CZ20012574A3 - Sloučenina, oligonukleotidový analog a jeho pouľití, farmaceutický prostředek, sonda a primer - Google Patents
Sloučenina, oligonukleotidový analog a jeho pouľití, farmaceutický prostředek, sonda a primer Download PDFInfo
- Publication number
- CZ20012574A3 CZ20012574A3 CZ20012574A CZ20012574A CZ20012574A3 CZ 20012574 A3 CZ20012574 A3 CZ 20012574A3 CZ 20012574 A CZ20012574 A CZ 20012574A CZ 20012574 A CZ20012574 A CZ 20012574A CZ 20012574 A3 CZ20012574 A3 CZ 20012574A3
- Authority
- CZ
- Czechia
- Prior art keywords
- group
- amino
- protected
- oxo
- ethylene
- Prior art date
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/06—Pyrimidine radicals
- C07H19/10—Pyrimidine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7042—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
- A61K31/7052—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
- A61K31/706—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
- A61P17/06—Antipsoriatics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
- A61P31/16—Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
- A61P31/18—Antivirals for RNA viruses for HIV
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
- A61P31/20—Antivirals for DNA viruses
- A61P31/22—Antivirals for DNA viruses for herpes viruses
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/06—Pyrimidine radicals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/16—Purine radicals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/16—Purine radicals
- C07H19/20—Purine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
- Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
- Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
- Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10T—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION
- Y10T436/00—Chemistry: analytical and immunological testing
- Y10T436/14—Heterocyclic carbon compound [i.e., O, S, N, Se, Te, as only ring hetero atom]
- Y10T436/142222—Hetero-O [e.g., ascorbic acid, etc.]
- Y10T436/143333—Saccharide [e.g., DNA, etc.]
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Virology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Oncology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Rheumatology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Pain & Pain Management (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Pulmonology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Dermatology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- AIDS & HIV (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Description
Sloučenina, oligonukleotidový analog a jeho použití, farmaceutický prostředek, sonda a primer.
Oblast techniky
Popisují se nové oligonukleotidové analogy, které vykazují ^nesmyslnou nebo antigenní aktivity^ výbornou stabilitu nebo vykazují výbornou aktivitu jako detekční činidlo (sonda) pro specifický gen nebo jako primer pro počátek amplifikace, a nové nukleosidové analogy, které mohou zprostředkovat jejich produkci.
Dosavadní stav techniky
Očekává se, že oligonukleotidové analogy, které vykazují výbornou nesmyslnou nebo antigenní aktivitu a ktere jsou v těle stabilní, se budou moci použití jako farmaceutické prostředky. Navíc oligonukleotidové analogy, které vykazují vysoký stupeň schopnosti tvořit stabilní komplementární řetězec s DNA nebo mRNA se mohou použít jako detekční činidla vhodná pro specifický gen nebo jako primery pro začátek amplifikace.
Naopak je známo, že přirozeně se vyskytující oligonukleotidy se rychle rozkládají pomocí různých nukleáz, které jsou přítomny v krvi a v buňkách. V některých případech přirozeně se vyskytující oligonukleotidy nevykazují dostatek citlivosti při použití jako detekční činidlo pro specifické geny nebo jako primery pro začátek amplifikace, což je způsobeno jejich afinitou vůči sekvencím komplementárních bází.
Za účelem překonat nedostatky, se připravily různé nepřirozeně se vyskytující oligonukleotidové analogy, které jsou určeny pro použití jako farmaceutické prostředky nebo detekční činidla pro specifické geny. Jmenovitě známé příklady takových nepřirozeně se vyskytujících oligonukleotidových analogů zahrnují ty, kde atom kyslíku zachycený na atomu fosforu ve fosfordiesterové vazbě oligonukleotidu je nahrazen atomem síry, • ·· ·· ·· ·· · • · · · · ·· · · ♦·· • · · ···· · · · ·· ··· ······ · · • · · · · · ··· ··· ·· ·· · · · · · · dále ty, kde uvedený atom kyslíku je nahrazen atomem bóru a ty, ve kterých cukerná část a báze oligonukleotidu je upravena chemickou cestou. Například společnost ISIS Corp. vyvinula thioátový typ oligonukleotidu ISIS2922 (Vitravene) jako terapeutický prostředek vhodný pro lidský zánět sítnice způsobený cytomegalovirem a tento prostředek se uvedl na trh v USA.
Když se vsak zvazuje potenciál aesmyslne a antigenní aktivity shora popsaných nepřirozeně se vyskytujících oligonukleotidových analogů, jmenovitě pak schopnost tvořit stabilní komplementární řetězec s DNA nebo mRNA, stabilita s ohledem na různé nukleázy a zobrazení nežádoucích vedlejších účinků způsobených nespecifickým navázáním na různé proteiny v těle, je nutné připravit nepřirozeně se vyskytující oligonukleotidový analog, který má dokonce lepší stabilitu v těle a malý výskyt vedlejších účinků a vysoký stupeň schopnosti tvpřit komplementární řetězce.
Podstata vynálezu
Vynález popisuje nepřirozeně se vyskytující oligonukleoti, , ptačit dové analogy, ktere vykazuji výbornou 'i*esmyslnou nebo antigenní aktivitu, výbornou stabilitu v těle a nízký výskyt nežádoucích vedlejších účinků. Zjistilo se, že oligonukleotidové analogy nebo nukleosidové analogy vykazující etherovou vazbu , _ pp&W v uvedených molekulách je mozne použit jako 's=esmyslne nebo antigenní prostředky mající výbornou stabilitu, jako detekční činidla (sondy) vhodné pro specifický gen, jako primer pro začátek amplifikace nebo jako meziprodukt pro jejich přípravu.
Nové nukleosidové analogy podle vynálezu jsou sloučeniny obecného vzorce 1:
• 9 • ·· ·· ·· ·· ··· · · * · · ♦ • · · · · ····· · ····· ·· ·· ·· ·
kde symboly R1 a R2 jsou stejné a reprezentují atom vodíku, hydroxylovou ochranou skupinu, skupinu kyseliny fosforečné, chráněnou skupinu kyseliny fosforečné nebo -P(R3)R4, kde symboly R3 a R4 jsou stejné nebo různé a reprezentují hydroxylovou skupinu, chráněnou hydroxylovou skupinu, merkaptoskupinu, chráněnou merkaptoskupinu, aminoskupinu, alkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, alkylthioskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, kyanalkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 5 atomů uhlíku, nebo aminoskupinu substituovanou alkylovou skupinou, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, symbol A reprezentuje alkylenovou skupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl nebo substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, která má substituent vybraný z následující skupiny a, nebo jejich sole.
Oligonukleotidové analogy podle vynálezu jsou oligonukleotidové analogy, které mají jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2:
(2) kde [symbol A reprezentuje alkylenovou skupinu, která má 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl a substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, kde se substituent vybral z následující skupiny a], nebo jejich farmaceuticky přijatelné sole.
Skupina a je:
hydroxylová skupina chráněná hydroxylová skupina alkoxyskupina s 1 až 4 atomy uhlíku, merkaptoskupina chráněná merkaptoskupina alkylthioskupina s 1 až 4 atomy uhlíku aminoskupina chráněná aminoskupina aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou s 1 až 4 atomy uhlíku alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku a halogenový atom.
Termín „alkylenová skupina, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku symbolu A ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat methylenovou, ethylenovou, trimethylenovou a tetramethylenovou skupinu, přičemž je výhodnější methylenová skupina.
Termín „hydroxylová chránící skupina symbolu R1 a R2 „chráněná hydroxylová skupina symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 znamená chránící skupinu, kterou je možné štěpit chemickou metodou jako je hydrogenolýza, rozklad, hydrolýza, elXetrolýza a fotolýza nebo biologickou metodou, jako je hydrolýza v těle člověka. Takové chránící skupiny mohou zahrnovat „alifatickou acylovou skupinu jako je alkylkarbonylová skupina, což je například formyl, acetyl, propionyl, butyryl, isobutyryl, pentanoyl, pivaloyl, valeryl, isovaleryl, oktanoyl, nonanoyl, dekanoyl, 3-methylnonanoyl, • ··· · ····· · • · · · · · · • · « · · ·· · · ·· ·
8-methylnonanoyl, 3-ethyloktanoyl, 3,7-di-methyloktanoyl, undekanoyl, dodecanoyl, tridekanoyl, tetradekanoyl, pentadekanoyl, hexadekanoyl, 1-methylpenta-dekanoyl, 14-methylpentadekanoyl, 13,13-dimethyltetradekanoyl, heptadekanoyl, 15-methylhexadekanoyl, oktadekanoyl, 1-methyl-heptadekanoyl, nonadekanoyl, eikosanoyl a heneikosanoyl, karboxylovaná alkylkarbonylová skupina, je to například sukcinoylová, glutaroylová a adipoylová skupina, halogen nižší alkylkarbonylová skupina, například chloracetylová, dichloracetylová, trichloracetylová a trifluoracetylová, nižší alkoxyalkyl karbonylová skupina, což je například methoxyacetyl, a nesaturovaná alkoxykarbonylová skupina, což je například (E)-2-methyl-2-butenoyl,
Termín „aromatická acylová skupina, jako například arylkarbonylová skupina je například 2-brombenzoylová a 4-chlorbenzoylová, nižší alkylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2,4,6-trimethylbenzoyl a 4-toluoyl, nižší alkoxylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-ani-soyl, karboxylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2-karboxybenzoylová, 3-karboxybenzoyl a 4-karboxybenzoyl, nitrovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-nitro-benzoyl a 2-nitrobenzoyl, nižší alkoxykarbonylovaná arylkarbonylová skupina , což je například 2-(methoxykar-bonyl)benzoyloová a arylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-fenylbenzoyl.
Termín „tetrahydropyranylová skupina nebo tetrahydrothiopyranylová skupina je například tetrahydropyran-2-yl, 3-bromotetrahydropyran-2-yl, 4-methoxytetrahydropyran-4-yl, tetrahydropyran-2-yl a 4-methoxytetrahydrothiopyran-4-yl.
Termín „tetrahydrofuranylová skupina nebo tetrahydrothiofuranylová skupina je například tetrahydrofuran-2-yl a tetrahydrothiofuran-2-yl.
Termín „silylová skupina zahrnuje například silylovou skupinu obsahující tři nižší alkyly, což je například trimethylsilyl, triethylsilyl, isopropyldimethylsilyl, t-butyldimebutyldimethylsilyl, methyldiisopropylsilyl, methyldi-t-butylsilyl a triisopropylsilyl a silylová skupina obsahující tři alkyly substituovaná jednou nebo dvěmi arylovými skupinami, což je například difenylmethylsilyl, difenylbutylsilyl, difenylisopropylsilyl a fenyladiisopropylsilyl.
Termín „nižší alkoxymethylová skupina je například metho xymethyl, 1,1-dimethyl-l-methoxymethyl, ethoxymethyl, propoxymethyl, isopropoxymethyl, butoxymethyl a t-butoxy/methyl.
Termín „nižší alkoxylovaná nižší alkoxymethylová skupina je například 2-methoxyethoxxymethyl.
Termín „halogenovaná nižší alkoxymethylová skupina znamená například 2,2,2-trichlorethoxymethyl a bis(2-chlorethoxy)methyl.
Termín „nižší alkoxylovaná ethylová skupina znamená například 1-ethoxyathyl a 1-(isopropoxy)ethyl.
Termín „halogenovaná ethylová skupina znamená například
2,2,2-trichlorethyl.
Termín „methylovaná skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami znamená například benzyl, α-naftylmethyl, β-naftylmethyl, difenylmethyl, trifenylmethyl, α-naftyl-difenylmethyl a 9-antrylmethyl.
Termín „methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, kde uvedený arylový kruh je substituován nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou zahrnuje například 4-methylbenzyl, 2,4,6-tri-methylbenzyl, 3,4,5-trimethylbenzyl, 4-methoxybenzyl, 4-methoxyfenyldifenylmethyl, 4,4'-dimethoxytrifenylmethyl, 2-nitrobenzyl, 4-nitrobenzyl, 4-chlorbenzyl, 4-brombenzyl a
4-kyanbenzyl.
Termín „nižší alkoxykarbonylová skupina zahrnuje například methoxykarbonyl, ethoxykarbonyl, t-butoxykarbonyl a isobutoxykarbonyl.
Termín „nižší alkoxykarbonylová skupina substituovaná halogenem nebo „silylová skupina obsahující tři nizžší alkyly • ·· · · ·· ·· •99 9 · · 9 · · *9 zahrnuje 2, 2,2-trichlorethoxykarbonyl a 2-trimethylsilylethoxykarbonyl.
Termín „alkenoyloxykarbonylová skupina zahrnuje vinyloxykarbonyl a alyloxykarbonyl.
Termín „aralkyloxykarbonylová skupina, kde uvedený arylový kruh se může substituovat jednou nebo dvěmi alkoxy nebo nitroskupinami zahrnuje například benzyloxykarbonyl, 4-methoxybenzyloxykarbonyl, 3,4-dimethoxybenzyloxykarbonyl, 2-nitrobenzyloxykarbonyl a 4-nitrobenzylkarbonyl.
„Hydroxylová chránící skupina symbolu R1 a R2 přednostně zahrnuje „alyfatickou acylovou skupinu, „aromatickou acylovou skupinu, „methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, „methylovou skupinu substituovanou 1 až třemi arylovými skupinami, kde arylový kruh se substituoval nižší alkylovou, nižší alkoxy, kyanoskupinou nebo halogenem nebo „sulylovou skupinu. Výhodnější je acetylová skupina, benzoylová skupina, benzylová skupina, p-methoxybenzoylová skupina, dimethoxytritylová skupina, monomethoxytritylová skupina nebo terc-butyldifenylsilylová skupina.
Chránící skupina „chráněné hydroxylové skupiny symbolu R3 a R4 nebo skupina a může s výhodou zahrnovat „alifatickou acylovou skupinu nebo „aromatickou acylovou skupinu, výhodnější je benzoylová skupina.
Chránící skupina „chráněné skupiny kyseliny fosforečné symbolu R1 a R2 ve shora uvedeném vzorci 1 reprezentuje chránící skupinu, která se může štěpit chemickou metodou, jako je hydrogenolýza, hydrolýza, elektrolýza a fosfolýza a biologickou metodou, jako je hydrolýza v lidském těle. Takové chránící skupiny mohou zahrnovat „nižší alkylovou skupinu jako je methyl, ethyl, n-propyl, isopropyl, a-butyl, isobutyl, s-butyl, terc-butyl, n-pentyl, isopentyl, 2-methylbutyl, neopentyl, 1-ethylpropyl, n-hexyl, isohexyl, 4-methylpentyl, 3-methylpentyl, 2-methylpentyl, 1-methylpentyl, 3,3-dimethylbutyl,
2.2- dimethylbutyl, 1,1-dimethylbutyl, 1,2-dimethylbutyl, 1,3-dimethylbutyl, 2,3-dimethylbutyl a 2-ethylbutyl.
„Nižší alkylová skupina substituovaná kyanoskupinou zahrnuje například 2-kyanoethyl a 2-kyano-l,1-dimethylethyl.
„Ethylová skupina substituovaná silylovou šupinou zahrnuje například 2-methyldifenylsilylethyl, 2-trimethylsilylethyl a 2-trifenylsilylethyl.
„Halogenovaná nižší alkylová skupina zahrnuje například
2.2.2- trichlorethyl, 2,2,2-tribromethyl, 2,2,2-trifluorethyl a
2.2.2- trichlor-l,1-dimethylethyl.
„Nižší alkenylová skupina zahrnuje například ethenyl, 1-propenyl, 2-propenyl, l-methyl-2-propenyl, 1-methyl-l-propenyl, 2-methyl-l-propenyl, 2-methyl-2-propenyl, 2-ethyl-2-propenyl, 1-butenyl, 2-butenyl, l-methyl-2-butenyl, 1-methyl-2-butenyl, 1-methyl-l-butenyl, 3-methyl-2-butenyl, l-ethyl-2-butenyl, 3-butenyl, l-methyl-3-butenyl, 2-methyl-3-butenyl, l-ethyl-3-butenyl, 1-pentenyl, 2-pentenyl, l-methyl-2-pentenyl, l-methyl-2-pentenyl, 3-pentenyl, l-methyl-3-pentenyl, 2-methyl-3-pentenyl, 4-pentenyl, l-methyl-4-pentenyl, 2-methyl-4-pentenyl, 1-hexenyl, 2-hexenyl, 3-hexenyl, 4-hexenyl a 5-hexenyl.
„Cykloalkylová skupina zahrnuje například cyklopropyl, cyklobutyl, cyklopentyl, cyklohexyl, cykloheptyl, norbornyl a adamantyl.
„Kyanátovaná nižší alkenylová skupina je například 2-kyanobutenyl.
„Arylalkylová skupina zahrnuje například benzyl, a-naftylmethyl, indenylmethyl, fenantrenylmethyl, antracenylmethyl, difenylmethyl, trifenylmethyl, 1-fenethyl, 2-fenethyl, 1-naftylethyl, 2-naftylethyl, 1-fenylpropyl, 2-fenylpropyl, 3-fenylpropyl, 1-naftylpropyl, 2-naftylpropyl, 3-naftylpropyl, 1-fenylbutyl, 2-fenylbutyl, 3-fenylbutyl, 4-fenylbutyl, 1-naftylbutyl, 2-naftylbutyl, 3-naftylbutyl, 4-naftylbutyl, 1-fenylpentyl, 2-fenylpentyl, 3-fenylpentyl, 4-fenylpentyl, 4-fe9 • ·· *· ·· ·· · • · · · · ♦ · ♦ ♦ ? · · • · · · · · · ·« · • · ··· ····«· · · ··· · · · · · · ··· ·· ·· ·· ·* ··· nylpentyl, 5-fenylpentyl, 1-naftylpentyl, 2-naftylpentyl, 3-naftylpentyl, 4-naftylpentyl, 5-naftylpentyl, 1-fenylhexyl, 3-fenylhexyl, 4-fenylhexyl, 5-fenylhexyl, 6-fenylhexyl, 1-naftylhexyl, 2-naftylhexyl, 3-naftylhexyl, 4-naftylhexyl, 5-naftylhexyl a 6-naftylhexyl.
„Aralkylová skupina, kde uvedený arylový kruh se substituoval nitroskupinou nebo halogenovým atomem zahrnuje 4-chlorbenzyl, 2-(4-nitrofenyl)ethyl, o-nitrobenzyl, 4-nitrobenzyl,
2.4- dinitrobenzyl a 4-chlor-2-nitrobenzyl.
„Arylová skupina zahrnuje fenyl, indenyl, naftyl, fenantrenyl a antracenyl a „arylová skupina substituovaná nižší alkylovou skupinou, atomem halogenu nebo nitroskupinou zahrnuje 2-methylfenyl, 2,6-dimethylfenyl, 2-chlorfenyl, 4-chlorfenyl,
2.4- dichlorfenyl, 2,5-dichlorfenyl, 2-bro-mofenyl, 4-nitrofenyl a 4-chlor-2-nitrofenyl.
Výhodné jsou „nižší alkylová skupina, „nižší alkylová skupina substituovaná cyanoskupinou, „aralkylová skupina nebo „aralkylová skupina, kde uvedený arylový kruh se substituuje nitroskupinou nebo halogenovým atomem. Výhodnější je 2-kyanoethylová skupina, 2,2,2-trichlorethylová skupina nebo benzylová skupina.
„Alkoxyskupina zahrnující 1 až 4 atomy uhlíku symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 a 2 může zahrnovat methoxy, ethoxy, n-propoxy, isopropoxy, a-butoxy, isobutoxy, s-butoxy nebo terc-butoxyskupinu. Výhodná je methoxyskupina nebo ethoxyskupina.
Chránící skupina „chráněné merkaptoskupiny symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 a 2 může zahrnovat mimo hydroxylovách chránících skupin uvedených shora v textu „skupinu, která tvoří disulfid jako je alkylthioskupina, což je například methylthioskupina, ethylthioskupina, terc-butylthioskupina a aralkylthioskupina jako je benzylthioskupina. Výhodná je „alifatická acylová skupina nebo „aromatická acylová skupina, výhodnější je benzoylová skupina. Termín „alky10 « ·· ♦· ·· ·· ΦΦΦΦ ···· 9 9 • · · » · · ·*♦ · 9 · ····· · 4 9
999 99 ·· *· ·♦
Ithioskupina, která vykazuje 1 až 4 atomy uhlíku symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat methylthioskupinu, ethylthioskupinu, propylthioskupinu, isopropylthioskupinu, butylthioskupinu, s-butylthioskupinu a terc-butylthioskupinu. Výhodná je methylthioskupina nebo ethylthioskupina.
Chránící skupina „chráněné aminoskupiny skupiny a ve sho ra uvedeném vzorci 1 a 2 zahrnuje „alifatickou acylovou skupinu jako je alkylkarbonylová skupina a to například formyl, acetyl, propionyl, butyryl, isobutyryl, pentanoyl, pivaloyl, valeryl, isovaleryl, aktanoyl, nonanoyl, dekanoyl, 3-methylnonanoyl, 8-methyl-nonanoyl, 3-ethyloctanoyl, 3,7-dimethyloktanoyl, undekanoyl, dodekanoyl, tridekanoyl, tetradekanoyl, pentadekanoyl, hexadekanoyl, 1-methyl-pantadekanoyl, 14-methylpentadekanoyl, 13,13-dimethyltetra-dekanoyl, heptadekanoyl, 15-methylhexa-dekanoyl, oktadekanoyl, 1-methylheptadekanoyl, nonadekanoyl, eikosanoyl a heneikosanoyl a karboxylovaná akylkarbonylová skupina, jako je například sukcinoyl, glutaroyl a adipoyl, halogen nižší alkylkarbonylová skupina, což je například chloracetyl, dichloracetyl, trichloracetyl a trifluoracetyl, nižší alkoxy nižší alkylkarbonylová skupina, jako je například methoxyacetyl, a nesaturovaná alkylkarbonylová skupina, což je například (E)-2-methyl-2-butenoyl.
„Aromatická acylová skupina je například arylkarbonylová skupina, což je například benzoyl, α-naftoyl a β-naftoyl, halogenoarylkarbonylová skupina, jako je například benzoyl, a-naftoyl a β-naftoyl, halogenarylkarbonylová skupina, což je například 2-brombenzoyl a 4-chlorbenzoyl, nižší alkylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2,4,6-trimethylbenzoyl a 4-toluoyl, nižší alkoxylovaná arylkarbonylovaná skupina, jako je například 4-anisoyl, karboxylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2-karboxybenzoyl, 3-karboxybenzoyl a 4-karboxybenzoyl, nitrovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-nitrobenoyl a 2-nitrobenzoyl, nižší alkoxykarbonylovaná
9 9 Μ 99 9· 9
909 9 9 99 9 * 999
999 99#9 99 9
999 999999 9 9
999 99 9 999
999 99 99 99 99 99 ,aryl karbonylovaná skupina, což je například 2-(methoxykarbonyl)benzoyl a arylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-fenylbenzoyl.
„Nižší alkoxykarbonylová skupina, což je například methoxykarbonyl, ethoxykarbonyl, t-butoxykarbonyl a isobutoxykarbonyl.
„Nižší alkoxykarbonylová skupina substituovaná halogenem nebo silylová skupina s třeminižšími alkyly zahrnuje například 2,2,2-trichlorethoxykarbonyl a 2-trimethylsilylethoxykarbonyl.
„Alkenyloxykarbonylová skupina zahrnuje například vinyloxykarbonyl a alyloxykarbonyl.
Termín „aralkyloxykarbonylová skupina, kde uvedený arylový kruh se může substituovat nižší alkoxyskupinou nebo nitroskupinou zahrnuje benzyloxykarbonyl, 4-methoxybenzyloxykarbonyl, 3,4-dimethoxybenzyloxykarbonyl, 2-nitrobenzyloxykarbonyl a 4-nitrobenzoyloxykarbonyl, přičemž je výhodná „alifatická acylová skupina nebo „aromatická acylová skupina. Více se upřednostňuje benzoylová skupina.
„Aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou zahrnující 1 až 4 atomy uhlíku symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora popsaném vzorci 1 a 2 může zahrnovat methylamino, ethylamino, propylamino, isopropylamino, butylamino, isobutylamino, s-butylamino, terc-butylamino, dimethylamino, díethylamino, dípropylamino, diisopropylamino, dibutylamino, diisobutyl-amino, di(s-butyl)amino a di(terc-butyl)amino, přičemž je výhodné použít skupinu methylamino, ethylamino, dimethylamino, diethylamino nebo diisopropylamino.
Termín „kyanoalkoxyskupina vykazující 1 až 5 atomů uhlíku symbolu R3 a R4 ve shora uvedeném vzorci 1 reprezentuje skupinu, ve které shora popsaná „alkoxyskupina vykazující 1 až 4 atomy uhlíku se substituovala kyanoskupinou. Taková skupina může zahrnovat kyanomethoxy, 2-kyanoethoxy, 3-kyanopropoxy, 412
4 4 · · · · 4
4 4 4 4 4 4 · • · 4 · 4 4 444 * · • 4 4 4 4 4 4
4·· 44 44 44
-kyanobutoxy, 3-kyano-2-methylpropoxy nebo 1-kyanomethyl-l, 1-dimethylmethoxy. Výhodná je 2-kyanoethoxyskupina.
Termín „alkylová skupina zahrnující 1 až 4 atomy uhlíku skupiny a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat methyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, s-butyl a terc-butyl. Upřednostňuje se methylová a ethylová skupina.
Termín „atom halogenu skupiny a ve shora uvedeném vzorci nebo 2 může zahrnovat atom fluóru, chlóru a brómu nebo jódu. Výhodný je atom jódu nebo chlóru.
Preferované skupiny „purin-9-yl a „substituovaná skupina purin-9-yl symbolu B ve shora v textu uvedeném vzorci 1 nebo může zahrnovat jako celek 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 6-aminopurin-9-yl, 2,6-diaminoputin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2--amino-6-brompurin-9-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl chráněný aminoskupinou a hydroxylovou skupinou, 6-amino-2-methoxypurin-9-yl, 6-amino-2-chlorpurin-9-yl, 6-amino-2-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl nebo 6-merkaptopurin. Výhodnější je 6-benzylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6-hydroxypurin-9-yl nebo guaninylová skupina.
Výhodné skupiny „skupiny 2-oxopyrimidin-l-yl a „substituovaná skupina 2-oxopyrimidin-l-yl symbolu B ve shora v textu uvedením vzorci 1 a 2 mohou zahrnovat jako celek 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyremidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je 5-methylcytosinyl). Výhodnější • *· ·· ·* ·· 9 · · · · · « 9 · f ♦ · · • · · · ♦ ······ · · • · · · · · · · · ··» ·· ·· ·· ·» ♦·· je skupina 2-oxo-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytosinyl, thyminyl, uracinyl, 2-oxo-4-benzoylamino-5-methyl-pyrimidin-l-yl nebo 5-methylcytosinylová skupina.
Termín „nukleosidový analog znamená nepřirozený typ nukleosidu, ve kterém purinová nebo pyrimidinová skupina je zachycena na cukru.
Termín „oligonukleotidový analog zahrnuje nepřirozený typ derivátu „oligonukleotidu, který zahrnuje 2 až 50 „nukleosidů a mohou být stejné nebo odlišné a váží se pomocí diesterové vazby kyseliny fosforečné a takové analogy mohou přednostně zahrnovat cukerné deriváty, ve kterých se upravuje cukerná složka. Dále zahrnuje deriváty thiotátu, ve kterých část vázaná diesterovou vazbou kyseliny fosforečné je thioátována. Dále zahrnuje esterové produkty, kde je esterifikována terminální část kyseliny fosforečné a amidové produkty, kde aminoskupina na purinové bázi je amidována. Výhodné jsou cukerné deriváty, ve kterých se cukerná složka upravuje a deriváty thioátu, kde část diesteru kyseliny fosforečné je thioátována.
Termín „jejich sůl znamená sole sloučeniny obecného vzorce 1 podle vynálezu, poněvadž se mohou převést na sole a takové sole mohou s výhodou zahrnovat anorganické sole například sole kovů, jako jsou sole alkalických kovů, například sodné sole, draselné sole a litné sole, sole kovů alkalických zemin, například vápenaté sole a sole hořečnaté, sole hlinité, sole železité, sole zinku, mědi, niklu a kobaltu. Dále může zahrnovat sole aminů, jako jsou anorganické sole, například sole amonné, organické sole, například sole t-oktylaminu, sole dibenzylaminu, sole morfolinu, sole glukozaminu, sole fenylglycinalkylesteru, sole ethylendiaminu, sole N-methylglukaminu, sole guanidinu, sole diethylaminu, sole triethylaminu, sole dicyklohexylaminu, N,N'-dibenzylethylendiaminu, sole chlorprokainu, sole prokainu, sole diethanolaminu, sole N-benzylfenethylaminu, sole piperazinu, tetramethylamonné sole a sole tris(hydroxymethyl)aminomethanu. Dále zahrnuje sole anorganic14 ·· · · ·· • · · · · · · · · · ft · · · · · · · · • · · · ······ · · • · ·· · · · »
9· ·· ·· · * · *' „kých kyselin, jako jsou sole halogenovodíkových kyselin, například sole kyseliny fluorovodíkové, sole kyseliny chlorovodíkové, sole kyseliny bromovodíkové a sole kyseliny jodovodíkové, sole kyseliny dusičné, sole kyseliny chloristé, sole kyseliny sírové a sole kyseliny fosforečné. Dále zahrnuje sole organických kyselin, jako jsou sole kyseliny nižší alkensulfonové, například sole kyseliny methansulonové, sole kyseliny trifluormethansulfonové a sole kyseliny ethansulfonové, sole kyseliny arylsulfonové, například sole kyseliny benzensulfonové a sole kyseliny p-toluensulfonové, sole kyseliny octové, sole kyseliny máselné, sole kyseliny mravenčí, sole kyseliny jantarové, sole kyseliny citrónové, sole kyseliny vinné, sole kyseliny šťavelové a sole kyseliny máselné a sole aminokyselin, jako jsou například sole glycinu, sole lyzinu, sole argininu, sole ornitinu a sole kyseliny glutamové a sole kyseliny asparagové.
Poněvadž upravené oligonukleotidy nebo poloynukleotidové analogy podle vynálezu se mohou převést na sůl, termín „jejich farmaceuticky přijatelné sole může s výhodou zahrnovat anorganické sole, jako jsou například sole kovů, což jsou například sole alkalických kovů, například sodné sole, draselné sole a litné sole, sole kovů alkalických zemin, například vápenaté sole a sole hořečnaté, sole hlinité, sole železité, sole zinku, mědi, niklu a kobaltu. Dále může zahrnovat sole aminů, jako jsou anorganické sole, například sole amonné, organické sole, například sole t-oktylaminu, sole dibenzylaminu, sole morfolinu, sole glukozaminu, sole fenylglycinalkylesteru, sole ethylendiaminu, sole N-methylglukaminu, sole guanidinu, sole diethylaminu, sole triethylaminu, sole dicyklohexylaminu, N,N'-dibenzyl-ethylendiaminu, sole chlorprokainu, sole prokainu, sole diethanolaminu, sole N-benzylfenethylaminu, sole piperazinu, tetramethylamonné sole a sole tris(hydroxymethyl)aminomethanu. Dále zahrnuje sole anorganických kyselin, jako jsou sole halogenovodíkových kyselin, například sole ky»9 J-'-' »>· ······ v ··· 99 99 »· ·· ·♦' .seliny fluorovodíkové, sole kyseliny chlorovodíkové, sole kyseliny bromovodíkové a sole kyseliny jodovodíkové, sole kyseliny dusičné, sole kyseliny chloristé, sole kyseliny sírové a sole kyseliny fosforečné. Dále zahrnuje sole organických kyselin, jako jsou sole kyseliny nižší alkensulfonové, například sole kyseliny methansulonové, sole kyseliny trifluormethansulfonové a sole kyseliny ethansulfonové, sole kyseliny arylsulfonové, například sole kyseliny benzensulfonové a sole kyseliny p-toluensulfonové, sole kyseliny octové, sole kyseliny máselné, sole kyseliny mravenčí, sole kyseliny jantarové, sole kyseliny citrónové, sole kyseliny vinné, sole kyseliny šťavelové a sole kyseliny máselné a sole aminokyselin, jako jsou například sole glycinu, sole lyzinu, sole argininu, sole ornitinu a sole kyseliny glutamové a sole kyseliny asparagové.
Ze sloučenin podle obecného vzorce 1 a jejich solí podle vynálezu výhodné sloučeniny mohou zahrnovat (1) sloučeniny, ve kterých symbol R1 představuje atom vodíku, alifatickou acylovou skupinu, aromatickou acylovou skupinu, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, přičemž arylový kruh je substituovaný nižším alkylem, nižší alkoxyskupinu, halogenem nebo kyanoskupinou nebo silylovou skupinu, a její sole, (2) sloučeniny, kde symbol R1 představuje atom vodíku, acetylovou skupinu, benzoylovou skupinu, benzylovou skupinu, p-methoxybenzylovou skupinu, dimethoxytritylovou skupinu, monomethoxytritylovou skupinu nebo terc-butyldifenylsilylovou skupinu, a její sole, (3) sloučeniny, ve kterých symbol R2 představuje atom vodíku, alifatickou acylovou skupinu, aromatickou acylovou skupinu, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, přičemž arylový kruh je substituovaný nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem ♦· 99 ·· • 9 9 9 9 · a ♦ • 9 9 9 * 9 9
9 9 9 9*9 99 9
9 9 9 9 9
99 9*9 • 99 nebo kyanoskupinou nebo silylovou skupinou, skupinou fos foramiditu, fosfonylovou skupinou, skupinou kyseliny fos forečné nebo chráněnou skupinou kyseliny fosforečné, a je jí sole, (4) sloučeniny, kde symbol R2 představuje atom vodíku, acetylovou skupinu, benzoylovou skupinu, benzylovou skupinu, p-methoxybenzylovou skupinu, terc-butyldifenylsilylovou skupinu, -P (OCH2H4CN) (NCH (CH3) 2) , -P (OCH3) (NCH (CH3) 2) , fosfonylovou skupinu nebo 2-chlorfenyl nebo skupinu kyseliny 4-chlorfenylfosforečné a jejich sole, (5) sloučeniny, kde symbol A představuje methylenovou skupinu a jejich sole, (6) sloučeniny, kde symbol B představuje 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 6-aminopurin-9-yl, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, hydroxylová skupina chráněná skupinou 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, 6-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-amino-pyrimidin-1-yl (to je cytosinyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-amino-5fluorpyrimidin-l-yl, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrímidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-1-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l--yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l—yl (to je thyminyl), 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je 5-methylcyto« · • * φ» « · · · · · »··· ··· · · « t 9 9 9
-1-7 «···«· ··♦ · · · 9
X / 999 99 9 999
999 99 99 99 9 9. ··!
sinyl) nebo aminoskupina chráněná skupinou 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, a jejich sole a (7) sloučeniny, kde symbol B představuje 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6~hydroxypurin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl, a jejich sole.
Shora uvedené sloučeniny v odstavcích (1) a (2), (3) a (4) nebo (6) a (7) označují výhodné sloučeniny, jejichž počet se stává ve vzorci 1 vyšší. Sloučenina získaná výběrem symbolu R1 ze skupin popsaných v odstavcích (1) a (2), výběrem symbolu R2 ze skupin popsaných v odstavcích (3) a (4), výběrem symbolu A ze skupin popsaných v odstavci (5) a výběrem symbolu B ze skupin popsaných v odstavci (6) a (7) nebo jejich kombinací, a její sole je výhodná. Zvláště výhodné jsou sloučeniny a jejich sole vybrané z následujících skupin.
(Skupina sloučenin)
2'-0,4'-C-ethylenguanosin 2'-0,4'-C-ethylenadenosin ', 5 '-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin
3', 5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin 2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin
2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit 2'-0,4'-C-ethylenuridin
2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin
2'-0, 4'-C-ethylencytidin
2'-0,4'-C-ethylen-5-methylcytidin
3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylenuridin ·♦ μ ·♦ ·» · · · · · ♦ · · • · · » * « » * « · · · ♦ ··* · · · « · e » ·♦·· • ·* *· ·« ·* ·* .5 ' -O-dimethoxytrityl-2 '-0,4' -C-ethylenuridin 3',5'-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin 3',5'-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin 3',5'-di-0-benzýl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methyluridin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin
2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin
2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin
5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit a 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit
Výhodné sloučeniny zahrnující oligonukleotidové analogy obsahující jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2 a jejich farmaceuticky přijatelné sole podle vynálezu mohou zahrnovat (8) oligonukleotidové analogy, kde symbol A představuje methylenovou skupinu, a jejich farmaceuticky přijatelné sole, (9) oligonukleotidové analogy, kde symbol B představuje 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 6-ami-nopurin-9-yl, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlor-purin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2ami-no-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6« »« »· *· »· ·· « » »«»* «·· • « ♦ »»♦· »»
-1Γ, ··»»»··«»··· i y «···«··· · ·«··♦<··«···· hydroxypurin-9-yl, hydroxylová skupina chráněná skupinou 2-amino~6-hydroxypurin-9-yl, 6-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2 -amino-6-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-amino-pyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l—yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl), 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je 5-methylcytosinyl) nebo aminoskupina chráněná skupinou 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, a jejich sole a (10) oligonukleotidové analogy, kde symbol B představuje 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6-hydroxypurin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4-benzoylaminopyrimidin-1-yl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyrimidin-1-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl, a jejich farmaceuticky přijatelné sole.
Odstavce (9) a (10) shora v textu označují nejvýhodnější oligonukleotidové analogy, jejichž počet se zvyšuje, a preferují se oligonukleotidové analogy získané výběrem symbolu A z odstavce (8) a výběrem symbolu B z odstavce (9) a (10) nebo jejich kombinace a jejich farmaceuticky přijatelné sole.
Specifické sloučeniny zahrnuté ve sloučenině shora uvedeného obecného vzorce 1 podle vynálezu jsou uvedeny v tabulce č. 1 a 2. Avšak sloučeniny podle vynálezu se neomezují na zde uvedené sloučeniny.
V tabulce č. 1 a 2 zkratka Př.č. slouč. reprezentuje příklad sloučeniny číslo, Me představuje methylovou skupinu, Bn představuje benzylovou skupinu, Bz představuje benzoylovou skupinu, PMB reprezentuje p-methoxybenzylovou skupinu, Tr reprezentuje trifenylmethylovou skupinu, MMTr reprezentuje ·· 4»· ·· • 9 9 · 4 9 999 < · 9 <9 4 · • 999 9 999 99 9
9 9 9 9 9 9 <99 9« 49 44 4
4-methoxytrifenylmethylovou (monomethoxytritylovou) skupinu, DMTr reprezentuje 4,4'-dimethoxytrifenylmethylovou (dimethoxytritylovo) skupinu, zkratka .TMTr reprezentuje 4,4',4''-trimethoxytrifenylmethylovou (trimethoxytritylovou) skupinu, TMS reprezentuje trimethylsilylovou skupinu, TBDMS reprezentuje terc-butyldimethylsilylovou skupinu, TBDPS reprezentuje tercbutyldifenylsilylovou skupinu a TIPS reprezentuje triisopropylsilylovou skupinu.
(1·)
| • v | •9 «· | 99 | ||||
| • · | • | • · · 9 | • | 9 | 9 | |
| • · | • · | • i ··· · | • | • | ||
| • · | • | • · 9 | • | • | ||
| • 9 | ·» | 99 99 | *9 | 9 |
Tabulka č. 1:
| Př. slouč. č. | A | R1 | R2 | R3a | R4a |
| 1-1 | ch2 | H | H | H | H |
| 1-2 | ch2 | H | H | H | nh2 |
| 1-3 | ch2 | H | H | H | OH |
| 1-4 | ch2 | H | H | OH | H |
| 1-5 | ch2 | H | H | OH | nh2 |
| 1-6 | ch2 | H | H | OH | OH |
| 1-7 | ch2 | H | H | nh2 | H |
| 1-8 | ch2 | H | H | nh2 | nh2 |
| 1-9 | ch2 | H | H | nh2 | Cl |
| 1-10 | ch2 | H | H | nh2 | F |
| 1-11 | ch2 | H | H | nh2 | Br |
| 1-12 | ch2 | H | H | nh2 | OH |
| 1-13 | ch2 | H | H | OMe | H |
| 1-14 | ch2 | H | H | OMe | OMe |
| 1-15 | ch2 | H | H | OMe | nh2 |
| 1-16 | ch2 | H | H | Cl | H |
| 1-17 | ch2 | H | H | Br | H |
| 1-18 | ch2 | H | H | F | H |
| 1-19 | ch2 | H | H | Cl | Cl |
| 1-20 | ch2 | H | H | SH | H |
• · • ·
| 1-21 | ch2 | Bn | H | NHBz | H |
| 1-22 | ch2 | Bn | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-23 | ch2 | Bn | Bn | NHBz | H |
| 1-24 | ch2 | Bn | Bn | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-25 | ch2 | PMB | H | NHBz | H |
| 1-26 | ch2 | PMB | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-27 | ch2 | PMB | PMB | NHBz | H |
| 1-28 | ch2 | PMB | PMB | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-29 | ch2 | Tr | H | NHBz | H |
| 1-30 | ch2 | MMTr | H | NHBz | H |
| 1-31 | ch2 | DMTr | H | NHBz | H |
| 1-32 | ch2 | TMTr | H | NHBz | H |
| 1-33 | ch2 | Tr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-34 | ch2 | MMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-35 | ch2 | DMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-36 | ch2 | TMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-37 | ch2 | TMS | H | NHBz | H |
| 1-38 | ch2 | TBDMS | H | NHBz | H |
| 1-39 | ch2 | TBDPS | H | NHBz | H |
| 1-40 | ch2 | TIPS | H | NHBz | H |
| 1-41 | ch2 | TMS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-42 | ch2 | TBDMS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-43 | ch2 | TBDPS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-44 | ch2 | TIPS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-45 | (CH2)2 | H | H | H | H |
| 1-46 | (CH2)2 | H | H | H | nh2 |
| 1-47 | (CH2)2 | H | H | H | OH |
| 1-48 | (CH2)2 | H | H | OH | H |
| 1-49 | (CH2)2 | H | H | OH | nh2 |
| 1-50 | (CH2)2 | H | H | OH | OH |
| 1-51 | (CH2)2 | H | H | nh2 | H |
| 1-52 | (ch2)2 | H | H | nh2 | nh2 |
| 1-53 | (CH2)2 | H | H | nh2 | Cl |
| 1-54 | (CH2)2 | H | H | nh2 | F |
| 1-55 | (CH2)2 | H | H | nh2 | Br |
| 1-56 | (CH2)2 | H | H | nh2 | OH |
| 1-57 | (CH2)2 | H | H | OMe | H |
| 1-58 | (CH2)2 | H | H | OMe | OMe |
| 1-59 | (CH2)2 | H | H | OMe | nh2 |
| 1-60 | (CH2)2 | H | H | Cl | H |
| 1-61 | (CH2)2 | H | H | Br | H |
| 1-62 | (CH2)2 | H | H | F | H |
| 1-63 | (CH2)2 | H | H | Cl | Cl |
| 1-64 | (CH2)2 | H | H | SH | H |
| 1-65 | (CH2)2 | Bn | H | NHBz | H |
| 1-66 | (CH2)2 | Bn | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-67 | (CH2)2 | Bn | Bn | NHBz | H |
| 1-68 | (CH2)2 | Bn | Bn | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-69 | (CH2)2 | PMB | H | NHBz | H |
| 1-70 | (CH2)2 | PMB | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-71 | (CH2)2 | PMB | PMB | NHBz | H |
| 1-72 | (CH2)2 | PMB | PMB | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-73 | (CH2)2 | Tr | H | NHBz | H |
| 1-74 | (CH2)2 | MMTr | H | NHBz | H |
| 1-75 | (CH2)2 | DMTr | H | NHBz | H |
| 1-76 | (CH2)2 | TMTr | H | NHBz | H |
| 1-77 | (CH2)2 | Tr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-78 | (CH2)2 | MMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-79 | (CH2)2 | DMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-80 | (CH2)2 | TMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-81 | (CH2)2 | TMS | H | NHBz | H |
| 1-82 | (CH2)2 | TBDMS | H | NHBz | H |
| 1-83 | (CH2)2 | TBDPS | H | NHBz | H |
| 1-84 | (CH2)2 | TIPS | H | NHBz | H |
• · · 99 99 99 9 • 99 9 · ·· · · *99
999 9 9 9 9 99 9
999 999999 9 ·
999 99 9 ··· •99 99 99 99 99 999
| 1-85 | (CH2)2 | TMS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-86 | (CH2)2 | TBDMS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-87 | (CH2)2 | TBDPS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-88 | (CH2)2 | TIPS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-89 | (CH2)3 | H | H | H | H |
| 1-90 | (CH2)3 | H | H | H | NH2 |
| 1-91 | (CH2)3 | H | H | H | OH |
| 1-92 | (CH2)3 | H | H | OH | H |
| 1-93 | (CH2)3 | H | H | OH | nh2 |
| 1-94 | (CH2)3 | H | H | OH | OH |
| 1-95 | (CH2)3 | H | H | NH2 | Η |
| 1-96 | (CH2)3 | H | H | nh2 | nh2 |
| 1-97 | (CH2)3 | H | H | nh2 | Cl |
| 1-98 | (CH2)3 | H | H | nh2 | F |
| 1-99 | (CH2)3 | H | H | nh2 | Br |
| 1-100 | (CH2)3 | H | H | nh2 | OH |
| 1-101 | (CH2)3 | H | H | OMe | H |
| 1-102 | (CH2)3 | H | H | OMe | OMe |
| 1-103 | (CH2)3 | H | H | OMe | nh2 |
| 1-104 | (CH2)3 | H | H | Cl | H |
| 1-105 | (CH2)3 | H | H | Br | H |
| 1-106 | (CH2)3 | H | H | F | H |
| 1-107 | (CH2)3 | H | H | Cl | Cl |
| 1-108 | (CH2)3 | H | H | SH | H |
| 1-109 | (CH2)3 | Bn | H | NHBz | H |
| 1-110 | (CH2)3 | Bn | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-111 | (CH2)3 | 3n | Bn | NHBz | H |
| 1-112 | (CH2)3 | 3n | Bn | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-113 | (CH2)3 | PMB | H | NHBz | H |
| 1-114 | (CH2)3 | PMB | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-115 | (CH2)3 | PMB | PMB | NHBz | H |
| 1-116 | (CH2)3 | PMB | PMB | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-117 | (CH2)3 | Tr | H | NHBz | H |
| 1-118 | (CH2)3 | MMTr | H | NHBz | H |
| 1-119 | (CH2)3 | DMTr | H | NHBz | H |
| 1-120 | (CH2)3 | TMTr | H | NHBz | H |
| 1-121 | (CH2)3 | Tr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-122 | (CH2)3 | MMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-123 | (CH2)3 | DMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-124 | (CH2)3 | TMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-125 | (CH2)3 | TMS | H | NHBz | H |
| 1-126 | (CH2)3 | TBDMS | H | NHBz | H |
| 1-127 | (CH2)3 | TBDPS | H | NHBz | H |
| 1-128 | (CH2)3 | TIPS | H | NHBz | H |
| 1-129 | (CH2)3 | TMS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-130 | (CH2)3 | TBDMS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-131 | (CH2)3 | TBDPS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-132 | (CH2)3 | TIPS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-133 | (CH2)4 | H | H | H | H |
| 1-134 | (CH2)4 | H | H | H | NH2 |
| 1-135 | (CH2)4 | H | H | H | OH |
| 1-136 | (CH2)4 | H | H | OH | H |
| 1-137 | (CH2)4 | H | H | OH | nh2 |
| 1-138 | (CH2)4 | H | H | OH | OH |
| 1-139 | (CH2)4 | H | H | NH2 | H |
| 1-140 | (CH2)4 | H | H | nh2 | nh2 |
| 1-141 | (CH2)4 | H | H | nh2 | Cl |
| 1-142 | (CH2)4 | H | H | nh2 | F |
| 1-143 | (CH2)4 | H | H | nh2 | Br |
| 1-144 | (CH2)4 | H | H | nh2 | OH |
| 1-145 | (CH2)4 | H | H | OMe | H |
| 1-146 | (CH2)4 | H | H | OMe | OMe |
| 1-147 | (CH2)4 | H | H | OMe | nh2 |
| 1-148 | (CH2)4 | H | H | Cl | H |
| 1-149 | (CH2)4 | H | H | Br | H |
| 1-150 | (CH2)4 | H | H | F | H |
| 1-151 | (CH2)4 | H | H | Cl | Cl |
| 1-152 | (CH2)4 | H | H | SH | H |
| 1-153 | (CH2)4 | Bn | H | NHBz | H |
| 1-154 | (CH2)4 | Bn | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-155 | (CH2)4 | Bn | Bn | NHBz | H |
| 1-156 | (CH2)4 | Bn | Bn | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-157 | (CH2)4 | PMB | H | NHBz | H |
| 1-158 | (CH2)4 | PMB | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-159 | (CH2)4 | PMB | PMB | NHBz | H |
| 1-160 | (CH2)4 | PMB | PMB | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-161 | (CH2)4 | Tr | H | NHBz | H |
| 1-162 | (CH2)4 | MMTr | H | NHBz | H |
| 1-163 | (CH2)4 | DMTr | H | NHBz | H |
| 1-164 | (CH2)4 | TMTr | H | NHBz | H |
| 1-165 | (CH2)4 | Tr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-166 | (CH2)4 | MMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-167 | (CH2)4 | DMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-168 | (CH2)4 | TMTr | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-169 | (CH2)4 | TMS | H | NHBz | H |
| 1-170 | (CH2)4 | TBDMS | H | NHBz | H |
| 1-171 | (CH2)4 | TBDPS | H | NHBz | H |
| 1-172 | (CH2)4 | TIPS | H | NHBz | H |
| 1-173 | (CH2)4 | TMS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-174 | (CH2)4 | TBDMS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-175 | (CH2)4 | TBDPS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-176 | (CH2)4 | TIPS | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-177 | ch2 | H | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-178 | ch2 | H | H | NHBz | H |
| 1-179 | (CH2)2 | H | H | OH | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-180 | (CH2)2 | H | H | NHBz | H |
| 1-181 | (CH2)3 | H | H | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-182 | (CH2)3 | H | H | ΝΗΒζ | Η |
| 1-183 | (CH2)4 | H | H | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-184 | (CH2)4 | H | H | ΝΗΒζ | Η |
| 1-185 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-186 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | ΝΗΒζ | Η |
| 1-187 | (CH2)2 | DMTr | PÍNfiPrhXOCNELfCN) | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-188 | (CH2)2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | ΝΗΒζ | Η |
| 1-189 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-190 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | ΝΗΒζ | Η |
| 1-191 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2XOC2H4CN) | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-192 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | ΝΗΒζ | Η |
| 1-193 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-194 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | ΝΗΒζ | Η |
| 1-195 | (CH2)2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-196 | (CH2)2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | ΝΗΒζ | Η |
| 1-197 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-198 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | ΝΗΒζ | Η |
| 1-199 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-200 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | ΝΗΒζ | Η |
| 1-201 | ch2 | DMTr | P(O)(OH)H | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-202 | ch2 | DMTr | P(O)(OH)H | ΝΗΒζ | Η |
| 1-203 | (CH2)2 | DMTr | P(OXOH)H | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-204 | (CH2)2 | DMTr | P(O)(OH)H | ΝΗΒζ | Η |
| 1-205 | (CH2)3 | DMTr | Ρ(Ο)(ΟΗ)Η | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-206 | (CH2)3 | DMTr | Ρ(ΟΧΟΗ)Η | ΝΗΒζ | Η |
| 1-207 | (CH2)4 | DMTr | Ρ(ΟΧΟΗ)Η | ΟΗ | NHCOCH(CH3)2 |
| 1-208 | (CH2)4 | DMTr | Ρ(Ο)(ΟΗ)Η | ΝΗΒζ | Η |
Π)
Tabulka č. 2
| Př. slouč. č. | A | R1 | R2 | R5 | R6 |
| 2-1 | ch2 | H | H | OH | H |
| 2-2 | ch2 | H | H | OH | ch3 |
| 2-3 | ch2 | H | H | nh2 | H |
| 2-4 | ch2 | H | H | nh2 | ch3 |
| 2-5 | ch2 | H | H | nh2 | F |
| 2-6 | ch2 | H | H | Cl | H |
| 2-7 | ch2 | H | H | OMe | H |
| 2-8 | ch2 | H | H | SH | H |
| 2-9 | ch2 | Bn | H | OH | H |
| 2-10 | ch2 | Bn | Bn | OH | H |
| 2-11 | ch2 | PMB | H | OH | H |
| 2-12 | ch2 | PMB | PMB | OH | H |
| 2-13 | ch2 | Tr | H | OH | H |
| 2-14 | ch2 | MMTr | H | OH | H |
| 2-15 | ch2 | DMTr | H | OH | H |
| 2-16 | ch2 | TMTr | H | OH | H |
| 2-17 | ch2 | TMS | H | OH | H |
| 2-18 | ch2 | TBDMS | H | OH | H |
| 2-19 | ch2 | TBDPS | H | OH | H |
* 4»
• * · · • · · · • · · « « · • · · ·· · *
| 2-20 | ch2 | TIPS | H | OH | H |
| 2-21 | ch2 | Bn | H | OH | ch3 |
| 2-22 | ch2 | Bn | Bn | OH | ch3 |
| 2-23 | ch2 | PMB | H | OH | ch3 |
| 2-24 | ch2 | PMB | PMB | OH | ch3 |
| 2-25 | ch2 | Tr | H | OH | ch3 |
| 2-26 | ch2 | MMTr | H | OH | ch3 |
| 2-27 | ch2 | DMTr | H | OH | ch3 |
| 2-28 | ch2 | TMTr | H | OH | ch3 |
| 2-29 | ch2 | TMS | H | OH | ch3 |
| 2-30 | ch2 | TBDMS | H | OH | ch3 |
| 2-31 | ch2 | TBDPS | H | OH | ch3 |
| 2-32 | ch2 | TIPS | H | OH | ch3 |
| 2-33 | ch2 | Bn | H | NHBz | H |
| 2-34 | ch2 | Bn | Bn | NHBz | H |
| 2-35 | ch2 | PMB | H | NHBz | H |
| 2-36 | ch2 | PMB | PMB | NHBz | H |
| 2-37 | ch2 | Tr | H | NHBz | H |
| 2-38 | ch2 | MMTr | H | NHBz | H |
| 2-39 | ch2 | DMTr | H | NHBz | H |
| 2-40 | ch2 | TMTr | H | NHBz | H |
| 2-41 | ch2 | TMS | H | NHBz | H |
| 2-42 | ch2 | TBDMS | H | NHBz | H |
| 2-43 | ch2 | TBDPS | H | NHBz | H |
| 2-44 | ch2 | TIPS | H | NHBz | H |
| 2-45 | ch2 | 3n | H | NHBz | CH3 |
| 2-46 | ch2 | Bn | Bn | NHBz | ch3 |
| 2-47 | ch2 | PMB | H | NHBz | ch3 |
| 2-48 | ch2 | PMB | PMB | NHBz | ch3 |
| 2-49 | ch2 | Tr | H | NHBz | ch3 |
| 2-50 | ch2 | MMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-51 | ch2 | DMTr | H | NHBz | ch3 |
* ♦ · * * · · 9 •*·» 9 · · · «9« • · · 9 9*9 « « • 9 9 » · * ··« · « » • · · 9 9 · «3
9·*·· »9 * * 9 9 3
| 2-52 | ch2 | TMTr | H | NHBz | CH3 |
| 2-53 | ch2 | TMS | H | NHBz | ch3 |
| 2-54 | ch2 | TBDMS | H | NHBz | ch3 |
| 2-55 | ch2 | TBDPS | H | NHBz | ch3 |
| 2-56 | ch2 | TIPS | H | NHBz | ch3 |
| 2-57 | (CH2)2 | H | H | OH | H |
| 2-58 | (CH2)2 | H | H | OH | čh3 |
| 2-59 | (CH2)2 | H | H | NH2 | Η |
| 2-60 | (CH2)2 | H | H | nh2 | ch3 |
| 2-61 | (CH2)2 | H | H | nh2 | F |
| 2-62 | (CH2)2 | H | H | Cl | H |
| 2-63 | (CH2)2 | H | H | OMe | H |
| 2-64 | (CH2)2 | H | H | SH | H |
| 2-65 | (CH2)2 | Bn | H | OH | H |
| 2-66 | (CH2)2 | Bn | Bn | OH | H |
| 2-67 | (CH2)2 | PMB | H | OH | H |
| 2-68 | (CH2)2 | PMB | PMB | OH | H |
| 2-69 | (CH2)2 | Tr | H | OH | H |
| 2-70 | (CH2)2 | MMTr | H | OH | H |
| 2-71 | (ch2)2 | DMTr | H | OH | H |
| 2-72 | (CH2)2 | TMTr | H | OH | H |
| 2-73 | (CH2)2 | TMS | H | OH | H |
| 2-74 | (CH2)2 | TBDMS | H | OH | H |
| 2-75 | (CH2)2 | TBDPS | H | OH | H |
| 2-76 | (CH2)2 | TIPS | H | OH | H |
| 2-77 | (CH2)2 | Bn | H | OH | CH3 |
| 2-78 | (CH2)2 | 3n | Bn | OH | ch3 |
| 2-79 | (CH2)2 | PMB | H | OH | ch3 |
| 2-80 | (CH2)2 | PMB | PMB | OH | ch3 |
| 2-81 | (CH2)2 | Tr | H | OH | ch3 |
| 2-82 | (CH2)2 | MMTr | H | OH | ch3 |
| 2-83 | (CH2)2 | DMTr | H | OH | ch3 |
*· • · * *
| 2-84 | (CH2)2 | TMTr | H | OH | ch3 |
| 2-85 | (CH2)2 | TMS | H | OH | ch3 |
| 2-86 | (CH2)2 | TBDMS | H | OH | ch3 |
| 2-87 | (CH2)2 | TBDPS | H | OH | ch3 |
| 2-88 | (CH2)2 | TIPS | H | OH | ch3 |
| 2-89 | (CH2)2 | Bn | H | NHBz | H |
| 2-90 | (CH2)2 | Bn | Bn | NHBz | H |
| 2-91 | (CH2)2 | PMB | H | NHBz | H |
| 2-92 | (CH2)2 | PMB | PMB | NHBz | H |
| 2-93 | (CH2)2 | Tr | H | NHBz | H |
| 2-94 | (CH2)2 | MMTr | H | NHBz | H |
| 2-95 | (CH2)2 | DMTr | H | NHBz | H |
| 2-96 | (CH2)2 | TMTr | H | NHBz | H |
| 2-97 | (CH2)2 | TMS | H | NHBz | H |
| 2-98 | (CH2)2 | TBDMS | H | NHBz | H |
| 2-99 | (CH2)2 | TBDPS | H | NHBz | H |
| 2-100 | (CH2)2 | TIPS | H | NHBz | H |
| 2-101 | (CH2)2 | Bn | H | NHBz | ch3 |
| 2-102 | (CH2)2 | Bn | Bn | NHBz | ch3 |
| 2-103 | (CH2)2 | PMB | H | NHBz | ch3 |
| 2-104 | (CH2)2 | PMB | PMB | NHBz | ch3 |
| 2-105 | (CH2)2 | Tr | H | NHBz | ch3 |
| 2-106 | (CH2)2 | MMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-107 | (CH2)2 | DMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-108 | (CH2)2 | TMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-109 | (CH2)2 | TMS | H | NHBz | ch3 |
| 2-110 | (CH2)2 | TBDMS | H | NHBz | ch3 |
| 2-111 | (CH2)2 | TBDPS | H | NHBz | ch3 |
| 2-112 | (CH2)2 | TIPS | H | NHBz | ch3 |
| 2-113 | (CH2)3 | H | H | OH | H |
| 2-114 | (CH2)3 | H | H | OH | ch3 |
| 2-115 | (CH2)3 | H | H | nh2 | H |
| 2-116 | (CH2)3 | H | H | nh2 | CH3 |
| 2-117 | (CH2)3 | H | H | nh2 | F |
| 2-118 | (CH2)3 | H | H | Cl | H |
| 2-119 | (CH2)3 | H | H | OMe | H |
| 2-120 | (CH2)3 | H | H | SH | H |
| 2-121 | (CH2)3 | Bn | H | OH | H |
| 2-122 | (CH2)3 | Bn | Bn | OH | H |
| 2-123 | (CH2)3 | PMB | H | OH | H |
| 2-124 | (CH2)3 | PMB | PMB | OH | H |
| 2-125 | (CH2)3 | Tr | H | OH | H |
| 2-126 | (CH2)3 | MMTr | H | OH | H |
| 2-127 | (CH2)3 | DMTr | H | OH | H |
| 2-128 | (CH2)3 | TMTr | H | OH | H |
| 2-129 | (CH2)3 | TMS | H | OH | H |
| 2-130 | (CH2)3 | TBDMS | H | OH | H |
| 2-131 | (CH2)3 | TBDPS | H | OH | H |
| 2-132 | (CH2)3 | TIPS | H | OH | H |
| 2-133 | (CH2)3 | Bn | H | OH | ch3 |
| 2-134 | (CH2)3 | Bn | Bn | OH | ch3 |
| 2-135 | (CH2)3 | PMB | H | OH | ch3 |
| 2-136 | (CH2)3 | PMB | PMB | OH | ch3 |
| 2-137 | (CH2)j | Tr | H | OH | ch3 |
| 2-138 | (CH2)3 | MMTr | H | OH | ch3 |
| 2-139 | (CH2)3 | DMTr | H | OH | ch3 |
| 2-140 | (CH2)3 | TMTr | H | OH | ch3 |
| 2-141 | (CH2)3 | TMS | H | OH | ch3 |
| 2-142 | (CH2)3 | TBDMS | H | OH | ch3 |
| 2-143 | (CH2)3 | TBDPS | H | OH | ch3 |
| 2-144 | (CH2)3 | TIPS | H | OH | ch3 |
| 2-145 | (CH2)3 | Bn | H | NHBz | H |
| 2-146 | (CH2)3 | Bn | Bn | NHBz | H |
| 2-147 | (CH2)3 | PMB | H | NHBz | H |
• · ·· ·
| 2-148 | (CH2)3 | PMB | PMB | NHBz | H |
| 2-149 | (CH2)3 | Tr | H | NHBz | H |
| 2-150 | (CH2)3 | MMTr | H | NHBz | H |
| 2-151 | (CH2)3 | DMTr | H | NHBz | H |
| 2-152 | (CH2)3 | TMTr | H | NHBz | H |
| 2-153 | (CH2)3 | TMS | H | NHBz | H |
| 2-154 | (CH2)3 | TBDMS | H | NHBz | H |
| 2-155 | (CH2)3 | TBDPS | H | NHBz | H |
| 2-156 | (CH2)3 | TIPS | H | NHBz | H |
| 2-157 | (CH2)3 | Bn | H | NHBz | ch3 |
| 2-158 | (CH2)3 | Bn | Bn | NHBz | ch3 |
| 2-159 | (CH2)3 | PMB | H | NHBz | ch3 |
| 2-160 | (CH2)3 | PMB | PMB | NHBz | ch3 |
| 2-161 | (CH2)3 | Tr | H | NHBz | ch3 |
| 2-162 | (CH2)3 | MMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-163 | (CH2)3 | DMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-164 | (CH2)3 | TMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-165 | (CH2)3 | TMS | H | NHBz | ch3 |
| 2-166 | (CH2)3 | TBDMS | H | NHBz | ch3 |
| 2-167 | (CH2)3 | TBDPS | H | NHBz | ch3 |
| 2-168 | (CH2)3 | TIPS | H | NHBz | ch3 |
| 2-169 | (CH2)4 | H | H | OH | Η |
| 2-170 | (CH2)4 | H | H | OH | ch3 |
| 2-171 | (CH2)4 | H | H | NH2 | H |
| 2-172 | (CH2)4 | H | H | nh2 | ch3 |
| 2-173 | (CH2)4 | H | H | nh2 | F |
| 2-174 | (CH2)4 | H | H | Cl | H |
| 2-175 | (CH2)4 | H | H | OMe | H |
| 2-176 | (CH2)4 | H | H | SH | H |
| 2-177 | (CH2)4 | Bn | H | OH | H |
| 2-178 | (CH2)4 | Bn | Bn | OH | H |
| 2-179 | (CH2)4 | PMB | H | OH | H |
• ·
| 2-180 | (CH2)4 | PMB | PMB | OH | H |
| 2-181 | (CH2)4 | Tr | H | OH | H |
| 2-182 | (CH2)4 | MMTr | H | OH | H |
| 2-183 | (CH2)4 | DMTr | H | OH | H |
| 2-184 | (CH2)4 | TMTr | H | OH | H |
| 2-185 | (CH2)4 | TMS | H | OH | H |
| 2-186 | (CH2)4 | TBDMS | H | OH | H |
| 2-187 | (CH2)4 | TBDPS | H | OH | H |
| 2-188 | (CH2)4 | TIPS | H | OH | H |
| 2-189 | (CH2)4 | Bn | H | OH | ch3 |
| 2-190 | (CH2)4 | Bn | Bn | OH | ch3 |
| 2-191 | (CH2)4 | PMB | H | OH | ch3 |
| 2-192 | (CH2)4 | PMB | PMB | OH | ch3 |
| 2-193 | (CH2)4 | Tr | H | OH | ch3 |
| 2-194 | (CH2)4 | MMTr | H | OH | ch3 |
| 2-195 | (CH2)4 | DMTr | H | OH | ch3 |
| 2-196 | (CH2)4 | TMTr | H | OH | ch3 |
| 2-197 | (CH2)4 | TMS | H | OH | ch3 |
| 2-198 | (CH2)4 | TBDMS | H | OH | ch3 |
| 2-199 | (CH2)4 | TBDPS | H | OH | ch3 |
| 2-200 | (CH2)4 | TIPS | H | OH | ch3 |
| 2-201 | (CH2)4 | Bn | H | NHBz | H |
| 2-202 | (CH2)4 | Bn | Bn | NHBz | H |
| 2-203 | (CH2)4 | PMB | H | NHBz | H |
| 2-204 | (CH2)4 | PMB | PMB | NHBz | H |
| 2-205 | (CH2)4 | Tr | H | NHBz | H |
| 2-206 | (CH2)4 | MMTr | H | NHBz | H |
| 2-207 | (CH2)4 | DMTr | H | NHBz | H |
| 2-208 | (CH2)4 | TMTr | H | NHBz | H |
| 2-209 | (CH2)4 | TMS | H | NHBz | H |
| 2-210 | (CH2)4 | TBDMS | H | NHBz | H |
| 2-211 | (CH2)4 | TBDPS | H | NHBz | H |
| ' 2-212 | (CH2)4 | TIPS | H | NHBz | H |
| 2-213 | (CH2)4 | Bn | H | NHBz | CH3 |
| 2-214 | (CH2)4 | Bn | Bn | NHBz | ch3 |
| 2-215 | (CH2)4 | PMB | H | NHBz | ch3 |
| 2-216 | (CH2)4 | PMB | PMB | NHBz | ch3 |
| 2-217 | (CH2)4 | Tr | H | NHBz | ch3 |
| 2-218 | (CH2)4 | MMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-219 | (CH2)4 | DMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-220 | (CH2)4 | TMTr | H | NHBz | ch3 |
| 2-221 | (CH2)4 | TMS | H | NHBz | ch3 |
| 2-222 | (CH2)4 | TBDMS | H | NHBz | ch3 |
| 2-223 | (CH2)4 | TBDPS | H | NHBz | ch3 |
| 2-224 | (CH2)4 | TIPS | H | NHBz | ch3 |
| 2-225 | ch2 | H | H | NHBz | H |
| 2-226 | ch2 | H | H | NHBz | ch3 |
| 2-227 | (CH2)2 | H | H | NHBz | H |
| 2-228 | (CH2)2 | H | H | NHBz | ch3 |
| 2-229 | (ch2)3 | H | H | NHBz | H |
| 2-230 | (CH2)3 | H | H | NHBz | ch3 |
| 2-231 | (CH2)4 | H | H | NHBz | H |
| 2-232 | (CH2)4 | H | H | NHBz | ch3 |
| 2-233 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | OH | Η |
| 2-234 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | OH | ch3 |
| 2-235 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | NHBz | H |
| 2-236 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | NHBz | ch3 |
| 2-237 | (CH2)2 | DMTr | PÍNCiPrhXOCzILCN) | OH | H |
| 2-238 | (CH2)2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | OH | ch3 |
| 2-239 | (CH2)2 | DMTr | PCNCiPrhXOQJLCN) | NHBz | H |
| 2-240 | (CH2)2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | NHBz | ch3 |
| 2-241 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | OH | H |
| 2-242 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) - | OH | ch3 |
| 2-243 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | NHBz | H |
| 2-244 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | NHBz | ch3 |
| 2-245 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | OH | H |
| 2-246 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | OH | ch3 |
| 2-247 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | NHBz | H |
| 2-248 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OC2H4CN) | NHBz | ch3 |
| 2-249 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | OH | H |
| 2-250 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | OH | CH3 |
| 2-251 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | NHBz | H |
| 2-252 | ch2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | NHBz | ch3 |
| 2-253 | (CH2)2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | OH | H |
| 2-254 | (CH2)2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | OH | ch3 |
| 2-255 | (CH2)2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | NHBz | H |
| 2-256 | (CH2)2 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | NHBz | ch3 |
| 2-257 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | OH | Η |
| 2-258 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | OH | ch3 |
| 2-259 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | NHBz | H |
| 2-260 | (CH2)3 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | NHBz | CH3 |
| 2-261 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | OH | H |
| 2-262 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | OH | ch3 |
| 2-263 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | NHBz | H |
| 2-264 | (CH2)4 | DMTr | P(N(iPr)2)(OCH3) | NHBz | CH3 |
« ·
V tabulce č. 1 a 2 uvedené shora v textu výhodné sloučeniny zahrnuj í (i_5)? (μγχ (1-23), (1-24), (1-31), (1-35), (1-39), (1-43), (1-49), (1-51), (1-67), (1-68), (1-75), (1-79), (1-83), (1-87), (1-93), (1-95), (1-111), (1-112), (1-119), (1-123), (1-127), (1-131), (1-137), (1-139), (1-155), (1-156), (1-163), (1-167), (1-171), (1-175), (1-177), (1-178), (1-185), (1-186), (1-193), (1-194), (1-201), (1-202), (2-1), (2-2), (2-3), (2-4), (2-10), (2-15), (2-19), (2-22), (2-27), (2-31), (2-34), (2-39), (2-43), (2-46), (2-51), (2-55), (2-57), (2-58), (2-59), (2-60), (2-66), (2-71), (2-75), (2-78), (2-83), (2-87), (2-90), (2-95), (2-99), (2-102), (2-107), (2-111), (2-113), (2-114), (2-115), (2-116), (2-122), (2-127), (2-131), (2-134), (2-139), (2-143), (2-146), (2-151), (2-155), (2-158), (2-163), (2-167), (2-169), (2-170), (2-171), (2-172), (2-178), (2-183), (2-187), (2-190), (2-195), (2-199), (2-202), (2-207), (2-211), (2-214), (2-219), (2-223), (2-225), (2-226), (2-233), (2-234), (2-235) (2-236), výhodnější sloučeniny mohou zahrnovat 2 ' -O,4'-C-ethylenguanosin (1-5)
2'-O,4'-C-ethylenadenosin (1-7)
3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (1-23)
3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (124)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (131)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (1-35) '-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (1-177)
2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (1-178) '-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (1-185)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (1-186) '-0,4'-C-ethylenuridin (2-1)
2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin (2-2) ' -0,4'-C-ethylencytidin (2-3)
2'-O,4'-C-ethylen-5-methylcytidin (2-4) ',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylenuridin (2-10) • ·
5-O-dimethoxytrityl-2-0,4-C-ethylenuridin (2-15) ',5'-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin (2-22)
5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin (2-27)
3',5'-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin (2-34)
5'-0-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin (239)
3',5'-dí-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methyluridin (2-46)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin (2-51)
2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin (2-225)
2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin (2-226)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylenuridin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (2-233)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (2-234)
5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (2-235) a 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (2-36).
Postup A
(6)
Při postupu A, symbol X reprezentuje chránící skupinu, symbol Y reprezentuje chránící skupinu, symbol A reprezentuje to samé, jak se uvádí shora v textu, zatímco symbol B1 reprezentuje skupinu purin-9-yl, substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, uvedené substituenty se vybraly ze shora uvedených substituentů a, ale s výjimkou nechráněné aminoskupiny „aminoskupiny, která se může chránit, zatímco symbol B2 reprezentuje skupinu purin-9-yl, substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, uvedené substituenty se vybraly ze shora uvedených substituentů a, ale s výjimkou chráněných aminoskupin „aminoskupiny, která se může chránit. Symbol R7 reprezentuje skupinu, která tvoří odstupující skupinu a symbol R8 reprezentuje alifatickou acylovou skupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku.
Chránící skupina vyjádřená symbolem X je stejná skupina jako je „hydroxylová chránící skupina ve shora v textu uvedeném symbolu R1.
Chránící skupina Y je stejná skupina jako „hydroxylová chránící skupina ve shora uvedeném symbolu R2.
„Skupina, která tvoří odstupující skupinu, symbolu R7 může zahrnovat nižší alkylsulfonylovou skupinu, jako je methansulfonyl a ethansulfonyl, nižší alkylsulfonylovou skupinu substituovanou halogenem, jako je trifluormethansulfonyl a arylsulfonylová skupina, jako je p-toluensulfonyl, přičemž je výhodná methansulfonylová skupina nebo p-toluensulfonylová skupina.
„Alifatická acylová skupina zahrnující 2 až 4 atomy uhlíku symbolu R8 může zahrnovat acetylovou, propionylovou, butyrylovou skupinu a podobně. Výhodná je acetylová skupina.
Dále v textu se každý krok postupu A popisuje detailně.
Krok A-l
Účelem je připravit sloučeninu obecného vzorce 4 reakcí sloučeniny obecného vzorce 3, která se může připravit způsobem B až D popsaným dále v textu s činidlem vhodným pro zavedení odstupující skupiny v přítomnosti bazického katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroín a petroleter. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon, nitrosloučeniny, jako je nitroethan a nitrobenzen, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrolidon, N-methylpyrolidinon a hexamethylfosforečný triamid, sulfoxidy, jako je sulfolan a pyridinové deriváty, přičemž výhodný je pyridin.
Zde použitý bazický katalyzátor může přednostně zahrnovat bázi, jako je triethylamin, pyridin a dimethylaminopyridin.
Činidlo pro zavedení odstupující skupiny může zahrnovat alkylsulfonylové halidy, jako je methansulfonylchlorid a ethansulfonylbromid a arylsulfonylové halidy, jako je p-toluensulfonylchlorid, přičemž výhodný je methansulfonylchlorid a p-toluensulfonylchlorid.
• * ·
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, na rozpouštědle, na činidle pro zavedení odstupující skupiny a bazického katalyzátoru, ale je použitelný při teplotě 0°C až 50°C. Výhodná je teplota 10°C až 40°C.
Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, na rozpouštědle, na činidle pro zavedení odstupující skupiny a na bazickém katalyzátoru a reakční teplotě, ale je obvykle 10 minut až 24 hodin. Výhodný čas je 1 až 10 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 4 získala například neutralizací reakčního roztoku, koncentrací reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promýváním vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením nevodným síranem hořečnatým a rozpouštědlo se odstranilo destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistil, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem.
Krok A-2
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce 5 reakcí sloučeniny obecného vzorce 4 v kroku A-l s kyselým anhydridem v přítomnosti kyselého katalyzátoru v rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat ethery, jako je diethylether, dioxan a tetrahydrofuran, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidin, N-methylpyrrolidin a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a organická kyselina, jako je kyselina octová. Výhodné je použití kyseliny octové.
Zde použitelný kyselý katalyzátor může zahrnovat anorganické kyseliny, jako je kyselina chlorovodíková, kyselina sírová a kyselina dusičná. Výhodná je kyselina sírová (zvláště koncentrovaná kyselina sírová).
• · · ♦ · ♦·
Zde použitelný kyselý anhydrid může zahrnovat anhydrid nižší alifatické karboxylové kyseliny, jako je kyselý anhydrid a anhydrid kyseliny propionové, upřednostňuje se kyselý anhydrid .
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a kyselém anhydridu a je obvykle 0°C až 50°C. Výhodné je 10°C až 40 °C.
Reakční směs kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru, kyselém anhydridu a reakční teplotě, ale je obvykle 10 minuť až 12 hodin. Výhodný čas reakce je 30 minut až 3 hodiny.
Po reakci požadovaná sloučenina obecného vzorce 5 se získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je etylacetát, promytím vodou, separací organické vrstvy, která obsahuje požadovanou sloučeninu, sušením na síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstranilo destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistil, je-li to nutné, běžnou metodou, například rekrystalizací, chromatografií na koloně se silkagelem a podobně.
Krok A-3
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce 6 reakcí sloučeniny obecného vzorce 5 v kroku A-2 s trimethylsilylovanou sloučeninou odpovídající purinu nebo pyrimidinu, který může zahrnovat požadovaný substituent připravený podle publikace H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981) v přítomnosti katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelný rozpouštědlo může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen, xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N43 dímethylformamid, N, N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidin, N-methylpyrrolidinon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné, sulfid uhličitý. Výhodný je 1,2-di-chlorethan.
Zde použitelný kyselý katalyzátor může zahrnovat Lewisovy kyselé katalyzátory, jako je A1C13, SnCl4, TiCl4, ZnCl2, BF3, trimethylsilyltrifluormethansulfonát. Výhodný je trimethylsilyltrifluormethansulfonát.
Reakčni teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale obvykle se pohybuje od 0°C do 100 °C. Výhodná je teplota 50 °C až 80 °C.
Reakčni čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a reakčni teplotě, ale obvykle se pohybuje od 1 hodiny do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 8 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 6 získala například zakoncentrováním reakčni směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušení nevodným síranem hořečnatým a rozpouštědlo se odstranilo destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistil, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok Ά-4
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce la podle vynálezu cyklizací sloučeniny obecného vzorce 6 připravenév kroku A-3 v přítomnosti bazického katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelný rozpouštědlo může zahrnovat vodu, pyridinové deriváty, acetonitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidin, N-methylpyrrolidinon a ♦
« ♦
triamid kyseliny hexamethylfosforečné a jejich směsi. Výhodná je směs vody a pyridinu.
Zde použitelný bazický katalyzátor může zahrnovat hydroxidy alkalických kovů, jako je hydroxid sodný a hydroxid draselný, uhličitany alkalických kovů, jako je uhličitan sodný a uhličitan draselný, alkoxidy alkalických kovů, jako je methoxid sodný a ethoxid sodný a vodný amoniak. Výhodné jsou hydroxidy alkalických kovů (zvláště pak hydroxid sodný).
Teplota reakce kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a bazickém katalyzátoru, ale obvykle její hodnota je od 0°C do 50°C. Výhodná je teplota od 10°C do 30°C.
Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a reakční teplotě, ale je obvykle od 1 minuty do 5 hodin. Výhodný je čas reakce 1 minuta až 30 minut.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 6 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok A-5
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce lb reakcí sloučeniny obecného vzorce la připravené v kroku A-4 v přítomnosti činidla odstraňujícího ochranou skupinu v inertním rozpouštědle.
Metoda odstranění ochranné skupiny závisí na druhu ochranné skupiny a není omezena. Způsobuje vedlejší reakce a může se například provést způsobem popsaným v publikaci „Protective • ·
Groups in Organic Synthesis, Theodora W. Greene and Peter G. M. Wuts, 1999, Published A. Wiley-Interscience Publication).
Odstranění ochranné skupiny je možné zvláště provést následujícím způsobem, kde ochranná skupina je (1) alifatická acylová skupina nebo aromatická acylová skupina, (2) methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami nebo methylovou skupinou substituovanou jednou až třemi arylovými kruhy, které jsou substituovanými nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou nebo (3) silylovou skupinou.
(1) V případě, že ochranná skupina je alifatická acylová skupina nebo aromatická acylová skupina, reakce odstraňující ochrannou skupinu je obvykle provedena ošetřením alkalickým činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo není omezeno, pokud je jednoduše mísitelné s vodou, neinhibuje reakci a rozpouští počáteční materiál a může zahrnovat vodné a nevodné amidy, jako je dimethylformamid a dimethylacetamid, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan nebo tetrachlorid uhlíku a ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan. Výhodné jsou ethery. Výhodnější je tetrafuran.
Zde použitelné alkalické činidlo může zahrnovat hydroxidy alkalických kovů, jako je hydroxid litný, hydroxid draselný a hydroxid sodný, uhličitany alkalického kovu, jako je uhličitan sodný a uhličitan draselný, alkoxidy alkalických kovů, jako je methoxid sodný a ethoxid sodný a roztok amoniaku, jako je roztok amoniaku ve vodě a roztok amoniaku v methanolu.
Reakční teplota je od 0°C do 60 °C. Výhodná je teplota 20°C až 40°C. Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující po46 • *· žadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
(2) V případě, že ochranná skupina je methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami nebo methylovou skupinou substituovanou jednou až třemi arylovými kruhy, které jsou substituovanými nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou, reakce se provádí v inertním rozpouštědle za použití redukčního činidla.
Zde použitelné rozpouštědlo zahrnuje přednostně alkoholy, jako je methanol, ethanol aisopropanol, ethery, jako je diethylether, tetrahydrofuran a dioxan, aromatické uhlovodíky, jako je toluen, benzen a xylen, alifatické uhlovodíky, jako je hexan a cyklohexan, estery, jako je ethylacetát a propylacetát, organické kyseliny, jako je kyselina octová nebo směsi těchto organických rozpouštědel a vody.
Zde použitelné redukční činidlo není zvláště omezeno, pokud se může použít pro katalytickou redukci a je výhodné, aby zahrnovalo paládium na uhlíku, Raneyoův nikl, oxid platiny, platinovou čerň, oxid rhodičito-hlinitý, chlorid trifenylfosfinrhodíčitý a síran paladičito-barnatý.
Tlak není nijak omezen, ale je obvykle od 1 do 10 atmosfér .
Reakční teplota je od 0°C do 60°C. Výhodná je teplota od 20°C do 40°C.
Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je jedna hodina až tři hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promytím vodou, separací organické vrstvy obsahující po47
9 > »9 • · 9 • · 9 • 999 • 9 » 99 žadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čisti, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
V případě, že ochranná skupina je methylová skupina substituovaná třemi arylovými skupinami, to znamená tritylová skupina, reakce odstraňující tritylovou skupinu může také proběhnout za použití kyseliny.
V případě, že zde použitelné rozpouštědlo zahrnuje aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, alkoholy, jako je methanol, ethanol, isopropanol a terc-butanol, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidon, N-methylpyrolidon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a organické kyseliny, jako je kyselina octová. Výhodné jsou organické kyseliny (zvláště kyselina octová) nebo alkoholy (zvláště terc-butanol).
Zde použitelná kyselina může s výhodou zahrnovat kyselinu octovou nebo kyselinu trifluoicctovou.
Reakční teplota je od 0°C do 60°C. Výhodná je reakční teplota od 20°C do 40°C.
Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakončenírováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
·· Φ· > φ φ φ Φ Φ 9 Φ ΦΦΦ ► ♦ Φ ·· ΦΦ
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
(3) V případě, že ochranná skupina je silylová skupina, může se obvykle odstranit ošetřením se sloučeninou produkující fluorid, jako je tetrabutylamoniumfluorid, kyselina fluorovodíková, kyselina fluorovodíková-pyridin a fluorid draselný nebo organické kyseliny, jako je kyselina octová, kyselina methansulfonová, kyselina paratoluensulfonová, kyselina trifluorctová a kyselina trifluormethansulfonová nebo organické kyseliny, jako je kyselina chlorovodíková.
V případě, že se ochranná skupina odstraní fluoridem, reakce se někdy podpoří přidáním organických kyselin, jako je kyselina mravenčí, kyselina octová a kyselina propionová.
Zde použitelné rozpouštědlo není omezeno, pokud neinhibuje reakci a rozpouští počáteční materiál a může s výhodou použít ether, jako je tetrahydrofuran, diethylether, diisopropylether a dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, voda, organické kyseliny, jako je kyselina octová a jejich směsi.
Reakční teplota je od 0°C do 100°C. Výhodná je reakční teplota od 20°C do 70°C.
Reakční čas je od 5 minut do 48 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 24 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
. Krok A-6
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce lc reakcí sloučeniny obecného vzorce lb připravené v kroku A-5 v přítomnosti činidla odstraňujícího ochranou skupinu v inertním rozpouštědle.
Metoda odstranění ochranné skupiny závisí na druhu ochranné skupiny a není omezena. Způsobuje vedlejší reakce a může se například provést způsobem popsaným v publikaci „Protective Groups in Organic Synthesis, Theodora W. Greene and Peter G. M. Wuts, 1999, Published A. Wiley-Interscience Publication).
Odstranění ochranné skupiny je možné zvláště provést následujícím způsobem, když ochranná skupina je alifatická acylová skupina nebo aromatická acylová skupina, reakce odstraňující ochrannou skupinu je obvykle provedena ošetřením alkalickým činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použití rozpouštědla není omezeno, pokud je jednoduše mísitelné s vodou, neinhibuje reakci a rozpouští počáteční materiál a může zahrnovat vodné a nevodné alkoholy jako je methanol a ethanol, amidy, jako je dimethylformamid a dimethylacetamid, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan nebo chlorid uhličitý a ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan. Výhodné jsou alkoholy. Výhodnější je methanol.
Zde použitelné alkalické činidlo může zahrnovat hydroxidy alkalických kovů, jako je hydroxid litjyiý, hydroxid draselný a hydroxid sodný, uhličitany alkalického kovu, jako je uhličitan sodný a uhličitan draselný, alkoxidy alkalických kovů, jako je methoxid sodný a ethoxid sodný a roztok amoniaku. Výhodný je amoniak.
Reakční teplota je od 0°C do 50 °C. Výhodné je teplota od 10°C do 40°C.
Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 10 minut až 15 hodin.
• 9 • ·
Ml • 4 • 4 « 4 4 • » • 4 *4 «
·*· • 4 4
4
4 ·
*
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lc získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Meziprodukt obecného vzorce 3 popsaný shora v textu se může připravit způsobem B až D, jak se popisuje dále v textu.
Způsob B
B-3 xo
OHC0.
B-4
OY (10)
HO
(7) (11) (12)
Při způsobu B až D symboly X a Y mají stejný význam jako se definuje shora v textu. Symbol R9 reprezentuje skupinu, která tvoří odstupující skupinu, symbol E reprezentuje ethylen, trimethylen nebo tetramethylen a symbol Z reprezentuje jednoduchou vazbu, methylenovou nebo ethylenovou skupinu.
Skupina, která tvoří odstupující skupinu symbolu R9 může zahrnovat skupinu popsanou shora v textu pro symbol R7. Výhodná je trifluormethansulfonylová skupina.
Symboly R11 a R12 jsou stejné a reprezentují vodíkový atom a dohromady tvoří atom kyslíku.
V případě, kde symbol R11 a R12 dohromady tvoří atom kyslíku, symbol R10 reprezentuje alkylovou skupinu, která má 1 až 4 • · · · · ·· · · ··· · · · · · · ·· atomy uhlíku, jako je metyl, ethyl, propyl, isopropyl, butyl, isobutyl, s-butyl a terc-butyl. Výhodná je methylová skupina.
V případe, že symboly R a R jsou stejne a reprezentuji atom vodíku, symbol R10 může zahrnovat aralkylovou skupinu, jako je benzylová skupina, alkoxyalkylová skupina, jako je methoxymethylová skupina, arylkarbonyloxymethylovou skupinu, jako je benzoyloxymethylová skupina, aralkyloxymethylová skupina, jako je benzyloxymethylová skupina, alkoxyalkoxyalkylová skupina, jako je methoxyethoxymethylová skupina, silylová skupina, jako je trimethylsilyl, t-butyldimethylsilyl, difenylmethylsilyl, difenylbutylsilyl, difenyl-isopropylsilyl a fenyldiisopropylsilyl.
Sloučenina obecného vzorce 7, to znamená počáteční materiál používaný v postupu B nebo v postupu C, se může připravit následujícím způsobem.
Sloučenina odpovídající sloučenině obecného vzorce 6, jejíž část „X je atom vodíku, se připravila z 1,1,5,6-diisopropyliden-D-glukosy podle způsobu uvedeného v publikaci R.D. Youssefyeh, J. P. H. Verheyden, J.G. Moffatt. J. Organ. Chem., 44, 1301-1309 (1979) a následně sloučenina obecného vzorce 6 se může připravit podle metody popsané v publikaci T. Waga, T. Nishizaki, I. Miyakawa, H. Ohrui, H. Meguro, Biosci. Biotechnol. Biochem., 57, 1433-1438 (1993) (v případě, že symbol X je Bn).
Způsob B
Krok B-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 8 reakcí sloučeniny obecného vzorce 7 připravené shora v textu popsanou metodou s činidlem vhodným pro zavedení odstupující skupiny v přítomnosti alkalického katalyzátoru v inertním rozpouštědle .
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat amidy, jako je dimethylformamid a dimethylacetamid, halogenované uhlovodíky, • · · · · ·· ·· • · · · · ·· · · · · • · · ···· ·· ·· ··· ······ · ····· · · · ····· ·· ·· · · · . jako je methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan nebo chlorid uhličitý a ethery, jako je hydrofuran, diethylether a dioxan. Výhodný je methylenchlorid.
Použitelný alkalický katalizátor s výhodou může zahrnovat alkalické činidlo, jako je triethylamin, pyridin a dimethylaminopyridin.
Činidlo pro zavedení odstupující skupiny může zahrnovat s výhodou chlorid trifluormethansulfonové kyseliny nebo anhydrid kyseliny trifluormethansulfonové.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale je obvykle -100°C až -50 °C. Výhodná je teplota od -100°C do -70°C. Obvyklá teplota je od -100°C do -50°C. Výhodná je teplota -100°C až -70°C.
Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale obvykle je od 30 minut do 12 hodin. Výhodná je doba reakce 30 minut až 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 8 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok B-2
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 9 reakcí sloučeniny obecného vzorce 8, která se připravila v kroku B-l s činidlem pro zavedení kyanoskupiny v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat amidy, jako jsou methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan, chlorid uhličitý, ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan, acetonitril, dimethoxysulfoxid a podobně. Výhodné jsou amidy (dimethylformamid).
Použitelné činidlo pro zavedení kyanoskupiny může zahrnovat KCN, NaCN a kyanid trimethylsilanu. Významný je NaCN.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědlu a činidlu vhodném pro zavedení kyanoskupiny, ale obvykle je od 0°C do 100°C . Výhodná je teplota 30°C až 70°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, činidlu pro zavedení kyanoskupiny a teplotě reakce, ale je obvykle 30 minut až 12 hodin. Výhodná je reakční doba od 1 do 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 9 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok B-3
V tomto kroku se připraví sloučenina obecného vzorce 10 reakcí sloučeniny obecného vzorce 9 v kroku B-2 s redukčním činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat halogenované uhlovodíky, jako je methylchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je • · · · ·· ·· ·· · · · ♦ · * · • · ···· ·· • ··· · ····· · • · ·· · · 9· 9 aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon acyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid).
Zde použitá redukční činidla mohou zahrnovat diisobutylhydrid hlinitý a triethoxyhydrid hlinitý. Výhodný je diisobutylhydrid hlinitý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a redukčním činidlu, ale je obvykle -100°C a -50°C. Výhodná je teplota -90°C až -70°C.
Reakčni doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 30 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 1 hodina až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 9 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok B-4
V tomto kroku se připraví sloučenina obecného vzorce (3a), která je počátečním materiálem v postupu A s reakční sloučeninou obecného vzorce 10 připravené v kroku B-3 s redukčním činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alkoholy, jako je methanol, ethanol, n-propanol, isopropanol, n-butanol, isObutanol, isoamylalkohol, diethylglykol, terc-butanol, diethylglykol, glycerin, oktanol, cyklohexanol a methylcelosolv a kyselina octová. Výhodné jsou alkoholy (zvláště ethanol).
• ··· · ····· · • · · · ·· · ·
Použitelné redukční činidlo může zahrnovat borovodík alkalického kovu, jako je borovodík sodný a borovodík lítný, sloučeniny hydridu litného jako je hydrid litno-hlinitý a triethoxid litný-hydrid hlinitý a boran. Výhodný je hydrid sodnoboritý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a redukčním činidle, ale je obvykle 0°C až 50°C. Upřednostňuje se teplota od 10°C do 40°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3a získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Postup C
Krok C-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 11 reakcí sloučeniny obecného vzorce 7 připravené v postupu s oxidačním činidlem v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethyle57 • 9 · « · · · · • ··· · ····· · ·· ·· ·· ·· , ther, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, ísoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid.
Zde použitelná oxidační činidla zahrnují Swernovo činidlo pro oxidaci, Dess-Martinovo činidlo pro oxidaci, komplex oxidu chromového, jako je komplex pyridinhydrochlorid/oxid chromový (pyridinium chlorchromát a pyrídiníum dichromát). Výhodné je Swernovo činidlo pro oxidaci (jmenovitě dimethylsulfoxidoxalylchlorid).
Reakční teplota kolísí v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a oxidačním činidle, ale je obvykle od -100°C do -50°C. Výhodná je teplota -100°C až -70°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 11 získala například rozložením oxidačního činidla, zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok C-2
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 12 reakcí sloučeniny obecného vzorce 11 připravené v kroku C-l s činidle zvyšujícím počet uhlíků v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může ·· ·· ·· ·· ♦ · ♦♦·♦ « « · • ··· · * · · · · · • · · · · · · · ··· ·· ·· »· ·· · „ zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichloroethan, chlorobenzen a dichlorobenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid) .
Zde použitelná oxidační činidla zahrnují Wittingovo činidlo, Horner-Emmonsovo činidlo, Petersonovo reakční činidlo, reakční činidlo systému TiCl4-CH2Cl2-Zn a Tebbeho činidlo. Výhodné je Wittingovo činidlo, Horner-Emmosovo činidlo a Tebbeho činidlo.
Reakční teplota kolísí v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a oxidačním činidle, ale je obvykle od -20°C do 20°C. Výhodná je teplota 0°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 30 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je jedna až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 12 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok C-3 ♦ · • · • · · ·· · ·· • · * · · ·· · · · · φ
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 3a selektivně zavádějící hydroxylovou skupinu na koncový uhlík olefinu sloučeniny obecného vzorce 12 připravené v kroku C-2 v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou ethery (zvláště tetrahydrofuran).
Zde použitelná oxidační činidla zahrnují boranovodík, disiamylboran, thexylboran, 9-BBN (9-borabicyklo[3,3, l]nonan) . Výhodný je 9-BBN.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a oxidačním činidle, ale je obvykle od 0°C do 50°C. Výhodná je teplota 10°C až 40°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidle a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 6 hodin do 48 hodin. Výhodná doba reakce je 12 až 24 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3a získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
• · · · · 9 · · • · · · · ····« 9
9 9 9 9 9 9
999 99 99 99 99 9
Postup D Krok D-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 13 reakcí sloučeniny obecného vzorce 11 připravené v kroku C-l s činidlem zvyšujícím počet uhlíků v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid) .
Zde použitelná činidla ke zvyšování počtu uhlíků zahrnují Wittingovo činidlo, Horner-Emmonsovo činidlo.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a činidle, ale je obvykle od -20°C do 40°C. Výhodná je teplota 0°C až 20°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 30 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je jedna až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 13 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
• · *· · · ·· • · · ♦ · · · • · · · · ♦ · · • · · · · ··· · · φ * ····«·♦« ·· · · · ·· ·« · φ φ
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok D-2
V tomto kroku se připravila sloučenina obecného vzorce 14 reakcí sloučeniny obecného vzorce 13 připravené v kroku D-l s redukčním činidlem v inertním rozpouštědle.
Tento krok se provedl podle odstavce (2) v kroku A-5.
V případě, kde symbol R10 je substituován benzylovou skupinou a symboly R11 a R12 jsou atomy vodíku, se sloučenina 3b může přímo připravit v tomto kroku.
Krok D-3
V tomto kroku se připravila sloučenina obecného vzorce 3b, který je jeden z počátečních materiálů postupu A reakcí sloučeniny obecného vzorce 14 připravené v kroku D-2 s redukčním činidlem.
(a) Případ, kde symbol R11 a R12 dohromady tvoří atom kyslíku. Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alkoholy, jako je methanol, ethanol, n-propanol, isopropanol, n-propanol, isopropanol, n-butanol, isobutanol, isoamylalkohol, terc-butanol, diethylenglykol, glycerin, oktanol, cyklohexanol a methylcelosolv a kyselina octová. Výhodné jsou alkoholy (zvláště ethanol).
Použitelné redukční činidlo může zahrnovat borovodík alkalického kovu, jako je borovodík sodný a borovodík litný, sloučeniny hydridu litného jako je hydrid litno-hlinitý a triethoxid litný-hydrid hlinitý a boran. Výhodný je hydrid sodnoboritý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a redukčním činidle, ale je obvykle 0°C až 50 °C. Upřednostňuje se teplota od 10°C do 40°C.
• 9 • 99
99 99 • 9 9 9 9 9 • · 9 · «9 • 9 999 99 9 • 9 9 9 9 ·· 99 99
Reakčni doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakčni teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3b získala například zakoncentrováním reakčni směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
(b) Případ, kde symboly R11 a R12 jsou vodíkové atomy a symbol
R10 je skupina jiná než benzylová skupina.
V případě, kdy symbol R10 je silylová skupina, se tento krok provede podle metody popsané v odstavci (3) krok A-5.
V případě, že symbol R10 je aralkylová skupina, jako je benzylová skupina, alkoxyalkylová skupina, jako je methoxymethylová skupina, arylkarbonyloxymethylová skupina, jako je benzoyloxymethylová skupina nebo aralkyloxymethylenová skupina, jako je benzyloxymethylová skupina a alkoxyalkoxyalkylová skupina, jako je methoxyethoxymethylová skupina, se použije kyselý katalyzátor a ten může zahrnovat v tomto případě organickou kyselina, jako je p-toluensulfonovou kyselinu, trifluoroctovou kyselinu a dichloroctovou kyselinu a Lewisovou kyselinu, jako je BF3 a A1C13.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, nitrily, jako je acetonitril a isobutyrinitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidon,
99 99
9 9 9 9 9
9 9 9 9
999 99 9
9 9 9 9
99 99 9
N-methylpyrrolidinon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a sulfid uhličitý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale je obvykle 0°C až 50 °C. Upřednostňuje se teplota od 10°C do 40°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3b získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Oligonukleotidy obsahující upravený nukleosid nebo jeho thioátový derivát se mohou připravit podle postupu E, jak se popisuje dále v textu za použití sloučeniny obecného vzorce 1 podle vynálezu.
• 99 ·· 9 · 9 9 · *·9 9 9 · • 9 9 9 9 9 • 9 9 9 9 9
999 99 99 99
Postup E
E-3
->- oligonucleotid
V postupu E symbol A a B mají stejný význam jak se definuje shora v textu, symbol R13 reprezentuje hydroxylovou ochrannou skupinu (zvláště tritylovou skupinu, která se může substituovat methoxyskupinou),symbol R14 reprezentuje fosfonylovou skupinu a skupinu tvořenou reakcí monosubstituovaných chlor(alkoxy)fosfinů nebo dvakrát substituovaných alkoxyfosfinů popsaných dále v textu.
Postup E
Krok E-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 15 reakcí sloučeniny obecného vzorce 1 připravené postupem A s ochranným činidlem v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diisopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, * »4 ·* 44 4» • 4 » · · · · · « · » • 4 · · ♦ · f · 4 «4 4 · 4 ««···· ·
4 ♦ · · 4 · 4 •«4 4« ·« »» fc ketony, jako je aceton, methyl-ethylketon, methylisobutylketon, isoforon a cyklohexanon, nitrátované sloučeniny, jako je nitroethan a nitrobenze, nitrily, jako je acetonitril a isobutyronitril, amidy, jako je formamid, dimethylformamid (DMF), dimethylacet-amid a triamid kyseliny hexamethylfosforečné, sulfoxid, jako je dimethylsulfoxid a sulfolan, alifatické terciální aminy, jako je trimethylamin, triethylamin a N-methylmorfolin a aromatické aminy, jako je pyridin a pikolin. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid) a aromatické aminy (zvláště pyridin).
Použitelné chránící činidlo není nijak omezeno pokud se může selektivně chránit pouze 5-poloha a může se odstranit za kyselých nebo neutrálních podmínek. Může s výhodou zahrnovat triarylmethylhalidy, jako je tritylchlorid, monomethoxytritylchlorid a dimethoxytritylchlorid.
V případě triarylmethylhalidů se používá ochranné činidlo, obvykle používané alkalické činidlo.
V takovém případě zde použitelné alkalické činidlo může zahrnovat heterocyklické aminy, jako je pyridin, dimethylaminopyridin a pyrrolidinpyridin a alifatické terciální aminy, jako je trimethylamin a triethylamin. Výhodný je pyridin, dimethylaminopyridin a pyrrolidinpyridin.
V případě, že se jako rozpouštědlo použije kapalné alkalické činidlo, protože samotné alkalické činidlo funguje jako kyselé zachycovací činidlo, není potřeba přidat jiné alkalické činidlo.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a činidle, ale je obvykle od 0°C do 150°C. Výhodná je teplota 20°C až 100°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidle a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 1 do 100 hodin. Výhodná doba reakce je 2 až 5 hodin.
• · · · · · · t 9 · « * · 9··«· 9 9*9« 9 · · ·*« ·· 9* ·· *9 9
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 15 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením za použití nevodného síranu hořečnatého a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok E-2
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 16 reakcí sloučeniny obecného vzorce 15 připravené v kroku E-l s chlor(alkoxy)fosfiny s jednou substitucí nebo alkoxyfosfiny s dvěmi substitucemi, které se obvykle používají při amidaci v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo není omezeno pokud neovlivňuje reakcí a může přednostně zahrnovat ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan a halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen.
Chlor(alkoxy)fosfiny s jednou substitucí mohou zahrnovat fosfinové deriváty, jako je chlor(morfolin)methoxyfosfin, chlor(morfolin)kyanoethoxyfosfin, chlor(dimethylamino)methoxyfosfin, chlor(diisopropylamino)methoxyfosfin a chlor(diisopropylamino)kyanoethoxyfosfin. Výhodný je chlor(morfolin)methoxyfosfin, chlor(morfolin)kyanoethoxyfosfin, chlor(diisopropylamino) kyanoethoxyfosfin.
V případě chlor(alkoxy)fosfinů s jednou substitucí se používá kyselé zachytávací činidlo a toto činidlo může zahrnovat heterocyklické aminy, jako je pyridin a dimethylaminopyridin a alifatické aminy, jako je trimethylamin, triethylamin a diisopropylamin. Výhodné jsou alifatické aminy (zvláště diisopropylamin).
·· • » • t *φ ·φ • · » · · · • · · · · ·
Φ » Φ · Φ ··· · · · • · · φ · · · ·· ·· «· 4«
Zde použitelné alkoxyfosfiny se dvěmi substitucemi mohou zahrnovat deriváty fosfinů, jako je bis(diisopropylamino)kyanoethoxyfosfin, bis(diethylamino)methansulfonylethoxyfosfin, bis(diisopropylamino)2,2,2-trichlorethoxy)fosfin a bis(diisopropylamino)(4-chlorfenylmethoxy)fosfin. Výhodný je bis (diisopropylamino)kyanoethoxyfosfín.
V případě kde se používají alkoxyfosfiny s dvojitou substitucí se použije kyselina. V takovém případě používaná kyselina může s výhodou zahrnovat tetrazol, kyselinu octovou nebo kyselinu p-toluensulfonovou.
Reakční teplota není nijak omezena, ale obvykle je v rozmezí 0°C až 80 °C. Výhodná je teplota místnosti.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 5 minut až 30 hodin. Výhodná doba reakce je od 30 minut do 10 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 16 získala například neutralizací reakční směsi, odstraněním nerozpustných částic filtrací, jestliže existují, přidáním organického rozpouštědla němísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
V jiném případě se v tomto kroku připraví sloučenina obecného vzorce 16 reakcí sloučeniny obecného vzorce 15 připravené v kroku E-l s tris-(1,2,4-triazolyl)fosfitem v inertním rozpouštědle (s výhodou jde o halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid). Následuje adice vody za účelem dosažení Hfosfonace.
Reakční teplota není nijak omezena, ale obvykle je v rozmezí -20°C až 100 °C. Výhodná je teplota 10°C až 40°C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle 5 minut až 30 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut v případě, že reakce se provedla při teplotě místnosti.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 16 získala například neutralizací reakční směsi, odstraněním nerozpustných částic filtrací, jestliže existují, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok E-3
V tomto kroku se připravuje oligonukleotidový analog pomocí DNA syntetizéru za použití alespoň jedné sloučeniny obecného vzorce 16 připravené v kroku E-2 a obecně dostupného fosforamiditového činidla nutného při produkci oligonukleotidového analogu požadované nukleotidové sekvence v souladu s běžnými metodami.
Oligonukleotidový analog vykazující požadovanou nukleotidovou sekvenci se může syntetizovat DNA syntetizérem, jako je Perkin-Elmer model 392 za použití fosforamiditové metody v souladu s metodou popsanou v publikaci (Nucleic Acids Research, 12, 4539 (1984)).
Navíc v případě převedení thioátu derivát thioátu se může získat v souladu s metodou popsanou v publikaci Tetrahedron Letters, 32, 3005 (1991, J. Am. Chem. Soc. , 112, 1253 (1990) za použití činidla, které tvoří thioát reakcí s trivalentní kyselinou fosforečnou, jako je tetraethylthiuramdisulfid (TETD, Applied Biosystems lne.) nebo Beaucageovo činidlo (Millipore Corp.).
Výsledný surový oligonukleotidový analog se může čistit chromatograficky na koloně s reverzní fází OligoPak a čistota produktu se může potvrdit analýzou HPLC.
Délka řetězce výsledného oligonukleotidového analogu je v normálním případě 2 až 50 jednotek a s výhodou 10 až 30 jednotek v jednotkách nukleosidů.
Schopnost tvořit komplementární řetězec a odolnost vůči nukleázám výsledného oligonukleotidového analogu se může stanovit způsoby popsanými shora v textu.
Testovací metoda 1
Schopnost tvořit hybrid oligonukleotidového analogu podle vynálezu s ohledem na komplementární DNA a RNA se může stanovit teplotní hybridizací různých výsledných oligonukleotidových analogů s oligonukleotidovým analogem, který zahrnuje přirozeně se vyskytující DNA nebo RNA, která má komplementární sekvenci a měřitelnou teplotu denaturace (hodnota Tm).
Vzorek roztoku obsahující stejné množství oligonukleotidového analogu a přirozeně se vyskytujícího komplementárního oligonukleotidu v pufru fosforečnanu sodného se vložil do lázně s vroucí vodou a pak se pomalu ochlazoval při teplotě místnosti (teplotní hybridizace) . Teplota roztoku v cele spektrofotometru (například Shimadzu UV-2100PC) pak postupně trochu vzrostla z 20°C na 90 °C. Pak následuje měření absorbce ultrafialového světla při vlnové délce 260 nm.
Testovací metoda 2: Meření rezistence na nukleázy
K oligonukleotidu v pufru se přidala nukleáza a směs se zahřála. Příklady použitých nukleáz zahrnují fosfodiesterázu hadího jedu, endonukleázu Pl a Sl. Ačkoli neexistuje žádné zvláštní omezení v použitém pufru, doporučuje se pufr vhodný pro enzymy, v případě fosfodiesterázy hadího jedu se použil Tris-HCl, zatímco v případě endonukleázy Pl se použil pufr acetát sodný. Navíc je-li to nezbytné k roztoku pufru se přiΊΟ daly ionty kovů. Příklady iontů kovů zahrnujív případě fosfodiesterázu hadího jedu ionty horečnaté a v případě endonukleázy ionty zinečnaté. Reakční teplota je s výhodou 0 až 100°C. Výhodná je teplota v rozmezí 30°C až 50°C.
Po předem stanovené době se přidá kyselina ethylendiamintetraoctová (EDTA) a pak se směs zahřívá na teplotu 100 °C po dobu 2 minuty za účelem ukončit reakci.
Příklady metod používané k testování množství zbývajícího oligonukleotidu zahrnují metodu, při které se oligonukleotid značí radioizotopem, přičemž pak následuje testování štěpící reakce produktu analyzátorem obrazu, což je metoda, při které se produkt štěpící reakce testuje HPLC s reverzní fází a způsobem, při kterém se produkt štěpící reakce testuje barvivém (jako je ethidiumbromid) a obraz se zpracovávý na počítači.
Formy dávek oligonukleotidového analogu mající jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2 podle vynálezu mohou být tablety, kapsule, granule, prášek nebo syrup, které se používají pro orální aplikaci, nebo to mohou být injekce nebo čípky pro parenterální aplikaci. Tyto dávkové formy se připravují dobře známými metodami za použití přídavných činidel, jako jsou ekcipienti) například organické ekcipienti, jako jsou cukerné deriváty, například laktóza, sacharóza, glukóza, manitol a sorbitol, deriváty škrobu, jako je například kukuřičný škrob, bramborový škrob, α-škrob a dextrin, deriváty celulózy, jako je například krystalická celulóza, arabská guma, dextran a pululan a anorganické ekcipienti, jako jsou silikátové deriváty, například anhydrid křemičitý, syntetizovaný křemičitan hlinitý, křemičitan vápenatý a metakřemičitan hořečnatohlinitý, fosforečnany, jako je například hydrogenfosforečnan vápenatý, uhličitany, jako je například uhličitan vápenatý a sírany, jako je například síran vápenatý, lubrikační prostředek (například kyselina stearová, kovové sole kyseliny stearové, jako je stearát vápenatý a stearát hořečnatý, talek, koloidní silika, vosky, jako je včelí vosk a spermacet, kyselina bori71 tá, kyselina adipová, sulfáty, jako je například síran sodný, glykol, kyselina mravenčí, benzoát sodný, DL-leucin, sodná sůl mastné kyseliny, laurylsulfáty, jako je laurylsulfát sodný a laurylsulfát hořečnatý, kyselina orthokřemičitá, jako je anhydrid křemičitý a kyselý hydrát křemičitý a shora uvedené deriváty škrobu), pojidlo (například hydroxypropylcelulóza, hydroxypropylmethylcelulóza, polyvinylpyrrolidon, Macrogol a sloučeniny podobné shora uvedeným ekcipientům), disintegrační činidla (například deriváty celulózy, jako je málo substituovaná hydroxypropylcelulóza, karboxymethylcelulóza, karboxymethylacelulóza vápníku a karboxymethylacelulóza sodíku s vnitřními můstky a chemicky upravené škrob-celulózy, jako je karboxymethylový škrob, karboxymethylový škrob sodíku a polyvinylpyrrolidon s můstky), stabilizátory (paraoxybenzoáty, jako je methylparaben a propylparaben, alkoholy, jako je chlorbutanol, benzylalkohol a fenylethylalkohol, benzalkoniumchlorid, deriváty fenolu, jako je fenol a kresol, thimerosal, kyselina dehydrooctová a kyselina sorbová) , látky korigující smyslově nepříjemné vlastnosti léku (například sladidla, kyselící činidla), ředidla atd.
Zatímco dávka bude kolísat v závislosti na stavu onemocnění, věku pacienta, metodách aplikace atd., například v případě orální aplikace je nutné aplikovat aktivní látku v množství v rozmezí 0,01 kg/kg tělesné hmotnosti (upřednostňuje se 0,1 mg/kg tělesné hmotnosti) až 1 000 mg/kg tělesné hmotnosti (s výhodou jde o dávku 100 mg/kg tělesné hmotnosti) a v případě intravenózní aplikace je nutné aplikovat aktivní složku v množství od 0,001 mg/kg tělesné hmotnosti (s výhodou 0,01 mg/kg tělesné hmotnosti) až 100 mg/kg tělesné hmotnosti (výhodná je dávka 10 mg/kg tělesné hmotnosti) ve formě jediné dávky za den nebo se dávka rozdělí do několika dávek za den.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1: 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin (příklad sloučeniny číslo 2-34)
Vodný roztok 2N hydroxidu sodného (68 ml) se přidal k roztoku sloučeniny získané v příkladu 11 (6,80 g, 8,86 mmol) v pyridinu (136 ml) při teplotě 0°C a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs se neutralizovala přidáváním po kapkách 20% vodného roztoku kyseliny octové a extrahovala se chloroformem. Vrstva chloroformu se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol = 100:3), aby se získala sloučenina uvedená v názvu (3,3 g, 6,02 mmol, výtěžek je 68 %).
fo-NMRMOO MHz, CDC13) : 8,64(2H, brs), 7,89(2H, d, 7,6 Hz),
7, 64-7,60 (1H, m) , 7,54-7,51(2H, m) , 7,48-7,37(3H, m) , 7,367,26(8H, m) , 6,18(1H, s), 4,7O(1H, d, 11Hz), 4,6O(1H, d,
11Hz), 4,46(1H, d, 2,9Hz), 4,42(1H, d, 11Hz), 4,10-4,02(2H,
m) , 3,89(1H, d, 2,9 Hz), 3,75(1H, d, 11Hz) , 3,62(1H, d, 11Hz) , 2,34-2,26(1H, m), 1,39-1,36 (1H, m) .
FAB-MAS(mNBA): 554(M+H)+
Příklad 2: 2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benoylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-225)
Roztok (31,7 ml) 1,0 M trichlorboranu v dichlormethanu se přidal po kapkách do roztoku sloučeniny získané v příkladu 1 (2,06 gm 3,72 mmol) v nevodném methylenchloridu (317 ml) při teplotě -78°C a směs se míchala při teplotě -78°C po dobu jedné hodiny. Reakční směs se pomalu zahřívala na teplotu -20°C a reakční nádoba se umístila do ledové lázně s chloridem sodným a směs se míchala při teplotě mezi -20°C a -10°C po dobu 2 hodin. Do směsi se pomalu přidával methanol (12 ml) a směs se míchala po dobu 10 minut. Hodnota pH reakční směsi se upravila na hodnotu 7 až 8 tak, že se po kapkách přidával saturovaný • · · · ····»· · · • · · · · · · · • · · · · ·· · · ··· vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného. Směs se zahřála na teplotu místnosti a koncentrovala se vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol=100:5), aby se získala sloučenina uvedená v názvu (1,21 g, 3,24 mmol, výtěžek je 87 %) ve formě bílé pevné látky.
xH-NMR(500 MHz, DMSO-d6) : 11,23(1H, brs), 8,7O(1H, d, 7,2 Hz), 8,00(2H, d, 7,5 Hz), 7,3-6(4H, m), 5,97(1H, s), 5,35(1H, dd, 5 a 10 Hz), 4,1O(1H, dd, 5 a 10 Hz), 4,O3(1H, d, 3,2 Hz), 3,953,85(2H, m) , 3,83(1H, d, 3,2Hz), 3,65-3,51(2H, m), 2,061,98(1H, m), 1,26(1).
FAB-MAS(mNBA): 374(M+H)+
Příklad 3
2'-O,4 '-C-ethylencytidin (příklad sloučeniny č. 2-3)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 2 (0,1 g, 0,268 mmol) v methanolu saturovaném v amoniaku (12 ml) se nechal stát přes noc. Směs se zakoncentrovala do sucha, přičemž vzniká sloučenina uvedená v názvu (0,054 g, výtěžek je 75 %) ve formě bílé pevné látky.
^-NMRUOO MHz, DMSO-d6) : 8,18(1H, d, 7,4 Hz), 7,10(2H, br) ,
5,84(1H, s), 5,69(1H, d, 7,6 Hz), 5,27-5,24(2H, m) , 3,86(1H, d, 3,2 Hz), 3,90-3, 78 (2H, m) , 3,76(1H, d, 3,2 Hz), 3,56(1H, dd, 5,5 a 12 Hz), 3,49(1H, dd, 5,5 a 12 Hz), 2,01-1,93(1H, dt,
7,5 a 12 Hz), 1,22(1H, dd, 3,6 a 13 Hz).
FAB-MAS(mNBA): 270(M+H)+
Příklad 4: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcitidin (příklad sloučeniny č. 2-39)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 2 (1,29 g, 3,46 mmol) v nevodném pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem od74 stranit vodu. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (26 ml) v atmosféře dusíku a do roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (1,76 g, 5,18 mmol). Směs se míchala při teplotě mlsnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a z reakční směsi se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethanol:methanol = 100:5), přičemž se získala sloučenina uvedená v názvu (2,10 g, 3,11 mmol, výtěžek je 90 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
1H-NMR(270 MHz, DMSO-dg) : 11,27(lH,brs), 8,59(1H, m), 6,928,01(19H, m) , 6,O3(1H, s) , 5,56(1H, m) , 4,17(1H, m) , 4,O8(1H,
m) , 3,86(2H, m), 3,77(6H, s), 3,24(2H,m), 1,98(1H, m) .
FAB-MAS(mNBA): 676 (M+H)+
Příklad 5: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4x-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-235)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 4 (6,53 g, 9,66 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxovalo za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v nevodném dichlormethanu (142 ml). Do roztoku se přidal N, N-diisopropylamin (2,80 ml, 16,1 mmol) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N,N-diisopropylchlorfosforamidit (2,16 ml, 9,66 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 6 hodin. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:triethylamin = 50:1 - dichlormethan:ethylacetát:triethylamin = 60: 30:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (7,10 g , 8,11 mmol, výtěžek je 84 %), ve formě bílé látky.
xH-NMR(270 MHz, CDCl3) : 1,1-1,2(12H, m) , 1,35(1H, m) , 2,11(1H,
m) , 2,3(2H, m) , 3,35-3,7(6H, m) , 3,8(6H, m) , 3,9-4,l(2H, m) ,
4,33(1H, m) , 6,23(1H, m) , 6,23(1H, s) , 6,9(4H, s) , 7,37,9(15H, m), 8,7-8,8(lH, m).
Příklad 6: 3', 5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin (příklad sloučeniny č. 2-22)
Do sloučeniny získané v příkladu 10 (418 mg, 0,62 mmol) ve směsi pyridin:methanol:voda = 65:30:5 (5 ml) při teplotě 0°C se přidal 2N roztok hydroxidu sodného a roztok směsi (5 ml), která obsahuje pyridin:methanol:voda = 65:30:5 a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 15 minut. Reakčni směs se neutralizovala 1N kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem (přibližně 30 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 30 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 30 ml) , sušila se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čitil chromatografřeky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs hexan : ethylacetát = 1:1), aby se získala bezbarvá amorfní pevná látka (228 mg, 0,49 mmol, výtěžek je 79 %).
xH-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,35(1H, d, 13 Hz), 1,41(3H, s),
2,28(1H, dt, 9,4 a 13 Hz), 3,6O(1H, d, 11Hz) , 3,76(1H, d, 11Hz), 3,94(1H, d, 3,0 Hz), 4,1O(1H, d, 7,0 Hz), 4,14(1H, d, 7,0 Hz), 4,31(1H, d, 3,0 Hz), 4,51(1H, d, 12 Hz), 4,54(1H, d, 12 Hz), 4,58(1H, d, 12 Hz), 4,75(1H, d, 12 Hz), 6,O6(1H, s), 7,3(10H, m), 7,91(lH,s), 8,42(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA): 465 (M+H)+ • · ·»· »····· * · ··· ·» ·· ·· ·· ···
Příklad 7: 2'-Ο,4'-C-ethylen-5-methyluridin (příklad sloučeniny č. 2-2)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 6 (195 mg, 0,42 mmol) v methanolu (10 ml) se míchal v atmosféře vodíku za atmosferického tlaku v přítomnosti hydrogenačního katalyzátoru po dobu 5 hodin. Reakční směs se filtrovala za účelem odstranit katalyzátor a filtrát se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan/methanol = 10:1) za účelem získat bezbarví prášek (v množství 76 mg, 0,268 mmol a výtěžek je 64 %).
A-NMR^OO MHz, CD3OD) : 1,33(1H, dd, 3,8 a 13 Hz), 1,86(3H, D,
0,9 Hz), 1,94(1H, ddd, 7,5, 11,7 a 13 Hz), 3,86(1H, d, 12 Hz), 3,75(1H, d, 12 Hz), 3,9-4,0(2H, m), 4,O5(1H, d, 3,2 Hz),
4,O9(1H, d, 3,2 Hz), 6,00(lH, s), 8,28(1H, d, 1,1 Hz).
FAB-MAS(mNBA): 285 (M+H)+
Příklad 8: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin (příklad sloučeniny č. 2-27)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 7 (1,45 g, 5,10 mmol) v nevodném pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranění vody. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (44 ml) za atmosféry dusíku a 4,4'-dimethoxytritylchloridu (2,59 g, 7,65 mmol) a přidal se k roztoku. Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografíčky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol = 100 : 10) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu »» · * · · · · • * · · » ····· · « » · · · · ·· (2,42 g, 4,13 mmol, výtěžek je 81 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
M-NMR^O MHz, DMSO-dg) : ll,36(lH,s), 7,68(1H, s) , 6,907,44(13H, m) , 5,89(1H, s), 5,55(1H, d), 4,O9(1H, m) , 4,O4(1H, d) , 4,O4(1H, d) , 3,82(2H, m) , 3,74(6H,s), 3,19(2H, m) ,
1,99(1H, m), 1,36(1H, m) , 1,17(3H, s).
FAB-MAS(mNBA): 578 (M+H)+
Příklad 9: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-234)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 8 (4,72 g, 8,05 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v atmosféře dusíku v nevodném dichlormethanu (142 ml). K roztoku se přidal N,N-diisopropylamin (2,80 ml, 16,1 mmol) a pak 2-kyanoethyl-N,N-diisopropylchorfosforamidit (2,16 ml, 9,66 mmol) přidal po kapkách do ledové lázně. Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 6 hodin. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitannu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chormatograficky na koloně se silikagelem (jako eluát se použila směs hexan:ethylacetát:triethylamin = 50:50:1 - hexan : ethylacetát : triethylamin = 30:60:1) za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (5,64 g, 7,17 mmol, výtěžek je 89 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,1-1,2(15H, m) , 1,4(1H, m) , 2,08(lH,
m) , 2,4(2H, m) , 3,2-4,0(14H, m) , 4,38(2H, m) , 4,47(1H, m) ,
6,O6(1H, s), 6,8-6,9(4H, m), 7,2-7,5(9H, m), 7,91(1H, m).
FAB-MAS(mNBA): 787 (M+H)+
Příklad 10: 3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (příklad sloučeniny č. 1-23)
K sloučenině získané v příkladu 12 (238 mg, 0,30 mmol) ve směsi pyridin:methanol:voda = 65:30.5 (5 ml) při teplotě 0°C se přidal vodný 2N roztok hydroxidu sodného a roztok směsi (5 ml) obsahující pyridin:methanol:voda = 65:30:5. Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 15 minut. Reakční směs se neutralizovala 1N kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem (přibližně 30 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem uhličitanu sodného (přibližně 30 ml) a saturovaným vodným roztok chloridu sodného (přibližně 30 ml), sušila se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky a na koloně se silikagelem (jako eluát se použila směs dichlormethan:methanol = 50:1) za účelem získat bezbarvou amorfní pevnou látku (133 mg, 0,23 mmol, výtěžek je 78 %) .
to-NMRÍÍOO MHz, CDC13) : 1,44(1H, d, 13 Hz), 2,31(1H, dd, 13 a 19 Hz), 3,56(1H, d, 11Hz), 3,70(lH, d, 11Hz), 4,10(2H,m), 4,24(lH,s), 4,45(1H, d, 12 Hz), 4,53-4,67(4H, m), 6,52(1H, s), 7,3(10H, m) , 7,53(2H, m) , 7,62(1H, m) , 8,03(2H, d, 7,6 Hz), 8,66 (1H, s), 8,78(1H, s), 9,OO(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA): 578 (M+H)+
Příklad 11: 2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (příklad sloučeniny č. 1-178)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 10 (116 mg, 0,20 mmol) v bezvodém methylenchloridu (5 ml) při teplotě -78 °C se přidal pomalu po kapkách 1M roztok chloridu boritého (1,5 ml, 1,5 mmol) v dichlormethanu a směs se míchala při teplotě -78°C po dobu 3 hodiny. K reakční směsi se přidal 1M roztok chloridu boritého (1,5 ml, 1,5 mmol) v dichlormethanu a směs se míchala po dobu 2 hodin. Směs se pomalu zahřívala na teplotu místnosti a rychle se ochladila na teplotu -78°C a pak se přidal do směsi methanol (5 ml). Reakční směs se pomalu zahřívala na teplotu místnosti a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil
♦ · ·· · · ·· chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:methanol = 9:1). Vzniká bílý prášek (49 mg, 0,17 mmol, výtěžek je 84 %).
1H-NMR(400 MHz, CD3OD): 1,45(1H, dd, 4,3 a 13 Hz), 2,12(1H, m), 3,72(1H, d, 12Hz), 3,79(1H, d, 12Hz) , 4,O4(1H, dd, 7,3 a 12
Hz), 4,15(1H, dt, 4,3 a9,4 Hz), 4,36(1H, d, 3,2Hz), 4,43(1H, d, 3,2 Hz), 6,57(1H, s), 7,57(2H, m), 7,66(1H, m), 8,09(2H, d, 8,0 Hz), 8,72(1H, s), 8,85(1H, s).
FAB-MAS(mNBA): 398 (M+H)+
Příklad 12: 2'-0,4'-ethylenadenosin (příklad sloučeniny č. 1-7)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 11 (14 mg, 0,035 mmol) v methanolu saturovaném amoniakem (1 ml) se nechal stát přes noc. Směs se zakoncentrovala a zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol) za vzniku bílého prášku (10 mg, 0,034 mmol, výtěžek je 98 %) .
1H-NMR(400 MHz, CD3OD) : 1,32(1H, dd, 4 a 13 Hz), 2,04(lH, dt, 7,4 a 12 Hz), 3,53(1H, dd, 5 a 12 Hz), 3,61(1H, dd, 5,2 a 12 Hz), 3,90(lH, dd, 7,4 a 12 Hz), 3,97(1H, dt, 4 a 12 Hz), 4,15(1H, d, 3,1 Hz), 5,27(1H, t, 5,2 Hz), 5,39(1H, d, 3,1 Hz), 6,33(1H, s), 7,29(2H, s) , 7,66(1H, m) , 8,14(1H, s) , 8,42(1H,
s) .
FAB-MAS(mNBA): 294 (M+H)+
UV(Xmax):260(pH7), 260(pHl), 258(pHl3)
Příklad 13: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin (příklad sloučeniny číslo 1-31)
Roztok sloučeniny získaný v příkladu 11 (14 mg, 0,035 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v nevodném pyridinu (1
| • ♦ | • « • | ♦ | • a ♦· | • · • « | • · • | • |
| • · | * | ♦ | • · | • | • | |
| • · | ♦ | * · | * | « · · | ♦ · | • |
| * · | a · | • · | < » |
ml) za atmosféry dusíku a k roztoku se přidal 4,4'dimethoxytritylchlorid (2,59 g, 7,65 mmol). Směs se míchala při teplotě 40°C po dobu 5 hodin. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentroval se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol = 100 : 5) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (18 mg, 0,026 mmol, výtěžek je 73 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : l,63(lH,m), 2,14(1H, 7,5, 12 a 13 Hz),
3,37(1H, d, 11Hz), 3,41(1H, d, 11 Hz), 3,79(6H, s),
4,10(2H,m), 4,48(1H, d, 3,3 Hz), 4,59(1H, d, 3,3 Hz), 6,54(1H, s), 6,58(4H, m) , 7,2-7,6(12H, m) , 8,02(2H, m) , 8,45(1H, s),
8,82(1H, s) , 9,02(1H, brs) .
FAB-MAS(mNBA): 700 (M+H)+
Příklad 14: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 1-186)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 13 (16 mg, 0,023 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxovalo za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v bezvodém dichlormethanu (0,5 ml). K roztoku se přidal tetrazol-N, N-diisopropylaminová sůl (10 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N, N, Ν', N'-tetraisopropylchlorfosforamidit (přibližně 20 μΐ) . Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve va81 • « ·· ** ·· · * * · ♦ ♦ 9 ·· * · · · » I * * · «·« 9 · · <
·····♦···
999 99 99 ·· 99 + 9 9 kuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:ethylacetát =
2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (20 mg ,
0,022 mmol, výtěžek je 97 %), ve formě bílé pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : l,0-l,2(12H, m) , 1,54(1H, m) , 2,15(1H, m), 2,33(2H, m), 3,3-3,6(6H, m), 3,8(6H, s), 4,08(2H, m),
4,65(1H, m), 4,75(1H, m), 6,53(1H, s), 6,84(4H, m), 7,27,6(12H, m) , 8,01(2H, m) , 8,53(1H, s), 8,83(1H, s) , 9,O1(1H, brs) .
FAB-MAS(mNBA):900(M+H)+
Příklad 15: 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylenuridin (příklad sloučeniny č. 2-10)
Vodný roztok IN hydroxidu sodného (2 ml) se přidal k roztoku sloučeniny získané v příkladu 13 (194 mg, 0,292 mmol) v pyridinu (3 ml) při teplotě 0°C a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 30 minut. Reakční směs se neutralizovala IN kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem (10 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného, sušil se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluát se použila směs dichlormethan:methanol = 100:3) za vzniku bezbarvého oleje (105 mg, 0,233 mmol, výtěžek je 80 %).
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,36(1H, m) , 2,29(1H, m) , 3,63(1H, d,
Hz), 3,74(1H, d, 11 Hz), 3,87(1H, d, 2,9 Hz), 4,03(2H, m), 4,29(1H, d, 2,9 Hz), 4,49(1H, d, 12 Hz), 4,5O(1H, d, 11Hz), 4,53(1H, d, 12 Hz), 5,2O(1H, dd, 2 a 8 Hz), 6,O4(1H, s) , 7,27,4(10H, m),, 8,13(1H, d, 8,2 Hz), 8,57(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA):451(M+H)+
Příklad 16: 2'-0,4'-ethylenuridin • 9 9 9 9 4·9 · « · • · 9 · 9 9 9
999 49 99 ·· 99 9 (příklad sloučeniny č. 2-1)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 15 (100 mg, 0,222 mmol) v methanolu (4 ml) se míchal v atmosféře vodíku za atmosferického tlaku v přítomnosti hydrogenačního katalyzátoru po dobu 5 hodin. Reakční směs se filtrovala za účelem odstranění katalyzátoru a filtrát se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol = 10:1) za účelem získat bezbarvý olej (v množství 45 mg, 0, 167 mmol a výtěžek je 75 %) .
1H-NMR(400 MHz, CD3OD) : 1,35(1H, dd, 4 a 13 Hz), 2,13(1H, ddd,
7,11 a 13 Hz), 3,66(1H, d, 12 Hz), 3,73(1H, d, 12 Hz), 3,914,08(2H,m), 4,01(lH, d, 3,2 Hz), 4,12(lH, d, 3,2 Hz), 5,66(1H, d, 8,2 Hz), 6,OO(1H, s), 8,37(1H, d, 8,2 Hz).
FAB-MAS(mNBA): 271 (M+H)+
Příklad 17: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridin (příklad sloučeniny č. 2-15)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 16 (28 mg, 0,104 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (3 ml) v atmosféře dusíku a do roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (50 mg, 0,15 mmol). Směs se míchala při teplotě mísnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a z reakční směsi se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol=100:3), přičemž se získala sloučenina uvedená v názvu (25 mg, 0,044 mmol, výtěžek je 42 %) ve formě bezbarvého oleje.
· · *· >· ·· • · · « • · ♦ · · • ··· « · » * 9 9 · «
999 99 99 99 ·· ·
A-NMRHOO MHz, CD3OD) : 1,35(1H, dd, 3 a 14 Hz), 2,03(lH, ddd,
8, 11 a 14 Hz), 2,46(1H, d, 8Hz), 3,36(1H, d, 11 Hz), 3,41(1H, d, 11 Hz), 3,80(3H, s) , 3,81(3H, s), 3,97(2H, m) , 4,21(1), 4,33(1H, brm), 5,31(1H, m) , 6,1O(1H, s), 6,86(4H, m) , 7,27,5(9H, m) , 8,27(1H, d, 8,2 Hz), 8,43(1H, brs) .
FAB-MAS(mNBA): 573 (M+H)+
Příklad 18: 5'-O-dimethoxy trityl-2'-O,4'-C-ethylenuridin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-233)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 17 (6 mg, 0,0105 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu v atmosféře dusíku a do roztoku se přidal dichlormethan (0,5 ml). K roztoku se přidal tetrazol-N,N-diisopropylaminová sůl (3 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-Ν,Ν, Ν', N'-tetraisopropylchlorfosforamidit (přibližně 5 μΐ) . Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan : ethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (8mg) ve formě bílé pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,1-1,2(13H, m) , 2,O9(1H, m) , 2,4(2H,
m) , 3,3-3,6(6H, m) , 3,81(6H, s), 3,94(2H, m) , 4,47(1H, m) ,
5,18(1H, d, 8,2 Hz), 6,O8(1H, s), 6,86(4H, m), 7,2-7,4(9H, m) ,
8,31(1H, d, 8,2 Hz).
FAB-MAS(mNBA):773(M+H)+
Příklad 19: 3',5'-di-O-benyl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-46)
Φ · · • · φ • · · φφ· · φ φ * · «
Κ roztoku sloučeniny získané v příkladu 14 (310 mg, 0,396 mmol) v pyridinu (5 ml) při teplotě 0°C se přidal IN vodný roztok hydroxidu sodného (5 ml) a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 20 minut. Reakční směs se neutralizovala přidáváním po kapkách 20% kyseliny octové a extrahovala se dichlormethanem. Dichlormethanová vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se se použila směs dichlormethan : methanol = 100:2) a získala se sloučenina uvedená v názvu (190 mg, 0,334 mmol, výtěžek je 84 %).
8,29(2H, m)
FAB-MAS(mNBA):568(M+H)+
Příklad 20: 2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-226)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 19 (120 mg, 0,211 mmol) v bezvodém dichlormethanu (5 ml) při teplotě -78 °C se přidal po kapkách 1 M roztok chloridu boritého (1,6 ml) a směs se míchala při teplotě -78 °C po dobu 4 hodin. Ke směsi se po kapkách pomalu přidával methanol (1 ml) a směs se míchala po dobu 10 minut. pH reakce se upravilo na hodnotu 7 až 8 přidáváním saturovaného vodného roztoku hydrogenuhličitanu sodného. Reakční směs se zahřívala na teplotu místnosti a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použije směs dichlormetan : methanol = 100 : 6) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (29 mg,
0,075 mmol, výtěžek je 36 %) ve formě pevné látky.
• · · 9 9 999 99 9 • 9 9 9 9 9 9 ·9 99 99 99 1H-NMR(400 MHz, d-DMSO: 1,24(1H, m), 2,01(3H, m) , 2,0(lH, m) ,
3,54(1H, dd, 5,4 a 12 Hz), 3,64(1H, dd, 5,4 a 12 Hz), 3,88(3H, m) , 4,1O(1H, m) , 5,36(1H, d, 5,4 Hz), 5,49(1H, t, 5,0 Hz),
5,95(1H, s), 7,4-7,6(3H,
13,17(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA):388(M+H)+ !,21(2H, m) , 8,49(1H,
Příklad 21: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-51)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 20 (44 mg, 0,114 mmol) v nevodném pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranění vody. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (1 ml) za atmosféry dusíku a k roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (60 mg, 0,177 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol = 100 : 4) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (73 mg, 0,106 mmol, výtěžek je 93 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,46(1H, m) , 1,49(3H, s) , 2,O6(1H, m) , 2,59(lh, d, 8,6 Hz), 3,36(1H, d, 11 Hz), 3,39(1H, d, 11Hz) , 3,80(3H, s), 3,81(3H, s), 3,99(2H, m) , 4,3O(1H, d, 3,3 Hz),
4,39(1H, m) , 6,12(1H, s) , 6,85(4H, m) , 7,2 - 7,5 (12H, m) ,
8,03(1H, s), 8,28(2H, s).
FAB-MAS(mNBA): 573 (M+H) «*«
• ·
Příklad 22: 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-236)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 21 (35 mg, 0,0507 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxovalo za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v bezvodém dichlormethanu (1 ml) . K roztoku se přidala tetrazol-N,N-diisopropylaminová sůl (17 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N, N, Ν', N'-tetraisopropylchlorfosforamidit (přibližně 32 μΐ, 0,1 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:ethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (40 mg , 0,0445 mmol, výtěžek je 89 %), ve formě bílé pevné látky.
ta-NMRÍÍOO MHz, CDC13) : 1,1-1,2(12H, m) , 1,36(3H, m), 2,1O(1H, m) , 2,36(2H, m) , 3,3-3,6(6H, m) ,
3,98(2H, m) , 4,42(1H, m) , 4,49(1H, m) , 6,11(1H,
m), 7,2-7,5(12H, m), 8,14(1H, s), 8,28(2H, m). FAB-MAS(mNBA):890(M+H)+
s), 1,37(1H, 3,81(6H, m), s) , 6,88(4H,
Příklad 23: 2'-O,4'-C-ethylen-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-226)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 20 (11,6 mg, 0,030 mmol) v methanolu saturovaném amoniakem (2 ml) se nechal stát přes noc. Směs se zakoncentrovala a získalo se pevná bílá látka (8,5 mg, 0,030 mmol).
1H-NMR(400 MHz, d-DMSO): 1,2O(1H, m), 1,82(3H, s), 1,97(1H, m), 3,49(1H, dd, 5 a 12 Hz), 3,58(1H, dd, 5 a 12 Hz), 3,85(2H, m), • ·
5,23(1H, d, 5 Hz), 5,32(1H, t, 5 Hz), 5,84{lH, s), 6,7 (1H, brs), 7,2(1H, brs), 8,O8(1H, s).
FAB-MAS(mNBA):284(M+H)+
UV(lmax): 279(pH7), 289(pHl), 279(pH13)
Příklad 24: 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (příklad sloučeniny č. 1-24)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 15 (přibližně 200 mg) v pyridinu (2 ml) se přidal 1 N vodný roztok hydroxidu sodného (2 ml) a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 15 minut. Reakční směs se neutralizovala 1 N kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem. Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného, sušila se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se se použila směs dichlormethan : methanol = 50:1) a získala se bezbarvá amorfní pevná látka (20 mg, 0,36 mmol, výtěžek je 6 %, dva kroky).
fo-NMRKOO MHz, CDC13) : 1,27(3H, s) , 1,29(3H, s) , 1,43(1H, dd, a 13 Hz), 2,28(1H, m) , 2,59(1H, kvi, 6,9 Hz), 3,54(1H, d, 11 Hz), 3,68(1H, d, 11 Hz), 4,03(2H, m) , 4,15(1H, d, 3,0 Hz),
| 4,31(1H, | d, | 3,0 Hz), | 4,45(1H, d, | 12) , | 4,56(1H, d, 12 | Hz) , | |
| 4,61(1H, | d, | 12 Hz), | 4,63(1H, d, | 12 Hz) | , 6,18(1H, s), | 7,2- | |
| 7,4(10H, | m) , | 8, 19(1H, | s), 11,93(1H, | brs) . |
FAB-MAS(mNBA):560(M+H)
Příklad 25: 2'-O,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (příklad sloučeniny č. 1-177)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 24 (10 mg, 0,018 mmol) v methanolu (2 ml) se míchal v atmosféře vodíku za atmosferického tlaku v přítomnosti hydrogenačního katalyzátoru * φφ »φ ·φ ··
Φ·Φ« » φ · φ · « φ φ φ φ φ · · · « · • · Φ · · « ΦΦΦ * φ « φ φ · ·· φ φφ ··· φφ < φ φφ φφ « po dobu 5 hodin. Reakční směs se filtrovala za účelem odstranění katalyzátoru a filtrát se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan/methanol = 10:2) za účelem získání bezbarvého oleje (v množství 5 mg, 0,013 mmol a výtěžek je 72 %).
1H-NMR(400 MHz, CD3OD): 1,21(3H, s), 1,22(3H, s), 1,41(1H, dd, 4 a 13 Hz), 2,18 (1H, m) , 2,69(1H, kvi, 6,9 Hz), 3,69(1H, d,
Hz), 3,76(1H, d, 12 Hz), 4,0(2H, m) , 4,26(1H, d, 3,2 Hz),
4,3O(1H, d, 3,2 Hz), 6,30(lH, s), 8,4O(1H, s).
FAB-MAS(mNBA): 380 (M+H)+
Příklad 26: 5'-O-dimethoxytrityl-2-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin (příklad sloučeniny č. 1-35)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 25 (5 mg, 0,13 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranění vody. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (1 ml) za atmosféry dusíku a 4,4'-dimethoxytritylchloridu (14 mg, 0,04 mmol) a přidal se k roztoku. Směs se míchala při teplotě 40 °C po dobu 3 hodiny. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol = 100 : 6) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (4 mg, 0,0059 mmol, výtěžek je 45 %) ve formě bezbarvé pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,26(3H, d, 1,4 Hz), 1,28(3H, d, 1,4
Hz), 1,66(1H, m) , 2,15(1H, m) , 2,59(1H, kvi, 6,9 Hz), 3,65(1H, m) , 3,78(1H, m) , 4,06(2H, m) , 4,35(1H, m) , 4,38(1H, d, 3,2 Hz), 6,23(1H, s) , 6,8(4H, m) , 7,2-7,5(9H, m) , 8,01(lH, s) , 8,19(1H, brs).
FAB-MAS(mNBA): 682(M+H)+ • 94 99 *4 99 • 9 · 9 9 · 4 9 9 « 9 ο η ·«···«··· ο y ···♦·· ««· · · 9
994 99 3 99 • 9« 99 99 9« 99 9
Příklad 27: 5 '-0-c!imethoxytrityl-2 '-0, 4 '-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 1-185)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 26 (4 mg, 0,0058 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v bezvodém dichlormethanu (0,5 ml). K roztoku se přidala tetrazol-N,N-diisopropylaminová sůl (5 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N,N, Ν', N'-tetraisopropylchlorf osf oramidit (9 μΐ, 0,03 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:ethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (4 mg ) ve formě bílé pevné látky.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,1-1,4(19H, m) , 2,1(1H, m) , 2,4(2H,
m) , 2,6(1H, m) , 3,3-3,6(6H, m) , 3,8(6H, s) , 4,0-4,6(4H, m) ,
6,2(1H, s), 6,8(4H, m) , 7,2-7,5(9H, m) , 8,1(1H, s) .
Příklad 28: 2'-0,4'-ethylenguanosin (příklad sloučeniny č. 1-5)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 25 (0,5 mg) v methanolu saturovaném v amoniaku (0,5 ml) se nechal stát při teplotě 60 °C po dobu 5 hodin. Směs se zakoncentrovala a vytvořil se bílý prášek (0,4 mg).
FAB-MAS(mNBA): 310(M+H)+ UV(Xmax): 255(pH7), 256(pHl), 258266(pH13)
Příklad 29: Syntéza oligonukleotidového derivátu • · «··· * · • · · · · «·· * · · • · · · · · · ··» ·· ·· *« »· ·
Syntéza oligonukleotidového derivátu se provádí za použití mechanického syntetizéru nukleových kyselin (ABI model392 DNA/RNA syntetizér: produkt firmy Perkin-Elmer Corp.) v rozmezí 1,0 mikromolů. Rozpouštědla, činidla a koncentrace fosforamiditu v každém cyklu syntézy je stejná, jako při syntéze přirozených oligonukleotidů. Rozpouštědla, činidla a fosforamídity přirozeného typu nukleotidů jsou produkty firmy PE Biosystems. Každá sekvence upraveného oligonukleotidového derivátu se syntetizovala opakováním kondenzace sloučeniny získané v příkladu 9 nebo amidity obsahující čtyři druhy bází nukleové kyseliny vhodné pro syntézu nukleotidů s 5'-hydroxythymidinem produkovaným deprotekcí skupiny DMTr 5'-O-DMTr-thymidinu (1,0 mikromolů) za použití kyseliny trichlorctové, 3'-hydroxyskupiny thymidinu, která je zachycena na nosiči CGP. Cyklus syntézy je následující:
1) detritylace směsí kyselina trichlorctová/dichlormethan, 35 vteřin
2) spojování fosforamiditu (přibližně 20 ekv.), tetrazol/acetonitril, 25 vteřin nebo 10 minut
3) vyplňování mezer za použití směsi 1-methylimidazol/tetrahydrofuran, anhydrid kyseliny octové/pyridin/tetrahydrofuran, 15 vteřin
4) oxidace za použití směsi jód/voda/pyridin/tetrahydrofuran, vteřin
Když se použije ve shora uvedeném kroku 2) cyklusloučenina získaná v příkladu 9, reakční čas je 10 minut, a když se použijí fosforamidity, reakční čas je 25 vteřin.
Po syntéze požadované sekvence oligonukleotiového derivátu se odstranila skupina 5'-DTMr. Nosič obsahující požadovaný produkt se odstranil koncentrovaným vodným roztokem amoniaku za účelem odstranit oligomér z nosiče a tak se odstranila ochrana z kyanoethylové skupiny, která je chráněna fosforovou skupinou. Z oligoméru se odstranila ochranná aminoskupina v adeninu, guaninu a v cytosinu. Oligonukleotidový derivát se se Čistil HPLC s reverzní fází (HPLC: LC-PV: produkt firmy Shimazu Corp., kolona: Wakopak WS-DNA: produkt Wako Pure Chemical Industry, Ltd.) za účelem získání požadovaného oligonukleotidu.
Na základě této syntetické metody se získala následující oligonukleotidová sekvence (oligonukleotid je zde označen jako „oligonukleotid 1) (koncentrace je 0,23 μπιοί, výtěžek je 23 %)
Příkladem sekvence č. 2 uvedené v seznamu sekvencí je sekvence 5'-gcgttttttgct-3', kde cukerná část thymidinů v bázích č. 4 až 8 je 2'-O,4'-C-ethylen.
Připomínky k příkladu 1
3,5-di-O-benzyl-4-trifluormethansulfonyloxymethyl-1,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku 3,5-di-O-benzyl-4-trifluormethansulfonyloxymethyl-1,2-O-iso-propyliden-a-D-erythropentofuranosy (2 000 mg, 5,0 mmol) v bezvodém dichlormethanu (50 ml) a trifluorsulfonovém anhydridu (1 010 mg, 6,0 mmol) v atmosféře dusíku při teplotě -78°C se přidal bezvodý pyridin (0,60 ml, 7,5 mmol) a směs se míchala po dobu 40 minut. Reakční směs se částečně rozdělila mezi methylenchlorid a saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 100 ml) , sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu za vzniku bílého prášku (2 520 mg, 4,73 mmol, výtěžek je 95 %) , který se použije v další reakci, aniž dojde k dalšímu čištění.
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,34(3H, s) , 1,63(3H, s) , 3,48(1H, d, 10 Hz), 3,53(1H, d, 10 Hz), 4,21(1H, d, 5,0 Hz), 4,5(4H, m) , 4,74(1H, d, 12 Hz), 4,80(lH, d, 12 Hz), 5,01(lH, d, 12 Hz), 5,73(1H, d, 4,6 Hz), 7,3(10H, m) .
• ·· · · ·· ·· ··· · · · · · · · · ' Odkaz k příkladu 2
3.5- di-0-benzyl-4-kyanomethyl-l,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
Sloučenina získaná v příkladu 1 (2 520 mg, 4,73 mmol) se rozpustila v dimethylsulfoxidu (50 ml) při teplotě 90 °C.
K roztoku se přidal kyanid sodný (463 mg, 9,46 mmol) při teplotě místnosti a směs se míchala při teplotě 50°C po dobu 3 hodin. Reakční směs se rozdělila mezi vodu (přibližně 100 ml) a ethylacetát (přibližně 100 ml) . Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 100 ml), sušila se pomocí bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát =4:1) za vzniku bezbarvého oleje (1 590 mg, 3,89 mmol, výtěžek je 82 %). 1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,34(3H, s), 1,62(3H, s), 2,88(1H, d, 17 Hz), 3,15(1H, d, 17 Hz), 3,5O(1H, d, 10 Hz), 3,58(1H, d, 10 Hz), 4,O8(1H, d, 5,1 Hz), 4,52(1H, d, 12 Hz), 4,56(1H, d, 12Hz), 4,57(1H, m) , 4,58(1H, d, 12 Hz), 4,76(1H, d, 12 Hz),
5,73(1H, d, 3,7 Hz), 7,3(10H, m).
Odkaz k příkladu 3
3.5- di-0-benzyl-4-formylmethyl-l,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 2 (610 mg, 1,49 mmol) v dichlormethanu (10 ml) v atmosféře dusíku při teplotě -78°C se přidal po kapkách 1,5 M toluenový roztok hydridu isobutylhlinítého a směs se míchala po dobu 1 hodiny při teplotě -78°C a pak se zahřála na teplotu místnosti. K reakční směsi se přidal methanol (5 ml) a saturovaný vodný roztok chloridu amonného (přibližně 20 ml) a tato směs se míchala po dobu 30 minut. Reakční směs se extrahovala ethylacetátem (přibližně 30 ml) . Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 30 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 30 ml), sušila se • · · · · ·· ·· · • · · · · ·· · · »·· • · · ···· ·· · • · · · · ······ · · ··· ·· · ··· ··· · · ·· ·· ·· ··· pomocí bezvodého síranu horečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu za vzniku produktu, který se použil v další reakci bez dalšího čištění.
Odkaz k příkladu 4
3.5- di-0-benzyl-4-hydroxyethyl-l,2-0-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 3 (154 mg, 0,377 mmol) v ethanolu (5 ml) se přidal NaBH4 (7,6 mg, 0,2 mmol) a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs se rozdělila mezi ethylacetát (přibližně 10 ml) a vodu (přibližně 10 ml) a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 10 ml) , sušila se za použití vodného síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát =2:1) za vzniku bezbarvého oleje (117 mg, 0,284 mmol, 75 %).
Odkaz k příkladu 5
3.5- di-O-benzyl-4-formyl-1,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K methylenchloridu (200 ml) chlazenému při teplotě -78°C se přidal oxalylchlorid (6,02 ml, 69,0 mmol). K tomuto roztoku se po kapkách přidal roztok dimethylsulfoxidu (7,87 ml, 110 mmol) v bezvodém methylenchloridu (100 ml) . Po zamíchání po dobu 20 minut se k této směsi přidal roztok 3,5-di-O-benzyl-1,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosy (9 210 mg, 23,02 mmol) v bezvodém dichlormethanu (100 ml) a směs se míchala po dobu 30 minut. K reakční směsi se přidal triethylamin (28 ml, 200 mmol) a pomalu se zahříval na teplotu místnosti. Reakční směs se rozdělila mezi dichlormethan a vodu (přibližně 300 ml) . Organická vrstva se promyla vodou (přibližně 300 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 300 ml), sušila se pomocí bezvodého síranu hořečnatého a pak se • · · · · · · ·· ··· · · ·· · · »· koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na slikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 5:1) za vzniku bezbarvého oleje (8 310 mg, 20,88 mmol, výtěžek je 91 %) · 1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,35(3H, s), l,60(3H, s) , 3,68(1H, d,
Hz), 4,37(1H, d, 4,4 Hz), 4,46(1H, d, 12Hz), 4,52(1H, d, 12 Hz), 4,59(1H, d, 12 Hz), 4,59(1H, dd, 3,4, 4,4 Hz), 4,71(1H, d, 12 Hz), 5,84(1H, d, 3,4 Hz), 7,3(10H, m), 9,91(1H, s).
FABMS(mNBA): 397(M-H)+, 421(M+Na)+ [a]D+27,4° (0,51, methanol).
Odkaz k příkladu 6
3,5-di-O-benzyl-4-vinyl-l,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v odkazech k příkladu 5 (8
310 mg, 20,88 mmol) v bezvodém tetrahydrofuranu (300 ml) v atmosféře dusíku při teplotě 0°C se přidal 0,5 M toluenový roztok činidla Tebbe (44 ml, 22 mmol) a směs se míchala. Pak se pomalu přidával 0,1 N vodný roztok hydroxidu sodného (20 ml) . Směs se filtrovala přes celit za účelem odstranit sraženinu a sraženina se promyla diethyletherem (přibližně 100 ml) . Organická vrstva se sušila za použití bezvodého síranu horečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 8 : 1 až 5:1) za vzniku bezbarvého oleje (5 600 mg, 14,14 mmol, výtěžek je 68 %) .
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,28(3H, s) , 1,52(3H, s), 3,31(1H, d,
Hz), 3,34(1H, d, 11 Hz), 4,25(1H, d, 4,9 Hz), 4,4O(1H, d,
Hz), 4,52(1H, d, 12 Hz), 4,57(1H, dd, 3,9, 4,9 Hz),
4,59(1H, d, 12 Hz), 4,76(1H, d, 12 Hz), 5,25(1H, dd, 1,8, 11
Hz), 5,52(1H, dd, 1,8, 18 Hz), 5,76(1H, d, 3,9 Hz), 6,20(lH, dd, 11, 8 Hz) , 7,3 (10H, m) .
FABMS(mNBA): 419(M+Na)+.
* Odkaz k příkladu 7
3,5-di-0-benzyl-4-hydroxyethyl-l,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v odkazech k příkladu 6 (5
500 mg, 13,89 mmol) v bezvodém tetrahydrofuranu (200 ml) v atmosféře dusíku se přidal po kapkách 0,5 M roztok tetrahydrofuranu 9-BBN (9-borabicyklo[3,3, ljnonan) (80 ml, 40 mmol) a směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidávala voda do té doby než se zastavil vývoj plynu. Pak se přidal 3N vodný roztok hydroxidu sodného (30 ml) a pak se pomalu přidával 30 % vodný roztok hydrogenperoxidu při teplotě, která se udržovala mezi hodnotou 30 a 50 °C. Směs se míchala při teplotě 30 minut a dělila mezi saturovaný vodný roztok chloridu sodného (přibližně 200 ml) a ethylacetát (200 ml) . Organická vrstva se promyla neutrálním pufrovaným roztokem kyseliny fosforečné (přibližně 200 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 200 ml) a sušila se pomocí bezvodého síranu horečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 2 : 1 až 1 : 1) za vzniku bezbarvého oleje (5 370 mg, 12,97 mmol, výtěžek je 93 %). 1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,33(3H, s) , 1,66(3H, s) , 1,78(1H, ddd, 4,0, 8,5, 15 Hz), 2,51(1H, ddd, 3,4, 6,4, 15 Hz), 3,54(1H, d, 10 Hz), 3,80(2H, m), 4,13(1H, d, 5,3 Hz), 4,43(1H, d, 12 Hz), 4,52(1H, d, 12 Hz), 4,55(1H, d, 12 Hz), 4,65(1H, dd, 4,0, 5,3 Hz), 4,77(1H, d, 12 Hz), 5,77(1H, d, 4,0 Hz), 7,3(10H, m).
FABMS (mNBA) : 415(M+Na)+, [oc]D+57,4° (0,91, methanol).
Odkaz k příkladu 8
3,5-di-O-benzyl-4-(p-toluensulfonyloxyethyl)-1,2-O-isopropyliden-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v odkazu k příkladu 4, který se azeotropicky refluxoval s toluenem (1 035 mg, 2,5 mmol) v bezvodém dichlormethanu (35 ml) v atmosféře dusíku při tep96 lote 0 °C se přidal triethylamin (1,8 ml, 13 mmol), dimethylaminopyridin (30 mg, 0,25 mmol) a p-toluensulfonylchlorid (858 mg, 4,5 mmol) a směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se dělila mezi dichlormethan a saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml) . Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml) a saturovaného vodného roztoku chloridu sodného (přibližně 100 ml) a sušila se za pomoci bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát =3:1) za vzniku bezbarvého oleje (1 340 mg, 2,6 mmol, výtěžek je 94 %).
| XH | -NMR(400 | MHz, | CDC13) : 1 | ,33 ( | :3h, s), | 1,49(3H, | s), 1,99(1H, | dt, |
| 7, | 6 a 15 | Hz) , | 2,47(3H, | s) , | 2,60 (1H | ddd, 5, | 7, 7,6, 15 | Hz) , |
| 3, | 28 (1H, d, 10 | Hz), 3,45 | (1H, | . d, 10 | Hz), 4,11 | (1H, d, 5,3 | Hz) , | |
| 4, | 32(2H, | m) , | 4,42(1H, d, | 12 | Hz), 4, | 5O(1H, d, | 12 Hz), 4,54 | ‘ (1H, |
| d, | 12 Hz) | , 4, | 62(1H, dd, | 4, | 0, 5,2 | Hz), 4,76 | (1H, d, 12 | Hz) , |
5,74(1H, d, 4,0 Hz), 7,3(12H, m), 7,78(2H, d, 8,3 Hz).
FABMS(mNBA): 569(M+H)+.
Odkaz k příkladu 9
1,2-di-O-acetyl-3,5-di-O-benzyl-4-(p-toluensulfonyloxyethyl)-a-D-erythropentofuranosa
K roztoku sloučeniny získané v odkazu k příkladu 8 (1 340 mg, 2,36 mmol) v kyselině octové (15 ml) se přidal kyselý anhydrid (1,88 ml, 20 mmol) a koncentrovaná kyselina sírová (0,01 ml). Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs nalila do vody (60 ml) v ledové lázni a míchala se po dobu 30 minut a pak se dělila mezi saturovaný vodný roztok chloridu sodného (přibližně 100 ml) a ethylacetát (přibližně 100 ml). Organická vrstva se promyla neutrálním pufrovacím roztokem kyseliny fosforečné, saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a a sušila se za použití bezvodého sí• 9 ♦ 9 ránu horečnatého a pak se koncentrovala. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 2:1) za vzniku bezbarvého oleje (1 290 mg, 2,11 mmol, výtěžek je 89 %, poměr α : β je 1 : 5) .
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : (derivát β) 1,86(3H, s) , 2,05(3H, s),
2,08(lH, m), 2,18(1H, m) , 2,42(3H s) , 3,30(lH, d, 10 Hz), 3,33(1H, d, 10 Hz), 4,23(1H, d, 5,1 Hz), 4,24(2H, m) , 4,42(2H, s), 4,45(1H, d, 12Hz), 4,55(1H, d, 12 Hz), 5,28(1H, d, 5,1
Hz), 6,01(lH, s), 7,3 (12 H, m), 7,73(2H, d, 8,3 Hz).
FAB-MAS(mNBA): 613(M+H)+.
Odkaz k příkladu 10
2'-O-acetyl-3', 5'-di-O-benzyl-4-p-toluensulfonyloxyethyl-5-methyluridin
Trimethylsilyllovaný thymin (500 mg, přibližně 2 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolíkiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (650 mg, 1,06 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (15 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrifluormethansulfonát (0,36 ml, 2 mmol) a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 1 hodiny. Saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného se filtroval před celit. K filtrátu se přidal dichlormethan (50 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 50 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 50 ml) a sušila se za použití síranu horečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (použila se směs hexan : ethylacetát =1 : 2) za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (432 mg, 0,64 mmol, výtěžek je 60 %).
xH-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,52(3H, d, 0,9 Hz), 1,94(1H, dt, 7,5 a 15 Hz), 2,06(3H, s), 2,23(1H, dt, 6,0 a 15 Hz), 2,42(3H, s) , 3,38(1H, d, 10 Hz), 3,67(1H, d, 10 Hz), 4,17(2H, m) , 4,36(1H, *9 99 99
9999 9 *9
999 9 999*9 9
9 9 9 9 9 9
999 9* *9 99 9* 9 d, 6,0 Hz), 4,41(1H, d, 12 Hz), 4,44(1H, d, 12 Hz), 4,48(1H, d, 12 Hz), 4,58(1H, d, 12 Hz), 5,39(1H, dd, 5,1 a 6,0 Hz), 6,O4(1H, d, 5,1 Hz), 7,3 (12 H, m) , 7,73(2H, dt, 1?8 a 8,3
Hz), 8,18 (1H, s).
FAB-MAS(mNBA): 679(M+H)+.
Odkaz k příkladu 11
2'-O-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-4-N-benzoylcytidin
Trimethylsilylovaný benzoylcytosin (300 mg, přibližně 1,0 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981) se přidal k roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (383 mg, 0,626 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (4 ml). Trimethylsilyltrifluormethansulfonát (0,18 ml, 0,995 mmol) při teplotě 0 °C se přidal do směsi a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 1 hodiny. Do směsí se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 10 ml) a methylenchlorid (přibližně 20 ml) a směs se míchala. Výsledná bílá sraženina se odfiltrovala za použití celitu. Organická vrstva filtrátu se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 20 ml) a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (397 mg, výtěžek je 83 %). 1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 8,70(lH, br) , 8,18(1H, d, 7,4 Hz), 7,87(2H, d, 7,5 Hz), 7,72(2H, d, 8,3 Hz), 7,61-7,57 (1H, m) , 7,51-7,48(2H, m) , 7,43-7,21(13 H, m) , 6,02(lH, d, 2,9 Hz), 5,4O(1H, dd, 5,8, 2,9 Hz), 4,57(1H, d, 11 Hz), 4,39(1H, d, 11 Hz), 4,32-4,28(3H, m) , 4,19-4,16(2H, m) , 3,69(1H, d 11 Hz),
3,31(1H, d, 11 Hz), 2,40(3H, s) , 2,30-2,23(1H, m) , 2,06(3H,
s), 1,95-1,89(1H, m).
FAB-MAS(mNBA): 768(M+H)+.
Odkaz k příkladu 12 • ·· ·· ·· ·· · y y *········· ····«···♦♦··· • · · · · · · · · ··· ·· ·· ·· ·♦ ··· • 2'-O-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-6-N—
-benzoyladenosin
Trimethylsilylovaný benzoyladenosin (500 mg, přibližně 2 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (600 mg, 0,98 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (15 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku.
Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasílyltrífluormethansulfonát (0,36 ml, 2 mmol) a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 4 hodiny. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného a dichlormethan (50 ml). Reakční směs se rozdělila do těchto dvou vrstev. Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 50 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 50 ml) a sušila se za použití síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (použila se směs dichlormethan : methanol =50 : 1) za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (405 mg, 0,51 mmol, výtěžek je 52 %).
xH-NMR(400 MHz, CDC13) : 2,O(1H, m) , 2,06(3H, s), 2,32(1H, dt,
6,0 a 15 Hz), 2,40(3H, s) , 3,36(1H, d, 10 Hz), 3,58(1H, d, 10
| Hz) , | 4, | 22(2H, m), 4,39(1H, d, 12 | Hz) , | 4,45(1H, | d, | 12 Hz), |
| 4,47 | (1H, | d, 12 Hz), 4,59(1H, d, 12 | Hz), | 4, 62(1H, | d, | 5,6 Hz) , |
| 5, 94 | (1H, | dd, 4,5 a 5.6 Hz), 5,94 | (1H, | dd, 4,5 | a | 5,6 Hz), |
| 6,21 | (1H, | d, 4,5 Hz), 7,2-7,3(12H, | m) , | 7,54(2H, | m) , | 7,62(1H, |
| dt, | 1,2 | a 6,2 Hz), 7,72(2H, d, 8,3 | Hz) , | 8,02(2H, | m) , | 8,21(1H, |
s) , 8,75(1H, s), 8,97(1H, brs) .
FAB-MAS(mNBA): 7 92 (M+H)+.
Odkaz k příkladu 13
2'-O-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyluridin • «
100 φ φ · φ φ » φ φ φ ·· · · · · · · • · φ φ φ φ φφ φ φ φ • · φ φ φ φ φ φ φ φ φ φ φφ φ φ φφ φ
Trimethylsilylovaný uráčil (200 mg, přibližně 0,8 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolíkíewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (200 mg, 0,327 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (8 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrífluormethansulfonát (0,145 ml, 0,8 mmol) a směs se míchala při teplotě 70 °C po dobu 1 hodiny. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (10 ml) a směs se filtrovala za použití celitu. K filtrátu se přidal dichlormethan (přibližně 10 ml) . Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na silikagelu (použila se směs dichlormethan : methanol = 100 : 2) za vzniku bezbarvého oleje (199 mg, 0,299 mmol, výtěžek je 92 %) .
1H-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,94(1H, dt, 7,4 a 15 Hz), 2,07(3H, s), 2,23(1H, dt, 5,9 a 15 Hz), 2,43(3H, s), 3,36(1H, d, 10 Hz),
| 3,65(1H, d, 10 Hz), | 4,17 (2H, dd, | 6 a | 7 Hz), 4,31(1H, d, 5,9 |
| Hz), 4,38(1H, d, 11Hz), 4,39(1H, | d, | 11 Hz), 4,40(lH, d, 11 | |
| Hz), 4,58(1H, d, 11 | Hz), 5,29(1H, | dd, | 2,4 a 8,2 Hz), 5,33(1H, |
| dd, 4,5 a 6 Hz), | 6,00(lH, d, | 4,5 | Hz), 7,2-7,4(12H, m), |
| 7,61(1H, d, 8,2 Hz), | 7,74(1H, d, 8, | 3 Hz | ), 8,14(1H, brs). |
FAB-MAS(mNBA): 665(M+H)+.
Odkaz k příkladu 14
2'-O-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-4-N-benzoyl-5-methylcytidin
Trimethylsilylovaný uráčil (200 mg, přibližně 0,8 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu pří• *
101 kladu 9 (400 mg, 0,653 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (6 ml) . Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrifluormethansulfonát (0,180 μΐ, 1,0 mmol) při teplotě 0°C a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 1 hodiny. Reakční směs se zahřála na teplotu místnosti. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 5 ml) a methylenchlorid (přiližně 10 ml) a směs se zamíchala. Dále se směs filtrovala za použití celitu, aby se odstranila bílá sraženina. Organická vrstva filtrátu se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (320 mg, 0,409 mmol, výtěžek je 63 %) .
xH-NMR(400 MHz, CDC13) : 1,68(3H, s), 1,95(1H, dt, 7,3 a 15 Hz), 2,07(3H, s), 2,25(1H, dt, 6 a 15 Hz), 2,43(3H, s), 3,4O(1H, d, 10 Hz), 3,71(1H, d, 10 Hz), 4,18(2H, m), 4,37(1H, d, 5,8 Hz), 4,42(1H, d, 12 Hz), 4,46(1H, d, 12 Hz), 4,51(1H, d, 12 Hz), 4,61(lH,d, 12 Hz), 5,42(1H, dd, 4,9 a 5,8 Hz), 6,07(lH, d, 4,9 Hz), 7,2-7,6(17H, m) , 7,74(2H, d, 8,3 Hz), 8,28(2H, d, 7,0 Hz) .
FAB-MAS(mNBA): 782(M+H)+.
Odkaz k příkladu 15
2'-0-acetyl-3',5'-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-2-N-isobutyrylguanosin
Trimethylsilylovaný isobutyrylguanosin (650 mg, přibližně 1,5 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (400 mg, 0,65 mmol) v bezvodém 1,2-dichlorethanu (10 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrifluormethansulfonát (0,2 ml, 1,2 mmol) a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 4 hodin. Do reakční směsi se přidal saturovaný vod102
99 9999 9 • 99 9999 9 · ·
9 9 · 9 999 999 9
999 99 9 999 • 99 99 99 99 99 9 9 9 ný roztok hydrogenuhličitanu sodného (5 ml) a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu za vzniku produktu, který se použil v další reakci bez dalšího čištění.
Příklad testu 1
Test měření Tm
Roztok vzorku (1 ml), jehož konečná koncentrace NaCl je 100 mM, pufrovací roztok fosforečnanu sodného (pH7,2) s koncentrací 10 mM, oligonukleotid (1) s koncentrací 4 μΜ a komplementární DNA (zde uvedená jako oligonukleotid (2)), která vykazuje sekvenci indikovanou svým komplementárním řetězcem (sekvence 5'-agcaaaaaacgc-3'(sekvence č. 1 na seznamu sekvencí) nebo komplementární RNA (zde uvedená jako oligonukleotid (3)), která má sekvenci indikovanou sekvencí 5'-agcaaaaaacgc3' (sekvence č. 1 uvedenou na seznamu sekvencí) s koncentrací 4 μΜ, se zahřál v lázni s vroucí vodou a pomalu se chladil na teplotu místnosti, což trvalo přibližně dvě hodiny. Vzorek se pak zahřál a měřilo se za použití spektrofotometru (UV-3100PC: produkt firmy Shimadzu Corp.). Vzorek se zahřál v cele (tloušťka cely je 1,0 cm, cylindrický plášťový typ) cirkulující vodou zahřívanou v inkubátoru (Haake FE2: produkt firmy EKO Corp.) a monitorovala se teplota za použití teploměru (SÁTO SK1250MC) . Teplota se zvýšila z 20 °C na 95 °C a při každém zvýšení teploty o jeden °C se měřila absorbance ultrafialového záření při maximální absorpční vlnové délce 260 nm. Přirozeně se vyskytující DNA (zde uvedená jako oligonukleotid (4)), která má sekvenci indikovanou sekvencí 5'-gcgttttttgct3' (sekvence č. 2 uvedená v seznamu sekvencí), jenž má stejnou sekvenci jako oligonukleotid (1) (sloučenina příkladu 29) se použila jsko kontrola a provedl se stejný postup.
103 * · 4 4 4 *4 ♦» • •44 4444 444
444 4444 « «
444 4 44« 4 4 4
444 4 4 4 44
4444« 44 44 44 4
Teplota, při které změna na 1°C dosáhne maxima, je teplota Tm (teplota denaturace) a při této teplotě se hodnotila schopnost olígonukleotidového analogu tvořit komplementární řetězec .
Výsledky měření hodnot Tm oligonukleotidu (4) (přirozeně se vyskytující DNA) a oligonukleotidu (1) (sloučenina z příkladu 29) je vztažena k oligonukleotidu (2) (komplementární DNA) a oligonukleotidu (3) (komplementární RNA).
Tabulka č. 3
| Tm (°C) | ||
| sloučenina | oligonukleotid (2) | oligonukleotid (3) |
| oligonukleotid (4) | 48 | 44 |
| oligonukleotid (1) | 61 | 75 |
S tabulky plyne, že oligonukleotidový analog podle vynálezu vykazuje překvapivě vyšší hodnotu Tm a překvapivě vyšší schopnost tvořit komplementární řetězec ve srovnání s přirozeně se vyskytující DNA.
Příklad testu 2
Měření rezistence vůči nukleázám
Exonukleáza a endonukleáza se smíchaly s pufrem s oligonukleotidem a směs se udržovala při teplotě 37 °C po dobu 15 minut. Roztok směsi se pak udržoval při teplotě 37 °C po předem určenou dobu. K části směsi se přidala kyselina ethylendiaminotetraoctová (EDTA) a směs se zahřála na teplotu 100 °C po dobu 2 minuty, přičemž se zastavila reakce. Množství zbývajícího oligonukleotidu se stanovilo HPLC s reverními fázemi, měřily se změny množství oligonukleotidu závislé na čase v přítomnosti nukleázy.
Oligonukleotidové analogy podle vynálezu demonstrují překvapivou rezistenci vůči nukleázám.
104
9» 4» *» 9»
4·»· 9 4 4· · 9 9
499 «994 · · · · · · ··· 4 4 ·
49· 49 4 44
494 44 «4 4» 44 4
Průmyslová využitelnost
Nový oligonukleotidový a nukleosidový analog podle vynálezu se může použít jako antigenní farmaceutický prostředek, který vykazují skvělou stabilitu. Dále se mohou použít jako detekční činidla (sondy) specifického genu, jako primery pro začátek amplifikace nebo jako meziprodukty při jejich přípravě .
105 • ·· »* e* ·· * »· » » · O « · f ·· • · · * · · · · · 9 • 9 · » · · ··· · ♦ · « • « · ·· · · · 9 ··· ·· «· et ·« *··
Seznam sekvencí <210> 1 <211> 12 <212> DNA <213> umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: Syntetizovaný oligonukleotid určený pro testování hodnoty Tm <400> 1 agcaaaaaac gc 12 <210> 2 <211> 12 <212> DNA <213> umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: Syntetizovaný oligonukleotid určený pro testování hodnoty Tm
Claims (19)
- PATENTOVÉ NÁROKY1. Sloučenina obecného vzorce 1:kde symboly R1 a R2 jsou stejné nebo různé a reprezentují atom vodíku, hydroxylovou ochranou skupinu, skupinu kyseliny fosforečné, chráněnou skupinu kyseliny fosforečné nebo -P(R3)R4, [kde symboly R3 a R4 jsou stejné nebo různé a reprezentují hydroxylovou skupinu, chráněnou hydroxylovou skupinu, merkaptoskupinu, chráněnou merkaptoskupinu, aminoskupinu, alkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, alkylthioskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, kyanoalkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 5 atomů uhlíku, nebo aminoskupinu substituovanou alkylovou skupinou, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku], symbol A reprezentuje alkylenovou skupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl nebo substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, která má alespoň jeden substituent vybraný z následující skupiny a, nebo její sole, přičemž skupina a je hydroxylová skupina, chráněná hydroxylová skupina, alkoxyskupina, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, merkaptoskupina,107 chráněná merkaptoskupina, alkylthioskup.ina s 1 až 4 atomy uhlíku, aminoskupina, chráněná aminoskupina, aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou s 1 až 4 atomy uhlíku, alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku a halogenový atom.
- 2. Sloučenina podle nároku 1 nebo její sůl, kde symbol R1 je atom vodíku, alifatická acylová skupina, aromatická acylová skupina, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, jejichž arylový kruh je substituován nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou nebo silylovou skupinou.
- 3. Sloučenina podle nároku 1 nebo její sůl, kde symbol R1 je atom vodíku, acetylová skupina, benzoylová skupina, benzylová skupina, p-methoxybenzylová skupina, dimethoxytritylová skupina, monomethoxytritylová skupina nebo terc-butyldifenylsilylová skupina.
- 4. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 3 nebo její sůl, kde symbol R2 je atom vodíku, alifatická acylová skupina, aromatická acylová skupina, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, jejichž arylový kruh je substituován nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou, silylovou skupinou, fosforamiditovou skupinou, fosfonylovou skupinou, skupinou kyseliny fosforečné nebo chráněnou skupinou kyseliny fosforečné.
- 5. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 3 nebo její sůl, kde symbol R2 je atom vodíku, acetylová skupina, benzoylová skupina, benzylová skupina, p-methoxybenzylová skupina, terc-butyldifenylsilylová skupina, -P(OC2H4CN)NCH(CH3) 2) r108-P(OCH3) NCH(CH3) 2) , fosfonylová skupina nebo skupina kyseliny2-chlorfenylfosforečné nebo 4-chlorfenylfosforečné.
- 6. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 5 nebo její sůl, kde symbol A je methylenová skupina.
- 7. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 6 nebo její sůl, kde symbol B je 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl),6-aminopurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6«chlorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6•fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina a hydroxylová skupina jsou chráněné, 6-amino-2-methoxypurin-9-yl, 6-amino-2-chlorpurin-9-yl, 6-amino-2-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino5-fluorpyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je methylcytosinyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná.
- 8. Sloučenina podle libovolného z nároků 1 až 6 nebo její sůl, kde symbol B je 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6-hydroxypurin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4~benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyridin-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl.
- 9. Sloučenina nebo její sůl vybraná z následující skupiny:2'-O,4'-C-ethylenguanosin109 • ·2'-O,4'-C-ethylenadenosin3', 5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin 3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin 2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin2'-O,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-N-isobutyrylguanosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit 2'-0, 4'-C-ethylenuridin2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin2'-0, 4'-C-ethylencytidin2'-0,4'-C-ethylen-5-methylcytidin3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylenuridin5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridin3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin 3',5'-di-O-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit a110 • ·5'-O-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-methylcytidin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diisopropyl)fosforamidit.
- 10. Oligonukleotidový analog, který vykazuje jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2:kde symbol A reprezentuje alkylenovou skupinu, která má 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl a substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, kde se alespoň jeden substituent vybral z následující skupiny a, nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl, přičemž skupina a je: hydroxylová skupina, chráněná hydroxylová skupina, alkoxyskupina s 1 až 4 atomy uhlíku, merkaptoskupina, chráněná merkaptoskupina, alkylthioskupina s 1 až 4 atomy uhlíku, aminoskupina, chráněná aminoskupina, aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou s 1 až 4 atomy uhlíku, alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku a halogenový atom.
- 11. Oligonukleotidový analog podle nároku 10 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl, kde symbol A je methylenová skupina.111 • · · ·· ·· ·· β ···· ···· « · · ·· ··· ······ · ····· ·· ·· ** *
- 12. Oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 a 11 nebo jeho farmakologicky přijatelná sůl, kde symbol B je 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), 6-aminopurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina a hydroxylová skupina jsou chráněné, 6-amino-2-methoxypurin-9-yl, 6-amino-2-chlorpurin-9-yl, 6-amino-2-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), 2-oxo-4-aminopyrimídin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je methylcytosinyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná.
- 13. Oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 a 11 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl, kde symbol B je 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-isobutyrylamino-6-hydroxy-purin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyridin-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl.
- 14. Farmaceutický prostředek, vyznačuj ící se tím, že obsahuje účinné množství farmaceuticky aktivní sloučeniny spolu s nosičem nebo ředidlem, kde uvedená farmakologicky aktivní sloučenina je oligonukleotidový analog112 • 9 • 9 99 9 99 9 • · • · podle libovolného z nároků 10 až 13 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl.
- 15. Sonda vhodná pro gen obsahující oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 až 13.
- 16. Primer vhodný pro začátek amplifikace obsahující oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 až 13.
- 17. Použití oligonukleotidového analogu podle libovolného z nároků 10 až 13 nebo jeho farmakologicky přijatelné sole při výrobě léčiva vhodného pro prevenci nebo léčbu onemocnění, kterému je možné předcházet nebo ho léčit schopností uvedeného oligonukleotidového analogu vykazovat farmakologicky použitelnou aktivitu v těle pacienta po jeho aplikaci.
- 18. Použití oligonukleotidového analogu podle libovolného z nároků 10 až 13 nebo jeho farmakologicky přijatelné sole při výrobě léčiva vhodného pro prevenci nebo léčbu onemocnění, kterému je možné předcházet nebo ho léčit schopností uvedeného oligonukleotidového analogu vykazovat farmakologicky použitelnou antigenní aktivitu v těle pacienta po jeho aplikaci.
- 19. Oligonukleotidový analog podle libovolného z nároků 10 až 13 nebo jeho farmakologicky přijatelná sůl vhodná pro použití jako léčiva.
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP3386399 | 1999-02-12 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CZ20012574A3 true CZ20012574A3 (cs) | 2002-02-13 |
| CZ296576B6 CZ296576B6 (cs) | 2006-04-12 |
Family
ID=12398349
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CZ20012574A CZ296576B6 (cs) | 1999-02-12 | 2000-02-10 | Nukleosidový analog a oligonukleotidový analog a farmaceutický prostredek, sonda a primer s jeho obsahem |
Country Status (26)
| Country | Link |
|---|---|
| US (4) | US7335765B2 (cs) |
| EP (1) | EP1152009B2 (cs) |
| JP (1) | JP3420984B2 (cs) |
| KR (1) | KR100573231B1 (cs) |
| CN (1) | CN1273478C (cs) |
| AT (1) | ATE287897T2 (cs) |
| AU (1) | AU758956B2 (cs) |
| BR (1) | BRPI0008131B8 (cs) |
| CA (1) | CA2361318C (cs) |
| CZ (1) | CZ296576B6 (cs) |
| DE (1) | DE60017711T3 (cs) |
| DK (1) | DK1152009T4 (cs) |
| ES (1) | ES2234563T5 (cs) |
| HK (1) | HK1040084B (cs) |
| HU (1) | HU228398B1 (cs) |
| ID (1) | ID30093A (cs) |
| IL (2) | IL144338A0 (cs) |
| NO (1) | NO320441B1 (cs) |
| NZ (1) | NZ513402A (cs) |
| PL (1) | PL208245B1 (cs) |
| PT (1) | PT1152009E (cs) |
| RU (1) | RU2233844C2 (cs) |
| TR (2) | TR200604211T1 (cs) |
| TW (1) | TW513438B (cs) |
| WO (1) | WO2000047599A1 (cs) |
| ZA (1) | ZA200106544B (cs) |
Families Citing this family (478)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US7119184B2 (en) * | 1991-08-12 | 2006-10-10 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotides having A-DNA form and B-DNA form conformational geometry |
| US9096636B2 (en) | 1996-06-06 | 2015-08-04 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Chimeric oligomeric compounds and their use in gene modulation |
| US7812149B2 (en) | 1996-06-06 | 2010-10-12 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | 2′-Fluoro substituted oligomeric compounds and compositions for use in gene modulations |
| US5898031A (en) | 1996-06-06 | 1999-04-27 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligoribonucleotides for cleaving RNA |
| JP4148662B2 (ja) * | 2000-08-10 | 2008-09-10 | 第一三共株式会社 | ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体を含有する核酸試薬及び医薬 |
| JP4151751B2 (ja) * | 1999-07-22 | 2008-09-17 | 第一三共株式会社 | 新規ビシクロヌクレオシド類縁体 |
| JP4413493B2 (ja) | 2000-10-04 | 2010-02-10 | サンタリス ファーマ アー/エス | プリンlna類似体の改善された合成方法 |
| GB0114719D0 (en) * | 2001-06-15 | 2001-08-08 | Glaxo Group Ltd | Compound |
| WO2003033696A1 (en) * | 2001-10-18 | 2003-04-24 | Sankyo Company, Limited | Vegf antisense compound |
| EP1481983A4 (en) | 2002-02-13 | 2008-04-02 | Takeshi Imanishi | NUCLEOSIDE ANALOGUE AND OLIGONUCLEOTIDE DERIVATIVES CONTAINING A NUCLEOTIDE ANALOGON THEREOF |
| US20040219565A1 (en) | 2002-10-21 | 2004-11-04 | Sakari Kauppinen | Oligonucleotides useful for detecting and analyzing nucleic acids of interest |
| CA2504694C (en) | 2002-11-05 | 2013-10-01 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Polycyclic sugar surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation |
| US8604183B2 (en) | 2002-11-05 | 2013-12-10 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions comprising alternating 2′-modified nucleosides for use in gene modulation |
| AU2013201763B2 (en) * | 2002-11-18 | 2015-05-07 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Amino-LNA, thio-LNA and alpha-L-oxy-LN |
| US9045518B2 (en) | 2002-11-18 | 2015-06-02 | Santaris Pharma A/S | Amino-LNA, thio-LNA and alpha-L-oxy-LN |
| TWI347948B (en) * | 2002-11-19 | 2011-09-01 | Sankyo Co | Novel 2',5'-oligoadenylic acid compositions |
| JP5132025B2 (ja) * | 2002-11-19 | 2013-01-30 | 第一三共株式会社 | 新規2’,5’−オリゴアデニル酸類縁体 |
| JP4777777B2 (ja) * | 2002-11-25 | 2011-09-21 | 雅文 松尾 | mRNA前駆体のスプライシングを修飾するENA核酸医薬 |
| US20050089889A1 (en) | 2003-06-20 | 2005-04-28 | Ramsing Niels B. | Probes, libraries and kits for analysis of mixtures of nucleic acids and methods for constructing the same |
| US7683036B2 (en) | 2003-07-31 | 2010-03-23 | Regulus Therapeutics Inc. | Oligomeric compounds and compositions for use in modulation of small non-coding RNAs |
| EP1661905B9 (en) * | 2003-08-28 | 2012-12-19 | IMANISHI, Takeshi | Novel artificial nucleic acids of n-o bond crosslinkage type |
| US20050053981A1 (en) * | 2003-09-09 | 2005-03-10 | Swayze Eric E. | Gapped oligomeric compounds having linked bicyclic sugar moieties at the termini |
| US7480382B2 (en) * | 2003-09-30 | 2009-01-20 | Microsoft Corporation | Image file container |
| GB0324854D0 (en) * | 2003-10-24 | 2003-11-26 | Expresson Biosystems Ltd | App/ena antisense |
| DE602004015832D1 (de) | 2003-11-07 | 2008-09-25 | Daiichi Sankyo Co Ltd | Verfahren zum nachweis von genetischem polymorphismus |
| US8569474B2 (en) | 2004-03-09 | 2013-10-29 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Double stranded constructs comprising one or more short strands hybridized to a longer strand |
| TW200540180A (en) * | 2004-05-28 | 2005-12-16 | Sankyo Co | Telomerase inhibitor ena oligonucleotide |
| US8394947B2 (en) | 2004-06-03 | 2013-03-12 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Positionally modified siRNA constructs |
| US7884086B2 (en) | 2004-09-08 | 2011-02-08 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Conjugates for use in hepatocyte free uptake assays |
| WO2006059507A1 (ja) * | 2004-11-30 | 2006-06-08 | Sankyo Company, Limited | 11β-HSD1アンチセンス化合物 |
| EP1871913A2 (en) * | 2005-03-25 | 2008-01-02 | Ambion, Inc. | Methods and compositions for depleting abundant rna transcripts |
| WO2007027894A2 (en) | 2005-08-29 | 2007-03-08 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense compounds having enhanced anti-microrna activity |
| US20100226884A1 (en) | 2009-01-20 | 2010-09-09 | Immunomedics, Inc. | Novel Class of Monospecific and Bispecific Humanized Antibodies that Target the Insulin-like Growth Factor Type I Receptor (IGF-1R) |
| US8883162B2 (en) * | 2005-10-19 | 2014-11-11 | Ibc Pharmaceuticals, Inc. | Multivalent antibody complexes targeting IGF-1R show potent toxicity against solid tumors |
| US9862770B2 (en) | 2005-10-19 | 2018-01-09 | Ibc Pharmaceuticals, Inc. | Multivalent antibody complexes targeting IGF-1R show potent toxicity against solid tumors |
| EP1971371B1 (en) | 2005-12-01 | 2015-08-05 | Pronai Therapeutics, Inc. | Cancer therapies and pharmaceutical compositions used therein |
| JP5146957B2 (ja) * | 2005-12-09 | 2013-02-20 | 独立行政法人理化学研究所 | 核酸の複製の方法及び新規人工塩基対 |
| US8288354B2 (en) | 2005-12-28 | 2012-10-16 | The Scripps Research Institute | Natural antisense and non-coding RNA transcripts as drug targets |
| EP1984499B1 (en) | 2006-01-27 | 2015-05-27 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligomeric compounds and compositions for the use in modulation of micrornas |
| JP5342881B2 (ja) | 2006-01-27 | 2013-11-13 | アイシス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッド | 6−修飾された二環式核酸類似体 |
| US7569686B1 (en) | 2006-01-27 | 2009-08-04 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compounds and methods for synthesis of bicyclic nucleic acid analogs |
| EP2505649A1 (en) | 2006-05-05 | 2012-10-03 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compounds and methods for modulating expression of GCGR |
| EP2023940B1 (en) | 2006-05-05 | 2011-06-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compounds and methods for modulating expression of sglt2 |
| AU2007249349B2 (en) | 2006-05-11 | 2012-03-08 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | 5'-Modified bicyclic nucleic acid analogs |
| US7666854B2 (en) | 2006-05-11 | 2010-02-23 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Bis-modified bicyclic nucleic acid analogs |
| WO2008049085A1 (en) | 2006-10-18 | 2008-04-24 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense compounds |
| JP2010510807A (ja) * | 2006-11-27 | 2010-04-08 | アイシス ファーマシューティカルズ, インコーポレーテッド | 高コレステロール血症を治療するための方法 |
| US8093222B2 (en) | 2006-11-27 | 2012-01-10 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods for treating hypercholesterolemia |
| US20100292301A1 (en) * | 2007-02-28 | 2010-11-18 | Elena Feinstein | Novel sirna structures |
| EP2170917B1 (en) | 2007-05-30 | 2012-06-27 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | N-substituted-aminomethylene bridged bicyclic nucleic acid analogs |
| EP2173760B2 (en) | 2007-06-08 | 2015-11-04 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Carbocyclic bicyclic nucleic acid analogs |
| US20110046206A1 (en) * | 2007-06-22 | 2011-02-24 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Double strand compositions comprising differentially modified strands for use in gene modulation |
| CA2692579C (en) | 2007-07-05 | 2016-05-03 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | 6-disubstituted bicyclic nucleic acid analogs |
| AU2008307482B2 (en) | 2007-10-02 | 2012-07-12 | Amgen Inc. | Increasing erythropoietin using nucleic acids hybridizable to micro-RNA and precursors thereof |
| AU2008306455C1 (en) | 2007-10-03 | 2014-04-17 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | Novel siRNA structures |
| US8546556B2 (en) * | 2007-11-21 | 2013-10-01 | Isis Pharmaceuticals, Inc | Carbocyclic alpha-L-bicyclic nucleic acid analogs |
| US8614311B2 (en) | 2007-12-12 | 2013-12-24 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | RTP801L siRNA compounds and methods of use thereof |
| US20110105584A1 (en) * | 2007-12-12 | 2011-05-05 | Elena Feinstein | Rtp80il sirna compounds and methods of use thereof |
| WO2009090639A2 (en) * | 2008-01-15 | 2009-07-23 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | Sirna compounds and methods of use thereof |
| WO2009100320A2 (en) | 2008-02-07 | 2009-08-13 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Bicyclic cyclohexitol nucleic acid analogs |
| US10131904B2 (en) | 2008-02-11 | 2018-11-20 | Rxi Pharmaceuticals Corporation | Modified RNAi polynucleotides and uses thereof |
| US20110028531A1 (en) * | 2008-03-20 | 2011-02-03 | Elena Feinstein | Novel sirna compounds for inhibiting rtp801 |
| DK2285819T3 (da) | 2008-04-04 | 2013-12-02 | Isis Pharmaceuticals Inc | Oligomere forbindelser omfattende neutralt bundne, terminale bicykliske nukleosider |
| US8278287B2 (en) * | 2008-04-15 | 2012-10-02 | Quark Pharmaceuticals Inc. | siRNA compounds for inhibiting NRF2 |
| CA2726052A1 (en) | 2008-06-04 | 2009-12-10 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Modulation of gene expression through endogenous small rna targeting of gene promoters |
| JP5524189B2 (ja) | 2008-06-06 | 2014-06-18 | クォーク ファーマシューティカルズ インコーポレーティッド | 耳障害治療のための組成物および方法 |
| TWI455944B (zh) | 2008-07-01 | 2014-10-11 | Daiichi Sankyo Co Ltd | 雙股多核苷酸 |
| US8815818B2 (en) | 2008-07-18 | 2014-08-26 | Rxi Pharmaceuticals Corporation | Phagocytic cell delivery of RNAI |
| WO2010014592A1 (en) | 2008-07-29 | 2010-02-04 | The Board Of Regents Of The University Of Texas Sytem | Selective inhibition of polyglutamine protein expression |
| NZ601660A (en) * | 2008-08-25 | 2014-05-30 | Excaliard Pharmaceuticals Inc | Antisense oligonucleotides directed against connective tissue growth factor and uses thereof |
| CA2746527A1 (en) | 2008-09-22 | 2010-03-25 | Rxi Pharmaceuticals Corporation | Rna interference in skin indications |
| WO2010036698A1 (en) | 2008-09-24 | 2010-04-01 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Substituted alpha-l-bicyclic nucleosides |
| WO2010040112A2 (en) * | 2008-10-03 | 2010-04-08 | Curna, Inc. | Treatment of apolipoprotein-a1 related diseases by inhibition of natural antisense transcript to apolipoprotein-a1 |
| WO2010059226A2 (en) | 2008-11-19 | 2010-05-27 | Rxi Pharmaceuticals Corporation | Inhibition of map4k4 through rnai |
| RU2620970C2 (ru) | 2008-12-04 | 2017-05-30 | КьюРНА,Инк., | Лечение связанных с эритропоэтином (еро) заболеваний путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к еро |
| CN102361985B (zh) | 2008-12-04 | 2017-06-20 | 库尔纳公司 | 通过抑制肿瘤抑制基因的天然反义转录物治疗肿瘤抑制基因相关性疾病 |
| ES2600781T3 (es) | 2008-12-04 | 2017-02-10 | Curna, Inc. | Tratamiento para enfermedades relacionadas con el factor de crecimiento del endotelio vascular (vegf) mediante la inhibición de transcritos antisentido naturales de vegf |
| AU2009335740B2 (en) | 2008-12-17 | 2016-04-21 | Sarepta Therapeutics, Inc. | Antisense compositions and methods for modulating contact hypersensitivity or contact dermatitis |
| WO2010080452A2 (en) | 2008-12-18 | 2010-07-15 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | siRNA COMPOUNDS AND METHODS OF USE THEREOF |
| US9493774B2 (en) | 2009-01-05 | 2016-11-15 | Rxi Pharmaceuticals Corporation | Inhibition of PCSK9 through RNAi |
| US9745574B2 (en) | 2009-02-04 | 2017-08-29 | Rxi Pharmaceuticals Corporation | RNA duplexes with single stranded phosphorothioate nucleotide regions for additional functionality |
| WO2010093904A2 (en) | 2009-02-12 | 2010-08-19 | Curna, Inc. | Treatment of brain derived neurotrophic factor (bdnf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to bdnf |
| EP2408919B1 (en) | 2009-03-16 | 2017-10-18 | CuRNA, Inc. | Treatment of nuclear factor (erythroid-derived 2)-like 2 (nrf2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to nrf2 |
| CA2755404C (en) | 2009-03-17 | 2020-03-24 | Curna, Inc. | Treatment of delta-like 1 homolog (dlk1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to dlk1 |
| EP2421972A2 (en) | 2009-04-24 | 2012-02-29 | The Board of Regents of The University of Texas System | Modulation of gene expression using oligomers that target gene regions downstream of 3' untranslated regions |
| DE102009019476A1 (de) * | 2009-05-04 | 2010-11-11 | Biametrics Marken Und Rechte Gmbh | Wiedererkennbarer Träger für optische Meßverfahren |
| KR101722541B1 (ko) | 2009-05-06 | 2017-04-04 | 큐알엔에이, 인크. | Ttp에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 트리스테트라프롤린 관련된 질환의 치료 |
| CN102459596B (zh) | 2009-05-06 | 2016-09-07 | 库尔纳公司 | 通过针对脂质转运和代谢基因的天然反义转录物的抑制治疗脂质转运和代谢基因相关疾病 |
| ES2618572T3 (es) | 2009-05-08 | 2017-06-21 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con la familia de la distrofina mediante inhibición de un transcrito antisentido natural para la familia de dmd |
| WO2010135329A2 (en) | 2009-05-18 | 2010-11-25 | Curna, Inc. | Treatment of reprogramming factor related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a reprogramming factor |
| CA2762987A1 (en) | 2009-05-22 | 2010-11-25 | Joseph Collard | Treatment of transcription factor e3 (tfe3) and insulin receptor substrate 2 (irs2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to tfe3 |
| KR101704988B1 (ko) | 2009-05-28 | 2017-02-08 | 큐알엔에이, 인크. | 항바이러스 유전자에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 항바이러스 유전자 관련된 질환의 치료 |
| CN102458418B (zh) | 2009-06-08 | 2015-09-16 | 夸克制药公司 | 一种寡核苷酸化合物的制药用途 |
| ES2629339T3 (es) | 2009-06-16 | 2017-08-08 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con la paraoxonasa 1 (pon1) por inhibición de transcrito antisentido natural a pon1 |
| CA2765700C (en) | 2009-06-16 | 2021-01-05 | Opko Curna, Llc | Treatment of collagen gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a collagen gene |
| ES2618894T3 (es) | 2009-06-24 | 2017-06-22 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con el receptor del factor de necrosis tumoral 2 (tnfr2) por inhibición del transcrito natural antisentido para tnfr2 |
| CN102482672B (zh) | 2009-06-26 | 2016-11-09 | 库尔纳公司 | 通过抑制唐氏综合征基因的天然反义转录物治疗唐氏综合征基因相关疾病 |
| US20120252869A1 (en) | 2009-07-24 | 2012-10-04 | Opko Curna, Llc | Treatment of sirtuin (sirt) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a sirtuin (sirt) |
| ES2585360T3 (es) | 2009-08-05 | 2016-10-05 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con un gen de la insulina (INS) por inhibición de la transcripción antisentido natural en un gen de la insulina (INS) |
| EP2462153B1 (en) | 2009-08-06 | 2015-07-29 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Bicyclic cyclohexose nucleic acid analogs |
| ES2599986T3 (es) | 2009-08-11 | 2017-02-06 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con adiponectina (ADIPOQ) mediante la inhibición de un transcrito antisentido natural de una adiponectina (ADIPOQ) |
| CN102482670B (zh) | 2009-08-21 | 2018-06-15 | 库尔纳公司 | 通过抑制‘hsp70-相互作用蛋白的c末端’(chip)的天然反义转录物而治疗chip相关疾病 |
| EP2470657B1 (en) | 2009-08-25 | 2019-10-23 | CuRNA, Inc. | Treatment of 'iq motif containing gtpase activating protein' (iqgap) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to iqgap |
| DK2480669T3 (en) | 2009-09-25 | 2018-02-12 | Curna Inc | TREATMENT OF FILAGGRIN- (FLG) RELATED DISEASES BY MODULATING FLG EXPRESSION AND ACTIVITY |
| EP2495323A4 (en) | 2009-10-30 | 2014-04-30 | Daiichi Sankyo Co Ltd | MODIFIED DOUBLE-STRENGTH POLYNUCLEOTIDE |
| US20110110860A1 (en) | 2009-11-02 | 2011-05-12 | The Board Of Regents Of The University Of Texas System | Modulation of ldl receptor gene expression with double-stranded rnas targeting the ldl receptor gene promoter |
| KR101718534B1 (ko) | 2009-12-09 | 2017-03-22 | 닛토덴코 가부시키가이샤 | Hsp47 발현의 조절 |
| EP2510098B1 (en) | 2009-12-09 | 2015-02-11 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | Methods and compositions for treating diseases, disorders or injury of the cns |
| CA2782366A1 (en) | 2009-12-16 | 2011-07-14 | Opko Curna, Llc | Treatment of membrane bound transcription factor peptidase, site 1 (mbtps1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to mbtps1 |
| RU2619185C2 (ru) | 2009-12-23 | 2017-05-12 | Курна, Инк. | Лечение заболеваний, связанных с разобщающим белком 2 (ucp2), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к ucp2 |
| NO2516648T3 (cs) | 2009-12-23 | 2018-04-07 | ||
| US8921334B2 (en) | 2009-12-29 | 2014-12-30 | Curna, Inc. | Treatment of nuclear respiratory factor 1 (NRF1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to NRF1 |
| US8962585B2 (en) | 2009-12-29 | 2015-02-24 | Curna, Inc. | Treatment of tumor protein 63 (p63) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to p63 |
| DK2519632T3 (en) | 2009-12-31 | 2018-07-23 | Curna Inc | TREATMENT OF INSULIN RECEPTOR SUBSTRATE 2- (IRS2) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPTION TO IRS2 AND TRANSCRIPTION FACTOR E3 (TFE3) |
| DK2521784T3 (en) | 2010-01-04 | 2018-03-12 | Curna Inc | TREATMENT OF INTERFERON REGULATORY FACTOR 8- (IRF8) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENCE TRANSCRIPT TO IRF8 |
| KR101853509B1 (ko) | 2010-01-06 | 2018-04-30 | 큐알엔에이, 인크. | 췌장 발달 유전자에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 췌장 발달 유전자와 관련된 질환의 치료 |
| WO2011084193A1 (en) | 2010-01-07 | 2011-07-14 | Quark Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotide compounds comprising non-nucleotide overhangs |
| KR101854926B1 (ko) | 2010-01-11 | 2018-05-04 | 큐알엔에이, 인크. | 성 호르몬 결합 글로불린 (shbg)에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 성 호르몬 결합 글로불린 (shbg) 관련된 질환의 치료 |
| WO2011085102A1 (en) | 2010-01-11 | 2011-07-14 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Base modified bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom |
| DK2529015T3 (en) | 2010-01-25 | 2018-02-26 | Curna Inc | TREATMENT OF RNASE H1-RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPT TO RNASE H1 |
| WO2011097388A1 (en) | 2010-02-03 | 2011-08-11 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Selective inhibition of polyglutamine protein expression |
| RU2608496C2 (ru) | 2010-02-22 | 2017-01-18 | Курна, Инк. | Лечение заболеваний, связанных с пирролин-5 карбоксилатредуктазой 1(pycr1), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к pycr1 |
| RU2012143607A (ru) | 2010-03-12 | 2014-04-20 | Дайити Санкио Компани, Лимитед | Способ пролиферации кардиомиоцитов с применением микро-рнк |
| WO2011115818A1 (en) | 2010-03-17 | 2011-09-22 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | 5'-substituted bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom |
| US9080171B2 (en) | 2010-03-24 | 2015-07-14 | RXi Parmaceuticals Corporation | Reduced size self-delivering RNAi compounds |
| CN106074591B (zh) | 2010-03-24 | 2020-01-14 | 菲奥医药公司 | 眼部症候中的rna干扰 |
| BR112012024049A2 (pt) | 2010-03-24 | 2017-03-01 | Rxi Pharmaceuticals Corp | interferência de rna em indicações dérmicas e fibróticas |
| US8980856B2 (en) | 2010-04-02 | 2015-03-17 | Curna, Inc. | Treatment of colony-stimulating factor 3 (CSF3) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to CSF3 |
| KR101900962B1 (ko) | 2010-04-09 | 2018-09-20 | 큐알엔에이, 인크. | 섬유아세포 성장 인자 21 (fgf21)에 대한 자연 안티센스 전사체의 저해에 의한 섬유아세포 성장 인자 21 (fgf21) 관련된 질환의 치료 |
| KR101869570B1 (ko) | 2010-04-28 | 2018-06-20 | 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 | 변형된 뉴클레오사이드 및 그로부터 제조된 올리고머 화합물 |
| RU2018110642A (ru) | 2010-05-03 | 2019-02-27 | Курна, Инк. | Лечение заболеваний, связанных с сиртуином (sirt), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к сиртуину (sirt) |
| TWI586356B (zh) | 2010-05-14 | 2017-06-11 | 可娜公司 | 藉由抑制par4天然反股轉錄本治療par4相關疾病 |
| CA2799207C (en) | 2010-05-26 | 2019-03-26 | Curna, Inc. | Treatment of atonal homolog 1 (atoh1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to atoh1 |
| JP5917497B2 (ja) | 2010-05-26 | 2016-05-18 | カッパーアールエヌエー,インコーポレイテッド | メチオニンスルホキシドレダクターゼa(msra)に対する天然アンチセンス転写物の阻害によるmsra関連疾患の治療 |
| US8957200B2 (en) | 2010-06-07 | 2015-02-17 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom |
| WO2011163499A2 (en) | 2010-06-23 | 2011-12-29 | Opko Curna, Llc | Treatment of sodium channel, voltage-gated, alpha subunit (scna) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to scna |
| CN103068982B (zh) | 2010-07-14 | 2017-06-09 | 库尔纳公司 | 通过抑制盘状大同系物(dlg)的天然反义转录物而治疗dlg相关疾病 |
| EP2412724A1 (en) | 2010-07-29 | 2012-02-01 | Centre National de la Recherche Scientifique (C.N.R.S) | Regulation of Glypican 4 activity to modulate the fate of stem cells and uses thereof |
| ES2640755T3 (es) | 2010-10-06 | 2017-11-06 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con la Sialidasa 4 (neu4) mediante inhibición del transcrito antisentido natural al gen neu4 |
| US9222088B2 (en) | 2010-10-22 | 2015-12-29 | Curna, Inc. | Treatment of alpha-L-iduronidase (IDUA) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to IDUA |
| US10000752B2 (en) | 2010-11-18 | 2018-06-19 | Curna, Inc. | Antagonat compositions and methods of use |
| ES2657590T3 (es) | 2010-11-23 | 2018-03-06 | Curna, Inc. | Tratamiento de enfermedades relacionadas con nanog mediante inhibición del transcrito antisentido natural a nanog |
| AU2011337658A1 (en) | 2010-12-02 | 2013-07-04 | Daiichi Sankyo Company, Limited | Modified single-strand polynucleotide |
| US10017764B2 (en) | 2011-02-08 | 2018-07-10 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof |
| CN103492572A (zh) | 2011-03-03 | 2014-01-01 | 夸克医药公司 | 用于治疗肺疾病和损伤的组合物和方法 |
| US9796979B2 (en) | 2011-03-03 | 2017-10-24 | Quark Pharmaceuticals Inc. | Oligonucleotide modulators of the toll-like receptor pathway |
| CN103562387A (zh) | 2011-03-03 | 2014-02-05 | 夸克医药公司 | Toll样受体途径的寡核苷酸调剂 |
| US10196637B2 (en) | 2011-06-08 | 2019-02-05 | Nitto Denko Corporation | Retinoid-lipid drug carrier |
| TWI658830B (zh) | 2011-06-08 | 2019-05-11 | 日東電工股份有限公司 | Hsp47表現調控強化用類視色素脂質體 |
| EP2718439B1 (en) | 2011-06-09 | 2017-08-09 | CuRNA, Inc. | Treatment of frataxin (fxn) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to fxn |
| BR112013032223A2 (pt) | 2011-06-15 | 2016-12-20 | Grifols Therapeutics Inc | molécula de ácido nucleico isolada, e, composição |
| ES2651514T3 (es) | 2011-08-11 | 2018-01-26 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Compuestos oligoméricos gapados que comprenden deoxirribonucleósidos modificados en 5 ' -en la brecha y usos de ellos |
| KR101991980B1 (ko) | 2011-09-06 | 2019-06-21 | 큐알엔에이, 인크. | 소형 분자로 전압-개폐된 나트륨 채널 (SCNxA)의 알파 아단위에 관련된 질환의 치료 |
| HK1200484A1 (zh) | 2011-09-14 | 2015-08-07 | Translate Bio Ma, Inc. | 多聚寡核苷酸化合物 |
| JP6118331B2 (ja) | 2011-11-03 | 2017-04-19 | クォーク ファーマシューティカルズ インコーポレーティッドQuark Pharmaceuticals,Inc. | 神経保護のための方法および組成物 |
| JP2015502365A (ja) | 2011-12-12 | 2015-01-22 | オンコイミューニン,インコーポレイティド | オリゴヌクレオチドのイン−ビボ送達 |
| WO2013119602A1 (en) | 2012-02-06 | 2013-08-15 | President And Fellows Of Harvard College | Arrdc1-mediated microvesicles (armms) and uses thereof |
| US20150031750A1 (en) | 2012-03-15 | 2015-01-29 | The Scripps Research Institute | Treatment of brain derived neurotrophic factor (bdnf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to bdnf |
| AU2013203395A1 (en) | 2012-03-30 | 2013-10-17 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for modulating TAU expression for reducing seizure and modifying a neurodegenerative syndrome |
| EP2850092B1 (en) | 2012-04-09 | 2017-03-01 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Tricyclic nucleic acid analogs |
| WO2013154799A1 (en) | 2012-04-09 | 2013-10-17 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Tricyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom |
| WO2013159108A2 (en) | 2012-04-20 | 2013-10-24 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof |
| AU2013262709A1 (en) | 2012-05-16 | 2015-01-22 | Rana Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating MECP2 expression |
| JP2015523854A (ja) | 2012-05-16 | 2015-08-20 | ラナ セラピューティクス インコーポレイテッド | Smn遺伝子ファミリー発現を調節するための組成物及び方法 |
| WO2013173652A1 (en) | 2012-05-16 | 2013-11-21 | Rana Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating gene expression |
| US10837014B2 (en) | 2012-05-16 | 2020-11-17 | Translate Bio Ma, Inc. | Compositions and methods for modulating SMN gene family expression |
| JP2013256452A (ja) * | 2012-06-11 | 2013-12-26 | Kawaken Fine Chem Co Ltd | メラニン産生抑制剤とその組成物 |
| WO2013191129A1 (ja) | 2012-06-18 | 2013-12-27 | 第一三共株式会社 | ヌクレオシド類縁体の製造中間体及びその製造方法 |
| WO2014045126A2 (en) | 2012-09-18 | 2014-03-27 | Uti Limited Partnership | Treatment of pain by inhibition of usp5 de-ubiquitinase |
| WO2014059353A2 (en) | 2012-10-11 | 2014-04-17 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleosides and uses thereof |
| US9029335B2 (en) | 2012-10-16 | 2015-05-12 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Substituted 2′-thio-bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom |
| BR112015010220A2 (pt) | 2012-11-05 | 2017-12-05 | Pronai Therapeutics Inc | métodos de utilização de biomarcadores para tratamento de câncer |
| CN105143470B (zh) | 2013-02-28 | 2020-06-09 | 德克萨斯大学系统董事会 | 用于将癌症分类为易感于tmepai定向疗法以及治疗所述癌症的方法 |
| WO2014143158A1 (en) | 2013-03-13 | 2014-09-18 | The Broad Institute, Inc. | Compositions and methods for labeling of agents |
| US9273349B2 (en) | 2013-03-14 | 2016-03-01 | Affymetrix, Inc. | Detection of nucleic acids |
| ES2807379T3 (es) | 2013-03-14 | 2021-02-22 | Ionis Pharmaceuticals Inc | Composiciones y métodos para regular la expresión de Tau |
| WO2014176259A1 (en) | 2013-04-22 | 2014-10-30 | Icahn School Of Medicine At Mount Sinai | Mutations in pdgfrb and notch3 as causes of autosomal dominant infantile myofibromatosis |
| DK2991656T3 (da) | 2013-05-01 | 2020-03-23 | Ionis Pharmaceuticals Inc | Sammensætninger og fremgangsmåder til modulering af apolipoprotein c-iii-ekspression |
| TWI772856B (zh) | 2013-07-19 | 2022-08-01 | 美商百健Ma公司 | 用於調節τ蛋白表現之組合物 |
| US10174328B2 (en) | 2013-10-04 | 2019-01-08 | Translate Bio Ma, Inc. | Compositions and methods for treating amyotrophic lateral sclerosis |
| US11162096B2 (en) | 2013-10-14 | 2021-11-02 | Ionis Pharmaceuticals, Inc | Methods for modulating expression of C9ORF72 antisense transcript |
| WO2015075166A1 (en) | 2013-11-22 | 2015-05-28 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Methods and pharmaceutical compositions for treatment of a bacterial infection |
| WO2015084897A2 (en) | 2013-12-02 | 2015-06-11 | Mirimmune, Llc | Immunotherapy of cancer |
| US9765332B2 (en) | 2014-01-29 | 2017-09-19 | Inserm (Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale) | Oligonucleotides and methods for inhibiting or reducing bacterial biofilms |
| RS60707B1 (sr) | 2014-04-01 | 2020-09-30 | Biogen Ma Inc | Kompozicije za modulaciju ekspresije sod-1 |
| US11279934B2 (en) | 2014-04-28 | 2022-03-22 | Phio Pharmaceuticals Corp. | Methods for treating cancer using nucleic acids targeting MDM2 or MYCN |
| DK3137476T3 (da) | 2014-04-28 | 2019-11-18 | Ionis Pharmaceuticals Inc | Linker-modificerede oligomerforbindelser |
| SG11201608502TA (en) | 2014-05-01 | 2016-11-29 | Ionis Pharmaceuticals Inc | Compositions and methods for modulating complement factor b expression |
| GB201410693D0 (en) | 2014-06-16 | 2014-07-30 | Univ Southampton | Splicing modulation |
| TW201620526A (zh) | 2014-06-17 | 2016-06-16 | 愛羅海德研究公司 | 用於抑制α-1抗胰蛋白酶基因表現之組合物及方法 |
| JP6562517B2 (ja) * | 2014-07-31 | 2019-08-21 | 国立大学法人大阪大学 | 架橋型ヌクレオシドおよびヌクレオチド |
| IL234246A0 (en) | 2014-08-21 | 2014-11-30 | Omrix Biopharmaceuticals Ltd | Stabilized thrombin |
| KR102506169B1 (ko) | 2014-09-05 | 2023-03-08 | 피오 파마슈티칼스 코프. | Tyr 또는 mmp1을 표적화하는 핵산을 사용한 노화 및 피부 장애의 치료 방법 |
| CN107109411B (zh) | 2014-10-03 | 2022-07-01 | 冷泉港实验室 | 核基因输出的定向增加 |
| US9816080B2 (en) | 2014-10-31 | 2017-11-14 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery of CAS9 via ARRDC1-mediated microvesicles (ARMMs) |
| CA2970795A1 (en) | 2014-12-18 | 2016-06-23 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Reversir compounds |
| US9688707B2 (en) | 2014-12-30 | 2017-06-27 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Bicyclic morpholino compounds and oligomeric compounds prepared therefrom |
| WO2016112132A1 (en) | 2015-01-06 | 2016-07-14 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for modulating expression of c9orf72 antisense transcript |
| WO2016167780A1 (en) | 2015-04-16 | 2016-10-20 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Compositions for modulating expression of c9orf72 antisense transcript |
| CN108135923B (zh) | 2015-07-06 | 2021-03-02 | 菲奥医药公司 | 靶向超氧化物歧化酶1(sod1)的核酸分子 |
| US10808247B2 (en) | 2015-07-06 | 2020-10-20 | Phio Pharmaceuticals Corp. | Methods for treating neurological disorders using a synergistic small molecule and nucleic acids therapeutic approach |
| EP3919619A1 (en) | 2015-07-17 | 2021-12-08 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Multi-targeted single entity conjugates |
| JP6835826B2 (ja) | 2015-08-24 | 2021-02-24 | ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス | Lna−gプロセス |
| EP3359685B1 (en) | 2015-10-09 | 2026-01-28 | University Of Southampton | Modulation of gene expression for deregulated protein expression |
| WO2017070151A1 (en) | 2015-10-19 | 2017-04-27 | Rxi Pharmaceuticals Corporation | Reduced size self-delivering nucleic acid compounds targeting long non-coding rna |
| WO2017068087A1 (en) | 2015-10-22 | 2017-04-27 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotide detection method |
| US11273151B2 (en) | 2015-11-04 | 2022-03-15 | Icahn School Of Medicine At Mount Sinai | Methods of treating tumors and cancer, and identifying candidate subjects for such treatment |
| HUE067905T2 (hu) | 2015-11-12 | 2024-11-28 | Hoffmann La Roche | Oligonukleotidok paternális UBE3A expresszió indukálására |
| US11058709B1 (en) | 2015-12-04 | 2021-07-13 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Methods of treating breast cancer |
| US11096956B2 (en) | 2015-12-14 | 2021-08-24 | Stoke Therapeutics, Inc. | Antisense oligomers and uses thereof |
| EP3933041B1 (en) | 2015-12-14 | 2024-01-31 | Cold Spring Harbor Laboratory | Antisense oligomers for treatment of autosomal dominant retardation |
| PH12018501207B1 (en) | 2015-12-21 | 2024-02-23 | Novartis Ag | Compositions and methods for decreasing tau expression |
| WO2023150553A1 (en) | 2022-02-01 | 2023-08-10 | University Of Rochester | Gpr17 promoter-based targeting and transduction of glial progenitor cells |
| KR20250065735A (ko) | 2016-03-14 | 2025-05-13 | 에프. 호프만-라 로슈 아게 | Pd-l1 발현의 감소를 위한 올리고뉴클레오티드 |
| AU2017234678A1 (en) | 2016-03-16 | 2018-08-16 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Methods of modulating KEAP1 |
| WO2017161168A1 (en) | 2016-03-16 | 2017-09-21 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Modulation of dyrk1b expression |
| EP3442983A1 (en) | 2016-04-14 | 2019-02-20 | H. Hoffnabb-La Roche Ag | TRITYL-MONO-Ga1NAc COMPOUNDS AND THEIR USE |
| US11246868B2 (en) | 2016-04-26 | 2022-02-15 | Icahn School Of Medicine At Mount Sinai | Treatment of hippo pathway mutant tumors and methods of identifying subjects as candidates for treatment |
| EP3471781A4 (en) | 2016-06-17 | 2020-05-06 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | MODULATION OF GYS1 EXPRESSION |
| CN109414448B (zh) | 2016-06-17 | 2021-10-26 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 用于减少PAPD5或PAPD7 mRNA治疗乙型肝炎感染的核酸分子 |
| AU2017289204A1 (en) | 2016-07-01 | 2019-01-17 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Antisense oligonucleotides for modulating HTRA1 expression |
| WO2018009466A1 (en) | 2016-07-05 | 2018-01-11 | Aduro Biotech, Inc. | Locked nucleic acid cyclic dinucleotide compounds and uses thereof |
| WO2018013525A1 (en) | 2016-07-11 | 2018-01-18 | Translate Bio Ma, Inc. | Nucleic acid conjugates and uses thereof |
| AU2017326372B2 (en) | 2016-09-14 | 2023-12-07 | Janssen Biopharma, Inc. | Modified oligonucleotides and methods of use |
| ES2963428T3 (es) | 2016-09-29 | 2024-03-27 | Biogen Ma Inc | Compuestos y métodos para reducir la expresión de Tau |
| US11730823B2 (en) | 2016-10-03 | 2023-08-22 | President And Fellows Of Harvard College | Delivery of therapeutic RNAs via ARRDC1-mediated microvesicles |
| US20190284621A1 (en) | 2016-11-11 | 2019-09-19 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Therapeutic oligonucleotides capture and detection |
| WO2018102745A1 (en) | 2016-12-02 | 2018-06-07 | Cold Spring Harbor Laboratory | Modulation of lnc05 expression |
| CN110199023A (zh) | 2016-12-28 | 2019-09-03 | 第一三共株式会社 | 阿尔波特氏综合症治疗药 |
| BR112019014282A2 (pt) | 2017-01-10 | 2020-03-03 | Arrowhead Pharmaceuticals, Inc. | Agentes de rnai de antitripsina (aat) alfa-1, composições incluindo agentes de rnai de aat, e métodos de uso |
| US20190367920A1 (en) | 2017-01-13 | 2019-12-05 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides for modulating nfkb1 expression |
| WO2018130582A1 (en) | 2017-01-13 | 2018-07-19 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides for modulating rel expression |
| WO2018130585A1 (en) | 2017-01-13 | 2018-07-19 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides for modulating relb expression |
| US20200216845A1 (en) | 2017-01-13 | 2020-07-09 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides for modulating rela expression |
| US20190345495A1 (en) | 2017-01-13 | 2019-11-14 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides for modulating nfkb2 expression |
| US11180756B2 (en) | 2017-03-09 | 2021-11-23 | Ionis Pharmaceuticals | Morpholino modified oligomeric compounds |
| US11377468B2 (en) | 2017-03-10 | 2022-07-05 | Lakewood Amedex, Inc. | Antimicrobial compounds, compositions, and uses thereof |
| US11795192B2 (en) | 2017-03-10 | 2023-10-24 | Lakewood Amedex, Inc. | Antimicrobial compounds, compositions, and uses thereof |
| US11963974B2 (en) | 2017-03-10 | 2024-04-23 | National Center For Child Health And Development | Antisense oligonucleotide and composition for prevention or treatment of glycogen storage disease type Ia |
| US12030908B2 (en) | 2017-03-10 | 2024-07-09 | Lakewood Amedex, Inc. | Antimicrobial compounds, compositions, and uses thereof |
| JP6917078B2 (ja) * | 2017-03-10 | 2021-08-11 | レイクウッド アメディックス、インコーポレイテッド | 抗菌化合物、組成物、及びそれらの使用 |
| WO2018169063A1 (ja) | 2017-03-17 | 2018-09-20 | 国立大学法人千葉大学 | 構造強化されたS-TuDを用いた新規がん治療法 |
| WO2018195355A1 (en) | 2017-04-19 | 2018-10-25 | Rxi Pharmaceuticals Corporation | Topical delivery of nucleic acid compounds |
| EP3626821A4 (en) | 2017-05-18 | 2021-03-03 | Kyoto University | COMPOSITION FOR THE PREVENTION OR TREATMENT OF SPINOCEREBEL ATAXIA TYPE 36 |
| US20190055564A1 (en) | 2017-06-01 | 2019-02-21 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Antisense oligonucleotides for modulating htra1 expression |
| WO2019009299A1 (ja) | 2017-07-05 | 2019-01-10 | 国立大学法人大阪大学 | α-シヌクレイン発現抑制するENAアンチセンスオリゴヌクレオチド |
| US11028390B2 (en) | 2017-07-10 | 2021-06-08 | Osaka University | Antisense oligonucleotide controlling expression amount of TDP-43 and use thereof |
| WO2019030313A2 (en) | 2017-08-11 | 2019-02-14 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | OLIGONUCLEOTIDES FOR MODULATION OF UBE3C EXPRESSION |
| US11197884B2 (en) | 2017-08-18 | 2021-12-14 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Modulation of the notch signaling pathway for treatment of respiratory disorders |
| WO2019038228A1 (en) | 2017-08-22 | 2019-02-28 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | OLIGONUCLEOTIDES FOR MODULATION OF TOM1 EXPRESSION |
| SG11202001590RA (en) | 2017-08-25 | 2020-03-30 | Stoke Therapeutics Inc | Antisense oligomers for treatment of conditions and diseases |
| US10517889B2 (en) | 2017-09-08 | 2019-12-31 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Modulators of SMAD7 expression |
| EP3682007A2 (en) | 2017-09-14 | 2020-07-22 | Janssen BioPharma, Inc. | Galnac derivatives |
| CN111226114A (zh) | 2017-10-13 | 2020-06-02 | 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 | 用部分立体限定的寡核苷酸子文库鉴定反义寡核苷酸改进的立体限定硫代磷酸酯寡核苷酸变体的方法 |
| UA126931C2 (uk) | 2017-10-16 | 2023-02-22 | Ф. Хоффманн-Ля Рош Аг | МОЛЕКУЛИ НУКЛЕЇНОВИХ КИСЛОТ ДЛЯ ЗМЕНШЕННЯ РІВНЯ мРНК PAPD5 І PAPD7 ДЛЯ ЛІКУВАННЯ ІНФЕКЦІЙНОГО ГЕПАТИТУ B |
| WO2019076919A1 (en) | 2017-10-17 | 2019-04-25 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | COMBINED TREATMENT OF CYSTIC FIBROSIS |
| WO2019111791A1 (ja) * | 2017-12-07 | 2019-06-13 | 第一三共株式会社 | ジストロフィン遺伝子のイントロンリテンションを解消するアンチセンスオリゴヌクレオチド |
| US20200385714A1 (en) | 2017-12-11 | 2020-12-10 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotides for modulating fndc3b expression |
| WO2019115417A2 (en) | 2017-12-12 | 2019-06-20 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotides for modulating rb1 expression |
| JP2021507253A (ja) | 2017-12-21 | 2021-02-22 | エフ.ホフマン−ラ ロシュ アーゲーF. Hoffmann−La Roche Aktiengesellschaft | Htra1 rnaアンタゴニストについてのコンパニオン診断 |
| WO2019122279A1 (en) | 2017-12-22 | 2019-06-27 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotides comprising a phosphorodithioate internucleoside linkage |
| CN111448316B (zh) | 2017-12-22 | 2025-02-14 | 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 | 新的硫代亚磷酰胺 |
| WO2019122282A1 (en) | 2017-12-22 | 2019-06-27 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Gapmer oligonucleotides comprising a phosphorodithioate internucleoside linkage |
| US20210095274A1 (en) | 2018-01-10 | 2021-04-01 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotides for modulating pias4 expression |
| WO2019140102A1 (en) | 2018-01-10 | 2019-07-18 | Translate Bio Ma, Inc. | Compositions and methods for facilitating delivery of synthetic nucleic acids to cells |
| AU2019207859A1 (en) | 2018-01-12 | 2020-07-02 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Alpha-synuclein antisense oligonucleotides and uses thereof |
| US20210095275A1 (en) | 2018-01-12 | 2021-04-01 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotides for modulating gsk3b expression |
| EA202091693A1 (ru) | 2018-01-12 | 2021-04-14 | Бристол-Маерс Сквибб Компани | Антисмысловые олигонуклеотиды, целенаправленно воздействующие на альфа-синуклеин, и их применения |
| BR112020013994A2 (pt) | 2018-01-12 | 2020-12-08 | Bristol-Myers Squibb Company | Oligonucleotídeos antissenso que direcionam alfa-sinucleína e seus usos |
| CN111615558A (zh) | 2018-01-17 | 2020-09-01 | 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 | 用于调节erc1表达的寡核苷酸 |
| WO2019141723A1 (en) | 2018-01-18 | 2019-07-25 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting srebp1 |
| WO2019145386A1 (en) | 2018-01-26 | 2019-08-01 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotides for modulating csnk1d expression |
| CA3088071A1 (en) | 2018-02-09 | 2019-08-15 | Genentech, Inc. | Oligonucleotides for modulating tmem106b expression |
| KR20200140805A (ko) | 2018-02-21 | 2020-12-16 | 브리스톨-마이어스 스큅 컴퍼니 | Camk2d 안티센스 올리고뉴클레오티드 및 그의 용도 |
| CN111511915A (zh) | 2018-03-09 | 2020-08-07 | 第一三共株式会社 | 糖原病Ia型治疗药 |
| KR20200131263A (ko) | 2018-03-13 | 2020-11-23 | 얀센 파마슈티카 엔.브이. | 변형 올리고뉴클레오티드 및 타우병증에서의 사용 방법 |
| MA52661A (fr) | 2018-04-05 | 2021-02-17 | Centre Leon Berard | Utilisation d'inhibiteurs de fubp1 dans le traitement d'une infection par le virus de l'hépatite b |
| US12060558B2 (en) | 2018-05-04 | 2024-08-13 | Stoke Therapeutics, Inc. | Methods and compositions for treatment of cholesteryl ester storage disease |
| WO2019215066A1 (en) | 2018-05-07 | 2019-11-14 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Quality control of lna oligonucleotide therapeutics using massively parallel sequencing |
| WO2019217459A1 (en) | 2018-05-07 | 2019-11-14 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Extrahepatic delivery |
| US20210371860A1 (en) | 2018-05-08 | 2021-12-02 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotides for modulating myh7 expression |
| EP3793685A1 (en) | 2018-05-18 | 2021-03-24 | F. Hoffmann-La Roche AG | Pharmaceutical compositions for treatment of microrna related diseases |
| WO2019224172A1 (en) | 2018-05-25 | 2019-11-28 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Novel process for making allofuranose from glucofuranose |
| WO2019233922A1 (en) | 2018-06-05 | 2019-12-12 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Oligonucleotides for modulating atxn2 expression |
| US20210207136A1 (en) | 2018-06-13 | 2021-07-08 | Daiichi Sankyo Company, Limited | Myocardial dysfunction therapeutic agent |
| CN112566640A (zh) | 2018-06-18 | 2021-03-26 | 罗切斯特大学 | 治疗精神分裂症和其他神经精神病症的方法 |
| WO2019246262A2 (en) | 2018-06-21 | 2019-12-26 | University Of Rochester | Methods of treating or inhibiting onset of huntington's disease |
| WO2020007772A1 (en) | 2018-07-02 | 2020-01-09 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting gbp-1 |
| WO2020007702A1 (en) | 2018-07-02 | 2020-01-09 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting bcl2l11 |
| WO2020007700A1 (en) | 2018-07-02 | 2020-01-09 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting spi1 |
| SG11202012759XA (en) | 2018-07-03 | 2021-01-28 | Hoffmann La Roche | Oligonucleotides for modulating tau expression |
| EP3819378A4 (en) | 2018-07-04 | 2022-09-14 | Aichi Medical University | OLIGONUCLEOTIDES FOR CONTROL OF TAU SPLICING AND THEIR USES |
| WO2020007889A1 (en) | 2018-07-05 | 2020-01-09 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting stat1 |
| WO2020007826A1 (en) | 2018-07-05 | 2020-01-09 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting mbtps1 |
| WO2020011653A1 (en) | 2018-07-09 | 2020-01-16 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting kynu |
| WO2020011743A1 (en) | 2018-07-09 | 2020-01-16 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting mafb |
| WO2020011744A2 (en) | 2018-07-11 | 2020-01-16 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting cers5 |
| WO2020011869A2 (en) | 2018-07-11 | 2020-01-16 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting tlr2 |
| WO2020011745A2 (en) | 2018-07-11 | 2020-01-16 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting cers6 |
| EP4512407A3 (en) | 2018-07-13 | 2025-09-24 | F. Hoffmann-La Roche AG | Oligonucleotides for modulating rtel1 expression |
| US20210292358A1 (en) | 2018-07-31 | 2021-09-23 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotides comprising a phosphorotrithioate internucleoside linkage |
| EP3830101B1 (en) | 2018-07-31 | 2025-11-19 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Oligonucleotides comprising a phosphorotrithioate internucleoside linkage |
| US20220193250A1 (en) | 2018-08-02 | 2022-06-23 | Dyne Therapeutics, Inc. | Muscle targeting complexes and uses thereof for treating facioscapulohumeral muscular dystrophy |
| US12018087B2 (en) | 2018-08-02 | 2024-06-25 | Dyne Therapeutics, Inc. | Muscle-targeting complexes comprising an anti-transferrin receptor antibody linked to an oligonucleotide and methods of delivering oligonucleotide to a subject |
| US11911484B2 (en) | 2018-08-02 | 2024-02-27 | Dyne Therapeutics, Inc. | Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy |
| US12097263B2 (en) | 2018-08-02 | 2024-09-24 | Dyne Therapeutics, Inc. | Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy |
| WO2020038973A1 (en) | 2018-08-23 | 2020-02-27 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting sptlc1 |
| WO2020038971A1 (en) | 2018-08-23 | 2020-02-27 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting vcan |
| WO2020038976A1 (en) | 2018-08-23 | 2020-02-27 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Antisense oligonucleotides targeting usp8 |
| EP3841220A1 (en) | 2018-08-23 | 2021-06-30 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Microrna-134 biomarker |
| JP2021536239A (ja) | 2018-08-28 | 2021-12-27 | ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス | スプライス調節化合物を使用したネオアンチゲン操作 |
| EP3620519A1 (en) | 2018-09-04 | 2020-03-11 | F. Hoffmann-La Roche AG | Use of isolated milk extracellular vesicles for delivering oligonucleotides orally |
| WO2020069055A1 (en) | 2018-09-28 | 2020-04-02 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Transthyretin (ttr) irna compositions and methods of use thereof for treating or preventing ttr-associated ocular diseases |
| SG11202103180QA (en) | 2018-10-17 | 2021-05-28 | Lakewood Amedex Inc | Methods and compositions for treating oral mucositis |
| EP3873920A1 (en) | 2018-11-01 | 2021-09-08 | F. Hoffmann-La Roche AG | Antisense oligonucleotides targeting tia1 |
| TW202028222A (zh) | 2018-11-14 | 2020-08-01 | 美商Ionis製藥公司 | Foxp3表現之調節劑 |
| BR112021008967A2 (pt) | 2018-11-15 | 2021-08-17 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | moduladores da expressão de irf5 |
| EP3883941A1 (en) | 2018-11-22 | 2021-09-29 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Pyridinium salts as activators in the synthesis of stereodefined oligonucleotides |
| WO2020109344A1 (en) | 2018-11-29 | 2020-06-04 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Occular administration device for antisense oligonucleotides |
| WO2020109343A1 (en) | 2018-11-29 | 2020-06-04 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Combination therapy for treatment of macular degeneration |
| CA3122289A1 (en) | 2018-12-11 | 2020-06-18 | University Of Rochester | Methods of treating schizophrenia and other neuropsychiatric disorders |
| US20220042011A1 (en) | 2018-12-21 | 2022-02-10 | Hoffmann-La Roche Inc. | Antisense oligonucleotides targeting card9 |
| EP3914232A1 (en) | 2019-01-25 | 2021-12-01 | F. Hoffmann-La Roche AG | Lipid vesicle for oral drug delivery |
| SG11202107399WA (en) * | 2019-01-31 | 2021-08-30 | Ionis Pharmaceuticals Inc | Modulators of yap1 expression |
| WO2020167822A2 (en) | 2019-02-13 | 2020-08-20 | University Of Rochester | Gene networks that mediate remyelination of the human brain |
| WO2020169696A1 (en) | 2019-02-20 | 2020-08-27 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Novel phosphoramidites |
| CA3130431A1 (en) | 2019-02-20 | 2020-08-27 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Phosphonoacetate gapmer oligonucleotides |
| CN113474633A (zh) | 2019-02-26 | 2021-10-01 | 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 | 寡核苷酸配制方法 |
| TW202540426A (zh) | 2019-02-27 | 2025-10-16 | 美商Ionis製藥公司 | Malat1表現之調節劑 |
| KR20210134003A (ko) | 2019-02-27 | 2021-11-08 | 스톡 테라퓨틱스, 인크. | 병태 및 질환의 치료를 위한 안티센스 올리고머 |
| US12215382B2 (en) | 2019-03-01 | 2025-02-04 | The General Hospital Corporation | Liver protective MARC variants and uses thereof |
| WO2020178258A1 (en) | 2019-03-05 | 2020-09-10 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Intracellular targeting of molecules |
| KR20210141554A (ko) | 2019-03-21 | 2021-11-23 | 코디악 바이오사이언시즈, 인크. | 세포외 소포 접합체 및 이의 용도 |
| WO2020203896A1 (ja) | 2019-03-29 | 2020-10-08 | シスメックス株式会社 | 新規人工核酸、その製造方法及び用途 |
| KR20210149107A (ko) | 2019-04-03 | 2021-12-08 | 브리스톨-마이어스 스큅 컴퍼니 | Angptl2 안티센스 올리고뉴클레오티드 및 그의 용도 |
| JP7499267B2 (ja) | 2019-04-04 | 2024-06-13 | エフ. ホフマン-ラ ロシュ アーゲー | Atxn2発現を調節するためのオリゴヌクレオチド |
| US11286485B2 (en) | 2019-04-04 | 2022-03-29 | Hoffmann-La Roche Inc. | Oligonucleotides for modulating ATXN2 expression |
| CN113661168A (zh) | 2019-04-16 | 2021-11-16 | 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 | 用于制备核苷酸p(v)单体的新方法 |
| JP7644025B2 (ja) | 2019-04-30 | 2025-03-11 | ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス | レニウムキレート化mag3オリゴヌクレオチドを調製するための新規の方法 |
| WO2020226960A1 (en) | 2019-05-03 | 2020-11-12 | Dicerna Pharmaceuticals, Inc. | Double-stranded nucleic acid inhibitor molecules with shortened sense strands |
| JP2022532652A (ja) | 2019-05-17 | 2022-07-15 | アルニラム ファーマスーティカルズ インコーポレイテッド | オリゴヌクレオチドの経口送達 |
| MX2021015003A (es) | 2019-06-06 | 2022-01-24 | Arrowhead Pharmaceuticals Inc | Metodos para el tratamiento de la deficiencia de alfa-1 antitripsina (aatd). |
| EP3980539A1 (en) | 2019-06-06 | 2022-04-13 | F. Hoffmann-La Roche AG | Antisense oligonucleotides targeting atxn3 |
| EP3988558A4 (en) * | 2019-06-19 | 2022-09-28 | Yamasa Corporation | CROSSLINKED INTERMEDIATE NUCLEOSIDE CRYSTAL AND METHOD OF PRODUCTION THEREOF AND METHODS OF PRODUCTION OF CROSSLINKED NUCLEOSIDAMIDITE |
| EP3995153A4 (en) | 2019-06-26 | 2023-11-22 | KNC Laboratories Co., Ltd. | Nucleic acid drug suppressing production of myostatin gene mrna |
| US20220251567A1 (en) | 2019-07-10 | 2022-08-11 | Inserm (Institut National De La Santè Et De La Recherche Médicale) | Methods for the treatment of epilepsy |
| BR112021024764A2 (pt) | 2019-07-12 | 2022-04-19 | Daiichi Sankyo Co Ltd | Oligonucleotídeo antissenso capaz de alterar o splicing de pré-mrna de dux4 |
| US20220267737A1 (en) | 2019-07-18 | 2022-08-25 | University Of Rochester | Cell-type selective immunoprotection of cells |
| EP3956450B1 (en) | 2019-07-26 | 2025-08-13 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Compounds and methods for modulating gfap |
| KR20220070433A (ko) | 2019-08-14 | 2022-05-31 | 코디악 바이오사이언시즈, 인크. | Stat6을 표적으로 하는 세포외 소포-aso 작제물 |
| EP4013876A1 (en) | 2019-08-14 | 2022-06-22 | Codiak BioSciences, Inc. | Extracellular vesicle-nlrp3 antagonist |
| CA3147366A1 (en) | 2019-08-14 | 2021-02-18 | Adam T. BOUTIN | Extracellular vesicles with stat3-antisense oligonucleotides |
| CA3147701A1 (en) | 2019-08-14 | 2021-02-18 | Codiak Biosciences, Inc. | Extracellular vesicles with antisense oligonucleotides targeting kras |
| CA3145924A1 (en) | 2019-08-14 | 2021-02-18 | Yi Zhang | Extracellular vesicle linked to molecules and uses thereof |
| AU2020330133A1 (en) | 2019-08-14 | 2022-03-17 | Lonza Sales Ag | Extracellular vesicle-ASO constructs targeting CEBP/beta |
| EP4013767A4 (en) | 2019-08-15 | 2023-10-25 | Ionis Pharmaceuticals, Inc. | Linkage modified oligomeric compounds and uses thereof |
| WO2021049504A1 (ja) | 2019-09-10 | 2021-03-18 | 第一三共株式会社 | 肝臓送達用GalNAc-オリゴヌクレオチドコンジュゲートおよび製造方法 |
| EP4034247A1 (en) | 2019-09-25 | 2022-08-03 | Codiak BioSciences, Inc. | Sting agonist comprising exosomes for treating neuroimmunological disorders |
| KR20220108036A (ko) | 2019-09-26 | 2022-08-02 | 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 | 최소 아레스틴 도메인 함유 단백질 1 (arrdc1) 구축물 |
| WO2021074657A1 (en) | 2019-10-17 | 2021-04-22 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Combination treatment for cystic fibrosis |
| IL292286A (en) * | 2019-10-18 | 2022-06-01 | Daiichi Sankyo Co Ltd | Production method for bicyclic phosphoramidite |
| CN111109591A (zh) | 2019-10-25 | 2020-05-08 | 新疆红旗坡农业发展集团有限公司 | 肠道微生态高效重建型苹果酵素及加工技术 |
| EP4055165A1 (en) | 2019-11-06 | 2022-09-14 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Transthyretin (ttr) irna compositions and methods of use thereof for treating or preventing ttr-associated ocular diseases |
| CA3160329A1 (en) | 2019-11-06 | 2021-05-14 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Extrahepatic delivery |
| US20230016983A1 (en) | 2019-11-19 | 2023-01-19 | lNSERM (INSTITUT NATIONAL DE LA SANTÉ ET DE LA RECHERCHE MÉDICALE) | Antisense oligonucleotides and thier use for the treatment of cancer |
| CN114829599A (zh) | 2019-12-19 | 2022-07-29 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | Scamp3抑制剂用于治疗乙型肝炎病毒感染的用途 |
| CN115516091A (zh) | 2019-12-19 | 2022-12-23 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | Cops3抑制剂用于治疗乙型肝炎病毒感染的用途 |
| CN114901821A (zh) | 2019-12-19 | 2022-08-12 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | Sept9抑制剂用于治疗乙型肝炎病毒感染的用途 |
| US20230020092A1 (en) | 2019-12-19 | 2023-01-19 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions for delivery of antisense compounds |
| JP2023506954A (ja) | 2019-12-19 | 2023-02-20 | エフ. ホフマン-ラ ロシュ エージー. | B型肝炎ウイルス感染を処置するためのsaraf阻害剤の使用 |
| JP2023506550A (ja) | 2019-12-19 | 2023-02-16 | エフ. ホフマン-ラ ロシュ エージー. | B型肝炎ウイルス感染症を処置するためのsbds阻害剤の使用 |
| EP4077672A1 (en) | 2019-12-20 | 2022-10-26 | F. Hoffmann-La Roche AG | Enhanced oligonucleotides for inhibiting scn9a expression |
| EP4081639A1 (en) | 2019-12-24 | 2022-11-02 | F. Hoffmann-La Roche AG | Pharmaceutical combination of a therapeutic oligonucleotide targeting hbv and a tlr7 agonist for treatment of hbv |
| CN114828852A (zh) | 2019-12-24 | 2022-07-29 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 用于治疗hbv的靶向hbv的抗病毒药剂和/或免疫调节剂的药物组合 |
| WO2021158810A1 (en) | 2020-02-05 | 2021-08-12 | Bristol-Myers Squibb Company | Oligonucleotides for splice modulation of camk2d |
| EP4110916A1 (en) | 2020-02-28 | 2023-01-04 | F. Hoffmann-La Roche AG | Oligonucleotides for modulating cd73 exon 7 splicing |
| EP4119167A4 (en) | 2020-03-11 | 2025-08-06 | Biocomber Co Ltd | SINGLE-STRANDED NUCLEIC ACID MOLECULE FOR INDUCING FRAME SHIFT-1 AND COMPOSITION |
| WO2021184020A1 (en) | 2020-03-13 | 2021-09-16 | Codiak Biosciences, Inc. | Methods of treating neuroinflammation |
| WO2021184021A1 (en) | 2020-03-13 | 2021-09-16 | Codiak Biosciences, Inc. | Extracellular vesicle-aso constructs targeting pmp22 |
| CN115843299A (zh) | 2020-03-31 | 2023-03-24 | 詹森生物制药有限公司 | 寡核苷酸的合成和相关化合物 |
| BR112022022889A2 (pt) | 2020-05-11 | 2023-04-04 | Stoke Therapeutics Inc | Oligômeros antissentido de opa1 para tratamento de condições e doenças |
| JP2023527693A (ja) | 2020-05-11 | 2023-06-30 | ジェネンテック, インコーポレイテッド | 神経疾患を治療するための補体成分c1r阻害剤、並びに関連する組成物、システム、及びそれを使用する方法 |
| WO2021231204A1 (en) | 2020-05-11 | 2021-11-18 | Genentech, Inc. | Complement component 4 inhibitors for treating neurological diseases, and related compositons, systems and methods of using same |
| CN115551519A (zh) | 2020-05-11 | 2022-12-30 | 基因泰克公司 | 用于治疗神经系统疾病的补体组分c1s抑制剂以及相关的组合物、系统和使用它们的方法 |
| TW202208628A (zh) | 2020-05-13 | 2022-03-01 | 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 | 靶向顆粒蛋白前體之寡核苷酸促效劑 |
| CN115884777A (zh) | 2020-05-22 | 2023-03-31 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 用于card9的剪接调节的寡核苷酸 |
| US20230212572A1 (en) | 2020-06-09 | 2023-07-06 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Guanosine Analogues for Use in Therapeutics Polynucleotides |
| AR122731A1 (es) | 2020-06-26 | 2022-10-05 | Hoffmann La Roche | Oligonucleótidos mejorados para modular la expresión de fubp1 |
| KR20230050336A (ko) | 2020-07-10 | 2023-04-14 | 인스티튜트 내셔널 드 라 싼테 에 드 라 리셰르셰 메디칼르 (인 썸) | 뇌전증을 치료하기 위한 방법과 조성물 |
| WO2022018155A1 (en) | 2020-07-23 | 2022-01-27 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Lna oligonucleotides for splice modulation of stmn2 |
| WO2022018187A1 (en) | 2020-07-23 | 2022-01-27 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Oligonucleotides targeting rna binding protein sites |
| JP7722666B2 (ja) | 2020-07-28 | 2025-08-13 | 神戸天然物化学株式会社 | アンギオテンシン変換酵素2遺伝子のエクソンのスキッピングを誘導するアンチセンス核酸 |
| JP2023538630A (ja) | 2020-08-21 | 2023-09-08 | エフ. ホフマン-ラ ロシュ アーゲー | B型肝炎ウイルス感染症を処置するためのa1cf阻害剤の使用 |
| WO2022043531A1 (en) * | 2020-08-28 | 2022-03-03 | Janssen Sciences Ireland Unlimited Company | 7'-substituted 2'-o-4'-c-ethylene-bridged nucleic acid (ena) monomers and uses thereof |
| JP7725490B2 (ja) | 2020-09-25 | 2025-08-19 | 株式会社理研ジェネシス | 新規人工核酸、その製造方法及び用途 |
| WO2022076596A1 (en) | 2020-10-06 | 2022-04-14 | Codiak Biosciences, Inc. | Extracellular vesicle-aso constructs targeting stat6 |
| WO2022117747A2 (en) | 2020-12-03 | 2022-06-09 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Antisense oligonucleotides targeting atxn3 |
| TW202237842A (zh) | 2020-12-03 | 2022-10-01 | 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 | 靶向atxn3之反義寡核苷酸 |
| JP2023553069A (ja) | 2020-12-08 | 2023-12-20 | エフ. ホフマン-ラ ロシュ アーゲー | ホスホロジチオエートオリゴヌクレオチドの新規合成 |
| TW202229553A (zh) | 2020-12-18 | 2022-08-01 | 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 | 靶向顆粒蛋白前體之反義寡核苷酸 |
| WO2022136140A1 (en) | 2020-12-22 | 2022-06-30 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Oligonucleotides targeting xbp1 |
| EP4271695A2 (en) | 2020-12-31 | 2023-11-08 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | 2'-modified nucleoside based oligonucleotide prodrugs |
| US20240117356A1 (en) | 2020-12-31 | 2024-04-11 | Dyne Therapeutics, Inc. | Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy |
| WO2022147214A2 (en) | 2020-12-31 | 2022-07-07 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Cyclic-disulfide modified phosphate based oligonucleotide prodrugs |
| TW202246500A (zh) | 2021-02-02 | 2022-12-01 | 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 | 用於抑制 rtel1 表現之增強型寡核苷酸 |
| JP2024506711A (ja) | 2021-02-17 | 2024-02-14 | ロンザ セールス アーゲー | 最適化リンカー及びアンカー部分を介して生物学的に活性な分子に連結した細胞外ベシクル |
| JP2024512236A (ja) | 2021-02-17 | 2024-03-19 | ロンザ セールス アーゲー | 細胞外ベシクル-nlrp3アンタゴニスト |
| US20240229036A9 (en) | 2021-02-26 | 2024-07-11 | Knc Laboratories Co., Ltd. | Nucleic acid medicine expressing splicing variant of myostatin |
| US20250243244A1 (en) | 2021-03-31 | 2025-07-31 | Entrada Therapeutics, Inc. | Cyclic cell penetrating peptides |
| IL305873A (en) | 2021-04-01 | 2023-11-01 | Lonza Sales Ag | Extracellular vesicle compositions |
| US20240358845A1 (en) | 2021-05-10 | 2024-10-31 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for intracellular therapeutics |
| WO2022240721A1 (en) | 2021-05-10 | 2022-11-17 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compositions and methods for modulating interferon regulatory factor-5 (irf-5) activity |
| WO2022240760A2 (en) | 2021-05-10 | 2022-11-17 | Entrada Therapeutics, Inc. | COMPOSITIONS AND METHODS FOR MODULATING mRNA SPLICING |
| KR20240019228A (ko) | 2021-06-08 | 2024-02-14 | 에프. 호프만-라 로슈 아게 | 올리고뉴클레오티드 프로그래눌린 효현제 |
| PE20242357A1 (es) | 2021-06-23 | 2024-12-16 | Entrada Therapeutics Inc | Compuestos antisentido y metodos para dirigirse a repeticiones cug |
| US11969475B2 (en) | 2021-07-09 | 2024-04-30 | Dyne Therapeutics, Inc. | Muscle targeting complexes and uses thereof for treating facioscapulohumeral muscular dystrophy |
| WO2023283403A2 (en) | 2021-07-09 | 2023-01-12 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Bis-rnai compounds for cns delivery |
| US11633498B2 (en) | 2021-07-09 | 2023-04-25 | Dyne Therapeutics, Inc. | Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy |
| TW202421169A (zh) | 2021-07-21 | 2024-06-01 | 美商艾拉倫製藥股份有限公司 | 代謝疾患相關的標靶基因iRNA組成物及其使用方法 |
| WO2023021046A1 (en) | 2021-08-16 | 2023-02-23 | Vib Vzw | Oligonucleotides for modulating synaptogyrin-3 expression |
| US20240390508A1 (en) | 2021-08-21 | 2024-11-28 | Takeda Pharmaceutical Company Limited | Human transferrin receptor binding peptide-drug conjugate |
| WO2023034817A1 (en) | 2021-09-01 | 2023-03-09 | Entrada Therapeutics, Inc. | Compounds and methods for skipping exon 44 in duchenne muscular dystrophy |
| JP2024536132A (ja) | 2021-09-29 | 2024-10-04 | エフ. ホフマン-ラ ロシュ アーゲー | Rna編集方法 |
| MX2024004437A (es) | 2021-10-15 | 2024-07-01 | Alnylam Pharmaceuticals Inc | Composiciones de inhibidor de la angiotensina-receptor neprilisina (arni) de administracion extrahepatica y metodos de uso de las mismas. |
| EP4426833A1 (en) | 2021-11-03 | 2024-09-11 | F. Hoffmann-La Roche AG | Oligonucleotides for modulating apolipoprotein e4 expression |
| CA3234478A1 (en) | 2021-11-11 | 2023-05-19 | Souphalone LUANGSAY | Pharmaceutical combinations for treatment of hbv |
| EP4444882A1 (en) | 2021-12-07 | 2024-10-16 | F. Hoffmann-La Roche AG | Antisense oligonucleotides targeting actl6b |
| EP4448763A1 (en) | 2021-12-17 | 2024-10-23 | F. Hoffmann-La Roche AG | Oligonucleotide gba agonists |
| EP4448106A1 (en) | 2021-12-17 | 2024-10-23 | Hoffmann-La Roche Inc. | Combination of oligonucleotides for modulating rtel1 and fubp1 |
| JP2024547071A (ja) | 2021-12-20 | 2024-12-26 | エフ. ホフマン-ラ ロシュ アーゲー | トレオース核酸アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびその方法 |
| MX2024007790A (es) | 2021-12-22 | 2024-09-06 | Camp4 Therapeutics Corp | Modulación de la transcripción génica utilizando oligonucleótidos antisentido dirigidos a arn reguladores. |
| JPWO2023127857A1 (cs) | 2021-12-27 | 2023-07-06 | ||
| EP4465994A1 (en) | 2022-01-20 | 2024-11-27 | Genentech, Inc. | Antisense oligonucleotides for modulating tmem106b expression |
| WO2023152369A1 (en) | 2022-02-14 | 2023-08-17 | INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) | Nucleic acid mir-9 inhibitor for the treatment of cystic fibrosis |
| US20240167040A1 (en) | 2022-02-21 | 2024-05-23 | Hoffmann-La Roche Inc. | Antisense oligonucleotide |
| JPWO2023176863A1 (cs) | 2022-03-16 | 2023-09-21 | ||
| KR20240161967A (ko) | 2022-03-16 | 2024-11-13 | 다이이찌 산쿄 가부시키가이샤 | 트랜스페린 수용체 2 의 발현을 억제하는 siRNA |
| US20250339553A1 (en) | 2022-04-15 | 2025-11-06 | Dyne Therapeutics, Inc. | Muscle targeting complexes and formulations for treating myotonic dystrophy |
| CN119173632A (zh) | 2022-05-10 | 2024-12-20 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 靶向cfp-elk1基因间区域的反义寡核苷酸 |
| EP4522742A2 (en) | 2022-05-13 | 2025-03-19 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Single-stranded loop oligonucleotides |
| PE20250394A1 (es) | 2022-05-18 | 2025-02-11 | Hoffmann La Roche | Oligonucleotidos mejorados que actuan sobre sitios de proteina de union a arn |
| EP4536831A2 (en) | 2022-06-10 | 2025-04-16 | Camp4 Therapeutics Corporation | Methods of modulating progranulin expression using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas |
| CN119365600A (zh) | 2022-06-17 | 2025-01-24 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 靶向颗粒蛋白前体的反义寡核苷酸 |
| WO2024006999A2 (en) | 2022-06-30 | 2024-01-04 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Cyclic-disulfide modified phosphate based oligonucleotide prodrugs |
| EP4558149A1 (en) | 2022-07-21 | 2025-05-28 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale | Methods and compositions for treating chronic pain disorders |
| IL318625A (en) | 2022-07-29 | 2025-03-01 | Regeneron Pharma | Compositions and methods for transferrin receptor (TFR)-mediated delivery to brain and muscle |
| US20260049309A1 (en) | 2022-08-15 | 2026-02-19 | Novo Nordisk A/S | Regulation of activity of rnai molecules |
| JP2025527531A (ja) | 2022-08-18 | 2025-08-22 | アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド | ユニバーサル非標的sirna組成物およびその使用方法 |
| EP4332221A1 (en) | 2022-08-29 | 2024-03-06 | Roche Innovation Center Copenhagen A/S | Threose nucleic acid antisense oligonucleotides and methods thereof |
| WO2024052403A1 (en) | 2022-09-06 | 2024-03-14 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Double-stranded rna molecule for administration to the eye |
| JP2025532985A (ja) | 2022-09-30 | 2025-10-03 | アルナイラム ファーマシューティカルズ, インコーポレイテッド | 修飾二本鎖rna剤 |
| IL320016A (en) | 2022-11-04 | 2025-06-01 | Regeneron Pharma | Calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 (cacng1) binding proteins and cacng1-mediated delivery to skeletal muscle |
| WO2024098061A2 (en) | 2022-11-04 | 2024-05-10 | Genkardia Inc. | Oligonucleotide-based therapeutics targeting cyclin d2 for the treatment of heart failure |
| AU2023379457A1 (en) | 2022-11-14 | 2025-05-15 | Regeneron Pharmaceuticals, Inc. | Compositions and methods for fibroblast growth factor receptor 3-mediated delivery to astrocytes |
| AU2023403208A1 (en) | 2022-12-01 | 2025-06-19 | Camp4 Therapeutics Corporation | Modulation of syngap1 gene transcription using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas |
| WO2024126654A1 (en) | 2022-12-14 | 2024-06-20 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Antisense oligonucleotides targeting actl6b |
| EP4646478A1 (en) | 2023-01-06 | 2025-11-12 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale | Intravenous administration of antisense oligonucleotides for the treatment of pain |
| EP4658281A1 (en) | 2023-01-30 | 2025-12-10 | Vib Vzw | Suppressors of tauopathies |
| EP4662311A2 (en) | 2023-02-09 | 2025-12-17 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Reversir molecules and methods of use thereof |
| JP2026507051A (ja) | 2023-02-21 | 2026-02-27 | ブイアイビー ブイゼットダブリュ | シナプトギリン-3発現を調節するためのオリゴヌクレオチド |
| WO2024175586A2 (en) | 2023-02-21 | 2024-08-29 | Vib Vzw | Inhibitors of synaptogyrin-3 expression |
| AU2024254919A1 (en) | 2023-04-12 | 2025-10-30 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Extrahepatic delivery of double-stranded rna agents |
| CN121263524A (zh) | 2023-05-04 | 2026-01-02 | 豪夫迈·罗氏有限公司 | 能够上调葡糖脑苷脂酶表达的寡核苷酸 |
| WO2024233864A2 (en) | 2023-05-10 | 2024-11-14 | Dicerna Pharmaceuticals, Inc. | Galnac-conjugated rnai oligonucleotides |
| WO2024238385A2 (en) | 2023-05-12 | 2024-11-21 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Single-stranded loop oligonucleotides |
| TW202516004A (zh) | 2023-06-16 | 2025-04-16 | 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 | 調節jak1表現之雙股寡核苷酸 |
| WO2025008406A1 (en) | 2023-07-04 | 2025-01-09 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale | Antisense oligonucleotides and their use for the treatment of cancer |
| TW202523839A (zh) | 2023-08-25 | 2025-06-16 | 學校法人福岡大學 | 導入有磷酸部修飾之穩定型標靶編輯引導rna |
| WO2025054459A1 (en) | 2023-09-08 | 2025-03-13 | Dicerna Pharmaceuticals, Inc. | Rnai oligonucleotide conjugates |
| WO2025064660A2 (en) | 2023-09-21 | 2025-03-27 | Alnylam Pharmaceuticals, Inc. | Activin a receptor type 1c (acvr1c) irna compositions and methods of use thereof |
| WO2025132962A2 (en) | 2023-12-21 | 2025-06-26 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Antisense oligonucleotide |
| CN117510564B (zh) * | 2024-01-08 | 2024-03-08 | 苏州诺维康生物科技有限公司 | 一种医药中间体N2-Ac-5'-O-DMT-2'-O-炔丙基鸟苷的合成方法 |
| WO2025237990A1 (en) | 2024-05-14 | 2025-11-20 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale | Antisense oligonucleotides and their use for the treatment of pulmonary fibrosis |
| WO2025252669A1 (en) | 2024-06-03 | 2025-12-11 | Evotec International Gmbh | Modified oligonucleotides for reducing atxn3 expression |
| WO2025255388A1 (en) | 2024-06-05 | 2025-12-11 | Camp4 Therapeutics Corporation | Modulation of syngap1 gene transcription using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas |
| WO2026041784A1 (en) | 2024-08-23 | 2026-02-26 | Vib Vzw | Oligonucleotides for modulating synaptogyrin-3 expression |
| EP4711455A1 (en) | 2024-09-11 | 2026-03-18 | Aarhus Universitet | Small artificial rna (smartrna) oligonucleotide for modulating protein expression |
| WO2026061986A1 (en) | 2024-09-17 | 2026-03-26 | Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale | Antisense oligonucleotide (aso)-mediated down-regulation of cd33 to safely enrich for genetically modified cells |
Family Cites Families (42)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US3687808A (en) | 1969-08-14 | 1972-08-29 | Univ Leland Stanford Junior | Synthetic polynucleotides |
| NZ209840A (en) | 1983-10-17 | 1988-11-29 | Kaji Akira | A method of inhibiting viral propagation by hybridising dna with the viral rna thus blocking its action |
| US5194428A (en) | 1986-05-23 | 1993-03-16 | Worcester Foundation For Experimental Biology | Inhibition of influenza virus replication by oligonucleotide phosphorothioates |
| US4806463A (en) | 1986-05-23 | 1989-02-21 | Worcester Foundation For Experimental Biology | Inhibition of HTLV-III by exogenous oligonucleotides |
| US5004810A (en) | 1988-09-30 | 1991-04-02 | Schering Corporation | Antiviral oligomers |
| US5457189A (en) | 1989-12-04 | 1995-10-10 | Isis Pharmaceuticals | Antisense oligonucleotide inhibition of papillomavirus |
| US5591623A (en) | 1990-08-14 | 1997-01-07 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotide modulation of cell adhesion |
| US5620963A (en) | 1991-10-15 | 1997-04-15 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotides for modulating protein kinase C having phosphorothioate linkages of high chiral purity |
| US5514788A (en) | 1993-05-17 | 1996-05-07 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotide modulation of cell adhesion |
| US5514577A (en) | 1990-02-26 | 1996-05-07 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotide therapies for modulating the effects of herpes viruses |
| US5248670A (en) | 1990-02-26 | 1993-09-28 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense oligonucleotides for inhibiting herpesviruses |
| US5166195A (en) | 1990-05-11 | 1992-11-24 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense inhibitors of the human immunodeficiency virus phosphorothioate oligonucleotides |
| US6111094A (en) | 1990-08-14 | 2000-08-29 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Enhanced antisense modulation of ICAM-1 |
| KR970005274B1 (ko) | 1990-08-14 | 1997-04-15 | 아이시스 파마슈티칼스, 인코포레이티드 | 안티센스 올리고뉴클레오티드에 의한 a형 인플루엔자 바이러스, 안 아아보스트레인(ann arbor strain) h2n2의 억제 |
| CA2089666C (en) | 1990-08-16 | 2003-01-07 | Kevin P. Anderson | Oligonucleotides for modulating the effects of cytomegalovirus infections |
| US5691461A (en) | 1990-08-16 | 1997-11-25 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotides inhibiting candida germ tube formation |
| US5442049A (en) | 1992-11-19 | 1995-08-15 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotides for modulating the effects of cytomegalovirus infections |
| JP2515230Y2 (ja) * | 1990-08-31 | 1996-10-30 | 徹 松井 | 道糸通し糸付き浮子 |
| RU2131436C1 (ru) * | 1990-09-13 | 1999-06-10 | Санофи | Резистентные к нуклеазе олигонуклеозиды, способ их получения и резистентный к нуклеазе нуклеозидный димер |
| US5242906A (en) | 1991-04-22 | 1993-09-07 | University Of North Carolina At Chapel Hill | Antisense oligonucleotides against Epstein-Barr virus |
| WO1994008003A1 (en) | 1991-06-14 | 1994-04-14 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE INHIBITION OF THE ras GENE |
| AU672175B2 (en) | 1991-06-14 | 1996-09-26 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense oligonucleotide inhibition of the ras gene |
| US5582986A (en) | 1991-06-14 | 1996-12-10 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense oligonucleotide inhibition of the ras gene |
| US5661134A (en) | 1991-10-15 | 1997-08-26 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotides for modulating Ha-ras or Ki-ras having phosphorothioate linkages of high chiral purity |
| US5607923A (en) | 1991-10-15 | 1997-03-04 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Oligonucleotides for modulating cytomegalovirus having phosphorothioate linkages of high chiral purity |
| US5681747A (en) | 1992-03-16 | 1997-10-28 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Nucleic acid sequences encoding protein kinase C and antisense inhibition of expression thereof |
| IL107150A0 (en) | 1992-09-29 | 1993-12-28 | Isis Pharmaceuticals Inc | Oligonucleotides having a conserved g4 core sequence |
| US5985558A (en) | 1997-04-14 | 1999-11-16 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Antisense oligonucleotide compositions and methods for the inibition of c-Jun and c-Fos |
| DK0820483T3 (da) | 1995-04-07 | 2001-01-02 | Mogens Havsteen Jakobsen | Fremgangsmåde til fotokemisk immobilisering af ligander under anvendelse af quinoner |
| US6127533A (en) | 1997-02-14 | 2000-10-03 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | 2'-O-aminooxy-modified oligonucleotides |
| AU6425098A (en) * | 1997-03-07 | 1998-09-22 | Kvaerner Oilfield Products A.S | Termination of a tension member, for use as a tendon for a tension leg platform |
| JP3756313B2 (ja) * | 1997-03-07 | 2006-03-15 | 武 今西 | 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体 |
| US5877309A (en) | 1997-08-13 | 1999-03-02 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Antisense oligonucleotides against JNK |
| US6794499B2 (en) * | 1997-09-12 | 2004-09-21 | Exiqon A/S | Oligonucleotide analogues |
| US7572582B2 (en) | 1997-09-12 | 2009-08-11 | Exiqon A/S | Oligonucleotide analogues |
| AU9063398A (en) | 1997-09-12 | 1999-04-05 | Exiqon A/S | Oligonucleotide analogues |
| US5955443A (en) | 1998-03-19 | 1999-09-21 | Isis Pharmaceuticals Inc. | Antisense modulation of PECAM-1 |
| US7084125B2 (en) * | 1999-03-18 | 2006-08-01 | Exiqon A/S | Xylo-LNA analogues |
| EP1178999B1 (en) * | 1999-05-04 | 2007-03-14 | Santaris Pharma A/S | L-ribo-lna analogues |
| JP4151751B2 (ja) | 1999-07-22 | 2008-09-17 | 第一三共株式会社 | 新規ビシクロヌクレオシド類縁体 |
| CN1317291C (zh) | 1999-09-10 | 2007-05-23 | 杰龙公司 | 寡核苷酸n3′→p5′硫代氨基磷酸酯,其合成及应用 |
| TW200540180A (en) | 2004-05-28 | 2005-12-16 | Sankyo Co | Telomerase inhibitor ena oligonucleotide |
-
2000
- 2000-02-10 CZ CZ20012574A patent/CZ296576B6/cs not_active IP Right Cessation
- 2000-02-10 TR TR2006/042112006/04211T patent/TR200604211T1/xx unknown
- 2000-02-10 DE DE60017711.4T patent/DE60017711T3/de not_active Expired - Lifetime
- 2000-02-10 PL PL349570A patent/PL208245B1/pl unknown
- 2000-02-10 CN CNB008056277A patent/CN1273478C/zh not_active Expired - Lifetime
- 2000-02-10 KR KR1020017009992A patent/KR100573231B1/ko not_active Expired - Lifetime
- 2000-02-10 IL IL14433800A patent/IL144338A0/xx unknown
- 2000-02-10 HK HK02101460.7A patent/HK1040084B/en not_active IP Right Cessation
- 2000-02-10 HU HU0105367A patent/HU228398B1/hu unknown
- 2000-02-10 EP EP00902887.9A patent/EP1152009B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2000-02-10 AT AT00902887T patent/ATE287897T2/de active
- 2000-02-10 PT PT00902887T patent/PT1152009E/pt unknown
- 2000-02-10 RU RU2001124910/04A patent/RU2233844C2/ru active
- 2000-02-10 ID IDW00200101604A patent/ID30093A/id unknown
- 2000-02-10 NZ NZ513402A patent/NZ513402A/xx not_active IP Right Cessation
- 2000-02-10 TR TR2001/02328T patent/TR200102328T2/xx unknown
- 2000-02-10 WO PCT/JP2000/000725 patent/WO2000047599A1/ja not_active Ceased
- 2000-02-10 ES ES00902887.9T patent/ES2234563T5/es not_active Expired - Lifetime
- 2000-02-10 BR BRPI0008131A patent/BRPI0008131B8/pt not_active IP Right Cessation
- 2000-02-10 DK DK00902887.9T patent/DK1152009T4/en active
- 2000-02-10 CA CA002361318A patent/CA2361318C/en not_active Expired - Lifetime
- 2000-02-10 AU AU24598/00A patent/AU758956B2/en not_active Expired
- 2000-02-11 TW TW089102314A patent/TW513438B/zh not_active IP Right Cessation
- 2000-02-14 JP JP2000034560A patent/JP3420984B2/ja not_active Expired - Lifetime
-
2001
- 2001-07-16 IL IL144338A patent/IL144338A/en not_active IP Right Cessation
- 2001-08-08 ZA ZA200106544A patent/ZA200106544B/en unknown
- 2001-08-09 US US09/925,673 patent/US7335765B2/en not_active Expired - Lifetime
- 2001-08-10 NO NO20013899A patent/NO320441B1/no not_active IP Right Cessation
-
2003
- 2003-05-05 US US10/430,705 patent/US7314923B2/en not_active Expired - Lifetime
-
2007
- 2007-07-27 US US11/881,775 patent/US7816333B2/en not_active Expired - Fee Related
-
2010
- 2010-07-22 US US12/804,500 patent/US8957201B2/en not_active Expired - Fee Related
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| AU758956B2 (en) | Novel nucleosides and oligonucleotide analogues | |
| US7994145B2 (en) | Bicyclonucleoside analogues | |
| TW200817514A (en) | ENA antisense oligonucleotides exhibiting sequence-specification | |
| JP4148662B2 (ja) | ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体を含有する核酸試薬及び医薬 | |
| JP4245837B2 (ja) | 2’,5’−オリゴアデニル酸類縁体 | |
| WO2000078775A1 (fr) | Nouveaux nucleosides pontes en 3'-4' et analogues d'oligonucleotides | |
| JP2002265489A (ja) | 新規3’‐4’架橋ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体を含有する核酸試薬 | |
| JP2001064296A (ja) | 新規3’‐4’架橋ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体 | |
| JP2002255990A (ja) | N3’−p5’結合を有する2’,4’−bnaオリゴヌクレオチド | |
| JP2001064297A (ja) | 新規ビシクロヌクレオシド誘導体 | |
| MXPA01008145A (en) | Novel nucleosides and oligonucleotide analogues | |
| JP2002249496A (ja) | 新規ビシクロヌクレオシド誘導体を含有する核酸試薬 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| MK4A | Patent expired |
Effective date: 20200210 |