JP2017525367A - 硫酸塩還元微生物用の内蔵型嫌気性培養デバイス - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2014年8月20日に出願された米国特許仮出願第62/039,638号、及び2015年7月1日に出願された同第62/187,293号に基づく優先権を主張するものであり、これらの開示は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
硫酸塩還元菌(SRB)は、海水中、腐敗性有機物を含有する地表水中、並びに、海洋環境及び淡水環境内で見出される堆積物中に偏在している。SRBは、一般に嫌気性環境中で見出されるが、少なくとも一部のSRBは、少なくとも低レベルの酸素を有する環境に耐え、その環境中で繁殖し得ることが報告されている。
全般的に、本開示は、試料中の硫酸塩還元微生物の検出、及び任意選択的に、その計数に関する。特に、本開示は、好気性雰囲気中でSRBを培養するためのデバイス、及びそのデバイスの使用方法に関する。SRBの増殖及び検出は、内蔵型の、修正環境生成培養デバイスを使用して遂行することできる。この修正環境生成デバイスは、SRBの増殖を促進する嫌気性の水性増殖培地を作り出すために、所定の体積の水性液体で活性化される。
本開示のいずれかの実施形態を詳細に説明する前に、本発明は、以下の説明に記載されるか、若しくは以下の図面に例示される、構成の詳細及び構成要素の配置に、その適用が限定されるものではない点を理解されたい。本発明は、他の実施形態が可能であり、様々な方式で実践又は実施することが可能である。また、本明細書で使用される表現法及び用語法は、説明を目的とするものであり、限定するものとして見なされるべきではない点も理解されたい。「含む(including)」、「備える(comprising)」、若しくは「有する(having)」、及びこれらの変化形の本明細書での使用は、その後に列挙される項目、及びそれらの等価物、並びに更なる項目を包含することを意味する。別段の指示又は限定のない限り、用語「接続された」及び「結合された」、並びにそれらの変化形は、広義に使用され、直接的並びに間接的な接続及び結合の双方を包含するものである。更には、「接続された」及び「結合された」は、物理的又は機械的な接続若しくは結合に制限されるものではない。本開示の範囲から逸脱することなく、他の実施形態を利用することができ、構造的又は論理的な変更を加えることができる点を理解されたい。更には、「前方」、「後方」、「上部」、「底部」などの用語は、各要素の互いに対する関係を説明するためにのみ使用されるものであり、装置の特定の向きに言及することも、装置に必須若しくは必要な向きを指示又は暗示することも、あるいは、本明細書で説明される発明が、使用時にどのように使用、装着、表示、又は位置決めされるかを指定することも、決して意味するものではない。
実施形態Aは、
防水性基部、該基部に取り付けられた防水性カバーシート、及びそれらの間に配置された増殖コンパートメントを含む本体部であって、該増殖コンパートメントが、周辺部と、該増殖コンパートメントへの液体のアクセスを提供する開口部とを有し、周辺部の一部分が防水シールによって画定され、この部分が周辺部の>50%を含む、本体部と、
上記増殖コンパートメント内で基部に付着された、乾燥した冷水可溶性ゲル化剤と、
上記増殖コンパートメント内に配置された乾燥培地であって、硫酸塩還元菌の増殖を促進するように選択される乾燥培地と、
上記増殖コンパートメント内に配置された、乾燥した第1の酸素消去試薬と、を備える、デバイスである。
防水性基部、該基部に取り付けられた防水性カバーシート、及びそれらの間に配置された増殖コンパートメントを含む本体部であって、該増殖コンパートメントが、周辺部と、該増殖コンパートメントへの液体のアクセスを提供する開口部と、を有し、周辺部の一部分が防水シールによって画定され、この部分が周辺部の>50%を含む、本体部と、
上記増殖コンパートメント内で基部に付着された、乾燥した冷水可溶性ゲル化剤と、
硫酸塩還元菌による硫化水素の産生を検出するための指示試薬であって、増殖コンパートメント内に配置された指示試薬と、
上記増殖コンパートメント内に配置された、乾燥した第1の酸素消去試薬と、を備える、デバイスである。
この培地が、硫酸塩還元菌の増殖を促進するように選択される、実施形態Cの培養デバイスである。
第1の乾燥成分が、増殖コンパートメント内で第1の接着剤層に付着される、実施形態Oのデバイスである。
第1の乾燥成分が第1の支持体に付着され、第1の支持体が、増殖コンパートメント内で第1の接着剤層に付着される、実施形態Oのデバイスである。
第1の乾燥成分が第2の接着剤層に付着される、実施形態Qのデバイスである。
カバーシートが、増殖コンパートメントの少なくとも一部分内で、その上に配置された第3の接着剤層を備え、
第2の乾燥成分が、増殖コンパートメント内でその第3の接着剤層に付着される、実施形態Sのデバイスである。
第2の乾燥成分が第2の支持体に付着され、その第2の支持体が、増殖コンパートメント内で第2の接着剤層に付着される、実施形態Tのデバイスである。
第2の乾燥成分が第4の接着剤層に付着される、実施形態Uのデバイスである。
平面状の防水性基材を含む本体部であって、上記基材が、周縁部と、離間配置された第1区画及び第2区画を含む第1主表面と、第1主表面の反対側の第2主表面と、第1区画を第2区画に対して重ね合わせて並置させる折り目と、を有し、第1区画及び第2区画が、上記増殖コンパートメントの内壁部を画定しており、上記増殖コンパートメントが、周辺部、及び上記増殖コンパートメントへの液体のアクセスを提供する開口部を有し、上記周辺部の一部分が防水シールによって画定され、この部分が周辺部の>50%を含む、本体部と、
増殖コンパートメント内の第1区画に付着された、冷水可溶性ゲル化剤と、
増殖コンパートメント内に配置された乾燥培地であって、硫酸塩還元菌の増殖を促進するように選択される、培地、又は、硫酸塩還元菌による硫化水素産生を検出するための、指示試薬であって、増殖コンパートメント内に配置された、指示試薬と、
増殖コンパートメント内に配置された、乾燥した第1の酸素消去試薬と、を備える、デバイスである。
それらの培地及び指示試薬が、双方とも増殖コンパートメント内に配置される、実施形態AC〜実施形態AHのうちのいずれか1つのデバイスである。
第1の乾燥成分が、増殖コンパートメント内で第1の接着剤層に付着される、実施形態AJのデバイスである。
第1の乾燥成分が第1の支持体に付着され、第1の支持体が、増殖コンパートメント内で第1の接着剤層に付着される、実施形態AJのデバイスである。
第1の乾燥成分が第2の接着剤層に付着される、実施形態ALのデバイスである。
防水性基材が、第2区画の少なくとも一部分上に配置された第3の接着剤層を備え、
第2の乾燥成分が、増殖コンパートメント内で第3の接着剤層に付着される、実施形態ANのデバイスである。
第2の乾燥成分が第2の支持体に付着され、その第2の支持体が、増殖コンパートメント内で第2の接着剤層に付着される、実施形態ANのデバイスである。
第2の乾燥成分が第4の接着剤層に付着される、実施形態APのデバイスである。
デバイスであって、防水性基部とその基部に取り付けられた防水性カバーシートとの間に配置された増殖コンパートメントを含む本体部であって、該増殖コンパートメントが、周辺部と、該増殖コンパートメントへの液体のアクセスを提供する開口部と、を有し、周辺部の一部分が防水シールによって画定され、この部分が周辺部の>50%を含む、本体部と、増殖コンパートメント内で基部に付着された、乾燥した冷水可溶性ゲル化剤と、増殖コンパートメント内に配置された、乾燥した第1の酸素消去試薬と、を備える、デバイスの増殖コンパートメント内に試料を堆積させることと、
硫酸塩還元微生物の増殖を促進する温度でデバイスをインキュベートすることと、
増殖コンパートメント内の硫酸塩還元微生物のコロニーの兆候を検出することと、を含む、方法である。
デバイスであって、平面状の防水性基材を含む本体部であって、この基材が、周縁部と、離間配置された第1区画及び第2区画を含む第1主表面と、第1主表面の反対側の第2主表面と、第1区画を第2区画に対して重ね合わせて並置させる折り目と、を有し、第1区画及び第2区画が、増殖コンパートメントの内壁部を画定しており、上記増殖コンパートメントが、周辺部、及び上記増殖コンパートメントへの液体のアクセスを提供する開口部を有し、周辺部の一部分が防水シールによって画定されており、この部分が周辺部の>50%を含む、本体部と、増殖コンパートメント内の第1区画に付着された、冷水可溶性ゲル化剤と、増殖コンパートメント内に配置された、乾燥した第1の酸素消去試薬と、を備える、デバイスの増殖コンパートメント内に試料を堆積させることと、
硫酸塩還元微生物の増殖を促進する温度で、デバイスをインキュベートすることと、
増殖コンパートメント内の硫酸塩還元微生物のコロニーの兆候を検出することと、を含む、方法である。
+++=プレート全域にわたる繁茂、単一コロニーが容易に計数可能
++=増殖がプレートの縁部の周りでは若干抑制された状態で存在し、単一コロニーが計数可能
+=増殖がプレートの縁部の周りでは著しく抑制された状態で存在し、コロニーは識別困難
−=黒色沈殿物は観察されず
TNTC=計数不能多数
ND=測定せず
+++=プレート全域にわたる繁茂、単一コロニーが容易に計数可能
++=増殖がプレートの縁部の周りでは若干抑制された状態で存在し、単一コロニーが計数可能
+=増殖がプレートの縁部の周りでは著しく抑制された状態で存在し、コロニーは識別困難
−=黒色沈殿物は観察されず
+++=プレート全域にわたる繁茂、単一コロニーが容易に計数可能
++=増殖がプレートの縁部の周りでは若干抑制された状態で存在し、単一コロニーが計数不能
+=増殖がプレートの縁部の周りでは著しく抑制された状態で存在し、コロニーは識別困難
−=黒色沈殿物は観察されず
Claims (20)
- 防水性基部、前記基部に取り付けられた防水性カバーシート、及び前記基部と前記カバーシートの間に配置された増殖コンパートメントを含む本体部であって、前記増殖コンパートメントが、周辺部と、前記増殖コンパートメントへの液体のアクセスを提供する開口部と、を有し、前記周辺部の一部分が防水シールによって画定され、前記部分が前記周辺部の>50%を含む、本体部と、
前記増殖コンパートメント内で前記基部に付着された、乾燥した冷水可溶性ゲル化剤と、
硫酸塩還元菌による硫化水素の産生を検出するための指示試薬であって、前記増殖コンパートメント内に配置された指示試薬と、
前記増殖コンパートメント内に配置された、乾燥した第1の酸素消去試薬と、を備える、デバイス。 - 前記増殖コンパートメント内に配置された乾燥培地を更に備え、
前記培地が、硫酸塩還元菌の増殖を促進するように選択される、請求項1に記載のデバイス。 - 前記増殖コンパートメント内に配置された、有効量の乾燥した還元剤を更に備える、請求項1又は2に記載のデバイス。
- 前記第1の酸素消去試薬が前記基部に付着される、請求項1〜3のいずれか一項に記載のデバイス。
- 生存可能微生物の存在を検出するための指示試薬を更に備え、
前記指示試薬が前記増殖コンパートメント内に配置される、請求項1〜4のいずれか一項に記載のデバイス。 - 前記増殖コンパートメント内に配置された、乾燥した第2の酸素消去試薬を更に備える、請求項1〜5のいずれか一項に記載のデバイス。
- 前記指示試薬が、前記第1の酸素消去試薬又は第2の酸素消去試薬である、請求項1〜6のいずれか一項に記載のデバイス。
- 前記第1の酸素消去試薬、第2の酸素消去試薬、還元試薬、栄養素、指示試薬、及び前述の成分のうちの任意の2つ以上の組み合わせからなる群から選択される第1の乾燥成分が、前記基部に付着される、請求項1〜7のいずれか一項に記載のデバイス。
- 前記第1の酸素消去試薬、第2の酸素消去試薬、還元試薬、栄養素、指示試薬、及び前述の成分のうちの任意の2つ以上の組み合わせからなる群から選択される第2の乾燥成分が、前記カバーシートに付着される、請求項1〜8のいずれか一項に記載のデバイス。
- 前記カバーシートが、前記増殖コンパートメントの少なくとも一部分内で前記カバーシート上に配置された第3の接着剤層を備え、
前記第2の乾燥成分が、前記増殖コンパートメント内で前記第3の接着剤層に付着される、請求項9に記載のデバイス。 - 前記基部が、前記開口部の近位に第1のタブを更に備え、
前記第1のタブが、前記第1のタブに付着された第1の封鎖接着剤を備える、請求項1〜10のいずれか一項に記載のデバイス。 - 前記冷水可溶性ゲル化剤が、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、キサンタンガム、グアーガム、ローカストビーンガム、カルボキシメチルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、アルギン、及びこれらの組み合わせからなる群から選択される、請求項1〜11のいずれか一項に記載のデバイス。
- 前記第1の酸素消去試薬が、硫酸第二鉄アンモニウム、塩化第二鉄、第二鉄塩、亜硫酸塩、亜硫酸水素塩からなる群から選択される、請求項1〜12のいずれか一項に記載のデバイス。
- 前記還元剤が、ジチオスレイトール、ジチオエリトリトール、チオグリコール酸の塩、及び前述の任意の2つ以上の組み合わせからなる群から選択される、請求項3に記載のデバイス。
- 前記防水シールが接着剤を含む、請求項1〜14のいずれか一項に記載のデバイス。
- デバイスであって、防水性基部と前記基部に取り付けられた防水性カバーシートの間に配置された増殖コンパートメントを含む本体部であって、前記増殖コンパートメントが、周辺部と、前記増殖コンパートメントへの液体のアクセスを提供する開口部と、を有し、前記周辺部の一部分が防水シールによって画定されており、前記部分が前記周辺部の>50%を含む、本体部と、前記増殖コンパートメント内で前記基部に付着された、乾燥した冷水可溶性ゲル化剤と、前記増殖コンパートメント内に配置された、乾燥した第1の酸素消去試薬と、を備える、デバイスの増殖コンパートメント内に試料を堆積させることと、
硫酸塩還元微生物の増殖を促進する温度で前記デバイスをインキュベートすることと、
前記増殖コンパートメント内の前記硫酸塩還元微生物のコロニーの兆候を検出することと、を含む、方法。 - 前記増殖コンパートメント内に前記試料を堆積させる前に、前記増殖コンパートメントが、乾燥培地を含み、前記培地が、硫酸塩還元菌の増殖を促進するように選択される、請求項16に記載の方法。
- 前記増殖コンパートメント内に前記試料を堆積させることが、前記増殖コンパートメント内に水性液体を堆積させることを更に含む、請求項16又は17に記載の方法。
- 前記方法が、前記開口部を封止することを更に含む、請求項16〜18のいずれか一項に記載の方法。
- 前記デバイスをインキュベートすることが、7日間以下の期間にわたって前記デバイスをインキュベートすることを含む、請求項16〜19のいずれか一項に記載の方法。
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