JPH067171A - フラビン還元活性を有する酵素の遺伝子 - Google Patents

フラビン還元活性を有する酵素の遺伝子

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JPH067171A
JPH067171A JP4279029A JP27902992A JPH067171A JP H067171 A JPH067171 A JP H067171A JP 4279029 A JP4279029 A JP 4279029A JP 27902992 A JP27902992 A JP 27902992A JP H067171 A JPH067171 A JP H067171A
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Abstract

(57)【要約】 【構成】 配列の長さ929の塩基配列を有するDNA
からなるフラビン還元活性およごニトロ還元活性を有す
る酵素遺伝子。この遺伝子は218個のアミノ酸からな
る分子量24562の蛋白質をコードしている。この遺
伝子を含有する組換えベクター、このベクターを含む細
菌。 【効果】 FMN還元活性およびニトロ還元活性を有す
る酵素遺伝子が提供された。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【技術分野】本発明は、フラビン還元活性を有する酵素
の遺伝子、酵素、該遺伝子を含む組換えベクター、およ
び該組換えベクターを含有する細菌に関する。
【0002】
【従来の技術】発光細菌に由来する酵素ルシフェラーゼ
は還元型フラビンモノヌクレオチド(以下FMNH2
いう)を発光素として長鎖脂肪族アルデヒドと酸素の存
在下、酸化型フラビンモノヌクレオチド(以下酸化型F
MNという)と長鎖カルボン酸とを生成し、その際に青
色に発光する反応を触媒する。基質であるFMNH
2 は、還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド:
フラビンモノヌクレオチド(NADH:FMN)還元酵
素および還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド
リン酸:フラビンモノヌクレオチド(NADPH:FM
N)還元酵素により、また長鎖アルデヒドは脂肪酸還元
酵素複合体により供給される。最近、Spyrouら
は、大腸菌からフラビン還元酵素遺伝子を単離し、その
一次構造を明らかにし、〔Spyrou,G.,Hag
gard−Ljungquist,E.,Krook,
M.,Jornvall,H.,Nilsson,
E.,& Reichard,P.(1991)J.B
acteriol.173 3673−3679〕に開
示している。
【0003】我々の身の回りには、遺伝子DNAに損傷
を与える物質(変異原)が多数存在しており、我々はこ
れらの物質に暴露されながら生活している。ニトロアレ
ーン類はこうした環境変異原の一グループであり、自動
車の排気ガス、焼却場の煙、都市の大気、河川の底質、
ストーブを焚く室内の空気、あるいは焼鳥の焦げた部分
に含まれている。変異原性、発癌性を示すニトロアレー
ンとして2‐ニトロフルオレンがよく知られている。ニ
トロアレーン自体が直接反応してDNAを損傷するわけ
ではなく、ニトロアレーンの代謝産物が突然変異を起こ
しDNAを損傷する。たとえばニトロフルオレンは、微
生物細胞内ではニトロ還元酵素によってN‐ヒドロキシ
体に還元されて細胞内に入り、その後O‐アセチル転移
酵素によって活性化され、最終的に生じたニトレニウム
イオンがDNAを攻撃するものと考えられる。従って、
ニトロ還元酵素と2‐ニトロフルオレンとの反応が2‐
ニトロフルオレンの変異原性発現の律速段階と考えるこ
とができる。
【0004】渡辺らは、サルモネラ菌からニトロ還元酵
素遺伝子を単離し、〔Watanabe,M.,Ish
idate,M. Jr.& Nohmi,T.(19
89)Mutation Research,2162
11−220〕に開示している。また、その一次構造を
明らかにし、〔Watanabe,M.,Ishida
te,M. Jr.& Nohmi,T.(1990)
Nucleic Acid Research,18,
1059〕に示している。
【0005】以上のように、FMN還元酵素は、細菌ル
シフェラーゼの発光反応を最大限に生かすために必須で
ある。それ故にFMN還元酵素遺伝子を単離することに
より、大量に該酵素を調製することが可能になり、該酵
素遺伝子の単離は重要な課題である。また、ニトロ還元
酵素遺伝子は、上述の変異原性あるいは発癌性物質を検
出する感度の向上に有用である。
【0006】しかしながら、いまだ発光細菌FMN還元
酵素遺伝子およびニトロ還元酵素遺伝子の単離、および
それらの大腸菌での発現については報告されていない。
【0007】
【発明が解決しようとする課題】本発明の目的は、上述
の技術的事情にかんがみ、発光細菌のFMN還元活性お
よびニトロ還元活性を有する酵素遺伝子および酵素を提
供することであり、さらに該遺伝子を含む組換えベクタ
ー、および該組換えベクターを含む細菌を提供すること
である。
【0008】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、鋭意研究
の結果、発光細菌Vibrio fischeri (ATCC 7744) からF
MN還元活性およびニトロ還元活性を有する酵素遺伝子
を単離し、その一次構造を明らかにすることに成功し、
また該遺伝子を大量に発現する大腸菌を作出することに
成功し、本発明を完成するに至った。すなわち、
【0009】本発明は、つぎの(1)〜(8)の構成を
有する。
【0010】(1) 配列番号1で表される塩基配列を
含む、フラビン還元活性を有する酵素遺伝子。 (2) 配列番号2で表される塩基配列を含む(1)項
記載のフラビン還元活性を有する酵素遺伝子。 (3) 塩基配列が配列番号3で表されるフラビン還元
活性を有する酵素遺伝子。
【0011】(4) 配列番号4で表されるアミノ酸配
列を有するフラビン還元活性を有する酵素。
【0012】(5) 塩基配列が配列番号1で表される
DNAを含有する組換えベクター。
【0013】(6) 配列番号1で表される塩基配列を
有する遺伝子がプラスミドベクターへ挿入された(5)
項記載の組換えベクター。
【0014】(7) 配列番号1で表される塩基配列を
有するDNAを含む組換えベクターを含有する細菌。
【0015】(8) 塩基配列が配列番号1で表される
DNAを含む組換えベクターで修飾されてなる細菌を培
養することからなる配列番号4で表されるアミノ酸配列
を含む酵素の製法。
【0016】本発明の酵素遺伝子は、配列番号1で表さ
れる配列の長さ657のヌクレオチド鎖を含むのが特徴
である。好ましく示す配列としては配列番号2で表され
るヌクレオチド鎖を含む。塩基配列が配列番号3で表さ
れる配列の長さが929のDNAであるが具体的に示す
ことができる。配列の種類はGenomic DNAで
あり、発光細菌Vibrio fischeri(AT
CC7744)から単離されるものである。その配列の
特徴は塩基、塩基番号109から762までの218個
のアミノ酸からなる分子量24562の蛋白質をコード
している。本発明の酵素遺伝子は、フラビン還元活性お
よびニトロ還元活性を有し、たとえば、FMN還元活性
およびニトロフラゾン還元活性を有するものである。
【0017】本発明の酵素は、配列番号1,2および3
の塩基配列から予測される配列番号4で表されるアミノ
酸配列を有する蛋白質である。その蛋白質は218個の
アミノ酸からなり分子量24562のものであり、発光
細菌のフラビン還元活性およびニトロ還元活性の二つの
活性を有する。
【0018】本発明の組換えベクターは、塩基配列が配
列番号1で表されるDNAを含有する。すなわち、本発
明の組換えベクターは、配列番号3で表される塩基配列
を有するDNAと、機能的同等物を含む。「機能的同等
物」とは適当な宿主による発光細菌のFMN還元活性及
びニトロ還元活性を有する酵素の産生において、実質的
に同じ結果を得るために実質的に同じ方法で使用できる
DNA断片のことである。すなわち、塩基配列が異なっ
ても、同一のアミノ酸配列を有する蛋白をコードしえる
DNA断片や若干の塩基配列の相違に伴う若干のアミノ
酸配列の違いがあるもののFMN還元活性及びニトロ還
元活性を有する蛋白をコードしえるDNA断片のことを
意味する。具体的には配列番号1の塩基配列や部位特異
的変異導入された配列番号1の塩基配列を示すことにな
る。たとえば、該塩基配列を含有するDNA断片をプラ
スミドベクターへ挿入されたものである。このベクター
としては、pUC〔C.Yanisch−Perro
n,J.Vieira & J.Messing,Ge
ne,33 110−115(1985)〕やpIN I
II 〔Y.Masui,J.Coleman,M.In
ouye,Experimental Manipul
ation of Gene Expression
(ed.M.Inouye).P.15Academi
c Press(1983)〕などが使用できる。
【0019】図3は、その組換えベクター(発現ベクタ
ー)構築工程を示す。すなわち、還元酵素遺伝子を有す
るベクターpFR3から制限酵素HincII、/制限酵
素Stu I消化によりコーディング領域を有する断片を
切り出し、pUC8プラミドDNA〔Hanna,
Z.,Fregeau,C.,Prefontain
e,G.,Brousseau,R.(1984)Ge
ne,30247〕のSma I切断部位に挿入し組換え
ベクターpFR5を構築した。さらに、このベクターp
FR5を制限酵素EcoR Iで消化し、dNTP存在下
でKlenow処理した後、T4DNAリガーゼ連結酵
素で連結し組換えベクターpFR7(発現ベクター)を
構築した。被構築物の方向付けのためアンピシリン耐性
遺伝子(Ampr )に制限酵素切断部位を示した。
【0020】本発明の細菌は、配列番号1で表される塩
基配列を含有する組換えベクターDNAを含む。本発明
の細菌の特徴はフラビン還元活性およびニトロ還元活性
を有する蛋白質を生産する。
【0021】本発明の酵素の製法は、塩基配列が配列番
号1で表されるDNAを含む組換えベクター(発現ベク
ター)で修飾された細菌を培養し、配列番号2で表され
るアミノ酸配列を含む蛋白質を製造することである。細
菌としては大腸菌、枯草菌など、培地としてはLB培
地、YT培地などをあげることができる。
【0022】以下、実施例にて本発明で重要な遺伝子の
単離とその同定に関する手順をのべる。
【実施例】
(実施例1) 〔NAD(P)H:FMN還元酵素の同定とN末端アミ
ノ酸配列の決定〕NAD(P)H:FMN還元酵素標品
(ベイリンガー・マンハイムより購入)を「スパロース
12」ゲルろ過カラム(ファルマシア社製)にかけ分画
した。各画分に対してそれぞれNADH及びNADP
H:FMN還元活性を、〔Jablonski,E.&
DeLuca,M.(1977)Biochemis
try,16,2932〕に記述されている方法で測定
し、ドデシル硫酸ナトリウム‐ポリアクリルアミドゲル
電気泳動(SDS‐PAGEと略す)による分析を〔L
aemmli,U.K.(1970)Nature,2
77,680〕に記述されている方法で行った。その結
果、FMN還元活性と26キロダルトン(kDa)の蛋
白質(図4に矢印で示した)との量比がパラレルである
ことが解った。この蛋白質をSDS‐PAGE分析後、
ナイロンメンブレンにトランスファーし、常法にしたが
ってプロテイン・シーケンサー〔アプライド・バイオシ
ステム(ABI)社製〕でアミノ酸配列の決定を行っ
た。その結果を図1を示すことができる。この結果から
配列番号1〜24までのN末端のアミノ酸配列を確認し
た。
【0023】(実施例2) 〔発光細菌遺伝子ライブラリーの作製〕発光細菌Vib
rio fischeri(ATCC7744)を発光
細菌培地で26℃で一晩振とう培養した。10000rp
m で遠心分離し集菌した後、トリス塩酸・EDTA緩衝
液(以下、TE緩衝液という)に菌体を懸濁した。37
℃で1時間リゾチーム処理した後、ドデシル硫酸ナトリ
ウム(以下SDSと略す)を添加し50℃で3時間プロ
テネースK処理をした。その後、フェノール処理を3回
しエタノール沈殿し、乾燥した後、TE緩衝液に溶解し
再度プロテネースK処理した。その後フェノール処理3
回後エタノール沈殿しゲノムDNAを回収した。このゲ
ノムDNAの50μgに10単位の制限酵素Sau3A
Iを37℃で作用させた。反応時間5,10,20,3
0,45,60,90,120分で一部分取し反応をE
DTA(エチレンジアミン四酢酸)を加えることにより
停止した。それぞれの一部をアガロースゲル電気泳動に
かけゲノムDNAの部分分解の度合を確認した。各時間
ごとの反応液を1本にまとめエタノール沈殿し回収し
た。それを少量のTE緩衝液に溶解後、アガロースゲル
電気泳動にかけ4‐6キロベース(Kb)の画分をDE
81ペーパーで回収した。1MのNaClでDE81ペ
ーパーから前記4‐6Kb画分のDNAを溶出し、フェ
ノール処理3回後エタノールで沈殿した。それを約20
0ng/μlになるようにTE緩衝液に溶解した。制限酵
素BamH Iであらかじめ切断してアルカリフォスファ
ターゼ(DNAの5′末端の脱リン酸化を触媒する酵
素)で処理されたpUC18プラスミドDNA(プラス
ミドベクター)に、前記4―6Kb画分のDNAをT4
DNAリガーゼ(DNA鎖どうしまたは、DNAとRN
Aの3′OHと5′P末端をホスホジエステルを結合を
つなぐ酵素)をもって16℃一晩連結反応した。連結反
応液をJM109大腸菌に形質転換し得られた形質転換
株を遺伝子ライブラリーとした。
【0024】〔合成オリゴヌクレオチド・プローブの調
製〕図1に示すアミノ酸配列の情報をもとに、オリゴヌ
クレオチド・プローブ(FR−1)とオリゴヌクレオチ
ド・プローブ(FR−2)の二つのプローブをDNAシ
ンセサイザー(ABI社製)で合成した。それぞれの合
成プローブはOPCカートリッジ(ABI社製)で精製
した。
【0025】〔NAD(P)H:FMN還元酵素遺伝子
のクローニングとその構造解析〕実施例2の遺伝子ライ
ブラリーをFR−1プローブとFR−2プローブでコロ
ニーハイブリダイゼーション法によりスクリーニングし
た。FR−1プローブとFR−2プローブは、〔γ‐32
P〕ATPで5′末端ラベルして標識プローブとして用
いた。遺伝子ライブラリーのタイターを測定後、プレー
ト当り200コロニーになるようにニトロセルロースフ
ィルター上にまかれた。37℃で一晩培養しそれぞれの
フィルターに対してレプリカを2枚とった。2枚1組の
レプリカフィルターは37℃で培養後ハイブリダイゼー
ションに用いた。フィルターは風乾後紫外線(UV)照
射しDNAを固定した後、ハイブリダイゼーション液
{20mlの6×SET緩衝液〔20×SET緩衝液:3
MのNaCl,0.6Mのトリス−塩酸(pH8.
0),0.04MのEDTA〕、10×Denhard
t′s液(牛血清アルブミン、ポリビニルピロリドン、
Ficollの各0.2%溶液)、0.1%SDS、サ
ケ精子DNA(熱変性したもの50μg/ml)}に入
れ、68℃で1時間保温した。さらに液を入れ替えて1
時間保温後、32P−標識プローブを加え室温で一晩ハイ
ブリダイゼーションした。溶液を捨てフィルターを6×
SET緩衝液で洗浄後、6×SET緩衝液37℃20分
間振とうした。この操作を2回繰り返した後、風乾しオ
ートラジオグラフィーにかけた。フィルターと現像した
X線フィルムを重ねインクマーカーの位置をフィルム上
に写し取った。1枚のプレートからできたプローブFR
−1とプローブFR−2の二枚のフィルム上でシグナル
が重なると同定されたコロニー(クローン)を五つ得
た。
【0026】〔組換えベクターの調製〕この五つのクロ
ーンの制限酵素切断試験(図2)を行った結果、この五
つの内の三つは同一クローンであった。すなわち3種類
の陽性クローンが取得できた。その中で最もインサート
DNAの小さい組換えベクターpFR3(図3)をその
後の解析に用いた。
【0027】〔酵素遺伝子の構造決定・アミノ酸配列の
決定〕FR−1プローブを用いてサザンプロット解析し
FMN還元酵素遺伝子の領域をジデオキシ変法〔Hat
tori,M.& Sakaki,Y.(1986)A
nal.Biochem.152,232〕にて決定
し、配列表3に示す一次構造を明らかにした。その結果
FMN還元酵素は配列表4に示す218個のアミノ酸か
らなる24562ダルトンのポリペプチドで、サルモネ
ラ菌のニトロ還元酵素〔Watanabe,M.,Is
hidate,M.Jr.& Nohmi,T.(19
90)Nucleic Acid Res.18,10
59〕と約30%の相同性があることがわかった。
【0028】(実施例3) 〔NAD(P)H:FMN還元酵素遺伝子の組換えベク
ター、発現ベクターの構築〕(図3参照)組換えベクタ
ーpFR3プラスミドDNAを制限酵素HincII/S
tu Iで消化した後−80℃で10分処理した。それを
アガロースゲル電気泳動にかけ約1KbのDNA断片を
DE81ペーパーで分離回収した。DE81ペーパーか
ら1MのNaClでDNA溶出し、フェノール処理3回
後エタノール沈殿した。それを約200ng/μlになる
ようにTE緩衝液に溶解した。制限酵素Sma Iであら
かじめ切断しアルカリフォスファターゼ処理されたpU
C8プラスミドDNA(プラスミドベクター)に、上記
DNAをT4DNAリガーゼをもって16℃一晩連結反
応した。連結反応液をJM109大腸菌に形質転換し、
5‐プロモ‐クロロ‐3‐インドリル‐β‐D‐ガラク
トシド(Xgal)を含んだ培地で選択し、一晩培養を
行ない、白コロニーを形成させた。この白コロニーがイ
ンサートDNAを挿入したプラスミドを含有する形質転
換株である。それらの形質転換株からプラスミドDNA
を調製し制限酵素切断試験して、転換ベクターpFR5
を含有する株を得た。組換えベクターpFR5のプラミ
スドDNAを調製し、EcoR I消化、Klenow処
理、T4DNAリガーゼ連結しD1210大腸菌に形質
転換した。形質転換株の内EcoR I切断部位が消失し
ているものを選択した。これが組換えベクター(発現ベ
クター)pFR7である。組換えベクターpFR5はN
末端のβ‐ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)に由来
するペプチドとFMN還元酵素の融合蛋白を発現するよ
うに構築してある。発現ベクターpFR7はlacZと
フレームずらしFMN還元酵素単独で発現するよう構築
してある。
【0029】(実施例4) 〔NAD(P)H:FMN還元酵素遺伝子の組み込んだ
大腸菌の調製〕発現ベクターpFR5およびpFR7
と、pUC8プラスミドDNAをD1210大腸菌に形
質転換した。
【0030】〔酵素の調製〕これらの形質転換株の一晩
培養液0.25mlをアンピシリンを含有したLB液体
(10ml)培地に植菌し、37℃で2時間振とう培養
後、最終濃度が1mMになるようにイソプロピル‐β‐D
(−)‐チオガラクトピラノシド(IPTGと略す)を
添加し、さらに3時間培養した。その菌体に対してSD
S−PAGEの分析を行い蛋白質の発現を確認した(こ
の蛋白質が本発明の酵素に相当する)。その結果を図4
に示すが、組換えベクターpFR5とpFR7において
市販の粗酵素標品と同一サイズの26kDaに新たなバ
ンドが出現した。また、組換えベクターpFR5におい
ては29kDaにもバンドの出現が見られ、このベクタ
ーはlacZとの融合蛋白に由来するものであろうと考
えられた。
【0031】IPTG誘導処理した培養液1.5mlを1
0000rpm で遠心分離し上清を除く。菌体を50mMリ
ン酸カリウム・1mMジチオスレイトール緩衝液0.5ml
に懸濁し超音波破砕した。12000rpm 、4℃で30
分間遠心分離しその上清を細胞抽出液とした。
【0032】その細胞抽出液に対して、つぎの酵素還元
活性を測定し、その結果を表1、表2、表3に示す。 フラビン還元活性:〔Jablonski,E.&
DeLuca,M.(1977)Biochemis
try,16,2932〕の方法で行った。 鉄還元活性:〔Fontecave,M.,Eli
asson,R.&Reichard,P.(198
7)J.Biol.Chem.262,12325−1
2331〕の方法で行った。 ニトロ還元活性:〔Watanabe,M.,Is
hibate,M.Jr.& Nohmi,T.(19
89)Mutation Research,216,
211−220〕の方法で行った。 各表の蛋白量はバイオラッド製の蛋白分析キットを用い
て色素結合法〔Bradford,M.M.(197
6)Anal.Biochem.72,248−25
4〕により決定した。
【0033】
【表1】
【0034】
【表2】
【0035】
【表3】 これらの表から活性を比較すると、pFR5もしくはp
FR7との活性は陰性コントロールであるpUC13に
くらべて約1〜3桁高い。この遺伝子はフラビン還元活
性及びニトロ還元活性を有する酵素蛋白の遺伝子と同定
できた。
【0036】
【発明の効果】本発明の酵素遺伝子は、FMN還元活性
およびニトロ還元活性を有する酵素の遺伝子としては、
はじめて単離されたものである。適当な宿主、例えば大
腸菌を宿主とすることによる変異原あるいは発癌性物質
の高感受性株を作出することにこれを使用できる。また
その大腸菌から大量に該還元酵素蛋白を調製することも
できる。その発現ベクターを適当な宿主たとえば、大腸
菌に導入することにより、発光細菌のFMN還元活性及
びニトロ還元活性を有する酵素を大量に発現する生物あ
るいは微生物を作出することができ、さらにその遺伝子
導入生物から抽出することにより該還元酵素を大量に調
製することができる。該遺伝子導入生物あるいは微生物
は上述した機能から変異原あるいは発癌性物質に対して
高い感受性を示し、高感度に変異原あるいは発癌性物質
を検出する指標として有用である。該還元酵素は上述し
た機能から細菌ルシフェラーゼの発光反応を増幅し、多
くの測定法に応用できたとえば診断薬や検査薬に有用で
ある。
【0037】
【配列表】配列番号: 1 配列の長さ: 657 配列の型:核酸 鎖の数: 1 トポロジー:直鎖 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:Vibrio fischeri 株名:ATCC 7744 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:E ATG ACL CAK CCL ATM ATM CAK GAK XTY GAJ AAK WGZ TAK ACL QRS AAJ 48 Met Thr His Pro Ile Ile His Asp Leu Glu Asn Arg Tyr Thr Ser Lys 1 5 10 15 AAJ TAK GAK CCL QRS AAJ AAJ GTL QRS CAJ GAJ GAK XTY GCL GTL XTY 96 Lys Tyr Asp Pro Ser Lys Lys Val Ser Gln Glu Asp Leu Ala Val Leu 20 25 30 XTY GAJ GCL XTY WGZ XTY QRS GCL QRS QRS ATM AAK QRS CAJ CCL TGG 144 Leu Glu Ala Leu Arg Leu Ser Ala Ser Ser Ile Asn Ser Gln Pro Trp 35 40 45 AAJ TTK ATM GTL ATM GAJ QRS GAK GCA GCL AAJ CAJ GGL ATG CAK GAK 192 Lys Phe Ile Val Ile Glu Ser Asp Ala Ala Lys Gln Gly Met His Asp 50 55 60 QRS TTK GCL AAK ATG CAK CAJ TTK AAK CAJ CCL CAK ATM AAJ GCL TGK 240 Ser Phe Ala Asn Met His Gln Phe Asn Gln Pro His Ile Lys Ala Cys 65 70 75 80 QRS CAK GTG ATM XTY TTK GCL AAK AAJ XTY QRS TAK ACL WGZ GAK GAK 288 Ser His Val Ile Leu Phe Ala Asn Lys Leu Ser Tyr Thr Arg Asp Asp 85 90 95 TAK GAK GTG GTL XTY QRS AAJ GCL GTL GCL GAK AAJ WGZ ATM ACL GAJ 336 Tyr Asp Val Val Leu Ser Lys Ala Val Ala Asp Lys Arg Ile Thr Glu 100 105 110 GAJ CAJ AAJ GAJ GCL GCL TTK GCL QRS TTK AAJ TTK GTL GAJ TTG AAK 384 Glu Gln Lys Glu Ala Ala Phe Ala Ser Phe Lys Phe Val Glu Leu Asn 115 120 125 TGK GAK GAJ AAK GGL GAJ CAK AAJ GCL TGG ACL AAJ CCL CAJ GCL TAK 432 Cys Asp Glu Asn Gly Glu His Lys Ala Trp Thr Lys Pro Gln Ala Tyr 130 135 140 XTY GCL XTY GGL AAK GCL XTY CAK ACL XTY GCL WGZ XTY AAK ATM GAK 480 Leu Ala Leu Gly Asn Ala Leu His Thr Leu Ala Arg Leu Asn Ile Asp 145 150 155 160 QRS ACL ACL ATG GAJ GGL ATM GAK CCL GAJ XTY TTG QRS GAJ ATM TTK 528 Ser Thr Thr Met Glu Gly Ile Asp Pro Glu Leu Leu Ser Glu Ile Phe 160 170 175 GCL GAK GAJ XTY AAJ GGL TAK GAJ TGK CAK GTL GCL XTY GCL ATM GGL 576 Ala Asp Glu Leu Lys Gly Tyr Glu Cys His Val Ala Leu Ala Ile Gly 180 185 190 TAK CAK CAK CCL QRS GAJ GAK TAK AAK GCL QRS TTG CCL AAJ QRS WGZ 624 Tyr His His Pro Ser Glu Asp Tyr Asn Ala Ser Leu Pro Lys Ser Arg 195 200 205 AAJ GCL TTK GAJ GCL GTL ATM ACL ATM XTY TJJ 657 Lys Ala Phe Glu Ala Val Ile Thr Ile Leu *** 210 215 (ただし,塩基の3文字連鎖は、左側に5′末端を及び
右側に3′末端を表わしている。この文字はヌクレオチ
ド配列を形成するプリン塩基(Pu)又はピリミジン塩基(P
y)を表わす。また、 A:アデニン, G:グアニン, C:シトシン, J:AもしくはG, K:TもしくはC, L:A,T,CもしくはG, M:A,CもしくはT, T:チミン, X:YがAもしくはGの場合はTまたはC, 或いはYがCもしくはTの場合はC, Y:XがCの場合はA,G,CまたはT, 或いはXがTの場合はAまたはG, W:ZがCもしくはTの場合はCまたはA, 或いはZがCもしくはTの場合はC, Z:WがGの場合はA,G,CまたはT, 或いはWがAの場合はAまたはG, QR:SがA,G,CもしくはTの場合はTC, ***はTAA TAG もしくはTGAを表す。)
【0038】
【配列表】配列番号: 2 配列の長さ: 657 配列の型:核酸 鎖の数: 1 トポロジー:直鎖 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:Vibrio fischeri 株名:ATCC 7744 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:E ATG ACG CAT CCA ATT ATT CAT GAT CTT GAA AAT CGT TAT ACA TCA AAA 48 Met Thr His Pro Ile Ile His Asp Leu Glu Asn Arg Tyr Thr Ser Lys 1 5 10 15 AAA TAT GAC CCA TCA AAG AAA GTA TCT CAA GAA GAT TTA GCG GTT TTG 96 Lys Tyr Asp Pro Ser Lys Lys Val Ser Gln Glu Asp Leu Ala Val Leu 20 25 30 CTT GAG GCT CTG CGT TTA TCT GCT TCT TCA ATT AAT TCA CAG CCT TGG 144 Leu Glu Ala Leu Arg Leu Ser Ala Ser Ser Ile Asn Ser Gln Pro Trp 35 40 45 AAA TTC ATT GTT ATT GAA TCC GAT GCA GCG AAG CAA GGT ATG CAT GAT 192 Lys Phe Ile Val Ile Glu Ser Asp Ala Ala Lys Gln Gly Met His Asp 50 55 60 TCG TTT GCA AAT ATG CAT CAG TTT AAT CAA CCT CAC ATC AAA GCG TGT 240 Ser Phe Ala Asn Met His Gln Phe Asn Gln Pro His Ile Lys Ala Cys 65 70 75 80 TCT CAT GTG ATT TTA TTT GCA AAT AAG CTT TCG TAT ACA CGA GAT GAT 288 Ser His Val Ile Leu Phe Ala Asn Lys Leu Ser Tyr Thr Arg Asp Asp 85 90 95 TAT GAT GTG GTT TTA TCT AAA GCG GTT GCT GAC AAG CGT ATT ACT GAA 336 Tyr Asp Val Val Leu Ser Lys Ala Val Ala Asp Lys Arg Ile Thr Glu 100 105 110 GAG CAA AAA GAA GCT GCT TTT GCT TCG TTT AAG TTT GTA GAA TTG AAC 384 Glu Gln Lys Glu Ala Ala Phe Ala Ser Phe Lys Phe Val Glu Leu Asn 115 120 125 TGT GAT GAA AAT GGT GAG CAT AAA GCA TGG ACT AAG CCT CAA GCT TAT 432 Cys Asp Glu Asn Gly Glu His Lys Ala Trp Thr Lys Pro Gln Ala Tyr 130 135 140 TTA GCT CTT GGT AAT GCT CTG CAT ACA TTA GCT AGA CTG AAC ATT GAC 480 Leu Ala Leu Gly Asn Ala Leu His Thr Leu Ala Arg Leu Asn Ile Asp 145 150 155 160 TCA ACA ACA ATG GAA GGC ATT GAT CCT GAA TTA TTG AGT GAA ATT TTT 528 Ser Thr Thr Met Glu Gly Ile Asp Pro Glu Leu Leu Ser Glu Ile Phe 160 170 175 GCT GAT GAA TTA AAA GGG TAT GAA TGT CAT GTT GCT TTA GCC ATT GGT 576 Ala Asp Glu Leu Lys Gly Tyr Glu Cys His Val Ala Leu Ala Ile Gly 180 185 190 TAT CAT CAT CCA AGC GAA GAT TAT AAT GCC TCT TTG CCT AAG TCT CGT 624 Tyr His His Pro Ser Glu Asp Tyr Asn Ala Ser Leu Pro Lys Ser Arg 195 200 205 AAG GCA TTT GAA GCA GTA ATT ACC ATC CTT TAG 657 Lys Ala Phe Glu Ala Val Ile Thr Ile Leu *** 210 215
【0039】配列番号: 3 配列の長さ: 929 配列の型:核酸 鎖の数: 1 トポロジー:直鎖 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:Vibrio fischeri 株名:ATCC 7744 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:109−762 特徴を決定した方法:E 配列 TGTCACATAT GGCAAATTAA ATATTGAGTA TGCCTTGCTT GTTGACATCA TAAGTTGTGC 60 AGACAAGAAT GTCTGTGGAT TAAAATTTCA CAAGTAAGGT TTATTATT ATG ACG CAT 117 Met Thr His 1 CCA ATT ATT CAT GAT CTT GAA AAT CGT TAT ACA TCA AAA AAA TAT GAC 165 Pro Ile Ile His Asp Leu Glu Asn Arg Tyr Thr Ser Lys Lys Tyr Asp 5 10 15 CCA TCA AAG AAA GTA TCT CAA GAA GAT TTA GCG GTT TTG CTT GAG GCT 213 Pro Ser Lys Lys Val Ser Gln Glu Asp Leu Ala Val Leu Leu Glu Ala 20 25 30 35 CTG CGT TTA TCT GCT TCT TCA ATT AAT TCA CAG CCT TGG AAA TTC ATT 261 Leu Arg Leu Ser Ala Ser Ser Ile Asn Ser Gln Pro Trp Lys Phe Ile 40 45 50 GTT ATT GAA TCC GAT GCA GCG AAG CAA GGT ATG CAT GAT TCG TTT GCA 309 Val Ile Glu Ser Asp Ala Ala Lys Gln Gly Met His Asp Ser Phe Ala 55 60 65 AAT ATG CAT CAG TTT AAT CAA CCT CAC ATC AAA GCG TGT TCT CAT GTG 357 Asn Met His Gln Phe Asn Gln Pro His Ile Lys Ala Cys Ser His Val 70 75 80 ATT TTA TTT GCA AAT AAG CTT TCG TAT ACA CGA GAT GAT TAT GAT GTG 405 Ile Leu Phe Ala Asn Lys Leu Ser Tyr Thr Arg Asp Asp Tyr Asp Val 85 90 95 GTT TTA TCT AAA GCG GTT GCT GAC AAG CGT ATT ACT GAA GAG CAA AAA 453 Val Leu Ser Lys Ala Val Ala Asp Lys Arg Ile Thr Glu Glu Gln Lys 100 105 110 115 GAA GCT GCT TTT GCT TCG TTT AAG TTT GTA GAA TTG AAC TGT GAT GAA 501 Glu Ala Ala Phe Ala Ser Phe Lys Phe Val Glu Leu Asn Cys Asp Glu 120 125 130 AAT GGT GAG CAT AAA GCA TGG ACT AAG CCT CAA GCT TAT TTA GCT CTT 549 Asn Gly Glu His Lys Ala Trp Thr Lys Pro Gln Ala Tyr Leu Ala Leu 135 140 145 GGT AAT GCT CTG CAT ACA TTA GCT AGA CTG AAC ATT GAC TCA ACA ACA 597 Gly Asn Ala Leu His Thr Leu Ala Arg Leu Asn Ile Asp Ser Thr Thr 150 155 160 ATG GAA GGC ATT GAT CCT GAA TTA TTG AGT GAA ATT TTT GCT GAT GAA 645 Met Glu Gly Ile Asp Pro Glu Leu Leu Ser Glu Ile Phe Ala Asp Glu 160 170 175 TTA AAA GGG TAT GAA TGT CAT GTT GCT TTA GCC ATT GGT TAT CAT CAT 693 Leu Lys Gly Tyr Glu Cys His Val Ala Leu Ala Ile Gly Tyr His His 180 185 190 195 CCA AGC GAA GAT TAT AAT GCC TCT TTG CCT AAG TCT CGT AAG GCA TTT 741 Pro Ser Glu Asp Tyr Asn Ala Ser Leu Pro Lys Ser Arg Lys Ala Phe 200 205 210 GAA GCA GTA ATT ACC ATC CTT 762 Glu Ala Val Ile Thr Ile Leu 215 TAGATTCTTA ATGTTTGAGA TGAAGAAAAG CCAGCGATTT AGCTGTGCTT TGTTTGTGCA 822 *** AAAATGTTCC TAATGGCGTA TTACTACGGT AGGAAGTCTA TTTAAAGTTT CTTTTACTCT 882 TTGGTATTAA TTGTCAATTA CGCGGAAATC ATTATCTAAC TAGGCCT 929
【0040】配列番号: 4 配列の長さ: 218 配列の型:アミノ酸 配列の種類:タンパク質 配列 Met Thr His Pro Ile Ile His Asp Leu Glu Asn Arg Tyr Thr Ser Lys 1 5 10 15 Lys Tyr Asp Pro Ser Lys Lys Val Ser Gln Glu Asp Leu Ala Val Leu 20 25 30 Leu Glu Ala Leu Arg Leu Ser Ala Ser Ser Ile Asn Ser Gln Pro Trp 35 40 45 Lys Phe Ile Val Ile Glu Ser Asp Ala Ala Lys Gln Gly Met His Asp 50 55 60 Ser Phe Ala Asn Met His Gln Phe Asn Gln Pro His Ile Lys Ala Cys 65 70 75 80 Ser His Val Ile Leu Phe Ala Asn Lys Leu Ser Tyr Thr Arg Asp Asp 85 90 95 Tyr Asp Val Val Leu Ser Lys Ala Val Ala Asp Lys Arg Ile Thr Glu 100 105 110 Glu Gln Lys Glu Ala Ala Phe Ala Ser Phe Lys Phe Val Glu Leu Asn 115 150 125 Cys Asp Glu Asn Gly Glu His Lys Ala Trp Thr Lys Pro Gln Ala Tyr 130 135 140 Leu Ala Leu Gly Asn Ala Leu His Thr Leu Ala Arg Leu Asn Ile Asp 145 150 155 160 Ser Thr Thr Met Glu Gly Ile Asp Pro Glu Leu Leu Ser Glu Ile Phe 165 170 175 Ala Asp Glu Leu Lys Gly Tyr Glu Cys His Val Ala Leu Ala Ile Gly 180 185 190 Tyr His His Pro Ser Glu Asp Tyr Asn Ala Ser Leu Pro Lys Ser Arg 195 200 205 Lys Ala Phe Glu Ala Val Ile Thr Ile Leu 210 215
【図面の簡単な説明】
【図1】NAD(P)H:FMN還元酵素のN末端アミ
ノ酸配列と合成オリゴヌクレオチド・プローブ(FR1
及びFR2)を示す。
【図2】本発明の酵素遺伝子の制限酵素地図およびシー
クエンスストラテジーを示す。矢印は塩基配列を決定し
た方向を示す。ボックスで示したところが酵素遺伝子に
相当する部分である。
【図3】本発明に係る発光細菌のFNM還元活性及びニ
トロ還元活性を有する酵素遺伝子を含有する本発明の組
換えベクター(発現ベクターpFR7)の構築工程を示
す。
【図4】SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によ
る発現蛋白の確認を示す。レーン1はpUC8/D12
10株、レーン2はpFR7/D1210株、レーン3
はpFR5/D1210株、レーン4はベーリンガー・
マンハイム社製NAD(P)H:FMN還元酵素標品で
ある。
【符号の説明】
lacP ラクトースプロモーター Amp アンピシリン耐性遺伝子 pUC8 プラスミドベクター pFR3 組換えベクター pFR5 組換えベクター pFR7 組換えベクター(発現ベクター) Sau3A I 4塩基(GATC)認識制限酵素 Hinc II 6塩基(GTPyPuAC)認識制限酵素 Sma I 6塩基(CCCGGG)認識制限酵素 Stu I 6塩基(AGGCCT)認識制限酵素 EcoR I 6塩基(GAATTC)認識制限酵素 Hind III 6塩基(AAGCTT)認識制限酵素 Acc I 6塩基〔GT(AC)(TG)AC〕認識制
限酵素 Nsp V 6塩基(TTCGAA)認識制限酵素 EcoR V 6塩基(GATATC)認識制限酵素
─────────────────────────────────────────────────────
【手続補正書】
【提出日】平成5年3月11日
【手続補正1】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正内容】
【書類名】 明細書
【発明の名称】 フラビン還元活性を有する酵素の遺伝
【特許請求の範囲】
【発明の詳細な説明】
【0001】
【技術分野】本発明は、ニトロ還元活性およびフラビン
還元活性を有する酵素をコードする遺伝子(以下、酵素
遺伝子という)、酵素、該遺伝子を含む組換えベクタ
ー、および該組換えベクターを含有する細菌に関する。
【0002】
【従来の技術】発光細菌に由来する酵素ルシフェラーゼ
は還元型フラビンモノヌクレオチド(以下FMNH2
いう)を発光素として長鎖脂肪族アルデヒドと酸素の存
在下、酸化型フラビンモノヌクレオチド(以下酸化型F
MNという)と長鎖カルボン酸とを生成し、その際に青
色に発光する反応を触媒する。基質であるFMNH2
は、還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド:フ
ラビンモノヌクレオチド(NADH:FMN)還元酵素
および還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリ
ン酸:フラビンモノヌクレオチド(NADPH:FM
N)還元酵素により、また長鎖アルデヒドは脂肪酸還元
酵素複合体により供給される。最近、Spyrouら
は、大腸菌からフラビン還元酵素遺伝子を単離し、その
一次構造を明らかにし、〔Spyrou,G.,Hag
gard−Ljungquist,E.,Krook,
M.,Jornvall,H.,Nilsson,
E.,& Reichard,P.(1991)J.B
acteriol.173 3673−3679〕に開
示している。
【0003】我々の身の回りには、遺伝子DNAに損傷
を与える物質(変異原)が多数存在しており、我々はこ
れらの物質に暴露されながら生活している。ニトロアレ
ーン類はこうした環境変異原の一グループであり、自動
車の排気ガス、焼却場の煙、都市の大気、河川の底質、
ストーブを焚く室内の空気、あるいは焼鳥の焦げた部分
に含まれている。変異原性、発癌性を示すニトロアレー
ンとして2‐ニトロフルオレンがよく知られている。ニ
トロアレーン自体が直接反応してDNAを損傷するわけ
ではなく、ニトロアレーンの代謝産物が突然変異を起こ
しDNAを損傷する。たとえばニトロフルオレンは、微
生物細胞内ではニトロ還元酵素によってN‐ヒドロキシ
体に還元されて細胞内に入り、その後O‐アセチル転移
酵素によって活性化され、最終的に生じたニトレニウム
イオンがDNAを攻撃するものと考えられる。従って、
ニトロ還元酵素と2‐ニトロフルオレンとの反応が2‐
ニトロフルオレンによるDNAの変異原性発現の律速段
階と考えることができる。
【0004】渡辺らは、サルモネラ菌からニトロ還元酵
素遺伝子を単離し、〔Watanabe,M.,Ish
idate,M. Jr.& Nohmi,T.(19
89)Mutation Research,2162
11−220〕に開示している。また、その一次構造を
明らかにし、〔Watanabe,M.,Ishida
te,M. Jr.& Nohmi,T.(1990)
Nucleic Acid Research,18,
1059〕に示している。
【0005】以上のように、FMN還元酵素は、細菌ル
シフェラーゼの発光反応を最大限に生かすために必須で
ある。それ故にFMN還元酵素遺伝子を単離することに
より、大量に該酵素を調製することが可能になり、該酵
素遺伝子の単離は重要な課題である。また、ニトロ還元
酵素遺伝子は、上述の変異原性あるいは発癌性物質を検
出する感度の向上に有用である。
【0006】しかしながら、いまだ発光細菌FMN還元
酵素遺伝子およびニトロ還元酵素遺伝子の単離、および
それらの大腸菌での発現については報告されていない。
【0007】
【発明が解決しようとする課題】本発明の目的は、上述
の技術的事情にかんがみ、発光細菌のFMN還元活性お
よびニトロ還元活性を有する酵素遺伝子および酵素を提
供することであり、さらに該遺伝子を含む組換えベクタ
ー、および該組換えベクターを含む細菌を提供すること
である。
【0008】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、鋭意研究
の結果、発光細菌Vibrio fischeri (ATCC 7744) からF
MN還元活性およびニトロ還元活性を有する酵素遺伝子
を単離し、その一次構造を明らかにすることに成功し、
また該遺伝子を大量に発現する大腸菌を作出することに
成功し、本発明を完成するに至った。すなわち、
【0009】本発明は、つぎの(1)〜(8)の構成を
有する。
【0010】(1) ニトロ還元活性およびフラビン還
元活性を有する酵素をコードし、配列番号1で表される
塩基配列を含む遺伝子。 (2) ニトロ還元活性およびフラビン還元活性を有す
る酵素をコードし、配列番号2で表される塩基配列を含
む遺伝子。 (3) ニトロ還元活性およびフラビン還元活性を有す
る酵素をコードし、塩基配列が配列番号3で表される遺
伝子。
【0011】(4) 配列番号4で表されるアミノ酸配
列を有するニトロ還元活性およびフラビン還元活性を有
する酵素。
【0012】(5) 塩基配列が配列番号1で表される
DNAを含有する組換えベクター。
【0013】(6) 配列番号1で表される塩基配列を
有する遺伝子がプラスミドベクターへ挿入された(5)
項記載の組換えベクター。
【0014】(7) 配列番号1で表される塩基配列を
有するDNAを含む組換えベクターを含有する細菌。
【0015】(8) 塩基配列が配列番号1で表される
DNAを含む組換えベクターで修飾されてなる細菌を培
養することからなる配列番号4で表されるアミノ酸配列
を含む酵素の製法。
【0016】本発明の酵素遺伝子は、配列番号1で表さ
れる配列の長さ657のヌクレオチド鎖を含むのが特徴
である。該ヌクレオチド鎖は後述の配列番号4のアミノ
酸配列から予知された。すなわち、タンパク質のアミノ
酸配列がDNAのヌクレオチド配列中に反映される。タ
ンパク質中で最も共通して見られる20種のアミノ酸の
おのおのに特異的に対応している3ヌクレオチド配列の
グループは1つ以上ある。いわゆるコドン表により配列
番号4のアミノ酸配列から配列番号1のヌクレオチド配
列が予知できる。本発明の酵素遺伝子の好ましく示す配
列としては配列番号2で表されるヌクレオチド鎖を含
む。塩基配列が配列番号3で表される配列の長さが92
9のDNAであるが具体的に示すことができる。本発明
のヌクレオチド配列の種類はGenomic DNA
ら誘導され、発光細菌Vibrio fischeri
(ATCC7744)から単離されるものである。その
配列の特徴は塩基、塩基番号109から762までの2
18個のアミノ酸からなる分子量24562の蛋白質を
コードしている。本発明の酵素遺伝子は、フラビン還元
活性およびニトロ還元活性を有する蛋白質をコードし
たとえば、FMN還元活性およびニトロフラゾン還元活
性を有するものである。
【0017】本発明の酵素は、配列番号3の塩基配列か
ら予測される配列番号4で表されるアミノ酸配列を有す
る蛋白質である。その蛋白質は218個のアミノ酸から
なり分子量24562のものであり、発光細菌のフラビ
ン還元活性およびニトロ還元活性の二つの活性を有す
る。
【0018】本発明の組換えベクターは、塩基配列が配
列番号1で表されるDNAを含有する。すなわち、本発
明の組換えベクターは、配列番号3で表される塩基配列
を有するDNAと機能的同等あるいは同じヌクレオチド
配列を含む。「機能的同等のヌクレオチド配列」とは、
実質的に同じ結果、すなわち適当な宿主による発光細菌
のFMN還元活性及びニトロ還元活性を有する酵素の産
生を得るために本発明の実質的に同じ方法で使用できる
DNA断片のことである。すなわち、塩基配列が異なっ
ても、同一のアミノ酸配列を有する蛋白をコードしえる
DNA断片や若干の塩基配列の相違に伴う若干のアミノ
酸配列の違いがあるもののFMN還元活性及びニトロ還
元活性を有する蛋白をコードしえるDNA断片のことを
意味する。具体的には配列番号の塩基配列や部位特異
的変異導入された配列番号1の塩基配列を示すことにな
る。たとえば、該塩基配列を含有するDNA断片をプラ
スミドベクターへ挿入されたものである。このベクター
としては、pUC〔C.Yanisch−Perro
n,J.Vieira & J.Messing,Ge
ne,33 110−115(1985)〕やpIN I
II 〔Y.Masui,J.Coleman,M.In
ouye,Experimental Manipul
ation of Gene Expression
(ed.M.Inouye).P.15Academi
c Press(1983)〕などが使用できる。
【0019】図は、その組換えベクター(発現ベクタ
ー)構築工程を示す。すなわち、還元酵素遺伝子を有す
るベクターpFR3から制限酵素HincII、/制限酵
素Stu I消化によりコーディング領域を有する断片を
切り出し、pUC8プラミドDNA〔Hanna,
Z.,Fregeau,C.,Prefontain
e,G.,Brousseau,R.(1984)Ge
ne,30247〕のSma I切断部位に挿入し組換え
ベクターpFR5を構築した。さらに、このベクターp
FR5を制限酵素EcoR Iで消化し、dNTP存在下
でKlenow処理した後、T4DNAリガーゼ連結酵
素で連結し組換えベクターpFR7(発現ベクター)を
構築した。被構築物の方向付けのためアンピシリン耐性
遺伝子(Ampr )に制限酵素切断部位を示した。
【0020】本発明の細菌は、配列番号1で表される塩
基配列を含有する組換えベクターDNAを含む。本発明
の細菌の特徴はフラビン還元活性およびニトロ還元活性
を有する蛋白質を生産する。
【0021】本発明の酵素の製法は、塩基配列が配列番
で表されるDNAを含む組換えベクター(発現ベク
ター)で修飾された細菌を培養し、配列番号で表され
るアミノ酸配列を含む蛋白質を製造することである。細
菌としては大腸菌、枯草菌など、培地としてはLB培
地、YT培地などをあげることができる。
【0022】以下、実施例にて本発明で重要な遺伝子の
単離とその同定に関する手順をのべる。
【実施例】 (実施例1) 〔NAD(P)H:FMN還元酵素の同定とN末端アミ
ノ酸配列の決定〕NAD(P)H:FMN還元酵素標品
(ベイリンガー・マンハイムより購入)を「スパロース
12」ゲルろ過カラム(ファルマシア社製)にかけ分画
した。各画分に対してそれぞれNADH及びNADP
H:FMN還元活性を、〔Jablonski,E.&
DeLuca,M.(1977)Biochemis
try,16,2932〕に記述されている方法で測定
し、ドデシル硫酸ナトリウム‐ポリアクリルアミドゲル
電気泳動(SDS‐PAGEと略す)による分析を〔L
aemmli,U.K.(1970)Nature,2
77,680〕に記述されている方法で行った。その結
果、FMN還元活性と26キロダルトン(kDa)の蛋
白質(図4に矢印で示した)との量比がパラレルである
ことが解った。この蛋白質をSDS‐PAGE分析後、
ナイロンメンブレンにトランスファーし、常法にしたが
ってプロテイン・シーケンサー〔アプライド・バイオシ
ステム(ABI)社製〕でアミノ酸配列の決定を行っ
た。その結果を図1を示すことができる。この結果から
配列番号1〜24までのN末端のアミノ酸配列を確認し
た。
【0023】(実施例2) 〔発光細菌遺伝子ライブラリーの作製〕発光細菌Vib
rio fischeri(ATCC7744)を発光
細菌培地で26℃で一晩振とう培養した。10000rp
m で遠心分離し集菌した後、トリス塩酸・EDTA緩衝
液(以下、TE緩衝液という)に菌体を懸濁した。37
℃で1時間リゾチーム処理した後、ドデシル硫酸ナトリ
ウム(以下SDSと略す)を添加し50℃で3時間プロ
テネースK処理をした。その後、フェノール処理を3回
しエタノール沈殿し、乾燥した後、TE緩衝液に溶解し
再度プロテネースK処理した。その後フェノール処理3
回後エタノール沈殿しゲノムDNAを回収した。このゲ
ノムDNAの50μgに10単位の制限酵素Sau3A
Iを37℃で作用させた。反応時間5,10,20,3
0,45,60,90,120分で一部分取し反応をE
DTA(エチレンジアミン四酢酸)を加えることにより
停止した。それぞれの一部をアガロースゲル電気泳動に
かけゲノムDNAの部分分解の度合を確認した。各時間
ごとの反応液を1本にまとめエタノール沈殿し回収し
た。それを少量のTE緩衝液に溶解後、アガロースゲル
電気泳動にかけ4‐6キロベース(Kb)の画分をDE
81ペーパーで回収した。1MのNaClでDE81ペ
ーパーから前記4‐6Kb画分のDNAを溶出し、フェ
ノール処理3回後エタノールで沈殿した。それを約20
0ng/μlになるようにTE緩衝液に溶解した。制限酵
素BamH Iであらかじめ切断してアルカリフォスファ
ターゼ(DNAの5′末端の脱リン酸化を触媒する酵
素)で処理されたpUC18プラスミドDNA(プラス
ミドベクター)に、前記4―6Kb画分のDNAをT4
DNAリガーゼ(DNA鎖どうしまたは、DNAとRN
Aの3′OHと5′P末端をホスホジエステルを結合を
つなぐ酵素)をもって16℃一晩連結反応した。連結反
応液をJM109大腸菌に形質転換し得られた形質転換
株を遺伝子ライブラリーとした。
【0024】〔合成オリゴヌクレオチド・プローブの調
製〕図1に示すアミノ酸配列の情報をもとに、オリゴヌ
クレオチド・プローブ(FR−1)とオリゴヌクレオチ
ド・プローブ(FR−2)の二つのプローブをDNAシ
ンセサイザー(ABI社製)で合成した。それぞれの合
成プローブはOPCカートリッジ(ABI社製)で精製
した。
【0025】〔NAD(P)H:FMN還元酵素遺伝子
のクローニングとその構造解析〕実施例2の遺伝子ライ
ブラリーをFR−1プローブとFR−2プローブでコロ
ニーハイブリダイゼーション法によりスクリーニングし
た。FR−1プローブとFR−2プローブは、〔γ‐32
P〕ATPで5′末端ラベルして標識プローブとして用
いた。遺伝子ライブラリーのタイターを測定後、プレー
ト当り200コロニーになるようにニトロセルロースフ
ィルター上にまかれた。37℃で一晩培養しそれぞれの
フィルターに対してレプリカを2枚とった。2枚1組の
レプリカフィルターは37℃で培養後ハイブリダイゼー
ションに用いた。フィルターは風乾後紫外線(UV)照
射しDNAを固定した後、ハイブリダイゼーション液
{20mlの6×SET緩衝液〔20×SET緩衝液:3
MのNaCl,0.6Mのトリス−塩酸(pH8.
0),0.04MのEDTA〕、10×Denhard
t′s液(牛血清アルブミン、ポリビニルピロリドン、
Ficollの各0.2%溶液)、0.1%SDS、サ
ケ精子DNA(熱変性したもの50μg/ml)}に入
れ、68℃で1時間保温した。さらに液を入れ替えて1
時間保温後、32P−標識プローブを加え室温で一晩ハイ
ブリダイゼーションした。溶液を捨てフィルターを6×
SET緩衝液で洗浄後、6×SET緩衝液37℃20分
間振とうした。この操作を2回繰り返した後、風乾しオ
ートラジオグラフィーにかけた。フィルターと現像した
X線フィルムを重ねインクマーカーの位置をフィルム上
に写し取った。1枚のプレートからできたプローブFR
−1とプローブFR−2の二枚のフィルム上でシグナル
が重なると同定されたコロニー(クローン)を五つ得
た。
【0026】〔組換えベクターの調製〕この五つのクロ
ーンの制限酵素切断試験(図2)を行った結果、この五
つの内の三つは同一クローンであった。すなわち3種類
の陽性クローンが取得できた。その中で最もインサート
DNAの小さい組換えベクターpFR3(図3)をその
後の解析に用いた。
【0027】〔酵素遺伝子の構造決定・アミノ酸配列の
決定〕FR−1プローブを用いてサザンプロット解析し
FMN還元酵素遺伝子の領域をジデオキシ変法〔Hat
tori,M.& Sakaki,Y.(1986)A
nal.Biochem.152,232〕にて決定
し、配列表3に示す一次構造を明らかにした。その結果
FMN還元酵素は配列表4に示す218個のアミノ酸か
らなる24562ダルトンのポリペプチドで、サルモネ
ラ菌のニトロ還元酵素〔Watanabe,M.,Is
hidate,M.Jr.& Nohmi,T.(19
90)Nucleic Acid Res.18,10
59〕と約30%の相同性があることがわかった。
【0028】(実施例3) 〔NAD(P)H:FMN還元酵素遺伝子の組換えベク
ター、発現ベクターの構築〕(図3参照)組換えベクタ
ーpFR3プラスミドDNAを制限酵素HincII/S
tu Iで消化した後−80℃で10分処理した。それを
アガロースゲル電気泳動にかけ約1KbのDNA断片を
DE81ペーパーで分離回収した。DE81ペーパーか
ら1MのNaClでDNA溶出し、フェノール処理3回
後エタノール沈殿した。それを約200ng/μlになる
ようにTE緩衝液に溶解した。制限酵素Sma Iであら
かじめ切断しアルカリフォスファターゼ処理されたpU
C8プラスミドDNA(プラスミドベクター)に、上記
DNAをT4DNAリガーゼをもって16℃一晩連結反
応した。連結反応液をJM109大腸菌に形質転換し、
5‐プロモ‐クロロ‐3‐インドリル‐β‐D‐ガラク
トシド(Xgal)を含んだ培地で選択し、一晩培養を
行ない、白コロニーを形成させた。この白コロニーがイ
ンサートDNAを挿入したプラスミドを含有する形質転
換株である。それらの形質転換株からプラスミドDNA
を調製し制限酵素切断試験して、転換ベクターpFR5
を含有する株を得た。組換えベクターpFR5のプラミ
スドDNAを調製し、EcoR I消化、Klenow処
理、T4DNAリガーゼ連結しD1210大腸菌に形質
転換した。形質転換株の内EcoR I切断部位が消失し
ているものを選択した。これが組換えベクター(発現ベ
クター)pFR7である。組換えベクターpFR5はN
末端のβ‐ガラクトシダーゼ遺伝子(lacZ)に由来
するペプチドとFMN還元酵素の融合蛋白を発現するよ
うに構築してある。発現ベクターpFR7はlacZと
フレームずらしFMN還元酵素単独で発現するよう構築
してある。
【0029】(実施例4) 〔NAD(P)H:FMN還元酵素遺伝子の組み込んだ
大腸菌の調製〕発現ベクターpFR5およびpFR7
と、pUC8プラスミドDNAをD1210大腸菌に形
質転換した。
【0030】〔酵素の調製〕これらの形質転換株の一晩
培養液0.25mlをアンピシリンを含有したLB液体
(10ml)培地に植菌し、37℃で2時間振とう培養
後、最終濃度が1mMになるようにイソプロピル‐β‐D
(−)‐チオガラクトピラノシド(IPTGと略す)を
添加し、さらに3時間培養した。その菌体に対してSD
S−PAGEの分析を行い蛋白質の発現を確認した(こ
の蛋白質が本発明の酵素に相当する)。その結果を図4
に示すが、組換えベクターpFR5とpFR7において
市販の粗酵素標品と同一サイズの26kDaに新たなバ
ンドが出現した。また、組換えベクターpFR5におい
ては29kDaにもバンドの出現が見られ、このベクタ
ーはlacZとの融合蛋白に由来するものであろうと考
えられた。
【0031】IPTG誘導処理した培養液1.5mlを1
0000rpm で遠心分離し上清を除く。菌体を50mMリ
ン酸カリウム・1mMジチオスレイトール緩衝液0.5ml
に懸濁し超音波破砕した。12000rpm 、4℃で30
分間遠心分離しその上清を細胞抽出液とした。
【0032】その細胞抽出液に対して、つぎの酵素還元
活性を測定し、その結果を表1、表2、表3に示す。 フラビン還元活性:〔Jablonski,E.&
DeLuca,M.(1977)Biochemis
try,16,2932〕の方法で行った。 鉄還元活性:〔Fontecave,M.,Eli
asson,R.&Reichard,P.(198
7)J.Biol.Chem.262,12325−1
2331〕の方法で行った。 ニトロ還元活性:〔Watanabe,M.,Is
hiate,M.Jr.& Nohmi,T.(19
89)Mutation Research,216,
211−220〕の方法で行った。 各表の蛋白量はバイオラッド製の蛋白分析キットを用い
て色素結合法〔Bradford,M.M.(197
6)Anal.Biochem.72,248−25
4〕により決定した。
【0033】
【表1】
【0034】
【表2】
【0035】
【表3】 これらの表から活性を比較すると、pFR5もしくはp
FR7との活性は陰性コントロールであるpUC13に
くらべて約1〜3桁高い。この遺伝子はフラビン還元活
性及びニトロ還元活性を有する酵素蛋白の遺伝子と同定
できた。
【0036】
【発明の効果】本発明の酵素遺伝子は、FMN還元活性
およびニトロ還元活性を有する酵素の遺伝子としては、
はじめて単離されたものである。適当な宿主、例えば大
腸菌を宿主とすることによる変異原あるいは発癌性物質
の高感受性株を作出することにこれを使用できる。また
その大腸菌から大量に該還元酵素蛋白を調製することも
できる。その発現ベクターを適当な宿主たとえば、大腸
菌に導入することにより、発光細菌のFMN還元活性及
びニトロ還元活性を有する酵素を大量に発現する生物あ
るいは微生物を作出することができ、さらにその遺伝子
導入生物から抽出することにより該還元酵素を大量に調
製することができる。該遺伝子導入生物あるいは微生物
は上述した機能から変異原あるいは発癌性物質に対して
高い感受性を示し、高感度に変異原あるいは発癌性物質
を検出する指標として有用である。該還元酵素は上述し
た機能から細菌ルシフェラーゼの発光反応を増幅し、多
くの測定法に応用できたとえば診断薬や検査薬に有用で
ある。
【0037】
【配列表】配列番号: 1 配列の長さ: 657 配列の型:核酸 鎖の数: 1 トポロジー:直鎖配列の種類:Genomic DNA 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:配列番号4による ATG ACL CAK CCL ATM ATM CAK GAK XTY GAJ AAK WGZ TAK ACL QRS AAJ 48 Met Thr His Pro Ile Ile His Asp Leu Glu Asn Arg Tyr Thr Ser Lys 1 5 10 15 AAJ TAK GAK CCL QRS AAJ AAJ GTL QRS CAJ GAJ GAK XTY GCL GTL XTY 96 Lys Tyr Asp Pro Ser Lys Lys Val Ser Gln Glu Asp Leu Ala Val Leu 20 25 30 XTY GAJ GCL XTY WGZ XTY QRS GCL QRS QRS ATM AAK QRS CAJ CCL TGG 144 Leu Glu Ala Leu Arg Leu Ser Ala Ser Ser Ile Asn Ser Gln Pro Trp 35 40 45 AAJ TTK ATM GTL ATM GAJ QRS GAK GCA GCL AAJ CAJ GGL ATG CAK GAK 192 Lys Phe Ile Val Ile Glu Ser Asp Ala Ala Lys Gln Gly Met His Asp 50 55 60 QRS TTK GCL AAK ATG CAK CAJ TTK AAK CAJ CCL CAK ATM AAJ GCL TGK 240 Ser Phe Ala Asn Met His Gln Phe Asn Gln Pro His Ile Lys Ala Cys 65 70 75 80 QRS CAK GTG ATM XTY TTK GCL AAK AAJ XTY QRS TAK ACL WGZ GAK GAK 288 Ser His Val Ile Leu Phe Ala Asn Lys Leu Ser Tyr Thr Arg Asp Asp 85 90 95 TAK GAK GTG GTL XTY QRS AAJ GCL GTL GCL GAK AAJ WGZ ATM ACL GAJ 336 Tyr Asp Val Val Leu Ser Lys Ala Val Ala Asp Lys Arg Ile Thr Glu 100 105 110 GAJ CAJ AAJ GAJ GCL GCL TTK GCL QRS TTK AAJ TTK GTL GAJ TTG AAK 384 Glu Gln Lys Glu Ala Ala Phe Ala Ser Phe Lys Phe Val Glu Leu Asn 115 120 125 TGK GAK GAJ AAK GGL GAJ CAK AAJ GCL TGG ACL AAJ CCL CAJ GCL TAK 432 Cys Asp Glu Asn Gly Glu His Lys Ala Trp Thr Lys Pro Gln Ala Tyr 130 135 140 XTY GCL XTY GGL AAK GCL XTY CAK ACL XTY GCL WGZ XTY AAK ATM GAK 480 Leu Ala Leu Gly Asn Ala Leu His Thr Leu Ala Arg Leu Asn Ile Asp 145 150 155 160 QRS ACL ACL ATG GAJ GGL ATM GAK CCL GAJ XTY TTG QRS GAJ ATM TTK 528 Ser Thr Thr Met Glu Gly Ile Asp Pro Glu Leu Leu Ser Glu Ile Phe 160 170 175 GCL GAK GAJ XTY AAJ GGL TAK GAJ TGK CAK GTL GCL XTY GCL ATM GGL 576 Ala Asp Glu Leu Lys Gly Tyr Glu Cys His Val Ala Leu Ala Ile Gly 180 185 190 TAK CAK CAK CCL QRS GAJ GAK TAK AAK GCL QRS TTG CCL AAJ QRS WGZ 624 Tyr His His Pro Ser Glu Asp Tyr Asn Ala Ser Leu Pro Lys Ser Arg 195 200 205 AAJ GCL TTK GAJ GCL GTL ATM ACL ATM XTY TJJ 657 Lys Ala Phe Glu Ala Val Ile Thr Ile Leu *** 210 215 (ただし,塩基の3文字連鎖は、左側に5′末端を及び
右側に3′末端を表わしている。この文字はヌクレオチ
ド配列を形成するプリン塩基(Pu)又はピリミジン塩基(P
y)を表わす。また、 A:アデニン, G:グアニン, C:シトシン, J:AもしくはG, K:TもしくはC, L:A,T,CもしくはG, M:A,CもしくはT, T:チミン, X:YがAもしくはGの場合はTまたはC, 或いはYがCもしくはTの場合はC, Y:XがCの場合はA,G,CまたはT, 或いはXがTの場合はAまたはG, W:ZがCもしくはTの場合はCまたはA, 或いはZがCもしくはTの場合はC, Z:WがGの場合はA,G,CまたはT, 或いはWがAの場合はAまたはG, QR:SがA,G,CもしくはTの場合はTC, ***はTAA TAG もしくはTGAを表す。)
【0038】配列番号: 2 配列の長さ: 657 配列の型:核酸 鎖の数: 1 トポロジー:直鎖 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:Vibrio fischeri 株名:ATCC 7744 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 特徴を決定した方法:E ATG ACG CAT CCA ATT ATT CAT GAT CTT GAA AAT CGT TAT ACA TCA AAA 48 Met Thr His Pro Ile Ile His Asp Leu Glu Asn Arg Tyr Thr Ser Lys 1 5 10 15 AAA TAT GAC CCA TCA AAG AAA GTA TCT CAA GAA GAT TTA GCG GTT TTG 96 Lys Tyr Asp Pro Ser Lys Lys Val Ser Gln Glu Asp Leu Ala Val Leu 20 25 30 CTT GAG GCT CTG CGT TTA TCT GCT TCT TCA ATT AAT TCA CAG CCT TGG 144 Leu Glu Ala Leu Arg Leu Ser Ala Ser Ser Ile Asn Ser Gln Pro Trp 35 40 45 AAA TTC ATT GTT ATT GAA TCC GAT GCA GCG AAG CAA GGT ATG CAT GAT 192 Lys Phe Ile Val Ile Glu Ser Asp Ala Ala Lys Gln Gly Met His Asp 50 55 60 TCG TTT GCA AAT ATG CAT CAG TTT AAT CAA CCT CAC ATC AAA GCG TGT 240 Ser Phe Ala Asn Met His Gln Phe Asn Gln Pro His Ile Lys Ala Cys 65 70 75 80 TCT CAT GTG ATT TTA TTT GCA AAT AAG CTT TCG TAT ACA CGA GAT GAT 288 Ser His Val Ile Leu Phe Ala Asn Lys Leu Ser Tyr Thr Arg Asp Asp 85 90 95 TAT GAT GTG GTT TTA TCT AAA GCG GTT GCT GAC AAG CGT ATT ACT GAA 336 Tyr Asp Val Val Leu Ser Lys Ala Val Ala Asp Lys Arg Ile Thr Glu 100 105 110 GAG CAA AAA GAA GCT GCT TTT GCT TCG TTT AAG TTT GTA GAA TTG AAC 384 Glu Gln Lys Glu Ala Ala Phe Ala Ser Phe Lys Phe Val Glu Leu Asn 115 120 125 TGT GAT GAA AAT GGT GAG CAT AAA GCA TGG ACT AAG CCT CAA GCT TAT 432 Cys Asp Glu Asn Gly Glu His Lys Ala Trp Thr Lys Pro Gln Ala Tyr 130 135 140 TTA GCT CTT GGT AAT GCT CTG CAT ACA TTA GCT AGA CTG AAC ATT GAC 480 Leu Ala Leu Gly Asn Ala Leu His Thr Leu Ala Arg Leu Asn Ile Asp 145 150 155 160 TCA ACA ACA ATG GAA GGC ATT GAT CCT GAA TTA TTG AGT GAA ATT TTT 528 Ser Thr Thr Met Glu Gly Ile Asp Pro Glu Leu Leu Ser Glu Ile Phe 160 170 175 GCT GAT GAA TTA AAA GGG TAT GAA TGT CAT GTT GCT TTA GCC ATT GGT 576 Ala Asp Glu Leu Lys Gly Tyr Glu Cys His Val Ala Leu Ala Ile Gly 180 185 190 TAT CAT CAT CCA AGC GAA GAT TAT AAT GCC TCT TTG CCT AAG TCT CGT 624 Tyr His His Pro Ser Glu Asp Tyr Asn Ala Ser Leu Pro Lys Ser Arg 195 200 205 AAG GCA TTT GAA GCA GTA ATT ACC ATC CTT TAG 657 Lys Ala Phe Glu Ala Val Ile Thr Ile Leu *** 210 215
【0039】配列番号: 3 配列の長さ: 929 配列の型:核酸 鎖の数: 1 トポロジー:直鎖 配列の種類:Genomic DNA 起源 生物名:Vibrio fischeri 株名:ATCC 7744 配列の特徴 特徴を表す記号:CDS 存在位置:109-762 特徴を決定した方法:E 配列 TGTCACATAT GGCAAATTAA ATATTGAGTA TGCCTTGCTT GTTGACATCA TAAGTTGTGC 60 AGACAAGAAT GTCTGTGGAT TAAAATTTCA CAAGTAAGGT TTATTATT ATG ACG CAT 117 Met Thr His 1 CCA ATT ATT CAT GAT CTT GAA AAT CGT TAT ACA TCA AAA AAA TAT GAC 165 Pro Ile Ile His Asp Leu Glu Asn Arg Tyr Thr Ser Lys Lys Tyr Asp 5 10 15 CCA TCA AAG AAA GTA TCT CAA GAA GAT TTA GCG GTT TTG CTT GAG GCT 213 Pro Ser Lys Lys Val Ser Gln Glu Asp Leu Ala Val Leu Leu Glu Ala 20 25 30 35 CTG CGT TTA TCT GCT TCT TCA ATT AAT TCA CAG CCT TGG AAA TTC ATT 261 Leu Arg Leu Ser Ala Ser Ser Ile Asn Ser Gln Pro Trp Lys Phe Ile 40 45 50 GTT ATT GAA TCC GAT GCA GCG AAG CAA GGT ATG CAT GAT TCG TTT GCA 309 Val Ile Glu Ser Asp Ala Ala Lys Gln Gly Met His Asp Ser Phe Ala 55 60 65 AAT ATG CAT CAG TTT AAT CAA CCT CAC ATC AAA GCG TGT TCT CAT GTG 357 Asn Met His Gln Phe Asn Gln Pro His Ile Lys Ala Cys Ser His Val 70 75 80 ATT TTA TTT GCA AAT AAG CTT TCG TAT ACA CGA GAT GAT TAT GAT GTG 405 Ile Leu Phe Ala Asn Lys Leu Ser Tyr Thr Arg Asp Asp Tyr Asp Val 85 90 95 GTT TTA TCT AAA GCG GTT GCT GAC AAG CGT ATT ACT GAA GAG CAA AAA 453 Val Leu Ser Lys Ala Val Ala Asp Lys Arg Ile Thr Glu Glu Gln Lys 100 105 110 115 GAA GCT GCT TTT GCT TCG TTT AAG TTT GTA GAA TTG AAC TGT GAT GAA 501 Glu Ala Ala Phe Ala Ser Phe Lys Phe Val Glu Leu Asn Cys Asp Glu 120 125 130 AAT GGT GAG CAT AAA GCA TGG ACT AAG CCT CAA GCT TAT TTA GCT CTT 549 Asn Gly Glu His Lys Ala Trp Thr Lys Pro Gln Ala Tyr Leu Ala Leu 135 140 145 GGT AAT GCT CTG CAT ACA TTA GCT AGA CTG AAC ATT GAC TCA ACA ACA 597 Gly Asn Ala Leu His Thr Leu Ala Arg Leu Asn Ile Asp Ser Thr Thr 150 155 160 ATG GAA GGC ATT GAT CCT GAA TTA TTG AGT GAA ATT TTT GCT GAT GAA 645 Met Glu Gly Ile Asp Pro Glu Leu Leu Ser Glu Ile Phe Ala Asp Glu 160 170 175 TTA AAA GGG TAT GAA TGT CAT GTT GCT TTA GCC ATT GGT TAT CAT CAT 693 Leu Lys Gly Tyr Glu Cys His Val Ala Leu Ala Ile Gly Tyr His His 180 185 190 195 CCA AGC GAA GAT TAT AAT GCC TCT TTG CCT AAG TCT CGT AAG GCA TTT 741 Pro Ser Glu Asp Tyr Asn Ala Ser Leu Pro Lys Ser Arg Lys Ala Phe 200 205 210 GAA GCA GTA ATT ACC ATC CTT 762 Glu Ala Val Ile Thr Ile Leu 215 TAGATTCTTA ATGTTTGAGA TGAAGAAAAG CCAGCGATTT AGCTGTGCTT TGTTTGTGCA 822 *** AAAATGTTCC TAATGGCGTA TTACTACGGT AGGAAGTCTA TTTAAAGTTT CTTTTACTCT 882 TTGGTATTAA TTGTCAATTA CGCGGAAATC ATTATCTAAC TAGGCCT 929
【0040】配列番号: 4 配列の長さ: 218 配列の型:アミノ酸 配列の種類:タンパク質 配列 Met Thr His Pro Ile Ile His Asp Leu Glu Asn Arg Tyr Thr Ser Lys 1 5 10 15 Lys Tyr Asp Pro Ser Lys Lys Val Ser Gln Glu Asp Leu Ala Val Leu 20 25 30 Leu Glu Ala Leu Arg Leu Ser Ala Ser Ser Ile Asn Ser Gln Pro Trp 35 40 45 Lys Phe Ile Val Ile Glu Ser Asp Ala Ala Lys Gln Gly Met His Asp 50 55 60 Ser Phe Ala Asn Met His Gln Phe Asn Gln Pro His Ile Lys Ala Cys 65 70 75 80 Ser His Val Ile Leu Phe Ala Asn Lys Leu Ser Tyr Thr Arg Asp Asp 85 90 95 Tyr Asp Val Val Leu Ser Lys Ala Val Ala Asp Lys Arg Ile Thr Glu 100 105 110 Glu Gln Lys Glu Ala Ala Phe Ala Ser Phe Lys Phe Val Glu Leu Asn 115 150 125 Cys Asp Glu Asn Gly Glu His Lys Ala Trp Thr Lys Pro Gln Ala Tyr 130 135 140 Leu Ala Leu Gly Asn Ala Leu His Thr Leu Ala Arg Leu Asn Ile Asp 145 150 155 160 Ser Thr Thr Met Glu Gly Ile Asp Pro Glu Leu Leu Ser Glu Ile Phe 165 170 175 Ala Asp Glu Leu Lys Gly Tyr Glu Cys His Val Ala Leu Ala Ile Gly 180 185 190 Tyr His His Pro Ser Glu Asp Tyr Asn Ala Ser Leu Pro Lys Ser Arg 195 200 205 Lys Ala Phe Glu Ala Val Ile Thr Ile Leu 210 215
【図面の簡単な説明】
【図1】NAD(P)H:FMN還元酵素のN末端アミ
ノ酸配列と合成オリゴヌクレオチド・プローブ(FR1
及びFR2)を示す。
【図2】本発明の酵素遺伝子の制限酵素地図およびシー
クエンスストラテジーを示す。矢印は塩基配列を決定し
た方向を示す。ボックスで示したところが酵素遺伝子に
相当する部分である。
【図3】本発明に係る発光細菌のFNM還元活性及びニ
トロ還元活性を有する酵素遺伝子を含有する本発明の組
換えベクター(発現ベクターpFR7)の構築工程を示
す。
【図4】SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によ
る発現蛋白の確認を示す。レーン1はpUC8/D12
10株、レーン2はpFR7/D1210株、レーン3
はpFR5/D1210株、レーン4はベーリンガー・
マンハイム社製NAD(P)H:FMN還元酵素標品で
ある。
【符号の説明】 lacP ラクトースプロモーター Ampr アンピシリン耐性遺伝子 pUC8 プラスミドベクター pFR3 組換えベクター pFR5 組換えベクター pFR7 組換えベクター(発現ベクター) Sau3A I 4塩基(GATC)認識制限酵素 Hinc II 6塩基(GTPyPuAC)認識制限酵素 Sma I 6塩基(CCCGGG)認識制限酵素 Stu I 6塩基(AGGCCT)認識制限酵素 EcoR I 6塩基(GAATTC)認識制限酵素 Hind III 6塩基(AAGCTT)認識制限酵素 Acc I 6塩基〔GT(AC)(TG)AC〕認識制
限酵素 Nsp V 6塩基(TTCGAA)認識制限酵素 EcoR V 6塩基(GATATC)認識制限酵素
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.5 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 //(C12N 15/53 C12R 1:63) (C12N 1/21 C12R 1:19) (C12N 9/02 C12R 1:19)

Claims (8)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列番号1で表される塩基配列を含む、
    フラビン還元活性を有する酵素遺伝子。
  2. 【請求項2】 配列番号2で表される塩基配列を含む請
    求項1記載のフラビン還元活性を有する酵素遺伝子。
  3. 【請求項3】 塩基配列が配列番号3で表されるフラビ
    ン還元活性を有する酵素遺伝子。
  4. 【請求項4】 配列番号4で表されるアミノ酸配列を有
    するフラビン還元活性を有する酵素。
  5. 【請求項5】 塩基配列が配列番号1で表されるDNA
    を含有する組換えベクター。
  6. 【請求項6】 配列番号1で表される塩基配列を有する
    遺伝子がプラスミドベクターへ挿入された請求項3記載
    の組換えベクター。
  7. 【請求項7】 配列番号1で表される塩基配列を有する
    DNAを含む組換えベクターを含有する細菌。
  8. 【請求項8】 塩基配列が配列番号1で表されるDNA
    を含む組換えベクターで修飾されてなる細菌を培養する
    ことからなる配列番号4で表されるアミノ酸配列を含む
    酵素の製法。
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