JP2017511332A - Amg416の製造方法 - Google Patents
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Abstract
Description
本願は、その内容全体が本願明細書の一部を構成する米国仮出願第61/974,899号(出願日:2014年4月3日)に基づく優先権の利益を主張するものである。
配列表は、EFSを介しテキストファイルの形式で電子ファイル(作成日:2014年4月3日およびファイル名:0419250488seqlist.txt(2531バイト))を提出しており、その内容は本明細書の一部を構成する。
特に断りのない限り、冠詞「a」および「an」は、本明細書では、1つまたは複数(すなわち、少なくとも1つ)の文法的目的語を指すために用いられる。例として、「ある要素」は、1つの要素または2つ以上の要素を意味する。
N−アセチル−D−システイニル−D−アラニル−D−アルギニル−D−アルギニル−D−アルギニル−D−アラニル−D−アルギンアミドとL−システインとのジスルフィドであり、以下の構造式:
例えば、Greene, T.W.; Wuts, P.G.M. Protective Groups in Organic Synthesis, 4th ed.; Wiley: New York, 2007; Isidro-Llobet, A., et al., Amino Acid-Protecting Groups, Chem. Rev 2009, 109, 2455-2504参照。本明細書に記載の反応性アミノ酸またはペプチドフラグメントは、しばしば、対象の化学変換の標的ではない官能基上に1以上の保護基を適切に含んでいる。保護基の例としては、例えば、カルボキシベンジル(ベンジルオキシカルボニルとしても称される)(「Cbz」または「Z」)、9−フルオレニルメトキシカルボニル(Fmoc)、2,2,4,6,7−ペンタメチルジヒドロベンゾフラン−5−スルホニル(Pbf)、tert−ブチルオキシカルボニル(Boc)、トリチル(Trt)、メチルエステル(OMe)、2−ピリジンスルフェニル(SPyまたはS−Pyr)、アミドなどが挙げられる。本明細書中に記載の簡略化した構造において、C末端の−NH2はアミド保護基(〜C(O)NH2)を意味し、N末端の「H」は遊離アミノ基を意味し、括弧内の保護基は、保護基がオルニチンのδ窒素上にあることを意味する。
1つ以上の実施形態において、AMG416塩酸塩は、以下のような一連の工程によって製造される:例示的な工程として、AMG416の7残基(seven-member)の線状フラグメントの固相ペプチド合成(段階I)、付随する側鎖脱保護およびシステイン活性化を伴う、ペプチドからのペプチド鎖の切断(段階II)、続いて粗製のAMG416を得るL−Cysとのin situでのコンジュゲーション(ジスルフィド形成)(段階III)、その直後、いくつかの実施形態では、精製されたAMG416TFA塩を得る分取HPLCおよび凍結乾燥(段階IV)。段階IVの後は、沈殿による塩交換(TFAからHCl)、そしていくつかの実施形態では、その後の精密濾過および凍結乾燥によって精製されたAMG416塩酸塩を得る(段階V)。
AMG416の7残基の線状フラグメントは、固相ペプチド合成(SPPS)を含む当技術分野で公知の任意の方法によって合成することができる。本明細書で使用される「固相合成」または「固相ペプチド合成」という用語は、成長中のペプチド鎖が固体支持体に連結される、当業者に周知の方法を指す。
固相合成は、典型的には以下の工程を含んでなる:(i)第1のアミノ酸(そのアミノ基はブロックされているかまたは「保護されている」)を固相担体に共有結合させる工程;(ii)脱保護剤を用いてアミノ基から保護基を脱離する工程;(iii)第2のアミノ酸(そのアミノ基はブロックされている)のカルボキシルを活性化し、第2のアミノ酸を固相担体に結合した第1のアミノ酸と接触させて、ジペプチド(そのアミノ基はブロックされている)を得る工程;(iv)ペプチド結合形成ステップを繰り返し、ペプチド鎖をC末端からN末端へ伸長させる工程;および(v)アミノ基の保護基を脱離し、切断剤で固相担体からペプチド鎖を分離してペプチドを得る工程。
Fmoc−D−Cys(Trt)−D−Ala−D−Arg(Pbf)−D−Arg(Pbf)−D−Arg(Pbf)−D−Ala−D−Arg(Pbf)−[樹脂]
(配列番号2)
Ac−D−Cys(Trt)−D−Ala−D−Arg(Pbf)−D−Arg(Pbf)−D−Arg(Pbf)−D−Ala−D−Arg(Pbf)−[樹脂]
(配列番号3)
ペプチドは、支持体から切り離し、保護基を当技術分野で公知の任意の手段によって側鎖から脱離することができる。例えば、Synthetic Peptides: A User's Guide (G.A. Grant, ed.), W.H. Freeman and Company, New York, 1992; and Chan, W.C., White, P.D. "Fmoc Solid Phase Peptide Synthesis, A Practical Approach", Oxford University Press (2000), p.64-66および105-109参照。
Ac-D-Cys(SPy)-D-Ala-D-Arg-D-Arg-D-Arg-D-Ala-D-Arg-NH2
(配列番号4)
SPy中間体は、当該分野で公知の任意の方法によってL−Cysにコンジュゲートすることができる。一実施形態において、L−Cysのコンジュゲーションは、水性TFA中で行われる。
TFA塩は、当該分野で公知の任意の手段によって、塩酸塩のような薬学的に許容される塩に変換することができる。
別の実施形態では、SPy中間体は、L−Cysへのコンジュゲーションの前に精製される。一般に、SPy中間体、特にペプチド−SPy中間体は、非常に不安定であると考えられ、すなわち、HPLCなどの効率的な精製に耐えるのに十分に安定でないと考えられる。しかしながら、本明細書で提供される方法を達成するに際して、予期しないことに、本明細書に記載の方法に従って製造されたペプチド−SPy中間体が、確かに、別の精製工程に耐えるのに十分に安定であることが本出願人によって見い出された。さらに、L−Cysへのコンジュゲーションに先立つこのような中間体の精製は、実際に最終的なペプチド医薬品の製造効率を増大し、製造コストを低下させることができることが見い出された。
AMG416は、7個のアミノ酸の線状配列を含んでなり、そのうちの4個はD−アルギニンである。AMG416の合成に用いられるD−アルギニンのFmoc誘導体であるFmoc−D−Arg(Pbf)−OHを合成する方法を本明細書に記載する。高品質のFmoc−D−Arg(Pbf)−OH出発材料の使用は、段階Iから段階IIIまでの粗製のAMG416にさらなる純度を与え、それによって段階IVにおける精製収率を高めることができる。さらに重要なことに、高品質で高純度の出発材料を使用することにより、所望の純度のAMG416を確保するための望ましく且つ有利な調節要素を提供することができる。より高収率で得られ、必要とする単位操作がより少なく、より確かな品質管理を提供し、大規模製造に適した、高品質のD−Arg(Pbf)−OHおよびFmoc−D−Arg(Pbf)−OHを製造するための新しい方法が開発された。要約すれば、本明細書に記載のFmoc−D−Arg(Pbf)−OHの製造方法によって、品質における潜在的な利益を伴ってAMG416製造の実行可能性が有意に増加する。
主鎖線状フラグメントの合成
主鎖線状フラグメントの合成を図2に示す。Rink Amide AM樹脂(アミノメチル樹脂に結合したFmoc 2,4−ジメトキシ−4’(カルボキシメチルオキシ)−ベンズヒドリルアミン)(1kg)をDMF(5.8L/kg)に加え、溶液を22℃で撹拌した。樹脂を濾過し、スラリーを洗浄した。サンプルを、残留Fmoc(UV試験)および残留ピペリジン(pH)について試験した。Fmoc脱保護が行われたことを確認するために、Kaiserおよび/またはTNBSカラー試験を行った。
主鎖線状フラグメントの合成
AMG416主鎖線状フラグメントの合成を図2に示す。ペプチド鎖は、Rink AMアミド樹脂上でC末端からN末端へ1サイクルにつき1アミノ酸ずつ構築した。各サイクルは2つの反応ステップからなる:1)N末端からのFmoc切断;2)次のFmoc保護アミノ酸のカップリングまたは最終的なアセチル化。
樹脂からの主鎖線状フラグメントの切断
カクテル溶液は、DIW(0.16L/kg);TFA(5.64L/kg);TIPS(0.46当量)およびDPDS(6.41当量)を室温にて混合した後、溶液を0±2℃に冷却することにより調製した。樹脂上のペプチドを0±2℃でカクテル溶液に添加し、溶液を25℃に加熱し、反応を進行させた。樹脂を濾過により除去し、洗浄した。溶液を−10℃に保持し、−10℃でIPE:MeCN(24.5L/kg)の6.8:1溶液を時間と共に添加して、温度および沈殿を制御した。反応を進行させ、AMG416 SPy中間体を−5℃で濾過し、洗浄した。SPy中間体を完全真空下、20℃で乾燥させた。図3を参照。
樹脂からの主鎖線状フラグメントの切断
切断用溶液は、反応器内でTFA、H2O、およびトリイソプロピルシラン(TIPS)を96.9:2.6:0.5(v/v/v)の比で混合することによって調製した。切断用溶液に、Dシステインのスルフヒドリル基の活性化剤としてDPDS(>1.2モル)を添加した。AMG416−樹脂(1.0モル)を反応器に入れ、反応混合物を室温で1時間以上撹拌した。樹脂を濾別した。濾液と洗浄液を別の反応器に移し、冷却した。次いで、この溶液に、ジイソプロピルエーテル(IPE)とACNの冷却貧溶媒混合物を加えて、AMG416−SPyを沈殿させた。懸濁液をフィルタードライヤーを介して濾過し、続いてAMG416−SPyのフィルターケーキをACNおよびIPEで洗浄し、減圧下、約20℃にてフィルタードライヤーで乾燥した。
L−Cysとのin−situコンジュゲーション/分取HPLC
AMG416 SPy中間体(1.0モル)を0.2%TFA溶液に添加した。Lシステイン(>1.1モル)を溶液に添加し、反応を室温で少なくとも15分間進行させた。
塩の変換
AMG416TFA塩を、完全な溶解が観察されるまで10℃でIPA(v/v)10L/kg中の15%水の溶液に添加した。この溶液を12MのHCl水溶液(0.27L/kg)およびIPA(49.4L/kg)に3時間かけて表面下添加を介して添加し、AMG416 4.5塩酸塩を直接沈殿させた。このバッチを3時間熟成させ、分析のためにサンプリングした。
SPy中間体の精製およびAMG416HClの生成
AMG416塩酸塩の製造方法の別法を記載する。上記実施例2に記載したように、SPy中間体を、樹脂からの切断、沈殿および濾過後、完全真空下20℃で乾燥させた。次いで、沈殿物を0.1%TFA水溶液に溶解し、HPLC精製のためにC−18カラムに充填した。カラムを<60バールで運転し、溶液温度は全体を通して15〜25℃とした。溶出液は0.1%TFAアセトニトリル溶液と0.1%TFA水溶液を用いた。フラクションを5℃で保存し、それらをサンプリングした後、フラクションをプールした。2回の操作で集めた混合プールを希釈し、同じHPLCカラムを使用して濃縮/精製操作を行い、総容量を減少させてさらなる不純物を除去した。フラクションは5℃で保存した。
H−D−Arg(Pbf)−OHの合成
実施例1に記載の主鎖線状フラグメントの合成は、線状フラグメントの7残基のうちの4つを構成するD−アルギニンサブユニットの付加にFmoc−D−Arg(Pbf)−OHの使用を必要とする。Fmoc−D−Arg(Pbf)−OHを合成するための改良された、より効率的な方法を以下に記載する。
Claims (13)
- AMG416の製造方法であって、
Fmoc−D−Cys(Trt)−D−Ala−D−Arg(Pbf)−D−Arg(Pbf)−D−Arg(Pbf)−D−Ala−D−Arg(Pbf)−[樹脂](配列番号2)およびAc−D−Cys(Trt)−D−Ala−D−Arg(Pbf)−D−Arg(Pbf)−D−Arg(Pbf)−D−Ala−D−Arg(Pbf)−[樹脂](配列番号3)からなる群から選択される構造を有する、樹脂結合ペプチドを提供すること;
該ペプチドを固体支持体から切断すること;および
D−Cys残基の側鎖を活性化すること
ことを含んでなる方法。 - 切断および活性化が同じ容器内で行なわれる、請求項1に記載の方法。
- 樹脂結合ペプチドを、水、トリフルオロ酢酸、トリイソプロピルシランおよびジピリジルジスルフィドを含む溶液と接触させる、請求項1に記載の方法。
- AMG416の製造方法であって、
Ac−D−Cys(SPy)−D−Ala−D−Arg−D−Arg−D−Arg−D−Ala−D−Arg−NH2(配列番号4)の構造を有するペプチドを提供すること、および
ペプチドをL−Cysと接触させてコンジュゲートされた生成物を生成させること
を含んでなる方法。 - 前記ペプチドを、L−Cysおよびトリフルオロ酢酸を含む水溶液と接触させる、請求項4に記載の方法。
- コンジュゲートされた生成物を凍結乾燥することをさらに含む、請求項4に記載の方法。
- コンジュゲートされた生成物をIPAおよびHClを含む水溶液と接触させ、それによりAMG416HCl(配列番号1)を含む沈殿物を生成させることをさらに含む、請求項4に記載の方法。
- 沈殿物をHPLCにより精製することをさらに含む、請求項7に記載の方法。
- AMG416の製造方法であって、
TFAの溶液中のAc−D−Cys(SPy)−D−Ala−D−Arg−D−Arg−D−Arg−D−Ala−D−Arg−NH2(配列番号4)の構造を有するペプチドを提供すること;
該ペプチドをHPLCにより精製すること;
共沸蒸留により溶媒交換を行うこと;および
該ペプチドをL−Cysと接触させてコンジュゲートされた生成物を生成させること
を含んでなる方法。 - 前記ペプチドをIPA中のL−Cysおよび水の水溶液と接触させる、請求項9に記載の方法。
- コンジュゲートされた生成物をIPAおよびHClを含む水溶液と接触させ、それによりAMG416HCl(配列番号1)を含む沈殿物を生成させることをさらに含む、請求項10に記載の方法。
- D−Arg(Pbf)−OHを合成する方法であって、
Boc−D−Arg−OHをPbfCl、NaOHおよびNaIと混合することにより、Boc−D−Arg−OHをBoc−D−Arg(Pbf)−OHに変換することを含んでなる方法。 - Boc−D−Arg(Pbf)−OHをHClおよびIPAcと混合することにより、Boc−D−Arg(Pbf)−OHをD−Arg(Pbf)−OHに変換することをさらに含む、請求項12に記載の方法。
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