ES2247202T3 - Protooncogen humano y proteina codificada en el mismo. - Google Patents

Protooncogen humano y proteina codificada en el mismo.

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ES2247202T3 ES01998634T ES01998634T ES2247202T3 ES 2247202 T3 ES2247202 T3 ES 2247202T3 ES 01998634 T ES01998634 T ES 01998634T ES 01998634 T ES01998634 T ES 01998634T ES 2247202 T3 ES2247202 T3 ES 2247202T3
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Abstract

Protooncogén KG-19 humano que presenta la secuencia de bases de la SEC ID nº 1 o un fragmento biológicamente activo de la misma, en el que este último presenta la actividad del protooncogén de longitud completa.

Description

Protooncogén humano y proteína codificada en el mismo.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a un nuevo protooncogén y proteína codificada en el mismo, que pueden utilizarse en el diagnóstico de diversos cánceres, en la preparación de un animal transgénico, en la terapia de genes antisentido y en el desarrollo de fármacos anticáncer.
Antecedentes de la invención
Los animales superiores, incluyendo el ser humano, contienen cada uno 100.000 genes, aunque sólo aproximadamente el 15% de los mismos se expresan y las características de los procesos biológicos individuales, por ejemplo la génesis, la diferenciación, la homeostasis, las respuestas a los estímulos, el control del ciclo de división celular, el envejecimiento y la apoptosis (muerte celular programada) se determinan en función de qué genes se expresan (Liang, P. y A.B. Pardee, Science 257:967-971, 1992).
Los fenómenos patogénicos, tales como la tumorogénesis, son provocados por mutaciones génicas que provocan cambios en el modo de expresión génica. Por lo tanto, se han llevado a cabo estudios comparativos de las expresiones génicas en diversas células con el fin de proporcionar las bases para establecer los enfoques viables en la comprensión de los diversos fenómenos biológicos.
Se ha dado a conocer que la tumorogénesis provocada por diversos cambios genéticos, tales como la pérdida de la heterocigosidad cromosómica, la activación de oncogenes y la inactivación de los genes supresores tumorales, por ejemplo del gen p53 (Bishop, J.M., Cell 64:235-248, 1991; y Hunter, T., Cell 64:249-270, 1991). Además, se ha dado a conocer que entre el 10% y el 30% de los cánceres humanos surgen de la activación de un oncogén a través de la amplificación de protooncogenes.
Por lo tanto, la activación de los protooncogenes desempeña un importante papel en la etiología de muchos tumores y ha existido una necesidad de identificar protooncogenes.
Los presentes inventores han tratado de desentrañar el mecanismo implicado en la tumorogénesis del cáncer cervical e inesperadamente han descubierto que nuevos protooncogenes, el protooncogén 1 cervical humano (HCCR-1) (solicitud de patente coreana nº 2000-16757 (31 de marzo de 2000) y el protooncogén HCCR-2 (solicitud de patente coreana nº 2000-71202 (28 de noviembre de 2000), se encuentra específicamente sobreexpresados en las células cancerosas. El protooncogén provoca cambios cuantitativos y cualitativos de la expresión del producto proteico correspondiente a través de un cambio conformacional (Weinberg, R.A., Cancer Research 49:3713-3721, 1989). La proteína cancerosa de conformación modificada destruye las rutas de transducción de señales en la superficie celular, citoplasma o núcleo, mientras que en ausencia del producto de un gen supresor tumoral, estimula la proliferación celular junto con otras proteínas cancerosas, perturba el ciclo celular y destruye el mecanismo de muerte celular (apoptosis) (Todd, R., Anticancer Research 19:4729-4746, 2000).
El procedimiento de los dos híbridos de levadura, desarrollado en 1989 por Fields et al. (Fields, S. y Song, O., Nature 340:245-246, 1989) para examinar dichas interacciones proteína-proteína, ha sido ampliamente aplicado para elucidar el mecanismo de la muerte celular (Wallach, D. et al., Curr. Opin. Immunol. 10:131-136, 1989), así como otros procesos biológicos utilizando diversas herramientas genéticas (Pandey, A. y Mann, M., Nature 405:837-846, 2000).
La presente invención se ha realizado con vistas a desarrollar una nueva proteína de unión al producto proteico derivado del protooncogén HCCR-1 utilizando el procedimiento de los dos híbridos de levadura y ha descubierto un nuevo protooncogén humano KG-19 que expresa una proteína que se une específicamente al protooncogén HCCR-2 así como a HCCR-1, respectivamente. Este protooncogén, KG-19, puede utilizarse ventajosamente en el diagnóstico, prevención y tratamiento de diversos cánceres, por ejemplo leucemia, linfoma y los cánceres de colon, de mama, de riñón, de estómago, de pulmón, de ovario y uterino.
Sumario de la invención
De acuerdo con lo expuesto anteriormente, un objetivo de la presente invención es proporcionar un nuevo protooncogén y un fragmento biológicamente activo del mismo.
Otros objetivos de la presente invención consisten en proporcionar:
un vector recombinante que contiene dicho protooncogén o un fragmento biológicamente activo del mismo y un microorganismo transformado con el mismo;
una proteína codificada en dicho protooncogén y en un fragmento biológicamente activo de la misma;
un kit para el diagnóstico de cáncer que comprende dicho protooncogén o un fragmento biológicamente activo del mismo;
un kit para el diagnóstico del cáncer, que comprende dicha proteína o un fragmento biológicamente activo de la misma;
un gen antisentido que presenta una secuencia de bases complementaria a la de dicho protooncogén o un fragmento del mismo;
un procedimiento para el tratamiento o prevención de cáncer mediante la utilización de dicho gen antisentido; y
un procedimiento para el cribado de candidatos a fármaco anticáncer mediante la utilización de dicho protooncogén o de un fragmento del mismo.
De acuerdo con un aspecto de la presente invención, se proporciona un nuevo protooncogén que presenta la secuencia nucleotídica de SEC ID nº 1 o un fragmento biológicamente activo del mismo.
De acuerdo con otro aspecto de la presente invención, se proporciona un vector recombinante que contiene dicho protooncogén o un fragmento biológicamente activo del mismo y un microorganismo transformado con dicho vector.
De acuerdo con todavía otro aspecto de la presente invención, se proporciona una proteína que presenta la secuencia de aminoácidos de la SEC ID nº 2 o un fragmento biológicamente activo de la misma derivada a partir de dicho protooncogén o de un fragmento del mismo.
Breve descripción de los dibujos
Lo anteriormente expuesto y otros objetivos y características de la presente invención se pondrán claramente de manifiesto a partir de la siguiente descripción de la invención, tomada conjuntamente con los dibujos adjuntos, que muestran, respectivamente:
la figura 1a: los resultados de los análisis de transferencia northern para el protooncogén KG-19 expresado en múltiples tejidos normales humanos en 12 pistas (cerebro, corazón, músculo esquelético, colon, timo, bazo, riñón, hígado, intestino delgado, placenta, pulmón y leucocitos sanguíneos periféricos);
la figura 1b: los resultados obtenidos tras hibridar la muestra de la figura 1a con \beta-actina;
la figura 2a: los resultados de los análisis de transferencia northern para el protooncogén KG-19 expresado en líneas celulares de cáncer humano (células HL-60 de la leucemia promielocítica, células HeLa de cáncer cervical, células K-562 de la leucemia mielógena crónica, células MOLT-4 de la leucemia linfoblástica, células Raji del linfoma de Burkitt, células SW480 del cáncer de colon, células A549 del cáncer de pulmón y células G361 de melanoma);
la figura 2b: los resultados obtenidos tras hibridar la misma muestra de la figura 2a con \beta-actina;
la figura 3a: los resultados de los análisis de transferencia northern para el protooncogén KG-19 expresado en tejidos ováricos cancerosos;
la figura 3b: los resultados obtenidos tras hibridar la muestra de la figura 3a con \beta-actina;
la figura 4a: los resultados de los análisis de transferencia northern para el protooncogén KG-19 expresado en tejidos mamarios cancerosos;
la figura 4b: los resultados obtenidos tras hibridar la muestra de la figura 4a con \beta-actina;
la figura 5a: los resultados de los análisis de transferencia northern para el protooncogén KG-19 expresado en tejidos pulmonares cancerosos;
la figura 5b: los resultados obtenidos tras hibridar la muestra de la figura 4a con \beta-actina;
la figura 6a: imagen de contraste de fases de las células 293 embriónicas de riñón humano de tipo salvaje cultivadas en monocapa;
la figura 6b: imagen de contraste de fases de las células 293 embriónicas de riñón humano transfectadas cultivadas en monocapa con KG-19;
la figura 7: tinción hematoxilina-eosina de células 293 embriónicas de riñón humano cultivadas en monocapa transfectadas con KG-19;
la figura 8: tumorogenicidad de las células KG-19 en ratones desnudos;
la figura 9: los resultados de dodecil sulfato sódico (SDS)-PAGE muestran los patrones de expresión de proteínas antes y después de la inducción con IPTG en células 293 embriónicas de riñón humano transfectadas con KG-19.
Descripción detallada de la invención
El nuevo protooncogén de la presente invención, denominado KG-19, consiste en 772 pares de bases y presenta la secuencia de ADN de la SEC ID nº 1. Este protooncogén KG-19 se une específicamente al protooncogén 1 del cáncer cervical humano (en lo sucesivo "protooncogén HCCR-1") descrito en la solicitud de patente coreana nº 2000-16757 y el protooncogén HCCR-2 descrito en la solicitud de patente coreana nº 2000-71202.
En la SEC ID nº 1, el marco de lectura abierto correspondiente a las bases números 138 a 638 es una región codificante de proteína de longitud completa y la secuencia teórica de aminoácidos derivada de la misma se muestra en la SEC ID nº 2, que consiste en 166 aminoácidos ("proteína KG-19"). Sin embargo, considerando los codones degenerados y los codones preferentes en un animal específico, en el que se expresará el protooncogén de la presente invención, pueden llevarse a cabo diversos cambios y modificaciones de las secuencias de ADN de SEC ID nº 1, por ejemplo en el área codificante de las mismas sin alterar negativamente la secuencia de aminoácidos de la proteína expresada, o en el área no codificante sin afectar negativamente la expresión del protooncogén. Por lo tanto, la presente invención también incluye, en su ámbito, un polinucleótido que presenta sustancialmente la misma secuencia de bases que el protooncogén inventivo y que un fragmento biológicamente activo del mismo. Tal como se utiliza en la presente memoria, "sustancialmente el mismo polinucleótido" se refiere a un polinucleótido cuya secuencia de bases muestra una homología del 80% o más, preferentemente del 90% o más, con la mayor preferencia del 95% o más con el protooncogén de la presente invención.
La proteína expresada a partir del protooncogén de la presente invención consiste en 166 aminoácidos y presenta la secuencia de aminoácidos de la SEC ID nº 2. El peso molecular de esta proteína es de aproximadamente 19 kDa. Sin embargo, pueden llevarse a cabo diversas sustituciones, adiciones y/o deleciones de los residuos aminoácidos de la proteína sin afectar negativamente la función de la proteína. Además, puede utilizarse una parte de la proteína cuando debe servir a un fin específico. Estos aminoácidos modificados y los fragmentos de los mismos también se encuentran comprendidos en el alcance de la presente invención. Por lo tanto, la presente invención abarca un polipéptido que presenta sustancialmente la misma secuencia de aminoácidos que la proteína derivada del oncogén de la presente invención y que un fragmento biológicamente activo del mismo. Tal como se utiliza en la presente memoria, la expresión "sustancialmente el mismo polipéptido" se refiere a un polipéptido cuya secuencia de aminoácidos presenta una homología del 80% o más, preferentemente del 90% o más, con la mayor preferencia del 95% o más con la secuencia de aminoácidos de la SEC ID nº 2.
El protooncogén, o la proteína, de la presente invención pueden obtenerse a partir de tejidos de cáncer humano o sintetizarse utilizando un procedimiento de síntesis convencional de ADN o de péptidos. Además, el gen preparado de esta manera puede insertarse en un vector convencional con el fin de obtener un vector de expresión, el cual a su vez puede introducirse en un huésped adecuado, por ejemplo en un microorganismo tal como una célula de E. coli o de levadura, o en una célula animal, tal como una célula de ratón o humana. Las células transformadas con protooncogén KG-19 o con un fragmento del mismo se denominan "células KG-19".
A continuación, puede utilizarse un huésped transformado para producir el ADN o proteína inventivos a gran escala. Por ejemplo, se transforma E. coli XL1-Blue con el vector de expresión pGEM-T (Promega, USA) que contiene el gen KG-19 inventivo con el fin de obtener un transformante de E. coli denominado XL1-Blue MRA/pGEM-T/KG-19 que se depositó el 18 de septiembre de 2000 en la Korean Collection for Type Cultures (KCTC) (dirección: Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), nº 52, Oun-dong, Yusong-ku, Taejon, 305-333, República de Corea) bajo el número de registro KCTC 0826BP de acuerdo con los términos del Tratado de Budapest sobre el reconocimiento internacional del depósito de microorganismos a los fines del procedimiento de patentes.
Para preparar un vector, se seleccionan adecuadamente las secuencias de control de la expresión, por ejemplo el promotor, el terminador, la secuencia de autorreplicación y la señal de secreción y se combinan dependiendo de la célula huésped utilizada.
La sobreexpresión del protooncogén de la presente invención no se produce en los tejidos humanos normales, por ejemplo cerebro, corazón, músculo esquelético, colon, timo, bazo, riñón, hígado, intestino delgado, placenta, pulmón y leucocitos sanguíneos periféricos, pero sí en los tejidos cancerosos, por ejemplo en la leucemia, linfoma, y líneas celulares de cáncer de mama, de riñón, de ovario, de pulmón, de estómago y de la piel. Esto sugiere que el protooncogén de la presente invención induce los cánceres anteriormente indicados. Además, cuando se transfecta una célula 293 embriónica de riñón humano (HEK) normal con el protooncogén de la presente invención, se produce una célula anormal. Las caracterizaciones morfológicas realizadas mediante microscopía óptica y electrónica muestran que la célula anormal presenta la forma de una célula tumoral. Mediante la utilización del procedimiento de tinción hematoxilina-eosina puede confirmarse que la célula tumoral es cancerosa (carcinoma).
Cuando las células 293 HEK normales transfectadas con el protooncogén de la presente invención se inyectan en el lomo de ratones desnudos, se observa tumorogénesis tras aproximadamente 14 días de la inyección, alcanzando el tamaño del tumor los 2,0 cm x 2,0 cm en 30 días.
Por lo tanto, se cree que el protooncogén de la presente invención es un factor común a todas las formas de los diversos cánceres y que puede utilizarse ventajosamente en el diagnóstico de diversos cánceres y en la producción de un animal transgénico, así como en una terapia génica antisentido y en el desarrollo de fármacos anticáncer.
Un procedimiento de diagnóstico que puede llevarse a cabo utilizando el protooncogén de la presente invención puede comprender, por ejemplo, las etapas de hibridación de ácidos nucleicos separados de los líquidos corporales de un sujeto con una sonda que contiene el protooncogén de la presente invención o un fragmento del mismo y determinación de si el sujeto presenta el protooncogén utilizando un procedimiento convencional de detección de la técnica. La presencia del protooncogén puede detectarse fácilmente marcando la sonda con un radioisótopo o con un enzima. Por lo tanto, la presente invención también abarca un kit diagnóstico de cáncer que contiene el protooncogén de la presente invención o un fragmento del mismo.
La presente invención también abarca un animal transgénico producido mediante la introducción del protooncogén de la presente invención en un mamífero, por ejemplo en una rata. Para producir dicho animal transgénico, resulta preferente introducir el protooncogén inventivo en un huevo fertilizado de un animal antes del 8º estadio del ciclo celular. El animal transgénico puede utilizarse ventajosamente para el cribado en busca de carcinógenos o de agentes anticáncer, tales como antioxidantes.
La presente invención también proporciona un gen antisentido que resulta útil en una terapia génica. Tal como se utiliza en la presente memoria, el término "un gen antisentido" significa un polinucleótido que comprende una secuencia de bases que es completa o parcialmente complementaria a la secuencia del ARNm que se transcribe a partir del protooncogén que presenta la secuencia de bases de la SEC ID nº 1 o de un fragmento del mismo, siendo capaz dicho nucleótido de prevenir la expresión del marco de lectura abierto (ORF) del protooncogén al unirse al sitio de unión de proteínas del ARNm.
La presente invención también abarca un procedimiento para tratar o prevenir el cáncer en un sujeto mediante la administración de una cantidad terapéuticamente efectiva del gen antisentido inventivo al sujeto.
En la terapia génica antisentido de la invención, se administra el gen antisentido de la presente invención a un sujeto de una manera convencional con el fin de prevenir la expresión del protooncogén. Por ejemplo, se mezcla el oligodesoxinucleótido (ODN) antisentido con un derivado poli-L-lisina hidrofobizado mediante interacción electrostática de acuerdo con el procedimiento dado a conocer por Kim, J.S. et al. (J. Controlled Release 53:175-182, 1998) y el ODN antisentido mixto resultante se administra intravenosamente al sujeto.
La presente invención también abarca una composición anticáncer que comprende el gen antisentido de la presente invención como ingrediente activo, en asociación con portadores, excipientes u otros aditivos farmacéuticamente aceptables, si resultan necesarios. La composición farmacéutica de la presente invención preferentemente se formula para la administración mediante inyección.
La cantidad de gen antisentido realmente administrada debe determinarse a la luz de diversos factores relevantes, incluyendo la condición a tratar, la vía de administración elegida, la edad y el peso del paciente individual y la severidad de los síntomas del paciente.
La proteína expresada a partir del protooncogén inventivo puede utilizarse para producir un anticuerpo útil como herramienta diagnóstica. El anticuerpo de la presente invención puede prepararse en la forma de un anticuerpo monoclonal o policlonal de acuerdo con cualquiera de los procedimientos bien conocidos en la técnica mediante la utilización de una proteína que presente la secuencia de aminoácidos de la SEC ID nº 2 o un fragmento de la misma. El diagnóstico de cáncer puede llevarse a cabo utilizando cualquiera de los procedimientos conocidos en la técnica, por ejemplo mediante ensayo de inmunosorción ligada a enzima (ELISA), radioinmunoensayo (RIA), ensayo sándwich, tinción inmunohistoquímica, transferencia western o de inmunoensayo sobre gel poliacrílico, con el fin de evaluar si la proteína se ha expresado y se encuentra en los líquidos corporales del sujeto. Por lo tanto, la presente invención también abarca un kit diagnóstico de cáncer que contiene la proteína que presenta la secuencia de aminoácidos de la SEC ID nº 2 o un fragmento de la misma.
Puede establecerse una línea continua viable de células cancerosas mediante la utilización del protooncogén de la presente invención y dicha línea celular puede obtenerse, por ejemplo, a partir de tejidos tumorales formados en el lomo de un ratón desnudo mediante la inyección de células fibroblásticas transformadas con el protooncogén de la presente invención. Las líneas celulares preparadas de esta manera pueden utilizarse ventajosamente en la búsqueda de agentes anticáncer.
La presente invención también abarca un procedimiento para el cribado de candidatos a fármaco anticáncer mediante la utilización de dicho protooncogén o de un fragmento del mismo.
Tras caracterizar el papel del protooncogén inventivo y su producto proteico en la tumorogénesis, pueden utilizarse para inhibir el oncogén u oncoproteína mediante la administración del oligodesoxinucleótido antisentido que reconoce los genes o anticuerpos que reconocen las proteínas. Mediante la utilización del papel caracterizado del protooncogén inventivo, también pueden encontrarse las moléculas interactuantes que se unen a oncoproteínas conocidas y seguidamente diseñar inhibidores, candidatos a fármaco anticáncer, que pueden degradar las moléculas interactuantes.
Los siguientes Ejemplos y Ejemplos de ensayo se proporcionan únicamente con fines ilustrativos y no pretenden limitar el alcance de la invención.
Ejemplo 1 Ensayo de dos híbridos de levadura
Con el fin de encontrar una proteína de unión al producto proteico del protooncogén humano HCCR-1 (nº de registro de Genebank AF195651), se llevó a cabo un ensayo de dos híbridos de levadura mediante la utilización de MATCHMAKER LexA Two-Hybrid System (Clontech Laboratories, Inc., USA) de acuerdo con el procedimiento dado a conocer previamente (Golemis, E.A., et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., capítulos 20.0 y 20.1, 1996).
Las líneas celulares y vectores utilizados en el experimento siguiente se indican en el kit nº de catálogo K1609-1 de Clontech Laboratories, Inc.
La cepa de levadura EGY48 se transformó con el vector p8op-lacZ y se cultivó en una placa SD/-uracilo/glucosa, un medio de selección sintético que no presenta uracilo. Se seleccionó la colonia que creció en esta placa, se cultivó en un medio SD/-uracilo/glucosa y se transformó con un vector preparado mediante la inserción del gen HCCR-1 en los sitios BamHI y SaII del vector pLexA como "plásmido cebo".
Con el fin de examinar la expresión del gen HCCR-1 clonado en el vector pLexA, se llevó a cabo transferencia western utilizando el anticuerpo LexA. El resultado mostró una banda de 64\sim65 kDa, respectivamente.
La colonia que expresaba el gen HCCR-1 se cultivó en un medio SD/-uracilo,-histidina/glucosa y se transformó con el vector pBD42AD, que es una biblioteca de fusión de DA (dominio de activación) derivada de cerebro fetal humano. Con el fin de confirmar la unión del cebo con la biblioteca, se llevó a cabo un ensayo de levantamiento de colonia (Breeden, L. y Nasmyth, K., Cold Spring Harbor Symposium Quant. Bio. 50:643-650, 1985). Si el cebo interacciona con la biblioteca, se formará una colonia azul en una placa X-gal. Se purificó el ADN de la levadura cultivada utilizando perlas de vidrio y se transformó E. coli KC8 con el ADN purificado mediante electroporación y se extendió en un medio mínimo M9 para seleccionar los transformantes.
La secuencia de nucleótidos del clon de ADNc de longitud completa KG-19 se registró en GenBank bajo el nº de registro AF283671.
En la SEC ID nº 1, el marco de lectura abierto completo de KG-19 correspondiente a los números de base 136 a 638 es una región codificante de proteína y la secuencia teórica de aminoácidos derivada de la misma se muestra en la SEC ID nº 2, que consiste en 166 aminoácidos.
Se insertó el ADNc de longitud completa KG-19 en el sitio de multiclonado del vector pGEM-T-easy (Promega, USA) utilizando ADN ligasa con el fin de obtener un vector recombinante que expresase el gen KG-19. Se transformó E. coli XL1-Blue MRA (Stratagene, USA) con el vector recombinante con el fin de obtener un E. coli transformado denominado XL1-Blue MRA/pGEM-T-easy KG-19, que se depositó en la Korean Collection for Type Cultures (Dirección: 52, Oun-dong, Yusong-ku, Taejon 305-333, República de Corea) el 18 de septiembre de 2000 bajo el número de registro KCTC 0862BP.
Ejemplo 3 Análisis de transferencia northern
Con el fin de determinar el nivel de expresión del gen KG-19 en diversos tejidos normales y cancerosos, también se llevaron a cabo análisis de transferencia northern según recomendaciones del fabricante (Clontech) utilizando una muestra comercial que contenía ADNs purificados procedentes de múltiples tejidos normales humanos en 12 pistas sobre una membrana de nilón (figuras 1a y 1b) y también utilizando una muestra de línea celular cancerosa humana que contenía ARNs purificados de 8 tipos de células cancerosas sobre una membrana de nilón (figuras 2a y 2b).
Las membranas se hibridaron durante la noche a 68ºC con sonda de ADNc KG-19 con cebadores aleatorios y marcada con ^{32}P que se preparó utilizando un sistema de marcado con cebadores aleatorios Rediprime II (Amersham, Inglaterra). El análisis de transferencia northern se repitió dos veces y los resultados se cuantificaron mediante densitometría. Se hibridaron las mismas membranas con una sonda de \beta-actina para confirmar la integridad del ARNm.
La figura 1a muestra el resultado del análisis de transferencia northern de múltiples tejidos normales humanos en 12 pistas, es decir, de cerebro, corazón, músculo esquelético, colon, timo, bazo, riñón, hígado, intestino delgado, placenta, pulmón y leucocitos sanguíneos periféricos, utilizando sonda de ADNc KG-19; y la figura 1b, la misma membrana hibridada con una sonda de \beta-actina. Tal como puede observarse en la figura 1a, no se detecta el transcrito de 0,8 kb de los dos transcritos de ARNm de KG-19 en ninguno de los tejidos normales, mientras que el transcrito de 7,5 kb, que se consideraba un transcrito que contenía el protooncogén KG-19 antes del corte, se expresa débilmente únicamente en tejido renal normal.
La figura 2a muestra el análisis de transferencia northern del gen KG-19 expresado en líneas celulares de cáncer humano, es decir, en células HL-60 de leucemia promielocítica, células HeLa de cáncer cervical, células K-562 de leucemia mielógena, células MOLT-4 de leucemia linfoblástica, células Raji del linfoma de Burkitt, células SW480 del cáncer de colon, células A549 del cáncer de pulmón y células G361 de melanoma, utilizando la sonda de ADNc KG-19; y en la figura 2b, la misma membrana hibridada con una sonda de \beta-actina. Tal como puede observarse en la figura 2a, se detecta el transcrito de 0,8 kb de KG-19 en las células Raji del linfoma de Burkitt y en las células HL-60 de leucemia promielocítica y el transcrito de 7,5 kb también se expresa a nivel elevado en la leucemia promielocítica HL-60, en las células HeLa de cáncer cervical, en las células K-562 de leucemia mielogénica crónica, en las células MOLT-4 de leucemia linfoblástica, en las células Raji de linfoma de Burkitt, en las células SW480 de cáncer de colon, en las células A549 de cáncer de pulmón y en las células G361 de melanoma. Las células MOLT-4 y Raji, en particular, mostraban niveles de transcripción más elevados en comparación con las otras células cancerosas.
Además, se llevaron a cabo análisis de transferencia northern de tejidos cancerosos de ovario, de mama y de pulmón y de sus contrapartidas normales con el fin de confirmar que se expresaba el gen KG-19. Se purificaron los ARN totales de los tejidos de ovario, de mama y de pulmón procedentes de personas sanas normales y de tejidos cancerosos de ovario, de mama y de pulmón de pacientes con cáncer, utilizando el kit Rneasy total RNA (Qiagen Inc., Alemania). Se desnaturalizaron 20 \mug de cada uno de los ARN totales y después se sometieron a electroforesis en un gel de agarosa-formaldehído al 1% y se transfirieron a membranas de nilón (Boehringer-Mannheim, Alemania). Las membranas se hibridaron a 68ºC con sonda de ADNc total KG-19 con cebadores aleatorios Rediprime II y marcada con ^{32}P (Amersham, Inglaterra). El análisis de transferencia northern se repitió dos veces consistentemente y el resultado se cuantificó mediante densitometría. Se hibridaron las mismas membranas con una sonda de \beta-actina con el fin de confirmar la integridad del ARNm.
La figura 3a muestra el resultado del análisis de transferencia northern del tejido ovárico normal y del tejido ovárico canceroso utilizando la sonda de ADNc KG-19; y la figura 3b, muestra la misma membrana hibridada con una sonda de \beta-actina. Tal como se muestra en la figura 3a, el transcrito de 0,8 kb de KG-19 se expresa a nivel elevado en los tejidos ováricos cancerosos, mientras que la expresión del gen KG-19 es apenas observable en los tejidos ováricos normales. En las figuras 3a y 3b, las pistas N y C representan tejido ovárico normal y canceroso, respectivamente.
La figura 4a muestra el resultado del análisis de transferencia northern de tejido de mama normal y canceroso utilizando la sonda de ADNc KG-19; y en la figura 4b, se muestra la misma membrana hibridada con una sonda de \beta-actina. Tal como se muestra en la figura 4a, el transcrito de 0,8 kb de KG-19 se expresa a nivel elevado en el tejido ovárico canceroso, mientras que la expresión del gen KG-19 es apenas observable en el tejido normal de mama. En las figuras 4a y 4b, las pistas N y C representan el tejido ovárico normal y canceroso, respectivamente.
La figura 5a muestra el resultado del análisis de transferencia northern de tejido pulmonar normal y canceroso utilizando la sonda de ADNc KG-19; y la figura 5b, la misma membrana hibridada con una sonda de \beta-actina. Tal como se muestra en la figura 5a, los transcritos de 0,8 kb y de 7,5 kb de KG-19 se expresan a niveles elevados en el tejido pulmonar canceroso, mientras que la expresión del gen KG-19 es apenas observable en el tejido pulmonar normal. En las figuras 5a y 5b, las pistas N y C representan el tejido pulmonar normal y canceroso, respectivamente.
Ejemplo 4 Construcción de vectores de expresión y transformación de células animales
Etapa 1
Preparación de un vector que contiene KG-19
Se construyó un vector de expresión que contenía la región codificante de KG-19 de la manera siguiente.
En primer lugar, se construyó el vector de fusión pCDNA3 (Invitrogen, USA)-glutatión-S-transferasa (GST) insertando el gen GST en el vector de expresión eucariótico pcDNA3 mediante digestión HindIII/KpnI. Se digirió el gen KG-19 con la totalidad de la secuencia codificante (correspondiente a los números de base 121 a 674 en la SEC ID nº 1) utilizando BamHI/XbaI y seguidamente el fragmento BamHI/XbaI que contenía la secuencia codificante KG-19 de longitud completa se insertó en el pCDNA3 digerido con BamHI/XbaI. Se utilizó lipofectamina (Gibco BRL) para introducir el vector resultante pCDNA3/GST/KG-19 en las células epiteliales 293 de riñón embriónico humano (ACTC CRL 1753, USA) seguido de la selección en un medio suplementado con G418 (Gibco, USA). Las células 293 resultantes transfectadas con KG-19 se denominaron "células KG-19".
Etapa 2
Células epiteliales 293 embriónicas de riñón humano transfectadas con el protooncogén KG-19
Las células 293 normales de tipo salvaje y las células 293 KG-19 obtenidas en la Etapa 1 se cultivaron en una monocapa en medio DMEM que contenía 10% de suero y se observaron sus características de crecimiento mediante microscopía de contraste de fases (Olympus, USA). Las figuras 6a y 6b muestran imágenes de contraste de fases de las células 293 embriónicas de tipo salvaje de riñón humano cultivado en monocapa y de las células 293 embriónicas de riñón humano transfectadas con KG-19. Tal como se muestra en la figura 6a, las células 293 de tipo salvaje que proliferaron como células epiteliales presentaban cada una forma ahusada con un núcleo fino y largo y poco citoplasma. En el caso de las células KG-19, la célula cambió de forma, adoptando una forma poligonal con un núcleo ovoide y citoplasma abundante, tal como se muestra en la figura 6b.
Las células KG-19 cultivadas en monocapa, teñidas con hematoxilina-eosina (H y E) mostraban pleiomorfismo nuclear, nucleolos diferenciados, patrones granulares en la cromatina, células tumorales gigantes y figuras mitóticas atípicas, tal como se muestra en la figura 7.
Ejemplo 5 Tumorogenicidad del protooncogén KG-19 en animales
Con el fin de analizar la tumorogenicidad, se inyectaron 5 x 10^{6} células KG-19 subcutáneamente en la parte posterior del tronco de 9 ratones desnudos (ratones atímicos nu/nu de 5 semanas de edad con origen BALB/c). La totalidad de los 9 ratones inyectados con células KG-19 mostraron tumores palpables tras 14 días, alcanzando los tumores un tamaño de 2,0 cm x 2,0 cm en 30 días, tal como se muestra en la figura 8.
Ejemplo 6 Determinación del tamaño de las proteínas expresadas tras la transfección de E. coli con el protooncogén KG-19
La región de secuencia codificante de longitud completa del protooncogén KG-19 correspondiente a los números de base 138 a 638 de la SEC ID nº 1 y codificante de los aminoácidos número 1 a 166 de la SEC ID nº 2 se insertó en el sitio de reconocimiento de BamHI/NotI del sitio de clonado múltiple del vector pGEX 4T-3 (Amersham Pharmacia Biotech., USA), se fusionó con el gen GST y el vector resultante pGEX 4T-3/KG-19 se transfectó en E. coli BL21 (ATCC 47092). Los E. coli transfectados se incubaron utilizando un medio LB caldo en un incubador con agitación rotatoria a 37ºC durante 16 horas, se diluyeron 1/100 y se incubaron durante 3 horas. Se añadió al mismo isopropil \beta-D-tiogalacto-piranósido (IPTG, Sigma) 1 mM con el fin de inducir la síntesis de proteínas.
Las células E. coli en el cultivo se rompieron mediante sonicación y se sometieron a electroforesis en gel utilizando dodecil sulfato sódico (SDS) al 12% antes y después de la inducción con IPTG. La figura 9 muestra los resultados del SDS-PAGE, los cuales muestran un patrón de expresión de proteínas de la cepa BL21 de E. coli transfectada con el vector pGEX 4T-3/KG-19. Tras la inducción con IPTG, se observó una banda de proteínas significativa a aproximadamente 45 kDa. Esta proteína fusionada de 45 kDa contenía una proteína GST de aproximadamente 26 kDa que se expresaba a partir del gen del vector pGEX 4T-3.
Aunque se han descrito e ilustrado unas formas de realización de la presente invención, resulta evidente que pueden llevarse a cabo en la misma diversos cambios y modificaciones sin apartarse por ello del espíritu de la presente invención, que estará limitado únicamente por el alcance de las reivindicaciones adjuntas.
<110> KIM, Jin Woo
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<120> Protooncogén humano y proteína codificada en el mismo
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<130> PCA/11049/KJW/PCT
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<160> 2
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<170> KOPATIN 1.5
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<210> 1
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<211> 772
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 1
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1
2
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<210> 2
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<211> 166
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 2
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3
4

Claims (11)

1. Protooncogén KG-19 humano que presenta la secuencia de bases de la SEC ID nº 1 o un fragmento biológicamente activo de la misma, en el que este último presenta la actividad del protooncogén de longitud completa.
2. Protooncogén o un fragmento biológicamente activo según la reivindicación 1, que es un fragmento que presenta una secuencia de bases correspondiente a los números de base 138 a 638 de la SEC ID nº 1.
3. Proteína que presenta la secuencia de aminoácidos SEC ID nº 2 o un fragmento biológicamente activo de la misma.
4. Vector que comprende el protooncogén o un fragmento biológicamente activo según la reivindicación 1.
5. Microorganismo transformado con el vector según la reivindicación 4.
6. Microorganismo según la reivindicación 5, que es E. coli XL1-Blue MRA/pGEM-T/KG-19 (nº de registro: KCTC 0862BP).
7. Procedimiento para la preparación de la proteína o de un fragmento biológicamente activo según la reivindicación 3, que comprende cultivar el microorganismo según la reivindicación 5 ó 6.
8. Kit para el diagnóstico de cáncer, que comprende el protooncogén o fragmento según la reivindicación 1 ó 2.
9. Kit para el diagnóstico de cáncer, que comprende la proteína o fragmento biológicamente activo según la reivindicación 3.
10. Gen antisentido que presenta una secuencia de bases que es complementaria a la secuencia del ARNm completo o parcial transcrito a partir del protooncogén o del fragmento biológicamente activo según la reivindicación 1 ó 2 y que es capaz de unirse al ARNm, inhibiendo la expresión de dicho protooncogén o fragmento.
11. Composición para la prevención o tratamiento de cáncer, que comprende una cantidad terapéuticamente efectiva del gen antisentido según la reivindicación 10 y un portador farmacéuticamente aceptable.
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