TH13932Y - กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาคทองคำ - Google Patents
กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาคทองคำInfo
- Publication number
- TH13932Y TH13932Y TH1503001077U TH1503001077U TH13932Y TH 13932 Y TH13932 Y TH 13932Y TH 1503001077 U TH1503001077 U TH 1503001077U TH 1503001077 U TH1503001077 U TH 1503001077U TH 13932 Y TH13932 Y TH 13932Y
- Authority
- TH
- Thailand
- Prior art keywords
- rifampicin
- detecting
- resistant tuberculosis
- gold particles
- primers
- Prior art date
Links
Abstract
แก้ไข 1 ก.ย. 2560 กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาค ทองคำ โดยเริ่มจากการออกแบบไพรเมอร์ 4 เส้น ที่จำเพาะต่อลำดับเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยา ไรแฟมพิซิน (rifampicin) ซึ่งในระบบนี้ดีเอ็นเอเป้าหมายจะถูกเพิ่มปริมาณภายใต้อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็น เวลา 1 ชั่วโมง ด้วยปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) หลังจากนั้นเติมตัวตรวจจับที่ติดฉลากไทอัล (thiol) ที่ปลายด้าน 5’ ลง ไปแล้วปล่อยไว้ที่อุณหภูมิเดิมเป็นเวลาอีก 5 นาที จากนั้นเมื่อมีการเติบเกลือโซเดียมคลอไรด์ (NaCL) หรือ แมกนีเซียมซัลเฟต (MgSO4) ลงไปในปริมาณที่เหมาะสม จะทำให้ผลผลิตของแลมป์ (LAMP) ดังกล่าวทำให้เชื้อวัณ โรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ที่มีเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 ของยีนอาร์โพบี (rpoB) ของ เชื้อวัณโรคจะเห็นอนุภาคทองคำเป็นสีชมพูแดงอยู่ในสารละลาย ในขณะที่ถ้าไม่มีลำดับเบสกลายพันธุ์นั้นจะทำให้ เห็นอนุภาคทองคำเปลี่ยนจากสีแดงเป็นสีม่วง ---------------------------------------------------------------------------------------------------- แก้ไขบทสรุปการประดิษฐ์ 10/03/2559 1503001077 กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรค ดื้อต่อยาแฟมพิซิน (rifam[icin) ด้วยอนุภาค ทองคำ โดยเริ่มจากการออกแบบไพรเมอร์ 4 ตัว ที่จำเพาะต่อลำดับเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยา ไรแฟมิซืน (rifampicin) ซึ่งในระบบนี้ดีเอ็นเอเป้าหมายจะถูกเพิ่มปริมาณภายใต้อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็น เวลา 1 ชั่วโมง ด้วยปฏิกิริยาแลมป์ (LAMP) หลังจากนั้นเติมตัวตรวจจับที่ติดฉลากไทอัล (thiol) ที่ปลายด้าน 5’ ลง ไป แล้วปล่อยไว้ที่อุณหภูมิเดิมเป็นเวลาอีก 5 นาที จากนั้นเมื่อมีการเติบเกลือโซเดียมคลอไรด์ (NaCL) หรือ แมกนีเซียมซัลเฟต (NgSO4) ลงไปในปริมาณที่เหมาะสม จะทำให้ผลผลิตของแลมป์ (LAMP) ดังกล่าวทำให้เชื้อวัณ โรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ที่มีเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 ของยีนอาร์โบบี (rpoB) ของ เชื้อวัณโรคจะเห็นอนุภาคทองคำเป็นสีชมพูแดงอยู่ในสารละลาย ในขณะที่ถ้าไม่มีลำดับเบสกลายพันธุ์นั้นจะทำให้ เห็นอนุภาคทองคำเปลี่ยนจากสีแดงเป็นสีม่วง -------------------------------------------------------------- คำขอใหม่ปรับปรุง การประดิษฐ์นี้เกี่ยวข้องกับการป้องกันการกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ที่เป็นปัญหาสำคัญของประเทศ โดยเริ่มจากการออกแบบ primers 4 ตัว ที่ออกแบบจากลำดับเบสในส่วนยีนเชื้อ วัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) ที่ออกแบบจำนวน 2 ชุด โดยชุดที่ 1 สำหรับการตรวจหาลำดับเบสกลาย พันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 บนยีน rpoB และ ชุดที่ 2 สำหรับตรวจหาลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 526 บนยีน rpoB ในระบบนี้ DNA เป้าหมายจะถูกเพิ่มปริมาณภายใต้อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลา 1 ชั่วโมง ผลการตรวจ พบว่าเทคนิค LAMP มีความจำเพาะในการตรวจสอบเชื้อวัณโรคกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (rifampicin) เทียบเท่ากับการตรวจสอบด้วยเทคนิค PCR แบบ real time ต่อจากนั้นทำการออกแบบตัวตรวจจับ (probe) ที่จำเพาะต่อลำดับเบสของผลผลิต LAMP ที่ได้ แล้วทดสอบสภาวะมี่เหมาะสม ในการตรวจสอบผลผลิต ของ LAMP ที่ได้บนแผ่น Dipstick แทนการตรวจสอบด้วยวิธี gel eletrophoresis ซึ่งจะใช้เวลาอีกเพียง 5-15 นาทีเท่านั้น
Claims (8)
1. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยการ เปลี่ยนแปลงสีของอนุภาคทองคำ เป็นเทคนิคใหม่ที่ซึ่งประกอบด้วยการทำปฏิกิริยา Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) ร่วมกับการประยุกต์ใช้อนุภาคทองคำ
2. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วย อนุภาคทองคำ ด้วยเทคนิคใหม่ในข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่งสภาวะที่เหมาะสมในการตรวจผลผลิตจาก LAMP ด้วยการ เปลี่ยนแปลงสีของอนุภาคทองคำ มีลักษณะเฉพาะคือ ทำปฏิกิริยา LAMP ที่อุณหภูมิประมาณ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลาประมาณ 1 ชั่วโมง แลวเติมตัวตรวจจับ ที่อุณหภูมิ 61 องศาเซลเซียส เป็นเวลาประมาณ 5 นาที หลังจาก นั้นทำการเติมเกลือ แล้วอ่านผล
3. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วย อนุภาคทองคำ ด้วยเทคนิคใหม่ ในข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่งกรรมวิธีการออกแบบตัวตรวจจับ (probe) ในการตรวจสอบ เบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง มี ลักษณะเฉพาะคือ ตัวตรวจจับติดฉลาก thiol (-SH) ที่ปลายด้าน 5’ เพื่อการตรวจผลผลิตจาก LAMP ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลงมีลำดับเบสดังนี้ 5’–SH-CATGGACCAGAACAAC-3’
4. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ด้วยเทคนิคใหม่ ในข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่งปฏิกิริยา Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) มีขั้นตอนดังนี้ การเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ป็นเวลาประมาณ 1 ชั่วโมงที่อุณหภูมิประมาณ 61 องศาเซลเซียส
5. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ด้วยเทคนิคใหม่ ในข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่งปฏิกิริยา Loop-mediated isothermal amplification (LAMP) จะต้องใช้เวลาในการเพิ่มปริมาณสารพันธุกรรมของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ที่มีเบสกลายพันธ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 บนยืน rpoB เป็นเวลาประมาณ 1 ชั่วโมง ที่อุณหภูมิ ประมาณ 61 องศาเซลเซียส และ ภายในปฏิกิริยา LAMP 25 ไมโครลิตร มีการใช้ไพรเมอร์ 2 ชุดด้วยกัน ชุดที่ 1 สำหรับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 บนยีน rpoB ประกอบด้วย inner primers FIP-rpoB และ BIP-rpoB531 อย่างละ 2 ?M, outer primers F3-rpoB และ B3-rpoB อย่างละ 0.2 ?M, dNTPs 1.6 mM ผสมด้วยสารเบตา อีน (betaine) 0.6 M, สารแมกนีเซียมซัลเฟส (MgSO4) 4 mM, 2.5U Bst 2.0 warm start DNA polymerase และ supplied buffer 1x ชุดที่ 2 สำหรับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 523 บนยีน rpoB ประกอบด้วย inner primers FIP-rpoB และ BIP-rpoB526 อย่างละ 2 ?M, outer primers F3-rpoB และ B3-rpoB อย่างละ 0.2 ?M, dNTPs 1.6 mM ผสมด้วยสารเบตาอีน (betaine) 0.6 M, สารแมกนีเซียมซัลเฟส (MgSO4) 4 mM, 2.5U Bst 2.0 warm start DNA polymerase และ supplied buffer 1x
6. ไพรเมอร์ที่ใช้ในปฏิกิริยา LAMP ในข้อถือสิทธิที่ 5 การออกแบบไพรเมอร์สำหรับเทคนิค LAMP ในการ ตรวจเชื้อ ที่มีเบสกลายพันธุ์เพียงหนึ่งเบส ไพรเมอร์ที่ใช้ในปฏิกิริยา LAMP ประกอบด้วยไพรเมอร์ 4 ตัว ที่จำเพาะ ต่อลำดับเบสกลายพันธุ์ที่ตำแหน่ง 531 และ 526 บนยีน rpoB ของเชื้อวัณโรคดังนี้ ไพรเมอร์ F3-KatG ลำดับเบส (5’-3’) CCGCAGACGTTGATCAACAT ไพรเมอร์ B3-KatG ลำดับเบส (5’-3’) CAGGGGTTTCGATTGGGC ไพรเมอร์ FIP-KatG1 ลำดับเบส (5’-3’) GGTGCTGAAGAACTCCTTGATTTTGCCGGTGGTGGTCGCCGCG ไพรเมอร์ BIP-rpoB531 ลำดับเบส (5’-3’) CTGGCATCGAGGTCGTATTTTTTCGTCGGGGTGTTCGTCC ไพรเมอร์ BIP-rpoB526 ลำดับเบส (5’-3’) AGCGCTTGGGGCCCGTTTTAGTGCGACGGGTGCA
7. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ในข้อถือสิทธิที่ 1 มีลักษณะเฉพาะคือ ไม่ต้องใช้เครื่อง PCR และเครื่องแยกสาร พันธุกรรมด้วยกระแสไฟฟ้า
8. กรรมวิธีใหม่ในการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสี อนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ด้วยเทคนิคใหม่ สำหรับการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยา ไรแฟนพิซิม (Rifampicin) ด้วยสีอนุภาคทองคำที่เปลี่ยนแปลง ในผู้ป่วยที่สงสัยการติดเชื้อดื้อยานี้ เพื่อการตรวจ วินิจฉัยและป้องกันการระบาดของโรค
Publications (3)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| TH13932A3 TH13932A3 (th) | 2018-06-07 |
| TH13932Y true TH13932Y (th) | 2018-06-07 |
| TH13932U TH13932U (th) | 2018-06-07 |
Family
ID=
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN104093856B (zh) | 检测核酸合成和/或扩增的方法 | |
| EP3339451B1 (en) | Primers for detecting influenza by using lamp, and use thereof | |
| JP6388540B2 (ja) | 改良したdnaポリメラーゼ活性アッセイおよび生菌の検出を可能にする方法 | |
| JP6145974B2 (ja) | 肺炎マイコプラズマの検出方法 | |
| AU2018250570A1 (en) | Methods for multiplex detection of alleles associated with corneal dystrophy | |
| JP5055118B2 (ja) | 試料中に存在するテンプレート核酸の量を決定するための方法 | |
| JoonáLee | Label/quencher-free detection of single-nucleotide changes in DNA using isothermal amplification and G-quadruplexes | |
| Tong et al. | A practical method for subtyping of Streptococcus agalactiae serotype III, of human origin, using rolling circle amplification | |
| CA2416332C (en) | Pharmacological applications of mitochondrial dna assays | |
| Yeo et al. | Rapid detection of codon 460 mutations in the UL97 gene of ganciclovir-resistant cytomegalovirus clinical isolates by real-time PCR using molecular beacons | |
| WO2021236964A1 (en) | Methods for measuring total cell-free dna using alu fragments | |
| TWI780315B (zh) | 量化標的基因的突變型等位基因負擔的方法 | |
| TH13932U (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยอนุภาคทองคำ | |
| Minucci et al. | DNA from buccal swab is suitable for rapid genotyping of angiotensin-converting enzyme insertion/deletion (I/D) polymorphism | |
| TH13931Y (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิด (isoniazid) ด้วยอนุภาคทองคำ | |
| TH13931U (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิด (isoniazid) ด้วยอนุภาคทองคำ | |
| WO2022107023A1 (en) | Systems for the detection of targeted gene variations and viral genomes and methods of producing and using same | |
| EP3523449B1 (en) | Phi6 internal control compositions, devices & methods | |
| TH13933Y (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิต (isoniazid) บนยีนไอเอ็นเอชเอ (inhA) ด้วยอนุภาคทองคำ | |
| TH13933U (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไอโซไนอะซิต (isoniazid) บนยีนไอเอ็นเอชเอ (inhA) ด้วยอนุภาคทองคำ | |
| TH14021U (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสี | |
| TH14021Y (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสี | |
| TH17935Y (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว | |
| TH17935U (th) | กรรมวิธีการตรวจสอบเบสกลายพันธุ์ของเชื้อวัณโรคดื้อต่อยาไรแฟมพิซิน (Rifampicin) ด้วยแถบสีในขั้นตอนเดียว | |
| JP6155750B2 (ja) | SNP(rs11881222)を検出するためのプローブ |