ES2299601T3 - Toxinas cry3a modificadas y secuencias de acidos nucleicos que las codifican. - Google Patents
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Abstract
Una toxina Cry3A modificada, que comprende un sitio de reconocimiento de proteasa que no se presenta de modo natural, en donde dicho sitio de reconocimiento de proteasa modifica una toxina Cry3A y está localizado en una posición seleccionada del grupo que consiste en: a) una posición entre aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 107 y 115 de la SEQ NO: 4; b) una posición entre aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4; y una posición entre aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 107 y 115 de la SEQ ID NO: 4, y c) entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4; en donde dicho sitio de reconocimiento de proteasa es reconocible por una proteasa intestinal del gusano de la raíz del maíz del oeste, y en donde dicha toxina Cry3A modificada causa mayor mortalidad al gusano de la raíz del maíz del oeste que la mortalidad causada por dicha toxina Cry3A al gusano de la raíz del maíz el oeste en una valoración biológica con dieta artificial.
Description
Toxinas Cry3A modificadas y secuencias de ácidos
nucleicos que las codifican.
La presente invención se refiere a los campos de
la ingeniería de las proteínas, a la biología molecular de las
plantas y al control de plagas. Más particularmente, la presente
invención se refiere a nuevas toxinas Cry3A modificadas y a las
secuencias de ácidos nucleicos cuya expresión da como resultado las
toxinas Cry3A modificadas, y a los métodos para preparar y a los
métodos de usar las toxinas Cry3A modificadas y a las
correspondientes secuencias de ácidos nucleicos para controlar
insectos.
Las especies del gusano de la raíz de maíz se
consideran las plagas más destructivas de los cereales. En los
Estados Unidos las tres especies más importantes son Diabrotica
virgifera virgifera, que es el gusano de la raíz del maíz del
oeste; D. longicornis barberi, que es el gusano de la raíz
del maíz del norte y D. undecimpunctata howardi, que es el
gusano de la raíz del maíz del sur. Únicamente los gusanos de la
raíz del maíz del oeste y del norte son considerados plagas
primarias del maíz en el US Corn Belt (Zona del maíz de
Estados Unidos). Las larvas del gusano de la raíz del maíz que se
alimentan casi exclusivamente de las raíces del maíz causan el daño
más importante en las plantas. Este daño ha demostrado que aumenta
el encamamiento de las plantas, reduce la producción del cereal y
el rendimiento vegetativo al mismo tiempo que altera el contenido
de nutrientes del cereal. La alimentación de las larvas produce
también efectos indirectos sobre el maíz al abrir avenidas a través
de las raíces para las infecciones bacterianas y fúngicas que
conducen a enfermedades de la raíz y pudrición del tallo. Los
gusanos adultos de la raíz del maíz son activos en los maizales a
finales del verano cuando se alimentan de espigas, estigmas y polen,
interfiriendo con la polinización normal.
Los gusanos de la raíz del maíz son controlados
principalmente mediante aplicaciones intensivas de plaguicidas
químicos, que son activos a través de la inhibición del desarrollo o
crecimiento del insecto, el impedimento de la alimentación o de la
reproducción del insecto o causan la muerte. Por lo tanto, puede
obtenerse un buen control del gusano de la raíz del maíz, pero
estos productos químicos algunas veces también afectan a otros
organismos beneficiosos. Otro problema resultante del amplio uso de
plaguicidas químicos es la aparición de variedades resistentes del
insecto. Un problema más se debe al hecho de que las larvas del
gusano de la raíz del maíz se alimentan subterráneamente lo cual
hace difícil aplicar tratamientos de rescate de los insecticidas.
Por lo tanto, la mayor parte de las aplicaciones de insecticidas se
efectúa profilácticamente en el momento de la siembra. Esta
práctica ocasiona una gran carga ambiental. Esto ha sido
parcialmente aliviado mediante diversas prácticas de gestión de
instalaciones agrícolas, pero existe una creciente necesidad de
descubrir mecanismos alternativos de control de plagas.
Los agentes biológicos para el control de
plagas, tales como cepas de Bacillus thuringiensis (Bt) que
expresan toxinasplaguicidas similares a las
\delta-endotoxinas, han sido aplicados también a plantas
de cultivo con resultados satisfactorios principalmente contra
plagas de insectos lepidópteros. Las
\delta-endotoxinas son proteínas mantenidas
dentro de una matriz cristalina que se sabe que poseen actividad
insecticida cuando son ingeridas por ciertos insectos. Las diversas
\delta-endotoxinas han sido clasificadas en base a
su espectro de actividad y homología de secuencias. Antes de 1990,
las principales clases fueron definidas por su espectro de
actividad con las proteínas Cry1 activas contra lepidópteros
(polillas y mariposas), las proteínas Cry2 activas tanto contra
tanto lepidópteros como dípteros (moscas y mosquitos), las proteínas
Cry3 activas contra coleópteros (escarabajos) y las proteínas Cy4
activas contra dípteros (Hofte y Whitely, 1989, Microbiol.
Rev. 53:242-255. Recientemente, se ha
desarrollado una nueva nomenclatura que clasifica sistemáticamente
las proteínas Cry en base a la homología de sus secuencias de
aminoácidos en vez de las especificidades contra el insecto diana
(Crickmore et al. 1998, Microbiol. Molec. Biol. Rev.
62:807-813).
El espectro de actividad insecticida de una
\delta-endotoxina individual de Bt es bastante
estrecho, siendo una \delta-endotoxina
determinada activa únicamente contra unas pocas especies dentro de
un orden. Por ejemplo, se sabe que la proteína Cry3A es muy tóxica
contra el escarabajo de la patata de Colorado, Leptinotarsa
decemlineata, pero tiene muy poca o ninguna toxicidad contra los
escarabajos relacionados del género Diabrotica (Johnson
et al., 1993, J. Econ. Entomol.
86:330-333). De acuerdo con Slaney et al.
(1992, Insect Biochem. Molec. Biol. 22:9-18)
la proteína Cry3A es por lo menos 2000 veces menos tóxica para las
larvas del gusano de la raíz del maíz del sur que para el
escarabajo de la patata de Colorado. También se sabe que la Cry3A
tiene muy poca o ninguna toxicidad para el gusano de la raíz del
maíz del oeste.
La especificidad de las
\delta-endotoxinas es el resultado de la eficacia
de las diversas etapas implicadas en la producción de la proteína
que es una toxina activa y su subsiguiente interacción con las
células epiteliales en el intestino medio del insecto. Para que
sean insecticidas, la mayor parte de las
\delta-endotoxinas conocidas deben ser ingeridas
primero por el insecto y activadas proteolíticamente para formar una
toxina activa. La activación de las proteínas cristalinas del
insecticida es un proceso de multi-etapas. Después
de la ingestión, los cristales deben solubilizarse primeramente en
el intestino del insecto. Una vez solubilizadas las
\delta-endotoxinas son activadas mediante
disociaciones proteolíticas específicas. Las proteasas del
intestino del insecto pueden jugar un papel en cuanto a la
especificidad determinando donde se procesa la
\delta-endotoxina. Una vez que la
\delta-endotoxina ha sido solubilizada y
procesada, se une a receptores específicos sobre la superficie del
epitelio del intestino medio del insecto y subsiguientemente se
integra en la bicapa lipídica de la membrana de borde piloso. Luego
se forman canales iónicos que interrumpen la función normal del
intestino medio conduciendo finalmente a la muerte del insecto.
\newpage
En los lepidópteros, las proteasas intestinales
procesan las \delta-endotoxinas a partir de
protoxinas de 130-140 kDa, a proteínas tóxicas de
aproximadamente 60-70 kDa. Se ha descrito que el
procesamiento de la protoxina a toxina prosigue por medio de la
eliminación tanto de los aminoácidos N- como
C-terminales, dependiendo la ubicación exacta del
procesamiento de los fluidos específicos del intestino del insecto
implicado (Qgiwara et al., 1992, J. Invert. Pathol.
60:121-126). La activación proteolítica de una
\delta-endotoxina puede desempeñar un papel
significativo para determinar su especificidad. Por ejemplo, una
\delta-endotoxina de la variedad de Bt
aizawa, denominada IC1, ha sido clasificada como una proteína
Cry1Ab en base a su homología de secuencia con otras proteínas
Cry1Ab conocidas. Las proteínas Cry1Ab son típicamente activas
contra insectos lepidópteros. Sin embargo, la proteína IC1 tiene
actividad tanto contra los insectos lepidópteros como contra los
dípteros, dependiendo de la forma en que se procesa la proteína
(Haider et al. 1986, Euro. J. Biochem.
156:531-540). En el intestino de los dípteros, se
obtiene una toxina IC1 activa de 53 kDa, mientras que en el
intestino de los lepidópteros, se obtiene una toxina IC1 activa de
55kDa. La IC1 difiere de la proteína del holotipo
HP-1 Cry1Ab únicamente en cuatro aminoácidos, de
manera que los grandes cambios en la región de unión del receptor
no parecen explicar las diferencias de actividad. Las diferentes
escisiones proteolíticas en los dos diferentes intestinos de
insectos permiten posiblemente que las moléculas activadas se
plieguen de forma diferente exponiendo por tanto diferentes
regiones capaces de unirse a diferentes receptores. Por lo tanto,
la especificidad parece residir en las proteasas del intestino de
los diferentes insectos.
Los insectos coleópteros tienen intestinos que
son más neutros a los ácidos, y las
\delta-endotoxinas específicas de coleópteros son
similares al tamaño de las toxinas específicas de lepidópteros
activadas. Por lo tanto, el procesamiento de las
\delta-endotoxinas específicas de coleópteros fue
considerado anteriormente innecesario para la toxicidad. Sin
embargo, recientes datos sugieren que las
\delta-endotoxinas activas de coleópteros son
solubilizadas y proteolizadas formando polipéptidos tóxicos más
pequeños. La proteína de \delta-endotoxina Cry3A
de 73 kDA producida por B. thuringiensis variedad
tenebrionis es fácilmente procesada en la bacteria en el
extremo N, perdiendo 49-57 residuos durante o
después de la formación de los cristales para producir la forma
comúnmente aislada de 67 kDa (Caroll et al., Biochem. J.
261:99-105). McPherson et al., 1988
(Biotechnology 6:61-66) también demostraron
que el gen cry3A natural contiene dos codones funcionales de
iniciación de la traducción en el mismo marco de lectura, uno que
codifica la proteína de 73 kDa y el otro que codifica la proteína
de 67 kDa a partir de Met-1 y Met-48
respectivamente, de la secuencia de aminoácidos deducida (véase la
SEQ ID NO: 2). Ambas proteínas pueden considerarse proteínas Cry3A
naturales de longitud completa. El tratamiento de la proteína
soluble Cry3A de 67 kDa con tripsina o bien con extracto de
intestino de insecto da como resultado un producto de escisión de
55 kDa, con Asn-159 de la secuencia de aminoácidos
deducida en el extremo N. Se halló que este polipéptido era tan
tóxico para un insecto coleóptero susceptible como la toxina
natural Cry3A de 67 kDa. (Carroll et al., Ibid). Por lo
tanto, existe un sitio de reconocimiento de la tripsina natural
entre Arg-158 y Asn-159 de la
secuencia de aminoácidos deducida de la toxina Cry3A natural (SEQ
ID NO: 2). La Cry3A puede escindirse también mediante quimotripsina,
lo cual da como resultado tres polipéptidos de 49, 11 y 6 kDa. El
análisis N-terminal de los componentes de 49 y 6 kDa
mostró que el primer residuo de aminoácido era
Ser-162 y Tyr-588, respectivamente
(Carroll et al., 1997 J. Invert. Biol.
70:41-49).Por lo tanto, existen sitios naturales de
reconocimiento de quimotripsina en Cry3A entre
His-161 y Ser-162 y entre
Tyr-587 y Tyr-588 de la secuencia de
aminoácidos deducida (SEQ ID NO: 2). El producto de quimotripsina
de 49 kDa parece ser más soluble a pH neutro que la proteína natural
de 67 kDa o el producto de tripsina de 55 kDa y retiene la
actividad insecticida total contra los insectos susceptibles a
Cry3A, el escarabajo de la patata de Colorado y el escarabajo de la
mostaza (Phaedon cochleariae). Las proteasas
intestinales del insecto funcionan típicamente ayudando al insecto a
obtener los aminoácidos necesarios de las proteínas de la dieta.
Las proteasas digestivas de insecto mejor entendidas son las
serina-proteasas que parecen ser las más comunes
(Englemann y Geraerts, 1980, J. Insect Physiol.
261:703-710), particularmente en las especies de
lepidópteros. La mayoría de adultos y larvas de los coleópteros, por
ejemplo del escarabajo de la patata de Colorado, tienen intestinos
medios ligeramente ácidos, y las cisteína-proteasas
proporcionan la principal actividad proteolítica (Wolfson y Mudock,
1990, J. Chem. Ecol. 16:1089-1102). Más
precisamente, Thie y Houseman (1990, Insect Biochem.
20:313-318) identificaron y caracterizaron las
cisteína-proteasas, catepsinas B y H y la
aspartil-proteasa, catepsina D en el escarabajo de
la patata de Colorado. Gillekin et al., (1992,
Arch. Insect Biochem. Physiol. 19:285-298)
caracterizaron la actividad proteolítica en los intestinos de las
larvas del gusano de la raíz del maíz del oeste y encontraron 15,
proteasas principalmente cisteína-proteasas. Hasta
la descripción en esta invención, no existe ningún informe que
indique que la serina-proteasa, catepsina G, existe
en el gusano de la raíz del maíz del oeste. La diversidad y
diferentes niveles de actividad de las proteasas del intestino de
los insectos pueden influenciar la sensibilidad de un insecto a una
toxina Bt particular.
Durante los últimos cinco años se han descrito
muchas nuevas y novedosas cepas Bt y
\delta-endotoxinas con actividades biológicas
mejoradas o nuevas incluyendo cepas que son activas contra nemátodos
(Patente Europea 0517367A1). Sin embargo, relativamente muy pocas
de estas cepas y toxinas tienen actividad contra los insectos
coleópteros. Además, ninguna de las
\delta-endotoxinas activas contra coleópteros, por
ejemplo Cry3A, Cry3B, Cry3C, Cry7A, Cry8A, Cry8B y Cry8C, tiene
suficiente toxicidad oral contra el gusano de la raíz del maíz para
proporcionar un adecuado control del campos si son administradas,
por ejemplo, a través de microbios o plantas transgénicas. Por lo
tanto, es necesario explorar otros enfoques para producir nuevas
toxinas activas contra el gusano de la raíz del maíz.
A medida que se ha obtenido más conocimiento con
respecto a la función de las \delta-endotoxinas,
han aumentados los intentos para manipular las
\delta-endotoxinas de modo que tengan nuevas
actividades. La manipulación por ingeniería genética de las
\delta-endotoxinas tuvo más posibilidades al
resolverse la estructura tridimensional de Cry3A en1991 (Li et
al., 1991, Nature 353:815-821). La
proteína tiene tres dominios estructurales: el dominio I
N-terminal con los residuos 1-290,
consiste en 7 hélices alfa, el dominio II con los residuos
291-500, contiene tres láminas beta y el dominio III
C-terminal con los residuos 501-644,
es un sándwich beta. En base a esta estructura, se ha formulado la
hipótesis con respecto a la relación de estructura/función de las
\delta-endotoxinas. Generalmente se cree que el
dominio I es principalmente responsable de la formación de los
poros en la membrana intestinal del insecto (Gazit y Shai, 1993,
Appl. Environ. Microbiol. 57:2816-1820), el
dominio II es principalmente responsable de la interacción con el
receptor intestinal (Ge et al., 1991, J. Biol. Chem.
32:3429-3436) y que el dominio III está muy
probablemente implicado en la estabilidad de la proteína. (Li et
al., 1991, supra), así como también que tiene un impacto
regulador sobre la actividad del canal iónico (Chen et al.,
1993, PNAS 90:9041-9045).
Las \delta-endotoxinas activas
en lepidópteros han sido manipuladas genéticamente en intentos para
mejorar la actividad específica o para ampliar el espectro de
actividad insecticida. Por ejemplo, el dominio de especificidad
para la polilla de los estigmas (Bombyx mori) de Cry1Aa, se
traspasó a Cry1Ac, impartiendo de esta manera una nueva actividad
insecticida a la proteína quimérica resultante (Ge et al.,
1989, PNAS (86:4037-4041). También Bosch
et al. 1998 (Patente de EE.UU. 5.736.131), crearon una nueva
toxina activa contra lepidópteros mediante el reemplazamiento del
dominio III de Cry1E por el dominio III de Cry1C produciendo de esta
manera la toxina híbrida Cry1E-Cry1C con un
espectro más amplio de actividad en lepidópteros.
Se ha informado sobre varios intentos de
manipulación genética de las \delta-endotoxinas
activas en coleópteros. Van Rie et al., 1997, (Patente de
EE.UU. nº 5.659.123) manipularon la Cry3A reemplazando
aleatoriamente aminoácidos, que se consideraban importantes para la
accesibilidad al disolvente, en el dominio II con el aminoácido
alanina. Varios de estos reemplazamientos aleatorios confinados al
dominio II de unión al receptor estuvieron implicados en el aumento
de la toxicidad del gusano de la raíz del maíz del oeste. Sin
embargo, otros han demostrado que algunos reemplazamientos con
alanina en el dominio II de Cry3A dan como resultado la
interrupción de la unión del receptor o inestabilidad estructural
(Wu y Dean, 1996, J. Mol. Biol. 255:628-640).
English et al., 1999, (publicación de solicitud de patente
internacional No. WO 99/31248) describieron sustituciones de
aminoácidos en Cry3Bb que causaban aumentos en la toxicidad para el
gusano de la raíz del maíz del sur y del oeste. Sin embargo, de los
35 mutantes de Cry3Bb mencionados, únicamente tres, con mutaciones
principalmente en el dominio II, y en la interfase dominio
II-dominio I, fueron activos contra el gusano de la
raíz del maíz del oeste. Además, las diferencias de toxicidad de las
Cry3Bb de tipo natural contra el gusano de la raíz del maíz del
oeste en los mismos ensayos, fueron superiores que cualquiera de las
diferencias entre las toxinas Cry3Bb mutadas y las Cry3Bb de tipo
natural. Por lo tanto, las mejoras en la toxicidad de los mutantes
Cry3Bb parecen estar confinadas principalmente al gusano de la raíz
del maíz del sur.
Sigue existiendo la necesidad de diseñar nuevos
y más eficaces agentes para el control de plagas que proporcionen
un beneficio económico para los agricultores y que sean
ambientalmente aceptables. En particular se necesitan toxinas Cry3A
modificadas que controlen el gusano de la raíz del maíz del oeste,
que es la principal plaga del maíz en los Estados Unidos, que sean
o que puedan ser resistentes a los agentes de control de insectos
existentes. Además, son necesarios agentes cuya aplicación minimice
la carga sobre el ambiente, tal como a través de plantas
transgénicas.
En vista de estas necesidades, es un objeto de
la presente invención proporcionar nuevas secuencias de ácidos
nucleicos que codifiquen toxinas Cry3A modificadas que tengan mayor
toxicidad para el gusano de la raíz del maíz. Mediante la inserción
de un sitio de reconocimiento de proteasas, que es reconocido por la
proteasa intestinal de un insecto diana en por lo menos una
posición de la toxina Cry3A, de acuerdo con la presente invención,
se diseña una toxina Cry3A modificada que tiene una toxicidad
significativamente superior, particularmente para el gusano de la
raíz del maíz del oeste y del norte. La invención se refiere
adicionalmente a la nuevas toxinas Cry3A modificadas resultantes de
la expresión de las secuencias de ácidos nucleicos, y a las
composiciones y formulaciones que contienen las toxinas Cry3A
modificadas, que son capaces de inhibir la capacidad de las plagas
de insectos para sobrevivir, crecer y reproducirse, o de limitar el
daño relacionado con los insectos o la pérdida de plantas de
cultivo. La invención se refiere además a un método de preparación
de toxinas Cry3A modificadas y a métodos de uso de las secuencias
de ácidos nucleicos de cry3A modificadas, por ejemplo en
microorganismos para controlar insectos o en plantas transgénicas
para conferir protección contra el deterioro causado por los
insectos, y a un método de uso de las toxinas Cry3A modificadas, y a
las composiciones y formulaciones que comprenden las toxinas Cry3A
modificadas, por ejemplo aplicando las toxinas o composiciones o
formulaciones de Cry3A modificadas a zonas infestadas por insectos,
o para tratar profilácticamente plantas o zonas susceptibles a los
insectos con el fin de conferir protección contra las plagas de
insectos.
Las nuevas toxinas Cry3A modificadas descritas
en la presente invención, son muy activas contra los insectos. Por
ejemplo, las toxinas Cry3A modificadas de la presente invención
pueden usarse para controlar plagas de insectos económicamente
importantes, tales como el gusano de la raíz del maíz del oeste
(Diabrotica virgifera virgifera) y el gusano de la raíz del
maíz del norte (D. longicornis barberi). Las toxinas Cry3A
modificadas pueden usarse solas o en combinación con otras
estrategias para el control de insectos, para conferir una eficacia
de control máxima de las plagas con un mínimo impacto ambiental.
De acuerdo con un aspecto, la presente invención
proporciona una molécula de ácido nucleico aislada que comprende
una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A
modificada, en donde la toxina Cry3A modificada comprende por lo
menos un sitio de reconocimiento de proteasa adicional que no se
presenta de forma natural en una toxina Cry3A. El sitio de
reconocimiento de proteasa adicional, que es reconocido por una
proteasa intestinal de un insecto diana está insertado
aproximadamente en la misma posición que el sitio de reconocimiento
de la proteasa natural en la toxina Cry3A. La toxina Cry3A
modificada causa mayor mortalidad a un insecto diana que la
mortalidad causada por una toxina Cry3A al mismo insecto diana.
Preferiblemente la toxina Cry3A modificada causa por lo menos
aproximadamente 50% de mortalidad para un insecto diana en el cual
una toxina Cry3A causa solo aproximadamente hasta 30% de
mortalidad.
En una realización de este aspecto, la proteasa
intestinal del insecto diana se selecciona del grupo que consiste
en serina-proteasas,
cisteína-proteasas y proteasas aspárticas.
Preferiblemente las serina-proteasas de acuerdo con
esta realización incluyen catepsina G, tripsina, quimotripsina,
carboxipeptidasa, endopeptidasa y elastasa, más preferiblemente
catepsina G.
En otra realización de este aspecto, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el dominio I
o en el dominio III o tanto en el dominio I como en el dominio III
en la toxina Cry3A. Preferiblemente, el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado en el dominio I o en el dominio
III o tanto en el dominio I como en el dominio III en una posición
que reemplaza a, está adyacente a, o que está dentro del sitio de
reconocimiento de la proteasa natural.
En otra realización, el sitio de reconocimiento
de proteasa adicional está insertado en el dominio I entre los
aminoácidos que corresponden a los números de aminoácido 154 y 162
de la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado entre los aminoácidos números 154
y 162 de la SEQ ID NO: 2 o entre los aminoácidos números 107 y115
de la SEQ ID NO: 4.
En todavía otra realización, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado entre los
aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 154 y 160 de
la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado entre los aminoácidos números 154
y 160 de la SEQ ID NO: 2 o entre los aminoácidos números 107 y 113
de la SEQ ID NO: 4.
En otra realización adicional, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el dominio I
entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 154
y 158 de la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el domino I
entre los aminoácidos números 154 y 158 de la SEQ ID NO: 2 o entre
los aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4.
En otra realización, el sitio de reconocimiento
de proteasa adicional está insertado en el dominio III entre los
aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 583 y 589 de
la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado en el dominio III entre los
aminoácidos números 583 y 589 de la SEQ ID NO: 2 o entre los
aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4.
En todavía otra realización, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el dominio
III entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números
583 y 588 de la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de proteasa
adicional está insertado entre los aminoácidos números 583 y 588 de
la SEQ ID NO: 2 o entre los aminoácidos números 536 y 541 de la SEQ
ID NO: 4.
En todavía otra realización el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el dominio
III entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números
587 y 588 de la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de proteasa
adicional está insertado en el dominio III entre los aminoácidos
números 587 y 588 de la SEQ ID NO: 2 o entre los aminoácidos
números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4.
En una realización, el sitio de reconocimiento
de proteasa adicional está insertado en el dominio I y en el
dominio III de la toxina Cry3A no modificada. Preferiblemente, el
sitio de reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el
dominio I en una posición que reemplaza o que está adyacente a un
sitio de reconocimiento de proteasa natural y en el dominio III en
una posición que está dentro, reemplaza a, o está adyacente a un
sitio de reconocimiento de proteasa natural.
En otra realización, el sitio de reconocimiento
de proteasa adicional está insertado en el dominio I entre los
aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 154 y 160 y
en el dominio III entre los aminoácidos que corresponden a los
aminoácidos números 587 y 588 de la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente,
el sitio de reconocimiento de proteasa adicional está insertado en
el dominio I entre los aminoácidos números 154 y 160 y en el dominio
III entre los aminoácidos números 587 y 588 de la SEQ ID NO: 2 o en
el dominio I entre los aminoácidos números 107 y 113 y en el
dominio III entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO:
4.
En todavía otra realización, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está situado en el dominio I
entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 154
y 158 y en el dominio III entre los aminoácidos que corresponden a
los aminoácidos números 587 y 588 de la SEQ ID NO: 2.
Preferiblemente, el sitio de reconocimiento de proteasa adicional
está insertado en el dominio I entre los aminoácidos números 154 y
158 y en el dominio III entre los aminoácidos números 587 y 588 de
la SEQ ID NO: 2 o en el dominio I entre los aminoácidos números 107
y 111 y en el dominio III entre los aminoácidos números 540 y 541 de
la SEQ ID NO: 4.
En otra realización, el sitio de reconocimiento
de proteasa adicional está situado en el dominio I entre los
aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 154 y 158 y
en el dominio III entre los aminoácidos que corresponden a los
aminoácidos números 583 y 588 de la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente,
el sitio de reconocimiento de proteasa adicional está insertado en
el dominio I entre los aminoácidos números 154 y 158 y en el dominio
III entre los aminoácidos números 583 y 558 de la SEQ ID NO: 2 o en
el dominio I entre los aminoácidos números 107 y 111 y en el
dominio III entre los aminoácidos números 536 y 541 de la SEQ ID NO:
4.
En una realización preferida, la molécula de
ácido nucleico aislada de la presente invención comprende los
nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 6, los
nucleótidos 1-1806 de la SEQID NO: 8, los
nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 10, los
nucleótidos 1-1794 de la SEQ ID NO: 12, los
nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 14, los
nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 16, los
nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 18 o los
nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 20.
En otra realización preferida, la molécula de
ácido nucleico aislada de la invención codifica una toxina Cry3A
modificada que comprende la secuencia de aminoácidos indicada en las
SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID
NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19 o la SEQ ID NO: 21.
De acuerdo con una realización de la invención,
la molécula de ácido nucleico aislada codifica una toxina Cry3A
modificada que es activa contra un insecto coleóptero.
Preferiblemente, la toxina Cry3A modificada tiene actividad contra
el gusano de la raíz del maíz del oeste.
La presente invención proporciona un gen
quimérico que comprende una secuencia promotora heteróloga unida
operativamente a la molécula de ácido nucleico de la invención. La
presente invención proporciona también un vector recombinante que
comprende dicho gen quimérico. Además, la presente invención
proporciona una célula hospedante no humana transgénica, tal como
un gen quimérico. Una célula hospedante transgénica de acuerdo con
este aspecto de la invención puede ser una célula bacteriana o una
célula vegetal, preferiblemente, una célula vegetal. La presente
invención proporciona además una planta transgénica que comprende
dicha célula vegetal. Una planta transgénica de acuerdo con este
aspecto de la invención puede ser sorgo, trigo, girasol, tomate,
patata, cultivo de coles, algodón, arroz, soja, remolacha azucarera,
caña de azúcar, tabaco, cebada, colza de semilla oleaginosa o maíz,
preferiblemente maíz. La presente invención proporciona también
semillas del grupo de plantas transgénicas que consisten en sorgo,
trigo, girasol, tomate, patata, cultivos de col, algodón, arroz,
soja, remolacha azucarera, caña de azúcar, tabaco, cebada, colza de
semilla oleaginosa y maíz. En una realización particularmente
preferida, la semilla es de una planta transgénica de maíz. En otro
aspecto, la presente invención proporciona toxinas producidas por
la expresión de las moléculas de ácidos nucleicos de la presente
invención. En una realización preferida, la toxina se produce
mediante la expresión de la molécula de ácido nucleico que
comprende los nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 6,
los nucleótidos 1-1806 de la SEQ ID NO: 8, los
nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 10, los
nucleótidos 1-1794 de la SEQ ID NO: 12, los
nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 14, los
nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 16, los
nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 18 o los
nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 20.
En otra realización, las toxinas de la invención
son activas contra insectos coleópteros, preferiblemente contra el
gusano de la raíz del maíz del oeste.
En una realización una toxina de la presente
invención comprende la secuencia de aminoácidos indicada en SEQ ID
NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO. 13, SEQ ID NO: 15,
SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19 o la SEQ ID NO: 21.
La presente invención proporciona también una
composición que comprende una cantidad eficaz controladora de
insectos de una toxina de acuerdo con la invención.
En otro aspecto, la presente invención
proporciona un método para producir una toxina que se activa contra
insectos, que comprende: (a) obtener una célula hospedante que
comprende un gen quimérico, que comprende por sí mismo una
secuencia promotora heteróloga unida operativamente a la molécula de
ácido nucleico de la invención: y (b) expresar la molécula de ácido
nucleico en la célula hospedante transgénica, lo cual da como
resultado por lo menos una toxina que es activa contra
insectos.
En otro aspecto, la presente invención
proporciona un método para producir una planta transgénica
resistente a insectos, que comprende introducir una molécula de
ácido nucleico de la invención en la planta transgénica, en donde
la molécula de ácido nucleico es expresable en la planta transgénica
en una cantidad eficaz para controlar insectos. En una realización
preferida, los insectos son insectos coleópteros, preferiblemente
el gusano de la raíz del maíz del oeste.
En todavía un aspecto adicional, la presente
invención proporciona un método para controlar insectos, que
comprende administrar a los insectos una cantidad eficaz de una
toxina de la invención. De acuerdo con una realización, los
insectos son insectos coleópteros, preferiblemente el gusano de la
raíz del maíz del oeste. Preferiblemente, la toxina se administra a
los insectos oralmente. En una realización preferida, la toxina se
administra oralmente a través de una planta transgénica que
comprende una secuencia de ácido nucleico que expresa una toxina de
la presente invención.
Asimismo se proporciona mediante la presente
invención un método para preparar una toxina Cry3A modificada, que
comprende: (a) obtener un gen cry3A de toxina que codifica
una toxina Cry3A; (b) identificar una proteasa intestinal de un
insecto diana; (c) obtener una secuencia de nucleótidos que codifica
un secuencia de reconocimiento para la proteasa intestinal; (d)
insertar la secuencia de nucleótidos de (c) en el dominio I o en el
dominio III o tanto en el dominio I como en el dominio II en una
posición que reemplaza a, está dentro de, o está adyacente a, una
secuencia de nucleótidos que codifica un sitio de reconocimiento de
proteasa natural en un gen cry3A de toxina, creando de esta
manera un gen cry3A de toxina modificado; (e) insertar el
gen de toxina cry3A modificado en un casete de expresión; (f)
expresar el gen cry3A de toxina modificado en una célula
hospedante no humana lo cual da como resultado que la célula
hospedante produzca una toxina Cry3A modificada; y (g) valorar
biológicamente la toxina Cry3A modificada contra un insecto diana,
con la cual la toxina Cry3A modificada causa mayor mortalidad al
insecto diana que la mortalidad causada por una toxina Cry3A. En
una realización preferida, la toxina Cry3A modificada causa por lo
menos aproximadamente 50% de mortalidad al insecto diana cuando la
toxina Cry3A causa hasta aproximadamente 30% de mortalidad.
La presente invención proporciona también un
método para controlar insectos en donde la planta transgénica
comprende además una segunda secuencia de ácido nucleico o grupos de
secuencias de ácidos nucleicos que codifican un segundo principio
plaguicida. Las segundas secuencias de ácidos nucleicos
particularmente preferidas son las que codifican una
\delta-endotoxina, las que codifican una toxina
proteínica insecticida vegetativa, descrita en las Patentes de
EE.UU. 5.849.870 y 5.877.012, que se incorporan como referencia en
la presente memoria, o las que codifican una vía para la producción
de un principio plaguicida no proteínico.
Un aspecto más de la presente invención es la
creación de un método para mutagenizar una molécula de ácido
nucleico de acuerdo con la presente invención, en donde la molécula
de ácido nucleico ha sido escindida en poblaciones de fragmentos
bicatenarios aleatorios de un tamaño deseado, que comprende: (a)
añadir a la población de fragmentos bicatenarios aleatorios uno o
más oligonucleótidos monocatenarios o bicatenarios, en donde los
oligonucleótidos comprenden cada uno una zona de identidad y una
zona de heterología para un molde de polinucleótido bicatenario;
(b) desnaturalizar la mezcla resultante de fragmentos bicatenarios
aleatorios y oligonucleótidos en fragmentos monocatenarios; (c)
incubar la población resultante de fragmentos monocatenarios con
polimerasa en condiciones que dan como resultado la reasociación de
los fragmentos monocatenarios en las zonas de identidad para formar
pares de fragmentos reasociados, siendo las zonas de identidad
suficientes para que un miembro del par cebe (inicie) la
replicación del otro, formando de esta manera un polinucleótido
bicatenario mutagenizado; y (d) repetir la segunda y tercera etapas
por lo menos dos ciclos más, en donde la mezcla resultante en la
segunda etapa de un ciclo posterior incluye el polinucleótido
bicatenario mutagenizado de la tercera etapa del ciclo previo, y en
donde el ciclo posterior forma un polinucleótido bicatenario
adicional mutagenizado.
Otros aspectos y ventajas de la presente
invención resultarán evidentes para los expertos en la técnica a
partir de un estudio de la siguiente descripción de la invención y
de los ejemplos no limitativos.
- SEQ ID NO: 1
- es la región codificadora del gen cry3A natural.
- SEQ ID NO: 2
- es la secuencia de aminoácidos de la toxina Cry3A codificada por el gen cry3A natural.
- SEQ ID NO: 3
- es la región codificadora del gen cry3A del maíz optimizada que comienza en el nucleótido 144 de la región codificadora del gen cry3A natural.
- SEQ ID NO: 4
- es la secuencia de aminoácidos de la toxina Cry3A codificada por el gen cry3A del maíz optimizado.
- SEQID NO: 5
- es la secuencia de nucleótidos de pCIB6850.
- SEQ ID NO: 6
- es la secuencia codificadora del gen cry3A054 del maíz modificada y optimizada.
- SEQ ID NO: 7
- es la secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 6.
- SEQ ID NO: 8
- es la secuencia codificadora del gen cry3A055 del maíz modificada y optimizada.
- SEQ ID NO: 9
- es la secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 8
- SEQ ID NO: 10
- es la secuencia codificadora del gen cry3A085 del maíz modificada y optimizada.
- SEQ ID NO: 11
- es la secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 10.
- SEQ ID NO: 12
- es la secuencia codificadora del gen cry3A082 del maíz modificada y optimizada.
- SEQ ID NO: 13
- es la secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 12.
- SEQ ID NO: 14
- es la secuencia codificadora del gen cry3A058 del maíz modificada y optimizada.
\newpage
- SEQ ID NO: 15
- es la secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 14.
- SEQ ID NO: 16
- es la secuencia codificadora del gen cry3A057 del maíz modificada y optimizada.
- SEQ ID NO: 17
- es la secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 16.
- SEQ ID NO: 18
- es la secuencia codificadora del gen cry3AO56 del maíz modificada y optimizada.
- SEQ ID NO: 19
- es la secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos de la SEQ ID NO: 18.
- SEQ ID NO: 20
- es la secuencia codificadora del gen cry3A083 del maíz modificada y optimizada.
- SEQ ID NO: 21
- es la secuencia de aminoácidos codificada por la secuencia de nucleótidos de la SEQID NO: 20.
- SEQ ID NOS: 22-34
- son los cebadores de PCR útiles en la presente invención.
- SEQ ID NO: 35
- es una secuencia de aminoácidos que comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G.
- SEQ ID NO: 36
- es una secuencia de aminoácidos que comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G.
- SEQ ID NO: 37
- es una secuencia de aminoácidos que comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G
- SEQ ID NO: 38
- es una secuencia de aminoácidos que comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
Por razones de claridad, ciertos términos usados
en la memoria se definen y presentan de la manera siguiente:
"Actividad" de las toxinas Cry3A
modificadas de la invención significa que las toxinas Cry3A
modificadas funcionan como agente oralmente activo para el control
de insectos, tienen un efecto tóxico, o son capaces de impedir o
interrumpir la alimentación del insecto, lo cual puede o no causar
la muerte del insecto. Cuando una toxina Cry3A modificada de la
invención se administra al insecto, el resultado es típicamente la
muerte del insecto, o el insecto deja de alimentarse de la fuente
que hace que la toxina Cry3A modificada esté disponible para el
insecto.
"Adyacente a"- De acuerdo con la presente
invención, un sitio de reconocimiento de proteasa adicional está
"adyacente a" un sitio de reconocimiento de proteasa natural
cuando el sitio de reconocimiento de proteasa adicional está dentro
de cuatro residuos, preferiblemente dentro de tres residuos, más
preferiblemente dentro de dos residuos, y aún más preferiblemente
dentro de un residuo de un sitio de reconocimiento de proteasa
natural. Por ejemplo, un sitio de reconocimiento de proteasa
adicional insertado entre Pro-154 y
Arg-158 de la secuencia de aminoácidos deducida de
una toxina Cry3A (SEQ ID NO: 2) está "adyacente" al sitio de
reconocimiento de tripsina natural ubicado entre
Arg-158 y Asn-159 de la secuencia de aminoácidos deducida de la toxina Cry3A (SEQ ID NO: 2).
Arg-158 y Asn-159 de la secuencia de aminoácidos deducida de la toxina Cry3A (SEQ ID NO: 2).
La frase "aproximadamente la misma
posición", tal como se usa en la presente memoria para describir
el lugar en donde está insertado el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional en una toxina Cry3A en relación a un sitio de
reconocimiento de proteasa natural, significa que el lugar está como
máximo cuatro residuos lejos de un sitio de reconocimiento de
proteasa natural. El lugar puede estar también alejado tres o dos
residuos de un sitio de reconocimiento de proteasa natural. El
lugar puede estar también un residuo alejado de un sitio de
reconocimiento de proteasa natural. "Aproximadamente la misma
posición" puede significar también que el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado dentro de un
sitio de reconocimiento de proteasa natural.
"Asociada con/unida operativamente" se
refiere a dos secuencias de ácido nucleico que están relacionadas
física o funcionalmente. Por ejemplo, una secuencia de DNA
promotora o reguladora se dice que está "asociada con" una
secuencia de DNA que codifica un RNA o una proteína si las dos
secuencias están unidas operativamente, o están situadas de manera
que la secuencia de DNA reguladora afectará el nivel de expresión de
la secuencia de DNA estructural o codificadora.
Un "gen quimérico" o "construcción
quimérica" es una secuencia de ácido nucleico recombinante en la
cual una secuencia de ácido nucleico promotora o reguladora está
unida operativamente a, o asociada con, una secuencia de ácido
nucleico que codifica un RNAm o que se expresa como una proteína, de
modo que la secuencia de ácido nucleico reguladora es capaz de
regular la transcripción o expresión de la secuencia codificadora de
ácido nucleico asociada. La secuencia de ácido nucleico reguladora
del gen quimérico no está normalmente unida operativamente a la
secuencia de ácido nucleico asociada tal como se encuentra en la
naturaleza.
\newpage
Una "secuencia codificadora" es una
secuencia de ácido nucleico que es transcrita en RNA, tal como RNAm,
rRNA, tRNA, snRNA, RNA con sentido o RNA antisentido.
Preferiblemente el RNA es luego traducido en un organismo para
producir una proteína.
"Controlar" insectos significa inhibir, a
través de un efecto tóxico, la capacidad de una plaga de insectos
para sobrevivir, desarrollarse, alimentarse y/o reproducirse, o para
limitar el deterioro relacionado con los insectos o la pérdida de
plantas de cultivo.
"Controlar" insectos puede significar o no
la muerte de los insectos, aunque preferiblemente significa la
muerte de los insectos.
"Corresponder a": en el contexto de la
presente invención, "corresponder a" significa que cuando las
secuencias de aminoácidos de las
\delta-endotoxinas Cry3A variantes están alineadas
una con la otra, los aminoácidos que "corresponden a" ciertas
posiciones enumeradas en la presente invención son los que están
alineados con estas posiciones en la toxina Cry3A (SEQ ID NO: 2),
pero no están necesariamente en estas posiciones numéricas exactas
en relación a la secuencia de aminoácidos de Cry3A particular de la
invención. Por ejemplo, el gen cry3A del maíz optimizado
(SEQ ID NO: 3) de la invención codifica una toxina Cry3A (SEQ ID NO:
4) que comienza en Met-48 de la toxina Cry3A (SEQ
ID NO: 2) codificada por el gen cry3A natural (SEQ ID NO: 1).
Por lo tanto, de acuerdo con la presente invención, los aminoácidos
números 107-115, incluyendo todos los números entre
los mismos, y 536-541, incluyendo todos los números
entre los mismos, de la SEQID NO: 4 corresponden a los aminoácidos
números 154-163, y todos los números entre los
mismos, y 583-588, y todos los números entre los
mismos, respectivamente, de la SEQID NO: 2.
Una "toxina Cry3A", tal como se usa en la
presente memoria, se refiere a una proteína activa contra
coleópteros de (Bt) (Sekar et al., 1987, Proc, Nalt.
Acad. Sci. 84:7036-7040), de Bacillus
thurigiensis variedad tenebrionis de aproximadamente 73
kDa (Kreig et al., 1983, Z. Angew. Entomol.
96:500-508), por ejemplo la SEQ ID NO: 2, así como
también cualesquiera variantes truncadas de peso molecular inferior,
derivable de una toxina Cry3A, por ejemplo la SEQ ID NO: 4, y que
retiene sustancialmente la misma toxicidad que la toxina Cry3A. Las
variantes de menor peso molecular pueden obtenerse mediante la
escisión de la proteasa de sitios de reconocimiento de la proteasa
natural de la toxina Cry3A o mediante un segundo codón de iniciación
de la traducción en el mismo marco que el codón de iniciación de
traducción que codifica la toxina Cry3A de 73 kDa. La secuencia de
aminoácidos de una toxina Cry3A y sus variantes de peso molecular
inferior pueden hallarse en una toxina que se presenta de forma
natural en Bt. Una toxina Cry3A puede estar codificada por un gen Bt
natural, tal como la SEQ ID NO: 1 o por una secuencia codificadora
sintética, tal como en la SEQ ID NO: 3. Una "toxina Cry3A2" no
tiene sitios de reconocimiento de proteasa adicionales con respecto
a los sitios de reconocimiento de proteasa que se presentan
naturalmente en la toxina Cry3A. Una toxina Cry3A puede aislarse,
purificarse o expresarse en un sistema heterólogo.
Un "gen cry3A", tal como se usa en
la presente memoria, se refiere a la secuencia de nucleótidos de la
SEQID NO: 1 ola SEQ ID NO: 3. Un gen cry3A(Sekar et
al., 1987, Proc. Natl. Acad. Sci.
87:7036-7040) puede presentarse de forma natural,
tal como el que se encuentra en Bacillus thuringiensis
variedad tenebrionis (Kreig et al., 1983, Z.
Angew. Entomol. 96:500-508), o puede ser
sintético y codifica una toxina Cry3A. El gen cry3A de esta
invención puede denominarse un gen cry3A natural, tal como en
la SEQ ID NO: 1 o como el gen cry3A del maíz optimizado, tal
como en la SEQ ID NO: 3.
"Administrar" una toxina significa que la
toxina entra en contacto con un insecto, lo cual da como resultado
un efecto tóxico y control del insecto. La toxina puede
administrarse de muchas formas reconocidas, por ejemplo, oralmente
por ingestión por el insecto o por contacto con el insecto a través
de la expresión en plantas transgénicas, en una(s)
composición(es) de proteínas formuladas, en una(s)
composición(es) de proteína rociable(s), en una
matriz para cebo, o en cualquier otro sistema de administración de
toxinas reconocido en la técnica.
"Cantidad eficaz controladora de insectos"
significa la concentración de toxina que inhibe, a través de un
efecto tóxico, la capacidad de los insectos para sobrevivir,
desarrollarse, alimentarse y/o reproducirse, o para limitar el daño
relacionado con los insectos o la pérdida de plantas de cultivo.
"Cantidad eficaz controladora de insectos" puede o no puede
significar matar los insectos, aunque preferiblemente significa
matar los insectos.
"Casete de expresión" tal como se usa en la
presente memoria significa una secuencia de ácido nucleico que es
capaz de dirigir la expresión de una secuencia de nucleótidos
particular en una célula hospedante apropiada, que comprende un
promotor unido operativamente a la secuencia de nucleótidos de
interés que a su vez está unida operativamente a señales de
terminación. Típicamente también comprende las secuencias requeridas
para una correcta traducción de la secuencia de nucleótidos. El
casete de expresión que comprende la secuencia de nucleótidos de
interés puede ser quimérico, lo cual significa que por lo menos uno
de sus componentes es heterólogo con respecto a por lo menos uno de
sus otros componentes. El casete de expresión puede ser también
natural pero que se ha obtenido en una forma recombinante útil para
la expresión heteróloga. Típicamente, sin embargo, el casete de
expresión es heterólogo con respecto al hospedante, es decir, la
secuencia particular de ácido nucleico del casete de expresión no
se presenta de forma natural en la célula hospedante y debe haber
sido introducida en la célula hospedante o en un antecesor de la
célula hospedante mediante un episodio de transformación. La
expresión de la secuencia de nucleótidos en el casete de expresión
puede estar bajo el control de un promotor constitutivo o de un
promotor inducible que inicia la transcripción únicamente cuando la
célula hospedante es expuesta a algún estímulo externo particular.
En el caso de un organismo multicelular, tal como una planta, el
promotor puede ser también específico para un tejido particular u
órgano o etapa de desarrollo.
Un "gen" es una región definida que está
situada dentro de un genoma y que, además de la secuencia de ácido
nucleico codificadora antes mencionada, comprende otras secuencias
de ácido nucleico principalmente reguladoras responsables del
control de la expresión, es decir de la transcripción y de la
traducción de la porción codificadora. Un gen puede comprender
también otras secuencias 5' y 3' no traducidas y secuencias de
terminación. Otros elementos que pueden estar presentes son, por
ejemplo, intrones.
"Gen de interés" se refiere a cualquier gen
que, cuando es transferido a una planta, confiere a la planta una
característica deseada, tal como resistencia a antibióticos,
resistencia a virus, resistencia a insectos, resistencia a
enfermedades o resistencia a otras plagas, tolerancia a los
herbicidas, valor nutricional mejorado, mejor rendimiento en un
proceso industrial o capacidad reproductiva alterada. El "gen de
interés" puede ser también uno que es transferido a plantas para
la producción en la planta de metabolitos o enzimas comercialmente
valiosos.
Una "proteasa intestinal" es una proteasa
que se encuentra naturalmente en el tracto digestivo de un insecto.
Esta proteasa usualmente está implicada en la digestión de las
proteínas ingeridas.
Una secuencia de ácido nucleico
"heteróloga" es una secuencia de ácido nucleico que no está
naturalmente asociada con una célula hospedante dentro de la cual
es introducida, incluyendo copias múltiples que no están presentes
en forma natural de una secuencia natural de ácido nucleico.
Una secuencia de ácido nucleico "homóloga"
es una secuencia de ácido nucleico naturalmente asociada con una
célula hospedante dentro de la cual es introducida.
"Recombinación homóloga" es el intercambio
recíproco de fragmentos de ácido nucleico entre moléculas de ácido
nucleico homólogas.
"Insecticida" se define como una actividad
biológica tóxica capaz de controlar insectos, preferiblemente
exterminándolos.
Una secuencia de ácido nucleico es
"iso-codificadora con" una secuencia de ácido
nucleico de referencia cuando la secuencia de ácido nucleico
codifica un polipéptido que tiene la misma secuencia de aminoácidos
que el polipéptido codificado por la secuencia de ácido nucleico de
referencia.
Una molécula de ácido nucleico "aislada" o
una toxina aislada es una molécula de ácido nucleico o toxina que,
por la acción del hombre, existe fuera de su ambiente natural y por
lo tanto no es un producto de la naturaleza. Una molécula de ácido
nucleico o toxinaaislada puede existir en una forma purificada o
puede existir en un ambienten natural, tal como, por ejemplo, una
célula hospedante recombinante.
Una "toxina Cry3A modificada" de esta
invención, se refiere a una toxina derivada de Cry3A que tiene por
lo menos un sitio de reconocimiento de proteasa adicional que es
reconocido por una proteasa intestinal de un insecto diana, que no
está presente naturalmente en una toxina Cry3A. Una toxina Cry3A
modificada no existe de forma natural y, por la acción del hombre,
comprende una secuencia de aminoácidos que no es idéntica a una
toxina natural que se encuentra en Bacillus thuringiensis. La
toxina Cry3A modificada produce una mortalidad más elevada de un
insecto diana que la mortalidad causada por una toxina Cry3A al
mismo insecto diana.
Un "gen cry3A modificado" de acuerdo
con esta invención, se refiere a un gen derivado de cry3A que
comprende la secuencia codificadora de por lo menos un sitio de
reconocimiento de proteasa adicional que no existe de forma natural
en el gen cry3A no modificado. El gen cry3A modificado
puede derivar de un gen cry3A natural o de un gen
cry3A sintético.
Un "sitio de reconocimiento de proteasa
natural". es un lugar dentro de la toxina Cry3A que es escindido
mediante una proteasa que no procede de un insecto o mediante una
proteasa o extracto intestinal de una especie de insectos
susceptible a la toxina Cry3A. Por ejemplo, un sitio de
reconocimiento de una proteasa natural, reconocido por tripsina y
proteasas que se encuentran en un extracto intestinal de insecto
susceptible, existe entre Arg-158 y
Asn-159 de la secuencia de aminoácidos de la toxina
Cry3A deducida (SEQ ID NO: 2). Los sitios de reconocimiento de
proteasa naturales, reconocidos por quimotripsina, existen entre
His-161 y Ser-162, así como también
entre Tyr-587 y Tyr-588 de la
secuencia de aminoácidos de la toxina Cry3A deducida (SEQ ID NO:
2).
Una "molécula de ácido nucleico" o
"secuencia de ácido nucleico" es un segmento lineal de un DNA o
RNA monocatenario o bicatenario que puede aislarse de cualquier
fuente. En el contexto de la presente invención, la molécula de
ácido nucleico es preferiblemente un segmento de DNA.
Una "planta" es cualquier planta en
cualquier de desarrollo, particularmente una planta de semilla.
Una "célula vegetal" es una unidad
estructural y fisiológica de una planta, que comprende un
protoplasto y una pared celular. La célula vegetal puede tener la
forma de una sola célula aislada o de una célula cultivada, o puede
formar parte de una unidad organizada superior, tal como por ejemplo
tejido de planta, órgano de planta, o una planta entera.
"Cultivo de célula vegetales" significa
cultivo de unidades de plantas, tales como por ejemplo,
protoplastos, células de cultivo celular, células de tejidos de
plantas, polen, tubos de polen, óvulos, sacos embrionarios, cigotos
y embriones en varias etapas de desarrollo.
"Material vegetal" se refiere a hojas,
tallos, raíces, flores o partes de flores, frutos, polen, óvulos,
cigotos, semillas, esquejes, cultivos de células o tejidos, o
cualquier otra parte o producto de una planta.
"Un órgano vegetal" es una parte distinta y
visiblemente estructurada y diferenciada de un vegetal, tal corno
una raíz, un tallo, una hoja, un brote de flor o un embrión.
"Tejido vegetal" tal como se usa en la
presente memoria se refiere a un grupo de células vegetales
organizadas en una unidad estructural y/o funcional. Incluye
cualquier tejido de una planta in planta o de cultivo. Este
término incluye, pero sin limitación, plantas enteras, órganos
vegetales, semillas de vegetales, cultivos de tejidos y cualquier
grupo de células vegetales organizadas en unidades estructurales y/o
funcionales. El uso de este término conjuntamente con, o en
ausencia de cualquier tipo específico de tejido vegetal, tal como
se enumera anteriormente o en otra parte abarcado por esta
definición no pretende excluir cualquier otro tipo de tejido
vegetal.
Un "promotor" es una secuencia de DNA no
traducida situada hacia el extremo 5' de la región codificadora que
contiene el sitio de unión para la RNA-polimerasa e
inicia la transcripción del DNA. La región promotora puede incluir
también otros elementos que actúan como reguladores de la expresión
génica.
Un "protoplasto" es una célula vegetal
aislada sin pared celular o únicamente con partes de la pared
celular.
"Elementos reguladores" se refiere a las
secuencias implicadas en controlar la expresión de una secuencia de
nucleótidos. Los elementos reguladores comprenden un promotor unido
operativamente a la secuencia de nucleótidos de interés y a las
señales de terminación. Típicamente abarcan las secuencias
necesarias para una adecuada traducción de la secuencia de
nucleótidos.
"Reemplaza" a un sitio de reconocimiento de
proteasa natural - De acuerdo con la presente invención, un sitio
de reconocimiento de proteasa adicional "reemplaza" a un sitio
de reconocimiento de proteasa natural cuando la inserción del sitio
de reconocimiento de proteasa adicional elimina el sitio de
reconocimiento de proteasa natural. Por ejemplo, un sitio de
reconocimiento de proteasa adicional entre Pro-154 y
Pro-160 de la secuencia de aminoácidos deducida de
una toxina Cry3A (SEQ ID NO: 2) que elimina los residuos
Arg-158 y Asn-159 "reemplaza"
al sitio de reconocimiento de tripsina natural situado entre
Arg-158 y Asn-159 de la secuencia de
aminoácidos deducida de la toxina Cry3A (SEQ ID NO: 2).
"Serina-proteasas",
describe el mismo grupo de enzimas que catalizan la hidrólisis de
enlaces peptídicos covalentes usando un mecanismo basado en el
ataque nucleófilo del enlace peptídico diana mediante una serina.
Las serina-proteasas son específicas de secuencia.
Es decir, cada serina-proteasa reconoce una
sub-secuencia específica dentro de una proteína en
donde ocurre el reconocimiento enzimático.
Un "insecto diana" es una especie de plaga
de insectos que tiene muy poca o ninguna susceptibilidad a una
toxina Cry3A y se identifica porque es candidato para usar la
tecnología de la presente invención como control. Este control
puede lograrse a través de diversos medios, pero el más preferible
es a través de la expresión de las moléculas de ácido nucleico de
la invención en plantas transgénicas.
Una "proteasa intestinal del insecto diana"
es una proteasa que se encuentra en el intestino de un insecto
diana cuyo sitio de reconocimiento puede estar insertado en una
toxina Cry3A para crear una toxina Cry3A modificada de la
invención.
"Transformación" es un procedimiento para
introducir ácido nucleico heterólogo en una célula u organismo
hospedante. En particular, "transformación" significa la
integración estable de una molécula de DNA en el genoma de un
organismo de interés.
"Transformado/transgénico/recombinante" se
refiere a un organismo hospedante, tal como una bacteria o una
planta en el cual se ha introducido una molécula heteróloga de ácido
nucleico. La molécula de ácido nucleico puede estar establemente
integrada en el genoma del hospedante o la molécula de ácido
nucleico puede estar también presente como molécula
extracromosómica. Dicha molécula extracromosómica puede ser
auto-replicante. Se entiende que las células,
tejidos o plantas transformados abarcan no solamente el producto
final de un proceso de transformación, sino también su progenie
transgénica. Un hospedante "no transformado", "no
transgénico", o "no recombinante" se refiere a un organismo
de tipo natural, por ejemplo una bacteria o una planta; que no
contiene la molécula de ácido nucleico heteróloga.
"Dentro" de un sitio de reconocimiento de
proteasa natural - De acuerdo con la presente invención un sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está "dentro" de un sitio
de reconocimiento de proteasa natural cuando el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está entre el residuo de
aminoácido que viene antes y el residuo de aminoácido que viene
después del sitio de reconocimiento de proteasa natural. Por
ejemplo, un sitio de reconocimiento de proteasa adicional insertado
entre Tyr-587 y Tyr-588 de la
secuencia de aminoácidos deducida de una toxina Cry3A (SEQ ID NO:
2) está "dentro" de un sitio de reconocimiento de quimotripsina
natural situado entre Try-587 y
Tyr-588 de la secuencia de aminoácidos deducida de
la toxina Cry3A (SEQ ID NO: 2). La inserción de un sitio de
reconocimiento de proteasa adicional dentro del sitio de
reconocimiento de proteasa natural puede cambiar o no el sitio de
reconocimiento de la proteasa natural mediante una proteasa.
Los nucleótidos están indicados por sus bases
mediante las siguientes abreviaturas convencionales: adenina (A),
citosina (C), timina (T) y guanina (G). Los aminoácidos están
también indicados mediante las siguientes abreviaturas: alanina
(Ala; A), arginina (Arg; R), asparraguina (Asn; N), ácido aspártico
(Asp; D), cisteína (Cys, C), glutamina (Gln; O), ácido glutámico
(Glu; E), glicina (Gly; G), histidina (His, H), isoleucina (Ile;
1), leucina (Leu; L), lisina (Lys; K), metionina (Met; M),
fenilalanina (Phe; F), prolina (Pro; P), serina (Ser; S), treonina
(Thr; T); triptófano (Trp; W), tirosina (Tyr; Y), y valina (Val;
V).
Esta invención se refiere a secuencias de ácidos
nucleicos cry3A modificadas cuya expresión da como resultado
las toxinas Cry3A modificadas, y a la preparación y uso de las
toxinas Cry3A modificadas para controlar plagas de insectos. La
expresión de la secuencias de ácidos nucleicos cry3A modificadas dan
como resultado toxinas Cry3A modificadas que pueden usarse para
controlar insectos coleópteros, tales como el gusano de la raíz del
maíz del oeste y el gusano de la raíz del maíz del norte. Una toxina
Cry3A modificada de la presente invención comprende por lo menos un
sitio de reconocimiento de proteasa adicional que no está presente
de forma natural en una toxina Cry3A El sitio de reconocimiento de
proteasa adicional, que es reconocido por una proteasa intestinal
de un insecto diana, está insertado aproximadamente en la misma
posición que el sitio de reconocimiento de la proteasa natural en
una toxina Cry3A. La toxina Cry3A modificada produce una mortalidad
mayor para un insecto diana que la mortalidad causada por una
toxina Cry3A en el mismo insecto diana. Preferiblemente, la toxina
Cry3A modificada produce por lo menos aproximadamente 50% de
mortalidad en el insecto diana en el que una toxina Cry3A produce
hasta aproximadamente 30% de mortalidad.
En una realización preferida, la invención
comprende una molécula de ácido nucleico aislada que codifica una
toxina Cry3A modificada, en donde el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional es reconocido por la proteasa intestinal del
insecto diana, catepsina G. Se determina que la actividad de la
catepsina G está presente en el intestino del insecto diana, del
gusano de la raíz del maíz del oeste, tal como se describe en el
Ejemplo 2. Preferiblemente, la secuencia de aminoácidos sustrato,
AAPF (SEQ ID NO: 35) usada para determinar la presencia de la
actividad de la catepsina G está insertada en la toxina Cry3A de
acuerdo con la presente invención. También pueden usarse otros
sitios de reconocimiento de catepsina G de acuerdo con la presente
invención, por ejemplo, AAPM (SEQ ID NO: 36); AVPF (SEQ ID NO: 37),
PFLF (SEQ ID NO: 38) u otros sitios de reconocimiento de catepsina
G, tal como se determina mediante el método de Tanaka et al.,
1985 (Biochemistry 24:2040-2047), que se
incorpora en la presente memoria como referencia. Pueden usarse por
ejemplo sitios de reconocimiento de proteasa de otras proteasas
identificadas en un intestino de un insecto diana, por ejemplo, los
sitios de reconocimiento de proteasa reconocidos por otras
serina-proteasas, cisteína-proteasas
y proteasas aspárticas. Las serina-proteasas
preferidas abarcadas por esta realización incluyen tripsina,
quimotripsina, carboxipeptidasa, endopeptidasa y elastasa.
En otra realización preferida, la invención
abarca una molécula aislada de ácido nucleico que codifica una
toxina Cry3A modificada, en donde el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado en el dominio I o en el dominio
III o tanto en el dominio I como en el dominio III de la toxina
Cry3A. Preferiblemente, el sitio de reconocimiento de proteasa
adicional está insertado en el dominio I, dominio III o tanto
dominio I y como dominio III en una posición que reemplaza, está
adyacente a, o está dentro de, un sitio de reconocimiento de una
proteasa natural en una toxina Cry3A. Específicamente ejemplificadas
en la presente invención están las moléculas de ácido nucleico que
codifican las toxinas Cry3A modificadas que comprenden un sitio de
reconocimiento de catepsina G insertado en el dominio I, en el
dominio III o tanto en el dominio I como en el dominio III en una
posición que reemplaza a, está adyacente a, o está dentro, de un
sitio de reconocimiento de proteasa natural en la toxina Cry3A no
modificada.
Las enseñanzas específicamente ejemplificadas de
los métodos para preparar moléculas modificadas de ácido nucleico
de cry3A que codifican las toxinas Cry3A modificadas pueden
hallarse en el Ejemplo 3. Los expertos en la técnica reconocerán
que pueden usarse también otros métodos conocidos en la técnica para
insertar sitios de reconocimiento de proteasa adicionales en las
toxinas Cry3A de acuerdo con la presente invención.
En otra realización preferida, la invención
abarca una molécula de ácido nucleico aislada que codifica una
toxina Cry3A modificada en donde el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado en el dominio I entre los
aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 154 y 162 de
la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado entre los aminoácidos números 154
y 162 de la SEQ ID NO: 2 o entre los aminoácidos números 107 y 115
de la SEQ ID NO: 4. En una realización preferida, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado entre los
aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 154 y 160 de
la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado entre los aminoácidos números 154
y 160 de la SEQ ID NO: 2 o entre los aminoácidos números 107 y 113
de la SEQ ID NO: 4. Específicamente se ilustra como ejemplo en esta
memoria una molécula de ácido nucleico denominada cry3A054
(SEQ ID NO: 6), que codifica la toxina Cry3A054 modificada (SEQ ID
NO: 7) que comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G
insertado en el dominio I entre los aminoácidos números 107 y 113
de la SEQ ID NO: 4. El sitio de reconocimiento de catepsina G
reemplaza a un sitio de reconocimiento de tripsina natural y está
adyacente a un sitio de reconocimiento de quimotripsina natural.
Cuando se expresa en un hospedante heterólogo, la molécula de ácido
nucleico de la SEQ ID NO: 6 da como resultado una actividad para el
control de insectos contra el gusano de la raíz del maíz del oeste y
el gusano de la raíz del maíz del norte, que muestra que la
secuencia de ácido nucleico indicada en la SEQ ID NO: 6 es
suficiente para la actividad de dicho control de insectos.
En otra realización preferida, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el dominio I
entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 154
y 158 de la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el dominio I
entre los aminoácidos números 154 y 158 de la SEQ ID NO: 2 o entre
los aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4.
Específicamente se ilustran como ejemplo en esta memoria las
moléculas de ácido nucleico denominadas cry3A055 (SEQ ID NO:
8), que codifican la toxina Cry3A055 modificada (SEQ ID NO: 9),
cry3A085 (SEQ ID NO: 10), que codifica la toxina Cry3A085
modificada (SEQ ID NO: 11), que comprenden el sitio de
reconocimiento de catepsina G insertado en el dominio I entre los
aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4. El sitio de
reconocimiento de catepsina G está adyacente a los sitios de
reconocimiento de tripsina y quimotripsina naturales. Cuando se
expresa en un hospedante heterólogo, la molécula de ácido nucleico
de las SEQ ID NO: 8 o SEQ ID NO: 10 da como resultado una actividad
del control de insectos contra el gusano de la raíz del maíz del
oeste y el gusano de la raíz del maíz del norte, lo cual demuestra
que la secuencia de ácido nucleico indicada en la SEQ ID NO: 8 o
SEQ ID NO: 10 es suficiente para dicha actividad de control de
insectos.
En una realización preferida, la invención
abarca una molécula aislada de ácido nucleico que codifica una
toxina Cry3A modificada en donde el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado en el dominio III entre los
aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 583 y 598 de
la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de proteasa adicional
está insertado en el dominio III entre los aminoácidos números 583 y
589 de la SEQ ID NO: 2 o entre los aminoácidos números 536 y 542 de
la SEQ ID NO: 4.
En otra realización preferida, la invención
abarca una molécula de ácido nucleico aislada que codifica una
toxina Cry3A modificada en donde el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado en el dominio III entre los
aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 583 y 588 de
la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente el sitio de proteasa adicional
está insertado en el dominio III entre los aminoácidos números 583 y
588 de la SEQ ID NO: 2 o entre los aminoácidos números 536 y 541 de
la SEQ ID NO: 4. Está específicamente ejemplificada en la presente
memoria una molécula de ácido nucleico denominada cry3A082
(SEQ ID NO: 12), que codifica la toxina Cry3A082 modificada (SEQ ID
NO: 13) que comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G
insertado en el dominio III entre los aminoácidos números 536 y 541
de la SEQ ID NO: 4. El sitio de reconocimiento de catepsina G
reemplaza a un sitio de reconocimiento de quimotripsina natural.
Cuando se expresa en un hospedante heterólogo, la molécula de ácido
nucleico de la SEQ ID NO: 12 da como resultado una actividad de
control de insectos contra el gusano de la raíz del maíz del oeste
y el gusano de la raíz del maíz del norte, que demuestra que la
secuencia de ácido nucleico indicada en la SEQ ID NO: 12 es
suficiente para dicha actividad de control de insectos.
En otra realización preferida, un sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el dominio
III entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números
587 y 588 de la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente, el sitio de
reconocimiento de proteasa adicional está insertado en el dominio
III entre los aminoácidos números 587 y588 de la SEQ ID NO: 2 o
entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4.
Específicamente se ilustra como ejemplo en esta memoria una
molécula de ácido nucleico denominada cry3A058 (SEQ ID NO:
14), que codifica la toxina Cry3A058 modificada (SEQ ID NO: 15) que
comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G insertado en el
dominio III entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO:
4. El sitio de reconocimiento de catepsina G está dentro de un
sitio de reconocimiento de quimotripsina natural. Cuando se expresa
en un hospedante heterólogo, la molécula de ácido nucleico de la SEQ
ID NO: 14 da como resultado una actividad de control de insectos
contra el gusano de la raíz del maíz del oeste y el gusano de la
raíz del maíz del norte, que demuestra que la secuencia de ácido
nucleico indicada en la SEQ ID NO: 14 es suficiente para dicha
actividad de control de insectos.
En todavía otra realización preferida, la
invención abarca una molécula aislada de ácido nucleico que codifica
una toxina Cry3A modificada, en donde el sitio de reconocimiento de
proteasa adicional está insertado en el dominio I entre los
aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 154 y 160 y
en el dominio III entre los aminoácidos que corresponden a los
aminoácidos números 587 y 588 de la SEQ ID NO: 2. Preferiblemente,
el sitio de reconocimiento de proteasa adicional está insertado en
el dominio I entre los aminoácidos números 154 y 160 y en el
dominio III entre los aminoácidos números 587 y 588 de la SEQ ID NO:
2 o en el dominio I entre los aminoácidos III 107 y 113 y en el
dominio III entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID
NO: 4.
Específicamente se ilustra como ejemplo en esta
memoria una molécula de ácido nucleico, denominada cry3A057
(SEQ ID NO: 16), que codifica la toxina Cry3A057 modificada (SEQ ID
NO: 17) que comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G
insertado en el dominio I entre los aminoácidos números 107 y 113 y
en el dominio III entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ
ID NO: 4. El sitio de reconocimiento de catepsina G reemplaza a un
sitio de reconocimiento de tripsina natural y está adyacente a un
sitio de reconocimiento de quimotripsina natural en el dominio I y
está dentro de un sitio de reconocimiento de quimotripsina natural
en el dominio III. Cuando se expresa en un hospedante heterólogo,
la molécula de ácido nucleico de la SEQ ID NO: 16 da como resultado
la actividad de control de insectos contra el gusano de la raíz del
maíz del oeste y el gusano de la raíz del maíz del norte, que
demuestra
que la secuencia de ácido nucleico indicada en la SEQ ID NO: 16 es suficiente para la actividad de control de insectos.
que la secuencia de ácido nucleico indicada en la SEQ ID NO: 16 es suficiente para la actividad de control de insectos.
En todavía otra realización preferida, el sitio
de reconocimiento de proteasa adicional está situado en el dominio
I entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números
154 y 158 y en el dominio III entre los aminoácidos que
corresponden a los aminoácidos números 587 y 588 de la SEQ ID NO: 2.
Preferiblemente, el sitio de reconocimiento de proteasa adicional
está insertado en el dominio I entre los aminoácidos números 154 y
158 y en el dominio III entre los aminoácidos números 587 y 588 de
la SEQ ID NO: 2 o en el dominio I entre los aminoácidos números 107
y 111 y en el dominio III entre los aminoácidos números 540 y 541 de
la SEQ ID NO: 4. Específicamente se ilustra como ejemplo en esta
memoria la molécula de ácido nucleico denominada cry3A056
(SEQ ID NO: 18), que codifica la toxina Cry3A056 modificada (SEQ ID
NO: 19) que comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G
insertado en el dominio I entre los aminoácidos números 107 y 111 y
en el dominio III entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ
ID NO: 4. El sitio de reconocimiento de catepsina G está adyacente
a los sitios de reconocimiento de tripsina y quimotripsina naturales
en el dominio I y está dentro de un sitio de reconocimiento de
quimotripsina natural en el dominio III. Cuando se expresa en un
hospedante heterólogo, la molécula de ácido nucleico de la SEQ ID
NO: 18 da como resultado una actividad de control de insectos
contra el gusano de la raíz del maíz del oeste y el gusano de la
raíz del maíz del norte, que demuestra que la secuencia de ácido
nucleico indicada en la SEQ ID NO: 18 es suficiente para dicha
actividad de control de insectos.
En todavía otra realización preferida, el sitio
de reconocimiento de proteasa adicional está situado en el dominio
I entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números
154 y 158 y en el dominio III entre los aminoácidos que
corresponden a los aminoácidos números 583 y 588 de la SEQ ID NO: 2.
Preferiblemente, el sitio de reconocimiento de proteasa adicional
está insertado en el dominio I y entre los aminoácidos números 154
y 158 y en el dominio III entre los aminoácidos números 583 y 588 de
la SEQ ID NO: 2 o en el dominio I entre los aminoácidos números 107
y 111 y en el dominio III entre los aminoácidos números 536 y 541 de
la SEQ ID NO: 4. Específicamente se ilustra como ejemplo en esta
memoria una molécula de ácido nucleico denominada cry3A083
(SEQ ID NO: 20), que codifica la toxina Cry3A083 modificada (SEQ ID
NO: 21) que comprende un sitio de reconocimiento de catepsina G
insertado en el dominio I entre los aminoácidos números 107 y 111 y
el dominio III entre los aminoácidos números 536 y 541 de la SEQ ID
NO: 4. El sitio de reconocimiento de catepsina G está adyacente a
los sitios de reconocimiento de tripsina y quimotripsina naturales
en el dominio I y reemplaza a un sitio de reconocimiento de
quimotripsina natural en el dominio III. Cuando se expresa en un
hospedante heterólogo, la molécula de ácido nucleico de la SEQ ID
NO: 20 da como resultado una actividad de control de insectos
contra el gusano de la raíz del maíz del oeste y el gusano de la
raíz del maíz del norte, que demuestra que la secuencia de ácido
nucleico indicada en la SEQ ID NO: 20 es suficiente para dicha
actividad de control de insectos.
En una realización preferida, la molécula de
ácido nucleico aislada de la presente invención comprende los
nucleótidos 1-179 de la SEQ ID NO: 6, los
nucleótidos 1-1806 de la SEQ ID NO: 8, los
nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 10, los
nucleótidos 1-1794 de la SEQ ID NO: 12, los
nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 14, los
nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 16, los
nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 18 y los
nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 20.
En otra realización preferida, la invención
abarca la molécula de ácido nucleico aislada que codifica una
toxina Cry3A modificada que comprende la secuencia de aminoácidos
indicada en las SEQ ID NO 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID
NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17. SEQ ID NO: 19 o SEQ I D NO:
21.
La presente invención abarca también los
vectores recombinantes que comprenden la secuencia de ácido nucleico
de esta invención. En dichos vectores, las secuencias de ácidos
nucleicos están preferiblemente contenidas en casetes de expresión
que comprenden elementos reguladores para la expresión de las
secuencias de nucleótidos en una célula hospedante capaz de
expresar las secuencias de nucleótidos. Dichos elementos reguladores
comprenden usualmente señales promotoras y de terminación y
comprenden también preferiblemente elementos que permiten una
traducción eficaz de los polipéptidos codificados por las secuencias
de ácido nucleico de la presente invención. Los vectores que
comprenden las secuencias de ácido nucleico usualmente son capaces
de replicación en células hospedante particulares, preferiblemente
como moléculas extracromosómicas, y por lo tanto se usan para
amplificar las secuencias de ácido nucleico de esta invención en las
células hospedantes. En una realización, las células hospedante
para dichos vectores son microorganismos, tales como bacterias en
particular Bacillus thuringiensis o E. coli. En otra
realización, las células hospedantes para dichos vectores
recombinantes son endofitas o epifitas. Una célula hospedante
preferida para dichos vectores es una célula eucariota, tal como
una célula vegetal. Las células vegetales tales como células de maíz
son las células hospedantes más preferidas. En otra realización
preferida, dichos vectores son vectores virares y se usan para la
replicación de las secuencias de ácidos nucleicos, en particular
células hospedante, por ejemplo células de insecto o células
vegetales. También se usan vectores recombinantes para la
transformación de las secuencias de nucleótidos de esta invención
en células hospedante, mediante lo cual las secuencias de
nucleótidos quedan establemente integradas en el DNA de las células
hospedante. En una de realizaciones, las células hospedantes son
células procariotas. En una realización preferida, dichas células
hospedantes son células eucariotas, tal como células vegetales. En
una realización más preferida, las células hospedantes son células
vegetales, tales como células de maíz.
En otro aspecto, la presente invención abarca
toxinas Cry3A modificadas producidas mediante la expresión de las
moléculas de ácido nucleico de la presente invención.
En realizaciones preferidas, las toxinas Cry3A
modificadas de la invención comprenden un polipéptido codificado
por una secuencia de nucleótidos de la invención. En otra
realización preferida, la toxina Cry3A modificada se produce
mediante la expresión de la molécula de ácido nucleico que comprende
los nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 6, los
nucleótidos 1-1806 de la SEQ ID. NO: 8, los
nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 10, los
nucleótidos 1-1794 de la SEQ ID NO: 12,los
nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 14, los
nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 16, los
nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 18, y los
nucleótidos 1-1818 de la SEQ I D NO: 20.
En una realización preferida, una toxina Cry3A
modificada de la presente invención comprende la secuencia de
aminoácidos indicada en las SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO:
11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19 o
SEQ ID NO: 21.
Las toxinas Cry3A modificadas de la presente
invención tienen actividad de control de insectos cuando se ensayan
contra plagas de insectos en valoraciones biológicas. En otra
realización preferida, las toxinas Cry3A modificadas de la
invención son activas contra insectos coleópteros, preferiblemente
contra el gusano de la raíz del maíz del oeste y el gusano de la
raíz del maíz del norte. Las propiedades controladoras de insectos
de las toxinas Cry3A modificadas de la invención se ilustran
adicionalmente en los Ejemplos 4 y 6.
La presente invención abarca también una
composición que comprende una cantidad eficaz para el control de
insectos de una Cry3A modificada de acuerdo con la invención.
En otra realización preferida, la invención
abarca un método para producir una toxina Cry3A modificada que es
activa contra insectos, que comprende: (a) obtener una célula
hospedante que comprende un gen quimérico, que por sí misma
comprende una secuencia promotora heteróloga unida operativamente a
la molécula de ácido nucleico de la invención; y (b) expresa la
molécula de ácido nucleico en la secuencia hospedante transgénica,
lo que da como resultado por lo menos una toxina Cry3A modificada
que es activa contra insectos.
En otra realización preferida, la invención
abarca un método para producir una planta transgénica resistente a
los insectos, que comprende introducir una molécula de ácido
nucleico de la invención en la planta transgénica, en donde la
molécula de ácido nucleico es expresable en la planta transgénica en
una cantidad eficaz para controlar insectos. En una realización
preferida, los insectos son insectos coleópteros, preferiblemente
gusano de la raíz del maíz del oeste y gusano de la raíz del maíz
del norte.
En todavía otra realización preferida, la
invención abarca un método para controlar insectos, que comprende
administrar a los insectos una cantidad eficaz de una toxina Cry3A
modificada de la invención. De acuerdo con esta realización, los
insectos son insectos coleópteros, preferiblemente gusano de la raíz
del maíz del oeste y gusano de la raíz del maíz del norte.
Preferiblemente, la toxina Cry3A modificada se administra a los
insectos oralmente. En un aspecto preferido, la toxina se administra
oralmente a través de una planta transgénica que comprende una
secuencia de ácido nucleico que expresa una toxina Cry3A modificada
de la presente invención.
La presente invención abarca también un método
para preparar una toxina Cry3A modificada que comprende: (a)
obtener un gen cry3A de toxina que codifica una toxina Cry3A;
(b) identificar una proteasa intestinal de un insecto diana; (c)
obtener una secuencia de nucleótidos que codifica un sitio de
reconocimiento para la proteasa intestinal; (d) insertar la
secuencia de nucleótidos de (c) en el dominio I o en el dominio III
o en tanto el dominio I como en el dominio III en una posición que
reemplaza a, está dentro de, o es adyacente a, una secuencia de
nucleótidos que codifica un sitio de reconocimiento de proteasa
natural en el gen cry3A de toxina, creando de esta manera un
gen cry3A de toxina modificado; (e) insertar el gen
cry3A de toxina modificado en un casete de expresión; (f)
expresar el gen cry3A de toxina modificado en una célula
hospedante no humana, lo cual da como resultado que la célula
hospedante produzca una toxina Cry3A modificada; y (g) valorar
biológicamente la toxina Cry3A modificada contra un insecto diana,
la cual causa mayor mortalidad para el insecto diana que la
mortalidad causada por una toxina Cry3A. En una realización
preferida, la toxina Cry3A modificada causa por lo menos
aproximadamente 50% de mortalidad en el insecto diana mientras que
la toxina Cry3A causa hasta aproximadamente 30% de mortalidad.
La presente invención abarca además un método
para controlar insectos en donde la planta transgénica comprende
además una segunda secuencia de ácido nucleico o grupos de
secuencias de ácidos nucleicos que codifican un segundo principio
plaguicida. Las secuencias particularmente preferidas del segundo
ácido nucleico son las que codifican una
\delta-endotoxina, las que codifican una toxina de
proteína insecticida vegetativa, descrita en las patentes de EE.UU.
nº 5.849.870 y 5.877.012, que se incorporan en la presente memoria
como referencia, o las que codifican una vía para la producción de
un principio no proteínico.
En otras realizaciones, las secuencias de
nucleótidos de la invención pueden estar adicionalmente modificadas
mediante la incorporación de mutaciones aleatorias en una técnica
conocida como recombinación in vitro o barajado de
DNA. Esta técnica ha sido descrita por Stemmer et al., Nature
370:389-391 (1994) y en la patente de EE.UU. Nº
5.605.793, que se incorpora en la presente memoria como referencia.
Se producen millones de copias mutantes de una secuencia de
nucleótidos en base a una secuencia de nucleótidos original de esta
invención y se recuperan variantes con propiedades mejoradas, tal
como un incremento de la actividad insecticida, mayor estabilidad o
diferentes gamas o especificidades de plagas de insecto diana. El
método comprende formar un polinucleótido bicatenario mutagenizado
a partir de un molde, que comprende una secuencia de nucleótidos de
esta invención, en donde el polinucleótido bicatenario molde ha sido
escindido en fragmentos bicatenarios aleatorios de un tamaño
deseado, y comprende las etapas de añadir a la población resultante
fragmentos bicatenarios aleatorios uno o más oligonucleótidos
monocatenarios o bicatenarios, en donde dichos oligonucleótidos
comprenden una zona de identidad y una zona de heterología para el
polinucleótido molde bicatenario; desnaturalizar la mezcla
resultante de fragmentos bicatenarios aleatorios y oligonucleótidos
en fragmentos monocatenarios; incubar la población resultante de
fragmentos monocatenarios con una polimerasa en condiciones que dan
como resultado la re-asociación de dichos
fragmentos monocatenarios en dichas zonas de identidad para formar
pares de fragmentos asociados, siendo dichas zonas de identidad
suficientes para que un miembro de un par cebe (inicie) una
replicación del otro, formando de esta manera un polinucleótido
bicatenario mutagenizado; y repetir la segunda y tercera etapas
durante por lo menos dos ciclos más, en donde la mezcla resultante
en la segunda etapa de otro ciclo incluye el polinucleótido
bicatenario mutagenizado de la tercera etapa del ciclo previo, y el
ciclo posterior forma otro polinucleótido bicatenario mutagenizado.
En una realización preferida, la concentración de una sola especie
de fragmentos bicatenarios aleatorios en la población de fragmentos
bicatenarios aleatorios es inferior a 1% en peso del DNA total. En
otra realización preferida, el polinucleótido bicatenario molde
comprende por lo menos aproximadamente 100 especies de
polinucleótidos. En otra realización preferida, el tamaño de los
fragmentos bicatenarios aleatorios es de aproximadamente 5 pb a 5
kb. En otra realización preferida, la cuarta etapa del método
comprende repetir la segunda y tercera etapas durante por lo menos
10 ciclos.
Como agentes biológicos para control de
insectos, las toxinas Cry3A insecticidas modificadas se producen
mediante la expresión de secuencias de nucleótidos en células
hospedante heterólogas capaces de expresar las secuencias de
nucleótidos. En una primera realización, se preparan células de
B. thuringiensis que comprenden modificaciones de una
secuencia de nucleótidos de esta invención. Dichas modificaciones
abarcan las mutaciones o deleciones de los elementos reguladores
existentes, lo cual conduce a la expresión alterada de la secuencia
de nucleótidos o a la incorporación de nuevos elementos reguladores
que controlan la expresión de la secuencia de nucleótidos. En otra
realización, se añaden copias adicionales de una o más de las
secuencias de nucleótidos a las células de Bacillus
thuringiensis mediante la inserción en el cromosoma o bien
mediante la introducción de moléculas extracromosómicamente
replicantes que contienen las secuencias de nucleótidos.
En otra realización, por lo menos una de las
secuencias de nucleótidos de la invención está insertada en un
casete de expresión apropiado que comprende un promotor y una señal
de terminación. La expresión de la secuencia de nucleótidos es
constitutiva o se usa un promotor inducible que responde a varios
tipos de estímulos para iniciar la transcripción. En una
realización preferida, la célula en la cual se expresa la toxina es
un microorganismo, tal como un virus, una bacteria o un hongo. En
una realización preferida, un virus tal como un baculovirus,
contiene una secuencia de nucleótidos de la invención en su genoma y
expresa grandes cantidades de la correspondiente toxina insecticida
después de la infección de células eucariotas apropiadas que son
adecuadas para la replicación del virus y la expresión de la
secuencia de nucleótidos. La toxina insecticida así producida se usa
como agente insecticida. Alternativamente, los baculovirus
manipulados por ingeniería genética para incluir la secuencia de
nucleótidos se usan para infectar insectos in vivo y para
eliminarlos, ya sea mediante la expresión de la toxina insecticida
o bien mediante una combinación de infección viral y expresión de la
toxina insecticida.
Las células bacterianas son también hospedantes
para la expresión de las secuencias de nucleótidos de la invención.
En una realización preferida, se usan bacterias simbióticas no
patógenas, que son capaces de vivir y replicarse dentro de tejidos
vegetales denominadas endofitas o bacterias simbióticas no patógenas
que son capaces de colonizar la filosfera o la rizosfera,
denominadas epifitas. Dichas bacterias incluyen bacterias de los
géneros Agrobacterium, Alcaligenes, Azospirillum, Azotobacter,
Bacillus, Clavibacter, Enterobacter, Erwinia, Flavobacter,
Klebsiella, Pseudomonas, Rhizobium, Serratia, Streptomyces y
Xanthomonas. Loshongos simbióticos tales como
Trichoderma y Gliocladium son también posibles
hospedantes para la expresión de las secuencias de nucleótidos de
la invención para el mismo propósito.
Los métodos para estas manipulaciones genéticas
son específicos para los diferentes hospedantes disponibles y son
conocidos en la técnica. Por ejemplo, los vectores de expresión
pKK223-3 y pKK223-2 pueden usarse
para expresar genes heterólogos en E. coli, ya sea en
fusión transcripcional o traduccional, detrás del promotor
tac o trc. Para la expresión de los operones que
codifican múltiples marcos de lectura abiertos (abreviadamente ORF
por la expresión inglesa Open Reading Frames) el
procedimiento más sencillo consiste en insertar el operón en un
vector tal como pKK223-3 en fusión transcripcional,
permitiendo que se use el sitio de unión de ribosoma
correspondiente de los genes heterólogos. Los métodos para la
sobreexpresión en las especies gram-positivas tales
como Bacillus también son conocidos en la técnica y pueden
usarse en el contexto de esta invención (Quax et al. en
Industrial Microorganisms: Basic and Applied Molecular
Genetics, Eds. Baltz et al., American Society for
Microbiology, Washington (1993)). Sistemas alternativos para la
sobreexpresión se basan por ejemplo en vectores de levadura e
incluyen el uso de Pichia, Saccharomyces y Kluyveromyces
(Sreekrishna, en: Industrial Microorganisms: Basic and Applied
Molecular Genetics, Baltz, Hegeman, and Skatrud eds.,
American Society for Microbiology, Washington (1993); Dequin
& Barre, Biotechnology L2:173-177
(1994); van der Berg et al., Biotechnology
8:135-139 (1990)).
En una realización particularmente preferida,
por lo menos una de las toxinas Cry3A modificadas de la invención
se expresan en un organismo superior, por ejemplo un vegetal. En
este caso, las plantas transgénicas que expresan cantidades
eficaces de las toxinas Cry3A modificadas se protegen a sí mismas
contras las plagas de insectos. Cuando el insecto comienza a comer
dicha planta transgénica, ingiere también las toxinas Cry3A
modificadas expresadas. Esto impedirá que el insecto siga mordiendo
el tejido de la planta o incluso puede dañar o matar al insecto.
Una secuencia de nucleótidos de la presente invención se inserta en
un casete de expresión, el cual luego es preferiblemente integrado
de forma estable en el genoma de dicha planta. En otra realización
preferida, se incluye la secuencia de nucleótidos en un virus
auto-replicante no patógeno. Las plantas
transformadas de acuerdo con la presente invención pueden ser
monocotiledóneas o dicotiledóneas e incluyen, pero sin limitación,
maíz, trigo, cebada, centeno, batata, judías, guisante, achicoria,
lechuga, col, coliflor, brécol, nabo, rábano, espinaca, espárrago,
cebolla, ajo, pimiento, apio, calabacín, calabaza, cáñamo, calabacín
de verano, manzana, pera, membrillo, melón, ciruela, cereza,
melocotón, nectarina, albaricoque, fresa, uva, frambuesa, zarzamora,
piña, aguacate, papaya, mango, plátano, soja, tomate, sorgo, caña
de azúcar, remolacha, girasol, colza, clavo, tabaco, zanahoria,
algodón, alfalfa, arroz, patata, berenjena, pepino, Arabidopsis, y
plantas leñosas, tales como coníferas y árboles de hoja caduca.
Una vez que la secuencia de nucleótidos deseada
ha sido transformada en una especie vegetal particular, puede ser
propagada en esa especie o ser pasada a otras variedades de la misma
especie, particularmente incluyendo variedades comerciales, usando
técnicas de cría tradicionales.
Una secuencia de nucleótidos de esta invención
se expresa preferiblemente en plantas transgénicas, produciendo de
esta manera la biosíntesis de la correspondiente toxina Cry3A
modificada en las plantas transgénicas. De esta manera, se generan
plantas transgénicas con mayor resistencia a los insectos. Para su
expresión en plantas transgénicas, las secuencias de nucleótidos de
la invención pueden requerir otras modificaciones y optimización.
Aunque en muchos casos pueden expresarse genes de organismos
microbianos en plantas a altos niveles sin modificación, la baja
expresión en plantas transgénicas puede ser el resultado de
secuencias de nucleótidos microbianas que tienen codones que no se
prefieren en plantas. Se sabe en la técnica que todos los organismos
tienen preferencias específicas para el uso de codones, y los
codones de las secuencias de nucleótidos descritos en esta invención
pueden cambiarse para adaptarse a las preferencias de las plantas
manteniendo al mismo tiempo los aminoácidos codificados por los
mismos. Además, se logra mejor una elevada expresión en plantas a
partir de secuencias codificadoras que tienen por lo menos 35% de
contenido de GC, preferiblemente más de aproximadamente 45%, más
preferiblemente más de aproximadamente 50%, y más preferiblemente
más de aproximadamente 60%. Las secuencias de nucleótidos
microbianas que tienen bajos contenidos de GC, pueden expresarse muy
pobremente en plantas debido a la existencia de los restos ATTTA
que pueden desestabilizar los mensajes, y los restos AATAAA que
pueden causar poliadenilación inapropiada. Aunque las secuencias
génicas preferidas pueden expresarse adecuadamente tanto en
especies de plantas vegetales monocotiledóneas como dicotiledóneas,
las secuencias pueden modificarse para tener en cuenta las
preferencias específicas de codones y las preferencias de contenido
de GC de las monocotiledóneas o dicotiledóneas, ya que estas
preferencias han demostrado que difieren (Murray et al.,
Nucl. Acids Res. 17:477-498 (1989)). Además,
las secuencias de nucleótidos se escrutan para determinar la
existencia de sitio de corte y empalme ilegítimos que pueden causar
el truncamiento del mensaje. Todos los cambios requeridos para ser
efectuados dentro de las secuencias de nucleótidos, tal como los
descritos anteriormente se efectúan usando técnicas bien conocidas
de mutagénesis dirigida al sitio, PCR, y construcción de genes
sintéticos usando los métodos descritos en las solicitudes de
patentes europeas publicadas EP 0385962 (de Monsanto), EP 0359472
(de Lubrizol), y la solicitud de patente internacional WO 93/07278
(de Ciba-Geigy).
En una realización de la invención, se prepara
un gen cry3A de acuerdo con el procedimiento descrito en la
patente de EE.UU.Nº 5.625.136, que se incorpora aquí como
referencia. En este procedimiento, se usan los codones preferidos
de maíz, es decir, el único codón que codifica más frecuentemente
ese aminoácido en el maíz. El codón de maíz preferido para un
aminoácido particular podría derivarse por ejemplo de secuencias
génicas conocidas del maíz. El uso de codones del maíz para 28 genes
a partir de plantas de maíz se encuentra en Murray et al.,
Nucleic Acids Research 17:477-498 (1989),
cuya descripción se incorpora en la presente memoria como
referencia. Una secuencia sintética preparada con codones de maíz
optimizados se representa en la SEQ ID NO: 3.
De esta manera, las secuencias de nucleótidos
pueden optimizarse para la expresión en cualquier planta. Se
reconoce que la totalidad o cualquier parte de la secuencia génica
puede ser optimizada o sintetizada. Es decir, también se pueden
usar secuencias sintéticas o parcialmente optimizadas.
Para una eficaz iniciación de la traducción, las
secuencias adyacentes a la metionina iniciadora pueden requerir
modificación. Por ejemplo, pueden modificarse mediante la inclusión
de secuencias que se sabe que son eficaces en plantas. Joshi ha
sugerido un consenso apropiado para plantas (NAR
15:6643-6653 (198.7)) y Clonetech sugiere un
iniciador de traducción de consenso adicional (catálogo de
1993/1994, página 210). Estos consensos son apropiados para ser
usados con las secuencias de nucleótidos de esta invención. Las
secuencias se incorporan en las construcciones que comprenden las
secuencias de nucleótidos hasta e incluyendo el ATG (mientras se
deja el segundo aminoácido sin modificar, o alternativamente hasta e
incluyendo el GTC subsiguiente al ATG (con la posibilidad de
modificar el segundo aminoácido del transgen).
La expresión de las secuencias de nucleótidos en
las plantas transgénicas es dirigida por promotores que funcionan
en las plantas. La elección del promotor variará dependiendo de los
requisitos temporales y espaciales para la expresión, y dependiendo
también de la especie que constituye la diana. Por lo tanto, se
prefiere la expresión de las secuencias de nucleótidos de esta
invención en hojas, en tallos o vástagos, en espigas, en
inflorescencias (por ejemplo, púas, panojas, mazorcas, etc), en
raíces, y/o plántulas. En muchos casos, sin embargo, se desea
protección contra más de un tipo de plaga de insecto, y por
consiguiente es deseable la expresión en múltiples tejidos. Aunque
muchos promotores de dicotiledones han demostrado que eran
operacionales en monocotiledones y viceversa, idealmente los
promotores de dicotiledones se seleccionan para la expresión en
dicotiledones, y los promotores de monocotiledones para la
expresión en monocotiledones. Sin embargo, no hay ninguna
restricción en cuanto al origen de los promotores seleccionados;
es suficiente que sean operacionales para dirigir la expresión de
las secuencias de nucleótidos en la célula deseada.
Los promotores preferidos que se expresan
constitutivamente incluyen promotores de genes que codifican actina
o ubicuitina y los promotores CaMV 35S y 19S. Las secuencias de
nucleótidos de esta invención pueden expresarse también bajo la
regulación de promotores que están químicamente regulados. Esto
permite que sean sintetizar solamente las toxinas de insecticidas
Cry3A modificadas cuando se tratan las plantas de cultivo con
productos químicos inductores. La tecnología preferida para la
inducción química de expresión génica se detalla en la solicitud de
patente europea publicada EP 0332104 (de Ciba-Geigy)
y la patente de EE.UU. Nº 5.614.395. Un promotor preferido para la
inducción química es el promotor PR-1a del
tabaco.
Una categoría de promotores preferida es la que
es inducible por lesiones. Se han descrito numerosos promotores que
se expresan en sitios lesionados y también en los sitios de
infección fitopatógena. Idealmente dicho promotor debe ser activo
localmente en los sitios de infección, y de este modo las toxinas
insecticidas Cry3A modificadas se acumularían solamente en células
que necesitan sintetizar las toxinas insecticidas Cry3A modificadas
para matar la plaga de insecto invasor. Los promotores preferidos
de esta clase incluyen los descritos por Stanford et al.,
Mol. Gen. Genet. 215:200-208 (1989), Xu
et al. Plant Molec. Biol. 22:573.588 (1993), Logemann
et al. Plant Cell 1:151-158 (1989),
Rohrmeier & Lehle, Plant Molec. Biol.
22:783-792 (1993), Firek et al. Plant.
Molec. Biol. 22:129-142 (1993) y Warner et
al. Plant J. 3:191-201 (1993).
Los promotores específicos de tejido o
preferenciales de tejido útiles para la expresión de los genes de
toxina Cry3A modificadas en plantas, particularmente el maíz, son
los que dirigen la expresión en la raíz, el carozo, las hojas o el
polen, particularmente en la raíz. Dichos promotores, por ejemplo
los que se aíslan a partir de PEPC o trpA, han sido descritos en la
patente de EE.UU. Nº 5.625.136 o MTL, descrito en la patente de
EE.UU. Nº 5.466.785. Ambas patentes estadounidenses se incorporan
aquí como referencia en su totalidad.
Otras realizaciones preferidas son plantas
transgénicas que expresan las secuencias de nucleótidos en una
manera inducible por daño o inducible por infección de
patógenos.
Además de los promotores, se encuentra también
disponible una variedad de terminadores de la transcripción para
uso en la construcción de genes quiméricos empleando los genes
cry3A de toxina modificados de la presente invención. Los
terminadores de la transcripción son responsables de la terminación
de la transcripción más allá del transgen y de su correcta
poliadenilación. Los terminadores de la transcripción apropiados y
los que se sabe que funcionan en plantas incluyen el terminador CaMV
35S, el terminador tml, el terminador de
nopalina-sintasa, el terminador rbcS E9 del
guisante, y otros conocidos en la técnica. Estos pueden
usarse tanto en plantas monocotiledóneas como en dicotiledóneas. En
el contexto de esta invención puede usarse cualquier terminador
disponible que se sabe que funciona en plantas.
Otras numerosas secuencias pueden incorporarse
en los casetes de expresión descritos en esta invención. Estas
incluyen secuencias que han demostrado que mejoran la expresión,
tales como secuencias de intrones (por ejemplo de Adhl y bronzel) y
secuencias virales líderes (por ejemplo de TMV, MCMV y AMV).
Puede ser preferible dirigir la expresión de las
secuencias de nucleótidos de la presente invención en diferentes
localizaciones celulares en la planta. En algunos casos la
localización en el citosol puede ser deseable, mientras que en
otros casos puede preferirse la localización en algún orgánulo
subcelular. La localización sub-celular de las
enzimas codificadas por transgenes se llevan a cabo usando métodos
bien conocidos en la técnica. Típicamente, el DNA que codifica el
péptido diana a partir de un producto génico conocido localizado en
los orgánulos es manipulado y fusionado en una posición situada
hacia el extremo 5' de la secuencia de nucleótidos. Muchas de
dichas secuencias dianasson conocidas para el cloroplasto y se ha
demostrado su funcionamiento en construcciones heterólogas. La
expresión de las secuencias de nucleótidos de la presente invención,
está también localizada en el retículo endoplasmático o en las
vacuolas de las células hospedantes. Los métodos para lograr esto
son bien conocidos en la técnica.
Los vectores apropiados para la transformación
de vegetales se han descrito en otra parte de esta memoria. Para la
transformación intermediada por Agrobacterium, son apropiados
los vectores binarios o los vectores portadores por lo menos de una
secuencia de límite de T-DNA mientras que para
cualquier transferencia directa de genes cualquier vector es
apropiado y puede preferirse DNA lineal que contenga únicamente la
construcción de interés. En el caso de una transferencia directa de
genes, puede usarse la transformación con una única especie de DNA
o la co-transformación (Shocher et al.,
Biotechnology 4:1093-1096 (1986)). Para la
transferencia génica directa y la transferencia intermediada por
Agrobacterium, la transformación usualmente (pero no
necesariamente), se efectúa con un marcador seleccionable que puede
proporcionar resistencia a un antibiótico (kanamicina, higromicina
o metotrexato) o un herbicida (basta). Los vectores de
transformación de vegetales que comprenden los genes cry3A
de la toxina modificados de la presente invención pueden comprender
también genes (por ejemplo, de
fosfomanosa-isomerasa; PMI) que proporcionan una
selección positiva de las plantas transgénicas, tal como se
describen en las patentes de EE.UU. 5.767.378 y 5.994.629 que se
incorporan en la presente memoria como referencia. Sin embargo, la
elección del marcador apropiado no es crítica para la
invención.
En otra realización, una secuencia de
nucleótidos de la presente invención se transforma directamente en
el genoma del plástido. Una ventaja importante de la transformación
del plástido es que los plástidos generalmente son capaces de
expresar genes bacterianos sin sustancial optimización de codones, y
los plástidos son capaces de expresar múltiples marcos de lectura
abiertos bajo el control de un solo promotor. La tecnología de
transformación de plástidos ha sido extensamente descrita en las
patentes de EE.UU. nº 5.451.513, 5.545.817, y 5.545.818, en la
solicitud PCT Nº WO 95116783, y en McBride et al., (1994)
Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 7301-7305. La
técnica básica para la transformación de cloroplastos implica
introducir regiones de DNA plástido clonado que flanquea un
marcador seleccionable conjuntamente con el gen de interés en un
tejido diana apropiado usando, por ejemplo, transformación
biolística o de protoplastos (por ejemplo, cloruro de calcio o
transformación mediada por PEG). Las regiones flanqueadoras de 1 a
1,5 kb, denominadas secuencias diana facilitan la recombinación
homóloga con el genoma del plástido y por lo tanto permiten el
reemplazamiento o modificación de regiones específicas del
plastoma. Inicialmente, se utilizan mutaciones puntuales en el
cloroplasto de RNAr 16S y en los genes rps 12 que confieren
resistencia a la espectinomicina y/o a la estreptomicina como
marcadores seleccionables para la transformación (Svab, Z.,
Hajdukiewicz, P., and Maliga, P (1990) Proc. Natl. Acad, Sci.
USA 87, 8526-8530, Staub, J. M. and Maliga, P.
(1992) Plant Cell 4, 39-45). Esto dio como
resultado transformantes homoplásmicos estables en una frecuencia
de aproximadamente uno por cada cien bombardeos sobre las hojas
dianas. La presencia de los sitios de clonación entre estos
marcadores permitió la creación de un vector diana en el plástido
para la introducción de genes extraños (Staub, J. M., and Maliga, P.
(1993) EMBO J. 12, 601-606). Se obtienen
incrementos sustanciales en la frecuencia de transformación mediante
el reemplazamiento de los genes recesivos de resistencia al RNAr o
antibiótico de proteína r con un marcador seleccionable dominante,
el gen bacteriano aadA que codifica la enzima cletoxificante
espectinomicina,
aminoglicósido-3'-adeníltransferasa
(Svah, 7; and Maliga; P. 1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90,
913-917). Previamente, este marcador había sido
usado con éxito para la transformación de alta frecuencia del genoma
del plástido de la alga verde Chlamydomonas reinhardtii
(Goldschmidt-Clermont, M. (1991) Nucl. Acids
Res. 19:4083-4089). Otros marcadores
seleccionables útiles para la transformación de plástidos son
conocidos en la técnica y están abarcados dentro del alcance de la
invención. Típicamente, se requieren aproximadamente
15-20 ciclos de división celular después de la
transformación para llegar a un estado homoplastídico. La expresión
del plástido, en la cual se insertan genes por recombinación
homóloga dentro de todos los varios centenares de copias del genoma
del plástido circular presente en cada célula vegetal, aprovecha la
ventaja de la enorme cantidad de copias con respecto a los genes
expresados en forma nuclear para permitir niveles de expresión que
puede exceder fácilmente el 10% de la proteína vegetal soluble
total. En una realización preferida, se inserta una secuencia de
nucleótidos de la presente invención en un vector diana de un
plástido, y se transforma en el genoma del plástido de una planta
hospedante deseada. Se obtienen plantas homoplásticas para genomas
de plástidos que contienen una secuencia de nucleótidos de la
presente invención, y que preferiblemente son capaces de alta
expresión de la secuencia de nucleótidos.
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Las toxinas Cry3A modificadas de la invención
pueden usarse en combinación con
\delta-endotoxinas Bt u otros principios
plaguicidas para aumentar la gama de dianas en la plaga. Además, el
uso de las toxinas Cry3A modificadas de la invención en combinación
con las \delta-endotoxinas Bt u otros principios
plaguicidas de distinta naturaleza, tiene una utilidad particular
para la prevención y/o para la manipulación de la resistencia a los
insectos.
Otros principios insecticidas incluyen, por
ejemplo, lectinas, \alpha-amilasa, peroxidasa y
colesterol-oxidasa. Los genes de la proteína
insecticida vegetativa, tales como vip1A(a) y
vip2A(a) que se han descrito en la patente de EE.UU.
Nº 5.889.174 y que se incorporan en la presente memoria como
referencia, son también útiles en la presente invención.
Esta co-expresión de más de un
principio insecticida en la misma planta transgénica puede lograrse
por manipulación genética de una planta de manera que contenga y
exprese todos los genes necesarios. Alternativamente, una planta,
Progenitora 1, puede manipularse genéticamente para la expresión de
genes de la presente invención. Una segunda planta, Progenitora 2,
puede manipularse genéticamente para la expresión de un principio
suplementario de control de insectos. Cruzando la plata Progenitora
1 con la planta Progenitora 2, se obtienen plantas de progenie que
expresan todos los genes introducidos en las plantas Progenitoras 1
y 2. La semilla transgénica de la presente invención puede tratarse
también con un revestimiento insecticida para semillas, tal como se
describió en las patentes de EE.UU. nº 5.849.320 y 5.876.739, que se
incorporan en la presente memoria como referencia. Cuando tanto el
revestimiento insecticida para semillas como la semilla transgénica
de la invención son activos contra el mismo insecto diana, la
combinación es útil (i) en un método para mejorar la actividad de
una toxina Cry3A modificada de la invención contra el insecto diana
y (ii) en un método para evitar el desarrollo de resistencia a una
toxina Cry3A modificada de la invención proporcionando un segundo
mecanismo de acción contra el insecto diana. Por lo tanto la
invención proporciona un método para mejorar la actividad o para
prevenir el desarrollo de resistencia en un insecto diana, por
ejemplo el gusano de la raíz del maíz, que comprende aplicar un
revestimiento insecticida para semillas a una semilla transgénica
que comprende una o más toxinas Cry3A modificada de la
invención.
Incluso cuando el revestimiento insecticida para
semillas es activo contra un insecto diferente, el revestimiento
insecticida para semillas es útil para ampliar la gama de control de
insectos, por ejemplo si se añade un revestimiento insecticida de
semillas que tiene actividad contra insectos lepidópteros a la
semilla transgénica de la invención, la cual tiene actividad contra
insectos coleópteros, la semilla transgénica revestida produce
controles tanto para plagas de insectos lepidópteros como
coleópteros.
La invención se describirá adicionalmente con
referencia a los siguientes ejemplos detallados. Estos ejemplos se
proporcionan con propósitos ilustrativos solamente, y no se
consideran limitativos a menos que se especifique lo contrario. Los
métodos de DNA recombinantes estándares y de clonación molecular
usados en la presente invención, son bien conocidos en la técnica y
han sido descritos por J. Sambrook, et al., Molecular Cloning:
A Laboratory Manual, 3d Ed.,Cold Spring Harbor, NY: Cold
Spring Harbor Laboratory Press (2001); por T. J. Silhavy, M.L,
Berman, and L.W. Enquist, Experiments with Gene Fusions, Cold
Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1984) y por
Ausubel, F.M. et al., Current Protocols in Molecular Biology,
New York, John Wiley and Sons Inc., (1988), Reiter, et al.,
Methods in Arabidopsis Research, World Scientific Press (1992),
and Schultz et al., Plant Molecular Biology Manual, Kluwer
Academic Publishers (1998).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
1
El gen cry3A del maíz optimizado se
prepara de acuerdo con el procedimiento descrito en la patente de
EE.UU. Nº 5.625.136. En este procedimiento se usan codones
preferidos de maíz, es decir el codón único que más frecuentemente
codifica ese aminoácido en el maíz. El codón preferido del maíz para
un aminoácido particular se deriva de secuencias génicas conocidas
del maíz. El uso de codón de maíz para 28 genes a partir de plantas
de maíz se describe en Murray et al., Nucleic Acids Research
17:477-498 (1989). La secuencia sintética preparada
con codones de maíz optimizados se representa en la SEQ ID NO:
3.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
2
Las actividades enzimáticas de la
(serina-proteasa) de tipo catepsina G,
(cisteína-proteasa) de tipo catepsina B en los
intestinos del gusano de la raíz del maíz del oeste se miden usando
sustratos colorimétricos. Cada reacción de 1 ml contiene cinco
intestinos medios homogeneizados del tercer estadio del gusano de la
raíz del maíz del oeste y 1 mg de sustrato disuelto en tampón de
reacción (Tris 10 mM, NaCl 5 mM, DTT 0,01M, pH 7,5). El sustrato de
catepsina G analizado es
Ala-Ala-Pro-Phe (SEQ
ID NO: 35)-pNA y el sustrato de catepsina B,
Arg-Arg-pNA. Las reacciones se
incuban a 28ºC durante 1 hora. La intensidad de la formación de
color amarillo, indicativa de la eficacia de una proteasa para
reconocer el sustrato apropiado, se compara en tratamiento frente a
controles. Las reacciones se califican como negativas (-) si no se
detecta ningún color o un color de fondo claro. Las reacciones que
están en 25%, 50%. 75% o 100% arriba del color base se califican
como +, ++, +++, ó ++++, respectivamente.
Los resultados de los ensayos enzimáticos se
muestran en la tabla siguiente
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\vskip1.000000\baselineskip
Esta es la primera vez que se ha identificado la
actividad de la serina-proteasa, catepsina G en
intestinos del gusano de la raíz del maíz del oeste. Los intestinos
del gusano de la raíz del maíz del oeste tienen claramente mayor
actividad de la serina-proteasa, catepsina G en
comparación con la actividad de la
cisteína-proteasa, catepsina B. La secuencia AAPF
(SEQ ID NO: 35) se selecciona como sitio de reconocimiento de la
proteasa, catepsina G, para crear toxinas Cry3A modificadas de la
presente invención.
\newpage
Ejemplo
3
Los genes cry3A modificados que
comprenden la secuencia de nucleótidos que codifica el sitio de
reconocimiento de catepsina G en el dominio I, en el dominio III, o
tanto en el dominio I como en el dominio III se preparan usando PCR
con solapamiento. El gen cry3A de maíz optimizado (SEQ ID NO:
2), contenido en el plásmido pCIB6850 (SEQ ID NO: 5), se usa como
molde inicial. Se preparan ocho construcciones de genes cry3A
modificados, que codifican las toxinas Cry3A modificadas;
cry3A054, cry3A055, y cry3A085, que comprenden
la secuencia codificadora del sitio de reconocimiento de catepsina
G en el dominio I; cry3A058, cry3A082, que comprenden
la secuencia codificadora del sitio de reconocimiento de catepsina G
en el dominio III; cry3A056, cry3A057,
cry3A083, que comprenden la secuencia codificadora del sitio
de reconocimiento de catepsina G en el dominio I y en el dominio
III. Los ocho genes cry3A modificados y las toxinas Cry3A
modificadas que codifican se describen a continuación.
El gen cry3A054 (SEQ ID NO: 6) comprenden una
secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A modificada.
Se usan tres pares de cebadores de PCR con solapamiento para
insertar la secuencia de nucleótidos que codifica el sitio de
reconocimiento de catepsina G en el gen cry3A del maíz
optimizado no modificado:
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El par de cebadores 1 y el par de cebadores 2
generan dos productos de PCR únicos. Estos productos se combinan
luego en partes iguales y se usa un par de cebadores 3 para unir los
productos para generar un fragmento de PCR que se clona nuevamente
en el molde pCIB6850 original. Luego el gen cry3A054
modificado se transfiere a pBluescript (Stratagene). El
plásmido resultante se denomina pCMS054 y contiene el gen
cry3A054 (SEQ ID NO: 6).
La toxina Cry3A054 modificada (SEQ ID NO: 7),
codificada por el gen cry3A modificado contenido en pCMS054,
tiene un sitio de reconocimiento de catepsina G, que contiene la
secuencia de aminoácidos AAPF (SEQ ID NO: 35), insertada en el
dominio I entre los aminoácidos 107 y 113 de la toxina Cry3A no
modificada (SEQ ID NO: 4). El sitio de reconocimiento de catepsina
G reemplaza al sitio de reconocimiento de tripsina natural y está
adyacente a un sitio de reconocimiento de quimotripsina natural.
El gen cry3A055 (SEQ ID NO: 8) comprenden
una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A
modificada. Se usan tres pares de cebadores de PCR con solapamiento
para insertar la secuencia de nucleótidos que codifica el sitio de
reconocimiento de catepsina G en el gen cry3A de maíz
optimizado no modificado:
El par de cebadores 1 y el par de cebadores 2
generan dos productos de PCR únicos. Estos productos se combinan
luego en partes iguales y se usa el par de cebadores 3 para unir los
productos para generar un fragmento de PCR que se clona nuevamente
en el molde pCIB6850. Luego se transfiere el gen cry3A055
modificado a pBluescript (Stratagene). El plásmido
resultante se denomina pCMS055 y contiene el gen cry3A055
(SEQ ID NO: 8).
La toxina Cry3A055 modificada (SEQ ID NO: 9),
codificada por el gen cry3A modificado contenido en pCMS055,
tiene un sitio de reconocimiento de catepsina G, que comprende la
secuencia de aminoácidos AAPF (SEQ ID NO: 35), insertada en el
dominio I entre los aminoácidos 107 y 111 de la toxina Cry3A no
modificada (SEQ ID NO: 4). El sitio de reconocimiento de catepsina
G está adyacente a un sitio de reconocimiento de tripsina y
quimotripsina natural.
El gen cry3A058 (SEQ ID NO: 14) comprende
una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A
modificada. Se usan tres pares de cebadores de PCR con solapamiento
para insertar la secuencia de nucleótidos que codifica el sitio de
reconocimiento de catepsina G en el gen cry3A de maíz
optimizado no modificado:
El par de cebadores 1 y el par de cebadores 2
generan dos productos de PCR únicos. Estos productos se combinan
luego en partes iguales y se usa el par de cebadores 3 para unir los
productos para generar un fragmento de PCR que se clona nuevamente
en el molde pCIB6850. El gen cry3A058 modificado se
transfiere luego a pBluescript (Stratagene). El plásmido
resultante se denomina pCMS058 y contiene el gen cry3A058
(SEQ ID NO: 14).
La toxina Cry3A058 modificada (SEQ ID NO: 15),
codificada por el gen cry3A modificado, tiene un sitio de
reconocimiento de catepsina G, que comprende la secuencia de
aminoácidos AAPF (SEQ ID NO: 35), insertada en el dominio III entre
los aminoácidos 540 y 541 de la toxina Cry3A no modificada (SEQ ID
NO: 4). El sitio de reconocimiento de catepsina G está dentro del
sitio de reconocimiento de quimotripsina natural.
El gen cry3A082 (SEQ ID NO: 12) comprende
una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A
modificada. Se usa un par de cebadores de PCR de mutagénesis
dirigida al sitio Quick Change, para insertar la secuencia
de nucleótidos que codifica el sitio de reconocimiento de catepsina
G en el gen cry3A de maíz optimizado no modificado:
El par de cebadores genera un producto de PCR
único. Este producto se clona nuevamente en el molde pCIB6850
original. El gen cry3A082 modificados se transfiere luego a
pBluescript (Stratagene). El plásmido resultante se denomina
pCMS082 y comprende el gen cry3A082 (SEQ ID NO: 12).
La toxina Cry3A082 modificada (SEQ ID NO: 13),
codificada por el gen cry3A modificado, tiene un sitio de
reconocimiento de catepsina G que comprende la secuencia de
aminoácidos AAPF (SEQ ID NO: 35), insertada en el dominio III entre
los aminoácidos 539 y 542 de la toxina Cry3A no modificada (SEQ ID
NO: 4). El sitio de reconocimiento de catepsina G reemplaza a un
sitio de reconocimiento de quimotripsina natural.
El gen cry3A056 (SEQ ID NO: 18) comprende
una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A
modificada. Se usan seis pares de cebadores de PCR con solapamiento
para insertar dos sitios de reconocimiento de catepsina G en el gen
cry3A no modificado:
\vskip1.000000\baselineskip
El par de cebadores 1 y el par de cebadores 2
generan dos productos de PCR únicos. Estos productos se combinan en
partes iguales y se usa el par de cebadores 3 para unir los
productos para generar un fragmento de PCR que se clona nuevamente
en el plásmido pCIB6850 original. El gen cry3A055 modificado
se transfiere luego a pBluescript (Stratagene). El plásmido
resultante se denomina pCMS055. El par de cebadores 4 y el par de
cebadores 5 generan otro conjunto de fragmentos únicos que se unen
mediante otra PCR con el par de cebadores 6. Este fragmento se
clona en el dominio III del gen cry3A055 modificado
contenido en pCMS055. El plásmido resultante se denomina pCMS056 y
comprende el gen cry3A056 (SEQ ID NO: 18).
La toxina Cry3A056 modificada (SEQ ID NO: 19),
codificada por el gen cry3A modificado, tiene un sitio de
reconocimiento de catepsina G, que comprende la secuencia de
aminoácidos AAPF (SEQ ID NO: 35), insertada en el dominio I entre
los aminoácidos 107 y 111 y en el dominio III entre los aminoácidos
540 y 541 de la toxina cry3A no modificada (SEQ ID NO: 4).
El sitio de reconocimiento de catepsina G está adyacente a un sitio
de reconocimiento de tripsina y quimotripsina natural en el dominio
I y está dentro de un sitio de reconocimiento de quimotripsina
natural en el dominio III.
El gen cry3A057 (SEQ ID NO: 16) comprende
una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A
modificada. Se usan seis pares de cebadores de PCR con solapamiento
para insertar dos sitios de reconocimiento de catepsina G en el
cry3A no modificado.
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El par de cebadores 1 y el par de cebadores 2
generan dos productos de PCR únicos. Estos productos se combinan en
partes iguales y se usa un par de cebadores 3 para unir los
productos para generar un fragmento de PCR que se clona nuevamente
en el plásmido pCIB6850 original. El gen cry3A054 modificado
se transfiere luego a pBluescript (Stratagene). El plásmido
resultante se denomina pCMS054. El par de cebadores 4 y el par de
cebadores 5 generan otro conjunto único de fragmentos que se unen
mediante otra PCR con el par de cebadores 6. Este fragmento se
clona en el dominio III del gen cry3A054 modificado contenido
en pCMS054. El plásmido resultante se denomina pCMS057 y contiene
el gen cry3A057 (SEQ ID NO: 16).
La toxina Cry3A057 modificada (SEQ ID NO: 17)
codificada por el gen cry3A modificado, tiene un sitio de
reconocimiento de catepsina G que comprende la secuencia de
aminoácidos AAPF (SEQ ID NO: 35), insertada en el dominio I entre
los aminoácidos 107 y 113 y en el dominio III entre los aminoácidos
540 y 541 de la toxina Cry3A no modificada (SEQ ID NO: 4). El sitio
de reconocimiento de catepsina G reemplaza a un sitio de
reconocimiento de tripsina natural y está adyacente a un sitio de
reconocimiento de quimotripsina natural en el dominio I y está
dentro del sitio de reconocimiento de quimotripsina natural en el
dominio III.
El gen cry3A083 (SEQ ID NO: 20) comprende
una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A
modificada. Se usan tres pares de cebadores de PCR con solapamiento
y un par de cebadores de PCR de mutagénesis dirigida al sitio
QuikChange para insertar dos sitios de reconocimiento de
catepsina G en el gen cry3A no modificado:
El par de cebadores 1 y el par de cebadores 2
generan dos productos de PCR únicos. Estos productos se combinan en
partes iguales y se usa el par de cebadores 3 para unir los
productos generando un fragmento de PCR que se clona nuevamente en
el plásmido pCIB6850 original. Luego se transfiere el gen
cry3A055 modificado a pBluescript (Stratagene). El
plásmido resultante se denomina pCMS055. El par de cebadores 4
genera otro fragmento único que se clona en el dominio III del gen
cry3A modificado contenido en pCMS055, El plásmido
resultante se denomina pCMS083 y comprende el gen cry3A083
(SEQ ID NO: 20).
La toxina Cry3A083 modificada (SEQ ID NO: 21),
codificada por el gen cry3A modificado, tiene un sitio de
reconocimiento de catepsina G, que comprende la secuencia de
aminoácidos AAPF (SEQ ID NO: 35), insertada en el dominio I entre
los aminoácidos 107 y 111, y entre los aminoácidos 539 y 542 de la
toxina Cry3A no modificada (SEQ ID NO:4). El sitio de
reconocimiento de catepsina G está adyacente a un sitio de
reconocimiento de tripsina y quimotripsina natural en el dominio I.
y reemplaza a un sitio de reconocimiento de quimotripsina natural
en el dominio III.
El gen cry3A085 (SEQ ID NO:10) comprende
una secuencia codificadora de catepsina G en la misma posición que
el gen cry3A055 descrito anteriormente. El gen
cry3A085 tiene 24 nucleótidos adicionales insertados en el
extremo 5' que codifican los aminoácidos 41-47 de la
secuencia de aminoácidos deducida indicada en la SEQ ID NO: 2 así
como una metionina adicional. Los nucleótidos adicionales se
insertan en el extremo 5' del gen cry3AO55 usando el
siguiente par de cebadores de PCR:
La toxina Cry3A085 modificada (SEQ ID NO: 11),
codificada por el gen cry3A modificado, tiene un sitio de
reconocimiento de catepsina G, que comprende la secuencia de
aminoácidos AAPF (SEQ ID NO: 35), insertada en el dominio I entre
los aminoácidos que corresponden a 107 y 111 de la toxina Cry3A no
modificada (SEQ ID NO: 4) y tiene ocho residuos de aminoácidos
adicionales en el extremo N de los cuales el segundo residuo
corresponde al aminoácido número 41 de la secuencia de aminoácidos
representada en la SEQ ID NO: 2.
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Ejemplo
4
Se ensayan las toxinas Cry3A modificadas para
determinar la actividad insecticida contra el gusano de la raíz del
maíz del oeste, el gusano de la raíz del maíz del norte y el gusano
de la raíz del maíz del sur en valoraciones biológicas de insectos.
Las valoraciones biológicas se efectúan usando un método de
incorporación en la dieta. Se cultivan clones de E.
coli que expresan una de las toxinas Cry3A modificadas de la
invención durante una noche. Se tratan con ultrasonidos 500 \mul
de un cultivo nocturno y luego se mezclan con 500 \mul de dieta
artificial molida (Marrone et al. (1985) J. of Economic
Entomology 78: 290-293). Una vez que la dieta
solidifica, se introduce en una placa Petri y se colocan en la dieta
20 gusanos neonatos de la raíz del maíz. Las placas Petri se
mantienen a 30ºC. Se registra la mortalidad después de 6 días. Todas
las toxinas Cry3A modificadas causan 5%-100% de mortalidad en los
gusanos de la raíz del maíz del oeste y del norte mientras que la
toxina Cry3A no modificada causa 0%-30% de mortalidad. Ninguna de
las toxinas Cry3A modificada tiene actividad contra el gusano de la
raíz del maíz del sur.
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Ejemplo
5
Seeligen para la transformación enplantas de
maíz tres genes cry3A modificados, el cry3A055,
representante de una modificación del dominio I, el
cry3A058, representante de una modificación de un dominio
III, y el cry3A056, representante de una modificación tanto
del dominio I como del dominio III. Un casetede expresión que
comprende una secuencia codificadora cry3A modificada se
transfiere a un vector apropiado para la transformación de maíz
mediada por Agrobacterium. Para este ejemplo, un casete de
expresión comprende, además del gen cry3A modificado, el
promotor MTL (Patente de EE.UU. Nº 5.466.785) y el terminador nos
que es conocido en la técnica.
La transformación de embriones de maíz inmaduros
se efectúa esencialmente tal como se ha descrito por Negrotto et
al., (2000), Plant Cell Reports
19:798-803. Para este ejemplo, todos los
constituyentes del medio son tal corno se han descrito en Negrotto
et al., supra. Sin embargo, pueden ser sustituidos por
diversos medios constituyentes conocidos en la técnica.
Los genes usados para la transformación se
clonan en un vector apropiado para la transformación de maíz. Los
vectores usados en este ejemplo contienen el gen de
fosfomanosa-isomerasa (PMI) para la selección de
líneas transgénicas (Negrotto et al (2000) Plant Cell
Reports 19: 798-803).
La cepa Agrobacterium LBA4404 (pSB1) que
contiene el plásmido de transformación de vegetales se cultiva en
un medio sólido de YEP (extracto de levadura (5 g/L), peptona (10
g/L), NaCl (5 g/L), 15 g/l de agar, pH 6,8) durante 2 a 4 días a
28ºC. Aproximadamente 0,8x10^{9} Agrobacterium se ponen en
suspensión en medios LS-inf suplementado con As 100
\muM (Negrotto et al., (2000) Plant Cell Rep. 19:
798-803). Las bacterias se
pre-inducen en este medio durante
30-60 minutos.
Se extraen embriones inmaduros de A188 o de otro
genotipo apropiado de mazorcas de 8-12 días, en
LS-inf + As100 \muM. Los embriones se lavan una
vez con un medio de infección reciente. Se añade una solución de
Agrobacterium y los embriones se somete a vórtice durante 30
segundos y se dejan sedimentar con las bacterias durante 5 minutos.
Los embriones se transfieren luego con el escutelio hacia arriba a
un medio LSA y se cultivan en la oscuridad durante 2 a 3 días.
Subsiguientemente, entre 20 y 25 embriones por placa Petri se
transfieren a un medio con LSDc suplementado con cefotaxima (250
mg/l) y nitrato de plata (1,6 mg/l) y se cultivan en la oscuridad
durante 10 días a 28ºC. Los embriones inmaduros, productores de
callos embriogénicos se transfieren a un medio LSD1M05S. Los
cultivos en este medio se seleccionan durante 6 semanas con una
etapa de sub-cultivo a las tres semanas.
Los callos sobrevivientes se transfieren a un
medio Reg1 suplementado con manosa. Después de cultivar bajo la luz
(régimen de 16 horas de luz/8 horas de oscuridad), los tejidos
verdes se transfieren a un medio Reg2 sin reguladores de
crecimiento y se incuban durante 1-2 semanas. Las
plántulas se transfieren a cajas magenta GA-7
(Magenta Corp, Chicago Illinois) que contienen un medio Reg3 y se
cultivan bajo la luz. Después de 2-3 semanas las
plantas se analizan mediante PCR para determinar la presencia de
genes PMI, y genes cry3A modificados. Las plantas positivas
en el ensayo de PCR se transfieren a un invernadero y se someten a
ensayos para determinar la resistencia al gusano de la raíz del
maíz.
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Ejemplo
6
Se toman muestras de plantas que se trasplantan
desde las cajas magenta GA-7 al suelo. Esto permite
tomar muestras de las raíces de un ambiente razonablemente estéril
en relación con las condiciones del suelo. La toma de muestras
consiste en cortar un pequeño trozo de raíz (aproximadamente
2-4 cm de longitud) y colocarlo en una pequeña
placa Petri sobre phytagar (phytagar, 12 g, sacarosa, 9 g, sales MS,
3 ml, vitaminas MS, 3 ml, nistatina
(25 mg/ml), 3 ml, cefotaxima 50 mg/ml), 7 ml, aureomicina (50 mg/ml), 7 ml, estreptomicina (50 mg/ml), 7 ml, dH_{2}O, 600 ml). Los controles negativos son plantas transgénicas que son negativas a la PCR para el gen cry3A modificado a partir del mismo experimento, o de plantas no transgénicas (de un tamaño similar a las plantas de ensayo), que se cultivan en el phytotron. Si las muestras de control se toman de raíces del suelo, las muestras de raíces se lavan con agua para eliminar cualquier residuo de suciedad, se sumergen en una solución de nistatina (5 mg/ml), se sacan del baño, se absorbe la humedad con toallitas de papel y se colocan en una placa de phytagar.
(25 mg/ml), 3 ml, cefotaxima 50 mg/ml), 7 ml, aureomicina (50 mg/ml), 7 ml, estreptomicina (50 mg/ml), 7 ml, dH_{2}O, 600 ml). Los controles negativos son plantas transgénicas que son negativas a la PCR para el gen cry3A modificado a partir del mismo experimento, o de plantas no transgénicas (de un tamaño similar a las plantas de ensayo), que se cultivan en el phytotron. Si las muestras de control se toman de raíces del suelo, las muestras de raíces se lavan con agua para eliminar cualquier residuo de suciedad, se sumergen en una solución de nistatina (5 mg/ml), se sacan del baño, se absorbe la humedad con toallitas de papel y se colocan en una placa de phytagar.
Las muestras de raíces se inoculan con gusanos
de la raíz del maíz del oeste colocando 10 larvas de primer estadio
sobre la superficie interna de la tapa de cada placa de phytagar y
luego se sellan de nuevo herméticamente las tapas. Las larvas se
manipulan usando un pincel con una punta fina. Después de inocular
todas las placas, se coloca la bandeja con las placas en la
oscuridad a temperatura ambiente hasta el momento de la recogida de
datos.
A los 3-4 días después de la
inoculación, se toman datos. El porcentaje de mortalidad de las
larvas se calcula junto con una evaluación visual del daño de la
raíz. El daño causado por alimentación se clasifica como elevado,
moderado, bajo o ausente y se le da un valor numérico de 3, 2, 1 ó 0
respectivamente. Las muestras de raíz que causan por lo menos una
mortalidad del 40% y las que tienen una clasificación de daño de 2 o
menos se consideran positivas.
Los resultados de la tabla siguiente muestran
que las plantas que expresan una toxina Cry3A causan de
40-100% de mortalidad en los gusanos de la raíz del
maíz del oeste mientras que las plantas de control causan
0-30% de mortalidad. Asimismo, las plantas que
expresan una toxina Cry3A modificada mantienen significativamente
menos daño por alimentación que las plantas de control.
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Algunas plantas positivas identificadas usando
la valoración biológica de extracción de raíz descrita anteriormente
se evalúan para determinar la resistencia del gusano de la raíz del
maíz del oeste usando una valoración biológica de planta entera.
Las plantas se infectaron en general después de tres días después de
completar el ensayo de extirpación de la raíz.
Se preincuban huevos del gusano de la raíz del
maíz del oeste de manera que la puesta ocurra 2-3
días después de la inoculación de la planta. Los huevos se
suspenden en 0,2% de agar y se aplican al suelo alrededor de las
plantas de ensayo aproximadamente a razón de 200 huevos/planta.
Dos semanas después de la puesta de huevos, las
plantas se evalúan para determinar el daño causado por las larvas
del gusano de la raíz del maíz del oeste. Los criterios que se usan
para determinar si las plantas son resistentes al daño por
alimentación causado por el gusano de la raíz del maíz del oeste son
la altura alcanzada por la planta, el encamamiento, y la masa de la
raíz. En el momento de la evaluación, las plantas de control son
típicamente más pequeñas que las plantas con la toxina Cry3a
modificada. Asimismo, las plantas de control no transgénicas y las
plantas que expresan la toxina Cry3A modificada codificada por el
gen de maíz cry3A optimizado se han encamado durante este
tiempo debido a una severa poda de la mayor parte de las raíces que
da como resultado que no se produzca acumulación de masa en la raíz.
En el momento de la evaluación, las plantas que expresan una toxina
Cry3A modificada de la invención son más altas que las plantas de
control, no se han encamado, y tienen una mayor masa de raíz
intacta debido a la actividad insecticida de la toxina Cry3A
modificada.
Para la determinación cuantitativa del nivel de
proteína Cry3A modificada y no modificada en plantas transgénicas
se usó el análisis por ELISA de acuerdo con el método descrito en la
patente de EE.UU. Nº 5.625.136.
\vskip1.000000\baselineskip
<110> Syngenta Participations AG
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Toxinas CryA modificadas y
secuencias de ácidos nucleicos que las codifican
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 60065/PCT
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<140>
\vskip0.400000\baselineskip
<141>
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<150> US 60/616421
\vskip0.400000\baselineskip
<151>
2001-08-31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn Ver. 3.0
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1932
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Bacillus thuringiensis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1932)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora natural de
Cry3A de acuerdo con Sekar et al. 1987. Proc. Acad. Sci.
84:7036-7040.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 644
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Bacillus thuringiensis
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1803
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1794)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora de cry3A del
maíz optimizada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 597
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Cry3A codificada por SEQ ID NO:
3.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 7208
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<223> pCIB6850
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1801
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1791)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora de cry3A
modificada y optimizada del maíz.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 596
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1807
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1806)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora de cry3A055
del maíz modificada y optimizada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 598
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1818
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1818)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora de cry3A085
del maíz modificada y optimizada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (346)..(357)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 606
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (346)..(357)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 11
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1794
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1794)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora de cry3A082
del maíz modificada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1609)..(1620)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 597
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1609)..(1620)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 13
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1816
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1812)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora de cry3A058
del maíz modificada y optimizada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1621)..(1632)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 601
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1621)..(1632)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1813
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1812)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora de cry3A057
modificada y optimizada del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1618)..(1629)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 600
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1819
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1818)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora de cry3A056
modificada y optimizada del maíz
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1624)..(1635)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 602
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1624)..(1625)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1797
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(1791)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora de cry3A083
del maíz modificada y optimizada
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1612)..(1623)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 597
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (322)..(333)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1612)..(1623)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Secuencia codificadora del sitio de
reconocimiento de catepsina G.
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(21)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> cebador BamExt1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggatccacca tgacggccga c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(29)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> cebador AAPFtail13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgaacggtgca gcggggttct tctgccagc
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(29)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> cebador AAPFtail14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgctgcaccgt tcccccacag ccagggccg
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(21)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> cebador XbaExt2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptctagaccca cgttgtacca c
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(29)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador Tail5mod
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgctgcaccgt tccgcaaccc ccacagcca
\hfill29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1).. (19)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador SalExt
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgagcgtcgac ttcttcaac
\hfill19
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 28
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1).. (30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador AAPF-Y2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 28
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgaacggtgca gcgtattggt tgaagggggc
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 29
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(30)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador AAPF-Y1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 29
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgctgcaccgt tctacttcga caagaccatc
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 30
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 21
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(21)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador SacExt
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 30
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgagctcagat ctagttcacg g
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 31
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador BBmodl
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 31
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcggggccccc gctgcaccgt tctacttcga ca
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(32)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador BBmod2
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptgtcgaagta gaacggtgca gcgggggccc cg
\hfill32
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 33
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 48
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(48)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador mo3Aext
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 33
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipggatccacca tgaactacaa ggagttcctc cgcatgaccg ccgacaac
\hfill48
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 34
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Secuencia artificial
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> Aspectos misceláneos
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1)..(20)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador CMS16
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 34
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipcctccacctg ctccatgaag
\hfill20
Claims (36)
1. Una toxina Cry3A modificada, que comprende un
sitio de reconocimiento de proteasa que no se presenta de modo
natural, en donde dicho sitio de reconocimiento de proteasa modifica
una toxina Cry3A y está localizado en una posición seleccionada del
grupo que consiste en:
- a)
- una posición entre aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 107 y 115 de la SEQ NO: 4;
- b)
- una posición entre aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4; y una posición entre aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 107 y 115 de la SEQ ID NO: 4, y
- c)
- entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4;
en donde dicho sitio de
reconocimiento de proteasa es reconocible por una proteasa
intestinal del gusano de la raíz del maíz del oeste, y en donde
dicha toxina Cry3A modificada causa mayor mortalidad al gusano de la
raíz del maíz del oeste que la mortalidad causada por dicha toxina
Cry3A al gusano de la raíz del maíz el oeste en una valoración
biológica con dieta
artificial.
2. La toxina Cry3A modificada de acuerdo con la
reivindicación 1, en donde dicha proteasa intestinal es una
serina-proteasa.
3. La toxina Cry3A modificada de acuerdo con la
reivindicación 2, en donde dicha proteasa intestinal es catepsina
G.
4. La toxina Cry3A modificada de acuerdo con la
reivindicación 1, en donde dicho sitio de reconocimiento de
proteasa esta:
- (i)
- localizado entre los aminoácidos números 107 y 115 de la SEQ ID NO: 4; o
- (ii)
- localizado entre los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4; o
- (iii)
- localizado entre los aminoácidos números 107 y 115 y entre los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4.
5. La toxina Cry3A modificada de acuerdo con la
reivindicación 1, en donde dicho sitio de reconocimiento de
proteasa está:
- (i)
- localizado entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 107 y 113 de la SEQ ID NO: 4; o
- (ii)
- localizado entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4; o
- (iii)
- localizado entre los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 536 y 541 de la SEQ ID NO: 4; o
- (iv)
- localizado entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4; o
- (v)
- localizado entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 107 y 113 de la SEQ ID NO:4 y entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4; o;
- (vi)
- localizado entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4 y entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 536 y 541 de la SEQ ID NO: 4; o;
- (vii)
- localizado entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4 y entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4.
6. La toxina Cry3A modificada de acuerdo con la
reivindicación 5, en donde dicho sitio de reconocimiento de
proteasa está:
- (i)
- localizado entre los aminoácidos números 107 y 113 de la SEQ ID NO: 4; o
- (ii)
- localizado entre los aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4; o
- (iii)
- localizado entre los aminoácidos números 536 y 541 de la SEQ ID NO: 4; o
- (iv)
- localizado entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4; o
- (v)
- localizado entre los aminoácidos números 107 y 113 de la SEQ ID NO: 4 y entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4; o
- (vi)
- localizado entre los aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4 y entre los aminoácidos números 536 y 541 de la SEQ ID NO: 4; o
- (vii)
- localizado entre los aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4 y entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4.
7. La toxina Cry3A modificada de acuerdo con la
reivindicación 1, en donde dicha toxina Cry3A modificada causa
por lo menos 50% de mortalidad al gusano de la raíz del maíz del
oeste al que dicha toxina Cry3A causa hasta 30% de mortalidad.
8. La toxina Cry3A modificada de acuerdo con la
reivindicación 1, que:
- (i)
- está codificada por los nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 6, los nucleótidos 1-1806 de la SEQ ID NO: 8, los nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 10, los nucleótidos 1-1794 de la SEQ ID NO: 12, los nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 14, los nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 16, los nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 18 o los nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 20; o
- (ii)
- comprende la secuencia de aminoácidos representada en la SEQ ID NO: 7, la SEQ ID NO: 9, la SEQ ID NO: 11, la SEQ ID NO: 13, la SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, la SEQ ID NO: 19 o la SEQ ID NO: 21.
9. La toxina Cry3A modificada de acuerdo con la
reivindicación 1, que es activa contra el gusano de la raíz del
maíz del norte.
10. Una molécula aislada de ácido nucleico, que
comprende una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina
Cry3A modificada de acuerdo con la reivindicación 1.
11. Una molécula aislada de ácido nucleico de
acuerdo con la reivindicación 10, que comprende una secuencia de
nucleótidos que codifica una toxina Cry3A modificada de acuerdo con
una cualquiera de las reivindicaciones 2 a 9.
12. Un gen cry3A modificado, que
comprende una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A
modificada, que comprende un sitio de reconocimiento de proteasa
que no se presenta de modo natural, en donde dicha gen modificado
cry3Acomprende una secuencia codificadora que codifica un
sitio de reconocimiento de proteasa, en donde dicha secuencia
codificadora modifica un gen cry3A y está insertado en una posición
seleccionada del grupo que consiste en:
- a)
- una posición entre los codones que codifican los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 107 y 115 de la SEQ ID NO: 4;
- b)
- una posición entre los codones que codifican los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4; y
- c)
- una posición entre los codones que codifican los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 107 y 115 de la SEQ ID NO: 4, y entre los codones que codifican los aminoácidos que corresponden a los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4,
en donde dicho sitio de
reconocimiento de proteasa es reconocible por una proteasa
intestinal del gusano de la raíz del maíz del oeste, y en donde
dicha toxina Cry3A modificada causa mayor mortalidad al gusano de la
raíz del maíz del oeste que la mortalidad causada por dicha toxina
Cry3A al gusano de la raíz del maíz del oeste en una valoración
biológica con dieta
artificial.
13. El gen cry3A modificado de acuerdo
con la reivindicación 12, en donde dicha proteasa intestinal es una
serina-proteasa.
14. El gen cry3A modificado de acuerdo
con la reivindicación 13, en donde dicha proteasa intestinal es
\hbox{catepsina G.} 15. El gen cry3A modificadode acuerdo con
la reivindicación 12, en donde:
- (i)
- dicha secuencia de nucleótidos comprende los nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 6, los nucleótidos 1-1806 de la SEQ ID NO: 8, los nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 10, los nucleótidos 1-1794 de la SEQ ID NO: 12, los nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 14, los nucleótidos 1-1812 de la SEQ ID NO: 16, los nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 18, o los nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 20; o
- (ii)
- dicha toxina Cry3A modificada comprende la secuencia de aminoácidos representada en la SEQ ID NO: 7, la SEQ ID NO: 9, la SEQ ID NO: 11, la SEQ ID NO: 13, la SEQ ID NO:. 15, SEQ ID NO: 17, la SEQ ID NO: 19, o la SEQ ID NO: 21.
16. El gen cry3A modificadode acuerdo con
la reivindicación 12, en donde dicha toxina Cry3A modificada es
activa contra el gusano de la raíz del maíz del norte.
17. Una planta de maíz transgénica que comprende
una secuencia de nucleótidos que codifica una toxina Cry3A
modificada de acuerdo con la reivindicación 1, en donde dicha planta
transgénica expresa dicha toxina Cry3A modificada en el tejido de
la raíz a un nivel que causa la mortalidad de gusano de la raíz de
maíz del oeste.
18. Una planta de maíz transgénica que comprende
un gen cry3A modificado que comprende una secuencia de
nucleótidos que codifica una toxina Cry3A modificada, siendo dicho
gen cry3A modificado como se ha definido en la
reivindicación 12, en donde dicha planta transgénica expresa dicha
toxina Cry3A modificada en el tejido de la raíz a un nivel que
causa la mortalidad de gusano de la raíz de maíz del oeste.
19. La planta de maíz transgénica de acuerdo con
la reivindicación 18, en donde dicho sitio de reconocimiento de
proteasa está:
- (i)
- localizado entre los aminoácidos números 107y 111 de la SEQ ID NO: 4; o
- (ii)
- localizado entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4; o
- (iii)
- localizado entre los aminoácidos números 107 y 111 de la SEQ ID NO: 4 y entre los aminoácidos números 540 y 541 de la SEQ ID NO: 4.
20. La planta de maíz transgénica de acuerdo con
la reivindicación 17 o la reivindicación 18, en donde:
- (i)
- dicha secuencia de nucleótidos comprende los nucleótidos 1-1806 de la SEQ ID NO: 8, los nucleótidos 1-1818 de la SEQ ID NO: 14, o los nucleótidos 1-1791 de la SEQ ID NO: 18; o
- (ii)
- dicha toxina Cry3A modificada comprende la secuencia de aminoácidos expuesta en la SEQ ID NO: 9, la SEQ ID NO: 15 o la SEQ ID NO: 19.
21. La planta de maíz transgénica de acuerdo con
la reivindicación 17, en donde dicho tejido de la raíz causa 40% de
mortalidad al gusano de la raíz del maíz del oeste.
22. La planta de maíz transgénica de acuerdo con
la reivindicación 17, en donde dicha planta transgénica expresa
dicha toxina Cry3A modificada a un nivel suficiente para:
- (i)
- impedir que el gusano de la raíz del maíz del oeste reduzca acusadamente las raíces de la planta transgénica; o
- (ii)
- impedir el daño por alimentación del gusano de la raíz del maíz del oeste que hace que la planta se encame.
23. Un método de controlar la infestación de
plantas de maíz por el gusano de la raíz del maíz del oeste,
comprendiendo dicho método:
- (a)
- crear la planta de maíz transgénica de acuerdo con la reivindicación 17; y
- (b)
- poner en contacto dicho gusano de la raíz del maíz del oeste con la planta.
24. Un método de producir una toxina Cry3A
modificada, que comprende:
- (a)
- obtener una célula hospedante bacteriana transgénica que comprende una construcción quimérica que comprende una secuencia promotora heteróloga unida operativamente al ácido nucleico de la reivindicación 10;
- (b)
- cultivar la célula hospedante bacteriana transgénica en condiciones que permiten la expresión de la toxina Cry3A modificada; y
- (c)
- recuperar la toxina Cry3A modificada expresada.
25. Un método de producir una planta resistente
a insectos, que comprende:
- (a)
- integrar establemente la molécula de ácido nucleico de acuerdo con la reivindicación 10 en el genoma de células vegetales; y
\newpage
- (b)
- regenerar plantas establemente transformadas de dichas células vegetales transformadas, en donde dichas plantas establemente transformadas expresan una cantidad eficaz de una toxina Cry3A modificada para hacer que dicha planta transformada sea resistente a por lo menos el gusano de la raíz del maíz del oeste.
26. Un método de controlar por lo menos el
gusano de la raíz del maíz del oeste, que comprende administrar por
vía oral al gusano de la raíz del maíz del oeste una cantidad eficaz
de una toxina de acuerdo con la reivindicación 1.
27. Un método de obtener una toxina Cry3A
modificada, que comprende:
- (a)
- obtener un gen cry3A que codifica una toxina Cry3A;
- (b)
- identificar una proteasa intestinal del gusano de la raíz del maíz del oeste;
- (c)
- obtener una secuencia de nucleótidos que codifica un sitio de reconocimiento para dicha proteasa intestinal;
- (d)
- insertar dicha secuencia de nucleótidos en dicho gen cry3A, de tal modo que dicho sitio de reconocimiento esté localizado en dicha toxina Cry3A en una posición entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 107 y 115 de la SEQ ID NO: 4, o en una posición entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4, o en una posición entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 107 y 115 de la SEQ ID NO: 4 y entre los aminoácidos que corresponde a los aminoácidos números 536 y 542 de la SEQ ID NO: 4, creando de este modo un gen cry3A modificado;
- (e)
- insertar dicho gen cry3A modificado en un casete de expresión; y
- (f)
- transformar dicho casete de expresión en una célula hospedante no humana, en donde dicha célula hospedante produce una toxina Cry3A modificada.
28. Una construcción de gen quimérico que
comprende una secuencia de promotor heteróloga unida operativamente
a:
- (i)
- la molécula de ácido nucleico de la reivindicación 10; o
- (ii)
- el gen cry3A modificado de la reivindicación 12.
29. Un vector recombinante que comprende la
construcción quimérica de la reivindicación 28.
30. Una célula hospedante transgénica no humana
que comprende la construcción quimérica de la reivindicación
28.
31. La célula hospedante transgénica de acuerdo
con la reivindicación 30, que es una célula bacteriana o una célula
vegetal.
32. Una planta transgénica que comprende la
célula de planta transgénica de la reivindicación 31.
33. La planta transgénica de acuerdo con la
reivindicación 32, en donde dicha planta es una planta de maíz.
34. La planta de maíz transgénica de acuerdo con
una cualquiera de las reivindicaciones 17 a 22, que es:
- (i)
- una planta endogámica; o
- (ii)
- una planta híbrida.
35. Semilla transgénica de la planta transgénica
de la reivindicación 32 o de la planta de maíz transgénica de la
reivindicación 33 o la reivindicación 34.
36. Una composición que comprende una cantidad
eficaz de la toxina de la reivindicación 1 para causar la mortalidad
del gusano de la raíz del maíz del oeste.
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US31642101P | 2001-08-31 | 2001-08-31 | |
| US316421P | 2010-03-23 |
Publications (1)
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