ES2273356T3 - Procedimiento para producir l-lisina. - Google Patents

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Abstract

UN ADNC REPLICABLE AUTONOMAMENTE EN CELULAS DE BACTERIA CORINEFORME, COMPRENDIENDO UNA SECUENCIA DE ADN QUE CODIFICA PARA UNA ASPARTOCINASA EN LA CUAL LA INHIBICION POR FEED-BACK CON LLISINA Y L-TREONINA ESTA SUSTANCIALMENTE DESENSIBILIZADA, Y UNA SECUENCIA DE ADN QUE CODIFICA UNA DESCARBOXILASA DIAMINOPIMELATO; UNA BACTERIA CORINEFORME QUE ALBERGA UNA ASPARTOCINASA CUYA INHIBICION POR FEED-BACK CON L-LISINA Y L-TREONINA ESTA SUSTANCIALMENTE DESENSIBILIZADA, Y COMPRENDIENDO UNA SECUENCIA DE ADN MEJORADO QUE CODIFICA UNA DESCARBOXILASA DIAMINOPIMELATO; Y UN METODO PARA LA PRODUCCION DE L-LISINA COMPRENDIENDO LOS PASOS DE CULTIVAR LA BACTERIA CORINEFORME EN UN MEDIO APROPIADO PARA PERMITIR QUE LA L-LISINA SE PRODUZCA Y SE ACUMULE EN UN CULTIVO DE LA BACTERIA, Y LA RECOLECCION DE L-LISINA DEL CULTIVO.

Description

Procedimiento para producir L-lisina.
Antecedentes de la invención
La presente invención se refiere a un procedimiento para la producción de L-lisina mediante el cultivo un microorganismo obtenido mediante la modificación de una bacteria coreneiforme usada para la producción fermentativa de un aminoácido o similar mediante una técnica basada en la ingeniería genética.
La L-Lisina, que se usa como aditivo en el forraje, se produce de forma habitualmente mediante un procedimiento fermentativo que usa una cepa mutante productora de L-lisina que pertenece a las bacterias coreneiformes. Varias de las L-lisina que se conocen en la actualidad están creadas mediante mutaciones artificiales que parten de cepas de tipo salvaje que pertenecen a las bacterias coreneiformes.
Al igual que para las bacterias coreneiformes, se describe un vector de plásmido que se puede replicar de manera autónoma en las células bacterianas, y que tiene un gen marcador de resistencia al fármaco (ver la Patente de los Estados Unidos Nº 4.514.502), y un procedimiento para introducir un gen en células bacterianas (por ejemplo, la Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 2-207791). Se describe igualmente la posibilidad de cultivar bacterias productoras de L-treonina de L-isoleucina usando las técnicas descritas más arriba (ver por ejemplo las Patentes de los Estados Unidos Nº 4.452.890 y 4.442.208). Tal como para el cultivo de una bacteria productora de L-lisina, se conoce una técnica, en la que un gen que participa en la biosíntesis de la L-lisina se incorpora en un vector de plásmido para amplificar el gen en células bacterianas (por ejemplo, la Patente Japonesa abierta a consulta por el público 56-160997).
Entre los genes conocidos para la biosíntesis de la L-lisina se incluyen por ejemplo, un gen de la dihidrodipicolinato reductasa (Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 7-75578) y a un gen de la diaminopimelato dehidrogenasa (Ishino, S. y col., Nucleic Acids Res., 15, 3917 (1987)) en el que se clona un gen que participa en la biosíntesis de la L-lisina, así como el gen de la fosfoenolpiruvato carboxilasa (Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 60-87788), un gen de la dihidropicolinato sintasa (Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 6-55149), y un gen de la diaminopimelato decarboxilasa (Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 60-62994), en la que la amplificación de un gen afecta a la productividad de la L-lisina.
Al igual que para los enzimas que participan en la biosíntesis de la L-lisina, se conoce el caso de un enzima que experimenta inhibición por retroalimentación cuando se usa como tipo salvaje. En este caso, se estimula la productividad de la L-lisina introduciendo el gen de un enzima que tiene una mutación tal que se insensibiliza dicha inhibición por retroalimentación. Entre los conocidos por este tipo de que introducido de forma específica se incluyen, por ejemplo, el gen de la aspartokinasa (Documento de la Publicación Internacional WO 94/25605).
Tal como se ha descrito más arriba, se han obtenido algunos resultados exitosos mediante la amplificación de genes del sistema de la biosíntesis de la L-lisina, o la introducción de genes mutantes. Por ejemplo, una bacteria coreneiforme, que alberga un gen mutante de la aspartokinasa que insensibiliza la inhibición concertada mediante lisina y treonina, produce una cantidad considerable de L-lisina (aproximadamente 25 g/L). Sin embargo esta bacteria experimenta una disminución en su velocidad de crecimiento cuando se compara con una bacteria que alberga un gen no mutante de la aspartokinasa. También se informa de que se mejora la productividad de la L-lisina introduciendo un gen de la dihidropicolinato sintasa además del gen mutante de la aspartokinasa (Applied and Environmental Microbiology, 57(6), 1746-1752 (1991)). Sin embargo, dicha bacteria experimenta una disminución adicional en su velocidad de crecimiento.
No se ha informado de ningún caso en el que se pretenda aumentar el crecimiento mejorando a la vez un gen de la biosíntesis de la L-lisina. En las circunstancias presente, no se conoce ningún caso de bacterias coreneiformes en las que nadie haya tenido éxito en la mejora remarcable del rendimiento de la L-lisina sin restringir el crecimiento, combinando una variedad de genes para la biosíntesis de la L-lisina.
Resumen de la invención
Un objeto de la presente invención es mejorar el rendimiento de la L-lisina sin restringir el crecimiento de una bacteria coreneiforme, por la mejora de una pluralidad de genes para la biosíntesis de la L-lisina en combinación con las bacterias coreneiformes.
Cuando se produce de forma fermentativa una sustancia objetivo mediante el uso de un microorganismo, resultan ser factores extremadamente importantes tanto la velocidad de producción como el rendimiento de la sustancia objetivo respecto del material introducido. Se puede producir una sustancia objetivo de forma remarcablemente barata aumentando la velocidad de producción por unidad de equipo de fermentación. De acuerdo con ello, es extremadamente importante desde el punto de vista industrial que el rendimiento fermentativo y la velocidad de producción sean compatibles entre sí. La presente invención propone una solución para el problema descrito más arriba, con el fin de producir L-lisina por vía fermentativa mediante el uso de una bacteria coreneiforme.
El principio de la presente invención está basado en el hecho de que se puede mejorar el crecimiento de una bacteria coreneiforme, y se puede mejorar la velocidad de producción de la L-lisina mediante la anterior mejorando tanto una secuencia de ADN que codifica una aspartokinasa en la que se ha insensibilizado la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina y L-treonina, como una secuencia de ADN que codifica una diaminopimelato decarboxilasa, en comparación con el caso en la que dichas secuencias de ADN se mejoran de forma individual.
En un primer aspecto, la presente invención, se proporciona un ADN recombinante que se puede replicar de forma autónoma en células de bacterias coreneiformes, que comprende una secuencia de ADN que codifica una aspartokinasa en la que se ha insensibilizado la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina y L-treonina, como una secuencia de ADN que codifica una diaminopimelato decarboxilasa. Se proporciona también un ADN recombinante que incluye de forma adicional una secuencia de ADN que codifica una fosfoenolpiruvato carboxilasa.
En un segundo aspecto de la presente invención, se proporciona una bacteria coreneiforme que alberga una aspartokinasa en la que se ha insensibilizado la inhibición por retroalimentación mediante L-lisina y L-treonina, y que comprende una secuencia de ADN mejorada que codifica una diaminopimelato decarboxilasa. Se proporciona también una bacteria coreneiforme que comprende de forma adicional una secuencia de ADN mejorada que codifica una fosfoenolpiruvato carboxilasa.
En un tercer aspecto de la presente invención, se proporciona un procedimiento para la producción de L-lisina que comprende las etapas de cultivas cualquiera de las bacterias coreneiformes que se han descrito más arriba en el medio adecuado para permitir que la L-lisina se produzca y acumule en el cultivo de la bacteria, y recoger la L-lisina de dicho cultivo.
A partir de ahora en el presente documento, la aspartokinasa se denominará como "AK", un gen que codifica la AK se denominará como "lysC", la AK en la que se ha insensibilizado inhibición por retroalimentación mediante L-lisina y L-treonina, se denominará como "AK mutante", y un gen que codifica la AK mutante se denominará como "lysC mutante", si es necesario También, la diaminopimelato decarboxilasa se denominará como "DDC", un gen que codifica la DDC se denominará como "lysA", la fosfoenolpiruvato carboxilasa se denominará como "PEPC", y un gen que codifica la PEPC se denominará como "ppc", si es necesario.
Las bacterias coreneiformes a las que hace referencia la presente invención son un grupo de microorganismos que se definen en el Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, 8ª ed., p. 599 (1974), que son aerobios Gram-positivos de forma cilíndrica acidorresistentes que no tienen capacidad de formación de esporas. Entre las bacterias coreneiformes se incluyen bacterias que pertenecen al género Corynebacterium, bacterias que pertenecen al género Brevibacterium, que se habían clasificado hasta la fecha en el género Brevibacterium pero que se han unido a las bacterias que pertenecen al género Corynebacterium en la actualidad, y las bacterias que pertenecen al género Brevibacterium muy relacionada a las bacterias que pertenecen al género Corynebacterium.
De acuerdo con la presente invención, se puede mejorar la cantidad de producción y la velocidad de producción de la L-lisina mediante bacterias coreneiformes.
Breve explicación de los dibujos
La Fig. 1 ilustra un procedimiento de construcción de los plásmidos p399AK9B y p399AKYB que comprenden la lysC mutante.
La Fig. 2 ilustra el proceso de construcción de un plásmido p299LYSA que comprende lysA.
La Fig. 3 ilustra el proceso de construcción de un plásmido pLYSAB que comprende lysA y Brevi.-ori.
La Fig. 4 ilustra el proceso de construcción de un plásmido pAKPFds que comprende un gen estructural PEPC.
La Fig. 5 ilustra el proceso de construcción de nuevos vectores de clonación para bacterias coreneiformes, pVK6 y pVK7,
La Fig. 6 ilustra el proceso de construcción de un plásmido pPwm que comprenden un ppc de tipo salvaje y expresión elevada.
La Fig. 7 ilustra el proceso de construcción de un plásmido pCL que comprenden lysC, lysA y Brevi.-ori mutantes.
La Fig. 8 ilustra el proceso de construcción de un plásmido pDPSB que comprende dapA y Brevi.-ori.
La Fig. 9 ilustra el proceso de construcción de un plásmido pDPRB que comprende dapB y Brevi.-ori.
La Fig. 10 ilustra el proceso de construcción de un plásmido pPK4D que comprende ddh y Brevi.-ori.
La Fig. 11 ilustra el proceso de construcción de un plásmido PCRCAB que comprende lysC, dapA y Brevi.-ori.
La Fig. 12 ilustra el proceso de construcción de un plásmido pCB que comprenden lysC, dapB, y Brevi.-ori mutante.
La Fig. 13 ilustra el proceso de construcción de un plásmido pCD que comprenden lysC y ddh mutante.
Descripción detallada de la invención <1> Preparación de los genes para la biosíntesis de la L-lisina usada para la presente invención
Los genes para la biosíntesis de la L-lisina usados en la presente invención se obtienen de forma respectiva preparando ADN cromosómico procedente de una bacteria como donante de ADN, construyendo una biblioteca de ADN cromosómico usando un vector de plásmido, o similar, seleccionando una cepa que alberga un gen deseado, y recuperar, a partir de dicha cepa seleccionada, ADN recombinante en el que se ha insertado el gen. El ADN donante del gen para la biosíntesis de la L-lisina usado en la presente invención no está limitado de manera específica, siempre que el gen deseado para la biosíntesis de la L-lisina exprese una proteína enzimática que funcione en las células de las bacterias coreneiformes. Sin embargo, se prefiere que el ADN donante proceda de una bacteria coreneiforme.
Todos los genes lysC, dapA, y ppc que se originan a partir de bacterias coreneiformes tienen secuencias conocidas. De acuerdo con ello, se pueden obtener llevando a cabo su amplificación de acuerdo con el procedimiento de reacción en cadena de la polimerasa (PCR; ver White, T. J. y col., Trends Genet., 5, 185 (1989)).
Cada uno de los genes para la biosíntesis de la L-lisina usados en la presente invención se puede obtener de acuerdo con algunos procedimientos como los que se ejemplifican a continuación:
(1) Preparación de la lysC mutante
Se puede preparar un fragmento de ADN que contiene la lysC mutante a partir de una cepa mutante en la que se ha insensibilizado de forma sustancial la inhibición sinérgica por retroalimentación mediante L-lisina y L-treonina (Documento Internacional de Publicación WO 94/25605). Dicha cepa mutante se puede obtener, por ejemplo, a partir de un grupo de células originadas a partir de una cepa de tipo salvaje de una bacteria coreneiforme sometida a un tratamiento de mutación aplicando un tratamiento de mutación ordinario tal como irradiación con ultravioleta y tratamiento con un agente mutagénico tal como la N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (NTG). Se puede medir la actividad de AK usando un procedimiento descrito por Miyajima, R. y col. en The Journal of Biochemistry (1968), 63(2), 139-148. El más preferido es aquel en el que una cepa mutante está representada por una bacteria productora de L-lisina AJ3445 (FERM P-1944) derivada mediante un tratamiento de mutación de una cepa de tipo salvaje de la Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869 (que ha cambiado su nombre en la actualidad por el de Corynebacterium glutamicum).
De manera alternativa, se puede obtener también la lysC mutante mediante un tratamiento de mutación in vitro con un ADN de plásmido que contenga la lysC de tipo salvaje. En otro aspecto, se conoce de forma específica la información para insensibilizar la inhibición por retroalimentación sinérgica de la AK mediante L-lisina y L-treonina (Documento Internacional de Publicación of WO 94/25605). De acuerdo con ello, se puede obtener también la lysC mutante mediante a partir de lysC de tipo salvaje sobre la base de la información de acuerdo con, por ejemplo, el procedimiento de mutagénesis dirigida al emplazamiento.
Se puede aislar un fragmento que comprende lysC a partir de una bacteria coreneiforme preparando ADN cromosómico de acuerdo con, por ejemplo, un procedimiento de Saito y Miura (H. Saito y K. Miura, Biochem. Biophys. Actav, 72, 619 (1963)), y amplificar la lysC de acuerdo con el procedimiento de reacción en cadena de la polimerasa (PCR; ver White, T. J. y col., Trends Genet., 5, 185 (1989)).
Los cebadores de ADN se ejemplifican mediante ADN de cadena simple de
23-mer y 21-mer que tienen la secuencia de nucleótidos que se muestra en las SEC. DE ID. NROS.: 1 y 2 del listado de secuencias con el objetivo de amplificar, por ejemplo, una región de aproximadamente 1.643 pb que codifican la lysC basado en una secuencia conocida de Corynebacterium alutamicum (ver Molecular Microbiology (1991), 5(5), 1197-1204; Mol. Gen. Genet. (1990), 224, 317-324). Se puede sintetizar el ADN de acuerdo con un procedimiento ordinario usando un sintetizador de ADN modelo 380B producido por Applied Biosystems y usando el procedimiento de la fosfoamidita (ver Tetrahedron Letters (1981), 22, 1859). Se puede llevar a cabo la PCR ADN Thermal Cycler Model PJ2000 producido por Takara Shuzo, y usando polimerasa Taq ADN de acuerdo con un procedimiento establecido por el suministrador.
Se prefiere que la lysC amplificada mediante PCR se enlace con un vector de ADN que se puede replicar de manera autónoma en células de E. coli y/o bacterias coreneiformes para preparar ADN recombinante, y que el ADN recombinante se introduzca en células de E. coli anteriores. Dicha condición facilita las operaciones posteriores. El vector que se puede replicar de manera autónoma en células de E. coli es de forma preferible un vector de plásmido que de manera preferible se puede replicar de manera autónoma en células de un huésped, entre los que se incluyen por ejemplo pUC19, pUC18, pBR322, pHSG299, pHSG399, pHSG398, y RSF1010.
Cuando un fragmento de ADN que tiene la capacidad de permitir que un plásmido se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes se inserta en dichos vectores, se puede usar como un así llamado vector lanzadera que se puede replicar de manera autónoma tanto en E. coli como en bacterias coreneiformes.
Dicho vector lanzadera incluye lo siguiente: se muestran los microorganismos que albergan cada uno de los vectores con números de acceso en las autoridades internacionales de depósito entre paréntesis:
pHC4: Escherichia coli AJ12617 (FERM PB-3532)
pAJ655: Escherichia coli AJ11882 (FERM PB-136) Corynebacterium glutamicum SR8201 (ATCC 39135)
pAJ1844: Escherichia coli AJ11883 (FERM PB-137) Corynebacterium glutamicum SR8202 (ATCC 39136)
pAJ611: Escherichia coli AJ11884 (FERM PB-138)
pAJ3148: Corynebacterium glutamicum SR8203 (ATCC 39137)
pAJ440: Bacillus subtilis AJ11901 (FERM PB-140)
Estos vectores se puede obtener a partir de los microorganismos depositados como sigue: las células recogidas en la fase de crecimiento logarítmico se lisaron usando lisozima y SDS, seguido de la separación del lisato mediante centrifugación a 30.000 X g para obtener un sobrenadante. Se añadió a este sobrenadante polietilén glicol, seguido por fraccionamiento y purificación mediante una centrifugación en gradiente de densidades en equilibrio de cloruro de cesio - bromuro de etidio.
Se puede transforma la E. coli introduciendo un plásmido de acuerdo con, por ejemplo, un procedimiento de D. M. Morrison (Methods in Enzymology, 68, 326 (1979)) o un procedimiento en el que las células receptoras se tratan con cloruro de calcio para aumentar su permeabilidad al ADN (Mandel, M. y Higa, A., J. Mol. Biol., 53, 159 (1970)).
Se obtiene la lysC de tipo salvaje cuando se aísla la lysC a partir de una cepa de AK de tipo salvaje, a la vez que se obtiene lysC mutante cuando se aísla la lysC a partir de una cepa de AK mutante de acuerdo con el procedimiento que se ha descrito más arriba.
Un ejemplo de una secuencia de nucleótido de un fragmento de ADN que contiene la lysC de tipo salvaje se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 3 en el Listado de Secuencias. La secuencia de aminoácidos de \alpha-subunidades de una proteína AK de tipo salvaje se deduce de la secuencia de nucleótidos, y se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 4 en el Listado de Secuencias junto con la secuencia de ADN. Sólo se muestra la secuencia de aminoácidos en la SEC. DE ID. Nº: 5. Se deduce una secuencia de aminoácidos de \beta-subunidades de una proteína AK de tipo salvaje a partir de la secuencia de nucleótidos del ADN, y se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 6 en el Listado de Secuencias junto con la secuencia de ADN. Sólo se muestra la secuencia de aminoácidos en la SEC. DE ID. Nº: 7. En cada una de las subunidades, se usa GTG como codón de iniciación, y se representa un aminoácido correspondiente por la metionina. Sin embargo, esta representación se refiere a metionina, valina, o formilmetionina.
La lysC mutante usada en la presente invención no se limita de manera específica siempre que codifique una AK en la que se haya insensibilizado la inhibición por retroalimentación sinérgica mediante by L-lisina y L-treonina. Sin embargo, la lysC mutante se ejemplifica mediante una que incluya una mutación en la que un residuo de aminoácido correspondiente al residuo de alanina número 279 que cuenta con un N-terminal se cambie por un residuo de aminoácido diferente a la alanina y diferente a un aminoácido ácido en la \alpha-subunidad, y que un residuo de aminoácido correspondiente al residuo de alanina número 30 que cuenta con un N-terminal se cambie por un residuo de aminoácido diferente a la alanina y diferente a un aminoácido ácido en la \beta-subunidad, de la secuencia de aminoácidos de la AK de tipo salvaje. La secuencia de aminoácidos de la AK de tipo salvaje incluye de forma específica la secuencia de aminoácidos que se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 5 en el Listado de Secuencias como las \alpha-subunidades, y la secuencia de aminoácidos que se muestra en SEC. DE ID. Nº: 7 en el Listado de Secuencias como las \beta-subunidades.
Se prefieren aquellos residuos de aminoácido diferentes a la alanina y diferentes de los aminoácidos ácidos, e incluyen residuos de treonina, arginina, cisteína, fenilalanina, prolina, serina, tirosina, y valina.
El codón correspondiente a un residuo de aminoácido a sustituir no está limitado de forma específica por su tipo, siempre que codifique el residuo de aminoácido. Se prefiere que la secuencia de aminoácidos de la AK de tipo salvaje sea ligeramente diferente dependiendo de la diferencia de especie bacteriana y de cepa bacteriana. Los AK que tienen mutaciones basadas en, por ejemplo, sustitución, delección, o inserción de uno o más residuos de aminoácidos en una o más posiciones irrelevante para la actividad enzimática según se ha descrito más arriba, se pueden usar también para la presente invención. Se puede obtener un ADN que codifique un AK que tenga una mutación espontánea aislando un ADN que se puede hibridar con, por ejemplo, el ADN que tenga parte de la secuencia de nucleótidos que se muestra en SEC. DE ID. Nº: 3 con la condición restrictiva. Por "condición restrictiva" definida en el presente documento se entiende una condición bajo la cual se forma un híbrido específico, y no se forma un híbrido no específico. Es difícil expresar la condición de forma clara con valores numéricos. Sin embargo, la condición se ejemplifica con una condición bajo la cual, los ácidos nucleicos que muestran elevada homología, por ejemplo ADN con una homología de no menos el 90% se hibridaban entre sí, mientras que los ácidos nucleicos que muestran una homología inferior a la señalada no se hibridaban entre sí, o una condición de una temperatura procedente de la temperatura de fusión (Tm) de un híbrido completamente emparejado de (Tm-30)ºC, de manera preferible comprendida entre Tm y (Tm-20)ºC y una concentración de sal correspondiente a 1 X SSC, de manera preferible 0,1 X SSC.
Otros AK, que tienen una mutación artificial basa en por ejemplo, sustitución, delección, o inserción de uno o más residuos de aminoácidos se pueden usar también siempre que no tengan influencia sustancial sobre la actividad de la AK, y sobre insensibilización de la inhibición por retroalimentación sinérgica mediante by L-lisina y L-treonina. Se puede obtener un ADN que codifica la AK que tenga la mutación artificial modificando la secuencia de nucleótidos para la sustitución, delección, o inserción dada en un emplazamiento específico mediante, por ejemplo, mutagénesis específica del emplazamiento. Igualmente, se puede usar una lysC que tenga una mutación mediante tratamiento mutagénico conocido. Entre los tratamientos mutagénicos se incluyen tratamiento in vitro de un ADN que contenga lysC con hidroxialanina o similar, y tratamiento de un microorganismo que albergue un ADN que contenga lysC con un mutágeno tal como irradiación con ultravioleta o un agente mutagénico usado para mutagénesis artificial ordinaria tal como la N-metil-N'-nitro-N-nitrosoguanidina (NTG) o ácido nítrico. Tras el tratamiento mutagénico, se puede determinar el emplazamiento en el que se introduce la mutación o en el que la mutación tiene lugar seleccionando un ADN o un microorganismo que codifique o produzca la AK que tenga la actividad AK y cuya secuencia de aminoácidos se haya mutado a partir del ADN sometido a tratamiento mutagénico o el microorganismo sometido a tratamiento mutagénico. El emplazamiento en el que se produce la mutación no se restringe de manera específica siempre que no ejerza influencia sustancial sobre la actividad de la AK y sobre la insensibilización a la inhibición por retroalimentación sinérgica mediante L-lisina y L-treonina. El número de mutaciones introducidas varía dependiendo del emplazamiento y del tipo de aminoácido mutado en la estructura estérica de una proteína, y no se restringe de manera específica siempre que no ejerza influencia sustancial sobre la actividad de la AK y sobre la insensibilización a la inhibición por retroalimentación sinérgica mediante L-lisina y L-treonina. Este número está normalmente comprendido entre 1 y 20, de manera preferible entre 1 y 10.
Se ha depositado una cepa AJ12691 obtenida mediante introducción un plásmido lysC mutante p399AK9B en una cepa AJ12036 (FERM PB-734) como una cepa de tipo salvaje de Brevibacterium lactofermentum el 10 de abril de 1992 en el National Institute of Bioscience and Human Technology de la Agency of Industrial Science and Technology del Ministry of International Trade and Industry (1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 305 Japón), con el número de acceso FERM P-12918 y se ha transferido a depósito internacional basado en el Tratado de Budapest el 10 de febrero de 1995, y depositada con el número de acceso FERM PB-4999.
(2) Preparación del lysA
Se puede preparar un fragmento de ADN que contiene la lysA a partir del cromosoma de una bacteria coreneiforme mediante PCR. El donante de ADN no se limita de manera específica, sin embargo, se ejemplifica mediante la cepa de Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869.
En las bacterias coreneiformes, el lysA forma un operón junto con el argS (gen de la arginil-ARNt sintasa), y el lysA está aguas abajo del argS. La expresión del lysA está regulado por un promotor que está aguas arriba del argS (ver Journal of Bacteriology, Nov., 7356-7362 (1993)). Las secuencias de ADN de estos genes son conocidas para Corynebacterium alutamicum (ver Molecular Microbiology, 4(11), 1819-1830 (1990); Molecular and General Genetics, 212, 112-119 (1988)), sobre la base de lo cual se pueden preparar cebadores de ADN para PCR. Dichos cebadores de ADN se ejemplifican de forma específica mediante ADN de 23-mers que de manera respectiva tienen la secuencia de nucleótidos que se muestra en SEC. DE ID. Nº: 8 en el Listado de Secuencias (correspondiente a los números de nucleótido del 11 al 33 en una secuencia de nucleótidos descrita en Molecular Microbiology, 4(11), 1819-1830 (1990)) y en la SEC. DE ID. Nº: 9 (correspondiente a los números de nucleótido del 1370 al 1390 en una secuencia de nucleótidos descrita en in Molecular and General Genetics, 212, 112-119 (1988)). La síntesis de ADN, PCR, y la preparación de un plásmido que contiene lysA se pueden llevar a cabo de la misma forma que se ha descrito para el lysC descrito más arriba.
En el ejemplo que se describe más adelante, se usó un fragmento de ADN que contiene un promotor, argS, y lysA con el fin de mejorar lysA. Sin embargo, el argS no es esencial para la presente invención. Se permite el uso de un fragmento de ADN en el que el lysA se enlace justamente corriente abajo del promotor.
Se ejemplifica una secuencia de nucleótidos de un fragmento de ADN que contiene argS, y lysA, y una secuencia de aminoácidos deducida que se debe codificar mediante la secuencia de nucleótidos de la SEC. DE ID. Nº: 10. Un ejemplo de una secuencia de aminoácidos codificada por argS se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 11, y un ejemplo de una secuencia de aminoácidos codificada lysA se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 12. Además de los fragmentos de ADN que codifican estas secuencias de aminoácidos la presente invención puede usar de forma equivalente fragmentos de ADN que codifiquen secuencias de aminoácidos que sean sustancialmente las mismas que las secuencias de aminoácidos que se muestran en la SEC. DE ID. Nº: 12, nominalmente secuencias de aminoácidos que tengan mutaciones basadas en, por ejemplo, sustitución, delección o inserción de uno o más aminoácidos, siempre que no tengan una influencia sustancial sobre la actividad DDC. Se puede obtener un lysA que tenga mutaciones espontáneas o artificiales de la misma manera que el ADN que codifica un AK que tenga una mutación que no ejerza influencia sobre la actividad AL y sobre la insensibilización de la inhibición por retroalimentación sinérgica mediante by L-lisina y L-treonina.
(3) Preparación del ppc
Se puede preparar un fragmento de ADN que contiene la ppc a partir del cromosoma de una bacteria coreneiforme mediante PCR. El donante de ADN no se limita de manera específica, sin embargo, se ejemplifica mediante la cepa de Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869.
Se conocen las secuencias del gen ppc para Corynebacterium glutamicum (ver O'Regan, M. y col., Gene, 77, 237-251 (1989)), sobre la base de lo cual se pueden preparar cebadores de ADN para PCR. Dichos cebadores de ADN se ejemplifican de forma específica mediante ADN de 23-mers que de manera respectiva tienen la secuencia de nucleótidos que se muestra en las SEC. DE ID. NROS 13 y 14 en el Listado de Secuencias. La síntesis de ADN, PCR, y la preparación de un plásmido que contiene lysA se pueden llevar a cabo de la misma forma que se ha descrito para el lysC descrito más arriba.
Se muestra una secuencia de nucleótidos de un fragmento de ADN que contiene la ppc, y una secuencia de aminoácidos deducida para codificar mediante la secuencia de nucleótidos en la SEC. DE ID. Nº: 15, Se muestra únicamente la secuencia de aminoácidos en la SEC. DE ID. Nº: 16.
Además de los fragmentos de ADN que codifican estas secuencias de aminoácidos la presente invención puede usar de forma equivalente fragmentos de ADN que codifiquen secuencias de aminoácidos que sean sustancialmente las mismas que las secuencias de aminoácidos que se muestran en la SEC. DE ID. Nº: 16, nominalmente secuencias de aminoácidos que tengan mutaciones basadas en, por ejemplo, sustitución, delección o inserción de uno o más aminoácidos, siempre que no tengan una influencia sustancial sobre la actividad PEPC. Se puede obtener un ppc que tenga mutaciones espontáneas o artificiales de la misma manera que el ADN que codifica un AK que tenga una mutación que no ejerza influencia sobre la actividad AL y sobre la insensibilización de la inhibición por retroalimentación sinérgica mediante by L-lisina y L-treonina.
El ppc procedente de las bacterias coreneiformes forma un operón junto con gap (gen de la gliceraldehído-3-fosfato dehidrogenasa), pgk (gen de la fosfoglicerato kinasa) y tpi (gen de la triosa fosfato isomerasa), y el ppc se encuentra aguas abajo del tpi. La expresión del ppc se regula mediante un promotor que se encuentra corriente arriba del pgk (ver Schwinde, J. W. y col., J. Bacteriol., 175(12), 3905-3908 (1993)). Por tanto, al igual que el lysA anteriormente mencionado, el ppc se puede amplificar junto con pgk y tpi mediante PCR para usar un fragmento de ADN que contiene pgk, tpi y ppc. Como se muestra en el ejemplo que se describe más adelante, se permite el uso de un fragmento de ADN en el que se enlace un promotor adecuado justo corriente arriba de una región de codificación del PEPC. El promotor incluye un promotor de lysC, promotor tac originado de E. coli, y un promotor trc.
<2> ADN recombinante y bacterias coreneiformes de la presente invención
El ADN recombinante comprende una secuencia de ADN que codifica una aspartokinasa en la que se ha insensibilizado la inhibición por retroalimentación sinérgica mediante L-lisina y L-treonina, y una secuencia de ADN que codifica una diaminopimelato decarboxilasa, y que se puede replicar de manera autónoma en células de bacterias coreneiformes. En una forma de realización preferida, el ADN recombinante comprende de manera adicional una secuencia de ADN que codifica una fosfoenolpiruvato carboxilasa además de las anteriores una secuencias de ADN.
La bacteria coreneiforme de la presente invención hospeda una aspartokinasa (AK mutante) en la que se ha insensibilizado la inhibición por retroalimentación sinérgica mediante by L-lisina y L-treonina, mientras que se ha estimulado el ADN (lysA) que codifica una diaminopimelato decarboxilasa. En una forma de realización preferida, la bacteria coreneiforme de la presente invención es una bacteria coreneiforme cuyo ADN (ppc) que codifica una fosfoenolpiruvato carboxilasa se ha estimulado de manera adicional. El término "mejora" en el presente documento hace referencia al hecho que la actividad intracelular de un enzima codificado por el ADN se aumenta mediante, por ejemplo, incrementar el número de copias de un gen, usando un promotor fuerte, usando un gen que codifica un enzima con una elevada actividad específica, o combinando estos procedimientos.
La bacteria coreneiforme que alberga la AK mutante se puede elegir entre las que producen la aspartokinasa mutante como resultado de una mutación, o las que hayan sido transformadas mediante la introducción de un lysC mutante.
Entre los ejemplos de bacterias coreneiforme usadas para introducir el ADN descrito más arriba incluye, por ejemplo, las siguientes cepas de tipo salvaje productoras de lisina.
Corynebacterium acetoacidophilum ATCC 13870;
Corynebacterium acetoglutamicum ATCC 15806;
Corynebacterium callunae ATCC 15991;
Corynebacterium glutamicum ATCC 13032;
(Brevibacterium divaricatum) ATCC 14020;
(Brevibacterium lactofermentum) ATCC 13869;
(Corynebacterium lilium) ATCC 15990;
(Brevibacterium flavum) ATCC 14067;
Corynebacterium melassecola ATCC 17965;
Brevibacterium saccharolyticum ATCC 14066;
Brevibacterium immariophilum ATCC 14068;
Brevibacterium roseum ATCC 13825;
Brevibacterium thioaenitalis ATCC 19240;
Microbacterium ammoniaphilum ATCC 15354;
Corynebacterium thermoaminoaenes AJ12340 (FERM PB-1539).
Se pueden usar otras aparte de las cepas bacterianas descritas más arriba, las que se pueden usar como huésped incluyen por ejemplo, cepas mutantes que tengan una capacidad productora de L-lisina derivada de las cepas anteriormente mencionadas. Entre dichas cepas artificiales mutantes se incluyen las siguientes: S-(2-aminoetil)-cisteína (a partir de ahora en el presente documento abreviada como "AEC") cepas mutantes resistentes (por ejemplo, Brevibacterium lactofermentum AJ11082 (NRRL B-1147), Publicación de Patente Japonesa con números. 56-1914, 56-1915, 57-14157, 57-14158, 57-30474, 58-10075, 59-4993, 61-35840, 62-24074, 62-36673, 5-11958, 7-112437, y 7-112438); cepas mutantes que requieren para su crecimiento aminoácidos tales como L-homoserina (Publicación de Patente Japonesa con números. 48-28078 y 56-6499); cepas mutantes que presentan resistencia a AEC y requieren aminoácidos tales como L-leucina, L-homoserina, L-prolina, L-serina, L-arginina, L-alanina, y L-valina (Patente de los Estados Unidos con números 3.708.395 y 3.825.472); cepas mutantes productoras de L-lisina que presentan resistencia a DL-\alpha-amino-\varepsilon-caprolactama, \alpha-amino-laurilactama, análogos de aspartato, sulfa fármacos, quinoides, y N-lauroil leucina; cepas mutantes productoras de L-lisina que presentan resistencia a inhibidores de la oxialoacetato decarboxilasa o enzimas del sistema respiratorio (Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº. 50-53588, 50-31093, 52-102498, 53-9394, 53-86089, 55-9783, 55-9759, 56-32995 y 56-39778, y Publicación de Patente Japonesa con números. 53-43591 y 53-1833); cepas mutantes productoras de L-lisina que requieren inositol o ácido acético (Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº. 55-9784 y 56-8692); cepas mutantes productoras de L-lisina que muestran sensibilidad al ácido fluoropirúvico o a temperatura no inferior a 34º C (Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº. 55-9783 y 53-86090); y cepas mutantes productoras que pertenezcan a los géneros Brevibacterium o Corynebacterium que presenten resistencia a etilén glicol y produzcan L-lisina (Patente de los Estados Unidos Nº 4.411.997).
En una forma de realización específica, con el fin de estimular los genes de la biosíntesis de la L-lisina en los huéspedes tal como se ha descrito más arriba, los genes se introducen en el huésped mediante un vector de plásmido, transposoma o vector de fago o similar. Tras la introducción, se espera que se produzca mejora en cierta extensión, incluso usando un vector de bajo tipo de copia. Sin embargo, se prefiere usar un vector de múltiple tipo de copia. Entre dichos vectores se incluyen, los vectores de plásmido, pAJ655, pAJ1844, pAJ611, pAJ3148, y pAJ440 que se describen más arriba. Además, los transposones derivados de bacterias coreneiformes se describen en los Documentos Internacionales de Publicación WO02/02627 y WO93/18151, en la Publicación de Patente Europea Nº 445385, en la Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 6-46867, en Vertes, A. A. y col., Mol. Microbiol., 11, 739-746 (1994), en Bonamy, C., y col., Mol. Microbiol., 14, 571-581 (1994), en Vertes, A. A. y col., Mol. Gen. Genet., 245, 397-405 (1994), en Jagar, W. y col., FEMS Microbiology Letters, 126, 1-6 (1995), en la Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 7-107976, en la Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 7-327680 y similares.
En la presente invención, no es indispensable que se mejore de forma específica el lysC mutante. Se permite el uso de aquellas que tengan una mutación el lysC del ADN cromosómico o en el que se incorpore el lysC mutante en el ADN cromosómico. De manera alternativa, se puede introducir el lysC mutante mediante el uso de un vector de plásmido. Por otra parte, se prefiere mejorar lysA y ppc con el fin de producir L-lisina de manera eficiente.
Cada uno de los genes de lysC, lysA, y ppc se pueden introducir de forma sucesiva en el huésped usando vectores diferentes, de manera respectiva. De manera alternativa, se pueden introducir conjuntamente dos o tres especies de genes usando un vector único. Cuando se usan vectores diferentes, los genes se pueden introducir en cualquier orden, sin embargo, se prefiere el uso de vectores que tengan un mecanismo estable de compartir y alojar en el huésped, y que sean capaces de coexistir entre sí.
Una bacteria coreneiforme que alberga el AK mutante y que comprende además lysA se puede obtener, por ejemplo mediante la introducción en una bacteria coreneiforme huésped, de un ADN recombinante que contiene lysC, lysA y ppc mutantes que se puede replicar de manera autónoma.
Una bacteria coreneiforme que contiene de manera adicional ppc mejorado además de los lysC, lysA mutantes se puede obtener, por ejemplo mediante la introducción en una bacteria coreneiforme huésped, de un ADN recombinante que contiene lysC, lysA y ppc mutantes que se puede replicar de manera autónoma. Igualmente, se puede obtener una bacteria coreneiforme que comprende los mutantes mejorados lysC, lysA y ppc mediante la introducción, en una bacteria coreneiforme que comprende los mutantes mejorados lysC, y lysA un ADN recombinante que contiene un ppc que se puede replicar de manera autónoma en las células de la bacteria coreneiforme.
Los ADN recombinantes mencionados mas arriba se pueden obtener, por ejemplo, insertando cada uno de los genes que participan en la biosíntesis de la L-lisina en un vector tales como un vector de plásmido, transposoma o vector de fago, como se ha descrito más arriba.
En el caso de que se use un plásmido como vector, el ADN recombinante se puede introducir en el huésped de acuerdo con el procedimiento del pulso eléctrico (Sugimoto y col., Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 2-207791). Se puede llevar a cabo la amplificación del gen usando transposomas mediante la introducción de un plásmido que trasporta un transposoma al interior de la célula huésped, e induciendo la transposición del transposoma.
<3> Procedimiento para la producción de L-lisina
Se puede producir L-Lisina de manera eficiente mediante el cultivo, en un medio apropiado de una bacteria coreneiforme que comprende los genes mejorados de la biosíntesis de la L-lisina que se describen más arriba, para permitir que se produzca y acumule la L-lisina en el cultivo de la bacteria, y recoger la L-lisina del cultivo.
El medio a usar se ejemplifica mediante un medio ordinario que contiene una fuente de carbono, una fuente nitrógeno, iones inorgánicos, y de manera opcional otros componentes orgánicos
Como fuente de carbono, es posible utilizar azúcares tales como glucosa, fructosa, sacarosa, melazas, y almidón hidrolizado; y ácidos orgánicos tales como ácido fumárico, ácido cítrico, y ácido succínico.
Como fuente de nitrógeno, es posible utilizar sales de amonio inorgánico tales como sulfato de amonio, cloruro de amonio, y de amonio fosfato; nitrógeno orgánico tales como hidrolizado de soja; amoniaco gas; y amoniaco acuoso.
Como nutrientes orgánicos traza, es deseable contener sustancias necesarias tales como vitamina B_{1}, y L-homoserina o extracto de levadura o similar, en cantidades apropiadas. Además de los anteriores, si es necesario se pueden añadir pequeñas cantidades de fosfato de potasio, sulfato de magnesio, ion hierro e ion manganeso.
Es preferible llevar a cabo los cultivos en condiciones aerobias durante aproximadamente 30 a 90 horas. La temperatura de cultivo se controla de manera preferible entre 25º C y 37º C, y el pH se controla de manera preferible entre 5 y 8 durante el cultivo. Para el ajuste del pH se pueden usar sustancias inorgánicas u orgánicas, ácidas o alcalinas, o amoniaco gaseoso. Se puede recoger la L-lisina de los cultivos combinando un procedimiento ordinario de resina de intercambio iónico, un procedimiento de precipitación, y otros procedimientos conocidos.
Ejemplos
La presente invención se explicará de forma más específica con referencia a los Ejemplos.
Ejemplo 1 Preparación del gen lysC de tipo salvaje y el gene lysC mutante procedentes de Brevibacterium lactofermentum <1> Preparación de los lysC de tipo salvaje y mutante, y preparación de los plásmidos que los contienen
Una cepa de Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869, y una cepa mutante productora de L-lisina AJ3445 (FERM P-1944) obtenida a partir de la cepa ATCC 13869 mediante un tratamiento de mutación se usaron como donantes de ADN cromosómico. Se sometió la cepa AJ3445 a mutación de forma que se cambió el lysC para implicar insensibilización de la inhibición por retroalimentación sinérgica mediante L-lisina y L-treonina (Journal of Biochemistry, 68, 701-710 (1970)).
Se amplificó un fragmento de ADN que contiene la lysC a partir de ADN cromosómico de acuerdo con el procedimiento de la reacción en cadena de la polimerasa; ver White, T. J. y col., Trends Genet., 5, 185 (1989)). Al igual que para los cebadores de ADN usados para la amplificación, se sintetizaron ADN de cadena única de 23-mer y 21-mer que tienen la secuencia de nucleótidos que se muestra en SEC. DE ID. NROS.: 1 y 2 con el fin de amplificar una región de aproximadamente 1.643 pb que codifican el lysC sobre la base de una secuencia conocida del Corynebacterium glutamicum (ver Molecular Microbiology (1991), 5(5), 1197-1204; y Mol. Gen. Genet. (1990), 224, 317-324). Se sintetizó el ADN de acuerdo con un procedimiento ordinario usando un sintetizador de ADN modelo 380B producido por Applied Biosystems y usando el procedimiento de la fosfoamidita (ver Tetrahedron Letters (1981), 22, 1859).
El gen se amplificó por PCR usando un ADN Thermal Cycler Model PJ2000 producido por Takara Shuzo, y usando polimerasa Taq DNA de acuerdo con un procedimiento diseñado por el fabricante. Se confirmó mediante electroforesis en gen de agarosa el fragmento de gen amplificado de 1.643 pd. Tras de eso, el fragmento retirado del gel se purificó de acuerdo con un procedimiento ordinario, y se digirió con los enzimas de restricción NruI (producido por Takara Shuzo) y EcoRI (producido por Takara Shuzo).
Se usó el pHSG399 (ver Takeshita, S. y col., Gene (1987), 61, 63-74) como vector de clonación para el fragmento de gen. El pHSG399 se digirió con los enzimas de restricción SmaI (producido por Takara Shuzo) y EcoRI, y se usó unido con el fragmento amplificado de lysC. Se enlazó el ADN usando un kit de enlace de ADN (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado. Una vez preparados los plásmidos, en los que los fragmentos de lysC amplificados de cromosomas procedentes de Brevibacterium lactofermentum se ligaron con pHSG399, respectivamente. El plásmido que comprendía lysC procedente de ATCC 13869 (cepa de tipo salvaje) se designó como p399AKI, y el plásmido que comprendía lysC procedente de AJ3463 (bacteria productora de L-lisina) se designó como p399AK9.
Un fragmento de ADN (denominado a partir de ahora en el presente documento como "Brevi.-ori") que tiene la capacidad de fabricar un plásmido que se puede replicar de manera autónoma en una bacteria que pertenece al género Corynebacterium se introdujo en p399AKI y p399AK9 de forma respectiva para preparar plásmidos que contienen lysC que se puede replicar de manera autónoma en bacterias que pertenecen al género Corynebacterium. Se preparó Brevi.-ori a partir de un vector de plásmido pHK4 que contiene la Brevi.-ori y que se puede replicar de manera autónoma en células tanto de Escherichia coli como pertenecientes al género Corynebacterium. Se preparó el pHK4 digiriendo el pHC4 con KpnI (producido por Takara Shuzo) y BamHI (producido por Takara Shuzo), extrayendo un fragmento Brevi.-ori y ligándolo con pHSG298 que se había digerido también con KpnI y BamHI (ver Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 5-7491). El pHK4 proporciona resistencia a la kanamicina a un huésped. La Escherichia coli que alberga pHK4 se denominó como Escherichia coli AJ13136, y se depositó el 1 de agosto de 1995 en el National Institute of Bioscience and Human Technology de la Agency of Industrial Science and Technology del Ministry of International Trade and Industry (1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 305 Japón) bajo el número de acceso FERM PB-5186.
El pHK4 se digirió con los enzimas de restricción KpnI y BamHI, y se enromaron los extremos rotos. La formación de los extremos enromados se llevó a cabo usando un ADN Blunting kit (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado. Tras la formación de los extremos romos, se ligó un enlazante BamHI (producido por Takara Shuzo) para hacer una modificación tal que el fragmento de ADN correspondiente a la porción Brevi.-ori se pudiera cortar del pHK4 mediante digestión con únicamente BamHI. Se digirió este plásmido con BamHI, de forma respectiva, y el fragmento generado Brevi.-ori ADN se ligó con p399AKI y p399AK9 que se habían digerido también con BamHI de forma respectiva para preparar plásmidos, que contuviera cada uno el gen lysC que se puede replicar de manera autónoma bacterias que pertenecen al género Corynebacterium.
El plásmido que contiene el gen de lysC de tipo salvaje originado en p399AKI se denominó como p399AKYB, y el plásmido que contiene el gen de lysC mutante originado en p399AK9 se denominó como p399AK9B. El procedimiento de construcción de p399AK9B y p399AKYB se muestra en la Fig. 1. Una cepa de AJ12691 obtenida por introducción del plásmido p399AK9B con lysC mutante en una cepa de Brevibacterium lactofermentum (AJ12036 cepa, FERM PB-734) de tipo salvaje se depositó el 10 de abril de 1992 en el National Institute of Bioscience and Human Technology de la Agency of Industrial Science y Technology del Ministry of International Trade y Industry (1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 305 Japón), bajo el número de acceso FERM P-12918, y transferido a un depósito internacional basado en el Tratado de Budapest, y depositada bajo el número de acceso FERM
PB-4999.
<2> Determinación de las secuencias de nucleótidos del lysC de tipo salvaje y del lysC mutante procedente de Brevibacterium lactofermentum
El plásmido p399AKI que contiene la lysC de tipo salvaje y el plásmido p399AK9 que contiene el lysC mutante se prepararon a partir de sus transformantes respectivos para determinar las secuencias de nucleótidos de los lysC de tipo salvaje y mutante. Se llevó a cabo la determinación de las secuencias de nucleótidos mediante un procedimiento de Sanger y col. (por ejemplo, F. Sanger y col., Proc. Natl. Acad. Sci., 74, 5463 (1977)).
La secuencia de nucleótidos del lysC de tipo salvaje codificado por el p399AKI se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 3 en el Listado de Secuencias. Por otra parte, la secuencia de nucleótidos del lysC mutante codificado por el p399AK9 tiene únicamente la mutación de un nucleótido tal como que el 1051º G se cambió por A en la SEC. DE ID. Nº: 3 cuando se compara con el lysC de tipo salvaje. Se sabe que el lysC de Corynebacterium glutamicum tiene dos subunidades (\alpha, \beta) codificadas en un marco de lectura idéntico sobre una hebra de ADN idéntica (ver Kalinowski, J. y col., Molecular Microbiology (1991) 5(5), 1197-1204). Juzgando a partir de la homología, se asume que el gen secuenciado en el presente documento también tiene dos subunidades (\alpha, \beta) codificadas en un marco de lectura idéntico sobre una hebra de ADN idéntica.
Una secuencia de aminoácidos de la \alpha-subunidad de la proteína AK de tipo salvaje deducida procedente de las secuencia de nucleótidos de ADN se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 4 junto con la secuencia de ADN. Solo se muestra la secuencia de aminoácidos en la SEC. DE ID. Nº: 5. Una secuencia de aminoácidos de la \beta-subunidad de la proteína AK de tipo salvaje deducida procedente de la secuencia de nucleótidos del ADN se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 6 junto con la secuencia de ADN. Sólo se muestra la secuencia de aminoácidos en la SEC. DE ID. Nº: 7. En cada una de las unidades, se usa GTG como codón de iniciación, y el correspondiente aminoácido se representa por la metionina. Sin embargo, esta representación hace referencia a metionina, valina, o formilmetionina.
Por otra parte, la mutación en la secuencia del lysC mutante significa la incidencia de la sustitución de residuos de aminoácido tales como que el residuo número 279 de alanina de de la \alpha-subunidad se cambia por un residuo de treonina, y que el residuo número 30 de la alanina de la \beta-subunidad se cambia por un residuo de treonina en la secuencia de aminoácidos de la proteína de tipo salvaje AK (SEC. DE ID. NROS.: 5, 7).
Ejemplo 2 Preparación del lysA a partir de Brevibacterium lactofermentum <1> Preparación del lysA y construcción de plásmido que contiene la lysA
Una cepa de tipo salvaje de Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869 se usó como donante ADN cromosómico. Se preparó ADN cromosómico procedente de las cepa ATCC 13869 de acuerdo con un procedimiento ordinario. Un fragmento de ADN que contiene la argS, lysA, y un promotor de un operón que los contiene se amplificó a partir del ADN cromosómico de acuerdo con PCR. Al igual que con los cebadores de ADN usados para la amplificación, se usó ADN sintético de 23-mers con la secuencia de nucleótidos que se muestra en SEC. DE ID. NROS.: 8 y 9 en el Listado de Secuencias, de forma respectiva con el fin de amplificar una región de aproximadamente 3,6 kb que codifica la arginil-ARNt sintasa y DDC sobre la base de una secuencia conocida de Corynebacterium glutamicum (ver Molecular Microbioloby, 4(11), 1819-1830 (1990); Molecular and General Genetics, 212, 112-119 (1988)). Se llevó a cabo la síntesis del ADN y la PCR de la misma forma que se ha descrito en Ejemplo 1. El pHSG399 se usó como vector de clonación para el fragmento amplificado del gen de 3.579 pb. El pHSG399 se digirió con un enzima de restricción SmaI (producido por Takara Shuzo), y se ligó con el fragmento de ADN que contiene la lysA amplificada. Se obtuvo un plásmido tal como se ha descrito más arriba, que tenía un lysA originado a partir de ATCC 13869, y que se designó como p399LYSA.
Se extrajo un fragmento de ADN que contiene la lysA digiriendo el p399LYSA con KpnI (producido por Takara Shuzo) y BamHI (producido por Takara Shuzo). Este fragmento de ADN se ligó con pHSG299 que se había digerido con KpnI y BamHI. El plásmido obtenido se designo como p299LYSA. El proceso de construcción del p299LYSA se muestra en la Fig. 2.
Se introdujo Brevi.-ori en el p299LYSA obtenido para construir un plásmido que transportaba la lysA que se puede replicar de manera autónoma en las bacterias coreneiformes. El pHK4 se digirió con los enzimas de restricción KpnI y BamHI, y los extremos romos se enromaron. Se llevó a cabo la formación de los extremos romos mediante un ADN Blunting kit (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado. Tras la formación de los extremos romos, se ligó un enlazante KpnI fosforilado para hacer una modificación de tal manera que el fragmento de ADN correspondiente a la porción Brevi.-ori se pudiera extraer del pHK4 mediante digestión únicamente con KpnI. Este plásmido se digirió con KpnI, y el fragmento de Brevi.-ori ADN generado se ligó con p299LYSA que se había digerido también con KpnI para preparar un plásmido que contiene la lysA que se puede replicar de manera autónoma en las bacterias coreneiformes. El plásmido preparado se denominó pLYSAB. El procedimiento de construcción del pLYSAB se muestra en la Fig. 3.
<2> Determinación de la secuencia de nucleótidos del lysA procedente de Brevibacterium lactofermentum
Se preparó el plásmido de p299LYSA, y se determinó su secuencia de nucleótidos de la misma forma que se ha descrito en Ejemplo 1. Una secuencia de nucleótidos deducida y una secuencia de aminoácidos que se deduce que es codificada por la secuencia de nucleótidos se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 10. Respecto de la secuencia de aminoácidos, una secuencia de nucleótidos codificada por argS y una secuencia de aminoácidos codificada por lysA se muestran en la SEC. DE ID. NROS.: 11 y 12, de forma respectiva.
Ejemplo 3 Preparación del ppc a partir de Brevibacterium lactofermentum <1> Preparación del ppc
Una cepa de tipo salvaje de Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869 se usó como donante de ADN cromosómico. El ADN cromosómico se preparó a partir de las cepas ATCC 13869 de acuerdo con un procedimiento ordinario. Se amplificó un fragmento de ADN que contiene la ppc a partir de los ADN cromosómico de acuerdo con PCR. Al igual que con los cebadores de ADN usados para la amplificación, se usaron ADN sintéticos de 23-mers con la secuencia de nucleótidos que se muestra en SEC. DE ID. NROS.: 13 y 14 en el Listado de Secuencias, de forma respectiva, con el fin de amplificar una región de aproximadamente 3,3 kb que codifica el PEPC sobre la base de una secuencia conocida de Corynebacterium glutamicum (ver O'Regan, M. y col., Gene, 77, 237-251 (1989)). La síntesis del ADN y la PCR se llevaron a cabo de la misma forma que se ha descrito en Ejemplo 1.
\newpage
Un fragmento de gen amplificado de aproximadamente 3.300 pb se confirmó mediante electroforesis en gel de agarosa, y a continuación, el fragmento extraído del gel se purifico mediante una un procedimiento ordinario y se digirió con el enzima de restricción SalI (producido por Takara Shuzo). El pHSG399 se usó como el vector de clonación para ppc. El pHSG399 se digirió con el enzima de restricción SalI (producido por Takara Shuzo), y se ligó con el fragmento de ADN que contiene el ppc amplificado. Se obtuvo un plásmido como se ha descrito más arriba, que tiene un ppc originado en ATCC 13869, y que se designó como pPCF.
<2> Ligadura del gen de ppc con el promotor de lysC
El pPCF obtenido tal como se ha descrito más arriba se digirió con el enzima de restricción DraI (producido por Takara Shuzo). Tras eliminar un fragmento de ADN de aproximadamente 150 pb corriente arriba del gen estructural de PEPC, se llevó a cabo el autoenlazado para obtener el plásmido pPCFds. El pPCFds se digirió con el enzima de restricción SalI (producido por Takara Shuzo), y los extremos romos se enromaron. Se llevó a cabo la formación de los extre-
mos romos mediante un ADN Blunting kit (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado.
El p399AKYB que contiene el lysC de tipo salvaje que se obtiene en el Ejemplo 1 se digirió con los enzimas de restricción ApaLI y PstI (ambos producidos por Takara Shuzo), y los extremos rotos se enromaron de la misma forma que anteriormente. Un fragmento más pequeño entre los dos fragmentos de ADN obtenidos contienen Brevi.-ori y un promotor de lysC. Estos fragmentos se ligaron con el fragmento anteriormente mencionado obtenido mediante digestión del pPCFds con SalI y los extremos se enromaron mediante un ADN Ligation kit (producido por Takara Shuzo).
Se introdujo ADN en solución de enlace en la Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869 de acuerdo con el procedimiento del pulso eléctrico (Sugimoto y col., Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 2-207791). Se seleccionaron los transformantes en un medio completo que contenía 5 \mug/ml de cloranfenicol. Se recogió el plásmido de ADN a partir de los transformantes, y se digirieron con EcoRI para obtener un plásmido en el que el promotor de lysC se ligó con el gen estructural de ppc en una orientación normal. Se denominó el plásmido obtenido como pAKPFds. El procedimiento de construcción del pAKPFds se muestra en la Fig. 4. El ppc ligado con el promotor lysC se denomina a partir de ahora en el presente documento como "ppc de tipo salvaje y elevada expresión".
<3> Inserción del ppc de tipo salvaje y elevada expresión en el vector
El ppc de tipo salvaje y elevada expresión obtenido más arriba se amplificó mediante PCR para insertarlo en un vector que tiene un origen de replicación que se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes diferente a Brevi.-ori. Al igual que con los cebadores de ADN, un oligonucleótido que se corresponde con la porción del promotor del lysC (SEC. DE ID. Nº: 7), que se había sintetizado sobre la base de una secuencia de lysC conocida para Corynebacterium glutamicum (ver Molecular Microbiology, 5(5), 1197-1204 (1991); Mol. Gen. Genet., 224, 317-324 (1990)), y un oligonucleótido que se corresponde con la porción ppc (SEC. DE ID. Nº: 8), que se había sintetizado sobre la base de una secuencia de ppc conocida para Corynebacterium glutamicum (ver O'Regan, M. y col., Gene, 77, 237-251 (1989)). Se diseñaron estos cebadores de forma que un fragmento de aproximadamente 3.150 pb que contiene el ppc de tipo salvaje y elevada expresión se pudiera amplificar, y que una porción terminar del fragmento de ADN amplificado se pudiera digerir mediante el enzima de restricción KpnI. La síntesis de ADN y la PCR se llevaron a cabo de la misma forma que se ha descrito en Ejemplo 1.
Un vector de clonación para bacterias coreneiformes, pVK7, que se había construido de nuevo, se usó como vector para la introducción del ppc de tipo salvaje y elevada expresión en las bacterias coreneiformes. Se construyó el pVK7 enlazando el pHSG299, un vector de E. coli (Km^{r}; Takeshita, S. y col., Gene, 61, 63-74 (1987)) con pAM330, un plásmido críptico de Brevibacterium lactofermentum tal como se describe más adelante. El pHSG299 se digirió con un enzima de restricción dando como resultado un emplazamiento de rotura, AvaII (producido por Takara Shuzo), se enromó mediante T4 ADN polimerasa, y se ligó con pAM330 que se había digerido con HindIII (producido por Takara Shuzo) y enromado mediante T4 ADN polimerasa. Dependiendo de la orientación del pAM330 insertado en pHSG299, los dos plásmidos obtenidos se designaron como pVK6 y pVK7, y se usó el pVK7 en los siguientes experimentos. El pVK7 se puede replicar de manera autónoma tanto en E. coli como en Brevibacterium lactofermentum y tiene múltiples emplazamientos de clonación que se originan a partir de pHSG299 y lacZ'. El procedimiento de construcción de los pVK6 y pVK7 se muestra en la Fig. 5.
Un fragmento de gen amplificado de aproximadamente 3.150 pb se confirmó mediante electroforesis en gel de agarosa, ay a continuación, el fragmento extraído del gel se purificó mediante un procedimiento ordinario y se digirió con el enzima de restricción KpnI (producido por Takara Shuzo). El fragmento de ADN se ligó con pVK7 que se había digerido con el enzima de restricción KpnI. El plásmido preparado se designó como pPwm. El procedimiento de construcción del pPwm se muestra en la Fig. 6.
Ejemplo 4 Preparación del plásmido que comprende la combinación de los mutantes lysC y lysA
Un plásmido que contiene los mutantes lysC, lysA, y un origen de replicación para bacterias coreneiformes se preparó a partir del plásmido p399AK9B que contiene los mutantes lysC y Brevi.-ori y el plásmido p299LYSA que contiene el lysA. El p299LYSA se digirió con los enzimas de restricción BamHI y KpnI (ambos producidos por Takara Shuzo) y los extremos se enromaron. Se llevó a cabo la formación de los extremos romos mediante un ADN Blunting kit (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado. El fragmento de ADN obtenido se ligó con p399AK9B que se había digerido con SalI y los extremos se enromaron. Así, se preparó un plásmido que contenía los mutantes lysC y lysA que se puede replicar de manera autónoma bacterias coreneiformes, y se designó como pCL. El procedimiento de construcción del pCL se muestra en la Fig. 7.
Ejemplo comparativo 1
Preparación del dapA, dapB y ddh a partir de Brevibacterium lactofermentum
Se obtuvieron como sigue los genes asociados con la biosíntesis de la L-lisina diferentes a lysC, lysA y ppc: dapA (gen de la dihidropicolinato sintasa), dapB (gen de la dihidropicolinato reductasa) y ddh (gen de la diaminopimelato dehidrogenasa).
<1> Preparación del dapA y construcción del plásmido que contiene la dapA
Se usó una cepa de Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869 de tipo salvaje como donante de ADN cromosómico. El ADN cromosómico se preparó a partir de la ATCC cepa 13869 de acuerdo con un procedimiento ordinario. Se amplificó un fragmento de ADN que contiene la dapA a partir del ADN cromosómico de acuerdo con PCR. Al igual que con los cebadores de ADN usados para amplificación, se sintetizaron ADN' de 23-mers con la secuencia de nucleótidos que se muestra en las SEC. DE ID. NROS.: 21 y 22 en el Listado de Secuencias, de forma respectiva, con el fin de amplificar una región de aproximadamente 1,5 kb que codifica el DDPS sobre la base de una secuencia conocida de Corynebacterium glutamicum (ver Nucleic Acids Research, 18(21), 6421 (1990); Nº de acceso EMBL Nº X53993). La síntesis de ADN y la PCR se llevaron a cabo de la misma forma que se ha descrito en Ejemplo 1. El pCR1000 (producido por Invitrogen, ver Bio/Technology, 9, 657-663 (1991)) se usó como vector de clonación para el fragmento de gen amplificado de 1.411 pb, y se ligó con el fragmento dapA amplificado. Se llevó a cabo el enlace con el ADN mediante el kit de enlace de ADN l (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado. Así, se construyó un plásmido en el que el fragmento dapA de 1.411 pb amplificado a partir del cromosoma de Brevibacterium lactofermentum se ligó con pCR1000. El plásmido, que se obtiene tal como se describe más arriba, que contenía dapA originado a partir de ATCC 13869, se denominó como pCRDAPA.
Una cepa transformante AJ13106 obtenida mediante introducción de PCRDAPA en la cepa E. coli JM109 está depositada de forma internacional desde el 26 de mayo de 1995 en el National Institute of Bioscience and Human Technology de la Agency of Industrial Science and Technology del Ministry of International Trade and Industry (1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 305 Japón) basado en el Tratado de Budapest bajo el número de acceso FERM PB-5113.
Se introdujo Brevi.-ori en el pCRDAPA preparado para construir un plásmido que transportaba dapA que se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes. El pHK4 se digirió con los enzimas de restricción KpnI y BamHI (producido por Takara Shuzo), y se enromaron los extremos rotos. Se llevó a cabo la formación de los extremos romos mediante un ADN Blunting kit (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado. Tras la formación de los extremos enromados, se ligó un enlazante SmaI fosforilado kit (producido por Takara Shuzo) para llevar a cabo una modificación de forma que el fragmento correspondiente a la porción Brevi.-ori se pudiera recortar del pHK4 mediante digestión únicamente con SmaI, y el fragmento de Brevi.-ori ADN generado se ligó con el pCRDAPA que se había digerido también con SmaI para preparar un plásmido que contiene la dapA que se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes. Este plásmido se designó como pDPSB. El procedimiento de construcción del pDPSB(Kmr) se muestra en la Fig. 8.
<2> Preparación del dapB y construcción del plásmido que contiene la dapB
Se usó una cepa de Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869 de tipo salvaje como donante de ADN cromosómico. El ADN cromosómico se preparó a partir de la ATCC cepa 13869 de acuerdo con un procedimiento ordinario. Se amplificó un fragmento de ADN que contiene la dapB a partir del ADN cromosómico de acuerdo con PCR. Al igual que con los cebadores de ADN usados para amplificación, se sintetizaron ADN de 23-mers con la secuencia de nucleótidos que se muestra en las SEC. DE ID. NROS.: 19 y 20 en el Listado de Secuencias, de forma respectiva, con el fin de amplificar una región de aproximadamente 2,0 kb que codifica el DDPR sobre la base de una secuencia conocida de Brevibacterium lactofermentum (ver Journal of Bacteriology, 175(9), 2743-2749 (1993)). La síntesis de ADN y la PCR se llevaron a cabo de la misma forma que se ha descrito en Ejemplo 1. El pCR-Script (producido por Invitrogen) se usó como vector de clonación para el fragmento de gen amplificado de 2.001 pb, y se ligó con el fragmento dapB amplificado. Así, se construyó un plásmido en el que el fragmento dapB de 2.001 pb amplificado a partir del cromosoma de Brevibacterium lactofermentum se ligó con pCR-Script. El plásmido, que se obtiene tal como se describe más arriba, que contenía dapB originado a partir de ATCC 13869, se denominó como pCRDAPB. Una cepa transformante AJ13107 obtenida mediante introducción de PCRDAPB en la cepa E. coli JM109 está depositada desde el 26 de mayo de 1995 de forma internacional en el National Institute of Bioscience and Human Technology de la Agency of Industrial Science and Technology del Ministry of International Trade and Industry (1-3, Higashi 1-chome, Tsukuba-shi, Ibaraki-ken, 305 Japón) basado en el Tratado de Budapest bajo el número de acceso FERM PB-5114.
Se extrajo un fragmento de 1.101 pb que contiene el gen estructural de DDPR mediante la digestión de pCRDAPB con EcoRV y SphI. Este fragmento se ligó con pHSG399 que se había digerido con HincII y SphI para preparar un plásmido. El plásmido preparado se designó como p399DPR.
Se introdujo Brevi.-ori en el p399DPR preparado para construir un plásmido que transportaba dapB que se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes. El pHK4 se digirió con el enzima de restricción KpnI (producido por Takara Shuzo), y se enromaron los extremos rotos. Se llevó a cabo la formación de los extremos romos mediante un ADN Blunting kit (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado. Tras la formación de los extremos enromados, se ligó un enlazante BamHI fosforilado kit (producido por Takara Shuzo) para llevar a cabo una modificación de forma que el fragmento correspondiente a la porción Brevi.-ori se pudiera recortar del pHK4 mediante digestión únicamente con BamHI, y el fragmento de Brevi.-ori ADN generado se ligó con el p399DPR que se había digerido también con BamHI para preparar un plásmido que contiene la dapB que se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes. Este plásmido se designó como pDPRB. El procedimiento de construcción del pDPRB se muestra en la Fig. 9.
<3> Preparación del ddh y construcción del plásmido que contiene el ddh
Se obtuvo un gen ddh mediante la amplificación del gen ddh a partir de ADN cromosómico de Brevibacterium lactofermentum ATCC 13869 de acuerdo con el procedimiento de PCR mediante el uso de dos cebadores de oligonucleótido (SEC. DE ID. NROS.: 23, 24) preparados sobre la base de una secuencia de nucleótidos conocida de un gen ddh de Corynebacterium glutamicum (Ishino, S. y col., Nucleic Acids Res., 15, 3917 (1987)). El fragmento obtenido de ADN amplificado se digirió con EcoT22I y AvaI, y se enromaron los extremos rotos. Tras esto, el fragmento se insertó en un emplazamiento a SmaI del pMW119 para obtener el plásmido PDDH.
A continuación, el pDDH se digirió con SalI y EcoRI, seguido por la formación de extremos romos. Tras esto, el fragmento obtenido se ligó con el pUC18 que se había digerido con SmaI. El plásmido así obtenido se denominó pUC18DDH.
Se introdujo Brevi.-ori en el pUC18DDH preparado para construir un plásmido que transportaba ddh que se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes. El pHK4 se digirió con los enzimas de restricción KpnI y BamHI, y se enromaron los extremos rotos. Se llevó a cabo la formación de los extremos romos mediante un ADN Blunting kit (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado. Tras la formación de los extremos enromados, se ligó un enlazante PstI fosforilado (producido por Takara Shuzo) para llevar a cabo una modificación de forma que se insertó en el emplazamiento PstI de pHSG299. El plásmido construido tal como se describe más arriba se denominó pPK4. A continuación, el pUC18DDH se digirió con XbaI y KpnI, y el fragmento generado se ligó con el pPK4 que se había digerido con KpnI y XbaI. Así, se construyó un plásmido que contiene la ddh que se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes. Este plásmido se designó como pPK4D. El procedimiento de construcción del pPK4D se muestra en la Fig. 10.
Ejemplo comparativo 2
Construcción del plásmido que contiene la combinación de lysC, y dapA, dapB o ddh mutantes <1> Construcción de la combinación de lysC y dapA mutantes
Se construyó un plásmido que comprendía los mutantes lysC, dapA, y un origen de replicación de bacterias coreneiformes a partir del plásmido pCRDAPA que comprende dapA y el plásmido p399AK9B que comprenden los mutantes lysC y Brevi.-ori. El p399AK9B se digirió completamente con SalI, y a continuación se enromaron los extremos rotos. Se ligó un enlazante EcoRI al anterior para construir un plásmido en el que el emplazamiento SalI estaba modificado en un emplazamiento EcoRI. El plásmido obtenido se denominó como p399AK9BSE. Los mutantes lysC y Brevi.-ori se recortaron en un único fragmento tras la digestión parcial del p399AK9BSE con EcoRI. Este fragmento se ligó con el pCRDAPA que se había digerido con EcoRI. El plásmido obtenido se denominó como pCRCAB. El plásmido se puede replicar de manera autónoma en E. coli y bacterias coreneiformes, y proporciona a un huésped resistencia la kanamicina, el plásmido comprende una combinación de los mutantes lysC y dapA. El procedimiento de construcción del pCRCAB se muestra en la Fig. 11.
<2> construcción del plásmido que contiene la combinación de los lysC y dapB mutantes
Se construyó un plásmido que comprendía los mutantes lysC, a partir del plásmido p399AK9 que tiene el lysC mutante y el plásmido p399DPR que comprenden dapB. Un fragmento de 1.101 pb que contiene el gen estructural de DDPR se extrajo mediante digestión de p399DPR con EcoRV y SphI. Este fragmento se con p399AK9 que se había digerido con SalI y a continuación los extremos se enromaron, y después se digirió con Sph para construir un plásmido que comprende una combinación de lysC y dapB mutantes. Este plásmido se denominó como p399AKDDPR.
A continuación, se introdujo Brevi.-ori en el p399AKDDPR obtenido. El plásmido pHK4 que contenía Brevi.-ori se digirió con el enzima de restricción KpnI (producido por Takara Shuzo), y se enromaron los extremos rotos. Se llevó a cabo la formación de los extremos romos mediante un ADN Blunting kit (producido por Takara Shuzo) de acuerdo con un procedimiento diseñado. Tras la formación de los extremos enromados, se ligó un enlazante BamHI fosforilado (producido por Takara Shuzo) para llevar a cabo una modificación de forma que el fragmento correspondiente a la porción Brevi.-ori se pudiera recortar del pHK4 mediante digestión únicamente con BamHII Este plásmido se digirió con BamHI, y el fragmento de Brevi.-ori ADN generado se ligó con el p399AKDDPR que se había digerido también con BamHI para preparar un plásmido que contiene los mutantes lysC y dapB que se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes. Ele plásmido construido se designó como pCB. El procedimiento de construcción del pCB se muestra en la Fig. 12.
<3> Construcción del plásmido que contiene la combinación de lysC y ddh mutantes
Se construyó un plásmido que comprendía los mutantes lysC, ddh, y un origen de replicación de bacterias coreneiformes a partir del plásmido pUC18DDH que comprende ddh y el plásmido p399AK9B que comprenden los mutantes lysC y Brevi.-ori. El pUC18DDH se digirió con el enzima de restricción EcoRI (producido por Takara Shuzo), se enromaron los extremos rotos y se ligó un polienlazante SalI al anterior para cambiar un emplazamiento EcoRI a un emplazamiento SalI. El plásmido obtenido se digirió con SalI para obtener un fragmento de ADN que contiene la ddh.
A continuación el p399AK9B se digirió con el enzima de restricción SalI y se ligó con el fragmento de ADN que contiene la ddh. Así, se preparó un plásmido que contiene los mutantes lysC, ddh y Brevi.-ori que se puede replicar de manera autónoma en bacterias coreneiformes, y se denominó como pCD. El procedimiento de construcción del pCD se muestra en la Fig. 13.
Ejemplo 5 Introducción de plásmidos que comprenden genes de la biosíntesis de la L-Lisina en las bacterias productoras de L-Lisina Brevibacterium lactofermentum
Los plásmidos que comprenden los genes de la biosíntesis de la L-lisina construidos como se describen más arriba, nominalmente p399AK9B (Cm^{r}), pLYSAB (Cm^{r}), pPwm (Km^{r}), pCRCAB (Km^{r}), pCB (Cm^{r}), pCD (Cm^{r}), y pCL (Cm^{r}), se introdujeron en una bacteria productora de L-lisina AJ11082 (NRRL B-11470) de Brevibacterium lactofermentum de forma respectiva. La cepa AJ11082 tiene la propiedad de resistencia a AEC. Los plásmidos se introdujeron de acuerdo con un procedimiento de pulso eléctrico (Sugimoto y col., Solicitud de Patente Japonesa abierta a consulta Nº 2-207791). Se seleccionaron transformantes basados en marcadores de resistencia a fármacos contenidos por los plásmidos respectivos. Se seleccionaron los transformantes en un medio completo que contenía 5 \mug/ml of cloranfenicol, cuando se había introducido un plásmido que contiene el gen de la resistencia al cloranfenicol, o se los transformantes en un medio completo que contenía 25 \mug/ml de kanimacina cuando se había introducido un plásmido que contiene el gen de la resistencia a la kanimacina.
Una cepa con los mutantes lysC y lysA se mejoró entre los transformantes obtenidos, se introdujo pPwm (Km^{r}) para obtener una cepa en la que se estimulaban los tres mutantes mutante lysC, lysA y ppc (AJ11082/pCL/pPwm). Los transformantes se seleccionaron en un medio completo que contenía 5 \mug/ml de cloranfenicol o 25 \mug/ml de kanimacina.
Ejemplo 6 Producción de L-Lisina
Cada uno de los transformantes obtenidos en el Ejemplo 5 se cultivó en un medio de producción de L-lisina para evaluar la productividad de L-lisina. El medio de de producción de L-lisina tenía la siguiente composición:
Medio de producción de L-lisina
Los siguientes componentes, excepto el carbonato de calcio, se disolvieron (en 1 L), y el pH se ajustó a 8,0 con KOH. El medio se esterilizó a 115ºC durante 15 minutos, y se añadió posteriormente a lo anterior el carbonato de calcio (50 g) en estado seco que se había esterilizado por separado en aire caliente
Glucosa 100 g
(NH_{4})_{2}SO_{4} 55 g
KH_{2}PO_{4} 1 g
MgSO_{4}7\cdotH_{2}O 1 g
Biotina 500 \mug
iamina 2000 \mug
FeSO_{4}\cdot7H_{2}O 0,01 g
MnSO_{4}\cdot7H_{2}O 0,01 g
Nicotinamida 5 mg
Hidrolizado de proteína (Mamenou) 30 ml
Carbonato de calcio 50 g
Cada uno de los diferentes tipos de transformante y cepas padre se inocularon al medio con la composición que se describe más arriba para llevar a cabo el cultivo a 31,5ºC con agitación recíproca. La cantidad de L-lisina producida tras 40 ó 72 horas de cultivo se muestra en la Tabla 1. En la tabla, lysC* representa el lysC mutante.
TABLA 1 Acumulación de L-Lisina tras 40 ó 72 horas de cultivo
1
Tal como se muestra más arriba, los mutantes lysC, lysA, o ppc se estimularon de manera separada, o cuando el mutante lysC se estimuló en compañía de dapA o ddh, la cantidad de L-lisina producida fue mayor que o equivalente la que produce la cepa padre tras 72 horas de cultivo, sin embargo, la cantidad de L-lisina producida es inferior a la producida por la cepa pariente tras 40 horas de cultivo. Nominalmente, la velocidad de producción de L-lisina disminuyó en cultivo durante un periodo de tiempo corto. De manera similar, cuando los mutantes lysC y ddh se estimularon en combinación, la cantidad de L-lisina producida es inferior a la producida por la cepa pariente tras 40 horas y 72 horas de cultivo. Por el contrario, en el caso de la cepa en la que se estimuló el dapB junto con el lysC mutante, se mejoró el crecimiento, se restauró con éxito la velocidad de producción de L-lisina en el periodo de cultivo a corto plazo, y la cantidad acumulada de L-lisina en el periodo de cultivo a largo plazo. En el caso de la cepa en la que los tres mutantes lysC, lysA, y ppc se estimularon de forma conjunta, la productividad de L-lisina mejoró de manera adicional.
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE: AJINOMOTO CO., LTD
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: PROCEDIMIENTO PARA PRODUCIR L-LISINA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 24
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(iv)
DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD:
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(D)
ESTADO:
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS:
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL (ZIP):
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
FORMULARIO LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: PatentIn, versión #1.0, versión #1.30
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FECHA DE LA SOLICITUD ACTUAL
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: JP 8-325658
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: 5-DIC-1996
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
FECHA DE LA SOLICITUD ANTERIOR
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN DEL REPRESENTANTE/AGENTE
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TELEFAX:
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: no
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TCGCGAAGTA GCACCTGTCA CTT
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 2
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: sí
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCION DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACGGAATTCA ATCTTACGGC C
\hfill
21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1643 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Brevibacterium lactofermentum
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: ATCC 13869
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 3
2
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1643 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN genómico
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Brevibacterium lactofermentum
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: ATCC 13869
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 217..1482
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 4
3
4
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 421 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 5
5
50
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 6
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1643 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN genómico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Brevibacterium lactofermentum
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: ATCC 13869
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 964...1482
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCION DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 6
6
7
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 172 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCION DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 7
\vskip1.000000\baselineskip
8
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: no
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTGGAGCCGA CCATTCCGCG AGG
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: sí
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCAAAACCGC CCTCCACGGC GAA
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3579 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN genómico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Brevibacterium lactofermentum
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: ATCC 13869
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 533..2182
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 2188..3522
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 10
\vskip1.000000\baselineskip
9
10
11
12
13
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 550 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 11
\vskip1.000000\baselineskip
14
15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 445 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 12
16
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: no
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TCGTCGGTCA GCCTGACGTC GAC
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: sí
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TCTTGGTGTCGAAAGTGCACACC
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3533 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN genómico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
FUENTE ORIGINAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
ORGANISMO: Brevibacterium lactofermentum
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CEPA: ATCC 13869
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 321..3077
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 15
17
18
19
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 919 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi) DESCRIPCION DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 16
21
22
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: no
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CGCGAGGTAC CACCTGTCAC
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: sí
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CAATCCAGGT ACCGGCAACC
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: no
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGATCCCCAA TCGATACCTG GAA
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: sí
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CGGTTCATCG CCAAGTTTTT CTT
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: no
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTCGACGGAT CGCAAATGGC AAC
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: sí
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGATCCTTGA GCACCTTGCG CAG
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: no
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CATCTAAGTA TGCATCTCGG
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN DE LA SEC. DE IDE. Nº: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencillo
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: diferente de un ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESCRIPCIÓN: /des = "ADN sintético"
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
ANTISENTIDO: sí
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(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC. DE IDE. Nº: 24
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TGCCCCTCGA GCTAAATTAG
\hfill
20
Referencia: 72 565 (m2) wa
Fecha: 20.03.1998
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LISTADO DE SECUENCIAS
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(1) INFORMACIÓN GENERAL
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(i)
SOLICITANTE:
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(A)
NOMBRE: AJINOMOTO CO., LTD
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 15-1, Kyobashi 1-chome, Chuo-ku
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Tokyo
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(E)
PAÍS: Japón
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(F)
ZIP: 104
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(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: PROCEDIMIENTO PARA PRODUCIR L-LISINA
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 24
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(v)
FORMULARIO LEGIBLE POR ORDENADOR:
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(A)
TIPO DE MEDIO: disco flexible
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(B)
ORDENADOR: IBM PC compatible
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(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
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(D)
SOFTWARE: PatentIn, versión #1.0, versión #1.30
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(vi)
FECHA DE LA SOLICITUD ACTUAL
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(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: 97 121 444.0

Claims (6)

1. Un ADN recombinante que se puede replicar de manera autónoma en células de bacterias coreneiformes, que comprende una secuencia de ADN que codifica una aspartokinasa en la que se ha insensibilizado de forma sustancial la inhibición por retroalimentación debida a L-lisina y L-treonina, una secuencia de ADN que codifica una diaminopimelato decarboxilasa, y una secuencia de ADN que codifica una fosfoenolpiruvato carboxilasa.
2. El ADN recombinante de acuerdo con la reivindicación 1, en el que dicha aspartokinasa en la que se ha insensibilizado de forma sustancial la inhibición por retroalimentación debida a L-lisina y L-treonina es una aspartokinasa que está originada en bacterias coreneiformes, y en el que dicha aspartokinasa es una aspartokinasa mutante en la que el residuo de aminoácido que corresponde al residuo de alanina número 279 tal como se cuenta desde su extremo N-terminal en la secuencia de aminoácidos que se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 5 se cambia por un residuo de aminoácido diferente de la alanina y diferente de un aminoácido ácido en su subunidad \alpha, y un el residuo de aminoácido que corresponde al residuo de alanina número 30 tal como tal como se cuenta desde su extremo N-terminal en la secuencia de aminoácidos que se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 7 se cambia por un residuo de aminoácido diferente de la alanina y diferente de un aminoácido ácido en su subunidad \beta.
3. El ADN recombinante de acuerdo con la reivindicación 1, en el que dicha secuencia de ADN que codifica la diaminopimelato decarboxilasa codifica una secuencia de aminoácidos que se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 12, o una secuencia de aminoácidos que es sustancialmente la misma que la secuencia de aminoácidos que se muestra en la SEC. DE ID. Nº: 12.
4. Una bacteria corineiforme que alberga una aspartokinasa en la que se ha insensibilizado de forma sustancial la inhibición por retroalimentación debida a L-lisina y L-treonina, y que comprende una secuencia de ADN mejorada que codifica una diaminopimelato decarboxilasa, y una secuencia de ADN mejorada que codifica una fosfoenolpiruvato carboxilasa.
5. La bacteria corineiforme de acuerdo con la reivindicación 4, transformada mediante la introducción del ADN recombinante tal como se ha definido en la reivindicación 1.
6. Un procedimiento para producir L-lisina que comprende las etapas de cultivar dicha bacteria corineiforme tal como se ha definido en la reivindicación 4 en un medio apropiado para permitir que la L-lisina se produzca y acumule en un cultivo de la bacteria, y recoger la L-lisina del cultivo.
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