ES2272611T3 - Activacion in vitro de celulas t citotoxicas. - Google Patents
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Abstract
Procedimiento para producir una célula T CD8+ activaad in vitro, comprendiendo el procedimiento poner en contacto, in vitro, una célula T CD8+ con una molécula del MHC de la Clase I humana cargada con antígeno y expresada sobre la superficie de una célula de insecto durante un período de tiempo suficiente para activar, de una manera específica para el antígeno, la célula T CD8+.
Description
Activación in vitro de células T
citotóxicas.
La presente invención se refiere a
procedimientos para activar células CD8 in vitro con
especificidad para determinados péptidos antigénicos, el uso in
vivo de células CD8 activadas para el tratamiento de una
diversidad de condiciones morbosas, y composiciones apropiadas para
estos usos.
La eficiencia con la que el sistema inmune cura
o protege los individuos de las enfermedades infecciosas ha
intrigado siempre a los científicos, ya que se ha creído que podía
ser posible activar el sistema inmune para combatir otros tipos de
enfermedades. Tales enfermedades incluyen el cáncer, el SIDA, la
hepatitis, y enfermedades infecciosas en pacientes inmunodeprimidos.
Mientras que varios procedimientos que implican el uso de
anticuerpos han sido aplicados en esos tipos de enfermedades, pocos
intentos exitosos, si alguno, usando células T citotóxicas han sido
descritos. Teóricamente, las células T citotóxicas serían los medios
preferidos para tratar los tipos de células mencionados más arriba.
No obstante, no ha habido disponible ningún procedimiento in
vitro para activar específicamente las células T
citotóxicas.
Las células T citotóxicas, o células CD8 como
son actualmente conocidas, representan la principal línea de
defensa contra las infecciones virales. Los linfocitos CD8 reconocen
y matan específicamente células que han sido infectadas por un
virus. Por tanto, el coste de eliminar una infección viral es la
pérdida simultánea de las células infectadas. Los receptor de la
célula T sobre la superficie de las células CD8 no pueden reconocer
antígeno extraños directamente. Contrariamente a los anticuerpos, el
antígeno debe ser presentado primero a los receptores.
La presentación del antígeno a las células B se
consigue mediante las moléculas del tipo Clase I del complejo de
histocompatibilidad principal (MHC). El complejo de
histocompatibilidad principal (MHC) se refiere a un gran locus
genético que codifica una familia extensa de glicoproteínas que
juegan un rol importante en la respuesta inmune. Los genes del MHYC,
el cual se denomina también complejo HLA (antígeno de leucocitos
humano), están ubicados en el cromosoma 6 en humanos. Las moléculas
codificadas por los genes del MHC están presentes sobre las
superficies celulares, y son en gran medida responsables del
reconocimiento de los transplantes de tejidos como "no
propios". Por tanto, las moléculas del MHC unidas a membrana
están íntimamente implicadas en el reconocimiento de antígenos por
parte de células T.
Los productos del MHC se agrupan en tres clases
principales, denominadas I, II y III. Las células T que sirven
principalmente como células auxiliares expresan el CD4, y están
restringidas primariamente por moléculas de la Clase II, mientras
que las células que expresan el CD8, las cuales representan
mayoritariamente las células efectoras citotóxicas, interaccionan
con moléculas de la Clase I.
Las moléculas de la Clase I son glicoproteínas
de membrana con la capacidad de unir péptidos derivados
principalmente de la degradación intracelular de proteínas
endógenas. Los complejos de moléculas del MHC con péptidos derivados
de proteínas virales, bacterianas y otras proteínas extrañas
comprenden el ligando que dispara la capacidad de respuesta al
antígeno de las células T. Por contra, los complejos de moléculas
del MHC con péptidos derivados de productos celulares normales
juegan un papel en "enseñar" a las células T a tolerar los
péptidos propios, en el timo. Las moléculas de la Clase I no
presentan antígenos enteros, intactos; más bien presentan fragmentos
de péptidos de los mismos, "cargados" sobre su "surco unidor
de péptidos".
WO91/16924 describe procedimientos para
potenciar la presentación de antígeno peptídico añadido exógenamente
por parte de células de mamífero presentadoras de antígeno.
Levy y Kvist (International Immunology,
2(10):995-1002 (1990)) describen el uso de
vectores baculovirus independientes para expresar MHC I, la
beta-2-microglobulina y la proteínas
del adenovirus-2, por separado y juntas en células
de insecto con objeto de investigar los efectos de la proteína
adenovírica sobre el ensamblaje de los complejos del MHC de la Clase
I.
Durante muchos años, los inmunólogos han
esperado generar células citotóxicas específicas que apuntaran a
virus, retrovirus y células cancerosas. Mientras que apuntar contra
enfermedades víricas en general podía conseguirse mediante
vacunación in vivo con vacunas vivas o atenuadas, no se ha
conseguido un éxito similar con los retrovirus o con las células
cancerosas.
EP-360.205-A
describe procedimientos para estimular la respuesta inmmune de un
paciente de cáncer contra el cáncer. Se exponen in vitro
linfocitos de la sangre periférica procedentes del paciente a
células cancerosas procedentes del mismo paciente, las cuales se han
tratado con mitomicina C para impedir la proliferación. A
continuación, los linfocitos estimulados se administran de nuevo al
paciente.
\newpage
WO93/10.816 describe vacunas de péptidos que
pueden usarse para inducir células T citotóxicas contra el VIH. Este
documento sugiere que las células T citotóxicas procedentes de
individuos inmunizados pueden aislarse, cultivarse y expandirse
in vitro y a continuación administrarse de nuevo al paciente
con objeto de impulsar la respuesta inmune contra el virus.
Más aún, la estrategia de la vacuna no ha tenido
la eficacia deseada en pacientes inmunodeprimidos. Un forma de
salvar esta dificultad sería inmunizar un individuo sano, aislar las
células CD8 a partir de este individuo, e inyectar estas células CD8
en la persona afectada por la enfermedad. Este protocolo
experimental parece funcionar en cepas endogámicas de ratones, pero
no se ha intentado con éxito en humanos. Hay varios posibles
explicaciones. En primer lugar, los péptidos son únicos para un MHC
determinad; dicho de otra forma, ciertos péptidos antigénicos se
unen preferentemente a especies particulares del MHC, pero no se
unen bien a otras, incluso en ausencia de la molécula del MHC
"preferida". Más aún, las moléculas del MHC son altamente
polimórficas, hecho que general al menos dos problemas. El primero,
las células CD8 de un individuo puede interaccionar sólo con
péptidos unidos a precisamente aquellas de tres a seis moléculas de
la Clase I presentes en ese individuo. El segundo, las células CD8
reaccionan violentamente con todas las moléculas de la Clase I, las
cuales son diferentes de aquéllas expresadas en el individuo del que
se obtienen las células CD8, con independencia de qué péptidos
contienen las moléculas de la Clase I. Esta reactividad se ha
observado desde hace cierto tiempo, y se denomina
alo-reactividad. Es la causa que subyace al rechazo
inmune de los órganos trasplantados.
Por tanto, aparte del algo heroico protocolo
experimental en el que un individuo se usa como donante de células
CD8 activadas para otro individuo, es difícil encontrar dos personas
que no sean familiares con el mismo conjunto exacto de moléculas de
la Clase I. Por esta razón, al menos un investigador ha adoptado la,
algo inespecífica, estrategia de "impulsar" las células CD8
existentes incubándolas in vitro con IL-2, un
factor de crecimiento para las células T. No obstante, este
protocolo (conocido como terapia celular LAK) sólo permitirá la
expansión de aquellas células CD8 que ya están activadas. Puesto que
el sistema inmune está siempre activo, por un motivo u otro, la
mayoría de las células estimuladas por la IL-2 serán
irrelevantes para el propósito de combatir la enfermedad. De hecho,
no se ha documentado que este tipo de terapia active ninguna
célula con la especificidad deseada. Por tanto, los beneficios de la
terapia celular LAK son controvertidos como mucho, y los efectos
secundarios son generalmente tan graves que muchos estudios han sido
interrumpidos.
Varias nuevas moléculas que parecen estar
implicadas en el proceso de carga del péptido pueden haber sido
recientemente identificadas. También se destaca que las moléculas de
la Clase I sin péptido unido (es decir, moléculas "vacías")
pueden producirse bajo ciertas condiciones restrictivas. Estas
moléculas "vacías" son a menudo incapaces de alcanzar la
superficie celular, no obstante, puesto que las moléculas de la
Clase I sin péptido unido son muy termolábiles. Por tanto, las
moléculas de la Clase I "vacías" se desensamblan durante su
transporte desde el interior de la célula hacia la superficie
celular. Este es un medio elegante mediante el cual el sistema
inmune puede asegurar que sólo son destruidas las células que están
sintetizando activamente proteínas virales. Por ejemplo, cuando se
mata una célula infectada viralmente, está liberará péptidos
virales. Si las células vecinas estuvieran expresando moléculas
"vacías" de la Clase I -es decir, aquéllas sin péptido unido-
estas células serían recubiertas por los péptidosvirales liberados.
Puesto que las células T citotóxicas (o células CD8) no tienen forma
de discernir cómo o porqué un péptido está unido a una molécula de
la Clase I, las células que obtuvieron pasivamente un recubrimiento
de péptido viral serían destruidas al igual que aquéllas que están
sintetizando activamente las proteínas virales.
Los péptidos virales in vivo son rotos
por una gran partícula conocida como el proteosoma. Este complejo
enzimático también rompe proteínas celulares normales, lo que
sugiere que los péptidos derivados de nuestras propias proteínas
celulares compiten con los péptidos derivados de virus por los
sitios de unión de las moléculas de la Clase I. Por tanto, sólo
algunas de las moléculas de la Clase I sobre la superficie de las
célula infectada por virus contienen péptidos virales, puesto que la
mayoría de las moléculas de la Clase I contendrán péptidos derivados
de nuestras propias proteínas celulares. Puesto que hay cientos de
miles de moléculas de la Clase I sobre la superficie de una célula,
y puesto que las células CD8 pueden reconocer tan pocas como 200
moléculas de la Clase I cargadas con un determinado péptido viral,
esta competición entre péptidos derivados de virus y proteínas
celulares no compromete completamente la eficiencia por la que las
células CD8 pueden destruir una célula infectada viralmente. Sin
embargo, si uno fuera capaz de "diseñar" células para expresar
moléculas de la Clase I exhibiendo sólo una especie de
péptido antigénico -es decir, si todas las moléculas de la Clase
tuvieran el mismo péptido unido a ellas- se puede argumentar que
esto incrementaría la eficiencia de la activación de CD8.
Las moléculas de la Clase I unen péptidos de una
manera específica. Todos los péptidos tienen que ser de
aproximadamente 8-9 aminoácidos de longitud, y sus
secuencias deben ajustarse al bolsillo unidor de péptidos de las
moléculas de la Clase I. En relación a esto, las moléculas de la
Clase I presentan algunos parecidos con los anticuerpos. No
obstante, mientras que un anticuerpo determinado tiende a unir sólo
un antígeno, una molécula determinada de la Clase I puede unir
muchos péptidos diferentes. Puesto que el número de virus y otros
patógeno es bastante elevado, es evidente que nuestra defensa inmune
sería pobre si tuviéramos sólo una única molécula de la Clase I,
incluso si fuera capaz de unir y alterar muchos péptidos diferentes.
Por esta razón, todos los humanos tienen entre tres y seis moléculas
diferentes de la Clase I, las cuales pueden unir muchos tipos
diferentes de péptidos. En consecuencia, las células CD8 pueden
reconocer muchos miles de péptidos unidos a una u otra molécula de
la Clase I.
Puesto que la selección parece ser la fuerza
dominante en la evolución, aparecen patógenos que no pueden ser
reconocidos eficientemente por el sistema inmune. Por tanto, una
secuencia viral, la cual da lugar a péptidos que se unen
eficientemente a una diversidad de moléculas de la Clase I, puede
mutar de forma que no sea reconocida por ninguna de las tres a seis
moléculas de la Clase I presentes en un individuo. Por tanto, este
virus puede no ser reconocido por el sistema inmune, y puede en
consecuencia causar la muerte del individuo afectado. Si todos los
individuos tuvieran un idéntico conjunto de moléculas de la Clase I,
un virus tal puede, de forma concebible, eliminar una especie
completa. No obstante, la variación individual es una salvaguardia
frente esta posibilidad, puesto que hay unas 100 formas diferentes
de moléculas de la Clase I presentes en la población. Por tanto, un
virus mutado puede dañar algunos individuos, pero es improbable que
resultara en la extinción de una población entera, puesto que
individuos diferentes poseen diferentes conjuntos de moléculas de la
Clase I.
Si las moléculas de la Clase I pueden unir una
diversidad de péptidos, incluyendo péptidos derivados de nuestras
propias proteínas celulares, uno puede preguntarse porqué las
células CD8 del sistema inmune no reconocen y destruyen nuestros
propios tejidos. Mientras que la respuesta a esta cuestión no está
completamente clara, actualmente se cree que hay operativos dos
mecanismos distintos. Primero, las células CD8 que pueden reaccionar
con los péptidos propios son eliminadas en el timo. Segundo, las
células CD8 pasan a no responder (anérgicas) a los péptidos propios
en los órganos periféricos del sistema inmune. Puesto que cada tipo
o epítopo de proteínas celulares no es sintetizado por las células
en el timo, el segundo mecanismo aparecería como la explicación más
probable. Este mecanismo parece ser operativo para el nivel de
péptidos propios que se encuentra normalmente. Si este nivel
incrementa de alguna manera, se pueden observar individuos que sí
que tienen células CD8 que pueden reconocer y destruir células que
expresan péptidos propios. Esta última observación es significativa
en relación al concepto de usar el sistema inmune para eliminar
células tumorales.
Una estrategia más directa para resolver los
problemas discutidos más arriba sería estimular directa y
específicamente sólo aquellas células CD8 que son relevantes para
combatir la enfermedad. Recientes descubrimientos sobre los
mecanismos que gobiernan la carga de péptido sobre las moléculas de
la Clase I nos permiten hacerlo ahora. Puesto que Drosophila
no tiene un sistema inmune, las diversas proteínas implicadas en la
maquinaria cargadora del péptido deberían estar ausentes de tales
células. Ahora es evidente que la ausencia de maquinaria cargadora
de péptido permite que las moléculas de la Clase I sean expresadas
como moléculas "vacías" sobre la superficie celular.
Otra ventaja de usar el sistema
Drosophila es que las células de Drosophila prefieren
una temperatura de 28°C en vez de 37°C. Este hecho es importante,
puesto que las moléculas "vacías" de la Clase I son
termolábiles y tienden a desintegrarse a 37°C. Mediante incubación
de células de Drosophila, que expresan la Clase I, con
péptidos que pueden unirse a la molécula de la Clase I, es posible
conseguir que cada molécula de la Clase I contenga uno y el mismo
péptido. Las células son, en consecuencia, muy diferentes de las
células de mamífero, en las que la molécula de la Clase I contiene
muchos tipos diferentes de péptidos, la mayoría de los cuales se
derivan de nuestra propias, inocuas proteínas celulares.
A pesar de los numerosos, y fallidos, esfuerzos
a lo largo de años en cientos de laboratorios para activar
específicamente células CD8 in vitro, parece razonable que el
nivel elevado de expresión de una molécula de la Clase I conteniendo
un único péptido puede superar la necesidad se la estimulación in
vivo del sistema. Mediante la incubación de células de
Drosophila convenientemente tratadas con células de bazo o
nódulo linfático procedentes de ratones no cebados (es decir,
ratones que nunca se habían encontrado previamente con los péptidos
usados), es posible ahora generar células T citotóxicas que son
totalmente específicas para el péptido antigénico. La respuesta
citotóxica es usualmente de tres a cinco veces más intensa que la
que se obtiene a través de procedimientos previamente conocidos.
Mientras que algunos ejemplos en éste presentan
un "modelo" usando moléculas de la Clase I de ratón, se
descubren en la presente invención otros ejemplos que usan moléculas
de la Clase I humana, o ratones transgénicos expresando moléculas
humanas. En un ejemplo, se usa un péptido derivado de la proteína
gag del VIH (el virus del SIDA). Esta combinación de
moléculas funciona bien; de hecho, funciona tan bien como los
experimentos que usan un modelo de ratón puro. Más aún, el sistema
actualmente descubierto, el cual usa moléculas humanas en un sistema
de Drosophila tal como se descubre, es mucho más versátil que
el sistema de ratón descrito en un artículo reciente por DeBruijn
et al. (Eur. J. Immunol. 21:2963-2970
(1991)). En concreto, éste último sistema requiere cantidades
enormes de células efectoras con objeto de matar efectivamente, y es
menos versátil que el sistema descubierto en la presente invención.
De forma más importante, el sistema descubierto en la presente
invención, a diferencia que el sistema de ratón, eficientemente usa
y activa respuestas contra moléculas humanas.
La mayoría de los experimentos, descubiertos en
la presente invención, realizados hasta la fecha han usado células
intactas de Drosophila. No obstante, se demuestra ahora que
pueden obtenerse moléculas vacías, truncadas, a partir de células de
Drosophila con buenos rendimientos (aproximadamente 1 mg/ml).
Tales moléculas pueden ser útiles para conseguir la inmunosupresión
en pacientes trasplantados y para el tratamiento de pacientes con
enfermedades autoinmunes tales como la artritis reumatoide.
En resumen, nuestra dedicación a largo plazo,
destinada a comprender los detalles de cómo se generan los péptidos
y se cargan sobre moléculas de la Clase I in vivo, ha
estimulado el desarrollo de un medio racional y altamente eficiente
por el cual las células CD8 pasan a estar activadas con péptidos de
nuestra elección. Es nuestra creencia que el uso de tales células
activadas puede tener un papel en el tratamiento de una amplia
variedad de estados morbosos.
Se descubre ahora, en la presente invención, un
medio racional, elegante, de producir, cargar y usar moléculas de la
Clase I para activar específicamente células CD8 in vitro. Se
descubren además las aplicaciones terapéuticas de esta nueva
tecnología en el tratamiento del cáncer, de tumores o neoplasias,
así como de enfermedades virales, retrovirales, autoinmunes, y del
tipo autoinmune.
La presente invención proporciona un
procedimiento para producir in vitro células CD8 activadas,
en donde un procedimiento comprende poner en contacto, in
vitro, células CD8 con moléculas del MHC de la Clase I humanas
cargadas de antígeno, y expresadas sobre la superficie de células de
insecto, durante un período de tiempo suficiente para activar, de
forma específica para un antígeno, la células CD8. En una variación,
las moléculas expresadas sobre la superficie son monotípicas; en
otra, las moléculas expresadas sobre la superficie son
mono-antigénicas. El procedimiento contemplado en la
presente invención puede comprender además (a) separar las células
CD8 activadas de las moléculas de la Clase I cargadas de antígeno,
(b) suspender las células CD8 activadas en un portador o excipiente
aceptable. De acuerdo con los procedimientos descubiertos, los
antígenos pueden comprender proteínas o polipéptidos nativos o no
degradados, o pueden comprender polipéptidos antigénicos que se han
cortado en fragmentos peptídicos, que comprenden al menos 8 residuos
aminoácidos, antes de la incubación con las moléculas de la Clase I
humanas.
Una célula T CD8 activada mediante los
procedimientos de la invención puede usarse en la preparación de un
medicamento para el tratamiento de un cáncer, tumor, o neoplasia,
infección vírica (por ejemplo, retrovírica), o una condición
autoinmune.
El medicamento puede ser apropiado para su
administración mediante inyección intravenosa.
La Figura 1 esquematiza la construcción de los
plásmidos de expresión pRmHa-2 y
pRmHa-3. En la Figura 1A se muestra la construcción
del pRmHa-2; en la Figura 1B se muestra la
construcción del pRmHa-3M; y en la Figura 1C, se
ilustra el vector pRmHa-3, mostrando la restricción,
el poliengarce, el promotor, y los sitios de poliadenilación, así
como un sitio en el que puede insertarse una secuencia de
nucleótidos para su expresión.
La Figura 2A muestra que el K^{b} Clase 1
MHC/\beta2 de ratón (m\beta2) y el D^{b}/m\beta2 expresados
en células de Drosophila tienen las características del
péptido libre o moléculas "vacías" de la Clase I. Las células
de Drosophila que expresaban el K^{b}/\beta2,
L^{d}/\beta2, y D^{b}/\beta2 se marcaron durante 45 minutos
con 35S-metionina y se prepararon los lisados. Cada
lisado se dividió en cuatro alícuotas, a las que se añadió OVA, NP o
péptido GP2, o ningún péptido. Después de su incubación durante 1
hora a 4°C, se incubó la otra durante 1 hora a 30°C. A continuación
se inmunoprecipitaron las moléculas de la Clase I a partir de los
lisados, y se analizaron mediante SDS-PAGE. La
Figura 2B ilustra los resultados de un ensayo de lisados de células
radiactivos, preparados a partir de células de Drosophila,
que expresaban K^{b}/\beta2, L^{d}/\beta2, y
D^{b}/\beta2, con microglobulina \beta2 de ratón o humana. Se
representa la temperatura de incubación (en °C) frente la
inmunoprecipitación de la cadena pesada (en %). Se muestran:
K^{b}/m\beta2 (cuadrados vacíos), K^{b}/m\beta2 + OVA
(cuadrados rellenos), L^{d}/m\beta2 (triángulos vacíos),
L^{d}/m\beta2 + NP (triángulos rellenos), D^{b}/\beta2
(círculos vacíos), y D^{b}/\beta2 + INF (círculos
rellenos).
La Figura 3 (A y B) muestra la fluorescencia
promedio de células de Drosophila transfectadas, cultivadas
en medio carente de suero, según se determinó mediante
citofluorimetría, después de teñir el K^{b}/m\beta2 con
anticuerpo Y3, y el D^{b}/m\beta2 con el anticuerpo B22.249.
Antes de la tinción, y tal como se indica en la figura, las células
se incubaron en el péptido (25 \mug/ml) durante una hora a 27°C,
seguida por una incubación de 2 hora a 37°C. La fluorescencia media
de cada población celular tratada se muestra representada frente a
las condiciones de incubación. La Figura 3A muestra que las
moléculas de la Clase I expresadas sobre la superficie de células de
Drosophila son rápidamente desnaturalizadas a 37°C, de tal
forma que ya no pueden ser reconocidas por los anticuerpos
anti-Clase I. La Figura 3B muestra que las moléculas
del MHC de la Clase I expresadas en células de Drosophila son
termolábiles en lisados de Triton X-100 a menos que
se preincuben en presencia del péptido que se sabe se une
específicamente a la
Clase I.
Clase I.
La Figura 4 ilustra datos procedentes de un
experimento diseñado para determinar si las células de insectos
pueden procesar antígeno y cargarlo sobre las moléculas de la Clase
I, y si éstas últimas pueden presentar, endógena o exógenamente,
antígeno derivado a las células T. Se incubaron células Schneider 2
(SC2) o 3T3, transfectadas con K^{b}/\beta2, con proteína
ovoalbúmina (OvPro) o el péptido ovoalbúmina OVA 24 (OvPep) en medio
isotónico (Iso) o hipertónico (Hyp). La línea celular de ratón
BALE/3T3 está disponible a partir de la ATCC bajo el número de
acceso CCL 163). Después del tratamiento, las células se
cocultivaron con el hibridoma B3/CD8 de célula T. El B3/CD8 es un
hibridoma de célula T entre B3 (Carbohe et al., J. Exp.
Med. 169:603-612 (1989)), célula T citotóxica
específica para el péptido de ovoalbúmina 253-276
presentado por moléculas H-2k^{b} de la Clase I, y
la línea celular secretora de IL-2 y portadora de
CD8. A partir de la estimulación antigénica, la B3/CD8 produce
IL-2, medida mediante incorporación de
^{3}H-timidina en la línea celular CTLL
dependiente de IL-2 (Gillis et al., J.
Immunol. 120:2027-2029 (1978)). Por tanto,
midiendo la cantidad de IL-2 producida, uno puede
ensayar el reconocimiento por parte de la célula T.
El sobrenadante procedente de los cultivos se
analizó en busca de IL-2 mediante la incorporación
de ^{3}H-timidina en parte de la línea celular
CTLL dependiente de IL-2 (ATCC nº TIB 214). La
cantidad de 3H-timidina incorporada se representa
frente los tratamientos iniciales de las células.
La Figura 5A muestra la termoestabilización,
inducida por el péptido, de la HLA B27 y HLA A2.1 expresadas sobre
la superficie de células de Drosophila por parte de péptidos
del VIH. La fluorescencia promedio de cada población celular se
muestra representada frente las condiciones de incubación.
La Figura 5B muestra que la HLA B7 expresada en
células de Drosophila tiene las características de las
moléculas de la Clase I vacías en lisados de Triton X100.
La Figura 5C ilustra que la HLA A2.2Y expresada
en células de Drosophila tiene las características de las
moléculas de la Clase I vacías en lisados de Triton X100.
La Figuras 6 ilustra la inducción de la
respuesta de CD8 primaria después de la estimulación in vitro
de CD8 en presencia o ausencia de péptidos. Las que responden son
células B6 del bazo de ratón, y las estimulantes son
RMA-S (triángulos vacíos); RMA-S más
OVA (triángulos rellenos); Drosophila más OVA (cuadrados
vacíos); y K^{b} de Drosophila más OVA (cuadrados
rellenos). En 6A, la diana son células RMA-S y el
péptido de ovoalbúmina; en 6B, la diana son células
RMA-S. En ambos diagramas se representa el
porcentaje de lisis respecto la proporción de efector/diana.
La Figura 7 ilustra la respuesta de inducción
después de la estimulación in vitro de CD8 con células de
Drosophila en presencia o ausencia de péptido. En 7, los
esplenocitos C57 B1/6 que responden son estimulados con células de
K^{b} de Drosophila y OVA. Las células diana incluyen: EL4
(cuadrados vacíos con un punto en el centro); EL4 OVA (rombos
rellenos); EL4 + péptido de OVA (cuadrados negros con un punto
blanco en el centro); RMA-S + péptido de OVA
(diamantes negros con un punto blanco en el centro); y
RMA-S (cuadrados sólidos). Se representa el
porcentaje de lisis respecto la proporción de efector/diana.
La Figura 8 (A y B) ilustra el cebado in
vivo con células transfectadas de Drosophila, en donde
las que responden son esplenocitos C57 B1/6 de ratón. En 8A, algunas
de las células están fijadas; en 8B, las células de
Drosophila están todas sin fijar. En 8A las células
estimulantes de mosca son tal como sigue: K^{b} (cuadrados vacíos
con un punto central); K^{b} OVA fijadas (rombos rellenos);
K^{b} OVA fijadas + S/N (cuadrado negro con un punto blanco en el
centro); K^{b} OVA (sin fijar) (rombo negro con un punto blanco en
el centro). En 8B, las células estimulantes de mosca se ilustran
como sigue: K^{b} (cuadrados vacíos con un punto central);
K^{b}/OVA (rombos rellenos); K^{b}/OVA in
vivo/K^{b}/OVA in vitro (cuadrados rellenos con un
punto blanco en el centro); K^{b}/OVA in vivo/D^{b}/OVA
in vitro (rombos rellenos con un punto blanco en el centro);
y D^{b} OVA (cuadrados rellenos). En ambas, A y B, se representa
el porcentaje de lisis respecto la proporción de efector/diana.
La Figura 9 ilustra el resultado de un
experimento en el que se inyectaron células C57BL/6 de ratón con 3MM
EL4 OVA y, subsiguientemente, con células de Drosophila y sin
células. El porcentaje de supervivencia de cada una de las tres
poblaciones de ratón se representa respecto el número de días de
supervivencia. El grupo I (rombos rellenos) recibió una inyección
subcutánea de células 50MM de Drosophila vivas, que
expresaban K^{b}/OVA, 5 días después de la inyección de EL4; el
grupo II (cuadrados vacíos) recibió células 50 MM de
Drosophila fijadas, que expresaban K^{b}/OVA, 5 días
después de la inyección de EL4; y el grupo III (círculos rellenos),
el grupo control, no recibió inyecciones adicionales. Los ratones
del grupo II se sacrificaron el día 20; los ratones del grupo III el
día 23.
Las Figuras 10A, B, y C ilustran la activación
in vitro con células transfectadas de Drosophila. En
ambas, A y B, las células que responden eran células de bazo de
ratón transgénicas de la B7/humana microglobulina \beta2. Las
células diana eran Jurkat (cuadrados vacíos con un punto central), y
Jurkat recubiertas con el péptido A GAG de VIH (rombos rellenos),
tal como se ilustra en ambas, A y B. En 10A, las células
estimulantes son células de Drosophila con el GAG B7 del VIH
(A); en 10B, éstas son células de Drosophila con B7. En 10C,
las células que responden son células de bazo de ratón transgénico
B7 estimuladas mediante VPR B7 de Drosophila. Las células
diana son Jurkat (cuadrados vacíos con un punto central); Jurkat/VPR
(rombos rellenos); RMA-S (cuadrados rellenos); y
RMA-S/VPR (rombos vacíos con un punto central). El
porcentaje de lisis se presenta respecto la proporción de
efector/diana en A, B y C.
Las Figuras 11A, B, y C ilustran la activación
in vitro con células de Drosophila transfectadas. En
11A, las células que responden son PBL HLA B7 humanas estimuladas
con células B7 VPR de Drosophila. El porcentaje de lisis se
presenta respecto la proporción de efector/diana. Las células diana
son Jurkat VPR (cuadrados vacíos con un punto central); EL4 B7
(rombos rellenos); Jurkat (cuadrados rellenos); y EL4 B7 VPR (rombos
rellenos con un punto central). En 11B, las células que responden
son PBL HLA2 humanos estimulados con células A2 GAG (A) (VIH) de
Drosophila. El porcentaje de lisis se presenta respecto la
proporción de efector/diana. Las células diana son Jurkat A2 (rombos
rellenos) y Jurkat A2 GAG (A) (cuadrados vacíos con un punto
central). En 11C, las células que responden son PBL B27 humanos
estimulados con células B27 VPR (VIH) de Drosophila. Las
células diana son Jurkat A2 (rombos rellenos) y Jurkat A2 GAG (A)
(cuadrados vacíos con un punto central). El porcentaje de lisis se
presenta respecto la proporción de efector/diana.
La Figura 12 ilustra la activación in
vitro con células transfectadas de Drosophila. Las
células que responden son PBL HLA A2.1 humanos estimulados con
células A2.1 de Drosophila recubiertas con péptido POL de
VIH. El porcentaje de lisis se presenta respecto la proporción de
efector/diana. Las células diana son Jurkat A2.1 de VIH (cuadrados
vacíos con un punto central) y Jurkat A2.1 (rombos rellenos).
Aminoácido: Todos los residuos
aminoácidos identificados en la presente invención tienen la
configuración L natural. De acuerdo con la nomenclatura estándar de
polipéptidos, J. Biol. Chem. 243:3557-3559
(1969), las abreviaturas de los residuos aminoácidos son tal como se
muestran en la siguiente Tabla de Correspondencias:
| Símbolo | Aminoácido | |
| 1 Letra | 3 Letras | |
| Y | Tyr | L-tirosina |
| G | Gly | glicina |
| F | Phe | L-fenilalanina |
| M | Met | L-metionina |
| A | Ala | L-alanina |
| S | Ser | L-serina |
| I | Ile | L-isoleucina |
| L | Leu | L-leucina |
| T | Thr | L-treonina |
| V | Val | L-valina |
| P | Pro | L-prolina |
| K | Lys | L-lisina |
| H | His | L-histidina |
| Q | Gln | L-glutamina |
| E | Glu | ácido L-glutámico |
| W | Trp | L-triptófano |
| R | Arg | L-arginina |
| D | Asp | ácido L-aspártico |
| N | Asn | L-asparagina |
| C | Cys | L-cisteína |
Debería destacarse que todas las secuencias de
residuos aminoácidos se representan con una fórmula cuyo orientación
de izquierda a derecha está en la dirección convencional de extremo
amino-terminal a extremo
carboxi-terminal.
Par de bases (pb): es una pareja de
adenina (A) con timina (T), o de citosina (C) con guanina (G) en un
doble hélice de ADN.
Clon: describe un gran número de células
o moléculas idénticas con una única célula o molécula ancestral.
Bases complementarias: los nucleótidos
que normalmente se emparejan cuando el ADN o ARN adopta una
configuración de doble hebra.
Secuencia de nucleótidos complementaria:
una secuencia de nucleótidos en una molécula de ADN o ARN de hebra
única que es suficientemente complementaria a aquélla en otra hebra
única como para hibridarse específicamente con ésta con los
consiguientes puentes de hidrógeno.
Conservada: una secuencia de nucleótidos
está conservada con respecto a una secuencia previamente
seleccionada (de referencia) si se hibrida de forma no aleatoria,
hasta una complementariedad exacta, con la secuencia previamente
seleccionada.
Cadena abajo: identifica secuencias que
progresan más allá en la dirección de expresión; por ejemplo, la
región codificante de un polipéptido para un gen está cadena abajo
respecto el codón de inicio.
Expresión: el proceso sufrido por un gen
estructural para producir un polipéptido. Es una combinación de
transcripción y traducción.
Gen (Cistrón): un ácido nucleico cuya
secuencia nucleotídica codifica un ARN o un polipéptido. Un gen
puede ser de ARN o ADN. También puede incluir regiones que preceden
o siguen a la región codificante (líderes o traileres), así como
secuencias intercaladas (intrones) entre segmentos codificantes
individuales (exones).
Hibridación: el emparejamiento de
secuencias nucleotídicas sustancialmente complementarias (hebras de
ácidos nucleicos) para formar un dúplex o heterodúplex mediante el
establecimiento de puentes de hidrógeno entre pares de bases
complementarias. Es una interacción específica, es decir, no es
aleatoria, entre dos polinucleótidos complementarios que puede ser
inhibida competitivamente.
Ligando: el ligando se refiere a una
molécula que contiene una porción estructural que está unida
mediante interacción específica con una proteína receptora
determinada.
Nucleótido: una unidad monomérica de ADN
o ARN, consistente en una porción azúcar (pentosa), un grupo
fosfato, y una base nitrogenada heterocíclica. La base está unida a
la porción azúcar mediante un enlace glicosídico (al carbono 1' de
la pentosa), y esa combinación de base y azúcar es un nucleósido.
Cuando el nucleósido contiene un grupo fosfato unido en la posición
3' o 5' de la pentosa, se denomina nucleótido. Una secuencia de
nucleótidos operativamente unidos se denomina típicamente en la
presente invención como "una secuencia de bases" o "secuencia
nucleotídica", y sus equivalentes gramaticales, y se representa
en la presente invención mediante una fórmula cuya orientación de
izquierda a derecha está en la dirección convencional del extremo 5'
al extremo 3'.
Oligonucleótido o polinucleótido: un
polímero de nucleótidos de hebra única o doble. Tal como se usa en
la presente invención, "oligonucleótido", y sus equivalentes
gramaticales, incluirán un rango completo de ácidos nucleicos. Un
oligonucleótido se referirá típicamente a una molécula de ácido
nucleico formada por una hebra lineal de ribonucleótidos. El tamaño
exacto dependerá de muchos factores, los cuales a su vez dependen de
la condición final de uso, tal como es bien sabido en la
técnica.
Pauta de lectura abierta: una secuencia
nucleotídica, usualmente una secuencia de ADN, la cual es
(potencialmente) traducible en una proteína.
Polipéptido o péptido son términos usados
de forma intercambiable en la presente invención para designar una
serie lineal de residuos aminoácidos, conectados los unos a los
otros mediante enlaces peptídicos entre los grupos
alfa-amino y carboxilo de residuos adyacentes.
Receptor: Receptor y proteína receptora
son términos usados de forma intercambiable en la presente invención
para indicar un molécula proteica biológicamente activa que une
específicamente a (o con) otras moléculas.
Molécula de ADN recombinante (rADN): una
molécula de ADN producida uniendo operativamente una secuencia de
ácido nucleico, tal como un gen, a una secuencia de molécula de ADN
de la presente invención. Por tanto, una molécula de ADN
recombinante es una molécula de ADN híbrida que comprende, al menos,
dos secuencias nucleotídicas que normalmente no se encuentran juntas
en la naturaleza. Los rADN que no tienen un origen biológicamente
común, es decir, que son evolutivamente distintos, se dice de son
"heterólogos".
Sustancialmente homólogo quiere decir que
una secuencia o molécula determinada, por ejemplo, una secuencia
mutante que es sujeto, varía respecto una secuencia de referencia
mediante una o más sustituciones, supresiones, o adiciones, el
efecto neto de las cuales no resulta en una diferencia funcional
adversa entre las secuencias de referencia y del sujeto. Para los
propósitos de la presente invención, se consideran sustancialmente
homólogas las secuencias de aminoácidos que tienen más del 90 por
ciento de similitud, actividad biológica equivalente, y
características de expresión equivalentes, Las secuencias de
aminoácidos que tienen más del 40 por ciento de similitud se
consideran sustancialmente similares. Para los propósitos de
determinar la homología o similitud, deberían descartarse la
truncación o supresiones internas de la secuencia de referencia, así
como también también deberían descartarse las modificaciosn
subsiguientes de la molécula, por ejemplo, la glicosilación. Las
secuencias que tienen niveles de homología inferiores y bioactividad
comparable se consideran equivalentes.
Transfección: es la adquisición de nuevos
marcadores genéticos mediante la incorporación de ADN añadido en
células eucariotas.
Vector: un ácido nucleico,
preferiblemente una molécula de ADN, capaz de replicación autónoma
en una célula, y al cual se puede unir operativamente un segmento de
ácido nucleico, por ejemplo, un gen o polinucleótido
(preferiblemente de ADN), para incorporar la replicación del
segmento unido. Los vectores capaces de dirigir la expresión de
segmentos (genes) de ácidos nucleicos (preferiblemente de ADN) que
codifican una o más proteínas, se denominan en la presente invención
"vectores de expresión". Otra variedad de vectores importante
permite la clonación de cADN (ADN complementario) a partir de mARN
producidos usando la transcriptasa inversa.
Vector de clonación: es cualquier
plásmido o virus en el que puede insertarse una secuencia
nucleotídica ajena (preferiblemente ADN) a clonar.
Vector de expresión: es cualquier
plásmido o virus en el que puede insertarse o expresarse una
secuencia nucleotídica ajena (preferiblemente ADN).
Una molécula del MHC de la Clase I humana de la
presente invención se selecciona de entre el grupo formado por
HLA-A, HLA-B, HLA-C,
HLA-E, HLA-F, y
HLA-G, y más preferiblemente, de entre el grupo
comprendido por HLA-A, HLA-B, y
HLA-C.
Aunque es posible aislar secuencias
nucleotídicas que codifican moléculas del MHC de la Clase I
procedentes de líneas celulares, establecidas y bien conocidas,
portadoras de las variantes apropiadas -por ejemplo, las líneas
celulares transformadas JY, BM92, WIN, MON Y MG- es más práctico
sintetizar la secuencia nucleotídica, a partir de una porción del
gen, mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) usando
los cebadores apropiados. Este procedimiento se ha usado
exitosamente para clonar el cADN de longitud completa de HLA; por
ejemplo, las secuencias para HLA-A25,
HLA-A2, HLA-B57,
HLA-51, y HLA-37 están depositadas
en la base de datos GenBank con los números de acceso M32321,
M32322, M32317, M32318, M32319 y M32320, respectivamente. Están
publicadas secuencias de nucleótidos y aminoácidos parciales y
putativas del HLA, incluyendo la secuencia consenso (ver, por
ejemplo, Zemmour y Parham, Immunogenetics
33:310-320 (1991)), y se conocen, y están
generalmente disponibles, líneas celulares que expresan variantes
del HLA, muchas de ellas a partir de la American Type Culture
Collection ("ATCC"). Por tanto, usando la PCR, es posible
sintetizar secuencias nucleotídicas que codifican el MHC de la Clase
I humana, las cuales pueden a continuación unirse de forma operativa
a un vector, y usarse para transformar un célula apropiada y
expresarlas en la presente invención.
Los procedimientos particularmente preferidos
para producir las moléculas del MHC de la Clase I humanas y
moléculas de la microglobulina \beta2 humana de la presente
invención se basan en el uso de oligonucleótidos preselecionados
como cebadores en una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) para
formar productos de reacción de la PCR tal como se describe en la
presente invención. LA preparación de los genes del MHC y de la
microglobulina \beta2 se consigue típicamente mediante la
extensión del cebador, preferiblemente mediante la extensión del
cebador en un formato de reacción en cadena de la polimerasa
(PCR).
Si los genes han de producirse mediante
amplificación (PCR), deben usarse dos cebadores, es decir, un par
cebador de PCR, para cada hebra codificantes de ácido nucleico a
amplificar. (Por motivos de simplicidad, se discutirá la síntesis de
una variante de HLA de ejemplo, pero debe sobrentenderse
expresamente que el procedimiento de amplificación mediante PCR
descrito es igualmente aplicable a la síntesis de microglobulina
\beta2 y todas las variantes de HLA, incluyendo aquéllas cuyas
secuencias completas son actualmente desconocidas). El primer
cebador pasa a formar parte de la hebra sin sentido (negativa o
complementaria) y se hibrida a una secuencia nucleotídica conservada
de entre las hebras (positivas o codificantes) de HLA. Para producir
homólogos del ADN codificante, los primeros cebadores se escogen,
por tanto, para que se hibriden a (es decir, sean complementarios
de) regiones conservadas dentro de los genes del MHC,
preferiblemente la secuencia consenso o similar, regiones
conservadas dentro de cada grupo de HLA -es decir, secuencias
consenso dentro de HLA-A, HLA-B,
HLA-C, y los grupos menos polimórficos
HLA-E, -F y -G. Los segundos cebadores pasan a
formar parte de la hebra codificante (positiva) y se hibridan a una
secuencia nucleotídica conservada entre las hebras negativas. Para
producir los homólogos del ADN codificante de HLA, los segundos
cebadores se escogen, por tanto, para hibridarse a una secuencia
nucleotídica conservada en el extremo 5' del gen que codifica HLA,
así como en aquella área que codifica la región líder o primera
estructural. Debería destacarse que en la amplificación de los
homólogos de ADN codificante, la secuencia nucleotídica 5'
conservada del segundo cebador puede ser complementaria a una
secuencia añadida exógenamente usando la transferasa de
desoxinucleotidil terminal, tal como describieron Loh et al.,
Science 243:217-220 (1989). Uno o ambos de
los cebadores primero y segundo pueden contener una secuencia
nucleotídica que defina un sitio de reconocimiento de endonucleasa.
Es sitio puede ser heterólogos al gen de la inmunoglobulina que se
está amplificando, y típicamente aparece en o cerca del extremo 5'
del cebador.
El primer cebador de un par cebador de PCR se
denomina en la presente invención "cebador con sentido", puesto
que se hibrida con la hebra codificante o con sentido de un ácido
nucleico. Además, el segundo cebador de un par cebador de PCR se
denomina en la presente invención "cebador
anti-sentido", puesto que se hibrida con la hebra
no codificante o anti-sentido de un ácido nucleico,
es decir, una hebra complementaria a una hebra codificante. Una
pluralidad de primer cebador y/o una pluralidad de segundos
cebadores pueden usarse para formar diferentes pares cebadores.
Alternativamente, puede usarse un par individual de primero y
segundo cebadores. En cualquier caso, los productos de amplificación
de las amplificaciones que usan la misma o diferentes combinaciones
de primero y segundo cebadores pueden combinarse para incrementar la
diversidad de la biblioteca de genes.
Cuando está presente, la porción que define el
sitio de restricción está típicamente ubicada en una porción 5' no
cebadora del cebador. El sitio de restricción definido por el primer
cebador se escoge típicamente para que sea uno reconocido por un
enzima de restricción que no reconozca el sitio de restricción
definido por el segundo cebador, siendo el objetivo ser capaz de
producir una molécula de ADN que tiene extremos adhesivos que no son
complementarios entre ellos, y que, por tanto, permiten la inserción
en una dirección en un vector.
En una realización, la presente invención
utiliza un conjunto de polinucleótidos para formar cebadores que
tienen una región cebadora ubicada en el extremo 3' del cebador. La
región cebadora corresponde típicamente a las 15 a 30 bases de
nucleótidos más 3' (3'-terminales). La porción
cebadora 3'-terminal de cada cebador es capaz de
actuar como un cebador para catalizar la síntesis de ácidos
nucleicos, es decir, inicial una reacción de extensión del cebador a
partir de su extremo 3'. Uno o ambos cebadores pueden adicionalmente
contener una porción no cebadora 5'-terminal (la más
5'), es decir, una región que no participa en la hibridación de la
plantilla de HLA.
En PCR, cada cebador trabaja en combinación con
un segundo cebador para amplificar una secuencia diana de ácido
nucleico. La elección de pares cebadores de PCR para su uso en PCR
está gobernada por consideraciones como la que se discuten en la
presente invención para producir moléculas del MHC de la Clase I y
microglobulina \beta2. Esto es, los cebadores tienen una secuencia
de nucleótidos que es complementaria a una secuencia conservada en
el gen de elección. Las secuencias cebadoras útiles se descubren en
la presente invención más adelante.
La estrategia usada para clonar los genes de HLA
dependerá, como es bien sabido en la técnica, del tipo, complejidad,
y pureza de los ácidos nucleicos que conforman los diversos genes
del HLA. Otros factores incluyen, si los genes han de ser
amplificados y/o mutados.
En general, los genes del HLA están formados por
hebras que codifican polinucleótidos, tales como la del mARN y/o la
hebra con sentido del ADN genómico. Si el HLA está en forma de ADN
genómico de doble hebra, habitualmente se desnaturaliza primero,
típicamente fundiéndolo, en hebras sencillas. Una secuencia de HLA
se somete a una reacción de PCR tratando (o poniendo en contacto) la
secuencia con un par cebador de PCR, teniendo cada miembro del par
una secuencia nucleotídica preseleccionada. El par cebador de PCR es
capaz de iniciar las reacciones de extensión del cebador
hibridándose a las secuencias nucleotídicas, preferiblemente a al
menos 10 nucleótidos de longitud, y más preferiblemente a al menos
aproximadamente 20 nucleótidos en longitud, conservados dentro de la
secuencia de HLA.
La reacción de la PCR se realiza mezclando el
par cebador de la PCR, preferiblemente una cantidad predeterminada
del mismo, con ácidos nucleicos del gen de la HLA, preferiblemente
una cantidad predeterminada de los mismos, en un tampón de la PCR,
para formar un mezcla de reacción de la PCR. La mezcla se mantiene
en condiciones de síntesis de polinucleótidos durante un período de
tiempo, el cual está típicamente predeterminado, suficiente para la
formación de un producto de reacción de la PCR, produciendo, por
tanto, una pluralidad de diferentes homólogos de ADN que codifican
el HLA.
En otra estrategia, el objeto es clonar los
genes codificando la variante de HLA a partir de una variante de HLA
proporcionando un complemento de polinucleótido del HLA, tal como la
hebra anti-sentido del dsADN genómico o el
polinucleótido producido sometiendo el mARN a una reacción de
transcriptasa inversa. Los procedimientos para producir tales
complementos son bien conocidos en la técnica.
La reacción de la PCR se realiza usando
cualquier procedimiento apropiado. Generalmente ocurre en una
solución acuosa tamponada, es decir, un tampón de PCR,
preferiblemente a un pH de 7-9, más
preferiblemente aproximadamente a 8. Preferiblemente, se mezcla un
exceso molar (para ácido nucleico genómico, usualmente
aproximadamente 10^{6}:1 cebador:plantilla) del cebador con el
tampón que contiene la hebra de plantilla. Se prefiere un gran
exceso molar para mejorar la eficiencia del proceso.
El tampón de la PCR también contiene
preferiblemente los trifosfatos de desoxirribonucleótido, dATP,
dCTP, dGTP, y dTTP, y una polimerasa, típicamente termoestable, todo
en las cantidades apropiadas para la reacción de extensión del
cebador (síntesis de polinucleótidos). La solución resultante
(mezcla de la PCR) se calienta a aproximadamente
90°C-100°C durante aproximadamente 1 a 10 minutos,
preferiblemente de 1 a 4 minutos. Después de este período de
calentamiento, se deja enfriar la solución hasta 54°C, que es
preferible para la hibridación del cebador. La reacción de síntesis
puede ocurrir a, desde temperatura ambiente hasta una temperatura
por encima de la cual la polimerasa (agente inductor) ya no funciona
eficientemente. Por tanto, por ejemplo, si se usa la polimerasa de
ADN como agente inductor, la temperatura no es generalmente superior
a aproximadamente 40°C. Un ejemplo de tampón de la PCR comprende lo
siguiente: KCl 50 mM; Tris-HCl 10 mM; pH 8,3;
MgCl_{2} 1,5 mM; gelatina al 0,001% (peso/volumen); dATP 200
\muM; dATP 200 \muM; dTTP 200 \muM; dCTP 200 \muM; y dGTP
200 \muM; 2,5 unidades de polimerasa I de ADN de Thermus
aquaticus (patente estadounidense nº 4.889.818) por 100
microlitros de tampón.
El agente inductor puede ser cualquier compuesto
o sistema que funcionará para conseguir la síntesis de productos de
extensión del cebador, incluyendo los enzimas. Los enzimas
apropiados para este propósito incluyen, por ejemplo, la polimerasa
I de ADN de E. coli, el fragmento Klenow de la polimerasa I
de ADN de E. coli, la polimerasa de ADN del T4, otras
polimerasas de ADN disponibles, la transcriptasa inversa, y otros
enzimas, incluyendo enzimas termoestables, los cuales facilitarán la
combinación de los nucleótidos libres en la disposición correcta
para formar los productos de extensión del cebador que son
complementarios a cada hebra de ácido nucleico. Generalmente, la
síntesis se iniciará en el extremo 3' de cada cebador, y procederá
en la dirección 5' a lo largo de la hebra de plantilla, hasta que se
termine la síntesis, produciendo moléculas de diferentes longitudes.
No obstante, puede haber agentes que iniciaran la síntesis en el
extremo 5' y procedieran en la dirección anterior, usando el mismo
proceso que se ha descrito más arriba.
El agente inductor también puede ser un
compuesto o sistema que funcionaría para conseguir la síntesis de
productos de extensión del cebador de ARN, incluyendo enzimas. En
las realizaciones preferidas, el agente inductor puede ser una
polimerasa de ARN dependiente de ADN, tal como la polimerasa de ARN
del T7, la polimerasa de ARN del T3, o la polimerasa de ARN de SP6.
Estas polimerasas producen un polinucleótido de ARN complementario.
La elevada velocidad de recambio de la polimerasa de ARN amplifica
el polinucleótido inicial, tal como ha sido descrito por Chamberlin
et al., The Enzymes, ed. P. Boyer, pp.
87-108, Academic Press, Nueva York (1982). Otra
ventaja de la polimerasa de ARN de T7 es que pueden introducirse
mutaciones en la síntesis del polinucleótido remplazando una porción
de cADN con uno o más oligodesoxinucleótidos (polinucleótidos)
mutados y transcribiendo directamente la plantilla parcialmente
desaparejada, tal como ha sido previamente descrito por Joyce et
al., Nuc. Acid Res. 17:711-722 (1989).
Los sistemas de amplificación basados en la transcripción han sido
descritos por Gingeras et al., en PCR Protocols, A Guide
to Methods and Applications, 245-252, Academic
Press, Inc., San Diego, CA (1990).
Si el agente inductor es una polimerasa de ARN
dependiente de ADN, e incorpora por tanto trifosfatos de
ribonucleótidos, se mezclan cantidades suficientes de ATP, CTP, GTP
y UTP con la mezcla de extensión del cebador y la solución
resultante se trata tal como se describe más arriba.
La hebra sintetizada de nuevo y su hebra de
ácido nucleico complementaria forman una molécula de doble hebra, la
cual puede usarse en los pasos siguientes del proceso.
Después de procesar homólogos de ADN que
codifican la variante del HLA, para uno o una pluralidad de genes
diferentes dentro del sistema del HLA, las moléculas de ADN se
amplifican típicamente aún más. Mientras que las moléculas de ADN
pueden ser amplificadas mediante técnicas clásicas, tales como la
incorporación en un vector de replicación autónomo, se prefiere
amplificar primero las moléculas sometiéndolas a la reacción en
cadena de la polimerasa (PCR) antes de insertarlas en un vector. La
PCR se realiza típicamente mediante termociclado, es decir,
incrementando y disminuyendo repetidamente la temperatura de una
mezcla de reacción de la PCR dentro de un rango de temperaturas cuyo
límite inferior es desde aproximadamente 10°C hasta 40°C, y cuyo
límite superior es desde aproximadamente 90°C hasta 100°C. El
incremento y disminución puede ser continuo, pero es preferiblemente
por fases, con períodos de tiempo de estabilidad relativa de la
temperatura a cada temperatura, favoreciendo la síntesis de
polinucleótido, la desnaturalización y la hibridación.
Los procedimientos de amplificación mediante la
PCR se describen en detalle en las patentes estadounidenses nº
4.683.192, 4.683.202, 4.800.159, y 4.965.188, y al menos en varios
textos, incluyendo "PCR Technology: Principles and Applications
for DNA Amplification", Ed. H. Erlich, Stockton Press, Nueva York
(1989); y "PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications",
Eds. Innis et al., Academic Press, San Diego, California
(1990). Varios procedimientos y cebadores usados en la presente
invención se describen en la presente invención más adelante, y son
descritos también, por ejemplo, por Nilsson et al.,
Cell 58:707 (1989), Ennis et al., PNAS USA
87:2833-2837 (1990), y Zemmour et al.,
Immunogenetics 33:310-320 (1991). En
concreto, se prefiere diseñar cebadores a partir de la comparación
de regiones 5' y 3' no traducidas de alelos de la HLA (por ejemplo,
alelos -A, -B, -C, -E, -F o -G), con selección de secuencias
conservadas. Los sitios de restricción también pueden incorporarse
en cebadores 5' y 3' para permitir que los productos de la
amplificación fueran subclonados en vectores de secuenciación y
expresión. También puede ser útil colocar un espaciador con una
secuencia de 4-bases proximal al sitio de
restricción para mejorar la eficiencia para cortar los productos de
amplificación con enzimas.
Se prefirieron los siguientes cebadores para la
amplificación del cADN de HLA-A, -B, -C, -E, -F y
-G, preferiblemente en reacciones separadas. Los cADN resultantes
pueden clonarse y secuenciarse a continuación tal como se describe
en la presente invención. Estos cebadores son apropiados para su uso
en amplificar todos los tipos de HLA conocidos y actualmente
desconocidos.
En una realización preferida, sólo un par de
cebadores primero y segundo se usa por reacción de amplificación. A
continuación se combinan los productos de la reacción de
amplificación obtenidos a partir de una pluralidad de
amplificaciones diferentes, cada una usando una pluralidad de pares
cebadores diferentes. No obstante, la presente invención también
contempla la producción de ADN homólogo a través de
co-amplificación (usando dos pares de cebadores), y
la amplificación múltiple (usanda hasta aproximadamente 8, 9 o 10
pares cebadores).
El proceso de la PCR se usa no sólo para
producir una variedad de moléculas de ADN que codifican la Clase I
humana, sino también para inducir mutaciones que pueden emular
aquéllas observadas en los locus altamente polimórficos del HLA, o
para crear diversidad a partir de un único clon progenitor, y
proporcionar por tanto una "biblioteca" de ADN codificando una
molécula del MHC de la Clase I que tiene una mayor heterogeneidad.
Primero, debería destacarse que el proceso de la PCR por sí mismo es
inherentemente mutagénico, debido a una diversidad de factores bien
conocidos en la técnica. Segundo, además de las variaciones
inductoras de mutación descritas en la patente estadounidense nº
4.683.195 antes citada, pueden emplearse otras variaciones de la PCR
inductoras de mutación. Por ejemplo, la mezcla de reacción de la PCR
puede formarse con cantidades diferentes de uno o más nucleótidos a
ser incorporados en el producto de extensión. Bajo tales
condiciones, la reacción de la PCR procede para producir
sustituciones de nucleótidos dentro del producto de extensión, a
resultas de la escasez de un base determinada. Similarmente, pueden
incorporarse en la mezcla inicial de reacción de la PCR cantidades
molares aproximadamente iguales de los nucleótidos en una cantidad
para realizar eficientemente un número X de ciclos, y a continuación
ciclar la mezcla a través de un número de ciclos en exceso respecto
X, tal como, por ejemplo 2X. Alternativamente, las mutaciones
durante la PCR pueden inducirse mediante incorporación en una mezcla
de reacción de derivados de nucleótidos, tales como inosina, que
normalmente no se encuentran en los ácidos nucleicos de las variante
de HLA que se está amplificando. Durante la subsiguiente
amplificación in vivo, el derivado del nucleótido será
remplazado por un nucleótido sustituto, induciendo por tanto una
mutación localizada.
Un procedimiento preferido, el cual puede
utilizarse para clonar una secuencia de nucleótidos que se puediera
expresar, que codificara el MHC de la Clase I humana, es como sigue.
Puede cultivarse células que contuvieran el(los)
gene(s) de elección en un medio apropiado (por ejemplo, RPMI
1640), suplementado según se precise (por ejemplo, con suero fetal
bovino y/o antibiótico). Se prepara el ARN celular total a partir
del cultivo de elección y a continuación se sintetiza el cADN de
primera hebra. El cADN puede sintetizarse usando, por ejemplo,
oligo(dT) y la transcriptasa inversa del virus de la
mieloblastosis de la aves. También puede usarse el radiomarcaje para
asistir en el aislamiento y la recuperación del producto clonado. A
continuación, el producto preferiblemente se extrae, se precipita, y
se usa como diana para la PCR de amplificación, usando el par
cebador de la PCR apropiado tal como se describe en esta. La
amplificación puede llevarse a cabo usando procedimientos y equipos
disponibles, por ejemplo, los equipos GeneAmp y un ciclador térmico
(Perkin-Elmer/Cetus). También son útiles varios
protocolos; un protocolo de amplificación progresa durante 30
ciclos, en los que cada ciclo consiste en 60 segundos a 94°C, 60
segundos a 65°C, y 90 segundos a 72°C, seguidos por 10 minutos a
72°C. Otro protocolo progresa durante 20 ciclos, con 60 segundos a
94°C, un segundo a 65°C, y un tiempo variable a 72°C, el cual
empieza a aproximadamente 50 segundos e incrementa gradualmente en
un segundo en cada ciclo. La amplificación finaliza entonces con 10
minutos a 72°C.
Típicamente, el producto de la PCR se subclona a
continuación y se secuencia de acuerdo con procedimientos conocidos.
Por ejemplo, el producto puede extraerse y extraerse de nuevo (por
ejemplo, con fenol/cloroformo), precipitarse, y digerirse con un
enzima apropiado -por ejemplo, HindIII- durante un intervalo de
tiempo apropiado. El producto doblemente cortado se aísla y purifica
(por ejemplo, con cuentas de vidrio) y se liga a vectores igualmente
cortados. A continuación se selecciona un vector apropiado en base a
las características de la línea celular seleccionada para expresar
la molécula del MHC. Por ejemplo, uno puede expresar el MHC en E.
coli con el propósito de recuperar el MHC para su análisis
secuencial. Alternativamente, uno puede expresar el MHC en una linea
celular transformada de la presente invención con el propósito de
activar células CD8. Por tanto, la selección de vectores apropiados
se descubre con mayor detalle en otras partes en esta sección.
Un vector de la presente invención es una
molécula de ácido nucleico (preferiblemente ADN) capaz de
replicación autónoma en una célula, y al cual puede unírsele
operativamente un segmento de ADN (por ejemplo, un gen o
polinucleótido) para proporcionar la replicación del segmento unido.
En la presente invención, uno de los segmentos de nucleótido a unir
operativamente a las secuencias del vector, codifica al menos una
parte de la molécula del MCH de la Clase I. Preferiblemente, la
secuencia del gen del MHC que codifica el péptido se inserta entera
en el vector y se expresa; no obstante, también es factible
construir un vector que también incluya algunas secuencias no
codificantes del MCH. Preferiblemente se excluyen las secuencias no
codificantes del MHC. Otro vector preferido incluye una secuencia
nucleotídica que codifica al menos una porción de una molécula
microglobulina \beta2 de mamífero unida operativamente al vector
para su expresión. Es también posible construir un vector que
incluya secuencias nucleotídicas que codifican ambas, la molécula
del MHC de la Clase I y la microglobulina \beta2.
Un vector preferido comprende un cassette que
incluye una o más secuencias de ADN traducibles, unidas
operativamente para su expresión a través de una secuencia de
nucleótidos adaptada para la ligadura en una dirección. El cassette
incluye preferiblemente secuencias de control control de la
expresión del ADN para expresar el polipéptido o proteína que se
produce cuando una secuencia traducible de ADN se inserta en una
dirección en el cassette a través de la secuencia de nucleótidos
adaptadas para la ligadura en una dirección. El cassette también
incluye preferiblemente una secuencia promotora cadena arriba
respecto la secuencia traducible, y una secuencia de poliadenilación
cadena abajo respecto la secuencia del MHC de mamífero. El cassette
también puede incluir un marcador de selección, aunque se prefiere
que tal marcador esté codificado en una secuencia nucleotídica
operativamente unida a otra secuencia del vector de expresión.
Un vector de expresión se caracteriza porque es
capaz de expresar, en un huésped compatible, un producto de un gen
estructural, tal como un polipéptido del MHC de la Clase I humana,
una microglobulina \beta2, o ambas.
Tal como se usa en la presente invención, el
término "vector" se refiere a una molécula de ácido nucleico
capaz de transportar entre entornos genéticos diferentes otro ácido
nucleico al cual ha sido unida operativamente. Los vectores
preferidos son aquéllos capaces de replicación autónoma y de
expresión de los productos de genes estructurales presentes en los
segmentos de nucleótidos (ADN) a los que están unidos
operativamente.
Tal como se usa en la presente invención, en
relación a las secuencias o segmentos de ADN, la frase
"operativamente unido" significa que las secuencias o segmentos
han sido unidos covalentemente dentro de una pieza de ADN, no
importa si en forma de hebra única o doble.
La elección del vector al que está unido
operativamente un cassette depende directamente, como es bien
sabido en la técnica, de las propiedades funcionales deseadas, por
ejemplo, la replicación del vector y la expresión de la proteína, y
de la célula huésped a ser transformada, siendo éstas limitaciones
inherentes en la técnica de construcción de moléculas de ADN
recombinantes.
En varias realizaciones, se utiliza un vector
para la producción de polipéptidos útiles en los procedimientos de
la presente invención, incluyendo variantes del MHC y péptidos
antigénicos. Tales vectores se utilizan preferiblemente en
conjunción con células "huésped" bacterianas adaptadas para la
producción de cantidades útiles de proteínas o polipéptidos. Tales
vectores pueden incluir un replicón eucariota, es decir, una
secuencia de nucleótidos que tiene la capacidad de replicación
directa autónoma y de mantener la molécula de ADN recombinante
extra-cromosomalmente en una célula huésped
procariota, tal como una célula huésped bacteriana, transformada con
la misma. Tales replicones son bien conocidos en la técnica. Además,
aquellas realizaciones que incluyen un replicón procariota pueden
incluir también un gen cuya expresión confiere una ventaja
selectiva, tal como la resistencia a drogas, a un huésped bacteriano
transformado con el mismo. Los genes bacterianos típicos de la
resistencia a drogas son aquéllos que confieren resistencia contra
la ampicilina o tetraciclina. Los vectores típicamente contienen
también sitios de restricción apropiados para la inserción de
secuencias nucleotídicas traducibles. Los ejemplos de vectores
incluyen los plásmidos pUC8, pUC9, pUC18, pBR322, y pBR329,
disponibles en BioRad Laboratories (Richmond, CA), pPL y pKK223,
disponibles en Pharmacia (Piscataway, NJ), y pBS y M13mp19
(Stratagene, La Jolla, CA). Otros ejemplos de vector incluyen el
pCMU (Nilsoon et al., Cell 58: 707 (1989)). También
pueden sintetizarse otros vectores apropiados, de acuerdo con
procedimientos conocidos; por ejemplo, los vectores pCMU/K^{b} y
PCMUII, usado en varias aplicaciones en la presente invención, son
modificaciones del pCMUIV (Nilsson et al., ver más
arriba).
Una secuencia de nucleótidos adaptada para su
ligadura en una dirección, es decir, un poliengarce, es una región
del vector de expresión que (1) se une operativamente para la
replicación y transporta las secuencias de nucleótidos de cadena
arriba y cadena abajo, y (2) proporciona un sitio o medios para la
ligadura en una dirección de una secuencia de nucleótidos dentro del
vector. Típicamente, un poliengarce direccional es una secuencia de
nucleótidos que definido dos o más secuencias de reconocimiento de
endonucleasas de restricción, o sitios de restricción. A partir del
corte de restricción, los dos sitios generan extremos adhesivos en
los que puede ligarse una secuencia de nucleótidos traducible al
vector de expresión. Preferiblemente, los dos sitios de restricción
proporcionan, a partir del corte de restricción, extremos adhesivos
que no son complementarios, y que permiten de ese modo la inserción
en una dirección de una secuencia de nucleótidos traducible dentro
del cassette. En una realización, los medios de ligación en una
dirección son suministrados por los nucleótidos presentes en la
secuencia de nucleótidos cadena arriba, la secuencia de nucleótidos
cadena abajo, o ambas. En otra realización, la secuencia de
nucleótidos adaptada para la ligación en una dirección comprende una
secuencia de nucleótidos que define múltiples medios de clonación en
una dirección. Cuando la secuencia de nucleótidos adaptada a la
ligación en una dirección define numerosos sitios de restricción, se
denomina como un sitio de clonación múltiple.
Una secuencia de nucleótidos traducible es una
serie lineal de nucleótidos que proporciona una serie
ininterrumpida, de al menos 8 codones, que codifican un polipéptido
en una pauta de lectura abierta. Preferiblemente, la secuencia de
nucleótidos es una secuencia de ADN. Además, preferiblemente hay una
secuencia cadena arriba respecto de la secuencia de nucleótidos
traducible que codifica una secuencia promotora. Preferiblemente, el
promotor es condicional (por ejemplo, inducible). Un promotor
condicional preferido usado en la presente invención es un promotor
de metalotioneína o un promotor de choque térmico.
Los vectores se pueden construir utilizando
cualquiera de las bien conocidas técnicas de construcción de
vectores. Esas técnicas, no obstante, se modifican hasta el punto de
que la secuencia de nucleótidos traducible a insertar en el genoma
de la célula huésped está flanqueada, "cadena arriba" de la
secuencia, por un promotor apropiado, y, en algunas variaciones de
la presente invención, la secuencia de nucleótidos traducible está
flanqueada "cadena abajo" por un sitio de poliadenilación. Esto
es particularmente preferido cuando la célula "huésped" es una
célula de insecto y la secuencia de nucleótidos se transmite a
través de transfección. La transfección puede conseguirse a través
de numerosos procedimientos, incluyendo el procedimiento del fosfato
de calcio, el procedimiento del DEAE-dextrano, el
procedimiento de transferencia estable, la electroporación, o a
través del procedimiento de mediación de liposomas. Hay disponibles
numerosos textos en los que se detallan procedimientos de
transfección conocidos y otros procedimientos para introducir
nucleótidos en las células, ver, por ejemplo, Current Protocols
in Molecular Biology, John Wiley & Sons, NY (1991).
El vector por sí mismo puede ser de cualquier
tipo apropiado, tal como un vector viral (ARN o ADN), una cadena
lineal desnuda, o un ADN circular, o una vesícula o cubierta
conteniendo el material de ácido nucleico y cualesquier polipéptidos
que hayan de insertarse en la célula. Con respecto a las vesículas,
las técnicas de construcción de vesículas lipídicas, tales como
liposomas, son bien conocidas. Tales liposomas pueden apuntarse
hacia células concretas usando otras técnicas convencionales, tales
como proporcionar un anticuerpo, u otra molécula de unión
específica, sobre el exterior del liposoma. Ver, por ejemplo, A.
Huang et al., J. Biol. Chem.
255:8015-8018 (1980).
Los vectores más útiles contienen múltiples
elementos, incluyendo uno o más de los siguientes, dependiendo de la
naturaleza de la célula "huésped" -es decir, la célula que está
siendo transformada: (1) un origen de replicación del SV40 para la
amplificación de un número elevado de copias; (2) un elemento
promotor eficiente para el inicio de la transcripción a un nivel
elevado; (3) señales para el procesamiento del ARN, tales como el
corte del mARN y secuencias de poliadenilación (y, frecuentemente,
también secuencias intercaladas); (4) poliengarces que contienen
múltiples sitio de restricción para endonucleasas para la inserción
de ADN "ajeno"; (5) marcadores seleccionables que pueden usarse
para seleccionar células que han integrado establemente el ADN del
plásmido; y (6) secuencias de control de la replicación del plásmido
para permitir la propagación en células bacterianas. Además de los
anteriores, michos vectores contienen también un sistema de
expresión inducible que está regulado por un estimulo externo. Las
secuencias de un cierto número de promotores que se requieren para
la transcripción inducida han sido identificadas y diseñadas en
vectores de expresión para obtener la expresión inducible. Varios
vectores inducibles útiles se han basado en la inducción mediante
interferón \beta, choque térmico, iones de metales pesados, y
esteroides (por ejemplo, glucocorticoides). (Ver, por ejemplo,
Kaufman, Meth. Enzymol. 185:487-511
(1990)).
En una realización preferida, el vector contiene
también un marcador de selección. Después de su expresión, el
producto de la secuencia nucleotídica traducible puede purificarse
usando anticuerpos contra esa secuencia. Un ejemplo un marcador de
selección es la resistencia a la neomicina. Un plásmido codificando
la resistencia a la neomicina, tal como phshsneo, phsneo, o pcopneo,
puede incluirse en cada transfección, de forma que una población de
células que exprese el(los) gen(es) de elección puede
discernirse haciendo crecer los transfectados en un medio de
selección.
selección.
En una realización preferida, la secuencia de
nucleótidos traducible puede incorporarse en un plásmido con un
promotor de transcripción controlable apropiado, secuencias de
control de la traducción, y un poliengarce para simplificar la
inserción de la secuencia nucleotídica traducible con la orientación
correcta, y puede expresarse en una célula eucariota, tal como
Drosophila, o en una célula procariota, tal como E.
coli, usando técnicas convencionales. Preferiblemente, hay
secuencias de control en 5' que definen un promotor para el inicio
de la transcripción, y un sitio de unión de ribosomas operativamente
unido al extremo 5' de la secuencia de ADN traducible ubicada cadena
arriba. Para conseguir niveles de expresión génica elevados en
células transformadas o transfectadas -por ejemplo, E. coli-
es necesario usar no sólo promotores fuertes para generar grandes
cantidades de mARN, sino también sitios de unión de ribosomas para
asegurar que el mARN se eficientemente traducido. Por ejemplo, en
E. coli el sitio de unión de ribosomas incluye también un
codón de inicio (AUG) y una secuencia de 3-9
nucleótidos de longitud ubicada 3-11 nucleótidos
cadena arriba respecto el codón de inicio (Shine et al.,
Nature 254:34 (1975)). La secuencia AGGAGGU, la cual se
denomina secuencia Shine-Dalgarno (SD), es
complementaria respecto el extremo 3' del mARN de 16S de E.
coli. La unión del ribosoma al mARN y la secuencia en el extremo
3' del mARN puede verse afectada por diversos factores, incluyendo
(1) el grado de complementariedad entre la secuencia SD y el extremo
3' del tARN de 16S; y (2) el espaciado y la posibilidad de que la
secuencia de ADN esté entre la secuencia SD y el AUG. (Ver, por
ejemplo, Roberts et al., PNAS USA 76:760 (1979a);
Roberts et al., PNAS USA 76:5596 (1979b); Guarente
et al., Science 209:1428 (1980); y Guarente et
al., Cell 20:543 (1980)). La optimización se consigue
generalmente midiendo el nivel de expresión de los genes en
plásmidos en los que este espaciado es sistemáticamente alterado. La
comparación de mARN diferentes muestra que hay secuencias
estadísticamente preferidas a partir de las posiciones -20 a +30 (en
donde la A de AUG está en la posición 0; ver, por ejemplo, Gold
et al., Ann. Rev. Microbiol. 35:365 (1981)). También
se ha observado que las secuencias líder influencian dramáticamente
la traducción (Roberts et al., 1979a, b, ver más arriba). La
unión del ribosoma también puede verse afectada por la secuencia de
nucleótidos que sigue al AUG, la cual afecta la unión del ribosoma.
(Ver, por ejemplo, Tanigucchi et al., J. Mol. Biol.
118:533 (1978)).
Un vector que puede usarse de acuerdo con la
presente invención incluye el promotor de choque térmico. Tales
promotores son conocidos en la técnica; por ejemplo, ver Stellar
et al., EMBO J 4:167-171 (1985). Si se
usa este promotor, también se prefiere añadir un sitio de
poliadenilación.
Un vector preferido para su uso de acuerdo con
la presente invención es un plásmido; más preferiblemente, es un
plásmido con un elevado número de copias. También es deseable que el
vector contenga una secuencia de promotor inducible, puesto que los
promotores inducibles tienden a limitar la presión de selección
contra las células en las que se han introducido tales vectores (los
cuales se construyen a menudo para portar secuencias nucleotídicas
no nativas o quiméricas). Es también preferible que el vector de
elección sea apropiado para la expresión en el huésped escogido. Si
la población de células huésped es un cultivo de células de
Drosophila, entonces un vector compatible incluye vectores
funcionalmente equivalentes a aquellos tales como el
p25-lacZ (ver Bello y Couble, Nature 346:480
(1990)) o pRmHa-1, -2 ó -3 (ver Bunch et al.,
Nucl. Acids Res 16:1043-1061 (1988)). En la
realización preferida, el vector es el pRmHa-3, el
cual se muestra en la Figura 1. Este vector incluye un promotor de
metalotioneína, el cual está preferiblemente cadena arriba respecto
el sitio en el que se inserta la secuencia del MHC, y el sitio de
poliadenilación está preferiblemente cadena abajo respecto dicha
secuencia del MHC. Las células de Drosophila son los
huéspedes preferidos de acuerdo con la presente invención; en
particular, las células de Drosophila tales como las células
Schneider 2, que tienen los factores
trans-actuadores necesarios requeridos para la
activación del promotor, y son, por tanto, más preferidas
incluso.
El vector de expresión pRmHa-3
se base en el plásmido bacteriano pRmHa-1, el cual
se basa en el plásmido pUC18 y está depositado en la Americal Type
Culture Collection (ATCC, Rockville, MD), y tiene el número de
acceso 37.253. El vector pRmHa-3 contiene el
promotor, la secuencia líder 5' no traducida del gen de la
metalotioneína (secuencias 1-421, SEC. Nº ID 13) con
los sitios R1 y Stu suprimidos; ver Figura 1C). También contiene la
porción 3' del gen ADH de Drosophila (secuencia
#6435-7270, SEC. Nº ID 14), incluyendo el sitio de
poliadenilación. Por tanto, el ADN clonado estará regulado
transcripcionalmente por el promotor de la metalotioneína y
poliadenilado. La construcción del plásmido pRmHa-1
se describe en Bunch et al., Nucl. Acids Res.
16:1043-1061 (1988). La construcción de los
plásmidos pRmHa-3 y pRmHa-2 (el
último de los cuales tiene una secuencia del promotor de
metalotioneína que puede suprimirse como un fragmento de EcoRI) se
ilustra en la Figura 1A, B y C. Con respecto a
pRmHa-3, un plásmido preferido para su uso de
acuerdo con la presente invención, PstI, SphI y HindIII están en el
fragmento promotor, y no son por tanto únicos. Xba está en el
fragmento de ADH (4 bases a partir de su extremo 3') y tampoco es
único. Los siguientes sitios de restricción son, no obstante, únicos
en pRmHa-3: EcoRI, SacI, KpnI, SmaI, BamHI, SalI,
Hinc2, y AccI.
Un cassette en un vector de expresión de ADN es
la región del vector que forma, a partir de la inserción de una
secuencia de ADN traducible, una secuencia de nucleótidos capa de
expresar, en un huésped apropiado, una proteína de fusión de esta
invención. La secuencia de nucleótidos competente para la expresión
se denomina "cistrón". Por tanto, el cassette preferiblemente
comprende elementos de control de la expresión del ADN
operativamente unidos a una o más secuencias traducibles de ADN. Un
cistrón se forma cuando una secuencia traducible de ADN se inserta
en una dirección (se liga en una dirección) entre los elementos de
control a través de la secuencia de nucleótidos adaptada para este
propósito. La secuencia de ADN traducible resultante, es decir, la
secuencia insertada, está, preferiblemente, operativamente unida en
la pauta de lectura apropiada.
Las secuencias de control de la expresión del
ADN comprenden un conjunto de señales de expresión del ADN para
expresar un producto del gen estructural, e incluyen tanto elementos
5' como 3', tal como es bien sabido, operativamente unidos al
cistrón, de tal forma que el cistrón es capaz de expresar un
producto de gen estructural. Las secuencias de control en 5' definen
un promotor para iniciar la transcripción, y un sitio de unión de
ribosomas operativamente unido al extremo 5' de la secuencia de ADN
traducible ubicada cadena arriba.
Por tanto, un vector de expresión de ADN de esta
invención proporciona un sistema para clonar secuencias de ADN
traducibles en la porción del cassette del vector, para producir un
cistrón capaz de expresar una proteína de fusión de esta
invención.
Una linea celular preferida de la presente
invención es capaz de crecer continuamente en cultivo, y es capaz de
expresar moléculas del MHC de la Clase I de mamíferos sobre la
superficie de sus células.
La línea celular es un línea celular de insecto.
Hay disponibles varias lineas celulares para su uso de acuerdo con
la presente invención, incluyendo la de polilla (ATCC CCL 80), la de
oruga de polilla (ATCC CRL 1771), las de larva de mosquito (ATCC
lineas CCL 125, CCL 126, CRL 1660, CRL 1591, CRL 6565, CRL 6586), y
la del gusano de seda (ATCC CRL 8851). En una realización preferida,
la linea celular es una linea celular de Drosophila tal como
una linea celular de Schneider (ver, Schneider et al., J.
Embryo. Exp. Morph. 27:353-365 (1972));
preferiblemente, la linea celular es una linea celular Schneider 2
(S2/M3) adaptada a crecer en medio M3 (ver Lindquist et al.,
Drosophila Information Service 58:164 (1982)).
Las células Schneider pueden prepararse
sustancialmente como sigue. Se recogen huevos de Drosophila
melanogaster a los largo de aproximadamente un intervalo de 4
horas y se suprime el corion en hipoclorito sódico acuoso al 2,5%, y
se esteriliza su superficie mediante inmersión en etanol al 70%
durante 20 minutos, seguida por 20 minutos adicionales en HgCl_{2}
al 0,05% en etanol al 70%. Después de aclararlos a conciencia en
agua destilada estéril, se transfieren los huevos a placas de petri
que contienen filtros negros Metricel estériles, soportados por
prefiltros Millipore, ambos humedecidos previamente con medio
cultivo. Se colocan los huevos durante la noche en un incubador a
22°C y se retiran para cultivarlos cuando tiene
20-24 horas de edad. Los embriones se cortan en
mitades o tercios, se colocan a continuación en tripsina al 0,2%
(1:250, Difco) en solución salina de Rinaldini (Rinaldini, Nature
(London) 173:1134-1135 (1954)) durante
20-45 minutos a temperatura ambiente. Se usaron unos
100-300 embriones para iniciar cada cultivo.
Después de la adición del suero fetal bovino
(FBS), se centrifugaron los fragmentos a 100 \timesg durante
2-3 minutos, se resuspendieron en 1,25 ml de medio
de cultivo, y se sembraron sobre frascos T-9 de
vidrio. Los cultivos se mantuvieron a aproximadamente
22-27^{d}eC \pm 0,5°C, con una fase gaseosa de
aire ambiente. Preferiblemente se usó el medio de Schneider
(Schneider, J. Exp. Zool. 156:91-104 (1964);
Schneider, J. Embryo. Exp. Morph. 15:271-279
(1966)) conteniendo 500 mg adicionales de peptona bacteriológica por
100 ml de medio, y suplementado con un 15% de FBS inactivado. El
pH (preferiblemente 6,7-6,8) se monitoriza
con rojo de fenol al 0,01%. Las lineas celulares se mantienen
preferiblemente subcultivándolas cada 3-7 días. Las
células se unen fácilmente al vidrio, pero no tan firmemente como
para requerir tratamiento con tripsina; típicamente, un sencillo
pipeteado es adecuado para arrancar la mayoría de las células del
fondo de los frascos. El aspecto morfológico de las células se
describe en Schneider, J. Embryo. Exp. Morph.
27:353-365 (1972). Estas son esencialmente
parecidas a epiteliales en su aspecto, y oscilan en aproximadamente
5-11 \mum en diámetro y 11-35
\mum de longitud. Puede haber pequeñas bolsas, conteniendo células
redondeadas, dispersas aleatoriamente entre las otras células.
Preferiblemente, las células Schneider 2 se
mantienen en medio de Schneider para Drosophila más un 10% de
FBS, incluyendo penicilina (100 unidades/ml) y estreptomicina (100
mg/ml). Es preferible mantener las células en una densidad de más de
0,5 \times 10^{5} ml, y cultivarlas a un rango de temperaturas
de 24-30°C. Las células tienden a duplicarse en
menos de 24 horas, y crecen hasta una densidad elevada, por ejemplo,
2 \times 10^{7}/ml o superior. Las células también pueden
congelarse en 90% de FBS y 10% de DMSO, para su uso o análisis
posterior. Uno puede colocar las células a -70°C y almacenarlas a
continuación en nitrógeno líquido.
Una linea celular preferida de acuerdo con la
presente invención, identificada como células de Schneider 2, ha
sido depositada, cumpliendo los requisitos del Tratado de Budapest,
en la American Type Culture Collection (ATCC), Rockville, MD, el 18
de febrero de 1992, y se le asignó el número de acceso
CRL-10.974.
La linea celular es una linea celular
transformada capaz de expresar genes del MHC de la Clase I
humana.
También se prefiere que la línea celular sea
capaz de expresar la microglobulina \beta2 humana. Una linea
celular aún más preferida es capaz de expresión estable o
transitoria.
Puede utilizarse un vector para
transformar/transfectar tal linea celular. Hay muchos vectores
disponibles que pueden ser útiles en la transformación/transfección
de lineas celulares; estos vectores se discuten con más detalle más
arriba. No obstante, en resumen, en las realizaciones preferidas,
las células de la presente invención se transfectan con cADN que
codifican cadenas pesadas del MHC (humanas) y microglobulina
\beta2, las cuales han sido insertadas en (es decir, se han unido
operativamente a) un vector de expresión. En una realización más
preferida, el vector comprende el plásmido pRmHa-3
de expresión en Drosophila, en el cual se han insertado
secuencias nucleotídicas expresables codificando moléculas del MHC
de la Clase I humanas o de la microglobulina \beta2 humana, usando
técnicas descubiertas en la presente invención. Preferiblemente, los
cADN que codifican el MHC y aquéllos que codifican la microglobulina
\beta2 están operativamente unidos a plásmidos de expresión
distintos, y se cotransfectan en las células cultivadas.
Alternativamente, los cADN que codifican el MHC y la microglobulina
\beta2 pueden estar operativamente unidos al mismo plásmido de
expresión y cotransfectarse con el mismo plásmido. En otra
variación, los cADN que codifican el MHC, la microglobulina
\beta2, y una citoquina tal como la IL2, están operativamente
unidos a plásmidos de expresión, y se cotransfectan en una linea
celular de la presente invención. La selección de genes del HLA, la
construcción de vectores apropiados, y la selección de cebadores, se
describen con mayor detalle en las secciones B.1 y B.2 más
arriba.
Las células exitosamente transformadas, es
decir, las células que contienen una secuencia nucleotídica
expresable de acuerdo con la presente invención, pueden
identificarse mediante técnicas bien conocidas. Por ejemplo, las
células resultantes de la introducción de un cADN o rADN de la
presente invención pueden clonarse para producir colonias
monoclonales. Las células procedentes de estas colonias pueden
recolectarse, lisarse, y su contenido en ADN examinarse en busca de
la presencia de rADN usando un procedimiento tal como el descrito
por Southern, J. Mol. Biol. 98:503 (1975). Además de ensayar
directamente en busca de la presencia de rADN, la transformación o
transfección exitosa puede confirmarse mediante procedimientos
inmunológicos bien conocidos cuando el rADN es capaz de dirigir la
expresión de un polipéptido quimérico sujeto. Por ejemplo, las
células exitosamente transformadas con un vector de expresión pueden
producir proteínas que exhibieran propiedades antigénicas concretas,
las cuales pueden determinarse fácilmente usando los antibióticos
apropiados. Además, la transformación/transfección exitosa puede
discernirse mediante el uso de un vector adicional portador de una
secuencia marcadora, tal como la resistencia a la neomicina, tal
como se describe en la presente invención más arriba.
Es también preferible que el cultivo sea capaz
de crecimiento sostenido a temperaturas reducidas. Por ejemplo, se
prefiere que el cultivo se mantenga a aproximadamente temperatura
ambiente, por ejemplo, aproximadamente 24-27°C. En
otras realizaciones, el cultivo se mantiene a temperaturas
superiores, particularmente durante el proceso de activación de
células CD8. Por tanto, se prefiere que un cultivo de acuerdo con la
presente invención sea capaz de soportar una condición de
temperatura de aproximadamente 30°C hasta aproximadamente 37°C. La
adición de microglobulina \beta2 a un cultivo lo estabiliza al
menos frente a la condición de 30°C; la adición de microglobulina
\beta2 y péptidos resulta en una mayor termoestabilidad a
temperaturas más elevadas, es decir, a 37°C.
Por tanto, es aún más preferido que un linea
celular de la presente invención sea capa de lo siguiente: (1)
crecimiento sostenido a temperaturas reducidas durante un período de
tiempo predeterminado; (2) transformación mediante un vector de
expresión; (3) expresión de microglobulina \beta2; (4) expresión
de uno o más tipos de moléculas del MHC de la Clase I; (5) cargar
péptidos sobre las moléculas del MHC de la Clase I; y (6) expresar
moléculas del MHC de la Clase I vacías sobre la superficie
celular.
En una realización preferida de la presente
invención, se establece un cultivo de células de Drosophila y
se transfecta con vectores operativamente unidos a (1) una o más
secuencias nucleotídicas que codifican moléculas del MHC de la Clase
I, (2) a al menos una secuencia nucleotídica que codifica la
microglobulina \beta2 humana. Estas secuencias pueden estar
operativamente unidas al mismo vector, pero preferiblemente, las
secuencias para la microglobulina \beta2 y para el MHC humano
están en vectores separados. Para propósitos de selección, es
también ventajoso transfectar la linea celular con un vector
operativamente unido a un marcador de selección, por ejemplo, la
resistencia a la neomicina. Subsiguientemente, se selecciona una
población de células que expresan moléculas del MHC de la Clase I
humana y microglobulina \beta2, y se mantienen en cultivo.
Con objeto de preparar el cultivo para la
expresión de moléculas del MHC vacías, o, más preferiblemente,
cargadas con péptido, el cultivo puede requerir primero su
estimulación, por ejemplo, a través de inducción con CuSO_{4},
durante un período de tiempo predeterminado. Después de un período
de inducción apropiado -por ejemplo, aproximadamente
12-48 horas, los péptidos pueden añadirse en una
concentración predeterminada (por ejemplo, aproximadamente 100
\mug/ml). Los péptidos pueden prepararse tal como se discute en la
presente invención más adelante en la sección B.5. Después de un
período de incubación adicional -por ejemplo, durante
aproximadamente 12 a aproximadamente 27°C- el cultivo está listo
para su uso en la activación de células CD8. Aunque este período de
incubación adicional puede reducirse, o tal vez omitirse, nuestra
observación es que el cultivo pasa a ser más estable frente a la
condición de temperatura si se le permite incubar durante un
intervalo antes de la adición de células CD8 en reposo o
precursoras. Por ejemplo, los cultivos de acuerdo con la presente
invención, a los que se ha añadido péptido, son capaces de expresar
cantidades significativas de moléculas del MHC de la Clase I
cargadas con péptido incluso cuando se incuban durante períodos de
tiempo prolongados a 37°C.
Los medios nutritivos útiles en el cultivo de
células huésped transformadas son bien conocidos en la técnica y
pueden obtenerse a partir de numerosas fuentes comerciales. En las
realización en las que la célula huésped es de mamífero,
preferiblemente se usa un medio "libre de suero".
Con objeto de establecer una linea celular capaz
de producir cantidades terapéuticamente útiles de moléculas del MHC
de la Clase I humanas expresadas sobre su superficie, es preferible
co-transfectar una linea celular con un vector
operativamente unido a una secuencia nucleotídica que codifique la
microglobulina \beta2, con objeto de efectuar los niveles de
expresión apropiados de moléculas del MHC en la linea celular.
Mientras que la secuencia nucleotídica que codifica la
microglobulina \beta2 de mamíferos, tal como la microglobulina
\beta2 de ratón, incrementa la estabilidad de las moléculas del
MHC de la Clase I humana expresadas en las lineas celulares de la
presente invención, es preferible co-transfectar la
linea celular con un vector operativamente unido a una secuencia
nucleotídica expresable que codifique una microglobulina \beta2
humana. Tal como se discutió en la sección B.2 anterior, un vector
preferido incluye una secuencia nucleotídica que codifica al menos
una porción de la molécula de microglobulina \beta2 humana
operativamente unida al vector para su expresión. Es también posible
construir un vector que incluya secuencias nucleotídicas codificando
ambas, una moléculas del MHC de la Clase I y una molécula de
microglobulina \beta2.
Ha sido publicada una secuencia de cADN de
microglobulina \beta2 humana (ver Suggs et al., PNAS
78;6613-6617 (1981)), y se usó la secuencia como una
plantilla para una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) usando
los siguientes cebadores:
Los cebadores se usan en una reacción estándar
de la PCR (ver sección B.1 anterior y las referencias citadas en la
misma). Los productos de la reacción se extrajeron con fenol, se
purificaron usando un equipo Geneclean (Bio 101, San Diego, CA), se
digirieron con BamHI y se clonaron en el sitio BamHI de pBS
(Stratagene, La Jolla, CA). Después de verificar la secuencia, este
fragmento BamHI se clonó en el sitio BamHI de un vector de expresión
apropiado. En la realización preferida, se sintetizó el cADN de la
microglobulina \beta2 humana, y se unió operativamente al vector
de expresión pRmHa-3.
Virtualmente todas las proteínas celulares,
además de los antígenos virales, son capaces de ser usadas para
generar fragmentos de péptidos relevantes que sirven como un ligando
potencial de la Clase I. En la mayoría de las células de mamíferos,
por tanto, cualquier complejo particular de péptido del MHC
representaría sólo una pequeña fracción del total de moléculas
codificadas del MHC encontradas sobre la superficie celular. Por
tanto, con objeto de producir moléculas del MHC de la Clase I
humanas, expresadas sobre la superficie, que tengan una capacidad
incrementada para activar específicamente células CD8, es preferible
aislar y cargar fragmentos de péptido, del tamaño y características
antigénicas apropiadas, sobre moléculas de la Clase I.
Los péptidos de la presente invención se unen a
moléculas del MHC de la Clase I. La unión ocurren en condiciones
biológicas que pueden crearse in vivo así como in
vitro. La naturaleza exacta de la unión de los péptidos no tiene
porque conocerse para practicar la invención.
En una realización preferida, los péptidos a
cargar sobre las moléculas de MHC de la Clase I son antigénicos.
También se prefiere que los péptidos sean de un tamaño uniforme,
preferiblemente de 8-meros ó
9-meros, y más preferiblemente,
8-meros. Es también preferible que los péptidos
preparados para cargar sobre las moléculas de MHC sean de especies
únicas; esto es, que todos los péptidos cargados sobre el MHC sean
idénticos en tamaño y secuencia. De esta forma, es posible producir
moléculas monoantigénicas de MHC cargadas de péptidos.
Los péptidos pueden presentarse sobre las
células de varias formas. Preferiblemente, los péptidos se
presentan en una forma que les permite entrar en un pool
intracelular de péptidos. Los péptidos pueden añadirse al cultivo en
forma de un polipéptido intacto o proteína, el cual es
subsiguientemente degradado por procesos celulares, por ejemplo,
mediante degradación enzimática. Alternativamente, le polipéptido
intacto o proteína puede degradarse a través de algunos otros
medios, tales como la digestión química (por ejemplo, con bromuro de
cianógeno) o protesas (por ejemplo, quimiotripsina) antes de su
adición al cultivo celular. En otras realizaciones, los péptidos se
presentan en segmentos más pequeños que pueden, o no, incluir
secuencias de aminoácidos epitópicos.
En una realización preferida, se añade una
cantidad suficiente de proteína(s) o péptido(s) al
cultivo celular para permitir que las moléculas de MHC de la Clase I
se usan y, subsiguientemente, presenten una gran densidad del
péptido -preferiblemente, con el mismo tipo de péptido unido a cada
MHC- sobre la superficie de células que están expresando el MHC de
la Clase I humano. Es también preferido permitir que el MHC de la
Clase I humano y la microglobulina \beta2 se unan -por ejemplo,
para formar heterodímeros- antes de presentar intracelularmente el
péptido a las moléculas del MHC.
En otra realización de la invención, los
péptidos se añaden a células transfectadas de la presente invención
con objeto de mejorar la termoestabilidad de las moléculas del MHC
expresadas por las células. Tal como se ha destacado más arriba, los
péptidos se añaden preferiblemente al medio de cultivo. Los péptidos
antigénicos que se unen a las moléculas de la Clase I sirven para
termoestabilizar las moléculas del MHC, y también incrementan la
expresión sobre la superficie celular. Los cultivos con péptidos
añadidos que se unen a las moléculas del MHC son, por tanto,
significativamente menos susceptibles a la condición de temperatura
que los cultivos sin péptido añadido.
En una realización de la presente invención, los
péptidos antigénicos se presentan a la linea celular
transformadas/transfectadas en varias formas. Por ejemplo, puede
degradarse química o enzimáticamente una proteína entera u otros
polipéptidos antigénicos, y añadirse a la linea celular en esta
forma. Por ejemplo, se degrada una proteína de interés con
quimiotripsina, y la mezcla resultante de fragmentos de
"péptidos" se añade a un cultivo de células transformadas o
transfectadas; a continuación, se deja "escoger" a estas
células los péptidos apropiados (los cuales son a menudo péptidos
más pequeños, preferiblemente 8-meros ó
9-meros) a cargar sobre las moléculas del MHC de la
Clase I. Alternativamente, puede clonarse un proteína entera o
secuencia polipeptídica en un vector apropiado, e insertarse en una
célula procariota, en donde la célula genera cantidades
significativas del polipéptido transgénico, las cuales se recolectan
a continuación, se purifican, y se digieren en péptidos, los cuales
se añaden a continuación al cultivo de células eucariotas
transformadas/transfectadas; de nuevo, se deja "escoger" a las
células los péptidos a cargar sobre el MHC expresado.
Las células CD8 en reposo (o precursoras) -es
decir, las células T que no ha sido activadas para apuntar a un
antígeno específico- se extraen preferiblemente del paciente antes
de la incubación de las células CD8 con los cultivos transformados.
También se prefiere que las células CD8 precursoras se recolecten de
un paciente antes del inicio de otro tratamiento o terapia que
pudiera interferir con la capacidad de las células CD8 de ser
activadas específicamente. Por ejemplo, si uno pretende tratar un
individuo con una neoplasia o tumor, es preferible obtener una
muestra de células y cultivarlas antes del inicio del tratamiento de
quimioterapia o radiación.
Los procedimientos para extraer y cultivar
linfocitos son bien conocidos. Por ejemplo, la patente
estadounidense nº 4.690.915 de Rosenberg describe un procedimiento
para obtener un número elevado de linfocitos mediante
linfocitoferesis. Los condiciones de cultivo usadas son apropiadas
para células de mamíferos, y se llevan a cabo típicamente a
37°C.
También hay varios procedimientos disponible
para separar y/o enriquecer los cultivos de células CD8 precursoras.
Algunos ejemplos de procedimientos generales para la separación de
células incluyen la unión indirecta de células a superficies
específicamente recubiertas. En otro ejemplo, los linfocitos de
sangre periférica humana (PBL), los cuales incluyen células CD8, se
aíslan mediante centrifugación en gradiente de
Ficoll-Hypaque (Pharmacia, Piscataway, NH). Los
linfoblastos de PBL pueden usarse inmediatamente después, o pueden
almacenarse en nitrógeno líquido, después de congelarlos con
nitrógeno líquido en FBS conteniendo un 10% de DMSO (Sigma Chemical
Co., St. Louis, Mo), lo que conserva la viabilidad celular y las
funciones de linfocitos.
Los procedimientos alternativos de separación
y/o enriquecimiento de cultivos de células precursoras incluyen el
siguiente ejemplo. Después de preparar poblaciones de PLB
enriquecidas en linfocitos a partir de sangre completa, las
subpoblaciones de linfocitos CD8 se aíslan a partir de las mismas
mediante técnicas de separación basadas en afinidad, dirigidas a la
presencia del antígeno del receptor del CD8. Estas técnicas basadas
en afinidad incluyen la microfluorimetría, incluyendo la
clasificación de células activada por fluorescencia (FACS), la
adhesión celular, y procedimientos similares. (Ver, por ejemplo,
Scher y Mage, en Fundamental Immunology, Ed. W. E. Paul, pp.
767-780, River Press, NY (1984)). Los procedimientos
de afinidad pueden utilizar anticuerpos
anti-receptor de CD8 como la fuente de reactivo de
afinidad. Hay varios anticuerpos monoclonales
anti-células T y anti-CD8
disponibles de forma general, para su uso en estos procedimientos, a
partir de una diversidad de fuentes comerciales, incluyendo la
Americal Type Culture Collection (Rockville, MD) y Pharmigen (San
Diego, CA). Dependiendo de la designación del antígeno, pueden ser
apropiados diferentes anticuerpos. (Para una discusión y revisión de
la nomenclatura, designación de antígenos, y anticuerpos asignados
para leucocitos humanos, incluyendo células T, ver Knapp et
al., Immunology Today 10:253-258 (1989).
Por ejemplo, en el catálogo de ATCC de lineas celulares e hibridomas
(ATCC, Rockville, MD) se identifica que los anticuerpos monoclonales
OKT4 (anti-CD4, ATCC nº CRL 8002), OKT5 (ATCC nº CRL
8013 y 8016), OKT8 (anti-CD8, ATCC nº CRL 8014), y
OKT9 (ATCC nº CRL 8021) reaccionan respectivamente con los
linfocitos T humanos, con subconjuntos de células T humanas, y
células T activadas. Varios otros anticuerpos están disponibles para
identificar y aislar especies de células T.
Preferiblemente, los PBL se purifican a
continuación. Para este propósito pueden utilizarse, por ejemplo,
gradientes de Ficoll. Los PBL purificados se mezclarían a
continuación con células de Drosophila sinérgicas
preincubadas con los péptidos antigénicos apropiados.
Con objeto de optimizar las condiciones in
vitro para la generación de células T citotóxicas específicas,
el cultivo de células estimulantes se mantiene en un medio
apropiado. En una realización preferida, las células estimulantes
son células de Drosophila, las cuales se mantienen
preferiblemente en un medio carente de suero (por ejemplo, Excell
400).
Antes de la incubación de las células
estimulantes con las células a activar, por ejemplo, células CD8
precursoras, se añade una cantidad del péptido antigénico al cultivo
celular estimulante, en cantidad suficiente para ser cargado sobre
las moléculas de la Clase I humanas que se expresarán sobre la
superficie de cada célula estimulante. Preferiblemente, las células
estimulantes se incuban con > 20 \mug/ml de péptido.
Las células CD8 en reposo o precursoras se
incuban a continuación con las células estimulantes apropiadas
durante un período de tiempo suficiente como para activar las
células CD8. Preferiblemente, las células CD8 deberían, por tanto,
activarse en una forma específica para antígeno. La proporción de
células CD8 (efectoras) en reposo o precursoras respecto células
estimulantes puede variar de individuo a individuo, y puede depender
además de varias variables, tales como la docilidad de los
linfocitos de un individuo a las condiciones de cultivo, y la
naturaleza y gravedad de la condición morbosa u otra condición para
la cual se usa la modalidad de tratamiento descrita en la presente
invención. No obstante, preferiblemente la proporción de
linfocito:célula estimulante (por ejemplo, célula de
Drosophila) está en el rango de aproximadamente 30:1 a 300:1.
Por ejemplo, en una realización se mezclaron 3 \times 10^{7} PBL
humanos y 1 \times 10^{6} células de Drosophila, y se
mantuvieron en 20 ml de medio de cultivo RPMI 1640.
El cultivo efector/estimulador puede mantenerse
durante tanto tiempo como fuera necesario para estimular un número
de células CD8 terapéuticamente usable o efectivo. En términos
generales, el tiempo óptimo está entre uno y cinco días,
observándose generalmente una meseta ("plateau") -es decir, un
"máximo" específico para el nivel de activación de CD8- después
de cinco días de cultivo.
Las células CD8 activadas pueden separarse
efectivamente de las células estimulantes (por ejemplo,
Drosophila) usando uno de una diversidad de procedimientos
conocidos. Por ejemplo, pueden utilizarse anticuerpos monoclonales
específicos para las células estimulantes, para los péptidos
cargados sobre las células estimulantes, o para las células CD8 (o
un segmento de las mismas) para unir su ligando complementario
apropiado. Las moléculas marcadas con anticuerpos pueden extraerse a
continuación a partir de la mezcla de células
estimulantes-efectoras a través de medios
apropiados, por ejemplo, mediante procedimientos de
inmunoprecipitación o inmunensayo bien conocidos.
La cantidades efectivas, citotóxicas de las
células CD8 activadas pueden variar entre los usos in vitro e
in vivo, así como con la cantidad y tipo de células que son
la diana final de estás células asesinas. La cantidad también
variará dependiendo de la condición del paciente, y debería ser
determinada, mediante la consideración de todos los factores
apropiados, por el practicante. No obstante, se usan preferiblemente
de 1 \times 10^{6} a aproximadamente 1 \times 10^{12}, más
preferiblemente de 1 \times 10^{8} a aproximadamente 1 \times
10^{11}, e incluso más preferiblemente de 1 \times 10^{9} a
aproximadamente 1 \times 10^{10} células CD8 activadas para
humanos adultos, en comparación con las aproximadamente 5 \times
10^{6} a aproximadamente 5 \times 10^{7} usadas en ratón.
Preferiblemente, tal como se discutió más
arriba, las células CD8 activadas se recolectan del cultivo de
células de Drosophila antes de la administración de las
células CD8 al individuo que se está tratando. No obstante, es
importante notar que, a diferencia de otras modalidades de
tratamiento actuales y propuestas, el presente procedimiento usa un
sistema de cultivo celular (es decir, células de Drosophila)
que no es tumorigénico. Por tanto, si no se consigue la completa
separación de células de Droso y células CD8 activadas, no
hay peligro inherente conocido asociado a la administración de un
pequeño número de células de Drosophila, mientras que la
administración de células promotoras de tumores puede ser
extremadamente arriesgada.
Los procedimientos para introducir componentes
celulares son conocidos en la técnica e incluyen procedimientos
tales como aquéllos ejemplificados en la patente estadounidense nº
4.844.893 para Honsik et al., y la patente estadounidense nº
4.690.915 para Rosenberg. Por ejemplo, la administración de células
CD8 vía infusión intravenosa es apropiada.
Tal como se ha destacado previamente, los
haplotipos/alotipos del HLA varían de individuo a individuo, y,
mientras que no es esencial para la práctica de la presente
invención, a menudo es útil determinar el tipo de HLA del individuo.
El tipo de HLA puede determinarse mediante procedimientos de tipado
estándares, y los PLB pueden purificarse mediante gradientes de
Ficoll. Los PBL purificados se mezclarían a continuación con células
de Drosophila sinérgicas preincubadas con los péptidos
antigénicos apropiados -por ejemplo, en aplicaciones terapéuticas
relacionadas con infecciones virales, cánceres, o tumores malignos,
péptidos derivados de proteínas específicas del cáncer o
de virus.
de virus.
Continuando con el uso de condiciones virales o
malignas como ejemplo, en aquellas circunstancias en las que se han
caracterizado péptidos específicos de un determinado antígeno viral
o del cáncer, preferiblemente se usarán los péptidos sintetizados
que codifican estos epítopos. En los casos en los que los péptidos
antigénicos preferidos no se han determinado con precisión, pueden
usarse digeridos de proteasas de proteínas específicas virales o del
cáncer. Como una fuente de tales antígenos, el cADN que codifica
proteínas específicas virales o tumorales se clona en un plásmido de
expresión en bacterias, y se usa para transformar bacterias, por
ejemplo, mediante procedimientos descubiertos en la presente
invención.
Después del tipado del HLA, si no hay
disponibles células de Drosophila que expresen el HLA
preferido, los cADN que codifican el HLA preferido pueden clonarse a
través del uso de la reacción en cadena de la polimerasa. Los
cebadores descubiertos en las SECCIÓN B.1 anterior (SEC. ID nº 1 a
SEC. ID nº 12) pueden usarse para amplificar los cADN de
HLA-A, -B, -C, -E, -F, o ADN-G en
reacciones separadas, las cuales pueden clonarse a continuación y
secuenciarse tal como se ha descrito en los procedimientos
descubiertos mas abajo para HLA A2.1. Las líneas celulares estables
que expresan el HLA clonado pueden a continuación establecerse en
las células de Drosophila. Alternativamente, para la
activación de CD8 in vitro, puede usarse una población de
células de insecto expresando transitoriamente una población a
granel de moléculas clonadas recombinantes procedentes de la
reacción de la PCR.
Se ha encontrado que el sobrenadante procedente
de células cultivadas de acuerdo con la presente invención aumenta o
restablece la capacidad de las lineas celulares de generar células
CD8 activadas específicas. La adición de aproximadamente un 10% de
sobrenadante del cultivo de Drosophila a un cultivo de
linfocitos, o a células fijadas, activa eficientemente las CD8. Las
células cultivadas que expresan antígenos singénicos de la Clase I
que no consiguieron activar CD8 en cultivo primario, fueron capaces
de generar CD8 específicas después de la adición de sobrenadante del
cultivo de células de Drosophila.
Un factor aislado procedente del cultivo, el
cual parece tener un impacto significativo sobre la activación de
las CD8 en cultivos de células de Drosophila es el mitógeno
celular de Drosophila. El mitógeno se caracteriza como una
sustancia secretada soluble con una buena estabilidad, el cual
mantiene su actividad incluso después de cuatro meses de
almacenamiento a 4°C. El mitógeno tiene un peso molecular
relativamente elevado -es decir, 500 kDa mediante filtración en gel
Superose (Pharmacia, Piscataway, NJ). También se une intensamente a
la Sepharose Mono Q (Pharmacia, Piscataway, NJ). El mitógeno de
células de Drosophila aparentemente induce la proliferación
de células B y activa los macrófagos.
El mitógeno hallado en Drosophila puede
ser un ejemplo de otros mitógenos de insectos, y proporcionar un
adyuvante terapéutico efectivo. Por ejemplo, pueden retirarse las
células procedentes de un animal infectado y usarse para estimular
subsiguientemente células de Drosophila mezcladas con
linfocitos de sangre primarios y mitógeno de Drosophila. La
mezcla puede usarse a continuación para el tratamiento del
organismo.
Los siguientes ejemplos de pretende que ilustren
pero no limiten, la presente invención.
El vector de expresión pRmHa-3,
para su uso en la expresión de proteínas del MHC en células
Schneider 2 de Drosophila tal como se describe en esta
invención, se construyo ligando el vector de expresión de ADN
pRmHa-1, linealizado con SphI, con un fragmento de
ADN resultante de un digestión con SphI del vector de expresión
pRmHa-2 descrito más abajo. La ligación de esta
manera del pRmHa-1 con el fragmento de
pRmHa-2 se realizó para suprimir uno de los dos
sitios de clonación para endonucleasa de restricción EcoRI presentes
en el pRmHa-1. Por tanto, el vector de expresión
pRmHa-3 resultante contenía sólo un sitio de
restricción EcoRI el el sitio de clonación múltiple (poliengarce) en
el que se insertaron varios fragmentos de ADN codificando MHC, tal
como se describe en los Ejemplos.
El vector de expresión pRmHa-1,
conteniendo un promotor de metalotioneína, secuencias consenso de
respuesta a metales (denominada MT), y un gen de la deshidrogenasa
de alcohol (ADH) conteniendo un sitio de poliadenilación aislado a
partir de Drosophila melanogaster, se construyó tal como
describieron Bunch et al., Nucl. Acids Res.
16:1043-1061 (1988). En la Figura 1B se muestra un
esquema de la construcción final del pRmHa-1. El
vector de expresión de plásmido, pUC18, que tiene el número de
acceso 37.253 en ATCC, se usó como vector fuente a partir del cual
se derivaron los diversos vectores descritos en la presente
invención. El plásmido pUC18 contiene los siguientes sitios de
restricción, de 5' a 3', en el sitio de clonación múltiple, todos
los cuales no se ilustran en las representaciones esquemáticas de
los vectores derivados del puc18 de la Figura 1: EcoRI; SacI; KpnI,
SmaI y SmaI ubicados en la misma posición; BamHI; XbaI; SalI; AccI e
HincII ubicados en la misma posición; PstI; SphI e HindIII. El
vector puc18 se digirió primero con HindIII para formar un puc18
linealizado. A continuación se crearon los extremos romos rellenando
los extremos de HindIII con el fragmento grande de la polimerasa I
de ADN, tal como describieron Maniatis et al., Molecular
Cloning: A Laboratory Manual, Eds. Cold Spring Harbor
Laboratory, Nueva York (1982).
El vector puc18 de extremos romos, linealizado,
se ligó con un fragmento HinfI de 740 pares de bases (p.b.)
procedente del gen de la ADH de Drosophila melanogaster, que
contiene un sitio de poliadenilación. El alelo de la ADH ligado se
aisló primero a partir del plásmido pSACI, descrito por Goldberg
et al., PNAS USA 77:5794-5798 (1980),
mediante digestión con el fragmento de HinfI, seguida por
embotamiento de los extremos con Klenow, resultando en la secuencia
nucleotídica listada en la SEC. Nº ID. 14. El vector pSACI que
contiene el alelo de la ADH se construyó subclonando en pBR322
(número de acceso en ATCC 31.344) un fragmento EcoRI de 4,7
kilobases (kb) del ADN de Drosophila, seleccionado a partir
de una biblioteca del bacteriófago lambda que contenía fragmentos
aleatorios de peso molecular elevado (superior a 15 kb). El sitio de
restricción 5' HinfI ocurrió de forma natural en el gen de la ADH en
la posición 1770, tal como describió Kreitman, Nature
304:412-417 (1983). El sitio 3' HinfI se derivó a
partir del vector puc18 en el que se había clonado el gen de la ADH.
Esta posición estaba 4 pares de base 3' respecto el sitio XbaI, en
la posición 25.000 del gen de la ADH. El segmento de la ADH se
extendía, desde los 35 p.b. cadena arriba de la secuencia de
poliadenilación/corte en la porción 3' no traducida del mARN de la
ADH, hasta 700 p.b. cadena abajo respecto la señal de
poliadenilación. El vector derivado del puc18 resultante conteniendo
el fragmento del gen de la ADH se denominó pHA-1 tal
como se muestra en la Figura 1A.
El fragmento EcoRI/StuI de 421 p.b. del gen MT
se obtuvo a partir de un clon que contenía ADN de aproximadamente
15,3 kb en una biblioteca de ADN genómico de Drosophila
melanogaster. La biblioteca, preparada con una digestión parcial
con MboI de ADN de imago, se clonó en el EMBL4 derivado de lambda.
El fragmento contenía el promotor de la MT y el elemento consenso de
respuesta a metal del gen de la MT de Drosophila (Maroni
et al., Genetics 112:493-504 (1986)).
Esta región, conteniendo el promotor y el inicio de transcripción en
el nucleótidos +1, correspondía a la posición -370 a +54 del gen de
la MT (SEC. Nº ID. 13). El fragmento resultante se ligó entonces en
el vector de expresión pHA-1 preparado más arriba,
el cual se linealizó previamente con EcoRI y SmaI. El extremo romo
3' en MT, creado por la digestión con StuI, era compatible con el
extremo romo en pHA-1, creado por la digestión con
SmaI. El vector derivado de puc18 resultante, que contenía un
fragmento 5' del gen de la MT de Drosophila y un fragmento 3'
del gen de la ADH, se denominó pRmHa-1. El vector de
expresión pRmHa-1, mostrado en la Figura 1B,
contenía el origen de replicación (ori) y el gen de la
beta-lactamasa, confiriendo resistencia a la
ampicilina (Amp^{r}) procedente del puc18, tal como se muestra en
la Figura 1A sobre el vector pHa-1. El diagrama ed
pRmHa-1 también muestra las posiciones 5' a 3'
contiguas al fragmento del gen MT, el sitio de clonación múltiple, y
el fragmento del gen de la ADH. El vector pRmHa-1 se
usó tal como se describe en c., más abajo, en la construcción del
vector de expresión pRmHa-3.
La construcción del pmrha-2 se
muestra en la Figura 1A. Para la construcción del vector de
expresión pRmHa-2, se insertó el fragmento MT
preparado más arriba en el vector pHA-1, derivado de
puc18, tal como se describió para la construcción del
pRmHa-1 más arriba, con unas pocas modificaciones.
Se añadió un engarce EcoRI al sitio StuI del fragmento del gen de la
MT aislado mediante EcoRI/StuI, preparado más arriba, para formar un
fragmento de metalotioneína que tenía sitios de restricción EcoRI en
ambos extremos. El fragmento resultante se ligó a continuación en el
vector de expresión pUC18 que contenía el fragmento de la ADH, el
cual se linealizó previamente con EcoRI. El vector derivado de puc18
resultante, que contenía un fragmento 5' del gen de la MT de
Drosophila, y un fragmento 3' del gen de la ADH, teniendo dos
sitio de restricción EcoRI 5' respecto el sitio de clonación
múltiple, se denominó pRmHa-2. El vector de
expresión pRmHa-2, mostrado en la Figura 1A,
contenía el origen de replicación (ori) y el gen de la
beta-lactamasa, que confiere resistencia a la
ampicilina (Amp^{r}), procedente del puc18. El diagrama de
pRmHa-2 también muestra las posiciones contiguas 5'
a 3' del fragmento del gen de la MT, el sitio de clonación múltiple,
y el fragmento del gen de la ADH. El vector pRmHa-2
se usó tal como se describe en c., más abajo, en la construcción del
vector de expresión pRmHa-3.
Para preparar el vector de expresión
pRmHa-3 que tenía sólo un sitio de restricción
EcoRI, se ligó un fragmento procedente de pRmHa-2 en
pRmHa-1. Para esta construcción, el
pRmHa-2, preparado en b., más arriba, se digirió
primero con SphI. El fragmento de SphI resultante, que empezaba en
la mitad del gen de la MT y se extendía hasta el sitio SphI en el
sitio de clonación múltiple, se aisló primero a partir del vector
del pRmHa-2, y se ligó a continuación en el
pRmHa-1 preparado en A.1., más arriba. El vector
pRmHa-1 se había modificado previamente para
suprimir el sitio de restricción EcoRI 5' respecto el fragmento del
gen de la MT, linealizado a continuación con SphI. Este proceso se
ilustra esquemáticamente en la Figura 1B. Para suprimir el sitio
EcoRI en el vector pRmHa-1, se digirió primero el
vector con EcoRI para formar un vector linealizado, a continuación
se hicieron romos sus extremos con la nucleasa Mung Bean, y se
religaron.
El vector pRmHa-1, carente de un
sitio EcoRI, se digirió a continuación con SphI para suprimir la
región correspondiente al fragmento SphI insertado, procedente de
pRmHa-2, y formar un vector pRmHa-1
linealizado. El fragmento de SphI procedente de
pRmHa-2 se ligó a continuación en el
pRmHa-1, linealizado con SphI, para formar el vector
de expresión pRmHa-3. En la Figura 1C se muestra un
esquema del vector pRmHa-3. Las posiciones relativas
de los diversos sitios de restricción procedentes del vector puc18,
a partir del que se derivó el pRmHa-3, se indican en
la figura. Además, se indican en la figura las posiciones relativas
y longitudes de los fragmentos de gen de la MT y ADH, separados por
el sitio de clonación múltiple (poliengarce) en el que se clona el
gen del MHC de interés. El vector pRmHa-3,
derivándose del vector puc18, contiene el origen de replicación
(ori) del puc18, y el gen de la beta-lactamasa, que
confiere resistencia a la ampicilina (Amp^{r}). Por tanto, los
fragmentos de ADN codificando el MHC, tal como se preparan en esta
invención y se clonan en el sitio de clonación múltiple del
pRmHa-3, están transcripcionalmente regulados por el
promotor de la MT y poliadenilados a través del gen de la ADH.
Para sintetizar el HLA A2.2., el cADN que
codifica un A2.2 completo (ver, Holmes et al., J.
Immunol. 139:936-941 (1987), para las secuencias
publicadas) se clona en un plásmido M13pm19, un vector de
bacteriófago comercialmente disponible (Stratagene, La Jolla, CA).
El cADN se sintetiza mediante PCR usando cebadores derivados a
partir de la secuencia publicada de A2. El cADN se libera a partir
de un clon M13mp19 como un fragmento NotI(voladizo rellenado
con Klenow)/EcoRI. (Los fragmentos Klenow son parte de la molécula
de la polimerasa I de ADN de E. coli, producidos por
tratamiento de la pol I de ADN De E. coli con subtilisina. Se
usan para "rellenar" voladizos 5' o 3' en los extremos de
moléculas de ADN producidos por nucleasas de restricción). El
fragmento NotI/EcoRI se inserta en pSP64T digerido con BgIII
(extremos rellenados con Klenow) y EcoRI. pSP64T es un vector de
clonación SP6 diseñado para proporcionar regiones flanqueantes 5' y
3' procedentes de un mARN, las cuales son eficientemente traducidas
(\beta-globina) a cualquier cADN que contenga su
propio codón de inicio. Este vector de traducción SP6 se construyó
mediante la digestión de pSP64-X\betam con BalI y
BstEII, rellenando los extremos escalonados con polimerasa de ADN de
T4, y añadiendo un engarce BglII mediante ligación. El BalI corta el
cADN de la \beta-globina dos bases cadena arriba
respecto el ATG (codón de inicio), el BstEII corta ocho bases cadena
arriba del TAA (codón de paro). Hay un único gran sitio BglII en
pSP64T, de forma que los enzimas de restricción que cortar en el
fragmento poliengarce, desde PatI hasta EcoRI, pueden usarse todavía
para linealizar el plásmido para su transcripción. (Ver Kreig y
Melton, Nucleic Acid Res. 12:7057-7070
(1984), que también describen la construcción del plásmido
pSP64-Xbm). El plásmido resultante se corta con
EcoRI (extremo rellenado con Klenow) y HindIII, y se clona en el
poliengarce de pCMUII entre HindIII (5') y StuI (3'). (Ver Paabo
et al., EMBO J. 5:1921-1927 (1986)).
El cADN entero se suprimió como un fragmento HindIII (extremo
relleno con Klenow)/BamHI, el cual se clonó en
pRmHa-3 cortado con SmaI y BamHI.
El HLA A2.2 sol se preparó diseñando un codón de
paro en el cADN de A2.2 descrito más arriba, precediendo
inmediatamente al dominio transmembrana. La mutagénesis se consigue
cortando el cADN de A2.2 clonado en el vector de expresi pCMUII
entre HindIII 5' y StuI 3' (ver más arriba) con MboII y BamHI,
insertando los siguientes oligonucleótidos:
Los plásmidos recombinantes resultantes se
cortaron con HindIII, los voladizos finales se rellenaron con
Klenow, a continuación se cortaron con BamH1, liberando un fragmento
de restricción que se clonó en el pRmHa-3 de la
misma forma que el A2.2 de longitud completa.
El cADN de HLA A2.1 se preparó como sigue. Se
sintetizó una secuencia de cADN truncada de HLA A2.1, mediante PCR,
usando los siguientes cebadores derivados a partir de la secuencia
publicada del A2.1 (Koller y Orr, J. Immunol.
134:2727-2733 (1985)) y las condiciones de reacción
descritas por Nilson et al., Cell
58:707-718 (1989).
El fragmento de PCR resultante se clonó en pBS
(Stratagene, La Jolla, CA), y la secuencia se verificó mediante
secuenciación con dideoxi. Se cortó un fragmento de 800 p.b.,
codificando la mayoría de la secuencia codificante del HLA A2.1, a
partir de este plásmido con AvaI y StuI, y se usó para remplazar el
mismo fragmento en la secuencia de transmembrana del HLA A2.2, la
cual se había clonado previamente en el pRmHa-3 (ver
más arriba).
El HLA B7 se sintetizó mediante la PCR usando
cebadores derivados de la secuencia publicada del B7 (ver, por
ejemplo, Zemmour y Parham, Immunogenetics
33:310-320 (1991)), flanqueada por sitios BamHI
clonados directamente en el sitio BamHI de pRmHa-3
(Ver Sood et al., Immunogenetics
22:101-121 (1988)).
El cADN de HLA B27 se sintetizó mediante la PCR
usando cebadores derivados de la secuencia publicada del B27 (ver,
por ejemplo, Zemmour y Parham, Immunogenetics
33:310-320 (1991)). Se proporcionan más detalles
inmediatamente más abajo.
El cADN de HLA B27 sol se preparó como el cADN
de B27 anterior, pero incorporando el codón de paro en el extremo
del dominio alpha 3 del clon pBI (ver Szotz et al., PNAS
USA 83:1428 (1986)). Ambos cADN de B27, truncado y de longitud
completa, se obtienen en el vector pDS5, con un extremo 5'
modificado (ver Stueber et al., EMBO J.
3:3143-3148 (1986)). Se realizó la mutagénesis
dirigida contra un sitio para extender el extremo 5' del cADN. Se
añadió la siguiente secuencia (en letras mayúsculas) al clon de cADN
de B27 publicado; la secuencia después de la barra inclinada (/) es
el inicio de la secuencia publicada:
| GGATCCTCTCAGACGCCGAGATGCGGGTCACGGCGCCC/acggcgccc.. | (SEC Nº ID 21) |
Los cADN del B27 completo y del B27 sol se
cortaron del plásmido pDS5 cortando primero con ApaLI (extremo
rellenado con Klenow) y BamHI. Los fragmentos resultantes se
clonaron directamente en pRmHa-3 cortado con SalI
(rellenado con Klenow) y BamHI.
Los cADN clonando cualquier HLA preferido pueden
clonarse mediante el uso de la reacción en cadena de la polimerasa.
Los cebadores descritos en la sección B.1. anterior (SEC Nº ID 1 a
SEC. Nº ID 12) pueden usarse para amplificar los cADN de los
HLA-A, -B, -C, -E, -F, o -G apropiados, en
reacciones separadas, los cuales pueden clonarse a continuación y
secuenciarse tal como se describió en los procedimientos descritos
para HLA A2.1 más arriba. La preparación de cADN a partir de células
humanas se realiza tal como se describe en Ennis et al.,
PNAS USA 87:2833-2837 (1990). En resumen, se
obtiene una muestra de sangre a partir de un individuo, y se
recuperan las células después de su centrifugación, y se usan para
preparar ARN total. Se sintetiza cADN de la primera hebra usando
oligo(dT) y transcriptasa inversa del virus de la
mieloblastosis de las aves. El cADN resultante se usa en una
reacción de amplificación de la PCR utilizando el(los)
cebadore(s) apropiado(s) tal como se menciona en la
sección B.1 anterior, y un equipo GeneAmp y un ciclador térmico
(Perkin-Elmer/Cetus). Las condiciones de reacción
son preferiblemente como sigue: se usan 100 ng de plantilla de cADN
y 50 picomoles de cada cebador oligonucleotídico. Se corren treinta
ciclos como sigue: (a) un minuto a 94°C; (b) un minuto a 60°C; y
(c) un minuto, 30 segundos a 72°C. A continuación se calienta la
reacción de la PCR hasta 100°C durante 10 minutos para destruir la
polimerasa Taq, y se embotan los extremos del ADN mediante la
polimerasa T4 (Stratagene, La Jolla, CA).
El cADN de la microglobulina \beta2 humana se
preparó usando una secuencia parcial de cADN publicada (ver Suggs
et al., PNAS USA 78:6613-6617 (1981))
como plantilla para una reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
con los siguientes cebadores:
\vskip1.000000\baselineskip
Los cebadores se usan en una reacción de PCR
estándar (ver Nilsson et al., Cell 58:707 (1989)). Los
productos de la reacción se extrajeron con fenol, se purificaron
usando un equipo Geneclean (Bio 101, San Diego, CA), se digirieron
con BamHI, y se clonaron en el sitio BamHI del pBS (Statagene, La
Jolla, CA). Después de verificar la secuencia, este fragmento de
BamHI se clonó en el sitio BamHI del pRmHa-3.
Tal como se destaca en los ejemplo, se utilizó
el cADN de la Clase I de ratón en varios casos. El cADN de la Clase
I de ratón se preparó como sigue.
H-2K^{b}: el cADN codificando
una molécula de K^{b} completa se obtuvo a partir de un plásmido
de expresión pMCU/K^{b} construido como sigue. Se preparó un cADN
líder H-2K^{b}, que carecía de la secuencia líder
y de la mayoría del dominio alpha I, de acuerdo con el procedimiento
de Reyes et al., PNAS 79:3270-3274
(1982), produciendo pH202. Este cADN se usó para generar una
molécula de longitud completa. La secuencia ausente se proporciona
usando un clon genómico que codifica el H-2K^{b}
(Caligan et al., Nature 291:35-39
(1981)) como plantilla en una reacción de PCR, usando un cebador 5'
flanqueado por un sitio NotI, seguido por 21 nucleótidos que
codifican los últimos siete aminoácidos de la secuencia líder, y 18
nucleótidos complementarios al inicio del dominio alpha I, y un
cebador 3' complementario de la región que abarca el sitio StyI. El
fragmento resultante se ligó con pH202 en el sitio StyI. La
secuencia 50 que codifica el resto de la secuencia de señal se
obtuvo a partir del cADN D^{b} (ver más abajo) como un fragmento
BamHI/NotH. La secuencia codificante entera se cortó a partir del
plásmido de expresión como un fragmento BamHI y se clonó en
pRmHa-3 cortado con BamHI.
H-2L^{d}: el cADN codificando
una molécula de L^{d} completa se obtuvo a partir de un plásmido
de expresión pCMUIV/L^{d} (ver Joly y Oldston, Gene 97:213
(1991)). El cADN completo se cortó a partir del vector de expresión
pCMUIV/L^{d} como un fragmento BamHI, y se clonó en
pRmHa-3 como K^{b}.
H-2D^{b}: el cADN codificando
una molécula de D^{b} completa se obtuvo a partir de un plásmido
de expresión pCMUIV/D^{b} (ver Joly y Oldston, Science
253:1283-1285 (1991)). El cADN completo se cortó a
partir del vector de expresión pCMUIV/D^{b} como un fragmento
BamHI, y se clonó en pRmHa-3 como K^{b}.
Microglobulina \beta2 de ratón: el cADN de la
microglobulina \beta2 de ratón de longitud completa se obtuvo como
un fragmento HindIII (5') (rellenado con Klenow)/BglII (3') a partir
del cADN de la microglobulina de ratón 132 de pSV2neo (ATCC nº
37.149), y se clonó en pRmHa-3 cortado con SmaI y
BamHI.
Tal como se ha mencionado anteriormente, el
vector pCUM (pCUMIV) se deriva del vector de expresión en eucariotas
pC18G como describen Nilsson et al., ver más arriba. El
vector pC81G, a su vez, se deriva de pA81G (Paabo et al.,
Cell 33:445-456 (1983)) de acuerdo con el
procedimiento descrito en (Paabo et al., EMBO J.
5:1921-1927 (1986)). En resumen, estos tres vectores
se construyeron como sigue.
La secuencias líder de 220 p.b. de longitud del
vector pA81G se acortaron suprimiendo un fragmento de 80 p.b.
HindIII a DdeI (nt 1286-1366 de la secuencia
publicada por Herisse et al., NAR
8:2173-2192 (1980)); esta construcción se denominó
pB81G. Un fragmento HinfI del gen de la
alfa-globina, abarcando la región desde nt -112
hasta +19 con respecto el sitio de inicio de la transcripción, se
subclonó en el sitio PstI del pUC9, y el potenciador de la
repetición de 72 p.b. del SV40 se insertó cadena arriba respecto el
promotor. Este elemento potenciador-promotor se
ensayó primero clonándolo en frente de la región que codifica el
antígeno de SV40, y la construcción resultante se transfectó en
células HeLa (ATCC CCL 185). Se fijaron las células transcurridos
dos días, y se tiñeron en busca de antígeno T mediante
inmunofluorescencia indirecta. Se hallo un número elevado de núcleos
teñidos, indicando una intensa actividad del promotor del fragmento
de la alfa-globina. A continuación se remplazó el
promotor del SV40 en el vector pB81G por este eficiente elemento
promotor conduciendo a la construcción de pC81G.
pCMUIV se construyó digiriendo el pC81G con
HindIII y BamHI, e insertando oligonucleótidos codificando la
secuencia 5' no traducida del cADN de la
\beta-globina de Xenopus laevis, usado para
genera el pSP64T (Krieg et al., NAR
12:7057-7070 (1984)). No obstante, se escogió el
sitio BamHI en vez del sitio BglII usado en pSP64T. La secuencia
insertada entre el HindIII y BamHI del pC81G fue:
El vector phshsneo confiere resistencia a la
neomicina (G418), y es un derivado del phsneo (pUChsneo) con una
secuencia adicional del promotor de choque térmico (hs), la cual
puede sintetizarse, a partir de pUC8 comercialmente disponibles, tal
como se describe en Steller et al., EMBO J. 4:167
(1985). El promotor de choque térmico contenido en estos vectores es
el promotor hsp70. Otros vectores útiles que confieren resistencia a
la neomicina (resistencia G418) incluyen el vector cósmido smart2
(ATCC 37.588), el cual se expresa bajo el control del promotor hsp70
de Drosophila, y el vector de plásmido pcopneo (ATCC
37.409).
Los productos de restricción se sometieron a
electroforesis sobre un gel de agarosa al 1% (Maniatis et
al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring
Harbor (1982)). Los fragmentos de restricción codificando los cADN
se cortaron a partir del gel, y se purificaron de la agarosa usando
"Geneclean" de acuerdo con las indicaciones del fabricante (Bio
101, San Diego, CA). El plásmido de expresión de Drosophila
pRmHa-3 (ver Bunch et al., Nucl. Acid
Res. 16:1043-1061 (1988)) se cortó con los
enzima de restricción apropiados en tampón One Phor All de acuerdo
con las indicaciones del fabricantes (Pharmacia, Piscataway, NJ), y
se trataron con fosfatasa alcalina tal como se describe en la
literatura del fabricante (Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN).
Cien ng del vector pRmHa-3 cortado y
"fosfatasado" se mezclaron con 300 ng de cADN de la cadena
pesada el MHC de la Clase I purificada en gel de agarosa o cADN de
microglobulina \beta2, y se ligaron usando la ligasa de ADN de T4
y tampón One Phor All tal como se describe en la literatura del
fabricante. Después de su incubación a 16°C durante cinco horas, se
usó la mezcla de ligación para transformar E. coli JM83
competente (Maniatis et al., ver más arriba (1982)).
Los procedimientos descritos por Maniatis et
al., ver más arriba, se usaron para preparar el cADN necesario;
en resumen, los procedimientos son como sigue. Los transformantes se
seleccionaron sembrando E. coli sobre placas de agar que
contenían ampicilina. Las colonias resistentes a la ampicilina se
cultivaron individualmente en cultivo líquido, y se preparó el ADN
usando el procedimiento miniprep de lisis alcalina. La presencia de
cADN de la cadena pesada de MHC, y su orientación en el vector, se
determina mediante mapado de restricción. Las bacterias que
contenían el vector con el cADN en la orientación correcta relativa
al promotor de la metalotioneína se usaron para la preparación a
gran escala de ADN usando el procedimiento de lisis alcalina y
purificación en gradiente de cloruro de cesio. La cantidad de ADN
obtenida se determinó espectrofotométricamente.
La células Schneider II se cultivan en medio
Schneider (Gibco/BRL, Grand Island, NY) suplementado con un 10% de
suero fetal bovino (tratado con calor durante una hora a 55ºC), 100
unidades/ml de penicilina, 100 mg/ml de estreptomicina, y glutamina
1 mM. (Por conveniencia, este medio suplementado se denomina a
partir de ahora como medio de Schneider). Las células se cultivaron
a 27ºC, y se pasaron típicamente cada siete días mediante dilución
1:17 en medio fresco. Las células se convirtieron a crecimiento en
medio libre de suero (Excell 400 ó 401, suplementado con 100
unidades/ml de penicilina, 100 mg/ml de estreptomicina, glutamina 1
mM, y 500 \mug/ml de G418 (JRH Biosciences, Lenexa, KS), mediante
dilución inicial al 50% de Schneider/50% de Excell 401. Una semana
más tarde, las células pueden pasarse a 10% de medio Schneider/90%
de Excell 401, y una semana más tarde a 100% de Excell 401. Las
células se mantuvieron en este medio y se pasaron cada siete días
diluyéndolas 2:17 en medio fresco.
Se sembraron 15 \times 10^{6} células
Schneider a una concentración de 10^{6} células por ml en placas
de petri de 85 mm. Doce horas más tarde, se añadieron precipitados
de fosfato/ADN, preparados como se describe más abajo (1 ml), gota a
gota, a las células. Después de 48 horas, se retiró cuidadosamente
el sobrenadante y se transfirieron las células a un frasco de 175
cm^{2} en un volumen total de 50 ml en medio de Schneider que
contenía 500 \mug/ml de Geneticin (G418) (Gibco/BRL, Grand Island,
NY). Transcurridos 21 días, se retiraron 20 ml de cultivo a un
frasco nuevo que contenía 30 ml de medio de schneider conteniendo
500 \mug/ml de G418. Diez días más tarde, se obtuvo una población
estable de células que se adherían débilmente al frasco y crecían
con una velocidad de duplicación de aproximadamente 24 horas, y
estas células se cultivaron subsiguientemente y se pasaron en el
medio de selección tal como se describe más arriba. Se prepararon
alícuotas congeladas de estas células recolectando
5-20 \times 10^{6} células mediante
centrifugación y resuspendiéndolas en 1 ml de medio de congelación
de células (93% de suero fetal bovino/7% dimetilsulfóxido). A
continuación de colocaron las alícuotas a -70°C durante una semana y
subsiguientemente se transfirieron para almacenamiento en nitrógeno
líquido.
Los precipitados de fosfato cálcico se
prepararon tal como describieron Paabo et al. (EMBO J.
5:1921-1927 (1986)), excepto que se usaron 25 \mug
de ADN por transfección. Las siguientes combinaciones de ADN se
usaron para preparar los transfectantes indicados:
- (a)
- cadena pesada del MCH de la Clase I sola: 23 \mug del ADN del vector de expresión de la cadena pesada + 2 \mug de ADN de phshsneo.
- (b)
- cadena pesada del MCH de la Clase I + microglobulina \beta2: 11,5 \mug del ADN del vector de expresión de la cadena pesada + 11,5 \mug de microglobulina \beta2 (humana o de ratón) + 2 \mug de ADN de phshsneo.
Veinticuatro horas antes del marcado metabólico,
se sembraron las células a una densidad celular de
3-5 \times 10^{6} células/ml (10 ml/placa de
petri de 85 mm) en medio Schneider que contenía CuSO_{4} 1 mM.
Treinta minutos antes del marcado, se aspiró el medio de las placas
y se lavaron las células con 2 \times 10 ml de PBS, y se incubaron
a continuación en medio Grace para insectos, menos la metionina y
cisteína (pedido especial a Gibco/BRL, Grand Island, NY), durante 20
minutos, y entonces en 1 ml de este medio conteniendo 0,1 mCi de 35S
Trans marcado (New England Nuclear; duPont, Boston, MA). Después del
período de marcado, se aspiró la solución de marcado, y las células,
o se lisaron inmediatamente sobre hielo, con PBS/Triton X100 al 1%
enfriado en hielo (1 ml), o después de un período de caza en
presencia de medio Schneider o Excell 400 conteniendo metionina (5
ml) (JRH Biosciences). El medio de caza se recolectó si se estaban
analizando moléculas del MHC de la Clase I solubles.
Todas las operaciones siguientes se realizaron
con los lisados mantenidos fríos (menos de 8°C). Los lisados se
recolectaron en tubos Eppendorf, se centrifugaron en un tubo de
microfuga durante 15 minutos a 13.000 \times g, se transfirieron a
un tubo nuevo que contenía 100 \mul de una papilla al 10% de
proteína A Sepharose, y se colocaron en un rotador de extremo a
extremo durante dos horas. A continuación de una centrifugación
adicional en la microfuga durante 15 minutos, los lisados de células
estaban listos para su análisis.
En los experimentos que utilizaban MHC de ratón,
se transfectaron células de Schneider 2 con los recombinantes del
MHC de ratón descritos más arriba usando el procedimiento de
precipitación en CuSO_{4}; cada cadena pesada se transfectó bien
sola o como una mezcla 50:50 con el vector que codificaba la
microglobulina \beta2. En cada transfección se incluye un plásmido
que codifica la resistencia a la neomicina, ADN phshsneo, de forma
tal que pudo obtenerse una población de células que expresaba
establemente el MHC de la Clase I mediante el cultivo de los
transfectantes en medio de selección (Geneticin
G418-sulfato, Gibco/BRL, Grand Island, NY).
Los péptidos antigénicos de acuerdo con la
presente invención pueden obtenerse a partir de fuentes que existen
naturalmente o puede sintetizarse usando procedimientos conocidos.
En varios ejemplos discutidos en esta, los péptidos se sintetizan en
un sintetizador Applied Biosystems, ABI 431A (Foster City, CA), y se
purifican subsiguientemente mediante HPLC. Los péptidos antigénicos
usados en varios experimentos descubiertos en la presente invención
incluyen aquéllos listados mas abajo:
El aislamiento o síntesis de péptidos
"aleatorios" también pueden ser apropiados, particularmente
cuando uno está intentando discernir un epítopo concreto con objeto
de cargar una molécula de MHC vacía con un péptido lo más probable
para estimular células CD8 precursoras. Uno puede producir una
mezcla de péptidos "aleatorios" a través del uso de proteosomas
(ver, por ejemplo, el Ejemplo 2.B.6), o sometiendo una proteína o
polipéptido a un proceso de degradación -por ejemplo, digestión con
quimiotripsina- o pueden sintetizarse péptidos. Mientras que hemos
observado que las lineas celulares de la presente invención son
capaces de degradar proteínas y polipéptidos en péptidos más
pequeños capaces de ser cargados sobre moléculas del MHC de la Clase
I humana, es preferible introducir péptidos más pequeños -por
ejemplo, 8-meros y 9-meros-
directamente en el cultivo celular para facilitar un carga y
proceso de expresión más rápidos.
Si uno está sintetizando péptidos, por ejemplo,
péptidos aleatorios de 8-, 9- y 18-aminoácidos,
todas las variedades de aminoácidos se incorporan preferiblemente
durante cada ciclo de la síntesis. No obstante, debería notarse que
varios parámetros -por ejemplo, incompatibilidad de solvente de
ciertos aminoácidos- pueden resultar en una mezcla que contiene
péptidos que carecen de ciertos aminoácidos. Por tanto, el proceso
debería ajustarse según se precise -es decir, alterando los
solventes y condiciones de reacción- para producir la mayor variedad
de péptidos.
Con objeto de determinar las "preferencias"
en la selección de péptidos mediante moléculas del MHC, se han
sintetizado, por tanto, una serie de péptidos de diferentes
longitudes, tal como se muestra en la Tabla 3. Estos incluyen
péptidos de 8 y 9 aminoácidos de longitud, así como péptidos más
largos. Con objeto de cuantificar la cantidad de termoestabilidad
conferida por péptidos de diferente longitud y por diferentes
microglobulinas \beta2, se ha examinado la estabilidad de estas
diversas moléculas en los lisados de células. Los lisados
radiactivos de células se prepararon a partir de células de
Drosophila que expresaban K^{b}/\beta2, L^{d}/\beta2,
y D^{b}/\beta2, bien con microglobulinas \beta2 de ratón o
humana, tal como se ha descrito previamente. Los lisados se
alicuotaron a continuación y se hicieron adiciones según se
describe. Para cada tratamiento, se prepararon cinco tubos; estos se
incubaron a continuación a diferentes temperaturas entre 4°C y 47°C
durante una hora, transcurrida la cual se inmunoprecipitó la Clase
I y se analizó mediante SDS-PAGE. A continuación, se
escanearon los autoradiogramas usando un densitómetro de láser, y la
cantidad de señal se representó frente a la temperatura de la
incubación a la que se había sometido la muestra. Se calculó la
temperatura a la que el 50% de las moléculas eran estables a partir
del gráfico, y se usó como una medición de las termoestabilidades
relativas de las diferentes especies. Tal como se ha destacado en la
presente invención más arriba, la cadenas pesadas de ratón
complejadas con microglobulina \beta2 humana fueron estables a
temperaturas aproximadamente 6-8 grados superiores
que si se complejaban con \beta2 de ratón. También se observó que
las estabilidades impartidas por el péptido y la microglobulina
\beta2 xenogénica eran aditivas. Un gran incremento en la
termoestabilidad de las moléculas de la Clase I tiene lugar si se
usan 8-9-meros en comparación con
12-25-meros; más aún, la diferencia
entre la estabilización impartida por los
8-9-meros comparada con los péptidos
mayores puede ser incluso mayor que la observada previamente,
porque, aunque los péptidos se han purificado mediante HPLC, es
probable que haya cierta contaminación de los péptidos mayores con
8-9-meros.
Se muestra ahora que la termoestabilidad de una
molécula de la Clase I depende aparentemente de: (1) el origen de la
microglobulina \beta2; (2) la presencia de péptido; y (3) la
longitud y secuencia de este péptido.
Antes de la experimentación con células
expresando moléculas del MHC de la Clase I humana, se realizó la
optimización de varios parámetros usando MHC de ratón. Primero se
verificó que las moléculas del MHC de la Clase I de ratón expresadas
en células de Drosophila tenían las características de las
molécula de Clase I "vacías" o libres de péptido.
Por ejemplo, las Figuras 2A y B ilustran
resultados de ensayos preparados a partir de células de
Drosophila que expresaban K^{b}/\beta2, L^{d}/\beta2,
y D^{b}/\beta2, con microglobulina \beta2 humana o de ratón.
Se marcaron células de Drosophila que expresaban
K^{b}/\beta2, L^{d}/\beta2, y D^{b}/\beta2 durante 45
minutos con 35S metionina, y se prepararon lisados tal como se
describe más arriba. Cada lisado se dividió en cuatro alícuotas, a
las que se añadió OVA, o péptido NP o GP2, o ningún péptido en
absoluto. Después de su incubación durante una hora a 4°C, se incubó
la otra durante una hora a 30°C. A continuación se
inmunoprecipitaron las moléculas de la Clase I a partir de lisados,
y se analizaron mediante SDS-PAGE. Ocurrió una
dramática estabilización K^{b}/\beta2 respecto el desafío de
temperatura cuando se añadieron OVA o péptido NP a los lisados;
similarmente, la L^{d}/beta2 fue estabilizada por la adición de
péptido NP. La D^{b}/\beta2 no parece ser tan lábil a la
temperatura como las otras dos moléculas; sin embargo, se observa un
incremento en la estabilidad de la molécula a partir de la adición
del péptido GP2 al lisado, mientras que la adición de OVA o péptido
NP no lo consigue. Pueden observarse dos bandas inmunoprecipitadas
para cada Clase I, representado las formas procesadas en Golgi
(inferior) o no procesada (superior), ambas moléculas parecen ser
estabilizadas igualmente bien mediante la adición de péptido al
lisado. La pequeña cantidad de proteína "resistente a 30°C"
observada en la K^{b}/\beta2 no tratada o en lisados de GP2 es
señal de fondo, puesto que la adición de Y3 a un lisado de células
marcadas con L^{d}/\beta2 resultó en el aislamiento de esta
banda (no se muestra).
A continuación, se investigó la posibilidad de
que la microglobulina \beta2 humana fuera mejor que la
microglobulina \beta2 de ratón para estabilizar las cadenas
pesadas de ratón. Se encontró que la adición de la \beta2 humana a
células de Drosophila creciendo en medio Excell 400 no tan
sólo incrementaba el nivel de estadio estacionario de las tres
moléculas de la Clase I de ratón, también hacía a las moléculas
estables a 37°C durante tres horas. La estabilidad incrementada de
la Clase I de ratón a partir de la adición de la \beta2 humana
pudo haber sido el resultado de incrementar la concentración de
\beta2 en el medio; esta posibilidad se descartó. Se clonó cADN de
la microglobulina \beta2 humana en el vector
pRmHa-3 de expresión en Drosophila, y se
cotransfectó con plásmidos de expresión que contenían los diversos
cADN de la cadena pesada de la Clase I de ratón y el plásmido
marcador de la resistencia, tal como se describió previamente.
Después de su selección con G418, se tiñeron las células con los
anticuerpos anti-Clase I apropiados para la
expresión sobre superficie, se seleccionaron las células que
expresaban intensamente usando la FACS. Se obtuvieron poblaciones
estables de células (no se muestran los datos). A continuación se
condicionaron las células a crecer en Excell 400, y se incubaron
durante diferentes períodos de tiempo a 37°C. Las moléculas de la
Clase I de ratón sintetizadas con la microglobulina \beta2 humana
fueron estables a una incubación de 3 horas a 37°C sin la adición de
\beta2 exógena al medio Excell (no se muestran los datos).
Nuestros resultados indican que la termoestabilidad de las
moléculas
de la Clase I de ratón depende de la presencia de péptido y del origen de la microglobulina \beta2. (Ver Figuras 3A y 3B).
de la Clase I de ratón depende de la presencia de péptido y del origen de la microglobulina \beta2. (Ver Figuras 3A y 3B).
Además, se ha determinado ahora que las
moléculas de la Clase I expresadas sobre la superficie celular son
estabilizadas aún más por la adición de péptidos del tamaño
apropiado. (Ver Figuras 5A-C). Se sintetizaron una
serie de péptidos de diferentes longitudes, tal como se muestra en
la Tabla 3 (ver Ejemplo 5.2). Estos incluyen un péptido que tiene 8
aminoácidos de longitud; RGYVYQGL (SEC. Nº ID 24) ha sido
caracterizado como el epítopo en la proteína G del virus de la
estomatitis vesicular (VSV). Similarmente, el péptido
8-mero de OVA SIINFEKL (SEC. Nº ID 23, residuos
5-12) ha sido identificado como el péptido en
ovoalbúmina que es presentado por la K^{b}/\delta2, y el péptido
de 9 aminoácidos de longitud ASNENMETM (SEC. Nº ID 25) ha sido
caracterizado como el epítopo de la proteína nuclear del virus de la
gripe presentado por la D^{b}/\delta2. La adición de estos
péptidos "progenitores" a células de Drosophila
cultivadas en Excell y expresando la Clase I de ratón resultó en la
termoestabilidad a 37°C de la K^{b}/\delta2 por el péptido de
OVA y de la D^{b}/\delta2 por el péptido de NP.
Con objeto de cuantificar la cantidad de
termoestabilidad conferida por péptidos de diferente longitud y por
diferentes microglobulinas \beta2, se examinó la estabilidad de
estas diversas moléculas en lisados de células. Los lisados
radiactivos de células se prepararon a partir de células de
Drosophila que expresaban K^{b}/\beta2, L^{d}/\beta2,
y D^{b}/\beta2, bien con microglobulinas \beta2 de ratón o
humana, tal como se ha descrito previamente. Los lisados se
alicuotaron a continuación y se hicieron adiciones según se describe
en el Ejemplo 1.D. Para cada tratamiento, se prepararon cinco tubos;
estos se incubaron a continuación a diferentes temperaturas entre
4°C y 47°C durante una hora, transcurrida la cual se inmunoprecipitó
la Clase I y se analizó mediante SDS-PAGE. A
continuación, se escanearon los autoradiogramas usando un
densitómetro de láser, y la cantidad de señal se representó frente a
la temperatura de la incubación a la que se había sometido la
muestra. Se calculó la temperatura a la que el 50% de las moléculas
eran estables a partir del gráfico, y se usó como una medición de
las termoestabilidades relativas de las diferentes especies. Tal
como se había observado previamente, las cadenas pesadas de ratón
complejadas con microglobulina \beta2 humana fueron estables a
temperaturas aproximadamente 6-8 grados superiores
que si se complejaban con \beta2 de ratón. Interesantemente, las
estabilidades impartidas por el péptido y la microglobulina \beta2
xenogénica eran aditivas. Un gran incremento en la termoestabilidad
de las moléculas de la Clase I tiene lugar si se usan
8-9-meros en comparación con
12-25-meros; más aún, la diferencia
entre la estabilización impartida por los
8-9-meros comparada con los péptidos
mayores puede ser incluso mayor que la observada previamente,
porque, aunque los péptidos se han purificado mediante HPLC, es
probable que haya cierta contaminación de los péptidos mayores con
8-9-meros.
La tabla siguiente muestra la temperatura (en
°C) a la que el 50% de las cadenas pesadas del MCH de la Clase I (se
indican) son estables en los lisados de TX100, cuando se
co-expresan con \beta2 de ratón o humana en
presencia o ausencia de péptidos.
Con objeto de prestar atención a la cuestión de
si el péptido puede unir moléculas de la Clase I vacías en ausencia
de microglobulina \beta2, se prepararon lisados con detergente a
partir de células de Drosophila que expresaban cadenas
pesadas K^{b} o D^{b} de la Clase I, marcadas con
^{35}S-metionina durante una hora, y tratadas. La
molécula de K^{b} se inmunoprecipitó con el anticuerpo Y3 y la
D^{b} con el anticuerpo B22.249. Sólo pudieron detectarse niveles
bajos de cadena pesada K^{b} inmunoreactiva en los lisados sin
tratar. La adición de cualquier péptido que se una a la Clase I o la
microglobulina \beta2 humana resulta en un incremento en la
cantidad de material inmunoreactivo; la adición de ambos resultó en
una mucha mayor cantidad de cadena pesada inmunoreactiva. Se
obtuvieron resultados similares para D^{b}. Por tanto, parece que
la cadena pesada puede unir péptido en ausencia de la microglobulina
\beta2, no obstante, o esta unión no resulta en una conformación
muy estable, o los anticuerpos usados no se unen bien a esta
conformación. La adición de microglobulina \beta2 también conduce
a un incremento en el número de moléculas inmunoreactivas,
presumiblemente por la misma razón. Los efectos de estos dos
reactivos son aditivos, sugiriendo que el complejo triple es la
forma más estable de la molécula y/o que esta molécula es la mejor
reconocida por el anticuerpo.
Estos resultados generan la pregunta de si uno
puede "reconstruir" complejos de cadena pesada/\beta2 a
partir de los lisados después del tratamiento a 30°C de temperatura.
Se trataron lisados procedentes de células de Drosophila que
expresaban K^{b}/\beta2 durante una hora a 30°C, transcurridos
los cuales se añadió péptido de NP o microglobulina \beta2 humana.
Después de su incubación a 4°C durante 4 horas, se
inmunoprecipitaron las cadenas pesadas de la Clase I o con Y3 o con
el anticuerpo K193 anti-cola citoplasmática. La
preparación de los antisueros se describe en el Ejemplo 2.1.
Tal como se ha informado previamente, se
encontró que la temperatura de tratamiento de moléculas de la Clase
I vacías en lisados de Triton TX-100 no resultaba en
su degradación (la molécula K^{b} puede inmunoprecipitarse
igualmente bien después del tratamiento a 30°C con un anticuerpo
anti-cola citoplasmática), pero que resultaba en su
desnaturalización. Más aún, la conformación asumida por estas
moléculas desnaturalizadas mediante calor es tal que ya no se unen a
la microglobulina \beta2, o pueden recuperarse en moléculas que
son reconocidas por el Y3 mediante la adición de péptido o
microglobulina \beta2 humana. Por tanto, es razonable concluir que
las cadenas pesadas de la Clase I pueden unir péptido, bien solas o
cuando están complejadas con microglobulina \beta2.
No obstante, la expresión en superficie del MHC
de la Clase I humana cargado con péptido parece ser, como mucho,
facilitada cargando las moléculas con péptido después de que las
cadenas pesadas se hayan complejado la microglobulina \beta2.
Una vez que se ha determinado que la
termoestabilidad de una molécula de la Clase I depende del origen de
la microglobulina \beta2, la presencia de péptido, y la longitud y
secuencia de este péptido, hemos utilizado esta información en la
creación de lineas celulares capaces de activar células CD8
específicamente a través de la expresión de moléculas del MHC de la
Clase I cargadas con péptido.
La termolabilidad parece ser una propiedad
inherente de las moléculas de la Clase I; presumiblemente evolucionó
para asegurar que las moléculas de la Clase I que, o no contienen
péptido o contienen un péptido con propiedades de unión pobres (que
confiere poca termoestabilidad), se autodestruyen. De esta forma, la
célula minimiza el número de moléculas vacías de la Clase I sobre su
superficie, puesto que tal situación sería presumiblemente peligrosa
en que péptidos derivados exógenamente pueden unirse y presentarse.
Las moléculas de la Clase I humana (B27 y A2.1) expresadas en
células de insectos con la \beta2 humana no son estables frente
una incubación extensa a 37°C; ni lo son las moléculas de la Clase I
humana expresadas en la línea celular mutante T2, la cual se ha
observado que es deficiente para cargar péptidos sobre moléculas de
la Clase I (Hosken y Bevan, Science
248:367-370 (1990); Cerundolo et al.,
Nature 345:449-452 (1990)). Por tanto, parece
que la afinidad entre la cadena pesada y la microglobulina \beta2
ha sido cuidadosamente conservada a través de la
co-evolución de las moléculas, de tal forma que
moléculas de la Clase I vacías, o aquéllas portando péptidos
pobremente unidores, se autodestruyen a la temperatura corporal del
organismo "huésped".
Se expresaron moléculas del MHC de la Clase I
humana en células Schneider. Se establecieron lineas celulares que
co-expresaban la microglobulina \beta2 humana y el
HLA A2.2Y, HLA A2.1, HLA B7 o HLA B27 usando procedimientos
previamente descritos. En resumen, los cADN que codificaban las
proteínas anteriores se clonaron en el vector
pRmHa-3 de expresión en Drosophila, y se
cotransfectaron con un plásmido que contenía la microglobulina
\beta2 humana y el plásmido phshsneo en células Schneider a través
de procedimientos descubiertos en la presente invención. Tres o
cuatro semanas más tarde, la población de células resistentes al
G418 se diluyeron 1:5 con medio de selección nuevo. Una vez se hubo
obtenido una población de células creciendo sanas, se añadió
CuSO_{4} a una alícuota de células y, 24 horas más tarde, se
analizaron las células mediante citometría de flujo usando un
anticuerpo monoclonal W6/32 (ATCC HB95, Bethesda, MD), el cual
reconoce un determinante monomórfico de las cadenas pesadas de la
Clase I humana cuando están asociadas con la microglobulina
\beta2. (Ver Barnstable et al., Cell 14:9 (1978)).
Se indujeron niveles elevados se expresión en superficie de cada una
de las moléculas de la Clase I humana inducidas por la adición de
CuSO_{4} (no se muestran los datos). Estas poblaciones estables se
clasificaron en busca de células de elevada expresión usando
citofluorimetría tal como se describe más abajo. Son estas estas
poblaciones de células clasificadas las que se usaron para todos los
experimentos subsiguientes.
Veinticuatro horas antes del análisis con FACS,
se añadió CuSO_{4} a las células Schneider establemente
transfectadas (3-4 \times 10^{6} células/ml)
hasta una concentración final de 1 mM, "encendiendo", por tanto
la expresión a partir de los genes transfectados. Se sembraron las
células en placas de 24 pocillos (2 ml por pocillo). Ocho horas
antes del análisis FACS, se remplazó el medio CuSO_{4} con medio
nuevo (1 ml), con o sin péptido a una concentración de 50 \mug/ml.
Se realizaron desafíos de temperatura a 37°C transfiriendo las
placas a una superficie plana en una habitación a 37°C, a diversos
intervalos de tiempo, antes de recolectar las células para su
análisis.
Para analizar la expresión en superficie del MHC
de la Clase I sobre las células Schneider, se transfirieron
alícuotas de células (5 \times 10^{5}) a tubos en hielo, se
recolectaron mediante centrifugación (1000 \times g, durante 4
minutos), se resuspendieron en 3 ml de PBS/BSA al 1%, 0,02% azida
sódica, se recolectaron mediante centrifugación, y se resuspendieron
en PBS/BSA (0,5 ml) conteniendo el anticuerpo primario apropiado
(fluidos ascíticos Y3, 28:18:8S, 30.5.7, W6/32, diluidos 1:200).
Los antisueros de conejo se diluyeron 1:500 y el sobrenadante de
hibridomas B22.293 se usó directamente. Después de una hora de
incubación sobre hielo, se lavaron las células dos veces en 3 ml de
PBS/BSA y se resuspendieron en 0,5 ml de PBS/BSA que contenía el
anticuerpo secundario marcado con FITC (Cappell, Durham, NC) y 1
mg/ml de yoduro de propidio. Después de 30 minutos de incubación
sobre hielo, se lavaron las células una cez con PBS/BSA y se
resuspendieron en este tampón a una concentración de 1 \times
10^{6}/ml. A continuación se analizaron las muestras mediante FACS
440 (Becton Dickinson). Las células muertas teñidas con yoduro de
propidio, se excluyen mediante la inclusión de una compuerta viva en
el análisis.
Para la clasificación de las células se usó el
mismo procedimiento descrito más arriba, excepto que todas las
operaciones de tinción se realizaron en una campana estéril. La
soluciones, incluyendo los anticuerpos, se esterilizaron mediante
filtración, y se usó medio de Schneider o Excell 400 en lugar del
PBS/BSA. Las células que unían específicamente el anticuerpo
primario se clasificaron usando un clasificador de células Becton
Dickinson. Las células clasificadas (2-8 \times
10^{5}) se lavaron una vez en medio antes de sembrarlas a una
concentración de 2 \times 10^{5} célu-
las/ml.
las/ml.
Con objeto de demostrar que las moléculas de la
Clase I humana expresadas sobre la superficie de células de
Drosophila están vacías, se incubaron las células a 37°C
durante dos horas, y se analizó la expresión sobre la superficie
celular mediante citofluorimetría. La expresión sobre la superficie
de ambos HLA, B27 y A2.1, está enormemente reducida si las células
se incuban a 37°C durante 2 horas; no obstante, preincubando las
células en péptidos HIV, que se sabe se unen a las moléculas de la
Clase I, permite una estabilidad térmica significativa de la Clase
I, mientras que los péptidos que no se unen no tienen poco efecto
(ver Figura 5A). Un péptido de 9 aminoácidos (ILKEPVHGV, SEC. Nº ID
31) procedente de la proteína POL del VIH se une y estabiliza el
HLA A2.1. Un péptido de 9 aminoácidos procedente de la proteína Vpr
del VIH se une y estabiliza el B27 (FRIGCRHSR, SEC. Nº ID 30).
Estos datos muestran que las moléculas de la Clase I humana
expresadas sobre la superficie de células de Drosophila están
vacías y pueden estabilizarse mediante la unión de péptidos del VIH
específicos.
La Figura 5A muestra la termoestabilización
inducida por péptido del HLA B27 y HLA A2.1 expresados sobre la
superficie de células de Drosophila mediante péptidos del
VIH. Se incubaron células de Drosophila que expresaban HLA
B27 o A2.1 con péptidos donde se indica, y se mantuvieron a
continuación a 28°C o se incubaron a 37°C durante dos horas antes
del análisis de la expresión sobre superficie de las moléculas de la
Clase I mediante el uso del anticuerpo W6/32 (procedente de ATCC
HB95) y citofluorimetría. La fluorescencia promedio de cada
población celular se muestra representada frente a las condiciones
de incubación. El péptido de POL del VIH (ILKEPVHGV, SEC. Nº ID 31)
estabiliza el A2.1 pero no el B27, mientras que el péptido de Vpr
(FRIGCRHSR, SEC. Nº ID 30) estabiliza el B27 pero no el A2.1.
La Figura 5B ilustra que el HLA A2.2Y expresado
en células de Drosophila tiene características de las
moléculas de la Clase I vacías en lisados con Triton X100. Los
lisados radiactivos con Triton X100, preparados a partir de células
de Droso que expresaban el A2.2Y, se alicuotaron y las
adiciones de péptidos se hicieron tal como sigue: A y B: sin
adiciones; C: un péptido KRWIILGLN (SEC. Nº ID 29) de GAG (B) de
VIH; D: péptido de la gripe ILGFVTLTV (SEC. Nº ID 32); E: péptido
8-mero aleatorio; F: péptido 9-mero
aleatorio. Las alícuotas B-F se incubaron a 37°C
durante una hora antes de su inmunoprecipitación con W6/32 y
análisis mediante SDS-PAGE.
La Figura 5C muestra que el HLA B7 expresado en
células de Drosophila tiene características de moléculas de
la Clase I vacías en lisados de Triton X100. Los lisados se
prepararon como en la Figura 5B, en células de Drosophila que
expresaban el HLA B7. Las alícuotas o no recibieron péptido (-P) o
péptido aleatorio de 18-meros o
9-meros según se indica. La mitad de las alícuotas
se incubaron a 39°C durante una hora antes de su inmunoprecipitación
con W6/32 y SDS-PAGE.
También se observó que el HLA B7 y A2.2Y
expresados en células de Drosophila estaban vacíos, ya que se
encontró que eran termolábiles en lisados de células con Triton
TX100 (ver Figuras 5B y 5C); no obstante, pudieron estabilizarse
mediante la adición de péptidos a los lisados antes del desafío de
temperatura. En particular, puede verse que un
10-mero derivado de la matriz de la gripe,
ILGFVFTLTV (SEC. Nº ID 32) (Gotch et al., J. Exp. Med.
168:2045-2057 (1988)) estabiliza el HLA A2.2, así
como lo hace un péptido 8-mero aleatorio que también
estabiliza el HLA B7.
El desafío de temperatura para los lisados de
células con Triton TX100 se realizó como se ha descrito previamente
en la presente invención para la Clase I de ratón. La conclusión a
partir de estos estudios es que las moléculas de Clase I humanas
expresadas en células de Drosophila tienen todas las
características de las moléculas vacías expresadas en la linea
celular mutante T2 (Salter et al., (1985), ver más arriba;
Hosken y Bevan (1990), ver más arriba).
Datos recientes han demostrado que las moléculas
de la Clase I unen péptido, los cuales contiene motivos secuencia
consenso. (Ver Falk et al., Nature
351:290-296 (1991); Van Bleek y Nathenson,
Nature 348:213-216 (1990)). Por tanto, los
residuos amino- y carboxi-terminales de péptidos
unidos a una determinada forma alélica de la molécula de la Clase I
parecen estar restringidos a unos pocos tipos de aminoácidos, y uno
o más residuos internos tendrían que ocupar posiciones específicas.
Falk et al., ver más arriba (1991); Van Bleek et al.,
ver más arriba (1990). El examen de la unión de péptidos a la
molécula K^{b} de ratón confirma que un péptido de ovoalbúmina,
OVA-8, con la secuencia SIINFEKL (SEC. Nº ID 23,
residuos 5-12), el cual se une a las moléculas de
K^{b} in vivo, contiene un motivo de unión óptimo y se une
intensamente a las moléculas de K^{b} in vitro. Puesto que
esta secuencia peptídica está flanqueada en la molécula de
ovoalbúmina por las secuencias ...QLE y TEW..., es evidente que
varias proteasas, una proteasa con una especificidad de sustrato muy
amplia, o un complejo enzimático con múltiples actividades
proteolíticas, deben ser responsables de la generación del péptido
OVA-8 a partir de la ovoalbúmina intacta.
Para examinar si los proteosomas aislados pueden
generar el péptido óptimo para la unión a moléculas de K^{b}, fue
útil hacer uso del hallazgo de que moléculas de K^{b} de la Clase
I vacías, es decir, aquéllas sin péptido unido- son muy termolábiles
(Ljunggren et al., ver más arriba (1990)). La incubación de
moléculas K^{b} vacías en detergente a 30°C durante una hora hace
que el anticuerpo Y3, específico para K^{b} y dependiente de
\beta2M, sea incapaz de reaccionar con la molécula de K^{b}
porque la \beta2 M se disocia rápidamente de la cadena pesada. La
unión de un péptido apropiado tal como la OVA-8
impide la disociación de la subunidad, permitiendo que el Y3 se una
al complejo de la Clase I. Péptidos de la misma longitud que
OVA-8, los cuales no pueden ser presentados por
moléculas de K^{b} in vivo (por ejemplo, el péptido
SNENMETM (SerAsnGluAsnMetGlyThrMe) (SEC. Nº ID 25, residuos
2-9), el cual se une a D^{b}, Townsend et
al., Cell 44:959-968 (1986)) son
incapaces de prevenir la disociación inducida por calor de las
moléculas la Clase I K^{b} (ver Figura 3). El péptido
OVA-24 con la secuencia
EQLESIINFEKLTEWTSSNVMEER (SEC. Nº ID 23) (el cual abarca la
secuencia de OVA-8, se muestra subrayada) se une
débilmente a las moléculas de K^{d}. No obstante, la débil unión
del OVA-24 no fue suficiente para impedir que el
complejo K^{b}-\beta2 M se disociara a 30°C.
Los diversos antisueros se prepararon como
sigue. El antisuero K193 se genera inmunizando conejos con la
limfocianina de la lapa con forma de ojo de cerradura (Keyhole
Limpet) (Calbiochem, La Jolla, CA) conjugada con péptido
sintético correspondiente a la secuencia COOH terminal de la
H-2K^{b} (LPDCKVMVHDPSLA o
LeuProAspCysArgValMetValHisAspProSerLeuAla) (SEC. Nº ID 33). Los
ascites Y3 se prepararon usando el hibridoma HB176 (ATCC, Rockville,
MD). (Ver también Hammerling et al,. PNAS USA 79:
4737-4741 (1982). Los ascites
28-14-8S se prepararon a partir del
hibridoma HB 27 (ATCC, Rockville, MD). (Ver Ozato y Sachs, J.
Immunol. 126:317-321 (1980); Myers et
al., J. Immunol. 142:2751-2758 (1989)).
Los ascites 30-5-7 se prepararon a
partir del sobrenadante de cultivo procedente del hibridoma B22.249
(Ver Hammerling et al., Immunogenetics
8:433-445 (1979); Allen et al., Nature
309:279-281 (1984)). Los antisueros policlonales
purificados contra el MHC de ratón se prepararon de acuerdo con
Kvist et al., Scan. J. Immunol.
7:265-276 (1978). Los anticuerpos secundarios
marcados con FITC (IgG de cabra anti-ratón y
anti-conejo purificadas mediante afinidad) se
obtuvieron a partir de Cappell (Durham, NC).
Usando este sistema de ensayo, se incubaron
moléculas con el anticuerpo monoclonal Y3, específico para K^{b},
K^{b} "vacías" marcadas biosintéticamente procedentes de
células RMA-S, las cuales no consiguen cargar
péptidos sobre las moléculas de la Clase I, se incubaron con el
anticuerpo monoclonal Y3 específico para K^{b}, y dependiente de
\beta2 M. Las moléculas unidas a anticuerpo se separaron mediante
SDS-PAGE y se visualizaron mediante autoradiografía.
El análisis de SDS-PAGE se realizó como sigue. Los
inmunoprecipitados recolectados para cuentas de proteóna
A-Sepharose se lavaron cinco veces con 1 ml de TX100 al 0,1%/PBS, e inmediatamente se hirvieron en tampón de muestras del SDS-PAGE o, donde se indica, después de la digerir la mitad de la muestra con Endoglicosidasa H (ver Jackson et al., EMBO J. 9:3153-3162 (1990)). A continuación se analizaron las muestras sobre geles de SDS-PAGE con un gradiente del 10-15%, y se trataron con Amplify (Amershman, Arlington Heights, IL) antes de autoradiografiarlas a -70°C usando película Kodak XOmat (Rochester, NY).
A-Sepharose se lavaron cinco veces con 1 ml de TX100 al 0,1%/PBS, e inmediatamente se hirvieron en tampón de muestras del SDS-PAGE o, donde se indica, después de la digerir la mitad de la muestra con Endoglicosidasa H (ver Jackson et al., EMBO J. 9:3153-3162 (1990)). A continuación se analizaron las muestras sobre geles de SDS-PAGE con un gradiente del 10-15%, y se trataron con Amplify (Amershman, Arlington Heights, IL) antes de autoradiografiarlas a -70°C usando película Kodak XOmat (Rochester, NY).
Las bandas correspondientes a la cadena K^{d}
se cuantificaron mediante densitometría. Para generar los datos (no
se muestra) se incubaron lisados de células
RMA-S,que contenían moléculas K^{b} de la Clase I
"vacías", con péptido y/o proteosomas purificados antes de su
incubación a 4°C o 30°C. durante una hora. Las moléculas de K^{b}
se inmunoprecipitaron con el anticuerpo monoclonal Y3, y se
analizaron mediante SDS-PAGE. Las moléculas K^{b}
"vacías" se incubaron con OVA-24; proteosomas
solos; OVA-24 y proteosomas; OVA-24,
proteosomas, y p-hidroximercuribenzoato; y
OVA-8. Se analizaron los lisados que contenían
K^{b} "vacía" sola (no se muestran los datos). Antes de la
inmunoprecipitación, se desafiaron las moléculas con calor a 30°C
durante una hora, y se mantuvieron a 4°C durante el mismo período
(no se muestran los datos). El péptido OVA-8 se usó
a una concentración final de 75 \muM y el péptido
OVA-24 a una concentración de 75 \muM.
Las moléculas de K^{b} incubadas durante la
noche a 4°C se disociaron casi completamente, a juzgar por su
ausencia de reactividad con el anticuerpo, pero se recuperaron
cuantitativamente de la mezcla de incubación que contenía el péptido
OVA-8.
Los barridos densitométricos de los carriles
numerados pares (no se muestran los datos) permitieron la
determinación de la cantidad de K^{b} recuperada después del
desafío con calor. Los datos se expresaron como porcentajes de la
cantidad de complejos K^{b}/OVA-8 recuperados
después del desafío con calor. La mayoría de las moléculas de
K^{b}, las cuales se habían incubado con OVA-8,
permanecieron intactas después del tratamiento a 30°c. El péptido
más largo, OVA-24, no fue tan eficiente como el
OVA-8 para estabilizar las moléculas de K^{b}, y,
en concordancia con nuestros datos previos sobre la unión débil del
OVA-24, sólo aproximadamente el 30% de las moléculas
permanecieron después del tratamiento con calor. Cuando la mezcla de
incubación contenía el péptido OVA-24 y proteosomas
purificados, pudieron precipitarse un mayor número de moléculas de
K^{b}, y aproximadamente el 80% de las moléculas de K^{b}
sobrevivieron a la exposición a 30°C. Que la estabilidad
incrementada de las moléculas de K^{b} se debía a
péptido(s) deriva-
do(s) del OVA-24 era evidente a partir del hecho de que los proteosomas solos fallaron para generar péptidos en el lisado que pudieran prevenir la disociación del complejo K^{b}-\beta2 M. Esta conclusión está apoyada también por el hecho de que los proteosomas tratados con el inhibidor p-hidroximercuribenzoato (Rivett, Arch. Bioch. Biophys. 268:1-8 (1989)) no consiguieron generar péptidos procedentes de OVA-24, lo cual puede estabilizar las moléculas de K^{b} a 30°C.
do(s) del OVA-24 era evidente a partir del hecho de que los proteosomas solos fallaron para generar péptidos en el lisado que pudieran prevenir la disociación del complejo K^{b}-\beta2 M. Esta conclusión está apoyada también por el hecho de que los proteosomas tratados con el inhibidor p-hidroximercuribenzoato (Rivett, Arch. Bioch. Biophys. 268:1-8 (1989)) no consiguieron generar péptidos procedentes de OVA-24, lo cual puede estabilizar las moléculas de K^{b} a 30°C.
Estos datos demostraron que los proteosomas
aislados pueden generar péptido(s) a partir de un péptido
precursor que se une débilmente a K^{b}, de tal forma que la
molécula de la Clase I fue estabilizada hasta el mismo nivel que con
péptidos endógenos. En consecuencia, el(los)
péptido(s) derivados del OVA-24 deberían
tener aproximadamente 8 aminoácidos de longitud y deben haber
abarcado la secuencia del péptido OVA-8. Además,
experimentos similares en los que se incubo ovoalbúmina
desnaturalizada, reducida, y alquilada, con proteosomas, también
resultaron en la recuperación de moléculas K^{b} termoestables (no
se muestran los datos).
Se cultivaron células HeLa (ATCC nº CCL 185) en
medio de Dulbecco modificado por Eagle (DMEM, Gibco, Grnad Island,
NY) suplementado con un 8% de suero fetal bovino, glutamina 2 mM,
penicilina (100 \mug/ml), y estreptomicina (100 \mug/ml). Los
esplenocitos de cuatro haplotipos de H-2 diferentes
(H-2^{k}, ^{s}, ^{d}, y ^{q}),
RMA-S, T1, T2 y astrocitos de ratón se cultivaron en
medio RPMI 1640 (Gibco, Grand Island, NY). RMA-S, un
mutante de ratón de la linea celular H-2^{b} de
linfoma (Ljunggren y Karre, J. Exp. Med.
162:1745-1759 (1985); Karre et al.,
Nature 319:675-678 (1986)), es incapaz de
presentar antígenos endógenos (Twonsend et al., Nature
340:443-448 (1989); Townsend y Bodmer, Ann. Rev.
Immunol. 7:601-624 (1989)). T1 y T2 derivan de
la linea celular mutante LBL 721.174 (0.174) de linfoblastoides B
fusionados al linfoma CEM de células T (Salter et al.,
Immunogenetics 21:235-237 (1985)). T1, del
híbrido 0.174-CEM, expresó niveles elevados del MHC
de la Clase I derivado del 0.174. T2, seleccionada por la pérdida de
ambas copias del cromosoma 6 humano, tiene el fenotipo de expresión
inferior de la Clase I del 0.174 (Hosken y Bevan, Science
248:367-370 (1990)).
El marcado metabólico de células se llevó a cabo
como se describe en Jackson et al., EMBO J.
9:3153-3162 (1990), con las siguientes
modificaciones. A menos que se indique lo contrario, las células se
trataron con interferón gamma (IFN-gamma; Boehringer
Mannheim, Indianapolis, IN) (2500 U/ml) durante 96 horas antes del
marcado metabólico. El medio del pulso contenía 0,15 mCi/ml de
L[35S]metionina-deficiente y
cisteína-deficiente DMEM. Las células se marcaron
rutinariamente durante 4 horas seguidas por períodos de caza de
diferentes intervalos de tiempo (hasta 36 horas) en presencia de
medio de cultivo normal. La inmunoprecipitación, la
SDS-PAGE (Blobel y Dobberstein, J. Cell.
Biol. 67:835-851 (1975)) y la fluorografía
(Bonner y Laskey, Eur. J. Biochem. 46:83-88
(1974)) se realizaron tal como se ha descrito (Jackson et
al., EMBO J. 9:3153-3162 (1990)). La
electroforesis en gel con gradiente de pH no en equilibrio en la
primera dimensión (usando anfolinas de pH 3,5-10) se
realizó como se describe en Jones, en Selected Methods in
Cellular Immunology, Eds. Mishell y Shigii, Freeman, San
Francisco, 1980, pp. 398-400. Para cuantificar la
radiactividad incorporada en la proteína, se determinaron las
intensidades de las bandas en las fluorografías mediante
densitometría de barrido usando un Ultroscanl XL de LKB (Brouma,
Suecia). Las proteínas marcadoras radiactivas, albúmina de suero
bovina (67 kDa), ovoalbúmina (46 kDa), anhidrasa carbónica (30 kDa)
y lactoglobulina A (18,4 kDa) se compraron a New England Nuclear
(duPont, Boston, MA).
Para el análisis del pulso-caza,
los lisados procedentes de varios instantes se alicuotaron en tubos
dependiendo del número de antibióticos que se usaban para analizar
el transporte. Se añadió anticuerpo al lisado (1 \mul de fluido de
ascites, Y3, 30.5.7, 28:14:8S, W6/32), o antisuero (K193, K270), 100
\mul de sobrenadante de cultivo de hibridomas (anticuerpo
B22.293); la mezcla de dejó durante 2-12 horas antes
de recoger el anticuerpo mediante incubación con proteína A
Sepharose durante una hora, y 5 segundos de centrifugación en la
microfuga.
Los sueros de conejo anti-humano
y anti-proteosomas de rata fueron proporcionados
amablemente por el Dr. A. Ichihara (Tanaka et al., J.
Cell Physiol. 139:34-41 (1986)). Los ascites Y3,
un anticuerpo monoclonal contra la H2-K^{b} de
ratón, se prepararon usando el hibridima nº HB 176 de las ATCC
(Hammerling et al., PNAS USA
79:4737-4741 (1982)). El IFN-gamma
procedente de linfocitos T humanos se obtuvo de Boehringer Mannheim
(Indianapolis, IN). El IFN-gamma de ratón se obtuvo
de Genentech (South San Francisco, CA) y de Amgen Biologicals
(Thousand Oaks, CA). Los péptidos se sintetizaron medaitne técnicas
de fase sólida en un sintetizador de péptidos 430A de Applied
Biosystems, y se purificaron adicionalmente en una columna de
cromatografía en fase inversa C_{18} (VyDac).
Las células HeLa homogeneizadas, no tratadas o
tratadas con IFN-gamma, se centrifugaron para
suprimir los restos nucleares y celulares, y los sobrenadantes
resultantes se sometieron a fraccionamiento con sulfato amónico
según se describió (Rivett, J. Biol. Chem.
260:12600-12612 (1985)). Los complejos de proteosoma
de 26S presentes en el sobrenadante se precipitaron selectivamente a
una saturación del 38%, mientras que los complejos de proteosomas de
19S presentes en el sobrenadante después del paso de fraccionamiento
al 38% se precipitaron con sulfato amónico al 60% (Wazman et
al., J. Biol. Chem. 262:2451-2457
(1987)).
Las células HeLa no tratadas y tratadas con
IFGN-gamma se marcaron durante 4 horas, se
homogeneizaron, y se sometieron a centrifugación diferencial. Los
homogenados se centrifugaron primero a 15.000 r.p.m. durante 30
minutos para suprimir los restos nucleares y celulares. Los
sobrenadantes resultantes se centrifugaron a continuación a 100.000
\times g durante 30 minutos para precipitar los microsomas. Los
proteosomas en la fracciones sobrenadantes (fracción citosólica) y
en los precipitados (fracción microsomal cruda) se
inmunoprecipitaron separadamente y se analizaron mediante
electroforesis en gel bidimensional.
Los proteosomas se purificaron a partir de
hígado bovino reciente usando una modificación del procedimiento
descrito por Skilton et al. (1991). En resumen, se
homogeneizó el hígado bovino reciente en Tris-HCl 10
mM (pH 7,2), KCl 50 mM, EDTA 0,1 mM, DTT 0,1 mM, y glicerol al 20%
(v/v) ("tampón A"). El homogenado se centrifugó a 105.000
\times g durante una hora. El sobrenadante se trató primero con
sulfato amónico al 38% de saturación con objeto de suprimir los
grandes agregados proteicos así como la forma 26S del proteosoma
(Waxman et al., J. Biol. Chem.
262:2451-2457 (1987)). El sobrenadante restante se
trató a continuación con sulfato amónico al 60% de saturación con
objeto de precipitar selectivamente la forma 19S del proteosoma. Se
resuspendió el precipitado en un pequeño volumen de tampón A. La
fracción de 60% de sulfato amónico resuspendida se sometió a tres
pasos de cromatografía secuenciales: DEAE-Sepharose,
cromatografía de intercambio iónico con Mono Q 10/10, y finalmente
gel filtración en una columna de Superose 6. Después de cada paso de
cromatografía, las fracciones que contenían proteosomas se
identificaron mediante SDS-PAGE, y mediante análisis
de la actividad peptidasa tal como se describe en Hough et
al., J. Biol. Chem. 262:8303-8313 (1987).
Los sustratos de péptidos usados fueron:
N-succinil-ala-ala-phe-MCA,
N-succinil-leu-leu-val-tyr-phe-MCA,
y
t-butoxicarbonil-phe-ser-arg-MCA.
El lisado de células RMA-S que
conteniendo molécula K^{b} de la Clase I vacía ser preparó usando
un procedimiento modificado (Lujnggren et al., Nature
346:476-480 (1990)). En resumen, las células
RMA-S se cultivaron en RPMI 1640 a 26°C durante 8
horas. A continuación se lavaron las células una vez en PBS y se
incubaron de nuevo a 26°C en medio que contenía 0,25 mCi/ml de
L-[^{35}S]metionina y, 25 mCi/ml de
L-[^{35}S]cisteína en RPMI 1640 carente de metionina y
carente de cisteína, y en medio RPMI 1640 normal, en una proporción
de 10:1, durante 16 horas. Se aclararon las células en PBS y se
lisaron tal como se describe más arriba. A continuación se incubó el
lisado conteniendo moléculas K^{b} de la Clase I vacías con
péptidos y/o proteosomas purificados, a 26°C, durante 1 hora, antes
de someterlo a incubación a 30°C durante una hora adicional. A
continuación se sometió esta mezcla a inmunoprecipitación con el
anticuerpo monoclonal Y3, y se analizó mediante
SDS-PAGE.
La carga osmótica de células SC2 y 3T3 con
proteína ovoalbúmina se realizó tal como describen Moore et
al., Cell 54:777-785 (1988). El
procedimiento de ensayo es como sigue. En una placa de 96 pocillos,
se co-cultivaron 1 \times 10^{5} células de
Drosophila (con o sin carga de proteína/péptido) o células
3T3 con 1 \times 10^{5} células del hibridoma B3/CD8T, en 200
\mul de medio RPMI suplementado con suero fetal bovino al 10%.
Después de 24 horas de incubación, se añadieron 100 \mul del
sobrena procedente de estos cultivos a 100 \mul de RPMI que
contenía 5000 células CTLL. Se co-cultivaron las
células durante 24 horas a 37°C cuando se añadieron 1 \muCi de
^{3}H-timidina (Amersham). Después de una
incubación adicional de 15 horas a 37°C, la incorporación de
radiomarcaje en las células CTLL se determinó mediante recuento del
centelleo.
Los ensayos realizados con MHC de ratón también
verificaron que las células de insecto son capaces de cargar péptido
sobre las moléculas de la Clase I. Células expresando tan pocas como
200-500 moléculas del MHC conteniendo un antígeno
determinado pueden ser detectadas por una célula T. Puesto que las
células de Drosophila no acumulan cromo, se usó un ensayo de
presentación de antígeno basado en B3/CD8, un hibridoma de célula T.
B3/CD8 es un hibridoma entre B3, una célula T citotóxica específica
para el péptido de la ovoalbúmina 253-276 presentado
por moléculas H-2K^{b} de la Clase I, y la linea
celular portadora de CD8 y secretora de IL-2 (ver
Carbone et al., ver más arriba, 1989). A partir de la
estimulación antigénica, la B3/CD8 produce IL-2,
mediada mediante incorporación de ^{3}H-timidina
en la linea celular CTLL dependiente de IL-2 (Gillis
et al., Immunol. 120:2027-2029
(1978)). Por tanto, midiendo la cantidad de IL-2
producida, se puede ensayar el reconocimiento de células T.
Con objeto de proporcionar un conjunto
intracelular de proteína ovoalbúmina a partir de la cual pudieran
derivarse péptidos, la ovoalbúmina (Sigma Chem. Co., MO) se cargó
osmóticamente en las células tal como describieron Moore et
al., ver más arriba (1988). Inmediatamente después de cargarlas,
se mezclaron las células con el hibridoma de la célula T. Después de
dos días de incubación, se retiró el medio y se ensayó en busca de
IL-2. La cantidad de IL-2 se
determinó por la capacidad del medio de mantener el crecimiento de
la línea celular CTLL dependiente de IL-2 (Gillis
et al., ver más arriba (1978)), y el crecimiento se
cuantificó mediante la cantidad de timidina radiactiva incorporada
en las células. Puede observarse en la Figura 4 que las células T
respondieron a las células de Drosophila si se añadía al
medio el péptido de ovoalbúmina. Las moléculas del MHC de la Clase I
expresadas sobre la superficie celular de la célula de insecto son
completamente funcionales en que pueden unir péptido si se añade al
medio de cultivo, y pueden presentarlo en el contexto correcto para
que sea reconocido por una célula T.
Para la optimización de las condiciones in
vitro para la generación de células T citotóxicas específicas,
el cultivo de células estimulantes de células de Drosophila
se mantiene preferiblemente en medio libre de suero (por ejemplo,
Excell 400). Las células estimulantes de células de
Drosophila se incuban preferiblemente con > 20 \mug/ml
de péptido. La proporción efectoras:estimulantes (proporción celular
de linfocito:Drosophila) está preferiblemente en el rango de
aproximadamente 30:1 hasta 300:1. El máximo específico de CD8 se
observa generalmente después de cinco días de cultivo. El cultivo de
células diana para ensayos de destrucción (killing assay) se
mantiene preferiblemente en un medio carente de suero.
La actividad citolítica mediada por células se
detectó con ^{51}Cr o ensayo de liberación. El porcentaje de lisis
específica de 10^{4} células diana marcadas con ^{51}Cr en 200
\mul se determinó para varias proporciones de linfocito respecto
células diana, y varias curvas de dosis-respuestas
de cada población mediante la representación de las citotoxicidad
específica frente al log_{10} del número de efectoras viables. Los
valores de liberación espontánea de ^{51}Cr variaron entre el 5% y
el 15% del marcaje total incorporado. El porcentaje de liberación
específica de ^{51}Cr se calculó de acuerdo con la fórmula
siguiente: (ER-MR) (MR-SR) \times
100, en donde ER es la liberación de 51Cr experimental observada, SR
es la liberación espontánea detectada incubando células diana en
medio de cultivo solo, y MR es el máximo de radiactividad liberada a
partir de células diana después de su incubación en 200 \mul de
HCl durante la duración del ensayo.
Los péptidos OVA, NP (gripe) y NP (LcMV) se
usaron como una fuente de péptidos para verificar su capacidad para
generar una respuesta CD8 primaria in vitro. (Ver Figuras 6A
y 6B). Una incubación de cinco días de células de bazo procedentes
de ratones Balb/c inmunizados con C57BL/6, con las respectivas
células de Drosophila expresando el antígeno
H2-K^{b} + antígeno H2-L^{d} +
antígeno, generó efectores que eficientemente lisaron el tumor EL4 y
P815 en presencia de péptidos.
P815 (ATCC T1B 64) (H2-L^{d})
es un mastocitoma procedente de ratones DBA/2. EL4 (ATCC T1B 39) es
un timoma procedente de C57BL/6 (H-2^{b}). EL4 se
transfectó con cADN de OVA en una construcción de plásmido con el
promotor de la \beta-actina humana para derivar la
línea celular EL4-OVA de producción de OVA. Estos
tumores se mantuvieron como cultivos en suspensión estacionarios en
RPMI 1640 suplementado con un 10% de suero fetal bovino FBS (ver
Moore et al., Cell 54:777-785 (1988)).
Jurkat (ATCC CRL 8163) es una linea celular humana que expresa el
HLA B7. Jurkat A2 es una linea celular transfectada producida
transfectando células Jurkat con HLA A2.1, por ejemplo, a través de
procedimientos descritos en la presente invención. (Ver también
Irwin et al., J. Exp. Med.
170:1091-1101 (1989)).
Los péptidos sintéticos pueden sustituirse por
proteínas virales sintetizadas endógenamente durante el
reconocimiento de CD8. La CD8 específica generada pudo reconocer
péptidos sintetizados endógenamente presentados por la Clase I sobre
la superficie de EL4 (transfectada con un ADN de ovoalbúmina). (Ver
Moore et al., Cell 54:777-785 (1988)).
Similarmente, la CD8 generada in vitro contra la D^{d}
cargada con péptido NP de la gripe reconoció células diana EL4
infectadas con la cepa A/PR/8 del virus de la gripe (ver Figura 7).
(Ver Carbone et al., J. Exp. Med.
167:1767-1779 (1988); la cepa A/PR/8/34 está también
disponible a partir de la American Type Culture Collection con el
número de acceso ATCC VR-95).
Para determinar si el reconocimiento específico
del péptido era debido a la actividad de la célula T, estas lineas
se trataron con anti-CD8 (OKT8, ATCC nº CRL 8014) o
anti-CD8 (OKT4, ATCC nº CRL 8002) y/o complemento,
antes de su adición al cultivo de ensayo. Sólo el tratamiento con
anti-CD8 abolió la citotoxicidad.
Estos CD8 específicos se ensayaron con células
3T3/D^{b} y 3T3/K^{b}, producidas mediante transfección de
células BALB 3T3 (ATCC CCL 163) respectivamente con D^{b} o
K^{b}. (Otros cultivos de 3T3 son fácilmente asequibles para su
usó, incluyendo el ATCC CCL 163.2). Preferiblemente, se prepararon
transfectantes estables vía cotransfección de 3T3 mediante
p^{CKU}/K^{b} o p^{CMU}/D^{b} y pSV2neo, y se seleccionaron
con G418 (Ver también Joly y Oldston, más arriba (1991)). La
respuesta de CD8 anti-OVA estuvo restringida por
D^{b} o K^{b}, confirmando que estas actividades muestran la
restricción clásica del MCH de la Clase I.
La capacidad de elicitar CD8 mediante la
estimulación con péptidos permite una técnica relativamente sencilla
con la que estudiar el reconocimiento restringido de la Clase I.
Puesto que las células T son específicas para formas
desnaturalizadas en vez de naturales o antígenos ajenos, los
péptidos representan claramente un medio potencial de vacunación
efectiva.
Los complejos de Clase I-péptido
de célula de Drosophila se fijaron con glutaraldehído al
0,001% y se lavaron a continuación, y se usaron como estimulantes es
co-cultivos de linfocitos. Transcurridos 5 días de
co-cultivo se detectó una actividad citotóxica muy
débil, confirmando que las células de Drosophila vivas (es
decir, no fijadas) son superiores para generar CD8 específicos. La
adición de un 10% de sobrenadante del cultivo de Drosophila a
las células fijadas restablece la generación de CD8 específicos.
(Ver Figuras 8A y B).
Las células cultivadas que expresaban los
antígenos sinérgicos de la Clase I, las cuales ordinariamente no
conseguían activar los CD8 en cultivos primarios, fueron capaces de
generar CD8 específicos después de la adición de sobrenadante del
cultivo de células de Drosophila.
La supresión de células CD4+ y Clase II+ de la
población que responde disminuye la actividad CD8 generada con
péptido cargado sobre células de Drosophila. Por tanto, la
respuestas primarias inducidas por las células de Drosophila
cargadas de péptido parece se dependiente de células CD4'u de la
Clase II.
Usando los procedimientos descubiertos en la
presente invención, es ahora posible matar específicamente células
diana en humanos usando las células CD8 activadas, específicas, de
la presente invención. Esencialmente, la metodología de tratamiento
incluye los siguientes pasos: (1) obtener una muestra de fluido
conteniendo células T procedentes de un individuo a ser tratado; (2)
cargar moléculas del MHC de la Clase I vacías con al menos una
especie de péptido antigénico, en donde el péptido es
sustancialmente homólogo a al menos una porción de un péptido
derivado de la célula diana; (3) mezclar las células T in
vitro con una cantidad de moléculas del MHC de la Clase I
cargadas con péptido suficiente para producir células CD8 activadas;
(4) recolectar las células CD8 activadas del cultivo; y (5)
administrar las células CD8 activadas al individuo a tratar.
Esta metodología ya está mostrando resultados
prometedores en un modelo con ratón. Por ejemplo, en un estudio, se
inyectaron subcutáneamente ratones hembras C57BL/6 (aproximadamente
de 6-8 semanas de edad) con tres millones (3MM) de
células tumorales EL4/OVA justo detrás de las orejas. Las células
tumorales se hicieron tumorigénicas mediante un único pasaje en
ratones C57BL/6. El día de la inoculación subcutánea con células
tumorales EL4/OVA, se inyectaron los ratones con células CD8
estimuladas con Drosophila/K^{b}/OVA, bien cerca de
(proximales a) el sitio de inyección de las células tumorales, o
intravenosamente.
El día 8, se midieron las dimensiones del tumor.
Los cinco ratones control que habían recibido sólo los 3MM de
células tumorales tenían tumores que medían 12 mm \times 12 mm de
tamaño. Se examinaron tres ratones que recibieron células tumorales
y 24MM de células CD8 inyectadas IV; el tamaño de los tumores era
(a) 2 mm \times 2 mm, (b) 5 mm \times 5 mm, y (c) 12 mm \times
12 mm en esos ratones. Se examinaron cinco ratones que recibieron
células tumorales y 24MM de células CD8 cerca del sitio de inyección
del tumor. Los resultados fueron como sigue: (i) tres ratones no
tenían tumores detectables el día 8; (ii) un ratón tenía un tumor
que medía 1 mm \times 1 mm; y (iii) un ratón tenía un tumor que
medía 5 mm \times 5 mm.
En el día, se determinó que los tamaños de los
tumores eran como sigue:
En un experimento subsiguiente, se midió el
volumen de tumores en ratón después de que se aplicaran varios
regímenes. Los ratones se inyectaron con tres millones (3MM) de
células tumorales EL4/OVA tal como se describió más arriba. El día
de las inoculaciones adicionales con células tumorales EL4/OVA, los
ratones se inyectaron previamente con células CD8 estimuladas con
Drosophila/K^{b}/OVA de forma intraperitoneal, subcutánea o
intravenosa, según se describe en la Tabla 2 más abajo. El volumen
del tumor se midió en los días 6, 8, 10, 12 y 20, a continuación de
la inyección. En cada experimento y en el grupo de control se
incluyeron cinco ratones. Los resultados se detallan en la Tabla 2
más abajo.
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Por ejemplo, pueden generarse poblaciones de CD8
específicas para la gripe de acuerdo con las técnicas descubiertas
en la presente invención, y probarse efectivas para proteger
individuos contra la infección de gripe letal. La CD8 reactiva
contra el virus, derivada del cebado con péptido in vitro, es
capaz de proporcionar protección in vivo, y sugiere que la
estimulación primaria de CD8 in vitro puede probarse útil en
el diseño de una variedad de vacunas antivirales y
antiretrovirales.
La inyección de 50 \times 10^{6} células de
Drosophila intraperitonealmente (IP) condujo a la inducción
de CD8 específicas. La detección de este cebado se realizó usando un
análisis de dilución limitada. La frecuencia de las CD8 específicas
para OVA fue de aproximadamente 10^{6} en ratones "ingenuos".
Después de inyectar células de Drosophila recubiertas con
péptido, la frecuencia es aproximadamente 10^{3} (no se muestran
los datos).
La Figura 8 (A y B) ilustra el cebado in
vivo con células de Drosophila transfectadas, en donde
las que responden son esplenocitos de ratón C57BL/6. En 8A, algunas
de las células están fijadas; en 8B, las células de
Drosophila están todas sin fijar.
Para una respuesta de CD8 secundaria, se cebaron
ratones C57BL/6 mediante una inyección IP de células de
Drosophila (5 \times 10^{7}) y se ensayaron
5-15 días después de la inmunización. (Ver Figura
8B). La inducción de CD8 activadas in vivo aparentemente
estimula el rechazo de tumores.
En otro experimento, se inyectaron
subcutáneamente ratones C57BL/6 con 3MM de EL4 OVA. Cinco días más
tarde, los ratones del grupo I recibieron una inyección subcutánea
de 50MM de células de Drosophila (vivas) expresando
K^{b}/OVA; los ratones del grupo II recibieron una inyección
subcutánea de células de Drosophila fijadas expresando
K^{b}/OVA; los ratones del grupo III fueron el gripo control y no
recibieron inyección adicional alguna el día 5. Los resultados del
experimento se ilustran en la Figura 9, la cual muestra que los
ratone del grupo I sobrevivieron durante más tiempo y sobrevivieron
en mayor número.
Las CD8 primarias se indujeron mediante Clase I
cargada con péptido en células de Drosophila y en ratones B6
no cebados. Las CD8 se estimularon una vez in vitro con
células de Drosophila cultivadas durante 36 horas a 22°C,
incubadas con diferentes concentraciones de péptidos OVA. La
cantidad mínima final de péptido es aproximadamente de 20 \mug/ml.
Las efectoras se recolectaron y ensayaron sobre células
RMA-S con 50 \mug de péptidos. Las poblaciones de
CD8 fueron capaces de reconocer RMA-S
OVA-8. (Ver Figuras 6A y B).
En otro experimento, se degradó proteína
ovoalbúmina con la endoproteinasa Glu-C (procedente
de Staph. aureus; Boehringer Mannheim, Indianapolis, IN). La
mezcla se añadió a cultivo de células de Drosophila con MHC
de ratón. Después de aproximadamente 5 días, las células CD8 se
expusieron a las efectoras; un cierto número de células CD8 fueron
capaces de reconocer RMA-S
OVA-8.
Estudios recientes han demostrado que los
péptidos de 9 aminoácidos de longitud están presentes como una
especie menor en las preparaciones de péptidos sintéticos. Aquéllos
más largos de 9 aminoácidos se unen con baja afinidad a la molécula
del MHC de la Clase I H-2K^{b}. Los experimentos
de valoración de péptido mostraron que una concentración 50 veces
inferior de un péptido 9-mero que de un péptido
16-mero es suficiente para la inducción de respuesta
de células T. La misma valoración de péptido se llevó a cabo para la
sensibilización de células diana. Los resultados indican que la
sensibilización de células se consigue con una concentración de
péptido aproximadamente 1000 veces menor que la requerida para la
inducción de una respuesta in vitro.
En este estudio se usaron ratones transgénicos
expresando HLA 2.1, HLA B7 y HLA B27. Los esplenocitos de los
ratones se cultivaron con células de Drosophila que
expresaban el HLA sinérgico (respectivamente, A2.1, B7 y B27). Las
respuestas CD8 específicas se generaron contra tres péptidos del
VIH. (Ver Figuras 10A, B y C).
En estos estudios se usaron ratones C75BL/6
(H2^{b}) y Balbic (H2^{d}) emparentados, así como varios
ratones transgénicos. Los ratones transgénicos incluían los
siguientes. Los ratones transgénicos B7 se produjeron en laboratorio
como sigue. En resumen, se microinyectó un clon
HLA-B7 genómico (incluyendo varios centenares de
pares de bases de las regiones flanqueantes 5' y 3') en embriones de
ratón B6 \times SJL (Scripps Research Institute Transgenic
Facility, La Jolla, CA). La linea transgénica B7 ha sido cruzada de
nuevo con C57BL/6 (H2^{b}) (Scripps Research Institute Transgenic
Facility, La Jolla, CA). Los ratones transgénicos B27 pueden
producirse de acuerdo con procedimientos conocidos; los nuestros se
produjeron inyectando clones genómicos en embriones B6 \times SJL
y cruzándolos de nuevo los mismos con C57BL/6 (Scripps Research
Institute Transgenic Facility, La Jolla, CA). (Ver también
Krimpenfort et al., EMBO J. 6(8):1673 (1987),
para otro procedimiento de generar ratones transgénicos B27). Los
ratones transgénicos de microglobulina \beta2 y los ratones
transgénicos de A2-1 se produjeron de forma similar
usando técnicas conocidas (ver, por ejemplo, Irwin et al.,
J. Exp. Med. 170:1091-1101 (1989)).
Se ensayaron PBL procedentes de donantes
negativos por su capacidad para generar CD8 específicas contra dos
péptidos del VIH. Estos donantes eran HLA A2, HLA B7 o HLA B27.
Después de 5 días de cultivo, pudo detectarse una actividad CD8 muy
intensa en el cultivo contra ambos péptidos del VIH. (Ver Figuras
11A, B y C).
\newpage
Los PBL humanos se aislaron mediante
centrifugación en gradiente de Ficoll-Hypaque
(Pharmacia, Piscataway, NJ). Los linfoblastos de PLB se almacenaron
en nitrógeno líquido después de congelarlos en FBS conteniendo un
10% de DMSO. La viabilidad celular y las funciones de linfocitos se
conservaron.
Las células CD8 específicas para un péptido se
generaron en cultivo primario sinérgico con células de
Drosophila que expresaban el complejo sinérgico de la Clase
I-péptido. Estos cultivos se establecieron con 3
\times 10^{7} células de bazo de ratón, o PBL humanos, que
respondían, y 10^{6} células vivas de Drosophila, en 20 ml
de medio de cultivo RPMI 1640 suplementado con 5 \times 10^{-5}
M de \beta-mercaptoetanol y 5% de FBS, en un
frasco de 25 cm^{2} en vertical, a 37°C en 7% de CO_{2}. Las
células CD8 se recolectaron después de 5 días en cultivo.
En otro experimento, los PBL humanos se
recolectaron y estimularon, a lo largo de un período de 5 días, con
células de Drosophila que expresaban el HLA A2.1 humano y se
cargaron con el péptido POL de VIH. Los PLB estimulados se ensayaron
a continuación en células Jurkat infectadas con VIH. Los resultados
de los experimentos se ilustran en la Figura 12. Los PLB humanos
estimulados in vitro fueron claramente capaces de reconocer
el A2.1 POL sobre células infectadas y de matar dichas células.
Puede establecerse y mantenerse un depósito o
"banco" de lineas celulares de Drosophila, expresando
cada linea celular uno de las 50 a 100 moléculas más comunes de la
Clase I. Los cADN codificando estas proteínas pueden clonarse en
base a variantes del HLA obtenidas a partir de lineas celulares
conteniéndolo -por ejemplo, mediante la reacción en cadena de la
polimerasa (ver Ennis et al., PNAS USA
87:2833-2837 (1990))- e insertarse en el vector
apropiado, tal como un vector de expresión en insecto, para generar
lineas celulares expresando cada variante de HLA. El ensayo de
acuerdo con el protocolo siguiente puede usarse, por ejemplo, para
determinar qué péptidos derivados del virus de elección se unen con
la mejor de las diferentes moléculas de la Clase I. Los diversos
cultivos pueden marcarse apropiadamente o catalogarse para indicar
qué moléculas de la Clase I son las mejores para su uso con
péptidos, alternativamente, pueden establecerse cultivos
transitorios según se necesitara. Tal como se ha discutido en la
presente invención, después de aproximadamente 48 horas de
incubación de un cultivo de células de insecto con un vector, ese
cultivo es aparentemente capaz de expresar moléculas del MHC vacías,
las cuales pueden cargarse con el(los) péptido(s) de
elección para el propósito de activar células CD8.
Después del tipado del HLA, si no hay
disponibles células de Drosophila expresando el HLA
preferido, los cADN codificando el HLA preferido pueden clonarse a
través del uso de la reacción en cadena de la polimerasa. Los
cebadores descubiertos en las sección B.1 anterior (SEC Nº ID 1 a
SEC Nº ID 12) pueden usarse para amplificar los cADN de
HLA-A, -B, -C, -E, -F o -G apropiados en reacciones
separadas, los cuales pueden clonarse a continuación y secuenciarse
según se describe en los procedimientos descubiertos en el Ejemplo
1, SECCIÓN anterior. A continuación se purifica el ADN a partir de
la reacción de la PCR usando un equipo Gene Clean (Bio 101, San
Diego, CA) y se liga directamente en el sitio SmaI de
pRmHa-3. Se aíslan clones individuales, se verifican
las secuencias, y se expresan lineas celulares de Drosophila
estable expresando el HLA establecido. Alternativamente, puede
cultivarse a gran escala una población conjunta de plásmidos
recombinantes, y purificarse el ADN mediante gradientes de cloruro
de cesio. El ADN purificado se usa entonces para transfectar células
de Schneider usando técnicas de precipitación con fosfato cálcico.
Transcurridas 24 horas, se lavó el precipitado se elimina mediante
lavado y se remplaza con medio Schneider reciente que contiene
CuSO_{4} 1 mM. Cuarenta y ocho horas más tarde, la población
general de células transfectadas transitoriamente se usa para la
activación in vitro de CD8 después de su incubación con
péptidos sinérgicos o digeridos de proteasa de proteínas
específicas.
A continuación pueden establecerse lineas
celulares estables expresando el HLA clonado en las células de
Drosophila. Alternativamente, una población de células de
insecto, expresando transitoriamente una población general de
moléculas recombinantes clonadas procedentes de la reacción de la
PCR, pueden usarse para la activación in vitro de CD8.
También es posible activar CD0 de haplotipo
específico in vitro usando células de insecto que expresan
MHC de la Clase I incubadas con péptidos, donde el MHC expresado por
la linea celular no es el elemento expresado in vivo. Esto
proporciona una oportunidad única para proliferar células CD8 que
reconocen un antígeno específico asociado con un MHC particular, el
cual no sería posible in vivo debido a restricciones
alélicas. Por ejemplo, un péptido (NP) procedente de la proteína
nuclear del virus de la gripo está ordinariamente restringido a la
molécula D^{b}; sin embargo, hemos hallado que un péptido tal
puede unirse a la K^{b} (aunque más débilmente que a la D^{b})
y puede generar un grado de estabilidad térmica para la K^{b} (ver
Figura 3). Además, las células de Drosophila expresando
K^{b} preincubadas con el péptido NP, y cocultivadas con
esplenocitos procedentes de un ratón B6, resultan en la activación
in vitro de CD8, las cuales reconocen específicamente las
molécula de K^{b} asociada con el péptido NP. Además, el
experimento recíproco, usando un péptido restringido a K^{b} (OVA)
derivado de la ovoalbúmina, y células de Drosophila
expresando D^{b}, resultó en la proliferación de CD8 que
reconocían específicamente D^{b} conteniendo el péptido OVA. Tales
CD8 son capaces de matar células (EL4 OVA) transfectadas con cADN
codificando la proteína ovoalbúmina, indicando que, in vivo,
algunas moléculas D^{b} son cargadas con el péptido OVA.
Por tanto, este sistema proporciona una
oportunidad única para proliferar CD8 contra antígenos específicos
presentados por una molécula de la Clase I, la cual, in vivo,
no es el elemento de restricción para ese péptido. Aunque suficiente
antígeno es presentado in vivo por dicha Clase I como para
que la célula sea reconocida por la CD8 y destruida, no es bastante
como para proliferar tales CD8 in vivo. Mediante la carga de
moléculas de la Clase I vacías, expresadas por células de
Drosophila, con péptido, somos presumiblemente capaces de
superar la restricción in vivo proporcionando un exceso de
péptido antigénico a la molécula de la Clase I en un entorno no
competitivo, de tal forma que suficiente antígeno es presentado por
la Clase I como para activar las CD8 específicas para que reconozcan
este complejo.
Las células activadas in vitro pueden
suministrarse a pacientes para su terapia in vivo.
Preferiblemente, primero se determina el genotipo (haplotipo) de la
Clase I del individuo. El tipado de tejidos convencional es
apropiado para este propósito, y puede realizarse en el centro de
tratamiento o mediante alguna operación comercial apropiada. Una vez
que se ha(n) determinado el(los) tipo(s) de HLA
del individuo, se discierne la mejor combinación de péptidos y
moléculas de la Clase I apropiadas para el paciente individual, y se
prepararan como se ha mencionado más arriba, y las células de
Drosophila y péptidos apropiados se proporcionan para el
tratamiento del paciente. Las células CD8 (T) en reposo o
precursoras, procedentes de la sangre del paciente, se estimulan a
continuación con el MHC cargado con péptido apropiado producido por
el cultivo de células de Drosophila. Después de su
activación, las células CD8 se reintroducen en el torrente sanguíneo
del paciente, y se continua monitorizando el proceso morboso del
paciente. Los procedimientos para retirar y reintroducir componentes
celulares en el torrente sanguíneo son conocidos en la técnica, e
incluyen procedimientos tales como los ejemplificados en la patente
estadounidense nº 4.844.893 para Honsik et al., y la patente
estadounidense nº 4.609.915 para Rosenberg.
Pueden administrarse tratamientos adicionales,
según fuera necesario, hasta que la enfermedad estuviera
suficientemente resuelta. Protocolos de tratamiento similares son
apropiados para su uso con otros individuos inmunodeprimidos,
incluyendo los pacientes de transplantes, pacientes ancianos, y
similares.
En los pacientes de cáncer se usa un
procedimiento de tratamiento similar al descrito más arriba. No
obstante, en tales pacientes, debería anticiparse que la terapia
convencional para reducir la masa del tumor puede preceder a la
terapia inmune descrita en la presente invención. Por tanto, se
prefiere que las muestra de sangre procedentes de los pacientes
putativos se obtengan y almacenen (por ejemplo, mediante
congelación) antes de comenzar la terapia convencional tal como la
radiación o quimioterapia, las cuales tienden a destruir las células
inmunitarias. Puesto que pocas, si alguna, formas de cáncer surgen
en respuesta directa a una infección viral, los péptidos diana para
el tratamiento se observan menos fácilmente. No obstante, estudios
recientes indican que las mutaciones en los oncogenes ras,
neu y p53 contribuyen al cáncer en tanto como el 50% de todos
los casos de cáncer. Por tanto, los péptidos derivados de estas
regiones mutadas de las moléculas son candidatos principales como
dianas para la presente terapia. Siguiendo los protocolos
descubiertos en la presente invención, puede determinarse y
administrarse la mejor combinación de péptidos y moléculas de la
Clase I para el paciente individual.
Por ejemplo, muchos tumores expresan antígenos
que son reconocidos in vitro por células CD8 derivadas de los
individuos afectados. Tales antígenos, que no se expresan en células
normales, pueden, por tanto, identificarse, así como el tipo HLA que
los presenta a las células CD8, para una inmunoterapia dirigida con
precisión usando los procedimientos de la presente invención. Por
ejemplo, van der Bruggen et al. han descrito un antígeno cuya
expresión está dirigida por un gen específico, antígeno que parece
ser presentado por HLA A1 (Science
254:1643-1647 (1991)). Puesto que se han aislado y
descrito varios antígenos de tumores humanos, ellos devienen buenos
candidatos para las aplicaciones inmunoterapéuticas tal como se
describen en la presente invención.
Puede ser posible administrar las células CD8,
activadas in vitro mediante procedimientos de la presente
invención, conjuntamente con otros inmunogenes. Por ejemplo, puede
administrarse el Imnunogén Multivalente Grande, descubierto en la
patente estadounidense nº 5.045.320, conjuntamente con células CD8
activadas.
También se contempla que citoquinas tales como
la IL2 e IL4, las cuales median la diferenciación y activación de
células T, pueden administrarse, puesto que las citoquinas son
capaces de estimular la respuesta de células T contra células
tumorales in vivo. Se cree que la IL2 juega un papel
principal en el crecimiento y diferenciación de las percursoras de
CTL (CD8) y en la proliferación de CD8. La administración de IL2 a
pacientes con cáncer se asocia frecuentemente con una mejora en la
respuesta anti-tumor, lo que probablemente esté
relacionado con la inducción de células T específicas para el tumor.
No obstante, los mejores efectos terapéuticos de la IL2 pueden
obtenerse mediante administración continua de IL2 local en vez de
sistémica, minimizando por tanto la toxicidad de IL2 y prolongado su
actividad biológica. Por tanto, se sugiere en la presente invención
que uno puede conseguir el suministro local a través de la
transfección de células tumorales con una construcción de gen de la
IL2.
El cADN de la IL2 se construye tal como
describrieron Karasuymaa y Melchers en Eur. J. Immunol.
18:97-104 (1988). La secuencia completa del cADD de
la IL2 se obtuvo como un fragmento XhoI a partir del plásmido
pBMGneo IL2 (ver Karasuymaa y Melchers, más arriba) y se ligó
directamente en el sitio SalI en pRmHa-3. El
plásmido pRmHa-3 recombinante, con el inserto en la
orientación correcta (determinada mediante mapado de restricción con
HindIII), se purificó mediante gradientes de cesio, y se usó para
cotransfectar células Schneider 2 usando la técnica del fosfato
cálcico. (Con este propósito se preparó una mezcla de ADN de
plásmido: 10 \mug de pRmHa-3 conteniendo cADN de
IL2, 6 \mug de cada uno de los plásmidos pRmHa-3
conteniendo cadena pesada de la Clase I, o microglobulina \beta2,
o 2 \mug de AND phshsneo). Se obtuvieron lineas celulares
estables, las cuales son inducibles mediante CuSO_{4}, para
expresar cadena pesada, microglobulina \beta2, e IL2, mediante
cultivo de los transfectantes en medio G418. Estas lineas celulares
estables se recubrieron con péptido y se usaron en el ensayo in
vitro tal como se ha descrito más arriba. Se observa que las
células tumorales transfectadas con IL2 potencian la actividad de
CTL (CD8) contra las células tumorales progenitoras y prescinden de
las función auxiliar de T y CD4 en la inducción de una respuesta
anti-tumor o citotóxica in vivo. Por tanto,
se sugiere en la presente invención el incremento del potencial del
sistema de Drosophila mediante la cotransfección con el gen
de la IL2.
Se pretende que lo precedente sea ilustrativo de
la presente invención, pero no limitante. Pueden efectuarse
numerosas variaciones y modificaciones sin apartarse del verdadero
espíritu y ámbito de la invención.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Peterson, Per A
\hskip4cm Jackson, Michael
\hskip4cm Lenglade-Demoyen,
Pierre
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: ACTIVACIÓN IN VITRO DE CÉLULAS T CITOTÓXICAS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SEQUENCIAS: 36
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: The Scripps Research Institute
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 10666 North Torrey Pines Street
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: La Jolla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAIS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- ZIP: 92037
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMATO LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: Compatible con PC de IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn Release #1.0, Versión #1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: PCT/US93/
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE REGISTRO: 18 de febrero de 1993
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICITUD PREVIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: 07/841.662
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE REGISTRO: 19 de febrero de 1992
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Logan, April
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 33.950
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: SEQ0002P
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: (619) 554-2937
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: (619) 554-6312
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGGC CGTCATGGCG CCC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCACACTT TACAAGCTCT GAG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGCT GGTCATGGCG CCC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGACTCGATG TGAGAGACAC ATC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGCG GGTCATGGCG CCC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCAGGCTT TACAAGCGAT GAG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGCG GGTAGATGCC CTC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTTACAAGC TGTGAGACTC AGA
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGGC GCCCCGAAGC CTC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCACACTT TATTAGCTGT GAG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGGC GCCCCGAACC CTC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCACAATT TACAAGCCGA GAG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 427 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 740 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 60 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCTTGGATCC AGATCTACCA TGTCTCGCTC CGTGGCCTTA GCTGTGCTCG CGCTACTCTC
\hfill60
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGATCCGGAT GGTTACATGT CGCGATCCCA CTTAAC
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGAGCCGTGA CTGACTGAG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCTCGGCAC TGACTGACTC CTAG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCGGATCCAT GGCCGTCATG GCGCCC
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGAATTCTC ATCAGGGCTT CGGCAGCCC
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGATCCTCTC AGACGCCGAG ATGCGGGTCA CGGCGCCC
\hfill38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 52 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCTTGAGCA CTTGTTCTTT TTGCAGAAGC TCAGAATAAA CGCTCAACTT
\hfill50
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Leu Arg Gly Tyr Val Tyr Gln Gly
Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Ser Asn Glu Asn Met Glu Thr Met}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Met Lys Asp Cys Thr Glu Arg Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Arg Trp Ile Ile Leu Gly Leu Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Arg Ile Gly Cys Arg His Ser Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Leu Lys Glu Pro Val His Gly Val}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 32:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Leu Gly Phe Val Phe Thr Leu The
Val}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 34:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 34:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATATGGATCC TCACCATCTC AGGGTGAGGG GC
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 35:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Gly Tyr Val Tyr Gln Gly Leu Lys
Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 36:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Ala Pro Gly Asn Tyr Pro Ala Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<110> The Scripps Research Institute
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Activación in vitro de
células T citotóxicas
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> SJK/FP6048722
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<140> EP 02014141.2
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
2002-06-25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> EP 93906141.2
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
1993-02-18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> US 7/841,662
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
1992-02-19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccaccatggc cgtcatggcg ccc
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggtcacactt tacaagctct gag
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccaccatgct ggtcatggcg ccc
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggactcgatg tgagagacac atc
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccaccatgcg ggtcatggcg ccc
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggtcaggctt tacaagcgat gag
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccaccatgcg ggtagatgcc ctcc
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggttacaagc tgtgagactc aga
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccaccatggc gccccgaagc cte
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggtcacactt tattagctgt gaga
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
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<400> 11
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\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill23
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
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<400> 12
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\hfill23
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 427
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Drosophila melanogaster
\newpage
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<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 740
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Drosophila melanogaster
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 60
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
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<400> 15
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\hfill60
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<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 36
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
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\hfill36
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<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
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<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
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<400> 18
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<210> 19
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<211> 26
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
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<400> 19
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<211> 29
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
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<400> 20
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<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 38
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: cADN de HLA B27 sol
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<400> 21
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\hskip-.1em\dddseqskipggatcctctc agacgccgag atgcgggtca cggcgccc
\hfill38
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 52
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipagcttgagca cttgttcttt ttgcagaagc tcagaataaa cgctcaactt tg
\hfill52
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
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<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
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\sa{Asp Leu Arg Gly Tyr Val Tyr Gln Gly
Leu}
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
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<400> 25
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<211> 14
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
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<400> 26
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\sa{Ser Glu Arg Pro Gln Ala Ser Gly Val Tyr Met
Gly Asn Leu}
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
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<400> 27
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\sa{Asp Ser Ser Gly Val Glu Asn Pro Gly Gly Tyr
Cys Thr Lys}
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\newpage
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\sa{Gln Met Lys Asp Cys Thr Glu Arg Gln}
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
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<400> 29
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\sa{Lys Arg Trp Ile Ile Leu Gly Leu Asn}
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
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<400> 30
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\sa{Phe Arg Ile Gly Cys Arg His Ser Arg}
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<211> 9
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Leu Lys Glu Pro Val His Gly Val}
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\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Leu Gly Phe Val Phe Thr Leu The
Val}
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<210> 33
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<211> 14
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<212> PRT
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Pro Asp Cys Lys Val Met Val His Asp Pro
Ser Leu Ala}
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<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Cebador de ADN
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatatggatcc tcaccatctc agggtgaggg gc
\hfill32
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 35
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Gly Tyr Val Tyr Gln Gly Leu Lys
Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Ala Pro Gly Asn Tyr Pro Ala Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Ile Ile Asn Phe Glu Lys Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Glu Ser Ile Ile Asn Phe Glu Lys Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Glu Ser Ile Ile Asn Phe Glu Lys
Leu}
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Ile Ile Asn Phe Glu Lys Leu Thr}
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Ile Ile Asn Phe Glu Lys Leu Thr
Glu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gly Tyr Val Tyr Gln Gly Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Gly Tyr Val Tyr Gln Gly Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Leu Arg Gly Tyr Val Tyr Gln Gly Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de la Secuencia
Artificial: Péptido Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 45
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ser Asn Glu Asn Met Glu Thr Met}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Peterson, Per A
\hskip4cm Jackson, Michael
\hskip4cm Lenglade-Demoyen,
Pierre
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: ACTIVACIÓN IN VITRO DE CÉLULAS T CITOTÓXICAS
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SEQUENCIAS: 36
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: The Scripps Research Institute
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 10666 North Torrey Pines Street
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: La Jolla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: California
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAIS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- ZIP: 92037
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMATO LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: Compatible con PC de IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- PROGRAMA: PatentIn Release #1.0, Versión #1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: PCT/US93/
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE REGISTRO: 18 de febrero de 1993
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (vii)
- DATOS DE LA SOLICITUD PREVIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: 07/841.662
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE REGISTRO: 19 de febrero de 1992
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Logan, April
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 33.950
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: SEQ0002P
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: (619) 554-2937
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: (619) 554-6312
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGGC CGTCATGGCG CCC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCACACTT TACAAGCTCT GAG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGCT GGTCATGGCG CCC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGACTCGATG TGAGAGACAC ATC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGCG GGTCATGGCG CCC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCAGGCTT TACAAGCGAT GAG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGCG GGTAGATGCC CTC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTTACAAGC TGTGAGACTC AGA
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGGC GCCCCGAAGC CTC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCACACTT TATTAGCTGT GAG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACCATGGC GCCCCGAACC CTC
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGTCACAATT TACAAGCCGA GAG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 427 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 740 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 60 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCTTGGATCC AGATCTACCA TGTCTCGCTC CGTGGCCTTA GCTGTGCTCG CGCTACTCTC
\hfill60
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGATCCGGAT GGTTACATGT CGCGATCCCA CTTAAC
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 19 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGAGCCGTGA CTGACTGAG
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCTCGGCAC TGACTGACTC CTAG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGCGGATCCAT GGCCGTCATG GCGCCC
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 29 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCGGAATTCTC ATCAGGGCTT CGGCAGCCC
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cADN
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGATCCTCTC AGACGCCGAG ATGCGGGTCA CGGCGCCC
\hfill38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 52 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCTTGAGCA CTTGTTCTTT TTGCAGAAGC TCAGAATAAA CGCTCAACTT
\hfill52
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asp Leu Arg Gly Tyr Val Tyr Gln Gly
Leu}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ala Ser Asn Glu Asn Met Glu Thr Met}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 26:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 27:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 28:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Gln Met Lys Asp Cys Thr Glu Arg Gln}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 29:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 29:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Arg Trp Ile Ile Leu Gly Leu Asn}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 30:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Arg Ile Gly Cys Arg His Ser Arg}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 31:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Leu Lys Glu Pro Val His Gly Val}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 32:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 32:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Ile Leu Gly Phe Val Phe Thr Leu The
Val}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 33:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 14 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 33:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 34:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 34:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATATGGATCC TCACCATCTC AGGGTGAGGG GC
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 35:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 10 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 35:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Arg Gly Tyr Val Tyr Gln Gly Leu Lys
Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ. ID. Nº 36:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 9 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: único
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICA: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTI-SENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- TIPO DE FRAGMENTO: interno
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ. ID. Nº: 36:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Phe Ala Pro Gly Asn Tyr Pro Ala Leu}
Claims (12)
1. Procedimiento para producir una célula T
CD8^{+} activada in vitro, comprendiendo el procedimiento
poner en contacto, in vitro, una célula T CD8^{+} con una
molécula del MHC de la Clase I humana cargada con antígeno y
expresada sobre la superficie de una célula de insecto durante un
período de tiempo suficiente para activar, de una manera específica
para el antígeno, la célula T CD8^{+}.
2. Procedimiento de la reivindicación 1, en la
cual el procedimiento comprende además:
- (a)
- separar la célula T CD8^{+} activada de la molécula del MHC de la Clase I humana cargada con antígeno; y
- (b)
- suspender la célula T CD8^{+} activada en un portador o excipiente aceptable.
3. Procedimiento de la reivindicación 1 ó
reivindicación 2, en la cual la célula de insecto es una célula
de
Drosophila.
Drosophila.
4. Procedimiento de la reivindicación 1 ó
reivindicación 2, en la cual la célula de insecto es una célula de
gusano soldado.
5. Procedimiento de la reivindicación 1 ó
reivindicación 2, en la cual la célula de insecto es una célula de
polilla, gusano de seda o de mosquito.
6. Procedimiento de una cualquiera de las
reivindicaciones precedentes, en la cual la célula T CD8^{+}
procede de un humano.
7. Procedimiento de una cualquiera de las
reivindicaciones precedentes, en la cual la célula T CD8^{+}
comprende un gen del MHC de la Clase I humano bajo el control de un
promotor inducible, y un gen expresable de la
\beta-2-microglobulina humana.
8. Procedimiento de la reivindicación 7, en la
cual las moléculas vacías del MHC de la Clase I se expresan sobre la
superficie de la célula de insecto, y la célula de insecto se pone
en contacto con un péptido antígeno.
9. Procedimiento de la reivindicación 7, en la
cual el promotor inducible es un promotor de metalotioneína.
10. Procedimiento de una cualquiera de las
reivindicaciones 7 a 9, en la cual el gen del MHC de la Clase I
humano y el gen de la
\beta-2-microglobulina humana se
transfectan dentro de la línea celular de insecto.
11. Procedimiento de la reivindicación 7, en la
cual el antígeno del MHC de la Clase I humano es B7, B27 ó A2.1.
12. Procedimiento de la reivindicación 8, en la
cual el péptido se deriva de una proteína vírica.
Applications Claiming Priority (2)
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| FR2722207B1 (fr) * | 1994-07-07 | 1996-09-27 | Inst Nat Sante Rech Med | Methode pour generer une population de cellules presentant a leur surface une forte densite d'un pepride exogene specifique associe azx molecules du cmh; population de cellules |
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| IL126843A (en) * | 1996-05-23 | 2007-06-17 | Scripps Research Inst | Mhc class ii antigen-presenting systems and methods for activating cd4+t cells in vitro |
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| US20020164318A1 (en) * | 1997-02-18 | 2002-11-07 | Houghton Alan N. | Cell lines and vectors for stimulation of an immune response to a differentiation antigen stimulated by an altered antigen |
| US20100068263A1 (en) * | 1997-02-18 | 2010-03-18 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Method and Compositions for Stimulation of an Immune Response to TRP2 using a Xenogeneic TRP2 Antigen |
| US8021666B2 (en) * | 1997-02-18 | 2011-09-20 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Method and compositions for stimulation of an immune response to CD20 using a xenogeneic CD20 antigen |
| US20100068262A1 (en) * | 1997-02-18 | 2010-03-18 | Sloan-Kettering Institute For Cancer Research | Method and Compositions for Stimulation of an Immune Response to PSMA using a Xenogeneic PSMA Antigen |
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| US6713250B1 (en) | 1997-08-08 | 2004-03-30 | The Research Foundation Of State University Of New York | Identification of human allergens and T-lymphocyte antigens in vitro |
| JP4789294B2 (ja) * | 1997-08-22 | 2011-10-12 | ソレクサ・インコーポレイテッド | ローリングプライマーを用いたdna伸長および分析 |
| TWI239847B (en) | 1997-12-02 | 2005-09-21 | Elan Pharm Inc | N-terminal fragment of Abeta peptide and an adjuvant for preventing and treating amyloidogenic disease |
| US6153398A (en) * | 1997-12-24 | 2000-11-28 | The University Of Chicago | Method to identify specific inhibitors of IMP dehydrogenase |
| AU755706B2 (en) * | 1998-03-20 | 2002-12-19 | Genzyme Corporation | Methods to provoke anti-cancer immune responses |
| WO1999064597A1 (en) * | 1998-06-10 | 1999-12-16 | The Government Of The United States Of America, Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services | β2 MICROGLOBULIN FUSION PROTEINS AND HIGH AFFINITY VARIANTS |
| US6682741B1 (en) * | 1998-06-10 | 2004-01-27 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | β2 microglobulin fusion proteins and high affinity variants |
| CA2343313A1 (en) * | 1998-09-14 | 2000-03-23 | Lars Ostergaard Pedersen | A method of producing a functional immunoglobulin superfamily protein |
| ES2261197T3 (es) * | 1999-04-16 | 2006-11-16 | Ortho-Mcneil Pharmaceutical, Inc. | Metodo para la deteccion de celulas t especificas de antigeno. |
| JP2003500041A (ja) * | 1999-05-25 | 2003-01-07 | ヒューマン ジノーム サイエンシーズ, インコーポレイテッド | Meth1およびmeth2ポリヌクレオチドおよびポリペプチド |
| UA81216C2 (en) | 1999-06-01 | 2007-12-25 | Prevention and treatment of amyloid disease | |
| US7572631B2 (en) | 2000-02-24 | 2009-08-11 | Invitrogen Corporation | Activation and expansion of T cells |
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| US20070026433A1 (en) | 2001-03-09 | 2007-02-01 | Hildebrand William H | Epitope testing using soluble HLA |
| US20040071671A1 (en) * | 2001-02-20 | 2004-04-15 | Leturcq Didier J. | Cell therapy method for the treatment of tumors |
| ES2306771T3 (es) * | 2001-02-20 | 2008-11-16 | Ortho Mcneil Pharm Inc | Un metodo de terapia celular para tratamiento de tumores. |
| AU2008200524B2 (en) * | 2001-02-20 | 2012-01-12 | Ortho-Mcneil Pharmaceutical, Inc. | A cell therapy method for the treatment of tumors |
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| WO2003057171A2 (en) * | 2002-01-03 | 2003-07-17 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Activation and expansion of t-cells using an engineered multivalent signaling platform |
| US7745140B2 (en) * | 2002-01-03 | 2010-06-29 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Activation and expansion of T-cells using an engineered multivalent signaling platform as a research tool |
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| AU2005250408B2 (en) | 2004-05-27 | 2010-09-23 | The Trustees Of The University Of Pennsylvania | Novel artificial antigen presenting cells and uses therefor |
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| WO2009078799A1 (en) | 2007-12-17 | 2009-06-25 | Marfl Ab | New vaccine for the treatment of mycobacterium related disorders |
| US8467973B2 (en) * | 2009-07-28 | 2013-06-18 | Promising Future, Llc | Pairing processes for preparing alloreactive cytotoxic T cells |
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