JPH03180179A - 人工ジスルフィド結合を持つ大腸菌リボヌクレアーゼh - Google Patents

人工ジスルフィド結合を持つ大腸菌リボヌクレアーゼh

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JPH03180179A
JPH03180179A JP32023089A JP32023089A JPH03180179A JP H03180179 A JPH03180179 A JP H03180179A JP 32023089 A JP32023089 A JP 32023089A JP 32023089 A JP32023089 A JP 32023089A JP H03180179 A JPH03180179 A JP H03180179A
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ribonuclease
cysteine
mutant
coli
amino acid
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JP32023089A
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Chieko Katsuta
勝田 知恵子
Shigenori Kanetani
茂則 金谷
Morio Ikehara
池原 森男
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TANPAKU KOGAKU KENKYUSHO KK
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TANPAKU KOGAKU KENKYUSHO KK
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 [産業上の利用分野] 本発明は、還元型変異大腸菌リボヌクレアーゼH1該変
異酵素をコードしている遺伝子、該遺伝子を含有し、大
腸菌内で発現可能な発現ベクター該発現ベクターを含有
している形質転換体および該形質転換体を用いて還元型
変異大腸菌リボヌクレアーゼHを製造する方法、及び還
元型変異大腸菌リボヌクレアーゼHをグルタチオンレド
ックスバッファーで処理し分子内にS−8結合を導入す
ることにより得られる酸化型変異大腸菌リボヌクレアー
ゼHに関するものである。
大腸菌のリボヌクレアーゼH(以下、本明細書では単に
リボヌクレアーゼH1またはRNaseHと称する)は
155アミノ酸からなる分子量約17Kdの加水分解酵
素であって、DNA−RNAハイブリッドのRNA鎖の
みを特異的にエンド作用で切断するという基質特異性を
有する。この酵素は、その基質特異性に基づき、下記の
如き様々な用途を有し、極めて利用価値の高い酵素とし
て注目されている。
1)cDNAのクローニングの際の鋳型mRNAの除去
2)mRNAのポリA領域の除去。
3)RNAの断片化。
リボヌクレアーゼHの重要性は遺伝子工学の発展に伴っ
てますます増大すると思われるが、この酵素は、大腸菌
内での産生量が極めて低いことから、組換えDNA技術
による該酵素の生産が試みられており、既にBRL、フ
ァルマシアおよび宝酒造等から、組換えDNA技術によ
り生産されたリボヌクレアーゼHが供給されている。こ
れらの市販の組換えリボヌクレアーゼHは、大腸菌を宿
主として生産されるものである。
一般にRNAの構造解析をおこなう時、塩基特異性のあ
るヌクレアーゼで部分消化してRNAの断片を得るが、
DNA/RNAハイブリッドのRNAだけをエンド作用
で切るという特異性を有するR N aseHにとって
も、反応条件をコントロールできれば、そのようなRN
Aの断片化が可能となる。ただし、望ましい切断を得る
ためには酵素作用の活性化および不活性化を調節するこ
とが必要となる。なぜなら、反応物を分析している間に
反応が進んでは困るからである。D N A/RN A
ハイブリッドの切断を部分消化でとめるには、現在ED
TAの添加または加熱処理などがおこなわれている。し
かし、加熱法ではD N A/RN Aハイブリッドが
ほどけてしまい、もう−度酵素を添加してそれを切るこ
とが困難となる。又EDTAで停止した場合、本酵素は
活性発現にM1+を要求するため、再活性化のために、
加えるMg!+濃度のコントロールが困難になる。従っ
て、EDTA添加または加熱法にかわる反応停止系の開
発が望まれている。さらに、この反応停止系が可逆的で
あるならば本酵素を再添加することなしに、その環境を
変化させただけで酵素活性の発現および停止を調節でき
るという点で上記部分消化によるRNAの断片化等に極
めて有用となると期待される。
上記の観点から、本発明者らは、lysozyme(リ
ゾチーム)へのSS結合導入による酵素活性の調節(マ
ツムラ及ヒマシユーズ、サイエンス、243.792−
794、[1989])を参考に、RNaseHに、S
−S結合を導入し、それによって酵素活性を調節するこ
とを目的に、該酵素の遺伝子に部位特異的突然変異を導
入して、アミノ酸置換を有する変異体を調製し、S−8
結合の導入を試みた。その結果、第44番目のA sn
(アスパラギン)がCys(システィン)、第63およ
び第133番目のCys(システィン)が、Ala(ア
ラニン)で置換されたアミノ酸配列を有する変異RNa
seHは、還元状態では活性を有し、酸化状態では第3
番目のCygと第44番目のCysとの間にS−3架橋
が形成されて活性を失うことを見出し、本発明を完成す
るに至った。
即ち、本発明の目的の1つは、第44番目のアスパラギ
ンがシスティンで、第63および第133番目のシステ
ィンがアラニンで置換されたアミノ酸配列を有する還元
型変異りボヌクレアーゼHを提供するものである。また
本発明は、リボヌクレアーゼH構造遺伝子のA sn”
をコードしているAACが部位特異的突然変異によって
CysをコードしているTGCに、cys”をコードし
ているTGCがAlaをコードしているGCCに、更に
C75133をコードしているTGTがAlaをコード
しているOCTに変換されている、還元型変異りボヌク
レアーゼH遺伝子を提供するものである。
更に本発明は、還元型変異りボヌクレアーゼHを大腸菌
で発現させるための発現ベクターであって、tacプロ
モーターの支配下に上記変異りボヌクレアーゼH遺伝子
を含有しているベクターを提供するものである。本発明
の発現ベクターは、プラスミドpUc1B由来の複製起
源を含有しているので、大腸菌内で複製可能である。
また本発明は、上記の発現ベクターで形質転換された、
変異りボヌクレアーゼH産生性の形質転換体を提供する
ものである。更に本発明は、該形質転換体を培養するこ
とによって、還元型変異りボヌクレアーゼHを製造する
方法を提供するものである。
本発明は、また、還元型変異りボヌクレアーゼHを適当
な方法、例えばグルタチオンレドックスバッファーを用
いて酸化することにより、分子内にS−8結合を導入す
ることを特徴とする酸化型変異りボヌクレアーゼHの製
造方法およびかかる方法により製造される酸化型変異り
ボヌクレアーゼHを提供するものである。
以上述べたように、本発明はりボヌクレアーゼI4をi
n  vitroで酸化すると、Cys”−Cys’番
にSS架橋が導入されて酵素は失活し、還元するとSS
架橋がはずれて酵素活性がもどるということを利用し、
本酵素の酵素活性をコントロールする手段を提供するも
のである。これにより、DNA/RNAハイブリッドの
RNAの理想的な断片化を行なうことが可能である。即
ち、本発明の変異りボヌクレアーゼHは、酸化、還元の
状態を変化させただけで酵素作用の活性化および非活性
化の調節が可能であり、従って部分消化によるRNAの
断片化等にきわめて有用である。
以下に実施例を挙げて本発明をさらに詳細に説明する。
実施例1  rnh遺伝子のM13mp19RF DN
Aへのサブクローニング rnh遺伝子源としてps K 750を用いた。プラ
スミドpsK750(10μg)を100μQの反応溶
液中、50ユニツトずつのPstlとEcoRIにより
、37°Cで1時間消化した。次いで消化物を1.5%
アガロースゲル電気泳動にかけた。rnh遺伝子を含む
820bp EcoRI −Pst I断片をエレクト
ロエリューション(電気溶出)によりアガロースゲルか
ら抽出した後、DE−52カラムクロマトグラフイーに
より精製した。エタ/−ル沈澱により回収された820
bp EcoR1−Pstl断片の量は約1μ9であっ
た。一方、プラスミドベク9−pUC19(TOYOB
O製)(2μg)を5゜μQの反応溶液中10ユニツト
ずつのPstlとEcoRIにより、37℃で1時間完
全に消化した。
消化物を0.7%アガロースゲル電気泳動にかけ、2.
7kb EcoRI−Pstl断片を820bp断片と
同様に溶出、精製した。回収率はほぼ100%であった
以上のようにして得られた820bp及び2.7kb 
EcoRI −Pst I断片それぞれ0.1μyを混
合し、20μQの反応溶液中、5ユニツトの74DNA
リガーゼ(TOYOBO製)と共に16℃で30分間反
応させ、プラスミドの環化を行なった。
次いで環化したプラスミドで大腸菌JMI 09を形質
転換し、形質転換体よりプラスミドpS K 820を
得た。
次イテ、コノプラスミドpsK820(10μ9)を1
00μQ反応溶液中、lOOユニットのHgiAIによ
り37°Cで1時間消化した。フェノール−クロロホル
ム抽出後エタ/−ル沈澱によりDNAを回収した後、2
0μQの反応溶液中、2.5ユニツトの74  DNA
ポリメラーゼを加え、37℃で15分間反応させた。6
5℃で5分間処理することにより反応を停止した後、反
応溶液を1゜5%アガロースゲル電気泳動にかけ、rn
h遺伝子を含む801bpHgiΔI断片を、820b
pEc。
R1−Pstl断片の場合と同様に溶出、精製した。
DNAの回収量は2μ2であった。一方プラスミドベク
9−pUC18(TOYOBO製)(2μy)を50μ
gの反応溶液中、IOlユニットSmalにより37°
Cで1時間完全に消化し、次いでlユニットの大腸菌ア
ルカリ性フォスファターゼを加え、更に30分間37℃
で反応させた。フェノール−クロロホルム抽出法により
反応を停止した後、DNAをエタノール沈澱により回収
した。回収率はほぼ100%であった。
以上のようにして得られた801bp Hg1A 1断
片と、S ma Iで消化した後、大腸菌アルカリ性フ
ォスファターゼで処理したpUc18.それぞれ0.1
μ2を混合し、20μQの反応溶液中、5ユニツトのT
4  DNAリガーゼと共に16°Cで300分間反応
せ、プラスミドの環化を行なった。
次いで環化したプラスミドで大腸菌JM109を形質転
換し、形質転換体よりプラスミドpKS801を得た。
次いで、このプラスミドpKs801(10μg)を1
00μgの反応溶液中、50ユニツトのEc。
RIと50ユニツトのPstIにより37℃で1時間、
完全消化し、消化物を1.5%アガロースゲル電気泳動
にかけた。rnh遺伝子を含む6oobpEcoRI 
−Pst I断片を、820bp EcoRI −Ps
tI断片の場合と同様に溶出、精製した。DNAの回収
量は約lμ9であった。一方、M13n+p19RFD
NA(タカラ酒造製)2μ2を、20μQの反応溶液中
、10ユニツトのEcoRIと10ユニツトのP+st
lにより37℃で1時間、完全に消化した。消化物を0
.7%アガロースゲル電気泳動にかけ、7.2kb E
coRI −Pst I断片を82Obp EcoRI
 −Pst I断片と同様に溶出、精製した。DNAの
回収量は約1.5μ9であった。以上のようにして得ら
れた600bp及び7.2kbEcoRI  Pstl
断片それぞれ0.1 tt9を混合し、20μgの反応
溶液中、5ユニツトの74 DNAリガーゼ(TOYO
BO製)と共に、16℃で300分間反応せ、RF  
DNAの環化を行なった。
次いで、環化したRF  DNAで大腸菌TG−1を形
質転換し、形質転換体より、M13+++p19RF 
DNAにrnh遺伝子が挿入されたM13mp19(r
nh)RF  D N Aを得た(第1図参照)。
実施例2pSS13の構築 RNaseHは13.63、および13333番目つの
遊離(free)のcysを持つが、目的の位置のS−
8結合の架橋を他のCysが妨害しないように、まずす
べてのCysをAlaに変換し、その後、目的の位置の
アミノ酸をCysに変換した。方法としては、Ml 3
mpl 9(rnh)RF DNAを、点突然変異によ
って、3つのCysをAlaに変換したM13mpl 
9(rnh −13,63,L 33A)を作製し、こ
のRF DNAを用いて、13番目のAlaをCys。
44番目のAsnをCysに変換した。こうして得られ
たMl 3a+pl 9(rnh−44C,63,13
3A)から変異RNaseH遺伝子を含むDNAフラグ
メントを切り出し、発現用プラスミドpDR600(全
容ら、特開平1−202284)に組み込み、変異型R
N aseHの発現プラスミドpss13を得た。実際
には実施例1で得たM l 3 mp 19 (rnh
)RF  DNAで形質転換した大腸菌TG−1の培養
上清からの一本鎖DNAの調製、オリゴヌクレオチドの
リン酸化およびrnh遺伝子への点突然変異の導入は、
いずれも、アマ−ジャムから市販されているキット(オ
リゴヌクレオチド ブイレフテッド インビトロ ミュ
ータゲネシス システム)を用い、添付の説明書に正確
に従って行なわれた。各プライマーは第2図に示した。
ブライマーNo、4を用いて第63番目のCysのコド
ンTGCをAlaのGCCに改変して調製した変異型リ
ボヌクレアーゼH遺伝子を含有するRF  DNAMl
 3mpl 9(rnh−63A)を作成した。次に、
このMl 3apl 9(rnh−63A)とプライ7
−No。
1および5を用いて、第13番目のCysのコドンTG
TをAlaのGCCに、又133番のCysのコドンT
GTをAlaのGCTに改変して調製した変異型RNa
seH遺伝子を含有するRF  DNA、M13mp1
9(rnh−13,63,133A)を得た。
このようにして、Cys不含のRF  DNAを作成し
たのち、目的の13および44位にCysを導入するた
めにブライマーNo、2および3を使用し、13番目の
AlaのコドンGCCをCysのTGTに、44番目の
ASNのコドンAACをCysのTGCに改変して調製
した変異RNaseH遺伝子を含有するRFDNA M
13mp19(rnh−44C,63゜133A)を作
成した。このようにして得られたM13n+p19(r
nh−44C,63,133A)とpDR600を、そ
れぞれXbaIおよび5stIIで、37℃、約1時間
消化した。M 13apl 9(rnh −44C,6
3,133A)の消化物を1.5%アガロースゲル電気
泳動にかけて、500bpのXbal−SstIIフラ
グメントを切り出し抽出した。またPDR600も同様
に、消化物を0.7%アガロースゲル電気泳動にかけて
、3.1kbのXbaI−3stnフラグメントを切り
出し抽出した。このようにして得られた500bp X
bal−8stIIフラグメント0.025 μ9と、
3. lkb Xbal −5stIIフラグメント0
.05μ9を混合し、DNAライゲーション・キット(
宝酒造)を用いて、添付の説明書に正確に従って、プラ
スミドを環化した。この環化したプラスミドで大腸菌J
MI 09を形質転換し、形質転換体よりプラスミドp
ss13を得た(第3図参照)。
上記のようにして得られた形質転換菌ニジエリシア・コ
リ(E、coli)J M 109/pS S 13は
、工業技術院微生物工業技術研究所に寄託されている(
微工研菌寄第11140号、受託日:平成元年12月5
日)。
実施例3  RNaseH(S S 13)の大腸菌に
おける生産と精製 1、形質転換体JM109/pSS、13の培養形質転
換体JM109/pss13を、80μ9のアンピシリ
ンを含むLB培地le中、37℃で振盪培養した。培養
液の濁度がクレット値で100前後まで生育した時点で
、I PTGを、最終濃度1111Mとなるように添加
し、更に4時間振盪を続けた後、集菌した。この時のク
レット値は約200、菌体の湿重量は約1.59であっ
た。
2、菌体からのりボヌクレアーゼH(S813)の抽出
、精製 得られた菌体を0.1mMEDTAを含む105Mトリ
ス塩酸緩衝液(TEXpH7,5)30村に懇濁した後
、水中で超音波処理により菌体を破砕した。l 5. 
OOOrpmで30分間、4°Cで遠心して得た遠心上
清(粗抽出液)を、TE(pH7,5)512に対して
4℃で透析した。同緩衝液で平衡化したDE−52カラ
ム(41112)およびP−11カラム(21のにこの
順序で通した。この条件下、変異型リボヌクレアーゼH
(SS13)は、DE−52カラムを素通りし、P−1
1カラムに吸着する。TE(pH7,5)4x(7、次
いでO,LM NaCl2を含むT E(pH7,5)
41112を流した後、NaCQ濃度を0.5Mまで直
線的に上昇させることによりP−11カラムから変異型
リボヌクレアーゼH(SS13)を溶出させた。変異型
リボヌクレアーゼH(SS13)を含むP−11溶出画
分を約2ytQに濃縮した後、さらに0.1M NaC
l2を含む10mM酢酸ナトリウム緩衝液(pH5,5
)で平衡化したセファクリルS−300(スーパーファ
イン)カラム(φ1.8x90cm)にかけることによ
り、変異型リボヌクレアーゼH(SS13)を精製した
。精製標品は15%5DS−PAGEで単一バンドを与
え、逆相HPLCでも単一ピークを示した。精製収量は
819/(l培養液であった。これは菌体粗抽出画分に
存在するタンパク質量の約80%に相当する。精製標品
の同定は、アクロモバクタ−プロテアーゼ■により消化
して得られるペプチドフラグメントを逆相PLCでマツ
ピングして各フラグメントピークの溶出位置を確認する
とともに、13.44位のアミノ酸を含むペプチドを分
取後アミノ酸配列分析により行った。
得られた精製標品のO,IM NaCl2を含むl○m
M酢酸ナトリウム緩衝液(pH5,5)中における20
0〜260nmでのCDスペクトルは天然型と同一であ
り、CDスペクトルで検出できるような2次構造の変化
は見られなかった。
実施例4  SS結合の導入 実施例3で得た精製標品は、そのままの状態ではジスル
フィド結合を持たなかったので、グルタチオンレドック
スバッファー(ERINK、Peters、Kim、、
 サイエンス、243,538−541(1989))
により、ジスルフィド結合を導入した。レドックスバッ
ファーは1mM酸化型グルタチオン、1mM還元型グル
タチオン、0.IMT ris(pH9、0)、ln+
M EDTA、0.2M KCQを含み、ここにRNa
seH(S S 13)を34μM添加し、30℃で4
〜5時間放置する。その後PD−10で脱塩し、バッフ
ァーをO,1MのNaCQを含む10mMAB(pH5
,5)に交換した。このような処理を行った酵素につい
て、前述と同様にペブタイドマッピングを行ったところ
、Cys13およびCys4番を含むピークが消失し、
かわって新しいピークが検出された。このピークを分取
し、アミノ酸配列分析を行ったところCys”およびC
ys“を含むそれぞれのフラグメントが1対lで得られ
た。またこの消化物にDTTを添加するとCy s l
 3およびCys44を含むそれぞれのピークが再び出
現した。このようにしてRNa5eH(S S 13)
にSS結合が導入されたことを確認した。以後、精製後
のSS架橋がかかっていない酵素を還元型5813、レ
ドックスバッファー処理によりSS架橋が導入された酵
素を酸化型5S13と命名し実験を行った。実施例4で
示した還元型および酸化型5813について、酵素活性
を以下の実験例の如くにして行い評価した。
1[f+  還元型および酸化型5S13の酵素活性の
比較 活性は、[’H]−M13DNA−RNAを基質として
用い、37℃、15分間に1 nmolのCMPを遊離
する酵素活性を1ユニツト(U)と定義した。
タンパク量は変異型リボヌクレアーゼHと天然型リボヌ
クレアーゼHとが同じ吸光係数を持つといおける吸光度
を測定することにより求めた。また、第1表で示すよう
に、酵素活性の測定用溶液中のDTTの濃度を変えて各
溶液で測定を行った。
このように、還元型5S13ではDTTの濃度をかえて
もコンスタントに天然型RNaseHに対して30〜5
0%の活性を有している。これに対して、酸化型5S1
3はDTT非存在下では、天然型に対して0.3%でほ
とんど失活しており、DTTの濃度を上げていくと、1
0mMDTTで0.7%、100++Mでは30%活性
がもどる。これは還元型の55%に達している。DTT
を希釈段階で、添加しておくと、還元型の約76%の活
性が回復する。このように5313は、酸化型で不活性
化、還元型で活性化されることが明らかになった。つま
り、本酵素は酸化・還元状態を調節するだけで酵素活性
の発現および停止を調節することができる。
第1表 活性は、[’H]−M13DNA−RNAを基質として
用いて測定した。比活性は、酵素量(ユニット)をタン
パク量(19)で割ったもので、タンパク量は091%
水溶液の280nmにおける紫外吸収が2.0として計
算した。
【図面の簡単な説明】
第1図はrnh遺伝子のMl 3mpRF  DNAへ
のサブクローニングの概略を示す模式図である。第2図
は、部位変異導入に用いたオリゴヌクレオチドの配列を
示す模式図である。第3図はプラスミドpSS13の組
立て模式図である。 1↑

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、大腸菌リボヌクレアーゼHのアミノ酸配列において
    、第44番目のアスパラギンがシステインで、第63番
    目および第133番目のシステインがアラニンで置換さ
    れたアミノ酸配列を有する還元型変異大腸菌リボヌクレ
    アーゼH。 2、請求項1に記載の還元型変異大腸菌リボヌクレアー
    ゼHをコードしている変異大腸菌リボヌクレアーゼH構
    造遺伝子。 3、大腸菌リボヌクレアーゼHをコードしている構造遺
    伝子において、対応するアミノ酸配列の第44番目のア
    スパラギンをコードするAACコドンがシステインをコ
    ードするTGCコドンに、第63番目のシステインをコ
    ードするTGCコドンが、アラニンをコードするGCC
    コドンに、第133番目のシステインをコードするTG
    TコドンがアラニンをコードするGCTコドンに部位特
    異的突然変異によって変換された請求項2に記載の変異
    大腸菌リボヌクレアーゼH構造遺伝子。 4、tacプロモーターの支配下に請求項2または3に
    記載の変異大腸菌リボヌクレアーゼH構造遺伝子を含有
    している、大腸菌内で複製および発現可能な発現ベクタ
    ー。 5、選択マーカーとしてアンピシリン耐性遺伝子を含有
    している請求項4に記載の発現ベクター。 6、プラスミドpSS13である請求項5に記載の発現
    ベクター。 7、請求項4〜6のいずれかに記載の発現ベクターで形
    質転換された形質転換体。 8、大腸菌JM109/pSS13である請求項7に記
    載の形質転換体。 9、請求項7または8に記載の形質転換体をリボヌクレ
    アーゼH遺伝子の発現に適した条件下で培養し、得られ
    た培養液から還元型変異大腸菌リボヌクレアーゼHを回
    収することからなる還元型変異大腸菌リボヌクレアーゼ
    Hの製造方法。 10、大腸菌リボヌクレアーゼHのアミノ酸配列におい
    て、第44番目のアスパラギンがシステインで、第63
    番目および第133番目のシステインがアラニンで置換
    されたアミノ酸配列を有する酸化型変異大腸菌リボヌク
    レアーゼH。 11、請求項1に記載の還元型変異大腸菌リボヌクレア
    ーゼHをグルタチオンレドックスバッファーで処理する
    ことからなる請求項10に記載の酸化型変異大腸菌リボ
    ヌクレアーゼHの製造法。
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JP32023089A Pending JPH03180179A (ja) 1989-12-08 1989-12-08 人工ジスルフィド結合を持つ大腸菌リボヌクレアーゼh

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JP (1) JPH03180179A (ja)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH053786A (ja) * 1991-06-28 1993-01-14 Tanpaku Kogaku Kenkyusho:Kk 配列特異的rna加水分解酵素

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