JP2000509277A - ヒト造血幹細胞及び前駆細胞抗原並びにその使用方法 - Google Patents

ヒト造血幹細胞及び前駆細胞抗原並びにその使用方法

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Abstract

(57)【要約】 造血前駆細胞及び試薬、特に前記抗原に対して特異的に結合する抗体が供給される。抗原の発現は、高い組織特異性である。それは、ヒト骨髄、胎児骨髄及び肝臓、臍帯血及び成人末梢血液に由来する造血前駆細胞のサブセットに基づいて単に検出される。AC133により認識される細胞のサブセットは、CD34brightであり、そしてCD34+集団に存在するCFU-GM活性の実質的にすべてを含む。AC133のこの高い特異性分布は、ヒト造血前駆体及び幹細胞を単離し、そして特徴づけるための試薬としてそれをひじょうに有用にする。AC133抗原の発現のために選択される細胞は、他の造血幹細胞及び前駆細胞マーカーのための選択によりさらに精製され得る。

Description

【発明の詳細な説明】 ヒト造血幹細胞及び前駆細胞抗原並びにその使用方法 技術分野 本発明は、造血幹細胞及び前駆細胞(progenitor cell)により発現された抗原 、及びそのような抗原を、特に細胞分離及び精製のために使用する方法に関する 。 背景 哺乳類血液細胞の高い交代速度(turnover)は、他の血液細胞系統を生ぜしめ ることができる造血幹細胞の供給を必要とする。造血幹細胞の直子孫は、前駆細 胞と呼ばれ、そして1又は複数の系統、すなわちエリスロイド、ミエロイド及び リンパ系統内の種々の細胞型を生ぜしめることができる。幹細胞及び前駆細胞集 団は、骨髄、胎児肝臓、等における全細胞数の数%のみを構成する。それらの集 団は、造血系をもとの集団にもどす(repapulate)それらの能力のために、非常 に興味あるものである。 造血幹細胞及び前駆細胞集団の精製又は富化のための多くの方法が、文献に記 載されて来た。造血前駆細胞は多くの臨床的用途を有するので、それらの方法に かなりの商業的関心がよせられている。前駆細胞移植が、白血病、乳癌及び他の 腫瘍の治療のために化学療法及び放射線と組合わせて現在使用されている。とき おり、移植片拒絶の危険性を回避するために自己由来の移植物が使用されている が、しかし移植細胞集団における腫瘍細胞の存在のために、病気再発の高い危険 性が存在する。従って、より精製された前駆細胞源の移植が好ましい。 遺伝子療法のためのビークルとしての造血前駆細胞の使用にも興味がもたれて いる。臨床的にはまだ証明されてはいないが、造血幹細胞の寿命、及び脈管構造 におけるそれらの子孫(progeny)の散在性(disseminity)は所望の特徴である。多 くのベクター、たとえば造血幹細胞をトランスフェクトすることができる、いく つかのレトロウィルス及びアデノウィルスに基く構造体が記載されて来た。 造血幹細胞及び前駆細胞集団上に見出される、タンパク質及び他の細胞表面マ ーカーは、それらがそれらの集団の同定、分離及び単離のための試薬の調製、及 びそれらの重要な細胞のさらなる特徴化において有用であるので、非常に興味あ るものである。幹細胞の同定及び分離(陽性及び陰性)において使用され得るい くつかの抗原、たとえば幹細胞上に見出されるが、しかし成熟血液細胞上には見 出されないCD34抗原が現在、知られているが、他の抗原、特に所望のクラス及び サブクラスの細胞、特に造血幹細胞及び前駆細胞の精製及び分離を単純にするこ とができる抗原の開発が常に必要とされている。 背景文献 アメリカ特許第5,061,620号は、実質的に均質なヒト造血幹細胞組成物及びそ のような組成物を得る態様を記載する。ストロマ細胞関連の造血が、Paulなど. (1991)Blood 77:1723-1733により記載されている。ローダミン染色による幹 細胞の表現型の同定が、Spangrnde and Johnson(1990)P.N.A.S 87:7433-743 7に論じられている。造血における細胞表面抗原発現が、Straussなど.(1983)Blood 61:1222-1231及びSieffなど.(1982)Blood 60:703-713に論じられて いる。多能性造血細胞の記載が、McNieceなど.(1989)Blood 74:609-612及び Mooreなど.(1979)Blood Cells 5:297-311に見出される。幼若細胞−含有コロニーをインビトロで形成できる ヒト造血前駆細胞の特徴化が、Gordonなど.(1987)J .Cell.Physiol.130:1 50-156及びBrandtなど.(1988)J .Clin.Invest.82:1017-1027に見出される 。移植への前駆細胞の使用が、Toなど.Progenitor Threshold in Transplantat ion (ISBN 1-880854 17-1)pp.15-20に論じられている。前記方法を用いて得ら れる細胞組成物の利用性及び本発明の組成物が、中でもそれらの出版物に記載さ れている。 ヒト造血前駆細胞の単離のための高いグラジエントの磁気分離の使用が、Thom as and Landsdorp(1992)Advances in Bone Merrow Purging pp.537-544;及び Kato and Radbrach(1993)Cytometry 14:384-392に記載されている。ヒト造血 前駆細胞についての磁気選択の他の方法が、Bigasなど.(1992)Advances in B one Merrow Purging pp.545-551;Okuなど.(1992)Advances in Bone Merrow Purging pp.553-560;及びHardwickなど.(1992)Advances in Bone Merrow Pu rging pp.583-589に記載されている。高いグラジエントの磁気細胞分類が、Milt enyiなど.(1990)Cytometry 11:231-238に記載されている。Moldayのアメリ カ特許第4,452,773号は、磁気性鉄−デキストラン微小球の分離を記載し、そし て生物学的材料への結合のために適切な粒子の種々の調製手段を記載する要約を 提供する。 発明の要約 ヒト造血前駆体及び幹細胞の富化及び特徴化のための方法及び組成物が提供さ れる。幹細胞及び前駆細胞上に存在し、そして造血細胞の生物学的(又は他の) 源に存在する莫大な数の細胞からのそれらの重要な細胞の同定及び/又は選択の ために使用され得る、本明 細書においてAC133抗原として言及される抗原が同定された。それら、たとえば 抗体と反応する新規抗原組成物及び試薬が、本発明の方法への使用のために、並 びに造血前駆体及び幹細胞生物学のさらなる研究のために供給される。たとえば 、造血細胞は、種々の源、たとえば胎児及び成人骨髄、サイトカイン可動化(mob ilized)末梢血液細胞、及び胎児肝臓から得られ、そして本発明の試薬及び方法 を用いて分離され得る。 図面の簡単な説明 本発明は今や、一般的に記載され、これは本明細書の一部を形成する図面と一 緒に、特定態様の次の記載に関して、良好に理解されるであろう。 図1は、胎児肝臓細胞の螢光活性化細胞分別(fluorescence activted cell so rting)(FACS)分析からのドット−プロットを示す。y軸はフィコエリトリン( PE)に接合されたAC133抗体による細胞染色を示す。細胞は、HPCA2−FITC(抗 −CD34)により対比染色された(counterstained)。数字は、枠内に含まれる合 計細胞の%を表わす。 図2は、ホルボールミリステートアセテート(PMA)活性化Y79.1細胞上でのAC1 33抗原発現のFACS分析を示すグラフである。 図3は、PMA活性化Y79.1細胞上でのAC133抗原及びCD34発現のFACS分析を示す グラフである。 図4A及び4Bは、胎児肝臓細胞上での抗体AC133,CD38及びHLA−DRの3色FA CS分析からのドット−プロットを示す。図4A中のx軸は、HLA-DR-FITCを表わ し、そしてy軸はAC133−PEによる細胞染色を示す。図4B中のx軸はCD38−FIT Cを表わし、そしてy軸はAC133−PEによる細胞染色を表わす。 図5A,5B,5C及び5Dは、胎児肝臓から精製されたAC133陽性細胞上で の抗体CD38,HLA-DR,CD90及びCD117のFACS分析からのドット−プロットを示す 。図5Aにおいては、x軸はCD38−FITC染色を示し、そしてy軸はHPCA2−PE染 色を示す。図5B,5C及び5Dにおいては、x軸はHPCA2−FITCによる染色を 示す。図5B中のy軸は抗−HLA-DR−PEによる細胞染色を表わす。図5C中のy 軸は抗−CD90−PEによる細胞染色を表わす。図5D中のy軸は抗−CD117−PEに よる細胞染色を表わす。数字は、ボックスゲート内にある合計細胞の%を示す。 図6は、AC133抗体並びに細胞系KG1a及びY79.1による免疫沈殿の結果を示す ゲルである。レーンは次の通りである:1)分子量マーカー;2)未沈殿KG1a溶 解物の1:5希釈物;3)未沈殿Y79.1溶解物の1:50希釈溶液;4)AC101抗 体(CD34)により沈殿したKG1a溶解物;5)AC101抗体により沈殿したY79.1溶 解物;6)HPCA2抗体(CD34)により沈殿したKG1a溶解物;7)HPCA2抗体によ り沈殿したY79.1溶解物;8)16D11抗体(CD34)により沈殿したKG1a溶解物; 9)16D11抗体により沈殿したY79.1溶解物;10)AC133抗体により沈殿したKG1a 溶解物;11)AC133抗体により沈殿したY79.1溶解物;12)AC133及びHPCA2抗体 の混合物により沈殿した、KG1a及びY79.1の混合物の溶解物;13)8A3(抗−CD10 9)抗体により沈殿したKG1a溶解物;14)15G5(抗−CD109)抗体により沈殿されたK G1a溶解物。 図7A及び7Bは、PMA活性化された、ツニカマイシン処理された又は未処理 のY79.1細胞上でのCD56(図7A)及びAC133抗原(図7B)発現のFACS分析を 示すグラフである。 図8は、AC133磁気精製された胎児肝臓細胞のHPCA2−PE(y軸)染色のFACS 分析を示すドット−プロットである。x軸はグリコホ リンA−FITC接合体による染色を示す。 図9A及び9Bは、AC133磁気分離の前及び後の、バフィーコート末梢血液単 核細胞のHPCA2染色のFACS分析を示すドット−プロットである。y軸は、HPCA2 −PEによる染色を示し、x軸は抗−CD45及び抗−CD15−FITC接合抗体による染色 を示す。 図10は、クローン原性アッセイにおけるAC133及びAC101で精製された細胞のク ローニング効率を示す棒グラフである。 図11は、AC133で精製された細胞、及びAC133陰性,CD34陽性細胞のプート効率 を示す棒グラフである。 図12は、AC133抗原についてのDNA及びアミノ酸配列を示す化学式である。 図13は、AC133抗原のトランスメンブラン領域及び他の領域の図解である。 特定の態様の記載 ヒト造血幹細胞及び/又は前駆細胞の富化及び/又は特徴決定に使用される方 法及び組成物が提供される。本明細書においては“前駆”細胞と呼ばれる、造血 幹細胞の直子孫(immediate progeny)は、1又は複数の系統(lineage)内に種々の 細胞型を生じさせることができる。本発明においては、幹細胞及び/又は前駆細 胞のサブセット(すなわち、短期移植(short ingraftment)のために必要とされ るCFU−GM細胞)が、それらの細胞に対して高い特異性を有するAC133抗原(Ag) として本明細書で言及される新しく発見された抗原に特異的に結合する試薬の使 用を通して同定され、又は選択され得る。AC133抗原発現の高い組織特異性は、 高く精製された前駆細胞集団についての富化の間、特に好都合である。AC133− 陽性細胞集団は、前駆細胞活性、特にCFU−GM活性を測定するアッセイにお いて活性的である細胞について高度に富化される。AC133陰性であり、且つCD34 陽性である細胞サブセットは、BFU−E活性、すなわちエリトロイド−コミッテ ッド(committed)前駆細胞活性の測定のために富化される。 AC133抗原に対して特異的に結合する試薬は、生理学的リガンド、合成リガン ド、ポリクローナル抗体及びモノクローナル抗体を包含する。AC133モノクロー ナル抗体は、ヒト骨髄、胎児骨髄及び肝臓、臍帯血及び成人末梢血液に由来する 造血前駆細胞上に発現されるAC133細胞抗原と特異的に相互作用するいづれかの モノクローナル抗体である。AC133に対して向けられる抗体により認識される前 駆細胞のサブセットは、CD34brightであり、そしてCD34+サブセット(及び前駆 細胞の収集において収集されるまだ幹細胞である細胞)に存在する実質的にすべ てのCFU-GM活性を含む。移植のためには、CFU−GMにおいて活性な細胞は、それ らが好中球の生成を提供するので、特に興味あるものである。AC133抗体の使用 は、造血前駆細胞集団の陽性免疫選択、及びフローサイトメトリーを用いての前 駆細胞集団の表現型分析を可能にする。特に、AC133に対する抗体は、短期移植 及び敗血症からの保護のために必要とされるCFU−GM細胞のみならず、さらに、 長期の移植のために必要である原始的な長期のもとの集団にもどる細胞(primiti ve long-term re-populuting cells)を認識する。次に、AC133抗原の発現につい て選択される細胞は、他の造血幹細胞及び前駆細胞マーカーについての選択によ りさらに精製され、そして/又は選択され得る。 下記に詳細に記載されるように、本発明の種々の方法における興味ある分子は 、AC133抗原それ自体、AC133又はそのフラグメントに対して特異的に結合する試 薬、AC133抗原をコードする核酸配列、及びAC133抗原又はそのいづれかのフラグ メントを発現する細胞 集団を包含する。AC133抗原は、天然源から単離され、又は組換えDNA技法を用い て製造され得る。核酸は、cDNA,RNA、ゲノム配列、又はコード配列を単独で、 又は転写調節領域、及び発現及び/又はクローニングベクターに見出される他の 配列と組合して含んで成る合成配列であり得る。AC133 Ag自体は、当業界におい て知られているアフィニティー結合法を用いてAC133抗体結合により陽性として 同定され得る細胞からの単離により精製された形で得られる。陽性同定は、細胞 膜タンパク質のタンパク質分解消化、及び図12に示されるAC133についてのタン パク質配列に対する配列の比較により入手できる。 mAb AC133は、明るい(bright)CD34+細胞上に発現される新規の細胞表面抗原 に対する特異性を有する抗体である。前記抗原は、ヒト骨髄、胎児骨髄及び肝臓 、臍帯血、及び成人末梢血液に由来する造血前駆細胞のサブセット上に発現され る。mAb AC133は、可能性ある治療利点、及びフローサイトメトリーを用いての 前駆細胞集団の表現型分析をもたらす、造血前駆細胞集団を免疫選択するために 磁気ビーズシステムに使用され得る。この新規分子の性質をさらに特長づけるた めに、AC133抗原がイムノアフィニティークロマトグラフィーにより精製された 。AC133抗原は、約120KDの減じられた分子量を有する一本鎖ポリペプチドから成 り、そして約20KDaのN−グリコシド結合多糖類と共に糖タンパク質を含んで成 る。還元されたAC133抗原はmAb AC133により認識され、これは線状エピトープ又 は糖エピトープを示唆する。 そのような分子は、類似性が同じ出発ペプチド構造体からの合成のために、AC 133分子の収集において、糖構造体間に確かに存在するが、ペプチド合成のため に存在する鋳型(すなわち、メッセンジャ−RNA)なしに存在する正確に同一の 糖構造体を、糖合成の酵素 性質のために有することが予測されないことが、糖タンパク質の分野におけるそ れらの実験により認識されるであろう。従って、“AC133抗原”は、グリコシル 化部位に付加される糖構造と共に図12(下記で論ぜられる)に示されるペプチド 構造を有するタンパク質を意味する。糖構造における天然の変動のために、グリ コシル化された分子のための広範囲の分子量がまた、予測され、そして本発明の 範囲内にある。AC133抗原の場合、他の既知のタンパク質に比較して、結合され る糖残基の構造及び大きさにおいて比較的低い変動性が存在すると思われる。AC 133の分子量は典型的には、分子量を測定するために、使用される実験技法の詳 細には無関係に、115〜127KDの範囲にあることが見出されている。 精製されたAC133抗原は、リシルエンドペプチダーゼにより消化されてペプチ ドが生成され、これは逆相HPLCにより単離され、そしてEdman分解により配列決 定された。それらのペプチドは、WERI−Rb−1cDNAライブラリー鋳型を用いての ポリメラーゼ連鎖反応に使用される縮重オリゴヌクレオチドを設計するために使 用される。この技法は、次に、1.7KBの明白な配列を生成し、これは完全なcDNA クローンを単離するために使用された。このcDNAは、2598個のヌクレオチドの単 一の読取り枠をコードし、そして解鎖を除去した抗原について見出される約90KD aの分子量に対応する、96.8KDaの分子量を有する865個のアミノ酸タンパク質を 予測せしめる。疎水度及びトランスメンブランらせん度の分析は、2つの大きな 細胞外ループをもたらす、5つのトランスメンブランドメインの存在を示唆する 。N−結合されるグリコシル化の部位のための合計8個のコンセンサス配列が存 在し、そのすべてが、2つの大きな細胞外ループ及び50個のアミノ酸のC−末端 細胞質テイルを有する本発明者が提案した構造モデルを支持する2つの大きな(2 60及び290個のa.a.)ル ープ上にある。前記細胞質末端を失ったAC133抗原の末端切除されたものはまだ 、mAb AC133により認識される。その生理学的リガンドとの受容体の相互作用に 関与し得る、両細胞外ループにロイシンジッパーモチーフ(leucine zipper mot if)のためのコンセンサス配列が存在する。図13に示されるように、AC133抗原 は、細胞外N−末端及び細胞質C−末端を有する5−トランスメンブランタンパ ク質(“5TMタンパク質”)として現われる。 4MT(また、テトラスパンとも呼ばれる)、7TM及び11TMタンパク質のファミ リーは、文献に特徴づけられている。テトラスパンファミリーの機能は知られて いないが、7TMタンパク質は一般的に、走化性アゴニストを結合するG−タンパ ク質結合の受容体結合であると思われ、そして11TMはイオン−チャンネル受容体 のファミリーを表わす。しかしながら、5TM分子はこれまで記載されておらず、 そしてAC133抗原の構造は、分子量及び細胞外ループの大きさに関して、既知の 7TM種類のメンバーと著しく異なる。さらに、AC133抗原は4TM又は7TMタンパ ク質と配列相同性を共有しないが、該TMメンバーは、特にトランスメンブランド メイン内でお互いと有意な相同性を共有する。 AC133遺伝子の短いフラグメントは、EST(発現された配列標識)、たとえば成人 の網膜、ランゲルハンス島及び胎児の脳として、Genbankに存在する。しかしな がら、AC133抗原の発現は、原始造血幹細胞及びいくつかの神経冠由来の組織に 限定されると思われる。AC133抗原はまた、NT−2奇形癌細胞上に発現され;し かしながら、発現は、それらの細胞が最終的にニューロンに分化するにつれて失 なわれる。AC133抗原(受容体)と生理学的リガンドとの相互作用は、細胞内シ グナルを供給することができる。 AC133抗原に対する発見された元のモノクローナル抗体は、CD34 bright ヒト造血幹細胞及び前駆細胞上に選択的に発現される、約120,000Mrの新 規抗原を定義する抗体のパネルの1つである。CD34bright細胞は長期のB細胞リ ンパ球産生及び骨髄造血をインビトロで支持し、そしてT,B、骨髄単球及び巨 核球のもとの集団へのもどりをインビボで仲介する。CD34dim細胞は、インビト ロ又はインビボで、長期の造血活性を付与しなかった。CD34bright集団は、すべ ての原始幹細胞活性を含み、そして従って、造血幹細胞移植及び遺伝子療法にお けるさらなる研究のために選択される集団である。AC133抗体は、造血幹細胞及 びコミッテット(committed)前駆細胞のサブセットの陽性選択及び表現型分析の ための手段を提供する。最初の特異的抗体AC133、すなわちネズミIgG1抗体は、 精製されたCD34+ヒト前駆細胞により免疫化されたマウスから誘導された。AC133 陽性細胞の正確な抗原表現型を決定するために、AC133及びCD34二重陽性細胞が 、3及び4色FACS分析を用いて、胎児肝臓、胎児及び成人骨髄、臍帯血及び末梢 血液において試験された。すべての組織においてAC133抗体により認識されるサ ブセットは、CD34bright、CD38-/+,HLA−DR+/-である。CD90+,CD117+及びCD10 9+幹細胞集団は、AC133陽性集団内に含まれる。典型的には、AC133はすべてのCD 34+細胞の20〜60%を染色し、その集団は系統に付されていない(non-lineage co mmitted)CD34+集団及び顆粒球/半球路に付された(committed)CD34+細胞のすべ てを含む。AC133抗原の発現は、標準のFACS法により、末梢血液単核細胞、顆粒 球、血小板又は臍帯静脈由来の内皮細胞上で示されない。50人のヒト細胞系のパ ネルに対するFACS分析は、わずか2種の網膜芽腫細胞系、すなわちY79.1及びWE RI−Rb−1が、NT−2奇形癌細胞と共にAC133抗原を発現することを示す。羊胎 児へのAC133陽性細胞の移植は、選択された細胞の移植能力を示しており、そし てその胎児の羊骨髄に 入ったヒト細胞が収穫され、そして二次受容体に移植することが示され、これは 選択された細胞の長期のもとの集団へのもどりの能力を提供する。AC133遺伝子 は、96.8KDaの予測されるサイズを有する、865個のaaから成るポリペプチドをコ ードする。このタンパク質は、膜を5回横切るユニークな構造を有する。従って 、AC133抗原は、哺乳類5TM膜タンパク質の新しいクラスを定義する。それらの データは一緒になって、AC133が造血幹細胞の同定及び分離のためのもう1つの 抗原システムを提供することを示す。 幹細胞及び/又は前駆細胞に選択的に結合する抗体は、特に興味あるものであ る。AC133 Agに対する抗体は、ヒト造血前駆細胞により異種移植免疫担当哺乳類 宿主(たとえば、ネズミ、ゲッ歯動物、ウサギ、羊、ブタ又はウシ宿主)を免疫 化することによって得られる。免疫化のための適切な前駆細胞集団は、サイトカ イン−可動化末梢血液、骨髄、胎児肝臓、又は他の前駆細胞源からCD34+細胞を 単離することによって得られる。細胞は、免疫原としてのそれらの使用の前、フ ィトヘマグルチニンと共にインキュベートされ得る。 免疫化は従来の技法に従って行なわれ、ここで細胞は宿主中に、皮下、筋肉内 、腹腔内、静脈内注射され得る。通常、約106〜108個の細胞が使用され、これは 1回又はそれ以上の回数の注射〜通常、約8回を越えない回数の注射に分けられ 、そして約1〜32週間の期間に及ぶ。この注射はアジュバントを伴って又はそれ を伴わないで行なわれ得;アジュバントの例は完全又は不完全フロイントアジュ バント、スペコール(specol)及びミョウバンを包含する。 好ましい態様においては、対側性免疫化(contralateral immunization)が、 下記例に記載のようにして使用される。この方法は、抗原刺激の部位に向かう免 疫リンパ球の自由に往来する能力による。動物は、身体の片側、たとえば左支脚 皿上の局部で、免疫優性で あるが、しかし無関係な多くの抗原を発現する細胞により予備免疫化される。種 々の造血細胞がこの目的のために使用され得る。注目の免疫原が、動物の反対側 上の局部で注射される。無関係の抗原により予備免疫化され、そしてその抗原に 対して応答するリンパ球が左側の流入リンパ節におびき寄せられ、そして注目の 免疫原に応答するリンパ球が支脚皿注射のために、右側の流入リンパ節、たとえ ば膝窩リンパ節に存在するであろう。この膝窩リンパ節は、融合のために細胞源 として使用され得る。 免疫化スケジュールの完結の後、抗血清が、AC133 Agを包含する造血前駆細胞 の表面膜タンパク質に対して特異的なポリクローナル抗血清を供給するために、 従来の技法に従って収穫され得る。次に、リンパ球が適切なリンパ組織、たとえ ば脾臓又は流出リンパ節から収穫され、そして適切な融合パートナー、通常、骨 髄腫系により融合せしめられ、特異的モノクローナル抗体を分泌するハイブリド ーマが生成される。興味ある抗原特異性についてのハイブリドーマのクローンの スクリーニングが、従来の方法に従って行なわれ得る。 特に次のものが興味あるものである:下記例に記載される特異的モノクローナ ル抗体AC133;AC133抗原に結合する他の抗体(モノクローナル及びポリクローナ ルの両者)、特に交差反応性抗体(すなわち、同じエピトープに結合し、そして 同時結合を実質的に阻害するもの);その種類似体;その結合フラグメント;及 びその接合体。AC133抗原に対する抗体を発現するネズミハイブリドーマ細胞系 の寄託は、1997年4月23日、American Type Cultuce Collection,1230)Parkla wn Drivo,Rockville MD 20852で行なわれ、そしてATCC受託番号 を 与えられた。それらの抗体は、注目の造血細胞サブセットについて免疫選択する ことができる。 抗体が通常のマルチ構造の代わりに一本鎖として生成され得ることは知られて いる。一本鎖抗体は、Jostなど.(1994)J.B.C 269:26267-73、及び多くの他 の文献に記載されている。H鎖の可変領域及びL鎖の可変領域をコードするDNA 配列は、グリシン及び/又はセリンを包含する、少なくとも約4個のアミノ酸の 小さな中性アミノ酸をコードするスペーサーに連結される。この融合体によりコ ードされるタンパク質は、機能的可変領域のアセンブルを可能にし、そして元の 抗体の特異性及び親和性を保持する。 抗体をヒト化する方法もまた、当業界において知られている。ヒト化抗体は、 トランスジェニックヒト免疫グロブリン−不変領域遺伝子を有する動物の生成物 であり得る(たとえば、国際特許出願WO90/10077及びWO90/04036を参照のこと) 。他方では、注目抗体は、CH1,CH2,CH3、ヒンジドメイン及び/又は骨格残 基をその対応するヒト配列により置換する組換えDNA技法により構築され得る(W O92/02190を参照のこと)。 キメラ免疫グロブリン遺伝子の構成へのIg cDNAの使用は、当業界において知 られている(Liuなど.(1987)P.N.A.S 84:3439及び(1987)J .Immunol.15 9:3521)。それらの技法においては、mRNAが抗体を生成するハイブリドーマ又 は他の細胞から単離され、そしてcDNAを生成するために使用される。注目のcDNA は、特異的プライマーを用いて、ポリメラーゼ連鎖反応により増幅され得る(ア メリカ特許第4,683,195号及び第4,683,202号)。他方では、ライブラリーが製造 され、そして注目配列を単離するためにスクリーンされ得る。次に、抗体の可変 領域をコードするDNA配列が、ヒト不変領域配列に融合される。ヒト不変領域遺 伝子の配列は、Kabatなど.(1991)Sequences of Proteins of Immunological Interest ,N.I.H.公開番号91−3242に見出され得る。ヒトC領域遺伝子は、 既知のクローンから容易に入手できる。次に、ヒト化されたキメラ抗体が従来の 方法により発現され得る。 抗体フラグメント、たとえばFv,F(ab')2及びFabフラグメントは、たとえば プロテアーゼ又は化学的分解により注目抗体の切断により調製され得る。あるい は、切断された遺伝が設計され得る。たとえば、F(ab')2フラグメントの部分を コードするキメラ遺伝子は、切断された抗体フラグメントを生成するために、H 鎖のCH1ドメイン及びヒンジ領域をコードするDNA配列、続いて、翻訳停止コド ンを含む。 AC133抗原に対する抗体は、約120KDの見掛け分子量(市販の標準に基づいて、 還元SDS−PAGEゲルからのウェスターンブロット条件下で)を有し、そして一般 的には、約115〜127KDの範囲であるように見えるタンパク質に結合する。AC133 抗体がツニカマイシン−処理されたWERI−Rb−1細胞から免疫沈殿され得ないの で、抗体は糖エピトープを認識すると思われる。AC133抗原は、CD34+細胞のサブ セット上に発現されるが、しかし内皮細胞及び線維芽細胞上には不在である。HL A−DR+,CD90+及びCD117+前駆細胞は、AC133−陽性細胞の集団に包含される(CD 90+としてこれまで知られている抗原は現在、CD90+として知られており;DR陽性 及び陰性、並びにCD38陽性及び陰性細胞はこの集団に包含される)。この集団は 、造血細胞のCD34+サブセットに存在する実質的にすべての造血幹活性を含む。 AC133抗原に特異的に結合する試薬は、抗体に制限されない。1つの種の他の 種への結合を検出する当業界において知られている多くの方法のいづれかが、AC 133抗原−結合試薬の存在についてアッセイするために使用され得る。1つの普 遍的に適合できるアッセイは、放射性ラベルされた試験化合物、及び固相に結合 されるAC133 抗原を用いて検出され得る、溶解相と固相との間の放射能の分布を包含する。AC 133抗原は、たとえばカラムにおける固相に結合され得、そして生理学的緩衝液 におけるチタン−又は14C−ラベルされた試験化合物がそのカラムに通され得る 。結合された放射能は、カラム上で直接的に、又は適用された放射能から、カラ ムを通して通過する溶解相における放射能を引き算することにより検出され得る 。結合親和性は、結合のために十分な時間、平衡化を可能にした後、試験化合物 の種々の濃度での結合された放射能のレベルを測定することによって検出され得 る。AC133に対する結合の特異性は、AC133に結合する試験化合物が成熟血液細胞 上に存在する抗原(又は予備選択されたアッセイ媒体における興味ある他の抗原 )にまた結合するかどうかを決定することによって検出され得る。特に好ましい リガンドは、成熟血液細胞上に存在するいづれかの抗原と10%以下、好ましくは 5%以下の交差反応性をもって、AC133に対して選択的であるものである。交差 反応性は、いづれかの標準技法により測定され得、そして好ましくは、純粋なAC 133抗原、試験されるべきリガンド、及び予測される交差反応性抗原間での競争 結合アッセイにより、一定濃度のAC133抗原及び試験リガンド(ここで、リガン ドの半分がAC133に対する結合を飽和する)を用いて測定される。最とも好まし くは、交差反応性は、抗体が50ng/100μlの濃度で存在する場合、その半分がモ ノクローナル抗体ATCC を飽和するAC133抗原の一定濃度で測定され る。 AC133に特異的に結合する試薬が同定されると、その試薬(放射能ラベルされ た形での、もう1つのラベルを含むように変性された非放射能形での、又はラベ ルされていない形での一定の使用での)は、AC133への試薬の結合を要する種々 のアッセイ又は生物学的使用、たとえば螢光染色、細胞分離、又は細胞識別に、 インビボ及び インビトロで使用され得る。たとえば、AC133に対する抗体による免疫選択は、 造血前駆細胞及び造血幹細胞を精製する手段を提供する。抗体はまた、造血細胞 を検出し又は数えるために診断に、CD34陽性集団を機能的に異るサブ集団に分割 することに、前駆細胞の単離に、及び成熟血液細胞を生成する前駆体の調製にも 使用される。生物学的サンプル(たとえば、血液又はその誘導体、生検、及び滑 液)は、対象抗体により結合される表面分子を発現する細胞の存在についてアッ セイされ得る。たとえば、アッセイは、細胞溶解物、損なわれていない細胞、又 は凍結物に対して、異なった細胞型を区別するために実施され得る。 AC133に特異的に結合する対象の抗体及び他の試薬は、実質的に純粋なヒト造 血前駆細胞及び造血幹細胞の調製のために有用である。前駆細胞のサブセットが AC133結合に基づいて他の造血細胞から分離され得、そして当業界において知ら れている他の表面マーカーに結合することによって、さらに相互に分離され得る 。造血細胞源は、胎児又は成人骨髄;胎児肝臓;臍帯血;及び末梢血液、特にサ イトカインで可動化された末梢血液を包含する(たとえば、Camposなど.(1993 )Leukemia 7:1409-15及びGriggなど.(1993)Bone Marrow Transplant”,Su ppl 2:23-9を参照のこと)。 ヒト幹細胞は、表現型CD34bright;HLA-DR+;CD38dim/negative;CD117(c−k it)dim;CD90(Thy-1)+を有し、そして種々の系統特異的マーカー、たとえばCD3 ,CD4,CD7,CD8,CD14,CD15及びCD19の発現を欠いていることが報告されて いる。Negativeの表示は、染色のレベルがイソタイプ−適合の陰性対照の明るさ で又はそれ以下で存在することを示す。dimの表示は、染色のレベルが陰性染色 のレベル近くで存在するが、しかしまた、イソタイプ適合の対照よりも明るいこ とを示す。 分離のための方法は、抗体被覆された磁気ビーズを用いての磁気分離、及び固 体マトリックス(たとえば相)に結合される抗体を用いてのアフィニティークロ マトグラフィー又は“パンニング”を包含する。正確な分離を提供する技法は、 種々の程度の洗練性を有する、たとえば複数のカラーチャンネル、低角度及び鈍 感な光分散検出チャンネル、又はインピーダンスチャンネルを有する螢光活性化 された細胞ソーターを包含する。死亡細胞は、死亡細胞に関連する色素(たとえ ばヨウ化プロピジウム、LDS)による選択により排除され得る。赤血球細胞は、 傾瀉、溶血又はFicoll−Paqueグラジエントにより除去され得る。選択された細 胞の生存性に対して過度に有害でないいづれかの技法が使用され得る。 便利には、抗体は、多くの異なった目的のために次のラベルにより接合され得 る:たとえば特定の細胞型の分離を容易にする磁気ビーズ;アビジン又はストレ プタビジンに対して高い親和性で結合するビオチン;螢光活性化された細胞ソー ターにより使用され得る螢光色素;ハプテン;及び同様のもの。多色分析がFACS と共に又は免疫磁気分離及び流動細胞計測を組合して使用され得る。多色分析は 、次の複数の表面抗原に基づいての細胞の分離のために興味あるものである:た とえばAC133+,CD90+又はCD117+,AC113-、又はCD34+。多色分析に使用される螢 光色素は、フィコビリタンパク質、例えばフィコエリトリン及びアロフィコシア ニン;フルオレセイン;及びテキサスレッドを包含する。 本発明の1つの態様においては、抗−AC133抗体は、磁気試薬、たとえば超常 磁性微小粒子(微小粒子)に直接的に又は間接的に接合される。磁気粒子への直 接的な接合は、当業界において知られているような種々の化学的結合基の使用に より達成される。たとえば、抗体は、側鎖アミノ又はスルフヒドリル基及び異種 機能性架橋試 薬を通して微小粒子に結合され得る。多数の異種機能化合物が存在物に対して結 合するために利用できる。抗体上の反応性スルフヒドリル基及び磁気ビーズ上の 反応性アミノ基との好ましい結合基は、3−(2−ピリジルジチオ)プロピオン 酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(SPDP)又は4−(N−マレイミドメ チル)−シクロヘキサン−1−カルボン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステ ル(SMCC)である。 他方では、抗−AC133抗体は、磁気粒子に間接的に結合される。その抗体はハ プテンに直接的に結合され、そしてハプテン特異的な第2段階の抗体がその粒子 に結合される。適切なハプテンは、ジゴキシン、ジゴキシゲニン、FITC、ジニト ロフェニル、ニトロフェニル、アビジン、及びビオチンを包含する。タンパク質 へのハプテンの結合のための方法は当業界において知られており、そしてそのよ うな結合のためのキットは市販されている。 幹細胞又は前駆細胞の分離又は同定のためには、抗体が造血細胞サンプルに添 加される。特定の細胞サブセットを結合するのに必要な抗−AC133抗体は、試験 分離及び分析を行なうことによって実験的に決定される。細胞及び抗−AC133 Ab は、複合体が形成されるのに十分な時間、通常少なくとも約5分、より通常には 少なくとも約10分、及び通常には、1時間以下、より通常には約30分以下の時間 インキュベートされる。 さらに、細胞は、造血前駆細胞又は造血幹細胞上に存在するか又は不在である ことが知られている細胞表面マーカーに対して特異的な抗体又は結合分子と共に インキュベートされ得る。たとえば、CD90,CD117及びHLA-DRは、幹細胞の陽性 選択において有用である。幹細胞上に不在であることが知られている種々のマー カー、たとえばCD3,CD4,CD8,CD14,CD15及びCD19は、陰性選択のために 使用され得る。ラベルされた細胞は、特異的抗体調製法に従って分離される。螢 光色素−ラベルされた抗体はFACS分離のために、そして磁気粒子は免疫磁気選択 又は特に高いグラジエントの磁気選択(HGMS)のために有用である。典型的な磁 気分離装置は、WO90/07380,PCT/US96/00953及びEP 438,520(それらは引用によ り本明細書に組込まれる)に記載されている。 精製された細胞集団は、いづれか適切な培地に集められ得る。種々の培地;た とえばダルベッコの改変イーグル培地(DMEM)、ハンクスの基本塩溶液(HBSS) 、ダルベッコのリン酸緩衝溶液(DPBS)、RPMI,Isoveの変性ダルベッコ培地(I MDM)、及び5mMのEDTAを含むリン酸緩衝液(それらはいづれも、ウシ胎児血清( FCS)、ウシ血清アルブミン(BSA)、又はヒト血清アルブミン(HSA)により補充され 得る)は、市販されており、そして使用され得る。 ヒト造血前駆細胞及び/又は造血幹細胞のために非常に富化された組成物(細 胞源に依存する)は、この態様においては、単一の段階で達成される。所望の細 胞は、細胞組成物中に約80%で又はそれ以上で存在し、そして好ましくは、細胞 組成物中に約90%で又はそれ以上で存在する。注目の特定集団は、CD34bright及 びHLA−DR+/-として特徴づけられるAC133+細胞を含む。この集団はさらに、CD90+ ,CD117+及び/又はCD38dimであるそれらの細胞のために選択され得る。機能的 に、それらの細胞は、CFU−GM活性のために及び長期のもとの集団にもどった細 胞について高く富化される。興味あるもう1つの集団は、BFU−E活性について 富化されたCD133-及びCD34+である。AC133がより制限された細胞集団により発現 されるので、精製への対象の抗体の使用はCD34の使用に比べて好都合であり、そ れにより、注目の特定の活性のためにより富化されたサブセットを可能にする。 所望の細胞が単離されるとすぐに、それらは、基質細胞からのならし培地にお いて増殖し、そのような基質細胞と共に同時培養し、又はそのような前駆細胞の 増殖を支持する維持因子、たとえば幹細胞因子又はインターロイキンの組合せを 含んで成る培地において増殖することによって成長せしめられ得る。細胞を培養 するために使用される培地は、便利には、定義された富化培地、たとえばIMDM、 又はIMDMとRPMI1640との混合物であり、そして一般的には、塩、アミノ酸、ビタ ミン、5×10-5Mのβ−メルカプトエタノール、ストレプトマイシン/ペニシリ ン及び10%ウシ胎児血清から構成され、そして時間から時間に、一般的には週当 たり少なくとも1〜2度、変えられ得る。 対象の細胞組成物は種々の手段で使用される。それらは、照射された宿主及び /又は化学療法下にある宿主を再構成するために使用され得る。特定の異なった 成長因子を通して1又は複数の選択された系統への成熟、増殖及び分化を付与す ることによって、前駆細胞は委託された系統に付された(committed)細胞源とし て使用され得る。エリトロポエチン、コロニー刺激因子(たとえば、GM−CSF,G −CSF、又はM−CSF)、インターロイキン(たとえば、IL−1,−2,−3,− 4,−5,−6,−7,−8,−9、又は−10)、又は同様のもののような因子 又は基質細胞が、前駆細胞の増殖及び分化に影響を及ぼすために使用され得る。 前記細胞はまた、造血細胞の分化及び成熟に関与する因子、たとえばAC133抗 原に特異的に結合する試薬の単離及び評価にも使用され得る。従って、前記細胞 は、培地、たとえばならし培地の活性を測定するために;成長因子活性又は関与 について流体を評価するために;又は同様のことを行なうためにアッセイにおい て使用され得る。 前記細胞は、遺伝的疾病の治療のために使用され得る。造血細胞に関連する遺 伝的疾病は、遺伝的欠損を補正し、又は疾病、たとえばHIVに対しての保護のた めに治療するために自己由来の又は同種異系の幹細胞の遺伝的修飾により治療さ れ得る。たとえば、疾病、たとえばβ−サラセミア、鎌状赤血球血症、アデノシ ンデアミナーゼ欠損症、組換え酵素(recombinase)欠損症、又は組換え酵素調節 遺伝子欠損症は、相同又はランダム組換えのいづれかにより、対象細胞中への野 生型遺伝子の導入により補正され得る。他方では、正常な同種異系前駆細胞が移 植され得る。造血細胞に関連する疾病以外の疾病もまた、その疾病が特定の分泌 される生成物、たとえばホルモン、酵素、インターフェロン、因子又は同様のも のの欠乏に関係している場合、治療され得る。 前記細胞は液体窒素温度で凍結され、そしてそれらが融解され、そして再使用 されるように、長期間、貯蔵され得る。細胞は通常、5%DMSO及び95%ウシ血清 アルブミンにおいて貯蔵されるであろう。融解されるとすぐに、細胞は幹細胞増 殖及び分化に関連する成長因子又は基質細胞の使用により拡張され得る。 AC133抗原は、天然源から又は組換え技法により実質的に純粋な形で得られる 。天然源からは、抗原陽性細胞が溶解され、そして抗−AC133モノクローナル抗 体のアフィニティーカラムに通される。造血前駆細胞が、従来の分離技法により 天然源から単離され得、又は実験セクションに記載される細胞系が抗原源として 使用され得る。アフィニティー精製されたタンパク質は、適切な塩溶液、又は通 常、低い酸濃度、たとえば0.1〜1%のトリフルオロ酢酸の存在下で、水性/有 機グラジエント、たとえばアセトニトリル又はエタノールにより、アフィニティ ーカラムから溶離される。次に、その溶離されたタンパク質は、従来の技法に従 って、クロマトグラフィー 、電気泳動、又は同様のものによりさらに精製される。 下記例は、95%以上の純度のAC133抗原をもたらすアフィニティークロマトグ ラフィーによりAC133抗原を精製するためへのモノクローナル抗体の使用を記載 する。そのような精製された調製物中のペプチドが配列分析のために調製され、 そして単離され、その結果として、核酸プローブがAC133遺伝子配列の単離のた めに企画され得る。本明細書に示されるAC133の遺伝子配列(図12)は、組換え 技法による抗原の獲得を可能にする。たとえば、全RNAが、標的化されたタンパ ク質を発現するよう抗体結合により示された細胞から単離される。残留DNAは、 従来の技法に従って除去され、そしてポリアデニル化されたRNAは、たとえばオ リゴ−dTセファロース上で又はゲルクロマトグラフィーによりさらに精製され得 る。次に、cDNAが、逆転写酵素を用いて従来の技法に従って調製される(Sambro okなど.,前記及び下記例を参照のこと)。次に、前記cDNAが、cDNAが発現される 適切なクローニングシステム、たとえばλgtll中に導入される。次に、ファージ プラークが、対象の抗体を用いて、又はポリクローナル抗血清を用いることによ ってスクリーンされ得る。他方では、AC133抗原タンパク質配列に由来する核酸 配列によるプローブを可能にするクローニングシステムが使用され得る。次に、 そのcDNA挿入物は、所望により、他のベクター中にサブクローン化される。cDNA は、完全な転写体のためのcDNAライブラリーのさらなるプロービングのために使 用され得る。他方では、そのcDNA配列は、対象のタンパク質をコードするゲノム 遺伝子を同定するためのゲノムライブラリーをプローブするために使用され得る (たとえば、Molecular Cloning:A Laboratory Manual,2nd ed.,J.Sambrook ,E.F.Fritsch,T.Maniatis,CSHL,Cold Spring Harbor,NY,1989を参照の こと)。 本発明のDNAは、AC133タンパク質又はそのフラグメントをコードするヌクレオ チド配列、及び前記遺伝子によりコードされるタンパク質の発現の調節に関与す る隣接する5’及び3’非コードヌクレオチド配列を包含し、そして成熟mRNA又 はゲノムDNAの長さをほぼ含むであろう。従って、本発明は、単離された核酸分 子を供給し、ここで前記分子は、(1)図1に示されるようなAC133のためのア ミノ酸コード領域を有する第1配列(配列番号1);(2)前記第1配列のサブ 配列であり、そして少なくとも14個、好ましくは少なくとも17又は20個、より好 ましくは少なくとも25個の長さのヌクレオチドである第2配列;(3)前記第1 又は第2配列の少なくとも1つのヌクレオチドが異なったヌクレオチドにより置 換されている第3配列;又は(4)前記第1、第2又は第3配列のいづれかに対 して相補的な第4配列を含んで成り、但し、(i)前記分子がRNA分子である場 合、Uが前記分子中の前記配列においてTを置換し、(ii)前記第3配列が前記 第1又は第2配列に対して少なくとも90%、好ましくは少なくとも95%同一であ り、そして(iii)前記第2配列が、配列番号1のヌクレオチド347−667,1564 −1696又は2110−2386でない。また、本発明のDNAとして、イントロンを包含す るその対応するゲノム配列が包含される。それらの非コード配列は、ターミネー ター及びポリアデニル化配列、調節タンパク質結合配列、転写配列、及び同様の 配列を包含する。十分な長さのAC133cDNA配列を含む分子は、結果物の源として 、又はAC133分子自体の調製のための出発材料として有用である。 “サブ配列(subsequence)”とはcDNA配列からの連続するヌクレオチドのグル ープである。それらの配列のいづれかが、AC133遺伝子の存在(又は不在)、又 はAC133抗原をコードするmRNAの発現の同定に使用され得る。そのようなサブ配 列は、出発ヌクレオチドか らの化学的合成(自動遺伝子合成機におけるように)により、又は十分な長さの 配列の生化学的操作(たとえば、フラグメントを調製するために制限エンドヌク レアーゼを用いて、任意には、続いて、(1)末端ヌクレオチドの切断及びエキ ソヌクレアーゼ及び/又は(2)所望する配列を選択するためにサイズソーティ ング及び/又は親和性捕獲による)により調製され得る。使用される条件下で存 在する他の核酸間でユニークである十分な長さの配列番号1に記載されるAC133 配列のいづれかのサブ配列は、ゲノムAC133遺伝子のすべて又は一部のポリメラ ーゼ鎖反応(PCR)増幅に使用される2つのプライマーの1つとして有用である。 所望の標的配列とユニークにハイブリダイズするのに必要なサブ配列の長さは、 使用される特定の方法により変化し、そしてその長さの選択は遺伝子材料の日常 の同定を行なう当業者の範囲内である。好ましいサブ配列は、少なくとも15の長 さのnt、より好ましくは少なくとも18のnt、さらにより好ましくは少なくとも19 ,20,21,25又は30の長さのntから、配列番号1に示されるヌクレオチド配列の 全長さまで、好ましくは、ハイブリダイゼーションプローブとして使用される場 合、200nt以下の長さ、又はPCRプライマーとして使用される場合、50nt以下の長 さである。 配列番号1のコード領域内の3個のサブ配列は、機能未知のEST'sとしてGenba nkにこれまで記録されている。従って、それらのGenbankサブ配列、すなわちヌ クレオチド347−667,1564−1696及び2010−2386は、本発明のサブ配列としては 請求されていない。さらに、配列番号1の3’非翻訳領域からの、又は機能未知 の、特にヌクレオチド2684−3332及び3408−3804の領域における多くのESTがGen bankに存在する。それらの2つの領域からのサブ配列は、本発明の一部として請 求されていない。Genbank配列の1又は複数の 配列を含む、配列番号1として示される完全な配列の長い方のサブ配列、及び1 又は複数のGenbank配列の一部を含むが、しかし配列番号1に示される新しく同 定されたヌクレオチドをも含むサブ配列は、本発明の一部として見なされる。 本発明の核酸組成物は、対象タンパク質のすべて又は一部をコードするゲノム 又はcDNA配列であり得る。従来の方法に従って、たとえば制限酵素消化又はPCR 増幅によりオリゴヌクレオチドを化学的に合成することによって、cDNA又はゲノ ム配列のフラグメントが得られる。多くの場合、フラグメントは、少なくとも12 個のnt、より通常には少なくとも18個のnt、又は上記の他の長さの1つのもので あろう。好ましいフラグメントは、機能的エピトープを含むであろう。機能的エ ピトープを供給する配列は、前記配列の発現、及び従来のイムノアッセイによる 特異的抗体とのその発現生成物の反応性についてのアッセイにより決定され得る 。 本発明の典型的なアミノ酸及びDNA配列は、下記配列番号1及び2に示されて いる。ヌクレオチド及びアミノ酸についての標準の略語が本明細書において使用 される。天然のAC133抗原に由来するポリペプチドは本発明の特に好ましい態様 であるが、しかしそれらのポリペプチドの特定の配列に基づく変動もまた、本発 明の一部である。その広い観点においては、本発明は(それはポリペプチド自体 に関係する場合)、(1)配列番号2に示されるAC133の第1アミノ酸配列;( 2)第1配列のサブ配列であり、そして少なくとも6個、好ましくは8個、より 好ましくは10個の長さのアミノ酸である第2アミノ酸配列;又は(3)前記第1 又は第2配列中の少なくとも1つのアミノ酸が異なったアミノ酸により置換され ている第3配列から成る群から選択されたいづれかのポリペプチドを包含し、但 し、ここで前記アミノ酸置換は他の残基と1つの酸性残基との、他 の残基と1つの塩基性残基との、他の残基と1つの非極性残基との、他の残基と 1つの荷電されていない極性残基との、又は他の残基との1つの芳香族残基との 置換であり、そして前記第3配列は、前記第1又は第2配列に対して少なくとも 90%、好ましくは95%の同一性を有する。 2種のアミノ酸配列は、それらの配列間に部分的な又は完全な同一性が存在す る場合、相同である。たとえば、85%の相同性とは、それらの2種の配列が最大 の適合性をもって一直線に並べられる場合にアミノ酸の85%が同一であることを 意味する。ギャップ(適合される2種の配列のいづれかにおける)は、最大の適 合性で可能にされる。5又はそれ以下のギャップが好ましく、そして2又はそれ 以下のギャップがより好ましい。あるいは、そして好ましくは、2種のタンパク 質配列(又は少なくとも30個の長さのアミノ酸の配列に由来するポリペプチド配 列)は、それらが、突然変異データマトリックスと共に整列プログラムを用いて の5以上(標準偏差単位において)の一列整列評点(alignment score)、及び6 又はそれ以上のギャップペナルティ(gap penalty)を有する場合、相同である(Du yhoff,M.O.,Atlas of Protein Sequence and Structure,1972,vol.5,Nati onal Biomedical Rosearch Foundation,pp.101-110、及び補足2,pp.1-10)。 それらの2種の配列又はその一部は、より好ましくは、それらのアミノ酸が、整 列プログラムを用いて最適に一列整列される場合、50%以上の又は50%の同一性 を有する場合、相同である。 配列番号2に示される天然のアミノ酸配列からのマイナーなアミノ酸の変動は 予期され;特に保存性アミノ酸置換が予期される。ある種類のアミノ酸内で生じ るそれらのアミノ酸の保存性置換は、それらの側鎖に関連している。遺伝子的に コードされたアミノ酸は一 般的に、次の4種の種類に分けられる:(1)酸性:アスパラギン酸、グルタミ ン酸;(2)塩基性:リシン、アルギニン、ヒスチジン;(3)非極性:アラニ ン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニ ン、トリプトファン;及び(4)荷電されていない極性:グリシン、アスパラギ ン、グルタミン、システイン、セリン、トレオニン、チロシン。フェニルアラニ ン、トリプトファン及びチロシンは時々、芳香族アミノ酸として分類される。た とえば、イソロイシン又はバリンによるロイシンの、グルタミン酸によるアスパ ラギン酸の、セリンによるトレオニンの単離された置換、又は構造的に関連する アミノ酸によるアミノ酸の類似する置換は、特にその置換が、AC133又はその誘 導体とAC133に対して特異的に結合する試薬との相互作用に関連する結合部位と してアミノ酸を含まない場合、得られる分子の結合特性に対して主要な効果を有 さないであろうことを予測することが道理に合っている。アミノ酸の変化が機能 的ペプチドに影響をもたらすかどうかは、そのペプチド誘導体の特異的結合性質 をアッセイすることによって容易に決定され得る。 図13に示されるように、AC133のペプチド構造体に異なる機能を有する多くの 領域が存在する。それらの領域は、細胞外N−末端、第1トランスメンブラン領 域、第1細胞質ループ、第2トランスメンブラン領域、第1細胞外ループ、第3 トランスメンブラン領域、第2細胞質ループ、第4トランスメンブラン領域、第 2細胞外ループ、第5トランスメンブラン及び細胞質C−末端として(アミノ末 端により開始して)記載され得る。前記領域のおおよそのサイズが図13に示され ており、そして異なる領域に存在するアミノ酸の最良の見積りは次の通りである :細胞外N−末端、aa 20-107;第1トランスメンブラン領域、aa 107-126;第 1細胞質ループ、aa 127-1 57;第2トランスメンブラン領域、aa 158-179;第1細胞外ループ、aa 180-435 ;第3トランスメンブラン領域、aa 436-454;第2細胞質ループ、aa 455-480; 第4トランスメンブラン領域、aa 481-503;第2細胞外ループ、aa 504-792;第 5トランスメンブラン、aa 793-816;及び細胞質C−末端、aa 817-865。コード されたペプチドのアミノ末端で切断可能なシグナル配列(aa 1-19)が存在するよ うに思え、この配列は、図13に示される領域の一部としては含まれないが、しか し合成的に生成されたAC133ペプチドに存在するであろう。 また、AC133抗原及びグリコシル化部位(結合の点で“Y”により示される) の構造を確かめるために同定された短いペプチドセグメント(P1−P4)のお およその位置が図13に示される。図12はまた、グリコシル化部位(アミノ酸配列 がボックスで囲まれている)及びトランスメンブラン領域(下線が引かれている )を示す。2つのグリコシル化部位はオーバーラップ(NNTS、オーバーラップす るNNT及びNTSから成る)し、そして点線により大きなボックスで示されており、 これは個々のコンセンサスグリコシル化部位を示す。 DNA 配列は、実質的な純度で得られ、そして損なわれていない染色体の配列以 外の単離された分子として得られる。通常、DNAは他の核酸化合物を実質的に含 まないで得られ、一般的には、少なくとも約50%、通常少なくとも約90%の純度 であり、そして典型的には、“組換え”であり、すなわち天然の染色体上で通常 関連しない1又は複数のヌクレオチドを両端に有する。 DNA 配列は種々の手段で使用される。それらは同じか又は他の種における関連 する表面タンパク質を同定するためのプローブとして使用され得る。DNAはまた 、対象の遺伝子を発現する細胞又は器官 を同定するためにも使用され得る。特定のヌクレオチド配列、特にDNA,mRNA又 はcDNAの存在について細胞をプローブする技法は、文献において十分に確立され ており、そして本明細書においては詳しく記載する必要はない。便利には、mRNA はDNAを有さないで単離され得、そして逆転写酵素及び特定のプライマーによるP CRを用いることによって、興味ある対象のDNAが拡張され、ゲル電気泳動上で分 離され、そして次に、サザンブロット又は配列決定を用いてプローブされ得る。 他の技法もまた、使用され得る。 相同配列は、本発明内に含まれるAC133抗原配列に対して実質的な配列類似性 を有するものであり、すなわち対象のDNA配列のヌクレオチド配列と少なくとも8 0%、好ましくは少なくとも90%、より好ましくは少なくとも95%の配列同一性 を有する。配列類似体は、大きな配列のサブセットである対照配列、たとえば保 存されたモチーフ、コード領域又はフランキング領域に基づいて計算される。対 照配列は通常、少なくとも約18個の長さのnt、より通常には少なくとも約30個の 長さのntであり、そして比較される完全な配列に延長することができる。そのよ うな相同核酸配列は、低い緊縮条件下で、たとえば50℃及び10×SSC(0.9MのNa Cl/0.09Mのクエン酸ナトリウム)でのハイブリダイゼーションにより検出され 、そして1×SSCによる55℃での洗浄にゆだねられる場合、結合されたまま存続 する。 発現のためには、DNA配列が適切な発現ベクター中に挿入され、ここで生来の 転写開始領域又は外来性転写開始領域が使用され得る。プロモーターは、インビ トロ組換え法により、又は染色体中への配列の相同組込みの結果として導入され 得る。広範囲の種類の転写開始領域が広範囲の種類の発現宿主のために知られて おり、ここで発現宿主は、原核生物又は真核生物、特にE.コリ(E.coll)、B .サブチリス(B.subtilis)、哺乳類細胞、たとえばCHO細胞、サル腎細胞、リン パ球、特にヒト細胞系、及び同様のものを包含する。一般的に、発現宿主におい て作動する選択マーカーが存在するであろう。プロモーター、翻訳可能なmRNA転 写体を生成するために、興味ある遺伝子のコード配列に操作可能的に連結され得 る。発現ベクターは、異種タンパク質をコードする核酸配列を挿入するためにプ ロモーター配列の近くに位置する便利な制限部位を有する。適切な発現ベクター におけるプロモーターは、構成的又は誘導的のいづれかであり得る。外来性融合 タンパク質が追加の機能性、たとえば高められたタンパク質合成、安定性、定義 された抗血清との反応性、又は酵素マーカー、たとえばβ−ガラクトシダーゼを 供給する、融合タンパク質の生成のためのプロモーターが特に興味あるものであ る。 内因性又は外因性エンハンサー配列を包含するエンハンサー配列を有するか又 はそれを有さない、構成的又は誘導的であり得る転写開始領域、AC133遺伝子又 はそのフラグメント、及びポリA配列の結合のためのシグナルを操作可能的に有 する転写終結領域を含んで成る発現カセットが調製され得る。遺伝子は、生来の イントロンを包含するゲノム、又はcDNA遺伝子、又はその一部であり得る。機能 的エピトープの発現を可能にする配列、通常少なくとも約24個の長さのヌクレオ チド、より通常には少なくとも約48個の長さのヌクレオチド、及び前記遺伝子中 の完全な読取り枠までの配列の使用が特に興味あるものである。 DNAの導入の後、前記構造物を含む細胞が選択マーカーにより選択され、前記 細胞が拡張され、そして次に、発現のために使用され得る。分泌が所望される場 合、シグナルペプチドが、対象のタンパク質をコードする配列又はそのフラグメ ントに連結され、それによ り、前記タンパク質が発現され、細胞膜を通してトランスロケートされ、そして シグナルペプチドを除くために加工される。 発現カセットは種々のベクター中に導入され得、ここで前記ベクターは通常、 発現ベクターを含んで成る細胞の選択を付与する能力により特徴づけられるであ ろう。ベクターは、特に、真核細胞における細菌又はウィルス中のプラスミドと して、染色体外維持を、又は特に哺乳類細胞における組込みを提供することがで きる。染色体外維持が所望される場合、元の配列は、低い−又は高い−コピーの プラスミドであり得るプラスミドの複製を提供するであろう。広範囲の種類のマ ーカー、特に毒素に対して、より特定には抗体に対して保護するマーカーが、選 択のために利用できる。選択される特定のマーカーは、宿主の性質に従って選択 され、ここで多くの場合、相補性が栄養要求宿主、たとえば酵母により使用され 得る。DNA構造体の導入は、いづれか便利な手段、たとえばカルシウム−沈殿さ れたDNA、エレクトロポレーション、融合;トランスフェクション、又はウィル スベクターによる感染によるものであり得る。 次の例は、例示的であって、本発明を限定するものではない。 体側性免疫化(Contralateral Immunization)によりAC133モノクローナル抗 体の合成 5匹のNew Zealand Black(NZB)マウスを、フィトヘマグルチニン(植物凝集 素)(PHA)(Gibco/BRL)によりプレインキュベートされた、精製されたCD34陽性 ヒト前駆細胞により、足肉証経路を通して、20日間にわたって合計7回、接種し た。 マウスを、多くの免疫優性ではあるが無関係の抗原を発現する細胞により、左 脚の肉跳に3日目に予備免疫化した。この場合、末梢 血液単核細胞(PBMC)を、それらが多くの抗原、たとえばクラスIHLA抗原、HLA- DR,CD15,CD26,CD29,CD31,CD36,CD44,CD45,CD58、等(また、造血幹細胞 上に発現される)を発現するように、無関係の細胞として使用した。0日目、PB MCを、左脚肉趾中に再注射し、そして精製された幹細胞を右脚肉趾中に注射した 。PBMC及び精製された幹細胞を、PHAと共に10分間、プレインキュベートし、そ して注射の前、PBSにより洗浄した。前駆細胞を、免疫磁気ビーズを用いて、サ イトカイン可動化されたドナーの白血球搬出パックから単離した。この処置は、 非特異的アジュバント効果を付与し、そして必要なアジュバント、たとえばフロ イントアジュバントを不必要にする。マウスに、3日間隔で合計5〜8回、その ような注射を行なう。 最後の注射の後の1日目、すなわち21日目、マウス右手膝窩リンパ節を除去し た。リンパ球懸濁液を調製し、そして細胞を、Kohler and Milstein(1975)Nat ure 256:495-497により始めに記載された方法の変法を用いて、SP2/OAg14骨 髄腫細胞に融合せしめた。細胞を、10-4Mのヒポキサンチン及び2μg/mlのア ザセリンと共に、DMEM及び20%ウシ胎児血清を含む96ウェルプレート上にプレー トした(Buckなど.(1984)Monoclonal Antiboudies and Functional Cell Line s ,Kennetなど.eds.,Planum Press,New York pp.275-309)。10日目、確認でき るハイブリドーマコロニーが明白であった。ハイブリドーマを含むウェルからの 上清液(s/n)を、2色流動細胞計測アッセイを用いて、15%までのCD34+細 胞を含む胎児細胞調製物に対する結合についてスクリーンした。試験細胞へのマ ウスIgを含むs/nの結合性を、フィコエリトリンに接合されるラット抗−マウ ス−Ig(IgPE)により追跡し、そして既知のマウス抗−CD34抗体(AC101)接合体 により対比染色した。図1は、AC13 3上清液を用いてのこの2色FACS分析からの結果を示す。AC133は、胎児肝臓調 製物において明るいCD34陽性細胞のみを染色することが示される。AC133ハイブ リドーマ細胞は、IgG1/カッパ抗体を分泌することが示された。前記細胞を培養 において拡張し、そしてストックを液体窒素により凍結した。AC133細胞を制限 希釈分析によりサブクローン化し、そして一連の陽性分泌サブクローンをまた、 液体窒素により凍結した。 抗体の精製及び接合 AC133細胞を、ヌードマウスにおいて腹水腫瘍として最初に増殖せしめ、そし て抗体に富む腹水を集めた。つい最近、AC133細胞は、中空繊維培養装置(Cellma x QUAD artificial copillary system,Cellco Inc.,Germantown,MD)において 、非常に高い密度に増殖されている。純粋なIgG抗体を、中空繊維培養物又は腹 水からプロテインAクロマトグラフィーにより調製した。純粋な抗体を0.01%ア ジ化ナトリウムを含む0.01Mのリン酸緩衝溶液(PBS)に4℃で貯蔵した。この純 粋な抗体ストックを用いて、フルオレセインイソチオシアネート(FI TC)(Wofs yなど.(1980)Selected Methods in Cellular Immunology,Mishelland Shiig i eds.,W.H.Freeman and Co.,San Francisco.pp.294-295)、フィコクリトリ ン(PE)(Hardy(1986)Handbook of Experimental Immunology,Weirなど.,eds .Blackwell Scientific Press,Oxford.p.31)、又は磁気ビーズ接合体を、標 準方法に従って調製した。 正常組織及び細胞系でのAC133発現 標準的FACS染色法を用いては、末梢血液単核細胞、顆粒球又は血小板、又はヒ ト臍帯静脈内皮細胞に、AC133抗体により検出できる染色は存在しなかった。FAC S分析によるヒト細胞系のパネルの試験(データは表1に示される)は、試験さ れた3種のみの細胞系、す なわち網膜芽腫細胞系Y79.1及びWERI−Rb-1及び奇形癌細胞系NT−2が検出で きるレベルのAC133抗原を発現することを示した。 表1.ヒト細胞系上でのAC133発現 PMAによるY79.1細胞の活性化は、AC133抗原の発現を高めることが見出された (図2に示される)。しかしながら、いくつかの他の細胞系のPMA活性化、又は ヒトPBMCのPHA活性化は、AC133抗原の発現を誘発できなかった(データは表2に 示される)。AC133抗原の発現は、試験されたCD34+細胞系上では検出できなかっ た。Y79.1細胞系上でのCD34発現の欠失(図3に示される)と共に、この発見は 、AC133がCD34抗原に向けられる可能性を除外する。AC133抗原の発現は、内皮及 び線維芽細胞上でまた発現されるCD34抗原とは異なって、初期幹及び前駆細胞に 制限される(Krauseなど.(1996)Blood 87:1-13)。 AC133抗原は、胎児及び成人骨髄、胎児肝臓、臍帯血、白血球搬出(LP)パッ ク、及びサイトカイン移動された血液からのLPパックから単離されたヒト前駆細 胞系のCD34bright集団上で発現される。典型的には、それはそれらの集団におけ るすべてのCD34+細胞の30〜50%を染色する。 表2.細胞系の活性化 AC133 陽性細胞の表現型決定 AC133及びCD34二重陽性細胞の表現型決定を、前駆細胞上に発現することが知 られている細胞表面構造体に向けられる接合された抗体のパネルを用いる2及び 3色FACS分析を用いて行なった。胎児肝臓、胎児及び成人骨髄、臍帯血及び末梢 血液を用いて、AC133陽性細胞の正確な表現型を決定した。それらの組織のすべ てに見出されるAC133細胞は、CD34bright,CD38-/+及びHLA−DR-/+である。デー タは図4に示される。CD90(Thy1)+及びCD117(c−kit)+幹細胞は、図5に示され るようにAC133陽性集団に包含される。AC133免疫磁気精製胎児肝臓細胞により 行なわれた一連の実験においては、CD38−FITC接合抗体は、AC133精製細胞の74. 5%を染色し、そして残りの24.8%はCD38陰性であった。予測されるように、HLA −DRは細胞の大部分を染色した(81.14%)。CD90は、27.4%を染色す ることが示され、そしてCD117は90%を染色した。初期(再集団化する)の造血 幹細胞はCD34bright,CD38dim/+,HLA-DR+,CD117dim及びCD90+の表現型を有す ると一般的に思われる。従って、AC133抗体は、ヒト造血前駆細胞の表現型的に 重要な集団を認識する。AC133 抗原の免疫沈殿 免疫沈殿実験は、AC133抗原が120KDの分子量を有することを示した。ビオチン (Pierce)ラベルされた、活性化Y79.1及びWeri−RB−1細胞を次の成分を含む 溶解緩衝液により溶解した:2.5%のBrij(Sigma)、25mMのトリス−HCl,pH8.0, 125mMのNaCl,2.5mMのEDTA,2.2μg/mlのアプロチニン(Sigma)及び1mMのPMSF (Sigma)。前記溶解物をAC133及び対照抗体と共に、安全性を前もって保証した後 にインキュベートした。免疫複合体をスタフィロコーカスアウレウス(Staphyloc occus aureus)細胞(Cal Biochem)に対して集め、そして1%の2−メルカプトエ タノールを含むSDS−PAGEサンプル緩衝液において95℃で5分間、加熱した。免 疫沈殿物をSDS−PAGEにより分離し、そしてニトロセルロース膜(Novex)に移した 。ホースラディシュペルオキシダーゼ(HRP)(Amersham)及びSupersignal(L−H RP基質システム(Pierce)に対して結合されるストレプタビジンを用いて可視化 せしめた。CD49d,CD71及びCD98を対照として用い、そして133KD,92KD及び80/ 40KDのそれらの予測されるバンドをそれらの対応するバンドにおいて観察した。 AC133による免疫沈殿は、120KDの分子量に対応する明確なバンドを示した。この バンドは、抗−CD34、抗体AC101,HPCA1及びHPCA2により免疫沈殿されたサン プルにおいては不在であり、このことは、CD34がY79.1細胞系において発現され ないことを示唆する。これはFACSデータと一致する。 さらなる実験からのデータが図6に示されており、ここで、ビオチンによりラ ベルされたY79.1及びKG1a細胞が同じゲル上でCD34及びAC133沈殿物を比較する ことによってAC133分子量データを確めた。この実験においては、CD34及びY79. 1抗原は、隣接するレーンにおける、ビオチル化されたKG1a(CD34+)及びY79.1 溶解物から沈殿せしめられた。前記結果は、1)個々の抗体がそれ自体の明確な 抗原を沈殿せしめ、2)それらの2種の抗原の分子量が明らかに異なっており、 それぞれ110及び127KDであることを明白に示す。対照レーン6及び8においては 、HPCA2及び16D11(抗−CD34)は、KG1a溶解物からの110KDのバンドを沈殿せしめ るが、しかしY79.1溶解物からのいづれのバンドも沈殿せしめない(レーン7及 び9)。AC133はY79.1溶解物からの120KDタンパク質を沈殿せしめるが(レーン 10)、しかしレーン11においてKG1aの溶解物からのいづれも沈殿せしめなかった 。レーン12において、KG1a及びY79.1溶解物は混合され、そしてAC133 Ag及びCD 34は同時沈殿せしめられた。それらの結果は、2種の抗原が異なった分子量のも のであることを示す。 AC133 磁気ビーズ接合 精製されたAC133抗体を、4−(N−マレイミドメチル)−シクロヘキサン− 1−カルボン酸N−ヒドロキシスクシンイミドエステル(SMCC)についての標準 のプロトコールを用いて磁気アミノ−デキストランビーズに接合せしめた。AC13 3抗体を、OD450単位当たり5μgで、SMCC活性化されたビーズに添加し、そして 室温で2時間インキュベートした。反応を、β−メルカプトエタノール及びNEM の添加により停止せしめた。接合体を、磁場の存在下で2つのカラム上で精製し 、そして溶離した。濃度をOD450=10に調整し、そしてOPGを安定化のために添加 した。PBS及び0.1%アジ化ナトリ ウムにおける接合体を0.2μmのフィルターを通して濾過し、そして4℃で貯蔵 した。 AC133 磁気ビーズ接合体によるヒト造血前駆細胞の分離 AC133直接的磁気ビーズ接合体を調製し、そして淡黄褐色被膜PBMC、胎児肝臓W C1、胎児骨髄及び成人骨髄に対して試験した。図8は、miniMACSを用いてAC133 ビーズ接合体により精製され、そしてグリコホリンA−FITC及びHCPA2−PEによ り染色された胎児肝臓細胞のFACSドットプロットを示す。出発材料は7.4%のCD3 4+細胞を含み、AC133精製に続いて、90%以上のAC133精製細胞は明るいCD34+で あった。図9は、AC133磁気接合体が、約26%のCD34+細胞を含む淡黄褐色被膜か らのCD34+細胞の富化においても非常に効果的であったことを示す。最終の精製 された集団は、HPCA2−PE染色により示されるように、CD34に対して64%の陽性 であった。磁気精製システムにおける細胞の分離能力は、AC133の機能的及び表 現型的性質のさらなる研究を可能にする。 AC133 陽性細胞のクローン原性能力 白血球搬出パックから精製された、AC133磁気ビーズ選択の細胞を、市販のキ ット(Stem Cell Technologies,Vancouver,B.C.)を用いてクローン原性アッセ イにより試験した。組換えヒト成長因子を用いて、調節された成長環境を提供す ることによって、この培養アッセイは、CD34陽性細胞集団内の主要コロニー形成 単位(CFU)を同定する。それは、特定の系統特異的分子に向けられる細胞の相対 的百分率に関して、前駆細胞集団の比較に基づく情報を提供する。典型的には、 末梢血液由来のCD34+細胞集団においては、BFU-e(バースト形成単位−エリト ロイド)及びCFU−GM(コロニー形成単位−顆粒球マクロファージ)が、認識さ れる有力なコロニーであり、3:1の比で存在する。図10は分離白血球搬出パッ クから得ら れたAC133及びCD34精製された細胞を比較する典型的なクローン原性実験からの 結果を示す。分別されていない対照細胞により得られたコロニーは典型的には主 としてBFU−E(29.34%)であり、そしてCFU−GMは少数である(5.14%)。CD34 精製された細胞は、23.3%BFU−E及び5.58%のCFU−GMの類似する分布を示す。 対照的に、AC133精製された細胞は、13.1%のBFU−E及び10.2%のCFU−GMの異 なったパターンを示す。計算は、58%のCFU−GMがAC133精製された画分から回収 され、そしてわずか13%のBFUEがその画分から回収されたことを示す。 図11は、AC133免疫磁気精製に続いて得られた類似するクロン原性アッセイか らの結果を示す。この実験においては、AC133細胞を陽性選択し、そして次に、C D34陽性細胞を、AC133陰性の流れから陽性選択した。この企画は、AC133+細胞( 同じドナーからのものは除く)とCD34+との直接的な比較を示した。それらの結 果は、CFU−GM前駆体の93.8%がAC133陽性画分に回収され、残りの6.2%がCD34+ /AC133-画分から回収されたことを示した。逆に言えば、CD34+AC133-画分はBFU −e前駆体の78.0%を含み、そして残りの22.0%がAC133+画分に得られた。 上記実験結果は、抗−AC133抗体がFc受容体に対する抗体であり、又は抗−AC1 33抗体が、Fc受容体摂取を通して幹細胞に結合する可能性を除外する。さらなる 実験は、AC133抗体染色が遊離PEによる可能性を除外する。AC133抗体は、RTK、 すなわち受容体チロシンキナーゼ、TIE、すなわち、免疫グロブリン様ドメイン 及び成長因子相同ドメインを含み、そして血管内皮細胞及び造血細胞において発 現されるチロシンキナーゼに対する抗体のように挙動しない。AC133抗体はまた 、P−糖タンパク質、すなわち造血細胞においてまた発現される170KDの複数薬 物耐性生成物に対する抗体のように 挙動しない。 本発明者は、AC133抗体が、骨髄、胎児肝臓及び末梢血液における明るいCD34+ 細胞上でのみ発現される抗原を認識することを示した。この抗体及びその抗原は 、いづれか既知のCD抗原の分子量又は分布に適合しない。幹細胞は別として、AC 133抗体は、CD34発現のために陰性であるヒト網膜芽腫細胞と反応することが示 された。さらに、AC133抗原は、多くのCD34+細胞系上で発現されない。 本発明は、初期幹細胞及び造血前駆細胞のサブセット上に見出される新規の抗 原、及び前記抗原に対して特異的に結合する抗体を供給することが上記結果から 明らかである。抗原の発現は高い組織特異性である。それは造血前駆細胞のサブ セット上に単に検出され、そしてCFU−GMアッセイにおいて活性的である実質的 にすべての細胞上に存在する。AC133抗原のこの高い特異的な分布は、ヒト造血 前駆体及び幹細胞を単離し、そして特徴づけるための試薬として例外的に有用に する。 AC133 抗原の精製及び特徴づけ AC133抗原の精製及び特徴づけ、並びにcDNAクローンの単離が本明細書に記載 される。この分子のタンパク質及び核酸配列分析は、AC133抗原が、既知のG− タンパク質結合の7種のトランスメンブランメンバーに対して、もし存在したと しても、低い相同性を有する5種のトランスメンブランドメインを有する新しい 種類のトランスメンブラン受容体の最初に記載されるメンバーであることを示す 。 抗体AC133を、上記のようにして調製し、そして精製し、そしてCNBrにより活 性化されたセファロースに接合した。CNBr活性化されたセファロースは、Pharma cia(Alameda,CA)から購入し、そしてmAB AC133親和性樹脂を、25分間のリガ ンドカップリング反応を用 いて、製造業者の方法により調製した。COS−7及びWERI−Rb−1網膜芽腫細胞 系を、American Type Culture Collection(Rockville,MD)から入手した。特注 プライマーは、Operon Technologies(Alameda,CA)により合成した。 AC133 抗原の精製 AC133抗原を、96時間、PMAにより活性化されたY79網膜芽腫細胞(例えば、AT CCから市販されている)から単離した。細胞(2×109)を、PBSにより洗浄し、 そして0.125MのNaCl,25mMのトリス、pH8,0.005%のNaN3,2.5mMのEDTA及び1 .0mMのフェニルメチルスルホニルフルオリド(PMSF)及び1mg当たり4:1のト リプシンインヒビター単位を含むアプロチニンの2.2mg/ml溶液の1/1000希釈 溶液(Sigma)を含む2.5%のBrij 99/96(2:1)界面活性剤溶液により溶解した 。細胞を室温で5分間、断続的に回転せしめ、そして次に20分間、氷上に放置し た。細胞核及び残骸を、12,000×Gで10分間の遠心分離により除去した。溶解物 上清液を、洗浄緩衝液(0.125MのNaCl,25mMのトリス、pH8.0,0.01%のNaN3,2 .5mMのEDTA,0.1%Brij)により平衡化された0.5mlのmAb AC133親和性カラム上へ の負荷の前、0.2μMのフィルターを通して濾過した。カラムを洗浄緩衝液によ り広範に洗浄し、そして抗原を、50mMのエタノールアミン、pH11.5,0.1%のBri j,0.01%のNaN3溶液に溶離した。pHをすぐに、HClにより中性に調節した。洗浄 緩衝液により平衡化された300μlの層体積のDEAEカラム上への抗原溶離液の通 過により、汚染性タンパク質の多くを除去し、そして上記のようなAC133抗体カ ラムを用いての第2のアフィニティークロマトグラフィー処理段階は、タンパク 質加水分解及びタンパク質配列決定分析に使用できる95%以上の純度のAC133抗 原をもたらした。AC133抗原の純度及び同一性を、ドデシル硫酸ナトリウム−ポ リア クリルアミドゲル電気泳動(SDS-PAGE)及びウェスターン分析により確かめた( Towbin,H.,T.Staehelin,and J.Gordon(1979)PNAS 76,4350-4354;Towbin ,H.and J.Gordon(1984)J.Immunol.Meth.7:313-340)。 精製されたAC133抗原のエンドグリコナーゼ処理 1μgのAC133抗原を水50ml及び0.1Mの2−メルカプトエタノール及び0.5%S DS溶液125μlに再懸濁した。タンパク質を5分間100℃で変性した。変性された 混合物(35μl)を、0.5Mのトリス(pH8)25μl、水10μl、10%のNP-40(1 0μl)と共に5本の管の個々に添加した。0〜0.1単位のPNGアーゼF(Sigma) を個々の管に添加し、そしてそれらの管を30℃で一晩インキュベートした。解糖 化された抗原を、銀染色されたSDS−ポリアクリルアミドゲル上で可視化した。 AC133 抗原のリシルエンドペプチダーゼ消化及びペプチドの単離 AC133抗原を、10%までのTCAの添加により2μg/mlの親和性カラム溶出液1. 4mlから沈殿せしめた。その沈殿された乾燥タンパク質を25μlの消化緩衝溶液( 8Mの尿素、400mMのトリス、pH7.8)に懸濁し、これに45mのDTT5μlを添加し 、そしてその混合物を50℃で15分間インキュベートした。室温に冷却した後、10 0mMのヨードアセトアミド5μlを添加し、そしてその混合物をさらに15分間イ ンキュベートした。蒸留水(70μl)を添加し、尿素を2Mに希釈し、そして2 pモルのリシルエンドペプチダーゼ、すなわちLysC(Wako Chemicals,USAから 入手できる)を添加した。消化を37℃で24時間、行なった。ペプチドを、0.1% のトリフルオロ酢酸(TFA)における4〜32%アセトニトリルグラジエントを有 するVYDACの狭い内孔のC18逆相カラム上でのHPLC分離により単離した。 AC133 抗原ペプチドのタンパク質配列分析 N−末端配列分析を、Applied Biosystems 477A又は473A液体パルスタンパク 質配列決定機上で、Edman化学(Edman,P.,Begg,G.(1967)Eur.J.Biochem .1,80-91;Huwick,R.M.,Hunkapillar,M.W.,Hood,L.E.,and Dreyer,W.J .(1987)J.Biol.Chem.256,p.7990)を用いて決定した。PTH−アミノ酸を 、Applied Biosystemsからの2〜4%のABI Premix Buffer濃縮物の緩衝液B( アセトニトリル)への添加、12〜36%の緩衝液B線状グラジエントでの18分間に わたって、続いて36%Bでの13分間のイソクラティク(isocratic)期間を伴っ て、緩衝液A(3.5%のテトラヒドロフラン)において55℃でBrownlee C-18逆相カ ラム(2.1mm×22cm)上で分離した。 AC133 抗原の単離及びタンパク質配列決定 120kDのAC133抗原を、収穫する96時間前、PMA活性化された網膜芽腫細胞系 、すなわちY79からイムノアフィニティークロマトグラフィーにより単離した。 連続的なアフィニティークロマトグラフィー及びDEAEクロマトグラフィーを用い て、SDS-PAGE及び銀染色により95%以上の純度のAC133抗原を生成し、そしてAC1 33抗原としてのその精製された分子の同一性をウェスターンブロットにより確か めた。N−末端糖を除去するためにPGNアーゼFによる前記抗原の解糖は、約30k Dの分子量が糖化によるものであることを示す。AC133抗原のN−末端を配列決定 するための反復された初期の試みは失敗しており、このことは、このタンパク質 がアミノ末端ブロックされることを示唆する。しかしながら、リシルエンドペプ チダーゼによる精製された抗原の消化、続く逆相HPLC処理は、12〜16個のアミノ 酸の長さを有する4種のペプチド配列を生成した。前記ペプチド及び得られる変 性オリゴヌクレオチド配列による主要タンパク質及び核酸データベスの研究は、 AC133抗原がいづれか記載される分 子により同定され得なかったことを示した。(そのアミノ酸配列は、現在、cDNA クローニングから推定されており、そして図12に示される。) cDNA クローニング 全RNAをWERI-Rb-1網膜芽腫細胞(American Type Culture Collection,Rockvi lle,MDから入手できる)から単離し、そしてポリA+RNAを、ポリA+Tract System (Promega Corp.,Madison,WI)を用いて調製した。cDNAを、スーパスクリプト 逆転写酵素(GIBCO BRL.,Gaithersburg,MD)及びオリゴdTプライマーを用いて 合成し(Guebler,U.and B.J.Hoffman(1983)Gene 25:263)。ブラント末端化 されたcDNAを、非自己相補性Bst XIアダプターに連結し、そしてゲル精製し、連 結されていないアダプター及び小さなフラグメントを除去した。次に、連鎖され たcDNAを、pcDNA-I発現ベクター中にエレクトロポレートした(Invitrogen,San Diego,CA)中に連結し、そしてE.コリ株MC1061/P3(Dower,W.J.(1990)Gen etic Engineering V.12 Edited by J.K.Seflow,Plenum Press,New York 275- 295.(細菌のエレクトロポレーション:遺伝子情報に対する一般的なアプローチ );Ausubel,F.M.,R.Brent,R.E.Kingston,D.D.Moore,J.G.Seidman,J.A .Smith and K.Strahl.1987-1994 Current Protocols in Molecular Biology John Wilest Surs;N.Y.)。WERI-Rb-1 ライブラリーcDNA(100ng/反応)を、4 種のAC133抗原ペプチドのタンパク質配列から企画された100pモルの個々の変性 センス及びアンチセンスプライマーと共に、PCR鋳型として使用した。PCR反応を 、反応当たり5単位のTaq DNAポリメラーゼ(Promega Corp,Madison,WI)により 緩衝液(50mMのKCl、10mMのトリス、pH9、0.1%のTriton X-100、1.5mMのMgCl 、0.2mMの(個々の)dNTP)において行なった。増幅を次の通りに、 MJ研究(データ)装置において行なった:92℃で1分間、55〜37℃で1分間、72 ℃で3分間、35サイクル。増幅の後、その反応混合物を1%アガロースゲル上で 試験し、個々のプライマー対照に出現しないユニークなバンドをゲル精製し、そ してTA Cloning Kit(Invitrogen,San Diego,CA)を用いてpCR2.1中にクローン 化した。その遺伝子の5’及び3’末端を、一群の組のAC133抗原遺伝子特異的 プライマー及びライブラリー特異的プライマーを用いて、半−特異的PCRにより 単離した。20サイクルの一本鎖PCRを、5単位のTaqポリメラーゼを含むPCR反応 緩衝液(上記)における100ngのライブラリーcDNA及び10pモルの個々のプライ マーと共に、50μlの反応体積において個々の遺伝子特異的プライマーを用いて 行なった。この反応混合物のアリコート(10μl)を除去し、そして遺伝子特異 的プライマー及びライブラリー特異的プライマーの両者を用いて、第2の35サイ クルPCR反応のために鋳型として使用した。次に、このPCR反応混合物のアリコー ト(5μl)を、一群のライブラリー及び遺伝子特異的プライマーを用いてのさ らなる35サイクルの反応のために使用した。前記遺伝子の5’及び3’末端に対 応するバンドをゲル精製し、そしてpCR2.1中にクローン化した。オーバーラップ するcDNAクローンを、螢光色素ターミネーター及びABI配列決定機(Applied Bios ystems,Foster City,CA)を用いて、ジデオキシ鎖反応により配列決定した。 AC133 抗原のcDNAクローンの単離 このタンパク質のためのcDNAを単離するために、cDNAライブラリーを、PMA活 性化されたY79細胞よりも約10倍、よりAC133抗原を発現するWERI-Rb-1網膜芽腫 細胞系から調製した。変性プライマーを、前記ライブラリーとの低い緊縮性、PC R反応に使用し、5’末端でペプチド3の正しい配列及び3’プライム端でペプ チド4の正 しい配列を含む1.7kbのフラグメントを生成した。さらに、ペプチド2の配列を 、正しい読取り枠におけるフラグメント内に見出した。遺伝子特異的プライマー 及びライブラリー特異的プライマーによる半−特異的PCRは、その遺伝子の5’ 及び3’末端に対応し、そして初期1.7KBのクローンとオーバーラップする追加 の1.2KB及び2KBフラグメントを生成した。 3種の部分的クローンの配列決定は、3.0KBの読取り枠を含み、そして遺伝子 のポリA+部分と関係しているように見え、そして真核生物のコンセンサススプ ライス配列を含まない128bpのイントロンをまた含む4KBのcDNAを生成した。イ ントロンを有さない、損なわれていない幹細胞由来のクローンを単離するために 、AC133+幹細胞を、mAb AC133の磁気接合体、及びMiltenyi磁気分離システム(M iltenyi Biotech,GMBH)を用いて、胎児肝臓から単離した。全RNAをそれらの細 胞から単離し、そしてRT-PCR反応のための鋳型として使用した。イントロンを拡 張するよう企画されたプライマーは、ポリA+由来のcDNA鋳型を有する582bpの一 本鎖フラグメントを生成し、そしてAC133+細胞系における全RNAからのイントロ ンを有さない454bpの一本鎖フラグメントを生成し(図3)、この事は、スプラ イスされたmRNAが全RNAプール内の主要生成物であることを示唆する。RT-PCRを 用いて、開始メチオニンの前で始まり、そして完全なcDNA配列を含むcDNAクロー ンを生成した。AC133抗原をコードする十分な長さのcDNAは、96.8kDの分子量を 有する863個のアミノ酸のタンパク質を予測する(図4)。前記配列の疎水性の 分析(図5)及びトランスメンプランヘリックスアルゴリズムは、タンパク質が 、2種の大きな(255及び280個のアミノ酸)細胞外ループ及びC−末端細胞質末端 の存在を示す細胞膜を合計5倍に拡張する(図6)ことを示す。タンパク質配列 により提供される他の構造的 特徴は、推定上の大きな細胞外ループ及びN−糖化のための6種のコンセンサス 配列の両者におけるロイシンジッパーモチーフを包含する。 トランスフェクトされたCOS-7細胞におけるAC133抗原の発現 AC133陽性細胞(1×107)を、上記のようにして胎児肝臓から単離した。全RNA を、Chomczynski,P.and Sacchi,N.(1987)Anal .Biochem.162,156に記載 のようにして、RNAzol(Gibco BRL,Gaithersburg,MD)を用いて単離した。RT-PC Rを、10ngの全RNA鋳型、及び開始メチオニンの前及び停止コドンの後に指図され たプライマーと共にPromega Access RT-PCRシステム(Promega Corp,Madison,WI )を用いて実施した。遺伝子のコード領域に対応する2.8kbのバンドを、CMVプロ モーターを含むInvitrogen指図の真核TAクローニングベクター(pCR3.1)中にク ローン化した。副集密的COS-7細胞(ATCC,Rockville,MDから入手できる)を、 エレクトロポレーションを用いて、5μgのクローン化されたDNAによりトラン スフェクトし、そしてFASS分析の前、48時間インキュベートした。トランスフェ クトされたCOS-7細胞を、50ng/100μlの試験mAb AC133-PEにより染色し、そし てBecton Dickerson(San Jose,CA)FACS走査により分析した。 COS 細胞におけるAC133抗原の発現 AC133抗原遺伝子によりトランスフェクトされたCOS細胞を、mAb AC133-PEによ り染色し、そしてFACSにより分析した(図7)。AC133抗原遺伝子によりトラン スフェクトされたCOS細胞はmAB AC133-PEにより明るく染色されたが、しかしな がら、トランスフェクトされていない細胞、空のベクターによりトランスフェク トされた細胞、又はCD-8のための遺伝子はこの抗体により染色されない。 種々のリンパ及び非リンパ細胞系におけるAC133発現 種々の細胞系におけるAC133抗原転写体の存在を、ノザン分析により評価した 。ノザンブロット分析を、Clontech(Palo Alto,CA)複合組織ノザンブロット を用いることによって、及び1%アガロース−2Mのホルムアルデヒドゲル上に RNAサンプルを溶解し、そしてナイロン膜中に一晩、細管ブロットすることによ って実施した。全RNAをTri試薬により単離し、そしてその15μgをレーン当たり に負荷した。メチレンブルーによるブロットの染色を、RNA濃度をモニターする ために使用した。cDNAの800bp EcoRIフラグメントを、32P-dGTPにより、ランダ ムプライミングを用いてラベルし、そしてプローブとして使用した。 種々の細胞系におけるAC133抗原転写体の存在を、ノザン分析により評価した 。4.4KBのmRNA転写体が、WERI-Rb-1細胞及びY79細胞、並びにMACS−単離された AC133+胎児肝臓細胞に検出できた。AC133抗原の発現はPMA活性化に基づいてY79 細胞において増強されるが、その対応するmRNAはダウンレギレーションされるよ うに思える。正常な造血組織においては、AC133抗原メッセージは、胎児鍛造に 検出でき、そしてそれらの組織におけるAC133+細胞が少数で存在する事実により 予測されるように、成人骨髄においては、弱く検出できる。AC133抗原転写体が また、非リンパ組織、特に膵臓、腎臓及び胎盤においても示された。弱いシグナ ルが肝臓、肺、脳及び心臓に観察された。すなわち、パラフィン組織断片の免疫 組織化学染色に対比する場合、AC133抗原の発現が骨髄においてのみ検出できた 。 類似する態様において、AC133抗原に対して特異的である他の抗体が開発され た。次の表は、抗体、免疫原、イソタイプ、及びそのような抗体パネルのための 交差阻止を示す。 本明細書に引用されるすべての出版物及び特許出願は、引用により本明細書に 組込まれる。 前述の発明は、より理解を明確にするために例示的及び例的にいくらか詳細に 記載されて来たが、一定の変更及び修飾が本発明の範囲内で行なわれ得ることは 、当業者に明らかであろう。
【手続補正書】特許法第184条の8第1項 【提出日】平成10年7月31日(1998.7.31) 【補正内容】 請求の範囲 1. 配列番号2に示すアミノ酸配列を有するAC133抗原に対して特異的に結合 する抗体。 2. 前記抗体が、ハイブリドーマ細胞系により生成されるモノクローナル抗体 である請求の範囲第1項記載の抗体。 3. 前記抗体が、対側性免疫化を通して誘導される請求の範囲第1項記載のモ ノクローナル抗体。 4. 造血幹細胞もしくは造血前駆細胞、又は両者の富化のための方法であって 、 造血幹細胞もしくは造血前駆細胞、又は両者を含んで成るヒト細胞の混合され た集団と、配列番号2に示すアミノ酸配列を有するAC133抗原に対して特異的に 結合する試薬とを組合せ;そして 前記試薬と結合する細胞を選択することを含んで成り; ここで前記選択された細胞が、前記ヒト細胞の混合された集団がそれぞれ、造 血幹細胞もしくは造血前駆細胞、又は両者を含むかどうかに依存して、造血幹細 胞もしくは造血前駆細胞活性又は両活性について富化されることを特徴とする方 法。 5. 前記ヒト細胞の混合された集団と、細胞表面マーカーCD90,CD117及びHLA -DRの少なくとも1つを特異的に認識する試薬とを組合せ;そして 前記細胞表面マーカーの少なくとも1つに対して陽性である細胞を選択する; ことをさらに含んで成る請求の範囲第4項記載の方法。 6. 前記試薬が抗体又は抗体混合物である請求の範囲第4項記載の方法。 7. 前記抗体の少なくとも1つが、螢光色素接合される請求の範 囲第6項記載の方法。 8. 前記螢光色素接合された抗体による前記選択がフローサイトメトリーによ る請求の範囲第7項記載の方法。 9. 前記抗体の少なくとも1つが、磁気粒子に接合される請求の範囲第6項記 載の方法。 10.前記磁気粒子接合された抗体による前記選択が高いグラジエントの磁気選 択による請求の範囲第9項記載の方法。 11.配列番号2に示すアミノ酸配列を有するAC133抗原に対して特異的に結合 する試薬に対して結合される実質的に純粋な造血前駆細胞集団。 12.前記試薬がモノクローナル抗体である請求の範囲第11項記載の実質的に純 粋な造血前駆細胞集団。 13.前記前駆細胞がヒト胎児肝臓から得られる請求の範囲第11項記載の実質的 に純粋な造血前駆細胞集団。 14.前記前駆細胞がヒト末梢血液から得られる請求の範囲第11項記載の実質的 に純粋な造血前駆細胞集団。 15.前記前駆細胞がヒト骨髄から得られる請求の範囲第11項記載の実質的に純 粋な造血前駆細胞集団。 16.前記骨髄が成人の骨髄である請求の範囲第15項記載の実質的に純粋な造血 前駆細胞集団。 17.前記骨髄が胎児の骨髄である請求の範囲第15項記載の実質的に純粋な造血 前駆細胞集団。 18.配列番号1に示されるAC133のためのアミノ酸コード領域を有する配列を 含んで成る単離された核酸分子を含んで成る分子であって、但し前記分子がRNA 分子である場合、前記分子の配列においてUがTを置換している分子。 19.配列番号1に示されるAC133のためのアミノ酸コード領域に 対して少なくとも90%の同一性を有する配列を含んで成る単離された核酸分子を 含んで成る分子であって、但し前記分子がRNA分子である場合、前記分子の配列 においてUがTを置換している分子。 20.配列番号1に示されるAC133のためのアミノ酸コード領域のサブ配列であ り、そして少なくとも14個の長さのヌクレオチドである配列を含んで成る単離さ れた核酸分子を含んで成る分子であって、但し、(i)前記分子がRNA分子であ る場合、前記分子の配列においてUがTを置換しており、そして(ii)前記配列 が配列番号1のヌクレオチド347-667,1564-1696又は2010-2386でない分子。 21.請求の範囲第18〜20のいづれか1項記載の分子の配列に対して相補的な配 列を含んで成る単離された核酸分子。 22.配列番号2に示されるAC133のアミノ酸分子をコードするDNAから実質的に 成る単離された核酸分子。 23.請求の範囲第18項記載の核酸配列を含んで成る発現ベクター。 24.請求の範囲第23項記載の分子によりトランスフェクトされた細胞。 25.単離されたポリペプチドであって; (1)配列番号2に示されるAC133の第1アミノ酸配列; (2)前記第1配列のサブ配列であり、そして少なくとも6個のアミノ酸から 成る長さを有する第2アミノ酸配列;又は (3)前記第1又は第2配列中の少なくとも1つのアミノ酸が異なったアミノ 酸により置換されている第3配列を含んで成り; 但し、前記アミノ酸置換が1つの酸性残基ともう1つの残基、1つの塩基性残 基ともう1つの残基、1つの非極性残基ともう1つの残基、1つの荷電されてい ない極性残基ともう1つの残基:又は1つの芳香族残基ともう1つの残基との置 換であり、そして前記第3 配列が前記第1又は第2配列に対して少なくとも90%の同一性を有することを特 徴とするポリペプチド。 26.前記ポリペプチドが前記第1配列を含んで成る請求の範囲第25項記載の単 離されたポリペプチド。 27.前記ポリペプチドが前記第2配列を含んで成る請求の範囲第25項記載の単 離されたポリペプチド。 28.前記ポリペプチドが前記第3配列を含んで成る請求の範囲第25項記載の単 離されたポリペプチド。 29.リガンドに対して複合体化される請求の範囲第25項記載のポリペプチド。 30.前記リガンドが抗体である請求の範囲第29項記載のポリペプチド複合体。 31.単離されたポリペプチドであって、配列番号2の細胞外N−末端、aa 20- 107;第1トランスメンブラン領域、aa 107-126;第1細胞質ループ、aa 127-15 7;第2トランスメンブラン領域、aa 158-179;第1細胞外ループ、aa 180-435 ;第3トランスメンブラン領域、aa 436-454;第2細胞質ループ、aa 455-480; 第4トランスメンブラン領域、aa 481-503;第2細胞外ループ、aa 504-792;第 5トランスメンブラン領域、aa 793-816;又は細胞質C−末端aa 817-865のアミ ノ酸配列を含んで成るポリペプチド。 32.ヒト造血幹細胞に対して結合するリガンドを同定するための方法であって 、請求の範囲第25項記載のポリペプチドにより前記リガンドの結合性を検出する ことを含んで成る方法。 33.請求の範囲第25項記載のポリペプチドに対して特異的に結合する試薬。 34.前記試薬が、モノクローナル抗体及びポリクローナル抗体から成る群から 選択される請求の範囲第33項記載の試薬。 35.前記試薬が、生理学的リガンド又は合成リガンドである請求の範囲第33項 記載の試薬。 36.前記ポリペプチドがグリコシル化されてない請求の範囲第25項記載のポリ ペプチド。 37.前記ポリペプチドがグリコシル化されてる請求の範囲第25項記載のポリペ プチド。 38.造血幹細胞上の抗原性マーカーに対するリガンドの選択的結合による幹細 胞の同定に基づく細胞分離技法を用いて、前記幹細胞を単離するための方法であ って; 前記抗原性マーカーとして、そのアミノ酸配列が配列番号2に示されているAC 133抗原を用いることを特徴とする方法。 39.前記リガンドが抗体である請求の範囲第38項記載の方法。 40.前記リガンドが、前記AC133抗原の細胞外領域に結合する請求の範囲第38 項記載の方法。 41.前記細胞外領域が、配列番号2の細胞外N−末端、aa 20-107;第1細胞 外ループ、aa 180-435;又は第2細胞外ループ、aa 504-792から選択されたアミ ノ酸を含んで成る請求の範囲第38項記載の方法。 42.前記リガンドが、試験化合物群中の化合物が前記AC133抗原に結合するか どうかを決定し、そして成熟血液細胞上に存在するいづれかの抗原と10%以下の 交差反応性を有する、前記AC133抗原に対して特異的に結合する化合物間から前 記リガンドを選択することによって同定される請求の範囲第38項記載の方法。 43.前記交差反応性が、前記リガンドがAC133への結合性を半−飽和する、AC1 33抗原及び前記リガンドの濃度を用いて、純粋なAC133抗原、前記リガンド、及 び前記推定される交差反応性抗原の間の競争結合アッセイにより測定される請求 の範囲第38項記載の方法 。 44.請求の範囲第32項記載の方法により同定されるAC133のためのリガンド。 45.成熟血液細胞上に存在するいづれかの抗原と5%以下の交差反応性を有す る、配列番号2に示すアミノ酸配列を有するAC133抗原に対して特異的に結合す る試薬。 46.前記試薬が、表面又は検出できるラベルに結合される請求の範囲第45項記 載の試薬。 47.前記ラベルが螢光ラベルである請求の範囲第45項記載の試薬。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) G01N 33/53 G01N 33/53 K 33/577 B 33/577 C12N 5/00 B (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(GH,KE,LS,MW,S D,SZ,UG),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ ,MD,RU,TJ,TM),AL,AM,AT,AU ,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH, CN,CU,CZ,DE,DK,EE,ES,FI,G B,GE,GH,HU,IL,IS,JP,KE,KG ,KP,KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT, LU,LV,MD,MG,MK,MN,MW,MX,N O,NZ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG ,SI,SK,TJ,TM,TR,TT,UA,UG, UZ,VN,YU (72)発明者 イン,アミー アメリカ合衆国,カリフォルニア 95117, サン ジョーズ,バンディ アベニュ 397 (72)発明者 バック,デビッド アメリカ合衆国,カリフォルニア 95054, サンタ クララ,アトランティック コー ト 4246

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1. AC133抗原に対して特異的に結合する抗体。 2. 前記抗体が、ハイブリドーマ細胞系により生成されるモノクローナル抗体 である請求の範囲第1項記載の抗体。 3. 前記抗体が、ハイブリドーマ細胞系ATCC により生成される抗体 による前記抗原に対しての同時結合を阻止する請求の範囲第2項記載のモノクロ ーナル抗体。 4. 前記抗体が対側性免疫化を通して誘発される請求の範囲第1項記載のモノ クローナル抗体。 5. ハイブリドーマ細胞系 により生成される請求の範囲第1項記載 のモノクローナル抗体。 6. 造血幹もしくは前駆細胞、又は両者の富化のための方法であって、 造血幹もしくは前駆細胞、又は両者を含んで成るヒト細胞の混合された集団と 、ハイブリドーマ細胞系ATCC により生成される抗体により認識される 造血前駆細胞抗原に対して特異的に結合する試薬とを組合わせ;そして 前記試薬を結合する細胞を選択することを含んで成り; ここで前記選択された細胞が、前記ヒト細胞の混合された集団がそれぞれ、造 血幹もしくは前駆細胞、又は両者を含むかどうかに依存して、造血幹もしくは前 駆細胞活性又は両活性において富化されることを特徴とする方法。 7. 前記ヒト細胞の混合された集団と、細胞表面マーカーCD90,CD117及びHLA -DRの少なくとも1つを特異的に認識する試薬とを組合わせ;そして 前記細胞表面マーカーの少なくとも1つに対して陽性であるそれ らの細胞を選択することをさらに含んで成る請求の範囲第6項記載の方法。 8. 前記試薬が抗体又は抗体混合物である請求の範囲第6項記載の方法。 9. 前記抗体の少なくとも1つが、螢光色素接合される請求の範囲第8項記載 の方法。 10.前記螢光色素接合された抗体による前記選択がフローサイトメトリーによ る請求の範囲第9項記載の方法。 11.前記抗体の少なくとも1つが、磁気粒子に接合される請求の範囲第8項記 載の方法。 12.前記磁気粒子接合された抗体による前記選択が高いグラジエントの磁気選 択による請求の範囲第11項記載の方法。 13.ハイブリドーマ細胞系ATCC により生成される抗体により認識さ れる造血前駆細胞抗原に対して特異的に結合する試薬に対して結合される実質的 に純粋な造血前駆細胞集団。 14.前記試薬がモノクローナル抗体である請求の範囲第13項記載の実質的に純 粋な造血前駆細胞集団。 15.前記モノクローナル抗体がハイブリドーマ細胞系ATCC により 生成される請求の範囲第14項記載の実質的に純粋な造血前駆細胞集団。 16.前記前駆細胞がヒト胎児肝臓から得られる請求の範囲第15項記載の実質的 に純粋な造血前駆細胞集団。 17.前記前駆細胞がヒト末梢血液から得られる請求の範囲第15項記載の実質的 に純粋な造血前駆細胞集団。 18.前記前駆細胞がヒト骨髄から得られる請求の範囲第15項記載の実質的に純 粋な造血前駆細胞集団。 19.前記骨髄が成人の骨髄である請求の範囲第18項記載の実質的 に純粋な造血前駆細胞集団。 20.前記骨髄が胎児の骨髄である請求の範囲第18項記載の実質的に純粋な造血 前駆細胞集団。 21.単離された核酸分子であって; (1)図12(配列番号1)に示されるようなAC133のためのアミノ酸コード領 域を有する第1配列; (2)前記第1配列の結果物であり、そして少なくとも14個の長さのヌクレオ チドである第2配列; (3)前記第1又は第2配列中の少なくとも1つのヌクレオチドが異なったヌ クレオチドにより置換されている第3配列;又は (4)前記第1、第2、又は第3配列のいづれかに対して相補的な第4配列を 含んで成り; 但し、(i)前記分子がRNA分子である場合、前記分子の配列においてUがT を置換し、(ii)前記第3配列が前記第1又は第2配列に対して少なくとも90% 同一であり、そして(iii)前記第2配列が配列番号1のヌクレオチド347-667, 1564-1696又は2010-2386ではないことを特徴とする単離された分子。 22.前記分子が前記第1配列を含んで成る請求の範囲第21項記載の単離された 分子。 23.前記分子が前記第2配列を含んで成る請求の範囲第21項記載の単離された 分子。 24.前記分子が前記第3配列を含んで成る請求の範囲第21項記載の単離された 分子。 25.前記分子が、AC133のアミノ酸配列をコードするDNAから実質的に成る請求 の範囲第21項記載の単離された分子。 26.請求の範囲第21項記載の核酸配列を含んで成る発現ベクター。 27.請求の範囲第26項記載の分子によりトランスフェクトされた細胞。 28.単離されたポリペプチドであって; (1)配列番号2に示されるようなAC133の第1アミノ酸配列; (2)前記第1配列の結果物であり、そして少なくとも6個の長さのアミノ酸 である第2アミノ酸配列;又は(3)前記第1又は第2配列中の少なくとも1つ のアミノ酸が異なったアミノ酸により置換されている第3配列を含んで成り; 但し、前記アミノ酸置換が1つの酸性残基ともう1つの残基、1つの塩基性残 基ともう1つの残基、1つの非極性残基ともう1つの残基、1つの荷電されてい ない極性残基ともう1つの残基:又は1つの芳香族残基ともう1つの残基との置 換であり、そして前記第3配列が前記第1又は第2配列に対して少なくとも90% の同一性を有することを特徴とするポリペプチド。 29.前記ポリペプチドが前記第1配列を含んで成る請求の範囲第28項記載の単 離されたポリペプチド。 30.前記ポリペプチドが前記第2配列を含んで成る請求の範囲第28項記載の単 離されたポリペプチド。 31.前記ポリペプチドが前記第3配列を含んで成る請求の範囲第28項記載の単 離されたポリペプチド。 32.リガンドに対して複合体化される請求の範囲第29項記載のポリペプチド。 33.前記リガンドが抗体である請求の範囲第32項記載のポリペプチド複合体。 34.単離されたポリペプチドであって、配列番号2の細胞外N−末端、aa 20- 107;第1トランスメンブラン領域、aa 107-126;第1細胞質ループ、aa 127-15 7;第2トランスメンブラン領域、aa 1 58-179;第1細胞外ループ、aa 180-435;第3トランスメンブラン領域、aa 436 -454;第2細胞質ループ、aa 455-480;第4トランスメンブラン領域、aa 481-5 03;第2細胞外ループ、aa 504-792;第5トランスメンブラン領域、aa 793-816 ;又は細胞質C−末端aa 817-865のアミノ酸配列を含んで成るポリペプチド。 35.ヒト造血幹細胞に対して結合するリガンドを同定するための方法であって 、請求の範囲第8項記載のポリペプチドにより前記リガンドの結合性を検出する ことを含んで成る方法。 36.請求の範囲第28項記載のポリペプチドに対して特異的に結合する試薬。 37.前記試薬が、モノクローナル抗体及びポリクローナル抗体から成る群から 選択される請求の範囲第36項記載の試薬。 38.前記試薬が、生理学的又は合成リガンドである請求の範囲第36項記載の試 薬。 39.前記ポリペプチドが糖化されない請求の範囲第28項記載のポリペプチド。 40.前記ポリペプチドが糖化される請求の範囲第28項記載のポリペプチド。 41.造血幹細胞上の抗原性マーカーに対するリガンドの選択的結合による幹細 胞の同定に基づく細胞分離技法を用いて、前記幹細胞を単離するための方法であ って; 前記抗原性マーカ1ーとしてAC133抗原を用いることを特徴とする方法。 42.前記リガンドが抗体である請求の範囲第41項記載の方法。 43.前記リガンドが、前記AC133抗原の細胞外領域に結合する請求の範囲第41 項記載の方法。 44.前記細胞外領域が、配列番号2の細胞外N−末端、aa 20-10 7;第1細胞外ループ、aa 180-435;又は第2細胞外ループ、aa 504-792から選 択されたアミノ酸を含んで成る請求の範囲第41項記載の方法。 45.前記リガンドが、試験化合物群中の化合物が前記AC133抗原に結合するか どうかを決定し、そして成熟血液細胞上に存在するいづれかの抗原と10%以下の 交差反応性を有する、前記AC133抗原に対して特異的に結合する化合物間から前 記リガンドを選択することによって同定される請求の範囲第41項記載の方法。 46.前記交差反応性が、前記リガンドがAC133への結合性を半−飽和する、AC1 33抗原及び前記リガンドの濃度を用いて、純粋なAC133抗原、前記リガンド、及 び前記推定される交差反応性抗原の間の競争結合アッセイにより測定される請求 の範囲第41項記載の方法。 47.前記交差反応性が、モノクローナル抗体ATCC が50ng/100μl の濃度で存在する場合、前記抗体を半飽和するAC133抗原の濃度で測定される請 求の範囲第41項記載の方法。 48.請求の範囲第36項記載の方法により同定されるAC133のためのリガンド。 49.成熟血液細胞上に存在するいづれかの抗原と5%以下の交差反応性を有す る、AC133抗原に対して特異的に結合する試薬。 50.前記試薬が、表面又は検出できるラベルに結合される請求の範囲第49項記 載の試薬。 51.前記ラベルが螢光ラベルである請求の範囲第49項記載の試薬。
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