ES2311700T3 - La1 - el genoma de una cepa de lactobacillus. - Google Patents

La1 - el genoma de una cepa de lactobacillus. Download PDF

Info

Publication number
ES2311700T3
ES2311700T3 ES03720340T ES03720340T ES2311700T3 ES 2311700 T3 ES2311700 T3 ES 2311700T3 ES 03720340 T ES03720340 T ES 03720340T ES 03720340 T ES03720340 T ES 03720340T ES 2311700 T3 ES2311700 T3 ES 2311700T3
Authority
ES
Spain
Prior art keywords
hskip1cm
baselineskip
sequence
sec
fragments
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Expired - Lifetime
Application number
ES03720340T
Other languages
English (en)
Inventor
Raymond David Pridmore
Beat Mollet
Fabrizio Arigoni
Josef Hermanns
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Societe des Produits Nestle SA
Nestle SA
Original Assignee
Societe des Produits Nestle SA
Nestle SA
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Societe des Produits Nestle SA, Nestle SA filed Critical Societe des Produits Nestle SA
Application granted granted Critical
Publication of ES2311700T3 publication Critical patent/ES2311700T3/es
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Lifetime legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/335—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Lactobacillus (G)
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Food Preservation Except Freezing, Refrigeration, And Drying (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Coloring Foods And Improving Nutritive Qualities (AREA)
  • Bakery Products And Manufacturing Methods Therefor (AREA)

Abstract

Un equipo que comprende un polinucleótido de Lactobacillus johnsonii como el identificado por el Id. de Sec. Nº: 1, fragmentos de una secuencia de DNA como los identificados por el Id. de Sec. Nº: 1, seleccionando dichos fragmentos a partir del grupo comprendido entre el nucleótido 1 y 54596, entre 56070 y 77430, entre 81302 y 308537, entre 309588 y 342757, entre 378458 y 389217, entre 389779 y 404510, entre 405561 y 501116, entre 503873 y 558194, entre 563262 y 696518, entre 697569 y 721736, entre 722787 y 756845, entre 761682 y 860446, entre 860723 y 865550, entre 868541 y 1448288, entre 1463851 y 1526077, entre 1527278 1552024, entre 1563147 y 1809115, entre 1810166 y 1858190, entre 1863258 y 1872871, entre 1877939 y 1930430, entre 1932063 y 1983043, en base a la numeración del Id. de Sec. Nº:1.

Description

La1 - El genoma de una cepa de Lactobacillus.
La presente invención está relacionada con un equipo de acuerdo con la reivindicación 1, un medio legible mediante computador de acuerdo con la reivindicación 2 y un sistema basado en un computador de acuerdo con la reivindicación 4.
Las bacterias del ácido láctico, es decir, los micro-organismos que producen ácido láctico durante su actividad (fermentadora), se conocen desde hace mucho tiempo y comprenden, por ejemplo, el género Lactococcus, Lactobacillus, Streptococcus, Bifidobacterium y Pediococcus. Estas bacterias normalmente son importantes en la leche y también para las fábricas de procesamiento de leche, respectivamente, en plantas vivas o en deterioro y representan un constituyente de la micro-flora intestinal en humanos y animales.
Se han utilizado las bacterias del ácido láctico como agentes para la conservación de alimentos, aprovechando la disminución del pH y la acción de los productos generados durante su actividad fermentadora para, por ejemplo, inhibir el crecimiento de las bacterias de la descomposición. Además, las bacterias del ácido láctico se han utilizado también para preparar una serie de diferentes productos alimenticios como el queso, yogurt y otros productos fermentados derivados de la leche.
Por último, las bacterias del ácido láctico han atraído mucho la atención porque se ha descrito que algunas cepas presentan propiedades valiosas para el hombre y los animales tras su ingestión. En particular, se ha descrito que cepas específicas del género Lactobacillus y Bifidobacterium traspasan el tracto gastrointestinal de forma viable sin ser destruidas en la parte superior del mismo, especialmente por el impacto del bajo pH que prevalece en el estómago. Además, se ha encontrado que son capaces de colonizar la mucosa intestinal, y se postula que su presencia temporal o sostenida en los intestinos puede aportar numerosos efectos positivos en la salud de los seres vivos. Estas cepas se denominan de forma genérica probióticos.
La patente PE 0 768 375 describe una cepa específica del género Bifidobacterium, que es capaz de implantarse en la flora intestinal. Se ha descrito que esta cepa de Bifidobacterium ayuda en la inmunomodulación, siendo capaz de excluir competitivamente la adhesión de bacterias patogénicas en las células intestinales, ayudando a mantener así la salud del individuo.
Aparte de las Bifidobacterias, también se ha descrito que algunas cepas de Lactobacilli tienen propiedades favorables para los humanos, como prevenir la colonización del intestino por parte de bacterias patogénicas o evitar la infección por rotavirus. En particular, la PCT/EP02/00958 describe una cepa que posee ambas propiedades mencionadas.
En los últimos años, la industria de la alimentación ha añadido dichas cepas a los productos, como bebidas lácticas o productos lácteos fermentados y acidificados. Los estudios clínicos realizados con estos productos y/o las cepas bacterianas confirmaron la idea de que esta clase de bacterias tienen propiedades promotoras de la salud in vivo y pueden incluso utilizarse para contener enfermedades, como las úlceras. En particular, se ha demostrado que una cepa del género Lactobacillus johnsonii es capaz de combatir a Helicobacter, que es una causa conocida de las úlceras en humanos.
En vista de las valiosas propiedades que pueden proporcionar cepas concretas de bacterias del ácido láctico, existe un gran interés en la materia por conocer las bases moleculares de estas propiedades promotoras de salud. En particular, es de gran interés determinar la sustancia o sustancias responsables de estos efectos. Para ello, son necesarias herramientas para el estudio de estos microorganismos en más detalle, para poder esclarecer los principios moleculares subyacentes a las propiedades probióticas, como la interacción con los huéspedes, el fenómeno de atravesar diferentes condiciones ambientales (y sobrevivir) en el intestino, así como la capacidad de adherirse a la mucosa intestinal y, finalmente, su participación en la potenciación del sistema inmunitario y la defensa frente a patógenos, cuya información permitirá entender mejor estos mecanismos.
En consecuencia, un problema de la presente invención es proporcionar datos sustanciales sobre las cepas bacterianas que presentan propiedades beneficiosas para los humanos y/o animales.
El problema anterior se ha solucionado proporcionando la secuencia de DNA que constituye la cepa probiótica Lactobacillus johnsonii La1.
En el contexto de esta solicitud, se entenderá que los términos genoma o secuencia genómica se refieren a la secuencia del cromosoma de Lactobacillus johnsonii. Los términos secuencia de nucleótidos, polinucleótidos o ácido nucleico designan un DNA de doble cadena, un DNA de cadena sencilla o productos transcripcionales de dichos DNA de diferentes longitudes, lo que incluye oligonucleótidos de alrededor de 5 a 200, preferiblemente de 10 a 100 nucleótidos de longitud.
De acuerdo con la presente invención, se entiende que una secuencia de nucleótidos homóloga indica una secuencia de nucleótidos con un porcentaje de identidad con la secuencia de Id. de Sec. Nº:1 (o porciones seleccionadas de la misma) de al menos un 90%, preferiblemente al menos un 95%, más preferiblemente del 96% y aún más preferiblemente al menos un 98%. Dicha secuencia homóloga puede comprender, por ejemplo, secuencias que corresponden a la secuencia genómica o a las secuencias de fragmentos de la misma que pertenecen a la especie Lactobacillus, más preferiblemente a la especie Lactobacillus johnsonii, así como a las secuencias que corresponden a la secuencia genómica o a las secuencias de los fragmentos representativos de una bacteria que pertenece a una especie relacionada. En la presente invención, los términos especie y género son mutuamente intercambiables.
Estas secuencias homólogas pueden corresponder así a variaciones relacionadas con una mutación dentro de la misma especie o entre especies y pueden corresponderse concretamente con truncaciones, sustituciones, deleciones y/o adiciones de al menos un nucleótido. Dichas secuencias homólogas pueden también corresponder a variaciones relacionadas con la degeneración del código genético o a una desviación en el código genético que es específica de la familia, especie o variante, y que probablemente estarán presentes en Lactobacillus.
Las homologías en la secuencia de una proteína y/o ácido nucleico pueden evaluarse utilizando cualquiera de los diferentes algoritmos y programas de comparación de secuencias conocidos en la materia. Tales algoritmos y programas incluyen, pero no se limitan a TBLASTN, BLASTP, FASTA, TFASTA y CLUSTALW (véase por ejemplo, Pearson y Lipman, 1988, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85 (8):2444-2448; Altschul et al., 1990, J. Mol. Biol. 215 (3):403-410; Thompson et al., 1994, Nucleic Acids Res. 22 (2):4673-4680; Higgins et al., 1996, Methods Enzymol. 266:383-402; Altschul et al., 1990, J. Mol. Biol. 215 (3):403-410; Altschul et al., 1993, Nature Genetics 3:266-272).
En una realización particularmente preferida, se evalúan las homologías entre proteínas y secuencias de ácido nucleico utilizando la herramienta "Basic Local Alignment Search Tool" ("BLAST") que es muy conocida en la materia (supra). En particular, se han utilizado cuatro programas BLAST específicos para realizar la siguiente
tarea:
(1) BLASTP: Compara una secuencia de aminoácidos problema frente a una base de datos de secuencias de proteínas.
(2) BLASTN: Compara una secuencia de nucleótidos problema frente a una base de datos de secuencias de nucleótidos.
(3) BLASTX: Compara una secuencia de nucleótidos problema traducida en todos los marcos de lectura frente a una base de datos de secuencias de proteínas.
(4) TBLASTN: Compara una secuencia de proteína problema frente a una base de datos de nucleótidos traducida de forma dinámica en todos los marcos de lectura.
Entre estos fragmentos representativos, son preferibles aquellos capaces de hibridar bajo condiciones astringentes con una secuencia de nucleótidos descrita en la presente invención. Hibridación bajo condiciones astringentes indica que la temperatura y las condiciones de fuerza iónica se escogen de forma que permiten el mantenimiento de la hibridación entre dos fragmentos de DNA complementarios. Tales condiciones de alta astringencia pueden lograrse por ejemplo, llevando a cabo la hibridación a una temperatura preferible de 65ºC en presencia de tampón SSC, por ejemplo, 1 x SSC que corresponde a NaCl 0,15 M y Na-citrato 0,05 M. Los pasos de lavado pueden ser, por ejemplo, los siguientes: 2 x SSC, SDS al 0,1% a temperatura ambiente seguido de tres lavados con 1 x SSC, SDS al 0,1%; 0,5 x SSC, SDS al 0,1%; 0,1 x SSC y SDS al 0,1% a 68ºC durante 15 minutos.
La secuencia de nucleótidos de Id. de Sec Nº:1 se obtuvo secuenciando el genoma de Lactobacillus johnsonii La1 mediante el método de secuenciación dirigida después de una secuenciación fluorescente automatizada de los insertos de los clones y ensamblando estas secuencias de fragmentos de nucleótido (insertos) mediante un programa informático. Para ello, se generaron fragmentos del genoma, se ligaron en vectores adecuados para la amplificación y propagación, y se secuenciaron los fragmentos correspondientes. Con la ayuda de programas adecuados, se analizaron los solapamientos y la distribución final de los fragmentos y la secuencia de nucleótidos de los
mismos.
Los clones para la secuenciación también incluyeron fragmentos de más de 10.000 pb como clones BAC que se utilizaron para proporcionar una mayor estructura de escalado para el ensamblaje. Debido a la presencia de varias regiones repetidas, fue extremadamente difícil un correcto ensamblaje. Estas incluyen especialmente las regiones repetitivas como los elementos IS, los operones ribosomales y específicamente los genes para dos proteínas grandes de superficie celular que contienen entre 100 y 200 repeticiones casi perfectas de 10 aminoácidos. En este caso la secuencia exacta de estas regiones no se pudo determinar debido a la incapacidad de las técnicas actuales de secuenciación de DNA para cubrir la región de una sola vez. Se excluyeron los cebadores internos de secuenciación, ya que ceban en múltiples sitios dentro del gen. Además, la orientación relativa de estos dos genes y su gran similitud de secuencia en una gran longitud, hace que sean dianas potenciales para la recombinación en el huésped. Aunque la topología aquí presentada se ha confirmado mediante PCR con los cebadores adecuados, el genoma es muy probablemente producto de tal evento de recombinación, como lo indica la posición relativa del origen y final de la replicación. Un segundo problema que aparece con las repeticiones del operón ribosomal es que se ha identificado la presencia de 6 operones en sólo 4 loci, y la localización exacta de las posiciones de los loci adicionales fue difícil de conseguir. Finalmente, dos de los elementos IS están presentes en múltiples copias, y dependiendo de sus orientaciones relativas, pueden ser dianas para la recombinación en el huésped. Tal evento se ha identificado al estudiar las secuencias que flanquean el elemento IS, específicamente la secuencia diana del cromosoma que se duplica durante la transposición, por lo que cada elemento IS debería estar flanqueado por repeticiones directas idénticas. Se han identificado dos elementos IS en los que las repeticiones directas están cambiadas debido a la recombinación en el huésped entre los elementos IS. Esto produce una inversión de alrededor de 600.000 pb que ha sido confirmada por PCR con cebadores específicos. Esta recombinación específica del elemento IS puede ser un evento dinámico que tiene lugar dentro de un cultivo en crecimiento, dando lugar una especie principal con una pequeña presencia del genoma recombinado (que se observa como una débil banda de PCR). Finalmente tenemos el caso del profago L771 (aproximadamente 40.000 pb) que está escindiéndose constantemente por una recombinasa específica de sitio. Se ha desarrollado una técnica de PCR cuantitativa para detectar la presencia y medir la abundancia relativa de cada variante. No se han obtenido cultivos puros hasta la fecha.
Los fragmentos particularmente preferibles de la secuencia de ácidos nucleicos identificada como Id. de Sec. Nº:1 son entre 1 y 54596, entre 56070 y 77430, entre 81302 y 308537, entre 309588 y 342757, entre 378458 y 389217, entre 389779 y 404510, entre 405561 y 501116, entre 503873 y 558194, entre 563262 y 696518, entre 697569 y 721736, entre 722787 y 756845, entre 761682 y 860446, entre 860723 y 865550, entre 868541 y 1448288, entre 1463851 y 1526077, entre 1527278 y 1552024, entre 1563147 y 1809115, entre 1810166 y 1858190, entre 1863258 y 1872871, entre 1877939 y 1930430, entre 1932063 y 1983043, todos basados en la numeración del Id. de Sec. Nº:1.
La presente invención puede también utilizarse para producir polipéptidos mediante el uso del conocimiento de los marcos abiertos de lectura (ORF) derivados del Id. de Sec. Nº:1 y expresar el polipéptido deseado de acuerdo con técnicas conocidas. Respecto a esto, un ácido nucleico que corresponde a un marco abierto de lectura puede seleccionarse e insertarse en un vector de expresión. El vector puede introducirse entonces en un huésped, que permite la transcripción y la traducción del marco de lectura abierto a un polipéptido bajo las condiciones adecuadas.
Las moléculas de ácido nucleico derivadas de la secuencia genómica identificadas por el Id. de Sec. Nº:1 pueden obtenerse fácilmente, mediante por ejemplo, la amplificación específica de la secuencia correspondiente utilizando la reacción en cadena de la polimerasa. Gracias a la información de la secuencia proporcionada aquí, un experto en la materia puede diseñar y sintetizar cualquier cebador de nucleótidos adecuado y amplificar un fragmento de interés utilizando la reacción en cadena de la polimerasa. Naturalmente, también pueden utilizarse otras técnicas para la amplificación del ácido nucleico diana, como por ejemplo, la técnica de TAS (Sistema de Amplificación basada en la Transcripción), la técnica de 3SR (Replicación de Secuencia Autosostenida), la técnica de NASBA (Amplificación Basada en la Secuencia de Ácidos Nucleicos), la técnica de SDA (Amplificación por Desplazamiento de Cadenas) o la técnica de TMA (Amplificación Mediada por la Transcripción), etc.
Los (poli)nucleótidos pueden utilizarse como sondas y pueden emplearse técnicas para amplificar o modificar un ácido nucleico que se utiliza como sonda, como por ejemplo, la técnica de LCR (Reacción en Cadena de la Ligasa), la técnica de RCR (Reacción de Reparación de la Cadena), la técnica de CPR (Reacción de Ciclación de Sondas) o la técnica de amplificación de la replicasa Q-beta.
Tanto las sondas de hibridación (detección) como los cebadores, se conciben para la detección de una secuencia de nucleótidos (nucleótido diana) de la presente invención. En el caso de que la diana sea una molécula de RNA, por ejemplo, un mRNA, dicho mRNA puede detectarse directamente o transformarse en un cDNA antes de la detección.
Alternativamente, para poder obtener fragmentos del ácido nucleico representado por el Id. de Sec. Nº:1, el DNA genómico de Lactobacillus johnsonii puede someterse a la digestión con enzimas de restricción seleccionados, separando los fragmentos mediante por ejemplo, electroforesis u otra técnica de separación adecuada. Tales técnicas son bien conocidas en la materia y se han discutido entre otros en Sambrook et al. A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, 1992. Dichos fragmentos pueden obtenerse fácilmente mediante el aislamiento del DNA genómico de Lactobacillus johnsonii La1 y realizando los pasos necesarios.
De forma alternativa, los ácidos nucleicos pueden también obtenerse mediante la síntesis química cuando no tienen un tamaño demasiado grande de acuerdo con los métodos bien conocidos por los expertos en la materia.
Se debe entender por secuencias de nucleótido modificadas cualquier secuencia de nucleótidos obtenida mediante mutagénesis de acuerdo con las técnicas bien conocidas por los expertos en la materia, que presentan modificaciones en relación con las secuencias normales, por ejemplo mutaciones en las secuencias reguladoras y/o promotoras de la expresión de un polipéptido, en particular las que conducen a una modificación a nivel de expresión de dicho polipéptido o a una modulación del ciclo replicativo. También se entenderá que secuencia de nucleótidos modificada indica cualquier secuencia de nucleótidos que codifica un polipéptido modificado tal como se define más
adelante.
Durante el estudio del genoma de Lactobacillus johnsonii pudieron determinarse los siguientes marcos de lectura abiertos y, en base a su homología con otras proteínas conocidas, es posible una anotación de la función del polipéptido resultante.
TABLA I
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
Los ORF que corresponden a varios polipéptidos se muestran en la tabla 1, supra, y están representados por su posición en la secuencia genómica tal como se identifica en el Id. de Sec. Nº:1.
Los marcos de lectura abiertos se han identificado a través de los análisis de homología, así como mediante el análisis de los sitios de inicio de ORF potenciales. Se debe entender que cada ORF identificado comprende una secuencia de nucleótidos que abarca la secuencia de nucleótidos contigua desde el codón inmediatamente en 3' del codón de parada del ORF precedente y a través del codón 5' hasta el siguiente codón de parada del Id. de Sec. Nº:1 en marco de lectura con la secuencia de nucleótidos del ORF.
La Tabla 1 también describe los resultados de búsquedas de homología que comparan las secuencias de los polipéptidos codificados por cada una de las secuencias de ORF presentes en las bases de datos.
La información de la secuencia descrita en la presente solicitud puede utilizarse para seleccionar un polinucleótido de interés, es decir, un ácido nucleico que contiene un marco de lectura abierto que codifica, un presunto polipéptido, conocido o desconocido, y para transformar micro-organismos con el polinucleótido seleccionado. Se pueden utilizar como vehículos de transformación bien conocidos los plásmidos, vectores fágicos (transfección) o vectores F (conjugación). El ácido nucleico introducido en el microorganismo seleccionado puede expresarse y su función biológica puede utilizarse como tal si se conoce, o esclarecerse, en el caso de que se exprese un polipéptido desconocido hasta el momento. El microorganismo seleccionado puede ser un Lactobacillus u otro microorganismo bien conocido, como puede ser otra bacteria, por ejemplo, E. coli, Streptococci o levadura, células de insecto o incluso células animales y de plantas.
Deberá entenderse que los polipéptidos pueden expresarse como tales o como un polipéptido de fusión. Los expertos en la materia conocen las técnicas para realizar ligaciones y expresar los correspondientes polipéptidos de fusión en una célula apropiada.
En vista de la presente invención, pueden idearse también nuevos vectores recombinantes para la clonación y/o expresión de una secuencia de nucleótidos de acuerdo con la presente invención. Los vectores comprenden elementos necesarios para permitir la expresión y/o secreción de las secuencias de nucleótidos en una célula huésped determinada, como un promotor, las señales de inicio y de finalización de la traducción, así como regiones adecuadas para la regulación de la transcripción. Por ejemplo, la expresión de una proteína o péptido puede controlarse mediante cualquier elemento promotor/potenciador conocido en la materia. Son ejemplos de promotores el promotor CMV, la región promotora temprana del SV40, el promotor contenido en la repetición terminal larga 3' del virus del sarcoma de Rous, el promotor de la timidina quinasa del Herpes, las secuencias reguladoras del gen de la metalotioneína, o para los sistemas de expresión procariotas, el promotor de la \beta-lactamasa, el promotor tac o el promotor T7.
El vector será capaz de mantenerse estable en la célula huésped y opcionalmente podrá poseer señales particulares que especifiquen la secreción de la proteína traducida. Estos diferentes elementos se escogen según la célula huésped utilizada. Para tal efecto, pueden insertarse secuencias de nucleótidos de acuerdo con la invención en vectores de replicación autónoma dentro del huésped escogido, o vectores integrativos en el huésped escogido, como por ejemplo, cromosomas artificiales de levadura, o vectores plasmídicos o virales.
Cualquiera de los métodos estándar para insertar fragmentos de DNA en un vector conocidos por los expertos en la materia, podrá utilizarse para construir vectores de expresión que contengan un gen quimérico que contenga señales de control de la transcripción/traducción apropiadas y las secuencias codificantes de la proteína. Estos métodos pueden incluir técnicas de DNA recombinante in vitro y de síntesis recombinante in vivo (recombinación genética).
Puede utilizarse el vector para transcribir y/o traducir un ácido nucleico comprendido en la Id. de Sec. Nº:1 para producir un RNA o RNA antisentido, respectivamente. Dicho vector puede permanecer en su forma episómica o integrarse en el cromosoma, mientras pueda transcribirse para producir el transcrito deseado.
Los ácidos nucleicos antisentido comprenden una secuencia complementaria en al menos una porción de un transcrito de RNA de una secuencia de polinucleótidos del Id. de Sec. Nº:1, que designa una secuencia que posee suficiente complementariedad para poder hibridar con el RNA formando un dúplex estable. En el caso de la secuencia de ácido nucleico antisentido de doble cadena, podrá analizarse una de las cadenas del dúplex de DNA o podrá analizarse la formación de tríplex.
De acuerdo con la presente invención, también pueden obtenerse células huésped transformadas con un ácido nucleico o un vector de acuerdo con lo descrito hasta aquí. Estas células pueden conseguirse al introducir una secuencia de nucleótidos o un vector en una célula adecuada tal y como se ha definido antes, y después cultivar dicha célula bajo condiciones que permitan la replicación y/o la expresión de la secuencia de nucleótidos transformada/transfectada.
La célula huésped puede escogerse de sistema eucariota o procariota, como por ejemplo células bacterianas, células de levadura, células animales y células vegetales. En el contexto de esta invención, deberá entenderse que célula puede comprender sistemas biológicos superiores, como animales, plantas enteras o partes de los mismos. Además, puede escogerse una cepa de célula huésped que module la expresión de las secuencias insertadas, o que modifique y procese el producto génico en la forma específica deseada.
Una célula huésped preferible para la expresión de las proteínas de la invención consiste en células procariotas, como las bacterias Gram negativas o Gram positivas. Una célula huésped más preferible de acuerdo con la invención es una bacteria que pertenece a la familia Lactobacillus, más preferiblemente a la especie de Lactobacillus johnsonii o escogida entre microorganismos asociados con la especie Lactobacillus.
Las células transformadas/transfectadas de acuerdo con la invención pueden utilizarse de forma ventajosa como modelo y pueden utilizarse en métodos para estudiar, identificar y/o seleccionar compuestos que puedan ser responsables de cualquier efecto beneficioso proporcionado por la presente cepa de Lactobacillus.
La invención además permite la síntesis de polipéptidos codificados por los ORF de Lactobacillus johnsonii, en particular aquellos listados en la Tabla 1. En la presente descripción, los términos polipéptido, péptido y proteína se utilizan indistintamente. Además, la presente invención también permite llevar a cabo un método para preparar tales polipéptidos mediante métodos recombinantes que comprenden los pasos de (a) cultivar una célula huésped de acuerdo con la presente invención bajo condiciones adecuadas para producir el polipéptido codificado por el polinucleótido; y (b) recuperar el polipéptido del cultivo.
Deberá apreciarse que los polipéptidos anteriores pueden también obtenerse utilizando química combinatoria, en la que el polipéptido se modifica en algunas posiciones antes de realizar un ensayo en sistemas modelo, para seleccionar los compuestos que son más activos o que presentan las propiedades deseadas.
En este contexto, la síntesis química posee la ventaja de poder utilizar aminoácidos no naturales o enlaces no peptídicos. De acuerdo con esto, para poder alargar la vida por ejemplo, de los polipéptidos de acuerdo con la invención, puede ser ventajoso utilizar dichos aminoácidos no naturales, por ejemplo en la forma D, o alternativamente análogos de aminoácidos, preferiblemente formas que contienen azufre.
Finalmente, la estructura de los polipéptidos, sus homólogos o formas modificadas, así como los fragmentos correspondientes, pueden integrarse en estructuras químicas de tipo polipeptídico y similares. De acuerdo con esto, para poder conservar el polipéptido en un ambiente in vivo será preferible proporcionar en los extremos N- y C-terminal, compuestos que proporcionen una resistencia a la degradación por parte de proteasas.
También se apreciará, que los diferentes polipéptidos producidos por el método anterior pueden representar antígenos para el sistema inmunitario de un huésped animal, por lo que pueden producirse anticuerpos dirigidos contra dichos polipéptidos. Estos anticuerpos podrán utilizarse para la detección de un polipéptido de interés en una mezcla o genéricamente de una cepa de Lactobacillus en una muestra. Además, podrán utilizarse como herramientas de investigación para, por ejemplo, producir anticuerpos contra epítopos de la superficie celular y determinar el efecto al bloquear ciertos polipéptidos de la pared de la célula bacteriana.
Un método para la detección y/o identificación de Lactobacilli, preferiblemente Lactobacillus johnsonii en una muestra biológica, puede comprender varias técnicas conocidas en la materia, como la PCR o simplemente la hibridación con una sonda adecuada. Alternativamente, puede utilizarse para este propósito un anticuerpo producido contra un epítopo de la pared de la célula de Lactobacillus, preferiblemente de Lactobacillus johnsonii. Podrá apreciarse que el método anterior puede también invertirse y que la presencia de anticuerpos contra Lactobacillus puede determinarse mediante el contacto de la muestra a ensayar con un polipéptido de Lactobacillus bajo condiciones que permitan la formación de inmunocomplejos.
Los polipéptidos y anticuerpos que pueden obtenerse de acuerdo con la presente invención y las secuencias de nucleótidos descritas en la misma, podrán utilizarse en métodos in vitro y/o in vivo para la detección y/o la identificación de bacterias que pertenecen a las especies de Lactobacillus en una muestra biológica (tejido o fluido biológico) que probablemente los contiene. Estos métodos, dependiendo de la especificidad de los polipéptidos, de los anticuerpos y de las secuencias de nucleótidos descritas hasta aquí, que se van a utilizar, podrán detectar y/o identificar las variantes bacterianas a las que pertenecen las especies de Lactobacillus, así como a microorganismos asociados que pueden detectarse por los polipéptidos, los anticuerpos y las secuencias de nucleótidos que serán escogidos. Será ventajoso, por ejemplo, escoger un polipéptido, un anticuerpo o una secuencia de nucleótidos que sea capaz de detectar cualquier bacteria de la familia Lactobacillus escogiendo un polipéptido, un anticuerpo y/o una secuencia de nucleótidos que sea específica de la familia.
Deberán considerarse como parte de la especificación las secuencias referidas aquí como Id. de Sec. Nº: 1 en los listados de secuencias anexados.
La presente invención también está relacionada con un medio legible por ordenador que tiene grabado una o más secuencias de nucleótidos y/o una secuencia de polipéptido de acuerdo con la invención. Este medio puede también comprender información adicional extraída de la presente invención, como por ejemplo, analogías con secuencias ya conocidas y/o información relacionada con las secuencias de nucleótidos y/o secuencias de polipéptidos de otros microorganismos para facilitar el análisis comparativo y la explotación de los resultados obtenidos. Los medios preferidos son por ejemplo, medios magnéticos, ópticos, eléctricos e híbridos como, por ejemplo, discos flexibles, CD-ROM o cintas de grabación.
La invención también está relacionada con equipos o unidades para la detección y/o identificación de bacterias que pertenecen a las especies de Lactobacillus johnsonii o a microorganismos asociados, que comprenden, un polipéptido de acuerdo con la invención, cuando sea apropiado, los reactivos para constituir el medio apropiado para la reacción inmunológica o especifica, los reactivos que permiten la detección de los complejos antígeno-anticuerpo producidos por la reacción inmunológica entre el(los) polipéptido(s) de la invención y los anticuerpos que pueden estar presentes en la muestra biológica, siendo también posible que estos reactivos posean un marcaje, o que puedan ser reconocidos a su vez por un reactivo marcado, concretamente en el caso que el polipéptido de acuerdo con la invención no esté marcado, una muestra biológica de referencia (control negativo) libre de anticuerpos que reconozcan un polipéptido de acuerdo con la invención y una muestra biológica de referencia (control positivo) que contiene una cantidad predeterminada de anticuerpos que reconocen un polipéptido de acuerdo con la invención.
La invención también está relacionada con un equipo o unidad para la detección y/o identificación de bacterias que pertenecen a la especie Lactobacillus johnsonii o de un microorganismo asociado, o para la detección y/o identificación de un microorganismo, en el que el equipo comprende un chip de proteínas.
<110> Société des Produits Nestlé S.A.
\vskip0.400000\baselineskip
<120> La1 - El genoma de un Lactobacillus 
\vskip0.400000\baselineskip
<130> 80404
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn versión 3.1
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1983043
\vskip0.400000\baselineskip
<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Lactobacillus johnsonii 
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1788207)..(1788207)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1788238)..(1788238)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1788240)..(1788240)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1788252)..(1788252)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1788269)..(1788269)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1788279)..(1788279)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1788282)..(1788282)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1788284)..(1788284)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1790068)..(1790068)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1980697)..(1980697)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1980698)..(1980698)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1980699)..(1980699)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1980700)..(1980700)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1980701)..(1980706)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1982537)..(1982546)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> característica miscelánea
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (1982537)..(1982546)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n puede ser a, c, g o t
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip1cm
15 
\hskip1cm
16 
\hskip1cm
17 
\hskip1cm
18 
\hskip1cm
19 
\hskip1cm
20 
\hskip1cm
21 
\hskip1cm
22 
\hskip1cm
23 
\hskip1cm
24 
\hskip1cm
25 
\hskip1cm
26 
\hskip1cm
27 
\hskip1cm
28 
\hskip1cm
29 
\hskip1cm
30 
\hskip1cm
31 
\hskip1cm
32 
\hskip1cm
33 
\hskip1cm
34 
\hskip1cm
35 
\hskip1cm
36 
\hskip1cm
37 
\hskip1cm
38 
\hskip1cm
39 
\hskip1cm
40 
\hskip1cm
41 
\hskip1cm
42 
\hskip1cm
43 
\hskip1cm
44 
\hskip1cm
45 
\hskip1cm
46 
\hskip1cm
47 
\hskip1cm
48 
\hskip1cm
49 
\hskip1cm
50 
\hskip1cm
51 
\hskip1cm
52 
\hskip1cm
53 
\hskip1cm
54 
\hskip1cm
55 
\hskip1cm
56 
\hskip1cm
57 
\hskip1cm
58 
\hskip1cm
59 
\hskip1cm
60 
\hskip1cm
61 
\hskip1cm
62 
\hskip1cm
63 
\hskip1cm
64 
\hskip1cm
65 
\hskip1cm
66 
\hskip1cm
67 
\hskip1cm
68 
\hskip1cm
69 
\hskip1cm
70 
\hskip1cm
71 
\hskip1cm
72 
\hskip1cm
73 
\hskip1cm
74 
\hskip1cm
75 
\hskip1cm
76 
\hskip1cm
77 
\hskip1cm
78 
\hskip1cm
79 
\hskip1cm
80 
\hskip1cm
81 
\hskip1cm
82 
\hskip1cm
83 
\hskip1cm
84 
\hskip1cm
85 
\hskip1cm
86 
\hskip1cm
87 
\hskip1cm
88 
\hskip1cm
89 
\hskip1cm
90 
\hskip1cm
91 
\hskip1cm
92 
\hskip1cm
93 
\hskip1cm
94 
\hskip1cm
95 
\hskip1cm
96 
\hskip1cm
97 
\hskip1cm
98 
\hskip1cm
99 
\hskip1cm
100 
\hskip1cm
101 
\hskip1cm
102 
\hskip1cm
103 
\hskip1cm
104 
\hskip1cm
105 
\hskip1cm
106 
\hskip1cm
107 
\hskip1cm
108 
\hskip1cm
109 
\hskip1cm
110 
\hskip1cm
111 
\hskip1cm
112 
\hskip1cm
113 
\hskip1cm
114 
\hskip1cm
115 
\hskip1cm
116 
\hskip1cm
117 
\hskip1cm
118 
\hskip1cm
119 
\hskip1cm
120 
\hskip1cm
121 
\hskip1cm
122 
\hskip1cm
123 
\hskip1cm
124 
\hskip1cm
125 
\hskip1cm
126 
\hskip1cm
127 
\hskip1cm
128 
\hskip1cm
129 
\hskip1cm
130 
\hskip1cm
131 
\hskip1cm
132 
\hskip1cm
133 
\hskip1cm
134 
\hskip1cm
135 
\hskip1cm
136 
\hskip1cm
137 
\hskip1cm
138 
\hskip1cm
139 
\hskip1cm
140 
\hskip1cm
141 
\hskip1cm
142 
\hskip1cm
143 
\hskip1cm
144 
\hskip1cm
145 
\hskip1cm
146 
\hskip1cm
147 
\hskip1cm
148 
\hskip1cm
149 
\hskip1cm
150 
\hskip1cm
151 
\hskip1cm
152 
\hskip1cm
153 
\hskip1cm
154 
\hskip1cm
155 
\hskip1cm
156 
\hskip1cm
157 
\hskip1cm
158 
\hskip1cm
159 
\hskip1cm
160 
\hskip1cm
161 
\hskip1cm
162 
\hskip1cm
163 
\hskip1cm
164 
\hskip1cm
165 
\hskip1cm
166 
\hskip1cm
167 
\hskip1cm
168 
\hskip1cm
169 
\hskip1cm
170 
\hskip1cm
171 
\hskip1cm
172 
\hskip1cm
173 
\hskip1cm
174 
\hskip1cm
175 
\hskip1cm
176 
\hskip1cm
177 
\hskip1cm
178 
\hskip1cm
179 
\hskip1cm
180 
\hskip1cm
181 
\hskip1cm
182 
\hskip1cm
183 
\hskip1cm
184 
\hskip1cm
185 
\hskip1cm
186 
\hskip1cm
187 
\hskip1cm
188 
\hskip1cm
189 
\hskip1cm
190 
\hskip1cm
191 
\hskip1cm
192 
\hskip1cm
193 
\hskip1cm
194 
\hskip1cm
195 
\hskip1cm
196 
\hskip1cm
197 
\hskip1cm
198 
\hskip1cm
199 
\hskip1cm
200 
\hskip1cm
201 
\hskip1cm
202 
\hskip1cm
203 
\hskip1cm
204 
\hskip1cm
205 
\hskip1cm
206 
\hskip1cm
207 
\hskip1cm
208 
\hskip1cm
209 
\hskip1cm
210 
\hskip1cm
211 
\hskip1cm
212 
\hskip1cm
213 
\hskip1cm
214 
\hskip1cm
215 
\hskip1cm
216 
\hskip1cm
217 
\hskip1cm
218 
\hskip1cm
219 
\hskip1cm
220 
\hskip1cm
221 
\hskip1cm
222 
\hskip1cm
223 
\hskip1cm
224 
\hskip1cm
225 
\hskip1cm
226 
\hskip1cm
227 
\hskip1cm
228 
\hskip1cm
229 
\hskip1cm
230 
\hskip1cm
231 
\hskip1cm
232 
\hskip1cm
233 
\hskip1cm
234 
\hskip1cm
235 
\hskip1cm
236 
\hskip1cm
237 
\hskip1cm
238 
\hskip1cm
239 
\hskip1cm
240 
\hskip1cm
241 
\hskip1cm
242 
\hskip1cm
243 
\hskip1cm
244 
\hskip1cm
245 
\hskip1cm
246 
\hskip1cm
247 
\hskip1cm
248 
\hskip1cm
249 
\hskip1cm
250 
\hskip1cm
251 
\hskip1cm
252 
\hskip1cm
253 
\hskip1cm
254 
\hskip1cm
255 
\hskip1cm
256 
\hskip1cm
257 
\hskip1cm
258 
\hskip1cm
259 
\hskip1cm
260 
\hskip1cm
261 
\hskip1cm
262 
\hskip1cm
263 
\hskip1cm
264 
\hskip1cm
265 
\hskip1cm
266 
\hskip1cm
267 
\hskip1cm
268 
\hskip1cm
269 
\hskip1cm
270 
\hskip1cm
271 
\hskip1cm
272 
\hskip1cm
273 
\hskip1cm
274 
\hskip1cm
275 
\hskip1cm
276 
\hskip1cm
277 
\hskip1cm
278 
\hskip1cm
279 
\hskip1cm
280 
\hskip1cm
281 
\hskip1cm
282 
\hskip1cm
283 
\hskip1cm
284 
\hskip1cm
285 
\hskip1cm
286 
\hskip1cm
287 
\hskip1cm
288 
\hskip1cm
289 
\hskip1cm
290 
\hskip1cm
291 
\hskip1cm
292 
\hskip1cm
293 
\hskip1cm
294 
\hskip1cm
295 
\hskip1cm
296 
\hskip1cm
297 
\hskip1cm
298 
\hskip1cm
299 
\hskip1cm
300 
\hskip1cm
301 
\hskip1cm
302 
\hskip1cm
303 
\hskip1cm
304 
\hskip1cm
305 
\hskip1cm
306 
\hskip1cm
307 
\hskip1cm
308 
\hskip1cm
309 
\hskip1cm
310 
\hskip1cm
311 
\hskip1cm
312 
\hskip1cm
313 
\hskip1cm
314 
\hskip1cm
315 
\hskip1cm
316 
\hskip1cm
317 
\hskip1cm
318 
\hskip1cm
319 
\hskip1cm
320 
\hskip1cm
321 
\hskip1cm
322 
\hskip1cm
323 
\hskip1cm
324 
\hskip1cm
325 
\hskip1cm
326 
\hskip1cm
327 
\hskip1cm
328 
\hskip1cm
329 
\hskip1cm
330 
\hskip1cm
331 
\hskip1cm
332 
\hskip1cm
333 
\hskip1cm
334 
\hskip1cm
335 
\hskip1cm
336 
\hskip1cm
337 
\hskip1cm
338 
\hskip1cm
339 
\hskip1cm
340 
\hskip1cm
341 
\hskip1cm
342 
\hskip1cm
343 
\hskip1cm
344 
\hskip1cm
345 
\hskip1cm
346 
\hskip1cm
347 
\hskip1cm
348 
\hskip1cm
349 
\hskip1cm
350 
\hskip1cm
351 
\hskip1cm
352 
\hskip1cm
353 
\hskip1cm
354 
\hskip1cm
355 
\hskip1cm
356 
\hskip1cm
357 
\hskip1cm
358 
\hskip1cm
359 
\hskip1cm
360 
\hskip1cm
361 
\hskip1cm
362 
\hskip1cm
363 
\hskip1cm
364 
\hskip1cm
365 
\hskip1cm
366 
\hskip1cm
367 
\hskip1cm
368 
\hskip1cm
369 
\hskip1cm
370 
\hskip1cm
371 
\hskip1cm
372 
\hskip1cm
373 
\hskip1cm
374 
\hskip1cm
375 
\hskip1cm
376 
\hskip1cm
377 
\hskip1cm
378 
\hskip1cm
379 
\hskip1cm
380 
\hskip1cm
381 
\hskip1cm
382 
\hskip1cm
383 
\hskip1cm
384 
\hskip1cm
385 
\hskip1cm
386 
\hskip1cm
387 
\hskip1cm
388 
\hskip1cm
389 
\hskip1cm
390 
\hskip1cm
391 
\hskip1cm
392 
\hskip1cm
393 
\hskip1cm
394 
\hskip1cm
395 
\hskip1cm
396 
\hskip1cm
397 
\hskip1cm
398 
\hskip1cm
399 
\hskip1cm
400 
\hskip1cm
401 
\hskip1cm
402 
\hskip1cm
403 
\hskip1cm
404 
\hskip1cm
405 
\hskip1cm
406 
\hskip1cm
407 
\hskip1cm
408 
\hskip1cm
409 
\hskip1cm
410 
\hskip1cm
411 
\hskip1cm
412 
\hskip1cm
413 
\hskip1cm
414 
\hskip1cm
415 
\hskip1cm
416 
\hskip1cm
417 
\hskip1cm
418 
\hskip1cm
419 
\hskip1cm
420 
\hskip1cm
421 
\hskip1cm
422 
\hskip1cm
423 
\hskip1cm
424 
\hskip1cm
425 
\hskip1cm
426 
\hskip1cm
427 
\hskip1cm
428 
\hskip1cm
429 
\hskip1cm
430 
\hskip1cm
431 
\hskip1cm
432 
\hskip1cm
433 
\hskip1cm
434 
\hskip1cm
435 
\hskip1cm
436 
\hskip1cm
437 
\hskip1cm
438 
\hskip1cm
439 
\hskip1cm
440 
\hskip1cm
441 
\hskip1cm
442 
\hskip1cm
443 
\hskip1cm
444 
\hskip1cm
445 
\hskip1cm
446 
\hskip1cm
447 
\hskip1cm
448 
\hskip1cm
449 
\hskip1cm
450 
\hskip1cm
451 
\hskip1cm
452 
\hskip1cm
453 
\hskip1cm
454 
\hskip1cm
455 
\hskip1cm
456 
\hskip1cm
457 
\hskip1cm
458 
\hskip1cm
459 
\hskip1cm
460 
\hskip1cm
461 
\hskip1cm
462 
\hskip1cm
463 
\hskip1cm
464 
\hskip1cm
465 
\hskip1cm
466 
\hskip1cm
467 
\hskip1cm
468 
\hskip1cm
469 
\hskip1cm
470 
\hskip1cm
471 
\hskip1cm
472 
\hskip1cm
473 
\hskip1cm
474 
\hskip1cm
475 
\hskip1cm
476 
\hskip1cm
477 
\hskip1cm
478 
\hskip1cm
479 
\hskip1cm
480 
\hskip1cm
481 
\hskip1cm
482 
\hskip1cm
483 
\hskip1cm
484 
\hskip1cm
485 
\hskip1cm
486 
\hskip1cm
487 
\hskip1cm
488 
\hskip1cm
489 
\hskip1cm
490 
\hskip1cm
491 
\hskip1cm
492 
\hskip1cm
493 
\hskip1cm
494 
\hskip1cm
495 
\hskip1cm
496 
\hskip1cm
497 
\hskip1cm
498 
\hskip1cm
499 
\hskip1cm
500 
\hskip1cm
501 
\hskip1cm
502 
\hskip1cm
503 
\hskip1cm
504 
\hskip1cm
505 
\hskip1cm
506 
\hskip1cm
507 
\hskip1cm
508 
\hskip1cm
509 
\hskip1cm
510 
\hskip1cm
511 
\hskip1cm
512 
\hskip1cm
513 
\hskip1cm
514 
\hskip1cm
515 
\hskip1cm
516 
\hskip1cm
517 
\hskip1cm
518 
\hskip1cm
519 
\hskip1cm
520 
\hskip1cm
521 
\hskip1cm
522 
\hskip1cm
523 
\hskip1cm
524 
\hskip1cm
525 
\hskip1cm
526 
\hskip1cm
527 
\hskip1cm
528 
\hskip1cm
529 
\hskip1cm
530 
\hskip1cm
531 
\hskip1cm
532 
\hskip1cm
533 
\hskip1cm
534 
\hskip1cm
535 
\hskip1cm
536 
\hskip1cm
537 
\hskip1cm
538 
\hskip1cm
539 
\hskip1cm
540 
\hskip1cm
541 
\hskip1cm
542 
\hskip1cm
543 
\hskip1cm
544 
\hskip1cm
545 
\hskip1cm
546 
\hskip1cm
547 
\hskip1cm
548 
\hskip1cm
549 
\hskip1cm
550 
\hskip1cm
551 
\hskip1cm
552 
\hskip1cm
553 
\hskip1cm
554 
\hskip1cm
555 
\hskip1cm
556 
\hskip1cm
557 
\hskip1cm
558 
\hskip1cm
559 
\hskip1cm
560 
\hskip1cm
561 
\hskip1cm
562 
\hskip1cm
563 
\hskip1cm
564 
\hskip1cm
565 
\hskip1cm
566 
\hskip1cm
567 
\hskip1cm
568 
\hskip1cm
569 
\hskip1cm
570 
\hskip1cm
571 
\hskip1cm
572 
\hskip1cm
573 
\hskip1cm
574 
\hskip1cm
575 
\hskip1cm
576 
\hskip1cm
577 
\hskip1cm
578 
\hskip1cm
579 
\hskip1cm
580 
\hskip1cm
581 
\hskip1cm
582 
\hskip1cm
583 
\hskip1cm
584 
\hskip1cm
585 
\hskip1cm
586 
\hskip1cm
587 
\hskip1cm
588 
\hskip1cm
589 
\hskip1cm
590 
\hskip1cm
591 
\hskip1cm
592 
\hskip1cm
593 
\hskip1cm
594 
\hskip1cm
595 
\hskip1cm
596 
\hskip1cm
597 
\hskip1cm
598 
\hskip1cm
599 
\hskip1cm
600 
\hskip1cm
601 
\hskip1cm
602 
\hskip1cm
603 
\hskip1cm
604 
\hskip1cm
605 
\hskip1cm
606 
\hskip1cm
607 
\hskip1cm
608 
\hskip1cm
609 
\hskip1cm
610 
\hskip1cm
611 
\hskip1cm
612 
\hskip1cm
613 
\hskip1cm
614 
\hskip1cm
615 
\hskip1cm
616 
\hskip1cm
617 
\hskip1cm
618 
\hskip1cm
619 
\hskip1cm
620 
\hskip1cm
621 
\hskip1cm
622 
\hskip1cm
623 
\hskip1cm
624 
\hskip1cm
625 
\hskip1cm
626 
\hskip1cm
627 
\hskip1cm
628 
\hskip1cm
629 
\hskip1cm
630 
\hskip1cm
631 
\hskip1cm
632 
\hskip1cm
633 
\hskip1cm
634 
\hskip1cm
635 
\hskip1cm
636 
\hskip1cm
637 
\hskip1cm
638 
\hskip1cm
639 
\hskip1cm
640 
\hskip1cm
641 
\hskip1cm
642 
\hskip1cm
643 
\hskip1cm
644 
\hskip1cm
645 
\hskip1cm
646 
\hskip1cm
647 
\hskip1cm
648 
\hskip1cm
649 
\hskip1cm
650 
\hskip1cm
651 
\hskip1cm
652 
\hskip1cm
653 
\hskip1cm
654 
\hskip1cm
655 
\hskip1cm
656 
\hskip1cm
657 
\hskip1cm
658 
\hskip1cm
659 
\hskip1cm
660 
\hskip1cm
661 
\hskip1cm
662 
\hskip1cm
663 
\hskip1cm
664 
\hskip1cm
665 
\hskip1cm
666 
\hskip1cm
667 
\hskip1cm
668 
\hskip1cm
669 
\hskip1cm
670 
\hskip1cm
671 
\hskip1cm
672 
\hskip1cm
673 
\hskip1cm
674 
\hskip1cm
675 
\hskip1cm
676 
\hskip1cm
677 
\hskip1cm
678 
\hskip1cm
679 
\hskip1cm
680 
\hskip1cm
681 
\hskip1cm
682 
\hskip1cm
683 
\hskip1cm
684 
\hskip1cm
685 
\hskip1cm
686 
\hskip1cm
687 
\hskip1cm
688 
\hskip1cm
689 
\hskip1cm
690 
\hskip1cm
691 
\hskip1cm
692 
\hskip1cm
693 
\hskip1cm
694 
\hskip1cm
695 
\hskip1cm
696 
\hskip1cm
697 
\hskip1cm
698 
\hskip1cm
699 
\hskip1cm
700 
\hskip1cm
701 
\hskip1cm
702 
\hskip1cm
703 
\hskip1cm
704 
\hskip1cm
705 
\hskip1cm
706 
\hskip1cm
707 
\hskip1cm
708 
\hskip1cm
709 
\hskip1cm
710 
\hskip1cm
711 
\hskip1cm
712 
\hskip1cm
713 
\hskip1cm
714 
\hskip1cm
715 
\hskip1cm
716 
\hskip1cm
717 
\hskip1cm
718 
\hskip1cm
719 
\hskip1cm
720 
\hskip1cm
721 
\hskip1cm
722 
\hskip1cm
723 
\hskip1cm
724 
\hskip1cm
725 
\hskip1cm
726 
\hskip1cm
727 
\hskip1cm
728 
\hskip1cm
729 
\hskip1cm
730 
\hskip1cm
731 
\hskip1cm
732 
\hskip1cm
733 
\hskip1cm
734 
\hskip1cm
735 
\hskip1cm
736 
\hskip1cm
737 
\hskip1cm
738 
\hskip1cm
739 
\hskip1cm
740 
\hskip1cm
741 
\hskip1cm
742 
\hskip1cm
743 
\hskip1cm
744 
\hskip1cm
745 
\hskip1cm
746 
\hskip1cm
747 
\hskip1cm
748 
\hskip1cm
749 
\hskip1cm
750 
\hskip1cm
751 
\hskip1cm
752 
\hskip1cm
753 
\hskip1cm
754 
\hskip1cm
755 
\hskip1cm
756 
\hskip1cm
757 
\hskip1cm
758 
\hskip1cm
759 
\hskip1cm
760 
\hskip1cm
761 
\hskip1cm
762 
\hskip1cm
763 
\hskip1cm
764 
\hskip1cm
765 
\hskip1cm
766 
\hskip1cm
767 
\hskip1cm
768 
\hskip1cm
769 
\hskip1cm
770 
\hskip1cm
771 
\hskip1cm
772 
\hskip1cm
773 
\hskip1cm
774 
\hskip1cm
775 
\hskip1cm
776 
\hskip1cm
777 
\hskip1cm
778 
\hskip1cm
779 
\hskip1cm
780 
\hskip1cm
781 
\hskip1cm
782 
\hskip1cm
783 
\hskip1cm
784 
\hskip1cm
785 
\hskip1cm
786 
\hskip1cm
787 
\hskip1cm
788 
\hskip1cm
789 
\hskip1cm
790 
\hskip1cm
791 
\hskip1cm
792 
\hskip1cm
793 
\hskip1cm
794 
\hskip1cm
795 
\hskip1cm
796 
\hskip1cm
797 
\hskip1cm
798 
\hskip1cm
799 
\hskip1cm
800 
\hskip1cm
801 
\hskip1cm
802 
\hskip1cm
803 
\hskip1cm
804 
\hskip1cm
805 
\hskip1cm
806 
\hskip1cm
807 
\hskip1cm
808 
\hskip1cm
809 
\hskip1cm
810 
\hskip1cm
811 
\hskip1cm
812 
\hskip1cm
813 
\hskip1cm
814 
\hskip1cm
815 
\hskip1cm
816 
\hskip1cm
817 
\hskip1cm
818 
\hskip1cm
819 
\hskip1cm
820 
\hskip1cm
821 
\hskip1cm
822 
\hskip1cm
823 
\hskip1cm
824 
\hskip1cm
825 
\hskip1cm
826 
\hskip1cm
827 
\hskip1cm
828 
\hskip1cm
829 
\hskip1cm
830 
\hskip1cm
831 
\hskip1cm
832 
\hskip1cm
833 
\hskip1cm
834 
\hskip1cm
835 
\hskip1cm
836 
\hskip1cm
837 
\hskip1cm
838 
\hskip1cm
839 
\hskip1cm
840 
\hskip1cm
841 
\hskip1cm
842 
\hskip1cm
843 
\hskip1cm
844 
\hskip1cm
845 
\hskip1cm
846 
\hskip1cm
847 
\hskip1cm
848 
\hskip1cm
849 
\hskip1cm
850 
\hskip1cm
851 
\hskip1cm
852 
\hskip1cm
853 
\hskip1cm
854 
\hskip1cm
855 
\hskip1cm
856 
\hskip1cm
857 
\hskip1cm
858 
\hskip1cm
859 
\hskip1cm
860 
\hskip1cm
861 
\hskip1cm
862 
\hskip1cm
863 
\hskip1cm
864 
\hskip1cm
865 
\hskip1cm
866 
\hskip1cm
867 
\hskip1cm
868 
\hskip1cm
869 
\hskip1cm
870 
\hskip1cm
871 
\hskip1cm
872 
\hskip1cm
873 
\hskip1cm
874 
\hskip1cm
875 
\hskip1cm
876 
\hskip1cm
877 
\hskip1cm
878 
\hskip1cm
879 
\hskip1cm
880 
\hskip1cm
881 
\hskip1cm
882 
\hskip1cm
883 
\hskip1cm
884 
\hskip1cm
885 
\hskip1cm
886 
\hskip1cm
887 
\hskip1cm
888 
\hskip1cm
889 
\hskip1cm
890 
\hskip1cm
891 
\hskip1cm
892 
\hskip1cm
893 
\hskip1cm
894 
\hskip1cm
895 
\hskip1cm
896 
\hskip1cm
897 
\hskip1cm
898 
\hskip1cm
899 
\hskip1cm
900 
\hskip1cm
901 
\hskip1cm
902 
\hskip1cm
903 
\hskip1cm
904 
\hskip1cm
905 
\hskip1cm
906 
\hskip1cm
907 
\hskip1cm
908 
\hskip1cm
909 
\hskip1cm
910 
\hskip1cm
911 
\hskip1cm
912 
\hskip1cm
913 
\hskip1cm
914 
\hskip1cm
915 
\hskip1cm
916 
\hskip1cm
917 
\hskip1cm
918 
\hskip1cm
919 
\hskip1cm
920 
\hskip1cm
921 
\hskip1cm
922 
\hskip1cm
923 
\hskip1cm
924 
\hskip1cm
925 
\hskip1cm
926 
\hskip1cm
927 
\hskip1cm
928 
\hskip1cm
929 
\hskip1cm
930 
\hskip1cm
931 
\hskip1cm
932 
\hskip1cm
933 
\hskip1cm
934 
\hskip1cm
935 
\hskip1cm
936 
\hskip1cm
937 
\hskip1cm
938 
\hskip1cm
939 
\hskip1cm
940 
\hskip1cm
941 
\hskip1cm
942 
\hskip1cm
943 
\hskip1cm
944 
\hskip1cm
945 
\hskip1cm
946 
\hskip1cm
947 
\hskip1cm
948 
\hskip1cm
949 
\hskip1cm
950 
\hskip1cm
951 
\hskip1cm
952 
\hskip1cm
953 
\hskip1cm
954 
\hskip1cm
955 
\hskip1cm
956 
\hskip1cm
957 
\hskip1cm
958 
\hskip1cm
959 
\hskip1cm
960 
\hskip1cm
961 
\hskip1cm
962 
\hskip1cm
963 
\hskip1cm
964 
\hskip1cm
965 
\hskip1cm
966 
\hskip1cm
967 
\hskip1cm
968 
\hskip1cm
969 
\hskip1cm
970 
\hskip1cm
971 
\hskip1cm
972 
\hskip1cm
973 
\hskip1cm
974 
\hskip1cm
975 
\hskip1cm
976 
\hskip1cm
977 
\hskip1cm
978 
\hskip1cm
979 
\hskip1cm
980 
\hskip1cm
981 
\hskip1cm
982 
\hskip1cm
983 
\hskip1cm
984 
\hskip1cm
985 
\hskip1cm
986 
\hskip1cm
987 
\hskip1cm
988 
\hskip1cm
989 
\hskip1cm
990 
\hskip1cm
991 
\hskip1cm
992 
\hskip1cm
993 
\hskip1cm
994 
\hskip1cm
995 
\hskip1cm
996 
\hskip1cm
997 
\hskip1cm
998 
\hskip1cm
999 
\hskip1cm
1000 
\hskip1cm
1001 
\hskip1cm
1002 
\hskip1cm
1003 
\hskip1cm
1004 
\hskip1cm
1005 
\hskip1cm
1006 
\hskip1cm
1007 
\hskip1cm
1008 
\hskip1cm
1009 
\hskip1cm
1010 
\hskip1cm
1011 
\hskip1cm
1012 
\hskip1cm
1013 
\hskip1cm
1014 
\hskip1cm
1015 
\hskip1cm
1016 
\hskip1cm
1017 
\hskip1cm
1018 
\hskip1cm
1019 
\hskip1cm
1020 
\hskip1cm
1021 
\hskip1cm
1022 
\hskip1cm
1023 
\hskip1cm
1024 
\hskip1cm
1025 
\hskip1cm
1026 
\hskip1cm
1027 
\hskip1cm
1028 
\hskip1cm
1029 
\hskip1cm
1030 
\hskip1cm
1031 
\hskip1cm
1032 
\hskip1cm
1033 
\hskip1cm
1034 
\hskip1cm
1035 
\hskip1cm
1036 
\hskip1cm
1037 
\hskip1cm
1038 
\hskip1cm
1039 
\hskip1cm
1040 
\hskip1cm
1041 
\hskip1cm
1042 
\hskip1cm
1043 
\hskip1cm
1044 
\hskip1cm
1045 
\hskip1cm
1046 
\hskip1cm
1047 
\hskip1cm
1048 
\hskip1cm
1049 
\hskip1cm
1050 
\hskip1cm
1051 
\hskip1cm
1052 
\hskip1cm
1053 
\hskip1cm
1054 
\hskip1cm
1055 
\hskip1cm
1056 
\hskip1cm
1057 
\hskip1cm
1058 
\hskip1cm
1059 
\hskip1cm
1060 
\hskip1cm
1061 
\hskip1cm
1062 
\hskip1cm
1063 
\hskip1cm
1064 
\hskip1cm
1065 
\hskip1cm
1066 
\hskip1cm
1067 
\hskip1cm
1068 
\hskip1cm
1069 
\hskip1cm
1070 
\hskip1cm
1071 
\hskip1cm
1072 
\hskip1cm
1073 
\hskip1cm
1074 
\hskip1cm
1075 
\hskip1cm
1076 
\hskip1cm
1077 
\hskip1cm
1078 
\hskip1cm
1079 
\hskip1cm
1080 
\hskip1cm
1081 
\hskip1cm
1082 
\hskip1cm
1083 
\hskip1cm
1084 
\hskip1cm
1085 
\hskip1cm
1086 
\hskip1cm
1087 
\hskip1cm
1088 
\hskip1cm
1089 
\hskip1cm
1090 
\hskip1cm
1091 
\hskip1cm
1092 
\hskip1cm
1093 
\hskip1cm
1094 
\hskip1cm
1095 
\hskip1cm
1096 
\hskip1cm
1097 
\hskip1cm
1098 
\hskip1cm
1099 
\hskip1cm
1100 
\hskip1cm
1101 
\hskip1cm
1102 
\hskip1cm
1103 
\hskip1cm
1104 
\hskip1cm
1105 
\hskip1cm
1106 
\hskip1cm
1107 
\hskip1cm
1108 
\hskip1cm
1109 
\hskip1cm
1110 
\hskip1cm
1111 
\hskip1cm
1112 
\hskip1cm
1113 
\hskip1cm
1114 
\hskip1cm
1115 
\hskip1cm
1116 
\hskip1cm
1117 
\hskip1cm
1118 
\hskip1cm
1119 
\hskip1cm
1120 
\hskip1cm
1121 
\hskip1cm
1122 
\hskip1cm
1123 
\hskip1cm
1124 
\hskip1cm
1125 
\hskip1cm
1126 
\hskip1cm
1127 
\hskip1cm
1128 
\hskip1cm
1129 
\hskip1cm
1130 
\hskip1cm
1131 
\hskip1cm
1132 
\hskip1cm
1133 
\hskip1cm
1134 
\hskip1cm
1135 
\hskip1cm
1136 
\hskip1cm
1137 
\hskip1cm
1138 
\hskip1cm
1139 
\hskip1cm
1140 
\hskip1cm
1141 
\hskip1cm
1142 
\hskip1cm
1143 
\hskip1cm
1144 
\hskip1cm
1145 
\hskip1cm
1146 
\hskip1cm
1147 
\hskip1cm
1148 
\hskip1cm
1149 
\hskip1cm
1150 
\hskip1cm
1151 
\hskip1cm
1152 
\hskip1cm
1153 
\hskip1cm
1154 
\hskip1cm
1155 
\hskip1cm
1156 
\hskip1cm
1157 
\hskip1cm
1158 
\hskip1cm
1159 
\hskip1cm
1160 
\hskip1cm
1161 
\hskip1cm
1162 
\hskip1cm
1163 
\hskip1cm
1164 
\hskip1cm
1165 
\hskip1cm
1166 
\hskip1cm
1167 
\hskip1cm
1168 
\hskip1cm
1169 
\hskip1cm
1170 
\hskip1cm
1171 
\hskip1cm
1172 
\hskip1cm
1173 
\hskip1cm
1174 
\hskip1cm
1175 
\hskip1cm
1176 
\hskip1cm
1177 
\hskip1cm
1178 
\hskip1cm
1179 
\hskip1cm
1180 
\hskip1cm
1181 
\hskip1cm
1182 
\hskip1cm
1183 
\hskip1cm
1184 
\hskip1cm
1185 
\hskip1cm
1186 
\hskip1cm
1187 
\hskip1cm
1188 
\hskip1cm
1189 
\hskip1cm
1190 
\hskip1cm
1191 
\hskip1cm
1192 
\hskip1cm
1193 
\hskip1cm
1194 
\hskip1cm
1195 
\hskip1cm
1196

Claims (4)

1. Un equipo que comprende un polinucleótido de Lactobacillus johnsonii como el identificado por el Id. de Sec. Nº: 1, fragmentos de una secuencia de DNA como los identificados por el Id. de Sec. Nº: 1, seleccionando dichos fragmentos a partir del grupo comprendido entre el nucleótido 1 y 54596, entre 56070 y 77430, entre 81302 y 308537, entre 309588 y 342757, entre 378458 y 389217, entre 389779 y 404510, entre 405561 y 501116, entre 503873 y 558194, entre 563262 y 696518, entre 697569 y 721736, entre 722787 y 756845, entre 761682 y 860446, entre 860723 y 865550, entre 868541 y 1448288, entre 1463851 y 1526077, entre 1527278 1552024, entre 1563147 y 1809115, entre 1810166 y 1858190, entre 1863258 y 1872871, entre 1877939 y 1930430, entre 1932063 y 1983043, en base a la numeración del Id. de Sec. Nº:1.
2. Un medio legible por ordenador que tiene grabada una secuencia de ácidos nucleicos de Lactobacillus johnsonii como la identificada con el Id. de Sec. Nº:1 o fragmentos de una secuencia de DNA como los identificados con el Id. de Sec. Nº:1, seleccionando dichos fragmentos a partir del grupo comprendido entre el nucleótido 1 y 54596, entre 56070 y 7743, entre 81302 y 308537, entre 309588 y 342757, entre 378458 y 389217, entre 389779 y 404510, entre 405561 y 501116, entre 503873 y 558194, entre 563262 y 696518, entre 697569 y 721736, entre 722787 y 756845, entre 761682 y 860446, entre 860723 y 865550, entre 868541 y 1448288, entre 1463851 y 1526077, entre 1527278 y 1552024, entre 1563147 y 1809115, entre 1810166 y 1858190, entre 1863258 y 1872871, entre 1877939 y 1930430, entre 1932063 y 1983043, en base a la numeración del Id. de Sec. Nº:1, o una secuencia de polipéptido derivada de la secuencia de nucleótidos como la identificada en el Id. de Sec. Nº:1.
3. El medio legible por ordenador de acuerdo con la reivindicación 2, en el que dicho medio se seleccionado de entre el grupo que consiste en:
(a) un disco flexible;
(b) un disco duro;
(c) una memoria de acceso aleatoria (RAM);
(d) una memoria de sólo lectura (ROM); y
(e) un CD-ROM.
4. Un sistema basado en un ordenador para identificar fragmentos del genoma de Lactobacillus johnsonii que comprende los siguientes elementos:
(a) un medio de almacenamiento de datos que comprende una secuencia de ácidos nucleicos de Lactobacillus johnsonii como la identificada con el Id. de Sec. Nº:1;
(b) un método de búsqueda para comparar una secuencia diana con la secuencia de nucleótidos del medio de almacenamiento de datos del paso (a) para identificar la(s) secuencia(s) homóloga(s); y
(c) un medio de recuperación para obtener dicha(s) secuencia(s) homóloga(s) del paso (b).
ES03720340T 2002-04-09 2003-03-19 La1 - el genoma de una cepa de lactobacillus. Expired - Lifetime ES2311700T3 (es)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP02007932 2002-04-09
EP02007932 2002-04-09

Publications (1)

Publication Number Publication Date
ES2311700T3 true ES2311700T3 (es) 2009-02-16

Family

ID=28685848

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
ES03720340T Expired - Lifetime ES2311700T3 (es) 2002-04-09 2003-03-19 La1 - el genoma de una cepa de lactobacillus.

Country Status (11)

Country Link
US (2) US20080044820A1 (es)
EP (2) EP1497422B1 (es)
JP (1) JP2006506042A (es)
CN (1) CN1659280A (es)
AT (1) ATE403718T1 (es)
AU (1) AU2003223971A1 (es)
CA (1) CA2482138C (es)
DE (1) DE60322689D1 (es)
DK (1) DK1497422T3 (es)
ES (1) ES2311700T3 (es)
WO (1) WO2003084989A2 (es)

Families Citing this family (15)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2004235346A1 (en) * 2003-04-25 2004-11-11 North Carolina State University Lactobacillus acidophilus nucleic acid sequences encoding cell surface protein homologues and uses therefore
DE602004032144D1 (de) 2003-06-23 2011-05-19 Univ North Carolina State Für fructooligosaccharid-nutzende verbindungen codierende nukleinsäuren aus lactobacillus acidophilus und verwendungen davon
US7455992B2 (en) 2004-02-23 2008-11-25 North Carolina State University Lactobacillus acidophilus nucleic acid sequences encoding protease homologues and uses therefore
US7459289B2 (en) 2004-03-08 2008-12-02 North Carolina State University Lactobacillus acidophilus nucleic acid sequences encoding carbohydrate utilization-related proteins and uses therefor
US7608700B2 (en) 2004-03-08 2009-10-27 North Carolina State University Lactobacillus acidophilus nucleic acid sequences encoding stress-related proteins and uses therefor
US7919277B2 (en) * 2004-04-28 2011-04-05 Danisco A/S Detection and typing of bacterial strains
US7550576B2 (en) 2004-08-09 2009-06-23 North Carolina State University Nucleic acid sequences encoding two-component sensing and regulatory proteins, antimicrobial proteins and uses therefor
EP1814995A2 (en) 2004-10-27 2007-08-08 North Carolina State University Lactobacillus acidophilus nucleic acids and uses thereof
US7495092B2 (en) * 2005-01-14 2009-02-24 North Carolina State University Compositions comprising promoter sequences and methods of use
JP5138197B2 (ja) * 2006-10-04 2013-02-06 茂 藤村 Ｌｇ２１株用プライマー及び該プライマーを用いた検出方法
JP4457364B2 (ja) 2007-04-27 2010-04-28 勇志 相場 新規な乳酸菌及び当該乳酸菌を使用して加工した各種製品
US20120021418A1 (en) * 2008-06-13 2012-01-26 Kabushiki Kaisha Yakult Honsha Gene that imparts oxygen resistance and application thereof
GB0914878D0 (en) * 2009-08-26 2009-09-30 Plant Bioscience Ltd Competetive exclusion compositions and methods
EP3011966A1 (en) 2014-08-08 2016-04-27 Institut National De La Recherche Agronomique Compositions for the inhibition of Giardia Lamblia
CN108315402B (zh) * 2018-04-28 2021-02-12 内蒙古农业大学 一种用于肠道中双歧杆菌属测序的扩增引物对及测序方法

Family Cites Families (10)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0768375B2 (fr) * 1992-07-06 2002-06-12 Societe Des Produits Nestle S.A. Bactérie lactique
JPH08185676A (ja) * 1994-12-28 1996-07-16 Sony Corp 磁気デイスク及びデイスク装置
AU5552396A (en) 1995-04-21 1996-11-07 Human Genome Sciences, Inc. Nucleotide sequence of the haemophilus influenzae rd genome, fragments thereof, and uses thereof
KR0159441B1 (ko) * 1995-08-28 1999-01-15 김광호 고용량 하드 디스크 드라이브 구현을 위한 디스크 기록매체와 그에 따른 서보제어방법
US5652838A (en) * 1996-05-20 1997-07-29 Lovett; Donna M. Smart disc cd-rom
EP0875579B1 (fr) * 1997-05-03 2007-06-27 Societe Des Produits Nestle S.A. Production de L(+)-Lactate
JP3028214B2 (ja) * 1997-06-03 2000-04-04 カルピス株式会社 鳥類用生菌剤の投与方法
EP1110555A1 (fr) * 1999-12-22 2001-06-27 Societe Des Produits Nestle S.A. Agent anti-adhesion de la flore pathogene de la peau
EP1311684A4 (en) * 2000-08-08 2005-10-19 Genesis Res & Dev Corp Ltd LACTOBACILLUS RHAMNOSUS POLYNUCLEOTIDES, POLYPEPTIDES, AND METHODS FOR THEIR USE
GB0027761D0 (en) * 2000-11-14 2000-12-27 Nestle Sa Nutritional composition for an immune condition

Also Published As

Publication number Publication date
ATE403718T1 (de) 2008-08-15
US20090098053A1 (en) 2009-04-16
EP1497422B1 (en) 2008-08-06
CN1659280A (zh) 2005-08-24
US7875421B2 (en) 2011-01-25
WO2003084989A2 (en) 2003-10-16
DE60322689D1 (de) 2008-09-18
AU2003223971A8 (en) 2003-10-20
DK1497422T3 (da) 2008-12-15
EP1816196A1 (en) 2007-08-08
WO2003084989A3 (en) 2004-02-05
CA2482138C (en) 2014-05-27
EP1497422A2 (en) 2005-01-19
JP2006506042A (ja) 2006-02-23
CA2482138A1 (en) 2003-10-16
AU2003223971A1 (en) 2003-10-20
US20080044820A1 (en) 2008-02-21

Similar Documents

Publication Publication Date Title
ES2420907T3 (es) Genoma del Bifidobacterium CNCM I-2618
ES2311700T3 (es) La1 - el genoma de una cepa de lactobacillus.
DK2336362T3 (en) USE OF CRISPR-ASSOCIATED GENES (CAS)
DK2860267T3 (en) CULTURES WITH IMPROVED PROFESS RESISTANCE
Gilbert et al. Protein Hpn: cloning and characterization of a histidine-rich metal-binding polypeptide in Helicobacter pylori and Helicobacter mustelae
ES2373586T3 (es) Microorganismos marcados y métodos para marcar.
US12599637B2 (en) Genetically modified Lactobacillus and uses thereof
EP0232229B1 (en) Cloning and expression of Bordetella pertussis toxin-encoding DNA
CN103119153B (zh) 抗龋齿组合物和益生菌/益生素
KR20030085528A (ko) 포토랍두스 루미네센스 균주 ｔｔ01 게놈 및 그 용도
JPH08509873A (ja) ヘリコバクター感染に対する免疫組成物、該組成物に用いられるポリペプチドおよび該ポリペプチドをコードする核酸配列
JP2004507217A (ja) リステリア菌ゲノム、ポリペプチドおよびその使用
JP2006500951A (ja) ポリヌクレオチドおよびポリペプチドと、これらを含む材料と、その利用方法
JP2004515227A (ja) リステリア・インノキュア、ゲノムおよびその用途
ES2302329T3 (es) Secuencias nucleicas procedentes del genoma de salmonella typhi y usos de las mismas, especialmente para el diagnostico in vitro de la presencia de bacterias del genero salmonella en los productos alimenticios.
US7026463B2 (en) Polynucleotides and polypeptides, materials incorporating them and methods for using them
KR20030032948A (ko) 독성 유전자, 단백질, 및 그 용도
Golneshin Characterisation of bacteriocin genes and proteins from Lactobacillus plantarum B21 as potential new antimicrobial agents and natural food preservatives
Krishnan et al. Pili in probiotic bacteria
JP2004512817A (ja) 大腸菌から単離される、ｂ２／ｄ＋ａ−型のポリヌクレオチド、ならびにこれらのポリヌクレオチドとそのポリペプチドの生物学的使用
Imboden et al. Construction and characterization of a partial Mycobacterium tuberculosis cDNA library of genes expressed at reduced oxygen tension
Harrington The role of Quorum Sensing in Interspecies Interactions between Oral Streptococci
ES2348069T3 (es) Utilización de genes asociados a crispr (cas).
ES2270650B1 (es) Deteccion de bacterias del acido lactico productoras de tiramina mediante reaccion en cadena de la polimerasa (pcr) y sus aplicaciones.
US20060099623A1 (en) Polynucleotides and polypeptides isolated from lactobacillus and methods for their use