ES2517391T3 - Procedimientos de producción de 3-O-desacil-4'-monofosforil lípido A (3D-MLA) - Google Patents
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Abstract
Un procedimiento de extraer lipopolisacárido (LPS) de un cultivo de células de cepa bacteriana mutante rugosa profunda, que comprende: a. extraer las células con una solución que consiste esencialmente en al menos el 75 % en peso de un alcohol alifático que tiene de 1 a 4 átomos de carbono y en el agua del resto; produciendo de este modo células con contenido fosfolipídico reducido; b. extraer las células con contenido fosfolipídico reducido con una solución que comprende cloroformo y metanol, produciendo de este modo una solución de LPS en cloroformo y metanol, en el que la extracción con alcohol alifático se lleva a cabo a una temperatura entre 35 ºC y 65 ºC.
Description
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DESCRIPCIÓN
Procedimientos de producción de 3-O-desacil-4'-monofosforil lípido A (3D-MLA)
Antecedentes de la invención
1. Campo de la invención
La presente invención se refiere, en general, al campo de la producción biosintética de 3-O-desacil-4'-monofosforil lípido A (3D-MLA). Más particularmente, se refiere a procedimientos de mejora del rendimiento de congéneres de 3D-MLA deseados o de minimización del coste de purificación de precursores de lipopolisacáridos (LPS) de 3D-MLA.
2. Descripción de técnica relacionada
Desde hace tiempo se reconoce que los lipopolisacáridos enterobacterianos (LPS) son potentes estimulantes del sistema inmunitario. Puede provocarse una variedad de respuestas, tanto beneficiosas como perjudiciales, por cantidades submicrográmicas de LPS. El hecho de que algunas de las respuestas sean perjudiciales y algunas de estas puedan ser mortales, ha descartado el uso clínico de LPS por sí mismo. Se ha observado que el componente de LPS más responsable de la actividad endotóxica es el lípido A.
Por consiguiente, se ha hecho un gran esfuerzo por atenuar los atributos tóxicos de LPS o lípido A sin disminuir los beneficios inmunoestimulantes de estos compuestos. Entre estos esfuerzos fueron notables los de Edgar Ribi y sus colaboradores, que dieron como resultado la producción del derivado de lípido A 3-O-desacil-4'-monofosforil-lípido A (3D-MLA; composiciones que comprenden 3D-MLA están comercialmente disponibles con el nombre comercial MPL® de Corixa Corporation (Seattle, WA)). 3D-MLA ha mostrado que tiene esencialmente las mismas propiedades inmunoestimulantes que el lípido A pero menor endotoxicidad (Myers y col., patente de EE.UU. n.º: 4.912.094). Myers y col. también informaron de un procedimiento para la producción de 3D-MLA, como sigue. Primero, LPS o lípido A obtenido de una cepa mutante rugosa profunda de una bacteria gram-negativa (por ejemplo, R595 de Salmonella minnesota) se somete a reflujo en soluciones de ácidos minerales de fuerza moderada (por ejemplo, HCl 0,1 N) durante un periodo de aproximadamente 30 min. Esto conduce a la desfosforilación en la posición 1 de la glucosamina del extremo reductor y a la descarbohidratación en la posición 6' de la glucosamina no reductora del lípido A. Segundo, el lípido A descarbohidratado desfosforilado (también conocido como monofosforil lípido A o MLA) se somete a una hidrólisis básica, por ejemplo, disolviendo en un disolvente orgánico tal como cloroformo:metanol (CM) 2:1 (v/v), saturando la solución con una solución acuosa de Na2CO3 0,5 M a pH 10,5 y evaporando al vacío el disolvente. Esto conduce a eliminación selectiva del resto ácido β-hidroximirístico en la posición 3 del lípido A, resultando 3-O-desacil4'-monofosforil-lípido A (3D-MLA).
La calidad del 3D-MLA producido mediante el procedimiento anterior es altamente dependiente de la pureza y composición de los LPS obtenidos de la bacteria gram-negativa. Por citar un ejemplo, el componente de lípido A de LPS es una mezcla de especies estrechamente relacionadas que contienen entre aproximadamente 5-7 restos de ácido graso. En la formación de 3D-MLA, como es evidente de la discusión anterior, un resto de ácido graso se elimina, produciendo 3D-MLA con entre aproximadamente 4-6 restos de ácidos grasos. Se mantiene generalmente que 3D-MLA con al menos 6 restos de ácido graso se prefiere en términos de la combinación de beneficios inmunoestimulantes mantenidos o potenciados, toxicidad reducida y otras propiedades deseables (Qureshi y Takayama, en “The Bacteria,” vol. XI (Iglewski y Clark, eds.), Academic Press, 1990, pág. 319-338).
Por citar otro ejemplo, la extracción a escala comercial de LPS de bacterias gram-negativas normalmente implica el procedimiento de Chen (Chen y col., J. Infect. Dis. 128:543 (1973)); concretamente, la extracción con CM, que conduce a una fase de CM rica en LPS y fosfolípidos de la que luego puede purificarse LPS. Sin embargo, la purificación de LPS a partir de la fase de CM rica en LPS y fosfolípidos normalmente requiere múltiples etapas de precipitación para obtener LPS de suficiente pureza para usar en aplicaciones inmunoestimulantes tales como, por ejemplo, uso como adyuvante de vacuna.
Por tanto, sería deseable disponer de procedimientos para preparar convenientemente composiciones de LPS altamente puras. Además, sería deseable disponer de procedimientos para generar composiciones de LPS cuyas composiciones tuvieran 3D-MLA con niveles elevados de congéneres de hexaacilo.
Se han usado técnicas de fermentación conocidas para preparar cultivos de bacterias gram-negativas que comprenden LPS fácilmente purificables. Estas técnicas conocidas normalmente implican la recogida de cultivos bacterianos en fase estacionaria temprana, de acuerdo con prácticas bacteriológicas convencionales. Sin embargo, se ha observado que el grado de acilación del LPS producido de acuerdo con condiciones conocidas es variable. Por ejemplo, el contenido de especies de heptaacilo en el lípido A de R595 de S. minnesota puede variar del 20 % al 80 %, dependiendo del lote (Rietschel y col., Rev. Infect. Dis. 9:S527 (1987)). Esta variabilidad en el contenido de congéneres de heptaacilo daría como resultado las diferencias significativas en el contenido de congéneres de hexaacilo en el 3D-MLA preparado a partir de estos lotes de LPS.
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Sumario de la invención
La presente invención se refiere a un procedimiento de extracción de lipopolisacárido (LPS) a partir de un cultivo de células de cepa bacteriana mutante rugosa profunda, que comprende:
- a.
- extraer las células con una solución que consiste esencialmente en al menos el 75 % en peso de un alcohol alifático que tiene de 1 a 4 átomos de carbono y en el agua del resto; produciendo de este modo células con contenido fosfolipídico reducido;
- b.
- extraer las células con contenido fosfolipídico reducido con una solución que comprende cloroformo y metanol, produciendo de este modo una solución de LPS en cloroformo y metanol, en la que la extracción con alcohol alifático se lleva a cabo a una temperatura entre 35 ºC y 65 ºC.
El procedimiento proporciona soluciones de LPS en CM que tienen contenido en fosfolípidos reducido y que por lo tanto son muy adecuados para modificación y peurificación adicionales de 3D-MLA. El procedimiento implica etapas relativamente simples y económicas.
Breve descripción de los dibujos
Los siguientes dibujos forman parte de la memoria descriptiva y están incluidos para demostrar adicionalmente ciertos aspectos de la presente invención. La invención puede entenderse mejor por referencia a uno o más de estos dibujos en combinación con la descripción detallada de realizaciones específicas presentadas en el presente documento.
La Figura 1 muestra placas de CCF de extractos de etanol y muestras de LPS obtenidas con diferentes temperaturas durante las extracciones con etanol. La placa de la izquierda muestra, de izquierda a derecha, los extractos de etanol a temperaturas de 22 ºC, 37 ºC y 50 ºC. La muestra en el extremo derecho de esta placa es una muestra de LPS auténtica. La placa a la derecha muestra los LPS obtenidos de cada preparación. Las muestras en los carriles 3, 4 y 5 se corresponden con LPS de células sometidas a pre-extracciones con etanol a 22 ºC, 37 ºC y 50 ºC, respectivamente. Las bandas pesadas a Rf~0,6 se corresponden con fosfolípido e impurezas de ácidos grasos. Los niveles de estas impurezas se reducen aumentando la temperatura de las extracciones con etanol y son muy bajos en la muestra que se pre-extrajo a 50 ºC.
Descripción de realizaciones ilustrativas
Los lipopolisacáridos son el principal constituyente lipídico en la valva externa de la membrana externa de bacterias gram-negativas. La fracción de lipopolisacáridos de una bacteria gram-negativa comprende, entre otros componentes, lípido A. Como se ha descrito, el lípido A puede descarbohidratarse y desfosforilarse parcialmente para proporcionar monofosforil-lípido A (MLA) y MLA puede desacilarse selectivamente en la posición 3 para proporcionar 3-O-desacil-4'monofosforil-lípido A (3D-MLA).
Sin embargo, el lípido A producido por bacterias gram-negativas normalmente comprende varias especies que tienen la misma estructura de lípido A global pero difieren en el número de restos de ácidos grasos que contienen. Grupos de especies del lípido A con el mismo número de ácidos grasos se denominan en el presente documento “congéneres”. Los congéneres del lípido A que tienen de 4 a 7 restos de ácidos grasos se producen por cultivo a escala comercial convencional de bacterias gram-negativas tales como R595 de S. minnesota. Como resultado, 3D-MLA producido de, por ejemplo, lípido A de R595 de S. minnesota tiene una composición de congéneres que normalmente oscila de 3 a 6 restos de ácidos grasos (debido a que 3D-MLA ha experimentado pérdida de un resto de ácido graso).
La heterogeneidad en la composición de congéneres de 3D-MLA (mediante lípido A y MLA) es atribuible a dos fuentes:
(1) variabilidad biosintética en el ensamblaje del lípido A y (2) pérdida de restos de ácidos grasos del esqueleto del lípido A durante el procesamiento a 3D-MLA. Aunque no se desea quedar ligado a teoría, se cree que la variabilidad biosintética se produce debido a la especificidad por sustratos no absolutos de las aciltransferasas que participan en las etapas terminales de la biosíntesis del lípido A, entre otras explicaciones. La pérdida de restos de ácidos grasos del esqueleto del lípido A también puede producirse durante las hidrólisis ácidas y alcalinas normalmente usadas en la producción de 3D-MLA.
Sorprendentemente, se descubrió que la composición de congéneres de 3D-MLA puede alterarse alterando los parámetros de un procedimiento de cultivo de una cepa bacteriana mutante rugosa profunda que produce lípido A. Específicamente, se descubrió que el mantenimiento del cultivo de la cepa bacteriana mutante rugosa profunda en fase estacionaria durante al menos aproximadamente 5 h antes de recogida da como resultado un cambio en las proporciones de congéneres del lípido A así producidos de forma que, normalmente, al menos aproximadamente el 20 % en moles del 3D-MLA producido después a partir del lípido A contienen 6 ácidos grasos. Preferentemente, al menos aproximadamente el 50 % en moles de 3D-MLA contiene 6 ácidos grasos. Se ha encontrado que es particularmente eficaz un mantenimiento en el tiempo de la fase estacionaria de aproximadamente 5,5 h. Esto es a diferencia de los procedimientos de cultivo típicos conocidos en la técnica, en los que la recogida se produce casi inmediatamente
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después de la entrada del cultivo en la fase estacionaria; en el procedimiento conocido, el contenido de congéneres del LPS es altamente variable y da como resultado 3D-MLA con contenido de congéneres de hexaacilo variable.
Por “cepa bacteriana mutante rugosa profunda” se quiere significar una cepa de una bacteria gram-negativa que tiene un fenotipo rugoso profundo. Un fenotipo “rugoso profundo” significa que el resto de polisacárido unido al lípido A consiste en solo aproximadamente 2-3 residuos de ácido 2-ceto-3-desoxi-D-mano-octulosónico (KDO). Preferentemente, la cepa bacteriana mutante rugosa profunda está seleccionada del género Salmonella. Más preferentemente, si la cepa bacteriana mutante rugosa profunda es del género Salmonella, es de la especie Salmonella minnesota e incluso más preferentemente es la cepa R595 de Salmonella minnesota. Pueden usarse otras cepas bacterianas mutantes rugosas profundas, tales como cepas de Proteus mirabilis, entre otras.
Puede usarse cualquier técnica apropiada para cultivar una cepa bacteriana mutante rugosa profunda. Normalmente, esto implicará el uso de al menos un biorreactor a escala comercial. En una realización, la técnica implica inocular un biorreactor relativamente pequeño (por ejemplo 15 l) con células de la cepa bacteriana mutante rugosa profunda, cultivar la cepa bacteriana mutante rugosa profunda hasta una fase estacionaria, seguido de transferencia aséptica del caldo de células de 15 l a un biorreactor grande (por ejemplo, 750 l).
El cultivo puede realizarse sobre cualquier medio conocido o descubierto para permitir el crecimiento de la cepa bacteriana mutante rugosa profunda. En una realización preferida, el medio es M9, una mezcla de sales inorgánicas complementada con dextrosa y casaminoácidos. La composición de M9 es muy conocida para un experto habitual en la técnica.
Después de obtenerse la cepa bacteriana mutante rugosa profunda en fase estacionaria durante al menos aproximadamente 5 h, las células pueden recogerse del cultivo y pueden extraerse LPS de las células. Pueden emplearse técnicas conocidas para recoger las células del cultivo y extraer LPS de las células, aunque una técnica preferida para extraer LPS de las células se describe a continuación.
La recogida puede realizarse por cualquier técnica conocida. En una realización preferida, después de que se ha mantenido el cultivo en fase estacionaria durante al menos aproximadamente 5 h, los contenidos del biorreactor se bombean a un aparato de filtración tangencial para separar el medio agotado de las células.
El LPS se extrae posteriormente de las células por cualquier técnica apropiada. Técnicas conocidas incluyen el procedimiento de Galanos, que implica extraer LPS con una mezcla de fenol, cloroformo y éter de petróleo (PCP), seguido de evaporación del cloroformo y éter de petróleo, adición de acetona y agua para precipitar LPS y recuperación del LPS por centrifugación o filtración (Galanos y col., Eur. J. Biochem. 9:245 (1969)) y el procedimiento de Chen, citado anteriormente, que implica extraer LPS con una mezcla de cloroformo y metanol (CM), seguido de una serie de etapas de precipitación en metanol.
Una mejora del procedimiento de Chen se describe más adelante y se prefiere para la fabricación de LPS y sus derivados para aplicaciones comerciales.
Independientemente de la técnica de extracción, el resultado es un LPS secado sustancialmente puro que puede procesarse adicionalmente por hidrólisis ácida e hidrólisis básica secuenciales para formar 3D-MLA, como se enseña por Ribi, patente de EE.UU. n.º: 4.436.727 y Myers y col., patente de EE.UU. n.º: 4.912.094. Para resumir las enseñanzas de estas referencias como una realización preferida para la formación de 3D-MLA, el LPS se hace reaccionar con un ácido orgánico o inorgánico y luego se liofiliza para producir MLA. El ácido inorgánico es preferentemente ácido clorhídrico, ácido sulfúrico o ácido fosfórico. El ácido orgánico es preferentemente ácido toluenosulfónico o ácido tricloroacético. La reacción puede realizarse a una temperatura de entre aproximadamente 90 ºC y aproximadamente 130 ºC durante un tiempo suficiente para completar la hidrólisis, comúnmente entre aproximadamente 15 min y aproximadamente 60 min. El MLA puede tratarse con un disolvente, preferentemente acetona, para disolver ácidos grasos y otras impurezas y se elimina el disolvente de ácidos grasos rico en impurezas.
Posteriormente, el MLA se somete a tratamiento alcalino suave para eliminar selectivamente el ácido β-hidroximirístico de la posición 3 del MLA (en condiciones alcalinas suaves, solo el ácido β-hidroximirístico en la posición 3 es lábil). El tratamiento alcalino suave puede llevarse a cabo en medios acuosos u orgánicos. Disolventes orgánicos apropiados incluyen metanol u otros alcoholes, sulfóxido de dimetilo (DMSO), dimetilformamida (DMF), cloroformo, diclorometano o mezclas de los mismos, entre otros. También pueden emplearse combinaciones de agua y disolventes orgánicos miscibles con agua.
La base alcalina usada para realizar la hidrólisis está seleccionada preferentemente de hidróxidos, carbonatos, fosfatos
o aminas. Bases inorgánicas ilustrativas incluyen hidróxido sódico, hidróxido potásico, carbonato sódico, bicarbonato potásico, bicarbonato sódico y bicarbonato potásico, entre otras. Bases orgánicas ilustrativas incluyen alquilaminas (tales como dietilamina y trietilamina, entre otras), entre otras.
En medios acuosos, el pH está normalmente entre aproximadamente 10 y aproximadamente 14, preferentemente entre
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aproximadamente 10 y aproximadamente 12. La reacción de hidrólisis se realiza normalmente a de aproximadamente 20 ºC a aproximadamente 80 ºC, preferentemente de aproximadamente 50 ºC a aproximadamente 60 ºC, durante un periodo de aproximadamente 10 min a aproximadamente 48 h.
Una técnica preferida para la hidrólisis alcalina implica disolver MLA en CM 2:1 (v/v), saturar la solución con un tampón acuoso de Na2CO3 0,5 M a pH 10,5 y luego evaporar al vacío el disolvente a 45-50 ºC con un aspirador al vacío (aproximadamente 13332,2 pascales (100 mm de Hg)).
La presente invención se refiere a un procedimiento de extracción de lipopolisacárido (LPS) de un cultivo de células de cepa bacteriana mutante rugosa profunda, que comprende:
- a.
- extraer las células con una solución que consiste esencialmente en al menos el 75 % en peso de un alcohol alifático que tiene de 1 a 4 átomos de carbono y en el agua del resto; produciendo de este modo células con contenido fosfolipídico reducido;
- b.
- extraer las células con contenido fosfolipídico reducido con una solución que comprende cloroformo y metanol, produciendo de este modo una solución de LPS en cloroformo y metanol, en la que la extracción con alcohol alifático se lleva a cabo a una temperatura entre 35 ºC y 65 ºC.
Las células de cepa bacteriana mutante rugosa profunda, el cultivo de las mismas y procedimientos de preparación del cultivo son como se han descrito anteriormente. Preferentemente, la cepa bacteriana mutante rugosa profunda está seleccionada de los géneros Salmonella o Escherichia. Más preferentemente, si la cepa bacteriana mutante rugosa profunda es del género Salmonella, es de la especie Salmonella minnesota e incluso más preferentemente es la cepa R595 de Salmonella minnesota. Si la cepa bacteriana mutante rugosa profunda es del género Escherichia, más preferentemente es de la especie Escherichia coli y más preferentemente es la cepa D31m4 de Escherichia coli.
La primera etapa de extracción puede realizarse con cualquier alcohol alifático de cadena corta. El alcohol alifático puede ser lineal, ramificado o cíclico. Preferentemente, el alcohol alifático tiene de 2 a 4 átomos de carbono y es miscible con agua. Más preferentemente, el alcohol alifático es etanol.
La solución que comprende el alcohol alifático puede comprender cualquier proporción de alcohol alifático del 75 % en peso o superior. Preferentemente, la solución comprende entre aproximadamente el 85 % en peso y aproximadamente el 95 % en peso de alcohol alifático. Esencialmente, el resto de la solución es agua. Pueden estar presentes trazas de otros compuestos como resultado de purificación incompleta u otra contaminación del alcohol alifático y componentes del agua de la solución.
La temperatura a la que se realiza la primera etapa de extracción puede ser cualquier temperatura que sea eficaz en proporcionar extracción suficiente del fosfolípido de las células cultivadas. Preferentemente, la temperatura está entre aproximadamente 35 ºC y aproximadamente 65 ºC. Más preferentemente, la temperatura está entre aproximadamente 45 ºC y aproximadamente 55 ºC.
Otros parámetros de la primera etapa de extracción, tales como tasa de adición de la solución de alcohol alifático, duración del contacto de la solución y las células y agitación o ausencia de la misma, entre otros, pueden variarse rutinariamente por un experto habitual en la técnica.
La primera etapa de extracción da como resultado (i) una fase de solución de alcohol alifático rica en fosfolípidos y (ii) células con un contenido de fosfolípidos reducido. El componente de LPS de las membranas celulares se segrega sustancialmente completamente con las células con un contenido de fosfolípidos reducido.
La segunda etapa de extracción implica extraer las células con un contenido de fosfolípidos reducido con una solución de cloroformo:metanol (CM).
Cualquier proporción de cloroformo y metanol conocida por ser adecuada para su uso en extraer LPS de las membranas celulares (tal como en el procedimiento de Chen) puede usarse en la segunda etapa de extracción. Normalmente, la proporción de cloroformo con respecto a metanol es de aproximadamente 2:1 a aproximadamente
9:1. También pueden usarse mezclas de disolventes con propiedades equivalentes a aquellas de CM para obtener LPS de las células con un contenido de fosfolípidos reducido.
Una ventaja del presente procedimiento con respecto al procedimiento de Chen se encuentra en la eliminación de fosfolípido en la primera etapa de extracción. Mientras que la extracción con CM del procedimiento de Chen da como resultado una solución de LPS que contiene niveles sustanciales de fosfolípidos, la segunda etapa de extracción de la presente invención, que se realiza sobre células con un contenido de fosfolípidos reducido, da como resultado una solución rica en LPS que está sustancialmente desprovista de fosfolípidos. Procedimientos alternativos de producir preparaciones de LPS que están relativamente libres de fosfolípidos, tales como el procedimiento de Galanos (véase anteriormente), son menos deseables debido a que no son flexibles para producción a gran escala, usan mezclas de
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disolventes que plantean problemas de salud y de seguridad (por ejemplo, fenol:cloroformo:éter de petróleo), o ambos.
Dada la ausencia sustancial de fosfolípido de la solución de LPS, la purificación adicional del LPS según este procedimiento es generalmente más simple y menos cara que con el procedimiento de Chen. Se ha encontrado que puede formarse un residuo de LPS seco de pureza suficiente evaporando el cloroformo y metanol de la solución de LPS.
Opcionalmente, el LPS puede procesarse adicionalmente, tal como por las etapas de hidrólisis ácida y de hidrólisis básica descritas anteriormente, para producir MLA o 3D-MLA.
El 3D-MLA producido siguiendo los procedimientos descritos anteriormente puede usarse para una diversidad de propósitos. Un uso preferido es un inmunoestimulante o adyuvante para composiciones farmacéuticas que comprenden un polinucleótido inmunogénico, polipéptido, anticuerpo, linfocito T o célula presentadora de antígeno (APC). Un inmunoestimulante o adyuvante se refiere a esencialmente cualquier sustancia que intensifique o potencie una respuesta inmunitaria (mediada por anticuerpos y/o células) a un antígeno exógeno.
Una respuesta inmunitaria que puede estimular el MLA o 3D-MLA producido según la presente invención es la tipo Th1. Se ha observado que una combinación de monofosforil lípido A 9 (MLA), preferentemente 3-O-desacil-monofosforil lípido A (3D-MLA), junto con una sal de aluminio es eficaz como un adyuvante para provocar una respuesta predominantemente de tipo Th1. Altos niveles de citocinas tipo Th1 (por ejemplo, IFN-γ, TNFα, IL-2 y IL-12) tienden a favorecer la inducción de respuestas inmunitarias mediadas por células a un antígeno administrado. Por el contrario, altos niveles de citocinas tipo Th2 (por ejemplo, IL-4, IL-5, IL-6 y IL-10) tienden a favorecer la inducción de respuestas inmunitarias humorales. Tras la administración de una composición farmacéutica que comprende MLA o 3D-MLA, un paciente sustentará una respuesta inmunitaria que incluye respuestas tipo Th1 y Th2. Cuando la respuesta es predominantemente tipo Th1, el nivel de citocinas tipo Th1 aumentará a un mayor grado que el nivel de citocinas tipo Th2. Los niveles de estas citocinas pueden evaluarse fácilmente usando ensayos convencionales. Para una revisión de las familias de citocinas véase Mosmann y Coffman, Ann. Rev. Immunol. 7:145-173, 1989.
En una realización preferida, el sistema adyuvante incluye la combinación de un monofosforil lípido A (MLA), preferentemente 3D-MLA, con un derivado de saponina (tal como QuiI A o derivados del mismo, que incluyen QS21 y QS7 (Aquila Biopharmaceuticals Inc., Framingham, MA); escina; digitonina; o saponinas de Gypsophila o Chenopodium quinoa), tal como la combinación de adyuvante de QS21 y 3D-MLA, como se describe en el documento WO 94/00153,
o una composición menos reactogénica en la que QS21 se inactiva con colesterol, como se describe en el documento WO 96/33739. Otras formulaciones preferidas comprenden una emulsión aceite en agua y tocoferol. Otra formulación de adyuvante particularmente preferida que emplea QS21, 3D-MLA y tocoferol en una emulsión aceite en agua se describe en el documento WO 95/17210.
Ejemplo 1 -Procedimientos generales
A. Preparación de medios
El cultivo celular se llevó a cabo en medio M9, que se prepara combinando soluciones estériles de sales inorgánicas, casaminoácidos y dextrosa. La solución salina M9 se prepara normalmente en el fermentador y contiene las siguientes sales: 2,0 g/l de NaCl, 0,2 g/l de MgSO4·7H2O, 3,0 g/l de KH2PO4, 6,0 g/l de Na2HPO4 y 1,0 g/l de NH4Cl. Soluciones estériles de 20 % (peso/volumen) de casaminoácidos (20 ml/l) y 50 % (peso/volumen) de dextrosa (32 ml/l) se añaden entonces asépticamente al fermentador para producir el medio completo.
B. Crecimiento inicial
Normalmente, un matraz Erlenmeyer de 250 ml estéril se cargó con 50 ml de medio M9 estéril. Un vial inicial de R595 de Salmonella minnesota (aprox. 108 ufc) se descongeló y se añadió al matraz, que luego se tapó con un tapón de gasa. El cultivo se incubó a 37 ºC durante 6-8 h, hasta que es evidente crecimiento fuerte.
C. Crecimiento celular
Cultivos de R595 de Salmonella minnesota se cultivaron en un fermentador BioFlo III (New Brunswick Scientific, Inc.) equipado con un recipiente de vidrio de 2,5 l. En una ejecución típica, el recipiente se cargó con 2,0 l de solución de sales M9, se esterilizó en autoclave y las soluciones estériles de casaminoácidos y dextrosa se añadieron luego asépticamente. El fermentador se equipó con líneas de alimentación para antiespumante (0,1 % de SAG-471, Witco Corp.) y NH4OH (30 %), además de sondas para pH, dO2 y espuma. El medio se ajustó a pH 6,9 usando la alimentación de NH4OH. El fermentador se inoculó luego con el cultivo inicial entero y se incubó a 37 ºC con burbujeo de aire (normalmente 2,0 l/min) y agitación (normalmente 50 rpm). La fase de crecimiento del cultivo se monitorizó midiendo la densidad óptica a 590 nm. Las células se recogieron por tanto centrifugación como filtración de flujo tangencial, se lavaron con agua y se liofilizaron.
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D. Extracción de lipopolisacárido (LPS)
Se aisló LPS de acuerdo con el procedimiento de Qureshi y col. (1986) con leves modificaciones. En una ejecución típica, las células secadas se agitaron primero a una concentración de 20 mg/ml en 90 % de etanol (v/v) a temperatura ambiente durante 1 h y luego se recuperaron por filtración al vacío. Las células se sometieron a una segunda extracción con etanol, seguida de extracciones secuenciales con acetona y éter dietílico (15 min cada una, ambas a 40 mg/ml, en base al peso inicial) y el polvo de éter resultante se dejó secar al aire durante la noche. Mientras tanto, se preparó una solución de fenol (89 %):cloroformo:éter de petróleo 19:45:72 (v/v/v; abreviado PCP) y se dejó reposar durante la noche. El polvo de éter se suspendió en PCP, que se separó por decantación del exceso de agua, a una concentración de 70 mg/ml. La solución se agitó durante 30 min y luego se centrifugó (3000 x g, 15 min, 0-5 ºC). La fracción de sobrenadante se decantó en un matraz redondo y el sedimento de células se extrajo una segunda vez con PCP. Las fracciones de sobrenadante se combinaron y se evaporaron rotatoriamente a 40 ºC hasta que todos los disolventes volátiles se eliminaron en gran parte. Después se midió el volumen que queda. Se añadió agua gota a gota hasta que fue evidente una turbidez persistente y luego se añadieron 5 volúmenes de acetona seguidos de 1 volumen de éter dietílico (ambos enfriados en un baño de hielo) a la solución de fenol con mezclado rápido. La solución se dispuso en un baño de hielo durante 30 min y después el LPS precipitado se recuperó por centrifugación (5000 x g, 15 min, 0-5 ºC). Generalmente fue necesario filtrar por gravedad la fracción de sobrenadante para recuperar cualquier LPS que no quedó en el sedimento. El LPS se lavó una vez en un volumen mínimo de acetona fría, se recuperó por centrifugación/filtración y luego se secó al vacío. Rendimientos típicos fueron del 4-5 % en base al peso seco inicial de las células.
E. Preparación de 4'-monofosforil-lípido A (MLA)
Se suspendió LPS en agua a una concentración de 10 mg/ml, usando sonicación en baño a 45-55 ºC para ayudar en la dispersión del material sólido. La solución resultante debe ser ligeramente turbia sin sólido visible a simple vista. A esta solución se añadió 1 volumen de HCl 0,2 N y luego se dispuso en un baño de agua hirviendo durante 15 min. La reacción se inactivó en un baño de hielo y luego se extrajo con 5 volúmenes (con respecto a la solución de LPS inicial) de cloroformo:metanol 2:1 (v/v). La solución bifásica se agitó con vórtex y las fases se separaron por centrifugación a baja velocidad (500-1000 x g). La fase inferior se recuperó y se evaporó en nitrógeno, dando MLA en bruto.
F. Preparación de 3-O-desacil-4'-monofosforil-lípido A (3D-MLA)
MLA en bruto se disolvió en cloroformo:metanol 2:1 (v/v) a una concentración de entre aproximadamente 1-5 mg/ml y 3,0 ml de esta solución se transfirieron a un tubo de ensayo de 16 x 100 mm. Se añadieron 0,4 ml adicionales de metanol al tubo y luego se dispuso en un baño de agua a 50 ºC durante 10 min. La reacción se inició mediante la adición de 40 µl de KHCO3 0,5 M, pH 10,5 y la solución se incubó a 50 ºC durante 20 min. Al final de este tiempo, el tubo se sacó del baño de agua y la reacción se inactivó mediante la adición de 2,0 ml de HCl 0,1 N (enfriado), seguido de agitación con vórtex. Se recuperó 3D-MLA mediante la adición de 1,0 ml de metanol, agitación con vórtex, centrifugación (500-1000 x g) y evaporación de la fase inferior (orgánica) a sequedad en nitrógeno.
Ejemplo 2 -Procedimientos analíticos
A. Cromatografía en capa fina (CCF) de MLA y muestras relacionadas
Todos los análisis de CCF se llevaron a cabo usando placas de 5 x 10 cm recubiertas con gel de sílice 60 (E Merck). Las muestras se aplicaron generalmente a las placas de CCF como soluciones de 10 mg/ml en cloroformo:metanol 4:1 (v/v), aplicándose 3 µl de solución (30 µg de muestra) en pequeñas manchas a una línea de 5 mm usando una pipeta capilar. Las placas se revelaron con un sistema de disolventes que comprendía cloroformo/metanol/agua/hidróxido de amonio 50:31:6:2 (v/v). Las bandas sobre las placas reveladas se visualizaron pulverizando con una solución de 10 % (peso/volumen) de ácido fosfomolíbdico en etanol, seguido de chamuscamiento a 150-160 ºC. En algunos casos, las intensidades relativas de las manchas se cuantificaron por densitometría de barrido con un Shimadzu CS9000U Dual Wavelength Flying Spot Scanner (Shimadzu Corp.), usando una longitud de onda de barrido de 520 nm.
B. Análisis de MLA/3D-MLA por cromatografía líquida de alta resolución (HPLC)
Las muestras a analizar se convirtieron primero en la forma de ácido libre lavando una solución de 3-5 mg de muestra en 5 ml de cloroformo:metanol (2:1 v:v) con 2 ml de HCl 0,1 N. El sistema bifásico se agitó con vórtex, se centrifugó y la fase (orgánica) inferior se transfirió a un tubo de ensayo y se evaporó en una corriente de nitrógeno. El residuo se metiló después mediante tratamiento con diazometano. Brevemente, una solución etérea de diazometano se preparó disponiendo 60-100 mg de 1-metil-3-nitro-1-nitrosoguanidina (MNNG; Aldrich) en un vial de 2 dracmas (7,10 ml), añadiendo 60 µl de éter dietílico por mg de MNNG, luego añadiendo 9 µl de NaOH 5 N por mg de MNNG agitando mientras la solución a <-10 ºC. Tras la finalización de la reacción, la fase de éter de color amarillo limón se secó transfiriéndola a un segundo vial que contenía varios sedimentos de NaOH y rotando, todo mientras está a <-10 ºC. La muestra lavada con ácido se disolvió en 1 ml de cloroformo:metanol 4:1 (v:v), se dispuso en un baño a <-10 ºC y se añadió gota a gota con agitación solución de diazometano hasta que persistió un tono amarillo débil. El disolvente se
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evaporó después a temperatura ambiente en una corriente de nitrógeno y se secó adicionalmente al vacío durante al menos 30 min.
Se realizaron análisis cromatográficos sobre una columna de fase inversa C18 (Nova-Pak, 4 µm de tamaño de partícula, 8 mm x 10 cm [Waters]). Las muestras metiladas se disolvieron en cloroformo:metanol 4:1 (v/v) a una concentración de 100 µg/ml y se hicieron pasar a través de un filtro de jeringuilla de PTFE de 0,45 µm. Normalmente se usó un volumen de inyección de 20-25 µl, seguido de elución con un gradiente lineal del 20 al 80 % de isopropanol en acetonitrilo durante 60 min a un caudal de 2 ml/min con monitorización a 210 nm.
C. Análisis del contenido de congéneres de LPS por HPLC
LPS tiende a ser un material altamente heterogéneo debido a la variabilidad en 1) el número de residuos de azúcar en el antígeno O y regiones centrales, 2) sustituciones polares en la región central y sobre los fosfatos en el lípido A y 3) el número y localización de ácidos grasos unidos al esqueleto del lípido A. Es esta última fuente de variabilidad la que es de interés con respecto al contenido de congéneres de 3D-MLA (MPL®). La hidrólisis de LPS a MLA y 3D-MLA elimina la variabilidad en el antígeno O y las regiones centrales; sin embargo también introduce heterogeneidad adicional debido a la pérdida incontrolada de ácidos grasos ligados a O. Esto evita que el patrón de acilación en el LPS intacto se conozca con exactitud. Como una forma de evitar esto, se desarrolló un procedimiento en el que los fosfatos y la región central se eliminaban en condiciones suaves que no producían la pérdida de ácidos grasos ligados a O. El lípido A desfosforilado resultante (fosforil lípido A cero, o ZPL) puede entonces analizarse por HPLC, proporcionando una reflexión precisa del patrón de acilación en el LPS parental.
El procedimiento se llevó a cabo normalmente como sigue. Se hidrolizaron entre 0,5-5,0 mg de muestra de LPS en 200 µl de ácido fluorhídrico concentrado durante 3-4 h a 27 ºC. Esta reacción debe hacerse en un tubo de teflón herméticamente cerrado y en una campana extractora bien ventilada. El HF se eliminó mediante evaporación en una corriente de nitrógeno a temperatura ambiente y el hidrolizado se disolvió entonces en cloroformo:metanol 4:1 (v/v) y se transfirió a un tubo de ensayo de vidrio de 16 x 100 mm y el disolvente se evaporó en una corriente de nitrógeno. El residuo se suspendió en 1,0 ml de 0,1 % de trietilamina usando sonicación en baño, se añadió 1,0 ml de NaOAc 40 mM y el tubo se suspendió en un baño de agua hirviendo durante 30-45 min. La reacción se inactivó enfriando en un baño de hielo y el ZPL se recuperó por extracción con 5 ml de cloroformo:metanol 2:1 (v/v). La fase orgánica se transfirió a un vial de tapa roscada pequeño y el disolvente se evaporó en nitrógeno. El ZPL se derivatizó añadiendo 200 µl de 10 mg/ml de O-(3,5-dinitrobencil)hidroxilamina·HCl (Regis Technologies, Inc.) en piridina, cerrando herméticamente el vial, luego incubando a 60 ºC durante 3 h. La piridina se evaporó en nitrógeno y el residuo se secó adicionalmente al vacío durante >30 min. El residuo se suspendió después en 500 µl de cloroformo:metanol 2:1 (v/v) y se cargó sobre un lecho de 0,5-1,0 ml de Accell-QMA (forma de acetato; Waters) que se había equilibrado previamente en el mismo disolvente. La columna se aclaró con un total de 5,0 ml de cloroformo:metanol 2:1 (v/v) en varias pequeñas porciones y el eluato se recogió en un tubo de ensayo de 16 x 100 mm. Se añadieron 2,0 ml de HCl 0,1 N al eluato, el sistema bifásico se agitó con vórtex, se centrifugó brevemente a 500-1000 x g y la fase inferior (orgánica) se transfirió a otro tubo de ensayo y se evaporó en nitrógeno. El residuo se disolvió en 100-300 µl de cloroformo:metanol
4:1 (v/v) y se filtró a través de un filtro de jeringuilla de PTFE de 0,45 µm. El filtro se aclaró dos veces con cloroformo:metanol 4:1 (v/v) y el filtrado se evaporó en nitrógeno. El filtrado se recogió finalmente en 50-150 µl de cloroformo:metanol 4:1 (v/v) y se transfirió a un vial de autoinyector para análisis por HPLC. Las condiciones de HPLC fueron del siguiente modo: columna de fase inversa C18 (por ejemplo, Waters), volumen de inyección de 10 µl, gradiente lineal del 20 al 80 % de isopropanol en acetonitrilo durante 60 min a un caudal de 2 ml/min, monitorización a 254 nm.
Ejemplo de referencia 3 -Comparación de composición de congéneres de MLA/3D-MLA de cultivos recogidos en momentos diferentes
Se realizó una serie de ejecuciones en fermentador con los siguiente parámetros: 2,0 l de medio M9 (pH inicial 6,846,87), 2 l/min de flujo de aire, agitación a 50 rpm, 37 ºC, sin control de pH. Los cultivos se monitorizaron midiendo la densidad óptica a 590 nm y se detuvieron cuando se obtuvo la fase de crecimiento deseada. Las células se procesaron y se extrajeron como se ha descrito anteriormente produciendo muestras de LPS, que luego se hidrolizaron a MLA y 3D-MLA y se analizaron por HPLC (véanse los Ejemplos 1 y 2). Los resultados se resumen en la Tabla 1.
Tabla 1. Composición de congéneres de MLA y 3D-MLA de células recogidas a diferentes edades.
- Ejecución
- Descripción Edad del cultivo en la recogida Tiempo en fase estacionaria MLA 3D-MLA
- 3-O-desacilhexaacilo
- heptaacilo
- 3-O-desacilhexaacilo
- A
- Exponencial tardía 6,75 h N/A 12,4 % 12,2 % 9,9 %
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(continuación)
- Ejecución
- Descripción Edad del cultivo en la recogida Tiempo en fase estacionaria MLA 3D-MLA
- 3-O-desacil
- heptaacilo
- 3-O-desacil
- hexaacilo
- hexaacilo
- B
- Fase 9,5 h ~0,5 h 9,2 % 6,8 % 9,2 %
- estacionaria
- temprana
- C
- Fase 15 h ~6 h 19,5 % 13,2 % 21,5 %
- estacionaria
- tardía
Los datos muestran que los cultivos de R595 de S. minnesota alteran el patrón de acilación de su LPS durante la fase estacionaria, produciendo un aumento en el contenido global de 3-O-desacil-hexaacilo más especies de heptaacilo en MLA derivado de este LPS y esto da lugar a su vez a contenido elevado de especies de 3-O-desacil-hexaacilo en 3D
5 MLA preparado a partir de este MLA.
Ejemplo de referencia 4 -Comparación de la composición de congéneres de LPS de cultivos recogidos en diferentes momentos
Se realizó una serie de ejecuciones en fermentador con los siguiente parámetros: 2,0 l de medio M9 (pH inicial 6,846,87), 2 l/min de flujo de aire, agitación a 225 rpm, 37 ºC, sin control de pH. La fase de crecimiento de los cultivos se
10 monitorizó midiendo la densidad óptica a 590 nm. Las células se procesaron y se extrajeron como se ha descrito en el Ejemplo 1 proporcionando muestras de LPS. Las muestras de LPS se hidrolizaron a ZPL y se analizaron por HPLC como se describe en Ejemplo 2. Los resultados se resumen en la Tabla 2.
Tabla 2. Composición de congéneres de LPS de células recogidas a diferentes edades.
- Ejecución
- Descripción Edad del cultivo en el momento Tiempo en fase Contenido de congéneres
- de la recogida
- estacionaria 3-O-acilhexaacilo 3-O-desacilhexaacilo heptaacilo
- A
- Fase estacionaria temprana 9 h ~0,5 h 76 % 0 % 24 %
- B
- Fase estacionaria tardía 15 h ~6 h 48 % 17 % 19 %
15 No se detectó componente de 3-O-desacil-hexaacilo en el LPS de las células en la fase estacionaria temprana (ejecución A). Así, la única fuente de congéneres hexaacilados en 3D-MLA preparado a partir de este LPS sería el material heptaacilado (24 %). Por el contrario, el LPS de células recogidas en la fase estacionaria tardía contuvo especies tanto de heptaacilo como de 3-O-desacil-hexaacilo (19 % y 17 %, respectivamente). Ambas de estas especies contribuirían al contenido de hexaacilo en 3D-MLA (MPL®) preparado a partir de este LPS. Fue inesperado
20 encontrar que las células producen especies de LPS de 3-O-desacil-hexaacilo en ciertas condiciones.
Ejemplo 5 -Efecto de la temperatura de pre-extracción sobre la pureza de LPS de R595 de S. minnesota
Células de R595 de S. minnesota se cultivaron en un fermentador de 80 l (New Brunswick Scientific) usando esencialmente las mismas condiciones que se han explicado resumidamente en el Ejemplo 1. Las células se concentraron por filtración de flujo tangencial, pero no se centrifugaron y la suspensión contenía 51,5 mg de masa 25 celular seca por ml. Se prepararon tres soluciones en las que alícuotas de 150 ml de la suspensión de células se combinaron cada una con 600 ml de etanol. Las soluciones de etanol se agitaron durante 1 h a 22 ºC, 37 ºC y 50 ºC y se filtraron. Las células se sometieron a una segunda extracción con etanol según las mismas condiciones salvo porque se usó 95 % de etanol. Las células se recuperaron por filtración por succión y luego se extrajeron durante la noche en cloroformo:metanol 4:1 (v/v) a 50 ºC. Las soluciones se filtraron y los filtrados se evaporaron rotatoriamente a 30 sequedad, proporcionando las preparaciones de LPS. Las muestras de los filtrados de las extracciones con etanol
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primera y segunda obtenidas a cada temperatura además del LPS obtenido de las células pre-extraídas se analizaron por cromatografía en capa fina según el procedimiento en el Ejemplo 2. Las imágenes de las placas de CCF se muestran en la Figura 1.
La Figura 1 muestra placas de CCF de extractos de etanol y muestras de LPS obtenidas con diferentes temperaturas
5 durante las extracciones con etanol. La placa de la izquierda muestra, yendo de izquierda a derecha, los extractos de etanol a temperaturas de 22 ºC, 37 ºC y 50 ºC. La muestra en el extremo derecho de esta placa es una muestra de LPS auténtica. La placa a la derecha muestra el LPS obtenido de cada preparación. Las muestras en los carriles 3, 4 y 5 se corresponden con LPS de células sometidas a pre-extracciones con etanol a 22 ºC, 37 ºC y 50 ºC, respectivamente. Las bandas pesadas a Rf~0,6 se corresponden con fosfolípido e impurezas de ácidos grasos. Los niveles de estas
10 impurezas se reducen aumentando la temperatura de las extracciones con etanol y son muy bajos en la muestra que se pre-extrajo a 50 ºC.
Es evidente a partir de las placas de CCF en la Figura 1 que la pre-extracción con etanol a temperaturas elevadas es eficaz en la eliminación de impurezas que de otro modo se co-extraen con cloroformo:metanol 4:1 (v/v). La preextracción a 50 ºC da como resultado LPS que está ampliamente libre de estas impurezas.
15 Ejemplo 6 -Comparación de LPS obtenido con pre-extracción con etanol y sin pre-extracción con etanol
Tres lotes de células de R595 de S. minnesota se cultivaron en un fermentador de 750 l (B. Braun) usando esencialmente las mismas condiciones que se han explicado resumidamente en el Ejemplo 1. Las células se recogieron por filtración de flujo tangencial y una muestra de la suspensión de células se obtuvo de cada lote y se liofilizó. La masa de las células se sometió a dos pre-extracciones con 90 % de etanol a 50 ºC durante 1 h. Las células 20 se recuperaron por filtración de flujo tangencial entre extracciones. Las células se extrajeron luego durante la noche con cloroformo:metanol 4:1 (v/v) a reflujo. El extracto se recuperó por filtración de flujo tangencial y se evaporó a sequedad. Las muestras de células liofilizadas se extrajeron durante la noche en cloroformo:metanol 4:1 (v/v) a reflujo y las soluciones se filtraron y los filtrados se evaporaron a sequedad. Las muestras de LPS obtenidas con y sin preextracción con etanol se analizaron por CCF esencialmente como se describe en el Ejemplo 2. Las placas de CCF se
25 escanearon desde aproximadamente Rf=0,01 hasta 0,90 y se calculó la relación de intensidad en la región de LPS (Rf=0,01 a 0,020) con respecto a la intensidad total para cada muestra. Los resultados se dan en la Tabla 3.
Tabla 3. Pureza de LPS de células con y sin pre-extracción con etanol.
- Ejecución
- Número de lote Porcentaje de intensidad total en la región de LPS1
- sin pre-extracción con etanol
- con pre-extracción con etanol
- A
- 48020-B2698C 7 86
- B
- 48020-C0598A 11 83
- C
- 48020-C0598B 14 88
- Nota: 1 Porcentaje de intensidad total en la región de LPS = [(intensidad en Rf=0,01 a 0,20)/(intensidad en Rf=0,01 a 0,90)] x 100
Los resultados en la Tabla 3 demuestran que el LPS obtenido tras la pre-extracción de células de R595 de S. 30 minnesota con 90 % de etanol a 50 ºC es sustancialmente más puro que el material de células sin pre-extracción.
Claims (9)
- E1117634016-10-2014REIVINDICACIONES1. Un procedimiento de extraer lipopolisacárido (LPS) de un cultivo de células de cepa bacteriana mutante rugosa profunda, que comprende:a. extraer las células con una solución que consiste esencialmente en al menos el 75 % en peso de un alcohol alifático5 que tiene de 1 a 4 átomos de carbono y en el agua del resto; produciendo de este modo células con contenido fosfolipídico reducido;b. extraer las células con contenido fosfolipídico reducido con una solución que comprende cloroformo y metanol, produciendo de este modo una solución de LPS en cloroformo y metanol,en el que la extracción con alcohol alifático se lleva a cabo a una temperatura entre 35 ºC y 65 ºC.10 2. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que la cepa bacteriana mutante rugosa profunda es del género Salmonella o Escherichia.
- 3. El procedimiento de la reivindicación 2, en el que la cepa bacteriana mutante rugosa profunda del género Salmonella es de la especie Salmonella minnesota
- 4. El procedimiento de la reivindicación 3, en el que la cepa bacteriana mutante rugosa profunda de la especie 15 Salmonella minnesota es la cepa R595 de Salmonella minnesota
-
- 5.
- El procedimiento de la reivindicación 2, en el que la cepa bacteriana mutante rugosa profunda del género Escherichia es de la especie Escherichia coli.
-
- 6.
- El procedimiento de la reivindicación 5, en el que la cepa bacteriana mutante rugosa profunda de la especie Escherichia coli es de la cepa D31m4 de Escherichia coli.
20 7. El procedimiento de la reivindicación 1, en el que el alcohol alifático tiene de 2 a 4 átomos de carbono. -
- 8.
- El procedimiento de la reivindicación 7, en el que el alcohol alifático es etanol.
-
- 9.
- El procedimiento de la reivindicación 1, en el que la solución que comprende alcohol alifático comprende entre el 85 % en peso y el 95 % en peso de alcohol alifático.
-
- 10.
- El procedimiento de la reivindicación 1, en el que la temperatura está entre 45 ºC y 55 ºC.
25 11. El procedimiento de la reivindicación 1, que comprende adicionalmente evaporar el cloroformo y el metanol de la solución de LPS, produciendo de esta forma un residuo de LPS seco. - 12. El procedimiento de la reivindicación 11, que comprende adicionalmente someter el residuo de LPS a hidrólisis ácida y a hidrólisis básica secuenciales, para formar 3D-MLA.11
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