JPH11243972A - アミノペプチダーゼファミリーのメンバー、metpro 02 - Google Patents

アミノペプチダーゼファミリーのメンバー、metpro 02

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JPH11243972A
JPH11243972A JP10306162A JP30616298A JPH11243972A JP H11243972 A JPH11243972 A JP H11243972A JP 10306162 A JP10306162 A JP 10306162A JP 30616298 A JP30616298 A JP 30616298A JP H11243972 A JPH11243972 A JP H11243972A
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polypeptide
seq
polynucleotide
amino acid
nucleotide sequence
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ディー.サザン クリストファー
Barges Nicola
バーゲス ニコラ
Chapman Conrad
チャップマン コンラッド
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SmithKline Beecham Ltd
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Abstract

(57)【要約】 (修正有) 【課題】 METPRO 02ポリペプチドおよびポリヌクレオ
チドを提供。 【解決手段】 特定のアミノ酸配列に対して少なくとも
70%の同一性を有するアミノ酸配列を含んでなるMETP
RO 02ポリペプチド、および特定のヌクレオチド配列に
対して少なくとも70%の同一性を有するヌクレオチド
配列を含んでなるMETPRO 02ポリヌクレオチドを得る。 【効果】 METPRO 02ポリペプチドおよびポリヌクレオ
チドは関節炎、呼吸器系疾患、血栓症、糖尿病、癌、炎
症性障害、骨粗鬆症、心血管障害、高血圧、卒中、喘
息、神経変性症、うつ病および他の中枢神経系障害を含
む機能障害または疾病の治療と、このような疾病の診断
アッセイに有用である。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、新たに同定された
ポリペプチド、該ポリペプチドをコードするポリヌクレ
オチド、該ポリペプチドおよびポリヌクレオチドの治療
の際のまたは治療に有効でありうるアゴニスト、アンタ
ゴニストおよび/またはインヒビターである化合物を同
定する際の使用、並びに該ポリペプチドおよびポリヌク
レオチドの生産方法に関する。
【0002】
【従来の技術】薬物探索プロセスには目下根本的な大変
化が生じている。というのは、それが「機能的ゲノム
学」(functional genomics) 、すなわち高処理量のゲノ
ムまたは遺伝子ベースの生物学に及んでいるからであ
る。治療標的としての遺伝子および遺伝子産物を同定す
る手段としてのこのアプローチは、「ポジショナルクロ
ーニング」に基づいた比較的初期のアプローチに急速に
取って代わりつつある。表現型、つまり生物学的機能ま
たは遺伝病、が同定され、続いてその遺伝子地図の位置
を手がかりとして病因遺伝子が突き止められるだろう。
機能的ゲノム学は、高処理量DNA配列決定技術および
現在入手できる多くの分子生物学データベースから興味
のもてそうな遺伝子配列を同定するための生物情報科学
(bioinformatics)の様々なツールに大きく依存してい
る。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】依然として、まだ未解
明の遺伝子およびその関連ポリペプチド/タンパク質を
薬物探索の標的として同定し特性づける必要性が存在し
ている。
【0004】
【課題を解決するための手段】本発明は、METPRO 02、
特にMETPRO 02ポリペプチドおよびMETPRO 02ポリヌクレ
オチド、組換え物質、並びにその生産方法に関する。も
う一つの態様において、本発明は、関節炎、呼吸器系疾
患、血栓症、糖尿病、癌、炎症性障害、骨粗鬆症、心血
管障害、高血圧、卒中、喘息、神経変性症(例えばアル
ツハイマー病、パーキンソン病)、うつ病および他の中
枢神経系障害(以後まとめて「前記疾患」という)の治
療をはじめとする、前記ポリペプチドおよびポリヌクレ
オチドの使用方法に関する。他の態様では、本発明は、
本発明により提供される物質を用いてアゴニストおよび
アンタゴニスト/インヒビターを同定する方法、並びに
同定された化合物を用いてMETPRO 02平衡異常と関連し
た症状を治療することに関する。さらに他の態様におい
て、本発明は不適当なMETPRO 02活性またはMETPRO02レ
ベルと関連した疾病を検出するための診断アッセイに関
する。
【0005】一つの態様において、本発明はMETPRO 02
ポリペプチドに関する。この種のペプチドには、配列番
号2または配列番号6の全長にわたる配列番号2または
配列番号6のアミノ酸配列に対して少なくとも70%の
同一性、好ましくは少なくとも80%の同一性、より好
ましくは少なくとも90%の同一性、さらに好ましくは
少なくとも95%の同一性、最も好ましくは少なくとも
97〜99%の同一性を有するアミノ酸配列を含んでな
る単離されたポリペプチドが含まれる。こうしたポリペ
プチドとしては配列番号2または配列番号6のアミノ酸
配列を含むものがある。
【0006】本発明の他のペプチドには、そのアミノ酸
配列が配列番号2または配列番号6の全長にわたる配列
番号2または配列番号6のアミノ酸配列に対して少なく
とも70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同
一性、より好ましくは少なくとも90%の同一性、さら
に好ましくは少なくとも95%の同一性、最も好ましく
は少なくとも97〜99%の同一性を有する単離された
ポリペプチドが含まれる。こうしたポリペプチドとして
は配列番号2または配列番号6のアミノ酸配列からなる
ポリペプチドがある。本発明の更なるペプチドには、配
列番号1または配列番号5に含まれるヌクレオチド配列
を含んでなるポリヌクレオチドによりコードされる単離
されたポリペプチドが含まれる。
【0007】本発明のポリペプチドはアミノペプチダー
ゼファミリーのメンバーであると考えられる。それゆ
え、それらには興味がもてる。なぜなら、選択的プロテ
アーゼのアンタゴニストもしくはアゴニストの設計また
はスクリーニングは、種々の疾病のための新規薬剤を開
発することにつながりうるからである(Seife,C.,Scienc
e 277,1602-1603)。このMETPRO 02ポリペプチドの機能
特性を以後「METPRO 02活性」または「METPRO 02ポリペ
プチド活性」または「METPRO 02の生物学的活性」とい
う。これらの活性の中には、前記METPRO 02ポリペプチ
ドの抗原性および免疫原性、特に配列番号2または配列
番号6のポリペプチドの抗原性および免疫原性も含まれ
る。本発明のポリペプチドはMETPRO 02の少なくとも1
つの生物学的活性を示すことが好ましい。
【0008】本発明のポリペプチドは「成熟」タンパク
質の形であっても、前駆体または融合タンパク質のよう
な、より大きいタンパク質の一部であってもよい。しば
しば、追加のアミノ酸配列を含めることが有利であり、
このようなアミノ酸配列としては、分泌すなわちリーダ
ー配列、プロ配列、多重ヒスチジン残基のような精製に
役立つ配列、または組換え生産の間の安定性を確保する
付加的配列などがある。
【0009】また、前記ポリペプチドの変異体、すなわ
ち同類アミノ酸置換(ある残基が性質の似ている他の残
基により置換される)により基準ポリペプチドと相違し
ているポリペプチドも本発明に含まれる。典型的なこう
した置換は、Ala, Val, Leuおよび Ileの間;Ser とThr
の間;酸性残基 AspとGlu の間;Asn とGln の間;塩
基性残基 LysとArg の間;または芳香族残基 PheとTyr
の間で起こる。特に、数個、5〜10個、1〜5個、1
〜3個、1〜2個または1個のアミノ酸が任意の組合せ
で置換、欠失または付加されている変異体が好適であ
る。
【0010】本発明のポリペプチドは任意の適当な方法
で製造することができる。このようなポリペプチドに
は、単離された天然のポリペプチド、組換え的に生産さ
れたポリペプチド、合成的に製造されたポリペプチド、
またはこれらの方法の組合せにより製造されたポリペプ
チドが含まれる。こうしたポリペプチドを製造するため
の手段は当業界でよく理解されている。
【0011】本発明の更なる態様において、本発明は、
METPRO 02ポリヌクレオチドに関する。このようなポリ
ヌクレオチドには、配列番号2または配列番号6の全長
にわたる配列番号2または配列番号6のアミノ酸配列に
対して少なくとも70%の同一性、好ましくは少なくと
も80%の同一性、より好ましくは少なくとも90%の
同一性、さらに好ましくは少なくとも95%の同一性を
有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含
んでなる単離されたポリヌクレオチドが含まれる。これ
に関して、少なくとも97%の同一性を有するポリペプ
チドが一層好ましいが、少なくとも98〜99%の同一
性を有するものがより一層好ましく、少なくとも99%
の同一性を有するポリペプチドが最も好ましいものであ
る。かかるポリヌクレオチドとして、配列番号2または
配列番号6のポリペプチドをそれぞれコードする配列番
号1または配列番号5に含まれるヌクレオチド配列を含
んでなるポリヌクレオチドが挙げられる。
【0012】本発明の更なるポリヌクレオチドには、配
列番号2または配列番号6のポリペプチドをコードする
ヌクレオチド配列に対して、その全コード領域にわたっ
て、少なくとも70%の同一性、好ましくは少なくとも
80%の同一性、より好ましくは少なくとも90%の同
一性、さらに好ましくは少なくとも95%の同一性を有
するヌクレオチド配列を含んでなる単離されたポリヌク
レオチドが含まれる。これに関して、少なくとも97%
の同一性を有するポリヌクレオチドが一層好ましいが、
少なくとも98〜99%の同一性を有するものがより一
層好ましく、少なくとも99%の同一性を有するポリヌ
クレオチドが最も好ましいものである。
【0013】本発明の更なるポリヌクレオチドには、配
列番号1または配列番号5の全長にわたる配列番号1ま
たは配列番号5のポリヌクレオチドに対して少なくとも
70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一
性、より好ましくは少なくとも90%の同一性、さらに
好ましくは少なくとも95%の同一性を有するヌクレオ
チド配列を含んでなる単離されたポリヌクレオチドが含
まれる。これに関して、少なくとも97%の同一性を有
するポリヌクレオチドが一層好ましいが、少なくとも9
8〜99%の同一性を有するものがより一層好ましく、
少なくとも99%の同一性を有するポリヌクレオチドが
最も好ましいものである。かかるポリヌクレオチドとし
て、配列番号1または配列番号5のポリヌクレオチドを
含んでなるポリヌクレオチドおよび配列番号1または配
列番号5のポリヌクレオチドが挙げられる。本発明はま
た、上記の全てのポリヌクレオチドに対して相補的なポ
リヌクレオチドを提供する。
【0014】配列番号1のポリヌクレオチド配列は、配
列番号2のポリペプチドをコードするヒト配列である。
配列番号3のポリヌクレオチド配列もまたヒトの配列で
あり、配列番号4の「query」と名付けたポリペプチド
をコードする。配列番号5のポリヌクレオチド配列は配
列番号1および配列番号3のヒト配列と高度の相同性を
示すマウス配列であり、配列番号6のマウスポリペプチ
ドをコードする。
【0015】配列番号1および配列番号5のヌクレオチ
ド配列はC.elegansコスミド F01F1/gb U13070(Wilson
ら、Nature 368,32-38(1994))との相同性を示す。配列
番号1のヌクレオチド配列はヒトcDNA配列であり、
471個のアミノ酸からなる配列番号2のポリペプチドを
コードする配列(ヌクレオチド番号 101-1514)をコード
するポリペプチドを含む。配列番号2のポリペプチドを
コードするヌクレオチド配列は、配列番号1に含まれる
ポリペプチドコード配列と同一であっても、遺伝子コー
ドの重複性(縮重)のため、やはり配列番号2のポリペ
プチドをコードする、配列番号1に含まれる配列以外の
配列であってもよい。配列番号5のヌクレオチド配列は
マウスcDNA配列であり、471個のアミノ酸からなる
配列番号6のポリペプチドをコードする配列(ヌクレオ
チド番号 126-1539)をコードするポリペプチドを含む。
配列番号6のポリペプチドをコードするヌクレオチド配
列は、配列番号5に含まれるポリペプチドコード配列と
同一であってもよく、または遺伝子コードの重複性(縮
重)のため、やはり配列番号5のポリペプチドをコード
する、配列番号1に含まれる配列以外の配列であっても
よい。配列番号2および配列番号6のポリペプチドはア
ミノペプチダーゼファミリーの他のタンパク質と構造的
に関連しており、C.elegansコスミド F01F1/gb U13070
との相同性および/または構造類似性を有しており、そ
の翻訳部分は、S.cerevisiae液胞型アミノペプチダーゼ
に類似している(Wilsonら、Nature 368,32-38(1994))。
【0016】本発明の好適なポリペプチドおよびポリヌ
クレオチドは、とりわけ、それと相同なポリペプチドお
よびポリヌクレオチドと同様の生物学的機能/性質をも
つことが期待される。さらに、本発明の好ましいポリペ
プチドおよびポリヌクレオチドは少なくとも1つのMETP
RO 02活性を有する。
【0017】また、本発明は、配列番号1および配列番
号2の対応する全長配列の決定に先立って最初に同定さ
れた部分的なまたは他のポリヌクレオチドおよびポリペ
プチドに関する。したがって、更なる態様において、本
発明は、(a) 配列番号3の全長にわたる配列番号3のヌ
クレオチド配列に対して少なくとも70%の同一性、好
ましくは少なくとも80%の同一性、より好ましくは少
なくとも90%の同一性、さらに好ましくは少なくとも
95%の同一性、最も好ましくは97〜99%の同一性
を有するヌクレオチド配列を含んでなるポリヌクレオチ
ド、(b) 配列番号3のヌクレオチド配列を含んでなるポ
リヌクレオチド、(c) 配列番号3のヌクレオチド配列か
らなるポリヌクレオチド、または(d) 配列番号4の全長
にわたる配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも
70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一
性、より好ましくは少なくとも90%の同一性、さらに
好ましくは少なくとも95%の同一性、最も好ましくは
97〜99%の同一性を有するアミノ酸配列からなるポ
リペプチドをコードするヌクレオチド配列を含んでなる
ポリヌクレオチド、を提供する。
【0018】さらに、本発明は、(a) 配列番号4の全長
にわたる配列番号4のアミノ酸配列に対して少なくとも
70%の同一性、好ましくは少なくとも80%の同一
性、より好ましくは少なくとも90%の同一性、さらに
好ましくは少なくとも95%の同一性、最も好ましくは
97〜99%の同一性を有するアミノ酸配列を含んでな
るポリペプチド、(b) 配列番号4のアミノ酸配列を含ん
でなるポリペプチド、(c) 配列番号4のアミノ酸配列か
らなるポリペプチド、または(d) 配列番号3に含まれる
ヌクレオチド配列を含んでなるポリヌクレオチドにより
コードされるポリペプチド、を提供する。
【0019】配列番号3のヌクレオチド配列およびそれ
によりコードされるペプチド配列はエクスプレスド・シ
ーケンス・タグ(Expressed Sequence Tag:EST)配
列から誘導される。当業者であれば、EST配列中に若
干のヌクレオチド配列読み取り誤差が必然的に存在する
ことを理解するであろう(Adams, M.D.ら, Nature 377
(supp)3, 1995を参照のこと)。したがって、配列番号
3のヌクレオチド配列およびそれによりコードされるペ
プチド配列は配列精度において同一の固有限界を受け
る。さらに、配列番号3によりコードされるペプチド配
列は、相同性または構造類似性が最も高いタンパク質と
同一の領域、または相同性および/または構造類似性
(例えば、同類アミノ酸の差異)が高い領域を含んでい
る。
【0020】本発明のポリヌクレオチドは、標準的なク
ローニングおよびスクリーニングにより、筋肉、胎盤、
脳の細胞中のmRNAから誘導されたcDNAライブラ
リーから、EST分析(Adams, M.D.ら, Science (199
1) 252:1651-1656; Adams, M.D.ら, Nature (1992) 35
5:632-634; Adams, M.D.ら, Nature (1995) 377 Supp:3
-174)を用いて得ることができる。また、本発明のポリ
ヌクレオチドはゲノムDNAライブラリーのような天然
源から得ることができ、商業的に入手可能な公知の技法
を用いて合成することもできる。
【0021】本発明のポリヌクレオチドを本発明のポリ
ペプチドの組換え生産のために用いる場合、そのポリヌ
クレオチドには、成熟ポリペプチドのコード配列単独、
または他のコード配列(例えば、リーダーもしくは分泌
配列、プレ−、プロ−もしくはプレプロ−タンパク質配
列、または他の融合ペプチド部分をコードするもの)と
同じリーディングフレーム内にある成熟ポリペプチドの
コード配列が含まれる。例えば、融合ポリペプチドの精
製を容易にするマーカー配列がコードされ得る。本発明
のこの態様の好ましい具体例として、マーカー配列は、
pQEベクター(Qiagen, Inc.)により提供されかつ Gen
tzら, Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1989) 86:821-824
に記載されるような、ヘキサ−ヒスチジンペプチド、ま
たはHAタグである。また、このポリヌクレオチドは5'
および3'非コード配列、例えば、転写されるが翻訳され
ない配列、スプライシングおよびポリアデニル化シグナ
ル、リボソーム結合部位、およびmRNA安定化配列を
含んでいてもよい。
【0022】本発明の更なる具体例としては、数個、例
えば5〜10個、1〜5個、1〜3個、1〜2個、また
は1個のアミノ酸残基が任意の組合せで置換、欠失また
は付加されている、配列番号2または配列番号6のアミ
ノ酸配列を含んでなるポリペプチド変異体をコードする
ポリヌクレオチドがある。
【0023】配列番号1または配列番号5に含まれるヌ
クレオチド配列と同一であるか実質的に同一であるポリ
ヌクレオチドは、本発明のポリペプチドをコードする全
長cDNAおよびゲノムクローンを単離するために、ま
た、配列番号1または配列番号5に対して高い配列類似
性を有する他の遺伝子(ヒト起源のパラログ体(paralog
s)ならびにヒト以外の種に由来するオーソログ体(ortho
log)およびパラログ体をコードする遺伝子を含む)のc
DNAおよびゲノムクローンを単離するために、cDN
AおよびゲノムDNA用のハイブリダイゼーションプロ
ーブとして、または核酸増幅(PCR)反応用のプライ
マーとして用いることができる。一般的に、これらのヌ
クレオチド配列は基準のヌクレオチド配列と好ましくは
80%、より好ましくは90%、最も好ましくは95%
同一である。プローブまたはプライマーはたいてい15
個以上のヌクレオチドを含み、好ましくは30個以上を
含み、50個以上のヌクレオチドを有していてもよい。
特に好ましいプローブは30〜50個の範囲のヌクレオ
チドを有するものである。特に好ましいプライマーは2
0〜25個の範囲のヌクレオチドを有するものである。
【0024】本発明のポリペプチド(ヒト以外の種に由
来する相同体を含む)をコードするポリヌクレオチド
は、配列番号1、配列番号5のヌクレオチド配列または
その断片を有する標識プローブを用いて、ストリンジェ
ントなハイブリダイゼーション条件下で適当なライブラ
リーをスクリーニングし、該ポリヌクレオチド配列を含
む全長cDNAおよびゲノムクローンを単離する各工程
を含んでなる方法により得られる。このようなハイブリ
ダイゼーション技法は当業者に公知である。好ましいス
トリンジェントなハイブリダイゼーション条件は、50%
ホルムアミド、5×SSC (150mM NaCl, 15mM クエン酸三
ナトリウム) 、50mMリン酸ナトリウム (pH7.6)、5×De
nhardt溶液、10% デキストラン硫酸および20μg/mlの変
性し剪断したサケ精子DNAを含有する溶液中42℃で
一夜インキュベートし、次いでフィルターを 0.1×SSC
中約65℃で洗浄することを含む。かくして、本発明
は、配列番号1もしくは配列番号5のヌクレオチド配列
またはその断片を有する標識プローブを用いて、ストリ
ンジェントなハイブリダイゼーション条件下で適当なラ
イブラリーをスクリーニングすることにより得られるポ
リヌクレオチドをも包含する。
【0025】当業者には理解されるように、多くの場
合、ポリペプチドをコードする領域がそのcDNAの5'
末端で短く切断されることから、単離されたcDNA配
列は不完全であるだろう。それは逆転写酵素のためであ
り、この酵素はもともと「プロセシビティ」(processi
vity:重合中に鋳型に結合した状態でいる該酵素の能力
の尺度)が低く、第一鎖cDNA合成の間にmRNA鋳
型のDNAコピーを完成させることができない。
【0026】全長cDNAを得るための、または短鎖c
DNAを伸長させるための、当業者に公知で利用可能な
方法がいくつかあり、例えば、cDNA末端高速増幅法
(RACE)に基づいた方法がある(例えば、Frohman
ら, PNAS USA 85, 8998-9002,1988を参照のこと)。例
えばMarathonTM技術(Clontech Laboratories Inc.)によ
り示されるような、上記技法の最近の改良により、より
長いcDNAの検索が大いに簡便化された。MarathonTM
技術では、所定の組織より抽出されたmRNAからcD
NAを作製し、各末端に「アダプター」配列を連結す
る。続いて、遺伝子特異的およびアダプター特異的なオ
リゴヌクレオチドプライマーの組合せを用いて核酸増幅
(PCR)を行い、cDNAの「欠失」5'末端を増幅す
る。次に、「nested」プライマー、すなわち増幅産物の
内部にアニールするように設計されたプライマー(典型
的には、アダプター配列のさらに3'側にアニールするア
ダプター特異的プライマーおよび既知遺伝子配列のさら
に5'側にアニールする遺伝子特異的プライマー)を用い
てPCR反応を繰り返す。その後、この反応の産物をD
NA塩基配列決定により解析し、この産物を既存のcD
NAに直接結合するか、または5'プライマー設計用の新
たな配列情報を用いて別の全長PCRを行うことによ
り、全長cDNAを構築することができる。
【0027】本発明の組換え体ポリペプチドは、当業界
で公知の方法を用いて、発現系を含有する遺伝子操作宿
主細胞から生産することができる。したがって、更なる
態様において、本発明は、本発明の1以上のポリヌクレ
オチドを含有する発現系、該発現系により遺伝子操作さ
れた宿主細胞、および組換え技法による本発明ポリペプ
チドの生産に関する。本発明のDNA構築物から誘導さ
れたRNAを用いてこの種のタンパク質を生産するため
に、無細胞翻訳系を使用することもできる。
【0028】組換え体生産に関しては、本発明のポリヌ
クレオチドの発現系またはその一部を組み込むために宿
主細胞を遺伝子操作する。宿主細胞へのポリヌクレオチ
ドの導入は、Davisら, Basic Methods in Molecular Bi
ology (1986) および Sambrookら, Molecular Cloning:
A Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor
Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989)
などの多くの標準的な実験室マニュアルに記載された方
法により行うことができる。好適なこうした方法とし
て、例えば、リン酸カルシウムトランスフェクション、
DEAE−デキストラン媒介トランスフェクション、ト
ランスベクション(transvection)、マイクロインジェク
ション、カチオン性脂質媒介トランスフェクション、エ
レクトロポレーション、形質導入、スクレープローディ
ング(scrape loading)、弾丸導入(ballistic introduct
ion)または感染などがある。
【0029】適当な宿主の代表的な例として、細菌細胞
(例:ストレプトコッカス、スタフィロコッカス、大腸
菌、ストレプトミセス、枯草菌)、真菌細胞(例:酵
母、アスペルギルス)、昆虫細胞(例:ドロソフィラS
2、スポドプテラSf9)、動物細胞(例:CHO、C
OS、HeLa、C 127、3T3、BHK、HEK 29
3、Bowes メラノーマ細胞)および植物細胞が挙げられ
る。
【0030】多種多様な発現系を使用することができ
る。こうした発現系として、特に、染色体、エピソーム
およびウイルス由来の系、例えば、細菌プラスミド由
来、バクテリオファージ由来、トランスポゾン由来、酵
母エピソーム由来、挿入因子由来、酵母染色体要素由
来、ウイルス(例:バキュロウイルス、SV40のよう
なパポバウイルス、ワクシニアウイルス、アデノウイル
ス、鶏痘ウイルス、仮性狂犬病ウイルス、レトロウイル
ス)由来のベクター、およびこれらの組合せに由来する
ベクター、例えば、コスミドやファージミドのようなプ
ラスミドとバクテリオファージの遺伝的要素に由来する
ものがある。これらの発現系は発現を起こさせるだけで
なく発現を調節する制御配列を含んでいてもよい。一般
的に、宿主内でのポリペプチドの産生のためにポリヌク
レオチドを維持し、増やし、発現することができる系ま
たはベクターはどれも使用しうる。Sambrookら, Molecu
lar Cloning: A Laboratory Manual (前掲) に記載され
るような、日常的に用いられる公知の技法のいずれかに
より、適当なヌクレオチド配列を発現系に挿入すること
ができる。翻訳されたタンパク質を小胞体の内腔に、細
胞周辺腔に、または細胞外の環境に分泌させるために、
適当な分泌シグナルを目的のポリペプチドに組み込むこ
とができる。これらのシグナルは目的のポリペプチドに
対して内因性であっても、異種シグナルであってもよ
い。
【0031】スクリーニングアッセイで使用するため本
発明のポリペプチドを発現させようとする場合、一般に
そのポリペプチドを細胞の表面に産生させることが好適
である。その場合は、スクリーニングアッセイでの使用
に先立って細胞を回収する。該ポリペプチドが培地に分
泌される場合は、そのポリペプチドを回収し精製するた
めに培地を回収する。細胞内に産生される場合は、その
細胞をまず溶解し、その後にポリペプチドを回収する必
要がある。
【0032】組換え細胞培養物から本発明のポリペプチ
ドを回収し精製するには、硫酸アンモニウムまたはエタ
ノール沈殿、酸抽出、アニオンまたはカチオン交換クロ
マトグラフィー、ホスホセルロースクロマトグラフィ
ー、疎水性相互作用クロマトグラフィー、アフィニティ
ークロマトグラフィー、ヒドロキシルアパタイトクロマ
トグラフィーおよびレクチンクロマトグラフィーを含め
た公知の方法を用いることができる。最も好ましくは、
高性能液体クロマトグラフィーが精製に用いられる。ポ
リペプチドが細胞内合成、単離および/または精製中に
変性されるときは、タンパク質を再生させるための公知
の技法を用いて、活性のあるコンフォメーションを復元
することが可能である。
【0033】本発明はまた、診断薬としての本発明のポ
リヌクレオチドの使用に関する。機能障害と関連した、
配列番号1または配列番号5のポリヌクレオチドにより
特徴づけられる遺伝子の変異型の検出は、該遺伝子の過
少発現、過剰発現または変化した空間的もしくは時間的
発現により生ずる疾病またはその疾病への罹りやすさの
診断に追加しうる、またはその診断を下しうる診断用ツ
ールを提供するだろう。該遺伝子に突然変異がある個体
を、さまざまな技法によりDNAレベルで見つけ出すこ
とができる。
【0034】診断用の核酸は、被験者の細胞、例えば血
液、尿、唾液、組織の生検または剖検材料由来の細胞か
ら得ることができる。検出のためにゲノムDNAを直接
使用してもよいし、分析前にPCRまたは他の増幅法を
使ってゲノムDNAを酵素的に増幅してもよい。同様の
方法でRNAまたはcDNAを使用することもできる。
欠失および挿入突然変異は、正常な遺伝子型と比較した
ときの増幅産物のサイズの変化により検出できる。点突
然変異は増幅DNAを標識METPRO 02ヌクレオチド配列
とハイブリダイズさせることで同定できる。完全にマッ
チした配列とミスマッチの二重鎖とはRNアーゼ消化に
より、または融解温度の差異により区別できる。また、
DNA配列の差異は、変性剤を含むもしくは含まないゲ
ルでのDNA断片の電気泳動の移動度の変化により、ま
たは直接DNA塩基配列決定によっても検出できる(例
えば、Myersら, Science (1985) 230:1242 を参照のこ
と)。特定位置での配列変化はヌクレアーゼプロテクシ
ョンアッセイ(例えば、RNアーゼおよびS1プロテク
ション)または化学的開裂法によっても確認できる(Co
ttonら, Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1985) 85:4397-
4401を参照のこと)。別の実施態様では、例えば、遺伝
子変異の効率のよいスクリーニングを行うため、METPRO
02ヌクレオチド配列またはその断片を含むオリゴヌク
レオチドプローブのアレイ(array)を構築することがで
きる。アレイ技法は公知で、一般的な適用可能性を有
し、遺伝子発現、遺伝的連鎖および遺伝的変異性を含め
た分子遺伝学のさまざまな問題を解きあかすために用い
られている(例えば、M. Cheeら,Science, Vol.274, p
p.610-613 (1996) を参照のこと)。
【0035】診断アッセイは、前記の方法によりMETPRO
02遺伝子の変異を検出することで、前記疾患への罹り
やすさを診断または判定する方法を提供する。さらに、
被験者から得られたサンプルからポリペプチドまたはm
RNAのレベルの異常な低下または増加を測定する方法
により、前記疾患の診断を下すことができる。発現の低
下または増加は、当業界で公知のポリヌクレオチドの定
量法、例えば核酸増幅(例:PCR、RT−PCR)、
RNアーゼプロテクション、ノーザンブロッティング、
その他のハイブリダイゼーション法のいずれかによりR
NAレベルで測定することができる。宿主から得られた
サンプル中の本発明ポリペプチドのようなタンパク質の
レベルを測定するアッセイ法は当業者によく知られてい
る。こうしたアッセイ法として、ラジオイムノアッセ
イ、競合結合アッセイ、ウエスタンブロット分析、EL
ISAアッセイなどがある。
【0036】かくして、もう一つの態様において、本発
明は、(a) 本発明のポリヌクレオチド(好ましくは、配
列番号1もしくは配列番号5のヌクレオチド配列)もし
くはその断片、(b) (a) のヌクレオチド配列に相補的な
ヌクレオチド配列、(c) 本発明のポリペプチド(好まし
くは、配列番号2もしくは配列番号6のポリペプチド)
もしくはその断片、または(d) 本発明のポリペプチド
(好ましくは、配列番号2もしくは配列番号6のポリペ
プチド)に対する抗体、を含んでなる診断用キットに関
する。このようなキットにおいて、(a) 、(b) 、(c) ま
たは (d)が実質的な構成成分であることが理解されよ
う。かかるキットは疾患または疾患への罹りやすさ、特
に関節炎、呼吸器系疾患、血栓症、糖尿病、癌、炎症性
障害、骨粗鬆症、心血管障害、高血圧、卒中、喘息、神
経変性症(例えばアルツハイマー病、パーキンソン
病)、うつ病および他の中枢神経系障害を診断するうえ
で有用である。
【0037】また、本発明のヌクレオチド配列は染色体
の位置決定にも有用である。この配列は個々のヒト染色
体上の特定の位置をターゲッティングし、その特定位置
とハイブリダイズすることができる。本発明に従って関
連配列の染色体地図を作成することは、これらの配列と
遺伝子関連疾患とを相関させるうえで重要な第一段階で
ある。ひとたび配列が正確な染色体位置にマップされた
ら、その染色体上のその配列の物理的位置を遺伝地図デ
ータと相関させることができる。この種のデータは、例
えば、V. McKusick, Mendelian Inheritance in Man (J
ohns Hopkins University Welch Medical Library から
オンラインで入手可能) 中に見いだせる。その後、同一
の染色体領域にマップされた遺伝子と疾患との関係を連
鎖分析(物理的に隣接した遺伝子の共遺伝)により確認
する。
【0038】罹患個体と非罹患個体とのcDNAまたは
ゲノム配列の差異も調べることができる。罹患個体の一
部または全部に突然変異が観察されるが、どの正常個体
にも観察されない場合は、その突然変異が疾患の原因で
ある可能性がある。本発明のヒト遺伝子はヒト染色体 2
q33-34にマップされる。
【0039】また、本発明のヌクレオチド配列は組織の
位置決定にも有用である。そうした技術においては、組
織におけるヒトMETPRO 02ポリペプチドの発現パターン
を、それらをコードするmRNAの検出することで決定
することができる。これらの技術はin situハイブリダ
イゼーション技術およびヌクレオチド増幅技術(例えば
PCR)を含む。こうした技術は当分野で公知である。
これらの研究の結果から、生物における前記ポリペプチ
ドの正常な機能の指標が提供される。さらに、ヒトMETP
RO 02mRNAの正常な発現パターンとヒトMETPRO 02遺
伝子によりコードされるmRNAの正常な発現パターン
との比較研究により、疾病における突然変異型ヒトMETP
RO 02ポリペプチドの役割または正常なヒトMETPRO 02ポ
リペプチドの不適切な発現の役割についての貴重な洞察
が得られる。そうした不適切な発現とは、空間的な性質
のものであっても、時間的な性質のものであっても、ま
たは単に定量的な性質のものであってもよい。
【0040】本発明のポリペプチド、その断片もしくは
類似体、またはそれらを発現する細胞は、本発明のポリ
ペプチドに免疫特異的な抗体を生産するための免疫原と
しても使用することができる。「免疫特異的」とは、そ
の抗体が従来技術における他の関連ポリペプチドに対す
るその親和性よりも本発明のポリペプチドに対して実質
的に高い親和性を示すことを意味する。
【0041】本発明のポリペプチドに対する抗体は、慣
用のプロトコールを用いて、動物(好ましくはヒト以外
の動物)に該ポリペプチドまたはエピトープを含む断
片、類似体もしくは細胞を投与することにより得られ
る。モノクローナル抗体の調製には、連続細胞系の培養
物から抗体を産生させる任意の技法を用いることができ
る。例を挙げると、ハイブリドーマ技法 (Kohler, G.お
よびMilstein, C., Nature(1975) 256:495-497)、トリ
オーマ技法、ヒトB細胞ハイブリドーマ技法 (Kozbor
ら, Immunology Today (1983) 4:72) およびEBV−ハ
イブリドーマ技法 (Coleら, Monoclonal Antibodies an
d Cancer Therapy, pp.77-96, Alan R. Liss,Inc., 198
5) などがある。
【0042】本発明のポリペプチドに対する一本鎖抗体
をつくるために、米国特許第4,946,778 号に記載される
ような一本鎖抗体の調製法を適応させることができる。
また、ヒト化抗体を発現させるために、トランスジェニ
ックマウスまたは他の哺乳動物を含む他の生物を利用す
ることができる。前記の抗体を用いて、そのポリペプチ
ドを発現するクローンを単離・同定したり、アフィニテ
ィークロマトグラフィーでそのポリペプチドを精製する
こともできる。
【0043】本発明のポリペプチドに対する抗体は、と
りわけ、前記疾患の治療に使用できる可能性がある。
【0044】本発明の更なる態様において、本発明は、
本発明のポリペプチドまたはその断片と、各種サブクラ
ス(IgG、IgM、IgA、IgE)の免疫グロブリ
ンのH鎖またはL鎖の定常領域の様々な部分と、を含ん
でなる遺伝子工学的に作製された可溶性融合タンパク質
に関する。免疫グロブリンとしてはヒトIgG、特にI
gG1のH鎖の定常部が好ましく、その場合は融合がヒ
ンジ領域で起こる。特定例では、血液凝固因子Xaで開
裂され得る開裂配列を組み込むことで、Fc部分を簡単
に除去できる。さらに、本発明は、これら融合タンパク
質の遺伝子工学的作製方法、並びに薬物スクリーニン
グ、診断および治療におけるそれらの使用に関する。ま
た、本発明の更なる態様はこのような融合タンパク質を
コードするポリヌクレオチドに関する。融合タンパク質
技術の例は国際特許出願 WO94/29458 およびWO94/22914
に見いだせる。
【0045】本発明の更なる態様は哺乳動物において免
疫学的応答を引き出す方法に関し、この方法は、特に前
記疾患から該動物を防御するための抗体および/または
T細胞免疫応答を生ずるのに十分な本発明のポリペプチ
ドを哺乳動物に接種することを含んでなる。本発明のさ
らに別の態様は、哺乳動物を前記疾患から防御する抗体
を産生させるような免疫学的応答を引き出すために、in
vivo で本発明のポリペプチドをコードするポリヌクレ
オチドの発現を指令するベクターを介して該ポリペプチ
ドを供給することを含んでなる、哺乳動物において免疫
学的応答を引き出す方法に関する。
【0046】本発明の更なる態様は、哺乳動物宿主に導
入したとき、その哺乳動物において本発明のポリペプチ
ドに対する免疫学的応答を引き出す免疫学的/ワクチン
製剤(組成物)に関し、この組成物は本発明のポリペプ
チドまたはポリヌクレオチドを含有する。ワクチン製剤
は適当な担体をさらに含んでいてもよい。ポリペプチド
は胃の中で分解される可能性があるので、非経口的に
(例えば、皮下、筋肉内、静脈内または皮内注射によ
り)投与することが好ましい。非経口投与に適した製剤
としては、酸化防止剤、緩衝剤、静菌剤およびこの製剤
を受容者の血液と等張にする溶質を含みうる水性および
非水性の無菌注射液、並びに懸濁化剤または増粘剤を含
みうる水性および非水性の無菌懸濁液がある。こうした
製剤は1回量容器または数回量容器(例えば、密閉アン
プルおよびバイアル)で提供することができ、また、使
用直前に無菌の液状担体を添加するだけでよい凍結乾燥
状態で保管することもできる。ワクチン製剤はこの製剤
の免疫原性を増強するためのアジュバント系、例えば水
中油型のアジュバント系や当業界で公知の他のアジュバ
ント系を含んでいてもよい。投与量はワクチンの比活性
により変化するが、ルーチンな実験操作により簡単に決
定できる。
【0047】本発明のポリペプチドは、1以上の病的状
態、特に前記疾患を含めて、1以上の生物学的機能に関
与している。それゆえ、このポリペプチドの機能を刺激
または抑制する化合物を同定するスクリーニング法を開
発することが望ましい。したがって、更なる態様におい
て、本発明は、このポリペプチドを刺激または抑制する
化合物を同定するための化合物のスクリーニング法を提
供する。一般的には、前記疾患の治療および予防目的の
ためにアゴニストまたはアンタゴニストが使用される。
種々の供給源、例えば、細胞、無細胞調製物、化学物質
ライブラリーおよび天然産物の混合物から化合物を同定
することができる。このように同定されたアゴニスト、
アンタゴニストまたはインヒビターは、場合により、該
ポリペプチドの天然のまたは修飾された基質、リガン
ド、受容体、酵素などであってよく、また、その構造的
または機能的なミメティックであってもよい(Coligan
ら, Current Protocols in Immunology 1(2): Chapter
5 (1991)を参照のこと)。
【0048】スクリーニング法では、本発明のポリペプ
チド、または該ポリペプチドを担持する細胞もしくは
膜、またはその融合タンパク質への候補化合物の結合
を、候補化合物に直接または間接的に結合された標識を
用いて簡単に測定できる。あるいはまた、スクリーニン
グ法では標識した競合物質との競合を用いることもあ
る。さらに、こうしたスクリーニング法では、候補化合
物がポリペプチドの活性化または抑制により生ずるシグ
ナルを結果的にもたらすか否かを、該ポリペプチドを担
持する細胞に適した検出系を用いて試験することができ
る。一般的には、既知のアゴニストの存在下で活性化の
インヒビターをアッセイして、アゴニストによる活性化
に候補化合物の存在が与える影響を調べる。アゴニスト
またはインヒビターの不在下で、候補化合物がポリペプ
チドの活性化を抑制するか否かを調べることによる逆ア
ゴニストまたはインヒビターのスクリーニング法では、
構成的に活性のあるポリペプチドが用いられる。さら
に、これらのスクリーニング法は、候補化合物と本発明
のポリペプチドを含む溶液とを混ぜ合わせて混合物をつ
くり、この混合物中のMETPRO 02活性を測定し、そして
この混合物のMETPRO 02活性をスタンダードと比較する
各ステップを単に含むだけでよい。本発明のポリペプチ
ドのアンタゴニストを同定する高処理量スクリーニング
アッセイでは、上記のようなFc部分とMETPRO 02ポリ
ペプチドから作製されるような融合タンパク質も使用す
ることができる(D. Bennettら, J. Mol. Recognition,
8:52-58 (1995)およびK. Johansonら, J. Biol. Chem.,
270(16):9459-9471 (1995)を参照のこと)。
【0049】また、本発明のポリヌクレオチド、ポリペ
プチドまたは該ポリペプチドに対する抗体を用いて、細
胞内でのmRNAまたはポリペプチドの産生に及ぼす添
加化合物の作用を検出するためのスクリーニング法を組
み立てることができる。例えば、当業界で公知の標準方
法によりモノクローナルまたはポリクローナル抗体を用
いて、ポリペプチドの分泌レベルまたは細胞結合レベル
を測定するためのELISAアッセイを構築することが
でき、これは適切に操作された細胞または組織からのポ
リペプチドの産生を抑制または増強する物質(それぞれ
アンタゴニストまたはアゴニストともいう)の探索に用
いることができる。
【0050】膜に結合した受容体または可溶性の受容体
が存在するのであれば、当業界で公知の標準的な受容体
結合法によりこの種の受容体を同定するために本発明の
ポリペプチドを用いることができる。こうした受容体結
合法には、限定するものではないが、リガンド結合アッ
セイおよび架橋アッセイがあり、これらのアッセイで
は、ポリペプチドを放射性アイソトープ(例:125I)で
標識するか、化学的に修飾(例:ビオチン化)するか、
または検出や精製に適したペプチド配列に融合させ、そ
して推定上の受容体源(細胞、細胞膜、細胞上清、組織
抽出物、体液など)とインキュベートする。その他の方
法としては、表面プラズモン共鳴および分光学のような
生物物理的方法がある。これらのスクリーニング法は、
該ポリペプチドまたは(存在するのであれば)その受容
体への結合と競合する該ポリペプチドのアゴニストまた
はアンタゴニストを同定するために用いることもでき
る。スクリーニングアッセイを行うための標準的な方法
は当業界でよく理解されている。
【0051】本発明のポリペプチドの潜在的なアンタゴ
ニストの例としては、抗体、ある場合には、該ポリペプ
チドのリガンド、基質、受容体、酵素などと密接な関係
があるオリゴヌクレオチドもしくはタンパク質(例え
ば、リガンド、基質、受容体、酵素などの断片)、また
は本発明のポリペプチドと結合するが応答を誘導しない
(それゆえ該ポリペプチドの活性を妨げる)小分子など
がある。
【0052】かくして、他の態様において、本発明は、
本発明のポリペプチドのアゴニスト、アンタゴニスト、
リガンド、受容体、基質、酵素など、またはこの種のポ
リペプチドの産生を低下または増加させる化合物を同定
するためのスクリーニングキットに関し、このキット
は、(a) 本発明のポリペプチド、(b) 本発明のポリペプ
チドを発現している組換え細胞、(c) 本発明のポリペプ
チドを発現している細胞膜、または(d) 本発明のポリペ
プチドに対する抗体、を含んでなり、前記ポリペプチド
は好ましくは配列番号2または配列番号6のポリペプチ
ドである。このようなキットにおいて、(a) 、(b) 、
(c) または (d)が実質的な構成成分であることが理解さ
れよう。
【0053】当業者であれば、本発明のポリペプチド
は、その構造に基づいて該ポリペプチドのアゴニスト、
アンタゴニストまたはインヒビターを設計する方法にも
使用できることが容易に理解されよう。この方法は、
(a) 最初に該ポリペプチドの三次元構造を解析し、(b)
アゴニスト、アンタゴニストまたはインヒビターの確実
と思われる反応部位または結合部位の三次元構造を想定
し、(c) 想定された反応部位または結合部位と結合また
は反応すると予想される候補化合物を合成し、そして
(d) その候補化合物が実際にアゴニスト、アンタゴニス
トまたはインヒビターであるか否かを調べる、ことを含
んでなる。これは通常相互作用プロセスであることがさ
らに理解されよう。
【0054】更なる態様において、本発明は、METPRO 0
2ポリペプチド活性の過剰量と不足量のいずれかに関係
した、例えば関節炎、呼吸器系疾患、血栓症、糖尿病、
癌、炎症性障害、骨粗鬆症、心血管障害、高血圧、卒
中、喘息、神経変性症(例えばアルツハイマー病、パー
キンソン病)、うつ病および他の中枢神経系障害などの
異常な状態の治療法を提供する。
【0055】該ポリペプチドの活性が過剰である場合
は、いくつかのアプローチが利用可能である。一つのア
プローチは、例えば、リガンド、基質、受容体、酵素な
どの結合をブロックすることにより、または第2のシグ
ナルを抑制することで異常な状態を軽減することによ
り、該ポリペプチドの機能を抑制するのに有効な量で、
上記のインヒビター化合物(アンタゴニスト)を製剤学
上許容される担体とともに患者に投与することを含んで
なる。もう一つのアプローチでは、内因性のポリペプチ
ドとの競合状態でリガンド、基質、酵素、受容体などと
結合する能力がまだある可溶性形態のポリペプチドを投
与することができる。このような競合物質の典型的な例
はMETPRO 02ポリペプチドの断片である。
【0056】さらに別のアプローチでは、発現阻止法を
使って内因性METPRO 02ポリペプチドをコードする遺伝
子の発現を抑制することができる。こうした公知技術
は、体内で産生されるか別個に投与されるアンチセンス
配列の使用を必要とする(例えば、Oligodeoxynucleoti
des as Antisense Inhibitors of Gene Expression (遺
伝子発現のアンチセンスインヒビターとしてのオリゴデ
オキシヌクレオチド), CRC Press, Boca Raton, FL (19
88) 中のO'Connor, J. Neurochem (1991) 56:560を参照
のこと)。あるいはまた、この遺伝子と共に三重らせん
を形成するオリゴヌクレオチドを供給することもできる
(例えば、Leeら, Nucleic Acids Res (1979) 6:3073;
Cooneyら, Science (1988) 241:456; Dervanら, Scienc
e (1991) 251:1360 を参照のこと)。これらのオリゴマ
ーはそれ自体を投与することもできるし、関連オリゴマ
ーをin vivo で発現させることもできる。合成アンチセ
ンスまたは三重らせんオリゴヌクレオチドは修飾塩基ま
たは修飾骨格を含みうる。後者の例にはメチルホスホネ
ート、ホスホロチオエートまたはペプチド核酸骨格が含
まれる。そうした骨格はアンチセンスまたは三重らせん
オリゴヌクレオチド中に取り込まれてヌクレアーゼによ
る分解からの防御を提供しており、当分野で公知であ
る。これらまたは他の修飾骨格を用いて合成されたアン
チセンスおよび三重らせん分子も本発明の一部を形成す
る。
【0057】さらに、ヒトMETPRO 02ポリペプチドの発
現はヒトMETPRO 02mRNA配列に特異的なリボザイム
を用いることにより阻止されうる。リボザイムは触媒的
に活性なRNAであり、天然のものでも合成されたもの
でもありうる(例えば、Usman,N,ら、Curr.Opin.Struct.
Biol(1996)6(4),527-33参照)。合成リボザイムを設計し
て選択した部位でヒトMETPRO 02mRNAを特異的に切
断し、それによりヒトMETPRO 02mRNAから機能的ポ
リペプチドへの翻訳を阻止することもできる。通常RN
A分子に見られるような天然のリボースリン酸骨格およ
び天然の塩基を用いてリボザイムを合成することもでき
る。また、リボヌクレアーゼ分解からの防御を提供する
ために非天然骨格を用いてリボザイム、例えば 2'-O-
メチルRNAを合成することも可能で、該リボザイムは
修飾塩基を含みうる。
【0058】METPRO 02およびその活性の過少発現に関
係した異常な状態を治療する場合も、いくつかのアプロ
ーチを取ることができる。一つのアプローチは、治療に
有効な量の本発明ポリペプチドを活性化する化合物(す
なわち、前記アゴニスト)を製剤学上許容される担体と
ともに患者に投与して、異常な状態を緩和することを含
んでなる。別法として、患者の関連細胞においてMETPRO
02を内因的に産生させるために遺伝子治療を用いるこ
とができる。例えば、上で述べたような複製欠損レトロ
ウイルスベクターによる発現のために本発明のポリヌク
レオチドを遺伝子操作する。次にレトロウイルス発現構
築物を単離し、本発明のポリペプチドをコードするRN
Aを含有するレトロウイルスプラスミドベクターで形質
導入されたパッケージング細胞に導入する。その結果、
パッケージング細胞は対象の遺伝子を含有する感染性の
ウイルス粒子を産生するようになる。in vivo 細胞操作
およびin vivo ポリペプチド発現のために、これらの産
生細胞を患者に投与する。遺伝子治療の概論に関して
は、Human Molecular Genetics, T Strachan and A PRe
ad, BIOS Scientific Publishers Ltd (1996)中のChapt
er 20, Gene Therapyand other Molecular Genetic-bas
ed Therapeutic Approaches(およびその中の引用文献)
を参照のこと。もう一つのアプローチは治療量の本発明
のポリペプチドを適当な製剤学上の担体とともに投与す
ることである。
【0059】更なる態様において、本発明は、治療に有
効な量のポリペプチド(例えば、可溶性形態の本発明ポ
リペプチド)、アゴニストもしくはアンタゴニストペプ
チド、または小分子化合物を製剤学上許容される担体ま
たは賦形剤と共に含有する医薬組成物を提供する。この
種の担体としては、食塩水、生理食塩水、デキストロー
ス、水、グリセロール、エタノール、およびこれらの組
合せがあるが、これらに限らない。本発明はさらに、上
記の本発明組成物の1以上の成分を充填した1以上の容
器を含んでなる医薬パックおよびキットに関する。本発
明のポリペプチドおよび他の化合物は単独で使用して
も、他の化合物、例えば治療用化合物と一緒に使用して
もよい。
【0060】医薬組成物は投与経路、例えば全身または
経口による投与経路に適合させることができる。全身投
与に適した形態は、注入(注射)、典型的には静注であ
る。皮下、筋肉内または腹腔内のような他の注入経路も
使用できる。全身投与の別の手段には、胆汁酸塩、フシ
ジン酸、その他の界面活性剤などの浸透剤を用いた経粘
膜および経皮投与がある。さらに、本発明のポリペプチ
ドまたは他の化合物を腸溶剤またはカプセル剤として製
剤化し得るのであれば、経口投与も可能である。これら
の化合物を軟膏、ペースト、ゲルなどの剤形で局所に投
与しても、かつ/または局在化させてもよい。
【0061】必要な投与量範囲は、本発明のペプチドま
たは他の化合物の選択、投与経路、製剤の性質、患者の
状態、そして医師の判断に左右される。しかし、適当な
投与量は患者の体重1kgあたり0.1〜100μgの範囲であ
る。入手可能な化合物が多様であること、投与経路の効
率が異なることを考慮すれば、必要とされる投与量は広
範に変動することが予測される。例えば、経口投与は静
注による投与よりも高い投与量を必要とすると予想され
よう。こうした投与量レベルの変動は、当業界でよく理
解されているような、標準的経験的な最適化手順を用い
て調整することができる。
【0062】治療に用いるポリペプチドは、上述したよ
うな「遺伝子治療」と称する治療法において、患者の体
内で産生させることもできる。例えば、患者由来の細胞
を、ポリペプチドをコードするDNAまたはRNAのよ
うなポリヌクレオチドにより、例えばレトロウイルスプ
ラスミドベクターを用いて、ex vivo で遺伝子工学的に
操作する。その後、これらの細胞を患者に導入する。
【0063】ポリヌクレオチドおよびポリペプチドの配
列は、類似の相同性を有する別の配列を同定する際の価
値ある情報源を提供する。これは、こうした配列をコン
ピュータ読み取り可能媒体中に保存し、次に保存したデ
ータを用いてGCGおよびLasergeneソフトウェアパッ
ケージのような公知の検索ツールにより配列データベー
スを検索することで最大限促進される。したがって、更
なる態様において、本発明は、配列番号1または配列番
号5の配列を含んでなるポリヌクレオチドおよび/また
はそれによりコードされるポリペプチドを保存したコン
ピュータ読み取り可能媒体を提供する。
【0064】以下の定義は上記の説明中でしばしば用い
られた用語を理解しやすくするためのものである。本明
細書中で用いる「抗体」には、ポリクローナルおよびモ
ノクローナル抗体、キメラ抗体、一本鎖抗体、ヒト化抗
体、さらにFabまたは他の免疫グロブリン発現ライブ
ラリーの産物を含むFabフラグメントが含まれる。
「単離された」とは、天然の状態から「人間の手によっ
て」改変されたことを意味する。「単離された」組成物
または物質が天然に存在するのであれば、それはそのも
との環境から変化しているか分離されており、またはそ
の両方である。例えば、生存している動物の体内に自然
界で存在するポリヌクレオチドまたはポリペプチドは
「単離された」ものではないが、その天然状態の共存物
質から分離されたポリヌクレオチドまたはポリペプチド
は、本明細書中で用いられるように、「単離された」も
のである。
【0065】「ポリヌクレオチド」とは、一般に任意の
ポリリボヌクレオチドまたはポリデオキシリボヌクレオ
チドをさし、これは修飾されていないRNAもしくはD
NA、または修飾されたRNAもしくはDNAであり得
る。「ポリヌクレオチド」には、制限するものではない
が、一本鎖および二本鎖DNA、一本鎖領域と二本鎖領
域が混じり合ったDNA、一本鎖および二本鎖RNA、
一本鎖領域と二本鎖領域が混じり合ったRNA、DNA
とRNAを含むハイブリッド分子(一本鎖でも、または
より典型的には二本鎖でもよく、一本鎖領域と二本鎖領
域が混じり合ったものでもよい)が含まれる。加えて、
「ポリヌクレオチド」はRNAまたはDNAまたはRN
AとDNAの両方からなる三重鎖領域を意味する。「ポ
リヌクレオチド」という用語はまた、1個以上の修飾塩
基を含有するDNAまたはRNA、および安定性または
他の理由のために修飾された骨格を有するDNAまたは
RNAも含む。「修飾」塩基としては、例えば、トリチ
ル化された塩基およびイノシンのような特殊な塩基があ
る。DNAおよびRNAに対してさまざまな修飾を行う
ことができる。こうして、「ポリヌクレオチド」は、自
然界に一般的に存在するポリヌクレオチドの化学的、酵
素的または代謝的に修飾された形態、並びにウイルスお
よび細胞に特徴的なDNAおよびRNAの化学的形態を
包含する。また、「ポリヌクレオチド」は、しばしばオ
リゴヌクレオチドと称される比較的短いポリヌクレオチ
ドも包含する。
【0066】「ポリペプチド」とは、ペプチド結合また
は修飾されたペプチド結合(すなわち、ペプチドアイソ
スター)により連結された2個以上のアミノ酸を含むペ
プチドまたはタンパク質を意味する。「ポリペプチド」
は短鎖(通常はペプチド、オリゴペプチドまたはオリゴ
マーという)と長鎖(一般的にはタンパク質という)の
両方をさす。ポリペプチドは20種類の遺伝子コード化
アミノ酸以外のアミノ酸を含んでもよい。「ポリペプチ
ド」は、翻訳後プロセシングのような天然のプロセス
で、または当業界で公知の化学的修飾法のいずれかで修
飾されたアミノ酸配列を含む。このような修飾は基本的
な教科書、より詳細な学術論文および研究文献に詳述さ
れている。修飾はペプチド骨格、アミノ酸側鎖、アミノ
またはカルボキシル末端を含めてポリペプチドのどこで
も行うことができる。同じタイプの修飾が所定のポリペ
プチドのいくつかの部位に同程度でまたはさまざまに異
なる程度で存在してもよい。また、所定のポリペプチド
が多くのタイプの修飾を含んでいてもよい。ポリペプチ
ドはユビキチン化のために分枝していても、分枝のある
又はない環状であってもよい。環状の、分枝した、また
は分枝した環状のポリペプチドは翻訳後の天然プロセス
から生じることがあり、また、合成法によって製造する
こともできる。修飾としては、アセチル化、アシル化、
ADP−リボシル化、アミド化、フラビンの共有結合、
ヘム部分の共有結合、ヌクレオチドまたはヌクレオチド
誘導体の共有結合、脂質または脂質誘導体の共有結合、
ホスファチジルイノシトールの共有結合、架橋、環化、
ジスルフィド結合の形成、脱メチル化、共有結合架橋の
形成、シスチンの形成、ピログルタメートの形成、ホル
ミル化、γ−カルボキシル化、グリコシル化、GPIア
ンカー形成、ヒドロキシル化、ヨウ素化、メチル化、ミ
リストイル化、酸化、タンパク質分解プロセシング、リ
ン酸化、プレニル化、ラセミ化、セレノイル化、硫酸
化、アルギニル化のようなタンパク質へのアミノ酸の転
移RNA媒介付加、ユビキチン化などがある(例えば、
Proteins - Structure and Molecular Properties 2nd
Ed., T.E. Creighton, W.H. Freeman and Company, Ne
w York, 1993; Posttranslational Covalent Modificat
ion of Proteins, B.C. Johnson編, Academic Press, N
ew York,1983中のWold, F., Post-translational Prote
in Modifications: Perspectives and Prospects, pgs.
1-12; Seifterら, “Analysis for protein modificat
ions and nonprotein cofactors", Meth Enzymol (199
0) 182:626-646;および Rattanら, “Protein Synthesi
s: Post-translational Modifications and Aging", An
n NY Acad Sci (1992) 663:48-62を参照のこと)。
【0067】本明細書中で用いる「変異体」とは、基準
のポリヌクレオチドまたはポリペプチドと異なるが、不
可欠な性質を保持しているポリヌクレオチドまたはポリ
ペプチドのことである。典型的なポリヌクレオチドの変
異体は基準ポリヌクレオチドとヌクレオチド配列の点で
相違する。この変異体のヌクレオチド配列の変化は、基
準ポリヌクレオチドによってコードされるポリペプチド
のアミノ酸配列を変更しても、しなくてもよい。ヌクレ
オチドの変化は、以下で述べるように、基準配列により
コードされるポリペプチドのアミノ酸の置換、欠失、付
加、融合および末端切断(トランケーション)をもたら
しうる。典型的なポリペプチドの変異体は基準ポリペプ
チドとアミノ酸配列の点で相違する。一般的には、基準
ポリペプチドの配列と変異体の配列が全般的によく類似
しており、多くの領域で同一となるような相違に限られ
る。変異体と基準ポリペプチドは任意に組み合わせた1
以上の置換、欠失、付加によりアミノ酸配列が相違して
いてよい。置換または付加されるアミノ酸残基は遺伝子
コードによりコードされるものであっても、なくてもよ
い。ポリヌクレオチドまたはポリペプチドの変異体はア
レル変異体のように天然に存在するものでも、天然に存
在することが知られていない変異体であってもよい。ポ
リヌクレオチドおよびポリペプチドの天然に存在しない
変異体は、突然変異誘発法または直接合成により作製す
ることができる。
【0068】当技術分野で知られた「同一性」とは、ポ
リペプチド配列またはポリヌクレオチド配列の比較によ
り決定された、2以上のかかる配列間の関係のことであ
る。当技術分野ではまた、「同一性」はポリペプチド配
列またはポリヌクレオチド配列の鎖間のマッチ(match)
により決定された、このような配列間の配列関係の程度
を意味する。「同一性」および「類似性」は公知の方法
により難なく算出することができ、こうした方法とし
て、例えば Computational Molecular Biology,Lesk,
A.M.編, Oxford University Press, New York, 1988; B
iocomputing: Informatics and Genome Projects, Smit
h, D.W. 編, Academic Press, New York,1993; Compute
r Analysis of Sequence Data, Part I, Griffin, A.M.
and Griffin, H.G. 編, Humana Press, New Jersey, 1
994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von H
einje, G., Academic Press, 1987; Sequence Analysis
Primer, Gribskov, M. and Devereux, J. 編, M Stock
ton Press, New York, 1991; および Carillo, H. and
Lipman, D., SIAM J. Applied Math., 48: 1073 (1988)
に記載された方法があるが、これらに限らない。同一
性を決定するための好ましい方法は、検討する配列間で
最大級のマッチが得られるように設計される。さらに、
同一性および類似性を決定する方法は一般に入手可能な
コンピュータプログラムに編集されている。2配列間の
同一性および類似性を決定する好適なコンピュータプロ
グラム法としては、GCGプログラムパッケージ (Deve
reux, J.ら, Nucleic Acids Research 12(1):387 (198
4))、BLASTP、BLASTNおよびFASTA (A
tschul, S.F.ら, J. Molec. Biol. 215:403-410 (199
0))があるが、これらに限らない。BLASTXプログ
ラムはNCBIおよび他のソースから一般に入手可能で
ある (BLAST Manual, Altschul, S.ら, NCBI NLM NIHBe
thesda, MD 20894; Altschul, S.ら, J. Mol. Biol. 21
5: 403-410 (1990))。公知のSmith Watermanアルゴリズ
ムも同一性の決定に使用することができる。
【0069】ポリペプチド配列を比較するための好適な
パラメーターは次のものを含む: 1)アルゴリズム:Needleman and Wunsch, J. Mol. Bi
ol. 48: 443-453 (1970); 比較マトリックス:BLOSSU
M62 、Hentikoff and Hentikoff, Proc. Natl. Acad. S
ci. USA, 89: 10915-10919 (1992) ギャップペナルティー:12 ギャップ長ペナルティー:4 これらのパラメーターと共に役に立つプログラムは Gen
etics Computer Group(Madison WI)から「gap」プロ
グラムとして一般に入手可能である。前記のパラメータ
ーはペプチド比較のためのデフォルトパラメーター(def
ault parameter) である(末端ギャップのペナルティー
は無し)。
【0070】ポリヌクレオチド配列を比較するための好
適なパラメーターは次のものを含む: 1)アルゴリズム:Needleman and Wunsch, J. Mol. Bi
ol. 48: 443-453 (1970); 比較マトリックス:マッチ
=+10、ミスマッチ=0 ギャップペナルティー:50 ギャップ長ペナルティー:3 これらのパラメーターと共に役に立つプログラムは Gen
etics Computer Group(Madison WI)から「gap」プロ
グラムとして入手可能である。前記のパラメーターはポ
リヌクレオチド比較のためのデフォルトパラメーターで
ある。
【0071】例として、本発明のポリヌクレオチド配列
は配列番号1の基準配列と同一、すなわち100%同一
であっても、該基準配列に対して、ある整数個までのヌ
クレオチド変異を含んでいてもよい。前記変異は少なく
とも1個のヌクレオチドの欠失、置換(トランジション
およびトランスバージョンを含む)または付加よりなる
群から選択され、こうした変異は基準ヌクレオチド配列
の5'もしくは3'末端位置、またはこれらの末端位置の間
のどこに存在してもよく、基準配列中のヌクレオチドの
間に個々に、または基準配列内に1以上の連続するグル
ープとして介在することができる。ヌクレオチド変異の
数は、配列番号1のヌクレオチドの総数に、それぞれの
(100で割った)同一性%値を掛け、その積を配列番
号1のヌクレオチドの総数から差し引くことにより、す
なわち、次式: nn ≦xn −(xn・y) により求めることができる。式中、nnはヌクレオチド
変異の数であり、xnは配列番号1のヌクレオチドの総
数であり、yは例えば70%については0.70、80%につい
ては0.80、85%については0.85、90%については0.90、
95%については0.95などであり、xnとyの非整数の積
は、その積をxnから引く前に、最も近似する整数に切
り下げる。配列番号2のポリペプチドをコードするポリ
ヌクレオチド配列の改変は、そのコード配列にナンセン
ス、ミスセンスまたはフレームシフト突然変異を生じさ
せ、それにより、こうした変異後に該ポリヌクレオチド
によりコードされたポリペプチドを改変させることがで
きる。
【0072】同様に、本発明のポリペプチド配列は配列
番号2の基準配列と同一、すなわち100%の同一性で
あっても、該基準配列に対して、ある整数個までのアミ
ノ酸変異を含んでいてもよい。前記変異は少なくとも1
個のアミノ酸の欠失、置換(同類および非同類アミノ酸
置換を含む)または付加よりなる群から選択され、こう
した変異は基準ポリペプチド配列のアミノもしくはカル
ボキシ末端位置、またはこれらの末端位置の間のいずれ
に存在してもよく、基準配列中のアミノ酸の間に個々
に、または基準配列内に1以上の連続するグループとし
て介在することができる。所定の同一性%についてのア
ミノ酸変異の数は、配列番号2のアミノ酸の総数に、そ
れぞれの(100で割った)同一性%値を掛け、その積
を配列番号2のアミノ酸の総数から差し引くことによ
り、すなわち、次式: na ≦xa −(xa・y) により求めることができる。式中、naはアミノ酸変異
の数であり、xaは配列番号2中のアミノ酸の総数であ
り、yは例えば70%については0.70、80%については0.
80、85%については0.85などであり、xaとyの非整数
の積は、その積をxaから引く前に、最も近似する整数
に切り下げる。
【0073】「相同体」とは、対象の配列に対して高度
の配列関連性を有するポリヌクレオチドまたはポリペプ
チドを示すための当技術分野で使用される一般的な用語
である。こうした関連性は、上記のような比較すべき配
列間の同一性および/または類似性の程度を決定するこ
とにより定量化できる。別の種におけるポリヌクレオチ
ドまたはポリペプチドの機能的等価物であるポリヌクレ
オチドまたはポリペプチドを意味する「オーソログ体」
(ortholog)、および同一の種内で考えるときに機能的に
類似した配列を意味する「パラログ体」(paralog) とい
う用語はこの一般的な用語に含まれる。
【0074】「融合タンパク質」とは、2つの、しばし
ば無関係の、融合された遺伝子またはその断片によりコ
ードされるタンパク質のことである。一例として、EP-A
-0 464には、免疫グロブリン分子の定常領域の様々な部
分と他のヒトタンパク質またはその一部とを含んでなる
融合タンパク質が記載されている。多くの場合、治療お
よび診断における使用には、融合タンパク質の一部とし
て免疫グロブリンFc領域を使用することが有利であ
り、これにより例えば薬物速度論的性質が向上する(例
えば、EP-A- 0232 262を参照のこと)。一方、いくつか
の使用にとっては、その融合タンパク質を発現させ、検
出し、精製した後でFc部分を除去することが望ましい
だろう。
【0075】本明細書中に引用された、特許および特許
出願明細書を含めた全ての刊行物は、あたかも各刊行物
が明確にかつ個々に示されているかのように、その全体
を参考としてここに組み入れるものとする。
【0076】 配列情報 配列番号1 GGGGCCGCCTGACCCAAAGCGAAACCGAAAGCCCCGCGGAGGGTGACCTGACGACTTTCC CGGGACTGGAAGGGGGAGTCCTGTGAGAGACTAGGTGGCCATGAACGGTAAGGCCCGCAA AGAGGCGGTGCAGACTGCGGCTAAGGAACTCCTCAAGTTCGTGAACCGGAGTCCCTCTCC TTTCCATGCTGTGGCTGAATGCCGCAACCGCCTTCTCCAGGCTGGCTTCAGTGAACTCAA GGAGACTGAGAAATGGAATATTAAGCCCGAGAGCAAGTACTTCATGACCAGGAACTCCTC CACCATCATAGCTTTTGCTGTAGGGGGCCAGTACGTTCCTGGCAATGGCTTCAGCCTCAT CGGGGCCCACACGGACAGCCCCTGCCTCCGGGTGAAACGTCGGTCTCGCCGCAGCCAGGT GGGCTTCCAGCAAGTCGGTGTGGAGACCTATGGTGGTGGGATCTGGAGCACCTGGTTTGA CCGTGACCTGACTCTGGCTGGACGCGTCATTGTCAAGTGCCCTACCTCAGGTCGGCTGGA GCAGCAGCTGGTGCACGTGGAGCGGCCCATTCTTCGCATCCCACACCTGGCCATCCATCT GCAGCGAAATATCAACGAGAACTTTGGGCCCAACACAGAGATGCATCTAGTCCCCATTCT TGCCACAGCCATCCAGGAGGAGCTGGAGAAGGGGACTCCTGAGCCAGGGCCTCTCAATGC TGTGGATGAGCGGCACCATTCGGTCCTCATGTCCCTGCTCTGTGCCCATCTGGGGCTGAG CCCCAAGGACATAGTGGAGATGGAGCTCTGCCTTGCAGACACCCAGCCTGCGGTCTTGGG TGGTGCCTATGATGAGTTCATCTTTGCTCCTCGGCTGGACAATCTGCACAGCTGCTTCTG TGCCCTGCAGGCCTTGATAGATTCCTGTGCAGGCCCTGGCTCCCTGGCCACAGAGCCTCA CGTGCGCATGGTCACACTCTATGACAACGAAGAGGTGGGGTCTGAGAGTGCACAGGGAGC ACAGTCACTGCTGACAGAGCTGGTGCTGCGGCGGATCTCAGCCTCGTGCCAGCACCCGAC AGCCTTCGAGGAAGCCATACCCAAGTCCTTCATGATCAGCGCAGACATGGCCCATGCTGT GCATCCCAACTACCTGGACAAGCATGAGGAGAACCACCGGCCTTTATTCCACAAGGGCCC CGTGATCAAGGTGAACAGCAAGCAACGCTATGCTTCAAACGCGGTGTCAGAGGCCCTGAT CCGAGAGGTGGCCAACAAAGTCAAGGTCCCCCTGCAGGATCTCATGGTCCGGAATGACAC CCCCTGTGGAACCACCATTGGACCTATCTTGGCTTCTCGGCTGGGGCTGCGGGTGCTGGA TTTAGGCAGCCCCCAACTGGCCATGCACTCTATCCGGGAGATGGCCTGCACCACAGGAGT CCTCCAGACCCTCACCCTCTTCAAGGGCTTCTTTGAGCTGTTCCCTTCTCTAAGCCATAA TCTCTTAGTGGATTGAGCCCTCTTGGAAAGACTTCTCTGCCATCCCTTTGCACCTGAGAG GGGAAGTTCTCAGCTGAGCTGAAGCTGGATTATTAAAGTGGATTGTCACTCAGACTCTAA GCTCTAAGGGCGAACCA 配列番号2 MNGKARKEAVQTAAKELLKFVNRSPSPFHAVAECRNRLLQAGFSELKETEKWNIKPESKY FMTRNSSTIIAFAVGGQYVPGNGFSLIGAHTDSPCLRVKRRSRRSQVGFQQVGVETYGGG IWSTWFDRDLTLAGRVIVKCPTSGRLEQQLVHVERPILRIPHLAIHLQRNINENFGPNTE MHLVPILATAIQEELEKGTPEPGPLNAVDERHHSVLMSLLCAHLGLSPKDIVEMELCLAD TQPAVLGGAYDEFIFAPRLDNLHSCFCALQALIDSCAGPGSLATEPHVRMVTLYDNEEVG SESAQGAQSLLTELVLRRISASCQHPTAFEEAIPKSFMISADMAHAVHPNYLDKHEENHR PLFHKGPVIKVNSKQRYASNAVSEALIREVANKVKVPLQDLMVRNDTPCGTTIGPILASR LGLRVLDLGSPQLAMHSIREMACTTGVLQTLTLFKGFFELFPSLSHNLLVD 配列番号3 GGTAAGTGGCTCCCGACGGCCCCACTTGAATTTCGATCCCAGACCGGGTCCGGCGCCCTC CGGNCCANAGCTTTAGCNNGGTGCTGCAGTGGGGCCGCCTGACCCAAAGCGAAACCGAAA GCCCCGCGTAGGGTGACCTGACGACTTTCCCGGGACTGGAAGGGGGAGTCGTGCGACCAC GCGCGGGGCCATGCAGGTGGCCATGAACGGTAAGGCCCGCAAAGAGGCGGTGCAGACTGC GGCTAAGGAACTCCTCAAGTTCGTGAACCGGAGTCCCTCTCCTTTCCATGCTGTGGCTGA ATGCCGCAACCGCCTTCTCCAGGCTGGCTTCAGTGAACTCAAGGAGACTGAGAAATGGAA TATTAAGCCCGAGAGCAAGTACTTCATGACCAGGAACTCCTCCACCATCATAGCTTTTGC TGTAGGGGGCCAGTACGTTCCTGGCAATGGCTTCAGCTCATCGGGGCCCACACGGACAGC CCCTGCCTCCGGGTGAAACGTCGGTCTCGCCGCAGCCAGGTGGGCTTCCAGCAAGTCGGT GTGGAGACCTATGGTGGTGGGATCTGGAGCACCTGGTTTGACCGTGACCTTGACTCTGGC TGGACGCGTCATTGTCAAGTGCCCTACCTCAGGTCGGCTGGAGCAGCAGCTGGTGCACGT GGAGCGGCCCATTCTTCGCATCCCACACCTGGCCATCCATCTGCAGCGAAATATCAACGA GAACTTTGGGCCCAACACAGAGATGCATCTAGTCCCCATTCTTGCCACAGCCATCCAGGA GGAGCTGGAGAAGGGGACTCCTGAGCCAGGGCCTCTCAATGCTGTGGATGAGCGGCACCA TTCGGTCCTCATGTCCCTGCTCTGTGCCCATCTGGGGCTGAGCCAAGNGTACATAGTGGA GATGGAGCTCTGCCTTGCAGACACCCAGCCTGCGGTCTTGGGTGGTGCCTATGATGAGTT CATCTTTGCTCCTCGGCTGGACAATCTGCACAGCTGCTTCTGTGCCCTGCAGGCCTTGAT AGATTCCTGTGCAGGCCCTGGCTCCCTGGCCACAGAGCCTCACGTGCGCATGGTCACACT CTATGACAACGAAGAGGTGGGGTCTGAGAGTGCACAGGGAGCACAGTCACTGCTGACAGA TGCTGGTGCTGCGGCGGATCTCAGCCTCGTGCCAGCACCCGACAGCCTTCGAGGAAGCCA TACCCAAGTCCTTCATGATCAGCGCAGACATGGCCCATGCTGTGATCCCAACTACCTGGA CAAGCATGAGGAGAACCACCGGCCTTTATTCCACAAGGGCCCCGTGATCAAGGTGAACAG CAAGCAACGCTATGCTTCAAACGCGGTGTCAGAGGCCCTGATCCGAGAGGTGGCCAACAA AGTCAAGGTCCCCCTGCAGGATCTCATGGTCCGGAATGACACCCCCTGTGGAACCACCAT TGGACCTATCTTGGCTTCTCGGCTGGGGCTGCGGGTGCTGGATTTAGGCAGCCCCCAACT GGCCATGCACTCTATCCGGGAGATGGCCTGCACCACAGGAGTCCTCCAGACCCTCACCCT CTTCAAGGGCTTCTTTGAGCTGTTCCCTTCTCTAAGCCATAATCTCTTAGTGGATTGAGC CCTCTTGGAAAGACTTCTCTGCCATCCCTTTGCACCTGAGAGGGGAAGTTCTCAGCTGAG CTGAAGCTGGATTATTAAAGTGGATTGTCACTCAGACTCTCCGTGTACGCTTATTTGGAG ACTAGAGGAGTGGGAGTTGAGCCTGGCTTGAACCTTTGGAACCAGAAAAGTTGGGGAGCA GGTGGAGGAGGCCACACTCCTGGGAGCTGATGGTTTTAAATCTGGTTTTAAATCTCATCT CTGTCTCAAGTCCATGTNTGAAGTGGGTGAAGGGTGGACTGGATCCTCAAGCAGAAGGTC ACTTCTCCCACCCCTAGTCCTCCACCTGGGAAATGGCCTCAACGGTCTTCCCTCTTTCCA TCCCCAGAATGGGTGTCCCGCTCTGCCTTCAGAGATCCT 配列番号4 Query: 230 VQTAAKELLKFVNRSPSPFHAVAECRNRLLQAGFSELKETEKWNIKPESKYFMTRNSSTI ++ AA+E + ++N++ +PFHA E ++RLLQAGF+EL E+ W+I+P SKYF+T+N S I Sbjct: 12 IRKAAQEFINYLNKAVTPFHATQEVKDRLLQAGFTELPESGHWDIQPTSKYFVTKNRSAI Query: 410 IAFAVGGQYVPGNGFSSSGPTRTAPASG*NVGLAAARWASSKS-VWRPMVVGSGAPGLTV +AFAVGG Y PG+GFS +P L + KS + + V + G+ Sbjct: 72 LAFAVGGSYKPGSGFSIVVGHTDSPC------LRVKPISHQKSDKFLQVGVSTYGGGIWR Query: 587 T-----LTLAGRVIVKCPTSGRLEQQLVHVERPILRIPHLAIHLQRNINENFGPNTEMHL T L++AG VIVK +L+ +L+ V++P+L IP+LAIHL+ + F PNTE L Sbjct: 126 TWFDRDLSVAGLVIVK--NGEKLQHKLIDVKKPVLFIPNLAIHLETD-RTTFKPNTETEL Query: 752 VPILATAIQEELEKGT-PEP----GPLNAVDERHHSVLMSLLCAHLGLSQXYIVEMELCL PIL T + PE P N + HH + L+ G IV+++L L Sbjct: 183 RPILETFAAAGINAPQKPESTGFADPRN-ITNNHHPQFLGLIAKEAGCQPEDIVDLDLYL Query: 917 ADTQPAVLGGAYDEFIFAPRLDNLHSCFCALQALIDSCAGPGSLATEPHVRMVTLYDNEE DT A + G DEFI RLDN + A+ L++S G S +P +R+ +DNEE Sbjct: 242 YDTNKAAIVGMEDEFISGARLDNQVGTYTAISGLLESLTGE-SFKNDPQIRIAACFDNEE Query:1097 VGSESAQGAQSLLTD---AGAAADLSLVPAPDSLRGSHTQVLHDQRRHGPCCDPNYLDKH VGS+SA GA S T+ +A S +++ G + DQ H PNY KH Sbjct: 301 VGSDSAMGASSSFTEFVLRRLSAGGSTTAFEEAI-GKSMLISADQA-HAT--HPNYSAKH Query:1268 EENHRPLFHKGPVIKVNSKQRYASNAVSEALIREVANKVKVPLQDLMVRNDTPCGTTIGP EENHRP FH G V+KVN QRYA+ + + A +++VA + +VPLQ ++VRND+PCG+T+GP Sbjct: 357 EENHRPAFHGGVVVKVNVNQRYATTSTTHAALKQVAFEAQVPLQVVVVRNDSPCGSTVGP Query:1448 ILASRLGLRVLDLGSPQLAMHSIREMACTTGVLQTLTLFKGFFELFPSLSHNL 1606 ILA++LGL+ +D+G PQLAMHSIRE A T+ + Q TL+ F+E ++ N+ Sbjct: 417 ILATKLGLQTVDVGCPQLAMHSIREFADTSSIYQATTLYSTFYERLSTVLSNM 469 配列番号4は、アライメント中、「Query」と名付けた
配列をいう。 配列番号5(マウス METPRO 02) CGGCACGATTCGGCAAAACTGGGTGGAGGTCCTCTTGCCCTGGGACTGAACCTTTGAGCC GAGAGCAGATCGAGCTAGGAATCCACATCTGTCGCCAGTGAAGTCCTCGGAGAGCAGAGA TGGCTATGAACGGCAGGGCTCGGAAAGAGGCCATCCAGGCATCAGCCCGAGAGCTCCTGA AGTTCGTGAACCGGAGTCCCTCTCCTTTCCACGTCGTGGCTGAGTGCCGCAGCCGCCTCC TCCAGGCTGGCTTCCGTGAACTCAAGGAAACAGAGGGCTGGGATATCGTACCAGAAAACA AGTACTTCTTAACCAGAAACTCCTCCTCCATCATTGCTTTTGCTGTGGGGGGCCAGTATG TTCCTGGCAATGGCTTCAGCCTCATTGGGGCCCACACGGACAGTCCCTGTCTCAGGGTGA AACGCAAATCGCGCCGAAGCCAGGTGGGCTACCACCAGGTCGGTGTTGAGACCTACGGCG GTGGGATCTGGAGCACATGGTTCGACCGGGACCTGACCTTGGCTGGACGCGTCATTATCA AGTGCCCTACCTCAGGCCGGCTGGAGCAGAGGCTCGTCCATATAGAACGGCCCATCCTGC GCATCCCACATCTGGCCATCCATCTGCAGCGAAATATCAATGAGAACTTTGGGCCCAACA CAGAGATCCACCTAGTCCCTATTCTTGCCACAGCAGTTCAGGAAGAGCTGGAGAAAGGGA CTCCTGAACCAGGGCCTCTCGGTGCCACTGATGAGCGGCACCACTCGGTCCTCATGTCCC TGCTCTGTACCCATCTGGGCCTGAGTCCTGACAGCATCATGGAGATGGAGCTCTGCCTGG CAGACACCCAGCCTGCAGTCCTGGGTGGAGCCTATGAAGAGTTCATCTTCGCTCCTCGAC TGGACAATCTGCACAGCTGCTTCTGTGCCCTGCAGGCATTGATTGATTCCTGTGCATCCC CTGCCTCTCTGGCCAGGGATCCACATGTGCGCATGGTCACACTCTACGACAATGAAGAGG TGGGGTCAGAGAGTGCACAAGGAGCACAGTCCCTGCTGACGGAGCTGATACTACGGCGCA TCTCAGCCTCACCTCAGCGTCTGACTGCCTTCGAGGAAGCCATACCTAAGTCCTTCATGA TCAGTGCAGACATGGCCCATGCTGTGCACCCAAACTACTCGGACAAGCATGAAGAAAACC ACCGGCCTTTGTTCCATAAGGGTCCTGTGATCAAGGTGAACAGCAAGCAGCGCTACGCCT CTAATGCAGTGTCTGAGTCCATGATTCGAGAGGTGGCTGGCCAAGTTGGGGTGCCCCTGC AGGACCTCATGGTCAGGAATGACTCCCCGTGTGGTACCACCATTGGACCTATCTTGGCTT CTCGACTGGGGCTTCGGGTGCTGGACTTAGGCAGCCCCCAACTGGCTATGCACTCTATCC GGGAGACAGCCTGTACCACTGGAGTTCTCCAGACCCTCACCCTTTTCAAGGGCTTCTTTG AGCTGTTCCCTTCTGTAAGCCGGAACCTCTTAGTGGACTGAGGCCTCTCGCCAAGAGTTG TCTTCCACCCCTTTGCAATTGAGAGGGGAGGATCTCAGTTTCGCTGATGTTGGATTATTA AAGTAGATTTTCACTCC 配列番号6(マウス METPRO 02ポリペプチド) MNGRARKEAIQASARELLKFVNRSPSPFHVVAECRSRLLQAGFRELKETEGWDIVPENKY FLTRNSSSIIAFAVGGQYVPGNGFSLIGAHTDSPCLRVKRKSRRSQVGYHQVGVETYGGG IWSTWFDRDLTLAGRVIIKCPTSGRLEQRLVHIERPILRIPHLAIHLQRNINENFGPNTE IHLVPILATAVQEELEKGTPEPGPLGATDERHHSVLMSLLCTHLGLSPDSIMEMELCLAD TQPAVLGGAYEEFIFAPRLDNLHSCFCALQALIDSCASPASLARDPHVRMVTLYDNEEVG SESAQGAQSLLTELILRRISASPQRLTAFEEAIPKSFMISADMAHAVHPNYSDKHEENHR PLFHKGPVIKVNSKQRYASNAVSESMIREVAGQVGVPLQDLMVRNDSPCGTTIGPILASR LGLRVLDLGSPQLAMHSIRETACTTGVLQTLTLFKGFFELFPSVSRNLLVD
【0077】
【配列表】
SEQUENCE LISTING <110> SMITHKLINE BEECHAM PLC <120> A Member of Aminopeptidase Family,METPRO 02 <130> GP30050<150> U.K.Application No.9808478.3 <151> 1998-4-21 <150> U.K.Application No.9802824.4 <151> 1998-2-9 <160> 6 <170> FASTSEQ FOR WINDOWS VERSION 3.0 <210> 1 <211> 1637 <212> DNA <213> HOMO SAPIENS <400> 1 ggggccgcct gacccaaagc gaaaccgaaa gccccgcgga gggtgacctg acgactttcc 60 cgggactgga agggggagtc ctgtgagaga ctaggtggcc atgaacggta aggcccgcaa 120 agaggcggtg cagactgcgg ctaaggaact cctcaagttc gtgaaccgga gtccctctcc 180 tttccatgct gtggctgaat gccgcaaccg ccttctccag gctggcttca gtgaactcaa 240 ggagactgag aaatggaata ttaagcccga gagcaagtac ttcatgacca ggaactcctc 300 caccatcata gcttttgctg tagggggcca gtacgttcct ggcaatggct tcagcctcat 360 cggggcccac acggacagcc cctgcctccg ggtgaaacgt cggtctcgcc gcagccaggt 420 gggcttccag caagtcggtg tggagaccta tggtggtggg atctggagca cctggtttga 480 ccgtgacctg actctggctg gacgcgtcat tgtcaagtgc cctacctcag gtcggctgga 540 gcagcagctg gtgcacgtgg agcggcccat tcttcgcatc ccacacctgg ccatccatct 600 gcagcgaaat atcaacgaga actttgggcc caacacagag atgcatctag tccccattct 660 tgccacagcc atccaggagg agctggagaa ggggactcct gagccagggc ctctcaatgc 720 tgtggatgag cggcaccatt cggtcctcat gtccctgctc tgtgcccatc tggggctgag 780 ccccaaggac atagtggaga tggagctctg ccttgcagac acccagcctg cggtcttggg 840 tggtgcctat gatgagttca tctttgctcc tcggctggac aatctgcaca gctgcttctg 900 tgccctgcag gccttgatag attcctgtgc aggccctggc tccctggcca cagagcctca 960 cgtgcgcatg gtcacactct atgacaacga agaggtgggg tctgagagtg cacagggagc 1020 acagtcactg ctgacagagc tggtgctgcg gcggatctca gcctcgtgcc agcacccgac 1080 agccttcgag gaagccatac ccaagtcctt catgatcagc gcagacatgg cccatgctgt 1140 gcatcccaac tacctggaca agcatgagga gaaccaccgg cctttattcc acaagggccc 1200 cgtgatcaag gtgaacagca agcaacgcta tgcttcaaac gcggtgtcag aggccctgat 1260 ccgagaggtg gccaacaaag tcaaggtccc cctgcaggat ctcatggtcc ggaatgacac 1320 cccctgtgga accaccattg gacctatctt ggcttctcgg ctggggctgc gggtgctgga 1380 tttaggcagc ccccaactgg ccatgcactc tatccgggag atggcctgca ccacaggagt 1440 cctccagacc ctcaccctct tcaagggctt ctttgagctg ttcccttctc taagccataa 1500 tctcttagtg gattgagccc tcttggaaag acttctctgc catccctttg cacctgagag 1560 gggaagttct cagctgagct gaagctggat tattaaagtg gattgtcact cagactctaa 1620 gctctaaggg cgaacca 1637 <210> 2 <211> 471 <212> PRT <213> HOMO SAPIENS <400> 2 MET ASN GLY LYS ALA ARG LYS GLU ALA VAL GLN THR ALA ALA LYS GLU 1 5 10 15 LEU LEU LYS PHE VAL ASN ARG SER PRO SER PRO PHE HIS ALA VAL ALA 20 25 30 GLU CYS ARG ASN ARG LEU LEU GLN ALA GLY PHE SER GLU LEU LYS GLU 35 40 45 THR GLU LYS TRP ASN ILE LYS PRO GLU SER LYS TYR PHE MET THR ARG 50 55 60 ASN SER SER THR ILE ILE ALA PHE ALA VAL GLY GLY GLN TYR VAL PRO 65 70 75 80 GLY ASN GLY PHE SER LEU ILE GLY ALA HIS THR ASP SER PRO CYS LEU 85 90 95 ARG VAL LYS ARG ARG SER ARG ARG SER GLN VAL GLY PHE GLN GLN VAL 100 105 110 GLY VAL GLU THR TYR GLY GLY GLY ILE TRP SER THR TRP PHE ASP ARG 115 120 125 ASP LEU THR LEU ALA GLY ARG VAL ILE VAL LYS CYS PRO THR SER GLY 130 135 140 ARG LEU GLU GLN GLN LEU VAL HIS VAL GLU ARG PRO ILE LEU ARG ILE 145 150 155 160 PRO HIS LEU ALA ILE HIS LEU GLN ARG ASN ILE ASN GLU ASN PHE GLY 165 170 175 PRO ASN THR GLU MET HIS LEU VAL PRO ILE LEU ALA THR ALA ILE GLN 180 185 190 GLU GLU LEU GLU LYS GLY THR PRO GLU PRO GLY PRO LEU ASN ALA VAL 195 200 205 ASP GLU ARG HIS HIS SER VAL LEU MET SER LEU LEU CYS ALA HIS LEU 210 215 220 GLY LEU SER PRO LYS ASP ILE VAL GLU MET GLU LEU CYS LEU ALA ASP 225 230 235 240 THR GLN PRO ALA VAL LEU GLY GLY ALA TYR ASP GLU PHE ILE PHE ALA 245 250 255 PRO ARG LEU ASP ASN LEU HIS SER CYS PHE CYS ALA LEU GLN ALA LEU 260 265 270 ILE ASP SER CYS ALA GLY PRO GLY SER LEU ALA THR GLU PRO HIS VAL 275 280 285 ARG MET VAL THR LEU TYR ASP ASN GLU GLU VAL GLY SER GLU SER ALA 290 295 300 GLN GLY ALA GLN SER LEU LEU THR GLU LEU VAL LEU ARG ARG ILE SER 305 310 315 320 ALA SER CYS GLN HIS PRO THR ALA PHE GLU GLU ALA ILE PRO LYS SER 325 330 335 PHE MET ILE SER ALA ASP MET ALA HIS ALA VAL HIS PRO ASN TYR LEU 340 345 350 ASP LYS HIS GLU GLU ASN HIS ARG PRO LEU PHE HIS LYS GLY PRO VAL 355 360 365 ILE LYS VAL ASN SER LYS GLN ARG TYR ALA SER ASN ALA VAL SER GLU 370 375 380 ALA LEU ILE ARG GLU VAL ALA ASN LYS VAL LYS VAL PRO LEU GLN ASP 385 390 395 400 LEU MET VAL ARG ASN ASP THR PRO CYS GLY THR THR ILE GLY PRO ILE 405 410 415 LEU ALA SER ARG LEU GLY LEU ARG VAL LEU ASP LEU GLY SER PRO GLN 420 425 430 LEU ALA MET HIS SER ILE ARG GLU MET ALA CYS THR THR GLY VAL LEU 435 440 445 GLN THR LEU THR LEU PHE LYS GLY PHE PHE GLU LEU PHE PRO SER LEU 450 455 460 SER HIS ASN LEU LEU VAL ASP 465 470 <210> 3 <211> 2019 <212> DNA <213> HOMO SAPIENS <400> 3 ggtaagtggc tcccgacggc cccacttgaa tttcgatccc agaccgggtc cggcgccctc 60 cggnccanag ctttagcnng gtgctgcagt ggggccgcct gacccaaagc gaaaccgaaa 120 gccccgcgta gggtgacctg acgactttcc cgggactgga agggggagtc gtgcgaccac 180 gcgcggggcc atgcaggtgg ccatgaacgg taaggcccgc aaagaggcgg tgcagactgc 240 ggctaaggaa ctcctcaagt tcgtgaaccg gagtccctct cctttccatg ctgtggctga 300 atgccgcaac cgccttctcc aggctggctt cagtgaactc aaggagactg agaaatggaa 360 tattaagccc gagagcaagt acttcatgac caggaactcc tccaccatca tagcttttgc 420 tgtagggggc cagtacgttc ctggcaatgg cttcagctca tcggggccca cacggacagc 480 ccctgcctcc gggtgaaacg tcggtctcgc cgcagccagg tgggcttcca gcaagtcggt 540 gtggagacct atggtggtgg gatctggagc acctggtttg accgtgacct tgactctggc 600 tggacgcgtc attgtcaagt gccctacctc aggtcggctg gagcagcagc tggtgcacgt 660 ggagcggccc attcttcgca tcccacacct ggccatccat ctgcagcgaa atatcaacga 720 gaactttggg cccaacacag agatgcatct agtccccatt cttgccacag ccatccagga 780 ggagctggag aaggggactc ctgagccagg gcctctcaat gctgtggatg agcggcacca 840 ttcggtcctc atgtccctgc tctgtgccca tctggggctg agccaagngt acatagtgga 900 gatggagctc tgccttgcag acacccagcc tgcggtcttg ggtggtgcct atgatgagtt 960 catctttgct cctcggctgg acaatctgca cagctgcttc tgtgccctgc aggccttgat 1020 agattcctgt gcaggccctg gctccctggc cacagagcct cacgtgcgca tggtcacact 1080 ctatgacaac gaagaggtgg ggtctgagag tgcacaggga gcacagtcac tgctgacaga 1140 tgctggtgct gcggcggatc tcagcctcgt gccagcaccc gacagccttc gaggaagcca 1200 tacccaagtc cttcatgatc agcgcagaca tggcccatgc tgtgatccca actacctgga 1260 caagcatgag gagaaccacc ggcctttatt ccacaagggc cccgtgatca aggtgaacag 1320 caagcaacgc tatgcttcaa acgcggtgtc agaggccctg atccgagagg tggccaacaa 1380 agtcaaggtc cccctgcagg atctcatggt ccggaatgac accccctgtg gaaccaccat 1440 tggacctatc ttggcttctc ggctggggct gcgggtgctg gatttaggca gcccccaact 1500 ggccatgcac tctatccggg agatggcctg caccacagga gtcctccaga ccctcaccct 1560 cttcaagggc ttctttgagc tgttcccttc tctaagccat aatctcttag tggattgagc 1620 cctcttggaa agacttctct gccatccctt tgcacctgag aggggaagtt ctcagctgag 1680 ctgaagctgg attattaaag tggattgtca ctcagactct ccgtgtacgc ttatttggag 1740 actagaggag tgggagttga gcctggcttg aacctttgga accagaaaag ttggggagca 1800 ggtggaggag gccacactcc tgggagctga tggttttaaa tctggtttta aatctcatct 1860 ctgtctcaag tccatgtntg aagtgggtga agggtggact ggatcctcaa gcagaaggtc 1920 acttctccca cccctagtcc tccacctggg aaatggcctc aacggtcttc cctctttcca 1980 tccccagaat gggtgtcccg ctctgccttc agagatcct 2019 <210> 4 <211> 459 <212> PRT <213> HOMO SAPIENS <220> <223> UNKNOWN AMINO ACID <400> 4 VAL GLN THR ALA ALA LYS GLU LEU LEU LYS PHE VAL ASN ARG SER PRO 1 5 10 15 SER PRO PHE HIS ALA VAL ALA GLU CYS ARG ASN ARG LEU LEU GLN ALA 20 25 30 GLY PHE SER GLU LEU LYS GLU THR GLU LYS TRP ASN ILE LYS PRO GLU 35 40 45 SER LYS TYR PHE MET THR ARG ASN SER SER THR ILE ILE ALA PHE ALA 50 55 60 VAL GLY GLY GLN TYR VAL PRO GLY ASN GLY PHE SER SER SER GLY PRO 65 70 75 80 THR ARG THR ALA PRO ALA SER GLY XAA ASN VAL GLY LEU ALA ALA ALA 85 90 95 ARG TRP ALA SER SER LYS SER VAL TRP ARG PRO MET VAL VAL GLY SER 100 105 110 GLY ALA PRO GLY LEU THR VAL THR LEU THR LEU ALA GLY ARG VAL ILE 115 120 125 VAL LYS CYS PRO THR SER GLY ARG LEU GLU GLN GLN LEU VAL HIS VAL 130 135 140 GLU ARG PRO ILE LEU ARG ILE PRO HIS LEU ALA ILE HIS LEU GLN ARG 145 150 155 160 ASN ILE ASN GLU ASN PHE GLY PRO ASN THR GLU MET HIS LEU VAL PRO 165 170 175 ILE LEU ALA THR ALA ILE GLN GLU GLU LEU GLU LYS GLY THR PRO GLU 180 185 190 PRO GLY PRO LEU ASN ALA VAL ASP GLU ARG HIS HIS SER VAL LEU MET 195 200 205 SER LEU LEU CYS ALA HIS LEU GLY LEU SER GLN XAA TYR ILE VAL GLU 210 215 220 MET GLU LEU CYS LEU ALA ASP THR GLN PRO ALA VAL LEU GLY GLY ALA 225 230 235 240 TYR ASP GLU PHE ILE PHE ALA PRO ARG LEU ASP ASN LEU HIS SER CYS 245 250 255 PHE CYS ALA LEU GLN ALA LEU ILE ASP SER CYS ALA GLY PRO GLY SER 260 265 270 LEU ALA THR GLU PRO HIS VAL ARG MET VAL THR LEU TYR ASP ASN GLU 275 280 285 GLU VAL GLY SER GLU SER ALA GLN GLY ALA GLN SER LEU LEU THR ASP 290 295 300 ALA GLY ALA ALA ALA ASP LEU SER LEU VAL PRO ALA PRO ASP SER LEU 305 310 315 320 ARG GLY SER HIS THR GLN VAL LEU HIS ASP GLN ARG ARG HIS GLY PRO 325 330 335 CYS CYS ASP PRO ASN TYR LEU ASP LYS HIS GLU GLU ASN HIS ARG PRO 340 345 350 LEU PHE HIS LYS GLY PRO VAL ILE LYS VAL ASN SER LYS GLN ARG TYR 355 360 365 ALA SER ASN ALA VAL SER GLU ALA LEU ILE ARG GLU VAL ALA ASN LYS 370 375 380 VAL LYS VAL PRO LEU GLN ASP LEU MET VAL ARG ASN ASP THR PRO CYS 385 390 395 400 GLY THR THR ILE GLY PRO ILE LEU ALA SER ARG LEU GLY LEU ARG VAL 405 410 415 LEU ASP LEU GLY SER PRO GLN LEU ALA MET HIS SER ILE ARG GLU MET 420 425 430 ALA CYS THR THR GLY VAL LEU GLN THR LEU THR LEU PHE LYS GLY PHE 435 440 445 PHE GLU LEU PHE PRO SER LEU SER HIS ASN LEU 450 455 <210> 5 <211> 1637 <212> DNA <213> MUS MUSCULUS <400> 5 cggcacgatt cggcaaaact gggtggaggt cctcttgccc tgggactgaa cctttgagcc 60 gagagcagat cgagctagga atccacatct gtcgccagtg aagtcctcgg agagcagaga 120 tggctatgaa cggcagggct cggaaagagg ccatccaggc atcagcccga gagctcctga 180 agttcgtgaa ccggagtccc tctcctttcc acgtcgtggc tgagtgccgc agccgcctcc 240 tccaggctgg cttccgtgaa ctcaaggaaa cagagggctg ggatatcgta ccagaaaaca 300 agtacttctt aaccagaaac tcctcctcca tcattgcttt tgctgtgggg ggccagtatg 360 ttcctggcaa tggcttcagc ctcattgggg cccacacgga cagtccctgt ctcagggtga 420 aacgcaaatc gcgccgaagc caggtgggct accaccaggt cggtgttgag acctacggcg 480 gtgggatctg gagcacatgg ttcgaccggg acctgacctt ggctggacgc gtcattatca 540 agtgccctac ctcaggccgg ctggagcaga ggctcgtcca tatagaacgg cccatcctgc 600 gcatcccaca tctggccatc catctgcagc gaaatatcaa tgagaacttt gggcccaaca 660 cagagatcca cctagtccct attcttgcca cagcagttca ggaagagctg gagaaaggga 720 ctcctgaacc agggcctctc ggtgccactg atgagcggca ccactcggtc ctcatgtccc 780 tgctctgtac ccatctgggc ctgagtcctg acagcatcat ggagatggag ctctgcctgg 840 cagacaccca gcctgcagtc ctgggtggag cctatgaaga gttcatcttc gctcctcgac 900 tggacaatct gcacagctgc ttctgtgccc tgcaggcatt gattgattcc tgtgcatccc 960 ctgcctctct ggccagggat ccacatgtgc gcatggtcac actctacgac aatgaagagg 1020 tggggtcaga gagtgcacaa ggagcacagt ccctgctgac ggagctgata ctacggcgca 1080 tctcagcctc acctcagcgt ctgactgcct tcgaggaagc catacctaag tccttcatga 1140 tcagtgcaga catggcccat gctgtgcacc caaactactc ggacaagcat gaagaaaacc 1200 accggccttt gttccataag ggtcctgtga tcaaggtgaa cagcaagcag cgctacgcct 1260 ctaatgcagt gtctgagtcc atgattcgag aggtggctgg ccaagttggg gtgcccctgc 1320 aggacctcat ggtcaggaat gactccccgt gtggtaccac cattggacct atcttggctt 1380 ctcgactggg gcttcgggtg ctggacttag gcagccccca actggctatg cactctatcc 1440 gggagacagc ctgtaccact ggagttctcc agaccctcac ccttttcaag ggcttctttg 1500 agctgttccc ttctgtaagc cggaacctct tagtggactg aggcctctcg ccaagagttg 1560 tcttccaccc ctttgcaatt gagaggggag gatctcagtt tcgctgatgt tggattatta 1620 aagtagattt tcactcc 1637 <210> 6 <211> 471 <212> PRT <213> MUS MUSCULUS <400> 6 MET ASN GLY ARG ALA ARG LYS GLU ALA ILE GLN ALA SER ALA ARG GLU 1 5 10 15 LEU LEU LYS PHE VAL ASN ARG SER PRO SER PRO PHE HIS VAL VAL ALA 20 25 30 GLU CYS ARG SER ARG LEU LEU GLN ALA GLY PHE ARG GLU LEU LYS GLU 35 40 45 THR GLU GLY TRP ASP ILE VAL PRO GLU ASN LYS TYR PHE LEU THR ARG 50 55 60 ASN SER SER SER ILE ILE ALA PHE ALA VAL GLY GLY GLN TYR VAL PRO 65 70 75 80 GLY ASN GLY PHE SER LEU ILE GLY ALA HIS THR ASP SER PRO CYS LEU 85 90 95 ARG VAL LYS ARG LYS SER ARG ARG SER GLN VAL GLY TYR HIS GLN VAL 100 105 110 GLY VAL GLU THR TYR GLY GLY GLY ILE TRP SER THR TRP PHE ASP ARG 115 120 125 ASP LEU THR LEU ALA GLY ARG VAL ILE ILE LYS CYS PRO THR SER GLY 130 135 140 ARG LEU GLU GLN ARG LEU VAL HIS ILE GLU ARG PRO ILE LEU ARG ILE 145 150 155 160 PRO HIS LEU ALA ILE HIS LEU GLN ARG ASN ILE ASN GLU ASN PHE GLY 165 170 175 PRO ASN THR GLU ILE HIS LEU VAL PRO ILE LEU ALA THR ALA VAL GLN 180 185 190 GLU GLU LEU GLU LYS GLY THR PRO GLU PRO GLY PRO LEU GLY ALA THR 195 200 205 ASP GLU ARG HIS HIS SER VAL LEU MET SER LEU LEU CYS THR HIS LEU 210 215 220 GLY LEU SER PRO ASP SER ILE MET GLU MET GLU LEU CYS LEU ALA ASP 225 230 235 240 THR GLN PRO ALA VAL LEU GLY GLY ALA TYR GLU GLU PHE ILE PHE ALA 245 250 255 PRO ARG LEU ASP ASN LEU HIS SER CYS PHE CYS ALA LEU GLN ALA LEU 260 265 270 ILE ASP SER CYS ALA SER PRO ALA SER LEU ALA ARG ASP PRO HIS VAL 275 280 285 ARG MET VAL THR LEU TYR ASP ASN GLU GLU VAL GLY SER GLU SER ALA 290 295 300 GLN GLY ALA GLN SER LEU LEU THR GLU LEU ILE LEU ARG ARG ILE SER 305 310 315 320 ALA SER PRO GLN ARG LEU THR ALA PHE GLU GLU ALA ILE PRO LYS SER 325 330 335 PHE MET ILE SER ALA ASP MET ALA HIS ALA VAL HIS PRO ASN TYR SER 340 345 350 ASP LYS HIS GLU GLU ASN HIS ARG PRO LEU PHE HIS LYS GLY PRO VAL 355 360 365 ILE LYS VAL ASN SER LYS GLN ARG TYR ALA SER ASN ALA VAL SER GLU 370 375 380 SER MET ILE ARG GLU VAL ALA GLY GLN VAL GLY VAL PRO LEU GLN ASP 385 390 395 400 LEU MET VAL ARG ASN ASP SER PRO CYS GLY THR THR ILE GLY PRO ILE LEU ALA SER ARG LEU GLY LEU ARG VAL LEU ASP LEU GLY SER PRO GLN 420 425 430 LEU ALA MET HIS SER ILE ARG GLU THR ALA CYS THR THR GLY VAL LEU 435 440 445 GLN THR LEU THR LEU PHE LYS GLY PHE PHE GLU LEU PHE PRO SER VAL 450 455 460 SER ARG ASN LEU LEU VAL ASP 465 470
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 FI A61K 31/00 626 A61K 31/00 626 635 635 38/46 39/00 H 39/00 39/395 D 39/395 48/00 48/00 C07K 14/47 C07K 14/47 C12P 21/02 C C12P 21/02 C12Q 1/68 A C12Q 1/68 G01N 33/53 D G01N 33/53 C12N 9/48 // C12N 9/48 A61K 37/54 (72)発明者 クリストファー ディー.サザン イギリス国 シー エム19 5エー ダブ ル エセックス,ハーロウ サード アベ ニュー,ニュー フロンティアーズ サイ エンス パーク サウス スミス クライ ン ビーチャム ファーマシューティカル ズ (72)発明者 ニコラ バーゲス イギリス国 シー エム19 5エー ダブ ル エセックス,ハーロウ サード アベ ニュー,ニュー フロンティアーズ サイ エンス パーク サウス スミス クライ ン ビーチャム ファーマシューティカル ズ (72)発明者 コンラッド チャップマン イギリス国 シー エム19 5エー ダブ ル エセックス,ハーロウ サード アベ ニュー,ニュー フロンティアーズ サイ エンス パーク サウス スミス クライ ン ビーチャム ファーマシューティカル ズ

Claims (22)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 配列番号2または配列番号6の全長にわ
    たる配列番号2または配列番号6のアミノ酸配列に対し
    て少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含
    んでなる、単離されたポリペプチド。
  2. 【請求項2】 アミノ酸配列が少なくとも95%の同一
    性を有する、請求項1に記載のポリペプチド。
  3. 【請求項3】 配列番号2または配列番号6のアミノ酸
    配列を含んでなる、請求項1に記載のポリペプチド。
  4. 【請求項4】 配列番号2または配列番号6のアミノ酸
    配列からなる、単離されたポリペプチド。
  5. 【請求項5】 配列番号2または配列番号6の全長にわ
    たる配列番号2または配列番号6のアミノ酸配列に対し
    て少なくとも70%の同一性を有するポリペプチドをコ
    ードするヌクレオチド配列を含んでなる単離されたポリ
    ヌクレオチド、または該ポリヌクレオチドに相補的なヌ
    クレオチド配列からなるポリヌクレオチド。
  6. 【請求項6】 配列番号2または配列番号6のアミノ酸
    配列からなるポリペプチドをコードするヌクレオチド配
    列に対して少なくとも70%の同一性を有するヌクレオ
    チド配列を含んでなる単離されたポリヌクレオチド、ま
    たは該ポリヌクレオチドに相補的なヌクレオチド配列か
    らなるポリヌクレオチド。
  7. 【請求項7】 配列番号1または配列番号5の全長にわ
    たる配列番号1または配列番号5のヌクレオチド配列に
    対して少なくとも70%の同一性を有するヌクレオチド
    配列を含んでなる単離されたポリヌクレオチド、または
    該ポリヌクレオチドに相補的なヌクレオチド配列からな
    るポリヌクレオチド。
  8. 【請求項8】 前記の同一性が少なくとも95%であ
    る、請求項5〜7のいずれか1項に記載のポリヌクレオ
    チド。
  9. 【請求項9】 以下の(a)〜(c)から選択される単離され
    たポリヌクレオチド、または該ポリヌクレオチドに相補
    的なヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチド: (a) 配列番号2または配列番号6のアミノ酸配列からな
    るポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含んで
    なるポリヌクレオチド、 (b) 配列番号1または配列番号5のヌクレオチド配列か
    らなるポリヌクレオチド、および (c) 適当なライブラリーを、ストリンジェントなハイブ
    リダイゼーション条件下で、配列番号1もしくは配列番
    号5のヌクレオチド配列またはその断片を有する標識プ
    ローブを用いてスクリーニングすることにより得られる
    ポリヌクレオチド。
  10. 【請求項10】 下記発現系が適合性の宿主細胞内に存
    在するとき請求項1に記載のポリペプチドを産生し得る
    ポリヌクレオチドを含有する発現系。
  11. 【請求項11】 請求項10に記載の発現系を含有する
    宿主細胞、または請求項1に記載のポリペプチドを発現
    しているその膜。
  12. 【請求項12】 請求項1に記載のポリペプチドを産生
    させるのに十分な条件下で請求項11に記載の宿主細胞
    を培養し、この培養培地から該ポリペプチドを回収する
    ことを含んでなる、請求項1に記載のポリペプチドの生
    産方法。
  13. 【請求項13】 請求項1に記載のポリペプチドに対し
    て免疫特異的な抗体。
  14. 【請求項14】 請求項1に記載のポリペプチドの機能
    を刺激または抑制する化合物を同定するためのスクリー
    ニング法であって、 (a) 候補化合物と、該ポリペプチド(または該ポリペプ
    チドを担持している細胞もしくはその膜)またはその融
    合タンパク質と、の結合を、該候補化合物に直接または
    間接的に結合させた標識により測定すること、 (b) 候補化合物と、該ポリペプチド(または該ポリペプ
    チドを担持している細胞もしくはその膜)またはその融
    合タンパク質と、の結合を、標識競合物質の存在下で測
    定すること、 (c) 候補化合物が該ポリペプチドの活性化または抑制に
    より生ずるシグナルをもたらすか否かを、該ポリペプチ
    ドを担持している細胞または細胞膜に適した検出系を用
    いて調べること、 (d) 候補化合物と、請求項1に記載のポリペプチドを含
    有する溶液と、を一緒にして混合物を調製し、該混合物
    中の該ポリペプチドの活性を測定し、該混合物の活性を
    スタンダードと比較すること、および (e) 候補化合物が細胞における該ポリペプチドをコード
    するmRNAおよび該ポリペプチドの産生に及ぼす効果
    を検出すること、よりなる群から選択される方法を含ん
    でなるスクリーニング法。
  15. 【請求項15】 請求項1〜4のいずれか1項に記載の
    ポリペプチドに対するアゴニストまたはアンタゴニス
    ト。
  16. 【請求項16】 治療に用いるための以下の(a)〜(c)か
    ら選択される化合物: (a) 請求項1〜4のいずれか1項に記載のポリペプチド
    に対するアゴニストまたはアンタゴニスト、 (b) 請求項5〜9のいずれか1項に記載のポリヌクレオ
    チド、および (c) 請求項1に記載のポリペプチドをコードするヌクレ
    オチド配列の発現をモジュレートする核酸分子。
  17. 【請求項17】 被験者における請求項1に記載のポリ
    ペプチドの発現または活性に関連した疾病または該疾病
    への罹りやすさを検査する方法であって、 (a) 該被験者のゲノム内の該ポリペプチドをコードする
    ヌクレオチド配列に突然変異があるか否かを調べるこ
    と、および/または(b) 該被験者から得られたサンプル
    における該ポリペプチド発現の存在または量を分析する
    こと、を含んでなる方法。
  18. 【請求項18】 以下の(a)〜(d)から選択される単離さ
    れたポリヌクレオチド: (a) 配列番号3の全長にわたる配列番号3のヌクレオチ
    ド配列に対して少なくとも70%の同一性を有するヌク
    レオチド配列を含んでなるポリヌクレオチド、 (b) 配列番号3のヌクレオチド配列を含んでなるポリヌ
    クレオチド、 (c) 配列番号3のヌクレオチド配列からなるポリヌクレ
    オチド、および (d) 配列番号4の全長にわたる配列番号4のアミノ酸配
    列に対して少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸
    配列からなるポリペプチドをコードするヌクレオチド配
    列を含んでなるポリヌクレオチド。
  19. 【請求項19】 以下の(a)〜(e)から選択される単離さ
    れたポリペプチド: (a) 配列番号4の全長にわたる配列番号4のアミノ酸配
    列に対して少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸
    配列を含んでなるポリペプチド、 (b) アミノ酸配列が配列番号4の全長にわたる配列番号
    4のアミノ酸配列に対して少なくとも70%の同一性を
    有するポリペプチド、 (c) 配列番号4のアミノ酸配列を含んでなるポリペプチ
    ド、 (d) 配列番号4のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
    および (e) 配列番号3に含まれるヌクレオチド配列を含んでな
    るポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチド。
  20. 【請求項20】 以下の(a)または(b)の単離されたポリ
    ペプチド: (a) 配列番号2のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
    または(b) 配列番号2のアミノ酸配列において、少なく
    とも1個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたア
    ミノ酸配列からなり、かつMETPRO 02活性を有するポリ
    ペプチド。
  21. 【請求項21】 請求項20に記載のポリペプチドをコ
    ードするポリヌクレオチド。
  22. 【請求項22】 以下の(a)または(b)の単離されたポリ
    ヌクレオチド: (a) 配列番号1のヌクレオチド配列からなるポリヌクレ
    オチド、または(b) (a) のポリヌクレオチドとストリン
    ジェントな条件下でハイブリダイズしかつMETPRO 02活
    性を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチ
    ド。
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