JPH10509587A

JPH10509587A - Ｈｉｖ−１のｏグループ（またはサブグループ）レトロウイルス性抗原のヌクレオチド配列

Info

Publication number: JPH10509587A
Application number: JP8513692A
Authority: JP
Inventors: ピエールシャルノー、; フランソワクラベル、; アンドレウボルマン、; カロリーヌキーラン、; ドニーズゲタール、; リュックモンターニエ、; ジャクリーヌドンジョン・ドゥ・サン−マルタン、; ジャック・アーシュ・エムコエン、
Original assignee: Institut Pasteur
Current assignee: Institut Pasteur
Priority date: 1994-10-20
Filing date: 1995-10-20
Publication date: 1998-09-22
Anticipated expiration: 2015-10-20
Also published as: CN1164258A; AU2009213045B2; US6399294B1; JP2009240315A; ATE374253T1; US7157225B2; CN1651457B; DK0787191T4; US20080261197A1; AU2005202281A1; EP0787191A2; WO1996012809A3; AU2009213045A1; EP0787191B2; DK0787191T3; AU715731B2; CN1651457A; JP4589420B2; CN102134609A; AU2005202281B2

Abstract

(57)【要約】ＨＩＶ-1のＯタイプＶＡＵ株、またはＨＩＶ-1のＯタイプ（またはサブタイプ）のＤＵＲ株による感染により得られる血清から単離できる抗体により認識されうる、ＨＩＶ-1のＯタイプ（またはサブタイプ）のレトロウイルスの、タンパク質、または天然、若しくは合成の、ポリペプチド、若しくはペプチド。

Description

【発明の詳細な説明】ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルス性抗原のヌクレオチド配列本発明は、ヌクレオチド配列の発現、または化学合成（例えば、Ａpplied Ｂi osystemsブランドの合成機を使用したもの）により、得られる抗原であって、ＨＩＶ-1グル−プ（またはサブグル−プ）変異体、より特にはウイルス粒子より単離することができるものに相当する抗原に関する。ＨＩＶ-1ウイルスのＯサブグル−プの例を挙げて、ＨＩＶ-1_(VAU)単離体、及びＨＩＶ-1_(DUR)単離体に言及する。本発明はまた、上記抗原により誘導される、モノクロナ−ル、またはポリクロ −ナル抗体に関する。本発明はまた、上記したウイルスのゲノムＲＮＡに対して相補的か相同である配列を有する、クロ−ン化ＤＮＡ配列に関する。本発明は更に上記のクロ−ン化ＤＮＡ配列を調製するための方法に関する。本発明は更に上記したクロ−ン化ＤＮＡ配列によりコ−ドされるアミノ酸配列を含んだポリペプチドに関する。更に本発明は、上記した抗原を、ある種のＡＩＤＳの形態にある危険な状態の人における、in vitroでの検出に適用することと、前記の人の一部に対しては、このレトロウイルスに対する免疫原性組成物とワクチン用組成物の産生へ適用することに関する。同様に本発明は、同じ目的のための上記した抗体の適用に関し、また、その目的の一部のため、ヒトＡＩＤＳに対する医薬品の活性素の産生への適用にも関する。本発明はまた、クロ−ン化したＤＮＡ配列と、遺伝子増幅用プライマまたはプロ−ブとしての上記配列に由来するポリペプチドの、診断キット中での適用に関する。本発明は更に、化学合成、または組み換え宿主細胞内での発現によって得られる抗原性組成物であって、これにより、ＨＩＶ-1、またはＨＩＶ-2のサブタイプに関わらず、ＨＩＶ型のヒトレトロウイルスによる感染の診断が可能になるものに関する。このような組成物は、ＨＩＶ-1、ＨＩＶ-2、ＨＩＶ-1_(DUR)、及びＨＩＶ-1_(VAU)ウイルス、または同様の免疫原性特徴を有する抗原性ペプチドの変異体に共通する抗原性ペプチドより選択した、少なくとも一つのペプチドを具備している。本発明は更に、ＨＩＶ-1型のヒトレトロウイルス、より特にはＨＩＶ-ＬＭグル−プ、ＨＩＶ-2、またはＯグル−プ（またはサブグル−プ）のＨＩＶ-1による感染の特異的診断を可能にする組成物であって、ＨＩＶ-1ウイルスに特異的な抗原性ペプチド、ＨＩＶ-2ウイルスに特異的な抗原性ペプチド、ＨＩＶ-1のＯグル −プ（またはサブグル−プ）に特異的な抗原性ペプチド、または同様の免疫原性特徴を有するこれらの抗原性ペプチドの変異体の少なくとも一つを具備している組成物に向けれれている。より特には、上記抗原性ペプチドは、ＨＩＶ-1のＭグル−プと、ＨＩＶ-2と、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（サブグル−プ）のウイルスのエンベロ−プタンパク質に由来している。本発明は更には、従来技術のペプチドでは必ずしも検出することができなかった抗ＨＩＶ抗体の検出を可能にするペプチドに向けられていて、これは特には新規のＨＩＶ-1株であるＨＩＶ-ＩＤＵＲの発見に基づいている。それに対する抗血清は、必ずしも、現在使用されているようなＨＩＶのコンセンサスペプチドとの反応性を有しているわけではない。「ＨＩＶのコンセンサス」という用語は、単離体間で保存されている領域を意味し、この証明は診断試薬の設計にとって必須であり、またこれが変異すると抗ウイルス医薬に対する抵抗性が付与される。本願で使用する「ペプチド」という用語は、オリゴペプチドとポリペプチドの両方を意味する。従来技術ＬＡＳ及びＡＩＤＳの進展の起因である２つのタイプのヒト免疫不全症ウイルス（ＨＩＶ）が単離されていて、また特徴付けられている。ＬＡＶ-1、またはＨＩＶ-1として知られる第一のウイルスは、単離されていて、ＧＢ特許出願8324,8 00、及び特許出願ＥＰ84401,834（1984年09月1411）二記載されている。このウイルスはまた、エフ．バ−レ−シノッシ（Ｆ.Ｂarre-Ｓinoussi）らにより記載されている（Ｓcience,1983,220.868-871）。２型のＨＩＶレトロウイルスは別のクラスに属し、１型のＨＩＶレトロウイルスとの免疫原性の関係は非常に限られている。ＨＩＶ-2レトロウイルスは、ヨ− ロッパ特許出願番号、87,400,151,4（発行番号は239,425）に記載されている。ＨＩＶ-1レトロウイルスは最も一般的であり、世界中の複数の地域では主要な存在となっている。ＨＩＶ-2レトロウイルスに関しては、西アフリカではよく見られるものであるが、グレズ（Ｇrez）らにより、最近になってこの地域から外への伝播が報告されている（Ｊ.Ｖirol.,68:2161-2168）。１型及び２型のヒト免疫不全症ウイルスはもちろん、ヒト以外の霊長類ウイルスを具備した、霊長類の免疫不全症レンチウイルス全体は、そのサイズ及び複雑さにおいて増大している。これらのウイルスで最も一般的なＨＩＶ-1は、現在、全世界的に流行しており、公衆衛生の主要な問題となっている。このウイルスの同定と分子的特徴付けのすぐ後で、このウイルスは非常に多様性があることが認識され、現在では幾つかのサブタイプを具備している（Ｍyers,1994,Ｌouwagie, et al.,1993,Ｌouwagie et al.,1992,Ｍyers Ｇ.1994“ＨＩＶ-1 Ｓubtypes and phylogenetics trees：Ｈuman Ｒetrovirus and ＡＩＤＳ；Ｍyers,Ｇ.,Ｋorbe r,Ｂ.,Ｗain-Ｈobson,Ｓ.,Ｓmith,Ｒ.Ｆ.and Ｐavlakis,Ｇ.Ｎ.,Ｅds.Ｌos Ａla mos Ｎational Ｌaboratory,Ｌos Ａlamos,ＮＭ.III-2-III-9）。このサブタイプの分化は主に、gagとenv遺伝子の多様性に基づいている。少なくとも６つのサブタイプが同定されていて、ＡからＦと命名されているが、幾つかは、ＨＩＶ-1 の単離体に関して進行中の世界的な集中的調査より出現する可能性がある。これらの種々のサブタイプはそれぞれ、スタ−系統樹と呼ばれている系統樹において等距離であることが判明していて、種々のＨＩＶ-1サブタイプは共通の祖先より同調して進化及び分化したことを示唆している。最近、ＨＩＶ-1に関するこのグル−プの２つの別個のウイルスが単離されて特徴付けされた。この２つのウイルスは、西中央アフリカのカメル−ン在住の患者より得られた（Ｇurter et al.,1994,Ｖanden Ｈeasevelde et al.,1994）。これらの配列、より特にはそのenv（エンベロ−プ）遺伝子は、このウイルスがＨＩＶ-1関連ウイルス（ＨＩＶ-1のＯグル−プと呼ばれるもの）の別個の範疇に属することを明らかに示している（Ｎkengasong et la.,1993）。しかしながら、ＨＩＶ-1関連ウイルスのこのグル−プ内での単離体の多様性は知られておらず、またはアフリカから外への伝播も報告されてはいない。ＨＩＶ-1の血清学的試験における一般的な制約は、疑似陽性結果と疑似陰性結果の両方を避けることであり、また同時に、以前の試験で可能であった、陽性血清の検出における感度を保持するか、または改善することも制約である。「env」遺伝子に必然的に由来する、コンセンサスペプチド（群）の使用に基づく試験は、ＨＩＶ-1-Ｏ変異体の発見が、疑似陰性結果の可能性を明るみに出されるまでは、最も理想的な解決であると認識されていた（Ｇenomic cloning a nd complete sequence analysis of a highly divergent Ａfrican human immun odeficiency virus isolate.Ｊ.Ｖirol.1994;68:1586-96:a new subtype of hum an immunodeficiency virus type 1(ＭＰＶ-5180)from Ｃameroon.Ｊ.Ｖirol.19 94;68:1581-85）。「env」ペプチド抗原との反応性が、ある種の試験ではないのに、患者において、ＡＩＤＳの臨床的特徴やそれより前に起きるリンパ節腫脹症候群が見られるのは、現在ではＨＩＶ-1-Ｏグル−プによるとされることがしばしばある（ＨＩＶ-1／ＨＩＶ-2seronegativity in ＨＩＶ-1 subtype Ｏ infected patients,Ｌ ancet 1994;343:1393- 94;Ｎew ＨＩＶ-1 subtype in Ｓwitzerland.Ｌancet 1994;344:270-271）。発明の記載本発明の目的は、診断実験室に対して、方法、特には特異的ペプチドであって、これまでは検出されにくかった抗ＨＩＶ-1抗体の検出を可能にするものを提供することにある。本発明は更に、「疑似陰性結果」の可能性を避けるための、ＨＩＶ-1_(DUR)のペプチドと、他のＨＩＶ群からの、それに対応したペプチドとの混合物に関する。本発明は更には、生物学的試料中の、ＨＩＶ-1-Ｍタイプレトロウイルスに特徴的な抗体と、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスの検出と、それらの間での区別をつけるための方法に関する。本発明は、在カメル−ンの陽性血清の女性であって、ウェスタ−ンブロッティング技術で確認された複数の試験中において、非定型な血清学的反応性を示した女性における観察より由来している。この非定形の血清学的反応性を説明するため、特には、Ｏタイプに対して修飾されてさえある、ある種の第三世代試験に対する反応性の欠如を説明するため、発明者らは、このＨＩＶ-1_(DUR)株のゲノムのある特定の部分、より特異的にはＧＡＧとＥＮＶ遺伝子の配列を決定することに興味を抱いた。しかしながら、Ｍグル−プ由来のプライマと、Ｏグル−プの既知のプライマとを用いたＰＣＲによる遺伝子増幅は、gp120のＶＰ3ル−プをコ−ドしている部分と、gp41の免疫優性領域に対しては、うまくいかなかった。ＧＡＧ領域のみが、従来技術の既知のプライマを使用して増幅することが可能であった（Ｌoussert- Ａjaka Ｉ,Ｌancet 1994;343:1393）。本発明の別の目的は、この問題を解決するプライマを決定することにある。リンパ球ＤＮＡより、糖タンパク質gp41とgp120の部分配列を、カプシドタンパク質（ＧＡＧ遺伝子）とともに決定し、このＨＩＶ-1ＤＵＲ株が、その一部に関してＨＩＶ-1−Ｏグル−プに属し、また、特にはgp41とgp120とに関してはＭグル−プとはかなり異なっていることが示された。故に、特にＨＩＶ-1_(DUR)のＧＡＧ配列に関して、Ｍグル−プの同じ領域のコンセンサス配列とは異なっている、Ｏグル−プ中のコンセンサス配列の存在を、幾つかの領域に証明することが可能であった。ＨＩＶ-1_(DUR)のＧＡＧ、gp４１、gp１２０をコ−ドする配列のクロ−ニングは、ＰＳＴ1部位を有する、Ｂluescript（登録商標）を利用して行った。増幅産物は、Ｔ3及びＴ7ユニバ−サルプライマを使用した標準的な手法でクロ−ニングするか、または先立つ（preceding）増幅のプライマを利用して直接的に配列を決定した。次いで配列を、アプライド・バイオシステムズの373Ａ自動配列決定機（ＥＤＧＤＭontigny le Ｂretonneux,Ｆrance）を利用して決定した。ヨ−ロッパ以外を旅行したことがなく、1992年にＡＩＤＳで死亡したフランス人患者より得られた、Ｏグル−プ単離体であるＨＩＶ-1_(VAU)のenv遺伝子を、発明者らは本発明の面において単離して、配列を決定した。そのエンベロ−プ配列によると、ＨＩＶ-1_(VAU)は、最近特徴付けられた二つのカメル−ンウイルスである、ＨＩＶ-1_ANT、及びＨＩＶ-1_MVP5180に関連している。env配列の系統樹的分析により、３つのウイルスが、以後本願ではＨＩＶ-1のＯグル−プと呼ぶ、一つの独立したグル−プを構成していることが明らかになった。この患者からＨＩＶ-1_(VAU)を単離したことはまた、アフリカ以外でＨＩＶ-1のＯグル−プの、ある程度の広がりが起きていることを示している。ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスの単離ＨＩＶ-1_(VAU)は、1992年に４１歳のフランス人のＡＩＤＳ患者より単離された。この患者は、1986年に、子宮頚部の癌に関連した重度のロイコ好中球減少症（leuconeutropenia）を発症している。しかしながらこの患者は次第に、日和見感染の症状を示し、循環しているＣＤ４⁺のＴ細胞の数が減少して、1992年にＡＩＤＳで死亡した。抗−ＨＩＶ-1抗体は、ＥＬＩＳＡ(Ｅlavia,Ｓanofi Ｄiagno sitics Ｐasteur and Ａbbotttest)により、1990年に最初に検出された。ヨ−ロッパ以外を旅行したことのない該患者は、静脈性の医薬を使用したことがなく、また如何なる輸血もされていなかった。アフリカ系の性交パ−トナ−は、全く同定されていない。この患者は、1971年に健常な子供を出産しているが、 1980年に出生した男子は、新生児性のＡＩＤＳを強く示唆する、症状を発症した後に、１歳で死亡した。該患者の三番目の子供は、1983年に出生しており、患者の配偶者（男）は現在も健常であって、感染していない。このウイルスの単離は、次のようにして行った。患者のＰＢＭＣ（末梢血リンパ球）に存在するＣＤ8⁺細胞をＩＯＴ8抗体（Ｉmmunotech）でコ−ティングされたビ−ズを使用して除去する。残りのＰＢＭＣをＰＨＡで刺激し、次いで健常なドナ−より得て、ＰＨＡで刺激済みのＣＤ8枯渇済みＰＢＭＣと共培養した。共培養中のウイルス増殖を、上清中の逆転写(ＲＴ)活性をアッセイすることと、ＨＩＶ-1のp24のＥＬＩＳＡ試験（Ｄupont de Ｎemoursにより販売の、診断キット）によりモニタ−した。初期の共培養より得られたウイルスを、ＣＤ8-枯渇済み、及びＰＨＡ刺激済みのＰＢＭＣ培養で、継代を数回行った。ＭＴ4細胞（Ｈara da,et al.,1985）、及びＣＥＭ細胞（Ｒey et al.,1989）はもちろん、Ｈela-ＣＤ4-ＬＴＲＬacＺ細胞株Ｐ4-2（Ｃlavel and Ｃharneau 1994）が含まれる形質転換細胞株の、ＨＩＶ-1_(VAU)による感染を幾度か試みた。ＨＩＶ-1_(VAU)の生物学的特徴付け患者のＣＤ8-枯渇済み、ＰＨＡ刺激済みＰＢＭＣと、健常なドナ−からの同様の細胞との共培養後２週間で、培養上清中のＲＴ活性のピ−クを示して、ウイルス産生が検出された。次いでこのウイルスをＣＤ8-枯渇済み、ＰＨＡ刺激済みＰＢＭＣを使用して、連続した継代を行うことができた。図１においてプレ−トＡは、ＨＩＶ-1_(VAU)の、感染済みＰＢＭＣ培養上清中での産生を表し、これはＲＴアッセイ（黒丸）と、ＨＩＶ-1p24捕獲ＥＬＩＳＡ（中抜きの丸）とで確認した。ＨＩＶ-1のp24の濃度は、ng/mlで表され、ＲＴ活性はcpm/μlで表されている。プレ−トＢでは、同じ実験を、ＡＩＤＳ患者からの標準的なＨＩＶ-1初代分離体で行った。ＨＩＶ-1_(VAU)の増殖は、ＲＴアッセイにより容易に検出できるが、ＨＩＶ-1 p24ＥＬＩＳＡによる、培養上清中のウイルス検出は、実質的に感度がよくない。図１は、ＲＴ、またはp24でアッセイしたときの、ＨＩＶ-1_(VAU)、またはＡＩＤＳ患者からの初代ＨＩＶ-1単離体での、ＰＢＭＣの増殖性感染の特徴の比較を示している。アッセイ上清中のＲＴ活性のアッセイで決定した、等量の粒子に対しては、他のＨＩＶ-1単離体の場合に比べてＨＩＶ-1_(VAU)の場合に、約２５分の１のp24が検出された。この差異は、EＬＩＳＡプレ−トのコ−ティングに使用される、ＨＩＶ-1p24に特異的なモノクロ−ナル抗体には、ＨＩＶ-1_(VAU)のgag 産物に対する弱い親和性しかないという事実による可能性がある。ＨＩＶ-1に感受性である、形質転換済みのヒトＴ細胞株で、ＨＩＶ-1_(VAU)を繁殖させる試みが幾つか行なわれたが、成功しなかった。特に、ＭＴ4細胞、またはＣＥＭ細胞の何れかと、ＨＩＶ-1_(VAU)惑染済みＰＢＭＣとの間の共培養を行っても、ウイルスは繁殖しなかった。、さらにこのウイルスは、tat遺伝子で誘導可能なlacＺ遺伝子を有する、ＣＤ4⁺ＨeＬa細胞（Ｐ4-2）を感染することができないことも判明した(Ｃlavel and Ｃharneu 1994）。同様に、ＨＩＶ-1_(VAU ₎ の複製も、複数のチンパンジ−から由来の、活性化した末梢血リンパ球で検出することができなかった。以下に詳細に記載する、ＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プ配列の分析、及び最近記載された２つのカメル−ン単離体との比較により、３つのウイルス全てはＨＩＶ-1関連ウイルスの同じグル−プに属することが示されている。更に、この比較により、該ウイルスの３つの変異体はそれぞれ、系統樹でほぼ等しく離れていることが示されている。結果的に、３つのウイルス変異体のそれぞれは、それ自身で、現在、Ｏグル−プと呼ばれているグル−プの内の、異なるサブタイプを構成している。このグル−プは、現在までに同定されていて、発明者らがＭグル−プと本願で呼んでいる、そのほかのＨＩＶ-1単離体のグル−プとは異なっている。この新規のグル−プの出現は、その起源に関しての疑問を投げかけている：Ｏグル−プはＭグル−プウイルスより発生したのか、（またはこれとは逆か？）、あるいはそれぞれのグル−プは異なる歴史を有するのか？。Ｍグル−プとＯグル −プの両方に関しては、同様の内部分岐の特徴を有しており、それぞれは、ヒトの異なるポピュレ−ションで、分岐した異なるウイルス祖先に相当していると、発明者らは考えている。現時点で入手可能な系統学的、及びウイルス学的デ−タによって、上記の２つのグル−プのそれぞれが、自然にヒトに影響したのか、それとも他の種よりヒトに導入されたのかどうかを調べることはできない。ヒト以外の霊長類に存在する、ＨＩＶ-1と同様の唯一のウイルスは、明らかに自然的に感染したチンパンジ−より単離した、ＳＩＶＣＰＺＧＡＢ単離体（Ｈuet et al. ,1990）であるが、これは明らかにＭグル−プ、及びＯグル−プからも異なっていて、これに相当するものはヒトでは発見されていない。ＨＩＶ-1_(VAU)のチンパンジ−リンバ球での複製が成功していない限り、Ｏグル−プのウイルスが最近になってチンパンジ−のウイルスより進化したとは考えにくい。Ｍグル−プよりも１５か２０年後になって、現在のみに、Ｏグル−プの流行が現れたのであろうか？３つの可能な説明がある。第一には、Ｏグル−プウイルスの祖先の、ヒトへの導入は、Ｍグル−プのものよりもより最近であると考えられる。第二には、それぞれの起源の地域では社会的条件が異なっていたので、Ｍグル−プはＯグル−プよりも速く伝播することができた。そして第三には、Ｏグル −プウイルスは、Ｍグル−プに比べてその伝播能力が低かった。このような性質は、感染患者でのより少ないウイルス負荷が低減した伝播性と関連しているＨＩＶ-2の全世界的伝播が顕著に起きていないことを説明すると、提案されている (ＤeＣock et al.,1993)。この点に関して、ＨＩＶ-1のＯグル−プに感染した患者でのウイルス負荷に関するデ−タは入手できないが、これらのウイルスの病原性は、ＨＩＶ-1のものとは異なっているとはいえないようである。ＨＩＶ-1_(VAU ₎ が単離された患者は、ＨＩＶ-1_MVP5180Ｏグル−プ単離体が得られた患者のようにして、死亡した。しかしながら、ＨＩＶ-1_(VAU)患者の自然な感染歴はいまだ不明であるが、ＡＩＤＳに似た症候群の第二子の死亡日から示唆されるように、この患者は1980以前に感染したという幾つかの兆候がある。本発明は、図６に記載の配列で、配列認識番号５にも記載の、「vau」とよばれる配列を具備したenv遺伝子によりコ−ドされる構造タンパク質と同等の免疫学的特徴を有する構造タンパク質を有する、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスの核酸配列の如何なる変異体、またはＯグル−プの同等の、如何なるウイルスに関する。本発明は更に、本発明による抗原、あるいは本発明による抗原を、一方において、一つ以上のＨＩＶ-1のＯグル−プウイルス若しくはそのほかの変異体ウイルスと、また他方において、一つ以上の、ＨＩＶ-2、及び／またはＨＩＶ-1、に由来する抽出物と組み合わした混合物の何れかを含む組成物であって、該組成物が、適宜標識されている、組成物に関する。如何なるタイプの適切な標識（酵素性、蛍光性、放射性等）も使用することが可能である。核酸本発明は、ＤＮＡ、またはＤＮＡ断片に関し、特にはＰＣＲやそのほかの遺伝子増幅法に使用可能な、ＲＮＡ、cＤＮＡ、またはプライマ由来の、クロ−ン化したＤＮＡとＤＮＡ断片で、ＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスのＲＮＡ、またはＤＮＡ由来のものに関する。本発明は、より特異的には、等価なＤＮＡ全てに関し、特にはＨＩＶ-1_(VAU)ＤＮＡ、特には図６に記載され、「vau」と呼ばれている配列に相当する配列を具備したＨＩＶ-1_(VAU)株のenv領域をコ−ドする配列と、相同な配列を有するＤＮＡに関する。ＨＩＶ-1のＭグル−プとの相同性は少なくとも５０％、好ましくは７０％、更に有益には９０％である。慨して本発明は、ＨＩＶ-1のＯグル−プのレトロウイルスのＤＮＡまたはＲＮＡとハイブリダイズすることができる、等価なＤＮＡ（またはＲＮＡ）に関する。本発明は更に上記したＤＮＡ配列に相当する、ＲＮＡ配列に関する。本発明は更に、配列認識番号７に記載の配列か、配列認識番号７の配列にハイブリダイズする配列を具備した、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのインテグラ−ゼ遺伝子に関する。本発明はまた、上記のＤＮＡに相当するＲＮＡに関する。本発明の主題はまた、上記したＤＮＡ、またはＤＮＡ断片にコ−ドされるペプチド、またはポリペプチドである。ＶＡＵ配列あるいはＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのインテグラ−ゼ遺伝子、特には少なくとも９つのヌクレオチドを具備したオリゴヌクレオチドに由来するオリゴヌクレオチドは、ＰＣＲ技術やそのほかの遺伝子増幅技術により、生物学的試料中、培養細胞中、または細胞抽出物中の、ＨＩＶ-1のＯグル−プウイルスＤＮＡまたはＲＮＡの検出に使用することが可能である。これらの配列は遺伝子増幅用のプライマとして、または遺伝子増幅産物の特異的な検出用のプロ−ブの何れかに使用することが可能である。さらにハイブリダイゼーションプロ−ブとして利用されることが可能なものには、増幅産物、またはそれに相当する、化学合成（Ａpplied Ｂiosystems）により得られる合成配列がある。本発明はまた、ハイブリダイゼーション反応にプロ−ブとして使用可能で、高厳密度条件下でのＨＩＶ-1_(VAU)変異体のゲノムの一部との反応を許容する、少なくとも１００ヌクレオチドの、如何なる断片をも含んでいる。ＨＩＶ-1_(VAU)env遺伝子のクロ−ニングと配列決定ＨＩＶ-1_(VAU)ＤＮＡに関する、初回のＰＣＲ増幅に対しては、全ＤＮＡをＨＩＶ-1_(VAU)感染ＰＢＭＣより抽出し、以下の縮重したプライマを利用して、pol 遺伝子のセグメント（インテグラ−ゼ領域）を増幅した：反応液は、５０mＭＫＣl、１０mＭトリス-ＨＣl(pＨ8.9)、１.５mＭＭgＣl₂ 、０.１mＭゲラチン、０.２mＭ dＮＴＰ、１単位のＴaqポリメラ−ゼ（Ａmersham ）を含有している。ＰＣＲは、９２℃１０秒、５０℃１分、７２℃４０秒、を４３回の熱サイクルで実行した。得られた増幅産物をpＢluescriptベクタにクロ−ニングして、ph4クロ−ンを作成し、1994年10月20日にＣＮＣＭへ、番号Ｉ-1486の下に寄託し、次いでこれをプロ−ブとして使用して、ＨＩＶ-1_(VAU)感染細胞より得られ、またＥcoＲＩで消化済みの、低分子量ＤＮＡのラムダライブラリ−のスクリ−ニングを行った。簡潔にいうと、ＨＩＶ-1_(VAU)感染済みＰＢＭＣを、ＰＨＡで刺激済み且つ、ＣＤ8⁺枯渇済みの細胞と２４時間共培養し、その後で高い細胞病変効果（ＣＰＥ）が見られた。次いで低分子量ＤＮＡをハ−トの方法（Ｈirt,1967）により抽出して、酵素ＥcoＲＩで消化した。このＤＮＡに対して行った、以前のサザンブロット分析では実際に、ＨＩＶ-1_(VAU)ゲノムにはただ一つのＥcoＲＩ部位があることが示されており、全ウイルスゲノムを表す、非インテグレ−ト型の環状ＤＮＡ種のクロ−ニングが可能である。得られる消化産物をアガロ−スゲル電気泳動にかけて、約８−１２kbのサイズのＤＮＡのポピュレ−ションを精製して、Ｅco ＲＩで消化済みのラムダＺapＤＮＡ（Ｓtratagene）に連結した。カプシド形成後、プレ−ティングと、³²Ｐで標識したph4ＤＮＡでのハイブリダイゼーションによるスクリ−ニングで、クロ−ン、λＨ34が陽性として同定されて、増幅にかけられた。ＥcoＲＩ挿入物を精製して、超音波処理し、「ショットガン」技術により、酵素ＳmaでＩ消化済みの、リン酸塩処理済みベクタＭ13mp18内でクロ−ニングした。得られた１５０クロ− ンを373ＡＤＮＡ配列決定機（Ａpplied Ｂiosystems）で配列決定し、得られた配列をウィスコンシンＧＣＧＤＮＡ分析パッケ−ジを使用して単一の配列に組み立てた。この配列を分析して、多くのナンセンスコドンを、全てのタンパク質読み取り枠内に見出したが、これは過度に変異したゲノムを強く示唆している(Ｖartania n,et al.,1991)。この配列は不安定であるため、結果的にはＨＩＶ.1_(VAU)感染済みＰＢＭＣ由来の全ＤＮＡと、λＨ３４配列より由来した以下のオリゴヌクレオチドプライマを使用して、ＰＣＲにより、ＨＩＶ-1_(VAU)のenv遺伝子を増幅させた：ＰＣＲ増幅を、９２℃１５秒、５２℃１分、６０℃２分、７２℃２分、を３５回の熱サイクルにより行った。サイズが３.５kbの、得られた増幅産物をＭ13mp1 8ベクタへクロ−ニングして、連続反応により、すなわちＭ13ユニバ−サルシ− ケンシングプライマを一回目に使用し、次いで上流配列より推定したプライマを使用して、配列決定を行った。ヌクレオチドとペプチドの配列分析は、ウィスコンシンＧＣＧＤＮＡ分析パッケ−ジを使用して行った。ＨＩＶ-1_(VAU)のenv遺伝子は、シグナルペプチドを含む、全８７７アミノ酸をコ−ドしている。ＨＩＶ -1_(VAU)のenv遺伝子のヌクレオチド配列は、配列認識番号５の配列に相当している（図３参照）。プロ−ブとしての核酸の利用本発明はまた当然のこととして、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのキャリア−であることが疑われている患者に由来する、血清試料、その他の生物学的液体、または組織中に、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスが存在すること、あるいはその逆を検出するために、ＤＮＡ、cＤＮＡ、若しくはその断片、または組み換えプラスミド、若しくはその断片を含んだ、他の等価なベクタのいずれかをプロ−ブとして利用することにも関している。これらのプロ−ブは、適宜標識されている(放射性、酵素性、または蛍光性のような標識)。ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルス、またはＨＩＶ-1_(VAU)の変異体を検出するための方法を実行するために極めて有益であるプロ−ブは、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスゲノムに相補的なＤＮＡ全体、またはその一部、あるいは特には種々のクロ−ンに含まれる断片を具備することを特徴としていてもよい。 env領域の全て、または一部を含む、ＨＩＶ-1_(VAU)のcＤＮＡ断片について、より特異的に言及する。ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスの検出のためのこの方法、または診断キットにおいて使用されるプロ−ブは、すでに記載されているプロ−ブのみには決して限定されない。該プロ−ブは、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルス、ＨＩＶ-1_(VAU)の変異体、または構造的に同等のウイルス、の何れかのゲノム由来のヌクレオチド配列を具備しているが、ただしＡＩＤＳの可能性のある人に由来する生物学的液体を使用して、ＨＩＶ-1_(VAU)のＤＮＡ、またはＲＮＡとのハイブリダイゼーションにより、ＨＩＶ-1のＯグル−プウイルス、特にはＨＩＶ-1_(VAU)を検出することが可能なものでなくてはならない。特に有益なのは、ＨＩＶ-1とハイブリダイズしたときに、Ｏグル−プに属するＨＩＶ-1と強く反応し、Ｍグル−プに属するＨＩＶ-1と弱く反応するプロ−ブである。限定するためのものではない例を挙げると、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのインテグラ−ゼ遺伝子配列（配列認識番号７）より構築されたプロ−ブは、特許ＥＰ 178978等に記載されているハイブリダイゼーション条件下でＨＩＶ-1とハイブリダイズすると、Ｏグル−プのＨＩＶとは強く反応し、Ｍグル−プのＨＩＶとは弱く反応する。検出はすでに知られている方法自体で行えるが、特には次のようである：まずプロ−ブを、生物学的液体（例えば髄液、唾液等）に含まれる細胞より由来した核酸、または上記の液体自体と接触させることにより行う。ただし、後者の場合には、当該核酸は、上記プロ−ブとのハイブリダイゼーションを許容する条件下で、上記プロ−ブとハイブリダイゼーションするようにされている。そして、産生するかもしれないハイブリダイゼーションを検出する。ハイブリダイゼーション反応が関わる、上記の診断はまた、それぞれＨＩＶ-1_(VAU) 、ＨＩＶ-1、及びＨＩＶ-2より由来したプロ−ブの混合物を使用して行うことができる。ただし、望むＨＩＶウイルスのタイプを区別する必要は、必ずしもない。本発明の主題はまた、ＨＩＶ-1のエンベロ−プタンパク質をコ−ドした配列、またはインテグラ−ゼをコ−ドした配列を含む、発現ベクタでもある。本発明はＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスの存在、またはその逆を、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのキャリア−であることが疑われている患者より由来した血清試料中、またはそのほかの生物学的液体や組織中に検出するための組成物を具備している。これらの組成物は、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスゲノム、特にはＨＩＶ-1_(VAU)ウイルス、若しくはＨＩＶ-1_(VAU)の変異体のenvタンパク質をコ−ドする領域、若しくはその一部を含んだＤＮＡ断片より得られるか、または誘導されるヌクレオチド配列に由来したプロ−ブを、少なくとも一つ具備することを特徴とする。有益には、上記した組成物はまた、ＨＩＶ-1、またはＨＩＶ-2に由来する配列から得られるプロ−ブを具備している。そのほかの診断組成物は、Ｏサブグル−プのレトロウイルス、またはこのレトロウイルスの変異体を遺伝子増幅する際に使用することが可能な、本発明のプライマを具備する。抗原、特にはタンパク質及び糖タンパク質本発明は、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）のレトロウイルス性タンパク質、または該タンパク質の少なくとも一部を具備した天然若しくは合成の、ペプチド、若しくはポリペプチドであって、ＨＩＶ-1のＯグル−プのＶＡＵ株、またはＨＩＶ-1のＯグル−プのＤＵＲ株での感染後に得られる血清より単離することが可能な抗体によって認識されうるものに関する。本発明は、ＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスの外部エンベロ−プタンパク質で、配列認識番号５に相当する配列を具備した遺伝子でコ−ドされているものに関する。本発明の好ましい態様では、このタンパク質は更に、配列認識番号６に相当し、図３に記載され、アミノ酸残基の１から５２６を具備したアミノ酸配列を具備することで特徴付けられる。本発明の主題はまた、如何なるポリペプチド、または該配列より由来の変異体であって、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスにより誘導される抗体により認識されうるエピト−プを有するものでもある。上記のタンパク質は糖付加型、または非糖付加型の形態で得られる。本発明の主題はまた、配列認識番号８に相当し、図３に記載され、アミノ酸残基５２７から８７７の間のアミノ酸を具備した、エンベロ−プ膜貫通型タンパク質でもある。この膜貫通型タンパク質は、本発明の範囲内においては、糖付加型、または非糖付加型である。本発明は、ＨＩＶ-1_(VAU)ゲノムのコ−ド配列の発現により得られ、ＨＩＶ-1₍ _VAU) のものと同等の免疫学的特徴を有する、全ての抗原、特にはタンパク質、糖タンパク質、ポリペプチド、またはペプチドに関する。該抗原は、本発明の範囲内においては、同等であるといわれる。ただしこれらは、同じ抗体、特にはＨＩＶ-1_(VAU)に感染した患者より得られた血清より単離されうる抗体により認識されうるものであること。特には、本発明の主題は、化学的に合成されるペプチド、またはポリペプチドであって、そのアミノ酸配列が、図３に表示の配列であるか、または同等のペプチド若しくはポリペプチドである、ＨＩＶ-1_(VAU)エンベロ−プタンパク質のものに含まれるものである。前記の同等なペプチド、ポリペプチド、タンパク質、または糖タンパク質の中には、由来する元の抗原との免疫学的交差反応性があるかぎり、化学的合成、または遺伝子工学的に調製される上記の抗原の断片、またはペプチドが含まれるべきである。言い換えると、本発明は、上記した抗原のエピト−プに相当するが同等であるエピト−プを有し、また同じ抗体により認識されうる、どのようなペプチド、またはポリペプチドにも関する。上記したポリペプチド、または抗原をコ −ドするＤＮＡ配列に相当するＤＮＡ配列の発現産物は、前記の後者のタイプのポリペプチドの一部を形成している。より特には、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスに由来するか、または遺伝子工学的、若しくは通常の化学合成により産生され、本発明の前後関係において非常に興味がもたれる上記抗原は、本発明のＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスと、ＨＩＶ-1及びＨＩＶ- 2のグル−プのウイルスとを明確に区別することを可能にする、抗原である。この点に関して、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのエンベロ−プタンパク質レベルにおいてはもちろん、ＰＭタンバク質の外部の免疫優性エピト−プのレベルにおいても、かなりの差異が見られている。gag及びpolタンパク質は、エンベロ−プタンパク質よりも、ＨＩＶ-1とのより高い類似度を示しているようである。本発明は更に、ＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プの膜貫通型の糖タンパク質に免疫優性領域と同一であるペプチド、またはポリペプチドに関する。この領域は図３に表示されている。この領域の好ましいポリペプチドは例えば、配列ＣＫＮＲＬＩＣを含むか、またはこの配列に相当したものを含むものである。これらは配列ＲＬＬＡＬＥＴＦＩＱＮＷＷＬＬＮＬＷＧＣＫＮＲＬＩＣに相当しているか、この配列を具備したペプチド、またはポリペプチドであってもよい。以下で「vau」という名前で呼ばれる、別の好ましいペプチドは以下の配列に相当するが、またはこの配列、若しくはこの配列の一部であって、ＨＩＶ-1_(VAU ₎ レトロウイルスのＲＡＲＬＬＡＬＥＴＦＩＱＮＱＱＬＬＮＬＷＧＣＫＮＲＬＩＣＹＴＳＶＫＷＮＫＴに対する抗体により認識されうるものを具備している。この配列のポリペプチド変異体は例えば、ＨＩＶ-1_(MVP5180)、及びＨＩＶ-1₍ _ANT70) 単離体のポリペプチドに対して図４に表示されているものである。これらのポリペプチドはまた、例えばアミノ酸残基による保存性の置換のような、挿入、及び／または欠失、及び／または置換による、先行物に由来するものであってもよい。本発明は、照会番号Ｉ-1542の下、1995年２月23日にＣＮＣＭに寄託されたＨＩＶ-1-ＯＤＵＲウイルス由来のペプチド、あるいは、アミノ酸の置換、欠失、または付加により、配列が上記のものとは異なっているペプチドであるが、上記のものの抗原性の特徴を保持しているペプチドに関する。本発明の範囲に含まれるその他のペプチドを、以下に定義している。故に、本発明の好ましいペプチドは、図８に表示のＧＡＧ配列中か、またはＧＡＧ配列と免疫学的に同等な配列でＨＩＶ-1-ＯＤＵＲウイルスの変異体由来のものの中に含まれる、少なくとも４つの連続したアミノ酸を有するペプチドであって、該免疫学的に同等な配列が、図８のＧＡＧ配列に含まれる配列、ＡＨＰＱＱＡ,ＬＷＴＴＲＡＧＮＰのうち少なくとも一つをも特異的に認識する抗体により認識されるものである、ペプチドである。好ましくは、このペプチドは、アミノ酸配列が以下の配列、のうちの−つか、相当する免疫学的に同等の配列の何れかの中に含まれるペプチドであって、このペプチドは、上記配列のうちの一つの、少なくとも４つの連続したアミノ酸配列を含んでいる、ペプチドからなっている。また好ましくは、このペプチドは、アミノ酸配列が以下の配列、のうち一つか、または相当する免疫学的に同等の配列の何れかに含まれるペプチドであって、このペプチドは、上記配列のうちの一つの、少なくとも４つの連続したアミノ酸配列を含んでいる、ペプチドからなっている。本発明において特に好ましいペプチドは、アミノ酸配列ＮＰＥＩ(9)、またはアミノ酸配列ＡＶＥＥＫＡＦＮＰＥＩＩＰＭＦＭ(10)を含むペプチドであって、より特には、アミノ酸配列が、ＩＧＧＨＱＧＡＬＱ(23)、ＲＥＰＴＧＳＤＩ(24)のうちの一つ、または相当する免疫学的に同等の配列のなかに含まれる、ペプチドであって、このペプチドは、上記配列のうちの一つの、少なくとも４つの連続したアミノ酸配列を含んでいる、ペプチドはもちろん、アミノ酸配列が以下の配列、または相当する免疫学的に同等の配列の何れかの中に含まれるペプチドであって、このペプチドは、上記配列の少なくとも４つの連続するアミノ酸を含んでいる、ペプチドである本発明は、ペプチド（２３）、（２４）、及び（２５）はもちろん、免疫学的に同等の配列をコ−ドする核酸配列だけでなく、これらの核酸配列の少なくとも一つを具備した組成物にも関する。本発明は更に、ＨＩＶ-1のＭグル−プ株とＨＩＶ-1のＯグル−プ株とに関する検出と区別のための、少なくとも一つの上記核酸の使用に関する。上に定義した、ＨＩＶ-1-ＯＤＵＲウイルス由来のペプチドはまた、本発明の範囲に含まれるが、該ペプチドは、ＨＩＶ-1-ＯＤＵＲウイルスに由来する、図９に表示のgp120のＶＰ3ル−プ、または相当する免疫学的に同等な配列の、少なくとも４つの連続するアミノ酸を含んでいるが、該免疫学的に同等な配列は、以下の配列、のうち少なくとも一つをも特異的に認識する抗体により認識される。このペプチドは好ましくは、またはこの配列の一部であって少なくとも４つのアミノ酸を含むもの、の何れか、または、 (b)１以上のアミノ酸が１以上のアミノ酸で置換されていて、(a)の配列とは別個である、アミノ酸配列（ただし、当該ペプチドには、上記ペプチドに対する血清との反応性が保持されていること）；または、 (c)１以上のアミノ酸が欠失、または付加されていて、(a)または(b)とは別個である、アミノ酸配列（ただし当該ペプチドには、(a)のペプチドに対する血清との反応性が保持されていること）；または、 (d)相当する、免疫学的に同等な配列、若しくはその一部；のうち何れかを含んでいる。また好ましくは、このペプチドは、配列ＫＥＩＫＩ(１２)、または配列ＥＲＥＧＫＧＡＮ(１３)、または配列ＧＰＭＡＷＹＳＭ（１６）の何れかを含んでいる。特に好ましい方法においては、上に定義されるペプチドには、アミノ酸配列ＣＶＲＰＧＮＮＳＶＫＥＩＫＩ(14)、またはＱＩＥＲＥＧＫＧＡＮＳＲ(15)の何れか一つが含まれる。上に定義した、ＨＩＶ-1-ＯＤＵＲウイルスより由来するペプチドはまた、本発明の範囲に含まれるが、該ペプチドは、その全アミノ酸配列が、ＨＩＶ-1-ＯＤＵＲウイルスの変異体より由来する、図９に表示のgp41の免疫優性領域内の配列、または相当する免疫学的に同等の配列内に含まれる、少なくとも４つの連続するアミノ酸を含むが、該免疫学的に相同な配列は、以下の配列、の少なくとも何れか一つをも特異的に認識する抗体により認識される。このペプチドは好ましくは、配列ＲＬＬＡＬＥＴＬＭＱＮＱＱＬ(17)、配列ＬＮＬＷＧＣＲＧＫＡＩＣＹＴＳＶＱＷＮＥＴＷＧ(18)、またはこのペプチド（１８）の一部で以下を含むもの、を含んでいるペプチドである： (a)配列ＣＲＧＫＡＩ(19)、またはＱが、適切な場合には、Ｋ以外の異なるアミノ酸で置換された配列ＳＶＱＷＮ(20)、あるいはこの二つの配列両方、 (b)１以上のアミノ酸が２つのアミノ酸で置換されていて、(a)の配列とは異なるアミノ酸配列（ただし当該ペプチドは、(a)のペプチドに対する血清との反応性を保持していること）、 (c)１以上のアミノ酸が欠失、または付加されていて、(a)または(b)とは異なるアミノ酸配列（ただし当該ペプチドは、(a)のペプチドに対する血清との反応性を保持していること）、または、 (d)相当する免疫学的に同等な配列、若しくはその一部。また好ましくは、このペプチドは、以下の特徴のうち一方、または他方を有している：・少なくとも８つのアミノ酸配列を含む、そのＮ末端配列は、ＨＩＶ-1-ＬＡＩ株のgp41の免疫優性領域内に含まれるＲＩＬＡＶＥＲＹ配列に対して形成された抗体により免疫学的に認識されない；・ＨＩＶ-1-ＬＡＩ株のＳＧＫＬＩＣペプチドに対して形成された抗体により認識されない；・以下の二つの配列の何れかを含んでいる：ＶＡＵペプチドの合成「連続フロ−（continuous flow）」Ｆmoc法を利用した、通常の固相ペプチド合成技術により、ＶＡＵペプチドを調製した。このペプチドは、Ｍilligen9050 ＰＥＰ合成機と、「Ｍillipore」ＰＥＧＰＡＭ」レジンとを使用して、最初のＣ末端アミノ酸を置換して調製した。アミノ酸側鎖は、以下の基で保護した：アルギニンに対してはＰmc；アスパラギン、グルタミン、及びシステインに対してはＴrt；リジンに対してはＢoc；グルタミン酸に対してはtＢuエステル；セリン、スレオニン、及びチロシンに対してはtＢuエ−テル。一過性のFmoc基は、ＤＭＦ中の２０％ピペリジン溶液で除去した。それぞれのアミノ酸のカップリング反応は、６等量のＤＩＰＣＤＩ及びＨＯＢＴで行った。残基の中には、特にアルギニン（１位及び２３位）、システイン（１９位及び２６位）、アスパラギン（１１位）、グルタミン（１０位、１２位、及び１３位）、アラニン（４位）、イソロイシン（９位）、及びロイシン（２位、３位、１４位、及び１５位）は、二重のカップリングが必要であった。カップリング後、レジンを真空下で乾燥した。ペプチドを、室温で４時間Ｋ試薬による処理で支持体より開裂させた。粗ペプチドを沈殿させ、エチルエ−テルで洗浄した。産生物を高圧液体クロマトグラフィ−（ＨＰＬＣ:high pressure l iquid chromatography）で精製した（ＷＡＴＥＲＳＬＣＰＲＥＰ 4000装置、ＷＡＴＥＲＳＤelta Ｐak Ｃ18 40Ｘ100mmカ−トリッジ、流速30ml／分、アセトニトリル/0.1％ＴＦＡのグラジエント）。該ペプチドを含む画分を合わせて、ロ −タリ−エバポレ−タ−で濃縮後、凍結乾燥した。環状化ペプチド（0.025mＭ）を10mＭの酢酸アンモニウム溶液に溶解した。１Ｍの水酸化アンモニウム溶液で、pＨを8.5に調節した。pＨは、３または４時間後に再び調節した。環状化は、ＨＰＬＣ（ＷＡＴＥＲＳＤelta Ｐak Ｃ18 ５μカラム、アセトニトリル／0.1％ＴＦＡのグラジエント）で、２１４nm、及び２８０nm でモニタ−した。１５時間で環状化は完了した。９７−１００％の酢酸を使用して、pＨを６にして、この溶液を凍結乾燥し、ついで粗ペプチドと同じ条件下で精製した。このペプチドをＨＰＬＣと、エレクトロスプレ−技術（ＦＩＳＯＮＶＧＴri o 2000分光器）を利用したマススペクトロスコピ−により検査した。Ｆmoc:９−フルオロエニルメチルオキシカルボニル；Ｐmc:８−メチルペンタン−６−スルフオニルクロマン； Trt:トリトリル；Ｂoc:Ｔertブチルオキシカルボニル； tＢu:tertブチル；ＤＭＦ:ジメチルホルムアミド；ＤＩＰＣＤＩ:ジイソプロピルカルボジイミド；ＨＯＢＴ:1−ヒドロキシベンゾトリアゾ−ル；ＴＦＡ:トリフルオロ酢酸試薬Ｋ:フェノ−ル／水／チオアニソ−ル／エタンジチオ−ル／ＴＦＡ；２.５ ml／２.５ml／２.５ml／１.５ml／４１ml。ＨＩＶ-1_(VAU)エンベロ−プタンパク質のアミノ酸と、その他のＨＩＶの相当する配列との比較ＨＩＶ-1_(VAU)に感染した患者由来の、一連の血清試料の、ウェスタ−ン−ブロット分析を図２に示してある。ＨＩＶ粒子(ＬＡＶ,ＢＬＯＴ,ＳＡＮＯＦＩＤＩＡＧＮＯＳＩＴＩＣＰＡＳＴＥＵＲ)由来のタンパク質で、電気泳動により分離されたものを有してる、ニトロセルロ−スのストライプを、同じ血清試料でインキュベ−ションし、その反応性を、製造業者推奨の方法により評価した。得られた結果は以下のようであった：ステップ１：ＨＩＶ-1_(VAU)患者から、1992年２月に得た血清試料と反応させた、ＨＩＶ-2特異的タンパク質；ステップ２−７：ＨＩＶ-1陽性血清；２：ＨＩＶ-1_(VAU)患者より、1990年11月に得た血清；３：ＨＩＶ-1_(VAU)患者より、1990年12月に得た血清；４：ＨＩＶ-1_(VAU)患者より、1991年２月に得た血清；５：ＨＩＶ-1_(VAU)患者より、1992年２月に得た血清；６：陰性の対照；７：陽性の対照（ＨＩＶ-1に感染した人より得た血清）。タンパク質の名前とサイズ（ｋＤ）を余白に示した。図３はＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プのアミノ酸配列を、ＨＩＶ-1-ＬＡＩ参照用単離体（Ｗain-Ｈobson,et al.,1985）の相当するものと整列させたものである。シグナルペプチド、ＶＰ3ル−プ、及びgp41免疫優性エピト−プを網掛けで示した。外部エンベロ−プ糖タンパク質gp120と、膜貫通型gp41との間の開裂部位を矢印で示した。アミノ酸の間の垂直な線は完全な一致を示し、コロン（：）は高い相同性を示し、また点(.)はそれぞれのアミノ酸間での限られた相同性を示す。ウィスコンシンのＧＣＧパッケ−ジのＧＡＰプログラムを使用して、整列を行った。ＧＡＰとＢＥＳＴＦＩＴプログラムの元のバ−ジョン(1.0)は、ニ−ドルマンとバンシュ（Ｎeedleman and Ｖunsch,Ｊ.Ｍol.biol.48,443.453(1970)）と、スミスとウォ−タ−マン(Ｓmith and Ｗaterman,Ａdv.Ａppl.Ｍath.2;482-489(198 1))の詳細な研究報告に基づき、ポ−ル・ヒバ−リ（Ｐaul Ｈaeberli）が記載したものである。この限定整列はポ−ル・ヒバ−リにより開発されて、バ−ジョン 3.0に組み込まれた。そしてこれはフィリプ・マルケス（Ｐhilip Ｍarquess）による単一のプログラムに融合されて、バ−ジョン4.0になった。整列中のギャップ欠失のペナルティ−は、文献(Ｒechid,Ｖingron and Ａrgos ＣＡＢＩＯＳ 5:1 07-113(1989))で示唆されているようにして修飾した。図３の整列は、２、３のドメインがあちらこちらで保持されている、より高い分岐度の、数多くの領域を示している。この保持領域は、通常のＨＩＶ-1単離体でも保持されている領域にほぼ対応する（Ａlizon et al.,1986,Ｂenn et al.,1 985）。分岐したドメインの中では、中和決定基とも呼ばれる（Ｊavaherian et al.,1990,Ｊavaherian et al.,1989,Ｍatsushita et al.,1988）ＶＰ3ル−プが、明らかに最も分岐している（ただし、ル−プを限定している二つのシステインは保持されている）。ＨＩＶ-1-ＬＡＩではＧＰＧＲＡＦである、ル−プのキャップ配列は、ＨＩＶ-1_(VAU)ではＧＰＭＡＷＹである。キャップのこのユニットは、カメル−ンのＯグル−プ単離体（ＨＩＶ_(ANT70)）のものに相当しているが(Ｖan den Ｈeas evelde et al.,1994)、該モチ−フがＧＰＭＲＷＲである、その他のＯグル−プ単位体（ＨＩＶ_MVP5180）のものとは異なっている。エンベロ−プ全体においては、全部で２９の、可能性のあるＮ-糖付加部位が同定され、このうちの１３が、その他のＨＩＶ-1エンベロ−プタンパク質と比較して、保持されている。全部で１９のシステインが見られ、該タンパク質の全体の折畳み構造が保持されていることを示しているが、５つの非保持システインが見られている。図４は種々のＨＩＶ-1単離体における、膜貫通型エンベロ−プ糖タンパク質の外部領域中の免疫優性ペプチドの、マルチプル整列を示している。配列は全て、ＨＩＶ-1-ＬＡＩ参照用配列と比較してある。ハイフンはＨＩＶ-1-ＬＡＩとの相同性を示す。整列は、ウィスコンシンＧＣＧパッケ−ジのＰＩＬＥＵＰプログラムを使用して行った。ＰＩＬＥＶＰプログラムでは、樹状図で表示される組み立て戦略をＵＰＧＭＡとよんでいて、これは代数的平均を利用した、「非偏重（unweighted）」ペア− グル−プ法を意味している（Ｓmith,Ｐ.Ｈ.Ａ.Ｓokal,Ｒ.Ｒ.(1973)Ｎumerical Ｔaxonomy(pp.230-234),Ｗ.Ｈ.Ｆreeman and Ｃompany,Ｓan Ｆrancisco,Ｃalif ornia,ＵＳＡ）。ＰＩＬＥＶＰでのそれぞれのペア−の整列には、ニ−ドルマンとバンシュの方法を使用した（Ｎeedleman and Ｗunsch,Ｊournal of Ｍolecula r Ｂiology 48:443-453(1970)）。図４に示されるように、ＴＭタンパク質の外部領域の免疫優性エピト−プのアミノ酸配列は、その他のＨＩＶ-1やＨＩＶ-2の単離体のものとは、実質的に異なっている。しかしながら、ＨＩＶ-1とＨＩＶ-2ウイルスの間で保存されている多くのアミノ酸は保持されていた。ある特定のアミノ酸が、Ｏグル−プ間のみで保存されていることが判明したが、２６アミノ酸のペプチド中の２１位のリジン、７位のスレオニン、及び１１位のアスパラギンがそうである。ＨＩＶ-1_(VAU)患者由来の血清の一つ、そしておそらくはその他のＯグル−プウイルスに感染した患者由来の血清によっては、通常のＨＩＶ-1エンベロ−プ抗原の検出がされないことが、上記の差異により説明がつく。全体では、ＨＩＶ-1-ＬＡＩと、ＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プ配列の比較では、５０％の相同性が示された。ＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プ配列はまた、その他の代表的なＨＩＶ（報告済みで配列が決定されている、ＨＩＶ-1のＯグル−プの２つのメンバ−である、ＨＩＶ-1_ANT70、及びＨＩＶ-1_MVP5180）、並びに代表的なＳＩＶとも比較した。この分析の結果を表１に示したが、これによりＨＩＶ-1_(VAU)がＯグル−プに属することが確立された。ＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プはＨＩＶ-1_ANT70のエンベロ−プとは７０％相同で、ＨＩＶ-1_MVP5180とは７１％相同である。一般的なＨＩＶ-1のサブタイプのほとんどでは、エンベロ−プのレベルでの相同性は、同等であり、７４％から８０％の範囲であった。ＨＩＶ-1_(VAU)、ＨＩＶ-1ウイルスの系統樹中のその他のメンバ−、及び最近報告されたＯグル−プ中の２つのウイルスの間の関係を、envの膜貫通領域のヌクレオチド配列を利用した、非偏重型節減（unweighted parsimony）の系統樹を構築して、分析した。この分析の結果は、図５に示してあるが、この図中の番号は、ヌクレオチドの変化の数を示してある。図５は、ＨＩＶ-1_(VAU)が他の２つのＯグル−プとはほぼ等しく離れていることと、全体では上記の３つのウイルスがそれぞれほぼ等しく離れていることとを示している。実際には、ＨＩＶ-1 ＭＶＰ5180と、ＨＩＶ-1_(VAU)との間のヌクレオチドの変化は、分析したゲノムの断片中では１８３であり、ＨＩＶ-1_ANT70とＨＩＶ-1_(VAU)との間では２１３である。この分岐の特徴は、その他のＨＩＶ-1のサブタイプ全てに存在するものと同等であり、二つの異なるサブタイプ間での単一のヌクレオチドの変化は１５７（サブタイプＥからサブタイプＦ）から２１９（サブタイプＡからサブタイプＤ）の範囲であった。表１は、ＨＩＶ-1に関連した、異なるウイルスのエンベロ−プ配列の比較である。番号は、ＧＡＰプラグラムを利用して計算した、エンベロ−プ配列間でのアミノ酸相同性の割合を示す：ＨＩＶ-1ＡＮＴ70の場合には、外部エンベロ−プタンパク質のみを比較に使用した。ＨＩＶ-1_(VAU)抗原を具備した組成物慨して本発明は、生物学的試料、特にはＨＩＶ-1_(VAU)、またはＨＩＶ-1_(VAU) 抗原の少なくとも一つに対する抗体と接触させられた人に由来する生物学的試料中での、存在をin vitroで検出するために使用可能な、如何なる組成物にも関する。この組成物は、特許出願ＥＰ 84401,834及びＥＰ87400,1514に記載の診断技術を使用して、ＨＩＶ-1のＯグル−プによる感染の選択的診断に適用することが可能である。本発明の背景事情の範囲内で、ＨＩＶ-1_(VAU)に対して産生された抗体により認識されることが可能な抗原性決定基を具備した如何なる組成物(例えば組み換え抗原、ペプチド、またはＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プの配列で定義される、化学的に合成されたペプチド)も使用可能である。この点に関して、本発明はより特には、少なくとも一つのＨＩＶ-1_(VAU)エンベロ−プタンパク質を有する組成物に関する。例としては、ＨＩＶ-1_(VAU)のgp41タンパク質の５９０−６２０の全領域に対応する、エンベロ−プタンパク質に由来する、タンパク質、糖タンパク質、若しくはペプチド、あるいは上記領域の一部であって、ペプチド-ＴＦＩＱＮ-または -ＷＧＣＫＮＲ-のようなＨＩＶ-1_(VAU)特異的なものがあるであろう。本発明は更に、組み換え型、若しくは合成の、ＨＩＶ-1_(VAU)タンパク質、及び／または糖タンパク質、及び／またはペプチドと、抽出、溶解、組み換え、または化学合成で得られる、ＨＩＶ-1、及び／またはＨＩＶ-2、及び／または別の、ＨＩＶ-1のＯグル−プに由来した、タンパク質、及び／または糖タンパク質、及び／またはペプチド、及び／または上記のタンパク質、または糖タンパク質由来であって、ＨＩＶ-Ｌ及び／またはＨＩＶ-2、及び／またはＨＩＶ-1のＯグル−プにより誘導される抗体により認識されうるペプチド、とを組み合わせた組成物に関する。診断用組成物であって、ＨＩＶ-1_(VAU)に対して向けられた抗体により認識されうる抗原決定基を有するもの、特にはペプチド組成物は、すでに入手可能である、ＨＩＶ-1及び／またはＨＩＶ-2レトロウイルスによる感染検出用のキットまたは組成物中に含めるが、あるいはこれらと組み合わせて、キットの検出範囲をＨＩＶ-1のＯグル−プにまで伸長することが可能である。以下の例があるが、これらは限定するためのものではない：コアタンパク質、特にはgag、pol、ＨＩＶ-1及びＨＩＶ-2のタンパク質、若しくはそのペプチド、並びにＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プタンパク質、若しくはそのペプチド、ＨＩＶ-1のエンベロ−プ糖タンパク質、ＨＩＶ-2のエンベロ−プ糖タンパク質、及びＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プ糖タンパク質、またはＨＩＶ-1タンパク質、及び／または糖タンパク質、ＨＩＶ-2のタンパク質、及び／または糖タンパク質、並びにＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プタンパク質、及び／または糖タンパク質、の何れか。ＨＩＶ-1のＯグル−プのウイルスに感染した患者から由来の抗体は、ＨＩＶ-1 のＭグル−プのウイルス由来のgag、及びpol抗原と強く反応するが、Ｍグル−プのエンベロ−プ抗原との反応性は全くないことに注目するのは重要である。よって、本発明の組成物は、少なくとも一つの、ＨＩＶ-1エンベロ−プタンパク質、若しくはペプチドを具備していて、このウイルスが確信をもって検出されるようになっていることが重要である。このような組成物は、診断に用いると、結果的にＡＩＤＳの診断や、それに関連した症状の診断に役立ち、これはより広い病原体のスペクトラムにまで拡張される。ＨＩＶ-1_(VAU)エンベロ−プタンパク質、及び／または糖タンパク質のみを含む診断用組成物の使用は、それでもなお、該疾患を引き起こすかもしれないレトロウイルスの範疇の、より選択的な検出にとって有益であることはいうまでもない。特にＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスにより引き起こされる感染の診断用の方法とキット本発明は、ＡＩＤＳ、及び関連した症候群の病原体であるＨＩＶ-1ウイルスにより引き起こされる感染の、in vitroでの診断用の方法であって、診断する患者由来の血清、または生物学的液体を、ＨＩＶ-1_(VAU)由来のタンパク質、糖タンパク質、またはペプチドを少なくとも一つ含む組成物と接触させる工程と、可能な免疫学的反応を検出する工程とを具備した、方法に関する。このような組成物の例は上に記載してある。。好ましい方法には、例えば、免疫蛍光、またはＥＬＩＳＡ型の免疫酵素反応が関わる。検出は、直接、若しくは間接的な免疫蛍光の測定、または直接的、若しくは間接的な免疫酵素的アッセイにより影響されうる。このような検出には、例えば、マイクロプレ−トのウェルの中に、本発明に準じて、一定量の抽出物、または所望の抗原性組成物をいれる工程；それぞれのウェルの中に、抗体を含むことが可能であってその存在をin vit roで検出する、希釈済み、または非希釈の血清を導入する工程；該マイクロプレ−トをインキュベ−ションする工程；適切な緩衝液でマイクロプレ−トを注意深く洗浄する工程；該マイクロプレ−トのウェルの中に、ヒト免疫グロブリンに対する、特異的に標識した抗体を導入する工程であって、上記標識は、基質を加水分解し、後者の放射の吸収を、少なくとも決められた波長のバンドにおいて修飾することが可能なものより選択される酵素である、工程、そして、好ましくは対照との比較において基質の加水分解の程度を測定して検出し、感染の危険性の目安、または実際の感染の事実とする、工程を具備する。本発明はまた、以下を特に具備した、ＨＩＶ-1_(VAU)感染の検出用キット、またはボックス（boxes）に関する：抽出物、より精製された画分、または上記したタイプのウイルスから派生した合成抗原（この抽出画分、または抗原は、例えば放射性、酵素性、蛍光性、若しくはその他の、標識がされている）；ヒト免疫グロブリンに対する抗体、またはプロテインＡ（これは例えばアガロ−スビ−ズ、マイクロプレ−トなどのような、水に不溶の支持体に有益に固定される）；適宜、陰性対照の検体より得た、同じ生物学的液体、若しくは細胞；緩衝液、及び、適切であれば標識可視化基質。本発明の主題はさらに、化学合成、または組み換えにより得られる抗原を認識する抗体の形成を誘導することが可能な、免疫原性組成物である。血清学ＨＩＶ-1_(VAU)に感染した患者由来の血清抗体が、ＨＩＶ-1の抗原性調製物と反応する能力を、商業的に入手可能な種々のキット（Ｓanofi Ｄiagnostic Ｐas teur,(Ｇenelavai Ｍixt)Ａbbott,Ｗllcome，およびＢehring）を利用して評価した。これらの抗体の、種々のＨＩＶ-1タンパク質との反応性を、サノフィ−診断パスツ−ル・ウェスタ−ン-ブロット・キットを製造業者推奨の方法で使用して調べた。より正確には、患者の血清を、ＨＩＶ-1特異的ＥＬＩＳＡキットを使用して数回調べた。最初に試験されて1990年に陽性であると証明されたものは、（測定したＯＤの、バックグラウンドＯＤに対する比で）7.33（サノフィ−診断パスツ− ルキット使用時）、3.50（アボットキット使用時）、及び2.70（ウェルカムキット使用時）であった、ＨＩＶ-1とＨＩＶ-2の両方に特異的な試薬の使用中には、 1.42（ベ−リングキット使用時）、4.40（ウェルカムキット使用時）であった。患者の血清の、異なる日における、異なるＨＩＶ-1構造タンパク質との反応性を、ＨＩＶ-1 ＬＡＶＢＬＯＴ免疫ブロットアッセイ（サノフィ−診断パスツ− ルで販売されている）を使用して調べた。図５に示されるように、調べた血清試料全てにおいて、envタンパク質gp160およびgp120との弱い反応性のみが見られた。しかしながら、該血清はＨＩＶ-1のgagタンパク質p55(gag前駆体)、及びp24 （ＣＡ）、並びにpol産物p66(ＲＴ)、及びp34(ＩＮ)とは強く反応した。ＨＩＶ- 2免疫ブロッティングにより、非常に弱い反応性がgagp26に関して検出された。これは、Ｏグル−プに特異的な抗体に関しての、商業的に入手可能な血清診断キットでの検出は、注意深く制御するべきであることを例示している。Ｏグル− プウイルスに感染した患者からの血清抗体は、Ｍグル−プのgag、及びpol抗原との強い交差性を示すが、それらはＭグル−プのエンベロ−プ抗原とはほとんど反応しないが、全く反応しない。結果として、Ｍグル−プに基づくキットの中には、上記患者のかなりの割合を検出しないものがあると推定できる。実際に、Ｏグル−プに感染した患者由来の、幾つかの血清を使った最近の予備的研究により、Ｏグル−プに特異的な抗体を検出する能力は、使用する検出キットにより、かなり異なっていることが明らかになった（Ｌoussert-Ａjaka,Ｉ.,Ｌy,Ｔ.Ｄ., Ｃhaix,Ｍ.Ｌ.,Ｉngrand,Ｄ.,Ｓaragosti,Ｓ.,Ｃourrouce,Ａ.Ｍ.,Ｂrun-Ｖezin et,Ｆ.,and Ｓimon,Ｆ.,(1994)ＨＩＶ-1／ＨＩＶ-2seronegativity in ＨＩＶ-1 subtype Ｏ infectedpatients）。これは、多くのＯグル−プ血清の、市場で入手可能な診断キット全てとの反応性を、注意深く且つ徹底的に調べる必要があることを示唆している。ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルス由来で、組み換え、若しくは合成抗原より調製した、ポリクロ−ナル、若しくはモノクロ−ナル抗体を具備した組成物本発明は、ＨＩＶ-1_(VAU)、特にはＨＩＶ-1_(VAU)の抗原性エピト−プ、より特にはＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プタンパク質の抗原性エピト−プを動物に接種して、該動物内で産生されうる血清に関する。本発明はより特には、それぞれの抗原、特には該ウイルスのタンパク質、または糖タンパク質に向けられたポリクロ−ナル抗体に関する。更には、種々の技術により産生されるモノクロ−ナル抗体であって、それぞれ種々のＨＩＶ-1_(VAU)タンパク質、特にはＨＩＶ-1_(VAU)のエンベロ−プタンパク質に向けられている抗体、より特には該タンパク質に対する抗体に関する。上記のポリクロ−ナル、またはモノクロ−ナル抗体を、種々の適用において使用することができる。本質的には、相当するタンパク質の中和のための使用であり、またはウイルス全体の感染性の阻害のための使用でもよいであろう。例えば、生物学的調製物中の、ウイルス抗原の検出、または相当するタンパク質、及び／または糖タンパク質の精製工程（例えばアフィニティ−クロマトグラフィ−カラムでの使用）を行うのに使用してもよい。例を挙げると、抗エンベロ−プ抗体、または抗gag抗体は、診断に使用可能な試薬であり、特にはＨＩＶ-1のＯグル−プを、抗原捕獲ＥＬＩＳＡにより検出するための試薬である。本発明は、１以上のＨＩＶ-1_(VAU)のアミノ酸配列より産生される、ＨＩＶ-1₍ _VAU) のウイルス抗原に向けられる抗体に関する。本発明のＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスの抗原性エピト−プと同等の抗原性エピト−プから、抗体を得る技術は、すでに記載されている。当業者は、アルマ−（Ｕlmer et al.,1993）らにより報告済みの抗体調整用技術を使用して、本発明の抗体を調製することができるが、本発明の抗原に適応させることが可能な修飾は、当業者の知識の一部を形成する。 vauペプチドの免疫反応性の調査抗ＨＩＶ抗体のスクリ−ニングに対して確立されている方法にそって、ＥＬＩＳＡプレ−トを調製して、vauペプチドの免疫反応性が確認された。この試験は、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）であるＶＡＵ株のエンベロ−プ糖タンパク質の免疫優性エピト−プを模倣するペプチドで調製した固相の検出に基づいている。該試験の実行は、Ｇenelavia（登録商標）Ｍixtキットで提案されている方法により、該キットでの試薬を使用してモデル化された。図２１及び図２２の二つの表で照合される実験デ−タは以下のことを示している： (a)ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）ウイルスで汚染されている患者からの４つの血清は、vauペプチドと強く反応する； (b)Ｐasteur Ｉnstitute of Ｙacoundeから送られてきた１９の血清のうち、ＨＩＶ-1のＯ（グル−プ、またはサブグル−プ）ウイルスで汚染されている患者からと見られる１０の血清もまた、同じペプチドとの高い反応性を示す； (c)ＨＩＶ-1のＢサブタイプウイルスで汚染された人（急性期）からの血清（４つの試料）は、vauペプチドとの反応性は示さない； (d)無症候性の血液ドナ−より得られた血清（４８の試料を試験した）は、vau ペプチドとの反応性は示さない；これらの実験デ−タは、（ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）の抗体陽性試料が不足（paupicity）しているが）選択したペプチドの感受性と特異性とに関する証拠となる。上記のテキストからは、本発明は更に、上記した抗体を、種々の段階を有する方法で使用することにより、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルス、または変異体を検出することに関していると分かるが、前記の段階は特にＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスの特徴的性質を明らかにすることを目的としている。本発明はまた、分子ハイブリダイゼーションによる、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスの検出に関する。慨して、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのキャリア−であると思われる患者由来の、生物学的試料、またはその他の生物学的液体若しくは組織中に、ＨＩＶ-1_(VAU) ウイルス、または変異体を検出するこの方法は、以下の段階を具備している：適宜標識された少なくとも一つのプロ−ブを製造する段階；疑いのある患者の試料中の核酸を前記の標識プロ−ブと接触させて、適宜該複合体を適切な固相支持体上に固定化する段階；適切であれば、該固相支持体を適切な洗浄溶液で洗浄する段階；該複合体を検出し、よってＨＩＶ-1_(VAU)の存在、または非存在を当業者に知られる適切な検出方法により検出する段階。本発明のこの方法に関する、別の好ましい態様においては、上記したハイブリダイゼーションは、非厳密な条件下で行なわれ、且つ、膜はハイブリダイゼーション用に適応した条件下で洗浄される。血清学、またはポリメラ−ゼ連鎖反応（ＰＣＲ）のような遺伝子増幅技術を使用して、ＨＩＶ-1のＯグル−プの流行度が正確に評価される。カメル−ンの、５から１０％のＨＩＶ-1感染患者は実際にＯグル−プのウイルスに感染していることが判明した。しかしながら、本願で記載したウイルス単離体とは別に、西中央アフリカの外での、Ｏグル−プの伝播は記録に残っていない。ＨＩＶ-1_(VAU)が単離された前記の患者は、フランスにずっと居住していてアフリカには一度も旅行したことがない。現在までには、該患者の感染源に関する正確な証拠は全くないが、このケ−スはＯグル−プウイルスのある程度の伝播がヨ−ロッパですでに起きていることを示す。本発明はまた、生物学的試料中の、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル− プ）レトロウイルスに特徴の抗体と、ＨＩＶ-1-Ｍタイプのレトロウイルスに特徴の抗体とを、検出、及び区別するための方法であって、該生物学的試料を、ＨＩＶ-1-Ｍタイプのレトロウイルスに特徴的である抗体とは反応しないペプチド、特には上記した、ペプチド（１）、（２）、（３）、（４）、（５a）、（５b ）、（９）及び（１０）から選択した一つと、接触させることを特徴とする、方法に関する。更に本発明は、生物学的試料中の、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル− プ）レトロウイルスに特徴の抗体と、ＨＩＶ-1-Ｍタイプのレトロウイルスに特徴の抗体とを、検出、及び区別するための方法であって、図８及び９で考慮に入れたＨＩＶ-1のＭウイルスの中の一つに由来し、尚且つペプチド（１）、（２）、（３）、（４）、（５a）、（５b）、（９）及び（１０）から選択したペプチドと相同性であるものと、上記生物学的試料を接触させることを特徴とし、またこの相同性ペプチドの配列は、図８または９に記載される、該配列自身がＨＩＶ -1のＭウイルスの対応した適切なペプチド配列中に含まれる、独自の連続したアミノ酸の垂直整列より得られるものであり、図８または９からもまた、該ペプチドの連続したアミノ酸配列が選択される、上記の方法に関する。本発明によると、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスによる感染と、ＨＩＶ-1のＭサブグル−プレトロウイルスによる感染とを検出、及び区別する方法はＡＩＤＳの診断試験にかけられる患者に由来する血清を、特にペプチドＲＩＬＡＶＥＲＹと接触させることで特徴付けられる。更に、ＨＩＶ-1のＯサブグル−プまたはＨＩＶ-1のＭサブグル−プレトロウイルスによる感染の検出方法は、二つの範疇のペプチドの混合物、すなわちその一方の範疇が、ペプチド（１）、（２）、（３）、（４）、（５a）、（５b）、（９）、及び（１０）に相当するものを使用することにより特徴付けられる。更に、ＨＩＶ-1-ＯＤＵＲレトロウイルスによる感染と、ＨＩＶ-1-Ｏの別のタイプのレトロウイルスによる感染とを区別する方法は、生物学的試験試料を、ペプチド（１１）から（１５）、またはペプチド（１７）から（２０）の何れかと接触させることにより特徴付けられる。あるいは、本発明は、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（又はサブグル−プ）のレトロウイルスによる感染と、ＨＩＶ-1のＭサブグル−プレトロウイルスによる感染とを区別する方法であって、開裂作用部位がＳＲジペプチドであるセリンペプチダ− ゼを使用することと、このレトロウイルスがＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）のレトロウイルスであるか、ＨＩＶ-1のＭサブグル−プのレトロウイルスであるかに応じて、該レトロウイルスのgp120のＶＰ3の開裂、または非開裂を検出することを具備している方法である。本発明は更に、生物学的試料中の、ＨＩＶ-1のＭサブグル−プレトロウイルスによる感染と、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（サブグル−プ）による感染とを検出、及び区別するための組成物であって、一方が特に、（１）、９２）、（３）、（４）、（５a）、（５b）、（９）、及び（１０）である、二つの範疇のペプチドの混合物を具備している、組成物に関する。ペプチド（１）から（２０）のそれぞれに特異的なモノクロ−ナル抗体もまた、本発明の範囲に含まれる。本発明は更に照会番号Ｉ-1548,Ｉ-1549,Ｉ-1550の下に、1995年２月24日にＣＮＣＭに寄託されたもののなかより選択したプラスミドにも関する。本発明は更に、本発明で定義されるペプチド（１）から（２０）のそれぞれをコ−ドする配列を有する核酸に向けられている。好ましい核酸配列の中では、図１０、１１、または１２に表示のものが選択されるであろう。本発明は更に、上で定義した核酸を含むベクタにも関する。本発明は更に、前記核酸、または前記ベクタの何れか一つを含むと考えられる細胞に向けられている。本発明は更に、照会番号Ｉ-1542の下に1995年２月23日にＣＮＣＭに寄託されたもののようなウイルスに関する。本発明の範囲にも含まれるウイルスは、上記と同じグル−プのウイルスであって、このウイルスのコンセンサスペプチドが、上記したペプチド、またはポリペプチドを特異的に認識する抗体により認識されることを特徴とするものである。このウイルスのゲノムＲＮＡもまた、本発明の範囲に入る。更に本発明の範囲に入るものには、ＨＩＶ-1タイプのヒトレトロウイルスに感染したと思われる患者からの血清、またはその他の生物学的試料中にある、抗体を検出するためのキット、またはボックスがあるが、これは以下を具備することを特徴としている：配列が、特に上記した（１）から（２０）の配列の一つを有する、少なくとも一つのペプチド、またはポリペプチド；上記のペプチド、または上記のポリペプチドと、試験する試料中に存在するかもしれない抗体との間の免疫複合体の形成反応を許容する手段（例えば、必要であるならば１以上のインキュベ−ション用緩衝液）；陰性対照試料；形成される、抗原／抗体複合体を可視化する手段。更に本発明によると、このキットには、ＨＩＶ-1株より由来する少なくとも一つのコンセンサスペプチド若しくはポリペプチド、あるいは、このポリペプチド若しくはペプチドの配列とは別個であり、その中の１以上のアミノ酸がその他のアミノ酸で置換されているアミノ酸配列（ただし、当該ペプチドには、コンセンサスペプチド若しくはポリペプチドに対する血清との反応性が保持されている）、または、１以上のアミノ酸が欠失、付加されているアミノ酸配列（ただし、当該ペプチド、またはポリペプチドはには、コンセンサスペプチド若しくはポリペプチドに対する血清との反応性が保持されている）、の何れかを具備したペプチド、若しくはポリペプチドに由来する少なくとも一つのコンセンサスペプチド若しくはポリペプチドを更に有している。好ましくは本発明のキットは更に、別のＨＩＶ株、好ましくはＨＩＶ-1-ＬＡＩ株に由来する、少なくとも一つのペプチド、またはペプチドを有する。本発明は更に、本発明のレトロウイルスによる感染の、in vitroでの診断用の、ポリペプチド組成物、またはその変異体の一つに関するが、この診断は、上記の感染後に形成される抗体を含んでいると思われる生物学的試料に対して行なわれる。この組成物は、ペプチド（１）から（２０）のうち、少なくとも一つを具備していることを特徴とする。生物学的試料は、特には血液、血漿、血清、またはその他の生物学的抽出物からなる。上記の組成物は、上記の生物学的試料のうちの一つの中の抗体を検出するのに使用することが可能である。よって本発明は更に、特にＨＩＶタイプのレトロウイルスによる感染の、in vi troでの診断方法であって、以下の工程で特徴付けられるものに向けられている：ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスに対する抗体を含むと思われる生物学的試料を、上に定義したペプチド、または上に定義したペプチド組成物と、抗原／抗体型の免疫複合体の形成を許容する適切な条件下で、接触させる工程；存在する可能性のある上記の複合体を検出する工程。本発明は更に、ワクチン作成に許容される薬学的媒介物（vehicle）と組み合わされた、少なくとも一つのペプチドを具備することを特徴とする、免疫学的組成物に関する。本発明は更に、以下の工程を具備することを特徴とする、本発明のカプシドタンパク質、gp41、gp120の調製方法に関する：本発明のＨＩＶ-1レトロウイルスに感染した細胞を溶解して、上清と感染細胞とを分離するか、または遠心により調製したウイルス沈殿物を溶解する工程；細胞抽出物、及び／またはウイルス抽出物を、精製済み抗体を含む免疫吸着剤（immunoadsorbant）にかける工程（該抗体は、本発明のレトロウイルスに感染した人の血清より得られ、また有益には適切な支持体に固定されていて、感染者の該血清は、本発明のウイルスのエンベロ−プタンパク質と強く反応する能力がある）；緩衝液の存在下で、抗原／抗体の免疫複合体の形成が起きるのに十分な時間だけ、インキュベ−ションする工程；上記の免疫吸着剤を緩衝液で洗浄して、該支持体に保持されていない分子を除去する工程；所望の抗原性タンパク質を回収する工程。この調製方法の第一の態様によると、ＨＩＶ-1 ＤＵＲのカプシドタンパク質、並びに糖タンパク質gp41、及びgp120の分離と回収は、電気泳動法と、該タンパク質の電気的還元法により行える。この調製方法の別の態様によると、該タンパク質は以下の工程により回収できる：上記の免疫吸着剤に付着したタンパク質を溶出させる工程；上記のように溶出された産物を、分離支持体に付着された抗体であって、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）ＤＵＲのカプシドタンパク質、糖タンパク質gp41及びgp120を認識するものを有する、クロマトグラフィ−カラムにより精製する工程。本発明の範囲に更に含まれるものには、本発明のペプチド、またはポリペプチドであって、以下のようにして産生される方法が含まれる：本発明の核酸を発現する；または、アミノ酸を付加して、該ペプチド、または該ポリペプチドが得られるまで化学合成する。遺伝子工学の標準的な原理と方法を使用することが可能である（Ｍolecular Ｃloning,Ｓambrook,Ｆritsch,Ｍaniatis,ＣＳＨ 1989）。本発明の範囲に含まれるものにはまた、上記した核酸の産生方法があるが、これは本発明のウイルスより単離するか、化学合成か、または特異的プライマからの、核酸のin vitro増幅の技術により行なわれる。本発明によるオリゴヌクレオチドプライマはまた、以下のヌクレオチド配列中の、少なくとも８つの連続するヌクレオチドを具備した配列を有する：上記のプライマは、本発明のペプチドをコ−ドするヌクレオチド配列に関して、例えばＰＣＲのような遺伝子増幅や、相当する技術において使用することが可能である。上記のプライマを使用して行った試験で、決定的な結果が得られた。更に、本発明はＰＣＲや上記した相当する技術にによる増幅を許容するキットに関する。更に本発明の範囲には、本発明によるレトロウイルスを含んでいる、ＨＩＶ-1 のＯグル−プ（またはサブグル−プ）ＤＵＲレトロウイルスに特徴的である核酸の、生物学的試料中での存在を検出する方法が含まれる。この方法は、上記の生物学的試料中に含まれるＲＮＡより形成したcＤＮＡを、このcＤＮＡとレトロウイルスゲノムとのハイブリダイゼーションを許容する条件下で接触させる工程と、このウイルス試料の遺伝子増幅を実行する工程とを具備している。本発明はまた、本発明のウイルスで感染した細胞の溶解により得られるウイルス溶解物にも関する。特に上記したペプチド、またはポリペプチドを含む、ＨＩＶ-1_(DUR)（またはＨＩＶ-1_(VAU)）株もまた、本発明の範囲に含まれる。本発明は、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）ＤＵＲの構造、またはこのレトロウイルスの変異体より得られる、特異的ペプチドであって、以下を可能にするものに関する：状況に応じて、地球規模でＯのカテゴリ−のＨＩＶ-1と、Ｍのカテゴリ−のＨＩＶ-1とを区別するか、または、より特異的には、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）ＤＵＲと、Ｏサブグル−プのその他のウイルスとを区別するか、あるいは、一方で、全てではないにしろほとんどのレトロウイルスで、Ｏグル−プ（またはサブグル−プ）及びＭサブグル−プの両方を認識する。更に本発明の範囲に含まれるものには、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）、またはＨＩＶ-1のＭサブグル−プの、対応する構造タンパク質に由来の、相当するペプチドであって、特にはＧＡＧ、gp120、およびgp41より由来する構造タンパク質でその一部が図に示されているものがあるが、上記の相同的なペプチドは整列により得られ、更にまたＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル −プ）ＤＵＲ、より特異的には本願で同定したものに由来するペプチドの図からも得られるものである。同様に、ある種の相同性ペプチドは上記した区別を可能にする試験で使用することが可能であり、この場合にはＧＡＧ、gp120、及びgp41の構造タンパク質由来の、対応するペプチドにかわって使用される。Ｏグル−プ特異的なオリゴヌクレオチドの決定ＶＡＵ配列、並びにＭＶＰ5180、及びＡＮＴ70配列との相関関係を使用して、全体がＶＰ3領域及びgp41領域に対してＯサブグル−プ特異的であるようにしたプライマを決めた。これらのプライマにより、ＤＵＲ株を増幅することが可能になり、結果としてぶちあたっていた増幅の問題の一つの解決となった。これらのＨＩＶのＯサブグル−ププライマの配列と部位を、図１３に記載してある。これらのプライマにより、臭化エチジウム染色で可視化できる増幅バンドを、３０サイクルの単一ステップのＰＣＲで得ることが可能になる、部分配列が得られた：ＧＡＧ:513塩基対（１７１アミノ酸）＝配列認識番号９； gp120 ＶＰ3ループ:５２５塩基対（７５アミノ酸）＝配列認識番号１０； gp41免疫優性領域：３１２塩基対（１０４アミノ酸）＝配列認識番号１１。ＤＵＲ配列に関して、ヌクレオチド（図１５）、及びタンパク質（図１６）の比較を、Ｏサブグル−プのＭＶＰ5180、ＡＮＴ、及びＶＡＵ配列、ＨＩＶ-1のコンセンサス配列、代表的なアフリカンＨＩＶ-1のＭＡＬ配列であるＬＡＩ、ガボンチンパンジ−のＣＩＶのＣＰＺで行うと、その他の報告済みのＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）株同士が遠縁であるのと同じように、ＤＵＲも、その他の報告済みのＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）株から離れている。差異はＧＡＧ領域でより少なく、またgp120のＶＰ3領域で最大であり、このタンパク質の比較では差異が４０％にまで達する(図１６)。系統樹により、ＤＵＲ株がＯサブグル−プの一部を形成することが一方で確認され、また記載された種々のＯ株間での差異の受容性が他方では証明されたが、明らかなサブタイプの枝分かれは起きていなかった（図１７）。ＧＡＧ配列の比較得られたＧＡＧ配列とその他の報告済みの２つのＯ株(ＡＮＴ70、及びＭＶＰ5 180)との比較はもちろん、Ｍグル−プの代表的な配列（図８）との比較により、Ｏのコンセンサス配列が複数の領域内に存在し、これが同じ領域のＭのコンセンサス配列とは異なっていることが判明した。ＭよりもＯに対しての方がより多様である、２つの超可変領域、及び一方または他方における、２、３の部位変異もまた判明した。しかしながら、ＳＰＲＴ・・・ＳＥＧＡ、ＭＬＮＡＩ・・・ＫＥＶＩＮ、ＧＰＬＰＰ・・・ＱＱＥＱＩ、及びＶＧＤ・・・ＳＰＶの領域は、Ｏのコンセンサス配列と、Ｍのコンセンサス配列との間では異なっているようである。ＱＱＡ及びＬＷＴＴＲＡＧＮＰの領域は超可変領域である。ＨＩＶ-1のＯグル −プ（またはサブグル−プ）ＤＵＲ株は、Ｍ及びＯのコンセンサス配列に対して、３つの部位で明らかに異なっていて(Ｉに対してＬ、Ｅに対して２回)、単離された３つの超可変部位に特異的なアミノ酸を有する（Ｌ9にＶ、Ａ77にＡ、110にＬ）。更に、ＧＡＧ領域内に、例えばＳＰＲＴＬＮＡＷＶＫ、ＧＳＤＩＡＧＴＴＳＴ、及びＱＧＰＫＥＰＦＲＤＹＶＤＲＦのような、Ｏグル−プと、Ｍグル−プに共通な断片を決めることは可能である。ＶＰ3ル−プ配列の比較この比較実験では、ＨＩＶ-1のＭサブグル−プのコンセンサス配列とは、最高で５６％までのタンパク質の差異が見られ、またＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）のコンセンサス配列とは、３５から４２％のタンパク質の差異が見られた。 gp120中のＶＰ3ル−プ領域中、及びgp41中の免疫優性領域中のペプチド配列の整列を、図９に示してある。ＤＵＲ株のＶＰ3ル−プの内部の配列は、ＨＩＶ-1 のＭサブグル−プのコンセンサス配列のものとはかなり異なっている。ＶＡＵ及びＡＮＴ70株とは、ＧＰＭＡＷＹＳＭモチ−フを共有しているが、２つの置換（Ａに対してＲ、及びＹに対してＲ）があるＭＶＰ株とは共有していない。ＶＰ3ル−プの残りの左右部分は、他の既知のＨＩＶ全てとはかなり異なっていて、他の交差性を有するとは想像できないほどであった。更にＤＵＲのＶＰ3 ル−プは他のＯコンセンサス配列よりも１アミノ酸だけ長く、これはＨＩＶ-1のＭグル−プの配列よりも１アミノ酸だけ長い。 gp41の免疫優性領域に関する、整列の比較配列ＣＲＧＫＡＩＣを有する、ＤＵＲ株の「ミニル−プ」はこの株に非常に特異的であることが証明された：これはエピト−プを構成するかもしれない（図９を参照）。更に、この配列は、gp41糖タンパク質のアンフォ−ルディングの状態の修飾に関わる可能性があり、結果的には該株の感染に関わる。このル−プを挟む１１アミノ酸長の長い配列は、ＶＡＵ配列と同じである。ＤＵＲ株の多型性は、分析したクロ−ンでは、ＳまたはＴの部位で見ることが可能である。他の既知のレトロウイルス株より得た、対応するペプチドもまた、図９に示してある。ＤＵＲ株は更に、ＨＩＶのＯサブグル−プの、gp41領域に関するコンセンサス配列の決定を可能にし、その中の幾つかの充分に長い相同性領域を使用することができる。これらの相同性領域は、とりわけ、ＲＬ^*ＬＥＥＴ,ＱＮＱＱ,ＬＷＧＬ,及びＣＹＴＶ（^*は可変アミノ酸を意味する）である。血清学的相関関係抗ＤＵＲ血清は、ＨＩＶ-1-Ｍのコンセンサス配列、ＨＩＶ-1 ＭＡＬ、ＨＩＶ-1 ＣＰＺ、またはＨＩＶ-1のＯグル−プ（またサブグル−プ）のＭＶＰ5180、の中のＶＰ3ル−プのペプチドとは反応しないが、しかし、ＨＩＶ-1-ＯＡＮＴ70 のＶＰ3ル−プのペプチドとは反応する。gp41の免疫優性領域に関しては、これは「標準的な」ＨＩＶ-1のＭサブグル−プのコンセンサス配列とは反応しないが、しかしながら驚くことに弱いながらも、ＨＩＶ-1のＭサブグル−プの右に伸長しているコンセンサス配列とは反応する。

【手続補正書】特許法第１８４条の８第１項【提出日】１９９６年８月２２日【補正内容】請求の範囲１.ヌクレオチド配列、より特異的には、ＨＩＶ-1のＯグル−プレトロウイルスのＲＮＡまたはＤＮＡから由来する、遺伝子増幅に使用可能な、ＲＮＡ、cＤＮＡ、またはプライマより得られる、ＤＮＡ、またはクロ−ン化したＤＮＡ断片であって、該ヌクレオチド配列が、配列認識番号５の配列に相当する配列はもちろん、この配列の如何なる部分、またはこの部分の変異体であって、ＨＩＶ-1のＯグル−プウイルスの対応するＤＮＡ、若しくはＲＮＡとハイブリダイズすることが可能である配列を具備することを特徴とする、ヌクレオチド配列。２.ＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスのＲＮＡまたはＤＮＡから由来する、遺伝子増幅に使用可能な、ＲＮＡ、cＤＮＡ、またはプライマより得られる、ＤＮＡ、またはＤＮＡ断片であって、当該配列が、配列認識番号５の配列に相当する配列はもちろん、この配列の如何なる部分、またはこの部分の変異体であって、ＨＩＶ -1_(VAU)ウイルスの対応するＤＮＡ若しくはＲＮＡとハイブリダイズすることが可能である配列を具備していることを特徴とする、請求項１に記載のヌクレオチド配列。３.請求項１または請求項２に記載のヌクレオチド配列であって、該配列が配列認識番号１、２、３、及び４の配列に相当する配列からなる群より選択されることを特徴とする、ヌクレオチド配列。４.配列認識番号７の配列に相当するヌクレオチド配列を具備し、またＨＩＶ-1 のＯグル−プレトロウイルス、特にはＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスのインテグラ−ゼをコ−ドすることを特徴とするヌクレオチド配列、あるいは配列認識番号７の配列を含む配列にハイブリダイズするヌクレオチド配列。５.請求項１乃至４の何れか一項に記載のヌクレオチド配列より得られ、ＨＩＶ- 1のＯグル−プレトロウイルスの遺伝子増幅用のプライマとして使用可能な、少なくとも９つのヌクレオチドを具備したオリゴヌクレオチド。６.請求項５に記載のプライマを利用した遺伝子増幅で産生されるＤＮＡと、高厳密度ハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズすることを特徴とする、プロ−ブとして利用可能なヌクレオチド配列。７.ＨＩＶ-1のＯグル−プレトロウイルスのキャリア−であることが疑われている患者から得た、血清、その他の生物学的液体、若しくは組織の何れかの試料中において、ＨＩＶ-1のＯグル−プレトロウイルス、特には、ＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスが存在するか、存在しないかを検出するための組成物であって、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのゲノム、特にはＨＩＶ-1_(VAU)ウイルス、及び請求項１乃至５の何れか一項で定義されたＨＩＶ-1_(VAU)の変異体の、env領域、またはその一部を含むＤＮＡ断片、に由来するヌクレオチド配列から得られた、少なくとも一つのプロ−ブを具備することを特徴とする、組成物。８.Ｏグル−プに属さないＨＩＶ-1、及び／またはＨＩＶ-2より得られるヌクレオチド配列より得られるプロ−ブを更に具備することを特徴とする、請求項７に記載の組成物。９.ＨＩＶ-1のＯグル−プレトロウイルス、特にはＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスが、生物学的試料中に存在するか、存在しないかを検出するための組成物であって、請求項１乃至５の何れか一項に記載の、少なくとも２つのヌクレオチド配列を具備し、該配列がＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのゲノム由来であって、その配列がＨＩＶ-1のＯグル−プのレトロウイルス、特にはＨＩＶ-1_(VAU) のＤＮＡ、及び／またはＲＮＡの増幅、特にはＰＣＲによる増幅用のプライマとして使用可能であることを特徴とする、組成物。１０.請求項１乃至７の何れか一項に記載のＤＮＡ配列に相当するＲＮＡ配列であることを特徴とする、ヌクレオチド配列。１１.ＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスのエンベロ−プタンパク質であって、請求項１に記載のヌクレオチド配列を宿主内で発現することにより得られることと、該タンパク質が、配列認識番号６の残基１から５２６の間のアミノ酸配列はもちろん、該配列に由来し、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスにより誘導される抗体により認識されうるエピト−プを有する、如何なるペプチド、如何なるポリペプチド、如何なる糖タンパク質、または如何なる変異体をも具備していることを特徴とする、ＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスのエンベロ−プタンパク質。１２.ＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスのエンベロ−プタンパク質であって、請求項１に記載のヌクレオチド配列を宿主内で発現することにより得られることと、該タンパク質が、配列認識番号７の残基５２７から８７７の間のアミノ酸配列はもちろん、該配列に由来しＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスにより誘導される抗体により認識されうるエピト−プを有する、如何なるペプチド、如何なるポリペプチド、如何なる糖タンパク質、または如何なる変異体をも具備していることとを特徴とする、ＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスのエンベロ−プタンパク質。１３.ＣＫＮＲＬＩＣ配列、または特には、ＲＬＬＡＬＥＴＦＩＱＮＷＷＬＬＮＬＷＧＣＫＮＲＬＩＣ配列、または、以下のような配列の変異体を具備することで特徴づけられる、請求項１１または１２に記載のペプチド、またはポリペプチド：１４.請求項１１及び１２に記載のタンパク質断片であること、配列認識番号６または７に記載の配列より得られること、更にＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスに対して誘導される抗体により認識されるか、またはこの断片の変異体が、ＨＩＶ -1 _(VAU) レトロウイルス対して誘導される抗体により認識されうることを特徴とする合成ペプチド。１５.ヒトの生物学的試料中に抗ＨＩＶ-1_(VAU)抗体が存在することをin vitroで検出するための組成物であって、請求項１１乃至１４の何れか一項で定義されるＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスのエンベロ−プタンパク質の、タンパク質、糖タンパク質、ポリペプチド、またはペプチドを具備する、少なくとも一つの抗原を具備した、組成物。１６.Ｏグル−プに属さないＨＩＶ-1ウイルス、及び／またはＨＩＶ-2ウイルスのタンパク質、糖タンパク質、ポリペプチド、またはペプチド、あるいは、Ｏグル−プに属さないＨＩＶ-1ウイルス、及び／またはＨＩＶ-2ウイルス由来のペプチドであって、Ｏグル−プに属さないＨＩＶ-1、及び／またはＨＩＶ-2 により誘導される抗体により認識されるエピト−プを有するペプチドのような抗原を更に具備することを特徴とする、請求項１５に記載の組成物。１７.Ｏグル−プに属さないＨＩＶ-1、及び／またはＨＩＶ-2のタンパク質、及び／または糖タンパク質が、gagタンパク質、またはpolタンパク質、あるいはこれらのペプチドであることを特徴とする、請求項１６に記載の組成物。１８.Ｏグル−プに属さないＨＩＶ-1、及び／またはＨＩＶ-2のタンパク質、及び／または糖タンパク質が、エンベロ−プ糖タンパク質であることを特徴とする、請求項１６に記載の組成物。１９.前記の組成物が、ＨＩＶ-1_(VAU)のgp41の５９０−６２０の全領域、またはＨＩＶ-1_(VAU)に特異的である、前記領域の一部に相当したペプチド配列を具備することを特徴とする、請求項１５乃至１８の何れか一項に記載の組成物。２０.前記のペプチド配列が、配列-ＴＦＩＱＮ-、ＣＫＮＲＬＩＣ、またはＷＧＣＫＮＲであることを特徴とする、請求項１９に記載の組成物。２１.エンベロ−プタンパク質、請求項１１に記載のエンベロ−プタンパク質由来のペプチド、若しくはポリペプチドを認識することが可能な抗体。２２.ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスにより引き起こされる感染の、in vitroでの診断方法であって、診断の対象となる患者より得た、血清、若しくは別の生物学的液体を、ＨＩＶ-1_(VAU) のエンベロ−プタンパク質若しくは糖タンパク質、または、請求項１１乃至１４の何れか一項に記載されているタンパク質、若しくは糖タンパク質の一つより由来する、ペプチド、若しくはポリペプチド、または、請求項１５乃至２０の何れか一項に記載の組成物、の少なくとも一つと接触させる工程と、免疫学的反応を検出する工程、とを具備した、診断方法。２３.ウェスタ−ンブロット（免疫ブロット）、またはＥＬＩＳＡの反応に必要な試薬であって、ＨＩＶ-1_(VAU) ウイルスのエンベロ−プタンパク質若しくは糖タンパク質、あるいは、請求項１１乃至１４の何れか一項に記載されているタンパク質、若しくは糖タンパク質、または、請求項１５乃至２０の何れか一項に記載されている組成物、の一つより由来したペプチド若しくはポリペプチドを含んでいる、試薬。２４.請求項１、または２に記載のヌクレオチド配列がコ−ドする抗原に対して向けられた抗体の、in vivioでの合成を誘導するための、該ヌクレオチド配列の使用。２５.動物内で抗体を誘導することが可能である、請求項１５乃至２０の何れか一項に記載の免疫原性組成物。２６.ＨＩＶ-1のＯグル−プのレトロウイルス、例えばＨＩＶ-1_(VAU) レトロウイルスの感染を、生物学的試料で、in vitroでの検出を行うための診断キットであって、Ｏグル−プのＨＩＶ-1レトロウイルスの遺伝子増幅用の、請求項５に記載のプライマと、該遺伝子増幅反応に必要な試薬とを具備することを特徴とする、キット。２７.生物学的試料を使った、ＨＩＶ-1のＯグル−プのレトロウイルスのin vitr o検出用キットであって、適宜標識済みのプロ−ブと、請求項１、２、３、４、５、６、若しくは１０の何れか一項に記載の、少なくとも一つの配列、または請求項７、８、若しくは９のうちの一項に記載の組成物と、適宜、請求項１乃至６の何れか一項に記載のもう一つのヌクレオチドプロ− ブ、または請求項７、８、若しくは９の何れか一項に記載されていて、適宜、固相支持体に固定化されている組成物、を具備することを特徴とする、キット。２８.ハイブリダイゼーションを行うための試薬を更に具備することを特徴とする、請求項２７に記載のキット。２９.受入れ番号Ｉ-1486のもと、１９９４年１０月２０日にＣＮＣＭに寄託された細菌株。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁶ 識別記号ＦＩＣ０７Ｋ 14/155 Ｃ０７Ｋ 14/16 14/16 Ｃ１２Ｎ 1/00 ＵＣ１２Ｎ 1/00 7/00 5/10 Ｃ１２Ｐ 21/08 7/00 Ｇ０１Ｎ 33/569 ＨＣ１２Ｐ 21/08 Ａ６１Ｋ 37/02 ＡＢＤＧ０１Ｎ 33/569 Ｃ１２Ｎ 5/00 Ｂ //(Ｃ１２Ｎ 15/09 ＺＮＡＣ１２Ｒ 1:92） (81)指定国ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，ＩＴ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＡＵ，ＣＡ，ＣＮ，ＪＰ，ＵＳ (72)発明者キーラン、カロリーヌフランス国、92120 モントルージュ、リュ・ドゥ・バーヌー 110 (72)発明者ゲタール、ドニーズフランス国、75015 パリ、リュ・アンセルム・ペイエン４ビス (72)発明者モンターニエ、リュックフランス国、92000 ル・プレシ・ロバンソン、リュ・ドゥ・マラブリ 21 (72)発明者ドンジョン・ドゥ・サン−マルタン、ジャクリーヌフランス国、92140 クラマル、アブニュー・ビクトール − ユゴー 65 (72)発明者コエン、ジャック・アーシュ・エムフランス国、51100 ラーンス、リュ・ドゥ・シュリー 17 【要約の続き】

Claims

【特許請求の範囲】１.少なくともＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスタンパク質の一部を具備していて、更に、ＨＩＶ-1のＯグル−プＶＡＵ株、またはＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）ＤＵＲ株での感染後に得られる血清から単離することが可能な抗体により認識されうる、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスタンパク質、または天然若しくは合成の、ペプチド若しくはポリペプチド。２.宿主内でのヌクレオチド配列の発現により得られ、より特異的には、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスのＲＮＡまたはＤＮＡから由来の、ＲＮＡ、cＤＮＡ、若しくは遺伝子増幅に使用可能なプライマより得られる、ＤＮＡ、またはcＤＮＡの発現により得られることを特徴とし、前記のヌクレオチド配列が、配列認識番号５に記載の配列と一致する配列はもちろん、該配列の如何なる部分、及び対応するＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）のＤＮＡ若しくはＲＮＡとハイブリダイズすることが可能な、前記部分の変異体を具備していることを特徴とし、更に、前記タンパク質が、配列認識番号６の残基１から５２６の間のアミノ酸配列はもちろん、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスにより誘導される抗体により認識されうるエピト−プを有する前記配列由来の、如何なるペプチド、如何なるポリペプチド、如何なる糖タンパク質、または如何なる変異体をも具備していることを特徴とする、請求項１に記載の、タンパク質、ポリペプチド、またはペプチド。３.宿主細胞内で、請求項１に記載のヌクレオチド配列の発現により得られることを特徴とし、また、配列認識番号７に記載の残基５２７から８７７の間のアミノ酸配列はもちろん、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスにより誘導される抗体により認識されうるエピト−プを有する該配列由来の、如何なるペプチド、如何なるポリペプチド、如何なる糖タンパク質、または如何なる変異体をも具備していることを特徴とする、請求項１、または２に記載のタンパク質、ポリペプチド、またはペプチド。４.ＣＫＮＲＬＩＣ配列、または特には、ＲＬＬＡＬＥＴＦＩＱＮＷＷＬＬＮＬＷＧＣＫＮＲＬＩＣ配列、または、以下のような配列の変異体を具備することで特徴づけられる、請求項１乃至３に記載のペプチド、またはポリペプチド：５.請求項１乃至４に記載のタンパク質断片であることと、配列認識番号６または７に記載の配列より得られることと、更にＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスに対して、またはＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスにより誘導される抗体により認識されうる、上記断片の変異体に対して誘導される抗体により認識されることとを特徴とする合成ペプチド。６.１９９５年２月２３日にＣＮＣＭにＩ-1542として寄託された、ＨＩＶ-1のＯ(ＤＵＲ)グル−プ（またはサブグル−プ）のウイルスのタンパク質、または、天然若しくは合成の、ペプチド若しくはポリペプチドであって、該ペプチド若しくは該ポリペプチドは、前記のタンパク質若しくはペプチドであって、少なくとも前記タンパク質の一部、またはアミノ酸の置換、欠失、若しくは付加により上記のものと区別がつくペプチドを具備していることを特徴とする、請求項１に記載のタンパク質、ポリペプチド、またはペプチド。７.少なくとも４つの連続するアミノ酸を含み、該連続アミノ酸配列全体が、図８に記載のＧＡＧ配列内に含まれるか、またはＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）のＤＵＲウイルスの変異体由来の、免疫学的に同等なＧＡＧ配列内に含まれ、前記の免疫学的に同等な配列が、図８に記載のＧＡＧ配列に含まれる、ＡＨＰＱＱＡ,ＬＷＴＴＲＡＧＮＰの少なくとも一つをもまた特異的に認識する抗体により認識されることを特徴とする、請求項６に記載のペプチド。８.ペプチドのアミノ酸配列が、以下の配列のうちどれか一つ、またはそれぞれに対応した免疫学的に同等な配列の何れかに含まれるペプチドであり、このペプチドが上記の配列の内の一つの、少なくとも４つの連続するアミノ酸を有することを特徴とする、請求項７に記載のペプチド：９.ペプチドのアミノ酸配列が、以下の配列のうちどれか一つ、またはそれぞれに対応した免疫学的に同等な配列の何れかに含まれるペプチドであり、このペプチドが上記の配列の内の一つの、少なくとも４つの連続するアミノ酸を有することを特徴とする、請求項７に記載のペプチド：１０.以下のアミノ酸配列を含んでいることを特徴とする、請求項８に記載のペプチド：１１.以下のアミノ酸配列を含んでいることを特徴とする、請求項８に記載のペプチド：１２.少なくとも４つの連続するアミノ酸を含み、配列全体が、図９に記載のg p120のＶＰ3ル−プ領域内の配列内に含まれるか、またはＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）ＤＵＲウイルスの変異体より得られる、対応した免疫学的に同等の配列内に含まれ、前記の免疫学的に同等な配列が、以下の配列のうち少なくとも一つもまた特異的に認識する抗体により認識される、請求項６に記載のペプチド：１３.(a)配列ＣＶＲＰＧＮＮＳＶＫＥＩＫＩＧＰＭＡＷＹＳＭＱＩＥＲＥＧＫＧＡＮＳＲＴＡＦＣ(11)、または少なくとも４つのアミノ酸を含んだ、該配列の一部；または、 (b)１以上のアミノ酸が２つのアミノ酸で置換されていて、(a)の配列とは別個である、アミノ酸配列（ただし、当該ペプチドには、上記ペプチドに対する血清との反応性が保持されていること）；または、 (c)１以上のアミノ酸が欠失、または付加されていて、(a)または(b)とは別個である、アミノ酸配列（ただし当該ペプチドには、(a)のペプチドに対する血清との反応性が保持されていること）；または、 (d)それぞれに対応した、免疫学的に同等な配列、若しくはその一部；のうち何れかを含む、請求項１２に記載のペプチド。１４.配列ＫＥＩＫＩ（１２）を含む、請求項１３に記載のペプチド。１５.配列ＥＲＥＧＫＧＡＮ（１３）を含む、請求項１３に記載の配列。１６.アミノ酸配列ＣＶＲＰＧＮＮＳＶＫＥＩＫＩ(14)、またはＱＩＥＲＥＧＫＧＡＮＳＲ(15)の何れか一つを含む、請求項１３または1４に記載のペプチド。１７.配列ＧＰＭＡＷＹＳＭ（１６）を具備した、請求項１３に記載のペプチド。１８.少なくとも４つの連続するアミノ酸を含み、アミノ酸配列全体が、図９に記載のgp41の免疫優性領域の配列内か、またはＨＩＶ-1Ｏグル−プ（またはサブグル−プ）ＤＵＲウイルスの変異体由来の免疫学的に同等の配列内に含まれ、前記の免疫学的に同等の配列が、以下の配列の内少なくとも一つ、もまた特異的に認識する抗体により認識される、請求項６に記載のペプチド：１９.配列ＲＬＬＡＬＥＴＬＭＱＮＱＱＬ(17)、ＬＮＬＷＧＣＲＧＫＡＩＣＹＴＳＶＱＷＮＥＴＷＧ(18)、または以下のものの内何れかを含む上記ペプチドの一部の何れかを含んでいる、請求項１８に記載のペプチド： (a)配列ＣＲＧＫＡＩ(19)、またはＱが、適切な場合には、Ｋ以外の異なるアミノ酸で置換された配列ＳＶＱＷＮ(20)、あるいはこの二つの配列両方； (b)１以上のアミノ酸が２つのアミノ酸で置換されていて、(a)の配列とは異なるアミノ酸配列（ただし当該ペプチドは、(a)のペプチドに対する血清との反応性を保持していること）： (c)１以上のアミノ酸が欠失、または付加されていて、(a)または(b)とは異なるアミノ酸配列（ただし当該ペプチドは、(a)のペプチドに対する血清との反応性を保持していること）；または、 (d)それぞれに対応した、免疫学的に同等な配列、若しくはその一部。２０.少なくとも８つのアミノ酸を含むＮ末端配列が、ＨＩＶ-1−ＬＡＩ株のg p４１の免疫優性領域に含まれる配列ＲＩＬＡＶＥＲＹに対して形成された抗体により免疫学的に認識されないことを特徴とする、請求項１９に記載のペプチド。２１.ＨＩＶ-1−ＬＡＩ株のペプチドＳＧＫＬＩＣに対して形成された抗体により認識されないことを特徴とする、請求項１９に記載のペプチド。２２.以下の配列のうち何れかを含むことを特徴とする、請求項１９に記載のペプチド：２３.ヌクレオチド配列、より特異的には、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスのＲＮＡまたはＤＮＡから由来する、ＲＮＡ、cＤＮＡ、または遺伝子増幅に使用可能なプライマより得られる、ＤＮＡ、またはクロ−ン化したＤＮＡ断片であって、該ヌクレオチド配列が、配列認識番号５、９、１０、または１１の配列はもちろん、この配列の如何なる部分も具備し、特に請求項８乃至２２の何れか一項に記載のタンパク質、ポリペプチド、若しくはペプチドをコ−ドする配列、またはこの部分の変異体であって、ＨＩＶ-1のＯグル −プ（またはサブグル−プ）ウイルスの対応するＤＮＡ、若しくはＲＮＡとハイブリダイズすることが可能であるものを具備することを特徴とする、ヌクレオチド配列。２４.ＨＩＶ-1_(VAU)、またはＨＩＶ-1_(DUR)レトロウイルスのＲＮＡまたはＤＮＡから由来する、ＲＮＡ、cＤＮＡ、または遺伝子増幅に使用可能なプライマより得られる、ＤＮＡ、またはＤＮＡ断片であって、当該配列が、配列認識番号５の配列と一致した配列はもちろん、この配列の如何なる部分、若しくはＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスの対応するＤＮＡ若しくはＲＮＡとハイブリダイズすることが可能な該部分の変異体を具備しているか、または、配列認識番号９、１０、または１１と一致したの配列はもちろん、該配列の如何なる部分、若しくはＨＩＶ-1_(DUR)ウイルスの対応するＤＮＡ若しくはＲＮＡとハイブリダイズすることが可能な該部分の変異体を具備していることを特徴とする、請求項２３に記載のヌクレオチド配列。２５.請求項２３または請求項７に記載のヌクレオチド配列であって、該配列が配列認識番号１、２、３、及び４の配列と一致する配列からなる群より選択されることを特徴とする、ヌクレオチド配列。２６.配列認識番号７の配列と一致するヌクレオチド配列を具備し、またＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルス、特にはＨＩＶ-1_(VAU ₎ レトロウイルスのインテグラ−ゼをコ−ドするヌクレオチド配列、あるいは配列認識番号７の配列を含む配列にハイブリダイズするヌクレオチド配列。２７.請求項２３乃至２６の何れか一項に記載のヌクレオチド配列より得られ、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスの遺伝子増幅用のプライマとして使用可能な、少なくとも９つのヌクレオチドを具備したオリゴヌクレオチド。２８.以下のヌクレオチド配列中の、少なくとも９つの連続するヌクレオチドからなる配列を有する、請求項２７に記載のオリゴヌクレオチド：２９.請求項６乃至２２の何れか一項に記載のペプチドをコ−ドするヌクレオチド配列の遺伝子増幅工程で使用することが可能であることを特徴とする、請求項２８に記載のオリゴヌクレオチド。３０.請求項２７乃至２９の何れか一項に記載のプライマを利用した遺伝子増幅で産生されるＤＮＡと、高厳密度ハイブリダイゼーション条件下でハイブリダイズすることを特徴とする、プロ−ブとして利用可能なヌクレオチド配列。３１.ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）のキャリア−であることが疑われている患者から得た、血清、その他の生物学的液体、若しくは組織の何れかの試料中において、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルス、特には、ＨＩＶ-1_(VAU)、及び／またはＨＩＶ-1_(DUR)レトロウイルスが存在するか、存在しないかを検出するための組成物であって、該組成物が、ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスのゲノム、特にはＨＩＶ-1_(VAU)ウイルス、及び請求項２３乃至２７の何れか一項で定義されたＨＩＶ-1_(VAU)の変異体の、env領域、またはその一部を含むＤＮＡ断片、に由来するヌクレオチド配列から得られた、少なくとも一つのプロ−ブ；及び／または、ＨＩＶ-1_(DUR)ウイルスのゲノム、並びにenv領域、またはenv領域の一部と、請求項２３若しくは２４で定義(lacuna)されているＨＩＶ-1_(DUR)ウイルスのＧＡＧ領域とを含むＨＩＶ-1_(DUR)ＤＮＡ、から得られるプロ−ブ、を具備することを特徴とする、組成物。３２.Ｏサブグル−プに属さないＨＩＶ-1、及び／またはＨＩＶ-2より得られるヌクレオチド配列より得られるプロ−ブを更に具備することを特徴とする、請求項１２に記載の組成物。３３.ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルス、特にはＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルス、及び／またはＨＩＶ-1のＯ_(DUR)グル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスが、生物学的試料中に存在するか、存在しないかを検出するための組成物であって、請求項２３乃至２７の何れか一項に記載の、少なくとも２つのヌクレオチド配列、及び請求項２３または２４に記載の、少なくとも２つのヌクレオチド配列を、該組成物が具備し、これらはそれぞれＨＩＶ-1_(V _AU) ウイルス、及びＨＩＶ-1_(DUR)ウイルスのゲノム由来であって、その配列はＯサブグル−プのＨＩＶ-1レトロウイルス、特にはＨＩＶ-1_(VAU)及びＨＩＶ-1_(DU _R) のＤＮＡ、及び／またはＲＮＡの増幅、特にはＰＣＲによる増幅用のプライマとして使用可能であることを特徴とする、組成物。３４.請求項２３乃至３１の何れか一項に記載のＤＮＡ配列に対応するＲＮＡ配列であることを特徴とする、ヌクレオチド配列。３５.ヒトの生物学的試料中の、抗ＨＩＶ-1_(VAU)抗体、及び抗ＨＩＶ-1_(DUR) 抗体の存在をin vitroで検出するための組成物であって、請求項１乃至５の何れか一項に記載のＨＩＶ-1_(VAU)レトロウイルスのエンベロ−プタンパク質、及び／または、配列認識番号９、１０若しくは１１の配列はもちろん、この配列の如何なる部分、あるいはこの部分の変異体であってＨＩＶ-1_(DUR)ウイルスの、対応するＤＮＡがＲＮＡとハイブリダイズすることが可能な変異体と一致する配列を具備した配列、のタンパク質、糖タンパク質、ポリペプチド、若しくはペプチドを具備した、少なくとも一つの抗原を具備する、組成物。３６Ｏサブグル−プに属さないＨＩＶ-1ウイルス、及び／またはＨＩＶ-2ウイルスのタンパク質、糖タンパク質、ポリペプチド、またはペプチド、あるいは、Ｏサブグル−プに属さないＨＩＶ-1ウイルス、及び／またはＨＩＶ-2ウイルス由来のペプチドであって、Ｏサブグル−プに属さないＨＩＶ-1、及び／またはＨＩＶ-2により誘導される抗体により認識されるエピト−プを有するペプチドのような抗原を更に具備することを特徴とする、請求項３５に記載の組成物。３７.Ｏサブグル−プに属さないＨＩＶ-1、及び／またはＨＩＶ-2のタンパク質、及び／または糖タンパク質が、gagタンパク質、またはpolタンパク質、あるいはこれらのペプチドであることを特徴とする、請求項３６に記載の組成物。３８.Ｏサブグル−プに属さないＨＩＶ-1、及び／またはＨＩＶ-2のタンパク質、及び／または糖タンパク質が、エンベロ−プ糖タンパク質であることを特徴とする、請求項３７に記載の組成物。３９.前記の組成物がＨＩＶ-1_(VAU)のgp41の５９０−６２０の全領域、またはＨＩＶ-1_(VAU)に特異的である、前記領域の一部に一致したペプチド配列を具備することを特徴とする、請求項３５乃至３８の何れか一項に記載の組成物。４０.前記のペプチド配列が、配列-ＴＦＩＱＮ-、ＣＫＮＲＬＩＣ、またはＷＧＣＫＮＲであることを特徴とする、請求項２０に記載の組成物。４１.請求項１乃至２０の何れか一項に記載のタンパク質から由来する、タンパク質、ペプチド、またはポリペプチドを認識することが可能な抗体。４２.ＨＩＶ-1_(VAU)ウイルス、及び／またはＨＩＶ-1_(DUR)ウイルスにより引き起こされる感染の、in vitroでの診断方法であって、診断の対象となる患者より得た、血清、若しくは別の生物学的液体を、ＨＩＶ-1_(VAU)、及び／またはＨＩＶ-2_(DUR)のエンベロ−プタンパク質若しくは糖タンパク質、または、それぞれが、請求項１乃至５の何れか一項、若しくは請求項６乃至２２の何れか一項に記載されているタンパク質、若しくは糖タンパク質の一つより由来する、タンパク質、若しくは糖タンパク質、または、請求項３５乃至３８の何れか一項に記載の組成物、の少なくとも一つと接触させる工程と、免疫学的反応を検出する工程とを具備した、診断方法。４３.ウェスタ−ンブロット（免疫ブロット）、またはＥＬＩＳＡに必要な試薬であって、請求項１乃至５の何れか一項、及び請求項６乃至２２の何れか一項に記載されているタンパク質、若しくは糖タンパク質、並びに、請求項３５乃至３８の何れか一項に記載されている組成物、の一つより由来した、ＨＩＶ-1_(VAU)、及び／またはＨＩＶ-1_(DUR)ウイルスのエンベロ−プタンパク質若しくは糖タンパク質を含んでいる、試薬。４４.請求項２３、または２４に記載のヌクレオチド配列がコ−ドする抗原に対して向けられた抗体の、in vivioでの合成を誘導するための、該ヌクレオチド配列の使用。４５.動物内で抗体を誘導することが可能である、請求項３５乃至３８の何れか一項に記載の免疫原性組成物。４６.Ｏサブグル−プのＨＩＶ-1レトロウイルス、例えばＨＩＶ-1_(VAU)、及び／またはＨＩＶ-1_(DUR)レトロウイルスの感染を、生物学的試料で、in vitroの検出を行うための診断キットであって、Ｏサブグル−プのＨＩＶ-1レトロウイルスの遺伝子増幅用の、請求項２７乃至２９の何れか一項に記載のプライマと、遺伝子増幅反応に必要な試薬とを具備することを特徴とする、キット。４７.生物学的試料を使った、ＨＩＶ-1のＯサブグル−プのin vitro検出用キットであって、適宜標識済みのラベルと、請求項２３乃至２９の何れか一項に記載の、少なくとも一つの配列、または請求項３１、３２、若しくは３３の一項に記載の組成物と、適宜、請求項２３乃至２９の何れか一項に記載のもう一つのヌクレオチドプロ−ブ、または請求項３１、３２、若しくは３３の何れか一項に記載されていて、適宜、固相支持体に固定化されている組成物とを具備することを特徴とする、キット。４８.ハイブリダイゼーションを行うための試薬を更に具備することを特徴とする、請求項２８に記載のキット。４９.生物学的試料中にある、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスに特有の抗体と、ＨＩＶ-1のＭサブグル−プに特有の抗体との検出、及びこれらの間の区別を行うための方法であって、請求項８のペプチド（１）、（２）、（３）、（４）、（５ａ）、（５ｂ）、請求項１０のペプチド（９）、及び請求項１１のペプチド（１０）の中から選択したペプチドと、上記の生物学的試料を接触させることを特徴とする、方法。５０.生物学的試料中にある、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスに特有の抗体と、ＨＩＶ-1のＭサブグル−プレトロウイルスに特有の抗体との検出、及びこれらの間の区別を行うための方法であって、図８及び９で考慮に入れたＨＩＶ-1のＭサブグル−プウイルス群の一つより得られ、尚且つ請求項４９に記載のものより選択したペプチドと相同性があるペプチドと、上記の生物学的試料を接触させることを特徴とし、この相同性ペプチドの配列が、図８または９に表示され、尚且つ対応したＨＩＶ-1のＭサブグル−プウイルスに関連したペプチド配列内に含まれる、自身の連続するアミノ酸配列に対して行った垂直アライメント（vertical alignment）より得られ、選択した該連続アミノ酸配列がまた図８、または９より判明する、方法。５１.ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスによる感染と、ＨＩＶ-1のＭタイプのサブグル−プによる感染とを検出、及び区別するための方法であって、ＡＩＤＳに対する診断テストを受ける患者より得た血清を、ペプチドＲＩＬＡＶＥＲＹと接触させることにより特徴付けられる、上記の方法。５２.ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスによるか、またはＨＩＶ-1のＭサブグル−プレトロウイルスによる感染を検出するための方法であって、第一の範疇のペプチドが請求項４９で同定されているものに一致している、二つの範疇のペプチドの混合物を使用することにより特徴付けられる、方法。５３.ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）ＤＵＲレトロウイルス若しくはその変異体、及び別のタイプの、ＨＩＶ-1のＯグル−プレトロウイルスによる感染を区別するための方法であって、検査する生物学的試料を、以下のペプチドのうちの何れか一つと接触させることにより特徴付けられる上記の方法：請求項３８のペプチド（１１）、請求項３９のペプチド（１２）、若しくは請求項４０のペプチド（１３）；請求項４１のペプチド（１４）、若しくはペプチド（１５）；または、請求項４４のペプチド（１７）、（１８）、（１９）、及び（２０）。５４.ヌクレオチド配列が、請求項２３乃至３０の何れか一項に記載のものと一致する核酸を有するベクタ。５５.プラスミドであることを特徴とする、請求項５７に記載のベクタ。５６.照会番号、Ｉ-1548,Ｉ-1549,及びＩ-1550のもとに、１９９５年２月２４日にＣＮＣＭに寄託されたものより選択したプラスミド。５７.ヌクレオチド配列が、請求項５４及び５５に記載の配列のうち何れか一つに一致する核酸を含んだ細胞。５８.照会番号Ｉ-1542のもと、１９９５年２月２３日にＣＮＣＭに寄託されたウイルス。５９.請求項５８のウイルスと同じタイプ、または同じサブタイプのウイルスであって、該ウイルスのコンセンサスペプチドが、請求項６乃至２２の何れか一項に記載のペプチドを特異的に認識する抗体により認識されることを特徴とする、ウイルス。６０.ＨＩＶに対する抗体をin vitroで検出するためのキットであって、請求項６乃至２２の何れか一項に記載のペプチドを少なくとも一つ含む、キット。６１.以下のものを具備した別のＨＩＶ株由来の、少なくとも一つのコンセンサスペプチドを含む、請求項６０に記載のキット：１以上のアミノ酸がその他のアミノ酸で置換されていて、該ペプチドとは別個であるアミノ酸配列（ただしこのペプチドは該コンセンサスペプチドに対する血清との反応性を保持している）か、または、１以上のアミノ酸が欠失、若しくは付加されているアミノ酸配列（ただしこのペプチド、またはポリペプチドは該コンセンサスペプチドを認識する血清との反応性を保持している）。６２.他方のＨＩＶ株がＨＩＶ-ＬＡＩ株であることを特徴とする、請求項６０、または６１に記載のキット。６３.ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）レトロウイルスによるか、またはＨＩＶ-1のＭサブグル−プレトロウイルスによる感染を区別するための方法であって、ＳＲジペプチド上で開裂を起こさせるセリンプロテア−ゼを使用していて、またこのレトロウイルスがＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル− プ）レトロウイルスであるか、またはＨＩＶ-1のＭサブグル−プレトロウイルスであるかに応じて、該レトロウイルスのgp120のＶ3ル−プの開裂物、若しくは開裂中のものを検出することを具備している、方法。６４.請求項５８、若しくは５９に記載のウイルス、またはＨＩＶ-1_(VAU)ウイルスで感染した細胞の溶解により得られるウイルス性溶解物。６５.請求項６乃至２２の何れか一項に記載の抗原性ペプチドを特に含んでいるＨＩＶ-1 Ｏ_(DUR)か、または請求項１乃至５の何れか一項に記載の抗原性ペプチドを特に含んでいるＨＩＶ-1のＯ_(VAU)グル−プ（またはサブグル−プ）の、タンパク性抽出物。６６.受入れ番号Ｉ-1486のもと、１９９４年１０月２０日にＣＮＣＭに寄託された細菌株。６７.生物学的試料中の、ＨＩＶ-1のＭサブグル−プレトロウイルスと、ＨＩＶ-1のＯグル−プ（またはサブグル−プ）との間の検出と区別とを行うための組成物であって、第一のペプチドが請求項４９で同定されているものである、二つの範疇のペプチドの混合物を具備した、組成物。６８.自身のアミノ酸配列が、配列:ＩＧＧＨＱＧＡＬＱ(23),ＲＥＰＴＧＳＤＩ(24)のうちの一つか、またはそれぞれに対応した免疫学的に同等の配列、の何れか一方に含まれるペプチドからなるものであって、このペプチドが前記の配列のうちの一つの、少なくとも４つの連続するアミノ酸を含むものであることを特徴とする、請求項８に記載のペプチド。６９.自身のアミノ酸配列が、アミノ酸配列ＩＮＤＥＡＡＤＷＤ(25)、または対応した、免疫学的に同等の配列に含まれるペプチドからなり、このペプチドが上記配列の少なくとも４つの連続するアミノ酸を含むことを特徴とする、請求項７に記載のペプチド。７０.請求項６８、及び６９に記載のペプチドをコ−ドする核酸。７１.請求項７０に記載の核酸を、少なくとも一つ具備した組成物。７２.ＨＩＶ-1のＭグル−プ株とＨＩＶ-1のＯグル−プ株の検出、及びその区別のための、請求項７０、及び７１に記載の、少なくとも一つの核酸の使用。