ES2246093T3 - Patogenicida molecular que induce una resistencia a la enfermedad en las plantas. - Google Patents
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Abstract
Una proteína de fusión que comprende (a) al menos un dominio de unión que comprende un anticuerpo o un sitio de unión del mismo que reconoce específicamente un epítopo de un patógeno vegetal; y (b) una secuencia de localización en la membrana y/o una unidad que conduce al anclaje en la membrana y, opcionalmente, una secuencia de redireccionamiento celular.
Description
Patogenicida molecular que induce una resistencia
a la enfermedad en las plantas.
La presente invención se refiere a constructos
génicos adecuados para expresar agentes para proteger una planta
frente a patógenos y a las proteínas adecuadas para semejante
protección vegetal. Estos agentes son denominados "patogenicidas
moleculares". Esta invención está relacionada con el diseño
genético de plantas y con los medios y métodos para conferir
resistencia a patógenos a una planta utilizando uno o varios genes
que codifican: un anticuerpo específico del patógeno y un anticuerpo
específico del patógeno incluyendo una actividad tóxica que bloquea
las fases del ciclo vital del patógeno, la replicación del patógeno
o el movimiento del patógeno dentro de la planta o la transmisión
del patógeno de planta a planta. Se proporcionan los medios y
métodos para la inmovilización de anticuerpos recombinantes,
proteínas de fusión de anticuerpos y complejos
anticuerpo-proteína en las membranas celulares en
diferentes orientaciones y la presentación de proteínas
recombinantes sobre la membrana celular de la planta. En esta
invención también se describen métodos novedosos y parejas de unión
a proteínas para ensamblar los complejos de proteína a partir de
cadenas polipeptídicas individuales durante la expresión de estas
proteínas in vivo. Asimismo se dan los métodos para la
activación de los patogenicidas moleculares mediante escisión
proteolítica in vivo.
Las enfermedades de las plantas constituyen una
amenaza principal y en curso para las provisiones alimenticias
humanas y el alimento de animales. La mayoría de las plantas de
cultivo están regularmente expuestas a uno o más patógenos y pueden
causar un daño increíble dando como resultado pérdidas económicas
sustanciales todos los años. El ataque por patógenos, tales como
virus, bacterias, hongos, nematodos e insectos es un grave problema
económico, que golpea a todos los cultivos económicamente
importantes, por ejemplo el arroz, la soja, la batata, el trigo, la
patata, el pomelo, el maíz y las plantas ornamentales. Las actuales
medidas protectoras se sustentan firmemente en las medidas de
control químico para los vectores patógenos, que tienen
consecuencias medioambientales no deseables. Un enfoque más eficaz
para proteger las plantas del ataque de patógenos consiste en crear
plantas que sean endógenamente resistentes a los patógenos. Sin
embargo, los criadores de plantas tienen fuentes limitadas de genes
de resistencia frente a las enfermedades vegetales. Esto se puede
lograr ahora utilizando técnicas de ingeniería genética,
proporcionando a la planta la información genética requerida para
afectar a los patógenos y para que sean resistentes a la enfermedad
causada por el patógeno. Por ejemplo, en el caso de un patógeno
viral, la planta huésped es resistente si tiene la capacidad de
inhibir o retardar la replicación de un virus, los síntomas de la
infección viral o el ciclo vital del virus, incluyendo su
transmisión. "Resistente" es lo contrario de "susceptible"
y se puede ser dividir en tres niveles:
1) Resistencia Completa,
2) Media,
3) Parcial.
Una planta puede ser considerada completamente
resistente cuando no muestra síntomas de infección y no hay
evidencia de replicación o reproducción del patógeno. La planta
huésped puede ser resistente al establecimiento de la infección, a
la reproducción del patógeno y/o al movimiento y la transmisión del
patógeno.
En los últimos años, los avances en virología
molecular vegetal han intensificado el conocimiento de la
organización del genoma del patógeno y de la función génica. Por
otra parte, la ingeniería genética de las plantas para la
resistencia a los virus ha proporcionado recientemente nuevas
estrategias para el control de las enfermedades virales (Baulcombe,
1994), (Gadani y col., 1990), (Wilson, 1993). Los siguientes genes
fueron expresados en plantas transgénicas con el fin de conferir
resistencia: proteínas de la envuelta viral, proteínas no
estructurales de los genomas virales, transcritos
anti-sentido virales, ARN satélites virales, genes
de ribozimas e interferón (Baulcombe, 1994), (Gadani y col., 1990),
(Wilson, 1993), Harrison y col., (1987), (Namba y col., 1991),
(Anderson y col., 1992). Aunque la mayor parte de estos enfoques han
sido eficaces para atenuar infecciones, la resistencia no era
completa y estaba confinada a un pequeño espectro de patógenos
virales (Falk y Bruening, 1994), (Wilson, 1993) y comporta riesgos
significativos (Palukaitis y Roossinck, 1996).
Las principales desventajas de estos métodos
son:
- 1)
- La gama de huésped es limitada.
- 2)
- la gama de patógeno es limitada.
- 3)
- la resistencia es parcial y aunque los síntomas sean retardados la infección todavía produce la enfermedad.
- 4)
- La resistencia se puede romper en caso de resistencia mediada por proteínas de la envuelta y resistencia mediada por ribozimas.
- 5)
- La expresión de las proteínas virales puede conducir a una actividad intensificada del patógeno. Por ejemplo, en el caso de la resistencia mediada por proteínas de la envuelta viral, se puede producir la encapsidación cruzada de cepas no patógenas suaves de virus por la proteína de la envuelta expresada lo que conduce después al desarrollo de una enfermedad más grave.
Una vía alternativa para proteger las plantas de
la infección por patógenos es la generación y la expresión de
anticuerpos recombinantes (rAb), que a menudo son referidos como
"planticuerpos" (anticuerpos producidos por plantas
transgénicas). Los anticuerpos recombinantes específicos de los
patógenos dirigidos a diferentes compartimentos de células vegetales
o diferentes órganos vegetales superan muchos de los problemas
mencionados antes y confieren un espectro más amplio de resistencia
a las enfermedades (Baulcombe, 1994). Para lograr esto, se tienen
que generar anticuerpos recombinantes (Plückthun, 1991), (Winter y
Milstein, 1991) contra las proteínas diana clonando los
correspondientes genes de las cadenas pesadas y ligeras del
anticuerpo a partir de células de hibridoma, de bancos de
presentación en fagos o de presentación en ribosomas sintéticos,
semisintéticos e inmunocompetentes; o mediante la generación de
anticuerpos diseñadores completamente sintéticos. Esto está seguido
de la posterior modificación y expresión de rAb en diferentes
compartimentos de huéspedes heterólogos tales como bacterias,
levaduras, algas, células de insectos infectadas por baculovirus,
células de mamíferos y plantas. Por ejemplo, se pueden utilizar
anticuerpos y proteínas de fusión con anticuerpos que se unen a
dominios funcionales conservados de proteínas de la envuelta viral,
proteínas del movimiento, replicasas o factores de transmisión para
inactivar tales dianas dentro o fuera de la célula vegetal a través
de la inmunomodulación. La posibilidad de expresar anticuerpos
recombinantes (Plückthun, 1991), (Winter y Milstein, 1991) para la
generación de resistencia ha sido demostrada recientemente tanto
para virus de animales (Chen y col. (1994), (Duan y col., 1994),
(Marasco y col., 1993) como de plantas (Tavladoraki y col., 1993),
(Voss y col., 1995), (Zimmermann y col., 1998). Los fragmentos de
anticuerpos de cadena sencilla derivados de anticuerpos monoclonales
(scFv) (Bird y col., 1988) dirigidos contra Rev (Duan y col.,
1994) y gp120 (Chen y col., 1994) (Marasco y col., 1993) de VIH,
inhibían la replicación del VIH, el ensamblaje del virión y la
formación de sincitios cuando eran expresados intracelularmente, o
dentro del RE de células humanas.
Interesantemente, la expresión intracelular de un
scFv específico para la proteína de la envuelta del virus del
moteado-rizado de la alcachofa en Tabaco transgénico
causaba una reducción de la infección y retardaba el desarrollo de
los síntomas (Tavladoraki y col., 1993). El redireccionamiento de
anticuerpos de tamaño normal específicos del TMV al espacio
intercelular de las plantas de Tabaco inhibía las infecciones
virales hasta el 70% (Voss y col., 1995). En el último caso, los
anticuerpos producidos por la planta mostraban la misma
especificidad y afinidad por el TMV (Fischer y col., 1998) que el
anticuerpo murino de origen. La expresión citosólica de un scFv
diseñado derivado de este anticuerpo anti-TMV rendía
plantas de tabaco totalmente resistentes, incluso en condiciones de
infección sistémica (Zimmermann y col., 1998). Estos estudios
demuestran el potencial de los anticuerpos recombinantes expresados
heterólogamente para combatir patógenos vía modulación intra- o
extra-celular de proteínas patógenas.
Las células vegetales pueden sintetizar grandes
cantidades de anticuerpos que son funcionalmente indistinguibles del
monoclonal de origen. Por ejemplo los anticuerpos completos (Düring
y col., 1990), (Hiatt y col., 1989), (Voss y col., 1995), los
fragmentos Fab (De Neve y col., 1993), los scFv (Owen y col., 1992;
Zimmermann y col., 1998), (Tavladoraki y col., 1993), las proteínas
de fusión de scFv (Fischer y col., 1999) y los dAb (Benvenuto y
col., 1991) han sido expresados con éxito en Tabaco, Patata
(Schouten y col., 1997) o Arabidopsis, alcanzando niveles de
expresión tan altos como el 6,8% de la proteína total (Fiedler y
col., 1997). El redireccionamiento de anticuerpos recombinantes
explotando las secuencias señal del tráfico de proteínas conocidas
permite ahora la expresión de rAb en el citoplasma (fragmentos scFv
(Tavladoraki y col., 1993; Zimmermann y col., 1998)), el retículo
endoplásmico (Fiedler y col., 1997), los cloroplastos (Düring y
col., 1990) y el espacio intercelular (Benvenuto y col., 1991; De
Neve y col., 1993; Voss y col., 1995); Zimmermann y col., 1998)
(fragmentos Fab de tamaño normal, scFv y Abs de dominio individual).
Estos resultados demuestran la flexibilidad del sistema vegetal para
expresar cualquier anticuerpo recombinante o fragmento de anticuerpo
recombinante en casi todos los compartimentos vegetales, utilizando
secuencias dirigidas que también pueden ser de plantas o derivadas
de otros eucariotas.
La ventaja de la expresión de proteínas dirigida
es que los rAb pueden ser expresados donde el patógeno es más
vulnerable y donde tengan el máximo efecto protector. En WO 96/00783
y WO 95/11305 se describe una proteína de fusión que consta de un
dominio de unión (v.g. un anticuerpo o la endotoxina
\delta-endotoxina Bt) fusionado a un dominio
tóxico (v.g. una enzima tóxica o un veneno) que es tóxico o
perjudicial para un patógeno. En la solicitud de Patente WO 96/09398
se propone la utilización de proteínas de fusión a anticuerpos como
agentes para controlar enfermedades de cultivos causadas por
patógenos.
El anticuerpo libera una toxina que elimina el
patógeno en las plantas transgénicas o cuando es expresado o
aplicado como inmunotoxina externa. WO 96/09398 está enfocada a
proteínas de fusión con Ab recombinante - polipéptidos individuales
que están ligados genéticamente, químicamente o
"bioquímicamente" para formar una inmunotoxina. Sin embargo, en
WO 96/09398 no se proporciona ninguna prueba o principio para la
resistencia mediada por anticuerpos y es dudoso que cualquiera de
los hipotéticos ejemplos de WO 96/9398 funcione hasta el punto de
que se pueda obtener una protección de las plantas frente al ataque
por patógenos suficiente para ajustarse a las necesidades de los
criadores y granjeros. Así, todavía existe la necesidad de medios y
métodos para conferir características antipatógenas/predadoras a las
plantas transgénicas.
El objetivo de la presente solicitud de patente
es proporcionar medios y métodos para proteger plantas, en
particular cultivos agrícolas de monocotiledóneas y dicotiledóneas y
plantas ornamentales, frente a los patógenos de una manera más
eficaz y más sensible desde el punto de vista medioambiental. Por
consiguiente, la solución al problema técnico se logra
proporcionando las realizaciones caracterizadas en las
reivindicaciones.
Como se describirá más abajo, el objetivo antes
mencionado se satisface según la invención mediante cualquiera de
las siguientes o de cualquier combinación de las siguientes
invenciones: i) la expresión de anticuerpos recombinantes
específicos para patógenos y de partes de los mismos, o ii) mediante
la fusión de anticuerpos o partes de los mismos a toxinas,
proteínas, o enzimas que tengan actividad frente a los patógenos o a
las partes efectivas de estas toxinas o enzimas, y mediante la
expresión después de estas proteínas de fusión, o iii) mediante el
ensamblaje de complejos de proteínas compuestos por un anticuerpo o
fragmento del mismo utilizando in vivo las proteínas de
fusión novedosas descritas aquí o iv) incluyendo una secuencia
sensible a una proteasa específica, que es escindida (v.g. en
presencia del patógeno o en un compartimento celular vegetal
específico) para liberar y/o activar la actividad tóxica de
cualquiera de las proteínas recombinantes de i) a iii), y v)
dirigiendo cualquiera de las proteínas recombinantes de i) a iv) a
membranas celulares o integrándolas en ellas en cualquier
orientación. Estos agentes también son denominados "patogenicidas
moleculares". Así, en un aspecto la presente invención hace
referencia a una proteína de fusión que comprende
- a)
- al menos un dominio de unión que comprende un anticuerpo o un sitio de unión del mismo que reconoce específicamente un epítopo de un patógeno vegetal; y
- b)
- una secuencia de localización en la membrana y/o una unidad que conduce al anclaje en la membrana y, opcionalmente, una secuencia de redireccionamiento celular.
En un aspecto adicional, dicha proteína de fusión
comprende al menos un dominio adicional que comprende una proteína o
secuencia peptídica que es tóxica para el patógeno o perjudicial
para su replicación, transmisión o ciclo celular.
Dichos dominios pueden estar conectados mediante
enlaces covalentes o no covalentes. En una realización preferida de
la proteína de fusión de la invención, dicho dominio de unión
comprende un anticuerpo, un receptor de las células T, un receptor
específico de patógenos, un péptido específico para un epítopo de un
patógeno, o al menos el sitio de unión de cualquiera de ellos.
En otro aspecto, la invención se refiere a
dominios de unión asociados a la membrana y otros dominios,
respectivamente, como se ha definido aquí.
Las proteínas de fusión compuestas por
anticuerpos específicos de patógenos y moléculas de toxina pueden
ser elaboradas fusionando las respectivas partes mediante medios
genéticos o bioquímicos. Además, la proteína quimérica puede ser
ensamblada preferiblemente in vivo a partir de sus partes por
la planta o por medio de la expresión en la maquinaria de proteínas
endógenas de los organismos. Estos dominios o partes de los mismos,
proteínas de fusión o complejos de proteínas también pueden ser
dirigidos a orgánulos y compartimentos de la célula vegetal o
inmovilizados y anclados a la membrana mediante la adición de
secuencias señal y/o anclas de membrana. La proteína patogenicida
molecular recombinante contiene preferiblemente secuencias de
escisión de proteasa específicas que son escindidas in vivo,
por una o varias proteasas específicas de una planta y/o un
patógeno, para liberar y/o activar el agente o los agentes tóxicos,
o partes del mismo, tras la infección.
La proteína de fusión de la presente invención
puede comprender adicionalmente una proteína portadora adecuada para
la liberación de la proteína de fusión o sus dominios en una célula
huésped, preferiblemente una célula vegetal o un compartimento
celular de la misma. Además, la proteína de fusión de la presente
invención puede comprender un fluoróforo tal como una proteína
fluorescente verde fusionada al menos a uno de los dominios
descritos antes de los que consta la proteína de fusión. En un
aspecto adicional, la presente invención hace referencia a un
patogenicida que comprende al menos un dominio de unión y/o uno
adicional como se ha definido aquí y una secuencia de
redireccionamiento celular y/o una secuencia de localización de
membrana y/o una unidad que conduce al anclaje a la membrana.
Preferiblemente, la secuencia de localización de membrana es
proteolíticamente sensible.
Las secuencias ancla de la membrana adecuadas,
que permiten la integración de proteínas de fusión con anticuerpos
recombinantes secretores y partes de la misma en la membrana
plasmática, incluyen dominios transmembrana de los receptores de las
células T humanas (Gross y Eshhar, 1992), anclas de
glico-fosfatidilinositol (GPI) (Gerber y col.,
1992), anclas de membrana de la superfamilia de las
inmunoglobulinas, miembros de la familia del tetraspan (Tedder y
Engel, 1994; Wright y Tomlinson, 1994) y cualquier secuencia o
secuencias transmembrana de una proteína conocida o secuencias
sintetizadas que tengan una función similar y puedan ser incluidas
en la proteína diana mediante tecnología de ADN recombinante. La
fusión de una proteína a estas secuencias permitiría la presentación
de la proteína recombinante sobre la cara luminal de los orgánulos
de la ruta secretora o endocítica o de la membrana de una célula
vegetal. Esto tiene la ventaja de que la proteína recombinante puede
ser dirigida al espacio intracelular donde muchos patógenos son muy
vulnerables.
Además, los anticuerpos o partes de los mismos, o
las proteínas de fusión a anticuerpos recombinantes, o partes de las
mismas, pueden ser redireccionados a membranas celulares en las que
podrían dar al lado citosólico de la membrana. Entre las secuencias
de redireccionamiento adecuadas para la presentación citoplásmica se
incluyen los dominios transmembrana de: KAR1, para la integración en
la membrana nuclear (Rose y Fink, 1987), el antígeno T medio (Kim y
col., 1997), para la integración en la membrana plasmática y el
citocromo b5, para la integración en la membrana del RE (Kim y col.,
1997). También se pueden utilizar conexiones
C-terminales a ácidos grasos utilizando secuencias
de aminoácidos consenso que conducen a una prenilación,
farnesilación, palmitoilación, miristoilación
post-traduccional o unidades de la secuencia de
ankirina. Esta presentación citoplásmica tiene la importante ventaja
de que las proteínas recombinantes pueden ser localizadas en el
lugar de replicación del patógeno intracelular, donde tendrán el
efecto más potente. Además, la localización en la membrana de las
proteínas estabiliza la proteína y reduce el efecto de la
degradación de la proteína C-terminal in
vivo. Preferiblemente, el patogenicida de la invención comprende
la proteína de fusión descrita aquí.
En una realización particularmente preferida, la
presente invención se refiere a los patogenicidas descritos en los
que dicho o dichos dominios de unión y/o dicho o dichos dominios
adicionales son capaces de autoensamblarse in vivo.
En una realización adicional, la presente
invención se refiere a un polinucleótido que codifica una proteína
de fusión o un patogenicida de la invención. Así, la invención se
refiere a uno o más constructos génicos que codifican una secuencia
de nucleótidos que codifica un anticuerpo o una parte del mismo que
es específica para un patógeno y en el caso de las proteínas de
fusión, para una secuencia de nucleótidos que codifica una proteína,
enzima o péptido que tiene efectos perjudiciales sobre el patógeno e
idealmente es tóxico para el patógeno. En esta invención se incluyen
los anticuerpos específicos para el patógeno y/o las proteínas del
huésped utilizadas por el patógeno durante su ciclo vital. Esta
invención también se refiere a proteínas quiméricas que constan de
un anticuerpo, anticuerpos o partes del mismo, que son específicos
para un patógeno, y una proteína o péptido que tiene efectos
perjudiciales o idealmente tóxicos sobre el patógeno y que han sido
construidas conectando bioquímicamente el anticuerpo o partes del
mismo a la toxina. Además, la presente invención se refiere a un
vector que comprende el polinucleótido de la invención. Dicho vector
puede comprender polinucleótidos separados que codifican al menos
uno de dichos dominios de unión y/o dicho o dichos dominios
adicionales de la proteína de fusión descrita antes. Además, la
presente invención se refiere a una composición que comprende
vectores en los que cada vector contiene al menos un polinucleótido
que codifica al menos un dominio de unión y/o al menos un dominio
adicional de la proteína de fusión o el patogenicida de la
invención; y donde la expresión de al menos dos de dichos
polinucleótidos da como resultado la producción de dicha proteína de
fusión o dicho patogenicida o el ensamblaje de los mismos in
vivo.
En una realización preferida del vector o la
composición de la invención el polinucleótido está conectado
operativamente a secuencias reguladoras que permiten la expresión de
la proteína de fusión, el patogenicida o los dominios del mismo en
una célula huésped. Dicha secuencia reguladora puede ser un promotor
constitutivo, quimérico, específico de un tejido o inducible.
Además, la presente invención se refiere a una
célula huésped que comprende uno cualquiera de los polinucléotidos,
vectores o vectores de las composiciones descritos antes.
En otra realización la presente invención se
refiere a un método para la producción de un patogenicida molecular
que comprende:
(a) cultivar la célula huésped de la invención en
condiciones adecuadas para la expresión del polinucleótidos; y
(b) recuperar la proteína de fusión, el
patogenicida o los dominios de los mismos del cultivo.
La presente invención también se refiere a un
patogenicida molecular obtenible mediante el método de la invención
o codificable por el polinucléotido de la invención.
Esta invención también se refiere a complejos de
proteínas ensambladas in vivo compuestos por una o más
cadenas polipeptídicas discretas, codificadas por secuencias de
nucleótidos separadas en uno o más constructos, que son ensamblados
por la maquinaria de la síntesis de proteínas de la planta o los
organismos de expresión en un complejo proteico.
Además, la presente invención se refiere a un
método para la producción de plantas transgénicas, células vegetales
o tejidos vegetales resistentes a patógenos, que comprende la
introducción de un polinucleótido o vector de la invención o los
vectores de la composición de la invención en el genoma de una
planta, célula vegetal o tejido vegetal.
La presente invención también se refiere a una
célula vegetal transgénica que contiene integrado establemente en el
genoma un polinucleótido o vector de la invención o los vectores de
la composición de la invención u obtenibles según el método de la
invención.
Además, la presente invención se refiere a una
planta o tejido vegetal transgénico que comprende las células
vegetales descritas antes u obtenibles mediante el método de la
invención. Asimismo están incluidas las plantas transgénicas en las
que la proteína de fusión o el patogenicida se han hecho funcionales
frente a patógenos mediante ensamblaje in vivo tras la
transformación simultánea de al menos dos constructos de expresión
vegetal independientes o tras el cruzamiento sexual para formar
vástagos híbridos a partir de dos plantas de origen que expresan uno
o más de los dominios de la proteína de fusión o el patogenicida, o
cualquier otra forma de recombinación genética. Preferiblemente, la
planta transgénica de la invención muestra una resistencia mejorada
frente a un patógeno al que la planta salvaje era susceptible.
Además, la presente invención se refiere a partes
cosechables y material de propagación de una planta de la invención
que comprende células vegetales de la invención.
En otra realización más, la presente invención se
refiere a un estuche que comprende cualquiera de las proteínas de
fusión, patogenicidas, polinucleótidos, composiciones o
patogenicidas moleculares de la invención descritos antes.
En otra realización la presente invención se
refiere al uso de los anticuerpos, las proteínas de fusión, los
polinucleótidos, los vectores, las composiciones y los patogenicidas
moleculares de la invención descritos en agricultura para la
protección de una planta frente a la acción de un patógeno.
Algunos aspectos de la presente invención se
describirán más abajo con detalle.
El término "dominio de unión" se utiliza
para indicar una o varias cadenas polipeptídicas que muestran una
fuerte unión monovalente, bivalente o polivalente a un epítopo o
epítopos dados. Preferiblemente, dicho dominio de unión es un
anticuerpo o un sitio de unión del mismo. Los anticuerpos pueden ser
generados mediante tecnología de hibridomas, o presentación en
ribosomas, o presentación en fagos, de bancos de origen
indiferenciado natural, o de origen inmunizado,
semi-sintéticos o totalmente sintéticos. El término
"anticuerpo" también se utiliza para indicar anticuerpos
diseñadores. Estos polipéptidos de anticuerpos son codificados por
un gen de inmunoglobulina o por genes de inmunoglobulinas, o
fragmentos de los mismos que se unen específicamente al epítopo o
los epítopos dados. Entre los genes de inmunoglobulinas reconocidos
se incluyen los genes de las cadenas ligeras kappa y lambda, las
regiones constantes mu, delta, gamma, alfa y épsilon así como todas
las regiones variables de las inmunoglobulinas de especies de
vertebrados, camélidos, aves y peces. El término anticuerpo, según
se utiliza aquí, incluye en particular aquellos anticuerpos
sintetizados o construidos de novo utilizando la metodología
del ADN recombinante, tal como anticuerpos de tamaño normal,
anticuerpos IgA secretores diméricos, anticuerpos IgM multiméricos,
fragmentos F(ab')_{2}, fragmentos Fab, fragmentos Fv,
fragmentos Fv de cadena sencilla (scFv), scFv biespecíficos,
"diabodies" (fragmentos bivalentes), anticuerpos de dominio
sencillo (dAb), "minibodies" y unidades de reconocimiento
molecular (MRU) recombinantes. Las secuencias de anticuerpos pueden
derivar de cualquier especie de vertebrado, camélido, ave, o pez
utilizando la tecnología del ADN recombinante, o también utilizando
bancos de presentación en fagos y ribosomas sintéticos,
semi-sintéticos e indiferenciados o
inmunocompetentes, bancos de mezclado de genes, y anticuerpos
diseñadores completamente sintéticos. En esta invención, los
anticuerpos son generados frente a epítopos vegetales específicos
del patógeno o del huésped que están implicados en la replicación,
reproducción o ciclo vital del patógeno.
El término "patógeno" se utiliza aquí para
indicar organismos virales o similares a virus, bacterias,
micoplasmas, hongos, insectos o nematodos que afectan a la
germinación de semillas, al crecimiento, desarrollo, reproducción,
cosecha, rendimiento o utilidad de una planta.
El término "tóxico" hace referencia a una
actividad que puede estar codificada por un péptido o un
polipéptido, que afecta a la reproducción o replicación de un
patógeno y/o a cualquiera de las fases de su ciclo vital. En el caso
de los patógenos virales, esto incluye la entrada en la planta, el
desprendimiento de la envuelta y el desensamblaje viral, la
replicación viral, el ensamblaje viral, el movimiento célula a
célula y a larga distancia y el desarrollo, propagación, o el ciclo
vital del virus. Entre las actividades tóxicas adecuadas se incluyen
ARNasa (Leland y col., 1998) y ADNasa, proteínas que desactivan el
ribosoma (Barbieri y col., 1993), (Girbes y col., 1996), (Hartley y
col., 1996) y/o toxinas con actividad antimicrobiana (Dempsey y
col., 1998). Los anticuerpos o las propias proteínas recombinantes
también son considerados tóxicos cuando afectan al patógeno
uniéndose al patógeno y/o a las proteínas del huésped que son
utilizadas por el patógeno durante la replicación, reproducción,
ciclo vital o transmisión. Por ejemplo, una proteína de fusión
compuesta por un anticuerpo específico para un virus y una proteína
de la envuelta viral que interferirá en la reproducción del virus
tanto uniéndose al virus como desorganizando el ensamblaje viral o
el desensamblaje en la célula huésped.
El término "patogenicida molecular" hace
referencia a los anticuerpos y proteínas descritos en esta
solicitud, que tienen efectos tóxicos sobre el o los patógenos en
forma de proteínas de fusión individuales, cuando son expresadas
combinadas con otras proteínas, o cuando son expresadas como parte
de complejos proteicos que se ensamblan in vivo.
Los anticuerpos monoclonales (Köhler y Milstein,
1975) pueden ser originados contra casi cualquier epítopo o
estructura molecular de un patógeno o proteína huésped utilizando
numerosas técnicas. El método más común es la técnica del hibridoma
que parte de linfocitos B inmunocompetentes del bazo o el timo que
son obtenidos tras la inmunización con un antígeno nativo, un
antígeno recombinante, proteínas de fusión a antígenos, dominios
antigénicos o mediante inmunización in vitro o genética.
Además, los recientes avances en las técnicas de biología molecular
permiten ahora utilizar los fragmentos de anticuerpos recombinantes
clonados y anticuerpos derivados de ratones y otros organismos
distintos del ratón. Entre los fragmentos de anticuerpos
recombinantes adecuados se incluyen los anticuerpos de tamaño normal
recombinantes completos, los anticuerpos IgA secretores diméricos,
los anticuerpos IgM multiméricos, el fragmento F(Ab')_{2},
el fragmento Fab, el fragmento Fv, los fragmentos de anticuerpos de
cadena sencilla (scFv), los dominios de unión sencillos (dAb), un
scFv bivalente ("diabody") (Poljak, 1994), un "minibody"
(Carter y Merchant, 1997), anticuerpos scFv biespecíficos (Plückthun
y Pack, 1997) donde la molécula de anticuerpo reconoce dos epítopos
diferentes, (que pueden ser del patógeno o del huésped o tanto del
patógeno como del huésped), "triabodies" (fragmentos
trivalentes) y cualquier otra parte del anticuerpo tal como unidades
de reconocimiento molecular (MRU), que muestran unión a los epítopos
diana. Los genes que codifican estos fragmentos de anticuerpos
recombinantes adecuados pueden derivar de especies de vertebrados,
camélidos, aves o peces.
Asimismo, los anticuerpos de cadena sencilla que
tienen afinidades por las estructuras de patógenos o del huésped y
las proteínas pueden ser identificados utilizando bancos de
presentación en fagos o bancos de presentación en ribosomas, bancos
de genes mezclados, que pueden ser construidos a partir de fuentes
sintéticas, semi-sintéticas o indiferenciadas e
inmunocompetentes (Plückthun, 1991; Winter y col., 1994; Winter y
Milstein, 1991). La presentación en fagos y las técnicas adecuadas
pueden ser utilizados para identificar específicamente anticuerpos,
o fragmentos de los mismos, con las propiedades de unión deseadas.
Utilizando la tecnología de los anticuerpos recombinantes es posible
identificar anticuerpos o fragmentos que sean altamente específicos
para un único patógeno, o que reconozcan un epítopo consenso
conservado entre diversos patógenos, donde los anticuerpos tengan
una amplia especificidad frente a los patógenos. La durabilidad y el
efecto de la resistencia mediada por anticuerpos pueden ser
mejorados mediante i) maduración de la afinidad del anticuerpo
recombinante, ii) aleatorización y selección de CDR, iii)
estabilización mediante optimización del marco de un anticuerpo
específico para un patógeno seleccionado, iv) expresión de
anticuerpos bi-específicos, v) generación de
proteínas de fusión a anticuerpos, o vi) expresión de anticuerpos en
combinaciones con otros que puedan potenciar sus efectos
individuales. Por ejemplo, la resonancia de plasmón superficial
empleada en el sistema BIAcore puede ser utilizada para incrementar
la eficacia de las selecciones de anticuerpos presentados en fagos,
rindiendo un gran incremento de la afinidad de un banco individual
de anticuerpos de fagos que se unen a un epítopo de un patógeno
(Schier, Human Antibodies Hybridomas 7 (1996),
97-105; Malmborg, J. Immunol. Methods 183 (1995),
7-13). Los anticuerpos recombinantes pueden ser
identificados y utilizados según los métodos que son familiares para
cualquier experto normal en la técnica.
Esta invención describe anticuerpos o fragmentos
de los mismos que reconocen estructuras del patógeno o de la planta
huésped y conducen directamente o indirectamente a la resistencia o
la resistencia parcial cuando son expresados solos o son expresados
en forma de una proteína de fusión quimérica acoplada a una
actividad tóxica o cuando son expresados y ensamblados in
vivo con una actividad tóxica para formar un complejo proteico
patogenicida molecular ensamblado in vivo. Se pueden generar
anticuerpos que reconocen epítopos específicos de patógenos o
epítopos específicos de plantas huésped que tienen un papel en el
ciclo celular de un patógeno. Entre los anticuerpos adecuados para
el diseño de la resistencia viral se incluyen, pero no están
limitados a, aquellos que se unen a dominios funcionales conservados
de proteínas de la envuelta viral, proteínas del movimiento, o
replicasas y son un enfoque para obtener resistencia de amplio
espectro y reducir los riesgos medioambientales inactivando las
dianas dentro y/o fuera de la célula vegetal a través de la
inmunomodulación. La posibilidad de este enfoque ha sido demostrada
recientemente para la resistencia viral tanto animal (Chen y col.,
1994), Duan y col., 1994), (Marasco y col., 1993) como vegetal
(Tavladoraki y col., 1993), (Voss y col., 1995), (Zimmermann y col.,
1998). Estos anticuerpos o fragmentos de los mismos pueden ser
inactivados en sí mismos o combinados con uno o más anticuerpos
distintos, o una toxina, o combinados con un portador, un dominio
transmembrana o un péptido señal. Esencialmente, la resistencia a
patógenos vegetales puede ser intensificada mediante la expresión
simultánea de múltiples anticuerpos.
En una realización preferida concreta, la
presente invención hace referencia a uno de los anticuerpos
descritos antes donde el anticuerpo o un derivado del mismo es capaz
de unirse al dominio funcional de una proteína de movimiento viral
y/o replicasa. Como se pudo demostrar sorprendentemente en los
Ejemplos 5 y 6, los anticuerpos dirigidos contra un movimiento viral
y una replicasa, respectivamente, pueden ser utilizados para diseñar
una resistencia intensificada contra el virus del que derivan el gen
del movimiento y de la replicasa. La ventaja de utilizar la proteína
del movimiento o la replicasa como diana para el anticuerpo o una
proteína de unión equivalente funcional es que se puede esperar que
los dominios funcionales de la proteína del movimiento y la
replicasa están altamente conservados entre los diferentes virus.
Así también se puede esperar que la expresión de un anticuerpo
dirigido contra semejante epítopo conservado de, por ejemplo, la
proteína del movimiento del TMV sea efectiva contra los virus
relacionados. Además, debido a la conservación de los dominios
funcionales en estas dos proteínas virales, una ventaja adicional es
que la heterogeneidad dentro de un único grupo de virus no debe ser
tan elevada como, por ejemplo, la de la proteína de la envuelta.
Así, el descubrimiento de la presente invención de que la proteína
del movimiento y la replicasa de un virus son accesibles para el
redireccionamiento del anticuerpo dentro de la célula vegetal, se
hizo posible un concepto novedoso para la generación de plantas
resistentes a virus. Es por esa razón, que en un aspecto separado de
la presente invención se hace referencia a tales anticuerpos para
diseñar resistencia a virus en plantas. Los virus que pueden ser la
diana de este enfoque son cualquiera que utilice proteínas del
movimiento durante la infección así como todos los virus que
codifiquen un gen de la replicasa. Se puede esperar que esto sea
eficaz debido a que el movimiento viral es una característica común
de muchas infecciones virales (McLean y col., Trends Microbiol. 1,
(1993), 105-9) y las replicasas son esenciales para
la patogénesis viral. La importancia de los enfoques que dirigen
estas proteínas está subrayada por el hecho de que la expresión de
versiones de tipo salvaje o defectuosas de las proteínas del
movimiento o las replicasas a menudo producen resistencia (Beachy,
(1997), Curr. Opin. Biotechnol. 8:215-220). Las
plantas transgénicas que expresan proteínas de movimiento del TMV
mutantes defectuosas son resistentes a múltiples virus,
presumiblemente debido a que las desorganizaciones del movimiento
viral intercelular (Cooper y col., (1995), Virology 206,
307-313) y la expresión de la replicasa es una
estrategia de resistencia eficaz (Anderson y col., (1992), Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 89:8759-8763; Baulcombe,
(1994), Trends Microbiol. 2:60-63; Brederode y col.,
(1995), Virology 207:467-470; Nguyen y col., (1996),
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:12643-12467; Rubino y
Russo, (1995), Virology 212:240-243).
Una desventaja de los enfoques de resistencia
mediada por anticuerpos actuales puede ser la elección de las
proteínas de la envuelta viral como diana. Las proteínas de la
envuelta viral vegetales tienen una amplia diversidad estructural y
esta puede restringir el efecto de los anticuerpos expresados a una
pequeña gama de virus y bajo estrés selectivo, la secuencia de la
proteína de la envuelta viral puede ser alterada sin pérdida de
función. La generación de anticuerpos recombinantes dirigidos contra
los dominios funcionales conservados de las replicasas virales y las
proteínas del movimiento puede proporcionar una mejor ruta para
obtener plantas resistentes a patógenos con una resistencia de
amplio espectro frente a los virus. El antígeno para producir
cualquiera de los anticuerpos descritos antes puede derivar de
proteínas del movimiento o replicasas de origen natural o fragmentos
de las mismas o pueden ser producidas por recombinación,
sintetizadas químicamente y/o derivadas mediante métodos bien
conocidos por los expertos en la técnica algunos de los cuales
también se tratan aquí. En vista de lo anterior, la invención
también se refiere a polinucleótidos que codifican los anticuerpos
descritos antes, los vectores que comprenden los mismos y las
células huésped transformadas con ellos. Los vectores, las células
huésped y las estrategias adecuados para la expresión de anticuerpos
recombinantes en plantas se describen aquí y pueden ser fácilmente
adaptados a partir de cualquiera de las realizaciones descritas
aquí.
Entre las toxinas se incluyen todas las proteínas
y péptidos que tienen un efecto perjudicial o tóxico sobre un
patógeno durante su ciclo vital y/o un efecto sobre el patógeno
durante la infección de la planta o la replicación, propagación o
transmisión del patógeno. Esto incluye las toxinas que eliminan
específicamente una célula huésped infectada y por tanto limitan la
propagación y el desarrollo de una enfermedad. Entre las toxinas
adecuadas se incluyen las siguientes:
- \ding{226}
- péptidos tóxicos que son específicos para el patógeno y median la toxicidad v.g. mediante permeabilización de la membrana basándose en la alteración del potencial de membrana (Ham y col., 1994; Sangster, 1997).
- \ding{226}
- péptidos bloqueadores que se unen a proteínas del patógeno estructurales o no estructurales, o unidades de ácido nucleico, e inhiben la función, crecimiento, desarrollo del patógeno o la toxicidad para el huésped (Hayakawa, 1991; Silbur y col., 1998).
- \ding{226}
- miméticos de péptidos que se unen a unidades proteicas del patógeno o del huésped y que modulan o bloquean la replicación del patógeno, v.g. derivados de péptidos de inhibidores de la proteinasa que juegan un papel fisiológico como inhibidores de la replicación viral y pueden ser utilizados como agentes antivirales (Bjorck y col., 1990), (Bjorck y col., 1989).
- \ding{226}
- dominios de unión, tales como los anticuerpos definidos antes que reconocen específicamente un epítopo de un patógeno vegetal.
- \ding{226}
- miméticos de péptidos que se unen a unidades proteicas del patógeno o del huésped y que modulan o bloquean el movimiento del patógeno dentro de la planta huésped. Como ejemplo, el péptido BC, que imita la región señal de localización nuclear de VIH-1, reduce la producción de VIH-1 en un 75% cuando es expresado en células T humanas cultivadas en división infectadas (Friedler y col., 1998).
- \ding{226}
- toxinas que eliminan la célula huésped donde el patógeno se está replicando y ha penetrado en el citosol (Barbieri y col., 1993; Hartley y col., 1996; Madshus y Stenmark, 1992), por ejemplo RIP (proteínas que inactivan el ribosoma) que entran en el citosol y están entre las citotoxinas más potentes conocidas. La inactivación del ribosoma se logra en todos los casos a través de la escisión de un enlace N-glicosídico entre ribosa y un resto adenina específico en la secuencia universalmente conservada 5'-AGUACGA*GAGGA-3' (donde A* indica la adenina diana) localizada a 250-400 nt desde el extremo 3' de los ARNr 23S/25S/28S (Endo y Tsurugi, 1987), (Hardley y col., 1996). Los ribosomas despurinizados de esta manera son incapaces de unirse al complejo EF-2/GTP y la síntesis de proteínas es bloqueada en la etapa de translocación (Montanaro y col., 1975). Una única molécula de RIP es capaz de despurinizar 1000-2000 ribosomas de una célula de mamífero por minuto en condiciones fisiológicas (Eiklid y col., 1980; Endo y Tsurugi, 1988).
- \ding{226}
- proteínas y enzimas tales como la ARNasa A que son potentes citotoxinas (Leland y col., 1998). Estas ribonucleasas citotóxicas degradan el ARN celular y causan la muerte celular y pueden ser utilizadas para eliminar células infectadas y por tanto para prevenir la proliferación y propagación de un patógeno.
Estos son ejemplos de proteínas que inhibirán la
replicación de un patógeno a nivel de ARN, ADN o proteína uniéndose
directamente a una proteína patógena, un intermedio de replicación o
un factor del huésped que es necesario para la replicación o el
movimiento o la transmisión del patógeno y el ciclo vital del
patógeno. Esta estrategia es particularmente adecuada para inactivar
patógenos virales. Además, se describen toxinas, tales como RIP o
ARNasa A que son adecuadas para ocasionar la muerte celular a la
entrada del patógeno y por tanto detener la propagación de la
infección o la proliferación de un patógeno.
En principio todos los anticuerpos, proteínas,
péptidos y enzimas que tienen actividad, que puede ser o no
enzimática, que son capaces de interferir en los ciclos vitales de
los patógenos son adecuados como parte de los presentes
constructos.
En una realización preferida de la presente
invención dicha enzima es la quitinasa o la glucanasa, la glucosa
oxidasa, la superóxido dismutasa, la ADNasa o la ARNasa o RIP o
fragmentos activos de las mismas ya sean individualmente o en
cualquier combinación o combinaciones.
Los constructos génicos pueden comprender lo
siguiente o cualquier combinación de lo siguiente y pueden estar
codificados en uno o más plásmidos: Los constructos génicos pueden
comprender una secuencia de nucleótidos o secuencias de nucleótidos
que codifiquen anticuerpos de tamaño normal recombinantes completos,
anticuerpos IgA secretores diméricos, anticuerpos IgM multiméricos,
el fragmento F(ab')_{2}, el fragmento Fab, el fragmento Fv,
fragmentos de anticuerpos de cadena sencilla (scFv), dominios de
unión sencillos (dAb), un scFv bivalente ("diabody") (Poljack,
1994), "minibody" (Carter y Mechant, 1997), anticuerpos scFv
biespecíficos (Plückthun y Pack, 1997; Fischer y col., Eur. J.
Biochem. 262:810-816 (1999)) donde la molécula
de anticuerpo reconoce dos epítopos diferentes que pueden proceder
de un patógeno o de un huésped o de ambos, "triabodys"
(fragmentos trivalentes) y cualquier otra parte del anticuerpo
(unidades de reconocimiento molecular (MRU)) que muestren unión a
los epítopos diana. Los genes que codifican estos fragmentos de
anticuerpos recombinantes adecuados pueden derivar de especies de
vertebrados, camélidos, aves o peces.
En los constructos según la invención, el
anticuerpo está fusionado preferiblemente a una secuencia completa
de un agente tóxico o una parte del mismo que todavía tenga
actividad, o que todavía sea funcionalmente activa. Asimismo, la
proteína quimérica puede ser codificada por secuencias de
nucleótidos en uno o más constructos y pueden ser ensamblados in
vivo por la planta o la maquinaria de ensamblaje y traducción de
las proteínas de los organismos de expresión. También se puede
obtener la proteína quimérica mediante ensamblaje bioquímico o
ensamblaje in vitro o in vivo de las subunidades de
inmunotoxina quimérica utilizando la maquinaria de ensamblaje de
proteínas endógena de las células. El anticuerpo, los anticuerpos o
los fragmentos de los mismos están fusionados directamente al agente
tóxico o conectados por un espaciador flexible que no interfiera en
la estructura o función de las dos proteínas. Entre tales conectores
flexibles se incluyen copias del conector
(Glicina-Glicina-Glicina-Glicina-Serina)_{n},
donde n es de 1 a 4 o más copias de la unidad conectora, el conector
Genex 212 y 218 y el péptido conector flexible de la
celobiohidrolasa I de Trichoderma reesi (CBHI) (Turner y
col., 1997), (Tang y col., 1996).
En esta invención, este enfoque de
redireccionamiento tiene la ventaja de que el patogenicida molecular
o anticuerpo o fragmento del mismo puede ser expresado donde el
patógeno es más vulnerable a la acción del patogenicida molecular
y/o el anticuerpo o fragmento del mismo.
La localización celular deseada del patogenicida
molecular, o cualquier componente del mismo, puede ser obtenida
utilizando las señales de redireccionamiento celular apropiadas,
entre estas se incluyen pero no están limitadas a péptidos señal,
secuencias de redireccionamiento, señales de retención, anclas de
membrana, modificaciones post-traduccionales y/o
dominios membrana-transmembrana que dirigen la
proteína al orgánulo deseado, la membrana deseada (membrana
plasmática, RE, Golgi, núcleo, cloroplasto o vacuola) u orientación
de membrana deseada (citoplásmica o luminal o presentación en la
membrana de la célula vegetal) (Kim y col., 1997; Rose y Fink,
1987). Las secuencias de localización pueden ser las secuencias de
redireccionamiento que se describen, por ejemplo en el capítulo 35
(redireccionamiento de proteínas) de L. Stryer Biochemistry
4ª edición, W.H. Freeman, 1995. Las proteínas sintetizadas sin un
péptido señal funcional no son insertadas mediante traducción
simultánea en la ruta secretora y permanecen en el citosol. Las
proteínas que llevan un péptido señal que las dirige a la ruta
secretora, que puede incluir una secuencia transmembrana o un ancla
de membrana, serán dirigidas a la secreción por defecto o residen en
sus orgánulos con membrana objetivo. Las señales de
redireccionamiento pueden dirigir las proteínas al RE, conservarlas
en el RE (unidad LYSLYS y KDEL), TGN 38, o dirigir las proteínas a
orgánulos celulares tales como cloroplastos, vacuolas, núcleo,
membrana nuclear, peroxisomas y mitocondria. Los ejemplos para las
secuencias señal y los péptidos de redireccionamiento se describen
en (von Heijne, 1985) (Bennett y Osteryoung, 1991) (Florack y col.,
1994). Además, las señales de redireccionamiento pueden ser
crípticas y codificadas por una célula de la planta huésped o las
proteínas de las células eucariotas heterólogas o proteínas animales
en las que se conoce la localización y donde la proteína puede ser
clonada. Construyendo una proteína de fusión con esta proteína, se
puede dirigir un patogenicida molecular a la localización de la
proteína sin la necesidad de identificar la señal de
redireccionamiento críptica. Las señales crípticas adecuadas son
aquellas codificadas por las enzimas de Golgi residentes. Los
patogenicidas moleculares descritos en esta invención pueden ser
dirigidos a membranas celulares incorporando secuencias heterólogas
en la proteína recombinante que permitan su síntesis como una
proteína de la membrana o como una proteína asociada a la membrana o
su modificación post-traduccional para asociarla con
las membranas celulares. Entre las secuencias ancla a la membrana
adecuadas, que permiten la integración de proteínas de fusión a
anticuerpos recombinantes y partes de los mismos en la membrana
plasmática, se incluyen los dominios transmembrana de los receptores
de las células T humanas (Gross y Eshhar, 1992), las anclas de
glicofosfatidil-inositol (GPI) (Gerber y col.,
1992), las anclas de la superfamilia de las inmunoglobulinas, los
miembros de la familia del tetraspan (Tedder y Engel, 1994; Wright y
Tomlinson, 1994) y cualquier secuencia transmembrana de una proteína
conocida o secuencias sintetizadas que tengan una función similar y
puedan ser incluidas en la proteína diana mediante tecnología de
recombinación de ADN.
Además, los anticuerpos o partes de los mismos, o
las proteínas de fusión a anticuerpos recombinantes, o partes de las
mismas, pueden ser dirigidos a las membranas celulares donde podrían
dar al lado citosólico de la membrana. Entre las secuencias de
redireccionamiento adecuadas para la presentación citoplásmica, se
incluyen los dominios transmembrana de: KAR1, para la integración en
la membrana nuclear (Rose y Fink, 1987), el antígeno T medio (Kim y
col., 1997), para la integración en la membrana plasmática y el
citocromo b5, para la integración en la membrana del RE (Kim y col.,
1997). También se pueden utilizar conexiones
C-terminales a ácidos grasos utilizando secuencias
de aminoácidos consenso que conducen a una prenilación,
farnesilación, palmitoilación, miristoilación
post-traduccional o unidades de la secuencia de la
ankirina.
Los anticuerpos recombinantes específicos de
patógenos pueden ser fusionados a diferentes anclas transmembrana
para mejorar los niveles de expresión y la estabilidad de estas
moléculas dentro de la célula vegetal, dirigiendo la proteína
recombinante expresada a membranas de la célula de diversas
orientaciones. Esto se puede lograr añadiendo:
- a)
- Secuencias de localización C-terminal para dirigir e integrar proteínas citosólicas recombinantes en péptidos líder N-terminales en la bicapa de membranas celulares, encarando de ese modo el apoplasto de la planta. Entre las secuencias de localización de membrana adecuadas se incluyen el dominio transmembrana de la cadena \beta del receptor de las células T humana y el dominio transmembrana del receptor del factor de crecimiento derivado de plaquetas humano (PDGFR), las anclas de glicofosfatidilinositol (GPI), las anclas de membrana de la superfamilia de las inmunoglobulinas y cualquier secuencia transmembrana de una proteína conocida o secuencias sintetizadas que tengan una función similar y puedan ser incluidas en la proteína diana mediante tecnología de ADN recombinante.
- b)
- Proteínas transmembrana amino terminales con dominios que abarcan la membrana plasmática duales o tetraméricos para exponer los extremos tanto N como C de las proteínas recombinantes secretoras al citosol. Esto se puede lograr utilizando miembros adecuados de la familia del tetraspan incluyendo CD9, CD20, CD81 y el híbrido de tipo II-IV de dualspan In-Hc-Ic de la cadena invariable del MHC y la proteína híbrida H-2^{d}. Este método permite la orientación de un constructo de anticuerpo secretado y anclado a la membrana con su extremo N y C en el citosol. Alternativamente se pueden utilizar fusiones SNAP-25 para la misma orientación.
- c)
- Secuencias ancla C-terminales para dirigir e integrar las proteínas citosólicas recombinantes sin péptidos líder N-terminales en la bicapa de endomembranas post-traduccionalmente. Entre las secuencias de redireccionamiento adecuadas se incluyen los dominios transmembrana de KAR1 para la integración nuclear (Rose y Fink, 1987), el antígeno medio T para la integración en la membrana plasmática (Kim y col., 1997) y el citocromo b5 para la integración en la membrana del RE (Kim y col., 1997).
- d)
- Adición de unidades consenso a la proteína que permitan conexiones C-terminales a ácidos grasos mediante prenilación, farnesilación, palmitoilación, miristoilación y el citosol que después conducen a la integración en la membrana.
- e)
- Adición de unidades de secuencia de ankirina (Lambert y Bennett, 1993; Peters y Lux, 1993).
Además, el anticuerpo o el fragmento del mismo
puede ser codificado por una secuencia de nucleótidos separada de la
de la toxina y el anticuerpo y la toxina, cualquiera de los cuales
puede codificar secuencias de localización en la membrana o de
redireccionamiento celular, pueden estar codificados por uno o más
vectores, v.g. plásmidos. Los constructos contienen secuencias de
nucleótidos que codifican proteínas de unión complementarias de
manera que cuando el anticuerpo, o el fragmento del mismo, está
genéticamente fusionado a una pareja de unión y la toxina o el
fragmento de la misma, está genéticamente fusionado a la segunda
pareja de unión, estas dos proteínas independientes portarán
actividades de unión que se reconoceran mutuamente. Cuando estas dos
proteínas independientes son expresadas en el mismo compartimento
vegetal, los dominios de unión se unirán para formar un patogenicida
molecular con dos subunidades y propiedades similares a las de una
proteína de fusión anticuerpo-toxina. Entre los
dominios de unión/parejas adecuados se incluyen:
- \ding{226}
- Un anticuerpo de cadena sencilla y su correspondiente epítopo, donde la cadena sencilla se une al epítopo y de ese modo permite la unión entre dos proteínas independientes,
- \ding{226}
- cremalleras de leucina (Carter y col., 1995),
- \ding{226}
- Cadenas pesadas y ligeras de anticuerpos, donde una proteína es fusionada a la cadena pesada y el ensamblaje de la cadena pesada y ligera tiene lugar en el RE,
- \ding{226}
- otros homo- o hetero-dominios de unión.
Cualquier experto en la técnica reconocerá que el
componente anticuerpo, anticuerpos o fragmentos de los mismos o el
componente péptidos de unión al patógeno, como se ha descrito, y el
componente toxina o los fragmentos de la misma pueden portar cada
uno una pareja de unión. Cuando se expresan en el mismo
compartimento de una planta, o cuando se encuentran entre sí, estos
dominios de unión pueden permitir después el ensamblaje de un
patogenicida molecular con todas las propiedades requeridas a partir
de los componentes. Cualquier experto en la técnica reconocerá que
esto se puede lograr por otros medios que los descritos antes que se
proponen como ejemplos para ilustrar mejor el principio del
ensamblaje in vivo y no se pretende que sean tomados como
limitantes de una descripción exhaustiva.
Cualquier experto en la técnica también
reconocerá que los diversos componentes de la presente invención
pueden ser expresados de tal manera que estén sobre la superficie de
una tercera proteína portadora, entre los portadores adecuados se
incluyen glutatión S-transferasa (GST) codificada
por Schistosoma japonicum (Smith y Johnson, 1988), la
proteína de la envuelta del TMV, la proteína de unión a maltosa y la
tiorredoxina (LaVallie y col., 1993) u otras proteínas.
Además, cualquiera de los componentes de la
presente invención puede ser etiquetado con un fluoróforo codificado
genéticamente, entre los fluoróforos adecuados se incluyen, pero no
están limitados a, la proteína fluorescente verde (GFP) de
Aequoria victoria. Este enfoque sería especialmente útil para
controlar la localización de un patógeno o un patogenicida molecular
durante la infección.
Si la proteína o las proteínas de fusión son
expresadas en un organismo heterólogo para la producción de la
proteína o las proteínas, puede ser necesario modificar el
constructo génico con el fin de equiparar la preferencia del
organismo por el codón y separar las unidades de ARNm que reduzcan
la estabilidad del transcrito.
Todos los componentes de los patogenicidas
moleculares descritos en esta invención pueden ser transformados por
separado en líneas vegetales que después pueden ser cruzadas
sexualmente para dar vástagos que produzcan los patogenicidas
moleculares en una forma funcional.
Cualquier experto en la técnica reconocerá que
los anticuerpos, péptidos y toxinas pueden ser combinados de
diversas formas y codificados en diferentes plásmidos para producir
proteínas que tengan el efecto deseado sobre el patógeno. Cualquier
experto en la técnica también reconocerá que el ensamblaje de los
patogenicidas moleculares a partir de subunidades codificadas
genéticamente de forma individual puede ser logrado mediante
numerosos métodos.
Virus, bacterias, micoplasmas, hongos, nematodos,
insectos y otros patógenos.
La presente invención también se refiere a
vectores, concretamente plásmidos, cósmidos, virus, bacteriófagos y
otros vectores utilizados convencionalmente en ingeniería genética
que contienen un polinucleótido según la invención o cualquiera de
los constructos génicos descritos antes. Los métodos que son bien
conocidos por los expertos en la técnica pueden ser utilizados para
construir diversos plásmidos y vectores; ver, por ejemplo, las
técnicas descritas en Sambrook, Molecular Cloning A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbor Laboratory (1989) N.Y. y Ausubel, Current
Protocols in Molecular Biology, Green Publishing Associates and
Wiley Interscience, N.Y. (1989), (1994). Alternativamente, los
polinucleótidos y vectores de la invención pueden ser reconstituidos
en liposomas para la liberación en las células diana.
En una realización preferida, el polinucléotido
presente en el vector está conectado a elementos reguladores que
permiten la expresión del polinucleótido en células procarióticas
y/o eucarióticas. La expresión comprende la transcripción de la
molécula de ácido nucleico preferiblemente en un ARN traducible. Los
elementos reguladores que aseguran la expresión en células
procarióticas y/o eucarióticas son bien conocidos por los expertos
en la técnica. En el caso de las células eucarióticas comprenden
normalmente promotores que aseguran el inicio de la transcripción y
opcionalmente señales de poli-A que aseguran la
terminación de la transcripción y la estabilización del transcrito,
por ejemplo, aquellos del ARN 35S del Virus del Mosaico de la
Coliflor (CaMV). Con respecto a esto, la persona experta en la
técnica apreciará fácilmente que los polinucleótidos que codifican
al menos uno de los dominios descritos antes de las proteínas de
fusión o el patogenicida de la invención pueden codificar todos los
dominios o sólo uno. Del mismo modo, dichos polinucleótidos pueden
estar bajo el control del mismo promotor o pueden estar controlados
por separado para la expresión. Otros promotores comúnmente
utilizados son el promotor del virus Mosaico de la Escrofularia, el
promotor de la poliubiquitina, y el promotor de la actina para la
expresión ubicua. Las señales de terminación empleadas normalmente
son de Nopalina Sintasa o del gen 35S de CaMV. Se ha demostrado que
un intensificador traduccional vegetal utilizado a menudo es la
secuencia omega de TMV, la inclusión de un intrón
(Intron-1 del gen Shrunken del maíz, por ejemplo)
incrementa los niveles de expresión hasta 100 veces. (Maiti y col.,
Transgenic Research 6 (1997), 143-156; Ni y col.;
Plant Journal 7 (1995), 661-676). Entre los
elementos reguladores adicionales se pueden incluir intensificadores
transcripcionales así como traduccionales. Los posibles elementos
reguladores que permiten la expresión en células huésped
procarióticas comprenden, v.g. el promotor P_{L}, lac, trp
o tac en E. coli, y los ejemplos de los elementos
reguladores que permiten la expresión en células huésped
eucarióticas son el promotor AOX1 o GAL1 en levadura o
el promotor de CMV, SV40, RSV (virus del Sarcoma de Rous), el
intensificador de CMV, el intensificador de SV40 o el intrón de la
globina en células de mamíferos y otros animales. En este contexto,
se conocen en la técnica vectores de expresión adecuados tales como
el vector pcDV1 de expresión de ADNc de Okayama-Berg
(Pharmacia), pCDMB8, pRc/CMV, pcDAN1, pcDNA3
(In-vitrogene), pSPORT1 (GIBCO BRL). Ventajosamente,
los vectores de la invención descritos antes comprenden un marcador
seleccionable y/o puntuable. Los genes marcadores seleccionables
útiles para la selección de huéspedes transformados, por ejemplo
células vegetales, callos, tejido vegetal y plantas son bien
conocidos por los expertos en la técnica y comprenden, por ejemplo,
resistencia anti-metabolitos como base de selección
de dhfr, que confiere resistencia al metotrexato (Reiss, Plant
Physiol. (Life Sci. Adv.) 13 (1994), 143-149); npt,
que confiere resistencia a los aminoglicosidos neomicina, kanamicina
y paromicina (Herrera-Estrella, EMBO J. 2 (1983),
987-995) e higro que confiere resistencia a
higromicina (Marsh, Gene 32 (1984), 481-485). Se han
descrito genes seleccionables adicionales, es decir trpB, que
permite que las células utilicen indol en lugar de triptófano; hisD,
que permite que las células utilicen histinol en lugar de histidina
(Hartman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85 (1988), 8047);
manosa-6-fosfato isomerasa que
permite que las células utilicen manosa (WO 94/20627 y ODC (ornitina
descarboxilasa) que confiere resistencia al inhibidor de la ornitina
descarboxilasa,
2-(difluorometil)-DL-ornitina, DFMO
(McConlogue, 1987, En: Current Communications in Molecular Biology,
Cold Spring Harbor Laboratory ed.) o desaminasa de Aspergillus
terreus que confiere resistencia a Blasticidina S (Tamura,
Biosci. Biotechnol. Biochem. 59 (1995),
2336-2338).
2336-2338).
Los marcadores puntuables útiles también son
conocidos por los expertos en la técnica y son asequibles
comercialmente. Ventajosamente, dicho marcador es un gen que
codifica la luciferasa (Giacomin, PI: Sci. 116 (1996),
59-72; Scikantha, J. Bact. 178 (1996), 121), la
proteína verde fluorescente (Gerdes, FEBS Lett. 389 (1996),
44-47) o la \beta-glucuronidasa
(Jefferson, EMBO J. 6 (1987), 3901-3907). Esta
realización es particularmente útil para un rastreo simple y rápido
de las células, tejidos y organismos que contienen un vector de la
invención.
La presente invención se refiere adicionalmente a
células huésped que comprenden un vector como se ha descrito antes o
un polinucleótido según la invención. El vector o polinucleótido
según la invención que está presente en la célula huésped puede
estar integrado en el genoma de la célula huésped o puede ser
mantenido de alguna forma extracromosómicamente.
La células huésped puede ser cualquier célula
procariótica o eucariótica, tal como una célula bacteriana, de
insecto, fúngica, vegetal o animal. Se prefieren las células
fúngicas, por ejemplo, aquellas del género Saccharomyces, en
particular aquellas de la especie S. Cerevisiae.
Otro sujeto de la invención es un método para la
preparación de las proteínas de fusión y los patogenicidas descritos
antes que comprende el cultivo de células huésped según la invención
que, debido a la presencia de un vector o un polinucleótido según la
invención son capaces de expresar semejante proteína, en condiciones
que permiten la expresión y opcionalmente el ensamblaje de la
proteína de fusión o el patogenicida y la recuperación de la
proteína así producida del cultivo. Dependiendo de los constructos
específicos y de las condiciones utilizadas, la proteína puede ser
recuperada de las células, del medio de cultivo o de ambos. Para la
persona experta en la técnica es bien sabido que no sólo es posible
expresar una proteína nativa sino también expresar la proteína en
forma de polipéptidos de fusión o añadir secuencias señal que
dirigen la proteína a compartimentos específicos de la célula
huésped, v.g., asegurando la secreción del péptido en el medio de
cultivo, etc. Además, semejante proteína y fragmentos de la misma
pueden ser sintetizados químicamente y/o modificados según los
métodos normalizados descritos, por ejemplo
aquí.
aquí.
La presente invención se refiere además a
patogenicidas moleculares codificados por los polinucleótidos según
la invención o producidos mediante el método descrito antes. En este
contexto, también se entiende que las proteínas de fusión y los
patogenicidas según la invención pueden ser modificados
adicionalmente mediante métodos convencionales conocidos en la
técnica.
Los constructos de fusión son expresados en
plantas o bien establemente en plantas transgénicas o bien
transitoriamente bajo el control de cualquier tipo de promotor que
sea activo en las plantas. Para la resistencia a largo plazo en
plantas huésped, se prefiere una producción con elevado rendimiento
de proteínas recombinantes, expresión
estable.
estable.
En general, tales elementos reguladores
comprenden un promotor activo en células vegetales. Para obtener la
expresión en todos los tejidos de una planta transgénica, se
utilizan preferiblemente promotores constitutivos, tales como el
promotor 35S de AcMV (Odell, Nature 313 (1985),
810-812) o promotores de los genes de poliubicuitina
de maíz (Christensen, Plant Mol. Biol. 18 (1982),
675-689). Con el fin de lograr la expresión en
tejidos específicos de una planta transgénica es posible utilizar
promotores específicos de tejidos (ver, v.g., Stockhaus, EMBO J. 8
(1989), 2245-2251). Son ejemplos adicionales:
- a)
- Elementos de control de la expresión (v.g. los promotores enumerados más abajo en b a f, las secuencias intensificadoras, los intensificadores transcripcionales y traduccionales, los terminadores de la transcripción, los sitios de poliadenilación etc.) y un marcador seleccionable si fuera necesario.
- b)
- Promotores constitutivos tales como CaMV-35S (Benfey y col., 1989) y el promotor nos (Mitra y Gynheung, 1989).
- c)
- Promotores subgenómicos virales.
- d)
- Promotores específicos de tejidos y promotores quiméricos (Ni y col., 1995), (Comai y col., 1990).
- e)
- Promotores inducibles (Caddick y col., 1998).
- f)
- Sistemas de expresión transitoria (Kapila y col., 1997).
Son conocidos los promotores que son activos
específicamente en tubérculos de patatas o en semillas de diferentes
especies vegetales, tales como maíz, Vicia, trigo, cebada etc. Los
promotores inducibles pueden ser utilizados con el fin de poder
controlar exactamente la expresión. Un ejemplo de promotores
inducibles son los promotores de genes que codifican proteínas de
choque térmico. Asimismo se han descrito elementos reguladores
específicos de microesporas y sus usos (WO 96/16182). Además, se
puede emplear el sistema Tet inducible químicamente (Gatz, Mol. Gen.
Genet. 227 (1991); 229-237). Otros promotores
adecuados adicionales son conocidos por las personas expertas en la
técnica y se describen, v.g. en Ward (Plant Mol. Biol. 22 (1993),
361-366). Los elementos reguladores pueden
comprender adicionalmente intensificadores transcripcionales y/o
traduccionales funcionales en células vegetales. Además, entre los
elementos reguladores se pueden incluir señales de terminación de la
transcripción, tales como una señal de poli-A, que
conduce a la adición de una cola de poli-A al
transcrito que puede mejorar su estabilidad.
Además, en principio es posible modificar la
secuencia codificadora de tal manera que la proteína sea localizada
en cualquier compartimento deseado de la célula vegetal. Entre estos
se incluyen el retículo endoplasmático, la vacuola, la mitocondria,
los plástidos, el apoplasto, el citoplasma etc. Los métodos para
llevar a cabo estas modificaciones y para que las secuencias señal
aseguren la localización en un compartimento deseado son bien
conocidos por las personas expertas en la técnica.
Los métodos para la introducción del ADN foráneo
en las plantas también son bien conocidos en la técnica. Entre estos
se incluyen, por ejemplo, la transformación de células o tejidos
vegetales con T-ADN utilizando Agrobacterium
tumefaciens o Agrobacterium rhizogenes, la fusión de
protoplastos, la transferencia génica directa (ver, v.g.
EP-A 164 575), la inyección, la electroporación, los
métodos biolísticos como el bombardeo de partículas y otros métodos
conocidos en la técnica. Los vectores utilizados en el método de la
invención pueden contener elementos funcionales adicionales, por
ejemplo secuencias "borde izquierdo" y "borde derecho" del
T-ADN de Agrobacterium que permiten la
integración estable en el genoma de la planta. Además, los métodos y
vectores son conocidos por el experto en la técnica que permite la
generación de plantas transgénicas libres de marcadores, es decir,
el gen seleccionable y puntuable se pierde en una cierta fase del
desarrollo de la planta o de la reproducción de la planta. Esto se
puede lograr, por ejemplo, mediante transformación simultánea
(Lyzink, Plant Mol. Biol. 13 (1989), 151-161; Peng,
Plant Mol. Biol. 27 (1995), 91-104) y/o utilizando
sistemas que emplean enzimas capaces de promover la recombinación
homóloga en plantas (ver, v.g. WO 97/08331; Bayley, Plant Mol. Biol.
18 (1992), 353-361); Lloyd, Mol. Gen. Genet. 242
(1994), 653-657; Maeser, Mol. Gen. Genet. 230
(1991), 170-176; Onouchi, Nucl. Acids Res. 19
(1991), 6373-6378). Los métodos para la preparación
de vectores apropiados los describe, v.g. Sambrook (Molecular
Cloning; A Laboratory Manual, 2ª Edición (1989), Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY). Las cepas de
Agrobacterium tumefaciens y los vectores adecuados así como
la transformación de Agrobacteria y los medios de crecimiento y
desarrollo apropiados son bien conocidos por los expertos en la
técnica y se describen en la técnica anterior (GV3101 (pMK90RK),
Koncz, Mol. Gen. Genet. 204 (1986), 383-396; C58C1
(pGV 3850kan), Deblaere, Nucl. Acid Res. 13 (1985), 4777; Bevan,
Nucleic. Acid Res. 12 (1984), 8711; Koncz, Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 86 (1989), 8467-8471; Koncz, Plant Mol. Biol. 20
(1992), 963-976; Koncz, Specialised vectors for gene
tagging and expression studies. En: Plant Molecular Biology Manual
Vol. 2, Gelvin y Schilperoort (Eds.), Dordrecht, Holanda; Kluwer
Academic Publ. (1994), 1-22;
EP-A-120 516; Hoekema: The Binary
Plant Vector System, Offsetdrukkerij Kanters B.V., Alblasserdam
(1985), Capítulo V, Fraley, Crit. Rev. Plant Sci., 4,
1-46; An, EMBO J. 4 (1985),
277-287). Aunque en el método de la invención se
prefiere el uso de Agrobacterium tumefaciens, se pueden
utilizar otras cepas de Agrobacterium, tales como
Agrobacterium rhizogenes, por ejemplo si se desea el fenotipo
conferido por dicha cepa.
Los métodos para la transformación utilizando
métodos biolísticos son bien conocidos por los expertos en la
técnica; ver, v.g., Wan, Plant Physiol. 104 (1994),
37-48; Vasil, Bio/Technology 11 (1993),
1553-1558 y Christou (1996) Trends in Plant Science
1, 423-431. La microinyección se puede realizar como
se describe en Potrykus y Spangenberg (eds.), Gene Transfer To
Plants. Springer Verlag, Berlin, NY (1995).
La transformación de la mayoría de las plantas
dicotiledóneas es posible con los métodos descritos antes. Pero
también para la transformación de monocotiledóneas se han
desarrollado numerosas técnicas de transformación útiles. Entre
estas se incluyen la transformación utilizando métodos biolísticos,
v.g., como se ha descrito antes así como la transformación de
protoplastos, electroporación de células parcialmente
permeabilizadas, introducción de ADN utilizando fibras de vidrio,
etc.
La transformación se puede realizar utilizando
cualquier método que conduzca a la expresión de uno o varios
constructos en una planta y estos métodos pueden ser utilizados para
la transformación estable en la que se incorpora un gen de interés
en el ADN de la planta huésped o en la que un constructo es
expresado transitoriamente. Entre los ejemplos de la tecnología de
la transformación se incluyen:
- a)
- Transformación mediada por Agrobacterium tumefaciens o Agrobacterium rhizogenes (Turpen y col., 1993; White, 1992): basada en la inserción de un ADN foráneo en el genoma de la planta llevada a cabo en un ADN plasmídico dentro de la agrobacteria. El gen foráneo es insertado en el genoma de la planta junto con las secuencias plasmídicas bacterianas.
- b)
- Bombardeo de partículas (Sanford y col., 1990), (Klein y Fitzpatrick-McElligot, 1993) o procedimiento biolístico (Furth, 1997): En el bombardeo de partículas se utilizan partículas recubiertas con el ADN que penetra en la célula vegetal a alta velocidad y el ADN es incorporado en el genoma del huésped mediante procedimientos de recombinación del huésped. Además de los procedimientos biolísticos de bombardeo de partículas también se incluyen los métodos de inyección.
- c)
- Electroporación de tejidos (Chowira y col., 1995; D'Halluin y col., 1992); bajo la influencia de un campo eléctrico, el ADN penetra por los poros de la membrana celular de la planta y es incorporado en el genoma de la planta mediante recombinación.
- d)
- Uso de liposomas o métodos que incrementan la absorción del ADN libre (Spörlein y Koop, 1991; White, 1992).
- e)
- Cualquier método para la integración de ADN foráneo en una célula vegetal dando como resultado plantas transformadas transitoriamente o establemente.
La presente invención se refiere a células
vegetales transgénicas que contienen un polinucleótido, un vector o
una composición de vectores de la invención. Preferiblemente, dicho
polinucleótido o vector está establemente integrado en el
genoma.
Como resulta inmediatamente evidente para un
experto en la técnica, los vectores de la presente invención pueden
llevar moléculas de ácido nucleico que codifiquen los dominios del
anticuerpo, la proteína de fusión o el patogenicida de la invención
ya sea solos o combinados. Lo mismo se aplica a las células
vegetales, tejidos vegetales y plantas descritas antes,
transformadas con ellos. Del mismo modo, dichas moléculas de ácido
nucleico pueden estar bajo el control de los mismos elementos
reguladores o pueden estar controladas separadamente para su
expresión. Con respecto a esto, la persona experta en la técnica
apreciará fácilmente que las moléculas de ácido nucleico que
codifican los dominios de la proteína de fusión o el patogenicida
pueden ser expresadas en forma de un ARNm sencillo como fusiones
transcripcionales y opcionalmente traduccionales. Esto significa que
los dominios son producidos como polipéptidos separados o en última
opción como un polipéptido de fusión que es madurado adicionalmente
a las proteínas individuales, por ejemplo por medio de un sitio de
escisión para proteinasas que haya sido incorporado entre las
secuencias de aminoácidos de ambas proteínas. Los dominios de la
proteína resultantes pueden ser auto-ensamblados
después in vivo. Por supuesto, los dominios pueden ser
expresados en forma de un polipéptido bi- o multifuncional,
preferiblemente dispuesto por medio de un conector peptídico que
permita ventajosamente suficiente flexibilidad de ambas proteínas.
Preferiblemente dicho conector peptídico comprende aminoácidos
plurales, hidrófilos, unidos a péptidos de una longitud suficiente
para abarcar la distancia entre el extremo
C-terminal de una de dichas proteínas y el extremo
N-terminal de la otra de tales proteínas cuando
dicho polipéptido adopta una conformación adecuada para la actividad
biológica de ambas proteínas cuando se disponen en solución acuosa
en la célula vegetal. Se pueden encontrar ejemplos de las
estrategias de expresión descritas antes en la literatura, v.g. para
el ARNm dicistrónico (Reiniciación) en Hefferon, J. Gen. Virol. 78
(1997), 3051-3059, las proteínas de fusión se
describen en Brinck-Peterson, Plant Mol. Biol. 32
(1996), 611-620 y Hotze, FEBS Lett. 374 (1995),
345-350; se estudian proteínas bifuncionales en
Lamp, Biochem. Biophys. Res. Com. 244 (1998),
110-114 y Dumas, FEBS Lett. 408 (1997),
156-160 y el péptido conector y la proteasa son
referidos en Doskeland, Biochem. J. 313
(1996), 409-414.
(1996), 409-414.
En una realización preferida de la invención, la
célula vegetal transgénica comprende un marcador seleccionable. Como
se ha descrito antes, se pueden emplear diversos marcadores
seleccionables según la presente invención. Ventajosamente, se
pueden utilizar marcadores seleccionables que sean adecuados para la
selección directa de plantas transformadas, por ejemplo el gen de la
fosfinotricin-N-acetiltransferasa
cuyo producto génico destoxifica el herbicida
L-fosfinotricina (glufosinato o BASTA); ver, v.g.,
De Block, EMBO J. 6 (1987), 2513-1518 y Dröge,
Planta 187 (1992), 142-151.
La presencia y la expresión de los
polinucléotidos o vectores en las células de la planta transgénica
conducen a la síntesis de una proteína de fusión, anticuerpo o
patogenicida de la invención o al ensamblaje de los mismos que tiene
una influencia sobre la resistencia al patógeno en las plantas que
contienen semejantes células.
Así, la presente invención también se refiere a
plantas transgénicas y tejidos vegetales que comprenden células
vegetales transgénicas según la invención. Debido a la expresión de
una proteína de fusión, el anticuerpo contra la proteína del
movimiento y/o la replicasa viral o el patogenicida de la invención
o sus dominios, v.g. en compartimentos celulares y/o tejido vegetal
estas plantas transgénicas pueden mostrar diversas modificaciones
fisiológicas, de desarrollo y/o morfológicas en comparación con las
plantas de tipo salvaje. Ventajosamente, estas plantas transgénicas
muestran una resistencia contra un patógeno al que la
correspondiente planta de tipo salvaje era susceptible.
En general, las plantas que pueden ser
modificadas según la invención pueden derivar de cualquier especie
de planta deseada. Pueden ser plantas monocotiledóneas o plantas
dicotiledóneas, preferiblemente pertenecen a especies vegetales de
interés en agricultura, cultivo para madera u horticultura, tales
como plantas de cultivos (v.g. maíz, arroz, cebada, trigo, centeno,
avenas etc.), patatas, plantas productoras de aceite (v.g. aceite de
colza, girasol, cacahuete, soja, etc.) algodón, remolacha, caña de
azúcar, plantas leguminosas (v.g. judías, guisantes etc.) plantas
productoras de madera, preferiblemente árboles, etc.
En otro aspecto más, la invención también se
refiere a las partes cosechables y al material de propagación de las
plantas transgénicas según la invención. Las partes cosechables
pueden ser en principio cualquiera de las partes útiles de una
planta, por ejemplo, hojas, tallos, frutos, flores, semillas, raíces
etc. Entre el material de propagación se incluyen, por ejemplo,
semillas, frutos, esquejes, plántulas, tubérculos, rizomas etc.
Además, la presente invención se refiere a un
estuche que comprende los anticuerpos, proteínas de fusión,
patogenicida, polinucleótidos o vectores descritos antes. El estuche
de la invención puede contener ingredientes adicionales tales como
marcadores de selección y componentes para medios selectivos
adecuados para la generación de las células vegetales, tejidos
vegetales o plantas transgénicos. El estuche de la invención puede
ser utilizado ventajosamente para llevar a cabo el método de la
invención y podría ser empleado, entre otros, en una variedad de
aplicaciones, v.g. en el campo del diagnóstico o como herramienta de
redireccionamiento. Las partes del estuche de la invención pueden
ser empaquetadas individualmente en viales o combinadas en
recipientes o unidades de múltiples recipientes. La fabricación del
estuche sigue preferiblemente procedimientos normalizados que son
conocidos por los expertos en la técnica. El estuche o sus
ingredientes según la invención pueden ser utilizados en cultivos de
células vegetales y tejidos vegetales, por ejemplo en agricultura.
Se espera que el estuche de la invención y sus ingredientes sean muy
útiles en la reproducción de nuevas variedades, por ejemplo, de
plantas que muestren propiedades mejoradas tales como las descritas
aquí.
También resulta inmediatamente evidente para un
experto en la técnica que los polinucléotidos y vectores de la
presente invención pueden ser empleados para producir plantas
transgénicas con un rasgo adicionalmente deseable debido a la
ingeniería genética (ver para la revisión TIPTEC Plant Product &
Crop Biotechnology 13 (1995), 312-397). Este puede
ser, por ejemplo, una resistencia adquirida a otros patógenos o
mejoras de la calidad de las plantas que comprenden (i) tolerancia a
herbicidas (DE-A-3701623; Stalker,
Science 242 (1988), 419), (ii) resistencia a insectos (Vaek, Plant
Cell 5 (1987), 159-169), (iii) resistencia a virus
(Powell, Science 232 (1986), 738-743; Pappu, World
Journal of Microbiology & Biotechnology 11 (1995),
426-437; Lawson, Phytopathology 86 (1996), 56
supl.), (vi) resistencia al ozono (Van Camp, Biotech, 12 (1994),
165-168), (v) mejora de la conservación de los
frutos (Oeller, Science 254 (1991), 437-439), (vi)
mejora de la composición y/o producción del almidón (Stark, Science
242 (1992), 419; Visser, Mol. Gen. Genet. 225 (1991),
289-296), (vii) alteración de la composición de
lípidos (Voelker, Science 257 (1992), 72-74), (viii)
producción de (bio)polímeros (Poirer, Science 256 (1992),
520-523), (ix) alteración del color de las flores,
v.g. manipulando la ruta biosintética de la antocianina y los
flavonoides (Meyer, Nature 330 (1987), 667-678, WO
90/12084), (x) resistencia a bacterias, insectos y hongos (Duering,
Molecular Breeding 2 (1996), 297-305; Strittmatter,
Bio/Technology 13 (1995), 1085-1089; Estruch, Nature
Biotechnology 15 (1997), 137-141), (xi) inducción y
mantenimiento de la esterilidad masculina y/o femenina
(EP-A1 0 412 006; EP-A1 0 223 399;
WO 93/25695), y (xii) remedio de suelos contaminados (Cunningham,
TIBTECH 13
(1995), 393-397).
(1995), 393-397).
Estas y otras realizaciones son descritos y
abarcados por medio de la descripción y los ejemplos de la presente
invención. Se puede recabar literatura adicional concerniente con
cualquiera de los métodos, usos y compuestos que se van a emplear
según la presente invención de bibliotecas públicas, utilizando por
ejemplo dispositivos electrónicos. Por ejemplo se puede utilizar la
base de datos pública "Medline" que está disponible en
Internet, por ejemplo en
http:\www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/medline.html. Son conocidas por
los expertos en la técnica bases de datos y direcciones adicionales,
tales como http:\www.ncbi.nim.nih.gov/, http:\www.infobiogen.fr/,
http:\www.fmi.ch.biology/research_tools.html, http:\www.tigr.org/, y
también pueden ser obtenidas utilizando, v.g.,
http://www.lycos.com. Una vista global de la información de
patentes en biotecnología y una vista de conjunto de las fuentes
relevantes de la información de patentes útiles para la búsqueda
retrospectiva y para el conocimiento actual se dan en Berks, TIBTECH
12 (1994), 352-364.
La Figura 1 muestra una descripción de diversas
orientaciones para la presentación del patogenicida molecular en
membranas celulares. Los patogenicidas moleculares recombinantes
pueden ser dirigidos por señales celulares y expresados en diversas
orientaciones sobre las membranas celulares, por ejemplo: A: cuando
la proteína recombinante da al citosol o al espacio extracelular
después de la fusión a un dominio transmembrana o tras la
modificación lipídica post-traduccional y B: cuando
la proteína recombinante es fusionada a una proteína con 4 dominios
transmembrana. En C y D se muestran posibles orientaciones de
toxinas. Además, la toxina y/o el fragmento de anticuerpo
recombinante pueden ser fusionados al extremo C de cualquiera de las
estructuras de proteína ejemplares.
N: amino terminal de la proteína;
C: carboxi terminal de la proteína; tm: dominio transmembrana; rAb:
fragmento de anticuerpo recombinante o dominio de
unión.
La Figura 2 muestra constructos ejemplares para
el anclaje a la membrana de scFv24 en la membrana plasmática de la
célula vegetal (ver ejemplo 1). 35SS; promotor 35S del Virus del
Mosaico de la Coliflor con un intensificador duplicado; CHS
5'-UT: región no traducida 5' de la chalcona
sintasa: Péptido líder; secuencia líder murina original de la cadena
ligera del anticuerpo monoclonal parental 24; V_{L}: Dominio
variable de la cadena ligera del anticuerpo monoclonal parental 24;
V_{H}: Dominio variable de la cadena pesada del anticuerpo
monoclonal parental 24; Conector: secuencia del conector de 14
aminoácidos; c-myc: secuencia etiquetada con el
epítopo c-myc; TcR\beta: Cadena \beta del
receptor de las células T humano; PDGFRTM: dominio transmembrana del
receptor del factor de crecimiento derivado de plaquetas; Term;
secuencia de terminación del virus del mosaico de la Coliflor.
La Figura 3 muestra constructos ejemplares para
la presentación del patogenicida molecular dando al citoplasma
celular. 35SS: promotor 35S del Virus del Mosaico de la Coliflor con
un intensificador duplicado; CHS 5'-UT: región no
traducida 5' de la chalcona sintasa: V_{L}: Dominio variable de la
cadena ligera del anticuerpo monoclonal parental 24; V_{H}:
Dominio variable de la cadena pesada del anticuerpo monoclonal
parental 24; Conector 1: secuencia del conector de 14 aminoácidos
(Genex 212); Conector 2: secuencia del conector de 10 aminoácidos
(Gly4Ser)2; Term; secuencia de terminación del virus del
mosaico de la Coliflor.
La Figura 4 muestra constructos ejemplares para
las proteínas de fusión al anticuerpo de la proteína de la envuelta
viral y diversas proteínas de fusión
anticuerpo-proteína portadoras potenciales; scFv24:
anticuerpo de cadena sencilla derivado del mAb24 monoclonal parental
que reconoce un neotopo sobre la superficie de viriones de TMV
intactos; GST: Glutation S-transferasa de
Schistosoma japonicum; Secuencia omega: región no traducida
5' del virus del Mosaico del Tabaco; conector: secuencia conectora
de 10 aminoácidos (Gly_{4}Ser)_{2}; His6: secuencia
etiquetada con el epítopo de 6 restos histidina; 35SS: promotor 35S
del Virus del Mosaico de la Coliflor con un intensificador
duplicado; TRXec: Tiorredoxina de Escherichia coli; TRXnt;
Tiorredoxina de Nicotiana tabacum; CP: monómero de la
proteína de la envuelta del virus del Mosaico del Tabaco; TMV 3' UT:
región no traducida 3' del Virus del Mosaico del tabaco.
La Figura 5 muestra la estrategia y los
constructos ejemplares para el ensamblaje del patogenicida molecular
in vivo utilizando una interacción anticuerpo:antígeno como
pareja de unión para el ensamblaje in vivo. Los dos
participes en la unión son una etiqueta epitópica y un anticuerpo de
elevada afinidad que reconoce específicamente esta etiqueta
epitópica. Para ensamblar un complejo de patogenicida
molecular-proteína, el anticuerpo específico del
epítopo es fusionado genéticamente a un anticuerpo específico del
patógeno y la etiqueta del epítopo es fusionada genéticamente a la
secuencia de la toxina. Ambas proteínas recombinantes son expresadas
después en el mismo compartimento celular. El anticuerpo específico
del epítopo se une al epítopo expresado sobre la superficie de la
toxina. Esta interacción de alta afinidad da después un complejo
patogenicida molecular-proteína, que reconoce
específicamente el patógeno y porta una actividad tóxica. El
conector 4 puede codificar sitios de escisión para proteasas
específicas. Los anticuerpos específicos del epítopo y del patógeno
también pueden ser incluidos en los constructos en la misma
orientación pero donde el anticuerpo específico del epítopo preceda
al anticuerpo específico del patógeno en la dirección 5' a 3'.
A: esquema del ensamblaje del
complejo patogenicida molecular-proteína en un
compartimento celular; B: Constructos ejemplares que muestran dos
posibles disposiciones (Ab1 y Ab2) de los dominios V_{L} y V_{H}
individuales de los fragmentos de anticuerpo tanto específico del
patógeno como específico del epítopo; C: dos posibles disposiciones
(Tox 1 y Tox 2) para las proteínas de fusión
epítopo-toxina.
La Figura 6 muestra la estrategia y los
constructos ejemplares para el ensamblaje del patogenicida molecular
in vivo utilizando una interacción cadena pesada de
anticuerpo:cadena ligera de anticuerpo como parejas de unión para el
ensamblaje in vivo. Las dos parejas de unión son una cadena
pesada de anticuerpo y una cadena ligera de anticuerpo que reconoce
específicamente esta etiqueta epitópica. Para ensamblar un complejo
de patogenicida molecular-proteína, el anticuerpo
específico del epítopo es fusionado genéticamente a un extremo C de
una cadena pesada del anticuerpo específico del patógeno. Tanto la
cadena pesada como la cadena ligera del anticuerpo recombinante son
expresadas después en el mismo compartimento celular, donde son
ensambladas por medio de puentes disulfuro para dar un complejo
patogenicida molecular-proteína, que reconoce
específicamente el patógeno y porta una actividad tóxica. El
conector 1 puede codificar sitios de escisión para proteasas
específicas o el anticuerpo específico del epítopo que reconoce una
toxina etiquetada con un epítopo. Asimismo, la toxina puede ser
fusionada al extremo N de la cadena pesada del anticuerpo utilizando
un conector 1, o el extremo N o C de la cadena ligera.
A: esquema del ensamblaje final del
patogenicida molecular ensamblado. B: Constructos
ejemplares.
La Figura 7 muestra un constructo de ADNc para el
redireccionamiento y la expresión de scFv24 sobre las membranas
celulares de la planta. Los ADNc de los dominios de la cadena ligera
(V_{L}) y pesada (V_{H}) variables de mAb24 conectados por un
conector de 14 aminoácidos fueron fusionados al dominio
transmembrana TcR\beta humano y clonados en los sitios de
restricción EcoRI y XbaI del vector de expresión de la
planta pSS (33). La secuencia de ADN del fragmento EcoRI/XbaI de
pscFV24-TcR\beta se representa en la SEC ID NUM:
3. 35SS = promotor CaMV-35S doblemente
intensificado; CHS-5'-UT = región no
traducida 5' de la chalcona sintasa; LP = secuencia señal de la
cadena ligera mAb24 murina; c-myc = etiqueta del
epítopo con c-myc; TM = dominio transmembrana; TCaMV =
secuencia de terminación CaMV.
La Figura 8 muestra los niveles de
scFv24-TcR\beta funcional en líneas celulares en
suspensión de N. Tabacum cv. BY-2
transgénico. Los niveles de producción de scFv24 en los extractos de
células de BY-2 de tabaco y el sobrenadante de
cultivo fueron analizados mediante ELISA utilizando los antisueros
anti-mAb24 e indicados como ng de scFv24 por g de
material celular.
T1_{BY-2}-T2_{BY-2}
= líneas de células en suspensión BY-2 transgénicas
que producen scFv24-TcR\beta.
La Figura 9 muestra análisis de transferencia
Western de una planta de tabaco T_{1} que produce
scFv24-TcR\beta. Se separaron cantidades
equivalentes de proteína de los fluidos de lavado intercelular y de
proteínas solubles totales de una planta T_{1} que producía
scFv24-TcR\beta (calle 1 y 2) en un gel
SDS-PAGE reductor al 12% (p/v) y se transfirieron a
nitrocelulosa. La proteína recombinante fue detectada utilizando un
antisuero anti-mAb24 de conejo como anticuerpo
primario y anticuerpo anti-conejo de cabra conjugado
con fosfatasa alcalina como anticuerpo secundario y seguido de
tinción con NBT/BCIP. Se indican los pesos moleculares estimados de
proteínas recombinantes (Marcador). IWF = fluido de lavado
intercelular; TSP = proteína soluble total.
La Figura 10 muestra la localización subcelular
de scFv24-TcR\beta anclado a membrana en
protoplastos de N. Tabacum cv. BY-2
transgénico mediante inmunofluorescencia indirecta. Los protoplastos
fijados de las células BY-2 no transgénicas (A) y de
la línea T2_{BY-2} que producía
scFv24-TcR\beta (B, C, D) fueron marcados
utilizando anticuerpo anti-mAb24 como anticuerpo
primario seguido de un anticuerpo secundario
anti-conejo de cabra conjugado con FITC (A, B, D) o
utilizando anticuerpo anti-TcR\beta humano como
anticuerpo primario, seguido de anticuerpo secundario
anti-ratón de cabra conjugado con FITC (C). Aumento
= X400.
La Figura 11 muestra la localización por
inmunomarcado con oro de scFv24- en hojas de N. Tabacum cv.
Petite Havana SR1 transgénico. Se rastrearon con sonda secciones
ultrafinas de la línea vegetal T4_{SR1} que producía
scFv24-TcR\beta con anticuerpo primario de
antisuero anti-mAb24 de conejo y anticuerpo
secundario anti-conejo de cabra conjugado con
partículas de oro de 12 nm. Las cabezas de flecha indican el
inmunomarcaje con oro de plasma celular y membrana nuclear de la
planta scFv24-TcR\beta anclado a membrana.
La Figura 12 muestra constructos de ADNc para
dirigir a membranas celulares de la planta y expresar en ellas
scFv24 citosólico. El ADN de scFv24, que comprende los dominios de
la cadena ligera variable (V_{L}) y de la cadena pesada (V_{H})
conectados por un conector 212 de 14 aminoácidos (conector 2),
fueron fusionados a los dominios transmembrana
C-terminales utilizando el conector Gly_{4}Ser
(conector 1) y subclonados en el vector de expresión vegetal pSS. A)
Vectores que se dirigen al citoplasma que contienen un dominio
transmembrana C-terminal. B) Vector de control que
se dirige al citoplasma que carece de un dominio transmembrana (la
construcción de este vector es descrita por: Zimmermann y col.,
1998). 35SS = promotor 35 de CaMV intensificado; CHS 5'UT = región
no traducida 5' de la chalcona sintasa; KAR1 = dominio transmembrana
de KAR1 para la integración en el membrana nuclear; mT = dominio
transmembrana del antígeno T medio para la de integración en la
membrana plasmática; cytb5 = dominio transmembrana del citocromo b5
para la integración en la membrana del RE; syn1 = dominio
transmembrana de sinaptobrevina 1 para la integración en la
membrana; His6 = etiqueta de histidina 6; c-myc:
etiquetada epitópica c-myc; TcAMV = secuencia de
terminación de CaMV. La secuencia de ADN del fragmento EcoRI/XbaI de
pscFv24-kar1 se representa en la SEC ID NUM: 12. El
uso del codón del dominio transmembrana KAR1 de levadura fue
adaptado al tabaco, al trigo y al guisante; excepto los codones TGT
(Cys) y CTT (Leu) que son codones poco comunes para el trigo. El
codón ATA para Ile (en el dominio transmembrana) también es un codón
nada frecuente para el trigo y el codón CTG para Leu (en el dominio
transmembrana) es un codón poco común para el guisante y el tabaco,
pero ambos codones son necesarios para introducir un sitio de
restricción Bst1107. La secuencia de ADN del fragmento
EcoRI/XbaI de pscFv24-mT se muestra en
la SEC ID NUM: 13. El uso del codón del dominio transmembrana del
antígeno T medio de polimovirus murino fue adaptado a tabaco, trigo
y guisante. El codón GCG para Ala y el codón CTG para Leu (ambos en
el dominio transmembrana) son codones poco comunes para el tabaco y
el guisante, pero ambos eran necesarios para introducir un sitio de
restricción Eco47-3. La secuencia de ADN del
fragmento EcoRI/XbaI de pscFv24-cytb5
se muestra en la SEC ID NUM: 14. El uso del dominio transmembrana b5
del citocromo de hígado de rata fue adaptado al tabaco, el trigo y
el guisante; excepto que el codón C-terminal (Asp)
que es un codón nada frecuente para el trigo. El codón GCG para Ala
(en el dominio transmembrana) también es un codón nada frecuente
para el guisante y el tabaco y el codón ATA para Ile (en el dominio
transmembrana) es un codón nada frecuente para el trigo pero ambos
codones son necesarios para introducir un sitio de restricción
EcoRV. La secuencia de ADN del fragmento
EcoRI/XbaI de pscFv24-syn1 se
representa en la SEC ID NUM: 15. El uso del codón del dominio
transmembrana de la sinaptobrevina humana fue adaptado al tabaco, el
trigo y el guisante; excepto el último codón (Asp) que es un codón
nada frecuente para el trigo.
La Figura 13 muestra un constructo de ADNc para
la dirección y expresión de scFv24-PE400. El ADNc de
scFv24, que comprende los dominios de la cadena ligera variable
(V_{L}) y de la cadena pesada (V_{H}) conectados por un conector
212 de 14 aminoácidos (conector 2), fueron fusionados al dominio III
de la exotoxina de Pseudomonas C-terminal
utilizando un conector de celobiohidrolasa I (CBH) de Trichoderma
reesi y subclonado en el vector de expresión vegetal pSS. 35SS =
promotor de CaMV-35S intensificado; CHS 5'UT =
región no traducida 5' de chalcona sintasa; LP = secuencia señal de
la cadena ligera de mAb24 murino; conector 1 = conector
Gly_{4}Ser; tag 54 = etiqueta epitópica; TcAMV = secuencia de
terminación de CaMV. La secuencia de ADN del fragmento
EcoRI/XbaI de pscFv24-PE400 se
representa en la SEC ID NUM: 18.
La Figura 14: Patogenicida molecular basado en
una fusión de una cadena sencilla (scFv24) a ARNasa E de E.
coli. Los dos dominios del patogenicida fueron conectados por un
péptido conector Gly-Gly-Gly corto.
Esta composición puede ser modificada de múltiples maneras
utilizando diferentes anticuerpos scFv que se unan a proteínas diana
virales estructurales y no estructurales, a otros genes de ARNasa o
a dominios de los mismos fusionados al extremo N o C de cualquier
ADNc de scFv seleccionado.
La Figura 15 muestra constructos para la
expresión de proteínas de fusión scFv24 en el citoplasma y el RE de
células vegetales. El ADNc de scFv24, que comprende los dominios de
la cadena ligera variable (V_{L}) y de la cadena pesada (V_{H})
conectados por un conector 212 de 14 aminoácidos (conector 2),
fueron fusionados a CP utilizando el conector
(Gly_{4}Ser)_{2} (conector 1) y subclonados en el vector
de expresión vegetal pSS. A) Vectores que se dirigen al citoplasma
que contienen una secuencia His6 o KDEL C-terminal.
B) Vectores de control que se dirigen al citoplasma que carecen de
pareja para la fusión. C) Vector de retención del RE. D) Vector que
se dirige al apoplasto (la proteína de fusión es secretada al
apoplasto y entrará en la célula uniéndose a los viriones de TMV
invasores). 35SS = promotor de CaMV-35S
intensificado; \cdot = región no traducida 5' de TMV; LP =
secuencia del péptido líder de ratón original de codón optimizado de
mAb24; CP = proteína de la envuelta de TMV partícipe en la fusión;
His6 = etiquetado con histidina 6; KDEL = señal de retención del RE;
Pw = región no traducida 3' de TMV. La secuencia de ADN del
fragmento EcoRI/XbaI de CP-scFv24H se
muestra en la SEC ID NUM: 24. La secuencia de ADN del fragmento
EcoRI/XbaI de CP-scFv24K se muestra en
la SEC ID NUM: 25. La secuencia de ADN del fragmento
EcoRI/XbaI de scFv24H se muestra en la SEC ID NUM: 26.
La secuencia de ADN del fragmento EcoRI/XbaI de
scFv24K se muestra en la SEC ID NUM: 27. La secuencia de ADN del
fragmento EcoRI/XbaI de L-CP-scFv24K
se muestra en la SEC ID NUM:28.
La Figura 16 muestra los niveles de proteína de
las proteínas de fusión scFv retenidas en el RE. Los niveles de
N. Tabacum cv. Petite Havana SR1 fueron transformados
transitoriamente con la agrobacteria recombinante conteniendo el
constructo L-CP-scFv24K e incubada
durante tres días. La proteína soluble total fue aislada y los
niveles de proteína de fusión scFv24 funcional fueron cuantificados
en un ELISA específico para TMV e indicados como ng por gramo de
material foliar. La columna representa el valor medio para cuatro
hojas. Se indican las desviaciones
típicas.
típicas.
La Figura 17 muestra el análisis de transferencia
Western de las proteínas de fusión retenidas en el RE. El
L-CP-scFv24K purificado por afinidad
fue separado mediante SDS-PAGE al 12% y las
proteínas fueron transferidas a una membrana de nitrocelulosa. Las
transferencias fueron rastreadas mediante sonda con anticuerpo
primario mAb29 específico de CP seguido de anticuerpo secundario
anti-ratón de cabra y anti-conejo de
cabra conjugados con fosfatasa alcalina y tinción con NBT/BCIP.
Calle 1: Marcador proteico teñido previamente; Calle 2:
L-CP-scFv24K purificado por afinidad
de TMV.
La Figura 18 muestra los niveles de las proteínas
de fusión expresadas en el citoplasma. Se transformaron
transitoriamente hojas de N. benthamiana con la agrobacteria
recombinante y se incubaron durante tres días. La proteína soluble
total fue aislada y los niveles de scFv24 funcional, expresado como
parte de las proteínas de fusión, fueron cuantificados en un ELISA
específico de TMV e indicados como ng por gramo de material foliar.
Cada columna representa el valor medio de cuatro hojas y demuestra
los niveles de proteína de los constructos
CP-scFv24H y scFv24H conteniendo una secuencia His6
C-terminal y los niveles de proteína de los
constructos CP-scFv24K y scFv24K conteniendo una
secuencia KDEL C-terminal. Las desviaciones típicas
se indican con barras.
La Figura 19 muestra la clonación de anticuerpos
específicos de la proteína del movimiento 30K de TMV en el vector de
expresión vegetal pSSH1. Los fragmentos de cadena sencilla obtenidos
mediante la presentación en fagos fueron subclonados en la casete de
expresión BISCA2429 (Fischer y col., (1999) Eur. J. Biochem.
262, 810-816) utilizando sitios de restricción
NcoI/SalI. Los constructos temporales resultantes
(secuencia omega 5'-UTR de TMV, scFv, etiqueta His6)
fueron subclonados en el vector de expresión vegetal pSSH1
utilizando el ensamblaje mediante subclonación con
EcoRI/XbaI del vector final para la transformación y
la expresión vegetal (promotor 35 SS, secuencia omega
5'-UTR de TMV, scFv, etiqueta His6,
3'-UTR y Terminador de CaMV) del scFv
anti-30K.
La Figura 20 muestra la reactividad en ELISA de
10 anticuerpos scFv específicos de 30K diferentes frente a
GST-30K (biotinilada y no biotinilada) y GST (A) y
la Reactividad en ELISA de los mismos 10 fragmentos scFv frente a
cinco dominios Diferentes de la proteína del movimiento 30K
expresada como proteínas de fusión con GST. (B) Los scFv específicos
de 30K fueron seleccionados a partir de una banco de fagos derivado
de ratones inmunizados con GST-30K.
La Figura 21 muestra los restos aminoácido de dos
scFv seleccionados que se unen a la proteína del movimiento 30K de
TMV obtenidos mediante presentación en fagos utilizando ratones
inmunizados con GST-30K para la amplificación basada
en PCR de fragmentos V_{H} y V_{L}. scFv 30-1 =
scFv específico de 30K Núm. 1, scFv 30-2 = scFv
específico de 30K Núm. 2. Los restos aminoácido fueron derivados la
secuenciación del ADNc de los respectivos clones de ADNc de scFv
derivados de fagos como se ha descrito (Figura 19).
La Figura 22 muestra el transcurso del tiempo
(44h, 48h, 52h, 56h, 62h y 72h después de la incubación, p.i.) para
controlar la acumulación de proteína de la envuelta en plantas que
expresan scFv anti-30K transgénicas y no
transgénicas detectada mediante transferencia Western utilizando un
anticuerpo específico de la proteína de la envuelta de TMV (mAb 24)
tras la incubación con TMV vulgare. SR1 = plantas de tipo
salvaje SR1, NC = control negativo (SR1 Transgénico que expresa el
scFvT84.66 anti-tumoral).
La Figura 23 muestra secuencias de aminoácidos
derivadas de la secuencia de ADNc de anticuerpos scFv antivirales
obtenidos mediante recuperación del hibridoma (Figura 24) dirigidos
contra la proteína del movimiento 3a de CMV (23a), un componente de
la replicasa de TMV (23b, 54K de TMV) y una proteína mínima de virus
vegetal (23c, 3min de PLRV).
La Figura 24 muestra la competencia de unión
entre los anticuerpos y el ssARN de PLRV. Se incubaron 100 ng de la
proteína GST-3min durante 30 minutos a la
temperatura ambiente o bien con las cantidades indicadas de
anticuerpos anti-3m policlonales (pAb, calles 3, 4,
5 y 6), anticuerpo anti-3min (mAb, calles 7, 8, 9 y
10) y anticuerpos anti-GST policlonales (calle 1) o
bien sin anticuerpo (calle 2). Los complejos fueron mezclados con
0,5 ng de sonda de ssARN marcada radiactivamente, incubados durante
25 minutos a 4ºC e irradiados con luz UV a la temperatura ambiente.
Tras la digestión del ARN no protegido mediante ARNasa A, los
complejos fueron analizados mediante SDS-PAGE al 15%
y el gel seco fue autorradografiado.
Figura 25 Mapeo de epítopos de los tres
anticuerpos antivirales diferentes es decir (a) mAb 29 (ver Ejemplo
1), (b) scFv 54-1 (Ejemplo 6, Figura 23b, Figura 29)
y (c) scFv 3a-2 (Ejemplo 6, Figura 23a). Las
secuencias fueron obtenidas de clones positivos al ELISA de fagos
después de la tercera serie de reconocimiento y selección
("biopanning") utilizando dos bancos de presentación de
péptidos (Cortese y col., (1995) Curr. Opin. Biotechnol. 6,
73-80). Las secuencias resultantes fueron alineadas
y el epítopo consenso fue determinado. En cada caso el epítopo pudo
ser cartografiado dentro de la secuencia parental de las diferentes
secuencias virales analizadas.
Figura 25a: Cartografía de epítopos y secuencia
consenso de mAb 29 utilizando la presentación de péptidos y dos
bancos de presentación de péptidos diferentes (banco al azar de
9meros (pVIII 9aa) y banco restringido de 9meros (9aa.Cys)). A
partir del banco al azar de 9meros se pudieron caracterizar y
secuenciar 10 clones positivos diferentes, a partir del banco
restringido de 9meros se caracterizaron 5 clones positivos. Ambos
bancos daban como resultado la identificación del mismo epítopo
basado en una secuencia consenso que pudo ser cartografiada dentro
de la secuencia de la proteína de la envuelta de TMV.
Figura 25b: Cartografía de epítopos y secuencia
consenso de scFv 54-1 utilizando la presentación de
péptidos (banco lineal de 9meros). A partir del banco lineal de
9meros se pudieron caracterizar y secuenciar 4 clones positivos
diferentes, dando como resultado la identificación del mismo epítopo
scFv basado en una secuencia consenso que pudo ser cartografiada
dentro de la proteína 54K.
Figura 25C: Cartografía de epítopos y secuencia
consenso de scFv 3min utilizando la presentación de péptidos y dos
bancos de presentación de péptidos diferentes (banco al azar de
9meros (pVIII 9aa) y 9meros (9aa.Cys). A partir del banco lineal de
9meros se pudieron caracterizar y secuenciar 8 clones positivos
diferentes, a partir del banco restringido de 9meros se
caracterizaron 7 clones positivos. Ambos bancos daban como resultado
la identificación del mismo epítopo basado en una secuencia consenso
que pudo ser cartografiada dentro de la región limítrofe de
GST-3min.
La Figura 26 muestra un constructo de ADNc para
estudiar el ensamblaje de proteínas recombinantes. Los constructos
para la expresión de biscFv2429, PE280-tag20 y
PE400-tag29 en el apoplasto de las células vegetales
y GST-tag29 en bacterias.
A) los ADNc de scFv, compuestos por mAb24 y
mAb29, dominios de la cadena ligera variable (V_{L}) y de la
cadena pesada (V_{H}) conectados por un conector 212 de 14
aminoácidos (conector 2), fueron fusionados utilizando el conector
CBHI. biscFv2429 fue subclonado en el vector de expresión vegetal
pSS. B) PE280 compuesto por el dominio PE II (aa
280-364) y el dominio III (aa
381-609) fue fusionado con el
epitag-29 por medio del conector Gly_{4}Ser
(conector 1).
PE280-tag29 fue subclonado en el vector de expresión pSS. C) PE400 compuesto por el dominio PE III (aa 381-609) fue fusionado al epitag-29 por medio de un conector Gly_{4}Ser (conector 1). PE400-tag29 fue subclonado en el vector de expresión vegetal pSS. D) El epitag-29 fue fusionado al extremo C de GST por medio de un conector Gly_{4}Ser (conector 1) en el vector pGEX-5X-3. La secuencia de ADN del fragmento EcoRI/XbaI de PE280-tag29 se muestra en la SEC ID NUM. 161. La secuencia de ADN del fragmento EcoRI/XbaI de PE400-tag29 se muestra en la SEC ID NUM: 162.
PE280-tag29 fue subclonado en el vector de expresión pSS. C) PE400 compuesto por el dominio PE III (aa 381-609) fue fusionado al epitag-29 por medio de un conector Gly_{4}Ser (conector 1). PE400-tag29 fue subclonado en el vector de expresión vegetal pSS. D) El epitag-29 fue fusionado al extremo C de GST por medio de un conector Gly_{4}Ser (conector 1) en el vector pGEX-5X-3. La secuencia de ADN del fragmento EcoRI/XbaI de PE280-tag29 se muestra en la SEC ID NUM. 161. La secuencia de ADN del fragmento EcoRI/XbaI de PE400-tag29 se muestra en la SEC ID NUM: 162.
35SS = promotor CaMV-35S
doblemente intensificado; Ptac = promotor tac;
CHS-5'-UT = región 5' no traducida
de la chalcona sintasa; LP = péptido líder de la cadena ligera del
anticuerpo monoclonal murino mAb24; GST = glutation
S-transferasa; his6 = etiqueta histidina 6; tag29 =
epitag-29; TCaMV = secuencia de terminación de
CaMV.
La Figura 27 muestra la detección de
GST-tag29 mediante inmunotransferencia. Se separaron
diluciones seriadas de GST-tag29 producido en
bacterias y purificado por afinidad en PBS (A) o extracto de
proteína de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 (B) en un gel
SDS-PAA reductor al 12% (p/v) y transferidas a
nitrocelulosa. La proteína recombinante fue detectada utilizando
rAb29 y anticuerpo anti-ratón de cabra conjugado con
fosfatasa alcalina como anticuerpo secundario y seguido de tinción
con NBT/BCIP. Se indican las cantidades de GST-tag29
cargadas y los pesos moleculares del marcador proteico antes de la
tinción.
La Figura 28 muestra la simulación del ensamblaje
in vivo mediante ELISA. El ensamblaje de biscFv2429 de
plantas transgénicas y GST-tag-29
producido en bacterias seguido de purificación por afinidad fue
analizado mediante ELISA. Los componentes fueron añadidos en el
siguiente orden a la placa de microtitulación: anticuerpos
anti-TMV de conejo TMV policlonales (7 \mug/ml),
BSA al 1% para el bloqueo, viriones de TMV (1 \mug/ml), extractos
vegetales de una planta transgénica que produce biscFv2429 (diluidos
1:10 o 1:100), mAb anti-GST de ratón,
GST-tag29 expresado bacterianamente (1 \mug/ml),
anticuerpo anti-Fc de ratón de cabra marcado con
fosfatasa alcalina diluida 1:5.000 y sustrato. Los controles se
realizaron utilizando extractos de una planta de tabaco no
transgénica. Los niveles de ensamblaje in vivo se indican
como la DO a 405 nm. Cada columna representa el valor medio de dos
experimentos ELISA independientes. Las desviaciones típicas se
indican con barras.
La Figura 29 muestra una inmunotransferencia de
hojas de tabaco transformadas transitoriamente con
PE280-tag29. Las hojas de tabaco transformadas
utilizando agrobacteria recombinante fueron incubadas durante 72
horas y el extracto de proteína fue aislado. Se separaron 15 \mul
y 5 \mul de proteínas solubles totales de hojas de tabaco que
producían PE280-tag29, 10 \mul de una planta no
transgénica (WT) y 400 ng de GST-tag29 purificado
por afinidad como control sobre un gel SDS-PAGE
reductor al 12% (p/v) y se transfirieron a nitrocelulosa. La
proteína recombinante fue detectada utilizando un mAb
anti-GST de ratón como anticuerpo primario y un
anticuerpo anti-ratón de cabra conjugado con
peroxidasa de rábano picante como anticuerpo secundario, seguido de
detección por quimioluminiscencia. La flecha indica la posición de
la banda de PE280-tag29 degradada. Se indican los
pesos moleculares de un marcador previamente teñido.
La Figura 30 muestra un constructo de ADNc para
dirigir y expresar scFv24 sobre membranas celulares vegetales. Los
ADNc de los dominios de la cadena ligera variable (V_{L}) y pesada
(V_{H}) de mAb24 conectados por un conector 14
Genex-212 aminoácidos (36) fueron fusionados al
PDGFR y clonados en los sitios de restricción EcoRI y
XbaI del vector de expresión vegetal pSS (33). 35SS =
promotor CaMV-35S doblemente intensificado;
CHS-5'-UT = región 5' no traducida
de la chalcona sintasa; c-myc = etiqueta epitópica
c-myc; TM = dominio transmembrana; TCaMV = secuencia de
terminación de CaMV. La secuencia de ADN del fragmento EcoRI/XbaI de
pscFv24-PDGFR se representa en la SEC ID NUM:
163.
La Figura 31 muestra los niveles de
scFv24-PDGFR funcional en líneas celulares en
suspensión de N. tabacum cv. BY-2
transgénico. Los niveles de producción de scFv24 en extractos
celulares de tabaco BY-2 y el cultivo sobrenadante
fueron analizados mediante ELISA utilizando antisuero
anti-mAb24 y son indicados como ng de scFv24 por g
de material celular.
P1_{BY-2}-P8_{BY-2}
= líneas celulares en suspensión BY-2 transgénicas
que producen scFv24-PDGFR.
La Figura 32 muestra el análisis de transferencia
Western de plantas de tabaco T_{1} que producen
scFv24-PDGFR. Se separaron cantidades equivalentes
de proteína de fluidos de lavado intercelular y proteínas solubles
totales de tres plantas T_{1} que producían
scFv24-PDGFR en un gel SDS-PAGE
reductor al 12% (p/v) y se transfirieron a nitrocelulosa. La
proteína recombinante fue detectada utilizando antisuero
anti-mAb24 de conejo como anticuerpo primario y
anticuerpo anti-conejo de cabra conjugado con
fosfatasa alcalina como anticuerpo secundario (A) o bien utilizando
un anticuerpo anti-c-myc murino como
anticuerpo primario y anticuerpo anti-ratón de
cabra conjugado con fosfatasa alcalina como anticuerpo secundario
(B) y seguido de tinción con NBT/BCIP. Se indican los pesos
moleculares estimados de las proteínas recombinantes (marcador). IWF
= fluido de lavado intercelular; TSP = proteína soluble
total.
total.
Los siguientes ejemplos se dan para describir
mejor la práctica y las aplicaciones de la presente invención y no
deben ser considerados una descripción limitante ni interpretados
como límite del alcance ni de las aplicaciones de la presente
invención. Los expertos en la técnica reconocerán que se pueden
realizar diversas modificaciones de los métodos y genes descritos
sin apartarse sustantivamente del espíritu y el alcance de la
presente invención.
Se efectúan las siguientes etapas:
- 1)
- Se generan anticuerpos contra la proteína de la envuelta de TMV, viriones intactos o péptidos de la proteína de la envuelta específicos y monoclonales mediante tecnología del hibridoma.
- 2)
- Se clonan líneas celulares de hibridoma y secuencias de ADNc que codifican las cadenas pesada y ligera del anticuerpo para generar un anticuerpo recombinante o cualquier versión recombinante del mismo. Esto se logra utilizando oligonucleótidos específicos pesados y ligeros del anticuerpo y la reacción en cadena de la polimerasa con transcriptasa inversa utilizando ARNm aislado de un único clon de hibridoma. Esto permite clonar el anticuerpo de tamaño normal;
- 3)
- Los ADNc de las cadenas pesada y ligera del anticuerpo específico de tamaño normal clonados de la etapa 2 se utilizan como molde para la amplificación de los dominios variables de la cadena pesada y ligera utilizando cebadores oligonucleótidos específicos incluyendo una secuencia peptídica conectora (es decir, GENEX 212 o (Gly_{4}Ser)_{n}) y la reacción en cadena de la polimerasa con prolongación del solapamiento del empalme. Esta etapa proporciona después el fragmento de anticuerpo de cadena sencilla y los dos dominios variables se conectan por medio de una secuencia de 14 aminoácidos.
- 4)
- El gen scFv recombinante de la etapa 3 es insertado en un vector de expresión microbiano o eucariótico.
- 5)
- La especificidad de unión y la función del scFv recombinante (es decir la especificidad y la afinidad por un antígeno diana) se verifican tras la expresión del constructo de la etapa 4 en un huésped heterólogo, tal como periplasma de E. coli, utilizando ELISA, resonancia superficial de plasmón o transferencia western.
- 6)
- Se añade una secuencia señal al extremo 5' de la secuencia de nucleótidos del scFv recombinante de la etapa 3. Se añade una secuencia peptídica conectora 3' (dominio constante del receptor de células T humanas) seguido después de la adición de una secuencia transmembrana 3' de la cadena \beta del receptor de las células T. Entre las secuencias de localización transmembrana adecuadas también se incluyen el dominio transmembrana del receptor del factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGFR).
- 7)
- Se añade la región 5' no traducida de la chalcona sintasa al extremo 5' del constructo de la etapa 6.
- 8)
- El gen quimérico de la etapa 7 es insertado después en un vector de expresión vegetal, tal como PSS (Voss y col., 1995), aguas arriba de la región 3' no traducida del virus del Mosaico de la Coliflor, o cualquier otra fuente y la región de terminación del virus del Mosaico de la Coliflor aguas abajo del promotor 35SS (Figura 2). Este vector también contiene un marcador seleccionable. En el caso de la transferencia génica sin marcador y sin vector, se pueden omitir las secuencias marcadoras.
- 9)
- Se transforma Agrobacterium tumefaciens mediante transformación en N_{2} con el constructo de la etapa 8.
- 10)
- Se verifican la expresión y la función del constructo scFv recombinante en plantas mediante expresión transitoria en células vegetales y ELISA, resonancia superficial de plasmón o transferencia western.
- 11)
- Se generan plantas transgénicas transfiriendo el constructo de la etapa 8, y un marcador de selección rastreable, que está presente en el vector de expresión pSS (v.g. el gen NPT-II para la resistencia a la kanamicina), al genoma vegetal mediante transformación mediada por Agrobacteria.
- 12)
- Se rastrean plantas regeneradas utilizando el marcador de selección para la integración del gen de fusión.
- 13)
- Se sigue la expresión de la proteína de fusión en plantas regeneradas sometiendo a transferencia western extractos celulares, mediante ELISA o análisis de resonancia superficial de plasmón.
- 14)
- La actividad de la proteína de fusión expresada (es decir, la afinidad y la especificidad) se verifica mediante ELISA utilizando viriones de TMV intactos como antígeno.
- 15)
- La localización de la proteína de fusión se verifica mediante inmunofluorescencia indirecta, o microscopía confocal o microscopía inmuno-electrónica.
- 16)
- La actividad del anticuerpo al generar resistencia contra los virus se somete a ensayo mediante bioanálisis de infección viral de las plantas transgénicas, generadas en las etapas 11 a 12 utilizando viriones o transcritos infecciosos.
La orientación de proteína de membrana de Tipo II
o Tetraspan puede ser explotada para permitir la presentación de
patogenicidas moleculares al citoplasma tras su síntesis en la ruta
secretora. Para la presentación citoplásmica de scFv recombinante,
se repiten las etapas 6) a 16) del ejemplo 1 con las siguientes
adaptaciones. La secuencia de localización en la membrana
C-terminal que incluye la secuencia conectora y la
secuencia líder de la etapa 6 del ejemplo 1 se separan y se añade un
conector adecuado y una secuencia de redireccionamiento
N-terminal perteneciente a la familia del tetraspán
al anticuerpo recombinante específico del patógeno para dirigir e
integrar post-traduccionalmente las proteínas
recombinantes en la bicapa de las membranas plasmáticas. Entre las
membranas adecuadas de la familia del tetraspán se incluyen CD9,
CD20, CD81 y el híbrido In-Hc-Ic
dualspan tipo II-IV de la cadena invariable de MHC y
la proteína híbrida H-2^{d}. Este método permite
la orientación de un constructo de anticuerpo secretado y anclado a
la membrana con sus extremos N y C en el citosol.
Cualquier experto en la técnica reconocerá que
estas etapas pueden ser seguidas para cualquier otro patógeno
seleccionando anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos
para el patógeno diana. Por ejemplo, se pueden originar anticuerpos
y clonarlos contra proteínas estructurales y no estructurales de
cualquier patógeno. Las secuencias ancla a la membrana pueden ser
sustituidas frente a cualquier secuencia que facilite la integración
en las membranas y proporcione una función biológica. Por otra
parte, se puede combinar el ejemplo 1 con la expresión de cualquiera
de los ejemplos 2-8 en cualquier combinación que
proporcione una elevada resistencia a la enfermedad.
Para integrar el scFv24 específico de TMV en la
membrana celular de la planta, se fusionó el fragmento de anticuerpo
a un péptido señal de mamífero N-terminal y un
dominio transmembrana receptor C-terminal. El
péptido señal de la cadena ligera N-terminal de
ratón del anticuerpo de origen (mAb24) utilizado para generar scFv24
fue utilizado para dirigir las proteínas de fusión a la ruta
secretora. La secuencia del dominio transmembrana de la cadena
\beta del receptor de las células T humanas (TcR\beta) fue
seleccionado para la fusión con el extremo C de scFv24, para la
dirección heteróloga del anticuerpo scFv24 a la membrana plasmática.
Para asegurar el plegamiento apropiado de los fragmentos del
anticuerpo de cadena sencilla expresados, el constructo contenía la
región constante de TcR\beta (pscFv24-TcR\beta)
como secuencia conectora entre el fragmento scFv24 y el ancla a la
membrana (Figura 7). La clonación del fragmento scFv24CM de cadena
sencilla anti-virus del mosaico del tabaco
(anti-TMV) específico del neotopo que incluía el
péptido líder ha sido descrita (Zimmermann y col. (1998). Para
generar el constructo de fusión pscFv24-TcR\beta
(Figuras 2 y 7), un fragmento de ADNc que codificaba el dominio
constante y transmembrana de la cadena TcR\beta humana (Yoshikai y
col. Nature 312:521-524 (1984)) fue amplificado
mediante PCR a partir de ARNm de bazo humano (Clontech, Heidelberg,
Alemania) utilizando los cebadores 5'-GCC GTC
GAC GAG GAC CTG AAC AAG GTG TTC CCA-3' (SEC ID
NUM: 1) Y 5'-GCC TCT AGA TCA GAA ATC CTT TCT
CTT G-3' (SEC ID NUM: 2). Los cebadores contenían
sitios de restricción SalI y XbaI (cursiva) para
permitir la clonación en marco del producto de la PCR con scFv24CM
(Zimmermann y col. 1998) dando como resultado el constructo final
scFv24-TcR\beta.
Para la expresión en células vegetales, el
fragmento EcoRI/XbaI (figura 7) de
scFv24-TcR\beta fue subclonado en los sitios de
restricción EcoRI y XbaI del vector de expresión
vegetal pSS (Voss y col., (1995)) conteniendo el promotor 35S
intensificado (Kay y col. (1987)) y la secuencia de terminación de
CaMV (Figura 7, pscFv24-TcR\beta).
Para analizar el nivel de expresión de la
proteína de fusión scFv recombinante fue transformada establemente
con A. tumefaciens recombinante y la expresión funcional del
dominio scFv24 de la proteína de fusión fue analizado mediante ELISA
utilizando antisuero anti-mAb24.
El constructo vector
pscFv24-TcR\beta fue transferido a A.
tumefaciens GV3101 mediante transformación en N_{2} líquido
(Höfgen y Willmitzer, Nucleic Acids Res. 16:9877 (1988)). Se
mantuvieron células de N. tabacum L. cv. amarillo brillante
(BY-2) en base salina de Murashige y Skoog con
sustancias orgánicas mínimas (MSMO+: MSMO (Sigma, Deisenhofen,
Alemania) más 200 mg/ml de KH_{2}PO_{4}, 0,6 Mg/ml de tiamina,
sacarosa al 3% y 0,2 \mug/ml de 2,4-D, pH 5,8) a
24ºC en la oscuridad sobre un aparato de sacudimiento orbital. Las
células fueron subcultivadas cada semana con un inóculo al 5%. Tres
días después del subcultivo, las células vegetales fueron
transformadas mediante cultivo simultáneo con A. tumefaciens
recombinante, como se ha descrito (An, Plant Physiol.
79:568-570 (1985)). La selección de transformantes
resistentes a la kanamicina fue realizada sobre medio de agar MSMO+
suplementado con 75 \mug/ml de kanamicina y 100 \mug/ml de
Claforan.
Para la extracción de las proteínas solubles
totales del cultivo en suspensión de BY-2
transgénico, las células de 1 ml de cultivo fueron recogidas por
centrifugación a 4.000 X g durante 5 minutos a 4ºC. El sedimento
celular fue resuspendido en 1 ml de tampón de extracción de proteína
(Tris-HCl 200 mM (pH 7,5), EDTA 5 mM, azida de sodio
al 0,02% (p/v) y Tween 20 al 0,1% (v/v)) y las células fueron
desorganizadas mediante sonicación a 60 watios durante 1 minuto
utilizando una sonda de sonicación (B. Braun, Melsungen, Alemania) a
4ºC. El desecho celular fue separado por centrifugación a 14.000 X g
durante 10 minutos a 4ºC. El sobrenadante claro que contenía
proteína soluble fue utilizado para un análisis adicional.
Para el ELISA y la transferencia western, se
utilizó antisuero anti-mAb24 (Zimmermann y col.
(1998)) como anticuerpo primario combinado con una dilución 1:5.000
de anticuerpos secundarios conjugados con fosfatasa alcalina
anti-conejo de cabra (Jackson Immuno Research
Laboratories, West Grove, PA). Las concentraciones de proteína
fueron determinadas con el Análisis de Proteínas de
Bio-Rad utilizando Seralbúmina Bovina (BSA) como
patrón. El análisis de las células de N. tabacum
BY-2 transformadas establemente reveló que
scFv24-TcR\beta era completamente intracelular
(Figura 8). ScFv24-TcR\beta no era detectable en
el sobrenadante de cultivo, indicando que el dominio transmembrana
TcR\beta es estable y adecuado para el redireccionamiento de
scFv24 a membranas celulares de tabaco.
Después se sometió a ensayo si el dominio
transmembrana de mamífero heterólogo TcR\beta fusionado a scFv24
dirigiría el anticuerpo de cadena sencilla a la membrana plasmática
en plantas de tabaco transformadas establemente. Se generaron N.
tabacum cv. Petit Havana SR1 transgénicas mediante
transformación de discos foliares con A. tumefaciens
recombinante y se generaron plantas transgénicas T_{0} a partir de
callos transformados (Horsch y col., Science 227:
1229-1231 (1985)). La extracción de proteínas
solubles totales a partir de hojas de tabaco y el posterior análisis
de scFv24 mediante ELISA fueron realizados como describe Fischer y
col. [Fischer R, Drossard J, Liao YC, Schillberg S: Characterisation
and applications of plant-derived recombinant
antibodies. En: Cunningham C, Porter AJR (eds), Recombinant proteins
in plants: Production and Isolation of Clinically useful compounds,
págs. 45-68. Vol. 3, Humana Press, Totowa, NJ
(1988)]. Para el ELISA y la transferencia western, se utilizó
antisuero anti-mAb24 (Zimmermann y col. (1998)) como
anticuerpo primario combinado con una dilución 1:5.000 de
anticuerpos secundarios conjugados con fosfatasa alcalina
anti-conejo de cabra (Jackson Immuno Research
Laboratories, West Grove, PA). Las concentraciones de proteína
fueron determinadas con el Análisis de Proteínas de
Bio-Rad utilizando Seralbúmina Bovina (BSA) como
patrón. Los niveles de expresión de
scFv24-TcR\beta fueron mucho mayores en N.
tabacum cv. Petite Havana SR1 que en los cultivos en suspensión
(Tabla 1). El nivel máximo de scFv24-TcR\beta
extraído con detergente era 296 veces superior (8.866 ng/g de tejido
foliar) que el obtenido en cultivos en suspensión transgénicos
(Figura 8).
Para determinar si el fragmento scFv24 estaba
integrado establemente en la membrana plasmática o era secretado en
el espacio extracelular de plantas intactas, se analizó mediante
ELISA el fluido de lavado intercelular de hojas de plantas de tabaco
transgénicas T_{1}. Para la detección de la proteína de fusión
scFv24 en fluidos de lavado intercelulares, se prepararon hojas de
N. tabacum cv. Petite Havana SR1 como describen Fischer y
col., (Fischer: Characterisation and applications of
plant-derived recombinant antibodies. En: Cunningham
C, Porter AJR (eds), Recombinant proteins in plants: Production and
Isolation of Clinically useful compounds, págs.
45-68. Vol. 3, Humana Press, Totowa, NJ (1988)). Los
extractos de proteínas totales de los fluidos de lavado fueron
concentrados mediante ultrafiltración (Microcon 10, Amicon, Witten,
Alemania) y analizados mediante SDS-PAGE al 12%
(Laemmli, Nature 227: 680-685 (1970)) seguido de
transferencia western. No había anticuerpo detectable en el fluido
de lavado intercelular de diez progenies T_{1} de dos líneas
vegetales (T4_{SR1} y T6_{SR1}) que producían la proteína de
fusión scFv24-TcR\beta. En general, las plantas
T_{1} utilizadas para el análisis IWF mostraban elevados niveles
de expresión de scFv24-TcR\beta intracelular
(1.570-8.490 ng/g de tejido foliar).
El análisis de transferencia western de la
proteína soluble total aislada de una progenie T_{1} de la línea
vegetal T4_{SR1} mostraba solamente la proteína de fusión
scFv24-TcR\beta de longitud normal pronosticada y
no eran detectables proteína de fusión intacta ni productos de
degradación en el fluido de lavado intercelular (Figura 9). Esto
demuestra que scFv24-TcR\beta no era secretado y
permanecía anclado a la membrana en plantas transgénicas.
Puesto que el constructo
scFv24-TcR\beta contiene secuencias del péptido
señal y transmembrana, la proteína de fusión podía ser localizada en
la membrana plasmática. Para determinar la localización subcelular
de la proteína de fusión, se generaron protoplastos de N.
tabacum cv. BY-2 y se analizaron mediante
microscopía de inmunofluorescencia (Figura 10).
Los protoplastos fueron preparados mediante
digestión de células de tabaco BY-2 de 3 días de
edad con celulasa Onozuka RS al 1,5% (p/v) (Yakult Honsha Co.,
Tokio, Japón), hemicelulasa al 0,7% (p/v) (Sigma) y pectoliasa Y23
al 0,1% (p/v) (Seishin Pharmaceuticals, Nihonbashi, Tokio, Japón) en
tampón MES (MES al 0,5% (p/v), CaCl_{2} 80 mM, manitol 0,3 M, pH
5,8) durante 1,5 horas a 25ºC en un aparato de sacudimiento
rotatorio. Los protoplastos fueron lavados con tampón MES,
transferidos a medio MSMO+ de nueva aportación e incubados durante
la noche a 24ºC en un aparato de sacudimiento orbital en la
oscuridad. Los protoplastos en regeneración fueron lavados una vez
con tampón MES y se dejó que se sedimentaran sobre portas de
múltiples pocillos recubiertos de
poli-L-lisina. Las células fueron
fijadas durante 15 minutos a la temperatura ambiente con
formaldehído al 4% (p/v) en tampón MTS (Pipes 50 mM, EGTA 5 mM,
Mg_{2}SO_{4} 5 mM, pH 6,9) más manitol 0,3 M. Los fantasmas de
protoplasto resultantes fueron lavados con tampón MTS e incubados
durante 1 hora a la temperatura ambiente con una dilución 1:2.500 de
antisuero anti-mAb24 de conejo (Zimmermann y col.
(1998)) o una dilución 1:50 de IgG anti-TcR\beta
humano de ratón (T Cell Diagnostics, Woburn, MA) en tampón MTS con
BSA al 3% (p/v) suplementado con manitol 0,3 M. Las células fueron
lavadas con tampón MTS e incubadas después durante 1 hora a la
temperatura ambiente con anticuerpos secundarios
anti-conejo de cabra conjugado con FITC o
anti-ratón de cabra conjugado con FITC (Jackson
Immuno Research Laboratories) diluido 1:100 en tampón MTS con BSA al
3% (p/v) suplementado con manitol 0,3 M. Después de lavar con tampón
MTS, los portas fueron montados en Citifluor
(anti-debilitamiento) (Citifluor Ltd., Londres,
Inglaterra) y se formaron imágenes en un microscopio invertido Zeiss
equipado con un objetivo de inmersión en aceite de 40X utilizando
una excitación de 450-490 nm y filtros de
interferencia de la emisión de 520-560 nm. Las
imágenes fueron registradas en una película T-max
400pro (Kodak,
Rochester, NY).
Rochester, NY).
Las enzimas de subdivisión de las paredes de la
célula ("protoplasting") contienen proteasas que degradan las
proteínas de la superficie celular y no era detectable la tinción de
la superficie celular directamente después de la subdivisión de las
paredes de la célula en las células BY-2. Sin
embargo, la regeneración durante la noche de los protoplastos
permitió la liberación de scFv24 unido a membrana recién sintetizado
a la superficie celular y dio una tinción óptima. Las células de
N. tabacum cv. BY-2 de tipo salvaje de
control no mostraban evidencia de tinción superficial (Figura 10A).
En contraste, los protoplastos derivados de la línea celular en
suspensión de N. tabacum cv. BY-2 transgénica
T2_{BY-2} productora de
scFv24-TcR\beta eran teñidos de manera brillante
con suero anti-Ab24 en la membrana plasmática,
demostrando la localización en la membrana plasmática de la proteína
de fusión scFv24-TcR\beta (Figura 10B). Además, la
localización de scFv24-TcR\beta con respecto a la
membrana plasmática también fue observada tiñendo con anticuerpo
anti-TcR\beta humano, que reconoce la región
constante de TcR\beta que conecta el dominio transmembrana a
scFv24 (Figura 10C). Además, del marcaje en la membrana plasmática,
algunos protoplastos mostraban tinción nuclear para
scFv24-TcR\beta-proteína de fusión
(Figura 10D).
Se realizó la microscopía
inmuno-electrónica sobre secciones
ultra-finas de hojas, para verificar la localización
del scFv24 unido a la membrana.
Se embebieron pequeños trozos de plantas de N.
tabacum cv. Petite Havana SR1 transgénicas a baja temperatura
para el inmunomarcaje con oro (Wells, Micron and Microscopica Acta
16: 49-53 (1985)). El marcaje mediante inmunomarcaje
con oro de secciones finas sobre gradillas de oro recubiertas con
una película de plástico se llevó a cabo como se ha descrito
previamente (McCann y col. J. Microsc. 166: 123-136
(1992)), excepto que el tampón de bloqueo utilizado para las
incubaciones con anticuerpos contenía BSA al 3% (p/v). Anticuerpos
primarios: antisuero anti-mAb24 de conejo a una
dilución 1:100 (Zimmermann y col. (1998)) o IgG
anti-TcR\beta humano de ratón a una dilución 1:25
(T Cell Diagnostics), fueron incubados con las secciones durante 1
hora. Los anticuerpos secundarios eran anti-conejo
de cabra conjugado con oro 12 nm o anti-ratón de
cabra conjugado con oro 12 nm (Jackson Immuno Research Laboratories)
y fueron incubados con las secciones a una dilución 1:40 durante 1
hora. Las microfotografías ópticas de campo brillante de secciones
de resina de 1 \mum de grosor fueron vistas a 80 kV sobre un
microscopio electrónico de transmisión Joel 1200EX, y las
fotografías fueron tomadas utilizando una película Kodak.
En hojas jóvenes de la planta transgénica
T4_{SR1} T_{0} que producía scFv24-TcR\beta,
se localizó scFv24 tanto en la membrana nuclear como plasmática
(Figura 11), confirmando la localización subcelular de
scFv24-TcR\beta mediante inmunofluorescencia en
protoplastos de N. tabacum cv. BY-2
transgénico. El número de partículas de oro encontrado en los
cloroplastos, mitocondrias, glioxisomas, matrices citoplásmicas y
vacuolas era coherente con el marcaje de fondo.
Para analizar los efectos biológicos el
anticuerpo específico de TMV anti-viral anclado a la
membrana sobre la resistencia viral, se inocularon progenies T_{1}
de una línea vegetal que expresaba la proteína de fusión
scFv24-TcR\beta (T6_{SR1}) con TMV.
Se recogieron semillas de plantas T_{0}
productoras de anticuerpo y se hicieron germinar sobre medio de agar
MSMO suplementado con sacarosa al 2% (p/v), 0,4 \mug/ml de
tiamina, 0,4 \mug/ml de glicina, 0,1 \mug/ml de ácido
nicotínico, 0,1 \mug/ml de piridoxina y 75 \mug/ml de
kanamicina. Las plantas T_{1} resistentes a la kanamicina fueron
utilizadas para la inoculación con TMV-v (1
\mug/ml) como se ha descrito previamente (Dietzgen, Arch. Virol.
87:73-86 (1986)). Se utilizaron como control plantas
de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 de tipo salvaje. Los
síntomas de la enfermedad fueron controlados entre los 6 y 20 días
posteriores a la inoculación (p.i.) y para las plantas resistentes
hasta 180
días p.i.
días p.i.
Las hojas inferiores fueron infectadas con TMV y
la diseminación sistémica del virus estuvo seguida del análisis de
las plantas superiores 6-20 días más tarde. Todas
las plantas de tabaco no transgénicas de control fueron infectadas
sistémicamente, pero el 16% (de 31 analizadas) de las plantas
transgénicas scFv24-TcR\beta no tenían síntomas
visibles de enfermedad en las hojas superiores (Tabla 2). Además, el
análisis mediante ELISA demostró que algunas de estas plantas
acumulaban partículas de virus en las hojas superiores indicando que
aunque se producía la diseminación viral sistémica, no se
desarrollaban síntomas. Sorprendentemente, en el 6% de las plantas
transgénicas scFv24-TcR\beta no se encontró virus
en las hojas superiores hasta 90 días después de la inoculación. Se
pudo detectar el virus en sitios de inoculación en las hojas
inferiores mediante ELISA demostrando que estas plantas habían sido
eficazmente inoculadas con TMV. Los niveles de expresión de
anticuerpo-proteína de fusión se correspondían con
la expresión de la resistencia a TMV (Tabla 2). Los niveles
superiores de scFv24-proteína de fusión conducían a
una fracción incrementada de plantas resistentes al virus,
confirmando que los scFv anclados a la membrana podían ser
utilizados para generar plantas resistentes a virus.
La proteína de fusión recombinante
scFv24-TcR\beta fue expresada funcionalmente en
cultivos en suspensión de tabaco transgénico y en plantas
transgénicas. El scFv24-TcR reconocía al TMV en un
ELISA y mostraba el tamaño esperado en el análisis de
inmunotransferencia. Además, la inmunofluorescencia y la microscopía
electrónica mostraron que el dominio transmembrana TcR\cdot
dirigía el scFv24 al plasma y a la membrana nuclear del tabaco. Los
bioanálisis de la infección viral mostraron que las plantas de
tabaco transgénicas que expresaban scFv24-TcR\cdot
eran resistentes a la infección sistémica por TMV. Estos resultados
demostraban que los fragmentos de anticuerpo
anti-viral anclados a la membrana son funcionales,
pueden ser dirigidos a la membrana plasmática in planta y son
un método novedoso para proteger las células vegetales de los
patógenos invasores.
| \begin{minipage}[t]{160mm} Niveles de proteína de fusión scFv24 funcional en la generación T_{0} de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 transgénico. La proteína vegetal soluble total fue aislada de hojas de plantas transgénicas que producían scFv24-TcR\beta. La expresión de la proteína de fusión scFv24 fue cuantificada mediante un ELISA específico de TMV utilizando antisuero anti-mAb24 y expresada como ng de scFv24 por g de tejido foliar \end{minipage} | ||||
| Constructo | Número de plantas | Número de plantas que | Intervalo de expresión | Expresión media |
| transgénicas | expresan scFv24 funcional | (ng/g de tejido foliar) | (ng/g de tejido foliar) | |
| PscFv-TcR\beta | 6 | 6 | 30-8.866 | 1.991 |
\vskip1.000000\baselineskip
| \begin{minipage}[t]{160mm} Análisis de la infección viral de plantas transgénicas que expresan scFv24 anclado a la membrana Se aplicó 1 \mug/ml de TMV-v sobre una hoja inferior de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 no transgénico y progenies T_{1} transgénicas de la línea vegetal P9_{SR1} que producía scFv24-PDGFR o T6_{SR1} que producía scFv24-TcR\beta. Los niveles de proteína de fusión scFv24 fueron determinados mediante ELISA utilizando el antisuero anti-mAb24 14 días p.i. y utilizados para la formación de grupos (productores bajos, medios y altos). ^{a} = las hojas superiores no mostraban síntomas de enfermedad visibles; ^{b} = basado en ELISA de TMV; ^{c} = nivel de resistencia de todos los productores bajos, medios y altos, los números entre paréntesis incluyen todas las plantas sin síntomas de enfermedad visibles \end{minipage} | |||||
| Líneas vegetales | Plantas sometidas | ng scFv24 por g | Fenotipo | Plantas | Nivel de |
| a ensayo | de tejido foliar | sano^{a} | resistentes^{b} | Resistencia (%)^{c} | |
| N. tabacum cv. | 62 | - | 0 | 0 | 0 |
| Petite Havana SR1 | |||||
| T6_{SR1}, productor bajo | 22 | 10-500 | 1 | 0 | |
| T6_{SR1}, productor medio | 2 | 501-2000 | 2 | 1 | 6(16) |
| T6_{SR1}, productor alto | 7 | 2001-21500 | 2 | 1 |
Las etapas 1) a 16) del ejemplo 1 se repiten con
las siguientes adaptaciones.
- 1)
- La secuencia señal N-terminal se separa y se remplaza por un codón de iniciación.
- 2)
- La secuencia de localización en la membrana C-terminal que incluía la secuencia conectora del ejemplo 1 fue remplazada por un conector adecuado y secuencias de redireccionamiento C-terminales para dirigir e integrar post-traduccionalmente las proteínas recombinantes a la bicapa de las endomembranas. Entre las secuencias de redireccionamiento adecuadas se incluyen los dominios transmembrana de KAR1 para la integración en la membrana nuclear (Rose y Fimk, 1987), el antígeno T medio para la integración en la membrana plasmática (Kim y col., 1997) y el citocromo b5 para la integración en la membrana del RE (Kim y col. 1997). Por otra parte, se pueden incorporar la prenilación, farnesilación, palmitoilación, miristoilación y unidades de la secuencia de ankirina.
Cualquier experto en la técnica reconocerá que
estas etapas pueden ser seguidas para cualquier otro patógeno
seleccionando anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos
para el patógeno diana. Por ejemplo, se pueden originar anticuerpos
contra proteínas estructurales y no estructurales de cualquier
patógeno. La secuencia o secuencias de ancla a la membrana pueden
ser sustituidas por cualquier secuencia que facilite la integración
en la membrana y proporcione una función biológica. Además, el
ejemplo 2 puede ser combinado con los ejemplos 1 y
3-8 en cualquier combinación.
Para integrar el scFv24 específico de TMV en la
bicapa de endomembranas se fusionó el fragmento de anticuerpo a un
dominio transmembrana receptor C-terminal. No se
incluyó ninguna secuencia señal N-terminal, por lo
tanto el fragmento scFv24 daba al citosol. La secuencia del dominio
transmembrana de KAR1 fue seleccionada para la integración en la
membrana nuclear (Rose y Fink, 1987), el antígeno T medio para la
integración en la membrana plasmática (Kim y col., 1997), el
citocromo b5 para la integración en la membrana del RE (Kim y col.
1997) y syn1 para la integración en vesículas (Kim y col., 1997).
Para asegurar un plegamiento adecuado de los fragmentos de
anticuerpo de cadena sencilla expresados, los constructos
scFv24-kar1, scFv24-mT,
scFv24-cytb y scFv24-syn1 contenían
una secuencia conectora Gly_{4}Ser entre el fragmento scFv24 y el
ancla de membrana (Figura 12).
Los dominios transmembrana
C-terminales KAR1, T-medio (mT),
citocromo b5 (cytb5) y synaptobrevina 1 (syn1) que incluían la
secuencia conectora Gly_{4}Ser fueron fusionados a scFv24 mediante
PCR. El ADNc de scFv24CW molde (Zimmermann y col. (1998)), el
cebador directo -40 (5'-GTT TTC CCA GTC ACG
AC-3' (SEC ID NUM: 4)) y los siguientes cebadores
inversos fueron utilizados para la amplificación por PCR: para
kar1 5'-GGC TCT AGA CGC TCG AGT TTA AAA CCT
ATA ATA CAC ATA GAT GTT GCA ATA AAG CAA AAT CAG TAT ACA AAT AGT CCA
CCA GAA ATA CTC CCT ATA CTT CTT AGC GGC CGC AGA ACC TCC ACC TCC GTC
G-3' (SEC ID NUM: 5); para mT
5'-GGC TCT AGA CGC TCG AGT TTA GAA ATG CCT AGA TCT
CTT AAT CAA GAT GAA GAG CAT CAA GCA AAT TCC GAG CAG CGC TGC CAA GAA
AGT CAC CAA GAG CAA AGT TCT TCC CAA TCT CCT AGC GGC CGC AGA ACC TCC
ACC TCC GTC G-3') SEC ID NUM: 6); para cytb5
5'-GGC TCT AGA CGC TCG AGT TTA ATC CTC TGC CAT GTA
GAG TCT ATA CAT GAG AGC AAC CAC GAG TGC TGA TAT CGC TGG GAT CAC CCA
ATT GGT CCA CCA TGA AGA GTT AGA CTC AAC AGC GGC CGC AGA ACC TCC ACC
TCC GTC G-3' (SEC ID NUM: 7) y para syn1
5'-GGC TCT AGA CGC TCG AGT TTA AGT GAA GAA ATA AAT
AAC AAT AAC AAC AAC AAT AAT AGC ACA AAT AGC ACC AAG CAT AAT CAT CAT
CTT ACA ATT CTT CCA AGC GGC CGC AGA ACC TCC ACC TCC GTC
G-3' (SEC ID NUM: 8). Los codones de los dominios
transmembrana eran codones optimizados para la expresión en tabaco,
guisante y trigo. Los fragmentos de la PCR restringidos por
5'-EcoRI y 3'-XbaI fueron subclonados en pUC18 y
secuenciados. Las mutaciones del dominio transmembrana mT y syn1
fueron eliminados mediante PCR utilizando el cebador directo -40
(5'-GTT TTC CCA GTC ACG AC-3' (SEC
ID NUM: 9)) y los cebadores inversos MUT7MT 5'-GGC
TCT AGA CGC TCG AGT TTA GAA ATG CCT AGA TC-3' (SEC
ID NUM: 10) para mT y SYN1SHORT 5'-GGC TCT AGA CGC
TCG AGT TTA AGT GAA GAA ATA AAT AAC AAT AAC AAC
AAC-3' (SEC ID NUM: 11) para syn1. La región 5' no
traducida de la chalcona sintasa y scFv24 fue sustituida por el
fragmento EcoRI y SalI de scFv24CW (Zimmermann y col.
(1998)). La posterior ligadura de los fragmentos
EcoRI-XbaI en el vector de expresión vegetal pSS, que
contenía un promotor 35S doblemente intensificado (Voss y col.,
(1995)), dio como resultado los constructos de expresión finales
pscFv24-kar1, pscFv24-mT,
pscFv24-cytb5 y pscFv24-syn1 (Figura
12).
Para analizar el nivel de expresión de las
proteínas de fusión con scFv recombinante, se transformaron
transitoriamente hojas de N. tabacum cv. Petite Havana SR1
con A. tumefaciens recombinante y se analizó el dominio
scFv24 de la proteína de fusión mediante ELISA utilizando antisuero
anti-mAb24.
Los constructos del vector fueron transferidos a
A. tumefaciens GV3101 mediante transformación en N_{2}
líquido (Höfgen y Willmitzer (1988)). La transformación transitoria
de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 se realizó como se ha
descrito (Kapila y col., Plant Science 122 (1996)
101-108). Para extraer las proteínas solubles
totales, se congelaron las hojas de Tabaco y se trituraron en
nitrógeno líquido y se analizó el nivel de proteína de
fusión-scFv mediante ELISA utilizando antisuero
anti-mAb24 (Zimmermann y col. (1998)) como
anticuerpo primario combinado con una dilución 1:5.000 de
anticuerpos secundarios conjugados con fosfatasa alcalina
anti-conejo de cabra (Jackson Immuno Research
Laboratories, West Grove, PA) (Fischer y col., en: C. Cunninghman,
A.J.R. Porter, (Eds.), Methods in biotechnology Vol. 3: Recombinant
proteins in plants: Production and Isolation of Clinically useful
compounds. Humana Press, Totowa, MJ (1998), ELISA III).
Las proteínas de fusión
scFv24-mT, scFv24-syn1 y el scFv24
de control que carecía de dominio transmembrana
C-terminal no fueron detectables en los extractos
vegetales de los experimentos de transformación transitoria (límite
de detección: 0,5 ng por gramo de tejido foliar). No obstante,
scFv24-kar1 y scFv24-cytb5 se
acumulaban en el citosol de las células vegetales a un nivel máximo
de 1,8 ng y 1,0 ng por gramo de tejido foliar, respectivamente.
La generación de N. tabacum cv. Petite
Havana SR1 transformado establemente y los bioanálisis para analizar
los efectos biológicos de scFv24-kar1 y
scFv24-cytb5 citosólicos en plantas de tabaco
transgénicas están progresando. Basándose en los resultados de los
autores de la presente invención con
scFv24-TcR\beta (ejemplo 1) se esperaba la
integración de las proteínas de fusión en la membrana celular
vegetal por medio de los dominios transmembrana
C-terminales KAR1 o syn1. El scFv24 da al citosol de
la planta, lo que da como resultado una resistencia viral
incrementada debido a que el efecto biológico de scFv24 es elevado
en el citosol de la planta y la integración en la membrana dirige el
scFv24 a la localización en la que el virus es más vulnerable. La
replicación del virus y el movimiento tienen lugar en los sistemas
de la membrana celular de la planta, por lo tanto se puede evitar
eficazmente el desensamblaje viral.
Se repiten las etapas 1) a 16) del ejemplo 1 y/o
las etapas 1) o 2) del ejemplo 2 con las siguientes
adaptaciones.
- 1)
- El constructo de expresión vegetal contiene una secuencia señal 5' para permitir la liberación del anticuerpo recombinante al lúmen del RE y después la secreción al apoplasto.
- 2)
- El dominio de dirección transmembrana se remplaza por un conector que acopla la proteína a una fusión C-terminal con una toxina - en este caso una enzima ARNasa que degrada el ARN celular, el ARN viral, las formas replicativas y/o los intermedios replicativos.
- 3)
- Tras unirse a los viriones en el apoplasto, la proteína de fusión entrará en el citosol de las células dañadas por medio de los viriones entrantes, donde la ARNasa citotóxica degradará el ARN viral, los intermedios replicativos y las formas replicativas y/o el ARN celular y causará la muerte celular de las células infectadas viralmente y por lo tanto evitará la replicación y la diseminación del patógeno.
Cualquier experto en la técnica reconocerá que
estas etapas pueden ser seguidas para cualquier otro patógeno
seleccionando anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos
para el patógeno diana. Por ejemplo, se pueden originar anticuerpos
contra proteínas estructurales y no estructurales de cualquier
patógeno. La secuencia o las secuencias de la ARNasa pueden ser
sustituidas por cualquier secuencia enzimática que interfiera en el
ciclo vital del patógeno. Por otra parte, el ejemplo 3 puede ser
combinado con los ejemplos 1-2 y 4-8
en cualquier combinación.
Para generar una inmunotoxina expresada en el
apoplasto, se fusionó el scFv24 específico de TMV a un péptido señal
de mamífero N-terminal y a una toxina
C-terminal. El péptido señal de la cadena ligera
N-terminal de ratón del anticuerpo original (mAb24)
utilizado para generar scFv24 fue utilizado para dirigir las
proteínas de fusión a la ruta secretora. El dominio III de la
exotoxina de Pseudomonas (PE) fue seleccionado para la fusión
con el extremo C de scFv24. El dominio III de la exotoxina de
Pseudomonas media la ribosilación con ADP del factor de
elongación 2, que detiene la síntesis de proteínas y ocasiona la
muerte celular. Para asegurar el correcto plegado de los fragmentos
de anticuerpo de cadena sencilla, el constructo de ADNc contenía el
conector de la celobiohidrolasa I (CBHI) de Trichoderma reesi
(Mallender y Voss, 1994, J. Biol. Chem. 269,
199-206) entre el fragmento scFv24 y el dominio III
de la PE. Se fusionó una etiqueta epitópica de 12 restos aminoácido
(tag54) al extremo C por medio del conector Gly_{4}Ser para
permitir la detección de la proteína recombinante en extractos
vegetales.
El dominio III de la PE fue amplificado mediante
PCR a partir del plásmido PE38 (Theuer y col., Cancer Res 15,
340-347 (1993)) utilizando los cebadores
PE400-directo 5'-GCG GAA TTC GAC GTC
GCC ATG GCC TTC CTC GGC GAC GGC GGC GAC-3' (SEC ID
NUM: 16) y PE-inverso 5'-GCG AAG CTT
GTC GAC CGG CGG TTT GCC GGG CTG GCT G-3' (SEC ID
NUM: 17). Los cebadores contenían los sitios de restricción
EcoRI, AatII y NcoI (PE400 directo) y SalI y
HindIII (PE-inverso) para la clonación. El
fragmento de la PCR fue subclonado por medio de EcoRI y
HindIII en pUC18 dando como resultado el constructo
PE400-intermedio y la secuencia fue verificada
mediante secuenciación. Para generar la inmunotoxina, se separó la
secuencia scFv29 de biscFv2429-apoplasto en pUC18
(Fischer y col., Eur. J. Biochem. 262,
810-816 (1999)) mediante AatII y SalI
y se intercambió el fragmento AatII (sitio de restricción interno) y
SalI de PE400-intermedio. Finalmente, el fragmento
EcoRI y SalI que contenía la región 5' no traducida de
la chalcona sintasa, la señal líder de la cadena ligera de mAb24
(Voss y col., 1995), el scFv24, el conector CBHI y el dominio III de
PE fue subclonado en los sitios de restricción EcoRI y
SalI del derivado pSS que contenía el promotor 35S
intensificado (Kay y col., 1987), la etiqueta epitópica tag54 y la
secuencia de terminación de CaMV dando como resultado el constructo
de expresión vegetal final pscFv24-PE400 (Figura
13).
La generación de N. tabacum cv. Petite
Havana SR1 transformado estable y de bioanálisis para analizar los
efectos biológicos de scFv24-PE400 en plantas de
tabaco transgénicas está progresando. Sin embargo,
PE280-tag29 fue expresado transitoriamente en hojas
de tabaco y se detectó un producto ligeramente degradado en
extractos vegetales de hojas de tabaco transformadas
transitoriamente, indicando que PE280-tag29 es
expresado y secretado muy probablemente en el apoplasto y por lo
tanto no es tóxico para las células vegetales (ver ejemplo 7). Por
consiguiente, la expresión de la imunotoxina
scFv24-PE400 no será tóxica para las plantas.
La fusión scFv24-PE
(scFv24-PE400) será secretada al apoplasto de
plantas de tabaco transgénicas. Durante la infección por TMV la
proteína de fusión se unirá a la partícula del virus por medio de
scFv24 (como se muestra para rAb24 de tamaño normal) y los viriones
de TMV que entran en la célula llevarán la fusión
scFv24-toxina. PE400 media la ribosilación con ADP
del factor de elongación 2, que detiene la síntesis de proteínas y
causa la muerte celular. PE es un toxina muy eficaz, ya que sólo se
requieren unas pocas moléculas para destruir la célula infectada,
evitando de ese modo la replicación y la diseminación del virus,
conduciendo a plantas altamente resistentes.
Una fusión C- o N-terminal de un
gen de scFv del anticuerpo específico para la proteína de la
envuelta (scFv24) con un ADNc que codifica un gen de la ARNasa (por
ejemplo ARNasa E de E. coli) da como resultado una proteína
de fusión scFv-enzima que puede ser dirigida al
citoplasma vegetal - o a orgánulos celulares, membranas, o al
apoplasto para interferir en la replicación viral.
Semejante fusión scFv-ARNasa fue
diseñada basándose en el scFv24 específico de TMV que se une a los
viriones de TMV intactos en lugar de a la proteína de la envuelta
sola. Este scFv24 fue elegido para dirigir el ARN viral en el
momento más temprano del ciclo de infección viral para actuar
inmediatamente sobre el ARN viral liberado tras el desensamblaje
viral. Un segundo constructo está basado en una fusión
scFv-ARNasa específica de 30 K que sigue la misma
estructura dada en la Fig. 14 basada en el scFv24. Este scFv se
describe en el Ejemplo 5 (scFv 30-1 o scFv
30-2) y será expresado simultáneamente con la fusión
scFv24-ARNasa E en plantas doblemente transgénicas
transformadas con ambos constructos. Para la fusión a los
anticuerpos scFv mencionados antes se seleccionó la ARNasa E de
E. coli (Claverie-Martin y col., J. Biol.
Chem. 266, 2843-2851] y se conectó al scFv tras la
amplificación mediante PCR utilizando tecnologías de clonación
normalizadas conocidas por los expertos en la técnica.
Se repitieron las etapas 1) a 16) del ejemplo 1
y/o las etapas 1) a 2) del ejemplo 2 con las siguientes
adaptaciones.
- 1)
- El dominio de redireccionamiento transmembrana enumerado en el ejemplo 1 es eliminado pero las secuencias de ancla C-terminal y conectora del ejemplo 2 se pueden mantener.
- 2)
- La secuencia señal N-terminal del ejemplo 1 es remplazada por un monómero de la proteína de la envuelta de TMV (N-terminal) localizado aguas arriba y después conectada por medio de un conector flexible al ADNc del anticuerpo recombinante.
- 3)
- La proteína de fusión es expresada en el citosol.
- 4)
- Alternativamente, el dominio transmembrana es remplazado por un conector que permite la fusión C-terminal con el monómero de la proteína de la envuelta de TMV. La proteína de fusión es expresada en el citosol (sin secuencia señal N-terminal) o enviada a la ruta secretora por medio de un péptido señal N-terminal.
Cualquier experto en la técnica reconocerá que
estas etapas pueden ser seguidas para cualquier otro patógeno
seleccionando anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos
para el patógeno diana. Por ejemplo, se pueden originar anticuerpos
contra proteínas estructurales y no estructurales de cualquier
patógeno. La secuencia o las secuencias de la proteína de la
envuelta N-terminales pueden ser sustituidas por
cualquier secuencia (por ejemplo Glutation
S-Transferasa, tiorredoxina, proteínas del
movimiento de virus vegetales, replicasa, proteínas mínimas o
dominios de las mismas) que estabilice un anticuerpo recombinante
expresado en el citosol e interfiera en el ciclo vital del patógeno.
Además, el ejemplo 4 puede ser combinado con los ejemplos
1-3 y 5-8 en cualquier
combinación.
Una proteína expresada citoplásmicamente (la
proteína de la envuelta del virus del mosaico del tabaco) fue
seleccionada como pareja de fusión para analizar su efecto sobre la
función y la estabilidad de scFv24 específico de TMV. La proteína de
la envuelta del virus del mosaico del tabaco (CP) fue clonada 5'
aguas arriba del scFv24 (Figura 15).
La proteína de la envuelta (CP) pareja de fusión
génica del TMV fue amplificada mediante PCR. Los ADNc fueron
amplificados a partir de un clon de ADNc de TMV como molde. Los
cebadores directos introducían un sitio de restricción NcoI
(extremo 5') y los cebadores inversos una secuencia conectora
C-terminal (Gly_{4}Ser) y un sitio de restricción
AatII (extremo 3'). Se utilizaron los siguientes cebadores
directo e inverso para la amplificación mediante PCR:
CP-directo 5'-ACT GCG CCA TGG CTT
ACA GTA TCA CT-3' (SEC ID NUM: 20),
CP-inverso 5'-CCG TCA GAC GTC AGA
ACC TCC ACC TCC ACT TCC GCC GCC TCC AGT TGC AGG ACC AGA GGT CCA AAC
CAA ACC-3' (SEC ID NUM: 21). Los fragmentos de la
PCR restringidos con 5'-NcoI y 3'-AatII fueron
subclonados en un derivado de pUC18 conteniendo el scFv24 específico
de TMV (Zimmermann y col., 1998) flanqueado por la región 5'\Omega
no traducida (secuencia omega) y la región 3' no traducida
(secuencia Pw) de TMV (Schmitz y col., Nucleic Acids res 24 (1996)
257-263); (Gallie y Kobayashi, Gene 142 (1994)
159-165). Se añadieron una secuencia His6- (H) o
KDEL (K) C-terminal a scFv24 del constructo de
fusión mediante PCR utilizando los cebadores inversos:
His6-inverso 5'-CTA CCC CTC GAG TTT
AGT GAT GGT GAT GGT GAT GAG CGG CCG CGT CGA CTG CAG AGA CAG TGA CCA
GAG TC-3' (SEC ID NUM: 22) Y
KDEL-inverso 5'-CCC TCA CTC GAG TTT
AGA GCT CAT CTT TCT CAG ATC CAC GAG CGG CCG CAG AAC CTC CAC CTC CGT
CGA CTG CAG AGA CAG TGA CCA G-3' (SEC ID NUM: 23).
La posterior ligadura de los fragmentos EcoRI-AscI en
el vector de expresión vegetal pSS, conteniendo un promotor 35S
doblemente intensificado (Voss y col., 1995), dio como resultado los
constructos de expresión final CP-scFv24H y
CP-scFv24K, que fueron utilizados para analizar la
acumulación de proteína de fusión scFv en el citoplasma (Figura
15A).
Para el redireccionamiento y la retención en el
RE, la secuencia líder optimizada del codón vegetal derivado de la
cadena ligera del anticuerpo monoclonal murino mAb24 (Voss y col.,
1995) fue integrada entre la región 5' \Omega no traducida y
scFv24 del constructo citoplásmico conteniendo la secuencia KDEL,
dando el vector de expresión vegetal
L-CP-scFv24K (Figura 15C). Para
dirigir el mismo constructo al apoplasto, se remplazó la secuencia
KDEL C-terminal por una secuencia His 6, dando el
vector de expresión vegetal
L-CP-scFv24H (Figura 15D).
Se utilizaron dos vectores de expresión que
carecían de secuencia líder y una pareja de fusión
N-terminal pero conteniendo scFv24 con una secuencia
His6 o KDEL C-terminal como controles para la
acumulación citoplásmica (scFv24H, scFv24K, Figura 15B).
La acumulación de proteína de fusión funcional en
el RE fue analizada mediante la expresión transitoria en hojas de
N. tabacum cv. Petite Havana SR1 y el scFv24 funcional fue
detectado mediante un ELISA específico de TMV. Los constructos de
expresión vegetal fueron transferidos a A. tumefaciens GV3101
por transformación en N_{2} (Höfgen y Willmitzer, Nucleic Acids
Res 16 (1988) 9877). La transformación transitoria de N.
tabacum cv. Petite Havana SR1 se realizó como se ha descrito
(Kapila y col., Plant Science 122 (1996) 101-108).
Para extraer las proteínas solubles totales, se congelaron hojas de
tabaco y se trituraron en nitrógeno líquido y se analizó el nivel de
proteína de fusión scFv mediante ELISA y transferencia Western
(Fischer y col., Methods in biotechnology Vol. 3: Recombinant
proteins in plants: Production and Isolation of Clinically useful
compounds. Humana Press, Totowa, NJ (1998), ELISA III). Se utilizó
un fragmento Fab de mAb24 como patrón del ELISA. Se determinaron las
concentraciones de proteína con BioRad Protein Assay utilizando
seralbúmina bovina (BSA) como patrón.
El nivel de scFv24 funcional detectado para la
proteína de fusión L-CP-scFv24K
retenida en el RE, ascendía a 1 \mug por gramo de material foliar
(media de 0,6 \mug por gramo de materia foliar, Figura 16).
Para verificar la integridad de las proteínas de
fusión scFv24, se llevó a cabo un análisis de transferencia western
utilizando L-CP-scFv24K purificada
por afinidad. Para la purificación por afinidad de las proteínas de
fusión scFv de extractos vegetales (preparados como se ha descrito
antes), se acoplaron viriones de TMV a una matriz de sefarosa
activada con CNBr. Se resuspendieron 300 mg de matriz de sefarosa 4B
activada con CNBr (Pharmacia, Freiburg, Alemania) en 1 ml de PBS a
pH 7,4 (NaCl 1,37 M, KCl 27 mM, Na_{2}HPO_{4} 81 mM,
KH_{2}PO_{4} 15 mM) y se incubaron durante 1 hora a la
temperatura ambiente en un aparato giratorio. La matriz fue
sedimentada (5.000 x g, 5 minutos, temperatura ambiente),
resuspendida en 1 ml de PBS, pH 7,4 conteniendo 10 mg de viriones de
TMV e incubada durante 2 horas a la temperatura ambiente en un
aparato giratorio. La matriz con el TMV acoplado fue centrifugada
(5.000 x g, 5 minutos, temperatura ambiente), resuspendida en 1 ml
de PBS pH 7,4 conteniendo BSA al 1% (p/v) y leche en polvo al 1%
(p/v) y rotada durante la noche a 8ºC para bloquear los sitios de
unión no específicos. La matriz con el TMV acoplado fue lavada tres
veces con PBS pH 7,4 y resuspendida en 1 ml de PBS pH 7,4. Se
añadieron 30 \mul de matriz con TMV a 1,5 ml de extracto vegetal
(preparado como se ha descrito antes) y se incubaron durante 1 hora
a la temperatura ambiente en un aparato giratorio. Después la matriz
con TMV se lavó tres veces con PBS y las proteínas unidas a la
matriz con TMV fueron solubilizadas en el tampón de la muestra y
analizadas mediante SDS-PAGE (Laemmli, Nature 227
(1970) 680-685) y tinción con azul brillante de
Coomassie. Las proteínas de fusión intactas fueron detectadas con el
tamaño esperado de 49,5 kDa para
L-CP-scFv24K (Figura 17).
Para la acumulación citoplásmica transitoria de
proteínas de fusión se utilizaron hojas de N. benthamiana.
Los constructos del vector fueron transferidos a A.
tumefaciens GV3101 mediante transformación en N_{2} líquido
(Höfgen y Willmitzer, Nucleic Acids res. 16: 9877 (1988)). La
transformación transitoria de N. benthamiana se realizó como
se ha descrito (Kapila y col., Plant Science 122 (1996)
101-108). Para extraer las proteínas solubles
totales, las hojas de tabaco fueron congeladas y trituradas en
nitrógeno líquido y el nivel de proteína de fusión scFv fue
analizado mediante ELISA y transferencia western (Fischer y col.,
Methods in biotechnology Vol. 3: Recombinant proteins in plants:
Production and Isolation of Clinically useful compounds. Humana
Press, Totowa, NJ (1998), ELISA III). Se utilizó un fragmento Fab de
mAb24 como patrón para el ELISA.
Los análisis utilizando los constructos que
contenían la secuencia His6 C-terminal (Figura 15)
demostraron que CP-scFv24H era detectable en un
ELISA específico de TMV, con un nivel de proteína medio de 0,9 ng de
scFv24 activo funcional por gramo de material foliar.
Los niveles de proteína del constructo de control
scFv24H que carecía de una pareja de fusión
N-terminal estaban por debajo del límite de
detección del ELISA (0,5 ng) (Figura 18).
Los autores de la presente invención evaluaron la
influencia de una secuencia KDEL C-terminal sobre la
acumulación de proteínas de fusión scFv24. La adición de la
secuencia KDEL C-terminal aumentaba el nivel de la
proteína de fusión (Figura 18). El nivel medio de proteína de
CP-scFv24 etiquetada con KDEL era 3 veces superior
que el de CP-scFv24H (2,9 ng por gramo de material
foliar). El nivel del constructo de control scFv24K estaba por
debajo del umbral de detección del ELISA. Un ELISA de control
realizado sin el antígeno TMV no dio señal, indicando que los
valores de CP-scFv24H y CP-scFv24K
no se podían corresponder con la unión específica de las fusiones de
CP a sueros policlonales anti-TMV.
Después los autores de la presente invención
sometieron a ensayo a qué nivel CP-scFv24K expresada
citoplásmicamente se acumulaba en las plantas de tabaco
transformadas establemente. Se generó N. tabacum cv. Petite
Havana SR1 transgénico mediante transformación de discos foliares
con A. tumefaciens recombinante y se generaron plantas
T_{0} transgénicas a partir de callos transformados (Horsch y
col., Science 227:1229-1231 (1985)). La extracción
de las proteínas solubles totales de hojas de tabaco y el posterior
análisis de scFv24 mediante ELISA se realizaron como describen
Fischer y col., (Fischer y col., En: Cunningham C, Porter AJR (eds),
Recombinant proteins in plants: Production and Isolation of
Clinically useful compounds, págs. 45-68. Vol. 3,
Humana Press, Totowa, NJ (1988)). Para el ELISA se utilizó antisuero
anti-mAb24 (Zimmermann y col., Molecular Biology
Breeding 4:369:379 (1998)) como anticuerpo primario combinado con
una dilución 1:5.000 de anticuerpos secundarios conjugados con
fosfatasa alcalina anti-conejo de cabra (Jackson
Immuno Research Laboratories, West Grove, PA) (Fischer, Methods in
biotechnology Vol. 3: Recombinant proteins in plants: Production and
Isolation of Clinically useful compounds. Humana Press, Totowa, NJ
(1998), ELISA III).
Los niveles de proteína de
CP-scF24K mostraban una media de 1,2 ng por gramo de
material foliar en 12 plantas de N. tabacum cv. Petite Havana
SR1 transgénicas analizadas. El nivel máximo de
CP-scFv24K extraída con detergente era de 2,3 ng por
g de tejido foliar, por tanto superior a scFv24 sin pareja de fusión
y secuencia KDEL (máximo 1,8 ng/g de tejido foliar; media 0,8 ng/g
de tejido foliar; Zimmermann y col., Molecular Breeding 4
(1998).
Los bioanálisis para analizar los efectos
biológicos de CP-scFv24K citosólico en N.
tabacum cv. Petite Havana SR1 transgénico están progresando.
Basándose en otros experimentos de inoculación, se puede esperar un
incremento de la resistencia viral cuando se compara con scFv24
citosólico sin pareja de fusión que crea un fenotipo resistente,
basado en el incremento de los niveles de proteína scFv24 y la
presencia de secuencias de TMV-CP y
TMV-ARN para inducir resistencia al virus mediada
por CP y mediada por ARN además de la resistencia del anticuerpo
primario.
Las etapas 1) a 16) del ejemplo 1 y/o 2) del
ejemplo 2 se repiten con las siguientes adaptaciones.
- 1)
- Se originan anticuerpos específicos que reconocen la proteína del movimiento 30K de TMV mediante tecnología del hibridoma, rastreo de presentación en fagos o ribosomas y posterior clonación para diseñar anticuerpos de cadena sencilla o cualquier forma recombinante de los mismos.
- 2)
- El anticuerpo es expresado en el citosol o enviado a la ruta secretora o está localizado en la membrana. El anticuerpo recombinante puede causar el efecto biológico deseado sin una pareja de fusión de manera que la secuencia de la toxina puede ser omitida.
- 3)
- Para el ELISA y la resonancia superficial de plasmón el antígeno de ensayo para la función del anticuerpo es la proteína del movimiento 30K de TMV nativa o recombinante o dominios de la misma.
- 4)
- Además de los bioanálisis enumerados en el ejemplo 1 las plantas transgénicas generadas serán sometidas a ensayo en cuanto a la resistencia de amplio espectro frente a diferentes cepas virales o géneros virales mediante inoculación de plantas transgénicas con viriones o transcritos infecciosos.
Cualquier experto en la técnica reconocerá que
estas etapas pueden ser seguidas para cualquier otro patógeno viral
seleccionando anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos
para la proteína del movimiento y cualquier dominio funcional. Por
otra parte, el ejemplo 5 puede ser combinado con los ejemplos
1-4 y 6-8 en cualquier
combinación.
Se generaron anticuerpos recombinantes
específicos de la proteína del movimiento (MP) mediante presentación
en fagos utilizando proteína del movimiento de TMV 30K expresada
bacterianamente fusionada a GST para facilitar la purificación por
afinidad (Pharmacia GST-System). Se inmunizaron
ratones Balb/c hembra utilizando un protocolo normalizado con
proteínas de fusión GST-30K solubles o dominios de
las mismas. La estructura nativa de GST y de 30K fusionada fue
sometida a ensayo mediante análisis de la actividad GST (Smith y
col., Gene 67 (1988), 31-40) y unión de ARN a 30K
(Vaquero, J. Gen. Virol. 78 (1997) 2095-2099). Las
regiones V_{H}- y V_{L}- del anticuerpo fueron rescatadas con
posterioridad de las células plasmáticas de ratones hiperinmunizados
y ensambladas a anticuerpos scFv utilizando un protocolo
SOE-PCR (Mc Cafferty y col., Nature 348 (1990),
552-554). Se desarrolló y se utilizó un grupo
ampliado de cebadores de la PCR para la amplificación específica de
la familia de V_{H} y V_{L} (Tabla 4). Utilizando este protocolo
se generó un banco > 10^{6} scFv diferentes para la
presentación de scFv sobre la superficie de fagos en fusión a la
proteína M13 piloto del gen III. Utilizando la presentación en fagos
se pudo aislar y caracterizar un panel de 10 anticuerpos específicos
diferentes de la proteína del movimiento que mostraban todos una
fuerte afinidad de unión a la proteína de fusión
GST-30K expresada en bacterias y no a la
GST-proteína sola expresada en bacterias (Figura
20a). El dominio de unión de estos 10 anticuerpos de 30K fue
cartografiado mediante la expresión de 5 dominios distintos de 30K y
análisis ELISA (Figura 20b). Para la evaluación de los efectos
biológicos de los anticuerpos anti-30K expresados
por la planta se clonaron con posterioridad los 6 aglutinantes más
fuertes en vectores de expresión vegetal y se expresaron y
analizaron mediante evaluación fenotípica y análisis moleculares
para evaluar sus efectos sobre la infección viral con TMV. A partir
de estos experimentos dos líneas vegetales que expresaban los
fragmentos de anticuerpo scFv 30-1 y scFv
30-2 (Figura 21) mostraban una inhibición
significativa de la infección por TMV confirmada por un fenotipo
sano de las plantas, una cantidad reducida y una acumulación
retardada de proteína de la envuelta de TMV en comparación con N.
tabacum Petite Havana SR1 de tipo salvaje.
Para expresar los anticuerpos
anti-30K en el citosol de N. tabacum cv.
Petite Havana SR1, se clonaron los fragmentos de anticuerpo en el
vector de expresión vegetal pSSH1 (Figura 19) (Voss y col.,
Molecular Breeding 1 (1995), 39-50). La clonación
del fragmento de anticuerpo biespecífico BISCA2429, que se utilizó
como constructo parental para la expresión del anticuerpo
anti-30K, incluyendo la secuencia Omega derivada de
TMV, en el vector de expresión vegetal pSSH1 ha sido descrita
(Fischer, y col., (1999) Eur. J. Biochem. 262,
810-816). Para la clonación de los scFv resultantes
en este vector los cebadores utilizados para establecer el banco de
presentación en fagos contenía los sitios para las enzimas de
restricción NcoI y SalI que facilitaban la clonación
en marco en el constructo intermedio pUC18-BISCA2429
(secuencia omega 5'-UTR de TMV, scFv, etiqueta
His6). Para la expresión en células vegetales, se subclonó el
fragmento EcoRI/XbaI (Figura 19) de este constructo intermedio en
los sitios de restricción EcoRI y XbaI del vector de expresión
vegetal pSS conteniendo el promotor intensificado 35S (Kay y col.,
Science 236 (1987), 1299-1302) y la secuencia de
terminación de CaMV (Figura 19). Los constructos finales contenían
una casete de expresión que empezaba con el promotor 35 SS seguido
de la secuencia omega 5'-UT de TMV, el scFv
específico de 30K, una etiqueta His6 para la purificación por
afinidad y la 3'-UTR de CaMV (Figura 19 y 21).
Una vez completado el análisis de scFv in
vitro, las plantas de tabaco estaban transformadas establemente
para el ensayo in vivo de los efectos de scFv sobre la
infección por TMV. Se generó N. tabacum cv. Petite Havana SR1
transgénico mediante transformación de discos foliares utilizando
A. tumefaciens recombinante y se generaron plantas T_{0}
transgénicas a partir de callos transformados (Horsch y col.,
Science 227 (1985), 1229-1231). A partir la
generación T_{0} se seleccionaron numerosas plantas y se
seleccionaron progenies T_{1} y T_{2} homozigotas para la
evaluación fenotípica y molecular de la resistencia mediada por el
anticuerpo scFv.
Para someter a ensayo si la expresión de scFv
específica anti-30K en plantas transgénicas tenía
efecto biológico sobre la replicación y la diseminación de TMV
dentro de la planta, se estableció un análisis de proteína de la
envuelta de TMV basado en el transcurso del tiempo donde la cantidad
de proteína de la envuelta viral era controlada en las hojas
superiores tras la infección de plantas transgénicas y no
transgénicas con TMV vulgare. La extracción de la proteína de
la envuelta de TMV de hojas de tabaco infectadas sistémicamente y el
posterior análisis sobre SDS-PAGE (Laemmli, Nature
227 (1970), 680-685) fue realizada como describen
Fischer y col., (Fischer y col., (1989) En: Cunningham C, Porter AJR
(eds), Recombinant proteins in plants: Production and Isolation of
Clinically useful compounds, págs. 45-68. Vol. 3,
Humana Press, Totowa, NJ). El control de la expresión de la proteína
de la envuelta en hojas de tabaco de tipo salvaje y de control
infectadas sistémicamente mediante transferencia western reveló
cantidades crecientes de la proteína de la envuelta de TMV. En el
caso de plantas que expresan los scFv específicos de 30K, la
acumulación de proteína de la envuelta se retrasaba
significativamente y los niveles eran significativamente más bajos
en comparación con N. tabacum cv. Petite Havana SR1 de tipo
salvaje, y N. tabacum cv. Petite Havana SR1 transgénico que
expresaba un scFv no relacionado, utilizado como control (Figura
22). Aunque la proteína de la envuelta era detectable en todas las
plantas transgénicas éstas no desarrollaban ningún síntoma o sólo
síntomas suaves basándose en las evaluaciones fenotípicas (Tabla
3).
Para analizar los efectos biológicos de los scFv
específicos de 30K sobre la resistencia viral, se inocularon las
progenies T_{1} y T_{2} de líneas vegetales que expresaban scFv
30-1 y scFv 30-2 (Figura 21) con
TMV. Se recogieron las semillas de diferentes plantas T_{0} y se
hicieron germinar en medio de agar MSMO suplementado con sacarosa al
2% (p/v), 0,4 \mug/ml de tiamina, 0,4 \mug/ml de glicina, 0,1
\mug/ml de ácido nicotínico, 0,1 \mug/ml de piridoxina y 75
\mug/ml de kanamicina. Las plantas en germinación fueron
transferidas a tierra y las plantas T_{0} totalmente desarrolladas
fueron autofertilizadas para la recolección de las semillas. Se
utilizaron las plantas T_{1} y T_{2} homozigotas resistentes a
la kanamicina para la inoculación con TMV-vulgare (40 ng/ml).
Las plantas de cuatro a seis semanas de edad fueron infectadas
mecánicamente en dos hojas superiores utilizando 200 \mul de la
suspensión que contenía TMV. Se inocularon como se ha descrito
plantas de tipo salvaje o transgénicas de N. tabacum cv. Petite
Havana SR1 que producían el scFv específico de tumores T84.66 como
control. Los síntomas de enfermedad fueron controlados 7 a 14 días
después de la inoculación (p.i.). Tras la infección de las dos hojas
superiores con TMV, se controló la diseminación sistémica del virus
mediante evaluación fenotípica de las hojas superiores al cabo de 7,
9, 11 y 14 días p.i. Todas las plantas de control fueron infectadas
sistémicamente, y mostraban cantidades crecientes de proteína de la
envuelta viral. Las plantas T_{1} y T_{2} transgénicas derivadas
de diferentes líneas vegetales T_{0} que expresaban scFv
30K-1 y scFv 30K-2 no mostraban
síntomas de enfermedad visibles o mostraban síntomas débiles en las
hojas superiores (Tabla 3). En los casos en los que el desarrollo de
síntomas era visible, éste coincidía entre las plantas derivadas de
una línea vegetal. En el caso de scFv 30K-2 se
obtuvo una línea vegetal que mostraba síntomas graves en la
generación T_{1} así como en la T_{2}. Esto puede ser debido a
efectos posicionales del transgen o al efecto silenciador del
transgen en la generación T_{1} y T_{2}. Además, el análisis
basado en SDS-PAA y la posterior transferencia
western de la acumulación de proteína de la envuelta de TMV a lo
largo de 72 horas p.i. en plantas infectadas demostró que todas
estas plantas acumulaban partículas de virus en las hojas superiores
aunque en un menor grado (Figura 22). Esto conduce a la conclusión
de que la expresión del scFv específico de la proteína del
movimiento puede evitar el comienzo de los síntomas y retrasar la
acumulación de CP tras la infección por TMV.
Para ampliar la aplicación de anticuerpos
antivirales en plantas transgénicas para el diseño de resistencia se
expresó la proteína del movimiento 3a del virus del mosaico del
pepino en E. coli en forma de una fusión con GST (Vaquero y
col., (1997) J. Gen. Virol. 78, 2095-2099). Se
generaron anticuerpos anti-3a específicos mediante
presentación en fagos y tecnología de hibridoma utilizando la
proteína del movimiento de CMV 3a expresada bacterianamente como ya
se ha descrito para la proteína del movimiento 30K de TMV (Figura
19). El mAb 3a-2 fue clonado a partir de células de
hibridoma (Krebber y col., (1997), J. Immunol. Methods 201,
35-55) y el scFv resultante 3a-2 fue
caracterizado in vitro mediante técnicas de ELISA (Figura
23a). Utilizando el cartografiado de epítopos mediante presentación
de péptido se pudo cartografiar el epítopo del anticuerpo para una
región distinta de la proteína del movimiento 3a.
| \begin{minipage}[t]{160mm} Evaluación fenotípica de plantas de N. tabacum transgénicas que expresan scFv específico de 30K de TMV en la generación T_{1} y T_{2}. Se sometieron a ensayo diferentes plantas de la generación T_{1} y T_{2} en cuanto a los síntomas de enfermedad fenotípicamente visibles tras la infección de dos hojas superiores con 40 ng/ml de TMV. Los síntomas de la enfermedad fueron controlados a los 7, 9, 11 y 14 días p.i. en las hojas superiores. \end{minipage} | ||||
| Plantas T_{1} | Plantas T_{2} | |||
| Constructo | Núm. de plantas | Síntomas | Núm. de plantas | Síntomas |
| infectad. | infectadas | |||
| PSS-scFv-30-1 | 55 | sin síntomas tras 11 | 22 | síntomas débiles tras 14 |
| a 14 días | días en todas las plantas | |||
| PSS-scFv-30-2 | 124 | síntomas débiles | 65 | ninguno a débil, |
| o medios, | síntomas | |||
| raramente graves | raramente graves |
Cebadores utilizados para amplificar dominios de
anticuerpos V_{H} y V_{L} murinos para la generación de scFv.
Estos cebadores fueron utilizados para clonar scFv antes de la
presentación en fagos así como para clonar scFv de líneas celulares
de hibridoma pre-existentes ("rescate de
hibridoma"). Se enumera la especificidad de todos los cebadores
según la base de datos Kabat (Kabat: "Sequences of immunological
interest", 1991), todos los cebadores contienen un saliente de 10
pb no codificador 5' para facilitar la digestión con enzimas de
restricción y la clonación. Para la clonación de fragmentos V_{H}
se utilizaron las enzimas de restricción Sf I, Fse I,
para la clonación de los fragmentos V_{L} las enzimas de
restricción Asc I/Not I.
\vskip1.000000\baselineskip
Las etapas 1) a 16) del ejemplo 1 y/o las etapas
1) a 2) del ejemplo 2 se repiten con las siguientes
adaptaciones:
- 1)
- Se originan anticuerpos específicos que reconocen la replicasa 54K TMV/183K TMV mediante tecnología de hibridoma y de presentación en fagos o ribosomas utilizando las proteínas 54K de TMV/183K de TMV como antígeno y se clonan para diseñar fragmentos de anticuerpos de cadena sencilla o cualquier forma recombinante de los mismos incluyendo scFv biespecíficos.
- 2)
- Estos anticuerpos son expresados en el citosol o dirigidos a la cara citoplásmica de las membranas intracelulares, donde se forman los complejos de replicación del virus, utilizando una secuencia C-terminal como se describe en el ejemplo 2. El anticuerpo recombinante puede causar el efecto biológico deseado sin fusión con una toxina.
- 3)
- Para el ELISA y la resonancia superficial de plasmón el antígeno de ensayo para la función del anticuerpo son las proteínas de la replicasa 54K y 183K de TMV recombinante o dominios de las mismas.
- 4)
- Además de los bioanálisis enumerados en el ejemplo 1, las plantas transgénicas generadas serán sometidas a ensayo en cuanto a la resistencia de amplio espectro contra diferentes cepas virales o géneros virales mediante inoculación de plantas transgénicas con viriones o transcritos infecciosos.
Cualquier experto en la técnica reconocerá que
estas etapas pueden ser seguidas para cualquier otro patógeno viral
seleccionando anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos
para la proteína de movimiento y cualquier dominio funcional. Por
otra parte, el ejemplo 6 puede ser combinado con los ejemplos
1-5 y 7-8 en cualquier
combinación.
Un método alternativo para evitar la infección
viral se basa en la expresión intracelular de anticuerpos tales como
los scFv específicos de la replicasa que pueden interaccionar con la
replicasa viral para interferir o inhibir la proliferación viral en
células infectadas. Como se describe en el ejemplo 5 para la
proteína del movimiento 30K la "proteína 54K" de TMV, fue
expresada en E.coli y se generaron anticuerpos utilizando
tecnologías de hibridoma normalizadas asequibles para los expertos
en la técnica. La proteína 54K puede ser considerada como un
componente integrante de la proteína 183K, la principal replicasa de
TMV, puesto que es expresada a partir de su propio ARN subgenómico y
promotor pero comparte el mismo marco de lectura de las últimas
1.400 bases de la proteína 183K. Aquí, son codificadas las regiones
conservadas tales como la Unidad GDD que se pueden encontrar en
todas las replicasas virales vegetales. Las regiones V_{H} y
V_{L} del anticuerpo fueron clonadas a partir de los hibridomas
utilizando el mismo grupo de cebadores descrito en el ejemplo 5 y
ensambladas en los anticuerpos scFv utilizando procedimientos de
clonación normalizados (Krebber y col. (1997), J. Immunol. Methods
201, 35-55). La actividad del anticuerpo scFv
resultante scFv 54-1 (Figura 23a) fue controlada
mediante detección por transferencia western y ELISA utilizando
GST-54K expresada bacterianamente. El epítopo del
scFv 54-1 fue determinado mediante presentación de
péptidos (Figura 25b) y pudo ser cartografiado para una región
distinta en el gen 54K/183K de TMV.
Las proteínas virales alternativas para el diseño
de resistencia viral son las "proteínas mínimas virales
vegetales" 1min, 2min y 3min como se ha descrito para PLRV. Una
característica de la proteína mínima 3min es su capacidad para
unirse a ácidos nucleicos por medio de la cual se une
preferentemente a ARN de hebra sencilla (Figura 24) (Prüfer y col.,
(1992) EMBO Journal 11, 1111-1117). Se generaron
anticuerpos específicos para 3min mediante tecnología de hibridoma
utilizando GST-3min expresada bacterianamente como
antígeno y el anticuerpo scFv3min fue clonado a partir de células de
hibridoma (Figura 23c). Puesto que la proteína 3min de PLRV se
describe como una proteína de unión a ácido nucleico la estructura
nativa de GST-3min expresada bacterianamente podría
ser confirmada mediante análisis de unión a ácido nucleico
utilizando GST 3min y transcritos in vitro de ARN y ADN
viral. Utilizando el anticuerpo scFv 3min la actividad de unión a
ARN/ADN de la proteína 3min pudo ser completamente bloqueada in
vitro. Utilizando el cartografiado de epítopos mediante
presentación de péptidos se pudo cartografiar el epítopo del
anticuerpo para una región distinta de la proteína mínima 3min por
medio de lo cual el epítopo identificado por la presentación de
péptidos se solapaba con la región de clonación GST del constructo
GST-3min (Figura 25c).
Para la elucidación de epítopos virales
reconocidos por los anticuerpos recombinantes desarrollados se
utilizaron dos bancos de presentación de péptidos para el
cartografiado epitópico de anticuerpos monoclonales (Cortese y col.
(1995), Curr. Opin. Biotechnol. 6, 73-80). Ambos
bancos expresan péptidos 9méricos al azar en el extremo N de la
proteína pVIII de fagos filamentosos. Un banco presenta los péptidos
en forma lineal, el otro banco presenta los péptidos flanqueados por
dos restos cisteína que forman un puente disulfuro, restringiendo el
péptido a una estructura de bucle.
Para identificar los epítopos de scFv 29, scFv
54-1, y scFv 3min se recubrieron inmunotubos
utilizando 20 \mug de antígeno purificado por afinidad utilizando
un procedimiento normalizado asequible por cualquier experto en la
técnica (Cortese y col., 81995) Curr. Opin. Biotechnol. 6,
73-80). Para la primera serie del reconocimiento y
selección ("panning"), se incubaron 5 x 10^{12} fagos en 1 ml
de PBS con el antígeno inmovilizado (16 h, 4ºC). Tras un lavado
extenso (15 veces PBST y 5 veces PBS), los fagos unidos se hicieron
eluir con 1 ml de Glicina-HCl pH 2,2, BSA al 0,1%
(p/v) (10 min, 20ºC), se neutralizaron con 60 \mul de Tris 2M y se
utilizaron para la infección de E. coli. El título de fagos
eluidos fue determinado cultivando en placa 100 \mul de la
bacteria infectada sobre 2x placas TY-Amp y contando
las unidades formadoras de colonias. Los factores de enriquecimiento
fueron calculados tras la comparación con un reconocimiento y
selección de control utilizando BSA como antígeno. Los fagos
monoclonales de la tercera serie de reconocimiento y selección
fueron sometidos a ensayo en cuanto a la reactividad con sus
antígenos mediante ELISA de los fagos.
Los fagos identificados positivamente del ELISA
de los fagos, utilizando ambos bancos de fagos individualmente sobre
todos los scFv, fueron secuenciados con posterioridad. Las
secuencias obtenidas fueron alineadas y se determinó la secuencia
consenso resultante. En los tres casos (scFv 29, scFv
54-1 y scFv 3min) se pudo determinar una secuencia
consenso (Figura 25). La secuencia consenso resultante también pudo
ser retrocartografiada a la secuencia parental del antígeno contra
el cual se generaron los anticuerpos. Puesto que el banco de
péptidos al azar 9méricos presenta preferentemente péptidos lineales
se considera que los tres epítopos de los scFv representan una
unidad lineal en el antígeno. Los epítopos de scFv29,
scFv54-1 y scFv3min fueron determinados mediante
presentación de péptidos y una secuencia consenso fue cartografiada
para cada scFv (Figura 25). Para los scFv29, la secuencia consenso
fue cartografiada en una región distinta de la proteína de la
envuelta (Figura 25a) y la secuencia consenso de
scFv54-1 fue cartografiada en una región distinta de
la proteína 54K de TMV (Figura 25b). Para el scFv3min la secuencia
consenso contenía parte de las proteínas GST y 3min (Figura 25c) en
el punto en el que 3min se fusionaba con GST. ScFv3min puede ser
considerado útil para diseñar resistencia a virus ya que inhibe la
actividad de unión al ácido nucleico de la proteína 3min (Figura
24).
Se efectúan las siguientes etapas:
- 1)
- Se generan anticuerpos contra viriones de TMV intactos y se generan monoclonales mediante tecnología de hibridoma.
- 2)
- Se clonan líneas celulares de hibridoma y se clonan secuencias de ADNc que codifican las regiones variables de los anticuerpos para generar un anticuerpo de cadena sencilla o cualquier versión recombinante del mismo que se una a los viriones de TMV (scFv24).
- 3)
- El anticuerpo de cadena sencilla que se une a los viriones intactos (scFv24) se fusiona con un ADNc clonado del anticuerpo de cadena sencilla (scFv-epitag29), que se une a un epítopo de aminoácidos específico (epitag29), utilizando un conector flexible tal como el péptido conector de la celobiohidrolasa I (CBHI) de Trichoderma reesi para generar una proteína recombinante que reconoce el patógeno, TMV, y la etiqueta epitópica. El scFv-epitag29 ha sido generado previamente (mediante tecnología de hibridoma convencional y después clonado como un scFv) y el epítopo específico es identificado mediante presentación de péptidos en fagos. Cualquier otro anticuerpo de elevada afinidad que reconozca un epítopo peptídico identificado sería adecuado como medio par de unión con su correspondiente epítopo como el otro miembro.
- 4)
- El gen recombinante de la etapa 3 es insertado en un vector de expresión microbiano o eucariótico.
- 5)
- La especificidad de unión y la función (es decir la especificidad y la afinidad) de la proteína recombinante de la etapa 3 se verifican tras la expresión en un huésped heterólogo, tal como en el periplasma de E. coli.
- 6)
- Se añade una secuencia señal al extremo N del constructo scFv biespecífico recombinante de la etapa 3, para permitir la liberación de la proteína al RE y la secreción al apoplasto tras la expresión en plantas. Se introducirán una región 5' no traducida y una 3' no traducida y una secuencia de una etiqueta para la detección (es decir c-myc) mediante tecnología de ADN recombinante, si fuera necesario.
- 7)
- El gen quimérico de la etapa 6 es insertado en el vector de expresión vegetal, v.g., pSS (Voss y col., 1995). Entre los vectores de expresión vegetales adecuados se incluyen secuencias promotoras, intensificadoras, terminadoras y marcadores de selección adecuados. En el caso de las secuencias marcadoras de selección de transferencia génica sin marcador y sin vector, se pueden omitir las secuencias marcadoras.
- 8)
- El ADNc que codifica una RIP (proteína inactivadora de ribosomas) fusionada por medio de un conector adecuado a la marca epitópica epitag29 (en el extremo N o C), que es específicamente reconocido por el scFv-epitag29, es preparado en paralelo para generar un segundo constructo de expresión independiente que codifica un gen RIP etiquetado.
- 9)
- El gen RIP etiquetado es insertado en un vector de expresión microbiano o eucariótico y la funcionalidad de la fusión RIP-epítopo se verifica tras la expresión en un huésped heterólogo.
- 10)
- Se preparará un segundo vector de expresión vegetal independiente, tal como pSS, conteniendo el gen RIP etiquetado recombinante con un péptido señal N- terminal, como se describe en la etapa 6 y en la etapa 7. la secuencia RIP etiquetada puede ser integrada después o bien en una disposición en tándem sobre el mismo plásmido que la proteína de fusión de la etapa 3 o bien integrada en un segundo plásmido independiente. Obsérvese que las secuencias permanecen discretas incluso si están en una disposición en tándem.
- 11)
- Ambos constructos de expresión vegetal enumerados en las etapas 6 y 10 son transformados en dos líneas vegetales independientes o son transformados simultáneamente en el mismo genoma vegetal, o si la proteína de fusión al anticuerpo de la etapa 3 y la toxina etiquetada de la etapa 10 están integradas en una disposición en tándem ese constructo es transformado en las mismas plantas.
- 12)
- Las plantas regeneradas son rastreadas utilizando el marcador de selección para la integración del gen de fusión en las líneas vegetales independientes o las líneas transformadas simultáneamente de la etapa 11.
- 13)
- Las plantas transgénicas que expresan solamente una cualquiera de la proteína de fusión al anticuerpo de la etapa 3 o la RIP etiquetada epitópicamente de la etapa 10 son cruzadas después sexualmente para dar vástagos que producirán ambas proteínas. Las plantas que producen ambas proteínas, ya sea a partir de esta etapa o de etapas anteriores, producirán complejo de proteínas ensambladas donde los dos partícipes en la unión, el anticuerpo específico del epítopo (scFv-epitag29) y el epítopo se unen y permiten el ensamblaje de un complejo de patogenicida molecular-proteína.
- 14)
- La expresión de la proteína de fusión scFv biespecífica y/o la RIP etiquetada así como el patogenicida molecular ensamblado in vivo es controlada mediante transferencia western de los extractos celulares, ELISA o análisis de resonancia de plasmón superficial. La actividad del scFv biespecífico se verifica mediante ELISA utilizando viriones de TMV intactos como antígeno.
- 15)
- La actividad de los patogenicidas moleculares ensamblados se verifica mediante ELISA y análisis de citotoxicidad.
- 16)
- La localización de la proteína de fusión se verifica mediante imunofluorescencia indirecta, microscopía confocal o microscopía inmunoelectrónica y transferencia western o ELISA o análisis de resonancia de plasmón superficial del fluido de lavado intercelular.
- 17)
- La actividad biológica del patogenicida molecular ensamblado in vivo frente a TMV es analizada mediante bioanálisis de las plantas transgénicas generadas utilizando viriones o transcritos infecciosos.
Cualquier experto en la técnica reconocerá que
estas etapas pueden ser seguidas para cualquier otro patógeno
seleccionando anticuerpos o fragmentos de los mismos específicos
para el patógeno diana. Por ejemplo, se pueden originar anticuerpos
y clonarlos contra proteínas estructurales y no estructurales de
cualquier patógeno. En lugar de RIP, se pueden utilizar toxinas
similares con actividad exterminadora celular o interferencia en la
patogenicidad (ARNasa, ADNasa, etc.). El ensamblaje de patogenicidas
moleculares puede ser logrado utilizando cualquier etiqueta
epitópica y un anticuerpo específico del epítopo dado con una
interacción molecular adecuada y estable in vivo, o cualquier
otro par de proteínas que se unan entre sí. Por otra parte, el
ejemplo 7 se puede combinar con los ejemplos 1-6 y 8
en cualquier combinación.
Para analizar el ensamblaje de un patogenicida
molecular que constaba de un anticuerpo específico de TMV marcado
con un anticuerpo de cadena sencilla específico del epítopo y
diferentes constructos de toxina marcados con etiquetas epitópicas
los autores de la presente invención generaron diferentes
constructos y se estudió el ensamblaje mediante inmunotransferencia
y ELISA.
Anticuerpo específico de TMV marcado con un
anticuerpo de cadena sencilla específico del epítopo
(bisFv2429): El anticuerpo de cadena sencilla que se unía a los
viriones intactos (scFv24) fue fusionado a un ADNc clonado a partir
del anticuerpo de cadena sencilla scFv-epitag29; que
se une a un epítopo de aminoácidos específico (epitag29), utilizando
el péptido conector flexible de la celobiohidrolasa I de
Trichoderma reesi (CBHI) para generar una proteína
recombinante que reconoce el patógeno, TMV, y la etiqueta epitópica.
El scFv-epitag29 ha sido generado previamente
(mediante tecnología de hibridoma convencional y después clonado en
forma de scFv) como se describe para scFv24 (Schillberg y col.,
Transgenic Research 8, 255-263 (1999)) y el
epítopo específico identificado mediante presentación de péptidos en
fagos. El péptido señal de la cadena ligera
N-terminal de ratón del anticuerpo original (mAb24)
utilizado para generar scFv24 fue utilizado para dirigir biscFv2429
a la ruta secretora. Para la expresión en células vegetales, la 5'
UT de la chalcona sintasa fue introducida y la casete fue insertada
entre el promotor 35S intensificado y la secuencia de terminación de
CaMV en el vector de expresión pSS (Figura 26) (Fischer y col.,
Eur. J. Biochem. 262, 810-816 (1999)).
Toxina marcada con etiqueta epitópica
(PE280-tag29 y PE400-tag29): Se
generaron dos constructos que contenían partes de la exotoxina de
Pseudomonas (PE) y el epitag29 C-terminal
fusionado por medio del conector Gly_{4}Ser. El constructo
PE280-tag29 (Figura 26B) contiene la secuencia de
aminoácidos (aa) 280 a 609, que comprende el dominio II y el dominio
III de PE. El constructo PE400-tag29 (Figura 26C)
contiene el dominio III de PE desde el aa 400 al aa 609. El dominio
III de PE media la ribosilación con ADP del factor de elongación 2,
que detiene la síntesis de proteínas y ocasiona la muerte celular.
El epitag-29, que es específicamente reconocido por
scFv-epitag29, fue fusionado en posición
C-terminal a ambos constructos vía un conector
Gly_{4}Ser. El péptido señal de la cadena ligera
N-terminal de ratón del anticuerpo monoclonal murino
mAb24 fue utilizado para dirigir PE280-tag29 y
PE400-tag29 a la ruta secretora.
PE280 y PE400 fueron amplificados mediante PCR a
partir del plásmido PE38 utilizando los siguientes cebadores: para
PE280: PE-280-directo
5'-GCG GAA TTC GAC GTC GCC ATG GGC TGG GAA CAA CTG
GAG CAG-3' (SEC ID NU: 157) Y
PE-inverso 5'-GCG AAG CTT GTC GAC
CGG CGG TTT GCC GGG CTG GCT G-3' (SEC ID NUM: 158);
para PE400: PE400-directo 5'-GCG GAA
TTC GAC GTC GCC ATG GCC TTC CTC GGC GAC GGC GGC
GAC-3' (SEC ID NUM: 159) Y
PE-inverso 5'-GCG AAG CTT GTC GAC
CGG CGG TTT GCC GGG CTG GCT G-3'(SEC ID NUM: 160).
Los cebadores contenían los sitios de restricción EcoRI,
AatII y NcoI (PE280-directo y
PE400-directo) y HindIII
(PE-inverso) para la clonación. Los fragmentos de la
PCR fueron subclonados por medio de EcoRI y HindIII en pUC18 dando
como resultado los constructos PE280 y PE400 intermedios y la
secuencia fue verificada mediante secuenciación. El fragmento
NcoI/SalI de los constructos (PE280 y PE400
intermedios) fue subclonado en un derivado de pUC18 conteniendo la
región 5' no traducida de la chalcona sintasa, la señal líder
optimizada del codón de la cadena ligera de mAb24 y la etiqueta
epitópica tag29 C-terminal dando como resultado los
constructos PE280-tag29 y
PE400-tag29. Para la expresión en células
vegetales, los fragmentos EcoRI/XbaI (Figura 26) de
PE280-tag29 y PE400-tag29 fueron
subclonados en los sitios de restricción EcoRI y XbaI
del vector de expresión vegetal pSS (Voss y col., Molecular Breeding
1: 39-50, (1995)) conteniendo el promotor 35S
intensificado (Kay y col., Science 236: 1299-1302
(1987)) y la secuencia de terminación de CaMV (Figura 26B y C).
Constructo de control, GST marcado con la
etiqueta epitópica (GST-tag29): Para analizar el
ensamblaje del epitag29 y el correspondiente anticuerpo, se generó
el constructo de control GST-tag29 introduciendo la
secuencia epitag-29 en el vector
pGEX-5X-3 (Pharmacia) en el extremo
C de GST.
El epitag-29 es específicamente
reconocido por scFv-epitag29 y el correspondiente
anticuerpo de tamaño normal mAb29 o su versión recombinante rAb29.
Para analizar la especificidad de unión de rAb29 a
epitag-29, se diluyó GST expresado bacterianamente,
purificado por afinidad o bien en PBS o bien en extracto de proteína
de una planta de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 de tipo
salvaje y se separaron diluciones seriadas sobre un gel de
SDS-PAA y se transfirieron a una membrana de
nitrocelulosa.
El plásmido recombinante
GST-tag29 fue transformado en E. coli BL21
(DE3) (Stratagene, La Jolla CA, USA) y la proteína de fusión fue
expresada induciendo un cultivo en fase log con IPTG
0,2-1,0 mM durante 1-3 horas a 30ºC.
La proteína de fusión GST-tag29 fue purificada por
afinidad sobre glutatión-agarosa mediante
purificación por lotes según las instrucciones del fabricante
(Pharmacia). Se resolvieron las diluciones seriadas de
GST-tag29 mediante SDS-PAGE y se
transfirieron a membranas de nitrocelulosa Hybond®-C (Amersham,
Braunschweig, Alemania). Las membranas fueron bloqueadas durante la
noche con leche desnatada sin grasa en PBS al 2% (MPBS) a 4ºC
seguido de incubación con rAb29 (Schillberg, y col., Transgenic
Research 8, 255-263 (1999)) a la temperatura
ambiente durante 2 horas. Los anticuerpos unidos fueron detectados
utilizando IgG anti-ratón de cabra conjugada con
fosfatasa alcalina (Jackson ImmunoResearch, West Grove, PA, USA) y
los sustratos cloruro de p-nitroazul de tetrazolio
(NBT) y fosfato de
5-bromo-4-cloro-3-indolilo
(BCIP).
Como se muestra en la Figura 27A, 80 ng de
GST-tag29 en PBS eran detectables utilizando rAb29.
Aunque en extracto de tabaco el límite de detección disminuía a 200
ng de GST-tag29 (Figura 27B), este resultado indica
que las proteínas derivadas de la planta no evitaban la unión de
rAb29 al epitag-29.
El ensamblaje in vivo en una célula
vegetal fue simulado mediante ELISA, en el cual el
scFv-epitag29 se unía al epítopo
epitop-29. Como se muestra en la Figura 28, era
detectable una reactividad DO significativa, indicando que la unión
de los dos miembros de la pareja tenía lugar en extractos
vegetales.
Para analizar el nivel de proteína recombinante
PE280-tag29 se transformaron transitoriamente hojas
de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 con A. tumefaciens
recombinante y se analizó la acumulación de
PE280-tag29 mediante inmunotransferencia.
El constructo de expresión vegetal
PE280-tag29 fue transferido a A. tumefaciens
GV3101 mediante transformación en N_{2} (Höfgen y Willmitzer,
Nucleic Acids Res 16 (1988) 9877). La transformación transitoria de
N. tabacum cv. Petite Havana SR1 se realizó como se ha
descrito (Kapila y col., Plant Science 122 (1996)
101-108). Para extraer las proteínas solubles
totales, se congelaron hojas de Tabaco y se trituraron en nitrógeno
líquido y se analizó el nivel de proteína de fusión scFv mediante
transferencia Western (Fischer y col., en: C. Cunningham, A.J.R.
Porter, (Eds.), Methods in biotechnology Vol. 3; Recombinant
proteíns in plants: Production and Isolation of Clinically useful
compounds. Humana Press, Totowa, NJ (1998)).
No fue detectable una proteína del tamaño
esperado (37,1 kDa) en los extractos vegetales (Figura 29). Sin
embargo era detectable un producto de degradación, indicando que la
proteína PE280-tag29 recombinante se acumulaba en
las hojas de tabaco. Las hojas de la planta mostraban un fenotipo
sano, indicando que PE280-tag29 era secretada muy
probablemente al apoplasto y por lo tanto no era tóxica para la
célula vegetal.
N. tabacum cv. Petite Havana SR1 fue
transformado con el constructo PE280-tag29
utilizando agrobacteria recombinante. Se generó N. tabacum
cv. Petite Havana SR1 transgénico mediante transformación de discos
foliares con A. tumefaciens recombinante y se generaron
plantas transgénicas T_{0} a partir de las células transformadas
(Horsch y col., Science 227:1229-1231 (1985)). La
regeneración de plantas transgénicas está en marcha.
Además, las plantas de N. tabacum cv.
Petite Havana SR1 transgénicas que acumulaban biscFv2429 en el
apoplasto serán retransformadas con el constructo de expresión
vegetal PE280-tag29 para analizar el ensamblaje
in vivo y los efectos biológicos del patogenicida
molecular.
El Patogenicida Molecular será ensamblado en el
RE por medio de scFv-epitag29 y epitag29. Los
experimentos presentados muestran que las proteínas pueden ser
ensambladas utilizando scFv-epitag29 y epitag29 en
extractos vegetales. Tras el ensamblaje el Patogenicida Molecular
será secretado al apoplasto. Durante la infección por TMV la
proteína de fusión se unirá a la partícula viral por la parte scFv24
y los viriones de TMV que entren en la célula llevarán unida la
proteína de fusión scFv24-toxina. PE400 media la
ribosilación con ADP del factor de elongación 2, que detiene la
síntesis de proteínas y ocasiona la muerte celular. PE es una toxina
muy eficaz ya que sólo se requieren una pocas moléculas para
destruir la célula infectada, evitando de ese modo la replicación
del virus, conduciendo a plantas altamente resistentes.
Las etapas 1) a 16) del ejemplo 1 y las etapas 1)
a 2) del ejemplo 2 se repiten con las siguientes adaptaciones.
- 1)
- Se añade una secuencia de escisión de proteasa que es procesada por una planta y/o una proteasa de patógeno in vivo o bien entre el constructo scFv recombinante y la secuencia de localización en la membrana C-terminal, utilizando un conector adecuado, o bien entre una toxina N-terminal y un anticuerpo recombinante anclado a la membrana C-terminal o viceversa.
- 2)
- El gen quimérico es insertado en un vector de expresión vegetal v.g. pSS (Voss y col., 1995).
- 3)
- Las secuencias de escisión de proteasa adecuadas incluyen una secuencia seleccionada de un banco de conectores al azar (Doskeland, Biochem. J. 313 (1996), 409-414) que habían sido seleccionados mediante proteolisis in vitro y cualquier sitio de proteasa conocido que es único para la proteína de fusión y no destruye el viricida molecular ni su actividad in vivo.
Como ejemplo, la etiqueta c-myc o
el conector CBHI es sensible a las proteasas vegetales. Cualquier
experto en la técnica reconocerá que estas etapas pueden ser
seguidas para cualquier otro patógeno seleccionando anticuerpos o
fragmentos de los mismos específicos para el patógeno diana. Por
ejemplo, se pueden originar anticuerpos y clonarlos contra proteínas
estructurales y no estructurales de cualquier patógeno. Además, se
pueden clonar toxinas C- o N-terminales de la
secuencia de escisión de la proteasa. Entre las toxinas se incluyen
todas las proteínas y péptidos que tienen un efecto perjudicial o
tóxico sobre el patógeno durante su ciclo vital y/o un efecto sobre
el patógeno durante la infección de la planta o la replicación, la
diseminación o la transmisión del patógeno. Esto incluye las toxinas
que destruyen específicamente una célula huésped infectada y por
tanto limitan la diseminación y el desarrollo de una enfermedad. Por
otra parte, el ejemplo 8 puede ser combinado con los ejemplos 1 a 7
en cualquier combinación.
Para integrar el scFv24 específico de TMV en la
membrana celular de la planta, se fusionó el fragmento de anticuerpo
a un péptido señal de mamífero N-terminal y un
dominio transmembrana receptor C-terminal. El
péptido señal de la cadena ligera N-terminal de
ratón de un anticuerpo parental (mAb24) utilizado para generar
scFv24 fue utilizado para dirigir las proteínas de fusión a la ruta
secretora. Los autores de la presente invención seleccionaron las
secuencias del dominio transmembrana del receptor del factor de
crecimiento derivado de plaquetas humano (PDGFR) para la fusión con
el extremo C de scFv24, para el redireccionamiento heterólogo del
anticuerpo scFv24 a la membrana plasmática. Para asegurar el
apropiado plegado del fragmento de anticuerpo de cadena sencilla
expresado y después escindido, el constructo contenía la secuencia
c-myc (pscFv24-PDGFR) como conector y una
secuencia de escisión entre el fragmento scFv24 y el ancla de
membrana (Figura 30).
Para construir pscFv24-PDGFR, el
ADNc que codificaba el epítopo c-myc seguido del dominio
transmembrana del receptor del factor de crecimiento derivado de
plaquetas (PDGFR) (18) fue escindido del vector
pHOOK-1 (Invitrogen, Leek, Holanda) y ligado en los
sitios de restricción SalI y XbaI del plásmido
pscFv24-TcR\beta (Ejemplo 1) para generar el
constructo de fusión pscFv24-PDGFR (Figura 30).
Para analizar el nivel de expresión de las
proteínas de fusión scFv recombinantes, la línea celular en
suspensión de N. tabacum cv. BY-2 fue
transformada establemente con A. tumefaciens recombinante y
la expresión funcional del dominio scFv24 de la proteína de fusión
fue analizada mediante ELISA utilizando antisuero
anti-mAb24.
El constructo vector
pscFv24-PDGFR fue transferido a A.
tumefaciens GV3101 mediante transformación en N_{2} líquido
(Höfgen y Willmitzer, Nucleic Acids Res. 16:9877 (1988)). Se
mantuvieron células de N. tabacum cv. Amarillo brillante 2
(BY-2) en sal base de Murashige y Skoog con
sustancias orgánicas mínimas (MSMO+: MSMO (Sigma, Deisenhofen,
Alemania) más 200 mg/ml de KH_{2}PO_{4}, 0,6 \mug/ml de
tiamina, sacarosa al 3% y 0,2 \mug/ml de 2,4-D, pH
5,8) a 24ºC en la oscuridad sobre un aparato de sacudimiento
orbital. Las células fueron subcultivadas cada semana con un inóculo
al 5%. Tres días después del subcultivo, las células vegetales
fueron transformadas mediante cultivo simultáneo con A.
tumefaciens recombinante, como se ha descrito (An, Plant
Physiol. 79:568-570 (1985)). La selección de
transformantes resistentes a la kanamicina fue realizada sobre medio
de agar MSMO+ suplementado con 75 \mug/ml de kanamicina y 100
\mug/ml de Claforan.
Para la extracción de las proteínas solubles
totales del cultivo en suspensión de BY-2
transgénico, las células de 1 ml de cultivo fueron recogidas por
centrifugación a 400 X g durante 5 minutos a 4ºC. El sedimento
celular fue resuspendido en 1 ml de tampón de extracción de proteína
(Tris-HCl 200 mM (pH 7,5), EDTA 5 mM, azida de sodio
al 0,02% (p/v) y Tween 20 al 0,1% (v/v)) y las células fueron
desorganizadas mediante sonicación a 60 watios durante 1 minuto
utilizando una sonda de sonicación (B. Braun, Melsungen, Alemania) a
4ºC. El desecho celular fue separado por centrifugación a 14.000 X g
durante 10 minutos a 4ºC. El sobrenadante claro que contenía
proteína soluble fue utilizado para un análisis adicional.
Para el ELISA y la transferencia western, se
utilizó antisuero anti-mAb24 (Zimmermann y col.
Molecular Breeding 4:369-379 (1998)) o el anticuerpo
monoclonal anti-c-myc 9E10 (Evan y
col., Mol. Cell. Biol. 5: 3610-3616 (1985)) como
anticuerpo primario combinado con una dilución 1:5.000 de
anticuerpos secundarios conjugados con fosfatasa alcalina
anti-conejo de cabra o anti-ratón de
cabra (Jackson Immuno Research Laboratories, West Grove, PA). Las
concentraciones de proteína fueron determinadas con el Análisis de
Proteínas de Bio-Rad utilizando Seralbúmina Bovina
(BSA) como patrón.
El análisis de las células de N. tabacum
BY-2 transformadas establemente reveló que
scFv24-PDGFR estaba presente tanto en el extracto
celular como en el sobrenadante de cultivo (Figura 31). Las líneas
en suspensión de célula transgénicas mostraban niveles de expresión
similares para ambas proteínas recombinantes, pero el
44-88% (valor medio = 69%, n=5) de
scFv24-PDGFR fue secretado en el sobrenadante de
cultivo. Esto indicaba que scFv24-PDGFR es liberado
mediante proteolisis de la membrana plasmática.
Después los autores de la presente invención
sometieron a ensayo si el dominio transmembrana de mamífero
heterólogo PDGFR fusionado a scFv24 dirigiría el anticuerpo de
cadena sencilla a la membrana plasmática en plantas de tabaco
transformadas establemente. Se generaron N. tabacum cv. Petit
Havana SR1 transgénicas mediante transformación de discos foliares
con A. tumefaciens recombinante y se generaron plantas
transgénicas T_{0} a partir de callos transformados (Horsch y
col., Science 227: 1229-1231 (1985)). La extracción
de proteínas solubles totales a partir de hojas de tabaco y el
posterior análisis de scFv24 mediante ELISA fueron realizados como
describe Fischer y col. (Fischer y col., en: Cunningham C. Porter
AJR (eds). Recombinant Proteins in plants: Production and Isolation
of Clinically useful compounds, págs. 45-68. Vol. 3,
Humana press, Totowa NJ, (1998)). Para el ELISA y la transferencia
western, se utilizó antisuero anti-mAb24 (Zimmermann
y col. Molecular Breeding 4: 369-379 (1998)) como
anticuerpo primario combinado con una dilución 1:5.000 de
anticuerpos secundarios conjugados con fosfatasa alcalina
anti-conejo de cabra (Jackson Immuno Rsearch
Laboratories, West Grove, PA). Las concentraciones de proteína
fueron determinadas con el Análisis de Proteínas de
Bio-Rad utilizando Seralbúmina Bovina (BSA)
como
patrón.
patrón.
Los niveles de expresión de
scFv24-PDGFR fueron mucho mayores en N.
tabacum cv. Petite Havana SR1 transgénico que en los cultivos en
suspensión (Tabla 5). El nivel máximo de
scFv24-PDGFR extraído con detergente era 13 veces
superior (388 ng/g de tejido foliar) que el obtenido en cultivos en
suspensión transgénicos (Figura 31).
En células en suspensión de N. tabacum cv.
BY-2 que producían la proteína de fusión
scFv24-PDGFR, scFv24 era detectable en el
sobrenadante de cultivo. Para determinar si los fragmentos scFv24
eran secretados en el espacio extracelular de plantas intactas, se
analizó mediante ELISA el fluido de lavado intercelular de hojas de
plantas de tabaco T_{1} transgénicas. Para la detección de las
proteínas de fusión scFv24 en los fluidos de lavado intercelulares,
se prepararon hojas de N. tabacum Petite Havana SR1 como
describen Fischer y col. (Fischer y col., en: Cunningham C. Porter
AJR (eds). Recombinant Proteins in plants: Production and Isolation
of Clinically useful compounds, págs. 45-68. Vol. 3,
Humana press, Totowa NJ, (1998)). Los extractos de proteína totales
de los fluidos de lavado fueron concentrados mediante
ultrafiltración (Microcon 10, Amicon, Witten, Alemania) y analizados
mediante SDS-PAGE al 12% (Laemmli, Nature 227:
680-685 (1970)) seguido de transferencia western.
ScFv24 estaba presente en el fluido de lavado intercelular de siete
progenies de una línea vegetal (P9_{SR1}) que producía
scFv24-PDGFR y el nivel de scFv24 secretado no se
correspondía con los niveles de expresión de proteína en hojas
intactas. En general, las plantas utilizadas para el análisis IWF
mostraban niveles de expresión de scFv24 de
1.080-1.540 ng/g de tejido foliar. Por lo tanto, la
proteína es escindida por una proteasa del huésped.
El análisis de transferencia western, utilizando
antisuero anti-mAb24, reveló que un único
polipéptido de scFv24 de 28 kDa era detectado en el fluido de lavado
intercelular de progenies T_{1} de transgénicos
scFv24-PDGFR (P9_{SR1}). Esto correspondía a un
producto de escisión de la proteína de fusión puesto que el peso
molecular pronosticado de scFv24-PDGFR era de 35KDa.
No obstante, tanto los fragmentos de tamaño normal (35KDa) como
escindidos (28KDa) de scFv24 estaban presentes en extractos de
proteínas celulares solubles totales a una proporción 1:1 de
producto de tamaño normal con respecto al fragmento (Figura 32A). En
análisis por transferencia western de extractos de proteínas
solubles totales con un anticuerpo anti-c-myc
sólo detectaba la proteína de fusión intacta
scFv24-PDGFR (Figura 32B). Esto indica que el
fragmento scFv24 en el apoplasto era separado por escisión de la
membrana cerca o en la etiqueta epitópica
c-myc.
Para analizar los efectos biológicos del
anticuerpo específico de TMV anti-viral anclado a la
membrana sobre la resistencia viral, se inocularon progenies T_{1}
de la línea vegetal que expresaba la proteína de fusión
scFv24-PDGFR (P9_{SR1}) con TMV.
Se recogieron semillas de plantas T_{0}
productoras de anticuerpo y se hicieron germinar sobre medio de agar
MSMO suplementado con sacarosa al 2% (p/v), 0,4 \mug/ml de
tiamina, 0,4 \mug/ml de glicina, 0,1 \mug/ml de ácido
nicotínico, 0,1 \mug/ml de piridoxina y 75 \mug/ml de
kanamicina. Las plantas T_{1} resistentes a la kanamicina fueron
utilizadas para la inoculación con TMV-v (1
\mug/ml) como se ha descrito previamente (Dietzgen y col., Arch.
Virol. 87:73-86 (1986)). Se utilizaron como control
plantas de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 de tipo salvaje.
Los síntomas de la enfermedad fueron controlados a los 6 y 20 días
después de la inoculación (p.i.) y para las plantas resistentes
hasta 180
días p.i.
días p.i.
Las hojas inferiores fueron infectadas con TMV y
la diseminación sistémica del virus estuvo seguida del análisis de
las hojas superiores 6-20 días más tarde. Todas las
plantas de tabaco no transgénicas de control fueron infectadas
sistémicamente, pero el 19% (de 68 analizadas) de las plantas
transgénicas scFv24-PDGFR no tenían síntomas
visibles de enfermedad en las hojas superiores (Tabla 6). Además, el
análisis mediante ELISA demostró que algunas de estas plantas
acumulaban partículas de virus en las hojas superiores indicando que
aunque se producía la diseminación viral sistémica, no se
desarrollaban síntomas. Sorprendentemente, en el 13% de las plantas
transgénicas scFv24-PDGFR no se encontró virus en
las hojas superiores hasta 90 días después de la inoculación. Se
pudo detectar el virus en sitios de inoculación en las hojas
inferiores mediante ELISA demostrando que estas plantas habían sido
eficazmente inoculadas con TMV. Los niveles de expresión de
anticuerpo-proteína de fusión se correspondían con
la expresión de la resistencia a TMV (Tabla 6). Los niveles
superiores de expresión de la proteína de fusión scFv24 conducían a
una fracción incrementada de plantas resistentes al virus.
Se pudo observar que la región conectora entre
scFv24 y el dominio transmembrana PDGFR es sensible a las proteasas
vegetales, el scFv24 es separado por escisión in vivo y
secretado al apoplasto en plantas transgénicas. scFv24 conserva su
función después de la escisión y crea un fenotipo resistente al
virus.
\vskip1.000000\baselineskip
| \begin{minipage}[t]{160mm} Niveles de proteína de fusión scFv24 funcional en la generación T_{0} de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 transgénico La proteína vegetal soluble total fue aislada de hojas de plantas transgénicas que producían scFv24-PDGFR. La expresión de la proteína de fusión scFv24 fue cuantificada mediante ELISA específico de TMV utilizando antisuero anti-mAb24 y expresada como ng de scFv24 por g de tejido foliar. \end{minipage} | ||||
| Constructo | Número de plantas | Número de plantas que | Intervalo de expresión | Expresión media |
| transgénicas | expresan scFv24 funcional | (ng/g de tejido foliar) | (ng/g de tejido foliar) | |
| PscFv24- | 12 | 9 | 3-388 | 114 |
| PDGFR |
\newpage
| \begin{minipage}[t]{160mm} Análisis de la infección viral de plantas transgénicas que expresan scFv24 anclado a la membrana. Se aplicó 1 \mu g/ml de TMV-v sobre una hoja inferior de N. tabacum cv. Petite Havana SR1 no transgénico y progenies T_{1} transgénicas de la línea vegetal P9_{SR1} que producía scFv24-PDGFR. Los niveles de proteína de fusión scFv24 fueron determinados mediante ELISA utilizando el antisuero anti-mAb24 14 días p.i. y utilizados para la formación de grupos (productores bajos, medios y altos). ^{a} = las hojas superiores no mostraban síntomas de enfermedad visibles; ^{b} = basado en ELISA de TMV; ^{c} = nivel de resistencia de todos los productores bajos, medios y altos, los números entre paréntesis incluyen todas las plantas sin síntomas de enfermedad visibles. \end{minipage} | |||||
| Líneas vegetales | Plantas sometidas | ng scFv24 por g | Fenotipo | Plantas | Nivel de |
| a ensayo | de tejido foliar | sano^{a} | resistentes^{b} | Resistencia (%)^{c} | |
| N. tabacum cv. | 62 | - | 0 | 0 | 0 |
| Petite Havana SR1 | |||||
| P9_{SR1}, productor bajo | 34 | 10-500 | 1 | 0 | |
| P9_{SR1}, productor medio | 23 | 501-2000 | 6 | 4 | 13(19) |
| P9_{SR1}, productor alto | 11 | 2001-4200 | 6 | 5 |
\vskip1.000000\baselineskip
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
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\hskip-.1em\dddseqskipgccgtcgacg aggacctgaa caaggtgttc cca
\hfill33
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
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<211> 28
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 2
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\hskip-.1em\dddseqskipgcctctagat cagaaatcct ttctcttg
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 3
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<211> 1378
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
\newpage
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<400> 3
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<210> 4
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<211> 17
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 4
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\hskip-.1em\dddseqskipgttttcccag tcacgac
\hfill17
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<210> 5
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<211> 130
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
\vskip1.000000\baselineskip
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<400> 5
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Artificial: origen sintético, no natural
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Artificial: origen sintético, no natural
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Artificial: origen sintético, no natural
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<212> ADN
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Artificial: origen sintético, no natural
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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Artificial: origen sintético, no natural
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Artificial: origen sintético, no natural
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<222> (5)..(5)
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<212> PRT
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<223> Descripción de la Secuencia
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<220>
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<222> (4)..(4)
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<223> Xaa es Pro o Ala
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 130
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<210> 131
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<220>
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
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<221> misc_rasgo
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<222> (5)..(5)
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\sa{Arg Val Asp Leu Xaa Arg Glu Thr}
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<211> 12
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 133
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Gln Ala Lys Ser Trp Ser Ser Leu}
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 136
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Gln Ala Lys Glu Trp Ser Asn Leu}
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\sa{Lys Asp Trp Glu His Arg Val Pro Ser}
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<211> 6
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\sa{Lys Asp Trp Ser His Leu}
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 140
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\sa{Pro Lys Ser Asp Pro Gln Met Gly Lys Arg Arg
Arg}
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\sa{His Pro Arg Pro Gln Leu Ala Ser Leu}
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 142
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<210> 143
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 143
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\sa{Arg Phe Thr Asp Pro Gln Leu His Pro}
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 144
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\sa{Lys Gln Asp Pro Gln Gln Gln Lys Gln}
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<210> 145
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
\newpage
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<400> 145
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\sa{Val Pro Asp Ser Gln Leu Glu Trp Pro}
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 146
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\sa{His Cys Asp Pro Gln Leu Tyr Gln Glu}
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<210> 147
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 147
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\sa{Asp Pro Gln Met Phe Arg Arg His Cys}
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 148
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\sa{Phe Lys Asp Gly Gln Leu Arg Pro Gln}
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<210> 149
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
\newpage
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<400> 149
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\sa{Cys Pro Asp Pro Gln Leu Arg Leu His Arg
Cys}
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<210> 150
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 150
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\sa{Cys Pro Asp Pro Gln Leu Asn Gly Thr Arg
Cys}
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<210> 151
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 151
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\sa{Cys Pro Asp Pro Gln Leu Ser Ser Leu Arg
Cys}
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<210> 152
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<211> 11
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 152
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\sa{Cys Pro Asp Pro Gln Leu Arg Leu His Arg
Cys}
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<210> 153
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 153
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\sa{Cys Pro Asp Pro Gln Leu Thr Leu His Arg
Cys}
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<210> 154
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 11
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 154
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Pro Asp Pro Gln Leu Ser Leu Gln Arg
Cys}
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 155
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<211> 11
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 155
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\sa{Cys Pro Asp Ala Gln Leu Ser Gly Thr Arg
Cys}
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<210> 156
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
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<212> PRT
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 156
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\sa{His Pro Asp Pro Gln Leu Ser Leu His
Arg}
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 157
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<211> 42
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 157
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\hskip-.1em\dddseqskipgcggaattcg acgtcgccat gggctgggaa caactggagc ag
\hfill42
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<210> 158
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<211> 37
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 158
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\hfill37
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<210> 159
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<211> 45
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 159
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<210> 160
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<211> 37
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<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 160
\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill37
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 161
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1136
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
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<400> 161
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<210> 162
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<211> 827
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 162
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<210> 163
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<211> 1046
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: origen sintético, no natural
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 163
Claims (35)
1. Una proteína de fusión que comprende
(a) al menos un dominio de unión que comprende un
anticuerpo o un sitio de unión del mismo que reconoce
específicamente un epítopo de un patógeno vegetal; y
(b) una secuencia de localización en la membrana
y/o una unidad que conduce al anclaje en la membrana y,
opcionalmente, una secuencia de redireccionamiento celular.
2. La proteína de fusión de la reivindicación 1,
que comprende al menos un dominio adicional que comprende una
secuencia de proteína o péptido que es tóxica para el patógeno o
perjudicial para su replicación, transmisión o ciclo vital.
3. La proteína de fusión de la reivindicación 1 o
2, donde la secuencia de localización en la membrana es
proteolíticamente sensible.
4. La proteína de fusión de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, donde dicha secuencia de localización en la
membrana es un dominio transmembrana del receptor de las células T
humano o cualquier otro miembro de la superfamilia de las
inmunoglobulinas, anclas de glicofosfatidilinositol (GPI), KAR1,
antígeno T medio, citocromo b5 o syn1.
5. La proteína de fusión de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 4, donde dichos dominios están conectados
mediante enlaces covalentes o no covalentes.
6. La proteína de fusión de una cualquiera de las
reivindicaciones 2 a 5, donde la actividad tóxica de la secuencia de
proteína o péptido es activada por la presencia del patógeno, un
componente del mismo o un componente de una célula huésped.
7. La proteína de fusión de la reivindicación 6,
donde la actividad tóxica de la secuencia de proteína o péptido es
activada por una proteasa específica del patógeno o de la célula
huésped.
8. La proteína de fusión de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 7, donde dicho anticuerpo o sitio de unión del
mismo es un anticuerpo de tamaño normal recombinante, un anticuerpo
IgA secretor dimérico, un anticuerpo IgM multimérico, un fragmento
F(ab')_{2}, un fragmento Fab, un fragmento Fv, un
anticuerpo Fv de cadena sencilla (scFv), un scFv biespecífico, un
diabody, un anticuerpo de un único dominio (dAb), un minobody o una
unidad de reconocimiento molecular (MRU), derivados de bancos de
presentación en fagos o de presentación en ribosomas de células de
hibridoma, sintéticos, semi-sintéticos,
indiferenciados o inmunocompetentes, o mediante generación de
anticuerpos diseñadores completamente sintéticos.
9. La proteína de fusión de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 8, que comprende al menos dos dominios de unión
para el mismo o diferentes epítopos.
10. La proteína de fusión de la reivindicación 9,
donde dichos epítopos son del mismo o de diferentes patógenos.
11. La proteína de fusión de una cualquiera de
las reivindicaciones 2 a 10, donde la toxina es una enzima o una
proteína estructural o no estructural viral o un dominio de unión
como se ha definido en una cualquiera de las reivindicaciones 1 a
10.
12. La proteína de fusión de la reivindicación
11, donde dicha enzima es la quitinasa o la glucanasa, la glucosa
oxidasa, la superóxido dismutasa, la ADNasa o la ARNasa o RIP o la
lipasa o fragmentos activos de las mismas ya sean solos o en
cualquier combinación.
13. La proteína de fusión de una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 12, donde el patógeno es un virus,
bacteria, micoplasma, hongo, nemátodo o insecto.
14. La proteína de fusión de una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 13, donde al menos uno de dichos dominios
está fusionado a una proteína portadora C- o
N-terminal.
15. La proteína de fusión de una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 14, donde al menos uno de dichos dominios
comprende un fluoróforo.
16. Un patogenicida que comprende la proteína de
fusión de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15.
17. La proteína de fusión de una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 15 o el patogenicida de la reivindicación
16, donde dicho dominio o dominios de unión y dicho dominio o
dominios adicionales son capaces de autoensamblarse in
vivo.
18. El patogenicida de las reivindicaciones 16 o
17, donde al menos uno de dichos dominios de unión de la proteína de
fusión de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15 reconoce
específicamente una proteína del movimiento viral y/o una
replicasa.
19. Un polinucleótido que codifica la proteína de
fusión de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15 o 17 o el
patogenicida de una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 18.
20. Un vector que comprende el polinucleótido de
la reivindicación 19.
21. Un vector que comprende polinucleótidos
separados que codifican al menos uno de dichos dominios de unión y/o
dichos dominios adicionales de la proteína de fusión de una
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15 o 17 o el patogenicida de
una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 18.
22. Una composición que comprende vectores donde
cada vector contiene al menos un polinucleótido que codifica al
menos un dominio de unión y/o al menos un dominio adicional de la
proteína de fusión de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15
o 17 o el patogenicida de una cualquiera de las reivindicaciones 16
a 18; y donde la expresión de al menos dos de dichos polinucleótidos
da como resultado la producción de dicha proteína de fusión o dicho
patogenicida o el ensamblaje del mismo in vivo.
23. El vector de la reivindicación 20 a 21 o la
composición de la reivindicación 22, donde el polinucleótido está
conectado operativamente a secuencias reguladoras que permiten la
expresión de la proteína de fusión, el patogenicida o los dominios
de los mismos en una célula huésped.
24. El vector o la composición de la
reivindicación 23, donde dicha secuencia reguladora es un promotor
constitutivo, quimérico, ubicuo, específico de tejidos, específico
de órganos o inducible.
25. Una célula huésped que comprende el
polinucleótido de la reivindicación 19, el vector de una cualquiera
de las reivindicaciones 20, 21, 23 o 24, o la composición de una
cualquiera de las reivindicaciones 22 a 24.
26. Un método para la producción de un
patogenicida molecular que comprende:
- (a)
- cultivar la célula huésped de la reivindicación 25 en condiciones adecuadas para la expresión del polinucleótido; y
- (b)
- recuperar la proteína de fusión, el patogenicida o los dominios del mismo del cultivo.
27. Un patogenicida molecular obtenible mediante
el método de la reivindicación 26 o codificable por el
polinucleótido de la reivindicación 19.
28. Un método para la producción de plantas
transgénicas resistentes a patógenos, células vegetales o tejido
vegetal que comprende la introducción de un polinucleótido de la
reivindicación 19, el vector de la reivindicación 20, 21, 23 o 24 o
los vectores de la composición de una cualquiera de las
reivindicaciones 22 a 24 en el genoma de una planta, célula vegetal
o tejido vegetal.
29. Una célula vegetal transgénica que contiene
integrado establemente en el genoma un polinucleótido de la
reivindicación 19, un vector de la reivindicación 20, 21, 23 o 24 o
los vectores de la composición de una cualquiera de las
reivindicaciones 22 a 24 u obtenible según el método de la
reivindicación 28.
30. Una planta o tejido vegetal transgénica que
comprende células vegetales de la reivindicación 29 u obtenible
mediante el método de la reivindicación 28.
31. La planta transgénica de la reivindicación
30, donde la proteína de fusión o el patogenicida se hacen
funcionales contra patógenos mediante ensamblaje in vivo tras
la transformación simultánea de al menos dos constructos de
expresión vegetales independientes o tras el cruzamiento sexual para
formar vástagos híbridos a partir de dos plantas parentales que
expresan uno o más de los dominios de la proteína de fusión o el
patogenicida, o cualquier otra forma de recombinación genética.
32. La planta transgénica de la reivindicación 30
o 31, que muestra una resistencia mejorada a un patógeno al que la
planta de tipo salvaje era susceptible.
33. Partes cosechables o material de propagación
de una planta de una cualquiera de las reivindicaciones 30 a 32,
comprendiendo dichas partes cosechables o material de propagación
células vegetales de la reivindicación 29.
34. Un estuche que comprende la proteína de
fusión de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15 o 17, el
patogenicida de una cualquiera de las reivindicaciones 16 a 18, el
polinucleótido de la reivindicación 19, el vector de la
reivindicación 20, 21, 23 o 24, la composición de una cualquiera de
las reivindicaciones 22 a 24 o el patogenicida molecular de la
reivindicación 27.
35. El uso de la proteína de fusión de una
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15 o el patogenicida de una
cualquiera de las reivindicaciones 16 a 18, el polinucleótido de la
reivindicación 19, el vector de la reivindicación 20, 21, 23 o 24,
la composición de una cualquier de las reivindicaciones 22 a 24 o el
patogenicida molecular de las reivindicación 27 para la protección
de una planta frente a la acción de un patógeno.
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