JPH08294399A - サルモネラ属菌検出のためのオリゴヌクレオチドおよびそれを用いた検出法 - Google Patents

サルモネラ属菌検出のためのオリゴヌクレオチドおよびそれを用いた検出法

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JPH08294399A
JPH08294399A JP7105192A JP10519295A JPH08294399A JP H08294399 A JPH08294399 A JP H08294399A JP 7105192 A JP7105192 A JP 7105192A JP 10519295 A JP10519295 A JP 10519295A JP H08294399 A JPH08294399 A JP H08294399A
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Abstract

(57)【要約】 【目的】 サルモネラ属菌の食中毒原因遺伝子を検出す
ることを目的とする。 【構成】 サルモネラ属菌の食中毒原因遺伝子と選択的
にハイブリダイズするオリゴヌクレオチド(配列番号1
〜9)を作製し、このオリゴヌクレオチドをプライマー
として遺伝子増幅に用い、食中毒症状を起こすサルモネ
ラ属菌のみを選択的に検出することを特徴としている。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、臨床検査、とりわけ食
中毒にかかる検査、あるいは、食品検査でのサルモネラ
属菌の検出に関するものである。
【0002】
【従来技術】食中毒にかかる検査では、検査材料は患者
の嘔吐物、糞便、患者が食した食品または患者の周辺環
境からの拭き取り材料の場合である。これらの材料から
サルモネラ属菌が検出・同定されるまでには、まず、増
菌培養、確認培養を行い、さらに抗原(血清型)を決定
しなければならない。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】しかしながら、サルモ
ネラ属菌は多数の血清型に分けられるが、完全な血清型
別には100種類にもおよぶ抗血清と十分な経験とを必
要とするため、一般検査室におけるサルモネラ検査の実
施は困難である。しかも、各培養段階に要する時間は、
18〜24時間であり、抗原型決定までを含めた総所要
時間は約3日となり、迅速性に欠ける。また、確認培養
では、TSI寒天、SIM培地、VP−MR培地および
リシン脱炭酸試験用培地に接種し、37℃で1晩培養す
る必要がある。さらに抗原型決定には市販のO血清およ
びH血清セットを用いるので、費用もかかり、操作も煩
雑である。
【0004】一方、最近では、オリゴヌクレオチドを用
いたDNAプローブ法、あるいはハイブリダイゼーショ
ン法が試みられるようになってきた。しかし、オリゴヌ
クレオチドを標識修飾したプローブにより、膜上、ある
いは他の支持体上でハイブリダイゼーションを行い、こ
れを検出する場合、細菌検査において十分な検出感度と
選択性を得るのが難しい。
【0005】そこで、本発明は、オリゴヌクレオチドを
核酸合成反応のプライマーとして機能させた遺伝子増幅
技術により、サルモネラ属菌の食中毒原因遺伝子を検出
するもので、簡便、迅速、かつ高感度な検査法を食中毒
検査、または下痢症検査に提供することにある。
【0006】
【課題を解決するための手段】本発明は、サルモネラ属
菌の食中毒原因遺伝子と選択的にハイブリダイズするオ
リゴヌクレオチドを作製し、このオリゴヌクレオチドを
プライマーとして遺伝子増幅に用い、食中毒症状を起こ
すサルモネラ属菌のみを選択的に検出することを特徴と
している。
【0007】プライマーとして用いるオリゴヌクレオチ
ドは、ネズミチフス菌のエンテロトキシン遺伝子(stn
遺伝子)をコードするヌクレオチド配列を標的とする場
合は、そのヌクレオチド配列と相補的となるように化学
合成されたオリゴヌクレオチドであって、合成ヌクレオ
チドが以下の配列群、 (5´)−CTTTGGTCGTAAAATAAGGCG−(3´) ・・・(配列番号1) (5´)−GAATCTCTCTGCTTTGGGCA−(3´) ・・・(配列番号2) (5´)−AGCTTTGGTCGTAAAATAAGG−(3´) ・・・(配列番号3) (5´)−TGCCCAAAGCAGAGAGATTC−(3´) ・・・(配列番号4) (5´)−CAAAGGGCTGGCGAAATACT−(3´) ・・・(配列番号5) (5´)−GATGCCCAAAGCAGAGAGAT−(3´) ・・・(配列番号6) または対応する相補的配列からなることを特徴とする。
【0008】また、ネズミチフス菌のinv A 遺伝子をコ
ードするヌクレオチド配列を標的とするときは、そのヌ
クレオチド配列と相補的となるように化学合成されたオ
リゴヌクレオチドであって、合成ヌクレオチドが以下の
配列群、 (5´)−GGGTCGTTCTACATTGACAG−(3´) ・・・(配列番号7) (5´)−TTCCCTTTCCAGTACGCTTC−(3´) ・・・(配列番号8) (5´)−CATCCGCATCAATAATACCG−(3´) ・・・(配列番号9) または対応する相補的配列からなることを特徴とする。
【0009】ここで、遺伝子増幅は、Saiki らが開発し
たPolymerase Chain Reaction 法(以下、略してPCR
法; Science 230 1350(1985))をもとに行っている。こ
の方法は、ある特定のヌクレオチド配列領域(本発明の
場合はサルモネラ属菌の食中毒原因遺伝子)を検出する
場合、その領域の両端の一方は+鎖を、他方は−鎖をそ
れぞれ認識してハイブリダイゼーションするようなオリ
ゴヌクレオチドを用意する。それを熱変性により1本鎖
状態にした試料核酸に対し、鋳型依存性ヌクレオチド重
合反応のプライマーとして機能させ、生成した2本鎖核
酸を再び1本鎖に分離し、再び同様な反応を起こさせ
る。この一連の操作を繰り返すことで2つのプライマー
に挟まれた領域は検出できるまでにコピー数が増大して
くる。
【0010】検体としては、臨床検査材料、例えば、糞
便、尿、血液、組織ホモジェネートなど、また、食品材
料でもよい。これら材料をPCRの試料として用いるに
は、材料中に存在する菌体から核酸成分を遊離させる操
作が前処理として必要となる。 しかし、プライマーが
ハイブリダイズできる核酸が数分子から数十分子以上存
在すれば,PCRは進むので、検査材料を溶菌酵素、界
面活性剤、アルカリ等で短時間処理するだけでPCRを
進行させるに十分な核酸量を含む試料液が調製できる。
【0011】本発明でプライマーとして用いられる上記
オリゴヌクレオチドは選択性や検出感度、および再現性
から考えて、10塩基以上、望ましくは15塩基以上の
長さを持ったヌクレオチド断片で、化学合成あるいは天
然のどちらでもよい。また、プライマーは、特に検出用
として標識されていなくてもよい。プライマーが規定し
ているサルモネラ属菌の食中毒原因遺伝子のヌクレオチ
ド配列における増幅領域は、50塩基から2, 000塩
基、望ましくは100塩基から 1,000塩基となれ
ばよい。
【0012】鋳型依存性ヌクレオチド重合反応には、耐
熱性DNAポリメラーゼを用いているが、この酵素の起
源については90〜95℃の温度で活性を保持していれ
ば、どの生物種由来でもよい。熱変性温度は90〜95
℃、プライマーをハイブリダイズさせるアニーリング操
作の温度は37〜65℃、重合反応は50〜75℃で、
この熱変性から重合反応までの操作を1サイクルとした
PCRを20から42サイクル行って、検体中に含まれ
るサルモネラ属菌の食中毒原因遺伝子を増幅させる。
【0013】検出はPCRを終えた反応液をそのままア
ガロースゲル電気泳動にかけることで、増幅されたヌク
レオチド断片の存在、およびその長さが確認できる。
【0014】その結果から、検体中にプライマーが認識
すべき配列を持ったヌクレオチドが存在しているかどう
かを判定できる。この判定は、そのままサルモネラ属菌
の食中毒原因遺伝子の有無を判定するものとなる。増幅
されたヌクレオチド断片の検出には、その他の電気泳動
やクロマトグラフィーも有効である。
【0015】また、上記の配列番号1〜9の配列の1つ
を有するオリゴヌクレオチドをプローブとして機能さ
せ、膜上あるいはその他支持体上の標的ヌクレオチド配
列を選択的に検出してもよい。この場合、オリゴヌクレ
オチドは標識物で修飾するのが好ましい。
【0016】
【作用】本発明は、オリゴヌクレオチドを核酸合成反応
のプライマーとして機能させた遺伝子増幅技術によりサ
ルモネラ属菌の食中毒原因遺伝子を検出するもので、簡
便、迅速かつ高感度な検出ができる。
【0017】
【実施例】
[実施例1:サルモネラ属菌(ネズミチフス菌)のstn
遺伝子の検出] (実験例1)検体の調製 サルモネラ属菌は表1−1〜1−7の縦の見出しに示し
た総計174株を用いた。これらの菌株は、食中毒事例
株で、食中毒患者の下痢便、嘔吐物、原因食品等から分
離されたものである。各菌株をブレインハートインフュ
ージョン培地(BBL社製)に接種し、37℃の好気的
条件下で終夜振とう培養を行った。各菌株培養液を10
mMトリスー塩酸緩衝液pH7.5(以下TE緩衝液)
で希釈し、95℃で10分間の加熱処理を行った後、こ
れらを遠心し、その上清を検体とした。
【0018】プライマーの合成 ネズミチフス菌(S.typhimurium )のstn 遺伝子の塩基
配列(Chopra, A,K.,et al., Microbial Pathogenesis
16, 85-98(1994) )から、請求項第2項に示した配列
(配列番号1〜6)を選び、それと同じ配列を持つオリ
ゴヌクレオチドを化学合成した。化学合成はサイクロン
プラスDNA合成装置(ミリジェン/バイオリサーチ社
製)を用い、βーシアノエチルフォスホアミダイト法に
より行った。合成したオリゴヌクレオチドの精製はC18
逆相カラムを用いた高速液体クロマトグラフィーで行っ
た。
【0019】PCR 前記検体液3μl を用い、それに滅菌蒸留水16.05
μl 、10x反応用緩衝液3μl、dNTP溶液4.8
μl、プライマー(A)1.5μl、プライマー(B)
1.5μl、および耐熱性DNAポリメラーゼ0.15
μlを加えて、全量30μlの反応液を調製した。この
反応液の入った容器にミネラルオイル(SIGMA 社製)を
50μl加え、反応液上に重層した。
【0020】各使用した溶液の内容、およびプライマー
(A)と(B)の組合せは次のとおりである。 10x反応用緩衝液: 500mM KCl, 100mM Tris-HCl pH8.3,
15mM MgCl2 0.1%(W/V) ゼラチン dNTP溶液: dATP, dCTP, dGTP, dTTPを混合させたも
ので各終濃度が1.25mM プライマー(A)および(B):前述した化学合成精製
品の各水溶液 (濃度3.75 OD/ml) プライマーの組合せ: 前述の化学合成精製品を下表に
示した組合せで使用した(1〜6は配列番号を示す)。
【0021】 プライマー(A) プライマー(B) 1 4 2 5 3 6 耐熱性DNAポリメラーゼ: Taq DNAポリメラー
ゼ(5 unit/ml; Perkin Elmer Cetus社製)。
【0022】反応条件は、次のとおりである。 熱変性: 94℃、1分 アニーリング: 55℃、1分 重合反応: 72℃、1分 熱変性からアニーリングを経て重合反応に至る過程を1
サイクル(所要時間5.7 分)とし、これを35サイクル
(総所要時間約3時間)行った。これらの操作は、DN
Aサーマルサイクラー(Perkin Elmer Cetus社製)に上
記反応条件をプログラムして行った。
【0023】検出 反応液から増幅されたヌクレオチド断片を検出するた
め、アガロースゲル電気泳動を以下のように行った。
【0024】アガロースゲルはゲル濃度3%(W/V )と
し、臭化エチジウム(0.5 μg/ml)を含むものを用い
た。泳動の条件は定電圧100V、30分で行った。操
作方法ならびに他の条件は、Manatis 等著 Molecular C
loning 第2版(1989)に記載されている技法で行った。
反応液の他に分子量マーカーの泳動も同時に行い、相対
移動度の比較によりヌクレオチド断片の長さを算出し
た。
【0025】結果 前述したように、S.typhimurium のstn 遺伝子は、すで
に塩基配列が決定されており、この遺伝子の相補鎖はヒ
ドロゲナーゼの調節遺伝子(hyd G の一部およびhyd H
)であるので、stn 遺伝子の塩基配列はサルモネラ属
のそれぞれの菌種に普遍的に存在すると考えられる。し
たがって、本発明のオリゴヌクレオチドをPCRのプラ
イマーとして使用すると、増幅されるヌクレオチド断片
の大きさは容易に推定できる。
【0026】それによるとプライマー1と4の組合せを
用いた場合には、260塩基の長さのヌクレオチドが増
幅されてくるはずである。同様にプライマー2と5、お
よびプライマー3と6を用いた場合には、それぞれ22
4塩基および264塩基の長さのヌクレオチドが増幅さ
れてくるはずである。
【0027】これらの推定値と増幅されたヌクレオチド
の長さが一致した場合、各プライマーの組み合わせはst
n 遺伝子の標的としている領域を正しく増幅していると
判断し、表1−1〜7中に”+”と記入した。一方、ヌ
クレオチドの増幅がみられなかったものには”−”を記
入した。表1−1〜7から明らかなように試験された全
てのサルモネラ属菌のstn 遺伝子が正しく検出されてい
ることがわかる。
【0028】(実験例2)実験例1で得られた結果がst
n 遺伝子をもつサルモネラ属菌に対して、選択的なもの
かどうかを確かめるため、臨床検査において検査対象と
なるサルモネラ属菌以外の食中毒菌または下痢症菌等の
遺伝子(表2−1〜2−12の299株)について本発
明のプライマーが反応するかどうか調べた。とりわけ、
従来法ではサルモネラ属菌との鑑別が困難なCitrobacte
r 属菌との鑑別が可能かを検討した。
【0029】方法は実験例1に示したものと同じである
が、表2中のClostridium perfring ens 、Campylobacte
r jejuni、Campylobacter coli、 Bacteroides fragili
s 、Bacteroides vulgatus、Lactobacillus acudophilu
s およびBifidobacterium ad olescentisについては、3
7℃、嫌気的条件下で培養を行い、Neisseria gonorr ho
eae 、およびNeisseria meningitidisについては3−1
0%CO2 存在下で培養した。また、ヒト胎盤由来DN
A(Human placenta DNA)は1μg/mlの濃度のもの
を調整し、これも同様にPCRを行わせた。
【0030】結果を表2に示す。本発明のオリゴヌクレ
オチド1〜6をプライマーとして用いた場合、サルモネ
ラ属菌のDNAを除いて、各種細菌のDNAおよびヒト
胎盤由来DNAを増幅することはなかった。とくにサル
モネラ属菌とは系統的にも近縁で、しかも従来法では鑑
別困難なCitrobacter 属菌のDNAとは極一部の菌株を
除いて反応しなかった(Citrobacter 属被検菌株61中
93%以上の一致率を示した)。したがって、本発明の
オリゴヌクレオチド、すなわちプライマーはサルモネラ
属菌にのみ特異的に反応するものであり、信頼性の高い
ものと断言できる。
【0031】なお、本発明の実施例で用いているアガロ
ースゲル電気泳動を前述の条件で行えば、100塩基対
以下のヌクレオチドであれば、5から10塩基対、ま
た、100から500塩基対の範囲のヌクレオチドであ
れば、10から20塩基対のヌクレオチドの長さの違い
を区別可能である。さらに、アガロースゲルの代わりに
ポリアクリルアミドゲルを使用することで、ヌクレオチ
ドの長さの測定精度を向上させることができ、stn 遺伝
子の特異的検出における信頼度は、さらに高まるものと
考えられる。
【0032】[実施例2:サルモネラ属菌のinv A 遺伝
子の検出] (実験例1)検体の調製 実施例1と同様の手法で検体を調整した。
【0033】プライマーの合成 サルモネラ属菌のinv A 遺伝子の塩基配列(Galan, J.
E.,et al.,J.Bacteriol.174,4338-4349(1992))から、
請求項第3項に示した配列(配列番号7〜9)までを選
び、それと同じ配列を持つオリゴヌクレオチドを化学合
成した。化学合成および合成したオリゴヌクレオチドの
精製は実施例1と同様の方法で行った。
【0034】PCRプライマーとして下記の組合わせの
ものを使用した以外は、実施例1と同様の手法で行った
(7〜9は配列番号を示す)。
【0035】 プライマー(A) プライマー(B) 7 8 7 9 検出 実施例1と同様の手法で行った。
【0036】結果 前述したように、サルモネラ属菌のinv A 遺伝子は、す
でに塩基配列が決定されており、したがって、本発明の
オリゴヌクレオチドをPCRのプライマーとして使用す
ると、増幅されるヌクレオチド断片の大きさは容易に推
定できる。
【0037】それによるとプライマー7と8の組合せを
用いた場合には、378塩基の長さのヌクレオチドが増
幅されてくるはずである。同様にプライマー7と9を用
いた場合には、343塩基の長さのヌクレオチドが増幅
されてくるはずである。
【0038】これらの推定値と増幅されたヌクレオチド
の長さが一致した場合、各プライマーの組み合わせはin
v A 遺伝子の標的としている領域を正しく増幅している
と判断し、表1−1〜7中に”+”と記入した。一方、
ヌクレオチドの増幅がみられなかったものには”−”を
記入した。表1−1〜7から明らかなように試験された
全てのサルモネラ属菌のinv A 遺伝子が正しく検出され
ていることがわかる。 (実験例2)実験例1で得られた結果がinv A 遺伝子を
もつサルモネラ属菌に対して、選択的なものかどうかを
確かめるため、実施例1と同様の手法で臨床検査におい
て対象となるサルモネラ属球菌以外の食中毒菌または下
痢症菌等の遺伝子について本発明のプライマーが反応す
るかどうか調べた。
【0039】表2に示すように、使用したプライマーは
食中毒菌DNAをはじめとする種々のDNAのについて
も、極一部のDNAを除いて増幅することはなかった。
したがって、本発明のオリゴヌクレオチド、すなわちプ
ライマーはinv A 遺伝子をもつサルモネラ属菌にのみ、
選択的に反応するものと断言できる。
【0040】
【表1−1】
【0041】
【表1−2】
【0042】
【表1−3】
【0043】
【表1−4】
【0044】
【表1−5】
【0045】
【表1−6】
【0046】
【表1−7】
【0047】
【表2−1】
【0048】
【表2−2】
【0049】
【表2−3】
【0050】
【表2−4】
【0051】
【表2−5】
【0052】
【表2−6】
【0053】
【表2−7】
【0054】
【表2−8】
【0055】
【表2−9】
【0056】
【表2−10】
【0057】
【表2−11】
【0058】
【表2−12】
【0059】
【発明の効果】本発明ではPCR法を用いたことで、サ
ルモネラ属菌の検出において、遺伝子増幅作用による高
い検出感度と、2つあるいは、それ以上のプライマーで
反応が規定されることによる高い選択性を得ることがで
きる。
【0060】また、高い検出感度のため多量の検体を必
要とせず、検体の前処理が簡便で済む。しかも、反応時
間が短く、検出も簡単な機材で済み、操作も容易なため
同定までの時間を大幅に短縮できる。例えば、実施例で
は、反応時間が約3時間、検出にかかる操作が30分で
ある。
【0061】また、検出にアガロースゲル電気泳動と臭
化エチジウムによる核酸染色法を用いることで、プライ
マー等を標識せずに検出が行え、しかも、核酸の長さが
確認できるので、結果の信頼性が高いものとなる。
【0062】食中毒菌としてのサルモネラ属菌を検出す
る場合には、サルモネラ属に属する全ての菌種が対象と
なるので、個々の種あるいは個々の血清型のサルモネラ
菌を逐一検出する方法に比べて、本発明のようにサルモ
ネラ属菌全てを検出できるような試薬もしくは検出法
は、より迅速・簡便な方法であり、非常に効果的な検出
法となる可能性が大である。
【0063】
【配列表】
配列番号(SEQ ID NO);1 配列の長さ 21塩基 配列の型 核酸 鎖の数 一本鎖 トポロジー 直鎖状 配列の種類 Genomic DNA ハイポセティカル配列 NO アンチセンス NO 起源 Salmonella typhimurium 配列の特徴 特徴を決定した方法 S 配列 CTTTGGTCGTAAAATAAGGCG
【0064】配列番号(SEQ ID NO);2 配列の長さ 20塩基 配列の型 核酸 鎖の数 一本鎖 トポロジー 直鎖状 配列の種類 Genomic DNA ハイポセティカル配列 NO アンチセンス NO 起源 Salmonella typhimurium 配列の特徴 特徴を決定した方法 S 配列 GAATCTCTCTGCTTTGGGCA
【0065】配列番号(SEQ ID NO);3 配列の長さ 21塩基 配列の型 核酸 鎖の数 一本鎖 トポロジー 直鎖状 配列の種類 Genomic DNA ハイポセティカル配列 NO アンチセンス NO 起源 Salmonella typhimurium 配列の特徴 特徴を決定した方法 S 配列 AGCTTTGGTCGTAAAATAAGG
【0066】配列番号(SEQ ID NO);4 配列の長さ 20塩基 配列の型 核酸 鎖の数 一本鎖 トポロジー 直鎖状 配列の種類 Genomic DNA ハイポセティカル配列 NO アンチセンス NO 起源 Salmonella typhimurium 配列の特徴 特徴を決定した方法 S 配列 TGCCCAAAGCAGAGAGATTC
【0067】配列番号(SEQ ID NO);5 配列の長さ 20塩基 配列の型 核酸 鎖の数 一本鎖 トポロジー 直鎖状 配列の種類 Genomic DNA ハイポセティカル配列 NO アンチセンス NO 起源 Salmonella typhimurium 配列の特徴 特徴を決定した方法 S 配列 CAAAGGGCTGGCGAAATACT
【0068】配列番号(SEQ ID NO);6 配列の長さ 20塩基 配列の型 核酸 鎖の数 一本鎖 トポロジー 直鎖状 配列の種類 Genomic DNA ハイポセティカル配列 NO アンチセンス NO 起源 Salmonella typhimurium 配列の特徴 特徴を決定した方法 S 配列 GATGCCCAAAGCAGAGAGAT
【0069】配列番号(SEQ ID NO);7 配列の長さ 20塩基 配列の型 核酸 鎖の数 一本鎖 トポロジー 直鎖状 配列の種類 Genomic DNA ハイポセティカル配列 NO アンチセンス NO 起源 Salmonella typhimurium 配列の特徴 特徴を決定した方法 S 配列 GGGTCGTTCTACATTGACAG
【0070】配列番号(SEQ ID NO);8 配列の長さ 20塩基 配列の型 核酸 鎖の数 一本鎖 トポロジー 直鎖状 配列の種類 Genomic DNA ハイポセティカル配列 NO アンチセンス NO 起源 Salmonella typhimurium 配列の特徴 特徴を決定した方法 S 配列 TTCCCTTTCCAGTACGCTTC
【0071】配列番号(SEQ ID NO);9 配列の長さ 20塩基 配列の型 核酸 鎖の数 一本鎖 トポロジー 直鎖状 配列の種類 Genomic DNA ハイポセティカル配列 NO アンチセンス NO 起源 Salmonella typhimurium 配列の特徴 特徴を決定した方法 S 配列 CATCCGCATCAATAATACCG
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 G01N 33/566 G01N 33/569 F 33/569 9162−4B C12N 15/00 ZNAA //(C12Q 1/04 C12R 1:42)

Claims (4)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 検体中におけるサルモネラ属菌(Salmon
    ella spp. )の食中毒原因遺伝子をコードするヌクレオ
    チド配列を標的とし、そのヌクレオチド配列と相補的と
    なるように化学合成されたオリゴヌクレオチドであっ
    て、合成ヌクレオチドが配列番号1〜9の配列群、また
    は対応する相補的配列からなることを特徴とするオリゴ
    ヌクレオチド。
  2. 【請求項2】 サルモネラ属菌(Salmonella spp. )の
    食中毒原因遺伝子がネズミチフス菌(Salmonella typh
    imurium )のエンテロトキシン遺伝子(sth遺伝子)で
    あって、その合成ヌクレオチドが配列番号1〜6の配列
    群、または対応する相補的配列からなる請求項1記載の
    オリゴヌクレオチド。
  3. 【請求項3】 サルモネラ属菌(Salmonella spp. )の
    食中毒原因遺伝子がネズミチフス菌(Salmonella typh
    imurium )のinv A 遺伝子であって、その合成ヌクレオ
    チドが配列番号7〜9の配列群、または対応する相補的
    配列からなる請求項1記載のオリゴヌクレオチド。
  4. 【請求項4】 請求項1〜3項に記載された各オリゴヌ
    クレオチドの配列のうち増幅されるべきヌクレオチド配
    列の両端を規定する2以上のオリゴヌクレオチドを鎖長
    反応のプライマーとして機能させ、標的ヌクレオチド配
    列を選択的に増幅させることを特徴とする方法であっ
    て、 (a )検体中の1本鎖状態の標的ヌクレオチド配列に前
    記プライマーをハイブリダイズさせ、4種のヌクレオチ
    ドの重合反応により鎖長反応を行わせ、 (b )得られた2本鎖標的ヌクレオチド配列を1本鎖に
    分離した場合、その相補鎖は更なる鎖長反応の鋳型とし
    て機能し、 (c )前記プライマーによる同時の鎖長反応、プライマ
    ー鎖長生成物の鋳型からの分離、そして更なるプライマ
    ーによるハイブリダイゼーションを繰り返すことによ
    り、特定のヌクレオチド配列が増幅され、増幅されたヌ
    クレオチド断片を検出し、 (d )その結果、前記検体中に認識されるべき配列が存
    在しているか否かを判定することでの検出を行うことを
    特徴とするサルモネラ属菌の検出方法。
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