JPH02242686A - アクロモバクタープロテアーゼi類遺伝子及びその遺伝子産物 - Google Patents
アクロモバクタープロテアーゼi類遺伝子及びその遺伝子産物Info
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- JPH02242686A JPH02242686A JP1059726A JP5972689A JPH02242686A JP H02242686 A JPH02242686 A JP H02242686A JP 1059726 A JP1059726 A JP 1059726A JP 5972689 A JP5972689 A JP 5972689A JP H02242686 A JPH02242686 A JP H02242686A
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- fragment
- apis
- achromobacter protease
- plasmid
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- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/48—Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
- C12N9/50—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
- C12N9/52—Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from bacteria or Archaea
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- Y10—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC
- Y10S—TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
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- Y10S435/824—Achromobacter
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
産jJlΔ利更蔓と訪
本発明はアクロモバク・′−プロテアーゼ■(^chr
omobactor preteasa 1.以下AP
Iと1トドぶ)およびAPIと同様の活性を有するAP
I類をコードするDNAをクローニングし、それを使用
してAPI類を遺伝子工学的手法を用いて効率よく生産
する方法に関する。
omobactor preteasa 1.以下AP
Iと1トドぶ)およびAPIと同様の活性を有するAP
I類をコードするDNAをクローニングし、それを使用
してAPI類を遺伝子工学的手法を用いて効率よく生産
する方法に関する。
従動1胤
APIはアクロモバクタ−リティカス(Achr。
mobactor 1ytj、cus)M2O3−I
Qから生産されるセリンプロテアーゼで、蛋白質および
ペプチドのリジン残基のカルボニル基側のペプチド結合
(−Lys−X−)を特異的に切断する酵素であり、リ
シルエンドペプチダーゼ(+<C3,4,Zl、50)
とも呼ばれている。本酵素は■、ys−Pro結合を含
めた全ての[、ys−X結合を切断するので、蛋白質や
ペプチドの一次構造解析のための断片化やペプチドマツ
プの作成、−Lys−X−化合物の合成に極めて有用で
ある。
Qから生産されるセリンプロテアーゼで、蛋白質および
ペプチドのリジン残基のカルボニル基側のペプチド結合
(−Lys−X−)を特異的に切断する酵素であり、リ
シルエンドペプチダーゼ(+<C3,4,Zl、50)
とも呼ばれている。本酵素は■、ys−Pro結合を含
めた全ての[、ys−X結合を切断するので、蛋白質や
ペプチドの一次構造解析のための断片化やペプチドマツ
プの作成、−Lys−X−化合物の合成に極めて有用で
ある。
一方、ある種の細胞が分泌する蛋白質、ポリペプチドの
単離精製は、その操作が煩雑でまた生産斌が少ないよう
な場合には、非常に難かしいのが常であり、この困難性
を解決するために、遺伝子工学的手法を用いることが最
近では行なわれることもある。
単離精製は、その操作が煩雑でまた生産斌が少ないよう
な場合には、非常に難かしいのが常であり、この困難性
を解決するために、遺伝子工学的手法を用いることが最
近では行なわれることもある。
が解決しようとする課題
上記のAPIの取得はアクロモバクタ−リティカスから
の生産に頼っていたが、この天然の生産斌は非常に少な
く、大量に生産し得る方法の開発が望まれていた。そこ
でこの種のものを犬軟に生産し得る遺伝子工学的手法を
適用することが課題となっていた。
の生産に頼っていたが、この天然の生産斌は非常に少な
く、大量に生産し得る方法の開発が望まれていた。そこ
でこの種のものを犬軟に生産し得る遺伝子工学的手法を
適用することが課題となっていた。
課 を解決するための手段
本発明者等はAPIの遺伝子工学的手法による生産を行
う方法を提供すへく研究を11【ね、A 1.) 1を
コードするDNAのクローニング、およびこれを用いた
に遺伝子工学的手法によるAl)Tの生産に成功したも
のである。
う方法を提供すへく研究を11【ね、A 1.) 1を
コードするDNAのクローニング、およびこれを用いた
に遺伝子工学的手法によるAl)Tの生産に成功したも
のである。
すなわち本発明は、(i)API類をコードするr)N
Aを含有するDNA、(ii)該DNAを発現用ベクタ
ーに、API類を発現させるように構築した組み換えD
NA、(ui)該組み換えDNAを保持する形質転換体
、(〜)該形質転換体を培養し、培養物中にAPI類を
生成蓄積せしめ、これを採取することを特徴とするAP
I類の製造法、および(v )A P I M蛋白質に
関するものである。
Aを含有するDNA、(ii)該DNAを発現用ベクタ
ーに、API類を発現させるように構築した組み換えD
NA、(ui)該組み換えDNAを保持する形質転換体
、(〜)該形質転換体を培養し、培養物中にAPI類を
生成蓄積せしめ、これを採取することを特徴とするAP
I類の製造法、および(v )A P I M蛋白質に
関するものである。
本発明者はAPIをクローニングするに当って第1図に
示す1〜2414位のDNA配列のものを得たが、この
内、387〜2348位が蛋白質発現部位(プレプロ体
)、387〜449イ1”t、 (若しくは387〜4
70位)がシグナル配列、1002〜1805位が成熟
蛋白質部位であり、この成熟蛋白質部位と同様の活性を
有するものとして1002位〜2348位が広義の成熟
蛋白質部位と呼べるものである。そして今回の遺伝子工
学的手法によるAPI類の生産における発現系の構築に
当っては、354〜2414位の塩Jん配列を組み込ん
でいるが、この塩基配列に包含されるこれより短いもの
であっても、AI)1類を発現し得るものであれば用い
ることができる。
示す1〜2414位のDNA配列のものを得たが、この
内、387〜2348位が蛋白質発現部位(プレプロ体
)、387〜449イ1”t、 (若しくは387〜4
70位)がシグナル配列、1002〜1805位が成熟
蛋白質部位であり、この成熟蛋白質部位と同様の活性を
有するものとして1002位〜2348位が広義の成熟
蛋白質部位と呼べるものである。そして今回の遺伝子工
学的手法によるAPI類の生産における発現系の構築に
当っては、354〜2414位の塩Jん配列を組み込ん
でいるが、この塩基配列に包含されるこれより短いもの
であっても、AI)1類を発現し得るものであれば用い
ることができる。
このDNA配列から推定されるアミノ酸配列を第1図に
併せて示しているが、このアミノ酸配列において、1〜
268位が成熟蛋白質部位、1〜269位ないし448
位が同様の活性を有する広義の成熟蛋白質部位の相当し
、また−205位から448位が蛋白質発現部位(プレ
プロ体)に相当するものである。
併せて示しているが、このアミノ酸配列において、1〜
268位が成熟蛋白質部位、1〜269位ないし448
位が同様の活性を有する広義の成熟蛋白質部位の相当し
、また−205位から448位が蛋白質発現部位(プレ
プロ体)に相当するものである。
本発明においては、このアミノ酸配列の1〜268位の
成熟蛋白質部位(API)および該成熟蛋白質部位と同
様の活性を有する1〜269位ないし448位に相当す
る広義の成熟蛋白質部位を含めてAPI類と総称する。
成熟蛋白質部位(API)および該成熟蛋白質部位と同
様の活性を有する1〜269位ないし448位に相当す
る広義の成熟蛋白質部位を含めてAPI類と総称する。
本発明におけるAPI類をコードする塩基配列を有する
DNAを含有する発現型ベクターは、例えば、(i)A
PI類産生産生細胞1ばアクロモバクタ−リティカス
M2O3−1からの全ゲノムDNAを制限酵素で消化し
、(ii)該1) N A断片をファージまたはプラス
ミドに組み込み、(iii )得られた組み換えファー
ジまたはプラスミドで宿主を形質転換し、(iv )得
られた形質転換体を培養後、形質転換体から適当な方法
、例えばAPI類の一部をコートするDNAプローブと
のハイブリダイゼーションにより目的とするDNAを含
有するファージあるいはプラスミドを単離し、(V)そ
の組み換えDNAから目的とするクローン化DNAを切
り出し、(vi)該クローン化1) N Aまたはその
一部を発現ベクター中のプロモーターの下流に連結する
。ことにより製造することができる。
DNAを含有する発現型ベクターは、例えば、(i)A
PI類産生産生細胞1ばアクロモバクタ−リティカス
M2O3−1からの全ゲノムDNAを制限酵素で消化し
、(ii)該1) N A断片をファージまたはプラス
ミドに組み込み、(iii )得られた組み換えファー
ジまたはプラスミドで宿主を形質転換し、(iv )得
られた形質転換体を培養後、形質転換体から適当な方法
、例えばAPI類の一部をコートするDNAプローブと
のハイブリダイゼーションにより目的とするDNAを含
有するファージあるいはプラスミドを単離し、(V)そ
の組み換えDNAから目的とするクローン化DNAを切
り出し、(vi)該クローン化1) N Aまたはその
一部を発現ベクター中のプロモーターの下流に連結する
。ことにより製造することができる。
Ar1類をコードするDNAについては、全合成あるい
は半合成によっても製造することができ。
は半合成によっても製造することができ。
この際、第1図に示したような配列に基いて合成するこ
とができる。
とができる。
AFII類の全ゲノムDNAの制限酵素による消化に当
っては、Eco R1,Sat l、BamHI等
の制限酵素が用いられる。
っては、Eco R1,Sat l、BamHI等
の制限酵素が用いられる。
消化されて得られたDNA断片を組み込むプラスミドと
しては、たとえば大II菌由来のpACYC17’7.
pAcYc’184.pUc8.pUC9、p B R
322、p I N 3 A 1 、 p K K 2
33−2などが挙げられるが、その他のものであっても
、宿主内で複製増殖されるものであれば、いずれをも用
いることができる。またDNA断片を組み込むファージ
ベクターとしては、たとえばM13ファージmp9.M
13ファージmp8.λgt11.λE M B L
3 、 ChB r o n 4などが挙げられるが、
その他のものであっても宿主内で増殖できるものであれ
ば用いることができる。
しては、たとえば大II菌由来のpACYC17’7.
pAcYc’184.pUc8.pUC9、p B R
322、p I N 3 A 1 、 p K K 2
33−2などが挙げられるが、その他のものであっても
、宿主内で複製増殖されるものであれば、いずれをも用
いることができる。またDNA断片を組み込むファージ
ベクターとしては、たとえばM13ファージmp9.M
13ファージmp8.λgt11.λE M B L
3 、 ChB r o n 4などが挙げられるが、
その他のものであっても宿主内で増殖できるものであれ
ば用いることができる。
DNA断片を組み込んだプラスミドまたはファージベク
ターは適当な宿主たとえばエシェリキア(lEschs
richia)[菌(大腸菌)、バチルス(Bacil
lus)属菌(枯草菌)、ストレプトマイセス(Str
eptO膳yces)属菌(放線菌)、サツカロマイセ
ス(Saccharomyces)属菌(酵母菌)、お
よび動物細胞たるll1onkey COS cell
などに導入する。
ターは適当な宿主たとえばエシェリキア(lEschs
richia)[菌(大腸菌)、バチルス(Bacil
lus)属菌(枯草菌)、ストレプトマイセス(Str
eptO膳yces)属菌(放線菌)、サツカロマイセ
ス(Saccharomyces)属菌(酵母菌)、お
よび動物細胞たるll1onkey COS cell
などに導入する。
上記エシェリキア属菌の例としては、E、c。
1itJT481株、JM103株、JM83株。
J M L 09株、NM522株、MV1304株、
バチルス属菌の例としてはバチルスサティリス(1’1
acillus 5ubtilis)、ストレプトマイ
セス属菌の例としてはストレプトマイセス コエリカラ
ー(Strepjoa+yces coeN、colo
r)、サツカロマイセス属菌の例としてはサツカロマイ
セスセレビシェ(Saccharomyces cer
evisiae)などカ1挙もずられる。
バチルス属菌の例としてはバチルスサティリス(1’1
acillus 5ubtilis)、ストレプトマイ
セス属菌の例としてはストレプトマイセス コエリカラ
ー(Strepjoa+yces coeN、colo
r)、サツカロマイセス属菌の例としてはサツカロマイ
セスセレビシェ(Saccharomyces cer
evisiae)などカ1挙もずられる。
このようにして得られた形質転換体力1ら、目的とする
DNAを含有するファージあるb11!プラスミドを単
離する方法としては、例え1fAPI類の一部をコード
するオリゴヌクレオチドをプローブとして用いたコロニ
ーノ1イブリダイゼーション、プラークハイブリダイゼ
ーション等による/%イブリダイゼーションにより行わ
れる。
DNAを含有するファージあるb11!プラスミドを単
離する方法としては、例え1fAPI類の一部をコード
するオリゴヌクレオチドをプローブとして用いたコロニ
ーノ1イブリダイゼーション、プラークハイブリダイゼ
ーション等による/%イブリダイゼーションにより行わ
れる。
本発明のAPI類遺伝子のクローニングの概要は、第2
図のフローチャートに示され、(A) API類遺伝子
類似配列を有するDNA断片のクロニングとその塩基配
列の決定〔(1)→(2)〕(BlAPI類遺伝子のク
ローニングとその塩基配列の決定(3)、(C)AI)
1類遺伝子5′領域のクローニングとその塩基配列の決
定〔(4)→(5)〕および(D)API類全長全長遺
伝子築、といった経路をたどり、API類遺伝子をコー
ドする正確な領域を決めたものである。
図のフローチャートに示され、(A) API類遺伝子
類似配列を有するDNA断片のクロニングとその塩基配
列の決定〔(1)→(2)〕(BlAPI類遺伝子のク
ローニングとその塩基配列の決定(3)、(C)AI)
1類遺伝子5′領域のクローニングとその塩基配列の決
定〔(4)→(5)〕および(D)API類全長全長遺
伝子築、といった経路をたどり、API類遺伝子をコー
ドする正確な領域を決めたものである。
このようにしてクローン化されたAI’1類をコードす
るDNAの塩基配列を、適当な制限サイトがある場合は
それを利用して、ない場合はDnase Iを用いた
欠除体(deletion体)をm1llシM13ファ
ージを用いたダイデオキシ法によるなどして、決定する
。このダイデオキシ法で決定したDNAの塩基配列と、
その塩基配列から判明したアミノ酸配列を第1図に示す
。
るDNAの塩基配列を、適当な制限サイトがある場合は
それを利用して、ない場合はDnase Iを用いた
欠除体(deletion体)をm1llシM13ファ
ージを用いたダイデオキシ法によるなどして、決定する
。このダイデオキシ法で決定したDNAの塩基配列と、
その塩基配列から判明したアミノ酸配列を第1図に示す
。
上記のようにしてクローン化されたAr1類をコードす
るDNAは目的によりそのまま、または所望により制限
酵素で消化して使用することが出来る。
るDNAは目的によりそのまま、または所望により制限
酵素で消化して使用することが出来る。
クローン化されたDNAから発現させたい領域を切り出
し、発現に適したビークル(ベクター)中のプロモータ
ーの下流に連結して発現型ベクターを得ることができる
。
し、発現に適したビークル(ベクター)中のプロモータ
ーの下流に連結して発現型ベクターを得ることができる
。
該DNAはその5′末端に翻訳開始コドンとしてのA
T Gを有し、また3′末端には翻訳終止コドンとして
のTAA、TGAまたはTAGを有していてもよい、こ
れらの翻訳開始コドンや翻訳終止コドンは、適当な合)
Q D N Aアダプターを用いて付加することもでき
る。さらに該DNAを発現させるにはその上流にプロモ
ーターを接続する。
T Gを有し、また3′末端には翻訳終止コドンとして
のTAA、TGAまたはTAGを有していてもよい、こ
れらの翻訳開始コドンや翻訳終止コドンは、適当な合)
Q D N Aアダプターを用いて付加することもでき
る。さらに該DNAを発現させるにはその上流にプロモ
ーターを接続する。
ベクターとしては、上記のエシェリキア属菌;1来のプ
ラスミド(例、pAcYc184.PtJc9、pKK
233−2.pAcYc177、T)ACYC184,
ptJc8.pBR322,pIN3A1)、バチルス
属菌由来のプラスミドp HY300PLK、サツカロ
マイセスJii(菌由来のプラスミドp B T I
−1、ストレプトマイセス属菌のプラスミドPIJ61
.モンキーCoS細胞のプラスミドpsVLなどが挙げ
られる。
ラスミド(例、pAcYc184.PtJc9、pKK
233−2.pAcYc177、T)ACYC184,
ptJc8.pBR322,pIN3A1)、バチルス
属菌由来のプラスミドp HY300PLK、サツカロ
マイセスJii(菌由来のプラスミドp B T I
−1、ストレプトマイセス属菌のプラスミドPIJ61
.モンキーCoS細胞のプラスミドpsVLなどが挙げ
られる。
本発明で用いられるプロモーターとしては、遺伝子の発
現に用いる宿主に対応して適切なプロモーターであれば
いかなるものでもよい。
現に用いる宿主に対応して適切なプロモーターであれば
いかなるものでもよい。
形質転換する際の宿主がエシェリキア属菌である場合は
l a Q p t a Q t j t’ P +
’ pP * P hoS等のプロモーター、バチルス
属菌の場合は5PO2,αアミラーゼ等のプロモーター
、サツカロマイセス属菌の場合はPACDl(アルコー
ルデヒドロゲナーゼプロモーター)−Pcv。1(チト
クロームCプロモーター) 、 monkey COS
細胞の場合はSV40アーリーおよびレイトプロモータ
ーなどが、その例として挙げられる。
l a Q p t a Q t j t’ P +
’ pP * P hoS等のプロモーター、バチルス
属菌の場合は5PO2,αアミラーゼ等のプロモーター
、サツカロマイセス属菌の場合はPACDl(アルコー
ルデヒドロゲナーゼプロモーター)−Pcv。1(チト
クロームCプロモーター) 、 monkey COS
細胞の場合はSV40アーリーおよびレイトプロモータ
ーなどが、その例として挙げられる。
このようにして構築されたAPtをコードするDNAを
含有するベクターを用いて、形質転換体を製造する。
含有するベクターを用いて、形質転換体を製造する。
宿主としては、たとえばエシェリキア属菌、バチルス属
菌、ストレプトマイセス属菌、サツカロマイセス属菌、
monkey COS 細胞などが挙げられる。
菌、ストレプトマイセス属菌、サツカロマイセス属菌、
monkey COS 細胞などが挙げられる。
上記エシェリキア属菌、バチルス属菌、ストレプトマイ
セス属菌、サツカロマイセス属菌、 monkeycO
3細胞の具体例としては、前記したものと同様のものが
挙げられる。
セス属菌、サツカロマイセス属菌、 monkeycO
3細胞の具体例としては、前記したものと同様のものが
挙げられる。
このようにして、API類をコードするDNAを含有す
る発現ベクターで形質転換された形質転換体が得られる
。
る発現ベクターで形質転換された形質転換体が得られる
。
本発明において形質転換体を培養する際、培養に使用さ
れる培地としては5通常のものでよいが。
れる培地としては5通常のものでよいが。
LB培地、M9培地、T培地などが挙げられる。
培地のpHは約6〜9、好ましくは7前後である。
培養時間、温度、培養方法等は適宜選択できるが、振盪
培養、培養温度25℃前後、好ましくは25℃より若干
低めがよく、特に好ましい組合せとしては、25℃、2
4時間、IPTO1mMを含むLB培地(pII7.2
)での揚機培養が挙げられる。
培養、培養温度25℃前後、好ましくは25℃より若干
低めがよく、特に好ましい組合せとしては、25℃、2
4時間、IPTO1mMを含むLB培地(pII7.2
)での揚機培養が挙げられる。
上記培養物からAPI類を分離精製するには、例えば下
記の方法により行なうことができる。
記の方法により行なうことができる。
API類を培養菌体あるいは細胞から抽出するに際して
は、培養後、公知の方法で菌体あるいは細胞を集め、こ
れを適当な緩衝液に懸濁し、超音波、オスモティック
ショック、リゾチームおよび/または凍結融解などによ
って菌体あるいは細胞を破壊したのち、遠心分離やろ過
によりAPIの前駆体たんばくや成熟ペプチドの粗抽出
液を得る方法などが適宜用い得る。緩衝液の中に尿素や
塩酸グアニジンなどのたんばく変性剤や、トリトンX−
100などの界面活性剤が含まれていてもよい。
は、培養後、公知の方法で菌体あるいは細胞を集め、こ
れを適当な緩衝液に懸濁し、超音波、オスモティック
ショック、リゾチームおよび/または凍結融解などによ
って菌体あるいは細胞を破壊したのち、遠心分離やろ過
によりAPIの前駆体たんばくや成熟ペプチドの粗抽出
液を得る方法などが適宜用い得る。緩衝液の中に尿素や
塩酸グアニジンなどのたんばく変性剤や、トリトンX−
100などの界面活性剤が含まれていてもよい。
培養液中に前駆体たんばくや成熟ペプチドが分泌される
場合には、培養終了後、それ自体公知の方法で菌体ある
いは細胞と上清とを分離し、上γnを集める。このよう
にして得られた培養上清、あるいは抽出液中に含まれる
前駆体たんばくや成熟ペプチドは、自体公知の分離・精
製法を適切に組み合わせて行なうことができる。これら
の公知の分離、精製法としては、塩析や溶媒沈澱法など
の溶解度を利用する方法、透析法、限外ろ過法、ゲルろ
過法、および5DS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動
法などの主として分子量の差を利用する方法、イオン交
換クロマ1〜グラフイーなどの荷電の差を利用する方法
、アフィニティークロマトグラフィーなどの特異的親和
性を利用する方法、逆相高速液体クロマトグラフィーな
どの疎水性の差を利用する方法1等電点電気泳動法など
の等重点の差を利用する方法などが挙げられる。
場合には、培養終了後、それ自体公知の方法で菌体ある
いは細胞と上清とを分離し、上γnを集める。このよう
にして得られた培養上清、あるいは抽出液中に含まれる
前駆体たんばくや成熟ペプチドは、自体公知の分離・精
製法を適切に組み合わせて行なうことができる。これら
の公知の分離、精製法としては、塩析や溶媒沈澱法など
の溶解度を利用する方法、透析法、限外ろ過法、ゲルろ
過法、および5DS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動
法などの主として分子量の差を利用する方法、イオン交
換クロマ1〜グラフイーなどの荷電の差を利用する方法
、アフィニティークロマトグラフィーなどの特異的親和
性を利用する方法、逆相高速液体クロマトグラフィーな
どの疎水性の差を利用する方法1等電点電気泳動法など
の等重点の差を利用する方法などが挙げられる。
作用・効果
本発明のDNAでDNA感染または形質転換した菌体や
細胞では、人足のAPI前翻体たんばくや成熟たんばく
を大足に生産、精製することができる。
細胞では、人足のAPI前翻体たんばくや成熟たんばく
を大足に生産、精製することができる。
API類は先に述べたように、蛋白質およびペプチドの
りジン残基のカルボニル基側のペプチド結合(−Lys
−X−)を特異的に切断する酵素であり、Lys−Pr
o結合を含めた全てのLys−X結合を切断するので、
蛋白質やペプチドの一次構造解析のための断片化やペプ
チドマツプの作成、−Lys−X−化合物の合成に極め
て有用である。
りジン残基のカルボニル基側のペプチド結合(−Lys
−X−)を特異的に切断する酵素であり、Lys−Pr
o結合を含めた全てのLys−X結合を切断するので、
蛋白質やペプチドの一次構造解析のための断片化やペプ
チドマツプの作成、−Lys−X−化合物の合成に極め
て有用である。
本発明明細書および図面において、塩基やアミノ酸など
を略号で表示する場合、IUl)AC−IU B Co
mm1sion on Biochem、1cal N
omenclatureによる略号あるいは当該分野に
おける慣用略号に基づくものであり、その例を下記する
。またアミノ酸に関し光学異性体があり得る場合は、特
に明示しなければL一体を示すものとする。
を略号で表示する場合、IUl)AC−IU B Co
mm1sion on Biochem、1cal N
omenclatureによる略号あるいは当該分野に
おける慣用略号に基づくものであり、その例を下記する
。またアミノ酸に関し光学異性体があり得る場合は、特
に明示しなければL一体を示すものとする。
DNA :デオキシリボ核酸
cDNA:相補的デオキシリボ核酸
A :アデニン
T :チミン
G ニゲアニン
C:シトシン
RNA :リボ核酸
mRNA:メツセンジャーリポ核酸
dATP:デオキシアデノシン三リン酸dTTP:デオ
キシチミジン三リン酸 dGTP:デオキシグアノシン三リン酸dCTP:デオ
キシシチジン三リン酸 ATP :アデノシン三リン酸 atyまたはG ニゲリシン AlaまたはA :アラニン ValまたはV :バリン LeuまたはL :ロイシン 11eまたはI :イソロイシン SerまたはS :セリン ThrまたはT :スレオニン CysまたはCニジスティン MetまたはM :メチオニン GluまたはE :グルタミン醸 A s pまたはD =アスパラギン酸LysまたはK
:リジン A r gまたはR:アルギニン Hi sまたはトI :ヒスチジン PheまたはF :フェニールアラニンTyrまたはY
:チロシン TrρまたはW ニトリブトファン ProまたはP ニブロリン AsnまたはN :アスパラギン GlnまたはQ :グルタミン なお1本発明のAPI類においては、同様の活性がある
限り、そのアミノ酸配列の一部が修飾(付加、除去、そ
の他のアミノ酸への置換など)されていてもよい。
キシチミジン三リン酸 dGTP:デオキシグアノシン三リン酸dCTP:デオ
キシシチジン三リン酸 ATP :アデノシン三リン酸 atyまたはG ニゲリシン AlaまたはA :アラニン ValまたはV :バリン LeuまたはL :ロイシン 11eまたはI :イソロイシン SerまたはS :セリン ThrまたはT :スレオニン CysまたはCニジスティン MetまたはM :メチオニン GluまたはE :グルタミン醸 A s pまたはD =アスパラギン酸LysまたはK
:リジン A r gまたはR:アルギニン Hi sまたはトI :ヒスチジン PheまたはF :フェニールアラニンTyrまたはY
:チロシン TrρまたはW ニトリブトファン ProまたはP ニブロリン AsnまたはN :アスパラギン GlnまたはQ :グルタミン なお1本発明のAPI類においては、同様の活性がある
限り、そのアミノ酸配列の一部が修飾(付加、除去、そ
の他のアミノ酸への置換など)されていてもよい。
衷展−例一
以下の実施例により本発明をより具体的に説明するが1
本発明はこれらに限定されるものではない。
本発明はこれらに限定されるものではない。
以下の実施例において、用いられた材料、操作は以下の
通りである。
通りである。
(i)制限酵素、修飾酵素及び塩基配列決定キットは宝
酒造製品を、DNaselはシグマ製品、DNAポリメ
ラーゼ1はニューイングランドバイオラボ製品、ニトロ
セルロース1漠はシュライヒャーアンドシュール(Sc
hleichar & 5chuell)社BA85を
3NP放射性ヌクレオチドはアマーシャムレディオケミ
カルズ製のものを夫々使用した。
酒造製品を、DNaselはシグマ製品、DNAポリメ
ラーゼ1はニューイングランドバイオラボ製品、ニトロ
セルロース1漠はシュライヒャーアンドシュール(Sc
hleichar & 5chuell)社BA85を
3NP放射性ヌクレオチドはアマーシャムレディオケミ
カルズ製のものを夫々使用した。
(ji)発現の際、用いたNco Iリンカ−とpK
K 233−2ベクターはピーエルバイオケミカルズ(
P、L、Biochemicals)社製品を用いた。
K 233−2ベクターはピーエルバイオケミカルズ(
P、L、Biochemicals)社製品を用いた。
又、本実験で用いた大腸菌株のゲッタイブは次に示され
る。
る。
UT4811(通Δ(b駈、釘り肋U爪胛l」二!/F
’ traD36 肛1俳肋lhZΔl’l15JM1
03Δ(loc、 艶り thi 5trA s町哩5
ndA sbc旧5hsdR4/ F’ traD:3
6 pro、別1咳」4Δ旧5(iii)ラベリングに
ついては、15pmolのオリゴヌクレオチド混合物を
100μC1の〔γ−J2P)A’l’P (>500
0Ci/mmo l)で1゛。
’ traD36 肛1俳肋lhZΔl’l15JM1
03Δ(loc、 艶り thi 5trA s町哩5
ndA sbc旧5hsdR4/ F’ traD:3
6 pro、別1咳」4Δ旧5(iii)ラベリングに
ついては、15pmolのオリゴヌクレオチド混合物を
100μC1の〔γ−J2P)A’l’P (>500
0Ci/mmo l)で1゛。
ポリヌクレオチドキナーゼを用いてラベルした。
0.5〜1μgのDNA断片は50μCiの〔αj2P
)dCTP (>3000Ci/mmo l)でニック
トランスレーションによりラベルされた。
)dCTP (>3000Ci/mmo l)でニック
トランスレーションによりラベルされた。
(iv)ハイブリダイゼーション
コロニーハイブリダイゼーション、ブラークツ1イブリ
ダイゼーシヨン、サザンハイプリダイゼーションにおい
て、その過程でニトロセルロース膜に移されたDNAと
プローブとのハイブリダイゼーションは次のようにして
行オ〕れた。
ダイゼーシヨン、サザンハイプリダイゼーションにおい
て、その過程でニトロセルロース膜に移されたDNAと
プローブとのハイブリダイゼーションは次のようにして
行オ〕れた。
本オリゴヌクレオチドを用いた場合
5xデンハルツ溶液(Denhart’s 5olut
ion)、 0 。
ion)、 0 。
1%SDS、10%ソジウムデキストランスルフェート
、19.8mM Tris−HCQ pH8,0,
6,□mM EDTA、0.9M NaC〕Ωを含む溶
液中で42℃で1時間膜を保った後、同じ溶液中へ標識
プローブを加え、室温下に24時間保った。膜は6XS
SCで室温下に13回、30分間洗浄し、その後40℃
で5分間洗浄し、増感紙の存在下−80℃で24時間オ
ー1〜ラジオグラフイーを行なった。
、19.8mM Tris−HCQ pH8,0,
6,□mM EDTA、0.9M NaC〕Ωを含む溶
液中で42℃で1時間膜を保った後、同じ溶液中へ標識
プローブを加え、室温下に24時間保った。膜は6XS
SCで室温下に13回、30分間洗浄し、その後40℃
で5分間洗浄し、増感紙の存在下−80℃で24時間オ
ー1〜ラジオグラフイーを行なった。
本ニックトランスレーションで標識されたDNA断片を
用いた場合 5XSSC,50%ホルムアミド、5xデンハルツ溶液
、50mMリン酸ナトリウム緩衝液、pH6,5,1■
/ m Q超音波処理したサケ精子DNAを含む溶液中
で42℃で2時間保った後、5XSSC,50%ホルム
アミド、1xデンハルツ溶液、10%ソジウムデキスト
ランスルフエート。
用いた場合 5XSSC,50%ホルムアミド、5xデンハルツ溶液
、50mMリン酸ナトリウム緩衝液、pH6,5,1■
/ m Q超音波処理したサケ精子DNAを含む溶液中
で42℃で2時間保った後、5XSSC,50%ホルム
アミド、1xデンハルツ溶液、10%ソジウムデキスト
ランスルフエート。
20mMリン酸ナトリウム緩衝液、1■/ m Q超音
波処理したサケ精子DNAを含む溶液中へ膜を移し、標
識プローブを加え、42℃で24時間保った。膜は2X
SSC,0,1%SDSの溶液で室温下に3回30分間
洗い1次に○、txssc。
波処理したサケ精子DNAを含む溶液中へ膜を移し、標
識プローブを加え、42℃で24時間保った。膜は2X
SSC,0,1%SDSの溶液で室温下に3回30分間
洗い1次に○、txssc。
0.1%SDSの溶液で55℃で3回30分間洗浄した
。オートラジオグラフィーは上と同様に行なった。
。オートラジオグラフィーは上と同様に行なった。
(V)スクリーニングについては次のように行なう。
本全ゲノムDNAを用いた場合
クロモゾーマルDNA250μgを制限酵素で消化した
後、プラスミドへ挿入しこれによる形質転換体をライブ
ラリーとし、コロニーハイブリダイゼーションを行なっ
た。
後、プラスミドへ挿入しこれによる形質転換体をライブ
ラリーとし、コロニーハイブリダイゼーションを行なっ
た。
本DNA断片からのサブクローニングの場合DNA断片
20μgを制限酵素で消化した後。
20μgを制限酵素で消化した後。
プラスミド又はファージDNAに挿入し、これによる形
質転換体をライブラリーとし、コロニーハイブリダイゼ
ーション、あるいはプラークハイブリダイゼーションを
行なった。
質転換体をライブラリーとし、コロニーハイブリダイゼ
ーション、あるいはプラークハイブリダイゼーションを
行なった。
木サイズ選択DNAの場合
クロモゾーマルDNA250μgを制限tSliで消化
した後、0.8%アガロースゲル電気泳動を行ない、こ
れに対しサザンハイプリダイゼーションを行いポジティ
ブなバンドに相当する領域を同様に泳動したゲルより切
り出し、それよりDNA断片を溶出する。溶出したDN
Aをプラスミドに挿入し、これによって得られた形質転
換体をライブラリーとし、コロニーハイブリダイゼーシ
ョンを行なった。
した後、0.8%アガロースゲル電気泳動を行ない、こ
れに対しサザンハイプリダイゼーションを行いポジティ
ブなバンドに相当する領域を同様に泳動したゲルより切
り出し、それよりDNA断片を溶出する。溶出したDN
Aをプラスミドに挿入し、これによって得られた形質転
換体をライブラリーとし、コロニーハイブリダイゼーシ
ョンを行なった。
(vi ) D N A塩基配列決定
クローニングされたDNA断片は適当な制限サイトのあ
る場合はそれを利用して、ない場合は1〕Na5s[を
用いた欠除体をtA製しML3ファージを用いたダイデ
オキシ法により決定した。
る場合はそれを利用して、ない場合は1〕Na5s[を
用いた欠除体をtA製しML3ファージを用いたダイデ
オキシ法により決定した。
以上、遺伝子操作方法に関してはマニアティス。
ティー(Maniatis、T)等、モレキュラー ク
ローニング(Molecular Cloning)ニ
ア ラボラトリ−マニュアル、コールドスプリングハー
バ−ラボラトリ−、NYに準じて行なった。
ローニング(Molecular Cloning)ニ
ア ラボラトリ−マニュアル、コールドスプリングハー
バ−ラボラトリ−、NYに準じて行なった。
実施例1(第2図参照)
(1)API類似遺伝子8Kbp EcoRI断片の
クローニング アクロモバクタ−リティカス M497−1菌のゲノム
DNA250μgをEco R1で消化し、pAcY
c184へ挿入し、これにより得られた形質転換体約6
、000個に対し、下記のオリゴヌクレオチドをプロ
ーブとして、コロニーハイブリダイゼーションによりス
クリーニングした。該プローブはAPI蛋白質の一次構
造(成熟蛋白な′lの71〜77位配列をコード)に基
いて合成された次の21マー をT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いて5′末端をラ
ベルして得た、A I:’ I遺伝子に特異的なプロー
ブである。室温洗浄後オートラジオグラフィーにかけ、
約600クローンをレプリカ、コロニーハイブリダイゼ
ーションを行った後、42℃洗浄、オートラジオグラム
上で1個のポジティブクローンが得られ、8Kbpの断
片が挿入されて4%だ(pAs800)、該約8Kb
pのEcoRI断片の回収を行った。
クローニング アクロモバクタ−リティカス M497−1菌のゲノム
DNA250μgをEco R1で消化し、pAcY
c184へ挿入し、これにより得られた形質転換体約6
、000個に対し、下記のオリゴヌクレオチドをプロ
ーブとして、コロニーハイブリダイゼーションによりス
クリーニングした。該プローブはAPI蛋白質の一次構
造(成熟蛋白な′lの71〜77位配列をコード)に基
いて合成された次の21マー をT4ポリヌクレオチドキナーゼを用いて5′末端をラ
ベルして得た、A I:’ I遺伝子に特異的なプロー
ブである。室温洗浄後オートラジオグラフィーにかけ、
約600クローンをレプリカ、コロニーハイブリダイゼ
ーションを行った後、42℃洗浄、オートラジオグラム
上で1個のポジティブクローンが得られ、8Kbpの断
片が挿入されて4%だ(pAs800)、該約8Kb
pのEcoRI断片の回収を行った。
(2)8Kbp EcoRI断片からの400bps
au3Alのサブクローニングと塩Jk配列決定 8Kbp EOo R1断片をS au 3 A
Iで消化しML3ファージm p 9へ挿入し、これを
ハ16tで得られた形質転換プラーク約1000個に対
し、上記のオリゴヌクレオチドをプローブとして、プラ
ークハイブリダイゼーションによりスクリーニングした
。12℃で洗浄後のオートラジオグラフィーの結果、ポ
ジティブとなった13クローンレ3ついてダイデオキシ
法により塩JIIG配列決定を行ない、アミノ酸配列へ
の変換番こより、アミノ酸レベルで約70%のホモロジ
ーを持つDNA断片であることが明らかとなった。その
後、この断片1まmp9からE c o RI / H
i n d m消化しこより切1ノ出されpUC9へ移
された(pAPs400)。
au3Alのサブクローニングと塩Jk配列決定 8Kbp EOo R1断片をS au 3 A
Iで消化しML3ファージm p 9へ挿入し、これを
ハ16tで得られた形質転換プラーク約1000個に対
し、上記のオリゴヌクレオチドをプローブとして、プラ
ークハイブリダイゼーションによりスクリーニングした
。12℃で洗浄後のオートラジオグラフィーの結果、ポ
ジティブとなった13クローンレ3ついてダイデオキシ
法により塩JIIG配列決定を行ない、アミノ酸配列へ
の変換番こより、アミノ酸レベルで約70%のホモロジ
ーを持つDNA断片であることが明らかとなった。その
後、この断片1まmp9からE c o RI / H
i n d m消化しこより切1ノ出されpUC9へ移
された(pAPs400)。
(3)API遺伝子2.5Kbp Sa ]、I断片
のクローニング (2)で得られたpAPs400をEcoR1/Pst
l消化して得られた約400bP断片の1μgを(”P
)dCTPを用いたニックトランスレーションによりラ
ベルしてプローブを調製し、全ゲノムDNA250μg
のSal、l消化物に対し、サザンハイプリダイゼーシ
ョンを行なった。
のクローニング (2)で得られたpAPs400をEcoR1/Pst
l消化して得られた約400bP断片の1μgを(”P
)dCTPを用いたニックトランスレーションによりラ
ベルしてプローブを調製し、全ゲノムDNA250μg
のSal、l消化物に対し、サザンハイプリダイゼーシ
ョンを行なった。
オートラジオグラム上に2本のバンドが得られたが、+
5+jlイバンドは先にクローニングした類似配列DN
Aと考えられるため、2.5Kbpのうすいバンドに相
当する領域を同様に泳動したゲルより切り出し、DNA
断片を回収した。これをpUC9に挿入し、これによっ
て生じた形質転換体約2000個をライブラリーとして
、400bpのI〕NA断片を用いてコロニーハイブリ
ダイゼーションによりスクリーニングを行なった。これ
より約12個の陽性クローンを得、それぞれのコロニー
よりプラスミドを調製、5alt消化し目的の約2.5
Kbp断片であることを11i度同−プローブのサザン
ハイプリダイゼーションで確認した(pAl)C250
)、この2.5Kbp断片は5alIで切り出し回収し
た後、M13ファージmp9Saltサイトへ挿入した
。このファージ感染体より両方向に挿入されたクローン
をとり、両クローンに対してDNaselにより欠除体
(d a l e t ion体)を作製し、両方向か
らのダイデオキシ法による塩基配列決定を行なった。
5+jlイバンドは先にクローニングした類似配列DN
Aと考えられるため、2.5Kbpのうすいバンドに相
当する領域を同様に泳動したゲルより切り出し、DNA
断片を回収した。これをpUC9に挿入し、これによっ
て生じた形質転換体約2000個をライブラリーとして
、400bpのI〕NA断片を用いてコロニーハイブリ
ダイゼーションによりスクリーニングを行なった。これ
より約12個の陽性クローンを得、それぞれのコロニー
よりプラスミドを調製、5alt消化し目的の約2.5
Kbp断片であることを11i度同−プローブのサザン
ハイプリダイゼーションで確認した(pAl)C250
)、この2.5Kbp断片は5alIで切り出し回収し
た後、M13ファージmp9Saltサイトへ挿入した
。このファージ感染体より両方向に挿入されたクローン
をとり、両クローンに対してDNaselにより欠除体
(d a l e t ion体)を作製し、両方向か
らのダイデオキシ法による塩基配列決定を行なった。
これより、この断片上にAPI成熟蛋白質をコードする
領域がすべて含まれていることが確認されたが、API
が分泌蛋白質であるにもかかわらず、シグナル配列を見
出せないこと1.いくつかあるMetの前にSD配列が
見出せないことより。
領域がすべて含まれていることが確認されたが、API
が分泌蛋白質であるにもかかわらず、シグナル配列を見
出せないこと1.いくつかあるMetの前にSD配列が
見出せないことより。
枠内(Ln frama)の可能性が考えられた。
グ
完全なAPI遺伝子をクローニングする目的で、アクロ
モバクタ−リティカスM497−1iのゲノムDNAが
BamHIで消化され、サザンハイプリダイゼーシゴン
が行なわれた。プローブとして(3)で得られたPAP
C250の5alI消化断片である2、5Kbp断片が
〔α32p)dCTPを用いたニックトランスレーショ
ンによりラベルされ使用された。
モバクタ−リティカスM497−1iのゲノムDNAが
BamHIで消化され、サザンハイプリダイゼーシゴン
が行なわれた。プローブとして(3)で得られたPAP
C250の5alI消化断片である2、5Kbp断片が
〔α32p)dCTPを用いたニックトランスレーショ
ンによりラベルされ使用された。
オートラジオグラム上で検出されるl 5Kb pに相
当する領域を同様に泳動したゲルより切り出し、DNA
断片を回収した。これらの断片はPACY C184に
挿入され、約1000個の形質転換体をライブラリーと
して同じプローブを用いコロニーハイブリダイゼーショ
ンを行なった結果、1個の陽性クローンが得られた(p
AI’W150)、これよりプラスミドを調製、Bam
HI消化し、目的の約15Kbpの断片であることを同
一プローブのサザンハイプリダイゼーションで確認、1
5Kbp断片が回収された。
当する領域を同様に泳動したゲルより切り出し、DNA
断片を回収した。これらの断片はPACY C184に
挿入され、約1000個の形質転換体をライブラリーと
して同じプローブを用いコロニーハイブリダイゼーショ
ンを行なった結果、1個の陽性クローンが得られた(p
AI’W150)、これよりプラスミドを調製、Bam
HI消化し、目的の約15Kbpの断片であることを同
一プローブのサザンハイプリダイゼーションで確認、1
5Kbp断片が回収された。
(5)15Kbp BamHI断片からの600bp
EcoRI断片のサブクローニング(3)で得られ
た2、5Kbp 5ail断片に続く領域を持つDN
A断片を得るために、2゜5Kbp断片よりプローブと
するDNA断片が調製された。配列分析の結果、2.5
Kbr+断片中には1ケ所だけEcoRIのサイトが確
認されていたので、pAPc250を5ale/Ec。
EcoRI断片のサブクローニング(3)で得られ
た2、5Kbp 5ail断片に続く領域を持つDN
A断片を得るために、2゜5Kbp断片よりプローブと
するDNA断片が調製された。配列分析の結果、2.5
Kbr+断片中には1ケ所だけEcoRIのサイトが確
認されていたので、pAPc250を5ale/Ec。
R1で消化し、得られる2断片のうち蛋白質N末端側に
わたる100bp EcoR[/5all断片を回収
した8次いで、この断片の5″末端リン酸基をバクチリ
アルアルカリンホスファターゼ(Bactarial
Alkaline Phosphatase)で除去し
、これを〔γ−3″P)ATPでオリゴヌクレオチドと
同様にラベルしてプローブとした。
わたる100bp EcoR[/5all断片を回収
した8次いで、この断片の5″末端リン酸基をバクチリ
アルアルカリンホスファターゼ(Bactarial
Alkaline Phosphatase)で除去し
、これを〔γ−3″P)ATPでオリゴヌクレオチドと
同様にラベルしてプローブとした。
15Kbp BamHI断片20μgはEc。
Rfで消化されサザンハイプリダイゼーションが行なわ
れた。この時0.lX5sc、o、1%SDS溶液での
洗浄は50℃で行なった。
れた。この時0.lX5sc、o、1%SDS溶液での
洗浄は50℃で行なった。
オートラジオグラム上で約600bpの位置にバンドが
出現したので、15Kb P断片のEc。
出現したので、15Kb P断片のEc。
R1消化物の6%ポリアクリルアミド電気泳動を行なっ
たゲルより、これに相当するバンドを切り出し溶出し、
M13ファージmp9へ挿入した。
たゲルより、これに相当するバンドを切り出し溶出し、
M13ファージmp9へ挿入した。
両方向挿入クローンをとり、塩基配列の決定を行った。
この結果、プローブとしたEcoR[−8ail断片
100bpの配列も確認された。後に、この600bp
EcoRI断片はptJc9へ移された(pAPN
600)。
100bpの配列も確認された。後に、この600bp
EcoRI断片はptJc9へ移された(pAPN
600)。
実施例2(第3図)
D API全 伝 の構築
(6)API全遺伝子を有するプラスミドの構築API
全遺伝子を持つプラスミドの製造は第3図の如く行なわ
れた。
全遺伝子を持つプラスミドの製造は第3図の如く行なわ
れた。
■pAPc250をEcciRIで切断し、プラスミド
上のEcoRIサイトと挿入DNA断片中のEco
R1サイトの間にはさまれた部分を取り去り、5′末端
リン酸基をバクチリアルアルカリンホスファターゼによ
り除去した。
上のEcoRIサイトと挿入DNA断片中のEco
R1サイトの間にはさまれた部分を取り去り、5′末端
リン酸基をバクチリアルアルカリンホスファターゼによ
り除去した。
■pAPN600をEco R1で切断し、プラスミ
ドよりEcoR1挿入断片を分離、回収した。
ドよりEcoR1挿入断片を分離、回収した。
■と■を連結し、API全領域を持つプラスミドが構築
された。なお、EcoRI断片の挿入方向はプラスミド
上にあるPvu■制限サイトす入断片中にあるPvun
、5ailを利用して消化断片の大きさで確認した。
された。なお、EcoRI断片の挿入方向はプラスミド
上にあるPvu■制限サイトす入断片中にあるPvun
、5ailを利用して消化断片の大きさで確認した。
実施例3(第4図)
DAPI 仏子 の構
pAFL1300をPvullで消化し、0.8%アガ
ロースゲルから約1.7Kbp断片を回収した0次いで
、この断片をCf r 135で消化し。
ロースゲルから約1.7Kbp断片を回収した0次いで
、この断片をCf r 135で消化し。
混合物のままでT4DNAポリメラーゼで末端を平滑化
した。この断片に87−Ncalリンカ−GCCATG
GCを結合した。Ncolリンカ−上のこの断片をEc
oRI、Naolで消化し目的とするNcol−Eco
RI断片(■)を得た。
した。この断片に87−Ncalリンカ−GCCATG
GCを結合した。Ncolリンカ−上のこの断片をEc
oRI、Naolで消化し目的とするNcol−Eco
RI断片(■)を得た。
PAPC250ti−EcoRI/Ncolで消化し、
約1.8KbのEcoR[−Nco [(■)を0.8
%アガロースゲルから回収した。
約1.8KbのEcoR[−Nco [(■)を0.8
%アガロースゲルから回収した。
発現ベクターであるPKK233−2をNe。
1で消化し、5°末端のリン酸基をバクチリアルアルカ
リンホスファターゼで除去した。
リンホスファターゼで除去した。
断片■、■、pKK233−2を結合し、APIの発現
プラスミドpKYN200を得た。Nco1断片の挿入
の方向性はEcoRI (ベクター側に一ケ所、挿入
断片に一ケ所)、Hindlll(ベクター側に一ケ所
)の消化で出現する断片の大きさで確認した。
プラスミドpKYN200を得た。Nco1断片の挿入
の方向性はEcoRI (ベクター側に一ケ所、挿入
断片に一ケ所)、Hindlll(ベクター側に一ケ所
)の消化で出現する断片の大きさで確認した。
この発現のシステムは第5図に示すようなものである0
図中、アがアクロモバクタ−由来遺伝子であり、イの部
分にあるMetで始まる翻訳は矢印の部分で終結する。
図中、アがアクロモバクタ−由来遺伝子であり、イの部
分にあるMetで始まる翻訳は矢印の部分で終結する。
−度終結した翻訳は、SDを利用して再びへのMetか
ら始められ、API蛋白質を生産する。
ら始められ、API蛋白質を生産する。
実施例4
E、coli UT481はIon一種であり(Lo
n=プロテアーゼLa:ATP依存プロテアーゼ)、産
物の分解がある程度抑えられるものと考えられた。
n=プロテアーゼLa:ATP依存プロテアーゼ)、産
物の分解がある程度抑えられるものと考えられた。
pKYN200のE、coli UT481への形質転
換体を一夜100 /A g / m lのアンピシリ
ンを含む培地中で前培養し、250m1の同じ培地に2
.5ml加え25℃で24時間培養した。
換体を一夜100 /A g / m lのアンピシリ
ンを含む培地中で前培養し、250m1の同じ培地に2
.5ml加え25℃で24時間培養した。
培養液より集菌した菌体よりオスモティック ショック
方法(Os+wotic 5hock procedu
re)(ウィルスキー、ジー アール(Willsky
、 G、 It、)等、ジャーナルオブバクテリオロジ
イ−(J、 Bactsriol、)127595−6
09(1976))によりペリプラズム蛋白質を抽出し
た。この蛋白質溶液を10mMTris−HCI p
H9,5で平衡化したQAEセファデックスA−50(
IX40■)に吸着させた後、500mMまでのNaC
1リニアーグラジェントをかけ溶出させた。60〜65
mMで溶出されたピークを分取し、10mM Tris
−HC1pH8,0に対し透析した後、凍結乾燥した。
方法(Os+wotic 5hock procedu
re)(ウィルスキー、ジー アール(Willsky
、 G、 It、)等、ジャーナルオブバクテリオロジ
イ−(J、 Bactsriol、)127595−6
09(1976))によりペリプラズム蛋白質を抽出し
た。この蛋白質溶液を10mMTris−HCI p
H9,5で平衡化したQAEセファデックスA−50(
IX40■)に吸着させた後、500mMまでのNaC
1リニアーグラジェントをかけ溶出させた。60〜65
mMで溶出されたピークを分取し、10mM Tris
−HC1pH8,0に対し透析した後、凍結乾燥した。
凍結乾燥した粗蛋白は2mlの水に溶解し、TSKゲル
2000SWカラムを用いたHPLCによるゲルろ過で
最終精製を行なった。HPLCの条件は流速0.7ml
/分、バッフy−0,2M酢酸アンモニウム、pH7,
0であった。
2000SWカラムを用いたHPLCによるゲルろ過で
最終精製を行なった。HPLCの条件は流速0.7ml
/分、バッフy−0,2M酢酸アンモニウム、pH7,
0であった。
培養1&IQ当り1.6mgのAPI類(第1図のアミ
ノ酸配列1〜448位に相当するもの)が生成し、上記
の方法により約0.5■の精製標品を得た。この標品は
成熟API(第1図のアミノ着配列1〜268位に相当
するもの)の60%の比活性を示し、腸炎ビブリオ由来
へモリジンの消化物の分析からLys−X結合を特異的
に加水分解することが判明した。また単離したAPI類
のN末端23残基は標準Δ1)I(市販品、天然品)の
それと完全に一致し、アミノ酸組成は第1表に示すとお
り1位のグリシンから448位のグリシンに至るペプチ
ド鎖の組成とよく一致した。また分子鼠4.8万は計算
値4.6万とほぼ一致した。
ノ酸配列1〜448位に相当するもの)が生成し、上記
の方法により約0.5■の精製標品を得た。この標品は
成熟API(第1図のアミノ着配列1〜268位に相当
するもの)の60%の比活性を示し、腸炎ビブリオ由来
へモリジンの消化物の分析からLys−X結合を特異的
に加水分解することが判明した。また単離したAPI類
のN末端23残基は標準Δ1)I(市販品、天然品)の
それと完全に一致し、アミノ酸組成は第1表に示すとお
り1位のグリシンから448位のグリシンに至るペプチ
ド鎖の組成とよく一致した。また分子鼠4.8万は計算
値4.6万とほぼ一致した。
第1表 アミノ酸組成
sp
h r
e r
Lu
Pr。
ty
La
a1
e t
1e
L e u
yr
he
Lys
Hi s
r g
53゜
56゜
51 。
22゜
25゜
51 。
45゜
26゜
3゜
15゜
19 。
13゜
13゜
10゜
8゜
15゜
第1図はAPI類をコードするDNAを包含するDNA
配列、およびそれに対応するアミ2ノ酸配列である。 第2図は本発明におけるAPI類をコードするDNAの
クローニングの過程を示すフローチャートである。 第3図はAPI類全長全長遺伝子築図であり、第4図は
API類遺伝子発現系の構築図である。 第5図は本発明におけるAPI類発現のシステムの概略
を示す図である。
配列、およびそれに対応するアミ2ノ酸配列である。 第2図は本発明におけるAPI類をコードするDNAの
クローニングの過程を示すフローチャートである。 第3図はAPI類全長全長遺伝子築図であり、第4図は
API類遺伝子発現系の構築図である。 第5図は本発明におけるAPI類発現のシステムの概略
を示す図である。
Claims (12)
- (1)アクロモバクタープロテアーゼ I 類をコードす
るDNAを含有するDNA。 - (2)アクロモバクタープロテアーゼ I 類をコードす
るDNAが第1図の387位から2348位の塩基配列
で表わされる請求項1記載のDNA。 - (3)アクロモバクタープロテアーゼ I 類をコードす
るDNAがアクロモバクターリティカスM497−1の
染色体DNA由来のDNAである、請求項1または2記
載のDNA。 - (4)請求項1、2または3記載のDNAを、アクロモ
バクタープロテアーゼ I 類を発現させるように、発現
用ベクターに構築した組み換えDNA。 - (5)第1図における354位から2414位の塩基配
列で表わされるDNAを発現用ベクターに構築した請求
項4記載の組み換えDNA。 - (6)請求項4もしくは5記載のDNAを保持する形質
転換体。 - (7)形質転換体の宿主が大腸菌である請求項6記載の
形質転換体。 - (8)請求項6または7記載の形質転換体を培養し、培
養物中にアクロモバクタープロテアーゼ I 類を生成蓄
積せしめ、これを採取することを特徴とする、該アクロ
モバクタープロテアーゼ I 類の製造法。 - (9)部位特異的変異により改変した請求項8記載のア
クロモバクタープロテアーゼ I 類の製造法。 - (10)アクロモバクタープロテアーゼ I 類蛋白質。
- (11)第1図のアミノ酸配列における1〜268位で
表わされる請求項10記載のアクロモバクタープロテア
ーゼ I 蛋白質。 - (12)第1図のアミノ酸配列における1〜269位乃
至1〜448位で表わされる請求項10記載のアクロモ
バクタープロテアーゼ I 類蛋白質。
Priority Applications (9)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP05972689A JP3205331B2 (ja) | 1989-03-14 | 1989-03-14 | アクロモバクタープロテアーゼi類遺伝子及びその遺伝子産物 |
| US07/482,266 US5248599A (en) | 1989-03-14 | 1990-02-20 | Achromobacter protease i gene and gene product thereof |
| CA002011378A CA2011378C (en) | 1989-03-14 | 1990-03-02 | Achromobacter protease i gene and gene product thereof |
| DE69027466T DE69027466T2 (de) | 1989-03-14 | 1990-03-03 | Achromobacter-Protease-I-Gen sowie Genprodukt |
| DK90104163.2T DK0387646T3 (da) | 1989-03-14 | 1990-03-03 | Achromobacter-protease I-gen og genprodukt deraf |
| EP90104163A EP0387646B1 (en) | 1989-03-14 | 1990-03-03 | Achromobacter protease I gene and gene product thereof |
| AT90104163T ATE139568T1 (de) | 1989-03-14 | 1990-03-03 | Achromobacter-protease-i-gen sowie genprodukt |
| ES90104163T ES2088911T3 (es) | 1989-03-14 | 1990-03-03 | Gen de la proteasa i de achromobacter y el producto de este gen. |
| GR960402170T GR3020790T3 (en) | 1989-03-14 | 1996-08-14 | Achromobacter protease I gene and gene product thereof |
Applications Claiming Priority (1)
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Family
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| EP (1) | EP0387646B1 (ja) |
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| DE (1) | DE69027466T2 (ja) |
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| ES (1) | ES2088911T3 (ja) |
| GR (1) | GR3020790T3 (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5693318A (en) * | 1996-07-15 | 1997-12-02 | Basf Corporation | Stable salicylic acid and peroxide containing skin and hair cleanser composition |
Families Citing this family (8)
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|---|---|---|---|---|
| US6171823B1 (en) * | 1994-12-09 | 2001-01-09 | Novo Nordisk A/S | Process for producing extracellular proteins in bacteria |
| WO1997033984A1 (en) * | 1996-03-12 | 1997-09-18 | Novo Nordisk A/S | Novel achromobacter lyticus protease variants |
| US6455678B1 (en) * | 1996-04-26 | 2002-09-24 | Amcell Corporation | Human hematopoietic stem and progenitor cell antigen |
| US6753155B1 (en) * | 1997-05-13 | 2004-06-22 | The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Army | Protein biomarker for mustard chemical injury |
| US6485956B1 (en) * | 2000-07-14 | 2002-11-26 | Immunex Corporation | Testis-specific human SVPH1-8 proteinase |
| DE69930370T2 (de) * | 1998-01-14 | 2006-10-12 | Immunex Corp., Seattle | Testisspezifische, menschliche proteinase, svph1-8 |
| ATE332373T1 (de) * | 1998-08-21 | 2006-07-15 | Immunex Corp | Menschlisches il-1 epsilon dna und polypeptide |
| CN116334050B (zh) * | 2019-11-20 | 2024-02-02 | 珠海联邦制药股份有限公司 | 人工设计的赖氨酰内切酶及编码序列和发酵方法 |
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|---|---|---|---|---|
| US4624926A (en) * | 1981-01-02 | 1986-11-25 | The Research Foundation Of State University Of New York | Novel cloning vehicles for polypeptide expression in microbial hosts |
| JPS5959189A (ja) * | 1982-09-28 | 1984-04-04 | Wako Pure Chem Ind Ltd | 新規なアルカリプロテア−ゼ |
-
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- 1989-03-14 JP JP05972689A patent/JP3205331B2/ja not_active Expired - Lifetime
-
1990
- 1990-02-20 US US07/482,266 patent/US5248599A/en not_active Expired - Lifetime
- 1990-03-02 CA CA002011378A patent/CA2011378C/en not_active Expired - Lifetime
- 1990-03-03 AT AT90104163T patent/ATE139568T1/de not_active IP Right Cessation
- 1990-03-03 ES ES90104163T patent/ES2088911T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1990-03-03 DE DE69027466T patent/DE69027466T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1990-03-03 DK DK90104163.2T patent/DK0387646T3/da active
- 1990-03-03 EP EP90104163A patent/EP0387646B1/en not_active Expired - Lifetime
-
1996
- 1996-08-14 GR GR960402170T patent/GR3020790T3/el unknown
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5693318A (en) * | 1996-07-15 | 1997-12-02 | Basf Corporation | Stable salicylic acid and peroxide containing skin and hair cleanser composition |
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| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP0387646B1 (en) | 1996-06-19 |
| US5248599A (en) | 1993-09-28 |
| GR3020790T3 (en) | 1996-11-30 |
| EP0387646A1 (en) | 1990-09-19 |
| DE69027466T2 (de) | 1997-01-23 |
| DK0387646T3 (da) | 1996-09-16 |
| CA2011378C (en) | 1999-10-26 |
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| ES2088911T3 (es) | 1996-10-01 |
| CA2011378A1 (en) | 1990-09-14 |
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| ATE139568T1 (de) | 1996-07-15 |
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