JPH0220286A - メチロトローフ酵母におけるHIV 24kDA gag蛋白質の発現 - Google Patents
メチロトローフ酵母におけるHIV 24kDA gag蛋白質の発現Info
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- JPH0220286A JPH0220286A JP1105731A JP10573189A JPH0220286A JP H0220286 A JPH0220286 A JP H0220286A JP 1105731 A JP1105731 A JP 1105731A JP 10573189 A JP10573189 A JP 10573189A JP H0220286 A JPH0220286 A JP H0220286A
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
産業上の利用分野
本発明は組み換えDNAバイオテクノロジーの分野に関
するものである。一つの態様において、本発明はメチロ
トローフ酵母類におけるH I V24kDa ga
gタンパク質の発現のための方法に関するものである。
するものである。一つの態様において、本発明はメチロ
トローフ酵母類におけるH I V24kDa ga
gタンパク質の発現のための方法に関するものである。
もう一つの態様において、本発明は新しいDNA分子と
、該分子で形質転換した新しい酵母に関するものである
。
、該分子で形質転換した新しい酵母に関するものである
。
従来の技術
レトロウィルス(retrovirus) i(I V
(以前はHTLV−mまたはLAVと呼ばれていた)
は後天性免疫不完症候群(acquired immu
ne deficiencysyndrome)(A
I D S )の病原体であることか明らかにされた。
(以前はHTLV−mまたはLAVと呼ばれていた)
は後天性免疫不完症候群(acquired immu
ne deficiencysyndrome)(A
I D S )の病原体であることか明らかにされた。
HIVのウィルスゲノム軸enome)はgag、 p
ol、env遺伝子に相当する6つの大きなオーブンリ
ーディングフレーム(openreading fra
mes)を含んでいる。gag遺伝子はウィルスのコア
タンパク質をコードしており、polはウィルスの逆転
写酵素、タンパク質分解酵素、エンドヌクレアーゼをコ
ードしており、envはウィルスの糖タンパク質をコー
ドしている。
ol、env遺伝子に相当する6つの大きなオーブンリ
ーディングフレーム(openreading fra
mes)を含んでいる。gag遺伝子はウィルスのコア
タンパク質をコードしており、polはウィルスの逆転
写酵素、タンパク質分解酵素、エンドヌクレアーゼをコ
ードしており、envはウィルスの糖タンパク質をコー
ドしている。
gag遺伝子はウィルス粒子成熟の間にプロセスされて
コアタンパク質になる前駆体をコードしている。gag
前駆体は約56kDaであり、タンパク質分解的にプロ
セスされて約24.16.14kDaの6つのタンパク
質になる。HIvレトロウィルスのgagコアタンパク
質の24kDa型は、以前このウィルスに暴露されたこ
とのある個体の大きな割合で抗体産生な誘導することが
見出されてきた。
コアタンパク質になる前駆体をコードしている。gag
前駆体は約56kDaであり、タンパク質分解的にプロ
セスされて約24.16.14kDaの6つのタンパク
質になる。HIvレトロウィルスのgagコアタンパク
質の24kDa型は、以前このウィルスに暴露されたこ
とのある個体の大きな割合で抗体産生な誘導することが
見出されてきた。
この観察に基ついてHIV 24kDa gagタン
パク質に対する抗体の有無を測定し、個人が141vに
暴露されたことがあるか否か、AIDSを発病する候補
者であるかも知れないか否かを評価する一つの方法とな
るアッセイ法が開発された。このアッセイ法を実行する
ため、精製したH’IV24kDa gagタンパク
質が診断薬として必要である。
パク質に対する抗体の有無を測定し、個人が141vに
暴露されたことがあるか否か、AIDSを発病する候補
者であるかも知れないか否かを評価する一つの方法とな
るアッセイ法が開発された。このアッセイ法を実行する
ため、精製したH’IV24kDa gagタンパク
質が診断薬として必要である。
現在、このタンパク質製剤の要求に応じるi−I I
V24 k D a g a gの簡単に入手できる
供給はない。
V24 k D a g a gの簡単に入手できる
供給はない。
同様にこのタンパク質は、もしこのタンパク質が安全で
経済的な方法で生産できれば、単独で、あるいは他のH
IVウィルスタンパク質と組み合わせてワクチンとして
も利用できる可能イがある。
経済的な方法で生産できれば、単独で、あるいは他のH
IVウィルスタンパク質と組み合わせてワクチンとして
も利用できる可能イがある。
従って、HIV 24kDa gag タ:yバク質
の生産のための効率的な方法を開発することは本分野に
重要な貢献となるだろう。
の生産のための効率的な方法を開発することは本分野に
重要な貢献となるだろう。
従って、HIV 24kDa gag タンパク質の
生産のための方法を提供することが本発明の1つの対象
である。
生産のための方法を提供することが本発明の1つの対象
である。
さらに、本発明のもう1つの対象は、HIV 24kD
a gagタンパク質をコードするDNA配列を含ん
だ新しいベクターを提供することである。
a gagタンパク質をコードするDNA配列を含ん
だ新しいベクターを提供することである。
本発明の対象はさらに、HIV 24kDa gag
タンパク質の増強された生産が可能な、一つあるいは複
数のベクターで形質転換された新しいメチロトロフィッ
ク酵母類を提供することである。
タンパク質の増強された生産が可能な、一つあるいは複
数のベクターで形質転換された新しいメチロトロフィッ
ク酵母類を提供することである。
本発明のこれらならびに他の対象は、本明細書に含まれ
る説明と特許請求の範囲から明らかになるだろう。
る説明と特許請求の範囲から明らかになるだろう。
発明の構成
本発明に従って、我々ばHIV 24kDa gag
タンパク質の構造遺伝子を含む酵母発現カセットと適合
するベクター少なくとも一つでメチロトローフ酵母を形
質転換することと、結果としてできた形質転換体を、H
I V 24 k D a g a gタンパク質の
生産を得るのに適切な条件下で培養することから成るH
IV 24kDa gag タンパク質の生産のため
の方法を発見した。
タンパク質の構造遺伝子を含む酵母発現カセットと適合
するベクター少なくとも一つでメチロトローフ酵母を形
質転換することと、結果としてできた形質転換体を、H
I V 24 k D a g a gタンパク質の
生産を得るのに適切な条件下で培養することから成るH
IV 24kDa gag タンパク質の生産のため
の方法を発見した。
第1図は、HIVの24kl)a gag遺伝子を含
む、I−IIVのEcoRI/C1aI断片の制限酵素
地図を示している。
む、I−IIVのEcoRI/C1aI断片の制限酵素
地図を示している。
第2図は、プラスミドpsL44Aの作製の流れ図を示
している。
している。
第3図は、プラスミドpsL44Aの説明を示している
。pSL44は、F l−o r iの挿入と唯一のE
coRI部位にHIV 24kDa構造遺伝子の挿入に
より修飾されたpAo 804の誘導体である。
。pSL44は、F l−o r iの挿入と唯一のE
coRI部位にHIV 24kDa構造遺伝子の挿入に
より修飾されたpAo 804の誘導体である。
pAO804はNRR,L B−18114で入手でき
、7.5Kb EcoRI断片としてプラスミドDNA
から回収することができる。
、7.5Kb EcoRI断片としてプラスミドDNA
から回収することができる。
HIVゲノムはこの分野ではよ(知られており、ラトナ
ー(Ratner)らにより塩基配列を決定された。A
IDSウィルス、HTLV−IIIの全塩基配列、Na
ture313:277(1985)。HIV 24k
Dagagタンパク質塩基配列はヌクレオチド729番
から始まり、ヌクレオチド部位1421で終わる。
ー(Ratner)らにより塩基配列を決定された。A
IDSウィルス、HTLV−IIIの全塩基配列、Na
ture313:277(1985)。HIV 24k
Dagagタンパク質塩基配列はヌクレオチド729番
から始まり、ヌクレオチド部位1421で終わる。
24kDa gagタンパク質・をコードする用いた
ヌクレオチド配列は表1に示されている。(しかし、約
1010−1115の間のヌクレオチドは、発表された
配列との一致を確認するために塩基配列は決定していな
い。)従って、24kDa gagタンパク質の塩基
配列は、HIVから構造遺伝子な再単離することにより
、またはインビトロ(in vitro)DNA合成、
あるいはこれらの技術の組み合わせにより入手すること
ができる。
ヌクレオチド配列は表1に示されている。(しかし、約
1010−1115の間のヌクレオチドは、発表された
配列との一致を確認するために塩基配列は決定していな
い。)従って、24kDa gagタンパク質の塩基
配列は、HIVから構造遺伝子な再単離することにより
、またはインビトロ(in vitro)DNA合成、
あるいはこれらの技術の組み合わせにより入手すること
ができる。
HIV 24kDa gagタンパク質の構造遺伝子
は、増殖、維持または組み換え操作のためにいずれの適
当な宿主ベクター系でも維持することができる。本発明
の実施に適した宿主/ベクター系は、pB R322プ
ラスミドと組み合わせた大腸菌(E、coli)宿主ま
たはpAO804かpAO807と組み合わせたピキア
・バストリスGS115宿主を含むが、これに限定され
るものではない。
は、増殖、維持または組み換え操作のためにいずれの適
当な宿主ベクター系でも維持することができる。本発明
の実施に適した宿主/ベクター系は、pB R322プ
ラスミドと組み合わせた大腸菌(E、coli)宿主ま
たはpAO804かpAO807と組み合わせたピキア
・バストリスGS115宿主を含むが、これに限定され
るものではない。
上記宿主株の培養は、いずれの適当な方法によっても達
することができる。宿主を培養する一般的な技術はこの
分野で概によく知られており、これらの方法をここで用
いた株の特異的な要求に適用することはいずれも十分に
当業者の能力の範囲内にある。
することができる。宿主を培養する一般的な技術はこの
分野で概によく知られており、これらの方法をここで用
いた株の特異的な要求に適用することはいずれも十分に
当業者の能力の範囲内にある。
宿主からのプラスミドDNAの回収は、該プラスミドD
NAの小型のサイズと閉環状の超らせん構造に基づいて
い(つかの技術により成し遂げることができる。例えば
集菌の後、宿主細胞は遠心でペレットにし、次に再懸濁
して溶菌することができる。溶菌液は細胞の破砕物を除
(ために遠心をし、DNAを含むその上清を集める。次
に、DNAを濃縮するためにPEG沈殿を行うことがで
きろ。次に沈殿したDNAをさらに密度勾配遠心か、ゲ
ルろ過技術を用いて、プラスミドDNAを細菌DNAか
ら分離することができる。上で述べた分離を成し遂げる
ための技術はこの分野でよ(知られており、これらの技
術を実行する数多(の方法が知られている。
NAの小型のサイズと閉環状の超らせん構造に基づいて
い(つかの技術により成し遂げることができる。例えば
集菌の後、宿主細胞は遠心でペレットにし、次に再懸濁
して溶菌することができる。溶菌液は細胞の破砕物を除
(ために遠心をし、DNAを含むその上清を集める。次
に、DNAを濃縮するためにPEG沈殿を行うことがで
きろ。次に沈殿したDNAをさらに密度勾配遠心か、ゲ
ルろ過技術を用いて、プラスミドDNAを細菌DNAか
ら分離することができる。上で述べた分離を成し遂げる
ための技術はこの分野でよ(知られており、これらの技
術を実行する数多(の方法が知られている。
プラスミドのヌクレアーゼ消化は、HIVgag構造遺
伝子の回収を容易にするような方法で、選んだプラスミ
ドを切るような適当なエンドヌクレアーゼを選ぶことに
より行った。用いるエンドヌクレア−ゼは、HIV 2
4kDa gag遺伝子を切り出すプラスミドに依る
である。
伝子の回収を容易にするような方法で、選んだプラスミ
ドを切るような適当なエンドヌクレアーゼを選ぶことに
より行った。用いるエンドヌクレア−ゼは、HIV 2
4kDa gag遺伝子を切り出すプラスミドに依る
である。
DNAのゲル電気泳動は多数の技術を用いて行うことが
できる。P、G、シーリー(Sealy)とE、M。
できる。P、G、シーリー(Sealy)とE、M。
サザン(S outhern)の、核酸のゲル電気泳動
−実際的アプローチ(D、リックウッド(Ri ckw
ood )とB、D。
−実際的アプローチ(D、リックウッド(Ri ckw
ood )とB、D。
ヘイムズ(Hames)編) p、39 (1982)
参照。溶出も用いたゲルに適した、電気溶出、拡散、ゲ
ル溶解(アガロース・ゲル)、または物理的抽出(アガ
ロース・ゲル)のような多(の技術を用いて行うことが
できる。それに加え、高品質、低融点アガロースのよう
ない(つかのゲルでは溶出は不要であることも知られて
いる。
参照。溶出も用いたゲルに適した、電気溶出、拡散、ゲ
ル溶解(アガロース・ゲル)、または物理的抽出(アガ
ロース・ゲル)のような多(の技術を用いて行うことが
できる。それに加え、高品質、低融点アガロースのよう
ない(つかのゲルでは溶出は不要であることも知られて
いる。
いったんHIV24kDa g’ag構造遺伝子を含
む断片、またはその断片群が単離されたら、それがベク
ターに挿入される前に追加的な操作が必要となるだろう
。これらの操作には、リンカ−の付加、または断片の末
端平滑化が含まれるが、これに限定されるものではない
。
む断片、またはその断片群が単離されたら、それがベク
ターに挿入される前に追加的な操作が必要となるだろう
。これらの操作には、リンカ−の付加、または断片の末
端平滑化が含まれるが、これに限定されるものではない
。
HIV gag 構造遺伝子の単離に続いて、該遺伝子
をプラスミドのような適当なメチロトローフ酵母ベクタ
ーに挿入する。本発明の実施に望ましいベクターはピキ
ア属、最も望ましいのはピキア・パストリスに適合した
ベクターである。
をプラスミドのような適当なメチロトローフ酵母ベクタ
ーに挿入する。本発明の実施に望ましいベクターはピキ
ア属、最も望ましいのはピキア・パストリスに適合した
ベクターである。
プラスミドは長い間組み換えDNA技術で用いられる基
本的な要素の1つであった。プラスミドは微生物中に見
出される環状の染色体外2本鎖DNAである。プラスミ
ドは細胞あたり単一あるいは複数σフコピーで存在する
ことが見出されている。プラスミドDNAには、プラス
ミドの複製のために必要な情報が含まれている。jなわ
ち細菌での複製のための複製起点は含まれている。形質
転換した細胞中でプラスミドを表現型で選択する単一ま
たは複数の手段も、プラスミドにコードされる情報に含
まれている。抗生物質耐性遺伝子や、宿主の生化学的糸
路の欠損を相補する遺伝子のような表現型の、あるいは
選択的マーカーは、形質転換された宿主細胞のクローン
を識別し、選択し、維持することを可能にする。
本的な要素の1つであった。プラスミドは微生物中に見
出される環状の染色体外2本鎖DNAである。プラスミ
ドは細胞あたり単一あるいは複数σフコピーで存在する
ことが見出されている。プラスミドDNAには、プラス
ミドの複製のために必要な情報が含まれている。jなわ
ち細菌での複製のための複製起点は含まれている。形質
転換した細胞中でプラスミドを表現型で選択する単一ま
たは複数の手段も、プラスミドにコードされる情報に含
まれている。抗生物質耐性遺伝子や、宿主の生化学的糸
路の欠損を相補する遺伝子のような表現型の、あるいは
選択的マーカーは、形質転換された宿主細胞のクローン
を識別し、選択し、維持することを可能にする。
HIV 24kDa gag構造遺伝子をメチロトロ
ーフ酵母中で発現させるために、該遺伝子は機能可能で
あるよ5に5’制御領域と、3′終結配列に連結しなげ
ればならす、それはベクターにより宿主中に挿入される
発現カセットとなる。
ーフ酵母中で発現させるために、該遺伝子は機能可能で
あるよ5に5’制御領域と、3′終結配列に連結しなげ
ればならす、それはベクターにより宿主中に挿入される
発現カセットとなる。
次の用語は明確にするためにここで定義する。
機能可能であるように連結した・・・・・・構成物がそ
の機能を果たすように配置される並置のことを言う。
の機能を果たすように配置される並置のことを言う。
制御領域・・・・・・種々の刺激に応答し、m J(、
N A転写の速度に影響を与えるDNA配列。
N A転写の速度に影響を与えるDNA配列。
、3′終結配列・・・・・・ポリアデニル化を引き起こ
す配列のようなmRNAを安定化する機能をする終止コ
ドンの、3′側の配列。
す配列のようなmRNAを安定化する機能をする終止コ
ドンの、3′側の配列。
゛ピキアに適合した″とはピキア由来の制御領域や3′
終終結列のような、ピキア中で正常な機能を果たすDN
A配列のことを言う。現在ヨーロッパ公示済特許第22
6752号明細書として公示された、ヨーロッパ特許出
願筒8i14700.7号明細書に述べられているよう
に、フレラダ(cregg)の線状の部位特異的組込み
(インテグレイティブ)ベクターのような組込みベクタ
ーが、本発明の実施には望ましい。そのようなベクター
は、少なくとも1)第1の挿入可能なDNA断片;2)
選択マーカー遺伝子;6)第2の挿入可能なDNA断片
を順に配置した配列より成る。
終終結列のような、ピキア中で正常な機能を果たすDN
A配列のことを言う。現在ヨーロッパ公示済特許第22
6752号明細書として公示された、ヨーロッパ特許出
願筒8i14700.7号明細書に述べられているよう
に、フレラダ(cregg)の線状の部位特異的組込み
(インテグレイティブ)ベクターのような組込みベクタ
ーが、本発明の実施には望ましい。そのようなベクター
は、少なくとも1)第1の挿入可能なDNA断片;2)
選択マーカー遺伝子;6)第2の挿入可能なDNA断片
を順に配置した配列より成る。
第1と第2の挿入可能な1〕N A断片は各々少なくと
も長さ約200ヌクレオチドあり、ピキア属の種のゲノ
ムDNAの部分と相同である塩基配列を持っている。挿
入型ベクターの種々の構成物は、発現カセットと選択マ
ーカー遺伝子が、第1の挿入可能なDNA断片の、3′
端と、第2の挿入可能なDNA断片の5′端の間に位置
するように線状のD N A断片となるように順に配置
されている。
も長さ約200ヌクレオチドあり、ピキア属の種のゲノ
ムDNAの部分と相同である塩基配列を持っている。挿
入型ベクターの種々の構成物は、発現カセットと選択マ
ーカー遺伝子が、第1の挿入可能なDNA断片の、3′
端と、第2の挿入可能なDNA断片の5′端の間に位置
するように線状のD N A断片となるように順に配置
されている。
第1と第2の挿入可能なDNA断片は、順に配置された
線状断片中で、該断片が親株のゲノムの中で配置してい
るように、お互いに対して配置している。
線状断片中で、該断片が親株のゲノムの中で配置してい
るように、お互いに対して配置している。
第1と第2の挿入可能なDNA断片として便利な塩基配
列はゲノムの修飾を起こそうとする、元のゲノムの部位
のお互いに離れた部分と相同な塩基配列である。従って
、例えばもし、アルコール・オキシダーゼ遺伝子の座位
にゲノムの修飾を起こそうとするなら、用いる第1と第
2の挿入可能すD N A断片は、アルコール・オキシ
ダーゼ遺伝子座位のお互いに離れた部分と相同な配列で
ある。
列はゲノムの修飾を起こそうとする、元のゲノムの部位
のお互いに離れた部分と相同な塩基配列である。従って
、例えばもし、アルコール・オキシダーゼ遺伝子の座位
にゲノムの修飾を起こそうとするなら、用いる第1と第
2の挿入可能すD N A断片は、アルコール・オキシ
ダーゼ遺伝子座位のお互いに離れた部分と相同な配列で
ある。
本発明に一致して起こそうとするゲノムの修飾のために
は、2つの挿入可能なDNA断片は、線状の断片中で、
親株のゲノムの中で存在している時と同じ相対的な配置
で、お互いに対して配置していなくてはならない。第1
と第2の挿入可能なDNA断片として用いることのでき
る塩基配列の例は、アルコール・オキシダーゼ(AOX
l ) 遺伝子、ジヒドロアセトン・シンターゼ(1)
HASI)遺伝子、p40遺伝子、HIS4遺伝子から
成るグループから選択した塩基配列である。AOX1遺
伝子、DHASI遺伝子、p40遺伝子、HIS4遺伝
子は参考文献として本明細書に含まれている本出願と同
時に係属中の特許出願第780.102号明細書に含ま
れている。
は、2つの挿入可能なDNA断片は、線状の断片中で、
親株のゲノムの中で存在している時と同じ相対的な配置
で、お互いに対して配置していなくてはならない。第1
と第2の挿入可能なDNA断片として用いることのでき
る塩基配列の例は、アルコール・オキシダーゼ(AOX
l ) 遺伝子、ジヒドロアセトン・シンターゼ(1)
HASI)遺伝子、p40遺伝子、HIS4遺伝子から
成るグループから選択した塩基配列である。AOX1遺
伝子、DHASI遺伝子、p40遺伝子、HIS4遺伝
子は参考文献として本明細書に含まれている本出願と同
時に係属中の特許出願第780.102号明細書に含ま
れている。
第1の挿入可能なDNA断片は発現カセット中で使われ
る制御領域を構成する機能可能である制御領域を含むこ
とができる。第1の挿入可能なDNA断片を発現カセッ
トの制御領域として用いることは本発明の望ましい態様
の一つである。第3図は第1の挿入可能なDNA断片を
カセットのための制御領域として用いるベクターの図を
示したものである。
る制御領域を構成する機能可能である制御領域を含むこ
とができる。第1の挿入可能なDNA断片を発現カセッ
トの制御領域として用いることは本発明の望ましい態様
の一つである。第3図は第1の挿入可能なDNA断片を
カセットのための制御領域として用いるベクターの図を
示したものである。
第3図に付加的に示されているように、単一あるいは複
数の挿入部位と、3′終結配列は、第1の挿入可能なD
NA断片のすぐ、3′側に置(ことができる。この線状
の部位特異的挿入型ベクターの構造は適合した3′終終
結列の付加の必要なしに、構造遺伝子の便利な挿入部位
を提供するという付加的な利点もある。
数の挿入部位と、3′終結配列は、第1の挿入可能なD
NA断片のすぐ、3′側に置(ことができる。この線状
の部位特異的挿入型ベクターの構造は適合した3′終終
結列の付加の必要なしに、構造遺伝子の便利な挿入部位
を提供するという付加的な利点もある。
宿主を形質転換するのに用いるL)NA中には選択マー
カー遺伝子が少なくとも1つ含まれることも必要である
。これは形質転換するDNAを取り込んだ生物を選択し
、単離′1−るのを容易にする。
カー遺伝子が少なくとも1つ含まれることも必要である
。これは形質転換するDNAを取り込んだ生物を選択し
、単離′1−るのを容易にする。
マーカー遺伝子は、宿主が持っていなかった表現型の特
徴、たとえば形質転換されていない宿主株が特定のアミ
ノ酸生合成系路に欠損を持っている場合には特定のアミ
ノ酸を生産する能力の回復、または抗生物質に対する耐
性などを形質転換された生物に与える。
徴、たとえば形質転換されていない宿主株が特定のアミ
ノ酸生合成系路に欠損を持っている場合には特定のアミ
ノ酸を生産する能力の回復、または抗生物質に対する耐
性などを形質転換された生物に与える。
例となる選択マーカー遺伝子は、ピキア・パストリスと
サッカロミセス・セレビシエ由来のHIS4遺伝子とA
RG4遺伝子、サッカロミセス・セレビシエ由来のイン
ベルターゼ遺伝子(SuC2)、または大腸菌転移要素
T n 601かTn903のG418ホスホトランス
フエラーゼ遺伝子から成るグループから選ぶことができ
る。
サッカロミセス・セレビシエ由来のHIS4遺伝子とA
RG4遺伝子、サッカロミセス・セレビシエ由来のイン
ベルターゼ遺伝子(SuC2)、または大腸菌転移要素
T n 601かTn903のG418ホスホトランス
フエラーゼ遺伝子から成るグループから選ぶことができ
る。
当業者は、本発明の実施に用いたベクターに、付加的な
L)NA配列、たとえば細菌のグラスミドDNA、バク
テリオファージのDNAなどを組み込むことが可能であ
ることを知っている。そのような配列はこれらのベクタ
ーを細菌宿主中で増幅したり維持したりすることを可能
にする。
L)NA配列、たとえば細菌のグラスミドDNA、バク
テリオファージのDNAなどを組み込むことが可能であ
ることを知っている。そのような配列はこれらのベクタ
ーを細菌宿主中で増幅したり維持したりすることを可能
にする。
もし第1の挿入可能なDNA断片が制御領域を持ってい
ないなら機能可能であるような発現カセットを提供する
ために、構造遺伝子と機能可能であるように連結した適
当な制御領域を挿入する必要がある。同様にもし発現カ
セットを完成するために挿入部位に、3′終結配列か与
えられていなければ、、3′終結配列は挿入される構造
遺伝子に機能可能であるように連結されなくてはならな
い。
ないなら機能可能であるような発現カセットを提供する
ために、構造遺伝子と機能可能であるように連結した適
当な制御領域を挿入する必要がある。同様にもし発現カ
セットを完成するために挿入部位に、3′終結配列か与
えられていなければ、、3′終結配列は挿入される構造
遺伝子に機能可能であるように連結されなくてはならな
い。
当業者は解析されメチロトローフ酵母類と組み合わせて
用いることのできる多(の制御領域を知っている。例と
なる制御領域は、サッカロミセス・セレビシエから単離
された酸性ホスファターゼガラクトキナーゼ、アルコー
ル・デヒドロゲナーゼ、シトクロムC、アルファー接合
因子、ダリセルアルデヒドろリン酸・デヒドロゲナーゼ
の制御領域と、ピキア・パストリス由来の主要なアルコ
ール・オキシダーゼ(AOXI)、ジヒドロキシアセト
ン・シンターゼ、(])ASI)、p40の制御領域と
HI S 4の制御領域など、から成るグループから選
んだ酵母の制御領域が含まれるが、これに限定されるも
のではない。本発明の実施において用いられている現在
望ましい制御領域は、本出願と同時に係属中の特許出願
第78U、102号明細書で開示されているAOX l
、DHASl、p40から成るグループから選んだ制御
領域のような、メタノールを含む培地に対する応答能に
より特徴付けられる上記制御領域である。
用いることのできる多(の制御領域を知っている。例と
なる制御領域は、サッカロミセス・セレビシエから単離
された酸性ホスファターゼガラクトキナーゼ、アルコー
ル・デヒドロゲナーゼ、シトクロムC、アルファー接合
因子、ダリセルアルデヒドろリン酸・デヒドロゲナーゼ
の制御領域と、ピキア・パストリス由来の主要なアルコ
ール・オキシダーゼ(AOXI)、ジヒドロキシアセト
ン・シンターゼ、(])ASI)、p40の制御領域と
HI S 4の制御領域など、から成るグループから選
んだ酵母の制御領域が含まれるが、これに限定されるも
のではない。本発明の実施において用いられている現在
望ましい制御領域は、本出願と同時に係属中の特許出願
第78U、102号明細書で開示されているAOX l
、DHASl、p40から成るグループから選んだ制御
領域のような、メタノールを含む培地に対する応答能に
より特徴付けられる上記制御領域である。
本発明の実施において最も望ましい制御領域はAOX1
制御領域である。
制御領域である。
、3′終結配列は発現カセット中で、または上で論じた
ようにベクターの一部として用いることができる。、3
′終結配列は遺伝子に機能可能であるように連結すると
、構造遺伝子によりコードされているメツセンジャーR
NAを終結させ、ポリアデニル化し、そして/また安定
化する働きをする。本発明の実施のための、3′終結配
列のための説明となる由来のいくつかの例はサッカロミ
セス・セレビシエ ハンセヌラ・ポリモルファ(Han
senulapolymorpha3,1.ピキアの3
′終結配列を含んでいるが、これに限定されるものでは
ない。AOX1遺伝子D HA S遺伝子、p4[]遺
伝子、HIS4遺伝子、0、3′終結配列から成るグル
ープから選んだもののようなピキア・パストリス由来の
ものが望ましい。
ようにベクターの一部として用いることができる。、3
′終結配列は遺伝子に機能可能であるように連結すると
、構造遺伝子によりコードされているメツセンジャーR
NAを終結させ、ポリアデニル化し、そして/また安定
化する働きをする。本発明の実施のための、3′終結配
列のための説明となる由来のいくつかの例はサッカロミ
セス・セレビシエ ハンセヌラ・ポリモルファ(Han
senulapolymorpha3,1.ピキアの3
′終結配列を含んでいるが、これに限定されるものでは
ない。AOX1遺伝子D HA S遺伝子、p4[]遺
伝子、HIS4遺伝子、0、3′終結配列から成るグル
ープから選んだもののようなピキア・パストリス由来の
ものが望ましい。
そして特に望ましいものはAOX1遺伝子の、3′終結
配列である。
配列である。
本発明の実施のためには、第3図に示されたように時計
回りのBglI[断片のような線状形質転換ベクターを
用いることが現在のところ望ましい。
回りのBglI[断片のような線状形質転換ベクターを
用いることが現在のところ望ましい。
HIV 24kDa gag構造遺伝子wm当なベク
ター中に挿入することは、選んだベクターを適切な単一
あるいは複数の部位で切断し、構造遺伝子を含んだ機能
可能である発現カセットを少なくとも一つベクター中に
入れるようにするあらゆる適切な技術を用いて行なうこ
とができる。
ター中に挿入することは、選んだベクターを適切な単一
あるいは複数の部位で切断し、構造遺伝子を含んだ機能
可能である発現カセットを少なくとも一つベクター中に
入れるようにするあらゆる適切な技術を用いて行なうこ
とができる。
HIV 24kl)a gag構造遺伝子の結合は′
1゛4D N A !Jガーゼを用いるような、あらゆ
る適切なライゲーション技術を用いて行なうことができ
る。
1゛4D N A !Jガーゼを用いるような、あらゆ
る適切なライゲーション技術を用いて行なうことができ
る。
HIV 24kDa gag構造遺伝子とヘクターノ
ライゲーション混合物の最初の選択、増殖、伺加的な増
幅は、混合物を(ライゲーション混合物は酵母宿主に直
接形質転換することも可能であるが)むしろ大腸菌のよ
うな細菌の宿主に形質転換することにより行われる。大
腸菌のための適切な形質転換の技術はこの分野でよ(知
られている。それに加え、ベクターの細菌宿主中での維
持に必要な選択マーカーと、細菌の複製起点もこの分野
ではよ(知られている。
ライゲーション混合物の最初の選択、増殖、伺加的な増
幅は、混合物を(ライゲーション混合物は酵母宿主に直
接形質転換することも可能であるが)むしろ大腸菌のよ
うな細菌の宿主に形質転換することにより行われる。大
腸菌のための適切な形質転換の技術はこの分野でよ(知
られている。それに加え、ベクターの細菌宿主中での維
持に必要な選択マーカーと、細菌の複製起点もこの分野
ではよ(知られている。
1(IV 24kl)a gag構造遺伝子を発現系
に含んでいる、希望のプラスミドの単離ならひに/もし
くは精製は、宿主DNAからプラスミドD N Aを分
離するためのあらゆる手段を用いて行うことができる。
に含んでいる、希望のプラスミドの単離ならひに/もし
くは精製は、宿主DNAからプラスミドD N Aを分
離するためのあらゆる手段を用いて行うことができる。
同様に、ライゲーションにより作製したベクターは、H
I V 24 k D a g a g遺伝子の存在
とその制御領域と、3′終結配列との機能可能な結合を
確認するために、むしろ増殖させた後に調べることがで
きる。これは、エンドヌクレアーゼ消化、ゲル電気泳動
またはエンドヌクレアーゼ消化、サザン+ハイブリダイ
ゼーション(5outhern hybridizat
ion)を含む種々の技術により行うことができるが、
これに限定されるものではない。
I V 24 k D a g a g遺伝子の存在
とその制御領域と、3′終結配列との機能可能な結合を
確認するために、むしろ増殖させた後に調べることがで
きる。これは、エンドヌクレアーゼ消化、ゲル電気泳動
またはエンドヌクレアーゼ消化、サザン+ハイブリダイ
ゼーション(5outhern hybridizat
ion)を含む種々の技術により行うことができるが、
これに限定されるものではない。
プラスミドあるいは線状のベクターを酵母宿主に形質転
換することは、ヒネン(Hinnen)らP roc。
換することは、ヒネン(Hinnen)らP roc。
Natl、Acad、 Sc1、 75. (1978
) 1929; イトウ(Ito)ら、 J 、Ba
cteriol 153. (198ろ)163;
ブレツク(cregg)らMol、Ce1l Biol
、 5(1985)pg、336;またはスリークリシ
ュナ(5reekrishna)ら、Gene、59(
1987)pg、115によって述べられたものを含む
かこれに限定されるものではない適切な形質転換技術に
より行うことができる。本発明の実施のためにはフレラ
グの形質転換技術が望ましい。
) 1929; イトウ(Ito)ら、 J 、Ba
cteriol 153. (198ろ)163;
ブレツク(cregg)らMol、Ce1l Biol
、 5(1985)pg、336;またはスリークリシ
ュナ(5reekrishna)ら、Gene、59(
1987)pg、115によって述べられたものを含む
かこれに限定されるものではない適切な形質転換技術に
より行うことができる。本発明の実施のためにはフレラ
グの形質転換技術が望ましい。
形質転換のための宿主は、すべての適切なメチロトロフ
ィ、り酵母がなることができる。メチロトロフィック酵
母はハンセヌラ(Hansenula)、 カンディ
ダ(candida)、りoエヶラ(]ぐ1oecke
ra)、 ピキア、サツカロミセス、トルロプシス(
Torulopsis)。
ィ、り酵母がなることができる。メチロトロフィック酵
母はハンセヌラ(Hansenula)、 カンディ
ダ(candida)、りoエヶラ(]ぐ1oecke
ra)、 ピキア、サツカロミセス、トルロプシス(
Torulopsis)。
ロドトルラ(Rhodotorula)から成る属の中
から選んだメタノール上で生育できる酵母を含むが、こ
れに限定するものではない。このクラスの酵母の例とな
る特定の種のリストはC,アンンニ(Anthony)
、 ’、[”he Hiodenistry of M
ethylotropbs。
から選んだメタノール上で生育できる酵母を含むが、こ
れに限定するものではない。このクラスの酵母の例とな
る特定の種のリストはC,アンンニ(Anthony)
、 ’、[”he Hiodenistry of M
ethylotropbs。
269(1982)に見出すことができる。栄養要求性
のピキア・パストリスGS 115 (NRRLY−1
5851)のようなピキア属のメチロトロフィック酵母
が現在のところ望ましい。栄養要求性メチロトロフィッ
ク酵母は本発明の実施においても、選択が容易なことか
ら利点がある。もしピキア・パストリスを形質転換して
ショ糖の上で生育できる株にする5IJC2の使用のよ
うな適切な形質転換マーカー遺伝子を選べば、または0
418のような抗生物質耐性マーカーを用いれは、野生
株のメチロトロフィック酵母も用いて同様に成功するこ
とができることが知られている。
のピキア・パストリスGS 115 (NRRLY−1
5851)のようなピキア属のメチロトロフィック酵母
が現在のところ望ましい。栄養要求性メチロトロフィッ
ク酵母は本発明の実施においても、選択が容易なことか
ら利点がある。もしピキア・パストリスを形質転換して
ショ糖の上で生育できる株にする5IJC2の使用のよ
うな適切な形質転換マーカー遺伝子を選べば、または0
418のような抗生物質耐性マーカーを用いれは、野生
株のメチロトロフィック酵母も用いて同様に成功するこ
とができることが知られている。
形質転換されたメチロ)oフィック酵母細胞は、以前栄
養要求性であった細胞を形質転換後(細胞の栄養要求性
に応じ)必要とされる生化学的産物の非存在下で培養す
る、新しい表現型(゛′メタノ+/− 一ル利用能十/ −、Mut ” )を検出する
ことによるスクリーニング、または形質転換体に含まれ
る耐性遺伝子がない場合は酵母に廟毒である抗生物質の
存在下で培養する、ということを含むが、これに限定さ
れない適切な技術を用いて選択することができる。
養要求性であった細胞を形質転換後(細胞の栄養要求性
に応じ)必要とされる生化学的産物の非存在下で培養す
る、新しい表現型(゛′メタノ+/− 一ル利用能十/ −、Mut ” )を検出する
ことによるスクリーニング、または形質転換体に含まれ
る耐性遺伝子がない場合は酵母に廟毒である抗生物質の
存在下で培養する、ということを含むが、これに限定さ
れない適切な技術を用いて選択することができる。
単離した形質転換されたメチロトロフィック酵母は、フ
ラスコ振盪発酵法、高密度発酵法、また479(198
7)で開示された技術のような、適切な発酵技術により
培養される。
ラスコ振盪発酵法、高密度発酵法、また479(198
7)で開示された技術のような、適切な発酵技術により
培養される。
発現は用いた制御領域に適切な方法により行うことがで
きろ。もしメタノール応答性制御領域を用いたら、発現
の誘導は栄養培地中の形質転換された細胞を、用いた制
御領域に適したアルコールに露すことにより行うことが
できる。
きろ。もしメタノール応答性制御領域を用いたら、発現
の誘導は栄養培地中の形質転換された細胞を、用いた制
御領域に適したアルコールに露すことにより行うことが
できる。
HIV 24kDa gag タンパク質は、十分な
時間誘導させた形質転換細胞を、ビーズ粉砕に続けて細
胞破砕物を除(のに十分な遠心を行うような標準的な技
術を用いて溶菌することにより粗製物の形で回収するこ
とができる。望ましい回収法は実施例■に含まれている
。
時間誘導させた形質転換細胞を、ビーズ粉砕に続けて細
胞破砕物を除(のに十分な遠心を行うような標準的な技
術を用いて溶菌することにより粗製物の形で回収するこ
とができる。望ましい回収法は実施例■に含まれている
。
以下の限定するものではない実施例は、本発明の実施を
さらに説明するために挙げた。
さらに説明するために挙げた。
実施例
実施例に関する一般的な情報。
菌株
ピキア・パストリス(P1、chia pastori
s)GS115(HIS4)[NRRL Y−158
51)はこれらの実施例で用いた宿主酵母株である。
s)GS115(HIS4)[NRRL Y−158
51)はこれらの実施例で用いた宿主酵母株である。
緩衝液、溶液、培地
以下の実施例で用いた緩衝液と溶液は以下のような組成
を持っている。
を持っている。
dH20ミリQ (mi l l i−Q)(Mill
ipore)試薬用水システム(reagent water system)で処理した脱1Mトリス緩
衝液 TE緩衝液 ED CE aS イオンしたH2O。
ipore)試薬用水システム(reagent water system)で処理した脱1Mトリス緩
衝液 TE緩衝液 ED CE aS イオンしたH2O。
800mLのH2Oに121.1gのトリス塩基:濃(
65%)塩酸を加え ることによりpHを希望の価に 合わせる;最終的pH調整の前 に溶液を室温に冷やし、終容積 が1Lになるよう希釈。
65%)塩酸を加え ることによりpHを希望の価に 合わせる;最終的pH調整の前 に溶液を室温に冷やし、終容積 が1Lになるよう希釈。
1.0mM EIDTA
0.01 M (pH8,0) )リス緩衝液中。
1M ツルピトー/l/(sorbitol)25mM
El)TA 50mM 1)TT pH8に調整 9、1 g ソルビトール 1.47.9 クエン酸ナトリウム 0.168g EDTA pl−1をHClで5.8に調整、 50 m1dHzo中 オートクレーフ 1Mソルビトール PEG溶液 溶液A 溶液B 1QmM CaCJh ・・・・・・3過滅菌 20% ホリエチレン・グリコール−33501Q m
M’ CaCaC 421Q )リス4−(cl(pH7,4)・・・・
・・ろ過滅菌 0.2M )リス−HC1(pH7,5)0.1M
fL9 C42 0,5M NaC7 0,01M ジチオスレイトール (di thiothreitol)(DTT)0.2
M )リス−HCA(pH7,5)0.1M Mg
CA2 0、IM DTT 4μl 10mM 4μノ 1QmM 4μA10mM 4μA10mM TTP GTP CTP TP 20XSSPE 4μlT4 リガーゼ(2U/μ1) 12μ7 H2O 溶液Cの処決はシラー(Zol Ier)とスミス(S
mith)を改変した。
El)TA 50mM 1)TT pH8に調整 9、1 g ソルビトール 1.47.9 クエン酸ナトリウム 0.168g EDTA pl−1をHClで5.8に調整、 50 m1dHzo中 オートクレーフ 1Mソルビトール PEG溶液 溶液A 溶液B 1QmM CaCJh ・・・・・・3過滅菌 20% ホリエチレン・グリコール−33501Q m
M’ CaCaC 421Q )リス4−(cl(pH7,4)・・・・
・・ろ過滅菌 0.2M )リス−HC1(pH7,5)0.1M
fL9 C42 0,5M NaC7 0,01M ジチオスレイトール (di thiothreitol)(DTT)0.2
M )リス−HCA(pH7,5)0.1M Mg
CA2 0、IM DTT 4μl 10mM 4μノ 1QmM 4μA10mM 4μA10mM TTP GTP CTP TP 20XSSPE 4μlT4 リガーゼ(2U/μ1) 12μ7 H2O 溶液Cの処決はシラー(Zol Ier)とスミス(S
mith)を改変した。
4.4g NaOH
7,4g Na2BDTA
27、6 gNaf42PO4・H2O210,9Na
C1 −−−−−・pHをNaOHで7.5−8.0に調整・
・・・H2Oで1リツトルに、 0XSSC (Polyvinylpyrol 1dine)59
BSA フラクションV 1(20で5 Q [] ml!に 175.3 、!9’ NaC11 88,2g クエン酸ナトリウム ・・・・・・pHをNaOHで7.0に調整・・・・・
・H2Oで1リツトルに、 (3す 40〃l ビオチン 134+++1H3P’04(85%)5.8,9
CaSO4・22H2 O92K2SO4 75,9MgSO4・7H20 21,9KO1( 0,30g 硫酸マグネシウム・H2O0,20,9
モリブデン酸ナトリウム 0.02g ホウ酸 2.00 g 硫酸亜鉛・H2O 4,8I 塩化第2鉄・H2O 3,00m1/リツトル硫酸 水で1リツトルに、 3500 ml水 ウェスタン緩衝液 1リツトルに 2.5g ゼラチンをマイクロウェー ブ溶液に入れる。
C1 −−−−−・pHをNaOHで7.5−8.0に調整・
・・・H2Oで1リツトルに、 0XSSC (Polyvinylpyrol 1dine)59
BSA フラクションV 1(20で5 Q [] ml!に 175.3 、!9’ NaC11 88,2g クエン酸ナトリウム ・・・・・・pHをNaOHで7.0に調整・・・・・
・H2Oで1リツトルに、 (3す 40〃l ビオチン 134+++1H3P’04(85%)5.8,9
CaSO4・22H2 O92K2SO4 75,9MgSO4・7H20 21,9KO1( 0,30g 硫酸マグネシウム・H2O0,20,9
モリブデン酸ナトリウム 0.02g ホウ酸 2.00 g 硫酸亜鉛・H2O 4,8I 塩化第2鉄・H2O 3,00m1/リツトル硫酸 水で1リツトルに、 3500 ml水 ウェスタン緩衝液 1リツトルに 2.5g ゼラチンをマイクロウェー ブ溶液に入れる。
最初’loomlの水に
100m110XP]35
1m150% トゥイーン(Tween)−204ml
5% アジ化ナトリウム dH20で1リツトルに、 再生寒天 [+、6 Kcz 2%寒天実施例
1 pAO8070作製 pA0804プラスミドは大腸菌の宿主に入って、合衆
国農業省(Department of Agrieu
ltnre)、ペオリア(Peor i a) 、イリ
ノイ州(Illinois)の北部地域研究センター(
Northerr Regional Re5earc
hCenter)寄託番号B−18114から入手する
ことができる。pAO804はフリスミドDNAを単離
し、EcoRIで消化し、ゲル電気泳動して唯一のgc
oRI部位で切断された線状のpAO804である〜7
.5 K b断片を回収することにより、回収される。
5% アジ化ナトリウム dH20で1リツトルに、 再生寒天 [+、6 Kcz 2%寒天実施例
1 pAO8070作製 pA0804プラスミドは大腸菌の宿主に入って、合衆
国農業省(Department of Agrieu
ltnre)、ペオリア(Peor i a) 、イリ
ノイ州(Illinois)の北部地域研究センター(
Northerr Regional Re5earc
hCenter)寄託番号B−18114から入手する
ことができる。pAO804はフリスミドDNAを単離
し、EcoRIで消化し、ゲル電気泳動して唯一のgc
oRI部位で切断された線状のpAO804である〜7
.5 K b断片を回収することにより、回収される。
1、 fl−oriDNAの調整
flバクテリオファージDNA(50gg)を50ユニ
ツトのRsa IとDra Iで(製造者の指示に従っ
て)消化し、flの複製起点(Orl)を含む〜458
bpのDNA断片を遊離させた。消化物の混合物は等容
のフェノール:クロロホルム(V/V )で抽出した後
、水層な等容のクロロホルムで抽出し、最後にNaC7
1濃度を0.2Mに合わせて2.5容のエタノールを加
えて水層のDNAを沈殿した。混合物を氷上(4℃)に
10分間放置した後、微量遠心機で4°Gで10.00
0X、9.60分間遠心することによりDNA沈殿を集
めた。
ツトのRsa IとDra Iで(製造者の指示に従っ
て)消化し、flの複製起点(Orl)を含む〜458
bpのDNA断片を遊離させた。消化物の混合物は等容
のフェノール:クロロホルム(V/V )で抽出した後
、水層な等容のクロロホルムで抽出し、最後にNaC7
1濃度を0.2Mに合わせて2.5容のエタノールを加
えて水層のDNAを沈殿した。混合物を氷上(4℃)に
10分間放置した後、微量遠心機で4°Gで10.00
0X、9.60分間遠心することによりDNA沈殿を集
めた。
DNAベレットは70%エタノール水溶液で2度洗浄し
た。洗浄したペレットは真空乾燥し、25μlのTE緩
衝液に溶解した。このDNAを1.5%アガロースゲル
で電気泳動し、〜458bpf1−ρr11断片を含む
ゲルの部分を切り出して、ゲル中ノD NAヲD E
81 (W21jlTLan)ペーパー上に電気溶出し
、ペーパーから1MNa(J!に溶出した。
た。洗浄したペレットは真空乾燥し、25μlのTE緩
衝液に溶解した。このDNAを1.5%アガロースゲル
で電気泳動し、〜458bpf1−ρr11断片を含む
ゲルの部分を切り出して、ゲル中ノD NAヲD E
81 (W21jlTLan)ペーパー上に電気溶出し
、ペーパーから1MNa(J!に溶出した。
DNA溶液は上で詳しく述べたように沈殿し、DNA沈
殿は25μlTE緩衝液に溶解した。
殿は25μlTE緩衝液に溶解した。
(fl−ori断片)
2、fl−oriのpBR322のDra I部位への
クローニング: pBR322(2μg)を2ユニツトのDra■テ(製
造者の指示に従って)部分消化した。反応はフェノール
:クロロホルム抽出に続けて、上のステップ1で詳しく
述べたようにDNA沈殿することにより停止させた。D
NAペレットを20μlTE緩衝液に溶解した。20μ
lのライゲーション緩衝液中で、1ユニツトのT0n)
NAIJガーゼと14℃で一夜保温することにより、こ
のDNAの約1oongをIDOngのfl−ori断
片(ステップ1)とライゲーションした。ライゲーショ
ンは70°Cで10分間加熱することにより停止させ、
その後大腸菌JM103株を形質転換するのに用い、p
BR322のDra I部位(ヌクレオチド番号626
2と3251)にクローニングされたfloriを含ん
だp、B Rf 1−oriを得た。
クローニング: pBR322(2μg)を2ユニツトのDra■テ(製
造者の指示に従って)部分消化した。反応はフェノール
:クロロホルム抽出に続けて、上のステップ1で詳しく
述べたようにDNA沈殿することにより停止させた。D
NAペレットを20μlTE緩衝液に溶解した。20μ
lのライゲーション緩衝液中で、1ユニツトのT0n)
NAIJガーゼと14℃で一夜保温することにより、こ
のDNAの約1oongをIDOngのfl−ori断
片(ステップ1)とライゲーションした。ライゲーショ
ンは70°Cで10分間加熱することにより停止させ、
その後大腸菌JM103株を形質転換するのに用い、p
BR322のDra I部位(ヌクレオチド番号626
2と3251)にクローニングされたfloriを含ん
だp、B Rf 1−oriを得た。
3、 pAO8070作製
pBRf l −ori(10μI)をそれぞれ10ユ
=ツトPstIとNdeIで67°Cで4時間消化した
。消化したDNAは、上のステップ1で詳しく述べたよ
うにフェノール:クロロホルムで抽出し、沈殿し、25
μlTE緩衝液に溶解した。この物質を1.2%アガロ
ース・ゲルで電気泳動し、上のステップ1で詳しく述べ
たようにfl−oriを含むNde fPst I断片
(約38kb)を単離し、20μlのTE緩衝液に溶解
した。このDNA約1100nを、あらかじめ均士1と
NdeIで消化し、ホスファターゼ処理をしたpAO8
041100nと混合した。この混合物は20μlのラ
イゲーション緩衝液中で、1ユニツトのT4DNA!J
ガーゼと14℃で一夜保温することによりライゲーショ
ンした。ライゲーションの反応は7D’Cで10分間加
熱することにより停止させた。このDNAを大腸菌J
M 103株を形質転換するのに用い、pAO807を
得た。
=ツトPstIとNdeIで67°Cで4時間消化した
。消化したDNAは、上のステップ1で詳しく述べたよ
うにフェノール:クロロホルムで抽出し、沈殿し、25
μlTE緩衝液に溶解した。この物質を1.2%アガロ
ース・ゲルで電気泳動し、上のステップ1で詳しく述べ
たようにfl−oriを含むNde fPst I断片
(約38kb)を単離し、20μlのTE緩衝液に溶解
した。このDNA約1100nを、あらかじめ均士1と
NdeIで消化し、ホスファターゼ処理をしたpAO8
041100nと混合した。この混合物は20μlのラ
イゲーション緩衝液中で、1ユニツトのT4DNA!J
ガーゼと14℃で一夜保温することによりライゲーショ
ンした。ライゲーションの反応は7D’Cで10分間加
熱することにより停止させた。このDNAを大腸菌J
M 103株を形質転換するのに用い、pAO807を
得た。
実施例2
ベクターpsL34Aの作製
24kDa gag配列と、他のHIV配列を含む、
3.85kbから成るH I Vウィルス由来の二部R
I/C]aI 断片を単離した。(第1図参照)この断
片25ngば1ユニツトのJ” 4リガーゼ(イーリン
ガ−0マンノ\イム(Bochringer Mann
beim) )を用いて、あらかじめ4:1過剰量のJ
”2co 1% IとCIaIエンドヌクレアーゼで製
造者の指示(全てのエンドヌクレアーゼはニュー・イン
グランド・バイオラプズ(New England B
iolabs)またはベーリンガー・マンハイムから入
手した)に従って消化し、仔牛腸アルカリ・ホスファタ
ーゼで処理したpBR322DNA、10ngと、20
μlのリガーゼ緩衝液(マニアティス(Maniati
s)ら1982)中で、14°Cで一夜ライゲーション
した。
3.85kbから成るH I Vウィルス由来の二部R
I/C]aI 断片を単離した。(第1図参照)この断
片25ngば1ユニツトのJ” 4リガーゼ(イーリン
ガ−0マンノ\イム(Bochringer Mann
beim) )を用いて、あらかじめ4:1過剰量のJ
”2co 1% IとCIaIエンドヌクレアーゼで製
造者の指示(全てのエンドヌクレアーゼはニュー・イン
グランド・バイオラプズ(New England B
iolabs)またはベーリンガー・マンハイムから入
手した)に従って消化し、仔牛腸アルカリ・ホスファタ
ーゼで処理したpBR322DNA、10ngと、20
μlのリガーゼ緩衝液(マニアティス(Maniati
s)ら1982)中で、14°Cで一夜ライゲーション
した。
コンピテント細胞はLB培地での細菌MC1061の1
00 mlの培養物を初期対数増殖期まで生育させるこ
とにより調製した。次に細胞をIECI)PR6000
遠心機で、3000rpm5分間、4°Cで遠心するこ
とによりペレットにした。次に細胞は40m1のca浴
溶液 5 QmMCaCA2と10%グリセロール)に
再懸濁し、水中に15−20分間装いた。細胞を先と同
様に遠心によりペレットにし5mlのCGに再懸濁した
。45m7!/チユーブの分注物を1.5111xツペ
ンドル7 (Eppendor f )チュブに入れ、
液体窒素で急速凍結し、−70℃で保存した。200μ
lの細胞を、6 8A600ユニツトに相当する最終濃
度で、各形質転換に用いた。
00 mlの培養物を初期対数増殖期まで生育させるこ
とにより調製した。次に細胞をIECI)PR6000
遠心機で、3000rpm5分間、4°Cで遠心するこ
とによりペレットにした。次に細胞は40m1のca浴
溶液 5 QmMCaCA2と10%グリセロール)に
再懸濁し、水中に15−20分間装いた。細胞を先と同
様に遠心によりペレットにし5mlのCGに再懸濁した
。45m7!/チユーブの分注物を1.5111xツペ
ンドル7 (Eppendor f )チュブに入れ、
液体窒素で急速凍結し、−70℃で保存した。200μ
lの細胞を、6 8A600ユニツトに相当する最終濃
度で、各形質転換に用いた。
pBR322とHIVEcoR,I/C1a 、r:ノ
ライゲーション混合物を200μlのコンピテントなM
C1061細胞を形質転換するのに用いた。細胞とライ
ゲーション混合物を混合し、氷上に20分間装いた後、
67℃で2分間保温した。次に混合物を室温に10分間
放置した。次に形質転換混合物を選択培地(LB培地に
50μji / ml!アンピシリンを添加)上にブレ
ーティングした。プレートは67℃で一夜保温した。
ライゲーション混合物を200μlのコンピテントなM
C1061細胞を形質転換するのに用いた。細胞とライ
ゲーション混合物を混合し、氷上に20分間装いた後、
67℃で2分間保温した。次に混合物を室温に10分間
放置した。次に形質転換混合物を選択培地(LB培地に
50μji / ml!アンピシリンを添加)上にブレ
ーティングした。プレートは67℃で一夜保温した。
アンピシリン耐性コロニーを同定し、アルカリ溶菌な用
いたマニアティスの技術に従い各耐性コロニーについて
微量調製を行った。回収したプラスミドDNAを4;1
過剰量のECOR,IとC1a Iで消化した。次に断
片をGS%アガロース・ゲルでTHE緩衝液中で泳動し
た。ゲル上で3.85kbC1aI/EcoR,I断片
が見えるコロニーをpsL32と呼び集めた。
いたマニアティスの技術に従い各耐性コロニーについて
微量調製を行った。回収したプラスミドDNAを4;1
過剰量のECOR,IとC1a Iで消化した。次に断
片をGS%アガロース・ゲルでTHE緩衝液中で泳動し
た。ゲル上で3.85kbC1aI/EcoR,I断片
が見えるコロニーをpsL32と呼び集めた。
シアンエチルホスホルアミダイド法を利用したアプライ
ド・バイオシステムズ社(App l1edB ios
ystems )モデル380ジーン・マシンによりオ
リゴヌクレオチド・アダプターを合成した。アダプター
は3.85kbCIaI/Ecol(、I断片を発現ベ
クターpAO807の唯一のEcoRI部位への挿入を
容易にするようにEC0I(I部位を与えるように設計
された。合成されたオリゴヌクレオチド・アダプターは
次の塩基配列を持っていた:5’ CGATGAATT
CATGGG’l”GCGAGAGCG3/ TA
CTTAAG’rACCCACGCTCTCGCTCA
GTATTAAGCGGGGGAGAATTAGA 3
’A(3’l”CATAATTCGCCCCCTCT’
、ll”AATCTAGC5’各鎖は別々に合成され、
5μgの両オリゴヌクレオチドを合わせてマニアティス
の方法を用いてキナーゼ反応を行(・、67°Cで1時
間保温した。保温後、混合物は水溶中で65℃で5分間
加熱し、次に水溶のスイッチを切って放置し、室温まで
ゆっ(り冷やした。10μIのプラスミドpsL32を
Cla Iで消化し、その末端をマニアティスの方法で
ホスファターゼ処理した。110−25nの脱リン酸化
したベクターを、約1ユニツトのT4’Jガーゼを用い
て、1:4から1=10モル過剰量存在するリン酸化し
、アニールした115−150nのオリゴヌクレオチド
・アダプターとライゲーションした。次にこの反応混合
物をコンピテントなMC1061細胞を形質転換するの
に用い、その細胞を選択培地上にプレートした。(これ
らの技術は上で以前に述べたように行った。)アンピシ
リン耐性コロニーについて微量調製を行い、各コロニー
をEco RIで消化した;アダプターを持つコロー一
ば〜3.85kb断片を遊離する。挿入を持った1つの
コロニーをpsL33と呼んだ。
ド・バイオシステムズ社(App l1edB ios
ystems )モデル380ジーン・マシンによりオ
リゴヌクレオチド・アダプターを合成した。アダプター
は3.85kbCIaI/Ecol(、I断片を発現ベ
クターpAO807の唯一のEcoRI部位への挿入を
容易にするようにEC0I(I部位を与えるように設計
された。合成されたオリゴヌクレオチド・アダプターは
次の塩基配列を持っていた:5’ CGATGAATT
CATGGG’l”GCGAGAGCG3/ TA
CTTAAG’rACCCACGCTCTCGCTCA
GTATTAAGCGGGGGAGAATTAGA 3
’A(3’l”CATAATTCGCCCCCTCT’
、ll”AATCTAGC5’各鎖は別々に合成され、
5μgの両オリゴヌクレオチドを合わせてマニアティス
の方法を用いてキナーゼ反応を行(・、67°Cで1時
間保温した。保温後、混合物は水溶中で65℃で5分間
加熱し、次に水溶のスイッチを切って放置し、室温まで
ゆっ(り冷やした。10μIのプラスミドpsL32を
Cla Iで消化し、その末端をマニアティスの方法で
ホスファターゼ処理した。110−25nの脱リン酸化
したベクターを、約1ユニツトのT4’Jガーゼを用い
て、1:4から1=10モル過剰量存在するリン酸化し
、アニールした115−150nのオリゴヌクレオチド
・アダプターとライゲーションした。次にこの反応混合
物をコンピテントなMC1061細胞を形質転換するの
に用い、その細胞を選択培地上にプレートした。(これ
らの技術は上で以前に述べたように行った。)アンピシ
リン耐性コロニーについて微量調製を行い、各コロニー
をEco RIで消化した;アダプターを持つコロー一
ば〜3.85kb断片を遊離する。挿入を持った1つの
コロニーをpsL33と呼んだ。
プラスミドpsL330犬量調製は、psL33で形質
転換されたMC1061細胞を100 mlの選択培地
(LB+50μi / mlアンピシリン)中で定常期
まで生育させることにより行った。
転換されたMC1061細胞を100 mlの選択培地
(LB+50μi / mlアンピシリン)中で定常期
まで生育させることにより行った。
次にこれらの細胞をGSAローターを用いて、5orv
all RC−5B遠心機で、10,000 rpms
で10分間遠心した。ペレットを25m1のGET
溶液(5QmMグルコース、10mMEDTA、25m
Mトリス・C4,pH8を含む)に 5mlの10係り
ゾチームを加えたものに再懸濁し、室温に1〜5分保温
した。50m1の1 % S D S溶液と0.2 N
NaOHを加え、ペレットを再懸濁するために逆に向
けることにより混合した。これに続けて38TLlの6
M酢酸カリウム(pf(4,5)を加え、逆に向けるこ
とにより中に混合した。この混合物を氷水中で15分間
冷却した。次に冷却した混合物をGSAローターを用い
て、5orvall RC−58遠心機で、10.00
0 rpmsで10分間再び遠心した。次に上清をガー
ゼのパッドを通して新しい遠心管に注ぎ入れた。12グ
ラムのPEG3000(ポリエチレン・グリコール)を
上清に加え、こうしてできた混合物を氷水中で60分間
冷却した。次に冷却した混合物を先に述べたように(1
0,000rpms。
all RC−5B遠心機で、10,000 rpms
で10分間遠心した。ペレットを25m1のGET
溶液(5QmMグルコース、10mMEDTA、25m
Mトリス・C4,pH8を含む)に 5mlの10係り
ゾチームを加えたものに再懸濁し、室温に1〜5分保温
した。50m1の1 % S D S溶液と0.2 N
NaOHを加え、ペレットを再懸濁するために逆に向
けることにより混合した。これに続けて38TLlの6
M酢酸カリウム(pf(4,5)を加え、逆に向けるこ
とにより中に混合した。この混合物を氷水中で15分間
冷却した。次に冷却した混合物をGSAローターを用い
て、5orvall RC−58遠心機で、10.00
0 rpmsで10分間再び遠心した。次に上清をガー
ゼのパッドを通して新しい遠心管に注ぎ入れた。12グ
ラムのPEG3000(ポリエチレン・グリコール)を
上清に加え、こうしてできた混合物を氷水中で60分間
冷却した。次に冷却した混合物を先に述べたように(1
0,000rpms。
10分間、GSAo−ター1.S、o、r、Va l
IRC−58)遠心した。次に遠心管は上清を徹底的に
除き、ペレットヲ9m1SのTE、緩衝液(10mM)
リス(pi−I8.0)と1mME])TA)に溶解し
た。溶解したペレットに9グラムのC8Clと3.45
m1sの1%エチジウム・ブロマイドを加えた。次にこ
の混合物をチューブにつめ、Tl750−ターに入れて
、ベックマン(Beckman) L 8−70超遠
心で、55000 rpms、16時間、18℃で遠心
した。DNAのバンドをC5Clから抜きとり、NaC
1で飽和した第2−ブタノールで3または4回抽出した
。最初の容積の2倍の水を加えた。この混合物に最初の
容積の6倍のイングロパノールを加えた。混合物を一2
0℃で数時間または一夜冷却するか、凍結するまでドラ
イ・アイス上で冷却した。次にDNAをHB−40−タ
ーで5orvall RC−58遠心機を用いて、20
分間、11.000 rpms で遠心することによ
りペレットにした。上清を注ぎ出し、ペレットをQ、4
5m1TE緩衝液に再懸濁し、次にエッペンドルフ・チ
ューブに移した。再懸濁したペレットに、Q5mlの6
M酢酸ナトリウム1m1のエタノールを加え、ドライ・
アイス上で凍結するまで冷却した。次にペレットを融解
し、低温室(4℃)中で微小遠心機で遠心した。次に融
解したペレットは200μlのTE緩衝液に溶解した。
IRC−58)遠心した。次に遠心管は上清を徹底的に
除き、ペレットヲ9m1SのTE、緩衝液(10mM)
リス(pi−I8.0)と1mME])TA)に溶解し
た。溶解したペレットに9グラムのC8Clと3.45
m1sの1%エチジウム・ブロマイドを加えた。次にこ
の混合物をチューブにつめ、Tl750−ターに入れて
、ベックマン(Beckman) L 8−70超遠
心で、55000 rpms、16時間、18℃で遠心
した。DNAのバンドをC5Clから抜きとり、NaC
1で飽和した第2−ブタノールで3または4回抽出した
。最初の容積の2倍の水を加えた。この混合物に最初の
容積の6倍のイングロパノールを加えた。混合物を一2
0℃で数時間または一夜冷却するか、凍結するまでドラ
イ・アイス上で冷却した。次にDNAをHB−40−タ
ーで5orvall RC−58遠心機を用いて、20
分間、11.000 rpms で遠心することによ
りペレットにした。上清を注ぎ出し、ペレットをQ、4
5m1TE緩衝液に再懸濁し、次にエッペンドルフ・チ
ューブに移した。再懸濁したペレットに、Q5mlの6
M酢酸ナトリウム1m1のエタノールを加え、ドライ・
アイス上で凍結するまで冷却した。次にペレットを融解
し、低温室(4℃)中で微小遠心機で遠心した。次に融
解したペレットは200μlのTE緩衝液に溶解した。
こうして得られたD 、N Aの濃度は260nmにお
ける吸光度の実測値をとり、濃度を見積る(1が50μ
i/mlに相当)ことにより決定した。
ける吸光度の実測値をとり、濃度を見積る(1が50μ
i/mlに相当)ことにより決定した。
25μgのpsL33を上で述べたように4=1過剰量
のEco RIで消化した。消化混合物を、7%アガロ
ース・ゲルでTBE緩衝液(10XTBEは108gr
)リス塩基、55 grホウ酸、6.72gEDTA2
・ナトリウムから成っている(結果としてpH8,1−
8,2) )中で電気泳動した。この消化により生成す
る3、85kbのEcoRI断片をゲルから切り出し、
透析チューブ中に置いてTBE緩衝液中に電気溶出した
。次に電気溶出した断片は、2容のエタノールで沈殿し
、フェノール・クロロホルムで抽出された。次に12.
55−125nのこの3.85 kb Eco R,I
断片は10ngのEcoR,Iで切断し、ホスファター
ゼ処理されたプラスミドpAO807にライゲーション
された。ライゲーションはマーアティスのりガーゼ緩衝
液を用いて行った。
のEco RIで消化した。消化混合物を、7%アガロ
ース・ゲルでTBE緩衝液(10XTBEは108gr
)リス塩基、55 grホウ酸、6.72gEDTA2
・ナトリウムから成っている(結果としてpH8,1−
8,2) )中で電気泳動した。この消化により生成す
る3、85kbのEcoRI断片をゲルから切り出し、
透析チューブ中に置いてTBE緩衝液中に電気溶出した
。次に電気溶出した断片は、2容のエタノールで沈殿し
、フェノール・クロロホルムで抽出された。次に12.
55−125nのこの3.85 kb Eco R,I
断片は10ngのEcoR,Iで切断し、ホスファター
ゼ処理されたプラスミドpAO807にライゲーション
された。ライゲーションはマーアティスのりガーゼ緩衝
液を用いて行った。
次にライゲーション混合物は200μlのコンピテント
なJM103細胞に形質転換された。
なJM103細胞に形質転換された。
コンピテントなJM1011B胞は添加物を補ったM9
培地、シラーとスミス、Methods inEnzy
mdogy I DO: 468 、490 (198
3)にJM103を植え、細胞が定常期に達するまで3
7℃で振盪しながら培養することにより調製した。50
μlの定常期JM103を50m1のLB培地に加え。
培地、シラーとスミス、Methods inEnzy
mdogy I DO: 468 、490 (198
3)にJM103を植え、細胞が定常期に達するまで3
7℃で振盪しながら培養することにより調製した。50
μlの定常期JM103を50m1のLB培地に加え。
67℃で2時間または0D600が、乙になるまで培養
した。細胞を集め、I E CD P R6000中で
3000 rpmsで5分間、4℃で遠心した。次に細
胞を25rnlの50I]llL、MCaC12に再懸
濁し、氷上に155分間置た。15分間の後、再び細胞
をIECDPR6000中で3000rpmsで5分間
、4℃で遠心した。次に細胞は2.5m1sの50 m
M Cact 2に再懸濁し、使用まで氷上に保存し
た。(細胞は使用までに2−6時間だけ保存してもよい
。) JM103のための形質転換プロトコールは先にMC1
061に用いたものと同じである。細胞はアンピシリン
を含むLB培地上に(MC1061のために先に述べた
ように)プレートし、アンピシリン耐性コロニーを選択
した。アルカリ溶菌のためのマニアティスのプロトコー
ルを用いて微量調製を行った。微量調製により得られた
DNAをEcoRIで消化し、。7%アガロース・ゲル
で泳動した。〜3.85kb断片を生じるコロニーを選
択し、psL34Aと名付けたが、これは第2図に示さ
れている。このプラスミドの方向もC1a I消化によ
って決定された。
した。細胞を集め、I E CD P R6000中で
3000 rpmsで5分間、4℃で遠心した。次に細
胞を25rnlの50I]llL、MCaC12に再懸
濁し、氷上に155分間置た。15分間の後、再び細胞
をIECDPR6000中で3000rpmsで5分間
、4℃で遠心した。次に細胞は2.5m1sの50 m
M Cact 2に再懸濁し、使用まで氷上に保存し
た。(細胞は使用までに2−6時間だけ保存してもよい
。) JM103のための形質転換プロトコールは先にMC1
061に用いたものと同じである。細胞はアンピシリン
を含むLB培地上に(MC1061のために先に述べた
ように)プレートし、アンピシリン耐性コロニーを選択
した。アルカリ溶菌のためのマニアティスのプロトコー
ルを用いて微量調製を行った。微量調製により得られた
DNAをEcoRIで消化し、。7%アガロース・ゲル
で泳動した。〜3.85kb断片を生じるコロニーを選
択し、psL34Aと名付けたが、これは第2図に示さ
れている。このプラスミドの方向もC1a I消化によ
って決定された。
実施例62
psL44Aの作製
■、オリゴヌクレオチド・ブイレフテッド変異遺伝子(
Oligonucleotide DirectedM
utagenes) プラスミドpSL34Aに、1) gag遺伝子の5′
端にEcoRI部位と開始メチオニンを加えるためと、
2) gag遺伝子の、3′端に終止コドンと&oR,
I部位を加えるために、2つの誘導体psL34Aプラ
スミド(psL42とpsL43、第2図参照)を作る
ことになる別々の変異作製(mutagenesis)
を行った。鋳型DNAは、(pSL34Aプラスミドに
より)アンピシリン耐性に形質転換されたJM106M
B胞のコロニーを、2mlのLBに100μg/mlア
ンピシリンを加えたものに再懸濁し、37℃で4−5時
間生育させることにより、psL34Aの形質転換体か
ら調製した。この飽和培養液0.5mlを5r:Jml
のL B −1−ampに植菌し、0D6oo=0.3
まで生育させた。次にこれは、ヘルパー・ファージの多
重感染をするばかりになった。ヘルパー・ファージの調
製は以下に述べる。ヘルパー・ファージR408からの
ファージ・ストックは、添加物を補ったM9培地でのJ
M1030オーバーナイト・カルチャー0.21nlと
、7 X 108 R408と、100μlのLB培地
を小さな滅菌済チューブに入れることにより調製した。
Oligonucleotide DirectedM
utagenes) プラスミドpSL34Aに、1) gag遺伝子の5′
端にEcoRI部位と開始メチオニンを加えるためと、
2) gag遺伝子の、3′端に終止コドンと&oR,
I部位を加えるために、2つの誘導体psL34Aプラ
スミド(psL42とpsL43、第2図参照)を作る
ことになる別々の変異作製(mutagenesis)
を行った。鋳型DNAは、(pSL34Aプラスミドに
より)アンピシリン耐性に形質転換されたJM106M
B胞のコロニーを、2mlのLBに100μg/mlア
ンピシリンを加えたものに再懸濁し、37℃で4−5時
間生育させることにより、psL34Aの形質転換体か
ら調製した。この飽和培養液0.5mlを5r:Jml
のL B −1−ampに植菌し、0D6oo=0.3
まで生育させた。次にこれは、ヘルパー・ファージの多
重感染をするばかりになった。ヘルパー・ファージの調
製は以下に述べる。ヘルパー・ファージR408からの
ファージ・ストックは、添加物を補ったM9培地でのJ
M1030オーバーナイト・カルチャー0.21nlと
、7 X 108 R408と、100μlのLB培地
を小さな滅菌済チューブに入れることにより調製した。
チューブは振盪なしで、67℃に15分間保温し、それ
からLBに0.7%寒天を加えたもの2.5m7を加え
て、混合物を前日に作ったLBプレートの表面に流し込
んだ。プレートは67℃で6時間生育させ、次に5rn
lのLBを重層し、低温室で一夜か、室温で、回転振盪
機の上で、ゆっ(すした振盪で455分間置てお(。
からLBに0.7%寒天を加えたもの2.5m7を加え
て、混合物を前日に作ったLBプレートの表面に流し込
んだ。プレートは67℃で6時間生育させ、次に5rn
lのLBを重層し、低温室で一夜か、室温で、回転振盪
機の上で、ゆっ(すした振盪で455分間置てお(。
上清を吸引し、5orvall遠心機と、HB 4か5
S34ヘツドを用いて8.00 Orpmで20分間遠
心し、この遠心の上清を吸引し新しい滅菌した50m1
Jの円錐状のチーーブに入れた。チューブを65℃で6
0分間加熱した。ストックは4℃で保存するべきである
。
S34ヘツドを用いて8.00 Orpmで20分間遠
心し、この遠心の上清を吸引し新しい滅菌した50m1
Jの円錐状のチーーブに入れた。チューブを65℃で6
0分間加熱した。ストックは4℃で保存するべきである
。
ファージの力価測定は、1rnlのLHに10−210
.10 .10 .10 の濃度でファージ・スト
ックの一連の希釈液を作ることにより行う。力価測定の
ための細菌のローン(lawns)は、LBプレートの
上にQ、 2 mlのJM1030オーバーナイト・カ
ルチャーと2.5 mlの07%寒天をブレーティング
し、プレートをフタをずらしてベンチの上に5分間置く
ことによって調製する。20μlの各希釈液をガラスの
マイクロピペットを用いてプレート上にスポットし、プ
レートを67℃で一夜保温する。−夜の生育の後、20
μlの10−9希釈液の10のプラークの存在は、5X
1011の力価を示している。これはストックを作るの
に使うファージ数のための望ましい値であり、−水銀生
産のためのプラスミド培養液の多重感染のために便利な
力価である。
.10 .10 .10 の濃度でファージ・スト
ックの一連の希釈液を作ることにより行う。力価測定の
ための細菌のローン(lawns)は、LBプレートの
上にQ、 2 mlのJM1030オーバーナイト・カ
ルチャーと2.5 mlの07%寒天をブレーティング
し、プレートをフタをずらしてベンチの上に5分間置く
ことによって調製する。20μlの各希釈液をガラスの
マイクロピペットを用いてプレート上にスポットし、プ
レートを67℃で一夜保温する。−夜の生育の後、20
μlの10−9希釈液の10のプラークの存在は、5X
1011の力価を示している。これはストックを作るの
に使うファージ数のための望ましい値であり、−水銀生
産のためのプラスミド培養液の多重感染のために便利な
力価である。
0D600−0.3の培養液をヘルパー・ファージR,
408〔う、 セル(Russel)ら(1986)G
ene45:333−338,1 で、感染多重度10
−20で多重感染させた。次に多重感染した培養液を、
5orvall RC−5B遠心機を用いて3Qmlコ
ーレックス、(corex) ’チューブ中で10,0
00 rpmsで、10分間、2回遠心した。上清は新
しいコーレックス・チューブに移し、7 mlの2.5
M NaC71を含む20%PE06000をそれに
加えた。混合物は4℃で一夜保温した。次に混合物を5
orvallRC5B遠心機を用いて、10,000
rpmsで10分間遠心し、上清は捨てた。ペレットを
2m1lのTEに再懸濁し、フェノール;フェノール:
クロロホルム次にエーテルで抽出した。1/1o容の8
M塩化リチウムと、2容のエタノールをこの混合物に加
えた。混合物を一20℃で一夜保温した。−夜の保温の
後、混合物を5orvallRC−5B遠心機で10.
000 rpm で10分間遠心した。上清を捨てベレ
ットをエタノールでリンスした。ベレットヲQ、 5
mlの10mM)リス・HClに再懸濁した。
408〔う、 セル(Russel)ら(1986)G
ene45:333−338,1 で、感染多重度10
−20で多重感染させた。次に多重感染した培養液を、
5orvall RC−5B遠心機を用いて3Qmlコ
ーレックス、(corex) ’チューブ中で10,0
00 rpmsで、10分間、2回遠心した。上清は新
しいコーレックス・チューブに移し、7 mlの2.5
M NaC71を含む20%PE06000をそれに
加えた。混合物は4℃で一夜保温した。次に混合物を5
orvallRC5B遠心機を用いて、10,000
rpmsで10分間遠心し、上清は捨てた。ペレットを
2m1lのTEに再懸濁し、フェノール;フェノール:
クロロホルム次にエーテルで抽出した。1/1o容の8
M塩化リチウムと、2容のエタノールをこの混合物に加
えた。混合物を一20℃で一夜保温した。−夜の保温の
後、混合物を5orvallRC−5B遠心機で10.
000 rpm で10分間遠心した。上清を捨てベレ
ットをエタノールでリンスした。ベレットヲQ、 5
mlの10mM)リス・HClに再懸濁した。
プライミングに用いた5′オリゴヌクレオチドは次の配
列のものだった: 5’ −AGCAG’ll’ CAG GTCAGC
GAA TTCATG ccTA’rAGTG CAG
AAC−3’プライミングに用いた、3′オリゴヌク
レオチドは次の配列のものだった: 5’ −AAG GCA AGA GTT TTG
TAA GAATTCATG AGCCAA GTA
ACA−3’合成ヌクレオチドはこれも、上で述べたよ
うにアプライド・バイオシステム社DNA合成機、モデ
ル680Aとシアノエチルホスホルアミダイド法を用い
て作った。5′端の変異作製は、次のプロトコールに従
ってプラスミドpsL34A由来の鋳型DNAを用いて
行い、プラスミドpsL42を得た。
列のものだった: 5’ −AGCAG’ll’ CAG GTCAGC
GAA TTCATG ccTA’rAGTG CAG
AAC−3’プライミングに用いた、3′オリゴヌク
レオチドは次の配列のものだった: 5’ −AAG GCA AGA GTT TTG
TAA GAATTCATG AGCCAA GTA
ACA−3’合成ヌクレオチドはこれも、上で述べたよ
うにアプライド・バイオシステム社DNA合成機、モデ
ル680Aとシアノエチルホスホルアミダイド法を用い
て作った。5′端の変異作製は、次のプロトコールに従
ってプラスミドpsL34A由来の鋳型DNAを用いて
行い、プラスミドpsL42を得た。
、3′端の変異作製は、次のプロトコールに従ってプラ
スミドpsL34A由来の鋳型DNAを用いて行い、プ
ラスミドpsL43を得た。
スミドpsL34A由来の鋳型DNAを用いて行い、プ
ラスミドpsL43を得た。
1nmolの変異作製用オリゴヌクレオチドは従来のプ
ロトコール(マニアティスら、1982)により、非放
射性ATPでリン酸化した。これらのオリゴヌクレオチ
ドの配列は上に挙げた。4゜pmolesの各々のリン
酸化されたオリゴヌクレオチドは、それぞれ別々に2g
mdlesのpsL34A由来の鋳型DNAと、溶液A
(0,2Mト’)、<−ncl!(pH7,5)、0.
5M NaCl、0.1 MMgCA’2,0.01
Mジチオスレイトール(DTT))中で、反応混合物を
2分間煮沸し、混合物を65℃で5分間保温し、水浴の
スイッチを切ることにより反応物を室温までゆっくりと
冷やすことによりアニールした。
ロトコール(マニアティスら、1982)により、非放
射性ATPでリン酸化した。これらのオリゴヌクレオチ
ドの配列は上に挙げた。4゜pmolesの各々のリン
酸化されたオリゴヌクレオチドは、それぞれ別々に2g
mdlesのpsL34A由来の鋳型DNAと、溶液A
(0,2Mト’)、<−ncl!(pH7,5)、0.
5M NaCl、0.1 MMgCA’2,0.01
Mジチオスレイトール(DTT))中で、反応混合物を
2分間煮沸し、混合物を65℃で5分間保温し、水浴の
スイッチを切ることにより反応物を室温までゆっくりと
冷やすことによりアニールした。
2.5μlの大腸菌DNAポリメラーゼIのクレノー・
フラグメントにュー・イングランド・バイオラブズ)と
25μlの溶液Cを各々のチューブに加えた。
フラグメントにュー・イングランド・バイオラブズ)と
25μlの溶液Cを各々のチューブに加えた。
次にチューブをベンチ上で5分装置いて、16°C−夜
に移した。
に移した。
、3′端の変異作製は、p8L34A由来の別のDNA
鋳型で同じプロトコールを用いて独立に行った。
鋳型で同じプロトコールを用いて独立に行った。
■、細菌への形質転換とコロニーのスクリーニング
次の朝、雌の細菌株MC1061のコンピテント細胞を
、伸長反応液の1=40希釈液の0.5゜2.5μlで
、上に挙げた形質転換法とコンピテント細胞の調製法を
用いて、形質転換した。各希釈液に5枚ずつのプレート
にプレートした。67°Cで一夜保温した後、グルンス
タイン(Grunstein)とホグネス(Hogne
s s )に基づ(方法を用いて、細菌ノコロニー由
来のDNAをニトロセルロース・フィルターの上へ移し
た;そしてコロニーにスクリーン用オリゴヌクレオチド
でハイブリダイズしたが、そのオリゴヌクレオチドは(
シラーとスミス、前出492)の方法で放射性ガンマ−
ATPの存在下でキナーゼ標識で、放射性にされた。N
端変異作製のスクリーニングに用いたオリゴヌクレオチ
ドの配列は: 5’ −GTCAGCGAA TTCATG CCT
ATA= 3’ であり、C端変異作製のスクリーニングに用いたオリゴ
ヌクレオチドの配列は: 5’ −GTT TTG TAA GAA T’l”
CATGAGC−3’ である。
、伸長反応液の1=40希釈液の0.5゜2.5μlで
、上に挙げた形質転換法とコンピテント細胞の調製法を
用いて、形質転換した。各希釈液に5枚ずつのプレート
にプレートした。67°Cで一夜保温した後、グルンス
タイン(Grunstein)とホグネス(Hogne
s s )に基づ(方法を用いて、細菌ノコロニー由
来のDNAをニトロセルロース・フィルターの上へ移し
た;そしてコロニーにスクリーン用オリゴヌクレオチド
でハイブリダイズしたが、そのオリゴヌクレオチドは(
シラーとスミス、前出492)の方法で放射性ガンマ−
ATPの存在下でキナーゼ標識で、放射性にされた。N
端変異作製のスクリーニングに用いたオリゴヌクレオチ
ドの配列は: 5’ −GTCAGCGAA TTCATG CCT
ATA= 3’ であり、C端変異作製のスクリーニングに用いたオリゴ
ヌクレオチドの配列は: 5’ −GTT TTG TAA GAA T’l”
CATGAGC−3’ である。
両オリゴヌクレオチドは、機構によりN端のオリゴから
トリチル基が除かれ、試料が(HPLCではなく)セフ
ァデク、z (5ephadex) G 〜40の中程
度のカラムを用いて脱塩されている以外は先に述べたよ
うに合成された。
トリチル基が除かれ、試料が(HPLCではなく)セフ
ァデク、z (5ephadex) G 〜40の中程
度のカラムを用いて脱塩されている以外は先に述べたよ
うに合成された。
放射性オリゴヌクレオチドのノ・イブリダイゼーション
は、42℃で5XSSPE、10Xデンノ・ルト溶液、
Q、5%SDS中で行われた。フィルターはハイブリダ
イゼーションに先立ち、同じ溶液中で65℃で60分間
、プレノ・イブリダイゼーンヨンし、ハイブリダイゼー
ションのためKm液を交換した。標識したオリゴヌクレ
オチドはノ・イブリダイゼーションに106cpm /
mlで用いた。フィルターは室温で、6×SSC中1
5分間洗浄6回42°Cで6×SSC中15分間洗浄1
回で洗浄した。X線フィルム(コダック(Kodak)
、X −OmatAR)に露出した後、各変異作製か
ら8個の仮の単一陽性コロニーを拾った;コロニーから
のDNAは標準の細菌微量調製プロトコール(マニアテ
ィス)を用いて調製し、DNAばEcoRIで消化し、
消化物をポリアクリルアミド・ゲルで泳動することによ
り、新しいEcoRI部位の存在でCheckした。N
とC端、各々に4個と2個の細菌の微量調製物は、新し
いEcoJ%I部位の存在を確認した。これらの陽性の
ものの各々1個、マニアティスの方法を用いてプラスミ
ドDNAの大量調製のために生育させ、これらの同じ陽
性のもの各々からの微量調製した]) N Aの1:4
0の希釈液1.5,10,20μlを、細菌株JfV1
103をアンピシリン耐性に形質転換するのに用いた。
は、42℃で5XSSPE、10Xデンノ・ルト溶液、
Q、5%SDS中で行われた。フィルターはハイブリダ
イゼーションに先立ち、同じ溶液中で65℃で60分間
、プレノ・イブリダイゼーンヨンし、ハイブリダイゼー
ションのためKm液を交換した。標識したオリゴヌクレ
オチドはノ・イブリダイゼーションに106cpm /
mlで用いた。フィルターは室温で、6×SSC中1
5分間洗浄6回42°Cで6×SSC中15分間洗浄1
回で洗浄した。X線フィルム(コダック(Kodak)
、X −OmatAR)に露出した後、各変異作製か
ら8個の仮の単一陽性コロニーを拾った;コロニーから
のDNAは標準の細菌微量調製プロトコール(マニアテ
ィス)を用いて調製し、DNAばEcoRIで消化し、
消化物をポリアクリルアミド・ゲルで泳動することによ
り、新しいEcoRI部位の存在でCheckした。N
とC端、各々に4個と2個の細菌の微量調製物は、新し
いEcoJ%I部位の存在を確認した。これらの陽性の
ものの各々1個、マニアティスの方法を用いてプラスミ
ドDNAの大量調製のために生育させ、これらの同じ陽
性のもの各々からの微量調製した]) N Aの1:4
0の希釈液1.5,10,20μlを、細菌株JfV1
103をアンピシリン耐性に形質転換するのに用いた。
■、鋳型DNAの調製と、塩基配列決定による確認者々
の20μl希釈プレートから6コロニーずつを、上記の
方法(多重感染したJM103細胞の上清のポリエチレ
ン・グリコール沈殿と、それに続けたフェノールとクロ
ロホルムによる脱タンパク質と、DNAのエタノール沈
殿を含む)により一本鎖鋳型DNAを調製するのに用い
た。N端変異作製の配列は、次の配列のオリゴヌクレオ
チドを用いて: 5’ −CACCAA GGA AGCTTT AG
A C−3’またC端変異作製の配列は次の配列のオリ
ゴヌクレオチドを用いて: 5’ −CGA ACCCAG ATT GTA A
GA CTA−3’サンガ(Sanger(1977)
)の鎖停止法(chaintermination m
ethod)を用いて確認した。pSL42とpsL4
3由来のEco RI −Psi I HI V断片を
、pAO8[170EcoR,I部位にライゲーション
することによりpSL44が作製された後、pSL44
から鋳型を調製した。この鋳型のPstI部位を通る配
列は、オリゴヌクレオチド: 5’ −CAA GCA GCCATG CAA AT
G TT−3’を用いて確認した。
の20μl希釈プレートから6コロニーずつを、上記の
方法(多重感染したJM103細胞の上清のポリエチレ
ン・グリコール沈殿と、それに続けたフェノールとクロ
ロホルムによる脱タンパク質と、DNAのエタノール沈
殿を含む)により一本鎖鋳型DNAを調製するのに用い
た。N端変異作製の配列は、次の配列のオリゴヌクレオ
チドを用いて: 5’ −CACCAA GGA AGCTTT AG
A C−3’またC端変異作製の配列は次の配列のオリ
ゴヌクレオチドを用いて: 5’ −CGA ACCCAG ATT GTA A
GA CTA−3’サンガ(Sanger(1977)
)の鎖停止法(chaintermination m
ethod)を用いて確認した。pSL42とpsL4
3由来のEco RI −Psi I HI V断片を
、pAO8[170EcoR,I部位にライゲーション
することによりpSL44が作製された後、pSL44
から鋳型を調製した。この鋳型のPstI部位を通る配
列は、オリゴヌクレオチド: 5’ −CAA GCA GCCATG CAA AT
G TT−3’を用いて確認した。
psL44Aを作製するために、pSL42とpSL4
3の10μgのプラスミドDNAをEco RIとPs
tIで4=1過剰量で消化した。5’p24断片は〜2
40 bp Eco RI−Pst I断片; 3’p
34断片は〜46 Q bp Pst I−EcoR
,I断片であった。断片は5%ポリアクリルアミド・ゲ
ルから、DNAQ含むゲル小片からの拡散により回収し
た。10μlのプラスミドpAO807をEcoRIで
消化し、末端をホスファターゼ処理し、ベクターと2つ
のp24をコードしている断片を6種ライゲーションに
より連結した。ライゲーション混合物はMC1061細
胞に形質転換し、amp r細胞を同定した。形質転換
体に対し、プラスミド微量調製を行い、消化と、8%ア
ガロースでの電気泳動により正しいプラスミドを同定し
た;これをpsL44Aと呼んだ。
3の10μgのプラスミドDNAをEco RIとPs
tIで4=1過剰量で消化した。5’p24断片は〜2
40 bp Eco RI−Pst I断片; 3’p
34断片は〜46 Q bp Pst I−EcoR
,I断片であった。断片は5%ポリアクリルアミド・ゲ
ルから、DNAQ含むゲル小片からの拡散により回収し
た。10μlのプラスミドpAO807をEcoRIで
消化し、末端をホスファターゼ処理し、ベクターと2つ
のp24をコードしている断片を6種ライゲーションに
より連結した。ライゲーション混合物はMC1061細
胞に形質転換し、amp r細胞を同定した。形質転換
体に対し、プラスミド微量調製を行い、消化と、8%ア
ガロースでの電気泳動により正しいプラスミドを同定し
た;これをpsL44Aと呼んだ。
(第3図参照)
実施例■
ピキア・パストリスの形質転換
■、ベクター調製
20μgのプラスミドpSL44をBglIIで完全に
消化した。
消化した。
プラスミドの完全消化は。8%アガロース・ゲル電気泳
動により決定した。消化混合物は、合衆国農業省(De
partment of Agriculture)の
北部地域研究センター(Northenn Regio
nal Re5earchCenter)に寄託番号N
RI’(L Y−15851で寄託されているピキア
・パストリスGS115株(his4”−)を形質転換
するのに用いた。ヒスチジノールデヒドロゲナーゼ遺伝
子を含むベクターによる形質転換はヒスチジン系路にお
けるこの欠損を相補し、GS115形質転換細胞な出S
+に変える。従って形質転換体のスクリーニングは、形
質転換後細胞をヒスチジンを欠(生育環境で培養し、こ
の条件下で生育可能な細胞を回収することにより容易に
行うことができる。
動により決定した。消化混合物は、合衆国農業省(De
partment of Agriculture)の
北部地域研究センター(Northenn Regio
nal Re5earchCenter)に寄託番号N
RI’(L Y−15851で寄託されているピキア
・パストリスGS115株(his4”−)を形質転換
するのに用いた。ヒスチジノールデヒドロゲナーゼ遺伝
子を含むベクターによる形質転換はヒスチジン系路にお
けるこの欠損を相補し、GS115形質転換細胞な出S
+に変える。従って形質転換体のスクリーニングは、形
質転換後細胞をヒスチジンを欠(生育環境で培養し、こ
の条件下で生育可能な細胞を回収することにより容易に
行うことができる。
Il、 細胞の生育
ピキア・バストリスGS 115 (NRRLY−15
851) を約10m1のYPD培地に植菌し、60
℃で12−20時間振盪培養した。1QQmlのYPD
培地に種培養を0D6ooが約o、ooiになるよう植
菌した。培地は60℃で振盪フラスコ中で約12.−2
0時間培養した。培養は0D6o。
851) を約10m1のYPD培地に植菌し、60
℃で12−20時間振盪培養した。1QQmlのYPD
培地に種培養を0D6ooが約o、ooiになるよう植
菌した。培地は60℃で振盪フラスコ中で約12.−2
0時間培養した。培養は0D6o。
が約0.2’−0,3になった時(約16−20時間後
)、IECDPR6000遠心機を用いて、3000r
pmsで5分間遠心することにより集菌した。
)、IECDPR6000遠心機を用いて、3000r
pmsで5分間遠心することにより集菌した。
IJl、 スフェロプラストの調製
細胞を1回101nlの滅菌水で洗い、次に300Or
pmで5分間遠心した。(特に記していない場合は、遠
心は各細胞洗浄の1IEcDPR6000を用いて30
0Drpmsで5分間行った。)次に細胞を10m1の
新しく調製したSEDで1回洗い、10m1の滅菌1M
ンルビトールで洗い、最後に1Q mlのSCE緩衝液
に再懸濁した。10μlのザイモリアーゼ(ZYmOl
yaSeXloo、000 !=ット/gをマイルス・
ラボラトリーズ(MilesLaboratories
)から人手)の4 mg / ml溶液を加えた。
pmで5分間遠心した。(特に記していない場合は、遠
心は各細胞洗浄の1IEcDPR6000を用いて30
0Drpmsで5分間行った。)次に細胞を10m1の
新しく調製したSEDで1回洗い、10m1の滅菌1M
ンルビトールで洗い、最後に1Q mlのSCE緩衝液
に再懸濁した。10μlのザイモリアーゼ(ZYmOl
yaSeXloo、000 !=ット/gをマイルス・
ラボラトリーズ(MilesLaboratories
)から人手)の4 mg / ml溶液を加えた。
次に細胞を60℃で約60分保温した。スフェロプラス
トを1500rpmsで10分間遠心することにより、
10〃+lの滅菌1Mソルビトール中で2回洗った。1
Q+++lの滅菌CaSを最後の細胞洗浄液として用い
、再び細胞を1500rpmsで10分間遠心し、Q、
6mlのCaSに再懸濁した。
トを1500rpmsで10分間遠心することにより、
10〃+lの滅菌1Mソルビトール中で2回洗った。1
Q+++lの滅菌CaSを最後の細胞洗浄液として用い
、再び細胞を1500rpmsで10分間遠心し、Q、
6mlのCaSに再懸濁した。
■、形質転換
GS115細胞を0.5,1.5.10Lgのプラスミ
ドDNA消化物で形質転換した。DNA試料を100μ
lのスフェロプラストに加え、室温に約20分間保温し
た。1TLlのPEG溶液を各試料に加え、室温に約1
5分間保温した。
ドDNA消化物で形質転換した。DNA試料を100μ
lのスフェロプラストに加え、室温に約20分間保温し
た。1TLlのPEG溶液を各試料に加え、室温に約1
5分間保温した。
■、スフェロプラストの再生
プレートあたり10m1の再生寒天の下部寒天層を、形
質転換の試料が用意される少なくとも60分前に流し込
んだ。これに加え、10m1Jの再生寒天を55°Cの
水浴に入れた50m1の円錐型の底のコーニングチュー
ブに分注した。10または990μlの形質転換試料を
55℃に保った溶けた再生寒天10m1に加え、固化し
た下部寒天層を含むプレートの上に流し込んだ。プレー
トは30°Cで6−5日間保温した。
質転換の試料が用意される少なくとも60分前に流し込
んだ。これに加え、10m1Jの再生寒天を55°Cの
水浴に入れた50m1の円錐型の底のコーニングチュー
ブに分注した。10または990μlの形質転換試料を
55℃に保った溶けた再生寒天10m1に加え、固化し
た下部寒天層を含むプレートの上に流し込んだ。プレー
トは30°Cで6−5日間保温した。
■、形質転換体の選択
形質転換体はヒスチジンを欠(培地である再生寒天上で
培養することにより選択された。His+のコロニーを
同定し、さらに以下の方法で適当なMut−の表現型に
関してスクリーニングした。滅菌蒸留水の存在下でプレ
ートの表面をかきとることにより、形質転換体をプール
し、低出力で15秒間超音波処理した。次にそれらをA
600 ”’ 0−1まで希釈し、0.2%クルコース
を炭素源として含む最少プレートの上に10−3と10
−4の希釈で重複してプレートし、30℃で1.5 =
2日間保温した。
培養することにより選択された。His+のコロニーを
同定し、さらに以下の方法で適当なMut−の表現型に
関してスクリーニングした。滅菌蒸留水の存在下でプレ
ートの表面をかきとることにより、形質転換体をプール
し、低出力で15秒間超音波処理した。次にそれらをA
600 ”’ 0−1まで希釈し、0.2%クルコース
を炭素源として含む最少プレートの上に10−3と10
−4の希釈で重複してプレートし、30℃で1.5 =
2日間保温した。
次にそれらを0.5%メタノールを炭素源として含む最
少プレートの上にレプリカした。60℃で一夜保温した
後、18/75(24%)の形質転換体はメタノール上
で残りの形質転換体より遅く生育することが明らかであ
った。psL44由来のBgll(断片でAOX1遺伝
子が置換されることにより予想されるゲノムのサザン・
プロット上の断片のパターンはこれらの株のうちのい(
つかで示された。
少プレートの上にレプリカした。60℃で一夜保温した
後、18/75(24%)の形質転換体はメタノール上
で残りの形質転換体より遅く生育することが明らかであ
った。psL44由来のBgll(断片でAOX1遺伝
子が置換されることにより予想されるゲノムのサザン・
プロット上の断片のパターンはこれらの株のうちのい(
つかで示された。
これらの株の1つはG−GAG44と名付げられた。
実施例■
(3−GAU44の発酵
10Lの発酵几un#358は次のように行われた。フ
ァーンパックーフラ、z、 コ(Fernback F
losk)中の500m1の緩衝されたナイトロジェン
ベース(Nitrogen Ba5e)(YNB )
−2%グリセロールに、種培養または最少グルコースプ
レートの培養から植菌した。200rpmで60°Cで
1日間振盪した後、植菌液を7リツトルの480gのグ
リセロール、40m9のビオチン、40m1の微量゛類
類溶液を含む最少培地に植えた。培養がバッチ・モード
でグリセロールが枯渇するまで(約24時間)生育する
間、発酵液は60℃、pH5,5に維持された。
ァーンパックーフラ、z、 コ(Fernback F
losk)中の500m1の緩衝されたナイトロジェン
ベース(Nitrogen Ba5e)(YNB )
−2%グリセロールに、種培養または最少グルコースプ
レートの培養から植菌した。200rpmで60°Cで
1日間振盪した後、植菌液を7リツトルの480gのグ
リセロール、40m9のビオチン、40m1の微量゛類
類溶液を含む最少培地に植えた。培養がバッチ・モード
でグリセロールが枯渇するまで(約24時間)生育する
間、発酵液は60℃、pH5,5に維持された。
pHはNH3ガスを加えることにより調節された。
グリセロールの枯渇は、CO2放出の急激な減少と、溶
解酸素の急激な上昇(または酸素吸収速度の低下)によ
り知る。メタノール供給は発酵液のレベルが〜Q、5%
MeOHまでにするように9ml/hで開始し、実際の
MeOH消費速度に基づいて、このレベルを維持するよ
うに調節した。40m1の微量塩類を、メタノール消費
速度を維持するために約2日間融で加えた。
解酸素の急激な上昇(または酸素吸収速度の低下)によ
り知る。メタノール供給は発酵液のレベルが〜Q、5%
MeOHまでにするように9ml/hで開始し、実際の
MeOH消費速度に基づいて、このレベルを維持するよ
うに調節した。40m1の微量塩類を、メタノール消費
速度を維持するために約2日間融で加えた。
実施例■
細胞をアミコン(Amicon)ろ過装置を用いて、発
酵培地から取り出し、破砕緩衝液(10mMNaPO4
,pH7,5,150mMNaC45mM El)TA
、 1mMPMsF)で洗った。約1600.9の細胞
を、全容量6.4リツトルの緩衝液中で定流ビーズミル
(cont 1nuous−f low beadmi
l l )(Dynomi I I)で破砕した。こ
うしてできた細胞溶菌液は7700Xgで遠心し、この
遠心の上清をpH5に調整し、さらに17.0OOX、
9で遠心した。この遠心の上清をpH7に調整し、2つ
の0.45μmフィルターを通して滅菌したポリスチレ
ンのコンテナ中にろ過した。
酵培地から取り出し、破砕緩衝液(10mMNaPO4
,pH7,5,150mMNaC45mM El)TA
、 1mMPMsF)で洗った。約1600.9の細胞
を、全容量6.4リツトルの緩衝液中で定流ビーズミル
(cont 1nuous−f low beadmi
l l )(Dynomi I I)で破砕した。こ
うしてできた細胞溶菌液は7700Xgで遠心し、この
遠心の上清をpH5に調整し、さらに17.0OOX、
9で遠心した。この遠心の上清をpH7に調整し、2つ
の0.45μmフィルターを通して滅菌したポリスチレ
ンのコンテナ中にろ過した。
最終試料中のp 24 gagの量はウェスタン・プロ
ッティングで約2020−3O,#であると見積られた
。全タンパク濃度はTCAローIJ −(Lowry)
法で6.85fl/lであると決定された。従って、試
料中のp24gagの最終濃度は全細胞タンパク質の約
0.5−0.75%であった。我々はこの操作の収率は
、最終細胞試料の10[]OD分の手作業の破砕からの
量に比べ約33−50%であると見積った。
ッティングで約2020−3O,#であると見積られた
。全タンパク濃度はTCAローIJ −(Lowry)
法で6.85fl/lであると決定された。従って、試
料中のp24gagの最終濃度は全細胞タンパク質の約
0.5−0.75%であった。我々はこの操作の収率は
、最終細胞試料の10[]OD分の手作業の破砕からの
量に比べ約33−50%であると見積った。
実施例■
生産物の分析
最終滅菌ろ液中p24 gagの量はCentocor
の35−kd融合タンパク質、PO2を標準に用いて[
Ghrayebら(1986)DNA5:93−99)
ウェスタン・プロットで見積った;バイオネティッグヌ
・・リサーチ(Bionetics Re5earch
)、Inc。
の35−kd融合タンパク質、PO2を標準に用いて[
Ghrayebら(1986)DNA5:93−99)
ウェスタン・プロットで見積った;バイオネティッグヌ
・・リサーチ(Bionetics Re5earch
)、Inc。
(Rockv i l l e 、M D )のウィル
ス抽出物に対するウサギ抗血清の1 :1250希釈液
と、125■−プロティンAにニュー・イングランド・
ニュークリアー(New England Nu4J:
eaゆを検出に用いた。
ス抽出物に対するウサギ抗血清の1 :1250希釈液
と、125■−プロティンAにニュー・イングランド・
ニュークリアー(New England Nu4J:
eaゆを検出に用いた。
前の実施例の6液はレムリ(Laerrrnl 1)(
IJK)Nature 227:680−685(19
70)のプロトコールに従ったポリアクリルアミド・レ
ムリ・ゲルにかけた。次にトウビニy (Towbin
)ら、Proc NatlAcad8ciUSA、76
:4350−4354(1979)のプロトコールに従
って、3 Q Q mAmp s定電流での11/2−
2時間の電気泳動によって、ゲルから45 /−1m
ノニトロセルロース・フィルターの上にエレクトロ・プ
ロッティングした。次にフィルターを、エレクトロ・プ
ロットから外し、ウェスタン緩衝液中で1時間保温した
。次にウェスタン緩衝液で希釈した抗体を加え、振盪機
の上で低温室に一装置いた。フィルターをウェスタン緩
衝液中で、各洗浄15分間ずつ、4回洗浄した。次にフ
ィルターを ■プロティンAと1.5μC1125I
−プロティンA/レーンで45分間保温した。フィルタ
ーを再びウェスタン緩衝液中で、各洗浄15分間ずつ、
4回洗浄し、コダックX −OMATAIFtフィルム
に露光した。
IJK)Nature 227:680−685(19
70)のプロトコールに従ったポリアクリルアミド・レ
ムリ・ゲルにかけた。次にトウビニy (Towbin
)ら、Proc NatlAcad8ciUSA、76
:4350−4354(1979)のプロトコールに従
って、3 Q Q mAmp s定電流での11/2−
2時間の電気泳動によって、ゲルから45 /−1m
ノニトロセルロース・フィルターの上にエレクトロ・プ
ロッティングした。次にフィルターを、エレクトロ・プ
ロットから外し、ウェスタン緩衝液中で1時間保温した
。次にウェスタン緩衝液で希釈した抗体を加え、振盪機
の上で低温室に一装置いた。フィルターをウェスタン緩
衝液中で、各洗浄15分間ずつ、4回洗浄した。次にフ
ィルターを ■プロティンAと1.5μC1125I
−プロティンA/レーンで45分間保温した。フィルタ
ーを再びウェスタン緩衝液中で、各洗浄15分間ずつ、
4回洗浄し、コダックX −OMATAIFtフィルム
に露光した。
P、パストリス株G−GAG44に対するウェスタン・
プロットで約80−90 kd、39kd、27kd。
プロットで約80−90 kd、39kd、27kd。
24kdに泳動される免疫反応するバンドが検出された
。6つの大きい分子種は形質転換されていない細胞の抽
出液にも存在し、従って明らかにH工■gag p24
以外の抗原に対する交差反応を表している。我々はp
24. gagの濃度を全細胞タンパク質の0.5から
0.75%の間であると見積った。
。6つの大きい分子種は形質転換されていない細胞の抽
出液にも存在し、従って明らかにH工■gag p24
以外の抗原に対する交差反応を表している。我々はp
24. gagの濃度を全細胞タンパク質の0.5から
0.75%の間であると見積った。
本実施例は単に本発明の詳細な説明するために挙げたも
のであり、いかなる意味においても本発明、または添付
の特許請求の範囲を制限するものとして読まれるべきで
はない。本発明の本質や精神を外れない合理的な変更や
修飾は、希望し、請求している特許の範囲内であること
を意図している。
のであり、いかなる意味においても本発明、または添付
の特許請求の範囲を制限するものとして読まれるべきで
はない。本発明の本質や精神を外れない合理的な変更や
修飾は、希望し、請求している特許の範囲内であること
を意図している。
第1図は、HIVの24kDa gag遺伝子を含む
、HiVのBcoRI / C1a I断片の制限酵素
地図を示している。 第2図は、プラスミドpsL44Aの作製の流れ図を示
している。 第3図は、プラスミドpsL44Aの説明を示している
。psL44は、Fl−oriの挿入と唯一のBcoR
I部位にHI V 24kDa構造遺伝子の挿入により
修飾されたpAO804の誘導体である。
、HiVのBcoRI / C1a I断片の制限酵素
地図を示している。 第2図は、プラスミドpsL44Aの作製の流れ図を示
している。 第3図は、プラスミドpsL44Aの説明を示している
。psL44は、Fl−oriの挿入と唯一のBcoR
I部位にHI V 24kDa構造遺伝子の挿入により
修飾されたpAO804の誘導体である。
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、HIV24kDa ¥gag¥タンパク質を生産す
る方法であって、 a)HIV24kDa ¥gag¥タンパク質の構造遺
伝子に、機能可能であるように連結した制御領域と、3
′終結配列を含んだ発現カセットを少なくとも一つ持っ
たベクター少なくとも一つで、メチロトローフ酵母を形
質転換し、その後 b)結果としてできた形質転換された酵母株を、該HI
V24kDaタンパク質の生産を得るのに適切な条件下
で培養する、ことからなる上記方法。 2、該ベクターがプラスミド、もしくは線状の組込み部
位特異的ベクターから成る群から選択される、特許請求
の範囲第1項記載の方法。 3、ベクターが線状の組込み、部位特異的ベクターであ
る、特許請求の範囲第2項記載の方法。 4、該線状の組込み部位特異的ベクターが次に挙げる一
連の配列、 a)第1の挿入可能なDNA断片 b)マーカー遺伝子を少なくとも一つ、及びHIV24
kDagagタンパク質の構造遺伝子に機能可能である
ように連結した制御領域と3′終結配列を含んだ発現カ
セット少なくとも一つ、そして c)第2の挿入可能なDNA断片 を含み、構成物(b)のマーカー遺伝子とカセットの順
序が交換可能な特許請求の範囲第3項記載の方法。 5、第1の挿入可能なDNA断片と第2の挿入可能なD
NA断片がピキア・パストリス(¥Pichia¥ ¥
postoris¥)から単離されたDNA配列由来で
、¥AOX1¥、p40、¥DHAS¥と¥HIS4¥
から成るグループから選択される、特許請求の範囲第4
項記載の方法。 6、該発現カセットが a)機能可能であるように下記(b)と連結した、ピキ
ア・パストリスから単離された¥AOX1¥、p40、
¥DHAS¥とサッカロミセス・セレビシエ(¥Sac
charomyces¥ ¥cerevisiae¥)
から単離された酸性ホスファターゼ、ガラクトキナーゼ
、アルコールデヒドロゲナーゼ、シトクロムC、アルフ
ァー接合因子、グリセルアルデヒド3リン酸デヒドロゲ
ナーゼから成るグループから選択された制御領域 b)機能可能であるように下記(c)と連結したHIV
24kDa¥gag¥タンパク質の構造遺伝子、 c)¥AOX1¥遺伝子、p40遺伝子、¥DHAS¥
遺伝子、¥HIS4¥遺伝子から単離された3′終結配
列より成るグループから選択した、ピキア・パストリス
由来の3′終結配列 から成る、特許請求の範囲第4項記載の方法。 7、該マーカー遺伝子が、ピキア・パストリスから単離
された¥HIS4¥と¥ARG4¥、サッカロミセス・
セレビシエから単離されたSUC_2、¥Tn903¥
と¥Tn601¥のG418^R遺伝子から成るグルー
プから選択される、特許請求の範囲第4項記載の方法。 8、該ベクターが a)機能可能であるように下記(b)と連結した、ピキ
ア・パストリスから単離された5′¥AOX1¥制御領
域の約1キロベースの第1の挿入可能なDNA断片、 b)機能可能であるように下記(c)と連結した、HI
V24kDa ¥gag¥タンパク質の構造遺伝子、 c)下記d)と結合した、ピキア・パストリスから単離
した¥AOX1¥の3′終結配列、 d)下記e)と結合した、ピキア・パストリスから単離
した¥HIS4¥のマーカー遺伝子少なくとも1つ、お
よび e)3′¥AOX1¥結配列の約0.85キロベースの
第2の挿入可能なDNA断片、 より成る、特許請求の範囲第4項記載の方法。 9、次に挙げる一連の配列、 a)第1の挿入可能なDNA断片 b)マーカー遺伝子を少なくとも1つ、及びHIV24
kDa ¥gag¥タンパク質の構造遺伝子に機能可能
であるように連結した制御領域と3′終結配列を含んだ
発現カセットを少なくとも1つ、そして c)第2の挿入可能なDNA断片 から成る、線状の挿入型部位特異的ベクターで、構成物
(b)のマーカー遺伝子とカセットの順序が交換可能な
上記ベクター。 10、該第1の挿入可能なDNA断片と同第2の断片が
、¥AOX1¥、p40、¥DHAS¥、¥HIS4¥
から成るグループから選択されるピキア・パストリスか
ら単離された遺伝子のDNA配列由来である、特許請求
の範囲第9項記載のベクター。 11、該発現カセットが、 a)機能可能であるように下記b)と連結した、ピキア
・パストリスから単離された¥AOX1¥、p40、¥
DHAS¥、¥HIS4¥と、サッカロミセス・セレビ
シエから単離された酸性ホスファターゼ、ガラクトキナ
ーゼ、アルコールデヒドロゲナーゼ、シトクロムC、ア
ルファー接合因子、グリセルアルデヒド3リン酸デヒド
ロゲナーゼから成るグループから選択された制御領域、 b)機能可能であるように下記c)と連結した、HIV
24kDa¥gag¥タンパク質の構造遺伝子、 c)ピキア・パストリスから単離された、 ¥AOX1¥遺伝子、p40遺伝子、¥DHAS¥遺伝
子、HIS4遺伝子から単離した、3′終結配列より成
るグループから選択された3′終結配列から成る、特許
請求の範囲第9項記載のベクター。 12、該マーカー遺伝子が、ピキア・パストリウスから
単離された¥HIS4¥、¥ARG4¥、サッカロミセ
ス・セレビシエから単離した¥SUC2¥、細菌のTn
903とTn601のG418^Rから成るグループか
ら選択される、特許請求の範囲第9項記載のベクター。 13、該ベクターが、 a)機能可能であるように下記b)と連結した、ピキア
・パストリスから単離された、長さ約1キロベースの、
5′¥AOX1¥遺伝子の機能可能な制御領域である第
1の挿入可能なDNA断片、 b)機能可能であるようにc)と連結したHIV24k
Da¥gag¥タンパク質の構造遺伝子、 c)下記d)と結合した、ピキア・パストリスから単離
した¥AOX1¥の3′終結配列、 d)下記e)と結合した、ピキア・パストリスから単離
した¥HIS4¥のマーカー遺伝子少なくとも1つ e)3′¥AOX1¥終結配列の約0.85キロベース
の第2の挿入可能なDNA断片、 より成る、特許請求の範囲第9項記載のベクター。 14、3′終結配列に機能可能であるように連結したH
IV24kDa ¥gag¥タンパク質の構造遺伝子に
、機能可能であるように連結した制御領域より成る発現
カセットを少なくとも1つ含んだベクター少なくとも一
つで形質転換したメチロトローフ酵母。 15、酵母がピキア・パストリスである、特許請求の範
囲第14項記載のメチロトローフ酵母。 16、酵母がピキア・パストリスGS115株である、
特許請求の範囲第14項記載のメチロトロフィック酵母
。 17、該GS115が、 a)第1の挿入可能なDNA断片 b)機能可能であるように下記c)と連結した、マーカ
ー遺伝子を少なくとも1つ及びHIV24kDa ¥g
ag¥タンパク質の構造遺伝子を含むピキアに適合した
発現カセットを少なくとも1つ、 c)ピキア・パストリスから単離した¥AOX1¥遺伝
子、p40遺伝子、¥DHAS¥遺伝子、¥HIS4¥
遺伝子から単離した3′終結配列から成るグループから
選択した3′終結配列、 d)第2の挿入可能なDNA断片、 の一連の配列である線状の挿入型、部位特異的ベクター
で、構成物(b)のマーカー遺伝子とカセットの順序が
交換可能な上記ベクター少なくとも一つで形質転換され
た、特許請求の範囲第16項記載のピキア・パストリス
GS115。 18、該ベクターが a)機能可能であるように下記b)と連結した、ピキア
・パストリスから単離した5′¥AOX1¥制御領域の
約1キロベースである第1の挿入可能なDNA断片 b)機能可能であるように下記c)と連結した、HIV
24kDa¥gag¥タンパク質の構造遺伝子、 c)下記d)と結合したピキア・パストリスから単離し
た¥AOX1¥の3′終結配列、 d)下記e)と結合した、ピキア・パストリスから単離
した¥HIS4¥であるマーカー遺伝子少なくとも1つ
、および e)3′¥AOX1¥終結配列の約65キロベースであ
る第2の挿入可能なDNA断片、 から成る、特許請求の範囲第17項記載の線状の部位特
異的組込みベクター。 19、ピキア・パストリスG−GAG44。 20、該GS115株が前記線状組込み部位特異性ベク
ターのコピー一つ以上で形質転換されている、請求項1
7のように形質転換されたピキア・パストリスGS11
5。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US18640988A | 1988-04-25 | 1988-04-25 | |
| US186409 | 1988-04-25 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH0220286A true JPH0220286A (ja) | 1990-01-23 |
Family
ID=22684832
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP1105731A Pending JPH0220286A (ja) | 1988-04-25 | 1989-04-25 | メチロトローフ酵母におけるHIV 24kDA gag蛋白質の発現 |
Country Status (6)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0339569A3 (ja) |
| JP (1) | JPH0220286A (ja) |
| AU (1) | AU3327789A (ja) |
| DK (1) | DK199889A (ja) |
| IL (1) | IL89993A0 (ja) |
| NO (1) | NO891717L (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2023134312A (ja) * | 2022-03-14 | 2023-09-27 | Kten Bio株式会社 | 生体中や環境あるいは食品中に存在する微小物質の濃縮法 |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5733781A (en) * | 1994-07-19 | 1998-03-31 | Gen-Probe Incorporated | Oligonucleotides and methods for inhibiting propagation of human immunodeficiency virus |
Family Cites Families (6)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US4855231A (en) * | 1984-10-30 | 1989-08-08 | Phillips Petroleum Company | Regulatory region for heterologous gene expression in yeast |
| US4885242A (en) * | 1984-10-30 | 1989-12-05 | Phillips Petroleum Company | Genes from pichia histidine pathway and uses thereof |
| US4882279A (en) * | 1985-10-25 | 1989-11-21 | Phillips Petroleum Company | Site selective genomic modification of yeast of the genus pichia |
| US4895800A (en) * | 1985-11-26 | 1990-01-23 | Phillips Petroleum Company | Yeast production of hepatitis B surface antigen |
| AU6713287A (en) * | 1986-01-06 | 1987-07-09 | F. Hoffmann-La Roche & Co. | Expression of htlv-iii gag-gene |
| IL82935A0 (en) * | 1986-08-12 | 1987-12-20 | Phillips Petroleum Co | Secretion of heterologous proteins from yeast |
-
1989
- 1989-04-17 IL IL89993A patent/IL89993A0/xx unknown
- 1989-04-21 AU AU33277/89A patent/AU3327789A/en not_active Abandoned
- 1989-04-25 JP JP1105731A patent/JPH0220286A/ja active Pending
- 1989-04-25 NO NO89891717A patent/NO891717L/no unknown
- 1989-04-25 DK DK199889A patent/DK199889A/da not_active Application Discontinuation
- 1989-04-25 EP EP19890107462 patent/EP0339569A3/en not_active Withdrawn
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2023134312A (ja) * | 2022-03-14 | 2023-09-27 | Kten Bio株式会社 | 生体中や環境あるいは食品中に存在する微小物質の濃縮法 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| NO891717D0 (no) | 1989-04-25 |
| DK199889A (da) | 1989-10-26 |
| DK199889D0 (da) | 1989-04-25 |
| EP0339569A2 (en) | 1989-11-02 |
| NO891717L (no) | 1989-10-26 |
| EP0339569A3 (en) | 1990-09-12 |
| AU3327789A (en) | 1989-10-26 |
| IL89993A0 (en) | 1989-12-15 |
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