JPH06121685A - ヒトdnaおよび有力マーカーを含む哺乳類セントロメア - Google Patents

ヒトdnaおよび有力マーカーを含む哺乳類セントロメア

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JPH06121685A
JPH06121685A JP3199732A JP19973291A JPH06121685A JP H06121685 A JPH06121685 A JP H06121685A JP 3199732 A JP3199732 A JP 3199732A JP 19973291 A JP19973291 A JP 19973291A JP H06121685 A JPH06121685 A JP H06121685A
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centromere
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Abstract

(57)【要約】 (修正有) 【目的】 ヒトDNAおよび支配マーカーを含む哺乳類
セントロメアおよび該セントロメアを含む非−ヒトセル
ラインの提供。 【構成】 有力マーカー遺伝子と共に哺乳類細胞中に存
在させたとき、機能性セントロメアを形成することの可
能なヒトDNA配列。この配列はそのようなセントロメ
ア用のプローブとしても使用できる。機能性セントロメ
アを含むセルライン。哺乳類のセントロメアDNAを単
離する方法および有力選択マーカー遺伝子と連結した過
剰量の哺乳類セントロメアを有するセルラインを製造す
る方法。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明はヒトDNAおよび支配マ
ーカーを含む哺乳類セントロメアおよび該セントロメア
を含む非−ヒトセルラインに関する。
【0002】
【従来の技術】セントロメアは真核生物の染色体の特別
な領域である。セントロメアは細胞分裂の間に染色体の
厳密な分離を可能にする構造体である動原体の形成場所
である。このことに加えて、真核生物染色体の高次構造
に対する構造上の役割の可能性も示唆されている(ハド
ラズキー(Hadlaczky),(1985),In
ternatl.Rev.,94:57−76)。
【0003】セントロメアの単離およびクローニング
は、その分子構造および機能の理解ばかりでなく、安定
な人工染色体の構築のためにも重要である。セントロメ
アに結合した遺伝子の存在を利用して、下等真核生物
(酵母)の機能性セントロメアの単離は成功している
(ブラックバーン(Blackburn)ら,(198
4)Ann.Rev.Biochem.,53:163
−194;クラーク(Clarke)ら,(198
5),Ann.Rev.Genet.,19:29−5
6)。機能性セントロメアと染色体末端を安定化させる
テロメアとの組み合わせにより、酵母の人工的セントロ
メアの構築が可能であった(ミュレイ(Murray)
ら,(1983),Nature,305:189−1
93;バーク(Burke)ら,(1987),Sci
ence,236:806−812)。これは染色体の
機能の研究および遺伝子操作における新たな時代を示唆
している。
【0004】高等生物(例えば哺乳類)では、酵母と異
なり、セントロメアの両端に境界を形成する繰り返しD
NA配列を含んでいる。この高度に繰り返しを有するD
NAは、特に動物染色体内の特定の蛋白質と相互作用し
て、セントロメアの周囲に遺伝的に不活性なゾーン(ヘ
テロクロマチン)を造る。このペリセントリックヘテロ
クロマチンは、任意の選択マーカー遺伝子を可なりの距
離に維持し、そのため繰り返しDNAはクロモゾーム
の”ウォーキング”によるセントロメア配列の分離を阻
止している。
【0005】従って、高等真核生物のセントロメアDN
Aを単離する方法が、当該分野で必要とされている。そ
のようなDNAの単離は、人工哺乳類染色体の構築のた
めに必要である。そのような染色体の使用は、遺伝子を
哺乳類細胞に導入する現在の技術に固有の問題(挿入ミ
ュータントの同時形成、導入されるDNAの寸法の制
限、およびプラスミドベクターの不完全な離脱を含む)
を解消するであろう。
【0006】
【発明が解決しようとする課題】本発明の目的は、哺乳
類からセントロメアDNAを単離する方法を提供するも
のである。本発明の他の目的は、減数分裂および有糸分
裂において、挿入されたDNAの確実な分離を可能にす
るDNA要素を提供することである。本発明のさらに別
の目的は、哺乳類細胞に大量のDNAを挿入するための
ベクターの形成のためのDNA要素を提供することであ
る。本発明のさらに別の目的は、哺乳類のセントロメア
蛋白質に結合するDNA要素を提供することである。本
発明のその他の目的は、下記の態様の一つもしくはそれ
以上により説明される。
【0007】
【課題を解決するための手段】本発明の一態様によれ
ば、ヒトDNA配列を含む機能性セントロメアを含む非
−ヒトセルラインが提供される。
【0008】他の態様によれば第1図の配列を有するD
NA分子にハイブリダイズする核酸プローブが提供され
る。
【0009】さらに別の態様によれば、哺乳類からセン
トロメアDNAを単離する方法が提供され、該方法は次
の工程からなる:哺乳類セルラインの有糸分裂中期のセ
ントロメアを単離し;染色体を断片に分けて染色体フラ
グメントを含む懸濁物を得;この懸濁物を、抗−セント
ロメア抗体を含むヒト血清とともにインキュベートし
て、染色体フラグメントを該抗体と結合させ;抗体−結
合染色体フラグメントを懸濁物から分離し;そして該結
合フラグメントの蛋白質を除去してセントロメアDNA
調製物を得る。
【0010】さらに別の態様によれば、過剰量の哺乳類
セントロメアを含む細胞を製造する方法が提供され、該
方法は次の工程よりなる:細胞を、(1)哺乳類のセン
トロメアDNAを含むDNA、および(2)有力選択マ
ーカーを有するDNAにより、コトランスフェクション
させ;有力選択マーカーを発現する細胞を選択し;そし
て過剰量の哺乳類セントロメアを持っている細胞を検出
する。
【0011】上記態様およびその化合物の態様を以下に
より詳細に説明する。従って、本発明は、哺乳類細胞の
重要なセントロメアDNAを入手および単離する方法を
提供する。特に、ヒトセントロメアDNA配列が提供さ
れ、これは遺伝子治療のための人工的染色体を造成する
ために使用できる。
【0012】図面の簡単な説明 第1図は、λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの配列を示す。
【0013】第2図は免疫沈降により得られたDNAフ
ラグメントのアガロースゲル電気泳動の結果を示し、 レーンAおよびB:染色体フラグメントから単離され抗
−セントロメアセファロースに未結合のDNA。 レーンCおよびD:抗−セントロメアセファロースに結
合した染色体フラグメントから単離されたDNA。高分
子量DNAフラグメント群の存在に注意。レーンBおよ
びDのサンプルは電気泳動の前に100μg/mlのR
Nase−Aで処理した。 レーンM:λHindIIIマーカー。
【0014】第3図は、CM8λシャロン4Aクローン
のヒトゲノムDNA挿入物の制限地図を示す。矢印は両
側の直接繰り返し配列を欠損した300bpのAlu繰
り返し構造の位置を示す。
【0015】第4図は、3H−チミジン標識したCM8
DNAのヒト有糸分裂中期染色体へのin situハ
イブリダイゼーションの結果を示す。 パネルA:ヒト染色体のセントロメア(矢印の頭)にお
ける銀粒子の優先的局在。 パネルB:131メタセントリック染色体上の銀粒子
(*)の分布を示す。数字は染色体の特定領域への銀粒
子の局在頻度を示す。
【0016】第5図は、抗−セントロメア抗体での間接
免疫螢光法による(パネルAおよびB)、そしてビオチ
ン標識したCM8プローブでのin situハイブリ
ダイゼーションによる(パネルC)およびAPH−II
遺伝子のSmaI/BglIIの1kbフラグメントに
よる(パネルD)、EC3/7細胞のダイセントリック
染色体およびミニ染色体の検出を示す。 パネルEおよびF:ヘキスト33258でのDNA染
色; パネルGおよびH:プロピジウムヨージドでのDNA染
色。パネルE−HはそれぞれA−Dに相当する。矢頭は
ジセントリックおよびミニ染色体を示している
【0017】第6図は、EC3/7セルラインでの余剰
セントロメアの複製を示す。 パネルA−C:ビオチン標識CM8プローブでのin
situハイプリダイゼーション。 パネルD−F:A−CのDNA染色にそれぞれ相当す
る。
【0018】第7図は、EC3/7細胞の同じ有糸分裂
中期において、組み込みDNA配列がセントロメア領域
と共に存在することを、抗−セントロメア血清での免疫
染色により(パネルAおよびD)、およびビオチン標識
CM8での(パネルB)およびAPH−IIプローブで
の(パネルE)引き続くin situハイブリダイゼ
ーションにより示している。 パネルCおよびF:DNA染色。
【0019】詳細な説明 ヒトDNAのセグメントを単離してマウス細胞に導入
し、機能的セントロメアを形成させうることが本発明に
より見出された。本発明のヒトDNAを含む機能的セン
トロメアは、好ましくは有力選択マーカーと結合させ
る。このマーカーは、例えばG418(Sigma)に
対する耐性を付与するアミノグリコシド−3’ホスホト
ランスフェラーゼ−IIであってよい。当該分野で知ら
れている他の同様なマーカーを使用することもできる。
【0020】本発明のセントロメアDNAを単離する方
法は、任意の高等真核生物、特に哺乳類に適用可能であ
る。好ましくはヒトセルラインが使用される。有糸分裂
中期の染色体は、当該分野で知られている技術により単
離される。次に染色体をフラグメントに分ける。エンド
ヌクレアーゼ消化および機械的剪断を用いて染色体をフ
ラグメント化する。大部分のフラグメントが1μm以下
の寸法範囲でありそして染色体のいくつかは壊れずに残
っていることが好ましい。未分解の染色体は約1500
gの遠心力で約10分間処理して、容易に調製物から除
去できる。
【0021】抗−セントロメア自己抗体を含むヒト血清
を本発明の方法に使用できる。この抗体はクレストシン
ドローム(CREST syndrome)患者から人
手可能である。抗体の代替供給源を用いることもでき、
例えばモノクローナル抗体または動物由来の抗−セント
ロメア抗体を含むポリクローナル血清である。抗体は染
色体フラグメントの調製物とともに、抗体−抗原複合体
が形成し且つ安定な条件でインキュベートする。抗体が
固相支持体に結合していると好都合である。好ましく
は、例えばプロテイン−A セファロースCL4B(フ
ァルマシア)のような支持体が、結合染色体フラグメン
トと未結合染色体フラグメントの分離を助けるために使
用される。しかしながら、固体支持体に結合した抗体を
使用することなく、当該分野で知られたこの目的を達成
する他の方法も用いることができる。
【0022】セントロメアDNAを含むDNAフラグメ
ントは抗体から分離され、そしてセントロメアの蛋白質
は脱蛋白質処理により除去される。最終的には、蛋白質
は分解されそして染色体フラグメント調製物から抽出さ
れて、DNAから全蛋白質を除外する。当該分野で知ら
れている任意の処理を用いることができ、その非限定的
例はプロテイナーゼKおよびフェノールのようなプロテ
アーゼと有機溶剤である。
【0023】セントロメアDNAフラグメントは、当該
分野で知られている任意の目的もしくは用途に使用でき
る。例えば、それを標識してプローブとして用いること
ができ、それをクローニングのベクターまたは配列の全
部分に連結することができ;およびそれを固体支持体に
結合してセントロメア蛋白質を精製するために用いるこ
とができる。
【0024】本発明の一つの特定の態様において、セン
トロメアDNAフラグメントを用いてこれとハイブリダ
イズするクローンを探すためにヒトもしくは他の哺乳類
のゲノムDNAライブラリーをプローブすることができ
る。ハイブリダイズするクローンを分析して、セントロ
メアDNAが有する機能を奏する能力を持つことを調べ
ることができる。そのような機能の一つはセントロメア
蛋白質に結合することである。そのような機能の他の一
つは、特異的にセントロメアを染色する抗−セントロメ
ア抗体を用いた適当な免疫染色法を用いて細胞学的に検
出できる、細胞内構造を形成することである。
【0025】本発明の他の方法によれば、過剰量の哺乳
類セントロメアを有する細胞が製造される。そのような
細胞はヒト細胞でも他の哺乳類細胞でもよい。セントロ
メアはその細胞と同一もしくは異なる哺乳類の種から単
離されたDNAを含むことができる。本発明の方法は二
種類のDNA分子での細胞のコトランスフェクションを
含み、一方はセントロメアDNAを有するDNAであ
り、他方は有力選択マーカーを含むDNAである。好ま
しくは、これら二種類のDNA分子は、コンカテマーを
形成することのできる配列、例えばλファージのような
ファージDNAを含有している。第一のDNA分子は、
例えばプローブとして上記セントロメアフラグメントを
用いて、ゲノムDNAライブラリーから単離することが
できる。別法として第一DNA分子は、上記セントロメ
アフラグメントを適当なサイズおよび末端を持つフラグ
メントを造成するための操作に続いて、例えばλファー
ジのようなファージにクローニングすることによって生
じたものでもよい。第二のDNA分子は、当業者が容易
に入手できるもので、例えば薬剤耐性マーカーを有する
λファージである。
【0026】λファージDNAはコンカテマーを形成す
るので、これを使用するのが望ましいと信じられるが、
しかしながら、それが絶対に必要であるとは決定されて
いない。さらに、たとえこの性質が必要であるとして
も、他のウイルスDNAまたはDNA構造物もこの機能
を提供できるであろう。そのように、コンカテマーを形
成できる他の手段の使用も本発明の範囲である。
【0027】コトランスフェクションの後、有力選択マ
ーカーを発現する細胞を、例えば該マーカーの不存在下
では細胞にたいして毒性量のG418中で増殖させるこ
とにより選択する。こうして選択された細胞群をさらに
過剰量の哺乳類セントロメアをもつ細胞の検出のために
スクリーニングする。このスクリーニングは標準的細胞
遺伝学的技術、並びに抗−セントロメア抗体での免疫染
色により行うことができる。好ましくはラムダ、マーカ
ーおよびセントロメアDNA(ラムダクローンからのも
の)は過剰セントロメアの部分に局在するであろう。こ
のことは、当該技術分野で知られているin situ
ハイブリダイゼーション試験で確認できる。
【0028】上記方法で製造された一つのセルライン
は、EC3/7であり、英国、ポートン ダウン(Po
rton Down)のヨーロピアン・コレクション・
オブ・アニマル・セル・カルチャーズに、1990年4
月10日付けでブダペスト条約の条件下に寄託番号90
051001で寄託された。本発明はさらに、このセル
ライン由来のヒト由来セントロメアを含む任意のセルラ
インも包含する。
【0029】EC3/7セルラインを製造するために用
いられたラムダファージ中のDNA挿入物の配列(本明
細書中ではCM8と呼ぶ)は、標準的技術で決定されそ
して第1図に示されている。この配列はいかなるDNA
配列バンクの配列とも異なっている。
【0030】本発明はまた好ましくは約10ヌクレオチ
ドの核酸プローブにも関し、このプローブは第1図に示
す配列を持つDNA分子にハイブリダイズする。そのよ
うな分子の一つはCM8であり、この配列を誘導したλ
ファージクローンである。プローブは、例えば望みの用
途に応じて放射標識、ビオチン標識または未標識で使用
できる。CM8の配列または少なくともその一部は、全
てのヒトのセントロメアに存在すると確信されるが、出
願人はこの仮説にしばられるものではない。
【0031】
【実施例】以下の実施例は、本発明を記載された特定の
態様に限定するためではなく、本発明を実施するための
一定の道筋を説明するために特に記載するものである。
【0032】実施例1 本実施例はセントロメアからのヒトDNAの単離を説明
する。ヒト結腸癌セルライン(Colo 320)を1
0%胎児ウシ血清(FCS)を添加したRPMI培地中
のサスペンジョンとして増殖させた。Colo 320
細胞の有糸分裂中期の染色体を標準的方法(Hadla
czkyら,(1982),Chromosomes,
86:643−659)により単離した。単離した有糸
分裂中期の染色体を1mlのバッファー(105mM
NaCl,50mMトリス塩酸 pH7.5,10mM
MgCl2、5mM 2−メルカプトエタノール)
に、1mg/mlのDNAとなるように再懸濁して、5
00単位のEcoRI制限エンドヌクレアーゼで1時間
消化した。懸濁物を4mlのIPPバッファー(500
mM NaCl、10mM トリス塩酸,0.5% N
P−40,pH8.0)で希釈し、MSE 5−70ソ
ニケーターで5x50sで音波処理した。この処理によ
り染色体のフラグメントおよび少量(1%以下)の未破
壊の小染色体を含む懸濁物が生じた。この懸濁物を15
00gで10分間遠心分離し未破壊の染色体フラグメン
トを除去した。光学顕微鏡観察によれば、上清にはほん
の小さい(1μm以下)の染色体フラグメントが含まれ
ていた。
【0033】250mgのプロテイン−A セファロー
ス CL4B(ファルマシア)を、IPPバッファー中
で膨潤させ、IPPバッファーで20倍に希釈した50
0μlのヒト抗−セントロメア血清LU851(Had
laczkyら(1989),Chromosoma,
97:282−288)とともにインキュベートした。
音波処理した染色体フラグメント(5ml)を抗−セン
トロメアセファロース(1ml)と混合し、穏やかにゆ
すりながら室温で2時間インキュベートした。続いて、
25mlのIPPバッファーで3回洗浄した後、セファ
ロースを200gで10分間遠心分離した。
【0034】免疫沈降物からのDNAの単離は、1%S
DSを含む10mM トリス塩酸,2.5mM EDT
A,pH8.0中で50℃一夜プロテイナーゼ−K処理
(Merck,100μg/ml)を行い、その後フェ
ノール抽出を繰り返しそしてイソプロパノールで沈澱さ
せて行った。全ての一般的DNA操作は「モレキュラー
・クローニング:ア・ラボラトリー・マニュアル(Mo
lecular Cloning:A Laborat
ory Manual)」〔コールド・スプリング・ハ
ーバー・ラボラトリー(Cold Spring Ha
rbor Laboratory),1982〕に従っ
て行った。
【0035】免疫沈降したDNAおよび上清DNAの電
気泳動の結果は第2図に示す。抗−セントロメアセファ
ロースに結合しなかった染色体フラグメント(上清)か
らのDNAの多くは、数百塩基対から5kbの範囲であ
り(第2図,レーンAおよびB)、一方、抗−セントロ
メアセファロースに結合した染色体フラグメントからの
DNAは、更に分子量の大きい(9−20kb)のフラ
グメント群も含んでいた(第2図,レーンCおよび
D)。このフラグメント寸法の分布は、セントロメアD
NAが哺乳類染色体中で構造的に最も安定な領域である
という認識(Hadlaczkyら,(1981),C
hromosoma,81:557−567)と一致
し、従ってこのDNAを酵素消化および機械的剪断に対
して比較的抵抗性にする。
【0036】実施例2 本実施例は、高分子量の免疫沈降DNAを、ゲノムDN
Aライブラリーをスクリーニングするためのハイブリダ
イゼーションプローブとして用いる用途を例示する。高
分子量DNAを実施例1のアガロースゲルから、電気溶
出により単離し、ランダムオリゴヌクレオチドプライミ
ング法(Feinbergら,(1983),Ana
l.Biochem.,132:6−13)により32
P−dATPで標識し、そしてλシャロン4Aヒトゲノ
ムライブラリー(Maniatisら,(1978),
Cell,,15:687−701)のスクリーニング
用プローブとして用いた。ハイブリダイズしたクローン
(CM8)を得、これは14kbのヒトDNA挿入物を
含んでいた。この挿入物のいくつかの制限酵素に対する
制限地図は第3図に示されている。この14kb挿入物
の一部分をヒトリンパ球ゲノムDNAにサザンハイブリ
ダイゼーションさせた結果、この14kb挿入物がゲノ
ム中のDNAの連続的部分であって、複数のフラグメン
トの連結生成物ではないことが示された。
【0037】実施例3 本実施例はクローンCM8の14kb挿入物のコピー数
がヒトゲノム中の各染色体に存在するコピー数と一致す
ることを示す。サザンプロット実験を行うために、シン
グルコピーのDNAプローブ(XV2C)(EStiv
illら,(1987),Nature,326:84
0−845)およびCM8挿入物の中心部XhoI−E
coRIフラグメント(第2図)を、ヒト末梢リンパ球
DNAの連続希釈列と、同時にハイブリダイズさせた。
プローブは、ランダムオリゴヌクレオチドプライミング
法(Feinbergら,(1983),Anal.B
iochem・,132:6−13)で標識して用い
た。CM8プローブのシグナルを既知のシングルコピー
プローブと比較することにより、CM8のコピー数は、
ハプロイドゲノム当たり16−32であると推定され
た。
【0038】実施例4 本実施例はヒト有糸分裂中期染色体に対するプローブと
しての、CM8 DNAの用途を示す例である。ヒト
(Colo 320)の有糸分裂中期染色体に対する、
3H−チミジン標識CM8 DNAの放射活性in s
ituハイブリダイゼーションを、Pinkelら(1
986),Proc.Natl・Acad.Sci.U
SA,83:2934−2938の方法で実施した。銀
粒子の優先的セントロメアへの局在か観察された(第4
図)。ビオチン標識した全CM8挿入物のサブフラグメ
ントを用いてグラハム((Graham)ら,(197
3),Virology,52:456−467)の方
法で行った、非−放射活性in situハイブリダイ
ゼーションにおいては、本発明者らの標準的方法におい
ては陽性ハイブリダイゼーションシグナルを検出するこ
とがきなかった。さらに、ビオチン標識プローブを用い
たシングルコピー遺伝子の検出に適するハイブリダイゼ
ーション法(Lawrenceら,(1988),Ce
ll,52:51−61)では、典型的なR−バンド様
Aluハイブリダイゼーションパターン(Korenb
ergら,(1988),Cell,53:391−4
00)を除いて、全14kb CM8挿入物をもつ染色
体のどれについても、特異的ハイブリダイゼーションシ
グナルは全く検出されなかった。この陰性結果に関して
は、これらの配列はセントロメア構造の内部で小さくた
たまれているために、ハイブリダイゼーションプローブ
が実質的に接近できないこと、およびビオチン系が放射
活性系よりも低感度であるためとの説明が可能であろ
う。
【0039】実施例5 本実施例はヒトセントロメアDNAの新規配列を開示す
る。λCM8のヒトゲノム挿入物の配列は、ダイデオキ
シ法(Sangerら,(1980),J.Mol.B
iol.,143:161−178;Bigginら
(1983),Proc.Natl.Acad.Sc
i.USA,80:3963−3965)で決定した。
第1図参照。13863bpのヒトCM8クローンの配
列を完全な核酸バンク(マイクロジェニー(Micro
Genie),ベックマン)と比較したところ、公知の
どの配列ともホモロジーを示さなかった。しかしなが
ら、両側の直接繰り返し配列中には欠損している300
bpのAlu繰り返しが、2.5kbのEcoRI−X
hoIフラグメント中に見出され(第3図)、このこと
はAlu型のin situハイブリダイゼーションパ
ターンを説明できる。
【0040】実施例6 本実施例は哺乳類細胞中にセントロメアを形成させるた
めのCM8 DNAの用途を例示する。CM8 DNA
のin vivoセントロメア機能を十分検出するため
に、該DNAをAPH−II選択遺伝子とともにマウス
LMTK−繊維芽細胞に導入した。マウス繊維芽細胞は
単層細胞として、10%FCSを添加したF12培地で
維持した。リン酸カルシウム法(Harperら,(1
981),Chromosoma,83:431−43
9)を用いて、細胞をペトリ皿(80mm)当たり20
μgのλ CM8および20μgのλgtWESneo
DNAでトランスフェクトした。2分間のグリセロー
ルショックを用いた。λgtWESneoは、pAG6
0プラスミド(Colbere−Garapinら,
(1981),J.Mol・Biol.,150:1−
14)を、λgtWES(Lederら(1977),
Science,196:175−177)バクテリオ
ファージベクターにクローニングすることにより製造し
た。
【0041】二つの理由から、完全λCM8およびλg
tWESneo構築物をトランスフェクションに使用し
た。第一に、セントロメア形成の間に起こりうるAPH
−II遺伝子の不活性化を避けるために、CM8配列か
らマーカー遺伝子を分離するため、第二にλDNAはコ
ンカテマー形成による長いタンデム配列のDNA分子を
形成することができるためである。コンカテマー形成は
セントロメアの形成に必要であると推測されている,と
いうのはS.pombe中では4ないし15コピーの保
存された配列部分がセントロメアを形成するためである
(Chikashigeら,(1989),Cel
l,,57:739−751)。これら二つの要因を考
慮すると、コンカテマー形成による仮想セントロメアD
NAの増殖は、セントロメアの形成の機会を増大させる
であろう。
【0042】形質転換された細胞は、400μg/ml
のG418(ゲンチシン,Sigma)を含む増殖培地
で選択した。各G418耐性クローンを分析した。形質
転換されたクローン中のヒト配列の存在は、CM8挿入
物のサブフラグメントをプローブとして用いるサザンブ
ロットによりモニターした。過剰量のセントロメアのス
クリーニングは、ヒト抗−セントロメア血清LU851
(Hadlaczkyら,(1989),Chromo
soma,97:282−288)を用いて間接免疫螢
光法により行った。”外来”DNA配列の染色体におけ
る局在は、ビオチン標識プローブを用いてin sit
uハイブリダイゼーションで決定した。
【0043】8個の形質転換クローンを分析した。全て
のクローンはマウス染色体中に組み込まれたヒトDNA
配列を有していた。しかしながら、2つのクローン(E
C5/6およびEC3/7)のみが、ジ−セントリック
な染色体の規則的存在を示した。ジ−,トリ−,および
多−セントメリックな染色体を有する、クローンEC5
/6の各細胞は極端に不安定であった。このセルライン
の60%以上の細胞において、組み込まれたDNA配列
の染色体での局在は、細胞間でばらついた。この不安定
性のためにクローンEC5/6は不適当とみなされた。
しかしながら、EC3/7細胞は安定であり、ジセント
リック(85%)またはミニ染色体(10%)のいずれ
かを有していた。ジセントリック染色体のセントロメア
およびミニ染色体のセントロメアは、抗−セントロメア
抗体(第5図AおよびB)による免疫染色によって、正
常マウスセントロメアとの識別が可能であった。
【0044】実施例7 本実施例は、新たにEC3/7セルライン中に導入され
たDNAがセントロメアの形成に寄与することを示す。
ビオチン標識したCM8、APH−II遺伝子、および
λファージDNAでの、in situハイブリダイゼ
ーションを行った。染色体をin situハイブリダ
イゼーション実験のためにプロピジウムヨージドで逆染
色し(カウンターステイン)(Pinkelら,(19
86),Proc.Natl.Acad.Sci・US
A,83:2934−2938)、一方間接免疫螢光法
はDNA結合色素のへキスト(Hoechst)332
58で行った。全ての観察および顕微鏡検査は、オリン
パスAHBS Vanox顕微鏡を用いて行った。写真
撮影のフィルムには、フォルト400プロフェッショナ
ルブラックアンドホワイト(Forte 400 Pr
ofessional black and whit
e)およびフジカラー400スーパーHGカラーフィル
ムを用いた。
【0045】これらの三つのプローブは、例外なく同じ
スポットにハイブリダイズした:そのスポットは、ジセ
ントリック染色体の遠位セントロメア上のもの(第5図
C)か、あるいはミニ染色体のセントロメア上のもの
(第5図D)である。EC3/7細胞の5%より少ない
細胞において、ハイブリダイゼーションシグナルの別の
局在が見られた。これらの細胞には一つ以上の組み込み
部位を持つ細胞、検出可能シグナルを持たない細胞、ま
たはジセントリック染色体であると同定された以外の染
色体上にハイブリダイゼーションが認められたものを含
んでいた。
【0046】0.5%より少ない細胞に、ジセントリッ
ク染色体上にハイブリダイゼーションシグナルのタンデ
ム配列が観察され(第6図A−C)、このことはこの追
加セントロメアが自己複製可能であることを示唆した。
これらの複製したセントロメアの少なくともあるものは
機能的であるように見えた。このことは二重セントロメ
アを持つミニ染色体の存在により示唆された。このミニ
染色体の両方のセントロメア共に抗−セントロメア抗体
による免疫染色が陽性であった(第7図A)。二重セン
トロメアを有するミニ染色体は、多セントロメア染色体
の分解産物である可能性もある。
【0047】マウスの有糸分裂中期細胞の間接免疫螢光
法は、Hadlaczkyら,(1989),Chro
mosoma,97:282−288に記載された方法
で行った。同じ有糸分裂中期に間接免疫螢光法およびi
n situハイブリダイゼーションを行って、有糸分
裂細胞をグリシン−ヘキシレン グリコールバッファー
(Hadlaczkyら,(1989),Chromo
soma,97:282−288)に再懸濁し、37℃
で10分間膨潤させ、続いて細胞遠心および冷(−20
℃)のメタノールによる固定を行った。標準的免疫染色
(Hadlaczkyら,(1989),Chromo
soma,97:282−288)ののち、中期細胞を
写真撮影し、次いでカバースリップをリン酸バッファー
サリンで洗浄し、そしてスライドを氷冷メタノール−酢
酸で固定し、風乾しそしてinsituハイブリダイゼ
ーションに用いた。
【0048】ヒト配列およびAPH−II遺伝子のセン
トロメア領域への組み込みを証明するため、抗−セント
ロメア抗体によるセントロメアの免疫染色、続いてCM
8およびAPH−IIプローブによるin situハ
イブリダイゼーションを、同じ有糸分裂中期のEC3/
7細胞のプレートで実施した。ビオチン−標識CM8お
よびAPH−IIプローブどちらのin situハイ
ブリダイゼーションの信号も、追加的セントロメアを有
する染色体の免疫染色セントロメア領域との同時局在を
示した(第7図)。
【0049】実施例8 本実施例はEC3/7セルラインの安定性を説明する。
単一の細胞に由来する46の独立サブクローンを単離し
て分析した。各サブクローンはジセントリック染色体を
有していた。ミニ染色体を含む細胞のパーセントは、サ
ブクローンによって2%と30%のあいだでばらつきを
示した。本発明者らは、追加的セントロメアをミニ染色
体のみに有するサブクローンを単離することはできなか
った。この結果はミニ染色体は不安定で、これがジセン
トリック染色体の規則的分解の生成物であるとみなしう
ることを示唆した。非−選択的培地で46日間培養した
EC3/7細胞(103 有糸分裂中期)の免疫染色に
よる、予備分析では、80.6%の細胞がジセントリッ
ク染色体(60.2%)またはミニ染色体(20.4
%)を有していた。引き続きビオチン標識プローブによ
るin situハイブリダイゼーションで、追加的セ
ントロメア中に”外来”DNAが存在することを確認し
た。これらの結果はこの培養期間において、非−選択条
件下で追加的セントロメアに重大な損失または不活性化
が生じないことを示唆する。
【0050】実施例9 本実施例はCM8挿入物がコンカテマーになってセルラ
インEC3/7の機能的セントロメアを形成することを
示す。EC3/7セルラインのDNAおよびヒトリンパ
球のDNAを制限エンドヌクレアーゼで消化し、そして
サザンハイブリダイゼーション実験でCM8挿入物のサ
ブフラグメントをプローブとして使用した。EC3/7
DNAによるハイブリダイゼーションシグナルの強さを
ヒトDNAのものと比較して、付加的セントロメア中に
組み込まれたヒト配列の最低数は30以上であると推定
された。ヒトリンパ球DNA中のCM8のコピー数は、
前記実施例3に記載したとおりと決定された。
【図面の簡単な説明】
【図1】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノムラ
イブラリー中に同定されたDNAの13863bpフラ
グメントの一連の配列における第1部分を示す図であ
る。
【図2】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノムラ
イブラリー中に同定されたDNAの13863bpフラ
グメントの一連の配列における第2部分を示す図であ
る。
【図3】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノムラ
イブラリー中に同定されたDNAの13863bpフラ
グメントの一連の配列における第3部分を示す図であ
る。
【図4】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノムラ
イブラリー中に同定されたDNAの13863bpフラ
グメントの一連の配列における第4部分を示す図であ
る。
【図5】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノムラ
イブラリー中に同定されたDNAの13863bpフラ
グメントの一連の配列における第5部分を示す図であ
る。
【図6】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノムラ
イブラリー中に同定されたDNAの13863bpフラ
グメントの一連の配列における第6部分を示す図であ
る。
【図7】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノムラ
イブラリー中に同定されたDNAの13863bpフラ
グメントの一連の配列における第7部分を示す図であ
る。
【図8】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノムラ
イブラリー中に同定されたDNAの13863bpフラ
グメントの一連の配列における第8部分を示す図であ
る。
【図9】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノムラ
イブラリー中に同定されたDNAの13863bpフラ
グメントの一連の配列における第9部分を示す図であ
る。
【図10】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第10部分を示す図で
ある。
【図11】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第11部分を示す図で
ある。
【図12】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第12部分を示す図で
ある。
【図13】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第13部分を示す図で
ある。
【図14】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第14部分を示す図で
ある。
【図15】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第15部分を示す図で
ある。
【図16】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第16部分を示す図で
ある。
【図17】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第17部分を示す図で
ある。
【図18】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第18部分を示す図で
ある。
【図19】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第19部分を示す図で
ある。
【図20】λシャロン(Charon)4Aヒトゲノム
ライブラリー中に同定されたDNAの13863bpフ
ラグメントの一連の配列における第20部分を示す図で
ある。
【図21】免疫沈降により得られたDNAフラグメント
のアガロースゲル電気泳動の結果を示す図である。
【図22】CM8λシャロン4Aクローンのヒトゲノム
DNA挿入物の制限地図を示す図である。
【図23】3H−チミジン標識したCM8DNAのヒト
有糸分裂中期染色体へのin situハイブリダイゼ
ーションの結果を示す図である。
【図24】抗−セントロメア抗体での間接免疫螢光法に
よる(パネルAおよびB)、そしてビオチン標識したC
M8プローブでのin situハイブリダイゼーショ
ンによる(パネルC)およびAPH−II遺伝子のSm
aI/Bgl IIの1kbフラグメントによる(パネ
ルD)、EC3/7細胞のダイセントリック染色体およ
びミニ染色体の検出を示す図である。
【図25】EC3/7セルラインでの余剰セントロメア
の複製を示す図である。
【図26】EC3/7細胞の同じ有糸分裂中期におい
て、組み込みDNA配列がセントロメア領域と共に存在
することを、抗−セントロメア血清での免疫染色により
(パネルAおよびD)、およびビオチン標識CM8での
(パネルB)およびAPH−IIプローブでの(パネル
E)引き続くin situハイブリダイゼーションに
より示す図である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.5 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 C12Q 1/68 A 7823−4B G01N 33/53 M 8310−2J //(C12N 5/10 C12R 1:91)

Claims (22)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 ヒトDNA配列を含む機能性セントロメ
    アを含む非−ヒトセルライン。
  2. 【請求項2】 該ヒトDNA配列が第1図に記載した配
    列とハイブリダイズするものである、請求項1記載のセ
    ルライン。
  3. 【請求項3】 セントロメアがクレスト(CREST)
    シンドローム患者から単離されたヒト自己抗体に結合す
    るものである請求項1記載のセルライン。
  4. 【請求項4】 セルラインがマウスのセルラインであ
    る、請求項1記載のセルライン。
  5. 【請求項5】 ヨーロピアン・コレクション・オブ・ア
    ニマル・セル・カルチャーズ(ECACC)に寄託番号
    90051001として寄託されており、EC3/7と
    しても知られているものである、請求項4記載のセルラ
    イン。
  6. 【請求項6】 セントロメアがECACC寄託番号90
    051001のセルライン由来のものである、請求項1
    記載のセルライン。
  7. 【請求項7】 第1図に示す配列を有するDNA分子に
    ハイブリダイズする核酸プローブ。
  8. 【請求項8】 放射活性標識されている、請求項7記載
    のプローブ。
  9. 【請求項9】 ビオチン標識されている、請求項7記載
    のプローブ。
  10. 【請求項10】 第1図に示す配列の少なくとも10ヌ
    クレオチドよりなる請求項7記載のプローブ。
  11. 【請求項11】 哺乳類のセントロメアDNAの単離方
    法において、 哺乳類セルラインから染色体を単離し;その染色体を断
    片に分けて染色体フラグメントを含む懸濁物を得;該懸
    濁物を抗−セントロメア抗体を含む血清とともにインキ
    ュベートして、染色体フラグメントを該抗体に結合さ
    せ;該懸濁物から抗体−結合染色体フラグメントを分離
    し;そして該結合フラグメントから蛋白質を除去して、
    セントロメアDNAの調製物を得る;ことよりなる哺乳
    類のセントロメアDNAの単離方法。
  12. 【請求項12】 血清がクレストシンドローム患者由来
    のものである、請求項11記載の方法。
  13. 【請求項13】 哺乳類セルラインがヒトセルラインで
    ある、請求項11記載の方法
  14. 【請求項14】 過剰量の哺乳類セントロメアDNAを
    有する細胞の製造方法において、 細胞を、(1)哺乳類セントロメアDNA、および
    (2)有力選択マーカーを有するDNA、でコトランス
    フェクションし;有力選択マーカーを発現する細胞を選
    択し;そして過剰量の哺乳類セントロメアを有する細胞
    を検出する;ことよりなる過剰量の哺乳類セントロメア
    DNAを有する細胞の製造方法。
  15. 【請求項15】 哺乳類セントロメアDNAがラムダフ
    ァージベクターにより運ばれる、請求項14記載の方
    法。
  16. 【請求項16】 有力選択マーカーがラムダファージベ
    クターにより運ばれる、請求項14記載の方法。
  17. 【請求項17】 DNA(1)およびDNA(2)がコ
    ンカテマーになりうる配列を含んでいる、請求項14記
    載の方法。
  18. 【請求項18】 哺乳類のセントロメアDNAがヒトD
    NAである、請求項14記載の方法。
  19. 【請求項19】 マーカーがG418耐性である請求項
    14記載の方法。
  20. 【請求項20】 過剰量の哺乳類セントロメアを含む細
    胞を検出する工程に抗−セントロメア抗体を用いる、請
    求項14記載の方法。
  21. 【請求項21】 請求項14記載の方法で製造された、
    過剰量の哺乳類セントロメアを含む細胞。
  22. 【請求項22】 少なくとも一つのセントロメアが請求
    項5記載のセルライン由来のものであり、そしてヒトD
    NA配列を含む、過剰量の哺乳類セントロメアを含む細
    胞。
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