JP6567494B2 - 4’−チオ−修飾ヌクレオチドを有するリボ核酸及び関連方法 - Google Patents
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Description
インビボで産生され得る治療用タンパク質をコードするmRNAの投与は、治療用タンパク質をコードするDNAの投与、及び治療用タンパク質の直接投与に対する有意な利点を提供し得る。しかしながら、治療用タンパク質をコードする治療用mRNAの開発は医学治療における有望な前進を表す一方で、そのような治療の有用性は、mRNA、特に全長タンパク質をコードするmRNAのインビボでの不良な安定性によって依然として限定され得る。
特に、遺伝子置換治療において使用されるmRNAの不良な安定性は、コードされた治療用タンパク質のインビボでの不十分な、またはより最適でない産生をもたらし得る。治療用タンパク質をコードするmRNAの投与後、mRNAは、例えば、1つ以上のヌクレアーゼへのインビボでの暴露時に、分解を受け得る。リボヌクレアーゼ(例えば、エンドリボヌクレアーゼ及びエキソリボヌクレアーゼ)は、RNAのより小さい成分への分解を触媒することができ、これによりmRNAに治療用タンパク質を産生することをできなくする、ヌクレアーゼ酵素の分類を表す。したがって、ヌクレアーゼ酵素(例えば、リボヌクレアーゼ)は、例えば、合成で、または組み換えで調製されたmRNAの循環半減期を短くすることができる。核酸分解による分解後、mRNAは翻訳されないため、意図された治療用利益を発揮することが阻止され、これはmRNA遺伝子治療の有効性を有意に低減し得る。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される:
(項目1)
コード領域及び任意で1つ以上の非コード領域を有するmRNA分子であって、前記mRNAが、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む少なくとも1つのヌクレオチド残基を含む、前記mRNA分子。
(項目2)
前記アデノシンヌクレオチド残基のうちの少なくとも1%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、項目1に記載の前記mRNA分子。
(項目3)
前記グアノシン残基のうちの少なくとも1%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、項目1または項目2に記載の前記mRNA分子。
(項目4)
前記ウリジン残基のうちの少なくとも1%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、項目1〜3のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目5)
前記シチジン残基のうちの少なくとも1%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、項目1〜4のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目6)
前記ヌクレオチド残基のうちの10%未満が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、項目1〜5のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目7)
前記残基のうちの少なくとも50%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、項目1〜5のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目8)
前記ヌクレオチド残基のうちの少なくとも99%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、項目1〜5または7のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目9)
前記非コード領域がポリAテールを含み、前記ポリAテールが4’−チオ−アデノシン残基を含む、項目1〜8のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目10)
前記ポリAテールが、少なくとも約90ヌクレオチド残基長である、項目9に記載の前記mRNA分子。
(項目11)
前記ポリAテールが、少なくとも約500ヌクレオチド残基長である、項目9または項目10に記載の前記mRNA分子。
(項目12)
前記mRNAが、少なくとも1つの非標準ヌクレオチド残基を更に含む、項目1〜11のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目13)
前記非標準ヌクレオチド残基が、5−メチル−シチジン、プソイドウリジン、及び2−チオ−ウリジンのうちの1つ以上から選択される、項目12に記載の前記mRNA分子。
(項目14)
前記1つ以上の非標準ヌクレオシド残基が、4’−チオ−フラノースを含むように更に修飾される、項目13に記載の前記mRNA分子。
(項目15)
前記分子が、少なくとも200個のヌクレオチド残基を含む、項目1〜14のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目16)
前記分子が、少なくとも5000個のヌクレオチド残基を含む、項目1〜15のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目17)
前記コード領域が、治療用タンパク質をコードする、項目1〜16のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
(項目18)
前記治療用タンパク質が、エリスロポエチン、ヒト成長ホルモン、嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(CFTR)、インスリン、アルファ−ガラクトシダーゼA、アルファ−L−イズロニダーゼ、イズロネート−2−スルファターゼ、N−アセチルグルコサミン−1−リン酸トランスフェラーゼ、N−アセチルグルコサミニダーゼ、アルファ−グルコサミニドアセチルトランスフェラーゼ、N−アセチルグルコサミン6−スルファターゼ、N−アセチルガラクトサミン−4−スルファターゼ、ベータ−グルコシダーゼ、ガラクトース−6−硫酸スルファターゼ、ベータ−ガラクトシダーゼ、ベータ−グルクロニダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、ヘパランスルファミダーゼ、ヒアルロニダーゼ、ガラクトセレブロシダーゼ、オルニチントランスカルバミラーゼ(OTC)、カルバモイル−リン酸シンテターゼ1(CPS1)、アルギニノコハク酸シンテターゼ(ASS1)、アルギニノコハク酸リアーゼ(ASL)、及びアルギナーゼ1(ARG1)、グルコース−6−ホスファターゼ、グルコース−6−リン酸トランスロカーゼ、グリコーゲン脱分枝酵素、リソソームアルファ−グルコシダーゼ、1,4−アルファ−グルカン分枝酵素、グリコーゲンホスホリラーゼ、ホスホフルクトキナーゼ、肝臓ホスホリラーゼ、GLUT−2、UDPグリコーゲンシンターゼ、アルファ−L−イズロニダーゼ、イズロネート硫酸シルファターゼ、ヘパラン硫酸スルファミダーゼ、アルファ−N−アセチルグルコースアミダーゼ、アルファ−グルコサミニド−N−アセチルトランスフェラーゼ、N−アセチルグルコサミン−6−硫酸スルファターゼ、アポリポタンパク質E、低密度リポタンパク質受容体(LDLR)、第VIII因子、第IX因子、脊髄運動ニューロン1(SMN1)、フェニルアラニンヒドロキシラーゼ、プロピオニル−CoAカルボキシラーゼ、ポルフォビリノーゲンデアミナーゼ、ペチルマロニル(pethylmalonyl)−CoAムターゼ、尿酸オキシダーゼ、C1エステラーゼ阻害剤、及び酸性アルファ−グルコシダーゼから選択される、項目17に記載の前記mRNA分子。
(項目19)
項目1〜18のいずれか一項に記載の少なくとも1つのmRNA分子及び担体を含む、組成物。
(項目20)
前記担体が、脂質を含む、項目19に記載の前記組成物。
(項目21)
前記mRNAが、脂質ナノ粒子内に被包される、項目20に記載の前記組成物。
(項目22)
前記担体が、XTC(2,2−ジリノレイ1−4−ジメチルアミノエチル−[1,3]−ジオキソラン)、MC3(((6Z,9Z,28Z,31Z)−ヘプタトリアコンタ−6,9,28,31−テトラエン−19−イル4−(ジメチルアミノ)ブタン酸)、ALNY−100((3aR,5s,6aS)−N,N−ジメチル−2,2−ジ((9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエニル)テトラヒドロ−3aH−シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール−5−アミン))、NC98−5(4,7,13−トリス(3−オキソ−3−(ウンデシルアミノ)プロピル)−N1,N16−ジウンデシル−4,7,10,13−テトラアザヘキサデカン−1,16−ジアミド)、DODAP(1,2−ジオレイル−3−ジメチルアンモニウムプロパン)、HGT4003、ICE、HGT5000、シス、またはトランスHGT5001、DOTAP(1,2−ジオレイル−3−トリメチルアンモニウムプロパン)、DOTMA(1,2−ジ−O−オクタデセニル−3−トリメチルアンモニウムプロパン)、DLinDMA、DLiN−KC2−DMA、及びC12−200から選択される1つ以上の陽イオン性脂質を含む脂質ナノ粒子である、項目19〜21のいずれか一項に記載の前記組成物。
(項目23)
前記脂質ナノ粒子が、DSPC(1,2−ジステアロイル−sn−グリセロ−3−ホスホコリン)、DPPC(1,2−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−ホスホコリン)、DOPE(1,2−ジオレイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン)、DPPE(1,2−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン)、DMPE(1,2−ジミリストイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン)、DOPG(,2−ジオレイル−sn−グリセロ−3−ホスホ−(1’−rac−グリセロール))、及びコレステロールから選択される1つ以上のヘルパー脂質を含む、項目21または項目22に記載の前記組成物。
(項目24)
前記脂質ナノ粒子が、ペグ化脂質を含む、項目21〜23のいずれか一項に記載の前記組成物。
(項目25)
前記脂質ナノ粒子が、1つ以上の陽イオン性脂質、1つ以上のヘルパー脂質、及びペグ化脂質を含む、項目21に記載の前記組成物。
(項目26)
前記担体が、ポリマーを含む、項目19に記載の前記組成物。
(項目27)
前記ポリマーが、ポリエチレンイミンである、項目26に記載の前記組成物。
(項目28)
項目1〜18のいずれか一項に記載の前記mRNA、または項目19〜27のいずれか一項に記載の前記組成物を対象に投与することを含む、タンパク質をインビボで産生する方法。
(項目29)
治療用タンパク質のインビボでの発現を誘発することができる薬物の前記製造のための、項目1〜18のいずれか一項の記載のmRNA分子の使用。
である。
C12−200、DOPE、コレステロール、DMG−PEG2K;
DODAP、DOPE、コレステロール、DMG−PEG2K;
HGT5000、DOPE、コレステロール、DMG−PEG2K;
HGT5001、DOPE、コレステロール、DMG−PEG2K;
XTC、DSPC、コレステロール、PEG−DMG;
MC3、DSPC、コレステロール、PEG−DMG;
ALNY−100、DSPC、コレステロール、PEG−DSG。
タンパク質をコードするmRNAを合成する。mRNAは、少なくとも1つの4’−チオ−置換フラノース環を含有する。mRNAは、医薬組成物に製剤化され、対象に投与される。mRNAは、より長い半減期を呈し、4’−チオ−置換フラノース環を含有しない対照mRNAよりも多い量の、mRNAによってコードされたタンパク質の合成もたらし得る。
I−A.メッセンジャーRNA材料
ホタルルシフェラーゼ(FFL)、ヒトエリスロポエチン(EPO)、及びヒトアルファ−ガラクトシダーゼ(GLA)を、遺伝子をコードするプラスミドDNA鋳型からのインビトロ転写によって合成し、ゲル電気泳動によって決定される、5’キャップ構造(キャップ1)(Fechter and Brownlee,J.Gen.Virology86:1239−1249(2005))及び約200ヌクレオチド長の3’ポリ(A)テールの添加を続ける。各mRNA産生物中に存在する5’及び3’非翻訳領を、それぞれX及びYとして表し、述べるように定義した(下記参照)。
GGGAUCCUACC
CGGGUGGCAUCCCUGUGACCCCUCCCCAGUGCCUCUCCUGGCCCUGGAAGUUGCCACUCCAGUGCCCACCAGCCUUGUCCUAAUAAAAUUAAGUUGCAUC
UUUGAAUU
プロトコルA:C12−200、DOPE、コレステロール、及びDMG−PEG2Kの50mg/mLのエタノール性溶液の一定分量を、混合し、エタノールで3mLの最終容積に希釈する。別個に、GLA mRNAの水性緩衝液(10mMのクエン酸/150mMのNaCl、pH4.5)を1mg/mLのストックから調製する。脂質溶液を、水性mRNA溶液中に急速に注入し、振盪して、20%エタノール中に最終懸濁液を生じさせる。結果として生じるナノ粒子懸濁液を濾過し、1×PBS(pH7.4)で透析濾過し、濃縮し、2〜8℃で保管する。最終濃度=0.85mg/mLのGLA mRNA(被包)。Z平均=81.2nm(偏差(50)=63.2nm;偏差(90)=104nm)。
II−a.メッセンジャーRNA構築物内の修飾塩基の定量化
4’−チオNTP修飾メッセンジャーRNAを、リボヌクレアーゼIまたはヌクレアーゼP1に様々な期間にわたって供し、十分に分解させる。完了時、結果として生じる一リン酸ヌクレオチドを、アルカリホスファターゼで更に分解して、それぞれのヌクレオシドを提供する。ヌクレオシド混合物を、効率的な酵素除去のためにAmiconスピンカラム(30,000MWCO)に適用する。結果として生じるヌクレオシド溶液を、HPLCによって分析し、それぞれの無修飾ヌクレオシドとのピーク面積比較によって定量化する。
4’−チオNTP修飾メッセンジャーRNAを、リボヌクレアーゼIまたはヌクレアーゼP1に様々な期間にわたって供し、ヌクレアーゼ分解に対する抵抗性を評価する。同様に、4’−チオNTP修飾メッセンジャーRNAを、血清(ヌクレアーゼを含有)で様々な期間にわたって処理し、ヌクレアーゼ分解を評価した。指定の時点で、ヌクレアーゼ反応物を阻害剤で急冷し、結果として生じる溶液を、効率的な酵素除去のためにAmiconスピンカラム(30,000MWCO)に適用する。完了時、残余分をアガロースゲルに適用し、mRNA構築物の生存率(サイズ、分解産生物など)について分析する。同一の実験を無修飾mRNA上に実行し、直接比較及び推測が導かれ得る。
インビトロでの研究:4’−チオNTP修飾mRNA及び無修飾mRNAのインビトロでの遺伝子導入を、HEK293T細胞を使用して実行する。1マイクログラムの各mRNA構築物の遺伝子導入を、別個のウェル内でリポフェクタミンを使用して実行する。選択時点(例えば、4時間、8時間、24時間、48時間、72時間など)で細胞を収集し、それぞれのタンパク質産生を分析する。FFL mRNAにおいて、生物発光アッセイによって、細胞可溶化液をルシフェラーゼ産生について分析する。EPO及びGLA mRNA研究において、細胞上清を取得し、ELISAに基づく方法を使用して、EPO及びGLAタンパク質についてそれぞれ分析する。無修飾対4’−チオNTP修飾mRNAの経時的なタンパク質産生の比較が、行われ得る。
III−a.注入プロトコル
全ての研究は、各実験の開始時点で生後約6〜8週間の雄のCD−1マウスを使用して実行する。試料を、30〜200マイクログラムの等価全用量の被包されていない、または被包されたFFL、EPO、またはGLA mRNA(修飾または無修飾)の単一ボーラス尾静脈注入によって導入する。指定された時点でマウスを屠殺し、生理食塩水で灌流する。
各マウスの肝臓及び脾臓を収集し、3つの部分に配分し、分析のために、10%の中性緩衝ホルマリン中で保管するか、またはスナップ冷凍し、−80℃で保管するかのいずれかにする。
全ての動物を、CO2窒息によって用量投与(±5%)の48時間後に安楽死させ、開胸及び末端心臓血液採取を続ける。安楽死させた動物への心臓穿刺によって、血清分離チューブ内に全血(最大取得可能容積)を採取し、室温で少なくとも30分間凝血させ、22℃±5℃で、9300gで10分間遠心分離し、その後血清を抽出する。中間血液採取のために、顔面静脈穿刺または尾切除によって約40〜50μLの全血を採取する。未処理の動物から採取した試料を、研究動物との比較のための基線GLAレベルとして使用する。
EPO ELISA:EPOタンパク質の定量化を、ヒトEPO ELISAキット(Quantikine IVD,R&D Systems、カタログ#Dep−00)について報告される手順に従って実行する。用いられ得る陽性対照は、超高純度、及び組織培養等級の組み換えヒトエリスロポエチンタンパク質(それぞれ、R&D Systems、カタログ#286−EP及び287−TC)からなる。指定された時点で血液試料を採取し、上記に記載するように処理する。Molecular Device Flex Station装置上吸収(450nm)によって、検出を監視する。
ルシフェラーゼアッセイ:Promega Luciferase Assay System(品目#E1500)を使用して、生物発光アッセイを行う。10mLのルシフェラーゼアッセイ緩衝液をルシフェラーゼアッセイ基質に添加することによって、Luciferase Assay Reagentを調製し、ボルテックスによって混合する。約20uLのホモジネート試料を、96ウェルの平板上に充填し、各試料に対して20uLの平板制御を続ける。別個に120uLのLuciferase Assay Reagent(上記に記載するように調製)を96ウェルの平底平板の各ウェルに添加する。その後、Molecular Device Flex Station装置を使用して、各平板を適切なチャンバーに挿入し、発光を測定(相対光単位(RLU)で測定)する。
本実施例は、4’−チオ修飾mRNAのインビボでの効果的な送達及び発現のための、例示的リポソーム製剤を提供する。
本明細書に記載される製剤は、様々な核酸に基づく材料を被包するように設計された、1つ以上の陽イオン性脂質、ヘルパー脂質(例えば、非陽イオン性脂質及び/またはコレステロールに基づく脂質)、ならびにペグ化脂質を用いる、多様な比率の多成分性脂質混合物を含む。陽イオン性脂質は、DOTAP(1,2−ジオレイル−3−トリメチルアンモニウムプロパン)、DODAP(1,2−ジオレイル−3−ジメチルアンモニウムプロパン)、DOTMA(1,2−ジ−O−オクタデセニル−3−トリメチルアンモニウムプロパン)、DLinDMA(Heyes,J.;Palmer,L.;Bremner,K.;MacLachlan,I.“Cationic lipid saturation influences intracellular delivery of encapsulated nucleic acids”J.Contr.Rel.2005,107,276−287)、DLin−KC2−DMA(Semple,S.C.et al.“Rational Design of Cationic Lipids for siRNA Delivery”Nature Biotech.2010,28,172−176),C12−200(Love,K.T.et al.“Lipid−like materials for low−dose in vivo gene silencing”PNAS2010,107,1864−1869)、HGT4003、HGT5000、HGT5001、MC3、cKK−E12(3,6−ビス(4−(ビス(2−ヒドロキシドデシル)アミノ)ブチル)ピペラジン−2,5−ジオン)、ICE、ジアルキルアミノに基づくもの、イミダゾールに基づくもの、グアニジウムに基づくものなどを含み得る(が、排他的ではない)。ヘルパー脂質は、DSPC(1,2−ジステアロイル−sn−グリセロ−3−ホスホコリン)、DPPC(1,2−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−ホスホコリン)、DOPE(1,2−ジオレイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン)、DPPE(1,2−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン)、DMPE(1,2−ジミリストイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン)、DOPG(,2−ジオレイル−sn−グリセロ−3−ホスホ−(1’−rac−グリセロール))、コレステロールなどを含み得る(が、排他的ではない)。ペグ化脂質は、C6〜C20の長さのアルキル鎖(複数可)で脂質に共有的に結合した、最大5kDaの長さのポリ(エチレン)グリコール鎖を含み得る(が、排他的ではない)。
本明細書に記載される更なる製剤は、分枝状ポリエチレンイミン(PEI)(25kDa)(Sigma#408727)、プロタミン、ペグ化プロタミン、PLL、ペグ化PLLなどを含み得る(が、排他的ではない)、様々な帯電したポリマー材料を含む。
ホタルルシフェラーゼ(FFL)、ヒトエリスロポエチン(EPO)、及びヒトアルファ−ガラクトシダーゼ(GLA)を、遺伝子をコードするプラスミドDNA鋳型からのインビトロ転写によって合成し、ゲル電気泳動によって決定される、5’キャップ構造(キャップ1)(Fechter,P.;Brownlee,G.G.“Recognition of mRNA cap structures by viral and cellular proteins”J.Gen.Virology2005,86,1239−1249)及び約200ヌクレオチド長の3’ポリ(A)テールの添加を続けた。各mRNA産生物中に存在する5’及び3’非翻訳領域を、それぞれX及びYとして表し、述べるように定義した(下記参照)。
A.C12−200及びGLA
C12−200、DOPE、コレステロール、及びDMG−PEG2Kの50mg/mLのエタノール性溶液の一定分量を、混合し、エタノールで3mLの最終容積に希釈した。別個に、GLA mRNAの水性緩衝液(10mMのクエン酸/150mMのNaCl、pH4.5)を1mg/mLのストックから調製した。脂質溶液を、水性mRNA溶液中に急速に注入し、振盪して、20%エタノール中に最終懸濁液を生じさせた。結果として生じるナノ粒子懸濁液を濾過し、1×PBS(pH7.4)で透析濾過し、濃縮し、2〜8℃で保管した。最終濃度=0.85mg/mLのGLA mRNA(被包)。Z平均=81.2nm(偏差(50)=63.2nm;偏差(90)=104nm)。
DODAP、DOPE、コレステロール、及びDMG−PEG2Kの50mg/mLのエタノール性溶液の一定分量を、混合し、エタノールで3mLの最終容積に希釈した。別個に、EPO mRNAの水性緩衝液(10mMのクエン酸/150mMのNaCl、pH4.5)を1mg/mLのストックから調製した。脂質溶液を、水性mRNA溶液中に急速に注入し、振盪して、20%エタノール中に最終懸濁液を生じさせた。結果として生じるナノ粒子懸濁液を濾過し、1×PBS(pH7.4)で透析濾過し、濃縮し、2〜8℃で保管した。最終濃度=1.35mg/mLのEPO mRNA(被包)。Z平均=75.9nm(偏差(50)=57.3nm;偏差(90)=92.1nm)。
2.0mg/mLの水性溶液PEI(分枝状、25kDa)の一定分量を、CFTR mRNAの水性溶液(1.0mg/mL)と混合した。結果として生じる複合した混合物を、上下に数回ピペッティングし、注入前に20分間放置した。最終濃度=0.60mg/mLのCFTR mRNA(被包)。Z平均=75.9nm(偏差(50)=57.3nm;偏差(90)=92.1nm)。
本実施例は、修飾mRNAの安定性、及び様々な標的組織におけるインビボでのタンパク質の発現を分析するための例示的な方法を図示する。
4’−チオNTP修飾mRNAを、リボヌクレアーゼIまたはヌクレアーゼP1に様々な期間にわたって供し、十分に分解させた。完了時、結果として生じる一リン酸ヌクレオチドを、アルカリホスファターゼで更に分解して、それぞれのヌクレオシドを提供した。ヌクレオシド混合物を、効率的な酵素除去のためにAmiconスピンカラム(30,000MWCO)に適用した。結果として生じるヌクレオシド溶液を、HPLCによって分析し、それぞれの無修飾ヌクレオシドとのピーク面積比較によって定量化した。
4’−チオNTP修飾mRNAを、リボヌクレアーゼIまたはヌクレアーゼP1に様々な期間にわたって供し、ヌクレアーゼ分解に対する抵抗性を評価した。指定の時点で、ヌクレアーゼ反応物を阻害剤で急冷し、結果として生じる溶液を、効率的な酵素除去のためにAmiconスピンカラム(30,000MWCO)に適用した。完了時、残余分をアガロースゲルに適用し、mRNA構築物の生存率(サイズ、分解産生物など)について分析した。同一の実験を無修飾mRNA上に実行し、直接比較及び推測を導いた。
4’−チオNTP修飾mRNA及び無修飾mRNAのインビトロでの遺伝子導入を、HEK293T細胞を使用して実行した。1マイクログラムの各mRNA構築物の遺伝子導入を、別個のウェル内でリポフェクタミンを使用して実行した。選択時点(例えば、4時間、8時間、32時間、48時間、56時間、80時間など)で細胞を収集し、それぞれのタンパク質産生を分析した。FFL mRNAにおいて、生物発光アッセイによって、細胞可溶化液をルシフェラーゼ産生について分析した。EPO及びGLA mRNA研究において、細胞上清を取得し、ELISAに基づく方法を使用して、EPO及びGLAタンパク質についてそれぞれ分析した。無修飾対4’−チオNTP修飾mRNAの経時的なタンパク質産生の比較を行った。例示的な結果を、図2に示す。
経時的なタンパク質産生の比較を、野生型マウス(CD−1)への4’チオNTP修飾mRNA被包ナノ粒子(脂質またはポリマー)の注入、対同一の様式で送達される無修飾mRNAによって行った。選択時点(例えば、6時間、12時間、24時間、48時間、72時間など)で血清及び器官を採取し、それぞれのタンパク質レベルを監視した。FFL mRNAにおいて、生物発光アッセイによって、肝臓ホモジネートをルシフェラーゼ産生について分析した。EPO及びGLA mRNA研究において、マウス血清を取得し、ELISAに基づく方法を使用して、EPO及びGLAタンパク質についてそれぞれ分析した。無修飾対4’−チオNTP修飾mRNAの経時的なタンパク質産生の比較を行った。
本実施例は、裸の、修飾された、mRNAまたはmRNA負荷ナノ粒子のいずれかの投与後の、例示的なタンパク質産生を分析するためのプロトコルを記載し、無修飾mRNAと比較した、4’−チオ修飾mRNAに関するmRNA安定性及びタンパク質産生を実証する。
EPOタンパク質の定量化を、ヒトEPO ELISAキット(Quantikine IVD,R&D Systems、カタログ#Dep−00)について報告される手順に従って実行した。用いた陽性対照は、超高純度、及び組織培養等級の組み換えヒトエリスロポエチンタンパク質(それぞれ、R&D Systems、カタログ#286−EP及び287−TC)からなった。指定された時点で血液試料を採取し、上記に記載するように処理した。Molecular Device Flex Station装置上の吸収(450nm)によって、検出を監視した。
Promega Luciferase Assay System(品目#E1500)を使用して、生物発光アッセイを行った。10mLのルシフェラーゼアッセイ緩衝液をルシフェラーゼアッセイ基質に添加することによって、Luciferase Assay Reagentを調製し、ボルテックスによって混合した。20uLのホモジネート試料を、96ウェルの平板上に充填し、各試料に対して20uLの平板制御を続けた。別個に120uLのLuciferase Assay Reagent(上記に記載するように調製)を96ウェルの平底平板の各ウェルに充填した。その後、Molecular Device Flex Station装置を使用して、各平板を適切なチャンバーに挿入し、発光を測定(相対光単位(RLU)で測定)した。
4’−チオ修飾または無修飾FFL mRNAの遺伝子導入によるFFLタンパク質の産生を、HEK293T細胞内で試験した。図2は、遺伝子導入の4時間、8時間、32時間、56時間、80時間後に取得した加重相対蛍光単位(RLU)スコアを表す。それぞれの時点で、25%の4’−チオウリジン(25%の4’−S−U)または100%の4’−チオウリジン(100%の4’−S−U)FFL mRNAのいずれかで遺伝子導入した細胞は、SNIM(登録商標)FFLまたは市販のFFLのいずれかで遺伝子導入した細胞よりも高い加重RLUスコアを有した。
合成手順:
Carbohydrate Research 2008,1790−1800
Organic Process Research and Development2006,487−492
Organic Process Research and Development2006,487−492
Carbohydrate Research 2008,1790−1800
Carbohydrate Research 2008,1790−1800
Carbohydrate Research 2008,1790−1800
一般的な計画
Claims (27)
- コード領域及び任意で1つ以上の非コード領域を有するmRNA分子であって、前記mRNAのヌクレオチド残基の少なくとも20%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込み、前記mRNAが少なくとも200個のヌクレオチド残基を含む、前記mRNA分子。
- 前記ヌクレオチド残基のうちの少なくとも25%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、請求項1に記載の前記mRNA分子。
- 前記ヌクレオチド残基のうちの少なくとも30%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、請求項1に記載の前記mRNA分子。
- 前記ヌクレオチド残基のうちの少なくとも40%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、請求項1に記載の前記mRNA分子。
- 前記ヌクレオチド残基のうちの少なくとも50%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、請求項1に記載の前記mRNA分子。
- 前記ヌクレオチド残基のうちの少なくとも99%が、4’−チオ−置換フラノース環を組み込む、請求項1〜5のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
- 前記非コード領域がポリAテールを含み、前記ポリAテールが4’−チオ−アデノシン残基を含む、請求項1〜6のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
- 前記ポリAテールが、少なくとも約90ヌクレオチド残基長である、請求項7に記載の前記mRNA分子。
- 前記ポリAテールが、少なくとも約500ヌクレオチド残基長である、請求項7または請求項8に記載の前記mRNA分子。
- 前記mRNA分子が、少なくとも1つの非標準ヌクレオチド残基を更に含む、請求項1〜9のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
- 前記非標準ヌクレオチド残基が、5−メチル−シチジン、プソイドウリジン、及び2−チオ−ウリジンのうちの1つ以上から選択される、請求項10に記載の前記mRNA分子。
- 前記1つ以上の非標準ヌクレオチド残基が、4’−チオ−フラノースを含むように更に修飾される、請求項11に記載の前記mRNA分子。
- 前記分子が、少なくとも5000個のヌクレオチド残基を含む、請求項1〜12のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
- 前記コード領域が、治療用タンパク質をコードする、請求項1〜13のいずれか一項に記載の前記mRNA分子。
- 前記治療用タンパク質が、エリスロポエチン、ヒト成長ホルモン、嚢胞性線維症膜コンダクタンス制御因子(CFTR)、インスリン、アルファ−ガラクトシダーゼA、アルファ−L−イズロニダーゼ、イズロネート−2−スルファターゼ、N−アセチルグルコサミン−1−リン酸トランスフェラーゼ、N−アセチルグルコサミニダーゼ、アルファ−グルコサミニドアセチルトランスフェラーゼ、N−アセチルグルコサミン6−スルファターゼ、N−アセチルガラクトサミン−4−スルファターゼ、ベータ−グルコシダーゼ、ガラクトース−6−硫酸スルファターゼ、ベータ−ガラクトシダーゼ、ベータ−グルクロニダーゼ、グルコセレブロシダーゼ、ヘパランスルファミダーゼ、ヒアルロニダーゼ、ガラクトセレブロシダーゼ、オルニチントランスカルバミラーゼ(OTC)、カルバモイル−リン酸シンテターゼ1(CPS1)、アルギニノコハク酸シンテターゼ(ASS1)、アルギニノコハク酸リアーゼ(ASL)、及びアルギナーゼ1(ARG1)、グルコース−6−ホスファターゼ、グルコース−6−リン酸トランスロカーゼ、グリコーゲン脱分枝酵素、リソソームアルファ−グルコシダーゼ、1,4−アルファ−グルカン分枝酵素、グリコーゲンホスホリラーゼ、ホスホフルクトキナーゼ、肝臓ホスホリラーゼ、GLUT−2、UDPグリコーゲンシンターゼ、アルファ−L−イズロニダーゼ、イズロネート硫酸シルファターゼ、ヘパラン硫酸スルファミダーゼ、アルファ−N−アセチルグルコースアミダーゼ、アルファ−グルコサミニド−N−アセチルトランスフェラーゼ、N−アセチルグルコサミン−6−硫酸スルファターゼ、アポリポタンパク質E、低密度リポタンパク質受容体(LDLR)、第VIII因子、第IX因子、脊髄運動ニューロン1(SMN1)、フェニルアラニンヒドロキシラーゼ、プロピオニル−CoAカルボキシラーゼ、ポルフォビリノーゲンデアミナーゼ、ペチルマロニル(pethylmalonyl)−CoAムターゼ、尿酸オキシダーゼ、C1エステラーゼ阻害剤、及び酸性アルファ−グルコシダーゼから選択される、請求項14に記載の前記mRNA分子。
- 請求項1〜15のいずれか一項に記載の少なくとも1つのmRNA分子及び担体を含む、組成物。
- 前記担体が、脂質を含む、請求項16に記載の前記組成物。
- 前記mRNA分子が、脂質ナノ粒子内に被包される、請求項17に記載の前記組成物。
- 前記担体が、XTC(2,2−ジリノレイ1−4−ジメチルアミノエチル−[1,3]−ジオキソラン)、MC3(((6Z,9Z,28Z,31Z)−ヘプタトリアコンタ−6,9,28,31−テトラエン−19−イル4−(ジメチルアミノ)ブタン酸)、ALNY−100((3aR,5s,6aS)−N,N−ジメチル−2,2−ジ((9Z,12Z)−オクタデカ−9,12−ジエニル)テトラヒドロ−3aH−シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール−5−アミン))、NC98−5(4,7,13−トリス(3−オキソ−3−(ウンデシルアミノ)プロピル)−N1,N16−ジウンデシル−4,7,10,13−テトラアザヘキサデカン−1,16−ジアミド)、DODAP(1,2−ジオレイル−3−ジメチルアンモニウムプロパン)、HGT4003、ICE、HGT5000、シス、またはトランスHGT5001、DOTAP(1,2−ジオレイル−3−トリメチルアンモニウムプロパン)、DOTMA(1,2−ジ−O−オクタデセニル−3−トリメチルアンモニウムプロパン)、DLinDMA、DLiN−KC2−DMA、及びC12−200から選択される1つ以上の陽イオン性脂質を含む脂質ナノ粒子である、請求項16〜18のいずれか一項に記載の前記組成物。
- 前記脂質ナノ粒子が、DSPC(1,2−ジステアロイル−sn−グリセロ−3−ホスホコリン)、DPPC(1,2−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−ホスホコリン)、DOPE(1,2−ジオレイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン)、DPPE(1,2−ジパルミトイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン)、DMPE(1,2−ジミリストイル−sn−グリセロ−3−ホスホエタノールアミン)、DOPG(,2−ジオレイル−sn−グリセロ−3−ホスホ−(1’−rac−グリセロール))、及びコレステロールから選択される1つ以上のヘルパー脂質を含む、請求項18または請求項19に記載の前記組成物。
- 前記脂質ナノ粒子が、ペグ化脂質を含む、請求項18〜20のいずれか一項に記載の前記組成物。
- 前記脂質ナノ粒子が、1つ以上の陽イオン性脂質、1つ以上のヘルパー脂質、及びペグ化脂質を含む、請求項18に記載の前記組成物。
- 前記担体が、ポリマーを含む、請求項16に記載の前記組成物。
- 前記ポリマーが、ポリエチレンイミンである、請求項23に記載の前記組成物。
- 請求項1〜15のいずれか一項に記載の前記mRNA分子、または請求項16〜24のいずれか一項に記載の前記組成物を含む、タンパク質をインビボで産生するための組成物。
- 治療用タンパク質のインビボでの発現を誘発することができる薬物の製造のための、請求項1〜15のいずれか一項に記載のmRNA分子の使用。
- 治療用タンパク質のインビボでの発現を誘発するための組成物であって、請求項1〜15のいずれか一項に記載のmRNA分子を含む、組成物。
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