WO2020025801A1 - Behandlung von immunerkrankungen durch die antikörpervermittelte neutralisierung spezifischer darmbakterien - Google Patents

Behandlung von immunerkrankungen durch die antikörpervermittelte neutralisierung spezifischer darmbakterien Download PDF

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Daniel Christoph WAGNER
Armin Braun
Christina HESSE
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    • C07K2317/76—Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding

Definitions

  • the present invention relates to the treatment of immune diseases and other diseases by the antibody-mediated neutralization of specific intestinal bacteria.
  • the invention relates to antibodies or an antigen-binding fragment thereof, the antibody or the antigen-binding fragment binding to an antigen of the bacterium Candidatus Savagella and (i) inhibiting the adhesion of the bacterium to intestinal epithelial cells, preferably human intestinal epithelial cells, and / or (ii) the bacterium is depleted.
  • the invention further provides a pharmaceutical composition comprising the antibody according to the invention or an antigen-binding fragment thereof, or comprising an antibody which is produced by the method according to the invention.
  • the invention relates to a kit comprising an antibody according to the invention or an antigen-binding fragment thereof for reducing Th 17 cell proliferation, Th 17 cell differentiation or Th 17 cell activity, and / or inhibiting the formation of antibodies against the body's own antigens by B cells.
  • the kit according to the invention optionally contains an antibiotic.
  • the invention also provides a method for producing an antibody according to the invention, the method comprising: a) immunizing chickens with an immunogenic peptide from an antigen of the bacterium Candidatus Savagella; and b) recovering and purifying the antibodies produced in the chickens or in an egg laid by these chickens.
  • the invention relates to a method for producing a medicament according to the invention, comprising: a) producing an antibody according to the invention or an antigen-binding fragment thereof; and b) formulation of the antibody or an antigen-binding fragment thereof as a medicament.
  • dysbiosis a disturbed homeostasis between the microbiome and the immune system
  • Other causes of dysbiosis can be a change in colon colonization after birth, for example after caesarean section, and due to increased hygiene in the living environment.
  • the human microbiome however, has a significant influence on the expression of immune reactions [1]. Certain bacteria, which are non-pathological per se, can nevertheless have an immunoregulatory or immunostimulatory influence.
  • Candidatus Savagella American “segmented filamentous bacteria”, SFB
  • SFB single-chain bacterium
  • Th 17 cells which in turn can fight harmful intestinal bacteria.
  • the same immune cells are also responsible for the development and progression of immune-mediated diseases such as autoimmune diseases and atopies.
  • experimental animals without SFB colonization have significantly lower symptoms in animal models of rheumatoid arthritis, multiple sclerosis and allergic asthma [2-4]
  • Candidatus Savagella produces an ongoing physiological inflammatory reaction in the intestinal mucosa, which leads to an overall strengthening Immune defense against pathological intestinal germs.
  • This evolutionarily conserved concept can be excessively harmful (eg in the case of dysbiosis) and lead to immune-mediated diseases in the rest of the body [1]
  • this connection has increasingly been taken up by basic science and published with high priority [2; 3; 11-13]
  • WO 2011/047153 describes a modulation of the Thl7 immune response, inter alia by influencing the adherence and proliferation of SFB.
  • the invention thus relates to an antibody or an antigen-binding fragment thereof, the antibody or the antigen-binding fragment binding to an antigen of the bacterium Candidatus Savagella and (i) inhibiting the adhesion of the bacterium to intestinal epithelial cells, preferably human intestinal epithelial cells, and / or (ii) the bacterium is depleted.
  • the antibody or the antigen-binding fragment preferably binds to an antigen of the bacterium Candidatus Savagella and inhibits the adhesion of the bacterium to intestinal epithelial cells, preferably human intestinal epithelial cells, and depletes the bacterium.
  • An antibody according to the invention or an antigen-binding fragment thereof binds specifically to an antigen of the bacterium Candidatus Savagella (English “segmented filamentous bacteria”, SFB), preferably to a bacterial wall protein.
  • the antigen is chosen so that the binding of the antibody according to the invention or the antigen-binding fragment thereof inhibits the adhesion of the bacterium to intestinal epithelial cells or depletes the bacterium.
  • the binding of the antibody according to the invention or of the antigen-binding fragment thereof to the antigen can also inhibit the proliferation of the bacterium. Combinations of these mechanisms are also included in the sense of the invention.
  • the antigen can be selected such that the antibody according to the invention binds the antigen of the bacterium Candidatus Savagella and inhibits the adhesion of the bacterium to intestinal epithelial cells and depletes the bacterium.
  • the antigen can be chosen so that the antibody according to the invention binds the antigen of the bacterium Candidatus Savagella and inhibits the adhesion of the bacterium to intestinal epithelial cells and inhibits the proliferation of the bacterium.
  • a combination of all three mechanisms is also included, so that the antigen is determined such that the antibody or the antigen-binding fragment according to the invention binds to the antigen of the bacterium Candidatus Savagella and inhibits the adhesion of the bacterium to intestinal epithelial cells, and inhibits the proliferation of the bacterium , and the bacterium is depleted.
  • SFB-specific antibodies were obtained from the eggs of chickens immunized with SFB proteins; this method enables the fast and very cost-effective generation of strong binding antibodies, which also have special acid stability and are therefore well suited for oral treatment [5]
  • FIG. 1 Filiform Candidatus Savagella bacteria (“segmented filamentous bacteria”, SFB) colonize the intestinal wall and activate Thl7 cells via dendritic cells, which contribute to autoimmunity and atopy.
  • SFB mented filamentous bacteria
  • suitable bacterial wall proteins of the named bacterium are identified, synthesized and injected into chickens.
  • the chickens form highly specific, neutralizing anti-SFB antibodies, which can be isolated from the eggs and are available for oral antibody therapy.
  • a reduction in the number of SFB bacteria in the intestine can lead to a reduction in Thl7 effector cell activity and thus to immune tolerance.
  • a specific neutralization of SFB with orally administered antibodies has the great advantage that there is practically no transfer of the antibodies into the circulation and thus frequent side effects of antibody therapy can be avoided, or side effects such as those observed with dexamethasone for allergic respiratory diseases .
  • Examples of the successful oral use of antibodies for the reduction of intestinal pathogenic viruses [14], fungi [15] and bacteria [16; 17] have already been described.
  • Oral antibody therapies with the aim of immunomodulation have so far only been carried out with the direct target of the immune system.
  • a successful example of this is the use of antibodies against the T cell surface protein CD3 ([18]; US 7,883,703 B2).
  • a major advantage of this invention is the use of therapeutic IgY antibodies from the eggs of immunized chickens.
  • This method offers numerous advantages: In addition to a very The antibodies can be produced quickly and in large quantities at low cost. lgY are more acid-resistant than lgG and are therefore particularly suitable for oral application. A chicken can produce up to 30 g of pure antibody per year, which is also highly binding. Finally, IgY have a different Fc region than mammalian IgG; there are therefore no side effects due to activation of the recipient complement system [5]
  • IgY antibody-mediated inhibition of the bacterium Candidatus Savagella can have a direct influence on immune-mediated diseases.
  • Immune diseases such as multiple sclerosis, rheumatoid arthritis and allergic asthma are largely determined by the activity of Th 17 immune cells.
  • Th 17 activity can also be treated preventively or therapeutically by depleting SFB.
  • IgY antibodies are conceivable as a medicament for the prevention or therapy of immune-mediated diseases, in particular Th 17 dependent diseases. This is said to be a therapeutic agent for microbiome correction. This can also be used as "functional food” or “nutraceutical”, so that there may be options for a greatly simplified approval, for example as "novel food”.
  • the antibodies according to the invention are preferably used for oral administration in humans.
  • the bacterium "Candidatus Savagella” (English “segmented filamentous bacteria", SFB) is for example by Schnupf et al. (Curr Opin Microbiol. 2017 Feb; 35: 100-109. Doi: l0.l0l6 / j.mib.20l7.03.004. Epub 2017 Apr 25; Semin Immunol. 2013 Nov 30; 25 (5): 342-51. Doi : l0.l0l6 / j.smim.20l3.09.00l. Epub 2013 Oct 31) and in US 2012/276149 and WO 2011/047153.
  • the “antigen” of the bacterium Candidatus Savagella which is specifically bound by the antibody according to the invention or the antigen-binding fragment of the antibody, is involved in the attachment of the bacterium to intestinal epithelial cells, preferably human Intestinal epithelial cells, the proliferation of the bacterium, and / or mediates depletion, that is, killing the bacterium.
  • a suitable antigen from Candidatus Savagella bacteria is selected from the group of function-determining and “segmented filamentous bacteria” (SFB) -specific proteins.
  • Such a protein is characterized, for example, by the fact that it is resistant to the bacteria (bacterial wall protein) and has an essential or even unique role for adherence to the intestinal epithelium and / or the survival of Candidatus Savagella or "segmented filamentous bacteria" (SFB).
  • a suitable antigen from the bacterium mentioned is, for example, the “myosin-cross-reactive antigen” (MCRA) protein described in more detail below, the amino acid sequence of which is shown in SEQ ID No. 1.
  • MCRA myosin-cross-reactive antigen
  • Specific epitopes from the "myosin cross-reactive antigen” (MCRA) protein include e.g. the amino acid sequence SVLDEFYWLDKKDPYSL (SEQ ID No. 2), PDFKAVRFTRRNQYESMI (SEQ ID No. 3), or QATSIKILRDGKEEEIKL (SEQ ID No. 4).
  • “Specific binding” of the antibody according to the invention or a fragment thereof to an antigen from the bacterium describes the binding properties of the antibody, such as binding affinity, binding specificity and binding avidity; see e.g. David J. King, Applications and Engineering of Monoclonal Antibodies, pp. 240 (1998).
  • Detailed analyzes of antigen-antibody interactions are possible, for example, with surface plasmon resonance (SPR).
  • SPR surface plasmon resonance
  • the kinetic characterization of the binding properties of antibodies and their antigens is an essential prerequisite for evaluating their applicability for different methods.
  • the rate constants for association kass
  • dissociation kdiss
  • antibody encompasses both a polyclonal and a monoclonal antibody (mAb), which can be modified, as described below.
  • the antibody specifically binds to an antigen of the bacterium Candidatus Savagella and is preferably a neutralizing antibody.
  • Neutralizing antibody means the inhibition of the adhesion or binding of the bacterium Candidatus Savagella to (preferably human) intestinal epithelial cells, the inhibition of the proliferation of the bacterium mentioned and / or its depletion or killing by the antibody.
  • Candidatus Savagella means at least 50%, 60%, 70% or 75%, preferably 80% or 85%, particularly preferably 90% or 95% inhibition of the attachment or binding of the bacterium mentioned to intestinal epithelial cells, or the inhibition of Proliferation of the bacterium, or that at least 50%, 60%, 70% or 75%, preferably 80% or 85%, particularly preferably 90% or 95% of the total number or population of the bacterium are depleted, measured in in-vitro tests.
  • altered antibody means a protein encoded by an altered immunoglobulin coding region that can be obtained by expression in a selected host cell.
  • altered antibodies include engineered antibodies (e.g., chimeric, reshaped, humanized, or vectorized antibodies) or antibody fragments that lack all or part of a constant immunoglobulin region, such as Fv, Fab or F (ab) 2, and the like.
  • Modified immunoglobulin coding region means a nucleic acid sequence that encodes a modified antibody. If the modified antibody is a CDR-grafted or humanized antibody, the sequences encoding the complementarity-determining regions (CDRs) from a non-human immunoglobulin, such as a chicken antibody, are inserted into a first immunoglobulin partner, the human variable framework sequence includes. The first immunoglobulin partner may be operatively linked to a second immunoglobulin partner, for example in order to produce a bispecific antibody.
  • CDRs complementarity-determining regions
  • First immunoglobulin partner means a nucleic acid sequence encoding a human framework or variable region of a human immunoglobulin, in which the native (or naturally occurring) CDR coding regions are replaced by the CDR coding regions of a donor antibody, e.g. of a chicken antibody.
  • the human variable region can be a heavy chain, a light chain (or both chains) of an immunoglobulin, an analog, or functional fragments thereof.
  • Such CDR regions that are within the variable region of antibodies (immunoglobulins) can be determined by methods known in the art. For example, Kabat et al. (Sequences of Proteins of Immunological Interest, 4th ed., U.S. Department of Health and Human Services, National Institutes of Health (1987)) Rules for focalizing CDRs. In addition, computer programs are known that are useful for identifying CDR regions / structures.
  • “Second immunoglobulin partner” denotes another nucleotide sequence which encodes a protein or peptide to which the first immunoglobulin partner is fused, that is to say operatively linked, in a grid or by means of an optional conventional Finker sequence. It is preferably an immunoglobulin gene.
  • the second immunoglobulin partner can include a nucleic acid sequence that spans the entire constant region for the same (ie homologous - the first and the second modified antibody is from the same source) or an additional (ie heterologous) antibody of interest. It can be a heavy chain or light chain of an immunoglobulin (or both chains as part of a single polypeptide).
  • the second immunoglobulin partner is not limited to any particular immunoglobulin class or isotype.
  • the second immunoglobulin partner can comprise part of a constant region of an immunoglobulin as found in a Fab or F (ab) 2 , ie a discrete part of a human constant region or framework region.
  • Such a second immunoglobulin partner may also include a sequence encoding an integral membrane protein exposed on the outer surface of a host cell, for example as part of a phage display library, or a sequence containing a protein for analytical or diagnostic detection coded, e.g. horseradish peroxidase, ß-galactosidase etc.
  • Fv, Fc, Fd, Fab or F (ab) 2 are used with their standard meanings (see e.g. Harlow et ab, Antibodies A Faboratory Manual, Cold Spring Harbor Faboratory (1988)).
  • a "genetically engineered antibody” describes a type of engineered antibody, i.e. a full-catch synthetic antibody (e.g., a chimeric, unshaped, or humanized antibody as opposed to an antibody fragment) in which part of the variable domains of the light and / or heavy chain of a selected acceptor antibody are replaced by analogue parts from one or more donor antibodies (e.g. Chickens antibodies) that have specificity for the selected epitope.
  • donor antibodies e.g. Chickens antibodies
  • such molecules can include antibodies characterized by a humanized heavy chain associated with an unmodified light chain or (or chimeric light chain), or vice versa.
  • Genetically engineered antibodies can also be characterized by altering the nucleic acid sequences encoding the framework regions of the light and / or heavy variable domain of the acceptor antibody to reflect the donor antibody binding specificity, e.g. of a chicken antibody. These antibodies can replace one (eg CDR-H3) or several CDRs (preferably all CDRs, ie CDR-Fl, CDR-F2, CDR-F3, CDR-HI, CDR-H2, and CDR-H3) from the acceptor. Antibodies against CDRs from a donor antibody described here, ie a chicken antibody.
  • a “chimeric antibody” refers to a type of genetically engineered antibody that has a naturally occurring variable region (light chain and heavy chains) derived from a donor antibody (e.g., a chicken antibody) associated with constant regions of the light and heavy Contains chain derived from an acceptor antibody.
  • a donor antibody e.g., a chicken antibody
  • a “humanized antibody” means a type of genetically engineered antibody whose CDRs are derived from a non-human donor immunoglobulin, such as a chicken Antibodies originate, the remaining parts of the molecule derived from immunoglobulin originating from one (or more) human immunoglobulins.
  • scaffold support residues can be altered to maintain binding affinity (see, for example, Queen et al, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86: 10029-10032 (1989), Hodgson et al, Bio / Technology, 9: 421 (1991 )).
  • An agent can be bound to the antibody, for example to improve transport into the intestine.
  • the agent bound to the antibody can actively or passively influence transporter proteins in the intestine.
  • the attachment can be chemical or, alternatively, the unit can be genetically engineered into the antibody.
  • donor antibody refers to an antibody (monoclonal or recombinant) that contributes the nucleic acid sequences of its variable regions, CDRs or other functional fragments or analogues thereof for a first immunoglobulin partner to the altered immunoglobulin coding region and the resulting expressed altered antibody with the antigenic specificity and neutralizing activity property of the donor antibody, eg of the chicken antibody.
  • acceptor antibody means an antibody (monoclonal or recombinant) which is heterologous to the donor antibody and all (or a part, but preferably all) nucleic acid sequences which are its heavy and / or light chain framework regions and / or encode its heavy and / or light chain constant regions for which the first immunoglobulin partner contributes.
  • a human antibody is preferably the acceptor antibody.
  • CDRs are defined as the amino acid sequences of the complementarity-determining region of an antibody, which are the hypervariable regions of the heavy and light chains of an immunoglobulin. See, e.g., Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 4th ed., US Department of Health and Human Services, National Institutes of Health (1987). There are three heavy chain CDRs (CDR-HI, -2 and -3) and three light chain CDRs (CDR-L1, -2 and -3) (or CDR regions) in the variable part of an immunoglobulin.
  • CDRs as used herein means all three heavy chain CDRs or all three light chain CDRs (or both all heavy chain and all light chain CDRs, if appropriate).
  • the structure and protein folding of the antibody can mean that other residues are considered part of the antigen binding region and would be understood by one of skill in the art. See, for example, Chothia et al. (1989), Conformations of immunoglobulin hypervariable regions; Nature 342, pp. 877-883. CDRs provide the majority of the contact residues for binding the antibody to the antigen or epitope.
  • CDRs of interest in this invention are derived from the donor antibody variable heavy and light chain sequences, e.g., a chicken antibody, and include analogs of naturally occurring CDRs, the analogs having the same antigen binding specificity and / or neutralizing ability as that Share or retain donor antibodies from which they are derived.
  • a “functional fragment” is a partial variable heavy or light chain sequence (e.g., minor deletions at the amino or carboxy terminus of the immunoglobulin variable region) that maintains the same antigen binding specificity and / or neutralizing ability as the antibody from which the fragment was derived.
  • an “analog” is an amino acid sequence modified with at least one amino acid, wherein the modification is chemical or a substitution or rearrangement of a few amino acids (ie preferably no more than 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 or 1 Amino acid residue (s)), the modification of the amino acid sequence allowing the biological properties, for example antigen specificity and high affinity, of the unmodified sequence to be retained.
  • (silent) mutations can be constructed via substitutions if certain endonuclease restriction sites are created within or around CDR coding regions.
  • the present invention contemplates the use of analogs of the antibody of the invention.
  • analogs of the antibody of the invention include those in which the CDRs in the hypervariable region of the heavy and light chains are at least 80% homologous, preferably at least 85%, at least 90% homologous and particularly preferably at least 95%, 96%, 97%, 98% or 99% are homologous to the CDRs as defined above as CDR-HI, CDR-H2, CDR-H3, CDR-Ll, CDR-L2 and CDR-L3 and the specific binding to an antigen of the bacterium Candidatus Savagella and neutralizing Maintain activity.
  • Amino acid sequences are at least 80% homologous if they have 80% identical amino acid residues in a similar position when the sequences are optimally matched, with gaps or insertions counted as non-identical residues.
  • Algorithms for determining sequence identity and programs for sequence comparison are well known in the prior art.
  • Analogs can also occur as allelic variations.
  • An "allelic variation or modification” is a change in the nucleic acid sequence. Such variations or modifications may be based on the degeneracy of the genetic code or may be deliberately engineered or recombinantly made to the desired ones Deliver properties. These variations and modifications may or may not result in changes in an encoded amino acid sequence.
  • effector agent refers to non-protein carrier molecules to which the modified antibodies and / or natural or synthetic light or heavy chains of the donor antibody, such as a chicken antibody, or other fragments of the donor antibody can be associated by conventional means .
  • non-protein carriers can include conventional carriers used in the diagnostic field, for example polystyrene or other plastic beads, polysaccharides, e.g. as used in the BIAcore system [Pharmacia], or other non-protein substances that are useful in the medical field and safe for administration to humans and animals.
  • Other effector agents can include a macrocycle to complex a heavy metal atom or radioisotopes. Such effector agents can also be useful for increasing the half-life of the modified antibodies, e.g. Polyethylene glycol (PEG).
  • PEG Polyethylene glycol
  • a neutralizing antibody specific for the bacterium Candidatus Savagella has not yet been described in the prior art and is made available for the first time by the present invention.
  • Another aspect of the invention provides a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising an antibody of the invention together with a pharmaceutically acceptable diluent or carrier.
  • antibodies, altered antibodies and fragments can be constructed by immunizing a non-human species (e.g. cattle, sheep, monkeys, chickens, rodents (e.g. mice, hamsters and rats) etc.) to contribute to a desirable immunoglobulin
  • a non-human species e.g. cattle, sheep, monkeys, chickens, rodents (e.g. mice, hamsters and rats) etc.
  • rodents e.g. mice, hamsters and rats
  • Candidatus Savagella of any kind against which antibodies which are cross-reactive to the native or recombinant antigen from the bacterium
  • Candidatus Savagella can be generated, for example humans or chickens.
  • hybridoma techniques are used to provide a hybridoma cell line that secretes a non-human monoclonal antibody, such as a chicken antibody, against the native antigen from the Candidatus Savagella bacterium.
  • Such hybridomas are then bound to using Candidatus Savagella bacterial or recombinant antigen coated on 384 or 96-well plates, with biotinylated native or recombinant Savagella bacterial antigen bound to a streptavidin-coated plate, or in a screened homogeneous Europium-APC-linked immunoassay using biotinylated native or recombinant antigen from the Candidatus Savagella bacterium.
  • a native human antibody can be generated, for example, in a human antibody mouse such as the "Xenomouse” (Abgenix), in which the mouse immunoglobulin genes are removed and genes encoding the human immunoglobulins have been inserted into the mouse chromosome. The mice are immunized normally and develop an antibody response derived from the human genes. Thus, the mouse produces human antibodies bypassing the need for humanization after selection of positive hybridomas (see LL Green, J. Immunol. Methods, Dec. 10, 1999; 231 (1-2): 11-23).
  • a Fab fragment contains the entire light chain and the amino-terminal part of the heavy chain; and an F (ab ') 2 fragment is the fragment formed by two Fab fragments linked by disulfide bonds.
  • Fab fragments and F (ab ') 2 fragments can be obtained by conventional means, e.g. Cleavage of monoclonal antibodies (mAb) with the appropriate proteolytic enzymes, papain and / or pepsin, or can be obtained by recombinant methods.
  • the Fab and F (ab ’) 2 fragments themselves are useful as a therapeutic or prophylactic and as donors for sequences that include the variable regions and CDR sequences that are useful in the generation of recombinant or humanized antibodies as described herein.
  • the Fab and F (ab ') 2 fragments can also be constructed via a combinatorial phage library (see, for example, Winter et al., Ann. Rev. Immunol., 12: 433-455 (1994)), or via immunoglobulin Chain exchange ("chain shuffling") (see, for example, Marks et al., Bio Technology, 10: 779-783 (1992)).
  • human antibody fragments that are specific for a native or recombinant antigen from the bacterium Candidatus Savagella can be isolated using human antibody fragment phage display libraries.
  • a library of bacteriophage particles representing human antibody fragment proteins is tested against the native or recombinant antigen from the Candidatus Savagella bacterium.
  • Those phages that represent antibody fragments that bind the native or recombinant antigen from the bacterium Candidatus Savagella are retained from the library and amplified by cloning.
  • human antibody genes are then excised from the specific bacteriophage and inserted into human IgG expression constructs containing the constant regions of human IgG to contain the intact human IgG molecule with the variable regions from that for native or recombinant antigen from the bacterium Candidatus Savagella to form specific, isolated bacteriophages.
  • the donor antibodies can contribute sequences such as variable heavy and / or light chain peptide sequences, framework sequences, CDR sequences, functional fragments and analogues thereof, and the nucleic acid sequences encoding them useful in the Construction and maintenance of various modified antibodies, which are characterized by the antigen binding specificity of the donor antibody, for example a chicken antibody.
  • various coding sequences can be constructed that encode the amino acid sequences of the variable heavy and light chain, and CDR sequences as well as functional fragments and analogues thereof that share the antigen specificity of the donor antibody, such as a chicken antibody .
  • Isolated nucleic acid sequences or fragments thereof that encode the variable chain peptide sequences or CDRs can be used to generate modified antibodies, for example chimeric or humanized antibodies, or other genetically engineered antibodies when operatively combined with a second immunoglobulin partner.
  • Modified immunoglobulin molecules can encode modified antibodies, including genetically modified antibodies such as chimeric antibodies and humanized antibodies.
  • a desired altered immunoglobulin coding region contains CDR coding regions that encode peptides with the antigen specificity of an anti-Candidatus Savagella antigen antibody, preferably a high affinity antibody, inserted into a first immunoglobulin partner (a human framework region or a variable region of a human immunoglobulin).
  • the first immunoglobulin partner is preferably operatively connected to a second immunoglobulin partner.
  • the second immunoglobulin partner is defined above and can include a sequence encoding a second antibody region of interest, e.g. an Fc region.
  • Second immunoglobulin partners can also include sequences encoding another immunoglobulin to which the constant region of the light or heavy chain is fused in a raster or by means of a linker sequence.
  • Genetically engineered antibodies directed against functional fragments or analogs of native or recombinant antigen from the Candidatus Savagella bacterium can be engineered to elicit increased binding.
  • the second immunoglobulin partner can also be associated with effector agents as defined above, including non-protein carrier molecules to which the second immunoglobulin partner can be operably linked by conventional means.
  • the fusion or binding between the second immunoglobulin partner, for example antibody sequences, and the effector agent can be carried out by any suitable means, for example by conventional covalent or ionic bonds, protein fusions or heterobifunctional crosslinking agents, for example carbodiimide, glutaraldehyde and the like.
  • suitable means for example by conventional covalent or ionic bonds, protein fusions or heterobifunctional crosslinking agents, for example carbodiimide, glutaraldehyde and the like.
  • linker sequences that simply provide a desired amount of space between the second immunoglobulin partner and the effector agent can also be constructed into the modified immunoglobulin coding region. The construction of such linkers is well known to those skilled in the art.
  • the antibody can have an additional agent attached to it.
  • the recombinant DNA technique can be used to generate a genetically engineered antibody in which the Fc fragment or the CH2-CH3 domain of a complete antibody molecule is generated by an enzyme or other detectable molecule (ie, a polypeptide Effector or a reporter molecule) was replaced.
  • the second immunoglobulin partner can also be operatively linked to a non-immunoglobulin peptide, protein or fragment thereof which is heterologous to the CDR-containing sequence with the antigen specificity of anti-Candidatus Savagella antigen antibodies.
  • the resulting protein can have both anti-Candidatus Savagella antigen specificity and properties of the non-immunoglobulin when expressed.
  • the property of the fusion partner can e.g. a functional property such as another binding or receptor domain or a therapeutic property if the fusion partner is itself a therapeutic protein, or additional antigenic properties.
  • Another desirable protein of this invention can be a complete, full length, heavy and light chain antibody molecule, or any discrete fragment thereof, such as the Fab or F (ab ') 2 fragments, a heavy chain dimer, or any minimal recombinant fragments thereof, such as an Fv or a single chain antibody (SCA) or any other molecule with the same specificity as the selected donor antibody, such as a chicken antibody.
  • a protein can be used in the form of an altered antibody or can be used in its unfused form.
  • Antibodies produced by genetic engineering or recombinant means can comprise constant regions of the immunoglobulin (Ig) and variable framework regions from a source, for example the acceptor antibody, and one or more (preferably all) CDRs from the donor antibody, for example a chicken antibody.
  • Ig immunoglobulin
  • variable framework regions from a source, for example the acceptor antibody, and one or more (preferably all) CDRs from the donor antibody, for example a chicken antibody.
  • deletions, substitutions or additions, of the framework region of the light and / or heavy variable domain of the acceptor monoclonal antibody (mAb) at the nucleic acid or amino acid level or of the donor CDR regions can be carried out to the antigen binding specificity of the donor antibody, such as a chicken antibody.
  • Such genetically engineered or recombinantly produced antibodies are designed to use one (or both) of the variable heavy and / or light chains of the anti-Candidatus Savagella antigen antibody or one or more of the CDRs of the heavy or light chain.
  • the genetically engineered or recombinantly produced antibodies can be neutralizing as defined above.
  • Such genetically engineered or recombinantly produced antibodies may include a humanized antibody containing the framework regions of a selected human immunoglobulin or subtype, or a chimeric antibody containing the constant regions of the human heavy and light chain fused to the functional fragments of the anti-Candidatus Savagella Antigen antibody.
  • a suitable human (or other animal) acceptor antibody can be obtained from a conventional database, e.g. the KABAT® database, the Los Alamos database and the Swiss Protein database, by homology with the nucleotide and amino acid sequences of the donor antibody, for example a chicken antibody.
  • a human antibody characterized by homology with the donor antibody framework regions may be suitable to provide a heavy chain constant region and / or a heavy chain variable framework region for insertion of the donor CDRs .
  • a suitable acceptor antibody that can donate constant or variable framework regions of the light chain can be selected in a similar manner. It should be noted that the heavy and light chains of the acceptor antibody do not have to come from the same acceptor antibody.
  • the heterologous scaffold regions and the constant regions are desirably selected from human immunoglobulin classes and isotypes such as IgG (subtypes 1 to 4), IgM, IgA and IgE.
  • the acceptor antibody need not only include human immunoglobulin protein sequences.
  • a gene can be constructed in which a DNA sequence encoding part of a human immunoglobulin chain is fused to a DNA sequence encoding a non-immunoglobulin amino acid sequence such as a polypeptide effector or a reporter molecule.
  • variable domains in both the human heavy and light chains were preferably genetically engineered by one or more CDR exchanges. It is possible to use all six CDRs or different combinations of less than the six CDRs. All six CDRs are preferably replaced. It is possible to exchange the CDRs only in the human heavy chain, the unmodified light chain from the human acceptor antibody being used as the light chain. Alternatively, a compatible light chain from another human antibody can be selected by using the conventional antibody databases. The rest of the engineered antibody can be from any suitable human acceptor immunoglobulin.
  • the genetically engineered or recombinantly produced humanized antibody thus has the structure of a natural human antibody or a fragment thereof and has the combination of properties which are required for effective therapeutic use.
  • variable domain amino acids can be further modified by altering the variable domain amino acids without necessarily affecting the specificity and high affinity of the donor antibody, such as a chicken antibody (i.e. an anologon). It is anticipated that heavy and light chain amino acids can be substituted with other amino acids in either the variable domain frameworks or CDRs or both.
  • the constant region can be changed to increase or decrease selective properties of the molecules of the present invention, such as dimerization, binding to Fc receptors, or the ability to bind and activate complement (see, e.g., Angal et al., Mol Immunol. 30: 105-108 (1993), Xu et al, J. Biol. Chem. 239: 3469-3474 (1994), Winter et al., EP 307,434-B).
  • a modified antibody which is a chimeric antibody, differs from the humanized antibodies described above in that it connects the entire variable regions of the heavy chain and light chain of the non-human donor antibody, such as a chicken antibody, including the framework regions with the constant regions of human immunoglobulin for both chains.
  • variable heavy and light regions which contain at least the CDR coding regions and those parts of the framework regions of the light and / or heavy variable domain of the acceptor mAb which are required to determine the binding specificity of the donor mAb, such as a chicken monoclonal antibody and the remaining immunoglobulin-derived portions of the antibody chain derived from a human immunoglobulin are obtained using polynucleotide primers and reverse transcriptase.
  • the CDR coding regions are identified using a known database and by comparison with other antibodies.
  • a chicken / human chimeric antibody can then be made and tested for binding ability.
  • Such a chimeric antibody contains the entire VH and VL regions of the non-human chicken donor antibody in conjunction with the human lg constant regions for both chains.
  • Homologous framework regions of a variable region of the heavy chain from a human antibody can be identified using computerized databases, eg KABAT®, and a human antibody with homology to the chicken donor antibody will be selected as the acceptor antibody.
  • a suitable variable framework region of the light chain can be created in a similar manner.
  • a humanized antibody can be derived from the chimeric antibody or, preferably, synthetically produced by inserting the CDR coding regions of the chicken donor mAb from the heavy and light chains appropriately within the selected heavy and light chain framework.
  • a humanized antibody can be produced using standard mutagenesis techniques.
  • the resulting humanized antibody contains human framework regions and CDR-coding regions of the chicken donor mAb. Subsequent manipulation of scaffold residues can occur.
  • the resulting humanized antibody can be found in recombinant host cells, e.g. COS, CHO or myeloma cells can be expressed.
  • a conventional expression vector or a recombinant plasmid is produced by placing these coding sequences for the antibody in operative association with conventional regulatory control sequences which can control the multiplication and expression in and / or secretion from a host cell. Regulatory sequences include promoter sequences, for example a CMV promoter, and signal sequences that can be derived from other known antibodies.
  • a second expression vector can be made with a DNA sequence encoding a complementary light or heavy chain of an antibody. This second expression vector is preferably identical to the first, except as far as the coding sequences and selectable markers are concerned, in order to ensure as far as possible that each polypeptide chain is functionally expressed.
  • the heavy and light chain coding sequences for the altered antibody can rest on a single vector.
  • a selected host cell is co-transfected (or simply transfected with a single vector) by conventional techniques with both the first and second vectors to produce the transfected host cell that includes both the recombinant or synthetic light and heavy chains.
  • the transfected cell is then cultured by conventional techniques to generate the genetically engineered or recombinantly produced antibody of the invention.
  • the humanized antibody which includes the association of the recombinant heavy chain and / or light chain, is screened from the culture by a suitable assay, for example ELISA or RIA. Similar conventional techniques can be used to construct other engineered antibody molecules.
  • Suitable vectors for the cloning and subcloning steps used in the methods and construction of the compositions provided herein can be selected by one of skill in the art.
  • the conventional pUC series of cloning vectors can be used.
  • a vector, pUCl9 is commercially available from suppliers such as Amersham (Buckinghamshire, United Kingdom) or Pharmacia (Uppsala, Sweden).
  • any vector that can be easily replicated has a variety of cloning sites and selectable genes (eg, antibiotic resistance), and is easily manipulated can be used for cloning.
  • the vectors used for the expression of the antibodies can be selected by a person skilled in the art from any conventional vector.
  • the vectors also contain selected regulatory sequences (such as CMV promoters) that target the replication and expression of heterologous DNA sequences in selected host cells.
  • These vectors contain the DNA sequences described above which code for the antibody or the modified immunoglobulin coding region.
  • the vectors can take up the selected immunoglobulin sequences, which are modified by the insertion of desired restriction sites for easy manipulation.
  • the expression vectors can also be characterized by genes which are suitable for amplifying the expression of the heterologous DNA sequences, for example the dihydrofolate reductase gene (DHFR) from mammals.
  • Other preferred vector sequences include a poly A signal sequence, such as from bovine growth hormone (BGH); and the beta globin promoter sequence (beta glopro).
  • BGH bovine growth hormone
  • beta globin promoter sequence beta glopro
  • the components of such vectors e.g. Replicons, selection genes, enhancers, promoters, signal sequences and the like can be obtained from commercial or natural sources, or obtained by known methods for use in directing the expression and / or secretion of the product of the recombinant DNA in a selected host.
  • Other suitable expression vectors of which numerous types are known in the art for mammalian, bacterial, insect, yeast and fungal expression, can also be selected for this purpose.
  • the vectors can be used to generate a cell line that is transfected with a recombinant plasmid that contains the coding sequences of the antibodies or modified immunoglobulin molecules thereof.
  • Host cells useful for cloning and other manipulations of these cloning vectors are also conventional.
  • bacterial cells such as cells from different strains of E. coli, yeast cells, insect cells, or mammalian cells, can be used to multiply the cloning vectors and for other steps in the construction of modified antibodies of this invention.
  • Suitable host cells or cell lines for expressing the antibody of the invention are preferably mammalian cells such as NS0, Sp2 / 0, CHO, COS, a fibroblast cell (e.g. 3T3) and myeloid cells and particularly preferably a CHO or myeloid cell.
  • Human cells can be used, making it possible to modify the molecule with human glycosylation patterns.
  • other eukaryotic cell lines can be used.
  • the selection of suitable mammalian host cells and methods for transformation, culture, amplification, screening and product manufacture and purification are known in the art; see e.g. Sambrook et al., Cited above.
  • Bacterial cells can prove useful as host cells suitable for expression of the recombinant Fabs of the present invention (see, e.g., A. Plückthun, Immunol. Rev., 130: 151-188 (1992)).
  • any recombinant Fab produced in a bacterial cell would have to be screened for retention of antigen binding ability. If the molecule expressed by the bacterial cell were generated in an appropriately folded form, the bacterial cell would be a desirable host.
  • various strains of E. coli used for expression are commonly known as host cells in the field of biotechnology.
  • strains of yeast cells known to those skilled in the art are also available as host cells, as are insect cells, e.g. Drosophila and Fepidoptera, and viral expression systems. See e.g. Miller et al., Genetic Engineering, 8: 277-298, Plenum Press (1986) and references cited therein.
  • the transfection methods required to generate the host cells, and culture methods required to generate the modified antibody of the invention from such host cells are all conventional techniques.
  • the antibodies of the invention can be purified from the cell culture contents according to standard procedures in the art, which include ammonium sulfate precipitation, affinity columns, column chromatography, gel electrophoresis and the like. Such techniques are within the skill of those skilled in the art.
  • the antibody is then assayed for in vitro activity using an appropriate assay.
  • Conventional ELISA test formats are currently used to assess the qualitative and quantitative binding of the antibody to MAG.
  • other in vitro assays for verifying specific binding to the antigen and neutralizing efficacy as described herein can be used prior to subsequent human clinical trials performed to evaluate antibody persistence in the body despite the usual clearance mechanisms.
  • the antibody or the antigen-binding fragment is selected from the group consisting of: immunoglobulin molecule, polyclonal antibody, monoclonal antibody, chimeric antibody, antibody generated by CDR grafting, humanized antibody, Fab, Fab ', F (ab ') 2, Fv, disulfide-linked Fv, scFv, single domain antibody, diabody, multispecific antibody, dualspecific antibody, and bispecific antibody.
  • the antibody is a chicken immunoglobulin molecule or antibody.
  • the antibody is preferably generated against an antigen or a suitable peptide of the bacterium Candidatus Savagella and is preferably a polyclonal or monoclonal chicken antibody.
  • the chicken antibody can be humanized or altered as defined elsewhere.
  • the chicken immunoglobulin molecule is particularly preferably an IgY immunoglobulin molecule or polyclonal IgY antibody.
  • Immunoglobulin Y is a class of immunoglobulin molecules which are contained in the serum of chickens and, in high concentrations, in particular in the egg yolk of chicken eggs. As with the other immunoglobulins, IgY is a protein that is produced by the immune system in response to certain foreign structures and recognizes them specifically.
  • Immunoglobulin Y is the functional equivalent of IgG in chickens and, like this, is made up of two light and two heavy chains. Structurally, the two immunoglobulin classes differ primarily in the heavy chains, which have a molecular mass of around 65.1 kilodaltons in IgY and are therefore larger than those in IgG.
  • the light chains of IgY with a molar mass of about 18.7 kilodaltons are somewhat smaller compared to IgG.
  • the molar mass of IgY is thus about 167 kilodaltons.
  • the steric flexibility of the IgY molecule is less than that of IgG.
  • IgY is partially comparable to both IgE and IgG. In contrast to IgG, however, IgY does not bind to protein A or protein G and also not to cellular ones Fc receptors. In addition, IgY does not activate the complement system.
  • the name immunoglobulin Y was proposed by GA Leslie and LW Clem in 1969 after showing differences between the immunoglobulins and immunoglobulin G found in chicken eggs.
  • IgY offers various advantages over the use of mammalian antibodies. Since the antibodies are obtained from the egg yolk of laid eggs, it is a non-invasive method of antibody production. No blood has to be taken from the chickens to obtain blood serum. Repeated egg laying from the same chicken increases the available amount of a certain antibody considerably. Cross-reactivity with mammalian proteins is also significantly lower than that of IgG. In addition, the immune response to certain antigens is more pronounced in chickens than in rabbits or other mammals. Since only IgY of the immunoglobulins produced during the immune response can be found in chicken eggs, no contaminations with IgA or IgM are contained in corresponding preparations.
  • the yield of IgY from a chicken egg is high and comparable to that of IgG from rabbit serum.
  • IgY is used as a component of food, particularly in Asian countries such as Japan.
  • yoghurt products that contain specific IgY are sold there. This prevents bacteria from the Helicobacter pylori species from attaching to the stomach.
  • the IgY used for this is obtained from the eggs of immunized chickens.
  • Antibodies are also produced against Salmonella and other bacteria, but also against viruses and used as part of the food to protect against these pathogens.
  • the IgY according to the invention can thus be used, for example, in the form of “novel food” or “nutraceuticals”.
  • the antibody or the antigen-binding fragment (indirectly) leads to a reduction in Th 17 cell proliferation, Th 17 cell differentiation or Th 17 cell activity.
  • the antibody or the antigen-binding fragment inhibits the formation of antibodies against the body's own antigens by B cells.
  • Th 17 cells develop from so-called naive T helper cells, i.e. T helper cells that have not yet come into contact with their specific antigen, only after they have been activated Antigen contact.
  • IL-6 and TGF-ß are necessary for the differentiation of Thl7 cells.
  • Thl7 cells are named after the interleukin IL-17 they produce and have an important role in the activation of neutrophil granulocytes, but are also associated with the development of chronic inflammation and autoimmune diseases.
  • Other secretion products from Thl7 cells are TNF-a and IL-6.
  • Receptors for IL-17 are found on various cell types of the immune system, for example on myeloid cells, which include the neutrophils granulocytes, and on lymphocytes.
  • the messenger substances released by the Thl7 cells cause inflammatory processes in which neutrophil granulocytes play a dominant role.
  • IL-17 causes G-CSF, IL-6 and IL-8 to be released in the target cells mentioned, which induce and activate neutrophil granulocytes.
  • inflammatory proteins such as IL-1, IL-6, PGE-2, cyclooxygenase 2 and matrix metalloproteases are increasingly expressed.
  • the antibody of the invention contributes to an increased immune tolerance.
  • Immune diseases such as multiple sclerosis, rheumatoid arthritis, type 1 diabetes and allergic asthma are largely determined by the activity of Th 17 immune cells.
  • the gut bacterium, Candidatus Savagella induces precisely these Thl7 immune cells (see e.g. US 2012/276149; WO 2011/047153).
  • the present invention comprises the neutralization of this bacterium with orally administered chicken protein antibodies, in order to treat Thl7 immune-cell-mediated diseases.
  • Tests for reducing Th 17 cell proliferation, reducing Th 17 cell differentiation, reducing Th 17 cell activity or inhibiting the formation of antibodies against endogenous antigens by B cells are known to the person skilled in the art and are described in the prior art; see for example US 2012/276149 or WO 2011/047153.
  • the antigen of the Candidatus Savagella bacterium is a bacterial wall protein, particularly preferably the "myosin cross-reactive antigen" (SEQ ID No. 1)
  • an antigen in the sense of the invention is a cell wall protein of the bacterium Candidatus Savagella, such as the "myosin cross-reactive antigen", the amino acid sequence of which is shown in SEQ ID No. 1.
  • the antibody or the antigen-binding fragment binds to an epitope from the myosin cross-reactive antigen, comprising or consisting of the amino acid sequence S VLDEF YWLDKKDP Y SL (SEQ ID No. 2),
  • the invention also relates to a method for producing an antibody according to the invention, comprising:
  • a suitable protein is selected from the group of function-determining and “segmented filamentous bacteria” (SFB) -specific proteins, which is characterized in that it is a bacterial wall protein and a non-redundant role for adherence to the intestinal epithelium and / or survival of Candidatus Savagella or "segmented filamentous bacteria” (SFB) plays, such as the "myosin-cross-reactive antigen” (MCRA) protein.
  • MCRA myosin-cross-reactive antigen
  • Suitable epitopes are then determined within the protein sequence of the selected target antigen, for example using “epitope prediction programs” and / or using databases. The target sequence with the mathematically best antigenicity / immunogenicity is then selected for the antibody production.
  • the corresponding peptide is synthesized in sufficient quantity with the amino acid sequence.
  • small molecules such as peptides have to be coupled to carrier proteins.
  • ovalbumin hen's egg albumin
  • bovine or human serum albumin the snail protein KLH is a carrier protein widely used in biotechnology for the immunization of animals.
  • the peptide can then e.g. can be coupled to the slotted screw hemocyanin (keyhole limpet hemocyanin, KLH) protein.
  • KLH keyhole limpet hemocyanin
  • a chicken produces up to 3 grams of IgY per month.
  • the antibodies are then isolated from the egg yolk and tested for their neutralizing effect, i.e. whether the antibody is able to inhibit the adhesion or binding of the bacterium Candidatus Savagella to intestinal epithelial cells, to inhibit the proliferation of the said bacterium and / or to deplete or kill the bacterium.
  • the process is the myosin-cross-reactive antigen as the antigen of the bacterium Candidatus Savagella.
  • the epitope sequences from the myosin cross-reactive antigen with the amino acid sequence SEQ ID No. 1, ie peptides with the amino acid sequence S VLDEF YWLDKKDP Y SL (SEQ ID No. 2), PDFKAVRFTRRNQYESMI (SEQ ID No. 3), or QATSIKILRDGKEEEIKL (SEQ ID No. 4).
  • the present invention relates to a pharmaceutical composition
  • a pharmaceutical composition comprising the antibody or an antigen-binding fragment of the invention, or the antibody produced by the method according to the invention.
  • the antibody or an antigen-binding fragment of the invention is suspended in a pharmaceutically acceptable carrier.
  • the patient to be treated is preferably a human.
  • the present invention further provides a medicament comprising the antibody or an antigen-binding fragment of the invention, or the antibody produced by the process according to the invention, and preferably suitable additives and / or auxiliaries.
  • suitable additives and / or auxiliary substances are, for example, a physiological saline solution, suitable stabilizers, proteinase inhibitors, etc.
  • Suitable stabilizers are, for example, Tween 80 (0.02%), sugar solutions, such as. B. sucrose solution (20-30%) or amino acid solutions, such as. B. glycine or cysteine solutions.
  • the medicament according to the invention is usually produced by adding suitable additives and / or auxiliary substances to the antibody or an antigen-binding fragment of the invention.
  • the therapeutic agents of this invention can be administered as a prophylactic or otherwise as needed.
  • the dose and duration of treatment are related to the relative duration of the molecules of the present invention in human circulation and can be adjusted by one of skill in the art depending on the condition being treated and the general health of the patient.
  • the mode of administration of the therapeutic agent of the invention can be any suitable route that delivers the agent to the host.
  • the antibodies and pharmaceutical compositions / drugs of the invention are particularly useful for oral administration.
  • the medicament according to the invention is for use in the prevention or treatment of an oncological disease, allergic disease or an immune disease, preferably an autoimmune disease, the diseases mentioned being mediated by the activity of Th 17 cells.
  • an allergy sufferer or patient with autoimmune disease takes the specific SFB antibodies of the invention orally over a defined period of time in a defined treatment regimen.
  • the reduction in the allergic reaction is then determined, for example, using a prick test.
  • the effect of the specific SFB antibodies on a patient with autoimmune disease can be demonstrated, for example, by reducing the formation of autoantibodies.
  • the reference corresponds to the strength of the reaction without SFB antibody treatment.
  • the allergic disease, immune disease or autoimmune disease is preferably selected from the group consisting of: multiple sclerosis, type 1 diabetes, rheumatoid arthritis, allergic respiratory disease and allergic asthma.
  • the antibody or an antigen-binding fragment thereof is administered orally.
  • Chicken antibodies are particularly acid-stable and are therefore particularly suitable for oral use in patients.
  • all previous routes that are used for the transfer of immunoglobulins are also included, e.g. intramuscular, intravenous, intraperitoneal, or intratecal administration.
  • the antibody or an antigen-binding fragment thereof is used in combination with an antibiotic, preferably a beta-factam and / or glycopeptide antibiotic.
  • the present invention relates to a method for producing a medicament according to the invention, comprising:
  • the present invention relates to a kit comprising an antibody according to the invention or an antigen-binding fragment thereof for reducing Th 17 cell proliferation, Thl7 cell differentiation or Thl7 cell activity, and / or inhibiting the formation of antibodies against the body's own antigens by B cells.
  • the kit can also comprise an antibiotic such as beta-factam and / or a glycopeptide antibiotic, as well as instructions for using the components of the kit.
  • an antibiotic such as beta-factam and / or a glycopeptide antibiotic
  • determining encompass qualitative, semi-quantitative and / or quantitative determination, for example the quantitative determination of the antibody of the invention in the serum or plasma of a patient to whom this antibody is used for therapeutic purposes was administered.
  • the content of all references cited here is hereby incorporated by reference to the respective specific disclosure content and in their entirety.
  • FIG. 1 Graphical summary of the concept on which this invention is based: Special filiform Candagatus Savagella bacteria ("segmented filamentous bacteria", SFB) colonize the intestinal wall and activate Thl7 cells via dendritic cells (DC), which contribute to autoimmunity and atopy.
  • SFB mented filamentous bacteria
  • DC dendritic cells
  • suitable bacterial wall proteins of the named bacterium are identified (1), synthesized and injected into chickens (2).
  • the chickens form highly specific anti-SFB antibodies, which can be isolated from the eggs (3) and are available for oral antibody therapy in humans (4).
  • a reduction in the number of SBF bacteria in the intestine can lead to a reduction in Th 17 effector cell activity and thus to immune tolerance.
  • Example 1 Production and production of neutralizing antibodies against the "myosin-cross-reactive antigen” (MCRA) protein
  • the "myosin-cross-reactive antigen” (MCRA) protein was selected from the group of function-determining and "segmented filamentous bacteria" (SFB) -specific proteins.
  • the protein is located in the bacterial wall and the non-redundant role for adherence to the intestinal epithelium in humans and the survival of Candidatus Savagella or "segmented filamentous bacteria” (SFB) is a suitable target for a neutralizing antibody.
  • Suitable epitopes were then determined within the known protein sequence of the MCRA protein (SEQ ID No. 1). The target sequence with the best calculated antigenicity was selected for antibody production. With the known amino acid sequence, the corresponding peptide with the SEQ ID Nm.
  • the inventors' underlying working hypothesis states that a reduced colonization density with SFB in the intestine of patients leads to a reduced TH17 response. In general, this would have great therapeutic relevance in TH 17-mediated inflammatory diseases.
  • the inventors assume that the SFB also exists in the intestines of human patients and that oral therapy with a neutralizing antibody could be suitable for the treatment of a whole range of allergic diseases, immune diseases, autoimmune diseases and oncological diseases.
  • chicken antibodies is a basic concept of the present invention.
  • the use of chicken antibodies (IgY) has numerous advantages over classic approaches: IgY, for example, does not react with the human complement system and has a particularly high acid stability, which makes it attractive for the development of an orally administered therapeutic agent.
  • the oral application can look like this:
  • An allergy sufferer takes the specific SFB antibodies orally over a defined period in a defined treatment regimen.
  • the reduction in the allergic reaction is then determined, for example, using a prick test.
  • the reference corresponds to the strength of the reaction without SFB antibody treatment.
  • the appropriate SFB bacterial wall proteins were identified, synthesized and injected into chickens in this project.
  • the chickens produced highly specific, neutralizing anti-SFB antibodies that were isolated from the eggs.
  • This product with pharmaceutical potential isolated from the eggs can then be used for oral antibody therapy in the patient for the treatment of a whole range of allergic diseases, Immune diseases, autoimmune diseases and oncological diseases can be used.

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Abstract

Die vorliegende Erfindung betrifft Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon, wobei der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment an ein Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella bindet und (i) die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen, vorzugsweise humane Darmepithelzellen, inhibiert, und/oder (ii) das Bakterium depletiert. Die Erfindung stellt ferner ein Arzneimittel zur Verfügung, umfassend den erfindungsgemäßen Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon oder umfassend einen Antikörper, der durch das erfindungsgemäße Verfahren hergestellt ist. Des Weiteren betrifft die Erfindung ein Kit umfassend einen erfindungsgemäßen Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon zur Reduktion der Th17 Zellproliferation, Th17 Zelldifferenzierung oder Th17 Zellaktivität, und/oder Hemmung der Bildung von Antikörpern gegen körpereigene Antigene durch B Zellen. Optional enthält das erfindungsgemäße Kit ein Antibiotikum. Außerdem stellt die Erfindung ein Verfahren zur Herstellung eines erfindungsgemäßen Antikörpers zur Verfügung, wobei das Verfahren umfasst: a) Immunisierung von Hühnern mit einem immunogenen Peptid aus einem Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella; und b) Gewinnung und Aufreinigung der in den Hühnern oder in einem von diesen Hühnern gelegten Ei gebildeten Antikörper. Schließlich betrifft die Erfindung ein Verfahren zur Herstellung eines erfindungsgemäßen Arzneimittels, umfassend: a) Herstellung eines erfindungsgemäßen Antikörpers oder eines antigen-bindenden Fragments davon; und b) Formulierung des Antikörpers oder eines antigen-bindenden Fragments davon als Arzneimittel.

Description

Behandlung von Immunerkrankungen durch die antikörpervermittelte Neutralisierung spezifischer Darmbakterien
Die vorliegende Erfindung betrifft die Behandlung von Immunerkrankungen sowie weiterer Erkrankungen durch die antikörpervermittelte Neutralisierung spezifischer Darmbakterien. Insbesondere betrifft die Erfindung Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon, wobei der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment an ein Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella bindet und (i) die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen, vorzugsweise humane Darmepithelzellen, inhibiert, und/oder (ii) das Bakterium depletiert. Die Erfindung stellt ferner ein Arzneimittel zur Verfügung, umfassend den erfindungsgemäßen Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon, oder umfassend einen Antikörper, der durch das erfindungsgemäße Verfahren hergestellt ist. Des Weiteren betrifft die Erfindung ein Kit umfassend einen erfindungsgemäßen Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon zur Reduktion der Th 17 Zellproliferation, Th 17 Zelldifferenzierung oder Th 17 Zellaktivität, und/oder Hemmung der Bildung von Antikörpern gegen körpereigene Antigene durch B Zellen. Optional enthält das erfindungsgemäße Kit ein Antibiotikum. Außerdem stellt die Erfindung ein Verfahren zur Herstellung eines erfindungsgemäßen Antikörpers zur Verfügung, wobei das Verfahren umfasst: a) Immunisierung von Hühnern mit einem immunogenen Peptid aus einem Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella; und b) Gewinnung und Aufreinigung der in den Hühnern oder in einem von diesen Hühnern gelegten Ei gebildeten Antikörper. Schließlich betrifft die Erfindung ein Verfahren zur Herstellung eines erfindungsgemäßen Arzneimittels, umfassend: a) Herstellung eines erfindungsgemäßen Antikörpers oder eines antigen-bindenden Fragments davon; und b) Formulierung des Antikörpers oder eines antigen-bindenden Fragments davon als Arzneimittel.
Jeder Mensch beherbergt mehr als 100 Trillionen Bakterien, die in ihrer Gesamtheit als Mikrobiom bezeichnet werden. Die meisten dieser Bakterien besiedeln den Darm und nutzen dem Menschen bei der Verdauung von Pflanzenfasern, der Bereitstellung von Vitaminen und der Verdrängung von schädlichen Mikroorganismen. Für das menschliche Immunsystem stellt diese Symbiose eine tägliche Belastungsprobe dar: Lediglich eine einschichtige Barriere aus Epithelzellen trennt den Menschen von seinem Mikrobiom. Die Immunzellen der Darmwand müssen ständig zwischen Toleranz gegenüber nützlichen und Abwehr gegenüber schädlichen Bakterien entscheiden. Es ist daher nicht verwunderlich, dass die Zusammensetzung des Mikrobioms einen direkten und signifikanten Einfluss auf das Immunsystem und somit auf die Gesundheit des Menschen hat [1]
In den vergangen Jahrzenten ist in allen Industrieländern ein deutlicher Anstieg von immunvermittelten Erkrankungen zu verzeichnen. Dazu gehören unter anderem die häufigen Diagnosen Colitis ulcerosa, Morbus Crohn, rheumatoide Arthritis, Diabetes mellitus Typ 1 und multiple Sklerose, aber auch atopische Erkrankungen, wie Neurodermitis und allergisches Asthma. Die Geschwindigkeit mit der diese Erkrankungen zunehmen ist so schnell, dass genetische Veränderungen nicht ursächlich sein können. Beispielsweise stieg die Häufigkeit des allergischen Asthmas in den USA zwischen 1980 und 1994 um 75%, während im selben Zeitraum die Häufigkeit in Entwicklungsländern unverändert blieb [6] Es drängt sich die Frage auf, welcher Umwelteinfluss diesen rasanten Anstieg immunvermittelter Erkrankungen erklären kann. Möglicherweise bedingen veränderte Emährungsgewohnheiten, vor allem die vermehrte Aufnahme von Salz, Fett, Zucker und pestizid- und antibiotika-belasteten Nahrungsmitteln, aber auch das Fehlen von immunmodulierenden, parasitischen Darmwürmem eine gestörte Homöostase zwischen Mikrobiom und Immunsystem (Dysbiose). Weitere Ursachen für eine Dysbiose können in einer veränderten Darmkolonialisierung nach der Geburt, zum Beispiel nach Kaiserschnitt, und durch eine gesteigerte Hygiene im Lebensumfeld liegen. Das menschliche Mikrobiom hat jedoch einen erheblichen Einfluss auf die Ausprägung von Immunreaktionen [1] Bestimmte Bakterien, die per se nichtpathologisch wirken, können trotzdem einen immunregulatorischen oder immunstimulierenden Einfluss haben. Die Beeinflussung des Mikrobioms mit dem Ziel der therapeutischen Immunmodulation stellt daher Inzidenz ausgewählter Immunerkrankungen [7] einen interessanten Therapieansatz für zahlreiche sozioökonomisch-relevante Erkrankungen dar. Bisherige Ansätze wie probio tische [8], präbio tische [9] und antibiotische [10] Therapien sind zwar teilweise erfolgreich, aber zu unspezifisch, um die gewünschten immunologischen Effekt zu erreichen.
Ein fadenförmiges Bakterium mit dem Namen Candidatus Savagella (Englisch„segmented filamentous bacteria“, SFB) weist eine besonders interessante Interaktion mit seinem Wirt auf: Im Säuglingsalter ist es wesentlich an der Entstehung und Reifung des Immunsystems beteiligt, in späteren Lebensabschnitten stimuliert es bestimmte Effektorzellen des erworbenen Immunsystems, die Th 17 Zellen, die wiederum schädliche Darmbakterien bekämpfen können. Dieselben Immunzellen sind jedoch auch für die Entstehung und Progression von immunvermittelten Erkrankungen wie Autoimmunerkrankungen und Atopien verantwortlich. Tatsächlich weisen Versuchstiere ohne SFB Besiedelung deutlich geringere Symptome in Tiermodellen der rheumatoiden Arthritis, multiplen Sklerose und des allergischen Asthmas auf [2-4]
Das Bakterium Candidatus Savagella (SFB) erzeugt eine andauernde physiologische Entzündungsreaktion in der Darmschleimhaut, die insgesamt zu einer Stärkung der Immunabwehr gegen pathologische Darmkeime führt. Dieses evolutionär konservierte Konzept kann im Übermaß (z.B. bei einer Dysbiose) schädlich sein und zu immunvermittelten Erkrankungen im übrigen Körper führen [1] Dieser Zusammenhang ist in den letzten Jahren vermehrt grundlagenwissenschaftlich aufgegriffen und hochrangig publiziert worden [2; 3; 11- 13]
US 2012/276149 beschreibt die Applikation von SFB, um die Immunkompetenz gegenüber Darminfektionen zu stärken.
WO 2011/047153 beschreibt eine Modulation der Thl7 Immunantwort unter anderem durch die Beeinflussung der Adhärenz und Proliferation von SFB.
Ein konkretes therapeutisches Konzept ist bisher jedoch nicht beschrieben.
Als der vorliegenden Erfindung zugrunde liegende technische Aufgabe kann daher die Bereitstellung eines solchen Therapieansatzes angesehen werden.
Die technische Aufgabe wird durch die in den Ansprüchen und nachfolgend beschriebenen Ausführungsformen gelöst.
Die Erfindung betrifft somit einen Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon, wobei der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment an ein Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella bindet und (i) die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen, vorzugsweise humane Darmepithelzellen, inhibiert und/oder (ii) das Bakterium depletiert. Bevorzugt bindet der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment an ein Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella und inhibiert die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen, vorzugsweise humane Darmepithelzellen, und depletiert das Bakterium.
Ein erfindungsgemäßer Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon bindet spezifisch an ein Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella (Englisch „segmented filamentous bacteria“, SFB), vorzugsweise an ein Bakterienwandprotein.
Das Antigen ist hierbei so gewählt, dass die Bindung des erfindungsgemäßen Antikörpers oder des antigen-bindenden Fragments davon die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen inhibiert oder das Bakterium depletiert. Die Bindung des erfindungsgemäßen Antikörpers oder des antigen-bindenden Fragments davon an das Antigen kann auch die Proliferation des Bakteriums inhibieren. Umfasst im Sinne der Erfindung sind auch Kombinationen dieser Mechanismen. Beispielsweise kann das Antigen dergestalt ausgewählt sein, dass der erfindungsgemäße Antikörper das Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella bindet und die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen inhibiert und das Bakterium depletiert. Alternativ kann das Antigen so gewählt sein, dass der erfindungsgemäße Antikörper das Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella bindet und die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen inhibiert und die Proliferation des Bakteriums inhibiert. Außerdem umfasst ist eine Kombination aller dreier Mechanismen, so dass das Antigen so bestimmt ist, dass der erfindungsgemäße der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment an das Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella bindet und die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen inhibiert, die Proliferation des Bakteriums inhibiert, und das Bakterium depletiert.
In einer am Fraunhofer IZI und ITEM durchgeführten Studie konnte gezeigt werden, dass die Besiedelungsdichte von SFB durch eine orale Antikörperbehandlung reduziert werden kann, und dass diese spezifische Korrektur des Mikrobioms zu einer Immuntoleranz im Rahmen immunvermittelter Erkrankungen führt. Die SFB-spezifischen Antikörper wurden aus den Eiern von mit SFB-Proteinen immunisierten Hühnern gewonnen; diese Methode erlaubt die schnelle und sehr kostengünstige Generierung von bindungsstarken Antikörpern, die darüber hinaus eine besondere Säurestabilität aufweisen und somit gut für eine orale Behandlung geeignet sind [5]
Das der vorliegenden Erfindung zugrundeliegende Konzept ist in Figur 1 illustriert: Fadenförmige Candidatus Savagella Bakterien („segmented filamentous bacteria“, SFB) besiedeln die Darmwand und aktivieren über dendritische Zellen Thl7 Zellen, die zur Autoimmunität und Atopie beitragen. Zuerst werden geeignete Bakterienwandproteine des genannten Bakteriums identifiziert, synthetisiert und in Hühner injiziert. Die Hühner bilden hochspezifische, neutralisierende anti-SFB Antikörper, die aus den Eiern isoliert werden können und für die orale Antikörpertherapie zur Verfügung stehen. Eine Reduktion der SFB Keimzahl im Darm kann zu einer Reduktion der Thl7 Effektorzellaktivität und somit zur Immuntoleranz führen.
Eine spezifische Neutralisierung von SFB mit oral applizierten Antikörpern hat den großen Vorteil, dass es praktisch nicht zu einem Übertritt der Antikörper in die Zirkulation kommt und somit häufige Nebenwirkungen einer Antikörpertherapie vermieden werden können, oder Nebenwirkungen wie sie etwa bei Dexamethason für die allergische Atemwegserkrankung beobachtet werden. Beispiele für die erfolgreiche orale Nutzung von Antikörpern für die Reduktion darmpathogener Viren [14], Pilze [15] und Bakterien [16; 17] sind bereits beschrieben. Orale Antikörpertherapien mit dem Ziel der Immunmodulation sind bisher jedoch nur mit dem direkten Ziel Immunsystem durchgeführt worden. Ein erfolgreiches Beispiel hierfür ist die Nutzung von Antikörpern gegen das T Zell Oberflächenprotein CD3 ([18]; US 7,883,703 B2).
Ein wesentlicher Vorteil dieser Erfindung ist der Einsatz therapeutischer IgY Antikörper aus den Eiern von immunisierten Hühnern. Diese Methode bietet zahlreiche Vorteile: Neben einer sehr kostengünstigen Herstellung können die Antikörper schnell und in großen Mengen produziert werden. lgY sind säurebeständiger als lgG und sind daher besonders gut für die orale Applikation geeignet. Ein Huhn kann pro Jahr bis zu 30 g reinen Antikörper produzieren, der zudem eine hohe Bindungsstärke aufweist. Schließlich weisen lgY eine andere Fc Region auf als Säugetier lgG; es kommt daher nicht zu Nebenwirkungen wegen einer Aktivierung des Empfänger- Komplementsystems [5]
In einem„proof-of-concept“ Experiment konnte bereits nachgewiesen werden, dass die orale Gabe von anti-SFB lgY Antikörpern zu einer deutlichen Reduktion der SFB Ausscheidung - als Korrelat der intestinalen SFB Besiedelung - führt. Hinweise für die therapeutische Relevanz dieser Mikrobio mveränderung wurde schließlich im Tiermodell der allergischen Atemwegserkrankung beobachtet (Fraunhofer ITEM): Die Reduktion der intestinalen SFB Besiedlung führte zu einer Abschwächung der Entzündungszellinfiltration in die Funge, in einem vergleichbaren Maße wie das Standardtherapeutikum Dexamethason.
Eine lgY antikörpervermittelte Inhibierung des Bakteriums Candidatus Savagella (SFB) kann einen direkten Einfluss auf immunvermittelte Erkrankungen haben. Immunerkrankungen wie multiple Sklerose, rheumatoide Arthritis und allergisches Asthma werden hierbei wesentlich von der Aktivität von Th 17 Immunzellen bestimmt. Aber auch andere, durch die Th 17 Aktivität bestimmte Immunerkrankungen oder onkologische Erkrankungen können durch eine Depletion von SFB vorbeugend bzw. therapeutisch behandelt werden.
Der Einsatz dieser lgY Antikörper ist denkbar als Medikament zur Vorbeugung bzw. Therapie immunvermittelter Erkrankungen, insbesondere Th 17 abhängiger Erkrankungen. Hierbei soll es sich um ein Therapeutikum zur Mikrobiomkorrektur handeln. Dieses kann auch als„Functional Food" bzw.„Nutrazeutika" eingesetzt werden, so dass gegebenenfalls Möglichkeiten für eine stark vereinfachte Zulassung bestehen, zum Beispiel als„Novel Food“.
Ein Einsatz der erfindungsgemäßen Antikörper ist bevorzugt für eine orale Applikation im Menschen vorgesehen.
Das Bakterium„ Candidatus Savagella“ (englisch„segmented filamentous bacteria“, SFB) ist beispielsweise von Schnupf et al. (Curr Opin Microbiol. 2017 Feb; 35: 100-109. doi: l0.l0l6/j.mib.20l7.03.004. Epub 2017 Apr 25; Semin Immunol. 2013 Nov 30; 25(5): 342-51. doi: l0.l0l6/j.smim.20l3.09.00l. Epub 2013 Oct 31) sowie in US 2012/276149 und WO 2011/047153 beschrieben.
Das„Antigen“ des Bakteriums Candidatus Savagella, das vom erfindungsgemäßen Antikörper oder dem antigen-bindenden Fragment des Antikörpers spezifisch gebunden wird, ist involviert in die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen, vorzugsweise humane Darmepithelzellen, die Proliferation des Bakteriums, und/oder vermittelt eine Depletion, also eine Abtötung des Bakteriums. Ein geeignetes Antigen aus Candidatus Savagella Bakterien wird aus der Gruppe von funktionsbestimmenden und„segmented filamentous bacteria“ (SFB)- spezifischen Proteinen selektioniert. Ein solches Protein ist etwa dadurch charakterisiert, dass es bakterienwandständig ist (Bakterienwandprotein) und eine wesentliche oder gar unikale Rolle für Adhärenz an das intestinale Epithel und/oder das Überleben von Candidatus Savagella oder „segmented filamentous bacteria“ (SFB) innehat.
Ein geeignetes Antigen aus dem genannten Bakterium ist beispielsweise das in der Folge näher beschriebene„myosin-cross-reactive antigen“ (MCRA) Protein, dessen Aminosäuresequenz in der SEQ ID Nr. 1 gezeigt ist. Spezifische Epitope aus dem„myosin-cross-reactive antigen“ (MCRA) Protein umfassen z.B. die Aminosäuresequenz SVLDEFYWLDKKDPYSL (SEQ ID Nr. 2), PDFKAVRFTRRNQYESMI (SEQ ID Nr. 3), oder QATSIKILRDGKEEEIKL (SEQ ID Nr. 4).
„Spezifische Bindung“ des erfindungsgemäßen Antikörpers oder eines Fragmentes davon an ein Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella umschreibt die Bindeeigenschaften des Antikörpers, wie etwa, Bindungsaffinität, Bindespezifität und Bindungsavidität; siehe z.B. David J. King, Applications and Engineering of Monoclonal Antibodies, pp. 240 (1998). Detaillierte Analysen von Antigen- Antikörper- Wechselwirkungen sind beispielsweise mit Oberflächen Plasmonresonanz (surface plasmon resonance, SPR) möglich. Die kinetische Charakterisierung der Bindungseigenschaften von Antikörpern und deren Antigenen ist eine wesentliche Voraussetzung, um ihre Anwendbarkeit für verschiedene Methoden bewerten zu können. Neben der Bindungsstärke (Affinität, KD- Wert) werden auch die Geschwindigkeitskonstanten für Assoziation (kass) und Dissoziation (kdiss) bestimmt. Damit sind auch Aussagen über die Geschwindigkeit der Komplexbildung und des Komplexzerfalls möglich. Diese Informationen helfen, die Effizienz der erfindungsgemäßen Antikörper in diagnostischen, biotechnologischen oder therapeutischen Anwendungen beurteilen und Prozesse in deren Anwendung optimieren zu können. Die genannten Begriffe und Abkürzungen in Bezug auf die spezifische Bindung werden mit ihren Standardbedeutungen verwendet.
Der Begriff„Antikörper“ umfasst sowohl einen polyklonalen als auch monoklonalen Antikörper (mAb), der verändert sein kann, wie in der Folge beschrieben. Der Antikörper bindet spezifisch an ein Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella und ist vorzugsweise ein neutralisierender Antikörper.
"Neutralisierender Antikörper" bezeichnet dabei die Inhibierung der Anhaftung oder Bindung des Bakteriums Candidatus Savagella an (vorzugsweise humane) Darmepithelzellen, die Inhibierung der Proliferation des genannte Bakteriums, und/oder dessen Depletion oder Abtötung, durch den Antikörper. "Neutralisierung“ des Bakteriums Candidatus Savagella bezeichnet mindestens 50 %, 60 %, 70 % oder 75 %, bevorzugt 80 % oder 85 %, besonders bevorzugt 90 % oder 95 % Inhibierung der Anhaftung oder Bindung des genannten Bakteriums an Darmepithelzellen, oder der Inhibierung der Proliferation des Bakteriums, oder dass mindestens 50 %, 60 %, 70 % oder 75 %, bevorzugt 80 % oder 85 %, besonders bevorzugt 90 % oder 95 % der Gesamtzahl oder Population des Bakteriums depletiert werden, gemessen in in-vitro-Untersuchungen.
"Veränderter Antikörper" bezeichnet ein durch eine veränderte Immunglobulin-codierende Region codiertes Protein, das durch Expression in einer ausgewählten Wirtszelle erhalten werden kann. Solche veränderten Antikörper schließen gentechnisch hergestellte Antikörper (z.B. chimäre, umgeformte, humanisierte oder vektorisierte Antikörper) oder Antikörperfragmente ein, denen die gesamte oder ein Teil einer konstanten Immunglobulinregion fehlt, z.B. Fv, Fab oder F(ab)2 und dergleichen.
"Veränderte Immunglobulin-codierende Region" bezeichnet eine Nukleinsäuresequenz, die einen veränderten Antikörper codiert. Wenn der veränderte Antikörper ein CDR-grafted oder humanisierter Antikörper ist, werden die Sequenzen, die die Komplementaritäts-bestimmenden Regionen (CDRs) aus einem nicht-humanen Immunglobulin, etwa einem Hühner Antikörper, codieren, in einen ersten Immunglobulinpartner inseriert, der humane variable Gerüstsequenzen umfaßt. Gegebenenfalls ist der erste Immunglobulinpartner operativ mit einem zweiten Immunglobulinpartner verbunden, etwa um einen bispezifischen Antikörper herzustellen.
"Erster Immunglobulinpartner" bezeichnet eine Nukleinsäuresequenz, die eine humane Gerüstregion oder variable Region eines humanen Immunglobulins codiert, worin die nativen (oder natürlich vorkommenden) CDR-codierenden Regionen durch die CDR-codierenden Regionen eines Donor-Antikörpers, z.B. eines Hühner Antikörpers, ersetzt sind. Die humane variable Region kann eine schwere Kette, eine leichte Kette (oder beide Ketten) eines Immunglobulins, ein Analogon oder funktionelle Fragmente davon sein. Solche CDR-Regionen, die sich innerhalb der variablen Region von Antikörpern (Immunglobulinen) befinden, können durch fachbekannte Verfahren bestimmt werden. Zum Beispiel offenbaren Kabat et al. (Sequences of Proteins of Immunological Interest, 4. Aufl., U.S. Department of Health and Human Services, National Institutes of Health (1987)) Regeln zur Fokalisierung von CDRs. Zusätzlich sind Computerprogramme bekannt, die zur Identifizierung von CDR- Regionen/Strukturen nützlich sind.
"Zweiter Immunglobulinpartner" bezeichnet eine andere Nukleotidsequenz, die ein Protein oder Peptid codiert, an das der erste Immunglobulinpartner im Raster oder mittels einer optionalen herkömmlichen Finker- Sequenz fusioniert ist, d.h. operativ gebunden ist. Bevorzugt ist er ein Immunglobulin-Gen. Der zweite Immunglobulinpartner kann eine Nukleinsäuresequenz einschließen, die die gesamte konstante Region für den gleichen (d.h. homologen - der erste und der zweite veränderte Antikörper stammen aus der gleichen Quelle) oder einen zusätzlichen (d.h. heterologen) Antikörper von Interesse codiert. Er kann eine schwere Kette oder leichte Kette eines Immunglobulins sein (oder beide Ketten als Teil eines einzelnen Polypeptids). Der zweite Immunglobulinpartner ist nicht auf eine besondere Immunglobulinklasse oder einen Isotyp beschränkt. Zusätzlich kann der zweite Immunglobulinpartner einen Teil einer konstanten Region eines Immunglobulins umfassen, wie er in einem Fab oder F(ab)2 gefunden wird, d.h. ein diskreter Teil einer humanen konstanten Region oder Gerüstregion. Ein solcher zweiter Immunglobulinpartner kann auch eine Sequenz umfassen, die ein integrales Membranprotein codiert, das an der äußeren Oberfläche einer Wirtszelle exponiert ist, zum Beispiel als Teil einer Phagen-Display-Bibliothek, oder eine Sequenz, die ein Protein für den analytischen oder diagnostischen Nachweis codiert, z.B. Meerrettichperoxidase, ß-Galactosidase etc.
Die Begriffe Fv, Fc, Fd, Fab oder F(ab)2 werden mit ihren Standardbedeutungen verwendet (siehe z.B. Harlow et ab, Antibodies A Faboratory Manual, Cold Spring Harbor Faboratory (1988)).
Wie hier verwendet beschreibt ein "gentechnisch hergestellter Antikörper" einen Typ von verändertem Antikörper, d.h. einen synthetischen Antikörper voller Fänge (z.B. einen chimären, ungeformten oder humanisierten Antikörper im Gegensatz zu einem Antikörperfragment), in dem ein Teil der variablen Domänen der leichten und/oder schweren Kette eines ausgewählten Akzeptorantikörpers durch analoge Teile aus einem oder mehreren Donor-Antikörpern (z.B. Hühner Antikörper) ersetzt ist, die Spezifität für das ausgewählte Epitop haben. Zum Beispiel können solche Moleküle Antikörper einschließen, die durch eine humanisierte schwere Kette charakterisiert sind, die mit einer unmodifizierten leichten Kette oder (oder chimären leichten Kette) assoziiert sind, oder umgekehrt. Gentechnisch hergestellte Antikörper können auch durch Veränderung der Nukleinsäuresequenzen gekennzeichnet sein, die die Gerüstregionen der leichten und/oder schweren variablen Domäne des Akzeptor-Antikörpers codieren, um die Donor- Antikörper-Bindungsspezifität, z.B. eines Hühner Antikörpers, beizubehalten. Diese Antikörper können einen Austausch eines (z.B. CDR-H3) oder mehrerer CDRs (bevorzugt aller CDRs, d.h. CDR-Fl, CDR-F2, CDR-F3, CDR-Hl, CDR-H2, und CDR-H3) aus dem Akzeptor- Antikörper gegen CDRs aus einem hier beschriebenen Donor-Antikörper, d.h. einem Hühner Antikörper, umfassen.
Ein "chimärer Antikörper" bezeichnet einen Typ von gentechnisch hergestelltem Antikörper, der eine natürlich vorkommende variable Region (leichte Kette und schwere Ketten), die aus einem Donor-Antikörper (z.B. einem Hühner Antikörper) stammt, in Verbindung mit konstanten Regionen der leichten und schweren Kette enthält, die aus einem Akzeptor- Antikörper stammen.
Ein "humanisierter Antikörper" bezeichnet einen Typ von gentechnisch hergestelltem Antikörper, dessen CDRs aus einem nicht-humanen Donor-Immunglobulin, etwa einem Hühner Antikörper, stammen, wobei die verbleibenden aus Immunglobulin stammenden Teile des Moleküls aus einem (oder mehreren) humanen Immunglobulinen stammen. Zusätzlich können Gerüstträgerreste verändert sein, um die Bindungsaffinität zu bewahren (siehe z.B. Queen et al, Proc. Natl. Acad. Sei. USA, 86: 10029-10032 (1989), Hodgson et al, Bio/Technology, 9:421 (1991)).
An den Antikörper kann ein Mittel gebunden werden, beispielsweise um den Transport in den Darm zu verbessern. Dabei können beispielsweise durch das am Antikörper gebundene Mittel aktiv oder passiv Transporterproteine im Darm beeinflusst werden. Die Anbringung kann chemisch sein, oder alternativ kann die Einheit gentechnisch in den Antikörper eingebaut werden.
Der Begriff "Donor-Antikörper" bezeichnet einen Antikörper (monoklonal oder rekombinant), der die Nukleinsäuresequenzen seiner variablen Regionen, CDRs oder andere funktionale Fragmente oder Analoga davon für einen ersten Immunglobulinpartner beiträgt, um die veränderte Immunglobulin-codierende Region und den resultierenden exprimierten veränderten Antikörper mit der antigenen Spezifität und neutralisierenden Aktivitätseigenschaft des Donor- Antikörpers, z.B. des Hühner Antikörpers, zu versehen.
Der Begriff "Akzeptor-Antikörper" bezeichnet einen Antikörper (monoklonal oder rekombinant), der heterolog für den Donor- Antikörper ist und alle (oder einen Teil, aber bevorzugt alle) Nukleinsäuresequenzen, die seine Gerüstregionen der schweren und/oder leichten Kette und/oder seine konstanten Regionen der schweren und/oder leichten Kette codieren, für den ersten Immunglobulinpartner beiträgt. Bevorzugt ist ein humaner Antikörper der Akzeptor- Antikörper.
"CDRs" werden als die Aminosäuresequenzen der Komplementarität bestimmenden Region eines Antikörpers definiert, die die hypervariablen Regionen der schweren und leichten Ketten eines Immunglobulins sind. Siehe z.B. Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 4. Aufl., U.S. Department of Health and Human Services, National Institutes of Health (1987). Es gibt drei CDRs der schweren Kette (CDR-Hl, -2 und -3) und drei CDRs der leichten Kette (CDR-Ll, -2 und -3) (oder CDR-Regionen) im variablen Teil eines Immunglobulins. So bezeichnet "CDRs" wie hier verwendet alle drei CDRs der schweren Kette oder alle drei CDRs der leichten Kette (oder sowohl alle CDRs der schweren und alle der leichten Kette, falls passend). Die Struktur und Proteinfaltung des Antikörpers kann bedeuten, dass andere Reste als Teil der Antigen-Bindungsregion betrachtet werden, und sie würden so von einem Fachmann verstanden werden. Siehe zum Beispiel Chothia et al. (1989), Conformations of immunoglobulin hypervariable regions; Nature 342, S. 877-883. CDRs liefern die Mehrzahl der Kontaktreste für die Bindung des Antikörpers an das Antigen oder Epitop. CDRs von Interesse in dieser Erfindung stammen aus den Sequenzen der variablen schweren und leichten Kette des Donor- Antikörpers, z.B. eines Hühner Antikörpers, und schließen Analoga der natürlich vorkommenden CDRs ein, wobei die Analoga die gleiche Antigen-Bindungsspezifität und/oder neutralisierende Fähigkeit wie der Donor-Antikörper teilen oder beibehalten, aus dem sie abgeleitet wurden.
Ein "funktionales Fragment" ist eine partielle variable Sequenz der schweren oder leichten Kette (z.B. geringfügige Deletionen am Amino- oder Carboxy-Terminus der variablen Region des Immunglobulins), die die gleiche Antigen-Bindungsspezifität und/oder neutralisierende Fähigkeit wie der Antikörper beibehält, aus dem das Fragment abgeleitet wurde.
Ein "Analogon" ist eine mit wenigstens einer Aminosäure modifizierte Aminosäuresequenz, worin die Modifikation chemisch oder eine Substitution oder Umlagerung einiger weniger Aminosäuren (d.h. vorzugsweise nicht mehr als 10, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2 oder 1 Aminosäurerest(e)) sein kann, wobei die Modifikation der Aminosäuresequenz erlaubt, die biologischen Eigenschaften, zum Beispiel Antigenspezifität und hohe Affinität, der unmodifizierten Sequenz zu bewahren. Zum Beispiel können (stumme) Mutationen über Substitutionen konstruiert werden, wenn bestimmte Endonuklease-Restriktionsorte innerhalb oder umgebend um CDR-codierende Regionen geschaffen werden. Die vorliegende Erfindung erwägt die Verwendung von Analoga des Antikörpers der Erfindung. Es ist allgemein bekannt, dass geringfügige Veränderungen von Aminosäure- oder Nukleinsäuresequenzen zum Beispiel zu einer allelischen Form des ursprünglichen Proteins führen können, die im Wesentlichen ähnliche Eigenschaften beibehalten. Somit schließen Analoga des Antikörpers der Erfindung diejenigen ein, in denen die CDRs in der hypervariablen Region der schweren und leichten Ketten wenigstens 80 % homolog, bevorzugt wenigstens 85%, wenigstens 90 % homolog und besonders bevorzugt wenigstens 95 %, 96 %, 97 %, 98 % oder 99 % homolog zu den CDRs wie oben definiert als CDR-Hl, CDR-H2, CDR-H3, CDR-Ll, CDR-L2 und CDR-L3 sind und die spezifischen Bindung an ein Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella und neutralisierende Aktivität beibehalten. Aminosäuresequenzen sind wenigstens 80 % homolog, falls sie 80 % identische Aminosäurereste in einer ähnlichen Position haben, wenn die Sequenzen optimal angeglichen sind, wobei Lücken oder Insertionen als nicht-identische Reste gezählt werden. Algorithmen zur Bestimmung der Sequenzidentität und Programme zum Sequenzvergleich sind im Stand der Technik hinlänglich bekannt.
Analoga können auch als allelische Variationen auftreten. Eine "allelische Variation oder Modifikation" ist eine Veränderung in der Nukleinsäuresequenz. Solche Variationen oder Modifikationen können auf der Degeneriertheit des genetischen Codes beruhen oder können absichtlich gentechnisch oder rekombinant hergestellt werden, um die gewünschten Eigenschaften zu liefern. Diese Variationen und Modifikationen können oder können nicht zu Veränderungen in einer codierten Aminosäuresequenz führen.
Der Begriff "Effektormittel" bezeichnet Nicht-Protein-Trägermoleküle, an die die veränderten Antikörper und/oder natürliche oder synthetische leichte oder schwere Ketten des Donor- Antikörpers, etwa eines Hühner Antikörpers, oder andere Fragmente des Donor-Antikörpers durch herkömmliche Mittel assoziiert werden können. Solche Nicht-Proteinträger können herkömmliche Träger einschließen, die auf dem diagnostischen Gebiet verwendet werden, zum Beispiel Polystyrol oder andere Kunststoffkügelchen, Polysaccharide, z.B. wie im BIAcore- System [Pharmacia] verwendet, oder andere Nicht-Proteinsubstanzen, die auf dem medizinischen Gebiet nützlich und sicher zur Verabreichung an Menschen und Tiere sind. Andere Effektormittel können einen Makrozyklus zur Komplexierung eines Schwermetallatoms oder Radioisotope einschließen. Solche Effektormittel können auch nützlich zur Erhöhung der Halbwertszeit der veränderten Antikörper sein, z.B. Polyethylenglykol (PEG).
Ein für das Bakterium Candidatus Savagella spezifischer neutralisierender Antikörper wurde bislang noch nicht im Stand der Technik beschrieben und wird erstmals durch die vorliegende Erfindung zur Verfügung gestellt.
Ein weiterer Aspekt der Erfindung stellt eine pharmazeutische Zusammensetzung bereit, die einen erfindungsgemäßen Antikörper zusammen mit einem pharmazeutisch akzeptablen Verdünnungsmittel oder Träger umfasst.
Wie dem Fachmann geläufig, kann man Antikörper, veränderte Antikörper und Fragmente durch Immunisieren einer nicht-humanen Art (zum Beispiel Rind, Schaf, Affe, Huhn, Nagetier (z.B. Maus, Hamster und Ratte) etc.) konstruieren, um ein wünschenswertes Immunglobulin bei Präsentation mit nativem oder rekombinanten Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella aus jeder Art zu erzeugen, gegen die Antikörper, die kreuzreaktiv gegenüber dem nativem oder rekombinanten Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella sind, erzeugt werden können, z.B. Mensch oder Huhn. Herkömmliche Hybridomtechniken werden eingesetzt, um eine Hybridom-Zelllinie bereitzustellen, die einen nicht-humanen monoklonalen Antikörper, etwa einen Hühner Antikörper, gegen das native Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella sezemiert. Solche Hybridome werden dann auf Bindung unter Verwendung von auf Platten mit 384 oder 96 Vertiefungen aufgetragenem nativen oder rekombinanten Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella, wobei biotinyliertes natives oder rekombinantes Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella an eine Streptavidin-beschichtete Platte gebunden ist, oder in einem homogenen Europium-APC-gekoppelten Immunoassay unter Verwendung von biotinyliertem nativem oder rekombinantem Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella durchmustert. Ein nativer humaner Antikörper kann z.B. in einer humanen Antikörper-Maus wie der "Xenomouse" (Abgenix) erzeugt werden, worin die Immunglobulin-Gene der Maus entfernt und Gene, die die humanen Immunglobuline codieren, in das Maus-Chromosom inseriert wurden. Die Mäuse werden normal immunisiert und entwickeln eine Antikörperreaktion, die aus den humanen Genen stammt. Somit erzeugt die Maus humane Antikörper unter Umgehung der Notwendigkeit zur Humanisierung nach Selektion positiver Hybridome (siehe L.L. Green, J. Immunol. Methods, 10. Dez. 1999; 231 (1-2): 11-23).
Ein Fab-Fragment enthält die gesamte leichte Kette und den Amino -terminalen Teil der schweren Kette; und ein F(ab')2-Fragment ist das durch zwei Fab-Fragmente, die durch Disulfidbindungen gebunden sind, gebildete Fragment. Fab-Fragmente und F(ab')2-Fragmente können durch herkömmliche Mittel, z.B. Spaltung von monoklonalen Antikörpern (mAb) mit den geeigneten proteolytischen Enzymen, Papain und/oder Pepsin, oder durch rekombinante Verfahren erhalten werden. Die Fab- und F(ab’)2-Fragmente sind selbst als Therapeutikum oder Prophylaktikum und als Donoren für Sequenzen nützlich, die die variablen Regionen und CDR- Sequenzen einschließen, die nützlich in der Bildung von rekombinanten oder humanisierten Antikörpern wie hier beschrieben sind.
Die Fab- und F(ab’)2-Fragmente können auch über eine kombinatorische Phagen-Bibliothek konstruiert werden (siehe z.B. Winter et al., Ann. Rev. Immunol., 12:433-455 (1994)), oder über Immunglobulin-Kettenaustausch ("chain shuffling") (siehe z.B. Marks et al., Bio Technology, 10:779-783 (1992)).
So können humane Antikörperfragmente (Fv, scFv, Fab), die für ein natives oder rekombinantes Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella spezifisch sind, unter Verwendung humaner Antikörperfragment-Phagen-Display-Bibliotheken isoliert werden. Eine Bibliothek von Bakteriophagenpartikeln, die die humanen Antikörperfragmentproteine darstellen, wird gegen das native oder rekombinante Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella getestet. Diejenigen Phagen, die Antikörperfragmente darstellen, die das native oder rekombinante Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella binden, werden aus der Bibliothek zurückbehalten und klonierend amplifiziert. Die humanen Antikörper-Gene werden dann aus dem spezifischen Bakteriophagen ausgeschnitten und in humane IgG-Expressionskonstrukte inseriert, die die konstanten Regionen von humanem IgG enthalten, um das intakte humane IgG- Molekül mit den variablen Regionen aus dem für natives oder rekombinantes Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella spezifischen, isolierten Bakteriophagen zu bilden.
Die Donor-Antikörper können Sequenzen, wie z.B. Peptidsequenzen der variablen schweren und/oder leichten Kette, Gerüstsequenzen, CDR- Sequenzen, funktionale Fragmente und Analoga davon, und die sie codierenden Nukleinsäuresequenzen beitragen, die nützlich in der Konstruktion und im Erhalt verschiedener veränderter Antikörper sind, die durch die Antigen- Bindungsspezifität des Donor-Antikörpers, z.B. eines Hühner Antikörpers, gekennzeichnet sind.
Unter Berücksichtigung der Degeneriertheit des genetischen Codes können verschiedene codierende Sequenzen konstruiert werden, die die Aminosäuresequenzen der variablen schweren und leichten Kette codieren, und CDR-Sequenzen sowie funktionale Fragmente und Analoga davon, die die Antigenspezifität des Donor-Antikörpers, etwa eines Hühner Antikörpers, teilen. Isolierte Nukleinsäuresequenzen oder Fragmente davon, die die Peptidsequenzen der variablen Kette oder CDRs codieren, können zur Erzeugung veränderter Antikörper, zum Beispiel chimärer oder humanisierter Antikörper, oder anderer gentechnisch hergestellter Antikörper verwendet werden, wenn sie operativ mit einem zweiten Immunglobulinpartner kombiniert werden.
Veränderte Immunglobulinmoleküle können veränderte Antikörper codieren, die gentechnisch veränderte Antikörper wie chimäre Antikörper und humanisierte Antikörper einschließen. Eine gewünschte veränderte Immunglobulin-codierende Region enthält CDR-codierende Regionen, die Peptide mit der Antigenspezifität eines anti -Candidatus Savagella Antigen-Antikörpers codieren, bevorzugt eines hochaffinen Antikörpers, inseriert in einen ersten Immunglobulinpartner (eine humane Gerüstregion oder variable Region eines humanen Immunglobulins).
Bevorzugt ist der erste Immunglobulinpartner operativ mit einem zweiten Immunglobulinpartner verbunden. Der zweite Immunglobulinpartner ist oben definiert und kann eine Sequenz einschließen, die eine zweite Antikörperregion von Interesse codiert, z.B. eine Fc-Region. Zweite Immunglobulinpartner können auch Sequenzen einschließen, die ein anderes Immunglobulin codieren, an das die konstante Region der leichten oder schweren Kette im Raster oder mittels einer Linker- Sequenz fusioniert ist. Gentechnisch hergestellte Antikörper, die gegen funktionale Fragmente oder Analoga von nativem oder rekombinantem Antigen aus dem Bakterium Candidatus Savagella gerichtet sind, können zur Hervorrufung einer gesteigerten Bindung konstruiert werden.
Der zweite Immunglobulinpartner kann auch mit Effektormitteln wie oben definiert assoziiert sein, einschließlich von Nicht-Protein-Trägermolekülen, an die der zweite Immunglobulinpartner operativ durch herkömmliche Mittel gebunden sein kann.
Die Fusion oder Bindung zwischen den zweiten Immunglobulinpartnem, zum Beispiel Antikörpersequenzen, und dem Effektormittel kann durch jedes geeignete Mittel erfolgen, zum Beispiel durch herkömmliche kovalente oder ionische Bindungen, Proteinfüsionen oder heterobifünktionelle Vernetzer, z.B. Carbodiimid, Glutaraldehyd und dgl. Solche Techniken sind fachbekannt und allgemein in herkömmlichen Chemie- und Biochemietexten beschrieben. Zusätzlich können herkömmliche Linker- Sequenzen, die einfach eine gewünschte Menge an Raum zwischen dem zweiten Immunglobulinpartner und dem Effektormittel vorsehen, auch in die veränderte Immunglobulin-codierende Region konstruiert werden. Die Konstruktion solcher Linker ist den Fachleuten allgemein bekannt.
In noch einer weiteren Ausführungsform kann der Antikörper ein zusätzliches Mittel daran angebracht aufweisen. Zum Beispiel kann das Verfahren der rekombinanten DNA-Technik verwendet werden, um einen gentechnisch hergestellten Antikörper zu erzeugen, in dem das Fc- Fragment oder die CH2-CH3 -Domäne eines kompletten Antikörpermoleküls durch ein Enzym oder ein anderes detektierbares Molekül (d.h. einen Polypeptid-Effektor oder ein Reportermolekül) ersetzt wurde.
Der zweite Immunglobulinpartner kann auch operativ mit einem Nicht-Immunglobulinpeptid, - protein oder -fragment davon verbunden sein, das heterolog zur CDR-haltigen Sequenz mit der Antigenspezifität von anti -Candidatus Savagella Antigen-Antikörpem ist. Das resultierende Protein kann sowohl Anti -Candidatus Savagella-Antigenspezifität als auch Eigenschaften des Nicht-Immunglobulins bei der Expression aufweisen. Die Eigenschaft des Fusionspartners kann z.B. eine funktionale Eigenschaft wie eine andere Bindungs- oder Rezeptordomäne oder eine therapeutische Eigenschaft, falls der Fusionspartner selbst ein therapeutisches Protein ist, oder zusätzliche antigene Eigenschaften sein.
Ein anderes wünschenswertes Protein dieser Erfindung kann ein komplettes Antikörpermolekül mit schweren und leichten Ketten voller Länge oder jedes diskrete Fragment davon wie die Fab- oder F(ab')2-Fragmente, ein Dimer der schweren Kette oder beliebige minimale rekombinante Fragmente davon wie ein Fv oder ein einkettiger Antikörper (SCA) oder jedes andere Molekül mit der gleichen Spezifität wie der ausgewählte Donor- Antikörper, etwa ein Hühner Antikörper, sein. Ein solches Protein kann in Form eines veränderten Antikörpers verwendet werden oder kann in seiner unfusionierten Form verwendet werden.
Immer wenn der zweite Immunglobulinpartner aus einem Antikörper stammt, der sich vom Donor-Antikörper, etwa einem Hühner Antikörper, unterscheidet, resultiert ein gentechnisch oder rekombinant hergestellter Antikörper. Gentechnisch oder rekombinant hergestellte Antikörper können konstante Regionen des Immunglobulins (lg) und variable Gerüstregionen aus einer Quelle, z.B. dem Akzeptor-Antikörper, und ein oder mehrere (bevorzugt alle) CDRs aus dem Donor-Antikörper, etwa einem Hühner Antikörper, umfassen. Zusätzlich können Veränderungen, z.B. Deletionen, Substitutionen oder Additionen, der Gerüstregion der leichten und/oder schweren variablen Domäne des Akzeptor-monoklonalen Antikörpers (mAb) auf der Nukleinsäure- oder Aminosäureebene oder der Donor-CDR-Regionen durchgeführt werden, um die Antigen-Bindungsspezifität des Donor-Antikörpers, etwa eines Hühner Antikörpers, beizubehalten. Solche gentechnisch oder rekombinant hergestellten Antikörper werden konstruiert, um eine (oder beide) der variablen schweren und/oder leichten Ketten des anti -Candidatus Savagella Antigen-Antikörpers oder eine oder mehrere der CDRs der schweren oder leichten Kette einzusetzen. Die gentechnisch oder rekombinant hergestellten Antikörper können neutralisierend wie oben definiert sein.
Solche gentechnisch oder rekombinant hergestellten Antikörper können einen humanisierten Antikörper, der die Gerüstregionen eines ausgewählten humanen Immunglobulins oder Subtyps enthält, oder einen chimären Antikörper einschließen, der die konstanten Regionen der humanen schweren und leichten Kette enthält, fusioniert an die funktionalen Fragmente des Anti- Candidatus Savagella Antigen- Antikörpers. Ein geeigneter humaner (oder anderer tierischer) Akzeptor- Antikörper kann ein aus einer herkömmlichen Datenbank, z.B. der KABAT®- Datenbank, der Los Alamos-Datenbank und Swiss Protein-Datenbank, durch Homologie mit den Nukleotid- und Aminosäuresequenzen des Donor-Antikörpers, etwa eines Hühner Antikörpers, ausgewählter sein. Ein humaner Antikörper, der durch eine Homologie mit den Gerüstregionen des Donor-Antikörpers (auf einer Aminosäurebasis) gekennzeichnet ist, kann geeignet sein, um eine konstante Region der schweren Kette und/oder eine variable Gerüstregion der schweren Kette zur Insertion der Donor-CDRs bereitzustellen. Ein geeigneter Akzeptor-Antikörper, der konstante oder variable Gerüstregionen der leichten Kette spenden kann, kann in einer ähnlichen Weise ausgewählt werden. Es sollte beachtet werden, dass die schweren und leichten Ketten des Akzeptor- Antikörpers nicht aus dem gleichen Akzeptor- Antikörper stammen müssen.
Wünschenswert werden die heterologen Gerüstregionen und die konstanten Regionen aus humanen Immunglobulinklassen und -isotypen wie IgG (Subtypen 1 bis 4), IgM, IgA und IgE ausgewählt. Jedoch braucht der Akzeptor-Antikörper nicht nur humane Immunglobulin- Proteinsequenzen umfassen. Zum Beispiel kann ein Gen konstruiert werden, in dem eine DNA- Sequenz, die einen Teil einer humanen Immunglobulinkette codiert, an eine DNA-Sequenz fusioniert ist, die eine Nicht-Immunglobulin-Aminosäuresequenz wie einen Polypeptideffektor oder ein Reportermolekül codiert.
Bevorzugt wurden in einem humanisierten Antikörper die variablen Domänen sowohl in den humanen schweren als auch leichten Ketten durch eine oder mehrere CDR-Austausche gentechnisch hergestellt. Es ist möglich, alle sechs CDRs oder verschiedene Kombinationen aus weniger als den sechs CDRs zu verwenden. Bevorzugt werden alle sechs CDRs ausgetauscht. Es ist möglich, die CDRs nur in der humanen schweren Kette auszutauschen, wobei als leichte Kette die unmodifizierte leichte Kette aus dem humanen Akzeptor-Antikörper verwendet wird. Alternativ kann eine kompatible leichte Kette aus einem anderen humanen Antikörper durch Rückgriff auf die herkömmlichen Antikörper-Datenbanken ausgewählt werden. Der Rest des gentechnisch hergestellten Antikörpers kann aus jedem geeigneten humanen Akzeptor- Immunglobulin stammen. Der gentechnisch oder rekombinant hergestellte humanisierte Antikörper hat somit die Struktur eines natürlichen humanen Antikörpers oder eines Fragments davon und besitzt die Kombination von Eigenschaften, die für eine wirksame therapeutische Verwendung erforderlich sind.
Die Fachleute werden verstehen, dass ein gentechnisch hergestellter Antikörper weiter durch Veränderungen der Aminosäuren der variablen Domäne modifiziert werden kann, ohne dass notwendigerweise die Spezifität und hohe Affinität des Donor-Antikörpers, etwa eines Hühner Antikörpers, beeinflusst wird (d.h. ein Anologon). Es ist vorhergesehen, dass Aminosäuren der schweren und leichten Kette durch andere Aminosäuren entweder in den Gerüsten der variablen Domäne oder CDRs oder beiden substituiert werden können.
Zusätzlich kann die konstante Region verändert werden, um selektive Eigenschaften der Moleküle der vorliegenden Erfindung zu steigern oder zu verringern, wie zum Beispiel Dimerisierung, Bindung an Fc-Rezeptoren oder die Fähigkeit zur Bindung und Aktivierung von Komplement (siehe z.B. Angal et al., Mol. Immunol. 30:105-108 (1993), Xu et al, J. Biol. Chem. 239:3469-3474 (1994), Winter et al., EP 307,434-B).
Ein veränderter Antikörper, der ein chimärer Antikörper ist, unterscheidet sich von den oben beschriebenen humanisierten Antikörpern, indem er die gesamten variablen Regionen der schweren Kette und leichten Kette des nicht-humanen Donor-Antikörpers, etwa eines Hühner Antikörpers, einschließlich der Gerüstregionen, in Verbindung mit den konstanten Regionen des humanen Immunglobulins für beide Ketten bereitstellt.
Die Herstellung von Antikörpern, die spezifisch an ein Antigen binden, ist hinlänglich im Stand der Technik beschrieben, z.B. durch die in Sambrook et al. beschriebenen Techniken (Molecular Cloning (A Laboratory Manual), 2. Auflage, Cold Spring Harbor Laboratory (1989; 2001)). Die Herstellung eines humanisierten monoklonalen Antikörpers ist in der Folge kurz skizziert. Die variablen schweren und leichten Regionen, die wenigstens die CDR-codierenden Regionen und diejenigen Teile der Gerüstregionen der leichten und/oder schweren variablen Domäne des Akzeptor-mAb enthalten, die erforderlich sind, um die Bindungsspezifität des Donor-mAb, etwa eines Hühner monoklonalen Antikörpers beizubehalten, sowie die verbleibenden aus Immunglobulin stammenden Teile der Antikörperkette, die aus einem humanen Immunglobulin stammen, werden unter Verwendung von Polynukleotidprimem und Umkehrtranskriptase erhalten. Die CDR-codierenden Regionen werden unter Verwendung einer bekannten Datenbank und durch Vergleich mit anderen Antikörpern identifiziert.
Ein Hühner/humaner chimärer Antikörper kann dann hergestellt und auf Bindungsfähigkeit untersucht werden. Ein solcher chimärer Antikörper enthält die gesamten VH- und VL-Regionen des nicht-humanen Hühner Donor- Antikörpers in Verbindung mit den konstanten Regionen von humanem lg für beide Ketten. Homologe Gerüstregionen einer variablen Region der schweren Kette aus einem humanen Antikörper können unter Verwendung computerisierter Datenbanken, z.B. KABAT®, identifiziert werden, und ein humaner Antikörper mit Homologie zum Hühner Donor-Antikörper wird als Akzeptor-Antikörper ausgewählt werden. Eine geeignete variable Gerüstregion der leichten Kette kann in einer ähnlichen Weise geschaffen werden.
Ein humanisierter Antikörper kann aus dem chimären Antikörper stammen oder bevorzugt synthetisch durch Inserieren der CDR-codierenden Regionen des Hühner Donor-mAb aus den schweren und leichten Ketten in geeigneter Weise innerhalb des ausgewählten Gerüsts der schweren und leichten Kette hergestellt werden. Alternativ kann ein humanisierter Antikörper unter Verwendung von Mutagenese-Standardtechniken hergestellt werden. Somit enthält der resultierende humanisierte Antikörper humane Gerüstregionen und CDR-codierende Regionen des Hühner Donor-mAb. Es kann eine anschließende Manipulation von Gerüstresten geben. Der resultierende humanisierte Antikörper kann in rekombinanten Wirtszellen, z.B. COS-, CHO- oder Myelomzellen, exprimiert werden.
Ein herkömmlicher Expressionsvektor oder ein rekombinantes Plasmid wird durch Platzieren dieser codierenden Sequenzen für den Antikörper in operativer Assoziation mit herkömmlichen regulatorischen Kontra llsequenzen hergestellt, die die Vermehrung und Expression in und/oder Sekretion aus einer Wirtszelle kontrollieren können. Regulatorische Sequenzen schließen Promotorsequenzen, zum Beispiel einen CMV-Promotor, und Signalsequenzen ein, die aus anderen bekannten Antikörpern stammen können. In ähnlicher Weise kann ein zweiter Expressionsvektor mit einer DNA-Sequenz hergestellt werden, die eine komplementäre leichte oder schwere Kette eines Antikörpers codiert. Bevorzugt ist dieser zweite Expressionsvektor identisch mit dem ersten, ausgenommen insoweit die codierenden Sequenzen und selektierbaren Marker betroffen sind, um soweit wie möglich sicherzustellen, dass jede Polypeptidkette funktionell exprimiert wird. Alternativ können die codierenden Sequenzen der schweren und leichten Kette für den veränderten Antikörper auf einem einzelnen Vektor ruhen.
Eine ausgewählte Wirtszelle wird durch herkömmliche Techniken mit sowohl dem ersten als auch dem zweiten Vektor ko-transfiziert (oder einfach mit einem einzelnen Vektor transfiziert), um die transfizierte Wirtszelle zu erzeugen, die sowohl die rekombinanten oder synthetischen leichten als auch schweren Ketten umfat. Die transfizierte Zelle wird dann durch herkömmliche Techniken kultiviert, um den gentechnisch oder rekombinant hergestellten Antikörper der Erfindung zu erzeugen. Der humanisierte Antikörper, der die Assoziation der rekombinanten schweren Kette und/oder leichten Kette einschließt, wird aus der Kultur durch einen geeigneten Assay, zum Beispiel ELISA oder RIA, durchmustert. Ähnliche herkömmliche Techniken können eingesetzt werden, um andere veränderte Antikörpermoleküle zu konstruieren. Geeignete Vektoren für die in den Verfahren und der Konstruktion der hierin zur Verfügung gestellten Zusammensetzungen eingesetzten Klonierungs- und Subklonierungsschritte können durch einen Fachmann ausgewählt werden. Zum Beispiel kann die herkömmliche pUC-Reihe von Klonierungsvektoren verwendet werden. Ein Vektor, pUCl9, ist kommerziell erhältlich von Lieferanten wie Amersham (Buckinghamshire, United Kingdom) oder Pharmacia (Uppsala, Schweden). Zusätzlich kann jeder Vektor, der leicht vervielfältigt werden kann, eine Vielzahl von Klonierungsorten und selektierbaren Genen (z.B. Antibiotikaresistenz) aufweist und leicht manipuliert wird, zur Klonierung verwendet werden.
In ähnlicher Weise können die für die Expression der Antikörper eingesetzten Vektoren durch einen Fachmann aus jedem herkömmlichen Vektor selektiert werden. Die Vektoren enthalten auch ausgewählte regulatorische Sequenzen (wie CMV-Promotoren), die die Vervielfältigung und Expression heterologer DNA-Sequenzen in ausgewählten Wirtszellen ausrichten. Diese Vektoren enthalten die oben beschriebenen DNA-Sequenzen, die für den Antikörper oder die veränderte Immunglobulin-codierende Region codieren. Zusätzlich können die Vektoren die ausgewählten Immunglobulin-Sequenzen aufnehmen, die durch die Insertion gewünschter Restriktionsorte zur leichten Manipulation modifiziert sind.
Die Expressionsvektoren können auch durch Gene gekennzeichnet werden, die zur Amplifizierung der Expression der heterologen DNA-Sequenzen, zum Beispiel des Dihydrofolatreduktase-Gens (DHFR) aus Säugetier, geeignet sind. Andere bevorzugte Vektorsequenzen schließen eine Poly A-Signalsequenz ein, wie zum Beispiel aus bovinem Wachstumshormon (BGH); und die Betaglobin-Promotorsequenz (Betaglopro). Die hier nützlichen Expressionsvektoren können durch Fachleuten allgemein bekannte Techniken synthetisiert werden.
Die Komponenten solcher Vektoren, z.B. Replikons, Selektionsgene, Verstärker, Promotoren, Signalsequenzen und dgl., können aus gewerblichen oder natürlichen Quellen erhalten oder durch bekannte Verfahren zur Verwendung in der Ausrichtung der Expression und/oder Sekretion des Produkts der rekombinanten DNA in einem ausgewählten Wirt erhalten werden. Andere geeignete Expressionsvektoren, von denen zahlreiche Typen auf diesem Gebiet für die Säugetier-, bakterielle, Insekten-, Hefe- und Pilz Expression bekannt sind, können ebenfalls für diesen Zweck ausgewählt werden.
Die Vektoren können zur Generierung einer Zelllinie eingesetzt werden, die mit einem rekombinanten Plasmid transfiziert ist, das die codierenden Sequenzen der Antikörper oder veränderten Immunglobulinmoleküle davon enthält. Für die Klonierung und andere Manipulationen dieser Klonierungsvektoren nützliche Wirtszellen sind ebenfalls herkömmlich. Beispielsweise können Bakterienzellen, wie Zellen aus verschiedenen Stämmen von E. coli, Hefezellen, Insektenzellen, oder Säugetierzellen zur Vervielfältigung der Klonierungsvektoren und für andere Schritte in der Konstruktion veränderter Antikörper dieser Erfindung verwendet werden.
Geeignete Wirtszellen oder Zellinien zur Expression des Antikörpers der Erfindung sind bevorzugt Säugetierzellen wie NS0, Sp2/0, CHO, COS, eine Fibroblastenzelle (z.B. 3T3) und Myeloidzellen und besonders bevorzugt eine CHO- oder Myeloidzelle. Humane Zellen können verwendet werden, wodurch es möglich wird, das Molekül mit humanen Glykosylierungsmustem zu modifizieren. Alternativ können andere eukaryontische Zelllinien eingesetzt werden. Die Auswahl geeigneter Säugetier-Wirtszellen und Verfahren zur Transformation, Kultur, Amplifikation, Durchmusterung und Produktherstellung und -reinigung sind fachbekannt; siehe z.B. Sambrook et al., oben zitiert.
Bakterielle Zellen können sich nützlich als Wirtszellen erweisen, die für die Expression der rekombinanten Fabs der vorliegenden Erfindung geeignet sind (siehe z.B. A. Plückthun, Immunol. Rev., 130:151-188 (1992)). Jedoch müsste aufgrund der Tendenz von Proteinen, die in bakteriellen Zellen exprimiert werden, in einer ungefalteten oder ungeeignet gefalteten Form oder in einer nicht-glykosylierten Form zu sein, jedes in einer bakteriellen Zelle erzeugte rekombinante Fab auf Beibehaltung der Antigen-Bindungsfähigkeit durchmustert werden. Falls das durch die bakterielle Zelle exprimierte Molekül in einer geeignet gefalteten Form erzeugt würde, wäre die bakterielle Zelle ein wünschenswerter Wirt. Zum Beispiel sind verschiedene Stämme von E. coli, die zur Expression verwendet werden, allgemein als Wirtszellen auf dem Gebiet der Biotechnologie bekannt.
Verschiedene Stämme von B. subtilis, Streptomyces, anderen Bacilli und dgl. können auch in diesem Verfahren eingesetzt werden.
Nach Wunsch sind auch Stämme von Hefezellen, die den Fachleuten bekannt sind, als Wirtszellen verfügbar, ebenso wie Insektenzellen, z.B. Drosophila und Fepidoptera, und virale Expressionssysteme. Siehe z.B. Miller et al., Genetic Engineering, 8: 277-298, Plenum Press (1986) und darin zitierte Literaturstellen.
Die allgemeinen Verfahren, durch die die Vektoren konstruiert werden können, die Transfektionsverfahren, die zur Erzeugung der Wirtszellen erforderlich sind, und Kulturverfahren, die zur Erzeugung des veränderten Antikörpers der Erfindung aus solchen Wirtszellen notwendig sind, sind allesamt herkömmliche Techniken. Gleichsam können die Antikörper der Erfindung, sobald sie erzeugt sind, aus den Zellkulturinhalten gemäß Standardverfahren auf diesem Gebiet gereinigt werden, die Ammoniumsulfat-Präzipitation, Affinitätssäulen, Säulenchromatographie, Gelelektrophorese und dgl. einschließen. Solche Techniken gehören zum Können des Fachmanns. Sobald er durch das gewünschte Verfahren exprimiert wird, wird der Antikörper dann auf in- vitro -Aktivität durch Verwendung eines geeigneten Tests (Assay) untersucht. Derzeit werden herkömmliche ELISA-Testformate eingesetzt, um die qualitative und quantitative Bindung des Antikörpers an MAG zu beurteilen. Zusätzlich können andere in- vitro- Assay s zur Verifizierung der spezifischen Bindung an das Antigen und neutralisierenden Wirksamkeit wie hierin beschrieben vor anschließenden humanen klinischen Studien verwendet werden, die zur Auswertung der Fortdauer des Antikörpers im Körper trotz der gewöhnlichen Clearance- Mechanismen durchgeführt werden.
In einer bevorzugten Ausführungsform ist der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment gewählt aus der Gruppe bestehend aus: Immunglobulin Molekül, polyklonaler Antikörper, monoklonaler Antikörper, chimärer Antikörper, durch CDR-grafting erzeugter Antikörper, humanisierter Antikörper, Fab, Fab‘, F(ab‘)2, Fv, Disulfid-verknüpftes Fv, scFv, Einzeldomänenantikörper, Diabody, multispezifischer Antikörper, dualspezifischer Antikörper, und bispezifischer Antikörper.
Vorzugsweise ist der Antikörper ein Huhn Immunglobulin Molekül oder Antikörper. Der Antikörper wird bevorzugt gegen ein Antigen oder geeignetes Peptid des Bakteriums Candidatus Savagella erzeugt und ist bevorzugt ein polyklonaler oder monoklonaler Hühner Antikörper. Der Hühner Antikörper kann dabei humanisiert oder verändert sein, wie an anderer Stelle definiert.
Besonders bevorzugt ist das Huhn Immunglobulin Molekül ein IgY Immunglobulin Molekül oder polyklonaler IgY Antikörper.
Immunglobulin Y, abgekürzt IgY, ist eine Klasse von Immunglobulin- Molekülen, die im Serum von Hühnern und, in hohen Konzentrationen, insbesondere im Eigelb von Hühnereiern enthalten sind. Wie bei den anderen Immunglobulinen handelt es sich auch bei IgY um Proteine, die vom Immunsystem als Reaktion auf bestimmte Fremdstrukturen gebildet werden und diese spezifisch erkennen.
Immunglobulin Y ist in Hühnern das funktionelle Äquivalent zu IgG und ist wie dieses aus zwei leichten und zwei schweren Ketten aufgebaut. Strukturell unterscheiden sich beide Immunglobulinklassen vor allem in den schweren Ketten, die bei IgY eine Molekülmasse von etwa 65,1 Kilodalton haben und damit größer sind als bei IgG. Die leichten Ketten von IgY sind mit einer molaren Masse von etwa 18,7 Kilodalton etwas kleiner im Vergleich zu IgG. Die molare Masse von IgY beträgt damit etwa 167 Kilodalton. Die sterische Flexibilität des IgY Moleküls ist geringer als die von IgG.
Funktionell ist IgY sowohl teilweise mit IgE als auch mit IgG vergleichbar. IgY bindet jedoch im Gegensatz zu IgG nicht an Protein A beziehungsweise Protein G und auch nicht an zelluläre Fc-Rezeptoren. Darüber hinaus aktiviert IgY nicht das Komplementsystem. Der Name Immunglobulin Y wurde 1969 von G.A. Leslie und L.W. Clem vorgeschlagen, nachdem sie Unterschiede zwischen den in Hühnereiern gefundenen Immunglobulinen und Immunglobulin G zeigen konnten.
Für die gezielte Gewinnung von Antikörpern und deren Verwendung in der Bioanalytik bietet IgY verschiedene Vorteile gegenüber der Verwendung von Säugetier Antikörpern. Da die Antikörper aus dem Eigelb gelegter Eier gewonnen werden, handelt es sich um eine nicht invasive Methode der Antikörperproduktion. Den Hühnern muss also kein Blut zur Gewinnung von Blutserum entnommen werden. Durch die wiederholte Eiablage vom gleichen Huhn steigt die verfügbare Menge eines bestimmten Antikörpers erheblich. Auch die Kreuzreaktivität mit Proteinen von Säugetieren ist deutlich geringer als die von IgG. Darüber hinaus ist die Immunantwort gegen bestimmte Antigene in Hühnern stärker ausgeprägt als in Kaninchen oder anderen Säugetieren. Da von den während der Immunantwort entstehenden Immunglobulinen nur IgY in Hühnereiern zu finden ist, sind in entsprechenden Präparationen keine Verunreinigungen mit IgA oder IgM enthalten. Die Ausbeute an IgY aus einem Hühnerei ist hoch und vergleichbar mit der an IgG aus Kaninchenserum. Die Tatsache, dass IgY nicht an Protein A/G bindet, keine Komplementfaktoren aktiviert und nicht an den Fc Teil von Antikörpern bindet, führt zu einem reduzierten Hintergrund in vielen Anwendungen.
Darüber hinaus wird IgY insbesondere in asiatischen Ländern wie Japan als Bestandteil von Lebensmitteln eingesetzt. So werden dort zum Beispiel Joghurtprodukte vertrieben, die spezifisches IgY enthalten. Dieses verhindert das Anheften von Bakterien der Art Helicobacter pylori im Magen. Das hierzu verwendete IgY wird aus den Eiern von immunisierten Hühnern gewonnen. Antikörper werden so auch gegen Salmonellen und andere Bakterien, aber auch gegen Viren produziert und als Bestandteil der Nahrung zum Schutz gegen diese Krankheitserreger eingesetzt. Somit kann das erfindungsgemäße IgY zum Beispiel in Form von „Novel Food“ oder„Nutrazeutika" eingesetzt werden.
Es gibt mittlerweile eine Reihe von kommerziellen Anbietern für polyklonale Antikörperproduktion aus Hühnereigelb oder die Herstellung von monoklonalen Antikörpern aus Hühnern (z.B. Genosphere Biotechnologies, Davids Biotechnologie).
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform führt der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment (indirekt) zu einer Reduktion der Th 17 Zellproliferation, Th 17 Zelldifferenzierung oder Th 17 Zellaktivität. Alternativ oder zusätzlich hemmt der Antikörper oder das antigen bindende Fragment die Bildung von Antikörpern gegen körpereigene Antigene durch B Zellen.
Th 17 Zellen entwickeln sich aus sogenannten naiven T Helferzellen, also T Helferzellen, die noch keinen Kontakt mit ihrem spezifischen Antigen hatten, erst nach deren Aktivierung durch Antigenkontakt. Für die Differenzierung von Thl7 Zellen ist IL-6 und TGF-ß nötig. Thl7 Zellen sind nach dem von ihnen produzierten Interleukin IL-17 benannt und haben eine wichtige Rolle bei der Aktivierung von Neutrophilen Granulozyten, werden aber auch mit der Entstehung von chronischen Entzündungen und Autoimmunerkrankungen in Verbindung gebracht. Weitere Sekretionsprodukte von Thl7 Zellen sind TNF-a und IL-6. Rezeptoren für IL-17 befinden sich auf verschiedenen Zelltypen des Immunsystems, beispielsweise auf myeloiden Zellen, zu denen die Neutrophilen Granulozyten gehören, und auf Lymphozyten. Die von den Thl7 Zellen ausgeschütteten Botenstoffe bewirken Entzündungsprozesse, bei denen Neutrophile Granulozyten eine dominante Rolle spielen. IL-17 bewirkt in den genannten Zielzellen eine Ausschüttung von u.a. G-CSF, IL-6 und IL-8, die Neutrophile Granulozyten zum Einwandem bringen und aktivieren. Außerdem werden verstärkt entzündungsfördemde Proteine wie IL-l, IL- 6, PGE-2, Cyclooxygenase 2 und Matrixmetalloproteasen exprimiert.
Durch die oben angeführten Mechanismen, i.e. Reduktion der Th 17 Zellproliferation, Th 17 Zelldifferenzierung oder Th 17 Zellaktivität und/oder Hemmung der Bildung von Antikörpern gegen körpereigene Antigene durch B Zellen, trägt der Antikörper der Erfindung zu einer erhöhten Immuntoleranz bei. Immunerkrankungen wie multiple Sklerose, rheumatoide Arthritis, Typ-l Diabetes und allergisches Asthma werden wesentlich von der Aktivität von Th 17 Immunzellen bestimmt. Das Darmbakterium, Candidatus Savagella („segmented filamentous bacteria“) induziert genau diese Thl7 Immunzellen (siehe z.B. US 2012/276149; WO 2011/047153). Die vorliegende Erfindung umfasst die Neutralisierung dieses Bakteriums mit oral applizierten Hühnereiweiß-Antikörpem, um so Thl7 immunzellvermittelte Erkrankungen zu therapieren. Tests zur Reduktion der Th 17 Zellproliferation, Reduktion der Th 17 Zelldifferenzierung, Reduktion der Th 17 Zellaktivität oder Hemmung der Bildung von Antikörpern gegen körpereigene Antigene durch B Zellen sind dem Fachmann bekannt und im Stand der Technik beschrieben; siehe etwa US 2012/276149 oder WO 2011/047153.
In einer bevorzugten Ausführungsform ist das Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella ein Bakterienwandprotein, besonders bevorzugt das„myosin-cross-reactive antigen“ (SEQ ID Nr. 1)·
Beispiel für ein Antigen im Sinne der Erfindung ist ein Zellwandprotein des Bakteriums Candidatus Savagella, wie etwa das „myosin-cross-reactive antigen“, dessen Aminosäuresequenz in der SEQ ID Nr. 1 gezeigt ist.
In einer bevorzugten Ausführungsform bindet der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment an ein Epitop aus dem myosin-cross-reactive antigen, umfassend oder bestehend aus der Aminosäuresequenz S VLDEF YWLDKKDP Y SL (SEQ ID Nr. 2),
PDFKAVRFTRRNQYESMI (SEQ ID Nr. 3), oder QATSIKILRDGKEEEIKL (SEQ ID Nr. 4). Die Erfindung betrifft außerdem ein Verfahren zur Herstellung eines erfindungsgemäßen Antikörpers, umfassend:
a) Immunisierung von Hühnern mit einem immunogenen Peptid aus einem Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella; und
b) Gewinnung und Aufreinigung der in den Hühnern oder in einem von diesen Hühnern gelegten Ei gebildeten Antikörper.
Zur Generierung eines neutralisierenden Antikörpers der Erfindung wird aus der Gruppe von funktionsbestimmenden und„segmented filamentous bacteria“ (SFB)-spezifischen Proteine ein geeignetes Protein ausgewählt, das sich dadurch auszeichnet, dass es ein Bakterienwandprotein ist und eine nicht-redundante Rolle für Adhärenz an das intestinale Epithel und/oder das Überleben von Candidatus Savagella oder„segmented filamentous bacteria“ (SFB) spielt, wie z.B. das„myosin-cross-reactive antigen“ (MCRA) Protein. Innerhalb der Proteinsequenz des ausgewählten Targetantigens werden anschließend geeignete Epitope bestimmt, beispielsweise durch„epitope prediction programs“ und/oder mit Hilfe von Datenbanken. Die Zielsequenz mit der rechnerisch besten Antigenität/Immunogenität wird dann für die Antikörperherstellung ausgewählt. Mit der Aminosäuresequenz wird im nächsten Schritt das entsprechende Peptid in ausreichender Menge synthetisiert. Um als Antigen wirken zu können, müssen niedermolekulare Moleküle wie Peptide an Trägerproteine („carrier“) gekoppelt werden. Neben Ovalbumin (Hühnerei-Albumin) und bovinen oder humanen Serumalbuminen ist das Schneckenprotein KLH ein in der Biotechnologie verbreitetes Trägerprotein bei der Immunisierung von Tieren. So kann das Peptid anschließend z.B. an das Protein Schlitzschnecken-Hämocyanin (keyhole limpet hemocyanin, KLH) gekoppelt werden. Die Hühner werden innerhalb von 60 Tagen vier Mal mit dem Peptid-KLH Komplex immunisiert, während der ersten Immunisierung erhält das Tier dabei die doppelte Menge. Nach dieser Immunisierungsphase produziert ein Huhn bis zu 3 Gramm IgY pro Monat. Die Antikörper werden anschließend aus dem Eidotter isoliert und auf ihre neutralisierende Wirkung hin getestet, d.h. ob der Antikörper in der Lage ist, die Anhaftung oder Bindung des Bakteriums Candidatus Savagella an Darmepithelzellen zu hemmen, die Proliferation des genannte Bakteriums zu inhibieren, und/oder das Bakterium zu depletieren oder abzutöten.
Bevorzugt zur Herstellung des erfindungsgemäßen Antikörpers nach dem o.a. Verfahren ist das myosin-cross-reactive antigen als Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella. Besonders bevorzugt sind die Epitopsequenzen aus dem myosin-cross-reactive antigen mit der Aminosäuresequenz SEQ ID Nr. 1, also Peptide mit der Aminosäuresequenz S VLDEF YWLDKKDP Y SL (SEQ ID Nr. 2), PDFKAVRFTRRNQYESMI (SEQ ID Nr. 3), oder QATSIKILRDGKEEEIKL (SEQ ID Nr. 4).
Die zuvor getroffenen Definitionen und gemachten Erklärungen der Begriffe gelten für die nachfolgend beschriebenen Ausführungsformen entsprechend. Außerdem betrifft die vorliegende Erfindung ein Arzneimittel, umfassend den Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment der Erfindung, oder den nach dem erfindungsgemäßen Verfahren hergestellten Antikörper. Bevorzugt ist der Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment der Erfindung in einem pharmazeutisch akzeptierbaren Träger suspendiert. Bevorzugt ist der zu behandelnde Patient ein Mensch.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist ein Arzneimittel umfassend den Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment der Erfindung, oder den nach dem erfindungsgemäßen Verfahren hergestellten Antikörper, sowie vorzugsweise geeignete Zusatz- und/oder Hilfsstoffe. Als Zusatz- und/oder Hilfsstoffe eignen sich beispielsweise eine physiologische Kochsalzlösung, geeignete Stabilisatoren, Proteinaseinhibitoren, etc. Als Stabilisatoren eignen sich beispielsweise Tween 80 (0,02%), Zucker lösungen, wie z. B. Saccharose-Lösung (20-30%) oder Aminosäure-Lösungen, wie z. B. Glycin- oder Cystein- Lösungen. Üblicherweise wird das erfindungsgemäße Arzneimittel dadurch hergestellt, dass der Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment der Erfindung mit geeigneten Zusatz- und/oder Hilfsstoffen versetzt wird.
Die therapeutischen Mittel dieser Erfindung können als Prophylaktikum oder ansonsten nach Bedarf verabreicht werden. Die Dosis und Dauer der Behandlung steht in Beziehung zur relativen Dauer der Moleküle der vorliegenden Erfindung im humanen Kreislauf und kann durch einen Fachmann in Abhängigkeit vom behandelten Zustand und der allgemeinen Gesundheit des Patienten eingestellt werden.
Der Verabreichungsmodus des therapeutischen Mittels der Erfindung kann jeder geeignete Weg sein, der das Mittel an den Wirt abgibt. Die Antikörper und pharmazeutischen Zusammensetzungen/ Arzneimittel der Erfindung sind besonders nützlich zur oralen Verabreichung.
In einer bevorzugten Ausführungsform ist das erfindungsgemäße Arzneimittel zur Verwendung zur Prävention oder Behandlung einer onkologischen Erkrankung, allergischen Erkrankung oder einer Immunerkrankung, vorzugsweise einer Autoimmunerkrankung, wobei die genannten Erkrankungen durch die Aktivität von Th 17 Zellen vermittelt werden.
Beispielsweise nimmt ein Allergiker oder Patient mit Autoimmunerkrankung über einen definierten Zeitraum in einem definierten Behandlungsschema die spezifischen SFB Antikörper der Erfindung oral ein. Anschließend wird die Reduktion der allergischen Reaktion beispielsweise über einen Prick-Test bestimmt. Die Wirkung der spezifischen SFB Antikörper auf einen Patienten mit Autoimmunerkrankung kann beispielsweise über eine Verminderung der Bildung von Auto-Antikörpern nachgewiesen werden. Die Referenz entspricht der Stärke der Reaktion ohne SFB Antikörperbehandlung. Bevorzugt ist die allergische Erkrankung, Immunerkrankung oder Autoimmunerkrankung ausgewählt aus der Gruppe bestehend aus: multipler Sklerose, Typ-l Diabetes, rheumatoide Arthritis, allergische Atemwegserkrankung und allergisches Asthma.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform wird der Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon oral appliziert. Hühner Antikörper (IgY) sind besonders säurestabil und eignen sich deshalb besonders für eine orale Anwendung beim Patienten. Umfasst sind jedoch auch alle bisherigen Routen, die für den Transfer von Immunglobulinen verwendet werden, z.B. intramuskuläre, intravenöse, intraperitoneale, oder intratekale Verabreichung.
In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform wird der Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon in Kombination mit einem Antibiotikum verwendet, vorzugsweise einem Beta- Factam und/oder Glykopeptid Antibiotikum.
Zudem betrifft die vorliegende Erfindung ein Verfahren zur Herstellung eines erfindungsgemäßen Arzneimittels, umfassend:
a) Herstellung eines erfindungsgemäßen Antikörpers oder eines antigen-bindenden Fragments davon; und
b) Formulierung des Antikörpers oder eines antigen-bindenden Fragments davon als Arzneimittel.
Schließlich betrifft die vorliegende Erfindung ein Kit umfassend einen erfindungsgemäßen Antikörper oder eines antigen-bindenden Fragments davon zur Reduktion der Th 17 Zellproliferation, Thl7 Zelldifferenzierung oder Thl7 Zellaktivität, und/oder Hemmung der Bildung von Antikörpern gegen körpereigene Antigene durch B Zellen.
Neben dem erfindungsgemäßen Antikörper oder einem antigen-bindenden Fragment davon kann das Kit auch ein Antibiotikum wie Beta-Factam und/oder ein Glykopeptid Antibiotikum umfassen, sowie eine Anleitung zur Anwendung der Komponenten des Kit.
Der Begriff„etwa“ wie hierin verwendet, bezieht sich auf einen spezifischen Wert, auf den in dieser Beschreibung Bezug genommen wird, einschließlich einer Variation, die im Bereich von +/- 20%, +/- 10%, +/- 5%, +/- 4%, + liegt / -3%, +/- 2% oder +/- 1% liegt.
Die Begriffe„Bestimmen“,„Bestimmung“ oder„Nachweis“ wie hier verwendet umfassen die qualitative, semi-quantitative und/oder quantitative Bestimmung, beispielsweise die quantitative Bestimmung des Antikörpers der Erfindung im Serum oder Plasma eines Patienten, dem dieser Antikörper zu therapeutischen Zwecken verabreicht wurde. Der Inhalt sämtlicher hierin zitierten Literaturstellen ist hiermit durch Bezugnahme auf den jeweiligen speziellen Offenbarungsgehalt und in ihrer Gesamtheit aufgenommen.
Weitere besonders bevorzugte Ausführungsformen der Erfindung sind in den folgenden Beispielen gezeigt.
Figuren:
Figur 1: Graphische Zusammenfassung des dieser Erfindung zugrundeliegenden Konzepts: Spezielle fadenförmige Candidatus Savagella Bakterien („segmented filamentous bacteria“, SFB) besiedeln die Darmwand und aktivieren über dendritische Zellen (DC) Thl7 Zellen, die zur Autoimmunität und Atopie beitragen. Zuerst werden geeignete Bakterienwandproteine des genannten Bakteriums identifiziert (1), synthetisiert und in Hühner injiziert (2). Die Hühner bilden hochspezifische anti-SFB Antikörper, die aus den Eiern isoliert werden können (3) und für die orale Antikörpertherapie im Menschen zur Verfügung stehen (4). Eine Reduktion der SBF Keimzahl im Darm kann zu einer Reduktion der Th 17 Effektorzellaktivität und somit zur Immuntoleranz führen.
Beispiele:
Die nachfolgenden Beispiele dienen der Illustration der Erfindung. Sie dürfen im Hinblick auf den Schutzumfang nicht in einschränkender Weise ausgelegt werden.
Beispiel 1: Herstellung und Gewinnung von neutralisierenden Antikörpern gegen das „myosin-cross-reactive antigen“ (MCRA) Protein
Aus der Gruppe der fünktionsbestimmenden und„segmented filamentous bacteria“ (SFB)- spezifischen Proteine wurde das„myosin-cross-reactive antigen“ (MCRA) Protein ausgewählt, das durch die bakterienwandständige Lage und die nicht-redundante Rolle für Adhärenz an das intestinale Epithel im Menschen und das Überleben von Candidatus Savagella oder„segmented filamentous bacteria“ (SFB) ein geeignetes Target für einen neutralisierenden Antikörper darstellt. Innerhalb der bekannten Proteinsequenz des MCRA Proteins (SEQ ID Nr. 1) wurden anschließend geeignete Epitope bestimmt. Die Zielsequenz mit der rechnerisch besten Antigenität wurde für die Antikörperherstellung ausgewählt. Mit der bekannten Aminosäuresequenz wurde im nächsten Schritt das entsprechende Peptid mit den SEQ ID Nm. 2, 3 und 4 in ausreichender Menge synthetisiert und anschließend an das Protein Schlitzschnecken- Hämocyanin (keyhole limpet hemocyanin, KLH) gekoppelt. Die Hühner wurden innerhalb von 60 Tagen vier Mal mit dem Peptid-KLH Komplex immunisiert, während der ersten Immunisierung erhielt das Tier dabei die doppelte Menge. Nach dieser Immunisierungsphase produzierte ein Huhn bis zu 3 Gramm IgY pro Monat. Die Antikörper wurden anschließend aus dem Eidotter isoliert (Hassl et al., 1987 http://www.unet.univie.ac.at/~a7505973/texte/JiMl.pdf).
Beispiel 2: Therapeutische Anwendung von neutralisierenden Antikörpern gegen das „myosin-cross-reactive antigen“ (MCRA) Protein
Die zugrundeliegende Arbeitshypothese der Erfinder besagt, dass eine verringerte Kolonisationsdichte mit SFB im Darm von Patienten zu einer reduzierten TH17 Antwort führt. Dies hätte allgemein eine große therapeutische Relevanz in TH 17- vermittelten entzündlichen Erkrankungen.
Die Erfinder gehen davon aus, dass das SFB auch im Darm menschlicher Patienten existiert und die orale Therapie mit einem neutralisierenden Antikörper für die Behandlung einer ganzen Reihe von allergischen Erkrankungen, Immunerkrankungen, Autoimmunerkrankungen und onkologischen Erkrankungen geeignet sein könnte.
Der gewählte Therapieansatz ist besonders attraktiv, da kaum Nebenwirkungen zu erwarten sind - im Gegensatz zu den meisten etablierten Therapien, wie beispielsweise Dexamethason für die allergische Atemwegserkrankung - und gegebenenfalls Möglichkeiten für eine stark vereinfachte Zulassung bestehen, zum Beispiel als„Novel Food“.
Diesbezüglich ist die Verwendung von Hühner- Antikörpern (IgY) ein grundlegendes Konzept der vorliegenden Erfindung. Die Verwendung von Hühner-Antikörpern (IgY) hat zahlreiche Vorteile gegenüber klassischen Ansätzen: IgY reagieren zum Beispiel nicht mit dem menschlichen Komplementsystem und weisen eine besonders hohe Säurestabilität auf, welches sie attraktiv für die Entwicklung eines oral applizierten Therapeutikums machen.
Die orale Applikation kann hierbei wie folgt aussehen:
Ein Allergiker nimmt über einen definierten Zeitraum in einem definierten Behandlungsschema die spezifischen SFB Antikörper oral ein. Anschließend wird die Reduktion der allergischen Reaktion beispielsweise über einen Prick-Test bestimmt. Die Referenz entspricht der Stärke der Reaktion ohne SFB Antikörperbehandlung.
Zusammenfassend wurden in diesem Projekt die geeigneten SFB Bakterienwandproteine identifiziert, synthetisiert und in Hühner injiziert. Die Hühner produzierten hochspezifische, neutralisierende anti-SFB Antikörper, die aus den Eiern isoliert wurden. Dieses aus den Eiern isolierte Produkt mit pharmazeutischem Potential kann dann für die orale Antikörpertherapie im Patienten zur Behandlung einer ganzen Reihe von allergischen Erkrankungen, Immunerkrankungen, Autoimmunerkrankungen und onkologischen Erkrankungen genutzt werden.
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Claims

Ansprüche
1. Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon, wobei der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment an ein Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella bindet und (i) die Anhaftung des Bakteriums an Darmepithelzellen, vorzugsweise humane Darmepithelzellen, inhibiert, und/oder (ii) das Bakterium depletiert.
2. Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon nach Anspruch 1, wobei der
Antikörper oder das antigen-bindende Fragment gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus: Immunglobulin Molekül, polyklonaler Antikörper, monoklonaler Antikörper, chimärer Antikörper, durch CDR-grafting erzeugter Antikörper, humanisierter Antikörper, Fab, Fab‘, F(ab‘)2, Fv, Disulfid-verknüpftes Fv, scFv, Einzeldomänenantikörper, Diabody, multispezifischer Antikörper, dualspezifischer
Antikörper, und bispezifischer Antikörper.
3. Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon nach Anspruch 1 oder 2, wobei der Antikörper ein Huhn Immunglobulin Molekül oder Antikörper ist.
4. Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon nach Anspruch 3, wobei das Huhn Immunglobulin Molekül IgY ist.
5. Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon nach einem der Ansprüche 1 bis 4, wobei der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment zu einer Reduktion der
Thl7 Zellproliferation, Thl7 Zelldifferenzierung oder Thl7 Zellaktivität führt und/oder die Bildung von Antikörpern gegen körpereigene Antigene durch B Zellen hemmt.
6. Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon nach einem der Ansprüche 1 bis 5, wobei das Antigen des Bakteriums Candidatus Savagella ein Bakterienwandprotein ist, vorzugsweise das myosin-cross-reactive antigen umfassend die in der SEQ ID Nr. 1 gezeigten Aminosäuresequenz.
7. Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon nach einem der Ansprüche 1 bis 6, wobei der Antikörper oder das antigen-bindende Fragment an ein Epitop aus dem myosin-cross-reactive antigen bindet, wobei das Epitop aus der Aminosäuresequenz S VLDEF YWLDKKDP Y SL (SEQ ID Nr. 2), PDFKAVRFTRRNQYESMI (SEQ ID Nr. 3), oder QATSIKILRDGKEEEIKL (SEQ ID Nr. 4) besteht oder diese umfasst.
8. Verfahren zur Herstellung eines Antikörpers nach einem der Ansprüche 1 bis 7, umfassend:
a) Immunisierung von Hühnern mit einem immunogenen Peptid aus einem Antigen, vorzugsweise einem Bakterienwandprotein, des Bakteriums Candidatus Savagella; und b) Gewinnung und Aufreinigung der in den Hühnern oder in einem von diesen Hühnern gelegten Ei gebildeten Antikörper.
9. Arzneimittel, umfassend den Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon nach einem der Ansprüche 1 bis 7 oder einen Antikörper, der durch das Verfahren nach Anspruch 8 hergestellt ist.
10. Arzneimittel nach Anspruch 9 zur Verwendung zur Prävention oder Behandlung einer onkologischen Erkrankung, einer allergischen Erkrankung, einer Immunerkrankung, oder einer Autoimmunerkrankung, wobei die genannten Erkrankungen durch die Aktivität von Thl7 Zellen vermittelt werden.
11. Arzneimittel nach Anspruch 10, wobei die allergische Erkrankung, Immunerkrankung oder Autoimmunerkrankung ausgewählt ist aus der Gruppe bestehend aus: multipler Sklerose, Typ-l Diabetes, rheumatoide Arthritis und allergisches Asthma.
12. Arzneimittel nach einem der Ansprüche 9 bis 11, wobei der Antikörper oder ein antigen bindendes Fragment davon oral appliziert wird.
13. Arzneimittel nach einem der Ansprüche 9 bis 12, wobei der Antikörper oder ein antigen bindendes Fragment davon in Kombination mit einem Antibiotikum verwendet wird, vorzugsweise einem Beta-Lactam und/oder Glykopeptid Antibiotikum.
14. Verfahren zur Herstellung eines Arzneimittels nach einem der Ansprüche 9 bis 13, umfassend:
a) Herstellung eines Antikörpers oder eines antigen-bindenden Fragments davon nach einem der Ansprüche 1 bis 7; und
b) Formulierung des Antikörpers oder eines antigen-bindenden Fragments davon als Arzneimittel.
15. Kit umfassend einen Antikörper oder ein antigen-bindendes Fragment davon nach einem der Ansprüche 1 bis 7 zur Reduktion der Th 17 Zellproliferation, Th 17 Zelldifferenzierung oder Thl7 Zellaktivität, und/oder Hemmung der Bildung von Antikörpern gegen körpereigene Antigene durch B Zellen, und optional ein Antibiotikum.
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