ES2289754T3 - Sistema de alta eficacia para la liberacion de compuestos especificos de tejido que utiliza una proteina de fusion estreptavidina-proteina a. - Google Patents

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Abstract

LA INVENCION SE REFIERE A UN METODO PARA SUMINISTRAR TOXINAS O ACIDOS NUCLEICOS A TIPOS DE CELULAS ESPECIFICOS Y A LOS COMPLEJOS PARA LA PUESTA EN PRACTICA DEL METODO. SEGUN LA INVENCION, UN ANTICUERPO QUE RECONOCE UN ANTIGENO EN LA SUPERFICIE DE UNA CELULA ESTA UNIDO DE FORMA NO COVALENTE AL CENTRO DE UNION DEL ANTICUERPO DE UNA PROTEINA DE FUSION ST-PA; UN ACIDO NUCLEICO O UNA TOXINA BIOTINILADOS SE UNEN AL CENTRO DE UNION DE LA BIOTINA. EN UNA REALIZACION ALTERNATIVA, LA TOXINA O ACIDO NUCLEICO PUEDEN ESTAR UNIDOS A UNA TERCERA MOLECULA BIOTINILADA, UN ADAPTADOR, QUE SE UNE AL CENTRO DE UNION DE LA BIOTINA.

Description

Sistema de alta eficacia para la liberación de compuestos específicos de tejido que utiliza una proteína de fusión estreptavidina-proteína A.
1. Introducción
La presente invención se refiere a métodos y composiciones que se pueden utilizar para introducir toxinas y ácidos nucleicos en el citoplasma o núcleo de una célula eucariota, particularmente una célula de un vertebrado superior. La presente invención permite la liberación eficiente y específica de las toxinas y ácidos nucleicos en células que se unen a un anticuerpo. La presente invención se refiere en particular a la utilización de una proteína de fusión de secuencias de estreptavidina y proteína A para formar un complejo no covalente de una toxina o un ácido nucleico y un anticuerpo.
La presente invención da a conocer un procedimiento de tratamiento de una enfermedad humana mediante la introducción de toxinas o nucleótidos antisentido en células humanas, por ejemplo, células tumorales, in vivo o ex vivo. La presente invención también da a conocer métodos para realizar investigación biológica y métodos útiles en la producción de productos biológicos mediante la introducción de moléculas de ADN de cadena doble exógenas en células cultivadas.
2. Antecedentes de la invención
La introducción selectiva de compuestos en el citoplasma o el núcleo de células específicas ha sido una técnica valiosa en la investigación biológica y médica y en la práctica médica. El marcaje específico de citotoxinas en las células se ha realizado mediante la formación de complejos de toxinas con proteínas de unión celulares que se pueden unir preferentemente a células marcadas. Las proteínas del complejo de unión celular pueden ser anticuerpos, particularmente anticuerpos monoclonales, o ligandos de proteínas, por ejemplo, factores de crecimiento, que reconocen los correspondientes antígenos o receptores de superficie. Los complejos de toxina y anticuerpo se han denominado inmunotoxinas.
De forma conveniente, la toxina y la proteína de unión celular del complejo se han unido de forma covalente mediante unión química o fusión génica. Las inmunotoxinas convencionales se han realizado mediante la unión química de un componente toxina a un anticuerpo, habitualmente un anticuerpo monoclonal, con un reactivo de reticulación heterobifuncional que es no específico. Por consiguiente, este método produce un producto heterogéneo en el que algunas moléculas de toxinas bloquean la capacidad del anticuerpo para unirse al antígeno mediante la unión a la parte F(ab) del anticuerpo. Adicionalmente, la química de acoplamiento puede destruir parcialmente la actividad de las toxinas.
Muchos de los problemas asociados con la conjugación química se han superado mediante la generación de toxinas de fusión de cadena única utilizando tecnología de ADN recombinante. Sin embargo, esta tecnología requiere una nueva toxina recombinante para cada célula diana. La actividad biológica de cada nueva toxina recombinante es impredecible.
Se han desarrollado técnicas alternativas en las que la citotoxina está unida de forma no covalente al anticuerpo o al ligando. Una de dichas técnicas explota la interacción específica entre la proteína A de Staphylococcal aureus e inmunoglobulinas para generar complejos de anticuerpos con dos especificidades. Según esta técnica, la proteína A forma complejos con anticuerpos de dos especificidades diferentes: un anticuerpo específico de toxina y un anticuerpo específico de la superficie celular. Dichos complejos se han utilizado para liberar toxina de ricina en células diana (Laky y otros, 1986/1987, Immunology Letters 14:127-132). En un segundo sistema de marcaje de inmunotoxinas, los anticuerpos de cadena única se fusionan con estreptavidina que tiene una afinidad de unión fuerte y específica para la biotina. Utilizando esta construcción, la toxina biotinilada se liberó en una célula diana (Dubel, y otros, 1995, Journal of Immunological Methods, 178:201-209).
Recientemente, Sano y otros describieron una proteína de fusión que consistía en estreptavidina y uno o dos dominios de unión a inmunoglobulina G (IgG) de la proteína A en Escherichia coli. (Patente de Estados Unidos 5.328.985, concedida el 12 de julio de 1994, que se incorpora en su totalidad en la presente invención como referencia). La proteína de fusión estreptavidina-proteína A (ST-PA) tiene biotina funcional y sitios de unión a IgG. Sano además describió complejos de la proteína de fusión estreptavidina-proteína A, un anticuerpo monoclonal para BSA, y peroxidasa de rábano picante biotinilada.
Sano también describió un método de marcaje de células utilizando la proteína de fusión ST-PA. Las células se incubaron con un anticuerpo para un antígeno de la superficie celular, Thy-1. El complejo proteína quimérica-marcador biotinilado se añadió posteriormente a la suspensión celular. Esta técnica se utilizó para liberar FITC biotinilado a la superficie de las células que tenían antígeno Thy-1 en su superficie. Sin embargo, Sano no describió ni sugirió la utilización de la proteína de fusión ST-PA para liberar compuestos en el citoplasma o núcleos de células específicas.
Las inmunotoxinas parecen entrar en la célula mediante la endocitosis mediada por un receptor (Pastan y otros, 1986, Cell 47: 1-44 y Pirker y otros, 1987, Lymphokines 14: 361-382). A la unión de la parte de anticuerpo del complejo de inmunotoxina al receptor superficial le sigue, en primer lugar, el agrupamiento del complejo en huecos recubiertos y, a continuación, la internalización del complejo en endosomas o receptosomas en el interior de la célula (Middlebrook y otros, 1994, Microbiol. Rev., 48: 199-221; Morris y otros, 1985, Infect. Immun. 50: 721-727; Fitzgerald y otros, 1980, Cell 21: 867-873). Durante el desplazamiento en la célula, el complejo puede transportarse a través de diferentes compartimentos intracelulares que varían en pH y la actividad de enzimas proteolíticas antes de que las toxinas se desplacen a través de una membrana intracelular y en el citoplasma de la célula donde pueden provocar la muerte celular.
Una segunda área que se ha desarrollado se refiere a métodos para la introducción de ácidos nucleicos en células. Los métodos más ampliamente utilizados utilizan fosfato cálcico o DEAE-dextrano para provocar la captación de ácidos nucleicos. Estos métodos parecen implicar las etapas de unión del ADN a la superficie celular, entrar en el citoplasma mediante endocitosis, y la posterior transferencia en el núcleo. Maniatis, Laboratory Cloning Manual, volumen 2, 16.30. Dependiendo del tipo de célula, hasta un 20% de una población de células cultivadas pueden captar ADN utilizando fosfato cálcico o DEAE-dextrano.
La electroporación es un método de transfección alternativo en el que se aplica un campo eléctrico para abrir poros en la membrana plasmática de la célula. El ADN parece entrar en la célula a través de estos poros.
Los liposomas también se han utilizado para introducir ácidos nucleicos en las células. Según esta técnica, las vesículas de bicapa lipídica artificiales que contienen lípidos catiónicos y neutros median la transferencia de ADN o ARN en las células. El mecanismo de transfección mediada por liposomas no está bien comprendido, pero parece que los grupos fosfatos cargados negativamente en el ADN se unen a la superficie cargada positivamente del liposoma, y que la carga positiva residual se une a los residuos de ácido siálico cargados negativamente en la superficie celular.
Sano no utilizó el complejo para introducir ácidos nucleicos en la célula. Sano y otros describieron complejos de ADN-anticuerpo con la proteína de fusión ST-PA mediante la incorporación de una única molécula de biotina en un extremo de un plásmido pUC 19 linealizado, a diferencia de los métodos de transfección de ácidos nucleicos en la célula que se han descrito anteriormente.
3. Características de la invención
La presente invención se refiere a la liberación de toxinas o ácidos nucleicos en tipos específicos de células y a los complejos para realizar el método. Según la presente invención, un anticuerpo que reconoce un antígeno de la superficie celular no está unido de forma covalente al sitio de unión a anticuerpo de una proteína de fusión ST-PA; una toxina o un ácido nucleico biotinilados están unidos al sitio de unión a biotina. En una realización alternativa, la toxina o el ácido nucleico pueden estar unidos a una tercera molécula biotinilada, un adaptador, que está unido al sitio de unión a biotina.
En una realización de la presente invención, se libera un ácido nucleico en un tipo de célula específica. El ácido nucleico puede ser un ácido nucleico de cadena única biotinilado unido al sitio de unión a biotina de la proteína de fusión ST-PA. En una realización alternativa, el ácido nucleico puede ser un ácido nucleico de doble cadena que forma una cadena triple complementaria con un ácido nucleico de cadena única biotinilado, que a su vez está unido al sitio de unión a biotina.
El método de la presente invención se refiere a las etapas de formar un complejo entre una proteína de fusión de estreptavidina-proteína A; un anticuerpo, que es específico para una proteína de la superficie celular, que experimenta endocitosis después de la unión con el anticuerpo; y cierto material marcado, por ejemplo, un producto génico de resistencia a múltiples fármacos (mdr) biotinilado, profármaco, toxina o ácido nucleico; aislar el complejo de la toxina que no está unida al sitio de unión a biotina; y exponer la célula diana al complejo, de manera que el material marcado entra en la célula.
3.1 Definiciones
Tal como se utiliza en la presente invención,
toxina se refiere a holotoxinas, toxinas modificadas, subunidades catalíticas de toxinas, o cualquier enzima que no está presente normalmente en una célula que, bajo condiciones definidas, provoca la muerte de la célula. Una toxina biotinilada se refiere a una toxina que está directamente biotinilada o bien, que está unida a un adaptador biotinilado.
El término "anticuerpo" se refiere a cualquier molécula que contiene uno o más dominios funcionales de unión a antígeno y un dominio Fc que se une específicamente a la proteína A.
4. Breve descripción de las figuras
Figura 1A. Representación esquemática de la unión de inmunotoxina o toxina recombinante al correspondiente antígeno o receptor superficial en la superficie celular.
Figura 1B. Representación esquemática de la unión de complejo de estreptavidina-proteína A/macromolécula biotinilada al correspondiente antígeno o receptor superficial en la superficie celular.
Figura 2. Comparación de la liberación de biotina-\beta galactosidasa en células A431 de un complejo ST-PA/mAB anti-EGFR/biotina-\beta galactosidasa y un complejo ST-TGF/biotina-\beta galactosidasa.
Figura 3. Análisis en el transcurso del tiempo de la tinción en células con \beta galactosidasa después de la transferencia de \beta galactosidasa en las células.
Figura 4A. Líneas celulares y moléculas de la superficie celular marcadas mediante el complejo ST-PA-biotina-\beta galactosidasa-anticuerpo.
Figura 4B. Transferencia de ST-PA/mAB/biotina-\beta galactosidasa en células humanas, en la que mAB es específico para las moléculas de la superficie celular HLA-DR, CD33 o CD34.
Figura 5. Representación esquemática de la construcción del vector de expresión de pAT-\beta galactosidasa para formar el ADN de cadena triple con poli(dT) oligonucleótido biotinilado.
Figura 6A. Homología de aminoácidos entre fibronectina (SEC ID No: 1) y estreptavidina (SEC ID No: 2). En negrita se indican los residuos homólogos. Los dominios RGD y RYD de cada proteína se encuentran subrayados. La secuencia mostrada para fibronectina empieza en el residuo 1481 y la secuencia de estreptavidina empieza en el residuo 49.
Figura 6B. Cebadores de oligonucleótido DES (SEC ID No: 3) y DER (SEC ID No: 4) diseñados para modificar la secuencia RYD del gen de estreptavidina.
Figura 6C. Representación esquemática de la metodología a utilizar en la modificación de la secuencia RYD de estreptavidina.
5. Descripción detallada de las realizaciones preferentes
La presente invención da a conocer un método de liberación específica de material marcado, por ejemplo, toxinas, profármacos, productos génicos de mdr, o ácidos nucleicos en células mediante un complejo del material marcado, un anticuerpo específico para un antígeno de la superficie celular en la célula, donde dicho antígeno se endocitosa cuando las células se exponen a una concentración eficaz del anticuerpo, y una proteína de fusión ST-PA.
La proteína de fusión estreptavidina-proteína A (ST-PA) se une de forma no covalente al anticuerpo específico de la célula en el sitio de unión a anticuerpo y al material marcado biotinilado en el sitio de unión a biotina. La manera y el método mediante el cual se biotinila el material marcado no son críticos; la presente invención incluye la utilización de cualquiera y todos los métodos y reactivos.
En una realización, la presente invención da a conocer un método para la destrucción específica de células, por ejemplo, la destrucción de células tumorales en un huésped o ex vivo en cultivos a corto y largo plazo. Se puede seleccionar una toxina del grupo que consiste en: timidina quinasa, endonucleasa, ARNasa, toxina alfa, ricina, abrina, exotoxina A de Pseudomonas, toxina de la difteria, saporina, momordina, gelonina, proteína antivírica de la fitolaca, alfa-sarcina y toxina del cólera. La toxina se biotinila y se forma el complejo de PA-ST/Ab/toxina biotinilada. A continuación, se puede administrar una cantidad eficaz del complejo al huésped o al sistema de cultivo ex vivo.
En una realización alternativa, la presente invención da a conocer un método de utilización de un anticuerpo para una célula para introducir en la célula un profármaco citotóxico, es decir, un compuesto no tóxico que es convertido por una enzima, normalmente presente en la célula, en un compuesto citotóxico. La realización contempla la utilización de un complejo de la proteína quimérica ST-PA con un anticuerpo monoclonal selectivo del tumor y un profármaco. Entre los compuestos adecuados como profármacos se incluyen, a modo de ejemplo, un glutamil derivado de un agente alquilante mostaza de ácido benzoico ("mustard alkylating agent"), derivados fosfato de etopósido o mitomicina C y derivado fenoxi-acetamida de doxorubicina.
Una realización adicional de la presente invención contempla un complejo para la liberación de ácido nucleico de cadena única en las células. Tal como se utiliza en la presente invención, el término "ácido nucleico de cadena única" se refiere a ácidos nucleicos tanto naturales como no naturales. El ácido nucleico a liberar se puede biotinilar utilizando cualquiera de los métodos actualmente disponibles, tales como la incorporación aleatoria, reacciones de extensión utilizando ADN polimerasa, y PCR con cebadores biotinilados. Dichos ácidos nucleicos se pueden utilizar para destruir específicamente ARNms a los que son complementarios.
Una realización adicional de la presente invención se refiere a la introducción en una célula de ADN de cadena doble que puede integrarse en el genoma de la célula o replicarse episomalmente y que se puede transcribir. La incorporación directa de biotina en un ADN de cadena doble puede interferir con la replicación y la transcripción del ADN. Para superar estos problemas, el ADN de cadena doble a liberar en la célula se modifica para incluir una secuencia que puede formar una región de ácido nucleico de cadena triple con un ácido nucleico de cadena única.
Se han descrito formaciones de ADN de cadena triple y habitualmente consisten en las triadas de nucleótidos T-A-T y C-G-C. La tercera cadena de la cadena triple ocupa el hueco principal de una hélice de ADN de forma A y forma pares de bases de Hoogsteen con el ADN de cadena doble homopolimérico. Alternativamente, una cadena triple se puede formar con ADN de cadena doble. Tal como se utiliza en la presente invención, el término "cadena triple" se refiere a una estructura formada por el emparejamiento de bases de Hoogsteen entre un ADN de cadena doble y un ácido nucleico de cadena única.
En esta realización, el complejo contiene ADN de cadena doble Hoogsteen emparejado con un ácido nucleico de cadena única, el cual está biotinilado y forma un complejo con el complejo ST-PA/mAb. El ADN de cadena doble puede ser una ADN de cadena doble lineal, el cual es adecuado para la recombinación en el genoma de una célula o, alternativamente, la cadena doble puede ser un ADN circular o circular superenrollado, el cual se puede replicar episomalmente.
Esta realización de la presente invención se puede utilizar bajo cualquier circunstancia en la que se desee introducir ADN clonado en una célula, por ejemplo, para expresar un producto o para alterar el fenotipo de la célula, para investigar la función de cualquier gen clonado.
Una realización adicional de la presente invención comprende un complejo de un anticuerpo para una proteína de la superficie celular hallado en una célula que presenta antígenos, la proteína de fusión ST-PA y una proteína biotinilada de una bacteria o virus patológicos, donde dicho complejo se puede utilizar para localizar el antígeno para células que presentan antígenos y, de este modo, aumentar la respuesta inmune de células T positivas CD4 en relación con la de otros linfocitos.
Los complejos de la presente invención se pueden formar mezclando simplemente ST-PA, un anticuerpo monoclonal, y el material biotinilado en las proporciones adecuadas. Los componentes se pueden mezclar en cualquier orden.
La proteína de fusión ST-PA forma tetrámeros que se unen hasta con cuatro moléculas biotiniladas y cuatro moléculas IgG, que son cada una bivalente. Sin limitarse a ninguna teoría, se cree que la unión octovalente de los complejos de la presente invención a la superficie celular provoca que los complejos tengan una unión y unas propiedades de internalización superiores en comparación con otras inmunotoxinas y complejos inmunofarmacéuticos.
La estreptavidina bloqueada por biotina es capaz de interaccionar específicamente con superficies celulares a través de una secuencia Arg-Tyr-Asp presente en la proteína (el "sitio RYD"). Este sitio es diferente del hueco de unión a biotina de la proteína y tiene una elevada homología con el dominio de unión de la célula que contiene RGD de fibronectina que media las interacciones fibronectina-superficie celular (Alon y otros, 1993, Europ. J. Cell Biol. 60: 1-11). Los estudios han sugerido que la estreptavidina actúa como un mimético próximo de la fibronectina (Alon y otros, 1993, Europ. J. Cell Biol. 60: 1-11).
Los dominios RYD y RGD conservados de la fibronectina y la estreptavidina funcionan como secuencias de reconocimiento universales para las interacciones con muchos receptores unidos a membrana. En una realización de la presente invención, el componente estreptavidina del complejo se puede modificar para alterar el sitio RYD. Tal como se utiliza en la presente invención, el término "secuencia RYD modificada" incluye cualquier alteración al sitio RYD o la región flanqueante que elimina la interacción de la estreptavidina con las proteínas de la superficie celular del tipo del sitio de unión sin biotina. Una de dichas modificaciones es la sustitución de ácido aspártico por ácido glutá-
mico.
6. Ejemplos 6.1 Materiales y métodos
El plásmido, pTSAPA-2, descrito en la Patente de Estados Unidos 5.328.985, concedida en 12 de julio de 1994, transporta el gen quimérico de estreptavidina y proteína A (región E y D). La expresión y purificación de la fusión génica de ST-PA se llevó a cabo según los métodos que se indican a continuación.
Preparación de la proteína de fusión
Se transformó un lisógeno de la cepa bacteriana BL21 (DE3) (pLysS) con el vector de expresión de la fusión estreptavidina-proteína A pTSAPA-2. La cepa transformada se desarrolló a 37ºC en medio LB complementado con ampicilina 50 \mug/ml, cloramfenicol 34 \mug/ml y glucosa al 0,2%. Cuando la absorbancia a 600 nm del cultivo estaba entre 0,8 y 1,0 de DO, se añadieron 100 mM de isopropil \beta-D-tiogalactopiranósido (IPTG) disuelto en agua hasta una concentración final de 0,4 mM para inducir el gen T7 de ARN polimerasa situado bajo el promotor lac UV5. Después de la inducción, las células se incubaron a 37ºC con agitación durante 2 horas.
La purificación de la proteína quimérica de fusión estreptavidina-proteína A se llevó a cabo a 4ºC o sobre hielo a menos que se indique lo contrario. El cultivo (100 ml) de BL21 (DE3) (pLysS) (pTSAPA-2) incubado durante 2 horas después de la inducción se centrifugó a 2.900 x g durante 15 minutos. El residuo celular se suspendió en 10 ml de EDTA 2 mM, Tris-Cl 30 mM (pH 8,0), Triton X-100 al 0,1%, PMSF 0,5 mM para lisar las células y el lisado se guardó a -70ºC hasta que se utilizó. Al lisado celular descongelado, se añadieron PMSF, leupeptina y pepstatina A hasta las concentraciones finales de 0,5 mM, 1 \muM y 1 \muM, respectivamente. A continuación, el lisado se trató con 10 \mug/ml de desoxirribonucleasa I y 10 \mug/ml de ribonucleasa A en presencia de MgSO_{4} 12 mM a temperatura ambiente durante 20 minutos. La mezcla se centrifugó a 39.000 x g durante 15 minutos y el residuo se disolvió en 100 ml de clorhidrato de guanidina 7 M durante toda la noche a 4ºC con agitación. Después de que el residuo se disolviera, la proteína se dializó a continuación contra NaCl 150 mM, Tris-Cl 50 mM (pH 7,5), Tween 20 al 0,05%, PMSF 0,1 mM, leupeptina 1 \muM, pepstatina A 1 \muM, NaN_{3} al 0,02%. Para conseguir la extracción lenta del clorhidrato de guanidina, la bolsa de diálisis que contenía la solución de proteínas se dejó durante toda la noche en la solución de diálisis (\sim1000 ml) sin agitación, seguido de 3 cambios de la solución de diálisis y diálisis con agitación a 4ºC. El dialisado se centrifugó a 39.000 x g durante 15 minutos y el sobrenadante se aplicó a una columna de flujo rápido IgG Sefarosa 6 (1,2 x 1,1 cm) lavada previamente con 5-10 volúmenes del lecho de tampón TST. A continuación, la columna se equilibró con 2-3 volúmenes del lecho de cada uno de los siguientes: 1) Ácido acético 0,5 M, pH 3,4 (pH ajustado con NH_{4}CH_{3}COOH (NH_{4}Ac); 2) NaCl 150 mM, Tris-Cl 50 mM (pH 7,5), Tween 20 al 0,05% (tampón TST); 3) Ácido acético 0,5 M, pH 3,4; y 4) TST. La muestra se aplicó a la columna y la proteína no unida se extrajo mediante el lavado de la columna con: 1) 10 volúmenes del lecho de TST, y 2) 2 volúmenes del lecho de NH_{4}Ac 5 mM, pH 5,0. La elución se realizó con Ácido acético 0,5 M, pH 3,4. El eluato se recogió en fracciones de 1-2 ml, y las fracciones que tenían la DO más elevada a 280 se dializaron contra NaCl 1 mM, carbonato sódico 50 mM (pH 11,0). El dialisado se aclaró mediante centrifugación a 39.000 x g durante 15 minutos, y se aplicó a una columna de 2-iminobiotina agarosa (1,2 x 1,2 cm) previamente equilibrada con NaCl 1M, carbonato sódico 50 mM (pH 11,0). Después de extraer las proteínas no unidas con la misma solución, las proteínas unidas se eluyeron con urea 6 M, acetato amónico 50 mM (pH 4,0). Las proteínas eluidas se dializaron contra una solución salina tamponada con Tris [TBS; NaCl 150 mM, Tris-Cl 20 mM (pH 7,5)] que contenía NaN_{3} al 0,02% y el dialisado se guardó a 4ºC después de la filtración a través de un filtro de 0,22 \mum (Millex-GV, Millipore).
Formación del complejo ST-PA/mAb/\beta-galactosidasa biotinilada
Se incubó a temperatura ambiente durante como mínimo 10 minutos una mezcla de \sim2 \mug de anticuerpo, \sim28 \mug de proteína de fusión y \sim2 unidades de \beta-galactosidasa biotinilada. Después de esta incubación, el complejo estaba listo para utilizar.
Tinción con \beta-galactosidasa: (tinción X-GAL)
La tinción con \beta-galactosidasa de células que se adhieren a la placa se realizó según Sanes y otros, 1986, EMBO J. 5: 3133-3142.
El protocolo de Molecular Probes, Inc. se utilizó para detectar la expresión del gen lacZ-\beta-Galactosidasa en células que crecieron en suspensión.
Los protocolos anteriores se utilizaron para determinar si el complejo que contiene el anticuerpo acoplado a la proteína de fusión y la enzima \beta-Galactosidasa biotinilada se transdujo de manera satisfactoria en el célula de elección. Si la transducción era completa, las células eran azules después de incubación durante toda la noche.
2) Modificación de la secuencia RYD de la proteína estreptavidina
La estreptavidina bloqueada por biotina se une específicamente (Kd = 3 x 10^{8} M) a las superficies celulares, presumiblemente mediante una secuencia que contiene RYD que es diferente del hueco de unión a biotina de la proteína.
Se espera que la alternancia del dominio (secuencia) RYD con otros residuos de aminoácidos elimine la unión de superficie específica de tipo sin biotina de una gran variedad de células.
Una manera de modificar la secuencia RYD sería cambiar la secuencia RYD por RYE. El cambio de la secuencia RYD por RYE se puede conseguir mediante la introducción de una mutación puntual utilizando las etapas secuenciales de la PCR. Esto se puede conseguir mediante el diseño de dos cebadores, DES (SEC ID No: 1) y DER (SEC ID No: 2) (Ver figura 5) y la utilización del vector de expresión pTSAPA-2 como plantilla del gen de estreptavidina. En primer lugar, la PCR se lleva a cabo utilizando dos parejas de cebadores: promotor T7/DER y finalizador T7/DES. En segundo lugar, los dos fragmentos de ADN amplificados se purifican a continuación y se agrupan en una muestra. A continuación, se realiza un segundo ciclo de PCR utilizando los productos purificados agrupados del primer ciclo como plantillas y los cebadores promotor T7 y finalizador T7. La secuencia RYE mutada en el componente del gen de estreptavidina se confirma mediante el análisis de secuencia del producto del segundo ciclo de PCR.
3) Liberación de biotina-\beta-galactosidasa en células A431
A efectos de estudiar la capacidad de ST-PA para liberar compuestos en una célula, la liberación de este complejo se comparó con la de un complejo en el que la estreptavidina central estaba unida de forma covalente al receptor TGF\alpha.
pTSA-TGF\alpha, un vector de expresión para estreptavidina-TGF-\alpha (ST-TGF) se construyó mediante la sustitución del gen de la proteína A en pTSAPA-2 por un gen de TGF-\alpha humano maduro (aminoácidos 1-50).
Para demostrar la capacidad de las proteínas de fusión ST-PA y ST-TGF\alpha para liberar proteína biotinilada en tipos de células específicas, la \beta-galactosidasa biotinilada formó complejos con el componente estreptavidina de la proteína de fusión. La liberación de \beta-galactosidasa en células A431 se cuantificó utilizando técnicas de tinción conocidas y análisis FACS.
ST-PA/biotina \beta-galactosidasa formó complejos con mAb anti-EGFR y el complejo resultante se incubó a continuación con células epidermoides humanas A431 que sobreexpresan el receptor del factor de crecimiento epidérmico (EGFR). Alternativamente, ST-TGF se mezcló con biotina \beta-galactosidasa y el complejo resultante se administró a células A431.
Tal como se muestra en la figura 2, la proteína de fusión ST-PA liberó de manera eficaz biotina \beta-galactosidasa en células A431 a través de EGFR en su superficie (células positivas > 99%). La proteína de fusión ST-TGF\alpha también mostró una liberación eficaz de biotina \beta-galactosidasa en células A431 (células positivas > 99%). Sorprendentemente, la cantidad de biotina \beta-galactosidasa liberada en cada célula por la proteína de fusión ST-TGF\alpha era inferior a la observada en el sistema de liberación ST-PA (la actividad de fluorescencia promedio observada fue 214 y 2402, respectivamente).
La liberación de eficacia muy elevada por la proteína de fusión ST-PA de biotina \beta-galactosidasa en células A431 puede ser debido a los cuatro sitios de unión para biotina e IgG contenidos en cada tetrámero de ST-PA (Figura 1B). En un experimento con el tiempo mostrado en la Figura 3, más del 99% de las células mostraron una tinción positiva para \beta-galactosidasa hasta 2 días después de la transferencia de biotina \beta-galactosidasa en la célula.
4) Liberación de biotina \beta-galactosidasa en células utilizando mAbs de diferente especificidad
El procedimiento experimental aplicado en el estudio de la liberación de biotina \beta-galactosidasa en células A431 también se utilizó para estudiar la liberación del complejo anticuerpo/ST-PA/\beta-galactosidasa biotinilada en otros tipos de células. El estudio utilizó anticuerpos que reconocen varias moléculas diferentes de la superficie celular. Las líneas celulares y las moléculas de la superficie celular utilizadas en este experimento se resumen en la Figura 4A. Tal como se muestra en la figura 4B, el complejo ST-PA/mAb era altamente eficaz (células positivas >99%) en la transferencia de \beta-galactosidasa en los tipos de células humanas ensayadas mediante las moléculas HLA-DR, CD33 y CD34 presentes en la superficie de estas células.
5) Vector de expresión pAT-\beta-galactosidasa
Aunque la biotina se puede incorporar en el ADN (por ejemplo, plásmidos de expresión), la incorporación aleatoria de biotina en el ADN puede dar lugar a una pérdida de actividad transcripcional. A efectos de mantener la actividad transcripcional del ADN a introducir en la célula, se desarrolló un nuevo sistema de transferencia de genes que utiliza un vector de expresión de pAT que tiene una extensión poli(dA)/poli(dT) en dirección descendente del cassette de expresión (figura 5). Según este sistema de transferencia, el ADN a liberar en la célula se clona en el vector de expresión. El vector de expresión de pAT forma ADN de cadena triple con un poli(dT) oligonucleótido biotinilado que se une al sitio de unión a biotina de la proteína de fusión ST-PA. El anticuerpo unido al sitio de unión a anticuerpo de la proteína de fusión ST-PA marca las células en las que el ADN va a liberarse.
El protocolo para la formación de ADN de cadena triple y la transferencia de ADN del gen de \beta-galactosidasa a las células se indica a continuación. El gen de la \beta-galactosidasa se clona en el cassette de expresión del vector de expresión de pAT (figura 5). La mezcla de 4 \mug del vector de expresión pAT-\beta-galactosidasa y 20 pmol de poli(dT) oligonucleótido biotinilado (Promega) en tampón TMN (10 mM de Tris, pH 8,0, 10 mM de MgCl_{2}, 50 mM de NaCl) se incuba a 37ºC durante 1 hora. A continuación, la proteína de fusión ST-PA (0,5 \mug) y mAB (1,0 \mug) se añaden a la mezcla y la mezcla resultante se incuba a temperatura ambiente durante 30 minutos. El complejo ADN de triple cadena-ST-PA-mAb se añade a las células (1 x 10^{6}) y se incuba a 37ºC durante 48 horas. La actividad de la \beta-galactosidasa se detecta mediante FACS.
Referencias
Sano, T. y Cantor, C.R. 1991. A streptavidin-protein A chimera that allows one-step production of a variety of specific antibody conjugates. Bio/Technol. 9: 1378-1381.
Pastan, I. y FitzGerald, D. 1991. Recombinant toxins for cancer treatment. Science. 254: 1173-1177.
Goshorn, S.C., Svensson, H.P., Kerr, D.E., Somerville, J.E., Senter, P.D. y Fell, H.P. 1993. Genetic construction, expression, and characterization of a single chain anticarcinoma antibody fused to b-lactamase. Cancer Res. 53: 2123-2127.
Siegall, C.B., Xu, Y.-H., Chaudhary, V.K., Adhya, S., FitzGerald, D. y Pastan, I. 1989. Cytotoxic activities of a fusion protein comprised of TGF\alpha and pseudomonas exotoxin. FASEB J. 3: 2647-2652.
Ghetie, M.-A., Laky, M., Moraru, I. y Ghetie, V. 1986. Protein A vectorized toxins-I. Preparation and properties of protein A-Ricin toxin conjugates. Mol. Immunol. 23: 1373-1379.
Kiyama, R., Nishikawa, N. y Oishi, M. 1994. Enrichment of human DNAs that flank poly(dA). poly(dT) tract by triplex DNA formation. J. Mol. Biol. 237: 193-200.
Ito, T., Smith, C.L. y Cantor, C.R. 1992. Sequence-specific DNA purification by triplex affinity capture. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 495-498.
Alon R., E. Bayer, M. Wilchek, 1993, Cell Adhesion to streptavidin via RGD-dependent integrins, European Journal of Cell Biology 60: 1-11.
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE: Meruelo, Daniel
\hskip4cmOhno, Kouichi
\hskip4cmLevin, Brandi
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Sistema de alta eficacia para la liberación de compuestos específicos de tejido que utiliza una proteína de fusión estreptavidina-proteína A.
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 4
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DIRECCIÓN PARA LA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DIRECCIÓN: Pennie y Edmonds
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: Avenue of the Americas, 1155
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Nueva York
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: Nueva York
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: EEUU
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CP: 10036-2711
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
TIPO DE LECTURA POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO MEDIO: Disquete
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: PC compatible con IBM
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: Patentin Release #1.0, Versión #1.30
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN DEL ABOGADO/REPRESENTANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Poissant, Brian M.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 28,462
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE INFORME/EXPEDIENTE: 8105-007
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: (212) 790-9090
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TELEFAX: (212) 869-8864
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TELEX: 66441 PENNIE
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID No. 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID No. 1:
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Thr Ile Thr Val Tyr Ala Val Thr Gly Arg Gly Asp Ser Pro Ala}
\sac{Ser Ser Lys Pro}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID No. 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: Péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID No. 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asn Ala Glu Ser Arg Tyr Val Leu Thr Gly Arg Tyr Asp Ser Ala Pro}
\sac{Ala Thr Asp Gly Ser}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID No. 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID No. 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CGTTACGAAA GCGCCCCG
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID No. 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 15 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
HEBRA: única
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID No. 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TGGCAATGC TTTCG
\hfill
15

Claims (23)

1. Complejo para transferir un material marcado a una célula, que comprende:
(a) una proteína de fusión de estreptavidina-proteína A que tiene un sitio de unión a anticuerpo y un sitio de unión a biotina;
(b) un anticuerpo, unido al sitio de unión a anticuerpo, en el que el anticuerpo es específico para una proteína de la superficie celular, y en el que la proteína de la superficie celular experimenta endocitosis después de la unión con el anticuerpo; y
(c) un material marcado biotinilado, unido al sitio de unión a biotina, cuyo complejo es capaz de transferir dicho material marcado a una célula cuando entra en contacto con la célula después de formar dicho complejo.
2. Complejo, según la reivindicación 1, en el que el material marcado se selecciona entre el grupo que consiste en una toxina, un profármaco, un producto génico de MDR, un ácido nucleico de cadena única, un ácido nucleico de cadena doble, o un a proteína de una bacteria o un virus patológicos.
3. Complejo, según la reivindicación 2, en el que el material marcado es una toxina.
4. Complejo, según la reivindicación 3, en el que la toxina se selecciona del grupo que consiste en:
(a)
timidina quinasa;
(b)
endonucleasa;
(c)
ARNasa;
(d)
toxina alfa;
(e)
ricina;
(f)
abrina;
(g)
exotoxina A de Pseudomonas;
(h)
toxina de la difteria;
(i)
saporina;
(j)
momordina;
(k)
gelonina;
(l)
proteína antivírica de la fitolaca;
(m)
alfa-sarcina; y
(n)
toxina del cólera.
5. Complejo, según la reivindicación 2, en el que el material marcado es un profármaco.
6. Complejo, según la reivindicación 2, en el que el material marcado es un producto génico de MDR.
7. Complejo, según la reivindicación 2, en el que el material marcado es un ácido nucleico de cadena única.
8. Complejo, según la reivindicación 2, que comprende además un ácido nucleico de cadena única biotinilado, que tiene una parte de homopurina u homopirimidina, unido al sitio de unión a biotina; y en el que el material marcado es un ácido nucleico de cadena doble que comprende un ADN de cadena doble que forma una estructura de cadena triple con el ácido nucleico de cadena única biotinilado.
9. Complejo, según la reivindicación 2, en el que el material marcado es una proteína de una bacteria o un virus patológicos.
10. Complejo, según las reivindicaciones 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 ó 9, en el que existen cuatro sitios de unión a anticuerpo y cuatro sitios de unión a biotina.
11. Complejo, según las reivindicaciones 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 ó 9, en el que el componente estreptavidina de dicha proteína de fusión estreptavidina-proteína A tiene una secuencia RYD modificada.
12. Complejo, según las reivindicaciones 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 ó 9, que comprende además un anticuerpo que se une al receptor de transferina.
13. Complejo, según las reivindicaciones 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 u 8, en el que el anticuerpo reconoce un antígeno de superficie seleccionado del grupo de
(a)
HLA DR;
(b)
CD33;
(c)
CD34; y
(d)
receptor EGF.
14. Complejo, según las reivindicaciones 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 ó 9, en el que el anticuerpo es un anticuerpo IgG.
15. Composición farmacéutica, que comprende:
(a) el complejo según las reivindicaciones 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8 ó 9, y
(b) un portador farmacéuticamente aceptable, donde dicha composición está sustancialmente libre de toxina no unida a la proteína de fusión estreptavidina-proteína A.
16. Método para transferir toxinas en una célula, que comprende las etapas de:
(a) formar un complejo que comprende
(i)
una proteína de fusión de estreptavidina-proteína A que tiene un sitio de unión a anticuerpo y un sitio de unión a biotina;
(ii)
un anticuerpo, unido al sitio de unión a anticuerpo, en el que el anticuerpo es específico para una proteína de la superficie celular, y en el que la proteína de la superficie celular experimenta endocitosis después de la unión con el anticuerpo; y
(iii)
una toxina biotinilada, unida al sitio de unión a biotina;
(b) aislar el complejo de la toxina que no está unida al sitio de unión a biotina, y
(c) exponer el complejo aislado a una célula, de manera que la toxina entra en la célula.
17. Método para transferir material marcado en una célula, que comprende las etapas de:
(a) formar un complejo que comprende
(i)
una proteína de fusión de estreptavidina-proteína A que tiene un sitio de unión a anticuerpo y un sitio de unión a biotina;
(ii)
un anticuerpo, unido al sitio de unión a anticuerpo, en el que el anticuerpo es específico para una proteína de la superficie celular, y en el que la proteína de la superficie celular experimenta endocitosis después de la unión con el anticuerpo; y
(iii)
material marcado biotinilado, unido al sitio de unión a biotina;
(b) exponer el complejo aislado a una célula, de manera que el material marcado entra en la célula;
en el que el material marcado se selecciona del grupo que consiste en un ácido nucleico de cadena única, un producto génico de MDR y un profármaco.
18. Método, según la reivindicación 17, en el que el material marcado es un ácido nucleico de cadena doble, en el que un ácido nucleico de cadena única biotinilado está unido al sitio de unión a biotina, y que comprende además un ADN de cadena doble que forma una estructura de cadena triple con el ácido nucleico de cadena única biotinilado.
19. Método, según la reivindicación 16, 17 ó 18, en el que el complejo tiene cuatro sitios de unión a anticuerpo y cuatro sitios de unión a biotina.
20. Método, según la reivindicación 16, 17 ó 18, en el que el componente estreptavidina de dicha proteína de fusión estreptavidina-proteína A tiene una secuencia RYD modificada.
21. Método, según la reivindicación 16, 17 ó 18, en el que el complejo comprende además un anticuerpo que se une al receptor de transferina.
22. Método, según la reivindicación 16, 17 ó 18, en el que el anticuerpo reconoce un antígeno de superficie seleccionado del grupo de
(a)
HLA DR;
(b)
CD33;
(c)
CD34; y
(d)
receptor EGF.
23. Método, según la reivindicación 16, 17 ó 18, en el que el anticuerpo es un anticuerpo IgG.
ES96941471T 1995-11-30 1996-11-26 Sistema de alta eficacia para la liberacion de compuestos especificos de tejido que utiliza una proteina de fusion estreptavidina-proteina a. Expired - Lifetime ES2289754T3 (es)

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US566421 1983-12-28
US08/566,421 US6497881B1 (en) 1995-11-30 1995-11-30 High efficiency tissue specific compound delivery system using streptavidin-protein a fusion protein

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