JPH03505209A - 標的付与されたオリゴヌクレオチド類の合成に使用できるヌクレオシド誘導体類、これ等誘導体類から得たオリゴヌクレオチド類及びそれ等の合成 - Google Patents
標的付与されたオリゴヌクレオチド類の合成に使用できるヌクレオシド誘導体類、これ等誘導体類から得たオリゴヌクレオチド類及びそれ等の合成Info
- Publication number
- JPH03505209A JPH03505209A JP1507487A JP50748789A JPH03505209A JP H03505209 A JPH03505209 A JP H03505209A JP 1507487 A JP1507487 A JP 1507487A JP 50748789 A JP50748789 A JP 50748789A JP H03505209 A JPH03505209 A JP H03505209A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- formulas
- tables
- group
- chemical formulas
- mathematical
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 title claims description 87
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 title claims description 86
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 title claims description 80
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 title claims description 52
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 title claims description 34
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 61
- 230000008685 targeting Effects 0.000 claims description 61
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 60
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 55
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 42
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims description 33
- 125000004435 hydrogen atom Chemical group [H]* 0.000 claims description 28
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 21
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 claims description 21
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 claims description 17
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 claims description 17
- -1 dimethoxytolyl group Chemical group 0.000 claims description 16
- 125000002887 hydroxy group Chemical group [H]O* 0.000 claims description 16
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 claims description 13
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 238000009833 condensation Methods 0.000 claims description 9
- 230000005494 condensation Effects 0.000 claims description 9
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 claims description 8
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 8
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 claims description 8
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 8
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 7
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 claims description 7
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 claims description 7
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 7
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims description 6
- 125000002252 acyl group Chemical group 0.000 claims description 5
- 239000011630 iodine Substances 0.000 claims description 5
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 claims description 5
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 claims description 4
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 claims description 4
- 238000010647 peptide synthesis reaction Methods 0.000 claims description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 claims description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 claims description 2
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 claims description 2
- 125000002743 phosphorus functional group Chemical group 0.000 claims description 2
- 229910052814 silicon oxide Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims 4
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 claims 3
- 125000006297 carbonyl amino group Chemical group [H]N([*:2])C([*:1])=O 0.000 claims 2
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 2
- 241000239290 Araneae Species 0.000 claims 1
- 241000277269 Oncorhynchus masou Species 0.000 claims 1
- 229930189851 creoside Natural products 0.000 claims 1
- 241000894007 species Species 0.000 claims 1
- RAHZWNYVWXNFOC-UHFFFAOYSA-N sulfur dioxide Inorganic materials O=S=O RAHZWNYVWXNFOC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 38
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 28
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 27
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 22
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical compound C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 22
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylformamide Chemical compound CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 20
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 20
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 15
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 15
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 12
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 12
- OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N cytosine Chemical compound NC=1C=CNC(=O)N=1 OPTASPLRGRRNAP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 239000000047 product Substances 0.000 description 12
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 11
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 11
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 11
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 description 10
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 229940104302 cytosine Drugs 0.000 description 9
- 239000012153 distilled water Substances 0.000 description 8
- VOVZXURTCKPRDQ-CQSZACIVSA-N n-[4-[chloro(difluoro)methoxy]phenyl]-6-[(3r)-3-hydroxypyrrolidin-1-yl]-5-(1h-pyrazol-5-yl)pyridine-3-carboxamide Chemical compound C1[C@H](O)CCN1C1=NC=C(C(=O)NC=2C=CC(OC(F)(F)Cl)=CC=2)C=C1C1=CC=NN1 VOVZXURTCKPRDQ-CQSZACIVSA-N 0.000 description 8
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 8
- 229940126214 compound 3 Drugs 0.000 description 7
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 7
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 7
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 7
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 7
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 description 7
- AOSZTAHDEDLTLQ-AZKQZHLXSA-N (1S,2S,4R,8S,9S,11S,12R,13S,19S)-6-[(3-chlorophenyl)methyl]-12,19-difluoro-11-hydroxy-8-(2-hydroxyacetyl)-9,13-dimethyl-6-azapentacyclo[10.8.0.02,9.04,8.013,18]icosa-14,17-dien-16-one Chemical compound C([C@@H]1C[C@H]2[C@H]3[C@]([C@]4(C=CC(=O)C=C4[C@@H](F)C3)C)(F)[C@@H](O)C[C@@]2([C@@]1(C1)C(=O)CO)C)N1CC1=CC=CC(Cl)=C1 AOSZTAHDEDLTLQ-AZKQZHLXSA-N 0.000 description 6
- 229940126657 Compound 17 Drugs 0.000 description 6
- UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N guanine Chemical compound O=C1NC(N)=NC2=C1N=CN2 UYTPUPDQBNUYGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 6
- 239000000377 silicon dioxide Substances 0.000 description 6
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 6
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 6
- 230000001360 synchronised effect Effects 0.000 description 6
- RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N thymine Chemical compound CC1=CNC(=O)NC1=O RWQNBRDOKXIBIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N (1s,2s,3s,5r)-1-(carboxymethyl)-3,5-bis[(4-phenoxyphenyl)methyl-propylcarbamoyl]cyclopentane-1,2-dicarboxylic acid Chemical compound O=C([C@@H]1[C@@H]([C@](CC(O)=O)([C@H](C(=O)N(CCC)CC=2C=CC(OC=3C=CC=CC=3)=CC=2)C1)C(O)=O)C(O)=O)N(CCC)CC(C=C1)=CC=C1OC1=CC=CC=C1 SZUVGFMDDVSKSI-WIFOCOSTSA-N 0.000 description 5
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 5
- KCBAMQOKOLXLOX-BSZYMOERSA-N CC1=C(SC=N1)C2=CC=C(C=C2)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]3C[C@H](CN3C(=O)[C@H](C(C)(C)C)NC(=O)CCCCCCCCCCNCCCONC(=O)C4=C(C(=C(C=C4)F)F)NC5=C(C=C(C=C5)I)F)O Chemical compound CC1=C(SC=N1)C2=CC=C(C=C2)[C@H](C)NC(=O)[C@@H]3C[C@H](CN3C(=O)[C@H](C(C)(C)C)NC(=O)CCCCCCCCCCNCCCONC(=O)C4=C(C(=C(C=C4)F)F)NC5=C(C=C(C=C5)I)F)O KCBAMQOKOLXLOX-BSZYMOERSA-N 0.000 description 5
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 5
- 125000004429 atom Chemical group 0.000 description 5
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 5
- 229940125904 compound 1 Drugs 0.000 description 5
- 229940126543 compound 14 Drugs 0.000 description 5
- 229940125833 compound 23 Drugs 0.000 description 5
- 229940125898 compound 5 Drugs 0.000 description 5
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 5
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 5
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 5
- PHNDUXLWAVSUAL-SHYZEUOFSA-N 1-[(2r,4s,5r)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-4-sulfanylidenepyrimidin-2-one Chemical compound C1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1N1C(=O)NC(=S)C=C1 PHNDUXLWAVSUAL-SHYZEUOFSA-N 0.000 description 4
- PISWNSOQFZRVJK-XLPZGREQSA-N 1-[(2r,4s,5r)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methyl-2-sulfanylidenepyrimidin-4-one Chemical compound S=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 PISWNSOQFZRVJK-XLPZGREQSA-N 0.000 description 4
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N Ammonia Chemical compound N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229940125773 compound 10 Drugs 0.000 description 4
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 4
- ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N jdtic Chemical compound C1([C@]2(C)CCN(C[C@@H]2C)C[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H]2NCC3=CC(O)=CC=C3C2)=CC=CC(O)=C1 ZLVXBBHTMQJRSX-VMGNSXQWSA-N 0.000 description 4
- 150000003254 radicals Chemical class 0.000 description 4
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 4
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 4
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 4
- 235000012239 silicon dioxide Nutrition 0.000 description 4
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 4
- DZGWFCGJZKJUFP-UHFFFAOYSA-N tyramine Chemical compound NCCC1=CC=C(O)C=C1 DZGWFCGJZKJUFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- WWTBZEKOSBFBEM-SPWPXUSOSA-N (2s)-2-[[2-benzyl-3-[hydroxy-[(1r)-2-phenyl-1-(phenylmethoxycarbonylamino)ethyl]phosphoryl]propanoyl]amino]-3-(1h-indol-3-yl)propanoic acid Chemical compound N([C@@H](CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)C(=O)O)C(=O)C(CP(O)(=O)[C@H](CC=1C=CC=CC=1)NC(=O)OCC=1C=CC=CC=1)CC1=CC=CC=C1 WWTBZEKOSBFBEM-SPWPXUSOSA-N 0.000 description 3
- QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N (3S)-3-[[(2S)-2-[[(2S)-2-[5-[(3aS,6aR)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoylamino]-3-methylbutanoyl]amino]-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]-4-[1-bis(4-chlorophenoxy)phosphorylbutylamino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound CCCC(NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@H](Cc1ccc(O)cc1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)CCCCC1SC[C@@H]2NC(=O)N[C@H]12)C(C)C)P(=O)(Oc1ccc(Cl)cc1)Oc1ccc(Cl)cc1 QFLWZFQWSBQYPS-AWRAUJHKSA-N 0.000 description 3
- IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N (3S,8S,10R,13S,14S,17S)-17-isoquinolin-7-yl-N,N,10,13-tetramethyl-2,3,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-amine Chemical compound CN(C)[C@H]1CC[C@]2(C)C3CC[C@@]4(C)[C@@H](CC[C@@H]4c4ccc5ccncc5c4)[C@@H]3CC=C2C1 IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N 0.000 description 3
- QIVUCLWGARAQIO-OLIXTKCUSA-N (3s)-n-[(3s,5s,6r)-6-methyl-2-oxo-1-(2,2,2-trifluoroethyl)-5-(2,3,6-trifluorophenyl)piperidin-3-yl]-2-oxospiro[1h-pyrrolo[2,3-b]pyridine-3,6'-5,7-dihydrocyclopenta[b]pyridine]-3'-carboxamide Chemical compound C1([C@H]2[C@H](N(C(=O)[C@@H](NC(=O)C=3C=C4C[C@]5(CC4=NC=3)C3=CC=CN=C3NC5=O)C2)CC(F)(F)F)C)=C(F)C=CC(F)=C1F QIVUCLWGARAQIO-OLIXTKCUSA-N 0.000 description 3
- UNILWMWFPHPYOR-KXEYIPSPSA-M 1-[6-[2-[3-[3-[3-[2-[2-[3-[[2-[2-[[(2r)-1-[[2-[[(2r)-1-[3-[2-[2-[3-[[2-(2-amino-2-oxoethoxy)acetyl]amino]propoxy]ethoxy]ethoxy]propylamino]-3-hydroxy-1-oxopropan-2-yl]amino]-2-oxoethyl]amino]-3-[(2r)-2,3-di(hexadecanoyloxy)propyl]sulfanyl-1-oxopropan-2-yl Chemical compound O=C1C(SCCC(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)COCC(=O)N[C@@H](CSC[C@@H](COC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)OC(=O)CCCCCCCCCCCCCCC)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CO)C(=O)NCCCOCCOCCOCCCNC(=O)COCC(N)=O)CC(=O)N1CCNC(=O)CCCCCN\1C2=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C2CC/1=C/C=C/C=C/C1=[N+](CC)C2=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C2C1 UNILWMWFPHPYOR-KXEYIPSPSA-M 0.000 description 3
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229930024421 Adenine Natural products 0.000 description 3
- GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N Adenine Chemical compound NC1=NC=NC2=C1N=CN2 GFFGJBXGBJISGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OPFJDXRVMFKJJO-ZHHKINOHSA-N N-{[3-(2-benzamido-4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)-pyrazol-5-yl]carbonyl}-G-dR-G-dD-dD-dD-NH2 Chemical compound S1C(C=2NN=C(C=2)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CCCN=C(N)N)C(=O)NCC(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](CC(O)=O)C(N)=O)=C(C)N=C1NC(=O)C1=CC=CC=C1 OPFJDXRVMFKJJO-ZHHKINOHSA-N 0.000 description 3
- RWRDLPDLKQPQOW-UHFFFAOYSA-N Pyrrolidine Chemical compound C1CCNC1 RWRDLPDLKQPQOW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LNUFLCYMSVYYNW-ZPJMAFJPSA-N [(2r,3r,4s,5r,6r)-2-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[[(3s,5s,8r,9s,10s,13r,14s,17r)-10,13-dimethyl-17-[(2r)-6-methylheptan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1h-cyclopenta[a]phenanthren-3-yl]oxy]-4,5-disulfo Chemical compound O([C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1[C@@H](COS(O)(=O)=O)O[C@H]([C@@H]([C@H]1OS(O)(=O)=O)OS(O)(=O)=O)O[C@@H]1C[C@@H]2CC[C@H]3[C@@H]4CC[C@@H]([C@]4(CC[C@@H]3[C@@]2(C)CC1)C)[C@H](C)CCCC(C)C)[C@H]1O[C@H](COS(O)(=O)=O)[C@@H](OS(O)(=O)=O)[C@H](OS(O)(=O)=O)[C@H]1OS(O)(=O)=O LNUFLCYMSVYYNW-ZPJMAFJPSA-N 0.000 description 3
- WREOTYWODABZMH-DTZQCDIJSA-N [[(2r,3s,4r,5r)-3,4-dihydroxy-5-[2-oxo-4-(2-phenylethoxyamino)pyrimidin-1-yl]oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl] phosphono hydrogen phosphate Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)O[C@H]1N(C=C\1)C(=O)NC/1=N\OCCC1=CC=CC=C1 WREOTYWODABZMH-DTZQCDIJSA-N 0.000 description 3
- 229960000643 adenine Drugs 0.000 description 3
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 3
- 125000003236 benzoyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C(*)=O 0.000 description 3
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229940125758 compound 15 Drugs 0.000 description 3
- 229940125782 compound 2 Drugs 0.000 description 3
- 229940125810 compound 20 Drugs 0.000 description 3
- 108010041382 compound 20 Proteins 0.000 description 3
- 229940126086 compound 21 Drugs 0.000 description 3
- 229940126208 compound 22 Drugs 0.000 description 3
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 3
- 238000001704 evaporation Methods 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- JAXFJECJQZDFJS-XHEPKHHKSA-N gtpl8555 Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)N[C@H](B1O[C@@]2(C)[C@H]3C[C@H](C3(C)C)C[C@H]2O1)CCC1=CC=C(F)C=C1 JAXFJECJQZDFJS-XHEPKHHKSA-N 0.000 description 3
- 125000000623 heterocyclic group Chemical group 0.000 description 3
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 description 3
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 3
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 3
- 229940113082 thymine Drugs 0.000 description 3
- 229940045145 uridine Drugs 0.000 description 3
- 239000000052 vinegar Substances 0.000 description 3
- 235000021419 vinegar Nutrition 0.000 description 3
- AVKSPBJBGGHUMW-XLPZGREQSA-N 1-[(2r,4s,5r)-4-hydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]-5-methyl-4-sulfanylidenepyrimidin-2-one Chemical compound O=C1NC(=S)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 AVKSPBJBGGHUMW-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- ONBQEOIKXPHGMB-VBSBHUPXSA-N 1-[2-[(2s,3r,4s,5r)-3,4-dihydroxy-5-(hydroxymethyl)oxolan-2-yl]oxy-4,6-dihydroxyphenyl]-3-(4-hydroxyphenyl)propan-1-one Chemical compound O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@H]1OC1=CC(O)=CC(O)=C1C(=O)CCC1=CC=C(O)C=C1 ONBQEOIKXPHGMB-VBSBHUPXSA-N 0.000 description 2
- VWCUMTCXBIRRSG-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro(diphenyl)methyl]-2-methoxybenzene Chemical compound COC1=CC=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 VWCUMTCXBIRRSG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RSIWALKZYXPAGW-NSHDSACASA-N 6-(3-fluorophenyl)-3-methyl-7-[(1s)-1-(7h-purin-6-ylamino)ethyl]-[1,3]thiazolo[3,2-a]pyrimidin-5-one Chemical compound C=1([C@@H](NC=2C=3N=CNC=3N=CN=2)C)N=C2SC=C(C)N2C(=O)C=1C1=CC=CC(F)=C1 RSIWALKZYXPAGW-NSHDSACASA-N 0.000 description 2
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 description 2
- 235000007836 Chlorogalum pomeridianum Nutrition 0.000 description 2
- 240000006670 Chlorogalum pomeridianum Species 0.000 description 2
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N Morpholine Chemical compound C1COCCN1 YNAVUWVOSKDBBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020005187 Oligonucleotide Probes Proteins 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Chemical compound OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N Phosphine Chemical compound P XYFCBTPGUUZFHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N Sulfuric acid Chemical compound OS(O)(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical group OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 description 2
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 description 2
- 125000003282 alkyl amino group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001412 amines Chemical group 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000009895 amole Substances 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N atomic oxygen Chemical compound [O] QVGXLLKOCUKJST-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 229940126142 compound 16 Drugs 0.000 description 2
- 150000004985 diamines Chemical class 0.000 description 2
- UAOMVDZJSHZZME-UHFFFAOYSA-N diisopropylamine Chemical compound CC(C)NC(C)C UAOMVDZJSHZZME-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 150000002148 esters Chemical class 0.000 description 2
- 230000008020 evaporation Effects 0.000 description 2
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 2
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 2
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 2
- PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N iodine Chemical compound II PNDPGZBMCMUPRI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 2
- VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N methane Chemical compound C VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PSHKMPUSSFXUIA-UHFFFAOYSA-N n,n-dimethylpyridin-2-amine Chemical compound CN(C)C1=CC=CC=N1 PSHKMPUSSFXUIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AYOOGWWGECJQPI-NSHDSACASA-N n-[(1s)-1-(5-fluoropyrimidin-2-yl)ethyl]-3-(3-propan-2-yloxy-1h-pyrazol-5-yl)imidazo[4,5-b]pyridin-5-amine Chemical compound N1C(OC(C)C)=CC(N2C3=NC(N[C@@H](C)C=4N=CC(F)=CN=4)=CC=C3N=C2)=N1 AYOOGWWGECJQPI-NSHDSACASA-N 0.000 description 2
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 2
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 description 2
- 239000002751 oligonucleotide probe Substances 0.000 description 2
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 2
- 239000001301 oxygen Substances 0.000 description 2
- IZUPBVBPLAPZRR-UHFFFAOYSA-N pentachlorophenol Chemical compound OC1=C(Cl)C(Cl)=C(Cl)C(Cl)=C1Cl IZUPBVBPLAPZRR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000001147 pentyl group Chemical group C(CCCC)* 0.000 description 2
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 2
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 2
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 2
- 125000000561 purinyl group Chemical group N1=C(N=C2N=CNC2=C1)* 0.000 description 2
- BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N pyrene Chemical compound C1=CC=C2C=CC3=CC=CC4=CC=C1C2=C43 BBEAQIROQSPTKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229920006395 saturated elastomer Polymers 0.000 description 2
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 2
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-N sodium;hydron;carbonate Chemical compound [Na+].OC(O)=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 2
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 description 2
- KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N succinic acid Chemical compound OC(=O)CCC(O)=O KDYFGRWQOYBRFD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N succinimide Chemical compound O=C1CCC(=O)N1 KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000002730 succinyl group Chemical group C(CCC(=O)*)(=O)* 0.000 description 2
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 2
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 2
- 229960003732 tyramine Drugs 0.000 description 2
- YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N (2,5-dioxopyrrolidin-1-yl) 5-[(3as,4s,6ar)-2-oxo-1,3,3a,4,6,6a-hexahydrothieno[3,4-d]imidazol-4-yl]pentanoate Chemical compound C([C@H]1[C@H]2NC(=O)N[C@H]2CS1)CCCC(=O)ON1C(=O)CCC1=O YMXHPSHLTSZXKH-RVBZMBCESA-N 0.000 description 1
- BIIBYWQGRFWQKM-JVVROLKMSA-N (2S)-N-[4-(cyclopropylamino)-3,4-dioxo-1-[(3S)-2-oxopyrrolidin-3-yl]butan-2-yl]-2-[[(E)-3-(2,4-dichlorophenyl)prop-2-enoyl]amino]-4,4-dimethylpentanamide Chemical compound CC(C)(C)C[C@@H](C(NC(C[C@H](CCN1)C1=O)C(C(NC1CC1)=O)=O)=O)NC(/C=C/C(C=CC(Cl)=C1)=C1Cl)=O BIIBYWQGRFWQKM-JVVROLKMSA-N 0.000 description 1
- GHYOCDFICYLMRF-UTIIJYGPSA-N (2S,3R)-N-[(2S)-3-(cyclopenten-1-yl)-1-[(2R)-2-methyloxiran-2-yl]-1-oxopropan-2-yl]-3-hydroxy-3-(4-methoxyphenyl)-2-[[(2S)-2-[(2-morpholin-4-ylacetyl)amino]propanoyl]amino]propanamide Chemical compound C1(=CCCC1)C[C@@H](C(=O)[C@@]1(OC1)C)NC([C@H]([C@@H](C1=CC=C(C=C1)OC)O)NC([C@H](C)NC(CN1CCOCC1)=O)=O)=O GHYOCDFICYLMRF-UTIIJYGPSA-N 0.000 description 1
- NYNZQNWKBKUAII-KBXCAEBGSA-N (3s)-n-[5-[(2r)-2-(2,5-difluorophenyl)pyrrolidin-1-yl]pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]-3-hydroxypyrrolidine-1-carboxamide Chemical compound C1[C@@H](O)CCN1C(=O)NC1=C2N=C(N3[C@H](CCC3)C=3C(=CC=C(F)C=3)F)C=CN2N=C1 NYNZQNWKBKUAII-KBXCAEBGSA-N 0.000 description 1
- 125000003088 (fluoren-9-ylmethoxy)carbonyl group Chemical group 0.000 description 1
- CBRJPFGIXUFMTM-WDEREUQCSA-N 1-[(2S,5R)-2-methyl-5-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-ylamino)piperidin-1-yl]prop-2-en-1-one Chemical compound N1=CN=C(C2=C1NC=C2)N[C@@H]2CC[C@@H](N(C2)C(C=C)=O)C CBRJPFGIXUFMTM-WDEREUQCSA-N 0.000 description 1
- JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 1-[chloro-(4-methoxyphenyl)-phenylmethyl]-4-methoxybenzene Chemical compound C1=CC(OC)=CC=C1C(Cl)(C=1C=CC(OC)=CC=1)C1=CC=CC=C1 JBWYRBLDOOOJEU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UHDGCWIWMRVCDJ-UHFFFAOYSA-N 1-beta-D-Xylofuranosyl-NH-Cytosine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OLXZPDWKRNYJJZ-RRKCRQDMSA-N 2'-deoxyadenosine Chemical class C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](CO)O1 OLXZPDWKRNYJJZ-RRKCRQDMSA-N 0.000 description 1
- FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 2-(chloromethyl)pyridine-3-carbonitrile Chemical compound ClCC1=NC=CC=C1C#N FALRKNHUBBKYCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DILISPNYIVRDBP-UHFFFAOYSA-N 2-[3-[2-(2-hydroxypropylamino)pyrimidin-4-yl]-2-naphthalen-2-ylimidazol-4-yl]acetonitrile Chemical compound OC(CNC1=NC=CC(=N1)N1C(=NC=C1CC#N)C1=CC2=CC=CC=C2C=C1)C DILISPNYIVRDBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DWKNOLCXIFYNFV-HSZRJFAPSA-N 2-[[(2r)-1-[1-[(4-chloro-3-methylphenyl)methyl]piperidin-4-yl]-5-oxopyrrolidine-2-carbonyl]amino]-n,n,6-trimethylpyridine-4-carboxamide Chemical compound CN(C)C(=O)C1=CC(C)=NC(NC(=O)[C@@H]2N(C(=O)CC2)C2CCN(CC=3C=C(C)C(Cl)=CC=3)CC2)=C1 DWKNOLCXIFYNFV-HSZRJFAPSA-N 0.000 description 1
- FOYWCEUVVIHJKD-UHFFFAOYSA-N 2-methyl-5-(1h-pyrazol-5-yl)pyridine Chemical compound C1=NC(C)=CC=C1C1=CC=NN1 FOYWCEUVVIHJKD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZSLUVFAKFWKJRC-IGMARMGPSA-N 232Th Chemical compound [232Th] ZSLUVFAKFWKJRC-IGMARMGPSA-N 0.000 description 1
- YXNIEZJFCGTDKV-JANFQQFMSA-N 3-(3-amino-3-carboxypropyl)uridine Chemical compound O=C1N(CCC(N)C(O)=O)C(=O)C=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 YXNIEZJFCGTDKV-JANFQQFMSA-N 0.000 description 1
- RKVHNYJPIXOHRW-UHFFFAOYSA-N 3-bis[di(propan-2-yl)amino]phosphanyloxypropanenitrile Chemical compound CC(C)N(C(C)C)P(N(C(C)C)C(C)C)OCCC#N RKVHNYJPIXOHRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004080 3-carboxypropanoyl group Chemical group O=C([*])C([H])([H])C([H])([H])C(O[H])=O 0.000 description 1
- UXHQLGLGLZKHTC-CUNXSJBXSA-N 4-[(3s,3ar)-3-cyclopentyl-7-(4-hydroxypiperidine-1-carbonyl)-3,3a,4,5-tetrahydropyrazolo[3,4-f]quinolin-2-yl]-2-chlorobenzonitrile Chemical compound C1CC(O)CCN1C(=O)C1=CC=C(C=2[C@@H]([C@H](C3CCCC3)N(N=2)C=2C=C(Cl)C(C#N)=CC=2)CC2)C2=N1 UXHQLGLGLZKHTC-CUNXSJBXSA-N 0.000 description 1
- HFGHRUCCKVYFKL-UHFFFAOYSA-N 4-ethoxy-2-piperazin-1-yl-7-pyridin-4-yl-5h-pyrimido[5,4-b]indole Chemical compound C1=C2NC=3C(OCC)=NC(N4CCNCC4)=NC=3C2=CC=C1C1=CC=NC=C1 HFGHRUCCKVYFKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FZLSDZZNPXXBBB-KDURUIRLSA-N 5-chloro-N-[3-cyclopropyl-5-[[(3R,5S)-3,5-dimethylpiperazin-1-yl]methyl]phenyl]-4-(6-methyl-1H-indol-3-yl)pyrimidin-2-amine Chemical compound C[C@H]1CN(Cc2cc(Nc3ncc(Cl)c(n3)-c3c[nH]c4cc(C)ccc34)cc(c2)C2CC2)C[C@@H](C)N1 FZLSDZZNPXXBBB-KDURUIRLSA-N 0.000 description 1
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonium chloride Substances [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VCYUZUSHFPKBPD-UHFFFAOYSA-N CC(C)[NH2+]C(C)C.[O-]C(=O)C1=NN=NN1 Chemical compound CC(C)[NH2+]C(C)C.[O-]C(=O)C1=NN=NN1 VCYUZUSHFPKBPD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QDHHCQZDFGDHMP-UHFFFAOYSA-N Chloramine Chemical compound ClN QDHHCQZDFGDHMP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- UHDGCWIWMRVCDJ-PSQAKQOGSA-N Cytidine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 1
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 108090000626 DNA-directed RNA polymerases Proteins 0.000 description 1
- 102000004163 DNA-directed RNA polymerases Human genes 0.000 description 1
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 1
- OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N Hydrazine Chemical compound NN OAKJQQAXSVQMHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000026350 Inborn Genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- ABLZXFCXXLZCGV-UHFFFAOYSA-N Phosphorous acid Chemical compound OP(O)=O ABLZXFCXXLZCGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OAICVXFJPJFONN-OUBTZVSYSA-N Phosphorus-32 Chemical compound [32P] OAICVXFJPJFONN-OUBTZVSYSA-N 0.000 description 1
- 108091081062 Repeated sequence (DNA) Proteins 0.000 description 1
- 108091028664 Ribonucleotide Proteins 0.000 description 1
- UIIMBOGNXHQVGW-DEQYMQKBSA-M Sodium bicarbonate-14C Chemical class [Na+].O[14C]([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-DEQYMQKBSA-M 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical class [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229910052776 Thorium Inorganic materials 0.000 description 1
- MCRWZBYTLVCCJJ-DKALBXGISA-N [(1s,3r)-3-[[(3s,4s)-3-methoxyoxan-4-yl]amino]-1-propan-2-ylcyclopentyl]-[(1s,4s)-5-[6-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-2,5-diazabicyclo[2.2.1]heptan-2-yl]methanone Chemical compound C([C@]1(N(C[C@]2([H])C1)C(=O)[C@@]1(C[C@@H](CC1)N[C@@H]1[C@@H](COCC1)OC)C(C)C)[H])N2C1=CC(C(F)(F)F)=NC=N1 MCRWZBYTLVCCJJ-DKALBXGISA-N 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 125000002777 acetyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 239000012190 activator Substances 0.000 description 1
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 description 1
- VVJKKWFAADXIJK-UHFFFAOYSA-N allylamine Natural products NCC=C VVJKKWFAADXIJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910000147 aluminium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 1
- 150000008064 anhydrides Chemical class 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 1
- 125000003710 aryl alkyl group Chemical group 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001615 biotins Chemical class 0.000 description 1
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 238000012824 chemical production Methods 0.000 description 1
- 238000004040 coloring Methods 0.000 description 1
- 229940125797 compound 12 Drugs 0.000 description 1
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 1
- 239000004020 conductor Substances 0.000 description 1
- 125000004093 cyano group Chemical group *C#N 0.000 description 1
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 description 1
- UHDGCWIWMRVCDJ-ZAKLUEHWSA-N cytidine Chemical group O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-ZAKLUEHWSA-N 0.000 description 1
- 125000001295 dansyl group Chemical group [H]C1=C([H])C(N(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=C2C([H])=C([H])C([H])=C(C2=C1[H])S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 230000006866 deterioration Effects 0.000 description 1
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 1
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 1
- 238000001035 drying Methods 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 1
- GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N fluoranthrene Natural products C1=CC(C2=CC=CC=C22)=C3C2=CC=CC3=C1 GVEPBJHOBDJJJI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000016361 genetic disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 229940029575 guanosine Drugs 0.000 description 1
- 238000010438 heat treatment Methods 0.000 description 1
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- BHEPBYXIRTUNPN-UHFFFAOYSA-N hydridophosphorus(.) (triplet) Chemical group [PH] BHEPBYXIRTUNPN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 description 1
- 125000000959 isobutyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 description 1
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 1
- ZYQPNKHEEHSDCO-UHFFFAOYSA-N n-[[di(propan-2-yl)amino]-ethoxyphosphanyl]-n-propan-2-ylpropan-2-amine Chemical compound CCOP(N(C(C)C)C(C)C)N(C(C)C)C(C)C ZYQPNKHEEHSDCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001971 neopentyl group Chemical group [H]C([*])([H])C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 description 1
- 150000004713 phosphodiesters Chemical class 0.000 description 1
- 150000003008 phosphonic acid esters Chemical class 0.000 description 1
- PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N phosphoramidic acid Chemical compound NP(O)(O)=O PTMHPRAIXMAOOB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N phosphoric acid Substances OP(O)(O)=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003014 phosphoric acid esters Chemical class 0.000 description 1
- 150000003016 phosphoric acids Chemical class 0.000 description 1
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 1
- 229940097886 phosphorus 32 Drugs 0.000 description 1
- 229910000073 phosphorus hydride Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000003386 piperidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 1
- 239000012451 post-reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 1
- 150000003142 primary aromatic amines Chemical class 0.000 description 1
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 1
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- IGFXRKMLLMBKSA-UHFFFAOYSA-N purine Chemical compound N1=C[N]C2=NC=NC2=C1 IGFXRKMLLMBKSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001725 pyrenyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 description 1
- 238000010791 quenching Methods 0.000 description 1
- 230000000171 quenching effect Effects 0.000 description 1
- 239000012429 reaction media Substances 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 239000002336 ribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002652 ribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 150000003336 secondary aromatic amines Chemical class 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000010898 silica gel chromatography Methods 0.000 description 1
- 229910052710 silicon Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010703 silicon Substances 0.000 description 1
- HRZFUMHJMZEROT-UHFFFAOYSA-L sodium disulfite Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S(=O)S([O-])(=O)=O HRZFUMHJMZEROT-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 235000010262 sodium metabisulphite Nutrition 0.000 description 1
- 239000001384 succinic acid Substances 0.000 description 1
- 229940014800 succinic anhydride Drugs 0.000 description 1
- 229960002317 succinimide Drugs 0.000 description 1
- BDHFUVZGWQCTTF-UHFFFAOYSA-M sulfonate Chemical compound [O-]S(=O)=O BDHFUVZGWQCTTF-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 125000000472 sulfonyl group Chemical group *S(*)(=O)=O 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 238000010189 synthetic method Methods 0.000 description 1
- 150000003513 tertiary aromatic amines Chemical group 0.000 description 1
- 150000003536 tetrazoles Chemical group 0.000 description 1
- 150000005691 triesters Chemical class 0.000 description 1
- 125000004044 trifluoroacetyl group Chemical group FC(C(=O)*)(F)F 0.000 description 1
- LZTRCELOJRDYMQ-UHFFFAOYSA-N triphenylmethanol Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(O)C1=CC=CC=C1 LZTRCELOJRDYMQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N triphenylmethyl chloride Chemical compound C=1C=CC=CC=1C(C=1C=CC=CC=1)(Cl)C1=CC=CC=C1 JBWKIWSBJXDJDT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002221 trityl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1C([*])(C1=C(C(=C(C(=C1[H])[H])[H])[H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C1[H] 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- 238000001291 vacuum drying Methods 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/06—Pyrimidine radicals
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H19/00—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
- C07H19/02—Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
- C07H19/04—Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
- C07H19/16—Purine radicals
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
標的付与されたオリゴヌクレオチド類の合成に使用できるヌクレオシド誘導体類
、これ等誘導体類から得たオリゴヌクレオチド類及びそれ等の合成
〔産業上の利用分野〕
本発明と標的付与され(marked)或いは標識付けされた(labbele
d)オリゴヌクレオチド類の合成に使用するヌクレオシド類の誘導体類並びにこ
れ等誘導体類から得たオリゴヌクレオチド類及びそれ等の合成に関する。
標的付与されたオリゴヌクレオチド類例えば核酸消息子(pr−obe)類は遺
伝子の及び感染症の病気、癌及び細胞型の決定のような種々の分野で非常に興味
ある診断手段となっている。
これ等の診断手段はハイブリダイゼーション法の利用、すなわち、2本の相補的
な核酸鎖(DNA或いはRNA)の水素結合による会合の利用に基づいている。
それ故この反応は2本のDNA鎖、DNA鎖とRNA鎖或いは2本のRNA[に
間する反応である。該反応を通じて、チミン(或いはRNAの場合にはウラシル
)はアデニンと対を形成し、シトシンはグアニンと対を形成する。該二重鎖ら線
の形成はpH、ナトリウムイオン濃度、反応温度及び反応時間のような物理化学
的要素によって影響をうける0診断法に用いる場合標的すなわち決定さるべき生
物学的試料の配列と相補的な配列を持つオリゴヌクレオチド消息子を利用する。
更に消息子を探し当てるために、消息子には適当な標識付与或いは標的付与をす
る要素を付ける。この要素は放射線的に、免疫酵素的に、発色的に、蛍光的ある
いは発光的な方法によって探し当てることができる。
非放射線的標的付与を利用する場合には、消息子を利用する前に化学的或いは生
化学的生成法を用いて標的付与したヌクレオチド消息子を直接的に合成すること
ができる。しかしながら、標的付与を放射線的におこなう場合には、消息子に標
的付与要素を導入することは即座的におこなわなければならない。
標的付与されたオリゴヌクレオチド類を作るための生化学的生成法にあって、ラ
ンガー等は自然科学アカデミ−協会専門誌(米国)生化学部門1981.11月
号78巻第11号6633〜6637頁(L−anger et al: Pr
oc、Natl、Acad、 Sci、USA、 vol、 7B+ no、
11゜pp6633〜6637. November 198L Bioche
mistry )において、種々のDNA或いはRNAポリメラーゼ類を用いて
ポリヌクレオチドにビオチンを用いて標的付与をする作成法とビオチンがウラシ
ル部分にアリルアミン結合を用いて連結されている。ウラシル部分を含んでいる
ヌクレオシド誘導体を作成する方法とについて記載している。この方法はしかし
短かい消息子頻にts識づけする場合には適しないというのが重大な欠点である
。
ムラスギ等は核酸3巻第3号269〜277頁(1984) (DNA。
vol、3.no、3.1984. pp、269〜277 )に、大腸菌(E
schericbiacoli)のDNAポリメラーゼIの存在下にウリジン三
燐酸のビオチン化誘導体を含んでいる2つのオリゴヌクレオチドと3つのヌクレ
オシド誘導体の反応を利用してビオチンで標的付与されたオリゴヌクレオチド消
息子類を作成することを記載している。ここで2つのオリゴヌクレオチドを用い
て反応する場合に一つを大過剰に用いることには興味がある。更に、標的付与或
いは標識付与の収率は、オリゴヌクレオチド消息子の中に一箇ある。
ヨーロンパ特許公開第063879号公報[EP−A−063879)(エール
大学)にはプリンの8位或いはピリミジンの5位が、ポリペプチドを用いて検出
できる錯体形成能のある基(radical)で置換されているプリン或いはピ
リミジンを含有しているヌクレオシドの誘導体について記載している。この誘導
体は酵素的に重合するオリゴヌクレオチドの合成に使用することができる。
国際特許公開−〇−880593[flo−A−880593] (バストウー
ル研究所(Institute Pa5teur))にはアデノここの8位にビ
オチン化した2′−デオキシアデノシン誘導体が記載されている。
この誘導体もまた酵素的オリゴヌクレオチドに組み込むことができる。
先の場合と同様、この誘導体もオリゴヌクレオチドの3′の位置にしか標的付与
ができない。更にこの誘導体は自動ヌクレオチド合成機では取扱えない。
ビオチン化ヌクレオチドは酵素学手法65巻43〜62頁(1980)(Met
hods in Enzymology、 vol、65.1980. pp、
43〜62)にウー(wu)によって記載されている方法に従ってデオキシヌク
レオチジル基転移酵素で移動する末端を用いて組み込むことができる。
この方法は短鎖のオリゴヌクレオチド消息子に(一般に3箇から5箇の)ビオチ
ンを組み込むことができるので興味深い方法である。この標識付与には、オリゴ
ヌクレオチド合成に続いて副次的過程が必要である。種々の大きさの生成物の複
雑な混合物が得られるので、明らかに一定の融点を持つ消息子を得るように分離
しなければならないので明らかに一定数の標的付与基が組み込まれた消息子を作
成するのがむづかしい。二重に標的付与或いは標識付与をおこなうことはずっと
困難なことであると思われる。更に標的付与はやはり3′位置にしかできない。
化学的方法にあって、合成が終り、オリゴヌクレオチドの保護基をはづした後に
鎖の末端で標的付与をおこなう方法がある。
この方法はオリゴヌクレオチドの酵素側(Oside)部分に核酸研究誌−13
巻第5号1529〜1540頁(1985) l:Nucleic Ac1ds
Re5ea−rch、 vol、13. no、5.1985. pp152
9 1540)にA、CholleLによって記載されている方法で標的付与基
を固定する方法である。
この方法を使用することはオリゴヌクレオチド当り単一の標的付与分子を固定す
るように導き、オリゴヌクレオチド合成に引続いて、該標的付与基を付ける付加
的な化学反応段階が必要であるという主要な欠点を持っている。オリゴヌクレオ
チドに結合している標的付与基の数を増すために、合成し、その保護基をはずし
た後オリゴヌクレオチド基に標的付与基を結合するために、ローデュ(Rodu
it)等がヌクレオシド及びヌクレオチド誌6 (1+2>巻349〜352頁
(1987) (Nucleosides & Nucleot−4des、
6 (1+2)、pp、349〜352.1987 〕に記載している方法
に従って工夫がなされて来た。この場合数ケの標的付与基を結合することができ
るが、オリゴヌクレオチド類の決ったヌクレオチドの上に異った標的付与基を確
定的に結合することはできていない、更にその上標的付与の効率は60%以下に
留まっている。
ビオチンを標的付与基にしたオリゴヌクレオチドを作成する今一つの方法がキル
チェク(Kierzek)等によってヌクレオシド及びヌクレオチド6 (1+
2)巻403〜4o5頁(19187) [Nucleos−jdes & N
ucleotides、 6 (1+2)、 I)I)403−405.19
87 )及び国際特許公開−〇−8606726 (同−A−8606726)
に記載されている。
この場合には、オリゴヌクレオシド合成はオリゴヌクレオチド合成中に使用した
機能性を持つヌクレオシド誘導体並びにシチジンに結合している−(CHり 、
−Nu−R結合(Rはトルフルオロ酢酸基のような保護基を表わす)を持つヌク
レオシド誘導体を利用してオリゴヌクレオチド合成をおこなう。
合成の終点で、保護基はづしをおこなった後にビオチンをレチジン結合のところ
組み込む方法であるから参照した公知文献にあるように違って標的付与基を使用
することはできない、同じように、オリゴヌクレオチド合成を終了して保護基を
はづしてから種々の化学反応をおこなう必要がある。この化学反応はオリゴヌク
レオチド合成装置にかけて自動で反応をおこなうことはできない。
国際特許公開−〇−8403285号四〇−A−8403285]に標識付与し
たオリゴヌクレオシドの製造法が記載されている。この場合ヌクレオシドの誘導
体から出発している。このヌクレオシドの塩基には標的付与基と反応することが
できる置換基があり、標的付与はオリゴヌクレオチド合成の次におこなわれる。
加えるにタック等の文献核酸研究16巻第9号4077〜4095号(1988
) [Nucleic Ac1ds Re5earch、 vol、 16+
no、9+ 1988゜pp、4077−4095)に示されるように、オリ
ゴヌクレオチド合成の前或いは後どちらでもビオチンを導入する2捧の方法があ
るけれども、ビオチンと、オリゴヌクレオチド合成に使用する反応薬との間に不
都合な反応が起り昌いので合成の後でおこなうことを推せんする。
従って標的付与或いは標識付与したオリゴヌクレオチドの合成として現実によく
知られている製造法ではよい条件の下でもオリゴヌクレオド鎖の完全に決まって
いる位置に、特に5′の位置に、1つ或いはそれ以上の標的付与基分子を導入す
ること及び異った標的付与基によって鎖の標的付与をおこなうことはできない。
更に、多くの場合現実に、オリゴヌクレオチド合成をおこなった後で補助的に反
応する必要があるという不利益な要求が起り、そのため標的付与するオリゴヌク
レオチドの直接合成が自動的にはおこなえなくなる。
本発明は上記した合成法の欠点を回避し得る、標的付与されたオリゴヌクレオチ
ド類の合成に有用なヌクレオド類の誘導体に関するものである。
それ故事発明は特に下記の式に合致する特徴を有する標的付与されたオリゴヌク
レオチドの合成に有用なヌクレオシド誘導体に関する。
図において
R1は水素原子或いはヌクレオチド合成に適する酸性媒体中で不安定な基を表わ
し、
R2は水素原子、保護基、オリゴヌクレオチド合成に適する機能性基、或いは酸
素原子をはさんで結合しているオリゴヌクレオチド合成に有用な支持体(sup
port)を表わし、R3は水素原子、水酸基或いは保護された水酸基を表わし
、Bは次の式で表わされるプリン或いはピリミジン塩基から誘導される基を表わ
す。
図において
R5はH,CHs、或いはR’Zを表わし、Rhは水素原子或いはR’Z群を表
わし、弐Bで表わされる基は弐■の基の位置し或いは弐■、及びVの基の9位置
でNによって酸素側部分に向って結合しているR4は一重結合或いは次の式で表
わされる各基から選ばれた炭化水素基を表わす。
N)I (CRt)、1−X−(CL) 、−NH(C)Iz)−−X−(C)
Iz)p−NH−0−(CHz)−−X−(CHt) p−−0−(CH,)、
−X−(CHl)、−Nl(−5−(CHt) 、1−X−(CHり p−5−
(CHt) −−X−(C)It) p−No−−NHCO−(C)12)、−
X−(C)1g)p−−NHCO−(C)lりj−X−(CHり、−NH−NH
3Ot−(CHz) 、1−X−(CHz) p−−N)IsO□−(Cut)
、−X−(CHz)−NH−=(CHI) 、X−(CHz) p−−(CH
2)、−X−(CH2)p−NH−CO−(CHz)R−X−(CHz)p−C
D−(C)I2)−−X−(CHt) p−NH−ここでnは1から6の間の整
数、pは0か或いは1から6の整数、pはOから或いは1から6の整数、XはC
Hz 、O5S、NHlCOlHC= C)I−1(CI(t)−Z 、 (C
Hz)rNHz 、 :;C=Ctl(CL)rZ 。
;C=CH(CHり、NH2、/N(CM、)、Z 、ンN(CHz)−NHz
、;CH−0(CH2)、Z 、 ンC1l−0−(C1h)、No2 、 ;
HC5(C)1m)、Z 。
Ic5(CHz)、NoZ 、ここで
rは1から6の整数である。
Zはペブチッド合成に有用な保護基、或いは標的付与基として有用な分子群から
選ばれた標的付与をする分子、及び該分子の先駆体から誘導される基、
ZはR2が結合長さを伸ばす腕部分を持つ結合を有する支持体である時は保護基
を表わすと定められている。
それ放光に参照したヌクレオシド誘導体は、種々の形式の標的付与分子を付加で
きる。直接検知し得る標的付与分子を使用することも可能で、例えばそれは蛍光
或いは燐光を発する標的付与基であり、他の分子に強い親和性を持つ抗原分子或
いはその誘導体を用いることが可能である。
例えば直接的に検知し得る標的付与分子にはアビジン或いはストレフタビディン
(streptavidin)と結合し得る分子、抗原−抗体型の反応を誘起し
得る分子或いは蛍光発光或いは紫外可視光を発する性質を持つ分子などがあり得
る。
又、使用する時にその場で放射性元素を付加できる標的付与分子の使用すること
もできる。この場合、放射性原子を使用するに当って放射性原子の半減期からの
理由及び原子が誘起する放射線分解反応のために使用に当って上手くこれらの標
的付与分子を導入することは困難である。加えて、本発明の方法によれば、かか
る場合標的付与される分子として、放射性元素、例えば放射性ヨウ素を用いて、
後工程として標的付与し得る分子、そのような標的付与分子を使用する。
本発明の方法によるヌクレオシド誘導体では、他の標的付与分子を使用し得る。
特に便利なのは免疫学的分野の抗原、抗体一般的な合成法でオリゴヌクレオチド
を合成する場合に同調性基質(synthons)としてこの種のヌクレオシド
誘導体を利用することが多くの利点をもっている。
ヌクレオシドのこの種の誘導体(同調性基質)は安定で自動オリゴヌクレオチド
合成の場合にしばしば利用されている誘導体に比べ得る程の安定性を持ち、すべ
ての自動合成の操作を受けても変質することはなく市販されているヌクレオシド
誘導体を使用した場合に比べ同等遜色のない反応性を持っている。
ただ、従来技術の場合と異って本発明の誘導体は、すでに標的付与元素を付加さ
れているヌクレオシド誘導体を使用するために、通常のオリゴヌクレオチド合成
の場合のように、副次的な工程を必要とせず直接的に速やかに標識消息子を作成
することができる。このため合成操作は簡単で、最終収率がよい。
僅か6分間で標的付与分子を付加することができしかも自動反応機でおこなえる
。これに対して従来の技術では標的付与分子を付加するのに1日或いは2日が必
要である。
標的付与分子を持つ誘導体を付加する工程の収率はどの工程も100%に近い、
これに対して、従来の他の方法は収率がもっと低い、このような場合化学反応で
オリゴヌクレチドを合成した後で精製をする必要がある。
多くのオリゴヌクレオチド合成の場合と同じように、標識消息子を作成する場合
自動化することができる。
オリゴヌクレオチド鎖に何ヶの目標づけ分子をどの位置につけるかに関して、完
全に明確に決まった位置に1ヶ或いはそれ以上の標的付与分子を導入することが
できる。
更には、同じオリゴヌクレオド鎖の複数の異った標的付与分子を夫々の導入位置
に付加して、しかも高純度のオリゴヌクレオチドを得ることができる。
本発明の方法によるヌクレオシドの誘導体は、放射性原子を使用することに対し
てもよく適合する、なぜならばヌクレオチドの合成中に放射線元素で容易に標的
付与される分子をヌクレオシド誘導体に付けて、それをヌクレオチドに組み込ん
だ後、ヌクレオチドを使用する直前に放射線元素を導入し得るからである。
例えば、標的付与分子がアビジン或いはストレフタビジンと結合し得る分子であ
る時には、基Zは次に示す分子式で表わされる。
(■) (■)(■) (■)
二二でs−4,5,6或いは7、t−3,4,5,6或いは7そしてR7はアル
キル基である。
これらの基にあって、s−4の分子式(Vl)の基はビオチンから誘導され、従
ってアビジンに強い親和性をもっている。
例えば、目標づけ分子が、抗原−抗体型の反応をおこなう分子であるならば、そ
の時Zは次の式で表わされる。
例えば目標づけ分子が蛍光発光性である場合には、Zは次のXX
XXIXXn
XXIここでRI5および1716は今でも異っていてもよく、水素原
子かアルキル基である。
標的付与分子がヨードで標的付与され得る分子であるときは、1ヶ以上のフェノ
ール、或いは第1級、第2級或いは第3級の芳香族アミン機能を持つ分子を用い
る。この場合Zとして次の式に従うものを使用する。
および
ここでu=Q、あるいは1〜6の整数、V−0,1或いは2、w=3.2或いは
1但しv+w−3である。
R1は水素原子或いはアシル基
YはCHz 、NH,OlS、C01SO,、C0NH或いはSO,NHである
。
アシル基は例えばアセチル基である。
本発明では、R2が結合長さを伸ばす腕部分を持つ結合を有する支持基である時
には、Zは又R4を保護する基を表わす。この保護基はペプチド合成において使
用される保護基の一つ、例えばトルフルオロアセチル基であってよい。Fmoc
のように保護基として使用できる他の基についてローデュ(Roduit)等が
ヌクレオシド及びヌクレオチド誌6巻1号2号合併号349〜352頁1987
年(Nucleosides & Nucleotides、 1987,6
no、1and2+ pp。
349〜352.)に記載している。これらの基もまたR4が一本鎖結合である
場合に、オリゴヌクレオチド合成に当って使用できる保護基である。
かかる保護基の例としてはベンゾイル、アニソ−イル、イソブチリル基があり、
ヨーロンパ特許公開第0241363号公報(BP−A−0241363)に記
載されているものと合せて使用できる。
本発明によれば式■及び弐■の基の場合にはベンゾイル基が弐Vの基の場合には
イソブチリル基を使用することが好ましい。
本発明のヌクレオシド誘導体においては、プリン塩基或いはピリミジン塩基から
誘導される(式1における)B基は弐■及び弐Vの基の場合にはプリン塩基から
誘導される基の2.6及び/或いは8の位置にあるいくつかのR’Z基を、或い
は弐■の基の場合にはピリミジン塩基から誘導される基の4.5或いは6の位置
にあるいくつかのR’Z基を持つことができる。
本発明のヌクレオシド誘導体は特に標的付与されたヌクレオチドの合成に当って
同調的基質の型として使用することが望まれる。この場合R1基はヌクレオチド
の合成に適する酸性媒体中では不安定な基であり、R2基はヌクレオチド合成に
適するlI能性基である。R3が水素原子であるか、保護されていても、いなく
てもよく、どちらの水酸基であるかによってDNA型か或いはRNA型のオリゴ
ヌクレオチドが得られる。
R1の形として使用できる、酸性媒質中で不安定な基の例としては特にフェニル
−9−ザンテニル基及び次の式のトリチル基が挙げられる。
ここでR9、RIOおよび)1+1 は同しでも異っていてもよく、水素原子、
アルキル、アルコキシ或いはアミノ基を表わす。
R1はメトキシ−或いはジメトキシ−トリチル基、或いはR9或いはR9とRl
eがメトキシ基である式XX■で表わされる基であることが好ましい。
オリゴヌクレオチドの合成の場合にRt基がオリゴヌクレオチド合成に適する機
能的基、例えばオリゴヌクレオチドの燐酸トリエステル(phosphotri
ester)、燐酸ジエステル(phosphodi−es ter)、燐酸ア
ミド(phosphora+n1dite)或いはホスホン酸エステル(pho
sphona te)合成に使用する燐基或いは+1”Co基である。
ここでR+zは支持基に結合し易い、選択的にアルキルアミノ鎖を媒介として結
合する結合鎖を表わす。
ここで使用する燐基の例は次の式で表わされる基である。
ここでR′及びR’は、お互に関連なく別々に、炭素数10までのアルキル基、
アラルキル基或いはシクロアルキル基を表わすか、或いはR′とR′とで炭素数
5までのアルキレン鎖を形成するか或いは窒素原子と併せて、共に、ヘテロ環を
形成する、ここでヘテロ環にはN、0及びSから選ばれたヘテロ原子の1つ或い
はそれ以上を含むことができる。
R′及びR′は関連なく別々の基である時には、それ等の基はイソプロピル、L
−ブチル、イソブチル、2級ブチル、ネオペンチル、3級ペンチル、インペンチ
ル、或いは2級ペンチル基の如き低級アルキル基であることが好ましい。R′及
びR′が窒素原子と共にヘテロ環を形成する場合には、ピロリジン、モルホリン
或いはピペリジン基であることが好ましい。
例えばR2は次の式で表わされる基である。
NCCHzC)lto P N [CH(CH3) z]□オリゴヌクレオ
チドの合成に際してR2は又酸素原子と共に結合長さを伸ばす腕部分となる結合
を持っている支持体となっていることもある。
この支持体には種々の型式がある。一般的には無水珪酸で形成されており、50
〜1100uの直径に調整された粒状をしている。
伸びた腕は、支持体にヌクレオシドを固定している。この腕は例えば、コハク酸
のような二価の酸から誘導された基でヌクレオシドの酸素原子と、基とを結合す
る基のようなアルキルアミノ鎖から形成されている。
R3が保護されている水酸基である時には、リボヌクレオチドの合成に使用して
便利な基が該水酸基の保護基となっている。
R1が保護基で、R2がヌクレオチドの合成に適した機能性基である、弐(1)
の構造をもったヌクレオシドの誘導体類は、これまで説明して来たように、直接
検出できる分子或いは通常の方法で、検出できる分子に変換できる分子からなる
少くとも一ヶの標的付与分子を有する′ヌクレオチドの直接的な化学的合成をす
るのに使用できる。
この化学的オリゴヌクレオチドの製造はR2が弐(XX■)の基である時には燐
酸トリエステル合成によるか、R1が式(XX■)或いは(XXIX)の基であ
る場合には燐酸アミド合成によって、また或いはR2が式(XXX)の基である
場合にはホスホン酸合成によって製造される。この合成は溶液中でおこなう方法
か或いは支持体で合成するか何れかの方法でおこなわれるが、支持体上で合成す
る方法が選択され、現在では最もよい結果を得ている。
本発明のオリゴヌクレオチド合成法は数回の縮合サイクル(くり返し工程)を実
施することから成り、各サイクルで、ヌクレオシド誘導体がヌクレオシド誘導体
に縮合するか、オリゴヌクレオチドと縮合することから成り、少なくとも使用さ
れたヌクレオシド誘導体のうちの一つは次の式に合致するヌクレオシド誘導体で
あることに特徴がある。
ここでR1は酸性媒体中で不安定な基であり、R2はヌクレオチド合成に通した
機能性基であるか、或いは、長く伸びた腕を持つ結合で酸素原子と結合するヌク
レオチド合成に使用される支持体を表わしている。
R3は水素原子、水酸基或いは保護されて水酸基を表わしBは以下に示す意味を
有する。
本発明に従って、種々のZを持ったいくつかのヌクレオシド誘導体を、上記した
合成工程で用いた場合に、標的付与されたオリゴヌクレオチドが得られ、そこで
得られたオリゴヌクレオチドは、従来の合成技術を用いてはできなかった、種々
の標的付与基を有するオリゴヌクレオチド鎖を持っている。
加えて、本発明によって種々のヌクレオチドのくり返し単位を持ち、その単位に
は少なくとも2つのヌクレオチド単位が異った標的付与基を持っているか或いは
鎖の5′末端に位置する相隣る2つのヌクレオチドが標的付与分子で標的付与さ
れているか、或いは標的付与分子の前駆体であるような単位が含まれている標的
付与されたヌクレオチドが得られる。
、 本発明によって得たヌクレオチド誘導体はそれ故、例えばビオチン成るいは
、その類似体の一つで標的付与された、ダンシル(dansyl)或いはピレン
スルフォニルのような蛍光性誘導体或いはジニトロフェニルのような抗原性試薬
で標的付与された、冷消息子(cold probe)を作成するのに使用でき
る。
これ等のヌクレオシド誘導体はまた、標的付与する分子、或いは出発、ヌクレオ
シド誘導体に用いられている分子Zに放射性ヨードで特に標的付与できる消息子
を作成するために使用できる。
本発明のヌクレオシド誘導体はプライヤー(primers)、例えばPCR型
増巾法の合成に用いることができる。
本発明は文種々のヌクレオチドのくり返しの中に、次の式の基の中から選ばれた
基(車)で標的付与されたヌクレオチドの少くとも一つを含んでいる標的付与さ
れたオリゴヌクレオチドを得ることに関する。
ここで、U=O或いは1から6の整数
v=o、1或いは2
w=3.2或いは1で v+w+3
R8は水素原子か或いはアシル基で
YはCTo 、N)]、 OSS、 Co、 Sow、 C0NH,或いは50
,111(ここでR1は水素原子であり、u、v、w及びYは上記した値と与え
られた意味を持ち、yは1.2.3或いは4の値で、I。
は放射性ヨード原子である。
次の式で表わされる基(radical)ε0−
ここでRISとR16は同じか或いは異なり、水素原子或いはアルキル基を表わ
す、そして
次の式で表わされるピレニル基(radical) m1XIX
Xv XvXVI[XVIII X IX〔等の基
類の中から基(本)が選ばれる〕本発明は又、異ったヌクレオシドのくり返し連
結鎖を有し、そのくり返し連結鎖の少なくとも末端のうちの1つに位置する5ケ
のヌクレオシドが標的付与分子で標的付与されているか、その分子の前駆体であ
ることを特徴とする、標的付与されたオリゴヌクレオチドに関するものである。
このオリゴヌクレオチドを作成する工程は大変興味あるものである、それは連結
鎖の一つの末端の少なくとも5ケの標的付与分子が存在することが、感度を高め
るからである。
本発明によるヌクレオシド誘導体は核酸の有機化学なる書物、Part B、(
N、に、Kochetkov and E、1.Bodovski+ 1972
organicchemistry of Nucleic Acids(P
lenum、 New York )に記載されている公知の方法で合成できる
一般に、出発物質は次の式で表わされるヌクレオシド誘導体である。
ここでR1、Rt及びR3は既に上記した意味を有し、B′は次の式の基を表わ
す。
(Ill’ ) (■’ ) (V’ )こ
こでR5はH或いはCHsを表わし、先に述べたと同じ位置に対して公知の方法
を用いて1つ或いはそれ以上のR’Z基が結合される。
合成されるヌクレオシド誘導体のもつ基Bが■式の基である時、保護されている
、或いは保護されていない4−チオチミジン或いは4−チオデオキシウリジンを
出発物質として、ジアミン、置換ジアミン誘導体或いは、それが−級アミン機能
とカップリングし得る場合には、標的分子H,N−R’Zと反応させて該誘導体
を合成することができる。
後者の反応は次の反応図で表わされる。
ここでR13及び/或いはRI4は同じであっても、異っていてもよく、水素原
子或いは保護基を表わし、Rは炭化水素基すなわちR’Zである。
この反応の後ヌクレオシド誘導体をヌクレオチド合成に適するように処理し、若
し必要ならば、そして特にRが)I’Z Mでない時には1つ或いはそれ以上の
標的分子を付加する。
他の様式及び本発明の利点は次に示す実施例から明らかになるであろう。本実施
例は本発明を実証するものであり制限するものではない。
(実施例−1)
次の式で表わされるヌクレオシド誘導体(化合物−1)の合成
式(1)のうちこのヌクレオ、シト誘導体において、R1,11”及びR3は水
素原子を表わし、Bは式(I[[)の基を表わし、R5は水素原子、R6はR’
Zを表わす、又R4は−(CL) J)l−をZはヒオ−1−7から誘導される
基を表わす、ここでm=oである。
a) (化合物−2)の合成
4−チオデオキシウリジンの0.26 g (1mmo]e)を絶対エタノール
の5−に溶解し、この溶液に1.6−ジアミツヘキサンの0.58g(5ミリモ
ル)を加え、60゛Cに16時間保つ。乾燥するまで蒸発し、つづいて水のl0
KIdlとトリエチルアミンの0.2 idに溶解し、つづいて蒸発乾個する。
残渣をエチルエーテル910iを加えて4回すりつぶし操作をおこなう。残渣は
Ce1ite 545の1gに吸着させて、これを酢酸エチル−メトキシエタノ
ール−水の4=1=2の混合比の混合物の下側の相の溶液と共にCe1ite塔
内に納め、この内容物を上記混合液の上側の相の溶液で溶出し、目的製品を酢酸
エチル−n−ブタノール−水の1:1:1混合溶液の上側相の溶液で溶出する。
溶出した適当な溜升を蒸発乾個し、凍結乾燥すると(化合物−2)の220■(
収率65%)を得る。
b) (化合物−1)の合成
(化合物−2)の653■(2mmole)をジメチルフォルムアミドの15−
に溶解し、エチェチルアミン0.4d (4+as+ole)及びN−ヒドロキ
シコハク酸イミドの700■(2IIIIO1e)を加える。20”で3時間混
合した後、反応混合物を真空乾燥し、蒸溜水の151d。
と共に2回蒸発乾個し次に絶対エタノールを加えて蒸発し乾燥する。残渣をメタ
ノールに溶解(抽出)し、これに(0,2から0.5日径の)シリカゲル8gを
加え、そのまま懸濁物を真空乾燥する。先にシリカ上に吸着していたこの混合物
をシリカゲル塔(メルクゲル60)上に置き、クロロホルムとメタノールの混合
物(5から20%)溶液で濃度を漸時濃くして溶出する。かくして(化合物−1
)の740■を得る。収率は65%に相当する。
(実施例−2)
(化合物−3)の合成、この合成物は下記の式で表わされるヌクレオシド誘導体
である。
(化合物−1)の1.11 g (2m+aole)を無水ピリジン中に加熱溶
解する。この溶液を冷却し、真空乾燥する。残渣は無水のジメチルホルムアミド
の5dに溶解し、無水ピリジンの20dで稀釈する。混合物を、攪拌しなからO
″Cに冷却する。次に4,4”−ジメトキシトリチルクロライドの744■を加
える。混合物を166時間混する。この混合物にメタノール2mを加え、15分
後反応混合物を飽和の重炭酸ナトリウム水溶液の35d中に注入する。
混合物からクロロホルム50mで2回抽出をおこない、有機溶媒層(クロロホル
ム抽出物)を蒸発乾個し、トルエンの20dを加え蒸発乾個することを2回おこ
なう。
残留物はジクロロメタンで熔解(抽出)し、シリカゲルクロマトグラフ(メルク
ゲル60)法により、ジクロロメタンのメタノール濃度勾配のついた溶液で溶出
して精製した。(化合物−3)の1.38gを得た、これは81%の収率に相当
する。
(実施例−3)
本実施例では、(化合物−3)を次式で表わされる(化合物−4)から合成する
。
a) (化合物−4)の合成
ジメトキシトリチル−5′−千オー4−デオキシー2′−ウリジンの3.7g(
6,8mmole)を絶対エタノールの40d中に溶解し、これに1,6ジアミ
ノヘキサンの3.9g (34mmole)を加え、60°Cに16時間放置す
る。蒸発乾個後クロロホルムと0.INソーダ液の間に分離熔解し、有機溶媒相
を水で洗浄して中和し、つづいて蒸発乾個する。残渣をジクロロメタンに溶解(
抽出)し、メルク6シリカゲルクロマトグラフ法を用いクロロホルム中のメタノ
ール濃度を変えて溶出して精製する。(化合物−4)の3.65gを得、これは
85%の収率に相当する。
b) (化合物−°3)の合成
(化合物−4)の3.15 g (5mmole)をジメチルホルムアミドの5
0dに溶解し、この溶液にN−ジメチルヒドロキシコハク酸イミドビオチンの1
.7g(5,5mmole)とトリエチルアミン770μf(5,5mmole
)とを加える。常温で3時間撹拌後、溶媒を蒸発乾個し、残渣をクロロホルム5
00m1:4こ溶解(抽出)する。このクロロホルム溶液を10%の重炭酸ナト
リウム溶液の500dを用いて2回洗浄し、つづいて蒸溜水500−で洗浄する
。有機溶媒相を蒸発乾個する。残渣をジクロロメタンに溶解(抽出)しクロロホ
ルム溶媒中のメタノール勾配を用いた溶出をおこなうメルク60シリカゲルクロ
マトグラフをおこなう。目的製品を含む溜升を蒸発しく化合物−3)の3.2g
を得、これは75%の収率に相当する。
(実施例−4)
下記式の(化合物−5)の合成
(化合物−3)の854■(lsmole)を絶対ピリジン中で共蒸発すること
によって無水化し、続いて無水のジクロロメタンの10dに溶解する。つづいて
ジイソプロピルアンモニウムテトラゾレートの85■(0,5v+mole)
、並びにビス−(ジイソプロピルアミノ)−シアノエトキシホスフィンの341
μlを加える。この反応媒体を室温に2時間撹拌し、つづいてジクロロメタン5
0mを加える。この有機溶媒溶液を重炭酸ナトリウムの飽和水溶液の50戚で3
回洗浄して、つづいて飽和食塩水Sodで洗浄する。有機溶媒相を真空乾燥し、
残渣をジクロロメタンの5mに溶解(抽出)し、−78℃に冷却したヘキサンの
100Id中に注入して沈澱させる。この沈澱物を集め、真空乾燥する。(化合
物−5)の897■を得、85%収率に相当する。
(実施例−5)
下記式で表わされる(化合物−6)の合成a)下記式で表わされる(化合物−7
)の合成(実施例−1)のa)の例と同じ操作工程を4−チオデオキシウリジン
の代りに4−チオチミジンを用いて(化合物−7)の合成に対しておこなう。
b) (化合物−6)の合成
(実施例−1)のb)と同じ操作工程を、(化合物−7)の681■(2a+m
ole) とジメチルホルムアミドの15−とトリエチルアミン0.4m (
4+++mole)及びN−ヒドロキシコハク酸イミドビオチンの700mg
(2a+mole)を用いて(化合@!!−7)から(化合物−6)を合成する
ためにおこなう、(化合物−6)の7151gを得た。
これは63%収率に相当する。
(実施例−6)
下記式で表わされる(化合物−8)の合成この化合物は(化合物−6)から(実
施例−2)と同じ操作工程を用いて、(化合物−6)の1.]、4 g (2m
+mole)及びジメトキシ−4,4’−)リチルクロライドの1.14 g
(21℃mole)を用いておこなう。
(実施例−7)
下記式で表わされる(化合物−9)から(化合物−8)の合a) (化合物−
9)の合成
(実施例−3)のa)と同じ操作工程を用いて、ジメトキシトリチル−5′−チ
オ−4−デオキシ−2′−ウリジンの代りに、ジメトキシトリチル−5′−チオ
−4−チオチミジンを用いて(化合物−9)の合成をおこなう。
b) (化合物−8)の合成
(実施例−3)と同じ操作工程を用いて、(化合物−9)の1.29 g (2
mmole)、ジメチルホルムアミドの2O−1N−ヒドロオキシコハク酸イミ
ドビオチンの689mg及びトリエチルアミンの−300pl <2mmole
>を用いて(化合物−9)から(化合物−8)の合成をおこなった。3時間の反
応後(化合物−8)の1.37gを得た。これは79%の収率に相当する。
(実施例−8)
下記式で表わされる(化合物−10)の合成(実施例−4)と同じ操作工程を用
い(化合物−8)の870■(1+amole)、ジイソプロピルアンモニウム
テトラゾレート85g及びビス−(ジイソプロピルアミノ)−シアノエトオキシ
ホスフィンの340piを用いて(化合物−8)から(化合物−10)を合成す
る。最終沈澱をおこなった後、(化合物−10)の930■を得た。これは87
%の収率に相当する。
(実施例−9)
ビオチンで標的付与されたオリゴヌクレオチドの合成この実施例は下記の配列を
持つビオチンで標的付与されたオリゴヌクレオチドを(化合物−5)を用いてお
こなう実施例を示している。
5’ −d (XC;TCATAGCTGTTTCCTG)−3’この配列にお
いて、Aはアデニンから作られたヌクレオチドを表わし、Cはシトシン、Gはグ
アニン、Tはチミンから作られたヌクレオチドを夫々表わし、そしてχは(ビオ
チオアミド−6−へキシル−1)−4−シトシンから作られたヌクレオチドを表
わす。
この合成は(ビオチンアミド−6−へキシル−1)−4−シトシンに相当する同
調的基質として(化合物−5)と、そしてアデノシン、シトシン、グアニン及び
チミンに夫々相当する同調的基ii類とを用いておこなわれる。
後者の同調的基質類はジメトキシ−4,4’−)リチル基で5′のヒドロキシ基
を保護し、3′のヒドロキシ基を下記の式の基で機能性化することにより夫々相
当するヌクレオシド類を用いて得られる。
アデニン及びシトシンに相当するヌクレオチドに対して、環状構造から突出して
いるアミノ基はベンゾイル基で保護する。
グアニンの場合、環状構造から突出しているアミノ基はイソブチリル基で保護す
る。
合成は、アミノ鎖を延長用の腕とした「孔径を調節された硝子」(”Contr
olled Pore Glass″)なる支持体−とにグラフト(接木結合)
された、そしてヌクレオシドとアミンとの間の結合はサクシニル基を用いておこ
なった、ヌクレオシドの0.2μmmoleを用い、(実施例−4)の合成で得
られた、ヌクレオシド誘導体(化合物−5)或いはデオキシ−2′−アデノシン
、デオキシ−2′−シチジン、デオキシ−2′−グアノシン及びチミジンの同調
的基質類を各縮合周期当り10+Qg、すなわちヌクレオチドを単位として約1
0当量を用い、及びテトラゾール基を含んでいる活性化剤を各縮合周期当り7■
、すなわちヌクレオチドを単位として10当量を用い、応用ビオシステムス38
1A(Applied Biosyste++s 381A ) と呼称される
自動オリゴヌクレオチド合成機を用いておこなわれた。
縮合の周期は、応用ビオシステムス381A装置の標準シアノエチルホスホアミ
ダイド0.2μmoleの周期である。
縮合周期の終りには、支持体にサクシニル基を含む延長鎖を経て支持体に結合し
ているビオチンで標的付与された、そして保護されているオリゴヌクレオチドが
得られる。
オリゴヌクレオチドは28%アンモニアで2時間処理して支持体から切り離なす
。そこで得たアンモニア溶液を60°Cで5乃至16時間加熱して保護基をはず
す、アンモニアは蒸発させる。残渣は蒸溜水の500μ!に溶解し、セファデッ
クス25の塔(直径11高さ7 cm )でろ過する。この254D11に最初
の吸収を持つ分別物を集め凍結乾燥する。
合成したビオチン付加したオリゴヌクレオチドの正しい長さを、ポリヌクレオチ
ドキナーゼを対照物としてこれと比較して燐32を標識として、又、ポリアクリ
ルアミドの電気泳動とによって確認した。製品は厚いポリアクリルアミドゲル中
に電気泳動させて作った。この物質に相当する帯部を(紫外光で確認した後)切
り出して製品を得た。
得たオリゴヌクレオチドは溶出後、同じ配列を持つオリゴヌクレオチドと並べて
検定した。この場合比較品のビオチン標識は常法に従っておこない、相補的配列
を見出す怒度が同じであることを明らかにした。
(実施例−10)
ビオチンによる標的付与オリゴヌクレオチドの合成(実施例−9)の場合と同じ
方法で、ビオチン標的付与オリゴヌクレオチドの次のような配列を持ったものを
合成した。
5’ −d (YGTCATAGCTGTTTCCTG)−3’この配列におい
て、Yは(ビオチンアミド−6−アミノへキシル−1)−4−メチル−5−シト
シンの構造を持つヌクレオチドを表わし、Yとして使用される相当する同調的基
質は(化合物−10)である。(実施例−9)の場合と同様の方法で合成したビ
オチニレートしたオリゴヌクレオチドの正しい長さを検査し、相補的配列の検査
に対する感度についても検査した。
(実施例−11)
ビオチンにより標的付与されたオリゴヌクレオチドの合成(実施例−9)の場合
と同じ操作工程を下記式の配列を持つ、ビオチン標的付与したオリゴヌクレオチ
ドを合成するのに使用した。
5’ −d (XXXGTCATAGCTGTTTCCTG)−3’この配列に
おいて、Xは(実施例−9)の場合と同じ基を表わし、(ビオチンアミド−6−
ヘキジルー1)−4−シトシンでヌクレオチドを作った。これは(化合物−5)
に相当する同調的基質である。(実施例−9)でおこなったのと同じ方法で合成
したビオチニル化オリゴヌクレオチドの正しし)長さを検定した、その安定性と
検査した。
このオリゴヌクレオチドは3ケのビオチニル化ヌクレオチドを持ち、その感応性
はそのビオチン数に比例してps4から感度は3倍に近く上る。
同様の方法で同じ同調的基質を用いて次の弐で表わされるビオチン標的付与オリ
ゴヌクレオチドを合成した。
5’ −d(XXXX XXX XXX TTT CCT GTT
GCT GTG AGCTTG CTGAGCTAA CTG
CTCTGCCCT GGC)−3’この場合は配列の5′末端に10ケのビ
オチニル化ト化したヌクレオチド類を持つオリゴヌクレオチドが得られた。
同じようにして、次の式で表わされるビオチン標的付与オリゴヌクレオチドが得
られた。
5’ −d(XXXXX TTT CCT GTT GCT GTG AGCT
TG CTG AGCTAACTG CTCTGCCCT GGC) −3’こ
の場合は5′末端に5ケのビオチニレート ヌクレオチドと共にオリゴヌクレオ
チドを与える。
(実施例−12)
次の式の(化合物−11)の合成
ここで、DMTOはジメトキシトリチル基を表わす。この式(1)のヌクレオシ
ド誘導体の場合Bはシトシンから誘導された弐(III)の基である。この合成
は次のa)からf)の段階の反応のくり返しを用いてチオチミジン(化合物−1
2)から出発しておこなった。。
a) チオチミジン(化合物−12)から出発し、チオチミジン(化合物−13
)のモノメトキシトリチレート誘導体の合成次の反応図式に従う反応
%式%)
ここで?IMTCZはモノメトキシトリチルクロリドを表わし、?LMTはモノ
メトキシトリチル基である。
本反応の目的はR’Z基の導入中にその基のアセチル化が起きないように5′及
び3′末端の酸素側の水酸基の保護のためである。この基は(化合物−11)の
場合チオチミジンの5mmo1.eをvaneポンプで乾燥した後、無水ピリジ
ン50d中に?8解したモノメトオキシトリチルクロライド(MMTCZ)の1
5mmoleと反応させる。この反応を常温で16時間、つづいて50°Cで5
時間続ける。この反応を5iのメタノールを加えて停止する、そして反応混合物
をクロロホルムの2507に溶解(抽出)する、得られた溶液を5%の重炭酸ナ
トリウム水溶液250 dで3回つづいて、蒸溜水250−で洗浄する。
生成物はシリカの塔に仕込でCHtC1dヘキサンの9:1比から純CH2CZ
Zまでの濃度勾配を持つ液で溶出させ分離する。得た製品はトリタノールを除く
ためヘキサンで沈殿させる。得た(化合物−13)の収率は87%である。
b)次の式を表わされる(化合物−14)の合成次の式のチラミンと(化合物−
13)との反応によって(化合物−14)を得る。
(化合物−13) 5+mmoleとチラミン(4当量)の20I1mlole
を60°C24時間、25M1フラスト中でエタノールの10iに溶解し、反応
する。この混合物は乾燥するまで蒸発させ、次にクロロホルム100dで溶解(
抽出)する。続いて1溜水100RRで3回洗浄する。得た製品は二酸化珪素上
において、クロロホルム−(りロワホルム/メタノール)(93ニア)の勾配で
分離する。
c) (化合物−15)
次の式(15)の製造
(化合物−14)を無水酢酸と共に反応して合成する。
(化合物−14)の3 mmoleを無水ピリジン中に共蒸溜して乾燥し、無水
ピリジンの30d中で無水酢酸の3m(約10当量)と4時間反応する。反応を
、メタノール3dを加えて停止し、蒸発乾個する。クロロホルムと重炭酸ナトリ
ウムの混合物で抽出後有機溶媒層を分け、蒸発乾個する。そして酸化珪素と混合
する。この生成物をメチレンジクロライドとメタノール98:2の混合液で溶出
する。収率は82%である。
d)下記式で表わされる(化合物−16)の合成(化合物−15)を酢酸と反応
して合成する。
(化合物−15)の3 +m5oleを80%酢酸の30−と30分間逆流させ
て反応し、蒸発乾個する。残渣を蒸溜水に溶解し、水を蒸発させ残渣を蒸溜水の
50mに溶解する。水相をトルエン50mと共に2回洗浄し、蒸発乾個させて(
化合物−16)を得る。収率は、この化合物は分離精製せずに使用するので、測
定していない。
e)下記式で表わされる(化合物−17)の合成f) (化合物−17)から
(化合物−11)の合成(化合物−17)を無水アセトニトリルと共に共蒸発し
て乾燥する。(化合物−17)をジクロロメタン54とジイソプロピルアンモニ
ウムテトラゾレートの0.25mm+oleとの混合物に溶解し、これにシアノ
エトキシ−ビス−ジイソプロピルアミノホスフィンの1.1+amoleを加え
る。この反応は2時間続ける、その後ジクロロメタン50jdを加える。有機性
溶液を5%の重炭酸ナトリウム水溶液の501+1i!と共に3回洗浄し、つづ
いて硫酸ナトリウムを入れて蒸発乾個する。残渣をジクロロメタンの51に溶−
を加えて沈殿させる。この沈澱は少なくとも1日間真空デシケータ−中に入れて
おく。
(実施例−13)
標的付与されたオリゴヌクレオチドの合成(実施例−9)の場合と同じ操作工程
をおこなって、次の配列を持ったヨードで標的付与されたオリゴヌクレオチドを
合成した。
5’ −d CXGTCATAGCTGTTTCCTG)−3’上の配列でA
、C,G、Tは(実施例−9)で使用したのと同じヌクレオチドを表わしている
。
Xは((ヒドロオキシ−4−フェニル)−2−エチル) −N、メチル−5−シ
トシンで形成されたヌクレオチドを表わす。
この合成をおこなうためにA、C,G及びTについて(実施例−9)の場合と同
じ同調的基質を使用し、ヌクレオチドXについては(化合物−11)を同調的基
質として使用する。
合成は(実施例−9)の場合と同じ条件で自動の「アブライドビオシステムス3
81AJオリゴヌクレオチド合成機を用いておこなう。
縮合周期の終りに、支持体に結合された、保護されたオリゴヌクレオチドを使用
する。このオリゴヌクレオチドは支持体から分離し保護基をはづし、(実施例−
9)の場合と同じ条件で精製する。
このオリゴヌクレオチドは放射性ヨードを使用して標的付与或いは標識付けをお
こなう。この目的のため、蒸溜水10pl中に置いた20pmoleのオリゴヌ
クレオチドと、クロルアミン(chlo−ra+n1ne) i液Tの10tt
l (0,1mmole)とを燐酸緩衝液(0,05M、 pH−7,5)の9
ttl中にある+ts1のl μ+noleに加える。
5分間反応して二亜硫酸ナトリウムで反応を停止させる。シトシンから誘導され
る式(I[[)の基であり、その合成は(化合物−17)から出発して、次のa
)からC)の各段階を逐次実行しておこなわれる。
a) (化合物−17)からサクシニル誘導体(化合物−19)の合成
無水ピリジン中で共沸、蒸発させて乾燥した(化合物−17)の(0,5+u+
ole、 353mg )にジメチルアミノピリジン(DMAP)の1.5++
+mo1eと無水コハク酸の1.5m++moleを加える0反応は16時間で
終了する。反応混合物は蒸発乾個し、クロロホルムの100−で溶解(抽出)す
る。得られた有機性溶液をクエン酸の100−で3回洗浄する。有機性相を硫酸
ソーダ上で乾燥し、蒸発乾個する。
残渣をクロロホルムの10dに溶解し、ヘキサンの200mに加えて沈澱させる
。収率87%
b) (化合物−19)から活性エステル(化合物−20)の合成同じヨード
による標的付与処理を、上記したと同じ条件であるが、ヌクレオシドXを含まな
い、標的づけしていないオリゴヌクレオチドについておこなった。これ等の条件
ではオリゴヌクが含まれていることが、ヨードによる標的付与には必須の条件で
あることが判る。
(実施例−9)の場合のように、標的付与されたオリゴヌクレオチドは、ハイブ
リダイゼーション法による相補的配列のものの検出に使用できることが確定され
た。
(実施例−14)
下記式で表わされる(化合物−18)の合成(化合物−18)
この式においてN)Iへへ小■ は結合鎖を延長しているアミノ基を有する無水
珪素から成る支持体を表わしている。式(1)で表わされるこのヌクレオシド誘
導体について、置換基Bは無水ピリジン中で共沸蒸発して前もって乾燥させて(
化合物−19)の0.25++mole 、ペンタクロロフェノールの0.28
mmole及びジシクロへキシルカーポジイミド(DCC)の0.37++mo
leを無水ジメチルホルムアミドの10Idt中で16時間反応させる。
反応混合物を濾過し、濾過液を蒸発乾個し、クロロホルムの1001に溶解する
。得た有機性溶液を蒸溜水の100dで3回洗浄し、つづいてクロロホルムの5
から10dで溶解しヘキサン200−中に加えて沈澱させる。収率93%
c) (化合物−20)から(化合物18)の合成(化合物−20)のQ、2
mmoleを無水DMF中で、トリエチ/L/7ミン30ulと共に、アルキル
アミノで作られている結合鎖延長腕を持つ二酸化珪素CPGの200■と2日間
機械的に混合攪拌する。2日後グラフト化された支持体を回収し、無水のDMF
の20dで3回洗浄し、次に20.dのエタノールで3回洗浄する0反応してい
ないアミノ基は、50Jdのピリジン中で無水酢酸の5dを用いて保1(blo
ck)する、この支持体を回収し、ピリジン20iで3回、エタノール20I1
1で3回洗浄する。
支持体のグラフト化の量は酸性媒体中に遊離するジメトキシトリチルカチオンの
着色の強さで測定する。支持体のクラフト化は27μmole/gであった。
(化合物−21)の式は下記の通り
(化合物−21)
この(化合物−21)は上記と同様にして(化合物−8)を出発物として合成さ
れる。
(実施例−15)
次の式の(化合物−22)の合成
4−チオデオキシ−2′−ウリジンの411IIlO1eを無水ピリジンの10
dで2回共沸蒸発して乾燥する。残渣をピリジン4011!1!に溶解し、溶液
を氷の入ったバス中で冷却する。この溶液に次にジメトキントリチル・クロライ
ドの4.4III+++ole (0,93g)を加え、4°Cで一昼夜攪拌し
て反応をおこなわせる。反応が終了したと思われた時(二酸化珪素上でTLC法
で確認して)メタノールのIHlを加える、30分後、反応混合物をその容積の
174にまで濃縮する。残渣に100dのジクロロメタン中に加えて溶解(抽出
)し、飽和の重炭酸ナトリウムの100dで3回洗浄し、次に水の100Iiで
洗浄する。有機性相を硫酸ナトリウム上で乾燥し、蒸発乾個し、トルエンを加え
て共沸蒸発させる。かくして得た生成物は二酸化珪素ゲル上に吸着させ、ジクロ
ロメタン中に(0から4%)勾配をもって加えたメタノールで溶出して精製する
。無定形、黄色の(化合物−22)が得られ、収率は1.s4g (84%)で
あった。
(実施例−2)の(化合物−3)を合成するためには、(実施例−1)と同じ操
作工程を経て4−チオデオキシウリデンの代りに(化合物−22)を用いて、(
化合物−3)を合成できる。
(実施例−16)
次の式で表わされる(化合物−23)の合成チオ−4−チミジンの0.64 g
(2,5mmole)から(化合物−23)を、(実施例−15)と同じ操作
工程によって合成できる。
(化合物−23)は1.20 g得られ、収率86%であった。(化合物−23
)は(実施例−1)の操作工程をおこない、4−チオデオキシウリジンの代りに
(化合物−23)を用いて、(実施例−6)の(化合物−8)の合成に使用され
る。
発明の効果
標的付与されたオリゴヌクレオチド類を合成するために、次の式で表わされる、
夫々相当するヌクレオシド誘導体を用いて目的を達成することができる。
R1は水素原子或いはヌクレオチド合成に適する酸性媒体中で不安定な基を表わ
す。
R2は水素原子、保護的基、機能性基或いはヌクレオチド合成に役立つ支持体を
表わす。
R3は水素原子、水酸基或いは保護された水酸基を表わす。
そして
−BはR’Z基が置換している環状アミン基を含むプリン或いはビリジデン塩基
から誘導された基で
ここでR4は一本鎖結合或いは炭化水素基を表わし、Zは標的付与要素ある。
この標的付与されたオリゴヌクレオチド類は遺伝子や、怒染症の病気などの診断
手段に利用できる。
国際調査報告
国際調査報告
FR8900312
SA 29B37
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.標的付与されたオリゴヌクレオチド類の合成に使用できる、下記式(I)に 従うことを特徴とするヌクレオシド誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼(I)ここで、 −R1は水素原子或いはヌクレオチド合成に適する酸性媒体中で不安定な基を表 わし、 −R2は水素原子、保護基、オリゴヌクレオチド合成に適する機能的基、或いは 酸素原子を伴った、結合を伸ばす腕を持った結合を持つヌクレオチド合成に使用 し得る支持体を表わし、−R3は水素原子、水酸基或いは保護された水酸基を表 わし、−Bは下式記で表わすプリン或いはピリミジンから誘導する基を表わし、 ▲数式、化学式、表等があります▼(III)▲数式、化学式、表等があります ▼(IV)▲数式、化学式、表等があります▼(V)ここでR5はH、CH3、 或いはR4Zを表わし、R6は水素原子或いはR4Z基を表わし、そして式Bの 基は式(III)の基の1位置のNに、或いは式(IV)及び(V)の基の9位 置に、酵素側部分に向けて結合しており、−R4は一重結合か或いは下記式で示 す基類の中から選んだ炭化水素を表わし、−NH(CH2))n−X−(CH2 )p−−NH−(CH2))n−X−(CH2)p−NH−−O−(CH2)n −X−(CH2)p−−O−(CH2)n−X−(CH2)p−NH−−S−( CH2)n−X−(CH2)p−−S−(CH2)n−X−(CH2)p−NH −−NHCO−(CH2)n−X−(CH2)p−−NHCO−(CH2)n− X−(CH2)p−NH−−NHSO2−(CH2)n−X−(CH2)p−− NHSO2−(CH2)n−X−(CH2)p−NH−−(CH2)n−X−( CH2)p− −(CH2)n−X−(CH2)p−NH−−CO−(CH2)n−X−(CH 2)p−−CO−(CH2)n−X−(CH2)p−NH−ここでnは1から6 の間の整数、pは0か或いは1から6の間の整数であり、XはCH2、O、S、 NH、CO、HC=CH−、−(CH2)rZ、(CH2)rNHZ、▲数式、 化学式、表等があります▼、▲数式、化学式、表等があります▼、▲数式、化学 式、表等があります▼、▲数式、化学式、表等があります▼、▲数式、化学式、 表等があります▼、▲数式、化学式、表等があります▼、▲数式、化学式、表等 があります▼、▲数式、化学式、表等があります▼を表わし、rは1から6の間 の整数であり、 −Zはペプチッド合成に有用な保護基或いは標的付与物類として使用できる分子 類の群から選んだ標的付与分子から誘導した基であり、但しZは若しR2が結合 を延長する結合を持つ支持体である場合には保護的基を表わすに過ぎない。 2.標的付与分子がアビジン或いはストレプタビジンと結合し得る分子であるこ とを特徴とする、請求項1に記載のヌクレオシド誘導体。 3.Zが下記の式で表わす基類から選んだ基であることを特徴とする請求項2に 記載の誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼(VI)▲数式、化学式、表等があります▼ (VII)▲数式、化学式、表等があります▼(VIII)▲数式、化学式、表 等があります▼(IX)▲数式、化学式、表等があります▼(X)▲数式、化学 式、表等があります▼(XI)ここでs=4,5,6或いは7、t=3,4,5 ,6,或いは7R7はアルキル基である。 4.標的付与分子が抗原−抗体型の反応をおこない得る分子であることを特徴と する請求項1に記載のヌクレオシド誘導体。 5.Zが下記の式で表わす基類から選んだ基であることを特徴とする請求項4に 記載のヌクレオシド誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼(XII)及び▲数式、化学式、表等があり ます▼(XIII)6.標的付与分子が蛍光発光特性を持つ分子であることを特 徴とする請求項1に記載のヌクレオシド誘導体。 7.Zが下記式で表わす基類から選んだ基であることを特徴とする請求項6に記 載のヌクレオシド誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼(XIX)▲数式、化学式、表等があります ▼(XV)▲数式、化学式、表等があります▼(XVI)▲数式、化学式、表等 があります▼(XVlI)▲数式、化学式、表等があります▼(XVIII)▲ 数式、化学式、表等があります▼(XIX)▲数式、化学式、表等があります▼ (XX)▲数式、化学式、表等があります▼(XXI)▲数式、化学式、表等が あります▼(XXII)▲数式、化学式、表等があります▼(XXIII)ここ でR15とR16は、同じであっても異っていてもよく、水素原子或いはアルキ ル基を表わす。 8.標的付与分子がヨードを用いて標的づけされた分子であることを特徴とする 請求項1に記載のヌクレオシド誘導体。 9.Zが下記の式で表わす基類から選んだ基であることを特徴とする請求項8に 記載のヌクレオシド誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼(XXIV)及び ▲数式、化学式、表等があります▼(XXV)ここで u=0或いは1から6の整数、 v=0,1或いは2、 w=3,2、1但しv+w=3 R8は水素原子或いはアシル基を表わし、YはCH2、HN、O、S、CO、S O2、CONH、SO2NHを表わす。 10.Bが下記式で表わす基であることを特徴とする請求項1に記載のヌクレオ シド誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼ ここでR5はH或いはCH3を表わし、R4及びZは請求項1で示した意味をも つ。 11.R4Zは式(CH2)6−NHZの基を表わし、この式中のZは下記の式 の基であることを特徴とする請求項10に記載のヌクレオシド誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼ 12.R4Zが▲数式、化学式、表等があります▼で表わされることを特徴とす る請求項10及び請求項11のうちの何れかの請求項に記載の誘導体。 13.R1が水素原子か或いはジメトキシトリル基であることを特徴とする請求 項10から請求項12のうちの何れか1つの請求項に記載の誘導体。 14.R2が下記式の燐基であることを特徴とする請求項10から請求項13の うちの何れか1つの請求項に記載の誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼ 15.R2が式中の▲数式、化学式、表等があります▼が結合を伸ばす腕である アミノ基を有する酸化珪素支持体を表している▲数式、化学式、表等があります ▼なる式の基であることを特徴とする請求項10及び請求項13のうちの何れか 1つの請求項に記載の誘導体。 16.数回の縮合過程、該縮合過程の1回の過程の中でヌクレオシド誘導体がヌ クレオシド誘導体に、或いはオリゴヌクレオチドに縮合することをくり返す縮合 過程からなるオリゴヌクレオチド合成の製造法は、使用されるヌクレオシド誘導 体の少なくとも1種が下記式(I)に従うヌクレオシド誘導体であることを特徴 とする。 ▲数式、化学式、表等があります▼(I)ここで −R1はヌクレオチド合成に適する酸性媒質中では不安定な基を表わし、 −R2はヌクレオチド合成に適する機能的基、或いは酸素原子を伴った、結合を 伸ばす腕を持った結合を持つ、ヌクレオチド合成に使用し得る支持体を表わし、 −R3は水素原子、水酸基或いは保護された水酸基を表わし、そして−Bは請求 項1で与えた意味をもっている。 17.異った種類のヌクレオチドの連結鎖からなるオリゴヌクレオチドはその連 結鎖中の少なくとも2種のヌクレオチドが異った標的付与物によって標的化され ていることを特徴とする標的付与されたオリゴヌクレオチド。 18.異った種類のヌクレオチドの連結鎖からなる、そのヌクレオチドの少なく とも−種が次の式の基酸。 ▲数式、化学式、表等があります▼ 或いは ▲数式、化学式、表等があります▼ ここで、u=0或いは1から6の整数 v=0,1或いは2 w=3,2或いは1但しv+w=3 R8は水素原子、或いはアシル基を表わし、そしてYはCH2、NH、O、S、 CO、SO2、CONH、或いはSO2NH次の式の基類 ▲数式、化学式、表等があります▼ および ▲数式、化学式、表等があります▼ ここでR8は水素原子であり、u、v、w及びYは上記に指定した意味を持ち、 y=1,2,3或いは4のであり、1■は放射性ヨード原子である。 次の式の基類 ▲数式、化学式、表等があります▼ R15及びR16は同じか異っており、水素原子或いはアルキル基を表わす、そ して 次の式の基類 ▲数式、化学式、表等があります▼(XIX)▲数式、化学式、表等があります ▼(XV)▲数式、化学式、表等があります▼(XVI)▲数式、化学式、表等 があります▼(XVII)▲数式、化学式、表等があります▼(XVII)▲数 式、化学式、表等があります▼(XVII)▲数式、化学式、表等があります▼ (XX)▲数式、化学式、表等があります▼(XXI)上記基類から選んだ基に よって標的付与されることを特徴とする、標的付与したオリゴヌクレオチド。 19.異なったヌクレオチド類からなる連結鎖を有し、その連結鎖の末端の少な くとも−方の末端に位置する少なくとも5ケのヌクレオチド類が標的付与分子或 いは該分子の前駆体によって標的付与されていることを特徴とする標的付与され たオリゴヌクレオチド。 20.異なったヌクレオチド類からなる連結鎖を有し、その連結鎖の5′末端に 位置する少なくとも2ケの相隣るヌクレオチドが標的付与分子或いは該分子の前 駆体によって標的付与されていることを特徴とする標的付与されたオリゴヌクレ オチド。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| FR8808240A FR2632955B1 (fr) | 1988-06-20 | 1988-06-20 | Derives de nucleosides utilisables pour la synthese d'oligonucleotides marques, oligonucleotides obtenus a partir de ces derives et leur synthese |
| FR88/08240 | 1988-06-20 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH03505209A true JPH03505209A (ja) | 1991-11-14 |
| JP2835630B2 JP2835630B2 (ja) | 1998-12-14 |
Family
ID=9367476
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP1507487A Expired - Lifetime JP2835630B2 (ja) | 1988-06-20 | 1989-06-19 | 標的付与されたオリゴヌクレオチド類の合成に使用できるヌクレオシド誘導体類、これ等誘導体類から得たオリゴヌクレオチド類及びそれ等の合成 |
Country Status (6)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0422090B1 (ja) |
| JP (1) | JP2835630B2 (ja) |
| AU (1) | AU3866089A (ja) |
| DE (1) | DE68906890T2 (ja) |
| FR (1) | FR2632955B1 (ja) |
| WO (1) | WO1989012642A1 (ja) |
Families Citing this family (14)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US5262536A (en) * | 1988-09-15 | 1993-11-16 | E. I. Du Pont De Nemours And Company | Reagents for the preparation of 5'-tagged oligonucleotides |
| DE4037363A1 (de) * | 1990-04-09 | 1991-10-10 | Europ Lab Molekularbiolog | 2-0-alkylnukleotide sowie polymere, die solche nukleotide enthalten |
| US5658731A (en) * | 1990-04-09 | 1997-08-19 | Europaisches Laboratorium Fur Molekularbiologie | 2'-O-alkylnucleotides as well as polymers which contain such nucleotides |
| CN102712696A (zh) | 2009-09-16 | 2012-10-03 | 弗·哈夫曼-拉罗切有限公司 | 包含卷曲螺旋和/或系链的蛋白质复合体及其用途 |
| TW201138821A (en) | 2010-03-26 | 2011-11-16 | Roche Glycart Ag | Bispecific antibodies |
| CN103384681B (zh) | 2010-12-23 | 2018-05-18 | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 | 结合剂 |
| EP2659269B1 (en) | 2010-12-23 | 2016-10-26 | Roche Diagniostics GmbH | Detection of a posttranslationally modified polypeptide by a bi-valent binding agent |
| EP2655413B1 (en) | 2010-12-23 | 2019-01-16 | F.Hoffmann-La Roche Ag | Polypeptide-polynucleotide-complex and its use in targeted effector moiety delivery |
| MX2014009565A (es) | 2012-02-10 | 2014-11-10 | Genentech Inc | Anticuerpos monocatenarios y otros heteromultimeros. |
| CN102718822A (zh) * | 2012-05-18 | 2012-10-10 | 大连大学 | 微波辅助下4-硫胸腺嘧啶核苷及其类似物的合成方法 |
| KR20150030744A (ko) | 2012-06-27 | 2015-03-20 | 에프. 호프만-라 로슈 아게 | 표적에 특이적으로 결합하는 하나 이상의 결합 단위를 포함하는 항체 Fc-영역 접합체의 제조 방법 및 그의 용도 |
| ES2597228T3 (es) | 2012-06-27 | 2017-01-17 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Procedimiento para la selección y la producción de entidades de objetivación, como dianas, altamente selectivas y multiespecíficas, personalizadas, las cuales contienen por lo menos dos entidades de unión diferentes, y utilización de éstas |
| WO2016087416A1 (en) | 2014-12-03 | 2016-06-09 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Multispecific antibodies |
| CN110669088B (zh) * | 2018-07-02 | 2023-03-28 | 成都阿奇生物医药科技有限公司 | N-(2-乙基胺)苯磺酰胺基虫草素衍生物及其制备方法和应用 |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPS60500717A (ja) * | 1982-09-30 | 1985-05-16 | シンジーン,インコーポレイテッド | リポ−タ−グル−プを含んでいる一定配列の1本鎖オリゴヌクレオチド、およびその化学的合成法 |
| WO1988000593A1 (fr) * | 1986-07-22 | 1988-01-28 | Institut Pasteur | Sondes de detection d'acides nucleiques renfermant des derives de desoxy-2' adenosine |
| JPS63501565A (ja) * | 1985-05-15 | 1988-06-16 | アモコ・コーポレーション | シチジン同族体 |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CA1219824A (en) * | 1981-04-17 | 1987-03-31 | David C. Ward | Modified nucleotides and methods of preparing and using same |
| AU596068B2 (en) * | 1983-02-22 | 1990-04-26 | Syngene, Inc. | Defined sequence single strand oligonucleotides incorporating reporter groups, process for the chemical synthesis thereof, and nucleosides useful in such synthesis |
| FR2620122B1 (fr) * | 1987-09-03 | 1989-12-29 | Pasteur Institut | Procede d'obtention par voie chimique d'oligonucleotides marques et applications biologiques |
| DE19928872A1 (de) * | 1999-06-24 | 2001-01-18 | Rockwool Mineralwolle | Dämmstoffelement |
-
1988
- 1988-06-20 FR FR8808240A patent/FR2632955B1/fr not_active Expired - Lifetime
-
1989
- 1989-06-19 WO PCT/FR1989/000312 patent/WO1989012642A1/fr not_active Ceased
- 1989-06-19 JP JP1507487A patent/JP2835630B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1989-06-19 EP EP89907771A patent/EP0422090B1/fr not_active Expired - Lifetime
- 1989-06-19 DE DE89907771T patent/DE68906890T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1989-06-19 AU AU38660/89A patent/AU3866089A/en not_active Abandoned
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPS60500717A (ja) * | 1982-09-30 | 1985-05-16 | シンジーン,インコーポレイテッド | リポ−タ−グル−プを含んでいる一定配列の1本鎖オリゴヌクレオチド、およびその化学的合成法 |
| JPS63501565A (ja) * | 1985-05-15 | 1988-06-16 | アモコ・コーポレーション | シチジン同族体 |
| WO1988000593A1 (fr) * | 1986-07-22 | 1988-01-28 | Institut Pasteur | Sondes de detection d'acides nucleiques renfermant des derives de desoxy-2' adenosine |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO1989012642A1 (fr) | 1989-12-28 |
| DE68906890D1 (de) | 1993-07-08 |
| AU3866089A (en) | 1990-01-12 |
| FR2632955B1 (fr) | 1991-12-27 |
| DE68906890T2 (de) | 1993-12-02 |
| FR2632955A1 (fr) | 1989-12-22 |
| EP0422090A1 (fr) | 1991-04-17 |
| JP2835630B2 (ja) | 1998-12-14 |
| EP0422090B1 (fr) | 1993-06-02 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| EP0135587B1 (en) | Defined sequence single strand oligonucleotides incorporating reporter groups, process for the chemical synthesis thereof, and nucleosides useful in such synthesis | |
| US5278043A (en) | Ruthenium-lumazine energy transfer systems | |
| US5015733A (en) | Nucleosides possessing blocked aliphatic amino groups | |
| US4849513A (en) | Deoxyribonucleoside phosphoramidites in which an aliphatic amino group is attached to the sugar ring and their use for the preparation of oligonucleotides containing aliphatic amino groups | |
| US5118802A (en) | DNA-reporter conjugates linked via the 2' or 5'-primary amino group of the 5'-terminal nucleoside | |
| US5118800A (en) | Oligonucleotides possessing a primary amino group in the terminal nucleotide | |
| JP5364380B2 (ja) | ポリヌクレオチド標識試薬 | |
| US5625050A (en) | Modified oligonucleotides and intermediates useful in nucleic acid therapeutics | |
| US4948882A (en) | Single-stranded labelled oligonucleotides, reactive monomers and methods of synthesis | |
| US4876335A (en) | Poly-labelled oligonucleotide derivative | |
| JPH06500107A (ja) | オリゴ(α―アラビノフラノシル・ヌクレオチド)およびそれらのα―アラビノフラノシル前駆体 | |
| JPH05310779A (ja) | オリゴヌクレオチド類似体、その製造法および用途 | |
| BG61484B1 (bg) | 3'-(2')-амино-и тиолмодифицирани, свързани с флуоресциращо багрило нуклеозиди,нуклеотиди и олигонуклеотиди и метод за тяхното получаване и приложението им | |
| MXPA96004355A (en) | Oligonucleotides and used modified intermediaries in nucleic acids therapeuti | |
| JP2011084573A (ja) | 固体支持体上での標識化オリゴヌクレオチドおよびアナログの合成のための方法および組成物 | |
| EP0466773A1 (en) | COUMARIN DERIVATIVES FOR USE AS NUCLEOTIDE CROSSLINKING REAGENTS. | |
| US6664058B2 (en) | Base analogues | |
| JP2835630B2 (ja) | 標的付与されたオリゴヌクレオチド類の合成に使用できるヌクレオシド誘導体類、これ等誘導体類から得たオリゴヌクレオチド類及びそれ等の合成 | |
| JPH01500353A (ja) | 2′‐デオキシアデノシン誘導体を含む核酸検出用プローブ | |
| AU2006316903B8 (en) | Polynucleotide labelling reagent | |
| JPH0374239B2 (ja) | ||
| EP1112281B1 (en) | Pteridine nucleotide analogs | |
| JPH064670B2 (ja) | 酵素標識化されたポリヌクレオチドおよびその製法 | |
| JPS6169789A (ja) | 混合プローブおよびその応用、その前駆体、これらの製造ならびにこの製造用の修飾塩基含有誘導体 | |
| JPS60166694A (ja) | オリゴヌクレオチド誘導体およびその製造法 |