JPH0779783A - ビブリオ フィシエリ由来のフラビン還元酵素遺伝子 - Google Patents

ビブリオ フィシエリ由来のフラビン還元酵素遺伝子

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JPH0779783A
JPH0779783A JP5181850A JP18185093A JPH0779783A JP H0779783 A JPH0779783 A JP H0779783A JP 5181850 A JP5181850 A JP 5181850A JP 18185093 A JP18185093 A JP 18185093A JP H0779783 A JPH0779783 A JP H0779783A
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glu
ile
gly
seq
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JP5181850A
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Shuhei Yoshino
修平 善野
Kaoru Saigo
薫 西郷
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JNC Corp
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Chisso Corp
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    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0071—Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Y—ENZYMES
    • C12Y114/00—Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14)
    • C12Y114/14—Oxidoreductases acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (1.14) with reduced flavin or flavoprotein as one donor, and incorporation of one atom of oxygen (1.14.14)
    • C12Y114/14003—Alkanal monooxygenase FMN (1.14.14.3), i.e. bacterial-luciferase

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Abstract

(57)【要約】 【目的】 発光細菌 Vibrio fischeriフラビン還元酵素
遺伝子を提供すること。 【構成】 配列の長さ１２２１の塩基配列を有するＤＮ
Ａからなるフラビン還元活性を有する酵素遺伝子。この
遺伝子は２３６個のアミノ酸からなる分子量２６０６７
の蛋白質をコードしている。この遺伝子を含有する組換
えベクター、このベクターを含む細菌。 【効果】 ＦＭＮ還元活性を有する酵素遺伝子が提供さ
れた。

Description

【発明の詳細な説明】
【０００１】
【技術分野】本発明は、発光細菌Vibrio fischeri 由来
のフラビン還元酵素遺伝子、酵素、該遺伝子を含む組換
えベクター、および該組換えベクターを含有する細菌に
関する。
【０００２】
【従来の技術】発光細菌に由来する酵素ルシフェラーゼ
は、還元型フラビンモノヌクレオチド（以下ＦＭＮＨ2
という）と長鎖脂肪族アルデヒドを基質として、酵素の
存在下、酸化型フラビンモノヌクレオチド（以下ＦＭＮ
という）と長鎖カルボン酸とを生成し、その際に青色に
発光する反応を触媒する。細胞内において、この反応に
用いられる基質ＦＭＮＨ2 は、還元型ニコチンアミドア
デニンジヌクレオチド：フラビンモノヌクレオチド（Ｎ
ＡＤＨ：ＦＭＮ）還元酵素および還元型ニコチンアミド
アデニンジヌクレオチドリン酸：フラビンモノヌクレオ
チド（ＮＡＤＰＨ：ＦＭＮ）還元酵素により、また長鎖
脂肪族アルデヒドは脂肪酸還元酵素複合体により供給さ
れる。最近、Spyrouらは、大腸菌からフラビン還元酵素
遺伝子を単離し、その一次構造を明らかにし、〔Spyro
u,G.,Haggard-Ljungquist,E.,Krook,M.,Jornvall,H.,Ni
lsson,E.,& Reichard,P.(1991)J.Bacteriol.173 3673-3
679〕に開示している。我々も、発光細菌Vibrio fische
ri のＦＭＮ還元酵素遺伝子をすでに単離し、その塩基
配列を決定した。さらに本遺伝子を大腸菌内に発現する
ことに成功している。〔特願平０３−３５１，７１
７〕。また発光細菌Xenorhabdus luminescens 由来のフ
ラビン還元酵素遺伝子を単離し、その大腸菌での発現に
成功した。〔特願平０４−２７９０２９〕。今回、Vibr
io fischeri 菌から、以前とは別の新規なフラビン還元
酵素遺伝子を単離した〔本出願内容〕。ＦＭＮＨ2 は空
気中でたやすく、即時に自動酸化され、ＦＭＮに変換さ
れる。細菌ルシフェラーゼの発光能力を最大限に発揮さ
せるためには、基質であるこのＦＭＮＨ2 を常時供給し
続ける必要がある。その目的を達成するのに、最も大切
なのがＦＭＮ還元酵素である。この酵素は上述のよう
に、細菌ルシフェラーゼと共役し、ルシフェラーゼ反応
の生成物であるＦＭＮをＦＭＮＨ2 に変換する反応を触
媒する為、反応系の中にルシフェラーゼとＦＭＮ還元酵
素を共存させることにより、発光反応を持続させること
ができる。すなわち、細菌ルシフェラーゼが何回もター
ンオーバーするため、大過剰の長鎖アルデヒドが反応系
に存在する限り、発光しつづける。以上のように、ＦＭ
Ｎ還元酵素は細菌ルシフェラーゼを最大限に生かす為に
必須であり、その遺伝子の取得により、大量に本酵素を
調製することが可能になる。
【０００３】
【発明が解決しようとする課題】本発明者らは、鋭意研
究の結果、発光細菌Vibrio fischeri (ATCC 7744) から
フラビン還元酵素遺伝子を単離し、その一次構造を明ら
かにすることに成功し、また該遺伝子を大量に発現する
大腸菌を作出することに成功し、本発明を完成するに至
った。すなわち、本発明の目的は上述の技術的事情にか
んがみ、発光細菌Vibrio fischeri のフラビン還元酵素
遺伝子および酵素を提供することであり、さらに該遺伝
子を含む組換えベクター、および該組換えベクターを含
む細菌を提供することである。
【０００４】
【課題を解決するための手段】本発明は、つぎの（１）
〜（８）の構成を有する。
【０００５】（１）配列番号１で表される塩基配列を含
む、フラビン還元酵素遺伝子。
【０００６】（２）配列番号２で表される塩基配列を含
む前記第（１）項記載のフラビン還元酵素遺伝子。
【０００７】（３）塩基配列が配列番号３で表されるフ
ラビン還元酵素遺伝子。
【０００８】（４）配列番号４で表されるアミノ酸配列
を有するフラビン還元酵素。
【０００９】（５）塩基配列が配列番号１で表されるＤ
ＮＡを含有する組換えベクター。
【００１０】（６）配列番号２で表される塩基配列を有
する遺伝子がプラスミドベクターへ挿入された前記第
（５）項記載の組換えベクター。
【００１１】（７）配列番号１で表される塩基配列を有
するＤＮＡを含む組換えベクターを含有する細菌。
【００１２】（８）塩基配列が配列番号１で表されるＤ
ＮＡを含む組換えベクターで修飾されてなる細菌を培養
することからなる配列番号４で表されるアミノ酸配列を
含む酵素の製法。
【００１３】本発明の構成と効果につき以下に詳述す
る。本発明の酵素遺伝子は、配列番号１で表される配列
の長さ７１１のヌクレオチド鎖を含むのが特徴である。
好ましく示す配列としては配列番号２で表されるヌクレ
オチド鎖を含む。塩基配列が配列番号３で表される配列
の長さが１２２１のＤＮＡであるが具体的に示すことが
できる。配列の種類はGenomic ＤＮＡであり、発光細菌
Vibrio fischeri(ATCC 7744)から単離されるものであ
る。その配列の特徴は塩基、塩基番号２８７から９９４
までの２３６個のアミノ酸からなる分子量２６０６７の
蛋白質をコードしている。本発明の酵素遺伝子産物は、
フラビン還元活性を有し、たとえば、ＦＭＮ還元活性を
有するものである。本発明の酵素は、配列番号１，２お
よび３の塩基配列から予測される配列番号４で表される
アミノ酸配列を有する蛋白質である。その蛋白質は２３
６個のアミノ酸からなり分子量２６０６７のものであ
り、発光細菌中でフラビン還元活性を有する。
【００１４】本発明の組換えベクターは、塩基配列が配
列番号１で表されるＤＮＡを含有する。すなわち、本発
明の組換えベクターは、配列番号２で表される塩基配列
を有するＤＮＡと、機能的同等物を含む。「機能的同等
物」とは適当な宿主による発光細菌のＦＭＮ還元活性を
有する酵素の産生において、実質的に同じ結果を得るた
めに実質的に同じ方法で使用できるＤＮＡ断片のことで
ある。すなわち、塩基配列が異なっても、同一のアミノ
酸配列を有する蛋白をコードしえるＤＮＡ断片や若干の
塩基配列の相違に伴う若干のアミノ酸配列の違いがある
もののＦＭＮ還元活性を有する蛋白をコードしえるＤＮ
Ａ断片のことを意味する。具体的には配列番号１の塩基
配列や部位特異的変異導入された配列番号１の塩基配列
を示すことになる。たとえば、該塩基配列を含有するＤ
ＮＡ断片をプラスミドベクターへ挿入されたものであ
る。このベクターとしては、ｐＵＣ(C.Yanisch-Perron,
J.Vieira &J.Messing, Gene ,33, 110-115[1985]) やp
IN III(Y.Masui, J.Coleman, M.Inouye, Experimental
Manipulation of Gene Expression (ed.M.Inouye),p.15
Academic Press[1983]) などが使用できる。図３は、
その組換えベクター（発現ベクター）構築工程を示す。
すなわち、還元酵素遺伝子を有するファージＤＮＡλＶ
Ｆ２からインサートである約１３ｋｂのＳａｌＩ断片を
ｐＵＣ１３のＳａｌＩ切断部位に挿入し、プラスミドｐ
ＶＦ２を得る。ｐＶＦ２プラスミドＤＮＡをＸｈｏＩと
ＢｇｌIIで消化し、１．２ｋｂの断片を回収し、再びｐ
ＵＣ１３のＳａｌＩ及びＢａｍＨＩ切断部位に連結する
ことにより、発現ベクターｐｆＦＲ１を作製する。結果
的に、ｐｆＦＲ１は１ａｃのプロモーターの支配下にフ
ラビン還元酵素遺伝子が、配置されており、フラビン還
元酵素が発現されるようになっている。
【００１５】本発明の細菌は、配列番号１で表される塩
基配列を含有する組換えベクターＤＮＡを含む。本発明
の細菌の特徴はフラビン還元活性を有する蛋白質を生産
する。
【００１６】本発明の酵素の製法は、塩基配列が配列番
号１で表されるＤＮＡを含む組換えベクター（発現ベク
ター）で修飾された細菌を培養し、配列番号４で表され
るアミノ酸配列を含む蛋白質を製造することである。細
菌としては、大腸菌、枯草菌など、培地としてはＬＢ培
地、ＹＴ培地などをあげることができる。
【００１７】以下、実施例にて本発明で重要な遺伝子の
単離とその同定に関する手順をのべる。
【実施例】
実施例１ Vibrio fischeri のフラビン還元酵素遺伝子(fre) の単
離 発光細菌Vibrio fischen (ATCC 7744)をPhotobacterium
培地で２６℃、一晩振とう培養した。１００００ｒｐ
ｍで遠心分離し集菌した後、トリス塩酸・ＥＤＴＡ緩衝
液（以下、ＴＥ緩衝液という）に菌体を懸濁した。３７
℃で１時間リゾチーム処理した後、ドデシル硫酸ナトリ
ウム（以下ＳＤＳと略す）を添加して５０℃で３時間プ
ロテネースＫ処理をした。その後、フェノール処理を３
回し、エタノール沈殿し、乾燥した後、ＴＥ緩衝液に溶
解し再度プロテネースＫ処理した。その後フェノール処
理３回後エタノール沈殿しゲノムＤＮＡを回収した。大
腸菌と発光細菌Xenorhabdus luminescens (ATCC 29999)
のフラビン還元酵素遺伝子(fre) のコーディング領域で
保存されている部分である図１に示す合成オリゴヌクレ
オチド・プライマーＦＲＥ３とＦＲＥ４を用いてV.fisc
heriゲノムＤＮＡを鋳型にしてＰＣＲ法［Saiki,R.K.,
D.H.Gelfand, S.Stoffel, S.J.Scharf, R.Higuchi, G.
T.Horn, K.B.Mullis and H.A.Erlic(1988) Science 239
487]によりfre 遺伝子を増幅し、そのＤＮＡ断片をｐ
ＵＣ８プラスミドＤＮＡ［Hanna,Z.,Fregeau,C.,Prefon
taine,G.,Brousseau,R.(1984)Gene, 30 247]のＨｉｎｃ
ＩＩ切断部位に挿入した。
【００１８】塩基配列の決定 ［Hattori,M. & Sakaki,Y.(1986) Anal.Biochem. 152 2
32］からVibrio fischeri fre遺伝子であることを確認
した。このプラスミドＤＮＡから fre遺伝子部分のＤＮ
Ａ断片をＨｉｎｄIII ／ＥｃｏＲＩで切り出し、完全鎖
長 fre遺伝子のスクリーニングのプローブＤＮＡとして
用いた。プローブＤＮＡの32Ｐ標識はランダム・プライ
ミング法［Feinberg,A. & Vogelstein,B.(1983) Anal.B
iochem.132 6 ］で行った。 実施例２ 発光細菌遺伝子のラムダ・ファージライブラリーの作製 発光細菌 Vibrio fischeri（ATCC 7744)を Photobacter
ium 培地で２６℃で一晩振とう培養した。１００００ｒ
ｐｍで遠心分離し集菌した後、トリス塩酸・ＥＤＴＡ緩
衝液（以下、ＴＥ緩衝液という）に菌体を懸濁した。３
７℃で１時間リゾチーム処理した後、ドデシル硫酸ナト
リウム（以下ＳＤＳと略す）を添加し５０℃で３時間プ
ロテネースＫ処理をした。その後、フェノール処理を３
回しエタノール沈殿し、乾燥した後、ＴＥ緩衝液に溶解
し再度プロテネースＫ処理した。その後フェノール処理
３回後エタノール沈殿しゲノムＤＮＡを回収した。この
ゲノムＤＮＡの５０μｇに１０単位の制限酵素Ｓａｕ３
ＡＩを３７℃で作用させた。反応時間５，１０，２０，
３０，４５，６０，９０，１２０分で一部分取し反応を
ＥＤＴＡ（エチレンジアミン四酢酸）を加えることによ
り停止した。それぞれの一部をアガロースゲル電気泳動
にかけゲノムＤＮＡの部分分解の度合を確認した。各時
間ごとの反応液を１本にまとめエタノール沈殿回収し
た。それを少量のＴＥ緩衝液に溶解後、アガロースゲル
電気泳動にかけ９〜２３キロベース（Kb）の画分を電気
溶出操作で回収した。９〜２３Ｋｂ画分を含むアガロー
スゲルから前記９〜２３Ｋｂ画分のＤＮＡを透析チュー
ブ内に電気泳動的に溶出し、フェノール処理３回後エタ
ノールで沈殿した。それを約２００ｎｇ／μｌになるよ
うにＴＥ緩衝液に溶解した。制限酵素ＢａｍＨＩであら
かじめ切断してアルカリフォスファターゼ（ＤＮＡの
５’末端の脱リン酸化を触媒する酵素）で処理されたＥ
ＭＢＬ３ファージＤＮＡに、前記９〜２３Ｋｂ画分のＤ
ＮＡをＴ４ＤＮＡリガーゼ（ＤＮＡ鎖どうしまたは、Ｄ
ＮＡとＲＮＡの３’ＯＨと５’Ｐ末端をホスホジエステ
ルを結合をつなぐ酵素）もって１６℃で一晩連結反応し
た。連結反応液をパッケージング抽出液と混合し、２２
℃で２時間反応して組換えファージとした。このファー
ジを遺伝子ライブラリーとした。
【００１９】実施例３ 完全長鎖のフラビン還元酵素遺伝子の単離 実施例２で作製の遺伝子ライブラリーのタイター測定
後、プレート当り１万個のファージがプラークを形成す
るようにまき、３７℃で一晩培養した。４℃に２時間放
置後、それぞれのプレートに対して、ナイロンメンブレ
ン・フィルターで２枚づつファージをトランスファーし
た。フィルターを変性し、中和後、紫外線照射した。そ
して、ハイブリダイゼーション液｛２０ｍｌの６×ＳＥ
Ｔ緩衝液〔２０×ＳＥＴ緩衝液：３ＭのＮａＣｌ，０．
６Ｍのトリスー塩酸（ｐＨ８．０），０．０４ＭのＥＤ
ＴＡ〕、１０×Ｄｅｎｈａｒｄｔ’ｓ液（牛血清アルブ
ミン、ポリビニルピロリドン、Ｆｉｃｏｌｌの各０．２
％溶液）、０．１％ＳＤＳ、サケ精子ＤＮＡ（熱変性し
たもの５０μｇ／ｍｌ）｝に入れ、６８℃で１時間保温
した。さらに液を入れ替えて１時間保温後、32Ｐ標識し
た Vibrio fischeri freのプローブを加え６５℃で一晩
ハイブリダイゼーションした。溶液を捨てフィルターを
２×ＳＥＴ緩衝液で洗浄後、０．２×ＳＥＴ緩衝液６５
℃で２０分間振とうした。この操作を２回繰り返した
後、風乾しオートラジオグラフィーにかけた。フィルタ
ーと現像したＸ線フィルムを重ねインクマーカーの位置
をフィルム上に写し取った。一枚のプレートからできた
二枚のフィルム上でシグナルが重なると同定されたファ
ージ（クローン）を約１０００個の組換えファージから
１個得た。このクローンをλＶＦ２と名付けた。このイ
ンサートＤＮＡをｐＵＣ１３プラスミドのＳａｌＩ部位
に挿入し、ｐＶＦ２を得た。このプラスミドＤＮＡを鋳
型として、ＰＣＲクローンの塩基配列を基に調製した合
成オリゴヌクレオチドプライマー（２０ｍｅｒ）を用い
て、ジデオキシ法［Hattori,M. & Sakaki,Y.(1986) Ana
l.Biochem. 152 232 ］で塩基配列を決定した。また、
新たにその塩基配列を基に合成プライマーを作製し、同
様にして塩基配列を決定した。図２にその制限マップと
配列決定の戦略を示した。決定された塩基配列は、配列
番号３に示される通りで、１２２１ｂｐの長さで、塩基
番号２８７〜９９４までの２３６個のアミノ酸からなる
分子量２６０６７の蛋白質をコードすると考えられた。
【００２０】実施例６ フラビン還元酵素遺伝子の発現ベクターの構築とその形
質転換株の調製（図３参照） 組換えプラスミドｐＶＦ２のＤＮＡをＸｈｏＩ及びＢｇ
ｌIIで消化し、１．２Ｋｂの断片を回収し、プラスミド
ｐＵＣｌ３のＳａｌＩ／ＢａｍＨＩ部位にＴ４ＤＮＡリ
ガーゼで連結反応した。その反応液の一部を大腸菌Ｄ１
２１０株に形質転換した。形質転換株からプラスミドＤ
ＮＡを調製し、インサートＤＮＡが１．２Ｋｂのものを
選択した。そのプラスミドをｐｆＦＲ１と名付けた。ｐ
ｆＦＲ１はラクトースオペロン（１ａｃ）のプロモータ
ーの支配下にフラビン還元酵素遺伝子を配置した形とな
っており、フラビン還元酵素を発現するように構築して
ある。
【００２１】実施例７ フラビン還元酵素の調製とその活性測定 この形質転換株の一晩培養液０．２５ｍｌをアンピシリ
ンを含有したＬＢ液体（１０ｍｌ）培地に植菌し、３７
℃で２時間振とう培養後、最終濃度が１ｍＭになるよう
にイソプロピル−β−Ｄ（−）−チオガラクトピラノシ
ド（ＩＰＴＧと略す）を添加し、さらに３時間培養し
た。ＩＰＴＧ誘導処理した培養液３．０ｍｌを１０００
０ｒｐｍで遠心分離し上清を除く。菌体を５０ｍＭリン
酸カリウム・１ｍＭジチオスレイトール緩衝液０．７５
ｍｌに懸濁し超音波破砕した。１２０００ｒｐｍ、４℃
で３０分間遠心分離しその上清を細胞抽出液とした。そ
の細胞抽出液に対して、酵素還元活性を測定し、その結
果を表１に示す。 フラビン還元活性：〔Jablonski,E. & DeLuca,M. (19
77) Biochemistry,16,2932〕の方法で行った。蛋白量は
バイオラッド製の蛋白分析キットを用いて色素結合法
〔Bradford, M. M. (1976) Anal. Biochem. 72,248-25
4〕により決定した。
【００２２】
【表１】
【００２３】表１の結果からｐｆＦＲ１のＦＭＮとリボ
フラビンの還元活性は、ｐＵＣ１３に比べて１ケタ高い
値を示した。この遺伝子がフラビン還元酵素をコードす
ることが確認された。
【００２４】
【発明の効果】本発明の酵素遺伝子は、発光細菌Vibrio
fischeri のＦＭＮ還元活性を有する酵素の遺伝子とし
ては、単離されたものである。適当な宿主、例えば大腸
菌を宿主とすることにより、その大腸菌から大量に該酵
素蛋白を調製することができる。その発現ベクターを適
当な宿主たとえば、大腸菌に導入することにより、発光
細菌のＦＭＮ還元活性を有する酵素を大量に発現する生
物あるいは微生物を作出することができ、さらにその遺
伝子導入生物から抽出することにより該還元酵素を大量
に調製することができる。該還元酵素は上述した機能か
ら細菌ルシフェラーゼの発光反応を増幅し、多くの測定
法に応用でき、たとえば診断薬や検査薬に有用である。
【００２５】
【配列表】
【００２６】配列番号：１ 配列の長さ：７１１ 配列の型：核酸 鎖の数：１ トポロジー：直鎖 配列の種類：Genomic ＤＮＡ 起源 生物名：Vibrio fischeri 株名：ＡＴＣＣ７７４４ 配列の特徴 特徴を表す記号：ＣＤＳ 特徴を決定した方法：Ｅ
【００２７】 配列 ATG CCL ATM AAK TGK AAJ GTL AAJ QRS ATM GAJ CCL XTY GCL TGK AAK 48 Met Pro Ile Asn Cys Lys Val Lys Ser Ile Glu Pro Leu Ala Cys Asn 1 5 10 15 ACL TTK WGZ ATM XTY XTY CAK CCL GAJ CAJ CCL GTL GCL TTK AAJ GCL 96 Thr Phe Arg Ile Leu Leu His Pro Glu Gln Pro Val Ala Phe Lys Ala 20 25 30 GGL CAJ TAK XTY ACL GTL GTL ATG GGL GAJ AAJ GAK AAJ WGZ CCL TTK 144 Gly Gln Tyr Leu Thr Val Val Met Gly Glu Lys Asp Lys Arg Pro Phe 35 40 45 QRS ATM GCL QRS QRS CCL TGK WGZ CAK GAJ GGL GAJ ATM GAJ XTY CAK 192 Ser Ile Ala Ser Ser Pro Cys Arg His Glu Gly Glu Ile Glu Leu His 50 55 60 ATM GGL GCL GCL GAJ CAK AAK GCL TAK GCL GGL GAJ GTL GTL GAJ QRS 240 Ile Gly Ala Ala Glu His Asn Ala Tyr Ala Gly Glu Val Val Glu Ser 65 70 75 80 ATG AAJ QRS GCL XTY GAJ ACL GGL GGL GAK ATM XTY ATM GAK GCL CCL 288 Met Lys Ser Ala Leu Glu Thr Gly Gly Asp Ile Leu Ile Asp Ala Pro 85 90 95 CAK GGL GAJ GCL TGG ATM WGZ GAJ GAK QRS GAK WGZ QRS ATG XTY XTY 336 His Gly Glu Ala Trp Ile Arg Glu Asp Ser Asp Arg Ser Met Leu Leu 100 105 110 ATM GCL GGL GGL ACL GGL TTK QRS TAK GTL WGZ QRS ATM XTY GAK CAK 384 Ile Ala Gly Gly Thr Gly Phe Ser Tyr Val Arg Ser Ile Leu Asp His 115 120 125 TGK ATM QRS CAJ CAJ ATM CAJ AAJ CCL ATM TAK XTY TAK TGG GGL GGL 432 Cys Ile Ser Gln Gln Ile Gln Lys Pro Ile Tyr Leu Tyr Trp Gly Gly 130 135 140 WGZ GAK GAJ TGK CAJ XTY TAK GCL AAJ GCL GAJ XTY GAJ QRS ATM GCL 480 Arg Asp Glu Cys Gln Leu Tyr Ala Lys Ala Glu Leu Glu Ser Ile Ala 145 150 155 160 CAJ GCL CAK QRS CAK ATM ACL TTK GTL CCL GTL GTL GAJ AAJ QRS GAJ 528 Gln Ala His Ser His Ile Thr Phe Val Pro Val Val Glu Lys Ser Glu 165 170 175 GGL TGG ACL GGL AAJ ACL GGL AAK GTL XTY GAJ GCL GTL AAJ GCL GAK 576 Gly Trp Thr Gly Lys Thr Gly Asn Val Leu Glu Ala Val Lys Ala Asp 180 185 190 TTK AAK QRS XTY GCL GAK ATG GAK ATM TAK ATM GCL GGL WGZ TTK GAJ 624 Phe Asn Ser Leu Ala Asp Met Asp Ile Tyr Ile Ala Gly Arg Phe Glu 195 200 205 ATG GCL GGL GCL GCL WGZ GAJ CAJ TTK ACL ACL GAJ AAJ CAJ GCL AAJ 672 Met Ala Gly Ala Ala Arg Glu Gln Phe Thr Thr Glu Lys Gln Ala Lys 210 215 220 AAJ GAJ CAJ XTY TTK GGL GAK GCL TTK GCL TTK ATM TAA 711 Lys Glu Gln Leu Phe Gly Asp Ala Phe Ala Phe Ile *** 225 230 235 （ただし、塩基の３文字連鎖は、左側に５’末端を及び
右側に３’末端を表わしている。この文字はヌクレオチ
ド配列を形成するプリン又はピリミジン塩基を表わす。
また、Ａ：アデニン、Ｇ：グアニン、Ｃ：シトシン、
Ｊ：ＡもしくはＧ、Ｋ：ＴもしくはＣ、Ｌ：Ａ、Ｔ、Ｃ
もしくはＧ、Ｍ：Ａ、ＣもしくはＴ、Ｔ：チミン、Ｘ：
ＹがＡもしくはＧの場合はＴまたはＣ、或いはＹがＣも
しくはＴの場合はＣ、Ｙ：ＸがＣの場合はＡ、Ｇ、Ｃま
たはＴ、或いはＸがＴの場合はＡまたはＧ、Ｗ：ＺがＣ
もしくはＴの場合はＣまたはＡ、或いはＺがＣもしくは
Ｔの場合はＣ、Ｚ：ＷがＧの場合はＡ、Ｇ、Ｃまたは
Ｔ、或いはＷがＡの場合はＡまたはＧ、ＧＲ：ＳがＡ、
Ｇ、ＣまたはＴの場合はＴＣ、＊＊＊はＴＡＡ、ＴＡＧ
もしくはＴＧＡを表す。）
【００２８】配列番号：２ 配列の長さ：７１１ 配列の型：核酸 鎖の数：１ トポロジー：直鎖 配列の種類：Genomic ＤＮＡ 起源 生物名：Vibrio fischeri 株名：ＡＴＣＣ７７４４ 配列の特徴 特徴を表す記号：ＣＤＳ 特徴を決定した方法：Ｅ
【００２９】 配列 ATG CCA ATC AAT TGC AAA GTA AAG TCT ATC GAG CCA TTG GCT TGT AAT 48 Met Pro Ile Asn Cys Lys Val Lys Ser Ile Glu Pro Leu Ala Cys Asn 1 5 10 15 ACT TTT CGA ATT TTA CTT CAC CCA GAA CAG CCT GTT GCT TTT AAA GCA 96 Thr Phe Arg Ile Leu Leu His Pro Glu Gln Pro Val Ala Phe Lys Ala 20 25 30 GGC CAA TAC CTA ACG GTT GTT ATG GGT GAA AAA GAC AAA CGC CCA TTC 144 Gly Gln Tyr Leu Thr Val Val Met Gly Glu Lys Asp Lys Arg Pro Phe 35 40 45 TCA ATC GCA AGT AGT CCT TGT CGC CAC GAA GGT GAA ATT GAG TTA CAT 192 Ser Ile Ala Ser Ser Pro Cys Arg His Glu Gly Glu Ile Glu Leu His 50 55 60 ATT GGT GCC GCA GAG CAC AAT GCT TAT GCC GGA GAA GTG GTT GAA TCA 240 Ile Gly Ala Ala Glu His Asn Ala Tyr Ala Gly Glu Val Val Glu Ser 65 70 75 80 ATG AAA TCG GCA CTA GAA ACG GGT GGT GAT ATT TTA ATT GAT GCG CCT 288 Met Lys Ser Ala Leu Glu Thr Gly Gly Asp Ile Leu Ile Asp Ala Pro 85 90 95 CAT GGT GAA GCG TGG ATC CGT GAA GAC AGC GAT CGT TCA ATG TTA TTG 336 His Gly Glu Ala Trp Ile Arg Glu Asp Ser Asp Arg Ser Met Leu Leu 100 105 110 ATT GCT GGC GGT ACA GGT TTT AGT TAC GTA CGT TCA ATT CTT GAT CAC 384 Ile Ala Gly Gly Thr Gly Phe Ser Tyr Val Arg Ser Ile Leu Asp His 115 120 125 TGT ATT AGC CAA CAG ATT CAA AAA CCA ATT TAC CTA TAC TGG GGT GGT 432 Cys Ile Ser Gln Gln Ile Gln Lys Pro Ile Tyr Leu Tyr Trp Gly Gly 130 135 140 CGT GAT GAA TGC CAA CTG TAT GCA AAA GCA GAA TTA GAG AGC ATT GCT 480 Arg Asp Glu Cys Glu Leu Tyr Ala Lys Ala Glu Leu Glu Ser Ile Ala 145 150 155 160 CAA GCG CAT AGC CAT ATT ACG TTT GTG CCA GTG GTT GAG AAA AGT GAA 528 Gln Ala His Ser His Ile Thr Phe Val Pro Val Val Glu Lys Ser Glu 165 170 175 GGC TGG ACA GGT AAA ACG GGT AAT GTG TTA GAA GCG GTA AAA GCC GAT 576 Gly Trp Thr Gly Lys Thr Gly Asn Val Leu Glu Ala Val Lys Ala Asp 180 185 190 TTT AAC TCA CTA GCA GAT ATG GAT ATT TAC ATC GCA GGT CGC TTT GAA 624 Phe Asn Ser Leu Ala Asp Met Asp Ile Tyr Ile Ala Gly Arg Phe Glu 195 200 205 ATG GCT GGT GCA GCA CGT GAG CAG TTC ACC ACT GAA AAA CAA GCG AAG 672 Met Ala Gly Ala Ala Arg Glu Gln Phe Thr Thr Glu Lys Gln Ala Lys 210 215 220 AAA GAG CAG CTG TTT GGT GAT GCA TTC GCA TTT ATC TAA 711 Lys Glu Gln Leu Phe Gly Asp Ala Phe Ala Phe Ile *** 225 230 235
【００３０】配列番号：３ 配列の長さ：１２２１ 配列の型：核酸 鎖の数：１ トポロジー：直鎖 配列の種類：Genomic ＤＮＡ 起源 生物名：Vibrio fischeri 株名：ＡＴＣＣ７７４４ 配列の特徴 特徴を表す記号：ＣＤＳ 存在位置：５３−７５１ 特徴を決定した方法：Ｅ
【００３１】 配列 C TCG AGG CGG GAA TTA ATT ATC CAA ACC GAT GCC AAG TCG GCG CAT 46 GTG CTA TGT GCT TAT GCA AAA AAT TAG AGG GTG AAA TTG AAT ACG ATT 94 TAG AGC CTC TTC TTA CCG ATA AAG AAC AAC AAG AAG GGT GGG TAT TTG 142 CGT GTC AGG CAA CAG CAA AAA GTG ATT TAG TGC TGT TGT TAG AAT AAA 190 TCC TCC CCG TAT AAT TAG AGT TTA ATG CTC AAT ACA CAT AAT AAT GAC 238 AGC GTA CAA ATG CCA TAT TAA AAA GGC ATC AGC TGA AAA AGG AAA GTC 286 ATG CCA ATC AAT TGC AAA GTA AAG TCT ATC GAG CCA TTG GCT TGT AAT 334 Met Pro Ile Asn Cys Lys Val Lys Ser Ile Glu Pro Leu Ala Cys Asn 1 5 10 15 ACT TTT CGA ATT TTA CTT CAC CCA GAA CAG CCT GTT GCT TTT AAA GCA 382 Thr Phe Arg Ile Leu Leu His Pro Glu Gln Pro Val Ala Phe Lys Ala 20 25 30 GGC CAA TAC CTA ACG GTT GTT ATG GGT GAA AAA GAC AAA CGC CCA TTC 430 Gly Gln Tyr Leu Thr Val Val Met Gly Glu Lys Asp Lys Arg Pro Phe 35 40 45 TCA ATC GCA AGT AGT CCT TGT CGC CAC GAA GGT GAA ATT GAG TTA CAT 478 Ser Ile Ala Ser Ser Pro Cys Arg His Glu Gly Glu Ile Glu Leu His 50 55 60 ATT GGT GCC GCA GAG CAC AAT GCT TAT GCC GGA GAA GTG GTT GAA TCA 526 Ile Gly Ala Ala Glu His Asn Ala Tyr Ala Gly Glu Val Val Glu Ser 65 70 75 80 ATG AAA TCG GCA CTA GAA ACG GGT GGT GAT ATT TTA ATT GAT GCG CCT 574 Met Lys Ser Ala Leu Glu Thr Gly Gly Asp Ile Leu Ile Asp Ala Pro 85 90 95 CAT GGT GAA GCG TGG ATC CGT GAA GAC AGC GAT CGT TCA ATG TTA TTG 622 His Gly Glu Ala Trp Ile Arg Glu Asp Ser Asp Arg Ser Met Leu Leu 100 105 110 ATT GCT GGC GGT ACA GGT TTT AGT TAC GTA CTG TCA ATT CTT GAT CAC 670 Ile Ala Gly Gly Thr Gly Phe Ser Tyr Val Arg Ser Ile Leu Asp His 115 120 125 TGT ATT AGC CAA CAG ATT CAA AAA CCA ATT TAC CTA TAC TGG GGT GGT 718 Cys Ile Ser Gln Gln Ile Gln Lys Pro Ile Tyr Leu Tyr Trp Gly Gly 130 135 140 CGT GAT GAA TGC CAA CTG TAT GCA AAA GCA GAA TTA GAG AGC ATT GCT 766 Arg Asp Glu Cys Gln Leu Tyr Ala Lys Ala Glu Leu Glu Ser Ile Ala 145 150 155 160 CAA GCG CAT AGC CAT ATT ACG TTT GTG CCA GTG GTT GAG AAA AGT GAA 814 Gln Ala His Ser His Ile Thr Phe Val Pro Val Val Glu Lys Ser Glu 165 170 175 GGC TGG ACA GGT AAA ACG GGT AAT GTG TTA GAA GCG GTA AAA GCC GAT 862 Gly Trp Thr Gly Lys Thr Gly Asn Val Leu Glu Ala Val Lys Ala Asp 180 185 190 TTT AAC TCA CTA GCA GAT ATG GAT ATT TAC ATC GCA GGT CGC TTT GAA 910 Phe Asn Ser Leu Ala Asp Met Asp Ile Tyr Ile Ala Gly Arg Phe Glu 195 200 205 ATG GCT GGT GCA GCA CGT GAG CAG TTC ACC ACT GAA AAA CAA GCG AAG 958 Met Ala Gly Ala Ala Arg Glu Gln Phe Thr Thr Glu Lys Gln Ala Lys 210 215 220 AAA GAG CAG CTG TTT GGT GAT GCA TTC GCA TTT ATC TAA TTT AGA GCA 1006 Lys Glu Gln Leu Phe Gly Asp Ala Phe Ala Phe Ile *** 225 230 235 CTA AAA AGA CAA ATA AAA ATG CCA CTC AAT AAT GAG TGG CAT TTT TTT 1054 ATG GAT GTT ATA AAA AAT GAA TTA GCC TTT ATC ATC AAC CAT AGT CAG 1102 TGC TTT ACG AGA AAG ATC T 1121
【００３２】配列番号：４ 配列の長さ：２３６ 配列の型：アミノ酸 配列の種類：タンパク質
【００３３】 配列 Met Pro Ile Asn Cys Lys Val Lys Ser Ile Glu Pro Leu Ala Cys Asn 1 5 10 15 Thr Phe Arg Ile Leu Leu His Pro Glu Gln Pro Val Ala Phe Lys Ala 20 25 30 Gly Gln Tyr Leu Thr Val Val Met Gly Glu Lys Asp Lys Arg Pro Phe 35 40 45 Ser Ile Ala Ser Ser Pro Cys Arg His Glu Gly Glu Ile Glu Leu His 50 55 60 Ile Gly Ala Ala Glu His Asn Ala Tyr Ala Gly Glu Val Val Glu Ser 65 70 75 80 Met Lys Ser Ala Leu Glu Thr Gly Gly Asp Ile Leu Ile Asp Ala Pro 85 90 95 His Gly Glu Ala Trp Ile Arg Glu Asp Ser Asp Arg Ser Met Leu Leu 100 105 110 Ile Ala Gly Gly Thr Gly Phe Ser Tyr Val Arg Ser Ile Leu Asp His 115 120 125 Cys Ile Ser Gln Gln Ile Gln Lys Pro Ile Tyr Leu Tyr Trp Gly Gly 130 135 140 Arg Asp Glu Cys Gln Leu Tyr Ala Lys Ala Glu Leu Glu Ser Ile Ala 145 150 155 160 Gln Ala His Ser His Ile Thr Phe Val Pro Val Val Glu Lys Ser Glu 165 170 175 Gly Trp Thr Gly Lys Thr Gly Asn Val Leu Glu Ala Val Lys Ala Asp 180 185 190 Phe Asn Ser Leu Ala Asp Met Asp Ile Tyr Ile Ala Gly Arg Phe Glu 195 200 205 Met Ala Gly Ala Ala Arg Glu Gln Phe Thr Thr Glu Lys Gln Ala Lys 210 215 220 Lys Glu Gln Leu Phe Gly Asp Ala Phe Ala Phe Ile *** 225 230 235
【図面の簡単な説明】
【図１】フラビン還元酵素の保存されたアミノ酸配列と
合成オリゴヌクレオチド・プライマー。
【図２】本発明の酵素遺伝子の制限酵素地図およびシー
ケンス・ストラテジーを示す。矢印は塩基配列を決定し
た方向を示す。ボックスで示したところが、酵素の構造
遺伝子部分に相当する。
【図３】本発明に係る発光細菌のフラビン還元酵素遺伝
子を含有する本発明の発現ベクターｐｆＦＲ１の構築工
程を示す。白ボックスはフラビン還元酵素遺伝子のコー
ディング領域である。点線はｐＵＣのベクター部分を、
黒ボックスは大腸菌のラクトースオペロンのプロモータ
ー部分を示す。
【符号の説明】
ｌａｃＰ ラクトースオペロンのプロモーター ｐＵＣ１３ プラスミド・ベクター λＶＦ２ 組換えファージＤＮＡ ｐＶＦ２ 組換えプラスミド ｐｆＦＲ１ 発現プラスミド ＨｐａＩ 制限酵素 ＳａｃII 〃 ＳｎａＢＩ 〃 ＰａｃＩ 〃 ＳａｃII 〃 ＮｓｐＶ 〃 ＢｇｌII 〃 ＳａｌＩ 〃 ＨｉｎｄIII 〃 ＸｈｏＩ 〃
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 ＦＩ 技術表示箇所 (Ｃ１２Ｎ 1/21 Ｃ１２Ｒ 1:19） (Ｃ１２Ｎ 9/02 Ｃ１２Ｒ 1:19）

Claims (8)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項１】 配列番号１で表される塩基配列を含む、
    フラビン還元酵素遺伝子。 【配列表１】
  2. 【請求項２】 配列番号２で表される塩基配列を含む請
    求項１記載のフラビン還元酵素遺伝子。 【配列表２】
  3. 【請求項３】 塩基配列が配列番号３で表されるフラビ
    ン還元酵素遺伝子。 【配列表３】
  4. 【請求項４】 配列番号４で表されるアミノ酸配列を有
    するフラビン還元酵素。 【配列表４】
  5. 【請求項５】 塩基配列が配列番号１で表されるＤＮＡ
    を有する組換えベクター。 【配列表５】
  6. 【請求項６】 配列番号２で表される塩基配列を有する
    遺伝子がプラスミドベクターへ挿入された請求項５記載
    の組換えベクター。 【配列表６】
  7. 【請求項７】 配列番号１で表される塩基配列を有する
    ＤＮＡを含む組換えベクターを含有する細菌。 【配列表７】
  8. 【請求項８】 塩基配列が配列番号１で表されるＤＮＡ
    を含む組換えベクターで修飾されてなる細菌を培養する
    ことからなる配列番号４で表されるアミノ酸配列を含む
    酵素の製法。 【配列表８】
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