ES2279647T3 - Reguladores mitogenicos. - Google Patents
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Abstract
Una proteína asilada que comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada de: a) SEQ ID Nº 2 b) SEQ ID Nº 21 c) SEQ ID Nº 42 d) una de las secuencias de aminoácidos de a) hasta c) con una deleción en las mismas o una adición en las mismas de menos del 5% de los aminoácidos de dicha secuencia de aminoácidos, en la que dicha proteína es capaz de generar intermediarios reactivos de oxígeno, o e) una proteína aislada capaz de generar intermediarios reactivos de oxígeno que comprende una secuencia de aminoácidos de a) hasta c) con una sustitución conservativa seleccionada de los grupos 1) a 6), que son: 1) alanina, serina o treonina, una por otra; 2) ácido aspártico o ácido glutámico, uno por el otro; 3) asparagina o glutamina, una por la otra; 4) arginina o lisina, una por la otra; 5) isoleucina, leucina, metionina o valina, una por la otra; y 6) fenilalanina, tirosina o triptofano, uno por el otro, o f) un fragmento de una secuencia de aminoácidos seleccionado de uno de a) hasta c), en el que dicho fragmento es capaz de generar intermediarios reactivos de oxígeno.
Description
Reguladores mitogénicos.
La presente invención se refiere al campo del
crecimiento celular normal y anormal, en particular a la regulación
mitogénica. La presente invención provee lo siguiente: secuencias de
nucleótidos que codifican la producción de enzimas que son
reguladores mitogénicos; secuencias de aminoácidos de estas enzimas;
vectores conteniendo estas secuencias de nucleótidos;
procedimientos para transfectar células con vectores que producen
estas enzimas; células transfectadas; procedimientos para
administrar estas células transfectadas a animales no humanos para
inducir la formación de tumores; y anticuerpos para estas enzimas
que son útiles para detectar y medir los niveles de estas enzimas,
y para unirse a células que poseen epítopes extracelulares de estas
enzimas.
Los intermediarios reactivos de oxígeno (ROI)
son productos de reducción parcial de oxígeno: 1 electrón reduce
O_{2} para formar superóxido (O_{2}^{-}), y 2 electrones
reducen O_{2} para formar peróxido de hidrógeno (H_{2}O_{2}).
Los ROI se generan como un subproducto del metabolismo aeróbico y
por mecanismos toxicológicos. Existen evidencias crecientes de la
generación enzimática regulada de O_{2}^{-} y su conversión a
H_{2}O_{2} en una diversidad de células. La conversión de
O_{2}^{-} a H_{2}O_{2} se produce espontáneamente, pero es
acelerada de forma notable por superóxido dismutasa (SOD). Los
niveles elevados de IOR están asociados con daños en biomoléculas
tales como ADN, biomembranas y proteínas. Evidencias recientes
indican la generación de ROI bajo condiciones celulares normales y
apuntan a señalar el papel que cumplen O_{2}^{-} y
H_{2}O_{2}.
Varios sistemas biológicos generan oxígeno
reactivo. Las células fagocíticas tales como neutrófilos generan
grandes cantidades de ROI como parte de su batería de mecanismos
bactericidas. La exposición de neutrófilos a bacterias o a diversos
mediadores solubles tales como
formil-Met-Leu-Phe o
ésteres de forbol activa un consumo masivo de oxígeno, llamado
explosión respiratoria, para generar inicialmente superóxido, con la
generación secundaria de H_{2}O_{2}, HOCI y radical hidroxilo.
La enzima responsable de este consumo de oxígeno es la oxidasa de
explosión respiratoria (nicotinamida adenina dinucleótido fosfatasa
en forma reducida (NADPH) oxidasa).
Existen crecientes evidencias de la generación
de ROI por parte de células no fagocíticas, particularmente en
situaciones relacionadas con proliferación celular. Se ha notado una
generación significativa de H_{2}O_{2}, O_{2}^{-}, o ambos
en algunos tipos de células. Los fibroblastos y células endoteliales
muestran liberación aumentada de superóxido en respuesta a
citoquinas tales como interleuquina-1 o factor de
necrosis tumoral (TNF) (Meier y col. (1989) Biochem J. 263,
539-545.; Matsubara y col. (1986) J. lmmun.137,
3295-3298). Los fibroblastos transformados con Ras
muestran liberación aumentada de superóxido comparados con
fibroblastos control (Irani, y col. (1997) Science 275,
1649-1652). Las células de músculo liso vascular de
rata muestran liberación aumentada de H_{2}O_{2} en respuesta a
PDGF (Sundaresan y col. (1995) Science 270, 296-299)
y angiotensina II (Griendling y col. (1994) Circ. Res. 74,
1141-1148; Fukui y col. (1997) Circ. Res.
80, 45-51; Ushio-Fukai y col. (1996)
J. Biol. Chem. 211, 23317-23321), y el
H_{2}O_{2} está asociado en estas células con tasas aumentadas
de proliferación. En la Tabla 1 se resume la generación de ROI en
una diversidad de tipos celulares (adaptado de Burdon, R. (1995)
Free Radical Biol. Med.18, 775-794).
Los ROI generados por neutrófilos tienen función
citotóxica. Aunque los ROI son dirigidos normalmente al microbio
invasor, los ROI pueden también inducir daño tisular (por ejemplo,
en condiciones inflamatorias tales como artritis, choque,
enfermedad pulmonar y enfermedad intestinal inflamatoria) o pueden
estar involucrados en el inicio o promoción de tumores, debido a
efectos dañinos sobre el ADN.. Nathan (Szatrowski y col. (1991)
Canc. Res. 51, 794-798)
propusieron que la generación de ROI en células tumorales puede contribuir a la hipermutabilidad observada en los tumores, y puede por lo tanto contribuir a la heterogeneidad, a la invasión y metástasis tumoral.
propusieron que la generación de ROI en células tumorales puede contribuir a la hipermutabilidad observada en los tumores, y puede por lo tanto contribuir a la heterogeneidad, a la invasión y metástasis tumoral.
Además de los papeles citotóxico y mutagénico,
los ROI tienen propiedades ideales como moléculas señal: 1) se
generan de manera controlada en respuesta a señales previas; 2) la
señal puede terminar por rápido metabolismo de O_{2}^{-} y
H_{2}O_{2} por parte de SOD y peroxidasas de catalasa; 3)
ejercen efectos posteriores en moléculas diana, por ejemplo,
proteínas reguladoras sensibles a redox tales como NF kappa B y
AP-1 (Schreck y col. (1991) EMB4 J.10,
2247-2258; Schmidt y col. (1995) Chemistry &
Biology 2, 13-22). Los oxidantes tales como
O_{2}^{-} y H_{2}O_{2} tienen un papel como señal
relativamente bien definido en las bacterias, operando por medio
del regulón SoxIIII para regular la transcripción.
Los ROI parecen tener un papel directo en la
regulación de la división celular y pueden funcionar como señales
mitogénicas en afecciones patológicas relacionadas con el
crecimiento. Estas afecciones incluyen cáncer y enfermedad
cardiovascular. El O_{2}^{-} se genera en células endoteliales
en respuesta a citoquinas y puede jugar un papel en la angiogénesis
(Matsubara y col. (1986) J. lmmun.137, 3295-3298).
Se propone también que O_{2}^{-} y H_{2}O_{2} funcionan
como "señales de vida", previniendo a las células de sufrir
apoptosis (Matsubara y col. (1986) J. Immun.137,
3295-3298). Como se discutió anteriormente, muchas
células responden a factores de crecimiento (por ejemplo, factor de
crecimiento derivado de plaquetas (PDGF), factor de crecimiento
derivado de epidermis (EGF), angiotensina II, y diversas citoquinas)
con producción aumentada de O_{2}^{-} y H_{2}O_{2} y
proliferación aumentada. La inhibición de generación de ROI previene
la respuesta mitogénica. La exposición a O_{2}^{-} y
H_{2}O_{2} generados de manera exógena da como resultado un
aumento en la proliferación celular. En la Tabla 2 a continuación
se muestra una lista parcial de tipos celulares que responden a
O_{2}^{-} y H_{2}O_{2} (adaptado de Burdon, R. (1995) Free
Radical Biol. Med.18, 775-794).
Mientras que las células no transformadas pueden
responder a factores de crecimiento y citoquinas con producción de
ROI, las células tumorales parecen producir ROI de manera
descontrolada. Una serie de células tumorales humanas produjeron
grandes cantidades de peróxido de hidrógeno en comparación con
células no tumorales (Szatrowski y col. (1991) Canc. Res. 51,
794-798). Las células NIH 3T3 transformadas con Ras
generaron cantidades elevadas de superóxido, y la inhibición de
generación de superóxido por medio de varios mecanismos dio como
resultado una reversión a un fenotipo de crecimiento
"normal".
El O_{2}^{-} ha sido implicado en el
mantenimiento del fenotipo transformado en células cancerosas
incluyendo melanoma, cáncer de mama, fibrosarcoma y células
tumorales transfectadas con virus. Se han medido niveles
disminuidos de la forma manganeso de SOD (MnSOD) en células
cancerosas y en líneas celulares transformadas in vitro,
pronosticando niveles aumentados de O_{2}^{-} (Burdon, R. (1995)
Free Radical Biol. Med.18, 775-794). La MnSOD está
codificada en el cromosoma 6q25 que frecuentemente se pierde en el
melanoma. La sobreexpresión de MnSOD en melanoma y otras células
cancerosas (Church y col. (1993) Proc. of Natl. Acad. Sci. 90,
3113-3117; Fernandez-Pol y col.
(1982) Canc. Res. 42, 609-617; Yan y col. (1996)
Canc. Res. 56, 2864-2871) dio como resultado la
supresión del fenotipo transformado.
Los ROI están implicados en el crecimiento del
músculo liso vascular asociado con la hipertensión, aterosclerosis
y reestenosis tras angioplastia. Se observa generación de
O_{2}^{-} en la lámina adventicia de aorta de conejo (Pagano y
col. (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. 94, 14483-14488).
Las células endoteliales vasculares liberan O_{2}^{-} en
respuesta a citoquinas (Matsubara y col. (1986) J. Immun. 137,
3295-3298). Las células de músculo liso de aorta en
cultivo generan O_{2}^{-}, y la generación aumentada de
O_{2}^{-} es estimulada por angiotensina II que también induce
hipertrofia celular. En un sistema en modelo de rata, la infusión de
angiotensina II lleva a hipertensión así como a generación
aumentada de O_{2}^{-} en el tejido aórtico aislado
posteriormente (Ushio-Fukai y col. (1996) J. Biol.
Chem. 271, 23317-23321.; Yu y col. (1997) J. Biol.
Chem. 272, 27288-27294). La infusión intravenosa de
una forma de SOD que se localiza en la vasculatura o una infusión
de un barredor de O_{2}^{-} previno la hipertensión inducida por
angiotensina II e inhibió la generación de ROI (Fukui y col. (1997)
Circ. Res. 80, 45-51).
La NADPH oxidasa de neutrófilos, conocida
también como oxidasa de explosión respiratoria de fagocitos, provee
un paradigma para el estudio de sistemas enzimáticos generadores de
ROI especializados. Esta enzima ampliamente estudiada oxida NADPH y
reduce oxígeno para formar O_{2}^{-}. La NADPH oxidasa está
constituida por múltiples proteínas y está regulada por el ensamble
de componentes citosólicos y de membrana. El fragmento catalítico
está constituido por flavocitocrono b_{558}, una enzima integral
de membrana plasmática que comprende dos componentes: gp91phox (gp
se refiere a glicoproteína; phox es una abreviatura de las palabras
fagocito y oxidasa) y p22phox (p se refiere a proteína), gp91 phox
contiene 1 flavinadenindinucleótido (FAD) y 2 hemos así como
también un sitio de unión para NADPH. El componente p22phox tiene
una secuencia en el extremo C terminal rica en prolina que sirve
como sitio de unión para proteínas reguladoras citosólicas. Las dos
subunidades del citocromo, gp91 phox y p22phox parecen
estabilizarse una a la otra, ya que la ausencia genética de
cualquier subunidad, como en la afección hereditaria llamada
enfermedad granulomatosa crónica (CGD), da como resultado la
ausencia de la otra subunidad (Yu y col. (1997) J. Biol. Chem. 272,
27288-27294). Las proteínas citosólicas esenciales
incluyen p47phox, p67phox y la pequeña GTPasa Rac, de la que hay dos
isoformas. Tanto p47phox como p67phox contienen regiones SH_{3} y
regiones ricas en prolina que participan en interacciones proteicas
que dirigen el ensamble de los componentes de la oxidasa durante la
activación. La enzima de los neutrófilos es regulada en respuesta a
la fagocitosis bacteriana o a señales quimiotácticas por la
fosforilación de p47phox, y tal vez otros componentes, así como por
intercambio de nucleótidos guanina para activar la proteína de unión
a GTP, Rac.
El origen de los ROI en tejidos no fagocíticos
no está probado, pero se ha evaluado la presencia de componentes de
oxidasas de fagocitos en varios sistemas por medio de procedimientos
inmunoquímicos, reacciones de transferencia Northern y reacción en
cadena de polimerasa con transcriptasa inversa
(RT-PCR). El mensaje para p22phox se expresa
ampliamente, como también el mensaje para Rac1. Se ha demostrado que
varios tipos de células que son capaces de generar O_{2}^{-}
contienen todos los componentes de phox incluyendo gp91phox, como se
resume en la Tabla 3 a continuación. Estos tipos celulares incluyen
células endoteliales, la adventicia de al aorta y linfocitos.
Sin embargo, se observa un patrón claramente
diferente en varios otros tipos de células mostrados en la Tabla 3
incluyendo células mesangiales glomerulares, músculo liso aórtico y
fibroblastos. En estas células, está ausente la expresión de gp91
mientras que se ha demostrado que están presentes p22phox y en
algunos casos componentes citosólicos de phox. Dado que gp91 phox y
p22phox se estabilizan una a la otra en los neutrófilos, se ha
especulado mucho en que alguna molécula, posiblemente relacionada
con gp91phox, explique la generación de ROI en células mesangiales
glomerulares, músculo liso aórtico de rata y fibroblastos
(Ushio-Fukai y col. (1996) J. Biol. Chem. 271,
23317-23321). La investigación de fibroblastos de un
paciente con ausencia genética de gp91phox provee pruebas de que la
subunidad gp91phox no está involucrada en la generación de ROI en
estas células (Emmendorffer y col. (1993) Eur. J. Haemafol. 51,
223-227). La depleción de p22phox del músculo liso
vascular usando un enfoque antisentido indicó que esta subunidad
participa en la generación de ROI en estas células, a pesar de la
ausencia de gp91phox detectable (Ushio-Fukai y col.
(1996) J. Biol. Chem. 271, 23317-23321).
Actualmente se desconocen los candidatos moleculares posiblemente
relacionados con gp91phox e involucrados en la generación de ROI en
estas células.
En consecuencia, lo que se necesita es la
identidad de las proteínas involucradas en la generación de ROI,
especialmente en tejidos y células no fagocíticos. También se
necesitan las secuencias que codifican estas proteínas, y las
secuencias primarias de las mismas proteínas. Se necesitan también
vectores diseñados para incluir nucleótidos que codifiquen esas
proteínas. Se necesitan sondas y cebadores de PCR derivados de las
secuencias de nucleótidos que se quiere detectar, localizar y medir
las secuencias de nucleótidos, incluyendo ARNm, involucradas en la
síntesis de estas proteínas. Además, lo que se necesita es un medio
para transfectar células con estos vectores. También se necesitan
sistemas de expresión para la producción de estas moléculas. Se
necesitan también anticuerpos dirigidos a estas moléculas para una
diversidad de usos incluyendo localización, detección, medición e
inmunización pasiva.
La presente invención resuelve los problemas
descritos anteriormente proveyendo una nueva familia de secuencias
de nucleótidos y proteínas codificadas por estas secuencias de
nucleótidos llamadas proteínas mox. En particular, la presente
invención provee composiciones que comprenden las secuencias de
nucleótidos SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, y fragmentos
de las mismas, que codifican la expresión de proteínas que
comprenden SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42,
respectivamente, y fragmentos de las mismas. Se cree que estas
proteínas están involucradas en la producción de ROI. Sin querer
estar ligados a la afirmación anterior, la presente invención
también provee vectores que contienen estas secuencias de
nucleótidos, células transfectadas con estos vectores que producen
las proteínas que comprenden SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº
42, y fragmentos de las mismas, y anticuerpos para estas proteínas
y fragmentos de las mismas. La presente invención también provee
procedimientos para estimular la proliferación celular administrando
vectores codificados para la producción de las proteínas que
comprenden SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, y fragmentos de
las mismas. Los nucleótidos y anticuerpos de la presente invención
son útiles para la detección, localización y medición de los ácidos
nucleicos que codifican la producción de las proteínas de la
presente invención, y también para la detección, localización y
medición de las proteínas de la presente invención. Estos
nucleótidos y anticuerpos pueden combinarse con otros reactivos en
equipos para fines de detección, localización y medición.
Más particularmente, la presente invención
incluye un procedimiento para regular la división celular o
proliferación celular modificando la actividad o expresión de las
proteínas descritas como SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, o
fragmentos de las mismas. Se espera que estas proteínas, y sus
formas expresadas o que se presentan naturalmente, sean útiles en
el desarrollo de fármacos, por ejemplo para seleccionar bibliotecas
químicas y de fármacos mediante la observación de la inhibición de
la actividad de estas enzimas. Tales compuestos químicos y fármacos
probablemente serían útiles como tratamientos para el cáncer,
hipertrofia prostática, hipertrofia prostática benigna,
hipertensión, aterosclerosis y muchas otras afecciones que incluyen
crecimiento o proliferación celular anormal descritas
anteriormente. La proteína completa expresada puede ser útil en
estos ensayos. Las porciones de la molécula que pueden ser dianas
para inhibición o modificación incluyen, pero no se limitan a,
sitio de unión para nucleótidos piridina (NADPH o NADH), el dominio
de flavoproteína (aproximadamente los 265 aminoácidos del extremo C
terminal), y/o el sitio de unión o el sitio catalítico para
flavinadenindinucleótido (FAD).
El procedimiento de la presente invención puede
usarse para desarrollar fármacos y otros tratamientos de afecciones
asociadas con crecimiento anormal incluyendo, pero no limitado a las
siguientes: cáncer, soriasis, hipertrofia prostática, hipertrofia
prostática benigna, enfermedad cardiovascular, proliferación de
vasos, incluyendo pero no limitado a vasos sanguíneos y vasos
linfáticos, malformaciones arteriovenosas, problemas vasculares
asociados con el ojo, aterosclerosis, hipertensión y reestenosis
tras angioplastia. Las enzimas de la presente invención son dianas
excelentes para el desarrollo de fármacos y otros agentes que pueden
modular la actividad de estas enzimas. Debe entenderse que la
modulación de la actividad puede dar como resultado el aumento,
disminución o ausencia de actividad enzimática. La modulación de la
actividad de estas enzimas puede ser útil en el tratamiento de
afecciones asociadas con el crecimiento anormal.
Los fármacos que afectan la actividad de las
enzimas representadas en SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, o
fragmentos de las mismas, pueden también combinarse con otros
tratamientos en el tratamiento de afecciones específicas. Por
ejemplo, estos fármacos pueden combinarse con inhibidores de
angiogénesis en el tratamiento del cáncer, con antihipertensivos
para el tratamiento de hipertensión, y con fármacos que disminuyen
los niveles de colesterol para el tratamiento de la
aterosclerosis.
En consecuencia, es un objetivo de la presente
invención proveer secuencias de nucleótidos, o fragmentos de las
mismas para la producción de proteínas, o fragmentos de las mismas,
que están involucrados en la producción de ROI.
Otro objetivo de la presente invención es
proveer vectores conteniendo estas secuencias de nucleótidos, o
fragmentos de las mismas.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer células transfectadas con estos vectores.
Otro objetivo de la presente invención es
proveer proteínas, o fragmentos de las mismas, que están
involucradas en la producción de ROI.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer anticuerpos, incluyendo anticuerpos monoclonales y
policlonales, o fragmentos de los mismos, dirigidos a proteínas, o
fragmentos de las mismas, que están involucradas en la producción
de ROI.
Otro objetivo de la presente invención es
administrar genes que contienen secuencias de nucleótidos, o
fragmentos de las mismas, que codifican la producción de proteínas,
o fragmentos de las mismas, que están involucradas en la producción
de ROI, a células obtenidas de animales o seres humanos.
Otro objetivo de la presente invención es
administrar secuencias complementarias antisentido de genes que
contienen secuencias de nucleótidos, o fragmentos de las mismas, que
codifican la producción de proteínas, o fragmentos de las mismas,
que están involucradas en la producción de ROI, a células obtenidas
de animales o seres humanos.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer modelos en animales en desarrollo de formación de tumores
usando un procedimiento para estimular o inhibir la proliferación
celular administrando vectores conteniendo secuencias de
oligonucleótidos, o fragmentos de las mismas, que están involucradas
en la producción de ROI, a animales. Es un objetivo de la presente
invención modelos en animales en desarrollo de formación de tumores
usando un procedimiento para estimular o inhibir la proliferación
celular administrando vectores conteniendo secuencias
complementarias antisentido de secuencias de nucleótidos, o
fragmentos de las mismas, que codifican la producción de proteínas,
o fragmentos de las mismas, que están involucradas en la producción
de ROI, a animales.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer anticuerpos útiles en inmunoterapia contra cánceres
expresando las proteínas representadas en SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21,
SEQ ID Nº 42, o fragmentos de las mismas.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer sondas de nucleótidos útiles para la detección, localización
y medición de secuencias de nucleótidos, o fragmentos de los
mismos, que codifican la producción de proteínas, o fragmentos de
las mismas, que están involucradas en la producción de ROI.
Otro objetivo de la presente invención es
proveer anticuerpos útiles para la detección, localización y
medición de secuencias de nucleótidos, o fragmentos de las mismas,
que codifican la producción de proteínas, o fragmentos de las
mismas, que están involucradas en la producción de ROI.
Otro objetivo de la presente invención es
proveer equipos útiles para la detección de ácidos nucleicos que
incluyen los ácidos nucleicos representados en SEQ ID Nº 1, SEQ ID
Nº 22, SEQ ID Nº 41, o fragmentos de los mismos, que codifican
proteínas, o fragmentos de las mismas, que están involucradas en la
producción de ROI.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer equipos útiles para la detección y medición de ácidos
nucleicos incluyendo los ácidos nucleicos representados en SEQ ID Nº
1, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, o fragmentos de los mismos, que
codifican proteínas, o fragmentos de las mismas, que están
involucradas en la producción de ROI.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer equipos útiles para la localización de ácidos nucleicos
incluyendo los ácidos nucleicos representados en SEQ ID Nº 1, SEQ ID
Nº 22, SEQ ID Nº 41, o fragmentos de los mismos, que codifican
proteínas, o fragmentos de las mismas, que están involucradas en la
producción de ROI.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer equipos útiles para la detección de proteínas incluyendo
las proteínas representadas en SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº
42, o fragmentos de las mismos, que están involucradas en la
producción de ROI.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer equipos útiles para la detección y medición de proteínas
incluyendo las proteínas representadas en SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21,
SEQ ID Nº 42, o fragmentos de las mismos, que están involucradas en
la producción de ROI.
Otro objetivo más de la presente invención es
proveer equipos útiles para la localización de proteínas incluyendo
las proteínas representadas en SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº
42, o fragmentos de las mismos, que están involucradas en la
producción de ROI.
Otro objetivo de la presente invención es
proveer equipos útiles para la detección, medición y localización
de ácidos nucleicos, o fragmentos de los mismos, que codifican la
producción de proteínas, o fragmentos de las mismas, que están
involucradas en la producción de ROI, para uso en el diagnóstico o
pronóstico de la proliferación celular anormal relacionada con la
producción de ROI.
Otro objetivo de la presente invención es
proveer equipos útiles para la detección, medición y localización
de proteínas, o fragmentos de las mismas, que están involucradas en
la producción de ROI, para uso en el diagnóstico o pronóstico de la
proliferación celular anormal relacionada con la producción de
ROI.
Estos y otros objetivos, características y
ventajas de la presente invención resultarán evidentes tras una
revisión de la siguiente descripción detallada de las formas de
realización descritas y de los dibujos incluidos.
Fig. 1(a-d). Comparación
de secuencias de aminoácidos de proteína mox1 humana (marcada
mox1.human, SEQ ID Nº 2), proteína mox1 de rata (marcada mox1.rat,
SEQ ID Nº 21), proteína mox2 humana (marcada mox2.human, SEQ ID Nº
4) de la presente invención con las proteínas: humana (gp91
phox/human.pep, SEQ ID Nº 12) bovina (gp91 phox/bovine.pep, SEQ 30
ID Nº 37), y murina (gp91 phox/mouse.pep, SEQ ID Nº 38).
Están incluidas también las proteínas enzimáticas relacionadas de
plantas cytb 558.arabidopsis.pep (SEQ ID Nº 39) y cytb558.rice.pep,
(SEQ ID Nº 40). Los restos similares de aminoácidos están encerrados
en cajas.
Fig. 2. Similitudes de secuencia entre proteínas
relacionadas con gp91 phox incluyendo mox1 humana (SEQ ID Nº 2),
mox2 humana (SEQ ID Nº 4), y mox1 de rata (SEQ ID Nº 21). El
dendrograma indica el grado de similitud entre esta familia de
proteínas, y también incluye las enzimas relacionadas de
plantas.
Fig. 3. Ensayo libre de células para actividad
de mox1. La generación de superóxido se midió usando la reacción
quimioluminiscente entre lucigenina y superóxido en lisados
celulares de vector control NEF2 y células NIH3T3 transfectadas con
mox1.
Fig. 4. Generación de superóxido por mox1
humana. La reducción de NBT en fibroblastos transfectados con mox1
y fibroblastos control se midió en ausencia (barras rellenas) o en
presencia (barras abiertas) de superóxido dismutasa.
Fig. 5. Aconitasa (barras rellenas), lactato
deshidrogenasa (trama estrecha) y fumarasa (trama ancha) se
determinaron en lisados de células transfectadas con vector solo
(NEF2) o con mox1 (YA26, YA28 y YA212).
La presente invención resuelve los problemas
descritos anteriormente proveyendo una nueva familia de secuencias
de nucleótidos y proteínas codificadas por estas secuencias de
nucleótidos llamadas proteínas mox. El término "mox" se
refiere a "oxidasa mitogénica". En particular, la presente
invención provee composiciones que comprenden las secuencias de
nucleótidos SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, y fragmentos de
las mismas, que codifican, respectivamente, la expresión de
proteínas que comprenden SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, y
fragmentos de las mismas.
Las proteínas mox descritas en este documento
tienen homología con la proteína gp91 phox involucrada en la
generación de ROI, sin embargo, las proteínas mox comprenden una
familia nueva y diferente de proteínas. Las proteínas mox incluidas
en la presente invención tienen un peso molecular de aproximadamente
65 kDa como se determinó por medio de electroforesis en gel
reductor y son capaces de inducir la generación de ROI en células.
Como se describe en más detalle a continuación, las proteínas mox de
la presente invención funcionan también en la regulación del
crecimiento celular, y están por consiguiente implicadas en
enfermedades que incluyen crecimiento celular anormal tal como el
cáncer. La presente invención describe proteínas mox halladas en
seres humanos y en ratas, sin embargo, es probable que la familia
de genes/proteínas mox esté ampliamente distribuida entre los
organismos multicelulares.
Además de las secuencias de nucleótidos
descritas anteriormente, la presente invención también provee
vectores que contienen estas secuencias de nucleótidos y fragmentos
de las mismas, células transfectadas con estos vectores que
producen las proteínas que comprenden SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ
ID Nº 42, y fragmentos de las mismas, y anticuerpos para estas
proteínas y fragmentos de las mismas. La presente invención también
provee procedimientos para estimular la proliferación celular
administrando vectores, o células conteniendo vectores, que
codifican la producción de las proteínas que comprenden SEQ ID Nº 2,
SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, y fragmentos de las mismas. Los
nucleótidos y anticuerpos de la presente invención son útiles para
la detección, localización y medición de ácidos nucleicos que
codifican la producción de las proteínas de la presente invención, y
también para la detección, localización y medición de las proteínas
de la presente invención. Estos nucleótidos y anticuerpos pueden
estar combinados con otros reactivos en equipos para los fines de
detección, localización y medición. Estos equipos son útiles para
diagnóstico y pronóstico de afecciones que incluyen proliferación
celular asociada con producción de intermediarios reactivos de
oxígeno.
La presente invención soluciona los problemas
descritos anteriormente proveyendo una composición que comprende la
secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 1 y fragmentos de la misma. La
presente invención también provee una composición que comprende la
secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 22 y fragmentos de la misma. La
presente invención también provee una composición que comprende la
secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 41 y fragmentos de la misma.
La presente invención provee una composición que
comprende la proteína SEQ ID Nº 2 codificada por la secuencia de
nucleótidos SEQ ID Nº 1. La presente invención provee una
composición que comprende la proteína SEQ ID Nº 21 codificada por
la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 22. La presente invención
provee una composición que comprende la proteína SEQ ID Nº 42
codificada por la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 41.
La presente invención provee una composición que
comprende la proteína SEQ ID Nº 2 o fragmentos de la misma,
codificada por la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 1 o fragmentos
de la misma. La presente invención también provee una composición
que comprende la proteína SEQ ID Nº 21 o fragmentos de la misma,
codificada por la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 22 o
fragmentos de la misma. La presente invención también provee una
composición que comprende la proteína SEQ ID Nº 42 o fragmentos de
la misma, codificada por la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 41 o
fragmentos de la misma.
La presente invención también provee vectores
que contienen la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº
22, SEQ ID Nº 41, o fragmentos de las mismas. La presente invención
también provee células transfectadas con estos vectores. Además, la
presente invención provee células transfectadas de manera estable
con la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 1 o fragmentos de la
misma. La presente invención también provee células transfectadas
de manera estable con la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 3 o
fragmentos de la misma. La presente invención también provee
células transfectadas de manera estable con la secuencia de
nucleótidos SEQ ID Nº 22 o fragmentos de la misma. La presente
invención también provee células transfectadas de manera estable con
la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 41 o fragmentos de la
misma.
La presente invención provee células
transfectadas de manera estable con la secuencia de nucleótidos SEQ
I D Nº 1 o fragmentos de la misma, que producen la proteína SEQ ID
Nº 2 o fragmentos de la misma. Además, la presente invención provee
células transfectadas de manera estable con la secuencia de
nucleótidos SEQ ID Nº 22 o fragmentos de la misma que producen la
proteína SEQ ID Nº 21 o fragmentos de la misma. La presente
invención también provee transfectadas de manera estable con la
secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 41 o fragmentos de la misma que
producen la proteína SEQ ID Nº 42 o fragmentos de la misma.
La presente invención provee un procedimiento
para estimular el crecimiento administrando células transfectadas
de manera estable con la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 1 que
producen la proteína SEQ ID Nº 2 o fragmentos de la misma. La
presente invención también provee un procedimiento para estimular el
crecimiento administrando células transfectadas de manera estable
con la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 22 o fragmentos de la
misma, que producen la proteína SEQ ID Nº 21 o fragmentos de la
misma. La presente invención también provee un procedimiento para
estimular el crecimiento administrando células transfectadas de
manera estable con la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 41 o
fragmentos de la misma, que producen la proteína SEQ ID Nº 42 o
fragmentos de la misma.
Específicamente, la presente invención provee un
procedimiento para estimular la formación de tumores administrando
células transfectadas de manera estable con la secuencia de
nucleótidos SEQ ID Nº 1 o fragmentos de la misma, que producen la
proteína SEQ ID Nº 2 o fragmentos de la misma. La presente invención
también provee un procedimiento para estimular la formación de
tumores administrando células transfectadas de manera estable con la
secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 22 o fragmentos de la misma, que
producen la proteína SEQ ID Nº 21 o fragmentos de la misma. La
presente invención también provee un procedimiento para estimular la
formación de tumores administrando células transfectadas de manera
estable con la secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 41 o fragmentos de
la misma, que producen la proteína SEQ ID Nº 42 o fragmentos de la
misma, o
La presente invención puede también usarse para
desarrollar secuencias de nucleótidos antisentido para SEQ ID Nº 1,
SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, o fragmentos de las mismas. Estas
moléculas antisentido pueden usarse para interferir con la
traducción de secuencia de nucleótidos, tales como SEQ ID Nº 1, SEQ
ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, o fragmentos de las mismas, que codifican
las proteínas tales como SEQ IDNº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, o
fragmentos de las mismas. La administración de estas moléculas
antisentido, o vectores que codifican moléculas antisentido, a
seres humanos y animales, podría interferir con la producción de
proteínas tales como SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, o
fragmentos de las mismas, disminuyendo así la producción de ROI e
inhibiendo la proliferación celular. Estos procedimientos son útiles
en la producción de modelos animales para uso en el estudio de
desarrollo de tumores y desarrollo y crecimiento vascular, y para el
estudio de la eficacia de tratamientos que afectan el crecimiento
tumoral y vascular in vivo.
La presente invención también provee un
procedimiento altamente productivo para seleccionar fármacos y
compuestos químicos que modulan la actividad proliferativa de las
enzimas de la presente invención, afectando de esta manera la
división celular. Pueden seleccionarse bibliotecas de química
combinatoria en busca de compuestos químicos que modulan la
actividad proliferativa de estas enzimas. Pueden evaluarse fármacos
y compuestos químicos en base a su capacidad para modular la
actividad enzimática de las proteínas expresadas de manera endógena,
incluyendo aquellas representadas por SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21,
SEQ ID Nº 42, o fragmentos de las mismas. Las proteínas endógenas
pueden obtenerse de muchos tejidos y células diferentes, tales como
células del colon. También pueden evaluarse fármacos en base a su
capacidad para unirse a las proteínas expresadas o endógenas
representadas por SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, o
fragmentos de las mismas. La actividad enzimática puede ser
generación de superóxido dependiente de NADPH o NADH catalizada por
la holoproteína. La actividad enzimática puede también ser
actividad de diaforasa dependiente de NADPH- o NADH- catalizada por
la holoproteína o el dominio de flavoproteína.
Por dominio de flavoproteína, se entiende
aproximadamente la mitad del extremo C terminal de las enzimas que
se muestran en SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, o fragmentos
de las mismas. Este fragmento de gp91phox tiene actividad reductasa
dependiente de NADPH hacia citocromo c, nitroazul tetrazolio y otros
colorantes. Pueden usarse proteínas expresadas o fragmentos de las
mismas para seleccionar por medio de robótica bibliotecas de
química combinatoria existentes. Sin la intención de estar ligados a
la siguiente afirmación, se cree que el sitio de unión para NADPH o
NADH y el sitio de unión para FAD son útiles para evaluar la
capacidad de fármacos y otras composiciones para unirse a las
enzimas mox y duox o para modular su actividad enzimática. Resulta
de preferencia el uso de holoproteína o la mitad C terminal o
regiones del extremo para desarrollar una selección de fármacos
altamente productiva. Además, el tercio N terminal del domino duox
(el dominio peroxidasa) puede también usarse para evaluar la
capacidad de fármacos y otras composiciones para inhibir la
actividad peroxidasa, y para desarrollar además una selección de
fármacos altamente productiva.
La presente invención también provee anticuerpos
dirigidos a las proteínas SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID
Nº 42, y fragmentos de las mismas. Los anticuerpos de la presente
invención son útiles para una diversidad de objetivos incluyendo
localización, detección y medición de las proteínas SEQ ID Nº 2, SEQ
ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, y fragmentos de las mismas. Los anticuerpos
pueden usarse en equipos para lograr estos objetivos. Estos
anticuerpos pueden también estar unidos a agentes citotóxicos para
eliminar células selectivamente. El término anticuerpo supone la
inclusión de cualquier clase de anticuerpo tales como IgG, IgM y
otras clases. El término anticuerpo también incluye un anticuerpo
completamente intacto y también fragmentos de los mismos,
incluyendo pero no limitado a fragmentos Fab y fragmentos Fab +
Fc.
La presente invención también provee las
secuencias de nucleótidos SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41,
y fragmentos de las mismas. Estos nucleótidos son útiles para una
diversidad de objetivos incluyendo localización, detección y
medición de ARN mensajero involucrado en la síntesis de las
proteínas representadas como SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº
42, y fragmentos de las mismas. Estos nucleótidos pueden también
usarse en la construcción de sondas marcadas para localización,
detección y medición de ácidos nucleicos tal como ARN mensajero o
alternativamente para el aislamiento de secuencias de nucleótidos
más grandes conteniendo las secuencias de nucleótidos que se
muestran en SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, o fragmentos de
las mismas. Estas secuencias de nucleótidos pueden usarse para
aislar hebras homólogas de otras especies usando técnicas conocidas
por los expertos en la técnica. Estas secuencias de nucleótidos
pueden también usarse para generar sondas y hebras complementarias.
Los nucleótidos pueden usarse en equipos para lograr estos
objetivos.
Más particularmente, la presente invención
incluye un procedimiento para modular el crecimiento modificando
las proteínas representadas como SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID
Nº 42, o fragmentos de las mismas.
El término "reguladores mitogénicos" como
se usa en este documento significa cualquier molécula que actúa
afectando la división celular.
El término "animal" como se usa en este
documento significa animales no humanos de ambos sexos.
Los términos "un", "una" y "el"
"la" como se usa en este documento significan uno o más e
incluye el plural a menos que el contexto sea inapropiado.
"Proteínas", "péptidos,""polipéptidos" y "oligopéptidos" son cadenas de
aminoácidos (típicamente L-aminoácidos) cuyos
carbonos alfa están unidos a través de enlaces peptídicos formados
por una reacción de condensación entre el grupo carboxilo del
carbono alga de un aminoácido y el grupo amino del carbono alfa de
otro aminoácido. El aminoácido terminal en un extremo de la cadena
(es decir, el amino terminal) tiene un grupo amino libre, mientras
que el aminoácido terminal en el otro extremo de la cadena (es
decir, el carboxi terminal) tiene un grupo carboxilo libre. Como
tal, la expresión "amino terminal" (abreviado N terminal) se
refiere al grupo alfa amino libre en el aminoácido en el extremo
amino terminal de la proteína, o al grupo alfa amino (grupo imino
cuando participa en un enlace peptídico) de un aminoácido en
cualquier otra ubicación dentro de la proteína. De manera similar,
la expresión "carboxi terminal" (abreviado C terminal) se
refiere al grupo carboxilo libre en el aminoácido en el extremo
carboxi terminal de una proteína, o al grupo carboxilo de un
aminoácido en cualquier otra ubicación dentro de la proteína.
Típicamente, los aminoácidos que forman una
proteína se numeran en orden, comenzando en el amino terminal y
aumentando en dirección hacia el carboxi terminal de la proteína.
Por ello, cuando se dice que un aminoácido "sigue" a otro, ese
aminoácido está ubicado más cerca al extremo carboxi terminal de la
proteína que el aminoácido precedente.
El término "resto" se usa en este documento
para referirse a un aminoácido (D o L) o a un mimético de aminoácido
que se incorpora en una proteína por medio de un enlace amida. Como
tal, el aminoácido puede presentarse naturalmente o, a menos que
esté limitado de otra manera, puede abarcar análogos conocidos de
aminoácidos naturales que funcionan de manera similar a los
aminoácidos que se presentan naturalmente (es decir, miméticos de
aminoácidos). Más aún, un mimético de enlace amida incluye
modificaciones del esqueleto peptídico bien conocidas por los
expertos en la técnica.
Además, un experto reconocerá que, como se
mencionó anteriormente, sustituciones, deleciones o adiciones
individuales que alteran, agregan o quitan un único aminoácido o un
pequeño porcentaje de aminoácidos (típicamente menos del 5%, más
típicamente menos del 1%) en una secuencia codificada son
variaciones modificadas de manera conservativa cuando las
alteraciones dan como resultado la sustitución de un aminoácido con
un aminoácido químicamente similar. Las tablas de sustituciones
conservativa que proveen aminoácidos con funcionalidad similar son
bien conocidas en la técnica. Los siguientes seis grupos contienen
cada uno aminoácidos que son sustituciones conservativas para el
otro:
- 1)
- Alanina (A), Serina (S), Treonina (T);
- 2)
- Ácido aspártico (D), Ácido glutámico (E);
- 3)
- Asparagina (N), Glutamina (Q);
- 4)
- Arginina (R), Lisina (K);
- 5)
- Isoleucina (I), Leucina (L), Metionina (M), Valina (V); y
- 6)
- Fenilalanina (F), Tirosina (Y), Triptofano (W).
Cuando los péptidos son relativamente cortos (es
decir, menos de aproximadamente 50 aminoácidos), frecuentemente se
sintetizan usando técnicas químicas convencionales de síntesis de
péptidos. La síntesis en fase sólida en la que el aminoácido C
terminal de la secuencia se une a un soporte insoluble seguido por
el agregado secuencial de los restantes aminoácidos en la secuencia
es un procedimiento de preferencia para la síntesis química de los
epítopes antigénicos descritos en este documento. Las técnicas para
síntesis en fase sólida son conocidas por los expertos en la
técnica.
Como alternativa, los epítopes antigénicos
descritos en este documento se sintetizan usando procedimientos de
ácidos nucleicos recombinantes. Generalmente, esto incluye la
creación de una secuencia de ácido nucleico que codifica el péptido
o proteína, colocando el ácido nucleico en un módulo de expresión
bajo el control de un promotor particular, expresando el péptido o
proteína en un huésped, aislando el péptido o proteína expresada y,
si es necesario, renaturalizando el péptido o proteína. En la
bibliografía pueden encontrarse suficientes técnicas para guiar a
un experto a través de tales procedimientos.
Cuando varios fragmentos deseados de proteínas o
péptidos están codificados en la secuencia de nucleótidos
incorporada en un vector, un experto en la técnica apreciará que los
fragmentos de proteínas o péptidos pueden estar separados por
moléculas espaciadoras tales como, por ejemplo, un péptido
constituido por uno o más aminoácidos. Generalmente, el espaciador
no tendrá otra actividad biológica más que unir los fragmentos
deseados de proteína o péptidos, o conservar una distancia mínima u
otra relación espacial entre ellos. Sin embargo, los aminoácidos
que constituyen el espaciador pueden seleccionarse para tener
influencia sobre alguna propiedad de la molécula tal como
plegamiento, carga neta o hidrofobicidad. Pueden construirse dentro
del vector secuencias de nucleótidos que codifican la producción de
restos que pueden ser útiles en la purificación de proteínas. Tales
secuencias son conocidas en la técnica. Por ejemplo, puede
agregarse una secuencia de nucleótidos que codifica una secuencia
polihistidina a un vector para facilitar la purificación de la
proteína recombinante expresada en una columna de níquel.
Una vez expresados, los péptidos, polipéptidos y
proteínas recombinantes pueden purificarse de acuerdo con
procedimientos convencionales conocidos por los expertos en la
técnica, incluyendo la precipitación con sulfato de amonio,
columnas de afinidad, cromatografía en columna, electroforesis en
gel y similares. Resultan de preferencia las composiciones
sustancialmente puras con aproximadamente 50 a 99% de homogeneidad,
y para uso como agentes terapéuticos resulta de preferencia una
homogeneidad de entre 80 y 95% o más.
Un experto en la técnica reconocerá que tras la
síntesis química, expresión biológica o purificación, las proteínas
deseadas o fragmentos de las mismas pueden tener una conformación
sustancialmente diferente de las conformaciones de las proteínas
nativas, fragmentos y péptidos de las mismas. En este caso, con
frecuencia es necesario desnaturalizar y reducir la proteína y a
continuación provocar nuevamente el plegamiento de la proteína para
lograr la conformación de preferencia. Los expertos en la técnica
conocen procedimientos para reducir y desnaturalizar proteínas e
inducir el plegamiento.
Las construcciones genéticas de la presente
invención incluyen secuencias codificadoras para diferentes
proteínas, fragmentos de las mismas y péptidos. Las construcciones
genéticas también incluyen epítopes o dominios elegidos para
permitir la purificación o detección de la proteína expresada. Tales
epítopes o dominios incluyen secuencias de ADN que codifican el
dominio de unión de glutatión de la glutatión
S-transferasa, hexahistidina, tioredoxina, antígeno
hemaglutinina, proteína de unión a maltosa y otras comúnmente
conocidas por los expertos en la técnica. La construcción genética
de preferencia incluye las secuencias de nucleótidos de SEQ ID Nº 1,
SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, o fragmentos de las mismas. Debe
entenderse que pueden incluirse secuencias de nucleótidos
adicionales o alternativas en las construcciones genéticas con el
fin de codificar los siguientes: a) múltiples copias de las
proteínas deseadas; b) diversas combinaciones de las proteínas,
fragmentos de las mismas o péptidos deseados; y c) modificaciones
conservativas de las proteínas, fragmentos de las mismas o péptidos
deseados. Las proteínas de preferencia incluyen la proteína mox1
humana y la proteína mox2 humana como se muestra en SEQ ID Nº 2 y
fragmentos de las mismas. Algunos fragmentos de preferencia de la
proteína mox1 humana (SEQ ID Nº 2) incluyen pero no están limitados
a las proteínas mostradas como SEQ ID Nº 23, SEQ ID Nº 24, y SEQ ID
Nº 25. En esta solicitud, la proteína mox1 es también llamada
p65mox. Otra proteína de preferencia de la presente invención es la
proteína mox1 de rata, mostrada como SEQ ID Nº 21 y fragmentos de la
misma. Otra proteína de preferencia de la presente invención es la
proteína mox1 B de rata, mostrada como SEQ ID Nº 42 y fragmentos de
la misma.
La secuencia de nucleótidos de la presente
invención puede usarse también para hibridar a ácidos nucleicos
tales como secuencia de nucleótidos de ADN o ARN bajo condiciones de
alta rigurosidad que permiten la detección, por ejemplo, de
mensajes empalmados alternativamente.
La construcción genética se expresa en un
sistema de expresión tal como en células NIH 3T3 usando secuencias
recombinantes en un vector pcDNA-3 (Invitrogen,
Carlsbad, CA) para producir una proteína recombinante. Los sistemas
de expresión de preferencia incluyen, pero no se limitan a células
Cos-7, células de insecto usando baculovirus
recombinantes, y levaduras. Debe entenderse que para la expresión de
construcciones genéticas de la presente invención pueden usarse
otros sistemas de expresión conocidos por los expertos en la
técnica. Las proteínas de preferencia de la presente invención son
las proteínas llamadas en este documento mox1 humana y mox2 humana
o fragmentos de las mismas que tienen las secuencias de aminoácidos
expuestas en SEQ ID Nº 3 y SEQ ID Nº 4, respectivamente, o una
secuencia de aminoácidos con sustituciones de aminoácidos como se
definieron anteriormente y que no alteran significativamente la
función de la proteína recombinante en una manera adversa. Otra
proteína de preferencia de la presente invención es llamada en este
documento mox1 de rata y tiene la secuencia de aminoácidos expuesta
en SEQ ID Nº 21. Otra proteína más de preferencia de la presente
invención es llamada en este documento mox1B de rata y tiene la
secuencia de aminoácidos expuesta en SEQ ID Nº 42.
Debería entenderse que parte de la terminología
usada para describir las proteínas mox nuevas contenida en este
documento es diferente de la terminología usada en la Solicitud
Provisional de EEUU Nº de Serie 60/149.332 sobre la que esta
solicitud reivindica prioridad en parte. Como se describe en este
documento, la expresión "mox2 humana" se refiere a una
proteína que comprende una secuencia de aminoácidos como la expuesta
en SEQ ID Nº 4, o un fragmento de la misma, y codificada por la
secuencia de nucleótidos expuesta en SEQ ID Nº 3, o un fragmento de
la misma. o fragmentos de la misma.
Se une el gen deseado a un vector de
transferencia, tal como pcDNA3, y se usan los recombinantes para
transformar células huésped tales como células
Cos-7. Deberá entenderse que pueden usarse
diferentes vectores de transferencia, células huésped y
procedimientos de transfección conocidos comúnmente por los expertos
en la técnica. En SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22 y SEQ ID Nº 41 se
muestran seis genes deseados para uso en la transfección. Por
ejemplo, se usó transfección mediada por lipofectamina y
recombinación homóloga para introducir el gen de mox1 en
células
NIH 3T3.
NIH 3T3.
Se clona el gen sintético y se produce la
construcción recombinante conteniendo el gen de mox en cultivos de
monocapas confluentes de una línea celular Cos-7.
Posteriormente se purifica la proteína recombinante expresada, de
preferencia usando técnicas de cromatografía por afinidad, y se
determina su pureza y especificidad por medio de procedimientos
conocidos.
Puede usarse una diversidad de sistemas de
expresión para la proteína recombinante. Tales procedimientos de
expresión incluyen, pero no se limitan a los siguientes: sistemas de
expresión bacterianos, incluyendo aquellos que usan E. coli
y Bacillus subtilis; sistemas virales; sistemas de expresión
en levaduras; células cultivadas de insectos y de mamíferos; y
otros sistemas de expresión conocidos por los expertos en la
técnica.
Debe entenderse que los vectores de la presente
invención pueden transfectarse en cualquier célula o línea celular
deseada. Tanto la transfección de células in vivo como in
vitro están contempladas como parte de la presente invención.
Las células de preferencia para transfección incluyen pero no se
limitan a las siguientes: fibroblastos (posiblemente para mejorar
la cicatrización de heridas y la formación de piel), granulocitos
(posible beneficio para aumentar la función en un sistema inmune
comprometido como puede verse en SIDA y en anemia aplásica),
células musculares, neuroblastos, células madre, células de médula
ósea, osteoblastos, linfocitos B y linfocitos T.
Las células pueden transfectarse con una
diversidad de procedimientos conocidos por los expertos en la
técnica e incluyen pero no se limitan a los siguientes:
electroporación, pistola de genes, fosfato de calcio, lipofectamina
y fugene, así como sistemas de transfección adenoviral.
Se usan células transfectadas con los ácidos
nucleicos representados en SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41
o fragmentos de los mismos, para expresar las proteínas SEQ ID Nº 2,
SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, respectivamente, o fragmentos de las
mismas.
Estas proteínas expresadas se usan para obtener
anticuerpos. Estos anticuerpos pueden usarse para una diversidad de
aplicaciones que incluyen pero no se limitan a inmunoterapia contra
cánceres que expresan una de las proteínas mox, y para detección,
localización y medición de las proteínas que se muestran en SEQ ID
Nº 2, SEQ 1 D NO-21, SEQ 1 D Nº 42, o fragmentos de
las mismas.
Las proteínas de la presente invención pueden
expresarse como una proteína de fusión con un componente
polihistidina, tal como una hexahistidina, y purificarse por unión
a una columna de afinidad de metales usando matrices de afinidad de
níquel o cobalto. La proteína puede también expresarse como una
proteína de fusión con glutatión S-transferasa y
purificarse por medio de cromatografía de afinidad usando una matriz
de glutatión agarosa. La proteína puede purificarse también por
cromatografía de inmunoafinidad expresándola como una proteína de
fusión, por ejemplo con antígeno hemaglutinina. La proteína
expresada o que se presenta naturalmente puede también purificarse
por medio de procedimientos cromatográficos y de purificación
convencionales que incluyen la cromatografía de intercambio
aniónico y catiónico, cromatografía de exclusión en gel,
cromatografía en hidroxiapatita, cromatografía de unión a
colorantes, precipitación con sulfato de amonio, precipitación en
disolventes orgánicos u otras técnicas comúnmente conocidas por los
expertos en la técnica.
Se dispone de diferentes procedimientos para
evaluar la actividad de las proteínas expresadas de la presente
invención, que incluyen pero no se limitan a las proteínas
representadas como SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42,
análogos sustituidos de las mismas y fragmentos de las mismas.
Estos ensayos son útiles para evaluar la
eficacia de fármacos diseñados para modular la actividad de las
enzimas de la presente invención. La holoproteína puede expresarse
en células COS-7, células NIH 3T3, células de
insectos (usando tecnología baculoviral) u otras células usando
procedimientos bien conocidos por los expertos en la técnica. Se
usan fracciones de membrana o proteínas purificadas para el ensayo.
El ensayo puede necesitar o puede aumentarse por otras proteínas
celulares tales como p47phox, p67phox, y Rac1, así como
potencialmente otros factores no identificados (por ejemplo,
quinasas u otras proteínas reguladoras).
Se usa NADPH o NADH como sustrato reductor, en
una concentración de aproximadamente 100 \muM. La reducción de
citocromo c se controla por medio de espectrofotometría mediante el
incremento de la absorbancia a 550 nm, asumiendo un coeficiente de
extinción de 21 mM^{-1} \cdot cm^{-1}. El ensayo se realiza en
ausencia y en presencia de aproximadamente 10 \mug de superóxido
dismutasa. La reducción dependiente de superóxido se define como la
reducción de citocromo c en ausencia de superóxido dismutasa menos
la reducción en presencia de superóxido dismutasa (Uhlinger y col.
(1991) J. Biol. Chem. 266, 20990-20997). Puede
usarse también citocromo c acetilado, ya que se piensa que la
reducción de citocromo c acetilado es exclusivamente a través de
superóxido.
Para la reducción de nitroazul de tetrazolio
(NBT), se usa el mismo protocolo general, excepto que se usa NBT en
vez de citocromo c. En general, se agrega aproximadamente 1 ml de
nitroazul de tetrazolio al 0,25% filtrado (Sigma, St. Louis, MO) en
tampón de Hanks sin o con aproximadamente 600 Unidades de
superóxido dismutasa (Sigma) y se incuban las muestras a
aproximadamente 37ºC. El NBT oxidado es claro, mientras que el NBT
reducido es azul e insoluble. Se recoge el producto insoluble por
centrifugación, se suspende la pella en aproximadamente 1 ml de
piridina (Sigma) y se calienta durante aproximadamente 10 minutos a
100ºC para disolver el NBT reducido. Se determina la concentración
de NBT midiendo la absorbancia a 510 nm, usando un coeficiente de
extinción de
11.000 M^{-1} \cdot cm^{-1}. Los pocillos no tratados se usaron para determinar el número de células.
11.000 M^{-1} \cdot cm^{-1}. Los pocillos no tratados se usaron para determinar el número de células.
La generación de superóxido puede controlarse
también con un sistema de detección de quimioluminiscencia que usa
lucigenina (nitrato de
bis-N-metilacridinio, Sigma, St.
Louis, MO). Se mezcla la muestra con aproximadamente 100 \muM de
NADPH (Sigma, St. Louis, MO) y 10 \muM de lucigenina (Sigma, St.
Louis, MO) en un volumen de aproximadamente 150 \mul de solución
de Hanks. Se controla la luminiscencia en una placa de 96 pocillos
usando un LumiCounter (Packard, Downers Grove, IL) durante 0,5
segundos por lectura en intervalos de aproximadamente 1 minuto para
un total de aproximadamente 5 minutos; el valor estable más elevado
en cada serie de datos se usa para comparación. Como anteriormente,
se agrega superóxido dismutasa a algunas muestras para probar que
la luminiscencia se produce a partir del superóxido. Se resta un
blanco de tampón de cada lectura (Ushio-Fukai y
col. (1996) J. Biol. Chem. 271, 23317-23321).
Los ensayos para generación de superóxido
generación pueden llevarse a cabo usando células intactas, por
ejemplo, las células NIH 3T3 transfectadas con mox. En principio,
cualquiera de los ensayos anteriores puede usarse para evaluar la
generación de superóxido usando células intactas, por ejemplo las
células NIH 3T3 transfectadas con mox. Un procedimiento de
preferencia es la reducción de NBT.
Sin pretender estar ligados a la siguiente
afirmación, no se espera que la proteína truncada que comprende
aproximadamente los 265 restos aminoácido del extremo C terminal
genere superóxido, y por lo tanto, no se agrega superóxido
dismutasa en los ensayos de proteína truncada. Básicamente, se
establece un ensayo similar y se examina la reducción independiente
de superóxido de NBT, citocromo c, diclorofenolindofenol,
ferricianuro u otro colorante activo por redox.
Las secuencias de nucleótidos SEQ ID Nº 1, SEQ
ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, así como los fragmentos de las mismas y
cebadores de PCR de las mismas, pueden usarse, respectivamente, para
localización, detección y medición de ácidos nucleicos
relacionados con SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41 así como
fragmentos de los mismos. La secuencia de nucleótidos SEQ ID Nº 1
es llamada también gen mox1 humano en esta solicitud. La SEQ ID Nº
22 es conocida también como el gen de mox1 de rata en esta
solicitud. La SEQ ID Nº 41 es conocida también como el gen mox1B de
rata en esta solicitud.
Las secuencias de nucleótidos SEQ ID Nº 1, SEQ
ID Nº 22, SEQ ID Nº 41 así como fragmentos de las mismas, pueden
usarse para crear sondas para aislar secuencias de nucleótidos más
largas conteniendo las secuencias de nucleótidos SEQ ID Nº 1, SEQ
ID Nº 22 y SEQ ID Nº 41 respectivamente. Las secuencias de
nucleótidos SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, así como
fragmentos de las mismas, pueden usarse también para crear sondas
para identificar y aislar proteínas mox de otras especies.
Los ácidos nucleicos descritos en este documento
incluyen ARN mensajero que codifica la producción de SEQ ID Nº 2,
SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, y fragmentos de las mismas. Tales ácidos
nucleicos incluyen, pero no se limitan a sondas de ADNc. Estas
sondas pueden estar marcadas en una diversidad de formas conocidas
por los expertos en la técnica. Tales procedimientos incluyen pero
no se limitan a marcado isotópico y no isotópico. Pueden usarse
estas sondas para hibridación in situ para localización de
ácidos nucleicos tal como ARNm que codifica SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº
21, SEQ ID Nº 42, y fragmentos de los mismos. La localización puede
realizarse usando hibridación in situ a nivel de resolución
ultraestructural y a nivel de microscopía óptica usando técnicas
conocidas por los expertos en la técnica.
Estas sondas pueden también usarse para detectar
y cuantificar ácidos nucleicos y niveles de ARNm usando técnicas
conocidas por los expertos en la técnica que incluyen pero no se
limitan a hibridación de solución.
Las proteínas que se muestran en SEQ ID Nº 2,
SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, o fragmentos de las mismas, se combinan
con un vehículo farmacéuticamente aceptable para producir una
composición farmacéutica y administrarla a animales para la
producción de anticuerpos policlonales usando procedimientos
conocidos por los expertos en la técnica. Los animales de
preferencia para la producción de anticuerpos son conejos y ratones.
Pueden usarse otros animales para inmunización con estas proteínas
o fragmentos de las mismas; ovejas, caballos, cerdos, burros, vacas,
monos y roedores tales como cobayas y ratas.
La expresión "vehículo farmacéuticamente
aceptable" se usa en este documento para significar cualquier
líquido incluyendo pero no limitado a agua o solución salina,
aceite, gel, bálsamo, disolvente, diluyente, base de ungüento
fluido, liposoma, micela, micela gigante y similares, que es
adecuado para uso en contacto con animales o tejidos humanos vivos
sin causar respuestas fisiológicas adversas, y que no interactúa con
los otros componentes de la composición de manera perjudicial.
Las composiciones farmacéuticas pueden
presentarse convenientemente en formas de dosificación unitarias y
pueden prepararse por medio de técnicas farmacéuticas
convencionales. Tales técnicas incluyen la etapa de asociar el
ingrediente activo y el(los) vehículo(s) o
excipiente(s) farmacéutico(s). En general, las
formulaciones se preparan asociando uniforme e íntimamente el
ingrediente activo con los vehículos líquidos.
Las formulaciones adecuadas para administración
parenteral incluyen soluciones para inyección estériles acuosas y
no acuosas que pueden contener antioxidantes, tampones,
bacteriostáticos y solutos que otorgan a la formulación
isotonicidad con la sangre del receptor; y suspensiones estériles
acuosas y no acuosas que pueden incluir agentes de suspensión y
agentes espesantes. Las formulaciones pueden presentarse en envases
de dosis unitarias o de dosis múltiples, por ejemplo, ampollas y
viales sellados, y pueden almacenarse liofilizadas requiriendo sólo
el agregado del vehículo estéril líquido, por ejemplo agua para
inyecciones, inmediatamente previo al uso. Las suspensiones y
soluciones para inyección extemporánea pueden prepararse a partir de
polvos estériles, gránulos y comprimidos comúnmente usados por un
experto en la técnica.
Las formulaciones de dosificación unitaria de
preferencia son aquellas que contienen una dosis o unidad, o una
fracción adecuada de las misma, del ingrediente administrado.
Debería entenderse que en el agregado de otros ingredientes,
particularmente mencionados anteriormente, la presente invención
puede incluir otros agentes comúnmente usados por los expertos en
la técnica. La composición farmacéutica puede administrarse a través
de diferentes vías, tales como oral, incluyendo bucal y sublingual,
rectal, parenteral, aerosol, nasal, intramuscular, subcutánea,
intradérmica y tópica. La composición farmacéutica de la presente
invención puede administrarse en diferentes formas, incluyendo pero
no limitado a soluciones, emulsiones y suspensiones, microesferas,
partículas, nanopartículas y liposomas. Se espera que se necesiten
desde aproximadamente 1 hasta 7 dosificaciones por régimen de
inmunización. Las inyecciones iniciales pueden variar desde
aproximadamente 0,1 hasta 1 mg, con un intervalo de preferencia
desde aproximadamente 1 \mug hasta 800 \mug, y un intervalo de
más preferencia desde aproximadamente 25 \mug hasta 500 \mug.
Las inyecciones de estímulo pueden variar desde 0,1 \mug hasta 1
mg, con un intervalo de preferencia de aproximadamente 1 \mug a
800 \mug, y de más preferencia desde aproximadamente 10 \mug
hasta 500 \mug.
El volumen de administración variará dependiendo
de la vía de administración y el tamaño del receptor. Por ejemplo,
las inyecciones intramusculares pueden variar desde aproximadamente
0,1 ml hasta 1,0 ml.
La composición farmacéutica puede almacenarse a
temperaturas desde aproximadamente 4ºC hasta -100ºC. La composición
farmacéutica puede también almacenarse en estado liofilizado a
diferentes temperaturas incluyendo temperatura ambiente. La
composición farmacéutica puede esterilizarse a través de medios
convencionales conocidos por los expertos en la técnica. Tales
medios incluyen, pero no se limitan a filtración, radiación y calor.
La composición farmacéutica de la presente invención puede también
combinarse con agentes bacteriostáticos, tal como timerosal, para
inhibir el crecimiento bacteriano.
Puede administrarse una diversidad de adyuvantes
conocidos por los expertos en la técnica en conjunción con la
proteína en la composición farmacéutica. Tales adyuvantes incluyen,
pero no se limitan a los siguientes: polímeros, copolímeros tales
como copolímeros de polioxietileno-polioxipropileno,
incluyendo copolímeros de bloque; polímero P1005; adyuvante
completo de Freund (para animales); adyuvante incompleto de Freund;
sorbitán monooleato; escualeno; adyuvante CRL-8300;
alum; QS 21, dipéptido de muramilo; trehalosa; extractos
bacterianos, incluyendo extractor de micobacterias; endotoxinas
detoxificadas; lípidos de membrana; o combinaciones de los
mismos.
Pueden producirse anticuerpos monoclonales
usando tecnología de hibridomas de acuerdo con los procedimientos
bien conocidos por los expertos en la técnica. Los anticuerpos son
útiles como reactivos de diagnóstico o investigación o pueden
usarse para inmunización pasiva. La composición puede opcionalmente
contener un adyuvante.
Los anticuerpos policlonales y monoclonales
útiles como reactivos de diagnóstico o investigación pueden usarse
para la detección y medición de SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº
42, y fragmentos de las mismas. Tales anticuerpos pueden usarse
para detectar estas proteínas en una muestra biológica, incluyendo
pero no limitado a muestras tales como células, extractos
celulares, tejidos, extractos tisulares, biopsias, tumores y fluidos
biológicos. Tal capacidad de detección es útil para detectar
enfermedades relacionadas con estas proteínas para facilitar el
diagnóstico y pronóstico y para sugerir posibles alternativas de
tratamiento.
La detección puede lograrse a través del uso de
inmunocitoquímica, ELISA, radioinmunoensayo u otros ensayos
comúnmente conocidos por los expertos en la técnica. Las proteínas
mox1, mox2, duox1 y duox2, o fragmentos de las mismas, pueden
marcarse a través de técnicas comúnmente conocidas que incluyen pero
no se limitan a las siguientes: radiomarcado, colorantes,
partículas magnéticas, biotina-avidina, moléculas
fluorescentes, moléculas y sistemas quimioluminiscentes, ferritina,
oro coloidal y otros procedimientos conocidos por los expertos en
la técnica de marcado de proteínas.
Los anticuerpos dirigidos a las proteínas
mostradas como SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, o dirigidos
a fragmentos de las mismas, pueden también administrarse
directamente a seres humanos y animales en un paradigma de
inmunización pasiva. Los anticuerpos dirigidos a porciones
extracelulares de SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, se unen
a estos epítopes extracelulares. La unión de marcadores a estos
anticuerpos facilita la localización y visualización de los sitios
de unión. La unión a estos anticuerpos de moléculas tales como
ricina u otras citotoxinas ayuda a dañar o matar selectivamente
células que expresan SEQ ID Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 42, o
fragmentos de las mismas.
La presente invención incluye equipos útiles con
los anticuerpos, ácidos nucleicos, sondas de ácidos nucleicos,
anticuerpos marcados, proteínas marcadas o fragmentos de las mismas
para la detección, localización y medición de SEQ ID Nº 1, SEQ ID
Nº 2, SEQ ID Nº 21, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41, SEQ ID Nº 42, o
combinaciones y fragmentos de las mismas.
Los equipos pueden usarse para
inmunocitoquímica, hibridación in situ, hibridación en
solución, radioinmunoensayo, ELISA, reacciones de transferencia
Western, PCR cuantitativa y otros ensayos para la detección,
localización y medición de estos ácidos nucleicos, proteínas o
fragmentos de las mismas usando técnicas conocidas por los expertos
en la técnica.
Las secuencias de nucleótidos mostradas en SEQ
ID Nº 1, SEQ ID Nº 22; SEQ ID Nº 41 o fragmentos de las mismas,
pueden también usarse bajo condiciones de rigurosidad alta para
detectar mensajes empalmados alternativamente relacionados con SEQ
ID Nº 1, SEQ ID Nº 22, SEQ ID Nº 41 o fragmentos de las mismas,
respectivamente.
Como se discutió en uno de los Ejemplos, la
proteína mox1 (SEQ ID Nº 21) es similar a la proteína gp91 de
ratón (SEQ ID Nº 38), mientras que la proteína mox1B de rata (SEQ
ID Nº 42) es similar a la proteína gp91 humana (SEQ ID Nº 12). Esta
observación sugiere que pueden existir otras isoformas de gp91 de
ratón y humana. Además, también existe otro subtipo de mox1 humana
similar a mox1B de rata (SEQ ID Nº 42). La presencia de dos
isoformas de proteína mox1 de rata en músculo liso vascular puede
tener consecuencias fisiológicas y aplicaciones biomédicas
importantes. Por ejemplo, las dos isoformas pueden tener diferentes
actividades biológicas, diferente distribución tisular y pueden
estar reguladas de manera diferente en condiciones fisiológicas y/o
patológicas. El hecho de que se aislara mox1B (SEQ ID Nº 42) de
células expuestas a angiotensina II, conocida por promover el
estrés oxidativo y crecimiento vascular, sugiere que podría ser
regulada positivamente por esta hormona y que podría haber
sobreexpresión en la enfermedad. Por consiguiente, los equipos para
diagnóstico de la presente invención pueden medir la expresión
relativa de las dos isoformas de mox. Los equipos para diagnóstico
pueden también medir o detectar la expresión relativa de las
proteínas mox descritas en este documento (es decir, mox1 humana y/o
mox2 humana).
Los fragmentos de SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22, SEQ
ID Nº 41 que contienen la secuencia de hibridación relevante pueden
sintetizarse sobre la superficie de una matriz de chip.
Posteriormente se marcan fluorescentemente muestras de ADN, por
ejemplo de tumores, y se hibridan en el chip para detección. Este
enfoque puede usarse como diagnóstico para caracterizar los tipos
de tumores y para diseñar tratamientos y/o proveer información
acerca del pronóstico. Tal información sobre el pronóstico puede
tener valor predictivo con relación a la progresión de la
enfermedad y expectativa de vida y puede también afectar la elección
del tratamiento.
La presente invención se ilustra además con los
siguientes ejemplos.
Usando gp91 como secuencia consultada, una
porción secuenciada de 334 bases de la secuencia tag expresada
(EST) 176696 (GenBank Número de Acceso AA305700) mostró 68,8% de
identidad de secuencia al nivel predicho de aminoácidos con (h)
gp91phox humana. Se adquirió la cepa bacteriana número 129134
conteniendo la secuencia EST en el vector pBluescript SK, en la
American Tissue Type Culture Collection (ATCC, Rockville, MD). Se
clonó la secuencia EST originalmente de la línea celular de
carcinoma de colon Caco-2 humana. Además se
secuenció el ADN de EST176696 usando los promotores y cebadores T7
y T3 de los vectores, diseñados para coincidir con la secuencia 3'
conocida. Los cebadores internos usados para la secuenciación fueron
los siguientes: 5'-AAC AAG CGT GGC TTC AGC
ATG-3' SEQ ID Nº 5 (251S, la numeración está basada
en los nucleótidos a partir del extremo 5' de EST176696, y S indica
la dirección con sentido), 5'-AGC AAT ATT GTT GGT
CAT-3' SEQ ID Nº 6 (336S), 5'-GAC
TTG ACA GAA AAT CTA TAA GGG-3' SEQ ID Nº 7 (393S),
5'-TTG TAC CAG ATG GAT TTC AA-3' SEQ
ID Nº 8 (673A, A indica la dirección antisentido),
5'-CAG GTC TGA AAC AGA AAA CCT-3'
SEQ ID Nº 9 (829S), 5'ATG AAT TCT CAT TAA TTA TTC AAT
AAA-3' SEQ ID Nº 10 (1455A).La secuencia
codificadora en EST176696 mostró homología con una extensión de 250
aminoácidos correspondiente al 44% del extremo N terminal de
gp91phox humana, y contenía un codón de finalización
correspondiente con la localización en gp91phox humana. La
amplificación 5' rápida de extremos de ADNc (RACE) se llevó a cabo
usando una biblioteca de ADNc de colon humano y el equipo de
amplificación Marathon cDNA Amplification Kit (CIonTech) usando
5'-ATC TCA AAA GAC TCT GCA CA-3' SEQ
ID Nº 11(41A) como cebador interno específico de gen
(Frohman y col. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85,
8998-9002). La 5' RACE dio como resultado un
fragmento de 1,1 kb que representa la secuencia 5' completa, basado
en la homología con gp91phox. La reamplificación se realizó con
cebadores abarcando los codones de inicio putativo y de terminación,
usando el producto de 5' RACE de 1,1 kb y
pSK-EST176696 para el diseño del cebador. El
fragmento amplificado de 1,7 kb se clonó por clonación TA en el
vector PCR2.1 (Invitrogen, Carlsbad, CA). Nos referimos a este
vector recombinante como PCR-mox.
La Figura 1 (a-d) presenta una
comparación de las secuencias presentes de aminoácidos de gp91phox
humana, bovina y murina con las proteínas mox1 humana y de rata de
la presente invención y la proteína duox2 humana de la presente
invención. También se muestran las secuencias de aminoácidos para
proteínas enzimáticas relacionadas con plantas.
La hp65mox codificada (refiriéndose "mox" a
oxidasa mitogénica y "65" a su peso molecular predicho) se
presenta como SEQ ID Nº 2. h-gp91phox (SEQ ID Nº
12) y SEQ ID Nº 2 difieren en longitud por 3 restos y son una 70%
idénticas en su secuencia de aminoácidos. h-gp91phox
y SEQ ID Nº 2 muestran un porcentaje de identidad mayor en la mitad
C terminal de la molécula que contiene los sitios de unión a NADPH y
FAD putativos, y existen diversas extensiones relativamente largas
con identidad completa dentro de esta región.
Un dendrograma (Figura 2) que compara las
secuencias de aminoácidos de gp91phox de ratón y humana con la
secuencia de mox1 SEQ ID Nº 2 muestra que la última probablemente
representa una isoforma distinta de gp91phox. También se indican
dos homólogos de la subunidad grande de citocromo b558 de plantas y
representan relaciones más distantes con las secuencias humanas. La
humana (y mox1 de rata más extensamente descrita a continuación)
carece de sitios de glicosilación unidos a asparagina, que se
observan en las gp91phox altamente glicosiladas de humano y de
ratón. Además, los perfiles de hidrofobicidad de gp91phox humana y
mox1 son prácticamente idénticos e incluyen cinco extensiones
hidrófobas en la mitad amino terminal de las moléculas que se
predice que son regiones que abarcan la membrana.
Se hibridaron membranas de transferencia
northern (MTN) y Human MTN Blot IV (CIonTech) de múltiples tejidos
humanos con la región codificadora putativa del vector
PCR-mox a 68ºC durante varias horas. La región que
codifica mox se marcó por cebado aleatorio con
[\alpha-^{32}P]dCTP (10 \muCi) usando
el equipo Prime-It II (Stratagene). Para el
análisis de expresión de mox1 en líneas celulares, se preparó ARN
total a partir de 10^{6} células usando el equipo High Pure RNA
Isolation Kit (Boehringer Mannheim) o el equipo RNeasy (Quiagen).
Se separó el ARN total (10-20 \mug) en un minigel
de agarosa 1% y formaldehído y se transfirió a un filtro Nytran
(Biorad) y se inmovilizó por entrecruzamiento con luz
ultravioleta.
La transferencia Northern reveló que la mayor
localización de ARNm que codifica la proteína mox1 fue el colon.
También se detectó el mensaje en próstata y útero. La línea celular
de carcinoma de colon humano, Caco-2, también
expresó grandes cantidades de mensaje de mox1. La transferencia
Northern de ARNm de células de músculo liso de aorta de rata
también mostraron fuerte hibridación, que aumentó al doble en 12
horas tras el tratamiento con factor de crecimiento derivado de
plaquetas. Este aumento en la expresión de mox1 de rata es coherente
con idea de que mox1 contribuye con los efectos estimulantes del
crecimiento de PDGF.
Se subclonó la secuencia de nucleótidos (SEQ ID
Nº 1) que codifica la producción de la proteína mox1 (SEQ ID Nº 2)
en el sitio Not1 del vector pEF-PAC (obtenido en
Mary Dinauer, Indiana University Medical School, Indianapolis, IN)
que tiene un gen de resistencia a la puromicina. La transfección se
realizó como describen Sambrook y col., Molecular Cloning, A
Laboratory Manual, Volúmenes 1-3, 2º edición, Cold
Spring Harbor Laboratory Press, N.Y.,1989. Se transfectaron la SEQ
ID Nº 1 en pEF-PAC y el vector vacío por separado en
células NIH 3T3 usando Fugene 6 (Boeringer Mannheim). Se
transfectaron aproximadamente 2 x 10^{6} células mantenidas en
DMEM conteniendo 10% de suero de ternera con 10 \mug de ADN. Tras
2 días, se separaron las células y se seleccionaron en el mismo
medio conteniendo 1 mg/ml de puromicina. Se subcultivaron las
colonias supervivientes durante 10 a 14 días continuamente en
presencia de puromicina.
Las células transfectadas exhibieron una
morfología de tipo "transformada", similar a la observada con
células transfectadas con (V12)Ras, caracterizadas por
células similares a husos largos. Las células originales NIH 3T3 o
células transfectadas con vectores vacíos mostraron morfología
similar a fibroblastos.
Para verificar la expresión de ARNm de mox1 tras
la transfección, se realizaron RT-PCR y
transferencias Northern. Se preparó ARN total a partir de 10^{6}
células usando el equipo High Pure RNA Isolation Kit (Boeringer
Mannheim) o el equipo RNeasy (Qiagen), se prepararon DNAc de cada
colonia a partir de 1-2 \mug de ARN total usando
un equipo Advantage RT-PCR Kit (CIonTech). La
amplificación por PCR se realizó usando cebadores,
5'-TTG GCTAAATCC CAT CCA-3' SEQ ID
Nº 13 (NN459S, los números que tienen NN indican numeración a partir
del codón de inicio de mox1) y 5'-TGC ATG ACC AAC
AAT ATT GCT G-3' SEQ ID Nº 14 (NN1435A). Para la
transferencia Northern, se separaron 10-20 \mug
de ARN total en un gel de agarosa 1% y formaldehído y se transfirió
a un filtro de nylon. Tras el entrecruzamiento por ultravioleta
(UV), se usaron los filtros para en ensayo de transferencia
Northern como se describió en el Ejemplo 2.
Se eligieron las colonias que expresaron la
mayor cantidad de ARNm de mox1 para otros análisis. La expresión de
ARNm para gliceraldehído 3-fosfato deshidrogenasa
fue normal en diversas líneas celulares.
Se prepararon 10^{5} a 10^{3} células
transfectadas de manera estable con gen de mox1 humana SEQ ID Nº 1
y con el vector vacío en solución al 0,3% de agar caliente (40ºC)
conteniendo DMEM y 10% de suero de ternera. Se distribuyeron las
células en placas de agar al 0,6% endurecido preparadas con DMEM y
10% de suero de ternera. Tras tres semanas en cultivo (37ºC, 5% de
CO_{2}) se observó la formación de colonias por microscopía.
Las células transfectadas de manera estable con
el vector vacío y cultivadas en agar blando durante 3 semanas como
anteriormente, no mostraron crecimiento independiente del anclaje.
Por el contrario, las células NIH 3T3 transfectadas de manera
estable con mox1 (SEQ ID Nº 1) y cultivadas durante 3 semanas en
agar blando demostraron crecimiento de colonias independiente del
anclaje.
En una forma de realización de la presente
invención, se analizaron células NIH 3T3 transfectadas de manera
estable con el gen de mox1 humana (SEQ ID Nº 1) para la generación
de superóxido usando el ensayo de luminiscencia con lucigenina
(Bis-N-metilacridinio) (Sigma, St.
Louis, MO, Li y col. (1998) J. Biol. Chem. 273,
2015-2023). Se lavaron las células con solución de
HANK fría y se homogeneizaron en tampón de HANHS conteniendo 15% de
sacarosa sobre hielo usando un homogeneizador Dounce. Se congelaron
inmediatamente los lisados celulares en un baño de hielo
seco/etanol. Para el ensayo, se mezclaron 30 \mug de lisado
celular con 200 \muM de NADPH y 500 \muM de lucigenina. Se
controló la luminiscencia usando un LumiCounter (Packard) en tres
intervalos sucesivos de un minuto y se usó el valor más elevado
para comparación. Se determinó la concentración de proteína por el
método de Bradford.
Se controló la generación de superóxido en
lisados de algunas de las líneas celulares transfectadas y se
comparó con la generación de superóxido en los lisados de células
NIH 3T3 no transfectadas. Los resultados se muestran en la Tabla 4.
Las líneas celulares 26, 27 y 28 dieron el mayor grado de cambios
morfológicos por examen microscópico correspondiendo a los mayores
grados de generación de superóxido. Se inhibió la señal luminiscente
por medio de superóxido dismutasa y el inhibidor general de
flavoproteínas difenilen yodonio, pero no se vio afectada por el
agregado de p47phox, p67phox y Rac1 (GTP-\gammaS)
recombinantes humanas, que son factores citosólicos esenciales para
la oxidasa de explosión respiratoria de fagocitos.
En una forma de realización alternativa de
preferencia de la presente invención, se cultivaron las células
transfectadas de manera estable con mox1(YA28) o con vector
vacío (NEF2) en placas de cultivo tisular de 10 cm en medio
conteniendo DMEM, 10% de suero de ternera, 100 unidades/ml de
penicilina, 100 \mug/ml de estreptomicina, y 1 \mug/ml de
puromicina hasta una confluencia de aproximadamente 80%. Se lavaron
las células (cinco placas de cultivo tisular de cada tipo celular)
ligeramente con 5 ml de solución salina tamponada con fosfato (PBS),
a continuación se disociaron de las placas con PBS conteniendo 5 mM
de EDTA. Se sedimentaron las células por centrifugación breve
a 1000 g.
a 1000 g.
Para permeabilizar las células, se llevó a cabo
la lisis por congelación-descongelación y
posteriormente se pasaron las células a través de una aguja de
pequeño calibre. Se retiraron los sobrenadantes y se congelaron las
células en hielo seco durante 15 minutos. Tras descongelar las
células, se agregaron 200 \mul de tampón de lisis (Solución
Salina Tamponada de HANK HBBS) conteniendo una mezcla de inhibidores
de proteasas de Sigma (Nº de Catálogo: P2714). Se pasaron las
células en hielo 10 veces a través de una aguja de calibre 18 y se
agregaron 200 \mul de tampón HBBS conteniendo 34% de sacarosa para
dar una concentración final de sacarosa de 17%. Aparentemente la
sacarosa mejora la estabilidad tras el almacenamiento. La
combinación de congelación-descongelación y el
pasaje a través de la aguja da como resultado la lisis de
esencialmente todas las células, a este material lo llamamos
"lisado celular".
Se ensayaron los lisados celulares para obtener
la concentración de proteína usando el sistema de ensayo de
proteínas de BioRad. Se analizaron los lisados celulares para
quimioluminiscencia dependiente de NADPH combinando tampón HBBS,
ácido araquidónico y 0,01-1 \mug de proteína en
las placas de ensayo (placas de plástico de 96 pocillos). Se inició
la reacción agregando 1,5 mM de NADPH y 75 \muM de lucigenina a la
mezcla del ensayo para dar una concentración final de 200 \muM de
NADPH y 10 \muM de lucigenina, y se controló inmediatamente la
quimioluminiscencia. El volumen final del ensayo fue de 150 \mul.
La concentración óptima de ácido araquidónico fue de entre 50 y 100
\muM. Se usó un luminómetro Packard Lumicount para medir la
quimioluminiscencia de la reacción entre lucigenina y superóxido a
37ºC. Se controló la placa continuamente durante 60 minutos y se
usó el valor máximo de unidad relativa de luminiscencia (RLU) para
el gráfico.
La Figura 3 muestra RLU en varias
concentraciones de lisados celulares de células transfectadas con
mox1 (YA28) y células control de vector (NEF2). La presencia de
NaCl o KCI dentro del intervalo de concentraciones de
50-150 \muM es importante para la actividad
óptima. MgCl_{2} (1-5 mM) además mejoró la
actividad en aproximadamente 2 veces. Este ensayo libre de células
para actividad NADPH oxidasa de mox1 es útil para seleccionar
moduladores (inhibidores o estimuladores) de la enzima mox1. El
ensayo puede usarse también para detectar actividad NADPH oxidasa
de mox y duox en general y para seleccionar moduladores (inhibidores
o estimuladores) de la familia de enzimas mox y duox.
Se controló la generación de superóxido por
células intactas usando la reducción de nitroazul de tetrazolio
sensible a superóxido dismutasa. Se plaquearon células NEF2
(control, vector solo), YA26 (transfectadas con mox1(SEQ ID
Nº 1)) y YA28 (transfectadas con mox1 (SEQ ID Nº 1)) en seis placas
a razón de 500.000 células por pocillo. Aproximadamente 24 más
tarde, se retiró el medio de las células y se lavaron las células
una vez con 1 ml de solución de Hanks (Sigma, St. Louis, MO). Se
agregó aproximadamente 1 ml de Nitroazul de tetrazolio al 0,25%
filtrado (NBT, Sigma) en solución de Hanks sin o con 600 unidades de
superóxido dismutasa (Sigma) y se incubaron las células a 37ºC en
presencia de 5% de CO_{2}. Tras 8 minutos, se rasparon las células
y se sedimentaron a más de 10.000 g. Se resuspendió la pella en 1
ml de piridina (Sigma) y se calentó durante 10 minutos a 100ºC para
disolver el NBT reducido. Se determinó la concentración de NBT
reducido midiendo la absorbancia a 510 nm, usando un coeficiente de
extinción de 11.000 M^{-}1 \cdot cm^{-1}. Algunos pocillos no
se trataron y se usaron para determinar el número de células.
Los datos se presentan en la Tabla 5 y en la
Figura 4 e indican que las células transfectadas con mox1 (SEQ ID
Nº 1) generaron cantidades significativamente importantes de
superóxido.
Dado que no es probable que la superóxido
dismutasa penetre en las células, el superóxido debe generarse
extracelularmente. La cantidad de superóxido generada por estas
células es aproximadamente el 5-10% del generado por
neutrófilos humanos activados.
Para probar si el superóxido generado por mox1
puede afectar "dianas" intracelulares, se controló la actividad
aconitasa en células control y en líneas celulares transfectadas
con mox como describen Suh y col. en (1999) Nature 401,
79-82. La aconitasa contiene un centro activo de
cuatro hierros y cuatro azufres que es altamente susceptible de
modificación por superóxido, dando como resultado la pérdida de
actividad, y se ha usado como indicador de generación intracelular
de superóxido. Se determinó la actividad aconitasa como describieron
Gardner y col. en (1995) J. Biol. Chem.
270,13399-13405. La actividad aconitasa disminuyó
significativamente en todas las líneas celulares transfectadas con
mox designadas YA26, YA28 y YA212 en comparación con el control
transfectado (Figura 5). Aproximadamente el 50% de la aconitasa en
estas células es mitrocondrial, en base a la centrifugación
diferencial, y las formas citosólica y mitocondrial fueron ambas
afectadas. Las enzimas control citosólicas y mitocondriales que no
contienen centros activos hierro azufre no fueron afectadas. El
superóxido generado en las células transfectadas con mox1 es por lo
tanto capaz de reaccionar con componentes celulares y
modificarlos.
Se inyectaron aproximadamente 2 x 10^{6}
células NIH 3T3 (transfectadas con mox1 con SEQ ID Nº 1 o células
transfectadas usando vector vacío) por vía subdérmica en la cara
lateral del cogote de ratones desnudos de 4-5
semanas. Se inyectaron tres a seis ratones para cada una de las
líneas celulares transfectadas con mox1, y se inyectaron 3 ratones
con células transfectadas con vector vacío (control). Tras 2 a 3
semanas, se sacrificaron los ratones. Se fijaron los tumores en
formalina al 10% y se caracterizaron por análisis histológico. El
tamaño promedio de los tumores fue de 1,5 x 1 x 1 cm y mostraron
histología típica para tumores de tipo sarcoma. Además, los tumores
resultaron muy vascularizados con capilares superficiales. Once de
doce ratones inyectados con células transfectadas con gen de mox1
desarrollaron tumores, mientras que ninguno de los tres animales
control desarrollaron tumores.
En otro estudio, se inyectaron 15 ratones con
células NIH 3T3 transfectadas con mox1. De los 15 ratones
inyectados, 14 mostraron grandes tumores en el transcurso de 17
días de la inyección, y los tumores mostraron expresión de ARNm de
mox1. Histológicamente, los tumores se parecieron a fibrosarcomas y
fueron similares a los tumores inducidos por ras. Por ello, ras y
mox1 tuvieron potencia similar en relación a la capacidad de inducir
tumorigenicidad de células NIH 3T3 en ratones atímicos.
Se demostró un papel en el crecimiento normal en
células de músculo liso vascular de aorta en ratas usando
antisentido para mox1 de rata. La transfección con el ADN
antisentido dio como resultado una disminución en la generación de
superóxido y en el crecimiento dependiente de suero. Por
consiguiente, mox1 está implicada en el crecimiento normal en este
tipo celular.
SEQ ID Nº 2 también se expresó en células de
insecto usando baculovirus recombinante. Para establecer el sistema
de virus expresando p65mox1, se clonó inicialmente el gen de mox1
(SEQ ID Nº 1) en el vector pBacPAK8 (Clontech, Palo Alto, CA) y se
construyó el baculovirus recombinante usando procedimientos
convencionales de acuerdo con los protocolos del fabricante.
Brevemente, se clonó ADN de mox1 amplificado por PCR en los sitios
KpnI y EcoRI del vector. Los cebadores usados para la amplificación
por PCR fueron: 5'-CAA GGT ACC TCT TGA CCA TGG GAA
ACT-3', SEQ ID Nº 15, y 5'-ACG AAT
TCA AGT AAA TTA CTG AAG ATA C-3', SEQ ID Nº 16. Se
infectaron células Sf9 de insecto (2 x 10^{6} células) con 0,5 mg
de ADN de baculovirus linealizado comercializado bajo la marca
registrada BACULOGOLD® (PharMingen, San Diego, CA) y 5 mg de
pBacPACB-p65mox1 usando Tampones de Transfección A
y B (PharMingen, San Diego, CA). Tras 5 días, se recogieron los
sobrenadantes conteniendo los virus recombinantes y se amplificaron
infectando células sf9 nuevas durante 7 días. La amplificación se
realizó tres veces y la presencia de virus recombinante conteniendo
ADN de mox1 se confirmó por PCR usando los mismos cebadores. Tras
amplificar tres veces los virus, se realizó una purificación en
placa para obtener valoraciones de virus elevadas. Se infectaron
aproximadamente 2 x 10^{8} células sf9 en placas de agar durante 5
días con diluciones en serie de virus y se tiñeron con rojo neutro
para facilitar la detección de placas de virus. Se extrajeron las
placas de virus seleccionadas y se confirmó nuevamente la presencia
de ADN de mox1 humana por PCR.
Se obtuvieron clones de ADNc de p65mox de
células de músculo liso de aorta de rata. Se realizó
RT-PCR (reacción en cadena de polimerasa con
transcripción inversa) de la siguiente manera: la síntesis de la
primer hebra de ADNc se realizó usando ARN total de células de
músculo liso vascular de aorta de rata, cebador oligo dT y
transcriptasa inversa superscript II, a continuación se incubó con
RNasa H. Los cebadores de PCR degenerados se diseñaron para
hibridar con áreas conservadas en las regiones de codificación de
h-mox1 y gp91phox de origen humano (X04011), de
ratón (U43384) y porcino (SSU02476). Los cebadores fueron: sentido
5'-CCIGTITGTCGIAATCTGCTSTCCTT-3',
SEQ ID Nº 17 y antisentido
5'-TCCCIGCAIAICCAGTAGAARTAGATCTT-3',
SEQ ID Nº 18. Se purificó un producto principal de PCR del tamaño
esperado 1,1 kb por electroforesis en agarosa y se usó como molde en
una segunda reacción de amplificación por PCR.
Se generaron extremos romos en una alícuota del
producto de RT-PCR, se unieron a un vector Litmus 29
modificado y se usó para transformar E. coli XL10
competente. Se seleccionaron aproximadamente 120 colonias de
bacterias para la presencia del inserto completo por PCR directa
usando cebadores de vectores y polimerasa Taq. Se purificaron
plásmidos de 25 colonias positivas y se mapearon por digestión con
BamHI. Se secuenciaron parcialmente plásmidos representativos de
cada patrón de digestión. Cinco de 25 clones contenían productos de
amplificación no específicos y 20 contenían insertos idénticos a
(h)mox1humana. Se determinó la secuencia completa de uno de
los últimos clones y resultó ser 83% idéntico a (h)mox1
sobre 1060 nucleótidos. Se generó una sonda de 1,1 kb por
amplificación con PCR del inserto de un clon de mox1 de rata con
los cebadores degenerados descritos anteriormente y se usaron para
hibridar a una Northem de ARN de células de músculo liso vascular de
rata. Una banda única, migrando entre ARNr 28S y ARNr 18S, indicó
la presencia de un mensaje con un tamaño compatible con el de mox1
humana
(2,6 kb).
(2,6 kb).
Para obtener mox1 de rata en toda su extensión,
se llevaron a cabo reacciones de amplificación rápida (RACE) 3' y
5' de los extremos de ADNc como se describió anteriormente, usando
los cebadores específicos de gen 5'-TTGGCA
CAGTCAGTGAGGATGTCTTC-3', SEQ ID Nº 19 y 5'-CTGTTGGCTTCTACTGTAGCGTTCAAAGTT-3', SEQ ID Nº 20 para RACE 3' y 5', respectivamente. Se obtuvieron los productos principales de 1,5 km y 850 pb para RACE 3' y 5', respectivamente. Se purificaron estos productos por electroforesis en gel de agarosa y se reamplificó con polimerasa Taq. Se clonaron ambos productos en el vector pCR 2.1 y se usaron para transformar E. coli XL1 azul electrocompetente. Se secuenciaron los productos de RACE y se diseñaron cebadores terminales nuevos: sentido
5'-TTCTGAGTAGGTGTGCATTTGAGTGTCATAAAGAC-3' (SEQ ID Nº 43), y antisentido 5'TTTTCCGTCAAA
ATTATAACTTTTTATTTTCTTTTTATA ACACAT-3' (SEQ ID Nº 44). La amplificación por PCR de ADNc de VSMC de rata se realizó usando estos cebadores.
CAGTCAGTGAGGATGTCTTC-3', SEQ ID Nº 19 y 5'-CTGTTGGCTTCTACTGTAGCGTTCAAAGTT-3', SEQ ID Nº 20 para RACE 3' y 5', respectivamente. Se obtuvieron los productos principales de 1,5 km y 850 pb para RACE 3' y 5', respectivamente. Se purificaron estos productos por electroforesis en gel de agarosa y se reamplificó con polimerasa Taq. Se clonaron ambos productos en el vector pCR 2.1 y se usaron para transformar E. coli XL1 azul electrocompetente. Se secuenciaron los productos de RACE y se diseñaron cebadores terminales nuevos: sentido
5'-TTCTGAGTAGGTGTGCATTTGAGTGTCATAAAGAC-3' (SEQ ID Nº 43), y antisentido 5'TTTTCCGTCAAA
ATTATAACTTTTTATTTTCTTTTTATA ACACAT-3' (SEQ ID Nº 44). La amplificación por PCR de ADNc de VSMC de rata se realizó usando estos cebadores.
Se obtuvo un único producto de 2,6 kb, unido a
pCR 2.1 y se usó para transformar E. coli XL1 azul
electrocompetente. Se obtuvo la secuencia del inserto con 12
cebadores con sentido y 14 antisentido. Su longitud es de 2577 pb
(incluyendo las secuencias de cebadores), comprendiendo un marco de
lectura abierto de 1692 pb, 127 bp 5' y 758 pb 3' de regiones sin
traducir. La presencia de seis codones de terminación dentro del
marco en la región no traducida 5' sugiere que se obtuvo la región
codificadora en toda su extensión. Las secuencias de poliadenilación
de consenso están presentes en los nucleótidos 2201 y 2550. La
traducción conceptual da un péptido de 563 aminoácidos, un resto
más corto que la secuencia deducida humana. Esta nueva secuencia de
aminoácidos es más similar a mox1 humana SEQ ID Nº 3 (82% de
identidad) que a gp91 phox de ratón SEQ ID Nº 38 (55% de identidad),
sugiriendo que es por cierto mox1 de rata (SEQ ID Nº 21). Este
homólogo de rata (r) de la proteína p65mox es llamado
r-p65mox o p65mox/rat.pep y se muestra como SEQ ID
Nº 21. La secuencia de nucleótidos que codifica
r-p65mox se muestra como SEQ ID Nº 22.
Usando el clon de ADNc parcial de rata, se
examinaron los cultivos de células de músculo liso de aorta de rata
para la expresión del mensaje para r-p65mox. Se
observó el ARNm para r-p65mox en estas células.
Anteriormente se informó (Griendling y col. (1994) Circ. Res.
74,1141-1148; Fukui y col. (1997) Circ. Res. 80,
45-51; Ushio-Fukai y col. (1996) J.
Biol. Chem. 271, 23317-23321) que el tratamiento
in vitro o in vivo con angiotensina II (AII) es un
estímulo de crecimiento para células de músculo liso vascular, y que
AII induce un aumento de generación de superóxido en estas células.
El factor de crecimiento derivado de plaquetas (PDGF) y PMA son
señales proliferativas para las células de músculo liso vascular.
Se observó que el ARNm para r-p65mox se indujo
aproximadamente 2-3 veces por angiotensina II (100
nM), correspondiendo al aumento del nivel de generación de
superóxido. Por ello, el aumento de generación de superóxido en
estas células se correlaciona con el aumento de expresión del ARNm
para esta enzima. El ARNm para r-p65mox también
aumentó 2 o más veces en respuesta al estímulo de crecimiento con
PDGF (20 ng/ml), y 2-3 veces en respuesta a PMA. La
cuantificación por densitometría reveló que se indujo el mensaje de
mox1 de rata casi 4 veces a las 6 y 12 horas en respuesta a PDGF, y
aproximadamente 2 veces a las 12 horas en respuesta a AII. Como
control de recuperación para ARN se usó ARN 28S.
Se generaron anticuerpos policlonales en ratones
contra la mitad C terminal de h-p65mox (restos 233
hasta 564, SEQ ID Nº 23) que se predice que se pliega en un dominio
citosólico conteniendo el sitio de unión para FAD y NADPH o NADH.
Se expresó este dominio en E. coli como una proteína de
fusión GST N terminal y se purificó en agarosa y glutatión por
medio de procedimientos convencionales. Se generaron también dos
anticuerpos antipéptidos contra h-p65mox (restos
243-256, llamado Péptido A, SEQ ID Nº 24) y
h-65mox (restos 538-551, llamado
Péptido B, SEQ ID Nº 25). Se conjugaron los péptidos con hemocianina
de lapa (KLH) usando glutaraldehído.
Inicialmente se inyectaron los antígenos en
diferentes conejos en adyuvante completo de Freund, y se estimularon
4 veces con antígeno en adyuvante incompleto de Freund en
intervalos cada tres semanas. Se administró aproximadamente 0,5 mg
a 1 mg de péptido en cada inyección. Se extrajo sangre 1 semana tras
cada estímulo y se realizó una extracción de sangre final 2 semanas
tras el último estímulo. Los anticuerpos para Péptido A y Péptido B
se purificaron por afinidad por medio de cromatografía en columna a
través de péptido A o péptido B conjugado a Afrigel 15
(Bio-Rad, Richmond, CA). Se entrecruzaron con
enlaces covalentes 10 mg de péptido a 2 ml de resina Affigel 15 y
se lavó el gel con 20 ml de tampón de unión (Hepes 20 mM/NaOH, pH
7,0, 200 mM de NaCl, y 0,5% de Triton X-100). Se
bloqueó la N-hidrosuccinimida restante con 100
\mul de etanolamina 1 M. Tras lavar con 20 ml de tampón de unión,
se incubaron 5 ml de antisuero con la resina Affigel conjugada con
pep-A durante la noche a 4ºC. Se retiró la proteína
no unida mediante lavado con 20 ml de tampón de unión. Se realizó la
elución de los anticuerpos del gel con 6 ml de tampón de unión
(glicina 100 mM/HCl, pH 2,5, 200 mM de NaCl, y 0,5% de Triton
X-100). Posteriormente se neutralizó el eluato
agregando 0,9 ml de Tris 1M/HCl, pH 8,0. La forma de
fusión-GST de la proteína p65mox1 truncada (restos
233-566, SEQ ID Nº 23) se expresó en E. coli.
Se llevó a cabo electroforesis en SDS-PAGE 12% de
muestras (20 \mul cada una) previa inducción o tras 1 o 4 horas
de la inducción con 100 \muM de IPTG (isopropil
P-tiogalactósido).
Se sometió a las proteínas extraídas a
inmunosondeo con antisuero para péptido A purificado por afinidad en
una dilución 1:1000. La detección de antígenos se realizó usando un
equipo mejorado de quimioluminiscencia (Amersham, Buckinghamshire,
RU). El anticuerpo para mox1 (243-256, SEQ ID Nº 24)
purificado por afinidad se usó en una dilución 1:1000 en una
transferencia Western en la que se agregaron un total de 10 \mug
de proteína a cada carril. La banda principal observada 4 horas
tras la inducción con IPTG correspondió al tamaño de
GST-mox1 expresado en bacterias conteniendo el
vector pGEX-2T que codifica la proteína de fusión
GST-mox1.
Se detectó una actividad NADPH oxidasa
generadora de superóxido en homogenados de células NIH 3T3, y esta
actividad aumentó 10-15 veces en células NIH 3T3
transformadas con Ras (Tabla 6). Para establecer las líneas
celulares transformadas con Ras de manera estable, se subclonó el
ADN de Ras humano que codifica una mutación activadora en el
aminoácido 12 (Valina, llamada V12Ras) en los sitios BamHI y EcoRI
del vector pCDNA3 que tiene un gen de resistencia a neomicina. Se
transfectó V12-Ras en pCDNA3 y vector vacío en
células NIH 3T3 usando Lipofectamine Plus (Gibco). Se mantuvieron 2
x 10^{6} células con DMEM conteniendo 10% de suero de ternera y
se transfectaron con 1 mg de ADN. Tras 2 días, se separaron las
células y se seleccionaron con el mismo medio pero conteniendo 1
mg/ml de neomicina. Se subcultivaron las colonias supervivientes en
el medio selectivo durante 10 a 14 días y se caracterizaron por
análisis de inmunotransferencia usando anticuerpos anti
H-Ras humano. Se analizó la expresión de Ras en
células transfectadas con vector pcDNA-3 solo o en
las tres líneas celulares transfectadas con V12-Ras
en el mismo vector en un análisis de transferencia Western. Se llamó
a las tres líneas celulares
V12-Ras-7,
V12-Ras-4 y
V12-Ras-8. La expresión de
V12-Ras varió ampliamente entre las tres líneas
celulares probadas. La línea celular
V12-Ras-4 expresó el nivel más
elevado deRas, seguida por la línea celular
V12-Ras-8. La línea celular
V12-Ras-7 expresó el nivel más bajo
de Ras.
A continuación se prepararon lisados de cada una
de las líneas celulares y se probaron para determinar su capacidad
de generar superóxido. Para cada línea celular, se lavaron células
con solución salina equilibrada de HANKS (HBSS), se recogieron por
centrifugación, se mantuvieron en hielo seco durante más de 30
minutos y se lisaron suspendiéndolas en tampón de baja salinidad
(LSB; 50 mM de Tris/HCl, pH 7,5, 1 mM de PMSF y mezcla de proteasas
de Sigma) y pasándolas diez veces a través de una aguja de jeringa
(calibre 18). Se congelaron los lisados celulares en hielo seco
inmediatamente tras determinar la concentración de proteínas.
La Tabla 6 muestra la generación de superóxido
en las células transfectadas medida usando en ensayo de
luminiscencia con lucigenina. Para este ensayo, se incubaron 5
\mug de lisado celular con la mezcla de reacción conteniendo 10
\muM de lucigenina (sonda luminiscente) y 100 \muM de NADPH
(sustrato) en presencia o en ausencia de 100 \muM de araquidonato
en ausencia o en presencia de 100 U de superóxido dismutasa (SOD) o
1 \muM de difenilen yodonio (DPI). Se controló la luminiscencia
de la reacción durante 0,5 segundos con un LumiCounter (Packard)
cuatro veces con intervalos de 3 segundos. RLU en la Tabla 5 se
refiere a unidades relativas de luminiscencia.
Como se muestra en la Tabla 6, la luminiscencia
se inhibió parcialmente por superóxido dismutasa, indicando que la
señal se debió al menos en parte a la generación de superóxido. DPI,
un conocido inhibidor de la actividad oxidasa NADPH en neutrófilos
y en células diferentes a neutrófilos, inhibió completamente la
actividad. La generación de superóxido se correlacionó con la
expresión de Ras en las tres líneas celulares. Por ello,
aparentemente Ras oncogénico induce una actividad generadora de
superóxido dependiente de NADHP que es similar a la actividad
catalizada por p65mox1.
Se seleccionó una biblioteca de ADNc de rata en
un esfuerzo por identificar nuevas secuencias de mox de rata. La
biblioteca se construyó en un vector fago lambda ZAP express
(Stratagene, La Jolla, CA) usando ARN aislado de células de
músculo liso vascular de rata expuestas a 100 nM de angiotensina II
durante 4 horas. Se seleccionó la biblioteca usando técnicas de
hibridación mancha transferencia convencionales con la sonda mox1 de
rata descrita anteriormente. Se obtuvieron quince clones
individuales que se caracterizaron mediante PCR y mapeo de
restricción. Se identificaron así dos tipos diferentes de clones y
se secuenciaron representantes de cada tipo. Se encontró que un
clon del primer tipo (representativo de 13) era similar al
previamente identificado mox1 de rata y se llamó por ello mos1B de
rata. Los clones del segundo tipo (representativo de 2) eran
secuencias incompletas de mox de rata.
La longitud de la secuencia de nucleótidos de
mox1B de rata es de 2619 pb y se presenta como SEQ ID Nº 41. El
marco de lectura abierto único mayor de 1497 pb abarca los
nucleótidos 362 a 1858. La presencia de dos codones de terminación
dentro del marco en la región 5' sin traducir en los nucleótidos 74
y 257 indica que se ha aislado la región codificadora en toda su
extensión. Están presentes dos sitios de poliadenilación putativos
en las posiciones 2243 y 2592. El alineamiento de la secuencia de
nucleótidos de mox1 de rata (SEQ ID Nº 22) y la secuencia de
nucleótidos mox1B de rata (SEQ ID Nº 41) muestra que las dos
secuencias de nucleótidos son idénticas excepto en sus extremos 5',
sugiriendo que pueden representar dos mensajes alternativamente
separados del mismo gen. La identidad de secuencia comienza en los
nucleótidos 269 y 311, para mox1 de rata y mox1B de rata,
respectivamente.
La traducción conceptual de la B secuencia de
nucleótidos de mox1 de rata (SEQ ID Nº 41) da una secuencia de 499
aminoácidos con una predicción de peso molecular de 58 kDa. Esta
secuencia de aminoácidos de la proteína mox1B de rata se muestra en
SEQ ID Nº 42. El alineamiento de las secuencias deducidas de
aminoácidos para mox1 de rata (SEQ ID Nº 21) y mox1B de rata (SEQ
ID Nº 42) indica que mox1B de rata es idéntica a mox1A de rata,
excepto por una extensión faltante de 64 restos en el extremo N
terminal. Por consiguiente, aparentemente mox1B de rata es una
variante separada derivada del mismo gen de mox1 de rata.
Nótese que la proteína mox2 descrita en este
documento, se describió en la Solicitud Provisional de EEUU Nº de
Serie 60/149.332 como mox3.
Se realizó una búsqueda usando la secuencia de
mox1 como secuencia consultada. La secuencia identificada con esta
búsqueda fue una secuencia presente en la base de datos GenBank que
contiene regiones de homología con mox1 y gp91phox. La secuencia de
GenBank localizada en la búsqueda fue una región secuenciada de 90,6
kb del cromosoma 6 humano (6q25.1-26) que se
informó como una presentación directa de GenBank con fecha 9 de
Febrero de 1999, y con Nº de Acceso AL031773. La determinación de
la secuencia se llevó a cabo como parte del proyecto de
secuenciación del genoma humano por S. Palmer, en Sanger Centre, en
Hinxton, Cambridgeshire, RU. La secuencia de GenBank se informó
como similar a "Citocromo B" y no se informó que tuviere
homología o relación con una proteína mox. La secuencia contenía
una secuencia teórica de aminoácidos derivada por ordenador usando
un algoritmo que predice las fronteras intrón/exón y regiones
codificadoras. La región predicha contenía una secuencia de 545
aminoácidos que fue 56% idéntica a mox1 y 58% idéntica a
gp91phox.
En la presente invención, en base a la secuencia
genómica de GenBank y las homologías descritas anteriormente, se
diseñaron varios cebadores específicos y se usaron para determinar
los patrones de expresión en tejidos de una proteína mox nueva,
mox2, usando Paneles de PCR en Múltiples Tejidos Humanos (Clontech,
Palo Alto, CA). Los cebadores fueron los siguientes: Cebador 1;
5'CCTGACAGATGTATTTCACTACCCAG-3' (SEQ ID Nº 49);
Cebador 2:
5'-GGATCGGAGTCACTCCCTTCGCTG-3' (SEQ
ID Nº 50); Cebador 3:
5'-CTAGAAGCTCTCCTTGTTGTAA
TAGA-3' (SEQ ID Nº 51); Cebador 4: 5'-ATGAACACCTCTGGGGTCAGCTGA-3' (SEQ ID Nº 52). Se determinó que mox2 se expresa primariamente en tejidos fetales, con la expresión más elevada en riñón fetal, también se observó expresión en hígado fetal, pulmón fetal, cerebro fetal, bazo fetal y timo fetal. Entre los 16 tejidos de adulto probados, se observó expresión de mox2 en cerebro, riñón, colon y pulmón, aunque los niveles de expresión fueron muy bajos.
TAGA-3' (SEQ ID Nº 51); Cebador 4: 5'-ATGAACACCTCTGGGGTCAGCTGA-3' (SEQ ID Nº 52). Se determinó que mox2 se expresa primariamente en tejidos fetales, con la expresión más elevada en riñón fetal, también se observó expresión en hígado fetal, pulmón fetal, cerebro fetal, bazo fetal y timo fetal. Entre los 16 tejidos de adulto probados, se observó expresión de mox2 en cerebro, riñón, colon y pulmón, aunque los niveles de expresión fueron muy bajos.
Además, se usaron las técnicas 5'RACE (RACE =
Amplificación Rápida de Extremos de ADNc) y 3' RACE para completar
la secuencia de las regiones 5' y 3' de mox2. (El equipo 5' RACE y
el equipo 3' RACE eran de Clontech, Palo Alto, CA y están descritos
con más detalle en Frohman y col. (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. EEUU
85, 8998-9002. Se realizaron las técnicas 5' RACE y
3'-RACE usando una biblioteca de riñón fetal humano
(Biblioteca de ADNc Marathon-Ready, Cat.
Nº7423-1), usando los siguientes cebadores
específicos: 5'-RACE; Cebador 4:
5'-AT
GAACACCTCTGGGGTCAGCTGA-3' (SEQ ID Nº 53); Cebador 5: 5'-GTCCTCTGCAGCATTGTTCCTCTTA-3' (SEQ ID Nº 54); 3'-RACE: Cebador 1: 5'-CCTGACAGATGTATTTCACTACCCAG-3' (SEQ ID Nº 55); Cebador 2: 5'-GGATCGGAGTCACTCCCTTCGCTG-3' (SEQ ID Nº 56). Los procedimientos de RACE completaron exitosamente la secuencia 5' y confirmaron la secuencia 3'. La secuencia de codificación completa de mox2 se muestra en SEQ ID Nº 2, mientras que la secuencia predicha de aminoácidos de mox2 se muestra en SEQ ID Nº 4.
GAACACCTCTGGGGTCAGCTGA-3' (SEQ ID Nº 53); Cebador 5: 5'-GTCCTCTGCAGCATTGTTCCTCTTA-3' (SEQ ID Nº 54); 3'-RACE: Cebador 1: 5'-CCTGACAGATGTATTTCACTACCCAG-3' (SEQ ID Nº 55); Cebador 2: 5'-GGATCGGAGTCACTCCCTTCGCTG-3' (SEQ ID Nº 56). Los procedimientos de RACE completaron exitosamente la secuencia 5' y confirmaron la secuencia 3'. La secuencia de codificación completa de mox2 se muestra en SEQ ID Nº 2, mientras que la secuencia predicha de aminoácidos de mox2 se muestra en SEQ ID Nº 4.
Al comparar las secuencias de la presente
invención con las regiones codificadoras predichas de la secuencia
de GenBank, la secuencia de GenBank no contiene un codón de inicio,
faltan aproximadamente 45 pares de bases en el extremo N terminal,
y contiene un diferencia más importante en la región codificadora
predicha que podría haberse debido a imprecisión en la predicción
por ordenador de las fronteras intrón/exón.
<110> Universidad de Emory
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Reguladores Mitogénicos Nuevos
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 05501-0103wp
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<140>
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 61
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 2.0
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2609
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (207)..(1901)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 564
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2044
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (104)...(1810)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 568
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaacaagcgtg gcttcagcat g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipagcaatattg ttggtcat
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgacttgacag aaaatctata aggg
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttgtaccaga tggatttcaa
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcaggtctgaa acagaaaacc t
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatgaattctc attaattatt caataaa
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatctcaaaag actctgcaca
\hfill20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 569
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttggctaaat cccatcca
\hfill18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptgcatgacca acaatattgc t
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcaaggtacct cttgaccatg ggaaact
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipacgaattcaa gtaaattact gaagata
\hfill27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> ()..)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n en posición 3 = inosina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> ()
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n en posición 6 = inosina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> ()
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n en posición 12 = inosina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipccngtntgtc gnaatctgct stcctt
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (5)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n en posición 5 = inosina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (9)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n en posición 9 = inosina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> base modificada
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (11)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n en posición 11 = inosina
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400>18
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptcccngcana nccagtagaa rtagatctt
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttggcacagt cagtgaggat gtcttc
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctgttggctt ctactgtagc gttcaaagtt
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 563
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rata
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2577
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rata
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 332
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Cys Ala Glu Ser Phe Glu Met Trp Asp Asp Arg
Asp Ser His}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Lys Ser Leu Arg Lys Cys Cys His Arg Tyr Ser
Ser Leu Asp}
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgaagtggtgg gaggcgaaga cata
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcctgtcatac ctgggacggt ctgg
\hfill24
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
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\vskip0.400000\baselineskip
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\hfill24
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<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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<400> 29
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\hskip-.1em\dddseqskipggaaggcagc agagagcaat gatg
\hfill24
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<210> 30
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<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
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\hskip-.1em\dddseqskipacatctgcga gcggcacttg caga
\hfill24
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<211> 25
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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<400> 31
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\hfill25
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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<400> 32
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\hfill24
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\newpage
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgagagctctg gagacacttg agttc
\hfill25
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<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 22
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
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\hskip-.1em\dddseqskipcatgttctct ctggctgaca ag
\hfill22
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<210> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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<400> 35
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcacaatagcg agctccgctt cacgc
\hfill25
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 36
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 36
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgcaggacatc aaccctgcac tctc
\hfill24
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<210> 37
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 570
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Bovino
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 37
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 38
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 570
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Murino
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 38
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 39
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 944
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Arabidopsis sp.
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 39
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 40
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 590
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Arroz
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 40
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 41
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 2619
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rata
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 42
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 499
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Rata
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 42
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 43
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 35
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador Sintético
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<400> 43
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttctgagtag gtgtgcattt gagtgtcata aagac
\hfill35
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 44
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador Sintético
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 44
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttttccgtca aaattataac tttttatttt ctttttataa cacat
\hfill45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 45
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 5508
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
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<222> (155)..(4810)
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 45
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 46
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1521
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 46
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 47
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 3453
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (438)..(3134)
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 47
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 899
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
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<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 48
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 49
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 49
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcctgacagat gtatttcact acccag
\hfill26
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<210> 50
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 50
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\hskip-.1em\dddseqskipggatcggagt cactcccttc gctg
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<210> 51
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<211> 26
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 51
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctagaagctc tccttgttgt aataga
\hfill26
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<210> 52
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 52
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatgaacacct ctggggtcag ctga
\hfill24
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<210> 53
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 53
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatgaacacct ctggggtcag ctga
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 54
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 54
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgtcctctgca gcattgttcc tctta
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 55
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 55
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcctgacagat gtatttcact acccag
\hfill26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 56
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 56
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggatcggagt cactcccttc gctg
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 57
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 57
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaatgacactg tactggaggc cacag
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 58
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 58
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipctgccatcta ccacacggat ctgc
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 59
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 59
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcttgccattc caaagcttcc atgc
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 60
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia Artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 60
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\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgtacaagtca ggacagtggg tgcg
\hfill24
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 61
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<211> 24
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<212> ADN
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<213> Secuencia Artificial
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<220>
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<223> Descripción de Secuencia Artificial:
Cebador
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<400> 61
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptggatgatgt cagccdgcca ctca
\hfill24
Claims (16)
1. Una proteína asilada que comprende una
secuencia de aminoácidos seleccionada de:
a) SEQ ID Nº 2
b) SEQ ID Nº 21
c) SEQ ID Nº 42
d) una de las secuencias de aminoácidos de a)
hasta c) con una deleción en las mismas o una adición en las mismas
de menos del 5% de los aminoácidos de dicha secuencia de
aminoácidos, en la que dicha proteína es capaz de generar
intermediarios reactivos de oxígeno, o
e) una proteína aislada capaz de generar
intermediarios reactivos de oxígeno que comprende una secuencia de
aminoácidos de a) hasta c) con una sustitución conservativa
seleccionada de los grupos 1) a 6), que son:
- 1)
- alanina, serina o treonina, una por otra;
- 2)
- ácido aspártico o ácido glutámico, uno por el otro;
- 3)
- asparagina o glutamina, una por la otra;
- 4)
- arginina o lisina, una por la otra;
- 5)
- isoleucina, leucina, metionina o valina, una por la otra; y
- 6)
- fenilalanina, tirosina o triptofano, uno por el otro, o
f) un fragmento de una secuencia de aminoácidos
seleccionado de uno de a) hasta c), en el que dicho fragmento es
capaz de generar intermediarios reactivos de oxígeno.
2. Una secuencia de nucleótidos aislada, que
codifica la proteína que se definió en la reivindicación 1.
3. La secuencia de nucleótidos de la
reivindicación 2, en la que dicha secuencia de nucleótidos está
representada como SEQ ID Nº 1, SEQ ID Nº 22 o SEQ ID Nº 41.
4. Un vector, que comprende una secuencia de
nucleótidos de acuerdo con las reivindicaciones 2 ó 3.
5. Una célula que contiene un vector de acuerdo
con la reivindicación 4.
6. Un anticuerpo dirigido a una proteína
constituida por una secuencia de aminoácidos representada como a)
SEQ ID Nº 2, b) SEQ ID Nº 21, c) SEQ ID Nº 42, o d) un fragmento
antigénico de una secuencia de aminoácidos seleccionada de una de
a) hasta c).
7. El anticuerpo de la reivindicación 6, en el
que el anticuerpo es un anticuerpo monoclonal.
8. La proteína de la reivindicación 1 para
estimular la formación de superóxido in vitro o in
vivo.
9. La secuencia de nucleótidos de cualquiera de
las reivindicaciones 2 ó 3 para el desarrollo de secuencias de
nucleótidos antisentido.
10. El vector de la reivindicación 4 para
estimular la formación de superóxido in vitro o in
vivo.
11. Un procedimiento para determinar la
capacidad de un fármaco o compuesto químico para modular la
actividad enzimática de una proteína como se definió en la
reivindicación 1 para generar de intermediarios reactivos de
oxígeno in vitro, que comprende poner en contacto la proteína
definida en la reivindicación 1, o una célula huésped que expresa
la proteína de la reivindicación 1 con el fármaco o producto
químico, y medir la generación de intermediarios reactivos de
oxígeno, determinando de esta manera la capacidad del fármaco o
producto químico para modular la actividad enzimática para generar
intermediarios reactivos de oxígeno.
12. Un procedimiento de acuerdo con la
reivindicación 11 que comprende medir la actividad enzimática de la
proteína definida en la reivindicación 1, para estimular la
producción de superóxido tras el agregado del fármaco o producto
químico.
13. El procedimiento de la reivindicación 12, en
el que la actividad enzimática es la generación de superóxido
dependiente de NADPH o dependiente de NADH.
14. El procedimiento de la reivindicación 12, en
el que la actividad enzimática es la actividad diaforasa
dependiente de NADPH o dependiente de NADH.
15. Un procedimiento de la reivindicación 11 que
comprende medir la unión del fármaco o el producto químico a la
proteína definida en la reivindicación 1.
16. El procedimiento de cualquiera de las
reivindicaciones 11 a 14, en el que la actividad enzimática se
evalúa usando células intactas, células transfectadas o lisados de
tales células.
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