JPH04365477A - Dnaクローニングベクターtg1 - Google Patents

Dnaクローニングベクターtg1

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JPH04365477A
JPH04365477A JP3272989A JP27298991A JPH04365477A JP H04365477 A JPH04365477 A JP H04365477A JP 3272989 A JP3272989 A JP 3272989A JP 27298991 A JP27298991 A JP 27298991A JP H04365477 A JPH04365477 A JP H04365477A
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】本発明は細胞系内へのDNAの組み込みを
行なうために、アクチノファージTG1関連ベクター(
vectors)に付加DNAを組み込む方法に関する
。より詳細には、本発明はファージTG1宿主菌種スト
レプトマイセス  カトレヤ(Streptomyce
s cattleya)NRRL8057、ストレプト
マイセス アベルミチリス(Streptomyces
 avermitillis)MA4990、ストレプ
トマイセス ビリドクロモゲネス(S. virido
chromogenes)NRRL3414、ストレプ
トマイセス ガリファルス(S. garyphalu
s)NRRL2448などを含め細菌などの生物体内へ
のクローニングベクターとして有用な新規なバクテリオ
ファージTG1ゲノムおよびその誘導体(欠失および挿
入変異型)ゲノムへの外来DNAの組み込み方法に関す
る。本発明によって得られた細胞は新規であり、その細
胞の複製及び/又はDNAまたはファージとしてのその
ベクター誘発および複製を通じて、あるいはその外来核
酸の存在によってその細胞に価値ある特性を付与するこ
とを通じてこの外来核酸及び/又はその産物の製造手段
として有用性を持つものである。
【0002】DNAのクローニングのためのバクテリオ
ファージの利用は、すでに確立された技法に属する。し
かしながら この技術のアクチノマイセス(Actin
omyces)のファージへの応用は最近のことである
。この点に関しては、下記の論文および特許文献が参照
される。 1)“Development of a DNA C
loning System in Streptom
yces Using Phage Vectors”
, J.E.Suarez と K.F.Chater
;6 Cienc. Biol. 第99〜110頁(
1981年)。 2)“Restriction Mapping of
 the DNA of the Streptomy
ces Temperate PhageφC31 a
nd Its Derivatives”, K.F.
 Chater, C. J. Bruton および
 J. E.Suarez;14  Gene, 第1
83〜194頁(1981年)。 3)“DNA Cloning in Strepto
myces: Resistance Genes f
rom Antibiotic −Producing
 Species”,C.J.Thompson,J.
M.Ward およびD.A.Hopwood;286
 Nature, 第525〜527頁(1980年)
。 4)“Dispensable Sequences 
and Packaging Constraints
 of DNA from theStreptomy
ces Temperate Phage φC31”
, K. F. Chater, C. J. Bru
ton, W.Springer および J. E.
 Suavez;15 Gene, 第249〜256
頁 (1981年)。 5)“A DNA Cloning System f
or Interspecies Gene Tran
sfer in AntibioticProduci
ng Streptomyces”, M. Bibb
, J. L. Schottel および S.N.
Cohen;284 Nature,第526〜531
頁(1980年)。 6)“DNA Cloning in strepto
myces;A Bifunctional Repl
icon Comprising PBR 322 I
nserted into A Streptomyc
es Phage”, J. E. Suarez と
 K. F.Chater;286 Nature, 
第527〜529頁(1980年)。 7)“Cloning and Expression
 in Streptomyces lividans
 of Antibiotic Resistance
 Genes Derived from Esche
richia coli.”, J. L. Scho
ttel, M.Bibb および S. N. Co
hen;146 Journal of Bacter
iology, 第360〜368頁(1981年)。 8)“ActinoPhage DNA”,K.F.C
hater;21 Developments in 
Industrial Microbiology, 
第6章、第65〜74頁(1980年)。 9)英国特許願G.B.第2023612A号;No.
7919158;1980年1月3日発行。 10)英国特許願G.B.第2031434A号;No
.7928156;1980年4月23日発行。 11)英国特許願G.B.第2018778A号;No
.7913033;1979年10月24日発行。 12)欧州特許願第0036259A2号;No.81
300858.8;1981年9月23日発行。 13)英国特許願G.B.第2046272A号;No
.8011000;1980年11月12日発行。 14)英国特許願G.B.第2069503A号;No
.8104473;1981年8月26日発行。 15)欧州特許願第0020147A1号;No.80
39178.4;1980年12月16日発行。 16)欧州特許願第0020251A2号;No.80
400722.7;1980年12月10日発行。
【0003】土壌から単離された本発明のバクテリオフ
ァージTG1は広範な特性研究に基づき、従来未だ記載
されていないアクチノファージであることが同定された
。このファージはテンペレート(temperate)
である、すなわちStreptomyces catt
leya MA4297(NRRL8057)の溶原化
(lysogenic) ファージである。このファー
ジは、ブラッドレー[David E. Bradle
y (1967)“Ultrastructure o
f Bacteriophages and Bact
riocins”, Bacteriol., Rev
. 31、第230〜314頁]によるB型形態を有す
る。このファージの頭部は正二十面体形であり平均頭部
直径は約57nmである;そうして第1図の電子顕微鏡
に見られるように基板を含めたファージ尾部は長さ約1
28nmである。このファージの核酸は二本鎖DNA分
子であって、付着末端を有し、長さは41.47キロ塩
基対である。第2図は、このファージDNAの制限エン
ドヌクレアーゼ分裂部位の位置を示す地図である。これ
らの位置は、シングルPstI部位に最も近いこのファ
ージDNAの末端からのキロ塩基対の部位距離として与
えられている。地図は、酵素Hind III、Kpn
I、PstI、SmaI、SphI、XbaIのすべて
の部位を示しており、これらはアガロースゲル電気泳動
と、0.2キロ塩基対およびそれ以上の断片の臭化エチ
ジウム染色とによって決定することができた。下記酵素
は、このDNAを分裂し得なかった:BamI、Nae
I、NarI、PvuI、SstI、SstII、St
uIおよびXhoI。或る種の欠失変異体および雑種フ
ァージ誘導体については、以下に同様に記載する。ファ
ージTG1は以下にさらに詳細に記載する。なお、以下
の記載においては、該ファージの単離、保存、繁殖に関
する明瞭な特定化情報ならびに特にサイズとその制限マ
ッピングとによって定義されたその核酸のデータが記載
される。なお、後記のごとく、TG1プロファージを含
む微生物、代表的TG1プロファージ誘導体およびTG
1プラスミド誘導体は、特許手続上の微生物の寄託の国
際的承認に関するブダペスト条約の下に公認されたカル
チャーコレクションに寄託されている(表I参照)。
【0004】本明細書に記載のごとく、ファージTG1
、そのゲノム、誘導体およびTG1ゲノムまたはそのい
くつかの部分を含むキメラDNA分子は、特に組換えD
NA技術におけるクローニングビヒクル(clonin
g vehicles)として有用性を持つ。ファージ
TG1は、DNAクローニングベクターとしてそれを格
別に有用なものとするある特別な性質を有している。そ
のDNAおよびその誘導体は、単離が容易であり且つプ
ロトプラストに細胞感染(トランスフェクション)させ
次に得られたファージを溶菌増殖させることによって容
易に増加させることができる(実施例1、J項参照)。 これらの機能ならびに宿主菌を溶原化する能力を保持し
且つ相当量(数キロ塩基対)の外来DNAを挿入するの
に十分なスペースを与える欠失突然変異体が容易に得ら
れる。さらに、本ファージDNAは、制限エンドヌクレ
アーゼPstIのためのただ1つの開裂部位を有してい
る。その部位は、そのファージゲノムの必要不可欠では
ない領域内に位置している。この部位における外来DN
Aの挿入は、該ファージの溶菌的および溶原的機能を損
なうことがない(実施例1、I項およびM項参照)。こ
のようなDNA挿入に格別に好適な部位を持つことは、
クローニングベクターの1つの重要な特性である。なぜ
ならば、所望立体配置の混成分子が得られる可能性が、
ただ2個の新しいDNA結合の形成が必要となるだけで
大幅に増大されるからである。
【0005】ある1つのベクターへのクローニングのた
めに使用しうる制限酵素について広い選択の余地がある
ことは、組換えDNAの実験においてきわめて有利であ
る。多数の制限エンドヌクレアーゼは、このファージD
NAを開裂させ得ない(実施例1、H項参照)。その特
別なPstI部位は、アダプター分子の使用によってこ
れら酵素のいずれか1つのための独特な部位に変換させ
られうる[R. G. Rothstein、 L. 
F. Lau、 C. P. Bahl、S. A. 
Naraang および R. Wu の Metho
ds inEnzymology 68巻(1979年
)、S. P. Colowick および N. O
. Kaplan 編、第98〜109頁所載の論文参
照]。 このPstIクローニング部位を別の独自な部位に変換
するための別の技術は、所望部位を含む短い断片を挿入
することである。実施例2のA項には、両側にPstI
部位を有する単一BamH  I部位を持つ短断片をP
stI部位に挿入するための方法が示されている。
【0006】TG1ベクターとその誘導体が宿主DNA
内へ挿入されうることは、いま1つの重要な特性である
。この特性が、遺伝子および遺伝子の新規な組合せを伝
達する雑種ベクターを宿主内へ安定的に組込むことを可
能にし、これによってその宿主に対して新規な化合物の
生産(たとえば、B型肝炎表面抗原、実施例2参照)、
あるいは例えば増加された遺伝子量による通常細胞産物
の生産増加が可能となる。組込みはまた、宿主突然変異
体の遺伝的相補性によるクローン遺伝子の検定のために
も役立つ。その遺伝子を含む溶原菌が一旦同定されてし
まえば、その溶原菌から得られたファージを増殖し、次
いでそのファージDNAを単離することによって簡単に
大量にその遺伝子を回収することがベクターにより可能
となる。すなわち、このベクターはプラスミドpACY
C177のDNAの大量生産に役立つ(実施例1、M項
参照)。
【0007】このファージの宿主域は、特別に興味ある
ものである。Streptomyces cattle
yaMA4297(NRRL8057)は化合物チエナ
マイシンを産生する(米国特許第3950357号参照
)。チエナマイシンは、グラム陽性菌およびグラム陰性
菌の両者に対して強力な抗菌作用を持っている。これは
さらに、ベーターラクタマーゼの存在の故に、ペニシリ
ンやセファロスポリンのごときベーターラクタム抗生物
質に対して耐性のある細菌に対しても有効である。別の
ファージ宿主である Streptomyces av
ermitilis は、アベルメクチンと呼ばれてい
る化学的に類縁の剤の錯体を産生し、これはきわめて強
力な駆虫作用を示す(R.W.Burg等の論文:An
timicrobial Agents and Ch
emotherapy、15、第361〜367頁(1
979年)。本ファージは、これら重要な化合物の合成
および合成制御に関連して、当該遺伝子中の突然変異体
の遺伝的相補性により遺伝子および遺伝子産物の同定、
単離および研究のために使用することができる(たとえ
ばチエナマイシンのために、実施例3参照)。
【0008】ファージTG1のある種の混成誘導体は、
別の面において役立つ。実施例1のM項にその構造およ
び特性が記載されているこれら雑種は、TG1ベクター
の誘導体が Escherichia coli 内で
プラスミドとして複製されることを可能にする。これら
雑種ファージ−プラスミドベクターは、トランスフェク
ションによってあるいはトランスフォーメーションによ
って、異なる種の間を転移させることができる。この特
性は非常に価値あるものである。なぜならばこれによっ
て Escherichia coli のためにこれ
まで開発されてきた遺伝子技術の使用が可能となるから
である。たとえば、S.cattleya からの遺伝
子をE.coli へ組み入れて相補的な突然変異を生
じさせることが可能となろう。E.coli 中のその
S.cattleya遺伝子内への突然変異の導入が、
たとえば、トランスポゾン突然変異誘発によってできよ
う。あるいはまた、ナンセンスサプレッサー(翻訳停止
コードン)によって抑圧される突然変異体を単離するこ
とが可能となろう。後者の突然変異された遺伝子は、S
.cattleya 内へ戻すことができ、そして S
.cattleya 内の翻訳停止コードンを抑圧する
ことが可能な突然変異体を単離するために使用すること
ができる。このようなサプレッサー突然変異は、かかる
生物の遺伝研究に役立つ。 E.coli 内でそのベクターが複製できるというこ
とは、別の面でも有益である。この特性は、挿入プラス
ミドDNAの領域外でのベクターDNAの欠失部の選択
のために使用された(実施例1、N参照)。かかる欠失
は、ベクター内のかなりの量のDNAのクローニングの
ために重要である。TG1とその誘導体は、特定ファー
ジベクターのDNA中への挿入のために適当な各種の制
限酵素を用いて切除されたDNA配列をクローン化する
ために別の仕方で利用することができる。組換えDNA
技術の有益な解説書の1つはMethods in E
nzymology、 Vol.68(1979年)、
Academic Press 社(ニューヨーク)発
行である。
【0009】クローニング実施法の改良、変更は、別の
ファージ変種の使用および別の制限酵素の使用以外にさ
らに以下のものを含む。制限されたベクターDNAをホ
スファターゼで処理して末端リン酸基を除去し、しかし
てそのベクターDNAの自己連結(self liga
tion)を防止すること;1つの制限酵素による開裂
によって生じた一本鎖端部をSIヌクレアーゼを用いて
除去、或いはかかる一本鎖端部の相補部のDNAポリメ
ラーゼによる合成の後に平滑末端連結を行う;および/
またはベクターと挿入されるべきDNAとの間に付着端
を与えるDNA尾端反応(tailing react
ion)を行なうことである。 (Nelson および Brutlag、 Meth
ods inEnzymology, Vol.68(
1979年)第41〜50頁参照)。
【0010】トランスフェクション頻度は、記載されて
いる条件または成分を変えることによって、あるいは連
結されたDNAをリポゾームカプセル封入し、続いてか
かるリポゾームを受容菌のプロトプラストへ融合するこ
とによって向上させることができる。このような技法は
、最近J.F.Makins と G.Holt によ
って染色体DNAのリポゾームトランスフォーメーショ
ンの場合について記載されている[Nature 29
3(1981年)、第671〜673頁]。そこに記載
された方法またはその変法が使用できる。
【0011】所望の挿入DNAを含む雑種ファージのた
めのファージクローンまたは溶原菌のスクリーニングは
、挿入体の形質的または遺伝的性状に応じていくつかの
方法で実施することができる。たとえば、特にアミノ酸
、ビタミン、プリンまたはピリミジンのごとき一次代謝
物質の合成の途中がブロックされた突然変異体を相補で
きる遺伝子を、次の方法で検出することができる。
【0012】特定突然変異種をプロトプラスト化し、そ
して連結されたDNAでトランスフェクトし、そしてな
んら選択をせずに放置して再生させる。この結果生じる
コロニーは、非トランスフェクト細胞、非雑種ファージ
によるトランスフェクトから生じた溶原菌ならびに雑種
ファージによる感染から生じた溶原菌を含んでいる。所
望の挿入体を含んでいる溶原菌は、1つの特定栄養素が
欠乏している最少培地上でその再生培養を培養すること
によって単離される。コロニーは適当なDNA挿入体を
含む再生溶原菌からのみ生じる。所望の挿入体を同じく
簡単に検出できる第2の方法は、野生型プロトプラスト
を連結DNAでトランスフェクトし、これを野生型菌(
germlings)と混合し、そしてこの混合物を適
当なプレート上で平板培養して溶菌斑(プラーク)を形
成させる方法である。増殖後の培地は親のファージの再
連結(religation)に起因するプラークと、
挿入体を持つファージに起因するプラークとを含む(実
質的にはプラスミドpACYC177をTG1誘導体に
挿入したものを単離するために使用される方法と同じで
ある;実施例1、M項参照)このファージを採集して実
施例B項に記載したような無菌ファージストックが得ら
れる。これらの溶菌液は適当な突然変異株に形質導入す
るために使用される。 所望の挿入体を含むファージのみが特定突然変異の形質
導入の能力を持ち、そしてコロニーを形成させる。通常
容易に検出可能な増殖表現型を持たない抗生物質のごと
き二次代謝生成物の生産中にブロックされる突然変異体
の場合には、所望の挿入体を含むファージは、上記に記
載した方法のいずれかによって得られた溶原菌を適当な
培地で培養することによって検出される。ある時間だけ
コロニーを生育させたのち、その抗生物質に敏感な生物
の培養物を培地に流し込み、そして更に培養する。機能
性抗生物質合成遺伝子を持つ挿入体を含む溶原菌は、そ
の抗生物質を産生し、そしてコロニーのまわりに増殖阻
止域を形成させる(実施例2参照)。
【0013】リポゾームRNAや転移RNAのような、
なんら検出可能な表現型を授けないDNAの挿入体を含
むファージは、プローブとして相補DNAを用いてプラ
ークまたはコロニー交雑によって検出することができる
【0014】所望コロニー単離の効率は、溶原菌の直接
選択の方法が開発されたならば、相当程度まで増大させ
ることができる。このような選択は、抗生物質に対する
耐性または生合成ステップをコードする挿入DNAを含
むDNAをベクターファージとして用いて行うことがで
きる(実施例2及び3を参照)。いずれの選択でも、未
感染プロトプラストから生じるコロニーの分析が不必要
になろう。
【0015】抗生物質合成のための遺伝子を含むファー
ジクローンは、いくつかの他の実験にも使用することが
できる。このファージは、野生型あるいは他の抗生物質
産生培養物に形質導入し生産レベルでの、特定クローン
遺伝子の増加量の効果を調べるために使用できる。部位
特異的突然変異誘発の技術は、特定クローン遺伝子内の
突然変異体の単離のために使用することができ、これに
よって、離れているが多分有害な損傷(lesions
)がある株に導入されることが排除される。このような
局所突然変異誘発は、抗生物質の生産を増加または減少
させる突然変異体の単離を可能にし、そして生産菌の改
良および抗生物質の合成および制御の遺伝的解析の助け
になるであろう。組換えDNAの技術はまた、特定の抗
生物質合成遺伝子の発現を大幅に増強するために、適当
な部位に高レベルプロモータ配列を導入することを可能
ならしめるであろう。遺伝子産物量の増加は、その菌株
の生産性を顕著に高めるであろう。クローン遺伝子産物
は、宿主細胞を紫外線照射し次いで特定雑種ファージを
感染させることによって同定されうる。放射線標識をつ
けたアミノ酸の存在下で増殖させると、そのファージに
よってコードされたタンパク質が放射線標識されて合成
されるであろう。宿主細胞によってコードされたタンパ
ク質は、紫外線処理によって生じた損傷のために合成さ
れないであろう。これらタンパク質は、標準技術によっ
て分離されそして分析されうる。
【0016】外来DNA、すなわち宿主菌以外の源から
のDNAも本ファージベクター内へ挿入できる。pAC
YC177の該ファージへの挿入は、その1例である。 このような場合、宿主制限系の存在は、トランスフェク
ションの頻度を大幅に低下させ、したがって所望クロー
ンの検出を困難にする。この問題を排除するために、宿
主制限に欠陥のある菌突然変異体を単離することができ
る。このような菌株およびその誘導体は、次にクローニ
ング実験のための宿主として役立てることができる。有
用であることが証明されうる外来DNAの例は、抗生物
質産生遺伝子、情報サップレッサー(転移RNA)の暗
号を持つ遺伝子、あるいはトランスポゾンまたは突然変
異遺伝子のごとき突然変異誘発性要素である。
【0017】クローン化抗生物質遺伝子は、標準的組換
えDNAの技術を用いて物理的に単離可能であり、そし
て他のクローニングベクターへ転移されることができる
。これらは、宿主生体内で複製を行なうプラスミドまた
は他の菌株内で複製を行なうプラスミドを含む。クロー
ン化抗生物質遺伝子は、TG1またはその誘導体を介し
て、通常はその抗生物質を産生しない他のStrept
omyces 菌株へ転移されうる。この転移により、
新規な抗生物質の合成、あるいはそのクローン遺伝子の
発現の変化がもたらされるであろう。
【0018】本ベクターは、DNAクローニングを達成
するためいくつかの別の仕方で使用することができる。 通常は無関係の菌株のプラスミドたとえばE.coli
のプラスミドは、それがあるファージ宿主菌株に導入さ
れた場合、それが外来起源であるが故に複製しないかあ
るいは保存されない。しかしながら、もしそのプラスミ
ドが該宿主染色体に存在するものと相同なDNA配列の
挿入によって予め変えられていたならば、その相同座位
において該染色体に該プラスミドが組み込まれた組換え
が可能となる。もしその宿主菌株がファージ溶原菌であ
る場合には、プラスミド上のその相同シーケンスは、1
つのファージ断片によって提供されうる。この場合、染
色体に組み込まれるプロファージに、そのプラスミドが
挿入される。このような挿入されたプラスミドは、その
プロファージが組み込まれた状態のままでいる限り宿主
染色体の一部として保存されるであろう。あるいは、フ
ァージの通常の組み込みのために必要な機能を持ってい
るある特定ファージ断片、すなわち、付着部位とファー
ジ組み込みに必要な遺伝子産物を指示するコードを持つ
ファージ遺伝子とを持つ断片をプラスミドに挿入しても
よい。このようなベクターは、野生型ファージの組み込
みと同様な態様且つ同じ座位において宿主遺伝子へ挿入
可能でなければならない。挿入されたベクターを持つ組
換え菌は、もしある選択可能な遺伝子型も同時にそのベ
クターによって運ばれていたならば、容易に同定するこ
とができる。このタイプのベクターは、下記のごときい
くつかの利点を持つ: (1)  そのような分子内にクローン化されうるDN
Aの量が、ファージパッケージングの束縛によって制限
されることがない。 (2)  プラスミドがそのオリジナル宿主内で複製可
能である。たとえばStreptomyces 宿主内
よりもはるかに容易に種々の遺伝的または物理的操作を
行なうことのできるE.coliオリジナル宿主内で複
製可能である;(3)  たとえば、ラムダcos部位
のようなエレメントも導入可能である。これによってコ
スミドDNAクローニングの技術(Methods i
nEnzymology,Vol.68参照)を用いて
プラスミド宿主たとえばE.coli内で大きなDNA
断片をクローニングし、次いで生じた雑種DNAを単離
しそしてStreptomyces 菌株のプロトプラ
ストをトランスフォーメーションまたはトランスフェク
ションすることが可能となる。
【0019】その他のファージシーケンスもまたクロー
ニングの目的のために使用することができる。一例を挙
げれば、ファージTG1のcos部位である。この部位
は、DNAをファージキャプシドの中にパッケージング
する間ある1つのファージ産物によって認識される。効
果的なパッケージングのために、順次連続するcos座
位間のDNAの長さが一定以上である必要がある。この
cos部位が1つのプラスミド内に挿入され且つ他のD
NAも挿入されれば、そのDNAを処理しそしてファー
ジ粒子を形成するために試験管内パッケージングシステ
ムが使用できる。cos座位間のDNAの正しい長さを
作り出すような挿入物のみをパッケージすることができ
、これによって大きい挿入物が選択される。
【0020】染色体遺伝子を異なる制御下におくために
ファージプロモータシーケンスも利用することができる
。ファージプロモータのいくつかは、ファージレギュレ
ータ機構によって制御される。すなわち、正しく挿入さ
れたクローン遺伝子の発現もまたかかる制御機構によっ
て制御されることとなる。たとえば、温度感受性リプレ
ッサーは、低温においては、オペレータ座位に結合する
ことによってある特定のプロモータの発現を大幅に低減
させるであろう。他方、高温においては、そのリプレッ
サーは不活性となりそして高レベルの転写が起こるであ
ろう。もしある所望のクローン遺伝子が適当な位置に挿
入されたならば、その発現とその遺伝子の生産レベルは
、温度調節によって発酵の間制御可能である。
【0021】                          
        表  I             
                   微生物寄託 
      菌    株             
                         
   受    託     番    号     
           固有ベクター        
     番    号     (注a)     
                         
           (注b)       MA5
766                 TG2  
        ATCC 39077   MA57
67                 TG1   
       ATCC 39078   MA576
9                 TG4    
      NRRL 15034   MA5770
                 TG5     
     NRRL 15035   MB4540 
              pTG6       
   ATCC 39079   MB4541   
            pTG12        
ATCC 39080   MB4542      
         pTG16        ATC
C 39081   MB4543         
      pTG7          ATCC 
39082   MB4544           
    pTG15        NRRL B−1
5027   MB4545            
   pTG8          NRRL B−1
5028   MB4546            
   pTG9          NRRL B−1
5029   MB4547            
   pTG10        NRRL B−15
030   MB4548             
  pTG11        NRRL B−150
31   MB4549              
 pTG13        NRRL B−1503
2   MB4550               
pTG14        NRRL B−15033
【0022】注a 菌株の呼称はメルク社(Merk and Co.In
c.,Rahway, New Jersey)の培養
コレクションの呼称である。MA5766〜MA577
0は指示したファージベクターに対して溶原性であるS
treptomyces cattleya  MA4
297(NRRL8057)の誘導体である。MB45
40〜MB4550は指示した雑種ファージ−プラスミ
ドベクターを含む Escherichia  col
i K−12RR1の誘導体である。E.coli K
−12RR1はF.Bolivar、 R.L.Rod
riquez、M.C.BetlachおよびH.W.
Boyerによって、 Gene 2、第75〜93頁
(1977年)に記載されている。 注b 各菌株の培養物はATCC(the American
 Type Culture Collection)
、米国メリーランド州、ロックビル、パークローンドラ
イブ12301所在、に永久寄託され、そして1982
年4月2日現在すべて完全である。また1982年現在
the Agricultural Research
 Culture Collection (NRRL
)、Ferementation Laborator
y、Northern Regional Resea
rch Center、Science and Ed
ucation Administration、U.
S. Department of Agricult
ure、米国イリノイ州、ペオリア、ノースユニバーシ
ティストリート1815所在、に寄託されており、そし
て表に示した受託番号が与えられた。
【0023】図面についての説明 第1図 これはファージTG1の電子顕微鏡写真である。サンプ
ルは、2%のリンタングステン酸水溶液(1.0モルK
OHでpH6.3に調整)で染色された。試料は、フィ
リップス300透過型電子顕微鏡(Philips 3
00 Transmission Electron 
Microscope)を用いて210570倍の倍率
で観察された。
【0024】第2図 これはファージTG1の制限地図である。位置は任意的
に左端として示してある単一のPstI座位に最も近い
ファージDNAの端からのキロ塩基対単位での座位距離
として与えられている。この地図は、Hind III
、Kpn I、PstI、Sma I、SphI、Xb
a Iの酵素のためのすべての部位を示す。これらの位
置はアガロースゲル電気泳動と、0.2キロ塩基対およ
びそれより大きな断片の臭化エチジウム染色とによって
決定することができた。
【0025】第3図 これはファージTG1の欠失突然変異体を示す。欠失は
当該DNAを酵素Hind III、Kpn I、Ps
t I、Sph I、Xba Iで消化させることによ
って解析された。TG1のための制限部位の位置は、第
2図と同様に、ファージDNAの左端からのキロ塩基対
で示されている。各誘導体についての欠失DNAの位置
が未確認であることはTG1の地図の下に横向きカッコ
で指示されている。なお、ファージ地図の左端のみが示
されていることに注意されたい。この領域外には欠失は
起こらなかった。欠失の最も左の可能位置は、上向きカ
ギカッコで示唆されており、最も右の可能位置は、下向
きカギカッコで示唆されている。キロ塩基対(Kbp)
単位での各欠失長さは、関連するカッコの右側の丸カッ
コ内に記載してある。ファージ突然変異体は左側に同定
されている。ただし、一方のカギカッコの端位置の部位
がその突然変異体に存在しない場合には、それは他方の
カギカッコの中に閉じられていることに注意されたい。 その他の場合はその所位は存在する。
【0026】第4図 これは雑種ファージTG6とTG7および欠失突然変異
体を示す。TG6とTG7の制限地図の左端のみが示さ
れていることに注意されたい。10.28Kbpの位置
にあるPstIの右側のすべての制限座位は第2図に示
したTG1のそれと同じである。ただし、これらの制限
座位の位置は、PstI座位のすぐ左の2.0Kbpの
DNAの欠失(第3図のTG2参照)とこの部位への3
.9KbpのpACYC177DNAの挿入を考慮すれ
ば、1.9Kbpp分だけ増えているはずである。pA
CYC177からのDNAを含む領域は6.38Kbp
と10.28Kbpとにそれぞれ位置するPstIの2
つの座位の間に濃い線で示してある。各種誘導体の欠失
部は、第3図の場合と同様に各関連する親の下に指示さ
れている。
【0027】しかして、本発明の目的の1つは、新規な
バクテリオファージTG1それ自体およびその誘導体(
複数)を提供すること;かかるファージおよびその誘導
体のゲノム(核酸)成分(欠失突然変異体を含む)、フ
ァージTG1ゲノムまたはその部分を含む混成(キメラ
)核酸分子および生体へのDNAクローニングベクター
として有用なその他のDNAシーケンスを提供すること
である。上記生体は、たとえばS.cattleya 
NRRL 8057のごとき菌である。上記ファージゲ
ノムの部分は、さらに組換えDNAクローニング技法に
おける補助体として役立つ。たとえば下記の機能を持つ
:1)  組込まれた状態でも、自律的エレメントとし
ても、宿主内でのクローン化DNAの保存を可能ならし
める。 2)  内因性のまたは外来の遺伝子の発現を強化する
プロモータとして働く。この場合、それが連結されてい
る遺伝子に対するプロモータとして働く。また他の場合
でもプロモータとして役立つ。 3)  内因性および外来の遺伝子の発現を制御するた
めの制御エレメントとして働く。
【0028】クローニングベクターとして、TG1およ
びその欠失突然変異体は、有用な機能をコードするDN
Aシーケンス(遺伝子)たとえば抗生物質チエナマイシ
ン生産のために必要な遺伝子あるいはB型肝炎抗原の生
産に必要な遺伝子の担体として役立つ。またそれ自体が
有用なDNAシーケンスたとえば本来有用性のある別個
のプラスミドベクターの担体として働く。かかる変異さ
れたクローニングベクター(TG1ゲノムまたはその部
分および外来DNAシーケンスを含む混成DNA分子)
は感染、トランスフェクションまたはトランスフォーメ
ーションによって受容生体内へ導入され、そこで該混成
DNAは組込モード、溶菌(増殖相)モードおよび/ま
たはプラスミドモードで機能する。
【0029】本発明のいま1つの目的はしたがって、T
G1プロファージおよびその欠失および雑種(キメラ)
誘導体を含む微生物、および雑種(キメラ)ファージプ
ラスミドおよびその誘導体を含む微生物を提供すること
である。[なお、本明細書で使用されている“TG1ベ
クター”という言葉は、一般的意味において、TG1で
あるバクテリオファージおよびすべてのその誘導体、T
G1およびその誘導体のゲノム(全部および部分を含む
)、およびTG1およびその誘導体のゲノム(全部およ
び部分を含む)を含有するクローニングベクターを包括
するものである]。以下、本発明をいくつかの代表的実
施例について更に詳細に説明する。なお、“実施例”と
いう言葉は明細書の記載形式の点から便宜上使用するも
のであり、これらの実施例は上記した本発明に対してな
んら限定を加えるものではない。
【0030】実施例1 TG1ベクターの単離、構成、保存および増殖このファ
ージとDNAは、クローニングベクターとして従来使用
されていた他のバクテリオファージおよびプラスミドに
関する作業によって確立された技法とは多少異なる方法
で単離され、処理された。技法の良い手引書の1つは、
R.W.Davis、D.Botstein および 
J.R.Roth によって書かれた“A Manua
l forGenetic Engineering:
Advanced Bacterial Geneti
cs”、ニューヨーク、コールドスプリングハーバー所
在、GoldSpring Harbor Labor
atory 刊行(1980年)である。本願に係わる
作業に使用した特定の方法が、上記マニュアルに記載し
た方法と同一でない点については以下に記載がなされる
。TG1ベクターとその誘導体とを特定化するために役
立つデータおよびそれらを他のクローニングベクターか
ら役立つデータは適当な箇所で記載がなされる。
【0031】A.ファージTG1の単離約300種のさ
まざまな土壌試料を収集して S.cattleya 
上で生育しうるファージが存在しないかを調べた。 土壌試料1gを、105個/mlの濃度で菌を含むYC
肉汁5mlと混合し、そして30℃で振盪しながら16
時間培養することによってファージの存否を検査した。 この検査に使用した菌は、YC肉汁中、107コロニー
形成単位(cfu−colony−forming u
nit)/mlの濃度のStoreptomyces 
cattleya  MA4297の芽胞を振盪しなが
ら37℃で3時間培養することによって準備された。Y
C肉汁は1リットルにつきディフコ(Difco)イー
スト抽出物4.0g、ディフコ麦芽抽出物10gおよび
D−グルコース4.0gを含有する。オートクレーブし
たのち1.0モルMgCl2および2.5モルCaCl
2各10mmを添加する。土と共にインキュベートした
このブロスを濾過し、106個の菌を含有している軟寒
天を上掛けしたプレートの上に濾過したブロスの1滴を
たらした。この培養プレートを30℃で16時間培養し
た。 使用した上掛けは菌0.1mlをYC軟寒天4.0ml
と混合し、そしてこの混合物を約40mlのYC寒天を
含有する1枚のペトリ皿に注入することによって作成し
た。YC軟寒天は46℃の溶融ディフコ寒天0.6%(
w/v)を含むYC肉汁である。YC寒天は2.0%(
w/v)ディフコ寒天で固めたYC肉汁である。
【0032】菌細胞溶解域からその軟寒天を取り出し、
そして推定上のファージを抽出してYCで希釈した。各
希釈物の0.1mlを試料として取って菌0.1mlと
混ぜた。室温に10乃至20分間放置したのち、4.0
mlのYC軟寒天を添加した。その軟寒天培地が固化し
たのち、各培養皿を30℃で16時間培養した。わずか
数個のファージが加えられていた培養皿に単一ファージ
の成長と繁殖から形成された、プラーク(溶菌斑)と呼
ばれている菌細胞溶解の小さな領域が観察された。各培
養皿に観察されるプラークの数はその懸濁物中のファー
ジの濃度に正比例する。約30の異なるファージ単離物
が、このようにして獲られた。ファージTG1は他と異
なりさらに2日の培養後に合一して広がった溶菌域が濁
ってきた。この観察がそのファージが溶原性であること
を示唆した。その可能性について更に詳細な吟味を行っ
た(後記のC項およびE項参照)。
【0033】B.ファージTG1の成長ファージTG1
は28℃から32℃までの間の温度において最も良く成
長する。プラークの形成のためにはCa++が要求され
る。プラークは通常その直径が1乃至3mmである。安
定性を得るためには二価陽イオン(M++で十分)が要
求される。このことはピロリン酸塩、エチレンジアミン
テトラ酢酸塩のごときキレート剤の存在でファージが不
活性化されることによって明かである(後記のI項およ
びN項参照)。単一ファージの子孫を繁殖させるために
は、1つのプラークの中心から軟寒天培地を取り出して
1ml当り2×107cfuの菌を含有するYC肉汁1
0mlと混合し、そして40乃至50r.p.m.の速
度で回転している組織培養ローラドラム(New Br
unswick Scientific、Model 
TC−7)中、25×150mm培養管内で30℃の温
度において16時間培養する。生じる溶菌物を0.45
ミクロンの細孔サイズのフィルターに通す。この濾液が
管1本のファージストックとなり、通常は1010pf
u/mlの内容物を含む。全面溶菌を起こすのに十分な
量のファージ(約1014pfu=プラーク形成単位)
で感染された平板培養からその寒天上掛けを取り上げて
5.0mlのYC肉汁に再懸濁する。この混合物を約1
0秒間激しく混合攪拌する。寒天を遠心分離によって除
き、そして上澄みを濾過する。この濾液が一皿のファー
ジストックとなり、通常109pfu/mlの内容物を
含む。これらのファージストックを4℃で貯蔵する。
【0034】C.溶原菌の単離と確認 プラークを有する培養皿をさらに1日または2日培養す
ると、溶菌域内においてわずかながら菌増殖が観察され
る。それらの菌を取り出して芽胞化する。それらの芽胞
を汚染ファージを除くため洗滌し、希釈しそして単離コ
ロニーとして成長させる。このような純粋培養から得ら
れる芽胞または成長能力のある細胞は溶原性であり、こ
れがさらに成長すると、それら細胞のいくつかはファー
ジを放出する。この培養液は新しい遊離のファージを蓄
積し、蓄積されたファージは、濾過によってその菌から
分離することができる。細胞自体は遊離ファージが感染
して溶菌することはない。Streptomyces 
oattleyaファージ溶原菌の凍結乾燥された芽胞
の1本の管ストックから次のようにしてファージが調製
できる。凍結乾燥された芽胞の管を無菌的に開封し、そ
の内容物を25×150mmの培養管に入れられている
10mlの殺菌YC肉汁中に懸濁する。そして40乃至
50r.p.m.の回転速度で回転している組織培養ロ
ーラドラム内で30℃の温度において6時間培養する。 その培養液を細孔サイズ0.45ミクロンのフィルター
に通す。得られた懸濁物中のファージは保存可能であり
、上記と同様にして増殖させることができる。
【0035】D.  Streptomyces oa
ttleya からの染色体DNAの単離 約107 芽胞を用いて接種を行なう。接種は二価陽イ
オンが添加されていない。ただしグリシン0.1%(w
/v)を加えた25mlのYC肉汁を含有している25
0mlのバッフルつきエルレンマイヤーフラスコに対し
て行なう。このフラスコを220r.p.m.シェーカ
ー[行程約5cm(2インチ)]にのせて37℃で16
時間振盪する。この時間で培養には十分である。遠心分
離によって細胞を集め、0.09%(w/v)のNaC
lの25mlで1回洗い、そして25%(w/v)スク
ロースと50ミリモルのトリス(ヒドロキシメチル)ア
ミノメタンを含有している溶液5mlに再懸濁する。そ
の溶液は予め塩酸でpH8.0に調整されていて、そし
てニワトリ卵白リソチームの最終濃度が2mg/mlと
なるよう使用直前に添加されている。この混合物を37
℃で1時間培養し、次いでNaOHでpH8に調整され
たエチレンジアミンテトラ酢酸二ナトリウム0.25モ
ルを含有する溶液2.5mlに加える。この混合物を氷
上に15分間放置し、そして2.0%(w/v)のN−
ラウロイル−N−メチルグリシンを含有する溶液7.5
mlを加える。さらに30分間氷上に放置したのち、牛
のパンクレアチンリボヌクレアーゼAを添加する(0.
1モル酢酸ナトリウム中5mg/mlの溶液として0.
15ml。この溶液は予め100℃で10分間加熱され
ていた)。次に新規に調製されたプロナーゼ(Pron
ase(登録商標))溶液0.6mlを添加する。この
溶液は、緩衝液Pに25mg/mlの量で溶解されたプ
ロナーゼを含有し、使用直前に37℃で45分間温めら
れた。なお緩衝液Pは50ミリモルのNaCl、50ミ
リモルのエチレンジアミンテトラ酢酸二ナトリウムおよ
び30ミリモルのトリス(ヒドロキシメチル)アミノメ
タンを含有しており、溶液は塩酸でpH7.5に調整さ
れていた。上記の添加による混合物を37℃で2時間培
養する。この溶菌液を30分間で3回等容量のフェノー
ルで抽出する。フェノールは3回とも使用直前に0.2
モルのトリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンの溶液
(これは塩酸でpH7.5に調整されていた)の等量で
平衡化して中和されていた。次にその溶菌液を等容量の
クロロホルムで10回抽出し、そして10分の1容量の
酢酸塩溶液と混合する(この溶液は酢酸ナトリウム3.
0モルとエチレンジアミンテトラ酢酸二ナトリウム1.
0ミリモルを含有しており、NaOHでpH7.0に調
整されていた)。そのあと0.54容量部のイソプロパ
ノールを添加する。DNAをガラスロッドに巻きつけて
回収し、そして0.1%(v/v)のジエチルピロカー
ボネートを含有する水5.0mlに再溶解する。連続し
て2回以上同様方法で沈殿させる。但し、各回の沈殿後
に10ミリモルのトリス(ヒドロキシメチル)アミノメ
タンと1.0ミリモルのエチレンジアミンテトラ酢酸二
ナトリウムを含有する溶液50ml(塩酸でpH8.2
に調整したもの)に再溶解させる。
【0036】E.  ファージTG1溶原菌のゲルトラ
ンスファーハイブリダイゼーション分析 適当な制限酵素によって消化されたDNAをアガロース
ゲル電気泳動によって分離する。それらの断片を精製し
、変性し、そしてニトロセルロースペーパーに移す(S
chleicher and Sohuell,BA8
5)。精製したファージからのDNAで放射線標識をつ
けた試料をつくり、この試料を熱で変性し、そして上記
のニトロセルロース上のDNAとハイブリダイズさせる
。これはホルムアルデヒド、フイコル、牛血清アルブミ
ンおよびポリビニルピロリドンの存在且つ硫酸デキスト
ランの不存在下で42℃で48時間、実質的にDavi
s 等(前掲)により記載されているような仕方で実施
される。
【0037】ファージTG1の溶原性モードを決定する
ためには、ファージ制限地図が役立った。一般に、溶原
性ファージはプラスミドとして、あるいは宿主染色体内
への組込みによって溶原化する[A.M.Cambel
l; The episomes. Adv. Gen
et.11(1962年)第101〜145頁参照]。 溶原化のモードの知識はそのファージがDNAベクター
として使用される予定である場合にはかなり重要なこと
である。適当な制限エンドヌクレアーゼで消化された溶
原性染色体DNAのゲルトランスファー分析によって、
いずれのモードの可能性があるかが判別される。そのフ
ァージがプラスミドとして溶原化する場合には、プロフ
ァージDNAと増殖能力あるファージDNAとの間の差
異は、その付着末端がプロファージでは共に結合される
ということのみである。そのファージが組込まれる場合
には、しかしながら、組込み部位が存在する特定制限断
片が欠けている。それは元の断片の両半分が染色体DN
Aと融合することによって生じる2つの新しい断片によ
って置換されるからである。われわれの実験結果は、フ
ァージTG1が S.cattleyaの染色体内へ組
込まれることを示している。酵素 Pst Iと Cl
a Iとが選択され、そのファージDNAは実質的に2
つの領域に分割された。すなわち、25 Kbpサイズ
の大きな1つの内部断片と、サイズ16.3Kbp の
、cos 断片と呼ばれているファージ付着末端を持つ
2つの断片が結合したことから結果する1つの断片とで
ある。結合する前の2つの断片のサイズはそれぞれ8.
4Kbpと7.9Kbpである。増殖能力のあるファー
ジからのDNA(0.01μg)と溶原菌からの染色体
DNA(1.0μg)とをそれら酵素で消化し、そして
アガロースゲル上で分離した。その制限パターンを上記
した放射線標識ファージDNAとハイブリダイズして分
析した。非溶原菌からのDNAはファージDNAと相同
なシーケンスを含んでいなかった。cos 断片はその
溶原菌内に欠けており、そしてファージDNAとハイブ
リダイズするサイズ15kbp と11kbp との2
つの新規な断片によって置換されていた。この結果は、
そのファージDNAが宿主DNA内へ組込まれたことを
示す。
【0038】F.  ファージ粒子の精製1皿または1
管のファージストックの試料1.0mlを菌濃度107
ofu/ml、温度30℃のYC肉汁1.0リットルに
加える。これを回転シェーカー上の2.0リットルフラ
スコ内で30℃で16時間培養する。シェーカーの行程
は約5センチ(2インチ)、そして回転速度は220r
.p.m.であった。溶解物をガラスウールを通して濾
過して清澄化する。この溶解物は約109pfu/ml
の内容を持つ。NaCl  20gとポリエチレングリ
コール(平均分子量6000)を加えてファージを沈殿
させる。攪拌して添加物を溶解させたのち、この混合物
を攪拌しないで一晩4℃で放置する。ファージを低速遠
心分離によって沈殿させる。ペレット状になった物質を
再び10mlのSM緩衝液に溶解する。SM緩衝液はN
aCl  0.5%(w/v)、トリス(ヒドロキシメ
チル)アミノメタン20ミリモル、ゼラチン0.01%
、MgCl2 10ミリモル、CaCl2 5ミリモル
を含有し、その全体は塩酸でpH7.5に調整されてい
た。
【0039】5分間2500×gの遠心分離にかけて上
記懸濁物を清澄化する。その上澄み液を新しい遠心管に
入れ、そしてSM緩衝液中下記量のCsClの溶液各2
.0mlを下に重層する。即ち密度1.3g/ml、1
.5g/ml、および1.7g/mlである。この管を
10℃で1.5時間ベックマン60Tiロータを用い5
0000r.p.m.の回転速度(平均回転遠心力18
0000×g)で遠心分離する。ファージ粒子は、底の
2つの層の間の界面に濁った帯域として可視となる。 この帯域の物質をピペットで取り、最終体積10mlを
与えるのに十分な量の密度1.5g/mlのSM緩衝液
中CsClの溶液と混合し、そしてベックマン80Ti
ロータにより40000 r.p.m.(平均回転遠心
力110000×g)、温度10℃で16時間遠心分離
する。ファージは再び管の真中近くに1つの濁ったバン
ドとして可視となる。これをピペットで採集し、そのフ
ァージ懸濁物を各バッチ2.0リットルのバッファー液
に対して順次透析する。使用バッファー液はトリス(ヒ
ドロキシメチル)アミノメタン20ミリモル、MgCl
210ミリモル、CaCl2  5ミリモルを含有し、
塩酸でpH7.5に調整された溶液にNaClをそれぞ
れ1.0モル、0.3モル、0.1モル、0.01モル
溶解させたものである。
【0040】G.  ファージDNAの製造本DNAは
、精製されたファージ粒子から標準的ないくつかの方法
によって製造することができる。そのうちの2つの方法
をここに述べる。 方法1.  再蒸留されたフェノールを続けて3回、塩
酸でpH8に調整した0.2モルのトリス(ヒドロキシ
メチル)アミノメタンの1.0容量で平衡化する。平衡
化されたフェノールの等容量をファージ懸濁物に加え、
そして30分間管の上下をくり返し反転させて2相を混
合する。フェノール(下層)をピペットで除去する。こ
のフェノール抽出を2回くり返す。水性相を等容量のエ
ーテルで3回抽出する。ピペットで除去できないエーテ
ルを放置して蒸発させる。酢酸でpH6.5に調整され
た3.0モルの酢酸ナトリウム溶液を10分の1の容量
だけ添加し、次いで2倍容量の200プルーフエタノー
ルを添加する。エタノールを水性相と混ぜ合わせると沈
殿したDNAが可視となる。このDNAを13000×
gで10分間遠心分離にかけて回収する。上澄みを傾瀉
し、そのペレットを70%(v/v)のエタノールで洗
い、そして残存液体を窒素ガス流で蒸発させる。このD
NAを少量のTEに再溶解する。TEはトリス(ヒドロ
キシメチル)アミノメタン10ミリモルとエチレンジア
ミンテトラ酢酸二ナトリウム1.0ミリモルとを含有す
るものであり、塩酸でpH7.8に調整される。精製し
たDNAを4℃または−70℃で貯蔵する。
【0041】方法2.  ファージ懸濁液を5分の1容
量のトリス(ヒデロキシメチル)アミノメタン0.5モ
ルとエチレンジアミンテトラ酢酸二ナトリウム0.25
モルとを含有し、塩酸でpH8.0に調整された溶液に
混合する。1/5000容量のジエチルピロカーボネー
トを添加する。この混合物を37℃で1時間培養する。 等容量のホルムアミドを加える。この時に完全なファー
ジ粒子による濁りが消え、溶液はDNAの放出のために
粘性となる。透析によってファージ懸濁物からCsCl
が除去されていない場合には最初の水溶液と等容量の水
をホルムアミド含有混合物に加える。DNAを沈殿させ
るために、この溶液を2倍容量の200プルーフエタノ
ールと混合する。沈殿したDNAを回収して上記方法1
の場合と同様に貯蔵する。純度はやや乏しいが、しかし
制限分析(H項)、トランスフェクション(J項)また
はトランスフォーメーション(K項)のために使用でき
るファージDNAもこの方法によって、ベックマン80
Tiロータの45000r.p.m.(平均回転遠心力
150000×g)で3時間遠心分離することにより管
内溶菌物から採集されたファージから製造できる。この
ファージペレットを0.2ミリモルのトリス(ヒドロキ
シメチル)アミノエタンと25ミリモルのエチレンジア
ミンテトラ酢酸塩とを含み、予め塩酸でpH8.5に調
整された溶液0.5mlに懸濁させる。この懸濁物に直
接的にジエチルピロカーボネートを加える。上記と同様
に単離されたDNAを、牛のパンクレアチンリボヌクレ
アーゼAを最終濃度10μg/mlの量で添加して72
℃で10分間加熱する。そして上記のように貯蔵する。
【0042】H.  ファージDNAの制限分析DNA
を制限エンドヌクレアーゼの種々の組合わせで制限切断
し、そしてそれらの制限生成物を実質的に Davis
 等(上掲)により記載された方法によりアガロースゲ
ル電気泳動によって分析した。結果は、ファージTG1
核酸が付着末端を持つ長さ41.47キロ塩基対(kp
b)の線形二本鎖DNA分子よりなることを示した。下
記の酵素はこのDNAを開裂させることができない:B
amH I,Nae I,Nar I,Pvu I,S
st I,Sst II,Stu I,XhoI。下記
の酵素は複数部位において、このDNAを開裂させる:
Bgl I,BstE II,HgiA I,Hph 
I,Mbo II,Sal I,Xma III,Xo
rII,Nru I,Pvu I,EcoR I,Bc
l I,Bgl II,Bal I,Kpn I,Hp
a I,Sph,Ava I,Hind III。下記
酵素はただ1つの部位において、そのDNAを開裂する
:Pst I,Xba I,Cla I,Sma I。 これら酵素のいくつかの場合にもたらされた制限パター
ンが第2図に示されている。
【0043】 I.  ファージTG1の欠失突然変異体の単離欠失突
然変異体はDNAのクローニングのために特に役立つ。 1個のファージ粒子内にパッケージしうるDNAの量は
限度がある。ファージDNAの一部の欠失は、その欠失
サイズに等しい付加的量のDNAをそのファージに挿入
できるスペースを与える。また、欠失によって、そのフ
ァージゲノムのどの部分が必要不可欠でないか、すなわ
ちどの部分がDNA挿入のために適当かが判明する。他
の領域への挿入はおそらくファージの機能に必要な遺伝
子をこわすであろう。突然変異体はキレート剤に耐性の
あるファージ変種を単離するために一般に使用されてい
る技術(前記参考文献8参照)によって得られた。ファ
ージ粒子の安定性のためにはマグネシウムイオンが必要
である。もしMg++がキレート剤(この場合ではエチ
レンジアミンテトラ酢酸塩)の添加によって有効的に除
去されると、生きたファージの個数は急速に減少する。 ファージゲノムの幾分かの欠失に由来する突然変異のた
めに、より短いDNA分子を含むファージ粒子はMg+
+の不存在でもより安定であり、生き残る。
【0044】ファージTG1の欠失突然変異体を得るた
め、KOHでpH6.5に調整した1.0モルの2−(
N−モルホリノ)エタンスルホン酸0.10mlと、N
aOHでpH7に調整した0.50モルのエチレンジア
ミンテトラ酢酸二ナトリウム0.10mlとをファージ
の平板または管ストックの1.0mlと混合する。この
混合物を37℃で30分間培養する。ついで、これを2
5mlのYC肉汁と0.10mlの菌とを含有している
250mlのエルレンマイヤーフラスコに添加する。 時としてはファージの増殖を促進するため5ミリモルの
HCl中FeCl3・6H2O 10mg/mlの溶液
を0.50ml添加することが必要である。これの必要
性はYC肉汁の特定バッチの種類による。このフラスコ
を140r.p.m.のシェーカー[行程約5センチ(
2インチ)]上で30℃において16時間振盪する。一
晩培養したのち得られた溶菌液を0.45ミクロンの細
孔サイズを持つフィルターに通して濾過し、そして生き
ているファージの濃度を判定する。もしこれが107p
tu/ml以上であった場合には、エチレンジアミンテ
トラ酢酸塩による処理ならびにそれに続くファージの培
養をくり返す。エチレンジアミンテトラ酢酸塩の第1回
目の処理でpfu/ml濃度は約104乃至105倍低
下する。その後の処理によるpfu/mlの減少度は段
々と低くなる。通常この処理を3回くり返す。最後の処
理終了後に単一プラークから増殖させたファージのDN
Aを精製し、そして制限エンドヌクレアーゼによる消化
によって分析する。クローンファージの多くはそれらの
DNAの一部が欠失されてしまっている。かかる欠失フ
ァージの制限分析により少なくとも4つの型のファージ
欠失種が生じたことが判明する。例えばファージTG2
,TG3,TG4,TG5(第3図参照)である。これ
らのファージDNA分子について酵素Hind III
, KpnI,Pst I,Sph I の制限部位の
存否を調べた。 ファージTG2はDNAの2.0kbpの欠失を持ち、
これにより6.72kbp位置の Sph I部位、7
.93kbp位置のKpn I部位および7.99kb
p位置のHind III部位が取り去られている。フ
ァージTG3は2.5kbpのDNAの欠失を持ち、7
.93kbp位置のKpn I部位、7.99kbp位
置のHind III 部位および8.38kbp位置
のPst I 部位が取り去られている。ファージTG
4は2.1kbpのDNA欠失を持ち、6.72kbp
位置のSph I部位、7.93kbp位置のKpn 
I部位および8.38kbp位置のPst I部位が取
り去られている。 これらのファージを放出する能力を持つ S.catt
leya NRRL8057の溶原菌は前記表Iに記載
したようにファージTG2を放出するものは菌株ATC
C39077(MA5766)として、ファージTG4
を放出するものは菌株NRRL  15034(MA5
769)として、ファージTG5を放出するものは菌株
NRRL  15035(MA5770)として寄託さ
れている。多分、他の型の欠失突然変異体も同様にして
得られ、そしてそれらは有用性を持っているであろう。 第3図はこれらファージのそれぞれにおいて欠失された
TG1ゲノム部分を示す図である。第3図に示した欠失
突然変異体のすべては溶原菌形成能力がある。偶発的に
得られたすべての欠失突然変異体について同じことが言
えるとは限らない。第3図に示したファージ内のDNA
欠失域はそのファージの細胞溶解性機能にも溶原性機能
にも必要ない領域である。これら欠失のうち2つはファ
ージゲノムの単一Pst I部位を取り去ってしまって
いる。ファージの機能に影響を与えることなしにこの部
位に外来DNAが挿入可能であり、したがって、この部
位はクローンされるべきDNAの挿入のために有用な部
位であることが判明している(M項参照)。欠失型のう
ちの2つはPst I部位を手つけずに残している。こ
れらのDNA分子はクローンされるべきDNAの挿入の
ために格別に有用である。Pst Iのための部位以外
の他の部位もまたDNAのクローニングのために役立つ
ことが判明する可能性は大きい。
【0045】J.  Streptomyces ca
ttleya MA4297トランスフェクション トランスフェクションは下記方法で実施される。遠心分
離によって菌を採集し、そして約1010cfu/ml
で2.0mlのPMC20に懸濁する。PMC20はス
クロース200g、K2SO4 0.25g、MgCl
2・6H2O  2.0gおよび微量元素液2.0ml
を最終体積が1.0リットルとなるよう水に溶解し、オ
ートクレーブ後に2.5モルCaCl2 10mlおよ
びKOHでpH6.0に調整した1.0モル2−(N−
モルホリノ)エタンスルホン酸と0.5%(w/v)K
H2PO4の溶液10mlを1リットルにつき添加する
ことによって調整される。微量元素液は1リットルにつ
きZnCl2を40mg、FeCl3・6H2Oを20
0mg、CuCl2・2H2Oを10mg、MnCl2
・2H2Oを10mg、Na2B4O7・10H2Oを
10mg、(NH4)6Mo7O24・4H2Oを10
mg含有する。上記の菌懸濁物にニワトリ卵白リゾチー
ム2.0ml(2mg/mlPMC20)を加える。こ
の混合物を37℃で90分間培養し、その後で2500
×gの遠心分離に5分間かけてプロトプラストを集める
。このペレットをPMC20の4.0mlに再懸濁して
氷上に保持する。DNAのサンプル、たとえばベクター
DNAを1マイクロリットル当り0.25μg含有して
いるDNAサンプル20μlを等容量のヘパリン溶液(
シグマ、ナトリウム塩、2倍濃縮したPMC20の1m
lにつき5mg)と混合し、そしてPMC20の240
μlを添加し、次いでPMC20に溶解した28%(W
/v)ポリエチレングリコール(シグマ、平均分子量1
000)1.50mlを添加する。この混合物を室温で
10分間培養する。0.7mlの試料を取ってRM軟寒
天10mlおよびPMC20の1ml当り107cfu
の濃度のS.cattleya の芽胞0.2mlと混
合し、そして直ちに四角(100×15mm)のペトリ
皿に注入する。この皿にはRM寒天約60mlが入って
いる。なお、RMはスクロース200g、K2SO4 
 0.25g、MgCl2・6H2O 10g、D−グ
ルコース10g、ディフコカサミノ酸類0.1g、デイ
フコオートミール寒天3.5g、微量元素液2.0ml
、L−プロリン3g、ディフコイースト抽出物2gおよ
び2−(N−モルホリノ)エタンスルホン酸1.95g
を含有しており、これらは水の中で十分に混合され、K
OHでpH6.0に調整され、1.0リットルまで希釈
されてオートクレーブで煮られた。オートクレーブで煮
たのち、1リットルにつき8.0mlの2.5モルCa
Cl2と10mlの0.5%(w/v)KH2PO4 
が添加された。RM寒天は2.0%(w/v)のディフ
コ寒天で固めたRMのことである。RM軟寒天とは温度
46℃で0.6%(w/v)溶融ディフコ寒天を含んで
いるRMである。軟寒天の上掛けが固まったのち、皿を
28℃で2日間培養する。ファージは菌溶解域から単離
され、そして増殖される。
【0046】K.  Escherichia col
i K−12RR−1のトランスフォーメーション DNAの取込みにコンピテントとなったE・coli細
胞が下記方法によって得られる。Escherichi
a coli K−12RR−1[F.Bolivar
、 R.L.Rodriquerz、M. C.Bet
lach、 H. W. Boyer の論文、2 G
ene、第75〜93頁(1977年)参照]は、培地
LB250ml中、37℃の温度で指数関数的に増殖す
る。LBは蒸留水1リットル中にバクト−トリプトン1
0g、バクト−イースト抽出物5gおよびNaCl 5
gを含有するものである。細胞濃度が2×108cfu
/mlに達したらその培養物を氷の温度まで15分間冷
却し、しかるのち4℃で遠心分離(6000xg、5分
間)により細胞を集める。上澄み液を傾瀉し、そして細
胞を氷冷した0.1モルCaCl2溶液125mlで懸
濁する。この細胞懸濁物を15分間氷の上に保持する。 再び遠心分離によって細胞を集め、氷冷0.1モルCa
Cl2 25mlに懸濁し、そしてさらに15分間氷上
に保持する。この細胞懸濁物に0.1モルCaCl中4
0%(w/v)グリセリンを含む氷冷溶液(15ml)
を混合する。これは−70℃で貯蔵しておくこともでき
るし、また直接使用することもできる。DNA(TE3
0μl中約0.1乃至1.0μg)を、50ミリモルN
aCl、5ミリモル クエン酸ナトリウム、67ミリモ
ルCaCl2を含有する溶液100μlと混合する。次
に細胞懸濁物(0.20ml)を加え、そしてこの混合
物を45分乃至1時間氷上においておく。培養液LB(
4.0ml)を加え、振盪しながら37℃で3時間細胞
を培養する。この培養期間中にプラスミドの確立と変換
DNAによって授与された選択可能な特性の表現が可能
である。遠心分離によって細胞を集め、そして種々の量
でこれを寒天培養皿の上に拡げる。これらの培養皿には
付加されたDNAによって授与された特性を獲得した菌
のみの成長を許容する培養培地を入れておく。たとえば
、1.5%(w/v)のディフコ寒天で固められ、そし
て抗生物質たとえば50μg/mlの濃度のカナマイシ
ンを添加したLBを培養培地とする。
【0047】L. E.coli  K−12からのプ
ラスミドDNAの製造 プラスミドDNAはE.coli  K−12のプラス
ミド含有誘導体から標準的技法、たとえば Davis
 等(前掲)の第116〜119頁に記載された方法に
よって単離することができる。純度はやや低いが、しか
しトランスフォーメーション、トランスフェクションま
たは制限分析のために使用するのに適当なDNAが下記
方法によってより早く単離することができる。選択性培
地、通常は抗生物質を加えたLBの5ml中で細胞を静
止相になるまで一晩増殖させる。これらの細胞を遠心分
離(3000xg、5分間)によって採集し、そして下
記成分を含み全体がKOHでpH8に調整された溶液0
.45mlに懸濁する。8%(w/v)スクロース、5
%(w/v)Triton  X−100、50ミリモ
ルのエチレンジアミンテトラ酢酸二ナトリウムおよび5
0ミリモルのトリス(ヒドロキシメチル)アミノメタン
、リゾチーム(TEの1ml中10mgの新しく調製し
た溶液25μl)を加える。この混合物を沸騰水中で6
0秒間インキュベートし、そしてその後直ちに室温で遠
心分離する(12000xg、10分間)。上澄み液の
100μlを取り、そして100μlのイソプロパノー
ルと混合する。 −20℃で30分間培養後、DNA沈殿を遠心分離(1
2000xg、10分間)により回収し、100μlの
TEに溶解して4℃で貯蔵する。制限分析、トランスフ
ェクションまたはトランスフォーメーションのためには
5乃至20μlで十分である。
【0048】M.  ファージTG2DNA内へのプラ
スミドpACYC 177の挿入 この実験は、このベクター内への外来DNAのクローニ
ングが実行可能であることを実証するものである。プラ
スミドpACYC 177は A. C.Y. Cha
ng と S. N. Cohen によってJ.Ba
cteriol. 134(1978年) 第1141
〜1156頁に記載されている。これは E. Col
i から得られたものであり、サイズは約3.6キロ塩
基対である。これはアムピシリンおよびカナマイシンに
対する耐性を与え、そしてアムピシリンに対する耐性を
コードしているDNAシーケンス内に単一PstI部位
を持っている。共有結合的に閉環しているpACYC 
177 プラスミドDNAとファージTG2DNAとは
、下記組成の反応混合物0.25ml中で37℃で8時
間インキュベートすることによって別々に開裂された。 反応混合物はTE0.20ml中のDNA50μgに5
×KC[0.1モルのトリス(ヒドロキシメチル)アミ
ノメタン、50ミリモルのMgCl2、0.1モルのK
Clを含み、HClでpH7.7に調整した溶液]0.
05mlとPstエンドヌクレアーゼ15μl(150
単位、Bethesda Researoh Labo
ratories 製品)とを混合してなるものであっ
た。4時間インキュベートしたのち、さらに100単位
のエンドヌクレアーゼをファージDNA含有反応混合物
に添加した。各混合物を70℃に10分間加熱し、しか
るのちジエチルピロカーボネート1.0μlを添加し、
そしてさらに37℃で1時間インキュベートしてエンド
ヌクレアーゼを不活性化した。前記のごとく、このDN
Aをエタノールを添加して沈殿させ、そしてTEの0.
20mlに再溶解する。各開裂されたDNA試料(75
μl)を、次のものをプラスして互いに混合した。TE
75μl、LM[0.66モルのトリス(ヒドロキシメ
チル)アミノメタン、66ミリモルのMgCl2を含み
、HClでpH7.5に調整したもの]28μl、4.
0ミリモルのアデノシン−5’−三リン酸塩(二ナトリ
ウム塩)25μl、0.10モルのジチオスレイトール
25μlおよびT4DNAリガーゼ3μl(6単位、B
ethesda Research Laborato
ries)。この混合物を3.5℃で24時間インキュ
ベートした。エタノールでDNAを沈殿させ、そしてT
E75μlに再溶解した。このDNA調製物の数部量が
J項に記載したように S. cattleyaのプロ
トプラストのトランスフェクトのために使用された。フ
ァージが単離されて、それらのDNAが制限分析によっ
て調べられた。挿入によって親のファージとは異なった
DNAを持つファージが得られた。この挿入は、プラス
ミドpACYC177のサイズと制限特性を有するDN
Aが単一PstI部位に挿入されたものであり、Pst
Iの消化によって線形に切り出すことができた。第4図
に示すように、互いに反対の配位(orientati
on)で挿入されたpACYC177を持つ2種のファ
ージ、TG6とTG7とが得られた。これらファージの
DNAがK項に記載したように E. coli K−
12RR 1のトランスフォームのために使用された。 形質転換体(トランスフォーマント)は1.5%(w/
v)ディフコ寒天で固められ、そして50μg/mlの
カナマイシンを補足されたLBを含有するペトリ皿上で
選択された。
【0049】上記のペトリ皿を37℃で一晩培養した。 カナマイシン耐性菌の多数のコロニーがファージTG6
とTG7のDNAにさらされた細胞から得られた。この
ような菌を再精製した。そしてファージTG6から得ら
れたプラスミドpTG6を含有する菌は菌株ATCC3
9079(MB4540)として、そしてファージTG
7からのプラスミドpTG7を含有するものは菌株AT
CC39082(MB4543)として寄託されている
。L項に記載したように、これら菌株からプラスミドD
NAが単離され、そしてHind IIIの制限分析に
よって検査された。そのプラスミドは付着末端が結合さ
れている点を除き対応する増殖能力のあるファージ、T
G6とTG7のDNAと同じであった。さらに、未消化
のDNA調製物をJ項に記載した仕方と同様な仕方でS
treptomyces cattleya MA42
97のプロトプラストをトランスフェクトするために使
用した。その結果、同様判定によってはファージTG6
およびTG7から区別不能なファージが生じた。
【0050】N.  交配ファージの欠失突然変異体の
単離 プラスミドpACYC177を欠失ファージTG2に挿
入すると、そのゲノム(核酸)が元のファージTG1の
それよりも4.7%長いファージが生じる。このファー
ジにパッケージされたDNAのその余分な長さは、元の
TG1よりもキレート剤に対してそのDNAをより敏感
にする。この特性は、次のようにして欠失突然変異体の
単離のために利用することができる。注目すべきは、元
の単離物のゲノムよりも大きいゲノムサイズをもたらす
ことになるファージTG1のいずれの誘導体内へのいず
れのDNAの挿入も類似の特性を示すであろうことであ
る。ファージTG6およびTG7の欠失突然変異体を単
離するため、単一プラークから調製された管ストックの
10μlを、二価陽イオンを添加されていないそして2
5ミリモルのピロリン酸ナトリウムが補足され且つNa
OHでpH6.0に調整されたYC肉汁0.10mlと
混合する。35℃で30分間培養したのち(この時点で
生き残っているファージ個体数は最初の濃度の約10−
3である)、YC肉汁に菌を懸濁した懸濁物0.20m
lを加える。室温で10乃至20分間経過させたのち、
YC軟寒天4.0mlを加え、その混合物をYC寒天皿
の上に注ぎ、そして30℃で一晩培養する。これにより
1皿のファージストックが得られる。ピロリン酸塩によ
るファージ処理を続けて2回以上くり返す。
【0051】第2回目、第3回目の処理後に生き残るフ
ァージの割合は、実質的に段々と大きくなる。このよう
なピロリン酸塩耐性ファージから単離された単一プラー
クのDNAは、通常その挿入されたプラスミドの領域が
欠失されている。この欠失の平均サイズは4乃至6kb
pである。挿入されたプラスミドの領域とは別の領域に
欠失を持つ突然変異体を選択するため、上記のピロリン
酸塩耐性ファージ皿ストックの試料0.10mlから直
接的に調製されたファージ管ストックからDNAを単離
する。このようなストックは混合集団であり、そのうち
のいくつかのメンバーが所望の欠失を持つファージであ
る。そのDNAをE.coli K−12RR1をカナ
マイシン耐性にするために使用する。かかる形質転換(
トランスフォーマント)のプラスミドDNAは再生機能
と挿入されたpACYC177プラスミドのカナマイシ
ン耐性遺伝子とを保持しているはずである。二者択一的
に選択可能な特質を授与する挿入DNAを持つ誘導体は
同じような方法で利用することができる。もし、その特
質が E. coli ではなくて S. cattl
eya の中で発現されるならば、そのピロリン酸塩耐
性ファージ混合集団を S. cattleya菌に直
接感染させることによって、これら欠失突然変異体を得
ることができる。そのファージを吸着させたのち、菌を
2乃至4時間増殖させれば、選択的培地に移す前にその
ベクター分子の確立とその選択可能な特質の発現とがな
される。
【0052】ベクターDNAを形質転換細胞から(或は
場合によっては溶原菌から放出されたファージから)単
離し、そして欠失の有無を調べる。ファージTG6とT
G7のピロリン酸塩耐性集団からのDNAで得られたカ
ナマイシン耐性形質転換体は増殖性ファージDNA制限
地図の左端(第4図)と挿入プラスミドのカナマイシン
耐性遺伝子との間の位置に欠失を持つプラスミドを含有
していた。ファージTG6とTG7の制限地図に関する
位置およびそれら欠失のサイズは第4図に示されている
。制限酵素Hind III,SphI,PstI,S
maIおよびBamHIについてそれらプラスミドを分
析した。
【0053】TG6から下記のプラスミドが誘導された
: pTG 8:これは3.1kbpのDNA欠失を持ち、
これによって6.38kbp位置のPstI部位および
7.27kbp位置のBamHI部位が取り去られてい
る; pTG 9:これは4.7kbpのDNA欠失を持ち、
その結果4.75kbp位置のSphI部位、6.38
kbp位置のPstI部位および7.27kbp位置の
BamHI部位が取り除かれている; pTG 10:これは3.0kbpのDNA欠失を持ち
、その結果1.66位置のHind III部位が除去
されている; pTG 11:これは2.0kbpのDNA欠失を持ち
、これにより6.38kbp位置のPstI部位と7.
27kbp位置のBamHI部位が除去されている; pTG 12:これは6.0kbpのDNA欠失を持ち
、4.75kbp位置のSphI部位、6.38kbp
位置のPstI部位および7.2kbp位置のBamH
I部位が除去されている; pTG 13:これは2.8kbpのDNA欠失を持ち
、その結果6.38kbp位置のPstI部位と7.2
7kbp位置のBamHI部位とが取り去られている; pTG 14:これは4.1kbpのDNA欠失を持ち
、そのため4.75kbp位置のSphI部位が取り去
られている。
【0054】 TG7からは下記のプラスミドが誘導された:pTG 
15:これは3.1kbpの欠失を持ち、これにより4
.75kbp位置のSphI部位が除去されている; pTG 16:これは4.6kbpの欠失を持ち、その
結果4.75kbp位置のSphI部位が除去されてい
る。 これらのプラスミド誘導体のいくつかを含む代表的誘導
体は以下の菌株番条をもって寄託されている。 プラスミドpTG 12を含む菌株ATCC39080
(MB4541);プラスミドpTG 16を含む菌株
ATCC39081(MB4542);プラスミドpT
G 8を含む菌株NRRLB−15027(MB454
4);プラスミドpTG 9を含む菌株NRRLB−1
5028(MB4545);プラスミドpTG 10 
を含む菌株NRRLB−15029(MB4546);
プラスミドpTG 11 を含む菌株NRRLB−15
030(MB4547);プラスミドpTG 13 を
含む菌株NRRLB−15031(MB4548);プ
ラスミドpTG 14 を含む菌株NRRLB−150
32(MB4549);プラスミドpTG 15 を含
む菌株NRRLB−15033(MB4550)。
【0055】これらのプラスミドは、S. cattl
eya のプロトプラストをトランスフェクトするため
に使用され、そしてそのDNAが、付着末端が分離され
うる点を除き、対応するプラスミドDNAと同じであっ
たファージを生じた。プラスミドpTG8はファージT
G8を、pTG9はファージTG9を与えた。他につい
ても同様であった。
【0056】実施例2 チエナマイシン遺伝子のクローニング この実施例はTG1ベクターの誘導体がどのようにして
チエナマイシン遺伝子の同定およびクローニングのため
に使用しうるかを示すものである。実験は種々の方法で
実施可能であり、ここに記載するのはその一例を示すに
すぎない。したがって、本実施例は目的を達成するため
にTG1およびその誘導体を用いる方法を例示するだけ
であり、なんら限定的なものではない。
【0057】A.  チオストレプトン耐性遺伝子を担
持するTG1誘導体の構成 薬剤に対する耐性の遺伝子を担持するTG1誘導体を構
成することは、溶原菌の直接的選択を可能にする。これ
はチエナマイシン遺伝子のためのハイブリッドベクター
クローンをスクリーニングするために役立つ(本実施例
のB項参照)。Streptomycesでは抗生物質
チオストレプトンに対する耐性を与える遺伝子がすでに
クローンされている[C.J.Ward、J.M.およ
び Hopwood.D.A.: DNAClonin
g in Streptomyces : resis
tance genes from antibiot
ic−producing species.  Na
ture 286(1980)第525〜527頁参照
]。この遺伝子を持つプラスミドDNAを単離し、そし
てBamHIで開裂する。そのチオストレプトン耐性遺
伝子を持つ断片(2.0kbp)を、アガロースゲル電
気泳動により精製する。精製された断片をBclIで部
分的に消化する。この断片は、その薬剤耐性遺伝子の両
側にBclI部位を持っている。部分的に開裂されたD
NAとBamHIですでに開裂されているベクターTG
15のDNAとを混合し、そして結合する。結合された
DNAを実施例1、J項に記載したようにStrept
omycescattleyaのプロトプラストをトラ
ンスフェクトするために使用する。 ただし今回は、ポリエチレングリコールによる処理後に
そのプロトプラストを10mlのRMおよび芽胞と混合
し、そして250mlのエルレンマイヤーフラスコ内3
0℃の温度でゆっくりと振り回しながら一晩培養する。 細胞を種々の度合いに希釈し、そして最初濃度5および
10μg/mlでチオストレプトンを追加したYC寒天
を含有するペトリ皿の上に撒く。チオストレプトン耐性
溶原菌の成長によりコロニーが生じる。これらの溶原菌
からのファージのDNAを分析してBamHI部位の有
無を調べる。
【0058】単一のBamHI部位を持つハイブリッド
ベクターとBamHI部位を全く持たないハイブリッド
ベクターとを選択する。BclIで消化されて生じた端
はBamHIの消化によって生じた端で連結されうるが
、しかしその新規連結はいずれの酵素のための部位も再
生しないからして、1端においてBamHIでそして他
端においてBclIで開裂されて生じた断片の挿入は単
一のBamHI部位を持つベクターを与え、両端におい
てBclIで開裂されて生じた断片の挿入は全くBam
HI部位を持たないベクターを与える。1端にBamH
I部位を持つチオストレプトン耐性遺伝子を担持する挿
入体の長さは約1.5kbpである。BamHI部位を
全く持たないチオストレプトン耐性遺伝子を担持する挿
入体の長さは1.1kbpである。
【0059】チオストレプトン遺伝子の左側に位置する
ファージおよびpACYC177の欠失は、実質的に上
記した方法(実施例1、I項およびN項参照)により得
られる。所望の欠失により4乃至4.5kbpのDNA
とpACYC177DNAの左端に位置するPstI部
位が除去される。これは、そのファージをキレート剤で
処理し、そして所望の欠失を持つDNAを有するファー
ジを放出するチオストレプトン耐性溶原菌をスクリーニ
ングすることによって選択される。BamHI部位のな
いベクター内へBamHI部位を次のごとくして導入す
ることができる。プラスミドpBR322のDNAをR
saIおよびSphIで消化させる。この消化によって
生じた0.4kbpの断片にNelson および B
rutlagによって記載された方法に従って10乃至
15のデオキシチジンヌクレオチド残分を端付加する[
T. Nelson および D. Brutlagの
論文“ Additcon of homopolym
ers to 3’−ends of duplex 
DNA with terminal transfe
rase”;Methods in Enzymolo
gy,Vol.68(1979年)、S. P. Co
ldwick および N. O. Kaplan 編
、第41〜50頁参照]。
【0060】BamHI部位を持たず挿入チオストレプ
トン耐性遺伝子の左側のファージとプラスミドDNAの
1部分が欠失されたベクターのDNAを、PstIで開
裂する。このベクター内には、挿入された遺伝子の右側
にただ1つのPstI部位が残る。開裂されたベクター
DNAに10乃至15のデオキシグアノシンヌクレオチ
ド基の尾端を付ける(Nelson および Brut
lag の論文(前掲参照)。尾端をつけた断片と尾端
をつけたベクターとを混合し、そして Strepto
myces cattleyaのプロトプラストをトラ
ンスフェクトするために使用する。生じたファージのD
NAをpBR322からの断片の挿入のために調べる。 このベクターはクローン断片に隣接するPstI部位と
SphI部位を持つ、Sau3AIによる部分消化によ
って生じた任意断片のクローニング(B項参照)に有利
である。PstIで開裂されたDNAにデオキシグアノ
シンで尾端をつけると最終混合成分子内にPstI部位
が再生され、他方SphIで開裂されたDNAにデオキ
シシチジンの尾端をつけるとSphI部位が再生される
。これらの余分な部位は、その後のクローン断片の切取
りのために有利である。
【0061】B.  チエナマイシン遺伝子の単離と同
定Streptomyces cattleya の染
色体DNAをSan3AIで部分的に消化させる。この
消化生成物をアガロースゲル電気泳動によって分割する
。長さ3乃至10kbp範囲の断片をそのゲルから抽出
する( David 等、(前掲)参照)。これらの断
片をBamHIですでに開裂されているベクターTG1
5の誘導体と混合する。この誘導体の構成は上記した。 このDNAを用いて S. cattleyaのプロト
プラストのランスフェクションを行ない、そしてチオス
トレプトンに耐性のある溶原菌を本実施例のA項に記載
のように単離する。これらの溶原菌中のベクターの多く
は S. cattleya染色体DNAの挿入体を担
持する。これをスクリーニングにかけて、次のようにし
てチエナマイシン合成の途中がブロックされている S
. cattleyaの突然変異体を補足できる挿入体
の存在を調べる。
【0062】上記溶原菌の混合物からファージストック
を調製し、そして液体培養基中で各種チエナマイシン突
然変異体を感染させるために使用する。ファージと共に
数時間培養したのち、細胞をチオストレプトンを付加し
たYC寒天皿の上に撒く。宿主内に存在する突然変異を
補完する能力のある遺伝子を担持する雑種ベクターの寄
宿している細胞のコロニーを検出する。この検出はチエ
ナマイシンに感受性のある菌を接種した軟寒天上掛けを
その培養皿にかけることによって行なわれる[J. S
. Kahn、F. M. Kahn、R. Goeg
elman、S. A. Currie、M. Jac
kson、 E. O.Stapley、T. W. 
Miller、A. K. Miller、D. He
ndlin、S. Mochales、S. Hern
andez、H. B. Woodruff および 
J. Birnbanm の論文、“ Thienam
ycin,a new beta−lactam an
tibiotic. I. Discovery, t
axonomy, isolation and ph
ysical properties”J. Anti
biot.32(1979年)第1〜12参照]。その
ような雑種ベクターを持つ菌のコロニーは、チエナマイ
シン感受性菌の大きい円形溶解域の中央にある。雑種ベ
クターの存在は、その溶原菌によって産出されたファー
ジからのDNAを分析することによって確認される。チ
エナマイシン遺伝子の存在はその突然変異体に雑種ファ
ージを再感染させることによって確認される。この新規
雑種ファージを用いて得られたすべての溶原菌はチエナ
マイシン合成能力を獲得するはずである。
【0063】実施例3 B型肝炎表面抗原の S.cattleya へのクロ
ーニングS.cattleya 内で発現される遺伝子
に、B型肝炎表面抗原遺伝子のC−末端部の大部分を挿
入することによってS. cattleya 内へB型
肝炎表面抗原をクローニングすることができる。もしそ
の表面抗原挿入が正しい配位と正しい暗号翻訳の読み枠
でなされたならば、B型肝炎表面抗原の抗原特性を持つ
配合タンパク質が産生されるであろう[ J. C. 
Edman 等の論文、Nature 291(198
1年)第503〜506頁参照]。本実施例ではB型肝
炎表面抗原が、ネオマイシンに耐性を授与する遺伝子に
挿入される。S.cattleya の中においてB型
肝炎表面抗原を発現させるという目的は種々の方法で達
成することができる。ここに記載する方法はTG1ベク
ターおよびその誘導体がこの目的達成のためにどのよう
に使用できるかを例示するだけのものであり、なんら限
定的なものではない。
【0064】A.  ネオマイシン耐性遺伝子を担持す
るTG1ベクターの誘導体の構成 Streptomyces において抗生物質ネオマイ
シンに耐性を授与する遺伝子はすでにクローンされてい
る(Thompson 等、supra 参照)。この
遺伝子はネオマイシンホスホトランスフェラーゼのコー
ドを有する。この遺伝子を持つプラスミドDNAを単離
し、そしてSstII で開裂させる。ネオマイシン耐
性遺伝子を持っている断片(長さ1.0kbp)をアガ
ロースゲル電気泳動で精製する。 この断片をSstIIですでに開裂されているベクター
TG8のDNAと混合する。ベクターTG8は、そのD
NAのpACYC177部内のSmaI部位とPatI
部位との間に位置する単一のSstII部位を持ってい
る。 このDNAを連結してS.cattleya のプロト
プラストのトランスフェクションのために使用する。ネ
オマイシンに耐性のある溶原菌を10および20μg/
mlのネオマイシンを補給されたYC寒天皿の上で単離
する(実施例2、A項に記載した方法と同様にして行な
う)。
【0065】B.  ネオマイシンホスホトランスフェ
ラーゼ−B型肝炎表面抗原融解タンパク質を発現する誘
導体の構成 SstII部位にネオマイシン断片が挿入されたファー
ジのDNAをBamHIで開裂する。このベクターはネ
オマイシン耐性の暗号を持つ遺伝子の中央付近に位置し
た単一のBamHI部位を持っている。このベクターに
約10乃至15のデオキシグアノシンヌクレオチド残分
の尾端をつける(Nelson および Brutla
g、spura 参照)。 クローンされたB型肝炎ウィルスのDNAをHincI
Iで消化し、そしてB型肝炎表面抗原の部分を含む74
4−塩基対断片(その22アミノ末端アミノ酸は欠けて
いる)をポリアクリルアミドゲル電気泳動により単離す
る[J. C. Edman、 R. H. Hall
ewell、P. Valenzuela、H. M.
 Goodman および W. J.Rutter 
の “Synthesis of hepatitis
 B surface and core antig
ens in  E.coli”、Nature Vo
l 291(1981年)、503〜506頁参照]。 この断片に約10乃至15のデオキシチジンヌクレオチ
ド残分の尾端をつける(Nelsonおよび Brut
lag、supra 参照)。ついでこの断片を尾端を
つけたベクターと交配し、そしてその混合物を用いて 
S. cattleyaのプロトプラストにトランスフ
ェクションを行なう。生じたプラークからファージを単
離し、そしてそれらのDNAを制限分析によってB型肝
炎表面抗原断片の挿入について調べる。溶原菌を単離し
、そして35S−システイン標識タンパク抽出物の免疫
沈殿によって(Edman 等、supra参照)、予
期したネオマイシンホスホトランスフェラーゼ−B型肝
炎表面抗原融合タンパク質(ネオマイシン遺伝子のアミ
ノ末端のデオキシグアノシン尾端から由来する短いグリ
シン残分によって結合されている)の産生の有無を調べ
る。挿入されたB型肝炎表面抗原断片は正しい配位と正
しい読み枠になければならないから、雑種クローンの6
つのうちのわずか1つぐらいがその融合タンパク質を産
生するにすぎないだろう。
【図面の簡単な説明】
【図1】ファージTG1の電子顕微鏡写真を示す図であ
る。
【図2】ファージTG1の制限地図を示す図である。
【図3】ファージTG1の欠失突然変異体の制限地図を
示す図である。
【図4】雑種ファージTG6とTG7および欠失突然変
異体を示す図である。

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 【1】  アクチノファージTG1(ATCC3907
    8)またはその欠失もしくは挿入変異体ファージのゲノ
    ムおよびそのゲノム変異体中に付加的DNAを組み込む
    ための方法であって、該方法が、該ゲノムまたは変異体
    DNAを制限エンドヌクレアーゼで切断し、切断された
    DNAに付加的DNAを組み合せ、このDNA混合物を
    処理して連結を起こさせ、該付加的DNAと該バクテリ
    オファージの双方のDNAを全部または一部を共に組み
    込んでいるバクテリオファージ、あるいはその雑種ファ
    ージを形成させることを特徴とする方法。
JP3272989A 1982-04-15 1991-10-22 Dnaクローニングベクターtg1 Granted JPH04365477A (ja)

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