CZ296576B6 - Nukleosidový analog a oligonukleotidový analog a farmaceutický prostredek, sonda a primer s jeho obsahem - Google Patents

Nukleosidový analog a oligonukleotidový analog a farmaceutický prostredek, sonda a primer s jeho obsahem Download PDF

Info

Publication number
CZ296576B6
CZ296576B6 CZ20012574A CZ20012574A CZ296576B6 CZ 296576 B6 CZ296576 B6 CZ 296576B6 CZ 20012574 A CZ20012574 A CZ 20012574A CZ 20012574 A CZ20012574 A CZ 20012574A CZ 296576 B6 CZ296576 B6 CZ 296576B6
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
group
amino
protected
oxo
ethylene
Prior art date
Application number
CZ20012574A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ20012574A3 (cs
Inventor
Kaneko@Masakatsu
Morita@Koji
Imanishi@Takeshi
Original Assignee
Sankyo Company Limited
Sankyo Lifetech Company Limited
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=12398349&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=CZ296576(B6) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Sankyo Company Limited, Sankyo Lifetech Company Limited filed Critical Sankyo Company Limited
Publication of CZ20012574A3 publication Critical patent/CZ20012574A3/cs
Publication of CZ296576B6 publication Critical patent/CZ296576B6/cs

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06—Pyrimidine radicals
    • C07H19/10—Pyrimidine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/706—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/06—Antipsoriatics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/16—Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/14—Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/18—Antivirals for RNA viruses for HIV
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A61P31/20—Antivirals for DNA viruses
    • A61P31/22—Antivirals for DNA viruses for herpes viruses
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/06—Pyrimidine radicals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/16—Purine radicals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/16—Purine radicals
    • C07H19/20—Purine radicals with the saccharide radical esterified by phosphoric or polyphosphoric acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/113—Non-coding nucleic acids modulating the expression of genes, e.g. antisense oligonucleotides; Antisense DNA or RNA; Triplex- forming oligonucleotides; Catalytic nucleic acids, e.g. ribozymes; Nucleic acids used in co-suppression or gene silencing
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02P—CLIMATE CHANGE MITIGATION TECHNOLOGIES IN THE PRODUCTION OR PROCESSING OF GOODS
    • Y02P20/00—Technologies relating to chemical industry
    • Y02P20/50—Improvements relating to the production of bulk chemicals
    • Y02P20/55—Design of synthesis routes, e.g. reducing the use of auxiliary or protecting groups
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10T—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER US CLASSIFICATION
    • Y10T436/00—Chemistry: analytical and immunological testing
    • Y10T436/14—Heterocyclic carbon compound [i.e., O, S, N, Se, Te, as only ring hetero atom]
    • Y10T436/142222—Hetero-O [e.g., ascorbic acid, etc.]
    • Y10T436/143333—Saccharide [e.g., DNA, etc.]

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • AIDS & HIV (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Nukleosidový analog obecného vzorce 1, oligonukleotidový analog obecného vzorce 2, vykazující protismyslnou nebo antigenní aktivitu. Je popsán farmaceutický prostredek nebo sonda s jeho obsahem pro specifický gen nebo primer s jeho obsahem vhodný pro zacátek amplifikace.

Description

Nukleosidový analog a oligonukleotidový analog a farmaceutický prostředek, sonda a primer s jeho obsahem
Oblast techniky
Vynález se týká nových oligonukleotidových analogů, které vykazují protismyslnou nebo antigenní aktivitu, výbornou stabilitu nebo vykazují výbornou aktivitu jako detekční činidlo (sonda) pro specifický gen nebo jako primer pro počátek amplifikace, a nových nukleosidových analogů, které mohou zprostředkovat jejich produkci.
Dosavadní stav techniky
Očekává se, že oligonukleotidové analogy, které vykazují výbornou protismyslnou nebo antigenní aktivitu a které jsou v těle stabilní, se budou moci použít jako farmaceutické prostředky. Navíc oligonukleotidové analogy, které vykazují vysoký stupeň schopnosti tvořit stabilní komplementární řetězec s DNA nebo mRNA, se mohou použít jako detekční činidla vhodné pro specifický gen nebo jako primery pro začátek amplifikace.
Naopak je známo, že přirozeně se vyskytující oligonukleotidy se rychle rozkládají pomocí různých nukleáz, které jsou přítomny v rvi a v buňkách. V některých případech přirozeně se vyskytující oligonukleotidy nevykazují dostatek citlivosti při použití jako detekční činidlo pro specifické geny nebo jako primery pro začátek amplifikace, což je způsobeno jejich afinitou vůči sekvencím komplementárních bází.
Za účelem překonat nedostatky se připravily různé nepřirozeně se vyskytující oligonukleotidové analogy, které jsou určeny pro použití jako farmaceutické prostředky nebo detekční činidla pro použití jako farmaceutické prostředky nebo detekční činidla pro specifické geny. Jmenovitě známé příklady takových nepřirozeně se vyskytujících oligonukleotidových analogů zahrnují ty, kde atom kyslíku zachycený na atomu fosforu ve fosfordiesterové vazbě oligonukleotidu je nahrazen atomem síry, dále ty, kde uvedený atom kyslíku je nahrazen atomem bóru a ty, ve kterých cukerná část a báze oligonukleotidu je upravena chemickou cestou. Například společnost ISIS Corp. vyvinula thioátový typ oligonukleotidu ISIS2922 (Vitravene) jako terapeutický prostředek vhodný pro lidský zánět sítnice způsobený cytomegalovirem a tento prostředek se uvedl na trh v USA.
Sloučeniny mající protismyslnou nebo antigenní aktivitu jsou popsány v WO-A-98/39352. Liší se od sloučenin podle předloženého vynálezu tím, že mají mezi uhlíkovými atomy 2' a 4' jsoucími v kruhu spíše můstek -CH2-O- nežli -A-CH2-O-. Sloučeniny podle předloženého vynálezu vykazují překvapivě zvýšenou nukleázovou aktivitu ve srovnání sWO-A-98/39352.
Když se však zvažuje potenciální protismyslné a antigenní aktivity shora popsaných nepřirozeně se vyskytujících oligonukleotidových analogů, jmenovitě pak schopnost tvořit stabilní komplementární řetězec s DNA nebo mRNA, stabilita s ohledem na různé nukleázy a zobrazení nežádoucích vedlejších účinků způsobených nespecifickým navázáním na různé proteiny v těle, je nutné připravit nepřirozeně se vyskytující oligonukleotidový analog, který má dokonce lepší stabilitu v těle a malý výskyt vedlejších účinků a vysoký stupeň schopnosti tvořit komplementární řetězec.
Podstata vynálezu
Vynález popisuje nepřirozeně se vyskytující oligonukleotidové analogy, které vykazují výbornou protismyslnou nebo antigenní aktivitu, výbornou stabilitu v těle a nízký výskyt nežádoucích
-1 CZ 296576 B6 vedlejších účinků. Zjistilo se, že oligonukleotidové analogy nebo nukleosidové analogy vykazující etherovou vazbu v uvedených molekulách je možné použít jako protismyslné nebo antigenní prostředky mající výbornou stabilitu, jako detekční činidla (sondy) vhodné pro specifický gen, jako primer pro začátek amplifikace nebo jako meziprodukt pro jejich přípravu.
Nové nukleosidové analogy podle vynálezu jsou sloučeniny obecného vzorce 1:
kde symboly R1 a R2 jsou stejné nebo různé a reprezentují atom vodíku, hydroxylovou chránící skupinu, skupinu kyseliny fosforečné, chráněnou skupinu kyseliny fosforečné nebo -P(R3)R4, kde symboly R3 a R4 jsou stejné nebo různé a reprezentují hydroxylovou skupinu, chráněnou hydroxylovou skupinu, merkaptoskupinu, chráněnou merkaptoskupinu, aminoskupinu, alkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, alkylthioskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, kyanalkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 5 atomů uhlíku, nebo aminoskupinu substituovanou alkylovou skupinou, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, symbol A reprezentuje alkandiylovou skupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl nebo substituovanou skupinou purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl mající substituent 'vybraný z následující skupiny a, nebo jejich soli.
Oligonukleotidové analogy podle vynálezu jsou oligonukleotidové analogy, které mají jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2:
kde [symbol A reprezentuje alkandiylovou skupinu, která má 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl a substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl mající substituent vybraný z následující skupiny a], nebo jejich farmaceuticky přijatelné soli.
Skupina a je:
hydroxylová skupina chráněná hydroxylová skupina alkoxyskupina s 1 až 4 atomy uhlíku, merkaptoskupina chráněná merkaptoskupina alkylthioskupina s 1 až 4 atomy uhlíku aminoskupina chráněná aminoskupina aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou s 1 až 4 atomy uhlíku alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku alkylová skupina s 1 až 4 atomy uhlíku a halogenový atom.
Termín „alkyldiylová skupina, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku“ symbolu A ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat methylenovou, ethylenovou, trimethylenovou a tetramethylenovou skupinu, přičemž je výhodnější methylovaná skupina.
Termín „hydroxylová chránící skupina“ symbolu R1 a R2 „chráněná hydroxylová skupina“ symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 znamená chrámci skupinu, kterou je možné štěpit chemickou metodou jako je hydrogenolýza, rozklad, hydrolýza, elektrolýza a fotolýza nebo biologickou metodou, jako je hydrolýza v těle člověka. Takové chránící skupiny mohou zahrnovat „alifatickou acylovou skupinu“ jako je alkylkarbonylová skupina, což je například formy, acetyl, propionyl, butyryl, izobutyryl, pentanoyl, pivaloyl, valeryl, izovaleryl, oktanoyl, nonanoyl, dekanoyl, 3-methylnonanoyl, 8-methylnonanoyl, 3-ethyloktanoyl, 3,7—di— methyloktanoyl, undekanoyl, dodekanoyl, tridekanoyl, tetradekanoyl, pentadekanoyl, hexadekanoyl, 1-methylpenta-dekanoyl, 14—methylpentadekanoyl, 13,13-dimethyltetradekanoyl, heptadekanoyl, 15-methylhexadekanoyl, oktadekanoyl, 1-methyl-heptadekanoyl, nonadekanoyl, eikosanoyl a heneikosanoyl, karboxylovaná alkylkarbonylová skupina, je to například sukcinoylová, glukaroylová a adipoylová skupina, halogen nižší alkylkarbonylová skupina, například chloracetylová, dichloracetylová, trichloracetylová a trifluoracetylová, nižší alkoxyalkyl karbonylová skupina, což je například methoxyacetyl, a nesaturovaná alkoxykarbonylová skupina, což je například (Eý-2-methyl-2-butenoyl.
Termín „aromatická acylová skupina“, jako například arylkarbonylová skupina je například
2-brombenzoylová a 4-chlorbenzoylová, nižší alkylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2,4,6-trimethylbenzoyl a 4-toluoyl, nižší alkoxylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-anizoyl, karboxylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2-karboxybenzoylová, 3-karboxybenzoyl a 4-karboxybenzoyl, nitrovaná arylkarbonylová skupina, což je například 4-nitro-benzoyl a 2-nitrobenzoyl, nižší alkoxykarbonylová arylkarbonylová skupina, což je například 2-(methoxykarbonyl)benzoylová a arylová arylkarbonylová skupina, což je například 4-fenylbenzoyl.
Termín „tetrahydropyranylová skupina nebo tetrahydrothiopyranylová skupina“ je například tetrahydropyran-2-yl, 3-bromotetrahydropyran-2-yl, 4-methoxytetrahydropyran-4-yl, tetrahydropyran-2-yl a 4-methoxytetrahydrothiopyran-4-yl.
Termín „tetrahydrofuranylová skupina nebo tetrahydrothiofuranylová skupina“ je například tetrahydrofuran-2-yl a tetrahydrothiofuran-2-yl.
Termín „silylová skupina“ zahrnuje například silylovou skupinu obsahující tři nižší alkyly, což je například trimethylsilyl, triethylsilyl, izopropyldimethylsilyl, t-butyldimebutyldimethylsilyl,
-3CZ 296576 B6 methyldiizopropylsilyl, methyldi-t-butylsilyl a triizopropylsilyl a silylová skupina obsahující tři alkyly substituovaná jednou nebo dvěma arylovými skupinami, což je například difenylmethylsilyl, difenylbutylsilyl, difenylizopropylsilyl a fenyladiizopropylsilyl.
Termín „nižší alkoxymethylová skupina“ je například methoxymethyl, 1,1-dimethyl-l-methoxymethyl, ethoxymethyl, propoxymethyl, izopropoxymethyl, butoxymethyl a t-butoxymethyl.
Termín „nižší alkoxylová nižší alkoxymethylová skupina“ je například 2-methoxyethoxymethyl.
Termín „halogenovaná nižší alkoxymethylová skupina“ znamená například 2,2,2-trichlorethoxymethyl a bis(2-chlorethoxy)methyl.
Termín „nižší alkoxylovaná ethylová skupina“ znamená například 1-ethoxyethyl a l-(izopropoxy)ethyl.
Termín „methylovaná skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami“ znamená například benzyl, a-naftylmethyl, β-naftylmethyl, difenylmethyl, trifenylmethyl, a-naftyl-difenylmethyl a 9-antrylmethyl.
Termín „methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, kde uvedený arylový kruh je substituován nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou“ zahrnuje například 4-methylbenzyl, 2,4,6-tri-methylbenzyl, 3,4,5-trimethylbenzyl, 4-methoxybenzyl, 4-methoxyfenyldifenylmethyl, 4,4'-dimethoxytrifenylmethyl, 2-nitrobenzyl, 4-nitrobenzyl, 4-chlorbenzyl, 4—brombenzyl a 4-kyanobenzyl.
Termín „nižší alkoxykarbonylová skupina“ zahrnuje například methoxykarbonyl, ethoxykarbonyl, t-butoxykarbonyl a izobutoxykarbonyl.
Termín „nižší alkoxykarbonylová skupina substituovaná halogenem nebo „silylová skupina obsahující tři nižší alkyly“ zahrnuje 2,2,2-trichlorethoxykarbonyl a 2-trimethylsilylethoxykarbonyl.
Termín „alkenoyloxykarbonylová skupina“ zahrnuje vinyloxykarbonyl a alyloxykarbonyl.
Termín „aralkyloxykarbonylová skupina, kde uvedený arylový kruh se může substituovat jednou nebo dvěmi alkoxy nebo nitroskupinami“ zahrnuje například benzyloxykarbonyl, 4-methoxybenzyloxykarbonyl, 3,4—dimethoxybenzyloxykarbonyl, 2-nitrobenzyloxykarbonyl a 4-nitrobenzylkarbonyl.
„Hydroxylová chránící skupina“ symbolu R1 a R2 přednostně zahrnuje „alifatickou acylovou skupinu“, „aromatickou acylovou skupinu“, „methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami“, „methylovou skupinu substituovanou 1 až třemi arylovými skupinami, kde arylový kruh se substituoval nižší alkylovou, nižší alkoxy, kyanoskupinou nebo halogenem“ nebo „silylovou skupinu“. Výhodnější je acetylová skupina, benzoylová skupina, benzylová skupina, p-methoxybenzoylová skupina, dimethoxytritylová skupina, monomethoxytritylová skupina nebo íerc-butyldifenylsilylová skupina.
Chrániči skupina „chráněné hydroxylové skupiny“ symbolu R3 a R4 nebo skupina a může s výhodou zahrnovat „alifatickou acylovou skupinu“ nebo „aromatickou acylovou skupinu“, výhodnější je benzoylová skupina.
Chránící skupina „chráněné skupiny kyseliny fosforečné“ symbolu R1 a R2 ve shora uvedeném vzorci 1 reprezentuje chránící skupinu, která se může štěpit chemickou metodou, jako je hydrogenolýza, hydrolýza, elektrolýza a fosfolýza a biologickou metodou, jako je hydrolýza v lidském těle. Takové chránící skupiny mohou zahrnovat „nižší alkoxylovou skupinu“ jak oje methyl, ethyl, n-propyl, izopropyl, a-butyl, izobutyl, s-butyl, terc-butyl, n-pentyl, izopentyl, 2-methyl-4CZ 296576 B6 butyl, neopentyl 1-ethylpropyl, n-hexyl, izohexyl, 4-methylpentyl, 3-methylpentyl, 2-methylpentyl, 1-methylpentyl, 3,3-dimethylbutyl, 2,2-dimethylbutyl, 1,1-dimethylbutyl, 1,2-dimethylbutyl, 1,3-dimethylbutyl, 2,3-dimethylbutyl a 2-ethylbutyl.
„Nižší alkylová skupina substituovaná kyanoskupinou“ zahrnuje například 2-kyanoethyl a
2- kyano-1,1 -dimethylethyl.
„Ethylová skupina substituovaná silylovou skupinou“ zahrnuje například 2-methyldifenylsilylethyl, 2-trimethylsilylethyl a 2-trifenylsilylethyl.
„Halogenovaná nižší alkylová skupina“ zahrnuje například 2,2,2-trichlorethyl, 2,2,2-tribromethyl, 2,2,2-trifluorethyl a 2,2,2-trichlor-l,l-dimethylpethyl.
„Nižší alkenylová skupina“ zahrnuje například ethenyl, 1-propenyl, 2-propenyl, l-methyl-2propenyl, 1-methyl-1-propenyl, 2-methyl-l-propenyl, 2-methyl-2-propenyl, 2-ethyl-2-propenyl, 1-butenyl, 2-butenyl, l-methyl-2-butenyl, l-methyl-2-butenyl, 1-methyl-1-butenyl,
3- methyl-2-butenyl, l-ethyl-2-butenyl, 3-butenyl, l-methyl-3-butenyl, 2-methyl-3-butenyl,
1- ethyl-3-butenyl, 1-pentenyl, 2-pentenyl, l-methyl-2-pentenyl, l-methyl-2-pentenyl, 3-pentenyl, l-methyl-3-pentenyl, 2-methyl-3-pentenyl, 4-pentenyl, l-methyl-4-pentenyl,
2- methyl-4-pentenyl, 1-hexenyl, 2-hexenyl, 3-hexenyl, 4-hexenyl a 5-hexenyl.
„Cykloalkylová skupina“ zahrnuje například cyklopropyl, cyklobutyl, cyklopentyl, cyklohexyl, cykloheptyl, norbomyl a adamantyl.
„Kyanátovaná nižší alkenylová skupina“ je například 2-kyanobutenyl.
„Arylalkylová skupina“ zahrnuje například benzyl, α-naftylmethyl, indenylmethyl, fenantrenylmethyl, antracenylmethyl, difenylmethyl, trifenylmethyl, 1-fenethyl, 2-fenethyl, 1-naftylethyl,
2- naftylethyl, 1-fenylpropyl, 2-fenylpropyl, 3-fenylpropyl, 1-naftylpropyl, 2-naftylpropyl,
3- naftylpropyl, 1-fenylbutyl, 2-fenylbutyl, 3-fenylbutyl, 4—fenylbutyl, 1-naftylbutyl, 2-naftylbutyl, 3-naftylbutyl, 4-naftylbutyl, 1-fenylpentyl, 2-fenylpentyl, 3-fenylpentyl, 4-fenylpentyl,
4- fenylpentyl, 5-fenylpentyl, 1-naftylpentyl, 2-naftylpentyl, 3-naftylpentyl, 4—naftylpentyl,
5- naftylpentyl, 1-fenylhexyl, 3-fenylhexyl, 4-fenylhexyl, 5-fenylhexyl, 6-fenylhexyl, 1-naftylhexyl, 2-naftylhexyl, 3-naftylhexyl, 4-naftylhexyl, 5-naftylhexyl a 6-naftylhexyl.
„Aralkylová skupina, kde uvedený arylový kruh se substituoval nitroskupinou nebo halogenovým atomem“ zahrnuje 4-chlorbenzyl, 2-(4-nitrofenyl)ethyl, o-nitrobenzyl, 4—mtrobenzyl, 2,4-dinitrobenzyl a 4-chlor-2-nitrobenzyl.
„Arylová skupina“ zahrnuje fenyl, indenyl, naftyl, fenantranyl a antracenyl a „arylová skupina substituovaná nižší alkylovou skupinou, atomem halogenu nebo nitroskupinou“ zahrnuje 2-methylfenyl, 2,6-dimethylfenyl, 2-chlorfenyl, 4-chlorfenyl, 2,4-dichlorfenyl, 2,5-dichlorfenyl, 2-bromofenyl, 4-nitrofenyl a 4-chlor-2-nitrofenyl.
Výhodné jsou „nižší alkylová skupina“, „nižší alkylová skupina substituovaná kyanoskupinou“, „aralkylová skupina“ nebo „aralkylová skupina, kde uvedený arylový kruh se substituuje nitroskupinou nebo halogenovým atomem“. Výhodnější je 2-kyanoethylová skupina, 2,2,2-trichlorethylová skupina nebo benzylová skupina.
„Alkoxyskupina zahrnující 1 až 4 atomy uhlíku“ symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 a 2 může zahrnovat methoxy, ethoxy, n-propoxy, izopropoxy, a-butoxy, izobutoxy, s-butoxy nebo terc-butoxyskupinu. Výhodná je methoxyskupina nebo ethoxyskupina.
Chránící skupina „chráněné merkaptoskupiny“ symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 a 2 může zahrnovat mimo hydroxylových chránících skupin uvedených shora
-5CZ 296576 B6 v textu „skupinu, která tvoří disulfíd“ jako je alkylthioskupina, což je například methylthioskupina, ethylthioskupina, terc-butylthioskupina a aralkylthioskupina jako je benzylthioskupina. Výhodná je „alifatická acylová skupina“ nebo „aromatická acylová skupina“, výhodnější je benzoylová skupina. Termín „alkylthioskupina, která vykazuje 1 až 4 atomy uhlíku“ symbolu R3 a R4 nebo skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat methylthioskupinu, ethylthioskupinu, propylthioskupinu, izopropylthioskupinu, butylthioskupinu, s-butylthioskupinu a terc-butylthioskupinu. Výhodná je methylthioskupina nebo ethylthioskupina.
Chrániči skupina „chráněné aminoskupiny“ skupiny a ve shora uvedeném vzorci 1 a 2 zahrnuje „alifatickou acylovou skupinu“ jako je alkylkarbonylová skupina, a to například formyl, acetyl, propionyl, butyryl, izobutyryl, pentanoyl, pivaloyl, valeryl, izovaleryl, oktanoyl, nonanoyl, dekanoyl, 3-methylnonanoyl, 8-methyl-nonanoyl, 3-ethyloctanoyl, 3,7-dimethylokranoyl, undekanoyl, dodekanoyl, tridekanoyl, tetradekanoyl, pentadekanoyl, hexadekanoyl, 1-methyl-pentadekanoyl, 14-methylpentadekanoyl, 13,13-dimethyltetra-dekanoyl, heptadekanoyl, 15-methylhexa-dekanoyl, oktadekanoyl, 1-methylheptadekanoyl, nonadekanoyl, eikosanoyl a heneikosanoyl a karboxylovaná alkylkarbonylová skupina, jako je například sukcinoyl, glutaroyl a adapoyl, halogen nižší alkylkarbonylová skupina, cožje například chloracetyl, dichloracetyl, trichloracetyl a trifluoracetyl, nižší alkoxy nižší alkylkarbonylová skupina, jako je například methoxyacetyl a nesaturovaná alkylkarbonylová skupina, cožje například (E)-2-methyl-2-butenoyl.
„Aromatická acylová skupina“ je například arylkarbonylová skupina, což je například benzyl, oc-naftoyl a β-naftoyl, halogenoarylkarbonylová skupina, jako je například benzoyl, α-naftoyl a β-naftoyl, halogenarylkarbonylová skupina, což je například 2-brombenzoyl a 4—chlorbenzoyl, nižší alkylovaná arylkarbonylová skupina, což je například 2,4,6-trimethylbenzoyl a 4-toluoyl, nižší alkoxylovaná arylkarbonylovaná skupina, jako je například 4-anizoyl, karboxylová arylkarbonylová skupina, což je například 2-karboxybenzoyl, 3-karboxybenzoyl a 4-karboxybenzoýl, nitrovaná arylkarbonylová skupina, cožje například 4-nitrobenzoyl a 2-nitrobenzoyl, nižší alkoxykarbonylovaná arylkarbonylovaná skupina, což je například 2-(methoxykarbonyl)benzoyl a arylovaná arylkarbonylová skupina, cožje například 4-fenylbenzoyl.
„Nižší alkoxykarbonylová skupina“, což je například methoxykarbonyl, ethoxykarbonyl, t-butoxykarbonyl a izobutoxykarbonyl.
„Nižší alkoxykarbonylová skupina“, což je například methoxykarbonyl, ethoxykarbonyl, t-butoxykarbonyl a izobutoxykarbonyl.
„Nižší alkoxykarbonylová skupina substituovaná halogenem nebo silylová skupina s třemi nižšími alkyly“ zahrnuje například 2,2,2-trichlorethoxykarbonyl a 2-trímethylsilylethoxykarbonyl.
„Alkenyloxykarbonylová skupina“ zahrnuje například vinyloxykarbonyl a alyloxykarbonyl.
Termín „aralkyloxykarbonylová skupina“ kde uvedený arylový kruh se může substituovat nižší alkoxyskupinou nebo nitroskupinou“ zahrnuje benzyloxykarbonyl, 4-methoxybenzyloxykarbonyl, 3,4-dimethoxybenzyloxykarbonyl, 2-nitrobenzyloxykarbonyl a 4-nitrobenzoyloxykarbonyl, přičemž je výhodná „alifatická acylová skupina“ nebo „aromatická acylová skupina“. Více se upřednostňuje benzoylová skupina.
„Aminoskupina substituovaná alkylovou skupinou zahrnující 1 až 4 atomy uhlíku“ symbolu R3 a
R4 nebo skupina a ve shora popsaném vzorci 1 a 2 může zahrnovat methylamino, ethylamino, propylamino, izopropylamino, butylamino, izobutylamino, s-butylamino, terc-butylamino, dimethylamino, diethylamino, dipropylamino, diizopropylamino, dibutylamino, diizobutyl-amino, di(s-butyl)amino a di(terc-butyl)amino, přičemž je výhodné použít skupinu methylamino, ethylamino, dimethylamin, diethylamino nebo diizopropylamino.
-6CZ 296576 B6
Termín „kyanoalkoxyskupina vykazující 1 až 5 atomů uhlíku“ symbolu R3 a R4 ve shora uvedeném vzorci 1 reprezentuje skupinu, ve které shora opsaná „alkoxyskupina vykazující 1 až 4 atomy uhlíku“ se substituovala kyanoskupinou. Taková skupina může zahrnovat kyanomethoxy,
2-kyanoethoxy, 3-kyanopropoxy, 4-kyanobutoxy, 3-kyano-2-methylpropoxy nebo 1-kyanomethyl-l,l-dimethyhnethoxy. Výhodná je 2-kyanoethoxyskupina.
Termín „alkylová skupina zahrnují 1 až 4 atomy uhlíku“ skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat methyl, ethyl, propyl, izopropyl, butyl, izobutyl, s-butyl a terc-butyl. Upřednostňuje se methylová a ethylová skupina.
Termín „atom halogenu“ skupina a ve shora uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat atom fluoru, chloru a bromu nebo jodu. Výhodný je atom jodu nebo chloru.
Preferované skupiny „purin-9-yl“ a „substituovaná skupina purin-9-yl“ symbolu B ve shora v textu uvedeném vzorci 1 nebo 2 může zahrnovat jako celek 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 6-aminopurin-9-yl, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-
6-chlorpurin-9-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl chráněný aminoskupinou a hydroxylovou skupinou, 6-ammo-2-methoxypurin-9-yl, 6-amino-2-chlorpurin-9-yl, 6-amino-2-methoxypurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl nebo 6-merkaptopurin. Výhodnější je 6-benzylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-izobutyrylamino6-hydroxypurin-9-yl nebo guaninylová skupina.
Výhodné skupiny „skupiny 2-oxopyrimidin-l-yl“ a „substituovaná skupina 2-oxopyrimidin-lyl“ symbolu B ve shora v textu uvedeném vzorci 1 a 2 mohou zahrnovat jako celek 2-oxo-4aminopyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, aminoskupinu chráněnou skupinou 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-1 -yl, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-1 -yl, 2-oxo-4methoxypyrimidin-1 -y 1, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-1 -yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-1 -yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl) nebo 4-atomy-5methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je 5-methylcytosinyl). Výhodnější je skupina 2-oxo-4benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytosinyl, thyminyl, uracinyl, 2-oxo-4-benzoylamino-5-methylpyrimidin-l-yl nebo 5-methylcytosinylová skupina.
Termín „nukleosidový analog“ znamená nepřirozený typ nukleosidu, ve kterém purinové nebo pyrimidinová skupina je zachycena na cukru.
Termín „oligonukleotidový analog“ zahrnuje nepřirozený typ derivátu „oligonukleotidu“, který zahrnuje 2 až 50 „nukleosidů“ a mohou být stejné nebo odlišné a váží se pomocí diesterové vazby kyseliny fosforečné a takové analogy mohou přednostně zahrnovat cukerné deriváty, ve kterých se upravuje cukerná složka. Dále zahrnuje deriváty thioátu, ve kterých část vázaná diasterovou vazbou kyseliny fosforečné je thioátována. Dále zahrnuje esterové produkty, kde je esterifikována terminální část kyseliny fosforečné a amidové produkty, kde aminoskupina na purinové bázi je amidována. Výhodné jsou cukerné deriváty, ve kterých se cukerná složka upravuje a deriváty thioátu, kde část diasteru kyseliny fosforečné je thioátována.
Termín Jejich sůl“ znamená sole sloučeniny obecného vzorce 1 podle vynálezu, poněvadž se mohou převést na sole a takové sole mohou s výhodou zahrnovat anorganické sole například sole kovů, jako jsou sole alkalických kovů, například sodné sole, draselné sole a lithné sole, sole kovů alkalických zemin, například vápenaté sole a sole hořečnaté, sole hlinité, sole železité, sole zinku, mědi, niklu a kobaltu. Dále může zahrnovat sole aminů, jako jsou anorganické sole, například sole amonné, organické sole, například sole t-oktylaminu, sole dibenzylaminu, sole morfolinu, sole glukozaminu, sole fenylglycinalkylesteru, sole ethylendiaminu, sole vV-methylglukaminu, sole guanidinu, sole diethylaminu, sole thiethylaminu, sole dicyklohexylaminu, Λζ/VMibenzyl-7CZ 296576 B6 ethylendiaminu, sole chlorprokainu, sole prokainu, sole diethanolaminu, sole V-benzylfenylhylaminu, sole piperazinu, tetramethylaminné sole a sole tris(hydroxymethyl)aminomethanu. Dále zahrnuje sole anorganických kyselin, jako jsou sole halogenovodíkových kyselin, například sole kyseliny fluorovodíkové, sole kyseliny chlorovodíkové, sole kyseliny bromovodíkové a sole kyseliny jodovodíkové, sole kyseliny dusičné, sole kyseliny chloristé, sole kyseliny sírové a sole kyseliny fosforečné. Dále zahrnuje sole organických kyselin, jako jsou sole kyseliny nižší alkenylsulfonové, například sole kyseliny methansulfonové, sole kyseliny trifluormethansulfonové a sole kyseliny ethansulfonové, sole kyseliny arylsulfonové, například sole kyseliny benzensulfonové a sole kyseliny p-toluensulfonové, sole kyseliny octové, sole kyseliny máselné, sole kyseliny mravenčí, sole kyseliny jantarové, sole kyseliny citrónové, sole kyseliny vinné, sole kyseliny šťavelové a sole kyseliny máselné a sole aminokyselin, jako jsou například sole glycinu, sole lyzinu, sole argininu, sole omitinu a sole kyseliny glutamové a sole kyseliny asparagové.
Poněvadž upravené oligonukleotidy nebo polynukleotidové analogy podle vynálezu se mohou převést na sůl, termín Jejich farmaceuticky přijatelné sole“ může s výhodou zahrnovat anorganické sole, jako jsou například sole kovů, což jsou například sole alkalických kovů, například sodné sole, draselné sole a litné sole, sole kovů alkalických zemin, například vápenaté sole a sole hořečnaté, sole hlinité, sole železité, sole zinku, mědi, niklu a kobaltu. Dále může zahrnovat sole aminů, jako jsou anorganické sole, například sole amonné, organické sole, například sole t-oktylaminu, sole dibenzylaminu, sole morfolinu, sole glukozaminu, sole fenylglycinalkylesteru, sole ethylendiaminu, sole TV-methylglukaminu, sole guanidinu, sole diethylaminu, sole triethylaminu, sole dicyklohexylaminu, Ν,Ν'-dibenzyl-ethylendiaminu, sole N-benzylfenethylaminu, sole piperazinu, tetramethylamonné sole a sole tris(hydroxymethyl)aminomethanu. Dále zahrnuje sole anorganických zemin, jako jsou sole halogenovodíkových kyselin, například sole kyseliny fluorovodíkové, sole kyseliny chlorovodíkové, sole kyseliny bromovodíkové a sole kyseliny jodovodíkové, sole kyseliny dusičné, sole kyseliny chloristé, sole kyseliny sírové a sole kyseliny fosforečné. Dále zahrnuje sole organických kyselin, jako jsou sole kyseliny nižší alkensulfonové, například sole kyseliny methansulfonové, sole kyseliny trifluormethansulfonové a sole kyseliny ethansulfonové, sole kyseliny arylsulfonové, například sole kyseliny benzensulfonové a sole kyseliny p-toluensulfonové, sole kyseliny octové, sole kyseliny máselné, sole kyseliny mravenčí, sole kyseliny jantarové, sole kyseliny citrónové, sole kyseliny vinné, sole kyseliny šťavelové a sole kyseliny máselné a sole aminokyselin, jako jsou například sole glycinu, sole lyzinu, sole argininu, sole omitinu a sole kyseliny glutamové a sole kyseliny asparagové.
Ze sloučenin podle obecného vzorce 1 a jejich solí podle vynálezu výhodné sloučeniny mohou zahrnovat (1) sloučeniny, ve kterých symbol R1 představuje atom vodíku, alifatickou acylovou skupinu, aromatickou acylovou skupinu, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, přičemž arylový kruh je substituovaný nižším alkylem, nižší alkoxyskupinu, halogenem nebo kyanoskupinou nebo silylovou skupinu, a její sole, (2) sloučeniny, kde symbol R1 představuje atom vodíku, acetylovou skupinu, benzoylovou skupinu, benzylovou skupinu, p-methoxybenzylovou skupinu, dimethoxytritylovou skupinu, monomethoxytritylovou skupinu nebo řerc.-butyldifenylsilylovou skupinu, a její sole, (3) sloučeniny, ve kterých symbol R2 představuje atom vodíku, alifatickou acylovou skupinu, aromatickou acylovou skupinu, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, methylovou skupinu substituovanou jednou až třemi arylovými skupinami, přičemž arylový kruh je substituovaný nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou nebo silylovou skupinou, skupinou fosforamiditu, fosfonylovou skupinu, skupinou kyseliny fosforečné nebo chráněnou skupinou kyseliny fosforečné, a její sole,
-8CZ 296576 B6 (4) sloučeniny, kde symbol R2 představuje atom vodíku, acetylovou skupinu, benzoylovou skupinu, benzylovou skupinu, p-methoxybenzylovou skupinu, terc-butyldifenylsilylovou skupinu, -P(OCH2H4CN)(NCH(CH3)2), -P(OCH3)(NCH(CH3)2, fosfonylovou skupinu nebo 2-chlorfenyl nebo skupinu kyseliny 4-chlorfenylfosforečné a jejich sole, (5) sloučeniny kde symbol A představuje methylenovou skupinu a jejich sole, (6) sloučeniny, kde symbol B představuje 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 6-aminopurin-9-yl, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin9—yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-brompurin--9-yl, 2-amino-6hydroxypurin—9—yl (to je guaninyl), aminoskupina chráněná skupinou 2—amino—6—hydroxypurin-9-yl, hydroxylová skupina chráněná skupinou 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, 6-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-amino-pyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5fluorpyrimidin-l-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-
1— yl, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-
4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl), 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-lyl (to je 5-methylcytosinyl) nebo aminoskupina chráněná skupinou 4-amino-5-methyl-2oxopyrimidin-l-yl, a jejich sole a (7) sloučeniny, kde symbol B představuje 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-izobutyrylamino-6-hydroxypurin-9-y, guaninyl, 2-oxo-4-benzoylaminopynmidm-l-yl, cytosinyl,
2- oxo-5-methyl^4-benzoylaminopyrimidm-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thiminyl, a jejich sole.
Shora uvedené sloučeniny v odstavcích (1) a (2), (3) a (4) nebo (6) a (7) označují výhodné sloučeniny, jejichž počet se stává ve vzorci 1 vyšší. Sloučenina získaná výběrem symbolu R1 ze skupin popsaných v odstavcích (1) a (2), výběrem symbolu R2 ze skupin popsaných v odstavcích (3) a (4), výběrem symbolu A ze skupin popsaných v odstavci (5) a výběrem symbolu B ze skupin opsaných v odstavci (6) a (7) nebo jejich kombinací, a její sole je výhodná. Zvláště výhodné jsou sloučeniny a jejich sole vybrané z následujících skupin.
(Skupina sloučenin)
2'-O,4'-C-ethylenguanosin 2'-O,4'-C-ethylenadenosin 3',5'-di-0-benzyl-2'-C,4'-C-ethylen-6-7V-benzoyladenosin 3',5'-di-O-benzyl-2'-(9,4'-C-ethylen-2-AMzobutyrylguanosin 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-7V-benzoyladenosin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-2-AMzobutyrylguanosin 2'-O,4'-C-ethylen-2-AMzobutyrylguanosin
2'-O,4'-C-ethylen-6-;V-benzoyladenosin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-C>,4'-C-ethylen-6-2V-benzoyladenosin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diizopropyl)fosforamidit
5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-2-2V-osobutyrylguanosin-3'-(9-(2-kyanoethyl-A(?/diizopropyl)fosforamidin
2'-O,4'-C-ethylenuridin
2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin
2'-O,4'-C-ethylencytidin
2'-O,4'-C-ethylen-5-methylcytidin
-9CZ 296576 B6 ',5 '-di-O-benzyl-2 '-(9,4'C-ethylenuridin 5'-0-dimethyoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridin 3', 5 -di-O-benzyl-2'-CM'-C-ethylen-5-methyluridin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-C>,4-C-ethylen-5-methyluridin 3', 5 '-di-0-benzyl-2'-0,4'-C-ethylen-4-.N-benzoylcytidm 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4-C-ethylen-4-V-benzoylcytidin 3' ,5 '-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoyl-5-rnethyluridin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-V-benzoyl-5-methylcytidin 2'-O,4'-C-ethylen-4-V-benzoylcytidm 2'-O,4'-C-ethylen-4-7V-benzoyl-5-methylcytidin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-C>,4-C-ethylenuridin-3'-(9-(2-kyanoethyl-VA-diizopropyl)fosforamidin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-(7,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-O-(2-kyanoethyl-V,V-diizopropyl)fosforamidit
5'-O-dimethoxytrityl-2'-(9,4'-C-ethylen-4-V-benzoylcytidin-3'-O-(2-kyanoethyl-2V,7V-diizopropyl)fosforamidit a
5'-0-dimethoxytrityl-2'-(9,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-0-(2-kyanoethyl-V>V-diizopropyl)fosforamidit.
Výhodné sloučeniny zahrnující oligonukleotidové analogy obsahující jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2 a jejich farmaceuticky přijatelné sole podle vynálezu mohou zahrnovat (8) oligonukleotidové analogy, kde symbol A představuje methylenovou skupinu, a jejich farmaceuticky přijatelné sole, (9) oligonukleotidové analogy, kde symbol B představuje 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), aminoskupinu chráněnou skupinou 6-aminopurin-9-yl, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino6-chlor-purin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-hydroxypurin9-yl (to je guaninyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, hydroxylová skupina chráněná skupinou 2-arnino-6-hydroxypurin-9-yl, 6-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-amino-pyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo-4—arninopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrirnidin-lyl, aminoskupina chráněná skupinou 2-oxo^l-amino-5--fluorpyrimidin-l-yl, 4-amino-2oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl), 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je 5-methylcytosinyl) nebo aminoskupina chráněná skupinou 4-amino-5-methyl-2--oxopyrimidin-lyl, a jejich sole a (10) oligonukleotidové analogy, kde symbol B představuje 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-izobutyrylamino-6-hydroxypurin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4-benzoylaminopyrimidin-lyl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl, a jejich farmaceuticky přijatelné sole.
Odstavce (9) a (10) shora v textu označují nejvýhodnější oligonukleotidové analogy, jejichž počet se zvyšuje, a preferují se oligonukleotidové analogy získané výběrem symbolu A z odstavce (8) a výběrem symbolu B z odstavce (9) a (10) nebo jejich kombinace a jejich farmaceuticky přijatelné sole.
-10CZ 296576 B6
Specifické sloučeniny zahrnuté ve sloučenině shora uvedeného obecného vzorce 1 podle vynálezu jsou uvedeny v tabulce č. 1 a 2. Avšak sloučeniny podle vynálezu se neomezují na zde uvedené sloučeniny.
V tabulce č. 1 a 2 zkratka Př. č. slouč. reprezentuje příklad sloučeniny číslo, Me představuje methylovou skupinu, Bn představuje benzylovou skupinu, Bz představuje benzoyíovou skupinu, PMB prezentuje p-methoxybenzoylovou skupinu, Tr reprezentuje trifenylmethylovou skupinu, MMTr reprezentuje 4-methoxytrifenylmethylovou (monomethoxytritylovou) skupinu, DMTr reprezentuje 4,4'-dimethoxytrifenylmethylovou (dimethoxytritylovou) skupinu, zkratka TMTr ío reprezentuje 4,4',4''-trimethoxytrifenylmethylovou (trimethoxytritylovou) skupinu, TMS reprezentuje trimethylsilylovou skupinu, TBDMS reprezentuje Zerc-butyldimethylsilylovou skupinu, TBDPS reprezentuje Zerc-butyldifenylsilylovou skupinu a TIPS reprezentuje triizopropylsilylovou skupinu.
(Γ)
- 11 CZ 296576 B6
Tabulka č. 1:
Př. slouč. č. A R1 R2 R3a R4a
1-1 ch2 H H H H
1-2 ch2 H H H nh2
1-3 ch2 H H H OH
1-4 ch2 H H OH H
1-5 ch2 H H OH nh2
1-6 ch2 H H OH OH
1-7 ch2 H H nh2 Η
1-8 ch2 H H nh2 nh2
1-9 ch2 H H nh2 Cl
1-10 ch2 H H nh2 F
1-11 ch2 H H nh2 Br
1-12 ch2 H H nh2 OH
1-13 ch2 H H OMe H
1-14 ch2 H H OMe OMe
1-15 ch2 H H OMe nh2
1-16 ch2 H H Cl H
1-17 ch2 H H Br H
1-18 ch2 H H F H
1-19 ch2 H H Cl Cl
1-20 ch2 H H SH H
-12CZ 296576 B6
1-21 ch2 Bn H NHBz H
1-22 ch2 Bn H OH NHCOCH(CH3)2
1-23 ch2 Bn Bn NHBz H
1-24 ch2 Bn Bn OH NHCOCH(CH3)2
1-25 ch2 PMB H NHBz H
1-26 ch2 PMB H OH NHČOCH(CH3)2
1-27 ch2 PMB PMB NHBz H
1-28 ch2 PMB PMB OH NHCOCH(CH3)2
1-29 ch2 Tr H NHBz H
1-30 ch2 MMTr H NHBz H
1-31 ch2 DMTr H NHBz H
1-32 ch2 TMTr H NHBz H
1-33 ch2 Tr H OH NHCOCH(CH3)2
1-34 ch2 MMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-35 ch2 DMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-36 ch2 TMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-37 ch2 TMS H NHBz H
1-38 ch2 TBDMS H NHBz H
1-39 ch2 TBDPS H NHBz H
1-40 ch2 TIPS H NHBz H
1-41 ch2 TMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-42 ch2 TBDMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-43 ch2 TBDPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-44 ch2 TIPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-45 (CH2)z H H H H
1-46 (CH2)2 H H H nh2
1-47 (CH2)2 H H H OH
1-48 (CH2)2 H H OH H
1-49 (CH2)2 H H OH NH2
1-50 (CH2)2 H H OH OH
1-51 (CH2)2 H H nh2 H
1-52 (CH2)2 H H nh2 nh2
- 13 CZ 296576 B6
1-53 (CH2)2 H H nh2 Cl
1-54 (CH2)2 H H nh2 F
1-55 (CH2)2 H H nh2 Br
1-56 (CH2)2 H H nh2 OH
1-57 (CH2)2 H H OMe H
1-58 (CH2)2 H H OMe OMe
1-59 (CH2)2 H H OMe nh2
1-60 (CH2)2 H H Cl H
1-61 (CH2)2 H H Br H
1-62 (CH2)2 H H F H
1-63 (CH2)2 H H Cl Cl
1-64 (CH2)2 H H SH H
1-65 (CH2)2 Bn H NHBz H
1-66 (CH2)2 Bn H OH NHCOCH(CH3)2
1-67 (CH2)2 Bn Bn NHBz H
1-68 (CH2)2 Bn Bn OH NHCOCH(CH3)2
1-69 (CH2)2 PMB H NHBz H
1-70 (CH2)2 PMB H OH NHCOCH(CH3)2
1-71 (CH2)2 PMB PMB NHBz H
1-72 (CH2)2 PMB PMB OH NHCOCH(CH3)2
1-73 (CH2)2 Tr H NHBz H
1-74 (CH2)2 MMTr H NHBz H
1-75 (CH2)2 DMTr H NHBz H
1-76 (CH2)2 TMTr H NHBz H
1-77 (CH2)2 Tr H OH NHCOCH(CH3)2
1-78 (CH2)2 MMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-79 (ch2)2 DMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-80 (CH2)2 TMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-81 (CH2)2 TMS H NHBz H
1-82 (CH2)2 TBDMS H NHBz H
1-83 (CH2)2 TBDPS H NHBz H
1-84 (CH2)2 TEPS H NHBz H
- 14CZ 296576 B6
1-85 (CH2)2 TMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-86 (CH2)2 TBDMS H OH ŇHCOCH(CH3)2
1-87 (CH2)2 TBDPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-88 (CH2)2 TIPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-89 (CH2)3 H H H H
1-90 (CH2)3 H H H NH2
1-91 (CH2)3 H H H OH
1-92 (CH2)3 H H OH H
1-93 (CH2)3 H H OH NH2
1-94 (CH2)3 H H OH OH
1-95 (CH2)3 H H NH2 H
1-96 (CH2)3 H H nh2 nh2
1-97 (CH2)3 H H nh2 Cl
1-98 (CH2)j H H nh2 F
1-99 (CH2)3 H H nh2 Br
1-100 (CH2)3 H H nh2 OH
1-101 (CH2)3 H H OMe H
1-102 (CH2)3 H H OMe OMe
1-103 (CH2)3 H H OMe nh2
1-104 (CH2)3 H H Cl H
1-105 (CH2)3 H H Br H
1-106 (CH2)3 H H F H
1-107 (CH2)3 H H Cl Cl
1-108 (CH2)3 H H SH H
1-109 (CH2)3 Bn H NHBz H
1-110 (CH2)3 Bn H OH NHCOCH(CH3)2
1-111 (CH2)3 Bn Bn NHBz H
1-112 (CH2)3 Bn Bn OH NHCOCH(CH3)2
1-113 (CH2)3 PMB H NHBz H
1-114 (CH2)3 PMB H OH NHCOCH(CH3)2
1-115 (CH2)3 PMB PMB NHBz H
1-116 (CH2)3 PMB PMB OH NHCOCH(CH3)2
-15 CZ 296576 B6
1-117 (CH2>3 Tr H NHBz Η
1-118 (CH2)3 MMTr H NHBz H
1-119 (CH2)3 DMTr H NHBz H
1-120 (CH2)j TMTr H NHBz H
1-121 (CH2)3 Tr H OH NHCOCH(CH3)2
1-122 (CH2)3 MMTr H OH NHCÓCH(CH3)2
1-123 (CH2)j DMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-124 (ch2)3 TMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-125 (CH2)3 TMS H NHBz H
1-126 (CH2)j TBDMS H NHBz H
1-127 (CH2)3 TBDPS H NHBz H
1-128 (CH2)3 TIPS H NHBz H
1-129 (CH2)3 TMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-130 (CH2)3 TBDMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-131 (CH2)3 TBDPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-132 (CH2)j TIPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-133 (C1I2)4 H 11 H H
1-134 (CH2)4 H H H NH2
1-135 (CH2)4 H H H OH
1-136 (CH2)4 H H OH H
1-137 (CH2)4 II H OH nh2
1-138 (ch2)4 H H OH OH
1-139 (CH2)4 H H nh2 H
1-140 (CH2)4 H H nh2 nh2
1-141 (ch2)4 H H nh2 Cl
1-142 (CH2)4 H H nh2 F
1-143 (CH2)4 H H nh2 Br
1-144 (CH2)4 H H nh2 OH
1-145 (CH2)4 H H OMe H
1-146 (CH2)4 H H OMe OMe
1-147 (CH2)4 H í OMe nh2
1-148 (ch2)4 H H Cl H
- 16CZ 296576 B6
1-149 (CH2)4 H H Br H
1-150 (Ch2)4 H H F H
1-151 (CH2)4 H H Cl ČI
1-152 (CH2)4 H H SH H
1-153 (CH2)4 Bn H NHBz H
1-154 (CH2)4 Bn H OH ŇHCOCH(CH3)2
1-155 (CH2)4 Bn Bn NHBz H
1-156 (CH2)4 Bn Bn OH NHCOCH(CH3)2
1-157 (CH2)4 PMB H NHBz H
1-158 (CH2)4 PMB H OH NHCOCH(CH3)2
1-159 (CH2)4 PMB PMB NHBz H
1-160 (CH2)4 PMB PMB OH NHCOCH(CH3)2
1-161 (CH2)4 Tr H NHBz H
1-162 (CH2)4 MMTr H NHBz Ϊ1
1-163 (Cřl2)4 DMTr H NHBz H
1-164 (CH2)4 TMTr H NHBz H
1-165 (CH2)4 Tr H OH NHCOCH(CH3)2
1-166 (CH2)4 MMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-167 (CH2)4 DMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-168 (CH2)4 TMTr H OH NHCOCH(CH3)2
1-169 (CH2)4 TMS H NHBz H
1-170 (CH2)4 TBDMS H NHBz H
1-171 (CH2)4 TBDPS H NHBz H
1-172 (CH2)4 T1PS H NHBz H
1-173 (CH2)4 TMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-174 (CH2)4 TBDMS H OH NHCOCH(CH3)2
1-175 (CH2)4 TBDPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-176 (CH2)4 TIPS H OH NHCOCH(CH3)2
1-177 ch2 H H OH NHCOCH(CH3)2
1-178 ch2 H H NHBz H
1-179 (CH2)2 H H OH NHCOCH(CH3)2
1-180 (CH2)2 H H NHBz H
- 17CZ 296576 B6
1-181 (CH2)3 H H OH NHCOCH(CH3)2
1-182 (CH2)3 H H NHBz H
1-183 (CH2)4 H H OH NHCOCH(CH3)2
1-184 (CH2)4 H H NHBz H
1-185 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH NHCOCH(CH3)2
1-186 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4ČN) NHBz H
1-187 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH NHCOCH(CH3)2
1-188 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4ČN) NHBz H
1-189 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH NHCOCH(CH3)2
1-190 (CH2)j DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz H
1-191 (CH2)4 DMTr PíNíiPrhXOC^CN) OH NHCOCH(CH3)2
1-192 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4ČŇ) NHBz H
1-193 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH NHCOCH(CH3)2
1-194 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
1-195 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH NHCOCH(CH3)2
1-196 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
1-197 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH NHCOCH(CH3)2
1-198 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
1-199 (CH2)4 DMTr P(N(ÍPr)2)(OCH3) OH NHCOCH(CH3)2
1-200 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
1-201 ch2 DMTr P(O)(OH)H OH NHCOCH(CH3)2
1-202 ch2 DMTr P(O)(OH)H NHBz H
1-203 (CH2)2 DMTr P(O)(OH)H OH NHCOCH(CH3)2
1-204 (CH2)2 DMTr P(O)(OH)H NHBz H
1-205 (CH2)3 DMTr P(O)(OH)H OH NHCOCH(CH3)2
1-206 (CH2)3 DMTr P(O)(OH)H NHBz H
1-207 (CH2)4 DMTr P(O)(OH)H OH NHCOCH(CH3)2
1-208 (CH2)4 DMTr P(O)(OH)H NHBz H
-18CZ 296576 B6
(1)
Tabulka č. 2
Př. slouč. č. A R1 Rz R5 R6
2-1 ch2 H H OH H
2-2 ch2 H H OH CH3
2-3 ch2 H H nh2 H
2-4 ch2 H H nh2 ch3
2-5 ch2 H H nh2 F
2-6 ch2 H H Cl H
2-7 ch2 H H OMe H
2-8 ch2 H H SH H
2-9 ch2 Bn H OH H
2-10 ch2 Bn Bn OH H
2-11 ch2 PMB H OH H
2-12 ch2 PMB PMB OH H
2-13 ch2 Tr H OH H
2-14 ch2 MMTr H OH H
2-15 ch2 DMTr H OH H
2-16 ch2 TMTr H OH H
2-17 ch2 TMS H OH H
2-18 ch2 TBDMS H OH H
2-19 ch2 TBDPS H OH H
- 19CZ 296576 B6
2-20 ch2 TIPS H OH H
2-21 ch2 Bn H OH ch3
2-22 ch2 Bn Bn OH ch3
2-23 ch2 PMB H OH ch3
2-24 ch2 PMB PMB OH ch3
2-25 ch2 Tr H OH ch3
2-26 ch2 MMTr H OH ch3
2-27 ch2 DMTr H OH ch3
2-28 ch2 TMTr H OH ch3
2-29 ch2 TMS H OH ch3
2-30 ch2 TBDMS H OH ch3
2-31 ch2 TBDPS H OH ch3
2-32 ch2 TIPS H OH ch3
2-33 ch2 Bn H NHBz H
2-34 ch2 Bn Bn NHBz H
2-35 ch2 PMB H NHBz H
2-36 ch2 PMB PMB NHBz H
2-37 ch2 Tr H NHBz H
2-38 ch2 MMTr H NHBz H
2-39 ch2 DMTr H NHBz H
2-40 ch2 TMTr H NHBz H
2-41 ch2 TMS H NHBz H
2-42 ch2 TBDMS H NHBz H
2-43 ch2 TBDPS H NHBz H
2-44 ch2 TIPS H NHBz H
2-45 ch2 Bn H NHBz ch3
2-46 ch2 Bn Bn NHBz ch3
2-47 ch2 PMB H NHBz ch3
2-48 ch2 PMB PMB NHBz ch3
2-49 ch2 Tr H NHBz ch3
2-50 ch2 MMTr H NHBz ch3
2-51 ch2 DMTr H NHBz ch3
-20CZ 296576 B6
2-52 ch2 TMTr H NHBz ch3
2-53 ch2 TMS H NHBz ch3
2-54 ch2 TBDMS H NHBz ch3
2-55 ch2 TBDPS H NHBz ch3
2-56 ch2 TIPS H NHBz ch3
2-57 (CH2)2 H H OH H
2-58 (CH2)2 H H OH ch3
2-59 (CH2)2 H H NH2 H
2-60 (CH2)2 H H nh2 ch3
2-61 (CH2)2 H H nh2 F
2-62 (CH2)2 H H Cl Η
2-63 (CH2)2 H H OMe Η
2-64 (CH2)2 H H SH Η
2-65 (CH2)2 Bn H OH Η
2-66 (Cli2)2 Bn Bn OH Η
2-67 (CH2)2 PMB H OH Η
2-68 (CH2)2 PMB PMB OH Η
2-69 (CH2)2 Tr H OH Η
2-70 (CH2)2 MMTr H OH Η
2-71 (CH2)2 DMTr H OH Η
2-72 (CH2)2 TMTr H OH Η
2-73 (CH2)2 TMS H OH Η
2-74 (CH2)2 TBDMS H OH Η
2-75 (CH2)2 TBDPS H OH Η
2-76 (CH2)2 TIPS H OH Η
2-77 (CH2)2 Bn H OH ch3
2-78 (CH2)2 Bn Bn OH ch3
2-79 (CH2)2 PMB H OH ch3
2-80 (CH2)2 PMB PMB OH ch3
2-81 (CH2)2 Tr H OH ch3
2-82 (CH2)2 MMTr H OH ch3
2-83 (CH2)2 DMTr H OH CH3
-21 CZ 296576 B6
1 2-84 (CH2)2 TMTr H OH ch3
2-85 (CH2)2 TMS H OH ch3
2-86 (CH2)2 TBDMS H OH ch3
2-87 (CH2)2 TBDPS H OH ch3
2-88 (CH2)2 TIPS H OH ch3
2-89 (CH2)2 Bn H NHBz H
2-90 (CH2)2 Bn Bn NHBz H
2-91 (CH2)2 PMB H NHBz H
2-92 (CH2)2 PMB PMB NHBz H
2-93 (CH2)2 Tr H NHBz H
2-94 (CH2)2 MMTr H NHBz H
2-95 (CH2)2 DMTr H NHBz H
2-96 (CH2)2 TMTr H NHBz H
2-97 (CH2)2 TMS H NHBz H
2-98 (ch2)2 TBDMS H NHBz H
2-99 (CH2)2 TBDPS H NHBz H
2-100 (CH2)2 TIPS H NHBz H
2-101 (CH2)2 Bn H NHBz ch3
2-102 (CH2)2 Bn Bn NHBz ch3
2-103 (CH2)2 PMB H NHBz ch3
2-104 (CH2)2 PMB PMB NHBz ch3
2-105 (CH2)2 Tr H NHBz ch3
2-106 (CH2)2 MMTr H NHBz ch3
2-107 (CH2)2 DMTr H NHBz ch3
2-108 (CH2)2 TMTr H NHBz ch3
2-109 (CH2)2 TMS H NHBz ch3
2-110 (CH2)2 TBDMS H NHBz ch3
2-111 (CH2)2 TBDPS H NHBz ch3
2-112 (čh2)2 TIPS H NHBz ch3
2-113 (CH2)3 H H OH H
2-114 (CH2)3 H H OH ch3
2-115 (CH2)3 H H NH2 H
-22CZ 296576 B6
2-116 (CH2)3 H H nh2 ch3
2-117 (CH2)3 H H nh2 F
2-118 (C’H2)3 H H Cl H
2-119 (CH2)3 H H OMe H
2-120 (CH2)3 11 H SH H
2-121 (CH2)3 Bn H OH H
2-122 (CH2)3 Bn Bn OH H
2-123 (CH2)3 PMB H OH H
2-124 (CH2)3 PMB PMB OH H
2-125 (CH2)3 Tr H OH H
2-126 (CH2)3 MMTr H OH H
2-127 (CH2)3 DMTr H OH H
2-128 (CH2)3 TMTr H OH H
2-129 (CH2)3 TMS H OH H
2-130 (CH2)3 TBDMS H OH H
2-131 (CH2)3 TBDPS H OH H
2-132 (CI12)3 TIPS H OH H
2-133 (CH2)3 Bn H OH CH3
2-134 (CH2)3 Bn Bn OH ch3
2-135 (CH2)3 PMB H OH CH3
2-136 (CH2)3 PMB PMB OH ch3
2-137 (cii2)3 Tr H OH CHj
2-138 (CH2)3 MMTr H OH ch3
2-139 (CH2)3 DMTr Ή OH CHa
2-140 (Cll2)3 TMTr H OH CHa
2-141 (Cll2)3 TMS H OH CHa
2-142 (CH2)3 TBDMS H OH CHa
2-143 (Cll2)a TBDPS H OH CHa
2-144 (CH2)3 TIPS H OH CHa
2-145 (CH2)3 Bn H NHBz H
2-146 (CH2)3 Bn Bn NHBz H
2-147 (CH2)3 PMB H NHBz H
-23 CZ 296576 B6
2-148 (CH2)j PMB PMB NHBz H
2-149 (CH2)3 Tr H NHBz H
2450 (CH2)3 MMTr H NHBz H
2-151 (CH2)3 DMTr H NHBz H
2-152 (CH2)s TMTr H NHBz H
2-153 (CH2)3 TMS H NHBz H
2-154 (CH2)3 TBDMS H NHBz H
2-155 (CH2)3 TBDPS H NHBz H
2-156 (CH2)3 TIPS H NHBz H
2-157 (CH2)3 Bn H NHBz CH3
2458 (ch2)3 Bn Bn NHBz ch3
2-159 (CH2)3 PMB H NHBz cii3
2-160 (CH2)3 PMB PMB NHBz ch3
2461 (CH2)3 Tr H NHBz ch3
2-162 (CH2)3 MMTr H NHBz ch3
2-163 (CH2)3 DMTr H NHBz ch3
2-164 (CH2)3 TMTr H NHBz CH3
2-165 (CH2)3 TMS H NHBz ch3
2-166 (ch2)3 TBDMS H NHBz ch3
2-167 (CH2)3 TBDPS H NHBz ch3
2468 (Ch2)3 TIPS H NHBz ch3
2-169 (CH2)4 H H OH Η
2-170 (CH2)4 H H OH ch3
2-171 (CH2)4 H H nh2 H
2472 (CH2)4 H H nh2 ch3
2-173 (CH2)4 H H nh2 F
2474 (CH2)4 H H Cl H
2-175 (ch2)4 H H OMe H
2-176 (ch2)4 H H SH H
2477 (CH2)4 Bn H OH H
2-178 (CH2)4 Bn Bn OH Η
2-179 (ch2)4 PMB H OH H
-24CZ 296576 B6
2-180 (CH2)4 PMB PMB OH H
2-181 (CH2)4 Tr H OH H
2-182 (CH2)4 MMTr H OH H
2-183 (CH2)4 DMTr H OH H
2-184 (CH2)4 TMTr H OH H
2-185 (CH2)4 TMS H OH H
2-186 (CH2)4 TBDMS H OH H
2-187 (CH2)4 TBDPS H OH H
2-188 (CH2)4 TIPS H ÓH H
2-189 (CH2)4 Bn H OH ch3
2-190 (CH2)4 Bn Bn OH ch3
2-191 (CH2)4 PMB H OH ch3
2-192 (CH2)4 PMB PMB OH ch3
2-193 (CH2)4 Tr H OH ch3
2-194 (CH2)4 MMTr H OH ch3
2-195 (CH2)4 DMTr H OH ch3
2-196 (CH2)4 TMTr H OH ch3
2-197 (CH2)4 TMS H OH ch3
2-198 (CH2)4 TBDMS H OH ch3
2-199 (CH2)4 TBDPS H OH ch3
2-200 (CH2)4 TIPS H OH ch3
2-201 (CH2)4 Bn H NHBz H
2-202 (CH2)4 Bn Bn NHBz H
2-203 (CH2)4 PMB H NHBz H
2-204 (CH2)4 PMB PMB NHBz H
2-205 (CH2)4 Tr H NHBz H
2-206 (CH2)4 MMTr H NHBz H
2-207 (CH2)4 DMTr H NHBz H
2-208 (CH2)4 TMTr H NHBz H
2-209 (CH2)4 TMS H NHBz H
2-210 (CH2)4 TBDMS H NHBz H
2-211 (CH2)4 TBDPS H NHBz H
-25 CZ 296576 B6
2-212 (CH2)4 TIPS H NHBz H
2-213 (CH2)4 Bn H NHBz CH3
2-214 (CH2)4 Bn Bn NHBz ch3
2-215 (CH2)4 PMB H NHBz ch3
2-216 (CH2)4 PMB PMB NHBz čh3
2-217 (CH2)4 Tr H NHBz čh3
2-218 (CH2)4 MMTr H NHBz ch3
2-219 (CH2)4 DMTr H NHBz ch3
2-220 (CH2)4 TMTr H NHBz ch3
2-221 (CH2)4 TMS H NHBz ch3
2-222 (CH2)4 TBDMS H NHBz ch3
2-223 (CH2)4 TBDPS H NHBz ch3
2-224 (CH2)4 TIPS H NHBz ch3
2-225 ch2 H H NHBz Η
2-226 ch2 H H NHBz ch3
2-227 (ch2)2 H H NHBz H
2-228 (CH2)2 H H NHBz ch3
2-229 (CH2)j H H NHBz Η
2-230 (CH2)3 H H NHBz ch3
2-231 (CH2)4 H H NHBz H
2-232 (CH2)4 H H NHBz ch3
2-233 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH Η
2-234 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH ch3
2-235 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz Η
2-236 ch2 DMTr PÍNCiPrhXOCztUCN) NHBz ch3
2-237 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH Η
2-238 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH ch3
2-239 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz Η
2-240 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz ch3
2-241 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH H
2-242 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH CH3
2-243 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz H
-26CZ 296576 B6
2-244 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz CH3
2-245 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH H
2-246 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) OH CH3
2-247 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz H
2-248 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OC2H4CN) NHBz ch3
2-249 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH Η
2-250 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH ch3
2-251 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
2-252 ch2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz ch3
2-253 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH Η
2-254 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH ch3
2-255 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz Η
2-256 (CH2)2 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz ch3
2-257 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH Η
2-258 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH ch3
2-259 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
2-260 (CH2)3 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz ch3
2-261 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH H
2-262 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) OH ch3
2-263 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz H
2-264 (CH2)4 DMTr P(N(iPr)2)(OCH3) NHBz ch3
V tabulce č. 1 a 2 uvedené shora v textu výhodné sloučeniny zahrnují (1-5), (1-7), (1-23), (1-24), (1-31), (1-35), (1-39), (1-43), (1-49), (1-51), (1-67), (1-68), (1-75), (1-83), (1-87), (1-93), (1-95), (1-111), (1-112), (1-119), (1-123), (1-127), (1-131), (1-137), (1-139), (1-155), (1-156), (1-163), (1-167), (1-171), (1-175), (1-177), (1-178), (1-185), (1-186), (1-193), (1-194), (1-201), (1-202), (2-1), (2-2), (2-4), (2-10), (2-15), (2-19), (2-22), (2-27), (2-31), (2-34), (2-39), (2-43), (2-46), (2-51), (2-55), (2-57), (2-58), (2-59), (2-60), (2-66), (2-71), (2-75), (2-78), (2-83), (2-87), (2-90), (2-95), (2-99), (2-102), (2-107), (2-111), (2-113), (2-114), (2-115), (2-116), (2-122), (2-127), (2-131), (2-134), (2-139), (2-143), (2-146), (2-151), (2-155), (2-158), (2-163), (2-167), (2-169), (2-170), (2-171), (2-172), (2-178), (2-183), (2-187), (2-190), (2-195), (2-199), (2-202), (2-207), (2-211), (2-214), (2-219), (2-223), (2-225), (2-226), (2-233), (2-234), (2-235), (2-236), výhodnější sloučeniny mohou zahrnovat
2'-O,4'-C-ethylenguanosin (1-5) 2'-O,4'-C-ethylenadenosin (1-7) 3' ,5'-di-0-benzyl-2'-C>,4'-C-ethylen-6-7V-benzoyladenosin (1-23) 3',5'-di-O-benzyl-2'-(9,4'-C-ethylen-2-ŤV-izobutyrylguanosin (1-24)
-27CZ 296576 B6
5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4 '-C-ethylen-6-A-benzoyladenosin (1-31)
5'-O-dimethoxytntyl-2'-0,4'-C-ethylen-2-7V-izobutyrylguanosin (1-35) 2'-O,4'-C-ethylen-2-V-izobutyrylguanosin (1-177)
2-0,4 '-C-ethylen-6-A-benzoyladenosin (1-178) 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-6-/V'-benzoyladenosin-3'-0-(2-kyanoethyl-N,Ndiizopropyl)fosforamidit (1-185) 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylen-2-2V-osobutyrylguanosin-3'-0-(2-kyanoethyl-Ar,Adiizopropyl)fosforamidin (1-186)
2'-O,4'-C-ethylenuridin (2-1)
2'-O,4'-C-ethylen-5-methylundin (2-2)
2'-O,4'-C-ethylencitidin (2-3) 2'-O,4'-C-ethylen-5-methylcytidin (2-4)
3', 5 '-di-O-benzyl-2 '-O,4'-C-ethylenuridin (2-10)
5'-O-dimethyoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylenuridin (2-15) 3',5'-di-O-benzyl-2'-O-4'-C-ethylen-5-methylundm (2-22) '-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-rnethyluridin (2-27) 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen^l-/V-benzoylcytidin (2-34) 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4M>-ethylen-4-/V-benzoylcytidin (2-39) 3',5'-di-O-benzyl-2'-(9,4'-C-ethylen^4-7V-benzoyl-5-methyluridin (2^46) 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-7V-benzoyl-5-methylcytidin (2-51) 2'-O,4'-C-ethylen-4-jV-benzoylcytidin (2-225) 2'-O,4'-C-ethylen-4-Af-benzoyl-5-methylcytidin (2-226) 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4-C-ethylenuridin-3'-O-(2-kyanoethyl-A,A'-diizopropyl)fosforamidin (2-233) 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-O-(2-kyanoethyl-V,A'-diizopropyl)fosforamidit (2-234) '-O-dimethoxytrityl-2 '-O,4'-C-ethylen—4-Ar-benzoylcytidi n-3 '-O-(2-kyanoethyl-/V, TV-diizopropyl)fosforamidit (2-235) a 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-O-(2-l<yanoethyl-/V,7V-diizopropyl)fosforamidit (2-36).
Postup A
-28CZ 296576 B6
A-6
Při postupu A, symbol X reprezentuje chránící skupinu, symbol Y reprezentuje chránící skupinu, symbol A reprezentuje to samé, jak se uvádí shora v textu, zatímco symbol B1 reprezentuje skupinu purin-9-yl, substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, uvedené substituenty se vybraly ze shora uvedených substituentů a, ale s výjimkou nechráněné aminoskupiny „aminoskupiny“ která se může chránit“, zatímco symbol B2 reprezentuje skupinu purin-9-yl, substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl, uvedené substituenty se vybraly ze shora uvedených substituentů a, ale s výjimkou chráněných aminoskupin „aminoskupiny, která se může chránit“. Symbol R7 reprezentuje skupinu, která tvoří odstupující skupinu a symbol R8 reprezentuje alifatickou acylovou skupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku.
Chrániči skupina vyjádřená symbolem X je stejná skupina jako je „hydroxylová chránící skupina“ ve shora v textu uvedeném symbolu R1.
Chránící skupina Y je stejná skupina jako „hydroxylová chránící skupina“ ve shora uvedeném symbolu R2.
„Skupina, která tvoří odstupující skupinu, symbolu R7 může zahrnovat nižší alkylsulfonylovou skupinu, jako je methansulfonyl a ethansulfonyl, nižší alkylsulfonylovou skupinu substituovanou halogenem, jako je trifluormethansulfonyl a arylsulfonylová skupina, jako je p-toluensulfonyl, přičemž je výhodná methansulfonová skupina nebo p-toluensulfonylová skupina.
„Alifatická acylová skupina zahrnující 2 až 4 atomy uhlíku“ symbolu R8 může zahrnovat acetylovou, propionoylovou, butylovou skupinu a podobně. Výhodná je acetylová skupina.
Dále v textu se každý krok postupu A popisuje detailně.
KrokA-1
Účelem je připravit sloučeninu obecného vzorce 4 reakcí sloučeniny obecného vzorce 3, která se může připravit způsobem B až D popsaným dále v textu s činidlem vhodným pro zavedení odstupující skupiny v přítomnosti bazického katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petroleter. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen, a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diizopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylizobutylketon, izoforon a cyklohexanon, nitrosloučeniny, jako je nitroethan a nitrobenzen, nitrily, jako je acetonitril a izobutylronitril, amidy, jako je formamid, Α,Α-dimethylformamid, ΛζΑ-dimethylacetamid, 7V-methyl-2-pyrolidon, TV-methylpyrolidon a hexamethylfosforečný triamid, sulfoxidy, jako je sulfolan a pyridinové deriváty, přičemž výhodný je pyridin.
Zde použitý bazický katalyzátor může přednostně zahrnovat bázi, jako je triethylamin, pyridin a dimethylaminopyridin.
-29CZ 296576 B6
Činidlo pro zavedení odstupující skupiny může zahrnovat alkylsulfonylové halidy, jako je meťhansulfonylchlorid a ethansulfonylbromid a arylsulfonylové halidy, jako je p-toluensulfonylchlorid, přičemž výhodný je methansulfonylchlorid a p-toluensulfonylchlorid.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, na rozpouštědle, na činidle pro zavedení odstupující skupiny a bazického katalyzátoru, ale je použitelný při teplotě 0 až 50 °C. Výhodná je teplota 10 až 40 °C.
Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, na rozpouštědle, na činidle pro zavedení odstupující skupiny a na bazickém katalyzátoru a reakční teplotě, ale je obvykle 10 minut až 24 hodin. Výhodný čas je 1 až 10 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce I získala například neutralizací reakčního roztoku, koncentrací reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promýváním vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením nevodným síranem hořečnatým a rozpouštědlo se odstranilo destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistil, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografíi na koloně se silikagelem.
KrokA-2
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce 5 reakcí sloučeniny obecného vzorce 4 v kroku A-l s kyselým anhydridem v přítomnosti kyselého katalyzátoru v rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat ethery, jako je diethylether, dioxan a tetrahydrofuran, nitrily, jako je acetonitril a izobutyronitril, amidy, jako je formamid ΛΑ/V-dimethylformamid, ΛζΝ-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidin, /V-methylpyrrolidin a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a organická kyselina, jako je kyselina octová. Výhodné je použití kyseliny octové.
Zde použitelný kyselý katalyzátor může zahrnovat anorganické kyseliny, jako je kyselina chlorovodíková, kyselina sírová a kyselina dusičná. Výhodná je kyselina sírová (zvláště koncentrovaná kyselina sírová).
Zde použitelný kyselý anhydrid může zahrnovat anhydrid nižší alifatické karboxylové kyseliny, jako je kyselý anhydrid a anhydrid kyseliny propionové, upřednostňuje se kyselý anhydrid.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a kyselém anhydridu a je obvykle 0 až 50 °C. Výhodné je 10 až 40 °C.
Reakční směs kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru, kyselém anhydridu a reakční teplotě, aleje obvykle 10 minut až 12 hodin. Výhodný čas reakce je 30 minut až 3 hodiny.
Po reakci požadovaná sloučenina obecného vzorce 5 se získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je etylacetát, promytím vodou, separací organické vrstvy, která obsahuje požadovanou sloučeninu, sušením na síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstranilo destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistil, je-li to nutné, běžnou metodou, například rekrystalizací, chromatografíi na koloně se silikagelem a podobně.
-30CZ 296576 B6
Krok A-3
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce 6 reakcí sloučeniny obecného vzorce 5 v kroku A-2 s trimethylsilylovou sloučeninou odpovídající purinu nebo pyrimidinu, který může zahrnovat požadovaný substituent připravený podle publikace H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981) v přítomnosti katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen, xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, nitrily, jako je acetonitril a izobutyronitril, amidy, jako je formamid, ΛζΑ-dimethylformamid, VM-dimethylacetamid, A-methyl-2-pyrrolidm, TV-methylpyrrolidinon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné, sulfid uhličitý. Výhodný je 1,2-di-chlorethan.
Zde použitelný kyselý katalyzátor může zahrnovat Lewisovy kyselé katalyzátory, jako je A1C13, SnCl4, TiCl4, ZnCl2, BF3, trimethylsilyltrifluormethansulfonát. Výhodný je trimethylsilyltrifluormethansulfonát.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale obvykle se pohybuje od 0 do 100 °C. Výhodná je teplota 50 až 80 °C.
Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a reakční teplotě, ale obvykle se pohybuje od 1 hodiny do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 8 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 6 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušení nevodným síranem hořečnatým a rozpouštědlo se odstranilo destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistil, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok A-4
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce la podle vynálezu cyklizací sloučeniny obecného vzorce 6 připravené v kroku A-3 v přítomnosti bazického katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelný rozpouštědlo může zahrnovat vodu, pyridinové deriváty, acetonitrily, jako je acetonitril a izobutyronitril, amidy, jako je formamid, ΛζΑ-dimethylformamid, Λζ-V-dimethylacetamid, V-methyl-2-pyrrolidin, A-methylpyrrolidinon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a jejich směsi. Výhodná je směs vody a pyridinu.
Zde použitelný bazický katalyzátor může zahrnovat hydroxidy alkalických kovů, jako je hydrid sodný a hydroxid draselný, uhličitany alkalických kovů, jako je uhličitan sodný a uhličitan draselný, alkoxidy alkalických kovů, jako je methoxid sodný a ethoxid sodný a vodný amoniak. Výhodné jsou hydroxidy alkalických kovů (zvláště pak hydroxid sodný).
Teplota reakce kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a bazickém katalyzátoru, ale obvykle její hodnota je od 0 do 50 °C. Výhodná je teplota od 10 °C do 30 °C. Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru areakční teplotě, aleje obvykle od 1 minuty do 5 hodin. Výhodný je čas reakce 1 minuta až 30 minut.
-31 CZ 296576 B6
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 6 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografíí na koloně se silikagelem a podobně.
Krok A-5
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce lb reakcí sloučeniny obecného vzorce la připravené v kroku A-4 v přítomnosti činidla odstraňující ochrannou skupinu v inertním rozpouštědle.
Metoda odstranění ochranné skupiny závisí na druhu ochranné skupiny a není omezena. Způsobuje vedlejší reakce a může se například provést způsobem popsaným v publikaci „Protective Groups in Organíc Synthesis“, Theodora W. Greene and Peter G. m. Wuts, 1999, Published A. Wiley-Interscience Publication).
Odstranění ochranné skupiny je možné zvláště provést následujícím způsobem, kde ochranná skupina je (1) alifatická acylová skupina nebo aromatická acylová skupina, (2) methylová skupina, substituovaná jednou nebo třemi arylovými skupinami nebo methylovou skupinou substituovanou jednou až třemi arylovými kruhy, které jsou substituovanými nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou nebo (3) silylovou skupinou.
(1) V případě, že ochranná skupina je alifatická acylová skupina nebo aromatická acylová skupina, reakce odstraňující ochrannou skupinu je obvykle provedena ošetřením alkalickým činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo není omezeno, pokud je jednoduše mísitelné s vodou, neinhibuje reakci a rozpouští počáteční materiál a může zahrnovat vodné anevodné amidy, jako je dimethylformamid a dimethylacetamid, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan nebo tetrachlorid uhlíku a ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan. Výhodné jsou ethery. Výhodnější je tetrafuran.
Zde použitelné alkalické činidlo může zahrnovat hydroxidy alkalických kovů, jako je hydroxid lithný, hydroxid draselný a hydroxid sodný, uhličitany alkalického kovů, jako je methoxid sodný a ethoxid sodný a roztok amoniaku, jako je roztok amoniaku ve vodě a roztok amoniaku v methanolu.
Reakční teplota je od 0 do 60 °C. Výhodná je teplota 20 až 40 °C. Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelné s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografíí na koloně se silikagelem a podobně.
(2) V případě, že ochranná skupina je methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami nebo methylovou skupinou substituovanou jednou až třemi arylovými kruhy, které jsou substituovanými nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou, reakce se provádí v inertním rozpouštědle za použití redukčního činidla.
-32CZ 296576 B6
Zde použitelné rozpouštědlo zahrnuje přednostně alkoholy, jako je methanol, ethanol izopropanol, ethery, jako je diethylether, tetrahydrofuran a dioxan, aromatické uhlovodíky, jako je toluen, benzen a xylen, alifatické uhlovodíky, jako je hexan a cyklohexan, estery, jako je ethylacetát a propylacetát, organické kyseliny, jako je kyselina octová nebo směsi těchto organických rozpouštědel a vody.
Zde použitelné redukční činidlo není zvláště omezeno, pokud se může použít pro katalytickou redukci a je výhodné, aby zahrnovalo paládium na uhlíku, Raneyův nikl, oxid platiny, platinovou čerň, oxid rhodičito-hlinitý, chlorid trifenylfosfmrhodičitý a síran paladičito-bamatý.
Tlak není nijak omezen, aleje obvykle od 1 do 10 atmosfér.
Reakční teplota je od 0 do 60 °C. Výhodná je teplota od 20 do 40 °C.
Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je jedna hodina až tri hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promytím vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografíi na koloně se silikagelem a podobně.
V případě, že ochranná skupina je methylová skupina substituovaná třemi arylovými skupinami, to znamená tritylová skupina, reakce odstraňující tritylovou skupinu může také proběhnout za použití kyseliny.
V případě, že zde použitelné rozpouštědlo zahrnuje aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, alkoholy, jako je methanol, ethanol, izopropanol a terc-butanol, nitrily, jako je acetonitril a izobutyronitril, amidy, jako je formamid, N,N-dimethylformamid, N,N-dimethylacetamid, N-methyl-2-pyrrolidon, N-methylpyrrolidon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a organické kyseliny, jako je kyselina octová. Výhodné jsou organické kyseliny (zvláště kyselina octová), nebo alkoholy (zvláště terc-butanol).
Zde použitelná kyselina může s výhodou zahrnovat kyselinu octovou nebo kyselinu trifluoroctovou.
Reakční teplota je od 0 do 60 °C. Výhodná je reakční teplota od 20 do 40 °C.
Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografíi na koloně se silikagelem a podobně.
(3) V případě, že ochranná skupina je silylová skupina, může se obvykle odstranit ošetřením se sloučeninou produkující fluorid, jako je tetrabutylamoniumfluorid, kyselina fluorovodíková, kyselina fluorovodíková-pyridin a fluorid draselný nebo organické kyseliny, jako je kyselina
-33CZ 296576 B6 octová, kyselina methansulfonová, kyselina paratoluensulfonová, kyselina trifluoroctová a kyselina trifluormethansulfonová nebo organické kyseliny, jako je kyselina chlorovodíková.
V případě, že se ochranná skupina odstraní fluoride, reakce se někdy podpoří přidáním organických kyselin, jako je kyselina mravenčí, kyselina octová a kyselina propionová.
Zde použitelné rozpouštědlo není omezeno, pokud neinhibuje reakci a rozpouští počáteční materiál a může s výhodou použít ether, jako je tetrahydrofuran, diethylether, diizopropylether a dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, nitrily, jako je acetonitril a izobutyronitril, voda, organické kyseliny, jako je kyselina octová a jejich směsi.
Reakční teplota je od 0 do 100 °C. Výhodná je reakční teplota od 20 do 70 °C.
Reakční čas je od 5 minut do 48 hodin. Výhodná je doba reakce 1 až 24 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lb získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušení na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografíí na koloně se silikagelem a podobně.
Krok A-6
Dalším krokem je příprava sloučeniny obecného vzorce Ic reakcí sloučeniny obecného vzorce lb připravené v kroku A-5 v přítomnosti činidla odstraňujícího ochrannou skupinu v inertním rozpouštědle.
Metoda odstranění ochranné skupiny závisí na druhu ochranné skupiny a není omezena. Způsobu vedlejší reakce a může se například provést způsobem popsaným v publikaci „Protective Groups in Organic Synthesis“, Theodora W. Greene and Peter G. M. Wuts, 1999, Published A. Wiley-Interscience Publication).
Odstranění ochranné skupiny je možné zvláště provést následujícím způsobem, když ochranná skupina je alifatická acylovaná skupina nebo aromatická acylová skupina, reakce odstraňující ochrannou skupinu je obvykle provedena ošetřením alkalickým činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použití rozpouštědla není omezeno, pokud je jednoduše mísitelné s vodou, neinhibuje reakci a rozpouští počáteční materiál a může zahrnovat vodné a nevodné alkoholy jako je methanol a ethanol, amidy, jako je dimethylformarnid a dimethylacetamid, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan nebo chlorid uhličitý a ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan. Výhodné jsou alkoholy. Výhodnější je methanol.
Zde použitelné alkalické činidlo může zahrnovat hydroxidy alkalických kovů, jako je hydroxid lithný, hydroxid draselný a hydroxid sodný, uhličitany alkalického kovu, jako je uhličitan sodný a uhličitan draselný, alkoxidy alkalických kovů, jako je methoxid sodný a ethoxid sodný a roztok amoniaku. Výhodný je amoniak.
Reakční teplota je od 0 do 50 °C. Výhodné je teplota od 10 do 40 °C.
Reakční čas je od 10 minut do 24 hodin. Výhodná je doba reakce 10 minut až 15 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce lc získala například zakoncentrováním reakčním směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát,
-34CZ 296576 B6 promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušení na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například 5 rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Meziprodukt obecného vzorce 3 popsaný shora v textu se může připravit způsobem B až D, jak se popisuje dále v textu.
Způsob B
-35CZ 296576 B6
Při způsobu B a D symboly X a Y mají stejný význam jako se definuje shora v textu. Symbol R9 reprezentuje skupinu, která tvoří odstupující skupinu, symbol E reprezentuje ethylen, trimethylen nebo tetramethylen a symbol Z reprezentuje jednoduchou vazbu, methylenovou nebo ethylenovou skupinu.
Skupina, která tvoří odstupující skupinu symbolu R9 může zahrnovat skupinu popsanou shora v textu pro symbol R7. Výhodná je trifluormethansulfonylová skupina.
Symboly R11 a R12 jsou stejné a reprezentují vodíkový atom a dohromady tvoří atom kyslíku.
V případě, kdy symbol R11 a R12 dohromady tvoří atom kyslíku, symbol R10 reprezentuje alkylovou skupinu, která má 1 až 4 atomy uhlíku, jako je metyl, ethyl, propyl, izopropyl, butyl, izobutyl, .se/c-butyl a terc-butyl. Výhodná je methylová skupina. V případě, že symboly R11 a R12 jsou stejné a reprezentují atom vodíku, symbol R10 může zahrnovat aralkylovou skupinu, jako je benzylová skupina, alkoxyalkylová skupina, jako je methoxymethylová skupina, arylkarbonyloxymethylovou skupinu, jako je benzoyloxymethylová skupina, aralkyloxymethylová skupina, jako je benzyloxymethylová skupina, alkoxyalkoxyalkylová skupina, jako je methoxyethoxymethylová skupina, silylová skupina, jako je trimethylsilyl, í-butyldimethylsilyl, difenylmethylsilyl, difenylbutylsilyl, difenyl-izopropylsilyl a fenyldiizopropylsilyl.
Sloučenina obecného vzorce 7, to znamená počáteční materiál používaný v postupu B nebo v postupu C, se může připravit následujícím způsobem.
Sloučenina odpovídající sloučeniny obecného vzorce 6, jejíž část „X“ je atom vodíku, se připravila z 1,1,5,6-diizopropyliden-D-glukosy podle způsobu uvedeného v publikaci R.D. Youssefyeh, J.P.H. Verheyden, J.G. Moffatt, J. Organ. Chem., 44, 1301-1309 (1979) a následně sloučenina obecného vzorce 6 se může připravit podle metody popsané v publikaci T. Waga, T. Nishizaki, I. Miyakawa, H. Ohrui, H. Meguro, Biosci. Biotechnol. Biochem., 57, 1433-1438 (1993) (v případě, že symbol Xje Bn).
Způsob B
Krok B-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 8 reakcí sloučeniny obecného vzorce 7 připravené shora v textu popsanou metodou s činidlem vhodným pro zavedení odstupující skupiny v přítomnosti alkalického katalyzátoru v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat amidy, jako je dimethylformamid a dimethylacetamid, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan nebo chlorid uhličitý a ethery, jako je hydrofuran, diethylether a dioxan. Výhodný je methylenchlorid.
Použitelný alkalický katalyzátor s výhodou může zahrnovat alkalické činidlo, jako je triethylamin, pyridin a dimethylaminopyridm.
Činidlo pro zavedení odstupující skupiny může zahrnovat s výhodou chlorid trifluormethansulfonové kyseliny nebo anhydrid kyseliny trifluormethansulfonové.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale je obvykle -100 až -50 °C. Výhodná je teplota od -100 do -70 °C. Obvyklá teplota je od -100 do -50 °C. Výhodná je teplota -100 až -70 °C.
Reakční čas kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, ale obvykle je od 30 minut do 12 hodin. Výhodná je doba reakce 30 minut až 3 hodiny.
-36CZ 296576 B6
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 8 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Krok B-2
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 9 reakcí sloučeniny obecného vzorce 8, která se připravila v kroku B-l s činidlem pro zavedení kyanoskupiny v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat amidy, jako jsou methylenchlorid, chloroform, 1,2-dichlorethan, chlorid uhličitý, ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan, acetonitril, dimethoxysulfoxid a podobně. Výhodné jsou amidy (dimethylformamid).
Použitelné činidlo pro zavedení kyanoskupiny může zahrnovat KCN, NaCN a kyanid trimethylsilanu. Významný je NaCN.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědlu a činidlu vhodném pro zavedení kyanoskupiny, ale obvykle je od 0 do 100 °C. Výhodná je teplota 30 až 70 °C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, činidlu pro zavedení kyanoskupiny a teplotě reakce, aleje obvykle 30 minut až 12 hodin. Výhodná je reakční doba od 1 do 3 hodiny.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 9 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jak oje ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
KrokB-3
V tomto kroku se připraví sloučenina obecného vzorce 10 reakcí sloučeniny obecného vzorce 9 v kroku B-2 s redukčním činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, ethery, jako je diethylether, diizopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylizobutylketon, izoforon acyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid).
Zde použitá redukční činidla mohou zahrnovat diizobutylhydrid hlinitý a triethoxyhydrid hlinitý. Výhodný je diizobutylhydrid hlinitý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a redukčním činidlu, aleje obvykle -100 °C a -50 °C. Výhodná je teplota -90 až -70 °C.
-37CZ 296576 B6
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 30 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je hodina až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 9 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografíí na koloně se silikagelem a podobně.
Krok B-4
V tomto kroku se připraví sloučenina obecného vzorce (3a), která je počátečním materiálem v postupu A s reakční sloučeninou obecného vzorce 10 připravené v kroku B-3 s redukčním činidlem v inertním rozpouštědle.
Zde použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alkoholy, jako je methanol, ethanol, n-propanol, izopropanol, n-butanol, izobutanol, izoamylalkohol, diethylenglykol, terc-butanol, diethylenglykol, glycerin, oktanol, cyklohexanon a methylcelosolv a kyselina octová. Výhodné jsou alkoholy (zvláště ethanol).
Použitelné redukční činidlo může zahrnovat borovodík alkalického kovu, jako je borovodík sodný a borovodík litný, sloučeniny hydridu litného jako je hydrid litno-hlinitý a triethoxid litný— hydrid hlinitý a boran. Výhodný je hydrid sodnoboritý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a redukčním činidle, aleje obvykle 0 až 50 °C. Upřednostňuje se teplota do 10 do 40 °C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3a získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promýváním vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografíí na koloně se silikagelem a podobně.
Postup C
Krok C-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 11 reakcí sloučeniny obecného vzorce 7 připravené v postupu s oxidačním činidlem v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diizopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether,
-38CZ 296576 B6 ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylizobutylketon, izoforon a cyklohexanon.
Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid).
Zde použitelná oxidační činidla zahrnují Swernovo činidlo pro oxidaci, Dess-Martinovo činidlo pro oxidaci, komplex oxidu chromového, jako je komplex pyridinhydrochlorid/oxid chromový (pyridinium chlorchromát a pyridinium dichromát). Výhodné je Swernovo činidlo pro oxidaci (jmenovitě dimethylsulfoxidoxalylchlorid).
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědla a oxidačním činidle, ale je obvykle od -100 do -50 °C. Výhodná je teplota -100 až -70 °C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce se obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 11 získala například rozložením oxidačního činidla, zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografíí na koloně se silikagelem a podobně.
Krok C-2
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 12 reakcí sloučeniny obecného vzorce 11 připravené v kroku C-l s činidlem zvyšujícím počet uhlíku v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichloroethan, chlorobenzen a dichlorobenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diizopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylizobutylketon, izoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid).
Zde použitelná oxidační činidla zahrnují Wittingovo činidlo, Homer-Emmonsovo činidlo, Petersonovo reakční činidlo, reakční činidlo systému TiC14-CH2Cl2-Zn a Tebbeho činidlo. Výhodné je Wittingovo činidlo, Horner-Emmosovo činidlo a Tebbeho činidlo.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědlo a oxidačním činidle, aleje obvykle od -20 do 20 °C. Výhodná je teplota 0 °C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 30 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je jedna až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 12 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografíí na koloně se silikagelem a podobně.
-39CZ 296576 B6
Krok C-3
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 3a selektivně zavádějící hydroxylovou skupinu na koncový uhlík olefinu sloučeniny obecného vzorce 12 připravené v kroku C-2 v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diizopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylthylketon, methylizobutylketon, izoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou ethery (zvláště tetrahydrofuran).
Zde použitelná oxidační činidla zahrnují boranovodík, disiamylboran, thexylboran, 9-BBN (9-borabicyklo[3,3,l]nonan). Výhodný je 9-BBN.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a oxidačním činidle, ale je obvykle od 0 do 50 °C. Výhodná je teplota 10 až 40 °C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidle a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 6 hodin do 48 hodin. Výhodná doba reakce je 12 až 24 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3a získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promýváním vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
Postup D
Krok D-l
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 13 reakcí sloučeniny obecného vzorce 11 připravené v kroku C-l s činidlem zvyšujícím počet uhlíků v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alifatické uhlovodíky, jako je hexan, heptan, ligroin a petrolether. Dále může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je benzen, toluen, a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diizopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methylethylketon, methylizobutylketon, izoforon a cyklohexanon. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid).
Zde použitelná činidla ke zvyšování počtu uhlíků zahrnují Wittingovo činidlo, HomerEmmonsovo činidlo.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a činidle, aleje obvykle do -20 do 40 °C. Výhodná je teplota 0 až 20 °C.
-40CZ 296576 B6
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a činidle a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 30 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je jedna až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 13 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
KrokD-2
V tomto kroku se připravila sloučenina obecného vzorce 14 reakcí sloučeniny obecného vzorce 13 připravené v kroku D-l s redukčním činidlem v inertním rozpouštědle.
Tento krok se provedl podle odstavce (2) v kroku A-5. V případě, kde symbol R10 je substituován benzylovou skupinou a symboly R11 a R12 jsou atomy vodíku, se sloučenina 3b může přímo připravit v tomto kroku.
KrokD-3
V tomto kroku se připravila sloučenina obecného vzorce 3b, který je jeden z počátečních materiálů postupu A reakcí sloučeniny obecného vzorce 14 připravené v kroku D-2 s redukčním činidlem.
(a) Případ, kde symbol R11 a R12 dohromady tvoří atom kyslíku.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat alkoholy, jako je methanol, ethanol, n-propanol, izopropanol, n-propanol, izopropanol, n-butanol, izobutanol, izoamylalkohol, terc-butanol, diethylenglykol, glycerin, oktanol, cyklohexanol a methylcelosolv a kyselina octová. Vhodné jsou alkoholy (zvláště ethanol).
Použitelné redukční činidlo může zahrnovat borovodík alkalického kovu, jako je borovodík sodný a borovodík litný, sloučeniny hydridu litného jako je hydrid litno-hlinítý a triethoxid litný-hydrid hlinitý a boran. Výhodná je hydrid sodnoboritý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a redukčním činidle, aleje obvykle 0 až 50 °C. Upřednostňuje se teplota od 10 do 40 °C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3 b získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu horečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
(b) Případ, kdy symboly R11 a R12 jsou vodíkové atomy a symbol R10 je skupina jiná nebo benzylová skupina.
-41 CZ 296576 B6
V případě, kdy symbol R10 je silylová skupina, se tento krok provede podle metody popsané v odstavci (3) krok A-5.
V případě, že symbol R10 je aralkylová skupina, jako je benzylová skupina, alkoxyalkylová skupina, jako je methoxymethylová skupina, arylkarbonyloxymethylová skupina, jako je benzoyloxymethylová skupina nebo aralkyloxymethylenová skupina, jako je benzyloxymethylová skupina a alkoxyalkoxyalkylová skupina, jako je methoxyethoxymethylová skupina, se použije kyselý katalyzátor a ten může zahrnovat v tomto případě organickou kyselinu, jako je /i-toluensulfonovou kyselinu, trifluoroctovou kyselinu a dichloroctovou kyselinu a Lewisovou kyselinu, jako je BF3 a A1C13.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchloríd, chloroform, chlorid uhličitý, 1,2-dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, nitrily, jako je acetonitril a izobutyrinitril, amidy, jako je formamid, 7V,7V~dimethylformamid, Λζ/V-dimethylacetamid, V-methyl-2-pyrrolidon, N-methylpyrrolidinon a triamid kyseliny hexamethylfosforečné a sulfid uhličitý.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a kyselém katalyzátoru, aleje obvykle až 50 °C. Upřednostňuje se teplota do 10 do 40 °C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, kyselém katalyzátoru a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 10 minut do 12 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 3b získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, běžným způsobem, například rekrystalizací a chromatografíí na koloně se silikagelem a podobně.
Oligonukleotidy obsahující upravený nukleosid nebo jeho thioátový derivát se mohou připravit podle postupu E, jak se popisuje dále v textu za použití sloučeniny obecného vzorce 1 podle vynálezu.
E-2
oligonukleotid
-42CZ 296576 B6
V postupu E symbol A a B mají stejný význam jak se definuje shora v textu, symbol R13 reprezentuje hydroxylovou ochrannou skupinu (zvláště tritylovou skupinu, která se může substituovat methoxyskupinou), symbol R14 reprezentuje fosfonylovou skupinu a skupinu tvořenou reakcí monosubstituovaných chlor(alkoxy)fosfinů nebo dvakrát substituovaných alkoxyfosfinů popsaných dále v textu.
Postup E
KrokE-1
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 15 reakcí sloučeniny obecného vzorce 1 připravené postupem A s ochranným činidlem v inertním rozpouštědle.
Použitelné rozpouštědlo může zahrnovat aromatické uhlovodíky, jako je benzen, toluen a xylen, halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen, estery, jako je ethylformát, ethylacetát, propylacetát, butylacetát a diethylkarbonát, ethery, jako je diethylether, diizopropylether, tetrahydrofuran, dioxan, dimethoxyethan a diethylenglykoldimethylether, ketony, jako je aceton, methyl-ethylketon, methylizobutylketon, izoforon a cyklohexanon, nitrátované sloučeniny, jako je nitroethan a nitrobenzen, nitrily, jako je acetonitril a izobutyronitril, amidy, jako je formamid, dimethylformamid (DMF), dimethylacet-amid a triamid kyseliny hexamethylfosforečné, sulfoxid, jako je dimethylsulfoxid a sulfolan, alifatické terciální aminy, jako je trimethylamin, triethylamin a N-methylmorfolin a aromatické aminy, jako je pyridin a pikolin. Výhodné jsou halogenované uhlovodíky (zvláště methylenchlorid) a aromatické aminy (zvláště pyridh).
Použitelné chránící činidlo není nijak omezeno pokud se může selektivně chránit pouze 5'-poloha a může se odstranit za kyselých nebo neutrálních podmínek. Může s výhodou zahrnovat triarylmethylhalidy, jako je tritylchlorid, monomethoxytritylchlorid a dimethoxytritylchlorid.
V případě triarylmethylhalidů se použitá ochranné činidlo, obvykle používané alkalické činidlo.
V takovém případě zde použitelné alkalické činidlo může zahrnovat heterocyklické aminy, jako je pyridin, dimethylaminopyridin a pyrrolidinpyridin a alifatické terciální aminy, jako je trimethylamin a triethylamin. Výhodný je pyridin, dimethylaminopyridin a pyrrolidinpyridin.
V případě, že se jako rozpouštědlo použije kapalné alkalické činidlo, protože samotné alkalické činidlo funguje jako kyselé zachycovací činidlo, není potřeba přidat jiné alkalické činidlo.
Reakční teplota kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle a činidle, aleje obvykle od 0 do 150 °C. Výhodná je teplota 20 až 100 °C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidle a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 1 do 100 hodin. Výhodná doba reakce je 2 až 5 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 15 získala například zakoncentrováním reakční směsi, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením za použití nevodného síranu hořečnatého a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
KrokE-2
V tomto kroku se připravuje sloučenina obecného vzorce 16 reakcí sloučeniny obecného vzorce 15 připravené v kroku E-l s chlor(alkoxy)fosfiny s jednou substitucí nebo alkoxyfosfiny s dvěma substitucemi, které se obvykle používají při amidaci v inertním rozpouštědle.
-43 CZ 296576 B6
Použitelné rozpouštědlo není omezeno pokud neovlivňuje reakci a může přednostně zahrnovat ethery, jako je tetrahydrofuran, diethylether a dioxan a halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid, chloroform, chlorid uhličitý, dichlorethan, chlorbenzen a dichlorbenzen.
Chlor(alkoxy)fosfiny s jednou substitucí mohou zahrnovat fosfinové deriváty, jako je chlor(morfolinjmethoxyfosfin, chlor(morfolin)kyanoethoxyfosfín, chlor(dimethylamino)methoxyfosfín, chlor(diizopropylamino)methoxyfosfin a chlor(diizopropylamino)kyanoethoxyfosfin. Výhodný je chlor(morfolin)methoxyfosfin, chlor(morfolin)kyanoethoxyfosfm, chlor(diizopropylamino)kyanoethoxyfosfin.
V případě chlor(alkoxy) s jednou substitucí se používá kyselé zachytávací činidlo a toto činidlo může zahrnovat heterocyklické aminy, jako je pyridin adimethylaminopyridin a alifatické aminy, jako je trimethylamin, triethylamin a diizopropylamin. Výhodné jsou alifatické aminy (zvláště diizopropylamin).
Zde použitelné alkoxyfosfmy se dvěmi substitucemi mohou zahrnovat deriváty fosfínů, jako je bis(diizopropylamino)kyanoethoxyfosfín, bis(diethylamino)methansulfonylethoxyfosfín, bis(diizopropylamino)2,2,2-trichlorethoxy)fosfín a bis(diizopropylamino)(4chlorfenylmethoxyjfosfin. Výhodný j e bis(diizopropylamino)kyanoethoxyfosfin.
V případě kde se použijí alkoxyfosfmy s dvojitou substitucí se použije kyselina. V takovém případě používaná kyselina může s výhodou zahrnovat tetrazol, kyselinu octovou nebo kyselinu ptoluensulfonovou.
Reakční teplota není nijak omezena, ale obvykle je v rozmezí 0 až 80 °C. Výhodná je teplota místnosti.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle od 5 minut až 30 hodin. Výhodná doba reakce je od 30 minut do 10 hodin.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 16 získala například neutralizací reakční směsi, odstraněním nerozpustných částic filtrací, jestliže existují, přidáním organického rozpouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-1 to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografií na koloně se silikagelem a podobně.
V jiném případě se v tomto kroku připraví sloučenina obecného vzorce 16 reakcí sloučeniny obecného vzorce 15 připravené v kroku E-l s tris-(l,2,4-triazolyl)fosfitem v inertním rozpouštědle (s výhodou jde o halogenované uhlovodíky, jako je methylenchlorid). Následuje adice vody za účelem dosažení H-fosfonace.
Reakční teplota není nijak omezena, ale obvykle je v rozmezí -20 až 100 °C. Výhodná je teplota 10 až 40 °C.
Reakční doba kolísá v závislosti na počátečním materiálu, rozpouštědle, redukčním činidlu a reakční teplotě. Doba reakce je obvykle 5 minut až 30 hodin. Výhodná doba reakce je 30 minut v případě, že reakce se provedla při teplotě místnosti.
Po reakci se požadovaná sloučenina obecného vzorce 16 získala například neutralizací reakční směsi, odstraněním nerozpustných částic filtrací, jestliže existují, přidáním organického roz-44CZ 296576 B6 pouštědla nemísitelného s vodou, jako je ethylacetát, promývání vodou, separací organické vrstvy obsahující požadovanou sloučeninu, sušením na nevodném síranu hořečnatém a rozpouštědlo se odstraní destilací.
Takto získaný požadovaný produkt se dále čistí, je-li to nutné, konvenčním způsobem, například rekrystalizací a chromatografíí na koloně se silikagelem a podobně.
Krok E-3
V tomto kroku se připravuje oligonukleotidový analog pomocí DNA syntetizéru za použití alespoň jedné sloučeniny obecného vzorce 16 připravené v kroku E-2 a obecně dostupného fosforamiditového činidla nutného při produkci oligonukleotidového analogu požadované nukleotidové sekvence v souladu s běžnými metodami.
Oligonukletidový analog vykazující požadovanou nukleotidovou sekvenci se může syntetizovat DNA syntetizérem jako je Perkin-Elmer model 392 za použití fosforamiditové metody v souladu s metodou popsanou v publikaci (Nucleic Acids Research, 12, 4539 (1984)).
Navíc v případě převedení thioátu derivát thioátu se může získat v souladu s metodou popsanou v publikaci Tetrahedron Letters, 32, 3005 (1991, J. Am. Chem. Soc., 112, 1253 (1990) za použití činidla, které tvoří thioát reakcí s trivalentní kyselinou fosforečnou, jako je tetraethylthiuramdisulfid (TETD, Applied Biosystems, lne.) nebo Beacageovo činidlo (Millipore Corp.).
Výsledný surový oligonukleotidový analog se může čistit chromatografícký na koloně s reverzní fází OligoPak a čistota produktu se může potvrdit analýzou HPLC.
Délka řetězce výsledného oligonukleotidového analogu je v normálním případě 2 až 50 jednotek a s výhodou 10 až 30 jednotek v jednotkách nukleosidů.
Schopnost tvořit komplementární řetězec a odolnost vůči nukleázám výsledného oligonukleotidového analogu se může stanovit způsoby popsanými shora v textu.
Testovací metoda 1
Schopnost tvořit hydrid oligonukleotidového analogu podle vynálezu s ohledem na komplementární DNA a RNA se může stanovit teplotní hybridizací různých výsledných oligonukleotidových analogů s oligonukleotidovým analogem, který zahrnuje přirozeně se vyskytující DNA nebo RNA, které má komplementární sekvenci a měřitelnou teplotu denaturace (hodnota Tm).
Vzorek roztoku obsahující stejné množství oligonukleotidového analogu a přirozeně se vyskytujícího komplementárního oligonukleotidu v pufru fosforečnanu sodného se vložil do lázně s vroucí vodou a pak se pomalu ochlazoval při teplotě místnosti (teplotní hybridizace). Teplota roztoku v cele spektrofotometru (například Shimadzu UV-2100PC) pak postupně trochu vzrostla z 20 až 90 °C. Pak následuje měření absorbce ultrafialového světla při vlnové délce 260 nm.
Testovací metoda 2. Měření rezistence na nukleázy
K oligonukleotidu v pufru se přidala nukleáza a směs se zahřála. Příklady použitých nukleáz zahrnují fosfodiesterázu hadího jedu, endonukleázu PÍ a Sl. Ačkoli neexistuje žádné zvláštní omezení v použitém pufru, doporučuje se pufir vhodný pro enzymy, v případě fosfodiesterázy hadího jedu se použil Tris-HCl, zatímco v případě endonukleázy PÍ se použil pufr acetát sodný.
Navíc je-li to nezbytné k roztoku pufru se přidaly ionty kovů. Příklady iontů kovů zahrnují v případě fosfodiesterázu hadího jedu ionty hořečnaté a v případě endonukleázy ionty zinečnaté.
Reakční teplota je s výhodou 0 až 100 °C. Výhodná je teplota v rozmezí 30 až 50 °C.
-45 CZ 296576 B6
Po předem stanovené době se přidá kyselina ethylendiamintetraoctová (EDTA) a pak se směs zahřívá na teplotu 100 °C po dobu 2 minuty za účelem ukončit reakci.
Příklady metod používané k testování množství zbývajícího oligonukleotidu zahrnují metodu, při které se oligonukleotid značí radioizotopem, přičemž pak následuje testování štěpící reakce produktu analyzátorem obrazu, což je metoda, při které se produkt štěpící rekce testuje HPLC s reverzní fází a způsobem, při kterém se produkt štěpící reakce testuje barvivém (jako je ethidiumbromid) a obraz se zpracovává na počítači.
Formy dávek oligonukleotidového analogu mající jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2 podle vynálezu mohou být tablety, kapsle, granule, prášek nebo sirup, které se používají pro orální aplikaci, nebo to mohou být injekce nebo čípky pro parenterální aplikace. Tyto dávkové formy se připravují dobře známými metodami za použití přídavných činidel, jako je ekcipienti, například organické ekcipienti, jako jsou cukerné deriváty, například laktóza, sacharóza, glukóza, manitol a sorbitol, deriváty škrobu, jako je například kukuřičný škrob, bramborový škrob, oc-škrob a dextrin, deriváty celulózy, jako je například krystalická celulóza, arabská guma, dextran a pululan a anorganické ekcipienti, jako jsou silikátové deriváty, například anhydrid křemičitý, syntetizovaný křemičitan hlinitý, křemičitan vápenatý a metakřemičitan hořečnatohlinitý, fosforečnany, jako je například hydrogenfosforečnan vápenatý, uhličitany, jako je například uhličitan vápenatý a sírany, jako je například síran vápenatý, lubrikační prostředek (například kyselina stearová, kovové sole kyseliny stearové, jako je stearát vápenatý a stearát hořečnatý, talek, koloidní silika, vosky, jako je včelí vosk a spermacet, kyselina boritá, kyselina adipová, sulfáty, jako je například síran sodný, glykol, kyselina mravenčí, benzoát sodný, DL-leucin, sodná sůl mastné kyseliny, laurylsulfáty, jako je laurylsulfát sodný a laurylsulfát hořečnatý, kyselina orthokřemičitá, jako je anhydrid křemičitý a kyselý hydrát křemičitý a shora uvedené deriváty škrobu), pojidlo (například hydroxypropylcelulóza, hydroxypropylmethylcelulóza, polyvinylpyrrolidon, Macrogol a sloučeniny podobné shora uvedeným ekcipientům), desintegrační činidla (například deriváty celulózy, jako je málo substituovaná hydroxypropylcelulóza, karboxymethylcelulóza, karboxymethylcelulóza vápníku a karboxymethylcelulóza sodíku s vnitřními můstky a chemicky upravené škrob-celulózy, jako je karboxymethylový škrob, karboxymethylový škrob sodíku a polyvinylpyrrolidon s můstky), stabilizátory (paraoxybenzoáty, jako je methylparaben a propylparaben, alkoholy, jako je chlorbutanol, benzylalkohol a fenylethylalkohol, benzalkoniumchlorid, deriváty fenolu, jako je fenol a kresol, thimerosal, kyselina dehydrooctová a kyselina sorbová), látky korigující smyslově nepřijatelné vlastnosti léku (například sladidla, kyselící činidla), ředidla atd.
Zatímco dávka bude kolísat v závislosti na stavu onemocnění, věku pacienta, metodám aplikace atd., například v případě orální aplikace je nutné aplikovat aktivní látku v množství v rozmezí 0,01 kg/kg tělesné hmotnosti (upřednostňuje se 0,1 mg/kg tělesné hmotnosti) až 1000 mg/kg tělesné hmotnosti (s výhodou jde o dávku 100 mg/kg tělesné hmotnosti) a v případě intravenózní aplikace je nutné aplikovat aktivní složku v množství od 0,001 mg/kg tělesné hmotnosti (s výhodou 0,01 mg/kg tělesné hmotnosti) až 100 mg/kg tělesné hmotnosti (výhodná je dávka 10 mg/kg tělesné hmotnosti) ve formě jediné dávky za den nebo se dávka rozdělí do několika dávek za den.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-4-V-benzoylcytidin (příklad sloučeniny číslo 2-34)
Vodný roztok 2N hydroxidu sodného (68 ml) se přidal k roztoku sloučeniny získané v příkladu (6,80 g, 8,86 mol) v pyridinu (136 ml) při teplotě 0 °C a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs se neutralizovala přidáváním po kapkách 20% vodného roztoku kyseliny octové a extrahovala se chloroformem. Vrstva chloroformu se promyla saturo-46CZ 296576 B6 váným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol =
100:3), aby se získala sloučenina uvedená v názvu (3,3 g, 6,02 mmol, výtěžek je 68 %).
‘H-NMR (400 MHz, CDC13): 8,64 (2H, brs), 7,89 (2H, d, 7,6 Hz), 7,64-7,60 (1H, m), 7,54-7,51 (2H, m), 7,48-7,37 (3H, m), 7,36-7,26 (8H, m), 6,18 (1H, s), 4,70 (1H, d, 11Hz), 4,60 (1H, d, 11Hz), 4,46 (1H, d, 2,9Hz), 4,42 (1H, d, 11Hz), 4,10-4,02 (2H, m), 3,89 (1H, d, 2,9 Hz), 3,75 (1H, d, 11Hz), 3,62 (1H, d, 11Hz), 2,34-2,26 (1H, m), 1,39-1,36 (1H, m).
FAB-MAS (mNBA): 554 (M+H)+
Příklad 2 2'-O,4'-C-ethylen-4-?Z-benoylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-225)
Roztok (31,7 ml) 1,0 M trichlorboranu v dichlormethanu se přidal po kapkách do roztoku sloučeniny získané v příkladu 1 (2,06 mg 3,72 mmol) v nevodném methylenchloridu (317 ml) při teplotě -78 °C a směs se míchala při teplotě -78 °C po dobu jedné hodiny. Reakční směs se pomalu zahřívala na teplotu -20 °C a reakční nádoba se umístila do ledové lázně s chloridem sodným a směs se míchala při teplotě mezi -20 a -10 °C po dobu 2 hodin. Do směsi se pomalu přidával methanol (12 ml) a směs se míchala po dobu 10 minut. Hodnota pH reakční směsi se upravila na hodnotu 7 až 8 tak, že se po kapkách přidával saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného. Směs se zahřála na teplotu místnosti a koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol=100:5), aby se získala sloučenina uvedená v názvu (1,21 g, 3,24 mmol, výtěžek je 87 %) ve formě bílé pevné látky.
’Η-NMR (500 MHz, DMSO-d6): 11,23 (1H, brs), 8,70 (1H, d, 7,2 Hz), 8,00 (2H, d, 7,5 Hz), 7,3-6(4H, m), 5,97 (1H, s), 5,35 (1H, dd, 5 a 10 Hz), 4,10 (1H, dd, 5 a 10 Hz), 4,03 (1H, d,
3,2 Hz), 3,95-3,85 (2H, m), 3,83 (1H, d, 3,2Hz), 3,65-3,51 (2H, m), 2,06-1,98 (1H, m), 1,26 (1). FAB-MAS (mNBA): 374 (M+H)+
Příklad 3 2'-<9,4'-C-ethylencytidin (příklad sloučeniny č. 2-3)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 2 (0,1 g, 0,268 mmol) v methanolu saturovaném v amoniaku (12 ml) se nechal stát přes noc. Směs se zakoncentrovala do sucha, přičemž vzniká sloučenina uvedená v názvu (0,054 g, výtěžek je 75 %) ve formě bílé pevné látky.
‘H-NMR (500 MHz, DMSO-d6): 8,18 (1H, d, 7,4 Hz), 7,10 (2H, br), 5,84 (1H, s), 5,69 (1H, d,
7.6 Hz), 5,27-5,24 (2H, m), 3,86 (1H, d, 3,2 Hz), 3,90-3,78 (2H, m), 3,76 (1H, d, 3,2 Hz), 3,56 (1H, dd, 5,5 a 12 Hz), 3,49 (1H, dd, 5,5 a 12 Hz), 2,01-1,93 (1H, dt, 7,5 a 12 Hz), 1,22 (1H, dd,
3.6 a 13 Hz).
FAB-MAS (mNBA): 270 (M+H)+
Příklad 4 5 '-<9-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-yV-benzoylcitidm (příklad sloučeniny č. 2-39)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 2 (1,29 g, 3,46 mmol) v nevodném pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (26 ml) v atmosféře dusíku a do roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (1,76 g, 5,18 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a z reakční směsi se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a
-47CZ 296576 B6 saturovaným vodným roztokem chloridu sodného ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethanokmethanol = 100:5), přičemž se získala sloučenina uvedená v názvu (2,10 g, 3,11 mmol, výtěžek je 90 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
‘H-NMR (270 MHz, DMSO-d6): 11,27 (1H, brs), 8,59 (1H, m), 6,92-8,01 (19H, m), 6,03 (1H, s), 5,56 (1H, m), 4,17 (1H, m), 4,08 (1H, m), 3,86 (2H, m), 3,77 (6H, s), 3,24 (2H, m), 1,98 (lH,m).
FAB-MAS (mNBA): 676 (M+H)+
Příklad 5 5 '-0-dimethoxytrityl-2-0,4'-C-ethylen-4-/V-benzoylcytidin-3 '-O-(2-kyanoethyl-AjTY-diizopropyljfosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-235)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 4 (6,53 g, 9,66 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxovalo za účelem odstranit vodu.Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku vnevodném dichlormethanu (142 ml). Do roztoku se přidal ΛζΑ-dnzopropylarnin (2,80 ml 16,1 mmol) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-7V,A-dnzopropylchlorfosforamidit (2,16 ml, 9,66 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 6 hodin. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:triethylamin = 50:1 - dichlormethan:ethylacetát:triethylamin = 60: 30:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (7,10 g, 8,11 mmol, výtěžek je 84 %), ve formě bílé látky.
‘H-NMR (270 MHz, CDC13): 1,1-1,2 (12H, m), 1,35 (1H, m), 2,11 (1H, m), 2,3 (2H, m), 3,35-3,7 (6H, m), 3,8 (6H, m), 3,9-4,1 (2H, m), 4,33 (1H, m), 6,23 (1H, m), 6,12 (1H, s), 6,9 (4H, s), 7,3-7,9 (15H, m), 8,7-8,8 (1H, m).
Příklad 6 3',5'-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin (příklad sloučeniny č. 2-22)
Do sloučeniny získané v příkladu 10 (418 mg, 0,62 mmol) ve směsi pyridin:methanol:voda = 65:30:5 (5 ml) při teplotě 0 °C se přidal 2N roztok hydroxidu sodného a roztok směsi (5 ml), která obsahuje pyridin:methanol:voda = 65:30:5 a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 15 minut. Reakční směs se neutralizovala IN kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem (přibližně 30 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 30 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 30 ml), sušila se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs hexan:ethylacetát = 1:1), aby se získala bezbarvá amorfní pevná látka (228 mg, 0,49 mmol, výtěžek je 79 %).
‘H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,35 (1H, d, 13 Hz), 1,41 (3H, s), 2,28 (1H, dt, 9,4 a 13 Hz), 3,60 (1H, d, 11Hz), 3,76 (1H, d, 11Hz), 3,94 (1H, d, 3,0 Hz), 4,10 (1H, d, 7,0 Hz), 4,14 (1H, d, 7,0 Hz), 4,31 (1H, d, 3,0 Hz), 4,51 (1H, d, 12 Hz), 4,54 (1H, d, 12 Hz), 4,58 (1H, d, 12 Hz), 4,75 (1H, d, 12 Hz), 6,06 (1H, s), 7,3 (10H, m), 7,91 (1H, s), 8,42 (1H, brs).
FAB-MAS (mNBA): 465 (M+H)+
Příklad 7 2'-O,4'-C-ethylen-5-methylundin (příklad sloučeniny č. 2-2)
-48CZ 296576 B6
Roztok sloučeniny získané v příkladu 6 (195 mg, 0,42 mmol) v methanolu (10 ml) se míchal v atmosféře vodíku za atmosférického tlaku v přítomnosti hydrogenačního katalyzátoru po dobu 5 hodin. Reakční směs se filtrovala za účelem odstranit katalyzátor a filtrát se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan/methanol = 10:1) za účelem získat bezbarvý prášek (v množství 76 mg, 0,268 mmol a výtěžek je 64 %).
'H-NMR (400 MHz, CD3OD): 1,33 (1H, dd, 3,8 a 13 Hz), 1,86 (3H, D, 0,9 Hz), 1,94 (1H, ddd, 7,5, 11,7 a 13 Hz), 3,86 (1H, d, 12 Hz), 3,75 (1H, d, 12 Hz), 3,9-4,0 (2H, m), 4,05 (1H, d,
3,2 Hz), 4,09 (1H, d, 3,2 Hz), 6,00 (1H, s), 8,28 (1H, d, 1,1 Hz).
FAB-MAS (mNBA): 285 (M+H)+
Příklad 8 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin (příklad sloučeniny č. 2-27)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 7 (1,45 g, 5,10 mmol) v nevodném pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranění vody. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (44 ml) za atmosféry dusíku a 4,4'-dimethoxytritylchloridu (2,59 g, 7,65 mmol) a přidal se k roztoku. Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethan:methanol = 100 : 10) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (2,42 g, 4,13 mmol, výtěžek je 81 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
*H-NMR (270 Mhz, DMSO-d6): 11,36 (1H, s), 7,68 (1H, s), 6,90-7,44 (13H, m), 5,89 (1H, s), 5,55 (1H, d), 4,09 (1H, m), 4,04 (1H, d), 4,04 (1H, d), 3,82 (2H, m), 3,74 (6H, s), 3,19 (2H, m), 1,99 (1H, m), 1,36 (1H, m), 1,17 (3H, s).
FAB-MAS (mNBA): 578 (M+H)+
Příklad 9 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-<9-(2-kyanoethylÝV,7V-diizopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-234)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 8 (4,72 g, 8,05 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v atmosféře dusíku v nevodném dichlormethanu (142 ml). K roztok se přidal ΛζΑ-diizopropylamin (2,80 ml, 16,1 mmol) a pak 2-kyanoethyl-WA-diizopropylchorfosforamidit (2,16 ml, 9,66 mmol) přidal po kapkách do ledové lázně. Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 6 hodin. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluát se použila směs hexan:ethylacetát:triethylamin = 50:50:1 - hexan:ethylacetát:triethylamin = 30:60:1) za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (5,64 g, 7,17 mmol, výtěžek je 89 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
Ή-NMR (400 MHz, CDC13): 1,1-1,2 (15H, m), 1,4 (1H, m), 2,08 (1H, m), 2,4 (2H, m), 3,2-4,0 (14H, m), 4,38 (2H, m), 4,47 (1H, m), 6,06 (1H, s), 6,8-6,9 (4H, m), 7,2-7,5 (9H, m), 7,91 (1H, m).
FAB-MAS (mNBA): 787 (M+H)+
-49CZ 296576 B6
Příklad 10 3',5'-di-<?-benzyl-2'-č),4-C-ethylen-6-V-benzoyladenosin (příklad sloučeniny č. 1-23)
K sloučenině získané v příkladu 12 (238 mg, 0,30 mmol) ve směsi pyridin:methanol:voda = 65:30:5 (5 ml) při teplotě 0 °C se přidal vodný 2N roztok hydroxidu sodného a roztok směsi (5 ml) obsahující pyridin:methanol:voda = 65:30:5. Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 15 minut. Reakční směs se neutralizovala IN kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem (přibližně 30 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem uhličitanu sodného (přibližně 30 ml) a saturovaným vodným roztok chloridu sodného (přibližně 30 ml), sušila se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluát se použila směs dichlormethan:methanol = 50:1) za účelem získat bezbarvou amorfní pevnou látku (133 mg, 0,23 mmol, výtěžek je 78 %).
’Η-NMR (400 MHz, CDC13): 1,44 (1H, d, 13 Hz), 2,31 (1H, dd, 13 a 19 Hz), 3,56 (1H, d, 11Hz), 3,70 (1H, d, 11Hz), 4,10 (2H, m), 4,24 (1H, s), 4,45 (1H, d, 12 Hz), 4,53-4,67 (4H, m), 6,52 (1H, s), 7,3 (10H, m), 7,53 (2H, m), 7,62 (1H, m), 8,03 (2H, d, 7,6 Hz), 8,66 (1H, s), 8,78 (1H, s), 9,00 (1H, brs).
FAB-MAS (mNBA): 578 (M+H)+
Příklad 11 2'-O,4'-C-ethylen-6-A-benzoyladenosin (příklad sloučeniny č. 1-178)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 10 (116 mg, 0,20 mmol) v bezvodém methylenchloridu (5 ml) při teplotě -78 °C se přidal pomalu po kapkách 1M roztok chloridu boritého (1,5 ml, 1,5 mmol) v dichlormethanu a směs se míchala při teplotě -78 °C po dobu 3 hodiny. K reakční směsi se přidal 1M roztok chloridu boritého (1,5 ml, 1,5 mmol) v dichlormethanu a směs se míchala po dobu 2 hodin. Směs se pomalu zahřívala na teplotu místnosti a rychle se ochladila na teplotu -78 °C a pak se přidal do směsi methanol (5 ml). Reakční směs se pomalu zahřívala na teplotě místnosti a zakoncentroval se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethammethanol - 9:1). Vzniká bílý prášek (49 mg, 0,17 mmol, výtěžek je 84 %).
’Η-NMR (400 MHz, CD3OD): 1,45 (1H, dd, 4,3 a 13 Hz), 2,12 (1H, m), 3,72 (1H, d, 12Hz), 3,79 (1H, d, 12Hz), 4,04 (1H, dd, 7,3 a 12 Hz), 4,15 (1H, dt, 4,3 a 9,4 Hz), 4,36 (1H, d, 3,2Hz), 4,43 (1H, d, 3,2 Hz), 6,57 (1H, s), 7,57 (2H, m), 7,66 (1H, m), 8,09 (2H, d, 8,0 Hz), 8,72 (1H, s), 8,85 (1H, s).
FAB-MAS (mNBA): 398 (M+H)+
Příklad 12 2'-O,4'-ethylenadenosin (příklad sloučeniny č. 1-7)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 11 (14 mg, 0,035 mmol) vmethanolu saturovaném amoniakem (1 ml) se nechal stát přes noc. Směs se zakoncentrovala a zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluant se použila směs dichlormethammethanol) za vzniku bílého prášku (10 mg, 0,034 mmol, výtěžek je 98 %).
‘H-NMR (400 MHz, CD3OD): 1,32 (dd, 4 a 13 Hz), 2,04 (1H, dt, 7,4 a 12 Hz), 3,53 (1H, dd, 5 a
Hz), 3,61 (1H, dd, 5,2 a 12 Hz), 3,90 (1H, dd, 7,4 a 12 Hz), 3,97 (1H, dt, 4 a 12 Hz), 4,15 (1H, d, 3,1 Hz), 5,27 (1H, t, 5,2 Hz), 5,39 (1H, d, 3,1 Hz), 6,33 (1H, s), 7,29 (2H, s), 7,66 (1H, m), 8,14 (1H, s), 8,42 (1H, s).
FAB-MAS (mNBA): 294 (M+H)+
UV (Xmax): 260 (pH7), 260(pHl), 258 (pH13)
-50CZ 296576 B6
Příklad 13 5 '-C>-dimethoxytrityl-2'-(9,4'-C-ethylen-6-/V-benzoyladenosin (příklad sloučeniny číslo 1-31)
Roztok sloučeniny získaný v příkladu 11 (14 mg, 0,035 mmol) vbezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v nevodném pyridinu (1 ml) za atmosféry dusíku a k roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (2,59 g, 7,65 mmol). Směs se míchala při teplotě 40 °C po dobu 5 hodin. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentroval se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethammethanol = 100:5) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (18 mg, 0,026 mmol, výtěžek je 73 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
'H-NMR (400 MHZ, CDC13): 1,63 (1H, m), 2,14 (1H, 7,5, 12 a 13 Hz), 3,37 (1H, d, 11Hz), 3,41 (1H, d, 11 Hz), 3,79 (6H, s), 4,10 (2H, m), 4,48 (1H, d, 3,3 Hz), 4,59 (1H, d, 3,3 Hz), 6,54 (1H, s), 6,58 (4H, m), 7,2-7,6 (12H, m), 8,02 (2H, m), 8,45 (1H, s), 8,82 (1H, s), 9,02 (1H, brs). FAB-MAS (mNBA): 700 (M+H)+
Příklad 14 5 '-<9-dimethoxytrityl-2 '-<9,4'-C-ethylen-6-A-benzoyladenosin-3 '-O-(2-kyano ethyl-7V,A-diizopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny c. 1-186)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 13 (16 mg, 0,023 mmol) vbezvodém pyridinu se azeotropicky refluxovalo za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v bezvodém dichlormethanu (0,5 ml). K roztoku se přidal tetrazol-Λζ A-diizopropylaminová sůl (10 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-A,A, V(V-tetraizopropylchlorfosforamidit (přibližně 20 μΐ). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethamethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (20 mg, 0,022 mmol, výtěžek je 97 %), ve formě bílé pevné látky.
‘H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,0-1,2 (12H, m), 1,54 (1H, m), 2,15 (1H, m), 2,33 (2H, m), 3,3-3,6 (6H, m), 3,8 (6H, s), 4,08 (2H, m), 4,65 (1H, m), 4,75 (1H, m), 6,53 (1H, s), 6,84 (4H, m), 7,2-7,6 (12H, m), 8,01 (2H, m), 8,53 (1H, s), 8,83 (1H, s), 9,01 (1H, brs).
FAB-MAS (mNBA): 900 (M+H)+
Příklad 15 3',5'-di-C>-benzyl-2'-C>,4'-C-ethylenuridin (příklad sloučeniny č. 2-10)
Vodný roztok IN hydroxidu sodného (2 ml) se přidal k roztoku sloučeniny získané v příkladu 13 (194 mg, 0,292 mmol) v pyridinu (3 ml) při teplotě 0 °C a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 30 minut. Reakční směs se neutralizovala IN kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem (10 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného, sušil se na bezvodém síranu hořečnatém a pak se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluát se prožila směs dichlormethammethanol = 100:3) za vzniku bezbarvého oleje (105 mg, 0,233 mmol, výtěžek je 80 %).
-51 CZ 296576 B6 ’Η-NMR (400 MHz, CDC13): 1,36 (1H, m), 2,29 (1H, m), 3,63 (1H, d, 11 Hz), 3,74 (1H, d, 11 Hz), 3,87 (1H, d, 2,9 Hz), 4,03 (2H, m), 4,29 (1H, d, 2,9 Hz), 4,49 (1H, d, 12 Hz), 4,50 (1H, d, 11Hz), 4,53 (1H, d, 1 Hz), 5,20 (1H, dd, 2 a 8 Hz), 6,04 (1H, s), 7,2-7,4 (10H, m), 8,13 (1H, d, 8,2 Hz), 8,57 (1H, brs).
FAB-MAS (mNBA): 451 (M+H)+
Příklad 16 2'-O,4'-ethylenuridin (příklad sloučeniny č. 2-1)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 15 (100 mg, 0,222 mmol) vmethanolu (4 ml) se míchal v atmosféře vodíku za atmosférického tlaku v přítomnosti hydrogenačního katalyzátoru po dobu 5 hodin. Reakční směs se filtrovala za účelem odstranění katalyzátoru a filtrát se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethammethanol = 10:1) za účelem získat bezbarvý olej (v množství 45 mg, 0,167 mmol a výtěžek je 75 %).
’Η-NMR (400 MHz, CD3OD): 1,35 (1H, dd, 4 a 13 Hz), 2,13 (1H, ddd, 7,11 a 13 Hz), 3,66 (1H, d, 12 Hz), 3,73 (1H, d, 12 Hz), 3,91-4,08 (2H, m), 4,01 (1H, d, 3,2 Hz), 4,12 (1H, d, 3,2 Hz),5,66 (1H, d, 8,2 Hz), 6,00 (1H, s), 8,37 (1H, d, 8,2 Hz).
FAB-MAS (mNBA): 271 (M+H)+
Příklad 17 5'-0-dimethoxytrityl-2'-0,4'-C-ethylenuridm (příklad sloučeniny č. 2-15)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 16 (28 mg, 0,104 mmol) vbezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (3 ml) v atmosféře dusíku a do roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (50 mg, 0,15 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a z reakční směsi se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na kloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan:methanol=100:3), přičemž se získala sloučenina uvedená v názvu (25 mg, 0,044 mmol, výtěžek je 42 %) ve formě bezbarvého oleje.
’Η-NMR (400 MHz, CD3OD): 1,35 (1H, dd, 3 a 14 Hz), 2,03 (1H, ddd, 8, 11 a 14 Hz), 2,46 (1H, d, 8Hz), 3,36 (1H, d, 11 Hz), 3,41 (1H, d, 11 Hz), 3,80 (3H, s), 3,81 (3H, s), 3,97 (2H, m), 4,21 (1), 4,33 (1H, brm), 5,31 (1H, m), 6,10 (1H, s), 6,86 (4H, m), 7,2-7,5 (9H, m), 8,27 (1H, d,
8,2 Hz), 8,43 (1H, brs).
FAB-MAS (mNBA): 573 (M+H)+
Příklad 18 5'-O-dimethoxytrityl-2'-(9,4'-C-ethylenuridin-3'-(?-(2-kyanoethyl-A,7V-diizopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-233)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 17 (6 mg, 0,0105 mmol) vbezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu v atmosféře dusíku a do roztoku se přidal dichlormethan (0,5 ml). K roztoku se přidal tetranol-A(7Vdiizopropylaminová sůl (3 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-A,N,
ΝζΝ-tetraizopropylchlorfosforamidit (přibližně 5 μΐ). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a
-52CZ 296576 B6 saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethamethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (8 mg) ve formě pevné látky.
'H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,1-1,2 (13H, m), 2,09 (1H, m), 2,4 (2H, m), 3,3-3,6 (6H, m), 3,81 (6H, s), 3,94 (2H, m), 4,47 (1H, m), 5,18 (1H, d, 8,2 Hz), 6,08 (1H, s), 6,86 (4H, m), 7,2-7,4 (9H, m), 8,31 (1H, d, 8,2 Hz).
FAB-MAS (mNBA): 773 (M+H)+
Příklad 19 3 ',5 '-di-(9-benzyl-2'-(?,4'-C-ethylen-4-A-benzoyl-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-46)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 14 (310 mg, 0,396 mmol) v pyridinu (5 ml) při teplotě 0 °C se přidal IN vodný roztok hydroxidu sodného (5 ml) a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu 20 minut. Reakční směs se neutralizovala přidáváním po kapkách 20% kyseliny octové a extrahovala se dichlormethanem. Dichlormethanová vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan : methanol = 100:2) a získala se sloučenina uvedená v názvu (190 mg, 0,334 mmol, výtěžek je 84 %).
Ή-NMR (400 MHz, CDC13): 1,37 (1H, m), 1,58 (3H, s), 2,30 (1H, dt, 10 a 13 Hz), 3,64 (1H, d,
Hz), 3,79 (1H, d, 11 Hz), 3,95 (1H, d, 3,0 Hz), 4,04 (2H, dd, 2,3 a 10 Hz), 4,37 (1H, d, 3,0 Hz), 4,50 (1H, d, 12 Hz), 4,56 (1H, d, 11 Hz), 4,61 (1H, d, 11 Hz), 4,76 (1H, d, 12 Hz), 6,11 (1H, s), 7,2-7,5 (13H, m), 8,09 (1H, s), 8,29 (2H, m)
FAB-MAS (mNBA): 568 (M+H)+
Příklad 20 2'-O,4'-C-ethylen-4-/V-benzoyl-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-226)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 19 (120 mg, 0,211 mmol) vbezvodém dichlormethanu (5 ml) při teplotě -78 °C se přidal po kapkách 1 M roztok chloridu boritého (1,6 ml) a směs se míchala při teplotě -78 °C po dobu 4 hodin. Ke směsi se po kapkách pomalu přidával methanol (1 ml) a směs se míchala po dobu 10 minut. pH reakce se upravilo na hodnotu 7 až 8 přidáváním saturovaného vodného roztoku hydrogenuhličitanu sodného. Reakční směs se zahřívala na teplotu místnosti a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použije směs dichlormethan : methanol = 100 : 6) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (29 mg, 0,075 mmol, výtěžek je 36 %) ve formě pevné látky.
'H-NMR (400 MHz, d-DMSO: 1,24 (1H, m), 2,01 (3H, m), 2,0 (1H, m), 3,54 (1H, dd, 5,4 a
Hz), 3,64 (1H, dd, 5,4 a 12 Hz), 3,88 (3H, m), 4,10 (1H, m), 5,36 (1H, d, 5,4 Hz), 5,49 (1H, t, 5,0 Hz), 5,95 (1H, s), 7,4-7,6 (3H, m), 8,21 (2H, m), 8,49 (1H, s), 13,17 (1H, brs). FAB-MAS (mNBA): 388 (M+H)+
Příklad 21 5 '-O-dimethoxytrityl-2 '-(?,4'-C-ethylen-4-7V-benzoyl-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-51)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 20 (44 mg, 0,114 mmol) v nevodném pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranění vody. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (1 ml) za atmosféry dusíku a k roztoku se přidal 4,4'-dimethoxytritylchlorid (60 mg, 0,177 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se rozdělil mezi vodu a chloroform a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným
-53CZ 296576 B6 vodným roztokem chloridu sodného a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethammethanol = 100:4), za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (73 mg, 0,106 mmol, výtěžek je 93 %) ve formě bezbarvé amorfní pevné látky.
‘H-NMR (400 MHz, CDClj): 1,46 (1H, m), 1,49 (3Η, s), 2,06 (1H, m), 2,59 (1H, d, 8,6 Hz), 3,36 (1H, d, 11 Hz), 3,39 (1H, d, 11Hz), 3,80 (3H, s), 3,81 (3H, s), 3,99 (2H, m), 4,30 (1H, d, 3,3 Hz), 4,39 (1H, m), 6,12 (1H, s), 6,85 (4H, m), 7,2 - 7,5 (12H, m), 8,03 (1H, s), 8,28 (2H, s). FAB-MAS (mNBA): 573 (M+H)+
Příklad 22 5 '-O-dimethoxytrityl-2'-(9,4'-C-ethylen-4-A-benzoyl-5-methylcytidin-3'-0-(2kyanoethyl-A(A-diizopropyl)fosforamidit (příklad sloučeniny č. 2-236)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 21 (35 mg, 0,0507 mmol) v bezvodém pyridinu se azeotropicky refluxovalo za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku v bezvodém dichlormethanu (1 ml). K roztoku se přidala tetrazol-A,7V-diizopropylaminová sůl (17 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N,N, Ν',Ν'-tetraizopropylchlorfosforamidit (přibližně 32 μΐ, 0,1 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethan:ethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (40 mg, 0,0445 mmol, výtěžek je 89 %), ve formě bílé pevné látky.
'H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,1-1,2 (12H, m), 1,36 (3H, s), 1,37 (1H, m), 2,10 (1H, m), 2,36 (2H, m), 3,3-3,6 (6H, m), 3,81 (6H, m), 3,98 (2H, m), 4,42 (1H, m), 4,49 (1H, m), 6,11 (1H, s), 6,88 (4H, m), 7,2-7,5 (12H, m), 8,14 (1H, s), 8,28 (2H, m).
FAB-MAS (mNBA): 890 (M+H)+
Příklad 23 2'-O-4'-C-ethylen-5-methylcytidin (příklad sloučeniny č. 2-226)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 20 (11,6 mg, 0,030 mmol) v methanolu saturovaném amoniakem (2 ml) se nechal stát přes noc. Směs se zakoncentrovala a získalo se pevná bílá látka (8,5 mg, 0,030 mmol).
‘H-NMR (400 MHz, d-DMSO): 1,20 (1H, m), 1,82 (3H, s), 1,97 (1H, m), 3,49 (1H, dd, 5 a 12 Hz), 3,58 (1H, dd, 5 a 12 Hz), 3,85 (2H, m), 5,23 (1H, d, 5 Hz), 5,32 (1H, t, 5 Hz), 5,84 (1H, s), 6,7 (1H, brs), 7,2 (1H, brs), 8,08 (1H, s).
FAB-MAS (mNBA): 284 (M+H)+
UV (Zmax): 279 (pH7), 289 (pHl), 279(pH13)
Příklad 24 3',5 -di-(9-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-2-jV-izobutyrylguanosin (příklad sloučeniny č. 1-24)
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 15 (přibližně 200 mg) v pyridinu (2 ml) se přidal IN vodný roztok hydroxidu sodného (2 ml) a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu minut. Reakční směs se neutralizovala IN kyselinou chlorovodíkovou a extrahovala se ethylacetátem. Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného, sušila se na bezvodém síranu hořečna-54CZ 296576 B6 tém a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan : methanol = 50:1) a získala se bezbarvá amorfní pevná látka (20 mg, 0,36 mmol, výtěžek je 6 %, dva kroky).
'H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,27 (3Η, s), 1,29 (3Η, s), 1,43 (1H, dd, 3 a 13 Hz), 2,28 (1H, m),
2,59 (1H, kvi, 6,9 Hz), 3,54 (1H, d, 11 Hz), 3,68 (1H, d, 11 Hz), 4,03 (2H, m), 4,15 (1H, d, 3,0 Hz), 4,31 (1H, d, 3,0 Hz), 4,45 (1H, d, 12), 4,56 (1H, d, 12 Hz), 4,61 (1H, d, 12 Hz), 4,63 (1H, d, 12 Hz), 6,18 (1H, s), 7,2-7,4 (10H, m), 8,19 (1H, s), 11,93 (1H, brs).
FAB-MAS (mNBA): 560 (M+H)+
Příklad 25 2'-(9,4'-C-ethylen-2-A-izobutyrylguanosin (příklad sloučeniny č. 1-177)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 24 (10 mg, 0,018 mmol) v methanolu (2 ml) se míchal v atmosféře vodíku za atmosférického tlaku v přítomnosti hydrogenačního katalyzátoru po dobu 5 hodin. Reakční směs se filtrovala za účelem odstranění katalyzátoru a filtrát se koncentroval ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografií na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethan/methanol = 10:2) za účelem získání bezbarvého oleje (v množství 5 mg, 0,013 mmol a výtěžek je 72 %).
'H-NMR (400 MHz, CD3OD): 1,21 (3Η, s), 1,22 (3Η, s), 1,41 (1H, dd, 4 a 13 Hz), 2,18 (1H, m), 2,69 (1H, kvi, 6,9 Hz), 3,69 (1H, d, 12 Hz), 3,76 (1H, d, 12 Hz), 4,0 (2Η, m), 4,26 (1H, d,
3,2 Hz), 4,30 (1Η, d, 3,2 Hz), 6,30 (1H, s), 8,40 (1H, s).
FAB-MAS (mNBA): 380 (M+H)+
Příklad 26 5'-<9-dimethoxytrityl-2'-(9,4'-C-ethylen-2-N-izobutyrylguanosin (příklad sloučeniny č. 1-35)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 25 (5 mg, 0,13 mmol) vbezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranění vody. Produkt se rozpustil v bezvodém pyridinu (1 ml) za atmosféry dusíku a 4,4'-dimethoxytritylchloridu (14 mg, 0,04 mmol) a přidal se k roztoku. Směs se míchala při teplotě 40 °C po dobu 3 hodiny. Do reakční směsi se přidalo malé množství methanolu a pak se rozpouštědlo odpařilo ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se použila směs dichlormethanmethanol - 100:6) za vzniku sloučeniny uvedené v názvu (4 mg, 0,0059 mmol, výtěžek je 45 %) ve formě bezbarvé pevné látky.
'H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,26 (3H, d, 1,4 Hz), 1,28 (3H, d, 1,4 Hz), 1,66 (1H, m), 2,15 (1H, m), 2,59 (1H, kvi, 6,9 Hz), 3,65 (1H, m), 3,78 (1H, m), 4,06 (2H, m), 4,35 (1H, m), 4,38 (1H, d,
3,2 Hz), 6,23 (1H, s), 6,8 (4H, m), 7,2-7,5 (9H, m), 8,1 (1H, s), 8,19 (1H, brs).
FAB-MAS (mNBA): 682 (M+H)+
Příklad 27 5 '-O-dimethoxytrityl-2'-(?,4'-C-ethylen-2-A-izobutyrylguanosin-3'-0-(2kyanoethyl-A,A-diizopropyl)fosforarnidit (příklad sloučeniny č. 1-185)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 26 (4 mg, 0,0058 mmol) vbezvodém pyridinu se azeotropicky refluxoval za účelem odstranit vodu. Produkt se rozpustil za podmínek atmosféry dusíku vbezvodém dichlormethanu (0,5 ml). K roztoku se přidala tetrazol-A,A-diizopropylaminová sůl (5 mg) a pak se po kapkách do ledové lázně přidal 2-kyanoethyl-N,N, Ν',Ν'-tetraizopropylchlorfosforamidit (9 μΐ, 0,03 mmol). Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu
-55CZ 296576 B6 sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a zakoncentrovala se ve vakuu.
Zbytek se čistil chromatograficky na koloně se silikagelem (jako eluent se používá směs dichlormethamethylacetát = 2:1), za účelem získání sloučeniny uvedené v názvu (4 mg) ve formě bílé pevné látky.
‘H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,1-1,4 (19H, m), 2,1 (1H, m), 2,4 (2H, m), 2,6 (1H, m), 3,3-3,6 (6H, m), 3,8 (6H, ms), 4,0-4,6 (4H, m), 6,2 (1H, s), 6,8 (4H, m), 7,2-7,5 (9H, m), 8,1 (1H, s).
Příklad 28 2'-O,4'-ethylenguanosin (příklad sloučeniny č. 1-5)
Roztok sloučeniny získané v příkladu 25 (0,5 mg) v methanolu saturovaném v amoniaku (0,5 ml) se nechal stát při teplotě 60 °C po dobu 5 hodin. Směs se zakoncentrovala a vytvořil se bílý prášek (0,4 mg).
FAB-MAS (mNBA): 310 (M+H)+ UV (/.max): 255 (pH7), 256(pHl), 258-266 (pH13)
Příklad 29 Syntéza oligonukleotidového derivátu
Syntéza oligonukleotidového derivátu se provádí za použití mechanického syntetizéru nukleových kyselin (ABI model392 DNA/RNA syntetizér: produkt firmy Perkin-Elmer Corp.) z rozmezí 1,0 mikromolů. Rozpouštědla, činidla a koncentrace fosforamiditu v každém cyklu syntézy je stejná, jako při syntéze přirozených oligonukleotidů. Rozpouštědla, činidla a fosforamidity přirozeného typu nukleotidů jsou produkty firmy PE Biosystems. Každá sekvence upraveného oligonukleotidového derivátu se syntetizovala opakováním kondenzace sloučeniny získané v příkladu 9 nebo amidity obsahující čtyři druhy bází nukleové kyseliny vhodné pro syntézu nukleotidů s 5'-hydroxythymidinem produkovaným deprotekcí skupiny DMTr 5'-O-DTMrthymidinu (1,0 mikromolů) za použití kyseliny trichloroctové, 3'-hydroxyskupiny thymidinu, která je zachycena na nosiči CGP. Cyklus syntézy je následující:
1) detritylace směsí kyselina trichloroctová/dichlormethan, 35 vteřin
2) spojovací fosforamiditu (přibližně 20 ekv.), tetrazol/acetonitril, 25 vteřin nebo 10 minut
3) vyplňování mezer za použití směsi 1-methylimidazol/tetrahydrofuran, anhydrid kyseliny octové/pyridin/tetrahydrofuran, 15 vteřin
4) oxidace za použití směsi jód/voda/pyridin/tetrahydrofuran, 15 vteřin
Když se použije ve shora uvedeném kroku 2)d cyklu sloučenina získaná v příkladu 9, reakční čas je 10 minut, a když se použijí fosforamidity, reakční čas je 25 vteřin.
Po syntéze požadované sekvence oligonukleotidového derivátu se odstranila skupina 5'-DTMr. Nosič obsahující požadovaný produkt se odstranil koncentrovaným vodným roztokem amoniaku za účelem odstranit oligomér z nosiče a tak se odstranila ochrana z kyanoethylové skupiny, která je chráněna fosforovou skupinou. Z oligoméru se odstranila ochranná aminoskupina v adeninu, guaninu a v cytosinu. Oligonukleotidový derivát se čistil HPLC s reverzní fází (HPLC: LC-PV: produkt firmy Shimazu Corp., kolona: Wakopak WS-DNA: produkt Wako Pure Chemical Industry, Ltd.) za účelem získání požadovaného oligonukleotidu.
Na základě této syntetické metody se získala následující oligonukleotidová sekvence (oligonukleotid je zde označen jako „oligonukleotid 1“) (koncentrace je 0,23 pmol, výtěžek je 23 %).
-56CZ 296576 B6
Příkladem sekvence č. 2 uvedené v seznamu sekvencí je sekvence 5gcgttttttgct-3', kde cukerná část thymidinů v bázích č. 4 až 8 je 2'-O,4'-C-ethylen.
Připomínky v příkladu 1
3.5- di-0-benzyl-4-třifluormethansulfonyloxymethyl-l,2-C>-izopropyliden-a-D-erythropentofuranóza
K roztoku 3,5-di-(9-benzyl-4-trifluormethansulfonyloxymethyl-1,2-(9-izo-propyliden-a-Derythropentofuranózy (2000mg, 5,0mmol) vbezvodém dichlormethanu (50ml) a trifluorsulfonovém anhydridu (1010 mg, 6,0 mmol) v atmosféře dusíku při teplotě -78 °C a přidal bezvodý pyridin (0,60 ml, 7,5 mmol) a směs se míchala po dobu 40 minut. Reakční směs se částečně rozdělila mezi methylenchlorid a saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 100 ml), sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu za vzniku bílého prášku (2520 mg, 4,73 mmol, výtěžek je 95 %), který se použije v další reakci, aniž dojde k dalšímu čištění.
’Η-NMR (400 MHz, CDC13): 1,34 (3H, s), 1,63 (3Η, s), 3,48 (1H, d, 10 Hz), 3,53 (1H, d, 10 Hz), 4,21 (1H, d, 5,0 Hz), 4,5 (4H, m), 4,74 (1H, d, 12 Hz), 4,80 (1H, d, 12 Hz), 5,01 (1H, d, 12 Hz), 5,73 (1H, d, 4,6 Hz), 7,3(10H, m).
Odkaz k příkladu 2
3.5- di-0-benzyl-4-kyanomethyk-l,2-C>-izopropyliden-a-D-erythropentofuranóza
Sloučenina získaná v příkladu 1 (2 520 mg, 4,73 mmol) se rozpustila v dimethylsulfoxidu (50 ml) při teplotě 90 °C. K roztoku se přidal kyanid sodný (463 mg, 9,46 mmol) při teplotě místnosti a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 3 hodin. Reakční směs se rozdělila mezi vodu (přibližně 100 ml) a ethylacetát (přibližně 100 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 100 ml), sušila se pomocí bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícký na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 4:1) za vzniku bezvodého oleje (1 590 mg, 3,89 mmol, výtěžek je 82 %).
’Η-NMR (400 MHz, CDC13): 1,34 (3H, s), 1,62 (3H, s), 2,88 (1H, d, 17 Hz), 3,15 (1H, d, 17 Hz), 3,50 (1H, d, 10 Hz), 3,58 (1H, d, 10 Hz), 4,08 (1H, d, 5,1 Hz), 4,52 (1H, d, 12 Hz), 4,56 (1H, d, 12Hz), 4,57 (1H, m), 4,58 (1H, d, 12 Hz), 4,76 (1H, d, 12 Hz), 5,73 (1H, d, 3,7 Hz), 7,3 (10H, m).
Odkaz k příkladu 3
3.5- di-O-benzyl-4- formylmethyl-l,2-č?-izopropyliden-a-erythropentorfuranóza
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 2 (610 mg, 1,49 mmol) v dichlormethanu (10 ml) v atmosféře dusíku při teplotě -78 °C se přidal po kapkách 1,5M toluenový roztok hydridu izobutylhlinitého a směs se míchala po dobu 1 hodiny při teplotě -78 °C a pak se zahřála na teplotu místnosti. K reakční směsi se přidal methanol (5 ml) a saturovaný vodný roztok chloridu amonného (přibližně 20 ml) a tato směs se míchala po dobu 30 minut. Reakční směs se extrahovala ethylacetátem (přibližně 30 ml). Organická vrstva se promyla ethylacetátem (přibližně 30 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 30 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 30 ml), sušila se pomocí bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu za vzniku produktu, který se použil v další reakci bez dalšího čištění.
-57CZ 296576 B6
Odkaz k příkladu 4
3.5- di-O-benzyl-4-hydroxyethyl-1,2-O-izopropyl iden-a-D-erythropentofuranóza
K roztoku sloučeniny získané v příkladu 3 (154 mg,0,377 mmol) v ethanolu (5 ml) se přidal NaBH4 (7,6 mg, 0,2 mmol) a směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs se rozdělila mezi ethylacetát (přibližně 10 ml) a vodu (přibližně 10 ml) a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 10 ml), sušila se za použití vodného síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 2:1) za vzniku bezbarvého oleje (117 mg, 0,284 mmol, 75 %).
Odkaz k příkladu 5
3.5- di-O-benzyl—l-formyl-l,2-(?-izopropyliden-a-D-erythropentofuranóza
K methylenchloridu (200 ml) chlazenému při teplotě -78 °C se přidal oxalylchlorid (6,02 ml, 69,0 mmol). K tomuto roztoku se po kapkách přidal roztok dimethylsulfoxidu (7,87 ml, 110 mmol) vbezvodém methylenchloridu (100 ml). Po zamíchání po dobu 20 minut se ktéto směsi přidal roztok 3,5-di-O-benzyl-l,2-O-izopropyliden-a-D-erythropentofuranózy (9210mg, 23,02mmol) vbezvodém dichlormethanu (100ml) a směs se míchala po dobu 30 minut. K reakční směsi se přidal triethylamin (28 ml, 200 mmol) a pomalu se zahříval na teplotu místnosti. Reakční směs se rozdělila mezi dichlormethan a vodu (přibližně 300 ml). Organická vrstva se promyla vodou (přibližně 300 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 300 ml), sušila se pomocí bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 5:1) za vzniku bezbarvého oleje (8 310 mg, 20,88 mmol, výtěžek je 91 %).
'H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,35 (3H, s), 1,60 (3H, s), 3,68 (1H, d, 11 Hz), 4,37 (1H, d, 4,4 Hz), 4,46 (1H, d, 12Hz), 4,52 (1H, d, 12 Hz), 4,59 (1H, d, 12 Hz), 4,59 (1H, dd, 3,4, 4,4 Hz), 4,71 (1H, d, 12 Hz), 5,84 (1H, d, 3,4 Hz), 7,3 (lOh, m), 9,91 (1H, s).
FABMS (mNBA): 397 (M-H)+, 421 (M+Na)+ [a]D+27,4° (0,51, methanol).
Odkaz k příkladu 6
3.5- di-(2-benzyl-4-vinyl-l,2-0-izopropyliden-oc-D-erythropentofuranóza
K roztoku sloučeniny získané v odkazem kpříkladu 5 (8 310 mg, 20,88 mmol) vbezvodém tetrahydrofuranu (300 ml) v atmosféře dusíku při teplotě 0 °C se přidal, 0,5M toluenový roztok činidla Tebbe (44 ml, 22 mmol) a smě se míchala. Pak se pomalu přidával 0,lN vodný roztok hydroxidu sodného (20 ml). Směs se filtrovala přes celit za účelem odstranit sraženinu a sraženina se promyla diethyletherem (přibližně 100 ml). Organická vrstva se sušila za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 8 : 1 až 5 : 1) za vzniku bezbarvého oleje (5600 mg, 14,14 mmol, výtěžek je 68%).
'H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,28 (3H, s), 1,52 (3H, s), 3,31 (1H, d, 11 Hz), 3,34 (1H, d, 11 Hz), 4,25 (1H, d, 4,9 Hz), 4,40 (1H, d, 12 Hz), 4,52 (1H, d, 12 Hz), 4,57 (1H, dd, 3,9, 4,9 Hz), 4,59 (1H, d, 12 Hz), 4,76 (1H, d, 12 Hz), 5,25 (1H, dd, 1,8, 11Hz), 5,52 (1H, dd, 1,8, 18 Hz), 5,76 (1H, d, 3,9 Hz), 6,20 (1H, dd, 11, 8 Hz), 7,3 (10H, m).
FABMS (mNBA): 419 (M+Na)+.
Odkaz k příkladu 7
3.5- di-č?-benzyl-4-hydroxyethyl-l,2-0-izopropyliden-a-D-erythropentofuranóza
-58CZ 296576 B6
K roztoku sloučeniny získané v odkazech k příkladu 6 (5 500 mg, 13,89 mmol) vbezvodém tetrahydrofuranu (200 ml) v atmosféře dusíku se přidal po kapkách 0,5M roztok tetrahydrofuranu 9-BBN (9-borabicyklo[3,3,l]nonan) (80 ml, 40 mmol) a směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Do reakční směsi se přidávala voda do té doby než se zastavil vývoj plynu. Pak se přidal 3N vodný roztok hydroxidu sodného (30 ml) a pak se pomalu přidával 30% vodný roztok hydrogenperoxidu při teplotě, která se udržovala mezi hodnotou 30 a 50 °C. Směs se míchala při teplotě 30 minut a dělila mezi saturovaný vodný roztok chloridu sodného (přibližně 200 ml) a ethylacetát (200 ml). Organická vrstva se promyla neutrálním pufrovaným roztokem kyseliny fosforečné (přibližně 200 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 200 ml) a sušila se pomocí bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (za použití směsi hexan . ethylacetát = 2 : 1 až 1 : 1) za vzniku bezbarvého oleje (5 370 mg, 12,97 mmol, výtěžek je 93 %).
‘H-NMR (400 Mhz, CDC13): 1,33 (3H, s), 1,66 (3H, s), 1,78 (1H, ddd, 4,0, 8,5, 15 Hz), 2,51 (1H, ddd, 3,4, 6,4, 15 Hz), 3,54 (1H, d, 10 Hz), 3,80 (2H, m), 4,13 (1H, d, 5,3 Hz), 4,43 (1H, d, 12 Hz), 4,52 (1H, d, 12 Hz), 4,55 (1H, d, 12 Hz), 4,65 (1H, dd, 4,0, 5,3 Hz), 4,77 (1H, d, 12 Hz), 5,77 (1H, d, 4,0 Hz), 7,3 (10H, m).
FABMS (mNBA): 415 (M+Na)+, [a]D+57,4° (0,91, methanol).
Odkaz k příkladu 8
3,5-di-C*-benzyM—(p-toluensulfonyloxyethyl)-l,2-O-izopropyliden-a-D-erythropentofuranóza
K roztoku sloučenin získané v odkazu k příkladu 4, který se azeotropicky refluxoval s toluenem (1035 mg, 2,5 mmol) vbezvodém dichlormethanu (35 ml) v atmosféře dusíku při teplotě 0 °C se přidal triethylamin (1,8 ml, 13 mmol), dimethylaminopyridin (30 mg, 0,25 mmol) a />-toluensulfonylchlorid (858 mg, 4,5 mmol) a směs se míchala při teplotě místnosti přes noc. Reakční směs se dělila mezi dichlormethan a saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml). Organická vrstva se promyje saturovaným vodným roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 100 ml) a saturovaného vodného roztoku chloridu sodného (přibližně 100 ml) a sušila se za pomoci bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 3 : 1) za vzniku bezbarvého oleje (1 340 mg, 2,60 mmol, výtěžek je 94 %).
'H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,33 (3H, s), 1,49 (3H, s), 1,99 (1H, dt, 7,6 a 15 Hz), 2,47 (3H, s),
2,60 (1H, ddd, 5,7, 7,6, 15 Hz), 3,28 (1H, d, 10 Hz), 3,45 (1H, d, 10 Hz), 4,11 (1H, d, 5,3 Hz), 4, 32 (2H, m), 4,42 (1H, d, 12 Hz), 4,50 (1H, d, 12 Hz), 4,54 (1H, d, 12 Hz), 4,62 (1H, dd, 4,0,
5,2 Hz), 4,76 (1H, d, 12 Hz), 5,74 (1H, d, 4,0 Hz), 7,3 (12H, m), 7,78 (2H, d, 8,3 Hz).
FABMS (mNBA): 569 (M+H)+.
Odkaz k příkladu 9 l,2-di-0-acetyl-3,5-di-0-benzyl-4-(p-toluensulfonyloxyethyl)-a-D-erythropentofuranóza
K roztoku sloučeniny získané v odkazu k příkladu 8 (1 340 mg, 2,36 mmol) v kyselině octové (15 ml) se přidal kyselý anhydrid (1,88 ml, 20 mmol) a koncentrovaná kyselina sírová (0,01 ml). Směs se míchala při teplotě místnosti po dobu jedné hodiny. Reakční směs nalila do vody (60 ml) v ledové lázni a míchala se po dobu 30 minut a pak se dělila mezi saturovaný vodný roztok chloridu sodného (přibližně 100 ml) a ethylacetát (přibližně 100 ml). Organická vrstva se promyla neutrálním pufrovacím roztokem kyseliny fosforečné, saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a pak se koncentrovala. Zbytek se čistil chromatografícky na silikagelu (za použití směsi hexan : ethylacetát = 2:1) za vzniku bezbarvého oleje (1 290 mg, 2,11 mmol, výtěžek je 89%, poměr α : β je 1 : 5).
-59CZ 296576 B6 'H-NMR (400 MHz, CDC13): (derivát β) 1,86 (3H, s), 2,05 (3H, s), 2,08 (1H, m), 2,18 (1H, m),
2,42 (3H, s), 3,30 (1H, d, 10 Hz), 3,30 (1H, d, 10 Hz), 4,23 (1H, d, 5,1 Hz), 4,24 (2H, m), 4,42 (2H, s), 4,45 (1H, d, 12Hz), 4,55 (1H, d, 12 Hz), 5,28 (1H, d, 5,1 Hz), 6,01 (1H, s), 7,3 (12 H, m),
7,73 (2H, d, 8,3 Hz).
FAB-MAS (mNBA): 613 (M+H)+.
Odkaz k příkladu 10 2'-0-acetyl-3',5'-di-0-benzy>4'-jp-toluensulfonyloxyethyl-5-methyluridin
Trimethylsilyllovaný thymin (500 mg, přibližně 2 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (650 mg, 1,06 mmol) vbezvodém
1,2-dichlorethanu (15 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylsilyltrifluormethansulfonát (0,36 ml, 2 mmol) a smě se míchala při teplotě 50 °C po dobu 1 hodiny. Saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného se filtroval přes celit. K filtrátu se přidal dichlormethan (50 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 50 ml) a sušila se za použití síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatografícky na silikagelu (použila se směs hexan : ethylacetát = 1 : 2) za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (432 mg, 0,64 mmol, výtěžek je 60 %).
‘H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,52 (3H, d, 0,9 Hz), 1,94 (1H, dt, 7,5 a 15 Hz), 2,06 (3H, s), 2,23 (1H, dt, 6,0 a 15 Hz), 2,42 (3H, s), 3,38 (1H, d, 10 Hz), 3,67 (1H, d, 10 Hz), 4,17 (2H, m), 4,36 (1H, d, 6,0 Hz), 4,41 (1H, d, 12 Hz), 4,44 (1H, d, 12 Hz), 4,48 (1H, d, 12 Hz), 4,58 (1H, d, 12 Hz), 5,39 (1H, dd, 5,1 a 6,0 Hz), 6,04 (1H, d, 5,1 Hz), 7,3 (12 H, m), 7,73 (2H, dt, 1,8 a 8,3 Hz), 8,18 (1H, s).
FAB-MAS (mNBA): 679 (M+H)+.
Odkaz k příkladu 11 2'-(9-acetyl-3',5'-di-<9-benzyl-4'-/>-toluensulfonyloxyethyl-4-7V-benzoylcytidin
Trimethylsilylovaný benzoylcytosin (300 mg, přibližně 1,0 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrgeen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981) se přidal k roztoku sloučeniny získaní v odkazu příkladu 9 (383 mg, 0,626 mmol) vbezvodém 1,2-dichlorethanu (4 ml). Trimethylsilyltrifluormethansulfonát (0,18 ml, 0,995 mmol) při teplotě 0 °C se přidal do směsi a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 1 hodiny. Do směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 10 ml) a methylenchlorid (přibližně 20 ml) a směs se míchala. Výsledná bílá sraženina se odfiltrovala za použití celitu. Organická vrstva filtrátu se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 20 ml) a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu za vniku bezbarvé amorfní pevné látky (397 mg, výtěžek je 83 %).
‘H-NMR (400 MHz, CDC13): 8,70 (1H, br), 8,18 (1H, d, 7,4 Hz), 7,87 (2H, d, 7,5 Hz), 7,72 (2H, d, 8,3 Hz), 7,61-7,57 (1H, m), 7,51-7,48 (2H, m), 7,43-7,21 (13 H, m), 6,02 (1H, d, 2,9 Hz), 5,40 (1H, dd, 5,8, 2,9 Hz), 4,57 (1H, d, 11 Hz), 4,39 (1H, d, 11 Hz), 4,32^1,28 (3H, m), 4,19—4,16 (2H, m), 3,69 (1H, d 11 Hz), 3,31 (1H, d, 11 Hz), 2,40 (3H, s), 2,30-2,23 (1H, m), 2,06 (3H, s), 1,95-1,89 (1H, m).
FAB-MAS (mNBA): 769 (M+H)+
Odkaz k příkladu 12 2'-0-acetyl-3'-5'-di-(9-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-6-7V-benzoyladenosin
-60CZ 296576 B6
Trimethylsilylovaný benzoyladenosin (500 mg, přibližně 2 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (600 mg, 0,98 mmol) vbezvodém 1,2-dichlorethanu (15 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrifluormethansulfonát (0,36 ml, 2 mmol) a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 4 hodiny. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného a dichlormethan (50 ml). Reakční směs se rozdělila do těchto dvou vrstev. Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 50 ml) a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného (přibližně 50 ml) a sušila se za použití síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (použila se směs dichlormethan : methanol = 50 : 1) za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (405 mg, 0,51 mmol, výtěžek je 52%).
'H-NMR (400 MHz, CDC13): 2,0 (1H, m), 2,06 (3H, s), 2,32 (1H, dt, 6,0 a 15 Hz), 2,40 (3H, s), 3,36 (1H, d, 10 Hz), 3,58 (1H, d, 10 Hz), 4,22 (2H, m), 4,39 (1H, d, 12 Hz), 4,45 (1H, d, 12 Hz), 4,47 )1H, d, 12 Hz), 4,59 (1H, d, 12 Hz), 4,62 (1H, d, 5,6 Hz), 5,94 (1H, dd, 4,5 a 5,6 Hz), 5,94 (1H, dd, 4,5 a 5,6 Hz), 6,21 (1H, d, 4,5 Hz), 7,2-7,3 (12H, m), 7,54 (2H, m), 7,62 (1H, dt, 1,2 a
6,2 Hz), 7,72 (2H, d, 8,3 Hz), 8,02 (2H, m), 8,21 (1H, s), 8,75 (1H, s), 8,97 (1H, brs). FAB-MAS (mNBA): 792 (M+H)+.
Odkaz k příkladu 13 '-O-acetyl-3' ,5 '-di-(9-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyluridin
Trimethylsilylovaný uráčil (200 mg, přibližně 0,8 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Bern. 114, 1234-1255 (1981)) se připravil do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (200 mg, 0,327 mmol) v bezvodé,
1,2-dichlorethanu (8 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylsilyltrifluormethansulfonát (0,145 ml, 0,8 mmol) a směs se míchala při teplotě 70 °C po dobu 1 hodiny. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (10 ml) a směs se filtrovala za použití celitu. K filtrátu se přidal dichlormethan (přibližně 10 ml). Organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu. Zbytek se čistil chromatograficky na silikagelu (použila se směs dichlormethan : methanol = 100 : 2) za vzniku bezbarvého oleje (199 mg, 0,299 mmol, výtěžek je 92 %).
'H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,94 (1H, dt, 7,4 a 15 Hz), 2,07 (3H, s), 2,23 (1H, dt, 5,9 a 15 Hz), 2,43 (3H, s), 3,36 (1H, d, 10 Hz), 3,65 (1H, d, 10 Hz), 4,17 (2H, dd, 6 a 7 Hz), 4,31 (1H, d, 5,9 Hz), 4,38 (1H, d, 11 Hz), 4,39 (1H, d, 11 Hz), 4,40 (1H, d, 11 Hz), 4,58 (1H, d, 11 Hz), 5,29 (1H, dd, 2,4 a 8,2 Hz), 5,33 (1H, dd, 4,5 a 6 Hz), 6,00 (1H, d, 4,5 Hz), 7,2-7,4 (12H, m),
7,61 (1H, d, 8,2 Hz), 7,74 (1H, d, 8,3 Hz), 8,14 (1H, brs).
FAB-MAS (mNBA): 665 (M+H)+.
Odkaz k příkladu 14 2'-O-acetyl-3',5'-di-C-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-4-V-benzoyl-5-methylcytidin
Trimethylsilylovaný uráčil (200 mg, přibližně 0,8 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Vorbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (400 mg, 0,653 mmol) v bezvodém
1,2-dichlorethanu (6 ml). Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrifluormethansulfonát (0,180 μΐ, 1,0 mmol) při teplotě 0 °C a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 1 hodiny. Reakční směs se zahřála na teplotu místnosti. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (přibližně 5 ml) a methylenchlorid (přibližně 10 ml) a směs se zamíchala. Dále se směs filtrovala za použití celitu, aby se odstranila bílá sraženina. Organická
-61 CZ 296576 B6 vrstva filtrátu se promyla saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu za vzniku bezbarvé amorfní pevné látky (320 mg, 0,409 mmol, výtěžek je 63 %).
‘H-NMR (400 MHz, CDC13): 1,68 (3H, s), 1,95 (1H, dt, 7,3 a 15 Hz), 2,07 (3H, s), 2,25 (1H, dt, 6 a 15 Hz), 2,43 (3H, s), 3,40 (1H, d, 10 Hz), 3,71 (1H, d, 10 Hz), 4,18 (2H, m), 4,37 (1H, d, 5,8 Hz), 4,42 (1Hz, d, 12 Hz), 4,46 (1H, d, 12 Hz), 4,51 (1H, d, 12 Hz), 4,61 (1H, d, 12 Hz), 5,42 (1H, dd, 4,9 a 5,8 Hz), 6,07 (1H, d, 4,9 Hz), 7,2-7,6 (17H, m), 7,74 (2H, d, 8,3 Hz), 8,28 (2H, d, 7,0 Hz).
FAB-MAS (mNBA): 782 (M+H)+.
Odkaz k příkladu 15
2'-(9-acetly-3' ,5 '-di-O-benzyl-4'-p-toluensulfonyloxyethyl-2-.V-izobutyrylguanosin
Trimethylsilylovaný izobutyrylguanosin (650 mg, přibližně 1,5 mmol), který se připravil způsobem popsaným v publikaci H. Horbrggen, K. Krolikiewicz and B. Bennua, Chem. Ber., 114, 1234-1255 (1981)) se přidal do roztoku sloučeniny získané v odkazu příkladu 9 (400 mg, 0,65 mmol) vbezvodém 1,2-dichlorethanu (10 ml) při teplotě místnosti v atmosféře dusíku. Ke směsi se po kapkách přidal trimethylasilyltrifluormethansulfonát (0,2 ml, 1,2 mmol) a směs se míchala při teplotě 50 °C po dobu 4 hodin. Do reakční směsi se přidal saturovaný vodný roztok hydrogenuhličitanu sodného (5 ml) a organická vrstva se promyla saturovaným vodným roztokem hydrogenuhličitanu sodného a saturovaným vodným roztokem chloridu sodného a sušila se za použití bezvodého síranu hořečnatého a koncentrovala se ve vakuu za vzniku produktu, který se použil v další reakci bez dalšího čistění.
Příklad testu 1
Test měření Tm
Roztok vzorku (1 ml), jehož konečná koncentrace NaCl je 100 mM, pufrovací roztok fosforečnanu sodného (pH 7,2) s koncentrací 10 mM, oligonukleotid (1) s koncentrací 4 μΜ a komplementární DNA (zde uvedená jako oligonukleotid (2)), která vykazuje sekvenci indikovanou svým komplementárním řetězcem (sekvence 5'-agcaaaaacgc-3' (sekvence č. 1 na seznamu sekvencí) nebo komplementární RNA (zde uvedená jako oligonukleotid (3)), která má sekvenci indikovanou sekvencí 5'-agcaaaaaacgc-3' (sekvence č. 1 uvedenou na seznamu sekvencí) s koncentrací 4 μΜ, se zahřál v lázni s vroucí vodou a pomalu se chladil na teplotu místnosti, což trvalo přibližně dvě hodiny. Vzorek se pak zahřál a měřilo se za použití spektrofotometru (UV-3100PC:produkt firmy Shimadzu Corp.). Vzorek se zahřál v cele (tloušťka cely je 1,0 cm, cylindrický plášťový typ) cirkulující vodou zahřívanou v inkubátoru (Haake FE2: produkt firmy EKO Corp.) a monitorovala se teplota za použití teploměru (SÁTO SK1250MC). Teplota se zvýšila z 20 na 95 °C a při každém zvýšení teploty o jeden °C se měřila absorbance ultrafialového záření při maximální absorpční vlnové délce 260 nm. Přirozeně se vyskytující DNA (zde uvedená jako oligonukleotid (4)), která má sekvenci indikovanou sekvencí 5'-gcgttttttgct-3' (sekvence č. 2 uvedená v seznamu sekvencí), jenž má stejnou sekvenci jako oligonukleotid (1) (sloučenina příkladu 29) se použila jako kontrola a provedl se stejný postup.
Teplota, při které změna na 1 °C dosáhne maxima, je teplota Tm (teplota denaturace) a při této teplotě se hodnotila schopnost oligonukleotidového analogu tvořit komplementární řetězec.
Výsledky měření hodnot Tm oligonukleotidu (4) (přirozeně se vyskytující DNA) a oligonukleotidu (1) (sloučenina z příkladu 29) je vztažena k oligonukleotidu (2) (komplementární DNA) a oligonukleotidu (3) (komplementární RNA).
-62CZ 296576 B6
Tabulka č. 3
Tm (DC)
sloučenina oligonukleotid (2) oligonukleotid (3)
oligonukleotid (4) 48 44
oligonukleotid (1) 61 75
Z tabulky plyne, že oligonukleotidový analog podle vynálezu vykazuje překvapivě vyšší hodnotu Tm a překvapivě vyšší schopnost tvořit komplementární řetězec ve srovnání s přirozeně se vyskytující DNA.
Příklad testu 2
Měření rezistence vůči nukleázám
Exonukleáza a endonukleáza se smíchaly s pufrem s oligonukleotidem a směs se udržovala při teplotě 37 °C po dobu 15 minut. Roztok směsi se pak udržoval při teplotě 37 °C po předem určenou dobu. K části směsi se přidala kyselina ethylendiaminotetraoctová (EDTA) a směs se zahřála na teplotu 100 °C po dobu 2 minuty, přičemž se zastavila reakce. Množství zbývajícího oligonukleotidu se stanovilo HPLC s reverzními fázemi, měřily se změny množství oligonukleotidu závislé na čase v přítomnosti nukleázy.
Oligonukleotidové analogy podle vynálezu demonstrují překvapivou rezistenci vůči nukleázám.
Průmyslová využitelnost
Nový oligonukleotidový a nukleosidový analog podle vynálezu se může použít jako antigenní farmaceutický prostředek, který vykazují skvělou stabilitu. Dále se mohou požít jako detekční činidla (sondy) specifického genu, jako primery pro začátek amplifíkace nebo jako meziprodukty při jejich přípravě.
Seznam sekvencí <210> 1 <211> 12 <212> DNA <213 > umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: Syntetizovaný oligonukleotid určený pro testování hodnoty Tm <400> 1 agcaaaaaac gc gcgtttttt ct <210> 2 <211> 12 <212> DNA <213> umělá sekvence <220>
<223> Popis umělé sekvence: Syntetizovaný oligonukleotid určený pro testování hodnoty Tm <400> 2

Claims (2)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    1. Nukleosidový analog obecného vzorce 1 kde symboly R1 a R2 jsou stejné nebo různé a reprezentují atom vodíku, hydroxylovou chránící skupinu, skupinu kyseliny fosforečné, chráněnou skupinu kyseliny fosforečné nebo -P(R3)R4, kde symboly R3 a R4 jsou stejné nebo různé a reprezentují hydroxylovou skupinu, chráněnou hydroxylovou skupinu, merkaptoskupinu, chráněnou merkaptoskupinu, aminoskupinu, alkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, alkylthioskupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, kyanoalkoxyskupinu, která obsahuje 1 až 5 atomů uhlíku, nebo aminoskupinu substituovanou alkylovou skupinou, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku, symbol A reprezentuje alkandiylovou skupinu, která obsahuje 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl nebo substituovanou skupinou purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl mající alespoň jeden substituent vybraný ze skupiny a, která se skládá z hydroxylové skupiny, chráněné hydroxylové skupiny, alkoxyskupiny s 1 až 4 atomy uhlíku, merkaptoskupiny, chráněné merkaptoskupiny, alkylthioskupiny s 1 až 4 atomy uhlíku, aminoskupiny, chráněné aminoskupiny, aminoskupiny substituované alkylovou skupinou s 1 až 4 atomy uhlíku alkylové skupiny s 1 až 4 atomy uhlíku a halogenovaného atomu, nebo jeho sůl.
    2. Nukleosidový analog podle nároku 1 nebo jeho sůl, kde symbol R1 je atom vodíku, alifatická acylová skupina, aromatická acylová skupina, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, methylová skupina, substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, jejichž arylový kruh je substituován nižším arylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou nebo silylovou skupinou.
    3. Nukleosidový analog podle nároku 1 nebo jeho sůl, kde symbol R1 je atom vodíku, acetylová skupina, benzoylová skupina, benzylová skupina, p-methoxybenzylová skupina, dimethoxytritylová skupina, monomethoxytritylová skupina nebo íerc-butyldifenyl-silylová skupina.
    4. Nukleosidový analog podle kteréhokoliv z nároků 1 až 3 nebo jeho sůl, kde symbol R2 je atom vodíku, alifatická acylová skupina, aromatická acylová skupina, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, methylová skupina substituovaná jednou až třemi arylovými skupinami, jejichž arylový kruh je substituován nižším alkylem, nižší alkoxyskupinou, halogenem nebo kyanoskupinou, silylovou skupinou, fosforamiditovou skupinou, fosfonylovou skupinou, skupinou kyseliny fosforečné nebo chráněnou skupinou kyseliny fosforečné. 5
    5. Oligonukleotidový analog podle kteréhokoliv z nároků 1 až 3 nebo jeho sůl, kde symbol R2 je atom vodíku, acetylová skupina, benzoylová skupina, benzylová skupina, p-methoxybenzylová skupina, fórc-butyldifenylsilylová skupina, -P(OC2H4CN)NCH(CH3)2),
    -64CZ 296576 B6
    -P(OCH3)NCH(CH3)2), fosfonylová skupina nebo skupina kyseliny 2-chlorfenylfosforečné nebo
    4-chlorfenylfosforečné.
    6. Nukleosidový analog podle kteréhokoliv z nároků 1 až 5 nebo jeho sůl, kde symbol A je methylenová skupina.
    7. Nukleosidový analog podle kteréhokoliv z nároků 1 až 6 nebo jeho sůl, kde symbol B je 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), 6-aminopurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2,6-di-aminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6-brompurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), 2-amino-6-hydroxypurin9-yl, jehož aminoskupina a hydroxylová skupina jsou chráněné, 6-amino-2-methoxypurin-9-yl, 6-amino-2-chlorpurin-9-yl, 6-amino-2-fluor-purin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-aminopyrimidm-l-yl (to je cytosinyl), 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-oxo-4-amino-5fluorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je methylcytosinyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná.
    8. Nukleosidový analog podle kteréhokoliv z nároků 1 až 7 nebo jeho sůl, kde symbol B je 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-izobutyl-arylamino-6-hydroxypurin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-4-benzoylamino-pyrimidin-l-yl, cytosinyl, 2-oxo-5-methyl-4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl.
    9. Nukleosidový analog nebo jeho sůl vybraná z následující skupiny:
    2'-O,4'-C-ethylenguanosin 2'-C>,4'-C-ethylenadenosin 3', 5 '-di-O-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-6W-benzoyladenosin 3',5'-di-(9-benzyl-2'-O,4'-C-ethylen-2-7V-izobutyrylguanosin 5'-<?-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-6-N-benzoyladenosin 5'-(9-dimethoxytrityl-2'-Q4'-C~ethylen-2-7V-izobutyrylguanosin 2'-O,4'-C-ethylen-2-Ar-izobutyrylguanosin 2'-(?,4'-C-ethylen-6-Az-benzoyladenosin 5'-O-dimethoxytrityl-2'--O,4'-C-ethylen-6-.ZV-benzoyladenosin-3'-O-(2-kyanoethyl-N,N-diizopropyl)fosforamidit 5'-<9-dimethoxytrityl~2'-O,4'-C-ethylen-2-A-osobutyrylguanosin-3'-C>-(2-kyanoethyl-A/',AL diizopropyl)fosforamidin 2'-(9,4'-C-ethylenuridin
    2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin 2'-(?,4'-C-ethylencitidin
    2'-(9,4'-C-ethylen-5-methylcytidin 3',5'-di-O-benzyl-2'-<9,4'-C-ethylenuridin 5 '-O-dimethyoxytri tyl-2 '-O,4'-C-ethylenuridin 3 (5 '-di-O-benzyl-2'-ČM'-C-ethylen-5-methyluridin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin 3',5'-di-O-benzyl-2'-(9,4'-C-ethylen-4--JV-benzoylcytidin 5'~č?-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-JV-benzoylcytidin 3\5'-di-O-benzyl-2'-(9,4'-C-ethylen-4-JV-benzoyl-5--methyluridin 5'-O-dimethoxytrityl-2'-C>,4'-C-ethylen-4-7V-benzoyl-5-methylcytidin
    -65CZ 296576 B6
    2'-O,4'-C-ethylen-4-N-benzoylcytidin
    2'-O,4'-C-ethylen-4-A-benzoyl-5-methylcytidm
    5'-(9--dimethoxytntyl-2'-O,4-C-ethylenundm-3'~-O-(2-kyanoethyl-V,/V-diizopropyl)fosforamidin
    5'-<9-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-5-methyluridin-3'-(9-(2-kyanoethyl-A,ALdiizopropyl)fosforamidit
    5'-C>-dimethoxytrityl-2'-O,4'-C-ethylen-4-A-benzoylcytidin-3'-C>-(2-kyanoethyl-A(jV-diizopropyl)fosforamidit a
    5'-C*-dimethoxytrityl-2-C>,4'-C-ethylen-5-methylurídin-3'-O-(2-kyanoethyl-jV,/V-diizopropyl)fosforamidit.
    10. Oligonukleotidový analog, který vykazuje jednu nebo dvě nebo více struktur obecného vzorce 2:
  2. (2), kde symbol A reprezentuje alkandiylovou skupinu, která má 1 až 4 atomy uhlíku a symbol B reprezentuje skupinu purin-9-yl, 2-oxopyrimidin-l-yl nebo substituovanou skupinu purin-9-yl nebo substituovanou skupinu 2-oxopyrimidin-l-yl mající alespoň jeden substituent vybraný ze skupiny a, která se skládá z hydroxylové skupiny, chráněné hydroxylové skupiny, alkoxyskupiny s 1 až 4 atomy uhlíku, merkaptoskupiny, chráněné merkaptoskupiny, alkylthioskupiny s 1 až 4 atomy uhlíku, aminoskupiny, chráněné aminoskupiny, aminoskupiny substituované alkylovou skupinou s 1 až 4 atomy uhlíku, alkylové skupina s 1 až 4 atomy uhlíku nebo halogenovaného atomu, nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl.
    11. Oligonukleotidový analog podle nároku 10 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl, kde symbol A je methylenová skupina.
    12. Oligonukleotidový analog podle kteréhokoliv z nároků 10 a 11 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl, kde symbol B je 6-aminopurin-9-yl (to je adeninyl), 6-aminopurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2,6-diaminopurin-9-yl, 2-amino-6-chlorpurin-9-yl, 2-amino-6chlorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-fluorpurin-9-yl, 2-amino-6fluorpurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-brompurin-9-yl, 2-amino-6brompurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl (to je guaninyl), 2-amino-6-hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 2-amino-6hydroxypurin-9-yl, jehož aminoskupina a hydroxylová skupina jsou chráněné,6-amino-2methoxypurin-9-yl, 6-amino-2-chlorpurin-9-yl, 6-amino-2-fluorpurin-9-yl, 2,6-dimethoxypurin-9-yl, 2,6-dichlorpurin-9-yl, 6-merkaptopurin-9-yl, 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl (to je cytosinyl), 2-oxo-4-aminopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupinaje chráněná, 2-oxo-4-amino-5fluorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-amino-5-fluorpyrirnidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná, 4-amino-2-oxo-5-chlorpyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-methoxypyrimidin-l-yl, 2-oxo-4—merkaptopyrimidin-l-yl, 2-oxo-4-hydroxypyrimidin-l-yl (to je uracinyl), 2-oxo-4-hydroxy-5-methylpyrimidin-l-yl (to je thyminyl) nebo 4-amino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl (to je methylcytosinyl nebo 4-arnino-5-methyl-2-oxopyrimidin-l-yl, jehož aminoskupina je chráněná.
    -66CZ 296576 B6
    13. Oligonukleotidový analog podle kteréhokoliv z nároků 10 až 12 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl, kde symbol B je 6-benzoylaminopurin-9-yl, adeninyl, 2-izobutyrylamino-6-hydroxy-purin-9-yl, guaninyl, 2-oxo-Á—benzoylaminopyrimidin-l-yl, cytoxinyl, 2-oxo-5-methyl4-benzoylaminopyrimidin-l-yl, 5-methylcytosinyl, uracinyl nebo thyminyl.
    14. Farmaceutický prostředek, vyznačující se tím, že obsahuje účinné množství farmaceuticky aktivní sloučeniny spolu s nosičem nebo ředidlem, kde uvedená farmakologicky aktivní sloučenina je oligonukleotidový analog podle kteréhokoliv z nároků 10 až 13 nebo jeho farmaceuticky přijatelná sůl.
    15. Sonda vhodná pro gen, vyznačující se tím, že obsahuje oligonukleotidový analog podle kteréhokoliv z nároků 10 až 13.
    16. Primer vhodný pro začátek amplifíkace, vyznačující se tím, že obsahuje oligonukleotidový analog podle kteréhokoliv z nároků 10 až 13.
    17. Použití oligonukleotidového analogu podle kteréhokoliv z nároků 10 až 13 nebo jeho farmaceuticky přijatelné sole pro výrobu léčiva vhodného pro prevenci nebo léčbu onemocnění, kterému je možné předcházet nebo ho léčit schopností uvedeného oligonukleotidového analogu vykazovat farmakologicky přijatelnou protismyslnou aktivitu v těle pacienta po jeho aplikaci.
    18. Použití oligonukleotidového analogu podle kteréhokoliv z nároků 10 až 13 nebo jeho farmaceuticky přijatelné sole pro výrobu léčiva vhodného pro prevenci nebo léčbu onemocnění, kterému je možné předcházet nebo ho léčit schopností uvedeného oligonukleotidového analogu vykazovat farmakologicky použitelnou antigenní aktivitu v těle pacienta po jeho aplikaci.
    19. Oligonukleotidový analog podle kteréhokoliv z nároků 10 až 13 nebo jeho farmakologicky přijatelná sůl pro použití jako léčivo.
CZ20012574A 1999-02-12 2000-02-10 Nukleosidový analog a oligonukleotidový analog a farmaceutický prostredek, sonda a primer s jeho obsahem CZ296576B6 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP3386399 1999-02-12

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ20012574A3 CZ20012574A3 (cs) 2002-02-13
CZ296576B6 true CZ296576B6 (cs) 2006-04-12

Family

ID=12398349

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20012574A CZ296576B6 (cs) 1999-02-12 2000-02-10 Nukleosidový analog a oligonukleotidový analog a farmaceutický prostredek, sonda a primer s jeho obsahem

Country Status (26)

Country Link
US (4) US7335765B2 (cs)
EP (1) EP1152009B2 (cs)
JP (1) JP3420984B2 (cs)
KR (1) KR100573231B1 (cs)
CN (1) CN1273478C (cs)
AT (1) ATE287897T2 (cs)
AU (1) AU758956B2 (cs)
BR (1) BRPI0008131B8 (cs)
CA (1) CA2361318C (cs)
CZ (1) CZ296576B6 (cs)
DE (1) DE60017711T3 (cs)
DK (1) DK1152009T4 (cs)
ES (1) ES2234563T5 (cs)
HK (1) HK1040084B (cs)
HU (1) HU228398B1 (cs)
ID (1) ID30093A (cs)
IL (2) IL144338A0 (cs)
NO (1) NO320441B1 (cs)
NZ (1) NZ513402A (cs)
PL (1) PL208245B1 (cs)
PT (1) PT1152009E (cs)
RU (1) RU2233844C2 (cs)
TR (2) TR200604211T1 (cs)
TW (1) TW513438B (cs)
WO (1) WO2000047599A1 (cs)
ZA (1) ZA200106544B (cs)

Families Citing this family (484)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7119184B2 (en) * 1991-08-12 2006-10-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides having A-DNA form and B-DNA form conformational geometry
US7812149B2 (en) 1996-06-06 2010-10-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2′-Fluoro substituted oligomeric compounds and compositions for use in gene modulations
US5898031A (en) 1996-06-06 1999-04-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligoribonucleotides for cleaving RNA
US9096636B2 (en) 1996-06-06 2015-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Chimeric oligomeric compounds and their use in gene modulation
JP4148662B2 (ja) * 2000-08-10 2008-09-10 第一三共株式会社 ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体を含有する核酸試薬及び医薬
JP4151751B2 (ja) * 1999-07-22 2008-09-17 第一三共株式会社 新規ビシクロヌクレオシド類縁体
EP1334109B1 (en) 2000-10-04 2006-05-10 Santaris Pharma A/S Improved synthesis of purine locked nucleic acid analogues
GB0114719D0 (en) * 2001-06-15 2001-08-08 Glaxo Group Ltd Compound
WO2003033696A1 (en) * 2001-10-18 2003-04-24 Sankyo Company, Limited Vegf antisense compound
JP4383176B2 (ja) * 2002-02-13 2009-12-16 武 今西 ヌクレオシド類縁体およびそのヌクレオチド類縁体を含むオリゴヌクレオチド誘導体
US20040219565A1 (en) 2002-10-21 2004-11-04 Sakari Kauppinen Oligonucleotides useful for detecting and analyzing nucleic acids of interest
CA2504694C (en) 2002-11-05 2013-10-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Polycyclic sugar surrogate-containing oligomeric compounds and compositions for use in gene modulation
US8604183B2 (en) 2002-11-05 2013-12-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compositions comprising alternating 2′-modified nucleosides for use in gene modulation
EP2284269B1 (en) * 2002-11-18 2017-08-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense design
AU2013201763B2 (en) * 2002-11-18 2015-05-07 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Amino-LNA, thio-LNA and alpha-L-oxy-LN
JP5132025B2 (ja) * 2002-11-19 2013-01-30 第一三共株式会社 新規２’，５’−オリゴアデニル酸類縁体
TWI347948B (en) 2002-11-19 2011-09-01 Sankyo Co Novel 2',5'-oligoadenylic acid compositions
EP2530155B1 (en) * 2002-11-25 2016-03-16 Masafumi Matsuo ENA nucleic acid drugs modifying splicing in mRNA precursor
CN1833034B (zh) 2003-06-20 2014-04-16 埃克斯魁恩公司 用于分析核酸混合物的探针、文库和试剂盒及其构建方法
WO2005013901A2 (en) 2003-07-31 2005-02-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and compositions for use in modulation of small non-coding rnas
DK1661905T3 (da) * 2003-08-28 2012-07-23 Takeshi Imanishi Hidtil ukendte syntetiske nukleinsyrer af N-O-krydsbindingstype
US20050053981A1 (en) * 2003-09-09 2005-03-10 Swayze Eric E. Gapped oligomeric compounds having linked bicyclic sugar moieties at the termini
US7480382B2 (en) * 2003-09-30 2009-01-20 Microsoft Corporation Image file container
GB0324854D0 (en) * 2003-10-24 2003-11-26 Expresson Biosystems Ltd App/ena antisense
DE602004015832D1 (de) 2003-11-07 2008-09-25 Daiichi Sankyo Co Ltd Verfahren zum nachweis von genetischem polymorphismus
US8569474B2 (en) 2004-03-09 2013-10-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Double stranded constructs comprising one or more short strands hybridized to a longer strand
WO2005116207A1 (ja) * 2004-05-28 2005-12-08 Sankyo Company, Limited テロメラーゼ阻害ｅｎａオリゴヌクレオチド
US8394947B2 (en) 2004-06-03 2013-03-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Positionally modified siRNA constructs
US7884086B2 (en) 2004-09-08 2011-02-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Conjugates for use in hepatocyte free uptake assays
WO2006059507A1 (ja) * 2004-11-30 2006-06-08 Sankyo Company, Limited 11β-HSD1アンチセンス化合物
WO2006110314A2 (en) 2005-03-25 2006-10-19 Ambion, Inc. Methods and compositions for depleting abundant rna transcripts
WO2007027894A2 (en) 2005-08-29 2007-03-08 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense compounds having enhanced anti-microrna activity
US8883162B2 (en) * 2005-10-19 2014-11-11 Ibc Pharmaceuticals, Inc. Multivalent antibody complexes targeting IGF-1R show potent toxicity against solid tumors
US20100226884A1 (en) 2009-01-20 2010-09-09 Immunomedics, Inc. Novel Class of Monospecific and Bispecific Humanized Antibodies that Target the Insulin-like Growth Factor Type I Receptor (IGF-1R)
US9862770B2 (en) 2005-10-19 2018-01-09 Ibc Pharmaceuticals, Inc. Multivalent antibody complexes targeting IGF-1R show potent toxicity against solid tumors
US20090324587A1 (en) 2005-12-01 2009-12-31 Neal Clifford Goodwin Cancer Therapies and Pharmaceutical Compositions Used Therein
CA2642657A1 (en) * 2005-12-09 2007-06-14 Riken Method for replicating nucleic acids and novel unnatural base pairs
CN103301475B (zh) * 2005-12-28 2016-08-03 斯克里普斯研究所 药物组合物和表达载体以及调节基因表达的方法和核酸分子的应用
EP2388328A1 (en) 2006-01-27 2011-11-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds and compositions for the use in modulation of micrornas
US7569686B1 (en) 2006-01-27 2009-08-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for synthesis of bicyclic nucleic acid analogs
DE602007009487D1 (de) 2006-01-27 2010-11-11 Isis Pharmaceutical Inc 6-modifizierte bicyclische nukleinsäureanaloga
EP2505646A1 (en) * 2006-05-05 2012-10-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating expression of CRP
EP2505647A1 (en) 2006-05-05 2012-10-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. Compounds and methods for modulating expression of DGAT2
US7666854B2 (en) 2006-05-11 2010-02-23 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bis-modified bicyclic nucleic acid analogs
CA2651453C (en) 2006-05-11 2014-10-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5'-modified bicyclic nucleic acid analogs
EP2410053B2 (en) 2006-10-18 2020-07-15 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Antisense compounds
EA200900741A1 (ru) * 2006-11-27 2010-04-30 Айзис Фармасьютикалз, Инк. Способы лечения гиперхолестеринемии
US8093222B2 (en) 2006-11-27 2012-01-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Methods for treating hypercholesterolemia
WO2008104978A2 (en) * 2007-02-28 2008-09-04 Quark Pharmaceuticals, Inc. Novel sirna structures
DK2170917T3 (da) 2007-05-30 2012-10-08 Isis Pharmaceuticals Inc N-Substituerede bicycliske nukleinsyreanaloge med aminomethylenbro
WO2008154401A2 (en) 2007-06-08 2008-12-18 Isis Pharmaceuticals, Inc. Carbocyclic bicyclic nucleic acid analogs
WO2009002944A1 (en) * 2007-06-22 2008-12-31 Isis Pharmaceuticals, Inc. Double strand compositions comprising differentially modified strands for use in gene modulation
AU2008272918B2 (en) 2007-07-05 2012-09-13 Isis Pharmaceuticals, Inc. 6-disubstituted bicyclic nucleic acid analogs
CA2700953A1 (en) 2007-10-02 2009-04-09 Amgen Inc. Increasing erythropoietin using nucleic acids hybridizable to micro-rna and precursors thereof
CA2701845A1 (en) 2007-10-03 2009-04-09 Quark Pharmaceuticals, Inc. Novel sirna structures
WO2009067647A1 (en) * 2007-11-21 2009-05-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Carbocyclic alpha-l-bicyclic nucleic acid analogs
US8614311B2 (en) 2007-12-12 2013-12-24 Quark Pharmaceuticals, Inc. RTP801L siRNA compounds and methods of use thereof
US20110105584A1 (en) * 2007-12-12 2011-05-05 Elena Feinstein Rtp80il sirna compounds and methods of use thereof
WO2009090639A2 (en) * 2008-01-15 2009-07-23 Quark Pharmaceuticals, Inc. Sirna compounds and methods of use thereof
EP2265627A2 (en) 2008-02-07 2010-12-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexitol nucleic acid analogs
EP3643782A1 (en) 2008-02-11 2020-04-29 Phio Pharmaceuticals Corp. Modified rnai polynucleotides and uses thereof
RU2010138558A (ru) * 2008-03-20 2012-03-27 Кварк Фармасьютикалс. Инк, (Us) Новые соединения миphk для ингибирования rtp801
US9290534B2 (en) 2008-04-04 2016-03-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds having at least one neutrally linked terminal bicyclic nucleoside
WO2009144704A2 (en) * 2008-04-15 2009-12-03 Quark Pharmaceuticals, Inc. siRNA COMPOUNDS FOR INHIBITING NRF2
CA2726052A1 (en) 2008-06-04 2009-12-10 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Modulation of gene expression through endogenous small rna targeting of gene promoters
US8431692B2 (en) 2008-06-06 2013-04-30 Quark Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treatment of ear disorders
TWI455944B (zh) 2008-07-01 2014-10-11 Daiichi Sankyo Co Ltd 雙股多核苷酸
US8815818B2 (en) 2008-07-18 2014-08-26 Rxi Pharmaceuticals Corporation Phagocytic cell delivery of RNAI
AU2009276763B2 (en) 2008-07-29 2015-07-16 The Board Of Regents Of The University Of Texas Sytem Selective inhibition of polyglutamine protein expression
CN107083386A (zh) * 2008-08-25 2017-08-22 埃克斯雷德制药有限公司 阻止结缔组织生长因子的反义核苷酸及其用途
EP2342340A1 (en) 2008-09-22 2011-07-13 Rxi Pharmaceuticals Corporation Rna interference in skin indications
WO2010036698A1 (en) 2008-09-24 2010-04-01 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted alpha-l-bicyclic nucleosides
MY188457A (en) * 2008-10-03 2021-12-10 Opko Curna Llc Treatment of apolipoprotein-a1 related diseases by inhibition of natural antisense transcript to apolipoprotein-a1
US9074211B2 (en) 2008-11-19 2015-07-07 Rxi Pharmaceuticals Corporation Inhibition of MAP4K4 through RNAI
CA2745329C (en) 2008-12-04 2022-07-12 Opko Curna, Llc Treatment of erythropoietin (epo) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to epo
KR20110091796A (ko) 2008-12-04 2011-08-12 오피케이오 큐알엔에이, 엘엘씨 종양 억제 유전자에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의해 종양 억제 유전자 관련된 질환의 치료
WO2010065671A2 (en) 2008-12-04 2010-06-10 Curna, Inc. Treatment of vascular endothelial growth factor (vegf) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to vegf
US8592386B2 (en) 2008-12-17 2013-11-26 Sarepta Therapeutics, Inc. Antisense compositions and methods for modulating contact hypersensitivity or contact dermatitis
US20110288155A1 (en) 2008-12-18 2011-11-24 Elena Feinstein Sirna compounds and methods of use thereof
US9493774B2 (en) 2009-01-05 2016-11-15 Rxi Pharmaceuticals Corporation Inhibition of PCSK9 through RNAi
WO2010090762A1 (en) 2009-02-04 2010-08-12 Rxi Pharmaceuticals Corporation Rna duplexes with single stranded phosphorothioate nucleotide regions for additional functionality
HUE026280T2 (en) 2009-02-12 2016-06-28 Curna Inc Treatment of brain-derived neurotrophic factor (BDNF) -related diseases by inhibition of natural antisense transcripts associated with BDNF \ t
MX2011009751A (es) 2009-03-16 2011-09-29 Opko Curna Llc Tratamiento de enfermedades relacionadas con factor nuclear (eritroide derivado 2) tipo 2 (nrf2) por inhibicion del transcrito antisentido natural a nrf2.
US9708604B2 (en) 2009-03-17 2017-07-18 Curna, Inc. Treatment of delta-like 1 homolog (DLK1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to DLK1
WO2010124231A2 (en) 2009-04-24 2010-10-28 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Modulation of gene expression using oligomers that target gene regions downstream of 3' untranslated regions
DE102009019476A1 (de) * 2009-05-04 2010-11-11 Biametrics Marken Und Rechte Gmbh Wiedererkennbarer Träger für optische Meßverfahren
ES2609655T3 (es) 2009-05-06 2017-04-21 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con tristetraprolina (TTP) mediante inhibición de transcrito antisentido natural para TTP
CN102459596B (zh) 2009-05-06 2016-09-07 库尔纳公司 通过针对脂质转运和代谢基因的天然反义转录物的抑制治疗脂质转运和代谢基因相关疾病
EP2427554B1 (en) 2009-05-08 2016-11-16 CuRNA, Inc. Treatment of dystrophin family related diseases by inhibition of natural antisense transcript to dmd family
DK2432881T3 (en) 2009-05-18 2018-02-26 Curna Inc TREATMENT OF REPROGRAMMING FACTOR-RELATED DISEASES BY INHIBITING NATURAL ANTISENSE TRANSCRIPTS TO A REPROGRAMMING FACTOR
KR101703695B1 (ko) 2009-05-22 2017-02-08 큐알엔에이, 인크. 전사 인자 ｅ3(ｔｆｅ3)에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의해 ｔｆｅ3 및 인슐린 수용체 기질 2(ｉｒｓ2)의 치료
KR101704988B1 (ko) 2009-05-28 2017-02-08 큐알엔에이, 인크. 항바이러스 유전자에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 항바이러스 유전자 관련된 질환의 치료
EP2440214A4 (en) 2009-06-08 2013-07-31 Quark Pharmaceuticals Inc METHOD FOR THE TREATMENT OF CHRONIC KIDNEY DISEASES
WO2010148050A2 (en) 2009-06-16 2010-12-23 Curna, Inc. Treatment of collagen gene related diseases by inhibition of natural antisense transcript to a collagen gene
ES2629339T3 (es) 2009-06-16 2017-08-08 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con la paraoxonasa 1 (pon1) por inhibición de transcrito antisentido natural a pon1
ES2618894T3 (es) 2009-06-24 2017-06-22 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con el receptor del factor de necrosis tumoral 2 (tnfr2) por inhibición del transcrito natural antisentido para tnfr2
CN102482672B (zh) 2009-06-26 2016-11-09 库尔纳公司 通过抑制唐氏综合征基因的天然反义转录物治疗唐氏综合征基因相关疾病
KR101801407B1 (ko) 2009-07-24 2017-11-24 큐알엔에이, 인크. 시르투인 (ｓｉｒｔ)에 대한 천연 안티센스 전사체의 억제에 의한 시르투인 관련된 질환의 치료
CA2769665A1 (en) 2009-08-05 2011-02-10 Opko Curna, Llc Treatment of insulin gene (ins) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an insulin gene (ins)
EP2462153B1 (en) 2009-08-06 2015-07-29 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic cyclohexose nucleic acid analogs
US9044493B2 (en) 2009-08-11 2015-06-02 Curna, Inc. Treatment of Adiponectin related diseases by inhibition of natural antisense transcript to an Adiponectin
CN102482670B (zh) 2009-08-21 2018-06-15 库尔纳公司 通过抑制‘hsp70-相互作用蛋白的c末端’(chip)的天然反义转录物而治疗chip相关疾病
CN102482671B (zh) 2009-08-25 2017-12-01 库尔纳公司 通过抑制‘含有iq模体的gtp酶激活蛋白’(iqgap)的天然反义转录物而治疗iqgap相关疾病
NO2480669T3 (cs) 2009-09-25 2018-04-07
US20120220649A1 (en) 2009-10-30 2012-08-30 Daiichi Sankyo Company, Limited Modified double-stranded polynucleotide
US20110110860A1 (en) 2009-11-02 2011-05-12 The Board Of Regents Of The University Of Texas System Modulation of ldl receptor gene expression with double-stranded rnas targeting the ldl receptor gene promoter
CA2781896C (en) 2009-12-09 2021-03-30 Nitto Denko Corporation Modulation of hsp47 expression
WO2011072091A1 (en) 2009-12-09 2011-06-16 Quark Pharmaceuticals, Inc. Methods and compositions for treating diseases, disorders or injury of the cns
CA2782366A1 (en) 2009-12-16 2011-07-14 Opko Curna, Llc Treatment of membrane bound transcription factor peptidase, site 1 (mbtps1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to mbtps1
EP2515947B1 (en) 2009-12-23 2021-10-06 CuRNA, Inc. Treatment of uncoupling protein 2 (ucp2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to ucp2
US8940708B2 (en) 2009-12-23 2015-01-27 Curna, Inc. Treatment of hepatocyte growth factor (HGF) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to HGF
ES2585829T3 (es) 2009-12-29 2016-10-10 Curna, Inc. Tratamiento de las enfermedades relacionadas con la proteína tumoral 63 (p63) por inhibición de transcripción antisentido natural a p63
US8921334B2 (en) 2009-12-29 2014-12-30 Curna, Inc. Treatment of nuclear respiratory factor 1 (NRF1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to NRF1
CA2785727C (en) 2009-12-31 2020-01-07 Curna, Inc. Treatment of insulin receptor substrate 2 (irs2) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to irs2 and transcription factor e3 (tfe3)
US8946181B2 (en) 2010-01-04 2015-02-03 Curna, Inc. Treatment of interferon regulatory factor 8 (IRF8) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to IRF8
RU2612161C2 (ru) 2010-01-06 2017-03-02 Курна, Инк. Лечение заболеваний, связанных с геном развития поджелудочной железы, путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к гену развития поджелудочной железы
WO2011084193A1 (en) 2010-01-07 2011-07-14 Quark Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide compounds comprising non-nucleotide overhangs
NO2524039T3 (cs) 2010-01-11 2018-04-28
US8779118B2 (en) 2010-01-11 2014-07-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Base modified bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
ES2671877T3 (es) 2010-01-25 2018-06-11 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con la RNASA (H1) mediante inhibición del transcrito antisentido natural a RNASA H1
WO2011097388A1 (en) 2010-02-03 2011-08-11 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Selective inhibition of polyglutamine protein expression
WO2011103528A2 (en) 2010-02-22 2011-08-25 Opko Curna Llc Treatment of pyrroline-5-carboxylate reductase 1 (pycr1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to pycr1
KR20130008560A (ko) 2010-03-12 2013-01-22 다이이찌 산쿄 가부시키가이샤 마이크로 ｒｎａ를 이용한 심근 세포의 증식 방법
WO2011115818A1 (en) 2010-03-17 2011-09-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. 5'-substituted bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
US9095504B2 (en) 2010-03-24 2015-08-04 Rxi Pharmaceuticals Corporation RNA interference in ocular indications
WO2011119852A1 (en) 2010-03-24 2011-09-29 Rxi Pharmaceuticals Corporation Reduced size self-delivering rnai compounds
CA2794189C (en) 2010-03-24 2022-01-11 Rxi Pharmaceuticals Corporation Rna interference in dermal and fibrotic indications
CN102869777B (zh) 2010-04-02 2018-11-02 库尔纳公司 通过抑制集落刺激因子3(csf3)的天然反义转录物而治疗csf3相关疾病
WO2011127337A2 (en) 2010-04-09 2011-10-13 Opko Curna Llc Treatment of fibroblast growth factor 21 (fgf21) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to fgf21
WO2011139702A2 (en) 2010-04-28 2011-11-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Modified nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
RU2693462C2 (ru) 2010-05-03 2019-07-03 Курна, Инк. Лечение заболеваний, связанных с сиртуином (sirt), путем ингибирования природного антисмыслового транскрипта к сиртуину (sirt)
TWI586356B (zh) 2010-05-14 2017-06-11 可娜公司 藉由抑制ｐａｒ４天然反股轉錄本治療ｐａｒ４相關疾病
WO2011150005A2 (en) 2010-05-26 2011-12-01 Opko Curna Llc Treatment of atonal homolog 1 (atoh1) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to atoh1
DK2576784T3 (en) 2010-05-26 2018-02-26 Curna Inc TREATMENT OF METHIONIN SULPHOXIDE REDUCTASE A (MSRA) RELATED DISEASES BY INHIBITION OF NATURAL ANTISENCE TRANSCRIPTION TO MSRA
US8957200B2 (en) 2010-06-07 2015-02-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
CN109112126B (zh) 2010-06-23 2024-06-14 库尔纳公司 通过抑制电压门控钠通道α亚基(SCNA)的天然反义转录物而治疗SCNA相关疾病
CN103068982B (zh) 2010-07-14 2017-06-09 库尔纳公司 通过抑制盘状大同系物(dlg)的天然反义转录物而治疗dlg相关疾病
EP2412724A1 (en) 2010-07-29 2012-02-01 Centre National de la Recherche Scientifique (C.N.R.S) Regulation of Glypican 4 activity to modulate the fate of stem cells and uses thereof
US8993533B2 (en) 2010-10-06 2015-03-31 Curna, Inc. Treatment of sialidase 4 (NEU4) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to NEU4
CN103180445B (zh) 2010-10-22 2018-02-16 库尔纳公司 通过抑制α‑L‑艾杜糖醛酸酶(IDUA)的天然反义转录物而治疗IDUA相关疾病
WO2012068340A2 (en) 2010-11-18 2012-05-24 Opko Curna Llc Antagonat compositions and methods of use
US8987225B2 (en) 2010-11-23 2015-03-24 Curna, Inc. Treatment of NANOG related diseases by inhibition of natural antisense transcript to NANOG
TW201307376A (zh) 2010-12-02 2013-02-16 Daiichi Sankyo Co Ltd 經修飾之單股多核苷酸
US10017764B2 (en) 2011-02-08 2018-07-10 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
US9796979B2 (en) 2011-03-03 2017-10-24 Quark Pharmaceuticals Inc. Oligonucleotide modulators of the toll-like receptor pathway
EP2681314B1 (en) 2011-03-03 2017-11-01 Quark Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for treating lung disease and injury
AU2012223366B2 (en) 2011-03-03 2017-02-23 Quark Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide modulators of the toll-like receptor pathway
US10196637B2 (en) 2011-06-08 2019-02-05 Nitto Denko Corporation Retinoid-lipid drug carrier
TWI658830B (zh) 2011-06-08 2019-05-11 日東電工股份有限公司 Ｈｓｐ47表現調控強化用類視色素脂質體
WO2012170771A1 (en) 2011-06-09 2012-12-13 Curna, Inc. Treatment of frataxin (fxn) related diseases by inhibition of natural antisense transcript to fxn
MX340053B (es) 2011-06-15 2016-06-22 Grifols Therapeutics Inc * Metodos, composiciones y kits para determinar el virus de la inmunodeficiencia humana (vih).
US20140303235A1 (en) 2011-08-11 2014-10-09 Isis Pharmaceuticals, Inc. Linkage modified gapped oligomeric compounds and uses thereof
KR101991980B1 (ko) 2011-09-06 2019-06-21 큐알엔에이, 인크. 소형 분자로 전압-개폐된 나트륨 채널 (SCNxA)의 알파 아단위에 관련된 질환의 치료
HK1200484A1 (zh) 2011-09-14 2015-08-07 Translate Bio Ma, Inc. 多聚寡核苷酸化合物
EP2773758B1 (en) 2011-11-03 2017-06-07 Quark Pharmaceuticals, Inc. Compositions for use in neuroprotection
JP2015502365A (ja) 2011-12-12 2015-01-22 オンコイミューニン，インコーポレイティド オリゴヌクレオチドのイン−ビボ送達
US9737480B2 (en) 2012-02-06 2017-08-22 President And Fellows Of Harvard College ARRDC1-mediated microvesicles (ARMMs) and uses thereof
ES2694592T3 (es) 2012-03-15 2018-12-21 Curna, Inc. Tratamiento de enfermedades relacionadas con el factor neurotrófico derivado del cerebro (BDNF) por inhibición del transcrito antisentido natural de BDNF
CA2866392C (en) 2012-03-30 2023-10-24 Washington University Methods for modulating tau expression for reducing seizure and modifying a neurodegenerative syndrome
WO2013154799A1 (en) 2012-04-09 2013-10-17 Isis Pharmaceuticals, Inc. Tricyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
EP2850092B1 (en) 2012-04-09 2017-03-01 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Tricyclic nucleic acid analogs
EP3336189A1 (en) 2012-04-20 2018-06-20 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleotides and uses thereof
JP2015523854A (ja) 2012-05-16 2015-08-20 ラナ セラピューティクス インコーポレイテッド Ｓｍｎ遺伝子ファミリー発現を調節するための組成物及び方法
CN104583398A (zh) 2012-05-16 2015-04-29 Rana医疗有限公司 用于调节基因表达的组合物和方法
CN104583402A (zh) 2012-05-16 2015-04-29 Rana医疗有限公司 用于调节mecp2表达的组合物和方法
US10837014B2 (en) 2012-05-16 2020-11-17 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for modulating SMN gene family expression
JP2013256452A (ja) * 2012-06-11 2013-12-26 Kawaken Fine Chem Co Ltd メラニン産生抑制剤とその組成物
ES2798301T3 (es) * 2012-06-18 2020-12-10 Daiichi Sankyo Co Ltd Intermedio para producción de análogos de nucleósidos, y procedimiento para su producción
WO2014045126A2 (en) 2012-09-18 2014-03-27 Uti Limited Partnership Treatment of pain by inhibition of usp5 de-ubiquitinase
US9695418B2 (en) 2012-10-11 2017-07-04 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Oligomeric compounds comprising bicyclic nucleosides and uses thereof
US9029335B2 (en) 2012-10-16 2015-05-12 Isis Pharmaceuticals, Inc. Substituted 2′-thio-bicyclic nucleosides and oligomeric compounds prepared therefrom
CN104884637A (zh) 2012-11-05 2015-09-02 普隆奈治疗公司 利用生物标志物通过bcl2表达的调节治疗癌症的方法
EP2961853B1 (en) 2013-02-28 2018-09-19 The Board of Regents of The University of Texas System Methods for classifying a cancer as susceptible to tmepai-directed therapies and treating such cancers
WO2014143158A1 (en) 2013-03-13 2014-09-18 The Broad Institute, Inc. Compositions and methods for labeling of agents
BR112015022156A2 (pt) 2013-03-14 2017-11-14 Isis Pharmaceuticals Inc composições e métodos para modular a expressão de tau
US9273349B2 (en) 2013-03-14 2016-03-01 Affymetrix, Inc. Detection of nucleic acids
US9822418B2 (en) 2013-04-22 2017-11-21 Icahn School Of Medicine At Mount Sinai Mutations in PDGFRB and NOTCH3 as causes of autosomal dominant infantile myofibromatosis
PL2992098T3 (pl) 2013-05-01 2019-09-30 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Kompozycje i sposoby modulowania ekspresji hbv i ttr
TWI702046B (zh) * 2013-07-19 2020-08-21 美商Ionis製藥公司 用於調節τ蛋白表現之組合物
EP3052632A4 (en) 2013-10-04 2017-03-29 Rana Therapeutics, Inc. Compositions and methods for treating amyotrophic lateral sclerosis
US11162096B2 (en) 2013-10-14 2021-11-02 Ionis Pharmaceuticals, Inc Methods for modulating expression of C9ORF72 antisense transcript
WO2015075166A1 (en) 2013-11-22 2015-05-28 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Methods and pharmaceutical compositions for treatment of a bacterial infection
JP6772062B2 (ja) 2013-12-02 2020-10-21 フィオ ファーマシューティカルズ コーポレーションＰｈｉｏ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ Ｃｏｒｐ． 癌の免疫療法
US9765332B2 (en) 2014-01-29 2017-09-19 Inserm (Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale) Oligonucleotides and methods for inhibiting or reducing bacterial biofilms
HUE050704T2 (hu) 2014-04-01 2020-12-28 Biogen Ma Inc Összetételek a SOD-1 expressziójának modulálására
US9926556B2 (en) 2014-04-28 2018-03-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Linkage modified oligomeric compounds
CA2947270A1 (en) 2014-04-28 2015-11-05 Rxi Pharmaceuticals Corporation Methods for treating cancer using nucleic acids targeting mdm2 or mycn
CR20160554A (es) 2014-05-01 2017-03-07 Ionis Pharmaceuticals Inc Composiciones y métodos para modular la expresión del factor b del complemento
GB201410693D0 (en) 2014-06-16 2014-07-30 Univ Southampton Splicing modulation
TW201620526A (zh) 2014-06-17 2016-06-16 愛羅海德研究公司 用於抑制α－１抗胰蛋白酶基因表現之組合物及方法
WO2016017422A1 (ja) * 2014-07-31 2016-02-04 国立大学法人大阪大学 架橋型ヌクレオシドおよびヌクレオチド
IL234246A0 (en) 2014-08-21 2014-11-30 Omrix Biopharmaceuticals Ltd Stabilized thrombin
EP3188799B1 (en) 2014-09-05 2022-07-06 Phio Pharmaceuticals Corp. Methods for treating aging and skin disorders using nucleic acids targeting tyr or mmp1
CN107109411B (zh) 2014-10-03 2022-07-01 冷泉港实验室 核基因输出的定向增加
US9816080B2 (en) 2014-10-31 2017-11-14 President And Fellows Of Harvard College Delivery of CAS9 via ARRDC1-mediated microvesicles (ARMMs)
US20170369872A1 (en) 2014-12-18 2017-12-28 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Reversir tm compounds
US9688707B2 (en) 2014-12-30 2017-06-27 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Bicyclic morpholino compounds and oligomeric compounds prepared therefrom
US10793855B2 (en) 2015-01-06 2020-10-06 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating expression of C9ORF72 antisense transcript
WO2016167780A1 (en) 2015-04-16 2016-10-20 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Compositions for modulating expression of c9orf72 antisense transcript
US10808247B2 (en) 2015-07-06 2020-10-20 Phio Pharmaceuticals Corp. Methods for treating neurological disorders using a synergistic small molecule and nucleic acids therapeutic approach
US11001845B2 (en) 2015-07-06 2021-05-11 Phio Pharmaceuticals Corp. Nucleic acid molecules targeting superoxide dismutase 1 (SOD1)
CA3205381A1 (en) 2015-07-17 2017-01-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Multi-targeted single entity conjugates
KR20180043819A (ko) 2015-08-24 2018-04-30 로슈 이노베이션 센터 코펜하겐 에이/에스 Lna-g 방법
CN108603230A (zh) 2015-10-09 2018-09-28 南安普敦大学 基因表达的调节与蛋白质表达失调的筛选
US11021707B2 (en) 2015-10-19 2021-06-01 Phio Pharmaceuticals Corp. Reduced size self-delivering nucleic acid compounds targeting long non-coding RNA
WO2017068087A1 (en) 2015-10-22 2017-04-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotide detection method
EP3371211B1 (en) 2015-11-04 2025-01-01 Icahn School of Medicine at Mount Sinai Rho-associated protein kinase ("rock") inhibitor for treating tumors and cancer, and identifying candidate subjects for such treatment
HK1258434A1 (zh) 2015-11-12 2019-11-08 F. Hoffmann-La Roche Ag 来自灵长类物种的标准化神经元细胞测定试验
EP3389670A4 (en) 2015-12-04 2020-01-08 Ionis Pharmaceuticals, Inc. METHODS OF TREATING BREAST CANCER
US11096956B2 (en) 2015-12-14 2021-08-24 Stoke Therapeutics, Inc. Antisense oligomers and uses thereof
CN116059236A (zh) 2015-12-14 2023-05-05 冷泉港实验室 用于治疗常染色体显性精神发育迟滞5型和Dravet综合征的反义寡聚体
KR20250112919A (ko) 2015-12-21 2025-07-24 노파르티스 아게 타우 발현을 감소시키기 위한 조성물 및 방법
WO2023150553A1 (en) 2022-02-01 2023-08-10 University Of Rochester Gpr17 promoter-based targeting and transduction of glial progenitor cells
CA3013683C (en) 2016-03-14 2021-07-13 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotides for reduction of pd-l1 expression
CA3013799A1 (en) 2016-03-16 2017-09-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Methods of modulating keap1
WO2017161168A1 (en) 2016-03-16 2017-09-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of dyrk1b expression
WO2017178656A1 (en) 2016-04-14 2017-10-19 Roche Innovation Center Copenhagen A/S TRITYL-MONO-GalNAc COMPOUNDS AND THEIR USE
EP3448881B1 (en) 2016-04-26 2023-06-07 Icahn School of Medicine at Mount Sinai Treatment of hippo pathway mutant tumors and methods of identifying subjects as candidates for treatment
AU2017286811A1 (en) 2016-06-17 2018-11-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of gys1 expression
AU2017285350A1 (en) 2016-06-17 2018-12-20 F. Hoffmann-La Roche Ag Nucleic acid molecules for reduction of PAPD5 or PAPD7 mRNA for treating hepatitis B infection
RU2019101298A (ru) 2016-07-01 2020-08-03 Ф. Хоффманн-Ля Рош Аг Антисмысловые олигонуклеотиды для модулирования экспрессии htra1
EP3507367A4 (en) 2016-07-05 2020-03-25 Aduro BioTech, Inc. CYCLIC DINUCLEOTID COMPOUNDS WITH INCLUDED NUCLEIC ACIDS AND USES THEREOF
AU2017296195A1 (en) 2016-07-11 2019-01-24 Translate Bio Ma, Inc. Nucleic acid conjugates and uses thereof
AU2017326372B2 (en) 2016-09-14 2023-12-07 Janssen Biopharma, Inc. Modified oligonucleotides and methods of use
MD3519572T2 (ro) 2016-09-29 2024-03-31 Biogen Ma Inc Compuși și procedee de reducere a expresiei Tau
EP3518981A4 (en) 2016-10-03 2020-06-10 President and Fellows of Harvard College THERAPEUTIC RNA DELIVERY THROUGH ARRDC1 MICROVESICLES
WO2018087200A1 (en) 2016-11-11 2018-05-17 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Therapeutic oligonucleotides capture and detection
US11033570B2 (en) 2016-12-02 2021-06-15 Cold Spring Harbor Laboratory Modulation of Lnc05 expression
KR20190100225A (ko) 2016-12-28 2019-08-28 다이이찌 산쿄 가부시키가이샤 알포트 증후군 치료약
US10450565B2 (en) 2017-01-10 2019-10-22 Arrowhead Pharmaceuticals, Inc. Alpha-1 antitrypsin (AAT) RNAi agents, compositions including AAT RNAi agents, and methods of use
US20190345496A1 (en) 2017-01-13 2019-11-14 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating relb expression
WO2018130584A1 (en) 2017-01-13 2018-07-19 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating nfkb2 expression
EP3568478A1 (en) 2017-01-13 2019-11-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating rel expression
WO2018130581A1 (en) 2017-01-13 2018-07-19 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating rela expression
EP3568479A1 (en) 2017-01-13 2019-11-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides for modulating nfkb1 expression
US11180756B2 (en) 2017-03-09 2021-11-23 Ionis Pharmaceuticals Morpholino modified oligomeric compounds
JP7048574B2 (ja) 2017-03-10 2022-04-05 国立研究開発法人国立成育医療研究センター アンチセンスオリゴヌクレオチドおよび糖原病Ｉａ型予防または治療用組成物
KR102684529B1 (ko) * 2017-03-10 2024-07-12 레이크우드 아메덱스, 인크. 항미생물 화합물, 조성물, 및 그의 용도
US11377468B2 (en) 2017-03-10 2022-07-05 Lakewood Amedex, Inc. Antimicrobial compounds, compositions, and uses thereof
US11795192B2 (en) 2017-03-10 2023-10-24 Lakewood Amedex, Inc. Antimicrobial compounds, compositions, and uses thereof
US12030908B2 (en) 2017-03-10 2024-07-09 Lakewood Amedex, Inc. Antimicrobial compounds, compositions, and uses thereof
JP7306653B2 (ja) 2017-03-17 2023-07-11 国立大学法人千葉大学 構造強化されたＳ－ＴｕＤを用いた新規がん治療法
JP7167059B2 (ja) 2017-04-19 2022-11-08 フィオ ファーマシューティカルズ コーポレーション 核酸化合物の局所送達
WO2018212271A1 (ja) 2017-05-18 2018-11-22 国立大学法人京都大学 脊髄小脳変性症３６型の予防又は治療用組成物
US20190055564A1 (en) 2017-06-01 2019-02-21 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides for modulating htra1 expression
US20200172903A1 (en) 2017-07-05 2020-06-04 Osaka University ENA ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE FOR INHIBITION OF alpha-SYNUCLEIN EXPRESSION
US11028390B2 (en) 2017-07-10 2021-06-08 Osaka University Antisense oligonucleotide controlling expression amount of TDP-43 and use thereof
WO2019030313A2 (en) 2017-08-11 2019-02-14 Roche Innovation Center Copenhagen A/S OLIGONUCLEOTIDES FOR MODULATION OF UBE3C EXPRESSION
CA3071033A1 (en) 2017-08-18 2019-02-21 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulation of the notch signaling pathway for treatment of respiratory disorders
WO2019038228A1 (en) 2017-08-22 2019-02-28 Roche Innovation Center Copenhagen A/S OLIGONUCLEOTIDES FOR MODULATION OF TOM1 EXPRESSION
KR20260009385A (ko) 2017-08-25 2026-01-19 스톡 테라퓨틱스, 인크. 병태 및 질환 치료용 안티센스 올리고머
US10517889B2 (en) 2017-09-08 2019-12-31 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of SMAD7 expression
SG11202002149XA (en) 2017-09-14 2020-04-29 Janssen Biopharma Inc Galnac derivatives
CN111226114A (zh) 2017-10-13 2020-06-02 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 用部分立体限定的寡核苷酸子文库鉴定反义寡核苷酸改进的立体限定硫代磷酸酯寡核苷酸变体的方法
KR20200030594A (ko) 2017-10-16 2020-03-20 에프. 호프만-라 로슈 아게 B형 간염 감염을 치료하기 위한 PAPD5 및 PAPD7 mRNA의 감소용 핵산 분자
EP3697904A1 (en) 2017-10-17 2020-08-26 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Combination treatment for cystic fibrosis
WO2019111791A1 (ja) * 2017-12-07 2019-06-13 第一三共株式会社 ジストロフィン遺伝子のイントロンリテンションを解消するアンチセンスオリゴヌクレオチド
WO2019115416A2 (en) 2017-12-11 2019-06-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating fndc3b expression
WO2019115417A2 (en) 2017-12-12 2019-06-20 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating rb1 expression
CA3085211A1 (en) 2017-12-21 2019-06-27 F. Hoffmann-La Roche Ag Companion diagnostic for htra1 rna antagonists
US20200339982A1 (en) 2017-12-22 2020-10-29 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides comprising a phosphorodithioate internucleoside linkage
CN111448316B (zh) 2017-12-22 2025-02-14 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 新的硫代亚磷酰胺
CN111448317B (zh) 2017-12-22 2025-07-04 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 包含二硫代磷酸酯核苷间键的缺口聚物寡核苷酸
WO2019140102A1 (en) 2018-01-10 2019-07-18 Translate Bio Ma, Inc. Compositions and methods for facilitating delivery of synthetic nucleic acids to cells
CN111699258A (zh) 2018-01-10 2020-09-22 哥本哈根罗氏创新中心 用于调控pias4表达的寡核苷酸
EP3737759A1 (en) 2018-01-12 2020-11-18 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Alpha-synuclein antisense oligonucleotides and uses thereof
MY203356A (en) 2018-01-12 2024-06-25 Bristol Myers Squibb Co Antisense oligonucleotides targeting alpha-synuclein and uses thereof
WO2019140236A1 (en) 2018-01-12 2019-07-18 Bristol-Myers Squibb Company Antisense oligonucleotides targeting alpha-synuclein and uses thereof
US20210095275A1 (en) 2018-01-12 2021-04-01 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating gsk3b expression
WO2019141656A1 (en) 2018-01-17 2019-07-25 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating erc1 expression
EP3740573A1 (en) 2018-01-18 2020-11-25 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting srebp1
WO2019145386A1 (en) 2018-01-26 2019-08-01 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating csnk1d expression
BR112020016170A2 (pt) 2018-02-09 2020-12-15 Genentech, Inc. Oligonucleotídeos terapêutico e antissenso, conjugado, sal farmaceuticamente aceitável, composição farmacêutica, método in vitro ou in vivo para modular a expressão de tmem106b, método para tratar ou prevenir uma doença, uso do oligonucleotídeo e uso ou método
WO2019165067A1 (en) 2018-02-21 2019-08-29 Bristol-Myers Squibb Company Camk2d antisense oligonucleotides and uses thereof
WO2019172286A1 (ja) 2018-03-09 2019-09-12 第一三共株式会社 糖原病Ｉａ型治療薬
SG11202008895WA (en) 2018-03-13 2020-10-29 Janssen Pharmaceutica Nv Modified oligonucleotides for use in treatment of tauopathies
MA52661A (fr) 2018-04-05 2021-02-17 Centre Leon Berard Utilisation d'inhibiteurs de fubp1 dans le traitement d'une infection par le virus de l'hépatite b
JP2021523227A (ja) 2018-05-04 2021-09-02 ストーク セラピューティクス，インク． コレステリルエステル蓄積症の処置のための方法及び組成物
JP2021522815A (ja) 2018-05-07 2021-09-02 ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス 超並列シーケンシングを用いるｌｎａオリゴヌクレオチド治療法の品質管理法
CA3098623A1 (en) 2018-05-07 2019-11-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Extrahepatic delivery
US20210371860A1 (en) 2018-05-08 2021-12-02 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides for modulating myh7 expression
JP2021524450A (ja) 2018-05-18 2021-09-13 エフ．ホフマン−ラ ロシュ アーゲーＦ． Ｈｏｆｆｍａｎｎ−Ｌａ Ｒｏｃｈｅ Ａｋｔｉｅｎｇｅｓｅｌｌｓｃｈａｆｔ マイクロｒｎａ関連疾患の処置のための薬学的組成物
WO2019224172A1 (en) 2018-05-25 2019-11-28 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Novel process for making allofuranose from glucofuranose
EP3802824A1 (en) 2018-06-05 2021-04-14 F. Hoffmann-La Roche AG Oligonucleotides for modulating atxn2 expression
CA3102236A1 (en) 2018-06-13 2019-12-19 Daiichi Sankyo Company, Limited Myocardial dysfunction therapeutic agent
CN112566640A (zh) 2018-06-18 2021-03-26 罗切斯特大学 治疗精神分裂症和其他神经精神病症的方法
US12303549B2 (en) 2018-06-21 2025-05-20 University Of Rochester Methods of treating or inhibiting onset of Huntington's disease
WO2020007772A1 (en) 2018-07-02 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting gbp-1
WO2020007702A1 (en) 2018-07-02 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting bcl2l11
WO2020007700A1 (en) 2018-07-02 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting spi1
TWI862501B (zh) 2018-07-03 2024-11-21 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 用於調制 Tau 表現之寡核苷酸
EP3819378A4 (en) 2018-07-04 2022-09-14 Aichi Medical University OLIGONUCLEOTIDES FOR CONTROL OF TAU SPLICING AND THEIR USES
WO2020007826A1 (en) 2018-07-05 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting mbtps1
WO2020007889A1 (en) 2018-07-05 2020-01-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting stat1
WO2020011743A1 (en) 2018-07-09 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting mafb
WO2020011653A1 (en) 2018-07-09 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting kynu
WO2020011869A2 (en) 2018-07-11 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting tlr2
WO2020011745A2 (en) 2018-07-11 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting cers6
WO2020011744A2 (en) 2018-07-11 2020-01-16 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting cers5
BR112021000538A2 (pt) 2018-07-13 2021-04-06 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotídeos para modular a expressão de rtel1
CA3098267A1 (en) 2018-07-31 2020-02-06 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Oligonucleotides comprising a phosphorotrithioate internucleoside linkage
BR112021001756A2 (pt) 2018-07-31 2021-05-11 Roche Innovation Center Copenhagen A/S oligonucleotídeos, oligonucleotídeo gapmer, sal farmaceuticamente aceitável, conjugado, composição farmacêutica, usos de um oligonucleotídeo, método para o tratamento ou profilaxia de uma doença, processo para a fabricação de um oligonucleotídeo e invenção
US12018087B2 (en) 2018-08-02 2024-06-25 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle-targeting complexes comprising an anti-transferrin receptor antibody linked to an oligonucleotide and methods of delivering oligonucleotide to a subject
EP3830259A4 (en) 2018-08-02 2022-05-04 Dyne Therapeutics, Inc. MUSCLE TARGETED COMPLEXES AND THEIR USES IN THE TREATMENT OF FACIOSCAPULOHUMERAL MUSCULAR DYSTROPHY
US12097263B2 (en) 2018-08-02 2024-09-24 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy
US11911484B2 (en) 2018-08-02 2024-02-27 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy
EP3841220A1 (en) 2018-08-23 2021-06-30 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Microrna-134 biomarker
WO2020038971A1 (en) 2018-08-23 2020-02-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting vcan
WO2020038973A1 (en) 2018-08-23 2020-02-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting sptlc1
WO2020038976A1 (en) 2018-08-23 2020-02-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Antisense oligonucleotides targeting usp8
US20220160870A1 (en) 2018-08-28 2022-05-26 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Neoantigen engineering using splice modulating compounds
EP3620519A1 (en) 2018-09-04 2020-03-11 F. Hoffmann-La Roche AG Use of isolated milk extracellular vesicles for delivering oligonucleotides orally
CA3114396A1 (en) 2018-09-28 2020-04-02 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Transthyretin (ttr) irna compositions and methods of use thereof for treating or preventing ttr-associated ocular diseases
CN112839662A (zh) 2018-10-17 2021-05-25 莱克伍德阿美达克斯股份有限公司 用于治疗口腔粘膜炎的方法和组合物
JP2022512877A (ja) 2018-11-01 2022-02-07 エフ．ホフマン－ラ ロシュ アーゲー Ｔｉａ１を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
TW202028222A (zh) 2018-11-14 2020-08-01 美商Ionis製藥公司 Foxp3表現之調節劑
MX2021005758A (es) 2018-11-15 2021-09-21 Ionis Pharmaceuticals Inc Moduladores de la expresión de irf5.
WO2020104492A1 (en) 2018-11-22 2020-05-28 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Pyridinium salts as activators in the synthesis of stereodefined oligonucleotides
WO2020109343A1 (en) 2018-11-29 2020-06-04 F. Hoffmann-La Roche Ag Combination therapy for treatment of macular degeneration
WO2020109344A1 (en) 2018-11-29 2020-06-04 F. Hoffmann-La Roche Ag Occular administration device for antisense oligonucleotides
AU2019396450B2 (en) 2018-12-11 2025-08-28 University Of Rochester Methods of treating schizophrenia and other neuropsychiatric disorders
JP2022514648A (ja) 2018-12-21 2022-02-14 ベーリンガー インゲルハイム インターナショナル ゲゼルシャフト ミット ベシュレンクテル ハフツング Ｃａｒｄ９を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
CN113365607A (zh) 2019-01-25 2021-09-07 豪夫迈·罗氏有限公司 用于口服药物递送的脂质囊泡
TW202214854A (zh) * 2019-01-31 2022-04-16 美商Ionis製藥公司 Yap1表現之調節劑
EP3923962A2 (en) 2019-02-13 2021-12-22 University of Rochester Gene networks that mediate remyelination of the human brain
MX2021009950A (es) 2019-02-20 2021-09-21 Roche Innovation Ct Copenhagen As Oligonucleotidos gapmeros de fosfonoacetato.
WO2020169696A1 (en) 2019-02-20 2020-08-27 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Novel phosphoramidites
JP7503072B2 (ja) 2019-02-26 2024-06-19 ロシュ イノベーション センター コペンハーゲン エーエス オリゴヌクレオチドの製剤化方法
WO2020176771A1 (en) 2019-02-27 2020-09-03 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Modulators of malat1 expression
KR20210134003A (ko) 2019-02-27 2021-11-08 스톡 테라퓨틱스, 인크. 병태 및 질환의 치료를 위한 안티센스 올리고머
US12215382B2 (en) 2019-03-01 2025-02-04 The General Hospital Corporation Liver protective MARC variants and uses thereof
WO2020178258A1 (en) 2019-03-05 2020-09-10 F. Hoffmann-La Roche Ag Intracellular targeting of molecules
KR20210141554A (ko) 2019-03-21 2021-11-23 코디악 바이오사이언시즈, 인크. 세포외 소포 접합체 및 이의 용도
JP7413362B2 (ja) 2019-03-29 2024-01-15 シスメックス株式会社 新規人工核酸、その製造方法及び用途
JP7725370B2 (ja) 2019-04-03 2025-08-19 ブリストル－マイヤーズ スクイブ カンパニー Ａｎｇｐｔｌ２アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびその使用
US11286485B2 (en) 2019-04-04 2022-03-29 Hoffmann-La Roche Inc. Oligonucleotides for modulating ATXN2 expression
WO2020201339A1 (en) 2019-04-04 2020-10-08 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotides for modulating atxn2 expression
CN113661168A (zh) 2019-04-16 2021-11-16 罗氏创新中心哥本哈根有限公司 用于制备核苷酸p(v)单体的新方法
EP3962918A1 (en) 2019-04-30 2022-03-09 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Novel process for preparing rhenium chelated mag3 oligonucleotides
WO2020226960A1 (en) 2019-05-03 2020-11-12 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Double-stranded nucleic acid inhibitor molecules with shortened sense strands
WO2020236600A1 (en) 2019-05-17 2020-11-26 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Oral delivery of oligonucleotides
WO2020245233A1 (en) 2019-06-06 2020-12-10 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides targeting atxn3
AU2020286462B2 (en) 2019-06-06 2026-07-02 Arrowhead Pharmaceuticals, Inc. Methods for the treatment of alpha-1 antitrypsin deficiency (AATD)
CN113924308B (zh) * 2019-06-19 2024-09-13 雅玛山酱油株式会社 交联型核苷中间体的结晶及其制造方法以及交联型核苷亚磷酰胺的制造方法
EP3995153A4 (en) 2019-06-26 2023-11-22 KNC Laboratories Co., Ltd. Nucleic acid drug suppressing production of myostatin gene mrna
US20220251567A1 (en) 2019-07-10 2022-08-11 Inserm (Institut National De La Santè Et De La Recherche Médicale) Methods for the treatment of epilepsy
JP7627495B2 (ja) 2019-07-12 2025-02-06 学校法人東海大学 ＤＵＸ４ ｐｒｅ－ｍＲＮＡのスプライシングを変化させるアンチセンスオリゴヌクレオチド
WO2021011936A2 (en) 2019-07-18 2021-01-21 University Of Rochester Cell-type selective immunoprotection of cells
PL3956450T3 (pl) 2019-07-26 2025-12-22 Ionis Pharmaceuticals, Inc. Związki i sposoby modulowania gfap
EP4013878A1 (en) 2019-08-14 2022-06-22 Codiak BioSciences, Inc. Extracellular vesicle-aso constructs targeting cebp/beta
EP4013872A1 (en) 2019-08-14 2022-06-22 Codiak BioSciences, Inc. Extracellular vesicles with antisense oligonucleotides targeting kras
CA3147365A1 (en) 2019-08-14 2021-02-18 Joanne LIM Extracellular vesicle-nlrp3 antagonist
CN120771302A (zh) 2019-08-14 2025-10-14 隆萨销售股份公司 与分子连接的细胞外囊泡及其用途
CN114729327A (zh) 2019-08-14 2022-07-08 科迪亚克生物科学公司 具有stat3反义寡核苷酸的细胞外囊泡
CN114729356A (zh) 2019-08-14 2022-07-08 科迪亚克生物科学公司 靶向stat6的细胞外囊泡-aso构建体
KR20220062517A (ko) 2019-08-15 2022-05-17 아이오니스 파마수티컬즈, 인코포레이티드 결합 변형된 올리고머 화합물 및 이의 용도
IL291251B2 (en) 2019-09-10 2026-06-01 Daiichi Sankyo Co Limited CONJUGATE OF GalNAC-OLIGONUCLEOTIDE FOR DELIVERY TO LIVER AND MANUFACTURING METHOD THEREOF
EP4034247A1 (en) 2019-09-25 2022-08-03 Codiak BioSciences, Inc. Sting agonist comprising exosomes for treating neuroimmunological disorders
EP4034088A4 (en) 2019-09-26 2023-10-11 President and Fellows of Harvard College Minimal arrestin domain containing protein 1 (arrdc1) constructs
WO2021074657A1 (en) 2019-10-17 2021-04-22 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Combination treatment for cystic fibrosis
EP4047005A4 (en) * 2019-10-18 2024-03-06 Daiichi Sankyo Company, Limited PROCESS FOR MANUFACTURING BICYCLIC PHOSPHORAMIDITE
US20240148891A1 (en) 2019-10-18 2024-05-09 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy
CN111109591A (zh) 2019-10-25 2020-05-08 新疆红旗坡农业发展集团有限公司 肠道微生态高效重建型苹果酵素及加工技术
EP4055165A1 (en) 2019-11-06 2022-09-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Transthyretin (ttr) irna compositions and methods of use thereof for treating or preventing ttr-associated ocular diseases
WO2021092371A2 (en) 2019-11-06 2021-05-14 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Extrahepatic delivery
WO2021099394A1 (en) 2019-11-19 2021-05-27 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Antisense oligonucleotides and their use for the treatment of cancer
WO2021122910A1 (en) 2019-12-19 2021-06-24 F. Hoffmann-La Roche Ag Use of sbds inhibitors for treating hepatitis b virus infection
EP4058032A4 (en) 2019-12-19 2024-01-10 Entrada Therapeutics, Inc. Compositions for delivery of antisense compounds
CN114867856A (zh) 2019-12-19 2022-08-05 豪夫迈·罗氏有限公司 Saraf抑制剂用于治疗乙型肝炎病毒感染的用途
WO2021122921A1 (en) 2019-12-19 2021-06-24 F. Hoffmann-La Roche Ag Use of cops3 inhibitors for treating hepatitis b virus infection
JP2023506540A (ja) 2019-12-19 2023-02-16 エフ． ホフマン－ラ ロシュ エージー． Ｂ型肝炎ウイルス感染を処置するためのｓｃａｍｐ３阻害剤の使用
JP7634542B2 (ja) 2019-12-19 2025-02-21 エフ． ホフマン－ラ ロシュ アーゲー Ｂ型肝炎ウイルス感染症を処置するためのｓｅｐｔ９阻害剤の使用
WO2021123086A1 (en) 2019-12-20 2021-06-24 F. Hoffmann-La Roche Ag Enhanced oligonucleotides for inhibiting scn9a expression
EP4081639A1 (en) 2019-12-24 2022-11-02 F. Hoffmann-La Roche AG Pharmaceutical combination of a therapeutic oligonucleotide targeting hbv and a tlr7 agonist for treatment of hbv
EP4081217A1 (en) 2019-12-24 2022-11-02 F. Hoffmann-La Roche AG Pharmaceutical combination of antiviral agents targeting hbv and/or an immune modulator for treatment of hbv
JP7858532B2 (ja) 2020-01-10 2026-05-14 ダイン セラピューティクス，インコーポレーテッド 筋肉標的複合体および筋肉の健康に関連する遺伝子のモジュレーションのためのその使用
WO2021158810A1 (en) 2020-02-05 2021-08-12 Bristol-Myers Squibb Company Oligonucleotides for splice modulation of camk2d
EP4110916A1 (en) 2020-02-28 2023-01-04 F. Hoffmann-La Roche AG Oligonucleotides for modulating cd73 exon 7 splicing
EP4119167A4 (en) 2020-03-11 2025-08-06 Biocomber Co Ltd SINGLE-STRANDED NUCLEIC ACID MOLECULE FOR INDUCING FRAME SHIFT-1 AND COMPOSITION
WO2021184021A1 (en) 2020-03-13 2021-09-16 Codiak Biosciences, Inc. Extracellular vesicle-aso constructs targeting pmp22
WO2021184020A1 (en) 2020-03-13 2021-09-16 Codiak Biosciences, Inc. Methods of treating neuroinflammation
US12649761B2 (en) 2020-03-31 2026-06-09 Janssen Biopharma, Inc. Synthesis of oligonucleotides and related compounds
CN115551519A (zh) 2020-05-11 2022-12-30 基因泰克公司 用于治疗神经系统疾病的补体组分c1s抑制剂以及相关的组合物、系统和使用它们的方法
CN115698290A (zh) 2020-05-11 2023-02-03 基因泰克公司 用于治疗神经系统疾病的补体组分4抑制剂以及使用它们的相关组合物、系统和方法
US12338437B2 (en) 2020-05-11 2025-06-24 Stoke Therapeutics, Inc. OPA1 antisense oligomers for treatment of conditions and diseases
CN115605592A (zh) 2020-05-11 2023-01-13 基因泰克公司（Us） 用于治疗神经系统疾病的补体组分c1r抑制剂以及相关的组合物、系统和使用它们的方法
WO2021229036A1 (en) 2020-05-13 2021-11-18 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotide agonists targeting progranulin
US20230193269A1 (en) 2020-05-22 2023-06-22 Boehringer Ingelheim International Gmbh Oligonucleotides for splice modulation of card9
EP4162047A1 (en) 2020-06-09 2023-04-12 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Guanosine analogues for use in therapeutic polynucleotides
AR122731A1 (es) 2020-06-26 2022-10-05 Hoffmann La Roche Oligonucleótidos mejorados para modular la expresión de fubp1
KR20230050336A (ko) 2020-07-10 2023-04-14 인스티튜트 내셔널 드 라 싼테 에 드 라 리셰르셰 메디칼르 (인 썸) 뇌전증을 치료하기 위한 방법과 조성물
US11969475B2 (en) 2021-07-09 2024-04-30 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating facioscapulohumeral muscular dystrophy
WO2022018155A1 (en) 2020-07-23 2022-01-27 F. Hoffmann-La Roche Ag Lna oligonucleotides for splice modulation of stmn2
EP4185696A1 (en) 2020-07-23 2023-05-31 F. Hoffmann-La Roche AG Oligonucleotides targeting rna binding protein sites
US11633498B2 (en) 2021-07-09 2023-04-25 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy
WO2022024833A1 (ja) 2020-07-28 2022-02-03 神戸天然物化学株式会社 アンギオテンシン変換酵素２遺伝子のエクソンのスキッピングを誘導するアンチセンス核酸
JP2023538630A (ja) 2020-08-21 2023-09-08 エフ． ホフマン－ラ ロシュ アーゲー Ｂ型肝炎ウイルス感染症を処置するためのａ１ｃｆ阻害剤の使用
WO2022043531A1 (en) * 2020-08-28 2022-03-03 Janssen Sciences Ireland Unlimited Company 7'-substituted 2'-o-4'-c-ethylene-bridged nucleic acid (ena) monomers and uses thereof
EP4219517A4 (en) 2020-09-25 2024-09-25 Riken Genesis Co., Ltd. NOVEL ARTIFICIAL NUCLEIC ACID, METHOD FOR PRODUCING THE SAME AND USE THEREOF
WO2022076596A1 (en) 2020-10-06 2022-04-14 Codiak Biosciences, Inc. Extracellular vesicle-aso constructs targeting stat6
WO2022117745A1 (en) 2020-12-03 2022-06-09 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides targeting atxn3
TW202237843A (zh) 2020-12-03 2022-10-01 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 靶向ａｔｘｎ３之反義寡核苷酸
KR20230117182A (ko) 2020-12-04 2023-08-07 다인 세라퓨틱스, 인크. 항체-올리고뉴클레오티드 복합체 및 그의 용도
EP4259642A1 (en) 2020-12-08 2023-10-18 F. Hoffmann-La Roche AG Novel synthesis of phosphorodithioate oligonucleotides
EP4263831A1 (en) 2020-12-18 2023-10-25 F. Hoffmann-La Roche AG Antisense oligonucleotides for targeting progranulin
CN116670282A (zh) 2020-12-22 2023-08-29 豪夫迈·罗氏有限公司 靶向xbp1的寡核苷酸
US20240343746A1 (en) 2020-12-31 2024-10-17 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Cyclic-disulfide modified phosphate based oligonucleotide prodrugs
AU2021414227A1 (en) 2020-12-31 2023-07-06 Dyne Therapeutics, Inc. Muscle targeting complexes and uses thereof for treating myotonic dystrophy
US20240336914A1 (en) 2020-12-31 2024-10-10 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. 2'-modified nucleoside based oligonucleotide prodrugs
TW202246500A (zh) 2021-02-02 2022-12-01 瑞士商赫孚孟拉羅股份公司 用於抑制 ｒｔｅｌ１ 表現之增強型寡核苷酸
EP4294456A1 (en) 2021-02-17 2023-12-27 Lonza Sales AG Extracellular vesicle linked to a biologically active molecule via an optimized linker and an anchoring moiety
JP2024512236A (ja) 2021-02-17 2024-03-19 ロンザ セールス アーゲー 細胞外ベシクル－ｎｌｒｐ３アンタゴニスト
US20240229036A9 (en) 2021-02-26 2024-07-11 Knc Laboratories Co., Ltd. Nucleic acid medicine expressing splicing variant of myostatin
KR20240009393A (ko) 2021-03-31 2024-01-22 엔트라다 테라퓨틱스, 인크. 사이클릭 세포 침투 펩티드
CA3213989A1 (en) 2021-04-01 2022-10-06 Conlin O'NEIL Extracellular vesicle compositions
JP2024518476A (ja) 2021-05-10 2024-05-01 エントラーダ セラピューティクス，インコーポレイティド ｍＲＮＡスプライシングを調節するための組成物及び方法
IL308353A (en) 2021-05-10 2024-01-01 Entrada Therapeutics Inc Compositions and methods for modulating tissue distribution of intracellular therapies
US20250051393A1 (en) 2021-05-10 2025-02-13 Entrada Therapeutics, Inc. Compositions and methods for modulating interferon regulatory factor-5 (irf-5) activity
CA3222546A1 (en) 2021-06-08 2022-12-15 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotide progranulin agonists
AU2022298774A1 (en) 2021-06-23 2023-12-14 Entrada Therapeutics, Inc. Antisense compounds and methods for targeting cug repeats
WO2023283403A2 (en) 2021-07-09 2023-01-12 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Bis-rnai compounds for cns delivery
IL309897A (en) 2021-07-21 2024-03-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Target gene IRNA compositions associated with a metabolic disorder and methods of using them
EP4388094A1 (en) 2021-08-16 2024-06-26 Vib Vzw Oligonucleotides for modulating synaptogyrin-3 expression
WO2023026994A1 (ja) 2021-08-21 2023-03-02 武田薬品工業株式会社 ヒトトランスフェリンレセプター結合ペプチド－薬物コンジュゲート
EP4395829A1 (en) 2021-09-01 2024-07-10 Entrada Therapeutics, Inc. Compounds and methods for skipping exon 44 in duchenne muscular dystrophy
CN118019848A (zh) 2021-09-29 2024-05-10 豪夫迈·罗氏有限公司 Rna编辑
EP4416284A1 (en) 2021-10-15 2024-08-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Extra-hepatic delivery irna compositions and methods of use thereof
WO2023078883A1 (en) 2021-11-03 2023-05-11 F. Hoffmann-La Roche Ag Oligonucleotides for modulating apolipoprotein e4 expression
AU2022384619A1 (en) 2021-11-11 2024-04-11 F. Hoffmann-La Roche Ag Pharmaceutical combinations for treatment of hbv
CN118434858A (zh) 2021-12-07 2024-08-02 豪夫迈·罗氏有限公司 靶向actl6b的反义寡核苷酸
EP4448763A1 (en) 2021-12-17 2024-10-23 F. Hoffmann-La Roche AG Oligonucleotide gba agonists
CN119095603A (zh) 2021-12-17 2024-12-06 豪夫迈·罗氏有限公司 用于调节rtel1和fubp1的寡核苷酸的组合
JP2024547071A (ja) 2021-12-20 2024-12-26 エフ． ホフマン－ラ ロシュ アーゲー トレオース核酸アンチセンスオリゴヌクレオチドおよびその方法
WO2023122762A1 (en) 2021-12-22 2023-06-29 Camp4 Therapeutics Corporation Modulation of gene transcription using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas
WO2023127857A1 (ja) 2021-12-27 2023-07-06 株式会社理研ジェネシス 新規人工核酸、その製造方法及び用途
WO2023141507A1 (en) 2022-01-20 2023-07-27 Genentech, Inc. Antisense oligonucleotides for modulating tmem106b expression
WO2023152369A1 (en) 2022-02-14 2023-08-17 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Nucleic acid mir-9 inhibitor for the treatment of cystic fibrosis
AR128558A1 (es) 2022-02-21 2024-05-22 Hoffmann La Roche Oligonucleótido antisentido
EP4495241A1 (en) 2022-03-16 2025-01-22 Daiichi Sankyo Company, Limited Chemically-modified oligonucleotide having rnai activity
IL315659A (en) 2022-03-16 2024-11-01 Daiichi Sankyo Co Ltd siRNA FOR SUPPRESSING EXPRESSION OF TRANSFERRIN RECEPTOR-2
IL316143A (en) 2022-04-15 2024-12-01 Dyne Therapeutics Inc Muscle targeting complexes and formulations for the treatment of myotonic dystrophy
JP2025516554A (ja) 2022-05-10 2025-05-30 エフ． ホフマン－ラ ロシュ アーゲー Ｃｆｐ－ｅｌｋ１遺伝子間領域を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
EP4522742A2 (en) 2022-05-13 2025-03-19 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Single-stranded loop oligonucleotides
PE20250394A1 (es) 2022-05-18 2025-02-11 Hoffmann La Roche Oligonucleotidos mejorados que actuan sobre sitios de proteina de union a arn
KR20250022763A (ko) 2022-06-10 2025-02-17 캠프4 테라퓨틱스 코포레이션 조절 rna를 표적으로 하는 안티센스 올리고뉴클레오타이드를 사용하여 프로그래뉼린 발현을 조절하는 방법
WO2023242324A1 (en) 2022-06-17 2023-12-21 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides for targeting progranulin
EP4547683A2 (en) 2022-06-30 2025-05-07 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Cyclic-disulfide modified phosphate based oligonucleotide prodrugs
WO2024017990A1 (en) 2022-07-21 2024-01-25 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Methods and compositions for treating chronic pain disorders
CN120659627A (zh) 2022-07-29 2025-09-16 瑞泽恩制药公司 用于转铁蛋白受体（tfr）介导的脑和肌肉递送的组合物和方法
US20260049309A1 (en) 2022-08-15 2026-02-19 Novo Nordisk A/S Regulation of activity of rnai molecules
WO2024039776A2 (en) 2022-08-18 2024-02-22 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Universal non-targeting sirna compositions and methods of use thereof
EP4332221A1 (en) 2022-08-29 2024-03-06 Roche Innovation Center Copenhagen A/S Threose nucleic acid antisense oligonucleotides and methods thereof
JP2025529283A (ja) 2022-09-06 2025-09-04 エフ． ホフマン－ラ ロシュ アーゲー 眼への投与のための二本鎖ｒｎａ分子
JP2025532985A (ja) 2022-09-30 2025-10-03 アルナイラム ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド 修飾二本鎖ｒｎａ剤
US20260166072A1 (en) 2022-11-04 2026-06-18 Genkardia Inc. Oligonucleotide-based therapeutics targeting cyclin d2 for the treatment of heart failure
AU2023371614A1 (en) 2022-11-04 2025-05-15 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Calcium voltage-gated channel auxiliary subunit gamma 1 (cacng1) binding proteins and cacng1-mediated delivery to skeletal muscle
AU2023379457A1 (en) 2022-11-14 2025-05-15 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Compositions and methods for fibroblast growth factor receptor 3-mediated delivery to astrocytes
EP4627084A1 (en) 2022-12-01 2025-10-08 Camp4 Therapeutics Corporation Modulation of syngap1 gene transcription using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas
WO2024126654A1 (en) 2022-12-14 2024-06-20 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides targeting actl6b
WO2024146935A1 (en) 2023-01-06 2024-07-11 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Intravenous administration of antisense oligonucleotides for the treatment of pain
WO2024160756A1 (en) 2023-01-30 2024-08-08 Vib Vzw Suppressors of tauopathies
IL322261A (en) 2023-02-09 2025-09-01 Alnylam Pharmaceuticals Inc Reverser molecules and methods of using them
WO2024175586A2 (en) 2023-02-21 2024-08-29 Vib Vzw Inhibitors of synaptogyrin-3 expression
WO2024175588A1 (en) 2023-02-21 2024-08-29 Vib Vzw Oligonucleotides for modulating synaptogyrin-3 expression
JP2026514045A (ja) 2023-04-12 2026-05-01 アルナイラム ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド 二本鎖ｒｎａ剤の肝外デリバリー
CN121263524A (zh) 2023-05-04 2026-01-02 豪夫迈·罗氏有限公司 能够上调葡糖脑苷脂酶表达的寡核苷酸
WO2024233864A2 (en) 2023-05-10 2024-11-14 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Galnac-conjugated rnai oligonucleotides
WO2024238385A2 (en) 2023-05-12 2024-11-21 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Single-stranded loop oligonucleotides
KR20260026070A (ko) 2023-06-16 2026-02-25 에프. 호프만-라 로슈 아게 Jak1 발현 조절을 위한 이중 가닥 올리고뉴클레오티드
WO2025008406A1 (en) 2023-07-04 2025-01-09 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Antisense oligonucleotides and their use for the treatment of cancer
WO2025047679A1 (ja) 2023-08-25 2025-03-06 学校法人福岡大学 リン酸部修飾を導入した安定型標的編集ガイドｒｎａ
WO2025054459A1 (en) 2023-09-08 2025-03-13 Dicerna Pharmaceuticals, Inc. Rnai oligonucleotide conjugates
WO2025064660A2 (en) 2023-09-21 2025-03-27 Alnylam Pharmaceuticals, Inc. Activin a receptor type 1c (acvr1c) irna compositions and methods of use thereof
AR134762A1 (es) 2023-12-21 2026-04-01 Hoffmann La Roche Oligonucleótido antisentido
CN117510564B (zh) * 2024-01-08 2024-03-08 苏州诺维康生物科技有限公司 一种医药中间体N2-Ac-5'-O-DMT-2'-O-炔丙基鸟苷的合成方法
WO2025237990A1 (en) 2024-05-14 2025-11-20 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Antisense oligonucleotides and their use for the treatment of pulmonary fibrosis
WO2025252669A1 (en) 2024-06-03 2025-12-11 Evotec International Gmbh Modified oligonucleotides for reducing atxn3 expression
WO2025255388A1 (en) 2024-06-05 2025-12-11 Camp4 Therapeutics Corporation Modulation of syngap1 gene transcription using antisense oligonucleotides targeting regulatory rnas
WO2026041784A1 (en) 2024-08-23 2026-02-26 Vib Vzw Oligonucleotides for modulating synaptogyrin-3 expression
EP4711455A1 (en) 2024-09-11 2026-03-18 Aarhus Universitet Small artificial rna (smartrna) oligonucleotide for modulating protein expression
WO2026061986A1 (en) 2024-09-17 2026-03-26 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Antisense oligonucleotide (aso)-mediated down-regulation of cd33 to safely enrich for genetically modified cells
EP4763209A1 (en) 2024-12-17 2026-06-24 Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale Use of (alpha)s-setmar agonist for preventing or treating glioblastoma
WO2026132147A1 (en) 2024-12-20 2026-06-25 F. Hoffmann-La Roche Ag Antisense oligonucleotides targeting downstream of the transcripts 3' terminus
WO2026151811A1 (en) 2025-01-07 2026-07-16 Camp4 Therapeutics Corporation Compositions and methods for treating urea cycle disorders

Family Cites Families (42)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3687808A (en) 1969-08-14 1972-08-29 Univ Leland Stanford Junior Synthetic polynucleotides
NZ209840A (en) 1983-10-17 1988-11-29 Kaji Akira A method of inhibiting viral propagation by hybridising dna with the viral rna thus blocking its action
US4806463A (en) 1986-05-23 1989-02-21 Worcester Foundation For Experimental Biology Inhibition of HTLV-III by exogenous oligonucleotides
US5194428A (en) 1986-05-23 1993-03-16 Worcester Foundation For Experimental Biology Inhibition of influenza virus replication by oligonucleotide phosphorothioates
US5004810A (en) 1988-09-30 1991-04-02 Schering Corporation Antiviral oligomers
US5457189A (en) 1989-12-04 1995-10-10 Isis Pharmaceuticals Antisense oligonucleotide inhibition of papillomavirus
US5620963A (en) 1991-10-15 1997-04-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating protein kinase C having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5514788A (en) 1993-05-17 1996-05-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide modulation of cell adhesion
US5591623A (en) 1990-08-14 1997-01-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide modulation of cell adhesion
US5514577A (en) 1990-02-26 1996-05-07 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide therapies for modulating the effects of herpes viruses
US5248670A (en) 1990-02-26 1993-09-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotides for inhibiting herpesviruses
US5166195A (en) 1990-05-11 1992-11-24 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense inhibitors of the human immunodeficiency virus phosphorothioate oligonucleotides
JPH06501843A (ja) 1990-08-14 1994-03-03 アイシス・ファーマシューティカルス・インコーポレーテッド アンチセンスオリゴヌクレオチドによるインフルエンザａ型ウイルス，アン・アーバｈ２ｎ２株の阻害
US6111094A (en) 1990-08-14 2000-08-29 Isis Pharmaceuticals Inc. Enhanced antisense modulation of ICAM-1
US5442049A (en) 1992-11-19 1995-08-15 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating the effects of cytomegalovirus infections
US5691461A (en) 1990-08-16 1997-11-25 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides inhibiting candida germ tube formation
HUT63430A (en) 1990-08-16 1993-08-30 Isis Pharmaceuticals Inc Process for producing oligonucleotides influencing the effect of cytomegalovirus infection
JP2515230Y2 (ja) * 1990-08-31 1996-10-30 徹 松井 道糸通し糸付き浮子
RU2131436C1 (ru) * 1990-09-13 1999-06-10 Санофи Резистентные к нуклеазе олигонуклеозиды, способ их получения и резистентный к нуклеазе нуклеозидный димер
US5242906A (en) 1991-04-22 1993-09-07 University Of North Carolina At Chapel Hill Antisense oligonucleotides against Epstein-Barr virus
WO1994008003A1 (en) 1991-06-14 1994-04-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE INHIBITION OF THE ras GENE
US5582986A (en) 1991-06-14 1996-12-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide inhibition of the ras gene
EP0590082B1 (en) 1991-06-14 1999-10-27 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotide inhibition of the ras gene
US5607923A (en) 1991-10-15 1997-03-04 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating cytomegalovirus having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5661134A (en) 1991-10-15 1997-08-26 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotides for modulating Ha-ras or Ki-ras having phosphorothioate linkages of high chiral purity
US5681747A (en) 1992-03-16 1997-10-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Nucleic acid sequences encoding protein kinase C and antisense inhibition of expression thereof
IL107150A0 (en) 1992-09-29 1993-12-28 Isis Pharmaceuticals Inc Oligonucleotides having a conserved g4 core sequence
US5985558A (en) 1997-04-14 1999-11-16 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense oligonucleotide compositions and methods for the inibition of c-Jun and c-Fos
ES2153097T3 (es) 1995-04-07 2001-02-16 Mogens Havsteen Jakobsen Procedimiento de inmovilizacion fotoquimica de ligandos usando quinonas.
US6127533A (en) 1997-02-14 2000-10-03 Isis Pharmaceuticals, Inc. 2'-O-aminooxy-modified oligonucleotides
AU6425098A (en) * 1997-03-07 1998-09-22 Kvaerner Oilfield Products A.S Termination of a tension member, for use as a tendon for a tension leg platform
JP3756313B2 (ja) * 1997-03-07 2006-03-15 武 今西 新規ビシクロヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
US5877309A (en) 1997-08-13 1999-03-02 Isis Pharmaceuticals, Inc. Antisense oligonucleotides against JNK
US6794499B2 (en) 1997-09-12 2004-09-21 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
EP1015469B2 (en) 1997-09-12 2015-11-18 Exiqon A/S Bi- and tri-cyclic nucleoside, nucleotide and oligonucleoide analogues
US7572582B2 (en) 1997-09-12 2009-08-11 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US5955443A (en) 1998-03-19 1999-09-21 Isis Pharmaceuticals Inc. Antisense modulation of PECAM-1
US7084125B2 (en) 1999-03-18 2006-08-01 Exiqon A/S Xylo-LNA analogues
ATE356824T1 (de) 1999-05-04 2007-04-15 Santaris Pharma As L-ribo-lna analoge
JP4151751B2 (ja) 1999-07-22 2008-09-17 第一三共株式会社 新規ビシクロヌクレオシド類縁体
HK1049339B (en) 1999-09-10 2008-06-27 Geron Corporation Oligonucleotide n3'-p5' thiophosphoramidates: their synthesis and use
WO2005116207A1 (ja) 2004-05-28 2005-12-08 Sankyo Company, Limited テロメラーゼ阻害ｅｎａオリゴヌクレオチド

Also Published As

Publication number Publication date
US7816333B2 (en) 2010-10-19
AU758956B2 (en) 2003-04-03
US8957201B2 (en) 2015-02-17
BR0008131A (pt) 2002-04-09
EP1152009B2 (en) 2017-09-06
EP1152009B1 (en) 2005-01-26
BRPI0008131B1 (pt) 2016-12-27
ES2234563T5 (es) 2018-01-17
DE60017711T2 (de) 2005-11-17
DK1152009T3 (da) 2005-03-07
IL144338A0 (en) 2002-05-23
US20110009471A1 (en) 2011-01-13
NO20013899D0 (no) 2001-08-10
DE60017711T3 (de) 2018-01-11
DE60017711D1 (de) 2005-03-03
CN1273478C (zh) 2006-09-06
RU2233844C2 (ru) 2004-08-10
TR200604211T1 (tr) 2007-02-21
JP3420984B2 (ja) 2003-06-30
CZ20012574A3 (cs) 2002-02-13
ID30093A (id) 2001-11-01
ATE287897T2 (de) 2005-02-15
HUP0105367A2 (hu) 2002-05-29
US20090149404A1 (en) 2009-06-11
CA2361318A1 (en) 2000-08-17
AU2459800A (en) 2000-08-29
NZ513402A (en) 2003-06-30
PL208245B1 (pl) 2011-04-29
DK1152009T4 (en) 2017-12-11
WO2000047599A1 (en) 2000-08-17
TW513438B (en) 2002-12-11
HUP0105367A3 (en) 2005-10-28
TR200102328T2 (tr) 2002-01-21
ES2234563T3 (es) 2005-07-01
BRPI0008131B8 (pt) 2021-05-25
JP2000297097A (ja) 2000-10-24
KR20020013498A (ko) 2002-02-20
US20030207841A1 (en) 2003-11-06
IL144338A (en) 2013-11-28
US20020147332A1 (en) 2002-10-10
KR100573231B1 (ko) 2006-04-24
ZA200106544B (en) 2002-11-08
EP1152009A1 (en) 2001-11-07
CA2361318C (en) 2008-11-25
HU228398B1 (en) 2013-03-28
US7314923B2 (en) 2008-01-01
EP1152009A4 (en) 2002-06-05
HK1040084A1 (en) 2002-05-24
NO20013899L (no) 2001-10-10
US7335765B2 (en) 2008-02-26
HK1040084B (en) 2005-04-22
CN1347418A (zh) 2002-05-01
NO320441B1 (no) 2005-12-05
PT1152009E (pt) 2005-03-31

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU758956B2 (en) Novel nucleosides and oligonucleotide analogues
US7217805B2 (en) Bicyclonucleoside analogues
TW200817514A (en) ENA antisense oligonucleotides exhibiting sequence-specification
JP4148662B2 (ja) ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体を含有する核酸試薬及び医薬
JP2002053575A (ja) アミノアルコ−ル類
JP4245837B2 (ja) ２’，５’−オリゴアデニル酸類縁体
WO2000078775A1 (fr) Nouveaux nucleosides pontes en 3&#39;-4&#39; et analogues d&#39;oligonucleotides
JP2002265489A (ja) 新規３’‐４’架橋ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体を含有する核酸試薬
JP2001064296A (ja) 新規３’‐４’架橋ヌクレオシド及びオリゴヌクレオチド類縁体
JP2002255990A (ja) Ｎ３’−ｐ５’結合を有する２’，４’−ｂｎａオリゴヌクレオチド
JP2001064297A (ja) 新規ビシクロヌクレオシド誘導体
MXPA01008145A (en) Novel nucleosides and oligonucleotide analogues
JP2002249496A (ja) 新規ビシクロヌクレオシド誘導体を含有する核酸試薬

Legal Events

Date Code Title Description
MK4A Patent expired

Effective date: 20200210