TH13932Y - กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาคทองคำ - Google Patents

กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาคทองคำ

Info

Publication number
TH13932Y
TH13932Y TH1503001077U TH1503001077U TH13932Y TH 13932 Y TH13932 Y TH 13932Y TH 1503001077 U TH1503001077 U TH 1503001077U TH 1503001077 U TH1503001077 U TH 1503001077U TH 13932 Y TH13932 Y TH 13932Y
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
rifampicin
detecting
resistant tuberculosis
gold particles
primers
Prior art date
Application number
TH1503001077U
Other languages
English (en)
Other versions
TH13932A3 (th
TH13932U (th
Inventor
จันทร์ศิริ นางสาวโกสุม
ขำดี นายจัตุรงค์
แก้วพินิจ นายธงชัย
สันติวัฒนกุล นายสมชาย
Original Assignee
มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ
Filing date
Publication date
Application filed by มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ filed Critical มหาวิทยาลัยศรีนครินทรวิโรฒ
Publication of TH13932A3 publication Critical patent/TH13932A3/th
Publication of TH13932Y publication Critical patent/TH13932Y/th
Publication of TH13932U publication Critical patent/TH13932U/th

Links

Abstract

แก้ไข 1 ก.ย. 2560 กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำ โดยเริ่มจากการออกแบบไพรเมอร์ 4 เส้น ที่จำเพาะต่อลำดับเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยา ไรแฟมพิซิน (rifampicin) ซึ่งในระบบนี้ดีเอ็นเอเป้าหมายจะถูกเพิ่มปริมาณภายใต้อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็น เวลา 1 ชั่วโมง ด้วยปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) หลังจากนั้นเติมตัวตรวจจับที่ติดฉลากไทอัล (thiol) ที่ปลายด้าน 5’ ลง ไปแล้วปล่อยไว้ที่อุณหภูมิเดิมเป็นเวลาอีก 5 นาที จากนั้นเมื่อมีการเติบเกลือโซเดียมคลอไรด์ (NaCL) หรือ แมกนีเซียมซัลเฟต (MgSO4) ลงไปในปริมาณที่เหมาะสม จะทำให้ผลผลิตของแลมป์ (LAMP) ดังกล่าวทำให้เชื้อวัณ โรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ที่มีเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 ของยีนอาร์โพบี (rpoB) ของ เชื้อวัณโรคจะเห็นอนุภาคทองคำเป็นสีชมพูแดงอยู่ในสารละลาย ในขณะที่ถ้าไม่มีลำดับเบสกลายพันธุ์นั้นจะทำให้ เห็นอนุภาคทองคำเปลี่ยนจากสีแดงเป็นสีม่วง ---------------------------------------------------------------------------------------------------- แก้ไขบทสรุปการประดิษฐ์ 10/03/2559 1503001077 กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรค ดื้อต่อยาแฟมพิซิน (rifam[icin) ด้วยอนุภาค ทองคำ โดยเริ่มจากการออกแบบไพรเมอร์ 4 ตัว ที่จำเพาะต่อลำดับเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยา ไรแฟมิซืน (rifampicin) ซึ่งในระบบนี้ดีเอ็นเอเป้าหมายจะถูกเพิ่มปริมาณภายใต้อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็น เวลา 1 ชั่วโมง ด้วยปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) หลังจากนั้นเติมตัวตรวจจับที่ติดฉลากไทอัล (thiol) ที่ปลายด้าน 5’ ลง ไป แล้วปล่อยไว้ที่อุณหภูมิเดิมเป็นเวลาอีก 5 นาที จากนั้นเมื่อมีการเติบเกลือโซเดียมคลอไรด์ (NaCL) หรือ แมกนีเซียมซัลเฟต (NgSO4) ลงไปในปริมาณที่เหมาะสม จะทำให้ผลผลิตของแลมป์ (LAMP) ดังกล่าวทำให้เชื้อวัณ โรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ที่มีเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 ของยีนอาร์โบบี (rpoB) ของ เชื้อวัณโรคจะเห็นอนุภาคทองคำเป็นสีชมพูแดงอยู่ในสารละลาย ในขณะที่ถ้าไม่มีลำดับเบสกลายพันธุ์นั้นจะทำให้ เห็นอนุภาคทองคำเปลี่ยนจากสีแดงเป็นสีม่วง -------------------------------------------------------------- คำขอใหม่ปรับปรุง การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับการป้องกันการกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ที่เป็นปัญหาสำคัญของประเทศ โดยเริ่มจากการออกแบบ primers 4 ตัว ที่ออกแบบจากลำดับเบสในส่วนยีนเชื้อ วัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ที่ออกแบบจำนวน 2 ชุด โดยชุดที่ 1 สำหรับการตรวจหาลำดับเบสกลาย พันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 บนยีน rpoB และ ชุดที่ 2 สำหรับตรวจหาลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 526 บนยีน rpoB ในระบบนี้ DNA เป้าหมายจะถูกเพิ่มปริมาณภายใต้อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 1 ชั่วโมง ผลการตรวจ พบว่าเทคนิค LAMP มีความจำเพาะในการตรวจสอบเชื้อวัณโรคกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) เทียบเท่ากับการตรวจสอบด้วยเทคนิค PCR แบบ real time ต่อจากนั้นทำการออกแบบตัวตรวจจับ (probe) ที่จำเพาะต่อลำดับเบสของผลผลิต LAMP ที่ได้ แล้วทดสอบสภาวะมี่เหมาะสม ในการตรวจสอบผลผลิต ของ LAMP ที่ได้บนแผ่น Dipstick แทนการตรวจสอบด้วยวิธี gel eletrophoresis ซึ่งจะใช้เวลาอีกเพียง 5-15 นาทีเท่านั้น

Claims (8)

แก้ไข 1 ก.ย. 2560 1. กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำ ที่ซึ่งประกอบด้วยการทำปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) ร่วมกับการประยุกต์ใช้ด้วยอนุภาคทองคำ ภายใน ปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) 25 ไมโครลิตร มีการใช้ไพรเมอร์ 2 ชุดด้วยการทำปฏิกิริยา 2 ครั้ง ชุดที่ 1 ประกอบด้วย ไพรเมอร์ 3 และไพรเมอร์ 4 อย่างละ 2 ไมโครโมลาร์, ไพรเมอร์ 1 และไพรเมอร์ 2 อย่างละ 0.2 ไมโครโมลาร์, ดี เอ็นทีพีส์ (dNTP) 1.6 มิลลิโมลาร์ผสมด้วยสารเบตาอีน (betaine) 0.6 โมลาร์, สารแมกนีเซียมซัลเฟส (MgSO4) 4 มิลลิโมลาร์, เอนไซม์ บีเอสที 2.0 วอร์ม สตาร์ท ดีเอ็นเอ โพลีเมอเรส (Bst 2.0 warm start DNA polymerase) 2.5U และสารละลายบัฟเฟอร์ ใช้ในการตรวจลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 ของยีนอาร์โฟบี (rpoB) ของ เชื้อวัณโรค ชุดที่ 2 ประกอบด้วยไพรเมอร์ 3 และไพรเมอร์ 5 อย่างละ 2 ไมโครโมลาร์, ไพรเมอร์ 1 และไพรเมอร์ 2 อย่างละ 0.2 ไมโครโมลาร์, ดีเอ็นทีพี (dNTP) 1.6 มิลลิโมลาร์ ผสมด้วยสารเบตาอีน (betaine) 0.6 โมลาร์, สาร แมกนีเซียมซัลเฟส (MgSO4) 4 มิลลิโมลาร์, เอนไซม์ บีเทสที 2.0 วอร์ม สตาร์ท ดีเอ็นเอ โพลีเมอเรส (Bst 2.0 warm start DNA polymerase) 2.5 U และสารละลายบัฟเฟอร์ สำหรับการตรวจลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 526 ของยีนอาร์โพบี (rpoB) ของเชื้อวัณโรค การออกแบบไพรเมอร์สำหรับเทคนิคแลมป์ (LAMP) ในการตรวจเชื้อ ที่มีเบสกลายพันธุ์เพียงหนึ่งเบส ไพรเมอร์ที่ใช้ในปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) ประกอบด้วยไพรเมอร์ 4 เส้น ที่จำเพาะ ต่อลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 ของยีนอาร์โพบี (rpoB) ของเชื้อวัณโรค ดังนี้ ไพรเมอร์ 1 ลำดับเบส (5’-3’) CCgCAgACgTTgATCAACAT ไพรเมอร์ 2 ลำดับเบส (5’-3’) CAggggTTTCgATTgggC ไพรเมอร์ 3 ลำดับเบส (5’-3’) ggTgCTgAAgAACTCCTTgATTTTgCCggTggTCgCCgCg ไพรเมอร์ 4 ลำดับเบส (5’-3’) AgCgCTTggggCCCgTTTTAgTgCgACgggTgCA ไพรเมอร์ 5 ลำดับเบส (5’-3’) HACAAgCgCCgACTgTCTTTTAgTgCgACgggTgCA H = A/C/T 2. กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งสภาวะที่เหมาะสมในการตรวจผลผลิตจากแลมป์ (LAMP) ผนวกกับอนุภาคทองคำ มี ลักษณะเฉพาะคือ ทำปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) ที่อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 1 ชั่วโมงแล้วเติมตัว ตรวจจับที่ติดด้วยอนุภาคทองคำ ที่อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 5 นาที หลังจากนั้นเมื่อมีการเติมเกลือ โซเดียมคลอไรด์ (NaCl) หรือแมกนีเซียมซัลเฟต (MgSO4) ลงไปในปริมาณที่เหมาะสม จะทำให้ผลผลิตของแลมป์ (LAMP) ดังกล่าวยังคงเห็นเป็นสีชมพูแดงอยู่ในสารละลาย ในขณะที่ถ้าไม่มีลำดับเบสกลายพันธุ์ จะทำให้เห็น อนุภาคทองคำเปลี่ยนจากสีแดงเป็นสีม่วง 3. กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งกรรมวิธีการออกแบบตัวตรวจจับ (probe) ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อ วัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง มีลักษณะเฉพาะคือ ตัวตรวจจับติด ฉลากไทอัล (thiol;-SH) ที่ปลายด้าน 5’ เพื่อการตรวจผลผลิตจากแลมป์ (LAMP) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่ เปลี่ยนแปลง มีลำดับเบสดังนี้ 5’- SH-CATggACCAgAACAAC-3’ 4. กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) มีขั้นตอนดังนี้ การเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมของเชื้อวัณโรค ดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) เป็นเวลา 1 ชั่วโมง ที่อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส 5. กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งมีลักษณะเฉพาะคือ ไม่ต้องใช้เครื่องพีซีอาร์ (PCR) และเครื่องแยกสารพันธุกรรมด้วย กระแสไฟฟ้า 6. กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งใช้สำหรับการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ในผู้ป่วยที่สงสัยการติดเชื้อนี้ เพื่อการตรวจวินิจฉัยและป้องกัน การระบาดของวัณโรคดื้อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ---------------------------------------------------------------------------------------------------- แก้ไข 10/03/2559 1. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟมพิซิน (rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำ ที่ซึ่งประกอบด้วยการทำปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) ร่วมกับการประยุกต์ใช้ด้วยอนุภาคทองคำ ภายใน ปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) 25 ไมโครลิตร มีการใช้โพรเมอร์ 2 ชุดด้วยการทำปฏิกิริยา 2 ครั้ง ชุดที่ 1 ประกอบด้วย ไพรเมอร์ 3 และไพรเมอร์ 4 อย่างละ 2 ไมโครโมลาร์, ไพรเมอร์ 1 และไพรเมอร์ 2 อย่างละ 0.2 ไมโครโมลาร์, ดี เอ็นทีพีส์ (dNTPs) 1.6 มิลลิโมลาร์ผสมด้วยสารเบตาอีน (betaine) 0.6 โมลาร์, สารแมกนีเซียมซัลเฟส (MgSO4) 4 มิลลิโมลาร์, เอนไซม์ บีเอสที 2.0 วอร์ม สตาร์ท ดีเอ็นเอ โพลีเมอเรส (Bst 2.0 warm start DNA polymerase) 2.5U และสารละลายบัฟเฟอร์ ใช้ในการตรวจลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 ของยีนอาร์โบบี (rpoB) ของเชื้อวัณโรค ชุดที่ 2 ประกอบด้วยไพรเมอร์ 3 และไพรเมอร์ 5 อย่างละ 2 ไมโครโมลาร์, ไพรเมอร์ 1 และไพรเมอร์ 2 อย่างละ 0.2 ไมโครโมลาร์, ดีเอ็นทีพีส์ (dNTPs) 1.6 มิลลิโมลาร์ ผสมด้วยสารเบตาอีน (betaine) 0.6 โมลาร์, สารแมกนีเซียมซัลเฟส (MgSO4) 4.8 มิลลิโมลาร์, เอนไซม์ บีเทสที 2.0 วอร์ม สตาร์ท ดีเอ็นเอ โพลี เมอเรส (Bst 2.0 warm start DNA polymerase) 3.5-5.0 U และสารละลายบัฟเฟอร์ สำหรับการตรวจลำดับ เบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 526 ของยีนอาร์โบบี (rpoB) ของเชื้อวัณโรค การออกแบบไพรเมอร์สำหรับเทคนิคแลมป์ (LAMP) ในการตรวจเชื้อ ที่มีเบสกลายพันธุ์เพียงหนึ่งเบส ไพรเมอร์ที่ใช้ในปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) ประกอบด้วย ไพรเมอร์ 4 ตัว ที่จำเพาะต่อลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 ของยีนอาร์โบบี (rpoB) ของเชื้อวัณ โรค ดังนี้ ไพรเมอร์ 1 ลำดับเบส (5’-3’) CCgCAgACgTTgATCAACAT ไพรเมอร์ 2 ลำดับเบส (5’-3’) CAggggTTTCgATTgggC ไพรเมอร์ 3 ลำดับเบส (5’-3’) ggTgCTgAAgAACTCCTTgATTTTgCCggTggTCgCCgCg ไพรเมอร์ 4 ลำดับเบส (5’-3’) HACAAgCgCCgACTgTCTTTTAgTgCgACgggTgCA H = A/C/T 2. กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งสภาวะที่เหมาะสมในการตรวจผลผลิตจากแลมป์ (LAMP) ผนวกกับอนุภาคทองคำ มี ลักษณะเฉพาะคือ ทำปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) ที่อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 1 ชั่วโมงแล้วเติมตัว ตรวจจับที่ติดด้วยอนุภาคทองคำ ที่อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 5 นาที หลังจากนั้นเมื่อมีการเติมเกลือ โซเดียมคลอไรด์ (NaCl) หรือแมกนีเซียมซัลเฟต (MgSO4) ลงไปในปริมาณที่เหมาะสม จะทำให้ผลผลิตของแลมป์ (LAMP) ดังกล่าวยังคงเห็นเป็นสีชมพูแดงอยู่ในสารละลาย ในขณะที่ถ้าไม่มีลำดับเบสกลายพันธุ์ จะทำให้เห็น อนุภาคทองคำเปลี่ยนจากสีแดงเป็นสีม่วง 3. กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งกรรมวิธีการออกแบบตัวตรวจจับ (probe) ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อ วัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง มีลักษณะเฉพาะคือ ตัวตรวจจับติด ฉลากไทอัล (thiol;-SH) ที่ปลายด้าน 5’ เพื่อการตรวจผลผลิตจากแลมป์ (LAMP) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่ เปลี่ยนแปลง มีลำดับเบสดังนี้ 5’- SH-CATggACCAgAACAAC-3’ 4. กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) มีขั้นตอนดังนี้ การเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมของเชื้อวัณโรค ดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) เป็นเวลา 1 ชั่วโมง ที่อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส 5. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ด้วย อนุภาคทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งมีลักษณะเฉพาะคือ ไม่ต้องใช้เครื่องพีซีอาร์ (PCR) และเครื่องแยกสาร พันธุกรรมด้วยกระแสไฟฟ้า 6. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ด้วย อนุภาคทองคำตามข้อถือสิทธิ 1 ที่ซึ่งใช้สำหรับการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ในผู้ป่วยที่สงสัยการติดเชื้อนี้ เพื่อการตรวจวินิจฉัยและป้องกัน การระบาดของวัณโรคดื้อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ------------------------------------------------------------------- คำขอใหม่ปรับปรุง
1. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยการ เปลี่ยนแปลงสีของอนุภาคทองคำ เป็นเทคนิคใหม่ที่ซึ่งประกอบด้วยการทำปฏิกิริยา Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) ร่วมกับการประยุกต์ใช้อนุภาคทองคำ
2. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วย อนุภาคทองคำ ด้วยเทคนิคใหม่ในข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่งสภาวะที่เหมาะสมในการตรวจผลผลิตจาก LAMP ด้วยการ เปลี่ยนแปลงสีของอนุภาคทองคำ มีลักษณะเฉพาะคือ ทำปฏิกิริยา LAMP ที่อุณหภูมิประมาณ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลาประมาณ 1 ชั่วโมง แลวเติมตัวตรวจจับ ที่อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลาประมาณ 5 นาที หลังจาก นั้นทำการเติมเกลือ แล้วอ่านผล
3. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วย อนุภาคทองคำ ด้วยเทคนิคใหม่ ในข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่งกรรมวิธีการออกแบบตัวตรวจจับ (probe) ในการตรวจสอบ เบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง มี ลักษณะเฉพาะคือ ตัวตรวจจับติดฉลาก thiol (-SH) ที่ปลายด้าน 5’ เพื่อการตรวจผลผลิตจาก LAMP ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลงมีลำดับเบสดังนี้ 5’–SH-CATGGACCAGAACAAC-3’
4. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ด้วยเทคนิคใหม่ ในข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่งปฏิกิริยา Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) มีขั้นตอนดังนี้ การเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ป็นเวลาประมาณ 1 ชั่วโมงที่อุณหภูมิประมาณ 61 องศาเซลเซียส
5. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ด้วยเทคนิคใหม่ ในข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่งปฏิกิริยา Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) จะต้องใช้เวลาในการเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ที่มีเบสกลายพันธ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 บนยืน rpoB เป็นเวลาประมาณ 1 ชั่วโมง ที่อุณหภูมิ ประมาณ 61 องศาเซลเซียส และ ภายในปฏิกิริยา LAMP 25 ไมโครลิตร มีการใช้ไพรเมอร์ 2 ชุดด้วยกัน ชุดที่ 1 สำหรับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 บนยีน rpoB ประกอบด้วย inner primers FIP-rpoB และ BIP-rpoB531 อย่างละ 2 ?M, outer primers F3-rpoB และ B3-rpoB อย่างละ 0.2 ?M, dNTPs 1.6 mM ผสมด้วยสารเบตา อีน (betaine) 0.6 M, สารแมกนีเซียมซัลเฟส (MgSO4) 4 mM, 2.5U Bst 2.0 warm start DNA polymerase และ supplied buffer 1x ชุดที่ 2 สำหรับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 523 บนยีน rpoB ประกอบด้วย inner primers FIP-rpoB และ BIP-rpoB526 อย่างละ 2 ?M, outer primers F3-rpoB และ B3-rpoB อย่างละ 0.2 ?M, dNTPs 1.6 mM ผสมด้วยสารเบตาอีน (betaine) 0.6 M, สารแมกนีเซียมซัลเฟส (MgSO4) 4 mM, 2.5U Bst 2.0 warm start DNA polymerase และ supplied buffer 1x
6. ไพรเมอร์ที่ใช้ในปฏิกิริยา LAMP ในข้อถือสิทธิที่ 5 การออกแบบไพรเมอร์สำหรับเทคนิค LAMP ในการ ตรวจเชื้อ ที่มีเบสกลายพันธุ์เพียงหนึ่งเบส ไพรเมอร์ที่ใช้ในปฏิกิริยา LAMP ประกอบด้วยไพรเมอร์ 4 ตัว ที่จำเพาะ ต่อลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 บนยีน rpoB ของเชื้อวัณโรคดังนี้ ไพรเมอร์ F3-KatG ลำดับเบส (5’-3’) CCGCAGACGTTGATCAACAT ไพรเมอร์ B3-KatG ลำดับเบส (5’-3’) CAGGGGTTTCGATTGGGC ไพรเมอร์ FIP-KatG1 ลำดับเบส (5’-3’) GGTGCTGAAGAACTCCTTGATTTTGCCGGTGGTGGTCGCCGCG ไพรเมอร์ BIP-rpoB531 ลำดับเบส (5’-3’) CTGGCATCGAGGTCGTATTTTTTCGTCGGGGTGTTCGTCC ไพรเมอร์ BIP-rpoB526 ลำดับเบส (5’-3’) AGCGCTTGGGGCCCGTTTTAGTGCGACGGGTGCA
7. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ในข้อถือสิทธิที่ 1 มีลักษณะเฉพาะคือ ไม่ต้องใช้เครื่อง PCR และเครื่องแยกสาร พันธุกรรมด้วยกระแสไฟฟ้า
8. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ด้วยเทคนิคใหม่ สำหรับการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยา ไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ในผู้ป่วยที่สงสัยการติดเชื้อดื้อยานี้ เพื่อการตรวจ วินิจฉัยและป้องกันการระบาดของโรค
TH1503001077U 2015-07-15 กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาคทองคำ TH13932U (th)

Publications (3)

Publication Number Publication Date
TH13932A3 TH13932A3 (th) 2018-06-07
TH13932Y true TH13932Y (th) 2018-06-07
TH13932U TH13932U (th) 2018-06-07

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN104093856B (zh) 检测核酸合成和/或扩增的方法
EP3339451B1 (en) Primers for detecting influenza by using lamp, and use thereof
JP6388540B2 (ja) 改良したdnaポリメラーゼ活性アッセイおよび生菌の検出を可能にする方法
JP6145974B2 (ja) 肺炎マイコプラズマの検出方法
AU2018250570A1 (en) Methods for multiplex detection of alleles associated with corneal dystrophy
JP5055118B2 (ja) 試料中に存在するテンプレート核酸の量を決定するための方法
JoonáLee Label/quencher-free detection of single-nucleotide changes in DNA using isothermal amplification and G-quadruplexes
Tong et al. A practical method for subtyping of Streptococcus agalactiae serotype III, of human origin, using rolling circle amplification
CA2416332C (en) Pharmacological applications of mitochondrial dna assays
Yeo et al. Rapid detection of codon 460 mutations in the UL97 gene of ganciclovir-resistant cytomegalovirus clinical isolates by real-time PCR using molecular beacons
WO2021236964A1 (en) Methods for measuring total cell-free dna using alu fragments
TWI780315B (zh) 量化標的基因的突變型等位基因負擔的方法
TH13932U (th) กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาคทองคำ
Minucci et al. DNA from buccal swab is suitable for rapid genotyping of angiotensin-converting enzyme insertion/deletion (I/D) polymorphism
TH13931Y (th) กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิด (isoniazid) ด้วยอนุภาคทองคำ
TH13931U (th) กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิด (isoniazid) ด้วยอนุภาคทองคำ
WO2022107023A1 (en) Systems for the detection of targeted gene variations and viral genomes and methods of producing and using same
EP3523449B1 (en) Phi6 internal control compositions, devices & methods
TH13933Y (th) กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิต (isoniazid) บนยีนไอเอ็นเอชเอ (inhA) ด้วยอนุภาคทองคำ
TH13933U (th) กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิต (isoniazid) บนยีนไอเอ็นเอชเอ (inhA) ด้วยอนุภาคทองคำ
TH14021U (th) กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสี
TH14021Y (th) กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสี
TH17935Y (th) กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว
TH17935U (th) กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว
JP6155750B2 (ja) SNP(rs11881222)を検出するためのプローブ