JP3127026B2 - 分子設計支援システム - Google Patents
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Description
【０００１】
【産業上の利用分野】本発明はグラフィック表示機能等
を利用して分子構造の生成あるいは変更操作を行なう分
子設計支援システムに係わり、特に分子内の各原子に関
する情報を、原子データと結合データを統合した１つの
部品情報で表現すると共に、これら部品情報の集合体に
より分子構造を定義して新たな分子構造の生成、あるい
は分子構造の変更操作を行なう分子設計支援システムに
関する。
を利用して分子構造の生成あるいは変更操作を行なう分
子設計支援システムに係わり、特に分子内の各原子に関
する情報を、原子データと結合データを統合した１つの
部品情報で表現すると共に、これら部品情報の集合体に
より分子構造を定義して新たな分子構造の生成、あるい
は分子構造の変更操作を行なう分子設計支援システムに
関する。
【０００２】コンピュ−タの高性能化と分子軌道法（Ｍ
Ｏ）、分子力場法（ＭＭ）、分子動力学（ＭＤ）等の理
論化学計算手法の発達に伴い、化学・製薬化学・材料工
学などの先端研究分野では分子設計支援システムの実用
的利用についてのニ−ズが高まっている。理論化学計算
を実行するためには、計算対象物質（化合物）の三次元
構造情報を入力データとして作成する必要があり、この
入力データの善し悪しが、得られる計算結果の信頼性、
汎用性を大きく左右する。
Ｏ）、分子力場法（ＭＭ）、分子動力学（ＭＤ）等の理
論化学計算手法の発達に伴い、化学・製薬化学・材料工
学などの先端研究分野では分子設計支援システムの実用
的利用についてのニ−ズが高まっている。理論化学計算
を実行するためには、計算対象物質（化合物）の三次元
構造情報を入力データとして作成する必要があり、この
入力データの善し悪しが、得られる計算結果の信頼性、
汎用性を大きく左右する。
【０００３】
【従来の技術】従来の分子設計支援システムにおいて
は、分子の構造情報は一般に、(1) 分子を構成する各原
子の元素種、原子座標、電荷等の原子データ群と、(2)
結合を形成する原子ペアの番号、結合次数等の結合デー
タ群の２種の独立した情報によって管理されている。
は、分子の構造情報は一般に、(1) 分子を構成する各原
子の元素種、原子座標、電荷等の原子データ群と、(2)
結合を形成する原子ペアの番号、結合次数等の結合デー
タ群の２種の独立した情報によって管理されている。
【０００４】図９は従来の分子構造を定義する分子構造
情報の説明図であり、図９(a)は分子式ＣＨ３ＣＯＯＨ
で表現される酢酸の化学構造式、図９(b)は該酢酸の分
子構造を定義する分子構造情報である。この分子構造情
報は、ＭＤＬ社のｍｏｌファイル形式で表現した例で、
分子内の原子データと結合データが区別されて記述され
ている。すなわち、１は分子（酢酸）の名称、２は分子
中の原子の数（＝８）と結合数（＝７）であり、３は分
子を構成する各原子の三次元座標及び各原子の元素記号
を含む原子データ、４は結合を構成する２つの原子の番
号（図９の元素記号に添えたサフィックス番号参照）と
その結合次数を含む結合データである。これらのデータ
は分子に属する個々の原子の絶対的又は相対的位置関係
を指定するもので、理論化学計算を行なう上で不可欠な
ものである。
情報の説明図であり、図９(a)は分子式ＣＨ３ＣＯＯＨ
で表現される酢酸の化学構造式、図９(b)は該酢酸の分
子構造を定義する分子構造情報である。この分子構造情
報は、ＭＤＬ社のｍｏｌファイル形式で表現した例で、
分子内の原子データと結合データが区別されて記述され
ている。すなわち、１は分子（酢酸）の名称、２は分子
中の原子の数（＝８）と結合数（＝７）であり、３は分
子を構成する各原子の三次元座標及び各原子の元素記号
を含む原子データ、４は結合を構成する２つの原子の番
号（図９の元素記号に添えたサフィックス番号参照）と
その結合次数を含む結合データである。これらのデータ
は分子に属する個々の原子の絶対的又は相対的位置関係
を指定するもので、理論化学計算を行なう上で不可欠な
ものである。
【０００５】ところで、ユ−ザにとって、これらのデー
タは直接的には馴染みがたいものである。このため、２
つの分子構造部分を結合して新規分子構造を組立てる際
に必要となる、結合距離、結合角、ねじれ角に代表され
る部品構造間の相対的位置関係の特定作業、換言すれ
ば、新規分子構造のデータ作成作業が面倒となる問題が
生じる。特に、上記従来の分子構造情報は、新規結合後
の分子構造情報を簡単に作成するデータ構成となってい
ないため、新規分子構造の組立作業に多大の労力を必要
とし、理論化学計算結果の解析、理論の展開といった本
来の目的のみに集中することができない。又、データの
作成には習熟が必要であり、その作成過程で人為的なミ
スが発生する危険性もある。
タは直接的には馴染みがたいものである。このため、２
つの分子構造部分を結合して新規分子構造を組立てる際
に必要となる、結合距離、結合角、ねじれ角に代表され
る部品構造間の相対的位置関係の特定作業、換言すれ
ば、新規分子構造のデータ作成作業が面倒となる問題が
生じる。特に、上記従来の分子構造情報は、新規結合後
の分子構造情報を簡単に作成するデータ構成となってい
ないため、新規分子構造の組立作業に多大の労力を必要
とし、理論化学計算結果の解析、理論の展開といった本
来の目的のみに集中することができない。又、データの
作成には習熟が必要であり、その作成過程で人為的なミ
スが発生する危険性もある。
【０００６】そこで、この新規分子構造情報作成作業の
効率化とデータ精度の向上を目的として、計算機のグラ
フィック機能等を活用した各種の分子設計支援システム
が提案され、実用化されている。第１の方法は、原子の
結合関係において、完全な情報を持つ官能基等の基本化
合物（基本分子構造）を単純に組み合わせることにより
目的とする分子構造を得るものである。又、第２の方法
は、原子価の満たされていない原子に新たに他原子団と
の結合を付加する際、その原子の周りの結合環境を参照
し、経験則に基づいてシステム側で決定した位置に配置
するものである。
効率化とデータ精度の向上を目的として、計算機のグラ
フィック機能等を活用した各種の分子設計支援システム
が提案され、実用化されている。第１の方法は、原子の
結合関係において、完全な情報を持つ官能基等の基本化
合物（基本分子構造）を単純に組み合わせることにより
目的とする分子構造を得るものである。又、第２の方法
は、原子価の満たされていない原子に新たに他原子団と
の結合を付加する際、その原子の周りの結合環境を参照
し、経験則に基づいてシステム側で決定した位置に配置
するものである。
【０００７】
【発明が解決しようとする課題】これら、従来の方法
は、各種官能基等、特定の安定な部分構造に属する原子
団の局所的な三次元構造データの作成には有用である。
しかし、第１の従来方法では、予め基本と成る化合物の
データを作成して用意する必要があり、しかも置換の際
に結合する２つの原子種間の結合長を決定する処理を必
要とし、そのためにデータテ−ブルを何回も参照しなけ
ればならず、処理が面倒となる問題がある。
は、各種官能基等、特定の安定な部分構造に属する原子
団の局所的な三次元構造データの作成には有用である。
しかし、第１の従来方法では、予め基本と成る化合物の
データを作成して用意する必要があり、しかも置換の際
に結合する２つの原子種間の結合長を決定する処理を必
要とし、そのためにデータテ−ブルを何回も参照しなけ
ればならず、処理が面倒となる問題がある。
【０００８】又、第２の従来方法では、分子構造生成時
の信頼性はシステムの処理方法に依存することになり、
特に、立体的な任意性のある部分（例えば、エネルギ−
障壁が小さく自由回転可能な単結合や、ある程度拘束さ
れている環構造における複数の可能性のある配座等）の
構造もシステム側から自動指定されるため、ユ−ザの意
図しない構造が生成される可能性がある。すなわち、、
経験的に相対的位置関係を特定できない例外があり、か
かる場合には、ユ−ザの意図しない分子構造が生成され
る問題がある。
の信頼性はシステムの処理方法に依存することになり、
特に、立体的な任意性のある部分（例えば、エネルギ−
障壁が小さく自由回転可能な単結合や、ある程度拘束さ
れている環構造における複数の可能性のある配座等）の
構造もシステム側から自動指定されるため、ユ−ザの意
図しない構造が生成される可能性がある。すなわち、、
経験的に相対的位置関係を特定できない例外があり、か
かる場合には、ユ−ザの意図しない分子構造が生成され
る問題がある。
【０００９】以上は新規分子構造の生成の場合である
が、分子構造の変更を行なう場合、従来のデータ構造で
は、独立した原子データ群と結合データ群の２種のデー
タに対して比較・参照を繰り返しながら内部データの変
更処理を行なう必要があり、内部処理の複雑化によりシ
ステムの操作性や応答時間が低下する問題がある。
が、分子構造の変更を行なう場合、従来のデータ構造で
は、独立した原子データ群と結合データ群の２種のデー
タに対して比較・参照を繰り返しながら内部データの変
更処理を行なう必要があり、内部処理の複雑化によりシ
ステムの操作性や応答時間が低下する問題がある。
【００１０】以上から本発明の目的は、簡単な操作で、
かつ効率良く新規分子構造を生成したり、変更できる分
子設計支援システムを提供することである。本発明の別
の目的は、高精度で分子構造を定義できる分子設計支援
システムを提供することである。
かつ効率良く新規分子構造を生成したり、変更できる分
子設計支援システムを提供することである。本発明の別
の目的は、高精度で分子構造を定義できる分子設計支援
システムを提供することである。
【００１１】
【課題を解決するための手段】図１は本発明の原理説明
図である。１１は分子設計支援システムの処理部、１２
は新規分子構造の生成又は変更時に必要な分子構造等を
表示するグラフィックディスプレイ装置、１３はマウ
ス、１６はハ−ドデイスク等で構成されたデータベ−ス
で、基本分子構造あるいは作成済みの分子構造の分子情
報を記憶している。又、グラフィックディスプレイ装置
において、１２ａはメインウインドウ、１２ｂはサブウ
インドウである。すなわち、本発明の分子設計支援シス
テムは、(1) グラフィカルに分子の構造を表示する表示
手段(グラフィックディスプレイ装置１１）、(2) 分子
を構成する第一の原子の種類を識別する識別子と該第一
の原子の中心座標と該第一の原子の混成軌道数と該第一
の原子に含まれるそれぞれの混成軌道の結合末端の位置
を表す座標からなる原子データと、該第一の原子部品と
結合される第二の原子の種類を識別する識別子と該第二
の原子の結合対象となる混成軌道を識別する識別子と該
第一の原子と該第二の原子を形成するそれぞれの原子の
間に確立される結合の結合次数を示す識別子からなる結
合データを含む原子部品情報を保持する手段（データベ
ース１６）、(3) 前記表示手段に表示された第一の位置
にある前記第一の原子を選択し、選択した該第一の原子
を第二の位置に移動する入力手段(マウス１３）、(4)
前記第一の原子と前記第二の原子とを結合して新たな分
子構造を生成する場合において、該第一の原子と該第二
の原子の互いに結合すべき混成軌道が指定されたとき、
前記第一の原子の中心座標と、前記第二の原子の結合対
象となる混成軌道の結合末端の座標と、前記第二の原子
の中心座標とが一直線上に並ぶように第一の分子構造と
第二の分子構造を結合し、新たな分子構造を構成する各
原子の部品情報を作成する処理手段(処理部１１）を備
えている。
図である。１１は分子設計支援システムの処理部、１２
は新規分子構造の生成又は変更時に必要な分子構造等を
表示するグラフィックディスプレイ装置、１３はマウ
ス、１６はハ−ドデイスク等で構成されたデータベ−ス
で、基本分子構造あるいは作成済みの分子構造の分子情
報を記憶している。又、グラフィックディスプレイ装置
において、１２ａはメインウインドウ、１２ｂはサブウ
インドウである。すなわち、本発明の分子設計支援シス
テムは、(1) グラフィカルに分子の構造を表示する表示
手段(グラフィックディスプレイ装置１１）、(2) 分子
を構成する第一の原子の種類を識別する識別子と該第一
の原子の中心座標と該第一の原子の混成軌道数と該第一
の原子に含まれるそれぞれの混成軌道の結合末端の位置
を表す座標からなる原子データと、該第一の原子部品と
結合される第二の原子の種類を識別する識別子と該第二
の原子の結合対象となる混成軌道を識別する識別子と該
第一の原子と該第二の原子を形成するそれぞれの原子の
間に確立される結合の結合次数を示す識別子からなる結
合データを含む原子部品情報を保持する手段（データベ
ース１６）、(3) 前記表示手段に表示された第一の位置
にある前記第一の原子を選択し、選択した該第一の原子
を第二の位置に移動する入力手段(マウス１３）、(4)
前記第一の原子と前記第二の原子とを結合して新たな分
子構造を生成する場合において、該第一の原子と該第二
の原子の互いに結合すべき混成軌道が指定されたとき、
前記第一の原子の中心座標と、前記第二の原子の結合対
象となる混成軌道の結合末端の座標と、前記第二の原子
の中心座標とが一直線上に並ぶように第一の分子構造と
第二の分子構造を結合し、新たな分子構造を構成する各
原子の部品情報を作成する処理手段(処理部１１）を備
えている。
【００１２】
【作用】分子内の各原子に関する情報を、原子データＡ
ＴＭと結合データＡＣＮを統合した１つの部品情報ＡＲ
Ｔで表現すると共に、原子データＡＴＭに原子の混成軌
道数ａ4、中心原子座標ａ3、各混成軌道の結合末端の座
標ａ5を含ませ、結合データＡＣＮに混成軌道毎に、結
合相手先の原子番号ｂ1と、混成軌道の番号ｂ2と、結合
次数ｂ3を含ませ、これら各原子毎の部品情報ＡＲＴの
集合体により分子構造を定義する。このように、分子情
報を構成したから、例えば第１分子構造の第１原子と、
第２分子構造の第２原子とを結合して新たな分子構造を
生成するには、第１、第２の分子構造２１，２２ｂをそ
れぞれディスプレイ装置１２のメインウインド１２ａと
サブウインド１２ｂに表示し、該第１、第２の原子の互
いに結合すべき混成軌道（結合軸）２１ａ，22b-1の末
端位置をマウスカ−ソルＭＣＳで指定すれば、自動的に
新たな分子構造の分子情報が作成されて新規分子構造が
定義される。すなわち、処理部１１は第１の原子の中心
座標と、第１の原子の結合混成軌道末端の座標と、第２
の原子の結合混成軌道末端の座標と、第２の原子の中心
座標とが一直線上に並ぶように第１の分子構造に第２の
分子構造を結合し、自動的に新たな分子構造の分子情報
を作成して新規分子構造を定義する。そして、この分子
情報には、従来の分子構造の付加において必要であった
結合角の情報は含まれており、又、結合長は第１、第２
分子構造の対応する軌道の結合先端の長さの単純な和に
帰結される。
ＴＭと結合データＡＣＮを統合した１つの部品情報ＡＲ
Ｔで表現すると共に、原子データＡＴＭに原子の混成軌
道数ａ4、中心原子座標ａ3、各混成軌道の結合末端の座
標ａ5を含ませ、結合データＡＣＮに混成軌道毎に、結
合相手先の原子番号ｂ1と、混成軌道の番号ｂ2と、結合
次数ｂ3を含ませ、これら各原子毎の部品情報ＡＲＴの
集合体により分子構造を定義する。このように、分子情
報を構成したから、例えば第１分子構造の第１原子と、
第２分子構造の第２原子とを結合して新たな分子構造を
生成するには、第１、第２の分子構造２１，２２ｂをそ
れぞれディスプレイ装置１２のメインウインド１２ａと
サブウインド１２ｂに表示し、該第１、第２の原子の互
いに結合すべき混成軌道（結合軸）２１ａ，22b-1の末
端位置をマウスカ−ソルＭＣＳで指定すれば、自動的に
新たな分子構造の分子情報が作成されて新規分子構造が
定義される。すなわち、処理部１１は第１の原子の中心
座標と、第１の原子の結合混成軌道末端の座標と、第２
の原子の結合混成軌道末端の座標と、第２の原子の中心
座標とが一直線上に並ぶように第１の分子構造に第２の
分子構造を結合し、自動的に新たな分子構造の分子情報
を作成して新規分子構造を定義する。そして、この分子
情報には、従来の分子構造の付加において必要であった
結合角の情報は含まれており、又、結合長は第１、第２
分子構造の対応する軌道の結合先端の長さの単純な和に
帰結される。
【００１３】分子構造を変更するには、回転中心軸とな
る結合軸を指定して回転操作すれば、処理部１１は結合
軸で結ばれる２つの分子構造部分の一方を回転し、回転
角度相当分だけ分子情報を自動的に変更する。この結
果、簡単な操作で、効率良く新規分子構造を生成した
り、変更することができる。特に、結合角やねじれ角が
ユ−ザが希望する角度でない場合には、変更操作により
簡単に所望の結合角やねじれ角に変更できるため、ユ−
ザの意図する分子構造を高精度で定義できる。
る結合軸を指定して回転操作すれば、処理部１１は結合
軸で結ばれる２つの分子構造部分の一方を回転し、回転
角度相当分だけ分子情報を自動的に変更する。この結
果、簡単な操作で、効率良く新規分子構造を生成した
り、変更することができる。特に、結合角やねじれ角が
ユ−ザが希望する角度でない場合には、変更操作により
簡単に所望の結合角やねじれ角に変更できるため、ユ−
ザの意図する分子構造を高精度で定義できる。
【００１４】更に、部品情報の原子データに価数を含ま
せておけば、結合原子の価数、結合原子における角混成
軌道の結合次数等を考慮して自動的に結合混成軌道の結
合次数を演算でき、ますます簡単な操作で新規分子構造
を生成することができる。
せておけば、結合原子の価数、結合原子における角混成
軌道の結合次数等を考慮して自動的に結合混成軌道の結
合次数を演算でき、ますます簡単な操作で新規分子構造
を生成することができる。
【００１５】
【実施例】本発明の概略 原子は単独で存在する場合と、他の原子と結合して分子
を形成する場合で異なった性質を示し、安定な分子にお
いて、それを構成する原子の構造は、一般にその化学結
合の形態によって元素種毎に決まった特定の規則を有す
る。そこで、原子価結合論的立場に立ち、分子内の原子
の情報を原子データと結合データを複合した１つの部品
情報として表現し、これらの部品情報の集合体として分
子を定義する。
を形成する場合で異なった性質を示し、安定な分子にお
いて、それを構成する原子の構造は、一般にその化学結
合の形態によって元素種毎に決まった特定の規則を有す
る。そこで、原子価結合論的立場に立ち、分子内の原子
の情報を原子データと結合データを複合した１つの部品
情報として表現し、これらの部品情報の集合体として分
子を定義する。
【００１６】例えば、鎖状飽和炭化水素において、ｓｐ
３混成軌道を形成する炭素は、互いに約１０９．５0の
角度をなす単結合４本を持ち、隣接する原子と共に４面
体型（tetrahedral)構造を形成する。そこで、このｓｐ
３型炭素を元素種及び混成タイプから決定した原子タイ
プ、中心原子座標、中心原子から延びる４つの混成軌道
の結合先端の座標、各軌道毎に定義された他の原子の軌
道との結合情報等のデータを有する１つの部品情報とし
て表現する。このように記述することによって、原子情
報は立体構造上の単なる点座標ではなく、潜在的な化学
結合の形態を含んだデータとして定義できる。更に、こ
の独立した部品情報の集合により分子を表現することに
よって分子設計支援システムにおける分子構造操作時の
内部処理の効率化と、精度の向上を図ることができる。
３混成軌道を形成する炭素は、互いに約１０９．５0の
角度をなす単結合４本を持ち、隣接する原子と共に４面
体型（tetrahedral)構造を形成する。そこで、このｓｐ
３型炭素を元素種及び混成タイプから決定した原子タイ
プ、中心原子座標、中心原子から延びる４つの混成軌道
の結合先端の座標、各軌道毎に定義された他の原子の軌
道との結合情報等のデータを有する１つの部品情報とし
て表現する。このように記述することによって、原子情
報は立体構造上の単なる点座標ではなく、潜在的な化学
結合の形態を含んだデータとして定義できる。更に、こ
の独立した部品情報の集合により分子を表現することに
よって分子設計支援システムにおける分子構造操作時の
内部処理の効率化と、精度の向上を図ることができる。
【００１７】かかる分子構造の定義方法に基づいたデー
タを利用すると、分子構造の組立において従来システム
で必要であった、結合情報テ−ブルの検索など他のデー
タの参照や特別な判断処理の付加が不要となり、単純な
処理によって構造情報を生成することができる。例え
ば、従来の分子構造の付加において必要であった結合角
の情報は既にこの部品情報の中に含まれており、又結合
長は２つの部品の対応する軌道の結合先端の長さの単純
な和に帰結される。
タを利用すると、分子構造の組立において従来システム
で必要であった、結合情報テ−ブルの検索など他のデー
タの参照や特別な判断処理の付加が不要となり、単純な
処理によって構造情報を生成することができる。例え
ば、従来の分子構造の付加において必要であった結合角
の情報は既にこの部品情報の中に含まれており、又結合
長は２つの部品の対応する軌道の結合先端の長さの単純
な和に帰結される。
【００１８】更に、潜在的な化学結合の形態を含んだデ
ータとして軌道の先端の座標が定義されているため、こ
れらを画面上に表示することによってユ−ザが直接的に
分子操作対象部位を指定することができる。この機能の
実現により分子組立時の座標の任意性を排除し、立体異
性が問題となる構造組立等も容易に可能となる。又、原
子相互の結合関係が個々の部品情報の中に内在されるた
め、結合次数等の結合情報の局所的な取扱が可能とな
る。
ータとして軌道の先端の座標が定義されているため、こ
れらを画面上に表示することによってユ−ザが直接的に
分子操作対象部位を指定することができる。この機能の
実現により分子組立時の座標の任意性を排除し、立体異
性が問題となる構造組立等も容易に可能となる。又、原
子相互の結合関係が個々の部品情報の中に内在されるた
め、結合次数等の結合情報の局所的な取扱が可能とな
る。
【００１９】全体の構成 図２は本発明の分子設計支援システムの実施例構成図で
あり、図１と同一部分には同一符号を付している。１１
は分子設計支援システムの処理部であり、プロセッサ
（ＣＰＵ）１１ａ、各種プログラムを記憶するプログラ
ムメモリ（ＲＯＭ）１１ｂ、処理結果等を記憶するデー
タメモリ（ＲＡＭ）１１ｃを有している。１２はグラフ
ィックディスプレイ装置であり、そのディスプレイ画面
には、新規作成あるいは変更の対象となっている分子構
造２１を表示する作業用のメインウインドウ１２ａと、
参照分子構造２２ａ，２２ｂ，２２ｃ・・・を表示する
サブウインドウ１２ｂと、各種メニュ−コマンド等を表
示するメニュ−ウインドウ１２ｃが設けられている。
あり、図１と同一部分には同一符号を付している。１１
は分子設計支援システムの処理部であり、プロセッサ
（ＣＰＵ）１１ａ、各種プログラムを記憶するプログラ
ムメモリ（ＲＯＭ）１１ｂ、処理結果等を記憶するデー
タメモリ（ＲＡＭ）１１ｃを有している。１２はグラフ
ィックディスプレイ装置であり、そのディスプレイ画面
には、新規作成あるいは変更の対象となっている分子構
造２１を表示する作業用のメインウインドウ１２ａと、
参照分子構造２２ａ，２２ｂ，２２ｃ・・・を表示する
サブウインドウ１２ｂと、各種メニュ−コマンド等を表
示するメニュ−ウインドウ１２ｃが設けられている。
【００２０】１３は各種操作を行うマウス、１４はマウ
ス入力制御部である。マウス１３には各種スイッチ１３
ａ，１３ｂ，１３ｃ、トラックボール（図示せず）が設
けられ、トラックボールを回転することによりスクリ−
ン上のマウスカ−ソルＭＣＳを移動したり、第１スイッ
チ１３ａをオンすることによりカ−ソル指示ポイントの
座標値やメニュ−コマンドを入力したり、第２スイッチ
１３ｂをオンしたままカ−ソルを移動させることにより
分子構造図形を移動（ドラッギング）するようになって
いる。マウス入力制御部１４は、マウス１３のトラック
ボールの回転に応じてマウスカ−ソルＭＣＳを各軸方向
に移動させる移動信号を発生すると共に、各スイッチの
オン・オフ状態を出力する。１５はキ−ボ−ド、１６は
ハ−ドデイスク等で構成されたデータベ−スであり、基
本分子構造や作成済みの分子構造の分子情報をファイル
として記憶する。
ス入力制御部である。マウス１３には各種スイッチ１３
ａ，１３ｂ，１３ｃ、トラックボール（図示せず）が設
けられ、トラックボールを回転することによりスクリ−
ン上のマウスカ−ソルＭＣＳを移動したり、第１スイッ
チ１３ａをオンすることによりカ−ソル指示ポイントの
座標値やメニュ−コマンドを入力したり、第２スイッチ
１３ｂをオンしたままカ−ソルを移動させることにより
分子構造図形を移動（ドラッギング）するようになって
いる。マウス入力制御部１４は、マウス１３のトラック
ボールの回転に応じてマウスカ−ソルＭＣＳを各軸方向
に移動させる移動信号を発生すると共に、各スイッチの
オン・オフ状態を出力する。１５はキ−ボ−ド、１６は
ハ−ドデイスク等で構成されたデータベ−スであり、基
本分子構造や作成済みの分子構造の分子情報をファイル
として記憶する。
【００２１】分子情報 分子構造を定義する分子情報ＭＬＤは、分子名ＭＬＮ
Ｍ、分子を構成する原子の数ＡＴＮＯ．、分子内の各原
子に関する部品情報ＡＲＴの集合体であり、各部品情報
ＡＲＴは原子データＡＴＭと結合データＡＣＮを含んで
いる。
Ｍ、分子を構成する原子の数ＡＴＮＯ．、分子内の各原
子に関する部品情報ＡＲＴの集合体であり、各部品情報
ＡＲＴは原子データＡＴＭと結合データＡＣＮを含んで
いる。
【００２２】原子データＡＴＭには、(1) 原子の識別デ
ータａ1、(2) 原子の価数ａ2、(3)中心原子座標値ａ3、
(4) 原子の混成軌道数ａ4、(5) 各混成軌道の結合末端
の座標値ａ5が含まれている。又、結合データＡＣＮに
は、各混成軌道毎に、結合相手先の(1)原子番号ｂ1と、
(2)混成軌道の番号ｂ2と、(3)結合次数ｂ3が含まれてい
る。
ータａ1、(2) 原子の価数ａ2、(3)中心原子座標値ａ3、
(4) 原子の混成軌道数ａ4、(5) 各混成軌道の結合末端
の座標値ａ5が含まれている。又、結合データＡＣＮに
は、各混成軌道毎に、結合相手先の(1)原子番号ｂ1と、
(2)混成軌道の番号ｂ2と、(3)結合次数ｂ3が含まれてい
る。
【００２３】図３は酢酸ＣＨ３ＣＯＯＨ（図９(a)参照)
の分子情報ＭＬＤである。又、図４は該酢酸の分子情報
をハ−フベクタ形式で表現した分子構造図であり、元素
記号（Ｃ，Ｏ，Ｈ）のサフィックス番号は原子番号を示
し、各原子の混成軌道（ハ−フベクタ）に付した番号は
混成軌道の番号示す。
の分子情報ＭＬＤである。又、図４は該酢酸の分子情報
をハ−フベクタ形式で表現した分子構造図であり、元素
記号（Ｃ，Ｏ，Ｈ）のサフィックス番号は原子番号を示
し、各原子の混成軌道（ハ−フベクタ）に付した番号は
混成軌道の番号示す。
【００２４】酢酸骨格は、メチル基を構成するｓｐ３形
炭素Ｃ1と、カルボキシル基を構成するｓｐ２形炭素Ｃ2
と、カルボニルｓｐ２形酸素Ｏ3と、アルコ−ル（エ−
テル）ｓｐ３形酸素Ｏ4と、４つの水素Ｈ5〜Ｈ8の総計
８個の原子部品の集合体である。従って、酢酸の原子数
ＡＴＮＯ．は８であり、各原子に対して部品情報ＡＴＭ
1〜ＡＴＭ8が作成されて、酢酸の分子情報ＭＬＤが定義
されている。
炭素Ｃ1と、カルボキシル基を構成するｓｐ２形炭素Ｃ2
と、カルボニルｓｐ２形酸素Ｏ3と、アルコ−ル（エ−
テル）ｓｐ３形酸素Ｏ4と、４つの水素Ｈ5〜Ｈ8の総計
８個の原子部品の集合体である。従って、酢酸の原子数
ＡＴＮＯ．は８であり、各原子に対して部品情報ＡＴＭ
1〜ＡＴＭ8が作成されて、酢酸の分子情報ＭＬＤが定義
されている。
【００２５】ＡＴＭ1はメチル基を構成するｓｐ３形炭
素Ｃ1の部品情報であり、原子の識別データ（Ｃ−ｓｐ
２）ａ1、原子の価数（＝４）ａ2、中心原子座標値(0.0
00000,0.00000, 0.000000)ａ3、原子の混成軌道数（＝
３）ａ4、３つの各混成軌道の結合末端の座標値ａ5より
なる原子データと、第１〜第３の各混成軌道が結合する
相手先の原子番号ｂ1と、混成軌道の番号ｂ2と、結合次
数ｂ3よりなる結合データを含んでいる。
素Ｃ1の部品情報であり、原子の識別データ（Ｃ−ｓｐ
２）ａ1、原子の価数（＝４）ａ2、中心原子座標値(0.0
00000,0.00000, 0.000000)ａ3、原子の混成軌道数（＝
３）ａ4、３つの各混成軌道の結合末端の座標値ａ5より
なる原子データと、第１〜第３の各混成軌道が結合する
相手先の原子番号ｂ1と、混成軌道の番号ｂ2と、結合次
数ｂ3よりなる結合データを含んでいる。
【００２６】結合について説明すると、ｓｐ２型炭素Ｃ
1の１番目の混成軌道は原子番号２の原子（ｓｐ３型炭
素Ｃ2）の１番目の混成軌道と結合次数１で結合し、２
番目の混成軌道は原子番号３の原子（カルボニルｓｐ２
形酸素Ｏ3）の１番目の混成軌道と結合次数２で結合
し、３番目の混成軌道は原子番号４の原子（アルコ−ル
ｓｐ３形酸素Ｏ4）の１番目の混成軌道と結合次数１で
結合していることが示されている。もちろん、データは
１対１に対応しており、相手側からたどっても同様の結
果が得られる。
1の１番目の混成軌道は原子番号２の原子（ｓｐ３型炭
素Ｃ2）の１番目の混成軌道と結合次数１で結合し、２
番目の混成軌道は原子番号３の原子（カルボニルｓｐ２
形酸素Ｏ3）の１番目の混成軌道と結合次数２で結合
し、３番目の混成軌道は原子番号４の原子（アルコ−ル
ｓｐ３形酸素Ｏ4）の１番目の混成軌道と結合次数１で
結合していることが示されている。もちろん、データは
１対１に対応しており、相手側からたどっても同様の結
果が得られる。
【００２７】尚、カルボキシル基を構成するｓｐ２形炭
素Ｃ2の部品情報ＡＴＭ2、カルボニルｓｐ２形酸素Ｏ3
の部品情報ＡＴＭ3、アルコ−ルｓｐ３形酸素Ｏ4の部品
情報ＡＴＭ、４つの水素Ｈ5〜Ｈ8の部品情報ＡＴＭ5〜
ＡＴＭ8も同様のデータを有している。
素Ｃ2の部品情報ＡＴＭ2、カルボニルｓｐ２形酸素Ｏ3
の部品情報ＡＴＭ3、アルコ−ルｓｐ３形酸素Ｏ4の部品
情報ＡＴＭ、４つの水素Ｈ5〜Ｈ8の部品情報ＡＴＭ5〜
ＡＴＭ8も同様のデータを有している。
【００２８】新規分子構造の生成処理 図５は本発明に係わる分子設計支援システムによる新規
分子構造の生成処理の流れ図であり、ホルムアルデヒド
の分子情報を定義する場合について説明する。ホルムア
ルデヒドの分子構造図は図６(a) に示すようになってお
り、図６(b)に示すｓｐ２型炭素Ｃ1と、ｓｐ２型カルボ
ニル酸素Ｏ2と、２個の水素Ｈ3〜Ｈ4の全４個の原子に
よって組立られている。
分子構造の生成処理の流れ図であり、ホルムアルデヒド
の分子情報を定義する場合について説明する。ホルムア
ルデヒドの分子構造図は図６(a) に示すようになってお
り、図６(b)に示すｓｐ２型炭素Ｃ1と、ｓｐ２型カルボ
ニル酸素Ｏ2と、２個の水素Ｈ3〜Ｈ4の全４個の原子に
よって組立られている。
【００２９】図７(a)に示すように、ｓｐ２型炭素Ｃ1の
分子構造２１をハ−フベクタ形式でメインウインドウ１
２ａに表示した状態で、付加分子構造（ｓｐ２型カルボ
ニル酸素Ｏ2，水素Ｈ3〜Ｈ4）２２ａ〜２２ｃをデータ
ベ−ス１６から呼び出してハ−フベクタ形式でサブウイ
ンドウ１２ｂに表示する（ステップ１０１）。尚、サブ
ウインドウ１２ｂには頁めくり操作により所望の付加分
子構造を表示することができる。
分子構造２１をハ−フベクタ形式でメインウインドウ１
２ａに表示した状態で、付加分子構造（ｓｐ２型カルボ
ニル酸素Ｏ2，水素Ｈ3〜Ｈ4）２２ａ〜２２ｃをデータ
ベ−ス１６から呼び出してハ−フベクタ形式でサブウイ
ンドウ１２ｂに表示する（ステップ１０１）。尚、サブ
ウインドウ１２ｂには頁めくり操作により所望の付加分
子構造を表示することができる。
【００３０】かかる状態で、ｓｐ２型炭素Ｃ1の分子構
造２１に付加すべきｓｐ２型カルボニル酸素Ｏ2の分子
構造（サブウインドウに表示されている）の混成軌道22
b-1の末端をマウスカ−ソルＭＣＳでヒットすると共
に、マウス１３の第２スイッチ１３ｂを押圧（オン）す
る（ステップ１０２）。
造２１に付加すべきｓｐ２型カルボニル酸素Ｏ2の分子
構造（サブウインドウに表示されている）の混成軌道22
b-1の末端をマウスカ−ソルＭＣＳでヒットすると共
に、マウス１３の第２スイッチ１３ｂを押圧（オン）す
る（ステップ１０２）。
【００３１】ついで、第２スイッチをオンしたまま、マ
ウスカ−ソルＭＣＳを移動させてｓｐ２型カルボニル酸
素Ｏ2の分子構造図を移動させると共に（ドラッギン
グ）、マウスカ−ソルＭＣＳをメインウインドウ１２ａ
に表示されているｓｐ２型炭素Ｃ1の結合したい混成軌
道２１ａの末端に位置決めする。これにより、ｓｐ２型
カルボニル酸素Ｏ2の混成軌道22b-1の末端がｓｐ２型炭
素Ｃ1の混成軌道２１ａの末端に重なる（ステップ１０
３）。
ウスカ−ソルＭＣＳを移動させてｓｐ２型カルボニル酸
素Ｏ2の分子構造図を移動させると共に（ドラッギン
グ）、マウスカ−ソルＭＣＳをメインウインドウ１２ａ
に表示されているｓｐ２型炭素Ｃ1の結合したい混成軌
道２１ａの末端に位置決めする。これにより、ｓｐ２型
カルボニル酸素Ｏ2の混成軌道22b-1の末端がｓｐ２型炭
素Ｃ1の混成軌道２１ａの末端に重なる（ステップ１０
３）。
【００３２】マウスカ−ソルを位置決め後、マウス１３
の第２スイッチ１３ｂの押圧を解除すると（ステップ１
０４）、処理部１１はｓｐ２型炭素Ｃ1の中心座標と、
混成軌道２１ａの末端の座標と、混成軌道22b-1の末端
の座標と、ｓｐ２型カルボニル酸素Ｏ2の中心座標とが
一直線上に並ぶように結合し、すなわち、指定された２
つの末端同士が向き合って混成軌道２１ａと混成軌道22
b-1とが一直線となるように(anti型結合）２つの分子構
造を結合し、しかる後、付加されたｓｐ２型カルボニル
酸素Ｏ2の中心原子座標、各混成軌道末端の座標を計算
し、結合状態を図７(b)に示すようにメインウインドウ
１２ａに表示する（ステップ１０５、１０６）。
の第２スイッチ１３ｂの押圧を解除すると（ステップ１
０４）、処理部１１はｓｐ２型炭素Ｃ1の中心座標と、
混成軌道２１ａの末端の座標と、混成軌道22b-1の末端
の座標と、ｓｐ２型カルボニル酸素Ｏ2の中心座標とが
一直線上に並ぶように結合し、すなわち、指定された２
つの末端同士が向き合って混成軌道２１ａと混成軌道22
b-1とが一直線となるように(anti型結合）２つの分子構
造を結合し、しかる後、付加されたｓｐ２型カルボニル
酸素Ｏ2の中心原子座標、各混成軌道末端の座標を計算
し、結合状態を図７(b)に示すようにメインウインドウ
１２ａに表示する（ステップ１０５、１０６）。
【００３３】ついで、ユ−ザは付加した分子構造（ｓｐ
２型カルボニル酸素Ｏ2）を結合混成軌道（結合軸）22b
-1を回転中心軸として回転する必要があるか判断し(ス
テップ１０７）、回転する必要があれば、回転操作を行
なって付加分子構造を回転し（ステップ１０８）、回転
角（ねじれ角）θに基づいて付加分子構造の原子中心座
標、混成軌道末端の座標を修正する（ステップ１０
９）。尚、設例の場合は、回転しても分子構造の性質は
変化しないため、ステップ１０７において「ＮＯ」とな
る。そして、得られた位置データを用いて、新規分子構
造を形成する各原子Ｃ1，Ｏ2の原子データを作成する
（ステップ１１０）。
２型カルボニル酸素Ｏ2）を結合混成軌道（結合軸）22b
-1を回転中心軸として回転する必要があるか判断し(ス
テップ１０７）、回転する必要があれば、回転操作を行
なって付加分子構造を回転し（ステップ１０８）、回転
角（ねじれ角）θに基づいて付加分子構造の原子中心座
標、混成軌道末端の座標を修正する（ステップ１０
９）。尚、設例の場合は、回転しても分子構造の性質は
変化しないため、ステップ１０７において「ＮＯ」とな
る。そして、得られた位置データを用いて、新規分子構
造を形成する各原子Ｃ1，Ｏ2の原子データを作成する
（ステップ１１０）。
【００３４】原子データの作成が終了すれば、結合した
２つの原子Ｃ1，Ｏ2の価数、及該原子Ｃ1，Ｏ2の結合混
成軌道２１ａ，22b-1以外の他の混成軌道の結合次数を
考慮して、結合混成軌道の結合次数を決定する(ステッ
プ１１１）。この場合、Ｏ2の混成軌道数は１で価数は
２であるから、結合次数は２となる。
２つの原子Ｃ1，Ｏ2の価数、及該原子Ｃ1，Ｏ2の結合混
成軌道２１ａ，22b-1以外の他の混成軌道の結合次数を
考慮して、結合混成軌道の結合次数を決定する(ステッ
プ１１１）。この場合、Ｏ2の混成軌道数は１で価数は
２であるから、結合次数は２となる。
【００３５】結合次数が求まれば、結合混成軌道２１
ａ，22b-1の結合データを作成し（ステップ１１２）、
ｓｐ２型炭素Ｃ1の分子構造２１にｓｐ２型カルボニル
酸素Ｏ2の分子構造を付加する処理は終了する。
ａ，22b-1の結合データを作成し（ステップ１１２）、
ｓｐ２型炭素Ｃ1の分子構造２１にｓｐ２型カルボニル
酸素Ｏ2の分子構造を付加する処理は終了する。
【００３６】図８は分子情報の変化状態の説明図であ
り、図８(a)はｓｐ２型炭素Ｃ1の分子情報、図８(b)は
ｓｐ２型カルボニル酸素Ｏ2が付加された後の分子情報
で、結合データｂ1〜ｂ3において「０００」は該当混成
軌道に他の原子が結合していない状態を意味する。
り、図８(a)はｓｐ２型炭素Ｃ1の分子情報、図８(b)は
ｓｐ２型カルボニル酸素Ｏ2が付加された後の分子情報
で、結合データｂ1〜ｂ3において「０００」は該当混成
軌道に他の原子が結合していない状態を意味する。
【００３７】以後、前記作成された新たな分子構造に、
同様の処理により２つの水素を順次付加すれば（図６
(c)参照）、最終的にホルムアルデヒドの分子情報が作
成され（図８(c)参照）、この分子情報によりホルムア
ルデヒドの分子構造が定義される。
同様の処理により２つの水素を順次付加すれば（図６
(c)参照）、最終的にホルムアルデヒドの分子情報が作
成され（図８(c)参照）、この分子情報によりホルムア
ルデヒドの分子構造が定義される。
【００３８】以上要約すれば、第１分子構造の第１原子
と、第２分子構造の第２原子とを結合して新たな分子構
造を生成するには、(1) 第１、第２の分子構造をそれぞ
れディスプレイ装置１２のメインウインド１２ａとサブ
ウインド１２ｂに表示し、(2)該第１、第２の原子の互
いに結合すべき混成軌道（結合軸）の末端をマウスカ−
ソルＭＣＳでドラッギング操作で重ねあわせれば、(3)
各結合軸が一直線となるように自動的に新たな分子構造
の分子情報が作成されて新規分子構造が定義される。
又、(4) 回転操作により、付加された第２分子構造を結
合軸を中心に回転して所望の分子構造を定義する分子情
報を作成することができる。
と、第２分子構造の第２原子とを結合して新たな分子構
造を生成するには、(1) 第１、第２の分子構造をそれぞ
れディスプレイ装置１２のメインウインド１２ａとサブ
ウインド１２ｂに表示し、(2)該第１、第２の原子の互
いに結合すべき混成軌道（結合軸）の末端をマウスカ−
ソルＭＣＳでドラッギング操作で重ねあわせれば、(3)
各結合軸が一直線となるように自動的に新たな分子構造
の分子情報が作成されて新規分子構造が定義される。
又、(4) 回転操作により、付加された第２分子構造を結
合軸を中心に回転して所望の分子構造を定義する分子情
報を作成することができる。
【００３９】分子構造の変更 分子構造を変更するには、メインウインドウ１２ａに表
示されている分子構造において、回転中心軸となる混成
軌道（結合軸）をマウスカ−ソルで指定すると共に、結
合軸で結ばれる２つの分子構造部分の一方を指定し、し
かる後、マウスを用いて回転操作することにより、指定
した分子構造部分を指定結合軸の周りに回転する。そし
て、回転角度相当分だけ回転した分子構造部分内の各原
子の位置情報及び軌道末端の位置座標を修正して、分子
構造を変更する。以上、本発明を実施例により説明した
が、本発明は請求の範囲に記載した本発明の主旨に従い
種々の変形が可能であり、本発明はこれらを排除するも
のではない。
示されている分子構造において、回転中心軸となる混成
軌道（結合軸）をマウスカ−ソルで指定すると共に、結
合軸で結ばれる２つの分子構造部分の一方を指定し、し
かる後、マウスを用いて回転操作することにより、指定
した分子構造部分を指定結合軸の周りに回転する。そし
て、回転角度相当分だけ回転した分子構造部分内の各原
子の位置情報及び軌道末端の位置座標を修正して、分子
構造を変更する。以上、本発明を実施例により説明した
が、本発明は請求の範囲に記載した本発明の主旨に従い
種々の変形が可能であり、本発明はこれらを排除するも
のではない。
【００４０】
【発明の効果】以上本発明の分子設計支援システムによ
れば、(1) 分子を構成する第一の原子の種類を識別する
識別子と該第一の原子の中心座標と該第一の原子の混成
軌道数と該第一の原子に含まれるそれぞれの混成軌道の
結合末端の位置を表す座標からなる原子データと、該第
一の原子部品と結合される第二の原子の種類を識別する
識別子と該第二の原子の結合対象となる混成軌道を識別
する識別子と該第一の原子と該第二の原子を形成するそ
れぞれの原子の間に確立される結合の結合次数を示す識
別子からなる結合データを含む原子部品情報をデータベ
ースに保持し、(2) 前記第一の原子と前記第二の原子と
を結合して新たな分子構造を生成する場合において、該
第一の原子と該第二の原子の互いに結合すべき混成軌道
が指定されたとき、前記第一の原子の中心座標と、前記
第二の原子の結合対象となる混成軌道の結合末端の座標
と、前記第二の原子の中心座標とが一直線上に並ぶよう
に第一の分子構造と第二の分子構造を結合し、新たな分
子構造を構成する各原子の部品情報を作成するようにし
たから、簡単な操作で、かつ効率良く、新規分子構造を
定義するための分子情報を作成することができる。
れば、(1) 分子を構成する第一の原子の種類を識別する
識別子と該第一の原子の中心座標と該第一の原子の混成
軌道数と該第一の原子に含まれるそれぞれの混成軌道の
結合末端の位置を表す座標からなる原子データと、該第
一の原子部品と結合される第二の原子の種類を識別する
識別子と該第二の原子の結合対象となる混成軌道を識別
する識別子と該第一の原子と該第二の原子を形成するそ
れぞれの原子の間に確立される結合の結合次数を示す識
別子からなる結合データを含む原子部品情報をデータベ
ースに保持し、(2) 前記第一の原子と前記第二の原子と
を結合して新たな分子構造を生成する場合において、該
第一の原子と該第二の原子の互いに結合すべき混成軌道
が指定されたとき、前記第一の原子の中心座標と、前記
第二の原子の結合対象となる混成軌道の結合末端の座標
と、前記第二の原子の中心座標とが一直線上に並ぶよう
に第一の分子構造と第二の分子構造を結合し、新たな分
子構造を構成する各原子の部品情報を作成するようにし
たから、簡単な操作で、かつ効率良く、新規分子構造を
定義するための分子情報を作成することができる。
【００４１】又、本発明によれば、回転中心軸となる結
合軸を指定して回転操作することにより、結合軸で結ば
れる２つの分子構造部分の一方を回転し、回転角度相当
分だけ分子情報を自動的に変更でき、簡単な操作で分子
構造を変更することができ、ユ−ザの意図する分子構造
を高精度で定義できる。
合軸を指定して回転操作することにより、結合軸で結ば
れる２つの分子構造部分の一方を回転し、回転角度相当
分だけ分子情報を自動的に変更でき、簡単な操作で分子
構造を変更することができ、ユ−ザの意図する分子構造
を高精度で定義できる。
【００４２】更に、本発明によれば、部品情報の原子デ
ータに価数を含ませておけば、結合原子の価数や該原子
の混成軌道の結合次数等を考慮して自動的に結合混成軌
道の結合次数を演算でき、ますます簡単な操作で新規分
子構造を生成することができる。又、本発明によれば、
分子構造データの変換処理を効率化し、更には使い易い
分子設計支援システムを提供できる。
ータに価数を含ませておけば、結合原子の価数や該原子
の混成軌道の結合次数等を考慮して自動的に結合混成軌
道の結合次数を演算でき、ますます簡単な操作で新規分
子構造を生成することができる。又、本発明によれば、
分子構造データの変換処理を効率化し、更には使い易い
分子設計支援システムを提供できる。
【図１】本発明の原理説明図である。
【図２】本発明の実施例構成図である。
【図３】本発明に係わる酢酸の分子情報である。
【図４】ハ−フベクタ形式で表現した酢酸の分子構造図
である。
である。
【図５】新規分子構造の生成処理の流れ図である。
【図６】新規分子構造の生成処理説明図である。
【図７】新規分子構造生成時における表示画像説明図で
ある。
ある。
【図８】新規分子構造生成時における分子情報変化説明
図である。
図である。
【図９】従来の分子情報の説明図である。
１１・・分子設計支援システムの処理部 １２・・グラフィックディスプレイ装置 １２ａ・・メインウインドウ １２ｂ・・サブウインドウ １３・・マウス １６・・データベ−ス ＡＲＴ・・部品情報 ＡＴＭ・・原子データ ＡＣＮ・・結合データ ａ3・・中心原子座標 ａ4・・原子の混成軌道数 ａ5・・混成軌道の結合末端の座標 ｂ1・・結合相手先の原子番号 ｂ2・・混成軌道の番号 ｂ3・・結合次数
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (58)調査した分野(Int.Cl.7，ＤＢ名) G06F 17/50 G06F 17/30 ＪＩＣＳＴファイル（ＪＯＩＳ)
Claims (1)
- 【請求項１】 分子構造の生成、変更を行う分子設計支
援システムにおいて、 グラフィカルに分子の構造を表示する表示手段と、 分子を構成する第一の原子の種類を識別する識別子と該
第一の原子の中心座標と該第一の原子の混成軌道数と該
第一の原子に含まれるそれぞれの混成軌道の結合末端の
位置を表す座標からなる原子データと、該第一の原子と
結合される第二の原子の種類を識別する識別子と該第二
の原子の結合対象となる混成軌道を識別する識別子と該
第一の原子と該第二の原子との間に確立される結合の結
合次数を示す識別子からなる結合データを含む一つまた
は複数の原子部品情報から構成される分子情報を保持す
る手段と、 前記表示手段に表示された第一の位置にある前記第一の
原子を選択し、選択した該第一の原子を第二の位置に移
動する入力手段と、 前記第一の原子と前記第二の原子とを結合して新たな分
子構造を生成する場合において、該第一の原子と該第二
の原子の互いに結合すべき混成軌道が指定されたとき、
該第一の原子の中心座標と、該第一の原子の結合対象と
なる混成軌道の結合末端の座標と、該第二の原子の結合
対象となる混成軌道の結合末端の座標と、該第二の原子
の中心座標とが一直線上に並ぶように第一の分子構造と
第二の分子構造を結合し、新たな分子構造を構成する各
原子の部品情報を作成する処理手段とを備えたことを特
徴とする分子設計支援システム。
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP03338878A JP3127026B2 (ja) | 1991-12-20 | 1991-12-20 | 分子設計支援システム |
| US08/446,300 US5572439A (en) | 1991-12-20 | 1996-05-22 | Molecular design support system |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP03338878A JP3127026B2 (ja) | 1991-12-20 | 1991-12-20 | 分子設計支援システム |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH05174110A JPH05174110A (ja) | 1993-07-13 |
| JP3127026B2 true JP3127026B2 (ja) | 2001-01-22 |
Family
ID=18322243
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP03338878A Expired - Fee Related JP3127026B2 (ja) | 1991-12-20 | 1991-12-20 | 分子設計支援システム |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US5572439A (ja) |
| JP (1) | JP3127026B2 (ja) |
Families Citing this family (16)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
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