JP2000516450A - 新規エリスロマイシン及びその製造方法 - Google Patents

新規エリスロマイシン及びその製造方法

Info

Publication number
JP2000516450A
JP2000516450A JP10504925A JP50492598A JP2000516450A JP 2000516450 A JP2000516450 A JP 2000516450A JP 10504925 A JP10504925 A JP 10504925A JP 50492598 A JP50492598 A JP 50492598A JP 2000516450 A JP2000516450 A JP 2000516450A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
plasmid
alkyl
compound
group
formula
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Granted
Application number
JP10504925A
Other languages
English (en)
Other versions
JP4173551B2 (ja
Inventor
フランシス リードレイ,ピーター
スタウントン,ジェームス
コルテス,イエズス
スティーブン パセイ,マイケル
Original Assignee
バイオティカ テクノロジー リミティド
ファイザー インコーポレイティド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from GBGB9614189.0A external-priority patent/GB9614189D0/en
Priority claimed from GBGB9710962.3A external-priority patent/GB9710962D0/en
Application filed by バイオティカ テクノロジー リミティド, ファイザー インコーポレイティド filed Critical バイオティカ テクノロジー リミティド
Publication of JP2000516450A publication Critical patent/JP2000516450A/ja
Application granted granted Critical
Publication of JP4173551B2 publication Critical patent/JP4173551B2/ja
Anticipated expiration legal-status Critical
Expired - Fee Related legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07DHETEROCYCLIC COMPOUNDS
    • C07D498/00Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms
    • C07D498/12Heterocyclic compounds containing in the condensed system at least one hetero ring having nitrogen and oxygen atoms as the only ring hetero atoms in which the condensed system contains three hetero rings
    • C07D498/18Bridged systems
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P1/00Drugs for disorders of the alimentary tract or the digestive system
    • A61P1/06Anti-spasmodics, e.g. drugs for colics, esophagic dyskinesia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/04Antibacterial agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P33/00Antiparasitic agents
    • A61P33/02Antiprotozoals, e.g. for leishmaniasis, trichomoniasis, toxoplasmosis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P9/00Drugs for disorders of the cardiovascular system
    • A61P9/10Drugs for disorders of the cardiovascular system for treating ischaemic or atherosclerotic diseases, e.g. antianginal drugs, coronary vasodilators, drugs for myocardial infarction, retinopathy, cerebrovascula insufficiency, renal arteriosclerosis
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H17/00Compounds containing heterocyclic radicals directly attached to hetero atoms of saccharide radicals
    • C07H17/04Heterocyclic radicals containing only oxygen as ring hetero atoms
    • C07H17/08Hetero rings containing eight or more ring members, e.g. erythromycins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/88Lyases (4.)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/44Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides
    • C12P19/60Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen of the saccharide radical directly bound to a non-saccharide heterocyclic ring or a condensed ring system containing a non-saccharide heterocyclic ring, e.g. coumermycin, novobiocin
    • C12P19/62Preparation of O-glycosides, e.g. glucosides having an oxygen of the saccharide radical directly bound to a non-saccharide heterocyclic ring or a condensed ring system containing a non-saccharide heterocyclic ring, e.g. coumermycin, novobiocin the hetero ring having eight or more ring members and only oxygen as ring hetero atoms, e.g. erythromycin, spiramycin, nystatin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Cardiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Heart & Thoracic Surgery (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Vascular Medicine (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Abstract

(57)【要約】 エリスロマイシン、特に新規のC−13置換基R1(例えば、C3〜C6シクロアルキル又はシクロアルケニル基)を有するものが、R1CO2Hの存在下で適切な生物を発酵させることにより調製される。好ましい生物は、好ましくは所望の化合物の合成を指図し得る組込プラスミドを含有するサッカロポリスポラ属のサッカロポリスポラ・エリスレア(Saccharopolyspora erythraea)である。

Description

【発明の詳細な説明】 新規エリスロマイシン及びその製造方法 産業上の利用分野 本発明は、新規のポリケチド(polyketide)及びその調製のための方法及び手 段に、特にヒトを含めた哺乳類、並びに魚類及び鳥類における抗細菌薬及び抗原 生動物薬として、並びにその他の用途(例えば、抗癌、アテローム硬化症、胃運 動性低減等)に有用な新規のエリスロマイシンに関する。本発明はさらに、新規 の化合物を含有する製剤組成物に、そしてこのような治療を必要とする哺乳類、 魚類及び鳥類に新規の化合物を投与することによる哺乳類、魚類及び鳥類におけ る細菌及び原生動物感染の治療方法に関する。 発明の背景 異なるポリケチド生合成遺伝子集団から得られるポリケチド生合成遺伝子又は その一部分を操作して、新規のエリスロマイシンを産生し得る。 ポリケチドは大きなそして構造的に多様な種類の天然物質であって、その例と しては、抗生物質的又はその他の薬理学的特性を有する多数の化合物、例えば、 エリスロマイシン、テトラサイクリン、ラパマイシン、アベルメクチン、ポリエ ーテルイオノフォア及びFK506が挙げられる。特に、ポリケチドはストレプ トミセス属及び関連する放線菌類(actinomycete)により豊富に産生される。そ れらは、脂肪酸生合成と同様の方法で、アシルチオエステルの反復的段階的縮合 により合成される。天然ポリケチド間に認められるより大きな構造的多様性は、 「スターター」又は「エキステンダー」 単位として(通常は)酢酸塩又はプロピオン酸塩を選択することにより、そして 各々の縮合後に観察されるβ−ケト基の異なる程度のプロセシングにより生じる 。プロセシング工程の例としては、β−ヒドロキシアシルへの還元、脱水後の2 −エノイル−への還元、及び飽和アシルチオエステルへの完全還元が挙げられる 。これらのプロセシング工程の立体化学的結果は、鎖延長の各周期に関しても明 記される。ポリケチドの生合成は、ポリケチドシンターゼとして公知の鎖生成酵 素の一群により開始される。2種類のポリケチドシンターゼ(PKS)が、放線 菌類(actinomycete)で記載されている。しかしながら、本発明の目的である新 規のポリケチドそして製造方法は、マクロライド系エリスロマイシン、アベルメ クチン及びラパマイシン(図1)に関するPKSに代表されるI型PKSにより 合成され、そしてポリケチド鎖延長の各周期に関する異なる組の又は「モジュー ル」の酵素で構成される(図2A)(Cortes,J.et al.,Nature(1990)348:1 76-178;Donadio,S.et al.,Science(1991)252:675-679;MacNeil,D.J.et al.,Gene(1992)115:119-125;Schwecke,T.et al.,Proc.Natl.Acad.Sci .USA(1995)92:7839-7843)。注:「天然モジュール」という用語は、本明細 書で用いる場合、一周期のポリケチド鎖延長を成し遂げるβ−ケトアシルシンタ ーゼ(「KS」)遺伝子から次のアシル担体タンパク質(「ACP」)遺伝子ま での隣接ドメインの組を示す。「組合せモジュール」という用語は、最初の天然 モジュールの第一の点から第二天然モジュールの第二の等価点まで延びる隣接ド メイン(及びドメイン部分)のあらゆる群を示すために用いられる。第一及び第 二の点は一般に、すべてのモジュールに存在するコアドメインに、即ち、それぞ れのKS、AT(アシルトランスフェラーゼ)、ACPドメインの等価点で、又 はドメイン間のリンカー領域にある 。 図2は、エリスロマイシン産生PKS(6−デオキシエリスロノリドBシンタ ーゼ DEBSとしても公知である)遺伝子の機構を示す。3つのオープンリー ディングフレームは、DEBSポリペプチドをコードする。遺伝子は、6つのモ ジュールと呼ばれる反復単位を編成する。最初のオープンリーディングフレーム は、3つのモジュール:即ち負荷モジュール(ery−負荷)と2つの延長モジ ュール(モジュール1及び2)から成る第一多重酵素又はカセット(DEBS1 )をコードする。負荷モジュールは、アシルトランスフェラーゼ及びアシル担体 タンパク質で構成される。これは、WO93/13663の図1と対比される( 以下に示す)。これはORF1が2つのモジュールのみから成ることを示し、そ の最初のものは実際、負荷モジュールと第一延長モジュールである。 DEBSにおけるモジュール5のケトレダクターゼドメインの一部をコードす るDNAのフレーム内欠失は、エリスロマイシン類似体 5,6−ジデオキシ− 3−ミカロシル−5−オキソエリスロノリドB、5,6−ジデオキシ−5−オキ ソエリスロノリドB及び5,6−ジデオキシ−6.6−エポキシ−5−オキソエ リスロノリドBの形成を引き起こす(Donadio,S.et al.,(1991)252:675-67 9)。同様に、DEBSにおけるモジュール4のエノイルレダクターゼドメイン の活性部位残基の変化は、対応するPKS−コードDNAの遺伝子工学処理及び Saccharopolyspora erythraea中へのその導入により、6,7−アンヒドロエリ スロマイシンCの産生を生じた(Donadio,S.et al.,Pro.Natl.Acad.Sci. USA(1993)90:7119-7123)。 国際特許出願第WO93/13663号(この記載内容は、参照により本明細 書中に含まれる)は、ポリケチドの変化を生じ得るD EBS遺伝子の別の種類の遺伝子操作を記載する。しかしながら、多数のこのよ うな試みは不毛であったことが報告されている(Hutchinson C.R.and Fujii,I .,Annu.Rev.Microbiol.(1995)49:201-238,p.231)。大環式免疫抑制ポリ ケチド ラパマイシンの生合成を支配するモジュラーI型PKSをコードするSt reptomyces hygroscopicusからの遺伝子の完全DNA配列が開示されている(Sc hwecke,T.et al.(1995)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 92:7839-7843)(図3 )。DNA配列は、寄託番号X86780で、EMBL/Genbank De tabaseに寄託されている。 多数の治療的に重要なポリケチドが確認されているけれども、増強された特性 を示すか又は完全に新規の生物活性を有する新規のポリケチドを得る必要が依然 としてある。モジュラーI型PKSにより産生される複雑なポリケチドは、それ らが、駆虫薬、殺昆虫薬、免疫抑制薬、抗真菌薬および/または抗細菌薬のよう な公知の用途を有する化合物を含む場合、特に有益である。それらが構造的に複 雑なために、全体的化学合成により、又は公知のポリケチドの化学的修飾によっ ては、このような新規のポリケチドは容易に得られない。本発明の一局面は、I 型PKS遺伝子アッセンブリーが延長モジュールを後に従えた負荷モジュール( loading module)をコードする、という我々の認識から生じる。負荷モジュール が延長モジュールに対して異種であり、スターターユニットの変化を示すポリケ チドを生じるようなものであるハイブリッドPKS遺伝子アッセンブリーを提供 することが特に有用である。これは、負荷モジュールの存在を認識しないため、 従来技術に対して全く未知の概念である。WO93/13663は、単一機能( 即ち、単一酵素)を不活性化することによりPKS遺伝子を変化させるか、ある いはその欠失、挿入又は置換により「完全モジュール」に影響を及ぼすことに言 及する。負荷アッセンブリーは、それらの表現では、モジュールではない。 負荷モジュールが多数の異なるカルボン酸単位を受容するものである場合には 、ハイブリッド遺伝子アッセンブリーを用いて多数の異なるポリケチドを生成し 得る。例えば、ハイブリッド遺伝子アッセンブリーは、ery延長モジュールを 伴うavr負荷モジュールをコードする核酸を用い得る。負荷モジュールは非天 然酸単位及びその誘導体を受容し得る;avr負荷モジュールは、これに関して は特に有用である(Dutton et al.,(1991)J.Antibiot.44:357-365)。さら に、非天然スターター単位に対する天然負荷モジュールの特異性を確定し、そし て新規のポリケチドを生成するための負4荷モジュールの特異性緩和を利用する ことができる。したがって、本発明の別の局面は、非天然カルボン酸及びその誘 導体を組み込んで、DEBS遺伝子のみを含有するエリスロマイシン産生株中で 新規のエリスロマイシンを生成するery負荷モジュールの予期せぬ能力である 。もちろん、異なる酸化状態でのおよび/または異なる立体化学を有するケチド 単位を与えるもので延長モジュールを置換することにより特に、生成物ポリケチ ド内で変更を成し得る。ポリケチド鎖中のメチル基の立体化学はアシルトランス フェラーゼにより確定されるが、しかしそれは、実際、PKSのその他のドメイ ンの特徴であり、したがってそのドメインの置換によって、個々に、あるいはモ ジュール置換によってのみ変化を開始する、と一般的に考えられる。メチル及び その他の置換基は、アシルトランスフェラーゼドメイン置換又は全体的モジュー ル置換によって、付加又は除去される。したがって、広範囲の新規のエリスロマ イシンを生成する一メカニズムとして、エリスロマイシン負荷モジュールの緩和 基質特異性の使用を延長モジュール置換と、そして延長モジュール置 き換えによるハイブリッド負荷モジュール置換と組合せることもできる、という ことも当業者には明らかになる。したがって、本発明は、非形質転換化生物によ る新規のエリスロマイシンの生成、並びにこのような遺伝子アッセンブリー、こ のような遺伝子アッセンブリーを含有するベクター、そして形質転換生物内で新 規のエリスロマイシンを生成するためにそれらを発現し得る形質転換体生物を記 載する。形質転換体生物は組換え体プラスミドを保有するか、又はプラスミドが 一体化し得る。int配列を有するプラスミドは、宿主染色体の特異的付着部位 (att)中に組み込まれる。形質転換体生物は、例えばエリスロマイシンの製 造においてすべての又はいくつかの生合成修飾を実施することにより、初期生成 物を修飾し得る(図2B)。しかしながら、正常経路のいくつかが遮断されて、 例えば、WO91/16334に又はWeber et al.,(1985)J.Bacteriol.16 4:425-433(これらの記載内容は、参照により本明細書中に含まれる)に記載さ れているように、例えば1つ又はそれ以上の「天然」ヒドロキシ基又は糖基を有 さない生成物を生成するように、突然変異体生物が使用される。あるいは、例え ばWO97/06266(この記載内容は、参照により本明細書中に含まれる) に記載されているように、所望の生成物の製造において考え得る速度制限工程を 克服するよう、正常経路のいくつかが過剰発現される生物体が用いられる。 本方法のこの局面は、酵素系を構築し、したがって所望の型の新規のエリスロ マイシン生成物を構築するために用いられる建築用ブロックとしてPKS遺伝子 モジュールを処理することに大いに関係がある。これは一般的に、モジュールの 切断及びアッセンブリー、並びに多重モジュール組分けを包含する。モジュール 間連結を作成及び破壊するための理論的場所は、モジュール間の連接領域にある 。しかしながら、実際には、その縁に近接したドメイン(即ち、酵素コード部分 )内で切断及び連結させるのが好ましい。DNAは、ここでは、全モジュールP KS間に高度に保存され、これは転写され得るハイブリッドの構築に役立つ。そ れは、コードか酵素の活性部位の間隔を保持する場合にも手助けし、このことは 重要である。例えば、ery負荷モジュールをavr負荷モジュールで置き換え ることによりハイブリッド遺伝子を生成する場合、eryモジュールは少量のそ の後のケトシンターゼ(KS)ドメインとともに除去される。KSドメイン(活 性部位と十分間隔を置いた)の開始は高度に保存され、したがって負荷ドメイン とKSドメインの開始との間のリンカー領域に対する代替物として適切なスプラ イシング部位を提供する。切り取られたeryモジュールは次に、avr負荷モ ジュールに置き換えられる。 実際、負荷モジュールを置換する場合は、負荷モジュールドメイン(一般にア シルトランスフェラーゼ(AT)及びアシル担体タンパク質(ACP))きっか りでなく、その後ろの延長モジュールの開始のKSも置き換えるのが望ましい。 典型的には、切り取られた負荷モジュールはプロピオン酸塩スターターを提供し 、置き換えは1つ又はそれ以上の異なるスターターを提供するよう意図される。 しかしながら、プロピオン酸塩は、宿主細胞中でプロピオン酸塩プールから延長 モジュールのKS中に送り込まれて、所望生成物の希釈液を生じる。これは、す べての又はほとんどのKSドメインを含めた延長化負荷モジュールを置換するこ とにより大いに阻止される(スプライシング部位はKS遺伝子の末端領域にある か、又は初期にはその後のAT遺伝子にあり、あるいはそれらの間のリンカー領 域にある)。 「モジュール」を置き換える場合、あるものは「天然」モジュー ルに制限されない。例えば、切り取られるか、および/または置換されるか、お よび/または挿入される「組合せモジュール」は、2つの天然型モジュールの対 応するドメインから、例えばあるモジュールのATから、次のATまで、あるい はKSからKSまで延長する。スプライシング部位は、対応する保存縁領域に、 又はリンカー領域にある。組合せモジュールはさらに、2つ又はそれ以上のモジ ュールを同時に付加するために、「二重」又はそれ以上の「多重」であり得る。 さらに別の局面では、本発明は前記の局面によって得られる新規のエリスロマ イシンを提供する。これらは、以下のものを包含する: (i)C−13がエチル以外の側鎖、一般的には直鎖C3〜C5アルキル基、分 枝鎖C3〜C8アルキル基、C3〜C8シクロアルキル又はシクロアルケニル基(任 意に、例えば1つ又はそれ以上のヒドロキシ、C14アルキル又はアルコキシ基 あるいはハロゲン原子で置換される)、あるいはO又はSを含有する、飽和、あ るいは全部又は一部不飽和、任意に置換される(シクロアルキルに関してと同様 に)3〜6員複素環を保有するか、あるいはR1がフェニル(C1〜C4アルキル 、C1〜C4アルコキシ及びC1〜C4アルキルチオ基、ハロゲン原子、トリフルオ ロメチル及びシアノから選択される少なくとも1つの置換基で任意に置換される )であるか;又はR1が下式(a): (式中、XはO、S又は−CH2−であり、a、b、c及びdは各 々別々に0〜2であって、a+b+c+d≦5である)を有する基であるエリス ロマイシン類似体(14員環を有するマクロライド系化合物である)。C−13 置換基Rの好ましい候補は,avrスターターモジュール又はラパマイシンスタ ーター変異体による基質として有用なカルボキシレート単位RCOOR’の基で ある。好ましい基質は、カルボン酸RCOOHである。有効に使用され得る代替 基質は、カルボン酸塩、カルボン酸エステル又はアミドである。好ましいエステ ルは、欧州特許第0350187号(この記載内容は、参照により本明細書中に 含まれる)でDutton等が説明したようにavrスターターモジュールにより基質 として容易に利用され得るN−アセチル−システアミンチオエステルである。好 ましいアミドは、N−アシルイミダゾールである。使用され得るその他の代替的 基質は、カルボン酸に対する酸化的前駆体である誘導体である;したがって、例 えば適切な基質は、式RCH(NH2)COOHのアミノ酸、式RCOCOOH のグリオキシル酸、式RCH2NH2のメチルアミン誘導体、式RCH2OHのメ タノール誘導体、式RCHOのアルデヒド、又は式R(CH2nCOOH(ここ で、nは2、4又は6である)の置換アルカン酸である。したがって、好ましい 基質の例としては、イソブチラート(R=i−Pr)及び2−メチルブチラート (R=1−メチルプロピル)が挙げられる。その他の可能性としては、n−ブチ ラート、シクロプロピルカルボキシレート、シクロブチルカルボキシレート、シ クロペンチルカルボキシレート、シクロヘキシルカルボキシレート、シクロヘプ タニルカルボキシレート、シクロヘキセニルカルボキシレート、シクロヘプテニ ルカルボキシレート、及び環状カルボキシレートの環メチル化変異体、並びにそ の前記の誘導体が挙げられる。 エリスロマイシン類似体は、PKSの初期物質(6−でオキシエ リスロノリド)又は1つ又はそれ以上の正常生合成工程後の生成物に対応する。 図2bに示したように、これらは:6−ヒドロキシル化;3−0−グリコシル化 ;5−0−グリコシル化;12−ヒドロキシル化;及び特異的糖メチル化を包含 する。 したがって、類似体は、図2bに示したように、6−デオキシエリスロノリド B、エリスロマイシンA、並びに種々の中間体及び代替物(これらに限定されな い)を含む。 (ii)1つ又はそれ以上のケチド単位酸化状態の対応する「天然」化合物と は異なるエリスロマイシン類似体(即ち、基:−CO−、−CH(OH)−、= CH−及び−CH2−からの代替物の選択)。 任意の−CH(OH)−の立体化学もそれぞれ選択可能である。 (iii)「天然」メチル側鎖の非存在下での対応する「天然」化合物とは異 なるエリスロマイシン類似体(これは変異体ATの使用により達成される)。正 常延長モジュールはC2又はC3単位を用いて非メチル化及びメチル化ケチド単位 を提供する。メチル化単位が天然である場合には非メチル化単位が提供され(そ して、天然非メチル化単位が存在する場合にはその逆)、さらに、より大きい単 位、例えばC4を提供して、エチル置換基を提供し得る。 (iv)「天然」メチル;および/またはメチル以外の環置換基の立体化学に おける対応する「天然」化合物とは異なるエリスロマイシン類似体。 (v)項(i)〜(iv)の2つ又はそれ以上の特徴を有するエリスロマイシ ン類似体。 (vi)非PKS酵素による加工処理、例えばヒドロキシル化、エポキシド化 、グリコシル化及びメチル化のうちの1つ又はそれ以上の処理を受けた上記の任 意の誘導体。 本発明の新規のエリスロマイシンの製造のための方法を記載する。最も簡単な 方法では、非天然スターター単位(好ましくは非天然スターター単位のカルボン 酸類似体、しかしこれらに限定されない)が、エリスロマイシンを生成し得る非 形質転換化生物体に導入される。好ましいアプローチとしては、エリスロマイシ ン生成生物の発酵ブロス中へのスターター単位の導入が含まれるが、このアプロ ーチはエリスロマイシンを生成し得る形質転換化生物に関してより有効である。 しかしながら、スターター単位類似体は、エリスロマイシン生成生物の代替調製 物、例えば分別又は非分別破壊細胞調製物にも導入される。さらに、このアプロ ーチは、エリスロマイシンを生成し得る形質転換化生物に関して、等しく有効で ある。別の方法では、異種I型PKS(「ドナー」PKS)内の個々のモジュー ル又はドメインをコードするDNAの1つ又はそれ以上のセグメントを用いて、 エリスロマイシン産生生物のDEBS遺伝子内のそれぞれ個々のモジュール又は ドメインをコードするDNAを置き換え得る。あらゆる天然又は非天然I型PK Sから得られた負荷モジュール及び延長モジュールは、この「ドナー」PKSに 適しているが、この目的に特に適しているのは、エリスロマイシン、ラパマイシ ン、アベルメクチン、テトロナシン、オレアンドマイシン、モネンシン、アンホ テリシン及びリファマイシンの生合成のためのI型PKSの成分であって、この ための遺伝子及びモジュール機構は、少なくとも一部は、遺伝子配列分析により 公知である。ドナーPKSの負荷モジュールの特に好ましい例は、特異性緩和を 示す負荷モジュール、例えばストレプトマイセス・アベルミチリス(Streptomyc es avermitilis)のアベルメクチン(avr)生成PKSの負荷モジュール;又 は例外的特異性を有する負荷モジュール、例えばラパマイシン、FK506−及 びアスコマイシン生成PKS(これらは すべて、シキミ酸由来スターター単位を天然に受容する)の負荷モジュールであ る。予期に反して、非形質転換化及び遺伝子工学処理エリスロマイシン産生生物 は、適切な条件下で培養されると、非天然性エリスロマイシンを産生することが 判明し、適切な場合には、生成物は天然エリスロマイシンと同じ加工処理を受け ることが判明した。 本発明のさらに別の局面では、「ドナー」PKS DNAを含有するプラスミ ドは、相同的組換えによりエリスロマイシン産生株の染色体上のDEBS遺伝子 中に組み込まれる条件下で、宿主細胞中に導入されて、ハイブリッドPKSを生 じる。好ましい実施態様は、ドナーPKS DNAが、この負荷モジュールが染 色体上でDEBS遺伝子に連結されるような方法で、負荷モジュールをコードす るセグメントを包含する。このようなハイブリッドPKSは、本明細書中に記載 したような適切な条件下で培養されると、有益且つ新規のエリスロマイシン生成 物を産生する。特に、DEBS遺伝子の負荷モジュールがアベルメクチン産生( avr)PKSの負荷モジュールに置き換えられた場合、新規のエリスロマイシ ン生成物はavrPKSに用いられるものに典型的なスターター単位を含有する 。したがって、eryPKSの負荷モジュールがavr負荷モジュールに置き換 えられると、このようなハイブリッドPKSを含有するサッカロポリスポラ・エ リスレア(Saccharopolyspora erythraea)株は,avrPKSにより典型的に用 いられるスターター単位を含有する14員マクロライドを産生することが分かっ ている。 S.エリスレア(S.erythraea)のこのような組換え体細胞により産生される1 4員マクロライド系ポリケチドがエリスロマイシンAの誘導体を含むことが判明 したことは予想外で、このことは、ハイブリッドPKSの生成物の新規の且つ治 療的に有益なエリスロマイ シンA誘導体への形質転換に必要ないくつかの処理工程が正しく実行されたこと を示す。本発明のさらに別の局面は、ハイブリッド遺伝子がそのプロモーターに 対する特異的アクチベーター遺伝子に連結されたII型PKS遺伝子に関してプ ロモーターの制御下に置かれると、あらゆるハイブリッドエリスロマイシン遺伝 子の転写が特異的に増大され得る、という予想外の且つ驚くべき知見である。こ のような制御下のハイブリッドエリスロマイシン遺伝子を含有する遺伝子工学処 理細胞がエリスロマイシン産生に適した条件下で培養されると、有意増強レベル の新規のエリスロマイシンが産生される、ということは特に注目すべきである。 有益なエリスロマイシン生成物の産生におけるこのような特異的増大は、II型 PKSプロモーター及びアクチベーター遺伝子の制御下に置かれた天然エリスロ マイシンPKSに関しても観察される。好ましい実施態様では、SCP2*由来 プラスミド上に存在する所望の遺伝子がStreptomyces coelicolorのアクチノロ ジン生合成遺伝子集団由来の二方向性actIプロモーターの制御下に置かれ、 この場合、ベクターはさらに、特異的アクチベータータンパク質Act II− orf4をコードする構造遺伝子を含有する。組換え体プラスミドは、導入PK S遺伝子又は宿主株中にすでに存在するPKS遺伝子がactIプロモーターの 制御下で発現される条件下で、サッカロポリスポラ・エリスレア(Saccharopolys pora erythraea)中に導入される。 このような株は所望のエリスロマイシン生成物を産生し、アクチベーター遺伝 子は、プロモーターからの転写効率を増強するためには、特異的プロモーターの 存在のみを要する。Act II−orf4族の活性物質がDNA結合タンパク 質の認識された種類に属さない場合には、これは特に意外である。したがって、 さらに別のタンパク質又はその他の制御素子が、アクチノロジン又は関連のイソ クロマンキノン色素を産生することが公知でない異種宿主で生じるための活性化 に必要である、と予測される。組換え体株が、同一PKS遺伝子が天然プロモー ターの制御下にある場合より10倍、エリスロマイシン生成物を産生し得る、そ して特異的エリスロマイシン生成物は成長相から定常相への移行中にのみという よりむしろ、成長培養中で早成的に産生される、ということも意外であり、且つ 有用である。このようなエリスロマイシンは、ヒト及び獣医学における抗生物質 として、そして多数のその他の目的のために、有用である。したがって、遺伝子 工学処理細胞がサッカロポリスポラ・エリスレア(Saccharopolyspora erythraea )である場合、アクチベーター及びプロモーターは、アクチノロジンPKS遺伝 子集団に由来し、そして低コピー数プラスミドベクターの部位特異的組込み後に 、actI/actII−orf4調節eryPKS遺伝子集団は染色体中に収 容され、適切な条件下でのこれらの細胞の培養は、このような異種制御下にない 匹敵する株におけるよりも10倍以上の総14員マクロライド系生成物を産生し 得る。S.エリスレア(S.erythraea)のこのような遺伝子工学処理細胞では、 この異種制御下のPKS遺伝子は、その構築が本明細書中に記載されているハイ ブリッドI型PKS遺伝子である場合、このような制御下にない同一のハイブリ ッドI型PKS遺伝子と比較して、10倍以上のハイブリッドポリケチド生成物 が得られる。特に、ハイブリッドI型PKS遺伝子が、付加モジュールがavr モジュールに置き換えられるeryPKS遺伝子である場合には、本明細書に記 載したような適切な条件下で培養すると、遺伝子工学処理細胞により産生される 新規の14員マクロライドの総量が10倍増大することが判明した。 非形質転換処理及び遺伝子工学処理エリスロマイシン産生細胞を 増殖させる適切な且つ好ましい手段、並びに新規のエリスロマイシンの単離、同 定及び実際的効用のための適切且つ好ましい手段は、実施例でさらに詳細に記載 する。 発明の要約 本発明は、式1: (式中、R1はα−分枝鎖C3〜C8アルキル、アルケニル、アルキニル、アル コキシアルキル又はアルキルチオアルキル基(そのいずれかが1つ又はそれ以上 のヒドロキシル基に任意に置換される);C5〜C8シクロアルキルアルキル基( ここで、アルキル基はα−分枝鎖C2〜C5アルキル基である);C3〜C8シクロ アルキル又はC5〜C8シクロアルケニル基(そのいずれかがメチル、あるいは1 つ又はそれ以上のヒドロキシル、あるいは1つ又はそれ以上のC1〜C4アルキル 基、あるいはハロ原子により任意に置換される);あるいは飽和された、あるい は完全又は一部不飽和で、任意に1つ又はそれ以上のC1〜C4アルキル基、ある いはハロ原子により任意に置換される、3〜6員化酸素又は硫黄含有複素環式 環であるか;あるいはR1はC1〜C4アルキル、C1〜C4アルコキシ及びC1〜C4 アルキルチオ基、ハロゲン原子、トリフルオロメチル及びシアノから選択され る少なくとも1つの置換基で任意に置換されるフェニルであるか;あるいはR1 は下記の式(a): (式中、XはO、S又は−CH2−であり、a、b、c及びdは各々別々に0 〜2であって、a+b+c+d≦5である) を有する基であり; R2は、H又はOHであり;R3〜R5は各々別々にH、CH3又はCH2CH3で あり;R6はH又はOHであり;そしてR7はH、CH3又はCH2CH3であり; R8はH又はデソサミンであり;R9はH、CH3又はCH2CH3であり;R10は OH、ミカロース(R13はHである)又はクラジノース(R13はCH3である) であり;R11はHであるか;R10=R11=Oであり;そしてR12はH、CH3又 はCH2CH3である) の化合物、及び製薬上許容可能なその塩に関する。 上記の定義において、3個又はそれ以上の炭素原子を含有するアルキル基は、 直鎖又は分枝鎖である。ハロとは、フルオロ、クロロ、ブロモ又はヨードを意味 する。α−分枝とは、C−13一に結合した炭素がさらに別の2つの炭素原子に 連結する第二炭素原子であることを意味し、残りのアルキル鎖は直鎖又は分枝鎖 である。式1の好ましい化合物は、R3〜R5、R7、R9及びR12がCH3であり 、R1が、1つ又はそれ以上のヒドロキシル基により任意に置換されるイソプロ ピル又はsec−ブチル、2−ブテン−2−イル 、2−ペンテン−2−イル又は4−メチル−2−ペンテン−2−イルであるもの である。さらに好ましいのは、R3〜R5、R7、R9及びR12がCH3であり、R1 が、1つ又はそれ以上のヒドロキシル基あるいは1つ又はそれ以上のC1〜C4ア ルキル基により任意に置換されるC3〜C6シクロアルキル又はシクロアルケニル である式1の化合物である。さらに別の群の好ましい化合物では、R1は、1つ 又はそれ以上のヒドロキシル基、あるいは1つ又はそれ以上のC1〜C4アルキル 基、あるいはハロゲン原子により任意に置換される5又は6員化酸素又は硫黄含 有複素環式環、特に3−チエニル又は3−フリル環である。別の群の好ましい化 合物では、R1はC3〜C8アルキルチオアルキル基、特に1−メチルチオエチル 基である。 本発明のその他の特定の実施態様は、式2: (式中、R1は、H、C1〜C8アルキル、C2〜C8アルケニル、C2〜C8アル キニル、各々のアルキル又はアルコキシ基中に1〜6個の炭素原子を含有するア ルコキシアルキル又はアルキルチオアルキル(ここで、前記のアルキル、アルコ キシ、アルケニル又 はアルキニル基はいずれかが1つ又はそれ以上のヒドロキシル基により、あるい は1つ又はそれ以上のハロ原子により置換される);あるいはメチル、あるいは 1つ又はそれ以上のC1〜C4アルキル基又はハロ原子により任意に置換されるC3 〜C8シクロアルキル又はC5〜C8シクロアルケニル;あるいは飽和された、あ るいは完全又は一部不飽和で、任意に1つ又はそれ以上のC1〜C4アルキル基、 あるいはハロ原子により任意に置換される3〜6員化酸素又は硫黄含有複素環式 環であるか;あるいは式SR14(ここで、R14はC1〜C8アルキル、C2〜C8ア ルケニル、C2〜C8アルキニル、C3〜C8シクロアルキル、C5〜C8シクロアル ケニル、フェニル、又は置換フェニル(ここで、置換基はC1〜C4アルキル、C1 〜C4アルコキシ又はハロである)、あるいは飽和された、あるいは完全又は一 部不飽和で、任意に1つ又はそれ以上のC1〜C4アルキル基、あるいはハロ原子 により任意に置換される3〜6員化酸素又は硫黄含有複素環式環である)の基で あり; R2は、H又はOHであり;R3〜R5は各々別々にH、CH3又はCH2CH3で あり;R6はH又はOHであり;そしてR7はH、CH3又はCH2CH3であり; R8はH又はデソサミンであり;R9はH、CH3又はCH2CH3であり;R10は OH、ミカロース(R13はHである)又はクラジノース(R13はCH3である) であり;R11はHであるか;R10=R11=Oであり;そしてR12はH、CH3又 はCH2CH3であるが、但し、R3〜R5がCH3であり、R7がCH3であり、R9 がCH3であり、そしてR12がCH3である場合には、R1はH又はC1アルキルで はない)の化合物、及び製薬上許容可能なその塩を包含する。 上記の定義において、3個又はそれ以上の炭素原子を含有するアルキル基は、 直鎖又は分枝鎖である。ハロとは、フルオロ、クロロ 、ブロモ又はヨードを意味する。 式2の好ましい化合物は、R2〜R6がCH3であり、R7がCH3であり、R9が CH3であり、そしてR12がCH2であり、R1がSR14(ここで、R14はメチル 又はエチルである)であるものである。別の群の好ましい化合物では、R1は、 1つ又はそれ以上のヒドロキシル基により置換されるメチル、イソプロピル又は sec−ブチルである。さらに別の群の好ましい化合物では、R1は、1つ又は それ以上のヒドロキシル基、あるいは1つ又はそれ以上のハロ原子、特に(トリ フルオロメチル)エチルにより置換される分枝C3〜C8アルキル基である。 本発明はさらに、治療的有効量の式1又は式2の化合物、あるいは製薬上許容 可能なその塩、そして製薬上許容可能な担体を包含する、哺乳類、魚類又は鳥類 における細菌感染又は原生動物感染の治療のための製剤組成物に関する。 本発明はさらに、治療的有効量の式1又は式2の化合物、あるいは製薬上許容 可能なその塩を、前記の哺乳類、魚類又は鳥類に投与することから成る、哺乳類 、魚類又は鳥類における細菌感染又は原生動物感染の治療方法に関する。 「治療」という用語は、本明細書中で用いる場合は、別記しない限り、本発明 の方法に提示されるような細菌感染又は原生動物感染の治療又は防止を含む。 本明細書中で用いる場合、別記しない限り、「細菌感染(単数又は複数)」及 び「原生動物感染」という用語は、本発明の化合物のような抗生物質を投与する ことにより治療又は防止され得る哺乳類、魚類及び鳥類に起きる細菌感染及び原 生動物感染、並びに細菌感染及び原生動物感染に関連した障害を含む。このよう な細菌感染及び原生動物感染、並びにこのような感染に関連した障害としては、 以下のものが挙げられる:ストレプトコッカス・ニューモニア(Streptococcus pneumoniae)、ヘモフィルス・インフルエンザ(Haemophilus influenzae)、モ ラキセラ・カタラリス(Moraxella catarrhalis)、スタフィロコッカス・アウレ ウス(Staphylococcus aureus)又はペプトストレプトコッカス・spp.(Peptostre ptococcus spp.)による感染に関連した肺炎、中耳炎、副鼻腔炎、気管支炎、扁 桃炎及び乳様突起炎;ストレプトコッカス・ピオゲニス(Streptococcus pyogen es)、C及びG群連鎖球菌、クロストリジウム・ジフテリア(Clostridium dipht heriae)又はアクチノバシルス・ヘモリティクム(Actinobacillus haemolyticum) による感染に関連した喉頭炎、リウマチ熱及び糸球体腎炎;マイコプラズマ・ニ ューモニア(Mycoplasma pneumoniae)、レギオネラ・ニューモフィラ(Legionell a pneumophila)、ストレプトコッカス・ニューモニア(Streptococcus pneumon iae)、ヘモフィルス・インフルエンザ(Haemophilus influenzae)又はクラミ ジア・ニューモニア(Chlamydia pneumoniae)による感染に関連した気道感染; スタフィロコッカス・アウレウス(Staphylococcus aureus)、コアグラーゼ陽性 ブドウ球菌(即ち、S.エピデルミディス(S.epidermidis)、S.ヘモリティ クス(S.hemolyticus)等)、ストレプトコッカス・ピオゲネス(Streptococcu s pyogenes)、ストレプトコッカス・アガラクチア(Streptococcus agalactiae )、連鎖球菌C〜F群(微小コロニー連鎖球菌)、ビリダンス(viridans)連鎖 球菌、コリネバクテリウム・ミヌチシウム(Corynebacteriumminutissimum)、 クロストリジウム spp.(Clostridium spp.)又はバルトネラ・ヘンセラ(Barto nella henselae)による感染に関連した非併発性皮膚及び柔組織感染、膿瘍及び 骨髄炎、並びに産褥熱;スタフィロコッカス・サプロフィチクス(Staphylococc us saprophyticus)又はエンテロコッ カス・spp.(Enterococcus spp.)による感染に関連した非併発性急性尿道感染; クラミジア・トラコマチス(Chlamydia trachomatis)、ヘモフィリス・ドゥクレ イル(Haemophilus ducreyl)、トレポネマ・パリドゥム(Treponema pallidum) 、ウレアプラズマ・ウレアリティクム(Ureaplasma urealyticum)又はナイゼリ ア・ゴノルヘア(Neiserria gonorrheae)による感染に関連した尿道炎及び子宮 頸管炎、並びに性感染症;S.アウレウス(S.aureus)(食中毒及びトキシック ショック症候群)、又はA、B及びC群連鎖球菌による感染に関連した毒素病; ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)による感染に関連した潰瘍;ボ レリア・レクレンチス(Borrelia recurrentis)による感染に関連した全身性熱 性症候群;ボレリア・ブルグドルフエリ(Borrelia burgdorferi)による感染に 関連したライム病;クラミジア・トラコマチス(Chlamydia trachomatis)、ナイ ゼリア・ゴノルホエア(Neisseria gonorrhoeae)、S.アウレウス(S.aureus) 、S.ニュモニア(S.pneumoniae)、S.ピオゲネス(S.pyogenes)、H.インフ ルエンザ(H.influenzae)又はリステリア・spp.(Listeria spp.)による感染に 関連した結膜炎、角膜炎及び涙膿炎;ミコバクテリウム・アビウム(Mycobacteri um avium)又はミコバクテリウム・イントラセルラー(Mycobacterium intracel lulare)による感染に関連した播種性鳥型結核菌複合(MAC)症;カンピロバ クター・ジェジュニ(Campylobacter jejuni)による感染に関連した胃腸炎;ク リプトスポジウム・ssp.(Cryptosporidium spp.)による感染に関連した腸管 原生動物;ビリダンス(viridans)連鎖球菌による感染に関連した歯牙形成性感 染;ボルデテラ・ペルツシス(Bordetella pertussis)による感染に関連した持 続性咳;クロストリジウム・ペルフリンゲンス(Clostridium perfringens)又は バクテロイデス・spp.(Bacteroides sp p.)による感染に関連したガス壊疸;並びにヘリコバクター・ピロリ(Helicobac ter pylori)又はクラジミア・ニューモニア(Chlamydia pneumoniae)による感 染に関連したアテローム硬化症。 動物において治療又は防止され得る細菌感染及び原生動物感染、並びにこのよ うな感染に関連した障害としては、以下のものが挙げられる:P.ハエム(P.ha em)、P.マルトシダ(P.multocida)、マイコプラズマ・ポビス(Mycoplasma bovis)又はボルデテラ・spp.(Bordetella spp.)による感染に関連したウシ呼 吸器疾患;大腸菌 E.coli又は原生動物(即ち、球虫類、クリプトスポリジウ ム属等)による感染に関連した雌牛腸疾患;スタフィロコッカス・アウレウス(S taph.aureus)、スタフィロコッカス・ウベリス(strep.uberis)、スタフィロ コッカス・アガラクチア(Strep.agalactiae)、スタフィロコッカス・ディスガ ラクチア(Strep.Dysgalactiae)、クレブシラ・spp.(Klebsiella spp.)、コリ ネバクテリウム(Corynebacterium)又はエンテロコッカス・spp.(Enterococcus spp.)による感染に関連した乳牛乳腺炎;A.プレウロ(A.pleuro)、P.マル トシダ(P.multocida)又はマイコプラズマ・spp.(Mycoplasma spp.)による感 染に関連したブタ呼吸器疾患;大腸菌(E.coli)、ラウソニア・イントラセルラ リス(Lawsonia intracellularis)、サルモネラ(Salmonella)又はセルプリナ ・ヒオジシンティア(Serpulina hyodyisinteriae)による感染に関連したブタ腸 疾患;大腸菌による感染に関連した雌牛子宮炎;フソバクテリウム・ネクロフォ ルム(Fusobacterium necrophorum)又はバクテロイデス・ノドサス(Bacteroides nodosus)による感染に関連した雌牛毛様疣;モラキセラ・ボビス(Moraxella bov is)による感染に関連した雌牛感染性角結膜炎;原生動物(即ち、ネオスポリウ ム(neosporium))による感染に関連した雌牛早発性流産;大腸菌による感染 に関連したイヌ及びネコにおける尿道感染;スタフィロコッカス・エピデルミデ ィス(Staph.epidermidis)、スタフィロコッカス・インテゥメディウス(Stap h.Intermedius)、コアグラーゼ陰性スタフィロコッカス(Staph.)又はP.マ ルトシダ(P.multocida)による感染に関連したイヌ及びネコにおける皮膚及び 柔組織感染;アルカリゲネス・spp.(Alcaligenes spp.)、バクテロイデス・sp p.(Bacteroides spp.)又はプレボテラ(Prevotella)による感染に関連したイ ヌ及びネコにおける歯又は口腔感染。帆なの方法により治療又は防止し得るその 他の細菌感染及び原生動物感染、並びにこのような感染に関連した疾患は、J.P .Sanford et al.,“The Sanford Guide To Antimicrobial Therapy”,26th E dition,(Antimicrobial Therapy,Inc.,1996)に示されている。本発明の化 合物が細菌又は原生動物感染に通常は関連しない疾病状態(例えば、癌、エイズ 及びアテローム硬化症)の治療にかなりの効用を有する、ということも漸次明ら かになりつつある。 哺乳類、例えばヒト、又は魚類又は鳥類における細菌感染又は細菌感染に関連 した疾患あるいは癌を治療するために用いられる場合、式1又は式2の化合物は 、単独で、又は化合物及び製薬上許容可能な希釈剤又は担体を包含する製剤組成 物の形態で投与し得る。このような組成物は、例えば錠剤又はカプセルとして経 口的に、あるいは皮下又は筋肉内注射を含めて非経口的に投与される。式1又は 式2の化合物は、例えば座薬の適用により直腸投与され得る。製薬上許容可能な 担体は、意図される投与方式に依っている。例えば、ラクトース、クエン酸ナト リウム及びリン酸の塩は、崩壊剤(例えばデンプン)及び滑剤(例えばステアリ ン酸マグネシウム、ラウリル硫酸ナトリウム及びタルク)と一緒に、製薬上許容 可能な担体として錠剤中に用い得る。さらに、カプセル中での使用に関しては、 有用な製薬上許容可能な担体は、ラクトース及び高分子ポリエチレングリコール (例えば、2,000〜4,000の分子量を有する)である。非経口的使用に 関しては、滅菌溶液又は懸濁液が調製されるが、この場合、製薬上許容可能な担 体は水性(例えば、水、等張食塩水又は等張デキストロース)又は非水性(例え ば、綿実油又は落花生油のような植物起源の、そしてグリセロール又はプロピレ ングリコールのようなポリオールの脂肪油)である。 哺乳類被験者における細菌感染又は細菌感染に関連した疾患を治療するために 、あるいはヒト(特に、非小型細胞肺癌)及びその他の哺乳類、例えばイヌにお ける種々の癌の治療のために、in vivoで用いる場合、有用1日用量は、0.1 〜100mg/体重1kg、特に0.5〜25mg/体重1kgの範囲で、1回 に又は数回に分けて投与する。 「製薬上許容可能な塩(1又は複数)」という語句は、本明細書中で用いる場 合には、別記しない限り、本発明の化合物中に存在し得る酸性又は塩基性基を含 む。天然で塩基性である本発明の化合物は、種々の無機及び有機酸による広範囲 の塩を生成し得る。このような塩基性化合物の製薬上許容可能な酸付加塩を調製 するために用い得る酸は、非毒性酸付加塩、即ち製薬上許容可能な陰イオンを含 有する塩、例えば塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、硝酸塩、硫酸塩、重 硫酸塩、リン酸塩、酸性リン酸塩、イソニコチン酸塩、酢酸塩、乳酸塩、サリチ ル酸塩、クエン酸塩、酸性クエン酸塩、酒石酸塩、パントテン酸塩、重酒石酸塩 、アスコルビン酸塩、コハク酸塩、マレイン酸塩、ゲンチシン酸塩、フマル酸塩 、グルコン酸塩、グルカノン酸塩、サッカリン酸塩、ギ酸塩、安息香酸塩、グル タミン酸塩、メタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩 、p−トルエンスルホン酸塩及びパモエート[即ち、 1,1‘−メチレン−ビス−(2−ヒドロキシ−3−ナフトエート)]を形成す るものである。 天然で酸性である本発明の化合物は、種々の製薬上許容可能な陽イオンと塩基 性塩を形成し得る。このような塩の例としては、アルカリ金属又はアルカリ土類 金属塩、特に、本発明の化合物のカルシウム、マグネシウム、ナトリウム及びカ リウム塩である。 本発明のある種の化合物は不斉中心を有し、したがって異なるエナンチオマー 及びジアステレオマー形態で存在する。本発明は、本発明の化合物のすべての光 学異性体及び立体異性体、並びにその混合物の使用に関し、そして本発明は、そ れらを用いるか又は含有するすべての製剤組成物及び治療方法に関する。 本発明は本発明の化合物、及びその製薬上許容可能な塩を包含するが、この場 合、1つ又はそれ以上の水素、炭素又はその他の原子はその同位体に置換される 。このような化合物は、代謝薬物動態試験における、そして結合検定における探 索及び診断用具として有用である。 本発明の化合物は、エリスロマイシンを産生し得る非形質転換化又は形質転換 化生物の発酵により生成される。それらの例としては、サッカロポリスポラ(Sac charopolyspora)の種、ストレプトコッカス・グリセオプラヌス(Streptomyces g riseoplanus)、ノカルディア(Nocardia)の種、ミクロモノスポラ(Micromonos pora)の種、アースムバクター(Arthobacter)の種及びストレプトマイセス(Str eptomyces)抗生物質が挙げられるが、これらに限定されず、又、S.コエリコ ラ(S.coelicolor)は含まれない。この点で特に適しているのは、サッカロポリ スポラ・エリスレア(Saccharopolyspora erythraea)の非形質転換及び形質転換 株、例えばNRRL 2338、18643,21484である。特に好ましい 形質転換株 は、エリスロマイシン負荷モジュールがアベルメクチン産生体であるストレプト マイセス・アベルミティリス(Streptomyces avermitilis)、又はラパマイシン 産生体であるストレプトマイセス・ヒグロスコポクス(Streptomyces hygroscop ocus)からの負荷モジュールで置き換えられたものである。本発明の化合物の化 合物の好ましい製造方法は、式R1COOH(ここで、R1は式1又は2の前述の 定義と同様である)の適切なカルボン酸又はその塩、エステル(特に好ましいの はN−アセチルシステアミンチオエステルである)又はアミド、あるいはその酸 化前駆体の存在下での適切な生物の発酵による。酸又はその誘導体は、接種時に 、又は発酵中に時々、発酵に付加される。本発明の化合物の生成は、発酵から試 料を取り出し、クロマトグラフィーにより、例えば高圧液体クロマトグラフィー を用いて本発明の化合物の出現後に、有機溶媒で抽出することにより、モニタリ ングする。式1又は2の化合物の収量が最大になるまで、一般的には4〜10日 間、インキュベーションを継続する。カルボン酸又はその誘導体の各々の好まし い付加レベルは、0.05〜4.0g/Lである。酸又はその誘導体を発酵に、 一般的に漸次付加することにより、例えば数日間毎日付加することにより、式1 又は2からの化合物の最高収量が得られる。発酵に用いられる培地は、炭素、窒 素及び微量元素の同化可能供給源を含有する従来の複合培地である。 非形質転換化及び遺伝子工学処理化エリスロマイシン産生細胞を増殖させる適 切且つ好ましい手段、並びに式1及び2の化合物の単離、同定及び実際的効用の ための適切且つ好ましい手段は、実施例に詳細に記載されている。 図面の簡単な説明 本発明のいくつの実施態様を、添付の図面を参照しながら説明する。 図1は、3つの公知のポリケチドの化学式を示す。 図2aは、エリスロマイシンAの前駆体である、6−デオキシエリスロノリド B(6−DEB)を産生するPKSである6−デオキシエリスロノリドシンター ゼB(DEBS)の機能を示す図である。 図2bは、6−DEBのエリスロマイシンAへの転換を含めたエリスロマイシ ンの後PKS生合成を示す。 図3a及び3bは、プラスミドplGlの構築を示す図である。 図4a、4b及び4cは、プラスミドpND30の構築を示す図である。 図5は、プラスミドpAVLDの構築を示す図である。 図6は、S.エリスレア(S.erythraes)NRRL2338のゲノム中へのp AVLDの組込みを示す。 図7は、ラパマイシンの生合成を示す図である。 図8は、プラスミドpMO6の構築を示す図である。 図9は、プラスミドpCJR26の構築を示す図である。 図10は、プラスミドpC−ATXの構築を示す図である。 図11は、プラスミドpC−AT12の構築を示す図である。 図12は、プラスミドpCJR49の構築を示す図である。 発明の詳細な説明 avr負荷モジュールに受容される広範囲のスターター単位が、従来の試験で 包括的に確定されている(例えば欧州特許出願第0 214 731号、第0 350 187号、 第0 317 148号)(これらの記載内容は、参照により本明細書中に含まれる)。 したがって、本発明はこ れらの実施例の特定の詳細に限定されず、それらは単にavr負荷モジュールの 有効性を確証するのに役立つと理解されるべきである。さらに、pIGl又はp ND30構築物を用いる実施例は、avr負荷モジュールに連結した場合に、本 発明の新規の化合物の発現を増強するactIプロモーター及びそのコグネイト アクチベーター遺伝子actII−orf4の能力を明確に立証する。サッカロ ポリスポラ・エリスレア(Saccharopolyspora erythraea)の非形質転換株も外因 的に供給される基質を容易に取り込んで、新規のエリスロマイシンポリケチドを 生成し得る、ということも実施例から明らかである。その結果として、適切なエ リスロマイシン産生株を選択し(任意に、所望の株中にpIGl又はpND30 プラスミドを組み入れる)、そして発酵に適切なスターター単位を補足すること により、本発明の特定の新規の化合物が容易に生成され得る、ということも当業 者には明らかである。したがって、本発明の6−デオキシエリスロマイシン及び 6,12−ジデオキシエリスロマイシン誘導体は、米国特許第5,141,92 6号及びWO97/06266に記載されているようなサッカロポリスポラ・エ リスレア(Saccharopolyspora erythraea)NRRL 18643又はNRRL2 1484を用いて容易に産生される。同様に、Weber等(J.Bacteriol.,164:42 5-433,1991)が記載したサッカロポリスポラ・エリスレア(Saccharopolyspora erythraea)株を用いて、本発明の所望の新規の類似体を得ることができる。例え ば、UW24株を用いて(任意にpIGl又はpND30で形質転換して)、エ リスロノリドBの新規の類似体が得られる。 Hewlett-Packard 1090Mダイオードアレイ分光光度計を用いて、UVスペ クトルを記録した。NMRスペクトルはすべて、別記しない限りは、Varian Uni ty500MHz分光計によりCDCl3 で測定した。ピーク位置は、テトラメチルシランからのダウンフィールド(pp m)で表される。ピーク形状は、以下のように示される:s 一重線;d 二重 線;t 三重線;q 四重線;m 多重線;br 広。NMR構造に示される原 子数は、標準名称を代表するものではないが、NMRデータを特定実施例に相関 させる。APCI供給源を装備したVG PlatformII質量分光計とイ ンターフェースするHewlett-Packard1090M液体クロマトグラフを用いて( 方法A)、又はAPCI供給源を装備したVG PlatformII質量分光 計とインターフェースするHewlett-Packard1050M液体クロマトグラフを用 いて(方法B及び方法C)、HPLC−MSデータを得た。 HPLC方法A: カラム Beckman Ultrasphere 5μm ODS 4mmx25cm 流速 0.85mL/分 移動相 勾配:アセトニトリル:0.05M酢酸アンモニウム(28:72)を22分 間でアセトニトリル:0.05M酢酸アンモニウム(50:50)に。アセトニトリル:0. 05M酢酸アンモニウム(50:50)に22〜25分の間保持。25〜30分で初期状態に戻る 。 HPLC方法B: カラム MetaChem Inertsil 5μm C8 3mmx150mm 流速 0.5mL/分 移動相 アイソクラチック:メタノール:0.05M酢酸アンモニウム+0.1% トリクロロ酢酸(60:40) HPLC方法C: カラム Waters Symmetry 5μm C18 2.1mmx150mm 流速 0.22mL/分 移動相 勾配:アセトニトリル:0.05M酢酸アンモニウム( 30:70)を30分間でアセトニトリル:0.05M酢酸アンモニウム(50:50)に。 以下の培地及び溶液を用いた: スクロース−コハク酸塩限定培地 スクロース 69g KNO3 10g コハク酸 2.36g KH2PO4 2.7g MgSO4・7H2O 1.2g ZnCl2 10mg MnCl2・4H2O 6.2g CuCl2・2H2O 0.53mg CoCl2 0.55mg FeSO4・7H2O 2.5mg CaCl2・2H2O 38mg milli-Q水 全量を1.0Lにする量 KOH pH6〜6.4にする量 水道水培地 グルコース 5g トリプトン 5g 酵母菌抽出物 2.5g EDTA 36mg 水道水 全量を1.0Lにする量 KOH pH7.1にする量 ERY−P培地 デキストロース 50g/L NutrisoyTM粉 30g/L (NH42SO4 3g/L NaCl 5g/L CaCO3 6g/L pHを7.0に調整 NutrisoyTM粉は、British Arkady Group,Skerton Road,Manchester,UKか ら購入。 以下の実施例により本発明を説明する。 実施例1a:プラスミドpIGlの構築 プラスミドpIGlは,ery負荷モジュール,eryPKSの最初の2つの 延長モジュール及びeryPKSのチオエステラーゼの代わりにavr負荷モジ ュールを包含するハイブリッドI型PKS遺伝子を含有するSCP2*由来プラ スミドから成る。これは、以下に示すように、いくつかの中間プラスミドを介し て構築される(図3)。 (i)プラスミドpVE3.4の構築 アベルメクチン(avr)PKS遺伝子の一部を含有するプラスミドpVE1 446を大腸菌ATCC68250株から得た(MacNeil,D.J.et al.,Ann.N .Y.Acad.Sci.(1994)721:123-132)。プラスミドpVE1446をBamHI で消化し、座標32.15及び3.40間の7.6kbp断片(MacNeil,D.J. et al.,Ann.N.Y.Acad.Sci.(1994)721:123-132)をゲル電気泳動により精 製し、再循環させた。混合物は、所望のプラスミドpVE3.4を含有した。こ れを大腸菌TGlrecO株(Dr.P.Oliver(Dept.of Genetics,U.Cambrid ge)により構築された;Kolodner,R.et al.,J.Bacteriol.(1985)163:1060 -1066;T.Gibson,Ph.D.Thesis,U.Cambridge,1985)の形質転換後に単離し た。 (ii)プラスミドpNCOl2の構築 プラスミドpBK25(Bevitt,D.J.et al.,Eur.J.Biochem.(1992)204 :39-49)をNcoIで消化し、12kbp断片を末端修復して、SmaIで線状 化しておいたプラスミドpUCl8に連結した。連結混合物を大腸菌TG1re cO中で形質転換させ、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べ た。所望のプラスミドpNCOl2を制限パターンにより同定した。 (iii)プラスミドpCRabcの構築 プラスミドpCRabc(図3)を、以下のように構築した。3つの別々のP CR反応を実施した:先ず、20pmolの各々の合成オリゴヌクレオチドAl (5'-CTCGTCGGTGGCTTTGCG-3')及びA2(5'-CCCGGGAAAAACGAAGACTAGTGGCGCGGAC GGCCG-3')を用いて100ngのpNCOl2鋳型から1.0kbp生成物を増 幅した。PCR生成物を末端修復して、リン酸化し、そしてSmaI切断pUC 18中でクローニングして、プラスミドpCRaを得た。第二に、20pmol の各々の合成オリゴヌクレオチドCl(5'-CACGCGCAGCGCGGCGGA-3')及びC2( 5'-CGAACCGCTAGCGGTCGTCGCGATGGCCT-3')を用いて100ngのpNCOl2鋳 型から1.5kbp生成物を増幅した。生成物を末端修復して、リン酸化し、そ してSmaI切断pUC18中でクローニングして、プラスミドpCRcを得た 。第三に、20pmolの各々の合成オリゴヌクレオチドB1(5’-GTGGCCCGGC CGTCCGCGCCACTAGTCTTCGTTTTT-3')及びB2(5'-AACAGCTAGCGGTTCGTCCGCCGCTGCC GTGCC-3’)を用いて100ngのpVE3.4鋳型から1.4kbp生成物を 増幅した。生成物を末端修復して、リン酸化し、そしてSmaI切断pUCl8 中でクローニングして、プラスミドpCRbを得た。 プラスミドpCRaをHindIII及びSpeIで消化して、プラスミドp CRabを得た。プラスミドpCRcをNheI及び EcoR1で消化して、1.5kbp挿入物を予めNheI及びEcoR1で消 化しておいたプラスミドpCRabと結紮して、プラスミドpCRabcを得た 。 (iv)プラスミドpNEWAVETEの構築 プラスミドpCRabcをMfeI及びSfiIで消化し,avrPKSの負 荷ドメインを含有するDNA断片をゲル電気泳動により精製し、MfeI及びS fiIで消化しておいたプラスミドpNTEP2と連結して、大断片をゲル電気 泳動で精製した。連結混合物を大腸菌TGlrecO中で形質転換させて、個々 のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミドpNE WAVETE(13.7kbp)をその制限パターンにより同定した。 (v)プラスミドpRM52の構築 プラスミドpRM52はプラスミドpRM5の誘導体である(Mc Daniel,R. et al.,Science,(1993)262:1546-1550)。pRM5を先ずNdeIで消化し て線状にし、末端修復して、次に再連結して、pRM51を生成した。pRM5 1をPacI及びNsiIで切断し、大型PacI−NsiI断片を単離し、N deI部位を含有する短二本鎖オリゴヌクレオチドリンカーに連結して、一緒に アニーリングした合成オリゴヌクレオチド5'-TAAGGAGGACACATATGCA-3’及び5'-T AATTCCTCCTGTGTAT-3'から構築した。連結混合物を大腸菌TGlrecO中で形 質転換させて、単離コロニーをそれらのプラスミド含量に関してスクリーニング した。所望のプラスミド(19.6kbp)をその制限マップにより同定し、p RM52と命名した。 (vi)プラスミドpIGlの構築 プラスミドpNEWAVETEをNdeI及びXbaIで消化し 、挿入物をスクロース勾配上での沈降により精製した。精製挿入物をNdeI及 びXbaIで消化しておいたプラスミドpRM52(19.6kbp)と連結し て、スクロース勾配上での沈降により、ベクターを精製した。連結混合物を用い て大腸菌を形質転換し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べ た。所望のプラスミドpIGlをその制限パターンにより同定した。 実施例1b:プラスミドpND30の構築 プラスミドpND30は,ery負荷モジュール,eryPKSの最初の2つ の延長モジュール及びeryPKSのチオエステラーゼの代わりにavr負荷モ ジュールを包含するハイブリッドI型PKS遺伝子を含有するSCP2*由来プ ラスミドから成る。これは、以下に示すように、いくつかの中間プラスミドを介 して構築される(図4)。 (i)プラスミドpCJR101の構築 pCJR101(図4)は、放線菌類におけるPKS遺伝子の発現のために用 いられるよう構築されたシャトルプラスミドである。それは、大腸菌中で複製さ せるためのCoIElレプリコン、SCP2*低コピー数ストレプトミセス属(S treptomyces)レプリコン(Bibb,M.J.and Hopwood,D.A.,J.Gen.Microbio l.(1981)126:427)及び、植物性菌糸体における成長相から定常相への移行中 にactプロモーターからの転写を活性化するact集団からのactII−o rf4アクチベーター遺伝子を包含する。それは、以下のように構築される:p MF1015からの約970bpのDNA断片(actII−orf4アクチベ ーター遺伝子を含有する)(Fernandez-Moreno,M.A.et al.,Cell(1991)66 :769-780)を、プライマーとして合成オリゴヌクレオチド:5'-ACTAGTCCACTGCCT CTCGGTAAAATCCAGC-3’及び5'-CTTAAGAGGGGCTCCACCGCGTTCACGGAC- 3'を用いて、PCRにより増幅する。これは、さらにフランキングSpeI及び AfIII制限部位を導入する。この断片をプラスミドpUC19の末端修復A atII部位中でクローニングして、プラスミドpCJR18を産生する。約2 15bpのDNA断片(Parro,V.et al.,Nucl.Acids Res.(1991)19:2623 -2627)を、プライマーとして合成オリゴヌクレオチド:5'-ACATTCTCTACGCCTAAG TGTTCCCCTCCCTGCCTC-3'及び5'-GTGATGTATGCTCATATGTGTCCTCCTTAATTAATCGATGCGTT CGTCCGGTG-3’を用いて、二方向性プロモーター対PactIII/PactI を含有するpMV400から増幅する。これもフランキングNdeI及びAfI II部位を導入する。PCR生成物をNdeI及びAfIIIで消化し、予めN deI及びAfIIIで切断しておいたプラスミドpCJR18と連結して、プ ラスミドpCJR19を生成した。チオストレプトンに対する耐性を賦与する、 tsr遺伝子を含有する1.1kbpのHindIII SphI断片を、鋳型 としてのプラスミドpIJ922からPCRにより、プライマーとしてオリゴヌ クレオチド:5'-TGAACACCAAGCTTGCCAGAGAGCGACGACTTCCCC-3'及び5'-GACAGATTGCA TGCCCTTCGAGGAGTGCCCGCCCGG-3'を用いて、得た。これもフランキングHindI II及びSphI部位を導入する。PCR生成物をHindIII及びSphI で消化し、予めHindIII及びSphIで切断しておいたプラスミドpCJ R19に連結して、プラスミドpCJR24を得た。プラスミドpIJ922を BamHI及びSstIで消化し、繁殖可能性遺伝子座及び複製のオリジンを含 有する断片(Lydiate,D.J.et al.,Gene(1985)35:223-235)をBamHI及 びSstIで消化したpUC19に連結して、二機能性プラスミドpCJR16 (14.7kbp)を生成した。プラスミドpCJR24をSaII及びSph Iで消化し、消化物からの2つの大型断片 をゲル電気泳動により精製し、予めXhoI及びSphIで消化しておいたプラ スミドpCJR16との4成分連結で併合した。連結混合物を用いて、Streptom yces lividansを形質転換し、チオストレプトンの存在下でコロニーを選択した 。このようなコロニーのあるものは、所望のプラスミドpCJR101(約12 .4kbp)を含有することが示され、これはその制限パターンにより同定され た。 (ii)プラスミドpCJR29の構築 プラスミドpCJR29の構築は、図4に説明されている。チオストレプトン に対する耐性を賦与する、tsr遺伝子を含有する1.1kbpのHindII I−XhoI断片を、鋳型としてのプラスミドpIJ922からPCRにより、 プライマーとしてオリゴヌクレオチド:5'-TGAACACCAAGCTTGCCAGAGAGCGACGACTTC CCC-3'及び5’-GACAGATTCTCGAGCCTTCGAGGAGTGCCCGCCCGG-3'を用いて、得た。こ れもフランキングHindIII及びXhoI部位を導入する。PCR生成物を HindIII及びXhoIで消化し、予めHindIII及びXhoIで切断 しておいたプラスミドpCJR16に連結して、プラスミドpCJR25を得た 。プラスミドpCJR25をHindIII及びSphIで消化し、予めHin dIII及びSphIで消化しておいたプラスミドpCJR19と連結して、所 望のプラスミドpCJR29(約12.4kbp)を生成し、これをその制限パ ターンにより同定した。プラスミドpCJR29は、プラスミドpCJR101 とは、複製のSCP2*由来オリジンに関して、tsr遺伝子、actII−o rf4遺伝子及びactII/actIIIプロモーターの配向が異なっていた 。 (iii)プラスミドpND30の構築 プラスミドpNEWAVETEをNdeI及びXbaIで消化し 、挿入物をスクロース勾配上での沈降により精製した。精製挿入物をNdeI及 びXbaIで消化しておいたプラスミドpCJR29(約12.4kbp)と連 結して、スクロース勾配上での沈降により、ベクターを精製した。連結混合物を 用いて大腸菌を形質転換し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して 調べた。所望のプラスミドpND30をその制限パターンにより同定した。 実施例1c:プラスミドpCJR26の構築 数工程で、プラスミドpMO6(図8)を先ず構築した: (i)プラスミドpMO1の構築 eryAI(Donadio,S.et al.,Science(1991)252,675-679)のヌクレオ チド1948からヌクレオチド3273に延びるS.erythraeaのeryAI遺伝 子の約1.3kbpDNAセグメントを、PCRにより、プライマーとして合成 オリゴヌクレオチド:5'-CATGCTCGAGCTCTCCTGGGAAGT-3'及び5'-CAACCCTGGCCAGGG AAGACGAAGACGG-3'を、そして鋳型としてプラスミドpNTEP2を用いて、増幅 した。PCR生成物を末端修復し、予めSmaIで消化して線状にしておいたプ ラスミドpUCl8に連結し、次にアルカリ性ホスファターゼで処理した。連結 混合物を用いて大腸菌TGlrecOを形質転換し、個々のコロニーをそれらの プラスミド含量に関して調べた。挿入物の境界を成すStuI部位がポリリンカ ー中のHindIII部位に隣接する所望のプラスミドpMO1(3.9kbp )をその制限パターンにより同定した。 (ii)プラスミドpMO2の構築 rapAのヌクレオチド1643からヌクレオチド2486に延びるストレプ トマイセス・ヒグロスコピクス(Streptomyces hygroscopicus)のrapA遺伝 子の約0.85kbpDNAセグメントを、PCRにより、プライマーとして次 の合成オリゴヌクレオチド :5'-TTCCCTGGCCAGGGGTCGCAGCGTG-3’及び5'-CACCTAGGACCGCGGACCACTCGAC-3’を 、そして鋳型として組換え体バクテリオファージλ−1E(Schwecke,T.et al .,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1995)92:7839-7843)からのDNAを用いて 、増幅した。PCR生成物を末端修復し、予めSmaIで消化して線状にしてお いたプラスミドpUCl8に連結し、次にアルカリ性ホスファターゼで処理した 。連結混合物を用いて大腸菌TGlrecOを形質転換し、個々のコロニーをそ れらのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミドpMO2(3.5kb p)をその制限パターンにより同定した。 (iii)プラスミドpMO3の構築 eryAIのヌクレオチド4128からヌクレオチド5928に延びるS.エ リスレア(S.erythraea)のeryAI遺伝子の約1.7kbpDNAセグメン トを、PCRにより、プライマーとして合成オリゴヌクレオチド:5'-TGGCCAGGG AGTCGGTGCACCTAGGCA-3’及び5'-GCCGACAGCGAGTCGACGCCGAGTT-3’を、そして鋳型 としてプラスミドpNTEP2を用いて、増幅した。PCR生成物を末端修復し 、予めSmaIで消化して線状にしておいたプラスミドpUCl8に連結し、次 にアルカリ性ホスファターゼで処理した。連結混合物を用いて大腸菌TG1 r ecOを形質転換し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた 。BaII及びAvrII部位がポリリンカー中のHindIII部位に隣接す る所望のプラスミドpMO3(4.4kbp)をその制限パターンにより同定し た。 (iv)プラスミドpMO4の構築 プラスミドpMO1をHindIII及びBaIIで消化し、1.3kbp挿 入物を、予めHindIII及びBaIIで消化して おいたプラスミドpMO3に連結した。連結混合物を用いて、大腸菌TG1 r ecOを形質転換し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた 。所望のプラスミドpMO4(5.6kbp)をその制限パターンにより同定し た。 (v)プラスミドpMO5の構築 プラスミドpMO4をStuIで消化し、3.0kbp挿入物を、予めStu Iで消化しておいたプラスミドpNTEP2に連結し、ゲル電気泳動により精製 して、3.8kbp挿入物を除去した。連結混合物を用いて、大腸菌TG1 r ecOを形質転換し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた 。プラスミドpMO5(12.8kbp)をその制限パターンにより同定した。 (vi)プラスミドpMO6の構築 プラスミドpMO2をBaII及びAvrIIで消化し、挿入物を、予めBa II及びAvrIIで消化しておいたプラスミドpMO5に連結した。連結混合 物を用いて、大腸菌TG1 recOを形質転換し、個々のコロニーをそれらの プラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミドpMO6(13.5kbp) をその制限パターンにより同定した。 (vii)プラスミドpCJR26の構築 プラスミドpCJR26は、ery負荷モジュール,eryPKSの一次及び 二次延長モジュール、並びにery鎖終止チオエステラーゼを包含するPKS遺 伝子を含有するSCP2*ベースのプラスミドであるが、但し、一次延長モジュ ール内のメチルマロニル−CoA:ACPアシルトランスフェラーゼをコードす るDNAセグメントは、rapPKSのモジュール2のマロニル−CoA:AC PアシルトランスフェラーゼをコードするDNAにより特異的に置換されていた 。それを、以下のように構築した(図9):プラスミ ドpMO6をNdeI及びXbaIで消化し,挿入物を、NdeI及びXbaI で消化しておいたプラスミドpCJR24と連結して、ゲル電気泳動で精製した 。連結混合物を用いて大腸菌TG1 recOを形質転換し、個々のコロニーを それらのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミドpCJR26をその 制限パターンにより同定した。 実施例1d:S.エリスレア(S.erythraea)JC2/pCJR26の構築及 びTKL誘導体の生成 プラスミドpCJR26を用いて、S.エリスレア(S.erythraea)JC2プ ロトプラストを形質転換した。チオストレプトン耐性コロニーを、10μg/m lのチオストレプトンを含有するR2T20培地上で選択した。いくつかのコロ ニーを、そのゲノムDNAとDIG標識DEBS1−TE遺伝子とのサザーンブ ロットハイブリダイゼーションにより染色体中に組み込まれたpCJR26の存 在に関して試験した。 pCJR26の組込みコピーを有するクローンを、5μg/mlのチオストレ プトンを含有するSSM培地中で増殖させて、28〜30℃で7日間増殖させた 。この後、ブロスを濾過して菌糸体を除去し、pH3に調整した。ブロスを2容 量の酢酸エチルで2回抽出し、併合酢酸エチル抽出物を等容量の飽和塩化ナトリ ウムで洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥して、減圧下で酢酸エチルを除去し 、約500mgの粗製物質を得た。生成物は(2S,3R,5R)−2−メチル −3,5−ジヒドロキシ−n−ヘキサン酸δ−ラクトン及び(2S,3R,5R )−2−メチル−3,5−ジヒドロキシ−n−ヘプタン酸δ−ラクトン: であることが示された。 実施例1e:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL 2338/pCJR 26の構築及び14員マクロライドの生成におけるその使用 約5mgのpCJR49を用いて、S.エリスレア(S.erythraea)NRRL 2338プロトプラストを形質転換して、プラスミドが染色体中に組み込まれる 株を得た。数個のコロニーから、全DNAを得て、サザーンハイブリダイゼーシ ョンにより分析して、プラスミドがEryAIのモジュール2に組み込まれて新 規のマクロライド生合成経路を生じることを確証した。さらなる組込みが起きて 、反復プラスミド配列を生じた。S.エリスレア(S.erythraea)NRRL23 38/pCJR49を5mg/mlのチオストレプトンを含有するトリプシンダ イズブロス中に接種して、30℃で3日間インキュベートした。100mLのこ の種子培養を用いて、分散及び300rpmでの振盪を補助するために2個のス プリングを有する、各々500mLの培地を含有する5x2Lフラスコ中の5m g/mlのチオストレプトンを含有する2Lのスクロースコハク酸塩限定培地に 接種した。さらに5日間増殖させた後、培養を遠心分離して、上清のpHをpH 9に調整した。次に、上清を等容量の酢酸エチルで3回抽出し、蒸発させて溶媒 を除去した。生成物をHPLC/MSにより分析し、2つのマクロライドをエリ スロマイシン 類似体: と同定した。 実施例1f:プラスミドpC−ATXの構築 プラスミドpC−ATXは、ery負荷モジュール、eryPKSの一次及び 二次延長モジュール、並びにery鎖終止チオエステラーゼを包含するPKS遺 伝子を含有するSCP2*ベースのプラスミドであるが、但し、一次延長モジュ ール内のメチルマロニル−CoA:ACPアシルトランスフェラーゼをコードす るDNAセグメントは、ストレプトマイセス・シンナモネンシス(Streptomyces cinnamonensis)ATCC 14513(ポリエーテルポリケチドモネンシンの プロデューサー)からクローン化された推定上のI型PKS遺伝子からのマロニ ル−CoA:ACPアシルトランスフェラーゼをコードするDNAにより特異的 に置換されていた。それを、いくつかの中間プラスミドを介して、以下のように 構築した(図10)。 (i)コスミドpSCIN02の単離 ストレプトマイセス・シンナモネンシス(Streptomyces cinnamonensis)AT CC 14513(モネンシンプロデューサー)のゲ ノムライブラリーを、BamHI−線状化及びアルカリ性ホスファターゼ処理コ スミドベクターpWEl5に連結した染色体DNAのサイズ分別化35〜45k bpSau3A断片から構築した。連結混合物を、Gigapackパッケージング抽出 物を用いてλ粒子中にパッケージングし、大腸菌NM1ブルー中にトランスフェ クトした。ライブラリーの約600個のコロニーをナイロン膜の表面で増殖させ て、溶解し、それらのDNAを、UV照射により膜に架橋させた。膜は、その後 、スクリーニング操作に用いた。DEBSのモジュール2からのケトシンターゼ ドメインを包含するpMO8の挿入物を35PαATPの存在下でのランダムプラ イミングにより標識して、DNAハイブリダイゼーション用のプローブとして用 いた。プローブを4.0xSSC緩衝液中で68℃で16時間ハイブリダイズし た後、0.8xSSC緩衝液中で68℃で1時間、洗い落とした。3つの陽性コ ロニーが単離された。3つのクローンすべての挿入物のDNAを、ベクターpW El5中に存在するT3及びT7プライミング部位から末端シーケンシングした 。I型ケトシンターゼ及びマロニル−CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ ドメインと相同の領域が、鋳型としてクローン2(pSCIN02と命名)を用 いて、T7プライミング部位からのDNA配列中に見出された。 マロニル−CoA:ACPアシルトランスフェラーゼドメイン(ATXと命名) の部分DNAシーケンシングは、前記のマロネート−又はメチルマロネート−異 的CoA:ACPアシルトランスフェラーゼ(Haydock,S.F.et al.,FIBS(19 95)374:246-248)とは実質的に異なるドメインの推定上の基質認識部分におけ る独特の配列モチーフを明示した。 (ii)プラスミドpMO38の構築 ATXドメインの約0.9kbpDNAセグメントを、PCRに より、プライマーとして次の合成オリゴヌクレオチド:5'-CTGGCCAGGGCGCGCAATG GCCGAGCAT-3'及び5'-CCCTAGGAGTCGCCGGCAGTCCAGCGCGGCGCCC-3'を、そして鋳型と してコスミドpSCIN02からのDNAを用いて、増幅した。PCR生成物を 末端修復し、予めSmaIで消化して線状にしておいたプラスミドpUCl8に 連結し、次にアルカリ性ホスファターゼで処理した。連結混合物を用いて大腸菌 TG1 recOを形質転換し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関 して調べた。所望のプラスミドpMO38(3.5kbp)をその制限パターン により同定した。 (iii)プラスミドpMO34の構築 プラスミドpMO34は、挿入されたD1−AT2遺伝子の停止コドン後に挿 入されたポリクローニング部位を有するpMO6の誘導体である。プラスミドp MO6をEceRI及びHindIIIで消化し、ポリクローニング部位の二本 鎖領域を形成する2つのオリゴヌクレオチド;5'-AATTCATAACTAGTAGGAGGTCTGGCC ATCTAGA-3'及び5'-TCGAAGATCTACCGGTCTGGAGGATGATCAATAC-3'を用いてアニーリン グした。混合物を連結し、大腸菌TG1 recO中で形質転換した。個々のコ ロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミドpMO34 (13.5kbp)をその制限パターンにより同定した。 (iv)プラスミドpMO35の構築 プラスミドpMO35は、ストレプトマイセス・コリヌス(Streptomyces coll inus)からのTKLS−AT2遺伝子及び翻訳的共役化クロトニル−CoA−レ ダクターゼ遺伝子を含有するpMO34の誘導体である(Wallace et al.,E.J .Biochem.(1995)233:954-962)。クロトニル−CoA−レダクターゼ遺伝子 を、NdeI−BamHI断片としてプラスミドpZYB3(K.Reynolds教授よ り贈呈された)から切り取って、これを緑豆ヌクレアーゼで処理して、盲端を生 成し、予めSpeIで切断しておいたpMO34に連結し、緑豆ヌクレアーゼを 用いて同様に盲端化した。連結混合物を用いて大腸菌TG1 recOを形質転 換し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた。クロトニル− CoA−レダクターゼ遺伝子の正しい配向を有する所望のプラスミドpMO35 (14.2kbp)をその制限パターンにより同定した。 (v)プラスミドpMO36の構築 プラスミドpMO38をBaII及びAvrIIで消化し、挿入物を、予めB aII及びAvrIIで消化しておいたプラスミドpMO35に連結した。連結 混合物を用いて、大腸菌TGl recOを形質転換し、個々のコロニーをそれ らのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミドpMO36(13.5k bp)をその制限パターンにより同定した。 (vi)プラスミドpC−ATXの構築 プラスミドpMO36をNdeI及びXbaIで消化し,NdeI及びXba Iで消化しておいたプラスミドpCJR29と連結して、ゲル電気泳動で精製し た。連結混合物を用いて大腸菌TG1recOを形質転換し、個々のコロニーを それらのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミドpC−ATXをその 制限パターンにより同定した。 実施例1g:S.エリスレア(S.erythraea)JC2/pC−ATXの構築及 びTKL誘導体の生成 プラスミドpC−ATXを用いて、S.エリスレア(S.erythraea)JC2プ ロトプラストを形質転換した。チオストレプトン耐性コロニーを、10μg/m lのチオストレプトンを含有するR2T20培地上で選択した。いくつかのコロ ニーを、そのゲノムDNA とDEBS1−TE遺伝子をコードするDIG標識DNAとのサザーンブロット ハイブリダイゼーションにより染色体中に組み込まれたpC−ATXの存在に関 して試験した。 pC−ATXの組込みコピーを有するクローンを、5μg/mlのチオストレ プトンを含有するSSM培地中で増殖させて、28〜30℃で7日間増殖させた 。この後、ブロスを濾過して菌糸体を除去し、pH3に調整した。ブロスを2容 量の酢酸エチルで2回抽出し、併合酢酸エチル抽出物を等容量の飽和塩化ナトリ ウムで洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥して、減圧下で酢酸エチルを除去し 、約500mgの粗製物質を得た。生成物をガスクロマトグラフィー、質量分析 法及びNMRにより特性化して、(2S,3R,4S,5R)−2−メチル−4 −エチル−3,5−ジヒドロキシ−n−ヘキサン酸δ−ラクトン及び(2S,3 R,4S,5R)−2−メチル−4−エチル−3,5−ジヒドロキシ−n−ヘプ タン酸δ−ラクトン: であることが示された。実施例1h:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL 2338/pC−AXの構築及び14員マクロライドの生成におけるその使用 約5mgのpC−ATX DNAを用いて、S.エリスレア(S.erythraea) NRRL2338プロトプラストを形質転換して、プ ラスミドが染色体中に組み込まれる株を得た。数個のコロニーから、全DNAを 得て、サザーンハイブリダイゼーションにより分析して、プラスミドがEryA Iのモジュール2に組み込まれて新規のマクロライド生合成経路を生じることを 確証した。さらなる組込みが起きて、反復プラスミド配列を生じた。S.エリス レア(S.erythraea)NRRL2338/pC−ATXを5mg/mlのチオス トレプトンを含有するトリプシンダイズブロス中に接種して、30℃で3日間イ ンキュベートした。10mLのこの種子培養を用いて、分散及び300rpmで の振盪を補助するために2個のスプリングを有する、各々500mLの培地を含 有する5x2Lフラスコ中の5mg/mlのチオストレプトンを含有する2Lの スクロースコハク酸塩限定培地に接種した。さらに5日間増殖させた後、培養を 遠心分離して、上清のpHをpH9に調整した。次に、上清を等容量の酢酸エチ ルで3回抽出し、蒸発させて溶媒を除去した。生成物をHPLC−MSにより分 析し、2つのマクロライド生成物: と同定した。 実施例1i:プラスミドpC−ATl2の構築 プラスミドpC−ATl2は、ery負荷モジュール、eryPKSの一次及 び二次延長モジュール、並びにery鎖終止チオエス テラーゼを包含するPKS遺伝子を含有するSCP2*ベースのプラスミドであ るが、但し、二次延長モジュール内のメチルマロニル−CoA:ACPアシルト ランスフェラーゼをコードするDNAセグメントは、rapPKSのモジュール 2のマロニル−CoA:ACPアシルトランスフェラーゼをコードするDNAに より特異的に置換されていた。それを、いくつかの中間プラスミドを介して、以 下のように構築した(図11)。 (i)プラスミドpMO25の構築 eryAI(Donadio,S.et al.,Science(1991)252,675-679)のヌクレオ チド6696からヌクレオチド7707に延びるS.エリスレア(S.erythraea )のeryAI遺伝子の約1.0kbpDNAセグメントを、PCRにより、プ ライマーとして合成オリゴヌクレオチド:5'-GGCGGGTCCGGAGGTGTTCACCGAGTT-3' 及び5’-ACCTTGGCCAGGGAAGACGAACACTGA-3’を、そして鋳型としてプラスミドp NTEP2を用いて、増幅した。PCR生成物を末端修復し、予めSmaIで消 化して線状にしておいたプラスミドpUCl8に連結し、次にアルカリ性ホスフ ァターゼで処理した。連結混合物を用いて大腸菌TGlrecOを形質転換し、 個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた。挿入物の境界を成す StuI部位がポリリンカー中のHindIII部位に隣接する所望のプラスミ ドpMO25(3.6kbp)をその制限パターンにより同定した。 (ii)プラスミドpMO26の構築 eryAIのヌクレオチド8660からヌクレオチド9258に延びるS.エ リスレア(S.erythraea)のeryAI遺伝子の約0.6kbpDNAセグメン トを、PCRにより、プライマーとして合成オリゴヌクレオチド:5'-TCCTAGGCC GGGCCGGACTGGTCGACCTGCCGGGTT-3'及び5'-AAACACCGCGACCTGGTCCTCCGAGC-3'を、そ して鋳型とし てプラスミドpNTEP2を用いて、増幅した。PCR生成物を末端修復し、予 めSmaIで消化して線状にしておいたプラスミドpUCl8に連結し、次にア ルカリ性ホスファターゼで処理した。連結混合物を用いて大腸菌TG1 rec Oを形質転換し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた。A vrII部位がポリリンカー中のHindIII部位に隣接する所望のプラスミ ドpMO26(3.2kbp)をその制限パターンにより同定した。 (iii)プラスミドpMO27の構築 プラスミドpMO1をEcoRI及びBaIIで消化し、1.0kbp挿入物 を、予めEcoRI及びBaIIで消化しておいたプラスミドpMO2に連結し た。連結混合物を用いて、大腸菌TG1 recOを形質転換し、個々のコロニ ーをそれらのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミドpMO27(4 .4kbp)をその制限パターンにより同定した。 (iv)プラスミドpMO32の構築 プラスミドpMO26をAvrII及びHindIIIで消化し、0.6kb p挿入物を、予めAvrII及びHindIIIで消化しておいたプラスミドp MO27に連結した。連結混合物を用いて、大腸菌TG1 recOを形質転換 し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミ ドpMO32(5.1kbp)をその制限パターンにより同定した。 (v)プラスミドpMO33の構築 プラスミドpMO32をBspEI及びSexAIで消化し、2.7kbp挿 入物を、予め同一の2つの酵素で消化しておいたプラスミドpNTEP2に連結 し、ゲル電気泳動により精製して、2.8kbp挿入物を除去した。連結混合物 を用いて、大腸菌TG1 recOを形質転換し、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べ た。プラスミドpMO33(12.8kbp)をその制限パターンにより同定し た。 (vi)プラスミドpC−AT12の構築 プラスミドpMO33をNdeI及びXbaIで消化し,NdeI及びXba Iで消化しておいたプラスミドpCJR29と連結して、ゲル電気泳動で精製し た。連結混合物を用いて大腸菌TG1recOを形質転換し、個々のコロニーを それらのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミドpC−ATl2をそ の制限パターンにより同定した。実施例1j:S.エリスレア(S.erythraea)JC2/pC−ATl2の構築 及びTKL誘導体の生成 プラスミドpC−ATl2を用いて、S.エリスレア(S.erythraea)JC2 プロトプラストを形質転換した。チオストレプトン耐性コロニーを、10μg/ mlのチオストレプトンを含有するR2T20培地上で選択した。いくつかのコ ロニーを、そのゲノムDNAとDEBS1−TE遺伝子をコードするDIG標識 DNAとのサザーンブロットハイブリダイゼーションにより染色体中に組み込ま れたpC−ATl2の存在に関して試験した。 pC−ATl2の組込みコピーを有するクローンを、5μg/mlのチオスト レプトンを含有するSSM培地中で増殖させて、28〜30℃で7日間増殖させ た。この後、ブロスを濾過して菌糸体を除去し、pH3に調整した。ブロスを2 容量の酢酸エチルで2回抽出し、併合酢酸エチル抽出物を等容量の飽和塩化ナト リウムで洗浄し、無水硫酸ナトリウム上で乾燥して、減圧下で酢酸エチルを除去 し、約500mgの粗製物質を得た。生成物は、(3R,4S,5R)−4−メ チル−3,5−ジヒドロキシ−n−ヘキサン酸δ−ラ クトン及び(3R,4S,5R)−4−メチル−3,5−ジヒドロキシ−n−ヘ プタン酸δ−ラクトン: であることが示された。 実施例1k:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL 2338/pC−A Tl2の構築及び14員マクロライドの生成におけるその使用 約5μgのpC−ATl2 DNAを用いて、S.エリスレア(S.erythraea )NRRL2338プロトプラストを形質転換して、プラスミドが染色体中に組 み込まれる株を得た。数個のコロニーから、全DNAを得て、サザーンハイブリ ダイゼーションにより分析して、プラスミドがEryAIのモジュール2に組み 込まれて新規のマクロライド生合成経路を生じることを確証した。さらなる組込 みが起きて、反復プラスミド配列を生じた。S.エリスレア(S.erythraea)N RRL2338/pC−ATl2を5mg/mlのチオストレプトンを含有する トリプシンダイズブロス中に接種して、30℃で3日間インキュベートした。1 00mLのこの種子培養を用いて、分散及び300rpmでの振盪を補助するた めに2個のスプリングを有する、各々500mLの培地を含有する5x2Lフラ スコ中の5μg/mlのチオストレプトンを含有する2Lのスクロースコハク酸 塩限定培地に接種した。さらに5日間増殖させた後、培養を遠心分離して、上清 のpHをpH9に調整した。次に、上清を等容量の酢酸エチルで3回抽出し、蒸 発させて溶媒を除去した。 生成物をHPLC−MSにより分析し、2つのマクロライド生成物を同定した: 実施例1l:プラスミドpCJR49の構築 プラスミドpCJR49は、モジュール2中にケトレダクターゼを有さない突 然変異体DEBS1−TE遺伝子を含有するpCJR24ベースのプラスミドで あり、二次モジュール内のメチルマロニルエキステンダーの代わりにマロニルエ キステンダーを組み入れるために、モジュール2のATドメインがRAPS A T2に置き換えられていた(図12)。 pMO32をBspEI及びSexAIで消化し、RAPモジュール2からの ATを含有する断片を、予めBspEI及びSexAIで消化しておいたpUC l−0中でクローン化して、プラスミドpCJR43を産生した。 pCJR43をNdeI及びXbaIで消化し,突然変異体DEBS1−TE 遺伝子を含有する断片を、予めNdeI及びXbaIで消化しておいたpCJR 24中でクローン化して、プラスミドpCJR49を産生した。pCJR49を その酵素マッピングにより確証した。 実施例1m:S.エリスレア(S.erythraea)JC2/pCJR 49の構築及びTKL誘導体の生成 約5μgのpCJR49 DNAを用いて、S.エリスレア(S.erythraea) JC2プロトプラストを形質転換して、プラスミドが染色体中に組み込まれる株 を得た。数個のコロニーから、全DNAを得て、サザーンハイブリダイゼーショ ンにより分析して、プラスミドがeryTEに組み込まれていたことを確証した 。S.エリスレア(S.erythraea)JC2/pCJR49を5μg/mlのチオ ストレプトンを含有するトリプシンダイズブロス中に接種して、30℃で3日間 インキュベートした。100mLのこの種子培養を用いて、分散及び300rp mでの振盪を補助するために2個のスプリングを有する、各々500mLの培地 を含有する5x2Lフラスコ中の5μg/mlのチオストレプトンを含有する2 Lのスクロースコハク酸塩限定培地に接種した。さらに5日間増殖させた後、培 養を遠心分離して、上清のpHをpH9に調整した。次に、上清を等容量の酢酸 エチルで3回抽出し、蒸発させて溶媒を除去した。生成物をメタノール中に溶解 し、Finnegan-MAT GCQ System上でGCMSにより分析した。こ の分析は、合成標準と比較することにより、2つの新規のラクトンが存在するこ とを示した。これらの生成物は、(4S,5R)−4−メチル−3−ケト−5− ヒドロキシヘキサン酸δラクトン及び(4S,5R)−4−メチル−3−ケト− 5−ヒドロキシヘプタン酸δラクトンであった: 実施例1n:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL 2338/pCJR 49の構築及び14員マクロライドの生成のためのその使用 5μgのpCJR49 DNAを用いて、S.エリスレア(S.erythraea)N RRL2338プロトプラストを形質転換して、プラスミドが染色体中に組み込 まれる株を得た。数個のコロニーから、全DNAを得て、サザーンハイブリダイ ゼーションにより分析して、プラスミドがEryAIのモジュール2に組み込ま れて新規のマクロライド生合成経路を生じることを確証した。さらなる組込みが 起きて、反復プラスミド配列を生じた。S.エリスレア(S.erythraea)/pC JR49を5μg/mlのチオストレプトンを含有するトリプシンダイズブロス 中に接種して、30℃で3日間インキュベートした。100mLのこの種子培養 を用いて、分散及び300rpmでの振盪を補助するために2個のスプリングを 有する、各々500mLの培地を含有する5x2Lフラスコ中の5μg/mlの チオストレプトンを含有する2Lのスクロースコハク酸塩限定培地に接種した。 さらに5日間増殖させた後、培養を遠心分離して、上清のpHをpH9に調整し た。次に、上清を等容量の酢酸エチルで3回抽出し、蒸発させて溶媒を除去した 。生成物をHPLC−MSにより分析し、2つのマクロライド生成物を同定した : 実施例2:avr負荷ドメインがS.erythraeaNRRL2338のery負荷 ドメインの代わりに置き換えられるハイブリッドPKS遺伝子を保 有するS.erythraeaERMD1の構築 (i)プラスミドpAVLDの構築 プラスミドpCRabc(実施例1)をBamHIで線状化して、予めBgI IIで消化したpIJ702に連結した。混合物は、所望のプラスミドpAVL D(図5)を含有した。連結混合物を大腸菌TG1 recO中で形質転換させ て、個々のコロニーをそれらのプラスミド含量に関して調べた。所望のプラスミ ドpAVLDをその制限パターンにより同定した(図5)。 (ii)S.エリスレア(S.erythraea)ERMD1の構築 大腸菌TG1 recO(pAVLD)から単離したpAVLD 約5〜10 μgをS.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338中で形質転換させて、 安定なチオストレプトン耐性コロニーを単離した。3つのコロニーのうちの1つ を選択して、全DNAをPstIで消化し、プローブとして、ケトシンターゼド メインKS1をコードするeryAI遺伝子の断片を含有するプラスミドpCR cからの挿入物を用いて、サザーンハイブリダイゼーションにより分析した。分 析は8.5kbp、4.8kbp及び33kbpの陽性ハイブリダイジングPs tI断片を示したが、これは、pAVLDの2つのタンデム方式で組み込まれた コピーの存在を示す(図6)。 実施例3:S.エリスレア(S.erythraea)ERMD1を用いたイソプロピル 及びsec−ブチルエリスロマイシンの調製 S.エリスレア(S.erythraea)ERMD1の50mL発酵を水道 水培地上で実施し、30℃で4日後に、菌糸体を収穫して、トリストレプトン( 50μg/mL)を含有する1.5Lのスクロース−コハク酸塩培地に接種した 。30℃で4日間増殖させた後、全ブロスを等容量の酢酸エチルで2回、抽出し た。併合抽出物を減圧下で濃縮し、クロロホルム/メタノール/.88アンモニ ア 8:2:0.01分(容量で)で溶離したシリカゲルプレート(20x20 cm)上での分取薄層クロマトグラフィー処理を2回施した。1mL/分でメタ ノール/0.5%酢酸アンモニウム(70:30(vol/vol))で溶離したPh aseSepCl8ベースの脱活性化逆相カラムS5ODS(オクタデシルシラ ン)6(4.6mmx25cm)上でのHPCLにより、生成物をさらに分離し た。分画を、3つの別々の注入から7〜11分の間に収集し、プールした分画を 10回の別々の注入で再注入した。4−炭素(C−4:イソブチリル)スタータ ー単位の組入れに由来するイソプロピル側鎖(式1のR1でのイソプロピル)を 含有する類似体は初期に溶離し、5−炭素(C−5:2−メチブチリル)スター ター単位の組入れに由来するsec−ブチル側鎖(式1のR1でのsec−ブチ ル)を含有する類似体は数分後に出現した。高分離度MSは、C−4eryA, eryB及びeryD類似体に関する、並びにC−5eryA及びeryB類似 体に関する結果を示し、これらは下記のように密接に対応する: これらの実験では、天然エリスロマイシンは低量又は検出不可能な量でのみ存 在し、検出可能量のeryC類似体は認められなかった。発酵ブロス中のC−4 /C−5化合物の全体的濃度比は、ブロスの酢酸エチル抽出物のESMSにより 査定した場合、4:1〜6:1でC−4化合物が優勢であった。A:B:D類似 体の比は変動性で、約15:60:25であったが、発酵が進行するとA類似体 の割合が増大した。エリスロマイシンの全収率は、約400μg/Lであった。 イソ酪酸又は2−メチル酪酸の補足は成されなかった。したがって、イソブチリ ル及び2−メチルブチリルスターター単位は、天然アベルメクチンの合成と同様 に、内因性供給前駆体に由来すると思われた(例えば、Hafner et al.,(1991 ),J.Antibiot.,44:349-356)。 実施例4a:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL 2338/pIGl の構築 約5μgのプラスミドpIGlをS.エリスレア(S.erythraea)NRRL 2338のプロトプラスト中で形質転換させて、安定チオストレプトン耐性コロ ニーを単離した。いくつかのこのようなコロニーから、全DNAを得て、サザー ンハイブリダイゼーションにより分析して、プラスミドがeryAI中に特異的 に組み入れられていたことを確証した。サザーン分析はさらに、組入れ部位が, ave負荷モジュールを介して変化したマクロライドを産生するのに適切であっ たことを示した。 実施例4b:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL 2338/pND3 0の構築 約5μgのプラスミドpND30をS.エリスレア(S.erythraea)NRRL 2338のプロトプラスト中で形質転換させて、安定チオストレプトン耐性コ ロニーを単離した。いくつかのこのよう なコロニーから、全DNAを得て、サザーンハイブリダイゼーションにより分析 して、プラスミドがeryAI中に特異的に組み入れられていたことを確証した 。サザーン分析はさらに、組入れ部位が、ave負荷モジュールを介して変化し たマクロライドを産生するのに適切であったことを示した。 実施例5a:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを 用いた13イソプロピル及び13−sec−ブチルエリスロマイ シンの調製 S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを、50μg/ mLチオストレプトンを含有する水道水培地中に接種し、30℃で4日間増殖さ せた。この後に、20mLの菌糸体を用いて、280rpmで振盪し、強打を低 減するために単一スプリングを有する2Lフラスコ中で、トリストレプトン(5 0μg/mL)を含有する500mLのスクロース−コハク酸塩培地に接種した 。3.5〜6日後、ブロスを濾過して菌糸体を除去し、次に等容量の酢酸エチル で3回、抽出した。併合酢酸エチル抽出物を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、蒸 発により溶媒を除去した。GC及び電気噴霧MSを用いて生成混合物を分析した 結果、全体で5〜6mg/Lの14員マクロライド生成物が生じ、大きい方の成 分はsec−ブチル−エリスロマイシンD(約1.5mg/L)であり、他の成 分はsec−ブチル−エリスロマイシンB及びsec−ブチル−エリスロマイシ ンA;イソプロピル−エリスロマイシンA、B及びD;そして少量の天然エリス ロマイシンA、B及びDであった。S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2 338/pIGlは、等価のS.エリスレア(S.erythraea)ERMD1構築物 (実施例2参照)と比較して、約10〜15倍多い新規のイソプロピル−及びs ec−ブチル−エリスロマイシンを産生した。これは、I型PKS の発現を増強するactIプロモーター及びそのコグネイトアクチベーター遺伝 子actII−orf4の能力を明白に実証する。さらに、イソ酪酸又は2−メ チル酪酸の補足は行われなかった。したがって、イソブチル及び2−メチルブチ リルスターター単位は内因的に供給された前駆体に由来する、と考えられた。 実施例5b:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30 を用いた13−イソプロピル及び13−sec−ブチルエリスロ マイシンの調製 S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30を、50μg /mLチオストレプトンを含有する水道水培地中に接種し、30℃で4日間増殖 させた。この後に、20mLの菌糸体を用いて、280rpmで振盪し、強打を 低減するために単一スプリングを有する2Lフラスコ中で、トリストレプトン( 50μg/mL)を含有する500mLのスクロース−コハク酸塩培地に接種し た。3.5〜6日後、ブロスを濾過して菌糸体を除去し、次に等容量の酢酸エチ ルで3回抽出した。併合酢酸エチル抽出物を無水硫酸ナトリウム上で乾燥し、蒸 発により溶媒を除去した。GC及び電気噴霧MSを用いて生成混合物を分析した 結果、全体で5〜6mg/Lの14員マクロライド生成物が生じ、大きい方の成 分はsec−ブチル−エリスロマイシンD(約1.5mg/L)であり、他の成 分はsec−ブチル−エリスロマイシンB及びsec−ブチル−エリスロマイシ ンA;イソプロピル−エリスロマイシンA、B及びD;そして少量の天然エリス ロマイシンA、B及びDであった。S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2 338/pND30は、等価のS.エリスレア(S.erythraea)ERMD1構築 物(実施例2参照)と比較して、約10〜15倍多い新規のイソプロピル−及び sec−ブチル−エリスロマイシンを産生した。これは、I型PK Sの発現を増強するactIプロモーター及びそのコグネイトアクチベーターー 伝子actII−orf4の能力を明白に実証する。したがって、イソブチル及 び2−メチルブチリルスターター単位は内因的に供給された前駆体に由来する、 と考えられた。 実施例6a:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを 用いた13−シクロペンチル−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを、300 mLエルレンマイヤーフラスコ中の50mL水道水培地中に接種した。28℃で 36時間インキュベーション後、このフラスコを用いて、5Lミニジャー中の3 .5LのERY−P培地に接種した。ブロスを、1.75L/分の通気速度で、 28℃でインキュベートした。シクロペンタンカルボン酸(1.4mL)を24 時間後に付加して、発酵を168時間継続した。この後、全ブロスを、水酸化ナ トリウム水溶液を用いてpH8.5に調整し、酢酸エチル(10L)で抽出した 。酢酸エチル抽出物を濃縮、乾燥して、粗製生成物をゴム(4.2g)として得 た。この抽出物1gを酢酸エチル(5mL)に溶解し、酢酸エチル(10mL) で予め状態調節した予充填シリカゲルカートリッジ(10g;International So rbent Technology)に付加した。カラムを継続的に酢酸エチル(4x10mL) ;ジクロロメタン:メタノール(1:1)(2x10mL);ジクロロメタン: メタノール:アンモニア(90:9:1)(1x10mL);ジクロロメタン: メタノール:アンモニア(80:19:1)(1x10mL);メタノール(2 x10mL)で溶離した。分画7〜10を併合し、蒸発、乾燥させた。この分別 を残りの3.2gのゴムに関して反復した。この濃縮工程により、所望の物質を 含有するゴム状固体約920mgを得た。これを 、8mL/分でのアセトニトリル:0.05M酢酸アンモニウム(7:3)の移 動相をもちいるZorbax 7μmODSカラム(21.2mmx25cm) を用いて分取逆相HPLCにより、さらに精製した。4つの別々の注入からの、 当該物質を含有する分画を併合し、蒸発、乾燥させた後に、アセトニトリル:0 .05酢酸アンモニウム(28:72)からアセトニトリル:0.05酢酸アン モニウム(50:50)までの移動相勾配を用いて、18分間掛けて(流速4m L/分)、Beckman5μm Ultrasphere ODSカラム(10mm x25cm)を用いる反復分取逆相HPLC処理した。5つの別々の注入からの 、当該物質を含有する分画を併合し、蒸発、乾燥して、精製白色固体(7mg) を得た。生成物の構造を、質量分析(MS)及び核磁気共鳴(NMR)分光法に より、以下のように確証した: HPLC保持時間−方法A−26.0分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察758。C4072NO12に ついて758であるべきである) NMRデータ: *星印で示した帰属は逆転する可能性があることを示す。実施例6b:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30 を用いた13−シクロペンチル−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30を用いた 実施例6aと同様の実験は、実施例6aで例示した化合物を生成した。 実施例7a:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを 用いた13−シクロブチル−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを、3x3 00mLエルレンマイヤーフラスコ中の50mL水道水培地中に接種した。28 ℃で72時間インキュベーション後、このフラスコを用いて、3x5Lミニジャ ー中の3.5LのERY−P培地に接種した。ブロスを、2.0L/分の通気速 度で、28℃でインキュベートし、500rpmで攪拌した。シクロブタンカル ボン酸(1.4mL)を24時間及び48時間後に付加して2回供給し、発酵を 168時間継続した。この後、全ブロスのpHを、水酸化ナトリウム水溶液を用 いてpH8.5に調整し、酢酸エチル(20L)で抽出した。酢酸エチル抽出物 を濃縮、乾燥して、粗製生成物をゴム(9.2g)として得た。この抽出物の一 部(2.3g)を酢酸エチル(12.5mL)に溶解し、酢酸エチル(10mL )で予め状態調節した予充填シリカゲルカートリッジ(10g;International Sorbent Technology)に付加した。カラムを継続的に酢酸エチル(4x24mL );ジクロロメタン:メタノール(9:1)(1x24mL);ジクロロメタン :メタノール(8:2)(2x24mL);ジクロロメタン:メタノール:アン モニア(80:19:1)(1x24mL)で溶離した。分画6〜8を併合し、 蒸発、乾燥させた。この分別を残りのゴム(4.7g)に関して反復した。この 濃縮工程により、所望の物質を含有する固体約415mgを得た。これを、8m L/分でのアセトニトリル:0.05M酢酸アンモニウム(3:1)の移動相を もちいるZorbax7μmODSカラム(21.2mmx25cm)を用いて 分取逆相HPLCにより、さらに精製した。5つの別々の注入からの、当該物質 を含有する分画を併合し、蒸発、乾燥させた後に、アセトニトリル:0.05酢 酸アンモニウム(28:72)からアセトニトリル:0.05酢酸アンモニウム (50:50)までの移動相勾配を用いて、18分間掛けて(流速4mL/分) 、Beckman 5μm Ultrasphere ODSカラム(10mmx25c m)を用いる反復分取逆相HPLC処理をした。当該物質を含有する分画を併合 し、蒸発、乾燥して、精製白色固体(27mg)を得た。生成物の構造を、MS 及びNMRにより、以下のように確証した: HPLC保持時間−方法A−22.3分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察744。C3970NO12に ついて744であるべきである) NMRデータ: 実施例7b:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30 を用いた13−シクロブチル−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30を用いた 実施例7aと同様の実験は、実施例7aで例示した化合物を生成した。実施例8a:S.エリスレア(S.erythraeaNRRL2338/pIGlを用 いた13−(3−フラニル)−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを、300 mLエルレンマイヤーフラスコ中の50mL水道水培地中に接種した。28℃で 72時間インキュベーション後、このフラスコを用いて、5Lミニジャー中の3 .5LのERY−P培地に接種した。ブロスを、1.75L/分の通気速度で、 28℃でインキュベートした。3−フロ酸(メタノール 6mL中に1.4g) を24時間後に付加して、発酵を138時間継続した。この後、全ブロスのpH を、水酸化ナトリウム水溶液を用いてpH8.5に調整し、酢酸エチル(10L )で抽出した。酢酸エチル抽出物を濃縮、乾燥して、粗製生成物をゴム(3.8 g)として得た。この抽出物の一部(1.9g)を酢酸エチル(10mL)に溶 解し、酢酸エチル(10mL)で予め状態調節した予充填シリカゲルカートリッ ジ(10g;International Sorbent Technology)に付加した。カラムを継続的 に酢酸エチル(4x24mL);ジクロロメタン:メタノール(9:1)(1x 24mL);ジクロロメタン:メタノール(8:2)(2x24mL);ジクロ ロメタン:メタノール:アンモニア(80:19:1)(1x36mL);メタ ノール(1x24mL)で溶離した。分画8及び9を併合し、蒸発、乾燥させた 。この分別を残りの1.9gのゴムに関して反復した。この濃縮工程により、所 望の物質を含有する固体を得た。これを、8mL/分でのアセトニトリル:0. 05M酢酸アンモニウム(3:1)の移動相をもちいるZorbax 7μmO DSカラム(21.2mmx25cm)を用いて分取逆相HPLCにより、さら に精製した。3つの別々の注入からの、当該物質を含有する分画を併合し、蒸発 、乾燥させた後に、アセトニトリル:0.05酢酸アンモニウム(28:72) からアセトニトリル:0.05酢酸アンモニウム(50:50)までの移動相勾 配を用いて、18分間掛けて(流速4mL/分)、Beckman 5μm Ultra sphere ODSカラム(10mmx25cm)を用いる反復分取逆相HP LC処理した。3つの別々の注入からの、当該物質を含有する分画を併合し、蒸 発、乾燥して、精製13−(3−フラニル)−エリスロマイシンBを白色固体( 9mg)として得た。生成物の構造を、質量分析により、以下のように確証した : HPLC保持時間−方法A−17.0分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察756。C3966NO13に ついて756であるべし) NMRデータ: *星印で示す帰属は逆転の可能性があることを示す。 実施例8b:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30 を用いた13−(3−フラニル)−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30を用いた 実施例8aと同様の実験は、実施例8aで例示した化合物を生成した。 実施例9a:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを 用いた13−シクロプロピル−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを、300 mLエルレンマイヤーフラスコ中の50mL水道水培地中に接種した。28℃で 72時間インキュベーション後、このフラスコを用いて、3.5LのERY−P 培地に接種した。滅菌直後に、チオストレプトン(105mg)を付加した。ブ ロスを、2L /分の通気速度で、28℃でインキュベートし、500rpmで攪拌した。シク ロプロパンカルボン酸(1.2mL)を24時間後に付加して、発酵を144時 間継続した。この後、全ブロスのpHを、水酸化ナトリウム水溶液を用いてpH 8.5に調整し、酢酸エチル(3L)で抽出した。酢酸エチル抽出物を濃縮、乾 燥して、粗製生成物をゴム(1.7g)として得た。この抽出物(0.85g) を酢酸エチル(10mL)に溶解し、酢酸エチル(20mL)で予め状態調節し た予充填シリカゲルカートリッジ(10g;International Sorbent Technology )に付加した。カラムを継続的に酢酸エチル(4x24mL);ジクロロメタン :メタノール(9:1)(1x24mL);ジクロロメタン:メタノール(8: 2)(1x24mL);ジクロロメタン:メタノール:アンモニア(80:19 :1)(3x24mL);メタノール(1x24mL)で溶離した。分画6〜9 を併合し、蒸発、乾燥させた。この分別を残りの0.85gのゴムに関して反復 した。この濃縮工程により、所望の物質を含有する固体を得た。これを、8mL /分でのアセトニトリル:0.05M酢酸アンモニウム(3:1)の移動相をも ちいるZorbax 7μmODSカラム(21.2mmx25cm)を用いて 分取逆相HPLCにより、さらに精製した。4つの別々の注入からの、当該物質 を含有する分画を併合し、蒸発、乾燥させた後に、アセトニトリル:0.05酢 酸アンモニウム(28:72)からアセトニトリル:0.05酢酸アンモニウム (50:50)までの移動相勾配を用いて、18分間掛けて(流速4mL/分) 、Beckman 5μm Ultrasphere ODSカラム(10mmx25c m)を用いる反復分取逆相HPLC処理した。3つの別々の注入からの、当該物 質を含有する分画を併合し、蒸発、乾燥して、精製13−シクロプロピル−エリ スロマイシンBを白色固体(9mg)と して得た。生成物の構造を、質量分析により、以下のように確証した: HPLC保持時間−方法A−17.9分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察730。C3868NO12に ついて730であるべし)NMRデータ: *星印で示した帰属は逆転の可能性があることを示す。 実施例9b:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30 を用いた13−シクロプロピル−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30を用いた 実施例9aと同様の実験は、実施例9aで例示した化合物を生成した。 実施例10a:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGl を用いた13−(1−メチルチオ−エチル)−エリスロマイシ ンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを、2.8 Lフェルンバッハフラスコ中の1L水道水培地中に接種した。29℃で84時間 インキュベーション後、このフラスコを用いて、14L発酵器ジャー中の8Lの 補足ERY−P培地(50g/L デキストロース、30g/L Nutrisoy粉、 3g/L 硫酸アンモニウム、5g/L NaCl、6g/L CaCO3、1 0g/L スクロース、5g/L コーン浸漬固体 corn steep solids、0. 5g/L MgSO4及び1mL/LのP2000)に接種した。ブロスを、8 L/分の通気速度で、28℃でインキュベートし、800rpmで攪拌し、Na OH又はH2SO4(15 %)を用いてpHを6.9〜7.3に保持した。メチルチオ乳酸(3.2mL) を24及び48時間後に付加した。さらに120時間後に、メチルチオ乳酸(1 .6mL)を付加した。発酵を142時間継続した。この後、全ブロスを、遠心 分離して、遠心分離物(34L)を生成し、これをXAD−16樹脂カラム(6 00mL;Rohm and Haas)に投入した。次に、樹脂カラムを水(1.8L)で 洗浄し、酢酸エチル(2.5L)で溶離した。酢酸エチルを一部濃縮して(25 0mLに)、次に当該生成物を100mMリン酸ナトリウム緩衝液 pH3.5 (1.3L)中に抽出し、生成物を、水を水酸化ナトリウムでpH9に調整して 酢酸エチルに戻し、次に酢酸エチル(450mL)と混合した。エリスロマイシ ンリッチな酢酸エチル層を分離し、蒸発させて、ゴム(5.0g)を得て、次に 、20%メタノール(120mL)中に再懸濁して、これをCG−161樹脂カ ラム(100mL;Toso Haas)に投入した。樹脂カラムを、連続的に20%メ タノール(3x100mL)、40%メタノール(3x100mL)、60%メ タノール(3x100mL)、80%メタノール(3x100mL)及び純メタ ノール(4x100mL)で溶離した。当該生成物を含有する純メタノール分画 2及び3を蒸発させて固体(220mg)とし、215mL/分の流速で60分 間、アセトニトリル:0.05M酢酸アンモニウム+0.1%トリフルオロ酢酸 の移動相を用いて、逆相10μmOKromasilC18HPLCカラム(75mmx 25cm)上で、さらに精製した。当該物質を含有する分画を併合し(1.7L )、水酸化ナトリウムでpH9に調整し、塩化メチレン(300mL)中に抽出 した。塩化メチレン層を分離し、蒸発、乾燥させて、部分的精製物質を得た。分 取HPLC工程及び抽出工程を反復して、精製13−(1−メチルチオ−エチル )−エリスロマイシンB(31mg)を 得た。生成物の構造を、MS及びNMR分光測光法(Bruker DMX500MHz分光光度 計)により、以下のように確証した: HPLC保持時間−方法B−14.9分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとしての観察764。C3870NO12 について764であるべし)NMRデータ: 実施例10b:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND3 0を用いた13−(1−メチルチオ−エチル)−エリスロマイ シンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30を用いた 実施例10aと同様の実験は、実施例10aで例示した化合物を生成した。 実施例11:S.エリスレ(S.erythraea)NRRL2338を用いた13− シクロブチル−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338を、300mLエルレ ンマイヤーフラスコ中の50mL水道水培地中に接種した。28℃で48時間イ ンキュベーション後、このフラスコを用いて、300mLエルレンマイヤーフラ スコ中の50mLのERY−P培地に接種した。ブロスを28℃でインキュベー トした。シクロブタンカルボン酸(20mL)を24時間後に付加して、発酵を 168時間継続した。この後、全ブロスのpHを、水酸化ナトリウム水溶液を用 いてpH8.5に調整し、酢酸エチル(50mL)で抽出した。酢酸エチル抽出 物を濃縮、乾燥した。試料をHPLC−MS分析のためにメタノール(1mL) に再溶解した。これにより、avr負荷モジュールを含有する遺伝子工学処理株 (NRRL2338/pIGl構築物)に関して実施例7に記載したような非形 質転換化、非組換え体NRRL2338による13−シクロブチル−エリスロマ イシンBの産生が確証された。 HPLC保持時間−方法A−22.3分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察744。C3970NO12に ついて744であるべし) 実施例12:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338 を用いた13−シクロプロピル−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338を、300mLエルレ ンマイヤーフラスコ中の50mL水道水培地中に接種した。28℃で48時間イ ンキュベーション後、このフラスコを用いて、300mLエルレンマイヤーフラ スコ中の50mLのERY−P培地に接種した。ブロスを28℃でインキュベー トした。シクロブタンカルボン酸(20mL)を24時間後に付加して、発酵を 168時間継続した。この後、全ブロスのpHを、水酸化ナトリウム水溶液を用 いてpH8.5に調整し、酢酸エチル(50mL)で抽出した。酢酸エチル抽出 物を濃縮、乾燥した。試料をHPLC−MS分析のためにメタノール(1mL) に再溶解した。これにより、avr負荷モジュールを含有する遺伝子工学処理株 (NRRL2338/pIGl構築物)に関して実施例9に記載したような非形 質転換化、非組換え体NRRL2338による13−シクロプロピル−エリスロ マイシンBの産生が確証された。 HPLC保持時間−方法A−17.9分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察730。C3868NO12に ついて730であるべし) 実施例13a:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGl を用いた13−シクロブチル−エリスロマイシンAの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを、3x3 00mLエルレンマイヤーフラスコ中の50mL水道水培地中に接種した。28 ℃で72時間インキュベーション後、このフラスコを用いて、3x5Lミニジャ ー中の3.5LのERY−P培地に接種した。ブロスを、2.0L/分の通気速 度で、28℃ でインキュベートし、500rpmで攪拌した。シクロブタンカルボン酸(1. 4mL)を24時間及び48時間後に付加して2回供給し、発酵を168時間継 続した。この後、全ブロスのpHを、水酸化ナトリウム水溶液を用いてpH8. 5に調整し、酢酸エチル(20L)で抽出した。酢酸エチル抽出物を濃縮、乾燥 して、粗製生成物をゴム(9.2g)として得た。この抽出物の一部(2.3g )を酢酸エチル(12.5mL)に溶解し、酢酸エチル(10mL)で予め状態 調節した予充填シリカゲルカートリッジ(10g;International Sorbent Tech nology)に付加した。カラムを継続的に酢酸エチル(4x24mL);ジクロロ メタン:メタノール(9:1)(1x24mL);ジクロロメタン:メタノール (8:2)(2x24mL);ジクロロメタン:メタノール:アンモニア(80 :19:1)(1x24mL)で溶離した。分画6〜8を併合し、蒸発、乾燥さ せた。この分別を残りのゴム(4.7g)に関して反復した。この濃縮工程によ り、所望の物質を含有する固体約415mgを得た。これを、8mL/分でのア セトニトリル:0.05M酢酸アンモニウム(3:1)の移動相を用いるZor bax 7μmODSカラム(21.2mmx25cm)を用いて分取逆相HP LCにより、さらに精製した。5つの別々の注入からの、当該物質を含有する分 画を併合し、蒸発、乾燥させた後に、アセトニトリル:0.05酢酸アンモニウ ム(28:72)からアセトニトリル:0.05酢酸アンモニウム(50:50 )までの移動相勾配を用いて、18分間掛けて(流速4mL/分)、Beckman 5 μm Ultrasphere ODSカラム(10mmx25cm)を用いて 反復分取逆相HPLC処理をした。当該物質を含有する分画を併合し、蒸発、乾 燥して、精製白色固体(4mg)を得た。生成物の構造を、MS及びNMRによ り、以下のように確証した: HPLC保持時間−方法A−17.5分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察760。C3970NO13に ついて760であるべし) NMRデータ: 実施例13b:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND3 0を用いた13−シクロブチル−エリスロマイシンAの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30を用いた 実施例13aと同様の実験は、実施例13aで例示した化合物を生成した。 実施例14a:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGl を用いた13−シクロプロピル−エリスロマイシンAの調製 6つの2800mLフェルンバッハフラスコに、S.エリスレア(S.erythra ea)NRRL2338/pIGlを接種した。各フラスコは、各フラスコに付加 された50mgのチオストレプトンを含む水道水培地1Lを含入した。28℃で 24時間インキュベーション後、各フラスコに、200ppmのシクロプロパン カルボン酸を付加した。フラスコを90時間インキュベートし、滅菌8L吸引瓶 中に混合した。吸引瓶を用いて、500ガロンバイロット容器中のERY−Pば いち314ガロンに接種した。ブロスをインキュベートし、27℃〜29℃で、 pH範囲6.7〜7.4で、通気速度20標準立方フィート/分で作用させ、1 75rpmで攪拌した。シクロプロパンカルボン酸(200mg/L)を33時 間、81時間及び117時間後に付加した。発酵を198時間継続した。この後 、全ブロスを0.2μmセラミックフィルター(30ft2、U.S.Filter)上 で濾過した。濾液をXAD−16樹脂カラム(12L;Rohm and Haas)上に投 入した。次に、樹脂カラムを酢酸エチ ル(60L)で溶離した。酢酸エチル抽出物を濃縮して、ゴム(302g)とし て、これに塩化メチレン2Lを付加した。その結果生じた塩化メチレン溶液を8 Lの250mM重炭酸ナトリウム緩衝液、pH9で洗浄した。 エリスロマイシンリッチな塩化メチレン層を分離し、蒸発させて、ゴム(20 0g)を得て、次に、40%メタノール(10L)中に再懸濁して、これをCG −161樹脂カラム(9L;Toso Haas)に投入した。樹脂カラムを40%メタ ノール(30L)で洗浄し、、連続的に75%メタノール(8x100mL)及 び純メタノール(3x10L)で溶離した。当該生成物を含有する75%メタノ ール分画5〜8を蒸発させて3.2Lとした。濃縮物をpH9に調整し、0.9 5Lの塩化メチレンに付加した。塩化メチレン層を分離し、蒸発させて、12. 4gのゴムを得た。ゴムの一部(6g)を、215mL/分の流速で、メタノー ル:0.05M酢酸アンモニウム+0.1%トリフルオロ酢酸アイソクラチック (50:50)の移動相を用いて、Kromasil10μm C18HPLCカラム( 75mmx25cm)を用いる分取逆相HPLCにより、さらに精製した。当該 物質を含有する分画を併合し(230mL)、蒸発させて濃縮し(110mL) 、水酸化ナトリウムでpH9に調整し、塩化メチレン(50mL)中に抽出した 。塩化メチレン層を分離し、蒸発、乾燥させて、630mgの部分的精製物質を 得た。ゴムの別の部分(1g)を、125mL/分の流速で50分間、アセトニ トリル:0.05M酢酸アンモニウム+0.1%トリフルオロ酢酸勾配(20: 80)〜(25:75)の移動相を用いて、MetaChem Inertsi l 10μmC8カラム(50mmx25cm)を用いる分取逆相HPLCによ りさらに精製した。当該化合物を含有する分画(28〜46分)を併合し、重炭 酸ナトリウム で飽和し、塩化メチレンで抽出した。塩化メチレンを分離し、蒸発、乾燥させて 、部分的精製物質361mgを得た。これらの部分的精製物質の一部を、100 mL/分の流速でメタノール:0.05M酢酸アンモニウム+0.1%トリフル オロ酢酸アイソクラチック(50:50)の移動相を用いて、Phenomen ex Prodigy 10μm C18カラム(50x250mm)により例 証されているように逆相HPLCによりさらに精製した。当該化合物を含有する 分画(27〜31分)を併合し、重炭酸ナトリウムで飽和し、塩化メチレンで抽 出した。塩化メチレンを分離し、蒸発、乾燥させて、部分的精製物質を得た。物 質を、100mL/分の流速でメタノール:0.05M酢酸アンモニウム+0. 1%トリフルオロ酢酸アイソクラチック(48:52)の移動相を用いて、Ph enomenex Prodigy 10μm C18カラム(50x25cm )を用いて、分取逆相HPLCによりさらに精製した。当該化合物を含有する分 画(41〜45分)を併合し、重炭酸ナトリウムで飽和し、塩化メチレンで抽出 した。塩化メチレンを分離し、蒸発、乾燥させて、13−シクロプロピル−エリ スロマイシンAを固体(20mg)として得た。生成物の構造を、MS及びNM R分光法(Bruker DMX500MHz分光光度計)により、以下のように確証した: HPLC保持時間−方法B−5.6分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察746。C3868NO13に ついて746であるべし) NMRデータ: 実施例14b:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND3 を用いた13−シクロプロピル−エリスロマイシンAの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30を用いた 実施例14aと同様の実験は、実施例14aで例示し た化合物を生成した。 実施例15a:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGl を用いた13−(3−チエニル)−エリスロマイシンBの調製 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pIGlを、300 mLエルレンマイヤーフラスコ中の50mL水道水培地中に接種した。28℃で 48時間インキュベーション後、このフラスコを用いて、300mLエルレンマ イヤーフラスコ中の50mLのERY−P培地に接種した。ブロスを28℃でイ ンキュベートした。3−チオフェンカルボン酸(メタノール0.5mL中に20 mg)のN−アセチルシステアミンチオエステルを24時間後に滅菌フィルター を付加して、発酵を168時間継続した。この後、全ブロスのpHを、水酸化ナ トリウム水溶液を用いてpH8.5に調整し、酢酸エチル(50mL)で抽出し た。酢酸エチル抽出物を分離し、濃縮、乾燥した。試料をHPLC−MS分析の ためにメタノール(1mL)に再溶解した。これにより、13−(3−チエニル )−エリスロマイシンBの産生が確証された。 HPLC保持時間−方法A−20,0分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察772。C3986NO12に ついて772であるべし) 実施例15b;S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND3 0を用いた13−(3−チエニル)−エリスロマイシンBの調 培養S.エリスレア(S.erythraea)NRRL2338/pND30を用いた 実施例15aと同様の実験は、実施例15aで例示した化合物を生成した。 実施例16:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL1864 3を用いた6−デオキシ−13−シクロプロピル−エリスロマイ シンBの調製 S.エリスレア(S.erythraea)のeryF突然変異体である培養S.エリス レア(S.erythraea)NRRL18643(Science,252;114-5,April 1991) を、2.8Lフェルンバッハフラスコ中の1L水道水培地中に接種した。200 rpmで攪拌しながら、29℃で24時間インキュベーション後、シクロプロパ ンカルボン酸(200mL)を付加した。計3日間のインキュベーション後、一 フラスコを用いて、14L発酵器ジャー中の8Lの補足ERY−P培地(60g /L セレロース、30g/L Nutrisoy粉、3g/L 硫酸アンモニウム、5 g/L NaCl、6g/L コーン浸漬固体 corn steep solids、0.5g /L MgSO4及び1mL/LのP2000)に接種した。ブロスを、8L/ 分の通気速度で、800rpmで攪拌しながら、28℃でインキュベートし、N aOH又はH2SO4(15%)を用いてpHを6.9〜7.3に保持した。シク ロプロパンカルボン酸(1.6mL)を24及び48時間後に付加した。発酵を 、二重に実施して、163時間インキュベーション後に、収穫した。全ブロスの pHを、水酸化ナトリウムを用いてpH9に調整し、酢酸エチル(16L)で抽 出した。20L Buchi回転蒸発ユニット中で、酢酸エチルを濃縮して、油とし た。油を塩化メチレン500mLで再溶解させた。水500mLをこの液体に付 加し、水性相のpHを、10%水酸化アンモニウムでpH9に調整した。激しく 攪拌後、塩化メチレン層を収集し、1L回転蒸発フラスコ中で蒸発させて、11 .0gの油状残渣を得た。この物質を4:6メタノール:水の溶液250mLに ようかいさせて、80mL CG−161樹脂カラム(Toso Haas)に投入した 。カラムを、4:6メタノール:水の溶液350m Lで洗浄した。次に、カラムを7:3メタノール:水溶液を用いて、8mL/分 で、着色不純物がカラムから溶離し始めるまで、カラムを手短に洗浄した(約2 床容量洗浄)。この時点で、1時間勾配処理を開始し、8mL/分で、1時間に 70%から100%にメタノールが濃縮された。当該物質を含有する分画を蒸発 、乾燥させて、120mL/分の流速で50分間、アセトニトリル:0.01M 酢酸アンモニウム+0.02%トリフルオロ酢酸+26%アセトニトリルを含有 する緩衝液(5:95)の移動相を用いて、逆相10μmOKromasilC18HP LCカラム(50mmx25cm)上で、さらに精製した。これを、次の40分 間に、(5:95)から(33:67)の線状勾配処理した。当該物質を含有す る分画を併合し(530mL)、10%水酸化アンモニウムでpH9に調整し、 塩化メチレン(400mL)中に抽出した。塩化メチレン層を分離し、蒸発、乾 燥させて、精製6−デオキシ−13−シクロプロピル−エリスロマイシンB(1 2mg)を得た。生成物の構造を、MSにより、以下のように確証した: HPLC保持時間−方法B−21.4分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察714。C3888NO12に ついて714であるべし) 実施例17:S.エリスレア(S.erythraea)NRRL18643を用いた6 −デオキシ−13−プロピル−エリスロマイシンBの調製 S.エリスレア(S.erythraea)NRRL18643を、_YPD寒天培地( 0.5%Difco酵母菌抽出物、0.5%Difco Bactoペプトン、0.25%デキス トロース、0.5%MOPS、1.7%Difco Bacto寒天。pHを7.0に調整 )上の3日間パッチから、250mLエルレンマイヤーフラスコ中の25mLの _YPDブ ロス(0.5%Difco酵母菌抽出物、0.5%Difco Bactoペプトン、0.25% デキストロース、0.5%MOPS。pHを7.0に調整)に接種した。フラス コを、29℃で48時間、225rpmでインキュベートした。2.5mLを2 5mLのERY−P培地(5% デキストロース、3% Nutrisoy粉、0.3% (NH42SO4、0.5%NaCl、0.6%CaCO3。pHを7.0に調整 )に接種し、225rpmで、29℃で、計6日間インキュベートした。酪酸を 、24,72及び120時間目(それぞれ、400ppm、400ppm、20 0ppm)にフラスコに付加した。次に、全ブロスのpHを、1N NaOHを 用いて9.1に調整した。試料を等容量の酢酸エチルで2回抽出した。酢酸エチ ル相を窒素中で濃縮、乾燥して、次にHPLC−MS分析のために、1.0mL メタノール中に再懸濁した。これは、6−デオキシ−13−プロピル−エリスロ マイシンBの産生を確証した。 HPLC保持時間−方法C−23.5分 APCI−MS−(M+H)+(m/eとして観察716。C3870NO11に ついて716であるべし) 実施例18:抗細菌活性の評価 in vitro抗細菌検定を微小力価で実行し、Performance Standards for Antimi crobial Disk Susceptibility Tests-Sixth Edition;Approved Standard(出版 :The National Committee for Clinical Laboratory Standards(NCCLS)guide lines)にしたがって解釈した。最小抑制濃度(MIC)は、種々の細菌に対し て得られた。例えば、Staphylococcus aureus80CR5(マクロライド感受性 株)は、一般的に≦0.1〜1.56μg/mLの範囲の値を提示した。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 33/02 171 A61P 33/02 171 C07H 17/08 C07H 17/08 B C12P 17/08 C12P 17/08 17/16 17/16 (31)優先権主張番号 9710962.3 (32)優先日 平成9年5月28日(1997.5.28) (33)優先権主張国 イギリス(GB) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF ,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE, SN,TD,TG),AP(GH,KE,LS,MW,S D,SZ,UG,ZW),EA(AM,AZ,BY,KG ,KZ,MD,RU,TJ,TM),AL,AM,AT ,AU,AZ,BA,BB,BG,BR,BY,CA, CH,CN,CU,CZ,DE,DK,EE,ES,F I,GB,GE,GH,HU,IL,IS,JP,KE ,KG,KP,KR,KZ,LC,LK,LR,LS, LT,LU,LV,MD,MG,MK,MN,MW,M X,NO,NZ,PL,PT,RO,RU,SD,SE ,SG,SI,SK,SL,TJ,TM,TR,TT, UA,UG,US,UZ,VN,YU,ZW (72)発明者 スタウントン,ジェームス イギリス国,ケンブリッジ シービー2 2イーティー,ポーソン ロード 29 (72)発明者 コルテス,イエズス イギリス国,ケンブリッジ シービー4 1ピーゼット,ユニオン レーン,ケンバ ンクス 26 (72)発明者 パセイ,マイケル スティーブン イギリス国,ケント シーティー10 3エ ルエル,ブロード―ステアーズ,キングス ゲート,セカンド アベニュ,セントーサ

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.式1: 〔式中、R1は、そのいずれかが1個又はそれより多くのヒドロキシル基により 置換されていてもよいα−分枝C3〜C8アルキル、アルケニル、アルキニル、ア ルコキシアルキル又はアルキルチオアルキル基;C5〜C8シクロアルキルアルキ ル基(ここで、アルキル基はα−分枝C2〜C5アルキル基である);C3〜C8シ クロアルキル又はC5〜C8シクロアルケニル基(そのいずれかがメチル、あるい は1個又はそれより多くのヒドロキシル、あるいは1個又はそれより多くのC1 〜C4アルキル基、あるいはハロゲン原子により置換されていてもよい);ある いは飽和、あるいは完全又は一部不飽和で、任意に1個又はそれより多くのC1 〜C4アルキル基、あるいはハロ原子により任意に置換される、3〜6員の酸素 又は硫黄含有複素環式環であるか;あるいはR1はC1〜C4アルキル、C1〜C4 アルコキシ及びC1〜C4アルキルチオ基、ハロゲン原子、トリフルオロメチル及 びシアノから選択される少なくとも 1つの置換基で置換されていてもよいフェニルであるか;あるいはR1は下記の 式(a):(式中、XはO、S又は−CH2−であり、a、b、c及びdは各々別々に0〜 2であって、a+b+c+d≦5である) を有する基であり; R2は、H又はOHであり;R3〜R5は各々別々にH、CH3又はCH2CH3で あり;R6はH又はOHであり;そしてR7はH、CH3又はCH2CH3であり; R8はH又はデソサミンであり;R9はH、CH3又はCH2CH3であり;R10は OH、ミカロース(R13はHである)又はクラジノース(R13はCH3である) であり;R11はHであるか;R10=R11=Oであり;そしてR12はH、CH3又 はCH2CH3である〕 で表わされる化合物、及び製薬上許容可能なその塩。 2.式2: 〔式中、R1は、H、C1〜C8アルキル、C2〜C8アルケニル、C2〜C8アルキ ニル、アルコキシアルキル又はアルキルチオアルキル(各々のアルキル又はアル コキシ基中に1〜6個の炭素原子を含有する)(ここで、前記のアルキル、アル コキシ、アルケニル又はアルキニル基はいずれかが1個又はそれより多くのヒド ロキシル基により、あるいは1個又はそれより多くのハロ原子により置換されて いてもよい);あるいはメチルにより、あるいは1個又はそれより多くのC1〜 C4アルキル基又はハロゲン原子により置換されていてもよいC3〜C8シクロア ルキル又はC5〜C8シクロアルケニル;あるいは飽和、あるいは完全又は一部不 飽和で、1個又はそれより多くのC1〜C4アルキル基により、あるいはハロ原子 により置換されていてもよい3〜6員の酸素又は硫黄含有複素環式環であるか; あるいは式SR14(ここで、R14はC1〜C8アルキル、C2〜C8アルケニル、C2 〜C8アルキニル、C3〜C8シクロアルキル、C5〜C8シクロアルケニル、フェ ニル、又は置換フェニル(ここで、置換基はC1〜C4アルキル、C1〜C4アルコ キシ又はハロである)、あるいは飽和、あるいは完全又は一部不飽和で、任意に 1個又はそれより多くのC1〜C4アルキル基、あるいはハロ原子により任意に置 換される3〜6員化酸素又は硫黄含有複素環式環である)の基であり; R2は、H又はOHであり;R3〜R5は各々別々にH、CH3又はCH2CH3で あり;R6はH又はOHであり;そしてR7はH、CH3又はCH2CH3であり; R8はH又はデソサミンであり;R9はH、CH3又はCH2CH3であり;R10は OH、ミカロース(R13はHである)又はクラジノース(R13はCH3である) であり;R11はHであるか;あるいはR10=R11=Oであり;そしてR12はH、 CH3又はCH2CH3であり、但し、R3〜R5 がCH3であり、R7がCH3であり、R9がCH3であり、そしてR12がCH3であ る場合には、R1はH又はC1アルキルではない〕 により表わされる化合物、及び製薬上許容可能なその塩。 3.R1が、1個又はそれより多くのヒドロキシル基によりあるいは1個又は それより多くのC1〜C4アルキル基により置換されていてもよいC3〜C6シクロ アルキル又はシクロアルケニル基である請求項1記載の式1の化合物。 4.R1がシクロプロピルである請求項3の化合物。 5.R1がシクロブチルである請求項3の化合物。 6.R1がシクロペンチルである請求項3の化合物。 7.R1がシクロヘキシルである請求項3の化合物。 8.R1がα−分枝C3〜C8アルキル、アルケニル、アルキニル、アルコキシ アルキル又はアルキルチオアルキル基である請求項1の化合物。 9.R1がイソプロピルである請求項8の化合物。 10.R1がsec−ブチルである請求項8の化合物。 11.R1が2−ブテン−2−イル、2−ペンテン−2−イル又は4−メチル −2−ペンテン−2−イルである請求項8の化合物。 12.R1が1−メチルチオエチルである請求項8の化合物。 13.R1が、1個又はそれより多くのヒドロキシル基により、あるいはC1〜 C4アルキル基又はハロゲン原子により置換されていてもよい5又は6員の酸素 又は硫黄含有複素環式環である請求項1の化合物。 14.R1が3−チエニルである請求項13の化合物。 15.R1が3−フラニルである請求項13の化合物。 16.R1がフェニルである請求項1の化合物。 17.R1が式(a)(式中、a及びbは0であり、c及びdは1であり、X は−CH2−である)の基である請求項1の化合物。 18.R1が式(a)(式中、a及びbは0であり、cは1であり、dは2で あり、Xは−CH2−である)の基である請求項1の化合物。 19.R1が式(a)(式中、a及びbは0であり、c及びdは1であり、X はOである)の基である請求項1の化合物。 20.R1がSR14であり、R14がメチル又はエチルである請求項2の化合物 。 21.R1がエチル、プロピル、ブチル、イソプロピル又はsec−ブチルで ある請求項2の化合物。 22.R1が1−(トリフルオロメチル)エチルである請求項2の化合物。 23.式R1CO2H(式中、R1は請求項1又は2に記載の通りである)のカ ルボン酸、あるいはその塩、エステル又はアミド、あるいはその酸化性前駆体の 存在下でエリスロマイシンを産生し得る生物を発酵させて、式1又は2の化合物 を単離する工程から成る請求項1記載の式1又は請求項2記載の式2の化合物の 製造方法。 24.生物がSaccharopolyspora erythraeaであり、式1の化合物の生合成を 指令し得る有効に組込まれたプラスミドを任意に含有し、前記プラスミドがII 型PKSプロモーター/アクチベーター遺伝子を任意に含有し得る請求項23の 方法。 25.生物Saccharopolyspora erythraeaが式1の化合物の生合成を指令し得 る有効に組込まれたプラスミドを任意に含有し得るNRRL 2338、186 43又は21484株から選択され、前記プラスミドがactIプロモーター及 びそのコグネイトアクチベーター遺伝子actII−orf4を任意に含有し得 る請求項24 の方法。 26.任意に有効に組込まれたプラスミドがpAVLD、pIGI,pND3 0、pCJR26、pCJR49、pC−AT12、pし−ATX又はその他の 同様の構築物である請求項25の方法。 27.生物がS.erythraeaERMD1、S.erythraea NRRL 2338/ pIGI、 S.erythraea NRRL 2338/pND30、又はその他の同 様の形質転換体である請求項25の方法。 28.治療的有効量の請求項1又は請求項2の化合物を製薬上許容可能な担体 と組合せて包含する製剤組成物。 29.哺乳類、魚類又は鳥類における細菌感染又は細菌感染に関連した疾患、 あるいは原生動物感染又は原生動物感染に関連した疾患の治療方法であって、治 療的有効量の請求項1又は請求項2の化合物を前記哺乳類、魚類又は鳥類に投与 する工程を包含する方法。 30.哺乳類、魚類又は鳥類における細菌感染を治療するための薬剤の製造に おける請求項1又は請求項2の化合物の使用。 31.哺乳類、魚類又は鳥類における性能効力(例えば、体重増大、食物有効 利用、乳汁産生)を改良するための請求項1又は請求項2の化合物の使用。
JP50492598A 1996-07-05 1997-07-04 新規エリスロマイシン及びその製造方法 Expired - Fee Related JP4173551B2 (ja)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB9614189.0 1996-07-05
GBGB9614189.0A GB9614189D0 (en) 1996-07-05 1996-07-05 Polyketides and their synthesis
US2418896P 1996-08-19 1996-08-19
GB9710962.3 1997-05-28
GBGB9710962.3A GB9710962D0 (en) 1997-05-28 1997-05-28 Polyketides and their synthesis
GB60/024,188 1997-05-28
PCT/GB1997/001810 WO1998001571A2 (en) 1996-07-05 1997-07-04 Erythromycins and process for their preparation

Publications (2)

Publication Number Publication Date
JP2000516450A true JP2000516450A (ja) 2000-12-12
JP4173551B2 JP4173551B2 (ja) 2008-10-29

Family

ID=27268361

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP10504933A Withdrawn JP2000511063A (ja) 1996-07-05 1997-07-04 ポリケチド類及びそれらの合成
JP50492598A Expired - Fee Related JP4173551B2 (ja) 1996-07-05 1997-07-04 新規エリスロマイシン及びその製造方法

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP10504933A Withdrawn JP2000511063A (ja) 1996-07-05 1997-07-04 ポリケチド類及びそれらの合成

Country Status (28)

Country Link
EP (3) EP2182067A3 (ja)
JP (2) JP2000511063A (ja)
KR (1) KR20000023579A (ja)
CN (1) CN1179046C (ja)
AP (1) AP1029A (ja)
AT (2) ATE451455T1 (ja)
AU (2) AU731301B2 (ja)
BG (1) BG103133A (ja)
BR (1) BR9710209A (ja)
CA (2) CA2259463A1 (ja)
DE (2) DE69739688D1 (ja)
DK (2) DK0909327T3 (ja)
EA (1) EA001744B1 (ja)
EE (1) EE03976B1 (ja)
ES (2) ES2337424T3 (ja)
GB (1) GB2331518B (ja)
GE (1) GEP20012348B (ja)
IL (1) IL127916A0 (ja)
IS (1) IS4940A (ja)
NO (1) NO990012L (ja)
NZ (1) NZ333861A (ja)
OA (1) OA10952A (ja)
PL (1) PL331285A1 (ja)
PT (1) PT909327E (ja)
SI (1) SI0910633T1 (ja)
SK (1) SK182498A3 (ja)
TR (1) TR199900006T2 (ja)
WO (2) WO1998001546A2 (ja)

Families Citing this family (78)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6063561A (en) * 1991-01-17 2000-05-16 Abbott Laboratories Polyketide derivatives and recombinant methods for making same
US6060234A (en) * 1991-01-17 2000-05-09 Abbott Laboratories Polyketide derivatives and recombinant methods for making same
US6500960B1 (en) 1995-07-06 2002-12-31 Stanford University (Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University) Method to produce novel polyketides
WO1998049315A2 (en) 1997-04-30 1998-11-05 Kosan Biosciences, Inc. Combinatorial polyketide libraries produced using a modular pks gene cluster as scaffold
US20030170725A1 (en) 1993-09-20 2003-09-11 Chaitan Khosla Combinatorial polyketide libraries produced using a modular PKS gene cluster as scaffold
US6927057B2 (en) 1993-09-20 2005-08-09 Kosan Biosciences Macrolide analogs
US6558942B1 (en) 1994-05-06 2003-05-06 The Leland Stanford Junior University Combinatorial polyketide libraries produced using a modular PKS gene cluster as scaffold
US5712146A (en) 1993-09-20 1998-01-27 The Leland Stanford Junior University Recombinant combinatorial genetic library for the production of novel polyketides
US6495348B1 (en) 1993-10-07 2002-12-17 Regents Of The University Of Minnesota Mitomycin biosynthetic gene cluster
IL122859A0 (en) 1995-07-06 1998-08-16 Univ Leland Stanford Junior Cell-free synthesis of polyketides
EP0870053A4 (en) 1995-12-19 2002-09-11 Univ Minnesota METABOLIC METHOD FOR PRODUCING POLYHYDROXYALKANOATE MONOMER SYNTHASES
US6271255B1 (en) 1996-07-05 2001-08-07 Biotica Technology Limited Erythromycins and process for their preparation
US6399789B1 (en) 1996-12-18 2002-06-04 Kosan Biosciences, Inc. Multi-plasmid method for preparing large libraries of polyketides and non-ribosomal peptides
US6902913B2 (en) 1997-04-30 2005-06-07 Kosan Biosciences, Inc. Recombinant narbonolide polyketide synthase
US6117659A (en) * 1997-04-30 2000-09-12 Kosan Biosciences, Inc. Recombinant narbonolide polyketide synthase
JP2008169226A (ja) * 1997-04-30 2008-07-24 Kosan Biosciences Inc 足場としてモジュラー性pks遺伝子クラスターを使用して生成されるコンビナトリアルなポリケチドライブラリー
US6503741B1 (en) 1998-05-28 2003-01-07 Kosan Biosciences, Inc. Polyketide synthase genes from Streptomyces venezuelae
US6262340B1 (en) 1997-07-10 2001-07-17 Kosan Biosciences, Inc. Production of polyketides in plants
AP1060A (en) 1998-01-02 2002-04-23 Pfizer Prod Inc Novel erythromycin derivatives.
AU2066799A (en) * 1998-01-14 1999-08-02 Glaxo Group Limited Polyketides and their synthesis
NZ509006A (en) * 1998-05-28 2003-09-26 Kosan Biosciences Inc Recombinant narbonolide polyketide synthase
US6265202B1 (en) 1998-06-26 2001-07-24 Regents Of The University Of Minnesota DNA encoding methymycin and pikromycin
GB9814006D0 (en) * 1998-06-29 1998-08-26 Biotica Tech Ltd Polyketides and their synthesis
EP1100927A2 (en) * 1998-07-02 2001-05-23 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods for making polyketides using altered pks
GB9814622D0 (en) * 1998-07-06 1998-09-02 Biotica Tech Ltd Polyketides,their preparation,and materials for use therein
WO2000024907A2 (en) 1998-10-28 2000-05-04 Kosan Biosciences, Inc. Library of novel "unnatural" natural products
KR20010083944A (ko) 1998-11-03 2001-09-03 실버스타인 아써 에이. 신규 마크롤라이드 항생물질
US6358712B1 (en) 1999-01-05 2002-03-19 Trustee Of Boston University Ordered gene assembly
WO2000040715A2 (en) 1999-01-05 2000-07-13 Trustees Of Boston University Improved nucleic acid cloning
CA2359708C (en) 1999-01-27 2005-10-25 Pfizer Products Inc. Ketolide antibiotics
US7001748B2 (en) 1999-02-09 2006-02-21 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods of making polyketides using hybrid polyketide synthases
CA2359801A1 (en) * 1999-02-09 2000-08-17 Rajesh S. Gokhale Methods to mediate polyketide synthase module effectiveness
US6939861B2 (en) 1999-04-16 2005-09-06 Kosan Biosciences, Inc. Amido macrolides
US6514944B2 (en) 1999-04-16 2003-02-04 Kosan Biosciences, Inc. Macrolide antiinfective agents
US6590083B1 (en) 1999-04-16 2003-07-08 Ortho-Mcneil Pharmaceutical, Inc. Ketolide antibacterials
IL145976A0 (en) 1999-04-16 2002-07-25 Ortho Mcneil Pharm Inc Ketolide antibacterials
US6451768B1 (en) 1999-04-16 2002-09-17 Kosan Biosciences, Inc. Macrolide antiinfective agents
ID30547A (id) 1999-04-16 2001-12-20 Kosan Biosciences Inc Zat anti-infeksi makrolida
EA200100983A1 (ru) 1999-05-24 2002-10-31 Пфайзер Продактс Инк. Производные 13-метилэритромицина
GB9912563D0 (en) * 1999-05-28 1999-07-28 Biotica Tech Ltd Polyketides and their synthesis
WO2001034816A1 (en) * 1999-10-29 2001-05-17 Kosan Biosciences, Inc. Rapamycin analogs
EP1101769A3 (en) 1999-11-18 2001-10-24 Pfizer Products Inc. Nitrogen containing erythromycin derivatives
CA2399198A1 (en) 2000-02-18 2001-08-23 Christopher Carreras Motilide compounds
EP1146051A3 (en) * 2000-04-10 2001-10-31 Pfizer Products Inc. Erythromycin A derivatives
ATE453719T1 (de) 2000-04-13 2010-01-15 Biotica Tech Ltd Glycosylierte hybrid-verbindungen, deren herstellung und verwendung
MXPA04008071A (es) * 2002-02-19 2004-11-26 Dow Agrosciences Llc Nuevas sintasas de poliquetida que producen espinosina.
CA2492153C (en) 2002-07-16 2012-05-08 Biotica Technology Limited Production of polyketide fkbp-ligand analogues
DK200201957A (da) * 2002-12-20 2003-01-20 Alpharma Aps 10-substituted erythromycin ketolides and methods of making
GB0230217D0 (en) * 2002-12-27 2003-02-05 Biotica Tech Ltd Borrelidin-producing polyketide synthase and its uses
US7476403B2 (en) 2003-06-16 2009-01-13 Andrx Pharmaceuticals, Llc Oral extended-release composition
GB0327720D0 (en) 2003-11-28 2003-12-31 Biotica Tech Ltd Erythromycins and process for their preparation
GB0417852D0 (en) 2004-08-11 2004-09-15 Biotica Tech Ltd Production of polyketides and other natural products
US7582611B2 (en) * 2005-05-24 2009-09-01 Pfizer Inc. Motilide compounds
EP2342335B1 (en) 2008-09-24 2015-09-16 Shanghai Institute Of Organic Chemistry, Chinese Academy Of Sciences Novel gene cluster
GB0904540D0 (en) 2009-03-17 2009-04-29 Biotica Tech Ltd Novel compounds and methods for their production
GB0914589D0 (en) 2009-08-20 2009-09-30 Biotica Tech Ltd Novel compounds and methods for their production
AU2011214135B2 (en) 2010-02-09 2014-07-31 Neurovive Pharmaceutical Ab Sanglifehrin based compounds
WO2011098808A1 (en) 2010-02-09 2011-08-18 Biotica Technology Limited Sanglifehrin based compounds
WO2011098805A1 (en) 2010-02-09 2011-08-18 Biotica Technology Limited Sanglifehrin based compounds
GB201118334D0 (en) 2011-10-24 2011-12-07 Biotica Tech Ltd Novel dosage form
WO2013172782A1 (en) * 2012-05-16 2013-11-21 Nanyang Technological University A polyketide synthase construct and its use in the preparation of polyketides
US10533016B2 (en) 2015-01-09 2020-01-14 Revolution Medicines, Inc. Compounds that participate in cooperative binding and uses thereof
CA3020594A1 (en) 2016-04-12 2017-10-19 Warp Drive Bio, Inc. Compositions and methods for the production of compounds
WO2018020272A1 (en) 2016-07-29 2018-02-01 Isomerase Therapeutics Limited Novel methods
KR102561694B1 (ko) * 2016-10-28 2023-07-28 징코 바이오웍스, 인크. 화합물의 생산을 위한 조성물 및 방법
JP2020501519A (ja) 2016-10-28 2020-01-23 ギンゴー バイオワークス, インコーポレイテッド 化合物の生産のための組成物および方法
JP7100652B2 (ja) 2017-02-22 2022-07-13 アイエスアール イミューン システム レギュレイション ホールディング アクチエボラグ(パブル) 新規免疫刺激マクロライド
EP3585796B1 (en) 2017-02-22 2021-06-16 ISR Immune System Regulation Holding AB (publ) Novel immune stimulating macrolides
JP2021523930A (ja) 2018-03-23 2021-09-09 アイエスアール イミューン システム レギュレイション ホールディング アクチエボラグ(パブル) マクロライド化合物と免疫チェックポイント阻害剤との組み合わせ
EP3914245A4 (en) 2019-01-22 2022-08-24 Aeovian Pharmaceuticals, Inc. MTORC-1 MODULATORS AND USES THEREOF
CN120699039A (zh) 2019-11-04 2025-09-26 锐新医药公司 Ras抑制剂
WO2021091956A1 (en) 2019-11-04 2021-05-14 Revolution Medicines, Inc. Ras inhibitors
MX2022005359A (es) 2019-11-04 2022-06-02 Revolution Medicines Inc Inhibidores de ras.
MX2023003060A (es) 2020-09-15 2023-04-05 Revolution Medicines Inc Derivados indolicos como inhibidores de ras en el tratamiento del cancer.
AU2022268962A1 (en) 2021-05-05 2023-12-14 Revolution Medicines, Inc. Ras inhibitors for the treatment of cancer
AR127308A1 (es) 2021-10-08 2024-01-10 Revolution Medicines Inc Inhibidores ras
KR102775118B1 (ko) 2022-07-26 2025-02-27 강원대학교산학협력단 에리트로마이신으로 로딩된 키토산 결합 닭뼈유래 수산화인회석 나노입자 및 그 제조방법
CN117288869B (zh) * 2023-11-24 2024-02-09 中国医学科学院医药生物技术研究所 一种原料药中对甲苯磺酸酯类杂质的检测方法

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6060234A (en) * 1991-01-17 2000-05-09 Abbott Laboratories Polyketide derivatives and recombinant methods for making same
WO1993013663A1 (en) * 1992-01-17 1993-07-22 Abbott Laboratories Method of directing biosynthesis of specific polyketides
US5712146A (en) * 1993-09-20 1998-01-27 The Leland Stanford Junior University Recombinant combinatorial genetic library for the production of novel polyketides
ES2164713T3 (es) * 1993-09-20 2002-03-01 Univ Leland Stanford Junior Produccion recombinante de nuevos poliquetidos.

Also Published As

Publication number Publication date
ES2337424T3 (es) 2010-04-23
EA001744B1 (ru) 2001-08-27
JP4173551B2 (ja) 2008-10-29
DE69733416T2 (de) 2006-04-27
AU731301B2 (en) 2001-03-29
PL331285A1 (en) 1999-07-05
EE03976B1 (et) 2003-02-17
EA199900087A1 (ru) 1999-08-26
WO1998001571A3 (en) 1998-02-19
AP9901444A0 (en) 1999-03-31
CN1179046C (zh) 2004-12-08
EP2182067A2 (en) 2010-05-05
WO1998001546A3 (en) 1998-04-09
AU731654B2 (en) 2001-04-05
GB2331518A (en) 1999-05-26
GEP20012348B (en) 2001-01-25
PT909327E (pt) 2005-10-31
EE9900014A (et) 1999-08-16
DE69739688D1 (de) 2010-01-21
SI0910633T1 (sl) 2010-04-30
EP0910633B1 (en) 2009-12-09
ATE296893T1 (de) 2005-06-15
AP1029A (en) 2001-12-11
NO990012D0 (no) 1999-01-04
GB2331518B (en) 2001-03-14
DK0910633T3 (da) 2010-03-29
EP0909327A2 (en) 1999-04-21
IS4940A (is) 1999-01-04
SK182498A3 (en) 2000-05-16
TR199900006T2 (xx) 1999-04-21
CA2259420A1 (en) 1998-01-15
AU3450997A (en) 1998-02-02
DE69733416D1 (de) 2005-07-07
ES2244001T3 (es) 2005-12-01
IL127916A0 (en) 1999-11-30
NZ333861A (en) 2000-08-25
EP2182067A3 (en) 2010-07-14
CA2259420C (en) 2007-09-18
JP2000511063A (ja) 2000-08-29
AU3451497A (en) 1998-02-02
DK0909327T3 (da) 2005-09-26
EP0909327B1 (en) 2005-06-01
NO990012L (no) 1999-02-23
CN1229438A (zh) 1999-09-22
ATE451455T1 (de) 2009-12-15
WO1998001571A2 (en) 1998-01-15
GB9900156D0 (en) 1999-02-24
BG103133A (en) 2000-04-28
BR9710209A (pt) 2000-01-11
EP0910633A2 (en) 1999-04-28
KR20000023579A (ko) 2000-04-25
WO1998001546A2 (en) 1998-01-15
OA10952A (en) 2002-02-25
CA2259463A1 (en) 1998-01-15

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP4173551B2 (ja) 新規エリスロマイシン及びその製造方法
US6271255B1 (en) Erythromycins and process for their preparation
JP4662635B2 (ja) エポチロンおよびエポチロン誘導体を生成するための組換え方法および材料
DE60033965T2 (de) Rapamycin analoge
DE69930510T2 (de) Polyketide und ihre herstellung
JP2002526114A (ja) ポリケチドシンターゼおよびその組換えdna構築物
DE60313659T2 (de) Borrelidin-derivate und ihre medizinische anwendung
JP2002500230A (ja) 新規なマクロライド系抗生物質
JP2003512013A (ja) 組換えオレアンドライドポリケチドシンターゼ
KR20020016799A (ko) 13-메틸-에리트로마이신 유도체
JP2002519066A (ja) ポリケチド、その調製及びそれに用いる物質
EP2658855A2 (en) Novel polyketide compounds and methods of making same
US7807418B2 (en) Method for producing hybrid polyketide synthases
US20040087003A1 (en) Methods and cells for improved production of polyketides
EP1602727A2 (en) Novel erythromycins and process for their preparation
CZ437598A3 (cs) Erythromyciny, způsoby jejich výroby, farmaceutická kompozice na jejich bázi, způsob léčení a použití
JP2009213479A (ja) ポリケチド類及びそれらの合成

Legal Events

Date Code Title Description
A621 Written request for application examination

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621

Effective date: 20040527

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20061024

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20070123

A602 Written permission of extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602

Effective date: 20070312

A524 Written submission of copy of amendment under article 19 pct

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A524

Effective date: 20070424

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20070911

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20071210

A602 Written permission of extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602

Effective date: 20080121

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20080311

A131 Notification of reasons for refusal

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131

Effective date: 20080520

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20080528

TRDD Decision of grant or rejection written
A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

Effective date: 20080715

A01 Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01

A61 First payment of annual fees (during grant procedure)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61

Effective date: 20080814

R150 Certificate of patent or registration of utility model

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20110822

Year of fee payment: 3

FPAY Renewal fee payment (event date is renewal date of database)

Free format text: PAYMENT UNTIL: 20120822

Year of fee payment: 4

LAPS Cancellation because of no payment of annual fees