ES2329875T3 - Procedimiento de preparacion de un polipeptido il-18 fisiologicamente activo. - Google Patents

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Robert B. Kirkpatrick
Allan R. Shatzman
Yen Sen Ho
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Abstract

Un procedimiento de producción de un polipéptido IL-18 humano activo a partir de un polipéptido precursor de IL-18 humana, que comprende: (i) Co-expresar bicistrónicamente la caspasa 4 o la caspasa 5 con el polipéptido precursor de IL-18 humana usando un vector de expresión bicistrónica que comprende una secuencia que codifica el precursor de IL- 18 humana seguido de una secuencia que codifica la caspasa 4 o la caspasa 5 separado por una región intergénica que incluye una secuencia Shine-Delgarno; y (ii) Purificar el polipéptido activo.

Description

Procedimiento de preparación de un polipéptido IL-18 fisiológicamente activo.
Antecedentes de la invención
La presente invención se refiere a un procedimiento para producir un polipéptido fisiológicamente activo y, más particularmente, a un procedimiento para producir IL-18 humana activa.
IL-18, también conocida como factor que induce interferón-\gamma, es una nueva citoquina recientemente descubierta. IL-18 activa contiene 157 restos de aminoácidos. Está dotada de potentes actividades biológicas, entre ellas la inducción de la producción de interferón-\gamma por células T y esplenocitos, la intensificación de la actividad asesina de las células NK y la promoción de la diferenciación de células T CD4+ vírgenes en células Th1. Además, IL-18 humana aumenta la producción de GM-CSF y disminuye la producción de IL-10. También se ha observado que la IL-18 tiene mayor poder para inducir interferón-\gamma que IL-12 y genera la señal a través de un receptor diferente y utiliza una ruta característica para la transducción de la señal.
IL-18, la secuencia nucleotídica codificante de la misma, y ciertas propiedades químicas y fisicoquímicas de la proteína purificada son conocidas (Ushio, S., et al., 1996, J. Immunology, 156, 4274-4279; Dinarello, C.A., et al. 1998, J. Leukocyte Biology, 1998. 63, 658-664).
En el documento de EE.UU. 5.192.324, Kabushiki Kaisha Hayashibara Seibutsu Kayaku Kenkyujo ("Hayashibara"), que corresponde a la EP 0692536, publicado el 17 de Enero de 1996, se divulga una proteína de ratón que induce la producción de IFN-gamma por células inmunocompetentes, caracterizándose además la proteína por tener propiedades fisicoquímicas y una secuencia de aminoácidos parcialmente definida. También se divulga una proteína que tiene una secuencia de 157 aminoácidos, dos fragmentos de la misma, ADN (471 pb (pares de bases)) codificante de la proteína, hibridomas, métodos de purificación de la proteína y métodos para detectar la proteína.
El documento de EE.UU. 6.214.584, de Hayashibara, que corresponde al EP 0712931, publicada el 22 de Mayo de 1996, divulga una proteína humana de 157 aminoácidos y homólogos de la misma, ADN que codifica la proteína, transformantes, procedimientos para preparar la proteína, anticuerpos monoclonales contra la proteína, hibridomas, métodos de purificación de la proteína, métodos para detectar la proteína y métodos de tratamiento y/o prevención de tumores malignos, enfermedades víricas, enfermedades infecciosas bacterianas y enfermedades inmunes.
El documento de WO 97/24441, de Incyte Pharmaceuticals, Inc., publicado el 10 de Julio de 1997, divulga una proteína de 193 aminoácidos que corresponde al precursor de IL-18 y a ADN codificante.
En las células humanas, los polipéptidos formados por la expresión de genes pueden ser procesados por enzimas intracelulares para ser parcialmente digeridos y recibir cadenas de azúcar. Los polipéptidos que se incorporarán satisfactoriamente en productos farmacéuticos pueden ser los que fueron procesados del mismo modo que en las células humanas. Se sabe que la mayoría de las citoquinas se producen habitualmente como precursores sin actividad biológica, y después son procesados por las enzimas intracelulares para convertirse en polipéptidos activos.
El polipéptido IL-18 existe habitualmente en las células humanas en forma de un precursor de 193 aminoácidos y sin actividad biológica. El precursor de IL-18 se denomina también Pro-IL-18. Un procedimiento para producir IL-18 activa a partir de su precursor está descrito en la Patente de EE.UU. 5.879.942, de Hayasihibara, que corresponde a la Patente Europea EP 0819757, publicada el 21 de Enero de 1998. La patente divulga una enzima o una proteína que convierte un precursor de IL-18 en IL-18 activa.
Otro procedimiento para producir IL-18 activa a partir de su precursor está descrito en la Patente de EE.UU. Nº 5.891.663, de Hayashibara, que corresponde a la Patente Europea EP 0821005, publicada el 28 de Enero de 1998. La patente divulga poner en contacto precursor de IL-18 con la enzima que convierte interleuquina-1\beta ("ICE"). Las doctrinas de las patentes y referencias se incorporan por referencia.
El papel de ICE como mediador de apoptosis e inflamación ha sido estudiado exhaustivamente en la bibliografía. También se conoce que ICE puede procesar precursores tanto de interleuquina-1 como de interleuquina-18 a formas activas (Thornberry, NA, et al., 1992, Nature 356, 768-774; Ghayur, T et al., 1997, Nature 386, 619-623).
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Sumario de la invención
La presente invención se refiere a métodos para la activación in vitro del precursor de IL-18 humana (también conocido como Pro-IL-18) con una enzima activadora, que comprenden poner en contacto el precursor de IL-18 humana con una enzima activadora, tal como caspasa 4 o caspasa 5. Más específicamente, la presente invención proporciona un método por el que la caspasa 4 y la caspasa 5 actúan sobre un precursor de IL-18 para escindir en un sitio específico y producir un polipéptido activo que induce la producción de IFN-\gamma en células inmunocompe-
tentes.
La presente invención se refiere además a métodos para la activación in vivo del precursor de IL-18 humana, que comprenden co-expresar la proteína con una proteasa activadora. Los autores describen métodos para la activación in vivo de IL-18 utilizando proteasas tales como caspasa 4, también conocida como ICE_{REL}II, caspasa 5, también conocida como ICE_{REL}III, y proteasa específica para ubiquitina, que actúan sobre un precursor del polipéptido IL-18 para convertirlo en un polipéptido activo que induce la producción de IFN-\gamma.
La presente invención proporciona un método para producir polipéptido IL-18 humano de un polipéptido precursor de IL-18 humana que comprende:
I)
Co-expresar bicistrónicamente la caspasa 4 o la caspasa 5 con el polipéptido precursor de IL-18 humana usando un vector de expresión bicistrónica que comprende una secuencia que codifica el precursor de IL-18 humana seguido de una secuencia que codifica la caspasa 4 o la caspasa 5 separado por una región intergénica que incluye una secuencia Shine-Delgarno; y
II)
Purificar el polipéptido activo.
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Breve descripción de los dibujos anexos
La Fig. 1 muestra la secuencia de aminoácidos del precursor de IL-18 humana (SEQ ID NO:1).
La Fig. 2 muestra la secuencia de ácidos nucleicos que codifican la IL-18 humana de longitud completa (SEQ ID NO:2).
La Fig. 3 muestra la secuencia de aminoácidos de IL-18 humana activa (SEQ ID NO: 3).
La Fig. 4 muestra la secuencia de aminoácidos de la caspasa 4 truncada en el extremo N-terminal y marcada con 6-his (SEQ ID NO:4).
La Fig. 5 muestra la secuencia de ácidos nucleicos que codifica la secuencia de aminoácidos de la caspasa 4 truncada en el extremo N-terminal marcado con 6-his (SEQ ID NO:5).
La Fig. 6 muestra la secuencia de aminoácidos de la caspasa 5 truncada en el extremo N-terminal marcada con 6-his (SEQ ID NO:6).
La Fig. 7 muestra la secuencia de ácidos nucleicos que codifica la secuencia de aminoácidos de la caspasa 5 truncada en el extremo N-terminal marcada con 6-his (SEQ ID NO:7).
La Fig. 8 es una diagrama esquemático de una caja de expresión bicistrónica contenida dentro de pET28-ProIL-18/Casp 4 para la co-expresión de Pro-IL-18 y caspasa 4 truncada en E. coli.
La Fig. 9 muestra una secuencia de la caja de expresión de Pro-IL-18/Caspasa 4 dentro de pET28 (SEQ ID NO:8).
La Fig. 10 muestra la secuencia anotada de la caja de expresión de Pro-IL-18/Caspasa 4. La numeración corresponde a la posición dentro del vector pET28a.
La Fig. 11 muestra la inducción de Pro-IL-18/Caspasa 4.
La Fig. 12 es un diagrama esquemático de la caja de expresión bicistrónica contenida dentro de pET28-Pro-IL18/caspasa 5 truncada para la co-expresión de Pro-IL8 y caspasa 5 en E. coli.
La Fig 13 muestra una secuencia de la caja de expresión de Pro-IL-18/Caspasa 5 dentro de pET28 (SEQ ID
NO:9).
La Fig. 14 muestra el diagrama de secuencia anotado de la caja de expresión de Pro-IL-18/caspasa-5 truncada que detalla las características de secuencia reguladoras y la traducción de Pro-IL-18 y caspasa 5 truncada. La numeración corresponde a la colocación dentro del vector pET28a.
La Fig. 15 muestra la inducción de Pro-IL-18/Caspasa 5.
La Fig. 16 muestra la secuencia de aminoácidos de Ub-IL-18 (SEQ ID NO: 10).
La Fig. 17 muestra la secuencia de ácidos nucleicos que codifica la secuencia de aminoácidos de Ub-IL-18 (SEQ ID NO:11).
La Fig. 18 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la caja de expresión de Ub-IL-18/Ubp-1 dentro del vector pET28 (SEQ ID NO:12).
La Fig. 19 muestra la secuencia anotada de Ub-IL-18/Ubp-1 dentro del vector pET28. La numeración corresponde a la posición dentro de pET28.
La Fig. 20 muestra la expresión de Ub-IL-18 y el procesamiento por Ubp-1.
La Fig. 21 muestra el ensayo de actividad de IL-18 utilizando células KG-1 (línea celular mielomonocítica humana) para vigilar la producción de IFN-\gamma (IL-18 expresada de varios modos, según se indica).
La Fig. 22 muestra el ensayo de actividad de IL-18 utilizando PBMC humanas purificadas para vigilar la producción de IFN-\gamma (IL-18 expresada de varios modos, según se indica).
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Descripción detallada de la invención
Las caspasas 4 y 5 son miembros de una familia de cisteína-proteasas que incluyen la enzima que convierte interleuquina-1\beta (ICE), que escinde preferentemente substratos que contienen un segmento de activación de proteasa que comprende la secuencia de aminoácidos XEYD, donde X se selecciona de un grupo de aminoácidos formado por W, L, F, Y, I, V, D ó E; E es ácido glutámico; Y se selecciona de un grupo de aminoácidos formado por H, I, A, T, S, P ó E; y D es ácido aspártico (Munday, N.A., et al., 1995, J. Biol. Chemistry, 270, 15870-15876; Talanian, R.V. et al., 1997, J. Biol. Chemistry 272, 9677-82; Thornberry, N.A. et al. 1997 J. Biol. Chemistry 272, 17907-11). El reconocimiento del substrato por caspasa-5 se piensa que es esencialmente el mismo para ICE y caspasa-4 y distinto de otros miembros de la familia caspasa (Talanian, R.V. et al, 1997, J. Biol. Chemistry 272, 9677-82; Thornberry, N.A. et al. 1997 J. Biol. Chemistry 272, 17907-11). Caspasa 4 está divulgada en el documento EP-B-0 754 234. Caspasa 5 está divulgada en los documentos de EE.UU. 5.552.536 y 5.760.180.
Las proteasas específicas para ubiquitina son una familia de enzimas independientes de ATP que pueden escindir con precisión el péptido ubiquitina de 76 aminoácidos, evolutivamente conservado, en el extremo N de proteínas que están fusionadas a él. Estas proteasas escinden específicamente el enlace peptídico entre el resto de aminoácido carboxi terminal de una proteína ubiquitina y el grupo \alpha-amino de cualquier proteína no ubiquitina a la que está unida ubiquitina. Las proteasas específicas para ubiquitina procedentes de Saccharomyces cerevisiae, Ubp1, Ubp-2 y Ubp-3, por ejemplo, son conocidas y se pueden expresar recombinantemente para catalizar reacciones de desubiquitinación que ocurren específicamente en proteínas de fusión de ubiquitina, tanto in vivo como in vitro (Baker, RT et al., 1992, J. Biol. Chem. 267: 23364-23375; Baker, RT et al., 1994 J. Biol. Chem. 269: 25381-25386). La especificidad de proteasas específicas para ubiquitina de Saccharomyces cerevisiae permite la separación precisa de ubiquitina de cualquier péptido con la excepción de los que empiezan por prolina. La proteasa específica para ubiquitina de otras especies tales como Unp de ratón y su homólogo humano, Unph, son capaces de producir una escisión eficaz incluso delante de prolina (Gilchrist CA et al. 1997, J. Biol. Chem. 272:32280-32285). Así, se puede generar virtualmente cualquier extremo N deseado mediante la separación de un péptido ubiquitina fusionado con precisión cuando se combina in vitro o se co-expresa con proteasas específicas para ubiquitina. Las proteasas específicas para ubiquitina están descritas en los documentos de EE.UU. 5.212.058; 5.683.904; 5.391.490 y 5.494.818.
En la presente invención, se puede utilizar cualquier caspasa 4, caspasa 5 o ubiquitina proteasa ya sea natural o producida por medios artificiales, con tal que produzcan polipéptidos activos que induzcan la producción de IFN-\gamma en células inmunocompetentes, independientemente de sus estructuras, fuentes y orígenes.
En células humanas, los polipéptidos formados por expresión de genes se pueden procesar por enzimas intracelulares. Las enzimas intracelulares escinden las proteínas precursoras, tales como Pro-IL-18, dando su forma activa. Los polipéptidos que se incorporan satisfactoriamente en productos farmacéuticos tendrán que recibir procesamiento similar al procesamiento que reciben los polipéptidos en las células humanas. En las células humanas existen habitualmente polipéptidos en forma de un precursor y carecen de actividad biológica. Se sabe que la mayoría de las citoquinas, entre ellas el polipéptido IL-18, son producidas habitualmente como precursores que carecen de actividad biológica, y después son procesadas por enzimas intracelulares que las convierten en los polipéptidos activos.
El precursor de IL-18 que se ha mencionado ya en la presente invención existe, por ejemplo, en células que producen inherentemente el polipéptido, en células hospedantes mamíferas, y en un sistema bacteriano, tal como E. coli, transformado por introducción de un ADN, por ejemplo, un ADN con la secuencia nucleotídica de SEQ ID NO:2, que contiene una región que codifica el polipéptido. Utilizando dichas células hospedantes mamíferas y bacterianas, el precursor de IL-18 puede ser co-expresado con proteasas para generar IL-18 activa.
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Escisión in vitro
La presente invención se refiere a métodos para la activación in vitro de un polipéptido precursor, tal como el precursor de IL-18, que comprende poner en contacto el polipéptido precursor con una enzima activadora.
La presente invención se refiere a un método para la activación in vitro del precursor de IL-18 humana que comprende poner en contacto el precursor de IL-18 humana con caspasa 4 o caspasa 5.
El precursor de IL-18 se activa in vitro por escisión con la enzima activadora que reconoce un segmento de activación de proteasa específico que comprende la secuencia de aminoácidos XEYD, en la que X se selecciona de un grupo de aminoácidos formado por W, L, F, Y, I, V, D ó E; e Y se selecciona de un grupo de aminoácidos formado por H, I, A, T, S, P ó E.
El precursor de IL-18 se puede activar in vitro por escisión del enlace peptídico entre el ácido aspártico 36 y la tirosina 37 en SEQ ID NO:1 con caspasa 4 o caspasa 5 para producir un polipéptido activo que induce la producción de IFN-\gamma en células inmunocompetentes.
Genéricamente, la caspasa 4 o la caspasa 5 se puede obtener a partir de células, que la producen inherentemente, y transformantes obtenidos por aplicación de la tecnología del ADN recombinante. Ejemplos de dichas células son las que se establecieron a partir de células mamíferas y humanas tales como las células epiteliales, células endoteliales, células intersticiales, células cartilaginosas, monocitos, granulocitos, linfocitos, y líneas celulares establecidas de las anteriores. Ejemplos de los transformantes incluyen microorganismos y células animales transformados obtenidos introduciendo un ADN que codifica caspasa 5 en microorganismos y células animales. Caspasa 4 o caspasa 5 se prepara cultivando estos transformantes en medios convencionales de cultivo utilizados en este campo, ya sea tratándolos con ultrasonido en forma de cultivos intactos o después de separarlos de los cultivos o remojando los transformantes en disolventes hipotónicos, aplicando al residuo celular resultante o a mezclas que contienen sobrenadantes del cultivo y residuo celular las siguientes técnicas convencionales utilizadas para purificar enzimas en este campo; intercambio de sal, diálisis, filtración, concentración, sedimentación separadora, cromatografía de intercambio iónico, cromatografía de filtración en gel, cromatografía de adsorción, cromatografía isoeléctrica, cromatografía hidrófoba, cromatografía en fase reversa, cromatografía de afinidad, electroforesis en gel y electroenfoque. Se pueden utilizar dos o más de estos métodos de purificación de forma combinada. El ADN que codifica caspasa 4 (Fig. 5) (SEQ ID NO:5) y caspasa 5 (Fig. 7) (SEQ ID NO:7) y los transformantes que producen caspasa 4 y caspasa 5 son conocidos en la técnica. Por ejemplo, las enzimas pueden ser producidas en forma activa en E. coli por expresión de péptidos truncados en el extremo N-terminal que carecen de la región pro, como se ha descrito (Munday NA et al., 1996, J. Biol. Chem 26:15870-76).
Las células que producen el polipéptido precursor, tales como Pro-IL-18, inherentemente o las que fueron transformadas para producir el precursor se cultivan en un medio de cultivo nutritivo. Los medios de cultivo preferidos incluyen los medios de cultivo bien conocidos en la técnica, tales como medio Luria-Bertani u otro medio rico para cultivar E. coli que comprende triptona y extracto de levadura.
Caspasa 4 o caspasa 5, obtenida utilizando el método anterior, se deja que coexista en los cultivos resultantes o se añade a las mezclas resultantes o residuo celular después de lisar las células proliferadas, separadas o no separadas de los cultivos. La cantidad de caspasa 4 o caspasa 5 requerida es menor que la cantidad equimolar del precursor. La caspasa 4 o caspasa 5 se pone en contacto con el precursor a temperaturas y pH que permiten que la caspasa 4 o caspasa 5 actúe sobre el precursor, habitualmente, se deja reaccionar la caspasa 4 o caspasa 5 con el precursor hasta que se forma la cantidad deseada de polipéptido activo a partir del material precursor a temperaturas de aproximadamente 4º a 40ºC y pH de aproximadamente 6 a 9. La temperatura preferida es aproximadamente 25ºC y el pH preferido es aproximadamente 7,2. Así, pueden obtenerse mezclas de reacción que contienen el polipéptido activo.
La actividad de caspasa 4 o caspasa 5 puede ser analizada y expresada por unidades de actividad de acuerdo con los \mug de polipéptido procesado producidos por \mug de caspasa 4 o caspasa 5 por minuto.
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Co-expresión in vivo
La presente invención se refiere además a métodos para la activación in vivo de un polipéptido precursor, tal como un precursor de IL-18, que comprende co-expresar la proteína con una proteasa activadora. También se describen métodos para la activación in vivo de IL-18, que comprenden la co-expresión bicistrónica de polipéptidos, tales como IL-18, con proteasas, tales como caspasa 4, también conocida como ICE_{REL}II, caspasa 5, también conocida como ICE_{REL}III, y ubiquitina.
En una realización preferida, la caspasa 4 humana, también conocida como ICE_{REL}II, se co-expresa bicistrónicamente con Pro-IL-18 humano para permitir el procesamiento in vivo de Pro-IL-18 en IL-18 activa.
En otra realización preferida, la caspasa 4 humana truncada (SEQ ID NO. 4), se co-expresa bicistrónicamente con Pro-IL-18 humana para permitir el procesamiento in vivo de Pro-IL-18 (SEQ ID NO:1) en IL-18 activa (SEQ ID NO:3).
En otra realización preferida, la caspasa 5 humana, también conocida como ICE_{REL}III, se co-expresa bicistrónicamente con Pro-IL-18 humano para permitir el procesamiento in vivo de Pro-IL-18 en IL-18 activa (SEQ ID NO:3).
La ubiquitina proteasa 1 (Ubp-1) se puede co-expresar bicistrónicamente con ubiquitina-IL-18 (Ubp-IL-18) para el procesamiento in vivo de UB-IL-18 en IL-18 activa, por ejemplo (SEQ ID NO:9) en IL-18 activa (SEQ ID NO. 3).
La caspasa 5 humana truncada (SEQ ID NO. 5), se puede co-expresar bicistrónicamente con Pro-IL-18 humano para permitir el procesamiento in vivo de Pro-IL-18 (SEQ ID NO:1) en IL-18 activa (SEQ ID NO:3).
Un ADN que codifica caspasa 4 o caspasa 5 y un ADN que codifica un precursor del polipéptido son introducidos ambos en una célula hospedante bacteriana o mamífera apropiada para transformarla. En este caso, la caspasa 4 o caspasa 5, formada por la expresión del ADN, actúa sobre un precursor del polipéptido, formado por la expresión del ADN en el mismo transformante, para formar un polipéptido activo (Figuras 11 y 15). Las células hospedantes preferidas son líneas celulares epidérmicas, intersticiales, neuroblásticas o hematopoyéticas, que proceden de seres humanos, monos, ratones y hámsteres y se utilizan convencionalmente como hospedantes, tales como las células 3T3, incluidas las células 3T3-Swiss albino (ATCC CCL 92), células C1271 (ATCC CRL 1616), células CHO, incluidas las células CHO-K1 (ATCC CCL 61), células CV-1 (ATCC CCL 70), células COS, incluidas las células COS-1 (ATCC CCL 1650), células HeLa (ATCC CCL 2), células MOP, entre ellas las células MOP-8 (ATCC CRL 1709) y mutantes de las mismas. Las células hospedantes más preferidas son E. coli. El método más preferido para introducir ADN que codifica caspasa 4 o caspasa 5 y un ADN que codifica un precursor del polipéptido en E. coli es la transformación química con cloruro de rubidio, que es bien conocida en la técnica. Los métodos para introducir un ADN codificante de caspasa 4 o caspasa 5 y un ADN codificante de un precursor del polipéptido en células hospedantes mamíferas incluyen el método convencional de DEAE-dextrano, el método del ácido fosfórico-calcio, electroporación, lipofección, microinyección, y el método de infección vírica utilizando retrovirus, adenovirus, herpesvirus y vaccinia virus. En este caso, los vectores tales como pCD, pcDL-SR\alpha, pKY4, pCDM8, pCEV4, pME18S y pSV2-gpt, incluidos los promotores, intensificadores, orígenes de replicación, sitios de terminación, secuencias de corte y empalme, secuencias de poliadenilación y/o marcadores de selección apropiados, pueden ser utilizados siguiendo las técnicas clásicas descritas en Ausubel FM et al., 1994 Current Protocols in Molecular Biology, New York: Greene Publishing Assoc. y Wiley Interscience. Los clones que producían un polipéptido activado, según se observó por detección inmunológica, fueron seleccionados eligiendo el clon deseado a partir de transformantes después del cultivo en medios de cultivo nutritivos. Pueden obtenerse cultivos que contienen el polipéptido activo pueden ser obtenidos cultivando el transformante clonado con cultivo nutritivo convencional utilizado en este campo. En cuando a las células que producen inherentemente un precursor del polipéptido y las demás células que fueron transformadas para producir el polipéptido, pueden producir el precursor junto con enzimas activadoras, que activan el polipéptido, tales como caspasa 4, caspasa 5 y ubiquitina. Las tecnologías de ADN recombinante utilizando células hospedantes mamíferas están descritas detalladamente en Glutzman, Cell, 23:175 (1981) Mullingan, PNAS78:2072 (1981). Las tecnologías de ADN recombinante utilizando células hospedantes bacterianas están descritas en Protein Expression: A Practical Approach, compiladores S.J. Higgins y B.D. Hames, 1999, New York, Oxford University Press.
Si bien las mezclas de reacción y los cultivos resultantes que contienen un polipéptido IL-18 activo pueden ser utilizados intactos como un inductor de IFN-\gamma, en una realización preferida, las células contenidas en los cultivos se rompen por ultrasonidos, por enzimas de lisis de células y/o tensioactivos, y seguidamente se separa el polipéptido de las células resultantes y el residuo celular por filtración, centrifugación, etc., siguiendo procedimientos industriales clásicos descritos en Protein Purification: Principles and Practice, compilador Cantor, C.R. 1993, New York, Springer-Verlag. El polipéptido libre de células y residuo celular puede ser purificado por métodos convencionales de purificación utilizados para purificar sustancias biológicamente activas en este campo, por ejemplo, intercambio de sal, diálisis, filtración, concentración, sedimentación separadora, cromatografía de intercambio iónico, cromatografía de filtración en gel, cromatografía de adsorción, cromatografía isoeléctrica, cromatografía hidrófoba, cromatografía de fase inversa, cromatografía de afinidad, electroforesis en gel y electroenfoque. Si es necesario, se pueden utilizar combinadamente dos o más de estos métodos de purificación. El polipéptido purificado resultante puede concentrarse y liofilizarse formando un producto líquido o sólido que cumpla con sus usos finales.
Las cajas de expresión bicistrónicas de la presente invención son vectores versátiles que se pueden utilizar para el procesamiento in vivo de prácticamente cualquier péptido que contenga los sitios apropiados de reconocimiento para la escisión por caspasa 4/caspasa 5 o ubiquitinasa, que se han descrito previamente (Tobias, J.W. et al., Journal of Biological Chemistry, 1991. 266(18): p.12021.12028; Talanian, R.V. et al., Journal of Biological Chemistry, 1997. 272(15): p.9677-9682). La expresión bicistrónica ofrece ventajas sobre otras estrategias de co-expresión ya que ambos genes están vinculados a la misma unidad de transcripción, garantizando la expresión concordante de ambos genes a lo largo del tiempo. Esto contrasta con los sistemas plasmídicos dobles en los que un plásmido puede ser perdido a lo largo del tiempo, o con los sistemas promotores dobles de un solo plásmido, en los que la expresión puede variar con cada promotor y de un experimento a otro. En particular, los sistemas de expresión bicistrónicos descritos aquí se ajustan idealmente a la activación in vivo de enzimas, citoquinas, factores de crecimiento y otras proteínas activables proteolíticamente, permitiendo con ello la producción a gran escala de tales proteínas a partir de células en un solo paso y eliminando la necesidad de un paso de activación in vitro separado.
Las proteasas activadoras, caspasa 4 (Ala105 a Asn377) o caspasa 5 (Ile146 a Asn418), se subclonaron como fusiones 6-His N-terminales inmediatamente después de la secuencia de Pro-IL-18 con el fin de generar una fusión transcripcional de los dos genes. Se sitúa una secuencia terminadora de T7 curso abajo de la secuencia de caspasa 4 para la terminación traduccional de la unidad de transcripción bicistrónica. También se añadió una pequeña región intergénica que incluía una secuencia de Shine-Dalgarno defectuosa para permitir una iniciación tan sólo mínima de la traducción a partir de la secuencia de caspasa 4 (Figuras 10 y 14). Otras regiones reguladoras incluyen una secuencia operadora lac de 25 pares de bases localizada inmediatamente curso abajo de la región promotora de 17 pares de bases que está unida por el represor lac codificado por una copia del gen lac-I localizada en el plásmido, suprimiendo por ello la transcripción basal en ausencia de ARN polimerasa de T7. Los plásmidos resultantes designados ProIL18/Casp4 y ProIL18/Casp5 se transfectaron después separadamente en la cepa de E. coli BL21 (DE3) que contiene una copia cromosómica inducible del gen de polimerasa de T7.
La transcripción de la caja bicistrónica está bajo la dirección del promotor de T7, que está controlado por la proteína ARN polimerasa de fago T7, codificada a partir de una copia lisógena del gen de ARN polimerasa de T7. Esta copia cromosómica de polimerasa de T7 está por sí misma bajo el control del promotor lacUV5, inducible por la adición de isopropil-1-tio-b-D-galactopiranósido. La inducción conduce a la transcripción y traducción coordinadas de Pro-IL-18 e His-caspasa-4 o His-caspasa-5. Caspasa 4 o caspasa 5 traducida nacientemente es autoprocesada formando una especie activa, que inicia la activación proteolítica de ProIL-18. Tanto el precursor de IL-18 traducido como la IL-18 activada post-traduccionalmente son principalmente solubles en el interior de E. coli. La IL-18 activa madura que contiene una tirosina N-terminal es purificada directamente a partir de los lisados celulares bacterianos después de la inducción por métodos cromatográficos convencionales. La escisión para formar IL-18 madura con caspasa 4 es completa en 4 horas a 37ºC o en 18 horas a 29ºC (Figura 11) y la escisión para formar IL-18 madura con caspasa 5 es completa en 18 horas a 29ºC (Figura 15).
Se puede utilizar una caspasa 4 truncada, como se indica en la FIG. 4 (SEQ ID NO:4 y SEQ ID NO:5), o caspasa 5 truncada, como se indica en la FIG. 5 (SEQ ID NO: 6 y SEQ ID NO: 7). La truncación de caspasa 4 y caspasa 5 está descrita en Munday, N.A., et al., 1995, J. Biol. Chemistry, 270, 15870-15876.
Se describe además un método para crear un polipéptido activo por co-expresión de una proteasa específica para ubiquitina con una fusión ubiquitina IL-18 N-terminal (precursor) que se convierte en la IL-18 activa por la actividad hidrolasa c-terminal de ubiquitina. Una proteína ubiquitina de 76 aminoácidos que contiene una tirosina N-terminal auténtica se fusiona al extremo N maduro de Il-18 humana y se co-expresa con una proteasa específica para ubiquitina en E. coli, por ejemplo como se indica en SEQ ID NO:10 y SEQ ID NO:11. La ubiquitina es una proteína de 76 restos, altamente conservada, encontrada en células eucarióticas que funciona para marcar proteínas para degradación (Baker, R.T., Current Opinion in Biotechnology, 1996. 7(5): p. 541-6). La ubiquitina se escinde específicamente de proteínas por la acción de proteasas específicas para ubiquitina que se expresan endógenamente en células eucarióticas pero que están ausentes en bacterias. La co-expresión de proteínas fusionadas a ubiquitina con proteasa específica para ubiquitina en E. coli también conduce a la separación eficiente de ubiquitina (Baker, R.T. et al., Journal of Biological Chemistry, 1992. 267(32): p. 23364-75) (Figura 20). Además, la mayoría de estas enzimas desubiquitinizantes son capaces de escindir delante de prácticamente cualquier aminoácido a excepción de la prolina. Así, la escisión de ubiquitina a partir de IL-18 madura es posible a pesar de la presencia del resto de tirosina aromático grande en la posición P1'.
La co-expresión de Ubiquitina-IL-18 (Ub-IL-18) y Ubiquitina-proteasa-1(Ubp-1) (Tobias, J.W. et al., Journal of Biological Chemistry, 1991. 266(18): p.12021.12028) se lleva a cabo a través de la expresión bicistrónica de los dos genes bajo el control del promotor de T7 inducible. IL-18 madura es expresada como una fusión N-terminal con el péptido ubiquitina de 76 aminoácidos evolutivamente conservado. El ADNc de Ub-IL-18 se subclona bajo el control del promotor de ARN polimerasa de T7 dentro del vector pET28a. Subsiguientemente, el ADNc que codifica la proteasa específica para ubiquitina de longitud completa se subclona curso abajo delante de la secuencia terminadora de T7 (Figura 19). Ambos ADNc de Ub-IL-18 y de la proteasa específica para ubiquitina se transcriben en un solo transcrito de mRNA a partir del cual se traducen separadamente las proteínas Ub-IL-18 y proteasa específica para ubiquitina.
Como se ha descrito anteriormente, el polipéptido IL-18 humano activo, obtenido por los presentes métodos tiene una actividad de inducir la producción de IFN-\gamma como sustancia biológicamente activa útil, estimula la producción de IFNg a partir de células KG-1 (línea celular mielomonocítica humana) (Figura 21) y PBMC humanas purificadas (Figura 22).
Los Ejemplos siguientes explican adicionalmente pero no limitan la presente invención:
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Ejemplo 1
Preparación del precursor de IL-18 (pro-IL-18)
El precursor de IL-18 humano fue expresado como una fusión marcada con seis histidinas N-terminales en E. coli. El plásmido de expresión, ProEx-hIL18, derivaba de un vector, pPROEX-1 (Life Technologies) que contenía el promotor de Trc e IacIq para la expresión inducible con isopropil-1-tio-\beta-D-galactopiranósido (IPTG). Con el fin de construir el vector de expresión recombinante, se multiplicó por PCR un fragmento de ADN que contenía el gen entero del precursor de caspasa 5 a partir de un clon de ADNc, añadiendo una cola 5' con el sitio de reconocimiento para la endonucleasa de restricción Nde I y una cola 3' con el sitio de reconocimiento para la endonucleasa de restricción Bam HI. El producto multiplicado se subclonó entre estos dos sitios de restricción en pPROEX-, generando así una fusión N-terminal en marco, estando presente la secuencia codificante de seis histidinas en el
vector.
El plásmido resultante se expresó en células hospedantes de DH10B tras la inducción con IPTG 1 mM durante 5 horas a 37ºC. Se recogió la proteína recombinante a partir de sedimentos celulares obtenidos después de centrifugar los cultivos inducidos.
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Ejemplo 2
Purificación de pro-IL-18
Se suspendieron 1,5 g de células E. coli que expresaban pro-IL-18 como se describe en el Ejemplo 1 en 3,6 litros de tampón C de lisis (Tris HCl 50 mM, BME 10 mM, NaCl 0,5 M, 5% de glicerol, 1 \mug/ml de pepstatina A, 1 \mug/ml de leupepsina, AEBSF 0,4 mM), se lisaron por dos pases a través de Microfluidics a 840 kg/cm^{2}, se centrifugaron a 28.000 g y se recogieron 3,7 l de sobrenadante. Al sobrenadante, se añadieron 600 ml de NiNTA agarosa preequilibrada con tampón C que contenía imidazol 5 mM (tampón D), y la suspensión se incubó durante una hora para capturar pro-IL-18. La suspensión se centrifugó a baja velocidad (3.000 rpm), el sobrenadante se decantó, y la suspensión se cargó en una columna. La columna se lavó con tampón D y se eluyó pro-IL-18 con imidazol 300 mM en tampón C. El material reunido se dializó en tampón E (HEPES 25 mM, BME 10 mM, pH 8,0) y se aplicó a una columna DEAE ToyoPearl 650M equilibrada con el mismo tampón. La columna se eluyó con un gradiente lineal de NaCl 0 a 0,5 M en tampón E. El material reunido contenía 650 mg de pro-IL-18 con pureza superior al 90%.
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Ejemplo 3
Preparación de Caspasa 4
También se expresó caspasa 4 humana como una fusión marcada con seis histidinas N-terminales en E. coli. El plásmido de expresión, pET16b-caspasa 4, derivaba de un vector pET16b (Novagen) que contenía el promotor de fago T7. El vector recombinante se construyó por multiplicación por PCR del dominio activo de caspasa 4 (aminoácidos Ile146 a Asn418) que incorpora una secuencia codificante de seis histidinas en el extremo N y añadiendo una cola con los sitios para las endonucleasas de restricción Nco I y Xho I. El producto PCR resultante se subclonó después entre estos dos sitios de restricción para generar el vector de fusión de seis histidinas N-terminal- caspasa 4.
El plásmido resultante se transformó en la cepa de E. coli BL21 DE3 lisógena que contenía una copia cromosómica de ARN polimerasa de T7 bajo el control del promotor lacUV5 que permitía la expresión inducible de caspasa 4 después de inducción con IPTG 1 mM. La proteína activa se purificó a partir de los sedimentos celulares aislados después de la inducción a 37ºC durante 3 horas.
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Ejemplo 4
Purificación de caspasa 4
Cuando se lisan las células de E. coli que expresan la caspasa 4 humana marcada con hexa-his en el extremo N-terminal, descrita en el Ejemplo 2, se puede detectar actividad de caspasa 4 en el sobrenadante del material lisado. Cuando la proteína es capturada sobre perlas de agarosa NiNTA a partir del sobrenadante, se recuperan tanto p10 como p20. Esto indica que se activa el dominio de proteasa de caspasa 4 durante el cultivo celular mediante autoescisión en el nexo de unión de p10 y p20 y permanece como un heterodímero soluble no covalente. Con esta información, se puede purificar el heterodímero p20/p10 marcado con hexa-His. El proceso completo se lleva a cabo a 4ºC para evitar cualquier descomposición adicional de la molécula.
Se suspendieron aproximadamente 400 g de sedimento celular de E. coli húmedo en 1,6 l de tampón de lisis que contenía HEPES 25 mM, 0,1% de CHAPS, NaCl 500 mM, beta-mercaptoetanol (BME) 10 mM a pH 7,4, y 10% de glicerol (tampón A) y se lisaron por dos pases a través de Microfluidics a 840 kg/cm^{2}. El lisado se centrifugó a 30.000 g durante una hora y el sobrenadante del lisado (1,7 l) se recogió. Al sobrenadante del lisado, se añadió agarosa NiNTA, 150 ml, que se había pre-equilibrado con tampón de lisis que contenía imidazol 5 mM, la suspensión se ajustó a pH 8 con NaOH 2 N y se absorbió por lotes caspasa 4 durante una hora. Se cargó agarosa NiNTA en la columna, se lavó con imidazol 5 M y 25 mM en tampón A secuencialmente para separar impurezas, y se eluyó caspasa 5 con imidazol 300 mM en tampón A. La proteína se dializó contra tampón B (HEPES 25 mM, 0,1% de CHAPS, 10% de glicerol, BME 10 mM, pH 8,0) y se aplicó a una columna DEAE ToyoPearl 650M preequilibrada con el mismo tampón. Se eluyó caspasa 4 a partir de la columna con NaCl 100 mM en el mismo tampón. Se reunieron las fracciones que presentaban la máxima actividad específica de caspasa 4 utilizando un substrato peptídico fluorescente, LEED-AMC.
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Ejemplo 5
Activación y preparación del polipéptido in vitro
La Pro-IL-18 purificada como se ha descrito en el Ejemplo 2 se incubó con caspasa 4 a una razón 1:500 p/p durante 3 horas a temperatura ambiente. La reacción de escisión del prodominio se completó en más del 90% de acuerdo con el análisis SDS-PAGE. A la mezcla de reacción, se añadieron 140 ml de agarosa NiNTA en tampón D, y ésta se incubó durante una hora, y se vertió en un embudo de vidrio sinterizado para recuperar el material no unido que contenía principalmente IL-18 madura. Pequeñas cantidades del pro-IL-18 restante, prodominio, caspasa 4 y otras impurezas se unieron a agarosa NINTA. La solución no unida se ajustó a DTT 25 mM, se incubó durante una hora para completar la reacción de reducción, se ajustó el pH de la solución a 6 por adición de ácido fosfórico 2 M y se concentró a 86 ml utilizando una membrana YM10. La muestra concentrada se aplicó a una columna Superdex 75 equilibrada con fosfato sódico 10 mM, pH 6,0, que contenía NaCl 0,1 M. Las fracciones reunidas contenían 560 mg de IL-18
madura.
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Ejemplo 6
Activación y preparación del polipéptido in vivo
También se puede producir activación de IL-18 in vivo a través de la expresión simultánea del precursor de IL-18 humano y caspasa 4. Pro-IL-18 es co-expresado bicistrónicamente en E. coli a partir de un solo transcrito de caspasa 4 humana dentro del plásmido de expresión, pET28-Pro-IL-18/Casp4 (Figuras 5 y 6). El gen de pro-IL-18 humano es subclonado en pET28a (Novagen) bajo el control del promotor de T7 que incluye una secuencia de Shine-Dalgarno eficiente para la iniciación óptima de la traducción a partir de la secuencia de Pro-IL-18 (Figura 8). El gen de caspasa 4 (Ile146 a Asn418) fue subclonado inmediatamente después de la secuencia Pro-IL-18 que incluía una secuencia de Shine-Dalgarno defectuosa, permitiendo una mínima iniciación de la traducción a partir de la secuencia de caspasa 4. Se incluyó una secuencia terminadora de T7 para la terminación traduccional después de la unidad de transcripción bicistrónica. La construcción resultante se transfectó después en un hospedante BL21(DE3) que contenía una copia cromosómica inducible del gen de polimerasa de T7. La inducción de esta construcción en este hospedante con IPTG 1 mM dio como resultado la transcripción y la traducción coordinadas de pro-IL-18 y pro-caspasa 4. La pro-caspasa 4 traducida nacientemente se autoprocesa convirtiéndose en una especie activa que inicia la activación proteolítica de pro-IL-18. La Figura 8 muestra un curso de tiempo de activación de IL-18 a lo largo de 18 horas a 29ºC después de inducción con IPTG 1 mM (0 a 18 horas).
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Ejemplo 7
Activación in vivo de caspasa 4
La activación in vivo de caspasa 4 está descrita en Munday, N.A., et al., 1995, J. Biol. Chemistry, 270, 15870-15876. La expresión de una forma truncada de caspasa 4 que empieza en Ala 59, que carece de la pro-región en E. coli, conduce a autoactivación por escisión en las subunidades P10 y P20, que se conectan formando un heterodímero enzimático activo. La demora en la activación de caspasa 4 se traduce en una demora en la escisión y activación de Pro-IL-18 a IL-18 madura (Figura 9). Esto permite la acumulación del Pro-IL-18 más estable antes de su escisión a IL-18 madura, que es menos estable en las células.
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Ejemplo 8
Purificación de IL-18 humana co-expresada con Caspasa 4
Se suspendieron 66 mg de células E. coli que expresan IL-18 como se ha descrito en el Ejemplo 6 en 130 ml de HEPES 0,1 M pH 7,5 que contiene EDTA 1 mM y DTT 10 mM (todo el proceso se realizó a 4ºC y en presencia de DTT 10 mM excepto el último paso para mantener SH libre) y se lisaron a 1.050 kg/cm^{2} por dos pases utilizando Microfluidics. El lisado (230 ml) se centrifugó a 34.000 xg durante 30 minutos. El sobrenadante (200 ml) se diluyó a 1 l con HEPES 25 mM pH 7,0 y se hizo fluir a través de dos columnas en tándem, ToyoPearl SP 650M y ToyoPearl DEAE 650M. Muchas de las impurezas derivadas de las células de E. coli se unieron a las columnas. El material eluido se ajustó a pH 0,5 con bistris-propano 25 mM, se diluyó a 2 l y se aplicó a una columna Source 15Q equilibrada con bistris-propano HCl 25 mM pH 9,5. La columna se eluyó con un gradiente lineal de 0 a 0,5 M de NaCl en el mismo tampón. Las fracciones que contenían IL-18 fueron identificadas utilizando RP-HPLC Vydac C4 y se reunieron (250 ml). Los materiales reunidos se concentraron a 50 ml utilizando membrana YM10 y se aplicaron a una columna Superdex 75 que se había equilibrado previamente con NaPO4 10 mM pH 6,0 que contenía EDTA 1 mM y NaCl 0,15 mM (sin DTT para uso in vivo).
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Ejemplo 9
Preparación de caspasa 5 truncada
También se expresó caspasa 5 truncada humana como una fusión marcada con Hexa-histidina N-terminal en E. coli. El plásmido de expresión, pET16b-caspasa 5 truncada, derivaba de un vector pET16b (Novagen) que contenía el promotor de fago T7. El vector recombinante fue construido por multiplicación PCR del dominio activo de caspasa 5 truncada (aminoácidos Ile146 a Asn418) que incorporaba una secuencia codificante de 6 histidinas en el extremo N-terminal y añadiendo una cola con los sitios para las endonucleasas de restricción Nco I y Xho I. Después, el producto PCR resultante se subclonó entre estos dos sitios de restricción para generar el vector de fusión Hexa-histidina N-terminal-caspasa 5 truncada.
El plásmido resultante se transformó en la cepa de E. coli BL21 DE3 lisógena que contenía una copia cromosómica de ARN polimerasa de T7 bajo el control del promotor lacUV5 que permitía la expresión inducible de caspasa 5 truncada después de la inducción con IPTG 1 mM. La proteína activa fue purificada a partir de sedimento celular aislado después de la inducción a 37ºC durante 3 horas.
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Ejemplo 10
Purificación de caspasa 5 truncada
Cuando se lisan células de E. coli que expresan la caspasa 5 truncada humana marcada con Hexa-his en el extremo N-terminal, descrita en el Ejemplo 9, se puede detectar actividad de caspasa 5 truncada en el sobrenadante del lisado. Cuando la proteína es capturada sobre perlas de agarosa NiNTA a partir del sobrenadante, se recuperan tanto p10 como p20. Esto indica que el dominio de proteasa de la caspasa 5 truncada es activado durante el cultivo celular mediante autoescisión en el nexo de unión de p10 y p20 y permanece como un heterodímero soluble no covalente. Con esta información, se puede purificar el heterodímero p20/p10 marcado hexa-His. Todo el proceso se lleva a cabo a 4ºC para evitar cualquier descomposición adicional de la molécula.
Se suspendieron aproximadamente 400 g de sedimento celular de E. coli húmedo en 1,6 l de tampón de lisis que contenía HEPES 25 mM, 0,1% de CHAPS, NaCl 500 mM, beta-mercaptoetanol (BME) 10 mM a pH 7,4, y 10% de glicerol (tampón A) y se lisaron por dos pases a través de Microfluidics a 840 kg/cm^{2}. El lisado se centrifugó a 30.000 g durante una hora y el sobrenadante del lisado, 1,7 l, se recogió. Al sobrenadante del lisado, se añadió agarosa NiNTA, 150 ml, que se había preequilibrado con tampón de lisis que contenía imidazol 5 mM, la suspensión se ajustó a pH 8 con NaOH 2 N y se absorbió por lotes caspasa 5 durante una hora. Se cargó agarosa NiNTA en la columna, se lavó con imidazol 5 M y 25 mM en tampón A secuencialmente para separar impurezas, y la caspasa 5 eluyó con imidazol 300 mM en tampón A. La proteína se dializó contra tampón B (HEPES 25 mM, 0,1% de CHAPS, 10% de glicerol, BME 10 mM, pH 8,0) y se aplicó a una columna DEAE ToyoPearl 650M preequilibrada con el mismo tampón. La caspasa 5 truncada se eluyó de la columna con NaCl 100 mM en el mismo tampón. Se reunieron las fracciones que presentan la máxima actividad específica de caspasa 5 truncada utilizando substrato peptídico fluorescente,
LEED-AMC.
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Ejemplo 11
Activación y preparación de polipéptido in vitro
El Pro-IL-18 preparado y purificado como se ha descrito en los Ejemplos 1 y 2 se incubó con caspasa 5 truncada en una relación 1:500 p/p durante 3 horas a temperatura ambiente. La reacción de escisión del prodominio fue completa en más del 90% según el análisis SDS-PAGE. A la mezcla de reacción, se añadieron 140 ml de agarosa NiNTA en tampón D, ésta se incubó durante una hora y se vertió en un embudo de vidrio sinterizado para recuperar el material no unido que contenía principalmente IL-18 madura. Pequeñas cantidades del pro-IL-18 restante, prodominio, caspasa 5 truncada y otras impurezas quedaron unidas a agarosa NINTA. La solución no unida se ajustó a DTT 25 mM, se incubó durante una hora para completar la reacción de reducción, se ajustó el pH de la solución a 6 por adición de ácido fosfórico 2 M y se concentró a 86 ml utilizando membrana YM10. La muestra concentrada se aplicó a una columna Superdex 75 equilibrada con fosfato sódico 10 mM pH 6,0 que contenía NaCl 0,1 M. Las fracciones reunidas contenían 560 mg de IL-18 madura.
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Ejemplo 12
Activación y preparación de polipéptido in vivo
También se puede conseguir la activación de IL-18 in vivo mediante la expresión simultánea del precursor de IL-18 humano y caspasa 5 truncada. Se co-expresó bicistrónicamente Pro-IL-18 en E. coli a partir de un solo transcrito con caspasa 5 truncada humana dentro del plásmido de expresión, pET28-ProIL18/Casp5 (Figura 9). El gen de pro-IL-18 humano se subclona en pET28a (Novagen) bajo el control del promotor de T7 que incluye una secuencia de Shine-Dalgarno eficiente para la iniciación óptima de la traducción a partir de la secuencia de Pro-IL-18 (Figura 10). El gen de caspasa 5 truncada (Ile146 a Asn418) se subclonó inmediatamente después de la secuencia de Pro-IL-18 que incluía una secuencia de Shine-Dalgarno defectuosa, que permitía una mínima iniciación de la traducción a partir de la secuencia de caspasa 5 truncada. Se incluyó una secuencia terminadora de T7 para la terminación traduccional después de la unidad de transcripción bicistrónica. Después, la construcción resultante se transfectó en un hospedante BL21(DE3) que contenía una copia cromosómica inducible del gen de polimerasa de T7. La inducción de esta construcción en este hospedante con IPTG 1 mM dio como resultado la transcripción y la traducción coordinadas de pro-IL-18 y pro-caspasa 5. Pro-caspasa 5 traducida nacientemente se autoprocesa formando una especie activa que inicia la activación proteolítica de pro-IL-18.
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Ejemplo 13
Purificación de IL-18 humana co-expresada con caspasa 5 truncada
Se suspendieron 66 g de células E. coli que expresaban IL-18 como se ha descrito en el Ejemplo 12 en 130 ml de HEPES 0,1 M pH 7,5 que contenía EDTA 1 mM y DTT 10 mM (todo el proceso se realizó a 4ºC y en presencia de DTT 10 mM excepto el último paso para mantener SH libre) y se lisaron a 1.050 kg/cm^{2} por dos pases utilizando Microfluidics. El lisado (230 ml) se centrifugó a 34.000 g durante 30 minutos. El sobrenadante (200 ml) se diluyó a 1 l con HEPES 25 mM pH 7,0 y se hizo fluir a través de dos columnas en tándem, ToyoPearl SP 650M y ToyoPearl DEAE 650M. Muchas de las impurezas derivadas de las células de E. coli se unieron a las columnas. El material eluido se ajustó a pH 9,5 con bistris-propano 25 mM, se diluyó a 2 l y se aplicó a una columna Source 15Q equilibrada con bistris-propano HCl 25 mM pH 9,5. La columna se eluyó con un gradiente lineal de NaCl 0 a 0,5 M en el mismo tampón. Las fracciones que contenían IL-18 se identificaron utilizando RP-HPLC Vydac C4 y se reunieron (250 ml). Las fracciones reunidas se concentraron a 50 ml utilizando la membrana YM10 y se aplicaron a una columna Superdex 75 que se preequilibró con NaPO4 10 mM pH 6,0 que contenía EDTA 1 mM y NaCl 0,15 M (sin DTT para uso in vivo).
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Ejemplo 14
Preparación de ubiquitina/Pro-IL-18/Ubp1
La secuencia codificante de ubiquitina de 76 aminoácidos se fusiona en marco con el principio de IL-18 humana madura mediante ligación de extremos romos tal que el primer codón de tirosina de la IL-18 madura va inmediatamente seguido del codón de glicina 76 de ubiquitina. La fusión génica se subclona después en un vector pET bajo el control del promotor de T7 que incluye una secuencia de Shine-Dalgarno eficiente para iniciación óptima de la traducción a partir de la secuencia génica de ubiquitina-IL-18. El gen Ubp-1 de longitud completa se subclona inmediatamente después de IL-18 que incluye una secuencia de Shine-Dalgarno defectuosa para traducción mínima de Ubp-1. La Fig. 11 muestra la secuencia de la caja de expresión de UbIL-18/Ubp-1 dentro de pET28. La Fig. 13 muestra la secuencia anotada de UbIL-18/Ubp-1 dentro de pET28. La numeración corresponde a la posición dentro de pET28.
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Ejemplo 15
Activación y preparación de IL-18 in vivo
La construcción del Ejemplo 14 se transfectó después en un hospedante BL21(DE3). La inducción con IPTG 1 mM dio como resultado la transcripción y la traducción coordinadas de ubiquitina-IL-18 y Ubp-1. La acción enzimática de Ubp-1 condujo al procesamiento eficiente de Ub-IL-18 a IL-18 activa madura que después se puede purificar directamente a partir de lisados de E. coli por métodos convencionales. La Figura 16 ilustra el curso de tiempo de la expresión y el procesamiento de IL-18 a 30ºC y 37ºC después de inducción con IPTG 1 mM. La flecha superior indica la parte de UB-IL-18 no procesada en la Calle 1. La flecha inferior indica la porción de IL-18 procesada en la Calle 3 (detección por transferencia Western utilizando antisueros anti-IL-18).
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Ejemplo 16
Purificación de IL-18 humana co-expresada con ubiquitina
Se suspendieron 66 g de células E. coli que expresan IL-18 como se describe en el Ejemplo 15 en 130 ml de HEPES 0,1 M pH 7,5 que contiene EDTA 1 mM y DTT 10 mM (todo el proceso se efectúa a 4ºC y en presencia de DTT 10 mM excepto el último paso para mantener SH libre) y se lisaron a 1.050 kg/cm^{2} (103.421 kPa) por dos pases utilizando Microfluidics. El lisado (230 ml) se centrifugó a 34.000 xg durante 30 minutos. El sobrenadante (200 ml) se diluyó a 1 l con HEPES 25 mM pH 7,0 y se pasó a través de dos columnas en tándem, ToyoPearl SP 650M y ToyoPearl DEAE 650M. Muchas de las impurezas derivadas de las células de E. coli se unieron a las columnas. El material eluido se ajustó a pH 9,5, con bistris-propano 25 mM, se diluyó a 2 l y se aplicó a una columna Source 15Q equilibrada con bistris-propano HCl 25 mM pH 9,5. La columna se eluyó con un gradiente lineal de NaCl de 0 a 0,5 M en el mismo tampón. Las fracciones que contenían IL-18 se identificaron utilizando RP-HPLC Vydac C4 y se reunieron (250 ml). El material reunido se concentró a 50 ml utilizando una membrana YM10 y se aplicó a una columna Superdex 75 que se había preequilibrado con NaPO4 10 mM pH 6,0 que contenía EDTA 1 mM y NaCl 0,15 M (sin DTT para uso in vivo).
<110> SMITHKLINE BEECHAM CORPORATION
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<120> PROCEDIMIENTO DE PREPARACIÓN DE UN POLIPÉPTIDO IL-8 FISIOLÓGICAMENTE ACTIVO
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<130> P51137
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<140> A SER ASIGNADO
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<141> con la presente
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<150> 60/211.832
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<151> 15-06-2000
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<150> 60/224.128
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<151> 10-08-2000
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<150> 60/264.923
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<151> 30-01-2001
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<160> 12
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<170> FastSEQ para Windows Versión 3.0
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<210> 1
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<211> 193
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 1
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1
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100
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<210> 2
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<211> 582
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 2
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2
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<210> 3
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<211> 157
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 3
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3
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<210> 4
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<211> 282
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 4
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4
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<210> 5
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<211> 849
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<210> 6
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<211> 282
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 6
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<210> 7
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<211> 849
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 7
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8
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<210> 8
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<211> 1743
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 8
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9
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90
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<210> 9
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<211> 1464
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 9
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10
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<210> 10
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<211> 233
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 10
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11
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<210> 11
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<211> 702
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 11
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12
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<210> 12
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<211> 3419
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400> 12
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13
\hskip0,8cm
14

Claims (3)

1. Un procedimiento de producción de un polipéptido IL-18 humano activo a partir de un polipéptido precursor de IL-18 humana, que comprende:
(i)
Co-expresar bicistrónicamente la caspasa 4 o la caspasa 5 con el polipéptido precursor de IL-18 humana usando un vector de expresión bicistrónica que comprende una secuencia que codifica el precursor de IL-18 humana seguido de una secuencia que codifica la caspasa 4 o la caspasa 5 separado por una región intergénica que incluye una secuencia Shine-Delgarno; y
(ii)
Purificar el polipéptido activo.
2. El procedimiento según la reivindicación 1, en el que el polipéptido IL-18 humano activo es un polipéptido que tiene la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO:3.
3. Un procedimiento según la reivindicación 1 o reivindicación 2, en el que la caspasa 4 tiene la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO:4 o la caspasa 5 tiene la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO:6.
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