TH22252U - Primers for detecting the presence of APP in pigs. and methods for detecting infection using primers - Google Patents

Primers for detecting the presence of APP in pigs. and methods for detecting infection using primers

Info

Publication number
TH22252U
TH22252U TH1903000929U TH1903000929U TH22252U TH 22252 U TH22252 U TH 22252U TH 1903000929 U TH1903000929 U TH 1903000929U TH 1903000929 U TH1903000929 U TH 1903000929U TH 22252 U TH22252 U TH 22252U
Authority
TH
Thailand
Prior art keywords
primer
nucleotide sequence
primers
pigs
app
Prior art date
Application number
TH1903000929U
Other languages
Thai (th)
Other versions
TH22252A3 (en
Inventor
สงสังข์ทอง นางสาววรางคณา
เลิศสกุลพาณิช นางสาวอุบลศรี
Original Assignee
สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
Filing date
Publication date
Application filed by สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ filed Critical สำนักงานพัฒนาวิทยาศาสตร์และเทคโนโลยีแห่งชาติ
Publication of TH22252U publication Critical patent/TH22252U/en
Publication of TH22252A3 publication Critical patent/TH22252A3/en

Links

Abstract

17/07/2563(OCR) การประดิษฐ์นี้เป็นการพัฒนาไพรเมอร์สำหรับตรวจหาเชื้อ Actinobacillus pleuropneumoniae หรือเชื้อเอพีพี เพื่อตรวจวินิจฉัยโรคปอดและเยื่อหุ้มปอดอักเสบในสุกร ไพรเมอร์ดังกล่าวมีความจำเพาะสูงต่อสารพันธุกรรมของเชื้อเอพีพี และยังมีความไวสูงแม้อุณหภูมิที่ไพรเมอร์สามารถจับกับสายดีเอ็นเอตั้งต้นจะเพิ่มขึ้น ส่งผลให้สามารถลดขั้นตอนและลดระยะเวลาในการตรวจวินิจฉัยโรคปอดและเยื่อหุ้มปอดอักเสบในสุกรโดยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสได้โดยไม่สูญเสียความจำเพาะหรือความไวของปฏิกิริยา หน้า 1 ของจำนวน 1 หน้า บทสรุปการประดิษฐ์ การประดิษฐ์นี้เป็นการพัฒนาไพรเมอร์สำหรับตรวจหาเชื้อ Actinobacillus pleuropneumoniae หรือ เชื้อเอพีพี เพื่อตรวจวินิจฉัยโรคปอดและเยื่อหุ้มปอดอักเสบในสุกร ไพรเมอร์ดังกล่าวมีความจำเพาะสูงต่อ สารพันธุกรรมของเชื้อเอพีพี และยังมีความไวสูงแม้อุณหภูมิที่ไพรเมอร์สามารถจับกับสายดีเอ็นเอตั้งต้นจะ เพิ่มขึ้น ส่งผลให้สามารถลดขั้นตอนและลดระยะเวลาในการตรวจวินิจฉัยโรคปอดและเยื่อหุ้มปอดอักเสบ ในสุกรโดยวิธีปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรสได้โดยไม่สูญเสียความจำเพาะหรือความไวของปฏิกิริยา 17/07/2020(OCR) This invention is the development of a primer for detecting infection. Actinobacillus pleuropneumoniae or APP virus To diagnose lung disease and pleurisy in pigs. The primers are highly specific to the genetic material of the APP strain. It is also highly sensitive even when the temperature at which the primers bind to the initial DNA strand increases. As a result, the process can be reduced and the time taken for diagnosing lung disease and pleurisy in pigs using the polymerase chain reaction method without compromising the specificity or sensitivity of the reaction. Page 1 of number 1 page summary of invention This invention is the development of a primer for detecting infection. Actinobacillus pleuropneumoniae or APP bacteria for diagnosis of lung disease and pleurisy in pigs. Such primers are highly specific to Genetic material of APP germs It is also highly sensitive even when the temperature at which the primers can bind to the initial DNA strand increases. As a result, the process can be shortened and the time taken for diagnosing lung disease and pleurisy will be reduced. in pigs by polymerase chain reaction without losing the specificity or sensitivity of the reaction.

Claims (6)

1. /07/2563(OCR) 1. ไพรเมอร์สำหรับตรวจหาเชื้อเอพีพีในสุกร ประกอบด้วย ไพรเมอร์อย่างน้อยหนึ่งเส้นจาก ไพรเมอร์ที่หนึ่ง (P25) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' ATGTCACCGGCAAAGGGAATGATGTGC 3' ไพรเมอร์ที่สอง (P26) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' CTCTACCCGCTTAGGATCCGCC 3' ไพรเมอร์ที่สาม (P27) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' GAGGATTTGTTTCTCGGTGGTGAGGG 3' ไพรเมอร์ที่สี่ (P28) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TCGCCGTTTTCTCTTCCCAA 3' ไพรเมอร์ที่ห้า (P29) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TGCGCCAAATAACCCGGGACGTAAC 3' หรือ ไพรเมอร์ที่หก (P30) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TCATCCGCAGCGAGCCAGCC 3'2. ไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ไพรเมอร์ดังกล่าว มีความจำเพาะดับยีน apxIVA3. ไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ไพรเมอร์ดังกล่าวถูกนำไปใช้กับเทคนิคพีซีอาร์4. ไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ไพรเมอร์ดังกล่าวสามารถจับกับสายดีเอ็นเอตั้งต้นด้วยเทคนิคพีซีอาร์ ที่อุณหภูมิในช่วง 5575 องศาเซลเซียส5. วิธีการสำหรับตรวจหาเชื้อเอพีพีในตัวอย่างชีวภาพของสุกร ด้วยไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 1 มีขั้นตอน ดังนี้ ก. การนำดีเอ็นเอที่สกัดได้จากตัวอย่างชีวภาพของสุกรมาทำเทคนิคพีซีอาร์ โดยเลือกไพรเมอร์ อย่างน้อยหนึ่งเส้นจาก ไพรเมอร์ที่หนึ่ง (P25) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' ATGTCACCGGCAAAGGGAATGATGTGC 3' ไพรเมอร์ที่สอง (P26) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' CTCTACCCGCTTAGGATCCGCC 3' ไพรเมอร์ที่สาม (P27) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' GAGGATTTGTTTCTCGGTGGTGAGGG 3' ไพรเมอร์ที่สี่ (P28) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TCGCCGTTTTCTCTTCCCAA 3' ไพรเมอร์ที่ห้า (P29) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TGCGCCAAATAACCCGGGACGTAAC 3' หรือ ไพรเมอร์ที่หก (P30) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TCATCCGCAGCGAGCCAGCC 3' โดยพีซีอาร์ทำภายใต้สภาวะที่มีอุณหภูมิที่ไพรเมอร์สามารถจับกับสายดีเอ็นเอตั้งต้นอยู่ในช่วง 5575 องศาเซลเซียส เพื่อให้ได้ผลิตภัณฑ์พีซีอาร์ ข. การวิเคราะห์ผลิตภัณฑ์พีซีอาร์โดยวิธีอิเล็กโตรโฟรีซิส6. วิธีการ ตามข้อถือสิทธิที่ 5 ที่ซึ่ง ตัวอย่างชีวภาพของสุกร เลือกได้จาก ชิ้นเนื้อเยื่อ เลือด ซีรั่ม สารคัด หลั่ง อย่างใดอย่างหนึ่งหรือหลายอย่างรวมกัน หน้า 1 ของจำนวน 1 หน้า ข้อถือสิทธิ 1. ไพรเมอร์สำหรับตรวจหาเชื้อเอพีพีในสุกร ประกอบด้วย ไพรเมอร์อย่างน้อยหนึ่งเส้นจาก ไพรเมอร์ที่หนึ่ง (P25) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' ATGTCACCGGCAAAGGGAATGATGTGC 3' ไพรเมอร์ที่สอง (P26) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' CTCTACCCGCTTAGGATCCGCC 3' ไพรเมอร์ที่สาม (P27) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' GAGGATTTGTTTCTCGGTGGTGAGGG 3' ไพรเมอร์ที่สี่ (P28) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TCGCCGTTTTCTCTTCCCAA 3' ไพรเมอร์ที่ห้า (P29) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TGCGCCAAATAACCCGGGACGTAAC 3 หรือ ไพรเมอร์ที่หก (P30) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TCATCCGCAGCGAGCCAGCC 3'1. /07/2020(OCR) 1. Primers for detecting APP in pigs consist of at least one primer from The first primer (P25) having the nucleotide sequence 5' ATGTCACCGGCAAAGGGAATGATGTGC 3', the second primer (P26) having the nucleotide sequence 5' CTCTACCCGCTTAGGATCCGCC 3', the third primer (P27) having the nucleotide sequence 5' GAGGATTTGTTTCTCGGTGGTGAGGG 3', the fourth primer (P28) having the nucleotide sequence 5' TCGCCGTTTTCTCTTCCCAA 3', the fifth primer (P29) having the nucleotide sequence 5' TGCGCCAAATAACCCGGGACGTAAC 3', or the sixth primer (P30) having the nucleotide sequence 5' TCATCCGCAGCGAGCCAGCC 3'. 2. The primer according to claim 1, wherein said primers 3. The primer of claim 1, wherein said primer is used in a PCR technique. 4. The primer of claim 1, wherein said primer is capable of binding to the starting DNA strand by a PCR technique at a temperature in the range of 5575°C. 5. A method for detecting APP in a biological specimen of a pig using the primers of claim 1, having the steps as follows: a. taking the DNA extracted from the biological specimen of the pig and subjecting it to a PCR technique by selecting at least one primer from The first primer (P25) with the nucleotide sequence 5' ATGTCACCGGCAAAGGGAATGATGTGC 3', the second primer (P26) with the nucleotide sequence 5' CTCTACCCGCTTAGGATCCGCC 3', the third primer (P27) with the nucleotide sequence 5' GAGGATTTGTTTCTCGGTGGTGAGGG 3', the fourth primer (P28) with the nucleotide sequence 5' TCGCCGTTTTCTCTTCCCAA 3', the fifth primer (P29) with the nucleotide sequence 5' TGCGCCAAATAACCCGGGACGTAAC 3', or the sixth primer (P30) with the nucleotide sequence 5' TCATCCGCAGCGAGCCAGCC 3', by PCR performed under conditions with a temperature at which the primers can bind to the starting DNA strand within the range of 5575 °C. To obtain a PCR product, b. Analysis of the PCR product by electrophoresis. 6. The method of claim 5, wherein the biological sample of the pig is selected from any or a combination of tissues, blood, serum, secretions, etc. Page 1 of 1 Claim 1. The primers for detecting APP in pigs comprise at least one primer from Primer one (P25) with the nucleotide sequence 5' ATGTCACCGGCAAAGGGAATGATGTGC 3', primer two (P26) with the nucleotide sequence 5' CTCTACCCGCTTAGGATCCGCC 3', primer three (P27) with the nucleotide sequence 5' GAGGATTTGTTTCTCGGTGGTGAGGG 3', primer four (P28) with the nucleotide sequence 5' TCGCCGTTTTCTCTTCCCAA 3', primer five (P29) with the nucleotide sequence 5' TGCGCCAAATAACCCGGGACGTAAC 3', or primer six (P30) with the nucleotide sequence 5' TCATCCGCAGCGAGCCAGCC 3'. 2. ไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ไพรเมอร์ดังกล่าว มีความจำเพาะกับยีน apxIVA2. A primer according to claim 1, wherein said primer is specific to the apxIVA gene. 3. ไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ไพรเมอร์ดังกล่าวถูกนำไปใช้กับเทคนิคพีซีอาร์3. A primer according to claim 1, wherein said primer is used in the PCR technique. 4. ไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 1 ที่ซึ่ง ไพรเมอร์ดังกล่าวสามารถจับกับสายดีเอ็นเอตั้งต้นด้วยเทคนิคพีซีอาร์ ที่อุณหภูมิในช่วง 5575 องศาเซลเซียส4. The primer according to claim 1, wherein said primer can bind to the starting DNA strand by PCR technique at a temperature in the range of 5575°C. 5. วิธีการสำหรับตรวจหาเชื้อเอพีพีในตัวอย่างชีวภาพของสุกร ด้วยไพรเมอร์ ตามข้อถือสิทธิที่ 1 มีขั้นตอน ดังนี้ ก. การนำดีเอ็นเอที่สกัดได้จากตัวอย่างชีวภาพของสุกรมาทำเทคนิคพีซีอาร์ โดยเลือกไพรเมอร์ อย่างน้อยหนึ่งเส้นจาก ไพรเมอร์ที่หนึ่ง (P25) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' ATGTCACCGGCAAAGGGAATGATGTGC 3' ไพรเมอร์ที่สอง (P26) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' CTCTACCCGCTTAGGATCCGCC 3' ไพรเมอร์ที่สาม (P27) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' GAGGATTTGTTTCTCGGTGGTGAGGG 3' ไพรเมอร์ที่สี่ (P28) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TCGCCGTTTTCTCTTCCCAA 3' ไพรเมอร์ที่ห้า (P29) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TGCGCCAAATAACCCGGGACGTAAC 3' หรือ ไพรเมอร์ที่หก (P30) ที่มีลำดับนิวคลีโอไทด์ 5' TCATCCGCAGCGAGCCAGCC 3' โดยพีซีอาร์ทำภายใต้สภาวะที่มีอุณหภูมิที่ไพรเมอร์สามารถจับกับสายดีเอ็นเอตั้งต้นอยู่ในช่วง 5575 องศาเซลเซียส เพื่อให้ได้ผลิตภัณฑ์พีซีอาร์ ข. การวิเคราะห์ผลิตภัณฑ์พีซีอาร์โดยวิธีอิเล็กโตรโฟรีซิส5. A method for detecting APP in a biological sample of pigs using primers according to claim 1, wherein the steps are as follows: (a) taking the DNA extracted from the biological sample of pigs and performing a PCR technique by selecting at least one primer from The first primer (P25) with the nucleotide sequence 5' ATGTCACCGGCAAAGGGAATGATGTGC 3', the second primer (P26) with the nucleotide sequence 5' CTCTACCCGCTTAGGATCCGCC 3', the third primer (P27) with the nucleotide sequence 5' GAGGATTTGTTTCTCGGTGGTGAGGG 3', the fourth primer (P28) with the nucleotide sequence 5' TCGCCGTTTTCTCTTCCCAA 3', the fifth primer (P29) with the nucleotide sequence 5' TGCGCCAAATAACCCGGGACGTAAC 3', or the sixth primer (P30) with the nucleotide sequence 5' TCATCCGCAGCGAGCCAGCC 3', by PCR performed under conditions with a temperature at which the primers can bind to the starting DNA strand within the range of 5575 °C. To obtain PCR products, b. Analysis of PCR products by electrophoresis. 6. วิธีการ ตามข้อถือสิทธิที่ 5 ที่ซึ่ง ตัวอย่างชีวภาพของสุกร เลือกได้จาก ชิ้นเนื้อเยื่อ เลือด ซีรั่ม สารคัด หลั่ง อย่างใดอย่างหนึ่งหรือหลายอย่างรวมกัน6. The method of claim 5, wherein the biological sample of a pig is selected from any or a combination of tissue, blood, serum, secretions, or other material.
TH1903000929U 2019-04-19 Primers for detecting APP infection in pigs and methods for detecting infection using primers TH22252A3 (en)

Publications (2)

Publication Number Publication Date
TH22252U true TH22252U (en) 2023-08-17
TH22252A3 TH22252A3 (en) 2023-08-17

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20120171725A1 (en) Amplicon Rescue Multiplex Polymerase Chain Reaction for Amplification of Multiple Targets
US20180195111A1 (en) 16s ribosomal rna universal primers and use thereof in microbiological analysis and diagnostics
US20150159207A1 (en) Use of markers including nucleotide sequence based codes to monitor methods of detection and identification of genetic material
RU2720713C9 (en) Set of synthetic oligonucleotides for detecting of coronavirus rna
AU2020343336A1 (en) Systems, methods, and compositions for the rapid early-detection of host RNA biomarkers of infection and early identification of COVID-19 coronavirus infection in humans
RU2727054C1 (en) Method for detecting cdna of sars-cov-2 coronavirus using synthetic oligonucleotide primers in polymerase chain reaction
CN101343672A (en) A detection kit for porcine reproductive and respiratory syndrome virus and its application
EP3277834A1 (en) Methods of capturing sperm nucleic acids
WO2010062897A1 (en) Methods and compositions to detect clostridium difficile
KR20180115967A (en) Primer for detecting FCoV, CCoV and TGEV simultaneously and detecting method using the same
CN105992827A (en) Universal controls for sequencing assays
WO2009087685A2 (en) Method for detection of hepatitis nucleic acid and uses thereof
TH22252U (en) Primers for detecting the presence of APP in pigs. and methods for detecting infection using primers
TH22252A3 (en) Primers for detecting APP infection in pigs and methods for detecting infection using primers
JP7726895B2 (en) Multiplex PCR method for detecting microorganisms and uses thereof
US20200181689A1 (en) Method for identifying helicobacter pylori infection by detection of the urec and caga genes in stool samples
KR20190065684A (en) DEVELOPMENT OF SINGLEPLEX REAL-TIME PCR KIT FOR RAPID DETECTION OF ENTEROHEMORRHAGIC ESCHERICHIA COLI USING stx1, stx2 TARGET GENE
KR101911017B1 (en) Composition for Detecting Taylorella equigenitalis, Composition for Diagnosing Contagious Equine Metritis Caused by Taylorella equigenitalis Infection, Method of Detecting Taylorella equigenitalis, and Method of Diagnosing Contagious Equine Metritis Caused by Taylorella equigenitalis Infection
US10030241B2 (en) Methods and kits for capturing sperm nucleic acids
KR101886520B1 (en) Method for diagnosing latent infection phase of Johne's Disease
KR102499837B1 (en) Composition For Detecting Epizootic Ulcerative Syndrome and Method of Detecting Epizootic Ulcerative Syndrome Using the Same
WO2015063121A1 (en) Method for analyzing body fluid samples
KR102291584B1 (en) Molecular diagnosis method for disease diagnosis of companion animals and livestock
ES2352782B1 (en) METHOD AND KIT FOR THE MOLECULAR DETECTION OF TROPHERYMA WHIPPLEI.
JP2019180351A (en) Quick gene detection methods of bovine leukemia virus using fluorescent lamp method