ES2322877T3 - Interleucina 19. - Google Patents
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Abstract
Un polinucleótido seleccionado del grupo constituido por: (a) un polinucleótido que codifica los restos 1 a 153 de la SEQ ID NO: 2; (b) un polinucleótido que codifica los restos -24 a 153 de la SEQ ID NO: 2; (c) un polinucleótido que tiene la secuencia de nucleótidos 116 a 574 de la SEQ ID NO: 1; (d) un polinucleótido que tiene la secuencia de nucleótidos 44 a 574 de la SEQ ID NO: 1; (e) un polinucleótido que codifica la forma madura del polipéptido codificado por el ADNc contenido en la ATCC 97662; (f) un polinucleótido que codifica el polipéptido completo codificado por el ADNc contenido en la ATCC 97662; (g) un polinucleótido que tiene la secuencia de codificación del ADNc contenido en la ATCC 97662 que codifica la forma madura del polipéptido; (h) un polinucleótido que tiene la secuencia de codificación del ADNc contenido en la ATCC 97662 que codifica el polipéptido completo; (i) un polinucleótido que codifica una porción portadora de epítopo inmunogénico de un polipéptido codificado por un polinucleótido de uno cualquiera de (a) a (h), en el que dicho epítopo inmunogénico es una porción del polipéptido que desencadena una respuesta de anticuerpo cuando el polipéptido completo es el inmunógeno; (j) un polinucleótido que codifica una porción portadora de epítopo de un polipéptido IL-19 que comprende los restos aminoacídicos VDNHGLRRC o RVFKDHQEPNPKILRKISS; (k) un polinucleótido idéntico en al menos un 90% al polinucleótido como se define en una cualquiera de (a) a (h) y que codifica un polipéptido que tiene actividad IL-19, en el que dicha actividad es la propiedad de modular la síntesis de al menos una citocina del grupo constituido por IFN-*, linfotoxina, IL-2, IL-3 y GM-CSF en una población de células T cooperadoras inducida a sintetizar una o más de estas citocinas mediante exposición a células presentadoras de antígeno singénicas (APC) y antígeno; y (l) un polinucleótido idéntico en al menos un 90% al polinucleótido como se define en una cualquiera de (a) a (h), en el que la cadena complementaria de dicho polinucleótido hibrida en condiciones de hibridación rigurosas con el polinucleótido de uno cualquiera de (a) a (h); o la cadena complementaria de dicho polinucleótido.
Description
Interleucina 19.
La presente invención se refiere a una proteína
interleucina 19 humana (IL-19) y a polinucleótidos
que codifican esta proteína.
La interleucina 10 (IL-10) es
una citocina pleiotrópica que ha sido implicada como un regulador
importante de las funciones de células linfoides y mieloides. La
IL-10 bloquea la activación de la síntesis de
citocina y varias funciones accesorias de los macrófagos, actuando
así como un potente supresor de las funciones efectoras de
macrófagos, células T y células NK. La IL-10 se ha
implicado también en la regulación de la diferenciación de
linfocitos B, mastocitos y timocitos.
Se ha identificado IL-10
independientemente en dos líneas de experimentos diferentes. Una de
estas identificó un mediador derivado de linfocitos B que
coestimulaba timocitos activos (Suda y col., Cell Immunol.
129: 228 (1990)). La otra identificación determinó que la
IL-10 está implicada en la regulación cruzada entre
dos ramas efectoras a menudo mutualmente excluyentes de la
inmunidad llevada a cabo por subpoblaciones de T cooperadores
(CD4^{+}), Th1 (implicada en las respuestas inmunitarias mediadas
por célula) y Th2 (implicada en respuestas inmunitarias mediadas
por anticuerpo). En este papel, se expresa IL-10 por
células Th2 y funciona suprimiendo la producción de citocina por
células Th1, una actividad denominada actividad de factor inhibidor
de la síntesis de citocina
(CSIF).
(CSIF).
Se aislaron clones de ADNc que codificaban
IL-10 de murina (mIL-10) basándose
en la expresión de la actividad CSIF (Moore y col., Science
248: 1230-1234 (1990)). Se identificaron
posteriormente clones de ADNc que codificaban IL-10
humana (hIL-10) mediante hibridación cruzada con el
ADNc de ratón (Vieira y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:
1172-1176 (1991)). Se expresa mIL-10
por células Th2 CD4^{+}, al menos un clon CD8^{+}, linfomas B,
células T, líneas de mastocitos activados, macrófagos activados,
queratinocitos y linfocitos B Ly-1
(B-1) (Fiorentino, D.F. y col., J. Exp. Med.
170: 2081 (1989); (Moore y col., Science 248:
1230-1234 (1990); 87-93 (1992); Lin
y col., Ann. N.Y. Acad. Sci. 651, O'Garra y col., Int.
Immunol. 2: 821-832 (1990); MacNeil y col.,
J. Immunol. 145: 4167-4173 (1990); Fiorentino
y col., J. Immunol. 147: 3815-3822 (1991);
Hisatsume y col., Lymphokine Cytokine Res. 11:
651-683 (1992)). Se expresa hIL-10
por células T CD4^{+} humanos y clones de células T Th0, Th1 y
Th2, por células T y clones CD8^{+} (Yssel y col., J.
Immunol.), monocitos/macrófagos, queratinocitos, linfocitos B
activados, linfomas B y líneas de linfoma de Burkitt infectadas con
una cepa de EBV transformante, pero no con una cepa no
transformante (Vieira, P. y col., Proc. Natl. Acad. Sci. USA
88: 1172-1176 (1991), de
Waal-Malefyt, R. y col., J. Exp. Med. 174:
1209-1220 (1991); de Waal-Maleyfit,
R. y col., J. Exp. Med. 174: 915-924 (1991);
Salgame P. y col., Science 254: 279-282
(1991); Yamamura, M. y col., Science 254:
277-279 (1991); Ralph, P. y col., J. Immunol.
148: 808-814 (1992); Benjamin, D. y col.,
Blood 80: 1289-1298 (1992)). En particular,
Vieira y col., PNAS, 1991, 1172-1176
describen el factor inhibidor de la síntesis de citocina humana
(CSIF) ((interleucina 10 (IL-10)), clones de ADNc
que codifican IL-10 humana aislados de un clon de
célula T humana específica de toxina del tétanos. Se considera que
hIL-10 exhibe una gran homología de secuencia de
ADN y aminoacídica con un marco abierto de lectura en el virus
Epstein-Barr, BCRFI, e hIL-10 y el
producto BCRFI inhiben la síntesis de citocina mediante células
mononucleares de sangre periférica humanas activadas y mediante un
clon Th1 de ratón. Por tanto, IL-10 no es
estrictamente una citocina específica de Th2 y su patrón de
expresión se parece a IL-6 más que a
IL-4 o IL-5 (Wang, S.C. y col.,
Transplant. Proc. 23: 2920-2922 (1991)).
Como IL-6, pero al contrario que la mayoría de las
demás citocinas derivadas de células T, la expresión de
IL-10 no está inhibida por la ciclosporina ni
FK-506 (Wang, S.C., y col., Transplant.
Proc. 23: 2920
(1991)).
(1991)).
En un intento de determinar el papel in
vivo de IL-10, se trataron ratones normales
desde el nacimiento hasta el estado adulto con anticuerpos
neutralizantes de IL-10 (Wang, S.C. y col.,
Transplant. Proc. 23: 2920 (1991); Ishida, H. y col., J.
Exp. Med. 175: 1213 (1992)). Los cambios fenotípicos resultantes
incluían un nivel aumentado de IFN-\gamma,
TNF-\alpha e IL-6 en circulación,
IgM e IgA séricas reducidas, un marcado agotamiento de linfocitos B
peritoneales y la incapacidad de desarrollar respuestas de
anticuerpo in vivo ante dos antígenos bacterianos conocidos
por ser combatidos por anticuerpos producidos por linfocitos B
peritoneales (Hayakawa, K. y col., Annu. Rev. Immunol. 6:
197 (1988)). Se determinó que la reducción de linfocitos B
peritoneales era una consecuencia de la elevación de
IFN-\gamma (Ishida, H. y col., J. Exp. Med.
175: 1213 (1992)).
Otros experimentos han mostrado que
IL-10 suprime la producción in vitro de
monocinas inflamatorias tales como TNF-\alpha e
IL-1. Este dato corresponde a estudios in
vivo que muestran que los antagonistas de IL-10
elevan las mismas monocinas inflamatorias. Estos resultados predicen
un fuerte papel antiinflamatorio para IL-10.
Además, los antagonistas de IL-10 pueden ser útiles
para potenciar la inmunidad de Th1, lo que podría ser beneficioso
en enfermedades infecciosas de origen vírico, o enfermedades que
implican a patógenos intracelulares.
Las diversas actividades biológicas de
IL-10 han conducido a predicciones de que tanto
IL-10 como sus antagonistas tendrán un amplio
intervalo de aplicaciones clínicas. Resulta evidente que existe una
necesidad continua en la técnica de aislar citocinas novedosas
capaces de mediar dichos diversos procesos biológicos.
La presente invención proporciona moléculas de
ácido nucleico aisladas que comprenden un polinucleótido que
codifica un polipéptido IL-19 humano que tiene la
secuencia aminoacídica de la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) o la secuencia
aminoacídica codificada por el clon de ADNc depositado como número
de depósito ATCC 97662 el 17 de julio de 1996. La secuencia
nucleotídica determinada secuenciando el clon de ADNc de
IL-19 depositado, que se muestra en la Figura 1
(SEQ ID NO: 1), contiene un marco abierto de lectura que codifica un
polipéptido de aproximadamente 177 restos aminoacídicos incluyendo
un codón de inicio en las posiciones nucleotídicas
44-46, una secuencia líder de aproximadamente 24
restos aminoacídicos y un peso molecular deducido de aproximadamente
20,4 kDa. La secuencia de 153 aminoácidos de la proteína
IL-19 madura predicha se muestra en la Figura 1
(últimos 153 restos) y en el SEQ ID NO: 2 (del resto aminoacídico 1
al resto 153).
Por tanto, un aspecto de la invención
proporciona moléculas de ácido nucleico aisladas que comprenden un
polinucleótido que tiene una secuencia nucleotídica seleccionada
del grupo constituido por: (a) una secuencia nucleotídica que
codifica el polipéptido IL-19 que tiene la secuencia
aminoacídica completa mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 2); (b)
una secuencia nucleotídica que codifica el polipéptido
IL-19 maduro que tiene la secuencia aminoacídica en
las posiciones 25-177 de la Figura 1 (restos
1-153 del SEQ ID NO: 21); (c) una secuencia
nucleotídica que codifica el polipéptido IL-19 que
tiene la secuencia aminoacídica completa codificada por el clon de
ADNc contenido en el depósito de ATCC nº 97662; (d) una secuencia
nucleotídica que codifica el polipéptido IL-19
maduro que tiene la secuencia aminoacídica codificada por el clon de
ADNc contenido en el depósito ATCC nº 97662; y (e) una secuencia
nucleotídica complementaria de cualquiera de las secuencias
nucleotídicas en (a), (b), (c) o (d) anteriores. Preferiblemente,
la molécula de ácido nucleico codificará el polipéptido maduro como
se muestra en la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) o como se codifica por el
ADNc depositado anteriormente descrito.
Realizaciones adicionales de la invención
incluyen moléculas de ácido nucleico aisladas que comprenden un
polinucleótido que tiene una secuencia nucleotídica al menos un 90%
idéntica, y más preferiblemente al menos un 95%, 97%, 98% o 99%
idéntica a cualquiera de las secuencias nucleotídicas en (a), (b),
(c), (d) o (e) anteriores, y que codifica un polipéptido que tiene
actividad IL-19, en las que dicha actividad es la
propiedad de modular la síntesis de al menos una citocina del grupo
constituido por IFN-\gamma, linfotoxina,
IL-2, IL-3 y GM-CSF
en una población de células T cooperadoras inducida a sintetizar una
o más de estas citocinas mediante exposición a células
presentadoras de antígeno singénicas (APC) y antígeno y/o la cadena
complementaria de dicho polinucleótido hibrida en condiciones de
hibridación rigurosas con un polinucleótido que tiene una secuencia
nucleotídica idéntica a una secuencia nucleotídica en (a), (b),
(c), (d) o (e) anteriores. El polinucleótido que hibrida no hibrida
en condiciones de hibridación rigurosas con un polinucleótido que
tiene una secuencia nucleotídica constituida sólo por restos A o
sólo por restos T. Una realización de ácido nucleico adicional de la
invención se refiere a una molécula de ácido nucleico aislada que
comprende un polinucleótido que codifica la secuencia aminoacídica
de una porción portadora de epítopo de un polipéptido
IL-19 que tiene una secuencia aminoacídica en (a),
(b), (c) o (d) anteriores.
La presente invención se refiere también a
vectores recombinantes que incluyen las moléculas de ácido nucleico
aisladas de la presente invención y a células hospedadoras que
contienen los vectores recombinantes, así como a procedimientos de
preparación de dichos vectores y células hospedadoras y para usarlos
para la producción de polipéptidos o péptidos IL-19
mediante técnicas recombinantes.
La invención proporciona además un polipéptido
IL-19 aislado que tiene una secuencia aminoacídica
seleccionada del grupo constituido por: (a) la secuencia
aminoacídica del polipéptido IL-19 que tiene la
secuencia completa de 177 aminoácidos incluyendo la secuencia líder
mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 2); (b) la secuencia
aminoacídica del polipéptido IL-19 maduro (sin la
líder) que tiene la secuencia aminoacídica en posiciones
25-177 en la Figura 1 (restos 1-153
del SEQ ID NO: 2); (c) la secuencia aminoacídica del polipéptido
IL-19 que tiene la secuencia aminoacídica completa
incluyendo la líder codificada por el clon de ADNc contenido en el
depósito ATCC nº 97662; y (d) la secuencia aminoacídica del
polipéptido IL-19 maduro que tiene la secuencia
aminoacídica codificada por el clon de ADNc contenido en el depósito
ATCC nº 97662. Los polipéptidos de la presente invención incluyen
también polipéptidos que tienen una secuencia aminoacídica con al
menos un 90% de similitud, más preferiblemente al menos 95% de
similitud, con los descritos en (a), (b), (c) o (d) anteriores, así
como polipéptidos que tienen una secuencia aminoacídica al menos un
80% idéntica, más preferiblemente al menos un 90% idéntica, y aún
más preferiblemente un 95%, 97%, 98% o 99% idéntica a las
anteriores.
Una realización adicional de este aspecto de la
invención se refiere a un péptido o polipéptido que tiene la
secuencia aminoacídica de una porción portadora de epítopo de un
polipéptido IL-19 que tiene una secuencia
aminoacídica descrita en (a), (b), (c) o (d) anteriores. Los
péptidos o polipéptidos que tienen la secuencia aminoacídica de una
porción portadora de epítopo inmunogénico de un polipéptido
IL-19 de la invención incluyen porciones de dichos
polipéptidos con al menos 6 ó 7, preferiblemente al menos 9, y más
preferiblemente al menos aproximadamente 30 aminoácidos a
aproximadamente 50 aminoácidos, aunque están incluidos también en la
invención los polipéptidos portadores de epítopo de cualquier
longitud hasta e incluyendo la secuencia aminoacídica completa de
un polipéptido de la invención descrito anteriormente, siendo dicho
epítopo inmunogénico una porción del polipéptido que desencadena
una respuesta de anticuerpo cuando el polipéptido entero es el
inmunógeno. En otra realización, la invención proporciona un
anticuerpo aislado que se une específicamente a un polipéptido
IL-19 que tiene una secuencia aminoacídica descrita
en (a), (b), (c) o (d) anteriores.
Los presentes inventores creen que
IL-19, que se secreta y que tiene una homología
significativa con IL-10, se expresa sólo, o al
menos principalmente, en monocitos activados (Figura 4). Por tanto,
detectar la expresión génica de IL-19 en células
del sistema inmunitario es útil para identificar monocitos
activados. Además, para una serie de trastornos, los inventores
creen que pueden detectarse niveles significativamente mayores o
menores de expresión génica de IL-19 en fluidos
corporales (por ejemplo, suero, plasma, orina, fluido sinovial o
fluido espinal) tomados de un individuo que tenga dicho trastorno
respecto a un nivel de expresión génica de IL-19
"estándar", concretamente, el nivel de expresión de
IL-19 en fluidos corporales de un individuo que no
tenga el trastorno. Por tanto, la solicitud describe un
procedimiento de diagnóstico útil durante el diagnóstico de un
trastorno relacionado con un nivel anormal de expresión génica de
IL-19, que implica (a) ensayar el nivel de
expresión génica de IL-19 en células o fluido
corporal de ese individuo; (b) comparar ese nivel de expresión
génica de IL-19 con un nivel de expresión génica de
IL-19 estándar, con lo que un aumento o reducción
del nivel de expresión génica del IL-19 ensayado
comparado con el nivel de expresión estándar es indicativo de un
trastorno. Un aspecto adicional de la invención está relacionado con
el uso de una preparación de una composición farmacéutica para
tratar un individuo necesitado de niveles reducidos de
IFN-\gamma, TNF-\alpha y/o
IL-6, que implica administrar a dicho individuo una
composición que comprende un polipéptido IL-19 de
la invención.
La Figura 1 muestra las secuencias nucleotídica
(SEQ ID NO: 1) y aminoacídica deducida (SEQ ID NO: 2) de la
proteína IL-19 completa determinadas mediante
secuenciación del clon de ADN contenido en el depósito ATCC nº
97662. La proteína tiene una secuencia líder de aproximadamente 24
restos aminoacídicos (subrayados) y un peso molecular deducido de
aproximadamente 20,4 kDa. La secuencia aminoacídica de la proteína
IL-19 madura predicha se muestra también en la
Figura 1 (últimos 153 aminoácidos) (restos 1-153 del
SEQ ID NO: 2).
La Figura 2 es un gel de proteínas que muestra
proteína IL-19 expresada a partir de la cepa de
E. coli M15rep4 (véase el ejemplo 1).
La Figura 3 es un gel de proteínas que muestra
proteínas IL-19 completas y truncadas producidas en
un sistema de transcripción/traducción acoplado in vitro
(véase el ejemplo 3).
La Figura 4 es un análisis de transferencia
Northern de la expresión de IL-19 en tejido humano
(HL-60, THP-1, U937 y monocitos
humanos primarios) (véase el ejemplo 5).
La Figura 5 muestra las regiones de similitud
entre las secuencias aminoacídicas de la proteína
IL-19 e IL-10 humana
(hIL-10) (SEQ ID NO: 3).
La Figura 6 muestra un análisis de la secuencia
aminoacídica de IL-19, generado por el módulo
Protean del paquete de software informático de análisis de
secuencia DNA* Star. Se muestran las regiones de hélice alfa,
lámina beta y giro predichas por los procedimientos de
Chou-Fasman, Garnier-Robson y
Eisenberg. Se muestran también los perfiles de hidrofilicidad e
hidrofobicidad de IL-19 predichos por los
procedimientos de Kyte-Doolittle y
Hopp-Woods, respectivamente. Se muestra también el
índice antigénico de la secuencia aminoacídica de
IL-19 predicho por el procedimiento de
Jameson-Wolf. Se muestran los restos aminoacídicos
de IL-19 que corresponden a las regiones de pico
(aminoácidos 20-28, 88-106 y
139-149) del índice antigénico de
Jameson-Wolf debajo de la gráfica de índice
antigénico.
La presente invención proporciona moléculas de
ácido nucleico aisladas que comprenden un polinucleótido que
codifica la proteína IL-19 que tiene la secuencia
aminoacídica mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 2), que se
determinó secuenciando un ADNc clonado. La proteína
IL-19 de la presente invención comparte homología de
secuencia con IL-10 humana (Figura 5) (SEQ ID NO:
3). La secuencia nucleotídica mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO:
1) se obtuvo secuenciando el clon de ADNc HMQBM23 que codifica un
polipéptido IL-19, que se depositó el 17 de julio
de 1996 en la American Type Culture Collection, 12301 Park Lawn
Drive, Rockville, Maryland 20852, y se le dio el número de acceso
97662. El clon depositado está contenido en el plásmido pBluescript
SK(-) (Stratagene, La Jolla, CA).
A menos que se indique otra cosa, todas las
secuencias nucleotídicas determinadas secuenciando una molécula de
ADN de la presente memoria se determinaron usando un secuenciador de
ADN automatizado (tal como el modelo 373 de Applied Biosystems,
Inc.), y todas las secuencias aminoacídicas de polipéptidos
codificados por moléculas de ADN determinadas en la presente
memoria se predijeron mediante traducción de una secuencia de ADN
determinada como anteriormente. Por lo tanto, como es conocido en
la técnica para cualquier secuencia de ADN determinada mediante
este enfoque automatizado, cualquier secuencia nucleotídica
determinada en la presente memoria puede contener algunos errores.
Las secuencias nucleotídicas determinadas automáticamente son
típicamente al menos aproximadamente un 90% idénticas, más
típicamente al menos aproximadamente un 95% a al menos un 99,9%
idénticas a la secuencia nucleotídica real de la molécula de ADN
secuenciada. La secuencia real puede determinarse más precisamente
mediante otros enfoques, incluyendo procedimientos de secuenciación
de ADN manuales bien conocidos en la técnica. Como es también
conocido en la técnica, una sola inserción o deleción en una
secuencia nucleotídica determinada comparada con la secuencia real
causará un desplazamiento del marco de traducción de la secuencia
nucleotídica de tal modo que la secuencia aminoacídica predicha
codificada por una secuencia nucleotídica determinada será
completamente diferente de la secuencia aminoacídica codificada
realmente por la molécula de ADN secuenciada, partiendo del punto
de dicha inserción o deleción.
A menos que se indique otra cosa, cada
"secuencia nucleotídica" expuesta en la presente memoria se
presenta como una secuencia de desoxirribonucleótidos (abreviados,
A, G, C y T). Sin embargo, por "secuencia nucleotídica" de una
molécula de ácido nucleico o polinucleótido se entiende, para una
molécula de ADN o polinucleótido, una secuencia de
desoxirribonucleótidos, y para una molécula de ARN o polinucleótido,
la correspondiente secuencia de ribonucleótidos (A, G, C y U), en
que cada desoxinucleótido timidina (T) en la secuencia
desoxinucleotídica especificada se reemplaza por el ribonucleótido
uridina (U). Por ejemplo, la referencia a una molécula de ARN que
tiene la secuencia de SEQ ID NO: 1 expuesta usando abreviaturas de
desoxirribonucleótidos, se entiende que indica una molécula de ARN
que tiene una secuencia en la que cada desoxinucleótido A, G o C del
SEQ ID NO: 1 se ha reemplazado por el correspondiente
ribonucleótido A, G o C, y cada desoxinucleótido T se ha reemplazado
por un ribonucleótido U.
Usando la información proporcionada en la
presente memoria, tal como la secuencia nucleotídica de la Figura
1, puede obtenerse una molécula de ácido nucleico de la presente
invención que codifica un polipéptido IL-19 usando
procedimientos de clonación y selección estándares, tales como
aquellos para clonación de ADNc usando ARNm como material de
partida. De forma ilustrativa de la invención, la molécula de ácido
nucleico descrita en la Figura 1 (SEQ ID NO: 1) se descubrió en una
colección de ADNc derivada de monocitos activados humanos. La
secuencia nucleotídica determinada de ADNc de IL-19
de la Figura 1 contiene un marco abierto de lectura que codifica
una proteína de aproximadamente 177 restos aminoacídicos con un
codón de inicio en las posiciones 44-46 de la
secuencia nucleotídica mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 1), una
secuencia líder predicha de aproximadamente 24 restos aminoacídicos
y un peso molecular deducido de aproximadamente 20,4 kDa. La
secuencia aminoacídica de la proteína IL-19 madura
predicha se muestra también en la Figura 1 (restos
1-153 del SEQ ID NO: 2) desde aproximadamente el
resto aminoacídico 25 hasta aproximadamente el resto 177. La
proteína IL-19 mostrada en la Figura 1 (restos
1-153 del SEQ ID NO: 2) es aproximadamente un 20%
idéntica y aproximadamente un 46% similar a IL-10
humana (Figura 5).
Como un experto apreciaría, debido a las
posibilidades de errores de secuenciación discutidas anteriormente,
así como a la variabilidad de los sitios de escisión para líderes en
diferentes proteínas conocidas, el polipéptido
IL-19 real codificado por el ADNc depositado
comprende aproximadamente 177 aminoácidos, pero puede estar en
cualquier punto del intervalo de 170-183
aminoácidos, y la secuencia líder real de esta proteína es de
aproximadamente 24 aminoácidos, pero puede estar en cualquier punto
en el intervalo de aproximadamente 18 a aproximadamente 29
aminoácidos.
Como se indica, las moléculas de ácido nucleico
de la presente invención pueden estar en forma de ARN, tal como
ARNm, o en forma de ADN incluyendo, por ejemplo, ADNc y ADN genómico
obtenido mediante clonación o producido sintéticamente. El ADN
puede ser bicatenario o monocatenario. El ADN o ARN monocatenario
puede ser la cadena de codificación, también conocida como cadena
con sentido, o puede ser la cadena de no codificación, también
designada como cadena antisentido.
Por molécula(s) de ácido nucleico
"aislada(s)" se entiende una molécula de ácido nucleico,
ADN o ARN, que se ha retirado de su entorno nativo. Por ejemplo,
las moléculas de ADN recombinante contenidas en un vector se
consideran aisladas con los fines de la presente invención. Ejemplos
adicionales de moléculas de ADN aisladas incluyen moléculas de ADN
recombinantes mantenidas en células hospedadoras heterólogas o
moléculas de ADN en solución purificadas (parcial o
sustancialmente). Las moléculas de ARN aisladas incluyen
transcriptos de ARN in vivo o in vitro de las
moléculas de ADN de la presente invención. Las moléculas de ácido
nucleico aisladas según la presente invención incluyen además
aquellas moléculas producidas sintéticamente.
Las moléculas de ácido nucleico aisladas de la
presente invención incluyen moléculas de ADN que comprenden un
marco abierto de lectura (ORF) con un codón de inicio en las
posiciones 44-46 de la secuencia nucleotídica
mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 1); moléculas de ADN que
comprenden la secuencia de codificación para la proteína
IL-19 madura mostrada en la Figura 1 (últimos 153
aminoácidos) (restos 1-153 del SEQ ID NO: 2) y
moléculas de ADN que comprenden una secuencia sustancialmente
diferente de las descritas anteriormente pero que, debido a la
degeneración del código genético, siguen codificando la proteína
IL-19. Por supuesto, el código genético es bien
conocido en la técnica. Por tanto, sería rutinario para un experto
generar las variantes degeneradas descritas anteriormente.
En otro aspecto, la invención proporciona
moléculas de ácido nucleico aisladas que codifican el polipéptido
IL-19 que tiene una secuencia aminoacídica
codificada por el clon de ADNc contenido en el plásmido depositado
como depósito ATCC nº 97662 el 17 de julio de 1996. Preferiblemente,
esta molécula de ácido nucleico codificará el polipéptido maduro
codificado por el clon de ADNc depositado descrito anteriormente. La
invención proporciona además una molécula de ácido nucleico aislada
que tiene la secuencia nucleotídica mostrada en la Figura 1 (SEQ ID
NO: 1) o la secuencia nucleotídica de ADNc de IL-19
contenida en el clon depositado anteriormente descrito, o una
molécula de ácido nucleico que tiene una secuencia complementaria de
una de las secuencias anteriores. Dichas moléculas aisladas,
particularmente moléculas de ADN, son útiles como sondas para
cartografía génica mediante hibridación in situ con
cromosomas y para detectar la expresión del gen
IL-19 en tejido humano, por ejemplo, mediante
análisis de transferencia Northern.
En otro aspecto, la invención proporciona una
molécula de ácido nucleico aislada que comprende un polinucleótido
que hibrida en condiciones de hibridación rigurosas con una porción
del polinucleótido de una molécula de ácido nucleico descrita
anteriormente, por ejemplo, el clon de ADNc contenido en el depósito
ATCC nº 97662. Por "condiciones de hibridación rigurosas", se
entiende incubación durante una noche a 42ºC en una disolución que
comprende: 50% de formamida, 5 x SSC (NaCl 750 mM, citrato trisódico
75 mM), fosfato de sodio 50 mM (pH 7,6), 5 x disolución de
Denhardt, 10% de sulfato de dextrano y ADN de esperma de salmón
fragmentado desnaturalizado 20 \mug/ml, seguido de lavado de los
filtros con 0,1 x SSC aproximadamente a 65ºC. Por polinucleótido que
hibrida con una "porción" de un polinucleótido se entiende un
polinucleótido (de ADN o ARN) que hibrida con al menos
aproximadamente 15 nucleótidos (nt), y más preferiblemente al menos
aproximadamente 20 nt, todavía más preferiblemente al menos
aproximadamente 30 nt, y aún más preferiblemente aproximadamente
30-70 nt del polinucleótido de referencia. Estos
son útiles como sondas de diagnóstico y cebadores como se describe
anteriormente y con más detalle a continuación.
Por supuesto, los polinucleótidos que hibridan
con una porción mayor del polinucleótido de referencia (por
ejemplo, el clon de ADNc depositado), por ejemplo, una porción de
50-750 nt de longitud, o incluso con toda la
longitud del polinucleótido de referencia, son también útiles como
sondas según la presente invención, ya que son polinucleótidos
correspondientes a la mayoría, si no toda, la secuencia nucleotídica
del ADNc depositado o la secuencia nucleotídica como se muestra en
la Figura 1 (SEQ ID NO: 1). Por una porción de un polinucleótido de
"al menos 20 nt de longitud", por ejemplo, se entiende 20 o más
nucleótidos contiguos de la secuencia nucleotídica del
polinucleótido de referencia (por ejemplo, el ADNc depositado o la
secuencia nucleotídica como se muestra en la Figura 1 (SEQ ID NO:
1)). Como se indica, dichas porciones son útiles para diagnóstico en
forma de sonda según técnicas de hibridación de ADN convencionales
o como cebadores para amplificación de una secuencia diana mediante
la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) como se describe, por
ejemplo, en "Molecular Cloning, A Laboratory Manual", 2ª
edición, editado por Sambrook y col., J. Fritsch, E.F. y Maniatis,
T. (1989), Cold Spring Harbor Laboratory Press.
Puesto que se ha depositado un clon de ADNc de
IL-19 y su secuencia nucleotídica determinada se
proporciona en la Figura 1 (SEQ ID NO: 1), generar polinucleótidos
que hibriden con una porción de la molécula de ADNc de
IL-19 sería rutinario para el experto. Por ejemplo,
la escisión con endonucleasa de restricción o fragmentación por
sonicación del clon de ADNc de IL-19 podrían usarse
fácilmente para generar porciones de ADN de diversos tamaños que
son polinucleótidos que hibridan con una porción de la molécula de
ADNc de IL-19. Como alternativa, los
polinucleótidos hibridantes de la presente invención podrían
generarse sintéticamente según técnicas conocidas. Por supuesto, un
polinucleótido que hibride sólo con una secuencia de poli A (tal
como el tramo poli(A) 3' terminal de ADNc de
IL-19 mostrado en la Figura 1 (SEQ ID NO: 1) o con
un intervalo complementario de restos T (o U) no se incluiría en un
polinucleótido de la invención usado para hibridar con una porción
de un ácido nucleico de la invención, puesto que dicho
polinucleótido hibridaría con cualquier molécula de ácido nucleico
que contuviera un intervalo poli (A) o el complemento del mismo (por
ejemplo, prácticamente cualquier clon de ADNc bicatenario).
La presente solicitud describe además fragmentos
de las moléculas de ácido nucleico aisladas descritas en la
presente invención. Por fragmento de molécula de ácido nucleico
aislado que tiene la secuencia nucleotídica del ADNc depositado o
la secuencia nucleotídica mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 1), se
entiende fragmentos de al menos aproximadamente 15 nt, y más
preferiblemente de al menos aproximadamente 20 nt, todavía más
preferiblemente de al menos aproximadamente 30 nt, y aún más
preferiblemente de al menos aproximadamente 40 nt de longitud, que
son útiles como sondas de diagnóstico y cebadores como se discute en
la presente memoria. Por supuesto, los fragmentos mayores de
50-950 nt de longitud son también útiles ya que son
fragmentos correspondientes a la mayoría, si no toda, la secuencia
nucleotídica del ADNc depositado o como se muestra en la Figura 1
(SEQ ID NO: 1). Por un fragmento de al menos 20 nt de longitud, por
ejemplo, se entiende fragmentos que incluyen 20 o más bases
contiguas de la secuencia nucleotídica del ADNc depositado o la
secuencia nucleotídica como se muestra en la Figura 1 (SEQ ID NO:
1). Puesto que el gen se ha depositado y se proporciona la secuencia
nucleotídica mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 1), generar dichos
fragmentos de ADN sería rutinario para el experto. Por ejemplo, la
escisión con endonucleasa de restricción o fragmentación por
sonicación podrían usarse fácilmente para generar fragmentos de
diversos tamaños. Como alternativa, dichos fragmentos podrían
generarse sintéticamente.
Los fragmentos de ácido nucleico preferidos de
la presente invención incluyen moléculas de ácido nucleico que
codifican porciones portadoras de epítopo de la proteína
IL-19. En particular, dichos fragmentos de ácido
nucleico de la presente invención incluyen moléculas de ácido
nucleico que codifican: un polipéptido que comprende restos
aminoácidos de aproximadamente 20 a aproximadamente 28 en la figura
1 (restos -5 a 4 del SEQ ID NO: 2), un polipéptido que comprende
los restos aminoacídicos de aproximadamente 88 a aproximadamente 106
en la Figura 1 (restos 64-82 del SEQ ID NO: 2) y un
polipéptido que comprende los restos aminoacídicos de
aproximadamente 139 a aproximadamente 149 de la Figura 1 (restos
115-125 del SEQ ID NO: 2). Los inventores han
determinado que los fragmentos polipeptídicos anteriores son
regiones antigénicas de la proteína IL-19. Los
procedimientos para determinar otras de dichas porciones portadoras
de epítopo de la proteína IL-10 se describen con
detalle a continuación.
La invención proporciona además moléculas de
ácido nucleico aisladas que comprenden un polinucleótido que
codifica una porción de la proteína IL-19. En
particular, se proporcionan moléculas de ácido nucleico aisladas
que codifican polipéptidos que comprenden los siguientes restos
aminoacídicos de la Figura 1 (SEQ ID NO: 2), que los presentes
inventores han determinado que son regiones antigénicas de la
proteína IL-19: restos 20-28,
restos 88-106 y restos 139-149
(véase la figura 6). Los procedimientos para generar dichas
porciones portadoras de epítopo de IL-19 se
describen con detalle a continuación.
Como se indica, las moléculas de ácido nucleico
de la presente invención que codifican el polipéptido
IL-19 pueden incluir, pero sin limitación, aquellas
que codifican la secuencia aminoacídica del polipéptido maduro por
sí mismas; la secuencia de codificación del polipéptido maduro y
secuencias adicionales, tales como aquellas que codifican la
secuencia líder o secretora de aproximadamente 24 aminoácidos, tal
como una secuencia de pre-, pro- o preproproteína; la secuencia de
codificación del polipéptido maduro, con o sin las secuencias de
codificación adicionales anteriormente citadas, junto con secuencias
de no codificación adicionales incluyendo, por ejemplo pero sin
limitación, intrones y secuencias 5' y 3' no codificantes tales como
las secuencias transcritas no traducidas que desempeñan un papel en
transcripción, procesamiento de ARNm, incluyendo señales de corte y
empalme y poliadenilación, por ejemplo, unión a ribosoma y
estabilidad del ARNm; una secuencia de codificación adicional que
codifica aminoácidos adicionales, tales como aquellos que
proporcionan funcionalidades adicionales. Por tanto, la secuencia
que codifica el polipéptido puede estar fusionada con una secuencia
marcadora, tal como una secuencia que codifica un péptido que
facilita la purificación del polipéptido fusionado. En ciertas
realizaciones preferidas de este aspecto de la invención, la
secuencia aminoacídica marcadora es un péptido de hexahistidina,
tal como el marcador proporcionado en un vector pQE (Qiagen, Inc.),
entre otros, muchos de los cuales están comercialmente disponibles.
Como describe en Gentz y col. (1989), Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 86: 821-824, por ejemplo, la hexahistidina
proporciona una purificación conveniente de la proteína de fusión.
El marcador "HA" es otro péptido útil para purificación que
corresponde con un epítopo derivado de la proteína hemaglutinina de
la gripe, que se ha descrito por Wilson y col., Cell 37:
767
(1984).
(1984).
La presente solicitud describe además variantes
de las moléculas de ácido nucleico de la presente invención que
codifican porciones, análogos o derivados de la proteína
IL-19. Las variantes pueden aparecer de forma
natural, tal como una variante alélica natural. Por una "variante
alélica" se entiende una de las varias formas alternativas de
que un gen ocupe un locus dado en un cromosoma de un organismo.
"Genes II", Lewin, ed. Las variantes de origen no natural
pueden producirse usando técnicas de mutagénesis conocidas en la
técnica.
Dichas variantes incluyen aquellas producidas
por sustituciones, deleciones o adiciones nucleotídicas. Las
sustituciones, deleciones o adiciones pueden implicar uno o más
nucleótidos. Las variantes pueden estar alteradas en regiones de
codificación o no codificación o ambas. Las alteraciones en las
regiones de codificación pueden producir sustituciones, deleciones
o adiciones conservativas o no conservativas. Se prefieren
especialmente entre éstas las sustituciones, adiciones o deleciones
silenciosas, que no alteran las propiedades y actividades de la
proteína IL-19 o porciones de la misma. Se prefieren
también especialmente a este respecto sustituciones conservativas.
Las más altamente preferidas son moléculas de ácido nucleico que
codifican la proteína IL-19 madura que tiene la
secuencia aminoacídica mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) o la
secuencia aminoacídica de IL-19 madura codificada
por el clon de ADNc depositado.
Realizaciones adicionales de la invención
incluyen moléculas de ácido nucleico aisladas que comprenden un
polinucleótido que tiene una secuencia nucleotídica al menos un 90%
idéntica, y más preferiblemente al menos un 95%, 97%, 98% o 99%
idéntica a (a) una secuencia nucleotídica que codifica el
polipéptido IL-19 completo que tiene la secuencia
aminoacídica completa de la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) incluyendo la
secuencia líder predicha; (b) una secuencia nucleotídica que
codifica el polipéptido IL-19 maduro (polipéptido
completo con la líder retirada) que tiene la secuencia aminoacídica
de posiciones 25-177 de la Figura 1 (restos
1-153 del SEQ ID NO: 2); (c) una secuencia
nucleotídica que codifica el polipéptido IL-19
completo que tiene la secuencia aminoacídica completa incluyendo la
líder codificada por el clon de ADNc contenido en el depósito ATCC
nº 97622; (d) una secuencia nucleotídica que codifica el
polipéptido IL-19 maduro que tiene la secuencia
aminoacídica codificada por el clon de ADNc contenido en el
depósito ATCC nº 97662; o (e) una secuencia nucleotídica
complementaria de cualquiera de las secuencias nucleotídicas en
(a), (b), (c) o (d).
Por un polinucleótido que tiene una secuencia
nucleotídica al menos, por ejemplo, un 95% "idéntica" a una
secuencia nucleotídica de referencia que codifica un polipéptido
IL-19, se entiende que la secuencia nucleotídica
del polinucleótido es idéntica a la secuencia de referencia excepto
porque la secuencia polinucleotídica puede incluir hasta 5
mutaciones puntuales por cada 100 nucleótidos de la secuencia
nucleotídica de referencia que codifica el polipéptido
IL-19. En otras palabras, para obtener un
polinucleótido que tiene una secuencia nucleotídica al menos un 95%
idéntica a una secuencia nucleotídica de referencia, hasta un 5% de
los nucleótidos de la secuencia de referencia pueden estar
eliminados o sustituidos por otro nucleótido, o pueden insertarse en
la secuencia de referencia una serie de nucleótidos de hasta un 5%
de los nucleótidos totales de la secuencia de referencia. Estas
mutaciones de la secuencia de referencia pueden aparecer en las
posiciones 5' o 3' terminales de la secuencia nucleotídica de
referencia o en cualquier punto entre esas posiciones terminales,
dispersadas individualmente entre nucleótidos de la secuencia de
referencia o en uno o más grupos contiguos dentro de la secuencia
de
referencia.
referencia.
\newpage
En la práctica, puede determinarse
convencionalmente si cualquier molécula de ácido nucleico particular
es al menos un 90%, 95%, 97%, 98% o 99% idéntica, por ejemplo, a la
secuencia nucleotídica mostrada en la Figura 1 o la secuencia
nucleotídica del clon de ADNc depositado usando programas
informáticos conocidos tales como el programa Bestfit (Wisconsin
Sequence Analysis Package, versión 8 para Unix, Genetics Computer
Group, University Research Park, 575 Science Drive, Madison, WI
53711). Bestfit usa el algoritmo de homología local de Smith y
Waterman (Advances in Applied Mathematics 2:
482-489, 1981) para encontrar el mejor segmento de
homología entre dos secuencias. Cuando se usa Bestfit o cualquier
otro programa de alineamiento de secuencia para determinar si una
secuencia particular es, por ejemplo, un 95% idéntica a una
secuencia de referencia según la presente invención, los parámetros
se fijan, por supuesto, de tal modo que el porcentaje de identidad
se calcula para toda la longitud de la secuencia nucleotídica de
referencia y que se permitan huecos de homología de hasta un 5% del
número total de nucleótidos en la secuencia de referencia.
La presente solicitud está dirigida a moléculas
de ácido nucleico al menos un 90%, 95%, 97%, 98% o 99% idénticas a
la secuencia de ácido nucleico mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO:
1) o a la secuencia de ácido nucleico del ADNc depositado,
independientemente de si codifican un polipéptido que tiene
actividad IL-19. Esto es debido a que, incluso
cuando una molécula de ácido nucleico particular no codifica un
polipéptido que tiene actividad IL-19, un experto
sabría todavía cómo usar la molécula de ácido nucleico, por ejemplo,
como sonda de hibridación o cebador de reacción en cadena de la
polimerasa (PCR). Los usos de las moléculas de ácido nucleico de la
presente invención que no codifican un polipéptido que tiene
actividad IL-19 incluyen, entre otros, (1) aislar
el gen IL-19 o variantes alélicas del mismo en una
colección de ADNc; (2) la hibridación in situ (por ejemplo,
"FISH") con dispersiones cromosómicas metafásicas para
proporcionar una localización cromosómica precisa del gen
IL-19 como se describe en Verma y col., "Human
Chromosomes: a Manual of Basic Techniques", Pergamon Press,
Nueva York (1988); y análisis de transferencia Northern para
detectar la expresión de ARNm de IL-19 en tipos
celulares específicos (por ejemplo, monocitos activados).
Sin embargo, se prefieren moléculas de ácido
nucleico que tienen secuencias al menos un 90%, 95%, 97%, 98% o 99%
idénticas a la secuencia de ácido nucleico mostrada en la Figura 1
(SEQ ID NO: 1) o a la secuencia de ácido nucleico del ADNc
depositado que, de hecho, codifican un polipéptido que tiene
actividad de proteína IL-19. Por "un polipéptido
que tiene actividad IL-19", se entiende
polipéptidos que exhiben una actividad similar, pero no
necesariamente idéntica, a una actividad de la proteína
IL-19 de la invención (la proteína completa o,
preferiblemente, la proteína madura) como se mide en un ensayo
biológico particular.
IL-19 exhibe varias actividades
biológicas que podrían formar la base de dichos ensayos biológicos.
En particular, los inventores creen que IL-19 tiene
la propiedad de modular la síntesis de al menos una citocina del
grupo constituido por IFN-\gamma, linfotoxina,
IL-2, IL-3 y GM-CSF
en una población de células T cooperadoras inducida a sintetizar
una o más de estas citocinas mediante exposición a células
presentadoras de antígeno singénicas (APC) y antígeno. En esta
actividad, las APC se tratan de modo que se conviertan en incapaces
de replicación, pero su maquinaria procesadora de antígeno
permanezca funcional. Esto se consigue convenientemente irradiando
las APC, por ejemplo, con aproximadamente
1.500-3.000 R (radiación gamma o X) antes de mezclar
con las células T.
Como alternativa, pueden ensayarse cambios de
los niveles de producción de citocina en reacciones de linfocitos
primarios o, preferiblemente, secundarios mixtos (MLR), en cuyo caso
no tienen que usarse APC singénicas. Las MLR son bien conocidas en
la técnica, por ejemplo, Bradley, pág. 162-166 en
Mishell y col., ed. "Selected Methods in Cellular Immunology"
(Freeman, San Francisco, 1980); y Battisto y col., Meth. In
Enzymol. 150: 83-91 (1987). Brevemente, se
mezclan las poblaciones celulares, habiéndose tratado una de las
poblaciones antes del mezclado para prevenir la proliferación, por
ejemplo mediante irradiación. Preferiblemente, se preparan las
poblaciones celulares a una concentración de aproximadamente 2 x
10^{6} células/ml en medios suplementados, por ejemplo RPMI 1640
con suero de ternera fetal al 10%. Tanto para cultivos de control
como de ensayo, se mezclan 0,05 ml de cada población para el
ensayo. Para una MLR secundaria, las células restantes después de 7
días en la MLR primaria se reestimulan mediante células estimulantes
irradiadas recién preparadas. Puede añadirse la muestra sospechosa
de contener IL-19 a los cultivos de ensayo en el
momento del mezclado, y tanto en cultivos de control como de ensayo
puede ensayarse la producción de citocina de 1 a 3 días después del
mezclado.
Obtener poblaciones de células T y/o poblaciones
de APC para ensayos de IL-19 emplea técnicas bien
conocidas en la técnica que se describen completamente en DiSabato
y col., ed., Meths in Enzymol. vol. 108 (1984). Las APC para
el ensayo de IL-19 preferido son monocitos de sangre
periférica. Estos se obtienen usando técnicas estándar, por
ejemplo, como se describe por los siguientes artículos en el
anteriormente citado de DiSabato y col., ed., Meth. in
Enzymol. vol. 108 (1984): Boyum, pág. 88-102;
Mage, pág. 118-132; Litvin y col., pág.
298-302; Stevenson, pág. 242-249 y
Romain, pág. 148-153.
Preferiblemente, se usan células T cooperadoras
en los ensayos de IL-19, que se obtienen separando
en primer lugar linfocitos de la sangre periférica y seleccionando
entonces, por ejemplo, mediante cribado o citometría de flujo,
linfocitos cooperadores usando un anticuerpo
anti-CD4 comercialmente disponible, por ejemplo,
OKT4, descrito en la patente de EE.UU. nº 4.381.295 y disponible en
Ortho Pharmaceutical Corp. Las técnicas necesarias se dan a conocer
completamente por Boyum en Scand. Jl. Clin Lab. Invest. 21
(supl. 97); 77 (1968) y en Meth. in Enzymol. vol. 108 (1984)
(citado anteriormente) y por Bram y col., Meth. in Enymol.
121: 737-748 (1986). Generalmente, se obtienen PBL
a partir de sangre reciente mediante centrifugación en gradiente de
densidad Ficoll-Hypaque.
Puede emplearse una variedad de antígenos en el
ensayo, por ejemplo, hemocianina de lapa cerradura (KLH),
\lambda-globulina aviar o similares. Más preferiblemente, en lugar de antígeno, se estimulan en el ensayo células T cooperadoras con anticuerpo monoclonal anti-CD3, por ejemplo, OKT3 dado a conocer en la patente de EE.UU. nº 4.361.549.
\lambda-globulina aviar o similares. Más preferiblemente, en lugar de antígeno, se estimulan en el ensayo células T cooperadoras con anticuerpo monoclonal anti-CD3, por ejemplo, OKT3 dado a conocer en la patente de EE.UU. nº 4.361.549.
Se miden las concentraciones de citocina en las
muestras de control y ensayo mediante ensayos biológicos y/o
inmunoquímicos estándar. La construcción de ensayos inmunoquímicos
para citocinas específicas es bien conocida en la técnica cuando
está disponible la citocina purificada, por ejemplo, Campbell,
"Monoclonal Antibody Technology" (Elsevier, Ámsterdam, 1984);
Tijssen, "Practice and Theory of Enzyme Immunoassays"
(Elsevier, Ámsterdam, 1985) y la patente de EE.UU. nº 4.486.530 son
ejemplos de la extensa bibliografía sobre el tema. Están
comercialmente disponibles los kits ELISA para IL-2
humana, IL-3 humana y GM-CSF humana
en Genzyme Corp. (Boston, MA) y está comercialmente disponible un
kit ELISA para IFN-\gamma humana en Endogen, Inc.
(Boston, MA). Están disponibles anticuerpos policlonales
específicos de linfotoxina humana en Genzyme Corp., que pueden
usarse en un radioinmunoensayo para linfotoxina humana, por
ejemplo, Chard, "An Introduction to Radioimmunoassay and Related
Techniques" (Elsevier, Ámsterdam, 1982).
Los ensayos biológicos de las citocinas
enumeradas anteriormente pueden usarse también para determinar si
una muestra tiene actividad IL-19, concretamente, si
una muestra modula la expresión o actividad de citocina de manera
similar a IL-19. Se da a conocer un ensayo biológico
para linfotoxinas humanas por Aggarwal, Meth. in Enzymol.
116: 441-447 (1985) y por Matthews y col., en
"Limphokines and Interferons: A Practical Approach", Clemens y
col., ed. IRL Press, Washington DC, 1987, pág.
221-225. Pueden ensayarse IL-2 y
GM-CSF humanas con líneas celulares
CTLL-2 y KG-1 dependientes de
factor, disponibles en la ATCC con números de acceso TIB 214 y
CCL246, respectivamente. La IL-3 humana puede
ensayarse mediante su capacidad de estimular la formación de un
amplio intervalo de colonias celulares hematopoyéticas en cultivos
de agar blando, por ejemplo, como se describe por Metcalf, "The
Hematopoietic Colony Stimulating Factors" (Elsevier, Ámsterdam,
1984). IFN-\gamma puede cuantificarse con ensayos
antivíricos, por ejemplo, Meager, pág. 129-147, en
Clemens y col., ed. (citado anteriormente).
La producción de citocina puede determinarse
también mediante análisis de ARNm. Los ARNm de citocina pueden
medirse mediante hibridación puntual citoplasmática, como se
describe por White y col. (J. Biol. Chem. 257:
8569-8572 (1982)) y Gillespie y col., patente de
EE.UU. nº 4.483.920.
Otros enfoques incluyen transferencia puntual
usando ARN purificado, por ejemplo, capítulo 6 de Harnes y col.,
ed., "Nucleic Acid Hybridization: A Practical Approach", IRL
Press, Washington DC, 1985.
Algunas muestras para ensayar la actividad
IL-19 deben pretratarse para retirar las citocinas
que podrían interferir con el ensayo. Por ejemplo,
IL-2 aumenta la producción de
IFN-\gamma en algunas células. Por tanto,
dependiendo de las células T cooperadoras usadas en el ensayo,
IL-2 puede tener que retirarse de la muestra que se
está ensayando. Dichas retiradas se facilitan convenientemente
pasando una muestra por una columna de afinidad
anti-citocina estándar.
Por tanto, usando un ensayo tal como los
descritos anteriormente, puede compararse el efecto de la sustancia
sospechosa de tener actividad IL-19 sobre la
actividad de una cualquiera de una serie de citocinas con la
proteína IL-19 de la invención para determinar si la
muestra tiene realmente actividad IL-19.
Por supuesto, debido a la degeneración del
código genético, un experto reconocerá inmediatamente que un gran
número de moléculas de ácido nucleico que tienen una secuencia al
menos un 90%, 95%, 97%, 98% o 99% idéntica a la secuencia de ácido
nucleico del ADNc depositado o la secuencia de ácido nucleico
mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 1) codificará un polipéptido
"que tiene actividad de proteína IL-19". De
hecho, puesto que las variantes degeneradas de estas secuencias
nucleotídicas codifican todas el mismo polipéptido, esto resultará
evidente para el experto, incluso sin efectuar uno de los ensayos de
comparación descritos anteriormente. Se reconocerá además en la
técnica que, para dichas moléculas de ácido nucleico que no son
variantes degeneradas, un número razonable codificará también un
polipéptido que tiene actividad de proteína IL-19.
Esto es debido a que el experto es completamente conocedor de
sustituciones aminoacídicas que es menos probable o improbable que
afecten significativamente a la función proteica (por ejemplo,
reemplazar un aminoácido alifático por un segundo aminoácido
alifático).
alifático).
Por ejemplo, se proporcionan directrices
referentes a cómo preparar sustituciones aminoacídicas
fenotípicamente silenciosas en Bowie, J.U. y col., "Deciphering
the Message in Protein Sequences: Tolerance to Amino Acid
Substitutions", Science 247: 1306-1310
(1990), en el que los autores indican que hay dos enfoques
principales para estudiar la tolerancia de la secuencia
aminoacídica al cambio. El primer procedimiento se basa en el
proceso evolutivo, en el que las mutaciones son aceptadas o
rechazadas por la selección natural. El segundo enfoque usa la
ingeniería genética para introducir cambios aminoacídicos en
posiciones específicas de un gen clonado y selecciones o cribas
para identificar secuencias que mantienen la funcionalidad. Como
afirman los autores, estos estudios han revelado que las proteínas
son sorprendentemente tolerantes a las sustituciones aminoacídicas.
Los autores indican además cuáles cambios aminoacídicos es probable
que sean permisivos en una cierta posición de la proteína. Por
ejemplo, la mayoría de restos aminoacídicos enterrados requieren
cadenas secundarias no polares, mientras que generalmente se
conservan pocos rasgos de las cadenas laterales superficiales. Se
describen otras de dichas sustituciones fenotípicamente silenciosas
en Bowie, J.U. y col, supra. y las referencias citadas en el
mismo.
La presente invención se refiere también a
vectores que incluyen las moléculas de ADN aisladas de la presente
invención, a células hospedadoras que se modifican por ingeniería
genética con los vectores recombinantes, y a la producción de
polipéptidos IL-19 o porciones de los mismos
mediante técnicas recombinantes.
Las construcciones recombinantes pueden
introducirse en células hospedadoras usando técnicas bien conocidas
tales como infección, transducción, transfección, transvección,
electroporación y transformación. El vector puede ser, por ejemplo,
un fago, plásmido, vector vírico o retrovírico. Los vectores
retrovíricos pueden ser competentes de replicación o defectivos de
replicación. En el último caso, la propagación vírica ocurrirá
generalmente sólo en células hospedadoras complementarias.
Los polinucleótidos pueden unirse a un vector
que contiene un marcador selectivo para propagación en un
hospedador. Generalmente, se introduce un vector plasmídico en un
precipitado, tal como un precipitado de fosfato de calcio, o en un
complejo con un lípido cargado. Si el vector es un virus, puede
empaquetarse in vitro usando una línea celular empaquetadora
apropiada y transduciendo entonces en células hospedadoras.
Se prefieren vectores que comprenden regiones de
control de acción en cis del polinucleótido de interés. Los
factores de acción en cis apropiados pueden suministrarse por el
hospedador, suministrarse por un vector complementario o
suministrarse por el vector mismo tras introducción en el
hospedador.
En ciertas realizaciones preferidas a este
respecto, los vectores proporcionan la expresión específica, que
puede ser inducible y/o específica del tipo celular. Se prefieren
particularmente entre dichos vectores aquellos inducibles por
factores ambientales que son fáciles de manipular, tales como
temperatura y aditivos nutrientes.
Los vectores de expresión útiles en la presente
invención incluyen vectores derivados de cromosomas, episomas y
virus, por ejemplo, vectores derivados de plásmidos bacterianos,
bacteriófagos, episomas de levadura, elementos cromosómicos de
levadura, virus tales como baculovirus, papovavirus, virus Vaccinia,
adenovirus, virus de viruela aviar, virus de pseudorrabia y
retrovirus, y vectores derivados de combinaciones de los mismos,
tales como cósmidos y fagémidos.
El inserto de ADN debería ligarse operativamente
a un promotor apropiado, tal como el promotor PL del fago lambda,
los promotores lac, trp y tac de E.
coli, los promotores temprano y tardío de SV40 y promotores de
LTR retrovíricos, por nombrar unos pocos. Serán conocidos por el
experto otros promotores adecuados. Las construcciones de expresión
contendrán además sitios para el inicio de la transcripción, la
terminación y, en la región transcrita, un sitio de unión a ribosoma
para traducción. La porción de codificación de los transcriptos
maduros expresada por las construcciones incluirá un AUG de inicio
de la traducción al inicio y un codón de terminación apropiadamente
situado al final del polipéptido a traducir.
Como se indica, los vectores de expresión
incluirán preferiblemente al menos un marcador selectivo. Dichos
marcadores incluyen dihidrofolato reductasa o resistencia a
neomicina para cultivo de células eucariotas y genes de resistencia
a tetraciclina o ampicilina para cultivar E. coli y otras
bacterias. Los ejemplos representativos de hospedadores apropiados
incluyen células bacterianas, tales como células E. coli,
Streptomyces y Salmonella typhimarium; células
fúngicas tales como células de levadura; células de insecto tales
como células S2 de Drosophila y Sf9 de Spodoptera;
células animales tales como células CHO, COS y de melanoma de Bowes
y células de planta. Son conocidos en la técnica los medios de
cultivo y condiciones apropiados para las células hospedadoras
anteriormente descritas.
Entre los vectores preferidos para uso en
bacterias se incluyen pA2, pQE70, pQE60 y pQE9, disponibles en
Qiagen; vectores pBS, vectores Phagescript, vectores Bluescript,
pNH8A, pNH16a, pNH18a, pNH46A, disponibles en Stratagene y ptrc99a,
pKK223-3, pKK233-3, pDR540, pRIT5
disponibles en Pharmacia. Entre los vectores eucarióticos preferidos
están pWLNEO, pSV2CAT, pOG44, pXT1 y pSG, disponibles en Stratagene
y pSVK3, pBPV, pMSG y pSVL disponibles en Pharmacia. Resultarán
fácilmente evidentes para el experto otros vectores adecuados.
Entre los promotores bacterianos conocidos
adecuados para uso en la presente invención, se incluyen los
promotores lacI y lacZ de E. coli, los
promotores T3 y T7, el promotor gpt, los promotores PR y PL y
el promotor trp de lambda. Los promotores eucarióticos
adecuados incluyen el promotor temprano inmediato de CMV, el
promotor de timidina cinasa HSV, los promotores temprano y tardío de
SV40, los promotores de LTR retrovíricos, tales como los de virus
del sarcoma de Rous (RSV) y promotores de metalotioneína, tales como
el promotor de metalotioneína de ratón I.
La introducción del constructo en la célula
hospedadora puede efectuarse mediante transfección con fosfato de
calcio, transfección mediada por DEAE-dextrano,
transfección mediada por lípido catiónico, electroporación,
transducción, infección u otros procedimientos. Dichos
procedimientos se describen en muchos manuales de laboratorio
estándares, tales como Davis y col., "Basic Methods in Molecular
Biology" (1986).
La transcripción del ADN que codifica los
polipéptidos de la presente invención por eucariotas superiores
puede aumentarse insertando una secuencia potenciadora en el vector.
Los potenciadores son elementos de ADN de acción en cis,
habitualmente de aproximadamente 10 a 300 pb que actúan aumentando
la actividad transcripcional de un promotor en un tipo de célula
hospedadora dado. Los ejemplos de potenciadores incluyen el
potenciador de SV40, que está situado en el lado tardío del origen
de replicación en las pb 100 a 270, el potenciador de promotor
temprano de citomegalovirus, el potenciador de polioma en el lado
tardío del origen de replicación y potenciadores de adenovirus.
Para la secreción de la proteína traducida al
lumen del retículo endoplasmático, al espacio periplasmático o al
entorno extracelular, pueden incorporare señales de secreción
apropiadas al polipéptido expresado. Las señales pueden ser
endógenas al polipéptido o pueden ser señales heterólogas.
El polipéptido puede expresarse en una forma
modificada, tal como una proteína de fusión, y puede incluir no
sólo señales de secreción, sino también regiones funcionales
heterólogas adicionales. Por ejemplo, puede añadirse una región de
aminoácidos adicionales, particularmente aminoácidos cargados, al
extremo N del polipéptido para mejorar la estabilidad y
persistencia en la célula hospedadora durante la purificación o
durante el posterior manejo y almacenamiento. También pueden
añadirse restos peptídicos al polipéptido para facilitar la
purificación. Dichas regiones pueden retirarse antes de la
preparación final del polipéptido. La adición de restos peptídicos
a polipéptidos para generar secreción o excreción, para mejorar la
estabilidad y para facilitar la purificación, entre otros, son
técnicas familiares y rutinarias en la técnica. Una proteína de
fusión preferida comprende una región heteróloga de una
inmunoglobulina que es útil para solubilizar proteínas. Por ejemplo,
el documento EP-A-O 464.533
(contrapartida canadiense 2045869) da a conocer proteínas de fusión
que comprenden diversas porciones de región constante de moléculas
de inmunoglobulina junto con otra proteína humana o parte de la
misma. En muchos casos, la parte Fc de una proteína de fusión es
enteramente ventajosa para uso en terapia y diagnóstico, y por
tanto da como resultado, por ejemplo, propiedades farmacocinéticas
mejoradas (documento EP-A 0.232.262). Por otro
lado, para algunos usos sería deseable poder eliminar la parte Fc
después de expresarse, detectarse y purificarse la proteína de
fusión de la manera ventajosa descrita. Este es el caso cuando la
porción Fc prueba ser un inconveniente para uso en terapia y
diagnóstico, por ejemplo cuando la proteína de fusión ha de usarse
como antígeno para inmunizaciones. En el descubrimiento de
medicamentos, por ejemplo, se han fusionado proteínas humanas tales
como hIL-5 con porciones de Fc con el fin de ensayos
de cribado de alto rendimiento para identificar antagonistas de
hIL-5. Véanse D. Bennett y col., Journal of
Molecular Recognition, vol. 8, 52-58 (1995) y
K. Johanson y col., The Journal of Biological Chemistry, vol.
270, nº 16, pág. 9459-9471 (1995).
La proteína IL-19 puede
recuperarse y purificarse a partir de cultivos de células
recombinantes mediante procedimientos bien conocidos, incluyendo
precipitación con sulfato de amonio o etanol, extracción ácida,
cromatografía de intercambio aniónico o catiónico, cromatografía en
fosfocelulosa, cromatografía de interacción hidrófoba,
cromatografía de afinidad, cromatografía en hidroxiapatito y
cromatografía en lectina. Lo más preferiblemente, se emplea
cromatografía líquida de alta resolución ("HPLC") para la
purificación.
Los polipéptidos de la presente invención
incluyen productos purificados naturalmente, productos de
procedimientos sintéticos químicos y productos producidos mediante
técnicas recombinantes a partir de un hospedador procariota o
eucariota incluyendo, por ejemplo, células bacterianas, de levadura,
de planta superior, insecto y mamífero. Dependiendo del hospedador
empleado en un procedimiento de producción recombinante, los
polipéptidos de la presente invención pueden estar glucosilados o
pueden estar no glucosilados. Además, los polipéptidos de la
invención pueden incluir también un resto de metionina modificado
inicial, en algunos casos como resultado de procesos mediados por
el hospedador.
La invención proporciona además un polipéptido
de IL-19 aislado que tiene la secuencia aminoacídica
codificada por el ADNc depositado, o la secuencia aminoacídica de
la Figura 1 (SEQ ID NO: 2), o un péptido o polipéptido que
comprende una porción de los polipéptidos anteriores. Los términos
"péptido" y "oligopéptido" se consideran sinónimos (como
se reconoce normalmente) y cada término puede usarse
intercambiablemente según requiera el contexto para indicar una
cadena de al menos aminoácidos acoplados por enlaces peptidilo. La
palabra "polipéptido" se usa en la presente memoria para
cadenas que contienen más de 10 restos aminoacídicos. Todas las
fórmulas o secuencias de oligopéptido y polipéptido en la presente
memoria se escriben de izquierda a derecha y en la dirección de
extremo amino a extremo carboxilo.
Se reconocerá en la técnica que algunas
secuencias aminoacídicas del polipéptido IL-19
pueden variar sin un efecto significativo de la estructura o
función de la proteína. Si se contemplan dichas diferencias de
secuencia, debe recordarse que habrá zonas críticas en la proteína
que determinen la actividad. En general, es posible reemplazar
restos que forman la estructura terciaria, a condición de que se
usen restos que efectúen una función similar. En otros casos, el
tipo de residuo puede no tener ninguna importancia si la alteración
aparece en una región no crítica de la
proteína.
proteína.
Por tanto, la solicitud describe además
variaciones del polipéptido IL-19 que muestran una
actividad de polipéptido IL-19 sustancial o que
incluyen regiones de la proteína IL-19 tales como
las porciones proteicas discutidas anteriormente. Dichos mutantes
incluyen deleciones, inserciones, inversiones, repeticiones y
sustituciones de tipo (por ejemplo, sustituir un resto hidrófilo
por otro, pero no uno fuertemente hidrófilo por otro fuertemente
hidrófobo en general). Cambios pequeños o dichas sustituciones
aminoacídicas "neutras" tendrán generalmente poco efecto sobre
la actividad.
Se observan típicamente como sustituciones
conservativas los reemplazos, uno por otro, entre los aminoácidos
alifáticos Ala, Val, Leu e Ile, el intercambio de los restos
hidroxílicos Ser y Thr, el intercambio de los restos ácidos Asp y
Glu, la sustitución entre los restos amídicos Asn y Gln, el
intercambio de los restos básicos Lys y Arg y reemplazos entre los
restos aromáticos Phe y Tyr.
Como se indica con detalle anteriormente, pueden
encontrarse directrices adicionales referentes a cuáles cambios
aminoacídicos es probable que sean fenotípicamente silenciosos
(concretamente, no es probable que tengan un efecto dañino
significativo sobre una función) en Bowie, J.U. y col.,
"Deciphering the Message in Protein Sequences: Tolerance to Amino
Acid Substitutions", Science 247:
1306-1310 (1990).
Los polipéptidos de la presente invención se
proporcionan preferiblemente en forma aislada, y preferiblemente
están sustancialmente purificados. Puede purificarse sustancialmente
una versión producida recombinantemente del polipéptido
IL-19 mediante el procedimiento de una etapa como se
describe en Smith y Johnson, Genes 67: 31-40
(1988).
Los polipéptidos de la presente invención
incluyen el polipéptido codificado por el ADNc depositado,
incluyendo la líder, el polipéptido maduro codificado por el ADNc
depositado menos la líder (concretamente, la proteína madura), el
polipéptido de la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) incluyendo la líder, el
polipéptido de la figura 1 (SEQ ID NO: 2) menos la líder, así como
polipéptidos que tienen al menos un 90% de similitud, más
preferiblemente al menos un 95% de similitud, y todavía más
preferiblemente al menos un 97%, 98% o 99% de similitud con los
descritos anteriormente. Los polipéptidos adicionales de la presente
invención incluyen polipéptidos al menos un 80% idénticos, más
preferiblemente al menos un 90% o 95% idénticos, todavía más
preferiblemente al menos un 97%, 98% o 99% idénticos al polipéptido
codificado por el ADNc depositado, al polipéptido de SEQ ID NO: 2,
e incluyen también porciones de dichos polipéptidos con al menos 30
aminoácidos y más preferiblemente al menos 50 aminoácidos, en los
que dicho polipéptido tiene actividad IL-19, en los
que dicha actividad es la propiedad de modular la síntesis de al
menos una citocina del grupo constituido por
IFN-\gamma, linfotoxina, IL-2,
IL-3 y GM-CSF en una población de
células T cooperadoras inducida a sintetizar una o más de estas
citocinas por exposición a células presentadoras de antígeno
singénicas (APC) y antígeno.
Por "% de similitud" para dos polipéptidos,
se entiende una puntuación de similitud producida comparando las
secuencias aminoacídicas de los dos polipéptidos usando el programa
Bestfit (Wisconsin Sequence Analysis Package, versión 8 para Unix,
Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science
Drive, Madison, WI 53711) y los ajustes por defecto para determinar
la similitud. Bestfit usa el algoritmo de homología local de Smith
y Waterman (Advances in Applied Mathematics 2:
482-489, 1981) para encontrar el mejor segmento de
similitud entre dos secuencias.
Por un polipéptido que tiene una secuencia
aminoacídica al menos, por ejemplo, un 95% "idéntica" a una
secuencia aminoacídica de referencia de un polipéptido
IL-19, se entiende que la secuencia aminoacídica del
polipéptido es idéntica a la secuencia de referencia, excepto
porque la secuencia polipeptídica puede incluir hasta 5
alteraciones aminoacídicas por cada 100 aminoácidos del aminoácido
de referencia del polipéptido IL-19. En otras
palabras, para obtener un polipéptido que tenga una secuencia
aminoacídica al menos un 95% idéntica a una secuencia aminoacídica
de referencia, hasta un 5% de los restos aminoacídicos de la
secuencia de referencia pueden eliminarse o sustituirse por otro
aminoácido, o pueden insertarse en la secuencia de referencia una
serie de aminoácidos de hasta un 5% de los restos aminoacídicos
totales de la secuencia de referencia. Estas alteraciones de la
secuencia de referencia pueden aparecer en las posiciones amino o
carboxilo terminales de la secuencia aminoacídica de referencia o
en cualquier punto entre estas posiciones terminales, dispersados
individualmente entre los restos de la secuencia de referencia o en
uno o más grupos contiguos dentro de la secuencia de
referencia.
En la práctica, puede determinarse
convencionalmente si cualquier polipéptido particular es al menos un
90%, 95%, 97%, 98% o 99% idéntico, por ejemplo, a la secuencia
aminoacídica mostrada en la Figura 1 (SEQ ID NO: 2) o a la
secuencia aminoacídica codificada por el clon de ADNc depositado,
usando programas informáticos conocidos tales como el programa
Bestfit (Wisconsin Sequence Analysis Package, versión 8 para Unix,
Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science
Drive, Madison, WI 53711). Cuando se usa Bestfit o cualquier otro
programa de alineamiento de secuencia para determinar si una
secuencia particular es, por ejemplo, un 95% idéntica a una
secuencia de referencia según la presente invención, los parámetros
se fijan, por supuesto, de tal modo que el porcentaje de identidad
se calcula para toda la longitud de la secuencia aminoacídica de
referencia y que se permitan huecos de homología de hasta un 5% del
número total de restos aminoacídicos en la secuencia de
referencia.
Como se describe con detalle a continuación, los
polipéptidos de la presente invención pueden usarse para crear
anticuerpos policlonales y monoclonales, que son útiles en ensayos
de diagnóstico para detectar la expresión de proteína
IL-19 como se describe a continuación o como
agonistas o antagonistas capaces de potenciar o inhibir la función
de la proteína IL-19. Además, dichos polipéptidos
pueden usarse en el sistema de dos híbridos de levadura para
"capturar" proteínas de unión a proteína IL-19
que son también candidatos a agonista y antagonista según la
presente invención. El sistema de dos híbridos de levadura se
describe en Fields y Song, Nature 340:
245-246 (1989).
En otro aspecto, la invención proporciona un
péptido o polipéptido que comprende una porción portadora de
epítopo de un polipéptido de la invención. El epítopo de esta
porción polipeptídica es un epítopo inmunogénico de un polipéptido
de la invención. Un "epítopo inmunogénico" se define como una
parte de una proteína que desencadena una respuesta de anticuerpo
cuando toda la proteína es el inmunógeno. Estos epítopos
inmunogénicos se cree que están confinados en unos pocos loci de la
molécula. Por otro lado, una región de una molécula de proteína a
la que puede unirse un anticuerpo se define como "epítopo
antigénico". El número de epítopos inmunogénicos de una proteína
es generalmente menor que el número de epítopos antigénicos. Véanse,
por ejemplo, Geysen, H.M., Meloen, R.H. y Barteling, S.J. (1984).
"Use of peptide synthesis to probe viral antigens for epitopes to
a resolution of a single amino acid". Proc. Natl. Acad. Sci.
USA 81: 3998-4002.
En cuanto a la selección de péptidos o
polipéptidos portadores de un epítopo antigénico (concretamente, que
contienen una región de una molécula proteica a la que puede unirse
un anticuerpo), es bien conocido en esa técnica que péptidos
sintéticos relativamente cortos que imitan parte de una secuencia
proteica son rutinariamente capaces de desencadenar un antisuero
que reacciona con la proteína parcialmente imitada. Véanse, por
ejemplo, Sutcliffe, J.G., Shinnick, T.M., Green, N. y Lerner, R.A.
(1983) "Antibodies that react with predetermined sites on
proteins", Science 219: 660-666. Los
péptidos capaces de desencadenar sueros reactivos con proteína se
representan frecuentemente en la secuencia primaria de una proteína,
pueden caracterizarse por un conjunto de normas químicas sencillas,
y no están confinados a regiones inmunodominantes de proteínas
intactas (concretamente epítopos inmunogénicos) ni a los extremos
amino o carboxilo. Los péptidos que son extremadamente hidrófobos y
aquellos de 6 o menos restos son generalmente ineficaces para
inducir anticuerpos que se unan a la proteína imitada;
habitualmente son eficaces péptidos solubles más largos,
especialmente aquellos que contienen restos de prolina. Sutcliffe y
col., supra, en 661. Por ejemplo, 18 de los 20 péptidos
diseñados según estas directrices, que contienen
8-39 restos que cubren un 75% de la secuencia de la
cadena polipeptídica de hemaglutinina HA1 del virus de la gripe,
inducían anticuerpos que reaccionaban con la proteína HAI o virus
intactos; y 12/12 péptidos de la polimerasa MuLV y 18/18 de
glucoproteína de la rabia inducían anticuerpos que precipitaban las
proteínas respectivas.
Los péptidos y polipéptidos portadores de
epítopo antigénicos descritos en la solicitud son por lo tanto
útiles para crear anticuerpos, incluyendo anticuerpos monoclonales,
que se unen específicamente a un polipéptido de la invención. Por
tanto, una alta proporción de hibridomas obtenidos mediante la
fusión de células de bazo de donantes inmunizados con un péptido
portador de epítopo antigénico secretan generalmente anticuerpo
reactivo con la proteína nativa. Sutcliffe y col, supra, en
663. Los anticuerpos creados por péptidos o polipéptidos portadores
de epítopo antigénicos son útiles para detectar la proteína imitada,
y pueden usarse anticuerpos contra diferentes péptidos para
rastrear el destino de diversas regiones de un precursor proteico
que experimenta procesamiento postraduccional. Los péptidos y
anticuerpos antipeptídicos pueden usarse en una variedad de ensayos
cualitativos o cuantitativos de la proteína imitada, por ejemplo, en
ensayos competitivos, puesto que se ha mostrado que incluso
péptidos cortos (por ejemplo, de aproximadamente 9 aminoácidos)
pueden unirse a y desplazar péptidos mayores en ensayos de
inmunoprecipitación. Véanse, por ejemplo Wilson, I.A., Niman, H.L.,
Houghten, R.A., Cherenson, A.R., Connolly, M.L. y Lerner, R.A.
(1984). "The structure of an antigenic determinant in a
protein", Cell 37: 767-778 en 777. Los
anticuerpos antipeptídicos de la invención son también útiles para
la purificación de la proteína imitada, por ejemplo, mediante
cromatografía de absorción usando procedimientos bien conocidos en
la
técnica.
técnica.
Los péptidos portadores de epítopo antigénicos
descritos en la solicitud y los polipéptidos de la invención
diseñados según las directrices anteriores contienen preferiblemente
una secuencia de al menos 7, más preferiblemente al menos 9, y lo
más preferiblemente entre aproximadamente 15 y aproximadamente 30
aminoácidos contenida en la secuencia aminoacídica de un
polipéptido de la invención. Sin embargo, los péptidos o
polipéptidos que comprenden una porción mayor de una secuencia
aminoacídica de un polipéptido de la invención, que contienen de
aproximadamente 30 a aproximadamente 50 aminoácidos, o cualquier
longitud hasta e incluyendo la secuencia aminoacídica entera de un
polipéptido de la invención, son considerados también péptidos o
polipéptidos portadores de epítopo de la invención y son también
útiles para inducir anticuerpos que reaccionan con la proteína
imitada. Preferiblemente, la secuencia aminoacídica del péptido
portador de epítopo se selecciona para proporcionar una solubilidad
sustancial en disolventes acuosos (concretamente, la secuencia
incluye restos relativamente hidrófilos y se evitan preferiblemente
las secuencia altamente hidrófobas); y se prefieren particularmente
secuencias que contienen restos de
prolina.
prolina.
Los ejemplos no limitantes de polipéptidos o
péptidos antigénicos que pueden usarse para generar anticuerpos
específicos de IL-19 incluyen: un polipéptido que
comprende los restos aminoacídicos de aproximadamente 20 a
aproximadamente 28 de la Figura 1 (restos -5 a 4 del SEQ ID NO: 2);
un polipéptido que comprende los restos aminoacídicos de
aproximadamente 88 a aproximadamente 106 de la Figura 1 (restos
64-82 del SEQ ID NO: 2); y un polipéptido que
comprende los restos aminoacídicos de aproximadamente 139 a
aproximadamente 149 de la Figura 1 (restos 115-125
del SEQ ID NO: 2). Como se indica anteriormente, los inventores han
determinado que los fragmentos polipeptídicos anteriores son
regiones antigénicas de la proteína endocina alfa.
Los péptidos y polipéptidos portadores de
epítopo de la invención pueden producirse mediante cualquier medio
convencional para preparar péptidos o polipéptidos, incluyendo
medios recombinantes usando moléculas de ácido nucleico de la
invención. Por ejemplo, puede fusionarse una secuencia aminoacídica
corta portadora de epítopo con un polipéptido mayor que actúa como
portador durante la producción y purificación recombinante, así como
durante la inmunización para producir anticuerpos antipeptídicos.
Los péptidos portadores de epítopo pueden sintetizarse también
usando procedimientos conocidos de síntesis química. Por ejemplo,
Houghten ha descrito un procedimiento sencillo para la síntesis de
grandes números de péptidos, tales como 10-20 mg de
248 péptidos de 13 restos diferentes que representan variantes
aminoacídicas sencillas de un segmento del polipéptido HA1, que se
prepararon y caracterizaron (mediante estudios de unión de tipo
ELISA) en menos de 4 semanas. Houghten, R.A. (1985) "General
method for the rapid solid-phase synthesis of large
numbers of peptides: specifitiy of antigen-antibody
interaction at the level of individual amino acids". Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 82: 5131-5135. Este
procedimiento de "síntesis peptídica múltiple simultánea
(SMPS)" se describe además en la patente de EE.UU. nº 4.631.211
de Houghten y col. (1986). En este procedimiento, las resinas
individuales para la síntesis en fase sólida de diversos péptidos
están contenidas en paquetes permeables a disolvente separados, que
posibilitan el uso óptimo en las muchas etapas repetitivas
idénticas implicadas en los procedimientos en fase sólida. Puede
realizarse simultáneamente un procedimiento completamente manual que
permite 500-1000 o más síntesis. Houghten y col.,
supra, en 5134.
Los péptidos y polipéptidos portadores de
epítopo de la invención se usan para inducir anticuerpos según
procedimientos bien conocidos en la técnica. Véanse, por ejemplo,
Sutcliffe y col., supra; Wilson y col., supra; Chow,
M., Yabrov, R., Bittle, J., Hogel., J. y Baltimore, D., Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 82: 910-914 y Bittle, F.J.,
Fry, C.M., Rowlands, D.J., Brown, F. Bittle, J.L., Houghten, R.A. y
Lerner, R.A. (1985) J. Gen. Virol. 66:
2347-2354. Generalmente, pueden inmunizarse animales
con el péptido libre, sin embargo, el título de anticuerpo
antipeptídico puede amplificarse acoplando el péptido con un
portador macromolecular, tal como hemocianina de lapa cerradura
(KLH) o toxoide del tétanos. Por ejemplo, los péptidos que contienen
cisteína pueden acoplarse a un portador usando un espaciador tal
como éster de
m-maleimidobenzoil-N-hidroxisuccinimida
(MBS), mientras que otros péptidos pueden acoplarse a un portador
usando un agente espaciador más general tal como glutaraldehído.
Los animales tales como conejos, ratas y ratones se inmunizan con
péptidos libres o acoplados con portador, por ejemplo, mediante
inyección intraperitoneal y/o intradérmica de emulsiones que
contienen aproximadamente 100 \mug de péptido o proteína
portadora y coadyuvante de Freund. Pueden ser necesarias varias
inyecciones de recuerdo, por ejemplo a intervalos de
aproximadamente 2 semanas, para proporcionar un título útil de
anticuerpo antipeptídico que pueda detectarse, por ejemplo,
mediante ensayo ELISA usando péptido libre adsorbido sobre una
superficie sólida. El título de anticuerpos antipeptídicos en el
suero de un animal inmunizado puede aumentarse mediante la
selección de anticuerpos antipeptídicos, por ejemplo, mediante
adsorción del péptido sobre un soporte sólido y elución de los
anticuerpos seleccionados según procedimientos bien conocidos en la
técnica.
Los péptidos portadores de epítopo inmunogénicos
de la invención, concretamente aquellas partes de una proteína que
desencadenan una respuesta de anticuerpo cuando la proteína completa
es inmunogénica, se identifican según procedimientos conocidos en
la técnica. Por ejemplo, Geysen y col., 1984, supra, dan a
conocer un procedimiento para la síntesis rápida y simultánea sobre
soportes sólidos de cientos de péptidos de suficiente pureza para
reaccionar en un ensayo de inmunosorción ligado a enzima. La
interacción de los péptidos sintetizados con anticuerpos se detecta
entonces fácilmente sin retirarlos del soporte. De esta manera,
puede identificarse rutinariamente un péptido portador de un
epítopo inmunogénico de una proteína deseada por un experto. Por
ejemplo, el epítopo inmunológicamente importante en la proteína de
cubierta del virus de la glosopeda fue localizado por Geysen y col.
con una resolución de 7 aminoácidos mediante la síntesis de un
conjunto superpuesto de todos los 208 hexapéptidos posibles que
cubren la secuencia entera de 213 aminoácidos de la proteína. Se
sintetizó entonces un conjunto de péptidos de reemplazo completo en
el que se sustituyeron todos los 20 aminoácidos a su vez en cada
posición del epítopo, y se determinaron los aminoácidos particulares
que conferían especificidad para la reacción con el anticuerpo. Por
tanto, pueden prepararse rutinariamente mediante este procedimiento
análogos peptídicos de los péptidos portadores de epítopo de la
invención. La patente de EE.UU. nº 4.708.781 de Geysen (1987)
describe además este procedimiento de identificación de un péptido
portador de un epítopo inmunogénico de una proteína
deseada.
deseada.
Es más, la patente de EE.UU. 5.194.392 de Geysen
(1990) describe un procedimiento general de detección o
determinación de la secuencia de monómeros (aminoácidos u otros
compuestos) que es un equivalente topológico del epítopo
(concretamente, un "mimótopo") que es complementario de un
parátopo particular (sitio de unión a antígeno) de un anticuerpo de
interés. Más generalmente, la patente de EE.UU. nº 4.433.092 de
Geysen (1989) describe un procedimiento de detección o
determinación de una secuencia de monómeros que es un equivalente
topográfico de un ligando que es complementario del sitio de unión
a ligando de un receptor de interés particular. De forma similar,
la patente de EE.UU. nº 5.480.971 de Houghten, R.A. y col. (1996)
sobre mezclas oligopeptídicas peralquiladas da a conocer
oligopéptidos peralquilados con alquilo
C_{1}-C_{7} y conjuntos y colecciones de dichos
péptidos, así como procedimientos para uso de dichos conjuntos y
colecciones de oligopéptidos para determinar la secuencia de un
oligopéptido peralquilado que se une preferentemente a una molécula
aceptora de interés. Por tanto, pueden prepararse también
rutinariamente mediante estos procedimientos análogos no peptídicos
de los péptidos portadores de epítopo de la invención.
Como apreciará un experto en la técnica, los
polipéptidos IL-19 de la presente invención y los
fragmentos portadores de epítopo de los mismos descritos
anteriormente pueden combinarse con partes del dominio constante de
inmunoglobulinas (Ig), dando como resultado polipéptidos quiméricos.
Estas proteínas de fusión facilitan la purificación y muestran una
semivida in vivo aumentada. Esto se ha mostrado, por ejemplo,
para proteínas quiméricas constituidas por los primeros dos
dominios del polipéptido CD4 humano y diversos dominios de las
regiones constantes de las cadenas pesada o ligera de
inmunoglobulinas de mamífero (documento EP A 394.827, Traunecker y
col., Nature 331: 84-86 (1988)). Las
proteínas de fusión que tienen una estructura dimérica ligada por
disulfuro debido a la parte de IgG pueden ser también más eficaces
en la unión y neutralización de otras moléculas distintas de
proteína IL-19 monomérica o fragmento de proteína
sola (Fountoulakis y col., J. Biochem. 270:
3958-3964 (1995)).
Las moléculas de ácido nucleico de la presente
invención son también valiosas para la identificación de cromosomas.
La secuencia está orientada específicamente a y puede hibridar con
una localización particular en un cromosoma humano individual.
Además, existe una necesidad actual de identificar sitios
particulares en el cromosoma. Actualmente están disponibles pocos
reactivos marcadores de cromosoma basados en datos de secuencia
reales (polimorfismos de repetición) para marcar la localización
cromosómica. La cartografía de los ADN de cromosomas según la
presente invención es una primera etapa importante para
correlacionar estas secuencias con genes asociados a
enfermedades.
En ciertas realizaciones preferidas a este
respecto, el ADNc dado a conocer en la presente memoria se usa para
clonar ADN genómico de un gen de proteína interleucina 19. Esto
puede conseguirse usando una variedad de técnicas y colecciones
bien conocidas, que generalmente están disponibles comercialmente.
Se usa entonces el ADN genómico para cartografía cromosómica in
situ usando técnicas bien conocidas con este fin. Típicamente,
según procedimientos rutinarios para cartografía cromosómica, pueden
ser necesarios algunos ensayos y errores para identificar una sonda
genómica que dé una buena señal de hibridación in situ.
En algunos casos, además, pueden cartografiarse
secuencias en cromosomas preparando cebadores de PCR
(preferiblemente de 15-25 pb) a partir del ADNc. El
análisis informático de la región 3' no traducida del gen se usa
para seleccionar rápidamente cebadores que no se extienden más de
un exón en el ADN genómico, complicando por tanto el proceso de
amplificación. Se usan entonces estos cebadores para cribado por PCR
de híbridos celulares somáticos que contienen cromosomas humanos
individuales. Sólo aquellos híbridos que contienen el gen humano
correspondiente con el cebador proporcionarán una porción
amplificada.
La cartografía por PCR de híbridos celulares
somáticos es un procedimiento rápido para asignar un ADN particular
a un cromosoma particular. Usando la presente invención con los
mismos cebadores oligonucleotídicos, puede conseguirse la
sublocalización con paneles de porciones de cromosomas específicos o
conjuntos de clones genómicos grandes de manera análoga. Otras
estrategias de cartografía que pueden usarse de forma similar para
cartografiar su cromosoma incluyen hibridación in situ,
precribado con cromosomas marcados separados por flujo y
preselección mediante hibridación para construir colecciones de
ADNc específicas de cromosoma.
La hibridación in situ con fluorescencia
("FISH") de un clon de ADNc con una dispersión cromosómica
metafásica puede usarse para proporcionar una localización
cromosómica precisa en una etapa. Esta técnica puede usarse con
sondas de ADNc tan cortas como de 50 ó 60 pb. Para una revisión de
esta técnica, véase Verma y col., "Human chromosomes: a manual of
basic techniques", Pergamon Press, Nueva York (1988).
Una vez se ha cartografiado una secuencia en una
localización cromosómica precisa, puede correlacionarse la posición
física de la secuencia en el cromosoma con los datos del mapa
genético. Dichos datos se encuentran, por ejemplo, en V. McKusick,
"Mendelian inheritance in man", disponible en línea en la Johns
Hopkins University, Welch Medical Library. Se identifica entonces
la relación entre genes y enfermedades que se han cartografiado en
la misma región cromosómica mediante análisis de entrecruzamiento
(herencia conjunta de genes físicamente adyacentes).
A continuación, es necesario determinar las
diferencias en el ADNC o la secuencia genómica entre individuos
afectados y no afectados. Si se observa una mutación en algunos o
todos los individuos afectados pero no en ningún individuo normal,
entones es probable que la mutación sea el agente causante de la
enfermedad.
Con la resolución actual de las técnicas de
cartografía física y cartografía genética, un ADNc localizado
precisamente en una región cromosómica asociada a la enfermedad
podría ser uno de entre 50 y 500 genes causantes potenciales (esto
supone una resolución cartográfica de 1 megabase y un gen por 20
kb).
Como se observa anteriormente,
IL-19 se secreta por monocitos activados, y comparte
una homología significativa con IL-10 humana. Por
tanto, los inventores creen que IL-19 es activa en
la inhibición de la producción de citocina durante la respuesta
inmune de mamíferos. Las citocinas cuya producción puede afectarse
por IL-19 incluyen IFN-\gamma,
TNF-\alpha e IL-6.
Una de dichas actividades de
IL-19 es la capacidad de limitar la producción
excesiva de interferón gamma (IFN-\gamma), y por
lo tanto los efectos consiguientes de dicha producción, incluyendo
enfermedades autoinmunitarias asociadas a la histocompatibilidad
mayor (MHC). Ya que la expresión aumentada de
IFN-\gamma se ha implicado en un aumento de los
genes de MHC, que puede aumentar entonces la posibilidad de una
respuesta autoimunitaria contra células que sobreexpresan MHC, la
capacidad de limitar la expresión de IFN-\gamma
puede ser terapéuticamente valiosa en el tratamiento de
manifestaciones clínicas de dichos trastornos de MHC. Estos incluyen
artritis reumatoide, lupus sistémico eritematoso (SLE), miastenia
grave, diabetes mellitus insulinodependiente y tiroiditis.
La regulación negativa de
IFN-\gamma por IL-19 puede ser
también terapéuticamente valiosa en el tratamiento de infecciones
parasitarias tales como leishmaniosis. Los niveles de
IFN-\gamma, IL-2 e
IL-4 están todos implicados en la regulación del
ciclo vital de este parásito. Por tanto, la capacidad de regular la
producción de estas citocinas por IL-19 sería
terapéuticamente valiosa.
Dadas las actividades moduladas por
IL-19, resulta fácilmente evidente que un nivel de
expresión de IL-19 sustancialmente alterado
(aumentado o reducido) en un individuo, en comparación con el nivel
estándar o "normal", produce afecciones patológicas tales como
las descritas anteriormente. Se apreciará también por un experto
que, puesto que la proteína IL-19 de la invención se
traduce con un péptido líder adecuado para la secreción de la
proteína madura desde las células que expresan
IL-19, cuando se añade proteína
IL-19 (particularmente la forma madura) de una
fuente exógena a células, tejidos o el cuerpo de un individuo, la
proteína ejercerá sus actividades modulatorias sobre cualquiera de
sus células diana. Por lo tanto, se apreciará que las afecciones
causadas por una reducción del nivel estándar o normal de actividad
IL-19 en un individuo pueden tratarse mediante la
administración de proteína IL-19. Por tanto, la
solicitud describe además un procedimiento de tratamiento de un
individuo necesitado de un nivel aumentado de actividad
IL-19, que comprende administrar a dicho individuo
una composición farmacéutica que comprende una cantidad de un
polipéptido IL-19 aislado de la invención,
particularmente una forma madura de la proteína
IL-19 de la invención, eficaz para aumentar el
nivel de actividad IL-19 en dicho
individuo.
individuo.
Un experto apreciará que las cantidades eficaces
de polipéptidos IL-19 para tratar in individuo
necesitado de un nivel aumentado de actividad IL-19
pueden determinarse empíricamente para cada afección en las que está
indicada la administración de IL-19. El polipéptido
que tiene actividad IL-19 puede administrarse en
composiciones farmacéuticas en combinación con uno o más
excipientes farmacéuticamente aceptables. Se entenderá que, cuando
se administran a un paciente humano, el uso diario total de las
composiciones farmacéuticas de la presente invención se decidirá
por el médico a cargo dentro del alcance del criterio médico
aceptado. El nivel de dosis terapéuticamente eficaz específica para
cualquier paciente particular dependerá de una variedad de factores,
incluyendo el tipo y grado de respuesta a conseguir, la composición
específica de otro agente empleado, si lo hubiera, la edad, peso
corporal, estado general de salud, sexo y dieta del paciente, el
momento de administración, la vía de administración y la velocidad
de excreción de la composición, la duración del tratamiento, los
medicamentos (tales como un agente quimioterapéutico) usados en
combinación o coincidentemente con la composición específica y
factores similares bien conocidos en la técnica médica.
Por ejemplo, se predice que se obtienen
resultados satisfactorios mediante la administración oral de un
polipéptido que tiene actividad IL-19 en
dosificaciones del orden de 0,05 a 10 mg/kg/día, preferiblemente de
0,1 a 7,5 mg/kg/día, más preferiblemente de 0,1 a 2 mg/kg/día,
administradas una vez o, en dosis divididas, 2 a 4 veces al día. En
la administración parenteral, por ejemplo mediante goteo o infusión
i.v., pueden usarse dosificaciones del orden de 0,01 a 5 mg/kg/día,
preferiblemente de 0,05 a 1,0 mg/kg/día y más preferiblemente de 0,1
a 1,0 mg/kg/día. Las dosificaciones diarias adecuadas para
pacientes son por tanto del orden de 2,5 a 500 mg por vía oral,
preferiblemente 5 a 250 mg por vía oral, más preferiblemente 5 a 100
mg por vía oral, o del orden de 0,5 a 250 mg por vía i.v.,
preferiblemente 2,5 a 125 mg por vía i.v., y más preferiblemente 2,5
a 50 mg por vía i.v.
La dosificación puede disponerse también en un
paciente de manera específica para proporcionar una concentración
predeterminada de una actividad IL-19 en la sangre,
como se determina mediante una técnica RIA, por ejemplo. Por tanto,
la dosificación al paciente puede ajustarse para conseguir niveles
sanguíneos regulares continuos, medidos por RIA, del orden de 50 a
1.000 mg/ml, preferiblemente 150 a 500 ng/ml.
Las composiciones farmacéuticas de la invención
pueden administrarse por vía oral, rectal, parenteral,
intracisternal, intravaginal, intraperitoneal, tópica (como
mediante polvos, ungüentos, gotas o parche transdérmico), bucal o
en forma de pulverizador oral o nasal. Por "portador
farmacéuticamente aceptable", se quiere indicar una carga,
diluyente, material encapsulante o auxiliar de formulación sólido,
semisólido o líquido no tóxico de cualquier tipo. El término
"parenteral" como se usa en la presente memoria designa modos
de administración que incluyen inyección e infusión intravenosa,
intramuscular, intraperitoneal, intrasternal, subcutánea e
intraarticular.
Las composiciones farmacéuticas de la presente
invención para inyección parenteral pueden comprender disoluciones,
dispersiones, suspensiones o emulsiones estériles acuosas o no
acuosas farmacéuticamente aceptables, así como polvos estériles
para reconstitución en disoluciones o dispersiones inyectables
estériles justo antes del uso. Los ejemplos de portadores,
diluyentes, disolventes o vehículos acuosos y no acuosos adecuados
incluyen agua, etanol, polioles (tales como glicerol,
propilenglicol, polietilenglicol y similares), carboximetilcelulosa
y mezclas adecuadas de los mismos, aceites vegetales (tales como
aceite de oliva) y ésteres orgánicos inyectables tales como oleato
de etilo. La fluidez apropiada puede mantenerse, por ejemplo,
mediante el uso de materiales de recubrimiento tales como lecitina,
mediante el mantenimiento del tamaño de partícula necesario en el
caso de dispersiones, y mediante el uso de tensioactivos.
Las composiciones de la presente invención
pueden contener también coadyuvantes tales como conservantes,
agentes humectantes, agentes emulsionantes y agentes dispersantes.
La prevención de la acción de los microorganismos puede asegurarse
mediante la inclusión de diversos agentes antibacterianos y
antifúngicos, por ejemplo, parabeno, clorobutanol, fenol, ácido
sórbico y similares. Puede ser deseable también incluir agentes
isotónicos tales como azúcares, cloruro de sodio y similares. La
absorción prolongada de la forma farmacéutica inyectable puede
producirse mediante la inclusión de agentes que retardan la
absorción tales como monoestearato de aluminio y
gelatina.
gelatina.
En algunos casos, para prolongar el efecto de la
composición farmacéutica, es deseable retardar la absorción del
medicamento por inyección subcutánea o intramuscular. Esto puede
conseguirse mediante el uso de una suspensión líquida de material
cristalino o amorfo con poca solubilidad acuosa. La velocidad de
absorción del medicamento depende entonces de su velocidad de
disolución que, a su vez, puede depender del tamaño de cristal y la
forma cristalina. Como alternativa, se consigue la absorción
retardada de una forma de medicamento administrada por vía
parenteral disolviendo o suspendiendo el medicamento en un vehículo
oleoso.
Las formas de liberación prolongada inyectables
se preparan formando matrices microencapsuladas del medicamento en
polímeros biodegradables tales como
polilactida-poliglicolida. Dependiendo de la
relación de medicamento a polímero y de la naturaleza del polímero
particular empleado, puede controlarse la velocidad de liberación
de medicamento. Los ejemplos de otros polímeros biodegradables
incluyen poli(ortoésteres) y poli(anhídridos). Las
formulaciones de liberación prolongada inyectables se preparan
también atrapando el medicamento en liposomas o microemulsiones que
sean compatibles con tejidos corporales.
Las formulaciones inyectables pueden
esterilizarse, por ejemplo, mediante filtración a través de un
filtro que retiene bacterias, o incorporando agentes esterilizantes
en forma de composición sólidas estériles que pueden disolverse o
dispersarse en agua estéril u otro medio inyectable estéril justo
antes del uso.
Las formas de dosificación sólidas para
administración oral incluyen cápsulas, comprimidos, píldoras, polvos
y gránulos. En dichas formas de dosificación sólidas, se mezclan
los compuestos activos con al menos un artículo de excipiente o
portador farmacéuticamente aceptable tal como citrato de sodio o
fosfato dicálcico y/o a) cargas o extensores tales como almidones,
lactosa, sacarosa, glucosa, manitol y ácido silícico, b)
aglutinantes tales como, por ejemplo, carboximetilcelulosa,
alginatos, gelatina, polivinilpirrolidona, sacarosa y goma arábiga,
c) humectantes tales como glicerol, d) agentes disgregantes tales
como agar agar, carbonato de calcio, almidón de patata o tapioca,
ácido algínico, ciertos silicatos y carbonato de sodio, e) agentes
retardantes de la disolución tales como parafina, f) aceleradores
de la absorción tales como compuestos de amonio cuaternario, g)
agentes humectantes tales como, por ejemplo, alcohol cetílico y
monoestearato de glicerol, h) absorbentes tales como caolín y
arcilla de bentonita y i) lubricantes tales como talco, estearato de
calcio, estearato de magnesio, polietilenglicoles sólidos,
laurilsulfato de sodio y mezclas de los mismos. En el caso de
cápsulas, comprimidos y píldoras, la forma de dosificación puede
comprender también agentes de tamponación.
Pueden emplearse también composiciones sólidas
de tipo similar como cargas en cápsulas de gelatina blandas y duras
rellenas usando excipientes tales como lactosa o azúcar de la leche,
así como polietilenglicoles de alto peso molecular y similares.
Las formas de dosificación sólida de
comprimidos, grageas, cápsulas, píldoras y gránulos pueden
prepararse con recubrimientos y cubiertas tales como recubrimientos
entéricos y otros recubrimientos bien conocidos en la técnica de la
formulación farmacéutica. Pueden contener opcionalmente agentes
opacificantes y pueden ser también de una composición que libere
el(los) ingrediente(s) activo(s) sólo, o
preferentemente, en una cierta parte del tracto intestinal,
opcionalmente de manera retardada. Los ejemplos de composiciones de
embebido que pueden usarse incluyen sustancias poliméricas y
ceras.
Los compuestos activos pueden estar también en
forma microencapsulada, si es apropiado, con uno o más de los
excipientes anteriormente mencionados.
Las formas de dosificación líquidas para
administración oral incluyen emulsiones, disoluciones, suspensiones,
jarabes y elixires farmacéuticamente aceptables. Además de los
compuestos activos, las formas de dosificación líquida pueden
contener diluyentes inertes usados normalmente en la técnica tales
como, por ejemplo, agua u otros disolventes, agentes solubilizantes
y emulsionantes tales como alcohol etílico, alcohol isopropílico,
carbonato de etilo, acetato de etilo, alcohol bencílico, benzoato de
bencilo, propilenglicol, 1,3-butilenglicol,
dimetilformamida, aceites (en particular, aceites de semilla de
algodón, nuez, germen de maíz, oliva, ricino y sésamo), glicerol,
alcohol tetrahidrofurfurílico, polietilenglicoles y ésteres de ácido
graso de sorbitán y mezclas de los mismos.
Además de diluyentes inertes, las composiciones
orales pueden incluir también coadyuvantes tales como agentes
humectantes, agentes emulsionantes y de suspensión, edulcorantes,
aromatizantes y perfumantes.
Las suspensiones, además de los compuestos
activos, pueden contener agentes de suspensión tales como, por
ejemplo, alcoholes isoestearílicos etoxilados, polioxietilensorbitol
y ésteres de sorbitán, celulosa microcristalina, metahidróxido de
aluminio, bentonita, agar agar y tragacanto, y mezclas de los
mismos.
El polipéptido activo puede administrarse
también en forma de liposomas. Como es conocido en la técnica, los
liposomas derivan generalmente de fosfolípidos u otras sustancias
lipídicas. Los liposomas se forman mediante cristales líquidos
mono- o multilamelares hidratados que se dispersan en un medio
acuoso. Puede usarse cualquier lípido no tóxico, fisiológicamente
aceptable y metabolizable capaz de formar liposomas. Las presentes
composiciones en forma de liposoma pueden contener, además del
agente o inhibidor, estabilizadores, conservantes, excipientes y
similares. Los lípidos preferidos son fosfolípidos y colatos de
fosfatidilo (lecitinas), tanto naturales como sintéticos. Los
procedimientos para formar liposomas son conocidos en la técnica.
Véase, por ejemplo, Prescott. Ed., "Methods in Cell Biology",
volumen XIV, Academia Press, Nueva York. N.Y., (1976), pág. 33 y
siguientes.
Es otra aplicación terapéutica de
IL-19 la administración de IL-19 en
inmunoterapia adoptiva para prevenir o reducir la producción de
citocinas que se cree que son responsables de muchos de los efectos
secundarios dañinos actualmente encontrados en inmunoterapia
adoptiva. Como se usa en la presente memoria "inmunoterapia
adoptiva" significa terapia en la que se transfieren a un
paciente células inmunes funcionales que combaten el cáncer. Las
células inmunes que combaten el cáncer comprenden preferiblemente
linfocitos infiltrantes de tumor (TIL) originados en el paciente
mismo. Como se conocido en la técnica, aunque IL-2
es útil en inmunoterapia adoptiva debido a su capacidad de activar
los linfocitos citotóxicos transferidos al paciente (Rosenberg y
col., Ann. Rev. Immunol. 4: 681-709 (1988)),
los graves efectos secundarios causados directa o indirectamente
por IL-2 han sido un obstáculo para el desarrollo de
protocolos de tratamiento rutinarios basados en este enfoque (Hsu,
D-H. y col., documento WO 92/12726). Ya que se cree
que IL-19 es capaz de prevenir o reducir la
producción de citocinas responsables de estos efectos secundarios,
los TIL cultivados en presencia tanto de IL-2 como
de IL-19 antes de la administración, en la que la
administración de IL-2 e IL-19
continúa después de la administración de estos TIL al paciente,
puede reducir los efectos secundarios dañinos típicos de la
inmunoterapia adoptiva.
\vskip1.000000\baselineskip
Otra aplicación terapéutica del polipéptido
IL-19 de la invención es el uso del polipéptido para
identificar antagonistas de IL-19, tales como un
anticuerpo específico de unión a IL-19, que puede
usarse entonces para aumentar la producción de IL-2
en células T cooperadoras. Por ejemplo, los pacientes infectados con
virus de la inmunodeficiencia humana (VIH) tienen un nivel reducido
de producción de IL-2 en células T cooperadoras no
infectadas víricamente. Se cree que IL-19 es capaz
de prevenir o reducir la producción de IL-2. Por lo
tanto, la administración de antagonistas de IL-19
puede dar como resultado un aumento de la producción de
IL-2 en pacientes infectados con VIH. Ya que
IL-2 es responsable de la proliferación de células
T, el mantenimiento de la producción de IL-2 es
beneficioso para pacientes infectados con VIH.
Pueden prepararse antagonistas específicos de
IL-19 mutando la secuencia aminoacídica de
IL-19 usando procedimientos de mutagénesis estándar
bien conocidos por los expertos en la técnica. Dichos procedimientos
incluyen el uso de vectores M13 para introducir mutaciones de sitio
único, para eliminar aminoácidos aleatorios de
IL-19, o para añadir aminoácidos. En las muteínas
resultantes se ensaya entonces en ensayos estándar la capacidad de
competir con IL-19 no mutada, incluyendo ensayos que
ensayan la capacidad de la muteína, en comparación con la proteína
IL-19 de la invención, de potenciar la proliferación
in vitro de células T dependiente de
IL-2.
Otros antagonistas de IL-19
adecuados incluyen un anticuerpo específico de unión a
IL-19 (\alphaIL-19) que
interfiere con su unión al receptor de T cooperadores. La producción
de dichos anticuerpos se ha descrito con detalle anteriormente.
Los anticuerpos usados en el procedimiento de la
invención son preferiblemente autólogos del paciente, minimizando
así problemas inmunitarios adicionales. Sin embargo, ya que los
individuos inmunodeficientes necesitados de dicho tratamiento
tenderán a ser menos reactivos a autoanticuerpos, serán también
útiles no autoanticuerpos derivados de células de la misma
especie.
Habiendo descrito en general la invención, se
entenderá más fácilmente la misma por referencia a los siguientes
ejemplos, que se proporcionan a modo de ilustración y no se
pretenden limitantes.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
1
Se amplificó la secuencia de ADN que codifica la
proteína IL-19 madura en el clon de ADNc depositado
usando cebadores oligonucleotídicos de PCR específicos de las
secuencias aminoterminales de la proteína IL-19 y de
secuencias de vector 3' del gen. Se añadieron nucleótidos
adicionales que contenían sitios de restricción para facilitar la
clonación en las secuencias 5' y 3', respectivamente.
El cebador oligonucleotídico 5' tenía la
secuencia 5' GGC ATG CCA TGG AGT TAC AGT GTG TTT CCC 3' (SEQ
ID NO: 4) (las secuencias específicas de la secuencia nucleotídica
de IL-19 están subrayadas), e incluía un sitio de
restricción NcoI.
El cebador 3' tenía la secuencia 5' GGA AGA TCT
AGC TGA GGA CAT TAC 3' (SEQ ID NO: 5) que contenía los 15
nucleótidos subrayados complementarios de los últimos 15 nucleótidos
inmediatamente después de la secuencia de codificación de la
proteína IL-19 en la Figura 1. El cebador 3' incluía
un sitio de restricción BglII.
\newpage
Los sitios de restricción eran convenientes para
los sitios de enzima de restricción del vector de expresión
bacteriana pQE60, que se usaron para expresión bacteriana en estos
ejemplos (Qiagen, Inc. 9259 Eton Avenue, Chatsworth, CA, 91311).
pQE60 codifica la resistencia al antibiótico ampicilina ("Amp")
y contiene un origen de replicación bacteriano ("ori"), un
promotor inducible por IPTG, un sitio de unión a ribosoma
("RBS"), un marcador 6-His y sitios de enzima
de restricción. Se digirieron tanto el ADN de proteína
IL-19 amplificado como el vector pEQ60 con
NcoI y BglII y se ligaron entonces conjuntamente los
ADN digeridos. La inserción del ADN de proteína
IL-19 en el vector pQE60 restringido dispuso la
región de codificación de la proteína IL-19 cadena
abajo y ligada operativamente al promotor inducible por IPTG del
vector y en fase con un ATG de inicio apropiadamente colocado para
traducción de la proteína IL-19.
Se transformó la mezcla de ligación en células
E. coli competentes usando procedimientos estándar. Se
describen dichos procedimientos en Sambrook y col., "Molecular
Cloning: A Laboratory Manual", 2ª ed., Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989). Se usó la cepa de
E. coli M15/rep4, que contiene múltiples copias del plásmido
pREP4, que expresa el represor lac y confiere resistencia a
kanamicina ("Kan") para llevar a cabo el ejemplo ilustrativo
aquí descrito. Esta cepa, que es sólo una de las muchas que son
adecuadas para expresar la proteína IL-19, está
comercialmente disponible en Qiagen.
Se identificaron los transformantes por su
capacidad de crecer en placas LB en presencia de ampicilina y
kanamicina. Se aisló ADN de plásmido de colonias resistentes y se
confirmó la identidad del ADN clonado mediante análisis de
restricción.
Se cultivaron durante una noche los clones que
contenían las construcciones deseadas ("O/N") en cultivo
líquido en medio LB suplementado tanto con ampicilina (100
\mug/ml) como kanamicina (25 \mug/ml).
Se usó el cultivo O/N para inocular un cultivo
grande, a una dilución de aproximadamente 1:100 a 1:250. Se
cultivaron las células hasta una densidad óptica a 600 nm
("DO_{600}") de entre 0,4 y 0,6. Se añadió entonces
B-D-tiogalactopiranósido de
isopropilo ("IPTG") a una concentración final 0,1 mM para
inducir la transcripción de promotores sensibles al represor
lac, inactivando el represor lacI. Se incubaron
posteriormente las células durante 4 horas adicionales (la Figura 2
muestra la inducción de proteína IL-19, las muestras
retiradas 0, 3, 5, 6 y 24 horas después de la adición de IPTG se
procesaron en un gel de poliacrilamida al 12,5% y se tiñeron con
azul brillante). Se indica la movilidad de la proteína
IL-19 por una flecha. Se recogieron entonces las
células mediante centrifugación y se desestabilizaron mediante
agitación suave durante una noche en HCl de guanidina 6 M en tampón
Na_{3}PO_{4} 50 mM a pH 8,0 a 4ºC. Se centrifugó entonces el
lisado y se pasó por una columna de Sepharose CL-4B
(Pharmacia). Se pasó entonces el caudal por una columna que contenía
agarosa activada con Ni^{2+}-NTA (Qiagen). Se
recogió la proteína IL-19 de la columna en una
fracción constituida por HCl de guanidina 6 M a pH 5,0. Se retiró
el HCl de guanidina de la fracción que contenía
IL-19 mediante diálisis frente a concentraciones
sucesivamente reducidas de guanidina en disolución salina tamponada
con fosfato (PBS) a pH 5,5.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
2
Se amplificó la secuencia de ADNc que codifica
la proteína IL-19 completa en el clon depositado
usando cebadores oligonucleotídicos de PCR correspondientes a las
secuencias 5' y 3' del gen:
El cebador 5' tenía la secuencia 5' GGC GGG
ATC CCG CCA TCA TGA AGT TAC AGT GTG TTT CCC 3' (SEQ ID NO: 6)
que contenía el sitio de enzima de restricción BamHI
subrayado seguido por 29 bases de la secuencia de la proteína
IL-19 de la Figura 1. Insertado en un vector de
expresión, como se describe a continuación, el extremo 5' del
fragmento amplificado que codifica IL-19 proporcionó
un péptido señal eficaz. Una señal de inicio de la traducción
eficaz en células eucariotas, como se describe por Kozak, M., J.
Mol. Biol. 196: 947-950 (1987) está localizada
apropiadamente en la porción de vector del constructo.
El cebador 3' tenía la secuencia 5' CCC AAG CTT
GGT ACC TCA TCA AGC TGA GGA CAT TAC 3' (SEQ ID NO: 7) que
contenía el sitio de restricción Asp718 seguido de
nucleótidos complementarios de los últimos 21 nucleótidos de la
secuencia de codificación de IL-19 expuesta en la
Figura 1.
Se aisló el fragmento amplificado de gel de
agarosa al 1% usando un kit comercialmente disponible
("Geneclean", BIO 101 Inc., La Jolla, Ca.). Se digirió
entonces el fragmento con BamHI y Asp718 y se purificó
de nuevo en un gel de agarosa al 1%. Este fragmento se designa en
la presente memoria F2.
Se usaron el vector y pA2-GP
para expresar la proteína IL-19 en el sistema de
expresión de baculovirus, usando procedimientos estándar como se
describen en Summers y col., "A manual of methods for baculovirus
vectors and insect cell culture procedures", Texas Agricultural
Experimental Station Bulletin nº 1555 (1987). Este vector de
expresión contiene el promotor fuerte de polihedrina del virus de la
polihedrosis nuclear de Autographa californica (AcMNPV)
seguido por sitios de restricción convenientes. El péptido señal de
AcMNPV gp67, que incluye la metionina N-terminal,
está localizado justo cadena arriba de un sitio BamHI. El
sitio de poliadenilación del virus de simio 40 ("SV40") se usa
para una poliadenilación eficaz. Para una selección sencilla del
virus recombinante, se inserta el gen de
beta-galactosidasa de E. coli en la misma
orientación que el promotor de polihedrina y seguido por la señal
de poliadenilación del gen de polihedrina. Las secuencias de
polihedrina están flanqueadas a ambos lados por secuencias víricas
para recombinación homóloga mediada por célula con ADN vírico de
tipo silvestre para generar virus viables que expresen el
polinucleótido clonado. La proteína IL-19 se
expresó también en baculovirus usando el vector
pA2.
pA2.
Podrían usarse muchos otros baculovirus en lugar
de pA2-GP, tales como pAc373, pVL941 y pAcIM1 a
condición de que, como apreciarán fácilmente los expertos, esa
construcción proporcione señales localizadas apropiadamente para
transcripción, traducción, tráfico y similares, tales como un AUG en
fase y un péptido señal, según sean necesarios. Dichos vectores se
describen en Luckow y col., Virology 170:
31-39, entre otros.
Se digirió el plásmido con las enzimas de
restricción BamHI y Asp718 y se desfosforiló entonces
usando fosfatasa intestinal de ternero, usando procedimientos
rutinarios conocidos en la técnica. Se aisló entonces el ADN a
partir de gel de agarosa al 1% usando un kit comercialmente
disponible ("Geneclean" BIO 101 Inc., La Jolla, Ca.). Este
vector de ADN se designa en la presente memoria "V2".
Se ligaron conjuntamente el fragmento F2 y el
plásmido desfosforilado V2 con ADN ligasa T4. Se transformaron
células HB101 de E. coli con mezcla de ligación y se
extendieron en placas de cultivo. Se identificaron bacterias que
contenían el plásmido con el gen IL-19 humano
digiriendo ADN de colonias individuales usando BamHI y
Asp718 y analizando entonces el producto de digestión
mediante electroforesis en gel. Se confirmó la secuencia del
fragmento clonado mediante secuenciación de ADN. Este plásmido se
designa en la presente memoria pBacIL-19.
Se cotransfectaron 5 \mug del plásmido
pBacIL-19 con 1,0 \mug de un ADN de baculovirus
linealizado comercialmente disponible ("ADN de baculovirus
BaculoGold^{TM}"; Pharmingen, San Diego, CA) usando el
procedimiento de lipofección descrito por Felgner y col., Proc.
Natl. Acad. Sci. USA 84: 7413-7417 (1987). Se
mezclaron 1 \mug de ADN vírico BaculoGold^{TM} y 5 \mug del
plásmido pBacCK\beta-15 en un pocillo estéril de
una placa de microvaloración que contenía 50 \mul de medio Grace
exento de suero (Life Technologies Inc., Gaithersburg, MD). Después
de ello, se añadieron 10 \mul de lipofectina más 90 \mul de
medio Grace, se mezclaron y se incubaron durante 15 minutos a
temperatura ambiente. Se añadió entonces gota a gota la mezcla de
transfección a células de insecto Sf9 (ATCC CRL 1711) sembradas en
una placa de cultivo de tejido de 35 mm con 1 ml de medio Grace sin
suero. Se sacudió la placa para mezclar la disolución recién
añadida. Se incubó entonces la placa durante 5 horas a 27ºC.
Después de 5 horas, se retiró la disolución de transfección de la
placa y se añadió 1 ml de medio de insecto Grace suplementado con
suero fetal de ternero al 10%. Se devolvió a un incubador la placa
y se continuó el cultivo a 27ºC durante 4 días.
Después de 4 días, se recogió el sobrenadante y
se efectuó un ensayo en placa, como se describe por Summers y
Smith, citado anteriormente. Se usó un gel de agarosa con "Blue
Gal" (Life Technologies Inc., Gaithersburg) para permitir una
fácil identificación y aislamiento de clones que expresan Gal, que
producen placas teñidas de azul (puede encontrarse también una
descripción detallada de un "ensayo en placa" de este tipo en
la "User's guide for insect cell culture and baculovirology"
distribuida por Life Technologies Inc., Gaithersburg, página
9-10).
4 días después de la dilución en serie, se
añadió el virus a las células. Después de una incubación apropiada,
se recogieron las placas teñidas de azul con la punta de una pipeta
Eppendorf. Se resuspendió entonces el agar que contenía los virus
recombinantes en un tubo Eppendorf que contenía 200 \mul de medio
Grace. Se retiró el agar mediante una breve centrifugación y se usó
el sobrenadante que contenía el baculovirus recombinante para
infectar células Sf9 sembradas en cubetas de 35 mm. 4 días después,
se recogieron los sobrenadantes de estas cubetas de cultivo y se
almacenaron entonces a 4ºC. Se identificó un clon que contenía hESSB
I, II y III apropiadamente insertados mediante análisis de ADN
incluyendo cartografía de restricción y secuenciación. Éste se
designa en la presente memoria
V-IL-19.
Se cultivaron células Sf9 en medio Grace
suplementado con FBS inactivado térmicamente al 10%. Se infectaron
las células con el baculovirus recombinante
V-IL-19 a una multiplicidad de
infección ("MOI") de aproximadamente 2 (aproximadamente 1 a
aproximadamente 3). 6 horas después, se retiró el medio y se
reemplazó por medio SF900 II menos metionina y cisteína (disponible
en Life Technologies Inc., Gaithersburg). 42 horas después, se
añadieron 5 \muCi de ^{35}S-metionina y 5
\muCi de ^{35}S-cisteína (disponible en
Amersham). Se incubaron además las células durante 16 horas y se
recogieron entonces mediante centrifugación, se lisaron y se
visualizaron las proteínas marcadas mediante
PAGE-SDS y autorradiografía.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
3
Se prepararon proteínas IL-19
recombinantes usando el sistema de extracto de germen de trigo
acoplado TNT (Promega, Madison, WI).
Se combinaron 25 \mul de extracto de germen de
trigo TNT, 10 U de ARN polimerasa T3, mezcla de aminoácidos 1 mM
(exenta de metionina), 4 \muCi de
^{35}S-metionina (1000 Ci/mmol), 40 U de RNasin®
(Promega, Madison, WI) y 1 \mug de ADN molde en un volumen final
de 50 \mul y se incubaron a 30ºC durante 2 h. Las reacciones de
transcripción/traducción acopladas incluían los siguientes ADN
molde: (1) sin ADN, (2) pBluescript, (3) los nucleótidos
44-577 (correspondientes a los aminoácidos
1-177) de la secuencia de IL-19
mostrada en la Figura 1 clonada en pBluescript, (4) los nucleótidos
116-577 (correspondientes a los aminoácidos
25-177 mostrados en la Figura 1 de la secuencia de
codificación de IL-19 clonada en pBluescript, (5) un
producto de PCR purificado en gel derivado del molde descrito en
(3) y amplificado usando cebadores de codificación e inversos M13 en
una reacción PCR estándar. Se calentaron las mezclas a 95ºC durante
10 minutos y se cargó entonces una alícuota de 5 \mul de cada
muestra en un gel de poliacriamida al 15%. Se procesó el gel a 100
voltios durante aproximadamente 2 horas. Se secó entonces el gel y
se expuso a película de rayos X durante 3 días a temperatura
ambiente. Se indica la movilidad de las proteínas
IL-19 completa y truncada (sin secuencia señal) en
la Figura 3. Un marcador de masa molecular aparente (M) muestra las
movilidades relativas de proteínas de 14,3, 21,5, 30, 46, 97,4 y
220 kDa.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
4
La mayoría de los vectores usados para la
expresión transitoria de la secuencia génica de la proteína
IL-19 en células de mamífero deben portar el origen
de replicación de SV40. Éste permite la replicación del vector con
alto número de copias en células (por ejemplo células COS) que
expresan el antígeno T necesario para el inicio de la síntesis de
ADN vírico. Puede utilizarse también cualquier otra línea celular de
mamífero con este fin.
Un vector de expresión de mamífero típico
contiene el elemento promotor, que media el inicio de la
transcripción de ARNm, la secuencia de codificación de proteína y
las señales necesarias para la terminación de la transcripción y la
poliadenilación del transcripto. Elementos adicionales incluyen
potenciadores, secuencias Kozak y secuencias intermedias
flanqueadas por sitios donantes y aceptores para corte y empalme de
ARN. Puede conseguirse una transcripción altamente eficaz con los
promotores temprano y tardío de SV40, las repeticiones terminales
largas (LTR) de retrovirus, por ejemplo, RSV, HTLVI, HIVI y el
promotor temprano de citomegalovirus (CMV). Sin embargo, pueden
usarse también señales celulares (por ejemplo, promotor de actina
humana). Los vectores de expresión adecuados para uso en la
práctica de la presente invención incluyen, por ejemplo, vectores
tales como pSVL y pMSG (Pharmacia, Uppsala, Suecia), pRSVcat (ATCC
37512), pSV2dhfr (ATCC 37416) y pBC12MI (ATCC 67109). Las células
hospedadoras de mamífero que podrían usarse incluyen células humanas
Hela, 283, H9 y Jurkat, células de ratón NIH3T3 y C127, células de
mono verde africano Cos 1, Cos 7 y CV1, células de codorniz
QC1-3, células L de ratón y células de ovario de
hámster chino.
Como alternativa, el gen puede expresarse en
líneas celulares estables que contienen el gen integrado en un
cromosoma. La cotransfección con un marcador selectivo tal como
dhfr, gpt, neomicina o higromicina permite la identificación y el
aislamiento de las células transfectadas.
El gen transfectado puede amplificarse también
para expresar grandes cantidades de la proteína codificada. La DHFR
(dihidrofolato reductasa) es un marcador útil para desarrollar
líneas celulares que portan varios cientos o incluso varios miles
de copias del gen de interés. Otro marcador de selección útil es la
enzima glutamina sintasa (GS) (Murphy y col., Biochem. J.
227: 277-279 (1991); Bebbington y col.,
Bio/Technology 10: 169-175 (1992)). Usando
estos marcadores, se cultivan las células de mamífero en medio
selectivo y se seleccionan las células con la mayor resistencia.
Estas líneas celulares contienen el(los) gen(es)
amplificado(s) integrado(s) en un cromosoma. Las
células de ovario de hámster chino (CHO) se usan a menudo para la
producción de proteínas.
Los vectores de expresión pC1 y pC4 contienen el
promotor fuerte (LTR) del virus del sarcoma de Rous (Cullen y col.,
"Molecular and Cellular Biology", 438-4470
(marzo de 1985)) más un fragmento del potenciador CMV (Boshart y
col., Cell 41: 521-530 (1985)). Múltiples
sitios de clonación, por ejemplo con los sitios de escisión por
enzima de restricción BamHI, XbaI y Asp718,
facilitan la clonación del gen de interés. Los vectores contienen
además del intrón 3' la señal de poliadenilación y terminación del
gen de preproinsulina de rata.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
4(a)
Se prepara el plásmido de expresión
pIL-19 HA clonando un ADNc que codifica
IL-19 en el vector de expresión pcDNA4 (que puede
obtenerse en Invitrogen, Inc.).
El vector de expresión pcDNA4 contiene: (1) un
origen de replicación de E. coli eficaz para propagación en
E. coli y otras células procariotas; (2) un gen de
resistencia a ampicilina para la selección de células procariotas
que contienen plásmido; (3) un origen de replicación de SV40 para
propagación en células eucariotas; (4) un promotor CMV, un sitio de
policlonaje, un intrón SV40 y una señal de poliadenilación
dispuestos de tal modo que un ADNc pueda colocarse convenientemente
bajo el control de expresión del promotor CMV y ligado
operativamente con el intrón SV40 y la señal de poliadenilación
mediante sitios de restricción en el sitio de policlonaje.
Se clona un fragmento de ADN que codifica la
proteína IL-19 y un marcador HA fusionado en fase
con su extremo 3' en la región del sitio de policlonaje del vector
de modo que la expresión de proteína recombinante esté dirigida por
el promotor CMV. El marcador HA corresponde a un epítopo derivado de
la proteína hemaglutinina de la gripe descrito por Wilson y col.,
Cell 37: 767 (1984). La fusión del marcador HA con la
proteína diana permite una fácil detección de la proteína
recombinante con un anticuerpo que reconoce el epítopo HA.
La estrategia de construcción de plásmido es la
siguiente. Se amplifica el ADNc de IL-19 del clon
depositado usando cebadores que contienen sitios de restricción
convenientes, como se describe anteriormente respecto a la
construcción de vectores de expresión para la expresión de
IL-19 en E. coli. Para facilitar la
detección, purificación y caracterización de la
IL-19 expresada, uno de los cebadores contiene un
marcador de hemaglutinina ("marcador HA") como se describe
anteriormente.
Los cebadores adecuados incluyen los siguientes,
que se usan en este ejemplo. El cebador 5', que contiene el sitio
BamHI subrayado, un codón de inicio AUG y 22 pb de la región
de codificación 5', tiene la siguiente secuencia:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
El cebador 3', que contiene el sitio
Asp718 subrayado, un codón de paro, formándose 10 codones
después de ello el marcador de hemaglutinina HA, y 25 pb de
secuencia de codificación 3' (en el extremo 3'), tiene la siguiente
secuencia:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
Se digieren el fragmento de ADN amplificado por
PCR y el vector pcDNAI/Amp con HindIII y XhoI y
después se ligan. Se transforma la mezcla de ligación en la cepa
SURE de E. coli (disponible en Stratagene Cloning Systems,
11099 North Torrey Pines Road, La Jolla, CA 92037), y se siembra el
cultivo transformado sobre placas con medio ampicilina que se
incuban después, permitiendo el crecimiento de colonias resistentes
a la ampicilina. Se aísla el ADN de plásmido de colonias
resistentes y se examina mediante análisis de restricción y
calibración en gel la presencia del fragmento que codifica
IL-19.
Para la expresión de IL-19
recombinante, se transfectan células COS con un vector de expresión
como se describe anteriormente, usando
DEAE-dextrano como se describe, por ejemplo, en
Sambrook y col., "Molecular cloning: a laboratory manual",
Cold Spring Laboratory Press, Cold Spring Harbor, Nueva York (1989).
Se incuban las células en condiciones para la expresión de
IL-19 por el vector.
Se detecta la expresión de la proteína de fusión
IL-19/HA mediante radiomarcaje e
inmunoprecipitación, usando procedimientos descritos, por ejemplo,
en Harlow y col., "Antibodies: a laboratory manual", 2ª ed.,
Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, Nueva York
(1988). Con este fin, dos días después de la transfección se marcan
las células mediante incubación en medio que contiene
^{35}S-cisteína durante 8 horas. Se recogen las
células y el medio y se lavan las células y el lisado con tampón
RIPA que contiene detergente: NaCl 150 mM, 1% de
NP-40, 0,1 de SDS, 1% de NP-40, 0,5%
de DOC, Tris 50 mM, pH 7,5, como se describe por Wilson y col.,
citado anteriormente. Se precipitan las proteínas del lisado celular
y del medio de cultivo usando un anticuerpo monoclonal específico
de HA. Se analizan entonces las proteínas precipitadas mediante
geles SDS_PAGE y autorradiografía. Se observa una producción de
expresión del tamaño esperado en el lisado celular que no se observa
en controles
negativos.
negativos.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
4(b)
Se usa el vector pC4 para la expresión de
proteína IL-19. El plásmido pC4 es un derivado del
plásmido pSV2-dhfr (nº de acceso ATTC 37146). Ambos
plásmidos contienen el gen DHFR de ratón bajo el control del
promotor temprano de SV40. Las células de ovario de hámster chino u
otras que carecen de actividad dihidrofolato que se transfectan con
estos plásmidos pueden seleccionarse cultivando las células en un
medio selectivo (MEM alfa menos, Life Technologies) suplementado
con el agente quimioterapéutico metotrexato. La amplificación de
genes DHFR en células resistentes a metotrexato (MTX) ha sido bien
documentada (véanse, por ejemplo, Alt, F.W., Kellems, R.M.,
Bertino, J.R. y Schimke, R.T., 1978, J. Biol. Chem. 253:
1357-1370, Hamlin, J.L. y Ma, C. 1990, Biochem.
et Biophys. Acta, 1097: 107-143, Page, M.J. y
Sydenham, M.A., 1991, Biotechnology vol. 9:
64-68). Las células cultivadas en concentraciones
crecientes de MTX desarrollan resistencia al medicamento mediante
sobreproducción de la enzima diana, DHFR, como resultado de la
amplificación del gen DHFR. Si está ligado un segundo gen al gen
DHFR, habitualmente se coamplifica y se sobreexpresa. Es estado de
la técnica desarrollar líneas celulares que portan más de 1.000
copias de los genes. Posteriormente, cuando se extrae el
metotrexato, las líneas celulares que contienen el gen amplificado
se integran en el(los) cromosoma(s).
El plásmido pC4 contiene para la expresión del
gen de interés un promotor fuerte de la repetición terminal larga
(LTR) del virus del sarcoma de Rous (Cullen y col., "Molecular and
cellular biology", marzo de 1985; 438-4470) más
un fragmento aislado del potenciador del gen temprano inmediato de
citomegalovirus humano (CMV) (Boshart y col., Cell 41:
521-530, 1985). Cadena abajo del promotor están los
siguientes sitios de escisión por enzima de restricción
individuales que permiten la integración de los genes: BamHI,
PvuII y NruI. Detrás de estos sitios de clonación, el
plásmido contiene codones de paro de traducción en los tres marcos
de lectura seguidos del intrón 3' y el sitio de poliadenilación del
gen de preproinsulina de rata. Pueden usarse también otros
promotores de alta eficacia para la expresión, por ejemplo, el
promotor de \beta-actina humana, los promotores
temprano o tardío de SV40 o las repeticiones terminales largas de
otros retrovirus, por ejemplo, VIH y HTLVI. Para la poliadenilación
del ARNm, pueden usarse también otras señales, por ejemplo, de
genes de hormona de crecimiento humana o globina.
Las líneas celulares estables que portan un gen
de interés integrado en los cromosomas pueden seleccionarse tras
cotransfección con un marcador selectivo tal como gpt, G418 o
higromicina. Es ventajoso usar más de un marcador selectivo al
inicio, por ejemplo, G418 más metotrexato.
Se digiere el plásmido pC4 con la enzima de
restricción BamHI y se desfosforila entonces usando fosfatasa
intestinal de ternero mediante procedimientos conocidos en la
técnica. Se aísla entonces el vector a partir de un gel de agarosa
al 1%.
Se amplifica la secuencia de ADN que codifica la
proteína IL-19 usando cebadores oligonucleotídicos
de PCR específicos de la secuencia aminoterminal de la proteína
IL-19 y de la secuencia 3' carboxiterminal del gen.
Se añaden a las secuencias 5' y 3', respectivamente, nucleótidos
adicionales que contienen sitios de restricción para facilitar la
clonación.
El cebador 5' tiene la secuencia 5' GGC GGG
ATC CCG CCA TCA TGA AGT TAC AGT GTG TTT CCC 3' (SEQ ID NO: 10),
que contiene el sitio de enzima de restricción BamHI
subrayado seguido de secuencia de Kozak y 23 bases de la secuencia
de IL-19 en la Fig. 1. El cebador 3' tiene la
secuencia 5' CCC AAG CTT GGT ACC TCA TCA AGC TGA GGA CAT TAC
3' (SEQ ID NO: 11), que contiene el sitio de restricción
Asp718 subrayado seguido de nucleótidos complementarios de
15 pb de la secuencia nucleotídica que precede al codón de paro en
la Fig. 1. Los sitios de restricción son convenientes para sitios
de enzima de restricción en el vector de expresión pC4 en
CHO.
CHO.
Se aíslan los fragmentos amplificados a partir
de un gel de agarosa al 1% como se describe anteriormente y se
digieren entonces con las endonucleasas BamHI y
Asp718, y se purifican entonces de nuevo en gel de agarosa
al
1%.
1%.
Se ligan entonces el fragmento aislado y el
vector desfosforilado con ADN ligasa T4. Se transforman entonces
células HB101 de E. coli y se identifican las bacterias que
contenían el plásmido pC4 insertado en la orientación correcta
usando la enzima de restricción BamHI. Se confirma la
secuencia del gen insertado mediante secuenciación de ADN.
Se usan células de ovario de hámster chino que
carecen de una enzima DHFR activa para transfección. Se
cotransfectan 5 \mug del plásmido de expresión pC4 con 0,5 \mug
del plásmido pSVneo usando el procedimiento de lipofección (Felgner
y col., supra). El plásmido pSV2-neo contiene
un marcador selectivo dominante, el gen neo de Tn5 que codifica una
enzima que confiere resistencia a un grupo de antibióticos que
incluye G418. Se siembran las células en MEM alfa menos
suplementado con G418 1 mg/ml. Después de 2 días, se tripsinizan las
células y se siembran en placas de clonación de hibridoma (Greiner,
Alemania) y se cultivan durante 10-14 días. Después
de este periodo, se tripsinizan los clones individuales y se
siembran entonces en cubetas Petri de 6 pocillos usando diferentes
concentraciones de metotrexato (25 nM, 50 nM, 100 nM, 200 nM, 400
nM). Se transfieren entonces los clones que crecen a las mayores
concentraciones de metotrexato a nuevas placas de 6 pocillos que
contienen concentraciones aún mayores de metotrexato (500 nM, 1
\muM, 2 \muM, 5 \muM). Se repite el mismo procedimiento hasta
que los clones crecen a una concentración 100 \muM.
Se analiza la expresión del producto génico
deseado mediante análisis de transferencia Western y SDS_PAGE.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
5
Se llevó a cabo un análisis de transferencia
Northern para examinar los niveles de expresión de proteína
IL-19 en tejidos humanos, usando procedimientos
descritos por, entre otros, Sambrook y col., citado
anteriormente.
Se cultivaron las líneas celulares
HL-60, THP-1 y U937 y monocitos
humanos primarios aislados mediante adherencia de una población de
leucocitos mixtos durante 12 horas en presencia (+) o ausencia (-)
de lipopolisacárido bacteriano (LPS). Se preparó el ARN total de
los cultivos con reactivo TRIzol (Life Technologies, Gaithersburg,
MD) esencialmente como se describe por el fabricante. Se secó
completamente el ARN total (10 \mug), se resuspendió en un tampón
de carga de formamida/formaldehído y se resolvió mediante
electroforesis a través de un gel de agarosa al 1% que contiene
formaldehído 2,2 M. Se transfirió el gel durante una noche en 20 x
SSC a una membrana de nailon (Boehringer Mannheim, Indianápolis,
IN). Se preparó ADN de sonda mediante PCR, amplificando el inserto
de IL-19 entero mostrado en la Figura 1 usando
cebadores de codificación e inversos M13. Se marcó ADN de sonda (25
ng) con ^{32}P usando el kit de marcaje RediPrime Random Primer
(Amersham Life Science) con una actividad específica de más de
10^{6} cpm/mg. Se hibridó la transferencia con sonda
desnaturalizada en 10 ml de disolución de hibridación de hibrizol
durante una noche a 42ºC. Se lavó entonces la transferencia en
aproximadamente 100 ml de 0,2 x SSC/0,1% de SDA a 25ºC durante 20
minutos, y después dos veces en aproximadamente 100 ml de 0,2 x
SSC/0,1% de SDS a 65ºC durante 15 min. Se expuso entonces la
transferencia a película de rayos X durante 5 días, y se muestra en
la Figura 4. La flecha muestra la migración del ARN específico de
IL-19. Un marcador de ARN muestra las movilidades
relativas de ARN de 0,24, 1,35, 2,37, 4,40, 7,46 y 9,49 kb.
Resultará evidente que la invención puede
practicarse de otro modo que como se describe particularmente en la
descripción y los ejemplos anteriores.
Son posibles numerosas modificaciones y
variaciones de la presente invención a la vista de las enseñanzas
anteriores y, por lo tanto, están dentro del alcance de las
reivindicaciones adjuntas.
(1) INFORMACIÓN GENERAL
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- SOLICITANTE: Human Genome Science, Inc.
\hskip3,9cm9410 Key West Avenue
\hskip3,9cmRockville, MD 20850
\hskip3,9cmEstados Unidos de América
\vskip0.800000\baselineskip
- SOLICITANTES/INVENTORES: Rosen, Craig, A.
\hskip6,4cmKenny, Joseph J.
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TÍTULO DE LA INVENCIÓN: INTERLEUCINA 19
\vskip0.800000\baselineskip
- (iii)
- NÚMERO DE SECUENCIAS: 11
\vskip0.800000\baselineskip
- (iv)
- DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- DESTINATARIO: Sterne, Kessler, Goldstein & Fox, P.L.L.C
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- CALLE: 1100 New York Avenue, Suite 600
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CIUDAD: Washington
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- ESTADO: DC
\vskip0.500000\baselineskip
- (E)
- PAÍS: EE.UU.
\vskip0.500000\baselineskip
- (F)
- CÓDIGO POSTAL: 20005-3934
\vskip0.800000\baselineskip
- (v)
- FORMA DE LECTURA INFORMÁTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TIPO DE MEDIO: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- ORDENADOR: compatible con PC de IBM
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- SOFTWARE: PatentIn Release nº 1.0, versión 1.30
\vskip0.800000\baselineskip
- (vi)
- DATOS DE LA SOLICITUD ACTUAL:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NÚMERO DE SOLICITUD: por asignar
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- FECHA DE PRESENTACIÓN: 30 de agosto de 1996
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
- (viii)
- INFORMACIÓN DE REPRESENTANTE/AGENTE
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE: Goldstein, Jorge A.
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- NÚMERO DE REGISTRO: 29.021
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- NÚMERO DE REFERENCIA/EXPEDIENTE: 1488.041PC00
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- TELÉFONO: 202-371-2600
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TELEFAX: 202-371-2540
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 1:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 966 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 44...574
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: sig_peptide
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 44...115
\vskip0.800000\baselineskip
- (ix)
- CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- NOMBRE/CLAVE: mat_peptide
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- LOCALIZACIÓN: 116...574
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 177 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipACCTGAGGTC TGATGGCAAA GTCCAAGAAT
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGCATGCCAT GGAGTTACAG TGTGTTTCCC
\hfill30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 24 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGAAGATCTA GCTGAGGACA TTAC
\hfill24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 39 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGCGGGATCC CGCCATCATG AAGTTACAGT GTGTTTCCC
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\newpage
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCAAGCTTG GTACCTCATC AAGCTGAGGA CATTAC
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGCGGGATCC CGCCATGAAG TTACAGTGTG TTTCCC
\hfill36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 75 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 39 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipGGCGGGATCC CGCCATCATG AAGTTACAGT GTGTTTCCC
\hfill39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
- (i)
- CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
- (A)
- LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
- (B)
- TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
- (C)
- TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
- (D)
- TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
- (ii)
- TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
- (xi)
- DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipCCCAAGCTTG GTACCTCATC AAGCTGAGGA CATTAC
\hfill36
Claims (31)
1. Un polinucleótido seleccionado del grupo
constituido por:
(a) un polinucleótido que codifica los restos 1
a 153 de la SEQ ID NO: 2;
(b) un polinucleótido que codifica los restos
-24 a 153 de la SEQ ID NO: 2;
(c) un polinucleótido que tiene la secuencia de
nucleótidos 116 a 574 de la SEQ ID NO: 1;
(d) un polinucleótido que tiene la secuencia de
nucleótidos 44 a 574 de la SEQ ID NO: 1;
(e) un polinucleótido que codifica la forma
madura del polipéptido codificado por el ADNc contenido en la ATCC
97662;
(f) un polinucleótido que codifica el
polipéptido completo codificado por el ADNc contenido en la
ATCC
97662;
97662;
(g) un polinucleótido que tiene la secuencia de
codificación del ADNc contenido en la ATCC 97662 que codifica la
forma madura del polipéptido;
(h) un polinucleótido que tiene la secuencia de
codificación del ADNc contenido en la ATCC 97662 que codifica el
polipéptido completo;
(i) un polinucleótido que codifica una porción
portadora de epítopo inmunogénico de un polipéptido codificado por
un polinucleótido de uno cualquiera de (a) a (h), en el que dicho
epítopo inmunogénico es una porción del polipéptido que desencadena
una respuesta de anticuerpo cuando el polipéptido completo es el
inmunógeno;
(j) un polinucleótido que codifica una porción
portadora de epítopo de un polipéptido IL-19 que
comprende los restos aminoacídicos VDNHGLRRC o
RVFKDHQEPNPKILRKISS;
(k) un polinucleótido idéntico en al menos un
90% al polinucleótido como se define en una cualquiera de (a) a (h)
y que codifica un polipéptido que tiene actividad
IL-19, en el que dicha actividad es la propiedad de
modular la síntesis de al menos una citocina del grupo constituido
por IFN-\gamma, linfotoxina, IL-2,
IL-3 y GM-CSF en una población de
células T cooperadoras inducida a sintetizar una o más de estas
citocinas mediante exposición a células presentadoras de antígeno
singénicas (APC) y antígeno; y
(l) un polinucleótido idéntico en al menos un
90% al polinucleótido como se define en una cualquiera de (a) a
(h), en el que la cadena complementaria de dicho polinucleótido
hibrida en condiciones de hibridación rigurosas con el
polinucleótido de uno cualquiera de (a) a (h);
o la cadena complementaria de dicho
polinucleótido.
2. El polinucleótido de la reivindicación 1, que
es ADN o ARN.
3. El polinucleótido de la reivindicación 2, que
es ADN genómico.
4. El polinucleótido de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, fusionado con un polinucleótido
heterólogo.
5. El polinucleótido de la reivindicación 4, en
el que el polinucleótido heterólogo codifica un polipéptido
heterólogo.
6. El polinucleótido de la reivindicación 5, en
el que el polipéptido heterólogo está fusionado con un polipéptido
codificado por el polinucleótido de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3.
7. Un procedimiento de preparación de un vector
recombinante que comprende insertar un polinucleótido de una
cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 en un vector.
8. Un vector que contiene el polinucleótido de
una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 o producido mediante
el procedimiento de la reivindicación 7.
9. El vector de la reivindicación 8, en el que
el polinucleótido está unido operativamente a secuencias de control
de la expresión, permitiendo la expresión en células hospedadoras
procariotas o eucariotas.
10. Un procedimiento de preparación de una
célula hospedadora recombinante que comprende introducir el vector
de la reivindicación 8 ó 9 en una célula hospedadora.
11. Una célula hospedadora modificada por
ingeniería genética con el polinucleótido de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 6 o el vector de la reivindicación 8 ó 9 o
producida mediante el procedimiento de la reivindicación 10.
12. La célula hospedadora de la reivindicación
11, en la que dicha célula hospedadora es una célula procariota,
célula eucariota, célula animal, célula de mamífero, célula de
insecto, célula de planta, célula fúngica, célula COS, célula CHO o
célula de E. coli.
13. Un procedimiento para producir un
polipéptido que tiene actividad IL-19, en el que
dicha actividad es la propiedad de modular la síntesis de al menos
una citocina del grupo constituido por IFN-\gamma,
linfotoxina, IL-2, IL-3 y
GM-CSF en una población de células T cooperadoras
inducida a sintetizar una o más de estas citocinas mediante
exposición a células presentadoras de antígeno singénicas (APC) y
antígeno, que comprende: cultivar la célula hospedadora de la
reivindicación 11 ó 12 en condiciones tales que se exprese dicho
polipéptido y se recupere el polipéptido codificado por dicho
polinucleótido del cultivo.
14. Un polipéptido que tiene la secuencia
aminoacídica codificada por el polinucleótido de una cualquiera de
las reivindicaciones 1 a 6 u obtenible mediante el procedimiento de
la reivindicación 13.
15. Un polipéptido seleccionado del grupo
constituido por:
(a) un polipéptido que tiene una secuencia
aminoacídica al menos un 80% idéntica a los restos aminoacídicos
-24 a 153 de la SEQ ID NO: 2, en el que dicho polipéptido tiene
actividad IL-19;
(b) un polipéptido que tiene una secuencia
aminoacídica al menos un 80% idéntica a los restos aminoacídicos 1
a 153 de la SEQ ID NO: 2, en el que dicho polipéptido tiene
actividad IL-19;
(c) un polipéptido que tiene una secuencia
aminoacídica al menos un 80% idéntica al polipéptido completo
codificado por el ADNc contenido en la ATCC 97662, en el que dicho
polipéptido tiene actividad IL-19;
(d) un polipéptido que tiene una secuencia
aminoacídica al menos un 80% idéntica a la forma madura del
polipéptido codificado por el ADNc contenido en la ATCC 97662, en
el que dicho polipéptido tiene actividad IL-19;
(e) un polipéptido constituido por al menos 30
aminoácidos contiguos de los restos aminoacídicos -24 a 153 del SEQ
ID NO: 2, en el que dicho polipéptido tiene actividad
IL-19;
(f) un polipéptido constituido por al menos 50
aminoácidos de los restos aminoacídicos -24 a 153 del SEQ ID NO: 2,
en el que dicho polipéptido tiene actividad
IL-19;
(g) un polipéptido constituido por al menos 30
aminoácidos del polipéptido completo codificado por el ADNc
contenido en la ATCC 97662, en el que dicho polipéptido tiene
actividad IL-19; y
(h) un polipéptido constituido por al menos 50
aminoácidos del polipéptido completo codificado por el ADNc
contenido en la ATCC 97662, en el que dicho polipéptido tiene
actividad IL-19, en el que dicha actividad
IL-19 de uno cualquiera de (a) a (h) es la
propiedad de modular la síntesis de al menos una citocina del grupo
constituido por IFN-\gamma, linfotoxina,
IL-2, IL-3 y GM-CSF
en una población de células T cooperadoras inducida a sintetizar
una o más de estas citocinas mediante exposición a células
presentadoras de antígeno singénico (APC) y antígeno.
16. El polipéptido de la reivindicación 14 ó 15,
en el que dicho polipéptido está radiomarcado o glucosilado.
17. El polipéptido de una cualquiera de las
reivindicaciones 13 a 15, en el que dicho polipéptido está fusionado
a un polipéptido heterólogo.
18. El polipéptido de una cualquiera de las
reivindicaciones 14 a 17, en el que dicho polipéptido carece de una
metionina N-terminal.
19. Un anticuerpo que se une específicamente al
polipéptido de una cualquiera de las reivindicaciones 14 a 16.
20. El anticuerpo de la reivindicación 19, en el
que dicho anticuerpo es policlonal o monoclonal.
21. Una molécula de ácido nucleico que comprende
un polinucleótido que hibrida en condiciones de hibridación
rigurosas con un polinucleótido de una cualquiera de las
reivindicaciones 1 a 3, en donde la cadena complementaria de dicho
polinucleótido que hibrida, es al menos un 90% idéntica a un
polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3.
22. Un antagonista del polipéptido de la
reivindicación 14 ó 15, en el que dicho antagonista es el anticuerpo
de la reivindicación 19 ó 20.
\newpage
23. Una composición farmacéutica que comprende
el polipéptido de una cualquiera de las reivindicaciones 14 a 18,
el anticuerpo de la reivindicación 19 ó 20 o el antagonista de la
reivindicación 22, y opcionalmente un vehículo farmacéuticamente
aceptable.
24. Una composición de diagnóstico que comprende
el polinucleótido de una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 o
el anticuerpo de la reivindicación 19 ó 20.
25. Uso del polipéptido de una cualquiera de las
reivindicaciones 14 a 18 para la preparación de una composición
farmacéutica para el tratamiento de un individuo necesitado de
niveles reducidos de IFN-\gamma,
TNF-\alpha y/o IL-6, de artritis
reumatoide, lupus sistémico eritematoso (SLE), miastenia grave,
diabetes mellitus insulinodependiente, tiroiditis, infecciones
parasitarias o para "inmunoterapia adoptiva" de cáncer.
26. Uso del antagonista de la reivindicación 22
o el anticuerpo de la reivindicación 19 ó 20 para la preparación de
una composición farmacéutica para aumentar la producción de
IL-2.
27. Uso del polipéptido de una cualquiera de las
reivindicaciones 14 a 18 en la preparación de un medicamento.
28. Uso del anticuerpo de una cualquiera de las
reivindicaciones 19 ó 20 en la preparación de un medicamento.
29. Uso del antagonista de la reivindicación 22
en la preparación de un medicamento.
30. Una composición farmacéutica para el
tratamiento de un individuo necesitado de niveles reducidos de
IFN-\gamma, TNF-\alpha y/o
IL-6, de artritis reumatoide, lupus sistémico
eritematoso (SLE), miastenia grave, diabetes mellitus
insulinodependiente, tiroiditis, infecciones parasitarias o para
"inmunoterapia adoptiva" de cáncer, que comprende el
polipéptido de una cualquiera de las reivindicaciones 14 a 18.
31. Una composición farmacéutica para aumentar
la producción de IL-2, que comprende el antagonista
de la reivindicación 22 o el anticuerpo de las reivindicaciones 19
ó 20.
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