JPH0427392A - G6アミラーゼ遺伝子 - Google Patents
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- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
Landscapes
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
(産業上の利用分野)
本発明は好アルカリ性バチルス属細菌由来のアミラーゼ
遺伝子に関する。更に詳細には、好アルカリ性バチルス
属細菌H−167株由来のマルトヘキサオース生成アミ
ラーゼ(G6アミラーゼ)をコードするアミラーゼ遺伝
子、及びアミラーゼ遺伝子発現用調節遺伝子に関する。
遺伝子に関する。更に詳細には、好アルカリ性バチルス
属細菌H−167株由来のマルトヘキサオース生成アミ
ラーゼ(G6アミラーゼ)をコードするアミラーゼ遺伝
子、及びアミラーゼ遺伝子発現用調節遺伝子に関する。
(従来の技術)
従来、澱粉からブドウ糖、麦芽糖などを製造するために
用いる酵素として、グルコアミラーゼ、β−アミラーゼ
、糖化型α−アミラーゼ、液化型α−アミラーゼなどの
アミラーゼが知られている。
用いる酵素として、グルコアミラーゼ、β−アミラーゼ
、糖化型α−アミラーゼ、液化型α−アミラーゼなどの
アミラーゼが知られている。
最近では、α−1,4−グルコシド結合でグルコビラノ
ースが直鎖状に結合したマルトヘキサオースなどのオリ
ゴ糖がすぐれた各種特性を有することから、これらオリ
ゴ糖の食品、医薬品への用途開発が盛んに行われている
。
ースが直鎖状に結合したマルトヘキサオースなどのオリ
ゴ糖がすぐれた各種特性を有することから、これらオリ
ゴ糖の食品、医薬品への用途開発が盛んに行われている
。
これらオリゴ糖を製造するために用いる酵素としては、
マルトヘキサオース生成アミラーゼ(G6アミラーゼ)
が知られており、例えばバチルス・サーキュランス[−
2株が産生するG6アミラーゼ[AQric、Biol
、Chem、、 51 (6) 、 1521〜152
7 (1987)]、バチルス属細菌H=167株が産
生ずるG6アミラーゼ[特開昭62−208278号公
報; Agric、Biol、Chem可l、443
(1988) : ADDl、Hicrobi。
マルトヘキサオース生成アミラーゼ(G6アミラーゼ)
が知られており、例えばバチルス・サーキュランス[−
2株が産生するG6アミラーゼ[AQric、Biol
、Chem、、 51 (6) 、 1521〜152
7 (1987)]、バチルス属細菌H=167株が産
生ずるG6アミラーゼ[特開昭62−208278号公
報; Agric、Biol、Chem可l、443
(1988) : ADDl、Hicrobi。
Biotechnol、、28.281 (1988)
1などh<ある。バチルス属細菌H−167株由来の
G6アミラーぜは、好アルカリ性バチルス属細菌が産生
するアミラーゼであって耐アルカリ性を示し安定pH範
囲が広く、耐熱性にも優れており、今後の開発が期待さ
れるものである。
1などh<ある。バチルス属細菌H−167株由来の
G6アミラーぜは、好アルカリ性バチルス属細菌が産生
するアミラーゼであって耐アルカリ性を示し安定pH範
囲が広く、耐熱性にも優れており、今後の開発が期待さ
れるものである。
遺伝子組換え技術を用いたG6アミラーゼの製造法につ
いての研究も行われており、例えば、バチルス・サーキ
ュランスF−2株由来のG6アミラーゼをコードする遺
伝子が明らかにされている(特公昭63−5076号公
報)。また、バチルス属細菌1−1−167株由来の0
6アミラーゼについても、その遺伝子をベクターpBR
329を用いTE、COj!l HB101中でクロ
ーニングしG6アミラーゼが発現された例が報告されて
いる[^gric、Bio1.chei、、 53 (
2> 、 491−495 (1989)]。
いての研究も行われており、例えば、バチルス・サーキ
ュランスF−2株由来のG6アミラーゼをコードする遺
伝子が明らかにされている(特公昭63−5076号公
報)。また、バチルス属細菌1−1−167株由来の0
6アミラーゼについても、その遺伝子をベクターpBR
329を用いTE、COj!l HB101中でクロ
ーニングしG6アミラーゼが発現された例が報告されて
いる[^gric、Bio1.chei、、 53 (
2> 、 491−495 (1989)]。
しかしながら、バチルス属細菌H−167株由来のG6
アミラーゼについてはそのアミノ酸配列は明らかにされ
ておらず、またそれをコードする遺伝子の@呈配列の解
明も末だなされていない。
アミラーゼについてはそのアミノ酸配列は明らかにされ
ておらず、またそれをコードする遺伝子の@呈配列の解
明も末だなされていない。
(発明が解決しようとする課題)
本発明の目的は、好アル7Jり性バチルス属細菌H−1
67株由来のG6アミラーゼをコードする遺伝子を提供
することにある。
67株由来のG6アミラーゼをコードする遺伝子を提供
することにある。
本発明の他の目的は、好アルカリ性バチルス属細菌1−
1−167株由来のG6アミラーゼをコードする遺伝子
を発現するために用いる調節遺伝子を提供することにあ
る。
1−167株由来のG6アミラーゼをコードする遺伝子
を発現するために用いる調節遺伝子を提供することにあ
る。
(課題を解決するための手段)
本発明によれば、
第1図に示すアミノ酸配列を有するG6アミラーゼある
いはそれと同様の酵素活性を有するポリペプチドをコー
ドするG6アミラーゼ遺伝子が提供される。
いはそれと同様の酵素活性を有するポリペプチドをコー
ドするG6アミラーゼ遺伝子が提供される。
更に本発明によれば、
第2図に示すDNA塩基配列の8番目から243番目ま
でのDNA塩基配列を有するG6アミラーゼ遺伝子発現
用調節遺伝子が提供される。
でのDNA塩基配列を有するG6アミラーゼ遺伝子発現
用調節遺伝子が提供される。
以下に、本発明のG6アミラーゼ遺伝子及び調WJ遺伝
子の塩基配列決定の方法及びそれら塩基配列の特徴等に
ついて詳細に説明する。
子の塩基配列決定の方法及びそれら塩基配列の特徴等に
ついて詳細に説明する。
(1) 遺伝子の供与体
本発明の遺伝子の供与体となった好アルカリ性バチルス
属細菌)−1−167株は、昭和61年3月5日付けに
て工業技栴院微生物工業技術研究所に寄託され、受託番
号としてFERM P−8683が付与されており、
特開昭62−208278号公報に報告されている。こ
の菌株は以下に述べる菌学的性質を有する。
属細菌)−1−167株は、昭和61年3月5日付けに
て工業技栴院微生物工業技術研究所に寄託され、受託番
号としてFERM P−8683が付与されており、
特開昭62−208278号公報に報告されている。こ
の菌株は以下に述べる菌学的性質を有する。
(a)形態:単桿菌、大きさ(0,4〜0.7)X (
2,0〜3.0)μm、ダラム陰性、運動性を有する。
2,0〜3.0)μm、ダラム陰性、運動性を有する。
球形〜楕円形の胞子を形成する。
(b)生理学的性質
イ)硝酸塩の還元:+
口)脱窒反応;
ハ)VPテスト:
二)インドールの生成:
ホ)liii化水素の生成:
へ)澱粉の加水分解:+
カゼインの加水分解:
無機窒素の利用:
色素の生成;+
ウレアーゼ:
オキシダーゼ:+
+
カタラーゼ:+
ソ)
ツ)
酸素に対するB度:好気性
クエン酸の利用:
0−Fテスト:好気的及び嫌気的に酸を生成
耐塩性:12%食塩濃度で生育
生育範囲(pH及び温度):pH7−12;最適pH9
−10゜温度20−52℃;最適温度35−45℃。
−10゜温度20−52℃;最適温度35−45℃。
炭素源の利用:D−グルコース、し−アラビノース、D
−キシロース、ンルトース、シュークロース及びソルビ
トールより好気的及び嫌気的に酸を生成する。しかし、
ガスの発生はない。
−キシロース、ンルトース、シュークロース及びソルビ
トールより好気的及び嫌気的に酸を生成する。しかし、
ガスの発生はない。
DNA塩基組成: DNAのGC含有半は46、3%。
バチルス属細菌)1−167株が産生するG6アミラー
ゼは、アラレカリ側(pH10−11>にその最適作用
Dllを有し、且つ熱安定性の高いマルトヘキサオース
生成アミラーゼである(特開昭62−208278号公
報)。
ゼは、アラレカリ側(pH10−11>にその最適作用
Dllを有し、且つ熱安定性の高いマルトヘキサオース
生成アミラーゼである(特開昭62−208278号公
報)。
(2) G6アミラーぜ遺伝そのクローニングつぎに
06アミラーゼ遺伝子のクローニングの手順に付いて説
明する。好アルカリ性バチルス属鵬菌H−167株をG
6アミラーゼの遺伝子供与体として用い、クローニング
の為の宿主としては例えば大腸菌)−18101株を用
いる。ベクターは例えばプラスミドDBR329を使用
する。
06アミラーゼ遺伝子のクローニングの手順に付いて説
明する。好アルカリ性バチルス属鵬菌H−167株をG
6アミラーゼの遺伝子供与体として用い、クローニング
の為の宿主としては例えば大腸菌)−18101株を用
いる。ベクターは例えばプラスミドDBR329を使用
する。
即ち、バチルス属細菌)−1−167株を培養してその
菌を回収し、そのクロモシーム1)NAを例えばフェノ
ール法[Biochimica et Biophys
+caActa 72.619−629 (1963
)コによりW4製する。これを制限酵素、例えば3au
3AIで部分消化して密度勾配遠心法により処理して2
kb以上のDNA断片を得る。この断片を、あらかじめ
DI限酵素3amHIで切断したプラスミドpBR32
9にT 41) N Aリガーぜを用いて連結し、得ら
れる反応物を用いて大腸菌)−18101株を形質転換
し、常法に従ってショットガンクローニングを行う。目
的とするQ6アミラーぜ遺伝子を含有するクローンの選
別には、スターチ・アズール(Starch azul
e) (Signa社)及びクロラムフェニコールを含
むしB寒天培地上で形質転換体を培養して、コロニーの
周囲に明瞭なりリアゾーン(halo)が形成されるコ
ロニーを選別することによって行う。
菌を回収し、そのクロモシーム1)NAを例えばフェノ
ール法[Biochimica et Biophys
+caActa 72.619−629 (1963
)コによりW4製する。これを制限酵素、例えば3au
3AIで部分消化して密度勾配遠心法により処理して2
kb以上のDNA断片を得る。この断片を、あらかじめ
DI限酵素3amHIで切断したプラスミドpBR32
9にT 41) N Aリガーぜを用いて連結し、得ら
れる反応物を用いて大腸菌)−18101株を形質転換
し、常法に従ってショットガンクローニングを行う。目
的とするQ6アミラーぜ遺伝子を含有するクローンの選
別には、スターチ・アズール(Starch azul
e) (Signa社)及びクロラムフェニコールを含
むしB寒天培地上で形質転換体を培養して、コロニーの
周囲に明瞭なりリアゾーン(halo)が形成されるコ
ロニーを選別することによって行う。
以上の手法により、目的のクローンが一株得られた。型
開の保持するプラスミドは、pBR329の13amH
1部位に約3,3kbのG6アミラーゼ遺伝子を含む挿
入断片を持っていた。木組換えプラスミドをpsB40
4と命名した[^gricBio1.Chegi、、
53 (2) 、 491〜495 (1989)]。
開の保持するプラスミドは、pBR329の13amH
1部位に約3,3kbのG6アミラーゼ遺伝子を含む挿
入断片を持っていた。木組換えプラスミドをpsB40
4と命名した[^gricBio1.Chegi、、
53 (2) 、 491〜495 (1989)]。
このプラスミドpSB404上のG6アミラーゼ遺伝子
を以下に示す塩基配列決定に用いる。
を以下に示す塩基配列決定に用いる。
f3) G6アミラーゼ遺伝子の塩基配列の決定組換
えプラスミドpSB404上のG6アミラーピ遺伝その
塩基配列は、Sangerのジデオキシチェーンターミ
ネーション法[J、Ho1.Biol、、94 。
えプラスミドpSB404上のG6アミラーピ遺伝その
塩基配列は、Sangerのジデオキシチェーンターミ
ネーション法[J、Ho1.Biol、、94 。
441< 1975) :Pr0C,Natl、ACa
d、SCi、 ll5A74.5463 (1977)
コに従って決定することができる。
d、SCi、 ll5A74.5463 (1977)
コに従って決定することができる。
即ち、例えば、E、coJ!i MV1184とDU
C118、pUcコ19の宿主ベクター系[宝酒造■コ
を用いて、G6アミラーゼ遺伝子のサブクローニングを
行う。対象とするDNA断片を効率良く無駄なく配列決
定するために、プラスミドpsB404の制限酵素地図
[AOrlC,BIOChem、、53 (2)、49
1〜495 (1989)を利用した強制りU−ニング
とデレージョン[Gene、28,351〜359 (
1984):Gene、33,103〜119 (19
85)コを併用してサブクローニゲを行うのがよい。次
いでヘルパーファージM13KO7[宝酒造■;Vie
ira1.and Hessing、J、 (198
7) Methodsn Enzyn+ologV、
153 、3−11 Eを各サブクローンに感染させる
ことにより、対象とするDNA断片を含有するDNA−
重鎖がファージ粒子に包み込まれ、該ファージ粒子がサ
ブクローンの菌体外に放出される。このファージ粒子を
フェノール処理し、常法により塩基配列決定に必要な高
純度の一重鎖テンプレートDNAが得られる。
C118、pUcコ19の宿主ベクター系[宝酒造■コ
を用いて、G6アミラーゼ遺伝子のサブクローニングを
行う。対象とするDNA断片を効率良く無駄なく配列決
定するために、プラスミドpsB404の制限酵素地図
[AOrlC,BIOChem、、53 (2)、49
1〜495 (1989)を利用した強制りU−ニング
とデレージョン[Gene、28,351〜359 (
1984):Gene、33,103〜119 (19
85)コを併用してサブクローニゲを行うのがよい。次
いでヘルパーファージM13KO7[宝酒造■;Vie
ira1.and Hessing、J、 (198
7) Methodsn Enzyn+ologV、
153 、3−11 Eを各サブクローンに感染させる
ことにより、対象とするDNA断片を含有するDNA−
重鎖がファージ粒子に包み込まれ、該ファージ粒子がサ
ブクローンの菌体外に放出される。このファージ粒子を
フェノール処理し、常法により塩基配列決定に必要な高
純度の一重鎖テンプレートDNAが得られる。
このDNAを用いて、Sangerのジデオキシチェー
ンターミネーション法に基いて塩基配列の決定を行うこ
とができる。
ンターミネーション法に基いて塩基配列の決定を行うこ
とができる。
(4) 塩基配列の特徴
上記の塩基配列決定法により、第2図に示すDNA塩基
配列が得られた。開始コドンTTG(244番目の塩基
)で始まり、終止コドンTAG(3109109番目わ
る、2.865bpからなるオーブン・リーディング・
フレームが見い出された。このオーブン・リーディング
・フレームに対応するアミノ酸配列をアミノ酸の1文字
表記により第2図に同時に示した。また第2図で得られ
たアミノ酸配列(開始コドンに対応するMがら、終止コ
ドンの前の」トンに対応するPまで)を第1図に示した
。ここで得られた第1図に示すG6アミラーゼのアミノ
酸配列は本発明前によって初めて明らかにされたもので
ある。本発明では、第1図に示すアミノ酸配列をコード
する全てのG6アミラーゼ遺伝子が本発明の範囲内に包
含される。
配列が得られた。開始コドンTTG(244番目の塩基
)で始まり、終止コドンTAG(3109109番目わ
る、2.865bpからなるオーブン・リーディング・
フレームが見い出された。このオーブン・リーディング
・フレームに対応するアミノ酸配列をアミノ酸の1文字
表記により第2図に同時に示した。また第2図で得られ
たアミノ酸配列(開始コドンに対応するMがら、終止コ
ドンの前の」トンに対応するPまで)を第1図に示した
。ここで得られた第1図に示すG6アミラーゼのアミノ
酸配列は本発明前によって初めて明らかにされたもので
ある。本発明では、第1図に示すアミノ酸配列をコード
する全てのG6アミラーゼ遺伝子が本発明の範囲内に包
含される。
また、本発明では、第1図に示すアミノ酸配列を有する
G6アミラーゼと四様の酵素活性を有するポリペプチド
をコードする遺伝子も本発明の範囲内に包含される。こ
のような遺伝子の例として以下のものが挙げられる。
G6アミラーゼと四様の酵素活性を有するポリペプチド
をコードする遺伝子も本発明の範囲内に包含される。こ
のような遺伝子の例として以下のものが挙げられる。
即ち、微生物から高等植物、哺乳類に至るまでα−アミ
ラーゼのアミノ酸配列には、活性部位もしくは基質結合
部位にあたると思われる三つの共通部分が存在すること
が知られている[JBiochen、、 98.95〜
103 (1985) :^pp1.Hicrobio
1.Biotechno1.、 23 、355〜36
0 コ 。
ラーゼのアミノ酸配列には、活性部位もしくは基質結合
部位にあたると思われる三つの共通部分が存在すること
が知られている[JBiochen、、 98.95〜
103 (1985) :^pp1.Hicrobio
1.Biotechno1.、 23 、355〜36
0 コ 。
以下に示す3つのアミノ酸配列:
ASp−A I a−Va l −11e−A
snHis(領域A); GIV−Phe−△rg−1eu−AspA l a−
A l a−Lys−Hi s (領1BIPhe−V
a 1−Asn−Asn−Hi 5ASp(領域C
) がその共通配列である。DNAの塩基配列から推定した
G6アミラーゼのアミノ酸配列の中にもこれらの共通領
域が認められた。これらの共通領域A、B、Cは第2図
のアミノ酸配列のFに下線でそれぞれ示した。従ってこ
れらの共通領域A、B、Cを少なくとも含有し、他のア
ミノ酸配列部分が置換あるいは欠失し、且つ第1図に示
すアミノ酸配列を有するG6アミラーゼと同様の酵素活
性を有するポリペプチドをコードする遺伝子も本発明に
包含される。
snHis(領域A); GIV−Phe−△rg−1eu−AspA l a−
A l a−Lys−Hi s (領1BIPhe−V
a 1−Asn−Asn−Hi 5ASp(領域C
) がその共通配列である。DNAの塩基配列から推定した
G6アミラーゼのアミノ酸配列の中にもこれらの共通領
域が認められた。これらの共通領域A、B、Cは第2図
のアミノ酸配列のFに下線でそれぞれ示した。従ってこ
れらの共通領域A、B、Cを少なくとも含有し、他のア
ミノ酸配列部分が置換あるいは欠失し、且つ第1図に示
すアミノ酸配列を有するG6アミラーゼと同様の酵素活
性を有するポリペプチドをコードする遺伝子も本発明に
包含される。
また、G6アミラーゼの分子間は本来、約10o、oo
oであるが、プロテアーゼによってC末端側が切断され
、約60.000までプロセッシングされることが知ら
れている[ Agric、 Bi。
oであるが、プロテアーゼによってC末端側が切断され
、約60.000までプロセッシングされることが知ら
れている[ Agric、 Bi。
Chelll、、53(2)、491 〜495 (
1989)]。このプロ廿ツシングによって酵素の及応
特異性や反応生成物などの品持性が変化するわけではな
いことも明らかになっている。従って、第1図に示すア
ミノ酸配列のC末端側から約1/′3までを欠失したア
ミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする遺伝子も
本発明に包含される。
1989)]。このプロ廿ツシングによって酵素の及応
特異性や反応生成物などの品持性が変化するわけではな
いことも明らかになっている。従って、第1図に示すア
ミノ酸配列のC末端側から約1/′3までを欠失したア
ミノ酸配列からなるポリペプチドをコードする遺伝子も
本発明に包含される。
また、後述する実施例に示したように、バチルス属細菌
H−167株が産生するG6アミラーゼを実際に精製し
、そのN末端のアミノ酸配列を決定したところ、第1図
に示したアミノ酸配列の34番目の3erから始まる配
列と一致した。従って、それより前の部分は菌体外への
分泌過程で、シグナルペプチドとして働き、切断された
ものと考えられる。このことから第1図のN末端のMか
ら33番目のへまでを欠失したアミノ酸配列からなるポ
リペプチドをコードする遺伝子も本発明に包含される。
H−167株が産生するG6アミラーゼを実際に精製し
、そのN末端のアミノ酸配列を決定したところ、第1図
に示したアミノ酸配列の34番目の3erから始まる配
列と一致した。従って、それより前の部分は菌体外への
分泌過程で、シグナルペプチドとして働き、切断された
ものと考えられる。このことから第1図のN末端のMか
ら33番目のへまでを欠失したアミノ酸配列からなるポ
リペプチドをコードする遺伝子も本発明に包含される。
第2図に示されているように、G6アミラーゼ遺伝子の
開始コドンの10塩基上流にはリボソーム結合部位(S
D)と思われる配列 (AGGAGA>が、更にその上流にはσ55タイプの
プロモーター様配列(” −35″配列、TTGATT
: ”−10″配列、TAGAAT )[Nucle
ic Ac1ds Res、、 11 、 2237
〜2255 (1983)]が、認められた。これらの
配列を含む、第2図に示す8番目から243番目までの
DNA1!基配列からなる調節領域は新規なものであり
、例えばE、coj! iでの各種のG6アミラーゼの
発現用に使用することが可能なものである。
開始コドンの10塩基上流にはリボソーム結合部位(S
D)と思われる配列 (AGGAGA>が、更にその上流にはσ55タイプの
プロモーター様配列(” −35″配列、TTGATT
: ”−10″配列、TAGAAT )[Nucle
ic Ac1ds Res、、 11 、 2237
〜2255 (1983)]が、認められた。これらの
配列を含む、第2図に示す8番目から243番目までの
DNA1!基配列からなる調節領域は新規なものであり
、例えばE、coj! iでの各種のG6アミラーゼの
発現用に使用することが可能なものである。
第2図に示したように、終止コドンの約100塩基を流
の3212〜3226番目及び3236〜3250番目
にはパリンドローム構造が認められ、ターミネータ−と
して機能しているものと考えられる。
の3212〜3226番目及び3236〜3250番目
にはパリンドローム構造が認められ、ターミネータ−と
して機能しているものと考えられる。
(発明の効果)
本発明により明らかにされたG6アミラーゼ遺伝子を用
いることによって、広範囲の作用1)Hを有し耐熱性に
優れたマルトヘキサオース生成アミラ−ゼ(G6アミラ
ーゼ)を、例えば大腸−菌中で遺伝子組換え技術により
生産することが可能となる。
いることによって、広範囲の作用1)Hを有し耐熱性に
優れたマルトヘキサオース生成アミラ−ゼ(G6アミラ
ーゼ)を、例えば大腸−菌中で遺伝子組換え技術により
生産することが可能となる。
また、本発明で明らかにされたG6アミラーゼ遺伝子の
塩基配列に基づき、他の発現効率の高いG6アミラーゼ
遺伝子を開発することも可能であり、その工業的意義は
大きい。また本発明のG6アミラーゼ調節遺伝子は、各
種の06アミラーゼ構造遺伝子を発現させるための調節
領域として使用することができる。
塩基配列に基づき、他の発現効率の高いG6アミラーゼ
遺伝子を開発することも可能であり、その工業的意義は
大きい。また本発明のG6アミラーゼ調節遺伝子は、各
種の06アミラーゼ構造遺伝子を発現させるための調節
領域として使用することができる。
(実施例)
以下に実施例により本発明を更に詳細に説明する。
実施例
(1)使用菌株及びプラスミド
好アルカリ性バチルスH−167株(FERMP−86
83)を06アミラーゼの遺伝子供与体として用いた。
83)を06アミラーゼの遺伝子供与体として用いた。
クローニングの為の宿主としては大lI!!菌)−18
101株を用い、ベクターはプラスミドpBR329を
使用した。
101株を用い、ベクターはプラスミドpBR329を
使用した。
(2) 培地及び培養条件
H−167株は、pH9のアルカリ培地(2%ポリペプ
トン、0.1%イースト1キス、0,1%K HPo
、0.02%Mo5O−7H20゜1%溶性デンプン、
2.5%NaHCO3)を用いて培養した。H8101
株の培養には、LB培地を用いた。プラスミドを保持す
る菌を培養する場合には、LB培地にクロラムフェニコ
ールを20μg/Idになるように添加した。
トン、0.1%イースト1キス、0,1%K HPo
、0.02%Mo5O−7H20゜1%溶性デンプン、
2.5%NaHCO3)を用いて培養した。H8101
株の培養には、LB培地を用いた。プラスミドを保持す
る菌を培養する場合には、LB培地にクロラムフェニコ
ールを20μg/Idになるように添加した。
(3) クローニングの手順と結果
先ず上述のアルカリ培地を用いてH−167株を培養し
た(37℃、48時間)。続いて培養液から遠心分離(
8,OOOrpm 、30m1n > ニ依って菌を回
収し、クロモシームDNAをフェノール法[斉藤、三浦
、Biochilca et Biophysica^
cta72,619−629 (1963)コにより調
製した。これの約10μ9を制限酵素5au3Al
2Uにて10分間、部分分解した後、シ」糖密度勾配遠
心(ショ糖+1ff!Ij[:5−20%、28.OO
Orpm 、17 h) にかけ、2kb以上のDNA
断片からなる画分を得た。
た(37℃、48時間)。続いて培養液から遠心分離(
8,OOOrpm 、30m1n > ニ依って菌を回
収し、クロモシームDNAをフェノール法[斉藤、三浦
、Biochilca et Biophysica^
cta72,619−629 (1963)コにより調
製した。これの約10μ9を制限酵素5au3Al
2Uにて10分間、部分分解した後、シ」糖密度勾配遠
心(ショ糖+1ff!Ij[:5−20%、28.OO
Orpm 、17 h) にかけ、2kb以上のDNA
断片からなる画分を得た。
一方、1μ9のクローニングベクターp B R329
を101Jの制限酵素BamH1で切断した後、アルカ
リノオスノアターゼ処理を行なった。続いて、両者をT
4DNAリガーゼを用いて連結しく16℃、−晩)、大
腸菌H8101株を形質転換した。形質転換法は、Le
derbergとC0henらの方法[J、Bacte
riol、110.1072〜1074(1974)]
に従って行った。即ち、プラスミド溶液5C11(50
ngDNA)と、コンピテントな大腸菌1−1B 10
1株の懸濁液200μl(大腸菌の濃度I Q9cel
l/me)を混合し、水中で1時間保持した後、42℃
で2分間加温処理した。
を101Jの制限酵素BamH1で切断した後、アルカ
リノオスノアターゼ処理を行なった。続いて、両者をT
4DNAリガーゼを用いて連結しく16℃、−晩)、大
腸菌H8101株を形質転換した。形質転換法は、Le
derbergとC0henらの方法[J、Bacte
riol、110.1072〜1074(1974)]
に従って行った。即ち、プラスミド溶液5C11(50
ngDNA)と、コンピテントな大腸菌1−1B 10
1株の懸濁液200μl(大腸菌の濃度I Q9cel
l/me)を混合し、水中で1時間保持した後、42℃
で2分間加温処理した。
続いて、11dのしB培地を加え、更に2時間、37℃
で保持した後、0.2%5tarch azule(S
igma社)及び20μ9/ldクロラムフエニコール
を含むLB寒天培地(LB−8Aプレート)に塗布した
。アミラーゼ活性は、本プレート上でコロニーの周囲に
形成される明瞭なりリアゾーン(ha l o)として
検出された。結果として、目的のクローンが一株得られ
た。本クローンは、クロラムフェニコール耐性、テトラ
サイクリン感受性で、LB−8Aプレート上で、〜1[
に・−の周りに大きなりリアゾーンを形成した。本国の
保持するプラスミドは、pBR329の3amH1部位
に約3.3kbの挿入断片を持っていた。この挿入断片
が親株のH−167由来であることをリザンハイプリダ
イゼーションによって確認した。H−167株のクロモ
シームルDNAI OH2を制限酵素BamH1にて完
全に分解し、1%アガロースゲルを用いて、電気泳動を
行った。電気泳動後、アルカリ処理によって、ゲル中の
DNAを変性させてから、ニトロセルロースのフィルタ
ーに移して固定した。1方、プローブとしては、得られ
た組換えプラスミドを用い、これをニックトランスレー
ションキット(BRI−社)を用いてビオチンラベル化
した。前記フィルターをビチオンラベル化したプローブ
の溶液に浸し、45%ホルムアシド存在下、42℃で1
6時間、ハイブリダイゼーションを行った。プローブの
溶液から取り出したフィルターを、よく洗浄した後、ス
トレプトアヒジン−アルカリフォスターゼ−NBT色素
を用いて、プローブのハイ1リダイズしたバンドを発色
・可視化した。結果として、H−167株のクロモゾー
マルDNAに、組換えプラスミドがハイブリダイズする
ことが確認され、り[1−ン化したDNA断片が、H−
167由来のものであることが証明された。また、この
プラスミドは大腸菌H8101株を高頻度でアミラーゼ
産生菌に形質転換した。得られた組換えプラスミドをp
SB404と命名した。
で保持した後、0.2%5tarch azule(S
igma社)及び20μ9/ldクロラムフエニコール
を含むLB寒天培地(LB−8Aプレート)に塗布した
。アミラーゼ活性は、本プレート上でコロニーの周囲に
形成される明瞭なりリアゾーン(ha l o)として
検出された。結果として、目的のクローンが一株得られ
た。本クローンは、クロラムフェニコール耐性、テトラ
サイクリン感受性で、LB−8Aプレート上で、〜1[
に・−の周りに大きなりリアゾーンを形成した。本国の
保持するプラスミドは、pBR329の3amH1部位
に約3.3kbの挿入断片を持っていた。この挿入断片
が親株のH−167由来であることをリザンハイプリダ
イゼーションによって確認した。H−167株のクロモ
シームルDNAI OH2を制限酵素BamH1にて完
全に分解し、1%アガロースゲルを用いて、電気泳動を
行った。電気泳動後、アルカリ処理によって、ゲル中の
DNAを変性させてから、ニトロセルロースのフィルタ
ーに移して固定した。1方、プローブとしては、得られ
た組換えプラスミドを用い、これをニックトランスレー
ションキット(BRI−社)を用いてビオチンラベル化
した。前記フィルターをビチオンラベル化したプローブ
の溶液に浸し、45%ホルムアシド存在下、42℃で1
6時間、ハイブリダイゼーションを行った。プローブの
溶液から取り出したフィルターを、よく洗浄した後、ス
トレプトアヒジン−アルカリフォスターゼ−NBT色素
を用いて、プローブのハイ1リダイズしたバンドを発色
・可視化した。結果として、H−167株のクロモゾー
マルDNAに、組換えプラスミドがハイブリダイズする
ことが確認され、り[1−ン化したDNA断片が、H−
167由来のものであることが証明された。また、この
プラスミドは大腸菌H8101株を高頻度でアミラーゼ
産生菌に形質転換した。得られた組換えプラスミドをp
SB404と命名した。
(4) G6アミラーゼ遺伝子の塩基配列の決組換え
プラスミドpSB404上の06アミラーゼ遺伝子の塩
基配列をサンガーのジデオキシチェーンターミネーショ
ン法により決定した。G6アミラーゼの分子量(100
,000)を考慮すると、遺伝子はクローン化したDN
All1片のほぼ全体にわたっていると考えられたので
、塩基配列の決定も3.3kbの挿入断片全体について
行なった。
プラスミドpSB404上の06アミラーゼ遺伝子の塩
基配列をサンガーのジデオキシチェーンターミネーショ
ン法により決定した。G6アミラーゼの分子量(100
,000)を考慮すると、遺伝子はクローン化したDN
All1片のほぼ全体にわたっていると考えられたので
、塩基配列の決定も3.3kbの挿入断片全体について
行なった。
まず、旦ユcoj!i MV1184とpUC118
、DUC119の宿主ベクター系を用いてG6アミラー
ゼ遺伝子のサブクローニングを行なった。目的の領域の
DNA断片を無駄なくシーフェンスする為に、制限酵素
地図を利用した強制クローニングとデレージョンを併用
してサブクローンを進めた。
、DUC119の宿主ベクター系を用いてG6アミラー
ゼ遺伝子のサブクローニングを行なった。目的の領域の
DNA断片を無駄なくシーフェンスする為に、制限酵素
地図を利用した強制クローニングとデレージョンを併用
してサブクローンを進めた。
続いてヘルパーファージM13KO7を用いて一本鎖の
DNAを調製した。
DNAを調製した。
サブクローニングしたプラスミドを保持する大腸菌MV
1184株をしB培地1mを用いて37℃、1夜培養し
た。
1184株をしB培地1mを用いて37℃、1夜培養し
た。
1夜培養した液50111に50μlのMl 3KO7
、ファージ液を加え、37℃で1時間保持し、感染を行
った。次に5jli!の2xYT培地(16gトリプト
ン、10g酵母抽出物、59Nacj!/l水)を加え
、37℃で20時間培養し1=。
、ファージ液を加え、37℃で1時間保持し、感染を行
った。次に5jli!の2xYT培地(16gトリプト
ン、10g酵母抽出物、59Nacj!/l水)を加え
、37℃で20時間培養し1=。
G)IJcI 18、DUC119は、その内部にM1
3ファージのインテグレーション領域を持っており、ヘ
ルパーファージM13KO7の感染により一本鎖DNA
となって、ファージ粒子に包み込まれ、菌体外に放出さ
れる。
3ファージのインテグレーション領域を持っており、ヘ
ルパーファージM13KO7の感染により一本鎖DNA
となって、ファージ粒子に包み込まれ、菌体外に放出さ
れる。
遠心分離にて菌体を除いた上澄について1−のPEG溶
液(20%PEG、15%NacJ)を加え、ファージ
粒子を沈澱させた。
液(20%PEG、15%NacJ)を加え、ファージ
粒子を沈澱させた。
沈澱をTEバッファーに懸濁後、フェノール処叩にてタ
ンパク質を除いた後、エタノールにて沈澱濃縮し、高純
度の一本IEIDNAを得た。こうして調製したG6ア
ミラーゼ遺伝子の部分断片に付いてその塩基配列をへB
1社製DNA 5equencino system、 model
370 Aを用い、サンガーのジデオキシチェーンタ
ーミネーション法によって決定した。
ンパク質を除いた後、エタノールにて沈澱濃縮し、高純
度の一本IEIDNAを得た。こうして調製したG6ア
ミラーゼ遺伝子の部分断片に付いてその塩基配列をへB
1社製DNA 5equencino system、 model
370 Aを用い、サンガーのジデオキシチェーンタ
ーミネーション法によって決定した。
結果は第2図に示した通りである。
(5) 塩基配列の特徴
開始コドンTTG (244番目の塩基)で始まり、終
止]トンTAG(3109109番目)で終わる、2,
865bpからなるオーブン・リーディング・フレーム
が見いだされた。
止]トンTAG(3109109番目)で終わる、2,
865bpからなるオーブン・リーディング・フレーム
が見いだされた。
また開始コドンの10塩基上流にはリポソーム結合部位
と思われる配列(AGGAGA)が、更にその上流には
σ55タイプのプロモーター様配列(” −35″配列
、r rGA r丁; 11 10 I+配列、T A
G A A T )が認められた。終止コドンの約1
00塩基ト流にはパリンドローム構造が認められ、ター
ミネータ−として機能しているものと考えられた。
と思われる配列(AGGAGA)が、更にその上流には
σ55タイプのプロモーター様配列(” −35″配列
、r rGA r丁; 11 10 I+配列、T A
G A A T )が認められた。終止コドンの約1
00塩基ト流にはパリンドローム構造が認められ、ター
ミネータ−として機能しているものと考えられた。
微生物から高等植物、哺乳類に至るまでα−アミラーゼ
のアミノ酸配列には、活性部位もしくは基質結合部位に
あたると思われる三つの共通部分が存在することが知ら
れている。Asp−A l aVat−11e−Asn
−His(領域A)、G I V−Phe−Arに1−
LelJ−△spA l a−A l a−L
ys −トlis (領 IRB) 、Ph
e−Va 1−ASp−ASn−Hi 5Asp(領域
C)がその共通配列である。DNAの塩基配列から推定
したG6アミラーゼのアミノ酸配列の中にもこれらの共
通領域が、認められた(第2図、下線A、B、C)。
のアミノ酸配列には、活性部位もしくは基質結合部位に
あたると思われる三つの共通部分が存在することが知ら
れている。Asp−A l aVat−11e−Asn
−His(領域A)、G I V−Phe−Arに1−
LelJ−△spA l a−A l a−L
ys −トlis (領 IRB) 、Ph
e−Va 1−ASp−ASn−Hi 5Asp(領域
C)がその共通配列である。DNAの塩基配列から推定
したG6アミラーゼのアミノ酸配列の中にもこれらの共
通領域が、認められた(第2図、下線A、B、C)。
G6アミラーゼを実際に精製し、N末端のアミノ酸配列
を決定したところ、冒頭に示したアミノ酸配列の34番
目のsepから始まる配列と一致した。従って、それよ
り前の部分は菌体外への分泌過程で、シグナルペプチド
として働き、切断されたものと考えられる。
を決定したところ、冒頭に示したアミノ酸配列の34番
目のsepから始まる配列と一致した。従って、それよ
り前の部分は菌体外への分泌過程で、シグナルペプチド
として働き、切断されたものと考えられる。
本酵素の分子iは本来、約100.000であるが、プ
ロテアーゼによってC末端側が切断され、約60.00
0までプロセッシングされることが知られている[Ao
ric、Biol、Chem、、 53 (2) 。
ロテアーゼによってC末端側が切断され、約60.00
0までプロセッシングされることが知られている[Ao
ric、Biol、Chem、、 53 (2) 。
491〜495 (1989)]。また、このププロセ
ラシンによって酵素の反応特異性や反応生成物などの品
持性が変化するわけではないことも明らかになっている
[八pp1.HicrobiolBiotechno1
..28.281 (1988) ] 、このことから
、本遺伝子の後半、約1/3はG6アミラーゼの発瑣に
は必須ではないことが類推される。
ラシンによって酵素の反応特異性や反応生成物などの品
持性が変化するわけではないことも明らかになっている
[八pp1.HicrobiolBiotechno1
..28.281 (1988) ] 、このことから
、本遺伝子の後半、約1/3はG6アミラーゼの発瑣に
は必須ではないことが類推される。
第1図は、好アルカリ性バチルス属細菌ト1−167株
由来のマルトヘキサホス生成アミラーゼ(G6アミラー
ゼ)のアミノ酸配列を示す。 第2図は、好アルカリ性バチルス属細菌H−167株由
来のG6アミラーゼ遺伝子及びそれに対応するアミノ酸
配列を示す。
由来のマルトヘキサホス生成アミラーゼ(G6アミラー
ゼ)のアミノ酸配列を示す。 第2図は、好アルカリ性バチルス属細菌H−167株由
来のG6アミラーゼ遺伝子及びそれに対応するアミノ酸
配列を示す。
Claims (3)
- (1)第1図に示すアミノ酸配列を有するG6アミラー
ゼあるいはそれと同様の酵素活性を有するポリペプチド
をコードするG6アミラーゼ遺伝子。 - (2)第2図に示すDNA塩基配列の244番目から3
108番目までのDNA塩基配列である請求項第1項記
載のG6アミラーゼ遺伝子。 - (3)第2図に示すDNA塩基配列の8番目から243
番目までのDNA塩基配列を有するG6アミラーゼ遺伝
子発現用調節遺伝子。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP13372690A JPH0427392A (ja) | 1990-05-23 | 1990-05-23 | G6アミラーゼ遺伝子 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP13372690A JPH0427392A (ja) | 1990-05-23 | 1990-05-23 | G6アミラーゼ遺伝子 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH0427392A true JPH0427392A (ja) | 1992-01-30 |
Family
ID=15111476
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP13372690A Pending JPH0427392A (ja) | 1990-05-23 | 1990-05-23 | G6アミラーゼ遺伝子 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPH0427392A (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2000058447A1 (en) * | 1999-03-30 | 2000-10-05 | Danisco A/S | Non-maltogenic exoamylase from b. clausii and its use in retarding rerogradation of a starch product |
-
1990
- 1990-05-23 JP JP13372690A patent/JPH0427392A/ja active Pending
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2000058447A1 (en) * | 1999-03-30 | 2000-10-05 | Danisco A/S | Non-maltogenic exoamylase from b. clausii and its use in retarding rerogradation of a starch product |
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