TWI882964B - Bet 溴結構域(bromodomain)抑制劑之固體形式之製備方法 - Google Patents

Bet 溴結構域(bromodomain)抑制劑之固體形式之製備方法 Download PDF

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Abstract

本發明係關於化合物I之固體形式，其調節或抑制含BET溴結構域蛋白質之活性，包括其製備方法、製備其之中間物及其醫藥組合物，其中化合物I適用於治療諸如癌症之疾病。

Description

BET溴結構域(BROMODOMAIN)抑制劑之固體形式之製備方法
本發明係關於化合物I (1-苯甲基-6-(3,5-二甲基異噁唑-4-基)-N-甲基-1H-咪唑并[4,5-b]吡啶-2-胺)之固體形式，其調節或抑制含BET溴結構域蛋白質之活性，包括其製備方法、製備其之中間物及其醫藥組合物，其中化合物I適用於治療諸如癌症之疾病。
調節或抑制含BET溴結構域蛋白質(諸如BRD2、BRD3、BRD4及BRDT)之活性的治療劑具有治癒、治療或改善患有疾病(諸如癌症、自體免疫及心血管疾病)之患者生活的可能。特定言之，BET溴結構域調節劑或抑制劑具有治療B急性淋巴球性白血病、伯基特氏淋巴瘤(Burkitt's lymphoma)、瀰漫大細胞淋巴瘤、多發性骨髓瘤、原發性漿細胞白血病、肺癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸癌、結腸癌、胃癌、神經膠母細胞瘤、前列腺癌、卵巢癌或神經母細胞瘤等的可能。用於治療此類疾病及病狀之化合物揭示於PCT公開案第WO 2015/002754號，其揭示內容以全文引用之方式併入本文中。
迫切需要化合物，其包括具有高純度之苯并咪唑之衍生物的固體形式。除有效性之外，化合物亦展現出改良穩定性、溶解性及有利於治療由含BET溴結構域蛋白質調節之疾病的藥物動力學及藥效學概況，且重要的是，可大規模有效製備以促進臨床及商業用途。
已知化合物I調節或抑制BET活性，及描述於WO 2015/002754中。化合物I具有下式：化合物I
本發明提供一種化合物I之固體形式，以及用於製備所揭示之化合物I之固體形式、用於其製備之中間物、包含化合物I之結晶形式的醫藥組合物的方法，及用於在治療由BET蛋白質介導之疾病中使用此類形式及醫藥組合物的方法。一或多個實施例之細節闡述於以下描述中。其他特徵、目標及優點將自實施方式及申請專利範圍顯而易見。
本發明提供一種製備適用於提高比例及大規模製備之化合物I的方法。製備化合物I之方法描述於WO 2015/002754中，其以全文引用之方式併入本文中，及尤其化合物I及其合成的描述。相較於WO 2015/002754中所描述之合成，本文所提供之方法具有適用於提高化合物I之較佳多晶型形式(形式VII)之比例的某些優勢。舉例而言，本文所述之方法使用危害較小的試劑、較低的反應溫度、更適用於提高比例的試劑、經簡化的處理程序及消除藉由管柱層析法之純化對中間物進行流線型分離。此等所有因素使得製造方法在效率及品質方面優於先前方法，減少了環境足跡且降低了成本。
在一些實施例中，製備化合物I之方法包含起始物質A及G及中間物B、C、D、E及F：
在一些實施例中，製備化合物B之方法包含：將化合物A (步驟1)：化合物A 與苯甲醛在酸存在下反應。在一些實施例中，酸為乙酸。
在一些實施例中，步驟1在溶劑存在下進行。在一些實施例中，溶劑為甲醇。在一些實施例中，溶劑為乙醇。在步驟1中使用甲醇或乙醇作為溶劑消除了管柱層析法之需要，從而提供更有效的處理及分離。
在步驟1之一些實施例中，在反應完成後將NaHCO3 溶液添加至反應混合物中，使產物沈澱，其簡化了化合物B之分離及純化。
在步驟1之一些實施例中，化合物A與苯甲醛以1:1之莫耳比使用。
在一些實施例中，步驟1在低溫下進行，及在一些實施例中，反應溫度為0℃至5℃、或低於10℃、或低於20℃。
在一些實施例中，製備化合物C之方法包含：將化合物B (步驟2)：化合物B 與NaCNBH3 或NaBH4 在溶劑中反應。在一些實施例中，溶劑為醇。在一些實施例中，溶劑為甲醇或乙醇。
在一些實施例中，溶劑為乙醇，使得NaCNBH3 或NaBH4 之負載相對於化合物B減少至0.6莫耳當量，從而使方法對環境更友好且降低了總體成本。
在一些實施例中，NaCNBH3 或NaBH4 之負載相對於化合物B等於或小於一當量，諸如相對於化合物B小於0.9當量、或小於0.75當量、或等於或小於0.6當量。
在步驟2之一些實施例中，藉由以下進行處理及分離：添加HCl溶液以淬滅反應，接著添加水，使產物(化合物C)以高純度(+95%)沈澱，藉此簡化處理及分離方法。在一些實施例中，可使用其他試劑以淬滅反應，諸如水或乙酸。
在一些實施例中，步驟2在10℃至40℃、或15℃至20℃、或20℃至25℃下進行。
在一些實施例中，製備化合物D之方法包含：將化合物C (步驟3)：化合物C 與化合物G 在過渡金屬催化劑及鹼存在下反應，其中過渡催化劑為鈀催化劑。
在一些實施例中，鈀催化劑為[1,1'-雙(二苯基膦基)二茂鐵]二氯鈀(II) (Pd(dppf)Cl2 、二氯(雙{二第三丁基[4-(二甲胺基)苯基]磷烷基})鈀(PD-132)或肆(三(鄰甲苯基)磷化氫)鈀(0)。
在一些實施例中，鈀催化劑為Pd(PPh3 )4 。
在一些實施例中，鹼為CsF。在一些實施例中，鹼為鹼金屬碳酸鹽。在一些實施例中，鹼為K2 CO3 。在一些實施例中，鹼為鹼金屬磷酸鹽。在一些實施例中，鹼為K3 PO4 。
相較於K2 CO3 ，使用K3 PO4 為有利的，因為K3 PO4 充分分散於反應器中及因此反應具有較少副產物，且產物(化合物D)純度較高。
在一些實施例中，反應在包含1,4-二噁烷及水之溶劑混合物中進行。
在一些實施例中，反應在高溫下進行，諸如80℃至100℃、或90℃至100℃、或90℃至95℃。
在一些實施例中，製備化合物E之方法包含：將化合物D (步驟4)：化合物D 與羰基二咪唑(CDI)在溶劑中反應。
在一些實施例中，溶劑為非質子性溶劑。在一些實施例中，溶劑為1,4-二噁烷、DMSO或DMF。
使用DMSO之優勢在於其為一種較安全(級別3)且對環境更友好的溶劑。使用DMSO亦使得開發出經簡化之分離程序，其涉及藉由將水添加至反應混合物中，以使產物(化合物E)沈澱。此消除了冗長的處理方法，包括使用層析法，及因此以高效方式提供化合物E。
在一些實施例中，在溶劑中逐份添加CDI，以降低添加至反應混合物期間的熱量釋放。
在一些實施例中，反應在高溫下進行，諸如20℃至70℃、或30℃至40℃、或40℃至65℃、或55℃至60℃。
在一些實施例中，製備化合物F之方法包含：將化合物E (步驟5)：化合物E 與氯化劑在鹼存在下反應。
在一些實施例中，氯化劑為磷醯氯(POCl3 )。
在一些實施例中，POCl3 以過量使用(相對於化合物E之2至30莫耳當量，或4至7當量，或5至15當量，或7至10當量)。
在一些實施例中，鹼為胺鹼。
在一些實施例中，胺鹼為N,N-二異丙基乙胺(DIPEA)。在一些實施例中，胺鹼為三甲胺或N,N-二甲基苯胺。
在一些實施例中，DIPEA以過量使用(相對於化合物E之1.01至10莫耳當量，或1.01至3當量，或5至10當量)。
在一些實施例中，相對於化合物E，使用4至5莫耳當量、或8至9莫耳當量之POCl3 ，及相對於化合物E使用1.0至1.1莫耳當量、或2.5莫耳當量之DIPEA，降低非所需副產物之形成及簡化化合物E之純化方法。
在一些實施例中，步驟5在高溫下進行，諸如95℃至100℃或80℃至100℃。
在一些實施例中，步驟5進一步包含將粗反應混合物與乙酸乙酯共蒸餾。此為用於將過量POCl3 由反應混合物移除，隨後用NaHCO3 溶液淬滅反應之有效方法。
在一些實施例中，產物(化合物F)藉由自乙酸乙酯與非極性共溶劑之混合物結晶來分離。在一些實施例中，非極性共溶劑為己烷、庚烷或甲苯。
在一些實施例中，產物(化合物F)藉由自乙酸乙酯/正庚烷混合物結晶來分離。
在一些實施例中，製備化合物I之方法包含：將化合物F (步驟6)：化合物F 與甲胺反應。
在一些實施例中，使用甲胺2 M於THF。
在一些實施例中，反應在20℃至30℃下進行。此溫度避免了甲胺揮發及壓力積聚。
在一些實施例中，反應處理包含將粗產物溶解於HCl水溶液(例如7 N HCl)及用非極性溶劑洗滌。在一些實施例中，非極性溶劑為二氯甲烷，其有效地將剩餘雜質由先前步驟移除。隨後，將粗產物用NaOH水溶液中和及分離產物。
在一些實施例中，化合物I之所需形式(形式VII)由自乙醇(EtOH)及甲基第三丁基醚(MTBE)結晶獲得。
在一些實施例中，為了移除任何剩餘HCl，可將經乾燥的化合物I溶解於乙醇中，用氫氧化鈉於乙醇中之溶液處理，接著添加處理水，以使產物沈澱。
在一些實施例中，將用化合物I形式VII接種來結晶，以確保形成所需多晶型物。
在一些實施例中，沈澱藉由以下進行：(1)冷卻化合物I之乙醇溶液，(2)將化合物I形式VII之晶種添加至溶液，(3)將混合物攪拌約10小時，(4)進一步冷卻混合物及添加MTBE，(5)攪拌約3至5小時，以使化合物I形式VII沈澱。
在一些實施例中，可添加MBTE，隨後添加化合物I形式VII之晶種。
本文揭示一種製備化合物I之結晶固體形式之方法。相同化合物之結晶形式通常具有不同特性，包括吸濕性、溶解性及穩定性。具有高熔點之多晶型物通常具有良好的熱力學穩定性，其有利於延長含化合物之固體形式之調配物的儲存期限。具有較低熔點之多晶型物通常在熱力學上較不穩定，但有利於增加水溶性，通常轉變為增加之化合物的生物可用性。吸濕性差的多晶型物通常對熱及潮濕更穩定及在儲存期間對降解具有抗性。無水多晶型物通常為有利的，因為其可一致地製備，由於溶劑及水含量變化而組成無變化或變化較小。
化合物I可以固體結晶形式(稱為形式VII)獲得。形式VII為無水物。形式VII (化合物I之多晶型物)表徵為其XRPD及其他資料。於使用Cu-Kα 輻射管在繞射儀上測定時，化合物I之形式VII表徵為包含以2θ表示之峰的X射線粉末繞射圖(XRPD)，峰在16.5度±0.2度θ。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為於使用Cu-Kα 輻射管在繞射儀上測定時，包含以2θ表示之一或多個峰的X射線粉末繞射圖(XRPD)，峰在7.2、10.3、11.2、12.0、13.8、13.9、15.2、15.6、16.5、17.3、20.7、20.9、21.6及22.5度處，其中每個峰為±0.2度θ。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為於使用Cu-Kα 輻射管在繞射儀上測定時，包含以2θ表示之三個或更多個峰的X射線粉末繞射圖(XRPD)，峰在7.2、10.3、11.2、12.0、13.8、13.9、15.2、15.6、16.5、17.3、20.7、20.9、21.6及22.5度處，其中每個峰為±0.2度θ。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為於使用Cu-Kα 輻射管在繞射儀上測定時，包含以2θ表示之六個或更多個峰的X射線粉末繞射圖(XRPD)，峰在7.2、10.3、11.2、12.0、13.8、13.9、15.2、15.6、16.5、17.3、20.7、20.9、21.6及22.5度處，其中每個峰為±0.2度θ。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為於使用Cu-Kα 輻射管在繞射儀上測定時，包含以2θ表示之十個或更多個峰的X射線粉末繞射圖(XRPD)，峰在7.2、10.3、11.2、12.0、13.8、13.9、15.2、15.6、16.5、17.3、20.7、20.9、21.6及22.5度處，其中每個峰為±0.2度θ。
在一些實施例中，在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為於使用Cu-Kα 輻射管在繞射儀上測定時，包含以2θ表示之峰的X射線粉末繞射圖(XRPD)，峰在7.2、10.3、11.2、12.0、13.8、13.9、15.2、15.6、16.5、17.3、20.7、20.9、21.6及22.5度處，其中每個峰為±0.2度θ。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為於使用Cu-Kα 輻射管在繞射儀上測定時，實質上如圖1中所示之X射線粉末繞射圖(XRPD)。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為具有在約205℃之溫度下之吸熱峰的差示掃描熱量測定(DSC)溫度記錄圖。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為實質上如圖2中所示之差示掃描熱量測定(DSC)溫度記錄圖。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為實質上如圖3中所示之熱解重量分析(TGA)溫度記錄圖。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為包含以約3066 cm- 1 及1600 cm- 1 之IR波段的紅外(IR)光譜。
在一些實施例中，化合物I之形式VII表徵為實質上如圖4中所示之紅外(IR)光譜。 本文亦揭示適用於合成BET溴結構域抑制劑的中間物，諸如化合物B：(化合物B) 及化合物C：(化合物C)。
在一個實施例中，本文揭示一種製備調節或抑制含BET溴結構域蛋白質(諸如BRD2、BRD3、BRD4及BRDT)之活性之治療劑(化合物I)的方法，治療劑具有治癒、治療或改善患有由含溴結構域蛋白質介導之疾病(諸如癌症、自體免疫及心血管疾病)之患者生活的可能。
一個實施例係關於治療對其有需要之個體之至少部分地由含BET溴結構域蛋白質介導之疾病的方法，其包含投與治療有效量之呈結晶形式VII的化合物I。
在一個實施例中，疾病選自癌症、發炎疾病及心血管疾病。
在一個實施例中，疾病為癌症，包括B急性淋巴球性白血病、伯基特氏淋巴瘤、瀰漫大細胞淋巴瘤、多發性骨髓瘤、原發性漿細胞白血病、肺癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸癌、結腸癌、胃癌、神經膠母細胞瘤、前列腺癌、卵巢癌或神經母細胞瘤。
在一個實施例中，疾病為前列腺癌。
在一個實施例中，疾病為去勢抵抗性前列腺癌(castration-resistant prostate cancer)。
在一個實施例中，疾病為轉移性去勢抵抗性前列腺癌。
在一個實施例中，疾病為為乳癌。
在一個實施例中，疾病為為三陰性乳癌。
在一個實施例中，疾病為雌激素受體陽性乳癌。
在一個實施例中，個體為人類。
當治療對其有需要之個體之至少部分地由含BET溴結構域蛋白質介導的疾病時，個體可能受益於組合藥物治療。舉例而言，本文所述之化合物I的一或多種形式可與一或多種治療劑以單一組合物形式組合或呈單獨投與之組合物，組合物可同時、依序或依照指定治療方案投與。
在一個實施例中，本文所述之化合物I的形式可與一或多種額外治療劑依序投與。依序意謂將化合物I之一或多種形式與一或多種額外治療劑以數秒(例如15秒、30秒、45秒、60秒或更低)、若干分鐘(例如1分鐘、2分鐘、5分鐘或更低、10分鐘或更低、15分鐘或更低)、1至8小時、1至7天或1至4週之時間間隔投與。當依序投與時，本文所述之化合物I的一或多種形式與額外治療劑可以兩種或更多種投與方式投與，且含於獨立組合物或劑型中，組合物或劑型可含於相同封裝或不同封裝中。
在一個實施例中，本文所述之化合物I的一或多種形式可與用於治療癌症之一或多種治療劑組合。
在一個實施例中，本文所述之具有形式VII的化合物I可與用於治療癌症之一或多種治療劑組合。
在一個實施例中，本文所述之具有形式VII的化合物I可與選自以下之治療劑組合：雄激素受體拮抗劑、雄激素合成抑制劑、芳香酶抑制劑、選擇性雌激素受體調節劑、選擇性雌激素下調劑、聚ADP核糖聚合酶(PARP)抑制劑或免疫治療劑。
在一個實施例中，本文所述之具有形式VII的化合物I可與選自以下之治療劑組合：阿比特龍(Abiraterone)(茲替伽(Zytiga))、恩雜魯胺(Enzalutamide)(安可坦(Xtandi))、阿帕魯胺(Apalutamide)(ARN-509，Erleada)、達諾米德(Darolutamide)、氟維司群(Fulvestrant)、依西美坦(Exemestane)、他拉唑帕尼(Talazoparib)、奧拉帕尼(Olaperib)、維利帕尼(Veliparib)、蘆卡帕尼(Rucaparib)、他拉唑帕尼(Talazoparib)、尼拉帕尼(Niraparib)、帕博利珠單抗(Pembrolizumab)、納武單抗(Nivolumab)、德瓦魯單抗(Durvalumab)及利妥昔單抗(Rituximab)。
實施例的清單包括： 1. 一種具有下式之化合物的固體形式：化合物I 其中固體形式為結晶。 2. 如實施例1之固體形式，其為無水物。 3. 如實施例1之固體形式，其中固體形式為形式VII。 4. 如實施例3之固體形式，其於使用Cu-Kα 輻射管在繞射儀上測定時，具有以2θ表示之三個或更多個特徵XRPD峰，峰在7.2、10.3、11.2、12.0、13.8、13.9、15.2、15.6、16.5、17.3、20.7、20.9、21.6及22.5度處。 5. 如實施例3之固體形式，其於使用Cu-Kα 輻射管在繞射儀上測定時，具有以2θ表示之六個或更多個特徵XRPD峰，峰在7.2、10.3、11.2、12.0、13.8、13.9、15.2、15.6、16.5、17.3、20.7、20.9、21.6及22.5度處，其中每個峰為±0.2度θ。 6. 如實施例1至3中任一項之固體形式，其具有實質上類似於圖1中所示之XRPD圖。 7. 如實施例1至6中任一項之固體形式，其具有在約205℃之溫度下之吸熱峰的DSC溫度記錄圖。 8. 如實施例1至6中任一項之固體形式，其具有實質上類似於圖2中所示之DSC溫度記錄圖。 9. 如實施例1至7中任一項之固體形式，其具有實質上類似於圖3中所示之TGA溫度記錄圖。 10. 一種醫藥組合物，其包含如實施例1至9中任一項之固體形式及至少一種醫藥學上可接受之載劑。 11. 一種治療癌症之方法，其包含向需要此類治療之個體投與治療有效量之如實施例1至9中任一項之固體形式或如實施例10之醫藥組合物。 12. 如實施例11之方法，其中癌症為B急性淋巴球性白血病、伯基特氏淋巴瘤、瀰漫大細胞淋巴瘤、多發性骨髓瘤、原發性漿細胞白血病、肺癌、膀胱癌、乳癌、子宮頸癌、結腸癌、胃癌、神經膠母細胞瘤、前列腺癌、卵巢癌或神經母細胞瘤。 13. 如實施例12之方法，其中癌症為前列腺癌。 14. 如實施例12之方法，其中癌症為去勢抵抗性前列腺癌。 15. 如實施例12之方法，其中癌症為轉移性去勢抵抗性前列腺癌。 16. 如實施例12之方法，其中癌症為為乳癌。 17. 如實施例12之方法，其中癌症為為三陰性乳癌。 18. 如實施例12之方法，其中癌症為雌激素受體陽性乳癌。 19. 一種治療發炎疾病之方法，其包含向需要此類治療之患者投與治療有效量之如實施例1至9中任一項之固體形式或實施例10之醫藥組合物。 20. 一種治療心血管疾病之方法，其包含向需要此類治療之患者投與治療有效量之如實施例1至9中任一項之固體形式或實施例10之醫藥組合物。 21. 如實施例11之方法，其中個體為人類。 22. 一種製備結晶化合物I之形式VII的方法：(化合物I) 其包含由包含化合物I及一或多種溶劑沈澱形式VII。 23. 如實施例22之方法，其中溶劑為乙醇、第三丁基甲基醚(MTBE)或其混合物。 24. 如實施例22之方法，其中沈澱藉由以下進行： (1)冷卻化合物I之乙醇溶液； (2)將化合物I形式VII之晶種添加至溶液； (3)將混合物攪拌約10小時； (4)進一步冷卻混合物及添加MTBE；及 (5)攪拌約3至5小時，以使化合物I形式VII沈澱。 25. 如實施例24之方法，其中添加MTBE，隨後將化合物I形式VII之晶種添加至混合物中。 26. 一種製備化合物I之方法化合物I 其包含步驟(a)至(d)： (a) 將(化合物C) 與化合物G：(化合物G) 反應產生化合物D：化合物D； (b)將化合物D：(化合物D) 與第一試劑反應產生化合物E：(化合物E)； (c)將化合物E：(化合物E) 與氯化劑反應產生化合物F：(化合物F)；及 (d)將化合物F：(化合物F) 與甲胺反應。 27. 如實施例26之方法，其中步驟(a)在過渡金屬催化劑及鹼存在下進行。 28. 如實施例27之方法，其中過渡金屬催化劑為鈀催化劑。 29. 如實施例28之方法，其中鈀催化劑為Pd(PPh3 )4 。 30. 如實施例27之方法，其中鹼為鹼金屬碳酸鹽。 31. 如實施例27之方法，其中鹼為K3 PO4 。 32. 如實施例26之方法，其中步驟(b)中之第一試劑為羰基二咪唑(CDI)，及步驟(b)在溶劑中進行。 33. 如實施例32之方法，其中溶劑為非質子性溶劑。 34. 如實施例32之方法，其中溶劑為DMSO。 35. 如實施例32之方法，其中步驟(b)包含將水添加至反應混合物中及使化合物E沈澱。 36. 如實施例26之方法，其中步驟(c)在鹼存在下進行。 37. 如實施例36之方法，其中氯化劑為磷醯氯(POCl3 )。 38. 如實施例36之方法，其中鹼為N,N-二異丙基乙胺(DIPEA)。 39. 如實施例36之方法，其中相對於化合物E，使用4至5或8至9莫耳當量之POCl3 及1.0至1.1或2.5莫耳當量之DIPEA。 40. 如實施例36之方法，其進一步包含與乙酸乙酯共蒸餾，隨後用NaHCO3 溶液淬滅反應。 41. 如實施例36之方法，其中化合物F藉由自乙酸乙酯/正庚烷混合物結晶來分離。 42. 如實施例26之方法，其中步驟(d)使用甲胺2 M於THF中進行。 43. 如實施例26之方法，其中步驟(d)在20℃至30℃下進行。 44. 如實施例26之方法，其中步驟(d)進一步包含反應處理，其包含將粗產物溶解於HCl水溶液中及用非極性溶劑洗滌，接著用NaOH水溶液中和。 45. 如實施例26之方法，其中步驟(d)進一步包含移除任何剩餘HCl，其包含將經乾燥的物質溶解於乙醇中，用氫氧化鈉於乙醇中之溶液處理，接著添加水，以使產物沈澱。 46. 如實施例26之方法，其中化合物C藉由以下製備 (e)將化合物B：(化合物B) 與NaBH4 在溶劑中反應。 47. 如實施例46之方法，其中溶劑為醇。 48. 如實施例46之方法，其中溶劑為乙醇。 49. 如實施例46之方法，其中相對於化合物B，使用0.6莫耳當量之NaBH4 。 50. 如實施例46之方法，其進一步包含處理及分離，其包含添加HCl溶液以淬滅反應，接著添加水，以使化合物C沈澱。 51. 如實施例46之方法，其中化合物B藉由以下製備： 將化合物A：(化合物A) 與苯甲醛在酸存在下反應。 52. 如實施例51之方法，其中酸為乙酸。 53. 如實施例51之方法，其進一步包含溶劑，其中溶劑為甲醇。 54. 如實施例51之方法，其進一步包含在反應完成之後，將NaHCO3 溶液添加至反應混合物中，以使化合物B沈澱。 實例
通用方法：在Nicolet 380 FT-IR分光光度計上獲得化合物I之FT-IR。在TA Q5000儀器熱解重量分析儀上進行TGA分析。在TA Q2000儀器差示掃描量熱計(30℃至300℃，以10℃/分鐘)上進行DSC分析。在Bruker儀器D8先進繞射儀或類似物上獲得化合物I之XRPD圖，主要使用以下設置：40 KV、40 mA、Kα =1.5406 A (Cu-Kα 輻射管)、掃描範圍4至40度2θ、15 rpm、10度/分鐘。在Bruker AV400 MHz光譜儀上記錄NMR實驗。
實例 1 ：合成 5- 溴 -N3 -( 苯基亞甲基 ) 吡啶 -2,3- 二胺 ( 化合物 B) 在反應器中，將化合物A (12.47 kg)溶解於甲醇(100 kg)及乙酸(2.3 kg)中。將溶液冷卻至0℃至5℃及攪拌0.5至1小時，及歷經2小時逐滴添加苯甲醛(56.4 g)。一旦反應完成(5至10小時)，則歷經2小時添加水(53 kg)，及歷經2小時逐滴添加NaHCO3 溶液(7%於水中)，保持低溫(0℃至5℃)。將混合物攪拌3小時。濾出固體及用甲醇/水(1:1)洗滌，接著乾燥，藉由HPLC得到產率為94%及純度為+99%之化合物B。1 H-NMR (DMSO-d6 ): δ 8.75 (1H), 8.04 (2H), 7.93 (1H), 7.65 (1H), 7.50-7.60 (3H)。
實例 2 ：合成 N3 - 苯甲基 -5- 溴吡啶 -2,3- 二胺 ( 化合物 C) 將化合物B (17.1 kg)溶解於乙醇(140 kg)中及逐份添加NaBH4 (1.4 kg)，保持溫度為15℃與25℃之間。將反應混合物攪拌8至15小時，直至由HPLC監測到反應完成。添加HCl溶液(2 N，12 kg)，將pH調節為6至7，接著歷經5小時逐滴添加水(350 kg)，保持溫度為15℃與25℃之間。將混合物攪拌1至5小時，過濾及用乙醇/水混合物(1:1比率，50 kg)洗滌。將固體在約60℃下乾燥15至20小時後，得到化合物C (產率：14.35 kg (83%)，純度：99%)。1 H-NMR (DMSO-d6 ): δ 7.2-7.4 (6 H), 6.55 (1 H), 5.70-5.83 (3 H), 4.30 (2 H)。
實例 3 ：合成 N3 - 苯甲基 -5-(3,5- 二甲基 -1,2- 噁唑 -4- 基 ) 吡啶 -2,3- 二胺 ( 化合物 D) 將化合物C(14.2 kg)、化合物G(14.8 kg)及磷酸三鉀三水合物(22.0 kg)混合，接著添加1,4-二噁烷(145 kg)及水(28 kg)，及攪拌1至2小時。將所得混合物用氮氣充分吹掃。添加肆(三苯基膦)鈀(0) (2.9 kg)，及將溶液用氮氣充分吹掃，及加熱至90℃至95℃，直至由HPLC量測之化合物C與化合物D的比率不超過1% (16至20小時)。冷卻至20℃至30℃後，將反應混合物過濾，用1,4-二噁烷(25 kg)洗滌固體，移除水相，及濃縮有機相。在40℃至45℃下添加水(96 kg)，將混合物冷卻至20℃至25℃，及攪拌混合物1至2小時，直至母液中之剩餘化合物D的量不超過0.5%。藉由過濾分離化合物D及將其用1,4-二噁烷/水(1:2比率，25 kg)及第三丁基甲基醚(27 kg)依序洗滌。在40℃至45℃下，將濕濾餅在二氯甲烷(658 kg)中混合，直至所有固體溶解及添加矽膠(7.0 kg)。攪拌0.5至1小時後，將混合物冷卻至20℃至25℃，過濾，用二氯甲烷(85 kg)洗滌，隨後濃縮。在35℃至40℃下，將混合物冷卻及逐滴添加第三丁基甲基醚(56 kg)。將反應器冷卻至5℃至10℃及攪拌2至3小時。藉由過濾分離產物，用甲基第三丁基醚洗滌及乾燥，直至二氯甲烷、第三丁基甲基醚及水分含量不超過0.5%，得到化合物D (產量：9.7 kg (65%)，純度：99%)。1 H-NMR (DMSO-d6 ): δ 7.30-7.45 (4 H), 7.20-7.25 (2 H), 6.35 (1 H), 5.65-5.80 (3 H), 4.30-4.40 (2 H), 2.15 (3 H), 1.95 (3 H)。或者在30℃至40℃下，可將用1,4-二噁烷/水及MTBE依序洗滌後獲得之濕濾餅使用乙醇(5體積)漿料純化1至3小時，接著乾燥，直至水分含量不超過0.5%及乙醇含量不超過0.5%。
實例 4 ：合成 1- 苯甲基 -6-(3,5- 二甲基 -1,2- 噁唑 -4- 基 )-3H- 咪唑并 [4,5-b] 吡啶 -2- 酮 ( 化合物 E) 將羰基二咪唑固體(8.4 kg)添加(CDI可分批添加)至化合物D (10.0 kg)與二甲基亞碸(35 kg)之攪拌混合物中。將混合物加熱至55℃至60℃持續1至3小時或35℃至40℃，直至化合物D與化合物E之比率為NMT 0.5%。將混合物冷卻至35℃至40℃及歷經4小時添加水。將所得混合物在環境溫度下攪拌3小時。藉由過濾分離產物及用水洗滌。在使用加熱及真空乾燥之前，二甲基亞碸經檢驗為NMT 0.5%。當水分含量為NMT 0.5%時，乾燥完成。得到化合物E (產量：9.8 kg (94%)，純度：99.9%)。1 H-NMR (DMSO-d6 ): δ 11.85 (1 H), 7.90 (1 H), 7.20-7.45 (6 H), 5.05 (2 H), 3.57 (3 H), 2.35 (3 H), 2.15 (3 H)。
實例 5 ：合成 4-[1- 苯甲基 -2- 氯 -1H- 咪唑并 [4,5-b] 吡啶 -6- 基 ]-3,5- 二甲基 -1,2- 噁唑 ( 化合物 F) 將化合物E (9.6 kg)與氧氯化磷(40 kg)混合，及隨後在50℃下用二異丙基乙基胺(DIPEA) (9.8 kg)逐滴處理。將所得混合物加熱至95℃至100℃持續60至70小時。反應完成後，將混合物濃縮，隨後冷卻。添加乙酸乙酯及將混合物在真空下濃縮3次，與乙酸乙酯共蒸餾。將乙酸乙酯(EtOAc) (114 kg)添加至濃縮物中，將混合物冷卻至環境溫度，及隨後緩慢添加至碳酸氫鈉水溶液(7%)，保持混合物為15℃與25℃之間。分離有機相且將有機層用碳酸氫鈉水溶液(7%)洗滌，及隨後用水洗滌。濃縮有機相，添加乙酸乙酯(288 kg)，及將混合物濃縮以確保水分含量不超過0.2%。將混合物於乙酸乙酯用碳(CUNO，含有1.2 kg活性碳)脫色。將混合物濃縮及添加正庚烷(23 kg)。藉由過濾分離產物及在真空下乾燥。當殘餘水分、乙酸乙酯及正庚烷不超過0.5%時，乾燥完成。得到化合物F (4.95 kg，46%，純度：95%)。1 H-NMR (MeOH-d4 ): δ 8.40 (1 H), 7.90 (1 H), 7.25-7.45 (5 H), 5.65 (2 H), 2.37 (3 H), 2.22 (3 H)。
實例 6 ： 1- 苯甲基 -6-(3,5- 二甲基 -1,2- 噁唑 -4- 基 )-N- 甲基 -1H- 咪唑并 [4,5-b] 吡啶 -2- 胺 ( 化合物 I) 將化合物F (4.54 kg)與甲胺於四氫呋喃(THF) (31.9 kg，2 M)中混合及在環境溫度下攪拌，直至由HPLC之化合物F與化合物I的比率為NMT 0.1%。反應完成後，將混合物在真空下濃縮，逐滴添加水(34 kg)以保持環境溫度，攪拌1至1.5小時，及藉由過濾分離產物。將濾餅用水洗滌。將濕濾餅放入反應器中及添加水(17 kg)，及添加鹽酸(36 kg，35%)且攪拌2小時，以使固體溶解。將所得溶液用二氯甲烷洗滌兩次，以移除雜質。將水溶液藉由歷經1.5小時逐滴添加氫氧化鈉溶液(14.5 kg，15%)中和，及攪拌5小時。藉由過濾分離化合物I，用水洗滌及在真空下乾燥。為了移除任何剩餘鹽酸，必要時可將經乾燥的物質溶解於乙醇(13.4 kg)中，用氫氧化鈉於乙醇中之溶液(0.2 kg NaOH於4 kg乙醇)處理，及攪拌1小時，接著添加水(70 kg)，以使產物沈澱。藉由過濾分離化合物I，用水洗滌及乾燥。必要時可將化合物I藉由漿料於熱水中進一步純化。
將乾化合物I溶解於乙醇(16.2 kg)中，及將所得溶液過濾至無塵室中。將乙醇溶液用純乙醇共沸型乾燥。將所得混合物加熱以溶解產物及濃縮。將混合物加熱，以回流溶解任何固體及用接種(化合物I形式VII)緩慢冷卻。在50℃至60℃下，將混合物攪拌10小時。XRPD表示形式VII。將混合物進一步冷卻至45℃至50℃，及在45℃至50℃下攪拌3小時，固體XRPD表示形式VII。在45℃至50℃下，逐滴添加第三丁基甲基醚(MTBE) (26 kg)持續至少4小時及在45℃至50℃下攪拌1小時。將混合物冷卻至20℃至30℃持續3小時及在20℃至30℃下攪拌2小時。過濾固體且用MTBE沖洗及乾燥，得到化合物I形式VII (2.82 kg，63%，純度＞99%)。1 H-NMR (DMSO-d6 ): δ 7.96 (d, 1H, J=2.0 Hz), 7.42 (d, 1H, J=2.0 Hz), 7.37 (q, 1H, J=4.2 Hz), 7.32 (m, 2H), 7.26 (m, 1H), 7.24 (m, 2H), 5.30 (s, 2H), 3.00 (d, 3H, 4.5 Hz), 2.34 (s, 3H), 2.16 (s, 3H). 13C-NMR (DMSO- d6): d 164.8, 158.4, 157.7, 156.0, 141.1, 136.4, 128.6 (2C), 127.5, 127.4, 127.2 (2C), 115.8, 114.2 (2C), 44.5, 29.3, 11.2, 10.3)。或者，可添加MTBE，隨後將化合物I形式VII之晶種添加至混合物中。
圖1展示了化合物I形式I之X射線粉末繞射圖(XRPD)。
圖2展示了化合物I形式VII之差示掃描量熱計(DSC)曲線。
圖3展示了化合物I形式VII之熱解重量分析(TGA)。
圖4展示了化合物I形式VII之紅外光譜(IR)。

Claims (21)

  1. 一種製備化合物I之方法 化合物I 其包含步驟(a)至(d)： (a) 將 (化合物C) 與化合物G： (化合物G) 反應產生化合物D： 化合物D； 其中步驟(a)在Pd(PPh 3) 4及鹼K 3PO 4存在下，以及80℃至100℃下進行； (b)將化合物D： (化合物D) 與羰基二咪唑(CDI)反應產生化合物E： (化合物E)； 其中步驟(b)在DMSO中，以及30℃至70℃下進行； (c)將化合物E： (化合物E) 與氯化劑反應產生化合物F： (化合物F)；及 (d)將化合物F： (化合物F) 與甲胺反應。
  2. 如請求項1之方法，其中步驟(b)包含將水添加至反應混合物中及使化合物E沈澱。
  3. 如請求項1之方法，其中步驟(c)在鹼存在下進行。
  4. 如請求項3之方法，其中該氯化劑為磷醯氯(POCl 3)。
  5. 如請求項3之方法，其中該鹼為N,N-二異丙基乙胺(DIPEA)。
  6. 如請求項3之方法，其中相對於化合物E，使用8至9莫耳當量之POCl 3及2.5莫耳當量之DIPEA。
  7. 如請求項3之方法，其進一步包含與乙酸乙酯共蒸餾，隨後用NaHCO 3溶液淬滅該反應。
  8. 如請求項3之方法，其中化合物F藉由自乙酸乙酯/正庚烷混合物結晶來分離。
  9. 如請求項1之方法，其中步驟(d)使用含甲胺2 M之THF進行。
  10. 如請求項1之方法，其中步驟(d)在20℃至30℃下進行。
  11. 如請求項1之方法，其中步驟(d)進一步包含反應處理，其包含將粗產物溶解於HCl水溶液中及用非極性溶劑洗滌，接著用NaOH水溶液中和。
  12. 如請求項1之方法，其中步驟(d)進一步包含移除任何剩餘HCl，其包含將經乾燥的物質溶解於乙醇中，用氫氧化鈉於乙醇中之溶液處理，接著添加水，以使產物沈澱。
  13. 如請求項1之方法，其中化合物C藉由以下製備 (e)將化合物B： (化合物B) 與NaBH 4在溶劑中反應。
  14. 如請求項13之方法，其中該溶劑為醇。
  15. 如請求項13之方法，其中該溶劑為乙醇。
  16. 如請求項13之方法，其中相對於化合物B，使用0.6莫耳當量之NaBH 4。
  17. 如請求項13之方法，其進一步包含處理及分離，其包含添加HCl溶液以淬滅該反應，接著添加水，以使化合物C沈澱。
  18. 如請求項13之方法，其中化合物B藉由以下製備： (f)將化合物A： (化合物A) 與苯甲醛在酸存在下反應。
  19. 如請求項18之方法，其中該酸為乙酸。
  20. 如請求項18之方法，其進一步包含溶劑，其中該溶劑為甲醇。
  21. 如請求項18之方法，其進一步包含在反應完成之後，將NaHCO 3溶液添加至該反應混合物中，以使化合物B沈澱。
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