ES2203635T3 - Nucleosidos y oligonucleotidos con grupos 2'-eter. - Google Patents
Nucleosidos y oligonucleotidos con grupos 2'-eter.Info
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Abstract
SE DESCRIBEN COMPUESTOS DE LA FORMULA DONDE R SUB.1 Y R SUB.2} INDEPENDIENTE UNO DE OTRO SON HIDROGENO O UN GRUPO DE PROTECCION, O R{SUB.1} TIENE ESTE SIGNIFICADO Y R{SUB.2} ES UN RESTO QUE FORMA UN GRUPO DE PUENTE-NUCLEOTIDO QUE CONTIENE FOSFORO; B SIGNIFICA UN RESTO PIRIMIDINA O PURINA O UN ANALOGO; Y R{SUB.3} ES OH, F O (CF{SUB.2}NCF{SUB.3}, DONDE N ES UNA CIFRA DESDE 0 HASTA 7 Y OLIGONUCLEOTIDOS QUE CONTIENEN ESTOS NUCLEOSIDOS.
Description
Nucleósidos y oligonucleótidos con grupos
2'-éter.
La invención se refiere a análogos de
ribonucleósidos cuyo grupo 2'-OH está eterificado
con grupos hidroxietilo o fluoroalquilo, a un procedimiento para su
producción, oligonucléotidos con estos nucleósidos y el uso de los
nucleósidos para la producción de oligonucleótidos con las mismas o
diferentes unidades de nucleósidos en la molécula.
Los nucleósidos y oligonucleótidos como
principios activos antivíricos o debido a su capacidad de
interaccionar con los ácidos nucleicos (oligonucleótidos
"antisentido"), con la consiguiente actividad biológica, han
despertado un gran interés, véase por ejemplo, Uhlmann, E., Peyman,
A., Chemical Reviews 90:543-584 (1990). Para la
producción de nucleósidos con nuevas propiedades o para mejorar la
interacción de los oligonucleótidos antisentido con los ácidos
nucleicos naturales, así como su estabilidad frente a las
nucleasas, se han modificado de diversas maneras los restos de
azúcar de los nucleósidos (o de las unidades de nucleótidos en los
oligonucléotidos) o la unión fosfato internucleotídica en los
oligonucléotidos, véase por ejemplo Marquez, V.E., Lim, M.I.,
Medicinal Research Reviews 6:1-40 (1986), Hélène,
C., Toulmé, J.J. Biochimica et Biophysica Acta
1049:99-125(1990), Englisch, U., Gauss, D.H,
Angewandte Chemie 103:629-646 (1991), Matteucci,
M.D., Bischofberger, N., Annual Reports in Medicinal Chemistry
26:87-296 (1991). En Cook, P.D.,
Anti-Cancer Drug Design 6:585-607
(1991) y WO 91/06556 se describen nucleósidos que están modificados
en el grupo 2'-OH del azúcar. Las modificaciones
descritas tienen como consecuencia un aumento de la resistencia a
nucleasas; cuanto más largo es el resto alquilo, mayor es la
resistencia a nucleasas. Así, con restos de alquilo pequeños como
metilo, etilo o propilo, se observa un débil aumento de la afinidad
de unión, mientras que en el caso de cadenas más largas, la
afinidad de unión disminuye drásticamente. En Lesnik, E.A. et al.,
Biochemistry 32, 7832-7838 (1993) se describen
oligonucleótidos con elementos nucleosídicos que están sustituidos
en la posición 2', especialmente: sustituyentes
2'-F, 2'-O-metilo,
2'-O-etilo,
2'-O-propilo,
2'-O-butilo,
2'-O-pentilo,
2'-O-nonilo,
2'-O-alilo y
2-O-bencilo. En este caso se
muestra que la estabilidad dúplex más elevada se consigue con los
sustituyentes 2'-F. Hasta ese momento en los
nucleósidos nunca se habían incluido nucleósidos con grupos
hidroxietilo o fluoroalquilo como cadenas laterales en el grupo
2'-OH. Sorprendentemente, estas modificaciones de la
invención aumentan la afinidad de unión al ARN complementario
frente a cadenas alquilo no sustituidas y de la misma longitud. No
se esperaba obtener este resultado a causa de los datos publicados.
De forma análoga a los oligorribonucleótidos modificados en
2'-OH, los compuestos de la invención se
caracterizan también por una marcada resistencia a las nucleasas.
Además, los oligonucleótidos que contienen los nucleósidos de la
invención presentan una absorción celular mayor y, por consiguiente,
presentan una mejor biodisponibilidad y actividad in
vivo.
Un objeto de la presente invención está
constituido por los compuestos de fórmula i
en la que R_{1} y R_{2} son
independientemente hidrógeno o un grupo protector o R_{1} tiene
esos significados y R_{2} es un resto formador de un grupo puente
entre nucleótidos que contiene fósforo; B es un resto de purina o
de pirimidina o un análogo de éstos y R_{3} es OH, F o
(CF_{2})_{n}CF_{3}, en la que n es un número desde 0
hasta
7.
Cuando R_{3} es OH, este grupo hidroxi puede
estar protegido con un grupo como los definidos para R_{1} y
R_{2}.
En una forma de realización preferida n es el
número 0.
En una forma de realización preferida R_{1} y
R_{2} representan hidrógeno.
Los grupos protectores y el procedimiento para la
derivación de grupos hidroxilo con tales grupos protectores son en
general conocidos en la química de los azúcares y los nucleótidos y
se describen, por ejemplo, en Greene, B.T., Protective Groups in
Organic Synthesis, Wiley Interscience, Nueva York (1991), von
Sonveaux, E., Bioorganic Chemistry 14:274-325 (1986)
o von Beaucage, S.L., Yyer, R., Tetrahedron
48:2223-2311 (1992). Ejemplos de estos grupos
protectores son: bencilo, metilbencilo, dimetilbencilo,
metoxibencilo, dimetoxibencilo, bromobencilo,
2,4-diclorobencilo; difenilmetilo,
di(metilfenil)-metilo,
di(dimetilfenil)metilo,
di(metoxifenil)metilo,
di(dimetoxifenil)-metilo, trifenilmetilo,
tris-4,4',4''-terc-butilfenilmetilo,
di-p-anisilfenilmetilo,
tri(metilfenil)metilo,
tri(dimetilfenil)metilo,
metoxifenil(difenil)metilo,
di(metoxifenil)fenilmetilo,
tri(metoxifenil)metilo,
tri(dimetoxifenil)-metilo; trifenilsililo,
alquildifenilsililo, dialquilfenilsililo y trialquilsililo con 1
hasta 20, preferiblemente 1 hasta 12, prefiriéndose especialmente 1
hasta 8 átomos de carbono en los grupos alquilo, por ejemplo,
trimetilsililo, trietilsililo,
tri-n-propilsililo,
i-propil-dimetilsililo,
t-butil-dimetilsililo,
t-butil-difenilsililo,
n-octil-dimetilsililo,
(1,1,2,2-tetrametiletil)-dimetilsililo;
-(alquil con de 1 a 8 átomos de carbono)_{2}
Si-O-Si-(alquil con de 1 a 8 átomos
de carbono)_{2}, donde alquilo significa, por ejemplo,
metilo, etilo, n- e y-propilo, n-, i- o
t-butilo; acilo con de 2 a 12 átomos de carbono,
especialmente con de 2 a 8 átomos de carbono, como por ejemplo,
acetilo, propanoílo, butanoílo, pentanoílo, hexanoílo, benzoílo,
metilbenzoílo, metoxibenzoílo, clorobenzoílo y bromobenzoílo;
R_{S1}-SO_{2}-, donde R_{S1} es alquilo con de
1 a 12 átomos de carbono, especialmente alquilo con de 1 a 6 átomos
de carbono, cicloalquilo con 5 ó 6 átomos de carbono, fenilo,
bencilo, alquilfenilo con de 1 a 12 átomos de carbono y
especialmente alquilfenilo con de 1 a 4 átomos de carbono o
alquilbencilo con de 1 a 12 átomos de carbono y especialmente
alquilbencilo con de 1 a 4 átomos de carbono o halofenilo o
halobencilo, por ejemplo, metil, etil, propil, butil, fenil, bencil,
p-bromo, p-metoxi y
p-metilfenilsulfonilo, alcoxicarbonilo con de 1 a
12 átomos de carbono, preferiblemente alcoxicarbonilo con de 1 a 8
átomos de carbono, no sustituido o sustituido con F, Cl, Br, alcoxi
con de 1 a 4 átomos de carbono, tri-(alquil con de 1 a 4 átomos de
carbono)sililo o alquilsulfonilo con de 1 a 4 átomos de
carbono, por ejemplo, metoxi, etoxi, n- o i-propoxi
o n-, i- o t-butoxicarbonilo,
2-trimetilsililetoxicarbonilo,
2-metilsulfoniletoxicarbonilo, aliloxicarbonilo o
feniloxicarbonilo o benciloxicarbonilo no sustituido o sustituido
como en el caso del alcoxicarbonilo, por ejemplo, metil o metoxi o
clorofeniloxicarbonilo o clorobenciloxicarbonilo, así como
9-fluorenilmetiloxicarbonilo. Siempre que R_{1}
y/o R_{2} signifiquen alquilo, pueden estar sustituidos con F,
Cl, Br, alcoxi con de 1 a 4 átomos de carbono, feniloxi,
clorofeniloxi, metoxifeniloxi, benciloxi, metoxibenciloxi o
clorofeniloxi. En la fórmula I R_{1} y R_{2} pueden ser los
mismos o diferentes grupos protectores.
En una forma de realización especialmente
preferida, R_{1} y R_{2} representan como grupos protectores
bencilo, metilbencilo, dimetilbencilo, metoxibencilo,
dimetoxibencilo, bencilo halogenado, especialmente bromobencilo;
difenilmetilo, di(metilfenil)metilo,
di(dimetilfenil)metilo,
di(metoxifenil)metilo,
di(metoxifenil)(fenil)-metilo,
trifenilmetilo, tris-4,4',4''
-terc-butilfenilmetilo,
di-p-anisilfenilmetilo,
tri(metilfenil)metilo,
tri(dimetilfenil)metilo,
tri(metoxifenil)metilo,
tri(dimetoxifenil)metilo; trimetilsililo,
trietilsililo, tri-n-propilsililo,
i-propil-dimetilsililo,
t-butil-dimetilsililo,
t-butil-difenilsililo,
n-octil-dimetilsililo,
(1,1,2,2-tetrametiletil)-dimetilsililo;
-(CH_{3})_{2}Si-O-Si-(CH_{3})_{2}-,
-(i-C_{3}H_{7})_{2}Si-O-Si-(i-C_{3}H_{7})_{2}-;
acetilo, propanoílo, butanoílo, pentanoílo, hexanoílo, benzoílo,
metilbenzoílo, metoxibenzoílo, clorobenzoílo y bromobenzoílo;
metil, etil, propil, butil, fenil, bencil, p-bromo,
p-metoxi y p-metilfenilsulfonilo;
metoxi, etoxi, n- o i-propoxi o n-, i- o
t-butoxicarbonilo o fenoxicarbonilo o
feniloxicarbonilo, benciloxicarbonilo, metil o metoxi o
clorofeniloxicarbonilo o benciloxicarbonilo o
9-fluorenilmetiloxicarbonilo.
R_{2} puede corresponder a un resto formador de
un grupo puente entre nucleótidos que contiene fósforo de fórmula
P1 o P2
en la que Y_{a} es hidrógeno, alquilo con de 1
a 12 átomos de carbono, arilo con de 6 a 12 átomos de carbono,
aralquilo con de 7 a 20 átomos de carbono, alcarilo con de 7 a 20
átomos de carbono, -OR_{b}, -SR_{b}, -NH_{2}, amino primario,
amino secundario, O^{-}M^{+} o S^{-}M^{+}; X_{a} significa
hidrógeno o azufre; R_{a} es hidrógeno, M^{+}, alquilo con de 1
a 12 átomos de carbono, alquenilo con de 2 a 12 átomos de carbono,
arilo con de 6 a 12 átomos de carbono o el grupo R_{a}O significa
un
N-heteroaril-N-ilo
con 5 elementos en el anillo y 1 a 3 átomos de nitrógeno; R_{b}
es hidrógeno, alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono o arilo con
de 6 a 12 átomos de carbono; y M^{+} es Na^{+}, K^{+},
Li^{+}, NH_{4}^{+} o amonio primario, secundario, terciario o
cuaternario, a lo que alquilo, arilo, aralquilo y alcarilo en
Y_{a}, R_{a} y R_{b} no están sustituidos o están sustituidos
con alcoxi, tioalquilo, halógeno, -CN, -NO_{2}, fenilo,
nitrofenilo o
halofenilo.
Y_{a} contiene como grupo amino primario
preferiblemente de 1 a 12, prefiriéndose especialmente de 1 a 6
átomos de carbono y como amino secundario preferiblemente de 2 a 12,
prefiriéndose especialmente de 2 a 6 átomos de carbono.
En el caso del amino primario y secundario puede
tratarse por ejemplo de restos de fórmula R_{c}R_{d}N, en la
que R_{c} es H o tiene independientemente el significado de
R_{d}, y R_{d} representa alquilo con de 1 a 20 átomos de
carbono, preferiblemente alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono,
prefiriéndose especialmente alquilo con de 1 a 6 átomos de carbono,
aminoalquilo con de 1 a 20 átomos de carbono, preferiblemente con
de 1 a 12 átomos de carbono, prefiriéndose especialmente con de 1 a
6 átomos de carbono, hidroxialquilo con de 1 a 20 átomos de
carbono, preferiblemente con de 1 a 12 átomos de carbono,
prefiriéndose especialmente con de 1 a 6 átomos de carbono;
carboxialquilo o carbalcoxialquilo, a lo que el grupo carbalcoxi
contiene de 2 a 8 átomos de carbono y el grupo alquilo de 1 a 6,
preferiblemente 1 a 4 átomos de carbono; alquenilo con de 2 a 20
átomos de carbono, preferiblemente con de 2 a 12 átomos de carbono,
prefiriéndose especialmente con de 2 a 6 átomos de carbono; fenilo,
mono o di-(alquil o alcoxi con de 1 a 4 átomos de
carbono)fenilo, bencilo, mono o di-(alquil o alcoxi con de 1
a 4 átomos de carbono)bencilo; o 1,2-, 1,3- o
1,4-imidazolil-alquilo con de 1 a 6
átomos de carbono, o R_{c} y R_{d} representan conjuntamente
tetra o pentametileno,
3-oxa-1,5-pentileno,
-CH_{2}-NR_{e}-CH_{2}CH_{2}-
o
-CH_{2}CH_{2}-NR_{19}-CH_{2}CH_{2}-,
donde R_{e} es H o alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono. El
grupo amino en el aminoalquilo puede estar sustituido con uno o dos
grupos alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono o hidroxialquilo. El
grupo hidroxilo en el hidroxialquilo puede estar eterificado con
alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono.
Como amonio primario, secundario, terciario y
cuaternario, se entiende para Y_{a}, en relación con la
definición de M^{+}, un ion de fórmula
R_{f}R_{g}R_{h}R_{j}N^{+}, en la que R_{f} es alquilo,
aminoalquilo, hidroxialquilo con de 1 a 20 átomos de carbono,
preferiblemente con de 1 a 12 átomos de carbono, prefiriéndose
especialmente con de 1 a 6 átomos de carbono; carboxialquilo o
carbalcoxialquilo, a lo que el grupo carbalcoxi contiene de 2 a 8
átomos de carbono y el grupo alquilo 1 a 6, preferiblemente 1 a 4
átomos de carbono; alquenilo con de 2 a 20 átomos de carbono,
preferiblemente con de 2 a 12 átomos de carbono, prefiriéndose
especialmente alquenilo con de 2 a 6 átomos de carbono, fenilo, mono
o di-(alquil o alcoxi con de 1 a 4 átomos de carbono)fenilo,
bencilo, mono o di-(alquil o alcoxi con de 1 a 4 átomos de
carbono)bencilo; o 1,2, 1-3- o
1,4-imidazolil-alquilo con de 1 a 6
átomos de carbono, y R_{g}, R_{h} y R_{i} son
independientemente hidrógeno o tienen el significado de R_{f}, o
R_{f} y R_{g} representan juntos tetra o pentametileno,
3-oxa-1,5-pentileno,
-CH_{2}-NR_{e}-CH_{2}CH_{2}-
o
-CH_{2}CH_{2}-NR_{e}-CH_{2}CH_{2}-,
en la que R_{e} es H o alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono, y
R_{h} y R_{i} tienen independientemente el significado de
R_{f}. El grupo amino en el aminoalquilo puede estar sustituido
con uno o dos grupos alquilo o hidroxialquilo con de 1 a 4 átomos de
carbono. El grupo hidroxilo en el hidroxialquilo puede estar
eterificado con alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono.
Ejemplos de carboxialquilo son carboximetilo,
carboxietilo, carboxipropilo y carboxibutilo y ejemplos de
carboxialquilo son estos grupos carboxialquilo esterificados con
metilo o etilo. Ejemplos de alquenilo son alilo,
but-1-en-3-ilo
o 4-ilo, pent-3- o
4-en-1-ilo o
2-ilo, hex-3- o -4- o
-5-en-ilo o 2-ilo.
Ejemplos de alquil y alcoxifenilo o alquil y alcoxibencilo son
metilfenilo, dimetilfenilo, etilfenilo, dietilfenilo, metilbencilo,
dimetilbencilo, etilbencilo, dietilbencilo, metoxifenilo,
dimetoxifenilo, etoxifenilo, dietoxifenilo, metoxibencilo,
dimetoxibencilo, etoxibencilo, dietoxibencilo. Ejemplos de
imidazolalquilo en los que el grupo alquilo contiene preferiblemente
de 2 a 4 átomos de carbono, son 1,2-, 1,3- o
1,4-imidazoliletilo o n-propilo o
n-butilo. R_{19} representa preferiblemente H,
metilo o etilo.
Ejemplos preferidos de amino primario o
secundario son metil, etil, dimetil, dietil,
di-i-propilo, mono o
di-(1-hidroxi-et-2-il),
fenil y bencilamino, acetilamino y benzoilamino, así como
piperidinilo, piperazinilo y morfolinilo.
Ejemplos preferidos de amonio primario o
secundario son metil, etil, dimetil, dietil,
di-i-propil, mono o
di-(1-hidroxi-et-2-il),
fenil y bencilamonio.
Ejemplos de Y_{a}, R_{a} y R_{b}como
alquilo son metilo, etilo y los isómeros de propilo, butilo,
pentilo, hexilo, heptilo y octilo; ejemplos de Y_{a}, R_{a} y
R_{b}como arilo son fenilo y naftilo; ejemplos de R_{a} como
alquenilo son alilo y (alquil con de 1 a 4 átomos de
carbono)CH=CH-CH_{2}-; ejemplos de Y_{a}
como aralquilo son fenil-C_{n}H_{2n}- con n
igual a un número desde 1 a 6, especialmente bencilo; ejemplos de
Y_{a} como alcarilo son mono-, di- y tri(alquil con de 1 a
4 átomos de carbono)fenilo. Sustituyentes preferidos son
cloro, bromo, metoxi, -NO_{2}, -CN,
2,4-diclorofenilo y 4-nitrofenilo.
Ejemplos de R_{b}son 2,2,2-tricloroetilo,
4-clorofenilo, 2-clorofenilo y
2,4-diclorofenilo; y ejemplos de R_{b}O- como
N-heteroarilo son
pirrol-N-ilo,
triazol-N-ilo y
benzatriazol-N-ilo.
En una forma especialmente preferida R_{a}
significa \beta-cianoetilo e Y_{a} representa
di(i-propilamino).
Cuando B representa un resto de purina o un
análogo de éste, entonces puede ser un resto de fórmula II, IIa,
IIb, IIc, IId, IIe o IIf,
en la que R_{b1} es H, Cl, Br, OH o
-O-alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, y
R_{b2}, R_{b3} y R_{b5} significan independientemente entre sí
H, OH, SH, NH_{2}, NHNH_{2}, NHOH, NHO-alquilo
con de 1 a 12 átomos de carbono,
-N=CH-N(alquilo con de 1 a 12 átomos de
carbono)_{2}, -N=CH- azacicloalquilo, F, Cl, Br, alquilo
con de 1 a 12 átomos de carbono, hidroxialquilo con de 1 a 12 átomos
de carbono, aminoalquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, alcoxi
con de 1 a 12 átomos de carbono, benciloxi, tioalquilo con de 1 a
12 átomos de carbono, a lo que los grupos hidroxilo y amino no están
sustituidos o están sustituidos con un grupo protector, fenilo,
bencilo, amino primario con 1 a 20 átomos de carbono o amino
secundario con 2 a 30 átomos de carbono, R_{b4} representa
hidrógeno, CN o -C\equivC-R_{b7}, R_{b6} y
R_{b7} representan hidrógeno o alquilo con de 1 a 4 átomos de
carbono.
Grupos protectores adecuados se han mencionado
anteriormente. Los grupos protectores preferidos son grupos acilo
con de 1 a 8 átomos de carbono, como por ejemplo, acetilo,
propionilo, butiroílo y benzoílo. R_{b6} representa
preferiblemente H o metilo.
El amino primario contiene preferiblemente 1 a 12
y prefiriéndose especialmente 1 a 6 átomos de carbono y el amino
secundario preferiblemente 2 a 12, prefiriéndose especialmente 2 a 6
átomos de carbono.
Algunos ejemplos de alquilo, alcoxi, tioalquilo,
hidroxialquilo y aminoalquilo, que contienen preferiblemente de 1 a
6 átomos de carbono, son metilo, etilo y los isómeros de propilo,
butilo, pentilo, hexilo, heptilo, octilo, nonilo, decilo, undecilo y
dodecilo, así como los correspondientes restos alcoxi, tioalquilo,
hidroxialquilo y aminoalquilo. Los alquilo, alcoxi, tioalquilo,
hidroxialquilo y aminoalquilo contienen preferiblemente de 1 a 4
átomos de carbono. Los restos alquilo, alcoxi, tioalquilo,
hidroxialquilo y aminoalquilo preferidos son metilo, etilo, n- e
i-propilo, n- i- y t-butilo,
metoxi, etoxi, tiometilo y tioetilo, aminometilo, aminoetilo,
hidroximetilo e hidroxietilo.
Los aminos primario y secundario pueden ser, por
ejemplo, restos de fórmula R_{a1} R_{a2}N, en la que R_{a1}
es H o tiene independientemente el significado de R_{a2} y
R_{a2} representa alquil, aminoalquilo, hidroxialquilo con de 1
a 20 átomos de carbono, preferiblemente con de 1 a 12 átomos de
carbono, prefiriéndose especialmente con de 1 a 6 átomos de
carbono; carboxialquilo o carbalcoxialquilo, a lo que el grupo
carbalcoxi contiene de 2 a 8 átomos de carbono y el grupo alquilo 1
a 6, preferiblemente 1 a 4 átomos de carbono; alquenilo con de 2 a
20 átomos de carbono, preferiblemente con de 2 a 12 átomos de
carbono, prefiriéndose especialmente con de 2 a 6 átomos de
carbono; fenilo, mono o di-(alquil o alcoxi con de 1 a 4 átomos de
carbono)fenilo, bencilo, mono o di-(alquil o alcoxi con de 1
a 4 átomos de carbono)bencilo; o 1,2-, 1,3- o
1,4-imidazolil-alquilo con de 1 a 6
átomos de carbono, o R_{a1} y R_{a2} juntos representan tetra
o pentametileno,
3-oxa-1,5-pentileno,
-CH_{2}-NR_{a3}-CH_{2}CH_{2}-
o
-CH_{2}CH_{2}-NR_{a3}-CH_{2}CH_{2}-,
en la que R_{a3} es H o alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono.
El grupo amino en el aminoalquilo puede estar sustituido con uno o
dos alquilo o hidroxialquilo con de 1 a 4 átomos de carbono. El
grupo hidroxilo en el hidroxialquilo puede estar eterificado con
alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono.
Ejemplos de alquilo se han citado anteriormente.
Ejemplos de aminoalquilo son aminometilo, aminoetilo,
1-aminoprop-2-ilo o
-3-ilo,
1-amino-but-2-ilo
o -3-ilo o -4-ilo,
N-metil- o N, N-dimetil- o
N-etil- o N,N-dietil- o
N-2-hidroxietil- o
N,N-Di-2-hidroxietilaminometilo
o aminoetilo o aminopropilo o aminobutilo. Ejemplos de
hidroxialquilo son hidroximetilo,
1-hidroxi-et-2-ilo,
1-hidroxi-prop-2- o
-3-ilo,
1-hidroxi-but-2-ilo,
-3-ilo o 4-ilo. Ejemplos de
carboxialquilo son carboximetilo, carboxietilo, carboxipropilo y
carboxibutilo y ejemplos de carboxialquilo son estos grupos
carboxialquilo esterificados con metilo o etilo. Ejemplos de
alquenilo son alilo,
but-1-en-3-ilo
o 4-ilo, pent-3-o
4-en-1-ilo o
-2-ilo, hex-3- o -4- o
-5-en-1-ilo o
-2-ilo. Ejemplos de alquilo y alcoxifenilo o alquilo
y alcoxibencilo son metilfenilo, dimetilfenilo, etilfenilo,
dietilfenilo, metilbencilo, dimetilbencilo, etilbencilo,
dietilbencilo, metoxifenilo, dimetoxifenilo, etoxifenilo,
dietoxifenilo, metoxibencilo, dimetoxibencilo, etoxibencilo,
dietoxibencilo. Ejemplos de imidazolilalquilo en el que el grupo
alquilo contiene preferiblemente de 2 a 4 átomos de carbono, son
1,2-, 1,3- o 1,4-imidazoliletilo o
n-propilo o -n-butilo. R_{a3}
representa preferiblemente H, metilo o etilo.
Ejemplos preferidos de amino primario y
secundario son metil, etil, dimetil, dietil, alil, mono o
di-(1-hidroxi-et-2-il),
fenil y benzilamino, acetilamino, isobutirilamino y
benzoilamino.
En una forma de realización preferida, R_{b1}
representa hidrógeno. En otra forma de realización preferida,
R_{b5} representa hidrógeno. En otra forma de realización
preferida, R_{b2} y R_{b3} significan independientemente entre
sí H, F, Cl, Br, OH, SH, NH_{2}, NHOH, NHNH_{2}, metilamino,
dimetilamino, benzoilamino, isobutirilamino, metoxi, etoxi y
tiometilo.
Algunos ejemplos de análogos de la serie de la
purina son además de la purina, xantina, hipoxantina, adenina,
N-metiladenina, N-benzoiladenina,
2-metiltioadenina, 2-aminoadenina,
6-hidroxipurina,
2-amino-6-cloropurina,
2-amino-6-metiltio-purina,
guanina, N-isobutirilguanina. Son especialmente
preferidos adenina, 2-aminoadenina y guanina, así
como sus derivados protegidos con bases.
Si B en la fórmula I representa un resto de
pirimidina, entonces se trata preferiblemente de un resto uracilo,
timina o citosina de fórmula III, IIIa, IIIb o IIIc
en la que R_{b6} es H o alquilo con de 1 a 4
átomos de carbono y R_{b8} es H, OH, SH, NH_{2}, NHNH_{2},
NHOH, NHO-alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono,
-N=CH-N(alquilo con de 1 a 12 átomos de
carbono)_{2}, -N=CH-azacicloalquilo, F, Cl,
Br, alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, hidroxialquilo con de
1 a 12 átomos de carbono, aminoalquilo con de 1 a 12 átomos de
carbono, alcoxi con de 1 a 12 átomos de carbono, benciloxi,
tioalquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, a lo que los grupos
hidroxilo y amino no están sustituidos o están sustituidos con un
grupo protector, fenilo, bencilo, amino primario con 1 a 20 átomos
de carbono, amino secundario con 2 a 30 átomos de carbono, alquenilo
con de 1 a 12 átomos de carbono o alquinilo con de 1 a 12 átomos de
carbono, y el grupo NH_{2} en la fórmula IIIb no está sustituido
o está sustituido con alquilo con de 1 a 6 átomos de carbono,
benzoílo o un grupo protector, así como los derivados dihidro de
los restos de fórmulas III, IIIa IIIb y IIIc. Preferiblemente,
R_{b8} en la fórmula III representa H, alquilo o hidroxialquilo
con de 1 a 6 átomos de carbono, alquenilo o alquinilo con de 2 a 6
átomos de carbono, F, Cl, Br, NH_{2}, benzoilamino, mono o
dialquilamino con de 1 a 6 átomos de carbono. Preferiblemente
R_{b8} en la fórmula IIIb y IIIc representa H, alquilo, alcoxi o
hidroxialquilo con de 1 a 6 átomos de carbono, alquenilo o alquinilo
con de 2 a 6 átomos de carbono, F, Cl, Br, NH_{2}, benzoilamino,
mono o dialquilamino con de 1 a 6 átomos de
carbono.
R_{b6} representa preferiblemente H o metilo.
R_{b8} significa en la fórmula III preferiblemente H, F, Cl, Br,
NH_{2}, NHCH_{3}, N(CH_{3})_{2}, alquilo con
de 1 a 4 átomos de carbono, alquenilo con de 2 a 4 átomos de
carbono o alquin-1-ilo con de 2 a 4
átomos de carbono. R_{b8} en la fórmula IIIb y IIIc representa
preferiblemente H, alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono,
especialmente metilo, alquenilo con de 2 a 4 átomos de carbono,
especialmente vinilo o alquin-1-il
con de 2 a 4 átomos de carbono, especialmente
1-propin-1-ilo o
NH_{2}, NHCH_{3} o (CH_{3})_{2}N.
Algunos ejemplos de análogos de pirimidina son
uracilo, timina, citosina, 5-fluoruracilo,
5-clorouracilo, 5-bromouracilo,
dihidrouracilo, 5-metilcitosina,
5-propintimina y
5-propincitosina.
Otro objeto de la invención es un procedimiento
para la producción de compuestos de fórmula I,
en la que R_{1} y R_{2} son
independientemente entre sí hidrógeno o un grupo protector y B
significa un resto de purina o pirimidina o un análogo de éstos;
y
(a) R_{3} significa OH,
que está caracterizado porque un compuesto de
fórmula IVa
en la que R_{14} y R_{15} son los mismos
o diferentes grupos protectores y B significa un resto de purina o
de pirimidina o un análogo de éstos, a lo que grupos funcionales del
resto base B están protegidos con grupos protectores, se hace
reaccionar en un disolvente inerte con un compuesto de fórmula
A
(A)X-CH_{2}-COOR_{4}
en la que R_{4} significa alquilo con de 1 a 4
átomos de carbono y X es Cl, Br, I, tosil-O o
mesil-O;
y a continuación la función éster se reduce con
NaBH_{4} o LiAlH_{4}, a lo que los grupos OH originados se
pueden proteger circunstancialmente con un grupo como se ha definido
para R_{1};
(b) R_{3} significa F,
que está caracterizado porque un compuesto de
fórmula I, en la que R_{3} significa OH, se hace reaccionar con
un compuesto de fórmula B
(c) R_{3} significa
-(CF_{2})_{n}-CF_{3}, en la que n es un
número desde 0 hasta 7,
que está caracterizado porque un compuesto de
fórmula IVa se hace reaccionar con un compuesto de fórmula C, D o
E
(B)CH\equiv
C-(CF_{2})_{n}-CF_{3}
(D)CH_{2}=CH-(CF_{2})_{n}-CF_{3}
y a continuación los dobles enlaces o dobles
enlaces clorados eventualmente presentes se reducen catalíticamente
a
CH_{2}CH_{2}(CF)_{n}CF_{3},
(d) R_{3} significa OH, F o
-(CF_{2})_{n}-CF_{3}
que está caracterizado porque un compuesto de
fórmula IVb
en la que R_{14} y R_{15} tienen el
significado anteriormente citado y A es un grupo saliente,
preferiblemente alcoxi, aciloxi, mesil-O,
tosil-O, prefiriéndose especialmente OCH_{3},
OCOCH_{3} y benciloxi, está sustituido en el grupo
2'-OH según uno de los procedimientos descritos en
(a) a (c), y se introduce posteriormente según la forma en sí
conocida el resto base B por sustitución [E. Lukevics, A. Zablocka,
Nucleoside Synthesis, Ellis Horwood, Nueva York (1991)] y
eventualmente se separan los grupos protectores R_{14} y
R_{15}.
Los compuestos de las fórmulas IVa y IVb, A, B,
C, D y E son conocidos, algunos de ellos se pueden comprar o se
pueden producir siguiendo procedimientos conocidos análogos.
Disolventes inertes son, por ejemplo,
hidrocarburos, hidrocarburos halogenados, carboxiamidas alquiladas
y lactamas, éter, nitrilos como acetonitrilo, dialquilsulfonas o
sulfóxidos o sulfonas y sulfóxidos cíclicos.
Las temperaturas de reacción en los pasos del
procedimiento (a) a (d) están entre -50 a 200ºC, preferiblemente
entre 0 a 90ºC.
Las reacciones, salvo con B, se llevan a cabo
ventajosamente en presencia de bases, por ejemplo, hidruros,
alcoholatos, hidróxidos y carbonatos de metales alcalinos,
trialquilaminas o diazobicicloundeceno.
El aislamiento de los compuestos de fórmula I y
su purificación tiene lugar mediante procedimientos en sí
conocidos, como por ejemplo, precipitación o cristalización y
filtración y métodos cromatográficos.
A partir de los compuestos de fórmula I pueden
construirse oligonucleótidos que debido a su interacción con ácidos
nucleicos pueden presentar actividades biológicas valiosas y que se
pueden utilizar como principios activos farmacéuticos o como medios
diagnósticos.
Otro objeto de la invención es el uso de los
compuestos de fórmula I para la producción de oligonucleótidos que
contienen las mismas o distintas unidades monoméricas de los
compuestos de fórmula I, aunque al menos una unidad monomérica de
los compuestos de fórmula I en combinación con las unidades
monoméricas de otros nucleósidos naturales o sintéticos, a lo que
los oligonucleótidos contienen de 2 a 200 unidades monoméricas.
Preferiblemente, los oligonucleótidos contienen de 2 a 100,
preferiblemente de 2 a 50 y prefiriéndose especialmente de 4 a 30
unidades monoméricas. Se prefieren los oligonucleótidos que
contienen las mismas o diferentes unidades monoméricas de los
compuestos de fórmula I. Se prefieren además los oligonucleótidos
que contienen adicionalmente unidades monoméricas de nucleósidos
sintéticos o naturales que derivan de la D-ribosa o
de la 2-desoxirribosa.
Otro objeto de la invención son oligonucleótidos
de fórmula V
(V)5'-U-(O-Y-O-V-)_{x}O-Y-O-W-3'
en la que x significa un número desde 0 hasta 200
e Y un grupo puente entre nucleótidos, U, V y W representan los
mismos o diferentes restos de nucleósidos naturales o sintéticos y
al menos uno de los restos U, V y/o W representa un resto de fórmula
VI,
y B y R_{3} tienen los significados citados
para los compuestos de fórmula I, incluidas las preferencias y los
ejemplos.
Un grupo Y puente preferido es el grupo que
existe de forma natural en los oligonucleótidos
-P(O)O--. Ejemplos de otros grupos puente son
-P(O)S^{-}, P(S)S^{-}, -P(O)
R_{16}-, P(O)NR_{17}R_{18} o -CH_{2}-, en la
que R_{16} representa H o alquilo con de 1 a 6 átomos de carbono y
R_{17} y R_{18} tienen independientemente el significado de
R_{16}. En la fórmula V, x representa preferiblemente un número de
0 a 100, prefiriéndose especialmente un número de 1 a 50,
prefiriéndose especialmente un número de 3 a 29. Los restos de
fórmula VI pueden estar situados terminalmente o estar unidos a la
secuencia de nucleótidos, a lo que todos o varios, por ejemplo 2 a
5 restos de fórmula VI pueden estar situados de forma sucesiva, o
los restos de fórmula VI pueden estar unidos entre los restos de
los nucleósidos naturales o sintéticos o pueden existir formas
mixtas de estas distribuciones en la secuencia de nucleótidos.
Una forma de realización especialmente preferida
son los oligonucleótidos de fórmula V, en la que x es un número
desde 2 hasta 50, preferiblemente desde 2 hasta 30, Y es el grupo
-P(O)O^{-}, U, V y W significan los mismos o
diferentes restos de un nucleósido natural y al menos uno de los
restos U, V o W corresponde a la fórmula VI. Como nucleósidos
naturales se tienen en cuenta adenosina, citidina, guanosina,
uridina, 2-aminoadenina,
5-metilcitosina, 2'-desoxiadenosina,
2'-desoxicitidina,
2'-desoxiguanosina y timidina. Como bases de
nucleósidos naturales cabe nombrar especialmente adenina, citosina,
guanina, timina y uracilo. Los restos de fórmula VI pueden estar
situados terminalmente o estar unidos a la secuencia de
nucleótidos, donde todos o varios, por ejemplo 2 a 5 restos iguales
o distintos de fórmula VI pueden estar situados de forma sucesiva,
o los mismos o diferentes restos de fórmula VI pueden estar
situados entre los restos de los nucleósidos naturales o sintéticos
o pueden existir formas mixtas de estas distribuciones en la
secuencia de nucleótidos. En otra forma de realización preferida de
los oligonucleótidos de fórmula V, todos los restos U, V y W
corresponden a los mismos o diferentes restos de fórmula VI.
Preferiblemente x representa un número desde 3 hasta 20 y
preferiblemente están contenidos de 1 a 12 restos de fórmula
VI.
La producción de los oligonucleótidos de la
invención puede realizarse de manera en sí conocida según los
diferentes procedimientos en sintetizadores de ADN automatizados,
dado el caso, y que se pueden adquirir comercialmente junto con las
especificaciones del procedimiento. En el caso del grupo puente
-P(O)O^{-} puede utilizarse el procedimiento
fosfotriéster, el procedimiento fosfito-triéster o
el procedimiento H-fosfonato, que son habituales
para el experto en la técnica. En el caso del método
fosfito-triéster se puede proceder de tal manera que
el nucleósido de fórmula I, en la que R_{1} y R_{2} son H, se
hace reaccionar con un reactivo de grupo protector, por ejemplo,
cloruro de 4,4'-dimetoxitrifenilmetilo, para dar un
nucleósido de fórmula F
y el compuesto de fórmula F se une mediante un
acoplador ("linker"), por ejemplo, anhídrido succínico
a un material soporte, por ejemplo un vidrio de poro controlado
(CPG), que contiene grupos alquilamino de cadena larga. En un
procedimiento separado, se deriva el grupo hidroxilo del compuesto
de fórmula F, por ejemplo, para dar una fosforamidita utilizando
R'OP[N(i-propil)_{2})]_{2}
para dar un compuesto de fórmula
G
en la que R' representa por ejemplo
\beta-cianoetilo.
Después de la separación del grupo protector,
como por ejemplo el grupo DMT del material unido al soporte, se
acopla bajo separación de
-N(i-CH_{3}H_{7})_{2} con el
compuesto de fórmula F, se bloquean los grupos hidroxilo
eventualmente libres (capping) y el fosfito formado se oxida
dando fosfato. Tras la desprotección del dímero se repite el ciclo
de reacción con un compuesto de fórmula G hasta que se ha
sintetizado un oligómero con el número deseado de unidades
monoméricas y el producto se desprende del material soporte. De
esta forma se obtienen oligonucleótidos en los cuales todos los
restos U, V y W están compuestos según la fórmula V de restos de
fórmula VI. De esta manera, también se pueden producir
oligonucleótidos con unidades monoméricas cualquiera y con cualquier
secuencia, dependiendo de los componentes nucleosídicos sintéticos,
naturales y de la invención utilizados en los ciclos de reacción
individuales.
Los compuestos de la invención de fórmula I, en
la que R_{1} y R_{2} significan H, presentan propiedades
antivíricas y antiproliferativas y pueden utilizarse por lo tanto
como medicamentos. Los oligonucleótidos de la invención presentan
además una gran estabilidad frente a la degradación por nucleasas.
Es especialmente sorprendente su extraordinario emparejamiento con
las cadenas de ácidos nucleicos complementarias, sobre todo del
tipo ARN. Adicionalmente, muestran una inesperada elevada absorción
celular. Los oligonucleótidos de la invención son adecuados
especialmente en la tecnología antisentido, es decir para la
inhibición de la expresión de productos proteicos no deseados
mediante la unión a secuencias de nucleótidos complementarios de
ARNm adecuadas (EP266.099, W087/07300 y WO89/08146). Pueden
utilizarse por ejemplo para el tratamiento de infecciones y
enfermedades, por ejemplo, por bloqueo de la expresión de proteínas
bioactivas a nivel de ácidos nucleicos (por ejemplo, oncogenes). Los
oligonucleótidos de la invención son también adecuados como medios
diagnósticos y pueden utilizarse como sondas génicas para la
detección de infecciones víricas o enfermedades genéticas por
interacción selectiva a nivel de ácidos nucleicos mono o
bicatenarios ("gene probes"). En especial, gracias a la
elevada estabilidad frente a nucleasas, es posible una utilización
diagnóstica in vitro (por ejemplo, en muestras de tejido
aisladas, plasma y suero). Tales posibilidades de utilización se
describen por ejemplo en el documento WO 91/06556.
Otro objeto de la invención se refiere al uso de
los oligonucleótidos de la invención como medios diagnósticos para
la detección in vitro de infecciones víricas o de
enfermedades genéticas.
Otro objeto de la invención se refiere a una
preparación farmacéutica que contiene una cantidad activa de un
nucleósido de fórmula I o de un oligonucleótido de fórmula V solo o
junto con otros principios activos, un vehículo farmacéutico,
preferiblemente en una cantidad significativa y eventualmente
excipientes.
Los nucleósidos y oligonucleótidos
farmacológicamente activos de la invención se pueden utilizar en
forma de preparaciones parenterales o de soluciones para infusión.
Estas soluciones son preferiblemente soluciones o suspensiones
acuosas isotónicas, las cuales por ejemplo en el caso de preparados
liofilizados, que contienen el principio activo sólo o junto con un
vehículo, por ejemplo manitol, se pueden preparar antes de su uso.
Las preparaciones farmacéuticas pueden estar esterilizadas y/o
contener excipientes, por ejemplo, conservantes, estabilizantes,
humectantes y/o emulsionantes, solubilizadores, sales para la
regulación de la presión osmótica y/o tampones. Las preparaciones
farmacéuticas que deseablemente pueden contener otras sustancias
farmacológicamente activas, por ejemplo antibióticos, se producen de
manera en sí conocida, por ejemplo, mediante procedimientos de
solución o liofilización convencionales y contienen aproximadamente
desde 0,1% hasta el 90%, especialmente desde aproximadamente el 0,5%
hasta aproximadamente el 30%, por ejemplo del 1% al 5%, de
principio(s) activo(s).
Los siguientes ejemplos aclaran la invención. Los
espectros de RMN-H^{1} se basan en la numeración
de los átomos de carbono de los siguientes esqueletos cíclicos de
carbono:
Compuestos de partida:
Nucleósidos (Ejemplos):
Abreviaturas utilizadas en el texto y en las
fórmulas
| DMF | Dimetilformamida |
| ClBnCl_{2} | Cloruro de 2,4-diclorobencilo |
| Bn | Bencilo |
| Ac | Acetilo |
| \Phi | Fenilo |
| BSA | N,N-Bistrimetilsililacetamida |
| DBU | Diazabiciclo[5.4.0]undec-7-eno |
| BOM-Cl | Cloruro de benciloximetilo |
| DMTCI | Cloruro de 4,4'-dimetoxitritilo |
| THF | Tetrahidrofurano |
Ejemplo
A1
A 13,5 g de NaH en 130 ml de DMF se añaden gota a
gota a 60ºC 28,0 g de 1-metilrribosa. Cuando se ha
completado el desprendimiento de H_{2}, se añaden gota a gota
110,0 g de ClBnCl_{2}. La mezcla de reacción se continúa agitando
durante 16 horas a 25ºC. Para neutralizar el NaH aún presente se
añade gota a gota cuidadosamente metanol y se vierte la mezcla de
reacción sobre hielo/agua. El residuo grumoso se filtra y se lava
con acetonitrilo. Se obtiene el compuesto (A1):
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): El protón H-C(l) aparece a 5,0
ppm como singlete. EM: 638 (M^{+})
Ejemplo
A2
65,9 g del producto producido en el ejemplo A1 se
disuelven en 600 ml de cloruro de metileno y se enfrían hasta 0ºC.
A continuación se añaden gota a gota 121 ml de SnCl_{4} en 800 ml
de cloruro de metileno y se deja en reposo a 3ºC. Después de 26
horas se añaden de nuevo 2 ml de SnCl_{4}. Después de un total de
35 horas se vierte cuidadosamente la solución de reacción sobre 700
ml de una solución de NaHCO_{3} saturada. Tras diluir con 400 ml
de cloruro de metileno se filtra el residuo que contiene Sn. La
fase orgánica del filtrado se seca con MgSO_{4} y se concentra
para dar el compuesto (A2).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): El protón H-C(1) aparece a 4,90
ppm como doblete con J=5 Hz.
Ejemplo
A3
Se disuelven 125,9 g del producto obtenido en el
ejemplo A2 en 1 l de piridina. Se añaden 25,5 g de anhídrido
acético a 20ºC y 1 g de 4-dimetilaminopiridina. A
continuación se agita durante 17 horas. La mezcla de reacción se
vierte en 1 l de agua, se acidifica con ácido clorhídrico
concentrado y se extrae con acetato de etilo. El extracto se seca
con MgSO_{4} y se concentra. Por último, el residuo se extrae
con hexano hasta que se produce la cristalización. Se obtiene el
compuesto (A3).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 5,15 [d, J=4,5 Hz, H-C(1)]; 3,50 (s,
OCH_{3}); 2,17 (s, OCOCH_{3});
EM: 522 (M^{+})
[\alpha]_{Na(D)} = 87,4 \pm
1,0º, CHCl_{3} (0,998%)
Ejemplo
A4
Se suspenden 24 g de timina en 100 ml de
1,2-dicloroetano. Tras la adición de 116,4 g de BSA
se calienta a reflujo hasta que se forma una solución transparente.
A continuación se enfría a 50ºC y se añaden 50 g del producto
obtenido en el ejemplo A3, así como 27,5 g de
trifluorometanosulfonato de trimetilsililo. Se agita durante 20
horas a 70ºC y a continuación se vierten en 300 ml de una solución
de NaHCO_{3} y se filtra. Tras la extracción con dicloroetano se
seca con MgSO_{4} y se concentra. Por último se cristaliza en
metanol. Se obtiene el compuesto (A4).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 8,25 (s, NH); 6,10 [d, J=4,5 Hz,
H-C(1')]; 2,13 (s, OCOCH_{3}); 1,66 (s,
CH_{3})
EM: 616 (M^{+})
Ejemplo
A5
Se suspenden 85 g del producto preparado en el
ejemplo A4 en 850 ml de acetonitrilo. Se añaden gota a gota a
temperatura ambiente 24,2 g de DBU y 24,9 g de
BOM-Cl. Tras 20 horas de agitación la mezcla se
vierte sobre agua y se extrae con acetato de etilo. El extracto se
seca con MgSO_{4} y se concentra. Se obtiene el compuesto
(A5).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 6,05 [d, J=4,5 Hz, H-C(1')]; 5,5 (AB,
CH_{2}); 5,37 [dd, H-C(2')]; 2,13
(s, OCOCH_{3}); 1,55 (s, CH_{3})
EM: 736 (M^{+})
Ejemplo
A6
Se suspenden 106 g del producto preparado en el
ejemplo A5 en 1 l de THF. Se añaden gota a gota 26 g de una
solución de NaOCH_{3}/CH_{3}OH al 30%. Después de 2,5 horas de
agitación, la solución de reacción se vierte sobre agua, se mezcla
con una solución acuosa de cloruro sódico saturada y se extrae con
acetato de etilo. Después de secar con MgSO_{4} se concentra el
extracto. Se obtiene el compuesto (A6).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 5,93 [d, J=5 Hz, H-C(1')]; 5,5 (AB,
CH_{2}); 3,03 (d, J=6,5 Hz, OH); 1,72 (s,
CH_{3})
EM: 694 (M^{+})
Ejemplo
A7
Se disuelven 79,4 del producto obtenido en el
ejemplo A6 en 800 ml de THF. Tras la adición de 3,3 g de NaH, se
hierve brevemente y a continuación se añaden gota a gota a 40ºC 21 g
de bromoacetato de metilo. La mezcla de reacción se agita durante
un total de 27 horas a 60ºC, añadiéndose a las 16 horas y a las 20
horas en cada caso 1 g de NaH y 2 ml de bromoacetato de metilo.
Por último la mezcla de reacción se vierte sobre
agua y se extrae con acetato de etilo. El extracto se seca con
MgSO_{4} y se concentra. Se obtiene el Compuesto (A7).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 7,70 [s, H-C(6)]; 5,92 [s,
H-C(1')]; 5,48 (AB, CH_{2}); 3,75 (s,
OCH_{3}); 1,58 (s, CH_{3}).
EM: 766 (M^{+})
Ejemplo
A8
Se disuelven 37 g del producto obtenido según el
ejemplo A7 en 400 ml de THF. Se añaden por partes a 20ºC 1,5 g de
LiBH_{4} y se agita durante 1 hora. A continuación se vierte
cuidadosamente la mezcla de reacción sobre 500 ml de agua y se
neutraliza con 32 ml de ácido clorhídrico 2 N. Tras la extracción
con acetato de etilo y concentración se obtiene el compuesto
(A8).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 7,65 [s, H-C(6)]; 5,96 [s,
H-C(1')]; 5,50 (AB, CH_{2}); 2,57 (s ancho,
OH); 1,60 (s, CH_{3}).
EM: 738 (M^{+})
Ejemplo
A9
Se disuelven 20,0 g del producto preparado en el
ejemplo A8 en 200 ml de THF y se hidrogena con 2 g de Pd/C (5%) a
25ºC y a presión normal durante 4,5 horas (absorción de H_{2}
102%). Tras la filtración y la concentración del filtrado se
disuelve el residuo en 170 ml de metanol y se ajusta a pH 11 con
una solución de NaOCH_{3}/CH_{3}OH al 30%. Después de 24 horas,
se vierte sobre 250 ml de agua, se acidifica con ácido clorhídrico
acuoso 2 N y se extrae con acetato de etilo. El extracto se seca con
MgSO_{4} y se concentra. Se obtiene el compuesto (A9).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 9,24 (s, NH); 7,90 [s, H-C(6)]; 5,99 [s,
H-C(1')]; 2,68 (t, OH); 1,60 (s, CH_{3})
EM: 618 (M^{+})
Ejemplo
A10
Se disuelven 4,2 g del producto preparado en el
ejemplo A9 en 50 ml de piridina y tras adición de 2,4 g de
anhídrido acético se agita durante 19 horas a temperatura ambiente.
La solución se vierte sobre 100 ml de HCl 2 N y se extrae con
acetato de etilo. El extracto se lava con HCl 2 N, se seca sobre
MgSO_{4} y se concentra. Se obtiene el compuesto (A10).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 9,28 (s, NH); 7,67 [s, H-C(6)];
5,95 [s, H-C(1')]; 2,00 (s, CH_{3}); 1,60
(s, CH_{3}).
EM: 663 (M+H)^{+}.
Ejemplo
A11
Se hidrogenan 4,2 g del producto preparado en el
ejemplo A10 en 50 ml de metanol en presencia de 2,09 g de acetato
sódico anhidro sobre 0,8 g de Pd/C (5%) a 35ºC y a presión normal.
Tras 58 horas se filtra la mezcla de hidrogenación y se concentra.
El residuo se cromatografía en una frita pequeña con gel de sílice
para eliminar las sales (acetato de etilo/metanol 9:1). Se obtiene
el compuesto (A11).
^{1}H-RMN (250 MHz, DMSO): 10,1
(s, NH); 7,61 [s, H-C(6)]; 5,64 [d, J=6 Hz,
H-C(1')]; 1,70 (s, CH_{3}); 1,57.
EM: 379 (M+Cl)^{-}.
Ejemplo
A12
Se absorben y se concentran dos veces en piridina
2,27 g del producto preparado en el ejemplo A11. Se absorbe de
nuevo en 30 ml de piridina y se añaden 2,57 g de DMTCl. Después de
20 horas de agitación a temperatura ambiente, la mezcla de reacción
se diluye con 250 ml de acetato de etilo y se vierten sobre 50 ml
de agua. La fase orgánica se seca con MgSO_{4} y se concentra. El
residuo se cromatografía en gel de sílice (tolueno/acetato de
etilo/trietilamina 49:49:2). Se obtiene el compuesto (A12).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 9,22 (s, NH); 7,70 [s, H-C(6)]; 5,94 [d,
J=1,5 Hz, H-C(1')]; 3,78 (s, OCH_{3}); 2,19
(s, CH_{3}), 1,36 (s, CH_{3}).
EM: 706 (M+NH_{4})^{+}.
Ejemplo
A13
Se añaden 2,70 g del producto obtenido en el
ejemplo A12 a 0,93 g de diisopropilamoniotetrazol, 1,51 g de
2-cianoetil-N,N,N',N'-tetraisopropilfosforodiamidita
y 30 ml de cloruro de metileno. La mezcla de reacción se agita
durante 17 horas a temperatura ambiente y a continuación se vierte
sobre una solución acuosa saturada de NaHCO_{3}-. La fase orgánica
se seca con MgSO_{4} y se concentra. El residuo se cromatografía
sobre gel de sílice (etanol/acetato de etilo 1:1 con adición de un
2% de trietilamina). La espuma obtenida se disuelve con 1 ml de
metil-t-butiléter y se añade gota a
gota a 0ºC a pentano. Se obtiene el compuesto (A13)
(diastereoisómeros, 1:1).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 7,74 [s, H-C(6)] y 7,68 [s,
H-C(6)]; 6,08 [d, J=4 Hz, H-C(1)];
5,97 [d, J=4 Hz, H-C(1')];
^{31}P-RMN (CDCl_{3}): 150, 174 y 150, 038 EM:
847 (M+H)^{+}.
Ejemplo
14
Se disuelven 20,6 g del producto obtenido en el
ejemplo A8 en 200 ml de CH_{2}Cl_{2}. Se añaden a 5ºC 4,35 g de
trifluoruro dietilaminosulfuro (DAST) y la mezcla de reacción se
agita durante 3 horas a 5ºC. A continuación se vierte la solución
sobre 300 ml de una solución saturada de 300 ml de NaHCO_{3} y se
extrae con CH_{2}Cl_{2}. El extracto se seca sobre MgSO_{4} y
se concentra. El residuo se cromatografía (gel de sílice,
tolueno/acetato de etilo 1:1). Se obtiene el compuesto (A14).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 7,68 [s, H-C(6)], 5,92 [s,
H-C(1')]; 5,50 [AB, CH_{2}], 1,58 (s,
CH_{3}).
^{19}F-RMN (CDCl_{3}):
-223,74 (t, CH_{2}F).
EM: 758 (M+NH_{4})^{+}.
Ejemplo
A15
Se disuelven 1,30 g del producto obtenido en el
ejemplo A14 en 26 ml de THF y se hidrogena sobre 0,65 g de Pd/C
(5%) a 20ºC y a presión normal. Después de 0,5 horas se filtra el
catalizador y el filtrado de concentra. El residuo se absorbe en
metanol (15 ml) y se ajusta hasta pH 11 con una solución de
NaOMe/MeOH. Después de 20 horas de agitación se vierte sobre 20 ml
de agua y se extrae con acetato de metilo. Después de concentrar se
obtiene el compuesto (A15).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 8,99 (s, NH); 7,61 [s, H-C(6)];
5,88 [d, J=1,5 Hz, H-C(1')]; 1,52 [s,
CH_{3}].
EM: 621 (M+H)^{+}.
Ejemplo
A16
De manera análoga a las especificaciones de
trabajo (A11), (A12) y (A13) se convierte el compuesto (A15) en la
fosforamidita (A16) (diastereoisómeros 1:1).
^{1}H-RMN (250 MHz,
cDCl_{3}): 7,75 [s, H-C(6)] y 7,68 [s,
H-C(6)]; 6,06 [d, J=4 Hz,
H-C(1')] y 6,00 [d, J=4 Hz,
H-C(1')];
^{31}P-RMN (CDCl_{3}): 150,
107.
Ejemplo
A17
Se disuelven 20,0 g del compuesto (A6) en 200 ml
de THF y se mantienen a 60ºC con 0,83 g de NaH (100%) hasta que
finaliza el desprendimiento de H_{2}. Después de enfriar se añaden
a presión a esta solución en el autoclave 48,0 g de
trifluoropropino y se calienta a 50ºC. Después de 48 horas la
mezcla de reacción se concentra hasta la mitad, a continuación se
vierte sobre agua y se extrae con acetato de etilo. El extracto se
seca (MgSO_{4}) y se concentra. El residuo se cromatografía en gel
de sílice (n-hexano/ácido acético 4:1). Se obtiene
el compuesto (A17).
^{1}H-RMN (250 MHz,
CDCl_{3}): 7,72 [s, H-C(6)] 6,80 [d, J=8
Hz, CH=C); 5,82 [s, H-C(1')]; 5,48
(AB, CH_{2}); 4,85 (m, CH=C); 1,58 (s, CH_{3}).
EM: 789 (M+H)^{+}.
Ejemplo
A18
Se disuelven 10,0 g del compuesto (A17) en 200 ml
de THF y se hidrogenan sobre 2 g de Pd/C a temperatura ambiente y
presión normal. Después de 1 hora el catalizador se filtra y el
filtrado se concentra. El residuo se trata a continuación con NaOMe
y se cromatografía de manera análoga a la del Ejemplo 15 (gel de
sílice; n-hexano/acetato de etilo 2:1).
Se obtiene el compuesto (A18).
^{1}H-RMN (CDCl_{3}): 9,00
(s, NH); 7,66 [s, H-C(6)]; 5,93 [d, J=1,5 Hz,
H-C(1')]; 1,61 (s, CH_{3}).
^{19}F-RMN (CDCl_{3}):
-65,23.
EM: 705 (M+Cl)^{-}.
Ejemplo
A19
Se disuelven 8,9 g del compuesto (A6) en 90 ml de
THF y se hierven brevemente con 0,34 g (100%) de NaH. Luego de
atenuarse el desprendimiento de H_{2} se añaden gota a gota a 20ºC
5,1 g de
1,1,2-tricloro-3,3,3-trifluoropropeno
y a continuación se agita durante 5 horas a 55ºC. La mezcla de
reacción se vierte sobre agua y se extrae con acetato de etilo. Tras
concentrar se cromatografía (gel de sílice, tolueno/acetato de
etilo 4:1). Se obtiene el compuesto (A19) como mezcla
cis/trans(aproximadamente 1:1).
^{1}H-RMN (CDCl_{3}): 7,63 y
7,60 [cada uno s, cada uno H-C(6)]; 5,91 y
5,87 [cada uno s, cada uno H-C(1')]; 1,61 y
1,57 (cada uno s, cada uno CH_{3}).
EM: 891 (M+Cl)^{-}.
Ejemplo
A20
Si el compuesto (A18) o (A19) se desprotege de
manera análoga a los ejemplos anteriores y se convierte en la
fosforamidita, entonces se obtiene el compuesto (A20)
(diastereoisómeros 1:1).
^{1}H-RMN (CDCl_{3}): 8,6 (s
ancho, NH); 7,74 y 7,69 [cada uno s, cada uno
H-C(6)]; 5,97 y 5,94 [cada uno d, J=4 Hz,
cada uno H-C(1')];
^{31}P-RMN (CDCl_{3}):
150,287 y 150,035 ppm.
Ejemplo
B
Los oligonucleótidos se unen a un soporte fijo
(vidrio de poro controlado, CPG) mediante la utilización de los
nucleósidos según la invención
[3'-(\beta-cianoetoxi-di
(i-propilamino)fosforamidita)] dimetoxilados
y activados en 3' o de los nucleósidos naturales activados y la
síntesis se realiza en un sintetizador de ADN (Applied Biosystems,
Modelo 380 B, química de la fosforamidita y oxidación de yodo
estándar) según los protocolos estándar del fabricante [véase
también "Oligonucleotide synthesis a practical approach" M.J.
Gait; IRL Press 1984 (Oxford-Washington DC)]. Tras
el acoplamiento del último elemento nucleotídico, el
oligonucleótido protegido en 5' se separa durante la noche del
soporte mediante tratamiento con amoníaco concentrado acuoso,
separándose simultáneamente el resto de los grupos protectores y a
continuación se purifica mediante HPLC de fase inversa utilizando 50
mM de tampón acetato amónico (pH 7)/acetonitrilo. A continuación,
el grupo protector 5'-dimetoxitritilo se separa
mediante tratamiento durante 20 minutos con ácido acético acuoso al
80%, el oligonucleótido precipita en etanol y se aísla por
centrifugación. La pureza del oligonucleótido se analiza mediante
electroforesis en gel (poliacrilamida) y se identifica mediante
MALDI-TOF-MS (Matrix assisted
laser desorption/ionisation - time of flight mass
spectrometry; ionización/desorción por láser asistida por matriz
acoplada a espectrómetro de masas de tiempo de vuelo)
Ejemplo
C1
La interacción de los oligonucleótidos con los
correspondientes oligómeros con complementariedad de bases de los
ribonucleótidos naturales se caracteriza registrando las curvas de
fusión-UV y los valores T_{m} calculados a partir
de las mismas. Este método estándar se describe por ejemplo en
Marky, L.A., Breslauer, K.J., Biopolymers
26:1601-1620 (1987).
Se prepara una solución de los oligonucleótidos y
los correspondientes oligorribonucleótidos naturales con
complementariedad de bases en tampón fosfato 10 mM, NaCl 100 mM,
EDTA 0,1 mM, pH = 7,0 (c = 4\cdot10^{-6} M/
oligonucleótido) y se registra la modificación de la extinción a 260 nm en dependencia de la temperatura (15 a 95ºC). A partir de las curvas de fusión se calcula el valor T_{m} (Tabla 3).
oligonucleótido) y se registra la modificación de la extinción a 260 nm en dependencia de la temperatura (15 a 95ºC). A partir de las curvas de fusión se calcula el valor T_{m} (Tabla 3).
Ejemplo
D2
Se preparan soluciones del oligonucleótido con
los correspondientes oligonucleótidos con complementariedad de
bases de las secuencias r(GGA CCG GAA YGG TAC GAG) en tampón
fosfato 10 mM, NaCl 100 mM, EDTA 0,1 mM, pH 7, c = 4\cdot10^{-6}
M/oligonucleótido) y se mide la extinción a 260 nm dependiendo de
la temperatura (15ºC a 95ºC). A partir de las curvas se calcula el
valor T_{m}. Los resultados se presentan en la Tabla 4.
Ejemplo
C3
14 \mug de cada oligonucleótido sintético o del
correspondiente oligómero natural se incuban a 37ºC en 200 \mul
de suero bovino fetal inactivado por calor al 10% (c = 70
\mug/ml). Después de 0,5; 1; 2; 4; 6, 24 y 48 horas se
neutralizan, en cada caso, 15 \mul de la solución de reacción por
adición a 25 \mul de urea 9 M y tampón trisborato (pH 7) y se deja
reposar a -20ºC hasta la medición. Las soluciones de reacción
neutralizadas se separan por electroforesis en gel de poliacrilamida
y los productos separados se determinan por su contenido en fósforo
(método Phospoimagers). La relación R entre la suma de las
concentraciones de oligonucleótido totalmente intacto
(c_{n}^{(t)}) y del fragmento originado por la separación del
elemento estructural carbono natural del extremo
3'(c_{n-1}^{(t)}) en un tiempo dado t y la
concentración inicial de oligonucleótido totalmente intacto en el
punto t = 0 (C_{n}^{(0)}) R = (c_{n}^{(t)} +
c_{n-1}^{(t)})/C_{n}^{(0)} se representa
gráficamente frente al tiempo. Los valores de vida media
\tau_{1/2} así determinados, es decir los tiempos para los
cuales R = 0,5, ascienden a
Claims (51)
1. Compuestos de fórmula I
en la que R_{1} y R_{2} representan
independientemente hidrógeno o un grupo protector o R_{1} tiene
estos significados y R_{2} es un resto formador de un grupo entre
nucleótidos que contiene fósforo; B es un resto de purina o
pirimidina o un análogo de los mismos y R_{3} significa OH, F o
(CF_{2})_{n}CF_{3}, en la que n significa un número
desde 0 hasta
7.
2. Compuestos según la reivindicación 1,
caracterizados porque R_{1} y R_{2} son hidrógeno.
3. Compuestos según la reivindicación 1,
caracterizados porque R_{1} y R_{2} significan los
mismos grupos protectores.
4. Compuestos según la reivindicación 1, en los
que B como resto de purina o un análogo de éste representa un resto
de fórmula II, IIa, IIb, IIc, IId, IIe o IIf,
en la que R_{b1} es H, Cl, Br, OH o
-O-alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono y
R_{b2}, R_{b3} y R_{b5} significan independientemente entre sí
H, OH, SH, NH_{2}, NHNH_{2}, NHOH, NHO-alquilo
con de 1 a 12 átomos de carbono,
-N=CH-N(alquilo con de 1 a 12 átomos de
carbono)_{2}, -N=CH-azacicloalquilo, F, Cl,
Br, alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono,
hidroxialquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, aminoalquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, alcoxi con de 1 a 12 átomos de carbono, benciloxi, tioalquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, a lo que los grupos hidroxilo y amino no están sustituidos o están sustituidos con un grupo protector, fenilo, bencilo, amino primario con de 1 a 20 átomos de carbono o amino secundario con de 2 a 30 átomos de carbono, R_{b4} representa hidrógeno, CN o -C\equivC-R_{b7}, como también R_{b6} y R_{b7} representan hidrógeno o alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono.
hidroxialquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, aminoalquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, alcoxi con de 1 a 12 átomos de carbono, benciloxi, tioalquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, a lo que los grupos hidroxilo y amino no están sustituidos o están sustituidos con un grupo protector, fenilo, bencilo, amino primario con de 1 a 20 átomos de carbono o amino secundario con de 2 a 30 átomos de carbono, R_{b4} representa hidrógeno, CN o -C\equivC-R_{b7}, como también R_{b6} y R_{b7} representan hidrógeno o alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono.
5. Compuestos según la reivindicación 4, en los
que el grupo protector de los grupos hidroxilo y amino representa
acilo con de 1 a 8 átomos de carbono.
6. Compuestos según la reivindicación 4, en los
que el amino primario contiene de 1 a 12 átomos de carbono y el
amino secundario contiene de 2 a 12 átomos de carbono.
7. Compuestos según la reivindicación 4, en los
que el amino primario y el amino secundario son restos de fórmula
R_{a1}R_{a2}N, en la que R_{a1} es H o tiene
independientemente el significado de R_{a2} y R_{a2}
representa alquilo, aminoalquilo, hidroxialquilo con de 1 a 20
átomos de carbono; carboxialquilo o carbalcoxialquilo, a lo que el
grupo carbalcoxi contiene de 2 a 8 átomos de carbono y el grupo
alquilo de 1 a 6, preferiblemente de 1 a 4 átomos de carbono;
alquenilo con de 2 a 20 átomos de carbono; fenilo, mono o
di-(alquilo o alcoxi con de 1 a 4 átomos de carbono)fenilo,
bencilo, mono o di-(alquilo o alcoxi con de 1 a 4 átomos de
carbono)bencilo; o 1,2-, 1,3- o
1,4-imidazolil-alquilo con de 1 a 6
átomos de carbono o R_{a1} y R_{a2} juntos representan tetra o
pentametileno,
3-oxa-1,5-pentileno,
-CH_{2}-NR_{a3}
-CH_{2}CH_{2}- o
-CH_{2}CH_{2}-NR_{a3}-CH_{2}CH_{2}-,
en la que R_{a3} es H o alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono,
donde el grupo amino en el aminoalquilo puede no estar sustituido o
estar sustituido con uno o dos alquilo o hidroxialquilo con de 1 a
4 átomos de carbono y el grupo hidroxilo en el hidroxialquilo puede
estar eventualmente eterificado con alquilo con de 1 a 4 átomos de
carbono.
8. Compuestos según la reivindicación 6, en los
que el amino primario y el amino secundario son metil, etil,
dimetil, dietil, alil, mono o
di-(hidroxi-et-2-il),
fenil y benzil, acetil, isobutiril y benzoilamino.
9. Compuestos según la reivindicación 4, en los
que R_{b1} en las fórmulas II, IIb, IIc, IId y IIe representa
hidrógeno.
10. Compuestos según la reivindicación 4, en los
que R_{b5} en la fórmula IId representa hidrógeno.
11. Compuestos según la reivindicación 4, en los
que R_{b2} y R_{b3} en las fórmulas II, IIa, IIb, IIc, IId y
IIf significan independientemente entre sí H, F, Cl, Br, OH, SH,
NH_{2}, NHOH, NHNH_{2}, metilamino, dimetilamino, benzoilamino,
metoxi, etoxi y tiometilo.
12. Compuestos según la reivindicación 4, en los
que B es un resto de purina o un resto de un análogo de purina de
la serie adenina, N-metiladenina,
N-benzoiladenina,
2-metiltioadenina, 2-aminoadenina,
6-hidroxipurina,
2-amino-6-cloropurina,
2-amino-6-metiltio-purina,
guanina y N-isobutirilguanina.
13. Compuestos según la reivindicación 1, en los
que B en la fórmula I representa como resto de pirimidina un resto
de uracilo, timina o citosina de fórmula III, IIIa, IIIb o
IIIc,
en la que R_{b6} es H o alquilo con de 1 a 4
átomos de carbono y R_{b8} es H, OH, SH, NH_{2}, NHNH_{2},
NHOH, NHO-alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono,
-N=CH-N(alquilo con de 1 a 12 átomos de
carbono)_{2}, -N=CH-azacicloalquilo, F, Cl,
Br, alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, hidroxialquilo con de
1 a 12 átomos de carbono, aminoalquilo con de 1 a 12 átomos de
carbono, alcoxi con de 1 a 12 átomos de carbono, benciloxi,
tioalquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, a lo que los grupos
hidroxilo y amino no están sustituidos o están sustituidos con un
grupo protector, fenilo, bencilo, amino primario con de 1 a 20
átomos de carbono, amino secundario con de 2 a 30 átomos de carbono,
alquenilo con de 1 a 12 átomos de carbono o alquinilo con de 1 a 12
átomos de carbono y el grupo NH_{2} en la fórmula IIIb no está
sustituido o está sustituido con alquilo con de 1 a 6 átomos de
carbono, benzoílo o un grupo protector, así como los derivados
dihidro de los restos de fórmulas III, IIIa IIIb y
IIIc.
14. Compuestos según la reivindicación 13, en los
que R_{b8} representa H, alquilo o hidroxialquilo con de 1 a 6
átomos de carbono, alquenilo o alquinilo con de 2 a 6 átomos de
carbono, F, Cl, Br, NH_{2}, benzoilamino, mono o dialquilamino
con de 1 a 6 átomos de carbono.
15. Compuestos según la reivindicación 13, en los
que R_{b8} representa H, alquilo, alcoxi o hidroxialquilo con de
1 a 6 átomos de carbono, alquenilo o alquinilo con de 2 a 6 átomos
de carbono, F, Cl, Br, NH_{2}, benzoilamino, mono o dialquilamino
con de 1 a 6 átomos de carbono.
16. Compuestos según la reivindicación 14, en los
que R_{b8} significa H, F, Cl, Br, NH_{2}, NHCH_{3},
N(CH_{3})_{2}, alquilo con de 1 a 4 átomos de
carbono, alquenil-(1) con de 2 a 4 átomos de carbono o alquinil-(1)
con de 2 a 4 átomos de carbono.
17. Compuestos según la reivindicación 15, en los
que R_{b8} significa H, alquilo con de 1 a 4 átomos de carbono,
alquenil-(1) con de 2 a 4 átomos de carbono, alquinil-(1) con de 2 a
4 átomos de carbono, NH_{2}, NHCH_{3} o
(CH_{3})_{2}N.
18. Compuestos según la reivindicación 1, en los
que B como resto de un análogo de pirimidina deriva de uracilo,
timina, citosina, el 5-fluoruracilo,
5-clorouracilo, 5-bromouracilo,
dihidrouracilo, 5-metilcitosina,
5-propintimina y
5-propincitosina.
19. Compuestos según la reivindicación 1,
caracterizados porque R_{2} como resto formador de un
grupo puente entre nucleótidos que contiene fósforo corresponde a la
fórmula P1 o P2
en la que Y_{a} es hidrógeno, alquilo con de 1
a 12 átomos de carbono, arilo con de 6 a 12 átomos de carbono,
aralquilo con de 7 a 20 átomos de carbono, alcarilo con de 7 a 20
átomos de carbono, -OR_{b}, -SR_{b}, -NH_{2}, amino primario,
amino secundario, O^{-}M^{+} o S^{-}M^{+}; X_{a}
significa oxígeno o azufre; R_{a} es hidrógeno, alquilo con de 1 a
12 átomos de carbono, alquenilo con de 2 a 12 átomos de carbono,
arilo con de 6 a 12 átomos de carbono o el grupo R_{a}O significa
un
N-heteroaril-N-ilo
con 5 elementos en el anillo y con de 1 a 3 átomos de nitrógeno;
R_{b} es hidrógeno, alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono o
arilo con de 6 a 12 átomos de carbono; y M^{+} es Na^{+},
K^{+}, Li^{+}, NH_{4}^{+} o amonio primario, secundario,
terciario o cuaternario, a lo que alquilo, arilo, aralquilo y
alcarilo en Y_{a}, R_{a} y R_{b}no están sustituidos o están
sustituidos con alcoxi, tioalquilo, halógeno, -CN, -NO_{2},
fenilo, nitrofenilo o
halofenilo.
20. Compuestos según la reivindicación 19,
caracterizados porque R_{a} significa
\beta-cianoetilo e Y_{a} representa
di(i-propilamino).
21. Compuesto según la reivindicación 1,
caracterizado porque R_{3} significa OH.
22. Compuestos según la reivindicación 1,
caracterizados porque R_{3} significa F.
23. Compuestos según la reivindicación 1,
caracterizados porque R_{3} significa
(CF_{2})_{n}CF_{3}, en la que n es un número desde 0
hasta 7.
24. Compuestos según la reivindicación 23,
caracterizados porque n es el número 0.
25. Procedimiento para la producción de
compuestos de fórmula I,
en la que R_{1} y R_{2} son
independientemente entre sí hidrógeno o un grupo protector y B
significa un resto de purina o pirimidina o un análogo de éstos;
y
(a) R_{3} significa OH,
caracterizado porque un compuesto de
fórmula IVa
en la que R_{14} y R_{15} son los mismos o
diferentes grupos protectores y B significa un resto de purina o de
pirimidina o un análogo de éstos, donde los grupos funcionales en el
resto base B están protegidos con grupos protectores, se hace
reaccionar en un disolvente inerte con un compuesto de fórmula
A,
(A)X-CH_{2}-COOR_{4}
en la que R_{4} significa alquilo con de 1 a 4
átomos de carbono y X es Cl, Br, I, tosil-O o
mesil-O;
y a continuación la función éster se reduce con
NaBH_{4} o LiAlH_{4}, con lo que los grupos OH originados se
pueden proteger circunstancialmente con un grupo como se ha definido
para R_{1};
(b) R_{3} significa F,
caracterizado porque un compuesto de
fórmula I, en la que R_{3} significa OH, se hace reaccionar con
un compuesto de fórmula B
c)R_{3} significa
-(CF_{2})_{n}-CF_{3}, en la que n es un
número desde 0 hasta
7,
caracterizado porque un compuesto de
fórmula IVa se hace reaccionar con un compuesto de fórmula C, D o
E
(C)CH\equiv
C-(CF_{2})_{n}-CF_{3}
(D)CH_{2}=CH-(CF_{2})_{n}-CF_{3}
y a continuación los dobles enlaces o dobles
enlaces clorados eventualmente presentes se reducen catalíticamente
a
CH_{2}CH_{2}(CF)_{n}CF_{3},
(d) R_{3} significa OH, F o
-(CF_{2})_{n}-CF_{3}, en la que n es un
número desde 0 hasta 7
caracterizado porque un compuesto de
fórmula IVb,
en la que R_{14} y R_{15} tienen el
significado anteriormente citado y A es un grupo saliente, se
sustituye en el grupo 2'-OH según uno de los
procedimientos descritos en (a) a (c), se introduce según la forma
conocida el resto base B por sustitución y eventualmente se separan
los grupos protectores R_{14} y
R_{15}.
26. Uso de los compuestos según la reivindicación
1 para la producción de oligonucleótidos que contienen las mismas o
distintas unidades monoméricas de los compuestos de fórmula I,
aunque al menos una unidad monomérica de los compuestos de fórmula I
en combinación con las unidades monoméricas de otros nucleósidos
naturales o sintéticos, a lo que los oligonucleótidos contienen de 2
a 200 unidades monoméricas.
27. Uso según la reivindicación 26 para la
producción de oligonucleótidos con 2 a 100 unidades
monoméricas.
28. Uso según la reivindicación 27 para la
producción de oligonucleótidos con 2 a 50 unidades monoméricas.
29. Uso según la reivindicación 28 para la
producción de oligonucleótidos con 4 a 30 unidades monoméricas.
30. Uso según la reivindicación 26 para la
producción de oligonucleótidos con las mismas o diferentes unidades
monoméricas de los compuestos de fórmula I.
31. Uso según la reivindicación 26 para la
producción de oligonucleótidos con las mismas unidades monoméricas
de los compuestos de fórmula I y unidades monoméricas de nucleósidos
naturales o sintéticos.
32. Oligonucleótidos de fórmula V
(V)5'-U-(O-Y-O-V-)_{x}O-Y-O-W-3'
en la que x significa un número desde 0 hasta 200
e Y un grupo puente entre nucleótidos, U, V y W representan los
mismos o diferentes restos de nucleósidos naturales o sintéticos y
al menos uno de los restos U, V y/o W representa un resto de fórmula
VI
en la que B representa un resto purina o
pirimidina o un análogo de los mismos; y R_{3} significa OH, F o
(CF_{2})_{n}CF_{3}, en la que n significa un número
desde 0 hasta
7.
33. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
caracterizados porque n significa el número 0.
34. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
caracterizados porque el grupo Y puente es
-P(O)O^{-}-, -P(O)S^{-}-,
P(S)S^{-}-, -P(O)R_{16}-,
P(O)NR_{17}R_{18}- o -CH_{2}-, en la que
R_{16} representa H o alquilo con de 1 a 6 átomos de carbono y
R_{17} y R_{18} tienen independientemente el significado de
R_{16}.
35. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
caracterizados porque el grupo Y puente es
-P(O)O^{-}-.
36. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
caracterizados porque x es un número desde 0 hasta 100.
37. Oligonucleótidos según la reivindicación 36,
caracterizados porque x es un número desde 1 hasta 50.
38. Oligonucleótidos según la reivindicación 37,
caracterizados porque x es un número desde 3 hasta 29.
39. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
caracterizados porque los restos de fórmula VI pueden estar
situados terminalmente y/o estar unidos a la secuencia de
nucleótidos.
40. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
caracterizados porque los restos de fórmula VI están unidos
entre los restos de nucleósidos naturales o sintéticos.
41. Oligonucleótidos según las reivindicaciones
39 y 40, caracterizados porque se suceden de 2 a 5 restos
iguales o diferentes de fórmula VI.
42. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
caracterizados porque contienen en total de 4 a 30 unidades
de nucleósidos y de 1 a 12 restos de fórmula VI.
43. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
en los que B como resto de purina o un análogo de éste representa
un resto de fórmula II, IIa, IIb, IIc, IId, IIe o IIf,
en la que R_{b1} es H, Cl, Br, OH o
-O-alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono y
R_{b2}, R_{b3} y R_{b5} significan independientemente entre sí
H, OH, SH, NH_{2}, NHNH_{2}, NHOH, NHO-alquilo
con de 1 a 12 átomos de carbono,
-N=CH-N(alquilo con de 1 a 12 átomos de
carbono)_{2},
-N=CH-N-cicloalquilo, F, Cl, Br,
alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, hidroxialquilo con de 1 a
12 átomos de carbono, aminoalquilo con de 1 a 12 átomos de carbono,
alcoxi con de 1 a 12 átomos de carbono, benciloxi, tioalquilo con
de 1 a 12 átomos de carbono, donde los grupos hidroxilo y amino no
están sustituidos o están sustituidos con un grupo protector,
fenilo, bencilo, amino primario con 1 a 20 átomos de carbono o amino
secundario con 2 a 30 átomos de carbono, R_{b4} representa
hidrógeno, CN o -C\equivC-R_{b7}, R_{b6} y
R_{b7} representan hidrógeno o alquilo con de 1 a 4 átomos de
carbono.
44. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
en los que B representa un resto de uracilo, timina o citosina de
fórmula III, IIIa, IIIb o IIIc,
en la que R_{b6} es H o alquilo con de 1 a 4
átomos de carbono y R_{b8} es H, OH, SH, NH_{2}, NHNH_{2},
NHOH, NHO-alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono,
-N=CH-N(alquilo con de 1 a 12 átomos de
carbono)_{2},
-N=CH-N-cicloalquilo, F, Cl, Br,
alquilo con de 1 a 12 átomos de carbono, hidroxialquilo con de 1 a
12 átomos de carbono, aminoalquilo con de 1 a 12 átomos de carbono,
alcoxi con de 1 a 12 átomos de carbono, benciloxi, tioalquilo con
de 1 a 12 átomos de carbono, a lo que los grupos hidroxilo y amino
no están sustituidos o están sustituidos con un grupo protector,
fenilo, bencilo, amino primario con de 1 a 20 átomos de carbono,
amino secundario con de 2 a 30 átomos de carbono, alquenilo con de 1
a 12 átomos de carbono o alquinilo con de 1 a 12 átomos de carbono
y el grupo NH_{2} en la fórmula IIIb no está sustituido o está
sustituido con alquilo con de 1 a 6 átomos de carbono, benzoílo o un
grupo protector, así como los derivados dihidro de los restos de
fórmulas III, IIIa IIIb y
IIIc.
45. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
en los que R_{3} significa OH.
46. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
en los que R_{3} significa F.
47. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
en los que R_{3} significa (CF_{2})_{n}CF_{3}.
48. Oligonucleótidos según la reivindicación 32,
en los que n significa un número desde 0 hasta 3.
49. Oligonucleótidos según la reivindicación 48,
en los que n significa 0.
50. Uso de los oligonucleótidos de fórmula V como
medios diagnósticos para la detección de infecciones víricas o
enfermedades genéticas.
51. Preparación farmacéutica que contiene una
cantidad eficaz de un nucleósido de fórmula I o de un
oligonucleótido de fórmula V, sólo o junto con otros principios
activos, un vehículo farmacéutico y eventualmente excipientes.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CH1307/94 | 1994-04-27 | ||
| CH130794 | 1994-04-27 |
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| JP2011520471A (ja) | 2008-05-23 | 2011-07-21 | サイバス オイルズ，エルエルシー | 酵母を使用したスクアレンの生成 |
| JP5438922B2 (ja) * | 2008-06-25 | 2014-03-12 | 日東電工株式会社 | 核酸の製造方法 |
| KR20110063447A (ko) | 2008-09-08 | 2011-06-10 | 베링거 인겔하임 인터내셔날 게엠베하 | 피라졸로피리미딘 및 ｃｎｓ 장애의 치료를 위한 이들의 용도 |
| US20120059045A1 (en) * | 2008-10-24 | 2012-03-08 | Isis Pharmaceuticals, Inc. | Methods of using oligomeric compounds comprising 2'-substituted nucleosides |
| PT2414363E (pt) | 2009-03-31 | 2014-02-26 | Boehringer Ingelheim Int | Derivados de 1-heterociclil-1,5-di-hidro-pirazolo[3,4- d]pirimidin-4-ona e sua utilização como moduladores de pde9a |
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| DE4317323A1 (de) * | 1993-05-25 | 1994-12-01 | Bayer Ag | N-(4-Fluor-phenyl)-heteroaryloxyacetamide |
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