ES2316149T3 - Un nuevo receptor de hemopoyetina. - Google Patents
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Abstract
LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE EN GENERAL A NUEVOS RECEPTORES DE HEMOPOYETINA, O A COMPONENTES O PARTES DE LOS MISMOS Y A UN METODO PARA CLONAR LAS SECUENCIAS GENETICAS QUE LOS CODIFICAN. EN PARTICULAR, LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE A RECEPTORES DE HEMOPOYETINA RECOMBINANTES O SINTETICOS O A COMPONENTES O PARTES DE LOS MISMOS. LAS MOLECULAS DE LOS RECEPTOR O LOS COMPONENTES O PARTES DE LOS MISMOS Y SUS SECUENCIAS GENETICAS DE LA PRESENTE INVENCION SON UTILES EN EL DESARROLLO DE UNA AMPLIA GAMA DE AGONISTAS, ANTAGONISTAS Y REACTIVOS TERAPEUTICOS Y DE DIAGNOSTICO BASADOS EN LA INTERACCION DE LOS LIGANDOS CON SU RECEPTOR.
Description
Un nuevo receptor de hemopoyetina.
\global\parskip0.950000\baselineskip
La presente invención se refiere generalmente a
nuevos receptores de hemopoyetina, o componentes o partes de los
mismos, y a un método para clonar secuencias genéticas que codifican
los mismos. Más particularmente, la invención en cuestión se dirige
a receptores de hemopoyetina sintéticos recombinantes o componentes
o partes de los mismos. Las moléculas receptoras o los componentes
o las partes de las mismas y sus secuencias genéticas de la
presente invención son útiles en el desarrollo de una amplia
variedad de agonistas, antagonistas y reactivos terapéuticos y
diagnósticos basados en la interacción del ligando con su
receptor.
Detalles bibliográficos de las publicaciones
referidas numéricamente en esta memoria descriptiva se recogen al
final de la descripción. Los Números de Identidad de Secuencia (Nº
ID SEC) para las secuencias de nucleótidos y aminoácidos a las que
se hace referencia en la memoria descriptiva se definen después de
la bibliografía.
A lo largo de esta memoria descriptiva y las
reivindicaciones que siguen, a no ser que el contexto requiera otra
cosa, se entenderá que la palabra "comprenden", o variaciones
tales como "comprende" o "que comprende", implica la
inclusión de un integrante o grupo de integrantes indicado, pero no
la exclusión de ningún otro integrante o grupo de integrantes.
La proliferación, la diferenciación y la función
de una amplia variedad de células están controladas por reguladores
secretados, conocidos como citoquinas. Una de tales citoquinas es la
interleuquina (IL)-11, que es una molécula
funcionalmente pleiotrópica (1, 2), caracterizada inicialmente por
su capacidad para estimular la proliferación de la línea celular de
plasmacitoma dependiente de IL-6, T11 65 (3). Otras
acciones biológicas de IL-11 incluyen la inducción
de la proliferación de células progenitoras de hemopoyetina
multipotenciales (4, 5, 6), la potenciación de la formación de
megacariocitos y plaquetas (7, 8, 9, 10), la estimulación de la
síntesis de proteínas en fase aguda (11) y la inhibición de la
actividad de lipasa de lipoproteínas de adipocitos (12, 13). La
función diversa y pleiotrópica de IL-11 la
convierte en una importante molécula de hemopoyetina para estudiar,
especialmente al nivel de su interacción con su receptor.
La estructura del receptor de
IL-11 no es bien conocida. Se sabe que los
anticuerpos neutralizadores para gp130 inhiben la proliferación
dependiente de IL-11 de células TF-1
(14) y, de ahí, es probable que gp130 forme parte del receptor.
Yang y Yin (Biofactors, 4, páginas 15-21, 1992)
presentaron que IL-6 e IL-11 parecen
usar el transductor de señales gp130 y Fourcin et al. (Eur.
J. Immunol., 24, páginas 277-280, 1994) presentaron
que IL-11 actúa a través del transductor de señales
gp130/la proteína de señalización de IL-6.
Miembros de la familia de receptores de
hemopoyetina comprenden generalmente las cadenas \alpha y \beta
(15, 16, 17). Sin embargo, hasta la llegada de la presente
invención, no había información sobre la existencia de cadenas del
receptor de IL-11. Durante el trabajo que condujo a
la presente invención, los inventores desarrollaron un
procedimiento de clonación para receptores de hemopoyetina que no
requiere un conocimiento previo de sus ligandos. El procedimiento
de clonación ha sido satisfactorio para clonar la cadena \alpha de
receptor de IL-11, permitiendo, por primera vez, un
análisis molecular detallado del receptor de IL-11.
Por lo tanto, la presente invención se basa en un método
generalizado para clonar receptores de hemopoyetina y en particular
cadenas integrantes particulares de los mismos que proporciona una
base para desarrollar una gama de agonistas, antagonistas y agentes
terapéuticos y diagnósticos basados en el receptor de
IL-11.
De acuerdo con esto, un aspecto de la presente
invención proporciona una molécula de ácido nucleico aislada que
comprende una secuencia de nucleótidos que codifica, o
complementaria de una secuencia que codifica, una cadena \alpha
de un receptor de interleuquina (IL)-11 que
tiene
- (i)
- una secuencia de aminoácidos como la indicada en el Nº ID SEC: 3; o
- (ii)
- una secuencia de aminoácidos que es parte de la secuencia de aminoácidos indicada en el Nº ID SEC: 3, comprendiendo dicha secuencia de aminoácidos los aminoácidos 24 a 432 del Nº ID SEC: 3, o los aminoácidos 1 a 367 del Nº ID SEC: 3 o los aminoácidos 24 a 367 del Nº ID SEC: 3, secuencia que comprende un motivo de la secuencia de aminoácidos como el indicado en el Nº ID SEC: 1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
- \quad
- en donde Xaa es cualquier aminoácido, y secuencia que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11; o
- (iii)
- una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 80% de similitud con la secuencia de aminoácidos indicada en el Nº ID SEC: 3, que comprende un motivo de la secuencia de aminoácidos como el indicado en el Nº ID SEC: 1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
- \quad
- en donde Xaa es cualquier aminoácido, y que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11.
La presente invención se basa en un método para
identificar y/o clonar una secuencia genética que codifica o
complementaria de una secuencia que codifica un receptor de
hemopoyetina y en particular un receptor de IL-11 o
un componente o una parte del mismo, comprendiendo dicho método
rastrear una fuente de material genético con uno o más
oligonucleótidos degenerados diseñados a partir de la secuencia de
aminoácidos que comprende la secuencia indicada en el Nº ID SEC:
1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
en donde Xaa es cualquier
aminoácido.
La secuencia definida en el Nº ID SEC: 1 se ha
identificado en las cadenas tanto \alpha como \beta de
receptores de hemopoyetina y en particular el receptor de
IL-11. De acuerdo con esto, el método es aplicable
a la clonación de secuencias genéticas que codifican una cadena
\alpha, una cadena \beta o una combinación de cadenas tanto
\alpha como \beta, tal como en un receptor de longitud
completa.
Preferiblemente, la molécula genética es de
origen mamífero, tal como, pero no limitado a, seres humanos,
animales de ganadería (por ejemplo, ovejas, vacas, cerdos, cabras,
caballos), animales para pruebas de laboratorio (por ejemplo,
ratones, ratas, cobayas), animales de compañía (por ejemplo, gatos,
perros) o animales salvajes capturados. Los orígenes más preferidos
son de seres humanos y especies múridas (por ejemplo, ratones). La
fuente de material genético puede ser una biblioteca genómica o una
biblioteca de cDNA obtenida a partir de mRNA de un tipo de célula
particular tal como, pero no limitada a, células hepáticas, células
de la médula ósea, células de placenta y células de hepatoma. Se
prefiere una biblioteca de cDNA y también puede ser una biblioteca
de expresión. Por otra parte, para la generación de mutantes, la
biblioteca de cDNA puede prepararse mediante la reacción en cadena
de la polimerasa (PCR) de alto grado de error dando como resultado
una biblioteca mutante.
El término "rastreo" incluye cualquier
medio conveniente para identificar clones diana. Por ejemplo, puede
emplearse hibridación de colonias con sondas oligonucleotídicas o,
si se prepara una biblioteca de expresión, el rastreo puede ser,
por ejemplo, la actividad enzimática o la interactividad de
anticuerpos. Términos tales como "componentes", "partes"
o "fragmentos" incluyen separadamente una cadena \alpha y una
cadena \beta o partes de las mismas. Preferiblemente, los
"componentes", las "partes" y los "fragmentos" son
funcionales y más preferiblemente una cadena \alpha o \beta
funcional.
La molécula genética puede ser DNA (por ejemplo
DNA genómico), cDNA o mRNA lineal o circular cerrado, de cadena
simple o doble, o combinaciones de los mismos. La molécula genética
también puede incluir un vector tal como un componente de un vector
de expresión para facilitar la expresión de la secuencia genética
\hbox{del receptor de IL-11.}
De acuerdo con la presente invención, la
secuencia genética codifica la cadena \alpha de receptores de
IL-11 y en particular cadena \alpha de receptor
de IL-11 múrido codificada por una secuencia de
nucleótidos como la indicada en el Nº ID SEC: 2 o comprende una
secuencia de aminoácidos como la indicada en el Nº ID SEC: 3, o
comprende una parte o un derivado de la misma según se define
anteriormente. Sin embargo, el método de clonación usado en la
presente memoria también puede usarse para clonar o identificar
otras secuencias de receptores de hemopoyetina, tales como la que
codifica la cadena \alpha de receptor de IL-11
humana y que comprende la secuencia de nucleótidos que se indica en
el Nº ID SEC: 4 o una secuencia de aminoácidos como la indicada en
el Nº ID SEC: 5 o una parte o un derivado de la misma también
descrito pero no reivindicado en la presente memoria. Las
secuencias genéticas entonces identificadas pueden incluir una
molécula capaz de codificar un receptor de IL-11 de
longitud completa o un fragmento o una porción del mismo tal como
una cadena \alpha o una cadena \beta ya sea funcional o no o
puede corresponder a una porción del mismo caracterizada por la
secuencia de aminoácidos
Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
en la que Xaa es cualquier residuo de aminoácido. Adicionalmente,
la secuencia genética o parte de la misma puede actuar como una
molécula o moléculas antisentido para mRNA que codifica la cadena
\alpha o \beta del receptor de IL-11. Tales
moléculas antisentido pueden ser útiles en terapia genética o en el
diseño racional de agentes agonistas o antagonistas.
En una realización particular, se proporciona
una secuencia genética que codifica un receptor de
IL-11 o un componente, una parte o un fragmento del
mismo en donde dicha secuencia genética comprende una secuencia de
nucleótidos a la que puede hibridarse el Nº ID SEC: 2 bajo
condiciones de alta restricción. Tal secuencia genética puede
definirse por la capacidad de un oligonucleótido seleccionado de la
siguiente lista para hibridarse a la misma:
| 5' (A/G)CTCCA(C/T)TC(A/G)CTCCA 3' | (Nº ID SEC: 6); |
| 5' (A/G)CTCCA(A/G)TC(A/G)CTCCA 3' | (Nº ID SEC: 7); |
| 5' (A/G)CTCCA(N)GC(C/T)CTCCA 3' | (Nº ID SEC: 8); |
| 5' (A/G)CTCCA(N)GG(A/G)CTCCA 3' | (Nº ID SEC: 9); |
| 5' (A/G)CTCCA(C/T)TT(A/G)CTCCA 3' | (Nº ID SEC: 10); |
o una secuencia complementaria del
mismo o una combinación de los
mismos.
\global\parskip1.000000\baselineskip
Con el propósito de definir el nivel de
restricción, puede hacerse convenientemente referencia a Sambrook
et al. (26), que se incorpora en la presente memoria mediante
referencia, donde las etapas de lavado de las páginas
9.52-9.57 se consideran alta restricción. Una baja
restricción se considera en la presente memoria en SDS al
0,1-0,5% p/v a 37-45ºC durante
2-3 horas. Dependiendo de la fuente y la
concentración de ácido nucleico implicadas en la hibridación,
pueden emplearse condiciones de restricción alternativas tales como
condiciones restrictivas medias, que se considera en la presente
memoria que son SDS al 0,25-0,5% p/v a \geq 45ºC
durante 2-3 horas, o condiciones restrictivas altas
como las descritas por Sambrook et al. (26).
La referencia en los Ejemplos a una cadena
\alpha se considera una notación abreviada para todo el receptor
o diversas partes del mismo, incluyendo la cadena \alpha o
\beta.
En una realización adicional, la secuencia
genética está fusionada a una secuencia genética heteróloga para
codificar de ese modo una molécula de fusión con, por ejemplo,
glutationa-S-transferasa, un
receptor o una subunidad de la misma para IL-2,
IL-3, IL-4, IL-5,
IL-6, IL-7, IL-9,
eritropoyetina, trombopoyetina, hormona del crecimiento,
prolactina, CNTF, G-CSF, GM-CSF,
gp130, o la subunidad p40 de IL- 12.
La molécula genética puede ser DNA (por ejemplo
DNA genómico), cDNA o mRNA lineal o circular cerrado, de cadena
simple o doble, o combinaciones de los mismos, tal como en la forma
de híbridos de DNA:RNA. La molécula genética también puede incluir
un vector tal como un componente de un vector de expresión para
facilitar la expresión del receptor de IL-11 o sus
componentes o partes. En una realización preferida, la secuencia
genética codifica la cadena \alpha de IL-11 que
tiene una secuencia de aminoácidos indicada en el Nº ID SEC: 3
(múrido) o comprende una parte o un derivado de la misma según se
define anteriormente. Lo más preferiblemente, la secuencia genética
comprende una secuencia de nucleótidos como la indicada en el Nº ID
SEC: 2 (múrido) o comprende una secuencia de nucleótidos que se
hibrida a la misma bajo condiciones de alta restricción.
Un estuche útil para clonar un miembro de la
familia de receptores de hemopoyetina o un componente o una parte
del mismo puede comprender en forma compartimentada un primer
compartimento adaptado para contener al menos una especie de
oligonucleótidos que tienen una secuencia de nucleótidos basada en
la secuencia de aminoácidos Nº ID SEC: 1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
en la que Xaa es cualquier residuo
de aminoácido, y opcionalmente uno o más de otros compartimentos
adaptados para contener una o más de otras especies de
oligonucleótido basadas en el Nº ID SEC: 1 y/o reactivos requeridos
para un ensayo de hibridación para secuencias genéticas de
receptores de hemopoyetina. El estuche también puede estar envasado
para la venta con instrucciones de uso. Oligonucleótidos preferidos
incluyen, pero no se limitan a, los Nº ID SEC: 6 a
10.
Otro aspecto de la presente invención se dirige
a un polipéptido recombinante que comprende una secuencia de
aminoácidos correspondiente a una cadena \alpha de receptor de
IL-11 mamífera y que tiene
- (i)
- la secuencia de aminoácidos que se indica en el Nº ID SEC: 3; o
- (ii)
- una secuencia de aminoácidos que es parte de la secuencia de aminoácidos indicada en el Nº ID SEC: 3, comprendiendo dicha secuencia de aminoácidos los aminoácidos 24 a 432 del Nº ID SEC: 3, o los aminoácidos 1 a 367 del Nº ID SEC: 3 o los aminoácidos 24 a 367 del Nº ID SEC: 3, secuencia que comprende un motivo de la secuencia de aminoácidos como el indicado en el Nº ID SEC: 1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
- \quad
- en donde Xaa es cualquier aminoácido, y secuencia que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11; o
- (iii)
- una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 80% de similitud con la secuencia de aminoácidos indicada en el Nº ID SEC: 3, que comprende un motivo de la secuencia de aminoácidos como el indicado en el Nº ID SEC: 1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
- \quad
- en donde Xaa es cualquier aminoácido, y que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11; o
- (iv)
- una secuencia de aminoácidos como la indicada en el Nº ID SEC: 3 o una secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos 24 a 432 del Nº ID SEC: 3, los aminoácidos 1 a 367 del Nº ID SEC: 3 o los aminoácidos 24 a 367 del Nº ID SEC: 3 que está químicamente modificada mediante modificación de la cadena lateral, incorporación de aminoácidos no naturales, reticuladores u otras modificaciones químicas que imponen una limitación de conformación al polipéptido, y que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11.
En una realización, el polipéptido comprende una
secuencia de aminoácidos sustancialmente como la indicada en el Nº
ID SEC: 3 (múrido) o que tiene al menos aproximadamente 80% y aún
más preferiblemente al menos aproximadamente 90-95%
o mayor similitud con la secuencia indicada en el Nº ID SEC: 3.
El polipéptido puede tener secuencias de
aminoácidos adicionales fusionadas al mismo, incluyendo GST, otra
citoquina, un componente de un receptor o gp130. Puede estar
glicosilado o no glicosilado dependiendo de la célula usada para
producir el mismo. De acuerdo con esto, el polipéptido puede
producirse en una célula procariótica (por ejemplo E. coli o
especies de Bacilli) o en una célula eucariótica (por ejemplo
células mamíferas tales como células BA/F3 [18], células de
levadura, células de insecto).
Mutantes y derivados del receptor de
hemopoyetina polipeptídico recombinante incluyen sustituciones,
deleciones y/o adiciones de aminoácidos. Por otra parte, los
aminoácidos pueden reemplazarse por otros aminoácidos que tienen
propiedades similares, tales como hidrofobia, hidrofilia,
electronegatividad, cadenas laterales voluminosas, grupos
interactivos y/o funcionales, etc.
Las sustituciones de aminoácidos son típicamente
de residuos simples; las inserciones serán habitualmente del orden
de aproximadamente 1-10 residuos de aminoácido; y
las deleciones variarán de aproximadamente 1-20
residuos. Las deleciones o inserciones se realizan preferiblemente
en pares adyacentes, es decir: una deleción de 2 residuos o una
inserción de 2 residuos.
Las variantes de aminoácidos mencionadas
anteriormente pueden elaborarse fácilmente usando técnicas
sintéticas para péptidos bien conocidas en la especialidad, tales
como síntesis de péptidos en fase sólida y similares, o mediante
manipulaciones de DNA recombinante. Las técnicas para realizar
mutaciones de sustitución en sitios predeterminados en DNA que
tiene una secuencia conocida son bien conocidas, por ejemplo a
través de mutagénesis M13. La manipulación de secuencias de DNA
para producir proteínas variantes que manifiestan variantes de
sustitución, inserción o deleción es bien conocida en la
especialidad.
Otros ejemplos de mutantes y derivados
recombinantes o sintéticos del polipéptido receptor de hemopoyetina
recombinante de la presente invención incluyen sustituciones,
deleciones y/o adiciones simples o múltiples en cualquier molécula
asociada con el ligando, tales como carbohidratos, lípidos y/o
proteínas o polipéptidos. Formas glicosiladas presentes en la
naturaleza o alteradas del ligando en cuestión son particularmente
contempladas por la presente invención.
Alteraciones de aminoácidos para el presente
polipéptido contemplado en la presente memoria incluyen inserciones
tales como fusiones aminoácido- o
carboxilo-terminales así como inserciones
intrasecuencia de aminoácidos simples o múltiples. Generalmente,
las inserciones dentro de la secuencia de aminoácidos serán menores
que las fusiones amino- o carboxilo-terminales, del
orden de, por ejemplo, 1 a 4 residuos. Las variantes de la
secuencia de aminoácidos por inserción son aquellas en las que uno o
más residuos de aminoácido se introducen en un sitio predeterminado
en la proteína. Las variantes por deleción se caracterizan por la
retirada de uno o más aminoácidos de la secuencia. Las variantes
por sustitución son aquellas en las que al menos un residuo de la
secuencia se ha retirado y se ha insertado en su lugar un residuo
diferente. Tales sustituciones pueden realizarse de acuerdo con
la
Tabla 1:
Tabla 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(Tabla pasa a página
siguiente)
Los términos "análogos" y "derivados"
también se extienden a cualquier equivalente químico funcional del
ligando caracterizado por su estabilidad y/o eficacia incrementadas
in vivo o in vitro. Los términos "análogos" y
"derivados" se extienden además a cualquier derivado de
aminoácido del ligando que se describe anteriormente.
Análogos del receptor polipeptídico de
hemopoyetina contemplado en la presente memoria incluyen, pero no se
limitan a, modificaciones en las cadenas laterales, incorporación
de aminoácidos no naturales y/o derivación de la molécula y el uso
de reticuladores y otros métodos que imponen limitaciones de
conformación a los péptidos o sus análogos. Ejemplos de
modificaciones de la cadena lateral contemplados por la presente
invención incluyen modificaciones de grupos amino tales como
mediante alquilación reductiva con un aldehído seguida por reducción
con NaBH_{4}; amidinación con acetimidato de metilo; acilación
con anhídrido acético; carbamoilación de grupos amino con cianato;
trinitrobencilación de grupos amino con ácido
2,4,6-trinitrobencenosulfónico (TNBS); acilación de
grupos amino con anhídrido succínico y anhídrido tetrahidroftálico;
y piridoxilación de lisina con 5'-fosfato de
piridoxal seguida por reducción con NaBH_{4}.
El grupo guanidina de los residuos de arginina
puede modificarse mediante la formación de productos de condensación
heterocíclicos con reactivos tales como
2,3-butanodiona, fenilglioxal y glioxal.
El grupo carboxilo puede modificarse mediante
activación de carbodiimida a través de la formación de
O-acilisourea seguida por derivación subsiguiente,
por ejemplo, hasta una amida correspondiente.
Los grupos sulfhidrilo pueden modificarse
mediante métodos tales como carboximetilación con ácido yodoacético
o yodoacetamida; oxidación con ácido perfórmico hasta ácido
cisteico; formación de disulfuros mixtos con otros compuestos
tiólicos; reacción con maleimida, anhídrido maleico u otra maleimida
sustituida; formación de derivados mercuriales usando
4-cloromercuribenzoato, ácido
4-cloromercurifenilsulfónico, cloruro de
fenilmercurio,
2-cloromercuri-4-nitrofenol
y otros compuestos mercuriales; carbamoilación con cianato a pH
alcalino.
Los residuos de triptófano pueden modificarse,
por ejemplo, mediante oxidación con
N-bromosuccinimida o alquilación del anillo
indólico con bromuro de
2-hidroxi-5-nitrobencilo
o haluros de sulfenilo. Por otra parte, los residuos de tirosina
pueden alterarse mediante nitración con tetranitrometano para formar
un derivado de 3-nitrotirosina.
La modificación del anillo de imidazol de un
residuo de histidina puede conseguirse mediante alquilación con
derivados de ácido yodoacético o N-carbetoxilación
con pirocarbamato de dietilo.
Ejemplos de incorporar aminoácidos y derivados
no naturales durante la síntesis de proteínas incluyen, pero no se
limitan a, el uso de norleucina, ácido
4-aminobutírico, ácido
4-amino-3-hidroxi-5-fenilpentanoico,
ácido 6-aminohexanoico,
t-butilglicina, norvalina, fenilglicina, ornitina,
sarcosina, ácido
4-amino-3-hidroxi-6-metilheptanoico,
2-tienilalanina y/o isómeros D de aminoácidos.
Los reticuladores pueden usarse, por ejemplo,
para estabilizar conformaciones tridimensionales, usando
reticuladores homobifuncionales tales como los imidoésteres
bifuncionales que tienen grupos espaciadores (CH_{2})_{n}
con n = 1 a n = 6, glutaraldehído, ésteres de
N-hidroxisuccinimida y reactivos heterobifuncionales
que habitualmente contienen un resto reactivo con amino tales como
N-hidroxisuccinimida y otro resto reactivo
específico para un grupo tal como un resto maleimido o ditio (SH) o
carbodiimida (COOH). Además, los péptidos podrían limitarse en
cuanto a la conformación mediante, por ejemplo, la incorporación de
C_{\alpha}- y N_{\alpha}-metilaminoácidos, la
introducción de dobles enlaces entre los átomos C_{\alpha} y
C_{\beta} de los aminoácidos y la formación de péptidos cíclicos
o análogos introduciendo enlaces covalentes tal como formando un
enlace amida entre los extremos N y C, entre dos cadenas laterales
o entre una cadena lateral y el extremo N o C.
Por lo tanto, la presente invención se extiende
a péptidos o polipéptidos y análogos de aminoácidos y/o químicos de
los mismos que tienen las características identificativas de la
cadena \alpha del receptor de IL-11.
De acuerdo con esto, la referencia en la
presente memoria a la cadena \alpha del receptor de
IL-11 o a un polipéptido que tiene propiedades de
la cadena \alpha de IL-11 incluye la molécula
presente en la naturaleza, formas recombinantes, sintéticas y
análogas de la misma y cualesquiera mutantes, derivados y homólogos
humanos y no humanos de la misma incluyendo variantes de
aminoácidos y de glicosilación.
La disponibilidad de la cadena \alpha del
receptor de IL-11 recombinante y secuencias
genéticas que codifican la misma permite por primera vez el
desarrollo de una gama de agonistas, antagonistas, agentes
terapéuticos y agentes diagnósticos para tratar una variedad de
estados que implican una deficiencia de IL- 11, una cantidad
excesiva de IL-11 o efectos aberrantes de niveles
normales de IL-11 endógena.
La presente invención se describe además
mediante las Figuras y/o los Ejemplos no limitativos siguientes.
En las Figuras:
La Figura 1 es una representación de la
secuencia de nucleótidos, la secuencia de aminoácidos predicha y la
estructura de cDNA de la cadena \alpha del receptor de
IL-11 (IL-NrI); (A) Estructura del
cDNA de IL-11r\alpha, que muestra las regiones no
traducidas 5' y 3' (línea sólida) y la región codificante que
contiene la secuencia de señal predicha (\blacksquare), el
dominio extracelular maduro (\boxempty) el dominio de
transmembrana 100 y el dominio citoplásmico
101 . El tamaño y la extensión de cada uno de los
clones de cDNA de IL-11r\alpha que se sometía a
secuenciación completamente se muestran posteriormente. (B). La
secuencia de nucleótidos y de aminoácidos predicha de
IL-11r\alpha. La región no traducida se muestra en
minúsculas y la región codificante en mayúsculas. Se emplea en
todas partes el código convencional de una letra para aminoácidos.
Los dos sitios de glicosilación conectados a asparagina potenciales
(NXS/T) se muestran subrayados y en negrita. La secuencia de señal
potencial y el dominio de transmembrana están remarcados por barras
entre la secuencia de nucleótidos y aminoácidos. El dominio de
hemopoyetina (D200) está encerrado en una caja y la línea
discontinua separa los dos dominios SD100 que comprenden en dominio
D200. Una señal de poliadenilación de consenso en la región no
traducida 3' se muestra en negrita.
La Figura 2 es una comparación de Nr1 con otros
miembros de la familia de receptores de hemopoyetina; Alineamiento
de la secuencia de aminoácidos de Nr1 múrido, la cadena \alpha de
receptor de IL-6 múrida, la cadena \alpha de
receptor de CNTF humana, la subunidad p40 de IL-12
humana y la cadena \alpha de receptor de GM-CSF
múrido. Los alineamientos se llevaron a cabo a simple vista.
La Figura 3 es una representación fotográfica de
análisis de la cadena de polimerasa con transcriptasa inversa de
mRNA de Nr1; Se preparó RNA citoplásmico a partir de las siguientes
fuentes; carril 2, células 3T3-L1; carril 3,
células BAd; carril 4, células UMR-106; carril 5,
células PC13; carril 6, células NFS-60; carril 7,
células FDCP-1; carril 8, células 32D; carril 9,
células D35; carril 10, células M1; carril 11, células J774; carril
12, células WEHI-3B D; carril 13, médula ósea
humana; carril 14, médula ósea de ratón; carril 15, bazo de ratón;
carril 16, timo de ratón; carril 17, ovario de ratón; carril 18,
útero de ratón; carril 19, testículo de ratón; carril 20, epidídimo
de ratón; carril 21, cerebro de ratón; carril 22, corazón de ratón;
carril 23, riñón de ratón; carril 24, músculo de muslo de ratón;
carril 25, hígado de ratón y carril 26, glándula salivar de ratón.
1 \mug de cada muestra de RNA y un control que no contenía RNA
(carril 1) se sometió a transcripción inversa, con una reacción
idéntica realizada en ausencia de transcriptasa inversa. 5% de la
reacción de DNA de la primera hebra se sometió a PCR con cebadores
específicos para Nr1 (cuadro superior) o la GAPDH de control
(cuadro inferior). Los productos de PCR se resolvieron sobre un gel
de agarosa al 1,0% p/v, se transfirieron a nitrocelulosa y se
hibridaron con oligonucleótidos internos específicos para GAPDH o
Nr1.
La Figura 4 es una representación gráfica de
análisis de Scatchard de isotermas de saturación de
IL-11 que se une a diversas líneas celulares; (A)
células Ba/F3 parentales (\medbullet), células Ba/F3 que expresan
Nr1 (\medcirc), células Ba/F3 que expresan Nr1 y el receptor de
LIF (\blacksquare), (B) células Ba/F3 que expresan el receptor de
LIF y gp130 (\medbullet), células Ba/F3 que expresan Nr1 y gp130
(\blacksquare), células Ba/F3 que expresan el Nr1, el receptor de
LIF y gp130 (\medcirc), (C) células M1 parentales (\medbullet),
células M1 que expresan Nr1 (\medcirc) y (D) células
3T3-L1 (\blacksquare) se incubaron con diversas
concentraciones de IL-11 marcada en presencia o
ausencia de un exceso de 10-100 veces de
IL-11 no marcada. Después de 18 horas de incubación
sobre hielo, las IL-11 unida y libre se separaron
mediante centrifugación a través de suero de ternero fetal. La
^{125}I-IL-11 unida y libre se
cuantificó en un contador \gamma y los datos se representaron como
una transformación de Scatchard. En cada caso, los datos se
normalizaron para el número de células y se mostraron como unión a
10^{6} células.
La Figura 5 muestra la especificidad molecular
de la unión de IL-11 a diversas líneas celulares:
células Ba/F3 que expresan los receptores indicados se incubaron en
100 \mul de medio que contenía 60.000 cpm (Nr 1 de Ba/F3 o 6.000
cpm de ^{125}I-IL-11 (Nr 1 de
Ba/F3/gp130 y Nr 1 de Ba/F3/gp130/receptor de LIF), en presencia o
ausencia de 20 ng de IL-11 o 200 ng de
IL-6, LIF, OSM o IL-3. Después de 18
horas de incubación sobre hielo, las IL-11 unida y
libre se separaron mediante centrifugación a través de suero de
ternero fetal. Las ^{125}I-IL-11
unida y libre se cuantificaron en un contador \gamma y la cantidad
de unión se expresó como un porcentaje de la observada en ausencia
de
competidor.
competidor.
La Figura 6 muestra diferenciaciones de células
M1 que expresan Nr1 en respuesta a IL-11; 300
células M1 parentales (cuadro izquierdo) o células M1 que expresan
Nr1 (cuadro derecho) se cultivaron en 1 ml de agar semisólido con
las concentraciones indicadas de LIF (\medcirc) o
IL-11 (\medbullet). Después de 7 días, se
determinó la proporción de colonias que contenían células
diferenciadas.
La Figura 7 muestra la proliferación dependiente
de factor de células Ba/F3 que expresan diversas combinaciones de
Nr1, gp130 y el receptor de LIF; Células Ba/F3 parentales, células
Ba/F3 que expresan Nr1, células Ba/F3 que expresan el Nr1 y el
receptor de LIF, células Ba/F3 que expresan receptor de LIF y
gyp130, células Ba/F3 que expresan Nr1 y gp130 y células Ba/F3 que
expresan Nr1, el receptor de LIF y gp130 se incubaron a 200 células
por pocillo en un volumen de 15 \mul, con las concentraciones
indicadas de IL-11 (\medbullet),
IL-3 (\boxempty) o LIF (\medcirc), o con 3
\mug/ml de IL-6 y 500 ng/ml de cadena \alpha de
receptor de IL-6 soluble (\ding{115}). Después de
48 horas, se contaron los números de células
viables.
viables.
La Figura 8 es una representación de la
secuencia de nucleótidos compuesta y la secuencia de aminoácidos
predicha del receptor de IL-11 humano. La secuencia
de aminoácidos predicha se presenta usando el código de una sola
letra convencional. El asterisco representa el codón de terminación.
Los cuatro residuos de cisteína conservados, el motivo WSTWS y los
sitios de glicosilación conectados a asparagina potenciales (NXS/T)
se muestran en negrita y subrayados. La secuencia de señal
potencial y la región de transmembrana se presentan mediante un
subrayado delgado y un subrayado doble, respectivamente. Una señal
de poliadenilación de consenso se muestra en minúsculas y negrita.
La región encerrada en una caja representa el dominio de
hemopoyetina de 200 aminoácidos (D200) y está compuesta por dos
subdominios de 100 aminoácidos (SD100) según se marca mediante la
línea quebrada. Las dos flechas indican la posición se secuencias
intrónicas presentes en algunos de los clones de cDNA.
La Figura 9 es una representación de una
comparación de la secuencia de aminoácidos predicha de la cadena
\alpha del receptor de IL-11 humana (H) y múrido
(M). El símbolo de asterisco indica identidad. La marca de
almohadilla (#) representa huecos introducidos para mejorar el
alineamiento.
La Figura 10 es una representación fotográfica
de una transferencia Southern que demuestra hibridación de especies
cruzadas de (A) sonda de cDNA de la cadena \alpha del receptor de
IL-11 múrido (fragmento Sph I/Sac I de 445
pb) y (B) sonda de cDNA de la cadena \alpha del receptor de
IL-11 humana (fragmento Pst I/Xba I de 560
pb del clon Nº 17.1) a DNA genómico humano (H) y múrido (M) digerido
con Hind III. Membrana de nailon procesada bajo condiciones de alta
restricción (0,2 X SSC, SDS al 0,1% p/v, 65ºC). La exposición era
durante 16 horas a -70ºC usando pantallas intensificadoras.
La Figura 11 es una representación esquemática
de la estructura del cDNA de IL-11r\alpha humana,
que presenta la región no traducida 5' y 3' (línea sólida) y la
región codificante que contiene la secuencia de señal
101 , el dominio extracelular (\boxempty), la
región de transmembrana 100 , la porción citoplásmica
(\blacksquare) y la cola de poli-A (AAAA). Se
indica la posición aproximada de los residuos de cisteína
conservados (C) y el motivo WSXWS. El tamaño y la extensión de los
cuatro clones de cDNA seleccionados para el análisis se muestran
posteriormente. Las posiciones aproximadas de los intrones se
indican (V) como su tamaño en pb. La longitud de los clones se
representa sin los intrones. El cDNA compuesto se obtuvo de los
clones Nº 9.1y Nº 17.1 mediante ligación en el sitio Pst I indicado
(flecha) y se usó para estudios de expresión.
La Figura 12 es una representación esquemática
de análisis de Scatchard de isotermas de saturación de
IL-11 humana que se une a células M1 manipuladas
para expresar IL-11r\alpha humana (), células M1
que expresan la IL-11r\alpha múrida
(\medbullet), y células M1 parentales (\medcirc). Las células se
incubaron con diversas concentraciones de IL-11
marcada en presencia de un exceso de 10-100 veces de
IL-11 no marcada. Después de 18 horas de incubación
sobre hielo, las IL-11 unida y libre se separaron
mediante centrifugación a través de FCS. La IL-11
marcada unida y libre se cuantificó en un contador \gamma y los
datos se representaron como una transformación de Scatchard. En
cada caso, los datos se normalizaron para el número de células y se
mostraron como unión a 10^{6} células. La cantidad de unión no
específica estaba entre 0,1 y 1% de la IL-11
marcada total añadida. Se observó unión de alta afinidad para
células M1 que expresan IL-11r\alpha humana
(Kd=250 pM) e IL-11r\alpha múrida (Kd=275 pM). Las
células M1 parentales no presentaban unión específica.
La Figura 13 es una representación fotográfica
que muestra la morfología de células M1 parentales y células M1
manipuladas para expresar la cadena \alpha de receptor de
IL-11 humana (M1/hIL-11ra) y en
respuesta a IL-11 humana (1000 U/ml) y LIF múrida
(1000 U/ml). La morfología celular se examinó después de 5 días de
incubación. Los cuadros a, b y c muestran células M1 parentales
con: solución salina normal (Cuadro a), LIF (Cuadro b) e
IL-11 (Cuadro c). El Cuadro d es representativo de
células M1/hIL-11r\alpha estimuladas con
IL-11 (X400).
La Figura 14 es una representación gráfica que
muestra la proliferación de células Ba/F3 parentales (\ding{115}),
células Ba/F3 manipuladas para expresar la cadena \alpha de
receptor de IL-11 humana
(Ba/F3+hIL-11ra) y Ba/F3 manipuladas para expresar
cadena \alpha de receptor de IL-11 humana junto
con gp130 humana (Ba/F3+hIL-11r\alpha+gp130). Se
establecieron tres líneas celulares clonales
(Ba/F3+hIL-11r\alpha) (representadas por
\medbullet) que eran insensible. Después de la expresión de la
molécula de gp130 humana, todas las líneas celulares eran sensibles
a IL-11 (símbolos abiertos). Se muestran diluciones
en serie de IL-11 humana. Los resultados son medias
de triplicados procedentes de dos experimentos. Todas las células
proliferaban en IL-3.
\vskip1.000000\baselineskip
Las siguientes abreviaturas de una y tres letras
para residuos de aminoácidos se usan en la memoria descriptiva:
\vskip1.000000\baselineskip
Las siguientes abreviaturas se adoptan en la
presente memoria descriptiva:
- IL-11:
- Interleuquina 11
- IL-11r:
- Receptor de IL-11
- IL-11r\alpha:
- Cadena \alpha de receptor de IL-11
- D:
- Dominio
- SD:
- Subdominio
- Nr1:
- IL-11r
\newpage
Ejemplo
1
Se usaron bibliotecas de cDNA de hígado de ratón
adulto comerciales clonados en \lambdagt10 y \lambdaZAP
(Clonetech, CA, EE. UU. de A. y Stratagene, CA, EE. UU. de A.) para
infectar Escherichia coli de la cepa LE392. Las bacterias
infectadas se hicieron crecer sobre veinte placas de 150 mm de agar,
para dar aproximadamente 50.000 calvas por placa. Las calvas se
transfirieron a continuación a membranas de nailon de 150 mm de
diámetro (Colony/Plaque Screen^{TM}, NEN Research Products, MA,
EE. UU. de A.), las bacterias se sometieron a lisis y el DNA se
fijó tratando en autoclave a 100ºC durante min con evacuación en
seco. Los filtros se enjuagaron dos veces en dodecilsulfato sódico
(SDS) al 0,1% p/v, 0,1 x SSC (SSC es cloruro sódico 150 mM,
dihidrato de citrato sódico 15 mM) a temperatura ambiente y se
prehibridaron durante la noche a 37ºC en 6 x SSC que contiene 2
mg/ml de albúmina de suero bovino, 2 mg/ml de Ficoll, 2 mg/ml de
polivinilpirrolidona, ATP 100 \muM, 10 \mug/ml de tRNA,
pirofosfato sódico 2 mM, 2 mg/ml de DNA de esperma de salmón,
NP-40 al 0,1% y 200 \mug/ml de azida sódica. El
tampón de prehibridación se retiró. Una cantidad de 1,2 \mug de
los oligonucleótidos degenerados para hibridación (HYB1, HYB2 y
HYB3; Tabla 1) se fosforiló con polinucleótido quinasa de T4 usando
960 \muCi de \gamma^{32}P-ATP (Bresatec, S.A.,
Australia). El ATP no incorporado se separó del oligonucleótido
marcado usando una columna de filtración en gel prerrellena
(NAP-5; Pharmacia, Uppsala, Suecia). Los filtros se
hibridaron durante la noche a 37ºC en 80 ml del tampón de
prehibridación que contenía SDS al 0,1% p/v, en lugar de NP40, y
10^{6} - 10^{7} cpm/ml de oligonucleótido marcado. Los filtros
se enjuagaron brevemente dos veces a temperatura ambiente en 6 x
SSC, SDS al 0,1% v/v, dos veces durante 30 min a 45ºC en un baño de
agua con agitación que contenía 1,5 1 del mismo tampón y a
continuación brevemente en 6 x SSC a temperatura ambiente. A
continuación, los filtros se secaron con papel secante y se
expusieron a película autorradiográfica a -70ºC usando
pantallas intensificadoras, durante 7-14 días antes
del revelado.
Las calvas que aparecían positivas sobre
películas duplicadas orientadas se recogieron, se eluyeron en 1 ml
de NaCl 100 mM, MgCl_{2} 10 mM, Tris.HCl 10 mM, pH 7,4, que
contenía gelatina al 0,5% p/v y cloroformo al 0,5% v/v y se
almacenaron a 4ºC. Después de 2 días, las células LE392 se
infectaron con el eluato procedente de los bloques primarios y se
cultivaron en placa de nuevo para el rastreo secundario. Este
procedimiento se repitió hasta que las calvas hibridantes eran
puras.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
2
Se preparó DNA a partir de calvas positivas
usando columnas Promega Magic Lambda DNA (Promega Corporation, WI,
EE. UU. de A.) de acuerdo con las instrucciones del fabricante. Una
cantidad de 100 ng de DNA procedente de cada bacteriófago positivo
se sometió a secuenciación usando un estuche de secuenciación fmol
(Promega Corporation, WI, EE. UU. de A.) con los oligonucleótidos
marcados con ^{33}P gt10for, gt10rev y bien HYB1, bien
HYB2 o bien HYB3. Los productos se resolvieron sobre un gel de
poliacrilamida al 6% p/v y la secuencia de cada clon se analizó
usando los programas de comparación de bases de datos Blast y la
función de traducción de la serie de programas Wisconsin.
La secuencia de un clon
(Nr1-AZ-36) contenía motivos
característicos de la familia de receptores de hemopoyetina. Se
diseñaron dos oligonucleótidos, Nº 26 y Nº 60 (nucleótidos
946-970 y 1005-1034; Figura 1; Tabla
2) a partir de esta secuencia y se usaron para rastrear de nuevo
los filtros primarios a partir de la biblioteca de hígado original
y otras dos bibliotecas de cDNA hepático de adulto. El clon de cDNA
inicialmente aislado, Nr1-AZ-36, y
otros cuatro clones de cDNA (Nrl-30.2, 30.3, 30.4 y
30.17) se sometieron a secuenciación completamente, en ambas
hebras, usando el método didesoxi (18) con el estuche de
secuenciación de polimerasa de T7 de Pharmacia (Pharmacia, Uppsala,
Suecia). La secuencia del nuevo receptor se comparó con las bases de
datos de EMBL y Genbank usando el programa FASTA. Los alineamientos
con receptores de citoquina conocidos se llevaron a cabo a simple
vista.
Un método más rápido alternativo para el
análisis de calvas positivas se identificó usando oligonucleótidos
degenerados para el motivo WSXWS.
Calvas positivas primarias se identifican y se
recogen.
Se usaron 5 \mul de eluato de calvas primarias
en una reacción en cadena de la polimerasa que contenía lo
siguiente: 5 \mul de 10 x tampón de PCR con Mg (Boehringer
Mannheim,) 1 \mul de dATP, dCTP, dGTP y dTTP 10 mM (Promega
Corp), 2,5 \mul de cada cebador en 100 \mug/ml y 0,5 \mul de
polimerasa de Taq (Boehringer Mannheim). Los cebadores utilizados
eran aquellos cebadores de WSXWS usados en la hibridación en
combinación con cebadores específicos para el bacteriófago
\lambda en el que se clonaba la biblioteca. Se llevó a cabo PCR
en una máquina Perkin Elmer 9600 usando el siguiente protocolo: 96ºC
durante 2 min, 25 ciclos de 96ºC durante 30 s, 55ºC durante 30 s y
72ºC durante 2 min, 4ºC indefinidamente.
Se sometieron a electroforesis 20 \mul de la
PCR sobre un gel de agarosa al 1% p/v en TAE. Cualquier producto se
aisló usando el reactivo GeneClean y se sometió a secuenciación bien
usando cebadores de WSXWS marcados con ^{33}P con el estuche de
secuenciación fmol (Promega Corp) o bien cebadores de WSXWS no
marcados y didesoxinucleótidos fluoresceinados con un secuenciador
automatizado. La secuencia se usa a continuación para verificar
motivos comunes a receptores de la familia de hemopoyetina.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
3
La síntesis de cDNA de la primera hebra se
realizó sobre 1 \mug de poliA+ RNA citoplásmico. La transcripción
inversa se llevó a cabo a 42ºC durante 60 min en 20 \mul de
Tris.HCl 50 mM, pH 8,3, KCl 20 mM, MgCl_{2} 10 mM, ditiotreitol 5
mM, 1 mM de cada dNTP, 20 \mug/ml de
oligo(dT)_{15} y 12,5 unidades de transcriptasa
inversa de AMV (Boehringer Mannheim GmbH, Mannheim, Alemania). Se
realizaron reacciones de control para cada muestra de RNA bajo
condiciones idénticas, excepto que la transcriptasa inversa se
omitió de la reacción. La mezcla de reacción de transcripción
inversa se diluyó hasta 100 \mul con agua y se usaron 5 \mul
para cada reacción de PCR. Las reacciones de PCR se llevaron a cabo
en 50 \mul de tampón de reacción (Boehringer Mannheim GmbH,
Mannheim, Alemania) que contenía 200 \muM de cada dNTP, 1 \muM
de cada cebador y 2,5 U de polimerasa de Taq (Boehringer Mannheim
GmbH, Mannheim, Alemania). A partir del homólogo Y con otros
miembros de la familia de receptores de hemopoyetina, se predijo
que los cebadores usados para la amplificación del cDNA de la
cadena \alpha del receptor de IL-11 (Nr1)
abarcaban al menos un intrón. Estos oligonucleótidos eran Nº 449 y
Nº 285 (nucleótidos 133-156 y
677-661; Figura 1, Tabla 2), mientras que para la
amplificación de cDNA de GAPDH se usaron los cebadores Nº 495 y Nº
496 (Tabla 2). La PCR se realizó durante 30 ciclos a 94ºC durante 2
min, a 60ºC durante 2 min y a 72ºC durante 3 min en un ciclador
Perkin Elmer Cetus Thermal (Perkin Elmer Cetus, CA, EE. UU. de A.).
Una parte alícuota de la mezcla de reacción se sometió a
electroforesis sobre un gel de agarosa al 1,0% p/v y el DNA se
transfirió a una membrana Zetaprobe. Se realizaron transferencias
Southern según se describe por Reed y Mann (19). La hibridación se
llevó a cabo con oligonucleótidos marcados en los extremos (Nº 489
para la cadena \alpha del receptor de IL-11 y Nº
741 para GAPDH; Tabla 2).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
4
Se usó Nr1-30.3 en una PCR con
los cebadores 30fl y 30r1 (Tabla 2) para generar un cDNA que
contenía poca región no traducida 5'o 3'. El producto de PCR se
clonó en el sitio BstX I de pEF-BOS (21) usando
adaptadores para BstX I (Invitrogen, CA, EE. UU. de A.). El inserto
de cDNA se sometió a secuenciación en ambas hebras. cDNA que
codifican el receptor de LIF humano y gp130 de ratón también se
subclonaron en pEF-BOS. Los cDNA del receptor en
pEF-BOS se linealizaron con Aat II antes de la
transfección. Derivados de pBluescript que contenían cDNA que
codifican los marcadores seleccionables puromicina transferasa
(pPGKpuropA) y neomicina transferasa (pPGKneopA) transcritos a
partir de un promotor de PGK y con la región no traducida 3' de
globina \beta se linealizaron con Sca I.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
5
Las células se transfectaron establemente
mediante electroporación. En resumen, las células se lavaron dos
veces en PBS enfriada con hielo y se resuspendieron en PBS en 5 x
10^{6} por ml. Una cantidad de 4 x 10^{6} células se dividió en
partes alícuotas en cubetas de electroporación de 0,4 mm con 20
\mug de pEF-BOS con o sin Nr1, gp130 o el
receptor de LIF clonado en el sitio BstX I y 2 \mug de los
marcadores seleccionables pPGKpuro o pPGKneo. El DNA y las células
se incubaron durante 10 minutos sobre hielo y se sometieron a
electroporación a 270 V y 960 \muF en un Bio-Rad
Gene Pulser (Bio-Rad Laboratories, CA, EE. UU. de
A.). Las células se mezclaron con 1 ml de medio de cultivo, se
centrifugaron a través de 3 ml de FCS y se resuspendieron en 100 ml
de medio de cultivo. A continuación, las células se dividieron en
partes alícuotas en cuatro platos de 24 pocillos. Después de dos
días, se comenzó la selección mediante la adición de geneticina
hasta una concentración de 1,2 mg/ml, de puromicina hasta una
concentración de 40 \mug/ml para células M1 y 5 \mug/ml para
células Ba/F3. Después de 10-14 días, los clones de
células proliferantes se transfirieron a matraces y, después de la
expansión, se probaron con respecto a la expresión de receptor.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
6
IL-3 e IL-11
múridas se adquirieron de PeproTech (PeproTech, NJ, EE. UU. de A.),
LIF humano y OSM humana se produjeron usando el sistema pGEX,
esencialmente como se describe (25).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
7
La proliferación de células Ba/F3 en respuesta a
citoquinas se midió en Lux60 microwell HL-A plate
(NuncInc., IL, EE. UU. de A.). Las células se lavaron tres veces en
DME que contenía 20% v/v de suero de ternero recién nacido y se
resuspendieron a una concentración de 2 x 10^{4} células por ml en
el mismo medio. Partes alícuotas de 10 \mul de la suspensión
celular se pusieron en los pocillos de cultivo con 5 \mul de
diluciones en serie de IL-3, IL-11
o LIF recombinantes purificados, o IL-6 en 3
\mug/ml y cadena \alpha de receptor de IL-6
soluble en 500 ng/ml. Después de 2 días de incubación a 37ºC en una
incubadora totalmente humidificada que contenía 10% v/v de CO_{2}
en aire, las células viables se contaron usando un microscopio
invertido.
Para ensayar la diferenciación de células M1 en
respuesta a citoquinas, 300 células se cultivaron en cápsulas de
Petri de 35 mm que contenían 1 ml de DME complementado con FCS al
20% v/v, agar al 0,3% p/v y 0,1 ml de diluciones en serie de
IL-6, IL-11, LIF u OSM. Después de 7
días de cultivo a 37ºC en una atmósfera totalmente humidificada,
que contenía 10% v/v de CO_{2} en aire, las colonias de células M1
se contaron y se clasificaron como diferenciadas si contenían
células dispersadas o una corona de células dispersadas alrededor de
un centro estrechamente relleno.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
8
Se disolvió IL-11 a una
concentración de 100 \mug/ml en fosfato sódico 50 mM, NaCl 150 mM
(PBS), Tween 20 al 0,02% v/v y azida sódica al 0,02% p/v a pH 7,4.
La IL-11 se radioyodó de acuerdo con el método de
Bolton y Hunter (24). En resumen, 2 \mug de IL-11
se incubaron con 2 mCi de reactivo de Bolton-Hunter
monoyodado (New England Nuclear, MA, EE. UU. de A.) a temperatura
ambiente en 20 \mul de borato sódico 150 mM, pH 8,5. Después de
dos horas la reacción se extinguió con 100 \mul de glicina 1M en
el mismo tampón y la proteína marcada se separó de reactivo de
Bolton-Hunter no incorporado usando una columna
Sephadex G-25 (PD-10; Pharmacia,
Uppsala, Suecia) prerrellena equilibrada en PBS que contiene Tween
20 al 0,02% v/v y azida sódica al 0,02% p/v. Antes del uso, la
^{125}IL-11 se diluyó 10 veces con Tris HCl 50 mM,
pH 7,5, que contenía Tween 20 al 0,02% v/v y azida sódica al 0,02%
p/v y se aplicó a una columna de 250 \mul de
CM-Sephamse CL-4B (Pharmacia,
Uppsala, Suecia) equilibrada en el mismo tampón. La columna se lavó
con 5 ml de tampón de equilibración y se eluyó con partes alícuotas
secuenciales de 5 ml de DME que contenía FCS al 10%. En esta fase,
el ^{125}I era precipitable en más de 95% con ácido
tricloroacético frío. La capacidad de unión de la preparación de
^{125}I-IL-11 se evaluó como se
describe previamente (21) y era aproximadamente 80%. La
radiactividad específica de la
^{125}I-IL-11 era aproximadamente
130.000 cpm/ng y se determinó mediante análisis de
autodesplazamiento (22).
Se realizaron estudios de unión como se describe
previamente (22). En resumen, 5 x 10^{5} - 1,5 x 10^{7} células
en 40 \mul de medio RPMI-1640 que contenía Hepes
20 mM, pH 7,4, y suero de ternero fetal (RHF) se incubaron durante
la noche sobre hielo, con entre 5 x 10^{3} y 2 x 10^{6} cpm de
^{125}I-IL-11, con o sin un
exceso de 100 veces de IL-11 no marcada. En otros
experimentos, los receptores se saturaron con una cantidad
constante de ^{125}I-IL-11 y
cantidades crecientes de IL-11 no marcada o
IL-3, IL-6, LIF, OSM o
G-CSF no marcados. Las
^{125}I-IL-11 asociada a células y
libre se separaron mediante centrifugación rápida a través de 180
\mul de suero de ternero fetal y se cuantificaron en un contador
\gamma.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
9
Los miembros de la familia de receptores de
hemopoyetina exhiben un nivel relativamente bajo de similitud de
secuencia. Una de las características ("features") de los
receptores en esta familia es el motivo de cinco aminoácidos
Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
(WSXWS) (15, 16, 17). En un intento de clonar nuevos receptores de
hemopoyetina, 10^{6} calvas de una biblioteca de cDNA de hígado
de ratón adulto se rastrearon con oligonucleótidos degenerados
correspondientes al motivo WSXSW. Se recogieron calvas de
bacteriófago \lambda que aparecían positivas sobre los filtros
duplicados, se eluyeron y se aislaron mediante dos rondas
subsiguientes de enriquecimiento de calvas. A continuación, el DNA
de calvas hibridantes puras se sometió a secuenciación.
La utilidad de esta técnica se demostró mediante
la identificación de varios cDNA que codifican el receptor de LIF,
el receptor de IL-7, gp130 múridos y una nueva
secuencia que parecía relacionada con miembros de la familia de
receptores de hemopoyetina que se denomina en la presente memoria
"Nr1". El cDNA (Nr1-AZ-36) que
codifica este nuevo receptor se sometió a secuenciación
completamente y, aunque contenía una señal de poliadenilación y una
cola de poli-A extensa, estaba claramente truncado
en el extremo 5' (Figura 1).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
10
Para aislar cDNA de Nr1 de longitud completa, la
biblioteca original y una segunda biblioteca de hígado de ratón
adulto se rastrearon con oligonucleótidos (Nº 26 y Nº 60; Tabla 2)
diseñados a parir del extremo 5' del clon
Nr1-AZ-36. Ocho clones de cDNA se
aislaron y cuatro se sometieron a secuenciación completamente
(Figura 1). Los análisis de las secuencias de cDNA revelaban un
marco de lectura abierto de 1296 pb que codifica una proteína de
432 aminoácidos de longitud. La secuencia primaria predicha incluía
una secuencia líder hidrófoba potencial (residuos
1-23), un dominio extracelular con dos sitios de
glicosilación conectados a N potenciales (residuos
24-367), un dominio de transmembrana (residuos
368-393) y una cola citoplásmica corta (residuos
394-432). Se ha estimado inicialmente que el peso
molecular nuclear del receptor maduro es aproximadamente 36.000
daltons.
El dominio extracelular contenía residuos
característicos de un dominio de hemopoyetina clásico (D200; 15)
(Figuras 1 y 2), incluyendo residuos de prolina que preceden a cada
subdominio de 100 aminoácidos (SD100), cuatro residuos de cisteína
conservados, una serie de residuos polares e hidrófobos y un motivo
WSXWS. El dominio receptor de hemopoyetina del nuevo receptor
estaba precedido por un dominio similar a inmunoglobulina de 87
aminoácidos y seguido por 37 aminoácidos antes del dominio de
transmembrana. En cuanto a su estructura global y su secuencia
primaria (Figura 2), el nuevo receptor era el más similar a la
cadena \alpha del receptor de IL-6 (24% de
identidad de aminoácidos), la cadena \alpha del receptor de CNTF
(22% de identidad de aminoácidos) y la subunidad p40 de
IL-12 (16% de identidad de aminoácidos).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
11
La distribución de la expresión de mRNA de Nr1
se analizó mediante transferencia Northern y la reacción en cadena
de la polimerasa con transcriptasa inversa (RT-PCR).
Entre un estudio de RNA poliadenilado procedente de 15 muestras de
tejido primario y 17 líneas celulares, solo el RNA procedente de la
línea celular preadipocítica 3T3-L 1 daba una banda
de hibridación detectable de aproximadamente 2,0 kb de longitud en
una transferencia Northern. Esto se compara con una longitud de
aproximadamente 1650 pb para el cDNA de Nr1 más largo aislado y
sugiere que este clon puede no estar completo en el extremo 5'.
La baja abundancia del mRNA de Nr1 sugerida a
partir de análisis Northern apuntaba al uso de
RT-PCR como un medio de detección más sensible.
Todas las muestras contenían mRNA de GAPDH, según se juzgaba por
RT-PCR (Figura 3), sin embargo, solo las células
3T3-L1, la línea estromal BAd, la línea celular de
carcinoma embrionario PC13 y las líneas celulares de hemopoyetina
dependientes de factor FDCP-1 y D35 expresaban mRNA
de Nr1 (Figura 3). Una amplia gama de tejidos primarios también era
positiva (Figura 3), incluyendo los tejidos hemopoyetínicos médula
ósea, bazo y timo, así como el hígado, el cerebro, el corazón, el
riñón, el músculo y la glándula salivar. En muestras de mRNA
procedentes de varias líneas celulares y tejidos, no podían
detectarse transcritos para Nr1. Tales resultados negativos
necesitaban confirmarse usando un sistema más cuantitativo para el
análisis de mRNA. En experimentos de control, se realizaba PCR
sobre mRNA que no se había sometido a transcripción inversa. En
ninguna de estas muestras se detectaba un producto de Nr1.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
12
Dada su similitud de secuencia con las cadenas
\alpha de receptores de IL-6 y CNTF y su expresión
en células 3T3-L1, se razonó que Nr1 podría ser una
cadena \alpha de receptor que interactuaría con gp130 y/o el
receptor de LIF para generar un receptor de alta afinidad capaz de
transducción de señales. Puesto que no se han descritos cadenas
\alpha de receptor, similares en estructura a la cadena \alpha
de receptor de IL-6, para LIF, OSM e
IL-11, estas citoquinas representan candidatos
atractivos para el ligando cognado de Nr1.
Para probar si LIF, OSM o IL-11
se unen al nuevo receptor, la línea celular de hemopoyetina
dependiente de factor Ba/F3 y la línea celular leucémica de ratón
M1 se transfectaron establemente con el vector
pEF-BOS que contiene el cDNA que codifica Nr1. Las
células M1 parentales expresan el receptor de LIF y gp130 y, por lo
tanto, se unen a ^{125}I-LIF y
^{125}I-OSM. La expresión de Nr1 en células M1 no
daba como resultado la unión alterada de
^{125}I-LIF ni ^{125}I-OSM. En
contraste, las células Ba/F3 no expresaban ni el receptor de LIF ni
gp130 y no se observó unión de ^{125}I-LIF ni
^{125}I-OSM en células Ba/F3 parentales o células
que expresaban Nr1.
No podía detectarse unión de
^{125}I-IL-11 en células M1 o
Ba/F3 parentales (Figura 4A y C). Sin embargo, notablemente, la
expresión de Nr1 en cada tipo de célula daba como resultado la
capacidad para unirse a
^{125}I-IL-11, lo que sugería que
Nr1 podría ser la cadena \alpha del receptor de
IL-11. La transformación de Scatchard de las
isotermas de unión de saturación revelaba que la afinidad de
IL-11 para su receptor difería entre los dos tipos
de células (Figura 4A frente a 4C). La unión de
^{125}I-IL-11 a células Ba/F3 que
expresan Nr1 era de muy baja afinidad. Se estimó que la constante
de disociación en equilibrio aparente (K_{D}) para esta
interacción era aproximadamente 10 pM y las células expresaban un
promedio de entre 2.000 y 8.000 receptores en su superficie (Figura
4A). Células M1 transfectadas con un cDNA de Nr1 expresaban un
número similar de receptores de IL-11 (Figura 4C),
sin embargo, la afinidad de la interacción era superior
(K_{D}=400-800 pM). Los receptores de
IL-11 expresados sobre células M1 transfectadas con
Nr1 era similares en afinidad a los receptores expresados
naturalmente sobre células 3T3-L 1 (Figura 4D).
Una explicación para la generación de receptores
de baja afinidad o alta afinidad de acuerdo con el tipo de célula
en el que se expresa Nr1 es que el propio Nr1 tiene una afinidad
intrínsecamente baja para IL-11, pero las células
M1 expresan un exceso de un componente receptor adicional requerido
para la generación de un complejo de alta afinidad. Existe una
evidencia indirecta del papel de gp130 en la transducción de señales
del receptor de IL-11, ya que los anticuerpos
neutralizadores para gp130 inhibían la proliferación de células
TF-1 inducida por IL-11. Para
probar esta propuesta directamente, gp130 y/o el receptor de LIF se
expresaron en células Ba/F3 parentales o en células Ba/F3 que
expresaban Nr1.
Las células Ba/F3 parentales y las células Ba/F3
que expresaban gp130 y el receptor de LIF, solas o en combinación,
no se unían a IL-11 (Figura 4A y B). Las células
Ba/F3 que expresaban Nr1 y el receptor de LIF se unían a
IL-11 con una afinidad muy baja que era
indistinguible de células que expresaban la cadena \alpha del
receptor de IL-11 sola (Figura 4A). En contraste,
cuando gp130 y Nr1 se coexpresaban en células Ba/F3, se generaban
receptores de alta afinidad para IL-11 (Figura 4B).
La afinidad de los receptores era similar a la de receptores
expresados por células 3T3-L1 y células M1 que
expresaban la cadena \alpha del receptor de IL-11
(Figura 4B-D). La expresión del receptor de LIF con
Nr1 y gp130 no incrementaba la afinidad de unión a
IL-11 (Figura 4B).
Nr1 parece ser un receptor que es específico
para IL-11. La unión de
^{125}I-IL-11 a células Ba/F3 que
expresan Nr1 entraba en competencia con IL-11 no
marcada, pero no IL-6, LIF, OSM o
IL-3 (Figura 5). Existe una situación más compleja
en células en la Nr1 se expresa con gp130 y el receptor de LIF. La
unión de ^{125}I-IL-11 a células
Ba/F3 que expresaban Nr1 y gp130 entraba en competencia con OSM e
IL-11 no marcada (Figura 5), mientras que la unión
a células Ba/F3 que expresaban Nr1, gp130 y el receptor de LIF
entraba en competencia con LIF, así como OSM e
IL-11 (Figura 5).
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Ejemplo
13
Muchas citoquinas ejercen efectos sobre la
diferenciación celular así como la división celular. En ausencia de
estímulos de diferenciación, las colonias de células M1 leucémicas
parentales están estrechamente rellenas y están compuestas por
células blásticas no diferenciadas. En respuesta a LIF, OSM e
IL-6, pero no IL-11, las colonias
de M1 que crecían en agar semisólido se dispersaban debido a la
inducción de la diferenciación de macrófagos (Figura 6A). Además,
LIF, OSM e IL-6 suprimen la clonogenicidad de
células M1 dando como resultado el desarrollo de números reducidos
de colonias. Las células M1 que expresaban la cadena \alpha del
receptor de IL-11 exhibían una respuesta normal a
LIF, OSM e IL-6 pero ahora se diferenciaban en
macrófagos cuando eran estimuladas por IL-11
(Figura 6B). Como con LIF, IL-6 y OSM, eran
producidas menos colonias por células M1 que expresan Nr1 en
presencia de IL-11 que en cultivos de control y
estas colonias contenían menos células.
La línea celular de hemopoyetina dependiente de
IL-3 Ba/F3 se ha usado para estudiar la capacidad de
una variedad de receptores de citoquina para transducir una señal
proliferativa. Las células Ba/F3 son absolutamente dependientes de
IL-3 para la proliferación, pero no proliferan en
respuesta a IL-11, LIF o IL-6. Por
lo tanto, se determinó si la expresión de Nr1, gp130 y el receptor
de LIF ampliaba el espectro de citoquinas a las que podían responder
estas células. Aunque ninguna de las líneas celulares examinadas
podía proliferar en respuesta a IL-6 sola, cada
línea celular que expresaba gp130, independientemente de si se
coexpresaban o no otros receptores, proliferaba en respuesta a una
combinación de IL-6 y la cadena \alpha del
receptor de IL-6 soluble (Figura 7). La
proliferación en respuesta a LIF requería la coexpresión del
receptor de LIF y gp130 (Figura 7), sin embargo, estas células eran
incapaces de proliferar en respuesta a IL-11.
Asimismo, las células Ba/F3 que expresaban Nr1 solo o Nr1 y el
receptor de LIF eran incapaces de responder a IL-11
(Figura 7). La respuesta a IL-11 requería la
coexpresión tanto de Nr1 como de gp130 (Figura 7). La proliferación
semimáxima de estas células se producía a una concentración de
IL-11 de entre 20 y 100 pg/ml. La expresión del
receptor de LIF, además de Nr1 y gp130, no alteraba esta respuesta
(Figura 7).
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Ejemplo
14
Para determinar la factibilidad de clonar la
IL-11r\alpha basándose en la homología con el
receptor múrido, se llevó a cabo un análisis de DNA genómico múrido
y humano usando un fragmento de cDNA de
IL-11r\alpha múrida como una sonda (para el
método, véase el Ejemplo 13). La Figura 10A muestra una banda
específica de 14 kb en el DNA humano, en comparación con 4,8 kb en
el DNA múrido, cuando se examinan bajo condiciones de alta
restricción de hibridación (0,2 X SSC, a 65ºC).
La misma sonda múrida (fragmento Sph
I/Sac I de 445 pb) se usó a continuación para rastrear
aproximadamente 10^{6} calvas procedentes de cinco bibliotecas de
cDNA humano. Estas incluían dos bibliotecas de médula ósea de
adulto (27; Nº Cat. Clontech HL1058a) y bibliotecas procedentes de
la placenta (Nº Cat. Clontech HL1008b), el hígado (Nº Cat. Clontech
HL1001a) humanos y una línea celular de hepatoma (Nº Cat. Clontech
HL1015b). Las calvas positivas se aislaron y se purificaron
mediante rondas sucesivas de rastreo por hibridación (para el
método, véase el Ejemplo 17). Se obtuvieron aproximadamente 30
clones positivos de cada una de las bibliotecas de médula ósea de
adulto y la biblioteca placentaria. No se identificaron clones
positivos de las bibliotecas de hígado o hepatoma a pesar de que el
receptor múrido se aislaba de este tejido (véanse los Ejemplos
previos). Las calvas positivas también se examinaron durante una
estrategia basada en PCR; los eluatos de las calvas se usaron como
plantillas en una reacción de PCR cebada con un oligonucleótido
antisentido que codifica el motivo WSXWS múrido y un cebador
oligonucleotídico apropiado derivado de la secuencia del vector en
la región adyacente al sitio de clonación. Tres clones procedentes
de una biblioteca de médula ósea se eligieron inicialmente para una
caracterización detallada. El análisis Southern usando un fragmento
de restricción procedente del cDNA humano identificaba bandas
equivalentes a las detectadas usando la
IL-11r\alpha múrida, confirmando así la identidad
del cDNA humano (Fig. 10B). La secuencia de nucleótidos del inserto
procedente de cada uno de estos clones (Nº 9.1, Nº 4.3, Nº 8.2) se
determinó en ambas direcciones. El inserto procedente del clon Nº
9.1 se usó para generar una sonda para volver a rastrear la
biblioteca de cDNA de médula ósea y daba como resultado la
identificación de otro clon único (Nº 17.1, Fig. 11). La secuencia
de nucleótidos de este clon también se determinó en ambas
direcciones.
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Ejemplo
15
Según se representa en la Fig 11, los clones Nº
9.1 y Nº 4.3 estaban incompletos mientras que los clones Nº 8.2 y
Nº 17.1 abarcaban toda la región codificante. Los clones Nº 8.2 y Nº
17.1 contenían una secuencia intrónica de 287 pb y los clones Nº
4.3 y Nº 8.2 contenían una secuencia intrónica de 254 pb. Estas
secuencias se confirmaron como intrones mediante el análisis de
clones de DNA genómico, exhibían secuencias
donantes-aceptoras de corte y empalme típicas y se
atribuyeron al corte y empalme incompleto del mRNA. La Figura 8
muestra la secuencia de nucleótidos compuesta determinada a partir
de los cuatro clones de cDNA de IL-11r\alpha. La
secuencia incluía 127 pb de región no traducida (UTR) 5' que estaba
representada en 3 clones, y una UTR 3' con una señal de
poliadenilación y cola de poli-A. Había un marco de
lectura abierto de 1269 pb que se predecía que codificaba una
proteína de 432 aminoácidos (aa). La proteína predicha tenía una
secuencia líder hidrófoba potencial (1-23 aa), una
región extracelular (24-366 aa), un dominio de
transmembrana (367-392 aa) y una cola citoplásmica
(393-423 aa). El dominio extracelular contenía dos
posibles sitios de glicosilación conectada a N (Fig. 8). Como con
la IL-11r\alpha múrida (véanse los Ejemplos
previos) y en común con otros receptores de citoquina (15; 28), la
IL-11r\alpha humana exhibía un dominio similar a
inmunoglobulina y un dominio de hemopoyetina (D200, Fig. 8) en la
región extracelular. La última estaba compuesta por dos subdominios
de 100 aa (SD100, Fig. 8) e incluía residuos de prolina que
precedían a cada subdominio, cuatro residuos de cisteína
conservados, una serie de residuos polares e hidrófobos y el motivo
WSXWS. El aminoácido variable "S" se identificó como treonina
en el receptor humano en comparación con alanina en el equivalente
múrido (véanse los Ejemplos previos).
Se apreciaron varias diferencia entre clones
aislados de la misma biblioteca. Una sustitución de nucleótidos en
el clon Nº 4.3 (G\leftrightarrowC en el pb 944, Fig. 8) daba como
resultado un residuo de aminoácido diferente (E\leftrightarrowQ
en el aa 273, Fig. 8). El clon Nº 4.3 y el Nº 17.1 diferían del clon
Nº 8.2 en una sustitución de nucleótidos (G\leftrightarrowA en el
pb 1135, Fig. 8) en la región codificante sin cambio consiguiente en
la proteína. Además, los clones Nº 17.1 y Nº 8.2 diferían en la UTR
3' en una sola sustitución (A\leftrightarrowG en el pb 1658, Fig.
8). Se interpretaba que estas diferencias representaban
polimorfismos.
La comparación de las secuencias de las cadenas
IL-11r\alpha múrida y humana mostraba un alto
grado de homología (Fig. 12). Había una identidad global de 85% a
nivel de ácidos nucleicos y 84% a nivel de proteínas. La homología
era más evidente en las regiones extracelular y de transmembrana y
lo era menos en la cola citoplásmica donde el receptor humano era 8
aminoácidos más corto que el equivalente múrido. Ninguna proteína
contenía un dominio similar a tirosina quinasa identificable.
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Ejemplo
16
La línea celular leucémica mieloide múrida M1
(29) expresa constitutivamente gp130 múrida, la molécula de
señalización para receptores de LIF, IL-6, OSM e
IL-11. En respuesta a LIF, OSM y
IL-6, colonias de células M1 parentales en agar
semisólido se dispersan como células diferenciadas en macrófagos y
adquieren la capacidad de migrar a través de agar. Además, existe
la supresión de la clonogenicidad que conduce a números de colonias
reducidos. Las células M1 manipuladas para expresar la
IL-11r\alpha múrida presentaban unión específica
de IL-11 y se diferenciaban en respuesta a
IL-11 (véanse los Ejemplos previos). La
IL-11r\alpha humana se expresaba en células M1
múridas usando el vector de expresión mamífero pEFBOS (30; Ejemplo
15). Se llevaron a cabo estudios de unión usando
IL-11 humana marcada con ^{125}I para probar si la
IL-11 se unía específicamente a estas células
(véase el Ejemplo 15 para los métodos). Según se muestra en la Tabla
3, las células M1 manipuladas para expresar la
IL-11r\alpha humana (fracciones reunidas Nº 1 - Nº
4) demostraban una unión específica significativa de
IL-11 humana. Las células de control positivas, las
células M1 y las células Ba/F3 que expresan la
IL-11r\alpha múrida y la gp130 múrida (véanse los
ejemplos previos) también mostraban unión de alto nivel. Según se
esperaba, las células M1 parentales no exhibían unión específica
detectable de IL-11. El análisis de Scatchard de
isotermas de saturación de IL-11 que se une a
células M1 que expresaban IL-11r\alpha humana
confirmaba la unión con alta afinidad (Fig. 13). Se estimó que la
constante de disociación en equilibrio aparente (K_{d}) era 250
pM. Estas células expresaban un promedio de 3190 receptores en su
superficie. Este resultado era comparable a células M1 que expresan
IL-11r\alpha múrida (K_{d}=275 pM, y 4815
receptores/célula) y se atribuía a una interacción de la
IL-11r\alpha humana con gp130 múrida.
La Tabla 4 resume los resultados de experimentos
de cultivo en agar de células M1 que expresaban
IL-11r\alpha humana y muestra su respuesta a LIF
e IL-11. Según se describe anteriormente, las
células M1 que expresaban la IL-11r\alpha múrida
presentaban supresión clonal y diferenciación de macrófagos en
respuesta a IL-11. En contraste, las células M1
parentales centrales no respondían a IL-11. Las
cuatro fracciones reunidas de células M1 manipuladas para expresar
la IL-11r\alpha humana, cuando se trataban con
In-11, mostraban una supresión notable de la
clonogenicidad (Tabla 4). Además, las pocas colonias que crecían en
IL-11 presentaban un fenotipo diferenciado. Todas
las líneas celulares mostraban la respuesta esperada a LIF.
Células M1 que expresaban
IL-11r\alpha humana y células de control también
se examinaron en cultivos en suspensión para evaluar la
diferenciación de macrófagos en respuesta a IL-11 y
LIF (31; 32). La morfología de los macrófagos se evaluó después de
cinco días en el cultivo. Según se muestra en la Fig. 13, la mayoría
de las células presentaba un fenotipo de macrófago después de la
estimulación con IL-11. Se observaron resultados
similares con células M1 que expresaban la
IL-11r\alpha múrida, mientras que las células M1
parentales no respondían a IL-11. Así, estos
experimentos documentaban la capacidad del cDNA humano aislado para
codificar una proteína receptora funcional y demostraban que la
cooperación entre la IL-11r\alpha humana y la
gp130 múrida era suficiente para la transducción de
señales.
señales.
Para tratar directamente el requerimiento de
gp130 para la señalización de receptor de IL-11
humano, se examinaron células Ba/F3 múridas. Estas células eran
totalmente dependientes de IL-3 para la
supervivencia y no expresan constitutivamente gp130. Las células
Ba/F3 se manipularon para expresar IL-11r\alpha
humana y se expandieron basándose en la expresión del gen de
resistencia a puromicina sometido a coelectroporación. Se
establecieron tres líneas celulares clonales. Se confirmó que estas
expresaban IL-11r\alpha humana según se evaluó
mediante la unión de IL-11 humana radiomarcada,
aunque a un nivel bajo (106; 97; 116; conteos específicos medios
unidos por 10^{6} células frente a unión indetectable para
células Ba/F3 parentales). Según se muestra en la Fig. 14, estas
células eran insensibles a IL-11. La molécula de
gp130 humana se expresó a continuación en cada una de estas líneas
clonales: las células proliferaban entonces en respuesta a
IL-11 (Fig. 14). Este resultado confirmaba la
expresión de la IL-11r\alpha humana, en células
Ba/F3, y el requerimiento de gp130 para la proliferación. Las
células Ba/F3 parentales usadas como control no respondían a
IL-11 y, según se esperaba, todas las células
proliferaban en respuesta a IL-3
múrida.
múrida.
\newpage
Ejemplo
17
Las siguientes bibliotecas de cDNA humano se
rastrearon usando la sonda múrida mencionada anteriormente: dos
bibliotecas de médula ósea (27; Nº Cat. Clontech HL1058a), una
biblioteca placentaria (Nº Cat. Clontech HL1008b), una biblioteca
de hígado (Nº Cat. Clontech HL1001a) y una biblioteca de células de
hepatoma (Nº Cat. Clontech HL1015b). Aproximadamente 10^{6}
calvas procedentes de cada biblioteca se elevaron sobre membranas de
nitrocelulosa y se fijaron incubando a 80ºC durante 2 h bajo vacío.
Los filtros se prehibridaron durante 1 h y a continuación se
hibridaron a 65ºC durante 16 h en una solución que contenía 2 X SSC,
2 mg/ml de albúmina de suero bovino, 2 mg/ml de Ficoll, 2 mg/ml de
polivinilpirrolidona, ATP \muM, 50 \mug/ml de tRNA, pirofosfato
sódico 2 mM, 2 mg/ml de DNA de esperma de salmón, 200 \mug/ml de
azida sódica y SDS al 1% p/v. Los filtros se lavaron finalmente
durante 30 min a 65ºC con 0,2 X SSC, SDS al 0,1%. Las calvas
positivas sobre filtros duplicados se aislaron y se purificaron
mediante rondas adicionales de rastreo por hibridación.
El clon Nº 91 humano (Fig. 11) también se marcó
y se usó para sondar una biblioteca de cDNA de médula ósea humana.
Esto daba como resultado el clon Nº 17.1.
Una cantidad de 15 \mug de DNA genómico humano
(obtenido de leucocitos de sangre periférica) y DNA genómico múrido
(obtenido de la línea celular FDCP-1) se digirió
hasta la terminación con la enzima de restricción Hind III
(Boehringer Mannheim, Alemania). Los fragmentos de DNA se separaron
sobre un gel de agarosa al 0,8% p/v y se transfirieron a NaOH 0,4 M
sobre una membrana de nailon (Gene Screen Plus, Biotechnology
Systems, NEN Research Products).
Un fragmento de digestión con enzimas de
restricción Sph I/Sac I de 445 pb procedente del clon
30.1 de IL-11r\alpha múrida (véanse los Ejemplos
previos) y un fragmento de digestión de restricción Pst
I/Sba I de 560 pb procedente del clon Nº 17.1 de cDNA humano
se usaron como sondas. Una cantidad de 100 ng de DNA se marcó
usando un estuche de marcaje aleatorio de decanucleótidos
(Braesatec, Adelaide, S.A., Australia). El [^{32}P]ATP
incorporado se separó del marcador no incorporado usando una columna
NICK (Pharmacia, Uppsala, Suecia). La membrana se prehibridó y se
hibridó a 65ºC durante la noche en el tampón recomendado por el
fabricante. La membrana se lavó finalmente en SDS al 0,1% p/v SDS,
0,2 X SSC (cloruro sódico 30 mM, citrato trisódico 3 mM) durante 30
min a 65ºC.
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Ejemplo
18
Placas positivas aisladas usando la sonda múrida
se rastrearon adicionalmente mediante una estrategia basada en PCR.
El eluato procedente de calvas puras (5 \mul) se usó como una
plantilla en una reacción de PCR de 50 \mul de volumen usando 2,5
U de polimerasa de Taq (Boehringer Mannheim, Alemania), el tampón
suministrado, 200 \muM de cada dNTP. La reacción se cebó con 250
ng de cebador oligonucleotídico antisentido correspondiente al
motivo WSXWS
5'-[(G/A)CTCCA(N)GC(G/A)CTCAA-3']
(Nº ID SEC. 23) y un cebador oligonucleotídico vectorial apropiado
que flanqueaba los cebadores de cDNA:promotor T3 y T7 clonados para
el plásmido pBluescript, y los cebadores directo e inverso ygt10 y
ggt11 apropiados. También se realizaron reacciones de control que
carecían de la plantilla. Se seleccionaron tres calvas (Nº 91., Nº
4.3, Nº 8.2 aisladas de una biblioteca de médula ósea). Los cDNA se
sometieron a secuenciación sobre ambas hebras usando el método de
terminación didesoxi (18) y el estuche de secuenciación de
polimerasa de T7 de Pharmacia (Pharmacia, Uppsala, Suecia).
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Ejemplo
19
Un constructo de cDNA que incluía toda la región
codificante y la señal de poliadenilación pero que excluía las
secuencias intrónicas se elaboró ligando fragmentos de digestión con
enzimas de restricción procedentes de Nº 9.1 (fragmento Eco
RI/Pst I) y Nº 17.1 (fragmento Pst I/Eco RI).
El constructo se clonó en el sitio Bst XI de
pEF-BOS (30) usando adaptadores de Bst XI
(Invitrogen, San Diego, CA, EE. UU. de A.). Se linealizó con Aat II
antes de la electroporación en células M1 y Ba/F3. pPGKpuropA y
pPGKneopA son derivados de pBluescript que contienen el cDNA que
codifica puromicina transferasa y neomicina transferasa y se
sometieron a coelectroporación en células y se usaron como
marcadores de selección. gp130 humana clonada en
pEF-BOS se sometió a electroporación en células BaF3
manipuladas para expresar la IL-11r\alpha humana.
Células M1 (29) se hicieron crecer en medio de Eagle modificado de
Dulbecco (DMEM) que contenía suero de ternero fetal (FCS) al 10%
v/v en CO_{2} al 10% v/v a 37ºC. Células Ba/F3 (33) se hicieron
crecer en medio RPMI-1640 que contenía FCS al 10%
v/v y medio acondicionado con WEHI-3B D como una
fuente de IL-3 (34). Células M1 y Ba/F3 que
expresan establemente el constructo de
IL-11r\alpha humana se generaron mediante
electroporación como se describe anteriormente. Las células se
sometieron a coelectroporación con pPGKPuropA. Clones de Ba/F3 que
expresaban IL-11r\alpha humana se expandieron con
selección del antibiótico puromicina y se introdujo gp130 humana
con pPGKneopA. Estas células se expandieron en G418.
Para los ensayos biológicos, células M1 (300 por
ml) se cultivaron en DMEM, FCS al 20% v/v, agar al 0,3% p/v y con
IL-11 humana (1000 U/ml) o LIF múrido (1000 U/ml) o
solución salina normal. Los cultivos se incubaron en aire
humidificado con CO_{2} al 10% v/v a 37ºC. Después de 7 días, las
colonias se contaron y la diferenciación se evaluó usando criterios
estándar (35). En los cultivos en suspensión, 1,5 x 10^{4} células
M1 se cultivaron en 1,5 ml de DMEM que contenía FCS al 10% v/v y
con o sin IL-11 (1000 U/ml) o LIF (1000 U/ml) y se
incubaron como anteriormente. La diferenciación se determinó
mediante el examen morfológico de células teñidas con
May-Grunwald Giemsa: se examinó un mínimo de 200
células.
La proliferación de células Ba/F3 se midió en un
ensayo de micropocillos como el descrito anteriormente. En resumen,
200 células/pocillo se incubaron en 15 \mul de medio que contenía
los siguientes estímulos: solución salina normal,
interleuquina-3 (IL-3) múrida en una
concentración final de 1000 unidades/ml y diluciones en serie de
IL-11 humana. Las células viables se contaron
después de 48 horas.
La yodación de IL-11 usando el
reactivo de Bolton-Hunter y los estudios de unión
con células M1 y Ba/F3 se realizaron como se describe previamente
con anterioridad.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
20
IL-3 múrida e
IL-11 humana se adquirieron de Peprotech (Rocky
Hill, NJ, EE. UU. de A.) y LIF múrido y AMRAD de Pty. Ltd.
(Melbourne, Australia). La IL-11 humana usada en
estudios de unión a ligandos se obtuvo mediante la expresión en
células COS-M6. En resumen, un cDNA que codifica la
proteína madura para IL-11 humana se obtuvo
mediante la reacción en cadena de la polimerasa a partir de cDNA
derivado de una línea celular estromal humana 197/17 (36). La
región codificante madura de IL-11 humana se insertó
en pEF/IL3SIG/FLAG que es un vector de expresión derivado de
pEF-BOS (30) que contiene secuencias que codifican
la secuencia de señal de IL-3 múrida seguido por la
secuencia FLAG (Eastman Kodak, CT, EE. UU. de A.), y a continuación
se expresó en células COS-M6 dando como resultado
la secreción de una proteína de IL-11 humana
biológicamente activa con una flag N-terminal. La
IL-11 human con flag N-terminal se
purificó mediante cromatografía de afinidad sobre una columna de
anticuerpo monoclonal M2 anti-FLAG (Eastman Kodak,
CT, EE. UU. de A.) según era recomendado por el fabricante, con
elución de péptido seguida por cromatografía de filtración en gel
sobre Superdex 75 (Pharmacia, Uppsala, Suecia). La proteína
purificada daba una sola banda de PM 25.000 sobre geles de
poliacrilamida en presencia de SDS.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
21
Puesto que no estaban disponibles anticuerpos
para la cadena \alpha de receptor de IL-11 para
verificar la expresión, se sometieron a ingeniería genética
constructos para expresar una versión soluble de la cadena \alpha
de receptor de IL-11 múrida con un epítopo FLAG
N-terminal (International Biotechnologies/Eastman
Kodak, CT, EE. UU. de A.). En primer lugar, se generó un derivado
del vector de expresión mamífero pEF-BOS de modo
que contuviera DNA que codifica la secuencia de señal de
IL-3 múrida (MVLASSTTSIHTMLLLLLMLFHLGLQASIS) y el
epítopo FLAG (DYKDDDDK), seguido por un sitio de clonación
Xba I único. Este vector se denominó pEF/IL3SIG/FLAG.
Se realizó PCR para amplificar fragmentos de DNA
que codifican el dominio extracelular sin las regiones de
transmembrana o citoplásmica (S24 a Q367). Los cebadores usados
eran:
| 5'-ATCTTCTAGATCCCCCTGCCCCCAAGCT-3' | (Nº ID SEC: 24) |
| 5'ACTTTCTAGATTATTGCTCCAAGGGGTCCCTGTG-3' | (Nº ID SEC: 25) |
El producto de PCR de la cadena \alpha de
receptor de IL-11 múrida soluble se digirió con
Xba I y se clonó, en el marco, en el sitio XbaI de
pEF/IL3SIG/FLAG para dar
pEF-sIL-11r\alpha.
Para confirmar que la cadena \alpha de
receptor de IL-11 múrida soluble podía producirse
usando los vectores de expresión
pEFSIL-11r\alpha, células COS se transfectaron
transitoriamente con estos constructos. En resumen, células COS
procedentes de un matraz de cultivo tisular de 175 cm^{2}
confluente se resuspendieron en PBS y se sometieron a
electroporación (BioRad Gene pulser; 500 \muF, 300 V) con 20
\mug de pEF-sIL-11r\alpha sin
cortar en una cubeta de 0,4 cm (BioRad). Después de 2 a 3 días a
37ºC en una incubadora completamente humidificada que contenía
CO_{2} al 10% v/v en aire, las células se usaron para análisis de
expresión de proteínas. El medio acondicionado se recogió mediante
centrifugación y se almacenó estérilmente a 4ºC.
El medio se cromatografió a continuación en una
columna de afinidad de anticuerpo anti-FLAG
(International Biotechnologies/Eastman Kodak, CT, EE. UU. de A.).
Las proteínas que no se unían a la columna se lavaron a su través
con PBS, mientras que las proteína de la cadena \alpha de receptor
de IL-11 múrida que se unían a la columna se
eluyeron con 8 ml de \mug/ml de péptido FLAG. La cadena \alpha
de receptor de IL-11 múrida soluble purificada se
sometió a electroforesis sobre un gel de poliacrilamida en presencia
de SDS, que se tiñó con plata para revelar la presencia de una
banda principal con un peso molecular aparente de aproximadamente
40.000 similar al tamaño predicho de la cadena \alpha del receptor
de IL-11 múrida soluble.
La cadena \alpha del receptor de
IL-11 múrida soluble purificada se probó con
respecto a su capacidad para estimular la diferenciación de células
M1 en presencia o ausencia de IL-11. La
IL-11 y la cadena \alpha del receptor de
IL-11 múrida soluble eran incapaces de estimular la
diferenciación de M1 solas, sin embargo, cuando se combinaban, se
observaba diferenciación en cultivo tanto líquido como semisólido.
Estos resultados demuestran que la cadena \alpha del receptor de
IL-11 múrida soluble puede actuar como un agonista,
permitiendo que la IL-11 ejerza efectos sobre
células que expresan gp130 en ausencia de cadena \alpha del
receptor de IL-11 unida a membrana. de este modo,
la cadena \alpha del receptor de IL-11 soluble es
similar a la cadena \alpha del receptor de IL-6
soluble.
Los expertos en la técnica apreciarán que la
invención descrita en la presente memoria es susceptible de
variaciones y modificaciones distintas de las descritas
específicamente. Se entenderá que la invención incluye todas estas
variaciones y modificaciones. La invención también incluye todas las
etapas, las características, las composiciones y los compuestos
mencionados o indicados en esta memoria descriptiva, individualmente
o colectivamente, y todas y cada una de las combinaciones de
cualesquiera dos o más de dichas etapas o características.
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\global\parskip0.000000\baselineskip
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE (distintos de EE.UU.): AMRAD CORPORATION LIMITED (solo EE.UU.): Douglas James HILTON
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: UN NUEVO RECEPTOR DE HEMOPOYETINA
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 25
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: DAVIES COLLISON CAVE
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 1 LITTLE COLLINS STREET
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: MELBOURNE
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: VICTORIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: AUSTRALIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- ZIP: 3000
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: Disco flexible
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: PC compatible con IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release Nº 1.0, Versión Nº 1.25
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE SOLICITUD ACTUALES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: AU PROVISIONAL
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 05-SEP-1994
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DEL ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: HUGHES DR, E JOHN L
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- REFERENCIA/NÚMERO DE EXPEDIENTE: EJH/EK
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: +61 3 9254 2777
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFÁX: +61 3 9254 2770
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 5 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1705 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN: 45.. 1340
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 432 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 1800 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: cDNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- HIPOTÉTICO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- ANTISENTIDO: NO
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- POSICIÓN: 128.. 1396
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 423 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipRCTCCAYT CRCTCCA
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipRCTCCART CRCTCCA
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipRCTCCANGCY CTCCA
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipRCTCCANGG RCTCCA
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipRCTCCAYT TRCTCCA
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 25 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
(
\vskip0.800000\baselineskip
- ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTGGTCCACGG TGGAGCCCAT TGGCT
\hfill25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCACACGCGG TACGAGTCAG TGCCAGGGAC
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipAGCAAGTTCA GCCTGGTTAA G
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTTATGAGTA TTTCTTCCAG GGTA
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCTTCATTG ACCTCAACTA CATG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCATGCCAGTG AGCTTCCCGT TCAG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGGTCCTCCA GGGGTCCAGT ATGG
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGAGGCCTCC AGAGGGT
\hfill17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCTCCTGTACT TGGAGTCCAG G
\hfill21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGAAAGCTGT GGCGTGATGG CCGTGGGGCA
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGGCGGAGGC CGCTGGCGGG CG
\hfill22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipTTATCAGCTG AAGTTCTCTG GGG
\hfill23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 15 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipRCTCCANGCR CTCAA
\hfill15
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 28 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 24:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipATCTTCTAGA TCCCCCTGCC CCCAAGCT
\hfill28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA EL Nº ID SEC: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 34 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE HEBRA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: DNA
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: Nº ID SEC: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACTTTCTAGA TTATTGCTCC AAGGGGTCCC TGTG
\hfill34
Claims (8)
1. Una molécula de ácido nucleico aislada que
comprende una secuencia de nucleótidos que codifica, o
complementaria de una secuencia que codifica, una cadena \alpha
de un receptor de interleuquina (IL)-11 que
tiene
- (i)
- una secuencia de aminoácidos como la indicada en el Nº ID SEC: 3; o
- (ii)
- una secuencia de aminoácidos que es parte de la secuencia de aminoácidos indicada en el Nº ID SEC: 3, comprendiendo dicha secuencia de aminoácidos los aminoácidos 24 a 432 del Nº ID SEC: 3, o los aminoácidos 1 a 367 del Nº ID SEC: 3 o los aminoácidos 24 a 367 del Nº ID SEC: 3, secuencia que comprende un motivo de la secuencia de aminoácidos como el indicado en el Nº ID SEC: 1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
- \quad
- en donde Xaa es cualquier aminoácido, y secuencia que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11; o
- (iii)
- una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 80% de similitud con la secuencia de aminoácidos indicada en el Nº ID SEC: 3, que comprende un motivo de la secuencia de aminoácidos como el indicado en el Nº ID SEC: 1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
- \quad
- en donde Xaa es cualquier aminoácido, y que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11.
2. Una molécula de ácido nucleico aislada de
acuerdo con la reivindicación 1, en la que el receptor de
IL-11 es de origen mamífero.
3. Una molécula de ácido nucleico aislada de
acuerdo con la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en la que el
receptor de IL-11 es de origen humano o múrido.
4. Una molécula de ácido nucleico aislada de
acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones precedentes, en
la que el ácido nucleico es DNA.
5. Una molécula de ácido nucleico aislada de
acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en la que
dicha molécula de ácido nucleico
- (i)
- comprende una secuencia de nucleótidos como la indicada en el Nº ID SEC: 2 o
- (ii)
- es capaz de hibridarse a la secuencia del Nº ID SEC:2 bajo condiciones de alta restricción.
6. Un vector recombinante que comprende la
molécula de ácido nucleico de acuerdo con una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 5.
7. Un polipéptido recombinante que comprende una
secuencia de aminoácidos correspondiente a una cadena \alpha de
receptor de IL-11 mamífera y que tiene
- (i)
- la secuencia de aminoácidos que se indica en el Nº ID SEC: 3; o
- (ii)
- una secuencia de aminoácidos que es parte de la secuencia de aminoácidos indicada en el Nº ID SEC: 3, comprendiendo dicha secuencia de aminoácidos los aminoácidos 24 a 432 del Nº ID SEC: 3, o los aminoácidos 1 a 367 del Nº ID SEC: 3 o los aminoácidos 24 a 367 del Nº ID SEC: 3, secuencia que comprende un motivo de la secuencia de aminoácidos como el indicado en el Nº ID SEC: 1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
- \quad
- en donde Xaa es cualquier aminoácido, y que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11; o
- (iii)
- una secuencia de aminoácidos que tiene al menos 80% de similitud con la secuencia de aminoácidos indicada en el Nº ID SEC: 3, que comprende un motivo de la secuencia de aminoácidos como el indicado en el Nº ID SEC: 1:
- \quad
- Trp-Ser-Xaa-Trp-Ser
- \quad
- en donde Xaa es cualquier aminoácido, y que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11; o
- (iv)
- una secuencia de aminoácidos como la indicada en el Nº ID SEC: 3 o una secuencia de aminoácidos que comprende los aminoácidos 24 a 432 del Nº ID SEC: 3, los aminoácidos 1 a 367 del Nº ID SEC: 3 o los aminoácidos 24 a 367 del Nº ID SEC: 3 que está químicamente modificada mediante modificación de la cadena lateral, incorporación de aminoácidos no naturales, reticuladores u otras modificaciones químicas que imponen una limitación de conformación al polipéptido, y que tiene la función de una cadena \alpha de receptor de IL-11.
8. Un polipéptido recombinante de acuerdo con la
reivindicación 7, en el que el mamífero es una especie humana o
múrida.
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