JPH11221077A - 変異ヒトミトコンドリア遺伝子及び糖尿病遺伝子診断への応用 - Google Patents

変異ヒトミトコンドリア遺伝子及び糖尿病遺伝子診断への応用

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JPH11221077A
JPH11221077A JP10023196A JP2319698A JPH11221077A JP H11221077 A JPH11221077 A JP H11221077A JP 10023196 A JP10023196 A JP 10023196A JP 2319698 A JP2319698 A JP 2319698A JP H11221077 A JPH11221077 A JP H11221077A
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Japan
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dna
mitochondrial gene
gene
human mitochondrial
mutation
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JP10023196A
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Yukiko Hayashi
由紀子 林
Moritoshi Kinoshita
盛敏 木下
Tetsuya Hirai
哲也 平井
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Otsuka Pharmaceutical Co Ltd
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Otsuka Pharmaceutical Co Ltd
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Abstract

(57)【要約】 【課題】糖尿病発症関連ヒトミトコンドリア遺伝子(mt
DNA)に関する新規情報の提供、並びに該mtDNAの変異検
出法、該検出法を利用した糖尿病の診断法及び診断用試
薬キットの提供。 【解決手段】(a)又は(b)のDNAからなる変異mtDNAの少な
くとも塩基番号3426位を含みヒトmtDNAの同定特異性を
保持する塩基長からなるDNA:(a)正常ヒトmtDNAにおい
て、塩基配列の3426位がAからGに変異してなるDNA、
(b)(a)のDNAの塩基配列において、塩基番号3426部位を
除いて1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加
されたDNA断片であって、該塩基の欠失、置換及び付加
が突然変異に起因するものであるヒトmtDNAのDNA;上記
DNAの合成用プライマー;被験者のヒトmtDNAの3426位に
おけるA→G置換を検出するヒトmtDNA異常の検出方
法;上記プライマーを含むmtDNA変異検出用試薬キッ
ト、該キットを含む糖尿病診断用剤。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、糖尿病に関するヒ
トミトコンドリア遺伝子の異常に関する。より詳細に
は、本発明は少なくとも塩基配列3426位に点変異を
含む変異ヒトミトコンドリア遺伝子のDNA及び該変異
部を含むDNA断片に関する。また本発明は、上記ヒト
ミトコンドリア遺伝子の異常を迅速かつ特異的に検出す
る方法、該検出のために用いられるプライマー、並びに
該プライマーを含むミトコンドリア遺伝子の変異(A→
G3426)検出用試薬キット及び糖尿病診断用剤に関す
る。
【0002】本発明で提供するヒトミトコンドリア遺伝
子の変異(A→G3426)は糖尿病に関連する新規な遺伝
子異常であり、また従来公知の塩基番号3243位の変
異等と異なり完全に母性遺伝型の遺伝子異常である。
【0003】ゆえに該遺伝子異常を検出する本発明の検
出方法及び検出用試薬キットは、糖尿病の遺伝子診断及
び糖尿病発症の予知・予防に極めて有用である。
【0004】
【従来の技術】糖尿病は、近年、癌、脳卒中及び心筋梗
塞に次ぐ4大疾患に指定され、その対策が緊急に望まれ
ている疾患の一つである。
【0005】糖尿病の病型は、一般にインスリン依存性
糖尿病(Insulin-Dependent Diabetes Mellitus:IDD
M)、インスリン非依存性糖尿病(Non-Insulin-Depend
entDiabetes Mellitus:NIDDM))及び slowly pro
gressive IDDM等に大別されるが、それらはインス
リン作用機構に関与する因子の遺伝子やインスリン分泌
に関与する因子の遺伝子等の種々の遺伝子の異常と密接
に関係することが報告されている。このようなことか
ら、糖尿病は、遺伝子異常に肥満、ストレス、加齢等の
環境因子が加わって発症する、比較的発症頻度の高い遺
伝病の一つであるともいえる。
【0006】従って、糖尿病に関与する遺伝子異常の有
無を事前に診断することができれば、日常生活において
食事や運動等に注意をすることによって糖尿病の発症を
未然に防ぐことが可能となる。
【0007】また、糖尿病が発症した場合でも、早期で
あれば食事療法や運動療法によって比較的症状は改善し
やすいものの、糖尿病の発症初期においてはその発見が
比較的困難であり、確実に診断するためにはOGTT等
の煩雑な検査を必要とするのが実情である。よって、か
かる観点からも簡単かつ確実な遺伝子診断法による糖尿
病の早期発見と適切な発症予防が求められている。
【0008】現在わかっている糖尿病原因遺伝子として
は、インスリンレセプター、インスリンレセプターサブ
ストレート1、グルコーストランスポータータイプ4、
グルコーストランスポータータイプ2、グルコキナー
ゼ、ミトコンドリア遺伝子等が挙げられる。
【0009】なかでもミトコンドリア遺伝子の異常は、
ミトコンドリアによる酸化的リン酸化がグルコース反応
性インスリン分泌に重要な役割を果たしていることか
ら、糖尿病の発症に極めて密接な関係があるものとして
注目されている。
【0010】このような状況のもとで、ミトコンドリア
遺伝子の塩基番号3243の点変異が糖尿病の発症に関
連した変異であることが報告された(Van den Ouwelan
d,J.M.W.,et al.:Mutation in mitochondrial tRNA
LEU(UUR) gene in a large pedigree with maternally
transmitted type II diabetes mellitus and deafnes
s. Nature Genet.,1: 368-371, 1992;Kadowaki,T.,et
al.:A subtype of diabetesmellitus associated with
a mutation in the mitochondrial gene. N.Engl,JMe
d., 330:962-968, 1994 ;Katagiri,H.,et al.:Mitocho
ndrial diabetes mellitus: prevalance and clinical
characterization of diabetes due to mitochondrial
tRNALEU(UUR) gene mutation in Japanese pationts. D
iabetologia,37:504-510, 1994)。しかしながら、当該
ミトコンドリア遺伝子の変異(A→G3243)に起因する
糖尿病は、日本人の糖尿病における頻度の1%前後に過
ぎず(厚生省糖尿病調査研究事業発症機序班、平成5年
度中間報告)、日本には他の遺伝子異常に基づく糖尿病
患者が未だ数万人もいると考えられる。
【0011】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、かかる事情
に鑑みて開発されたものであり、糖尿病発症に関連する
ヒトミトコンドリア遺伝子の異常に関する新たな情報を
提供することを目的とする。また、本発明はかかるヒト
ミトコンドリア遺伝子の変異を検出することからなる糖
尿病の診断法及び予知・予防法を提供することを目的と
する。さらに、本発明は、当該糖尿病に関連するヒトミ
トコンドリア遺伝子の変異の検出を簡便に実施するため
に有用な試薬及び試薬キットを提供することを目的とす
る。
【0012】
【課題を解決するための手段】本発明者らは、ヒトミト
コンドリア遺伝子異常と糖尿病との関連を解明すべく、
糖尿病患者のミトコンドリア遺伝子の塩基配列を健常人
のそれと比較検討していたところ、糖尿病患者のミトコ
ンドリア遺伝子に、有意な頻度でもって新規異常が存在
することを見出し、本発明を開発するに至った。
【0013】すなわち、本発明は、次に示すヒトミトコ
ンドリア遺伝子に由来するDNAである。
【0014】以下の(a)又は(b)のDNAからなる
変異ヒトミトコンドリア遺伝子の少なくとも塩基番号3
426部位を含みヒトミトコンドリア遺伝子の同定特異
性を保持する塩基長からなるDNA: (a)正常ヒトミトコンドリア遺伝子において、その塩
基配列の3426位がアデニン(A)からグアニン
(G)に変異してなるDNA; (b)(a)のDNAの塩基配列において、塩基番号3
426部位を除いて1若しくは数個の塩基が欠失、置換
若しくは付加されたDNA断片であって、該塩基の欠
失、置換及び付加が突然変異に起因するものであるヒト
ミトコンドリア遺伝子のDNA。
【0015】なお上記に示すDNAとは、ヒトミトコン
ドリア遺伝子に対応する全長のDNA(約16.6kb
p)のみならず、その一部、すなわち該遺伝子の特定部
位(塩基番号3426位)を含む部分DNA(DNA断
片)をも包含する概念で用いられる。後者部分DNAの
塩基長としては、好適には10〜500bpを挙げるこ
とができる。
【0016】また、本発明は上記DNA、特に上記部分
DNAを合成するために用いられるプライマーである。
より具体的なプライマーとしては、センスプライマーが
配列番号1又は配列番号2に示されるいずれかであっ
て、アンチセンスプライマーが配列番号3に示されるも
のが挙げられる。
【0017】さらに本発明は、被験者のヒトミトコンド
リア遺伝子において、塩基番号3426位における上記
変異(A→G3426)を検出することを特徴とするヒトミ
トコンドリア遺伝子異常を検出する方法である。より好
適な方法として、上記のプライマーを用いて被験者のヒ
トミトコンドリア遺伝子の塩基番号3426位を含むD
NAを増幅し、得られた増幅DNAの当該3426位を
含む塩基配列を解析する方法を挙げることができる。
【0018】更にまた、本発明は、前記のプライマーを
含むヒトミトコンドリア遺伝子の変異(A→G3426)検
出用試薬キット並びに該キットを有効成分とする糖尿病
診断用剤である。
【0019】なお、本明細書において、アミノ酸、ペプ
チド、塩基配列、核酸、制限酵素、その他に関する略号
による表示は、IUPAC及びIUPAC−IUBによ
る命名法又はその規定、及び「塩基配列又はアミノ酸配
列を含む明細書等の作成のためのガイドライン」(平成
9年3月、特許庁調整課審査基準室)に従うものとす
る。
【0020】また、本発明において表記する(A→G32
43)または(A→G3426)とは、ヒトミトコンドリア遺
伝子における塩基配列3243位のアラニン(A)また
は3426位のアラニン(A)がそれぞれグアニン
(G)に点変異していることを意味する。また(G→T
3423)とは、ヒトミトコンドリア遺伝子における塩基配
列3423位のグアニン(G)がチミン(T)に点変異
していることを意味する。なお、本発明で用いる塩基番
号や塩基の位置は、変異遺伝子及びDNA断片のいずれ
も、正常なミトコンドリア遺伝子の塩基配列を基準とし
て表記する。
【0021】
【発明の実施の形態】本発明は、糖尿病に関連するヒト
ミトコンドリア遺伝子の新規異常に関し、具体的にはヒ
トミトコンドリア遺伝子において、少なくとも塩基番号
3426位のAがGに変異してなる変異ヒトミトコンド
リア遺伝子のDNAである。
【0022】なお、本発明においてDNAとは、2本鎖
DNAのみならず、それを構成するセンス鎖及びアンチ
センス鎖といった各1本鎖DNAを包含する趣旨であ
る。従って、本発明の変異ヒトミトコンドリア遺伝子に
は、3426位がGに変異してなる2本鎖DNA及び1
本鎖DNA(センス鎖)、並びに該センス鎖と相補的な
配列を有する1本鎖DNA(アンチセンス鎖)が含まれ
る。
【0023】本発明の変異ヒトミトコンドリア遺伝子の
DNAは、基本的には糖尿病患者のミトコンドリア遺伝
子をPCR(ポリメラーゼチェインリアクション)法に
て増幅し、適当なベクターに挿入後、挿入されたDNA
配列を決定することよって得られた。また、本発明の変
異ミトコンドリア遺伝子の特定の変異部位は、上記糖尿
病患者のヒトミトコンドリア遺伝子のDNA配列と健常
人のヒトミトコンドリア遺伝子のDNA配列とを比較検
討することによって決定された。
【0024】図1〜図3の第1段目に、健常人が有する
正常ヒトミトコンドリア遺伝子の塩基番号3016〜3
518の塩基配列を、また図1〜図3の第2〜6段目
に、糖尿病患者が有する変異ヒトミトコンドリア遺伝子
の同塩基番号領域の塩基配列の一例を示す。図中、四角
で囲んだ部位が糖尿病患者に由来するミトコンドリア遺
伝子の変異部位である。なお、図1〜図3の第2〜6段
目中の「−」は正常遺伝子配列と同じDNA配列である
ことを示す。また、図1〜図3の第2〜6段目に示すミ
トコンドリア遺伝子の塩基配列は、実施例2で調製され
た任意の5つのクローンに由来するものである。
【0025】また、図1〜図3の第1段目に対応する正
常ヒトミトコンドリア遺伝子の全長DNAの塩基配列に
おいて塩基番号3426位が変異した変異ヒトミトコン
ドリア遺伝子のDNAを配列番号4に、図1〜図3の第
2段目及び第3段目に対応する変異ヒトミトコンドリア
遺伝子の全長DNAの塩基配列をそれぞれ配列番号5及
び6に示す。
【0026】図1〜図3に示されるように、DNA塩基
配列分析の結果、5つのクローンのうち、2つのクロー
ンに塩基番号3243位におけるAからGへの変異が見
つかり、また5つすべてのクローンに塩基番号3423
位におけるGからTへの変異および塩基番号3426位
におけるAからGへの変異が見つかった。
【0027】このうち、塩基番号3243位及び342
3位における変異は、糖尿病に関するヒトミトコンドリ
ア遺伝子異常として既に報告されているものである(Va
n den Ouweland,J.M.W.,et al.:Mutation in mitochond
rial tRNALEU(UUR) gene ina large pedigree with mat
ernally transmitted type II diabetes mellitus and
deafness. Nature Genet.,1: 368-371, 1992;Kadowak
i,T.,et al.:A subtype of diabetes mellitus associa
ted with a mutation in the mitochondrial gene. N.E
ngl,J Med., 330:962-968, 1994 ;Katagiri,H.,et a
l.:Mitochondrialdiabetes mellitus: prevalance and
clinical characterization of diabetesdue to mitoch
ondrial tRNALEU(UUR) gene mutation in Japanese pat
ionts. Diabetologia,37:504-510, 1994)。
【0028】ミトコンドリア遺伝子は、母系遺伝(mate
rnal inheritance)であり、核DNAと異なって、遺伝
情報は一般に卵のみから受け継がれる。しかし、卵のみ
から遺伝するとされているにもかかわらず、上記の塩基
番号3243位の変異は全ての細胞で変異しているわけ
ではなく、正常ヒトミトコンドリア遺伝子との共存状態
で存在することがわかっている。この現象をヘテロプラ
スミーといい、そのヘテロプラスミーの割合が定量的に
どのように遺伝するのかは現在のところ不明である。ま
た当該3243位の変異において、その浸透率(penetr
ance)と糖尿病発症についてもよく分かっていないが、
既に述べたように日本人糖尿病患者における当該変異
(A→G3243)の頻度は、1%前後に過ぎない。
【0029】それに対して、本発明に係る変異(A→G
3426)は、完全に母系遺伝型の遺伝子異常であり、上記
浸透率を考える必要がない。
【0030】なお、本発明のDNAは、ヒトミトコンド
リア遺伝子の塩基配列の少なくとも3426位のAがG
に変異してなるものであれば、他の塩基部位において1
若しくは幾つかの塩基が欠失、置換若しくは付加されて
いてもよい。より具体的には、塩基番号3426位の上
記変異に加えて、前述する塩基番号3243位(A→G
3243)および/または塩基番号3423位(G→T342
3)の変異を含むDNAが挙げられる。また、従来から
種々の疾患においてヒトミトコンドリア遺伝子の突然変
異による異常が報告され、かつその変異部位が特定され
ている(図4)。従って、本発明の変異ヒトミトコンド
リア遺伝子のDNAは、塩基番号3426位の上記変異
に加えて、図4に記載されるような従来公知の突然変異
若しくは将来見出される突然変異の少なくとも一つを含
んでいても良い。
【0031】糖尿病の発症に関与する遺伝子は従来から
複数存在することが知られているが、本発明の変異ヒト
ミトコンドリア遺伝子は、それらの糖尿病発症原因遺伝
子の一部を構成するものである。
【0032】従って、本発明のミトコンドリア遺伝子の
変異に関する情報は糖尿病の遺伝子診断に有用であり、
また必要に応じて従来公知の糖尿病関与変異もしくは将
来見出される糖尿病関与変異の情報と組み合わせること
によって、より一層確実な糖尿病の遺伝子診断を可能と
するものである。
【0033】本発明の変異に基づく糖尿病の遺伝子診断
は、基本的には被験者のミトコンドリア遺伝子に変異
(A→G3426)が存在するか否かを検出することによっ
て行われる。よって被験物はヒトミトコンドリア遺伝子
の全長DNAであってもよいが、必ずしもその必要はな
く、該遺伝子の少なくとも塩基番号3426位の変異位
置を含む部分DNAであってもよい。
【0034】このため、本発明はまた、前述する少なく
とも塩基番号3426位に変異(A→G)を有する変異
ヒトミトコンドリア遺伝子の全長DNA(約16.6KD
a)の部分DNAであって、少なくとも塩基番号342
6部位を含みヒトミトコンドリア遺伝子の同定特異性を
保持する塩基長からなるDNAを提供する。
【0035】すなわち、本発明にかかるDNAには、上
記変異ヒトミトコンドリア遺伝子の全長DNAのみなら
ず(以下、全長DNAともいう。)、該DNAの変異部
位(A→G3426)を含む特定の塩基長からなるDNA断
片(以下、部分DNAともいう)が包含される。
【0036】なお、本発明において「ヒトミトコンドリ
ア遺伝子の同定特異性を保持する塩基長」とは、他の遺
伝子と区別できるだけの(即ち、ヒトミトコンドリア遺
伝子に固有の)配列を有する塩基長を意味する。この要
件を充足する塩基長としては、選択するヒトミトコンド
リア遺伝子領域の配列によっても異なるが、通常10b
p程度以上、好ましくは20bp程度以上の長さを挙げ
ることができる。
【0037】かかる部分DNAは、上記するように、全
長DNAと同様、ヒトミトコンドリア遺伝子異常の検出
並びに糖尿病診断に供される被験DNAとして有用であ
る。また、PCR法等のDNA増幅法またはDNA伸長
法を含むDNA合成法を用いて被験DNAを調製するた
めの鋳型として有用である。
【0038】さらに、該部分DNAは本発明にかかる特
定変異を検出するためのプローブとしても有用である。
【0039】本発明の部分DNAは、前述する本発明変
異ヒトミトコンドリア遺伝子において、変異位置(塩基
番号3426)を含み、かつ同遺伝子の同定特異性を保
持すべく少なくとも10bp程度、好ましくは少なくと
も20bp程度の塩基長を有するものである限り、特に
制限されることなく、その用途に応じて適宜選択するこ
とができる。
【0040】通常、当該部分DNAは、例えば診断用の
被験DNAとして用いられる場合には、塩基番号342
6位を含む約100〜500bp、好ましくは200〜
300bpの塩基長を含む塩基配列で構成されることが
望ましい。
【0041】また、塩基番号3426位における点変異
(A→G)を検出するためのプローブとして用いられる
場合には、塩基番号3426位を含む約10〜100b
p、好ましくは10〜50bp、より好ましくは10〜
30bpの塩基長を含む塩基配列で構成されることが望
ましい。
【0042】また、本発明は被験者のヒトミトコンドリ
ア遺伝子において、塩基番号3426位におけるアデニ
ン(A)からグアニン(G)への塩基置換を検出するこ
とによるヒトミトコンドリア遺伝子異常の検出方法、及
び該検出方法に基づく糖尿病の診断方法を提供する。
【0043】当該ヒトミトコンドリア遺伝子異常の検出
方法並びにそれに基づく糖尿病の診断方法は、本発明に
よって明らかにされ、特徴づけられた前記特定のミトコ
ンドリア遺伝子変異(A→G3426)を検出するものであ
る限りにおいて、その手法などに何ら限定はなく、公知
もしくは将来得られ得る各種の方法を広く採用すること
ができる。本発明によって検出すべき遺伝子変異が明ら
かにされ、これが特定されている以上、本発明の開示に
従えば、その検出のための方法を適宜採用し、もしくは
該方法を適宜修飾して採用することは当業者であれば容
易にできる。
【0044】例えば、被験者のミトコンドリア遺伝子を
対象として特定の変異(A→G3426)を検出する方法と
しては、特に限定はされないが、サザンハイブリダイゼ
ーション法やドットハイブリダイゼーション法(いずれ
もSouthern, E.M.,J.Mol.Biol.,98:503-517, 1975等参
照)、ジデオキシ塩基配列決定法、またはDNAの増幅
手法を組み合わせた各種の検出法,例えばPCR−RF
LP(Restriction fragment length polymorphism:P
CR−制限酵素断片長多型分析法),PCR−単鎖高次
構造多型分析法(Orita,M., Iwahana,H., Kanazawa,H.,
Hayashi,K.andSekiya,T.,:Proc. Natl.Acad.Sci.,U.S.
A.,86:2766-2770, 1989等参照),PCR−SSO法(S
pecific sequence oligonucleotide:PCR−特異的配
列オリゴヌクレオチド法),PCR−SSOとドットハ
イブリダイゼーション法を用いる対立遺伝子特異的オリ
ゴヌクレオチド法(Saiki,R.K.,Bug awan,T.L.,Horn,G.
T.,Mullis,K.B. and Erlich,H.A., Nature,324:163-16
6, 1986等参照)等を例示することができる。
【0045】少量のDNA試料を用いて簡便かつ容易に
しかも感度および精度の高い検出が可能である観点から
は、PCR法若しくはそれに準じたDNA増幅法を組み
合わせた方法が好ましい。
【0046】本発明で特定された糖尿病に関するヒトミ
トコンドリア遺伝子異常(A→G3426)は、ヒトミ
トコンドリア遺伝子の塩基配列3426〜3431位の
領域に制限酵素ApaIの特異的切断サイト(GGGC
CC)を生じさせるため、より簡便には制限酵素断片長
多型分析法(RFLP法)を用いて達成できる。従っ
て、より好適には、PCR法又はその変法等によって被
験DNAを増幅・調製し、多量に調製されかつ濃縮され
た被験DNAを上記RFLP法に供して上記特異的切断
サイトの存在の有無を検出する方法を挙げることができ
る。
【0047】より具体的には、RFLP法を採用する場
合の本発明のヒトミトコンドリア遺伝子異常の検出方法
は、例えば次の方法に従って行われる。
【0048】まず、ヒト生体試料からミトコンドリア遺
伝子のDNAを抽出し、該遺伝子の少なくとも塩基番号
3426位を有する被験DNAを増幅し、多量にかつ濃
縮されたサンプルを得る。次いで、増幅DNAサンプル
を制限酵素ApaIを用いて消化し、DNAの切断様式
(切断の有無、切断フラグメントの塩基長など)を常法
に従って確認する。すなわち、本発明の変異(A→G34
26)を有する、例えば塩基番号3292〜3518位か
らなる塩基長227bpの増幅DNAは、ApaI消化
により、139bpと88bpの2つのフラグメントを
生じ、一方、本発明の変異を有しない増幅DNAではこ
の切断様式を呈しないため、当該方法により、本発明に
かかる遺伝子の変異の存在を検出することができる。
【0049】当該方法において、クローニング及び被験
DNAを調製するために用いられるDNAの増幅は、例
えばPCR法またはその変法に従って実施することがで
き、これは上記塩基番号3426位を有する所望のDN
A断片を特異的に増幅するように適宜選択したプライマ
ーを採用することにより行われる。
【0050】用いられるプライマーとしては、被験者の
ヒトミトコンドリア遺伝子に由来するDNAを鋳型とし
て、少なくとも本発明の変異(A→G3426)部位を含む
領域を有する一定塩基長のDNAを増幅できるように設
計されたものであれば、特に制限されない。ここで増幅
されるDNAの領域は、特に限定されないが、制限酵素
による切断の結果、切断断片が確認できるように塩基長
の差を与えるように設定するのがよい。
【0051】また、プライマーの塩基長は、通常プライ
マーとして機能し、採用される塩基長であれば特に制限
されず、通常15〜30bp程度、好ましくは20〜3
0bp程度、より好ましくは20〜25bp程度を挙げ
ることができる。
【0052】従って本発明は、被験者のヒトミトコンド
リア遺伝子に由来するDNAを鋳型として、少なくとも
特定の変異部位(A→G3426)を含む領域を有するDN
Aを合成できるように設計されたプライマーを提供す
る。
【0053】なお、ここでいうDNAの合成とは、特定
のDNA(センス鎖、アンチセンス鎖)を鋳型として、
その配列に相補的な配列を有するDNAを伸長及び増幅
することを広く含む概念である。
【0054】本発明のプライマーは、ヒトミトコンドリ
ア遺伝子に特異的であって、他の遺伝子と相同でなけれ
ば(例えば、繰り返し配列やパリンドローム配列でない
こと等が必要)特に制限されることなく、DNAの合成
の態様、合成するDNAの領域及び塩基長等に応じて適
宜選択することができる。より具体的には、配列番号1
及び2に示される、本発明においてそれぞれ“ mtseq
F”及び“mt3426F”と称されるプライマー、また配列
番号3に示される本発明において“mtseqR”と称され
るプライマーを挙げることができる。
【0055】当該“ mtseqF”及び“mtseqR”プライ
マーによれば、被験者のヒトミトコンドリア遺伝子に由
来するDNAを鋳型として、PCR法又はその変法によ
り、本発明の変異部位(A→G3426)を含む塩基番号3
016〜3518位の塩基長503bpのDNAフラグ
メントを合成することができる。また、当該“ mt3426
F”及び“mtseqR”プライマーによれば、被験者のヒ
トミトコンドリア遺伝子に由来するDNAまたは上記D
NAフラグメントを鋳型として、PCR法又はその変法
により、本発明の変異部位(A→G3426)を含む塩基番
号3292〜3518位の227bpの塩基長を有する
DNAフラグメントを合成することができる。
【0056】なお、本発明のプライマーは、DNA自動
合成機等を利用して本発明で開示する塩基配列に従って
合成することができる。
【0057】なお、本発明のヒトミトコンドリア遺伝子
異常の検出法において採用され得る各種の操作、例え
ば、DNA又はDNA断片の合成、DNAの切断,削
除,付加または結合を目的とする酵素処理、DNAの単
離,精製,複製,選択、DNA断片の増幅などはいずれ
も常法に従うことができ(分子遺伝学実験法、共立出版
(株)1983年発行;PCRテクノロジー、宝酒造
(株)1990年発行等参照)、また必要に応じて適宜
修飾して用いることができる。
【0058】また本発明の検出法において、測定対象で
あるミトコンドリア遺伝子はヒトに由来するものである
限り特に制限されることなく、ヒトミトコンドリア遺伝
子を含む例えば血液、毛髪、生体材料組織、手術切除組
織、細胞株等の生体試料から広く採取される。
【0059】ヒトミトコンドリア遺伝子の異常を検出
し、またかかる方法に基づいて糖尿病の遺伝子診断を行
うにあたっては、ミトコンドリア遺伝子変異(A→G34
26)の検出用試薬を有効成分として含有する試薬キット
を利用するのが好適である。
【0060】かかる試薬キットは、被験者のヒトミトコ
ンドリア遺伝子に由来するDNAを鋳型として塩基番号
3426位を含むDNA領域をを合成できるように設計
された前記のプライマーを必須成分として含有すること
を特徴とするものである。プライマーは、本発明の変異
の検出方法に応じて適宜選択することができるが、例え
ば、前述するPCR−RFLP法を用いて検出する場合
は、好適には、センスプライマーmtseqFとアンチセン
スプライマーmtseqRのセット、又はセンスプライマーm
t3426FとアンチセンスプライマーmtseqRのセットの少
なくとも一種を挙げることができる。
【0061】本発明の試薬キットは、上記プライマー成
分に加えて、本発明にかかる変異の存在の検出に応じた
一乃至数個の試薬を組み合わせたものであってもよい。
なお、かかる試薬は、採用される検出方法に応じて適宜
選択採用されるが、例えば制限酵素ApaI、dAT
P、dUTP、dTTP、dGTP、DNA合成酵素、
RNA合成酵素等を挙げることができる。
【0062】更に、当該試薬キットには、測定の実施の
便益のために適当な緩衝液、洗浄液等が含まれていても
よい。
【0063】当該本発明のヒトミトコンドリア遺伝子の
異常(A→G3426)検出用試薬キットは糖尿病診断
用剤として有用であり、本発明は、該試薬キットを有効
成分とする糖尿病診断用剤を提供するものである。
【0064】本発明によれば、ヒトミトコンドリアの遺
伝子情報に基づいて糖尿病の早期診断を行うことがで
き、これにより糖尿病の適切な予防と治療に多大な貢献
をするものと考えられる。
【0065】
【実施例】以下、本発明の内容を実施例を用いて具体的
に説明する。ただし、本発明はこれらに何ら限定される
ものではない。
【0066】実施例1 変異ヒトミトコンドリア遺伝
子のDNA断片の調製 DNA断片の調製のための鋳型となるミトコンドリアD
NAを糖尿病患者の血液から抽出した。
【0067】すなわち、血液0.5mlを2500rp
mで5分間遠心分離して上清を除去し、得られたペレッ
トに0.2%NaCl 2mlを加えて転倒混和し、再
度2500rpmで10分間遠心分離して上清を除去し
た。次いで、再度得られたペレットに10mM Tris-1
0mM EDTA(pH8)を450μl、10%SD
S50μl、25mg/ml Proteinase K 及び10m
g/ml Rnase 2μlを加えて転倒混和し、37℃で
8時間インキュベーションし、それからDNA抽出機N
A-1000(商品名:KURABO社製)を用いてD
NA抽出した。
【0068】次いで、得られたミトコンドリアDNA抽
出液5μlを鋳型とし、本発明のプライマー:mtseqF
(配列番号1)及び mtseqR(配列番号3)をプライマ
ーとして、AmpTaq(Perkin Elmer社製)を用い
て、PCRで増幅した(PCR反応:94℃で1分,5
6℃で1分,72℃で2分のサイクルを35回実施)。
【0069】実施例2 クローニング 実施例1で得られたPCR産物を3%アガロースゲルで
電気泳動を行い、得られたバンドを切り出した。次いで
該バンドからSephaglas BandPrep Kit(商品名:Pharma
cia Biotech社製)を用いて、DNAを抽出した。得ら
れたDNA抽出液2μlに、pCR2.1ベクター(商品
名:Invitrogen社製)1μl及びDNALidation Kit V
er IIのsolution I(商品名:宝酒造社製)3μlを混
和し、16℃で2時間ライゲーションを行った。
【0070】このライゲーション液全量を、氷上で溶か
しておいたコンピテント細胞JM109(宝酒造社製)
100μlに混ぜ、氷上で30分間インキュベートし
た。次いで、42℃のウォーターバスに40秒間浸けて
ヒートショックを加えた後、直ちに氷中で2分間冷やし
た。これにLB培地を900μl加え、37℃で1時間
振盪培養した。この培養液を、X−GAL0.1mM,
IPTG0.1mM及びアンピシリン50μg/mlを
含むLBプレートにストリークし、37℃、オーバーナ
イトで培養してコロニーを形成させた。
【0071】シングルコロニーを10個ピックアップ
し、アンピシリン50μg/mlを含むLB培地2ml
に植え継ぎ、37℃、オーバーナイトで培養し、その培
養液をプラスミド抽出機PI−100Σ(商品名:KU
RABO社製)を用いてプラスミド抽出を行った。
【0072】実施例3 塩基配列の決定 Dye Terminator法を用い、ABI PROSM377 DNA Sequenser
(商品名:Perkin Elmer社製)で、糖尿病患者由来のミ
トコンドリア遺伝子のDNAの塩基配列を決定した。
【0073】詳細には、Pre Mix8μl、M13 forwar
dプライマー3.2pmol(Promega社製)、実施例2で抽
出したプラスミド5μl、ミリQ水5μl及びABI c
yclesequencing kit(商品名:Perkin Elmer社製)で全
量20μlとし、最後にミネラルオイルを1滴加えて、
Robocycler40(商品名:STRATAGENE社製)を用いて、シ
ークエンス反応PCRを行った(PCR反応:96℃で
30秒,50℃で15秒,60℃で4分間の反応を35
サイクル)。得られたPCR産物をを Centri-Sep Spin
Columns(商品名:Perkin Elmer社製)で精製して乾燥
し、ホルムアミド/ブルーデキストラン(5:1)5μ
Lで溶解した。このサンプルを95℃2分間加熱処理し
て、ABI PROSM377 DNA Sequenserを用いて塩基配列決定
を行った。
【0074】当該塩基配列決定は、実施例2で調製した
任意の5つのクローンについて行い、得られた塩基配列
を健常人のミトコンドリア遺伝子のDNAと比較した。
結果を図1〜図3に示す。
【0075】その結果、糖尿病患者に由来するミトコン
ドリア遺伝子の5つのクローンのうち、2つのクローン
に塩基番号3243位におけるAからGへの変異が見つ
かり、また5つすべてのクローンに塩基番号3423位
におけるGからTへの変異および塩基番号3426位に
おけるAからGへの変異が見つかった。このうち、34
26位の変異(A→G3426)は、糖尿病に関連する変異
として本発明において新たに見つかった変異である。当
該変異(A→G3426)は、塩基番号3243位の変異と
は異なり、5クローンともすべて変異しており完全に母
系遺伝型の遺伝子異常であることが確認された。
【0076】実施例4 変異ミトコンドリア遺伝子の検
出 実施例2で調製したDNA断片5μLを鋳型とし、mt34
26F(配列番号2)及びmtseqR(配列番号3)をプラ
イマーとして、AmpTaq(Perkin Elmer社製)を用
いてPCR増幅した。PCR反応は94℃で1分間,5
8℃で1分間及び72℃で2分間のサイクルを35回行
った。得られたPCR産物を8μlに10×M Buffer
1μl及び制限酵素ApaIを5U加えて37℃で3時
間消化を行い、その後3%アガロースゲル電気泳動し
て、エチジウムブロマイド染色を行い、UVによりバン
ドを検出した。
【0077】その結果、227bpのバンドの少なくと
も一部が139bpと88bpに分かれることが観察さ
れ、ヒトミトコンドリア遺伝子の3426位が変異した
遺伝子であることが確認された。
【0078】
【配列表】
配列番号:1 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: 特徴を表す記号:primer 配列 GCAGCCGCTA TTAAGGTTCG 20 配列番号:2 配列の長さ:20 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴: 特徴を表す記号:primer 配列 TAGAGGGTAT GGTAGATGTG 20 配列番号:3 配列の長さ:21 配列の型:核酸 鎖の数:一本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 合成DNA 配列の特徴 特徴を表す記号:primer 配列 CCTCTTCTTA ACAACATACC C 21 配列番号:4 配列の長さ:16569 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 ミトコンドリアDNA(mtDN
A) 起源 生物名:ヒト 配列の特徴: 特徴を表す記号:mutation 存在位置:3426 特徴を決定した方法:S 配列 GATCACAGGT CTATCACCCT ATTAACCACT CACGGGAGCT CTCCATGCAT TTGGTATTTT 60 CGTCTGGGGG GTATGCACGC GATAGCATTG CGAGACGCTG GAGCCGGAGC ACCCTATGTC 120 GCAGTATCTG TCTTTGATTC CTGCCTCATC CTATTATTTA TCGCACCTAC GTTCAATATT 180 ACAGGCGAAC ATACTTACTA AAGTGTGTTA ATTAATTAAT GCTTGTAGGA CATAATAATA 240 ACAATTGAAT GTCTGCACAG CCACTTTCCA CACAGACATC ATAACAAAAA ATTTCCACCA 300 AACCCCCCCT CCCCCGCTTC TGGCCACAGC ACTTAAACAC ATCTCTGCCA AACCCCAAAA 360 ACAAAGAACC CTAACACCAG CCTAACCAGA TTTCAAATTT TATCTTTTGG CGGTATGCAC 420 TTTTAACAGT CACCCCCCAA CTAACACATT ATTTTCCCCT CCCACTCCCA TACTACTAAT 480 CTCATCAATA CAACCCCCGC CCATCCTACC CAGCACACAC ACACCGCTGC TAACCCCATA 540 CCCCGAACCA ACCAAACCCC AAAGACACCC CCCACAGTTT ATGTAGCTTA CCTCCTCAAA 600 GCAATACACT GAAAATGTTT AGACGGGCTC ACATCACCCC ATAAACAAAT AGGTTTGGTC 660 CTAGCCTTTC TATTAGCTCT TAGTAAGATT ACACATGCAA GCATCCCCGT TCCAGTGAGT 720 TCACCCTCTA AATCACCACG ATCAAAAGGA ACAAGCATCA AGCACGCAGC AATGCAGCTC 780 AAAACGCTTA GCCTAGCCAC ACCCCCACGG GAAACAGCAG TGATTAACCT TTAGCAATAA 840 ACGAAAGTTT AACTAAGCTA TACTAACCCC AGGGTTGGTC AATTTCGTGC CAGCCACCGC 900 GGTCACACGA TTAACCCAAG TCAATAGAAG CCGGCGTAAA GAGTGTTTTA GATCACCCCC 960 TCCCCAATAA AGCTAAAACT CACCTGAGTT GTAAAAAACT CCAGTTGACA CAAAATAGAC 1020 TACGAAAGTG GCTTTAACAT ATCTGAACAC ACAATAGCTA AGACCCAAAC TGGGATTAGA 1080 TACCCCACTA TGCTTAGCCC TAAACCTCAA CAGTTAAATC AACAAAACTG CTCGCCAGAA 1140 CACTACGAGC CACAGCTTAA AACTCAAAGG ACCTGGCGGT GCTTCATATC CCTCTAGAGG 1200 AGCCTGTTCT GTAATCGATA AACCCCGATC AACCTCACCA CCTCTTGCTC AGCCTATATA 1260 CCGCCATCTT CAGCAAACCC TGATGAAGGC TACAAAGTAA GCGCAAGTAC CCACGTAAAG 1320 ACGTTAGGTC AAGGTGTAGC CCATGAGGTG GCAAGAAATG GGCTACATTT TCTACCCCAG 1380 AAAACTACGA TAGCCCTTAT GAAACTTAAG GGTCGAAGGT GGATTTAGCA GTAAACTAAG 1440 AGTAGAGTGC TTAGTTGAAC AGGGCCCTGA AGCGCGTACA CACCGCCCGT CACCCTCCTC 1500 AAGTATACTT CAAAGGACAT TTAACTAAAA CCCCTACGCA TTTATATAGA GGAGACAAGT 1560 CGTAACATGG TAAGTGTACT GGAAAGTGCA CTTGGACGAA CCAGAGTGTA GCTTAACACA 1620 AAGCACCCAA CTTACACTTA GGAGATTTCA ACTTAACTTG ACCGCTCTGA GCTAAACCTA 1680 GCCCCAAACC CACTCCACCT TACTACCAGA CAACCTTAGC CAAACCATTT ACCCAAATAA 1740 AGTATAGGCG ATAGAAATTG AAACCTGGCG CAATAGATAT AGTACCGCAA GGGAAAGATG 1800 AAAAATTATA ACCAAGCATA ATATAGCAAG GACTAACCCC TATACCTTCT GCATAATGAA 1860 TTAACTAGAA ATAACTTTGC AAGGAGAGCC AAAGCTAAGA CCCCCGAAAC CAGACGAGCT 1920 ACCTAAGAAC AGCTAAAAGA GCACACCCGT CTATGTAGCA AAATAGTGGG AAGATTTATA 1980 GGTAGAGGCG ACAAACCTAC CGAGCCTGGT GATAGCTGGT TGTCCAAGAT AGAATCTTAG 2040 TTCAACTTTA AATTTGCCCA CAGAACCCTC TAAATCCCCT TGTAAATTTA ACTGTTAGTC 2100 CAAAGAGGAA CAGCTCTTTG GACACTAGGA AAAAACCTTG TAGAGAGAGT AAAAAATTTA 2160 ACACCCATAG TAGGCCTAAA AGCAGCCACC AATTAAGAAA GCGTTCAAGC TCAACACCCA 2220 CTACCTAAAA AATCCCAAAC ATATAACTGA ACTCCTCACA CCCAATTGGA CCAATCTATC 2280 ACCCTATAGA AGAACTAATG TTAGTATAAG TAACATGAAA ACATTCTCCT CCGCATAAGC 2340 CTGCGTCAGA TTAAAACACT GAACTGACAA TTAACAGCCC AATATCTACA ATCAACCAAC 2400 AAGTCATTAT TACCCTCACT GTCAACCCAA CACAGGCATG CTCATAAGGA AAGGTTAAAA 2460 AAAGTAAAAG GAACTCGGCA AATCTTACCC CGCCTGTTTA CCAAAAACAT CACCTCTAGC 2520 ATCACCAGTA TTAGAGGCAC CGCCTGCCCA GTGACACATG TTTAACGGCC GCGGTACCCT 2580 AACCGTGCAA AGGTAGCATA ATCACTTGTT CCTTAAATAG GGACCTGTAT GAATGGCTCC 2640 ACGAGGGTTC AGCTGTCTCT TACTTTTAAC CAGTGAAATT GACCTGCCCG TGAAGAGGCG 2700 GGCATAACAC AGCAAGACGA GAAGACCCTA TGGAGCTTTA ATTTATTAAT GCAAACAGTA 2760 CCTAACAAAC CCACAGGTCC TAAACTACCA AACCTGCATT AAAAATTTCG GTTGGGGCGA 2820 CCTCGGAGCA GAACCCAACC TCCGAGCAGT ACATGCTAAG ACTTCACCAG TCAAAGCGAA 2880 CTACTATACT CAATTGATCC AATAACTTGA CCAACGGAAC AAGTTACCCT AGGGATAACA 2940 GCGCAATCCT ATTCTAGAGT CCATATCAAC AATAGGGTTT ACGACCTCGA TGTTGGATCA 3000 GGACATCCCG ATGGTGCAGC CGCTATTAAA GGTTCGTTTG TTCAACGATT AAAGTCCTAC 3060 GTGATCTGAG TTCAGACCGG AGTAATCCAG GTCGGTTTCT ATCTACCTTC AAATTCCTCC 3120 CTGTACGAAA GGACAAGAGA AATAAGGCCT ACTTCACAAA GCGCCTTCCC CCGTAAATGA 3180 TATCATCTCA ACTTAGTATT ATACCCACAC CCACCCAAGA ACAGGGTTTG TTAAGATGGC 3240 AGAGCCCGGT AATCGCATAA AACTTAAAAC TTTACAGTCA GAGGTTCAAT TCCTCTTCTT 3300 AACAACATAC CCATGGCCAA CCTCCTACTC CTCATTGTAC CCATTCTAAT CGCAATGGCA 3360 TTCCTAATGC TTACCGAACG AAAAATTCTA GGCTATATAC AACTACGCAA AGGCCCCAAC 3420 GTGGTGGGCC CCTACGGGCT ACTACAACCC TTCGCTGACG CCATAAAACT CTTCACCAAA 3480 GAGCCCCTAA AACCCGCCAC ATCTACCATC ACCCTCTACA TCACCGCCCC GACCTTAGCT 3540 CTCACCATCG CTCTTCTACT ATGAACCCCC CTCCCCATAC CCAACCCCCT GGTCAACCTC 3600 AACCTAGGCC TCCTATTTAT TCTAGCCACC TCTAGCCTAG CCGTTTACTC AATCCTCTGA 3660 TCAGGGTGAG CATCAAACTC AAACTACGCC CTGATCGGCG CACTGCGAGC AGTAGCCCAA 3720 ACAATCTCAT ATGAAGTCAC CCTAGCCATC ATTCTACTAT CAACATTACT AATAAGTGGC 3780 TCCTTTAACC TCTCCACCCT TATCACAACA CAAGAACACC TCTGATTACT CCTGCCATCA 3840 TGACCCTTGG CCATAATATG ATTTATCTCC ACACTAGCAG AGACCAACCG AACCCCCTTC 3900 GACCTTGCCG AAGGGGAGTC CGAACTAGTC TCAGGCTTCA ACATCGAATA CGCCGCAGGC 3960 CCCTTCGCCC TATTCTTCAT AGCCGAATAC ACAAACATTA TTATAATAAA CACCCTCACC 4020 ACTACAATCT TCCTAGGAAC AACATATGAC GCACTCTCCC CTGAACTCTA CACAACATAT 4080 TTTGTCACCA AGACCCTACT TCTAACCTCC CTGTTCTTAT GAATTCGAAC AGCATACCCC 4140 CGATTCCGCT ACGACCAACT CATACACCTC CTATGAAAAA ACTTCCTACC ACTCACCCTA 4200 GCATTACTTA TATGATATGT CTCCATACCC ATTACAATCT CCAGCATTCC CCCTCAAACC 4260 TAAGAAATAT GTCTGATAAA AGAGTTACTT TGATAGAGTA AATAATAGGA GCTTAAACCC 4320 CCTTATTTCT AGGACTATGA GAATCGAACC CATCCCTGAG AATCCAAAAT TCTCCGTGCC 4380 ACCTATCACA CCCCATCCTA AAGTAAGGTC AGCTAAATAA GCTATCGGGC CCATACCCCG 4440 AAAATGTTGG TTATACCCTT CCCGTACTAA TTAATCCCCT GGCCCAACCC GTCATCTACT 4500 CTACCATCTT TGCAGGCACA CTCATCACAG CGCTAAGCTC GCACTGATTT TTTACCTGAG 4560 TAGGCCTAGA AATAAACATG CTAGCTTTTA TTCCAGTTCT AACCAAAAAA ATAAACCCTC 4620 GTTCCACAGA AGCTGCCATC AAGTATTTCC TCACGCAAGC AACCGCATCC ATAATCCTTC 4680 TAATAGCTAT CCTCTTCAAC AATATACTCT CCGGACAATG AACCATAACC AATACTACCA 4740 ATCAATACTC ATCATTAATA ATCATAATAG CTATAGCAAT AAAACTAGGA ATAGCCCCCT 4800 TTCACTTCTG AGTCCCAGAG GTTACCCAAG GCACCCCTCT GACATCCGGC CTGCTTCTTC 4860 TCACATGACA AAAACTAGCC CCCATCTCAA TCATATACCA AATCTCTCCC TCACTAAACG 4920 TAAGCCTTCT CCTCACTCTC TCAATCTTAT CCATCATAGC AGGCAGTTGA GGTGGATTAA 4980 ACCAGACCCA GCTACGCAAA ATCTTAGCAT ACTCCTCAAT TACCCACATA GGATGAATAA 5040 TAGCAGTTCT ACCGTACAAC CCTAACATAA CCATTCTTAA TTTAACTATT TATATTATCC 5100 TAACTACTAC CGCATTCCTA CTACTCAACT TAAACTCCAG CACCACGACC CTACTACTAT 5160 CTCGCACCTG AAACAAGCTA ACATGACTAA CACCCTTAAT TCCATCCACC CTCCTCTCCC 5220 TAGGAGGCCT GCCCCCGCTA ACCGGCTTTT TGCCCAAATG GGCCATTATC GAAGAATTCA 5280 CAAAAAACAA TAGCCTCATC ATCCCCACCA TCATAGCCAC CATCACCCTC CTTAACCTCT 5340 ACTTCTACCT ACGCCTAATC TACTCCACCT CAATCACACT ACTCCCCATA TCTAACAACG 5400 TAAAAATAAA ATGACAGTTT GAACATACAA AACCCACCCC ATTCCTCCCC ACACTCATCG 5460 CCCTTACCAC GCTACTCCTA CCTATCTCCC CTTTTATACT AATAATCTTA TAGAAATTTA 5520 GGTTAAATAC AGACCAAGAG CCTTCAAAGC CCTCAGTAAG TTGCAATACT TAATTTCTGT 5580 AACAGCTAAG GACTGCAAAA CCCCACTCTG CATCAACTGA ACGCAAATCA GCCACTTTAA 5640 TTAAGCTAAG CCCTTACTAG ACCAATGGGA CTTAAACCCA CAAACACTTA GTTAACAGCT 5700 AAGCACCCTA ATCAACTGGC TTCAATCTAC TTCTCCCGCC GCCGGGAAAA AAGGCGGGAG 5760 AAGCCCCGGC AGGTTTGAAG CTGCTTCTTC GAATTTGCAA TTCAATATGA AAATCACCTC 5820 GGAGCTGGTA AAAAGAGGCC TAACCCCTGT CTTTAGATTT ACAGTCCAAT GCTTCACTCA 5880 GCCATTTTAC CTCACCCCCA CTGATGTTCG CCGACCGTTG ACTATTCTCT ACAAACCACA 5940 AAGACATTGG AACACTATAC CTATTATTCG GCGCATGAGC TGGAGTCCTA GGCACAGCTC 6000 TAAGCCTCCT TATTCGAGCC GAGCTGGGCC AGCCAGGCAA CCTTCTAGGT AACGACCACA 6060 TCTACAACGT TATCGTCACA GCCCATGCAT TTGTAATAAT CTTCTTCATA GTAATACCCA 6120 TCATAATCGG AGGCTTTGGC AACTGACTAG TTCCCCTAAT AATCGGTGCC CCCGATATGG 6180 CGTTTCCCCG CATAAACAAC ATAAGCTTCT GACTCTTACC TCCCTCTCTC CTACTCCTGC 6240 TCGCATCTGC TATAGTGGAG GCCGGAGCAG GAACAGGTTG AACAGTCTAC CCTCCCTTAG 6300 CAGGGAACTA CTCCCACCCT GGAGCCTCCG TAGACCTAAC CATCTTCTCC TTACACCTAG 6360 CAGGTGTCTC CTCTATCTTA GGGGCCATCA ATTTCATCAC AACAATTATC AATATAAAAC 6420 CCCCTGCCAT AACCCAATAC CAAACGCCCC TCTTCGTCTG ATCCGTCCTA ATCACAGCAG 6480 TCCTACTTCT CCTATCTCTC CCAGTCCTAG CTGCTGGCAT CACTATACTA CTAACAGACC 6540 GCAACCTCAA CACCACCTTC TTCGACCCCG CCGGAGGAGG AGACCCCATT CTATACCAAC 6600 ACCTATTCTG ATTTTTCGGT CACCCTGAAG TTTATATTCT TATCCTACCA GGCTTCGGAA 6660 TAATCTCCCA TATTGTAACT TACTACTCCG GAAAAAAAGA ACCATTTGGA TACATAGGTA 6720 TGGTCTGAGC TATGATATCA ATTGGCTTCC TAGGGTTTAT CGTGTGAGCA CACCATATAT 6780 TTACAGTAGG AATAGACGTA GACACACGAG CATATTTCAC CTCCGCTACC ATAATCATCG 6840 CTATCCCCAC CGGCGTCAAA GTATTTAGCT GACTCGCCAC ACTCCACGGA AGCAATATGA 6900 AATGATCTGC TGCAGTGCTC TGAGCCCTAG GATTCATCTT TCTTTTCACC GTAGGTGGCC 6960 TGACTGGCAT TGTATTAGCA AACTCATCAC TAGACATCGT ACTACACGAC ACGTACTACG 7020 TTGTAGCCCA CTTCCACTAT GTCCTATCAA TAGGAGCTGT ATTTGCCATC ATAGGAGGCT 7080 TCATTCACTG ATTTCCCCTA TTCTCAGGCT ACACCCTAGA CCAAACCTAC GCCAAAATCC 7140 ATTTCACTAT CATATTCATC GGCGTAAATC TAACTTTCTT CCCACAACAC TTTCTCGGCC 7200 TATCCGGAAT GCCCCGACGT TACTCGGACT ACCCCGATGC ATACACCACA TGAAACATCC 7260 TATCATCTGT AGGCTCATTC ATTTCTCTAA CAGCAGTAAT ATTAATAATT TTCATGATTT 7320 GAGAAGCCTT CGCTTCGAAG CGAAAAGTCC TAATAGTAGA AGAACCCTCC ATAAACCTGG 7380 AGTGACTATA TGGATGCCCC CCACCCTACC ACACATTCGA AGAACCCGTA TACATAAAAT 7440 CTAGACAAAA AAGGAAGGAA TCGAACCCCC CAAAGCTGGT TTCAAGCCAA CCCCATGGCC 7500 TCCATGACTT TTTCAAAAAG GTATTAGAAA AACCATTTCA TAACTTTGTC AAAGTTAAAT 7560 TATAGGCTAA ATCCTATATA TCTTAATGGC ACATGCAGCG CAAGTAGGTC TACAAGACGC 7620 TACTTCCCCT ATCATAGAAG AGCTTATCAC CTTTCATGAT CACGCCCTCA TAATCATTTT 7680 CCTTATCTGC TTCCTAGTCC TGTATGCCCT TTTCCTAACA CTCACAACAA AACTAACTAA 7740 TACTAACATC TCAGACGCTC AGGAAATAGA AACCGTCTGA ACTATCCTGC CCGCCATCAT 7800 CCTAGTCCTC ATCGCCCTCC CATCCCTACG CATCCTTTAC ATAACAGACG AGGTCAACGA 7860 TCCCTCCCTT ACCATCAAAT CAATTGGCCA CCAATGGTAC TGAACCTACG AGTACACCGA 7920 CTACGGCGGA CTAATCTTCA ACTCCTACAT ACTTCCCCCA TTATTCCTAG AACCAGGCGA 7980 CCTGCGACTC CTTGACGTTG ACAATCGAGT AGTACTCCCG ATTGAAGCCC CCATTCGTAT 8040 AATAATTACA TCACAAGACG TCTTGCACTC ATGAGCTGTC CCCACATTAG GCTTAAAAAC 8100 AGATGCAATT CCCGGACGTC TAAACCAAAC CACTTTCACC GCTACACGAC CGGGGGTATA 8160 CTACGGTCAA TGCTCTGAAA TCTGTGGAGC AAACCACAGT TTCATGCCCA TCGTCCTAGA 8220 ATTAATTCCC CTAAAAATCT TTGAAATAGG GCCCGTATTT ACCCTATAGC ACCCCCTCTA 8280 CCCCCTCTAG AGCCCACTGT AAAGCTAACT TAGCATTAAC CTTTTAAGTT AAAGATTAAG 8340 AGAACCAACA CCTCTTTACA GTGAAATGCC CCAACTAAAT ACTACCGTAT GGCCCACCAT 8400 AATTACCCCC ATACTCCTTA CACTATTCCT CATCACCCAA CTAAAAATAT TAAACACAAA 8460 CTACCACCTA CCTCCCTCAC CAAAGCCCAT AAAAATAAAA AATTATAACA AACCCTGAGA 8520 ACCAAAATGA ACGAAAATCT GTTCGCTTCA TTCATTGCCC CCACAATCCT AGGCCTACCC 8580 GCCGCAGTAC TGATCATTCT ATTTCCCCCT CTATTGATCC CCACCTCCAA ATATCTCATC 8640 AACAACCGAC TAATCACCAC CCAACAATGA CTAATCAAAC TAACCTCAAA ACAAATGATA 8700 ACCATACACA ACACTAAAGG ACGAACCTGA TCTCTTATAC TAGTATCCTT AATCATTTTT 8760 ATTGCCACAA CTAACCTCCT CGGACTCCTG CCTCACTCAT TTACACCAAC CACCCAACTA 8820 TCTATAAACC TAGCCATGGC CATCCCCTTA TGAGCGGGCA CAGTGATTAT AGGCTTTCGC 8880 TCTAAGATTA AAAATGCCCT AGCCCACTTC TTACCACAAG GCACACCTAC ACCCCTTATC 8940 CCCATACTAG TTATTATCGA AACCATCAGC CTACTCATTC AACCAATAGC CCTGGCCGTA 9000 CGCCTAACCG CTAACATTAC TGCAGGCCAC CTACTCATGC ACCTAATTGG AAGCGCCACC 9060 CTAGCAATAT CAACCATTAA CCTTCCCTCT ACACTTATCA TCTTCACAAT TCTAATTCTA 9120 CTGACTATCC TAGAAATCGC TGTCGCCTTA ATCCAAGCCT ACGTTTTCAC ACTTCTAGTA 9180 AGCCTCTACC TGCACGACAA 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A) 起源 生物名:ヒト 配列の特徴: 特徴を表す記号:mutation 存在位置:3243.3423.3426 特徴を決定した方法:S 配列 GATCACAGGT CTATCACCCT ATTAACCACT CACGGGAGCT CTCCATGCAT TTGGTATTTT 60 CGTCTGGGGG GTATGCACGC GATAGCATTG CGAGACGCTG GAGCCGGAGC ACCCTATGTC 120 GCAGTATCTG TCTTTGATTC CTGCCTCATC CTATTATTTA TCGCACCTAC GTTCAATATT 180 ACAGGCGAAC ATACTTACTA AAGTGTGTTA ATTAATTAAT GCTTGTAGGA CATAATAATA 240 ACAATTGAAT GTCTGCACAG CCACTTTCCA CACAGACATC ATAACAAAAA ATTTCCACCA 300 AACCCCCCCT CCCCCGCTTC TGGCCACAGC ACTTAAACAC ATCTCTGCCA AACCCCAAAA 360 ACAAAGAACC CTAACACCAG CCTAACCAGA TTTCAAATTT TATCTTTTGG CGGTATGCAC 420 TTTTAACAGT CACCCCCCAA CTAACACATT ATTTTCCCCT CCCACTCCCA TACTACTAAT 480 CTCATCAATA CAACCCCCGC CCATCCTACC CAGCACACAC ACACCGCTGC TAACCCCATA 540 CCCCGAACCA ACCAAACCCC AAAGACACCC CCCACAGTTT ATGTAGCTTA CCTCCTCAAA 600 GCAATACACT GAAAATGTTT AGACGGGCTC ACATCACCCC ATAAACAAAT AGGTTTGGTC 660 CTAGCCTTTC TATTAGCTCT TAGTAAGATT ACACATGCAA GCATCCCCGT TCCAGTGAGT 720 TCACCCTCTA AATCACCACG ATCAAAAGGA ACAAGCATCA AGCACGCAGC AATGCAGCTC 780 AAAACGCTTA 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CCATGGCCAA CCTCCTACTC CTCATTGTAC CCATTCTAAT CGCAATGGCA 3360 TTCCTAATGC TTACCGAACG AAAAATTCTA GGCTATATAC AACTACGCAA AGGCCCCAAC 3420 GTTGTGGGCC CCTACGGGCT ACTACAACCC TTCGCTGACG CCATAAAACT CTTCACCAAA 3480 GAGCCCCTAA AACCCGCCAC ATCTACCATC ACCCTCTACA TCACCGCCCC GACCTTAGCT 3540 CTCACCATCG CTCTTCTACT ATGAACCCCC CTCCCCATAC CCAACCCCCT GGTCAACCTC 3600 AACCTAGGCC TCCTATTTAT TCTAGCCACC TCTAGCCTAG CCGTTTACTC AATCCTCTGA 3660 TCAGGGTGAG CATCAAACTC AAACTACGCC CTGATCGGCG CACTGCGAGC AGTAGCCCAA 3720 ACAATCTCAT ATGAAGTCAC CCTAGCCATC ATTCTACTAT CAACATTACT AATAAGTGGC 3780 TCCTTTAACC TCTCCACCCT TATCACAACA CAAGAACACC TCTGATTACT CCTGCCATCA 3840 TGACCCTTGG CCATAATATG ATTTATCTCC ACACTAGCAG AGACCAACCG AACCCCCTTC 3900 GACCTTGCCG AAGGGGAGTC CGAACTAGTC TCAGGCTTCA ACATCGAATA CGCCGCAGGC 3960 CCCTTCGCCC TATTCTTCAT AGCCGAATAC ACAAACATTA TTATAATAAA CACCCTCACC 4020 ACTACAATCT TCCTAGGAAC AACATATGAC GCACTCTCCC CTGAACTCTA CACAACATAT 4080 TTTGTCACCA AGACCCTACT TCTAACCTCC CTGTTCTTAT GAATTCGAAC AGCATACCCC 4140 CGATTCCGCT ACGACCAACT CATACACCTC CTATGAAAAA ACTTCCTACC ACTCACCCTA 4200 GCATTACTTA TATGATATGT CTCCATACCC ATTACAATCT CCAGCATTCC CCCTCAAACC 4260 TAAGAAATAT GTCTGATAAA AGAGTTACTT TGATAGAGTA AATAATAGGA GCTTAAACCC 4320 CCTTATTTCT AGGACTATGA GAATCGAACC CATCCCTGAG AATCCAAAAT TCTCCGTGCC 4380 ACCTATCACA CCCCATCCTA AAGTAAGGTC AGCTAAATAA GCTATCGGGC CCATACCCCG 4440 AAAATGTTGG TTATACCCTT CCCGTACTAA TTAATCCCCT GGCCCAACCC GTCATCTACT 4500 CTACCATCTT TGCAGGCACA CTCATCACAG CGCTAAGCTC GCACTGATTT TTTACCTGAG 4560 TAGGCCTAGA AATAAACATG CTAGCTTTTA TTCCAGTTCT AACCAAAAAA ATAAACCCTC 4620 GTTCCACAGA AGCTGCCATC AAGTATTTCC TCACGCAAGC AACCGCATCC ATAATCCTTC 4680 TAATAGCTAT CCTCTTCAAC AATATACTCT CCGGACAATG AACCATAACC AATACTACCA 4740 ATCAATACTC ATCATTAATA ATCATAATAG CTATAGCAAT AAAACTAGGA ATAGCCCCCT 4800 TTCACTTCTG AGTCCCAGAG GTTACCCAAG GCACCCCTCT GACATCCGGC CTGCTTCTTC 4860 TCACATGACA AAAACTAGCC CCCATCTCAA TCATATACCA AATCTCTCCC TCACTAAACG 4920 TAAGCCTTCT CCTCACTCTC TCAATCTTAT CCATCATAGC AGGCAGTTGA GGTGGATTAA 4980 ACCAGACCCA 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ATATTCTTTA TCTGCCTCTT CCTACACATC GGGCGAGGCC TATATTACGG 15060 ATCATTTCTC TACTCAGAAA CCTGAAACAT CGGCATTATC CTCCTGCTTG CAACTATAGC 15120 AACAGCCTTC ATAGGCTATG TCCTCCCGTG AGGCCAAATA TCATTCTGAG GGGCCACAGT 15180 AATTACAAAC TTACTATCCG CCATCCCATA CATTGGGACA GACCTAGTTC AATGAATCTG 15240 AGGAGGCTAC TCAGTAGACA GTCCCACCCT CACACGATTC TTTACCTTTC ACTTCATCTT 15300 GCCCTTCATT ATTGCAGCCC TAGCAACACT CCACCTCCTA TTCTTGCACG AAACGGGATC 15360 AAACAACCCC CTAGGAATCA CCTCCCATTC CGATAAAATC ACCTTCCACC CTTACTACAC 15420 AATCAAAGAC GCCCTCGGCT TACTTCTCTT CCTTCTCTCC TTAATGACAT TAACACTATT 15480 CTCACCAGAC CTCCTAGGCG ACCCAGACAA TTATACCCTA GCCAACCCCT TAAACACCCC 15540 TCCCCACATC AAGCCCGAAT GATATTTCCT ATTCGCCTAC ACAATTCTCC GATCCGTCCC 15600 TAACAAACTA GGAGGCGTCC TTGCCCTATT ACTATCCATC CTCATCCTAG CAATAATCCC 15660 CATCCTCCAT ATATCCAAAC AACAAAGCAT AATATTTCGC CCACTAAGCC AATCACTTTA 15720 TTGACTCCTA GCCGCAGACC TCCTCATTCT AACCTGAATC GGAGGACAAC CAGTAAGCTA 15780 CCCTTTTACC ATCATTGGAC AAGTAGCATC CGTACTATAC TTCACAACAA TCCTAATCCT 15840 AATACCAACT ATCTCCCTAA TTGAAAACAA AATACTCAAA TGGGCCTGTC CTTGTAGTAT 15900 AAACTAATAC ACCAGTCTTG TAAACCGGAG ATGAAAACCT TTTTCCAAGG ACAAATCAGA 15960 GAAAAAGTCT TTAACTCCAC CATTAGCACC CAAAGCTAAG ATTCTAATTT AAACTATTCT 16020 CTGTTCTTTC ATGGGGAAGC AGATTTGGGT ACCACCCAAG TATTGACTCA CCCATCAACA 16080 ACCGCTATGT ATTTCGTACA TTACTGCCAG CCACCATGAA TATTGTACGG TACCATAAAT 16140 ACTTGACCAC CTGTAGTACA TAAAAACCCA ATCCACATCA AAACCCCCTC CCCATGCTTA 16200 CAAGCAAGTA CAGCAATCAA CCCTCAACTA TCACACATCA ACTGCAACTC CAAAGCCACC 16260 CCTCACCCAC TAGGATACCA ACAAACCTAC CCACCCTTAA CAGTACATAG TACATAAAGC 16320 CATTTACCGT ACATAGCACA TTACAGTCAA ATCCCTTCTC GTCCCCATGG ATGACCCCCC 16380 TCAGATAGGG GTCCCTTGAC CACCATCCTC CGTGAAATCA ATATCCCGCA CAAGAGTGCT 16440 ACTCTCCTCG CTCCGGGCCC ATAACACTTG GGGGTAGCTA AAGTGAACTG TATCCGACAT 16500 CTGGTTCCTA CTTCAGGGTC ATAAAGCCTA AATAGCCCAC ACGTTCCCCT TAAATAAGAC 16560 ATCACGATG 16569 配列番号:6 配列の長さ:16569 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:他の核酸 ミトコンドリアDNA(mtDN
A) 起源 生物名:ヒト 配列の特徴: 特徴を表す記号:mutation 存在位置:3423.3426 特徴を決定した方法:S 配列 GATCACAGGT CTATCACCCT ATTAACCACT CACGGGAGCT CTCCATGCAT TTGGTATTTT 60 CGTCTGGGGG GTATGCACGC GATAGCATTG CGAGACGCTG GAGCCGGAGC ACCCTATGTC 120 GCAGTATCTG TCTTTGATTC CTGCCTCATC CTATTATTTA TCGCACCTAC GTTCAATATT 180 ACAGGCGAAC ATACTTACTA AAGTGTGTTA ATTAATTAAT GCTTGTAGGA CATAATAATA 240 ACAATTGAAT GTCTGCACAG CCACTTTCCA CACAGACATC ATAACAAAAA ATTTCCACCA 300 AACCCCCCCT CCCCCGCTTC TGGCCACAGC ACTTAAACAC ATCTCTGCCA AACCCCAAAA 360 ACAAAGAACC CTAACACCAG CCTAACCAGA TTTCAAATTT TATCTTTTGG CGGTATGCAC 420 TTTTAACAGT CACCCCCCAA CTAACACATT ATTTTCCCCT CCCACTCCCA TACTACTAAT 480 CTCATCAATA CAACCCCCGC CCATCCTACC CAGCACACAC ACACCGCTGC TAACCCCATA 540 CCCCGAACCA ACCAAACCCC AAAGACACCC CCCACAGTTT ATGTAGCTTA CCTCCTCAAA 600 GCAATACACT GAAAATGTTT AGACGGGCTC ACATCACCCC ATAAACAAAT AGGTTTGGTC 660 CTAGCCTTTC TATTAGCTCT TAGTAAGATT ACACATGCAA GCATCCCCGT TCCAGTGAGT 720 TCACCCTCTA AATCACCACG ATCAAAAGGA ACAAGCATCA AGCACGCAGC AATGCAGCTC 780 AAAACGCTTA GCCTAGCCAC 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AAACAATGGT CAACCAGTAA CTACTACTAA 14220 TCAACGCCCA TAATCATACA AAGCCCCCGC ACCAATAGGA TCCTCCCGAA TGAACCCTGA 14280 CCCCTCTCCT TCATAAATTA TTCAGCTTCC TACACTATTA AAGTTTACCA CAACCACCAC 14340 CCCATCATAC TCTTTCACCC ACAGGACGAA TCCTACCTCC ATCGCTAACC CCACTAAAAC 14400 ACTCACCAAG ACCTCAACCC CTGACCCCCA TGCCTCAGGA TACTCCTCAA TAGCCATCGC 14460 TGTAGTATAT CCAAAGACAA CCATCATTCC CCCTAAATAA ATTAAAAAAA CTATTAAACC 14520 CATATAACCT CCCCCAAAAT TCAGAATAAT AACACACCCG ACCACACCGC TAACAATCAA 14580 TACTAAACCC CCATAAATAG GAGAAGGCTT AGAAGAAAAC CCCACAAACC CCATTACTAA 14640 ACCCACACTC AACAGAAACA AAGCATACAT CATTATTCTC GCACGGACTA CAACCACGAC 14700 CAATGATATG AAAAACCATC GTTGTATTTC AACTACAAGA ACACCAATGA CCCCAATACG 14760 CAAAATTAAC CCCCTAATAA AATTAATTAA CCACTCATTC ATCGACCTCC CCACCCCATC 14820 CAACATCTCC GCATGATGAA ACTTCGGCTC ACTCCTTGGC GCCTGCCTGA TCCTCCAAAT 14880 CACCACAGGA CTATTCCTAG CCATGCACTA CTCACCAGAC GCCTCAACCG CCTTTTCATC 14940 AATCGCCCAC ATCACTCGAG ACGTAAATTA TGGCTGAATC ATCCGCTACC TTCACGCCAA 15000 TGGCGCCTCA ATATTCTTTA TCTGCCTCTT CCTACACATC GGGCGAGGCC TATATTACGG 15060 ATCATTTCTC TACTCAGAAA CCTGAAACAT CGGCATTATC CTCCTGCTTG CAACTATAGC 15120 AACAGCCTTC ATAGGCTATG TCCTCCCGTG AGGCCAAATA TCATTCTGAG GGGCCACAGT 15180 AATTACAAAC TTACTATCCG CCATCCCATA CATTGGGACA GACCTAGTTC AATGAATCTG 15240 AGGAGGCTAC TCAGTAGACA GTCCCACCCT CACACGATTC TTTACCTTTC ACTTCATCTT 15300 GCCCTTCATT ATTGCAGCCC TAGCAACACT CCACCTCCTA TTCTTGCACG AAACGGGATC 15360 AAACAACCCC CTAGGAATCA CCTCCCATTC CGATAAAATC ACCTTCCACC CTTACTACAC 15420 AATCAAAGAC GCCCTCGGCT TACTTCTCTT CCTTCTCTCC TTAATGACAT TAACACTATT 15480 CTCACCAGAC CTCCTAGGCG ACCCAGACAA TTATACCCTA GCCAACCCCT TAAACACCCC 15540 TCCCCACATC AAGCCCGAAT GATATTTCCT ATTCGCCTAC ACAATTCTCC GATCCGTCCC 15600 TAACAAACTA GGAGGCGTCC TTGCCCTATT ACTATCCATC CTCATCCTAG CAATAATCCC 15660 CATCCTCCAT ATATCCAAAC AACAAAGCAT AATATTTCGC CCACTAAGCC AATCACTTTA 15720 TTGACTCCTA GCCGCAGACC TCCTCATTCT AACCTGAATC GGAGGACAAC CAGTAAGCTA 15780 CCCTTTTACC ATCATTGGAC AAGTAGCATC CGTACTATAC TTCACAACAA TCCTAATCCT 15840 AATACCAACT ATCTCCCTAA TTGAAAACAA AATACTCAAA TGGGCCTGTC CTTGTAGTAT 15900 AAACTAATAC ACCAGTCTTG TAAACCGGAG ATGAAAACCT TTTTCCAAGG ACAAATCAGA 15960 GAAAAAGTCT TTAACTCCAC CATTAGCACC CAAAGCTAAG ATTCTAATTT AAACTATTCT 16020 CTGTTCTTTC ATGGGGAAGC AGATTTGGGT ACCACCCAAG TATTGACTCA CCCATCAACA 16080 ACCGCTATGT ATTTCGTACA TTACTGCCAG CCACCATGAA TATTGTACGG TACCATAAAT 16140 ACTTGACCAC CTGTAGTACA TAAAAACCCA ATCCACATCA AAACCCCCTC CCCATGCTTA 16200 CAAGCAAGTA CAGCAATCAA CCCTCAACTA TCACACATCA ACTGCAACTC CAAAGCCACC 16260 CCTCACCCAC TAGGATACCA ACAAACCTAC CCACCCTTAA CAGTACATAG TACATAAAGC 16320 CATTTACCGT ACATAGCACA TTACAGTCAA ATCCCTTCTC GTCCCCATGG ATGACCCCCC 16380 TCAGATAGGG GTCCCTTGAC CACCATCCTC CGTGAAATCA ATATCCCGCA CAAGAGTGCT 16440 ACTCTCCTCG CTCCGGGCCC ATAACACTTG GGGGTAGCTA AAGTGAACTG TATCCGACAT 16500 CTGGTTCCTA CTTCAGGGTC ATAAAGCCTA AATAGCCCAC ACGTTCCCCT TAAATAAGAC 16560 ATCACGATG 16569
【図面の簡単な説明】
【図1】正常ヒトミトコンドリア遺伝子の塩基配列(塩
基番号3016〜3518)のうち、塩基番号3016
〜3195の領域と糖尿病患者由来のミトコンドリア遺
伝子の同塩基配列領域を比較した図である。第1段目
は、正常ヒトミトコンドリア遺伝子の塩基配列であり、
第2〜6段目は糖尿病患者由来のミトコンドリア遺伝子
の塩基配列である。図中「−」は正常塩基配列と同じ塩
基配列であることを示す。
【図2】正常ヒトミトコンドリア遺伝子の塩基配列(塩
基番号3016〜3518)のうち、塩基番号3196
〜3375の領域と糖尿病患者由来のミトコンドリア遺
伝子の同塩基配列領域を比較した図である。第1段目
は、正常ヒトミトコンドリア遺伝子の塩基配列であり、
第2〜6段目は糖尿病患者由来のミトコンドリア遺伝子
の塩基配列である。糖尿病患者に由来するミトコンドリ
ア遺伝子の変異部位を四角で囲んで示す。図中「−」は
正常塩基配列と同じ塩基配列であることを示す。
【図3】正常ヒトミトコンドリア遺伝子の塩基配列(塩
基番号3016〜3518)のうち、塩基番号3376
〜3518の領域と糖尿病患者由来のミトコンドリア遺
伝子の同塩基配列領域を比較した図である。第1段目
は、正常ヒトミトコンドリア遺伝子の塩基配列であり、
第2〜6段目は糖尿病患者由来のミトコンドリア遺伝子
の塩基配列である。糖尿病患者に由来するミトコンドリ
ア遺伝子の変異部位を四角で囲んで示す。図中「−」は
正常塩基配列と同じ塩基配列であることを示す。
【図4】各種疾患に関連するヒトミトコンドリア遺伝子
異常の、変異部位と疾患との関係を示す図である。

Claims (9)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】以下の(a)又は(b)のDNAからなる
    変異ヒトミトコンドリア遺伝子の少なくとも塩基番号3
    426部位を含みヒトミトコンドリア遺伝子の同定特異
    性を保持する塩基長からなるDNA。 (a)正常ヒトミトコンドリア遺伝子において、その塩
    基配列の3426位がアデニン(A)からグアニン
    (G)に変異してなるDNA。 (b)(a)のDNAの塩基配列において、塩基番号3
    426部位を除いて1若しくは数個の塩基が欠失、置換
    若しくは付加されたDNA断片であって、該塩基の欠
    失、置換及び付加が突然変異に起因するものであるヒト
    ミトコンドリア遺伝子のDNA。
  2. 【請求項2】塩基長が10〜500bpである請求項1
    記載のDNA。
  3. 【請求項3】請求項1又は2記載のDNAを合成するた
    めに用いられるプライマー。
  4. 【請求項4】センスプライマーが配列番号1又は配列番
    号2に示されるいずれかであって、アンチセンスプライ
    マーが配列番号3に示されるものである請求項3に記載
    のプライマー。
  5. 【請求項5】被験者のヒトミトコンドリア遺伝子におい
    て、塩基番号3426の位置におけるアデニン(A)か
    らグアニン(G)への塩基置換を検出することを特徴と
    するヒトミトコンドリア遺伝子異常の検出方法。
  6. 【請求項6】請求項3または4に記載のプライマーを用
    いて被験者のヒトミトコンドリア遺伝子の塩基番号34
    26の位置を含むDNAを増幅し、得られた増幅DNA
    の当該3426位の位置を含む塩基配列を解析すること
    を含む、請求項5記載のヒトミトコンドリア遺伝子異常
    の検出方法。
  7. 【請求項7】3426位の位置を含む塩基配列の解析
    が、当該位置における塩基置換により生じる制限酵素A
    paIの特異的切断サイトを利用する制限酵素断片長多
    型分析法によるものである、請求項6記載の検出法。
  8. 【請求項8】請求項3又は4記載のプライマーを含む、
    ヒトミトコンドリア遺伝子の変異(A→G3426)検出用
    試薬キット。
  9. 【請求項9】請求項8記載のヒトミトコンドリア遺伝子
    の変異(A→G3426)検出用試薬キットを有効成分とす
    る糖尿病診断用剤。
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004092415A1 (ja) * 2003-04-16 2004-10-28 Arkray, Inc. ミトコンドリアdna3243変異の検出法および定量法ならびにそのためのキット

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US7625723B2 (en) 2003-04-16 2009-12-01 Arkray, Inc. Method of detecting or quantitatively determining mitochondrial DNA 3243 variation, and kit therefor
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