadas de modo a ensaiar para qualquer contribuição de proteoglicano endógeno (substrato potencial) sintetizado durante as 96 horas de cultura. Quando as amostras de meios foram localizadas imunologicamente com o anticorpo monoclonal 2-B-6 não foi observada coloração nos meios retirados de culturas em agarose contendo apenas células. Este resultado mostra que não havia contribuição significativa de substrato endógeno sintetizado de novo no período de cultura. As culturas contendo substrato de agrecano bovino adicionado 15 exogenamente mantido com e sem ácido retinóico mostram o conjunto previsível de núcleos de proteína, 'marcadores em escada', como previamente descritos em vários estudos (Hughes CE, et al., 1995; Ilic MZ, Handley CJ, Robinson HC, Biochem. Internat. 1990; 21:977-986). Resultados semelhantes foram também observados utilizando o anticorpo monoclonal 3-B-3 (Fig 2, pistas 4, 5 e 6). Em contraste, a coloração imunológica utilizando anticorpo BC-3, para o catabolito de agrecano gerado pela 'agrecanase' com a sequência do terminal N ARGSV... foi apenas observada nas culturas que foram sujeitas a tratamento com ácido retinóico. O peso molecular relativo deste catabolito de agrecano positivo de BC-3 foi ~160 kDa e é semelhante ao observado noutros sistemas de cultura (Hughes CE, et al., 1995).
Os meios e amostras de extracto de culturas com ambos o substrato recombinante e agrecano bovino nativo foram também pesquisados com um anticorpo desenvolvido de novo (BC-14) que reconhece a sequência do neoepitopo do terminal N FFGV... que é gerada por proteólise de agrecano IGD com MMP's 1, 2, 3, 7, 8 ou 9. A transferência imunológica com BC-14 foi negativa em ambos os sistemas de cultura (resultados não apresentados). Este resultado indica que o catabolismo do IGD neste sítio não ocorria, uma descoberta consistente com a relatada por outros laboratórios (Lark MW, et al., 1995).
Exemplo 10:
Para estudos posteriores empregámos o substrato recombinante rAGG-lmut, uma versão da nossa proteína de fusão rAGG-1, na qual um sítio dador de separação na extremidade aminoterminal do IGD foi mutada para evitar separação alternativa. Como sua construção de origem, rAGG-lmut contém um epitopo FLAG como marcador aminoterminal, o IGD do agrecano humano e a região constante de uma molécula de IgG humana como um marcador do 16 lí ’ terminal carboxilo. Após a transfecção transiente, o rAGG-lmut é excretado pelas células COS como uma proteína de fusão para o sobrenadante da cultura e surge como uma banda de 72 kDa em condições de redução e como uma banda de 140 kDa em condições de não redução, provavelmente reflectindo uma dimerisação devida à presença de cisteína não emparelhada na região de charneira da componente de imunoglobulina humana no terminal C da construção.
Após estimulação com ácido retinóico (RA), as células embebidas em agarose na linha celular de condrossarcoma de rato RX produzem agrecanase. O rAGG-lmut é catabolisado no sítio de agrecanase como tem sido descrito para rAGG-1, que é apresentado através da imunodetecção com o anticorpo monoclonal BC-3. O tamanho de 66 kD deste produto catabólico está de acordo com a perda prevista de 5,8 kD após clivagem no sítio de agrecanase. A sequência de aminoácidos de rAGG-lmut difere apenas na posição 34 da sequência de aminoácidos de rAGG-1: rAGG-lmut contém Ala 34, enquanto que rAGG-1 contém um Gly 34. A sequência de nucleótidos do ADN codificando rAGG-lmut difere em três posições do ADN codificando rAGG-1: A para C, 2450: G para C e 2451: T para A. DISCUSSÃO GERAL: Estes resultados são o primeiro relato da produção e utilização de um substrato recombinante para o estudo de actividade de 'agrecanase'. Adicionalmente, desenvolvemos um novo sistema de cultura de células para monitorizar a actividade de 'agrecanase' sem a complicação de agrecano endógeno actuando como um substrato. As propriedade únicas de agregação deste substrato artificial ( rAGGl) facilitou a sua imobilização no sistema de cultura de células em agarose. Além disso, somos capazes de utilizar condrócitos isolados de fresco sem a necessidade de estabelecer uma matriz extracelular endógena para actuar como um substrato para qualquer actividade de 17 r u 'agrecanase'. Os resultados obtidos com a construção de IGD recombinante demonstram que não há uma necessidade para um domínio G1 e/ou G2 na IGD de agrecano para clivagem no sítio da 'agrecanase'. Além disso, parece não existir necessidade para cadeias de sulfato de queratano, (na medida em que a construção de rAGG-1 não apresentou coloração positiva na análise de transferência de Western com um anticorpo contra sulfato de queratano 5-D-4, resultados não apresentados) na IGD, o que pode proporcionar rigidez a esta região na molécula nativa de agrecano. Este sistema de cultura desenvolvido de novo mostrar-se-á útil para estudos posteriores dos mecanismos moleculares envolvidos na degradação de agrecano por 'agrecanase'. É também uma nova abordagem experimental que poderia ser considerada para estudos do catabolismo de outras macromoléculas matriz dada a disponibilidade de substratos recombinantes e anticorpos para novos epitopos. 18 \ Γ u
Tabela 1: Sequência de aminoácidos de rAGG-1 (SEQ ID NO: 3)
Met Pro Met Gly Ser Leu Gin Pro Leu Ala Thr Leu Tyr Leu Leu Gly 15 10 15
Met Leu Vai Ala Ser Vai Leu Ala Asp Tyr Lys Asp Asp Asp Asp Lys 20 25 30
Thr Gly Glu Asp Phe Vai Asp Ile Pro Glu Asn Phe Phe Gly Vai Gly 35 40 45
Gly Glu Glu Asp Ile Thr Vai Gin Thr Vai Thr Trp Pro Asp Met Glu 50 55 60
Leu Pro Leu Pro Arg Asn Ile Thr Glu Gly Glu Ala Arg Gly Ser Vai 65 70 75 80
Ile Leu Thr Vai Lys Pro Ile Phe Glu Vai Ser Pro Ser Pro Leu Glu 85 90* 95
Pro Glu Glu Pro Phe Thr Phe Ala Pro Glu Ile Gly Ala Thr Ala Phe 100 105 110
Ala Glu Vai Glu Asn Glu Thr Gly Glu Ala Thr Arg Pro Trp Gly Phe 115 120 125
Pro Thr Pro Gly Leu Gly Pro Ala Thr Ala Phe Thr Ser Glu Asp Leu 130 135 140
Vai Vai Gin Vai Thr Ala Vai Pro Gly Gin Pro His Leu Pro Gly Gly 145 150 155 160
Gly Asp Pro Glu Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro 165 170 175 19 ) _ I—
Γ
Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Vai Phe Leu Phe 180 185 190
Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Vai 195 200 205
Thr Cys Vai Vai Vai Asp Vai Ser His Glu Asp Pro Glu Vai Lys Phe 210 215 220
Asn Trp Tyr Vai Asp Gly Vai Glu Vai His Asn Ala Lys Thr Lys Pro 225 230 235 240
Arg Glu Glu Gin Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Vai Vai Ser Vai Leu Thr 245 250 255
Vai Leu His Gin Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Vai 260 265 270
Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala 275 280 285
Lys Gly Gin Pro Arg Glu Pro Gin Vai Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg 290 295 300
Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gin Vai Ser Leu Thr Cys Leu Vai Lys Gly 305 310 315 320
Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Vai Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gin Pro 325 330 335
Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Vai Leu Asp Ser Asp Gly Ser 340 345 350 20
C t
Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Vai Asp Lys Ser Arg Trp Gin Gin 355 360 365
Gly Asn Vai Phe Ser Cys Ser Vai Met His Glu Ala Leu His Asn His 370 375 380
Tyr Thr Gin Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 385 390 395 Tabela 2: Sequência de rAGG-1 (SEQ ID NC >: 4) GGCGTAATCT GCTGCTTGCA AACAAAAAAA CCACCGCTAC CAGCGGTGGT TTGTTTGCCG 60 GATCAAGAGC TACCAACTCT TTTTCCGAAG GTAACTGGCT TCAGCAGAGC GCAGATACCA 120 AATACTGTCC TTCTAGTGTA GCCGTAGTTA GGCCACCACT TCAAGAACTC TGTAGCACCG 180 CCTACATACC TCGCTCTGCT AATCCTGTTA CCAGTGGCTG CTGCGAGTGG CGATAAGTCG 240 TGTCTTACCG GGTTGGACTC AAGACGATAG TTACCGGATA AGGCGCAGCG GTCGGGCTGA 300 ACGGGGGGTT CGTGCACACA GCCCAGCTTG GAGCGAACGA CCTACACCGA ACTGAGATAC 360 CTACAGCGTG AGCATTGAGA AAGCGCCACG. CTTCCCGAAG GGAGAAAGGC GGACAGGTAT 420 CCGGTAAGCG GCAGGGTCGG AACAGGAGAG CGCACGAGGG AGCTTCCAGG GGGAAACGCC 480 TGGTATCTTT ATAGTCCTGT CGGGTTTCGC CACCTCTGAC TTGAGCGTCG ATTTTTGTGA 540 TGCTCGTCAG GGGGGCGGAG CCTATGGAAA AACGCCAGCA ACGCAAGCTA GCTTCTAGCT 600 AGAAATTGTA AACGTTAATA TTTTGTTAAA ATTCGCGTTA AATTTTTGTT AAATCAGCTC 660 21 ^ 1—^ ^^ ATTTTTTAAC CAATAGGCCG AAATCGGCAA AATCCCTTAT AAATCAAAAG AATAGCCCGA 720 GATAGGGTTG AGTGTTGTTC CAGTTTGGAA CAAGAGTCCA CTATTAAAGA ACGTGGACTC 780 CAACGTCAAA GGGCGAAAAA CCGTCTATCA GGGCGATGGC CGCCCACTAC GTGAACCATC 840 ACCCAAATCA AGTTTTTTGG GGTCGAGGTG CCGTAAAGCA CTAAATCGGA ACCCTAAAGG 900 GAGCCCCCGA TTTAGAGCTT GACGGGGAAA GCCGGCGAAC GTGGCGAGAA AGGAAGGGAA 960 GAAAGCGAAA GGAGCGGGCG CTAGGGCGCT GGCAAGTGTA GCGGTCACGC TGCGCGTAAC 1020 CACCACACCC GCCGCGCTTA ATGCGCCGCT ACAGGGCGCG TACTATGGTT GCTTTGACGA 1080 GCACGTATAA CGTGCTTTCC TCGTTGGAAT CAGAGCGGGA GCTAAACAGG AGGCCGATTA 1140 AAGGGATTTT AGACAGGAAC GGTACGCCAG CTGGACCGCG GTCTTTCTCA ACGTAACACT 1200 TTACAGCGGC GCGTCATTTG ATATGATGCG CCCCGCTTCC CGATAAGGGA GCAGGCCAGT 1260 AAAAGCATTA CCCGTGGTGG GGTTCCCGAG CGGCCAAAGG GAGCAGACTC TAAATCTGCC 1320 GTCATCGACT TCGAAGGTTC GAATCCTTCC CCCACCACCA TCACTTTCAA AAGTCCGAAA 1380 GCTGCTCCCT GCTTGTGTGT TGGAGGTCGC TGAGTAGTGC GCGAGTAAAA TTTAAGCTAC 1440 AACAAGGCAA GGCTTGACCG ACAATTGCAT GAAGAATCTG CTTAGGGTTA GGCGTTTTGC 1500 GCTGCTTCGC GATGTACGGG CCAGATATAC GCGTTGACAT TGATTATTGA CTAGTTATTA 1560 ATAGTAATCA ATTACGGGGT CATTAGTTCA TAGCCCATAT ATGGAGTTCC GCGTTACATA 1620 ACTTACGGTA AATGGCCCGC CTGGCTGACC GCCCAACGAC CCCCGCCCAT TGACGTCAAT 1680 AATGACGTAT GTTCCCATAG TAACGCCAAT AGGGACTTTC CATTGACGTC AATGGGTGGA 1740 22 CTATTTACGG TAAACTGCCC ACTTGGCAGT ACATCAAGTG TATCATATGC CAAGTACGCC 1800 CCCTATTGAC gtcaatgacg GTAAATGGCC CGCCTGGCAT TATGCCCAGT ACATGACCTT 1860 ATGGGACTTT CCTACTTGGC AGTACATCTA CGTATTAGTC ATCGCTATTA CCATGGTGAT 1920 GCGGTTTTGG CAGTACATCA ATGGGCGTGG ATAGCGGTTT GACTCACGGG GATTTCCAAG 1980 TCTCCACCCC ATTGACGTCA ATGGGAGTTT gttttggcac CAAAATCAAC GGGACTTTCC 2040 AAAATGTCGT AACAACTCCG CCCCATTGAC GCAAATGGGC GGAATTCCTG GGCGGGACTG 2100 GGGAGTGGCG AGCCCTCAGA TGCTGCATAT AAGCAGCTGC TTTTTGCCTG TACTGGGTCT 2160 CTCTGGTTAG ACCAGATCTG AGCCTGGGAG CTCTCTGGCT AACTAGAGAA CCCACTGCTT 2220 AAGCCTCAAT AAAGCTTCTA GAGATCCCTC GACCTCGAGA TCCATTGTGC TCTAAAGGAG 2280 ATACCCGGCC AGACACCCTC ACCTGCGGTG CCCAGCTGCC CAGGCTGAGG CAAGAGAAGG 2340 CCAGAAACCA TGCCCATGGG GTCTCTGCAA CCGCTGGCCA CCTTGTACCT GCTGGGGATG 2400 CTGGTCGCTT CCGTGCTAGC CGACTACAAG GACGACGATG ACAAGACAGG TGAAGACTTT 2460 GTGGACATCC CAGAAAACTT CTTTGGAGTG GGGGGTGAGG AGGACATCAC CGTCCAGACA 2520 GTGACCTGGC CTGACATGGA GCTGCCACTG CCTCGAAACA TCACTGAGGG TGAAGCCCGA 2580 GGCAGCGTGA TCCTTACCGT AAAGCCCATC TTCGAGGTCT CCCCCAGTCC CCTGGAACCC 2640 GAGGAGCCCT TCACGTTTGC CCCTGAAATA GGGGCCACTG CCTTCGCTGA GGTTGAGAAT 2700 GAGACTGGAG AGGCCACCAG GCCCTGGGGC TTTCCCACAC CTGGCCTGGG CCCTGCCACG 2760 GCATTCACCA GTGAGGACCT CGTCGTGCAG GTGACCGCTG TCCCTGGGCA GCCGCATTTG 2820 CCAGGGGGAG GGGATCCCGA GGGTGAGTAC TAAGCTTCAG CGCTCCTGCC TGGACGCATC 2880 23 \
t CCGGCTATGC AGCCCCAGTC CAGGGCAGCA AGGCAGGCCC CGTCTGCCTC TTCACCCGGA 2940 GGCCTCTGCC CGCCCCACTC ATGCTCAGGG AGAGGGTCTT CTGGCTTTTT CCCCAGGCTC 3000 TGGGCAGGCA CAGGCTAGGT GCCCCTAACC CAGGCCCTGC ACACAAAGGG GCAGGTGCTG 3060 GGCTCAGACC TGCCAAGAGC CATATCCGGG AGGACCCTGC CCCTGACCTA AGCCCACCCC 3120 AAAGGCCAAA CTCTCCACTC CCTCAGCTCG GACACCTTCT CTCCTCCCAG ATTCCAGTAA 3180 CTCCCAATCT TCTCTCTGCA GAGCCCAAAT CTTGTGACAA AACTCACACA TGCCCACCGT 3240 GCCCAGGTAA GCCAGCCCAG GCCTCGCCCT CCAGCTCAAG GCGGGACAGG TGCCCTAGAG 3300 TAGCCTGCAT CCAGGGACAG GCCCCAGCCG GGTGCTGACA CGTCCACCTC CATCTCTTCC 3360 TCAGCACCTG AACTCCTGGG GGGACCGTCA GTCTTCCTCT TCCCCCCAAA ACCCAAGGAC 3420 ACCCTCATGA TCTCCCGGAC CCCTGAGGTC ACATGCGTGG TGGTGGACGT GAGCCACGAA 3480 GACCCTGAGG TCAAGTTCAA CTGGTACGTG GACGGCGTGG AGGTGCATAA TGCCAAGACA 3540 AAGCCGCGGG AGGAGCAGTA CAACAGCACG TACCGTGTGG TCAGCGTCCT CACCGTCCTG 3600 CACCAGGACT GGCTGAATGG CAAGGAGTAC AAGTGCAAGG TCTCCAACAA AGCCCTCCCA 3660 GCCCCCATCG AGAAAACCAT CTCCAAAGCC AAAGGTGGGA CCCGTGGGGT GCGAGGGCCA 3720 CATGGACAGA GGCCGGCTCG GCCCACCCTC TGCCCTGAGA GTGACCGCTG TACCAACCTC 3780 TGTCCCTACA GGGCAGCCCC GAGAACCACA GGTGTACACC CTGCCCCCAT CCCGGGATGA 3840 GCTGACCAAG AACCAGGTCA GCCTGACCTG CCTGGTCAAA GGCTTCTATC CCAGCGACAT 3900 CGCCGTGGAG TGGGAGAGCA ATGGGCAGCC GGAGAACAAC TACAAGACCA CGCCTCCCGT 3960 24 Γ L·, Κ GCTGGACTCC GACGGCTCCT TCTTCCTCTA CAGCAAGCTC ACCGTGGACA AGAGCAGGTG 4020 GCAGCAGGGG AACGTCTTCT CATGCTCCGT GATGCATGAG GCTCTGCACA ACCACTACAC 4080 GCAGAAGAGC CTCTCCCTGT CTCCGGGTAA ATGAGTGCGA CGGCCGCGAC TCTAGAGGAT 4140 CTTTGTGAAG GAACCTTACT TCTGTGGTGT GACATAATTG GACAAACTAC CTACAGAGAT 4200 TTAAAGCTCT AAGGTAAATA TAAAATTTTT AAGTGTATAA TGTGTTAAAC TACTGATTCT 4260 AATTGTTTGT GTATTTTAGA TTCCAACCTA TGGAACTGAT GAATGGGAGC AGTGGTGGAA 4320 TGCCTTTAAT GAGGAAAACC TGTTTTGCTC AGAAGAAATG CCATCTAGTG ATGATGAGGC 4380 TACTGCTGAC TCTCAACATT CTACTCCTCC AAAAAAGAAG AGAAAGGTAG AAGACCCCAA 4440 GGACTTTCCT TCAGAATTGC TAAGTTTTTT GAGTCATGCT GTGTTTAGTA ATAGAACTCT 4500 TGCTTGCTTT GCTATTTACA CCACAAAGGA AAAAGCTGCA CTGCTATACA AGAAAATTAT 4560 GGAAAAATAT TCTGTAACCT TTATAAGTAG GCATAACAGT TATAATCATA ACATACTGTT 4620 TTTTCTTACT CCACACAGGC ATAGAGTGTC TGCTATTAAT AACTATGCTC AAAAATTGTG 4680 TACCTTTAGC TTTTTAATTT GTAAAGGGGT TAATAAGGAA TATTTGATGT ATAGTGCCTT 4740 GACTAGAGAT CATAATCAGC C AT AC C AC AT TTGTAGAGGT TTTACTTGCT TTAAAAAACC 4800 TCCCACACCT CCCCCTGAAC CTGAAACATA AAATGAATGC AATTGTTGTT GTTAACTTGT 4860 TTATTGCAGC TTATAATGGT TACAAATAAA GCAATAGCAT CACAAATTTC ACAAATAAAG 4920 CATTTTTTTC ACTGCATTCT AGTTGTGGTT TGTCCAAACT CATCAATGTA TCTTATCATG 4980 TCTGGATCCT GTGGAATGTG TGTCAGTTAG GGTGTGGAAA GTCCCCAGGC TCCCCAGCAG 5040 GCAGAAGTAT GCAAAGCATG CATCTCAATT AGTCAGCAAC CAGGTGTGGA AAGTCCCCAG 5100 25 GCTCCCCAGC AGGCAGAAGT ATGCAAAGCA TGCATCTCAA TTAGTCAGCA ACCATAGTCC 5160
CGCCCCTAAC ATGGCTGACT TCCAGAAGTA TCCGCCCATC CCGCCCCTAA CTCCGCCCAG TTCCGCCCAT TCTCCGCCCC 5220 AATTTTTTTT ATTTATGCAG AGGCCGAGGC CGCCTCGGCC TCTGAGCTAT 5280 GTGAGGAGGC TTTTTTGGAC GCCTAGGCTT TTGCAAAAG CTAATTC 5337
Lisboa, 6 de Novembro de 2000
O AGENTE OFICIAL DA PROPRIEDADE INDUSTRIAL
26
Claims (17)
- REIVINDICAÇÕES 1. Substrato recombinante para sistemas de teste ín vitro de Agrecanase, em que o referido substrato contém um grupo de elementos estruturais compreendendo a) a sequência sinal de CD5, b) o epitopo-FLAG para detecção com anticorpo monoclonal Ml, c) o domínio interglobular de agrecano humano, d) a região de charneira de IgGl humano, e) a região CH2 de IgGl humano e f) a região CH3 de IgGl humano.
- 2. Substrato recombinante, de acordo com a reivindicação 1, em que a) o referido substrato possui a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO:3 ou partes desta, ou b) possui a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 3 ou partes desta, em que o aminoácido 34 está mutado para Ala.
- 3. ADN, de acordo com as reivindicações 1 ou 2, codificando um substrato recombinante.
- 4. ADN, de acordo com a reivindicação 3, em que a) o referido ADN possui a Sequência de nucleótidos dos nucleótidos 2350 a 4114 de SEQ ID NO:4 ou partes desta b) o referido ADN possui a sequência de nucleótidos dos nucleótidos 2350 a 4114 de SEQ ID NO: 4 ou partes desta, em que o nucleótido 2448 está mutado para C, o nucleótido 2450 está mutado para C e o nucleótido 2451 está mutado 1 u para A; ou o referido ADN híbrida em condições de severidade com o ADN de SEQ ID NO:4.
- 5. Vector contendo um fragmento de ADN com a sequência de nucleótidos de acordo com a reivindicação 4.
- 6. Célula hospedeira contendo um vector de acordo com a reivindicação 5.
- 7. Utilização de um substrato recombinante, de acordo com as reivindicações 1 ou 2, num sistema de cultura celular para estudar a actividade de agrecanase.
- 8. Utilização de um substrato recombinante, de acordo com a reivindicação 7, em que o referido sistema de cultura de linha celular está isento de proteoglicanos inerentes endógenos e outros componentes extracelulares.
- 9. Utilização de um substrato recombinante, de acordo com a reivindicação 7 ou 8, em que o estudo da actividade de agrecanase é realizado através de detecção de produtos de clivagem por anticorpos.
- 10. Utilização de um substrato recombinante, de acordo com as reivindicações 1 ou 2, para a detecção de novos sítios de clivagem enzimática no referido substrato.
- 11. Utilização de um substrato recombinante, de acordo com as reivindicações 1 ou 2, para a purificação de agrecanase por meio de cromatografia de afinidade.
- 12. Utilização de um substrato recombinante, de acordo com as reivindicações 1 ou 2, num sistema de clonagem funcional, para o isolamento de ADNc de agrecanase. 2
- 13. Utilização de um substrato recombinante, de acordo com as reivindicações 1 ou 2, para a pesquisa de um inibidor de agrecanase.
- 14. Método para monitorização do inicio da progressão de osteoartrite, compreendendo o referido método ensaiar uma amostra de fluido biológico, de um humano suspeito ou. do qual se sabe possuir osteoartrite, quanto à presença de agrecanase por meio do substrato recombinante, de acordo com as reivindicações 1 ou 2.
- 15. Método, de acordo com a reivindicação 14, em que o referido fluido biológico é seleccionado a partir do grupo consistindo em fluido sinovial, urina, soro e fluido linfático.
- 16. Método, de acordo com a reivindicação 14 ou 15, em que o referido método é utilizado para seguir a progressão da doença para determinar a eficiência de um tratamento.
- 17. Conjunto de diagnóstico contendo um substrato recombinante de acordo com as reivindicações 1 ou 2 e anticorpos para a detecção de produtos da clivagem da agrecanase. Lisboa, 6 de Novembro de 2000 O AGENTE OFICIAL DA PROPRIEDADE INDUSTRIAL3
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| EP96100682 | 1996-01-18 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PT785274E true PT785274E (pt) | 2001-01-31 |
Family
ID=8222415
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PT96120949T PT785274E (pt) | 1996-01-18 | 1996-12-27 | Substrato recombinante artificial (ragg 1) e agrecano nativo para estudar a actividade proteolitica de `agrecanase´ em sistemas de cultura de celulas |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US5872209A (pt) |
| EP (1) | EP0785274B1 (pt) |
| JP (1) | JP3973253B2 (pt) |
| AT (1) | ATE196652T1 (pt) |
| AU (1) | AU713828B2 (pt) |
| CA (1) | CA2195385C (pt) |
| DE (1) | DE69610483T2 (pt) |
| DK (1) | DK0785274T3 (pt) |
| ES (1) | ES2150064T3 (pt) |
| GR (1) | GR3034649T3 (pt) |
| PT (1) | PT785274E (pt) |
Families Citing this family (9)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0785274B1 (en) * | 1996-01-18 | 2000-09-27 | Aventis Pharma Deutschland GmbH | An artifical recombinant substrate (rAGG-1) and native aggrecan to study the proteolytic activity of 'Aggrecanase' in cell culture systems |
| WO1999005291A2 (en) | 1997-07-25 | 1999-02-04 | Du Pont Pharmaceuticals Company | Aggrecan degrading metallo proteases |
| AU8513098A (en) * | 1998-07-24 | 2000-02-14 | Du Pont Pharmaceuticals Company | Assays and peptide substrate for determining aggrecan degrading metallo proteaseactivity |
| US6649377B1 (en) | 1999-05-10 | 2003-11-18 | Syntex (U.S.A.) Llc | Human aggrecanase and nucleic acid compositions encoding the same |
| AU2002335747B2 (en) | 2001-09-15 | 2009-01-29 | Rush University Medical Center | Stratified cartilage tissue and methods to engineer same |
| US20030165473A1 (en) * | 2001-11-09 | 2003-09-04 | Rush-Presbyterian-St. Luke's Medical Center | Engineered intervertebral disc tissue |
| DE102004029470A1 (de) * | 2004-06-18 | 2006-01-05 | InViTek Gesellschaft für Biotechnik & Biodesign mbH | Verfahren zur Bestimmung von Aggrekanase-Aktivitäten |
| DE102005005972A1 (de) | 2005-02-09 | 2006-08-17 | Sanofi-Aventis Deutschland Gmbh | Verwendung von Thiopeptoliden zur Aktivitätsbestimmung von ADAM-T8 Proteasen |
| EP2315842A2 (en) * | 2008-07-28 | 2011-05-04 | Dorit Arad | Methods and compositions for detection of a pathogen, disease, medical condition, or biomarker thereof |
Family Cites Families (5)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5427954A (en) * | 1992-04-29 | 1995-06-27 | Shriner's Hospitals For Crippled Children | Compositions and methods for detection and treatment of human osteoarthritis |
| GB9310978D0 (en) * | 1993-05-27 | 1993-07-14 | Zeneca Ltd | Compounds |
| US5851523A (en) * | 1994-03-24 | 1998-12-22 | Ludwig Institute For Cancer Research. | Isolated, peptides derived from MAGE tumor rejection antigen precursors which complex with HLA-A2 molecules and uses thereof |
| SE9500023L (sv) * | 1994-05-17 | 1995-11-18 | Beki Ab | Sätt att detektera cancer |
| EP0785274B1 (en) * | 1996-01-18 | 2000-09-27 | Aventis Pharma Deutschland GmbH | An artifical recombinant substrate (rAGG-1) and native aggrecan to study the proteolytic activity of 'Aggrecanase' in cell culture systems |
-
1996
- 1996-12-27 EP EP96120949A patent/EP0785274B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1996-12-27 PT PT96120949T patent/PT785274E/pt unknown
- 1996-12-27 DE DE69610483T patent/DE69610483T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1996-12-27 AT AT96120949T patent/ATE196652T1/de active
- 1996-12-27 DK DK96120949T patent/DK0785274T3/da active
- 1996-12-27 ES ES96120949T patent/ES2150064T3/es not_active Expired - Lifetime
-
1997
- 1997-01-16 AU AU10199/97A patent/AU713828B2/en not_active Ceased
- 1997-01-17 US US08/784,512 patent/US5872209A/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-01-17 CA CA2195385A patent/CA2195385C/en not_active Expired - Fee Related
- 1997-01-20 JP JP02097097A patent/JP3973253B2/ja not_active Expired - Fee Related
-
1998
- 1998-10-21 US US09/176,228 patent/US6180334B1/en not_active Expired - Lifetime
-
2000
- 2000-10-20 GR GR20000402336T patent/GR3034649T3/el unknown
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| DE69610483T2 (de) | 2001-06-13 |
| ES2150064T3 (es) | 2000-11-16 |
| DK0785274T3 (da) | 2000-12-27 |
| US5872209A (en) | 1999-02-16 |
| JP3973253B2 (ja) | 2007-09-12 |
| US6180334B1 (en) | 2001-01-30 |
| DE69610483D1 (de) | 2000-11-02 |
| AU1019997A (en) | 1997-07-24 |
| EP0785274A1 (en) | 1997-07-23 |
| CA2195385C (en) | 2010-07-27 |
| EP0785274B1 (en) | 2000-09-27 |
| GR3034649T3 (en) | 2001-01-31 |
| ATE196652T1 (de) | 2000-10-15 |
| AU713828B2 (en) | 1999-12-09 |
| CA2195385A1 (en) | 1997-07-19 |
| JPH09191889A (ja) | 1997-07-29 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP7599740B2 (ja) | 細胞または生物のゲノムへのDNA配列の標的化組み込みのためのCas9レトロウイルスインテグラーゼおよびCas9レコンビナーゼ系 | |
| AU2022200262B2 (en) | Target-specific CRISPR mutant | |
| AU719001B2 (en) | Chimeric DNA-binding proteins | |
| Takagaki et al. | A polyadenylation factor subunit is the human homologue of the Drosophila suppressor of forked protein | |
| US7833784B2 (en) | Zinc finger binding domains for TNN | |
| US20070154989A1 (en) | Zinc finger domains specifically binding agc | |
| CA2964859C (en) | Mammalian cells expressing cytomegalovirus antigens | |
| AU713828B2 (en) | An artificial recombinant substrate (rAGG 1) and native aggrecan to study the proteolytic activity of 'aggrecanase' in cell culture systems | |
| DK2638152T3 (en) | VARIANTE, RECOMBINANT BETA-glucocerebrosidase PROTEINS WITH INCREASED STABILITY AND INCREASED RETAINED CATALYTIC ACTIVITY | |
| US20120329067A1 (en) | Methods of Generating Zinc Finger Nucleases Having Altered Activity | |
| CA2319096C (en) | Method for treating acute intermittent porphyria (aip) and other porphyric diseases | |
| MXPA97000469A (en) | An artificial recombinant substrate (ragg 1) and natural agrecano to study the proteolic activity of "agrecanasa" in cellular culture systems | |
| US20100056457A1 (en) | Zinc Finger Binding Domains for CNN | |
| RU2380373C2 (ru) | ПЕПТИД DED И ЕГО ПРИМЕНЕНИЕ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ И/ИЛИ ОЧИСТКИ РЕКОМБИНАНТНЫХ БЕЛКОВ, ВЕКТОР pDED | |
| CN101228269A (zh) | 用于生产治疗脓毒症的重组人活化蛋白c的、包含密码子优化的方法 | |
| Prasad¹ et al. | Characterization of a 32-Residue Peptide From Rat DNA Polymerase ẞ With Single-Stranded DNA-Binding Affinity |