TH54102A - ลำดับนิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับจีน oxyR - Google Patents

Abstract

DC60 (02/10/44) การประดิษฐ์สัมพันธ์กับพอลินิวคลิโอไทด์ที่ได้รับการแยกซึ่งประกอบรวมด้วยลำดับพอลิ นิวคลิโอไทด์ที่ได้รับการเลือกจากกลุ่มซึ่งประกอบด้วย a) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งเหมือนกันกับพอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่ง ประกอบรวมด้วยลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลขที่ 2 ที่ระดับอย่างน้อยที่สุด 70% b) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่งประกอบรวมด้วยลำดับกรดอะมิโน ซึ่งเหมือนกันกับลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลขที่ 2 ที่ระดับอย่างน้อยที่สุด 70% c) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งเป็นส่วนเสริมซึ่งกันและกันกับพอลินิวคลิโอไทด์ของ a) หรือ b) และ d) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งประกอบรวมด้วยอย่างน้อยที่สุด 15 นิวคลิโอไทด์ที่ต่อเนื่องกันของ ลำดับพอลินิวคลิโอไทด์ของ a) b) หรือ c) และกระบวนการสำหรับการเตรียมโดยการหมักของกรด L -อะมิโนโดยใช้คอรินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งมี อย่างน้อยที่สุดจีน oxyR ได้รับการปรากฏในรูปที่ได้รับการทำให้เพิ่มขึ้น และการใช้ลำดับพอลินิวคลิ โอไทด์เป็นโพรบการทำให้ผสมกัน การประดิษฐ์สัมพันธ์กับพอลินิวคลิโอไทด์ที่ได้รับการแยกซึ่งประกอบรวมด้วยลำดับพอลิ นิวคลิโอไทด์ที่ได้รับการเลือกจากกลุ่มซึ่งประกอบด้วย a) พอลินิวคลีโอไทด์ซึ่งเหมือนกันกับพอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่ง ประกอบด้วยลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลขที่ 2 ที่ระดับอย่างน้อยที่สุด 70% b) พอลินิวคลีโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่งประกอบด้วยลำดับกรดอะมิโน ซึ่งเหมือนกันกับลำดับกรอดอะมิโนของ SEQ ID เลขที่ 2 ที่ระดับอย่างน้อยที่สุด 70% c) พอลินิวคลีโอไทด์ซึ่งเป็นส่วนเสริมซึ่งกันและกันกับพอลินิวคลีโอไทด์ของ a) หรือ b) และ d) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งประกอบรวมด้วยอย่างน้อยที่สุด 15 นิวคลิโอไทด์ที่ต่อเนื่องกันของ ลำดับพอลินิวคลิโอไทด์ของ a) b) หรือ c) และกระบวนการสำหรับการเตรียมโดยการหมักของกรด L -อะมิโนโดยใช้คอรินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งมี อย่างน้อยทีสุดจีน oxyR ได้รับการปรากฎในรูปที่ได้รับการทำให้เพิ่มขึ้น และการใช้ลำดับพอลินิวคลิ โอไทด์เป็นโพรบการทำให้ผสมกัน

Claims (22)

1. พอลินิวคลีโอไทด์ที่ได้รับการแยกจากคอรินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งประกอบรวมด้วยลำดับพอลินิวคลิ โอไทด์ซึ่งได้รับการเลือกจากกลุ่มซึ่งประกอบด้วย a) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งเหมือนกันกับพอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่ง ประกอบด้วยลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลขที่ 2 ที่ระดับอย่างน้อยที่สุด 70% b) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่งประกอบด้วยลำดับกรดอะมิโน ซึ่งเหมือนกันกับลำดับกรดอะมิโนของ SEQ ID เลขที่ 2 ที่ระดับอย่างน้อยที่สุด 70% c) พอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งเป็นส่วนเสริมซึ่งกันและกันกับพอลินิวคลิโอไทด์ของ a) หรือ b) และ d) พอลินิวโคลีโอไทด์ซึ่งประกอบรามด้วยอย่างน้อยที่สุด 15 นิวคลิโอไทด์ที่ต่อเนื่องกันของ ลำดับพอลินิวคลิโอไทด์ของ a) b) หรือ c) พอลิเพปไทด์ อย่างที่ควรเลือกใช้ซึ่งมีความว่องไวของตัวบังคับการถอดรหัส OxyR

2. พอลินิวคลีโอไทด์ดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 1 ซึ่งพอลินิวคลีโอไทด์ คือ อย่างที่ควรเลือกใช้ รีคอมบิแนนท์ดีเอ็นเอ ซึ่งมีความสามารถในการถ่ายแบบในคอรินิฟอร์มแบคทีเรีย

3. พอลินนิวคลีโอไทด์ดังที่ถือสิทธิในข้อ 1 ซึ่งพอลินิวคลีโอไทด์ คือ อาร์เอ็นเอ

4. พอลีนิวคลีโอไทด์ดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 2 ซึ่งประกอบรวมด้วยลำดับกรดนิวคลิอิกตามที่ แสดงใน SEQ ID เลขที่ 1

5. ดีเอ็นเอดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 2 ซึ่งมีความสามารถในการถ่ายแบบ ซึ่งประกอบรวมด้วย (i) ลำดับนิวคลีโอไทด์ที่แสดงใน SEQ ID เลขที่ 1 หรือ (ii) อย่างน้อยที่สุด 1 ลำดับซึ่งตรงกันกับลำดับ (i) ภายในพิสัยของการเสื่อมของรหัสทางพันธุ กรรม หรือ (iii) อย่างน้อยที่สุด 1 ลำดับซึ่งผสมกันกับลำดับที่เป็นส่วนเสริมซึ่งกันและกันกับลำดับ (i) หรือ (ii) และอย่างเป็นทางเลือก (iv) การกลายแบบเซนส์ (sense) ของฟังก์ชันที่เป็นกลางใน (i)

6. ลำดับพอลินิวคลีโอไทด์ดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 2 ซึ่งใส่รหัสสำหรับพอลิเพปไทด์ซึ่ง ประกอบรวมด้วยลำดับกรดอะมิโนที่แสดงใน SEQ ID เลขที่ 2

7. คอรินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งมีจีน oxyR ได้รับการทำให้เพิ่มขึ้น โดยเฉพาะอย่างยิ่งได้รับการทำให้ แสดงออกมากเกิน

8. พลาสมิตเวกเตอร์ pT-oxyRexp. ซึ่ง 8.1 แฟรกเมนท์ภายใน ในขนาดของ 1400 คู่ฐานซึ่งมีจีน oxyR 8.2 แผนที่การจำกัดซึ่งได้รับการผลิตซ้ำในรูปที่ 2 และ 8.3 ซึ่งได้รับการฝากในคอรินิแลคทีเรียม กลูทามิคุมสายเชื้อ DSM 5715 / pT-oxyRexp. ภายใต้ เลขที่ DSM 13457 ที่ Deutsche Sammlung fur Mikroroganismen and Zellkulturen [การ สะสมของจุลินทรีย์และเซลล์เพาะเลี้ยงของเยอรมัน]

9. กระบวนการสำหรับการเตรียมโดยการหมักของกรด L-อะมิโน โดยเฉพาะอย่างยิ่ง L -ไลซีน ซึ่ง ประกอบรวมด้วยการทำให้ขั้นตอนตอนไปนี้สำเร็จ (a) การหมักของคอรินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งผลิตกรด L -อะมิโนที่ต้องการและซึ่งมีอย่างน้อยที่สุด จีน oxyR หรือลำดับนิวคลีโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับจีน oxyR ได้รับการทำให้เพิ่มขึ้น โดย เฉพาะอย่างยิ่งได้รับการทำให้แสดงออกมากเกิน (b) การทำให้กรด L -อะมิโนเข้มข้นในตัวกลางหรือในเซลล์ของแบคทีเรีย และ (c) การแยกกรด L -อะมิโน

10. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 9 ซึ่งแบคทีเรียที่มีจีนอื่นของวิถีทางชีวสังเคราะห์ของ กรด L-อะมิโนที่ต้องการได้รับการทำให้เพิ่มขึ้นอีก ได้รับการใช้

11. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 9 ซึ่งแบคทีเรียที่มีวิถีทางเมแทบอลิกซึ่งลดการก่อเกิด ของกรด L-อะมิโนที่ต้องการ อย่างน้อยที่สุดได้รับการกำจัดบางส่วน ได้รับการใช้

12. กระบวนการดังที่ถือสิทะในข้อถือสิทธิข้อ 9 ซึ่งการแสดงออกของพอลินิวคลิโอไทด์ซึ่งใส่รหัส สำหรับจีน oxyR ได้รับการทำให้เพิ่มขึ้น โดยเฉพาะอย่างยิ่งด้รับการทำให้แสดงออกมากเกิน

13. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 12 ซึ่งสายเชื้อที่ได้รับการแปลงด้วยพลาสมิตเวกเตอร์ ได้รับการใช้ และพาสมิดเวกเตอร์มีลำดับนิวคลีโอไทด์ซึ่งใส่รหัสสำหรับจีน oxyR

14. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 9 ซึ่งสมบัติการบังคับของพอลิเพปไทด์ (โปรตีน เอนไซม์) สำหรับที่ซึ่งพอลินิวคลิโอไทด์ oxyR ใส่รหัส ได้รับการทำให้เพิ่มขึ้น

15. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 9 ซึ่งสำหรับการเตรียมกรด L -อะมิโน โดยเฉพาะ อย่างยิ่ง L-ไลซีน ที่เวลาเดี่ยวกัน จุลินทรีย์คอรินิฟอร์มซึ่งมีจีนหนึ่งชนิดหรือมากกว่าซึ่งได้รับการ เลือกจากกลุ่มซึ่งประกอบด้วย 15.1 จีน dapA ซึ่งใส่รหัสสำหรับไดไฮโดรไดพิคอลิเนทซินเทส 15.2 จีน gap ซึ่งใส่รหัสสำหรับกลีเซอแรคดีไฮด์ 3 -ฟอสเฟทดีไฮโตรจิเนส 15.3 จีน tpi ซึ่งใส่รหัสสำหรับไทรโอสฟอรสเฟทไอโซเมอเรส 15.4 จีน pgk ซึ่งใส่รหัสสำหรับ 3-ฟอสฟอกลีเซอรเทไคเนส 15.5 จีน pyc ซึ่งใส่รหัสสำหรับไพรูเวทคาร์บอกซิเลส 15.6 จีน lysE ซึ่งใส่รหัสสำหรับการส่งออกไลซีน 15.7 จีน mqo ซึ่งใส่รหัสสำหรับบาเลท-ควิโนนออกซิโตรีดักเทส 15.8 จีน zwf ซึ่งใส่รหัสสำหรับกลูโคส 6-ฟอสเฟทดีไฮโตรจิเนส 15.9 จีน gnd ซึ่งใสรหัสำหรับ 6-ฟอสฟอกลูโคเนทดีไฮดตรจิเนส 15.10 จีน sod ซึ่งใส่รหัสสำหรับซุปเปอร์ออกไซด์ดิสมัลเทส 15.11 จีน zwal ซึ่งใส่รหัสสำหรับโปรตีน Zwal 15.12 จีน lysC ซึ่งใส่รหัสสำหรับแอสพาร์เททไคเนสที่ต้านทานการป้อนกลับ ได้รับการขยาย หรือได้รับการทำให้แสดงออกมากเกิน ได้รับการหมัก

16. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 9 ซึ่งสำหรับการเตรียมกรด L-อะมิโน โดยเฉพาะอย่าง ยิ่ง L -ไลซีน ที่เวลาเดียวกัน จุลินทรีย์คอรรินิฟอร์มซึ่งมีจีนหนึ่งชนิดหรือมากกว่าซึ่งได้รับการเลือก จากกลุ่มซึ่งประกอบด้วย 16.1 จีน pck ซึ่งใส่รหัสสำหรับฟอสฟออินอลไพรูเวทคาร์บอกซิไคเนส 16.2 จีน pgi ซึ่งใส่รหัสสำหรับกลูโคส-6-ฟอสเฟทไอโซเมอเรส 16.3 จีน poxB ซึ่งใส่รหัสสำหรับไพรูเวทออกซิเดส 16.4 จีน zwa2 ซึ่งใส่รหัสสำหรับโปรตีน Zwa2 ได้รับการทำให้อ่อนฤทธิ์ ได้รับการหมัก

17. คอรินิฟอร์มแบคทีเรียซึ่งมีเวกเตอร์ซึ่งมีพอลินิวคลิโอไทด์ดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 1

18. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิก่อนหน้านี้ข้อใดข้อหนึ่ง ซึ่งจุลินทรีย์ของสกุล คอรินิแบคทีเรียมได้รับการใช้

19. กระบวนการของการค้นพบฮาร์เอ็นเอ ซีดีเอ็นเอ และดีเอ็นเอเพื่อที่จะแยกกรดนิวคลิอีก หรือ พอลินิวคลิโอไทด์หรือจีนซึ่งใส่รหัสสำหรับตัวบังคับการถอดรหัส OxyR หรือมีความเหมือนกัน สูงกับลำดับของจีน oxyR ซึ่งประกอบรวมด้วยการใช้ลำดับพอลินิวคลีโอไทด์ดังที่ถือสิทธิในข้อ ถือสิทธิข้อ 1 2 3 หรือ 4 ข้อใดข้อหนึ่งเป็นโพรมการทำให้ผสมกัน

20. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 19 ซึ่งการทำให้ผสมกันได้รับการทำให้สำเร็จภายใต้ ความรุนแรงซึ่งตรงกันกับที่มากที่สุด 2x SSC

21. กระบวนการดังที่ถือสิทธิในข้อถือสิทธิข้อ 19 ซึ่งอาร์เรย์ ไมโครอาร์เรย์หรือแผ่นดีเอ็นเอได้รับ การใช้

22. คอรินิแบคทีเรียม กลูทามิคุมสายเชื้อ DSM 5715 /pT-oxyRexp ฝากเป็น Dsm 13457 ที่ Deutsche Sammlung fur Mikroroganismen and Zellkulturen [การสะสมของจุลินทรีย์และเซลล์ เพาะเลี้ยงของเยอรมัน] บรอนส์ชวิก เยอรมัน