WO2021106952A1

WO2021106952A1 - 移植片対宿主病に対する予防又は治療用組成物

Info

Publication number: WO2021106952A1
Application number: PCT/JP2020/043883
Authority: WO
Inventors: 和彦垣花; 恭子稲本; 賢也本田; 梢竹下; 優子切通
Original assignee: JSR Corp; Keio University; Tokyo Metropolitan Government
Current assignee: JSR Corp; Keio University; Tokyo Metropolitan Government
Priority date: 2019-11-26
Filing date: 2020-11-25
Publication date: 2021-06-03
Anticipated expiration: 2022-05-26
Also published as: US20230024068A1; EP4085916A4; CN115461064A; EP4085916A1; JPWO2021106952A1; US20250281549A1

Abstract

【課題】移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）に対する予防又は治療用組成物の提供。【解決手段】ブラウチア属、クロストリジウム属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、アクチノマイセス属、パラバクテロイデス属、ラクノクロストリジウム属、バクテロイデス属、フェカリバクテリウム属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、ロセブリア属、ルミノコッカス属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、ドレア属、ファスコラークトバクテリウム属、サテレラ属、メガモナス属、コリンセラ属、ユーバクテリム属、及びコプロコッカス属等からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、ＧＶＨＤの予防又は治療用組成物。

Description

移植片対宿主病に対する予防又は治療用組成物

　本発明は、細菌叢を含む組成物、特に移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）に対する予防又は治療用組成物に関する。

　同種造血幹細胞移植（ａｌｌｏ－ＨＳＣＴ）は種々の血液疾患の根治的治療法として広く実施されるが、ａｌｌｏ－ＨＳＣＴに伴う急性ＧＶＨＤは、再発・感染と並ぶ重要な合併症の一つである。このＧＶＨＤの初期治療（一次治療）として使用される薬剤は副腎皮質ステロイドホルモン（ステロイド）であるが、効果を認めるのは約半数であり（Ｂｌｏｏｄ．　２００７；１０９（１０）：４１１９－４１２６．（非特許文献１））、確立された二次治療は存在しない。

　腸内細菌やこれらの代謝物が、腸管の炎症抑制や免疫調整に重要な役割を果たしていることは広く知られているところであるが、近年、糞便細菌叢移植法（ｆｅｃａｌ　ｍｉｃｒｏｂｉｏｔａ　ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ：ＦＭＴ）のａｌｌｏ－ＨＳＣＴ後のＧＶＨＤへの適用の可能性が示唆されている（Ｂｌｏｏｄ．２０１４；１２４（７）：１１７４－１１８２．（非特許文献２））。そして、ＦＭＴに関して、特表２０１３－５３７５３１号公報（特許文献１）、特表２０１６－５０１８５２号公報（特許文献２）、特許第６４０８０９２号に記載の発明が知られている。
　しかしながら、ＧＶＨＤとＦＭＴとの関連性は明確ではない。

特表２０１３－５３７５３１号公報特表２０１６－５０１８５２号公報特許第６４０８０９２号

Ｂｌｏｏｄ．２００７；１０９（１０）：４１１９－４１２６．Ｂｌｏｏｄ．２０１４；１２４（７）：１１７４－１１８２．Ｂｏｎｅ　Ｍａｒｒｏｗ　Ｔｒａｎｐｌａｎｔａｔｉｏｎ　１９９５；１５，８２５－８２８．

　本発明は、特に腸管急性ＧＶＨＤに対する予防又は治療用組成物を目的とする。

　本発明者は、上記課題を解決するために鋭意検討を行った結果、糞便由来の細菌叢を含む組成物を移植することにより、ＧＶＨＤを予防又は治療することに成功し、糞便由来の細菌叢に含まれるＧＶＨＤの予防又は治療に有効な菌を特定することにより、本発明を完成するに至った。

　すなわち、本発明は以下の通りである。
（１）
ブラウチア（Ｂｌａｕｔｉａ）属、
クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
アクチノマイセス（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ）属、
パラバクテロイデス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属、
ラクノクロストリジウム（Ｌａｃｈｎｏｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属、
バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属、
フェカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）属、
ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
ドレア（Ｄｏｒｅａ）属、
ファスコラークトバクテリウム（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属、
サテレラ（Ｓｕｔｔｅｒｅｌｌａ）属、
メガモナス（Ｍｅｇａｍｏｎａｓ）属、
コリンセラ（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ）属、
ユーバクテリム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属、
コプロコッカス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）属、
シャーリア（Ｓｃｈａａｌｉａ）属、
アリスティペス（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ）属、
ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属、
ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）属、
ヴェイロネラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ）属、
アナエロスティペス（Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ）属、
ビロフィラ（Ｂｉｌｏｐｈｉｌａ）属、
ブチリシコッカス（Ｂｕｔｙｒｉｃｉｃｏｃｃｕｓ）属、
バルネシエラ（Ｂａｒｎｅｓｉｅｌｌａ）属、
フシカテニバクター（Ｆｕｓｉｃａｔｅｎｉｂａｃｔｅｒ）属、
フラボニフラクター（Ｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ）属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ、
フェカリカテナ（Ｆａｅｃａｌｉｃａｔｅｎａ）属、
プレボテラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）属、
メガスファエラ（Ｍｅｇａｓｐｈａｅｒａ）属、
ロビンソニエラ（Ｒｏｂｉｎｓｏｎｉｅｌｌａ）属、
フェカリタレア（Ｆａｅｃａｌｉｔａｌｅａ）属、
ラクノスピラ（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）属、及び
ロンボウツィア（Ｒｏｍｂｏｕｔｓｉａ）属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、ＧＶＨＤの予防又は治療用組成物。
（２）
ブラウチア属、
クロストリジウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
アクチノマイセス属、
パラバクテロイデス属、
ラクノクロストリジウム属、
バクテロイデス属、
フェカリバクテリウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア属、
ルミノコッカス属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
ドレア属、
ファスコラークトバクテリウム属、
サテレラ属、
メガモナス属、
コリンセラ属、
ユーバクテリム属、及び
コプロコッカス属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（１）に記載の組成物。
（３）
ブラウチア属、
クロストリジウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
アクチノマイセス属、
パラバクテロイデス属、
ラクノクロストリジウム属、
バクテロイデス属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア属、
ルミノコッカス属、
ファスコラークトバクテリウム属、
フェカリバクテリウム属、
シャーリア属、
アリスティペス属、
ビフィドバクテリウム属、
ラクトバチルス属、
ヴェイロネラ属、
ドレア属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
アナエロスティペス属、
コリンセラ属、
ブチリシコッカス属、
バルネシエラ属、及び
フシカテニバクター属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（１）に記載の組成物。
（４）
ブラウチア属、
クロストリジウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
アクチノマイセス属、
パラバクテロイデス属、
ラクノクロストリジウム属、及び
バクテロイデス属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（３）に記載の組成物。
（５）
フェカリバクテリウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア属、
ルミノコッカス属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
ドレア属、
ファスコラークトバクテリウム属、
サテレラ属、
バクテロイデス属、
ブラウチア属、
パラバクテロイデス属、
メガモナス属、
コリンセラ属、
ユーバクテリム属、
コプロコッカス属、
アナエロスティペス属、
ビロフィラ属、
フラボニフラクター属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ、
ブチリシコッカス属、
フェカリカテナ属、
プレボテラ属、
クロストリジウム属、
ラクノクロストリジウム属、
アリスティペス属、
メガスファエラ属、
ロビンソニエラ属、
フシカテニバクター属、
バルネシエラ属、
フェカリタレア属、
ラクノスピラ属、及び
ロンボウツィア属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（１）に記載の組成物。
（６）
フェカリバクテリウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア属、
ルミノコッカス属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
ドレア属、
ファスコラークトバクテリウム属、
サテレラ属、
バクテロイデス属、
ブラウチア属、
パラバクテロイデス属、
メガモナス属、
コリンセラ属、
ユーバクテリム属、及び
コプロコッカス属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（５）に記載の組成物。
（７）
　配列番号１～１２０に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、ＧＶＨＤの予防または治療用組成物。
（８）
　配列番号１２１～１５２に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（７）に記載の組成物。
（９）
　配列番号１５３～１９８に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（７）に記載の組成物。
（１０）
　配列番号１９９～２０１に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（９）に記載の組成物。
（１１）
　配列番号２０２～３１２に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（７）に記載の組成物。
（１２）
　配列番号３１３～３４４に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、（１１）に記載の組成物。
（１３）
　細菌が、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｖｕｌｇａｔｕｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｗｅｘｌｅｒａｅ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　ＡＲ２９、
Ｄｏｒｅａ　ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ、
Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃｉｕｍ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　Ｋ－１、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｏｖａｔｕｓ、
Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、
Ｍｅｇａｍｏｎａｓ　ｆｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、
［Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ］　ｔｏｒｑｕｅｓ、
Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ　ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｍｅｒｄａｅ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ｍ１０４／１、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃａｌｅ、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　８２６、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｃｏｐｒｏｃｏｌａ、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｆａｅｃｉｓ、
Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＶＰ１８ｋ１、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　ＡＴ４、
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ　ｒｏｇｏｓａｅ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ａ２－２０７、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｓｐ．　１１２０、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｄｏｒｅｉ、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｐｓｅｕｄｏｃａｔｅｎｕｌａｔｕｍ、
Ｍｅｇａｓｐｈａｅｒａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ　ｈａｄｒｕｓ、
Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ　ｐｕｔｒｅｄｉｎｉｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　Ｄ２５、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｉｎｕｌｉｎｉｖｏｒａｎｓ、
Ｂｉｌｏｐｈｉｌａ　ｓｐ．　４＿１＿３０、
Ｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ　ｐｌａｕｔｉｉ、
Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　８０／３、
Ｂｕｔｙｒｉｃｉｃｏｃｃｕｓ　ｆａｅｃｉｈｏｍｉｎｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｃｅｌｌｕｌｏｓｉｌｙｔｉｃｕｓ、
Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ　ｃａｔｕｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ、
Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＲＰ１４、
［Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ］　ｇｎａｖｕｓ、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｌｏｎｇｕｍ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｘｙｌａｎｉｓｏｌｖｅｎｓ、
Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ　ｓｔｅｒｃｏｒｅａ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｐｌｅｂｅｉｕｓ、
Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＶＲ５０、
Ｓｕｔｔｅｒｅｌｌａ　ｗａｄｓｗｏｒｔｈｅｎｓｉｓ、
Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　１＿１＿５７ＦＡＡ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｏｂｅｕｍ、
Ｂａｒｎｅｓｉｅｌｌａ　ｉｎｔｅｓｔｉｎｉｈｏｍｉｎｉｓ、
［Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ］　ｅｌｉｇｅｎｓ、
Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ　ｃｏｍｅｓ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　ＤＪＦ＿ＶＲ７０ｋ１、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ａ２－１７５、
Ｆａｅｃａｌｉｔａｌｅａ　ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｓｐ．　ＹＨＣ－４、
［Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ］　ｇｌｙｃｙｒｒｈｉｚｉｎｉｌｙｔｉｃｕｍ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　６５３、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｌａｃｔａｒｉｓ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＳＭ６／１、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＳＳ３／４、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＬＳ４０、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　１＿１＿３０、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｎｏｒｄｉｉ、
Ｆｕｓｉｃａｔｅｎｉｂａｃｔｅｒ　ｓａｃｃｈａｒｉｖｏｒａｎｓ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＳＬ７／１、
［Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ］　ｓｃｉｎｄｅｎｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ、
Ｓｃｈａａｌｉａ　ｏｄｏｎｔｏｌｙｔｉｃａ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｆａｅｃｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｆｒａｇｉｌｉｓ、
［Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ］　ｂｏｌｔｅａｅ、及び
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　ＨＧＦ２
からなる群から選ばれる少なくとも１種である、（１）に記載の組成物。
（１４）
　細菌が、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｖｕｌｇａｔｕｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｗｅｘｌｅｒａｅ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　ＡＲ２９、
Ｄｏｒｅａ　ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ、
Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃｉｕｍ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　Ｋ－１、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｏｖａｔｕｓ、
Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、
Ｍｅｇａｍｏｎａｓ　ｆｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、
［Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ］　ｔｏｒｑｕｅｓ、
Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ　ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｍｅｒｄａｅ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ｍ１０４／１、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃａｌｅ、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　８２６、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｃｏｐｒｏｃｏｌａ、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｆａｅｃｉｓ、
Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＶＰ１８ｋ１、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　ＡＴ４、
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ　ｒｏｇｏｓａｅ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ａ２－２０７、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｓｐ．　１１２０、及び
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｄｏｒｅｉ
からなる群から選ばれる少なくとも１種である、（１３）に記載の組成物。
（１５）
　細菌が、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｖｕｌｇａｔｕｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｗｅｘｌｅｒａｅ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　ＡＲ２９、
Ｄｏｒｅａ　ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ、
Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃｉｕｍ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　Ｋ－１、及び
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｏｖａｔｕｓ
からなる群から選ばれる少なくとも１種である、（１３）に記載の組成物。
（１６）
　ＧＶＨＤが、ステロイド抵抗性又はステロイド依存性のＧＶＨＤである、（１）～（１５）のいずれか１項に記載の組成物。
（１７）
　ＧＶＨＤが、腸管急性ＧＶＨＤである、（１）～（１５）のいずれか１項に記載の組成物。
（１８）
　（１）～（１７）のいずれか１項に記載の組成物を含む、ＧＶＨＤの予防又は治療用カプセル製剤。
（１９）
　（１）～（１７）のいずれか１項に記載の組成物、又は（１８）に記載のカプセル製剤をＧＶＨＤ患者に投与することを特徴とするＧＶＨＤの治療方法。
（２０）
　（１）～（１７）のいずれか１項に記載の組成物、又は（１８）に記載のカプセル製剤を造血幹細胞移植の前、後又はその両時期に、造血幹細胞移植対象患者に投与することを特徴とする、ＧＶＨＤ予防方法。
（２１）
　ヒトから採取された糞便から、（１）～（１５）のいずれか１項に記載された細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便を水性媒体に懸濁することを特徴とする、糞便細菌叢移植用懸濁液の製造方法。
（２２）
　ヒトから採取された糞便から、（１）～（１５）のいずれか１項に記載された細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便から当該細菌を分離し、分離された細菌を混合することを特徴とする、糞便細菌叢移植用細菌混合物の製造方法。
（２３）
　ヒトから採取された糞便から、（１）～（１５）のいずれか１項に記載された細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便から当該細菌を分離し、分離された細菌を製剤化することを特徴とする、糞便細菌叢移植用製剤の製造方法。
（２４）
　製剤がカプセル製剤である（２３）に記載の方法。
（２５）
　細菌の存在確認が、１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子解析によるものである、（２１）～（２４）のいずれか１項に記載の方法。

　本発明により、腸管急性ＧＶＨＤを予防又は治療することが可能となった。

Ｓｈａｎｎｏｎ　ｉｎｄｅｘによるα多様性評価結果を示す図である。ＦＭＴ前後における糞便細菌叢の属レベルでの組成比を表した図である。各属に属する細菌における１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各属に属する細菌における１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各属に属する細菌における１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各属に属する細菌における１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各属に属する細菌における１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各属に属する細菌における１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各属に属する細菌における１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。コリネバクテリウム属に属する細菌における１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示すを示す図である。各Ｓｐｅｃｉｅｓにおける１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各Ｓｐｅｃｉｅｓにおける１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各Ｓｐｅｃｉｅｓにおける１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各Ｓｐｅｃｉｅｓにおける１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各Ｓｐｅｃｉｅｓにおける１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各Ｓｐｅｃｉｅｓにおける１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各Ｓｐｅｃｉｅｓにおける１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各Ｓｐｅｃｉｅｓにおける１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。各Ｓｐｅｃｉｅｓにおける１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子を指標とした菌叢解析結果を示す図である。

　本発明者は、腸内細菌叢への介入が造血幹細胞移植後のＧＶＨＤの新たな予防法及び治療法につながるものと考え、ＧＶＨＤ患者に対して糞便細菌叢移植法（ｆｅｃａｌ　ｍｉｃｒｏｂｉｏｔａ　ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ：　ＦＭＴ）を試みた。ＦＭＴ法とは、健常者の糞便懸濁液を消化管内に投与することで、正常な細菌叢を大量に投与する治療法であり、腸内細菌叢のバランス異常（ディスバイオーシス、ｄｙｓｂｉｏｓｉｓ）が関与するとされる疾患で試みられている治療法である。

　さらに、本発明者は、造血幹細胞移植後ＧＶＨＤを発症した患者へのＦＭＴ前後の患者腸内菌叢解析を実施し、ＧＶＨＤの予防及び／又は治療に有用な菌を同定した。解析の結果、ＧＶＨＤが快方に向かった患者と、それ以外の患者との間では、定着した菌叢分布に明確な違いがあることが判明した。さらに、ＧＶＨＤが快方に向かった患者における定着した腸内菌叢をＧＶＨＤの治療に有用な菌としてピックアップし、レシピエントにおけるＦＭＴの治療効果による２群比較（以下ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群　－　Ｏｔｈｅｒｓ群）での存在量の不均一性、レシピエントでの定着期間の長さ等の独自の指標でグループ分けを実施した。
　その結果、ＧＶＨＤの予防及び／又は治療に有用な菌を特定することに成功した。

１．ＦＭＴ
　糞便細菌叢は、糞便自体、又は糞便の処理物に含まれることから、本発明の組成物として、糞便の処理物を使用することができる。糞便の処理物には、採取された糞便を適当な溶媒（例えば生理食塩水、緩衝液）に懸濁した懸濁液のほか、当該懸濁液を適当なふるい、ガーゼ、フィルターなど（例えば孔径０．１ｍｍ～０．５ｍｍ）に通してろ過させたもの、あるいは遠心分離後の沈殿物などが含まれる。さらに、これらの組成物を冷凍庫又は液体窒素により凍結したり、凍結乾燥又は噴霧乾燥などを施したものでもよい。前記溶媒を用いて懸濁液とする場合は、糞便１ｇあたり１～２０ｍｌの液体にて懸濁することができる。懸濁液を作成後、遠心して細菌を単離し使用する場合には、その菌量１ｇに対して０．２－１ｍＬの液量に再度懸濁することができる。

　凍結又は凍結乾燥の際には、各種糖（スクロース、フルクトース、ラクトース、マンニトール等）、グリセロール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、トレハロース、グリシン、グルコース、デキストラン、エリスリトールなどの凍結保護剤及び／又は凍結乾燥保護剤を添加することもできる。
　本発明において、採取された糞便又はその処理物は、糞便採取後又は処理後６～１０時間保存することができる。保存温度は特に限定されるものではないが、冷蔵保存（例えば４℃）であることが好ましい。

　このようにして調製した組成物をＦＭＴ材料とする。調製されたＦＭＴ材料は、使用まで嫌気的条件下（例えば嫌気ユニット、嫌気バッグ等）で保存することが好ましい。この場合も、保存は冷蔵保存（例えば４℃）であることが好ましい。
　本発明においては、糞便細菌叢を含む組成物（未処理又は処理済みの糞便材料）を、異なる個体間で、例えばヒトとヒトとの間で、または動物間で移植する。ＦＭＴに使用する組成物は、それを採取した個体と同じ個体に戻し移植することも、一の個体から採取した糞便細菌叢を、他の個体に移植することも可能である。
　対象となる疾患はＧＶＨＤであり、造血幹細胞移植によるＧＶＨＤが挙げられる。ＧＶＨＤとしては、腸管急性ＧＶＨＤが挙げられるが、これに限定されるものではない。

　移植方法は、経口投与であっても非経口投与であってもよく、特に限定されるものではない。例えば、胃十二指腸チューブによる移植、カプセルなどに充填しての内服、座薬の投与、大腸ファイバーや高圧浣腸などを用いた大腸内への移植などが挙げられる。
　１回の移植の移植量は、液体の場合は１５０ｍｌ～３００ｍｌであり、１日１回行う。レシピエントの状態に応じ、繰り返し行う場合には、４日～２週毎に計２回～４回行う。

　このようにして、本発明の組成物を、ＧＶＨＤ患者に移植（投与）することで、ＧＶＨＤを治療することができる。
　治療効果の判定は、最終投与から４週間後及び観察期間内の最大効果の結果を用いて、完全奏効（ＣＲ）及び部分奏効（ＰＲ）の合計である奏効率（ＣＲ＋ＰＲ）を評価する。　ＣＲ又はＰＲと判断された患者（群）における菌叢と、それ以外の群と判断された患者（群）における菌叢とを比較解析する。ドナーの糞便調整液、並びに患者の糞便（例えばＦＭＴ前、最終のＦＭＴから１～３日後、１、２、４週間後）の一部を用い、各タイムポイントにおける腸内細菌叢の解析を実施する。

２．ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群－Ｏｔｈｅｒｓ群間での菌の存在量の不均一性
　本発明においてＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群－Ｏｔｈｅｒｓ群間での菌の存在量の不均一性を指標とした絞り込みの方法は以下の２通りである。

方法１．ｍｅｄｉａｎによる絞り込み
　（１）糞便採取の各タイムポイントにおいてＣＲ又はＰＲ群（「ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群」という）、それ以外の群（「Ｏｔｈｅｒｓ群」という）でそれぞれの属又はＯＴＵ（ｏｐｅｒａｔｉｏｎａｌ　ｔａｘｏｎｏｍｉｃ　ｕｎｉｔｓ）のｒｅｌａｔｉｖｅ　ａｂｕｎｄａｎｃｅの群内のサンプルの平均値を算出し、「ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群」又は「Ｏｔｈｅｒｓ群」のどちらか大きい方の平均値が０．１％以上の属又はＯＴＵを解析に使用する。
　（２）各タイムポイントにおいてＣＲ　ｏｒ　ＰＲ　群、Ｏｔｈｅｒｓ群でそれぞれ属又はＯＴＵのｒｅｌａｔｉｖｅ　ａｂｕｎｄａｎｃｅの群内のサンプルのｍｅｄｉａｎを算出する。

　（３）　ｍｅｄｉａｎのＬｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅ（ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群／　Ｏｔｈｅｒｓ群）を算出する。ここでのＬｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅとは、ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群のｍｅｄｉａｎをＯｔｈｅｒｓ群のｍｅｄｉａｎで除した比率を求め、その比率の対数値（底２）を指す。ｍｅｄｉａｎは０を含む場合もあるため、ｍｅｄｉａｎに０．０００１をそれぞれ足してからＬｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅを算出する。
　（４）　Ｌｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅが０．５以上となる属又はＯＴＵをＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群に多いとみなし、－０．５以下はＯｔｈｅｒｓ群に多いとする。ただし、ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群においてドナーとＦＭＴ前におけるレシピエントのｍｅｄｉａｎの比のＬｏｇ２　Ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅが負の値となるもの、又はドナーにおいて該当する属若しくはＯＴＵに属する菌の保有率が０となるものは、ＦＭＴによりドナーから移植されたと判断できないため除外する。

　（５）　糞便移植以降に糞便採取したタイムポイントにおいて、Ｌｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅが０．５以上あるいは、－０．５以下であった回数をカウントする。
　（６）　手順５において、０．５以上の回数が１を超える場合は好ましいとし、回数が高いほどＦＭＴの効果に、より寄与する菌と判定する。カウントした回数が移植後の糞便採取の回数の過半数を超える場合は、よりＦＭＴの効果に寄与するとする。ただし、－０．５以下の回数が０．５以上の回数を上回る場合は、ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群に多いとは判断せず、除外する。

方法２．ｍｅａｎと保有率による菌の絞り込み
　（１）　糞便採取の各タイムポイントにおいてＣＲ又はＰＲ群（「ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群」という）、それ以外の群（「Ｏｔｈｅｒｓ群」という）でそれぞれの属あるいはＯＴＵのｒｅｌａｔｉｖｅ　ａｂｕｎｄａｎｃｅの群内のサンプルの平均値を算出し、「ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群」又は「Ｏｔｈｅｒｓ群」のどちらか大きい方の平均値が０．１％以上の属又はＯＴＵを解析に使用する。
　（２）各タイムポイントにおいてＣＲ　ｏｒ　ＰＲ　群、Ｏｔｈｅｒｓ群でそれぞれ　属あるいはＯＴＵのｒｅｌａｔｉｖｅ　ａｂｕｎｄａｎｃｅの群内のサンプルのｍｅａｎを算出する。更に、それぞれのタイムポイントにおいて、各群の属あるいはＯＴＵの保有率（ｒｅｌａｔｉｖｅ　ａｂｕｎｄａｎｃｅがゼロより大きいドナーまたはレシピエントの割合）を算出する。

　（３）　ｍｅａｎのＬｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅ　（ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群／　Ｏｔｈｅｒｓ群）を算出する。ここでのＬｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅとは、ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群のｍｅａｎをＯｔｈｅｒｓ群のｍｅａｎで除し比率を求め、その比率の対数値（底２）を指す。ｍｅａｎは０を含む場合もあるため、ｍｅａｎに０．０００１をそれぞれ足してからＬｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅを算出する。
　（４）　糞便移植以降に糞便採取したタイムポイントにおいて、Ｌｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅが０．５以上且つＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群の保有率が２０％以上であった回数をカウントする。この回数が多いほど、ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群に多い属又はＯＴＵとみなした。ただし（４）において、ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群においてドナーとＦＭＴ前におけるレシピエントのｍｅａｎの比のＬｏｇ２　Ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅが負の値となるもの、もしくはドナーにおいて該当する属又はＯＴＵに属する菌の保有率が０となるものは、ＦＭＴによりドナーから移植されたと判断できないため除外する。

　（５）　糞便移植以降に糞便採取したタイムポイントにおいて、Ｌｏｇ２　ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅが－０．５以下且つＯｔｈｅｒｓ群の保有率が２０％以上であった回数をカウントする。この回数が多いほど、Ｏｔｈｅｒｓ群に多い属又はＯＴＵとみなす。
　（６）　（４）において、カウントした回数が１を超える場合は好ましいとし、回数が高いほど、ＦＭＴの効果に、より寄与する菌と判定する。カウントした回数が移植後の糞便採取の回数の過半数を超える場合は、よりＦＭＴの効果に寄与するとする。ただし、（５）の回数が（４）の回数を上回る場合は、ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群に多いとは判断せず、除外した。

３．組成物の構成菌叢
３－１．　配列による定義
　方法１及び２の絞り込みにより抽出された菌の１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子、例えばｖ１－ｖ２領域の配列は配列番号１～１２０に示すいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。
　ここで、「９４％以上の相同性」とは、例えば９４％以上、９５％以上、９６％以上、９７％以上、９８％以上、９９％以上、９９．５％以上、９９．８％以上、９９．９％以上、又は１００％相同であることを意味する（以下同様）。
　更に好ましくは、配列番号１２１～１５２に示すいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。

　本発明の別の態様において、方法１及び２の絞り込みにより抽出された菌の１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子、例えばｖ１－ｖ２領域の配列は、配列番号１～１２０に示すいずれかの塩基配列と９７％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。
　更に好ましくは、配列番号１２１～１５２に示すいずれかの塩基配列と９７％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。

　本発明において、方法１（ｍｅｄｉａｎによる絞り込み）により好ましいと判断された菌は、その１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子のｖ１－ｖ２領域の配列が、配列番号１５３～１９８に示すいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。
　更に好ましくは、配列番号１９９～２０１に示すいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。

　本発明の別の態様において、方法１（ｍｅｄｉａｎによる絞り込み）により好ましいと判断された菌は、その１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子のｖ１－ｖ２領域の配列が、配列番号１５３～１９８に示すいずれかの塩基配列と９７％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。
　更に好ましくは、配列番号１９９～２０１に示すいずれかの塩基配列と９７％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。

　本発明において、方法２（ｍｅａｎと保有率による絞り込み）により好ましいと判断された菌は、その１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子のｖ１－ｖ２領域の配列が、配列番号２０２～３１２に示すいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。
　更に好ましくは、配列番号３１３～３４４に示すいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。

　本発明の別の態様において、方法２（ｍｅａｎと保有率による絞り込み）により好ましいと判断された菌は、その１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子のｖ１－ｖ２領域の配列が、配列番号２０２～３１２に示すいずれかの塩基配列と９７％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。
　更に好ましくは、配列番号３１３～３４４に示すいずれかの塩基配列と９７％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。

３－２．属名による定義
　本発明において、方法１（ｍｅｄｉａｎによる絞り込み）により好ましいと判断された菌は以下の属に属するものである。“ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　ｔａｘｏｎｏｍｙ名”（例えばｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ）に属する菌は下記表１Ａに示すＳｐｅｃｉｅｓ名に記載の菌の１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子の塩基配列と９４％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。

ブラウチア（Ｂｌａｕｔｉａ）属
クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ
アクチノマイセス（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ）属
パラバクテロイデス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属
ラクノクロストリジウム（Ｌａｃｈｎｏｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属
バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ
ロセブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）属
ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）属
ファスコラークトバクテリウム（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属
フェカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属
シャーリア（Ｓｃｈａａｌｉａ）属
アリスティペス（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ）属
ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属
ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）属
ヴェイロネラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ）属
ドレア（Ｄｏｒｅａ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ
アナエロスティペス（Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ）属
コリンセラ（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ）属
ビロフィラ（Ｂｉｌｏｐｈｉｌａ）属
ブチリシコッカス（Ｂｕｔｙｒｉｃｉｃｏｃｃｕｓ）属
バルネシエラ（Ｂａｒｎｅｓｉｅｌｌａ）属
フシカテニバクター（Ｆｕｓｉｃａｔｅｎｉｂａｃｔｅｒ）属

　上述のうち、ｒｅｃｅｐｉｅｎｔでの定着期間の長さから、より好ましいと判断された菌は以下の属に属するものである。
ブラウチア（Ｂｌａｕｔｉａ）属
クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ
アクチノマイセス（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ）属
パラバクテロイデス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属
ラクノクロストリジウム（Ｌａｃｈｎｏｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属
バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属

　また本発明において、方法２（ｍｅａｎと保有率による絞り込み）により好ましいと判断された菌は以下の属に属するものである。“Ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄｔａｘｏｎｏｍｙ名”に属する菌は、表１ＡのＳｐｅｃｉｅｓ名に記載の菌の１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子の塩基配列と９４％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。

フェカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ
ロセブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）属
ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）属
ドレア（Ｄｏｒｅａ）属
ファスコラークトバクテリウム（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属
サテレラ（Ｓｕｔｔｅｒｅｌｌａ）属
バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属
ブラウチア（Ｂｌａｕｔｉａ）属
パラバクテロイデス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属
メガモナス（Ｍｅｇａｍｏｎａｓ）属
コリンセラ（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ）属
ユーバクテリム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属
コプロコッカス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）属
アナエロスティペス（Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ）属
ビロフィラ（Ｂｉｌｏｐｈｉｌａ）属
フラボニフラクター（Ｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ
ブチリシコッカス（Ｂｕｔｙｒｉｃｉｃｏｃｃｕｓ）属
フェカリカテナ（Ｆａｅｃａｌｉｃａｔｅｎａ）属
プレボテラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）属
クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属
ラクノクロストリジウム（Ｌａｃｈｎｏｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属
アリスティペス（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ）属
メガスファエラ（Ｍｅｇａｓｐｈａｅｒａ）属
ロビンソニエラ（Ｒｏｂｉｎｓｏｎｉｅｌｌａ）属
フシカテニバクター（Ｆｕｓｉｃａｔｅｎｉｂａｃｔｅｒ）属
バルネシエラ（Ｂａｒｎｅｓｉｅｌｌａ）属
フェカリタレア（Ｆａｅｃａｌｉｔａｌｅａ）属
ラクノスピラ（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）属
ロンボウツィア（Ｒｏｍｂｏｕｔｓｉａ）属

　上述のうち、ｒｅｃｅｐｉｅｎｔでの定着期間の長さから、より好ましいと判断された菌は以下の属に属するものである。
フェカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ
ロセブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）属
ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）属
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ
ドレア（Ｄｏｒｅａ）属
ファスコラークトバクテリウム（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属
サテレラ（Ｓｕｔｔｅｒｅｌｌａ）属
バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属
ブラウチア（Ｂｌａｕｔｉａ）属
パラバクテロイデス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属
メガモナス（Ｍｅｇａｍｏｎａｓ）属
コリンセラ（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ）属
ユーバクテリム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属
コプロコッカス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）属

　上記２通りの絞り込みにより抽出された細菌の属は、以下の通りである
“Ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　ｔａｘｏｎｏｍｙ名”に属する菌は、表１ＡのＳｐｅｃｉｅｓ名に記載の菌の１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子の塩基配列と９４％以上の相同性を持つＤＮＡを有する菌である。

　ブラウチア属、クロストリジウム属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、アクチノマイセス属、パラバクテロイデス属、ラクノクロストリジウム属、バクテロイデス属、フェカリバクテリウム属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、ロセブリア属、ルミノコッカス属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、ドレア属、ファスコラークトバクテリウム属、サテレラ属、メガモナス属、コリンセラ属、ユーバクテリム属、コプロコッカス属、シャーリア属、アリスティペス属、ビフィドバクテリウム属、ラクトバチルス属、ヴェイロネラ属、アナエロスティペス属、ビロフィラ属、ブチリシコッカス属、バルネシエラ属、フシカテニバクター属、フラボニフラクター属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ、フェカリカテナ属、プレボテラ属、メガスファエラ属、ロビンソニエラ属、フェカリタレア属、ラクノスピラ属、ロンボウツィア属

　従って、本発明の組成物にはブラウチア属、クロストリジウム属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、アクチノマイセス属、パラバクテロイデス属、ラクノクロストリジウム属、バクテロイデス属、フェカリバクテリウム属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、ロセブリア属、ルミノコッカス属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、ドレア属、ファスコラークトバクテリウム属、サテレラ属、メガモナス属、コリンセラ属、ユーバクテリム属、コプロコッカス属、シャーリア属、アリスティペス属、ビフィドバクテリウム属、ラクトバチルス属、ヴェイロネラ属、アナエロスティペス属、ビロフィラ属、ブチリシコッカス属、バルネシエラ属、フシカテニバクター属、フラボニフラクター属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ、フェカリカテナ属、プレボテラ属、メガスファエラ属、ロビンソニエラ属、フェカリタレア属、ラクノスピラ属、ロンボウツィア属からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌が含まれる。

　より好ましくは、本発明の組成物にはブラウチア属、クロストリジウム属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、アクチノマイセス属、パラバクテロイデス属、ラクノクロストリジウム属、バクテロイデス属、フェカリバクテリウム属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、ロセブリア属、ルミノコッカス属、ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、ドレア属、ファスコラークトバクテリウム属、サテレラ属、メガモナス属、コリンセラ属、ユーバクテリム属、コプロコッカス属からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌が含まれる。

３－３．種名による定義
　本発明において、前記方法１（ｍｅｄｉａｎによる絞り込み）及び方法２（ｍｅａｎと保有率による絞り込み）は、好ましい菌種を定義するために適用することもできる。種名の定義は、「３－２．属名による定義」の項で定義された属名に属する菌種に絞り込み実施した。
　本発明において、方法１（ｍｅｄｉａｎによる絞り込み）により好ましいと判断された菌は以下の種である。

　また本発明において、方法２（ｍｅａｎと保有率による絞り込み）により好ましいと判断された菌は以下の種である。

　上記２通りの絞り込みにより抽出されたＳｐｅｃｉｅｓをまとめると、以下の通りである。

　本発明において、Ｓｐｅｃｉｅｓの絞り込みの結果、表１Ｄに記載の７６Ｓｐｅｃｉｅｓ（Ａ群という）がＣＲｏｒＰＲに多い。このうち、下記２７Ｓｐｅｃｉｅｓ（Ｂ群という）がさらに好ましく、Ｂ群に含まれるＳｐｅｃｉｅｓのうち、下記１０Ｓｐｅｃｉｅｓ（Ｃ群という）が最も好ましい。

Ｂ群（２７Ｓｐｅｃｉｅｓ）：
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｖｕｌｇａｔｕｓ
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ
Ｂｌａｕｔｉａ　ｗｅｘｌｅｒａｅ
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　ＡＲ２９
Ｄｏｒｅａ　ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ
Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃｉｕｍ
Ｂｌａｕｔｉａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　Ｋ－１
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｏｖａｔｕｓ
Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ
Ｍｅｇａｍｏｎａｓ　ｆｕｎｉｆｏｒｍｉｓ
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ
［Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ］　ｔｏｒｑｕｅｓ
Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ　ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｍｅｒｄａｅ
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ｍ１０４／１
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃａｌｅ
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　８２６
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｃｏｐｒｏｃｏｌａ
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｆａｅｃｉｓ
Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＶＰ１８ｋ１
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　ＡＴ４
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ　ｒｏｇｏｓａｅ
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ａ２－２０７
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｓｐ．　１１２０
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｄｏｒｅｉ

Ｃ群：
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｖｕｌｇａｔｕｓ
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ
Ｂｌａｕｔｉａ　ｗｅｘｌｅｒａｅ
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　ＡＲ２９
Ｄｏｒｅａ　ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ
Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃｉｕｍ
Ｂｌａｕｔｉａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　Ｋ－１
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｏｖａｔｕｓ

　本発明の組成物には、上記列挙した属に属する菌を単体で含めることも、複数の菌を組み合わせて含めることもできる。複数の菌の組み合わせを含める場合、４０種類以下の菌が好ましく、３０種類以下の菌がさらに好ましく、更には２０種類以下の菌が最も好ましい。２０種類以下であれば、例えば、２０，１９，１８，１７，１６，１５，１４，１３，１２，１１，１０，９，８，７，６，５，４，３，２種類の任意の組み合わせの菌を選択することができる。

　また、本発明の組成物は、ａｌｌｏ－ＨＳＣＴに適宜使用するために、あるいは長期使用可能とするために、任意の粉末、固体又は液体形態とすることができ、これらの粉末、固体又は液体形態をカプセル製剤とすることも可能である。カプセル製剤とすることで、チューブ挿入や大腸ファイバー等による出血などの合併症の回避が可能であり、また実施にあたって患者の負担軽減になるといった利点がある。
　さらに、本発明の組成物は、生菌であっても死菌であってもよく、生菌と死菌の混合物であってもよい。

　さらに、本発明の組成物に、ｐＨ安定剤、酸性化剤、防腐剤、ビタミン、ミネラル、栄養サプリメント、プレバイオティクス及びプロバイオティクスから選ばれる少なくとも１つを含めることができる。
　また本発明の組成物を、造血幹細胞移植の前又は後に、あるいはその両時期に、当該移植対象患者に投与することにより、ＧＶＨＤを予防又は治療することができる。
　ＧＶＨＤとしては、例えばステロイド抵抗性若しくはステロイド依存性のＧＶＨＤ、又は腸管急性ＧＶＨＤを挙げることができる。

　ここで、「治療」とはＧＶＨＤの発症を抑制することができる限り、抑制の程度は限定されるものではない。従って、「治療」には完全奏功（ＣＲ）及び部分奏功（ＰＲ）のいずれも含まれる。完全奏功（ＣＲ）とは、全ての消化管ＧＶＨＤ関連症状の消失を意味し、部分奏功（ＰＲ）とは、１つ以上の消化管ＧＶＨＤのｄｏｗｎ　ｓｔａｇｉｎｇを意味する。本発明においては、ステロイド抵抗例でＰＲ又はＣＲを到達した場合に、またステロイド依存例では治療前に比べ４０％以上のステロイド減量に成功したときに有効（治療した）とした。

　また、「予防」とは、ＧＶＨＤの発症を事前に抑制すること、既に発生しているＧＶＨＤの状態がそれよりも悪化するのを防ぐこと及び沈静化したＧＶＨＤの再発を防ぐことのいずれも意味する。
　本発明においては、前記組成物又はカプセル製剤をＧＶＨＤ患者に投与することを特徴とするＧＶＨＤの治療方法を提供する。
　さらに本発明は、前記組成物又はカプセル製剤を造血幹細胞移植の前、後又はその両時期に、造血幹細胞移植対象患者に投与することを特徴とする、ＧＶＨＤの予防方法を提供する。

　４．細菌混合物、製剤
　本発明は、ヒトから採取された糞便から、前記細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便を溶媒（例えば生理食塩水、緩衝液）に懸濁することを特徴とする、糞便細菌叢移植用懸濁液の製造方法を提供する。
　また、本発明は、ヒトから採取された糞便から、前記細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便から細菌叢を取得し、該細菌叢を溶媒に懸濁することを特徴とする、糞便細菌叢移植用懸濁液の製造方法を提供する。
　さらに、本発明は、ヒトから採取された糞便から、前記細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便から当該細菌を分離し、分離された細菌を混合することを特徴とする、糞便細菌叢移植用細菌混合物の製造方法を提供する。ここで、細菌の分離は、サンプル中に含まれる細菌の種類が、１種類でもよく、２種類以上でもよい。

　さらに本発明の別の態様では、ヒトから採取された糞便から、前記細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便の細菌叢、又は存在が確認された糞便から分離された細菌を製剤化することを特徴とする、糞便細菌叢移植用製剤の製造方法を提供する。
製剤化として、カプセルへの封入方法が例示される。

　糞便の採取は、前記「１．ＦＭＴ」の項に記載された方法に準じて行うことができる。
　細菌の存在を確認する方法は特に限定されるものではなく、例えば１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子解析法、対象細菌に特異的な領域のＤＮＡ配列を用いたｑＰＣＲやＭｉｃｒｏａｒｒａｙ，あるいはＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ　ＭＳ法などが挙げられる。
　１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子解析法等により細菌の存在が確認されると、採取元の糞便に当該細菌が含まれることになる。糞便の希釈懸濁液を、種々の培養条件に供し、単一コロニーを採取して菌を単離する。

　本発明の製剤は、本発明の前記細菌を含む限り、その剤形は特に限定されないが、経口投与製剤とすることが好ましい。
　経口用固形製剤を調製する場合には、主薬に賦形剤さらに必要に応じて結合剤、崩壊剤、滑沢剤、着色剤、矯味矯臭剤などを加えた後、常法により錠剤、被覆錠剤、顆粒剤、細粒剤、散剤、カプセル剤等とすることができる。
　カプセル剤としては、例えば、耐酸性カプセル剤が用いられる。耐酸性カプセル剤としては、ＤＲ　Ｃａｐｓ（登録商標）（Ｃａｐｓｕｇｅｌ社）が例示される。
　賦形剤としては、例えば、乳糖、コーンスターチ、白糖、ぶどう糖、ソルビット、結晶セルロース、二酸化ケイ素などが、結合剤としては、例えばポリビニルアルコール、エチルセルロース、メチルセルロース、アラビアゴム、ヒドロキシプロピルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース等が、滑沢剤としては、例えばステアリン酸マグネシウム、タルク、シリカ等が、着色剤としては医薬品に添加することが許可されているものが、矯味矯臭剤としては、ココア末、ハッカ脳、芳香酸、ハッカ油、龍脳、桂皮末等が用いられる。

　本発明においては、上記製剤中、カプセル製剤とすることが好ましい。
　製剤中に含まれる細菌は、乾燥菌体相当で、例えば、１～２０００ｍｇ、好ましくは１０～５００ｍｇ、さらに好ましくは１００～２５０ｍｇとすることができ、患者の体重、症状等に応じて１日あたり１５０～２００ｍｇ、好ましくは１７５ｍｇを投与することができる。
　本発明に関する菌は、医薬品としても医薬部外品としても使用することができる。

　　実施例
　以下、実施例により本発明をさらに具体的に説明する。但し、本発明の範囲はこれらの実施例により限定されるものではない。

　　好ましい細菌叢のスクリーニングのためのＦＭＴ　
［対象と方法］
ＦＭＴの対象者
　ステロイド抵抗性、又は依存性の腸管急性ＧＶＨＤ症例１５例に対してＦＭＴを実施した。
　急性ＧＶＨＤは腸管以外にも皮膚や肝臓が標的臓器となるが、他臓器と比較して腸管急性ＧＶＨＤはより重篤度が高い点から、今回は腸管を対象とした。ステロイド抵抗性とは、十分量（プレドニゾロンを１ｍｇ／ｋｇ以上）のステロイド治療にもかかわらず、治療開始５日目以降で病態が不変の症例とし、ステロイド依存例とはステロイド治療に一旦は反応するものの、ステロイドの減量に伴い増悪しステロイドを再増量をせざるを得ない症例（減量困難例）とした。
　上記に加え、ステロイド治療開始後３日目の腸管急性ＧＶＨＤ増悪例も対象とした。
他の腸管病変を合併している例でも、腸管急性ＧＶＨＤが下痢の主たる原因と考えられる場合にはエントリー可能とした。

　　除外基準は以下の通りとした。
１）　ステロイド治療に反応するＧＶＨＤ
２）　ステロイドによる一次治療後に増悪するＧＶＨＤ（この場合罹患臓器を問わない）
３）　コントロール不可能な感染症を有する症例
４）　下痢がＧＶＨＤ以外の原因によると考えられる場合

ＦＭＴのドナー選択
　患者の配偶者、又は４親等以内の親族又は友人からドナー候補を選択した
年齢は２０－６４歳で、下記のような感染のリスクを有さないものから選択した。
１）　直近３ヶ月以内に新たに入れ墨をしたり、ピアスをあけていないこと
２）　直近３ヶ月以内に新たなパートナーとの性交渉がないこと
３）　直近３ヶ月以内に輸血を受けていないこと
４）　直近３ヶ月以内に熱帯地域への渡航歴がないこと
５）　直近１ヶ月以内に抗生剤の使用歴がないこと
６）　悪性疾患や炎症性腸疾患の既往がないこと
７）　当日下痢などの消化器症状がないこと（ＦＭＴ当日に確認）
８）　高血圧、糖尿病、高脂血症、心筋梗塞や狭心症、心不全といった心疾患、脳卒中、喘息やアトピー性皮膚炎、食物アレルギーといったアレルギー疾患がないこと（花粉症は除く）

　上記の項目に問題がなければ、ドナー候補から採血し、また糞便検査を実施した。採血検査にて、ＨＩＶ、ｈｕｍａｎ　Ｔ－ｌｙｍｐｈｏｔｒｏｐｉｃ　ｖｉｒｕｓ　ｔｙｐｅ　Ｉ（ＨＴＬＶ－１）、Ａ型、Ｂ型及びＣ型肝炎、梅毒、ｃｙｔｏｍｅｇａｌｏｖｉｒｕｓ（ＣＭＶ）、Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒ　ｖｉｒｕｓ（ＥＢＶ）をチェックし、糞便検査でｐａｒａｓｉｔｅｓ、　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ、Ｃｒｙｐｔｏｓｐｏｒｉｄｉｕｍ、Ｇｉａｒｄｉａ、Ｍｉｃｒｏｓｐｏｒｉｄｉａ、Ｅｎｔａｍｏｅｂａ　ｈｉｓｔｏｌｙｔｉｃａ、Ｃｙｃｌｏｓｐｏｒａ、Ｉｓｏｓｐｏｒａ、Ｄｉｅｎｔａｍｏｅｂａ　ｆｒａｇｉｌｉｓ、Ｂｌａｓｔｏｃｙｓｔｉｓ　ｈｏｍｉｎｉｓ、Ｓｃｈｉｓｔｏｓｏｍａ等の病原性細菌の有無などをチェックした。ＣＭＶとＥＢＶに関しては、患者が既感染パターンである場合、問題なしと判断した。

ＦＭＴの方法
　ＦＭＴ実施当日、ドナーから糞便を採取し、使用まで４℃、嫌気状態で保管した。
　患者が胃十二指腸チューブを挿入するタイミングで糞便の調製を開始した。糞便の調製は、まず糞便の重さを測り、量に応じ滅菌生理食塩水２００－３００ｍＬを加え、均一になるまでよく攪拌した。これを、一度金ふるいで濾し、大きな未消化物を除去した。その後、滅菌ガーゼで２回濾すことにより懸濁液を作成した。患者の準備が整い次第ＦＭＴを実施した。
　懸濁液を５０ｍＬのシリンジに充填し、胃十二指腸チューブより糞便懸濁液を投与した。投与速度は５０ｍＬあたり３０秒を超えない速度とした。すべての懸濁液を入れ終わったのち、生理食塩水５０ｍＬでチューブ内を洗浄し、チューブを抜去して、投与を終了した。
　ＦＭＴに関連したｇｒａｄｅ３（非特許文献３による定義）以上の副作用が認められない場合、効果を見ながら１回目のＦＭＴから４－１４日の間に１回の追加投与を実施した。この場合、初回と同じドナーから糞便を採取することとした。糞便移植は、ドナーの糞便採取から１２時間以内、可能な限り８時間以内に実施することとした。

　腸管ＧＶＨＤのため、絶食となっている患者に関しては、食物繊維・オリゴ糖などを含むサプリメント（ＧＦＯ（登録商標）：大塚製薬工業）をプレバイオティクスとして、ＦＭＴ開始前日より摂取させた。また、抗生剤の投与はＦＭＴの前後２４時間は可能な限り中止することとした。
　ＦＭＴ後一週間以内に新たに発生、又はｇｒａｄｅ１（非特許文献３による定義）以上の悪化を認めた例をすべて副作用とし、Ｎａｔｉｏｎａｌ　Ｃａｎｃｅｒ　Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ　Ｃｏｍｍｏｎ　Ｔｅｒｍｉｎｏｌｏｇｙ　Ｃｒｉｔｅｒｉａ　ｆｏｒ　Ａｄｖｅｒｓｅ　Ｅｖｅｎｔｓ　（ＣＴＣ－ＡＥ）　ｖｅｒｓｉｏｎ　４．０で評価した。

　治療効果に関しては、最終のＦＭＴから４週間後に評価した。治療効果判定の基準は下記のとおりである。

１）完全奏功（ＣＲ）：全ての消化管ＧＶＨＤ関連症状の消失
２）部分奏功（ＰＲ）：　１つ以上の消化管ＧＶＨＤのｄｏｗｎ　ｓｔａｇｉｎｇ
３）進行（ＰＧ）：１つ以上のｓｔａｇｅ（非特許文献３による定義）の増悪
４）変化なし（ＮＣ）：　ｓｔａｇｅ（非特許文献３による定義）内の変動
５）Ｎｏｔ　Ｄｅｔｅｒｍｉｎｅｄ（ＮＤ）：治療後早期（７日以内）の死亡やＧＶＨＤ以外の症状のため評価が困難な場合
　ＦＭＴは、ステロイド抵抗例ではＰＲ又はＣＲを到達した場合に、ステロイド依存例では治療前に比べ４０％以上の減量に成功したときに有効と判断した。

腸内細菌叢の解析（メタ１６Ｓ解析法）
　作成した糞便調整液、並びに患者の糞便（ＦＭＴ前、最終のＦＭＴから１～３日後、１、２、４週間後）の一部を用い、腸内細菌叢の解析を実施した。
　各サンプルから常法に従って細菌のＤＮＡを抽出した。これを１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子の可変領域、ｖ１－ｖ２をカバーするように設計したプライマー（２７Ｆｍｏｄ：５’－ａｇｒｇｔｔｔｇａｔｙｍｔｇｇｃｔｃａｇ－３’（配列番号３４５）、３３８Ｒ：５’－ｔｇｃｔｇｃｃｔｃｃｃｇｔａｇｇａｇｔ－３’（配列番号３４６））を用い、ＰＣＲ（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ　ｃｈａｉｎ　ｒｅａｃｔｉｏｎ）により増幅したのちｉｌｌｕｍｉｎａ社ＭｉＳｅｑ（登録商標）で２５０ｂｐのＰａｉｒｅｄ　ｅｎｄにてシーケンスを実施した。得られた配列のＲｅａｄ１とＲｅａｄ２をマージした後クオリティチェックを行い、これにパスした配列データ３，０００リードを解析に用いた。得られたリードを同一配列のａｂｕｎｄａｎｃｅによって降順にソートし、同一ａｂｕｎｄａｎｃｅの場合はｑｕａｌｉｔｙの平均値によって降順にソートした。ソート後の配列について、ＵＣＬＵＳＴアルゴリズムを用い９７％の相同性を閾値としてｏｐｅｒａｔｉｏｎａｌ　ｔａｘｏｎｏｍｉｃ　ｕｎｉｔｓ（ＯＴＵｓ）　ｃｌｕｓｔｅｒｉｎｇを実施した。また、１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子データベース（ＲｅｆＳｅｑ，ＲＤＰ，ＧＲＤ，ＣＯＲＥ）に対してｇｌｓｅａｒｃｈを用いて相同性検索することにより菌種の同定を実施した。属の同定における相同性の閾値は９４％とした。Ｓｐｅｃｉｅｓの同定における相同性の閾値は９７％とした。

　またα多様性評価に関してはＳｈａｎｎｏｎ　ｉｎｄｅｘを用いた。なお、本解析におけるＴａｘｏｎｏｍｙ名は、２０１９年５月７日時点のＮＣＢＩ　Ｔａｘｏｎｏｍｙ　ＤａｔａｂａｓｅのＦＴＰサイトのｔａｘｄｍｐ．ｚｉｐの内容に準拠した。

腸内細菌叢の群間比較
　ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群とＯｔｈｅｒｓ群について、「方法１．ｍｅｄｉａｎによる絞り込み」及び「方法２．ｍｅａｎと保有率による菌の絞り込み」の項に記載の２つの方法を用いてＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群に多い腸内細菌の抽出を実施した。

［結果と考察］
　最終投与から４週間後の結果を用いた治療効果判定において、１５例中６例がＣＲと、３例がＰＲと判定され、奏効率６０％という結果であった。よって、本実施例により、ＧＶＨＤの治療・予防戦略としてのＦＭＴの有効性が認められた。
　ＦＭＴ前後における糞便細菌叢の多様性の経過時間変化については図１に示す通りである。ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群、Ｏｔｈｅｒｓ群ともにＦＭＴ後にα多様性の改善が見られた。ＦＭＴ後４週間にかけて、徐々にα多様性が低下したが、ＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群はＯｔｈｅｒｓ群と比較してその低下が抑制されていた。

　ＦＭＴ前後における糞便細菌叢の属レベルでの組成比を表したグラフを図２に示す。ＦＭＴ前では菌叢の多様性が低下しており（ディスバイオーシス）、ＳｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓやＥｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓなどが優勢な状態であった。ＦＭＴ後には、菌叢の多様性が回復しており、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ、Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍなどの種々の菌を含む菌叢に変化していた。Ｏｔｈｅｒｓ群では４週間後にＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａが優勢となるケースも観察された。更に属ごとの経時変化を図３～９に表す。図３～９に示した属はいずれもＯｔｈｅｒｓ群対比でＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群に多く存在していることが確認された。また、図１０に示したＣｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍは、全てのタイムポイントにおいてＯｔｈｅｒｓ群に多く存在していることが確認された。

　２群比較により「方法１．ｍｅｄｉａｎによる絞り込み」及び「方法２．ｍｅａｎと保有率による菌の絞り込み」の項に記載の２つの方法の結果を、ＯＴＵレベルは表２、表３にそれぞれ記載した。Ｇｅｎｕｓレベルは表４、表５に記載した。表にはＬｏｇ２　Ｆｏｌｄ　ｃｈａｎｇｅが０．５以上の回数が１回以上の菌に関して記載した。

　さらに、ＦＭＴ前後における糞便細菌叢のＳｐｅｃｉｅｓにおいて、前記Ｂ群における経時変化を図１１～１９に表す。図１１～１９に示したＳｐｅｃｉｅｓはいずれもＯｔｈｅｒｓ群対比でＣＲ　ｏｒ　ＰＲ群に多く存在していることが確認された。

配列番号３４５：合成ＤＮＡ
配列番号３４６：合成ＤＮＡ

Claims

ブラウチア（Ｂｌａｕｔｉａ）属、
クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
アクチノマイセス（Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ）属、
パラバクテロイデス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属、
ラクノクロストリジウム（Ｌａｃｈｎｏｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）属、
バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）属、
フェカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）属、
ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
ドレア（Ｄｏｒｅａ）属、
ファスコラークトバクテリウム（Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属、
サテレラ（Ｓｕｔｔｅｒｅｌｌａ）属、
メガモナス（Ｍｅｇａｍｏｎａｓ）属、
コリンセラ（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ）属、
ユーバクテリム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属、
コプロコッカス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）属、
シャーリア（Ｓｃｈａａｌｉａ）属、
アリスティペス（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ）属、
ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）属、
ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）属、
ヴェイロネラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ）属、
アナエロスティペス（Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ）属、
ビロフィラ（Ｂｉｌｏｐｈｉｌａ）属、
ブチリシコッカス（Ｂｕｔｙｒｉｃｉｃｏｃｃｕｓ）属、
バルネシエラ（Ｂａｒｎｅｓｉｅｌｌａ）属、
フシカテニバクター（Ｆｕｓｉｃａｔｅｎｉｂａｃｔｅｒ）属、
フラボニフラクター（Ｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ）属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ、
フェカリカテナ（Ｆａｅｃａｌｉｃａｔｅｎａ）属、
プレボテラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）属、
メガスファエラ（Ｍｅｇａｓｐｈａｅｒａ）属、
ロビンソニエラ（Ｒｏｂｉｎｓｏｎｉｅｌｌａ）属、
フェカリタレア（Ｆａｅｃａｌｉｔａｌｅａ）属、
ラクノスピラ（Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａ）属、及び
ロンボウツィア（Ｒｏｍｂｏｕｔｓｉａ）属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、ＧＶＨＤの予防又は治療用組成物。
ブラウチア属、
クロストリジウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
アクチノマイセス属、
パラバクテロイデス属、
ラクノクロストリジウム属、
バクテロイデス属、
フェカリバクテリウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア属、
ルミノコッカス属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
ドレア属、
ファスコラークトバクテリウム属、
サテレラ属、
メガモナス属、
コリンセラ属、
ユーバクテリム属、及び
コプロコッカス属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項１に記載の組成物。
ブラウチア属、
クロストリジウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
アクチノマイセス属、
パラバクテロイデス属、
ラクノクロストリジウム属、
バクテロイデス属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア属、
ルミノコッカス属、
ファスコラークトバクテリウム属、
フェカリバクテリウム属、
シャーリア属、
アリスティペス属、
ビフィドバクテリウム属、
ラクトバチルス属、
ヴェイロネラ属、
ドレア属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
アナエロスティペス属、
コリンセラ属、
ブチリシコッカス属、
バルネシエラ属、及び
フシカテニバクター属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項１に記載の組成物。
ブラウチア属、
クロストリジウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
アクチノマイセス属、
パラバクテロイデス属、
ラクノクロストリジウム属、及び
バクテロイデス属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項３に記載の組成物。
フェカリバクテリウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア属、
ルミノコッカス属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
ドレア属、
ファスコラークトバクテリウム属、
サテレラ属、
バクテロイデス属、
ブラウチア属、
パラバクテロイデス属、
メガモナス属、
コリンセラ属、
ユーバクテリム属、
コプロコッカス属、
アナエロスティペス属、
ビロフィラ属、
フラボニフラクター属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃａｃｅａｅ、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ、
ブチリシコッカス属、
フェカリカテナ属、
プレボテラ属、
クロストリジウム属、
ラクノクロストリジウム属、
アリスティペス属、
メガスファエラ属、
ロビンソニエラ属、
フシカテニバクター属、
バルネシエラ属、
フェカリタレア属、
ラクノスピラ属、及び
ロンボウツィア属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項１に記載の組成物。
フェカリバクテリウム属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ、
ロセブリア属、
ルミノコッカス属、
ｕｎｃｌａｓｓｉｆｉｅｄ　Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、
ドレア属、
ファスコラークトバクテリウム属、
サテレラ属、
バクテロイデス属、
ブラウチア属、
パラバクテロイデス属、
メガモナス属、
コリンセラ属、
ユーバクテリム属、及び
コプロコッカス属
からなる群から選ばれるいずれかの属に属する細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項５に記載の組成物。
　配列番号１～１２０に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、ＧＶＨＤの予防または治療用組成物。
　配列番号１２１～１５２に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項７に記載の組成物。
　配列番号１５３～１９８に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項７に記載の組成物。
　配列番号１９９～２０１に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項９に記載の組成物。
　配列番号２０２～３１２に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項７に記載の組成物。
　配列番号３１３～３４４に示されるいずれかの塩基配列と９４％以上の相同性を有する塩基配列からなるＤＮＡを含む細菌、又はこれらの組み合わせを含む、請求項１１に記載の組成物。
　細菌が、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｖｕｌｇａｔｕｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｗｅｘｌｅｒａｅ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　ＡＲ２９、
Ｄｏｒｅａ　ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ、
Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃｉｕｍ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　Ｋ－１、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｏｖａｔｕｓ、
Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、
Ｍｅｇａｍｏｎａｓ　ｆｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、
［Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ］　ｔｏｒｑｕｅｓ、
Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ　ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｍｅｒｄａｅ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ｍ１０４／１、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃａｌｅ、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　８２６、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｃｏｐｒｏｃｏｌａ、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｆａｅｃｉｓ、
Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＶＰ１８ｋ１、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　ＡＴ４、
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ　ｒｏｇｏｓａｅ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ａ２－２０７、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｓｐ．　１１２０、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｄｏｒｅｉ、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｐｓｅｕｄｏｃａｔｅｎｕｌａｔｕｍ、
Ｍｅｇａｓｐｈａｅｒａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ａｎａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ　ｈａｄｒｕｓ、
Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ　ｐｕｔｒｅｄｉｎｉｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　Ｄ２５、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｉｎｕｌｉｎｉｖｏｒａｎｓ、
Ｂｉｌｏｐｈｉｌａ　ｓｐ．　４＿１＿３０、
Ｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ　ｐｌａｕｔｉｉ、
Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｌｅｓ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　８０／３、
Ｂｕｔｙｒｉｃｉｃｏｃｃｕｓ　ｆａｅｃｉｈｏｍｉｎｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｃｅｌｌｕｌｏｓｉｌｙｔｉｃｕｓ、
Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ　ｃａｔｕｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ、
Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＲＰ１４、
［Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ］　ｇｎａｖｕｓ、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｌｏｎｇｕｍ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｘｙｌａｎｉｓｏｌｖｅｎｓ、
Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ　ｓｔｅｒｃｏｒｅａ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｐｌｅｂｅｉｕｓ、
Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＶＲ５０、
Ｓｕｔｔｅｒｅｌｌａ　ｗａｄｓｗｏｒｔｈｅｎｓｉｓ、
Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　１＿１＿５７ＦＡＡ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｏｂｅｕｍ、
Ｂａｒｎｅｓｉｅｌｌａ　ｉｎｔｅｓｔｉｎｉｈｏｍｉｎｉｓ、
［Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ］　ｅｌｉｇｅｎｓ、
Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ　ｃｏｍｅｓ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　ＤＪＦ＿ＶＲ７０ｋ１、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ａ２－１７５、
Ｆａｅｃａｌｉｔａｌｅａ　ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｓｐ．　ＹＨＣ－４、
［Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ］　ｇｌｙｃｙｒｒｈｉｚｉｎｉｌｙｔｉｃｕｍ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　６５３、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｌａｃｔａｒｉｓ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＳＭ６／１、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＳＳ３／４、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＬＳ４０、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　１＿１＿３０、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｎｏｒｄｉｉ、
Ｆｕｓｉｃａｔｅｎｉｂａｃｔｅｒ　ｓａｃｃｈａｒｉｖｏｒａｎｓ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＳＬ７／１、
［Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ］　ｓｃｉｎｄｅｎｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ、
Ｓｃｈａａｌｉａ　ｏｄｏｎｔｏｌｙｔｉｃａ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｆａｅｃｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｆｒａｇｉｌｉｓ、
［Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ］　ｂｏｌｔｅａｅ、及び
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　ＨＧＦ２
からなる群から選ばれる少なくとも１種である、請求項１に記載の組成物。
　細菌が、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｖｕｌｇａｔｕｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｗｅｘｌｅｒａｅ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　ＡＲ２９、
Ｄｏｒｅａ　ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ、
Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃｉｕｍ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　Ｋ－１、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｏｖａｔｕｓ、
Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ、
Ｍｅｇａｍｏｎａｓ　ｆｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ、
［Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ］　ｔｏｒｑｕｅｓ、
Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ　ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ、
Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｍｅｒｄａｅ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ｍ１０４／１、
Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃａｌｅ、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　８２６、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｃｏｐｒｏｃｏｌａ、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｆａｅｃｉｓ、
Ｌａｃｈｎｏｓｐｉｒａｃｅａｅ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ＤＪＦ＿ＶＰ１８ｋ１、
Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ　ｓｐ．　ＡＴ４、
Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ　ｒｏｇｏｓａｅ、
ｂｕｔｙｒａｔｅ－ｐｒｏｄｕｃｉｎｇ　ｂａｃｔｅｒｉｕｍ　Ａ２－２０７、
Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ　ｓｐ．　１１２０、及び
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｄｏｒｅｉ
からなる群から選ばれる少なくとも１種である、請求項１３に記載の組成物。
　細菌が、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｖｕｌｇａｔｕｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｗｅｘｌｅｒａｅ、
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｓｐ．　ＡＲ２９、
Ｄｏｒｅａ　ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ、
Ｐｈａｓｃｏｌａｒｃｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ　ｆａｅｃｉｕｍ、
Ｂｌａｕｔｉａ　ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ、
Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ　ｓｐ．　Ｋ－１、及び
Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ　ｏｖａｔｕｓ
からなる群から選ばれる少なくとも１種である、請求項１３に記載の組成物。
　ＧＶＨＤが、ステロイド抵抗性又はステロイド依存性のＧＶＨＤである、請求項１～１５のいずれか１項に記載の組成物。
　ＧＶＨＤが、腸管急性ＧＶＨＤである、請求項１～１５のいずれか１項に記載の組成物。
　請求項１～１７のいずれか１項に記載の組成物を含む、ＧＶＨＤの予防又は治療用カプセル製剤。
　請求項１～１７のいずれか１項に記載の組成物、又は請求項１８に記載のカプセル製剤をＧＶＨＤ患者に投与することを特徴とするＧＶＨＤの治療方法。
　請求項１～１７のいずれか１項に記載の組成物、又は請求項１８に記載のカプセル製剤を造血幹細胞移植の前、後又はその両時期に、造血幹細胞移植対象患者に投与することを特徴とする、ＧＶＨＤ予防方法。
　ヒトから採取された糞便から、請求項１～１５のいずれか１項に記載された細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便を水性媒体に懸濁することを特徴とする、糞便細菌叢移植用懸濁液の製造方法。
　ヒトから採取された糞便から、請求項１～１５のいずれか１項に記載された細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便から当該細菌を分離し、分離された細菌を混合することを特徴とする、糞便細菌叢移植用細菌混合物の製造方法。
　ヒトから採取された糞便から、請求項１～１５のいずれか１項に記載された細菌の存在を確認し、存在が確認された糞便から当該細菌を分離し、分離された細菌を製剤化することを特徴とする、糞便細菌叢移植用製剤の製造方法。
　製剤がカプセル製剤である請求項２３に記載の方法。
　細菌の存在確認が、１６Ｓ　ｒＲＮＡ遺伝子解析によるものである、請求項２１～２４のいずれか１項に記載の方法。