JPH08504588A - 改変クチナーゼ、dna、ベクター及び宿主 - Google Patents

改変クチナーゼ、dna、ベクター及び宿主

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JPH08504588A JP6514770A JP51477094A JPH08504588A JP H08504588 A JPH08504588 A JP H08504588A JP 6514770 A JP6514770 A JP 6514770A JP 51477094 A JP51477094 A JP 51477094A JP H08504588 A JPH08504588 A JP H08504588A
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Abstract

(57)【要約】 酵素表面の疎水性が増すようにアミノ酸配列を改変した、改善された脂肪分解活性を示す真核生物クチナーゼ変異体を提供する。特に、Fusarium sola ni pisiクチナーゼの変異体を提供する。

Description

【発明の詳細な説明】 改変クチナーゼ、DNA、ベクター及び宿主技術分野 本発明は一般に、脂肪分解酵素の分野に関する。本発明はとりわけ、組換えD NA技術により改変した脂肪分解酵素、その産生方法、及び特に酵素洗剤組成物 でのその使用に関する。背景及び従来技術 脂肪分解酵素は、トリグリセリドを遊離脂肪酸やジグリセリド、モノグリセリ ド、場合によってはグリセロールに加水分解できる酵素である。前記酵素は更に 、より複雑なエステル(例えば植物のクチン層又は皮脂)を分解し得る。脂肪分 解酵素は、業界ではトリグリセリドのエステル交換やエステル合成のような種々 の酵素法で使用されている。前記酵素は更に、洗剤製品の脂肪除去性を改善する ために洗剤組成物で使用されている。 最も広範に使用されている脂肪分解酵素は、リパーゼ(EC3.1.1.3) である。例えば、ヨーロッパ特許出願公開第258 068号及びヨーロッパ特 許出願公開第305 216号(共にNovo Nordisk)は共に、rD NA技術による異種宿主微生物を介した真菌リ パーゼの産生、特にThermomyces lanuginosus/Hum icola lanuginosa に由来するリパーゼの産生を記載している。 ヨーロッパ特許出願公開第331 376号(Amano)は、Pseudom onas cepacia 由来のリパーゼのアミノ酸配列を含め、リパーゼ、並 びにそのrDNA技術による産生及び使用を記載している。rDNA技術により 産生されるリパーゼの別の例はWO−A−89/09263号やヨーロッパ特許 出願公開第218 272号(共にGist−Brocades)に記載されて いる。リパーゼやその改変に関する刊行物が多数あるにもかかわらず、現在のと ころ、Humicola lanuginosa由来のリパーゼだけが洗剤製品 用添加剤としてLipolase(登録商標)の商品名で広く市販されている。 リパーゼの特徴は界面で活性を示すことである。これは、完全に溶解した基質 よりも、界面又はミセルを形成した基質への酵素活性が遥かに高いことを意味し ている。界面活性は、基質濃度が基質の臨界ミセル濃度(CMC)よりも高くな って、界面が形成されたときに脂肪分解活性の急増となって表れる。実験では、 この現象を酵素活性対基質濃 度のグラフで非連続性として観察することができる。 リパーゼの界面での活性化機構は、リパーゼ分子のタンパク質構造のコンホー メーション変化によって解明されてきた。遊離した未結合の状態では、らせん状 リッド(lid)が触媒結合部位を包囲している。脂質基質との結合時には、リッ ドが移動して、触媒部位が露出する。らせん状リッドは、脂質界面と相互作用し て、酵素を界面と結合した状態のままにするとも考えられている。 WO−A−92/05249号(Novo Nordisk)は、脂質接触領 域が改変された遺伝子工学的改変リパーゼ、特にHumicola lanug inosa 由来のリパーゼを開示している。脂質接触領域は本明細書では、活性 形のときにらせん状リッドにより覆われた表面と定義する。改変は、脂質接触領 域の1個以上のアミノ酸残基を欠失又は置換して、静電荷を増加させ、及び/又 は脂質接触領域の疎水性を減少させ、又は脂質接触領域の表面コンホーメーショ ンを変えることからなる。これは、脂質接触領域の1個以上の陰電荷アミノ酸残 基を欠失させ、又はこれらの残基を中性又はより陽性電荷のアミノ酸で置換し及 び/又は脂質接触領域の1個以上の中性アミノ酸残基 を陽電荷アミノ酸で置換し、及び/又は脂質接触領域の1個以上の親水性アミノ 酸残基を欠失させ、又はこれらの残基を疎水性アミノ酸で置換することにより達 成される。 クチナーゼは、ろうエステル加水分解酵素の一種である(EC3.1.1.5 0)。これらの酵素は、植物で葉や茎の保護膜として生じるエステル化長鎖脂肪 酸/脂肪アルコール網状体のクチンを分解し得る。更には、前記酵素はある程度 の脂肪分解活性を有し、即ちトリグリセリドを加水分解し得る。従って、前記酵 素は、特殊なリパーゼとみなすことができる。しかしながら、クチナーゼは、リ パーゼとは異なり実質的な界面での活性を示さない。 クチナーゼは、植物(例えば花粉)、細菌及び真菌のような多数の産生源から 得ることができる。クチナーゼは、その脂肪分解性のために、酵素洗剤組成物の 成分として提案されている。例えば、WO−A−88/09367号(Gene ncor)は、界面活性剤と実質的に純粋な細菌クチナーゼ酵素とを組み合わせ た効果的な洗浄組成物の製造を提案している。グラム陰性菌Pseudomon as putida ATCC 53552から得たクチナーゼを含む洗剤組成 物が開示されている。しかしながら、 より最近のヨーロッパ特許出願公開第476 915号(Clorox)では、 従来の方法を使用した場合、リパーゼと称する前記酵素は織物の油汚れ除去に対 して他のリパーゼほどの効果はないと開示されている。 最近、Fusarium solani pisi由来のクチナーゼの三次元 構造が解明された(Martinez等(1992)Nature 356,6 15−618)。このクチナーゼが触媒結合部位を覆うらせん状リッドを持たな いことが知見された。その代わり、活性部位のセリン残基が溶媒とアクセスし得 るように思える。これらの知見は、リパーゼの界面での活性化機構に関する現在 の理論を確定するように思える。 Fusarium solani pisi由来のクチナーゼ遺伝子はクロー ニングされ、配列決定されている(Ettinger等(1987)Bioch emistry 26,7883−7892)。WO−A−90/09446号 (Plant Genetics Systems)は、E.coliでの前記 遺伝子のクローニングや産生を記載している。クチナーゼは、クチナーゼと基質 との界面の存在下及び不在下で、水性及び非水性媒質中のエ ステルの合成や加水分解を効果的に触媒し得る。その一般的な安定性に基づき、 このクチナーゼを使用して、洗濯洗剤のような洗浄剤や、化粧品組成物やシャン プーのような他の特定の脂肪溶解製剤を製造することができる。経済的に可能な 酵素産生方法も、クチナーゼを含む特定の酵素洗剤組成物も開示されていない。 この特徴のため、即ち界面での活性がないために、本明細書中ではクチナーゼ を、実質的に界面で活性を示さない脂肪分解酵素と定義する。従って、クチナー ゼは、触媒結合部位を覆うらせん状リッドを持たない点が従来のリパーゼと異な る。 前述したように、現在のところ、Humicola lanuginosa由 来のリパーゼだけが洗剤製品用添加剤としてLipolase(登録商標)の商 品名で広く市販されている。Henrik Malmosは、Chemistr y and Industry 1990,183−186ページに記載する論 文で、洗濯プロセス中のリパーゼ活性は一般に低く、Lipolase(登録商 標)も例外でないことは周知であると指摘している。乾燥プロセス中に、織物の 含水率が低下すると、酵素は活性を取り 戻し、脂肪汚れは加水分解される。次の洗濯サイクル中に、加水分解された物質 が除去される。これで、リパーゼ作用が1回目の洗濯サイクルの後は低いのに、 以後のサイクルで有意となる理由の説明もつく。従って、洗濯プロセス中に有意 な活性を示す脂肪分解酵素が更に必要である。 クチナーゼ、特にFusarium solani pisi由来のクチナー ゼが明らかな洗濯中(in-the-wash)作用を示すことが知見された。しかしなが ら、洗濯中脂肪分解活性の改善されたクチナーゼやこのような酵素の産生方法が 更に必要である。 本発明の目的は、性能、特に洗濯中脂肪分解活性を改善するように改変された クチナーゼを提供することである。 驚くべきことに、真核生物クチナーゼ酵素、特にFusarium sola ni pisiColletotrichum capsiciColle totrichum gloeosporiodes 、及びMagnaport he grisea 由来のクチナーゼの脂肪分解活性が、酵素表面の疎水性が増 すようにアミノ酸配列を改変することにより改善され得ることが知見された。発明の定義 酵素表面の疎水性が増すようにアミノ酸配列を改変した親クチナーゼのクチナ ーゼ変異体。好ましくは酵素表面の疎水性を増して、拡大された脂質接触領域を 形成した。発明の説明 本発明は、クチナーゼ酵素の変異体に関する。前述したように、クチナーゼは 、植物(例えば花粉)、細菌及び真菌のような多数の産生源から得ることができ る。親クチナーゼとして、即ち組換えDNA技術による改変のための本発明の出 発材料として使用すべきクチナーゼは、真核生物クチナーゼの群の中から選択す る。真核生物クチナーゼは、植物(例えば花粉)又は真菌のような種々の産生源 から得ることができる。 (真核生物)真菌クチナーゼの群は、葉特異性及び茎特異性と特異性の異なる 2つのファミリーからなるように思える。葉特異性クチナーゼは、酸性又は中性 pH最適値を有する傾向にあり、茎特異性クチナーゼはアルカリ性pH最適値を 有する傾向にある。アルカリ性pH最適値を有するクチナーゼは、ヘビィーデュ ーティ織物粉末/液体洗剤のようなアルカリ性ビルダー入り洗剤組成物での使用 により適し、酸性又は中性pH最適値を有するクチナーゼは、 ライトデューティ製品又はリンスコンディショナーだけでなく、工業洗浄製品に より適している。 以下の表Iに、4種の異なる茎特異性クチナーゼとそのpH最適値を示す。 表I 茎特異性クチナーゼの例 pH最適値 Fusarium solani pisi 9 Fusarium roseum culmorum 10 Rhizoctonia solani 8.5 Alternaria brassicicola(PNBase I) 9 野生型Fusarium solani pisiから誘導され得るクチナー ゼ(Ettinger等,1987)が本発明で特に好ましい。このクチナーゼ は、特定の洗剤組成物で使用すると明白な“洗濯中”作用を示す。 アミノ酸配列がFusarium solani pisi由来のクチナーゼ と高度の相同性を示すクチナーゼも、親クチナーゼ、即ち組換えDNA技術によ る改変のための本発明の出発材料として適している。Colletotr ichum capsiciColletotrichum gloeosp oriodes 、及びMagnaporthe grisea由来のクチナーゼ がその例である。図12にこれらのクチナーゼの部分アミノ酸配列を示す。高度 の相同性を示すことが知見され得る。 遺伝子改変によるFusarium solani pisiクチナーゼの改 良に代わる方法として、(プロ)クチナーゼをコードするFusarium s olanipisiColletotrichum capsiciCol letotrichum gloeosporiodes 、及びMagnapo rthe grisea cDNAに由来する5’及び3’DNAプローブや、他の脂肪分解酵素の保存 配列を認識するプローブを用いて他の真核生物に由来するクチナーゼをコードす る遺伝子情報を単離することができ、また必要とあればこれらのプローブを用い 、ポリメラーゼ連鎖反応、即ちPCR技術を使用してクチナーゼを産生する真核 細胞のメッセンジャーRNA(mRNA)由来のcDNAを増殖させることがで きる(例えばWO−A−92/05249号参照)。このようにして得られたク チナーゼコード化遺伝子を標準的な手順 に従ってE.coliにクローニングして発現した後に、クチナーゼの(脂肪) 汚れ除去性能を適切な条件下で試験する。このようにして、洗濯中性能の改善さ れた前記クチナーゼの天然変異体を多数得ることができる。更には、これらの天 然クチナーゼの配列は、Fusarium solani pisiクチナーゼ の別のタンパク質を製造するための優れた基礎となる。 “洗濯中”脂肪分解酵素の活性を決定する因子に関する新たな考えや、Fus arium solani pisi クチナーゼの3D構造の細心の検査に基づ いて、このクチナーゼ、また一般にクチナーゼの性能を組換えDNA技術で改善 するための幾つかの可能性を見出した。 クチナーゼは基本的にLipolase(登録商標)のようなリパーゼとは異 なるので、クチナーゼ/基質(脂質界面)間の相互作用は基質と結合し得る疎水 性領域のリッド開放や露出とは異なる原理に基づく(Brzozowski等( 1991)Nature 351,491−494)。 本発明は、クチナーゼ分子が凝集し始めるほど大きい疎水性領域を改変クチナ ーゼの表面上に形成せずに基質との 相互作用を改善できるようにクチナーゼを改変できることを示している。疎水面 は、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン 、トリプトファン及びチロシンのような疎水性アミノ酸やメチオニン、量は少な くなるがグルタミン酸、グルタミン及びヒスチジンを導入することにより拡大し 得る。但し、これらのアミノ酸の疎水性側鎖はクチナーゼの疎水性コアに埋封し ないものとする。メチオニンは通常疎水性アミノ酸とみなさないが、特定位置で 取り込まれると、クチナーゼ分子表面の疎水性増加に効果的に作用し得る。 場合によっては、疎水性アミノ酸の他に帯電アミノ酸を導入して酵素の凝集を 回避することが有益であることが知見されている。驚くべきことに、リシンやア ルギニンのような陽電荷アミノ酸はクチナーゼ分子の特定位置に取り込まれると 、疎水性表面積を拡大し得ることも判明した。これは、リシンやアルギニンに存 在するメチレン基がクチナーゼ分子内に埋封されない位置に制限されるからであ る。リシン又はアルギニンを使用する利点は、メチレン基が露出して、脂質層と 相互作用し得る可能性がアミノ基又はイミド基により増大することである。 リシンやアルギニンは通常、疎水性アミノ酸とはみなされない。しかしながら 、これらの残基の側鎖を形成する原子は、脂質層と相互作用し得る多数の疎水性 原子を(メチレン部分中に)含んでいる。実際、リシン残基の疎水性部分の寸法 は、バリン残基の寸法に匹敵し得る。 クチナーゼの他の固有特性は陽電荷の導入により悪影響を受けるが、これは、 脂質層と相互作用するクチナーゼ分子の部分の表面又はこの部分に近い表面に相 殺(compensating)陰電荷を導入するか又は前記表面で陽電荷を欠失させること により相殺され得る。 活性部位周辺のFusarium solani pisiクチナーゼ表面の 疎水性を検査すると、疎水性が最適でないことが分かる。この領域内のこの特定 アミノ酸を改良するために、残基をより嵩高い疎水性残基で置換すべきである。 脂質分解酵素の構造と機能との関係を更に理解するために、このような幾つか の酵素の三次元(3D)構造を入念に研究した。これらの構造が文献に記載され ていない場合は、構造を分子モデル化技術により誘導した。 Rhizomucor mieheiリパーゼの3D構 造は、X線結晶法により確定している(Brady等(1990)Nature 343,767−770,Brzozowski等(1991)Nature 351,491−494,Derewenda等(1992)Biochem istry 31,1532−1541)。Ser−His−Aspプロテアー ゼ様触媒トリアッド部位に属する活性部位Ser 144を短いらせん状リッド (残基85−91)下に埋封する。活性部位Serが埋封されている構造を以下 では、酵素の“クローズド”コンホーメーションと称する。油−水界面での吸着 がらせん状リッドの移動と関係すると考えられている。この移動によって、活性 部位セリンは露出し、活性部位周辺の疎水性領域が増大する。“オープン”コン ホーメーションは、油−水界面で吸着される活性化酵素に相当すると考えられる 。 真菌Rhizomucor mieheiリパーゼの“クローズド”形態のC α−配位は、BrookhavenのProtein Data Bankに寄 託されている。綿密な計算法を使用して、Rhizomucor miehei リパーゼの全タンパク質配位(主鎖及び側鎖)を生成した。S.Wodak等( 1989)Protein Engineering 2,335−345に記載されている計算法を適用し て、Rhizomucor mieheiリパーゼのおおよその出発モデルを作 成した。この方法は、SYBYL分子モデル化ソフトウエアパッケージ(TRI POS associates,Inc.St.Louis,Missouri )で実施される。その後、BIOSYM分子モデル化ソフトウエアパッケージ( BIOSYM,San Diego,California)で実施されるよう なエネルギー最小化(EM)や分子力学(MD)技術を適用してモデルを修正し た。モデルのEM及びMD処理中に、知識をベースとするアプローチを適用した 。可能なエネルギー関数の詳細なエネルギー項(terms)や既知の構造基準につ いて、モデルを同時に最適化した。モデル品質を、水素結合の数や品質、二次構 造要素での水素結合パターン、ペプチド単位の配向、主鎖二面角の値、芳香族基 の相互作用角及びキャビティー寸法のような基準により評価した。更には、不適 切に埋封された電荷、極端に露出した疎水性残基、及びジスルフィド架橋のエネ ルギー的に好ましくない位置についてモデルを検査した。関係する側鎖ロータマ ー(rotamers)は、Ponder & Richardsロータマーライブラリーから選択した(Ponder等( 1987)J.Mol.Biol.193,775−791)。このライブラリ ーからの特定側鎖ロータマーの最終的な選択は、前述したような構造基準の評価 を基準とした。MDを使用して、側鎖原子を所定位置にアニーリングした。既知 の構造特性との一貫性についてモデル構造を入念に検査し、EM及びMD計算に より構造特性を最適化すると、Rhizomucor mieheiリパーゼの 確実な全原子モデルを形成することができる。Rhizomucor mieh ei リパーゼの“オープン”コンホーメーションは、C10−トリグリセリドがリ パーゼの活性部位に結合するMDコンピューターシミュレーションを適用して得 られた。文献に記載のオープン構造のコンホーメーション特性(Derewen da等,Biochemistry(1992)31,1532−1541)と 入念に比較すると、このようにして得られた“オープン”コンホーメーションの コンピューターモデルが本質的に同一であることが判明した。 真菌Rhizomucor mieheiリパーゼの既知の3D構造を出発点 とし、SYBYL分子モデル化ソフ トウエアパッケージ(TRIPOS associates,Inc.St.L ouis,Missouri)のCOMPOSERモジュールで実施されるよう なルールベースの比較モデル化技術を適用して、Humicola langi nosa リパーゼの“オープン”及び“クローズド”3D構造を得た。得られたHumicola langinosa リパーゼモデルを、前述したのと同一の 計算手順で修正した。 真菌Rhizomucor mieheiリパーゼ及びHumicola l anginosa リパーゼの三次元(3D)構造を比較して、基質の酵素上への 吸着に関与するリパーゼ分子の部分を同定した。 Fusarium solani pisiクチナーゼの既知の3D構造を出 発点とし、SYBYL分子モデル化ソフトウエアパッケージ(TRIPOS a ssociates,Inc.St.Louis,Missouri)のCOM POSERモジュールで実施されるようなルールベースの比較モデル化技術を適 用して、Colletotrichum gloeosporiodes由来の クチナーゼの3D構造を得た。得られたColletotri chum gloeosporiodes クチナーゼモデルを、前述したのと同 一の計算手順で修正した。 予期に反して、以下の表IIに示す脂肪分解酵素の三次元構造から、Fusar ium solani pisi クチナーゼの残基116−120のCα−原子 を介する最小自乗適合(least-square fit)である特定ベクトル(a particular vector which is the least-square fit through the Cα-atoms)を規定でき ることが観察された。このベクトルは、基質との相互作用が生じる面と殆ど垂直 である。 起源の異なる数種の脂肪分解酵素の一次配列を比較すると、例えばFusar ium solani pisi クチナーゼのアミノ酸残基116−120が機 能相同性の程度が高い領域に位置するように思えることが以下の表IIから分かる 。脂肪分解酵素のコンセンサス配列Gly−(His/Tyr)−Ser−X− Glyを使用して整列し比較することができる。 従って、Fusarium solani pisiクチナーゼ分子のアミノ 酸残基116−120を介するベクトルを使用して、洗浄中活性の改善されたク チナーゼを得るためにアミノ酸改変すべきクチナーゼ分子の部分を限定した。以 下の表IIIは、表IIに示す脂肪分解酵素について隣接するアミノ酸の構造を示す 。 本発明の一態様により、酵素表面の疎水性が増すようにアミノ酸配列を改変し た、洗浄中脂肪分解活性の改善された改変クチナーゼ酵素を提供する。好ましく は脂質接触領 域に隣接する酵素の表面の疎水性を増して、広い脂質接触領域を形成した。 1個以上のアミノ酸残基を、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プ ロリン、フェニルアラニン、トリプトファン及びチロシン、メチオニン、グルタ ミン酸、グルタミン及びヒスチジンからなる群の中から選択されるアミノ酸残基 で置換することにより、クチナーゼの表面疎水性を増すことができる。バリン、 ロイシン、イソロイシン、フェニルアラニン、トリプトファン及びメチオニンが 好ましい。 表面疎水性を増すだけでなく、1個以上のリシン又はアルギニン残基を導入し て1個以上の陽電荷を導入するようにアミノ酸配列を改変することが有利である ことが知見された。 改変残基が、Fusarium solani pisiクチナーゼの残基1 16−120のCα−原子又は異なるクチナーゼの対応するCα−原子を介する 最小自乗適合であるベクトルと、該ベクトルに垂直で、残基117のCα−原子 又は異なるクチナーゼの対応するCα−原子を含んでいる面によって規定される 分子部分に位置することが 好ましい。 前述したように、Fusarium solani pisi由来のクチナー ゼの三次元構造は文献に記載されている。この場合、どの改変が本発明の範囲内 の改変となるかは明白である。特定クチナーゼの三次元構造が判明していない場 合には、脂肪分解酵素のコンセンサス配列Gly−(His/Tyr)−Ser −X−Glyによって誘導される既知配列のアミノ酸配列(図12参照)の整列 比較によって、本発明の範囲内で適切な改変を行うことが可能である。このプロ セスでも分子モデル化技術を使用することが好ましい。 本発明に従って産生したクチナーゼ変異体は、洗剤又は洗浄組成物の一部分と して使用すると酵素活性で利点を示し得る。特に、前記クチナーゼ変異体は、洗 濯プロセスの主サイクル中に改善された洗濯中性能を示すことが判明した。洗濯 プロセスの主サイクル中の洗濯中性能とは、酵素を含む洗剤組成物が、濃度、水 の硬度、温度に関しては通常の洗濯条件を用い、ヨーロッパタイプの自動洗濯機 により、1回の洗濯プロセスで汚れた織物からかなりの量の油汚れを除去できる ことを意味する。市販されている従来の 脂肪分解酵素Lipolase(登録商標)(Novo Nordisk製)は 、同一の条件下で油汚れに対して有意な洗濯中作用を示すとは思えないことに留 意すべきである。 酵素の油汚れへの洗濯中作用は、以下のアッセイを用いて評価することができ る。綿含量が10%未満の新しいポリエステル試験布を以下に示すような酵素非 含有洗剤製品を用いて予洗し、その後十分に濯ぐ。次いで、このような汚れてい ない布にオリーブ油又は他の適切な加水分解可能な油しみをつける。各試験布( 重量約1g)を100mlのポリスチレンビン内の30mlの洗液でインキュベ ートする。洗液は以下に示す洗剤製品を1g/l含んでいる。通常の30℃主洗 濯プログラムを用い、水を一杯に入れたMiele TMT洗濯機でビンを30 分間撹拌する。予め3LU/mlのクチナーゼ変異体を洗液に添加する。対照は 酵素を含んでいない。粉末洗剤の組成を以下に示す(重量%): エトキシル化アルコール非イオン界面活性剤 9.5 硫酸ナトリウム 38.6 炭酸ナトリウム 40.4 ケイ酸ナトリウム(Na2O:Si2O=2.4) 7.3 水 4.2 非イオン界面活性剤としては、C12−C15エトキシル化アルコール10.5− 13EOを使用したが、エトキシル化アルコール非イオン界面活性剤の種類は広 範囲で変動し得る。 洗濯した後に、布を冷水で十分に濯ぎ、冷風式回転乾燥機で乾燥し、残留脂肪 量を評価する。これは幾つかの方法で実施することができる。通常の方法は、試 験布をSoxhlet抽出装置中、石油エーテルで抽出し、溶媒を留去してから 計量し、布の最初の脂肪量の分数としての残留脂肪分パーセンテージを決定する ことである。 更に高感度の第2の方法では、臭素化オリーブ油を用いて、試験布を汚す(R ichards,S.,Morris,M.A.及びArklay,T.H.( 1968),Textile Research Journal 38,10 5−107)。次いで、各試験布を100mlのポリスチレンビン内の30ml の洗液でインキュベートする。次いで、通常の30℃主洗濯プログラムを用い、 水を一杯に入れた洗濯機で一連のビンを撹拌する。主洗濯の後、 試験布を冷水中で5秒間入念に濯ぐ。濯いだ直後に試験布を冷風式乾燥機で乾燥 する。乾燥後、X線蛍光スペクトル分析で布の臭素含量を測定して脂肪残量を決 定することができる。脂肪除去は、以下のように試験布に最初に存在していた量 のパーセンテージとして決定することができる。 前記式中、臭素bwは洗濯前の布上の臭素パーセンテージを示し、臭素awは洗濯後 の臭素パーセンテージを示す。 酵素活性の別の評価方法は、標準的な技術に従って460nmで反射率を測定 することからなる。 本発明では、改変、突然変異もしくは突然変異体酵素、又は酵素変異体は、突 然変異体遺伝子を発現している突然変異微生物によって産生された酵素を意味す る。(サイレント突然変異のみを含むもの以外の)突然変異体遺伝子は、直接的 又は間接的に誘導され、1カ所以上の場所で対応する親酵素の配列と異なるアミ ノ酸配列を有する酵素をコードする遺伝子を意味する。親酵素とは、対応する未 変化遺伝子の遺伝子産物を意味する。遺伝子のサイレント突然変異とは、遺伝子 のポリヌクレオチド配列で生じる変化又は 相違のうち、(コドン−アミノ酸関係での縮重(redundancy)のために)前記遺 伝子によってコードされる酵素のアミノ酸配列が変化しない場合を意味する。 突然変異体又は突然変異微生物とは、酵素に対する遺伝子が突然変異を起こし た親微生物又はその子孫である微生物を意味する。微生物のこのような突然変異 は、(a)既に親微生物に存在している対応遺伝子(親遺伝子)を突然変異させ るか、又は(b)他の起源から直接又は間接的に得た対応遺伝子を突然変異微生 物となるべき微生物に移入(導入)する(例えば遺伝子を突然変異させる)こと により実施され得る。宿主微生物は、その突然変異体遺伝子又は他の起源の移入 遺伝子が一部分を構成している微生物である。一般に、宿主微生物は、株又は種 源又は血統が親微生物と同一であっても異なってもよい。 本発明は特に、WO−A−90/09446号(Plant Genetic s Systems)に開示されているFusarium solani pi si クチナーゼ、またColletotrichum capsiciCol letotrichum gloeosporiodes 、及びMagnapo rthe grisea 由来 のクチナーゼの突然変異体形態を提供する。これらのクチナーゼ変異体は、rD NA技術で得た又は製造した遺伝子を含むrDNA改変微生物により産生され得 る。 Fusarium solani pisiクチナーゼの残基116−120 のCα−原子又は異なるクチナーゼの対応するCα−原子を介する最小自乗適合 であるベクトルと、該ベクトルに垂直で、残基117のCα−原子又は異なるク チナーゼの対応するCα−原子を含んでいる面とによって規定される分子部分に 位置するアミノ酸残基が同定されると、同定した1つ以上の位置に適切なアミノ 酸を導入することにより、例えばFusarium solani pisiク チナーゼ又はその相同体の配列に関する突然変異N712Kのように、アミノ酸 配列を改変することができる。 当業者には自明の通り、このような改変はクチナーゼの構造に影響する。明ら かに、活性部位周辺の静電荷にそれほど影響しない改変が好ましい。本発明者ら は酵素のコンホーメーションの不可避的な歪みと酵素活性増加の利点とのバラン スの必要レベルの理解を深めた。これにより、高い成功率で有望なクチナーゼ変 異体を予測して、製造する ことができる。 以下の表IVや明細書の他の箇所では、ペプチド配列のアミノ酸やアミノ酸残基 を以下に示す1文字及び3文字の略字で示す。 表IV A=Ala=アラニン V=Val=バリン L=Leu=ロイシン I=Ile=イソロイシン P=Pro=プロリン F=Phe=フェニルアラニン W=Trp=トリプトファン M=Met=メチオニン G=Gly=グリシン S=Ser=セリン T=Thr=トレオニン C=Cys=システイン Y=Tyr=チロシン N=Asn=アスパラギン Q=Gln=グルタミン D=Asp=アスパラギン酸 E=Glu=グルタミン酸 K=Lys=リシン R=Arg=アルギニン H=His=ヒスチジン 本明細書では、タンパク質のアミノ酸配列に存在する突然変異、従って突然変 異体タンパク質自体は、突然変異の位置及び種類により以下の略記法で、即ち突 然変異を受けた元のアミノ酸残基のアイデンティティー、突然変異の (配列番号による)部位、及び元のアミノ酸残基にとって代わるアミノ酸残基の アイデンティティーにより記載され得る。余分のアミノ酸が配列に挿入されると 、その位置は、正規の配列又は基準配列の挿入直前の残基の番号に1個以上の下 付き文字を付けて示す。 例えば、172位のアスパラギンがリシンで置換されたことを特徴とする突然 変異体はAsn172Lys又はN172Kで表す。(仮に)アスパラギンの後 にプロリンのような別のアミノ酸残基を挿入すると、Asn172AsnPro 又はN172NPで表すか、172a位を示す挿入残基を用いて*172aPと して表す。(仮に)同じ位置でアスパラギンが欠失すると、Asn172*又は N172*で表す。*は、実際の欠失によって存在しないとみなされる場合は欠 失を意味し、この位置に残基を有する他の配列又は基準配列との単なる比較又は 相同性によって存在しないとみなされる場合はアミノ酸残基の不在を意味する。 複数の突然変異は+記号で分けて表す。例えばN172K+S54I+A12 8Fは、アミノ酸配列の前記3つの位置の各々で前述したような置換による3つ の突然変異を 有する突然変異体タンパク質を表す。所望とあれば、以下の表に示す突然変異を 組み合わせてもよい。 以下の表Vは、Fusarium solani pisi由来のクチナーゼ の配列に基づく本発明のクチナーゼ変異体の特定の有用な例を示している。 本発明の好ましい変異体は、Fusarium solani pisiクチ ナーゼのA85F、N172K及びE201K、並びに他のクチナーゼの対応変 異体である。このような対応クチナーゼ変異体の一例は、例えばColleto trichum gloeosporiodes クチナーゼに由来するAsp1 72Lys、即ちD172K変異体である。 本発明の別の態様によれば、本発明のクチナーゼ変異体の産生方法を提供する 。天然クチナーゼを産生する微生物 は通常植物病原体であり、これらの微生物は改変クチナーゼ遺伝子用宿主細胞と しての作用にはあまり適さない。従って、rDNA法のために好ましい宿主微生 物内に移入することのできるrDNAベクターに、改変(プロ)クチナーゼをコ ードする遺伝子を取り込んだ。このため、WO−A−90/09446号に記載 のrDNAベクターと本質的に同様のrDNAベクターを使用することができる 。 天然クチナーゼを産生する微生物は、発酵法にはあまり適さない。発酵法の収 率を改善するため、改良されたクチナーゼをコードする遺伝子を、安い培地で急 速増殖し得、また多量のクチナーゼの合成や分泌が可能な微生物に移入すべきで ある。本発明のこのような適したrDNA改変(宿主微生物)は、細菌(とりわ けBacilliCorynebacteria,Staphylococc 及びStreptomyces)又は下等な真核生物(例えばSacchar omyces cerevisiae 及び関連種、Kluyveromyces marxianus 及び関連種、Hansenula polymorpha 及び関連種、並びにAspergillus属種)である。好ましい宿主微生物 は下等な真核生物である。何 故ならば、これらの微生物は、発酵法で非常によく酵素を産生分泌し、クチナー ゼ分子を解糖し得るからである。グリコシル化は、洗浄系でのクチナーゼの安定 性に寄与し得る。 本発明は更に、改変真核生物クチナーゼ遺伝子(例えばFusarium s olani pisi 由来の遺伝子)をクローニングrDNAベクターに導入し て得られる遺伝子材料、及び新しい宿主細胞の形質転換やクチナーゼ変異体遺伝 子の新しい宿主細胞での発現のための前記遺伝子材料の使用を提供する。 前記クチナーゼ変異体をコードするrDNA技術によって製造又は改変される ポリヌクレオチド、該ポリヌクレオチドを含むrDNAベクター、並びに前記ポ リヌクレオチド及び/又は前記rDNAベクターを含むrDNA改変微生物も本 発明で提供する。本発明は更に、改変真核生物クチナーゼをコードする対応ポリ ヌクレオチド(例えば成熟クチナーゼ変異体をコードする塩基配列を有し、最終 翻訳コドンの次に終結コドンが来るポリヌクレオチドであるが、場合によっては 成熟クチナーゼ変異体をコードするヌクレオチド配列のすぐ上流にこのクチナー ゼ変異体のプレプロ 又はプロ配列をコードするヌクレオチド配列を有する)を提供する。 このようなポリヌクレオチドでは、産生源の微生物から誘導される、クチナー ゼをコードするヌクレオチド配列を、少なくとも1個のコドン、好ましくはでき るだけ多くのコドンが‘サイレント’突然変異の対象に対し、新しい宿主に好ま れるコドンである、同等のアミノ酸残基をコードするコドンを形成するように改 変することにより、前記宿主の細胞内での使用時に、安定性の改善された導入遺 伝子用mRNAを提供することができる。 プロ又は成熟クチナーゼをコードするヌクレオチド配列の上流には、特定宿主 に適したシグナル又は分泌配列をコードするヌクレオチド配列が位置し得る。従 って、本発明の一実施態様は、クチナーゼ変異体又はその前駆体をコードするヌ クレオチド配列が内部に挿入されたrDNAベクターに関する。 ヌクレオチド配列は例えば、以下の配列から誘導され得る: (a)(例えばFusarium solani pisiで産生したプロプレ 又はプロクチナーゼの元のアミノ酸 配列をコードする)天然ヌクレオチド配列; (b)新しい宿主に好まれるコドンと、新しい宿主で安定なメッセンジャーRN Aを生じさせるヌクレオチド配列とからなり、依然として元のアミノ酸配列をコ ードする化学合成ヌクレオチド配列; (c)アミノ酸配列は異なるが、洗剤系で優れた安定性及び/又は活性を示す、Fusarium solanipisi クチナーゼをコードする前項a又はb に記載したヌクレオチド配列の一方に由来する遺伝子工学的に作成されたヌクレ オチド配列。 要するに、好ましい宿主のひとつで前述したようなクチナーゼ遺伝子をコード するヌクレオチド配列の発現を指令し得るrDNAベクターは好ましくは、以下 の成分を含んでなる: (a)成熟クチナーゼ、又はプレクチナーゼ、又は(選択される宿主細胞にとっ て好ましい)分泌シグナルのすぐ下流でプレ配列の少なくとも一部分が除去され た対応プレクチナーゼをコードする二本鎖(ds)DNA。但し、翻訳されるべ き遺伝子の部分がコドンATGで開始していない場合、ATGコドンを前に置く べきである。また、遺伝子 の翻訳部分は常に適切な終結コドンで終了すべきである; (b)クチナーゼをコードするds DNA(成分(a))のプラス鎖の上流に 位置する、(選択される宿主微生物に適した)発現レギュロン; (c)クチナーゼをコードするds DNA(成分(a))のプラス鎖の下流に 位置する、(選択される宿主微生物に適した)ターミネーター配列; (d1)選択される宿主のゲノム内へのds DNAの組み込みを容易にするヌ クレオチド配列、又は (d2)選択される宿主で適した複製起点; (e1)場合によっては(栄養要求性)選択マーカー。栄養要求性マーカーは、 栄養要求性マーカーのコード領域と欠陥プロモーターとからなり得る; (e2)場合によっては、選択される宿主での一前駆体形態のクチナーゼの成熟 及び/又は分泌に関与するタンパク質をコードするds DNA配列。 このようなrDNAベクターは更に、前述したようなポリヌクレオチドの上流 及び/又は下流に、クチナーゼの機能発現を容易にする別の配列を有し得る。栄 養要求性マーカーは、栄養要求性マーカーのコード領域と、欠陥プロモ ーター領域とからなり得る。 本発明の他の実施態様は、前述の種々のクチナーゼ変異体の一種の発酵による 産生である。このような発酵は、通常のバッチ発酵であっても、フェドバッチ( fed-batch)発酵であっても、連続発酵であってもよい。使用すべき方法の選択 は、宿主株や(公知の)好ましい下流処理(down stream processing)法に依存 する。従って、本発明は更に、本明細書に記載するようなクチナーゼ変異体の産 生方法を提供し、本方法は、クチナーゼのアミノ酸配列に作用する少なくとも1 つの突然変異をもたらすrDNA技術により製造した遺伝子を含むrDNA改変 微生物を発酵培養して、クチナーゼの活性を対応する親酵素と比べて改善し、微 生物により産生されたクチナーゼを発酵ブロスと分離するか又は微生物細胞を発 酵ブロスと分離することによりクチナーゼ変異体調製物を製造し、分離した細胞 を破壊し、物理的又は化学的な濃縮又は精製法により前記ブロスから又は前記細 胞からクチナーゼ変異体を濃縮又は部分精製する段階からなる。クチナーゼ変異 体が微生物によって発酵ブロス内に分泌され、酵素が濾過又は遠心分離による細 胞除去後にブロスから回収されるような条件を選択すること が好ましい。場合によっては、次いで、クチナーゼ変異体を所望の程度に濃縮、 精製することができる。これらの発酵法自体は微生物の特殊性を除けば、既知の 発酵技術や、通常使用されている発酵/下流処理装置を基本とし得る。 rDNA技術によりクチナーゼ変異体を産生し得る改変微生物の産生方法を更 に本発明で提供する。本方法は、微生物内に導入されるクチナーゼ変異体をコー ドする遺伝子が5’末端で、宿主微生物のシグナル又は分泌配列として機能的な (改変)プレ配列をコードする遺伝子断片と融合することを特徴とする。本発明 の別の態様では、クチナーゼ変異体遺伝子を含み、該遺伝子によってコードされ るクチナーゼ変異体を産生し得るrDNA改変微生物を提供する。rDNA改変 微生物では、天然クチナーゼをコードする遺伝子が元々存在するならば、これを 除去(例えば他の構造遺伝子で置換)することが好ましい。 本発明の別の態様では、本発明のクチナーゼ変異体を含む酵素洗剤組成物を提 供する。このような組成物は、クチナーゼ変異体及び通常洗剤系で使用されてい る他の成分(例えば洗剤組成物用添加剤、全配合洗剤及び例えばヨーロッパ特許 出願公開第258 068号に記載されいてい る既知の種類の洗浄組成物の成分類)を組み合わせたものである。特に、前記組 成物は、5〜60重量%、好ましくは20〜50重量%の洗浄力ビルダーと、0 .1〜50重量%の活性剤系とを含んでなり得る。活性剤系は、1種以上のアニ オン界面活性剤を0〜95重量%、1種以上の非イオン界面活性剤を5〜100 重量%含んでなる。 このような洗剤組成物の他の成分は、例えば英国特許出願公開第1 372 034号(Unilever)、米国特許第3 950 277号、米国特許第 4 011169号、ヨーロッパ特許出願公開第179 533号(Proct er & Gamble)、ヨーロッパ特許出願公開第205 208号及びヨ ーロッパ特許出願公開第206 390号(Unilever)、特開昭63− 078000号(1988)、1988年6月の調査レポート(Research Discl osure)29056号や、本明細書で引用した幾つかの明細書の各々に記載され ているような多数の既知の種類のいずれであってもよい。前記特許出願明細書は 全て、参考として本明細書に組み入れる。 本発明のクチナーゼ変異体は、任意の適切な形態で、即ち酵素の顆粒組成物、 溶液もしくはスラリーの形態で、又 は担体材料(例えばヨーロッパ特許出願公開第258 068号に記載の材料や 、Novo Nordisk製Savinase(登録商標)及びLipola se(登録商標))と共に洗剤組成物に有効に添加することができる。 クチナーゼ変異体の添加量は、洗剤組成物1g当たり例えば10〜20,00 0LU、好ましくは50〜2,000LUと広範囲で選択することができる。本 明細書でのLU、即ちリパーゼ単位は、ヨーロッパ特許出願公開第258 06 8号(Novo Nordisk)で定義されている通りである。 更に存在し得る他の酵素の場合も同様の規定を準用する。ヨーロッパ特許出願 公開第407 225号も参照されたい。 pIが10未満のプロテアーゼを選択し、このプロテアーゼをクチナーゼと共 に前記洗剤組成物に存在させると有利であり得る。ヨーロッパ特許出願公開第2 71 154号(Unilever)は、このようなプロテアーゼを多数記載し ている。クチナーゼ変異体と共に使用されるプロテアーゼは、場合によっては、 例えばBPN’型又は文献に開示されている多数の型のサブチリシンを包含し得 る。 これらのうち数種は既に、例えばヨーロッパ特許出願公開第130 756号又 はヨーロッパ特許出願公開第251 446号(共にGenentech);米 国特許第4 760 025号(Genencor);ヨーロッパ特許出願公開 第214 435号(Henkel);WO−A−87/04661号(Amg en);WO−A−87/05050(Genex);Thomas等(198 6/5)Nature 316,375−376及び(1987)J.Mol. Biol.193,803−813;Russel等(1987)Nature 328,496−500に記載の突然変異体プロテアーゼのように洗剤用途で 提案されている。 以下の実施例で本発明を更に詳しく説明する。核酸物質の遺伝子操作や分析で 使用した全ての技術は、特に明記しない限り本質的にSambrook等(19 89)が記載した方法で実施した。 添付図面の説明: 図1A: 合成Fusarium solani pisiクチナーゼ遺伝子の カセット1及び構成するオリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列。オリ ゴヌクレオチドトランジションをカセット配列に示す。小文字は読み取り枠外の ヌクレオチド位置を示す。 図1B: 合成Fusarium solani pisiクチナーゼ遺伝子の カセット2及び構成するオリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列。オリゴヌクレ オチドトランジションをカセット配列に示す。 図1C: 合成Fusarium solani pisiクチナーゼ遺伝子の カセット3及び構成するオリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列。オリゴヌクレ オチドトランジションをカセット配列に示す。小文字は読み取り枠外のヌクレオ チド位置を示す。 図1D: Fusarium solani pisiプレ−プロ−クチナーゼ をコードする合成クチナーゼ遺伝子のヌクレオチド配列。クチナーゼのプレ配列 、プロ配列及び成熟配列を示す。クローニングやオリゴヌクレオチドトランジシ ョンに使用する部位も示す。小文字は読み取り枠外 のヌクレオチド位置を示す。 図2: Fusarium solani pisiプロクチナーゼをコードす る配列を、E.coliphoAプレ配列の誘導体をコードする配列と連結する ための合成DNA断片のヌクレオチド配列。クローニングで使用する制限酵素部 位やリボゾーム結合部位(RBS)を示す。コードされたphoAシグナル配列 やクチナーゼ遺伝子の一部のアミノ酸配列も1文字コードで示す。 図3: インベルターゼプレ配列及び成熟Fusarium solani p isi クチナーゼのコード配列の融合点をコードするカセット8、SacI− cl I断片のヌクレオチド配列。 図4: pUR2740由来の0.2kb SalI−NruIの欠失によって 得られたプラスミドpUR2741は、pBR322の一部と、2μmプラスミ ドから誘導される酵母細胞における複製起点と、酵母leu2D遺伝子と、酵母 ga17プロモーターの制御下にある酵母インベルターゼシグナル配列コード領 域と植物α−ガラクトシダーゼ 遺伝子との融合物とを含んでなるE.coli−S.cerevisiaeシャ トルベクターである。 図5: プラスミドpUR7219は、pBR322の一部と、2μmプラスミ ドから誘導される酵母細胞における複製起点と、酵母leu2D遺伝子と、酵母 ga17プロモーターの制御下にある酵母インベルターゼシグナル配列コード領 域と成熟Fusarium solani pisiクチナーゼをコードする領 域との融合物とを含んでなるE.coli−S.cerevisiaeシャトル ベクターである。 図6: プラスミドpUR2740は、pBR322の一部と、2μmプラスミ ドから誘導される酵母細胞における複製起点と、酵母leu2D遺伝子と、酵母 ga17プロモーターの制御下にある酵母インベルターゼシグナル配列コード領 域と植物α−ガラクトシダーゼ遺伝子との融合物とを含んでなるE.coli− S.cerevisiae シャトルベクターである。 図7: exlAプレ配列及び成熟Fusarium solani pisi クチナーゼのコード配列の結合の型が異なるカセット5、6及び7のヌクレオチ ド配列。 図8: Aspergillus niger変異株awamoriゲノムDN Aの5.3kb SalI断片をpUC19のSalI部位に挿入して得られた プラスミドpAW14B。 図9: pAW14BのexlA読み取り枠を含むBspHI−AflII断片 を、Fusarium solani pisiプレ−プロ−クチナーゼコード 配列を含むBspHI−AflII断片で置換して得られたプラスミドpUR7 280。従って、プラスミドpUR7280は、A.niger変異株awam ori プロモータ及びターミネーターの制御下にあるFusarium sol ani pisi プレ−プロ−クチナーゼ遺伝子を含んでいる。 図10: A.nidulans amdS及びA.niger変異株awam ori pyrGの両方 の選択マーカーをpUR7280に導入して得られたプラスミドpUR7281 。 図11: Fusarium solani pisiクチナーゼ分子の概略図 。 図12: Fusarium solani pisiColletotri chum capsiciColletotrichum gloeospo riodes 、及びMagnaporthe grisea由来のクチナーゼの 部分アミノ酸配列であって、残基の位置を3D構造で示す。 図13: Fusarium solani pisiクチナーゼ及びクチナー ゼ変異体N172Kの洗濯中作用。 図14: Fusarium solani pisiクチナーゼ及びクチナー ゼ変異体E201Kの洗濯中作用。 図15: Fusarium solani pisiクチナーゼ及びクチナー ゼ変異体A85Fの洗濯中作用。参考文献 実施例1 Fusarium solani pisi プレ−プロ−クチナーゼをコードす る合成遺伝子の構築 本質的にヨーロッパ特許出願公開第407 225号(Unilever)に 記載の方法に従って、Fusarium solani pisiプレ−プロ− クチナーゼをコードする合成遺伝子を構築した。発表されているFusariu m solani pisi 遺伝子のヌクレオチド配列に基づいて(Solid ay等(1984)及びWO−A−90/09446号,Plant Gene tic Systems)、Fusarium solani pisiプレ− プロ−クチナーゼポリペプチドをコードする領域を含む完全合成DNA断片を設 計した。この合成クチナーゼ遺伝子は、元のFusarium solani pisi 遺伝子のヌクレオチド配列に比べて幾つかのヌクレオチド変化を含み、 これにより制限酵素認識部位が、コードされたアミノ酸配列に影響することなく 遺伝子内の好都合な位置に導入されている。全合成クチナーゼ遺伝子のヌクレオ チド配列を図1Dに示す。 合成DNAオリゴヌクレオチドから開始する3個の異な るカセットを集合させて合成クチナーゼ遺伝子を構築した。各合成DNAカセッ トは、最初にEcoRI部位を、最後にHindIII部位を備えている。Ap plied Biosystems 380A DNA合成機を用いてオリゴヌ クレオチドを合成し、ポリアクリルアミドゲル電気泳動で精製した。各カセット を構築するため、以下に示す手順を用いた。所定のカセットを構成する等モル量 (50pmol)のオリゴヌクレオチドを標準的な技術に従って混合し、5’末 端でリン酸化し、アニールし、結合した。得られた二本鎖DNA分子の混合物をEco RI及びHindIIIで切断し、アガロースゲル電気泳動でサイズ分画 し、電気溶出でゲルから回収した。得られた合成DNAカセットをpUC9の2 .7kb EcoRI−HindIII断片と結合し、Escherichia coli に形質転換した。適切なオリゴヌクレオチドプライマーを用いて幾つ かのクローンのEcoRI−HindIIIインサートを両方向で完全に配列決 定し、合成カセットの配列を確定した。この手順を用いて、pUR7207(カ セット1を含む、図1A)、pUR7208(カセット2を含む、図1B)及び pUR7209(カセット3を含む、図 1C)を構築した。最後に、pUR7207の2.9kb EcoRI−Apa I断片をpUR7208の0.2kb ApaI−NheI断片及びpUR72 09の0.3kb NheI−HindIII断片と結合させて、合成クチナー ゼ遺伝子を作成し、pUR7210を得た。このプラスミドは、Fusariu m solani pisi の完全プレ−プロ−クチナーゼをコードする読み取 り枠を含んでいる(図1D)。実施例2 Escherichia coli でのFusarium solani pi si (プロ)クチナーゼの発現 合成クチナーゼ遺伝子を用いて、WO−A−90/09446号(Plant Genetic Systems)に記載のものと機能的に同様のE.col 用発現ベクターを構築した。Fusarium solani pisiプロ クチナーゼをコードする合成遺伝子の部分の前に、適切なE.coli発現シグ ナル、即ち(i)誘導性プロモーター、(ii)リボソーム結合部位、及び(iii )翻訳開始コドンを提供し、またプロクチナーゼの細胞質膜からの送出に必要な 情報を提供するシグナル配列が位置する構 築物を設計した。 E.coli phoAシグナル配列の誘導体(Michaelis等、19 83)を合成クチナーゼ遺伝子のプロ配列と融合するための合成リンカーを設計 した(図2参照)。シグナルペプチドの開裂やプロクチナーゼの分泌を最適化す るため、このリンカーのヌクレオチド配列は、phoAシグナル配列の3個のC 末端アミノ酸残基(Thr−Lys−Ala)をAla−Asn−Alaに変換 し、クチナーゼプロ配列のN末端アミノ酸残基(Leu1、図1D参照)をAl aに変換するようなものであった。この構築により、クチナーゼのペリプラスム 間隙内への分泌は確実である(WO−A−90/09446号参照、Plant Genetic Systems)。 このような構築物を得るため、クチナーゼプレ配列とプロ配列の一部を含む6 9bp EcoRI−SpeI断片をpUR7210から取り出し、E.col phoAプレ配列の誘導体及びクチナーゼプロ配列の改変N末端アミノ酸残 基を提供する合成DNAリンカー配列(EcoRI−SpeI断片)で置換した (図2)。得られたプラスミドをpUR7250と名付け、これを使用して、リ ボソ ーム結合部位及びphoAシグナル配列コード領域に融合したプロクチナーゼコ ード領域を含む0.7kb BamHI−HindIII断片を単離した。この 断片をpMMB67EHの8.9kb BamHI−HindIII断片(Fu rste等、1986)と結合して、pUR7220を得た。このプラスミドで は、プロクチナーゼをコードする合成遺伝子をphoAシグナル配列の変種と融 合して、誘導性tacプロモーターの制御下に置く。 pUR7220を含むE.coli株WK6を、 0.017M KH2PO4 0.017M K2HPO4 12g/l バクト−トリプトン 24g/l バクト−酵母抽出物 0.4%グリセロール(v/v) からなる0.5リットルのIXTB培地(Tartof及びHobbs,198 8)を含む2リットルの振盪フラスコで増殖させた。 培養物を強く振盪しながら(150rpm)、100μg/mlのアンピシリ ンの存在下、25°C〜30℃で一晩増殖させた。610nmでのODは10〜 12であった。 次いで、IPTG(イソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシド)を添加し て、最終濃度を10μMとし、更に12〜16時間インキュベーションを継続し た。培養物から取り出した試料の分析判定で、生じた脂肪分解活性の量に更なる 顕著な増加が観察できなかったときには、細胞を遠心分離で収集し、最初の培養 容量の20%スクロース含有緩衝液に0℃で再度懸濁させた。細胞を遠心分離で 収集し、最初の培養容量の氷冷水に再度懸濁させると、浸透圧ショックで細胞が 溶解した。細胞破片を遠心分離で除去し、無細胞抽出物に酢酸を添加してpH4 .8に酸性化し、4℃で一晩放置し、得られた沈殿物を除去した。この段階で、 無細胞抽出物の超濾過/凍結乾燥により、殆ど内在性リパーゼを含まない純度7 5%以上のクチナーゼ調製物が得られた。あるいは、SP−sephadex上 に酸性化無細胞抽出物を負荷し、酵素をpH8.0の緩衝液で溶出し、濃アルカ リ性溶液を適量のDEAE−cellulose(Whatman DE−52 )に通し、DEAE通過液を直接Q−sepharose HP(Pharma cia)カラムに通すことによって、クチナーゼを均質になるまで精製(純度9 5%以上)することができる。塩勾配で 溶出すると、典型的には75%以上の総収率で、均一なクチナーゼ調製物が得ら れた。実施例3 Fusarium solani pisi クチナーゼの変異体をコードする遺 伝子の構築 実施例1に記載のFusarium solani pisiプレ−プロ−ク チナーゼの合成遺伝子を使用して、コード化したアミノ酸配列に変化を含む変異 体遺伝子を構築した。この構築では、完全合成クチナーゼ遺伝子を構成する3個 のカセットの構築について実施例1で説明したのと本質的に同じ方法を適用した 。例えば、突然変異を起こすべき位置、即ちAsn 172のコード化トリプレ ットをカバーする2個のオリゴを除いて、実施例1に記載したのと同じオリゴヌ クレオチドを用いて新種のカセット3を作成して、Fusarium sola ni pisi クチナーゼ変異体N172Kをコードする遺伝子を構築した。代 わりには、2個の新しい合成オリゴを使用した。これらのオリゴは、変異体配列 を含んでいるが、これ以外は置換前のオリゴと同一である。特に、CUTI3D MH及びCUTI3K MHの代わりにそれぞれCUTI3D M H変異体(AATの代わりにAAGを含む)及びCUTI3K MH変異体(A TTの代わりにCTTを含む)を取り込んで、変異N172Kを含む新しいカセ ット3を作成した(図1C参照)。本質的に実施例1に記載した方法で新しいカ セット3をクローニングして配列決定し、変異を含む0.3kb NheI− in dIII DNA断片をpUR7210の対応断片と置換してpUR725 7(N172K)を得た。このプラスミドに由来する0.6kb SpeI− in dIII断片を使用して、pUR7220の対応断片を置換し、E.col 発現プラスミドpUR7224(N172K)を得た。このE.coli発現 プラスミドをE.coli株WK6に形質転換した。形質転換細胞を実施例2に 記載した方法で増殖させ、変異体プロクチナーゼ酵素を本質的に実施例2に記載 した方法で回収し、精製した。 CUTI3F MH及びCUTI3M MH(図1C参照)の代わりにそれぞ れCUTI3F MH変異体(GAGの代わりにAAGを含む)及びCUTI3 M MH変異体(CTCの代わりにCTTを含む)を取り込む新種のカセット3 を作成することにより、Fusarium so lani pisi クチナーゼ変異体E201Kをコードする遺伝子を同様に構 築した。 CUTI2C MH及びCUTI2I MH(図1B参照)の代わりにそれぞ れCUTI2C MH変異体(GCTの代わりにTTCを含む)及びCUTI2 I MH変異体(AGCの代わりにGAAを含む)を取り込む新種のカセット2 を作成することにより、Fusarium solani pisiクチナーゼ 変異体A85Fをコードする遺伝子を同様に構築した。実施例4 Saccharomyces cerevisiae でのFusarium s olani pisi クチナーゼの発現 Saccharomyces cerevisiaeでのFusarium solani pisi クチナーゼ合成遺伝子の発現のために、成熟クチナーゼ をコードする合成遺伝子の前に、S.cerevisiaeインベルターゼのプ レ配列(Taussig及びCarlsson,1983)及び強い誘導性ga l7プロモーター(Nogi及びFukasawa,1983)が存在する発現 ベク ターを構築した。このような融合のための合成クチナーゼ遺伝子を産生するため 、インベルターゼプレ配列のコード配列を、成熟クチナーゼのN末端のコード配 列と融合するアダプター断片を合成した。この断片を、本質的に実施例1に記載 したようなpUC9のEcoRI−HindIIIカセットとして作成して(カ セット8、図3参照)、pUR7217を得た。プラスミドpUR7210及び pUR7217をE.coli JM110(damメチラーゼ活性の欠失した 株)に形質転換し、pUR7217の2.8kb BclI−HindIII断 片をpUR7210の0.6kb BclI−HindIII断片に連結するこ とにより、成熟クチナーゼポリペプチドのコード化ヌクレオチド配列がS.ce revisiae インベルターゼプレ配列コード領域の一部と融合したpUR7 218を得た。 pUR2740の8.9kb NruI−SalI断片を単離し、SalI突 出末端をクレノーポリメラーゼで充填し(fill in)、断片を再度円形にして(r ecircularization)、pUR2740(Verbakel,1991,図6参照 )から発現ベクターpUR2741(図4参照) を誘導した。pUR2741の7.3kb SacI−HindIII断片をp UR7218の0.7kb SacI−HindIII断片と連結し、pUR7 219を得た(図5参照)。場合によって、S.cerevisiae poI IIターミネーターをクチナーゼ遺伝子の後ろのHindIII部位に置くこと ができるが、これはクチナーゼ遺伝子の効果的な発現には重要ではないことが判 明した。E.coli−S.cerevisiaeシャトルプラスミドpUR7 219は、2μプラスミドを保有するS.cerevisiae株(cir+株 )の複製起点と、S.cerevisiae leu2-株での高コピー数形質 転換細胞の選択を可能とするプロモーター欠失種のS.cerevisiae Leu2遺伝子と、強い誘導性S.cerevisiae gal7プロモータ ーの制御下にあってS.cerevisiaeインベルターゼプレ配列に操作的 に結合したFusarium solani pisiクチナーゼの成熟部分を コードする合成遺伝子とを含んでいる。 酵母細胞の電気穿孔法の標準的なプロトコルを用いて、株YT6−2−lL( Erhart及びHollenbe rg,1981)と同一のS.cerevisiae株SU50(a,cir0 ,leu2,his4,can1)を、2μのS.cerevisiaeプラス ミドとpUR7219との等モル混合物で同時形質転換した。ロイシン原栄養性 について形質転換細胞を選択し、幾つかの形質転換細胞から全DNAを単離した 。全ての形質転換細胞は、2μプラスミド及びpUR7219の両方を含むよう に思え、このことは、pUR7219上に含まれるプロモーター欠失種のleu 2遺伝子が、2μ酵母プラスミドと共存するために高いコピー数で存在すると、 leu2欠失株を単に機能的に補い得ることを示している。完全培地で40世代 以上培養し、次いで固形の選択及び完全培地でレプリカ平板培養して1個の形質 転換細胞をpUR7219について処理(cure)し、S.cerevisiae 株SU51(a,cir+,leu2,his4,can1)を得た。pUR7 219を保有するS.cerevisiae株SU51を、 −アミノ酸を含まない酵母窒素塩基(YNB) 6.7g/l -ヒスチジン 20mg/l -グルコース 20g/l からなる0.2リットルのMM培地を含む1リットルの振盪フラスコ内で増殖さ せた。培養物を強く振盪(150rpm)しながら30℃で一晩増殖させた。6 10nmでのODは2〜4であった。細胞を遠心分離により収集し、2リットル の振盪フラスコ内で、 −酵母抽出物 10g/1 −バクトペプトン 20g/1 −ガラクトース 50g/1 からなる1リットルのYPGAL培地に再度懸濁させ、更に12〜16時間イン キュベーションを継続した。一定の間隔で、試料を培養物から取り出し、遠心分 離にかけてバイオマスを除去した。オリーブ油を基質として用い、上清のクチナ ーゼ活性を滴定法で分析した。各試料に対し、5.0mlのリパーゼ基質(Si gma、リパーゼの基質としてオリーブ油を含む)と25.0mlの緩衝液(5 mMトリス−HCl pH9.0,40mM NaCl,20mM CaCl2 )の撹拌混合物に100〜200μlの濾液を添加した。30℃でアッセイを実 施し、Mettler DL25滴定装置を用い、0.05M NaOHによる pH9.0までの自動滴定により脂肪酸の放出を測定し た。滴定液量対時間の曲線が得られた。試料中に含まれるリパーゼ活性の量を、 この曲線の最大勾配から計算した。1酵素活性単位は、前述の条件下で、1分間 でオリーブ油から1μmolの脂肪酸を放出させる酵素の量として定義する。こ のような測定法は、当業者には公知である。 クチナーゼ活性の発生量が増加しなくなると、細胞を遠心分離にかけて除去し 、無細胞抽出物に酢酸を加えてpH4.8に酸性化して、クチナーゼを実施例1 に記載した方法で回収した。実施例5 S.cerevisiae でのFusarium solani pisiクチ ナーゼの変異体の発現 Fusarium solani pisiクチナーゼの変異体N176Kを 以下の方法でS.cerevisiaeで発現させた。pUR7257(N17 2K)の0.5kb ApaI−HindIII断片を使用してpUR7218 の類似断片を置換し、変異を含む遺伝子がS.cerevisiaeシグナル配 列をコードする配列に操作的に融合したpUR7228(N172K)を得た。 pUR2741の7.0kb SacI−HindIII断片 を、pUR7228(N172K)の0.7kb SacI−HindIII断 片に連結して、pUR7234(N172K)を得た。このプラスミドをS.c erevisiae 株SU51に形質転換した。得られた形質転換細胞を実施例 4に記載した方法でインキュベートし、産生した変異体酵素を実施例4及び1に 記載した方法で培養ブロスから回収した。 Fusarium solani pisiクチナーゼの変異体E201Kを 、実施例3に記載したように、クチナーゼ変異体E201KをコードするFus arium solani pisi クチナーゼ遺伝子の変異体を用いてS.c erevisiae で同様に産生した。 Fusarium solani pisiクチナーゼの変異体A85Fを、 実施例3に記載したように、クチナーゼ変異体A85FをコードするFusar ium solani pisi クチナーゼ遺伝子の変異体を用いてS.cer evisiae で同様に産生した。実施例6 AspergilliでのFusarium solani pisiクチナー ゼの発現 Aspergillus niger変異株awamoriでの合成Fusa rium solani pisi クチナーゼ遺伝子の発現のために、Fusa rium solani pisi プレ−プロ−クチナーゼをコードする合成遺 伝子をA.niger変異株awamoriの強い誘導性exlAプロモーター (Maat等,1992,de Graaff等1992)の制御下に置いた発 現ベクターを構築した。 プラスミドpAW14Bからプレ−プロ−クチナーゼ発現プラスミド(pUR 7280)を構築した。前記pAW14Bは、1990年5月31日にCBS2 37.90の番号でCentraalbureau voor Schimme lcultures,Baarn,The NetherlandsにE.co li 株JM109で寄託されたものであり、0.7kbのエンドキシラナーゼII (exlA)遺伝子が2.5kbの5’フランキング配列及び2.0kbの3’ フランキング配列と共に存在する約5.3kbのSalI断片を含んでいる(図 8)。pAW14Bで、exlAコード化領域をプレ−プロ−クチナーゼコード 化領域で置換した。exlA遺伝子の開始コドン(A TG)を含むBspHI部位(5’−TCATGA−3’)及びexlA遺伝子 の終結コドン(TAA)を含むAflII部位(5’−CTTAAG−3’)は 、pUR7280の構築を容易にした。 以下の方法で構築した:pAW14B(7.9kb)をBspHIで部分的に 切断し、線状化プラスミド(7.9kb)をアガロースゲルから単離した。その 後、単離した7.9kb断片を、問題のBspHI部位の数ヌクレオチド下流で 切断するBsmIで切断して、他のBspHI部位で線状化したプラスミドを除 去した。断片をアガロースゲルで分離し、7.9kb BspHI−BsmI断 片を単離した。これをAflIIで部分的に切断し、得られた7.2kb Bs HI−AflII断片を単離した。 Fusarium solani pisiプレ−プロ−クチナーゼをコード する全読み取り枠を含むpUR7210の0.7kb BspHI−AflII 断片を、pAW14Bの7.2kb BspHI−AflII断片と連結して、 pUR7280を得た。その後、構築したベクター(pUR7280)を従来の 同時形質転換技術によりカビ(例えばAspergillus niger sp ergillus niger 変異株awamori等)に移植することができ 、次いでプレ−プロ−クチナーゼ遺伝子をエンドキシラナーゼIIプロモーターの 誘導により発現させることができる。構築したrDNAベクターは更に、従来の 選択マーカー(例えばamdS又はpyrG、ヒグロマイシン等)を備えていて もよく、またカビを得られたrDNAベクターで形質転換して、所望のタンパク 質を産生してもよい。一例としては、amdS及びpyrG選択マーカーを発現 ベクターに導入してpUR7281(図10)を産生した。このため、合成オリ ゴヌクレオチド(5’−AATTGCGGCCGC−3’)を用いて(プレ−プ ロ−クチナーゼ遺伝子のATGコドンの1.2kb上流に存在する)EcoRI 部位をNotI部位に変換してNotI部位を生成して、pUR7282を産生 した。全A.nidulans amdS遺伝子及びA.niger変異株aw amori pyrG遺伝子をそれら自体のプロモーターやターミネーターと共 に含んでいる適切なDNA断片は、フランキングNotI部位を備えており、こ れをpUR7282のNotI部位に導入してpUR7281(図10)を産生 した。 Aspergillus niger変異株awamoriでの合成Fusa rium solani pisi クチナーゼ遺伝子の代替の発現方法として、 成熟クチナーゼをコードする合成遺伝子の前にそれ自体のプレ−プロ配列ではな く、A.niger変異株awamori exlAのプレ配列が存在する発現 ベクターを構築した。 このような融合のための合成クチナーゼ遺伝子を産生するために、exlAプ レ配列のコード化配列が種々の方法で成熟クチナーゼのN末端のコード化配列に 結合した数個のアダプター断片を合成した。カセット5では、この結合は、ex lAプレ配列をクチナーゼのプロ配列と融合して行う。カセット6では、exl Aプレ配列を成熟クチナーゼのN末端残基と融合する。カセット7はカセット6 と同一であるが、コード化成熟クチナーゼポリペプチドのN末端残基を元のグリ シンからセリン残基に変えて、シグナルペプチドの開裂要件により適合するよう にした。本質的に実施例1に記載したように、カセット5、6及び7を合成オリ ゴヌクレオチドから作成した(図7参照)。カセット5を使用して、pUR72 10の0.1kb EcoRI−SpeI断片を置換してpUR7287を産生 した。カ セット6、7を使用して、pUR7210の0.1kb EcoRI−BclI 断片を置換し、それぞれpUR7288及びpUR7289を産生した。プラス ミドpUR7287、pUR7288及びpUR7289の各々について、0. 7kb BspHI−AflII断片をpAW14Bの7.2kb BspHI −AflII断片と連結して、それぞれpUR7290、pUR7291及びp UR7292を得た。 その後、従来の同時形質転換技術により、構築したrDNAベクターをカビ(Aspergillus nigerAspergillus niger変 異株awamori)に移植し、エンドキシラナーゼIIプロモーターの誘導によ りプレ−(プロ)−クチナーゼ遺伝子を発現した。本実施例でpUR7280に ついて説明したように(上記参照)、構築したrDNAベクターは更に、従来の 選択マーカー(例えばamdS又はpyrG、ヒグロマイシン)を備えていても よく、またカビを得られたrDNAベクターで形質転換して、所望のタンパク質 を産生してもよい。 (対応するプロ配列を備えた又は備えていないFusarium solan i pisi 成熟クチナーゼコード 領域と、A.niger変異株awamori exlAプロモーター及びター ミネーターの制御下のクチナーゼシグナル配列又はexlAシグナル配列とを含 む)発現ベクターpUR7280、pUR7281、pUR7290、pUR7 291、pUR7292の各々で形質転換したAspergillus株を、以 下の条件下で増殖させた:400mlの合成培地(pH6.5)を含む多数の1 リットル振盪フラスコに、胞子(最終濃度:10E6/ml)を接種した。培地 組成を以下に示す(AW培地): スクロース 10g/l NaNO3 6.0g/l KCl 0.52g/l KH2PO4 1.52g/l MgSO4・7H2O 0.49g/l 酵母抽出物 1.0g/l ZnSO4・7H2O 22mg/l H3BO3 11mg/l MnCl2・4H2O 5mg/l FeSO4・7H2O 5mg/l CaCl2・6H2O 1.7mg/l CuSO4・5H2O 1.6mg/l NaH2MoO4・2H2O 1.5mg/l Na2EDTA 50mg/l Mk Xインキュベーターシェーカーで、200rpm、30℃で24時間イ ンキュベートした。増殖後、細胞を濾過(0.45μmフィルター)して収集し 、スクロース及び酵母抽出物を含まないAW培地(塩溶液)で2度洗浄し、50 mlの塩溶液に再度懸濁させ、キシロースを添加して10g/lの最終濃度にし た50mlの塩溶液(誘導培地)を含む300mlの振盪フラスコに移した。上 記と同一条件下でのインキュベーションを一晩継続した。得られた培養物をミラ クロス(miracloth)で濾過してバイオマスを除去し、クチナーゼを本質的に実 施例2に記載した方法で回収した。実施例7 AspergilliでのFusarium solani pisiクチナー ゼの変異体の発現 本質的に実施例6に記載した方法により、但し真菌発現ベクターの構築のため にpUR7210に代わりにプラス ミドpUR7257(N172K)を用いて、変異N172Kを含むFusar ium solani pisi クチナーゼの変異体をAspergillus niger 変異株awamoriで産生した。実施例8 Fusarium solani pisi クチナーゼ遺伝子に関連する遺伝子 の同定及び単離 Fusarium solani pisiクチナーゼとの相同性の程度が異 なるクチナーゼのコード化遺伝子を種々の真菌から単離した。Hankin及び Kolattukudy(1968)が記載する培地200mlに0.25%グ ルコースを補充したものを含む500mlの振盪フラスコで真菌培養物を増殖さ せ、Mk Xインキュベーターシェーカー(100rpm)で、28℃で4日間 インキュベートした。この時点で、グルコースが消費され、本質的にEttin ger等(1987)が記載したようにクチン水解物を添加してクチナーゼの産 生を誘導した。一定の間隔で試料を培養物から取り出し、標準的な技術に従って (実施例4参照)脂肪分解活性の存在を分析した。通常、誘導から約2日後に、 脂肪分解活性を実証することができ、 この時点で、標準的な技術を用いて細胞を濾過して収集した。標準的な技術に従 って、菌糸を洗浄し、液体窒素中で凍結し、凍結乾燥した。グアニジニウムチオ シアネート法を用いて全細胞RNA調製物を単離し、本質的にSambrook 等(1989)が記載したように、塩化セシウム密度勾配遠心分離により精製し た。polyAT管(tract)mRNA単離キット(Promga)を用いてp olyA(+)mRNA画分を単離した。標準的な技術に従い、Fusariu m solani pisi クチナーゼ遺伝子に由来するcDNA断片をプロー ブとして用いて、polyA(+)mRNA画分をノーザンハイブリダイゼーシ ョン分析で使用して、クチナーゼ関連遺伝子の発現を検証した。ZAP cDN A合成キット(Stratagene,La Jolla)を供給業者の指示に 従って用いて、プローブとハイブリダイズし得る物質を含むmRNA調製物でc DNAを合成して、poly−A領域に隣接しているXhoI付着端と、他端に EcoRIアダプターを有するcDNA断片を得た。得られたcDNA断片を用 い、λZAPIIベクター(Stratagene,La Jolla)でのセ ンス方向のダイレクショナルクローニン グにより発現ライブラリーを構築すると、β−ガラクトシダーゼ融合タンパク質 (Huse等、1988)を発現することができた。Fusarium sol ani pisi クチナーゼに対する抗血清を用いて、これらのライブラリーを スクリーニングした。 あるいは、クチナーゼ特異的プライマー(表2参照)を用いて、合成cDNA 画分をPCRスクリーニングにかけた。これらのプライマーは、数種の真菌クチ ナーゼ遺伝子のアミノ酸配列(Ettinger等、1987)の比較により得 られたものである。Fusarium solani pisiクチナーゼのc DNAを対照として用いてPCR反応の条件を、各組のプライマーについて最適 化した。同一条件下で、長さがFusarium solani pisiクチ ナーゼ由来のcDNAで産生されるPCR断片と同様である(又はそれ以上の) 特異的PCR断片の産生に使用され得るcDNA調製物について、PCR断片を ゲル電気泳動で精製して、ゲルから単離した。 代替の方法としては、クチナーゼ特異的プライマーを用いるPCRスクリーニ ング技術は更に、Fusarium solani pisiのゲノムDNAを 陽性対照とし て用いることにより、幾つかの真菌株のゲノムDNAに直接適用される。同一条 件下で、長さがFusarium solani pisiクチナーゼ由来のc DNAで産生されるPCR断片と同様である(又はそれ以上の)特異的PCR断 片の産生に使用され得る真菌ゲノムDNA調製物について、PCR断片をゲル電 気泳動で精製して、ゲルから単離した。 発現ライブラリー法又は(cDNAもしくはゲノムDNAを用いる)PCRス クリーニング法で陽性と評価された株や、他の幾つかの株について、高分子量ゲ ノムDNAを単離した。株を本質的にEttinger等(1987)の記載し た方法で増殖させ、ゲノムDNAをGraaff等(1988)が記載した方法 で単離した。ゲノムDNAを種々の制限酵素で消化し、類似cDNAインサート (発現ライブラリー法)又はPCR断片(PCRスクリーニング法)又はFus arium solani pisi クチナーゼ遺伝子(他の株)をプローブと して用いて、サザンハイブリダイゼーションで分析し、クチナーゼ遺伝子の物理 マップを構築した。ゲノムDNAの適切な消化物をゲル電気泳動でサイズ分画し 、適切サイズの断片をゲルから 単離し、pUC19にサブクローニングした。これらのゲノムライブラリーを対 応するcDNAインサート(発現ライブラリー法)又はPCR断片(PCRスク リーニング法)でスクリーニングして、クチナーゼ遺伝子のゲノムコピーを含む クローンを産生した。これらの遺伝子を両方向に配列決定した。対応cDNAを 配列決定するか又は他のクチナーゼ配列(Ettinger等、1987)と比 較してイントロンを同定した。成熟クチナーゼポリペプチドのN末端を更にこの ような比較から推定した。標準的なPCR技術を用いて、イントロンを除去し、Hin dIII部位を読み取り枠のすぐ下流で作成し、Saccharomyc es cerevisiae インベルターゼ遺伝子(前にSacI部位が存在す る、カセット8を比較、図3)のプレ配列のコード化配列を、成熟クチナーゼの N末端のコード化配列に融合した。S.cerevisiaeインベルターゼプ レ配列をコードする配列に操作的に連結したクチナーゼ遺伝子を含む産生Sac I−HindIII断片を、pUR7241(図4参照)の7.3kb Sac I−HindIII断片と連結し、S.cerevisiae株SU51に形質 転換した。真菌クチナーゼを発現し、 本質的に実施例4に記載したように培養ブロスから回収した。実施例9 Fusarium solani pisi クチナーゼ変異体N172Kの洗濯 中活性 クチナーゼ変異体N172Kの脂肪除去への作用を、野生型Fusarium solani pisi クチナーゼの場合と比較した。試験では、臭素化オリ ーブ油で汚したポリエステル試験布をモニターとして使用した。(前述したよう に)X線蛍光スペクトル分析で試験布上の臭素の量を測定して、試験布上の脂肪 量を決定した。 野生型Fusarium solani pisiクチナーゼ(WT)及びN 172K変異体を3LU/ml用い、酵素による汚れ除去量を幾つかの実験条件 下で測定した: 洗剤製品A〜Cの組成(重量%)を以下に示す: 製品A 製品B 製品C 様々な洗濯条件下で、洗濯中性能(油汚れ除去)が野生型Fusarium solani pisi クチナーゼに比べて改善されることは明白である。図1 3は、30℃、27゜FHで、30分間の洗濯で2g/lの洗剤製品Cを用いた 場合の種々の酵素濃度での洗濯中性能を示している。 比較として、更に同じ実験をLipolase(登録商標)を用いて実施した 。全ての条件下で、クチナーゼ変異体N172Kの方が優れていた。実施例12 Fusarium solani pisi クチナーゼ変異体E201Kの洗濯 中活性 種々の酵素濃度のクチナーゼ変異体E201Kが脂肪除去に及ぼす作用を、3 0℃、27゜FHで、30分間の洗濯で2g/lの洗剤製品C(実施例11を参 照)を用いて野生型Fusarium solani pisiクチナーゼの場 合と比較した。試験では、臭素化オリーブ油で汚したポリエステル試験布をモニ ターとして使用した。(前述したように)X線蛍光スペクトル分析で試験布上の 臭素の量を測定して、試験布上の脂肪量を決定した。 結果を図14に示す。洗濯中性能(油汚れ除去)が野生 型Fusarium solani pisiクチナーゼに比べて改善されるこ とは明白である。比較として、更に同じ実験をLipolase(登録商標)を 用いて実施した。E201Kクチナーゼ変異体の性能の方が明らかに優れている ことが知見された。実施例13 Fusarium solani pisi クチナーゼ変異体A85Fの洗濯中 活性 種々の酵素濃度のクチナーゼ変異体A85Fが脂肪除去に及ぼす作用を、30 ℃、27゜FHで、30分間の洗濯で2g/lの洗剤製品C(実施例11を参照 )を用いて野生型Fusarium solani pisiクチナーゼの場合 と比較した。試験では、臭素化オリーブ油で汚したポリエステル試験布をモニタ ーとして使用した。(前述したように)X線蛍光スペクトル分析で試験布上の臭 素の量を測定して、試験布上の脂肪量を決定した。 結果を図15に示す。洗濯中性能(油汚れ除去)が野生型Fusarium solani pisi クチナーゼに比べて改善されることは明白である。比較 として、更に同じ実験をLipolase(登録商標)を用いて実施し た。A85Fクチナーゼ変異体の性能の方が明らかに優れていることが知見され た。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI C12N 15/09 ZNA // C12S 11/00 8931−4B D06L 1/00 7199−3B (C12N 9/18 C12R 1:865) (C12N 9/18 C12R 1:77) (C12N 1/15 C12R 1:66) (C12N 1/19 C12R 1:85) (C12N 1/19 C12R 1:78) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:77) C12R 1:77) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AT,AU,BB,BG,BR,BY, CA,CH,CZ,DE,DK,ES,FI,GB,H U,JP,KP,KR,KZ,LK,LU,MG,MN ,MW,NL,NO,NZ,PL,PT,RO,RU, SD,SE,SK,UA,VN (72)発明者 フアン・デル・ヒーデン,ヘンドリクス・ テオドルス・ウエー・エム オランダ国、エヌ・エル―2907・カー・ベ ー・カペレ・アー/デー・イユツセル、ア イダ・64 (72)発明者 ムステルズ,ウオーテル オランダ国、エヌ・エル―3141・エル・デ ー・マースルイス、ウイツペルスパルク・ 138 (72)発明者 ペテルス,ハンス オランダ国、エヌ・エル―3051・イツク ス・ベー・ロツテルダム、サフイエルスト ラート・12 (72)発明者 フエリプス,コルネリス・テオドルス オランダ国、エヌ・エル―3142・カー・ベ ー・マースルイス、ハゲドールン・18 (72)発明者 デ・フリーグ,ヤコブ オランダ国、エヌ・エル―3142・アー・ペ ー・マースルイス、カスタニエーダル・32

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.酵素表面の疎水性が増すようにアミノ酸配列を改変した親クチナーゼのクチ ナーゼ変異体。 2.脂質接触領域に隣接する酵素表面の疎水性を増加して、拡大された脂質接触 領域を形成した請求項1に記載のクチナーゼ変異体。 3.1個以上のアミノ酸残基を、バリン、ロイシン、イソロイシン、フェニルア ラニン、トリプトファン及びメチオニンからなる群の中から選択されるアミノ酸 残基で置換して疎水性を増した請求項1又は2に記載のクチナーゼ変異体。 4.表面疎水性を増すだけでなく、1個以上の陽電荷を導入するようにアミノ酸 配列を改変した請求項1から3のいずれか一項に記載のクチナーゼ変異体。 5.1個以上のリシン又はアルギニン残基を導入して陽電荷を導入した請求項4 に記載のクチナーゼ変異体。 6.置換されるアミノ酸残基が小さな側鎖を有し、好ましくはアラニン、セリン 又はグリシンからなる群の中から選択される請求項1から5のいずれか一項に記 載のクチナーゼ変異体。 7.親クチナーゼが真核生物クチナーゼである請求項1から6のいずれか一項に 記載のクチナーゼ変異体。 8.親酵素が、Fusarium solani pisi由来のクチナーゼに 対する抗体と免疫学的に交差反応するクチナーゼである請求項1から7のいずれ か一項に記載のクチナーゼ変異体。 9.親酵素がFusarium solani pisi由来のクチナーゼであ る請求項1から8のいずれか一項に記載のクチナーゼ変異体。 10.改変残基が、Fusarium solani pisiクチナーゼの残 基116〜120のCα−原子又は異なるクチナーゼの対応するCα−原子を介 する最小自乗適合であるベクトルと、該ベクトルに垂直で、残基117のCα− 原子又は異なるクチナーゼの対応するCα−原子を含んでいる面とによって規定 される分子部分に位置する請求項1から9のいずれか一項に記載のクチナーゼ変 異体。 11 改変残基が、残基117のCα−原子から15A離れたFusarium solani pisi クチナーゼの残基116〜120のCα−原子を介す る最小自乗適合であるベクトルに垂直な第1の面と、該第1の面に平行 で、残基117のCα−原子を含んでいる第2の面との間に位置する分子部分中 に位置する請求項1から10のいずれか一項に記載のクチナーゼ変異体。 12.改変残基が、Fusarium solani pisiクチナーゼのア ミノ酸配列の以下の位置又は異なるクチナーゼの対応する位置: 17,18,19,40,42−46,50,53,54,58,74,75, 76,78,80−88,91,92,93,95,96,97,99,100 ,119,150−156,158,160,168,169,170,172 ,173,174,176,179,180−190,192,193,194 ,196,197,198,201 の1つ以上に位置する請求項1から11のいずれか一項に記載のクチナーゼ変異 体。 13.改変残基が、Fusarium solani pisiクチナーゼのア ミノ酸配列の以下の位置又は異なるクチナーゼの対応する位置: 19,41,45,49,54,58,75,76,82,85,92,93, 99,100,127,128,17 2,173,179,183,184,185,189,190,194,19 7,201 の1つ以上に位置する請求項1から12のいずれか一項に記載のクチナーゼ変異 体。 14.以下の改変: T19V,G41A,T45K,T45P,*I49a,S54I,N58R, G75R,A76P,G82A,D83S,A85F,A85V,S92R,A 93V,L99K,G100R,A127L,A128F,N172K,T17 3I,T179F,I183F,V184I,A185L,L189F,A19 0L,D194R,G197V,E201K の1つ以上が、Fusarium solani pisiクチナーゼのアミノ 酸配列で又は異なるクチナーゼの対応する位置で実施された請求項1から13の いずれか一項に記載のクチナーゼ変異体。 15.以下の改変:A85F、N172K、E201Kが、Fusarium solani pisi クチナーゼのアミノ酸配列で、又は異なるクチナーゼの 対応する位置で実施された請求項1から14のいずれか一項に記載のクチ ナーゼ変異体。 16.クチナーゼ変異体をコードするrDNA技術により製造した遺伝子を含む rDNA改変微生物を発酵培養し、微生物で産生されたクチナーゼ変異体を発酵 ブロスと分離するか又は微生物細胞を発酵ブロスと分離することによりクチナー ゼ変異体調製物を製造し、分離した細胞を破壊し、物理的又は化学的な濃縮又は 精製法により前記ブロスから又は前記細胞からクチナーゼを濃縮又は部分精製す る段階を包含する請求項1から15のいずれか一項に記載のクチナーゼ変異体の 産生方法。 17.請求項1から15のいずれか一項に記載のクチナーゼ変異体をコードする 遺伝子を保有するrDNAベクターによって形質転換されて、前記クチナーゼ変 異体を発現し得るrDNA改変微生物。 18.5’末端で、宿主微生物のシグナル又は分泌配列として機能的な(改変) プレ配列をコードする遺伝子断片と融合することによって微生物内に導入される クチナーゼ変異体をコードする遺伝子を保有する請求項17に記載のrDNA改 変微生物。 19.宿主微生物が真核生物、例えばSaccharom yces 属、Kluyveromyces属もしくはHansenula属の酵 母菌、又はAspergillus属の真菌である請求項17又は18に記載の rDNA改変微生物。 20.請求項1から15のいずれか一項に記載のクチナーゼ変異体をコードする 組換えDNAベクターを保有し、かつ先祖細胞のひとつで栄養要求性マーカーを コードする遺伝子を置換して栄養要求性突然変異体となったことを特徴とする、 請求項17から19のいずれか一項に記載のrDNA改変微生物。 21.最終翻訳コドンの次に終結コドンが存在し、場合によっては、成熟酵素を コードするヌクレオチド配列のすぐ上流にこのクチナーゼのプレ配列をコードす るヌクレオチド配列を有することを特徴とする、請求項1から15のいずれか一 項に記載の成熟クチナーゼ変異体又はその機能等価物又はその突然変異体をコー ドする塩基配列を有するポリヌクレオチド。 22.最終翻訳コドンの次に終結コドンが存在し、場合によっては、成熟酵素を コードするヌクレオチド配列のすぐ上流に対応プレ配列の少なくとも一部分、及 び/又は選択 される宿主微生物に適したシグナル配列もしくは分泌配列をコードするヌクレオ チド配列を有することを特徴とする、請求項1から15のいずれか一項に記載の クチナーゼ変異体をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチド。 23.請求項1から15のいずれか一項に記載の成熟クチナーゼ変異体又はその 機能等価物又はその突然変異体をコードする塩基配列を有するポリヌクレオチド であって、産生源の微生物から誘導される、クチナーゼ変異体をコードするヌク レオチド配列を、少なくとも1個のコドン、好ましくはできるだけ多くのコドン が‘サイレント’突然変異の対象に対し、請求項17から20のいずれか一項に 記載の新しい宿主に好まれるコドンである、同等のアミノ酸残基をコードするコ ドンを形成するように改変することにより、前記宿主の細胞内での使用時に、安 定性の改善された導入遺伝子用mRNAを提供する前記ポリヌクレオチド。 24.プロ又は成熟クチナーゼ変異体をコードするヌクレオチド配列の上流に、 請求項17から20のいずれか一項に記載の宿主に適したシグナル配列又は分泌 配列をコードするヌクレオチド配列が位置する請求項21から23のいずれか一 項に記載のポリヌクレオチド。 25.(a)成熟クチナーゼ変異体、又はプレクチナーゼ、又は(選択された宿 主細胞にとって好ましい)分泌シグナルのすぐ下流でプレ配列の少なくとも一部 分が除去された対応プレクチナーゼをコードする二本鎖(ds)DNAであるが 、但し、翻訳されるべき遺伝子の部分がコドンATGで開始していない場合はA TGコドンを前に置くべきとし、更に翻訳されるべき遺伝子部分は適切な終結コ ドンで終了する即ち前記コドンを付加するものとする、前記DNA; (b)クチナーゼ変異体をコードするds DNA(成分(a))のプラス鎖の 上流に位置する、(選択される宿主微生物に適した)発現レギュロン; (c)クチナーゼ変異体をコードするds DNA(成分(a))のプラス鎖の 下流に位置する、(選択される宿主微生物に適した)ターミネーター配列; (d1)選択される宿主のゲノム内へのds DNAの取り込みを容易にするヌ クレオチド配列、又は (d2)選択される宿主に適した複製起点; (e1)場合によっては(栄養要求性)選択マーカー; (e2)場合によっては、選択される宿主でのクチナーゼ 変異体の一前駆体形態の成熟及び/又は分泌に関与するタンパク質をコードする ds DNA配列 を含むことを特徴とする、クチナーゼ変異体遺伝子をコードするヌクレオチド配 列の発現を指令し得る組換えDNAベクター。 26.前記定義のポリヌクレオチドの上流及び/又は下流に、クチナーゼの機能 発現を容易にする別の配列を更に保有する請求項25に記載の組換えDNAベク ター。 27.栄養要求性マーカーのコード領域と、欠陥プロモーター領域とからなる栄 養要求性マーカーを保有する請求項25又は26に記載の組換えDNAベクター 。 28.請求項1から15のいずれか一項に記載のクチナーゼ変異体を含む酵素洗 剤組成物。
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