CZ20023698A3 - Savčí receptorové proteiny, činidla a metody, které se jich týkají - Google Patents

Savčí receptorové proteiny, činidla a metody, které se jich týkají Download PDF

Info

Publication number
CZ20023698A3
CZ20023698A3 CZ20023698A CZ20023698A CZ20023698A3 CZ 20023698 A3 CZ20023698 A3 CZ 20023698A3 CZ 20023698 A CZ20023698 A CZ 20023698A CZ 20023698 A CZ20023698 A CZ 20023698A CZ 20023698 A3 CZ20023698 A3 CZ 20023698A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
polypeptide
seq
dcrs5
cell
antibody
Prior art date
Application number
CZ20023698A
Other languages
English (en)
Other versions
CZ304022B6 (cs
Inventor
Madaline Chiraca
Robert A. Kastelein
Kevin W. Moore
Christi L. Parham
Original Assignee
Schering Corporation
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=22753958&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=CZ20023698(A3) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Schering Corporation filed Critical Schering Corporation
Publication of CZ20023698A3 publication Critical patent/CZ20023698A3/cs
Publication of CZ304022B6 publication Critical patent/CZ304022B6/cs

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/715—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for cytokines; for lymphokines; for interferons
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/04—Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system for ulcers, gastritis or reflux esophagitis, e.g. antacids, inhibitors of acid secretion, mucosal protectants
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00—Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/06—Antipsoriatics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00—Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/02—Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00—Drugs for disorders of the nervous system
    • A61P25/28—Drugs for disorders of the nervous system for treating neurodegenerative disorders of the central nervous system, e.g. nootropic agents, cognition enhancers, drugs for treating Alzheimer's disease or other forms of dementia
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P3/00—Drugs for disorders of the metabolism
    • A61P3/08—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis
    • A61P3/10—Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis for hyperglycaemia, e.g. antidiabetics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04—Antibacterial agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/10—Antimycotics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12—Antivirals
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02—Immunomodulators
    • A61P37/06—Immunosuppressants, e.g. drugs for graft rejection
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/08—Antiallergic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2319/00—Fusion polypeptide
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
    • Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y10S435/00—Chemistry: molecular biology and microbiology
    • Y10S435/975—Kit

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Neurosurgery (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Neurology (AREA)
  • Rheumatology (AREA)
  • Physical Education & Sports Medicine (AREA)
  • Obesity (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Dermatology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Emergency Medicine (AREA)
  • Pain & Pain Management (AREA)
  • Pulmonology (AREA)

Description

Oblast techniky
Vynález popisuje prostředky a metody ovlivnění fyziologie savců zahrnující funkci imunitního systému. Zvláště se popisují metody regulující vývoj a/nebo imunitní systém. Popisuje se také diagnostická a terapeutická použití těchto materiálů.
Dosavadní stav techniky
Technologie rekombinace DNA znamená v obecném případě způsob začlenění genetické informace z dárce do vektorů za účelem dalšího zpracování. Vektory se mohou zavést do hostitele, kde se vytvoří kopie přenesené genetické informace, a/nebo se exprimují v novém prostředí. V běžném případě existuje genetická informace ve formě komplementární DNA (cDNA) získané z messengerové RNA (mRNA) kódující požadovaný proteinový produkt. Nosičem je často plazmid, který vykazuje kapacitu začlenit cDNA za účelem pozdější replikace do hostitele a v některých případech dokonce řídit expresi cDNA, čímž řídí syntézu kódovaného produktu v hostiteli (popisuje se například v publikaci Sambrook, et al., (1989), Molecular Cloning: A Laboratory Manual, (2d ed.) vis. 1-3, CSH Press, NY) .
Je známo, že imunitní odezva savců je založena na sérii komplexních buněčných interakcí, které se nazývají „imunitní síť. Současný výzkum poskytuje nový pohled na vnitřní vazby v této síti. Zatímco je zřejmé, že ve skutečnosti se imunitní odezva příliš nepodílí na interakcích lymfocytů, makrofágů, granulocytů a jiných buněk, imunologové v současné době prosazují názor, že rozpustné proteiny známé jako lymfokiny, ······· · · ·· · · • · · · · ···· • · · · ·· ··· ·· ·· cytokiny nebo monokiny mají důležitou úlohu při řízení těchto buněčných interakcí. Je důležité izolovat a charakterizovat buněčné modulační faktory a porozumět jejich mechanizmu působení, což povede ke zlepšení diagnózy a terapie řady zdravotních abnormalit, například poruch imunitního systému.
Lymfokiny zjevně různým způsobem zprostředkovávají buněčné aktivity (popisuje se například v publikaci Paul (ed. 1996) Fundamental Immunology 3d ed., Raven Press, New York a Thomson (ed.1994) The Cytokine Handbook 2d ed., Academie Press, San Diego). Ukazuje se, že cytokiny podporují proliferací, růst a/nebo diferenciaci pluripotencionálních krvetvorných kmenových buněk do nesmírného počtu progenitorů, které obsahují odlišné diverzní linie, jenž tvoří komplexní imunitní systém. Správné a vyvážené interakce mezi buněčnými komponenty jsou nezbytné pro zdravou imunitní odpověď. V případě, že se lymfokiny aplikují ve spojení s jinými činidly, různé buněčné linie často odpovídají odlišným způsobem.
Buněčné linie, které jsou zvláště důležité pro imunitní odezvu zahrnují dvě třídy lymfocytů: B-buňky, které mohou produkovat a vylučovat imunoglobuliny (proteiny se schopností rozeznávat a vázat se na cizorodé látky za účelem jejich odstranění) a T-buňky různých subtypů, které vylučují lymfokiny a vyvolávají a potlačují B-buňky a různé jiné buňky (zahrnující jiné T-buňky), které tvoří imunitní siť. Tyto lymfokiny reagují s řadou jiných typů buněk.
Překážkou výzkumu za účelem lépe porozumět a léčit různé poruchy imunity je obecná neschopnost udržet buňky imunitního systému in vitro. Imunologové zjistily, že kultivace řady buněk může být doprovázena použitím T-buněk a jiných buněčných supernatantů, které obsahuj'! různé růstové faktory zahrnující řadu lymfokinů.
· · · · <
Existují různé růstové a regulační faktory, které modulují morfogenní vývoj. Je známa řada receptorů vhodných pro cytokiny. Často ve funkčním receptorů existují alespoň dvě kritické podjednotky (popisuje se v publikaci Heinrich, et al., (1998) Biochem. J. 334: 297-314, Gonda and D'Andrea (1997) Blood 89: 355-369, Presky, et al., (1996) Proč. Nati.
Acad. Sci. USA 93: 14002-14007, Drachman and Kaushansky (1995) Curr. Opin. Hematol. 2: 22-28, Theze (1994) Eur. Cytokine Netw. 5: 353-368 a Lemmon and Schlessinger (1994) Trends Biochem. Sci. 19: 459-463).
Se shora uvedených informací vyplývá, že objev a vývoj nových rozpustných proteinů a jejich receptorů, které zahrnují ty podobné lymfokinům, by se mohly podílet na nových terapiích širokého rozsahu degenerativních nebo abnormálních podmínek, které přímo nebo nepřímo zahrnují vývoj, diferenciaci nebo funkcí například imunitního systému a/nebo krvetvorných buněk. Velmi výhodné bude objevení a porozumění funkci nových receptorů vhodných pro molekuly podobné lymfokinům, které zesilují nebo umocňují výhodné aktivity jiných lymfokinů. Vynález popisuje nové receptory ligandů, které vykazují podobnost s látkami, jenž jsou podobné cytokinům, a příbuzné sloučeniny a metody jejich použití.
Podstata vynálezu
Vynález popisuje nové receptory příbuzné receptorům cytokinů, jako jsou například molekulové struktury podobné receptorům cytokinů, označované podjednotky receptorů cytokinů DNAX (DCRS), a jejich biologické aktivity. Vynález zvláště popisuje jednu podjednotku označovanou DCRS5. Vynález také zahrnuje nukleové kyseliny kódující samotné polypeptidy a metody jejích produkce .a využití. Nukleové kyseliny podle vynálezu se charakterizují svou homologií se zde uvedenými klonovanými komplementárními sekvencemi DNA (cDNA).
Navíc vynález popisuje spojení ligandu p40/IL-B30 s podjednotkami receptoru DCRS5 a IL-12Rpl, přičemž uvedené párování je indikací pro použití agonistů a antagonistů založených na činidlech řízených na tyto receptory.
Vynález popisuje v podstatě čisté nebo rekombinantní polypeptid obsahující alespoň deset sousedících aminokyselin vnitrobuněčné části se sekvencí SEQ ID NO: 2. V jistých provedeních vynálezu polypeptid obsahuje alespoň 25 sousedících aminokyselin vnitrobuněčné části se sekvencí SEQ ID NO: 2. Dále může být polypeptid rekombinantní obsahující vnitrobuněčnou část sekvence SEQ ID NO: 2. Dále může polypeptid obsahovat alespoň deset sousedících aminokyselin části, která není extrabuněčná a je popsána sekvencí SEQ ID NO: 2, nebo přirozenou sekvenci SEQ ID NO: 2 nebo je v podstatě čistým přirozeným polypeptidem. Mezi jinými rekombinantní polypeptid může obsahovat přirozenou sekvenci uvedenou v tabulce č. 1 a je neglykosylovaným polypeptidem, pochází z člověka, obsahuje alespoň 40 sousedících aminokyselin se sekvencí SEQ ID NO: 2, vykazuje alespoň tři nepřekrývající se segmenty tvořené z 15-ti sousedících aminokyselin se sekvencí SEQ ID NO: 2, je přirozená polymorfní varianta sekvence SEQ ID NO: 2, má délku alespoň okolo 30-ti aminokyselin, vykatuje alespoň dva nepřesahující epitopy, které jsou specifické pro DCRS5 primáta, má molekulovou hmotnost alespoň 30 000 s přirozenou glykosylací, je syntetickým polypeptidem, existuje ve sterilní formě, je ve vodném nebo pufrovaném roztoku, je připojen na pevný substrát, je konjugovaný s jinou chemickou částí nebo je fyzikálně spojen s polypeptidem IL-12Rpi.
Jiná provedení vynálezu popisují v podstatě čistý nebo rekombinantní polypeptid^ obsahující alespoň dva odlišné nepřekrývající se segmenty alespoň šestí sousedících aminokyselin vnitrobuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2,
v podstatě čistý nebo rekombinantní polypeptid obsahující alespoň dvanáct sousedících aminokyselin vnitrobuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2 nebo v podstatě čistou přirozenou sekvenci polypeptidu obsahující zralou sekvenci SEQ ID NO: 2. Polypeptidy se mohou vyskytovat v určitých formách, polypeptid obsahuje alespoň dva rozdílné nepřekrývající se segmenty tvořené alespoň šesti sousedícími aminokyselinami vnitrobuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2, kde rozdílné nepřekrývající se segmenty zahrnují jeden tvořený alespoň dvanácti aminokyselinami, zahrnují jeden tvořený alespoň sedmi aminokyselinami a druhý tvořený alespoň devíti aminokyselinami, zahrnuje třetí odlišný seggment tvořený alespoň šesti aminokyselinami nebo obsahuje jeden segment vybraný z R3555-L373, P378-L405, V407-D426, K428-D439, P441V452, I454-G460, I465-T587 nebo N592-606 nebo polyppetid dále obsahuje alespoň dva rozdílné nepřekrývající se segmenty tvořené alespoň šesti sousedícími aminokyselinami extrabuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2. V jiném případě polypeptid obsahující alespoň dvanáct sousedících aminokyselin intrabuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2 bude ten, kde segment s dvanácti aminokyselinami obsahuje jeden z R355-L373, P378L405, V407-D426, K428-D439, P441-V452, I454-G460, I465-T587 nebo N592-606, nebo polypeptid dále obsahuje alespoň dva odlišné nepřesahující segmenty tvořené alespoň šesti sousedícími aminokyselinami extrabuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2. Nebo čistá, přirozená sekvence polypeptidu obsahující zralou sekvenci SEQ ID NO: 2 může dále obsahovat epitop vhodný pro čištění nebo detekci. Takové polypeptidy mohou obsahovat zralou sekvenci uvedenou v tabulce č. 1, může být neglykosylovaným polypeptidem, může pocházet z člověka, obsahuje alespoň 40 sousedících aminokyselin se sekvencí SEQ ID NO: 2, vykazuje alespoň -tři nepřesahující segmenty alespoň 15-ti sousedících aminokyselin se sekvencí SEQ ID NO: 2, je přirozenou polymorfní variantou sekvence SEQ ID NO: 2, má
délku alespoň přibližně 30 aminokyselin, vykazuje alespoň dva nepřekryjící se epitopy, které jsou specifické pro DCRS5 primátů, mají molekulovou hmotnost alespoň 30 000 s přirozenou glykosylací, je syntetickým polypeptidem, je ve sterilní formě, vyskytuje se ve vodném nebo pufrovaném roztoku, je zachycen na pevném substrátu, je konjugován s jinou chemickou částí nebo je fyzikálně spojen s polypeptidem IL-12Rpi.
Vynález popisuje různé jiné prostředky, které například obsahují v podstatě čistý polypeptid kombinovaný s proteinem IL-12Rpi, nebo takový polypeptid a nosičem, kde nosič je vodná sloučenina zahrnující vodu, fyziologický roztok a/nebo pufr a/nebo je upraven pro orální, rektální, nasální, povrchovou nebo parenterální aplikaci.
Vynález popisuje sady obsahující popsaný polypeptid a kompartmen s polypeptidem, kompartment obsahující polypeptid IL-12Rpi, kompartment obsahující p40, IL-B30 nebo polypeptid p40/IL-B30 nebo instrukce vhodné pro použití nebo likvidaci činidel v sadě.
Popisují se protilátky a jiné vazebné sloučeniny, které například obsahují vazebné místo na antigen pocházející z protilátek, které specificky váže vnitrobuněčnou část DCRS5, kde vazebná sloučenina je v kontejneru, polypeptid pochází z člověka, vazebná sloučenina může být fragment Fv, Fab nebo Fab2, vazebná sloučenina se konjugovala s jinou chemickou částí. Protilátka je řízena proti peptidové sekvenci zralého polypeptidu uvedené v tabulce č. 1, protilátka je určena proti zralému DCRS5, proti zralému DCRS5, čištěnému lidskému DCRS5, vybrala se imunologickou metodou, je polyklonální protilátkou, váže se na denaturovaný DCRS5, vykazuje hodnotu konstanty Kd vůči antigenu alespoň 30 μιη, je zachycena na pevném substrátu, který zahrnuje kuličky nebo plastovou membránu, je ve formě sterilního prostředku nebo je detekovatelně značená, přičemž
Také se zahrnuje radioaktivní nebo fluorescenční značky. Také se popisují sady obsahující vazebnou sloučeninu a kompartment obsahující vazebnou sloučeninu, kompartment obsahující polypeptid p40, polypeptid IL-B30, polypeptid DCRS5 a/nebo polypeptid IL-12RP1, kompartment obsahující protilátku, která se selektivně váže na polypeptid p40, polypeptid IL-B30, polypeptid DCRS5 a/nebo polypeptid IL-12Rpi nebo instrukce pro použití nebo likvidaci činidel obsažených v sadě.
Vynález dále popisuje metody například produkci komplexu antigen:protilátka zahrnující kontakt polypeptidu primáta DCRS5 s protilátkou za vhodných podmínek, což umožňuje vytvoření komplexu. Taková metoda se může použít při izolaci komplexu od jiných cytokinových receptorů, komplex se izoluje od jiné protilátky, kontakt je se vzorkem, který obsahuje interferon, kontakt umožňuje kvantitativní detekcí antigenu, kontakt je se vzorkem obsahujícím protilátku nebo kontakt umožňuje kvantitativní detekci protilátky. Vynález popisuje i jiné prostředky. Je to například prostředek obsahující sterilní vazebnou sloučeninu nebo vazebnou sloučeninu a nosič, kde nosičem je vodná sloučenina zahrnující vodu, fyziologický roztok a/nebo pufr a/nebo je upravena pro orální, rektální, nasální nebo povrchovou nebo parenterální aplikaci.
Vynález také popisuje izolovanou nebo rekombinantní nukleovou kyselinu kódující polypeptid DCRS5, kde DCRS5 pochází z člověka, nebo nukleovou kyselinu kódující sekvenci antigenního peptidu uvedenou v tabulce č. 1 nebo kóduje velké množství sekvencí antigenních peptidů uvedených v tabulce č. 1, vykazuje shodu alespoň 14-ti nukleotidů s přirozenou cDNA kódující segment, je expresívním vektorem, dále obsahuje počátek replikace, pochází z přirozeného zdroje, obsahuje detekovatelnou značku, obsahuje syntetickou nukleotidovou sekvenci, ale menší než 6 kb, přednostně je menší než 3 kb, pochází z primátu, obsahuje přirozenou kódující sekvenci plné • · · · délky, je hybridizační sondou pro gen kódující DCRS5 nebo je primer PCR, produkt PCR nebo primer pro mutagenezi. Popisují se buňky obsahující rekombinantní nukleovou kyselinu zahrnující prokaryontní buňku, eukaryontní buňku, bakteriální buňku, kvasinkovou buňku, hmyzí buňku, myší buňku, buňku primáta nebo lidskou buňku.
Vynález dále popisuje sadu, která obsahuje nukleovou kyselinu a za kompartment obsahující nukleovou kyselinu, kompartment obsahující nukleovou kyselinu kódující polypeptid p40, polypeptid I1-B30, polypeptid DCRS5 a/nebo polypeptid IL12Rpi, kompartment obsahující protilátku, která se selektivně váže na polypeptid p40, polypeptid IL-B30, polypeptid DCRS5 a/nebo polypeptid IL-12RP1 nebo instrukce pro použití nebo likvidaci činidel v sadě.
Vynález dále popisuje nukleovou kyselinu, která hybridizuje za podmínek promývání po dobu 30 minut při teplotě 30 °C a v méně než 2 mM soli s částí sekvence SEQ ID NO: 1 kódující vnitrobuněčnou část nebo vykazující shodu pruhu alespoň 30-ti nukleotidů s vnitrobuněčnou částí DCRS5 primáta. Taková nukleová kyselina je s výhodou ta, kde promývací podmínky hybridizace jsou teplota 45 °C a/nebo 500 mM sůl nebo teplota 55 °C a/nebo 150 mM sůl nebo pruh je tvořen alespoň 55 nebo 75 nukleotidy.
Terapeutické použití zahrnuje způsoby modulace fyziologie nebo vývoje buňky zahrnující kontakt buňky s antagonistou p40/IL-B30, který je komplex obsahující extrabuněčnou část DCRS5 primáta a/nebo extrabuněčnou část IL-12RP1 primáta, antagonistou p40/IL-B30, který je protilátkou vázající se na komplex obsahující DCRS5 primáta a/nebo IL-12RP1, antagonistou p40/IL-B30, který je protilátkou vůči IL-12RP1, antagonistou p40/IL-B30, který je antisense nukleová kyselina vůči DCRS5 • · · · · • · nebo IL-12Rpi nebo agonistou p40/IL-B30, který je protilátkou vázající se na komplex obsahující DCRS5 primáta a/nebo IL-12Rpi primáta. Při jednom typu metod ke kontaktu dochází s antagonistou a kontakt probíhá v kombinaci s antagonistou vůči IL-12, IL-18, TNF a/nebo IFNy nebo buňka pochází z hostitele, který vykazuje znaky nebo symptomy chronického onemocnění zprostředkované TH1, vykazuje symptomy nebo znaky roztroušené sklerózy, revmatické artritidy, osteoartritidy, zánětlivého onemocnění střev, cukrovky, lupénky nebo sepse, nebo hostitel obdržel alogenní transplantáty. Naopak způsob může zahrnovat kontakt s agonistou a pak ke kontaktu dochází v kombinaci s IL-12, IL-18, TNF nebo IFNy nebo buňka pochází z hostitele, který vykazuje znaky nebo symptomy chronické odezvy Th2, trpí růstem nádoru, virovým nebo plísňovým onemocněním, aplikovala se mu vakcína nebo trpí alergickou odpovědí.
Osnova
I. Obecně
II. Aktivity
III. Nukleové kyseliny
A. kódující fragmenty, sekvence, sondy
B. mutace, chiméry, fúze
C. příprava nukleových kyselin
D. vektory, buňky obsahující vektory
IV. Proteiny, peptidy
A. fragmenty, sekvence, imunogeny, antigeny
B. muteiny
C. agonisty/antagonisty, funkční ekvivalenty
D. příprava proteinů
V. Příprava nukleových kyselin, proteinů
A. syntetické
B. rekombinantní
C. přirozené zdroje • · · ·
VI. Protilátky
A. polyklonální
B. monoklonální
C. fragmenty, Kd
D. anti-idiotypické protilátky
E. buněčné linie hybridomů
VII. Sady, diagnostika a kvantifikace
A. ELISA
B. test mRNA kódující
C. kvalita/kvantita
D. sady
VIII. Terapeutické prostředky, metody
A. kombinační prostředky
B. jednotková dávka
C. aplikace
IX. Testování
I. Obecně
Vynález popisuje aminokyselinovou sekvenci a sekvenci DNA savce, v tomto případě primáta, podjednotky molekul podobných receptoru cytokinu, kdy tato podjednotka označená podjednotka 5 receptoru cytokinu DNAX (DCRS5) má určitým způsobem definované vlastnosti a to jak strukturní tak biologické. Různé cDNA kódující tyto molekuly se získaly z primáta, například z knihovny sekvencí lidské cDNA. Požadují se také části z jiných primátů nebo savců.
Navíc vynález popisuje párování ligandu p40/IL-B30 s podjednotkami receptoru DCRS5 a IL-12Rpi, jejichž párování poskytuje proniknutí do indikací použití agonistů a antagonistů založených na činidlech.
'v
Některá ze standardních metod se popisují v publikaci Maniatis, et al., (1982) Molecular Cloning, A Laboratory • · « · η ···«··· · · « · · · • · ··· · · · · • · * · ·· · · · ·· ··
Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor Press, Sambrook, et al., (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, (2d ed.), vols. 13, CSH Press NY, Ausubel, et al., Biology, Greene Publishing Associates, Brooklyn, NY nebo Ausubel, et al., (1987 a periodické doplňky) Current Protocols in Molecular Biology, Greene/Wiley, New York).
Nukleotidová (SEQ ID NO: 1) a odpovídající aminokyselinová sekvence (SEQ ID NO: 2) primáta, jako je například člověk, kódující segment DCRS5 je zobrazena v tabulce č. 1. Předpokláná signální sekvence je určena, ale může záviset na typu buněk nebo může obsahovat v obou směrech několik zbytků navíc. Potenciální a glykosylační zbytky jsou asparagin 6, 24, 58, 118, 157, 209 a 250. Je pravděpodobné, že disulfidové můstky se nacházejí mezi cysteinovými zbytky v polohách 29 a 78 a konzervovaný motiv C_CXW se nachází v polohách 110/121/123. V poloze 219 je patrný tryptofan a motiv WxxWS je patrný od polohy 281 do 285. Segment v polohách 1 až 101 je v doméně Ig, v polohách 102 do 195 je doména 1 vázající cytokin, v polohách 196 až 297 je doména 2 vázající cytokin, oblast 298 až 330 je linker, oblast 329 až 354 je transmembránový segment a oblast 356 až 606 je vnitrobuněčná oblast. Vnitrobuněčné rysy zahrnují vazebná místa putativní SH2 v polohách Y374-I377, Y461-Q464 a Y588-Q591 a potencionálně důležité tyrosinové zbytky v poloze 406, 427,
440 a 453. Tato místa a hranice jsou patrné.
ORF obsahuje putativní signální sekvenci. Předpokládá se, že tato sekvence bude štěpena v místě CHG/GIT, jak se uvádí shora v textu. Předpovězenou extrabuněčnou oblast obsahující 328 aminokyselin následuje putativní transmembránový segment a nakonec cytoplazmatická oblast obsahující přibližně 252 aminokyselin. Funkce vázat ligand přináleží zbytku v extrabuněčné oblasti.
·* 9 • · * « <
• » · ·
Reverzní translace sekvence nukleové kyseliny je uvedena v tabulce č. 2.
Tabulka č. 1: Nukleotidové a polypeptidové sekvence forem podobných podjednotce receptoru cytokinu DNAX (DCRS5). Forma primáta například člověk (SEQ ID NO: 1 a 2). Předpokládaná signální sekvence je určená, ale může se měnit v několika polohách a závisí na typu buněk. Určité polohy variace jsou v nukleotidech 127 a 563, ve kterých se párují G a G (překládají se na kombinace Q a G) nebo T a A (překládají se na H a R).
gtggtacggg aattccattg tgttgggcag ccaacaaggg tggcagcctg gctctgaagt 60 ggaattatgt gcttcaaaca ggttgaaaga gggaaacagt cttttcctgc ttccagac
atg Met aat Asn cak gtc act Xaa Val Thr -20 att Ile caa tgg gat gca gta ata gcc ctt Leu -10 tac Tyr ata Ile 166
Gin Trp Asp -15 Ala Val Ile Ala
ctc ttc age tgg tgt cat gga gga att aca aat ata aac tgc tet ggc 214
Leu Phe Ser Trp Cys His Gly Gly Ile Thr Asn Ile Asn Cys Ser; Gly
-5 -1 1 5
cac atc tgg gta gaa cca gcc aca att ttt aag atg ggt atg aat atc 262
His Ile Trp Val Glu Pro Ala Thr Ile Phe Lys Met Gly Met Asn Ile
10 15 20 25
tet ata tat tgc caa gca gca att aag aac tgc caa cca agg aaa ctt 310
Ser Ile Tyr Cys Gin Ala Ala Ile Lys Asn Cys Gin Pro Arg Lys Leu
30 35 40
cat ttt tat aaa aat ggc atc aaa gaa aga ttt caa atc aca agg att 358
His Phe Tyr Lys Asn Gly Ile Lys Glu Arg Phe Gin Ile Thr Arg Ile
45 50 55
aat aaa aca aca get cgg ctt tgg tat aaa aac ttt ctg gaa cca cat 406
Asn Lys Thr Thr Ala Arg Leu Trp Tyr Lys Asn Phe Leu Glu Pro His
60 65 70
get tet atg tac tgc act get gaa tgt ccc aaa cat ttt caa gag aca 454
Ala Ser Met Tyr Cys Thr Ala Glu Cys Pro Lys His Phe Gin Glu Thr
75 80 85
ctg ata tgt gga aaa gac att tet tet gga tat ccg cca gat att cct 502
Leu Ile Cys Gly Lys Asp Ile Ser Ser Gly Tyr Pro Pro Asp Ile Pro
90 95 100 105
gat gaa gta acc tgt gtc att tat. gaa tat tea ggc aac atg act tgc 550
Asp Glu Val Thr Cys Val Ile Tyr Glu Tyr Ser Gly Asn Met Thr Cys
110 115 12 0
acc tgg aat get rgg aag ctc acc tac ata gac aca aaa tac gtg gta 598
Thr Trp Asn. Ala Xaa Lys Leu Thr Tyr Ile Asp Thr Lys Tyr Val Val
125 130 135
13 • 9 • 9 9 9 9 • 9 9 9 9 9 9 9 9 · 9 «9 * «9 9 » 9 · 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
cat gtg aag agt tta gag aca gaa gaa gag caa cag tat ctc acc tea 646
Sis Val Lys 14 0 Ser Leu Glu Thr Glu 145 Glu Glu Gin Gin Tyr 150 Leu Thr Ser
agc tat att aac atc tcc act gat tea tta caa ggt ggc aag aag tac 694
Ser Tyr 155 Ile Asn Ile Ser Thr 160 Asp Ser Leu Gin Gly 165 Gly Lys Lys Tyr
ttg gtt tgg gtc caa gca gca aac gca cta ggc atg gaa gag tea B.S.3. 742
Leu 170 Val Trp Val Gin Ala 175 Ala Asn Ala Leu Gly 180 Met Glu Glu Ser Lys 185
caa ctg caa att cac ctg gat gat ata gtg ata cct tet gca gcc gtc 790
Gin Leu Gin Ile Eis 190 Leu Asp Asp Ile Val 195 Ile Pro Ser Ala Ala 200 Val
att tcc agg gct gag act ata aat gct aca gtg ccc aag acc ata att 838
Ile Ser Arg Ala 205 Glu Thr Ile Asn Ala 2 ) Thr Val Pro Lys Thr 215 Ile Ile
tat tgg gat agt caa aca aca att gaa aag gtt tcc tgt gaa atg aga 886
Tyr Trp Asp 220 Ser Gin Thr Thr Ile 225 Glu Lys Val Ser Cys 230 Glu Met Arg
tac aag gct aca aca aac caa act tgg aat gtt aaa gaa ttt gac acc 934
Tyr Lys 235 Ala Thr Thr Asn Gin 240 Thr Trp Asn Val Lys 245 Glu Phe Asp Thr
aat ttt aca tat gtg caa cag tea gaa ttc tac ttg gag cca aac att 982
Asn 250 Phe Thr Tyr Val Gin 255 Gin Ser Glu Phe Tyr 260 Leu Glu Pro Asn Ile 265
aag tac gta ttt caa gtg aga tgt caa gaa aca ggc aaa agg tac tgg 1030
Lys Tyr Val Phe Gin 270 Val Arg Cys Gin Glu 275 Thr Gly Lys Arg Tyr 280 Trp
cag cct tgg agt tea ccg ttt ttt cat aaa aca cct gaa aca gtt ccc 1078
Gin Pro Trp Ser 285 Ser Pro Phe Phe His 290 Lys Thr Pro Glu Thr 295 Val Pro
cag gtc aca tea aaa gca ttc caa cat gac aca tgg aat tet ggg cta 1126
Gin Val Thr 300 Ser Lys Ala Phe Gin 3 05 His Asp Thr Trp Asn 310 Ser Gly Leu
aca gtt gct tcc atc tet aca ggg cac ctt act tet gac aac aga gga 1174
Thr Val 315 Ala Ser Ile Ser Thr 320 Gly His Leu Thr Ser 325 Asp Asn Arg Gly
gac att gga ctt tta ttg gga atg atc gtc ttt gct gtt atg ttg tea 1222
Asp 330 Ile Gly Leu Leu Leu 335 Gly Met Ile Val Phe 340 Ala Val Met Leu Ser 345
att ctt tet ttg att ggg ata ttt as ga tea ttc ega act ggg att 1270
Ile Leu Ser Leu Ile 350 Gly Ile Phe As- -Arg 355 Ser Phe Arg Thr Gly 360 Ile
aaa aga agg atc tta ttg tta ata cca aag tgg ctt tat gaa gat att 1318
Lys Arg Arg Ile 365 Leu Leu Leu Ile Pro 370 Lys Trp Leu Tyr Glu 375 Asp Ile
·· ·· · ······ • · · · · · · · · · ······· · · · · · · • · ··· · · 4 * • C · 4 · 4 444 44 44
cct Pro aat Asn atg Met 380 aaa Lys aac Asn agc Ser aat Asn gtt Val .385 gtg aaa atg Val Lys Met cta Leu cag Gin 390 gaa Glu aat Asn agt Ser 1366
gaa ctt atg aat aat aat tcc agt gag cag gtc cta tat gtt gat ccc 1414
Glu Leu Met Asn Asn Asn Ser Ser Glu Gin Val Leu Tyr Val Asp Pro
395 400 405
atg att aca gag ata aaa gaa atc ttc atc cca gaa cac aag cct aca 1462
Met Ile Thr Glu Ile Lys Glu Ile Phe Ile Pro Glu His Lys Pro Thr
410 415 420 425
gac tac aag aag gag aat aca gga ccc ctg gag aca aga gac tac ccg 1510
Asp Tyr Lys Lys Glu Asn Thr Gly Pro Leu Glu Thr Arg Asp Tyr Pro
430 435 440
caa aac tcg cta ttc gac aat act aca gtt gta tat att cct gat ctc 1558
Gin Asn Ser Leu Phe Asp Asn Thr Thr Val Val Tyr Ile Pro Asp Leu
445 450 455
aac act gga tat aaa ccc caa att tca aat ttt ctg cct gag gga agc 1606
Asn Thr Gly Tyr Lys Pro Gin Ile Ser Asn Phe Leu Pro Glu Gly Ser
460 465 470
cat ctc agc aat aat aat gaa att act tcc tta aca ctt aaa cca cca 1654
His Leu Ser Asn Asn Asn Glu Ile Thr Ser Leu Thr Leu Lys Pro Pro
475 480 485
gtt gat tcc tta gac tca S9a aat aat ccc agg tta caa aag cat cct 1702
Val Asp Ser Leu Asp Ser Gly Asn Asn Pro Arg Leu Gin Lys His Pro
490 495 500 505
aat ttt gct ttt tet gtt tca agt gtg aat tca cta agc aac aca ata 1750
Asn Phe Ala Phe Ser Val Ser Ser Val Asn Ser Leu Ser Asn Thr Ile
510 515 520
ttt ctt gga gaa tta agc ctc ata tta aat caa gga gaa tgc agt tet 1798
Phe Leu Gly Glu Leu Ser Leu Ile Leu Asn Gin Gly Glu Cys Ser Ser
525 530 535
cct gac ata caa aac tca gta gag gag gaa acc acc atg ctt ttg gaa 1846
Pro Asp Ile Gin Asn Ser Val Glu Glu Glu Thr Thr Met Leu Leu Glu
540 545 550
aat gat tca ccc agt gaa act att cca gaa cag acc ctg ctt cct gat 1894
Asn Asp Ser Pro Ser Glu Thr Ile Pro Glu Gin Thr Leu Leu Pro Asp
555 560 565
gaa ttt gtc tcc tgt ttg ggg atc gtg aat gag gag ttg cca tet att 1942
Glu Phe Val Ser Cys Leu Gly Ile Val Asn Glu Glu Leu Pro Ser Ile
570 575 580 585
aat act tat ttt cca caa aat att ttg gaa agc cac ttc aat agg att 1990
Asn Thr Tyr Phe Pro Gin Asn Ile ůeu Glu Ser His Phe Asn Arg Ile
590 595 600
• · · · η [- · ······ « · _L Ο · · · · · ··· · ·· ··· tca ctc ttg gaa aag tagagctgtg tggtcaaaat caatatgaga aagctgcctt Ser Leu Leu Glu Lys
605
gcaatctgaa cttgggtttt ccctgcaata gaaattgaat tctgcctctt tttgaaaaaa 2105
atgtattcac atacaaatct tcacatggac acatgttttc atttcccttg gataaatacc 2165
taggtagggg attgctgggc catatgataa gcatatgttt cagttctacc aatcttgttt 2225
ccagagtagt gacatttctg tgctcctacc atcaccatgt aagaattccc gggagctcca 2285
tgccttttta attttagcca ttcttctgcc tmatttctta aaattagaga attaaggtcc 2345
cgaaggtgga acatgcttca tggtcacaca tacaggcaca aaaacagcat tatgtggacg 2405
cctcatgtat tttttataga gtcaactatt tcctctttat tttccctcat tgaaagatgc 2465
aaaacagctc tctattgtgt acagaaaggg taaataatgc aaaatacctg gtagtaaaat 2525
aaatgctgaa aattttcctt taaaatagaa tcattaggcc aggcgtggtg gctcatgctt 2585
gtaatcccag cactttggta ggctgaggtr ggtggatcac ctgaggtcag gagttcgagt 2645
ccagcctggc caatatgctg aaaccctgtc tctactaaaa ttacaaaaat tagccggcca 2705
tggtggcagg tgcttgtaat cccagctact tgggaggctg aggcaggaga atcacttgaa 2765
ccaggaaggc agaggttgca ctgagctgag attgtgccac tgcactccag cctgggcaac 2825
aagagcaaaa ctctgtctgg aaaaaaaaaa aaaa 2859
MN (0/H) VTIOWDAVIALYILFSWCHGGITHINCSGHIWVEPATIFKMGMíJISIYCOAAIKNCOPRKLHF YKNGIKERFQITRINKTTARLWYKIÍFLEPHASMYCTAECPKHFQETLICGKDISSGYPPDIPDEVTCVIY EYSGNMTCTWNA(G/R) KLTYIDTKYWHVKSLETEEEQQYLTSSYINISTDSLQGGKKYLVWVQAANAL GMEESKQLQIHLDDIVIPSAAVISRAETINATVPKTIIYWDSQTTIEKVSCEMRYKATTNQTWNVKEFDT NFTYVQQSEFYLEPNIKYVFQVRCQETGKRYWQPWSSPFFHKTPETVPQVTSKAFQHDTWNSGLTVASIS TGHLTSDNRGDIGLLLGMIVFAVMLSILSLIGIFNRSFRTGIKRR1LLLIPKWLYEPIPNMKNSNWKML QENSELMNNNSSEQVLYVDPMITEIKEIFIPEHKPTDYKKENTGPLETRDYPQNSLFDNTTWYIPDLNT GYKPGISNFLPEGSHLSNNNEITSLTLKPPVDSLDSGNNPRLCKHPNFAFSVSSVNSLSNTIFLGELSLI LNQGECSSPDIQNSVEEETTMLLENDSPSETIPEQTLLPDEFVSCLGIVNEELPSLNTYFPCNILESHFN RISLLEK • * · · ······ ·
Tabulka č. 2: Reverzní translace DCRS5 primáta, člověka (SEQ ID NO: 3) například
ATGAAYCAYGTNACHATHCARTGGGAYGCaJGUTATHGCNYTNTAYAIHYTNTTYWSNTGGTGYCAYGGNGGHAT
HACNAAYATHAAYTGYWSNGGNCAYATHTGGGTNGARCCNGCIIACNATHTTYAARATGGGHATGAAYATHWSNA
THTAYTGYCARGCNGCNATHAARAAYTGYCAACCNMGNAARYTNCAYTrYTAYAARAAYGGNATHAARGARMGN
TTYCARATHACNMGNATHAAYAARACNACNGCNMGNYTNTGGTAYAAEAAYTTYYTNGARCaíCAYGCNWSNAT
GTAYTGYACNGCNGARTGYCCNAARCAYTTYCARGAEACNYTHATHTGYGGNAARGAYATHWSNWSNGGNTAYC
QICCKGAYATHCCNGAYGARGTNACNTGYGTNATHTAYGARTAr/ÍSNGGKAAYATGACNTGYACNTGGAAYGCN
MGNAAR.YTNAaTTAYATHGAYACNAARTAYGTNGTNCAYGTNAARWSNYTNGAEACWGARGARGARCARCARTA
YYTNACNWSNWSííTAYATHAAYATHWSNACNGAYWSNYTNCAíiGGNGGlíAAEAARTAYYTNGTNTGGGTlTCARG
CNGCNAAYGCÍTYTNGGNATGGARGARWSNAARCARYTNCARATHCAYYTNGAYGAYATHGTNATHCCNWSNGCN
GGNGTNATHWSNMGNGCNGARACNATHAAYGCNACNGTNCCNAARACNATHATHTAYTGGGAYWSNCARACNAC
NATHGARAARGTOTSOTGYGAÍUkTGMGimYAARGCNAOTACNAAYCARACKTGGAAYGTNAARGARTTYGAYA
CNAAYTTYACNTAYGTNCARCARWSNGARTTYTAYYTNGARCCNAAYATHAARTAYGTNTTYCARGTNMGNTGY
CARGARACNGGSIAARMGNTAYTGGCARCCNTGGWSNWS1ICCNTTYTTYCAYAARACNCCNGARAC1IGTNCCNCA
RGTNACNWSNAARGCNTTYCARCAYGAYACNTGGAAYWSNGGNYTNACNGTNGCNWSNATHWSÍIACNGGNCAYY
TWACNWSlJGAYAAYMGNGGNGAYATHGGNYTNYTNYTNGGNATGATHGTNTTYGCNGTNATGYTřWSWATSyTN
WSNYTOATHGGNATHTTYAAYMGKWSNTTYMGNACNGGNATHAZUmGNMGNATHYTNYTNYTNATHCCNAARTG
GYTNTAYGARGAYATHCCNAAYATGAARAAYWSlíAAYGTNGTNAARATGYTNCARGARAAYWSNGARYTNATGA
AYAAYAAYWSNWSNGARCARGTNYTNTAYGTNGAYCCNATGATBACHGARATHAARGARATHTTYATHCCNGAR
CAYAARCCNACNGAYTAYAARAARGARAAYACNGGNCCNYTNGARAaiMGNGAYTAYCCNCARAAYWSNYTNTT
YGAYAAYACNACNGTNGTNTAYATHCCITGAYYTMAAYACNGGNTAYAARCCNCARATHWSIíAAYTTYYTMCCNG
ARGGNWSNCAYYTNWSNAAYAAYAAYGARATHACNWSNYTNACNYTNAARCCNCCWGTNGAYWSNYTNGAYWSN
GGNAAYAAYCCaSMGNYTNCARAARCAYCCNAAYTTYGCinTYWSNGTNWSNMSNGTNAAYWSNYTNWSNAAYAC
NATHTTYYTNGGNGARYTNWSNYTNATHYTNAAYCAAGGNGAATGYWSNWSNCCNGAYATHCARAAYWSNGTNG
ARGARGARACNAClTATGYTIIYTNGARAAYGAYWSNCaWSNGAPACNATHCCNGARCARACNYTNYTlíCaíGAY
GARTTYGTNWSNTGYYTNGGNATHGTNAAYGARGARYTHCCNÍ-ÍSNATHAAYACNTAYTTYCCNCAEAAYATHYT
NGARWSNCAYTTYAAYMGNATHWSKYTNYTNGAEAAA
Ζλ.··' • ·
Tabulka č. 3: Uspořádání podjednotek různých cytokinových receptorů, protein gpl30 receptoru lidského IL-6 je SEQ ID NO: 4 (GenBank M57230) , podjednotka beta2 receptoru lidského 11-12 je SEQ ID N0:5 (GenBank U64198) huIL-12R 2 1 hugpl30 1 huDCRSS 1 huIL-12R 2 49 hugpl30 46 huDCRS5 50 huIL-12R 2 96 hugpl30 96 huDCRS5 94 huIL-12R 2 143 hugpl30 144 huDCRS5 144 huIL-12R 2 193 hugpl30 191 huDCRS5 190 huIL-12R 2 243 hugpl30 241 huDCRS5 239 huIL-12R 2 286 hugpl30 291 huDCRSS 286 huIL-12R 2 336 hugpl30 341 huDCRSS 321 huIL-12R 2 385 hugpl30 388 huDCRSS 358 huIL-12R 2 435 hugpl30 437 huDCRSS 388
MAHTFRGCSLAFMFIITWLLIKAKIDACKRGDVTVKPSHVILLGSTVN 48 MLTLQTWWQALFIFLTTESTGELLDPCG YIS PES P WQLHSNFT 4 5
MNHVTIQWDAVIALYILFSWCHGGITNINCS -GHIWVEPATIFKMGMNIS 4 9 * . *
ITCSLKPRQGCFHYSRRNKLILYKFDRRINFHHGHSLNSQVTGLPLG- - - 95
AVCVLKEKCMDYFHVNANYIVWKTNHFTIPKEQYTIINRTAS SVTFTDIA 95 IYCQAAIKN- -CQP- --RKLKFYKNGIKER-FQITRINKTTARLWYKNFL 93
- -TTLFVCKLACINSD-EIQICGAEIFVGVAPEQPQNLSCIQKGEQGTVA 142 SLNIQLTCNILTFGQL- EQNVYGITIISGLPPEKPKNLSCIVN- EGKKMR 143 EPHASMYCTAECPKHFQETLICGKDISSGYPPDIPDEVTCVIYEYSGNMT 143
CTWERGRDTHLYTEYTLQLSGPKNLTWQKQCKDIYCDYLDFGINLTPESP 192 CEWDGGRETHLETNFTLKS - -EWATHKFADCKAKRDTPTSCTVDYS -TVY 190 CTWNARKLTYIDTKYWHVKSLETEEEQQYLTSSYINISTDSLQGG----189 **.*.*...
ESNFTAKVTAVNSLGSSSSLPSTFTFLDIVRPLPPWDIRIKFQKASVSRC 242 FVNIEVWVEAENALGKVTSDHINFDPVYKVKPNPPHNLSVINSEELSSIL 240 -KKYLVWVQAANALGMEESKQLQIHLDDIVIPSAAVISRAETINATVPKT 23 8 ★ ★ * e 4e ie ★ * *
TLYWRD----EGLVLLNRLRYRPSNSRLWNMVN---VTKAKGRHDLLDLK 285
KLTWTNPSIKSVIILKYNIQYRTKDASTWSQIPPEDTASTRSSFTVQDLK 290 IIYWDS- -QTTIEKVSCEMRYKATTNQTWNVKEFD-TNFTYVQQSEFYLE 2 85 ★ . , . * . * . *
PFTEYEFQISSKLHLYKGSWSDWSESLRAQTPEEEPTGMLDVWYMKRHID 3 35 PFTEYVFRIRCMKEDGKGYWSDWSEEASGITYEDRPSKAPSFWYKIDPSH 340 PNIKYVFQVRCQ - ETGKRYWQPWS S PFFHKTPETVP--------------320 ★ * * ie ie *
YS -RQQISLFWKNLSVSEARGKILHYQVTLQELTGGKAMTQNITGHTSWT 3 84
TQGYRTVQLVWKTLPPFEANGK DYEVT---LTRWKSHLQNYTVNATKL 3 27
-----QVTSKAFQHDTWNSGLTV SISTG------HLTSDN- -RGDIGLL 357
TVIPRTGNWAVAVSAANSKGSSLPTRINIMNLCEAGLLAPRQVSANSEGM 434 TVNLTNDRYLATLTVRNLVGKSDAAVLTIP-ACDFQATHPVMDLKAFPKD 43 6 LGMIVFAVMLSILSLIGIFNRSFRTGIKRR-------------------- 387 • *
DNILVTWQPPRKDPSAVQEYWEWRELHPG-GDTQVPLNWLRSRPYNVSA 483
NMLWVEWTTPRE - - >SVKKYILEWCVLS---DKAPCITDWQQEDGTVHRT 480
----------------ILLLIPKWLYEDIPNMKNSNWKMLQEN----SE 417 *
-f huIL-12R 2 434 hugpl30 481 huDCRS5 418
LISENIKSYICYEIRVYALSGDQ-GGCSSILGNSKHKAPLSGPHINAITE YLRGNLAESKCYLITVTPVYADGPGSPESIKAYLKQAPPSKGPTVRTKKV LMNNKSSE--------QVLYVDP-----MITEIKEIFIPEHKPTDYKKE* * * * *
532
530
453 huIL-12R 2 533 hugpl30 531 hUDCRS5 454
EKGSILISWNSIPVQEQMGCLLEYRIYWKERDSNSQPQLCEIPYRVSQNS
GKNEAVLEWDQLPVDVQNGFIRNYTIF YRTIIGN----ETAVNVD S SHTE
- -NTGPLETRDYP---QNSLFDNTTWYIPDLNTG------YKPQISN- * * *
582
U76
490 huIL-12R 2 583 hugpl30 577 huDCRSS 491
HPINSLQPRVTYVLWMTALTAAGESSHGNEREFCLQGKAN-WMAFVAPSI YTLS SLTSDTL YMVRMAAYTDEG - GKDGPEFTFTTPKFAQGEIEAI WP V ------------------FLPEG--------------------------★
631
625
495 huIL-12R 2 632 hugpl30 626 huDCRS5 496
CIAIIMVGIFSTHYFQQKVFVLLAALRP-----------QWCSREIPDPA
CL^FLLTTLLGVLFCFNKRDLIKKHIWPNVPDPSKSHIAQWSPHTPPRHN -----------SHLSNNN- EITSLTLKP--------------PVDSLDSG . *
670
675
519 huIL-12R 2 671 hugp!30 676 huDCRS5 520
NSTCAKKYPIAEEKTQLPLDRLLID-WPTPEDPEPLVIS --EVLHQVTPV FNSKDQMYSDGNFTDVSWEIEANDKKPFPEDLKSLDLFKKEKINTEGHS NNPRLQKHPN-FAFSVSSVNSLSNT-------------1---FLGELSLI
717
725
552 huIL-12R 2 718 hugpl30 726 huDCRSS 553 frhppcsnwpqrekgiqghqasekdmmhsassppppralqaesrqlvdly SGIGGSSCMSSSRPSISSSDENESSQNTSSTVQYSTWHSGYRHQVPŠVQ LNQGECS---S - - PDIQNSVEEETTMLLENDSP----------------. * * *
767
775
580 huIL-12R 2 768 hugpl30 776 huDCRS5 581
KVLESRGSDPKPENPACPWTVLPAGDLPTHDGYLPSN---IDDLPSEEAP
VFSRSESTQPLLDSEERPEDLQLVDHVDGGDGILPRQQYFKQNCSQHESS - -SETIPEQTLLPDEFVSCLGIVNEELPSINTYFPQN ILESHFNR- 814
825
623 huIL-12R 2 815 hugpl30 826 huDCRSS 624
LADSLEELEPQHISLS-----VFPSSSLEPLTFSCG-------------PDISHFERSKQVSSVNEEDFVRLKQQISDHISQSCGSGQMKMFQEVSAAD
--ISLLEK * *
845
875
629 huIL-12R 2 846 hugpl30 876 huDCRS5 630
----------DKLTLDQLKMRCDSLML 362
AFGPGTEGQVERFETVGMEAATDEGMPKSYLPQTVRQGGYMPQ 913
629
Nejbližší příbuzní , extrabuněčné oblasti „IL-30R jsou signální transduktor IL-6 gpl30 a IL-12RP2. Méně blízcí příbuzní jsou receptor GCSF, receptor leptinu, receptor faktoru inhibující leukémii a receptor CNTF. Tak „IL-30R je člen třídy I větve superrodiny receptoru cytokinů a je úzce příbuzný rodině IL-6R/I1-12R.
Tabulka 3 zobrazuje porovnání dostupných sekvencí podjednotek receptoru primátu s DCRS5(IL-30R) primáta, například člověka. DCRS5 vykazuje podobnost s podjednotkou gpl30 receptoru IL-β (například podjednotka IL-6R) a s podjednotkou IL-12RP2. DCRS5 vykazuje strukturální rysy podjednotky beta, ale skutečná sekvence proteinových interakcí a signalizace zůstává nevyřešena.
Termín DCRS5 se může použít k popisu proteinu, který obsahuje aminokyselinovou sekvenci zobrazenou v tabulce č. 1. V mnoha případech jeho podstatný fragment bude funkční a strukturní ekvivalent vyvolávající další extracelulární segmenty. Vynález dále popisuje variace proteinu alely DCRS5, jejíž sekvence se popisuje shora v textu, například mutein nebo jiná konstrukce. V typickém případě takové variace budou vykazovat méně než přibližně 10% rozdíl sekvence ve srovnání s cílovou oblastí, takže budou často mít jednu až jedenáct substitucí, například 2, 3, 5, 7 substitucí. Zdůrazňují se také alelové a jiné varianty, například přirozený polymorfizmus, popsaného proteinu. V typickém případě se budou vázat s vysokou afinitou na odpovídající biologický ligand, možná v dimerizovaném stádiu s podjednotkou receptoru alfa, například alespoň s přibližnou koncentrací 100 nM, obvykle lépe než přibližně 30 nM, s výhodou lépe než přibližně 10 nM a ještě výhodněji lépe než přibližně 3 nM. Termín také zahrnuje příbuzné přirozeně se vyskytující formy, například alely, polymorfní varianty a metabolické varianty proteinu savce. Výhodné formy receptorových komplexů se budou vázat na vhodný i
ligand s afinitou a selektivitou vhodnou pro interakci ligandreceptor.
Tento vynález dále zdůrazňuje kombinace proteinů nebo peptidů, které vykazují podstatnou identitu aminokyselinové sekvence uvedené v tabulce č. 1. Budou zahrnovat varianty sekvence s relativně malým množstvím substitucí, například s výhodou méně než přibližně 3 až 5.
Podstatný polypeptidový „fragment nebo „segment je pruh aminokyselinových zbytků obsahujících alespoň přibližně 8 aminokyselin, v obecném případě alespoň 10 aminokyselin, více obecně alespoň 12 aminokyselin, často alespoň 14 aminokyselin, častěji alespoň 16 aminokyselin, v typickém případě alespoň 18 aminokyselin, více typické je, když obsahují alespoň 20 aminokyselin, obvykle alespoň 22 aminokyselin, obvykleji alespoň 24 aminokyselin, výhodné je alespoň 26 aminokyselin, výhodnější je alespoň 28 aminokyselin a ve zvláště výhodném provedení vynálezu alespoň přibližně 30 nebo více aminokyselin. Sekvence segmentů různých proteinů se mohou porovnávat jeden s druhým ve vhodné délce pruhů. V mnoha situacích fragmenty mohou vykazovat funkční vlastnosti nedotčených podjednotek, například extrabuněčná oblast transmembránového receptoru si může ponechat schopnost vázat se na ligand a může se použít k přípravě rozpustného komplexu podobného receptoru.
Homologie aminokyselinové sekvence nebo shoda sekvence se stanoví optimalizací párování zbytků. Při určitém porovnání je možné začlenit mezery, je-li to nutné (popisuje se například v publikaci Needleham, et al., (1970) J. Mol. Biol. 48: 443453, Sankoff et al., (1983) kapitola jedna v Time Warps, String Edits, and Macromolecules: The Theory and practice of sequence comparison, Adctison-Wesley, Reading, MA, použil se software IntelliGenetícs, Mountain View, CA a the University of Wisconsin Genetics Computer Group (GCG), Madison, WI) . To se mění, když se jako párování uvažují konzervativní substituce. Konzervativní substituce v typickém případě zahrnují substituce v následujících skupinách: glycin, alanin, valin, izoleucin, leucin, kyselina aspartová, kyselina glutamová, asparagin, glutamin, serin, threonin, lyzin, arginin a fenylalanin, tyrosin. Předpokládá se, že homologní aminokyselinové sekvence zahrnují v sekvenci cytokinu přirozené alelové a vnitrodruhové variace. Typické homologní proteiny nebo peptidy vykazují 50 až 100 % homologie (v případě, že se zavedou mezery) , 60 až 100 % homologie (v případě, že budou zahrnovat konzervativní substituce), když se srovnávají se segmentem aminokyselinové sekvence uvedeného v tabulce č. 1. Míra homologie je alespoň přibližně 70 %, v obecném případě alespoň 76%, dále alespoň 81 %, často alespoň 85 %, častěji alespoň 88 %, v typickém případě alespoň 90 %, dále alespoň 92 %, obvykle alespoň 94 %, obvykleji alespoň 95 %, s výhodou alespoň 96 % a výhodněji alespoň 97 % a ve zvláště výhodných provedeních alespoň 98 % a více. Stupeň homologie bude kolísat s délkou porovnávaných segmentů. Homologní proteiny nebo peptidy, jako jsou alelové varianty, budou sdílet většinu biologických aktivit s provedením popsaným v tabulce č. 1, zvláště ve vnitrobuněčné části.
Termín „biologická aktivita se používá k popisu účinků na signalizaci, zánětlivé odezvy, přirozené imunity a/nebo morfogenního vývoje ligandů podobných cytokinu. Tyto receptory zprostředkovávají například aktivity fosfatázy nebo fosforylázy, které se obvykle měří standardními postupy (popisuje se například v publikaci Hardie et al., (eds. 1995) The protein kinase FactBook vols. I and II, Academie Press, San Diego, CA, Hanks, et al., (1991) Meth. Enzymol. 200: 3862, Hunter, et al·., (199S) Cell 70: 375-388, Lewin (1990) Cell 61: 743-752, Pines, et al., (1991) Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 56: 449-463 a Parker, et al., (1993) Nátuře 363:
• · · · · ·
736-738). Receptory nebo jejich části se mohou použít jako enzymy značící fosfatázou ke značení obecných nebo specifických substrátů. Podjednotky mohou také být funkčními imunogeny, aby vyvolaly protilátky nebo antigeny schopné vázat protilátky.
Termíny ligand, agonista, antagonista a analog například DCRS5 splňují rysy DCRS5 interakcí ligand-receptor, například v případě, kde receptor je přirozený receptor nebo protilátka. Buněčné odezvy jsou v typickém případě zprostředkovány cestou receptorovou tyrosinovou kinázu.
Ligand je molekula, která slouží buď jako přirozený ligand, na který se uvedený receptor nebo jeho analog váže nebo molekula, která je funkční analog přirozeného ligandů. Funkční analog může být ligand s úpravami struktury nebo to může být zcela nepříbuzná molekula s tvarem molekuly, který reaguje s vhodnými determinanty vázajícími se na ligand. Ligandy mohou sloužit jako agonisté nebo antagonisté (popisuje se například v publikaci Goodman, et al., (eds. 1990) Goodman and Gilman's: The Pharmacological Bases of Therapeutics, Pergamon Press, New York.
Racionální vzhled léků může být také založen na studiích struktury tvaru molekul receptoru nebo protilátky a jejich efektorů nebo ligand (popisuje se v publikací Herz, et al., (1997) J. Recept. Signál Transduct. Res. 17; 671-776 a Chaiken, et al., (1996) Trends Biotechnol. 14: 369-375). Efektory mohou být další proteiny, které zprostředkovávají jiné funkce při odezvě na navázání ligandů nebo jiné proteiny, které v normálním případě reagují s receptorem. Jeden způsob stanovení míst reagujících s se specifickými proteiny je stanovení fyzikální struktury, například krystalografie použitím paprsků X nebo dvourozměrná NMR. Tyto metody poskytují způsob zjištění, které aminokyselinové zbytky tvoří
molekulové kontaktní oblasti. Detailnější popis stanovení struktury proteinu se popisuje například v publikaci Blundell and Johnson (1976) Protein Crystalography, Academie Press, New York.
II. Aktivity
Proteiny podobné receptorům cytokinů, když se přidají nebo odstraní ze specifického substrátu, mají řadu různých aktivit, jako je například vnitrobuněčné prostřednictvím STAT4, úpravou při metabolizmu fosforečnanů. To v obecném případě povede k úpravě zánětlivé funkce, přirozené imunitní odezvě nebo k morfologickému účinku. Podjednotka bude pravděpodobně mít specificky nízkou s ligandem.
biologických signalizace proliferace například buněk nebo afinitu navázání
DCRS5 má charakteristické motivy signalizace receptoru prostřednictvím dráhy JAK (popisuje se v publikaci Ihle, et al., (1997) Stem Cells 15 (suppl. 1): 105-111, Silvennoinen, et al., (1997) APMIS 105: 497-509, Levý (1997) Cytokine Growth Factor Review 8: 81-90, Winston nad Hunter (1996) Current Biol. 6: 668-671, Barret (1996) Baillieres Clin. Gastroenterol. 10: 1-15 a Briscoe, et al., (1996) Phílos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 351: 167-171. Středem zájmu jsou vazebné motivy SH2 popsané shora v textu.
Biologické aktivity podjednotek receptoru cytokinů souvisí s přidáním nebo odstraněním fosforečnanových částí do nebo z substrátů v typickém případě specifickým způsobem v netypickém případě nespecifickým způsobem. Substráty se mohou identifikovat nebo podmínky enzymatické aktivity se mohou testovat použitím standardních testů (popisuje se například v publikaci Hardie, et al., (eds. 1995) The protein kinase FactBook vols. I and II, Academie Press, San Diego, CA, • · · ·
Ο Λ · · ·· * · · · *
Z 4··· · ♦* ··· ·· ··
Hanks, et al., (1991) Meth. Enzymol. 200: 38-62, Hunter, et al., (1992) Cell 70: 375-388, Lewin (1990) Cell 61: 743-752, Pines, et al., (1991) Cold Spring Harbor Symp. Quant. Biol. 56: 449-463 a Parker, et al., (1993) Nátuře 363: 736-738).
Podjednotky receptoru se mohou kombinovat za vzniku funkčních komplexů, které se mohou například použít při navázání ligandu nebo přípravě protilátek. Ty se mohou použít pro diagnostické účely zahrnující detekci nebo kvantifikaci. Funkční vazba receptoru s ligandem p40/IL-B30 poskytuje důležitá proniknutí do klinické indikace, že je možné použít receptor. Tak antagonisté a agonísté budou mít předpokládané funkční účinky.
III. Nukleové kyseliny
Vynález popisuje použití izolované nukleové kyseliny nebo fragmentů, které například kódují uvedené nebo úzce příbuzné proteiny nebo jejich fragmenty. Kódují například odpovídající polypeptid, s výhodou ten, který je biologicky aktivní. Navíc tento vynález popisuje izolovanou a rekombinantní DNA, která kóduje kombinace takových proteinů nebo polypeptidů, které mají charakteristické sekvence, jako je například samotný DCRS5 nebo v kombinaci s jinými, jako je podjednotka IL-12Rpl (popisuje se v publikaci Showe, et al. (1996) Ann. N.Y. Acad. Sci. 795: 413-425, Gately, et al., (1998) Ann. Rev. Immunol.
16: 495-521, GenBank U03187, NM_005535) . V typickém případě je nukleová kyselina schopna hybridizovat za vhodných podmínek se segmentem sekvence nukleové kyseliny zobrazeným v tabulce č. 1, ale s výhodou nehybridizuje s odpovídájícími segmenty jiných receptorů zobrazenými v tabulce č. 3. Uvedený biologicky aktivní protein nebo polypeptid může být protein v plné délce nebo jeho .^fragment a bude v typickém případě obsahovat vysoce homologní segment aminokyselinové sekvence, který například vykazuje podstatnou shodu se segmentem uvedeným v tabulce č. ,1. Vynález dále popisuje použití izolované nebo rekombinantní nukleové kyseliny nebo jejího fragmentu, který kóduje proteiny obsahující fragmenty, které jsou ekvivalentní s proteiny DCRS5. Jako jsou například vnitrobuněčné části. Izolované nukleové kyseliny mohou mít regulační sekvence na 5' a 3'koncích. Jsou to například promotory, zesilovače, poly-A adiční signály a jiné, které pochází z přirozeného genu. Vynález také popisuje kombinace, například kombinaci DCRS5 s IL-12Rpi nebo jejich extrabuněčné části vázající se na ligand, jako ligandové antagonisty. Důležitá je také možnost využití pro diagnostické účely, například polymorfní nebo jiné varianty.
Popisuje se izolovaná nukleová kyselina, například RNA, DNA nebo smíchaný polymer, který je v podstatě čistý, například separovaný od jiných komponentů, jenž přirozeně doprovází přirozenou sekvenci, jako jsou ribozomy, polymerázy a přilehlé genomové sekvence z originálních druhů. Termín zahrnuje sekvenci nukleové kyseliny, která se vyňala ze svého přirozeného prostředí a zahrnuje rekombinantní a klonované izoláty DNA, které se tím stávají odlišitelné od přirozeně se vyskytujících látek a chemicky syntetizovaných analogů nebo analogů biologicky syntetizovaných heterologními systémy. V podstatě čistá molekula zahrnuje izolované formy molekuly, buď zcela nebo částečně čisté.
Izolovaná nukleová kyselina bude v obecném případě homogenní seskupení molekul, ale v některých provedeních bude obsahovat heterogenitu přednostně minoritní. Tato heterogenita byla v typickém případě zjištěna na koncích nebo v částech polymerů a zjistilo se, že není kritická pro požadovanou funkci nebo aktivitu.
Termín „rekombinantní nukleová kyselina se v typickém případě definuje svou metodou produkce nebo svou strukturou.
• ·
26*
Pokud jde o způsob produkce, například produkt připravený určitým způsobem, způsob používá metodu rekombinace nukleové kyseliny, například zahrnuje lidský zásah do nukleotidové sekvence. V typickém případě tento zásah zahrnuje manipulaci in vitro, ačkoli za jistých okolností může zahrnovat klasické metody šlechtění zvířat. V jiném případě se nukleová kyselina může připravit generováním sekvence obsahující fúzi dvou fragmentů, které přirozeně na sebe nenavazují, ale to znamená, že se vyjmou přirozené produkty, například přirozeně se vyskytující mutanti, které se nacházejí ve svém přirozeném stádiu. Popisují se například produkty připravené transformací buněk pomocí vektorů, který se přirozeně nevyskytují, jako jsou nukleové kyseliny obsahující sekvenci získanou použitím libovolného způsobu syntézy oligonukleotidu. Takový způsob se často provádí, aby se nahradil například kodon redundantním kodonem, který kóduje stejnou nebo konzervativní aminokyselinu, zatímco v typickém případě zavádí nebo odstraňuje místo rozeznávané restrikčním enzymem nebo místo vhodné pro analýzu vztahu struktura - funkce. V jiném případě se použije způsob vhodný ke spojení segmentů nukleové kyseliny, které vykazují požadované funkce za vzniku jediné genetické identity obsahující požadovanou kombinaci funkcí, které nebyly nalezeny v běžně dostupných přirozených formách, fúzní protein. Místa rozeznávaná jsou často cílem takových umělých manipulací, ale jako specifické cíle se mohou použít také jiná místa, jako jsou promotory, místa replikace DNA, regulační sekvence, řídící sekvence nebo jiné použitelné rysy. Podobný koncept je určený pro rekombinantní polypeptid, například fúzní polypeptid. Tento polypeptid bude zahrnovat dimerickou repetici nebo fúzi DCRS5 s podjednotkou IL-12Rpi. Specificky jsou zahrnuty syntetické nukleové kyseliny, které nadbytečným genetickým kódem kódují polypeptidy ekvivalentní s fragmenty například kódující restrikčním enzymem • ·
DCRS5 a fúze sekvencí z různých odlišných příbuzných molekul, jako jsou jiní členové rodiny receptoru cytokinů.
Termín „fragment v kontextu s nukleovou kyselinou je souvislý segment obsahujííc alespoň 17 nukleotidů, v obecném případě obsahuje alespoň 21 nukleotidů, obecněji obsahuje alespoň 25 nukleotidů, obyčejně obsahuje alespoň 30 nukleotidů nebo alespoň 35 nukleotidů, často obsahuje alespoň 39 nukleotidů, více často obsahuje alespoň 45 nukleotidů, v typickém případě obsahuje alespoň 50 nukleotidů, více typické je, když obsahuje alespoň 55 nukleotidů, obvykle obsahuje alespoň 60 nukleotidů, více obvykle je, když obsahuje alespoň 66 nukleotidů, s výhodou obsahuje alespoň 72 nukleotidů, výhodnější je, když obsahuje alespoň 79 nukleotidů a zvláště se preferovaná jsou provedení obsahující alespoň 85 nebo více nukleotidů zahrnující 90, 100, 120, 140, 160, 180, 200 atd. nukleotidů. V typickém případě se fragmenty různých genetických sekvencí mohou vzájemně porovnávat v celé délce vhodného pruhu sekvence, zvláště definované segmenty, jako jsou oblasti popsané dále v textu.
Nukleová kyselina, která kóduje DCRS5 bude zvláště použitelná k identifikaci genů mRNA a cDNA, které kódují samotné DCRS5 nebo blízce příbuzné proteiny, jako je DNA, která kóduje polymorfní, alelové nebo jiné genetické varianty, které například pocházejí z různých jedinců nebo příbuzných druhů. Preferované sondy, které se mohou použít při takovém testování, jsou ty oblasti receptoru, které jsou konzervativní mezi různými polymorfními variantami nebo které obsahují nukleotidy, jenž postrádají specifitu a budou se vyskytovat v plné délce nebo skoro v plné délce. V jiných situacích je lépe použít sekvence specifické pro polymorfní variantu. Mohou se také stanovit kombinace polymorfních variant DCRS5 s variantami IL-12Rpi.
• · · ·
28··· ·
Vynález dále popisuje rekombinantní molekuly nukleové kyseliny a fragmenty, které mají sekvenci nukleové kyseliny shodnou nebo vysoce homologní s izolovanou DNA popsanou dále v textu. Sekvence budou často operativně spojené se segmenty DNA, které řídí transkripci, translaci a replikaci DNA. Tyto adiční segmenty v typickém případě asistují při expresi požadovaného segmentu nukleové kyseliny.
Homologní nebo vysoce shodné sekvence nukleové kyseliny, když se vzájemně srovnávají, například sekvence DCRS5, vykazují podstatnou podobnost. Standardy homologie v nukleových kyselinách jsou buď mírou homologie obecně užívaných v oboru porovnáním sekvence nebo jsou založeny na podmínkách hybridizace. Porovnatelné podmínky hybridizace se popisují detailněji dále v textu.
Podstatná shoda při porovnání sekvence nukleových kyselin znamená buď, že segmenty nebo jejich komplementární řetězce jsou shodné, když jsou optimálně spárovány s vhodnými nukleotidovými inzerty nebo delecemi, alespoň přibližně 60 % nukleotidů, v obecném případě alespoň 66 %, běžně alespoň 71 %, často alespoň 76 %, více často alespoň 80 %, obvykle alespoň 84 %, obvykleji alespoň 88 %, v typickém případě alespoň 93 %, více typické je alespoň přibližně 95 %, výhodné je alespoň 96 až 98 % nebo více a v určitých provedeních je shoda až 99 % nebo více. Tyto sekvence například zahrnují segmenty kódující strukturální oblasti nebo jiné popsané segmenty.
V jiném případě bude existovat podstatná shoda, když segmenty budou hybridizovat za podmínek selektivní hybridizace s řetězcem nebo jeho komplementem v typickém případě za použití sekvence získané ž tabulky č. 1. V typickém případě k selektivní hybridizaci dojde, když pruh alespoň přibližně 14-ti nukleotidů vykazuje alespoň přibližně 55 % homologii, »· · · · · * · v typickém případě alespoň přibližně 65 % homologii, výhodná je alespoň přibližně 75 % homologie a výhodnější je alespoň přibližně 90 homologie (popisuje se v publikaci Kanehisa (1984) Nucl. Acids Res. porovnávání se popisuje
12: 203-213). Délka homologního pro delší pruhy a v jistých provedeních vynálezu budou pruhy obsahovat alespoň 17 nukleotidů, v obecném případě alespoň 20 nukleotidů, obyčejně alespoň přibližně 24 nukleotidů, obvykle alespoň přibližně 28 nukleotidů, v typickém případě alespoň přibližně 32 nukleotidů, více typické je alespoň přibližně 40 nukleotidů, výhodné je alespoň přibližně 50 nukleotidů a výhodnější je alespoň přibližně 75 až 100 nebo více nukleotidů. V tomto případě pruhy zahrnují například 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350 atd. nukleotidů a jiné délky.
Přísné podmínky hybridizace s ohledem na homologii jsou přísné kombinované podmínky koncentrace soli, teploty, organického rozpouštědla a jiných parametrů, které v typickém případě řídí hybridizační reakce. Přísné teplotní podmínky hybridizace obvykle zahrnují teploty přesahující přibližně 30 °C, obvykle přesahují přibližně 37 °C, v typickém případě přesahují přibližně 45 °C, více typické je, když přesahují teplotu okolo 55 °C, s výhodou přesahují teplotu 65 °C a výhodnější je, když přesahují teplotu okolo 70 °C. Přísné podmínky koncentrace solí budou obyčejně nižší než přibližně 500 mM, obvykle nižší než přibližně 400 mM nebo nižší než 300 mM, v typickém případě nižší než přibližně 200 mM, s výhodou nižší než přibližně 100 mM a výhodněji nižší než přibližně 80 mM, dokonce nižší než přibližně 50 nebo 20 mM. Kombinace parametrů je však daleko důležitější než míra libovolného jediného parametru (popisuje se například v publikaci Wetmur and Davidson (1986) J. Mol.-Biol. 31: 349-370).
x.
Izolovaná DNA se může snadno upravit substitucí a delecí a začleněním nukleotidů a inverzemi nukleotidových pruhů. Tyto
úpravy vedou ke vzniku 'nových sekvencí DNA, které kódují určitý protein nebo jeho deriváty. Tyto upravené sekvence se mohou použít při produkci mutantních proteinů (muteinů) nebo k zesílení exprese různých druhů. Zesílená exprese může zahrnovat amplifikaci genů, zvýšenou transkripci a translaci a jiné mechanizmy. Takový mutant DCRS5 se liší od proteinů podobných receptorům cytokinů, které se přirozeně vyskytují, aminokyselinovou sekvencí upravenou delecí, substitucí nebo inzercí. Termín „místně specifický mutant DCRS5 zahrnuje protein, který vykazuje podstatnou shodu sekvence s proteinem uvedeným v tabulce č. 1 a v typickém případě sdílí většinu biologických aktivit nebo účinků forem popsaných shora v textu. Také se definují různé přirozené polymorfní varianty sekvencí.
Ačkoli místa místně specifické mutace jsou předem stanovena, mutanti nemusí být místně specifičtí. Mutageneze savčího DCRS5 je možné dosáhnout začleněním nebo delecí aminokyselin v genu, což je spojené s expresí. Může být vytvořena substituce, delece, inzerce nebo řada kombinací, aby vznikl konečná konstrukce. Inzerce zahrnuje fúze N-konce nebo C-konce. Náhodnou mutagenezi je možné provést v cílovém kodonu a u exprimovaných mutantů savčího DCRS5 je možné testovat požadovanou aktivitu, což umožňuje nalézt vztah mezi strukturou a aktivitou. Metody přípravy substitučních mutantů v předem stanovených místech DNA, které mají známou sekvenci, jsou dobře známy v oboru, například mutageneze primerem M13 (popisuje se v publikaci Sambrook, et al., (1989), Molecular Cloning: A Laboratory Manual, (2d ed.) vis. 1-3, CSH Press, NY, Ausubel, et al., (1987 a periodické doplňky) Current Protocols in Molecular Biology, Greene/Wiley, New York). Zvláště použitelné konstrukce jsou extrabuněčné části DCRS5 spojené se segmenty ΙΣ-12Κβ1).
• ·
Mutace v DNA by v normálním případě neměla umístit kódující sekvence mimo čtecí rámec a je výhodné, když nevzniknou komplementární oblasti, které by mohly hybridizovat za vzniku sekundární struktury mRNA, jako jsou smyčky nebo vlásenky.
Fosforamiditová metoda popsaná v publikaci Beaucage and Carruthers (1981) Tetra. Letts. 22: 1859-1862 bude produkovat vhodné syntetické fragmenty DNA. Dvouřetězcový fragment je možné často získat buď syntézou komplementárního řetězce a teplotní hybridizací řetězce za vhodných podmínek nebo adicí komplementárního řetězce za použití DNA polymerázy s vhodnou sekvencí primeru.
Metody polymerázových řetězcových reakcí (PCR) se mohou často aplikovat při mutagenezi. V jiném případě primery pro mutagenezi jsou běžně užívanými metodami pro přípravu definovaných mutací v předem stanovaných místech (popisuje se například v publikaci Innis et al. , (eds. 1990) PCR Protocols: A guide to methods and applications academie press, San Diego, CA a Dieffenbach and Dveksler (1995, eds.) PCR primer: A laboratory manual, Cold Spring Harbor Press, CSH, NY).
Jistá provedení vynálezu popisují kombinace látek obsahujících popsanou sekvenci receptoru. V jiném provedení vynálezu funkční části sekvencí mohou být spojeny tak, aby kódovaly fúzní proteiny. V jiných formách se mohou substituovat varianty popsaných sekvencí.
IV. Proteiny, peptidy
Jak se uvádí shora v textu, vynález popisuje DCRS5 primáta, jehož sekvence jsou uvedeny v tabulce č. 1, jak se také popisuje shora v textu. Vynález zahrnuje také alelove nebo jiné varianty, kterými jsou například fúzní proteiny • · · ·
32’** ’ kombinující části takových sekvencí s jinými, které zahrnují například IL-12Rpl, epitop tag a funkční oblasti.
Vynález také popisuje rekombinantní proteiny, jako jsou například heterogenní fúzní proteiny, které obsahují segmenty z uvedených proteinů primátů nebo hlodavců. Heterogenní fúzní protein je fúze proteinů nebo segmentů, které netvoří přirozeně fúze stejným způsobem. Fúzní produkt DCRS5 s jiným cytokinovým receptorem je spojitá molekula proteinu, která má sekvence fúzované v typické peptidové spojení, v typickém případě připravené jako jediný translační produkt a vykazující vlastnostizískané z každého zdroje peptidu. Podobný koncept se aplikuje pro sekvence heterogenních nukleových kyselin. Také se popisují kombinace různých označených proteinů za vzniku komplexů.
Navíc nové konstrukce se mohou vytvořit kombinací podobných funkčních nebo strukturálních oblastí z jiných příbuzných proteinů, jako jsou například receptory cytokinů nebo receptory podobné Toll zahrnující varianty druhů. Segmenty vázající se na ligandy nebo jiné segmenty mohou být například přesunuty mezi nové fúzní polypeptidy nebo fragmenty (popisuje se například v publikaci Cunningham, et al., (1989) Science 243: 1330-1336 a 0'Dowd, et al., (1988) J. Biol. Chem. 263: 15985-15992). Pak nové chimérické polypeptidy vykazující nové kombinace specifity vzniknou z funkčního spojení specificity navázání na receptor. Oblasti vázající se na ligand z jiných příbuzných molekul se mohou přidat do jiných domén uvedeného nebo příbuzného proteinu nebo je mohou substituovat. Výsledný protein bude často míst funkci a vlastnosti hybridu. Fúzní protein může například zahrnovat oblast cílení, která může sloužit k zavedení fúzního proteinu do určité subbuněčné organely.
• · • · · · « * · ♦»· ·«· ······· · · ·· · « • · · · * ···»
33.............
Kandidát fúzních partnerů a sekvencí se může vybrat z různých databází sekvencí, jako je například GenBank, c/o IntelliGenetics, Mountain View, CA a BCG, University of Wisconsin Biotechnology Computing Group? Madison, WI. Zvláště výhodné jsou kombinace polypeptidových sekvencí uvedených v tabulce č. 1 a 3. Variační formy proteinů se mohou substituovat v popsaných kombinacích.
Vynález dále popisuje muteiny, které se váží na ligandy podobné cytokinům a/nebo jejichž transdukce je ovlivněna. Strukturální uspořádání lidského DCRS5 s inými členy rodiny receptoru cytokinů ukazuje konzervativní rysy/zbytky (uvádí se v tabulce č. 3). Seskupení sekvence lidského DCRS5 s jinými členy rodiny receptoru cytokinů indikuje různé strukturální a funkčně sdílené rysy (popisuje se v publikaci Bazan et al., (1996) Nátuře 379: 591, Lodi, et al., (1994) Science 263: 1762-1766, Sayle and Milner-White (1995) TIBS 20: 374-376 a Gronenberg, et al.', (1991) Protein Engeneering 4: 263-269).
Zvláště výhodné jsou substituce provedené s myšími sekvencemi nebo s lidskými sekvencemi. Naopak konzervativní substituce vzdálené od oblastí interakce vázající ligand budou pravděpodobně chránit většinu signalizačních aktivit a konzervativní substituce vzdálené od vnitrobuněčných oblastí budou pravděpodobně chránit většinu vlastností navázání na ligand.
Termín „deriváty DCRS5 primáta zahrnují aminokyselinovou sekvenci mutantů, glykosylační variace, metabolické deriváty a kovalentní nebo agregační konjugáty s jinými chemickými částmi. Kovalentní deriváty se mohou připravit spojením funkčnosti se skupinami, které se nacházejí ve vedlejších aminokyselinových řetězcích nebo na jejich N-konci, například způsoby, které jsou dobře známy v oboru. Tyto deriváty mohou zahrnovat bez omezení alifatické estery nebo amidy • · · • · · · · • · · ♦ · * karboxylového konce nebo· zbytky obsahující karboxylová boční řetězce, zbytky obsahující O-acylové deriváty hydroxylová skupiny a N-acylové deriváty N-terminální aminokyseliny nebo zbytky obsahující aminoskupinu, například lyzin nebo arginin. Acylové skupiny se vybraly ze skupiny alkylových částí, které zahrnují C3 až C18 normální alkyl, čímž se tvoří alkanoylaroylové druhy.
Zahrnují se také glykosylační změny, které vznikly například úpravou glykosylačních paternů polypeptidu během syntézy a zpracování nebo během dalších kroků zpracování. Zvláště výhodné způsoby provedení jsou vystavení polypeptidu glykosylačním enzymům získaným z buněk, které normálně poskytují takové zpracování, jako jsou například savčí glykosylační enzymy. Vynález také zahrnuje uvedené glykosylační enzymy. Vynález dále zahrnuje verze stejné primární aminokyselinové sekvence, která má jiné minoritní modifikace zahrnující fosforylované aminokyselinové zbytky, jako je například fosfotyrosin, fosfoserin nebo fosfothreonin.
Hlavní skupina derivátů jsou kovalentní konjugáty receptorů nebo jejich fragmentů s jinými proteiny polypeptidu. Tyto deriváty se mohou syntetizovat v rekombinantní kultuře, jako jsou N-terminální fúze nebo použitím činidel, jejich použitelnost pří řetězení proteinů prostřednictvím reaktivních vedlejších skupin je dobře známa v oboru. Výhodná derivatizační místa pomocí řetězících činidel jsou ve volných aminoskupinách, v sacharidových částech a na cysteinových zbytcích.
Popisují se fúzni polypeptidy mezi receptory a jinými homologními nebo heterologními proteiny. Homologní polypeptidy mohou tvořit fúze mezi různými receptory za vzniku hybridního proteinu, který vykazuje 'vazebnou specifítu pro řadu různých cytokinových ligandů nebo receptor, který může mít širokou • 9 • · · * ».».:· • · · · · · • · « · · 9 «99999« « · « 9 · « α · · 9 Λ ···« ··· 9 ·· 999 ·· »· nebo slabou specifitu substrátového účinku. Podobně se mohou zkonstruovat heterologni fúze, které budou vykazovat kombinaci vlastnosti nebo aktivit získaných proteinů. Typické příklady jsou fúze reportního polypeptidu, například luciferáza se segmentem nebo oblastí receptoru, jako je například segment vázající se na ligand tak, že je možné jednoduše stanovit přítomnost nebo lokaci požadovaného ligandu (popisuje se například v publikaci Duli et al., patentový dokument USA č. 4 859 609). Další fúzní partneři zahrnují glutathion-Stransferázu (GST), bakteriální β-galaktozidázu, trpE, protein A, β-laktamázu, alfa-amylázu, dehydrogenázu alkoholu a kvasinkový kopulační faktor alfa (popisuje se v publikaci Godowski, et al., (1988) Science 241: 812-816). Značené proteiny se budou často substituovat v popsaných kombinacích proteinů. Zvláště podstatná jsou spojení DCRS5 s IL-12í^l.
Fosforamiditový způsob popsaný v publikaci Beaucage and Carruthers (1981) Tetra, Letts. 22: 1859-1862, bude produkovat vhodné syntetické fragmenty DNA. Dvouřetězcový fragment je možné často získat buď’ syntézou komplementárního řetězce a teplotní hybridizací řetězců za vhodných podmínek nebo adicí komplementárního řetězce za použití DNA polymerázy s vhodnou sekvencí primeru.
Takové polypeptidy mohou také mít aminokyselinové zbytky, které mohou být chemicky upraveny fosforylací, sulfonací, biotinylací nebo adicí nebo odstraněním jiných částí zvláště těch, které mají molekulové tvary podobné fosfátovým skupinám. V některých provedeních úpravy budou použitelná značící činidla nebo budou sloužit jako cíle izolace, jako jsou například afinitní ligandy.
Fúzní proteiny budou v typickém případě vyrobeny metodou rekombinace nukleových kyselin nebo metodou syntetických polypeptidů. Metody manipulace a exprese se obecně popisují v publikaci Sambrook, et al., (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual, (2d ed.), vols. 13, CSH Press NY, nebo Ausubel, et al., (1987 a periodické doplňky) Current Protocols in Molecular Biology, Greene/Wiley, New York). Metody syntézy polypeptidů se popisují například v publikaci Merrifield (1963) J. Amer. Chem. Soc. 85: 2149-2156, Merrifield (1986) Science 232: 341-347 a metoda přípravy větších polypeptidů se popisuje v publikaci Atherton, et al., (1989) Solid Phase Peptide Synthesis: A practical approach, IRL Press, Oxford a také Dawson, et al., (1994) Science 266: 776-779).
Tento vynález dále popisuje použití derivátů DCRS5 jiných než jsou variace v aminokyselinové sekvenci nebo glykosylace. Takové deriváty mohou zahrnovat kovalentní nebo agregativní spojení s chemickými částmi. Tyto deriváta v obecném případě spadají do tří tříd: 1) sole, 2) boční řetězec a kovalentní úprava terminálního zbytku a 3) adsorbční komplexy, například s buněčnými membránami. Takové kovalentní nebo agregativní deriváty je možné použít jako imunogeny, jako činidla v imunologických testech nebo při izolačních metodách, jako se používají při afinitním čištění receptoru nebo jiné vázající se molekule, kterou je například protilátka. Ligand cytokinu se může imobilizovat kovalentní vazbou na pevný povrch, jako je sefaróza aktivovaná kaynbromidem způsoby, které jsou dobře známy v oboru, nebo adsorbovat na polyolefinové povrchy se sesítěním s glutaraldehydem nebo bez něho za účelem použití v testu nebo při čištění receptoru cytokinu, protilátek nebo jiných podobných molekul. Ligand se může také značit detekovatelnou skupinou, jako je například značení radioaktivním jódem pomocí postupu a chloraminem T, kovalentně vázanou na řídce se vyskytující cheláty kovů alkalických zemin nebo konjugované na jiné- fluorescenční části, které jsou vhodné pro použití v diagnostických testech.
• · · · · * « « « < '
9 9 * * · « w «.
Kombinace, která například zahrnuje DCRS5 podle vynálezu, se může použít jako imunogen při produkci antiséra nebo protilátek specifických pro popsané kombinace. Jsou například schopné rozlišit mezí jinými členy rodiny receptorů. Komplexy se mohou použít k testování monoklonálních protilátek nebo fragmentů vázajících antigen připravených imunizací s různými formami kontaminovaných přípravků, které obsahují protein. Termín „protilátky také zahrnuje fragmenty přirozených protilátek vázající antigen, například Fab, Fab2, Fv atd.. Izolovaný DCRS5 semůže také použít jako činidlo pro detekci protilátek vytvořených jako odezva na zesilující expresi nebo imunologické poruchy, které vedou k produkci protilátek proti endogennímu receptoru. Navíc fragmenty DCRS5 mohou také sloužit jako imunogeny vhodné pro produkci protilátek podle vynálezu, jak se popisuje bezprostředně dále v textu. Tento vynález dále popisuje protilátky, které mají vazebnou afinitu nebo jsou řízeny proti aminokyselinovým sekvencím zobrazeným v tabulce č. 1, jejich fragmentům nebo různým homologním peptidům. Vynález dále popisuje protilátky vykazující vazebnou afinitu nebo protilátky, které vznikly proti specifickým fragmentů, které budou vystaveny povrchu externích proteinů přirozeného DCRS5. Použitelné budou také komplexy kombinací proteinů a mohou se také vytvořit protilátkové přípravky.
V jistých jiných provedeních vynálezu se rozpustné konstrukce, například segmenty DCRS5 vázající extrabuněčný ligand, s IL-12Rpl mohou být vazebné kompozice pro ligand a mohou se také použít jako ligandový antagonisty nebo jako antigeny k blokaci signalizace zprostředkované ligandem. Takové konstrukce se mohou použít k diagnostickým účelům například pro histologické značení ligandů nebo pro terapeutické účely například jako antagonisti ligandů.
X
Blokování fyziologické odezvy na ligandy receptoru může vzejít z inhibice navázání ligandu na receptor, pravděpodobně • · * · · · • · > < · ··««· « ·· * • · » · » ·· * ·-* ·:'« prostřednictvím kompetitivní inhibice. Pak testy in vitro podle vynálezu budou často používat protilátky nebo segmenty těchto protilátek vázající antigen, rozpustné konstrukce receptoru nebo fragmenty spojené se substráty pevné fáze. Tyto testy také umožňují diagnostické stanovení účinků mutací nebo modifikací oblastí vázající ligand nebo jiných mutací nebo modifikací, které například ovlivňují signalizaci nebo enzymatickou funkci.
Vynález dále popisuje použití kompetitivních testů pro testování léků, kde například protilátky neutralizující receptorové komplexy nebo fragmenty soutěží s testovanou sloučeninou o navázání na ligand nebo jinou protilátku. Tímto způsobem se mohou neutralizační protilátky nebo fragmenty použít k detekci přítomnosti polypeptidu, který sdílí jedno nebo více vazebných míst vůči receptoru a také se může použít při obsazování vazebných míst na receptoru, které se může tak vázat na ligand. Konstrukce rozpustných receptorů kombinující extrabuněčná oblasti DCRS5 nebo oblasti DCRS5 vázající ligand s IL-12RP1 se mohou použít jako antagonisté pro kompetitivní navázání ligandu p40/IL-B30.
V. Příprava nukleových kyselin a proteinu
Dna, která kóduje protein nebo jeho fragment se může získat chemickou syntézou , testováním knihovny cDNA nebo testováním genomových knihoven připravených z mnoha buněčných linií nebo tkáňových vzorků. Přirozené sekvence se mohou izolovat použitím standardních metod a zde popsaných sekvencí (například v tabulce č. 1) . Jiné doplňky druhů se mohou identifikovat hybridizaci nebo různými metodami PCR kombinovanými s vyhledáváním v sekvenčních databází, jako je například GenBank. n.
• · • ·
Tato DNA se může · exprimovat v různých hostitelských buňkách za účelem syntézy receptoru v plné délce nebo fragmentu, který se může naopak například použít k vytvoření polyklonálních nebo monoklonálních protilátek, ve vazebných studiích, při konstrukci a expresi oblastí vázajících ligand nebo oblastí kinázy/fosfatázy a ke studiu vztahu struktury a funkce. Varianty nebo fragmenty se mohou exprimovat v hostitelských buňkách, které se transformují a transfekují vhodnými expresívními vektory. Tyto molekuly mohou být v podstatě bez proteinu nebo buněčných kontaminant, spíše než ty získané z rekombinantního hostitele a proto je možné je použít ve farmaceutických prostředcích, kde se kombinují s farmaceuticky přijatelným nosičem a/nebo ředidlem. Protein nebo jeho části se mohou exprimovat jako fúze s jinými proteiny. Zvláště zajímavé jsou kombinace požadovaných proteinů nebo nukleových kyselin, které je kódují.
Expresívní vektory jsou v typickém případě sami se replikující konstrukce DNA nebo RNA, které obsahují požadovaný receptorový gen, jeho fragmenty nebo kombinaci genů, obvykle operativně spojených s vhodnými genetickými řídícími elementy, které je možné najít ve vhodné hostitelské buňce. Řada genů může být postupně exprimována a mohou být na polycistronickém mesagge.Specifický typ řídících elementů nezbytný k dosažení exprese bude záviset na použití hostitelské buňky. V obecném případě genetické řídící elementy mohou zahrnovat prokaryontní promotorový systém nebo eukaryontní promotorový systém řídící expresí a v typickém případě zahrnuje transkripční promotor, operátor k řízení začátku transkripce, zesilovače transkripce, které zesilují expresi mRNA, sekvenci, která kóduje místo pro navázání na ribozóm, a sekvence, které ukončují transkripci a translaci. Expresívní vektory také obvykle obsahují počátek replikace, který umožňuje replikací vektoru nezávisle na hostitelské buňce.
• · · · · ·
Vektory podle vynálezu zahrnují ty, které obsahují DNA kódující popsanou kombinaci proteinů nebo biologicky aktivní ekvivalentní polypeptid. DNA může být řízena virovým promotorem a může kódovat selektivní markér. Vynález dále popisuje použití takových expresívních vektorů, které jsou schopny exprimovat eukaryontní cDNA kódující takové proteiny v prokaryontním nebo eukaryontním hostiteli, kde je vektor kompatibilní s hostitelem a kde eukaryontní cDNA jsou začleněny do vektoru tak, že při růstu hostitelské buňky, která obsahuje vektor, se exprimuje diskutovaná cDNA. V obvyklém případě se exprimované vektory navrhují tak, aby mohla proběhnout stabilní replikace v jejich hostitelských buňkách nebo amplifikace, která velmi zvýší celkový počet kopií požadovaných genů v buňce. Není vždy nezbytné vyžadovat, aby se expresívní vektor replikoval v hostitelské buňce. Je například možné, aby proběhla dočasná exprese proteinu nebo jeho fragmentů v různých hostitelích který neobsahují počátek replikace, hostitelskou buňkou. Je také možné použít vektory, které způsobují integraci částí kódujících protein do hostitelské DNA pomocí rekombinace.
za použití vektorů , který je rozeznáván
Zde používané vektory obsahují plazmidy, viry, bakteriofág, integrovatelné fargmenty DNA a jiné excipienty, které umožňují integraci fragmentů DNA do genomu hostitele. Expresívní vektory jsou specializované vektory, které obsahují genetické kontrolní elementy, jenž ovlivňují expresi operativně spojených genů. Plazmidy jsou běžně užívaná forma vektoru, ale mohou se použít všechny jiné formy vektorů, které vykazují ekvivalentní funkci a které jsou nebo se stávají dobře známy v oboru (popisuje se například v publikaci Pouwels, et al., (1985 a doplňky) Cloning Vectors: A laboratory manual, Elsevier, N.Y., a Rodriguez, et al., (eds. 1988) Vectors: A survey of molecular clonning vectors and their uses, Buttersworth, Boston).
Transformované buňky jsou buňky, s výhodou savčí buňky, které se transformovaly nebo ttransfekovaly s vektory konstruovanými za použití metod rekombinace DNA. Transformované hostitelské buňky exprimují požadované proteiny, ale pro účely klonování, amplifikace a manipulace DNA nepotřebují exprimovat proteiny. Vynález dále popisuje kultivaci transformovaných buněk v nutričním médiu, což umožňuje akumulaci proteinu. Proteiny je možné izolovat buď z kultury nebo v jistých případech z kultivačního média.
Pro účely vynálezu jsou nukleové sekvence operativně spojeny, když jsou vzájemně funkčně příbuzné. Například DNA presekvence nebo sekreční vedoucí sekvence je operativně spojena s polypeptidem, jestliže se exprimuje jako preprotein nebo se účastní řízení polypeptidu do buněčné membrány nebo při jeho sekreci. Promotor je operativně spojen s kódující sekvencí v případě že řídí transkripci polypeptidu. Místo vázající se na ribozom je operativně spojen s kódující sekvencí, jestliže je umístěna tak, aby dovolovala translaci. V obvyklém případě operativně spojený znamená souvislý a v jednom čtecím rámci, avšak jisté genetické elementy, jako jsou represorové geny nejsou souvisle spojeny, ale stále se váží na operátorové sekvence, které naopak řídí expresi.
Vhodné hostitelské buňky zahrnují prokaryonty, nižší eukaryonty a vyšší eukaryonty. Prokaryonty zahrnují gram negativní a gram pozitivní organizmy, jako jsou například E.
subtilis. Nižší eukaryonty zahenují kvasinky, cerevisíae a Pichia a druhy rodu Dictyostelium.
Vyšší eukaryonty zahrnují tkáňové kultivační buněčné linie pocházející ze zvířecích buněk, které nejsou savčího původu, například hmyzí buňky a buňky ptáků a buňky savčího původu, jako jsou například lidskéx.buňky, buňky primátů a hlodavců.
coli a B. například S
Prokaryontní hostitelské vektorové systémy zahrnují různé vektory pro řadu různých druhů. Pro účely vynálezu se v obecném případě používá mikroorganizmus E. coli a jeho vektory. Mohou se použít ekvivalentní vektory používané v případě jiných prokaryontů. Reprezentativní vektor vhodný pro amplifikaci DNA je pBR322 nebo řada jejich derivátů. Vektory, které se mohou použít k expresi receptoru nebo jeho fragmentů zahrnují, ale nejsou omezeny na takové vektory, které obsahují promotor lac (série pUC) , promotor trp (pBR322 trp), promotor Ipp (série pIN) , lambda pP nebo promotory pR (pOTS) nbeo hybridní promotory, jako je ptač (pDR540) (popisuje se v publikaci Brosius, et al., (1988) Expression vectors employing lambda and Ipp derived promotores, v Vectors: A survey of molecular clonning vectors and their uses (eds. Rodriguez and Denhardt) , Buttersworth, Boston, Chapter 10, pp. 205 236).
Nižší eukaryonty například kvasinky a Dictyostelium se mohou transformovat vektory obsahujícími sekvenci DCRS5. Pro účely tohoto vynálezu nejběžnějším nižším eukaryontním hostitelem jsou pekařské kvasinky Saccharomyces cerevisia. Tyto kvasinky se jsou používány k reprezentaci nižších eukaryontů, ačkoli je také dostupná řada jiných kmenů a druhů. Kvasinkové vektory v typickém případě obsahují počátek replikace (vyjma integračních typů), selekční gen, promotor, DNA kódující receptor nebo jiné fragmenty a sekvence pro ukončení translace, polyadenylaci a ukončení transkripce. Vhodné expresívní vektory určené pro kvasinky zahrnují takové konstitutivní promotory jako promotory genů 3-fosfoglycerátové kinázy a různé jiné promotory genů glykolytického enzymu nebo také índukovatelné promotory, jako je promotor dehydrogenázy alkoholu nebo promotor metalothioninu. Vhodné vektory zahrnují deriváty následujících typů: samostatně se replikující s malým počtem kopií (jako jsou série Yrp), samostatně se replikující s vysokým počtem kopií (jako jsou série Yep), integrační typy (jako jsou série Yip) nebo minichromozómy (jako jsou série YCp) .
Tkáňové buněčné kultury vyšších jsou v normálním případě výhodné hostitelské buňky vhodné pro expresi funkčně aktivního interleukinu nebo receptorových proteinů. V principu je možné použít řadu buněčných linií tkáňových kultur vyšších eukaryontů, jako jsou například expresívní systémy hmyzích bakulovirů ať už pochází z bezobratlých nebo z obratlovců. Preferují se však buňky savců. Transformace nebo transfekce a pomnožení takových buněk se stává rutinním postupem. Příklady takových použitelných buněčných linií zahrnují buňky HeLa, buněčné linie vaječníků čínských křečků (CHO), buněčné linie ledvin mláďat krys (BRK), hmyzí buněčné linie, ptačí buněčné linie, buněčné linie opic (COS). Expresívní vektory vhodné pro takové buněčné linie zahrnují počátek replikace, promotor, místo počátku translace, místa sestřihu RNA (jestliže se použije pouze DNA), polyadenylační místo a místo ukončení transkripce. Tyto vektory také v obvyklém případě obsahují selektivní gen nebo amplifikační gen. Vhodnými expresívními vektory mohou být plazmidy, viry nebo retroviry, které nesou promotory získané například z takových zdrojů, jako jsou adenoviry, SV40, parvoviry, virus vakcinie nebo cytomegalovírus. Reprezentativní vzorky vhodných expresívních vektorů zahrnují pCDNAl, pCD (popisuje se v publikaci Okayama, et al., (1985) Mol. Cell Biol. 5: 1136-1142), pMClneoPolyA (popisuje se v publikaci Thomas, et al. , (1987) Cell 51: 503512) a baculovirový vektor, jako je pAC 373 nebo pAC 610.
V případě vylučovaných proteinů a některých membránových proteinů otevřený čtecí rámec v obvyklém případě kóduje polypeptid, který obsahuje zralý nebo vylučovaný produkt kovalentně spojený s N-koncem signálního peptidu. Signální peptid se štěpí před sekrecí zralého nebo aktivního polypeptidu. Místo štěpení je možné předpovědět s vysokým • · · stupněm přesnosti z empirických pravidel (popisuje se například v publikaci von-Heijne (1986) Nucleic Acids Research 14: 4683-4690 a Nielsen, et al. (1997) Protein Eng. 10: 1-12) a přesné složení aminokyselin signálního peptidu se často nejeví být kritické ve spojení s jeho funkcí (popisuje se v publikaci Randall, et al., (1989) Science 243: 1156-1159, Kaiser et al. , (1987) Science 235: 317. Zralé proteiny podle vynálezu se mohou často stanovit za použití standardních metod.
Často bude nutné exprimovat tyto polypeptidy v systému, který poskytuje specifický nebo definovaný glykosylační patern. V tomto případě obvyklý patern bude ten, který je poskytován přirozeně expresívním systémem. Avšak patern se bude modufikovat vystavením polypeptidu, například neglykosylované formy, vhodným glykosylačním proteinům zavedeným do heterogenního expresívního systému. Receptorový gen se může společně transformovat jedním nebo více geny, které kódují savčí nebo jiné glykosylační enzymy. Za použití uvedeného přístupu jisté savčí glykosylační paterny budou dosažitelné v prokaryontních nebo jiných buňkách. Exprese v prokaryontních buňkách v typickém případě povede k neglykosylačním formám proteinu.
Zdroj DCRS5 může být eukaryontní nebo prokaryontní hostitel exprimující rekombinantní DCRS5, jak se popisuje shora v textu. Zdrojem může být také buněčná linie, ale jiné savčí buněčné linie, které také spadají do popisu uvedeného vynálezu. Výhodná buněčná linie pochází z lidského druhu.
že sekvence jsou známy, DCRS5 primáta, jeho deriváty se mohou připravit běžnými
V případě, fragmenty nebo způsoby syntézy peptidů. Tyto syntézy zahrnují způsoby syntézy popsané v publikaci Stewart peptide synthesis, Pierce and Young (1984) Solid phase Chemical Co., Rockford, IL,
Bodanszky and Bodanszky (1984) The practice of peptide synthesis, Springer Verlag, New York a Bodanszky (1984) The principles of peptide synthesis, Springer Verlag, New York. Například se může použít azidový postup, postup za použití kyselých chloridů, postup za použití kyselého anhydridu, postup použití míchaného anhydridu, způsob aktivního esteru (například p-nitrofenylester, ester N-hydroxysukcinimidu nebo ester kyanomethylu), karbodiimidazolu, oxidačně-redukční postup nebo dicyklohexylkarbodiimidový aditivní postup (DCCD). V případě shora v textu popsaných postupů je možné použít pevnou fázi a syntézu na pevné a kapalné fázi. Podobné metody lze použít s určitými sekvencemi DCRS5.
Proteiny DCRS5, fragmenty nebo deriváty je možné připravit v souladu se shora v textu popsanými postupy, které se v typickém případě používají pří syntéze peptidů. V obecném případě se používají tzv. postupné způsoby, které zahrnují kondenzaci aminokyseliny s terminální aminokyselinou, přičemž v sekvenci přibývá jedna za druhou nebo připojení peptidových fragmentů k termální aminokyselinou. Aminoskupiny, které se nepoužily při pérovací reakci se v typickém případě musí chránit, aby se předešlo interakci na špatném místě.
Jestliže se adoptovala syntéza na pevné fázi, C-terminální aminokyselina je vázána na nerozpustném nosiči nebo je podložena karboxylovou skupinou. Nerozpustný nosič není zvláště limitován, pokud je schopen se vázat na reaktivní karboxylovou skupinu. Příklady takových nerozpustných nosičů zahrnují halometylové pryskyřice, jako je chlorometylová nebo bromometylová pryskyřice, hydroxylmetylová, fenolová pryskyřice, terciální alkyloxykarbonylhydrazidátová pryskyřice a podobně.
Aminoskupinou chráněna aminokyselina se váže v sekvenci prostřednictvím kondenzace své aktivované karboxylové skupiny a reaktivní aminoskupina dříve vytvořeného peptidu nebo řetězce za účelem postupné syntézy peptidu. Po syntéze kompletní sekvence se peptid oddělí od od nerozpustného nosiče za vzniku peptidu. Tento přístup syntézy na pevné fázi se popisuje v publikaci Merrifield, et al., (1963) J. Am. Chem. Soc. 85: 2149-2156.
Připravené proteiny nebo jeho fragmenty se mohou izolovat a čistit z reakční směsi způsoby separace peptidu. Je to například extrakce, srážení, elektroforéza, různé formy chromatografíe, imunoafinity a podobně. Receptory podle vynálezu se mohou získat v různých stupních čistoty v závislosti na požadovaném použití. Čistoty je možné dosáhnout použitím metod čištění proteinu, který se popisuje dále v textu, nebo použitím protilátek, které se popisují v metodách imunoabsorbční afinitní chromatografíe. Tato imunoabsorbční afinitní chromatografíe se provádí: nejdříve se naváží protilátky na pevný povrch a pak přijdou do kontaktu s rozpuštěným lyzátem vhodných buněk, s lyzáty jiných buněk exprimující receptor nebo s lyzáty nebo supernatanty buněk produkujících protein jako výsledek metod DNA (popisuje se dále v textu).
V obecném případě izolované proteiny budou alespoň ze 40 % čisté, běžně alespoň z 50 % čisté, obvykle alespoň z 60 % čisté, v typickém případě alespoň ze 70 % čisté, ve více typickém případě alespoň z 80 % čisté, s výhodou alespoň z 90 % čisté a výhodnější je alespoň z 95 % čisté a v určitých provedeních alespoň z 97 až 99 % čisté nebo více. Čistota je obvykle stanovena na základě hmotnosti. Je-li to vhodné aplikují se různé testy. Mohou se izolovat jednotlivé proteiny a pak se kombinují.
VI. Protilátky ······ · · ·· · · • ··· · · · · • · · ··· ·· · ·
Protilátky mohou vzniknout proti různým savčím proteinům DCRS5 a jejich fragmentům, které se přirozeně vyskytují v nativní formách a v jejich rekombinantních formách. Rozdíl je, že protilátky vůči aktivnímu receptoru jsou rozeznávány epitopy přítomnými v přirozených konformacích. Dále se popisují protilátky rozeznávající epitopy prezentovány kombinací DCRS5 s IL-12Rpi. Detekce denaturovaného antigenu je také použitlná například ve westernové analýze. Také se popisují anti-idiotypické protilátky, které budou použitelné jako agonisté nebo antagonisté přirozeného receptoru nebo protilátky.
Protilátky, zahrnující vazebné fragmenty a verze jediného řetězce, proti předem definovaným fragmentům proteinu mohou vzniknout imunizací zvířat konjugáty fragmentů s imunogeními proteiny. Monoklonální protilátky jsou připravené z buněk vylučující požadované protilátky. U těchto protilátek se může testovat jejich schopnost vázat se na normální nebo defektní protein nebo agonistická nebo antagonistická aktivita. Tyto monoklonální protilátky se budou obvykle vázat s hodnotou konstanty KD přibližně 1 mM, více obvyklá je přibližná hodnota 300 μΜ, v typickém případě je přibližná hodnota alespoň 100 μΜ, ve více typickém případě je tato hodnota konstanty alespoň přibližně 30 μΜ. Přednostně je hodnota konstanty KD alespoň 10 μΜ a více se preferuje hodnota konstanty alespoň přibližně 3 μΜ nebo lepší.
Protilátky zahrnující fragmenty vázající antigen podle vynálezu mohou mít podstatnou diagnostickou nebo terapeutickou hodnotu. Mohou být potencionální antagonisté, které se vážou na receptor a inhibují navázání na ligand nebo inhibují schopnost receptoru vyvolávat biologickou odezvu například působit na jeho substrát .^Protilátky se mohou také použít jako protilátky, které nemají neutralizační vlastnosti a mohou se spojovat s toxiny nebo ' radionuklidy, aby se vázaly na produkující buňky nebo buňky lokalizované na zdroji interleukinu. Tyto protilátky se mohou dále konjugovat s léky nebo jinými terapeutickými činidly buď přímo nebo nepřímo pomocí linkeru.
Protilátky podle vynálezu se mohou také použít při diagnostických aplikacích. Jako záchytné nebo neneutralizační protilátky se mohou vázat na receptor bez inhibujících ligandů nebo navázání substrátu. Neutralizační protilátky se mohou použít v kompetitivním vazebném testu. Budou se také moci použít při detekci nebo kvantifikaci ligand. Mohou se také použít jako činidla při analýze westernovým přenosem nebo při imunologickém srážení nebo imunologickém čištění proteinu. Podobně se mohou na pevných substrátech nebo plastových listech imobilizovat nukleové kyseliny a proteiny. Substráty mohou být například částice z pevné pryskyřice nebo listy plastu.
Fragmenty proteinů se mohou vázat na jiné materiály, zvláště peptidy, jako fúzované nebo kovalentnš vázané polypeptidy, aby se mohly použít jako imunogeny. Savčí fúzovat nebo je hemocyanin receptory cytokinů a fragmentů se mohou kovalentně vázat na různé imunogeny, jako přílipkovitých plžů, albumin bovinního séra, toxoid tetanu (popisuje se v publikaci Microbiology, Hoeber Medical
Division, Harper and Row, 1969, Landsteiner (1962) Specifity of serological reactions, Dover Publications, New York a Wiliams, et al., (1967) Methods in Immunology and
Immunochemistry, Vol. 1, Academie Press, New York), kde se také popisují metody přípravy polyklonálního antiséra. Typická metoda zahrnuje hyperimunizaci zvířete s antigenem. Krátce po opakované imunizaci se shromáždí krev zvířete a izoluje se gamaglobulin.
• · ·· · ······ • · · ···· ·· · • · · ··« ··« ····«·· · · ·· · · • · · · · ···· ··· * ·· ··· ·· ··
V některých případech je nutné připravit monokionální protilátky z různých savčích hostitelů, jako je myš, hlodavci, primáti, lidé atd. Popis metod vhodných pro přípravu takových monoklonálních protilátek se nachází například v publikaci Stites, et al., (eds.) Basic and Clinical Immunology (4 th. ed.), Lange Medical Publications, Los Altos, CA, Harlow and Lané (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH Press, Goding (1986) Monoclonal Antibodies: Principles and practice (2d ed.) Academie Press, New York a zvláště v publikaci Kohler and Milstein (1975) in Nátuře 256: 495-497, kde se popisuje metoda generující monokionální protilátky. Tato metoda zahrnuje zavedení imunogenu do zvířete injekcí. Zvíře se pak usmrtí a ze sleziny se odeberou buňky , které se pak fúzují s buňkami myelomu. Výsledek je hybridní buňka nebo „hybridom, který je schopný se reprodukovat in vitro. Pak se testuje populace hybridomů za účelem izolovat jednotlivé klony, kdy každý z nich vylučuje jediný druh protilátek proti imunogenu. Tímto způsobem získané jednotlivé druhy protilátek jsou produkty imortalizovaných a klonovaných buněk B imunizovaného zvířete vytvořených jako odezva na specifické místo rozeznávané na imunogenní substanci.
Jiné vhodné metody zahrnují vystavení lymfocytů in vitro vůči antigenním polypeptidům nebo v jiném případě k selekci knihoven protilátek ve fágu nebo v podobných vektorech (popisuje se v publikaci Huse, et al., (1989) Generation of a large combinatorial library of the immunoglobulin repertoire in phage Lambda, Scinece 246: 1275-1281 a Ward, et al., (1989) Nátuře 341: 544-546). Polypeptidy a protilátky podle vynálezu se mohou použít s úpravami nebo bez úprav, které zahrnují chimérové nebo humanizované protilátky. Polypeptidy a protilátky budou často značeny kovalentním nebo nekovalentním připojením látky, která ·. poskytuje detekovatelný signál. Je známo široké rozmezí značících a konjugačních metod a jsou publikovány ve vědecké a patentové literatuře. K vhodnému
značení se používají radionukleotidy, enzymy, substráty, kofaktory, inhibitory, fluorescenční části, chemiluminiscenční části, magnetické částice a podobně. Použití takových značek se popisuje v patentové literatuře zahrnující US patent č. 3 817 837, 3 850 752, 3 939 350, 3 996 345, 4 277 437, 4 275 149 a 4 366 241. Mohou se také produkovat rekombinantní nebo chimérické imunoglobuliny (popisuje se v patentovém dokumentu USA č. 4 816 567) nebo imunoglobuliny připravené v transgenní myši (popisuje se v publikaci Mendez, et al. , (1997) Nátuře Genetics 15 : 146-156).
Protilátky podle vynálezu mohou být použity při afinitní chromatografií pří izolaci proteinů DCRS5 nebo peptidů. Mohou se připravovat kolony, kde protilátky jsou spojeny s pevným povrchem, například s částicemi jako je agaróza, Sephadex nebo podobně, kde buněčný lyzát může procházet kolonou. Kolona se promyje a pak následuje zvýšení koncentrací slabého denaturačního činidla, čímž se uvolní izolovaný protein. V jiném případě se protein může použít při čištění protilátek. Mohou se aplikovat vhodné zkřížené absorbance nebo deplece.
Protilátky se mohou také použít k testování expresívních knihoven za účelem získání jistých expresívních produktů. Obvykle protilátky užívané při takovém postupu budou značeny značkou umožňující jednoduchou detekci antigenu navázanou protilátkou.
Protilátky vytvořené proti cytokinovému receptoru se budou také moci použít k vytvoření anti-idiotypických protilátek. Tyto protilátky bude možné použít při detekci nebo diagnostice různých imunologických podmínek vztažených k expresi proteinu _ nebo buněk, které exprimují uvedený protein. Uvedené buňky se mohou také použít jako agonisté nebo antagonisté ligandu, který může být kompetrtivním inhibitorem receptoru nebo substituentem přirozeně se vyskytujících ligand. Jisté protilátky proti podjednotkám receptoru nebo kombinacím mohou sloužit jako aktivační protilátky, které mohou působit signalizaci, čímž slouží například jako agonisté ligandů.
Protein receptoru cytokinů, který se specificky váže nebo je specificky imunoreaktivní s protilátkou vytvořenou proti definovanému imunogenu, jako je imunogen obsahující aminokyselinovou sekvenci SEQ ID NO: 2, je v typickém případě stanoven pomocí imunologického testu. Imunologický test v typickém případě používá polyklonální antisérum, které se vytvořilo například proti proteinu se sekvencí SEQ ID NO: 2. Toto antisérum se vybralo tak, aby vykazovalo nízkou zkříženou reaktivitu s jinými členy rodiny cytokinových receptorů, jako je například podjednotka receptoru IL-12RP2 nebo podjednotka gpl30 receptoru IL-6, s výhodou ze stejných druhů a libovolná taková zkřížená reaktivita je před použitím v imunologickém testu odstraněna imunoabsorpcí.
Za účelem produkovat antisérum vhodné pro použití v imunologickém testu, se izoluje protein například se sekvencí SEQ ID NO: 2. Rekombinantní protein se může například produkovat v savčí buněčné linii. Vhodný hostitel například imbrední kmen myši, jako je Balb/c je imunizován vybraným proteinem, v typickém případě se používá standardní adjuvans, jako je Freundovo adjuvans, a standardní imunizační protokol pro myši (popisuje se v publikaci Harlow and Lané (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH Press, Goding (1986) Monoclonal Antibodies: Principles and practice (2d ed.) Academie Press, New York). V jiném případě se jako imunogen může použít syntetický peptid získaný ze zde popsaných sekvencí a je konjugován s nosičovým proteinem. Shromáždila se polyklonální antiséra a ·títrovala se proti imunogennímu proteinu v imunologickém testu. Použil se například imunologický test a imunogenem imobilizovaným na pevném povrchu. Polyklonální antisérum s titrem 104 nebo vyšší se • · · « vybralo a testovalo za účelem zjištění jeho zkřížené reaktivity proti členům rodiny cytokinových recepotrů, jako je například gpl30 nebo IL-12Rpl za použití kompetitivního vazebného imunologického testu, jak se popisuje v publikaci Harlow and Lané (1988) Antibodies: A Laboratory Manual, CSH Press, Goding (1986) Monoclonal Antibodies: Principles and practice (2d ed. ) Academie Press, New York na stránkách 570573). Při tomto stanovení se používají s výhodou dva členové rodiny cytokinových receptorů. Tyto členové rodiny cytokinových receptorů se mohou produkovat jako rekombinantní proteiny a izolovaly se za použití standardní molekulové biologie a popsaných metod chemie proteinů.
Imunologické testy v kompetitivním vazebném formátu se mohou použít při stanovení zkřížené reaktivity. Protein se sekvencí SEQ ID NO: 2 se může zmobilizovat na pevný podklad. Proteiny přidané do testu mohou soutěžit s navázáním antiséra s imobilizovaným antigenem. Schopnost shora popsaných proteinů soutěžit v navázání antiséra na zmobilizovaný protein se porovnává s proteiny, jako je například gpl30 nebo IL-12RP2. Procento zkřížené reaktivity shora uvedených proteinů se vypočítala za použití standardního výpočtu. Vybrala se a shromáždila se antiséra se zkříženou reaktivitou nižší než 10 % pro každý protein uvedený shora v textu. Zkříženě reagující protilátky se pak odstraní ze shromážděného antiséra imunologickou absorpcí se shora uvedenými proteiny.
koncentrací a k inhíbici 50
Imunologicky absorbovaná a shromážděná antiséra se pak použily v kompetitivním vazebném imunologickém testu, jak se popisuje shora v textu, aby se porovnal druhý protein s imunogenním proteinem (například protein podobný DCRS5 se sekvencí SEQ ID NO: 2) . Za účelem uskutečnit toto porovnání, se testoval každý ze\ dvou proteinů v širokém rozmezí stanovilo se množství každého proteinu nutné š navázání antiséra na zmobilizovaný protein.
4 4» · ···»·· ··· 4 4 · · ·· « • · * 4 4« · « · co ···»·«·· ···· · '-J -j · 4 44« «4··
444 4 ·4 4*4 ·· * ·
Jestliže nutné množství druhého proteinu je nižší než dvojnásobek množství vybraného proteinu nebo proteinu, který je nutný, pak se dá říci, že druhý protein se specificky váže na protilátku vytvořenou proti imunogenu.
Rozumí se, že tyto proteiny receptoru cytokinů jsou členové rodiny homologních proteinů, které obsahují řadu identifikovaných genů. V případě určitého genového produktu, jako je DCRS5, termín neznamená pouze zde popsané aminokyselinové sekvence, ale také jiné proteiny, které jsou alelické, nealelické nebo druhové varianty. Rozumí se, že termíny zahrnují nepřirozené mutace zavedené záměrnou mutací za použití běžné rekombinantní technologie, jako jsou mutace v jedné poloze nebo vystřiženým krátkých sekcí DNA kódující proteiny nebo substitucí nových aminokyselin nebo přidáním nových aminokyselin. Takové minoritní změny v typickém případě v podstatě udržovat imunologickou shodu původní molekuly a/nebo svou biologickou aktivitu. Tak tyto změny zahrnují proteiny, které jsou specificky imunoreaktivní s označenými přirozeně se vyskytujícím proteinem DCRS5. Biologické vlastnosti změněných proteinů se mohu stanovit expresí proteinu ve vhodné buněčné linii a měřením vhodného účinku například na transfekovaných lymfocytech. Určité minoritní úpravy proteinu zahrnují konzervativní substituci aminokyselin s podobnými chemickými vlastnostmi, jak se popisuje shora v textu v případě rodiny cytokinových receptorů jako celku. Srovnáním proteinu s proteinem cytokinových receptorů a použitím běžných zde popsaných imunologických testů za účelem stanovení imunologické shody je možné stanovit složení proteinu podle vynálezu.
Protilátky vytvořené proti podjednotkám receptoru mohou sloužit k prostorovému zablokování navázání ligandu na funkční receptor. Takové protilátky se mohou vytvořit buď proti • » · r « «··««· a · » » » * * « · « ·«·«·· » t · · » • ·« · <«·· ··· · ·» ·>« · « * · samotné podjednotce nebo proti kombinaci DCRS5 s IL-12Rpi. Výsledkem by měly být antagonisté protilátek.
VII. Sady, diagnózy a kvantifikace
V sadách a v testech podle vynálezu je možné použít přirozeně se vyskytující a rekombinantní formy molekul podobných receptoru cytokinů popsaných shora v textu. Tyto metody se mohou také aplikovat při testování vazebné aktivity, například ligandů, v případě uvedených proteinů. V současné době se vyvinulo několik metod automatického testování, které umožňují testování desetitisíců sloučenin v jednom roce (popisuje se v publikaci BIOMEK automated workstation, Beckman Instruments, Palo Alto, California a Fodor, et al., (1991) Science 251: 767-773). Později se popisují způsoby testování vazebných schopností velkého množství definovaných polymerů syntetizovaných na pevném substrátu. Vývoj vhodných testů k tetsování ligandů nebo agonistických/antagonistických homologních proteinů je umožněn schopností izolovat velké množství izolovaných, rozpustných cytokinových receptorů v aktivním stádiu.
Při testování shora popsaných ligandů je možné izolovaný DCRS5 vázat přímo na destičky. Avšak protilátky, které nemají neutralizační účinek vůči uvedeným proteinům, se mohou použít jako záchytné protilátky k imobilizaci receptoru na pevné fázi, což se dá využít pro diagnostické účely.
Vynález dále popisuje použití DCRS5, jeho fragmentů, peptidů a jejich fúzních produktů v různých diagnostických sadách a metodách při detekci přítomnosti proteinu nebo jeho ligandu. V jiném případě nebo navíc protilátky proti molekulám mohou být začleněny do sad a mohou se použít při různých metodách. V typickém případě sada bude mít nádobku obsahující buď peptid DCRS5 nebo segment genu nebo činidlo, které ·· ··· · ·· 9 ·· • « ····«·· · · 00 9 9 « «·« ««·· ··· * 99 999 99 99 rozeznává peptid nebo .genový segment. V typickém případě rozeznávací činidlo v případě peptidu bude receptorem nebo protilátkou nebo v případě genového segmentu by jím obvykle mohla být hybridizační sonda. Jiné složky sady mohou zahrnovat jiné proteiny nebo činidla příbuzná s polypeptidy p40, IL-B30 nebo IL-12Rpi párování ligand/receptor.
Výhodná sada pro stanovení koncentrace DCRS5 ve vzorku bude v typickém případě obsahovat značenou sloučeninu, nebo protlátku, která vykazuje známou například ligand vazebnou afinitu pro DCRS5, zdroj
DCRS5 (přirozeně se vyskytující nebo rekombinantní) jako pozitivní kontrolu a prostředky nevázaných pro separaci navázaných sloučenin od volných sloučenin, což je například pevná fáze pro imobilizaci DCRS5 v testovaném vzorku. V normálním případě sada obsahuje nádobky obsahující činidla a instrukce. Také jsou připraveny sady obsahující vhodnou nukleovou kyselinu nebo protein.
vázající antigen
Protilátky specifické pro fragmenty zahrnující fragmenty savčí DCRS5 nebo peptídový fragment nebo receptoru jsou použitelné při diagnostických aplikacích za účelem detekce přítomnosti zvýšeného množství ligandů a/nebo jeho fragmentů. Diagnostické testy mohou být homogenní (bez kroku separace mezi volným činidlem a komplexem protilátka-antigen) nebo heterogenní (s krokem separace). Existují různé běžné testy, jako je radioimunologický test (RIA), test ELISA, enzymatický imunologický test (EIA), test EMIT, substrátový imunologický test za použití fluorescenčního značení (SLFIA) a podobně. Neznačené protilátky mohou být použity jako sekundární protilátky, které jsou značeny a které rozeznávají protilátky vůči receptoru cytokinu nebo k jeho určitému fragmentu. Tyto^ testy se také velmi diskutují ve vědecké literatuře (popisuje se například v publikaci Harlow and Lané (1988) Antibodies: A laboratory manual, CSH a Coligan • · · · · · • · · (ed. 1991 and periodic supplements) Current protocols in immunology greene/Wiley, New York).
Anti-idiotypické protilátky mohou mít podobné použití. Mohou sloužit jako agonisté nebo antagonisté receptoru cytokinů. Mohou se také použít za vhodných okolností jako terapeutická činidla.
Činidla pro diagnostické testy jsou často dodávány přímo v sadách, aby se optimalizovala citlivost testu. Předmětem vynálezu v závislosti na podstatě testu je také protokol a značící činidlo, značené nebo neznačené protilátky nebo značený ligand. To je obvykle v kombinaci s jinými aditivy, jako jsou pufry, stabilizátory, materiály nezbytné pro produkci signálu, jako jsou substráty pro enzymy a podobně. Sada bude s výhodou obsahovat instrukce pro použití a likvidaci činidel po použití. V typickém případě sada obsahuje nádoby pro každé použitelné činidlo a bude obsahovat instrukce pro vhodné použití a likvidaci činidel. Je-li to nutné činidla se budou vyskytovat jako suchý lyofilizovaný prášek, přičemž se činidla dají uvést do vodného média a tak dosáhnout správné koncentrace pro uskutečnění testu.
Shora v textu uvedené konstituenty diagnostických testů se mohou použít bez úpravy nebo se mohou upravovat různými způsoby. Například značení se může provést kovalentním nebo nekovalentním spojením části, která přímo nebo nepřímo poskytuje detekovatelný signál. V řadě uvedených testů testovaná sloučenina, receptor cytokinu nebo jejich protilátky se mohou značit buď přímo nebo nepřímo. Možnosti přímého značení zahrnují značící skupiny: radioaktivní značení, jako je 125I, enzymy (popisuje se v patentovém dokumentu USA č. 3 645 090), jako je peroxidáza a alkalická fosfatáza a fluorescenční značky (popisuje se v patentovém dokumentu USA č. 3 940 475) schopné monitorovat změny intenzity • · ·· · ······ • · · ···· ·· ·
5Ί ······ · · ·· · · • ··· ···· ··· · ·· ··· ·» ·· fluorescence, posun vlnové délky nebo polarizaci fluorescence. Pravděpodobnost nepřímého značení zahrnuje značení jedné složky biotinem, pak následuje navázání na avidin, který je spojený s jednou ze shora popsaných skupin.
Existuje řada metod separace navázaného ligandu od volného ligandu nebo v jiném případě navázané sloučeniny od volné testované sloučeniny. Cytokinový receptor se může imobilizovat na různých matricích, po kterých následuje promytí. Vhodné matrice zahrnují plasty, jako jsou destičky vhodné pro test ELISA, filtry a částice. Metody imobilizujicí receptor na matrici zahrnují přímou adhezi na plast, použití záchytových protilátek, chemické spojování a biotin avidin. Poslední krok uvedeného přístupu zahrnuje srážení komplexu protilátka/antigen libovolnou z několika metod zahrnující tu, která používá například organické rozpouštědlo, jako je polyetylenglykol nebo sůl, jako je sulfát amonný. Jiné vhodné separační postupy zahrnují bez omezení metodu používající magnezivotelné částice fluoresceínem značených protilátek, jak se popisuje v publikaci Rattle et al. , (1984) Clin. Chem.
30(9): 1457-1461 a dvojitou protilátkovou separaci za použití magnetických částic (popisuje se v patentovém dokumentu USA č. 4 659 678).
Popisují se způsoby pro navázání proteinu nebo fragmentů na různé značky, které se dostatečně popisují v literatuře a nevyžadují další diskuzy. Řada technik pro vznik vazby používá aktivovaných karboxylových skupin buď použitím karbodiimidu nebo aktivních esterů za vzniku peptidových vazeb, vytvoření thioeterů reakcí merkaptoskupiny s aktivovaným halogenem, jako je chloroacetyl nebo aktivovaný olefin, jako je maleimid. Podle vynálezu se může také použít metoda fúze proteinů.
Jiný diagnostický přistup podle vynálezu zahrnuje použití oligonukleotidové nebo polynukleotidových sekvencí získaných ·· · · · «····· ··· · · · · · · · ·«···· · · ·· · · • « · · · · 4 · ··· « € · S · · ·· ·· ze sekvence cytokinového· receptorů. Tyto sekvence se mohou použít jako sondy pro detekci cytokinového receptorů u pacientů, u kterých se předpokládají imunologické poruchy.
V literatuře se popisuje a diskutuje příprava nukleotidových sekvencí RNA a DNA, značení sekvencí a výhodné místo sekvencí.
V normálním případě oligonukleotidová sonda by měla mít alespoň 14 nukleotidů, obvykle alespoň přibližně 18 nukleotidů a polynukleotidové sondy mohou být velikosti až několik kilobází. Mohou se použít různá značení, nejběžnější jsou radionukleotidy, zvláště 32P. Pro zavedení do polynukleotidů se mohou také použít nukleotidy upravené použitím biotinu. Biotin pak slouží jako místo pro navázání na avidin nebo protilátky, které se mohou značit rozmanitými druhy značících činidel, jako jsou radionukleotidy, fluorescenční činidla, enzymy nebo podobně. V jiném případě se mohou použít protilátky, které mohou rozpoznávat specifické duplexy, které zahrnují duplexy DNA a RNA, DNA a RNA hybridní duplexy nebo duplexy DNA a protein. Protilátky naopak mohou být značeny a testovány za účelem zjištění, kde je na povrchu vázán duplex tak, že na základě vytvoření duplexu na povrchu, je možné detekovat přítomnost protilátek na povrchu duplexu. Použití sond vůči nové antimediátorové RNA se může provést běžnými technikami, jako je hybridizace nukleových kyselin, testování plus a mínus, testování rekombinantními sondami, translace za uvolnění hybridů (HRT) a translace blokovaná hybridem (HART). Tyto techniky také zahrnují amplifikační metody, jako je polymerázová řetězcová reakce (PCR).
Vynález popisuje diagnostické sady, které se používají k testování přítomnosti kvalitativní nebo kvantitativní přítomnosti jiných markérů. Diagnóza a prognóza může záviset na kombinaci značících činidel (popisuje se v publikaci Viallet et al., (1989) Progress in growth factor res. 1: 8997). Detekce polymorfních variant, které mohou odrážet rozdíly signalizace funkčního receptorů se mohou použít při stanovení terapeutické strategie. Variace, které odráží větší nebo menší odezvu na ligand umožňují vybrání pacientů, kteří vykazují nebo nevykazují odezvu.
VIII. Terapeutické využití
Vynález popisuje činidla s podstatnou terapeutickou hodnotou (popisuje se v publikaci Levitzki (1996) Curr. Opin. Cell Biol. 8: 239-244). Cytokinové receptory (přirozeně se vyskytující nebo rekombinantní ), jejich fragmenty, receptory muteinu a protilátky spolu se sloučeninami, u nichž se ukázalo, že mají vazebnou afinitu vůči receptorům nebo protilátkám, by se měly použít při léčbě stavů, které vykazují abnormální expresi receptoru nebo jejich ligandu. Taková abnormalita se v typickém případě projevuje imunologickými poruchami (popisuje se v publikaci WO 01/18051) . Vynález navíc uvádí terapeutickou hodnotu při různých onemocněních spojených s abnormální expresí nebo spouštěním odezvy vůči ligandu. Naznačuje se, že například ligand p40/IL B30 se podílí na vývoji imunity zprostředkované buňkou, například protinádorové aktivity, vyvolání humorální a buněčné imunity a antivirových účinků. Ukazuje se, že ligand aktivuje buňky NK a T. Terapie může být kombinována s IL-18, IL-12, TNF, IFNy, radiaci/chemoterapií, adjuvans nebo antinádorovými, antivirovými nebo antifungicidními látkami.
V opačném případě antagonisté, které se mohou kombinovat s antagonisty TNF, IFNy, IL-18 nebo IL-12 nebo s IL-10 nebo steroidy mohou být indikovány u chronických onemocněních zrpostředkovanými Thl, u autoimunity nebo při transplantaci nebo/a odmítnutí transplantátu, při roztroušené skleróze, lupénce, chronických zánětlivých stavech, revmatické artritidě, osteoartritide· nebo zánětlivém onemocnění střev. Antagonisté mohou mít formu protilátek proti podjednotkám ·<* · · · ······ ··» · · · · · · ·
receptoru, nukleovým receptoru. receptoru agonistů a konstrukcím rozpustného receptoru nebo antisense kyselinám vůči jedné nebo více podjednotek
Párování ligandu p40/IL-B30 s podjednotkami DCRS5 a IL-12Rpl umožňuje proniknutí do použití antagonistů.
Při terapii je možné na základě popsaných aktivit p40/ILB30 ovlivnit antagonisty cytokinů, například pomocí rozpustného DCRS5 za přítomnosti rozpustného IL-12Rpi nebo bez jeho přítomnosti nebo pomocí protilátek vůči jejich podjednotce receptoru. Antagonisté se mohou použít jako inhibitory nežádoucí imunitní nebo zánětlivé odezvy, k cílení paměti buněk T nebo v kombinaci s antagonisty IL-12/IL-12R nebo s jinými protizánětlivými činidly nebo imunosupresory. Klinické indikace mohou být chronické zánětlivé nebo transplantační stavy. Různé polymorfizmy mohou zesílit nebo zeslabit funkci receptoru a jestli jsou dominantní, mohou se použít jako terapeutická činidla. Identifikace takových variant umožňuje určit pacienty vykazující nebo nevykazujících odezvu. Činidla se mohou použít jako detekční nebo značící činidla nebo ablační činidla pro paměť buněk T a/nebo NK.
Genová terapie může poskytovat požadovanou odezvu buněčných populací vůči ligandu p40/IL-B30, jako je například adjuvans pro nádorovou imunoterapii, které umožňuje aktivaci lymfocytů, buněk T nebo NK infiltrujících se do nádoru. Antisense strategie se může aplikovat například za účelem prevence citlivosti receptoru.
U buněčných typů, které vykazují testem northernova přenosu produkci mRNA IL-12 p40 a/nebo IL-B30, jsou známy různé abnormální stavy (popisuje se v publikaci Berkow (ed.) The Merck Manual of Diagnosis and Therapy, Merck and Co., 'x.
Rahway, N.J., Thorn, et al., Harrison's principles of internal medicine, McGraw-Hill, N.Y. a Weatherall, et al., (eds.)
Oxford Textbook of Medicine, Oxford University Press, Oxford. Řada jiných zdravotních stavů a onemocnění bude vykazovat na léčbu zde popsaného agonisty nebo antagonisty (popisuje se v publikaci Stites and Terr (eds. 1991) Basic and Clinical Immunology Appleton and Lange, Norwalk, Connecticut, a Samter, et al·., (eds.) Immunological Diseases Little, Brown and Co.). Jiné pravděpodobné indikace léčby zahrnují přeměnu kostí, sexuální dysfunkci, prevenci neurodegenerativního onemocnění, demenci, stres a jiná onemocnění. Tyto problémy by měly být citlivé vůči prevenci nebo léčbě za použití zde popsaných sloučenin.
Mohou se izolovat rekombinantní cytokinové receptory, muteiny, agonistické nebo antagonistické protilátky nebo protilátky, které se pak aplikují pacientovi. Tato činidla se mohou kombinovat pro terapeutické účely s dalšími aktivními činidly například v přijatelných nosičích nebo ředidlech spolu s fyziologicky neškodnými stabilizátory a ekcipienty. Tyto kombinace mohou být sterilní (sterilizuje se například filtrací) a mohou tvořit dávkové formy například lyofilyzáty v kompartmentech nebo stabilizované vodné přípravky. Vynález dále také popisuje použití protilátek nebo jejich vazebných fragmentů, které se naváží na komplement.
Testování ligandů za použití receptoru cytokinů nebo jeho fragmentu se může uskutečnit za účelem identifikovat molekuly vykazující vazebnou afinitu vůči receptorům. Následné biologické testy se mohou pak použít ke stanovení, zda putativní ligand může poskytnout kompetitivní navázání, které může blokovat skutečnou stimulující aktivitu. Fragmenty receptorů se mohou použít jako blokační činidla nebo jako antagonisté, přičemž blokují aktivitu ligandů. Sloučenina vykazující intrinsickou stimulující aktivitu může aktivovat receptor a je tak antagonistou tím, že stimuluje aktivitu ligandů, který například indukuje signál. Vynález dále • · ·· · ······ ··· ··*« · · · ······· · · · · · a • · · · · · · a a a·· · aa · · « a a aa o >
popisuje terapeutické použití protilátek proti receptorum cytokinu jako antagonistů.
Množství činidel nezbytných pro účinnou terapii bude záviset na řadě různých faktorů, které zahrnují způsoby aplikace, cílové místo, fyziologickou životnost činidla, farmaceutickou životnost činidla, fyziologický stav pacienta a jiné aplikované léčiva. Léčebné dávky by se měly titrovat za účelem optimalizace bezpečnosti a účinnosti. V typickém případě dávky užívané in vitro mohou být nápomocné při stanovení množství uvedených činidel použitelných při aplikaci in šitu. Testování dávek účinných pro léčbu určitých poruch na zvířatech poskytne další pomoc při stanovení lidské dávky. Různé možnosti se popisují v publikaci Gilman, et al., (eds. 1990) Goodman and Gilman's: The pharmacological bases of therapeutics, 8th Ed., Pergamon Press, a Remington's Pharmaceutical Sciences, 17 th ed. (1990), Mack Publishing Co., Easton, Penn). Diskutují se zde metody aplikace. Jsou to například orální, intravenózní, intraperitoneální nebo intramuskulární aplikace, transdermální difúze a jiné. Farmaceuticky přijatelné nosiče budou zahrnovat vodu, fyziologický roztok, pufry a jiné sloučeniny popsané například v publikaci Merck Index, Merck and Co., Rahway, New Jersey. Vzhledem k pravděpodobné vysoké afinitě navázání nebo číslu přeměny mezi putativním ligandem a jeho receptory, se očekává, že na počátku bude účinná nízká dávka uvedených činidel. Signalizační dráha naznačuje, že může být účinné extrémně malé množství ligandu. Očekává se, že rozmezí dávky je množství nižší než lmM koncentrace, v typickém případě nižší než přibližně koncentrace 10 mM, obvykle nižší než přibližně 100 nM, s výhodou nižší než přibližně 10 pM a nej výhodněj ší je množství nižší než koncentrace 1 fM (fentomolární) s vhodným nosičem. V případě kontinuální aplikace se často používají prostředky nebo přístroj umožňující pomalé uvolňování.
Receptory cytokinů, 'jejich fragmenty a protilátky nebo jejich fragmenty, antagonosté a agonisté se mohou aplikovat přímo hostiteli, který se bude léčit, nebo v závislosti na velikosti sloučenin může být nutné konjugovat před aplikací molekuly s nosičovými proteiny, jako je ovalbumin nebo sérový albumin. Terapeutické prostředky se mohou aplikovat v řadě běžných dávkových formách. Zatímco je možné aplikovat samotnou aktivní složku, je výhodné ji prezentovat jako farmaceutický prostředek. Prostředky obsahují alespoň jednu aktivní složku, jak se definuje shora v textu, spolu s jedním nebo více přijatelnými nosiči. Každý nosič může být jak farmaceuticky tak fyziologicky přijatelný v tom smyslu, že je kompatibilní s dalšími složkami a není škodlivý pro pacienta. Prostředky orální, rektální, nasální nebo subkutánní, intramuskulární, urcene pro (zahrnuj ící a intradermální’ zahrnují ty parenterální intravenózní aplikaci. Prostředky se mohou běžně vyskytovat v jednotkové dávce a mohou se připravovat metodami známými v oboru farmacie (popisuje se například v publikaci Gilman, et al., (eds. 1990) Godman and Gilman's: The pharmacological bases of therapeutics, 8 th Ed., Pergamon Press, a Remongton's Pharmaceutical Sciences, 17 th ed. (190), Mack Publishing Co., Easton, Penn, Avis et al., (eds 1993) Pharmaceutical Dosage Forms: Parenteral Medications Dekker, NY, Lieberman, et al., (eds. 1990) Pharmaceutical Dosage Forms: Tablets Dekker, NY a Lieberman, et al., (eds. 1990) Pharmaceutical Dosage Forms: Disperse Systems Dekker, NY. Terapie podle vynálezu se může kombinovat nebo použít ve spojení s jinými terapeutickými činidly, zvláště agonosty nebo antagonisty jiných členů rodiny cytokinových receptorů.
IX. Testování
Testování léku za použití DCRS5 nebo jeho fragmentu se může uskutečnit za účelem identifikace sloučenin, které
vykazují vazebnou afinitu na podjednotku receptoru zahrnující izolaci asociovaných komponentů. Následné biologické testy se mohou pak využívat ke stanovení, zda sloučenina vykazuje intrinsickou stimulující aktivitu a působí proto jako blokační činidlo nebo antagonista, čímž blokuje aktivitu ligandů.
Avšak párování ligandů p40/IL-B30 s funkčním receptorem DCRS3 s IL-12RP1, umožňuje testování za účelem zjištění antagonistů a agonistů s pozitivní kontrolou signálu. Může se uskutečnit testování malých molekul nebo protilátek.
Jedna metoda testování léků využívá eukaryontní nebo prokaryontní hostitelské buňky, které se stabilně transformují s molekulami rekombinantní DNA exprimující DCRS5 v kombinaci s jinou podjednotkou cytokinového receptoru, jako je například IL-12Rpi. Věří se, že signalizace používá STÁT 4. Mohou být izolovány buňky, které exprimují receptor separovaný od jiných funkčních receptorů. Takové buňky, buď v životaschopné nebo imobilizované formě, se mohou použít v případě standardního vazebného testu protilátka/antigen nebo ligand/receptor. V publikaci Parce et al., (1989) Science 246: 243-247 a
Owicki, et al., (1990) Proč. Naťl. Acad. Sci. USA 87 : 40074011 se popisují citlivé metody detekující buněčné odezvy. Kompetitivní testy je možné zvláště použít v případě, že buňky přicházejí do kontaktu a inkubují se se značeným receptorem nebo protilátkou vykazující známou vazebnou afinitu vůči ligandů. Protilátka značená 125I přichází s testovaným vzorkem, jehož vazebná afinita sloučenině se měří. Vázané a volné značené vazebné sloučeniny se pak separují, aby se odhadl stupeň navázání ligandů. Množství testované vázané sloučeniny je nepřímo úměrný množství značeného recepto-ru vázajícího se na známý zdroj. K separaci vázaného ligajidu od volného ligandů za účelem zjištění stupně navázání ligandů. Tento krok separace se v typickém případě podílí na postupu, jako je adheze na filtry do kontaktu vůči vazebné následovaná promýváním, adheze na plast následovaná promýváním nebo centrifugací buněčných membrán. Životaschopné buňky by se mohly také použít k testování účinků léků na funkce zprostředkované cytokinem, jako je například signalizace STAT4 a jiné. Některé detekční metody umožňují eliminovat krok separace, například použitím citlivého detekčního systému.
Příklady provedení vynálezu
Příklad 1: Obecné metody
Některé ze standardních metod se popisují například v publikaci Maniatis, et al., (1982) Molecular Clonning, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring
Hrabor Press, Sambrook, et al, ;i989) Molecular Cloning: A
Laboratory Manual, (2d ed.), vols. 1-3, CSH Press, NY nebo Ausubel, et al., (1987 and Supplements) Current Protocols in Molecular Biology, Grrene/Wiley, New York. Metody čištění proteinů zahrnují takové metody, jako je srážení síranem amonným, kolonová chromatografíe, elektroforéza, centrifugace, krystalizace a jiné (popisuje se v publikaci Ausubel, et al., Biology, Greene Publishing Associates, Brooklyn, NY nebo Ausubel, et al., (1987 a periodické doplňky) Current Protocols in Molecular Biology, Greene/Wiley, New York, Deutscher (1990) Guide to protein purification, Methods in Enzymology, vol. 182 a jiné díly v této sérii, manuály od výrobce popisující použití produktů izolace proteinů (Pharmacia, Pisctaway, N. J. nebo Bio-Rad, Richmond, CA) . Kombinace s rekombintními metodami umožňující fúze s vhodnými segmenty, například se sekvencí FLAG nebo s ekvivalentem, který může být fúzován prostřednictvím sekvence, kterou je proteinázou (popisuje se v publikaci
Purification of recombinant proteins with metal chelate absorbent, Setlow (ed.) Genetic Engeneering, Principle and Methods 12: 87-98, Plenům Press, N.Y. a Crowe, et al., (1992) možné odstranit Hochuli (1990) ,
QIA express: The high level expression and Protein purification systém QUIAGEN, lne., Chatsworth, CA).
Počítačová analýza sekvence se uskutečnila například použitím softwarových programů, které zahrnují programy pocházející z GCG (U. Wisconsin) a ze zdrojů GenBank. Také se použila veřejná databáze sekvencí, jako je například GenBank a j íné.
Řada aplikovat 5 789 192 metod aplikovatelných na receptory IL-10 se mohou na DCRS5, jak se popisuje v patentovém dokumentu č. (receptor IL-10).
Příklad 2: Funkční klonování
Zjistilo se, že protilátky proti hIL-12Rpi blokovaly odezvy na lidské buňky T na p40/IL-B30 a p40/IL-B30 vázaný na IL-12Rpi. To naznačuje, že IL-12RP1 je jedna podjednotka receptorového komplexu pro p40/IL-B30.
Identifikovala se jedna populace T na p40/IL-B30, ale nikoliv na IL-12, a odpovídají na IL-12, ale nikoliv na buněk, která odpovídá jiné populace, které p40/IL-B30. Navíc se pozorovalo, že buňky Ba/F3 exprimující rekombinantní mIL-12Rpl a mIL-12Rp2 odpovídaly na IL-12, ale neodpovídaly na p40/ILB30. Tyto výsledky kolektivně indikovaly, že receptorový komplex pro p40/IL-B30 podjednotku, kterou klonovací strategie receptorový komponent.
obsahoval IL-12Rpi nebyla IL-12Rpi. se navrhla, aby a alespoň jednu jinou Podobně expresívní se izoloval druhý
Knihovna cDNA se připrvila z mRNA, která se izolovala z buněk Kit225, z buněčné^linie lidských buněk T závislých na IL-2, která odpovídá na IL-12 i na p40/IL-B30. cDNA se připravila použitím retrovirového expresívního vektoru pMX.
Buňky Ba/F3 exprimující rekombinantní hIL-12Rpi se infikovaly touto knihovnou cDNA, nechaly se po 3 až 4 dny inkubovat v IL3, pak se promyly a nanesly se na destičky s 96 prohlubněmi s koncentrací přibližně 15 000 buněk na jednu prohlubeň v kultivačním médiu obsahujícím 50 ng/ml hyper-hp40/hIL-B30 (popisuje se v publikaci WO 01/18051). Kultury se doplňovaly každých 5 dní dalším hyper-hp40/hIL-B30. Přibližně po dvou týdnech 5 až 10 % prohlubní vykazovalo růst buněk. Shromáždily se buňky z každé prohlubně, jednotlivě se expandovaly do větších kultur v hyper-hp40/hIL-B30 a testovala se závislost jejich růstu na hyper-hp40/hIL-B30.
U buněk, jejichž růst závisel na p40/IL-B30, se analyzovala pomocí PCR přítomnost inzertů retrovirové cDNA. Ze 40 analyzovaných izolátů pouze jeden obsahoval cDNA kódující nový receptor DCRS5. Tento kandidát lidské cDNA se klonoval do expresívního vektoru a transfekoval se do buněk Ba/F3 exprimujících hIL-12Rpi. Tyto buňky začaly vykazovat odezvu na p40/IL-B30, což ukazuje, že nová cDNA kóduje požadovaný CDRS5, funkčně receptorovou jednotku IL-B30.
Příklad 3: Rysy proteinu DCRS5 plné délky, lokalizace na chromozomu
Cytoplazmatická oblast DCRS5 není blízce příbuzná jiným cytoplazmatickým oblastem cytokinového receptoru. Cytoplazmatická oblast obsahuje sedm zbytků tyr, alespoň tři z nich jsou částí rozeznatelných vazebných motivů SH2: YEDI, YKPQ a YFPQ. Motiv YEDI je podobný identifikovaným vazebným místům pro tyrozinovou fosfatázu shp2. Pozdější dva motivy jsou velice podobné sekvencím známým tím, že váží Statl/Stat3 nebo Stat3. Motiv YKPQ spolu s nejblížšími sousedícími sekvencemi se také podobá stupni motivů v Stat4 a IL-12RP2, o kterém se ví, že se váže na Statl-3. To souhlasí s dosavadními daty, která naznačují, ' že aktivuje Stat4.
p40/IL-B30 podobně jako
IL-12
Primery PCR získané ze sekvence DCRS5 se používají pro testování knihovny lidské cDNA. Sekvence se mohly získat například z tabulky č. 1, s výhodou jsou ty sekvence přilehlé ke koncům sekvencí. cDNA plné délky odpovídající DCRS5 primáta, hlodavce nebo jiných druhů se klonovala například testováním DNA hybridizace fága ZgtlO. Reakce PCR se provedly použitím DNA polymerázy Taqplus z mikroorganizmu T.aquaticus (Stratagene) za vhodných podmínek.
Připravily se smíry chromozomů. Hybridizace in šitu se provedla s chromozomy získanými z lidských lymfocytů stimulovaných fytohemagglutininem kultivovaných po dobu 72 hodin. 5-bromodeoxyuridin se přidával během posledních sedmi hodin kultivace (60 μ9/ιη1 kultivačního média), aby se zajistila dobrá viditelnost pruhů chromozomální DNA po hybridizaci.
Fragment PCR amplifikovaný pomocí primerů se klonoval do vhodného vektoru. Vektor je značen posunem jednořetězcového zlomu s 3H. Radioaktivně značená sonda se hybridizovala s metafázovým smírem v konečné koncentraci 200 ng/ml hybridizačního roztoku, jak se popisuje v publikaci Matteí, et al., (1985) Hum. Genet. 69: 327-331.
Po potažení jadernou emulzí (KODAK NTB2) se sklíčka exponovala. Aby se zabránilo sklouznutí libovolných částic stříbra během páskovací zobrazovací metody, chromozomální smír se nejdříve obarví pufrovaným roztokem Giemsa a metafáze se vyfotografuje. R-páskování se pak uskuteční metodou fluorochrom-fotolyze-Giemsa (FPG) a metafáze se před analýzou opět vyfotografuje.
V případě jiných druhů se používají podobné vhodné metody.
Příklad 4: Lokalizace mRNA DCRS5
Lidská mnohotná tkáň (kat. č. 1,2) a bloty buněčných linií zhoubného bujení (kat. č. 7751-7) obsahující přibližně 2 μς póly (A)+RNA v jedné dráze se získaly od firmy Clontech (Palo Alto, CA) . Sondy se značily radioaktivně pomocí [a-32P]dATP, například použitím značících sad Amersham Rediprime náhodných primerů (RPN1633). Prehybridizace a hybridizace se provedly například při teplotě 67 °C v 0,5 M Na2HPO4, 7% SDS, 0,5 M EDTA (pH 8,0). Promývání za vysoké přísnosti se provedlo například při teplotě 65 °C, kdy na začátku se promávaní opakuje dvakrát za podmínek 2x koncentrovaný SSC, 0,1 % SDS po dobu 40 minut, pak následuje promytí 0,lx koncentrovaným SSC, 0,1 % SDS po dobu 20 minut. Mebrány se pak ozářily paprsky X na film Kodak při teplotě 70 °C za použití štítu, který zesiluje záření. Detailnější studie pomocí metody Southernovy hybridizace knihovny cDNA se provedla s vybranými vhodnými klony lidského DCRS5, kdy se testovala exprese v krvetvorných nebo jiných buňkách.
V jiném případě se z tabulky č. 1 vybraly dva vhodné primery. RT-PCR se použily při testování vhodného vzorku mRNA za účelem zjištění přítomnosti message k produkci cDNA, například vzorek, který exprimuje gen.
Klony v plné délce se mohou izolovat hybridizací knihoven cDNA z vhodných tkání předem vybraným signálem PCR. Mohou se provést northernovy bloty.
Mesage vhodný pro geny kódující DCRS5 se budou testovat vhodnou technologií, například pomocí PCR, imunologickými testy, hybridizací nebo jinými způsoby. cDNA tkáně nebo orgánů je možné získat od firmy například Clontech, Mountain View, CA. Jak se popisuje, je možné použít identifikace zdrojů přirozené exprese. Stanovení párování funkčních receptorových
ΊΟ
podjednotek umožňuje předpovědět, co buňky exprimují při kombinaci receptorových podjednotek, jejichž odpovědí je fyziologická odezva na každý cytokinový ligand.
V případě distribuce u myší se provedla například Southernova analýza. DNA (v množství 5 μρ) z primárně amplifikované knihovny cDNA se štěpilo vhodnými restrikčními enzymy, aby se uvolnily inzerty, nechaly se dělit na 1% agarózovém gelu a přenesly se na nylonovou membránu (Schleicher and Shuell, Keene, NY) .
Vzorky izoloace mRNA z myší mohou zahrnovat buněčnou linii myších fibroblastových buněk L (C200), buňky tranfekované Braf:ER (Brafova fúze s receptorem estrogenu), kontrola (C201), T buňky TH1 polarizované („Mell4 bright, buňky CD4+ pocházející ze sleziny se polarizovaly po dobu 7 dní pomocí IL-4 a anti-IFN-γ, T201), T buňky vysoce polarizované TH1 (popisuje se v publikaci Openshaw, et al., (1995) J. Exp. Med. 182: 1357-1367, aktivované s anti-CD3 po dobu 2, 6 a 16 hod,
T201) T buňky vysoce polarizované TH2 (popisuje se v publikaci Openshaw, et al., (1995) J. Exp. Med. 182: 1357-1367, aktivované anti-CD3 po dobu 2, 6, 16 hod, T203), CD44-CD25+pre T buňky , získané z brzlíku (T204), TH1 T buňky klon Dl. 1 nechávají se v klidu po dobu 3 týdnů po poslední stimulaci antigenem (T205), buňky TH1 T klon Dl.l, které se stimulovaly ConA v koncentraci 10 μg/ml po dobu 15 hod (T206), buňky TH2 T klon CDC35, které se stimulovaly ConA v koncentraci 10 μg/ml (T208), naivní buňky Mell4+ pocházející ze sleziny (T209), T buňky Mell4+ polarizované na Thlpomocí IFN-y/IL-12/anti-IL-4 po dobu 6, 12, 24 hod (T210) , buňky T Mell4+ polarizoané na Th2
- pomocí IL-4/anti-IFN-y po dobu 6, 13, 24 hod (T211) , nestimulované přirozené buňky B buněčné linie A20 (B200), nestimulovaná buněčná linie buněk B CH12 (B201), nestimulovane velké buňky B pocházející ze sleziny (B202), buňky B
pocházející z celé sleziny aktivované pomocí LPS (B203), dendritické buňky obohacené metrizamidem pocházející ze sleziny (D200), dendritické buňky pocházející z kostní dřeně (D201), monocytícká buněčná linie RAV 264.7 aktivovaná s LPS po dobu 4 hod (M200), makrofágy z kostní dřeně získané pomocí GM a M-CSF (M201), buněčná linie makrofágů J774 (M202), buněčná linie makrofágů J774+LPS-anti-IL-10 shromažďované po při 0,5, 1, 3, 6, 12 hod (M204), tkáň z plic myší imunizované aerosolem, primery Th2, aerosol OVA, imunizace po 7, 14, 23 hod (popisuje se v publikaci Garlisi et al., (1995) Clinical Immunology and Immunopathology 75: 75-83, X206), tkáň z plic infikovaná Nippostrongulus (popisuje se v publikaci Coffman, et al., (1989) Science 245: 308-310, X200), Celé dospělé plíce, normální (0200), celé plíce, rag-1 (popisuje se v publikaci Schwarz, et al., (1993) Immunodefíciency 4: 249252, 0205), IL-10 K.O. slezina (popisuje se v publikaci Kuhn et al., (1991) Cell 75: 263-274, X201) , celá slezina dospělého jedince, normální (201), celá slezina, rag-1 (0207), IL-10
K.O. Peyerovy skvrny (0202), celé Peyerovy skvrny normální (0210), IL-10 K.O. mesenterické lymfoidní žlázy (X203), celé mesenterické lymfoidní žlázy, normální (0211), IL-10 K.O.
střevo (X203), celé normální střevo (0212), myší pankreas NOD (popisuje se v publikaci Makino et al., (1980) Jikken Dobutsu 29: 1-13, X205), cylý brzlík, rag-1 (0208), celé ledviny, rag1 (0206), krysí normální kloubní tkáň (0300) a krysí artritická klobní tkáň (X300).
Vzorek vhodný pro izolaci lidské mRNA může zahrnovat mononukleární buňky periferní krve (monocyty, T buňky, buňky NK, granulocyty, buňky Β) (T100), shromážděné jednojaderné buňky periferní krve aktivované pomocí anti-CD3 po dobu 2, 6, hod (T101) , T buňky THO. klon Mot 72 (T102) , shromážděné T buňky THO klon Mot 72 aktivované pomocí anti-CD28 a anti-CD3 po dobu 2, 7, 12 hod (Tlil), T buňky CD4+CD45RO-T buňky • · · 9 · « polarizované po dobu 27 · dní v anti-CD28, 11-4 a anti-IFN-y polarizované TH2 a aktivovaní pomocí anti-CD3 a anti-CD28 po dobu 4 hod (T116) , T buňky nádorové linie Jurkat a Hut 78 (T117), klony T buněk, shromážděné AD130.2, ΊΌ783.12, Tc783.13, Tc783.58, Tc782.69, (T118), buňky T, náhodný klon γδ
T buněk (T119) , splenocyty (B100) , splenocyty aktivované pomocí anti-CD40 a IL-4 (B101), shromážděné buňky B linií EBV WT49, RSB, JY, CVIR 721.221, RM3, HSY, (B102) , linie buněk B JY aktivovná pomocí PMA a ionomycinem po dobu 1, 6 hod (B103), shromážděné klony buněk NK 20 aktivované PMA a ionomycinem po dobu 6 hod (K101) , klon NKL získaný z periferní krve pacienta trpícího leukémií LGL, kterému se aplikovalo IL-2 (K106), NK cytotoxický klon 640-A30-1 (K107), krvetvorná prekurzorová buněčná linie TF1 aktivovaná pomocí PMA a ionomycinu po dobu 1, 6 hod (C100), U937 premonocytická linie (M100), shromážděná premonocytická linie (U937) aktivovaná pomocí
PMA ionomycinem po dobu 1, 6 hodin (M101) , shromážděné rozdružené monocyty aktivované pomocí LPS, IFNy, anti-IL-10 po dobu 1, 2, 6, 12, 24 hod (M102), rozdružené monocyty aktivované pomocí
LPS, IFNy, anti-IL-10 po dobu 1, 2, 6, 12, 24 hod (M102) , shromážděné rozdružené monocyty aktivované pomocí LPS, IFNy, anti-IL-10 po dobu 1, 2, 6, 12, 24 hod (M103) , shromážděné rozdružené monocyty aktivované pomocí LPS, IFNy, anti-IL-10 po dobu 4, 16 hod (M106), shromážděné rozdružené monocyty aktivované pomocí LPS, IFNy, anti-IL-10 po dobu 4 a 16 hod (M107), rozdružené monocyty aktivované pomocí LPS, po dobu 1 hod (M108), rozdružené monocyty aktivované pomocí LPS, po dobu 6 hod (M109), DC 70 % CDla+ z CD34+GM-CSF, TNFa 12 dní, (D101), DC 70 % CDla+ z CD34+GM-CSF, TNFa 12 dní, aktivované pomocí PMA a ionomycin po dobu 1 hod (D102), DC 70 % CDla+
Z CD34+GM-CSF, TNFa 12 dní’, aktivované PMA a ionomycinem po dobu 6 hodin (D103), shromážděné DC 95 % CDla+ z CD34+ GM-CSF, TNFa 12 dní FACS, aktivované pomocí PMA a ionomycinem po dobu • · · · · >
c ·
1, 6 hodin (D104), shromážděné DC 95 % CD14+ z ex CD34+ GMCSF, TNFa 12 dní FACS, aktivované pomocí PMA a ionomycinem po dobu 1, 6 hodin (D105), shromážděné DC CDla+ CD86+ z CD34+ GMCSF, TNFa 12 dní FACS, aktivované pomocí PMA a ionomycinem po dobu 1, 6 hodin (D106) , DC z monocytů GM-CSF, IL-4 5 dní (D107), DC z monocytů GM-CSF, IL-4 5 dní (D108), shromážděné DC z monocytů GM-CSF, IL-4 5 dní aktivované LPS po dobu 4, 16 hodin (D109) , shromážděné DC z monocytů GM-CSF, IL-4 5 dní aktivované TNFa, mopnocyty supe po dobu 4, 16 hodin (DUO) , benigní nádor leiom Lil (X101), normální myometrium M5 (0115), maligní leiomyosarkom GS1 (X103), shromážděná linie sarkomu plicního fibroblastu MRC5 aktivovaná pomocí PMA a ionomycinu po dobu 1, 6 hod (C101), shromážděná buněčná linie karcinomu ledvinového epitelu CHA aktivovaná pomocí PMA a ionomycinu po dobu 1, 6 hod (C102), ledviny plodu muže stáří 28 týdnů (0100), plíce plodu muže stáří 28 týdnů (0101), játra plodu muže stáří 28 týdnů (0102), srdce plodu muže stáří 28 týdnů (0103), mozek plodu muže stáří 28 týdnů (0104), žlučník plodu muže stáří 28 týdnů (0106), tenké střevo plodu muže stáří 28 týdnů (0107), tuková tkáň plodu muže stáří 28 týdnů (0108), vaječníky plodu ženy stáří 25 týdnů (0109), děloha plodu ženy stáří 25 týdnů (0110), varlata plodu muže stáří 28 týdnů (0111), slezina plodu muže stáří 28 týdnů (0112), placenta ženy stáří 25 týdnů (0109), placenta dospělého jedince (0113) a zánětlivé mandle z jedince ve věku 12 let (X100).
Podobné vzorky se mohou za účelem hodnocení izolovat i v jiných druzích.
Příklad 5: Klonování druhových doplňků DCRS5
Aby se získaly druhové doplňky DCRS5 přednostně z jiných primátů nebo hlodavců, se používaly jiné strategie. Jednou metodou je zkřížená hybriizace za použití DNA sond úzce • » 4* 4 ·····« ·· r « · ·· · * · ·«·· 4 » · * · · * « * · · 4 · 4 4 « • 44 ··· ·· ·· příbuzných druhů. To je' možné použít u vývojově podobných druhů, jako intermediální krok. Jinou metodou je použití specifických primerů PCR založených na identifikaci bloků podobnosti nebo rozdílů mezi geny, jako jsou například plochy vysoce konzervativního nebo nekonzervativního polypeptidu nebo nukleotidové sekvence.
Prohledáváním databáze se mohou identifikovat podobné sekvence a umožní se produkce vhodných sond.
Příklad 6: Produkce savčího proteinu DCRS5
Provedla se vhodná funkční konstrukce, například GST, pro expresi například v mikroorganizmu E. coli. Zkonstruoval se myší plazmid IGIF pGex a transformoval se do mikroorganizmu E. coli. Čerstvě transformované buňky se kultivovaly například v médiu LB, které obsahuje ampicilin v koncentraci 50 μg/ml, a exprese se indukovala pomocí IPTG (firma Sigma, St. Louis, MO) . Po indukci přes noc se bakterie sklízely a izoloval se pelet obsahující protein DCRS5. Pelety se homogenizovaly například v pufru TE (50 mM báze Tris pH 8,0, 10 mM EDTA a 2 mM pefabloc) o objemu 2 litrů. Tento materiál procházel třikrát přes mikrofluidizér (Microfluidics, Newton, MA) . Fluidizovaný supernatant se se centrifugoval na rotoru Sorwall GS-3 po dobu 1 hodiny při 13 000 otáčkách za minutu. Výsledný supernatant obsahující cytokinový receptorový protein se filtroval a procházel přes kolonu naplněnou glutathionSepharose uvedenou do rovnováhy 50 mM bází Tris pH 8,0.
Shromáždily se frakce obsahující fúzní protein DCRS5-GST a štěpily se například trombinem (Enzyme Research Laboratory, lne. South Bend, IN). Štěpené frakce pak prošly kolonou naplněnou Q-Sepharose, která se uvedla do rovnováhy 50 mM baží Tris. Frakce obsahující 7DCRS5 se shromáždily a ředily se chladnou destilovanou vodou, aby se snížila konduktuvita. Pak • · · · · · znovu prošly samotnou kolonou s čerstvou náplní Q-Sepharose nebo následovala kolona s imunoafinitní protilátkou. Spojily se frakce obsahující protein DCRS5, vytvořily se alikvoty a uchovávaly se při teplotě -70 °C.
Porovnání spektra CD s proteinem cytokinového receptoru může naznačit, že protein je správně sbalen (popisuje se v publikaci Hazuda, et al., (1969) J. Biol. Chem. 264: 16891693).
Příklad 7: Příprava protilátek specifických pro DCRS5
Inbrední myši Balb/c se imunizovaly intraperitoneálně s rekombinantními formami proteinu, jako je například čištěný DCRS5 nebo stabilně transfekované buňky NIH-3T3. Zvířata se imunizovala zselijící dávkou ve vhodném časovém okamžiku s proteinem, ke ketrému se přidalo adjuvans, za účlem dále stimulovat produkci protilátek. Shromáždilo se sérum nebo hybridoma produkované slezinou.
V jiném případě se myši Balb/c imunizovaly buňkami transformovanými genem nebo jeho fragmentem, buď endogenními nebo exogenními buňkami nebo izolovanými membránami obohacenými expresí antigenu. Ve vhodném čase se shromáždilo sérum, v typickém případě po řadě různých aplikacích. Mohou se použít různé techniky genové terapie. Může to být například prodikce proteinu in šitu za účelem vyvolání imunitní odezvy. Příprava séra nebo protilátky se může zkříženě absorbovat nebo imunologicky vybrat za účelem přípravy podstatně izolovaných protilátek s definovanou specifitou a vysokou afinitou.
Mohou se připravit monoklonální protilátky. Splenocyty se například fúzují s vhodným fúzním partnerem a hybridomy se
X.
slektují v růstovém médiu pomocí standardních postupů. Supernatant hybridomů se testoval za účelem zjištění přítomnosti protilátek, které se vážou na DCRS5, například testem ELISA nebo jiným testem. Mohou se také vytvořit nebo připravit protilátky, které specificky rozeznávají specifické provedení DCRS5.
Při jiné metodě jsou syntetické peptidy nebo izolovaný protein prezentovány imunnímu systému za účelem vytvoření monoklonálních nebo polyklonálních protilátek (popisuje se v publikaci Coligan et al., (ed. 1991) Current Protocols in Immunology Wiley/Grrene a Harlow and Lané (1989) Antibodies: A Laboratory Manual Cold Spring Harbor Press. Ve vhodných situacích se vazebné činidlo buď značí, jak se popisuje shora v textu například fluoresceinem nebo jiným prostředkem, nebo se imobilizuje na substrátu v případě panoramatických metod. Nukleové kyseliny se mohou také zavést do buněk zvířat za účelem produkce antigenu, který slouží k vyvolání imunitní odezvy (popisuje se v publikaci Wang et al., (1993) Proč. Nati. Acad. Sci. 90: 4156-4160, Barry, et al., (1994)
BioTechniques 16: 616-619 a Xiang et al., (1995) Immunity 2:
129-135).
Příklad 8: Produkce fúzních proteinů s DCRS5
Připravily se různé funkční konstrukce s DCRS5, které zahrnují provedení kombinující DCRS5 s IL-12RP1. Část vhodného genu se fúzovala s epitopem tag, jako například FLAG tag nebo s konstrukcí dvou hybridních systémů (popisuje se například v publikaci Fields and Song (1989) Nátuře 340: 245-246).
Epitop tag se může použít při expresívním klonovacím postupu s detekcí s protilátkami proti FLAG za účelem detekovat vazebného partner-a, jako je například ligand vhodný pro cytokinový receptor .xDva hybridní systémy se mohou také použít k izolaci proteinů, které se specificky váží na DCRS5.
i
Příklad 9: Vztah mezi strukturou a aktivitou
Použitím standardních postupů a analýz se získaly informace o kritické úloze určitých zbytků. Provedla se standardní analýza mutageneze například vytvořením řady různých variant v určité poloze, například v polohách identifikovaných shora v textu, a hodnocením biologických aktivit variant. To je možné uskutečnit za účelem rozšířit určující polohy, které upravují aktivitu nebo ukazují na speicifické polohy za účelem stanovení zbytků, které se mohou substituovat, přičemž se uchovává, blokuje nebo se upravuje biologická aktivita.
V jiném případě analýza přirozených variant může definovat polohy, které tolerují přirozené mutace. To může vyplývat z populační analýzy variací mezi jednotlivci nebo v kmenech nebo druzích. Vzorky z vybraných jednotlivců se analyzovaly například metodou PCR a sekvenováním. To umožňuje hodnotit polymorfizmy populace.
Příklad 10: Společná exprese DCRS5 a IL-12Rpl
Vektor nebo vektory kódující geny se mohou transfekovat do buňky. Takový vektor bude s výhodou zahrnovat selekční markéry za účelem identifikace, které buňky se úspěšně transformovaly. Společná exprese dvou genů umožní genovým produktům se správně spojit a vytvořit aktivní receptorový komplex.
V alternativním případě jsou dostupné metody způsobující spojení funkčních dimerů (popisuje se v publikaci O'Shea, et al., (1989) Science 245: 646-648, Kostelny et al., (1992) J. Immunol. 148: 1547-1553 a P-atel, et al., (1996) J. Biol. Chem. 271: 30386-30391). Výsledkem exprese extrabuněčných domén a fyzikální asociace, například řízená afinitou leucinového zipu Fos/Jun, budou konstrukce vázající ligand, které by měly ··· · ·· ··· ·· · · >
působit jako vazebné sloučeniny vhodné pro diagnostické nebo léčebné použití.
• · · ·
$
Seznam sekvencí (2) Informace o SEQ ID NO: 1:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE: -
(A) DÉLKA: 2 859 párů baží
(B) TYP: nukleofidová
(C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE:
(ii) DRUH MOLEKULY: DNA
(iii) HYPOTETICKÁ:
(ÍV) POZITIVNÍ:
(Ví ) PŮVODNÍ ZDROJ:
(ix) (A) ZNAKY: ORGANIZMUS: sapiens primát; domníváme se, že homo
(A) Název/klíč: CDS
(ix) (B) ZNAKY: Pozice: 119 . .2005
(A) Název/klíč: mat peptid
(ix) (B) ZNAKY: Pozice: 188 ..2005
(A) Název/klíč: mise feature
(C) Pozice: 1 . .2859
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 1:
gtggtacggg aattccattg tgttgggcag ccaacaaggg tggcagcctg gctctgaagt 60 ggaattatgt gcttcaaaca ggttgaaaga gggaaacagt cttttcctgc ttccagac 118
atg aat cak gtc act Thr att Ile caa tgg gat gca gta Ala Val ata Ile gcc Ala ctt Leu -10 tac Tyr ata Ile 166
Met Asn Xaa Val -20 Gin Trp Asp -15
ctc ttc age tgg tgt cat sga gga att aca aat ata aac tgc tet ggc 214
Leu Phe Ser Trp Cys His Gly Gly Ile Thr Asn Ile Asn Cys Ser Gly
-5 -1 1 5
cac atc tgg gta gaa cca gcc aca att ttt aag atg ggt atg aat atc 262
His Ile Trp Val Glu Pro Ala Thr Ile Phe Lys Met Gly Met Asn Ile
10 15 v 20 25
tet ata tat tgc caa gca gca att aag aac tgc caa cca agg aaa Ctt 310
Ser Ile Tyr Cys Gin Ala Ala Ile Lys Asn Cys Gin Pro Arg Lys Leu
35 40 • · · ·
cat ttt tat aaa aat ggc atc aaa gaa aga ttt caa atc aca agg att 358
His Phe Tyr Lys 45 Asn Gly Ile Lys Glu 50 Arg Phe Gin Ile Thr 55 Arg Ile
aat aaa aca aca gct cgg ctt tgg tat aaa aac ttt ctg OS.S cca cat 406
Asn Lys Thr 60 Thr Ala Arg Leu Trp 65 Tyr Lys Asn Phe Leu 70 Glu Pro His
gct tet atg tac tgc act gct gaa tgt ccc aaa cat ttt caa gag aca 454
Ala Ser 75 Met Tyr Cys Thr Ala 80 Glu Cys Pro Lys His 85 Phe Gin Glu Thr
ctg ata tgt gsa aaa gac att tet tet gga tat ccg cca gat att cct 502
Leu 90 Ile Cys Gly Lys Asp 95 Ile Ser Ser Gly Tyr 100 Pro Pro Asp Ile Pro 105
gat gaa gta acc tgt gtc att tat gaa tat tea ggc aac atg act tgc 550
Asp Glu Val Thr Cys 110 Val Ile Tyr Glu Tyr 115 Ser Gly Asn Met Thr 12 0 Cys
acc tgg aat gct rgg aag ctc acc tac ata gac aca aaa tac gtg gta 598
Thr Trp Asn Ala 125 Xaa Lys Leu Thr Tyr 130 Ile Asp Thr Lys Tyr 13 5 val Val
cat gtg aag agt tta gag aca gaa gaa gag caa cag tat ctc acc tea 646
His Val Lys 140 Ser Leu Glu Thr Glu 145 Glu C-lu Gin Gin Tyr 150 Leu Thr Ser
agc tat att aac atc tcc act gat tea tta caa ggt ggc aag aag tac 694
Ser Tyr 155 Ile Asn Ile Ser Thr 160 Asp Ser Leu Gin Gly 165 Gly Lys Lys Tyr
ttg gtt tgg gtc caa gca gca aac gca cta ggc atg gaa gag tea aaa. 742
Leu 170 Val Trp Val Gin Ala 175 Ala Asn Ala Leu Gly 180 Met Glu Glu Ser Lys 185
caa ctg caa att cac ctg gat gat ata gtg ata cct tet gca gcc gtc 790
Gin Leu Gin Ile His 190 Leu Asp Asp Ile Val 195 Ile Pro Ser Ala Ala 200 Val
att tcc agg gct gag act ata aat gct aca gtg ccc aag acc ata att 838
Ile Ser Arg Ala 205 Glu Thr Ile Asn Ala 210 Thr Val Pro Lys Thr 215 Ile Ile
tat tgg gat agt caa aca aca att gaa aag gtt tcc tgt gaa atg aga 886
Tyr Trp Asp 220 Ser Gin Thr Thr Ile 225 Glu Lys Val Ser Cys 230 Glu Met Arg
tac aag gct aca aca aac caa act tgg S13.C gtt aaa gaa ttt gac acc 934
Tyr Lys 235 Ala Thr Thr Asn Gin 240 Thr Trp Asn Val Lys 245 Glu Phe Asp Thr
aat ttt aca tat gtg caa cag tea gaa ttc tac ttg gag cca aac att 982
Asn 250 Phe Thr Tyr Val Gin 255 Gin Ser Glu Phe Tyr 260 Leu Glu Pro Asn Ile 265
aag tac gta ttt caa gtg aga tgt caa gaa aca ggc aaa agg tac tgg 1030
Lys Tyr Val Phe Gin Val Arg Cys Gin Glu Thr Gly Lys Arg Tyr Trp
270 275 280 • « · · • ·
81 • · · • ► * · • · · » • • · • · • · • • · · * · • • · • · • · · «·
cag cct tgg agt tea ccg ttt ttt cat aaa aca cct gaa aca gtt ccc 1078
Gin Pro Trp Ser 285 Ser Pro Phe Phe His 290 Lys Thr Pro Glu Thr 295 Val Pro
cag gtc aca tea aaa gca ttc caa cat gac aca tgg aat tet ggg cta 1126
Gin Val Thr 300 Ser Lys Ala Phe Gin 305 His Asp Thr Trp Asn 310 Ser Gly Leu
aca gtt gct tcc atc tet aca ggg cac ctt act tet gac aac aga gga 1174
Thr Val 315 Ala Ser Ile Ser Thr 320 Gly His Leu Thr Ser 325 Asp Asn Arg Gly
gac att gga ctt tta ttg gga atg atc gtc ttt gct gtt atg ttg tea 1222
Asp 330 Ile Gly Leu Leu Leu 335 Gly Met Ile Val Phe 340 Ala Val Met Leu Ser 345
att ctt tet ttg att ggg ata ttt aac aga tea ttc ega act ggg att 1270
Ile Leu Ser Leu Ile 350 Gly Ile Phe Asn Arg 355 Ser Phe Arg Thr Gly 360 Ile
aaa aga agg atc tta ttg tta ata cca aag tgg ctt tat gaa gat att 1318
Lys Arg Arg Ile 365 Leu Leu Leu Ile Pro 370 Lys Trp Leu Tyr Glu 375 Asp Ile
cct aat atg aaa aac age aat gtt gtg aaa atg cta cag gaa aat agt 1366
Pro Asn Met 380 Lys Asn Ser Asn Val 385 Val Lys Met Leu Gin 390 Glu Asn Ser
gaa ctt atg aat aat aat tcc agt gag cag gtc cta tat gtt gat ccc 1414
Glu Leu 395 Met Asn Asn Asn Ser 400 Ser Glu Gin Val Leu 405 Tyr Val Asp Pro
atg att aca gag ata aaa gaa atc ttc atc cca gaa cac aag cct aca 1462
Met 410 Ile Thr Glu Ile Lys 415 Glu Ile Phe Ile Pro 420 Glu His Lys Pro Thr 425
gac tac aag aag gag aat aca gga ccc ctg gaa aca aga gac tac ccg 1510
Asp Tyr Lys Lys Glu 430 Asn Thr Gly Pro Leu 435 Glu Thr Arg Asp Tyr 440 Pro
caa aac tcg cta ttc gac aat act aca gtt gta tat att cct gat ctc 1558
Gin Asn Ser Leu 445 Phe Asp Asn Thr Thr 450 Val Val Tyr Ile Pro 455 Asp Leu
aac act gga tat aaa ccc caa att tea aat ttt ctg cct gag gga age 1606
Asn Thr Gly 460 Tyr Lys Pro Gin Ile 465 Ser Asn Phe Leu Pro 470 Glu Gly Ser
cat ctc age aat aat aat gaa att act tcc tta aca ctt aaa cca cca 1654
His Leu 475 Ser Asn Asn Asn Glu 480 Ile Thr Ser Leu Thr 485 Leu Lys Pro Pro
gtt gat tcc tta gac tea gga aat aat ccc agg tta caa aag cat cct 1702
Val 490 Asp Ser Leu Asp Ser 495 Gly Asn Asn Pro Arg 500 Leu Gin Lys His Pro 505
aat ttt gct ttt tet gtt tea agt^gtg aat tea cta age aac aca ata 1750
Asn Phe Ala Phe Ser 510 Val Ser Ser Val Asn 515 Ser Leu Ser Asn Thr 520 Ile
* · • · · • · • · • · • · • * • • · • • • · · • · • • · • • · • · · • • • · • ·
82 • • · · • • · • · * • •
ttt ctt gga gaa tta agc ctc ata tta aat caa gga gaa tgc agt tet
Phe Leu Gly Glu Leu Ser Leu Ile Leu Asn Gin Gly Glu Cys Ser Ser
525 530 535
cct gac ata caa aac tca gta gag gag gaa acc acc atg ctt ttg gaa
Pro Asp Ile Gin Asn Ser Val Glu Glu Glu Thr Thr Met Leu Leu Glu
540 545 550
aat gat tca ccc agt gaa act att cca gaa cag acc ctg ctt cct gat
Asn Asp Ser Pro Ser Glu Thr Ile Pro Glu Gin Thr Leu Leu Pro Asp
555 560 565
gaa ttt gtc tcc tgt ttg 999 atc gtg aat gag gag ttg cca tet att
Glu Phe Val Ser Cys Leu Gly Ile Val Asn Glu Glu Leu Pro Ser Ile
570 575 580 585
aat act tat ttt cca caa aat att ttg gaa agc cac ttc aat agg att
Asn Thr Tyr Phe Pro Gin Asn Ile Leu Glu Ser His Phe Asn Arg Ile
590 595 600
tca ctc ttg gaa aag tagagctgtg tggtcaaaat caatatgaga aagctgcctt Ser Leu Leu Glu Lys
605
gcaatctgaa cttgggtttt ccctgcaata gaaattgaat tctgcctctt tttgaaaaaa
atgtattcac atacaaatct tcacatggac acatgttttc atttcccttg gataaatacc
taggtagggg attgctgggc catatgataa gcatatgttt cagttctacc aatcttgttt
ccagagtagt gacatttctg tgctcctacc atcaccatgt aagaattccc gggagctcca
tgccttttta attttagcca ttcttctgcc tmatttetta aaattagaga attaaggtcc
cgaaggtgga acatgcttca tggtcacaca tacaggcaca aaaacagcat tatgtggacg
cctcatgtat tttttataga gtcaactatt tcctctttat tttccctcat tgaaagatgc
aaaacagctc tctattgtgt acagaaaggg taaataatgc aaaatacctg gtagtaaaat
aaatgctgaa aattttcctt taaaatagaa tcattaggcc aggcgtggtg geteatgett
gtaatcccag cactttggta ggctgaggtr ggtggatcac ctgaggtcag gagttcgagt
ccagcctggc caatatgctg aaaccctgtc tctactaaaa ttacaaaaat tagccggcca
tggtggcagg tgcttgtaat cccagctact tgggaggctg aggcaggaga atcacttgaa
ccaggaaggc agaggttgca ctgagctgag attgtgccac tgcactccag cctgggcaac
aagagcaaaa ctctgtctgg aaaaaaaaaa aaaa
1798
1846
1894
1942
1990
2045
2105
2165
2225
2285
2345
2405
2465
2525
2585
2645
2705
2765
2825
2859 (2) Informace o SEQ ID NO: 2:
(í) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 629 aminokyselinových zbytků (B) TYP: aminokyselinová (C) DRUH ŘETĚZCE: TOPOLOGIE:
(ii) DRUH MOLEKULY: protein (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 2:
Met Asn Xaa Val -20 Thr Ile Gin Trp Asp -15 Ala Val Ile Ala Leu -10 Tyr Ile
Leu Phe Ser -5 Trp Cys His Gly Gly -1 1 Ile Thr Asn Ile 5 Asn Cys Ser Gly
His 10 Ile Trp Val Glu Pro 15 Ala Thr Ile Phe Lys 20 Met Gly Met Asn Ile 25
Ser Ile Tyr Cys Gin 30 Ala Ala Ile Lys Asn 35 Cys Gin Pro Arg Lys 40 Leu
His Phe Tyr Lys 45 Asn Gly Ile Lys Glu 50 Arg Phe Gin Ile Thr 55 Arg Ile
Asn Lys Thr 60 Thr Ala Arg Leu Trp 65 Tyr Lys Asn Phe Leu 70 Glu Pro His
Ala Ser 75 Met Tyr Cys Thr Ala 80 Glu Cys Pro Lys His 85 Phe Gin Glu Thr
Leu 90 Ile Cys Gly Lys Asp 95 Ile Ser Ser Gly Tyr 100 Pro Pro Asp Ile Pro 105
Asp Glu Val Thr Cys 110 Val Ile Tyr Glu Tyr 115 Ser Gly Asn Met Thr 120 Cys
Thr Trp Asn Ala 125 Xaa Lys Leu Thr Tyr 130 Ile Asp Thr Lys Tyr 135 Val Val
His Val Lys 14 0 Ser Leu Glu Thr Glu 145 Glu Glu Gin Gin Tyr 150 Leu Thr Ser
Ser Tyr Ile Asn Ile Ser Thr Asp Ser Leu Gin Gly Gly Lys Lys Tyr
155 160 165
Leu Val Trp Val Gin Ala Ala Asn Ala Leu Gly Met Glu Glu Ser Lys
170 175 180 185
Gin Leu Gin Ile His 190 Leu Asp Asp Ile Val 195 Ile Pro Ser Ala Ala 200 Val
Ile Ser Arg Ala 205 Glu Thr Ile Asn Ala 210 Thr Val Pro Lys Thr 215 Ile Ile
Tyr Trp Asp 220 Ser Gin Thr Thr Ile 225 Glu Lys Val Ser Cys 230 Glu Met Arg
Tyr Lys 235 Ala Thr Thr Asn Gin 240 Thr Trp Asn Val Lys 245 Glu Phe Asp Thr
Asn 250 Phe Thr Tyr Val Gin 255 Gin Ser Glu Phe Tyr 260 Leu Glu Pro Asn Ile 265
Lys Tyr Val Phe Gin 270 Val Arg Cys Gin Glu 275 Thr Gly Lys Arg Tyr 280 Trp
Gin Pro Trp Ser 285 Ser Pro Phe Phe His 290 Lys Thr Pro Glu Thr 295 Val Pro
Gin Val Thr Ser Lys Ala Phe Gin His Asp Thr Trp Asn Ser Gly Leu
300 305 310
Thr Val Ala Ser Ile Ser Thr Gly His Leu Thr Ser Asp Asn Arg Gly
315 320 325
Asp Ile Gly Leu Leu Leu Gly Met Ile Val Phe Ala Val Met Leu Ser
330 335 340 345
Ile Leu Ser Leu Ile Gly Ile Phe Asn Arg Ser Phe Arg Thr Gly Ile
350 355 360
Lys Arg Arg Ile Leu Leu Leu Ile Pro Lys- Trp Leu Tyr Glu Asp Ile
365 370 375
Pro Asn Met Lys Asn Ser Asn Val Val Lys Met Leu Gin Glu Asn Ser
380 385 390
Glu Leu Met Asn Asn Asn Ser Ser Glu Gin Val Leu Tyr Val Asp Pro
395 400 405
Met Ile Thr Glu Ile Lys Glu Ile Phe Ile Pro Glu His Lys Pro Thr
410 415 420 425
Asp Tyr Lys Lys Glu Asn Thr Gly Pro Leu Glu Thr Arg Asp Tyr Pro
430 435 440
Gin Asn Ser Leu Phe Asp Asn Thr Thr Val Val Tyr Ile Pro Asp Leu
445 450 455
Asn Thr Gly Tyr Lys Pro Gin Ile Ser Asn Phe Leu Pro Glu Gly Ser
460 465 470
His Leu Ser Asn Asn Asn Glu Ile Thr Ser Leu Thr Leu Lys Pro Pro
475 480 485
Val Asp Ser Leu Asp Ser Gly Asn Asn Pro Arg Leu Gin Lys His Pro
490 495 500 505
Asn Phe Ala Phe Ser Val Ser Ser Val Asn Ser Leu Ser Asn Thr Ile
510 515 520
Phe Leu Gly Glu Leu Ser Leu Ile Leu Asn Gin Gly Glu Cys Ser Ser
525 530 535
Pro Asp Ile Gin Asn Ser Val Glu Glu Glu Thr Thr Met Leu Leu Glu
540 545 550
Asn Asp Ser Pro Ser Glu Thr Ile Pro Glu Gin Thr Leu Leu Pro Asp
555 560 565
Glu Phe Val Ser Cys Leu Gly Ile Val Asn Glu Glu Leu Pro Ser Ile
570 575 580 585
Asn Thr Tyr Phe Pro Gin Asn •Jle Leu Glu Ser His Phe Asn Arg Ile
590 595 600
Ser Leu Leu Glu Lys 605
(2) Informace o SEQ ID NO: 3:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 1887 párů baží
(B) TYP: nukleová kyselina
(C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE: lineární
(ii) DRUH MOLEKULY: DNA
(ix) ZNAKY:
(A) Název/klíč: mise feature
(D) Pozice: 1 ..1887
(D) Jiné informace:
/poznámka: symbol a může být a, c, g nebo t/ (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 3:
atgaaycayg tnacnathca rtgggaygcn gtnathgcny tntayathyt nttywsntgg SO
tgycayggng gnathacnaa yathaaytgy wsnggncaya thtgggtnga rccngcnacn 120
athttyaara tgggnatgaa yathwsnath taytgycarg engenathaa raaytgycar 180
ccnmgnaary tncayttyta yaaraayggn athaargarm gnttycarat hacnmgnath 240
aayaaracna cngcnmgnyt ntggtayaar aayttyytng arccncaygc nwsnatgtay 300
tgyacngcng artgyccnaa rcayttycar garacnvtna thtgyggnaa rgavathwsn 360
wsnggntayc cnccngayat hccngaygar gtnacntgyg tnathtayga rtaywsnggn 420
aayatgacnt gyacntggaa ygcnmgnaar ytnacntaya thgayacnaa rtaygtngtn 480
caygtnaarw snytngarac ngargargar caxcartayy tnacnwsnws ntayathaay 540
athwsnacng aywsnytnca rggnggnaar aartayytng tntgggtnca rgcngcnaay SOO
gcnytnggna tggargarws naarcarytn carathcayy tngaygayat hgtnathccn 660
wsngcngcng tnathwsnmg ngcngaracn athaaygcna cngtnccnaa racnathath 720
taytgggayw sncaracnac nathgaraar gtnwsntgyg aratgmgnta yaargcnacn 780
acnaaycara cntggaaygt naargartty gayacnaayt tyacntaygt ncarcarwsn 840
garttytayy tngarccnaa yathaartay gtnttycarg tnmgntgyca rgaracnggn 900
aarmgntayt ggcarccntg gwsnwsnccn ttyttycaya aracnccnga racngtnccn 960
cargtnacnw snaargentt ycarcaygay acntggaayw snggnytnac ngtngcnwsn 1020
athwsnacng gncayytnac nwsngayaay mgnggngaya thggnytnyt nytnggnatg 1080
athgtnttyg cngtnatgyt nwsnathytn wsnytnathg gnathttyaa ymgnwsntty 1140
86 • · · • · · · « · · · • · · · · · · « * • · · · · • · · · • · · · · • · · · • · · · · • · · · • · · * «· • · · a • • · • ·
mgnacnggna thaarmgnmg nathytnytn ytnathccna artggytnta ygargayath 1200
ccnaayatga araaywsnaa ygtngtnaar atgytncarg araaywsnga rytnatgaay 1260
aayaaywsnw sngarcargt nytntaygtn gayccnatga thacngarat haargarath 1320
ttyathccng arcayaarcc nacngaytay aaraargara ayacnggncc nytngaracn 1380
mgngaytayc cncaraayws nytnttygay aayacnacng tngtntayat hccngayytn 1440
aayacnggnt ayaarccnca rathwsnaay ttyytnccng arggnwsnca yytnwsnaay 1500
aayaaygara th.acnwsn.yt nacnytnaar ccňccngtng aywsnytnga ywsnggnaay 1560
aayccnmgny tncaraarca yccnaaytty gcnttywsng tnwsnwsngt naaywsnytn 1620
wsnaayacna thttyytngg ngarytnwsn ytnathytna aycarggnga rtgywsnwsn 1680
ccngayathc araaywsngt ngargargar acnacnatgy tnytngaraa ygaywsnccn 1740
wsngaracna thccngarca racnytnytn ccngaygart tygtnwsntg yytnggnath 1800
gtnaaygarg arytnccnws nathaayacn tayttyccnc araayathyt ngarwsncay 1860
ttyaaymgna thwsnytnyt ngaraar 1887
i
(2) Informace o SEQ ID NO: 4:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 918 párů baží
(B) TYP: aminokyselinová
(C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE:
DRUH MOLEKULY: DNA
(vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANIZMUS: primát, domníváme se, že homo sapiens
(xi) Popis sekvence: SEQ ID NO : 4:
Met 1 Leu Thr Leu Gin 5 Thr Trp Val Val Gin 10 Ala Leu Phe Ile Phe 15 Leu
Thr Thr Glu Ser 20 Thr Gly Glu Leu Leu 25 Asp Pro Cys Gly Tyr 30 Ile Ser
Pro Glu Ser 35 Pro Val Val Gin Leu 40 His Ser Asn Phe Thr 45 Ala Val Cys
Val Leu 50 Lys Glu Lys Cys Met 55 Asp Tyr Phe His Val 60 Asn Ala Asn Tyr
Ile 65 Val Trp Lys Thr Asn 70 His Phe Thr Ile Pro 75 Lys Glu Gin Tyr Thr 80
Ile Ile Asn Arg Thr 85 Ala Ser Ser Val Thr 90 Phe Thr Asp Ile Ala 95 Ser
Leu Asn Ile Gin 100 Leu Thr Cys Asn Ile 105 Leu Thr Phe Gly Gin 110 Leu Glu
Glu Asn Val 115 Tyr Gly Ile Thr Ile 120 Ile Ser Gly Leu Pro 125 Pro Glu Lys
Pro Lys 130 Asn Leu Ser Cys Ile 135 Val Asn Glu Gly Lys 140 Lys Met Arg Cys
Glu 145 Trp Asp Gly Gly Arg 150 Glu Thr His Leu Glu 155 Thr Asn Phe Thr Leu 160
Lys Ser Glu Trp Ala 165 Thr His Lys Phe Ala 170 Asp Cys Lys Ala Lys 175 Arg
Asp Thr Pro Thr 180 Ser Cys Thr Val Asp 185 Tyr Ser Thr Val Tyr 190 Phe Val
Asn Ile Glu 195 Val Trp Val Glu Ala 200 Glu Asn Ala Leu Gly 205 Lys Val Thr
• ·· « ·····«
88 • 9 • • • • · · v » « · · • • > • · • • 9 • 9 9 • · • · 9 « · • « • · · • *9 9 · 9 « 9 9 •
Ser Asp 210 His Ile Asn Phe Asp 215 Pro val Tyr Lys Val 220 Lys Pro Asn Pro
Pro 225 His Asn Leu Ser Val 230 Ile Asn Ser Glu Glu 235 Leu Ser Ser Ile Leu 240
Lys Leu Thr Trp Thr 245 Asn Pro Ser Ile Lys 250 Ser Val Ile Ile Leu 255 Lys
Tyr Asn Ile Gin 260 Tyr Arg Thr Lys Asp 265 Ala Ser Thr Trp Ser 270 Gin Ile
Pro Pro Glu 275 Asp Thr Ala Ser Thr 280 Arg Ser Ser Phe Thr 285 Val Gin Asp
Leu Lys 290 Pro Phe Thr Glu Tyr 295 Val Phe Arg Ile Arg 300 Cys Met Lys Glu
Asp 305 Gly Lys Gly Tyr Trp 310 Ser Asp Trp Ser Glu 315 Glu Ala Ser Gly Ile 320
Thr Tyr Glu Asp Arg 325 Pro Ser Lys Ala Pro 330 Ser Phe Trp Tyr Lys 335 Ile
Asp Pro Ser His 340 Thr Gin Gly Tyr Arg 345 Thr Val Gin Leu Val 350 Trp Lys
Thr Leu Pro 355 Pro Phe Glu Ala Asn 360 Gly Lys Ile Leu Asp 365 Tyr Glu Val
Thr Leu 370 Thr Arg Trp Lys Ser 375 His Leu Gin Asn Tyr 380 Thr Val Asn Ala
Thr 335 Lys Leu Thr Val Asn 390 Leu Thr Asn Asp Arg 395 Tyr Leu Ala Thr Leu 400
Thr Val Arg Asn Leu 405 Val Gly Lys Ser Asp 410 Ala Ala Val Leu Thr 415 Ile
Pro Ala Cys Asp 420 Phe Gin Ala Thr His 425 Pro Val Met Asp Leu 430 Lys Ala
Phe Pro Lys 435 Asp Asn Met Leu Trp 440 Val Glu Trp Thr Thr 445 Pro Arg Glu
Ser Val 450 Lys Lys Tyr Ile Leu 455 Glu Trp Cys Val Leu 460 Ser Asp Lys Ala
Pro 455 Cys Ile Thr Asp Trp 470 Gin Gin Glu Asp Gly 475 Thr Val His Arg Thr 480
Tyr Leu Arg Gly Asn 485 Leu Ala Glu Ser Lys 490 Cys Tyr Leu Ile Thr 495 Val
Thr Pro Val Tyr 500 Ala Asp Gly Pro Gly 505 Ser Pro Glu Ser Ile 510 Lys Ala
Tyr Leu Lys Gin. Ala Pro Pro Ser Lys Gly Pro Thr Val Arg Thr Lys 515 520 525 <
89 • · · · · · • · • · · · • · • « • · • • • · · • · • • » • · k · · • •
Lys Val 530 Gly Lys Asn Glu Ala 535 Val Leu Glu Trp Asp 540 Gin Leu Pro Val
Asp 545 Val Gin Asn Gly Phe 550 Ile Arg Asn Tyr Thr 555 Ile Phe Tyr Arg Thr 560
Ile Ile Gly Asn Glu 565 Thr Ala Val Asn Val 570 Asp Ser Ser His Thr 575 Glu
Tyr Thr Leu Ser 580 Ser Leu Thr Ser Asp 585 Thr Leu Tyr Met Val 590 Arg Met
Ala Ala Tyr 595 Thr Asp Glu Gly Gly 600 Lys Asp Gly Pro Glu 605 Phe Thr Phe
Thr Thr 610 Pro Lys Phe Ala Gin 615 Gly Glu Ile Glu Ala 620 Ile Val Val Pro
Val S25 Cys Leu Ala Phe Leu 630 Leu Thr Thr Leu Leu 635 Gly Val Leu Phe Cys 640
Phe Asn Lys Arg Asp 645 Leu Ile Lys Lys His 650 Ile Trp Pro Asn Val 655 Pro
Asp Pro Ser Lys 660 Ser His Ile Ala Gin 665 Trp Ser Pro His Thr 670 Pro Pro
Arg His Asn 675 Phe Asn Ser Lys Asp 680 Gin Met Tyr Ser Asp 685 Gly Asn Phe
Thr Asp 690 Val Ser Val Val Glu 695 Ile Glu Ala Asn Asp 700 Lys Lys Pro Phe
Pro 705 Glu Asp Leu Lys Ser 710 Leu Asp Leu Phe Lys 715 Lys Glu Lys Ile Asn 720
Thr Glu Gly His Ser 725 Ser Gly Ile Gly Gly 730 Ser Ser Cys Met Ser 735 Ser
Ser Arg Pro Ser 740 Ile Ser Ser Ser Asp 745 Glu Asn Glu Ser Ser 750 Gin Asn
Thr Ser Ser 755 Thr Val Gin Tyr Ser 760 Thr Val Val His Ser 765 Gly Tyr Arg
His Gin 770 Val Pro Ser Val Gin 775 Val Phe Ser Arg Ser 780 Glu Ser Thr Gin
Pro 785 Leu Leu Asp Ser Glu 790 Glu Arg Pro Glu Asp 795 Leu Gin Leu Val Asp 800
His Val Asp Gly Gly 805 Asp Gly .Ile Leu Pro 810 Arg Gin Gin Tyr Phe 815 Lys
Gin. Asn Cys Ser 820 Gin His Glu Ser Ser 825 Pro Asp Ile Ser His 830 Phe Glu
Arg Ser Lys 835 Gin Val Ser Ser Val 840 Asn Glu Glu Asp Phe 845 Val Arg Leu
Lys Gin 850 Gin Ile Ser Asp His 855 Ile Ser Gin Ser Cys 860 Gly Ser Gly Gin.
Met 865 Lys Met Phe Gin Glu 870 Val Ser Ala Ala Asp 875 Ala Phe Gly Pro Gly 880
Thr Glu Gly Gin Val 885 Glu Arg Phe Glu Thr 890 Val Gly Met Glu Ala 895 Ala
Thr Asp Glu Gly 900 Met Pro Lys Ser Tyr 905 Leu Pro Gin Thr Val 910 Arg Gin
Gly Gly Tyr Met Pro Gin
915
(2) Informace o SEQ ID NO: 5:
(i) CHARAKTERISTIKA SEKVENCE:
(A) DÉLKA: 862 aminokyselinových zbytků
(B) TYP: aminokyselinová
(C) DRUH ŘETĚZCE:
(D) TOPOLOGIE:
ii) DRUH MOLEKULY: protein
(vi) PŮVODNÍ ZDROJ:
(A) ORGANIZMUS: primát, domníváme se, že homo
sapiens (xi) Popis sekvence: SEQ ID NO: 5:
Met 1 Ala His Thr Phe ' 5 Arg Gly Cys Ser Leu 10 Ala Phe Met Phe Ile 15 Ile
Thr Trp Leu Leu 20 Ile Lys Ala Lys Ile 25 Asp Ala Cys Lys Arg 30 Gly Asp
Val Thr Val 35 Lys Pro Ser His Val 40 Ile Leu Leu Gly Ser 45 Thr Val Asn
Ile Thr 50 Cys Ser Leu Lys Pro 55 Arg Gin Gly Cys Phe 60 His Tyr Ser Arg
Arg 65 Asn Lys Leu Ile Leu 70 Tyr Lys Phe Asp Arg 75 Arg Ile Asn Phe His 80
His Gly His Ser Leu 85 Asn Ser Gin Val Thr 90 Gly Leu Pro Leu Gly 95 Thr
Thr Leu Phe Val 100 Cys Lys Leu Ala Cys 105 Ile Asn Ser Asp Glu 110 Ile Gin
Ile Cys Gly 115 Ala Glu Ile Phe Val 120 Gly Val Ala Pro Glu 125 Gin Pro Gin
Asn Leu 13 0 Ser Cys Ile Gin Lys 135 Gly Glu Gin Gly Thr 140 Val Ala Cys Thr
Trp 145 Glu Arg Gly Arg Asp 150 Thr His Leu Tyr Thr 155 Glu Tyr Thr Leu Gin 160
Leu Ser Gly Pro Lys 165 Asn Leu Thr Trp Gin 170 Lys Gin Cys Lys Asp 175 Ile
Tyr Cys Asp Tyr 180 Leu Asp Phe Gly Ile 185 Asn Leu Thr Pro Glu 190 Ser Pro
• ·
92 • * * ·· · • · • · · · • • • · • * < • • 1 • 4 • · < ř · F · · • » · • • 4 · • · • • • • ·
Glu Ser Asn Phe Thr Ala Lys Val Thr Ala Val Asn Ser Leu Gly Ser
195 200 205
Ser Ser Ser Leu Pro Ser Thr Phe Thr Phe Leu Asp Ile Val Arg Pro
210 . 215 220
Leu Pro Pro Trp Asp Ile Arg Ile Lys Phe Gin Lys Ala Ser Val Ser
225 230 235 240
Arg Cys Thr Leu Tyr Trp Arg Asp Glu Gly Leu Val Leu Leu Asn Arg
245 250 255
Leu Arg Tyr Arg Pro Ser Asn Ser Arg Leu Trp Asn Met Val Asn Val
260 265 270
Thr Lys Ala Lys Gly Arg His Asp Leu Leu Asp Leu Lys Pro Phe Thr
275 280 285
Glu Tyr Glu Phe Gin Ile Ser Ser Lys Leu His Leu Tyr’ Lys Gly Ser
290 295 300
Trp Ser Asp Trp Ser Glu Ser Leu Arg Ala Gin Thr Pro Glu Glu Glu
305 310 315 320
Pro Thr Gly Met Leu Asp Val Trp Tyr Met Lys Arg His Ile Asp Tyr
325 330 335
Ser Arg Gin Gin Ile Ser Leu Phe Trp Lys Asn Leu Ser Val Ser Glu
340 345 350
Ala Arg Gly Lys Ile Leu His Tyr Gin Val Thr Leu Gin Glu Leu Thr
355 360 365
Gly Gly Lys Ala Met Thr Gin Asn Ile Thr Gly His Thr Ser Trp Thr
370 375 380
Thr Val Ile Pro Arg Thr Gly Asn Trp Ala Val Ala Val Ser Ala Ala
385 390 395 400
Asn Ser Lys Gly Ser Ser Leu Pro Thr Arg Ile Asn Ile Met Asn Leu
405 410 415
Cys Glu Ala Gly Leu Leu Ala Pro Arg Gin Val Ser Ala Asn Ser Glu
420 425 430
Gly Met Asp Asn Ile Leu Val Thr Trp Gin Pro Pro Arg Lys Asp Pro
435 440 445
Ser Ala Val Gin Glu Tyr Val Val Glu Trp Arg Glu Leu His Pro Gly
450 455 460
Gly Asp Thr Gin Val Pro Leu Asn Trp Leu Arg Ser Arg Pro Tyr Asn
465 470 475 480
Val Ser Ala Leu Ile Ser Glu Asn Ile Lys Ser Tyr Ile Cys Tyr Glu
485 490 495
Ile Arg Val Tyr Ala Leu Ser Gly Asp Gin Gly Gly Cys Ser Ser Ile
500 505 510
93 « * • • · · • • • » • · · · * • • • • • · • • · • · · • · • · • * • · · • * • · • • • · · · • • * • · • · · • · • • • • •
Leu Gly Asn Ser Lys His Lys Ala Pro Leu Ser Gly Pro His Ile Asn
515 520 525
Ala Ile Thr Glu Glu Lys Gly Ser Ile Leu Ile Ser Trp Asn Ser Ile
530 535 540
Pro Val Gin Glu Gin Met Gly Cys Leu Leu His Tyr Arg Ile Tyr Trp
545 550 555 560
Lys Glu Arg Asp Ser Asn Ser Gin Pro Gin Leu Cys Glu Ile Pro Tyr
565 570 575
Arg Val Ser Gin Asn Ser His Pro Ile Asn Ser Leu Gin Pro Arg Val
580 585 590
Thr Tyr Val Leu Trp Met Thr Ala Leu Thr Ala Ala Gly Glu Ser Ser
595 600 605
His Gly Asn Glu Arg Glu Phe Cys Leu Gin Gly Lys Ala Asn Trp Met
610 615 620
Ala Phe Val Ala Pro Ser Ile Cys Ile Ala Ile Ile Met Val Gly Ile
625 630 635 640
Phe Ser Thr His Tyr Phe Gin Gin Lys Val Phe Val Leu Leu Ala Ala
645 650 655
Leu Arg Pro Gin Trp Cys Ser Arg Glu Ile Pro Asp Pro Ala Asn Ser
660 665 670
Thr Cys Ala Lys Lys Tyr Pro Ile Ala Glu Glu Lys Thr Gin Leu Pro
675 680 685
Leu Asp Arg Leu Leu Ile Asp Trp Pro Thr Pro Glu Asp Pro Glu Pro
690 695 700
Leu Val Ile Ser Glu Val Leu His Gin Val Thr Pro Val Phe Arg His
705 710 715 720
Pro Pro Cys Ser Asn Trp Pro Gin Arg Glu Lys Gly Ile Gin Gly His
725 730 735
Gin Ala Ser Glu Lys Asp Met Met Eis Ser Ala Ser Ser Pro Pro Pro
740 745 750
Pro Arg Ala Leu Gin Ala Glu Ser Arg Gin Leu Val Asp Leu Tyr Lys
755 760 765
Val Leu Glu Ser Arg Gly Ser Asp Pro Lys Pro Glu Asn Pro Ala Cys
770 775 780
Pro Trp Thr Val Leu Pro Ala Gly Asp Leu Pro Thr His Asp Gly Tyr
785 790 795 800
Leu Pro Ser Asn Ile Asp Asp Leu Pro Ser His Glu Ala Pro Leu Ala
805 810 815
Asp Ser Leu Glu Glu Leu -Glu Pro Gin His Ile Ser Leu Ser Val Phe
820 825 830
Pro Ser Ser 835 Ser Leu His Pro Leu 840 Thr Phe Ser Cys
Thr Leu 850 Asp Gin Leu Lys Met 855 Arg Cys Asp Ser Leu 860
Gly Asp Lys Leu

Claims (3)

  1. PATENTOVÉ NÁROKY
    1. V podstatě čistý nebo rekombinantní polypeptid obsahující alespoň deset sousedících aminokyselin vnitrobuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2.
    2. Polypeptid podle nároku 1, kde
    a) uvedený polypeptid obsahuje alespoň 25 sousedících aminokyselin vnitrobuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2,
    b) uvedený polypeptid je rekombinanta obsahující vnitrobuněčnou část sekvence SEQ ID NO: 2,
    c) uvedený polypeptid dále obsahuje alespoň deset sousedících aminokyselin, které nejsou součástí jiné než vnitrobuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2,
    d) uvedený polypeptid obsahuje alespoň 25 aminokyselin extrabuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2,
    e) uvedený polypeptid obsahuje zralou sekvenci SEQ ID NO: 2 nebo
    f) uvedený polypeptid je v podstatě čistý přirozený polypeptid.
    3. Rekombinanntí polypeptid podle nároku 1, který
    a) obsahuje zralou skvenci uvedenou v tabulce č. 1,
    b) je neglykosylovaným polypeptidem,
    c) pochází z člověka,
    d) obsahuje alespoň 40 sousedících aminokyselin v sekvenci SEQ ID NO: 2,
    e) vykazuje alespoň tři nepřekrývající se segmenty alespoň patnácti sousedících aminokyselin se sekvencí SEQ ID NO: 2,
    f) je přirozenou polymorfní variantou se sekvencí SEQ ID NO: 2,
    g) je tvořen alespoň přibližně třiceti aminokyselinami, • «
    h) vykazuje alespoň dva nepřekrývající epitopy, které jsou specifické pro DCRS5 primáta,
    i) má molekulovou hmotnost alespoň 30 000 s přirozenou glykosylací,
    j) je syntetický polypeptid,
    k) je ve sterilní formě,
    l) je ve vodném nebo pufrovaném roztoku,
    m) je zachycen na pevném substrátu,
    n) je konjugován s jinou chemickou částí nebo
    o) je fyzikálně spojen s polypeptidem IL-12RP1
    4. Složení sloučeniny vybrané z
    a) v podstatě čistého nebo rekombinantního polypeptidu obsahuj ícího alespoň dva nepřekrýváj ící se segmenty alespoň šesti sousedících aminokyselin vnitrobuněčné oblasti sekvence SEQ ID NO: 2 f b) v podstatě čistého nebo rekombinantního polypeptidu obsahuj ícího alespoň 12 sousedících aminokyselin vnitrobuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2 nebo c) v podstatě čisté přirozené sekvence polypeptidu
    obsahující zralou sekvenci SEQ ID NO: 2.
    5. Polypeptid
    1) podle nároku 4a, kde
    a) uvedené rozdílné nepřekrývající se segmenty:
    i) zahrnují segment tvořený alespoň dvanácti aminokyselinami, ii) zahrnují jeden segment tvořený alespoň sedmi aminokyselinami a druhý segment tvořený alespoň devíti aminokyselinami, iii) , zahrnují třetí odlišný segment obsahující alespoň šest aminokyselin nebo iv) obsahují jeden z R3(?5-L373, P378-L405, V407-D426, K428D439, P441-V452, I454-G460, I465-T587 nebo N592-606 nebo • · ·< · • · * «··« »r » « # * * * ···»··· · ·> · · * · « β · · · » · «
    97 ··· · ·· ··· ·· .·
    b) uvedený polypeptid dále obsahuje alespoň dva odlišné nepřesehujici segmenty tvořené alespoň šesti sousedícími aminokyselinami extrabuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2,
  2. 2) podle nároku 4b, kde
    a) uvedený segment obsahující alespoň dvanáct sousedících aminokyselin zahrnuje jeden z R355-L373, P378-L405, V407D426, K428-D439, P441-V452, I454-G460, I465-T587 nebo N592606 nebo
    b) uvedený polypeptid dále obsahuje alespoň dva odlišné nepřekrývající se segmenty tvořené alespoň šesti sousedícími aminokyselinami extrabuněčné části sekvence SEQ ID NO: 2 nebo
  3. 3) podle nároku 4c, dále obsahuje epito vhodný pro čištění nebo detekci.
    6. Polypeptid podle nároku 4, který
    a) obsahuje zralou sekvenci uvedenou v tabulce č. 1,
    b) je neglykosylovaný polypeptid,
    c) pochází z člověka,
    d) obsahuje alespoň 40 sousedících aminokyselin se sekvencí SEQ ID NO: 2,
    e) vykazuje alespoň tři nepřekrývající se segmenty obsahující alespoň patnáct sousedících aminokyselin se sekvencí SEQ ID NO: 2,
    f) je přirozenou polymorfní variantou sekvence SEQ ID NO: 2,
    g) obsahuje alespoň přibližně 30 aminokyselin,
    h) vykazuje alespoň dva nepřekrývající se epitopy, které jsou specifické pro DCRS5 primáta,
    i) má molekulovou hmotnost alespoň 30 000 s přirozenou glykosylací,
    j) je syntetický polypeptid,
    k) je ve sterilní formě,
    l) je ve vodném nebo pufrbvaném roztoku,
    m) je zachycen na pevném substrátu,
    n) je spojen s jinou chemickou částí nebo
    o) je fyzikálně spojen s polypeptidem IL-12Rpi. 7 . Prostředek, vyznačuj ící s e tím, ž e obsahuj e a) v podstatě čistý polypeptid podle nároku 4 kombinovaný s proteinem IL-12RP1 nebo
    b) uvedený polypeptid podle nároku 4 a nosič, kde uvedený nosič je
    i) vodná sloučenina zahrnující vodu, fyziologický roztok a/nebo pufr a/nebo ii) vytvořený orální, rektální, nasální, povrchovou nebo parenterální aplikaci.
    8. Sada, vyznačující se tím, že obsahuje polypeptid podle nároku 4 a
    a) kompartment obsahující uvedný polypeptid,
    b) kompartment obsahující polypeptid IL-12Rpi,
    c) kompartment obsahující p40, IL-B30 nebo polypeptid p40/ILB30 nebo
    d) instrukce pro použití nebo likvidaci čibidel v uvedené sadě.
    9. Vazebná sloučenina obsahující místo vázající antigen, které pochází z protilátky, jenž se specificky váže na uvedenou vnitrobuněčnou část uvedeného polypeptidu podle nároku 1, kde
    a) uvedená vazebná sloučenina je v kontejneru,
    b) uvedený polypeptid pochází z člověka,
    c) uvedená vazebná sloučenina je fragment Fv, Fab nebo Fab2,
    d) uvedená vazebná sloučenina se konjugovala s jinou chemickou částí nebo
    e) uvedená protilátka
    i) vznikla proti pept^dové sekvenci zralého polypeptidu uvedené v tabulce č. 1, ii) vznikla proti zralému DCRS5, • · · 9 iii) vznikla proti izolovanému lidskému DCRS5, iv) je imunoselektivní,
    v) je polyklonální protilátkou, vi) váže se na denaturovaný DCRS5, vii) vykazuje hodnotu Kd antigenu alespoň 30 μΜ, vili) je zachycena na pevný substrát, který zahrnuje kuličky nebo plastovou membránu, ix) je obsažena ve sterilním prostředku nebo
    x) je detekovatelně značena a zahrnuje radioaktivní nebo fluorescenční značení.
    10. Sada, vyznačující se tím, že obsahuje vazebnou sloučeninu podle nároku 9 a
    a) kompartment obsahující uvedenou vazebnou sloučeninu,
    b) kompartment obsahující
    i) polypeptid p40, ii) polypeptid obsahující IL-B30, iii) polypeptid DCRS5 a/nebo iv) polypeptid IL-12R31,
    c) kompartment obsahující protilátku, která se selektivně váže na
    i) polypeptid p40, ii) polypeptid IL-B30, iii) polypeptid DCRS5 a/nebo iv) polypeptid IL-12Rpi nebo
    d) instrukce pro použití a likvidaci činidel obsažených v uvedené sadě.
    11. Způsob produkce komplexu antigen:protilátka, vyznačující se tím, že zahrnuje kontakt polypeptidu DCRS5 primáta s protilátkou podle nároku 9 za vhodných podmínek, což umožňuje vznik uvedeného komplexu.
    'V
    12. Způsob podle nároku 11, vyznačující se tím, ž e
    100 ······ · · · · β Λ • · · · ···· * · · ··· ·· · «
    a) uvedený komplex se izoluje od jiných cytokinových receptorů,
    b) uvedený komplex se izoloval od jiné protilátky,
    c) k uvedenému kontaktu dochází se vzorkem obsahujícím interferon,
    d) uvedený kontakt umožňuje kvantitativní detekci uvedeného antigenu,
    e) k uvedenému kontaktu dochází se vzorkem obsahujícím uvedenou protilátku nebo
    f) uvedený kontakt umožňuje kvantitativní detekci uvedené protilátky.
    13. Prostředek, vyznačující se tím, že obsahuj e
    a) sterilní vazebnou sloučeninu podle nároku 9 nebo
    b) uvedenou vazebnou sloučeninu podle nároku 9 a nosič, kde uvedený nosič je
    i) vodná sloučenina zahrnující vodu, fyziologický roztok a/nebo pufr a/nebo ii) připraven pro orální, rektální, nasální, povrchovou nebo parenterální aplikaci.
    14. Izolovaná nebo rekombinantní nukleová kyselina kódující polypeptid obsahující aminokyseliny 1 až 606 sekvence SEQ ID NO: 2.
    15. Buňka nebo tkáň obsahující uvedenou rekombinantní nukleovou kyselinu podle nároku 14.
    16. Buňka podle nároku 15,kterou je
    a) prokaryontní buňka,
    b) eukaryontní buňka,
    c) bakteriální buňka,
    d) buňka kvasinek, • ·
    e) hmyzí buňka, ♦♦· ···* . • · · · · , ······· « » . , „ ιοί ......... : • · · · ·· ··· ··, · > f) savčí buňka, g) myší buňka, h) buňka primáta nebo i) buňka člověka. 17 Sada, vyzná čující se tím, že obsahuje uvedenou nukleovou kyselinu podle nároku 14 a
    a) kompartment obsahující uvedenou nukleovou kyselinu,
    b) kompartment obsahující nukleovou kyselinu kódující:
    i) polypeptid p40, ii) polypeptid IL-B30, iii) polypeptid DCRS5 a/nebo iv) polypeptid IL-12RP1 nebo
    c) kompartment obsahující
    i) polypeptid p40, ii) polypeptid IL-B30, iii) polypeptid DCRS5 a/nebo iv) polypeptid IL-12Rpi nebo
    d) kompartment obsahující protilátku, která se selektivně váže na
    i) polypeptid p40, ii) polypeptid IL-B30, iii) polypeptid DCRS5 a/nebo iv) polypeptid IL-12R31 nebo
    e) instrukce pro použití sadě. nebo likvidaci činidel v uvedené 18 Způsob modulace fyziologie nebo vývoje buňky, vyznačuj ící se tím, že zahrnuje kontakt uvedené buňky s a) antagonistou p40/IL-B30, 'který je komplex obsahuj ící i) extrabuněčnou část DCRŠ5 primáta a/nebo
    ii) extrabuněčnou část IL-12Rpi primáta • ·
    102 • • • · · · · • · · · · ······ · · • · · · • · · · · · · • • · • '* b) antagonistou p40/IL-B30, který je protilátkou, j enž se váže komplex obsahující i) DCRS5 primáta a/nebo ii) IL-12Rpl c) antagonistou p40/IL-B30, který je protilátka, jenž se váže na DCRS5, d) antagonistou p40/IL-B30, který je protilátkou, j enž se váže
    na IL-12Rpi,
    e) antagonistou p40/IL-B30, který je antisense nukleovou kyselinou pro DCRS5 nebo IL-12Rpi nebo
    f) agonistou p40/IL-B30, který je protilátkou, jenž se váže na komplex obsahující
    i) DCRS5 primáta a/nebo ii) IL-12Rpi primáta.
    19. Způsob podle nároku 18, vyznačující se tím, ž e k uvedenému kontaktu dochází s antagonistou a
    a) uvedený kontakt je v kombinaci s antagonistou vůči
    i) IL-12, ii) IL-18, iii) TNF nebo iv) IFNy nebo
    b) uvedená buňka pochází z hostitele, který
    i) vykazuje příznaky nebo projevy chronického onemocnění zprostředkovaného Thl, ii) vykazuje projevy nebo příznaky roztroušené sklerózy, revmatoidní artritidy, osteoartritidy, zánětlivého onemocnění střev, cukrovky, lupénky nebo sepse nebo iii) obdržel alogenní transplantát.
    20. Způsob podle nároku 18, vyznačující se tím, ž e uvedený kontakt je s agonistou a
    a) uvedený kontakt je v kombinaci s
    i) IL-12,
    103 • · • · · · • · · · • · · · · · « • · · • · · · ii) IL-18, iii) TNF nebo iv) IFNy nebo
    b) uvedená buňka pochází z hostitele, který
    i) vykazuje příznaky a projevy chronické odezvy TH2, ii) trpí nádorem, růstem virů nebo plísní, iii) aplikovala se mu vakcína nebo iv) trpí alergickou odezvou.
    21. Nukleová kyselina podle nároku 14 obsahující nukleotidy 188 až 2005 sekvence SEQ ID NO: 1.
    22. V podstatě čistý nebo rekombinantní antigenní polypeptid se sekvencí SEQ ID NO: 2.
    23. Polypeptid podle nároku 22 obsahující
    a) zbytky 1 až 101 sekvence SEQ ID NO: 2,
    b) zbytky 102 až 195 sekvence SEQ ID NO: 2,
    c) zbytky 196 až 297 sekvence SEQ ID NO: 2,
    d) zbytky 1 až 328 sekvence SEQ ID NO: 2 nebo
    e) zbytky 1 až 606 sekvence SEQ ID NO: 2.
    24. Heterodimérová sloučenina obsahující polypeptid podle nároku 22 a IL-12Rpi.
    25.Sloučenina podle nároku 24 schopná vázat se na IL-B30/p40.
    26.Sada, vyznačující se tím, že obsahuje polypeptid podle nároku 22 a instrukce pro použití.
    27.Sada podle nároku 26, vyznačující se tím, ž- e také obsahuje
    a) polypeptid IL-12pi a
    b) p40, IL-B30 nebo polypeptidy IL-B30/p40.
    104
    a)
    b)
    c)
    a)
    b)
    c) .Vazebná sloučenina, která se specificky váže na polypeptid podle nároku 22.
    . Vazebná sloučenina podle nároku 28, kterou je polyklonální protilátka, monoklonální protilátka nebo fragment Fab, Fab2 nebo Fv.
    . Vazebná sloučenina podle nároku 28, která se specificky váže na polypeptid podle nároku 23.
    . Vazebná sloučenina podle nároku 30, kterou je polyklonální protilátka, monoklonální protilátka nebo fragment Fab, Fab2 nebo Fv.
    .Sada, vyznačující se tím, že obsahuje vazebnou sloučeninu podle nároku 28 a instrukce vhodné pro použití.
    .Způsob produkce komplexu antigen:protilátka, vyznačující se tím, že zahrnuje kontakt protilátky podle nároku 29 za podmínek vhodných pro vytvoření komplexu.
    Izolovaný nebo rekombinantní polypeptid podle nároku 22.
    polynukleotid kódující
    Polynukleotid podle nároku 34, podle nároku 23.
    který kóduje polypeptid . Polynukleotid podle nároku 34 obsahující sekvenci SEQ ID NO: 1.
    Expresívní vektor obsahující polynukleotid podle nároku
    34.
    • » ·» ·
    105
    38. Hostitelská buňka obsahující nároku 37.
    expresívní vektor podle
    39. Hostitelská buňka podle nároku 38, kterou je
    a) savčí buňka,
    b) buňka hmyzu,
    c) bakteriální buňka nebo kvasinková buňka.
    40. Způsob produkce antigenního polypeptidu se sekvencí SEQ ID NO: 2,vyznačující se tím, že zahrnuje
    a) kultivaci hostitelské buňky podle nároku 38 za podmínek vhodných pro expresi polypeptidu a
    b) izolaci nebo čištění polypeptidu.
    41. Způsob modulace fyziologie nebo vývoje buňky, vyznačující se tím, že zahrnuje kontakt buňky s agonistou nebo antagonistou sekvence SEQ ID NO: 2.
CZ20023698A 2000-05-10 2001-05-10 Savcí receptorové proteiny, cinidla a metody, které se jich týkají CZ304022B6 (cs)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US20342600P 2000-05-10 2000-05-10

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CZ20023698A3 true CZ20023698A3 (cs) 2003-04-16
CZ304022B6 CZ304022B6 (cs) 2013-08-28

Family

ID=22753958

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ20023698A CZ304022B6 (cs) 2000-05-10 2001-05-10 Savcí receptorové proteiny, cinidla a metody, které se jich týkají

Country Status (25)

Country Link
US (7) US6756481B2 (cs)
EP (3) EP1287130B2 (cs)
JP (6) JP5073909B2 (cs)
KR (1) KR100869621B1 (cs)
CN (2) CN1575337A (cs)
AT (1) ATE396264T1 (cs)
AU (2) AU2001261351B2 (cs)
CA (1) CA2408571C (cs)
CY (1) CY1108545T1 (cs)
CZ (1) CZ304022B6 (cs)
DE (1) DE60134136D1 (cs)
DK (1) DK1287130T3 (cs)
ES (1) ES2307618T3 (cs)
HK (1) HK1049862B (cs)
HU (1) HUP0302339A3 (cs)
IL (2) IL152414A0 (cs)
MX (1) MXPA02011081A (cs)
NO (2) NO331408B1 (cs)
NZ (1) NZ522146A (cs)
PL (1) PL209128B1 (cs)
PT (1) PT1287130E (cs)
SI (1) SI1287130T1 (cs)
SK (1) SK287984B6 (cs)
WO (1) WO2001085790A2 (cs)
ZA (1) ZA200208795B (cs)

Families Citing this family (38)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20030082734A1 (en) * 1999-06-01 2003-05-01 Dowling Lynette M. Mammalian receptor proteins; related reagents and methods
DK1188830T3 (da) 1999-06-02 2010-04-26 Chugai Pharmaceutical Co Ltd Nyt hæmopoietinreceptorprotein NR10
EP1221482B1 (en) 1999-09-27 2005-12-28 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Hemopoietin receptor protein, nr12
US7422743B2 (en) 2000-05-10 2008-09-09 Schering Corporation Mammalian receptor protein DCRS5;methods of treatment
US6756481B2 (en) * 2000-05-10 2004-06-29 Schering Corporation IL-23 receptor binding compositions
NZ539271A (en) * 2002-10-30 2008-12-24 Genentech Inc Inhibition of the production of proinflammatory cytokine interleukin-17 (IL-17) by T cells, using an antagonist of interleukin-23 (IL-23)
AU2003303384A1 (en) 2002-12-23 2004-07-22 Schering Corporation Uses of mammalian cytokine; related reagents
US20040219150A1 (en) * 2003-02-06 2004-11-04 Cua Daniel J. Uses of mammalian cytokine; related reagents
ATE440864T1 (de) * 2003-03-10 2009-09-15 Schering Corp Verwendung von il-23-antagonisten; verwandte reagenzien
EP1623011B1 (en) 2003-05-09 2013-01-02 Janssen Biotech, Inc. Il-23p40 specific immunoglobulin derived proteins, compositions, methods and uses
CN1942201B (zh) * 2004-02-17 2012-06-20 先灵公司 调节il-23活性的方法;相关试剂
US20050287593A1 (en) 2004-05-03 2005-12-29 Schering Corporation Use of cytokine expression to predict skin inflammation; methods of treatment
AU2005241020B2 (en) 2004-05-03 2008-07-10 Merck Sharp & Dohme Corp. Use of IL-17 expression to predict skin inflammation; methods of treatment
AR051444A1 (es) 2004-09-24 2007-01-17 Centocor Inc Proteinas derivadas de inmunoglobulina especifica de il-23p40, composiciones, epitopos, metodos y usos
EP1853707A2 (en) * 2004-12-20 2007-11-14 Schering Corporation Uses of il-23 antagonists in the treatment of diabetes mellitus
CA2613818C (en) 2005-06-30 2013-08-27 Centocor, Inc. Anti-il-23 antibodies, compositions, methods and uses
SI3219328T1 (sl) 2005-12-29 2020-10-30 Janssen Biotech, Inc. Človeška protitelesa proti-IL-23, sestavki, postopki in uporabe
ES2544888T3 (es) 2006-06-08 2015-09-04 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Prevención o remedio para enfermedades inflamatorias
TWI426918B (zh) 2007-02-12 2014-02-21 Merck Sharp & Dohme Il-23拮抗劑於治療感染之用途
MX2009009167A (es) * 2007-02-28 2009-09-04 Schering Corp Terapia de combinacion para el tratamiento de trastornos inmunes.
CA2679381A1 (en) 2007-02-28 2008-09-04 Schering Corporation Engineered anti-il-23r antibodies
CA2708065C (en) * 2007-12-05 2015-02-24 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Therapeutic agent for pruritus
BRPI0908312A2 (pt) 2008-05-05 2015-08-18 Novimmune Sa '' anticorpo monoclonal totalmente humano isolado, composição farmacêutica, método de alívio de um sintoma de uma indicação clínica e método de alívio de um sintoma de uma doença autoimune, distúrbio inflamatório ou distúrbio da proliferação celular''
WO2010027767A1 (en) * 2008-08-27 2010-03-11 Schering Corporation Engineered anti-il-23r antibodies
CA2759942A1 (en) * 2009-04-27 2010-10-07 Novartis Ag Composition and methods of use for therapeutic antibodies specific for the il-12 receptore betai subunit
EP2427203B1 (en) 2009-05-05 2018-10-17 Novimmune S.A. Anti-il-17f antibodies and use thereof
KR102049223B1 (ko) 2010-11-04 2019-11-28 베링거 인겔하임 인터내셔날 게엠베하 항-il-23 항체
CN109206516A (zh) 2012-05-03 2019-01-15 勃林格殷格翰国际有限公司 抗IL-23p19抗体
EP3172339A1 (en) 2014-07-24 2017-05-31 Boehringer Ingelheim International GmbH Biomarkers useful in the treatment of il-23a related diseases
CA2959629C (en) 2014-09-03 2023-10-31 Boehringer Ingelheim International Gmbh Compound targeting il-23a and tnf-alpha and uses thereof
KR20170120616A (ko) 2015-02-04 2017-10-31 베링거 인겔하임 인터내셔날 게엠베하 염증성 질환의 치료 방법
JP7516250B2 (ja) 2018-03-05 2024-07-16 ヤンセン バイオテツク,インコーポレーテツド 抗il-23特異的抗体を用いたクローン病の治療方法
MA55149A (fr) 2018-11-20 2021-09-29 Janssen Biotech Inc Procédé sûr et efficace de traitement du psoriasis avec un anticorps spécifique anti-il-23
AU2020224137B2 (en) 2019-02-22 2026-01-08 Five Prime Therapeutics, Inc. CD80 extracellular domain-Fc fusion proteins for treating PD-L1 negative tumors
MX2021013272A (es) 2019-05-03 2021-11-17 Five Prime Therapeutics Inc Formulaciones farmaceuticas que contienen proteinas de fusion fc de dominio extracelular de cd80.
EP3972690A4 (en) 2019-05-23 2023-07-05 Janssen Biotech, Inc. METHOD OF TREATMENT OF INFLAMMATORY BOWEL DISEASE USING COMBINATION THERAPY OF ANTIBODIES TO IL-23 AND TNF-ALPHA
TW202535466A (zh) 2019-09-09 2025-09-16 德商百靈佳殷格翰國際股份有限公司 抗-il-23p19抗體調配物
CA3183927A1 (en) 2020-05-21 2021-11-25 Janssen Biotech, Inc. Method of treating inflammatory bowel disease with a combination therapy of antibodies to il-23 and tnf alpha

Family Cites Families (22)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE2031216A1 (de) 1969-06-19 1971-01-14 Citizen Watch Co Ltd , Tokio Tag und Datum Stellvorrichtung fur Uhren mit Kalender
US3940475A (en) 1970-06-11 1976-02-24 Biological Developments, Inc. Radioimmune method of assaying quantitatively for a hapten
NL154598B (nl) 1970-11-10 1977-09-15 Organon Nv Werkwijze voor het aantonen en bepalen van laagmoleculire verbindingen en van eiwitten die deze verbindingen specifiek kunnen binden, alsmede testverpakking.
US3817837A (en) 1971-05-14 1974-06-18 Syva Corp Enzyme amplification assay
US3939350A (en) 1974-04-29 1976-02-17 Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Fluorescent immunoassay employing total reflection for activation
US3996345A (en) 1974-08-12 1976-12-07 Syva Company Fluorescence quenching with immunological pairs in immunoassays
US4277437A (en) 1978-04-05 1981-07-07 Syva Company Kit for carrying out chemically induced fluorescence immunoassay
US4275149A (en) 1978-11-24 1981-06-23 Syva Company Macromolecular environment control in specific receptor assays
US4366241A (en) 1980-08-07 1982-12-28 Syva Company Concentrating zone method in heterogeneous immunoassays
US4659678A (en) 1982-09-29 1987-04-21 Serono Diagnostics Limited Immunoassay of antigens
US4816567A (en) 1983-04-08 1989-03-28 Genentech, Inc. Recombinant immunoglobin preparations
US4859609A (en) 1986-04-30 1989-08-22 Genentech, Inc. Novel receptors for efficient determination of ligands and their antagonists or agonists
US5789192A (en) 1992-12-10 1998-08-04 Schering Corporation Mammalian receptors for interleukin-10 (IL-10)
US5888774A (en) 1994-12-19 1999-03-30 Cangene Corporation Recombinant DNA molecules and expression vectors for erythropoietin
US6060284A (en) * 1997-07-25 2000-05-09 Schering Corporation DNA encoding interleukin-B30
JPH11273358A (ja) 1998-03-26 1999-10-08 Kawasaki Steel Corp 半導体記憶装置
EP1181366B2 (en) * 1999-06-01 2013-08-21 Merck Sharp & Dohme Corp. Mammalian receptor proteins; related reagents and methods
US20030082734A1 (en) 1999-06-01 2003-05-01 Dowling Lynette M. Mammalian receptor proteins; related reagents and methods
DE60038304T3 (de) 1999-09-09 2017-04-06 Merck Sharp & Dohme Corp. Interleukin-12 p40 und interleukin-b30. kombinationen davon. antikörper. verwendungen in pharmazeutische zusammensetzungen
JP2008099690A (ja) 1999-09-27 2008-05-01 Chugai Pharmaceut Co Ltd 新規ヘモポエチン受容体蛋白質、nr12
EP1221482B1 (en) * 1999-09-27 2005-12-28 Chugai Seiyaku Kabushiki Kaisha Hemopoietin receptor protein, nr12
US6756481B2 (en) * 2000-05-10 2004-06-29 Schering Corporation IL-23 receptor binding compositions

Also Published As

Publication number Publication date
NZ522146A (en) 2004-10-29
PT1287130E (pt) 2008-09-01
NO20025354L (no) 2003-01-10
EP1918377B1 (en) 2013-12-04
EP1918377A1 (en) 2008-05-07
NO331408B1 (no) 2011-12-19
US20050100917A1 (en) 2005-05-12
AU6135101A (en) 2001-11-20
AU2001261351B2 (en) 2007-03-01
US20120121601A1 (en) 2012-05-17
PL365177A1 (en) 2004-12-27
EP1287130A2 (en) 2003-03-05
US20050100918A1 (en) 2005-05-12
JP5073909B2 (ja) 2012-11-14
US8110378B2 (en) 2012-02-07
JP2012187111A (ja) 2012-10-04
CZ304022B6 (cs) 2013-08-28
HK1049862A1 (en) 2003-05-30
WO2001085790A3 (en) 2002-07-18
US20110243842A1 (en) 2011-10-06
US6756481B2 (en) 2004-06-29
NO20111147L (no) 2003-01-10
JP2008273961A (ja) 2008-11-13
HUP0302339A2 (hu) 2003-10-28
JP2015110576A (ja) 2015-06-18
SK287984B6 (sk) 2012-08-06
US20030017617A1 (en) 2003-01-23
IL152414A0 (en) 2003-05-29
CA2408571C (en) 2014-04-29
CA2408571A1 (en) 2001-11-15
PL209128B1 (pl) 2011-07-29
US7510853B2 (en) 2009-03-31
SI1287130T1 (sl) 2008-08-31
US7749718B2 (en) 2010-07-06
EP2275548A1 (en) 2011-01-19
DK1287130T3 (da) 2008-09-01
HK1049862B (en) 2008-08-01
SK15742002A3 (sk) 2003-03-04
US7964703B2 (en) 2011-06-21
US7411041B2 (en) 2008-08-12
CY1108545T1 (el) 2014-04-09
ATE396264T1 (de) 2008-06-15
CN1575337A (zh) 2005-02-02
JP2003532408A (ja) 2003-11-05
NO20025354D0 (no) 2002-11-08
WO2001085790A2 (en) 2001-11-15
EP1287130B2 (en) 2017-07-26
IL152414A (en) 2010-05-31
DE60134136D1 (de) 2008-07-03
JP2012070740A (ja) 2012-04-12
US20100261273A1 (en) 2010-10-14
KR100869621B1 (ko) 2008-11-21
ZA200208795B (en) 2004-02-09
HUP0302339A3 (en) 2011-01-28
CN101654479A (zh) 2010-02-24
US20090060865A1 (en) 2009-03-05
KR20020092472A (ko) 2002-12-11
ES2307618T3 (es) 2008-12-01
EP1287130B1 (en) 2008-05-21
JP2015057396A (ja) 2015-03-26
MXPA02011081A (es) 2003-03-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
AU2001261351B2 (en) Mammalian receptor proteins; related reagents and methods
AU2001261351A1 (en) Mammalian receptor proteins; related reagents and methods
MXPA02011617A (es) Proteinas de mamiferos receptoras, reactivosy metodos relacionados.
JP2015007129A (ja) 哺乳動物レセプタータンパク質;関連する試薬および方法
WO1999040195A1 (en) Mammalian receptor proteins; related reagents and methods
AU2007202362B2 (en) Mammalian receptor proteins; related reagents and methods
HK1117192A (en) Mammalian cytokine receptor subunit proteins, related reagents and methods
MXPA00008848A (en) Human receptor proteins;related reagents and methods
HK1152072A (en) Mammalian cytokine receptor subunit proteins, related reagents and methods

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Patent lapsed due to non-payment of fee

Effective date: 20160510