ES2296287T3 - Quinasa similar a los receptores de activina (alk), que pertenece a la familia de los receptores de tgf y/o a la familia de los receptores de bmp. - Google Patents

Quinasa similar a los receptores de activina (alk), que pertenece a la familia de los receptores de tgf y/o a la familia de los receptores de bmp. Download PDF

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R. Scott Thies
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Abstract

NUEVAS PROTEINAS RECEPTORAS DE SERINA/TREONINA Y PROTEINAS RECEPTORAS DE BMP SON REVELADAS, ASI COMO MOLECULAS DE ADN QUE CODIFICAN DICHAS PROTEINAS Y METODOS PARA UTILIZAR LAS PROTEINAS RECEPTORAS. ADEMAS SE PRESENTAN PROTEINAS Y MOLECULAS RECEPTORAS BMP TRUNCADAS QUE ACTUAN COMO LIGANDOS DE DICHAS PROTEINAS RECEPTORAS BMP.

Description

Quinasa similar a los receptores de activina (ALK), que pertenece a la familia de los receptores de TGF y/o a la familia de los receptores de BMP.
Campo de la invención
La presente invención se refiere a nuevas proteínas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa, incluida una nueva familia de proteínas que son receptoras de proteínas morfogénicas óseas (BMP). Más particularmente, la presente invención se refiere a proteínas de receptores que son capaces de unirse a BMP, incluidas BMP-2 y BMP-4. La presente invención se refiere, además, a métodos para aislar nuevas proteínas de receptores de BMP utilizando fragmentos de ADN recientemente identificados como sondas para el aislamiento de dichas proteínas.
Antecedentes de la invención
Las proteínas morfogénicas óseas (BMP) son una familia de proteínas que se han identificado por su capacidad de inducir la formación de hueso y cartílago en extractos de tejidos. Las BMP constituyen una subfamilia dentro de la superfamilia de TGF-\beta. Las BMP tienen múltiples usos terapéuticos, incluida una amplia gama de escenarios en los que ha habido pérdidas óseas debidas a procesos fisiológicos o traumáticos.
Se ha comprobado que la superfamilia de proteínas TGF-\beta se unen a receptores con actividad serina/treonina-quinasa: Massague, Cell 69: 1067-1070 (1992); Attisano et al., Cell 68:97-108 (1992); Lin et al., Cell, 68:775-785 (1992); Wang et al., Cell 67:797-805 (1991). De modo similar, los receptores de activina han sido aislados y caracterizados como una serina-quinasa que se ha predicho que atraviesa la membrana: Mathews et al., Cell 65:973-982 (1991); Nakamura et al., J. Biol. Chem. 267:18924-18928 (1992). Ebner et al., Science, 260:1344-1348 (1993) describen la existencia de receptores de TGF-\beta de tipo I y de tipo II, y los efectos del receptor de tipo I en la unión del TGF-\beta al receptor de tipo II.
Se ha descrito que las proteínas de receptores de tipo I no se unen a las moléculas que son sus ligandos de forma independiente, sino que, actuando en concierto con las proteínas de receptores de tipo II, parece que contribuyen a aumentar la unión del ligando. Ver Matsuzaki et al., J. Biol. Chem., 268:12719-12723 (1993); Ebner et al., Science, 260:1344-1348 (1993).
Paralkar et al., PNAS USA 88:3397-3401 (1991) describen la presencia de sitios de unión de alta afinidad para BMP-4 en células MC3T3E1 y NIH3T3. No se encontró competición de TGF-\beta con las proteínas que se unen a BMP-4, ni se observó competición de BMP-4 por los receptores de TGF-\beta en el estudio de Attisano et al., Cell 68:97-108 (1992).
Sumario de la invención
En una forma de realización, la presente invención comprende una molécula de ADN aislada y purificada que codifica una proteína de receptor de BMP, tal como se define en la reivindicación 1.
Entre otras utilizaciones, estas moléculas de ADN son útiles en la actualidad como sondas para el aislamiento y la purificación de otros nuevos receptores de BMP.
La presente invención también comprende nuevas secuencias de ADN que codifican proteínas de receptores; dichas nuevas secuencias de ADN se identifican mediante un método que utiliza una secuencia de ADN que codifica la totalidad, o un fragmento, de las proteínas de receptores de la presente invención. En formas de realización preferidas, las nuevas secuencias de ADN se identifican utilizando una secuencia de ADN procedente del dominio de serina/treonina-quinasa de un receptor, que está muy conservada en la familia de receptores de BMP. Como alternativa, la secuencia de ADN que codifica el dominio de unión al ligando puede utilizarse para identificar otras nuevas secuencias que codifican receptores de BMP.
La presente invención comprende, además, moléculas de ADN que codifican proteínas truncadas, solubles, de receptores, y las mismas proteínas solubles. Las proteínas truncadas de receptores comprenden preferentemente el dominio de unión al ligando, pero no los dominios de serina/treonina-quinasa ni transmembranario, de la proteína de receptor. Las proteínas truncadas de receptores son solubles, y serán secretadas en el sobrenadante por células de mamífero. Así, cuando se expresa en células de mamífero utilizando una molécula de ADN que codifica una proteína truncada de receptor, la proteína truncada de receptor será secretada, en vez de expresarse en la superficie de la célula hospedadora. La proteína truncada de receptor expresada de dicha manera sigue uniéndose de forma específica a BMP, y puede utilizarse para bloquear la mediación de receptores en procesos celulares en los que participan normalmente como mecanismos de transmisión de señales mediante competición por el mismo ligando. La proteína truncada de receptor podría competir por el ligando funcional con proteínas de receptores que se expresan normalmente en la superficie de células que responden, e inhibir la formación de un complejo funcional receptor-ligando, bloqueando de este modo el mecanismo normal de transmisión de señales del complejo y los procesos celulares afectados normalmente por las interacciones funcionales receptor-ligando.
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En un aspecto, la invención proporciona un método para producir células que expresan más de una proteína de receptor, que comprende cultivar una célula hospedadora seleccionada que contiene una secuencia de polinucleótidos que codifica una primera proteína seleccionada, que es una proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmento activo de las mismas, y una secuencia de polinucleótidos que codifica una segunda proteína seleccionada, que es una proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmento activo de las mismas. Las células resultantes, que expresarán a la vez múltiple receptores biológicamente activos, pueden aislarse y utilizarse en una composición terapéutica.
Otro aspecto de la presente invención comprende ligandos para los receptores de BMP y la proteína truncada de receptor de BMP, estando caracterizados dichos ligandos por la capacidad de unirse a los receptores. Dichos ligandos pueden estimular el crecimiento del hueso y/o el cartílago, o pueden afectar a otros procesos del desarrollo. Dichos ligandos pueden ser anticuerpos monoclonales, pequeños péptidos que son análogos de BMP, o pequeñas moléculas orgánicas que son análogos de BMP, como se caracteriza adicionalmente en la presente memoria. En una forma de realización preferida, dichos ligandos comprenden anticuerpos contra la proteína truncada, soluble, de receptor y las proteínas de receptores de la invención. Estos anticuerpos pueden emplearse para diversas aplicaciones diagnósticas y terapéuticas. Dichos anticuerpos pueden utilizarse para identificar tipos celulares que expresan de forma natural receptores de la invención y, por consiguiente, pueden tener la capacidad de provocar una respuesta biológica cuando se exponen al ligando apropiado. Estos anticuerpos puede ser útiles también para la identificación de otras proteínas de receptores capaces de unirse a otras BMP individuales y/o heterodímeros de BMP. Además, dichos anticuerpos son útiles para bloquear la formación de complejos funcionales de receptor-ligando, e inhibir de este modo las respuestas celulares que serían mediadas normalmente por dichos complejos. Como alternativa, dichos anticuerpos pueden imitar el efecto de la BMP por su interacción con el receptor, de modo que se estimulen las respuestas celulares que serían normalmente mediadas por un complejo funcional receptor-ligando.
En otra forma de realización, la invención comprende composiciones farmacéuticas que comprenden un compuesto identificado primero para dicha utilización como ligando para el receptor truncado de BMP, y métodos terapéuticos para el tratamiento de trastornos del hueso y/o del cartílago, que comprenden administrar un ligando para el receptor truncado de BMP.
Otros aspectos y ventajas de la presente invención se pondrán más claramente de manifiesto a partir de la siguiente descripción detallada y de las formas de realización preferidas de la misma.
Breve descripción de las secuencias
La SEC ID nº: 1 comprende la secuencia de ADN y de aminoácidos de la proteína de receptor de BMP CFK1-23a, aislada a partir de la línea celular de rata CFK1. Este ADN contenido en el plásmido CFK1-23a, ha sido depositado y ha recibido el nº de la ATCC 69378, y se describe con más detalle más adelante.
La SEC ID nº: 2 comprende la secuencia aminoácida codificada por la secuencia de ADN de CFK1-23a.
La SEC ID nº: 3 comprende la secuencia de ADN y de aminoácidos de la proteína de receptor de BMP CFK1-43a, aislada a partir de la línea celular de rata CFK1. Este ADN contenido en el plásmido CFK1-43a ha sido depositado y ha recibido el nº de la ATCC 69381, y se describe con más detalle más adelante.
La SEC ID nº: 4 comprende la secuencia aminoácida codificada por la secuencia de ADN de CFK1-43a.
La SEC ID nº: 5 comprende la secuencia de ADN y de aminoácidos de la proteína de receptor con actividad serina/treonina-quinasa CFK1-10a, aislada a partir de la línea celular de rata CFK1. Este ADN contenido en el plásmido CFK1-10a ha sido depositado y ha recibido el nº de la ATCC 69380, y se describe con más detalle más adelante.
La SEC ID nº: 6 comprende la secuencia aminoácida codificada por la secuencia de ADN de CFK1-10a.
La SEC ID nº: 7 comprende la secuencia de ADN y de aminoácidos de la proteína de receptor con actividad serina/quinasa W101, aislada a partir de la línea celular murina W-20-17. Este ADN contenido en el plásmido pMT101 ha sido depositado y ha recibido el nº de la ATCC 69379, y se describe con más detalle más adelante.
La SEC ID nº: 8 comprende la secuencia aminoácida codificada por la secuencia de ADN de W101.
La SEC ID nº: 9 comprende la secuencia de ADN y de aminoácidos de la proteína de receptor con actividad serina/treonina-quinasa W120, aislada a partir de la línea celular murina W-20-17. Este ADN contenido en el plásmido pMT120E ha sido depositado y ha recibido el nº de la ATCC 69377, y se describe con más detalle más adelante.
La SEC ID nº: 10 comprende la secuencia aminoácida codificada por la secuencia de ADN de W120.
La SEC ID nº: 11 comprende la secuencia de ADN y de aminoácidos de la proteína de receptor con actividad serina/quinasa KDA-B5. Este ADN se utilizó como sonda para identificar nuevos receptores con actividad serina/quinasa de la presente invención.
La SEC ID nº: 12 comprende la secuencia aminoácida codificada por la secuencia de ADN de KDA-B5.
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La SEC ID nº: 13: comprende la secuencia de ADN del cebador oligonucleotídico A.
La SEC ID nº: 14: comprende la secuencia de ADN del cebador oligonucleotídico B.
La SEC ID nº: 15: comprende la secuencia de ADN del cebador oligonucleotídico C.
La SEC ID nº: 16 comprende la secuencia de ADN del cebador oligonucleotídico D.
La SEC ID nº: 17 comprende la secuencia de ADN del cebador oligonucleotídico E.
La SEC ID nº: 18: comprende la secuencia aminoácida de una porción de KDA-B5 utilizada para diseñar el cebador oligonucleotídico A.
La SEC ID nº: 19 comprende la secuencia aminoácida de una porción de KDA-B5 utilizada para diseñar los cebadores oligonucleotídicos B a E.
Descripción detallada de la invención
Las proteínas morfogénicas óseas se caracterizan por su capacidad de promover, estimular, o inducir de otro modo la formación de cartílago y/o hueso. La capacidad de estas proteínas de presentar actividad de formación de cartílago y/o hueso en el ensayo de formación de hueso en ratas se describe más adelante. Estas proteínas pueden utilizarse en composiciones que pueden emplearse para inducir la formación de hueso y/o cartílago. Estas composiciones con BMP también pueden utilizarse para la curación de heridas y la reparación de tejidos. Otras utilizaciones de dichas composiciones incluyen el tratamiento de defectos del hueso y/o del cartílago, enfermedad periodontal y otros procesos de reparación de dientes, el tratamiento de la osteoporosis y el aumento de la supervivencia neuronal.
Los receptores de BMP y los receptores truncados de la presente invención son útiles, entre otras aplicaciones, para la identificación de las BMP, la identificación de otros receptores de BMP, y la identificación de ligandos o moléculas, incluidos anticuerpos, que son capaces de imitar las características de unión de las BMP. Estos ligandos pueden actuar como agonistas o antagonistas, en función de ligando individual. La actividad de los ligandos puede caracterizarse en un ensayo de actividad de BMP, tal como el ensayo de inducción de la fosfatasa alcalina en células W-20-17 y el ensayo de formación de hueso ectópico en ratas, descritos más adelante en los Ejemplos XII y XIII. Los receptores de BMP son también útiles para inhibir los efectos de las BMP, cuando dicha inhibición es deseable.
Las proteínas de receptores de BMP de la presente invención pueden caracterizarse por una secuencia aminoácida que comprende los aminoácidos nº 1-532 de la SEC ID nº: 2; o los aminoácidos nº 1-502 de la SEC ID nº: 4.
Las proteínas humanas purificadas de receptores de BMP de la presente invención pueden producirse cultivando una célula hospedadora transformada con una secuencia de ADN que comprende la secuencia de ADN codificante de la SEC ID nº: 1 desde el nucleótido nº 61 hasta el nucleótido 1656 (o hasta el codón de terminación 1659); o de la SEC ID nº: 3 desde el nucleótido nº 247 hasta el nucleótido 1752 (o hasta el codón de terminación 1755); y recuperando y purificando, a partir de la membrana celular transformada, una proteína que contiene la secuencia aminoácida derivada, o una secuencia sustancialmente homóloga como la que va del aminoácido nº 24 hasta el aminoácido nº 532 de la SEC ID nº: 2; o desde el aminoácido nº 8 hasta el aminoácido nº 502 de la SEC ID nº: 4. Dado que se espera que las proteínas de receptores de BMP expresadas de esta manera permanezcan asociadas con la membrana celular de la célula transformada, las proteínas recombinantes de receptores de la invención pueden disociarse de la membrana celular transformada y purificarse después aislándolas de otros materiales proteicos con los que se coproducen, así como de otros contaminantes presentes.
Las proteínas truncadas de receptores de BMP de la presente invención pueden caracterizarse por una secuencia aminoácida que comprende los aminoácidos nº 1-149 de la SEC ID nº: 2, o los aminoácidos nº 1-124 de la SEC ID nº: 4.
Las proteínas truncadas humanas purificadas de receptores de BMP de la presente invención pueden producirse cultivando una célula hospedadora transformada con una secuencia de ADN que comprende la secuencia de ADN codificante de la SEC ID nº: 1 desde el nucleótido nº 61 hasta el nucleótido 507; o de la SEC ID nº: 3 desde el nucleótido nº 247 hasta el nucleótido 618; y recuperando y purificando a partir del medio de cultivo una proteína que contiene la secuencia aminoácida derivada, o una secuencia sustancialmente homóloga, como la que va del aminoácido nº 24 hasta el aminoácido nº 149 de la SEC ID nº: 2; o del aminoácido nº 8 hasta el aminoácido nº 124 de la SEC ID nº: 4. En las secuencias de aminoácidos anteriores, la secuencia líder secretora (por ejemplo, aminoácidos 1 hasta 23 de la SEC ID nº: 2) no estará presente, ya que estas secuencias típicamente se eliminan por escisión en las proteínas secretadas. La secuencia líder predicha para la SEC ID nº: 4 por los programas estándar de ordenador corresponde a los aminoácidos 1 a 7; sin embargo, se contempla que la secuencia líder real sea más larga, ya que siete aminoácidos constituyen una secuencia líder inusualmente corta. Así, la proteína purificada a partir de células hospedadoras cultivadas transformadas con una molécula de ADN que comprende la secuencia de ADN de la SEC ID nº: 3 desde el nucleótido nº 247 hasta el nucleótido 618 puede ser más corta que la secuencia que va desde el aminoácido nº 8 hasta el aminoácido nº 124 de la SEC ID nº: 4.
Las proteínas truncadas de receptores de BMP recuperadas a partir del medio de cultivo se purifican aislándolas de otros materiales proteicos con los que se coproducen y de otros contaminantes presentes.
Otras proteínas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa de la presente invención pueden caracterizarse por una secuencia aminoácida que comprende los aminoácidos nº 1-509 de la SEC ID nº: 6.
Las proteínas purificadas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa de la presente invención pueden producirse cultivando una célula hospedadora transformada con una secuencia de ADN que comprende la secuencia de ADN codificante de la SEC ID nº: 5 desde el nucleótido nº 474 hasta el nucleótido 2000 (o hasta el codón de terminación 2003); y recuperando y purificando a partir de la membrana celular transformada una proteína que contiene la secuencia aminoácida derivada, o una secuencia sustancialmente homóloga como la que va desde el aminoácido nº 18 hasta el aminoácido nº 509 de la SEC ID nº: 6. Dado que se espera que las proteínas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa expresadas de este modo permanezcan asociadas a la membrana celular de la célula transformada, las proteínas recombinantes de receptores de la invención pueden disociarse de la membrana celular transformada y purificarse después aislándolas de otros materiales proteicos con los que se coproducen y de otros contaminantes presentes.
Las proteínas truncadas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa de la presente invención pueden caracterizarse por una secuencia aminoácida que comprende los aminoácidos nº 1-121 de la SEC ID nº: 6.
Las proteínas truncadas humanas purificadas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa de la presente invención pueden producirse cultivando una célula hospedadora transformada con una secuencia de ADN que comprende la secuencia de ADN codificante de la SEC ID nº: 5 desde el nucleótido nº 474 hasta el nucleótido 836 y recuperando y purificando a partir del medio de cultivo una proteína que contiene la secuencia aminoácida derivada, o una secuencia sustancialmente homóloga, como la que va desde el aminoácido nº 18 hasta el aminoácido Nº 121 de la SEC ID nº: 6. Las proteínas truncadas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa recuperadas a partir del medio de cultivo se purifican aislándolas de otros materiales proteicos con los que se coproducen y de otros contaminantes presentes.
La proteínas de receptores con actividad serina/quinasa de la presente invención pueden caracterizarse por una secuencia aminoácida que comprende los aminoácidos nº 1-505 de la SEC ID nº: 8; o los aminoácidos nº 1-503 de la SEC ID nº: 10.
Las proteínas purificadas de receptores con actividad serina/quinasa de la presente invención pueden producirse cultivando una célula hospedadora transformada con una secuencia de ADN que comprende la secuencia de ADN codificante de la SEC ID nº: 7 desde el nucleótido nº 80 hasta el nucleótido 1594 (o hasta el codón de terminación 1597); o de la SEC ID nº: 9 desde el nucleótido nº 83 hasta el nucleótido 1591 (o hasta el codón de terminación 1594); y recuperando y purificando a partir de la membrana celular transformada una proteína que contiene la secuencia aminoácida derivada, o una secuencia sustancialmente homóloga como la que va desde el aminoácido nº 24 hasta el aminoácido nº 505 de la SEC ID nº: 8; o desde el aminoácido nº 30 hasta el aminoácido nº 503 de la SEC ID nº: 10. Dado que se espera que las proteínas de receptores con actividad serina/quinasa expresadas de este modo permanezcan asociadas con la membrana celular de la célula transformada, las proteínas recombinantes de receptores de la invención pueden disociarse de la membrana celular transformada y purificarse después aislándolas de otros materiales proteicos con los que se coproducen y de otros contaminantes presentes.
Las proteínas truncadas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa de la presente invención pueden caracterizarse por una secuencia aminoácida que comprende los aminoácidos nº 1-122 de la SEC ID nº: 8; o los aminoácidos nº 1-121 de la SEC ID nº: 10.
Las proteínas truncadas humanas purificadas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa de la presente invención pueden producirse cultivando una célula hospedadora transformada con una secuencia de ADN que comprende la secuencia de ADN codificante de la SEC ID nº: 7 desde el nucleótido nº 80 hasta el nucleótido 445; o de la SEC ID nº: 9 desde el nucleótido nº 83 hasta el nucleótido 445; y recuperando y purificando a partir del medio de cultivo una proteína que contiene la secuencia aminoácida derivada, o una secuencia sustancialmente homóloga, como la que va desde el aminoácido nº 24 hasta el aminoácido nº 122 de la SEC ID nº: 8; o desde el aminoácido nº 30 hasta el aminoácido nº 121 de la SEC ID nº: 10. Las proteínas truncadas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa recuperadas a partir del medio de cultivo se purifican aislándolas de otros materiales proteicos con los que se coproducen y de otros contaminantes presentes.
La presente invención también abarca moléculas de ADN que comprenden las nuevas secuencias de ADN, exentas de asociación con secuencias de ADN que codifican otros materiales proteicos, y que codifican la expresión de las proteínas de receptores descritas anteriormente. Estas secuencias de ADN incluyen las presentadas en las SEC ID nº: 1, 3, 5, 7 y 9, en la dirección 5' a 3', y aquellas secuencias que se hibridan en condiciones restrictivas de hibridación [ver, T. Maniatis et al., Molecular Cloning (A Laboratory Manual), Cold Spring Harbor Laboratory (1982), páginas 387 a 389] a las secuencias de ADN de las SEC ID nº: 1, 3, 5, 7 y 9; y codifican una proteína que tiene la capacidad de unirse a BMP, o que es útil para aislar nuevos receptores de BMP.
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De forma similar, las secuencias de ADN que codifican los anteriores polipéptidos de receptores representados por las secuencias aminoácidas de las SEC ID nº: 2, 4, 6, 8 y 10, pero que difieren en la secuencia de codones debido a degeneraciones del código genético o a variaciones alélicas (cambios de bases que aparecen en la naturaleza en las poblaciones de especies y que pueden dar lugar, o no, al cambio de un aminoácido) también codifican las nuevas proteínas de receptores descritas en la presente memoria. Las variaciones en las secuencias de ADN de las SEC ID nº: 1, 3, 5, 7 y 9 causadas por mutaciones puntuales o por modificaciones provocadas (incluidas la inserción, deleción y sustitución) para aumentar la actividad, la semivida o la producción de los polipéptidos así codificados también están abarcadas por la invención.
Otro aspecto de la presente invención proporciona un nuevo método para la producción de proteínas de receptores. El método de la presente invención implica el cultivo de una línea celular adecuada, que ha sido transformada con una molécula de ADN que comprende una secuencia de ADN que codifica la expresión de una proteína de receptor, bajo control de secuencias reguladoras conocidas. Las células hospedadoras transformadas se cultivan, y las proteínas de receptores se recuperan y se purifican a partir de la membrana celular transformada. Las proteínas purificadas están sustancialmente exentas de otras proteínas con las que han sido coproducidas, así como de otros contaminantes.
Otro aspecto de la presente invención proporciona un nuevo método para la producción de proteínas truncadas de receptores. El método de la presente invención implica el cultivo de una línea celular adecuada, que ha sido transformada con una molécula de ADN que comprende una secuencia de ADN que codifica la expresión de una proteína truncada de receptor, bajo el control de secuencias reguladoras conocidas. Las células hospedadoras transformadas se cultivan, y las proteínas truncadas de receptores se recuperan y se purifican a partir del medio de cultivo. Las proteínas purificadas están sustancialmente exentas de otras proteínas con las que han sido coproducidas, así como de otros contaminantes.
Las células o líneas celulares adecuadas para la producción de las proteínas de receptores o de las proteínas truncadas de receptores pueden ser células de mamífero, tales como células de ovario de hámster chino (CHO) o células BHK. La selección de células hospedadoras de mamífero adecuadas, y de métodos de transformación, cultivo, purificación, cribado, y producción y purificación del producto son conocidas en la técnica. Ver, por ejemplo, Gething y Sambrook, Nature, 293:620-625 (1981), o, como alternativa, Kaufman et al., Mol. Cell. Biol., 5(7):1750-1759 (1985) o Howley et al., patente US nº 4.419.446. Otra línea celular de mamífero adecuada, que se describe en los ejemplos adjuntos, es la línea celular de mono COS-1. También puede ser adecuada la línea celular de mamífero CV-1.
Las células bacterianas también pueden ser hospedadores adecuados. Por ejemplo, las diferentes cepas de E. coli (por ejemplo, HB101, MC1061) son bien conocidas como células hospedadoras en el campo de la biotecnología. También pueden emplearse en el presente método varias cepas de B. subtilis, Pseudomonas, otros bacilos, y similares.
Muchas cepas de levaduras conocidas por los expertos en la materia pueden emplearse asimismo como células hospedadoras para la expresión de los polipéptidos de la presente invención. Además, si se desea, pueden utilizarse células de insecto como células hospedadoras en el método de la presente invención. Ver, por ejemplo Miller et al., Genetic Engineering, 8:277-298 (Plenum Press 1986) y las referencias citadas en dicho documento.
Otro aspecto de la presente invención proporciona vectores para su utilización en la expresión de dichos nuevos polipéptidos de receptores. Preferentemente, los vectores contienen las nuevas secuencias completas de ADN descritas anteriormente, que codifican las nuevas proteínas de receptores de la invención. Además, los vectores contienen secuencias adecuadas para el control de la expresión, que permiten la expresión de las secuencias de la proteína de receptor.
Como alternativa, los vectores que incorporan secuencias modificadas de ADN como se ha descrito anteriormente son también formas de realización de la presente invención, y son útiles para la producción de las proteínas de receptores. Los vectores pueden emplearse en el método de transformación de líneas celulares y contienen secuencias reguladoras seleccionadas asociadas funcionalmente a las secuencias codificantes de ADN de la invención que son capaces de dirigir la replicación y la expresión de las mismas en células hospedadoras seleccionadas. Las secuencias reguladoras útiles para dichos vectores son conocidas por los expertos en la materia y pueden seleccionarse en función de las células hospedadoras escogidas. Dicha selección es una práctica habitual y no forma parte de la presente invención.
Se ha comprobado que las proteínas de receptores de BMP de la presente invención, tales como CFK1-23a y CFK1-43a, se unen a miembros de la familia de BMP, preferentemente BMP-2 y BMP-4, pero no al TGF-\beta. Por tanto, las proteínas de receptores de BMP de la presente invención se distinguen de los receptores del TGF-\beta, que se unen al TGF-\beta.
La presente invención puede incluir la cotransfección de células con moléculas de ADN que comprenden secuencias de ADN que codifican múltiples proteínas de receptores con el objeto de lograr la unión a una molécula de ligando tal como una BMP. Así, por ejemplo, una molécula de ADN que comprende una secuencia de ADN que codifica la proteína de receptor CFK1-10a puede utilizarse para cotransfectar células junto con una molécula de ADN que comprende una secuencia de ADN que codifica la proteína de receptor CFK1-23a o CFK1-43a.
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Las moléculas de ADN que comprenden secuencias de ADN que codifican las proteínas de receptores de la presente invención son útiles para la producción de células que expresan proteínas de receptores. Cuando estas células se transforman con las moléculas de ADN de la presente invención, expresarán proteínas de receptores en su superficie. A su vez, estas células se unirán más fácilmente al ligando y pueden demostrar una mayor capacidad de respuesta al ligando. Por ejemplo, las células que expresan las proteínas de receptores de BMP de la presente invención presentan una mayor unión a BMP-2 y BMP-4, y mostrarán una mayor capacidad de respuesta a BMP tales como BMP-2 y BMP-4. La mayor capacidad de respuesta a BMP es deseable para acelerar los efectos de las BMP, que incluyen la estimulación osteoinductora del crecimiento de huesos y de la regeneración del cartílago.
Las proteínas de receptores de BMP de la presente invención son útiles para el aislamiento de BMP. Además, las proteínas de receptores de BMP de la invención son útiles para la identificación de nuevas moléculas relacionadas con las BMP, que pueden ser capaces de provocar la formación de hueso o cartílago, o pueden afectar a otros procesos del desarrollo. Además, las proteínas de receptores de BMP son útiles para la identificación y/o cuantificación de BMP-2 y/o BMP4 en una muestra, así como para la inhibición de los efectos de BMP-2 o BMP-4 en las células. Los receptores de BMP de la presente invención pueden ser útiles también para la identificación de compuestos químicos sintéticos y naturales capaces de imitar los efectos de la unión de BMP-2 y/o BMP-4. Las proteínas de receptores de BMP de la invención pueden ser útiles también para la identificación de compuestos químicos sintéticos y naturales capaces de antagonizar y/o inhibir los efectos de la unión de BMP-2 y/o BMP4. Las proteínas de receptores de BMP también pueden ser útiles para la identificación de compuestos que desempeñan una función en la regulación de la expresión de proteínas de receptores de BMP. Dichos compuestos podrían utilizarse para estimular la capacidad de respuesta a BMP, por ejemplo: crecimiento óseo, en tejidos particulares o células de interés.
Las nuevas proteínas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa de la presente invención también incluyen W101 y W120, que han sido aisladas a partir de la línea celular murina W-20-17, una línea celular que se sabe que responde a BMP. El ADN que codifica una de dichas nuevas proteínas de receptores se ha utilizado como sonda para aislar otros clones que son miembros potenciales de la clase de proteínas de receptores de BMP, incluidos los clones CFK1-23a y CFK1-43a, de los que se ha confirmado que codifican proteínas que son miembros de la familia de receptores de BMP. De este modo, las moléculas de ADN que comprenden la secuencia de ADN que codifica las proteínas de receptores con actividad serina/quinasa de la presente invención son útiles para el aislamiento del ADN que codifica proteínas de receptores de BMP, y la presente invención incluye dicho método de utilización de las moléculas de ADN que comprenden la secuencia de ADN que codifica proteínas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa, así como las nuevas proteínas de receptores de BMP aisladas de dicha forma.
En una forma de realización de la presente invención, las nuevas secuencias de ADN que codifican proteínas de receptores de BMP se identifican por un método que utiliza la secuencia de ADN que codifica la totalidad, o un fragmento, de las proteínas de receptores con actividad serina/quinasa de la presente invención. En formas de realización preferidas, las nuevas secuencias de ADN se identifican utilizando la secuencia de ADN que codifica el dominio de serina/treonina-quinasa de un receptor. Como alternativa, la secuencia de ADN que codifica el dominio de unión al ligando podría utilizarse para identificar otras nuevas secuencias codificantes de receptores de BMP.
Por tanto, la presente invención comprende, además, métodos para la identificación de nuevas proteínas de receptores de BMP y moléculas de ADN que codifican dichas proteínas, y las proteínas y moléculas de ADN identificadas de esta forma. El método comprende preparar un fragmento de ADN que codifica un dominio seleccionado de una proteína de receptor de BMP, preferentemente el dominio de la quinasa de una proteína de receptor de BMP, o, como alternativa, un fragmento de ADN que codifica el dominio de unión al ligando, y utilizar dicho fragmento como sonda para cribar una genoteca genómica o de ADNc. La genoteca de ADNc se prepara preferentemente a partir de una línea celular que se sabe que expresa receptores de BMP. Dichas líneas incluyen la línea celular murina W-20-17 y la línea celular de rata CFK1. Las secuencias de ADN así identificadas comparten homología con la proteína conocida de receptor de BMP, por lo que se espera que codifiquen una proteína que capaz de unirse a una o más BMP. Utilizando métodos conocidos en la técnica se puede clonar la secuencia completa de ADN identificada de este modo, que se puede utilizar para expresar la nueva proteína identificada de receptor de BMP. La identificación de la nueva proteína como una proteína de receptor de BMP se confirma utilizando el ensayo de unión descrito en el Ejemplo VI.
Otra forma de realización de la presente invención comprende moléculas de ADN que comprenden secuencias de ADN que codifican proteínas truncadas de receptores, y las propias proteínas truncadas. Las proteínas truncadas de receptores preferentemente comprenden el dominio de unión al ligando, pero no los dominios de serina/treonina-quinasa y transmembranario, de la proteína de receptor. Las proteínas truncadas de receptores son solubles, y serán secretadas en el sobrenadante por células de mamífero. De este modo, cuando se expresa en células de mamífero utilizando una molécula de ADN que codifica una proteína truncada de receptor, la proteína truncada de receptor será secretada en vez de expresarse en la superficie de la célula hospedadora. La proteína truncada de receptor así expresada sigue uniéndose de forma específica a su ligando. Así, las proteínas truncadas de receptores de BMP pueden utilizarse para bloquear la mediación de receptores de BMP de la invención en procesos celulares en los que participan normalmente como mecanismos de transmisión de señales. La proteína truncada de receptor podría competir por la unión al ligando funcional con proteínas de receptores expresadas normalmente en la superficie de células que responden, e inhibir la formación de un complejo funcional de receptor-ligando, bloqueando de este modo el mecanismo normal de transmisión de señales del complejo y los procesos celulares afectados normalmente por las interacciones de los complejos funcionales receptor-ligando.
Las composiciones que contienen las proteínas truncadas de receptores de BMP de la presente invención pueden utilizarse para la inhibición de los efectos de las BMP, tales como BMP-2 y/o BMP-4, en las células. La presente invención incluye métodos terapéuticos que comprenden la administración de dicha composición por vía tópica, sistémica, o local, como implante o dispositivo. Cuando se administra, la composición terapéutica para su utilización en la presente invención está, naturalmente, en una forma exenta de pirógenos, aceptable desde el punto de vista fisiológico. Además, puede ser deseable encapsular o inyectar la composición en forma viscosa para su suministro en el lugar deseado. Opcionalmente, también pueden incluirse o administrarse de forma simultánea o secuencial agentes terapéuticos útiles tales como factores de crecimiento (por ejemplo, BMP, TGF-\beta, FGF, IGF), citocinas (por ejemplo, interleucinas y CSF) y antibióticos, junto con la composición de receptores en los métodos de la invención.
Otra forma de realización de la presente invención comprende células que han sido transformadas con las moléculas de ADN que comprenden secuencias de ADN que codifican las proteínas de receptores de BMP de la presente invención. Dichas células expresarán receptores de BMP en la superficie, lo que aumentará la capacidad de respuesta de las células a BMP. De este modo, las células transformadas con las moléculas de ADN que codifican las proteínas de receptores de BMP pueden administrarse de forma terapéutica, para estimular la respuesta a BMP, por ejemplo: regeneración de hueso y/o cartílago en el lugar deseado.
Existe una amplia gama de métodos que pueden utilizarse para suministrar las células que expresan proteínas de receptores de BMP a un sitio para su utilización en la estimulación de una respuesta a BMP tal como la regeneración de hueso y/o cartílago. En una forma de realización de la invención, las células que expresan la proteína de receptor de BMP pueden suministrarse por aplicación directa, por ejemplo, inyección directa de una muestra de dichas células en el lugar que presenta un defecto del hueso o del cartílago. En una forma de realización particular, dichas células pueden purificarse. En una forma de realización preferida, las células que expresan la proteína de receptor de BMP pueden suministrarse en un medio o matriz que impide parcialmente su movilidad, de modo que las células queden localizadas en un sitio en el que haya una lesión del hueso o del cartílago. Dicho medio o matriz puede ser un semisólido, tal como pasta o gel, incluido un polímero de tipo gel. Como alternativa, el medio o matriz puede estar en forma de sólido, preferentemente, un sólido poroso que permite la migración de células a la matriz sólida, y las mantiene en dicho lugar permitiendo la proliferación de las células.
En un método de la presente invención, las células que expresan receptores de BMP se aplican al sitio deseado como se ha descrito anteriormente, y se aplica BMP. La BMP puede aplicarse de forma simultánea o inmediatamente después de la aplicación de las células que expresan receptores de BMP. Las BMP son conocidas y se han descrito como sigue: BMP-2 (a veces denominada BMP-2A) y BMP-4 (a veces denominada BMP-2B), patente US nº 5.013.649; BMP-3, patente US nº 5.116.738; BMP-5, patente US nº 5.106.748; BMP-6, patente US nº 5.187.076; BMP-7, patente US nº 5.141.905; BMP-8, publicación PCT nº WO93/00432; BMP-9, nº de serie 07/720.590, presentada el 25 de junio de 1991; BMP-10, nº de serie _____, presentada el 12 de mayo de 1993. Se han descrito heterodímeros en la solicitud de patente US nº de serie 07/787.496, presentada el 7 de abril de 1992. La BMP puede aplicarse de formas conocidas en la técnica, tales como las descritas en las patentes anteriores, así como en la patente US nº 5.171.579.
Expresión de la proteína de receptor
Para producir la proteína de receptor, el ADN que codifica la proteína deseada se transfiere a un vector de expresión adecuado y se introduce en células de mamífero u otros hospedadores eucarióticos o procarióticos preferidos mediante técnicas convencionales de ingeniería genética. El sistema de expresión preferido en la actualidad para la proteína recombinante de receptor biológicamente activa son las células de mamífero transformadas de forma estable.
El experto en la materia puede construir vectores de expresión en mamíferos empleando la secuencia de la SEC ID nº: 1, 3, 5, 7 ó 9, u otras secuencias de ADN que contienen las secuencias codificantes de la SEC ID nº: 1, 3, 5, 7 ó 9, u otras secuencias modificadas y vectores conocidos, tales como pCD [Okayama et al., Mol. Cell Biol., 2:161-170 (1982)] y pJL3, pJL4 [Gough et al., EMBO J., 4:645-653 (1985)]. Las secuencias de ADNc de la proteína de receptor pueden modificarse mediante eliminación de los nucleótidos no codificantes adyacentes a los extremos 5' y 3' de la región codificante. Los nucleótidos no codificantes eliminados puede sustituirse, o no, por otras secuencias que sabe que son beneficiosas para la expresión. La utilización de dichos vectores para transformar células hospedadoras adecuadas puede dar lugar a la expresión de proteínas de receptores.
El experto en la materia puede manipular las secuencias de la SEC ID nº: 1, 3, 5, 7 ó 9 eliminando o sustituyendo las secuencias reguladoras de mamífero que flanquean la secuencia codificante con secuencias bacterianas, para crear vectores bacterianos para la expresión intracelular o extracelular en células bacterianas. Por ejemplo, las secuencias codificantes puede manipularse de forma adicional (por ejemplo, pueden ligarse a otros conectores conocidos, o modificarse eliminando las secuencias no codificantes de las mismas, o alterando los nucleótidos de las mismas mediante otras técnicas conocidas). La secuencia codificante modificada de la proteína de receptor puede insertarse después en un vector bacteriano conocido utilizando procedimientos tales como los descritos en T. Taniguchi et al., Proc. Natl Acad. Sci. USA 77:5230-5233 (1980). Este ejemplo de vector bacteriano puede después utilizarse para transformar células hospedadoras bacterianas y expresar de este modo la proteína de receptor. Para consultar una estrategia para producir la expresión extracelular de proteínas de receptores en células bacterianas, ver, por ejemplo, la solicitud de patente europea EPA 177.343.
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Pueden realizarse manipulaciones similares para la construcción de un vector de insectos [Ver, por ejemplo los procedimientos descritos en la solicitud publicada de patente europea 155.476] para la expresión en células de insecto. También puede construirse un vector de levaduras empleando secuencias reguladoras de levaduras para la expresión intracelular o extracelular de las proteínas de receptores de la presente invención por células de levaduras. [Ver, por ejemplo, los procedimientos descritos en la la publicación de solicitud de PCT WO86/00639, y la solicitud de patente europea EPA 123.289].
Un método para producir niveles elevados de una proteína de receptor de la invención en células de mamífero implica la construcción de células que contienen múltiples copias de uno o más de los genes heterólogos de receptores. El gen heterólogo se conecta a un marcador amplificable, por ejemplo el gen de la dihidrofolato-reductasa (DHFR) de modo que las células que contienen más copias del gen pueden seleccionarse para su propagación en concentraciones crecientes de metotrexato (MTX) siguiendo los procedimientos de Kaufman y Sharp, J. Mol. Biol., 159:601-629 (1982). Esta estrategia puede emplearse con diversos tipos celulares distintos.
Por ejemplo, un plásmido que contiene una secuencia de ADN para una proteína de receptor de BMP de la invención asociada funcionalmente a otras secuencias plasmídicas que permiten la expresión de la misma, y el plásmido de expresión de DHFR pAdA26SV(A)3 [Kaufman y Sharp, Mol. Cell. Biol., 2:1304 (1982)] pueden introducirse conjuntamente en células CHO que carecen de DHFR, DUKX-BII, mediante coprecipitación con fosfato de calcio y transfección, electroporación, fusión de protoplastos o lipofección. Los transformantes que expresan DHFR se seleccionan para su cultivo en medio alfa con suero dializado de ternero fetal, y después se seleccionan para su amplificación mediante cultivo en concentraciones crecientes de MTX (por ejemplo, en etapas secuenciales de 0,02, 0,2, 1,0 y 5 \muM de MTX) como se describe en Kaufman et al., Mol Cell Biol., 5:1750 (1983).
Los transformantes se clonan, y se mide la unión a BMP-2 o BMP-4 mediante el ensayo de unión descrito anteriormente en el Ejemplo VI. La unión a BMP-2 y BMP-4 debe aumentar al aumentar los niveles de resistencia al MTX. Pueden seguirse procedimientos similares para producir otras proteínas relacionadas de receptores de BMP.
Coexpresión de múltiples proteínas de receptores
Según una forma de realización de la presente invención, la célula hospedadora puede cotransfectarse con uno o más vectores que contienen secuencias codificantes de una o más proteínas de receptores, proteínas truncadas de receptores, o fragmentos activos de las mismas. Cada secuencia de polinucleótidos de receptores puede estar presente en el mismo vector o en vectores individuales cotransfectados en la célula. Como alternativa, los polinucleótidos que codifican receptores, receptores truncados, o fragmentos de los mismos, pueden incorporarse en un cromosoma de la célula hospedadora. Además, una sola unidad de transcripción puede codificar una sola copia de dos genes que codifican diferentes proteínas de receptores.
Según otra forma de realización de la presente invención, la célula hospedadora seleccionada que contiene las dos secuencias que codifican polipéptidos es una línea celular hibrida obtenida por fusión de dos células hospedadoras estables seleccionadas, en la que cada célula hospedadora se transfecta con, y es capaz de expresar de forma estable, una secuencia de polinucleótidos que codifica una primera o segunda proteína seleccionada, que es una proteína de receptor, proteína truncada de receptor o fragmento activo de las mismas.
Por consiguiente, en otro aspecto de la presente invención, se proporcionan composiciones de células que expresan más de una forma recombinante de proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmentos activos de las mismas, que retienen las características de unión del receptor o del receptor truncado. También se proporcionan composiciones de proteínas truncadas de receptores secretadas por las células hospedadoras. Las células, proteínas y composiciones de proteínas de receptores, proteínas truncadas de receptores, o fragmentos activos de las mismas, pueden caracterizarse por su capacidad de unirse de forma selectiva a las BMP con mayor afinidad de unión que otras proteínas de la superfamilia de TGF-\beta en un ensayo de unión.
Las células y composiciones pueden comprender una o más proteínas de receptores de BMP, proteínas truncadas de receptores de BMP, o fragmentos activos de las mismas; o una o más proteínas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa, proteínas truncadas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa, o fragmentos activos de las mismas, tales como W-101, W-120 o CFK1-10a, en combinación con una o más proteínas de receptores de BMP, proteínas truncadas de receptores de BMP, o fragmentos activos de las mismas, tales como CFK1-23a o CFK1-43a. Dichas células o composiciones pueden producirse mediante coexpresión de cada proteína en una célula hospedadora seleccionada y aislamiento de las células en una composición o, en el caso en el que se producen proteínas truncadas de receptores, mediante aislamiento de las proteínas truncadas de receptores a partir del medio de cultivo.
En otro aspecto adicional de la presente invención se proporciona una línea celular que comprende una primera secuencia de polinucleótidos que codifica una primera proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmento activo de las mismas, y una segunda secuencia de polinucleótidos que codifica una segunda proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmento activo de las mismas, estando las secuencias bajo control de uno o más sistemas reguladores de expresión adecuados capaces de coexpresar las proteínas de receptores. La línea celular puede transfectarse con una o más de una molécula de polinucleótido. Como alternativa, la línea celular puede ser una línea celular híbrida creada por fusión de células, como se ha descrito anteriormente.
Otro aspecto de la invención es una molécula de polinucleótido o vector plasmídico que comprende una secuencia de polinucleótidos que codifica una primera proteína seleccionada, que es una proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmento activo de las mismas, y una secuencia de polinucleótidos que codifica una segunda proteína seleccionada, que es una proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmento activo de las mismas. Las secuencias están bajo control de por lo menos una secuencia reguladora adecuada capaz de dirigir la coexpresión de cada proteína o fragmento activo. La molécula puede contener una sola unidad de transcripción que contiene una copia de ambos genes, o más de una unidad de transfección, que contiene cada una, una copia de un solo gen.
Una forma de realización del método de la presente invención para la producción de composiciones de células o proteínas recombinantes de receptores implica el cultivo de una línea celular adecuada, que ha sido cotransfectada con una secuencia de ADN que codifica la expresión de una primera proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmento activo de las mismas, y una secuencia de ADN que codifica la expresión de una segunda proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmento activo de las mismas, bajo control de secuencias reguladoras conocidas. Las células hospedadoras transformadas se cultivan, y las células se aíslan y se purifican para formar composiciones de células transformadas. En la forma de realización en la que se producen proteínas truncadas de receptores, la proteína truncada de receptor se recupera y se purifica a partir del medio de cultivo, y puede utilizarse para formar composiciones de proteínas truncadas de receptor.
En otra forma de realización de dicho método, que es el método preferido en la actualidad para la expresión de las proteínas recombinantes de receptores de la presente invención, una sola célula hospedadora, por ejemplo, una célula CHO DUKX, se cotransfecta con una primera molécula de ADN que contiene una secuencia de ADN que codifica una proteína de receptor, tal como la proteína de receptor CFK1-10a, y una segunda molécula de ADN que contiene una secuencia de ADN que codifica una segunda proteína seleccionada de receptor, como la proteína de receptor de BMP CFK1-23a o CFK1-43a. Uno o ambos plásmidos contienen un marcador seleccionable que puede utilizarse para generar líneas celulares estables que expresan las proteínas de receptores. Estos plásmidos individuales que contienen distintos genes de receptores en unidades distintas de transcripción se mezclan y se transfectan en células CHO utilizando protocolos convencionales. Puede determinarse una relación de plásmidos que proporcione la expresión máxima de la actividad en el ensayo de unión.
Por ejemplo, relaciones iguales de un plásmido que contiene el gen de la primera proteína de receptor y un gen marcador de dihidrofolato-reductasa (DHFR) y otro plásmido que contiene el gen de una segunda proteína de receptor y un gen marcador de DHFR pueden introducirse conjuntamente en células CHO, DUKX-BII, que carecen de DHFR, por coprecipitación con fosfato de calcio y transfección, electroporación, microinyección, fusión de protoplastos o lipofección. Los transformantes individuales que expresan DHFR se seleccionan mediante cultivo en medio alfa con suero dializado de ternero fetal mediante técnicas convencionales. Las células DHFR+ que contienen más copias del gen pueden seleccionarse para su propagación en concentraciones crecientes de metotrexato (MTX) (por ejemplo, etapas secuenciales en 0,02, 0,1, 0,5 y 2,0 \muM de MTX) siguiendo los procedimientos de Kaufman y Sharp, J. Mol. Biol., 159:601-629 (1982); y Kaufman et al., Mol. Cell Biol., 5:1750 (1983). La expresión de por lo menos una proteína de receptor ligada a la DHFR debería aumentar al aumentar los niveles de resistencia al MTX. Las células que expresan de forma estable uno o ambos genes de proteína de receptor/DHFR sobrevivirán. Sin embargo, con mucha frecuencia, las líneas celulares incorporan de forma estable y expresan ambos plásmidos que estaban presentes durante la transfección inicial. Después se recoge el medio condicionado y la proteína de receptor se aísla por métodos convencionales y se analiza para medir su actividad. Esta estrategia puede emplearse con células que carecen de DHFR.
Como forma de realización alternativa de este método, una molécula de ADN que contiene un gen de receptor seleccionado puede transfectarse en una línea celular estable que ya expresa otro gen de receptor seleccionado. Por ejemplo, una línea celular CHO estable que expresa el gen del receptor CFK1-10a con el marcador DHFR puede transfectarse con un plásmido que contiene el gen del receptor CFK1-23a y un gen de un segundo marcador seleccionable, por ejemplo, la resistencia a la neomicina (Neo). Tras la transfección, las células se cultivan y se seleccionan células adecuadas por tratamiento con MTX y el antibiótico G418. Las células que sobreviven se criban para detectar la expresión de ambas proteínas de receptores. Este sistema de expresión tiene la ventaja de permitir la selección en una sola etapa.
También pueden utilizarse estrategias alternativas de selección dual utilizando diferentes líneas celulares o diferentes marcadores. Por ejemplo, la utilización de un marcador de adenosina-desaminasa (ADA) para amplificar el gen del segundo receptor en una línea celular CHO estable que expresa un receptor diferente con el marcador de DHFR puede ser preferible, dado que el nivel de expresión puede aumentarse utilizando la amplificación de genes mediada por desoxicoformicina (DCF). Como alternativa, cualquier línea celular que exprese un receptor generada primero utilizando este marcador puede recibir después un vector de expresión de un segundo receptor que contiene un marcador distinto, y puede seleccionarse la resistencia dual y la coexpresión de los receptores.
Otra forma de realización adicional de un método para la expresión de receptores de la presente invención incluye transfectar la célula hospedadora con una sola molécula de ADN que codifica múltiples genes para la expresión en una sola unidad de transcripción o en unidades de transcripción distintas. La expresión multicistrónica implica múltiples polipéptidos codificados en un solo transcrito, que pueden traducirse de forma eficaz a partir de vectores que utilizan una secuencia líder, por ejemplo, a partir del virus EMC, a partir del poliovirus, o a partir de otras fuentes convencionales de secuencias líder. Dos genes de receptores (Rx y Ry, respectivamente) y un marcador seleccionable pueden expresarse en una sola unidad de transcripción. Por ejemplo, los vectores que contienen la configuración Rx-EMC-Ry-DHFR o Rx-EMC-Ry-EMC-DHFR pueden utilizarse para transfectar células CHO, y seleccionarse y amplificarse utilizando el marcador DHFR. Puede construirse un plásmido que contiene secuencias de ADN que codifican dos receptores diferentes, uno o más genes marcadores, y una secuencia líder o reguladora adecuada en una sola unidad de transcripción.
De modo similar, pueden transfectarse células hospedadoras con un solo plásmido que contiene unidades de transcripción distintas para cada receptor. Un marcador seleccionable, por ejemplo, DHFR, puede estar presente en otra unidad de transcripción, o, como alternativa, como el segundo cistrón en uno o en ambos genes de receptores. Estos plásmidos pueden utilizarse para transfectar una célula hospedadora seleccionada para la expresión de los receptores.
Otra forma de realización de este método de expresión implica la fusión de células. Dos líneas celulares estables que expresan receptores seleccionados, tales como una línea celular transformada con un vector para CFK1-23a (por ejemplo, pMV23a) y una línea celular transformada de forma estable con un vector para CFK1-43a (por ejemplo, pMV43a), generada utilizando el sistema de amplificación de genes con DHFR/MTX y que expresa elevados niveles de receptores, pueden transfectarse con uno o varios genes marcadores dominantes (por ejemplo, neo^{r}, higromicina^{r}, GPT). Después de un tiempo suficiente de cocultivo (aproximadamente un día) una línea celular resultante que expresa un receptor y un marcador dominante puede fusionarse con una línea celular que expresa un receptor diferente, y preferentemente un marcador diferente, utilizando un reactivo fusigénico, tal como polietilenglicol, virus Sendai, u otro agente conocido.
Los híbridos celulares resultantes que expresan ambos marcadores dominantes y DHFR pueden seleccionarse utilizando condiciones de cultivo adecuadas, y haciendo un cribado de la coexpresión de los receptores, los receptores truncados, o los fragmentos de los mismos. La célula híbrida seleccionada contiene secuencias que codifican ambos receptores seleccionados; y ambos receptores serán retenidos en la membrana de la célula. Las composiciones de células que expresan múltiples receptores pueden utilizarse en los métodos de la presente invención para interaccionar con BMP. En el caso en el que se utilizan genes que codifican receptores truncados, el receptor truncado se forma en la célula y después se secreta. La proteína truncada de receptor se obtiene en el medio condicionado, y se aísla y se purifica a partir del mismo empleando métodos convencionales. La composición resultante de proteína de receptor puede caracterizarse por métodos descritos en la presente memoria, y puede utilizarse en los métodos de la presente invención, por ejemplo, para competir por la unión al ligando con receptores presentes en células, e inhibir de este modo la actividad de BMP.
Las líneas celulares generadas empleando las estrategias descritas anteriormente pueden utilizarse para producir la coexpresión de polipéptidos de receptores. Las proteínas de receptores se retienen en la membrana de las células. Las composiciones de las células pueden utilizarse para aumentar la respuesta a BMP, por ejemplo, para estimular la formación de cartílago y/o hueso. Las composiciones de las células pueden aplicarse junto con BMP.
En el caso en el que se producen polipéptidos truncados de receptores, las proteínas de receptores se aíslan a partir del medio de cultivo en forma sustancialmente exenta de otras proteínas con las que se coproducen, así como de otros contaminantes presentes en las células hospedadoras, empleando técnicas convencionales de purificación. El método de producción preferido en la actualidad es la cotransfección con diferentes vectores de células CHO y la amplificación de genes mediada por metotrexato. Pueden utilizarse líneas celulares estables para generar medio condicionado que contiene el receptor truncado, que puede purificarse y analizarse in vitro e in vivo para detectar su actividad. Por ejemplo, las líneas celulares resultantes que producen receptores truncados obtenidas mediante cualquiera de los métodos descritos en la presente memoria pueden cribarse para detectar su actividad empleando los ensayos de unión descritos en el Ejemplo VI, expresión de ARN, y expresión de proteínas por electroforesis en gel de poliacrilamida con dodecilsulfato de sodio (SDS-PAGE).
Los métodos descritos anteriormente para la coexpresión de los receptores de la presente invención utilizan células hospedadoras o líneas celulares adecuadas. Las células adecuadas incluyen preferentemente células de mamífero, tales como células de ovario de hámster chino (CHO). La selección de células hospedadoras adecuadas de mamífero y los métodos de transformación, cultivo, amplificación, cribado, y producción y purificación del producto se conocen en la técnica. Ver, por ejemplo, Gething y Sambrook, Nature, 293:620-625 (1981), o, como alternativa, Kaufman et al., Mol. Cell. Biol., 5(7):1750-1759 (1985), o Howley et al., patente US nº 4.419.446. Otras líneas celulares adecuadas de mamíferos son la línea celular CV-1, las líneas celulares EHK, y la línea celular 293.
Otro aspecto de la presente invención proporciona moléculas de ADN o vectores plasmídicos para su utilización en la expresión de dichas proteínas recombinantes de receptores. Estos vectores plasmídicos pueden construirse empleando métodos conocidos y componentes disponibles conocidos por los expertos en la materia. En general, para generar un vector útil en los métodos de la presente invención, el ADN que codifica la proteína deseada: proteína de receptor, proteína truncada de receptor, o fragmento activo de las mismas, se transfiere a uno o más vectores de expresión apropiados, adecuados para la célula hospedadora seleccionada.
En la actualidad se contempla el empleo de cualquier vector de expresión adecuado para la expresión eficaz en células de mamífero para producir las proteínas recombinantes de receptores de la presente invención en células hospedadoras de mamífero. Preferentemente, los vectores contienen las secuencias de ADN del receptor descritas anteriormente y en las listas de secuencias, que codifican las proteínas seleccionadas: proteínas de receptores, o proteínas truncadas de receptores. Como alternativa, los vectores que incorporan secuencias modificadas son asimismo formas de realización de la presente invención, y son útiles para la producción de los vectores.
Además de los vectores específicos descritos anteriormente, el experto en la materia puede construir vectores de expresión en mamíferos empleando la secuencia de la SEC ID nº: 1, 3, 5, 7 ó 9, u otras secuencias de ADN que codifican proteínas de receptores, proteínas truncadas de receptores, o fragmentos activos de las mismas, y vectores conocidos, tales como pCD [Okayama et al., Mol. Cell Biol., 2:161-170 (1982)] y pJL3, pJL4 [Gough et al., EMBO J., 4:645-653 (1985)]. Las secuencias de ADN de los receptores pueden modificarse eliminando los nucleótidos no codificantes en los extremos 5' y 3' de la región codificante. Los nucleótidos no codificantes eliminados pueden sustituirse, o no, por otras secuencias que se sabe que son beneficiosas para la expresión. La utilización de estos vectores para transformar células hospedadoras adecuadas, como se ha descrito anteriormente, puede producir las proteínas de receptores.
El experto en la materia podría manipular las secuencias de la SEC ID nº: 1, 3, 5, 7 ó 9 eliminando o sustituyendo las secuencias reguladoras de mamífero que flanquean la secuencia codificante, con, por ejemplo, secuencias reguladoras de levadura o de insecto, para crear vectores para la expresión intracelular o extracelular en levaduras o en células de insecto. [Ver, por ejemplo, los procedimientos descritos en la publicación de solicitud de patente europea 155.476] para la expresión en células de insecto; y los procedimientos descritos en la publicación de solicitud PCT WO86/00639 y en la solicitud de patente europea EPA 123.289 para la expresión en células de levadura].
De modo similar, secuencias bacterianas y codones de preferencia pueden sustituir a las secuencias en los vectores de mamíferos descritos y presentados como ejemplo para crear sistemas de expresión adecuados para su utilización en la producción de las proteínas de receptores en el método descrito anteriormente. Por ejemplo, las secuencias codificantes podrían manipularse adicionalmente (por ejemplo, ligándolas a otros conectores conocidos, o modificándolas por eliminación de las secuencias no codificantes de las mismas, o por alteración de los nucleótidos contenidos en las mismas utilizando otras técnicas conocidas). Las secuencias codificantes modificadas de los receptores podrían insertarse después en un vector bacteriano conocido utilizando procedimientos tales como los descritos en T. Taniguchi et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:5230-5233 (1980). El vector bacteriano del ejemplo podría después utilizarse para transformar células hospedadoras bacterianas, y expresar de este modo las proteínas de receptores.
Otros vectores útiles en los métodos de la presente invención pueden contener múltiples genes en una sola unidad de transcripción. Por ejemplo, un plásmido propuesto contiene el gen del receptor CFK1-10a seguido de la secuencia líder del EMC, seguido por el gen del receptor de BMP CFK1-23a, seguido por el gen marcador de DHFR. Otro ejemplo contiene el gen del receptor de BMP CFK1-23a, la secuencia líder del EMC, el gen del receptor con actividad serina/treonina-quinasa W101, otra secuencia líder del EMC y el gen marcador de DHFR. Como alternativa, el vector puede contener más de una unidad de transcripción. Como ejemplo, el plásmido puede contener una unidad de transcripción para el gen del receptor de BMP CFK1-23a y una unidad de transcripción distinta para el gen del receptor CFK1-43a, es decir, CFK1-23a-EMC-DHFR y CFK1-43a-EMC-DHFR. Como alternativa, cada unidad de transcripción del plásmido puede contener un gen marcador diferente. Por ejemplo, el plásmido puede contener CFK1-10a-EMC-Neo y CFK1-43a-EMC-DHFR. Naturalmente, los ejemplos anteriores no son limitantes. Otras combinaciones (por ejemplo, coexpresión) de los receptores de la presente invención se encuentran también dentro del alcance de la invención.
Además, los vectores pueden contener también secuencias adecuadas para el control de la expresión, que son capaces de dirigir la replicación y la expresión del receptor en las células hospedadoras seleccionadas. Las secuencias reguladoras útiles para dichos vectores son conocidas por el experto en la materia y puede seleccionarse en función de las células hospedadoras escogidas. Dicha selección es práctica habitual y no forma parte de la presente invención. De modo similar, los vectores pueden contener uno o más marcadores de selección, tales como el gen de resistencia a antibióticos Neo, o marcadores seleccionables tales como DHFR y ADA. El gen marcador preferido en la actualidad es DHFR. Dichos genes marcadores pueden ser seleccionados también por el experto en la materia.
Los siguientes ejemplos ilustran la práctica de la presente invención para la recuperación y caracterización de las proteínas de receptores de la presente invención y su empleo para recuperar las correspondientes proteínas humanas de receptores de la presente invención, y para la expresión de las proteínas mediante técnicas recombinantes.
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Anticuerpos
Tal como se utiliza en la presente memoria, se dice que una molécula es "similar a BMP" si presenta por lo menos un actividad similar a BMP. A los efectos de la invención, la actividad similar a BMP incluye la capacidad de unirse a un receptor truncado de BMP y de estimular la proliferación de líneas celulares dependientes de BMP tales como la línea celular W-20-17 descrita en el Ejemplo VIII. Tal como se utiliza la presente memoria, el término "anticuerpo monoclonal similar a BMP" incluye anticuerpos monoclonales no humanos similares a BMP, regiones determinantes de la complementariedad (CDR) de los anticuerpos monoclonales no humanos similares a BMP, centros de reconocimiento de BMP de los anticuerpos monoclonales no humanos similares a BMP, todas las formas injertadas de los centros de reconocimiento de BMP de los anticuerpos monoclonales no humanos similares a BMP, y pequeños péptidos que son análogos de BMP.
Según la presente invención, el término "análogo de BMP" abarca anticuerpos monoclonales, pequeños péptidos, y pequeñas moléculas que poseen actividad similar a BMP. Para los efectos de la invención, actividad similar a BMP se define como la capacidad de unirse al receptor truncado de BMP y de estimular la proliferación de líneas celulares dependientes de BMP tal como la línea celular W-20-17 descrita en el Ejemplo VIII.
Los anticuerpos monoclonales similares a BMP de la invención pueden ser objeto de alteraciones moleculares para aumentar su utilidad como fármacos humanos. Por ejemplo, las CDR de los anticuerpos monoclonales similares a BMP comprenden sitios de reconocimiento específicos para receptores de BMP, que están abarcados por la presente invención. Dichas CDR pueden insertarse en regiones de la estructura de la inmunoglobulina humana para reducir al mínimo la antigenicidad causada por la presencia de regiones de inmunoglobulina no humana, por ejemplo, empleando las técnicas descritas en el documento WO 91/09967. Los sitios de reconocimiento del receptor de BMP de la presente invención pueden también insertarse en otras estructuras de proteínas para aumentar al máximo la eficacia terapéutica de los análogos de BMP generados a partir de los mismos. Las CDR de los anticuerpos monoclonales similares a BMP también pueden ser objeto de alteraciones moleculares para formar anticuerpos de cadena única.
Las CDR de los anticuerpos monoclonales similares a BMP también pueden utilizarse para generar pequeños péptidos que son análogos de BMP. Toda la CDR puede estar presente en los pequeños péptidos que son análogos de BMP de la invención, o una porción de la CDR similar a BMP puede comprender dichos pequeños péptidos que son análogos de BMP. Dos o más CDR pueden unirse en la orientación "cabeza a cabeza", "cabeza a cola", o "cola a cola" para formar dímeros o multímeros de pequeños péptidos que son análogos de BMP. Dado que cada anticuerpo monoclonal similar a BMP puede contener múltiples CDR, una sola CDR puede estar presente en el pequeño péptido que es un análogo de BMP, o pueden estar presentes diferentes CDR similares a BMP procedentes de uno o más anticuerpos monoclonales similares a BMP. Aminoácidos no presentes en la naturaleza, sintéticos, y D-aminoácidos pueden sustituir a los aminoácidos específicos de las CDR similares a BMP.
La invención abarca asimismo péptidos que se unen específicamente al receptor truncado, y que tienen actividad similar a BMP. Dichos péptidos pueden estar basados, pero no exclusivamente, en la secuencia de las CDR de los anticuerpos similares a BMP. Los péptidos pueden estar "conectados" o "unidos" a otros péptidos en estructuras multiméricas de dos péptidos o más, para generar la actividad similar a BMP. Los aminoácidos de los péptidos puede ser, pero no exclusivamente, aminoácidos "no naturales" de, por ejemplo, estereoespecificidad D, o análogos de aminoácidos con otros grupos químicos, o unidos a la cadena principal peptídica. Los péptidos también pueden tener estructura cíclica. Tal y como se utiliza en la presente memoria, un péptido es una molécula que comprende por lo menos dos aminoácidos, y hasta treinta aminoácidos.
La invención también abarca pequeñas moléculas orgánicas, que pueden incluir moléculas similares a aminoácidos, que presentan unión específica al receptor de BMP humano truncado, y que poseen actividad similar a BMP. Según la presente invención, las "pequeñas moléculas orgánicas" se definen como moléculas no proteicas que contienen carbonos, de peso molecular menor de 3000, que se han identificado primero debido a su empleo como análogos de BMP utilizando el receptor truncado de la invención. Las pequeñas moléculas orgánicas de la invención son susceptibles de ser incorporadas en fármacos orales para el tratamiento de trastornos del hueso y/o del cartílago.
Las composiciones farmacéuticas que contienen los anticuerpos monoclonales similares a BMP, pequeños péptidos que son análogos de BMP, o pequeñas moléculas orgánicas de la presente invención son útiles para el tratamiento de varios trastornos del hueso y/o del cartílago de diversas etiologías. Dichas composiciones farmacéuticas pueden contener también sustancias aceptables desde el punto de vista farmacéutico, tales como excipientes, diluyentes, sustancias de relleno, sales, tampones, estabilizantes, y/o otros materiales bien conocidos en la técnica. El término "aceptable desde el punto de vista farmacéutico" significa un material no tóxico que no interfiere con la eficacia de la actividad biológica del principio o principios activos. Las características del excipiente o de otro material dependerán de la vía de administración.
La administración de los anticuerpos monoclonales similares a BMP, pequeños péptidos que son análogos de BMP, o de las pequeñas moléculas orgánicas de la invención, puede llevarse a cabo empleando diversas vías convencionales, incluidas la utilización de matrices y/o excipientes tales como los descritos en la patente US nº 5.171.579. Para los anticuerpos monoclonales similares a BMP, es preferida la administración intravenosa al paciente. También puede emplearse la inyección cutánea o subcutánea para la administración de la realización de anticuerpo monoclonal de la invención. La administración oral es preferida para la administración de las realizaciones de análogos de BMP en forma de pequeños péptidos y pequeñas moléculas orgánicas de la invención.
La cantidad de anticuerpo monoclonal similar a BMP, análogo en forma de pequeño péptido o pequeña molécula orgánica de la composición farmacéutica de la presente invención, dependerá de la naturaleza y gravedad del trastorno que se va a tratar, y de la naturaleza de los tratamientos previos administrados al paciente. En última instancia, el médico encargado decidirá la cantidad de análogo de BMP con el que se tratará a cada paciente individual. Se contempla que las diversas composiciones farmacéuticas de la presente invención contengan aproximadamente 0,1 \mug hasta aproximadamente 100 \mug de molécula análoga de BMP por kg de peso corporal.
Ejemplos Ejemplo I Identificación de la secuencia KDA-B5 murina
Dos secuencias peptídicas procedían de la secuencia aminoácida del receptor de activina en la región descrita como el dominio de la quinasa de la molécula (Mathews et al., Cell, 65:973-982 (1991)). Estas secuencias particulares fueron seleccionadas sobre la base de una comparación entre la secuencia aminoácida del producto del gen Daf-1 y el receptor de activina, y se ha predicho que estarán conservadas en otras moléculas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa. Las dos secuencias peptídicas seleccionadas fueron:
1. Asn-Glu-Tyr-Val-Ala-Val-Lys
2. His-Arg-Asp-Ile-Lys-Ser
Se diseñó el siguiente cebador oligonucleotídico basado en la secuencia aminoácida nº 1, y se sintetizó en un sintetizador automático de ADN.
Cebador oligonucleotídico A: GCGGATCCGARTAYGTNGCNGTNAAR
Los primeros 8 nucleótidos de este cebador (subrayados) comprenden una secuencia de reconocimiento de la endonucleasa de restricción BamHI para facilitar las manipulaciones posteriores de los productos de ADN amplificado, y no proceden de la secuencia aminoácida nº 1.
Los siguientes cebadores oligonucleotídicos se diseñaron sobre la base de la secuencia aminoácida nº 2 y se sintetizaron en un sintetizador automático de ADN.
Cebador oligonucleotídico B: GACTCTAGARCTYTTDATRTCYCTRTG
Cebador oligonucleotídico C: GACTCTAGARCTYTTDATRTCNCGRTG
Cebador oligonucleotídico D: GACTCTAGANGAYTTDATRTCYCTRTG
Cebador oligonucleotídico E: GACTCTAGANGAYTTDATRTCNCGRTG
Los primeros 9 nucleótidos de los cebadores B a E (subrayados) comprenden una secuencia de reconocimiento de la endonucleasa de restricción XbaI para facilitar las manipulaciones posteriores de los productos de ADN amplificado, y no proceden de la secuencia aminoácida nº 2.
Los símbolos estándar de nucleótidos en los cebadores identificados anteriormente son los siguientes: A = adenosina, C = citosina, G = guanina, T = timina, R = adenosina o guanina, Y = citosina o timina, y D = guanina, adenosina o timina.
Estos oligonucleótidos han sido seleccionados por su capacidad prevista para amplificar de forma específica las secuencias codificantes del dominio de serina/treonina-quinasa similares a las presentes en la secuencia del receptor de activina. Dado que las moléculas de activina y de BMP son miembros de la gran superfamilia TGF-\beta de factores de crecimiento y diferenciación, cabe predecir que sus correspondientes receptores estarán asimismo relacionados en estructura y secuencia aminoácida primaria. La secuencia del receptor de TGF-\beta de tipo II (Lin et al., Cell, 68:775-785 (1992)) indica que, como es el caso del receptor de activina, es también una serina/treonina-quinasa. Sobre la base de las relaciones descritas anteriormente, cabe predecir que estos oligonucleótidos degenerados amplificarán de forma específica secuencias que codifican fragmentos de otras moléculas que son receptores con actividad serina/treonina-quinasa, incluidos los receptores de activina, los receptores de TGF-\beta y los receptores de BMP.
La línea celular de ratón W-20-17 que responde a BMP-2 se seleccionó como fuente del ARNm del que cabe predecir que contiene moléculas capaces de codificar receptores de BMP. Se extrajo el ARN total de células W-20-17 utilizando procedimientos estándar conocidos por los expertos en la materia, y después se seleccionó el ARNm por cromatografía con oligo-(dT)-celulosa. Se utilizaron 10 ng del ARNm de W-20-17 como molde para sintetizar la primera cadena del ADNc en una mezcla de reacción (volumen total de 20 \mul) que contenía 1 mM de cada uno de los desoxinucleótidos trifosfato (dATP, dGTP, dCTP, dTTP), Tris-HCl 10 mM (pH 8,3), KCl 50 mM, MgCl_{2} 5 mM, 1 U/\mul de inhibidor de ARNasa, 2,5 U/\mul de transcriptasa inversa, 2,5 \muM de hexámeros al azar, y 20 ng del ARNm de W-20-17 descrito anteriormente. Esta mezcla de reacción se incubó durante 10 minutos a temperatura ambiente, seguido por 15 minutos a 42ºC, y después 5 minutos a 99ºC. La reacción completada para la síntesis de la primera cadena del ADNc se mantuvo después a 4ºC.
Las combinaciones de oligonucleótidos que comprendían el cebador oligonucleotídico A emparejado con cualquiera de los cebadores oligonucleotídicos B, C, D o E fueron utilizadas como cebadores para permitir la amplificación de las secuencias específicas de nucleótidos del molde de la primera cadena del ADNc de W-20-17 descrita anteriormente. La reacción de amplificación se llevó a cabo ajustando la reacción de la primera cadena del ADNc descrita anteriormente (20 \mul) hasta un volumen de 100 \mul con el objeto de llevar los componentes del tampón de reacción hasta las siguientes concentraciones finales: MgCl_{2} 2 mM, Tris-HCl 10 mM (pH 8,3), KCl 50 mM, 2,5 U/100 \mul de ADN polimerasa Taq, 1 pM/\mul del cebador oligonucleotídico A y 1 pM/\mul de cualquiera de los cebadores oligonucleotídicos B, C, D o E. Después se incubó la mezcla de reacción completa a 95ºC durante dos minutos, y después se sometió a ciclos térmicos de la siguiente manera: 1 minuto a 95ºC, 1 minuto a 40ºC y 1 minuto a 72ºC durante cuarenta ciclos; seguido por una incubación de 7 minutos a 72ºC, después de lo cual se mantuvo la reacción completada a 4ºC.
El ADN que había sido específicamente amplificado por esta reacción se precipitó con etanol, se digirió con las endonucleasas de restricción BamHI y XbaI y se sometió a electroforesis en gel de agarosa. Las regiones del gel en las que aparecían bandas de ADN se cortaron, y el ADN contenido se eluyó con un kit de extracción en gel QIAEX (nº de catálogo de Qiagen: 20020) siguiendo las instrucciones del fabricante. Los fragmentos de ADN extraídos del gel se subclonaron en el vector plasmídico pGEM-3 entre los sitios BamHI y XbaI de la región de clonación múltiple. El análisis de la secuencia de ADN de uno de los subclones resultantes llamado KDA-B5 indicaba que el inserto de la secuencia de ADN específicamente amplificada codifica una secuencia aminoácida homóloga a la correspondiente región de los dominios de la quinasa del receptor de activina y del producto del gen Daf-1 en la región en la que se diseñaron los cebadores oligonucleotídicos A, B, C, D y E (como se ha descrito al comienzo del presente apartado). La secuencia aminoácida codificada por esta región de la secuencia de KDA-B5 específicamente amplificada presenta una identidad del 41% y 47% con las correspondientes regiones de los dominios de la quinasa del receptor de activina y de Daf-1, respectivamente.
La secuencia de ADN y la secuencia aminoácida derivada del fragmento de ADN de KDA-B5 específicamente amplificado se exponen en la SEC ID nº: 11 y la SEC ID nº: 12, respectivamente.
Los nucleótidos 1-24 de la secuencia expuesta en la SEC ID nº: 11 comprenden una porción del cebador oligonucleotídico A, y los nucleótidos 319-341 comprenden una porción del complemento inverso del cebador oligonucleotídico B utilizado para llevar a cabo la reacción de amplificación específica. Debido a la función de los oligonucleótidos A y B en la iniciación de la reacción de amplificación, puede que no correspondan exactamente a la secuencia real codificada por la proteína KDA-B5 de ratón, por lo que no han sido traducidos en la secuencia aminoácida derivada anterior.
Ejemplo II Aislamiento de los clones W101 y W120 a partir de una genoteca de ADNc de W-20-17
La secuencia de 341 pb del inserto de KDA-B5 expuesta en la SEC ID nº: 11 se utilizó como sonda para cribar una genoteca de ADNc de W-20-17 en condiciones poco restrictivas (4X SSC, SDS al 0,1% a 60ºC) para tratar de aislar otras secuencias de ratón relacionadas con KDA-B5 de la siguiente manera.
Se sembraron 1.000.000 recombinantes de una genoteca de ADNc de W-20-17 (Thies et al., Endocrinology, 130:1318-1324 (1992)) construida en el vector \lambdaZAPII a una densidad de 20.000 placas de bacteriófagos recombinantes en cada una de 100 placas de cultivo. Se hicieron réplicas duplicadas de las placas en nitrocelulosa. Un fragmento de ADN que correspondía a la secuencia de 341 pb del inserto de KDA-B5 presentado en la SEC ID nº: 11 se marcó con ^{32}P por el procedimiento de cebado al azar de Feinberg et al., Anal. Biochem. 132:6-13 (1983), y se hibridó a un grupo de filtros en tampón estándar de hibridación (SHB: 5X SSC, SDS al 0,1%, solución de Denhardt 5X, 100 \mug/ml de ADN de esperma de salmón) a 60ºC durante 2 días. El otro grupo de filtros se hibridó a una sonda de ADN que correspondía a los nucleótidos nº 710 hasta 1044 de la secuencia publicada del receptor de activina (Mathews et al., Cell, 65:973-982 (1991)) en las mismas condiciones descritas para el primer grupo. Esta región del dominio de la quinasa del receptor de activina corresponde a la secuencia de ADN del inserto de KDA-B5. Los filtros se lavaron en condiciones poco restrictivas (4X SSC, SDS al 0,1% a 60ºC). Se seleccionaron 13 placas de bacteriófagos recombinantes que resultaron positivas en la hibridación y se sembraron de nuevo en placas de cultivo para cribados secundarios. Se hicieron de nuevo réplicas duplicadas de las placas recombinantes en nitrocelulosa. De nuevo, un grupo de filtros se hibridó con la sonda de KDA-B5 y el otro grupo con la sonda del receptor de activina, como se ha descrito anteriormente para el cribado primario (en SHB a 60ºC durante 2 días). Ambos grupos de filtros se lavaron empleando las condiciones poco restrictivas descritas anteriormente (4X SSC, SDS al 0,1% a 60ºC). Dos recombinantes que presentaban una potente hibridación con la sonda de KDA-B5 pero no con la correspondiente sonda del receptor de activina fueron seleccionados para su análisis posterior. Estos dos clones de ADNc, denominados W-101 y W-120, fueron purificados por placas y sus insertos fueron transferidos al plásmido Bluescript SK (+/-) siguiendo el protocolo de escisión in vivo descrito por el fabricante (Stratagene). El análisis de la secuencia de ADN de estos recombinantes indicaba que codificaban proteínas homólogas al receptor de activina y al producto del gen Daf-1. La secuencia de ADN y la secuencia aminoácida derivada de una porción de pMT101 (ATCC 69379) se exponen en la SEC ID nº: 7 y la SEC ID nº: 8, respectivamente.
La secuencia de nucleótidos del clon W-101 indica que codifica un polipéptido parcial de 467 aminoácidos que comprende la porción carboxiterminal de la molécula del receptor murino W-101. Se preparó una genoteca de ADNc cebada al azar a partir del ARNm de W-20-17 utilizando un hexámero al azar pd(N)_{6} (Pharmacia/LKB, nº de catálogo 27-2166-01) para cebar la síntesis de la primera cadena del ADNc a partir del molde de ARNm de W-20-17. La genoteca se cribó con un oligonucleótido de 30 bases que correspondían a los nucleótidos nº 245 hasta 274 de la SEC ID nº: 7. La secuencia de ADN utilizada para diseñar esta sonda de oligonucleótido procedía de la secuencia codificante del clon W-101. La hibridación se llevó a cabo en SHB a 65ºC y se emplearon condiciones de lavado restrictivas con 0,2X SSC, SDS al 0,1% a 65ºC para eliminar la sonda unida de forma no específica. El inserto de ADN de uno de dichos clones, WR9, se caracterizó por análisis de la secuencia de ADN y se comprobó que contenía secuencias codificantes adicionales en 5' del receptor W-101 murino que no estaban presentes en el clon original ADNc descrito anteriormente. Sin embargo, el inserto de 0,7 kb del clon W9 carece de las secuencias que codifican la región C-terminal de la proteína del receptor W-101 murino. Con el objeto de construir una secuencia de ADNc que codifique la proteína completa del receptor W-101, las secuencias de ADN del oligo-(dT) original y del clon W9 cebado al azar han sido unidas en un sitio común de endonucleasa de restricción BstEII. La secuencia expuesta en la SEC ID nº: 7 contiene un marco abierto de lectura de 1515 pares de bases que codifica la secuencia completa de 505 aminoácidos de la proteína del receptor W-101 murino. Los nucleótidos 1-660 de la secuencia expuesta en la SEC ID nº: 7 proceden del clon W9 de ADNc, mientras que el resto de la secuencia (los nucleótidos 661-1648) procede del clon de ADNc W-101 cebado con el oligo-(dT). La secuencia de reconocimiento de la endonucleasa de restricción BstEII, GGTNACC (situada en la posición 660-666), facilitó la construcción de esta secuencia quimérica de ADNc. Esta construcción se llevó a cabo digiriendo el clon W-101 y el clon W9 con la endonucleasa de restricción BstEII, lo que da lugar a la linealización de cada plásmido en el sitio común de BstEII de sus respectivos insertos. Los dos plásmidos linealizados fueron aislados en gel, y después ligados entre sí en dicho sitio y digeridos con la endonucleasa de restricción SalI para separar la secuencia expuesta en la SEC ID nº: 7 de las secuencias del vector plasmídico (pBluescript). Los fragmentos de ADN resultantes de esta reacción secuencial de ligado y digestión con SalI fueron sometidos a electroforesis en un gel de agarosa. Una región que contenía un fragmento de ADN de aproximadamente 2,3 kb, que comprendía 660 pb del extremo 5' del ADNc de W9 y aproximadamente 1,64 kb del extremo 3' del ADNc original de W-101, se cortó del gel y el ADN allí contenido se eluyó con el kit de extracción en gel QIAEX (Qiagen, nº de catálogo 20020) siguiendo las instrucciones del fabricante. El fragmento de ADN resultante que comprende la secuencia expuesta en la SEC ID nº: 7 (que codifica la proteína completa del receptor W101 murino) se subclonó en el vector de expresión en células de mamíferos pMT3 en el sitio Sal I de la región de clonación múltiple. Este plásmido se denomina pMT101.
La secuencia de nucleótidos de una porción del inserto del clon de ADNc W120 se expone en la SEC ID nº: 9. La presunta secuencia codificante de la metionina iniciadora está precedida por 68 pb de secuencia no traducida en 5' y define un marco abierto de lectura de 1509 pb que codifica la secuencia completa de 503 aminoácidos de la molécula del receptor W-120 murino. El codón de terminación está seguido por al menos 203 pb de secuencia no traducida en 3'. El inserto del clon W120 que comprende la secuencia expuesta en la SEC ID nº: 9 se cortó del plásmido pBluescript empleando la endonucleasa de restricción EcoRI, y se transfirió al vector de expresión en células de mamíferos pMT3 en el sitio EcoRI de la región de clonación múltiple. Este plásmido se denomina pMT120E y ha sido depositado en la American Type Culture Collection (ATCC nº 69377).
Ejemplo III Aislamiento de CFK1-10a, CFK1-23a y CFK1-43a a partir de una genoteca de ADNc de CFK1
Otra línea celular que responde a BMP-2, CFK1 [Bernier y Goltzman, J. Cell. Physiol., 152:317 (1992)], se seleccionó como fuente de ARNm que estaba previsto que contuviese moléculas capaces de codificar receptores de BMP y otras secuencias codificantes de serina/treonina-quinasa relacionadas con el receptor del TGF-\beta, el receptor de activina, daf-1, W101 y W-120.
Se sembraron 1 x 10^{6} recombinantes de una genoteca de ADNc de CFK1 construida en el vector \lambdaZAPII a una densidad de 20.000 placas de bacteriófagos recombinantes en cada una de 50 placas de cultivo. Se hicieron réplicas duplicadas de las placas en nitrocelulosa. Un fragmento de ADN de 645 pares de bases del inserto de ADNc de W-101 correspondiente a los nucleótidos nº 828-nº 1472 de la SEC ID nº: 7 se marcó con ^{32}P mediante el procedimiento de cebado al azar de Feinberg et al., Anal. Biochem., 132:6-13 (1983) y se hibridó con ambos grupos de filtros en SHB a 60ºC durante dos días. Los filtros se lavaron empleando condiciones poco restrictivas (4X SSC, SDS al 0,1% a 60ºC). Se observaron muchos recombinantes duplicados que presentaban hibridación de intensidad variable (aproximadamente 200). 27 placas de bacteriófago, que eran representativas de la amplia gama de intensidades de hibridación, fueron purificadas por placas y sus insertos fueron transferidos al plásmido pBluescript SK (+/-) siguiendo el protocolo de escisión in vivo descrito por el fabricante (Stratagene). El análisis de la secuencia de ADN de varios recombinantes indicaba que codifican proteínas homólogas al receptor de activina, Daf-1 y otras proteínas de receptores de la familia de receptores con actividad serina/treonina-quinasa.
La secuencia de nucleótidos del clon CFK1-10a comprende un marco abierto de lectura de 1527 pb, y codifica una proteína de receptor CFK1-10a de 509 aminoácidos. Se considera que los 509 aminoácidos codificados de la proteína de receptor CFK1-10a constituyen el producto de traducción primario, ya que la secuencia codificante está precedida por 458 pb de secuencia no traducida en 5' con codones de terminación en los tres marcos de lectura. La secuencia de ADN y la secuencia aminoácida derivada de la mayor parte del inserto de CFK1-10a (ATCC nº 69380) se expone en la SEC ID nº: 5.
Sobre la base de los datos conocidos referentes a otras proteínas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa, la proteína CFK1-10a codificada de 509 aminoácidos presenta los rasgos característicos de los receptores con actividad serina/treonina-quinasa, en particular aquellos capaces de reconocer ligandos de la superfamilia TGF-\beta/BMP de factores de crecimiento y diferenciación. Esta molécula codifica una molécula de receptor de longitud completa con una secuencia líder hidrófoba característica que dirige el dominio de unión al ligando de la proteína al espacio extracelular, una región transmembranaria que ancla la molécula completa del receptor a la membrana celular, lo que permite el posicionamiento del dominio de serina/treonina-quinasa en el espacio intracelular. El dominio de unión al ligando de la molécula del receptor CFK1-10a de la invención presenta un perfil de conservación de cisteínas observado en otros receptores capaces de reconocer ligandos de la superfamilia TGF-\beta/BMP de factores de crecimiento y diferenciación. La región de la proteína del receptor CFK1-10 correspondiente al dominio intracelular de serina-treonina-quinasa presenta un grado significativo de identidad de secuencia aminoácida con el correspondiente dominio de otros receptores de esta familia, a saber: receptor de TGF-\beta de tipo II (Nº de acceso a Genbank: M85079), 35%; receptor de activina de tipo II (Nº de acceso a Genbank: M65287), 40%; receptor de activina de tipo IIB (Nº de acceso a Genbank: M84120), 38%; y Daf-1 (Nº de acceso a Genbank: A35103), 39%. El inserto de 3,2 kb del clon de ADNc de CFK1-10a se corta con la endonucleasa de restricción NotI y se transfiere al vector de expresión en células de mamíferos pMV2 en el sitio NotI de la región de clonación múltiple. Este plásmido se denomina CFK1-10a/Not-4.
El receptor CFK1-10a de la presente invención es homólogo a un ARNm humano de receptor con actividad serina/treonina-quinasa depositado en Genbank, con el número de acceso L02911, para el que no se ha identificado ningún ligando. Esta proteína de receptor es también homóloga a la secuencia descrita del receptor murino de TGF-\beta de tipo I, Ebner et al., Science, 260:1344-1348 (1993) (Nº de acceso a Genbank: L15436).
La secuencia de nucleótidos del clon CFK1-23a (ATCC nº 69378) comprende un marco abierto de lectura de 1596 pb, que codifica una proteína de receptor CFK1-23a de 532 aminoácidos. Se considera que los 532 aminoácidos codificados de la proteína de receptor CFK1-23a constituyen el producto de traducción primario. La secuencia codificante está precedida por 60 pb de secuencia no traducida en 5'. La secuencia de ADN y la secuencia aminoácida derivada de la mayor parte del inserto de CFK1-23a se expone en la SEC ID nº: 1.
Sobre la base de los datos conocidos referentes a otras proteínas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa, la proteína CFK1-23a codificada de 532 aminoácidos presenta los rasgos característicos de los receptores con actividad serina/treonina-quinasa, en particular aquellos capaces de reconocer ligandos de la superfamilia TGF-\beta/BMP de factores de crecimiento y diferenciación. La región de la proteína del receptor CFK1-23a correspondiente al dominio intracelular de serina-treonina-quinasa presenta un grado significativo de identidad de secuencia aminoácida con el correspondiente dominio de otros receptores de esta familia, a saber: receptor de TGF-\beta de tipo II (Nº de acceso a Genbank: M85079), 35%; receptor de activina de tipo II (Nº de acceso a Genbank: M65287), 41%; receptor de activina de tipo IIB (Nº de acceso a Genbank: M84120), 39%; y Daf-1 (Nº de acceso a Genbank: A35103), 39%. El inserto de 2,8 kb del clon de ADNc de CFK1-23a se corta con la endonucleasa de restricción EcoRI y se transfiere al vector de expresión en células de mamíferos pMV2 en el sitio EcoRI de la región de clonación múltiple. Este plásmido se denomina pMV23a.
La secuencia de nucleótidos del clon CFK1-43a comprende un marco abierto de lectura de 1506 pb, que codifica una proteína de receptor CFK1-43a de 502 aminoácidos. Se considera que los 502 aminoácidos codificados de la proteína de receptor CFK1-43a constituyen el producto de traducción primario, ya que la secuencia codificante está precedida por 239 pb de secuencia no traducida en 5' con codones de terminación en los tres marcos de lectura. La secuencia de ADN y la secuencia aminoácida derivada del inserto de CFK1-43a (ATCC nº 69381) se expone en la SEC ID nº: 3.
Sobre la base de los datos conocidos referentes a otras proteínas de receptores con actividad serina/treonina-quinasa, la proteína CFK1-43a codificada de 502 aminoácidos presenta los rasgos característicos de los receptores con actividad serina/treonina-quinasa, en particular aquellos capaces de reconocer ligandos de la superfamilia TGF-\beta/BMP de factores de crecimiento y diferenciación. La región de la proteína del receptor CFK1-43a correspondiente al dominio intracelular de serina-treonina-quinasa presenta un grado significativo de identidad de secuencia aminoácida con el correspondiente dominio de otros receptores de esta familia, a saber: receptor de TGF-\beta de tipo II (Nº de acceso a Genbank: M85079), 35%; receptor de activina de tipo II (Nº de acceso a Genbank: M65287), 41%; receptor de activina de tipo IIB (Nº de acceso a Genbank: M84120), 40%; y Daf-1 (Nº de acceso a Genbank: A35103), 38%. El inserto de 2,1 kb del clon de ADNc de CFK1-43a clon de ADNc se corta con la endonucleasa de restricción EcoRI y se transfiere al vector de expresión en células de mamíferos pMV2 en el sitio EcoRI de la región de clonación múltiple. Este plásmido se denomina pMV43a.
El receptor CFK1-43a de la invención es homólogo al ARNm del receptor con actividad serina/treonina-quinasa de pollo, depositado con nº de acceso a Genbank: D 13432, para el que no se ha identificado ningún ligando.
Ejemplo IV Cribado de receptores de BMP humanos
Se supone que los genes del receptor de BMP de ratón y/o rata son significativamente homólogos. Por consiguiente, las secuencias de ratón que codifican W-101 o W-120, o porciones de las mismas, pueden utilizarse para cribar una genoteca genómica humana o una genoteca de ADNc humano, o emplearse como sondas para identificar una línea celular o tejido humanos que sintetizan las proteínas análogas humanas de receptores de BMP. De modo similar, las secuencias de rata que codifican CFK1-10a, CFK1-23a o CFK1-43a, o porciones de las mismas, pueden utilizarse para cribar genotecas humanas, o como sondas para identificar una línea celular o tejido humanos que sintetizan las proteínas análogas humanas de receptores de BMP. Una genoteca genómica humana puede cribarse con dichas ondas, y los presuntos clones recombinantes que exhiben hibridación positiva pueden aislarse, y puede obtenerse su secuencia de ADN. Los indicios de que dichos recombinantes codifican porciones de las correspondientes proteínas humanas de receptores de BMP se basan en las homologías de ADN, proteínas y estructura de genes en ratones o ratas/seres humanos.
Una vez obtenido un bacteriófago o plásmido recombinante que contiene ADN que codifica una porción de una molécula de receptor humano de BMP, la secuencia codificante humana puede utilizarse para identificar una línea celular o tejido humanos que sintetizan el ARNm del correspondiente receptor humano de BMP. Como alternativa, la secuencia codificante del receptor de BMP de ratón o de rata puede utilizarse como sonda para identificar dicha línea celular o tejido humanos. Brevemente: se extrae ARN a partir de una fuente de células o tejidos seleccionados y se somete a electroforesis en gel de agarosa con formaldehído, y se transfiere a nitrocelulosa, o se hace reaccionar con formaldehído y se transfiere directamente a nitrocelulosa. Después se hibrida la nitrocelulosa con una sonda procedente de una secuencia que codifica el receptor de BMP de ratón, rata o seres humanos. Como alternativa, la secuencia que codifica el receptor de BMP de ratón o de rata se utiliza para diseñar cebadores oligonucleotídicos que amplificarán específicamente una porción de la secuencia codificante del receptor de BMP localizada en la región entre los cebadores utilizados para llevar a cabo la reacción de amplificación específica. Se contempla que las secuencias que codifican el receptor de BMP de ratón, rata o seres humanos serán suficientemente homólogas para permitir la amplificación específica de las correspondientes secuencias que codifican el receptor humano de BMP a partir de moldes de ARNm, ADNc o de ADN genómico. Una vez identificada una fuente positiva mediante uno de los métodos descritos anteriormente, se selecciona el ARNm por cromatografía en oligo-(dT)-celulosa y el ADNc se sintetiza y se clona en un vector adecuado (por ejemplo, \lambdagt10, \lambdaZAPII u otros vectores conocidos por los expertos en la materia) mediante técnicas reconocidas. También es posible llevar a cabo la reacción de amplificación dirigida por el cebador oligonucleotídico, descrita anteriormente, directamente en una genoteca humana predeterminada de ADNc o genómica que ha sido clonada en un vector del bacteriófago \lambda o en un vector plasmídico. En tales casos, una genoteca que proporciona un producto de ADN específicamente amplificado que codifica una porción de la proteína del receptor de BMP humano podría cribarse directamente, utilizando como sonda el fragmento amplificado de ADN que codifica el receptor de BMP.
Ejemplo V Expresión de receptores de BMP
Para producir proteínas de receptores de BMP de ratón, rata, seres humanos, u otros mamíferos, el ADN que codifica las mismas se transfiere a un vector de expresión adecuado (como se ha descrito anteriormente para el caso de W-101, W-120, CFK1-10a, CFK1-23a y CFK1-43a) y se introduce en las células de mamífero u otros hospedadores preferidos eucarióticos o procarióticos empleando técnicas convencionales de ingeniería genética. Las secuencias de ADN que codifican la proteína de receptor de BMP pueden insertarse en un vector adecuado para la célula hospedadora particular, como se ha descrito anteriormente. Se contempla que el sistema de expresión preferido para las proteínas recombinantes humanas de receptores de BMP sean células de mamífero transformadas de forma estable.
A. Expresión en células COS
Como ejemplo específico de expresión de una proteína de receptor con actividad serina/treonina-quinasa de la invención, el inserto de CFK1-23a (que contienen la secuencia completa del ADNc del receptor de BMP correspondiente a CFK1-23a) se libera de la estructura del vector por digestión con EcoRI y se subclona en el sitio EcoRI del vector de expresión de mamífero pMV2, un derivado de pMT2, que ha sido depositado en la ATCC con el número de acceso ATCC 67122, aunque también pueden ser adecuados otros derivados del mismo, tales como pMT3. El ADN plasmídico de este subclón se utiliza para transfectar células COS mediante el procedimiento con DEAE-dextrano [Sompayrac y Danna PNAS 78:7575-7578 (1981); Luthman y Magnusson, Nucl. Acids Res. 11: 1295-1308 (1983)] y las células se cultivan. El medio condicionado durante 24 h, exento de suero, se recoge de las células a partir de 40-70 h después de la transfección.
B. Expresión en células CHO (1) Expresión del receptor con actividad serina/treonina-quinasa en células CHO
Con el objeto de obtener elevados niveles de expresión de la proteína de receptor con actividad serina/treonina-quinasa, cada una de la secuencias de ADN de la SEC ID nº: 1, SEC ID nº: 3, SEC ID nº: 5, SEC ID nº: 7 o SEC ID nº: 9 se inserta en un vector de expresión eucariótica, por ejemplo, pMV2 o pMT3, se introduce de forma estable en células CHO y se amplifica hasta obtener un elevado número de copias mediante selección con metotrexato de DHFR [Kaufman et al., EMBO J. 6:189 (1987)]. Las células transformadas se cultivan y las proteínas de receptores expresadas permanecen asociadas a la membrana celular de la célula transformada. Las proteínas recombinantes de receptores de la presente invención pueden disociarse de la membrana de la célula transformada y después recuperarse y purificarse de otros contaminantes presentes.
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Una proteína de receptor con actividad serina/treonina-quinasa de la invención se expresa en células CHO liberando el inserto del CFK1-43a clonado descrito anteriormente con EcoRI. El inserto se subclona en el sitio de clonación de EcoRI del vector de expresión en mamíferos, pMV2, descrito anteriormente, aunque también pueden ser adecuados derivados del mismo, por ejemplo, pMT3.
Los métodos para producir proteínas heterólogas a partir de células CHO se conocen en la técnica y han sido descritos anteriormente, en las páginas 16 a 19.
Ejemplo VI Ensayos de unión para determinar la afinidad de los receptores clonados por diferentes ligandos de la superfamilia TGF-\beta/BMP
Un receptor de BMP de la invención puede definirse como una proteína que posee la capacidad de unirse a una BMP particular con mayor afinidad de unión que a TGF-\beta, activina, inhibina u otros miembros de la familia TGF-\beta de factores de crecimiento y diferenciación. Los receptores de BMP de la presente invención se unen específicamente a una BMP particular de modo que aproximadamente un exceso de 100 veces de un ligando competitivo tal como TGF-\beta o activina no desplazará de forma significativa la BMP. La unión específica de las BMP a un receptor particular de BMP de la invención puede demostrarse transfectando un plásmido de expresión que contiene secuencias de ADN que codifican la proteína particular de receptor de BMP de interés en células COS y permitiendo la expresión transitoria de la proteína de receptor de BMP en la superficie celular. Las BMP individuales, BMP heterodiméricas u otras proteínas de la superfamilia TGF-\beta se unen a células COS que expresan el receptor de BMP, y las células se analizan para determinar su capacidad de unirse específicamente a una molécula de BMP o a un grupo particular de proteínas BMP con mayor afinidad que a TGF-\beta u otros miembros de la superfamilia TGF-\beta. Dichos ensayos de unión pueden realizarse de la siguiente manera:
Células COS que han sido transfectadas con un vector de expresión que contiene la secuencia que codifica el receptor de BMP particular de interés (por ejemplo, pMT101, pMT120, CFK1-10a/Not4, pMV23a o pMV43a) se siembran en placas, tratadas con gelatina, de 6 pocillos, y se preincuban a 37ºC durante 60 minutos en tampón de unión (NaCl 128 mM, KCl 5 mM, MgSO_{4} 5 mM, CaCl_{2} 1,2 mM, HEPES 50 mM y 5 mg/ml de BSA, pH 7,5). Las células COS preincubadas se lavan y se incuban en tampón de unión al que se ha añadido KCN 10 mM y NaF 2 mM durante 10 minutos antes de la adición de BMP-4 y/o [I^{125}]BMP-4. Se permite que la unión de BMP-4 alcance el equilibrio a 37ºC durante 60 minutos. Tras la unión, las células se lavan dos veces con tampón de unión enfriado con hielo, y se solubilizan con Triton X-100 al 1%, glicerol al 10%, HEPES 25 mM y 1 mg/ml de BSA, pH 7,5, como se describe
por Massague [Meth. Enzymol.146:174-195 (1987)]. Después se determina la radiactividad en un contador gamma.
Ejemplo VII Producción de proteínas truncadas de receptores para la obtención de proteína truncada
Las proteínas truncadas de receptores de la invención comprenden preferentemente el dominio de unión al ligando pero no los dominios transmembranario y de serina/treonina-quinasa de las proteínas de receptores. Dichas proteínas truncadas de receptores pueden expresarse en células de mamífero de forma que las proteínas truncadas de receptores se secreten en el sobrenadante, en vez de expresarse en la superficie de la célula hospedadora. Las secuencias de ADN que codifican el dominio de unión al ligando de cada proteína de receptor de la invención pueden aislarse a partir de las secuencias de ADN que codifican los dominios transmembranario y de serina/treonina-quinasa de cada correspondiente proteína de receptor de la invención, e insertarse en vectores que permitan la producción de las proteínas truncadas de receptores en células de mamífero. Como alternativa, las secuencias de ADN que codifican las proteínas truncadas de receptores pueden aislarse e insertarse en vectores adecuados para la expresión en células bacterianas, de insecto, virus y levaduras. Dichos vectores son conocidos por los expertos en la materia y se describen en otro lugar de la presente solicitud.
En una forma de realización preferida, las secuencias de ADN que comprenden los nucleótidos nº 61 a nº 507 de la SEC ID nº: 1 que codifican los aminoácidos nº 1 a 149 de la proteína CFK1-23a de receptor de la invención (SEC ID nº: 2) pueden amplificarse específicamente, y la secuencia de ADN resultante puede insertarse en un vector estándar de expresión en células de mamíferos (por ejemplo, pMV2 o pMT3). Dicha amplificación específica puede realizarse de la siguiente manera:
En un sintetizador automático de ADN se sintetizan cebadores oligonucleotídicos que comprenden la secuencia de nucleótidos nº 1 a nº 20 de la SEC ID nº: 1 y un cebador distinto que comprende la cadena complementaria de la secuencia de nucleótidos nº 488 a 507 de la SEC ID nº: 1. Además, dichos oligonucleótidos pueden diseñarse de forma que incluyan secuencias de reconocimiento para endonucleasas de restricción conocidas por los expertos en la materia (por ejemplo, BamHI, EcoRI, XbaI etc.) que serán útiles en la manipulación de los productos de ADN amplificados y en la facilitación de su inserción en vectores plasmídicos. Además, el cebador que comprende los nucleótidos nº 488 a 507 puede incluir también una secuencia trinucleotídica que corresponde a un codón de terminación de la traducción (es decir, TAA, TAG o TGA) en lugar de los nucleótidos nº 583 a 585 de la SEC ID nº: 1. El oligonucleótido que comprende los nucleótidos nº 488 a 507 se diseñaría sobre la base de la cadena antisentido (complementaria) de esta región de la SEC ID nº: 1, y en combinación con un oligonucleótido que comprende los nucleótidos nº 1 a 20 de la cadena con sentido (codificante) de la SEC ID nº: 1 podría utilizarse para amplificar específicamente un fragmento de ADN que comprende los nucleótidos nº 1 a nº 507 de la SEC ID nº: 1. Este fragmento de ADN codificará una proteína truncada de receptor de la invención. El fragmento de ADN que codifica la proteína truncada de receptor de la invención puede producirse ampliando específicamente la secuencia que comprende los nucleótidos nº 1 a nº 507 de la SEC ID nº: 1 utilizando como molde un clon que codifica la secuencia completa del receptor de la invención, tal como pMV23a. Esta reacción de amplificación específica de ADN puede llevarse a cabo de la siguiente manera: aproximadamente 1 ng de ADN molde, tal como pMV23a, se combina con 100 pM de un oligonucleótido que comprende los nucleótidos nº 1 a 20, y 100 pM de un oligonucleótido que comprende la cadena complementaria de los nucleótidos nº 488 a 507 en una mezcla de reacción de 100 \mul que consta de Tris-HCl 10 mM (pH 8,3), KCl 50 mM, MgCl_{2} 1,5 mM, 200 \muM de cada desoxinucleótido trifosfato, 2,5 unidades de ADN-polimerasa Taq. Después se incuba toda la reacción a 95ºC durante dos minutos, y a continuación se somete a ciclos térmicos de la siguiente manera: 1 minuto a 95ºC, 1 minuto a 40ºC y 1 minuto a 72ºC durante veinticinco a cuarenta ciclos; seguido por una incubación de 7 minutos a 72ºC, después de lo cual se mantiene la reacción completada a 4ºC.
El fragmento de ADN que se amplifica específicamente por esta reacción se precipita con etanol, se digiere con las endonucleasas de restricción adecuadas en los casos en los que se hayan añadido secuencias de reconocimiento de endonucleasas de restricción a los oligonucleótidos utilizados para cebar la síntesis del fragmento de ADN amplificado (descrito anteriormente), y se someten a electroforesis en agarosa. Se corta una región del gel en la que aparece una banda de ADN del tamaño esperado y se subclona en un vector plasmídico. Como alternativa, este fragmento de ADN específicamente amplificado que codifica una proteína truncada de receptor de la invención podría subclonarse directamente en un vector estándar de expresión en células de mamíferos tal como pMT3 u otros vectores similares conocidos por los expertos en la materia.
Podrían llevarse a cabo manipulaciones similares a las descritas anteriormente, con el objeto de aislar y expresar otras proteínas truncadas de receptores de la invención.
Por ejemplo, las secuencias de ADN que comprenden los nucleótidos nº 247 a 618 de la SEC ID nº: 3, que codifican los aminoácidos nº 1 a 124 del receptor de BMP CFK1-43a de la invención (SEC ID nº: 4) pueden amplificarse específicamente para producir un fragmento de ADN que comprende los nucleótidos nº 247 a 618 de la SEC ID nº: 3, que codificaran otra proteína truncada de receptor de BMP. Estas secuencias codificarán el dominio de unión al ligando del receptor de BMP CFK1-43a, pero no codificarán los dominios transmembranario y de serina/treonina-quinasa de la correspondiente proteína de receptor. Cuando se inserta en un vector de expresión adecuado y se utiliza para transfectar la célula hospedadora adecuada, esta construcción permitirá la producción de una proteína truncada de receptor de BMP que será secretada en el medio, en vez de expresarse en la superficie de la célula hospedadora. Esta reacción de amplificación específica puede llevarse a cabo de forma similar a la descrita anteriormente en lo referente a la proteína truncada CFK1-23a de receptor de BMP. En este caso, se utilizan oligonucleótidos que comprenden la secuencia de nucleótidos nº 247 a 266 de la SEC ID nº: 3 y un cebador oligonucleotídico distinto que comprende la cadena complementaria de la secuencia de nucleótidos nº 599 a 618 de la SEC ID nº: 3 para amplificar de forma específica un fragmento de ADN que comprende los nucleótidos nº 247 a 618 de la SEC ID nº: 3. Estos oligonucleótidos y un ADN molde que codifica la correspondiente proteína de receptor de BMP de la invención tal como pMV43a, se sustituyen en la mezcla de reacción de amplificación específica de ADN descrita anteriormente.
Además, otros receptores con actividad serina/treonina-quinasa de la invención tales como W-101, W-120 o CFK1-10a pueden producirse en forma truncada. Las formas truncadas de estas moléculas de receptores pueden expresarse en células de mamífero de modo que las correspondientes proteínas truncadas se secreten en el medio de cultivo, en vez de expresarse en la superficie de la célula hospedadora. La expresión de estas proteínas solubles de receptores puede lograrse amplificando fragmentos de ADN que codifican el dominio de unión al ligando, pero no los dominios transmembranario y de serina/treonina-quinasa, de cada molécula respectiva de receptor con actividad serina/treonina-quinasa, como se ha descrito anteriormente para el caso de las proteínas truncadas de receptores de BMP.
Ejemplo VIII Bioensayos con W-20-17 A. Descripción de las células W-20-17
La utilización de células estromales de médula ósea W-20-17 como línea celular indicadora se basa en la conversión de dichas células en células del tipo de los osteoblastos tras el tratamiento con una proteína BMP [Thies et al., Journal of Bone and Mineral Research, 5:305 (1990); y Thies et al., Endocrinology, 130:1318 (1992)]. Específicamente, las células W-20-17 son una línea clonal de células estromales de médula ósea derivada de ratones adultos generada por los investigadores del laboratorio del Dr. D. Nathan, Children's Hospital, Boston, MA. El tratamiento de las células W-20-17 con ciertas proteínas dar lugar a (1) un aumento en la producción de fosfatasa alcalina, (2) la inducción de AMPc estimulado por PTH, y (3) la inducción de la síntesis de osteocalcina por las células. Mientras que (1) y (2) representan características asociadas con el fenotipo de los osteoblastos, la capacidad de sintetizar osteocalcina es una propiedad fenotípica que presentan sólo los osteoblastos maduros. Es más, hasta la fecha se ha observado conversión de células estromales W-20-17 en células del tipo de los osteoblastos sólo tras el tratamiento con BMP. De este modo, las actividades in vitro presentadas por las células W-20-17 tratadas con BMP correlacionan con la actividad osteogénica in vivo que presentan las BMP.
A continuación se describen dos ensayos in vitro útiles para comparar las actividades de BMP de formulaciones de BMP con la actividad de BMP conocidas.
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B. Protocolo de ensayo de la fosfatasa alcalina de W-20-17
Se siembran células W-20-17 en placas de cultivo de tejidos de 96 pocillos a una densidad de 10.000 células por pocillo en 200 \mul de medio (DME con suero termoinactivado de ternero fetal al 10%, glutamina 2 mM y 100 unidades/ml de penicilina + 100 \mug/ml de estreptomicina. Se deja que las células se adhieran durante toda la noche en un incubador con 95% de aire, 5% de CO_{2}, a 37ºC.
Los 200 \mul de medio se eliminan de cada pocillo con una pipeta de múltiples canales y se sustituyen por un volumen igual de la muestra problema en DME con suero termoinactivado de ternero fetal al 10%, glutamina 2 mM y 1% de penicilina-estreptomicina. Las sustancias problema se ensayan por triplicado.
Las muestras problema y los patrones se someten a un período de incubación de 24 horas con las células indicadoras W-20-17. Después de las 24 horas, se retiran las placas del incubador a 37ºC y se extrae el medio problema de las células.
Las capas de células W-20-17 se lavan 3 veces con 200 \mul por pocillo de solución salina tamponada con fosfato exenta de calcio/magnesio, y se desechan estos lavados.
Se añaden 50 \mul de agua destilada con vidrio a cada pocillo, y las placas de ensayo se colocan después en un baño de hielo seco/etanol para congelarlas rápidamente. Una vez congeladas, las placas de ensayo se retiran del baño de hielo seco/etanol y se descongelan a 37ºC. Esta etapa se repite 2 veces más hasta un total de 3 ciclos de congelación-descongelación. Una vez completado este paso, la fosfatasa alcalina unida a la membrana está lista para su medición.
Se añaden 50 \mul de la mezcla de ensayo (glicina 50 mM, Triton X-100 al 0,05%, MgCl_{2} 4 mM, 5 mM p-nitrofenol-fosfato, pH = 10,3) a cada pocillo de ensayo, y las placas de ensayo se incuban después durante 30 minutos a 37ºC en un baño de agua con agitación de 60 oscilaciones por minuto.
Al final de período de incubación de 30 minutos, la reacción se para añadiendo 100 \mul de NaOH 0,2 N a cada pocillo, y colocando las placas de ensayo en hielo.
Se lee la absorbancia espectrofotométrica de cada pocillo a una longitud de onda de 405 nanómetros. Después se comparan estos valores con los patrones conocidos, para obtener una estimación de la actividad de fosfatasa alcalina en cada muestra. Por ejemplo, utilizando cantidades conocidas de p-nitrofenol-fosfato se generan los valores de absorbancia que se muestran en la Tabla 2.
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TABLA 2
Los valores de absorbancia de cantidades conocidas de BMP pueden determinarse y convertirse en moles de p-nitrofenol-fosfato escindido por unidad de tiempo, como se muestra en la Tabla 3.
1
TABLA 3
2
Estos valores se utilizan después para comparar las actividades de cantidades conocidas de nuevas formulaciones de BMP con formulaciones conocidas de BMP activas.
C. Protocolo de RIA de osteocalcina
Se siembran células W-20-17 a una densidad de 10^{6} células por pocillo en placas de cultivo de tejidos de 24 pocillos en 2 ml de DME con suero termoinactivado de ternero fetal al 10%, glutamina 2 mM. Las células se dejan adherir durante toda la noche en atmósfera de 95% de aire, 5% de CO_{2} a 37ºC.
Al día siguiente se cambia el medio a DME con suero de ternero fetal al 10%, glutamina 2 mM, y la sustancia problema en un volumen total de 2 ml. Cada sustancia problema se añade a los pocillos por triplicado. Las sustancias problema se incuban con las células W-20-17 durante un total de 96 horas, con una sustitución a las 48 horas empleando los mismos medios problema.
Al final de las 96 horas, se extraen 50 \mul del medio problema de cada pocillo, y se analiza para determinar la producción de osteocalcina utilizando un radioinmunoensayo para la osteocalcina de ratón. Los detalles del ensayo se describen en el kit fabricado por Biomedical Technologies Inc., 378 Page Street, Stoughton, MA 02072. Los reactivos del ensayo tienen los siguientes números de catálogo: BT-431 (patrón de osteocalcina de ratón), BT-432 (anticuerpo caprino contra la osteocalcina de ratón), BT-431R (osteocalcina de ratón yodada), BT-415 (suero caprino normal) y BT-414 (anticuerpo de asno contra la IgG caprina). El RIA para la osteocalcina sintetizada por las células W-20-17 en respuesta al tratamiento con BMP se lleva a cabo como se describe en el protocolo suministrado por el fabricante.
Ejemplo IX Estudio ectópico en ratas
Veinticuatro ratas Long Evans, machos, se dividen en 6 grupos problema. Cada una recibe un implante subcutáneo, de un tamaño de 200 \mul, con una dosis de 0 ó 20 \mug/100 \mul de una muestra particular de BMP/matriz, por ejemplo BMP/partículas porosas de PLGA/coágulo sanguíneo, como se describe en la patente US nº 5.171.579. Después se 14 días, las ratas se sacrifican y se evalúa la formación de hueso en cada animal.
Ejemplo X Anticuerpos policlonales contra el receptor truncado de BMP
Tres conejos reciben inyecciones de proteína purificada truncada de receptor de BMP. Los anticuerpos policlonales procedentes del suero de dichos conejos se purifican por cromatografía en una columna de proteína A. Los anticuerpos se analizan para determinar su capacidad de unirse a receptores de BMP.
Ejemplo XI Anticuerpos monoclonales contra el receptor humano truncado de BMP
Se inmunizan tres grupos de tres ratones con proteína purificada truncada de receptor de BMP. Los bazos de los ratones se utilizan para generar múltiples líneas celulares de hibridomas. Los medios condicionados de las líneas de hibridoma de ratón no clonal se analizan para medir su capacidad de unirse a receptores de BMP. Las líneas clonales pueden generarse a partir de los anteriores mediante clonación secuencial en serie y en diluciones limitantes. Cuando las líneas no clonales se convierten en clonales, aquellas líneas que presentan actividad positiva en el estado no clonal mantendrán la capacidad de producir un anticuerpo que se une al receptor de BMP. A la inversa, las líneas que son negativas se mantendrán negativas durante todo el procedimiento de clonación. Los anticuerpos monoclonales pueden purificarse a partir del líquido ascítico procedente de clones de hibridoma tanto positivos como negativos.
\global\parskip0.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE: GENETICS INSTITUTE, INC.
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: PROTEÍNAS DE RECEPTORES
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 19
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DIRECCIÓN PARA CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
DESTINATARIO: Genetics Institute Inc.- Legal Affairs
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 87 CambridgePark Drive
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Cambridge
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: MA
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 02140
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
FORMA DE LECTURA POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: compatible con PC de IBM
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: PatentIn Release nº 1.0, Versión nº 1.25
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE LA SOLICITUD: por determinar
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: ADJUNTA
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
DATOS DE LA SOLICITUD PREVIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE LA SOLICITUD: US 08/123.934
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: 17-SEP-1993
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN SOBRE EL APODERADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: LAZAR, Steven R
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 32.618
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
NÚMERO DE REFERENCIA/ARCHIVO: 5203-PCT
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN PARA TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: (617) 498-8260
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TELEFAX: (617) 876-5851
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1813 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: CFK1-23a
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 61..1656
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
3
4
5
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 532 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácida
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 2:
6
7
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2076 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: CFK1-43a
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 247..1752
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
8
9
10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 502 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácida
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 4:
11
12
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3238 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: CFK1-10a
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 474..2000
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 5:
13
14
15
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 509 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácida
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
16
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1647 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: W-101
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 80..1594
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
18
19
20
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 505 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácida
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
21
22
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1794 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: W-120
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 83..1591
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 9:
24
25
26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 503 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácida
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
27
28
29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 341 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: KDA-B5
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 25..318
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
30
31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 98 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácida
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 12:
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: CEBADOR A
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCGGATCCGA RTAYGTNGCN GTNAAR
\hfill
26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
GENOTECA: CEBADOR B
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GACTGTAGAR CTYTTDATRT CYCTRTG
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 15
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: CEBADOR C
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GACTCTAGAR CTYTTDATRT CNCGRTG
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: CEBADOR D
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GACTCTAGNG AYTTDATRTC YCTRTG
\hfill
26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: CEBADOR E
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GACTCTAGAN GAYTTDATRT CNCGRTG
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 7 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácida
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: SECUENCIA PEPTÍDICA DE KDA-B5 UTILIZADA PARA DISEÑAR EL CEBADOR A
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Asn Glu Tyr Val Ala Val Lys}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEC ID nº: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 6 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácida
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
ORIGEN INMEDIATO:
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CLON: SECUENCIA PEPTÍDICA DE KDA-B5 UTILIZADA PARA DISEÑAR LOS CEBADORES B HASTA E
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEC ID nº: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{His Arg Asp Ile Lys Ser}

Claims (14)

1. Molécula de ADN que comprende una secuencia de ADN que codifica una proteína de receptor de proteínas morfogénicas óseas (BMP) con actividad serina/treonina-quinasa, o una forma truncada de la misma, que tiene la capacidad de unirse a BMP en un ensayo de unión, en la que dicha secuencia de ADN se selecciona a partir de:
(a)
la secuencia de ADN CFK1-43a expuesta en la SEC ID nº: 3;
(b)
nucleótidos 247 hasta 1752 de la SEC ID nº: 3;
(c)
una secuencia de ADN que codifica los aminoácidos 8 hasta 502 de la SEC ID nº: 4;
(d)
nucleótidos 247 hasta 618 de la SEC ID nº: 3;
(e)
una secuencia de ADN que codifica los aminoácidos 8 hasta 124 de la SEC ID nº: 4; y
(f)
una secuencia de ADN que codifica el dominio de unión al ligando de una variante alélica presente en la naturaleza de cualquiera de (a) a (e).
2. Vector que comprende la molécula de ADN según la reivindicación 1.
3. Vector según la reivindicación 2, asociado funcionalmente a una secuencia para el control de la expresión del mismo.
4. Célula hospedadora transformada con el vector según la reivindicación 2 ó 3.
5. Método para producir una proteína de receptor de BMP con actividad serina/treonina-quinasa, o una forma truncada de la misma, que tiene la capacidad de unirse a BMP en un ensayo de unión, que comprende las etapas siguientes:
(a)
cultivar en un medio de cultivo la célula hospedadora de la reivindicación 4; y
(b)
recuperar dicha proteína, o forma truncada de la misma, a partir del medio de cultivo.
6. Proteína de receptor de BMP con actividad serina/treonina-quinasa, o forma truncada de la misma, que tiene la capacidad de unirse a BMP en un ensayo de unión, en la que dicha proteína está codificada por la molécula de ADN según la reivindicación 1.
7. Anticuerpo monoclonal que tiene la capacidad de unirse a la forma truncada de la proteína de receptor de BMP con actividad serina/treonina-quinasa según la reivindicación 6.
8. Utilización de una proteína de receptor de BMP, o forma truncada de la misma, según la reivindicación 6 en un ensayo de unión para la identificación de un ligando que se une a la misma, en la que dicho ligando es un anticuerpo monoclonal similar a BMP, un pequeño péptido que es análogo a BMP, o una pequeña molécula orgánica que es análoga a BMP.
9. Composición que comprende células transformadas con una o más moléculas de ADN según la reivindicación 1.
10. Composición que comprende la proteína truncada de receptor de BMP según la reivindicación 6.
11. Proteína truncada de receptor de BMP según la reivindicación 6, para su utilización como medicamento.
12. Utilización de una composición según la reivindicación 9 para la preparación de un medicamento destinado a la estimulación del crecimiento de hueso y/o el cartílago.
13. Utilización de una composición según la reivindicación 10 para la preparación de un medicamento destinado a la inhibición de los efectos de BMP.
14. Proteína codificada por una molécula de ADN que se hibrida en condiciones restrictivas de hibridación a una molécula de ADN según la reivindicación 1, estando dicha proteína caracterizada porque tiene la capacidad de unirse selectivamente a BMP-2 y 4, pero no a TGF-\beta.
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