RU2018102796A - Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага - Google Patents

Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага Download PDF

Info

Publication number
RU2018102796A
RU2018102796A RU2018102796A RU2018102796A RU2018102796A RU 2018102796 A RU2018102796 A RU 2018102796A RU 2018102796 A RU2018102796 A RU 2018102796A RU 2018102796 A RU2018102796 A RU 2018102796A RU 2018102796 A RU2018102796 A RU 2018102796A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
streptococcus
staphylococcus
seq
bacteria
domain
Prior art date
Application number
RU2018102796A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2018102796A3 (ru
RU2735103C2 (ru
Inventor
Рэймонд ШУК
Роберт К. НОВИНСКИ
Майкл УИТТКАЙНД
Бабар КХАН
Джимми РОТОЛО
Original Assignee
Контрафект Корпорейшн
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Контрафект Корпорейшн filed Critical Контрафект Корпорейшн
Publication of RU2018102796A3 publication Critical patent/RU2018102796A3/ru
Publication of RU2018102796A publication Critical patent/RU2018102796A/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2735103C2 publication Critical patent/RU2735103C2/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/162—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from virus
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N63/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing microorganisms, viruses, microbial fungi, animals or substances produced by, or obtained from, microorganisms, viruses, microbial fungi or animals, e.g. enzymes or fermentates
    • A01N63/40—Viruses, e.g. bacteriophages
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01N—PRESERVATION OF BODIES OF HUMANS OR ANIMALS OR PLANTS OR PARTS THEREOF; BIOCIDES, e.g. AS DISINFECTANTS, AS PESTICIDES OR AS HERBICIDES; PEST REPELLANTS OR ATTRACTANTS; PLANT GROWTH REGULATORS
    • A01N63/00—Biocides, pest repellants or attractants, or plant growth regulators containing microorganisms, viruses, microbial fungi, animals or substances produced by, or obtained from, microorganisms, viruses, microbial fungi or animals, e.g. enzymes or fermentates
    • A01N63/50—Isolated enzymes; Isolated proteins
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/164—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43—Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/46—Hydrolases (3)
    • A61K38/47—Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2), e.g. cellulases, lactases
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/02—Bacterial antigens
    • A61K39/085—Staphylococcus
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
    • A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61L—METHODS OR APPARATUS FOR STERILISING MATERIALS OR OBJECTS IN GENERAL; DISINFECTION, STERILISATION OR DEODORISATION OF AIR; CHEMICAL ASPECTS OF BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES; MATERIALS FOR BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES
    • A61L2/00—Disinfection or sterilisation of materials or objects, in general; Accessories therefor
    • A61L2/16—Disinfection or sterilisation of materials or objects, in general; Accessories therefor using chemical substances
    • A61L2/18—Liquid substances
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61L—METHODS OR APPARATUS FOR STERILISING MATERIALS OR OBJECTS IN GENERAL; DISINFECTION, STERILISATION OR DEODORISATION OF AIR; CHEMICAL ASPECTS OF BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES; MATERIALS FOR BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES
    • A61L29/00—Materials for catheters, medical tubing, cannulae, or endoscopes or for coating catheters
    • A61L29/08—Materials for coatings
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61L—METHODS OR APPARATUS FOR STERILISING MATERIALS OR OBJECTS IN GENERAL; DISINFECTION, STERILISATION OR DEODORISATION OF AIR; CHEMICAL ASPECTS OF BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES; MATERIALS FOR BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES
    • A61L29/00—Materials for catheters, medical tubing, cannulae, or endoscopes or for coating catheters
    • A61L29/14—Materials characterised by their function or physical properties, e.g. lubricating compositions
    • A61L29/16—Biologically active materials, e.g. therapeutic substances
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/315—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Streptococcus (G), e.g. Enterococci
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/503—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from viruses
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14—Hydrolases (3)
    • C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/52—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from bacteria or Archaea
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y302/00—Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01—Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01017—Lysozyme (3.2.1.17)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61L—METHODS OR APPARATUS FOR STERILISING MATERIALS OR OBJECTS IN GENERAL; DISINFECTION, STERILISATION OR DEODORISATION OF AIR; CHEMICAL ASPECTS OF BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES; MATERIALS FOR BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES
    • A61L2103/00—Materials or objects being the target of disinfection or sterilisation
    • A61L2103/15—Laboratory, medical or dentistry appliances, e.g. catheters or sharps
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61L—METHODS OR APPARATUS FOR STERILISING MATERIALS OR OBJECTS IN GENERAL; DISINFECTION, STERILISATION OR DEODORISATION OF AIR; CHEMICAL ASPECTS OF BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES; MATERIALS FOR BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES
    • A61L2300/00—Biologically active materials used in bandages, wound dressings, absorbent pads or medical devices
    • A61L2300/40—Biologically active materials used in bandages, wound dressings, absorbent pads or medical devices characterised by a specific therapeutic activity or mode of action
    • A61L2300/404—Biocides, antimicrobial agents, antiseptic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61L—METHODS OR APPARATUS FOR STERILISING MATERIALS OR OBJECTS IN GENERAL; DISINFECTION, STERILISATION OR DEODORISATION OF AIR; CHEMICAL ASPECTS OF BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES; MATERIALS FOR BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES
    • A61L2300/00—Biologically active materials used in bandages, wound dressings, absorbent pads or medical devices
    • A61L2300/40—Biologically active materials used in bandages, wound dressings, absorbent pads or medical devices characterised by a specific therapeutic activity or mode of action
    • A61L2300/404—Biocides, antimicrobial agents, antiseptic agents
    • A61L2300/406—Antibiotics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61L—METHODS OR APPARATUS FOR STERILISING MATERIALS OR OBJECTS IN GENERAL; DISINFECTION, STERILISATION OR DEODORISATION OF AIR; CHEMICAL ASPECTS OF BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES; MATERIALS FOR BANDAGES, DRESSINGS, ABSORBENT PADS OR SURGICAL ARTICLES
    • A61L2420/00—Materials or methods for coatings medical devices
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30—Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Agronomy & Crop Science (AREA)
  • Pest Control & Pesticides (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Dentistry (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Claims (29)

1. Способ разрушения биопленки грам-положительных бактерий, включающих одну или несколько из бактерий Staphylococcus или Streptococcus, включающий контактирование биопленки с химерным белком, включающим каталитический домен или домен связывания полипептида лизина, включающего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1, или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с каталитическим доменом или доменом связывания полипептида SEQ ID NO: 1, и являющиеся эффективным для лизиса или связывания бактерий Staphylococcus и Streptococcus, где указанный каталитический домен или домен связывания функционально связан с гетерологичным полипептидом, где химерный белок является эффективным для лизиса бактерий Staphylococcus и Streptococcus в биопленке, и биопленку эффективно диспергируют или обрабатывают.
2. Сопособ по п.1, в котором химерный белок представляет собой химерный литический фермент, содержащий каталитический домен SEQ ID NO: 1 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с каталитическим доменом полипептида SEQ ID NO: 1, и являющиеся эффективными для лизиса Staphylococcus и Streptococcus, где указанный каталитический домен функционально связан с доменом связывания другого лизина.
3. Способ по п.2, в котором каталитический домен функционально связан с доменом связывания лизина, специфичного к Staphylococcus, или, где каталитический домен функционально связан с доменом связывания лизина, специфичного к Streptococcus.
4. Способ по любому из пп.1 или 2, в котором каталитический домен содержит SEQ ID NO: 3 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с полипептидом SEQ ID NO: 3, и биологической активностью для лизиса бактерий Staphylococcus и Streptococcus.
5. Способ по п.1, в котором химерный белок представляет собой химерный литический фермент, содержащий домен связывания SEQ ID NO: 1 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с доменом связывания полипептида SEQ ID NO: 1, и являющиеся эффективными для связывания бактерий Staphylococcus и Streptococcus, где указанный домен связывания функционально связан с каталитическим доменом другого лизина.
6. Способ по п.5, в котором домен связывания функционально связан с каталитическим доменом лизина, специфичного к Staphylococcus, или где домен связывания функционально связан с каталитическим доменом лизина, специфичного к Streptococcus.
7. Способ по п.1 или 5, в котором домен связывания содержит SEQ ID NO: 4 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с полипептидом SEQ ID NO: 4, и биологической активностью для связывания бактерий Staphylococcus и Streptococcus.
8. Способ по п.1, дополнительно включающий контактирование биопленки с одним или несколькими антибиотиками.
9. Способ по п.8, в котором антибиотик выбран из даптомицина, ванкомицина и линезолида.
10. Способ уменьшения популяции бактерий Staphylococcus или Streptococcus в биопленке, сформированной на медицинском устройстве, катетере или имплантате, включающий контактирование медицинского устройства, катетера или имплантата с биопленкой с химерным белком, содержащим каталитический домен или домен связывания полипептида лизина, содержащего аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 1 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с каталитическим доменом или доменом связывания полипептида SEQ ID NO: 1, и обладающие эффективностью для лизиса или связывания бактерий Staphylococcus и Streptococcus, где указанный каталитический домен или домен связывания функционально связан с гетерологичным полипептидом, где химерный белок является эффективным для лизиса или высвобождения бактерий Staphylococcus и Streptococcus в биопленке.
11. Способ по п.10, в котором химерный белок представляет собой химерный литический фермент, содержащий каталитический домен SEQ ID NO: 1 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с каталитическим доменом полипептида SEQ ID NO: 1, и являющиеся эффективными для лизиса бактерий Staphylococcus и Streptococcus, где указанный каталитический домен функционально связан с доменом связывания другого лизина.
12. Способ по п.11, в котором каталитический домен функционально связан с доменом связывания лизина, специфичного к Staphylococcus, или где каталитический домен функционально связан с доменом связывания лизина, специфичного к Streptococcus.
13. Способ по п.10 или 11, в котором каталитический домен содержит SEQ ID NO: 3 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с полипептидом SEQ ID NO: 3, и являющиеся биологически активными для лизиса бактерий Staphylococcus и Streptococcus.
14. Способ по п.10, в котором химерный белок представляет собой химерный литический фермент, содержащий связывающий домен SEQ ID NO: 1 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью, с доменом связывания полипептида SEQ ID NO: 1, и являющиеся эффективными для связывания Staphylococcus и Streptococcus, где указанный домен связывания функционально связан с каталитическим доменом другого лизина.
15. Способ по п.14, в котором домен связывания функционально связан с каталитическим доменом лизина, специфичного к Staphylococcus, или, где домен связывания функционально связан с каталитическим доменом лизина, специфичного к Streptococcus.
16. Способ по п.10 или 14, в котором домен связывания содержит SEQ ID NO: 4 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с полипептидом SEQ ID NO: 4, и являющиеся биологически активными для связывания бактерий Staphylococcus и Streptococcus.
17. Способ по п.10, дополнительно включающий контактирование биопленки с одним или несколькими антибиотиками.
18. Способ по п.17, в котором антибиотик выбран из даптомицина, ванкомицина и линезолида.
19. Способ по п.1 или 10, в котором бактерии Staphylococcus или Streptococcus представляют собой антибиотикоустойчивые бактерии.
20. Способ по п.19, в котором антибиотикоустойчивые бактерии выбраны из метициллин-резистентных Staphylococcus aureus (MRSA), ванкомицин-резистентных Staphylococcus aureus (VRSA), даптомицин-резистентных Staphylococcus aureus (DRSA) или линезолид-резистентных Staphylococcus aureus (LRSA).
21. Способ по любому из пп.1 или 10, в котором бактерии Staphylococcus или Streptococcus обладают измененной чувствительностью к антибиотику.
22. Способ по п.21, в котором бактерии представляют собой Staphylococcus aureus, обладающие промежуточной чувствительностью к ванкомицину (VISA).
23. Композиция для использования в разрушении бактериальной биопленки, содержащей одну или несколько бактерий Staphylococcus или Streptococcus, включающая эффективное количество химерного литического фермента, который содержит каталитический домен или домен связывания полипептида лизина, содержащего аминокислотную последовательность, представленную SEQ ID NO : 1 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с полипептидом SEQ ID NO: 1, и являющиеся эффективными для лизиса или связывания бактерий Staphylococcus и Streptococcus, причем указанный каталитический домен функционально связан с доменом связывания другого лизина, или, где указанная область связывания функционально связана с каталитическим доменом другого лизина, и, где химерный литический фермент является эффективным для лизиса бактерий Staphylococcus и Streptococcus в биопленке.
24. Композиция по п.23, дополнительно включающая один или несколько антибиотиков.
25. Композиция по п.23, в которой каталитический домен содержит SEQ ID NO: 3 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с полипептидом SEQ ID NO: 3, и являющиеся биологически активными для лизиса бактерии Staphylococcus и Streptococcus.
26. Композиция по п.23, в которой домен связывания содержит SEQ ID NO: 4 или ее варианты, обладающие по меньшей мере 80% идентичностью с полипептидом SEQ ID NO: 4, и являющиеся биологически активными для связывания бактерий Staphylococcus и Streptococcus.
27. Композиция по п.23, в которой биопленка включает одну или несколько бактерий Staphylococcus или Streptococcus, выбранные из Staphylococcus aureus, Staphylococcus simulans, Streptococcus suis, Staphylococcus epidermidis, Streptococcus equi, Streptococcus equi zoo, Streptococcus agalactiae (GBS), Streptococcus pyogenes (GAS), Streptococcus sanguinis, Streptococcus gordonii, Streptococcus dysgalactiae, Streptococcus Группы G, Streptococcus Группы E и Streptococcus pneumonia.
28. Композиция по п.23, в которой бактерии в биопленке являются антибиотикоустойчивыми бактериями или обладают измененной чувствительностью к антибиотику.
29. Композиция по п.28, в которой антибиотикоустойчивые бактерии выбраны из метициллин-резистентных Staphylococcus aureus (MRSA), ванкомицин-резистентных Staphylococcus aureus (VRSA), даптомицин-резистентных Staphylococcus aureus (DRSA), линезолид-резистентных Staphylococcus aureus (LRSA) или Staphylococcus aureus, обладающих промежуточной чувствительностью к ванкомицину (VISA).
RU2018102796A 2012-05-09 2013-05-09 Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага RU2735103C2 (ru)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201261644799P 2012-05-09 2012-05-09
US61/644,799 2012-05-09
US201261736813P 2012-12-13 2012-12-13
US61/736,813 2012-12-13

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014149348A Division RU2646102C2 (ru) 2012-05-09 2013-05-09 Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020133461A Division RU2020133461A (ru) 2012-05-09 2020-10-12 Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2018102796A3 RU2018102796A3 (ru) 2019-02-22
RU2018102796A true RU2018102796A (ru) 2019-02-22
RU2735103C2 RU2735103C2 (ru) 2020-10-28

Family

ID=49551275

Family Applications (3)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014149348A RU2646102C2 (ru) 2012-05-09 2013-05-09 Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага
RU2018102796A RU2735103C2 (ru) 2012-05-09 2013-05-09 Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага
RU2020133461A RU2020133461A (ru) 2012-05-09 2020-10-12 Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2014149348A RU2646102C2 (ru) 2012-05-09 2013-05-09 Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2020133461A RU2020133461A (ru) 2012-05-09 2020-10-12 Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага

Country Status (16)

Country Link
US (4) US9499594B2 (ru)
EP (2) EP3513807A1 (ru)
JP (4) JP6348901B2 (ru)
KR (4) KR20230135161A (ru)
CN (2) CN104780933B (ru)
AU (3) AU2013259427B2 (ru)
BR (1) BR112014027818B1 (ru)
CA (2) CA2872911C (ru)
DK (1) DK2846827T3 (ru)
ES (1) ES2729123T3 (ru)
HK (1) HK1212208A1 (ru)
IL (2) IL235526B2 (ru)
IN (1) IN2014MN02438A (ru)
MX (2) MX369056B (ru)
RU (3) RU2646102C2 (ru)
WO (1) WO2013170022A1 (ru)

Families Citing this family (20)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101801521B (zh) 2007-05-14 2015-06-17 纽约州立大学研究基金会 生物膜中细菌细胞内的生理学分散响应诱导
RU2018121290A (ru) * 2012-05-09 2019-03-06 Контрафект Корпорейшн Комбинации лизина бактериофага и антибиотика против грам-положительных бактерий
WO2015200783A2 (en) * 2014-06-26 2015-12-30 The Rockefeller University Acinetobacter lysins
CN104805066B (zh) * 2015-05-18 2018-04-24 武汉菲吉乐科生物科技有限公司 一种葡萄球菌裂解酶及其应用
EP3120866A1 (en) * 2015-07-24 2017-01-25 Zymetech ehf. Use of marine serine proteases for removal, prevention and inhibition of formation and growth of biofilms
US11103547B2 (en) 2016-02-04 2021-08-31 Yissum Research Development Company Of The Hebrew University Of Jerusalem Ltd. Methods for disrupting biofilms
US20210213096A1 (en) * 2016-02-19 2021-07-15 Forschungszentrum Borstel Leibniz-Zentrum Fur Medizin Und Biowssenschaften Means and methods for treating bacterial infections
RU2664708C1 (ru) * 2017-06-08 2018-08-21 Сергей Иванович Черныш Способ разрушения и предотвращения образования бактериальных биопленок комплексом антимикробных пептидов насекомых
BR112020017219A2 (pt) * 2018-02-26 2020-12-22 Contrafect Corporation Lisinas plyss2 modificadas e usos das mesmas
US11541105B2 (en) 2018-06-01 2023-01-03 The Research Foundation For The State University Of New York Compositions and methods for disrupting biofilm formation and maintenance
JP2022525914A (ja) * 2019-03-22 2022-05-20 コントラフェクト コーポレイション 感染性心内膜炎を治療する方法
WO2020210691A1 (en) * 2019-04-11 2020-10-15 Contrafect Corporation Method of treating and preventing bone and joint infections
KR102097128B1 (ko) * 2019-06-19 2020-04-06 서울대학교산학협력단 황색포도상구균 제어에 효과적인 키메릭 엔도라이신 Lys109
CN111019876B (zh) * 2019-12-30 2023-04-28 延安大学 一种铜绿假单胞菌工程菌的构建方法及应用
WO2021172266A1 (ja) 2020-02-26 2021-09-02 学校法人 明治薬科大学 バイオフィルム形成を評価する方法、及び、バイオフィルム形成の評価に用いられる無脊椎動物
US20230277632A1 (en) * 2020-05-19 2023-09-07 Contrafect Corporation MODIFIED PlySs2 LYSINS AND ANTIBIOTIC COMBINATIONS FOR USE AGAINST GRAM-POSITIVE BACTERIA
KR102426421B1 (ko) * 2021-01-06 2022-07-29 주식회사 리신바이오 신규 재조합 엔도라이신 및 이의 용도
AU2023304968A1 (en) * 2022-07-05 2025-01-16 Aushealth Corporate Pty Ltd Method of production of modified phage and method of treatment using same
CN118308337A (zh) * 2023-01-09 2024-07-09 华中农业大学 一种细菌裂解酶LLysSA9.10及其应用
CN121154798A (zh) * 2025-10-16 2025-12-19 青岛嘉智生物技术有限公司 一种含有牛乳铁蛋白和裂解酶的复合制剂及其应用

Family Cites Families (37)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU8108587A (en) 1986-10-08 1988-05-06 David Bernstein Method for exposing group a streptococcal antigens and an improved diagnostic test for the identification of group a streptococci
US6254866B1 (en) 1997-10-31 2001-07-03 New Horizons Diagnostics Corporation Use of phage associated lytic enzymes for treating bacterial infections of the digestive tract
US6248324B1 (en) 1997-10-31 2001-06-19 Vincent Fischetti Bacterial phage associated lysing enzymes for treating dermatological infections
US6264945B1 (en) 1997-10-31 2001-07-24 Vincent A Fischetti Parenteral use of bacterial phage associated lysing enzymes for the therapeutic treatment of bacterial infections
US20060292135A1 (en) 1997-10-31 2006-12-28 Lawrence Loomis Use of bacterial phage-associated lysing proteins for preventing and treating bacterial infections in humans, animals and fowl
US5997862A (en) 1997-10-31 1999-12-07 New Horizons Diagnostics Corporation Therapeutic treatment of group A streptococcal infections
AU2876799A (en) 1999-02-25 2000-09-14 New Horizons Diagnostics, Inc. A means for the prophylactic and therapeutic treatment of streptococcal infections
US6056955A (en) 1999-09-14 2000-05-02 Fischetti; Vincent Topical treatment of streptococcal infections
US20040213765A1 (en) 2001-07-13 2004-10-28 Vincent Fischetti Use of bacterial phage associated lytic enzymes to prevent food poisoning
JP2006513149A (ja) 2002-05-17 2006-04-20 ニュー ホライゾンズ ディアグノスティックス コーポレイション Ｂａｃｉｌｌｕｓａｎｔｈｒａｃｉｓを迅速かつ特異的に検出および殺滅するファージ関連溶菌酵素の同定
US7569223B2 (en) 2004-03-22 2009-08-04 The Rockefeller University Phage-associated lytic enzymes for treatment of Streptococcus pneumoniae and related conditions
EP1744779A2 (en) 2004-03-24 2007-01-24 The Rockfeller University Lytic enzymes and spore surface antigen for detection and treatment of "bacillus anthracis" bacteria and spores
EP1621205A1 (en) * 2004-07-28 2006-02-01 OctoPlus Technologies B.V. Antimicrobial peptides derived from CAP18
KR20070058631A (ko) * 2004-09-22 2007-06-08 글락소스미스클라인 바이오로지칼즈 에스.에이. 면역원성 조성물
US8389469B2 (en) 2005-06-06 2013-03-05 The Rockefeller University Bacteriophage lysins for Bacillus anthracis
US7582291B2 (en) 2005-06-30 2009-09-01 The Rockefeller University Bacteriophage lysins for Enterococcus faecalis, Enterococcus faecium and other bacteria
EP2360248A1 (en) 2005-08-24 2011-08-24 The Rockefeller University Ply-GBS mutant lysins
US20080019956A1 (en) 2006-07-24 2008-01-24 Manoj Kumar Enzymatic prevention and control of biofilm
WO2009024327A2 (en) * 2007-08-22 2009-02-26 Profos Ag New proteins for use in human and animal staphylococcus infections
CA2711841A1 (en) * 2008-01-10 2009-09-03 Trustees Of Boston University Engineered bacteriophages as adjuvants for antimicrobial agents and compositions and methods of use thereof
WO2010002959A2 (en) 2008-07-03 2010-01-07 The Rockefeller University A chimeric bacteriophage lysin with activity against staphylococci bacteria
US8563504B2 (en) * 2008-10-10 2013-10-22 Lusomedicamenta, S.A. Antibacterial phage peptides and methods of use thereof
KR101016918B1 (ko) 2009-01-08 2011-02-25 주식회사 인트론바이오테크놀로지 박테리아 특이적 넓은 항균 활성을 갖는 신규한 리신 단백질
US20120034456A1 (en) 2009-05-01 2012-02-09 Takeshi Hasegawa Mold release composition and surface protective film
EP2338916A1 (en) * 2009-12-23 2011-06-29 Hyglos Invest GmbH Chimeric polypeptides and their use in bacterial decoloniation
EP2539446B1 (en) 2010-01-25 2017-11-01 Alere Scarborough Inc. A25 bacteriophage lysin
SG184836A1 (en) * 2010-04-27 2012-11-29 Lysando Ag Method of reducing biofilms
EP2397548A1 (en) * 2010-06-18 2011-12-21 Hyglos Invest GmbH Methods of generating and screening for lytic chimeric polypeptides
DK2699253T3 (en) * 2011-04-21 2018-07-16 Univ Rockefeller STREPTOCOCCUS BACTERYPHAGIC LYSINES FOR THE DETECTION AND TREATMENT OF GRAM POSITIVE BACTERIES
EP2699689A4 (en) * 2011-04-21 2014-12-17 Univ Utrecht Holding Bv STREPTOCOCCUS BACTERIOPHAGEN LYSINE FOR THE TREATMENT OF GRAM-POSITIVE BACTERIA IN PETS AND UTILITIES
EP2702070B1 (en) 2011-04-27 2015-09-30 Lysando AG New antimicrobial agents
RU2018121290A (ru) 2012-05-09 2019-03-06 Контрафект Корпорейшн Комбинации лизина бактериофага и антибиотика против грам-положительных бактерий
EP2835193A1 (en) 2013-08-05 2015-02-11 Refractory Intellectual Property GmbH & Co. KG Refractory ceramic nozzle
CN104073478A (zh) * 2014-06-13 2014-10-01 上海交通大学 杀灭革兰氏阳性菌的酶抗生素及其制备、用途
CN104726439B (zh) * 2015-04-13 2017-11-14 武汉菲吉乐科生物科技有限公司 一种广谱的链球菌裂解酶及其应用
CN104805066B (zh) * 2015-05-18 2018-04-24 武汉菲吉乐科生物科技有限公司 一种葡萄球菌裂解酶及其应用
EP4115897A1 (en) * 2015-09-17 2023-01-11 Contrafect Corporation Use of lysin to restore/augment antibacterial activity in the presence of pulmonary surfactant of antibiotics inhibited thereby

Also Published As

Publication number Publication date
BR112014027818B1 (pt) 2023-03-28
HK1208366A1 (en) 2016-03-04
DK2846827T3 (da) 2019-05-13
JP6873939B2 (ja) 2021-05-19
JP2015521178A (ja) 2015-07-27
AU2013259427A1 (en) 2014-12-11
MX2014013587A (es) 2015-07-06
HK1212208A1 (en) 2016-06-10
EP2846827A1 (en) 2015-03-18
ES2729123T3 (es) 2019-10-30
KR20200023521A (ko) 2020-03-04
RU2018102796A3 (ru) 2019-02-22
EP2846827A4 (en) 2016-03-02
CA3187222A1 (en) 2013-11-14
US20170127683A1 (en) 2017-05-11
AU2020204014A1 (en) 2020-07-02
JP7368018B2 (ja) 2023-10-24
RU2014149348A (ru) 2016-07-10
RU2735103C2 (ru) 2020-10-28
US20150111813A1 (en) 2015-04-23
IL235526A0 (en) 2015-01-29
IL235526B2 (en) 2023-08-01
US9499594B2 (en) 2016-11-22
CN111803620A (zh) 2020-10-23
IL235526B1 (en) 2023-04-01
EP2846827B1 (en) 2019-02-13
US20190387745A1 (en) 2019-12-26
CA2872911C (en) 2023-10-03
KR20230135161A (ko) 2023-09-22
JP6348901B2 (ja) 2018-06-27
EP3513807A1 (en) 2019-07-24
IL269426A (en) 2019-11-28
AU2018201736A1 (en) 2018-04-12
KR20150039129A (ko) 2015-04-09
CN104780933B (zh) 2020-08-28
IN2014MN02438A (ru) 2015-07-10
AU2018201736B2 (en) 2020-03-19
JP2022163214A (ja) 2022-10-25
WO2013170022A1 (en) 2013-11-14
BR112014027818A2 (pt) 2017-08-08
JP2020189860A (ja) 2020-11-26
US20230277617A1 (en) 2023-09-07
CA2872911A1 (en) 2013-11-14
US11524046B2 (en) 2022-12-13
MX369056B (es) 2019-10-28
RU2646102C2 (ru) 2018-03-01
CN104780933A (zh) 2015-07-15
MX2019012877A (es) 2020-01-14
AU2013259427B2 (en) 2017-12-14
JP2018087242A (ja) 2018-06-07
KR20210118980A (ko) 2021-10-01
KR102084388B1 (ko) 2020-03-06
RU2020133461A (ru) 2022-04-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2018102796A (ru) Предотвращение, разрушение и обработка биопленки лизином бактериофага
Angelopoulou et al. Non-antibiotic microbial solutions for bovine mastitis–live biotherapeutics, bacteriophage, and phage lysins
Yong et al. Biofilm formation by staphylococci in health-related environments and recent reports on their control using natural compounds
US20220362352A1 (en) Use of lysin to restore/augment antibacterial activity in the presence of pulmonary surfactant of antibiotics inhibited thereby
Szweda et al. Peptidoglycan hydrolases-potential weapons against Staphylococcus aureus
RU2014149351A (ru) Комбинации лизина бактериофага и антибиотика против грам-положительных бактерий
Sojka et al. Antibiofilm efficacy of honey and bee-derived defensin-1 on multispecies wound biofilm
Wittekind et al. Cell wall hydrolases and antibiotics: exploiting synergy to create efficacious new antimicrobial treatments
Wang et al. A phage lysin fused to a cell-penetrating peptide kills intracellular methicillin-resistant Staphylococcus aureus in keratinocytes and has potential as a treatment for skin infections in mice
Fenton et al. Characterization of the staphylococcal bacteriophage lysin CHAPK
Simoes et al. Novel antibacterial agents: an emergent need to win the battle against infections
HRP20160038T1 (hr) Bakteriofag ili litiäśki protein izveden iz bakteriofaga koji je uäśinkovit za tretiranje biofilma staphylococcus aureusa
Weiss et al. Impact of sarA on daptomycin susceptibility of Staphylococcus aureus biofilms in vivo
Fischetti Lysin therapy for Staphylococcus aureus and other bacterial pathogens
JP2014518849A5 (ru)
Fan et al. Antibacterial activity of the recombinant antimicrobial peptide Ib-AMP4 from Impatiens balsamina and its synergy with other antimicrobial agents against drug resistant bacteria
Mishra et al. Expression and lytic efficacy assessment of the Staphylococcus aureus phage SA4 lysin gene
JP2021513865A5 (ru)
WO2013032964A1 (en) Compositions and methods for preventing and treating biofilms
MX2011007414A (es) Composicion farmaceutica para proteger a un animal contra un trastorno que se origina de una infeccion con una bacteria que pertenece al grupo de actinomicentos nacardioformes.
JP2013539776A5 (ru)
HRP20200195T1 (hr) Antibiotske terapije na bazi peptida porijeklom od vodenog bivola
WO2013041663A3 (de) Modifizierte apidaecinderivate als antibiotische peptide
WO2010131865A3 (ko) 항생제 내성 균주에 대한 항균용 조성물
WO2007127218A3 (en) Streptomyces-derived antimicrobial compound and method of using same against antibiotic-resistant bacteria

Legal Events

Date Code Title Description
HE9A Changing address for correspondence with an applicant