BR0211312A - Método para avaliar o potencial de uma entidade quìmica para associar-se com uma molécula ou com um complexo de moléculas e método para identificar um inibidor em potencial da d-ala-d-ala ligase ou um homólogo do mesmo - Google Patents
Método para avaliar o potencial de uma entidade quìmica para associar-se com uma molécula ou com um complexo de moléculas e método para identificar um inibidor em potencial da d-ala-d-ala ligase ou um homólogo do mesmoInfo
- Publication number
- BR0211312A BR0211312A BR0211312-0A BR0211312A BR0211312A BR 0211312 A BR0211312 A BR 0211312A BR 0211312 A BR0211312 A BR 0211312A BR 0211312 A BR0211312 A BR 0211312A
- Authority
- BR
- Brazil
- Prior art keywords
- ala
- potential
- molecule
- enzyme
- assessing
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title abstract 5
- 108020003338 D-alanine-D-alanine ligase Proteins 0.000 title abstract 3
- 150000005829 chemical entities Chemical class 0.000 title abstract 2
- 229940113306 Ligase inhibitor Drugs 0.000 title 1
- 239000000436 ligase inhibitor Substances 0.000 title 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 abstract 5
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 abstract 5
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 abstract 2
- 239000000758 substrate Substances 0.000 abstract 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 abstract 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 abstract 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 abstract 1
- 238000005457 optimization Methods 0.000 abstract 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 abstract 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/93—Ligases (6)
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Abstract
"MéTODO PARA AVALIAR O POTENCIAL DE UMA ENTIDADE QUìMICA PARA ASSOCIAR-SE COM UMA MOLéCULA OU COM UM COMPLEXO DE MOLéCULAS E MéTODO PARA IDENTIFICAR UM INIBIDOR EM POTENCIAL DA D-ALA-D-ALA LIGASE OU UM HOMóLOGO DO MESMO". A invenção é baseada na descoberta de que determinas moléculas pequenas podem se ligar aos sítios de ligação ATP da D-Ala-D-Ala ligase, mesmo na ausência de substratos de enzima, e podem causar uma alteração conformacional na estrutura enzimática similar àquela que ocorre por ligação do ATP e o substrato para a enzima. Sem basear-se em qualquer teoria, acredita-se que a referida alteração conformacional é requerida tanto na ativação quanto na inibição da enzima. A informação obtida a partir desta descoberta permitiu a identificação das chaves de interações no sítio ativo da enzima, bem como o desenho e a otimização dos inibidores.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US30167601P | 2001-06-28 | 2001-06-28 | |
| PCT/US2002/020465 WO2003002063A2 (en) | 2001-06-28 | 2002-06-28 | Structure-based drug design methods for identifying d-ala-d-ala ligase inhibitors as antibacterial drugs |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| BR0211312A true BR0211312A (pt) | 2004-07-13 |
Family
ID=23164377
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| BR0211312-0A BR0211312A (pt) | 2001-06-28 | 2002-06-28 | Método para avaliar o potencial de uma entidade quìmica para associar-se com uma molécula ou com um complexo de moléculas e método para identificar um inibidor em potencial da d-ala-d-ala ligase ou um homólogo do mesmo |
Country Status (16)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US20030119061A1 (pt) |
| EP (1) | EP1412516A4 (pt) |
| CN (1) | CN1268765C (pt) |
| BG (1) | BG108549A (pt) |
| BR (1) | BR0211312A (pt) |
| CA (1) | CA2451837A1 (pt) |
| CZ (1) | CZ200441A3 (pt) |
| EA (1) | EA007612B1 (pt) |
| EE (1) | EE200400044A (pt) |
| HU (1) | HUP0600158A2 (pt) |
| IL (1) | IL159539A0 (pt) |
| MX (1) | MXPA04000157A (pt) |
| PL (1) | PL367484A1 (pt) |
| SK (1) | SK282004A3 (pt) |
| WO (1) | WO2003002063A2 (pt) |
| YU (1) | YU102403A (pt) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US8329060B2 (en) * | 2008-10-22 | 2012-12-11 | General Electric Company | Blue-green and green phosphors for lighting applications |
| US20170314007A1 (en) * | 2014-09-30 | 2017-11-02 | China Three Gorges University | Medicament design pocket of ornithine decarboxylase and application of medicament design pocket |
| CN108504647B (zh) * | 2018-03-09 | 2021-11-05 | 中山大学 | 一种dna促旋酶的药物结合口袋及其应用 |
Family Cites Families (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US6251620B1 (en) * | 1995-08-30 | 2001-06-26 | Ariad Pharmaceuticals, Inc. | Three dimensional structure of a ZAP tyrosine protein kinase fragment and modeling methods |
| US6037117A (en) * | 1997-01-31 | 2000-03-14 | Smithkline Beecham Corporation | Methods using the Staphylococcus aureus glycyl tRNA synthetase crystalline structure |
| US6183121B1 (en) * | 1997-08-14 | 2001-02-06 | Vertex Pharmaceuticals Inc. | Hepatitis C virus helicase crystals and coordinates that define helicase binding pockets |
-
2002
- 2002-06-28 US US10/186,886 patent/US20030119061A1/en not_active Abandoned
- 2002-06-28 HU HU0600158A patent/HUP0600158A2/hu unknown
- 2002-06-28 SK SK28-2004A patent/SK282004A3/sk not_active Application Discontinuation
- 2002-06-28 CN CNB028152700A patent/CN1268765C/zh not_active Expired - Fee Related
- 2002-06-28 BR BR0211312-0A patent/BR0211312A/pt not_active IP Right Cessation
- 2002-06-28 EA EA200400093A patent/EA007612B1/ru unknown
- 2002-06-28 EP EP02749688A patent/EP1412516A4/en not_active Withdrawn
- 2002-06-28 CA CA002451837A patent/CA2451837A1/en not_active Abandoned
- 2002-06-28 PL PL02367484A patent/PL367484A1/xx not_active Application Discontinuation
- 2002-06-28 YU YU102403A patent/YU102403A/sh unknown
- 2002-06-28 MX MXPA04000157A patent/MXPA04000157A/es unknown
- 2002-06-28 EE EEP200400044A patent/EE200400044A/xx unknown
- 2002-06-28 IL IL15953902A patent/IL159539A0/xx unknown
- 2002-06-28 WO PCT/US2002/020465 patent/WO2003002063A2/en not_active Ceased
- 2002-06-28 CZ CZ200441A patent/CZ200441A3/cs unknown
-
2004
- 2004-01-28 BG BG108549A patent/BG108549A/bg unknown
-
2006
- 2006-08-01 US US11/461,678 patent/US20070207512A1/en not_active Abandoned
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| HUP0600158A2 (en) | 2006-05-29 |
| SK282004A3 (sk) | 2005-06-02 |
| US20070207512A1 (en) | 2007-09-06 |
| US20030119061A1 (en) | 2003-06-26 |
| EE200400044A (et) | 2004-10-15 |
| EP1412516A4 (en) | 2004-09-08 |
| EP1412516A2 (en) | 2004-04-28 |
| WO2003002063A3 (en) | 2003-02-20 |
| YU102403A (sh) | 2006-08-17 |
| EA200400093A1 (ru) | 2005-06-30 |
| BG108549A (bg) | 2005-02-28 |
| CZ200441A3 (cs) | 2004-08-18 |
| EA007612B1 (ru) | 2006-12-29 |
| MXPA04000157A (es) | 2005-06-06 |
| CN1268765C (zh) | 2006-08-09 |
| PL367484A1 (en) | 2005-02-21 |
| CN1539020A (zh) | 2004-10-20 |
| IL159539A0 (en) | 2004-06-01 |
| CA2451837A1 (en) | 2003-01-09 |
| WO2003002063A2 (en) | 2003-01-09 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| BRPI0209792B8 (pt) | anticorpo anti-vla-1, composição que o compreende, ácido nucléico e vetor, bem como métodos in vitro para determinar o nível de vla-1 em tecido e para identificar inibidor de domínio i de integrina | |
| BR0211551A (pt) | Controle de desenvolvimento de biofilmes em água de processo industrial | |
| BR9602187A (pt) | Processo de inibir a corrosão por ácido naftênico em um sistema de hidrocarboneto a alta temperatura | |
| BR0016569A (pt) | Processo de isolamento de rna de espécimes de tecido embutidos - parafina fixados - formalina | |
| BR0314275A (pt) | Derivados de hidantoina e seu uso como inibidores de tace | |
| BR0212197A (pt) | Sistema e método automatizados para criação de rascunho de patente e lançamento de tecnologia | |
| DE60142702D1 (de) | System und verfahren für den feinkörnigen zeitlichen zugriff auf eine datenbank | |
| NO20061285L (no) | Fremgangsmater og systemer for forbedring av en sokrangering ved a benytte populasjonsinformasjon | |
| BR9917289A (pt) | Cepas clostridium que produzem etanol de gases contendo substrato | |
| BR9916111A (pt) | Derivados de fenilglicina | |
| BRPI0600388A (pt) | composto e método para redução de corrosão de uma superfìcie metálica | |
| BR0307522A (pt) | Utilização de um inibidor de lipoxigenase-15 para a manufatura de um medicamento, métodos para tratamento e prevenção e kit para o diagnóstico de predisposição à perda óssea | |
| Hampel et al. | The Solvent-Protected Core of the Hairpin Ribozyme− Substrate Complex | |
| NO20091114L (no) | Bronnbehandling | |
| BRPI0713487A8 (pt) | compostos 2-(amino)-benzotiazol sulfonamida substituído, composição e composição farmacêutica contendo-os, método de preparação desta e uso dos mesmos | |
| BRPI0406596A (pt) | Métodos para tratar a dor articular e melhorar o sono utilizando um agonista/antagonista de estrogênio | |
| BR0116372A (pt) | Composto, composição farmacêutica e método de tratamento ou de prevenção de uma doença | |
| BR0309386A (pt) | Inibidores de metaloproteinases de triaril-óxi-arilóxi-pirimidina-2,4,6-triona | |
| BRPI0607971A2 (pt) | método para proteger as superfìcies de cimento em uma zona de tratamento e composição para uso em formar um precipitado protetor em superfìcies de cimento em furos de poços | |
| Hamm et al. | Oligonucleotide Incorporation of 8-Thio-2 ‘-deoxyguanosine | |
| BR0012135A (pt) | Métodos de tratamento de infecções de fungos com inibidores de enzima sintetase nad | |
| BRPI0515300A (pt) | processo para avaliar uma matéria-prima de refinaria | |
| Biardi et al. | A rapid and sensitive fluorometric method for the quantitative analysis of snake venom metalloproteases and their inhibitors | |
| WO2004087070A3 (en) | METHODS OF IDENTIFYING COMPOUNDS THAT TARGET tRNA SPLICING ENDONUCLEASE AND USES OF SAID COMPOUNDS AS ANTI-FUNGAL AGENTS | |
| BR0010191A (pt) | Determinação de estruturas de fosfolipìdio/lipìdio complexas com auxìlio de acilglicerìdeos marcados com fluorescência sintéticos |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| B08F | Application dismissed because of non-payment of annual fees [chapter 8.6 patent gazette] |
Free format text: REFERENTE A 6A,7A E 8A ANUIDADES. |
|
| B08K | Patent lapsed as no evidence of payment of the annual fee has been furnished to inpi [chapter 8.11 patent gazette] |
Free format text: REFERENTE AO DESPACHO 8.6 DA RPI 2060 DE 29/06/2010. |