JPH01501149A - 新規なデオキシリボヌクレオシドホスホルアミダイト及びオリゴヌクレオチドを製造するためのそれらの使用 - Google Patents

新規なデオキシリボヌクレオシドホスホルアミダイト及びオリゴヌクレオチドを製造するためのそれらの使用

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JPH01501149A
JPH01501149A JP62503763A JP50376387A JPH01501149A JP H01501149 A JPH01501149 A JP H01501149A JP 62503763 A JP62503763 A JP 62503763A JP 50376387 A JP50376387 A JP 50376387A JP H01501149 A JPH01501149 A JP H01501149A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 M」 新規なデオキシリボヌクレオシドホスホルアミダイト及びオリゴヌクレオチドを 製造するためのそれらの使用l1立11 オリゴヌクレオチドは定められた順序の4種のヌクレオチドの線状配列から成る 短かいポリマーである。ヌクレオチドサブユニットは、1ヌクレオチドの3°− ヒドロキシル部分に結合するホスホジエステル結合により次のヌクレオチドの5 °−ヒドロキシル部分に結合される。オリゴヌクレオチドの例は5’ >ApC pGpTpApTpGpGpC<3°である0文字A、C,G及びTはデオキシ リボースのl゛−位に結合したプリン或はピリミジン塩基の性質を言い、A1ア デニン:01シトシン;01グアニン;T1チミンである。「p」はホスホジエ ステル結合を表わす、オリゴヌクレオチドのセクションの化学構造を1式に示す 。
−o−p=。
DMA鎖の一部の構造 この式はダブリュ、エッチ、フリーマンアンドカンパニー、ルベルトストライヤ ー(Lub@rt 5try@r )著テキストブック「バイオヶミス\リー」 、第1版1975.558頁から採用した。
合成オリゴヌクレオチドは近代分子生物学及び組換えDNA研究における強力な 道具である。これらの分子について数多くの用途があり、a)遺伝子生成物のタ ンパク質配列に基づく特定の遺伝子の単離用グローブとして、b)新値の遺伝子 のインビトロ突然変異誘発に向けること、e)−重鎖のテンプレートに関するD NA合成用プライマーとして、d)遺伝子の全合成における段階として及びその 他多くを含み、ウィリアムアールパール(Wm、R,B a h 1 )等、F rog、 Nnel、 Ac1d R*s、 M61 。
Blol、21.101頁、(1978)に考察されている。
かかるオリゴヌクレオチドの効率的な化学的合成法の発達に、今迄極めて相当量 の努力が払われてきた。これらの方法が現在Kまで発達してきたにつれての簡単 な回顧が、り党ツケット、ジー、シー、 (Crock@tt 、 G、 C, )、アルドリヒミカアクタ16 (3) 、47〜55頁(1983)及び「オ リゴヌクレオチドシンセシス:アブラクチカルアプローチ」、英国、オツクスホ ード、IRLプレス、ゲイト、ヱム、ジエイ、(Gait、 )TL J、 )  IIl集(1984年)わせで用いる、マツテウツチ、エム、ディ、(Mat t・t+eel。
M、 D、 ) 及びカルナース、エム、エッチ、 (Caroth@rs 。
M、 IIl、 )、ジャーナルオプアメリカンケミカルソサイアテイ103. 3185頁(1981年);及びビューケージ、ニス、エル、(B・mucag ・、 S、 L、・)ゝ及びカルサース、二ム、エッチ、 、T@t、 I、・ tt、 22(20)、1858−1862頁(1981年)。この化学では、 合成すべき配列の31−ヌクレオシドを、塩基−不安定なり7カーアームを経て 固体支持体に結合させる。次のヌクレオシドを引き続いて前のヌクレオシドに結 合させて固体支持体から離れて伸びる規定の配列の線状ポリマーを生成する。デ オキシリボヌクレオシドホスホルアミダイトの一般構造を2式に示す: 8m =ヌクレオシド塩基 DMTr =ジ−p−アユシルフェニルメチル(ジメトキシトリチルとしても知 られている) 2式 及びオリゴヌクレオチド合成の各サイク/I/において用いられる化学段階を3 式に示す: ホスファイト−トリエステル法による固相オリゴデオキシリボヌクレオチド合成 土! (この式は、IRLプレスゲイト、エム、ジェ仁編、「オリコヌクレオチド合成 :アブックチヵルアブローチJい984年)、37頁から採用した) 40の塩基までの長さのオリゴヌクレオチドをこの方法で日常ペースで作ること ができ及び106の塩基程に長い分子が作られた。この化学を採用する機械が今 日市販されている。
その他の化学種を合成オリゴヌクレオチドに共有結合させる方法を凹む理由が多 くある。オリゴヌクレオチドに結合させた螢光染料は、放射性同位体が眉いられ る研究、診断、臨床方法から放射性同位体を排除し、保存寿命及び利用可能性を 向上させることを可能にする。検出のための適当な技術及び計装の発達及び螢光 ai&オリゴヌクレオチドの使用は、他の現在骨の折れる実験室及び臨床技術の 自動操作を可能にする。DNA開裂化学薬品、例えばシュルツ(5eht+1t z)等、ジャーナルオプアメリカンケミカルソサイアテイ、104.6861頁 (198咋)Hハーツパーグ、アール、ビー、 (Hertzb*rg、 R, P、 )及びダーバン、ビー、ビー、(D@rvan、 P、 B、 )、ジャ ーナルオプアメリカンケミカルソサイアテイ、104.313頁(1982年) に開示されているものの結合は、合成制限i!!lE票であって、それらの%J %性がオリゴヌクレオチド配列によって支配されるものを作製することを可能く する。
DNAの詰導体合成(d@rivatizatlon )の文献中にいくつかの 報告がある。ビオチン基をクラシルの5位の脂肪族アミノ基に結合させ゛た変性 ヌクレオシドトリホスフェートが開発された、ランガー(Lang*r )等、 Free 。
Na t、 Aead、 Se 1. U、 S、 A、 7B、6655−6 657頁(1981年)。「ニックトランスレーション」ト呼ハれるプロセスで 、このヌクレオチド誘導体を効率的に二本鎖のDNAK加入させる。ヌクレオチ ド誘導体は、−担DNA中に入れば、抗ビオチン抗体によって結合されることが でき、次いで螢光或は酵素法により検出用に用いることができる。ビオチン結合 させたヌクレオシドをッンガー等の方法によって中に加入させたDNAを分断し て一層小さい一本鎖及び二本鎖の片にする。これらのバイオケミストリー19. 1774〜1781頁(1980年)はバイサルファイド触媒アミノ基転移反応 による脂肪族アミノ基を導入し及びそれらを次いで螢光標識と反応させることに ついて報告した。ドレーノ(−及びゴールドでは、アミノ基を直接ピリミジン塩 基に結合させる。
そのように位置させたアミノ基は水素結合を阻止し、このため、これらの物質は ハイプリダイゼーシロン等において有用でない。また、この方法ではアミノ基を 所望の位置に選択的に挿入することができない。チュ(Chu)等、 Nwcl @ic Ac1ds Ram、 11 (1B)、65 1 B−6529頁( 1983年)は、アミンをオリゴヌクレオチド或は核酸の末端5′−ホスフェー トに結合させる方法を報告した。この方法は、数多くの逐次反応及び精製工程を 含み、実施するのに骨が折れ及びスケールアップするのが困細である。この方法 は、また、単一の7ミノ基をオリゴヌクレオチドの5゛−末端に導入することに 制限さ庇る。タケダ及びイケダ、Nucl、 Ac1ds Res、8ymp、  5eriesンのホスホトリエステル誘導体の合成及び使用について報告した 。これらの物質は本明細書において報告するものと、アミノ含有部分が塩基部分 に結合され、オリゴヌクレオチドの糖部分に結合されておらず、かつまた用いる DNA合成化学がホスホトリエステルであって・ホスホルアミダイトでなかった 点で、異なる。
本発明は1つ又はそれ以上の自由脂肪族アミノ基を合成オリゴヌクレオチドに導 入する一般的な方法を提供する。コレラの基をオリゴヌクレオチドの任意の所望 の位置に選択的に挿入することができる。それらは種々のアミノ反応性官能価と 容易にかつ特異的に反応され、それKよって広範囲の化学種を位置!!#異的方 法で共有結合させることを可能にする。このことを多数の螢光性オリゴヌクレオ チド誘導体を調製することKよって例示する。
この方式でli製した物質は、それらをDNA配列分析におけるプライマーとし て用いることにより、かつまたDNA二本二本酸生成けるそれらの融解挙動を研 究することによって例示する通りにDNAハイプリダイゼーシ璽ン法において有 効である。
本発明に従かえば、初めにヌクレオシドの糖部分に結合させた保護された脂肪族 アミノ基を含有するヌクレオシド類似体の3′−O−ホスホルアミダイF誘導体 を合成して、脂肪族アミノ基をオリゴヌクレオチドに導入する。このホスホルア ミダイトを次いで固体支持体上に合成されているオリゴヌクレオチドと反応させ る。アミノ保護基が塩基不安定であるならば、固相からのオリゴヌクレオチドの 開裂及び塩基部分及び脂肪族アミノ基の脱保護のプロセスは、アミノ誘導体合成 されたオリゴヌクレオチドを生じる。アミノ保護基が酸不安定ならば、支持体か らオリゴヌクレオチドを開裂させ及び塩基部分を脱保護する前に、無水の或は水 性の酸で処理して除くことができるか或はオリゴヌクレオチドのクロiトグフフ イー精製を簡単にし及び改良するために開裂及び脱保護する間に、アミノ保護基 を保持し、次いで後に水性酸で処理して取り去ることができ、どちらの場合でも アミノ誘導体合成ヌクレオチドを生じる。
より詳細には、本発明は本明細書中に詳細に述べる通りに保護しておいた脂肪族 アミノ基をヌクレオシドの糖部分に結合させる変性デオキシヌクレオシドホスホ ルアミダイトに関する。代表的なヌクレオシドの化学構造を4式に示す。
ヌクレオシドは、複素環式ピリミジン或はプリン塩基が炭素−窒素結合によって リボース(R=R’=R”=OH)或はデオキシリボース(R=R’ =oa; R”=a)のフラノース(糖)環に結合されていることを1#徽とする。糖炭素 原子の番号付け(ナンバリング)は弐において示す通りに11〜5′である;す なわち、塩基は糖のC−1′に結合される。脂肪族アミノ基は一般原則として5 つの環炭素の内のいずれに結合させてもよく、また、適当なホスフィンを適当に 保護したアミノヌクレオシドの自由な′51−ヒト四キシル基と反応させて合成 するそれぞれのホスホルアミダイト誘導体を構成する。
311]口り 簡単に言えば、本発明は下記式を有する新規な保護アミノヌクレオシドを含む: ここで、Bは通常のヌクレオシドプリン或はピリミジン塩基、例えばアデニン1 グアニン、チミン、シトシン、クラシル或はヒボキサンチン或はそれらめ保護誘 導体、特KDNA化学合成において現在用いられているもの、すなわちN・−ベ ンゾイルアデニンsN” −インプチリルプチルホルムアミジニルアデニン、N @ −(N−メチル−2−ビロリシンアミジニ/I/)アデニン、N@ −スク シニルアデニン、N−一7タロイルアデニン、N’ −ジメチルアセトアミジニ ルアデニン或はN3−ジーn−フ゛チルホルムアミジニルグアニン;或は一般的 でないプリン或はピリミジン塩基、例えばプリン、インシトシン或はキサンチン (47−シヒドロー1H−プリン−2,6−ジオン)或はそれらの保護誘導体1 或は置換されたプリン或はピリミジン塩基である。このようなt11換基は下記 を含み、これらに限定されないニジアノ、ハロ、ハロアルキル、カルボキシ、ホ ルミル、ヒドロキシ、アルコキシ、了り−ル、アジド、メルカプト、ニトロ、カ ルボキシエステル及びカルボキシアミド。このような塩基は下記を含み1これら に限定されない:6−クロロプリン、6−クロロース−フルオロプリン、z6− ジアミツフリン、2−フルオロ−N・−ヒドロキシアデニン、2.6−シヒドロ キシアミノプリン、8−ブロモアデニン、2−/ロロアデニン、8−アジドアデ ニン、8−メルカプトアデニン、8−アミノアデニン、6−チオグアニン、2. 6−ジクロロプリン、N、N−ジメチル−6−アミノプリン、N・−ベンジルア デニン、tS−ジメテルキサンチ/、2−アミノ−へ8−ジヒドロキシプリン、 °6−メト中シブリン、6−メルカプトグリy、6−(2−ヒドロキシニブル) アミノプリン、N・−(2−インペンチル)アデニン、N’−フル7リルアデニ ン(カイネチン)、5−プロモメチルクテシル、5−ジブロモメチルクラシル、 5−ヒドロキシメチルウテシル、5−ホルミルクツシル、5−フルオロクツシル 、5−ブロモクツシル、6−メチル−2−チオウラシル、5−ヒト田キシメチル −6−メチルウラシル、5−ヒドロキシウラシル(イソバルビッル酸)、5−メ トキシクチシル、5−メチルシトシン、5−)!Jフルオロメチルクラシル、5 −ニトロウラシル、5−アミノウラシル、2−チオシトシン、2−アミノ−46 −ジヒドロキシプリンジン、4−アミノ−2,6−シヒドロキシビリミジン、2 −アミノ−4−ヒドロキシ−6−メチルピリミジン、或は4−アミノ−6−ヒド ロキシ−2−メルカプトピリミジン、或はそれらの保護誘導体。
Bは、また、ヌクレオシド塩基類似体であってもよく、かかる類似体は通常のプ リン或はピIJ iジン塩基をそれらの構造(原子の種類及び配at)が通常の 塩基と同様であるが、通常の塩基の機能特性を追加して保持するか或はいくつか 欠くかのいずれかKなり得る点で、まねる。
このような塩基類似体は下記を含み、これらに限定されない:イミダゾリン及び その2−14−1及び/又は5−置換誘導体(置換基は前に規定した通りである )、インドール及びその2−13−14−15−16−及び/又は7−[換誘導 体、ベンズイミダゾール及びその2−14−15−16−及び/又は7−置換誘 導体、インダゾール及びその3−14−15−16−及び/又は7−m!置換誘 導体ピラゾール及びその3−14−及び/又は5−m換誘導体、トリアゾール及 びその4−及び/又は5−に換誘導体、テトラゾール及びそのS−W換誘導体、 ベンゾトリアゾール及びその4−15−16−及び/又は7−11換誘導体、8 −アザアデニン及びそのwt挨誘導体、8−アザグアニン及びその置換誘導体、 6−アザチミン及びそのII!換誘導体、6−アザクラシル及びその置換誘導体 、5−アザシトシン及びその置換誘導体、8−アザヒボキサンチン及びそのに抄 誘導体、ピッゾロピリミジン及びそのII換紡導体、3−デアザクラシル、オロ チンkl< 2.6−シオキソーt 2.&6−チトラヒドロー4−ピリミジン カルボン酸ン、バルビッル酸、尿酸、エテノアデニン、アログリノール(4−ヒ ドロキシ−ピッゾロ(44−d)ピリミジン、或はそれらの保診誘導体。
Bは、また、塩基と糖のC−1’との通常のC−N結合をC−C結合に代えた「 C−ヌクレオシド」になることができる。このような塩基は下記を含み、これら に限定されない:ウラシル(C−ヌクレオシドプソイドウリジンにおける)、1 −メチルウラシル、1.3−ジメチルクラシル、5(4) −カルボメトキシ− tZS−トリアゾール、5(4)−カルボキシアミドーt2.5−)リアゾール 、5(5)−カルボキシメチルピラゾール、3(51−カルボメトキシピラゾー ル、5−カルボエトキシ−1−メチルピラゾール、マレイミド(C−ヌクレオシ ドショウドマイシン(Shovdomyc1g+ )における)、3(4)−カ ルポクスアミド−4(3)−ヒドロキシピラゾール(C−ヌクレオシドビラゾマ イシンにおける)、或はそれらの保II誘導体。
5式において、R1、R2% BS 、R4及びRs C時には、全体としてR nと呼ぶ)は下記の通りに規定する:R@ =IISR4=OH% R1%R* 及びR,はH,OR或はNHR’のいずれかであり、ここでR及びR′は適当な 保護基であり;Rは通常低級アルキル或はアリールエーテ)’、例:IF!メf ル、t−ブチル、ベンジル、O−ニトロベンジル、p−ニトロベンジル、O−ニ トロ7エ二ル或はトリフェニルメチル、或は低級アルキル或はアリールエステル 、例えばアセチル、ベンゾイル或はp−ニトロベンゾイル、或はアルキルアセタ ール、例えばテトラヒドロピラニル、或はシリルエーテル、例えばトリメチルシ リル或はt−ブチル−ジメチルシリル、或はスルホン酸エステル、例えばp−) ルエンスルホニル或はメタンスルホニルであり;R1は任意の通常、標準の窒素 保護基、例えば通常ベプデド合成において用いられているものにューヲーク、ア カデミツクプレス、イー、グロス及びジエイ、マイエンホファー騙集−,[ザペ プテズ:アナラシス、シンセシス、バイオロジーJ、(1981年)、3巻、1 〜99頁、アールガイガー(R,G@量g@r )及びダプリュ、フーニング( W、 Kenimg ) )でありiこれは下記を含み1これらに限定されない :!2不安定性保護基、例えばホルミル、t−ブチルオキシカルボニル、N−ベ ークロロベンジルオキシカルボニル、4−7’ロロベンジルオキシカルボニル、 2.4−ジクロロベンジルオキシカルボニル、フルフリルオキシカルボニル、t −アミルオキシカルボニル、アダマンチルオキシカルボニル、2−フェニルプロ ピル+21オキシカルボニル、2−(4−ビフェニル)フロビル(2)−オキシ カルボニル、トリフェニルメチル、p−ア二シルジフェニルメチル、ジ−p−ア ユシルフェニルメチル、2−ニトロフェニルスルフェニル或はジフェニルホスフ ィニル警塩基不安定性保護基、例えばトリフルオロアセチル−グリシル、4−) ルエンースルホニルエチルーオキシカルボニル、メチルスルホニルエチル−オキ シカルボニル及び2−シアノ−t−ブチルオキシカルボニル;その他、例えばク ロロアセチル、アセトアセチル、2−ニトロベンゾイル、ジチアスクシノイル、 マレオイル、イソニコチニル、2−ブロモエチルオキシカルボエル及び2,2. 2− )リクロロエチルオキシカルポニル、但し、R,或はR3がNHR’であ るとき、R’は前述した基或はトリフルオロアセチル或は9−フルオロエニルメ チルオキシカルボニルの内のいずれかであることを条件とする。
TLI 、Rg及びR,の内の精々1つはNHR’になることができ及びR4の みがOHになることができる。
本明細書中上述したrRJ保護基は、炭素原子を含有する場合、1〜約25の炭 素原子を含有することができる。
ケース ORか或はHのいずれかKなることができる;この場合の分子を保!!i2’− アミノー2′−デオキシアツビノヌクレオシドと呼ぶ。
2)R,=NHR’なら、その場合R1=:a ; RgはORか或はHのいず れかKなることができる;この場合の分子を保112′−アミノー21−デオキ シリボヌクレオシドと呼ぶ。
3)Ri’=NHR’なら、その場合R1或はR雪のいずれかはORになること ができ、他方はHであり、或は両方がHになることができる;R1がORである なら、その分子を保護5′−アミノアラビノヌクレオシドと呼びIRfiがOR であるなら、その分子を保111sl−アミノーリボヌクレオクドと呼びjBB 及びR,の両方がHであるなら、その分子を保W15′−アミノー2I−デオキ シリボヌクレオシドと呼ぶ。
発明は更に下記式を有する新規なホスホルアミダイトここで、B s R1、R 2及びR1は前に規定した通りであり、 R・=低級アルキル、好ましくはメチル或はイソプロピルのような低級アルキル 、或は複素環式、例えばモルホリノ、ピロリジノ或は2.2.46−チトラメチ ルピロリジハ Rf=/?ル、ベーターシアノエテル、p−ニトロフェネチル、O−/ロロフェ ニル或G!p−クロロフェニル。
もう一度、本明細書中上述したrBJ基は、炭素原子を含有する場合、1〜約2 5の炭素を含有することができる。
5弐においてrBJによって表わす部分も、また、6弐によって表わすホスホル アミダイトを合成する前に、ホスホルアミダイトをDNAmアセンブリー化学に 連合させるために%連光に保証しなければならないことに注意しなければならな い。このような保護は、ゲイト、「オリゴヌクレオチドシンセシス:アプラクチ カルアプローチ」において十分に検討されており、通常、rBJの環外(・xo eyclle )アミノ基をアシル化或はアミノ化することを含み;かかるアシ ル基はアセデル、ベンゾイル、インブチリル、スクシニル、7タロイル或はアニ ソイルを含み、これらに限定されず畜かかるアミジン基はジメチルホルムアミジ ン、ジ−n−ブチルホルムアミジン或はジメチルアセトアミジンを含み、これら に限定されず;1B@を他の反応性基、例えばカルボキシJ%/1ヒド四キシル 或はメルカプトで置換するならば、これらは同様に適当に保護される。
本発明は別の面では、オリゴヌクレオチドを6式の保護アミノ誘導体合成ヌクレ オシドホスホルアミダイトと反応させる、面相支持体上でオリゴヌクレオチドを 合成することを含む。
加えて、本発明は少なくとも1つのアミノ誘導体合成ヌクレオシドを6式のホス ホルアミダイト前駆体を経て中に加入させた新規なオリゴヌクレオチドを含む。
本発明は、なお更に、上述した新規な脂肪族アミノ誘導体合成された一本釦のオ リゴヌクレオチドを、発色団、螢光剤、タンパク質、酵素、11!lのような放 射性原子或はその他つ「橿原」である検出可能な成分に結合させて成る。
本発明の目的は新規な保護ヌクレオシドを提供することにある。
本発明のなお別の目的は新規なホスホルアミダイトを提供することにある。
本発明の別の重要な面では、前述したホスホルアミダイトと反応させた固体支持 体に結合させた新規なオリゴヌクレオチドを提供することが目的である。
本発明のなお別の目的は、標準の検出手段によって容易に検出し得る新規な標し を付けた(tagg@d)オリゴヌクレオチドを提供するにある。
本発明のこれらや他の目的及び利点は、下記の一層ていねいかつ詳細な説明から 当業者に明らかになろう。
発明の詳細な説明 下記の引用は、上記5式の化合物の調製において用いるアミノヌクレオシド出発 原料の合成のリストを含む。
I)5’−アミノ−51−デオキシチミジン及び5′−アミノ−5′−デオキシ ウリジン及び適当な中間体の合成(ケース3の実施態様): t ホルビツツ、ジエイ、ビー、(H@rwitz、 J、P、)、) ムソ/  * Z −ジエイ、 (Tomson、 A、 J、 )、アーバンスキ、ジ エイ、 x −、(Urbanmki 、 J、 A、 )及びチュア。
ジエイ、(Cha&、 J、)ジャーナルオプアメリカンケミカルソサイアテイ 27.3045−5048頁(19tS2)。
I[)2’−アミノ−21−デオキシウリジン及び21−アミノ−2′−デオキ シシチジン及び適当な中間体の合成(ケース2の実施態様): t バーヘイ)”ン、 シx−イ、ビー、エッチ、(V*rh@yd*n。
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5式の範囲内の好ましい化合物群を下記によって与える。
ノー51−デオキシチミジンの5l−N−保護した誘導体:ここで、x−5式に 伴ない発明の詳細な説明において規定した通りの標準の窒素保護基;好ましくは 、X−)リフェニルーメチル(トリチル)或はp−アニシルジフエ二ルメチル( モノメトキシトリチル、MMTトモI+”!fれる)。
式は、また、化合物(X−H)を活性化された適当に保護されたアミノ醸誘導体 と反応させて生成する関連のある化合物群を包含する;コノ場合、VはX−Y  −NH−(CI(Q)!L−C0によって表わされ、ここで、Y−窒素保&基、 特に本明細書中前KXについて好ましいとしてリストしたもの、トリフルオロア セチル或は9−フル四エニルーメ)ヤシメチルオキシカルボニル;Q−任意の通 常のアミノ酸側鎖; * −1−約12、通常難<−6; !1−1の場合、Q は下記のような部分を含み、これらに限定されない:H(アミノ酸グリシンから )、メチル(アミノ酸アラニンカラ)、インプシビル(バリン)、ベンジ# ( 7xニルアラニン)、p−ヒドロキシベンジル(チロシン)、カルボキシメチル (アスパラギン酸)、カルボキシエチル(グルタミン酸)、4−アミノブチル( リシン)、イミダゾリル−メチル(ヒスチジン)、インドリルメチル(トリプト ファン)、メルカプトメチル(シスチン)或はヒドプキシメチ/1/(セリン) $11>1の場合、Qは通常Hであり;例えばn −2の時、対応するアミノ酸 はベーターアラニンであり; !l = jsの時、4−アミノ酪酸;m −5 のとき、6−7ミノへ午サン酸、QがOR,SR。
Co、H或はNH2のような反応性部分を含有するならば、これらもまた標準の 基で適当に保護する(このような基の十分な記述については、ガイガー及びコー ニング、「サヘブチズ:アナラシス、シンセシス、バイオロギー」を参照)。こ の化合物群では、保護されたアミノ基をヌクレオシドの糖環から空間的に取り失 って、その反応性を向上させるか、或はアミノ基に付されるべき「標識」からD NA鎖を空間的に分離する。
式は、また、線状様式で結合された1より多いアミノ酸(ペプチドと呼ぶ)を化 合物(X−H)に結合させることによってこの後者の群に関連した化合物群を包 含すル:コノ場合、XはX −Y −(NH−(CHQ l )!1− Co) mによって表わされ、ここで、Y及びnは本明細書中前に規定した通りであり、 種々のQlは本明例書中前にQについて規定した通りであり、l−1〜nf)最 大値、mm1〜約100;as−1は前のパングラフにおいて規定した群を表わ す。
5’−0−p−)ルエンスルホニルチミジン、5′−アジド−5′−デオキシチ ミジン及び51−アミノ−51−デオキシチミジン出発原料の合成は、 ホルビッツ、ジエ仁ピー宍午ン堅、ジェイ、アーバンスキ、ジエイ、ニー、及び チュア、ジエイ、、ジャーナルオブオーガエツクケミストリー、27.5045 −3048頁(19,62年)に示されている。
例1 下記式を有する5’−N−p−7ニシルジフエニルメチルー51−7ミノー51 −デオキシチミジン:5′−アミノ−5′−デオキシチミジン(2,411s1 0ミリモル)を2回無水ピリジン(各回25−)と共に共蒸発させ(co・マリ orat・)S次いで無水ピリジン(100d)中に懸濁させた。トリエチルア ミン(2,1114)、N。
N−ジメチルア之ノビリジン((LaO2:アルドリッチケミカルカンパニー) 及びp−アニシルークロνジフェニルメタン(46811,1&2ミリモル;ア ルドリッチケミカルカンパニー)を加えた。反応混合物を水分及び光から保護し 及び黄色−オレンジ溶液を室温で一晩攪拌した。反応を次いで水中で冷却し及び 冷飽和重炭酸ナトリウム水溶液(1001j)を加えて過剰のトリチル化(tr itylating ) 剤を分解した。50分した後に、混合物を1リツトル の分液漏斗に移し及びエチルアセテート(20am分)で2回抽出した。−緒に したエチルアセテート層を水(1001j分)で2回及び飽和塩化ナトリウム水 溶液(100m)で1回洗浄し、無水硫酸マグネシウムで乾燥し、f過し、減圧 下で回転蒸発乾固させた。
ガム状のオレンジ−黄色生成物を次いで無水トルエン(100*分)と共に2回 共蒸発させて残留ピリジンを除いた。残分を最少量のエチルアセテートに溶解し 及びヘキサン中に充填した中性アルミナ(活性グレードV。
15重量%:ホエルムファーマ(Wo@1m Pharma GmbHアンドカ ンパニー)のカラム(1003X&Ocm)に加えた。カラムを初めにエチルア セテート:ヘキサン(1:1マ/マ)で、鮮黄色物質が全てカラムから溶出され るまで溶出し、次いで純エチルアセテートで溶出した。
生成物を含有する留分をプールし及び回転蒸発乾固させた。無色に近いガム状残 分を歩容量のエチルアセテートに溶解し及び室温のヘキサン(400d)中に沈 殿させた。生成物をr過し及び真空デシケータ内で乾燥して結晶化されない白色 粉末453#lL8ミリモル、88%)となった。精製した生成物をシリカゲル LQ6DFプレー)(ピアースケミカルカンパニー)上でアセトニトリル;水( 9:1マ/マ)で展開させるTLC分析は、短波UV検出により1つのスボツ) Rfα87を示し、これ番1プレーFに過塩素酸:エタノール溶液(3:2マ/ マ)を吹付けた後にp−アエシルジフェニルメチルカチオンに特有のオレンジ− 黄色となった。生成物の構造を更にベルシュウチリウム置換した( p@rd鎗 at・rat・d)ジメチルスルホキシド(メルクアイソトープス)で”HNM R分光分析法によって確認した。
同様に、下記の化合物を調製する: 1)5′−アミノ−2’、5’−ジデオキシ−N@−ベンゾイル−アデノシンか らs’−N−p−7ニシルジフエニルメチルー51−アミノ−21,51−ジデ オキシ−N6−ベンゾイルアデノシン。
2)51−アミノ−2’、5’−ジデオキシ−N”−イソブチリルグアノシンか ら5’−N−p−アユシルジフェニルメチル−5′−アミノ−21,sl−ジデ オキシ−V−インブチリルグアノシン0 3)51−アミノ−21,51−ジデオキシ−N4−ペンシイyシスチジンから 5’−N−P−アユシルジフェニルメチル−51−フミノー21.5′−ジデオ キシ−N4−ベンゾイルシチジン。
リ 5′−アミノ−2’、 5’−ジデオキシクリジンd−ら5’−N−p−ア 二シ〃ジフェニルメチルー51−アミノ−21,sl−ジデオキシウリジン。
5)51−アミノ−21,sl−ジデオキシイノシンから5l−N−p−7ニシ ルジ7エエルメチルー51−アミノ21゜5I−ジデオキシイノシン0 6)51−アミノ−21−テ)ラヒドロピラニルーsl +デオキシウリジンか ら5’−N−(p−アニシルジフェニルメチ/I/) −5+−アミノ−21− テトラヒト四ビ2ニルー51−デオキシウリジン。
7)5′−アミノ−21−テトラヒト豐ピラニルー51−デオキシイノシンから s’−N−(p−アニシルジフェニルメチル)、−5l−アミノ−2′−テトラ ヒドロピラニル−5′−デオキシイノシン。
8)5′−アミノ−21−テトラヒドロピラニル−N” −ベンゾイル−5′− デオキシアデノシンから5’−N−(p−アニシルジフェニルメチル)−sl− アミノ−21−テシラヒドフビラニルーN@−ベンゾイル−5′−デオキシアデ ノシン。
9)5′−アミノ−2′−テトラヒドロピラニル−N’ −ベンゾイル−51− デオキシシトシンから5’−N−(p−アニシルジフェニルメチル) −sl− アミノ−21−テトラヒドロピラニル−N4−ベンゾイル−51−デオキシシト シン。
1o) 5’−アミノ−21−テトラヒドロピラニル−N” −イソブチリル− 5′−デオキシグアノシンからs + −N−(P−7ニシルジフエニルメチル )−sl−ア、 、 −21−テ)ラヒドロビラニルーH1−インブチリル−5 ′−デオキシグアノシン。
11)5’−アミノ−21,sl−ジデオキシ−Nt−ベンゾイルアゾlシンか ら5’−N−トリフェニルメチル−51−アミノ−21,51−ジデオキシ−N t−ベンゾイルアデノシン。
12)5’−アミノ−21,sl−ジデオキシ−N鵞−イソブチリルグアノシン から5’−N−)ジフェニルメチル−5′−アミノ−2’、5’−ジデオキシ− N1−インブチリルグアノシン0 1!S) 5’−アミノ−21,51−ジデオキシ−N6−ベンゾイルシチジン から5’−N−)リフェニルメチルーs+−アミノ−2′、5′−ジデオキシ− N4−ベンゾイルシチジン0 1す5′−アミノ−21,51−ジデオキシウリジンから5’−N−)ジフェニ ルメチル−51−アミノ−21,sl−ジデオキシウリジン。
1s) 5’−アミノ−zl、 sl−ジデオキシイノシンから5’−N−トリ フェニルメチル−51−アミノ−21,sl−ジデオキシイノシン0 16) 5’−アミノ−21−テトラヒドロピッニルーsl −デオキシウリジ ンから5’−N−)リフ二二ルメチルーー51−アミノ−21−テトラヒト田ピ ラニルー5′−デオキシウリジン。
17)5’−アミノ−21−テトラヒドロピラニル−5l−デオキシチミジンか ら5’−N−トリフェニルメチル−5′−アミノ−21−ナト2ヒト四ピラニル ー5′−デオキシイノシン。
18)5’−アミノ−21−テトラヒドロピッニル−N1−ベンゾイル−5′− デオキシアデノシンから5’−N−トリフェニルメチル−5′−アミノ−2′− テトラヒドロピッエル−N−−ベンシイ#−5’−デオキシアデノシン。
19)5’−アミノ−21−テトラヒドロピラニル−N4−ベンゾイル−5′− デオキシシトシンから5’−N−)ジフェニルメチAl−5’−アミノ−21− テトラヒドロビラニルーN4−ベンゾイル−51−デオキシシトシン。
20)5’−アミノ−21−テトラヒドロピラニル−Nt −インブチリル−5 1−デオキシグアノシンから5’−N−トリフェニルメチル−5′−アミノ−2 1−テトラヒドロピッニル−Nt−イソブチリル−51−デオキシグアノシンO ン: 5′−7ミノー51−デオキシチミジン(t211i150ミリモル)及びN− ベンジルオキシカルボニル−6−アミノヘキサン酸p−ニトマフェニルエステル (212,9、&5”すそル:下記の注を参照)を無水DMF(25d)に溶解 し及び3日室濃で攪拌した。次いで、溶液を減圧下で回転蒸発乾固させて黄色固 体を生じ、これを乾燥エチルエーテルを何回か変えて粗粉砕した。白色粉末状生 成物を、次いでr過し、ジエチルエーテルでよく洗浄し、真空デシケータ−中で 乾燥して2.511!(471リモル、95≦)となった。
注:N−ベンゾイルオキシカルぎ品ルー6−アミツヘキf :y 19 p−二 )胃フェニルエステルは、エチルアセテート溶液中のN−ベンジルオキシカルボ ニル−6−アミノへキサン@(シグマケミカルカンパニー)、p−ニドマフエノ ール(アルドリッチケミカルカンパニー)及びN。
Nl−ジシクUへキシルカルボジイミド(アルドリッチケミカルカンパニー)か ら様態技法によって合成した。
同様に、下記の化合物を11Mする: 1)51−アミノ−21,51−ジデオキシ−N1−ベンゾイル−アデノシンか ら5’−N−(N−ベンジルオキシカルボニル−6−7ミノヘキサノイル)−s l−7ミノー21−51−ジデオキシ−N6−ベンゾイルアゾlシン。
2)5′−アミノ−21,51−ジデオキシ−Hl−イソブチリルグアノシンか ら5’−N−(N−ベンジルオキシカルボニル−6−アミノヘキサノイル) +  51−7ミノ+ 21 、 s l−ジデオキシ−N3−イソブチリルグアノ シン0 3)51−アミノ−21,sl−ジデオキシ−N4−ベンゾイルシチジンから5 ’−N−(N−ベンジルオキシカルボニル−6−アミノヘキサノイル)−51− アミノ−21,51−シデオキシーN4−ベンゾイルシチジン。
4)5I−アミノ−zl、sl−ジデオキシウリジンから5’−N−(N−ベン ジルオキシカルボニル−6−アミノヘキサノイル) + s l−アミノ−21 ,sl−ジデオキシウリジン。
s)s’−アミノ−2’、5’−ジデオキシイノシンから5’−N−(N−ベン ジルオキシカルボエル−6−7ミノヘキサノイル)、−5l−アミノ−21,5 1−ジデオキシイノシン。
6)5′−アミノ−21−テトラヒト田ピラニルー51−デオキシイノシンから s’−N−(N−ペンジルオキシカルボニA/−6−7ミノヘキサノイル)−s l−7ミノー21−テ)ジヒドロビラニル−5′−デオキシイノシン0 7)5′−7ミノー21−テトラヒドロピッエル−N! −イソブチリル−5′ −デオキシグアノシンから5’−N−(N−ベンジルオキシカルボニル−6−ア ミノヘキサノイyv)−5’−アミノ−2′−テFラヒドロビラニル−一一イン プチリル−51−デオキシグアノシン。
8)5′−7ミノーzl、sl−ジデオキシクリジンから5l−N−(N−ベン ジルオキシカルボエル−6−アミノヘキサノイA/) −s l−アミノ−zl 、sl−ジデオキシウリ組成において説明した化合物の3’−0−ホスホルアミ ダイ): ここで、X−前のセクション(物質番号1の組成)において規定した通りであり 、 Ro−低級アルキル、好ましくはメチル或はイソプロピルのような低級アルキル 、或は非芳香族窒素含有接素環、例えばモルホリノ、ピペリジノ、ピロリジノ或 は2.2.46−チトラメチルビベリジノ、 R7−メチル、ベーターシアノエチル、p−ニトリフエネチル、0−クロロフェ ニル或はp−クロロフェニル。
例 JL:下記のホスホルアミダイト化合物を合成するの夷に用いたホスフィン出発 原料を文献の手順に従がって調製した: 1)マクブリッジ、エル、ジエイ(Me Bridg・)及びカルザース、エム 、エッチ9.テトラヘトブンレタース、24.245−248頁(1983年) 。
2)シンハ、エヌ、ディ、(5itiha、 N、 D、 )、ビアーナト、ジ エイ、(Bi@rnat、 J、)、マクマナス、ジエイ。
(Me Manui 、 J、 )及びコスタ−、エッチ、 (Koster、  H,)+Nut1. Ac1ds R@1.、12.4539−4557頁( 1984下記式を有する5’−N−p−アユシルジフェニルメチル−5′−アミ ノ−51−デオキシチミジン−3′−〇−ベーターシアノエチルーN、N−ジイ ンプレビルアミノホスホルアミダイト: キシチミジン(cL7851!、tstリモル)を、N、 N−ジイソプマビル エチルアミン(tsd)を含有スルトした。クロロ−N、N−ジーイソプロビル アミノーペーターシアノエ)キシホスフィン((L70d、五0ミリモル)を注 射器から溶液に約1分かけて滴下し及び反応を室温で攪拌した。エチルアセテ− )ニトリエチルアミン(? 9 =1マ/マ)中で展開させたシリカゲル60  F −254プレー)上のTLCは、反応が30分後に完結したことを示した0 次いで、無水メタノール((Llllj)を加えて過剰のホスフィチル化(ph oすh口ylat1ng )剤を分解し、反応を更に数分攪拌した。反応混合物 を、次いで1エチルアセテート(SOV、あらかじめ10%(v/マ)の冷炭酸 ナトリウム祷液50Iltで洗浄した)による分液漏斗に移し、10≦(W/マ )の冷炭酸すFリウム水溶液(8〇−分)で2回及び飽和冷塩化ナトリウム水溶 液(8〇−分)で2回洗浄した。有機溶液(、次いで、無水硼酸ナトリウムで乾 燥し、r過し、減圧下で回転蒸発させて透明な7オームになった。7オームをド ライエチルアセテ−)(10−1511j)に溶解し、この溶液を一78℃(ド ライアイス/アセトン浴)のへキサン(200d)に滴下した。沈降した生成物 をf過し、−78℃のヘキサンでよく洗浄し、真空デシケータ−内で乾燥して白 色粉末状固体CL932Jl(t31tリ−T−A/、87%)を生じた。生成 物の構造を更にベルジュクテリクム置換したアセトニトリル中の”HNMR分光 分析法によって確認した。ベルジエクテリクム置換したアセトニトリルにおけp pmにおける2つの一重線(シングレット)(ベルジュウテリクム置換したアセ トニトリル中のリン酸に対して)及び微量のみ(〈5%)の他のリン含有不純物 を示した。シリカゲルLQ6DFプレート上の上配溶fI&系におけるTLCは 、ジアステレオマー生成物により、短波U”l/検出下で2つの密接に移動する スボツ)、Rfα87及びcL92を示した。これらのスゴットは、過塩素戯: エタノール溶液(52マ/マ)に暴露した際に、p−7ニシルジフエニルメチル カチオンに特有の黄−オレンジ色となつた。
り田ローN、N−ジイソプロピルアミノ−、ベーターシアノエトキシホスフィン の代りにクロロ−N、N−ジイソプロピルアミノメトキシホスフィンを用いて上 記の例を繰り返した場合に、5’−N−p−アニシルジ7工二ルメチルー5′− アミノ−5′−デオキシチミジン−3′−〇−メチルーN、N−ジイソプロピル アミノホスホルアミダイFを得た。
同様に下記の化合物を調製する: 1)5’−N−p−アユシルジフェニルメチル−5’−アミノ−51−デオキシ チミジン−3′−〇−メチルーN、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイ ト。
2)5’−N−、−アニシルジフェニルメチル?子9佇15デオキシチミジン− s’−o−メチル−N、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
3)5’−N−p−アユシルジフェニルメチル−51−アミノ−5′−デオキシ チミジン−3′−〇−メチルモルホリノホスホルアミダイト。
4) 5 ’−N −p−7ニシfiy’)yx9”’5 ’−7ミ/ −5′ −デオキシチミジン−3′−〇−ベーターシアノエチルモルホリノホスホルアミ ダイト。
5)5’−N−p−アユシルジフェニルメチル−51−アミノ−5′−デオキシ チミジン−s’−o−p−ニトロ7エネチルーN、N−ジメチルアミノホスホル アミダイトっ 6)5’−N−p−アニシルジフエニ4も−1−アミノ−51−デオキシチミジ ン−31−〇−ベーターシアノエチルーN、N−ジメチルアミノホスホルアミダ イト。
7)5’−N−p−アニシルジフェニルメチルーs I −アミノ−21、s  l−ジデオキシウリジン−3’−0−ベーターシアノエチルーN、N−ジイソプ ロピルアミノホスホルアミダイト。
8)5’−N−p−アニシルジフェニルメチルーs l −アミノ−2+ 、  s +−ジデオキシイノシシ−3−〇−メチルーN、N−ジイソプロピルアミノ ホスホルアミダイト。
9)5’−N−p−アユシルジフェニルメチル−51−アミノ−N・−ベンゾイ ル−2+ 、 s +−ジデオキシアデノシン−s’−o−メチル−N、N−ジ メチルアミノホスホルアミダイト。
10)5’−N−、−アユシルジフェニルメチル5′−アミノ−N4−ペンシイ /I/−21151−ジデオキシシトシン−31−〇−メチルモルホリノホスホ ルアミダイト。
11)5’−N−p−アユシルジフェニルメチル5′−アミノ−N1−インブチ リル−2’、5’−ジデオキシグアノシン−31−〇−ベーターシアノエチルモ ルホリノホスホルアミダイト。
12)5’−N−p−アユシルジフェニルメチル5′−アミノ−21−テトラヒ ドロピラニ1LI−s l−デオキシウリジン−s ’−0−p−二トロ7エネ チルーN、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
13)5’−N−p−アユシルジフェニルメチル51−アミノ−2′−テトラヒ ドロピラニル−51−デオキシイノシン−3′−0−ベーターシアノエチル−N 、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
14)5’−N−p−アニシルジフエエルメチル5′−アミノ−21−テトラヒ ドロピレニル−N6−ペンゾイ1v−s’−デオキシアデノシン−3′−〇−ベ ーターシアノエチルーN、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。
15)5’−N−p−アユシルジフェニルメチル51−アミノ−2′−テトラヒ ドロピレニル−N4−ベンゾイル−5l−デオキシシトシン−3′−0−メチル −N、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。
16)5’−N−P−アユシルジフェニルメチル5′−アミノ−21−テトラヒ ドロピレニル−HR−イソブチリ/I/−5’−デオキシグアノシン−31−〇 −メチルーN。
N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
内の好ましい化合物群である5′−〇−保護された21−アミノ−21−デオキ シウリジン及び5′−〇−保護された2’−N−アミノアシ/I/−21−アミ ノ−21−デオキシウリジンの2“−N−保護された誘導体:ここで、凡=トリ 7エ二と13ツ71リチル)、p−アニシ〃ジフェニルメチル(モノメトキシト リチ#、MMT)、ジ−p−アニシルフェニルメチ/I/(ジメトキシトリチル 、DMT)9−フェニルキサンテニル(ビキシル)、ジーO−アニシルー1−ナ フチルメチル、p−アニシルー1−す7チルフ工ニルメチル等g X=S式に伴なう発明の詳細な説明において規定した通りの標準の窒素保護基j 好ましくは、X=)リフルオロアセチ#(Tfa)、9−フルオレニルメチルオ キシカルボニル(Fmoc)、)リフェニルメチル(トリチA/)或はp−アニ シルジフェニルメチル(また−モノメトキシトリチル、MMTとも呼ばれる)。
式は、また、化合物(X=U)を活性化された適当に保護されたアミノ酸誘導体 と反応させて生成する関連のある化合物群を包含する1この場合、XはX=Y− Nlll−(GHQ)。−COによって表わされ、ここで、Y=本明細書中前に Xについて規定した通りの標準の窒素保護基、特に本明細書中前にXについて好 ましいとしてリストしたもの+Q=任意の通常のアミノ酸側鎖1n=1〜約12 、通常n<−=6+n=1の場合、Qは下記のような部分を含み、これらに6定 されない:H(アミノ酸グリシンから)、メチル(アミノ酸アラニンから)、イ ソプロピル(バリン)、ベンジル(フェニルアラニン)、p−ヒトルキシベンジ /I/(チフシン)、力〃ボキシメチル(アスパラギン酸)、カルボキシエチ/ I/(グルタミン!t)、4−アミノブチル(リシン)、イミダゾリル−メチル (ヒスチジン)、インドリルメチ/I/(トリプトファン)、メルカプトメチル (シスチン)或はヒトレキジメチル(セリン)+n)1の場合、Qは通常■であ り1例えばn=2の時、対応するアミノ酎ベーターアラニンでありln=3の時 、4−アミノ酪酸1n=5のとき、6−アミノヘキサン酸。QがOR,SE:% Co、u或はNU、のような反応性部分を含有するならば、これらもまた標準の 基で適当に保護する(このような基の十分な記述については、ガイガー及びフー ニング、「ザヘブチズ:アナラシス、シンセシス、バイオロギーjを参f@)。
この化合物群では、保護されたアミノ基をヌクレオシドの精魂から空間的に取り 失って、その反応性を向上させるか、戒はアミノ基に付されるべき「標&!lj からDMA鎖を空間的に分離する。
式は、また、線状様式で結合された1より多いアミノ酸(ペプチドと呼ぶ)を化 合物(X−H)に結合させることによってこの後者の群に関連した化合物群を包 含する蓼この場合、XF′1X=Y−(NH−(CHQi)n−Co)、、によ って表わされ、ここで、Y及びnは本明細書中前に規定した通りであり、種々の Qiは本明細書中前にQについて規定した通りであり、i=1〜mの最大値、r n = 1〜約100100lは前のパラグラフにおいて規定した群を表わす。
一デオキシウリジン、2 ’−N−(N−ベンジルオキシ−デオキシウリジン及 び2′−トリフルオ四アセトアミドー21−デオキシウリジンの合成は下記に示 されてしする: バーヘイドン、ジエ仁ビー、エッチ0.ウェイシナ−。
デ仁 (Wag@n@r、 D)及びモファット、ジエイ、ジー、。
ジャーナルオプオーガニツクケミストリー、36.25〇−254頁(1971 年)。
シャーマツアール、ニー、(8barma、 R,人、)、ボペク。
エム、 (Eobek、M、)及びブロック、ニー、 (Bloeh、人、)。
J、Med、Cham、 1 B、955−957頁(1975年)。
イマザワ、エム、及びエックスタイン、エフ、ジャーナルオプオーガニツクケミ ストリー、44.2039−2041頁(1979年)。
般的に上記文献に見られる手順に従力2つた:1)2′−アジド−21−デオキ シウリジンをシリカゲルの代りにメタノ−/I/ニア七トン(1:1マ/マ)中 の中性アルミナのカラムで精製した寥 2)2′−アミノ−21−デオキシウリジンは、トリフェニルホスフィン及びア ンモニアを使用する代りに、炭素上にパラジウム5%を付着した触媒の存在にお し1て2′−アジド−2′−デオキシウリジンを水素で還元して得たl 3)2′−7ミノー21−デオキシウリジンのN−)リフルオロアセチル化はp −二トロフェニルトリフルオロアセテートを用いた後に、S−エチルチオールト リフルオロアセテートを使用する代りに、クロロホルム−メタ/−A/(6:  1v/v)中のシリカゲルのカラムクロマトグラフィーによって行なった。
例4 下記式を有する51−0−ジ−ルーアエシルフェニルメチル−2’−N−)リフ ルオロアセチル−2′−アミノ−21−デオキシウリジン: 2 ’−N−)リフルオロアセチル−2′−アミノ−2′−デオキシウリジン( 1259,18ミリモル)を無水ピリジン(s aILl)に溶解し、ジーp− アニシルフェニルメチルク田リドC1429,4,2ミリモル寥アメリカンバイ オニュークリアーコーポレーション)を加えた。
オレンジ溶液を、次いで、くらがりで室温において一晩攪拌した。水(1od) を加え、混合物を更に1時間攪拌した。溶媒を40°Cで回転蒸発させて除いて 樹脂状生成物とし、これをトルエン(1001Lt分)で2回#蒸発させたつフ オーム状生成物を水(50d)とエチルアセテート(100m)との間に分配さ せ、層を分離し、有機層を水(50d)及び飽和塩化ナトリウム水溶液(501 Lt)で抽出した。エチルアセテート溶液を無水硫酸ナトリウムで乾燥し、濾過 し、蒸発させて黄色フオームになった。このフオームを歩容量のエチルアセテー トニトリエチルアミン(’ 9 : i v/v)に溶解し及び同じ溶媒中に注 入したシリカゲルのカラム(3αX 25 cnr )にかけた。カラムをエチ ルアセテート:トリエチルアミン(9: 1 v/v)で溶出し?生成物を含有 する留分をプールし及び蒸発させて透明なガラス状固体になった。生成物を最少 容量のエチルアセテート(約10m1)に溶解し及び室温のヘキサン(100d )に沈殿させた。ゼラチン状の沈殿を濾過し及び真空デシケータ−内で乾燥して 結晶化されない白色粉末2.06g(5,5ミリモル、86%)トなった。クロ ロホルム:エタノール(9: 1 v/v)で展開させたシリカゲル60F−2 54プレート上の精製した生成物のTLC分析は短波UV検出により1つのスポ ット、Rf α6Ωを示し、これはプレートに過塩素酸:エタノール溶液(S  : 2 v/v)を吹付けた後に、ジ−n−アユシルフェニルメチルカチオン特 有の鮮オレンジ色となった。生成物の構造を更にベルシュウチリウム置換したジ メチルスルホキシド中のIHNMR分光分析法によって確認した。シュウチリウ ム置換したクロロホルム(アルドリッチケミカルカンパニー)中の7ツ@(1q F)NMR分光分析法は、単一のトリ2ルオロア七チル基について予期される通 りに405 ppmに1つの一重線を示シタ(シュウテリム置換したクロロホル ム中のトリフルオロ酢酸に対して)。
同様に、下記の化合物を調製する: 1)S’−Q−ジ−p−7ニシルフエ二ルメチルー2′−N−トリフルオロア七 チルー21−アミノ−2′−デオキシイノシン。
2)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−)リフルオロアセ チル−21−アミノ−N−−ベンゾイル−2′−デオキシアデノシン。
3)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−トリフルオロアセ チAl−2’−アミノ−N4−ベンゾイル−21−デオキシシトシン。
4)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−トリフルオロア七 チルー2′−アミノ−N寞 −イソブチリル−21−デオキシグアノシン。
5)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチh−2’−N−(q−フルオレニ ル−メチルオキシカルボニル)−2’−アミノル21−デオキシイノシン。
6)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(9−フルオレニ ル−メチルオキシカルボニル)−2′−アミノ−N−−ベンシイy−2’−デオ キシアデノシン。
7)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(9−フルオレニ ルメチルオキシカルボニル%り−21−アミノ−N4−ペンシイ、A/−2’− デオキシシトシン。
s)s’−o−ジ−ルーアエシルフェニルメチル−21−N−(9−フルオレニ ルメチルオキシカルボニル)−21−アミノ−N3−インブチリル−2′−デオ キシグアノシン0 9)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(9−77メオレ ニルーメチルオキシカルボニル)−2′−アミノ−2′−デオキシウリジン。
例5 下記式を有する51−0−ジ−p−アユシルフェニルメチ/I、 −2l−5− (N−)リフルオロアセチルグリシ、 ) −21−アミノ−2′−デオキシウ リジン:2l−N−グリシル−21−7ミノー21−デオキシウリジン(t29 、toミリモル)及びp−ニトロフェニル) IJ フルオ豐アセテート(12 g、5.1ミリモル暮アルドリッチケミカルカンパニー)を無水DMF(20t j)K溶解し、混合物を室温で一晩攪拌した。反応混合物を次いで50℃で回転 蒸発乾固させ、ガム状の黄色残分をエチルアセテート:メタノ−I%/(95: 5マ/マ)中のシリカゲル60のカラム(z5cnI×10インチ(25cll I))でフラッシュクロマトグラフィーにかけた(スチル、ダプリュ、シー、  (stitx、w、 c、 ) 、カーン、エム、(Kahn。
M、)及びミトラ、ニー、(Mltra、ム、)ジャーナルオブオーガニツクケ ミストリー、43.2925−2925頁(1978年)を参照)。生成物を含 有する留分を蒸発乾固させて白色7オームcts9、五7ミリモル、93%)と なり、これを結晶化させずに直接次の工程で使用した。
上記の物質(tSり、エフミリモル)をドライピリジン(!!ロー分)で2回蒸 発させ、残分をドライピリジン(5od)に溶解した。N、N−ジメチル−ラミ ノビリジン(25af、Q、19ミリモル)、トリエチルアミン(α8m!7. 5.2ミリモル)及びジーp−アニシル7工二ルメチルクロリド(154g、4 .4”リモル)を加え、オレンジ混合物を室温で一晩攪拌した。次いで−1炭酸 ナトリウム水溶液(5%W/マ、5oILt)を加え、混合物をもう15分攪拌 したつ混合物をエチルアセテート(1001分)で2回抽出し、−緒にしたエチ ルアセテート層を1度飽和塩化ナトリウム水溶1v(504)で洗浄し、無水硫 酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、蒸発乾固させた。
トルエン(100R1分)と2回共蒸発させた後に、フオーム状黄色生成物を、 クロ田ホルム:メタノール:トリエチルアミン(89: 10 : 1 v/v )を溶離剤として用いてシリカゲルのカラム(3cmX 25 CM)のクロマ トグラフィーによって精製した。生成物を含有する習分をプールし及び蒸発乾固 させて透明なガラス状固体になったっこの物質を最少のエチルアセテート(約1 01Lt)に溶解し及び室温のヘキサン(300′ml)に沈殿させた。生成物 を一過し及び真空デシケータ−内で乾燥して粉末状白色固体となり、これはベン ゼン/ヘキサンから結晶化することができた。ジクロロメタン:メタノール(9 2:8 v/v )中で展開させたシリカゲル60ア−254プレート上の精製 した生成物のTLC分析は短波UV検出により1つのスポット、Rfα33を示 し、これはプレートに過塩素酸:エタノール溶液(3:2v/マ)を吹付けた後 に、ジ−n−7ニシルフエニルメチルカチオン特有の鮮オレンジ色となった。生 成物の構造を更にべ〃シュウチリウム置換したジメチルスルホキシド中のI H NMR分光分析法によって確認した。シュウチリウム置換したクロロホルム中の ”F NMR分光分析法は、単一のトリフルオ四ア七チル基について予期される 通りに5.98ppmに1つの一重線を示した(シュウチリウム置換したクロロ ホルム中のトリフルオロ酢酸に対して)、)同様に、下記の化合物を調製する: 1)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−トリフルオ ロ−アセチルグリシル) −21−アミノ−N2−インブチリル−2′−デオキ シグアノシン。
2)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−トリフルオ ローア七チルグリシル) −21−アミノ−2′−デオキシイノシン。
り5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−トリフルオロ −アセチルグリシル)−2’−7ミノーN6−ペンゾイルー2′−デオキシアデ ノシン。
4)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−)リフルオ ローア七チルグリシル) −21−アミノ−R4−ベンゾイル−21−デオキシ トノシン。
s)s’−o−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−9−フルオ レニルメチルオキシカルボニル−グリシ/l/)−2′−アミノ−R8−インブ チリル−21−デオキシグアノシン。
6)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’−N−(N−9−フルオ レニルメチルオキシカルボニル−グリシル) −21−アミノ−2′−デオキシ ウリジン。
7)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチA/−2’−N −(N−9−フ ルオレニルメチルオキシカルボニル−グリシル) −21−アミノ−2′−デオ キシイノシン。
8)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−9−フルオ レニルメチルオキシカA/〆ニルーグリシル)−21−アミノ−N・−ベンゾイ ル−2′−デオキシアデノシン。
9)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチA/−2’−N−(N−9−フル オレニルメチルオキシカルボニル−グリシル)−2′−アミノ−R4−ベンシイ 、1%/−2′−デオキシシトシン。
物質番号4の組成: 下記の一般式を有する、物質番号3の組成において説明した化合物の3′ −〇 −ホスホルアミダイト:■ ここで、R=前のセクション(物質番号5の組成)において規定した通りである ; X=前のセクション(物質番号3の組成)において規定した通りである: R0=低級アル中ル、好ましくはメチル或はイソプロピルのような低級アルキル 、或は非芳香族窒素含有複素環、例えばモルホリノ、ピペリジノ、ピロリジノ戒 はλλへ6−チトラメチルピペリジノ。
Rv=メチル、ベーターシアノエチル、p−ニトロ7エネチル、o−1’ロロフ ェニyt、ハp −/ロロフェニル。
例 このセクションで説明する手順は、「物質番号2の組成」なる表題のセクション で説明したのと本質的に同じである。下記のホスホルアミダイト化合物を合成す るのに用いたホスフィ/出発原料は、そのセクションで挙げこ文献参考資料に従 かつ″′r:調製した。
例6 下記式を有する5′ −0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’ −N−) リフルオロアセチル−21−アミノ−21−デオキシウリジン−3′ −〇−メ チルーN。
N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト:5′−0−ジ−p−アユシルフ ェニルメチル−21−N −) IJフルオロアセチル−2′−アミノ−2′− デオキシウリジン(α95Jil、1.5ミリモル)を、N、N−ジイソプロピ ルエチルアミン(1,svt、s、oミリモル)を含有するドライジクロロメタ y(1o−1五酸化リン、次いで水素化カルシウムから蒸留して乾燥した)に溶 解した。溶液な乾炊アルゴン雰囲気下室温で攪拌し及びクロロ−N、N−ジイン グロビルアミノメトキシホスフィン(Ol 5d、 2.4ミリモ/L/)を注 射器から約1分かけて滴下した。エチルアセテート:トリエチルアきン(99:  1v/v)において展開させたシリカゲル60F−254プレート上のTLC は、反応が30分後に完結したことを示した。次いで、無水メタノール(α1− )を加えて過剰のホスフィチル化剤を分解し、反応を更に数分攪拌した。反応混 合物を、次いで、エチルアセテ−)(50rj、あらかじめ10チ(w/v)の 冷炭酸ナトリウム水溶液5(1gltで洗浄した)による分液漏斗に移し、10 チ(W/v)の冷炭酸す)IJウム水触触液8〇−分)で2回及び飽和冷塩化ナ トリウム水溶液(8〇−分)で2回洗浄した。有a溶液を、次いで、無水硫酸ナ トリウムで乾燥し、濾過し、減圧下で回転蒸発させて透明なフオームに々つだ。
7オームをドライエチルアセテート(1o−1s−)に浴解し、この溶液を一7 8℃(ドライアイス−アセトン浴)のへキサン(20o−)に滴下した。沈降し た生成物を濾過し、−78℃のヘキサンでよく洗浄し、真空デシケータ−内で乾 燥して白色粉末状固体1.04 f/ (1,5ミリモル、87%)を生じた。
生成物の構造にぺ〃シュウチリウム置換したアセトニトリル中の’HNMR分光 分析法によって確認した。ベルシュウチリウム置換したアセトニトリyにおける ”PNMR分光分析法は、ジアステレオツーホスホルアミダイト生成物について 予期される通りの15111及び15CL45ppmにおける2つの一重M(ベ ルシュウチリウム置換したアセトニトリル中のリン酸に対して)及び極めて微量 のみ(<1%)の他のリン含有不純物を示した。シュウチリウム置換したクロロ ホルムにおゆるI”F NMR分光分析法も、また、隣接するキラルリンのわず かな影響により、α42及びα58ppmKmいて2つの一重線を示した(シュ ウチリウム置換したクロロホルム中のトリフルオロ酢酸に対して)、シリカゲル LQ6DFプレートの上記溶媒系におけるTLCは、短波UV検出下で1つだけ のスボツ)、Rfα96を示した。このスポットは、過塩素酸:エタノール溶液 (3: 2 v / v )に暴露したIIK、ジ−p−アユシルフェニル−メ チルカチオンに特有の鮮オレンジ色となった。
同様に、下記の化合物を調製する: 1)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−)リフルオロアセ チル−21−アミノ−2′−デオキシウリジン−31−0−ベーターシアノエチ ル−N、N−ジインプロピルアミノホスホルアミダイト。
2)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−トリフルオロアセ チル−21−アミノ−2′−デオキシウリジン−5’−0−メチル−N、N−ジ メチルアミノホスホルアミダイト。
s)s’−0−ジ−p−7ニシルフエニ〃メチル−21−N−トリフルオロアセ チル−2′−アミノ−2′−デオキシウリジン−51−0−メチル−モルホリノ ホスホルアミダイト。
4)5’−0−ジ−p−7ニシルフエニルメチルー21−N −) I7 フル オロアセテルー21−アミノ−21−デオキシウリジン−31−〇−ベーターシ アノエチルーモルホリノホスホルアミダイト。
5)S’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2+ −N−)リフルオロア セチル−21−アミノ−2′−デオキシウリジン−3’−0−p−ニトロフェネ チル−N、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
6)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’−N−)I7フルオロア セチルー2′−アミノ−21−デオキシウリジン−s’−o−ベーターシアノエ チル−N、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
7)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−トリフルオロアセ チル−2′−アミノ−21−デオキシツノシン−31−〇−メチルーN、N−ジ イソプロピルアミノホスホルアミダイト。
a)s’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチ)%/−2′−N−)リフルオロ アセチル−2′−アミノ−N@−ヘyシイ)v −2’−デオキシアデノシンー 31−〇−メチル−N、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
9)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−トリフルオロアセ チル−2′−アミノ−N4−ベンゾイル−2′−デオキシシトシン−s’−0− メチルーモルホリホスホ〃アミダイト。
10)5’−0−ジーp−アニシルフェニルメテル−21−N−トリフルオロア セチA/−2’−アミノーN″−インブチリルー21−デオキシグアノシン−5 1−〇−ベーターシアノエチルモルホリノホスホルアミダイト。
11)5′−O−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−)IJフルオロ アセチル−2′−アミノ−21−デオキシイノシン−3′−O−ベータシアノエ テル−N、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
12)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチ/L/−2’N−(−9−フル オレニ〃メチルーオキシカルボニル)−2′−アミノ−2′−デオキシウリジン −5′−0−ベーターシアノエチル−N、N−ジイソプロピルアミノホスホルア ミダイト。
13)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’N−(−9−フルオレ ニルーメチルーオキシカルボニル)−21−アミノ−2′−デオキシクリジン− 3′−メチル−N、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。
14)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチ/l/−2’N−(−9−フル オレニル−メチ〃−オキシカルボニル)−2′−アミノ−2′−デオキシウリジ ン−3′−〇−メチルーN、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
1s)5’−0−ジーp−アニシ/l/フェニ〃メチル−2’N−(−9−フル オレニル−メチル−オキシカルボニル)−2′−アミノ−2′−デオキシウリジ ン−3′−〇−メチルーモルホリノホスホルアミダイト。
16)5’−0−ジーp−アニシ〃フェニルメチル−2’N−(−9−フルオレ ニル−メチル−オキシカルボニル)−21−アミノ−21−デオキシウリジン− 3′−O−ベール−シアノエチル−モルホリノホスホルアミダイト。
17) 5 ’ −0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21N−(−q−フ ルオレニル−メチル−オキシカルボニル)−21−アミノ−21−デオキシウリ ジン−3“−〇−p−二トロ7エネチルーN、N−ジメチルアミノホスホルアミ ダイト。
1a)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’N−(−9−フルオレ ニル−メチル−オキシカルボニル)−2′−アミノ−2′−デオキシクリジン− 31−〇−ベーターシアノエチルーN、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト 。
19)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’N−(−9−フルオレ ニル−メチル−オキシカルボニル)−21−アミノ−2′−デオキシイノシン− 3′−〇−メチノJ−1〜.N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。
20)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’N−(−9−フルオレ ニル−メチル−オキシカルボニル)−21−アミノ−N6−ペンゾイルー21− デオキシアデノシン−5’−0−メチ、F/−N、N−ジメチルアミノホスホル アミダイト。
21)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’N−(−9−フルオレ ニル−メチル−オキシカルボニル)−21−アミノ−N4−ベンゾイル−21− デオキシシトシン−3′−〇−メチルーモルホリノホスホルアミダイト。
22)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’N−(−9−フルオレ ニル−メチル−オキシカルボニル)−2′−アミノ−Nt −インブチリル−2 1−デオキシグアノシン−5′−0−ベーターシアノエチル−モルホリノホスホ ルアミダイト。
23)5’−0−ジ−p−7ニシルフエニルメチルー2’N−(−9−7〃オレ ニy−メチ〃−オキシカルボニル)−2′−アミノ−2′−デオキシイノシン− 31−〇−ベーターシアノエチルーN 、 ?J−ジメチルアミノホスホル下記 式を有する5゛−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’−N−(N−)リ フルオロアセチルグIJ X/ル)−21−アミノ−21−デオキシウリジン− 3′−0−メチル−N * N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト: 5′−〇−ジーp−アニシルフェニルメチル−2’−N−(N−トリフルオロア セチル−グリシル) −2’−7ミノー21−デオキシウリジン(1,071! 、1.5ミリモル)を、N、N−ジイソプロピルエチルアミン(1,3gIt。
5、.0ミリモル)を含有するドライジクロロメタン(1〇−1五酸化リン、次 いて水素化カルシウム力・ら蒸留して乾燥した)に溶解した。溶液を乾燥アルゴ ン雰囲気下室源で攪拌し及びクロロ−N、N−ジイソプロピルアミノメトキシホ スフィン(l145d、2.4ミリモル)を注射器から約1分かけて滴下した。
エチルアセテート:トリエチルアミン(99:1v/v)において展開させたシ リカゲル6op−2s4プレート上のTLCζ家、反応が30分後に完結したこ とを示した。無水メタノール([lL1+d)を加えて過剰のホスフィチル化剤 を分解し、反応を更)C数分攪拌した。反応混合物を、次いで、エチルアセテ− )(soi、あらかじめ10チ(w/v)の冷戻1zナトリウム水溶g、50m gで洗浄した)による分液漏斗に移し、10 % (w /マ)の冷炭酸ナトリ ウム水溶液(8〇−分)で2回及び飽和冷塩化ナトリウム水溶液(8〇−分)で 2回洗浄した。有機溶液を無水F!f、酸ナトリウムで乾燥し、濾過し、減圧下 で回転蒸発させて透明なフオームに乏っだ。フオームをドライエチルアセテ−) (10−15艷)に溶解し、この溶液を一78℃(ドライアイス−アセトン浴) のヘキサン(20oag)に滴下した。沈降した生成物を濾過し、−78℃のヘ キサンでよく洗浄し、真空デシケータ−内で乾燥して白色粉末状固体1.251 7 (1,4ミリモル、93%)を生じた。生成物の構造をベルシュウチリウム 置換したアセトニトリル中の’HNMR分光分析法によって確認した。ベルシュ ウチリウム置換したアセトニトリルにおけるAlpNMR分光分析法は、ジアス テレオマーホスホルアミダイト生成物について予期される通りの151.25及 び14&96ppmにおける2つの一重級(ベルシュウチリウム置換したアセト ニトリル中のリン酸に対して)及び極めて微量のみ(<29りの他のリン含有不 純物を示した。シュウチリウム置換したクロロホルムにおける”FNMR公党分 析法はα66 ppmにおける1つの−M線を示した(ジュクテリウム置換した トリフルオロ酢aK対して)。シリカグ#LQ6DFプレート上の上記溶媒系に おけるTLCは、短波UV検出下で1つのみのスポット、Rfα91を示した。
このスポットは、過塩素酸:エタノール溶液(5: 2 v / v )に暴露 した際に、ジ−p−アユシルフェニルメチルカチオンに特有の鮮オレンジ色とな った。
同様に、下記の化合物を調製する: 1)s’−0−ジ−p−7ニシルフエニルメチルー2 ′++N−(N−)リフ ルオロアセチル−グリシル)−2’−アミノ−2′−デオキシウリジン−31− 0−ベーターシアノエチル−N、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト 。
2)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−)リフルオ ロアセテルーグリシル) −2+ ++アミノー2′−デオキシクリジン−61 −〇−メチルーN。
N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
3)5’−0−ジーp−アニシル7工二ルメチル−2′−N−(N−)リフルオ ロアセチル−グリシル)−2′−アミノー21−デオキシクリジン−31−0− メチル−モルホリノホスホルアミダイト。
4)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2’−N−(N−)リフルオ ロアセチル−グリシル) −2′++アミノー2′−デオキ7ウリジ7−5’− 0−ベーターシアノエチル−モルホリノホスホルアミダイト。
s)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N −(N −) I Jフルオロアセチル−グリシル)−2°−デオキシクリジン−3’−0−p−二 トロ7エネff1−N、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
6)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−)す7)v オロアセチルーグリシル)−2’−アミノ−2゛−デオキシウリジン−31−O −ベータシアノエチル−N、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
7)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−トリフルオ ロアセチル−グリシル) −21−アミノ−21−デオキシイノシン−31−〇 −メチy−N。
N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。
a)s’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−トリフルオ ロアセチル−グリシ/I/)−2’−アミノ−N6−ペンゾイルー21−デオキ シアデノシン−3’−0−メチル−N、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト 。
?)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−)リフルオ ロアセチル−グリシル)−21−アミノ−N4−ぺ/シイルー21−デオキシシ トシン=s’−0−エチルモルホリノホスホルアミダイト。
N−(N−)リフルオロアセチル−グリシル)−21−アミノ−21−デオキシ イノシン−31−〇−ベーターシアノエチルーN、N−ジメチルアミノホスホル アミダイト。
11)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2+ −N−(N−トリフ /I/オロアセチルーグリシル) −2+ −アミノ−N@−ベンシイ# −2 ’−デオキシアデノシンー5”−0−p−ニトロフェネチル−N。N−ジメチル アミノホスホルアミダイト。
12)5’−0−ジーp−アニシyフェニルメチル−21−N−(N−トリフル オロアセチル−グリシル)−21−アミノ−1I4−ヘンシイルー21−デオキ シシトシン−s’−0−ベーターシアノエチルモルホリノホスホルアミダイト。
13)5’−0−ジ−p−7ニシルフエニルメチルー2′−N−(N−9−フル オレニル−メチルオキシカルボニル−グリシル)−2′−アミノ−21−デオキ シクリジy−31−O−ベーターシアノエチル−N、N−ジメチルアミノホスホ ルアミダイト。
14)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−9−フル オレニル−メチルオキシカルボニル−グリシル) −21−アミノ−2′−デオ キシイノシノー3’−0−ベーターシアノエチル−N、N−ジメチルアミノホス ホルアミダイト。
1s)s’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチA−2’ −N−(N−9−フ ルオレニル−メチルオキシカルボニル−グリシ//)−2’−アミノ−N@−ベ ンゾイル−21−デオキシアデノシン−31−0−p−ニトロフエネテμmN、 N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
16)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2T −N−(N−9−フ ルオレニル−メチルオキシカルボニル−グリシル)−2′−アミノ−N4−ベン ゾイル−21−デオキシシトシン−3I−o−ベーターシアノエチル−モルホリ ノホスホルアミダイト。
発明の用途 1)51−7ミノ末端を含有するオリゴデオキシリボヌクレオチドの合成。
保護51−アミノ−ヌクレオシドホスホルアミダイトを用いて5′−アミン末端 を含有するオリゴデオキシリボヌクレオチドを合成するのに含まれる段階を例8 の式に示し及び下記のテキストにおいて説明する。
標準のホスホルアミダイ)DNA合成技法(英国、オツクスホード、IRLプレ ス、ゲイト、エム、ジエイ、。
「オリゴヌクレオチドシンセシス:アプラクチカルアプローチJ(1984)、 55−82頁、アトキンソンテイ、 (Atklnaon T、 )及びスミス 、エム及びその中に引用されている参考文献を参照)を用いて、保護5° −ア ミノ−ヌクレオシド−3′ −0−ホスホルアミダイト、好ましくはBn=チミ ン、X −M M T 、 R* =イソプロピル、R7=メチ、I′I/戊は ベーターシアノエチル、最も好マシくはベーターシアノエチルであるものを、固 体支持体に結合された成長オリゴ−デオキシリボヌクレオチドの5′ −ヒドロ キシルにカップリングさせる。簡単に言えば、この手順は無水のアセトニトリル 溶液中の保護5′−アミノーヌクレオシド31−0−ホスホルアミダイトを支持 体に粘合したオリゴヌクレオチドと、不活性雰巳気下1H−テトラゾールの存在 において反応させ、支持体上の生成物から過=」の反応体を洗い去り、次いで、 項基住テトラヒドロフラン不溶液中のヨウ素溶液でホスファイト生成物を酸化し て所望のホスフェートにすることから成る。支持体に結合したオリゴヌクレオチ ドに対し、10〜20倍Airのホスホルアミダイト及び50〜100倍過剰の テトラゾールを用いるのが普通であり;保該5° −アミノホスホルアミダイト を用いて合成する場合、20倍過刺のホスホルアミダイト及び100倍過剰のテ トラゾールが好ましい。こnらの条件下で、hi ki T−保護された(例3 )ホスホルアミダイトは常習的に90−より良好な収率で、通常95チより良好 な収率でカップリングする。カンプリングは6分のカップリング反応時間及び3 分の欧化反応時間を用いて手動により行なうか、或は随伴するブレプログミド合 成サイクルを用いてアプライドバイオシステムメモデル380A自動操作DNA 合成装置(或はホスホルアミダイト化学に適応させるように設計された同様の器 械)により行なうことができる。
51−アミノオリゴヌクレオチドは、次いで、濃水酸化アンモニウム溶液で室温 において少なくとも4時間処理して支持体からDNAを開裂させた後に、DNA 塩基を同じ溶液中55℃において12〜16時間脱保獲することによって得る。
R,=メチルである時、DNAを支持体から開裂させる前に、ジオキ?y中のト リエチルアンモニウムチオ7エンオキシドで室温において1時間処理することも 必要とする。
X = MM Tである時、水散化アンモニウムにおける開裂及び脱保護処理は 、塩基不安定、数年安定のMMTアミノ保護基に影響を与えない。これより、所 望の生成物はM M T部分を51−アミノ基上に保護する。このMMT基は所 望の生成物DNAに増大した疎水性を付与し、C18カラムによるRP HPL C間の保持時間を著しく増大させることになる。不純物混入破損DNAシーケン スは所望のオリゴヌクレオチドよりずっと早くカラムから溶出し、次いで後者が 清浄な、よく分離された様式で溶出する。MMT保5基を、次いで、酢Wl/水 (80:20v/マ)溶液で室温において20〜30分間温和な酸処理して除き 、極めてPI製された遊離アミノオリゴヌクレオチドを生ずることができる。
例8 5’−N−p−7ニシルジフエニルメチルー51−アミノ++ s +−デオキ シチミジン−s’−0−メチル−N、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダ イトを用いた3 ’>HO−CpApTpGPCPTPGl)T−h’H* < sの合成オリゴデオキシリボヌクレオチド 3 ’>HO−CpApTpGpCpTpG−OH<5 ”r:、[9のホスホ #アミダイ)DNA合成技法にニーヨーク。プレナムプレス、セトロク、ニー、 及びホランダー、ジエイ、ケイ。
鰻集「ジエネチツクエンジニアリングJ(1982年)。
a@、1−77頁、カルザース、エム、エッチ6.ビューケージ、ニス、エル( Beaucage + S、 L、 ) + <ツカー瞥シ+、、!7カピツチ 、ダブリz 、 (Efcavitcbv W、 ) 。
フィッシャー、イー、z7.、ガルビワジー−(Gallupi 。
G、)、ゴールドマン、アール0.ドハーゼス瞥エフ・(de Haseth+  F、 ) * マーチン、エフ0.マチラッチ。
エム9.スタビンスキー、ワイ、 (5tabinak7. Y−) )を用い て、手動でアミノプマビルシリカ支持体(結合51−0−ジメトキシトリチル− N4−ベンゾイル−2′−デオキシシチジン約4マイクロキルを含有する)上に 合成した。5′−〇−ジメトキシトリチルチミジン、51−0−ジメトキシトリ チル−N@ −ベンゾイル−2′−デオキシアデノシン s l −Q−ジメト キシトリチル−N4−ベンゾイル−2′−デオキシシトシン及ヒs + −0− ジメトキシトリチル−N! −インブチリル−2′−デオキシグアノシンの31 −〇−メチルーN、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイトを公表された 手順(マクブリッジ、エル、ジエイ、及びカルサース、エム。
エッチ1.テトラヘドロンレターX、24,245−248頁(1983年)) に従がって合成した。合成の各サイクルの後にジメトキシトリチルカチオンの収 率を分光分析法分析して、ヘプタイマーについて総括収率8&8%、段階収率9 7.7チを示した。支持体をMMT−保護されたホスホルアミダイトで処理した 。担体結合されたオリゴデオキシリボヌクレオチドに対して20倍:A剰のホス ホルアミダイト及び100倍過剰の1H−テトラゾールを用い、カンプリング反 応時間を6分及び酸化反応時間を3分にした。
洗浄し及び乾燥した後に、支持体をジオキサン中のトリエチルアンモニウムチオ フェノキクドで1時間処理し、よく洗浄し、乾燥し、しつかりキャップをしたコ ニカル遠心管中湯水酸化アンモニウムで室温において4時間処理した。次いで、 上溌液を支持体からデカントし、濃水酸化アンモニウムの別のアリコートを加え 、溶液をしつかりシールした管(ゴム隔壁)内で55℃において16時間加熱し た。DNA宮有溶液を、次いで、1.5 dエツベンドルフ(Eppenaor f )管にアリコートし、凍結乾燥し、生成したベレットを水に溶解した。オリ ゴヌクレオチド溶液のアリコートを、次いで、2つのアルテックス(Altez ) 11oAポンプ、デュアルチャンバーグラジェントミキサー、レオダイン( Rheodyne )インジェクター、クレイトス(Kratos ) 757 UV−VI Sデテクター、アクシオム(Axxiom ) 710コントロー 2−から成るRPHPLCシステムでクロマトグラフィーにかけた。Vydae  C1sカラム(5ミクoy、25cm)を使用した。
MMT保護された5′−アミノ−5′−デオキシチミジンホスホルアミダイトか ら誇導したアミノオリゴヌクレオチドを、初めに、20チ緩衝液B/80チ緩衝 液人の60チ緩衝液B/40チ緩衝液人への線状勾配を40分にわたって用いて (M衝液A及びBは前で説明した通りである)、ジメトキシトリチル化付加体と してクロマトグラフィーにかけた。これらの条件下で、生成物が59分に溶出し た(流量1gItZ分)。MMT生成物のv4製運転を打力い、生成物を捕集し 及び凍結乾燥し、ベレットを酢酸/水(80:20v/マ)で室温において20 分間処理した。凍結乾燥し及び水に再溶解した後に、アリコートをFmoe9導 オリゴヌクレオクチドの場合と同じ染件を用いてクロマトグラフィーにかけた。
生成物が17.5分に溶出した。精製したアミノオリゴヌクレオチドはDNAt t象徴するUVスペクトル(260nmにおける主ピーク)を有していた。
下記の化合物を同様の方式で用いて対応する5“−アミノオリゴヌクレオチドを 作ることができる:1)5’−N−p−アニシyジフェニルメチルー5′−アミ ノ−5′−デオキシチミジン−3′−〇−メチルーN。
N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。
2)5’−N−P−アユシルジフェニルメチル−5′−アミノ−51−デオキシ チミジン−3′−〇−メチルーN。
N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
3) 5 ’ −N −p−アユシルジフェニルメチル−5′−アミノ−51− デオキシチミジン−s”−o−メチルモルホリノホスホルアミダイト。
4)5’−N−P−アユシルジフェニルメチル−5’−フミノー51−デオキシ チミジン−31−0−ベーターシアノエチルモルホリノホスホルアミダイト。
5) 5 ’ −N −p−アニシルジフェニルメチA/−5’−アミノ−5′ −デオキシチミジン−s’−0−p−二トロ7エネチルーN、N−ジメチルアミ ノホスホルアミダイト。
6) 5 ’ −’N −p−アユシルジフェニルメチル−5a−アミノ−51 −デオキシチミジン−S + ++ O−ベータシアノエチル−N、N−ジメチ ルアミノホスホルアミダイト。
2)5゛−末端に螢光部分を含有するオリゴデオキシリボヌクレオチドの水溶液 における合成。
オリゴヌクレオチドの5° −末端上に核的な脂肪族アミノ基が存在することは 、アミノDNAと種々の電子性試薬、とりわけアミン反応性螢光染料誘導体との それ以上の反応を可能にさせる。このような染料誘導体を1下記を含み、これら に限定されない:フルオレセインイソチオシアネート、テトラメチルローダミン イソチオシアネート、ニオシンインチオシアネート、エリスロシンイソチオシア ネート、ローダミンXインチオファネート、’) t i 7 (lissam lne )ローダミンBスルホニルクロリド、テキサスレッド、ルシ7アーイエ ロー、アクリジン−9−イソチオシアネート、ピレンスルホニルクロリド°・7 −ジエチルアミノー4−メチルクマリフ$−)、4−フルオロ−及び4−クロロ −7−ニドロベンズー2−オキサ−1.5−ジアゾール及びそれらの誘導体、例 工ばスクシンイミジル12−(N−メチル−N−(7−ニドロベンズー2−オキ サ−1.3−ジアゾール−4−イル))アミノドデカノエート。生成した染料− オリゴヌクレオチド接合物( conjcgate )を、次いで、種々の診断 或は検出用に使用することができる。
染料分子をアミノオリゴヌクレオチドに結合させるのに用いる基本的な手順は、 アミノDNA及び染料をpH9にff1%した水性(戒は水性/有機性)溶液中 で結合させ、室温において数時間静置させ、次いで生成物を2段階で絹製するこ とである。過剰の未反応染料を染料−DNA接合物から除き及び未反応のDNA をゲル濾過によって除く。凍結乾燥した後に、RP HPLCを用いて純染料− DNA接合物を得る。
例9 フルオレセイン−5−イソチオシアネートと3’>HO−CpAPTPGPCP TpGPT−NHI <5 ’ との結合51−アミノオリゴヌクレオチドを例 8に記載する通例9についての反応スキーム を33分で溶出した( 2 6 0 nmにおけるUV検出、りにして合成した 。′8製したアミノオリゴヌクレオチド2 4 0 nmにおける螢光励起、5 25nmパンドパスフ例えは無水ピリジン中2o*(v/v)の第三アミン或は 無水ピリジン中α5 Mの1゜8−ジアザビシクロ〔s40〕ウンデカ−7−二 ン(DBU)下、室温においてオリゴヌクレオチドホスフェートトリエステルか らベーター シフ/、!?ル基ヲ取り去ってホス7エートジエステルとすること ができるので、必要である。厳密に無水状態が観測されるならば、このような処 理はDNAに他の影響を与えたり、支持体から認め得る量を開裂したりしない。
自由アミノ基を有するトリエステル含有オリゴヌクレオチドは、染料との迅速な 反応を行なうのに必要とする塩基性の条件下で不安定であり及び分解して今まで のところ未識別の(uneharaeteriged ) D N A様になり 、もはや実施し得るアミン末端をもた力くなるので、ジエステルの生成は臨界性 である。ジエステル形への転化はこの分解を阻止する。
また、数年安定な保護基、例えばp−アニシルジフェニルメチ/l/(MMT) を5′−アミノ−51−デオキシチミジンホスホルアミダイト上に用いてオリゴ ヌクレオチドに51−アミン末端を導入することが必要である。これは、MMT 基が、前述したDNAの環基性分解を防止することを必要とする、ホスフェート 保護基を除くのに必要とする塩基性条件に安定であり、次いで、DNAが支持体 に結合されたままである温和な酸性条件を用いて取り去り、とうして染料と反応 するための遊離アミノオリゴヌクレオチドとすることができるので、必要とする 。
アミノオリゴヌクレオチドへの染料結合は、無水のN。
N−ジメチルホルムアミダイト/第三アミン、好ましくはN、N−ジイソプロピ ルエチルアミン(9o:1゜v / v ) *はトリエチルアミン(80:  20 v / v )中過剰の染料(10〜100倍)を濃溶液で用いて行なう 。
12〜24時間の後に、過剰の染料を洗い去り、染料−DNA接合物を支持体か ら開裂し、及び例8に記載した標準の条件下で濃水酸化アンモニウムを用いて塩 基保護基を取り去る。生成物を次−でRP HPLCによって精固体支持体上で のエオシン−5−インチオシアネート及び−r # ? スv y Y トs  ’>HO−TpTpTpTpTpTpT−h% <5 ’との結合 つ オリゴデオキシリボヌクレオチド S’>HO−TpTPTPTPTpT−OH<5’ を、ベーターシアノエチル 保護ホスホルアミダイト(アメリカンバイオニュークリアコーポレーションから 得るか或は例3に記載した通りにして合成した)を用いて例8に記載する通りに して1マイクロモルスケールで制御された細孔ガラス支持体上に合成した。各サ イクルの後のジメトキシトリチルカチオンの収率の分析は、ヘキサマーについて 総括収率89.6チ、段階収率97.8ヂを示した。5’ −N−p−アユシル ジフェニルメチル−5′−アミノ−s l +デオキシチミジンー3′−0−ベ ーターシアノエチル−N、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイトの最終 付加を例8に記載する通りにして行なった。
DNA約cL5uモルを含有する、完全に保護され、支持体結合されたアミノオ リゴヌクレオチド(支持体的20Tq)のアリコートを、次いで、無水ピリジン (500μり中N、N−ジメチルアミノピリジン(アルドリッチケミカルカンパ ニー)の5チ(、/マ)溶液と無水ピリジン(sonμj)中p−アニシルジ7 工二ルメチルクロリドの10 ’ir (w/マ)溶液との混合物で室温におい て1時間処理した。これは、全ての末端アミノ基を保護することを確実にするた めに行なったもので、染料結合をオリゴヌクレオチド合成のすぐ後で行なうこと ができるならば、おそらく不必要である。支持体を、次に、ドライピリジンでよ く洗浄し、無水ピリジン中15MDBUで室温において2時間処理した。支持体 を再びピリジンで、次いでジエチルエーテルでよく洗浄し及び風乾した。対照と 同じように通常の通りにして、アルコート(約4岬)を採取して開裂し、脱保i し、RP HPLCを行なった。
ドライ支持体結合MMT保護アミノオリゴヌクレオチドを酢酸/水(80:20 マ/Y)で室温において20分間脱トリチル化(detritylate )  した。支持体を、次いで、水及びメタノールで洗浄し及びトリエチルアミンな無 水ピリジンに溶解したもの(20:80マ/マ)で20分間処理してアセテート 塩から遊離アミンを発生させた。それをピリジン及びエーテルで洗浄し、空気及 び真空乾燥した。対照と同じように通常の通りにしてアリコート(4呼)を採取 し、開腹し、脱保詮し、RPHPLCを行なった。
染料結合反応を1.5−二ツペンドルフ管内で行なった。
染料はオレゴン、ジャンクションシティ、モレキュラーブロープズインコーボレ ーテツドから得た。約110モルの支持体結合アミノオリゴヌクレオチド(4− 5岬)を、N、N−ジイソプロピルエチルアミン10チ(マ/V)を含有する無 水DMF(soμ))中のエオシン−5−インチオシアネート(五5岬、50倍 過剰)か或はテキサスレッド(14岬、38倍過yj)のいずれかで処理した。
反応を暗がりで呈協において12〜16時間進行させた。反応混合物を、次いで 、小さいガラスークリツテド漏斗に移し、DMF、メタノール及びエーテルでよ く洗浄し、風乾した。この時点で、エオシン結合支持体はピンク色で、テキサス レッド結合支持体は紫色であった。両方の支持体は長波UV先光下強い螢光を発 した。
各染料−DNA接合物を例8に記載した通りにして(濃水酸化アンモニウム中室 温において4時間)支持体から開裂させ及び塩基脱保護条件(濃水酸化アンモニ ウム中55℃において12時間)K暴露させた。ポリーTオリゴヌクレオチドに ついては不必要であるが、この後者の処理を行なって染料部分及び染料−DNA 結合に対する処理の効果を試験した。螢光性の強いオレンジ(エオシン)及びビ ンクー赤色(テキサスレッド)染料−DNkm液を、次いで、凍結乾燥し、水に 溶解し及び各螢光性オリゴヌクレオチドな、10分にわたる10%緩衝液B/9 0チ緩衝液Aの30チ酸衝液B/70チ緩衝液人への、次いで10分にわたる3 〇−緩衝液B/70チ緩伽液人の60チ繊衝液B/40チ峻i&′i液人への碕 状勾配(my;p人及びBは例8に記載した通りである)を用いたRP HPL CによってN製した。
2つの染料−オリゴヌクレオチド接合体のHPLC分析は、エオシン−5−イン チオシアネートの場合、出発アミノオリゴヌクレオチドの消失から判断して、反 応は約80チの完結まで進行していたが、一方テキサスレッド、スルホニルクロ リドの場合、反応は約20〜5Otsの完結にまで進行していたKすぎないこと を示した。各クロマドグ2ムにおいて、非誘導体合成のアミノオリゴヌクレオチ ドを表わすピークを16分に観測した。所望のエオシン−DNAf=合物はカラ ムから25分に溶出し、テキサスレッド−DNA接合物は29.5分に溶出した 。
例5に記載した溶液法を用いて別々に合成した出発アミノオリゴヌクレオチド及 び各螢光性オリゴヌクレオチドの対照HPLC分析は、上記の割り振り(アサイ ンメント)を確認した。加えて、テキサスレッド−オリゴヌクレオチドは脱保護 条件によってそこなわれずに出現したが、エオシン−オリゴヌクレオチドは少量 の分解を受けたようであった。しかし、両方の場合において、固相法を用いた染 料−DNA接合物の総括収率は溶液法を用いた場合と同じ程に良好であるか或は それより一層良好であり、仕上は及び精製はずっと簡単であった。各々の精製し た染料−DNA接合体のUV可視スペクトルは予想される通りに2つの主ピーク を示した;エオシン−オリゴヌクレオチドの場合、2d2nmにおけるピーク( DNA吸光度)及び524 nmにおけるピーク(染料吸光度);及びテキサス レッド−オリゴヌクレオチドの場合、262 nmにおゆるピーク(DNA吸光 度)及び596 nmにおけるピーク(染料a光度)。
同様の接合物は、フルオレセイ/インチオシアネート、テトラメチルローダミン インチオシアネート、エオシンイソチオシアネート、エリスロシンインチオシア ネート、四−ダミンXインチオシアネート、リサミンローダミンBスルホニルク ロリド、ピレンスルホニルクロリド、7−ジエチルアミノ−4−メチル−クマリ ンイソチオシアネート、4−フルオロ−7−ニドロベンズー2−オキサ−1,3 −ジアゾ−々、−一クロロー7−二トロベンズー2−オキサ−1,3−ジアゾー ル、アクリジン−9−インチオシアネート、ルシファーイエローを用いて得るこ とができる。
4)1つ又はそれ以上のインターナル脂肪族アミノ基を含有するオリゴデオキシ リボヌクレオチドの合成。
「物質書号4の組成」力る表題のセクションにおいて記載したトリフ/I/オロ アセチル保!(Tra−保護)21−アミノ−21−デオキシウリジン−31− 〇−ホスホルアミダイトを用いてDNAオリゴマー中の内部位置に1つ又はそれ 以上の自由アミノ基を含有するオリゴデオキシリボヌクレオチドを合成すること ができる。これは、これらの化合物におけるアミノ基の位置(すなわち、糖環の 2′−炭素原子上)がDNA鎖の5’、5’−ホスホジエステル主鎖の形成にお いて含まれないので、可能である。それ故に、例8に記載した標準のホスホルア ミダイ)DNA合成技法を用いてこれらの化合物を、固体支持体に結合させた成 長オリゴデオキシリボヌクレオチドの5′−ヒドロキシルにカップリングさせる ことができる。保護5I−アミノ−5°−デオキシチミジン化合物であって、そ れらの使用は5′−末端上のアミノ基の存在により成長DNA鎖を停止させるも のと異なり、’ff*保獲2′−アミノー2゛−デオキシウリジン化合物の5° −ヒドロキシy上に存在するs l −o−ジ−p−7ニシルフエニルメチ〃基 を合成の次のサイクルで除いて、通常の手順によって合成オリゴヌクレオチドを 更に伸長させるのを可能にすることができる。Tfa保82’−アミノ−2′− デオキシウリジンユニットは鎖の任意の位置に挿入することができ、生成したオ リゴマーは任意の所望数の反応性アミノ基を含有することができる。
これらの化合物は、例8に概略した化学を用いて成長DNA鎖にカップリングす ること一層できるが、2+位に水素と異なる基鱒:存在することは、通常のデオ キシリボヌクレオチドホスホルアミダイトを用b″′C′C観測のと同様のカッ プリング効犀を達成するのに一層長いカップリング時間を用いることを必要とす る。もう一度、支持体結合オリゴヌクレオチドに対して10〜20倍過剰のホス ホルアミダイト及び50〜100倍過剰のtH−テトラゾ−〃を必要とし、この 場合、過剰が大きb根強く好ましい。これらの童を使用したカップリング時間は 。
通常のホスホ/I/7ミダイトカツプリングについて6分を用いるのに対して、 1〜1.5時間にするのが普通である。
Tfa保@ 2 )−アミノ−21−デオキシウリジンホスホルアミダイトはこ の一層長いカップリング時間の間にある程度の分解を受けるようであるので、1 つの伸長カップリングに2或は3短かいカンプリング(各々20〜30分)が好 ましい。これらの条件下で、Tfa保護2′−アミノ−2+−デオキシクリジン −31−〇−ホスホルアミダイト(例6及び7)は、常習的に80チより良好な 収鹿で、通常85%より良好な収率でカップリングする1つ又はそれ以上のイン ターナルアミノ基を含有するオリゴヌクレオチド生成物を、次いで、例8に略述 する欅準の開裂及び脱保詳条件を用いて得る。Tfa基は塩基不安定であるので 、濃水醪化アンモニウム処理する間に容易に除去されて、所望数の自由アミノ基 を含有するオリゴヌクレオチド生成物を生じる。生成物DNAは、凍結乾燥した 後に、上述した通りにRP HPLCか或はゲル電気泳動のいずれかによって精 製することができる。その上、粗製生成物DNAは5′−〇−ジーp−アニシル フェニルメチル基な含有して得ることができ、こうして5’−N−p−アニシル ジフェニルーメチル基について記載したのと同様の方法でRP HPLC精製を 簡単にすることができる。
5゛−O−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2°−N−トリフルオロアセチル −21−アミノ−2′−デオキシウリジン−3′−〇−メチルーN、N−ジイソ プロピルアミノホスホルアミダイトを用いた S ’>HO−CpApTpGpCpU(2’−昌) pGpT−OR(5+及 び5′−〇−ジーp−アニシルフェニルメチル−2’−N−(N−)リフルオル アセチルグリシA/) −2’−アミノー21−デオキシウリジン−31−〇− メチル−N、N−NH,迅NC凡C0NF( オリゴデオキシリボヌクレオチド 3’>HO−CPApTpGpC−OH<5’ を例8 に記載したAりにして 手動でアミラブルピルシリカ支持体上に合成した。次いで、支持体を2つの等し い部分に分けた。一方の部分子t s ’ −o−ジ−p−アユシルフェニルメ チル−2’−N−)リフルオ四アセチルー21−アミノ−21−デオキシウリジ ン(DMT−TfmNHdU)ホスホルアミダイトとのカップリングに用い及び 他方を51−〇−ジーp−アニシルフェニルメチル−2’−N−(N−)リフル オロアセチル−グリシル) + 21−アきノー21−デオキシウリジy(DM T−TfaGlyNHdU)ホスホルアミダイトとのカップリングに用いた。各 々の場合において、各々30分の2つの逐次カップリングを酸化反応の前に行な い、支持体をカップリングの間に無水のアセトニトリルでよく洗浄した。各々の カップリングにおいて、20倍過剰のホスホルアミダイト及び100倍過剰の1 H−テトラゾールを用いた。これらの条件下で、DMT−TfaNHdUホスホ ルアミダイト及びDMT−TfaGl)’NHdUホスホルアミダイトは共に収 率83〜85チ(このサイクルの後にジメチオキシトリチルカチオンの収車で判 断して)でカップリングした。3分の酸化反応及び3分のキャッピング反応の後 に、最後の2つのヌクレオチドホスホルアミダイトをアミノウリジン含有オリゴ ヌクレオチドにカップリングさせた。各々の場合において、これら2つのカップ リングの内の初めは98チより良好な収率で進行し、RP HPLCfi製を簡 単にするために、最終のジ−p−アユシルフェニルメチル基を各オリゴヌクレオ チドの5′ −末端上に保持した。
滉浄し及び乾燥した後に、支持体結合オリゴヌクレオチドの各アリコートを例8 に記載した枦準の開裂及び脱保C染件下で処理し、凍結乾燥し、水中に溶解した 。各溶液のアリコートに1次いで、例8に記載した系を用いてRPHPLC分析 を行なった。40分にわたる20チ緩脅液B/80チ緩贅液Aの60チ緩衝液B /40チv蓼液Aへの線状勾配(緩薮液A及びBは例8に記載した通りである) を用いて各トリチル化付加体を精製した。
これらの条件下で(流ゑ1−7分)、U(2’−NHり含有オリゴヌクレオチド 及びU (2’ −NHCOCH* NHt )含有オリゴヌクレオチドは共に 39分で溶出した。各オリゴヌクレオチドについて予備精製を行ない、生成物を 捕集し及び凍結乾燥し、ペレットを酢酸/水(80:2ov/v)で室温におい て30分間処理して5′−ジ−p−アユシルフェニルメチル基を除いた。凍結乾 燥し及び水に再溶解した後に、各溶液のアリコートを、30分にわたる10チ緩 衝液B/90チ援衝液Aの50チ覆衝液B/70 %緩衝液入への線状勾配を用 いてクロマトグラフィーにかけた。これらの条件下(流量1−7分)で、U ( 2’ −NHt )含有オクタマーは清浄に18分で溶出しく 260 nmに おゆろUV検出)、他方U(2’−NHCOCHtNHt )含有オクタマーは わずかに清浄性に劣つ′c19分で溶出した。この後者のクロマトグラムでは1 8分に溶出するピークが見られなかった。このことは、グリシン部分はあるとし てもほとんど合成する間の化学処理によってD N fi−から加水分解されな かったことを示す。両方の精製した2′−アミノオリゴヌクレオチドはDNAを 象徴するUVスペクトル(260nmにおける主ピーク)を有していた。
下記の化合物を同様の方式で用いて対応する21アミノオリゴヌクレオチドを調 製することができる:1)s’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチ/1/−2 ’−N−トリフルオロアセチル−2′−アミノ−21−デオキシウリジン−31 −〇−ベーターシアノエチルーN、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイ ト。
2)s’−0−ジ−p−7ニシルフエニルメチルー2′−N−)リフルオロアセ チル−2′−アミノ−21−デオキシイノシン−s l −o−メチh−N、N −ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。
3)s’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−トリフルオロアセ チル−2′−アミノ−2’−N” −ベンシイ/I/−2’−デオキシアデノシ ンーs’−o−メチ/l/ −N 、 N−ジイソプロピルアミノホスホルアミ ダイト。
4)5菅−O−ジ−p−アユシルフェニルメチ)v −2’ −N−)リフルオ ロアセチル−2′−アミノ−2’−N’−ベンシイ)w −2’−デオキシシト シンー3′−o−メチy−N、N−ジイソプロピルアミノホスホルア2ダイト・ s)s’−0−ジーp−アニシ/I/フェニルメチ/I/ −2’ −N−トリ フルオロアセチル−2′−アミノ−2’−N” −インブチリ/、/ −2’− デオキシグアノシンー3′−〇−メチル−N、N−ジインプロピルアミノホスホ ルアミダイト。
6)5’−Q−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(9−フルオレニ ルメチルオキシカルボニル)−21−アミノ−2′−デオキシウリジン−31− 〇−メチ7、/−N、N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。
7)5’−Q−ジ−p−アユシルフェニルメチ)v−2’ −N−(N−)リフ ルオロアセチル−グリシ/l/)−2’−アミノ−2′−デオキシウリジン−3 ′−〇−ベーターシアノエチルーN、N−ジインプロピルアミノホスホルアミダ イト。
s)s’−o−ジ−p−7ニシルフエニルメチルー2′−N−(N−)リフルオ ロアセチル−グリシル) −2+ ++アミノー2°−デオキシウリジン−51 −〇−メチ)v −1iJ 。
N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
?)5’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチAt −2’ −N −(N − ) リフルオロアセチル−グリシル)−2’−アミノ−2′−デオキシウリジン −31−〇−メチルーモルホリノホスホA・アミダイト。
1o)s’−o−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−)リフル オロアセチル−グリシル)−2′−アミノ−2′−デオキシウリジン−5′−〇 −ベーターシアノエチルーモルホリノホスホルアミダイト。
11)s’−0−ジ−p−7ニシルフエニルメチルー2l−N−(N−1−リフ ルオロアセチル−グリシル) −21−アミノ−21−デオキシウリジン−3′ −〇−p−ニトロフェネチルーN、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
12)s’−o−ジ−p−7ニシルフエニルメチルー2′−N−(N−)リフル オロアセチル−グリクル) −21++アミノー2′−デオイシウリジン−5′ −〇−ベーターシアノエチy−N、N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。
1s)s’−0−ジ−p−7ニシルフエニルメチルー2’−N−(N−)リフル オロアセチル−グリシ#)−2’ −アミノ−2′−デオキシイノシン−31− O−メチル−N。
N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。
14)s’−0−ジ−ルーア−クルフェニルメチル−2’−N−(N−)リフル オロアセチ7+/−グリシル) −21−アミノ−No−ベンゾイル−21−デ オキシアデノシン−3’−0−メチル−N、N−ジイソプロピルアミノホスホル アミダイト。
15)5″−〇−ジーp−アニシルフェニルメチル−2’−N−(N−トリフル レオロアでチル−グリシル) −2+ −アミノ−N4−ペンシイ/L/ −2 ’−デオキシシトシンー3′−〇−メチル−N + N−ジイソプロピルアミノ ホスホルアミダイト。
16)s’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−21−N−(N−)リフル オロアセチル−グリシy)−2’ −アミノ−N! −イソブチリル−21−デ オキシグアノシン−3′−0−メチル−N、N−ジイソプロピルアミノホスホル アミダイト。
17)S’−0−ジ−p−アユシルフェニルメチル−2+ −N−(N−9−フ ルオレニル−メチルオキシカルボニル−グリシル) −21−アミノ−21−デ オキシウリジン−3′−〇−メチルーN、N−ジインプロピルアミノホスホルア ミダイト。
5)インターナル2“位に1つ又はそれ以上の螢光性部分を含有するオリゴデオ キシリボヌクレオチドの水溶液における合成。
セクション2で説明した通りに、オリゴヌクレオチドに脂肪族アミノ基が存在す ることは、DNAと種々の試薬とのそれ以上の反応を可能にする。螢光染料の場 合、1つより多い染料分子をオリゴヌクレオチドに結合させることによって、高 められた検出感度な達成すごことができ、これよりオリゴマー当りの螢光量を増 大させることができる。任意の所望数のアミノ基を2′−アミノ−21−デオキ シウリジンホスホルアミダイトを経てオリゴヌクレオチドに加入させ得ることを 利用してこの増大を達成することができる。
螢光染料を2′−アミノオリゴヌクレオチドに結合させる基本的な手順は、例9 に記載したのと同じである。
例12 フルオレセイン−5−インチオシアネートと、3’ >HO−CpApTpGp CpU(2’ −MHz ) pGpT−OH<5 ’及び5 ’>HO−Cp ApTpGpCpU(2’ −NHCOCH*NHt )pGpT−OH<5’ との結合 H H N)1 21−アミノオリゴヌクレオチドを例11に記載する通りにして合成した。n災 したアミノオリゴヌクレオチドの各々(水中600−1000μm’/、!溶液 の75μl )tl、s−のエツベンドルフW内テ水(105μ/)及び1Mの 重炭醒ナトリウム/炭酸ナトリウム緩衝水溶i、pH9(50μりで希釈した。
フルオレセイン−5−インチオシアネー)(FITC)をDMFに溶解した溶液 (2oIIv/gd、 20 μt )を加え、黄色溶液をよく混合し及び暗が りで室温において一晩静置させた(約12−16時間)。次いで、各々の反応混 合物を、1〇−の使い捨て可能なプラスチックピペット内の水に充填したセファ デックスG−25の分離カラム(1o−)に加え、カラムを水で溶出した。各々 の場合において、カラムの空隙容積により溶出した早く移動する黄色バンド(長 波UV下で螢光性)を捕集した。粗製染料−DNA接合物を次いで凍結乾燥し、 水に溶解し、例9に記載した系を用いてRP HPLCを打力った。30分にわ たる10チ緩衝液B/90チ欣衝液Aの30チ緩衝液B/70チ緩衝液Aへの線 状勾配を用い(緩衝液A及びBは例8に記載した通りである)及び流量1−7分 であった。
U(2’−NH−FITC”)含有オリゴヌクレオチドの場合、2つの主ピーク を観狗した。出発2゛−アミノオリゴヌクレオチドは予想される通りに18分に 溶出し、他方、螢光生成物染料−オリゴヌクレオチド接合物は26分に溶出した ( 260 nmにおけるUV検出、240 nmにおける蚤光励起、525  nmバンドパスフィルターを用いた検出)。螢光生成物はサンプル中に存在する アミノ含有D N Aの全量の約50−の割合になった。
U(2’−NHCOCH*NH−FITC)含有オリゴヌクレオチドの場合、3 つの主ピークを1s、11した。出発21−7ミノオリゴヌクレオチドは予想さ れる通りに20分に溶出した。また、2α5分における詰2の主ピークが出5@ 2′−アミノオリゴヌクレオチドのクロマトグラムにおける汚染物として観測さ れた。螢光生成物染料−オリゴヌクレオチド接合物が28分に溶出した。しかし 、この場合、螢光生成物はサンプル中のアミノ含有DNAの全量の少なくとも9 0チの割合になった。相当に高い結合度は2“−アミノ基上にグリシン成分が存 在することに起因し得る。驚くべきことではないが、枠環から反応性アミノ基を 移し去り、こうして染料が接近する立体障害を減することが、得られる染料−D NA接合安の量を増大させる。よって、スペーサーの長さを調節し、こうしてK tRからの距離を調節することによってアミ7基の反応性の度合を制すすること が可能である。
両方の精製螢光性tリボヌクレオチドは260 nmにUV吸光度最大(DNA )C#有)及び496 nmに可視吸光度最大(フルオレセインに特有)を有し ていた。
上記は、また、テキサスレッド、テトラメチルローダミフィンチオシアネート、 エオシンイソチオシアネート、エリス四シンインチオシアネート、ローダミンX インチオシアネート、リサミンローダミンBスルホニルクロリド、ルシファーイ エロー、アクリジン−9−イソチオシ7ネ−)、ピレンスルホニルクロリド、7 −シエチルアミノー4−メチルクマリンインチオシアネー)、J−フルオロ−7 −ニドロペンズー2−オΦサー1.s−シフ1−ル、4−クロロ−7−ニドロベ ンズー2−オキサ−1゜3−ジアゾールを用いて行なうことができろ。
発明を十分に説明したが、発明は単に添付した請求の範囲の適法な範囲によって のみ制限されるつもりである。
PCT/US87101422 Attachment to forrn pc’r/工SA/210 Par t工。
工PC(4): ’19/167;19/173; 21100;21102; 211041+mnvmna−^so番cswPNo、p(+〒zaS++71 01422PCT/US87101422 Attachment to form pcr7IsA/21o Part  VLPCT/IjS87101422 Ti+a@ Lim1t for Filina a Protesセ

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.下記式を有する新規な保護アミノヌクレオシドホスホルアミダイト: ▲数式、化学式、表等があります▼、 ここで、Bはヌクレオシド塩基、ヌクレオシド塩基類似体或はそれらの保護され た誘導体から成る群すり選択し;R1、R2、R3、R4及びR5は以下に規定 する通りである:R3=H、R4=OH、R1、R2及びR3はH、OR或はN HR1のいずれかであり、但し、R1、R2及びR3の内の精々1つはNHR6 になつてもよく及びR3のみがOHになることがてきることを条件とし、ここで 、Bは一価の有機基であり、R1はトリフルオロアセチルグリシル、4−トルエ ン−スルホニルエチル−オキシカルボニル、メチルスルホニルエチル−オキシカ ルボニル、2−シアノ−t−ブチルオキシカルボニル;クロロアセチル、アセト −アセチル、2−ニトロベンゾイル、ジチアスクシノイル、マレオイル、イソニ コチニル、2−プロモエチルオキシ−カルボニル及び2.2.2−トリクロロエ チルオキシカルボニルから成る群すり選ぶ酸不安定性或は塩基不安定在保護基で ある窒素保護基であり、但し、R1或はR1がNHR1である時、R1は前記の 基、或はトリフルオロアセチル或は9−フルオレニルメチルオキシ−カルボニル の内のいずれかであることを条件とし;R6は低級アルキル或は複素環式であり ;R7は低級アルキル、シアノ低級アルキル、ハロ低級アルキル或にニトロフエ ニル低級アルキルである。 2.下記の一般式を有する新規な保護5′−アミノヌクレオシドホスホルアミダ イト: ▲数式、化学式、表等があります▼ ここで、Bはヌクレオシド塩基或はヌクレオシド塩基類似体或はそれらの保護さ れた誘導体から成る群より選択し;X1はp−アニシルジフェニルメチル、トリ フェニルメチル及び下記式を有する保護されたアミノアシル;Y−NH−(CH R)n−CO (式中、Yはトリフルオロアセチル、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル 、p−アニシルジフエニルメチル及びトリフエニルメチルから成る群より選択し ;n=1の時、Rはアミノ酸側領域は水素であり;nが2〜100の整数である 時、Rは水素である)から選択し;R1は低級アルキル(m=2の場合)及び複 素環式(m=1の場合)から成る群すり選択し;R1はメチル、ベーターシアノ エチル、p−ニトロフエネチル、o−クロロフエニル或はp−クロロフエニルか ら成る群すり選択する。 3.X1、がp−アニシルジフエニルメチルである請求の範囲第2項記載の化合 物。 4.X1がトリフエニルメチルである請求の範囲第2項記載の化合物。 5.X1がN−トリフルオロアセチルグリシルである請求の範囲第2項記載の化 合物。 6.Bがチミンである請求の範囲第2項記載の化合物。 7.Bがウラシルである請求の範囲第2項記載の化合物。 8.R2がメチルである請求の範囲第2項記載の化合物。 9.R2がベーターシアノエチルである請求の範囲第2項記載の化合物。 10.R1がメチルである請求の範囲第2項記載の化合物。 11.R1がイソプロピルである請求の範囲第2項記載の化合物。 12.R1がモルホリノである請求の範囲第2項記載の化合物。 13.Bがチミンであり及びXlがp−アニシルジフエニルメチルである請求の 範囲第2項記載の化合物。 14.Bがチミンであり及びX1がトリフエニルメチルである請求の範囲第2項 記載の化合物。 15.Bがチミンであり及びX1がN−トリフルオロアセチルグリシルである請 求の範囲第2項記載の化合物。 16.Bがウラシルであり及びXがトリフルオロアセチルである請求の範囲第2 項記載の化合物。 17.Bがウラシルであり及びXlが9−フルオレニルメチルオキシカルボニル である請求の範囲第2項記載の化合物。 18.Bがウラシルであり及びX1がp−アニシルジフエニルメチルである請求 の範囲第2項記載の化合物。 19.Bがウラシルであり及びX1がトリフエニルメチルである請求の範囲第2 項記載の化合物。 20.Bがウラシルであり及びX1がN−トリフルオロアセチルグリシルである 請求の範囲第21項記載の化合物。 21.下記式を有する51−N−p−アニシルジフエニルメチル−51−アミノ −51−デオキシチミジン−31−O−ペータ−シアノエチル−N,N−ジイソ プロピルアミノホスホルアミダイト: ▲数式、化学式、表等があります▼ 22.51−N−p−アニシルジフエニルメチル−51−アミノ−51−デオキ シチミジン−31−O−メチル−N,N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダ イト。 23.51−N−p−アニシルジフエニルメチル−51−アミノ−51−デオキ シチミジン−31−O−ベーターシアノエチル−N,N−ジメチルアミノホスホ ルアミダイト。 24.51−N−p−アニシルジフエニルメチル−51−アミノ−51−デオキ シチミジン−31−O−メチル−N,N−ジメチルアミノホスホルアミダイト。 25.51−N−p−トリフエニルメチル−51−アミノ−51−デオキシチミ ジン−31−O−ベータ−シアノニチル−N,N−ジイソプロピルアミノホスホ ルアミダイト。 26.下記の一般式を有する新規な保護21−アミノ−ヌクレオシドホスホルア ミダイト: ▲数式、化学式、表等があります▼ ここで、Bはヌクレオシド塩基或はヌクレオシド塩基類似体或はそれらの保護さ れた誘導体から成る群より選び;X1はトリフルォロアセチル、9−フルオレニ ルメチルオキシカルボニル、p−アニシルジフエニルメチル、トリフエニルメチ ル及び下記式を有する保護されたアミノアシル: Y−NH−(CHR)n−CO (式中、Yはトリフルオロアセチル、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル 、P−アニシルジフエニルメチル及びトリフエニルメチルから成る群すり選択し ;Rは、n=1の時、アミノ酸側鎖或は水素であり;nが2〜100の整数であ る時、Rは水素である)から選択し;R1は低級アルキル(m=2の場合)及び 複素環式(m=1の場合)から成る群すり選択し;R2はメチル、ベータ−シア ノエチル、p−ニトロフエネチル、p−クロロフエニル或はp−クロロフエニル から成る群すり選択し;X2ほトリフエニルメチル、p−アニシルジフエニルメ チル、ジ−p−アニシルフエニルメチル及び9−フエニルキサンテニルから選ぶ ヒドロキシル保護基である。 27.X1がトリフルオロアセチルである請求の範囲第26項記載の化合物。 28.X1が9−フルオレニルメチルオキシカルボニルである請求の範囲第26 項記載の化合物。 29.X1がN−トリフルオロアセチルグリシルである請求の範囲第26項記載 の化合物。 30.Bがウラシルである請求の範囲第26項記載の化合物。 31.R2がメチルである請求の範囲第26項記載の化合物。 32.R1がイソプロピルである請求の範囲第26項記載の化合物。 33.R1がモルホリノである請求の範囲第26項記載の化合物。 34.R2がメチルである請求の範囲第26項記載の化合物。 35.R2がベータ−シフノエチルである請求の範囲第26項記載の化合物。 36.Bがウラシルであり及びX1がトリフルオロアセチルである請求の範囲第 26項記載の化合物。 37.Bがウラシルであり及びX1がフルォレニルメチルオキシカルボキシルで ある請求の範囲第26項記載の化合物。 38.Bがウラシルであり及びX1がN−トリフルオロアセチルグリシルである 請求の範囲第26項記載の化合物。 39.下記式を有する51−O−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N− トリフルオロアセチル−21−アミノ−21−デオキシウリジン−31−O−メ チル−N,N−ジイソプロピルフミノホスホルアミダイト:▲数式、化学式、表 等があります▼ 40.下記式を有する51−O−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N− (N−トリフルオロ−アセチルグリシル)−21−アミノ−21−デオキシクリ ジン−31−O−メチル−N,N−ジイソノロビルアミノホスホルアミダイト: ▲数式、化学式、表等があります▼ 41.51−O−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N−トリフルオロア セチル−21−アミノ−21−デオキシウリジン−31−O−ベータ−シアノエ チル−N,N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。 42.51−o−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N−(N−トリフル オロ−アセチルグリシル)−21−アミノ−21−テオキシウリジン−31−O −ベータ−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。 43.下記の一般式を有する新規な保護21−アミノヌクレオシドホスホルアミ ダイト: ▲数式、化学式、表等があります▼ ここで、Bはヌクレオシド塩基或はヌクレオシド塩基類似体或はそれらの保護さ れた誘導体から成る群すり選択し;X1はトリフルオロアセチル、9−フルオレ ニルメチルオキシカルボニル、p−アニシルジフエニルメチル、トリフエニルメ チル及び下記式を有する保護されたアミノアシル: Y−NH−(CHR)n−CO (式中、Yはトリフルオロアセチル、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル 、p−アニシルジフエニルメチル及びトリフエニルメチルから成る群すり選択し ;Rは、n=1の時、アミノ酸側鎖或は水素であり;nが2〜100の整数であ る時、Rに水素である)から選択し;R1は低級アルキル(m=2の場合)及び 複素環式(m=1の場合)から成る群より選択し;R2はメチル、ベータ−シア ノエチル、p−ニトロフエネチル、0−クロロフェニル或はp−クロロフェニル から成る群より選択し;X2はトリフエニルメチル、p−アニシルジフエニルメ チル、ジ−p−アニシルフエニルメチル及び9−フエニルキサンテニルから選ぶ ヒドロキシル保護基である。 44.X1がトリフルオロアセチルである請求の範囲第43項記載の化合物。 45.X1が9−フルオレニルメチルオキシカルボニルである請求の範囲第43 項記載の化合物。 46.X1がN−トリフルオロアセチルグリシルである請求の範囲第43項記載 の化合物。 47.Bがウラシルである請求の範囲第43項記載の化合物。 48.H1がメチルである請求の範囲第43項記載の化合物。 49.R1がイソプロピルである請求の範囲第43項記載の化合物。 50.R1がモルホリノである請求の範囲第43項記載の化合物。 51.R2がメチルである請求の範囲第43項記載の化合物。 52.R2がベータ−シアノエチルである請求の範囲第43項記載の化合物。 53.Bがウラシルであり及びX1がトリフルオロアセチルである請求の範囲第 43項記載の化合物。 54.Bがウラシルであり及びXlがフルオレニルメチルオキシカルボキシルで ある請求の範囲第43項記載の化合物。 55.Bがウラシルであり及びX1がN−トリフルオロアセチルグリシルである 請求の範囲第43項記載の化合物。 56.51−O−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N−トリフルオロア セチル−21−アミノ−21−デオキシ−アラ−ウリジン−31−O−メチル− N,N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。 57.51−O−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N−(N−トリフル オロ−アセチルグリシル)−21−アミノ−21−デオキシ−アラ−ウリジン− 31−0−メチル−N,N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。 58.51−O−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N−トリフルオロア セチル−21−アミノ−21−デオキシ−アラ−ウリジン−31−O−ベーダ− シアノエチル−N,N−ジイソプロピルアミノホスホルアミダイト。 59.51−O−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N−(N−トリフル オロ−アセチルグリシル)−21−アミノ−21−デオキシ−アラーウリジン− 31−0−ベータ−シアノエチル−N,N−ジイソノロピルアミノホスホルアミ ダイト。 60.下記式を有する51−N−p−アニシルジフエニルメチル−51−アミノ −51−テオキシチミジン:▲数式、化学式、表等があります▼ 61.下記式を有する51−N−(N−ベンジルオキケカルボニル−6−アミノ ヘキサノイル)−51−アミノ−51−デオキシチミジン: ▲数式、化学式、表等があります▼ 62.下記式を有する51−O−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N− トリフルオロアセチル−21−アミノ−21−アミノ−21−デオキシウリジン : ▲数式、化学式、表等があります▼ 63.下記式を有する51−O−ジ−p−アニシルフエニルメチル−21−N− (N−トリフルオロ−アセチルグリシル)−21−アミノ−21−デオキシウリ ジン:▲数式、化学式、表等があります▼ 64.下記式を有する51−O−ジ−P−フニシルフエニルメチル−21−N− トリフルオロ−アセチル−21−アミノ−21−テオキシ−アラ−ウリジン:▲ 数式、化学式、表等があります▼ 65.下記式を有する51−O−ジ−P−アニシルフエニルメチル−21−N− (N−トリフルオロ−アセチルグリシル)−21−アミノ−21−デオキシ−ア ラ−ウリジン: ▲数式、化学式、表等があります▼ 66.下記式を有するホスホルアミダイト化合物:▲数式、化学式、表等があり ます▼ ここで、Bはヌクレオシド塩基、ヌクレオシド塩基類似体或はそれらの保護され た誘導体から成る群より選択し;R1、R2、R3、R4及びR5は以下に規定 する通りである:R3=H、R4=OH、R1、R2及びR3はH、OR或はN HB1のいずれかであり、但し、R1、E2及びR3の内の精々1つはNHB1 になつてもよく及びR5のみがOHになることができることを条件とし、ここで 、Rは一価の有機基であり、R1はトリフルオロアセチルグリシル、4−トルエ ン−スルホニルエチル−オキシカルボニル、メチルスルホニルエチル−オキシカ ルボニル、2−シアノ−t−ブチルオキシカルボニル;クロロアセチル、アセト −アセチル、2−ニトロ−ベンノイル、ジチアスクシノイル、マレオイル、イソ ニコチニル、2−ブロモエチルオキシカルボニル及び2,2,2−トリクロロエ チルオキシカルボニルから成る群より選ぶ酸不安定性或は塩基不安定性保護基で ある窒素保護基であり、但し、R1或はR2がNHB1である時、R1は前記の 基、或はトリフルオロアセチル或は9−フルオレニルメチルオキシ−カルボニル の内のいずれかであることを条件とし;R6は低級フルキル或は複素環式であり ;R7は低級アルキル、シアノ低級アルキル、ハロ低級アルキル或はニトロフエ ニル低級アルキルである を固相オリゴヌクレオチド合成の最後のカツプリング段階において固体支持休に 結合されたオリゴヌクレオチドと反応させることを台む51−アミノオリゴヌク レオチドの改良された合成方法。 67.下記の一般式を有するホスホルアミダイト化合物:▲数式、化学式、表等 があります▼ ここで、Bはヌクレオシド塩基或はヌクレオシド塩基類似体或はそれらの保護さ れた誘導体から成る群より選択し;Xlはp−アニシルジフエニルメチル、トリ フエニルメチル及び下記式を有する保護されたアミノアシル:Y−NH−(CH R)n−CO (式中、Yはトリフルオロアセチル、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル 、p−アニシルジフエニルメチル及びトリフエニルメチルから成る群より選択し ;n=1の時、Rはアミノ酸側鎖或は水素であり;nが2〜100の整数である 時、Rは水素である)から選択し;R1は低級アルキル(m=2の場合)及び複 素環式(m=1の場合)から成る群より選択し;R2はメチル、ベーターシアノ エチル、p−ニトロフエネチル、0−クロロフエニル或はp−クロロフエニルか ら成る群すり選択する を固相オリゴヌクレオチド合成の最後のカツプリング段階にかいて固体支持体に 結合されたオリゴヌクレオチドと反応させることを含む51−アミノオリゴヌク レオチドの改良された合成方法。 68.x1がP−アニシルジフエニルメチルである請求の範囲第67項記載の改 良方法。 69.Xlがトリフエニルメチルである請求の範囲第67項記載の改良方法。 70.XlがN−トリフルオロアセチルグリシルである請求の範囲第67項記載 の改良方法。 71.Bがチミンである請求の範囲第67項記載の改良方法。 72.Bがウラシルでわる請求の範囲第67項記載の改良方法。 73.R2がメチルである請求の範囲第67項記載の改良方法。 74.R2がベーターシアノエチルである請求の範囲第67項記載の改良方法。 75.R1がメチルである請求の範囲第67項記載の改良方法。 76.R1がイソプロピルである請求の範囲第67項記載の改良方法。 77.R1がモルホリノである請求の範囲第67項記載の改良方法。 78.Bがチミンであり及びX1がp−アニシルジフエニルメチルである請求の 範囲第67項記載の改良方法。 79.Bがチミンであり及びX1がトリフエニルメチルである請求の範囲第67 項記載の改良方法。 80.Bがチミンであり及びX1がN−トリフルオロアセチルグリシルである請 求の範囲第67項記載の改良方法。 81.Bがウラシルであり及びXがトリフルオロアセチルである請求範囲第67 項記載の改良方法。 82.Bがウラシルであり及びX1が9−フルオレニルメチルオキシカルボニル である請求の範囲第67項記載の改良方法。 83.Bがウラシルであり及びX1がp−アニシルジフエニルメチルである請求 の範囲第67項記載の改良方法。 84.Bがウラシルであり及びX1がトリフエニルメチルてある請求の範囲第6 7項記載の改良方法。 85.Bがウラシルであり及びX1がN−トリフルオロアセチルグリシルである 請求の範囲第67項記載の改良方法。 86.下記の一般式を有するホスホルアミダイト化合物:▲数式、化学式、表等 があります▼ ここで、Bはヌクレオシド塩基或はヌクレオシド塩基類似体或はそれらの保護さ れた誘導体から成る群より選び;Xlはトリフルオロアセチル、9−フルオレニ ルメチルオキシカルボニル、P−アニシルジフエニルメチル、トリフエニルメチ ル及び下記式を有する保護されたアミノアシル: Y−NH−(CHR)n−CO (式中、Yはトリフルオロアセチル、9−フルオレニルメチルオキシカルボニル 、p−アニシルジフエニルメチル及びトリフエニルメチルから成る群より選択し ;Rは、n=1の時、アミノ酸側鎖或は水素であり;nが2〜100の整数であ る時、Rは水素である)から選択し;R1は低級アルキル(m=2の場合)及び 複素環式(m=1の場合)から成る群より選択し;R2はメチル、ベーターシア ノエチル、p−ニトロフエネチル、o−クロロフエニル或はp−クロロフエニル から成る群すり選択し;X2にトリフエニルメチル、p−アニシルジフエニルメ チル、ジ−p−アニシルフエニルメチル及び9−フェニルキサンテニルから選ぶ ヒドロキシル保護基である を固相オリゴヌクレオチド合成の1つ又はそれ以上のカツプリング段階において 固体支持体に結合されたオリゴヌクレオチドと反応させることを含む21−アミ ノオリゴヌクレオチドの改良された合成方法。 87.X1がトリフルオロアセチルでおる請求の範囲第86項記載の改良方法。 88.X1が9−フルオレニルメチルオキシカルボニルである請求の範囲第86 項記載の改良方法。 89.XlがN−トリフルオロアセチルグリシルである請求の範囲第86項記載 の改良方法。 90.Bがウラシルである請求の範囲第86項記載の改良方法。 91.R1がメチルである請求の範囲第86項記載の改良方法。 92.R1がイソプロピルである請求の範囲第86項記載の改良方法。 93.R1がモルホリノである請求の範囲第86項記載の改良方法。 94.R2がメチルである請求の範囲第86項記載の改良方法。 95.R2がベーターシアノエチルである請求の範囲第86項記載の改良方法。 96.Bがウラシルであり及びXlがトリフルオロアセチルである請求の範囲第 86項記載の改良方法。 97.Bがウラシルであり及びXlがフルオレニルメチルオキシカルボキシルで ある請求の範囲第86項記載の改良方法。 98.Bがウラシルであり及びXlがN−トリフルオロアセチルグリシルである 請求の範囲第86項記載の改良方法。 99.下記の一般式を有するホスホルアミダイト化合物:▲数式、化学式、表等 があります▼ ここで、Bはヌクレオシド塩基或はヌクレオシド塩基類似体或はそれらの保護さ れた誘導体から成る群より選択し;X1はトリフルオロアセチル、9−フルオレ ニルメチルオキシカルボニル、p−アニシルジフエニルメチル、トリフェニルメ チル及び下記式を有する保護されたアミノアシル: Y−NH−(CHR)n−CO(式中、Yはトリフルオロアセチル、9−フルオ レニルメチルオキシカルボニル、p−アニシルジフエニルメチル及びトリフエニ ルメチルから成る群より選択し;Rは、n=1の時、アミノ酸側鎖或は水素であ り;nが2〜100の整数である時、Rは水素である)から選択し;R1は低級 アルキル(m=2の場合)及び複素環式(m=1の場合)から成る群より選択し ;R2はメチル、ベーターシアノエチル、p−ニトロフエネチル、o−クロロフ エニル或はp−クロロフエニルから成る群すり選択し;X2はトリフエニルメチ ル、p−アニシルジフエニルメチル、ジ−p−アニシルフエニルメチル及び9− フエニルキサンテニルから選ぶヒドロキシル保護基である を固相オリゴヌクレオチド合成の1つ又はそれ以上の段階において固体支持体に 結合されたオリゴヌクレオチドと反応させることを含む21−アミノオリゴヌク レオチドの改良された合成方法。 100.X1がトリフルオロアセチルである請求の範囲第99項記載の改良方法 。 101.X1が9−フルオレニルメチルオキシカルボニルてある請求の範囲第9 9項記載の改良方法。 102.X1がN−トリフルオロアセナルグリシルである請求の範囲第99項記 載の改良方法。 103.R1がメチルである請求の範囲第99項記載の改良方法。 104.R1がイソプロピルである請求の範囲第99項記載の改良方法。 105.R1がモルホリノである請求の範囲第99項記載の改良方法。 106.R2がメチルである請求の範囲第99項記載の改良方法。 107.R2がベーターシアノエチルである請求の範囲第99項記載の改良方法 。 l08.Xlがフルオレニルメチルオキシカルボキシルである請求の範囲第99 項記載の改良方法。 109.請求の範囲第66〜99項記載の生成物。 110.オリゴヌクレオチドを実質的に支持体から開裂させる請求の範囲第66 〜108項記載の方法。 111.X1成分が酸不安定性であり、R2成分がベーターシアノエチルであり 、ホスホルアミダイトをオリゴヌクレオチド合成の最後のカツプリング段階にお いて固体支持体に結合させたオリゴヌクレオチドに結合させた後に、ベーターシ アノエチル保護基を取り去り、酸不安定性保護基を取り去り、自由アミノ基と検 出可能な成分とを反応させ、次いで誘導体合成したオリゴヌクレオチドを支持体 から開裂させる請求の範囲第66項記載の方法。 112.検出可能な成分に結合させた請求の範囲第66〜108項記載の方法に よつて作られる生成物。 113.検出可能な成分が螢光性である請求の範囲第112項記載の生成物。 114.検出可能な部分が吸収性或は着色している請求の範囲第112項記載の 生成物。 115.検出可能な部分がタンパク質である請求の範囲第112項記載の生成物 。 116.検出可能な部分が酵素である請求の範囲第112項記載の生成物。 117.検出可能な部分が放射性1125を含有する請求の範囲第112項記載 の生成物。 118.検出可能な部分をテキサスレツト、テトラメチルロ−ダミンイソチオシ アネート、エオシンイソチオシアネート、エリスロシンイソチオシアネート、ロ ーダミンXイソナオッアネート、リサミンローダミンBスルホニルクロリド、ピ レンスルホニルクロリド、7−ジエチルアミノ−4−メチルクマリンイソチオシ アネート、4−フルオロ−7−ニトロベンズ−2−オキサ−13−ジアゾール、 4−クロロ−7−ニトロベンズ−2−オキサ−13−ジアゾール、アタリジン− 9−イソチオシアネート、ルシフアーイエロー、から成る群より選択する請求の 範囲第112項記載の組成物。
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