정의
달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 기술과학 용어는 본 발명이 속하는 분야에 일반적으로 사용되는 바와 동일한 의미를 갖는다. 본원을 해석하기 위해서, 하기의 정의를 적용하며 적합한 경우에는 단수로 사용된 용어가 복수를 또한 포함할 것이며 이의 역도 마찬가지이다.
본원에 사용되는 바와 같이, "항원 결합 분자"란 용어는 이의 가장 넓은 의미로, 항원 결정 인자에 특이적으로 결합하는 분자를 지칭한다. 항원 결합 분자의 예는 항체, 항체 단편 및 스캐폴드(scaffold) 항원 결합 단백질이다.
본원에서 "항체"란 용어는 가장 넓은 의미로 사용되며 다양한 항체 구조물, 예를 들어 비제한적으로 단클론 항체, 다클론 항체, 단일특이적 및 다중특이적 항체(예를 들어 이중특이적 항체), 및 항체 단편(목적하는 항원 결합 활성을 나타내는 한)을 포함한다.
본원에 사용되는 바와 같은 "단클론 항체"란 용어는 실질적으로 동종인 항체의 집단으로부터 수득되는 항체를 지칭한다, 즉 상기 집단을 포함하는 개별적인 항체가, 가능한 변이체 항체, 예를 들어 천연 돌연변이를 함유하거나 단클론 항체 제제의 생산 동안 발생하는 항체(상기와 같은 변이체는 일반적으로 소량으로 존재한다)를 제외하고, 동일하고/하거나 동일한 에피토프에 결합한다. 전형적으로 상이한 결정 인자(에피토프)를 향하는 상이한 항체를 포함하는 다클론 항체 제제와 대조적으로, 단클론 항체 제제의 각각의 단클론 항체는 항원 상의 단일의 결정 인자를 향한다.
본원에 사용되는 바와 같은 "단일특이적" 항체란 용어는 각각의 결합 부위가 동일한 항원의 동일한 에피토프에 결합하는 하나 이상의 상기 결합 부위를 갖는 항체를 나타낸다. "이중특이적"이란 용어는 항원 결합 분자가 2개 이상의 별개의 항원 결정 인자에 특이적으로 결합할 수 있음을 의미한다. 전형적으로, 이중특이적 항원 결합 분자는 2개의 항원 결합 부위를 포함하며, 이들은 각각 상이한 항원 결정 인자에 특이적이다. 일부 실시양태에서, 상기 이중특이적 항원 결합 분자는 2개의 항원 결정 인자, 특히 2개의 별개의 세포상에서 발현된 2개의 항원 결정 인자에 동시에 결합할 수 있다.
본원 내에 사용되는 바와 같은 "결합가"란 용어는 항원 결합 분자에서 하나 명시된 수의 결합 부위의 존재를 나타낸다. 이와 같이, "이가", "사가" 및 "육가"란 용어는 항원 결합 분자에서 각각 2개의 결합 부위, 4개의 결합 부위 및 6개의 결합 부위의 존재를 나타낸다.
"전장 항체", "완전 항체" 및 "전체 항체"란 용어는 본원에서 천연 항체 구조와 실질적으로 유사한 구조를 갖는 항체를 지칭하는 데 호환적으로 사용된다. "천연 항체"는 다양한 구조를 갖는 천연 면역 글로불린 분자를 지칭한다. 예를 들어, 천연 IgG-클래스 항체는 다이설파이드-결합되는 2개의 경쇄 및 2개의 중쇄로 구성된, 약 150,000 달톤의 이종사량체성 당단백질이다. N-말단에서부터 C-말단까지, 각각의 중쇄는 가변 영역(VH)(또한 가변 중쇄 도메인 또는 중쇄 가변 도메인이라 칭한다)에 이어서 3개의 불변 도메인(CH1, CH2 및 CH3)(또한 중쇄 불변 영역이라 칭한다)을 갖는다. 유사하게, N-말단에서부터 C-말단까지, 각각의 경쇄는 가변 영역(VL)(또한 가변 경쇄 도메인 또는 경쇄 가변 도메인이라 칭한다)에 이어서 경쇄 불변 도메인(CL)(또한 경쇄 불변 영역이라 칭한다)을 갖는다. 항체의 중쇄는 α(IgA), δ(IgD), ε(IgE), γ(IgG) 또는 μ(IgM)라 칭하는 5가지 유형 중 하나로 할당될 수 있으며, 이들 중 일부는 하위 유형, 예를 들어 γ1(IgG1), γ2(IgG2), γ3(IgG3), γ4(IgG4), α1(IgA1) 및 α2(IgA2)로 추가로 분류될 수 있다. 항체의 경쇄는 이의 불변 도메인의 아미노산 서열을 근거로, 카파(κ) 및 람다(λ)라 칭하는 2가지 유형 중 하나로 배정될 수 있다.
"항체 단편"은 완전 항체가 결합하는 항원에 결합하는 상기 완전 항체의 일부를 포함하는 상기 완전 항체 이외의 분자를 지칭한다. 항체 단편의 예는 비제한적으로 Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; 다이아바디, 트라이아바디, 테트라바디, 크로스-Fab 단편; 선형 항체; 단쇄 항체 분자(예를 들어 scFv); 및 단일 도메인 항체를 포함한다. 일부 항체 단편의 리뷰를 위해서, 문헌[Hudson et al., Nat Med 9, 129-134 (2003)]을 참조한다. scFv 단편의 리뷰를 위해서, 예를 들어 문헌[Pluckthun, in The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, vol. 113, Rosenburg and Moore eds., Springer-Verlag, New York, pp. 269-315 (1994)]을 참조한다; 또한 WO 93/16185; 및 미국특허 제5,571,894호 및 미국특허 제5,587,458호를 참조한다. 구조 수용체 결합 에피토프 잔기를 포함하고 증가된 생체내 반감기를 갖는 Fab 및 F(ab')2 단편에 대한 논의에 대해서, 미국특허 제5,869,046호를 참조한다. 다이아바디는 이가이거나 이중특이적일 수 있는 2개의 항원 결합 부위를 갖는 항체 단편이고, 예를 들어 EP 0 404 097; WO 1993/01161; 문헌[Hudson et al., Nat Med 9, 129-134 (2003)]; 및 문헌[Hollinger et al., Proc Natl Acad Sci USA 90, 6444-6448 (1993)]을 참조한다. 트라이아바디 및 테트라바디가 또한 문헌[Hudson et al., Nat. Med. 9, 129-134(2003)]에 개시되어 있다. 단일-도메인 항체는 항체의 중쇄 가변 도메인의 일부 또는 전부 또는 경쇄 가변 도메인의 일부 또는 전부를 포함하는 항체 단편이다. 특정 실시양태에서, 단일-도메인 항체는 인간 단일-도메인 항체이다(도맨티스 인코포레이티드(Domantis, Inc., 미국 매사추세츠주 월탐 소재); 예를 들어 미국특허 제6,248,516 B1호를 참조한다). 항체 단편을 본 발명에 개시된 바와 같은 다양한 기법, 예를 들어 비제한적으로 완전 항체의 단백질분해 절단뿐만 아니라 재조합 숙주 세포(예를 들어 에스케리키아 콜라이(Eschericia coli) 또는 파지)에 의한 생산에 의해 생산할 수 있다.
완전 항체의 파파인 절단은, 각각 중쇄 및 경쇄 가변 도메인 및 또한 상기 경쇄의 불변 도메인 및 상기 중쇄의 제1 불변 도메인(CH1)을 함유하는, "Fab" 단편이라 칭하는 2개의 동일한 항원 결합 단편을 생산한다. 따라서, 본원에 사용되는 바와 같이, "Fab 단편"이란 용어는 경쇄의 VL 도메인 및 불변 도메인(CL), 및 중쇄의 VH 도메인 및 제1 불변 도메인(CH1)을 포함하는 경쇄 단편을 포함하는 항체 단편을 지칭한다. Fab' 단편은 중쇄 CH1 도메인의 카복시 말단에 항체 힌지 영역으로부터의 하나 이상의 시스테인을 포함하는 소수의 잔기의 첨가에 의해 Fab 단편과 상이하다. Fab'-SH는 불변 도메인의 시스테인 잔기가 유리 티올 기를 갖는 Fab' 단편이다. 펩신 처리는 2개의 항원 결합 부위(2개의 Fab 단편) 및 Fc 영역의 일부를 갖는 F(ab')2 단편을 제공한다.
"크로스-Fab 단편" 또는 "xFab 단편" 또는 "크로스오버 Fab 단편"이란 용어는 중쇄 및 경쇄의 가변 영역 또는 불변 영역이 교환되는 Fab 단편을 지칭한다. 크로스오버 Fab 분자의 2개의 상이한 쇄 조성이 가능하며 이는 본 발명의 이중특이적 항체에 포함된다: 한편으로, Fab 중쇄 및 경쇄의 가변 영역이 교환된다, 즉 크로스오버 Fab 분자는 경쇄 가변 영역(VL) 및 중쇄 불변 영역(CH1)으로 구성된 펩티드 쇄, 및 중쇄 가변 영역(VH) 및 경쇄 불변 영역(CL)으로 구성된 펩티드 쇄를 포함한다. 크로스오버 Fab 분자를 또한 CrossFab(VLVH)라 칭한다. 다른 한편으로, Fab 중쇄 및 경쇄의 불변 영역이 교환될 때, 크로스오버 Fab 분자는 중쇄 가변 영역(VH) 및 경쇄 불변 영역(CL)으로 구성된 펩티드 쇄, 및 경쇄 가변 영역(VL) 및 중쇄 불변 영역(CH1)으로 구성된 펩티드 쇄를 포함한다. 크로스오버 Fab 분자를 또한 CrossFab(CLCH1)라 칭한다.
"단쇄 Fab 단편" 또는 "scFab"는 항체 중쇄 가변 도메인(VH), 항체 불변 도메인 1(CH1), 항체 경쇄 가변 도메인(VL), 항체 경쇄 불변 도메인(CL) 및 링커로 이루어지는 폴리펩티드며, 여기에서 상기 항체 도메인 및 상기 링커는 N-말단에서 C-말단 방향으로 하기의 순서 중 하나를 갖는다: a) VH-CH1-링커-VL-CL, b) VL-CL-링커-VH-CH1, c) VH-CL-링커-VL-CH1 또는 d) VL-CH1-링커-VH-CL; 여기에서 상기 링커는 30개 이상의 아미노산, 바람직하게는 32 내지 50개의 아미노산의 폴리펩티드다. 상기 단쇄 Fab 단편은 상기 CL 도메인과 CH1 도메인 사이의 천연 다이설파이드 결합을 통해 안정화된다. 또한, 이들 단쇄 Fab 분자는 시스테인 잔기의 삽입(예를 들어 카바트 넘버링에 따른 가변 중쇄의 위치 44 및 가변 경쇄의 위치 100)을 통해 쇄간 다이설파이드 결합의 생성에 의해 추가로 안정화될 수도 있다.
"크로스오버 단쇄 Fab 단편" 또는 "x-scFab"는 항체 중쇄 가변 도메인(VH), 항체 불변 도메인 1(CH1), 항체 경쇄 가변 도메인(VL), 항체 경쇄 불변 도메인(CL) 및 링커로 이루어지는 폴리펩티드며, 여기에서 상기 항체 도메인 및 상기 링커는 N-말단에서 C-말단 방향으로 하기의 순서 중 하나를 갖는다: a) VH-CL-링커-VL-CH1, 및 b) VL-CH1-링커-VH-CL; 여기에서 VH 및 VL은 함께 항원에 특이적으로 결합하는 항원 결합 부위를 형성하고, 여기에서 상기 링커는 30개 이상의 아미노산의 폴리펩티드이다. 또한, 이들 x-scFab 분자는 시스테인 잔기의 삽입(예를 들어 카바트 넘버링에 따른 가변 중쇄의 위치 44 및 가변 경쇄의 위치 100)을 통해 쇄간 다이설파이드 결합의 생성에 의해 추가로 안정화될 수도 있다.
"단쇄 가변 단편(scFv)"은 10 내지 약 25개의 아미노산의 짧은 링커 펩티드와 연결된, 항체의 중쇄(VH) 및 경쇄(VL)의 가변 영역의 융합 단백질이다. 링커는 대개 가요성을 위해 글리신이 풍부할 뿐만 아니라, 용해도를 위해서 세린 또는 트레오닌이 풍부하며, VH의 N-말단을 상기 VL의 C-말단과 연결시킬 수 있고, 이와 역으로 연결시킬 수도 있다. 상기 단백질은 불변 영역의 제거 및 링커의 도입에도 불구하고, 원래 항체의 특이성을 유지한다. scFv 항체는 예를 들어 문헌[Houston, J.S., Methods in Enzymol. 203 (1991) 46-96]에 기재되어 있다. 또한, 항체 단편은 기능성 항원 결합 부위에 대해, VH 도메인의 특징을 갖거나(즉 VL 도메인과 함께 조립될 수 있음) VL 도메인의 특징을 갖고(즉 VH 도메인과 함께 조립될 수 있음), 이에 따라 전장 항체의 항원 결합 특성을 제공할 수 있는 단쇄 폴리펩티드를 포함한다.
"스캐폴드 항원 결합 단백질"은 당분야에 공지되어 있으며, 예를 들어 피브로넥틴 및 설계된 안키린 반복 단백질(DARPin)이 항원 결합 도메인에 대한 대체 스캐폴드로서 사용되었다, 예를 들어 문헌[Gebauer and Skerra, Engineered protein scaffolds as next-generation antibody therapeutics. Curr Opin Chem Biol 13:245-255 (2009)] 및 문헌[Stumpp et al., Darpins: A new generation of protein therapeutics. Drug Discovery Today 13: 695-701 (2008)]을 참조한다. 본 발명의 하나의 양태에서, 스캐폴드 항원 결합 단백질은 CTLA-4(에비바디(Evibody)), 리포칼린(안티칼린(Anticalin)), 단백질 A-유래된 분자, 예를 들어 단백질 A의 Z-도메인(애피바디(Affibody)), A-도메인(애비머(Avimer)/맥시바디(Maxibody)), 혈청 트랜스페린(트랜스-바디); 설계된 안키린 반복 단백질(DARPin), 항체 경쇄 또는 중쇄의 가변 도메인(단일-도메인 항체, sdAb), 항체 중쇄의 가변 도메인(나노바디, VH), VNAR 단편, 피브로넥틴(애드넥틴(AdNectin)), C-유형 렉틴 도메인(테트라넥틴(Tetranectin)); 신규의 항원 수용체 베타-락타마제의 가변 도메인(VNAR 단편), 인간 감마-크리스탈린 또는 유비퀴틴(애필린(Affilin) 분자); 인간 프로테아제 억제제의 쿠니츠 유형 도메인, 마이크로바디, 예를 들어 크노틴과로부터의 단백질, 펩티드 앱타머 및 피브로넥틴(애드넥틴)으로 이루어지는 군 중에서 선택된다.
리포칼린은 작은 소수성 분자, 예를 들어 스테로이드, 빌린, 레티노이드 및 지질을 수송하는 세포외 단백질의 패밀리이다. 상기는 상이한 표적 항원에 결합하도록 조작될 수 있는 원추형 구조의 개방 단부에 다수의 루프를 갖는 강성의 베타-시트 2차 구조를 갖는다. 안티칼린은 160 내지 180 아미노산 크기이며 리포칼린으로부터 유래된다. 추가의 상세한 내용에 대해서 문헌[Biochim Biophys Acta 1482: 337-350 (2000)], US 7,250,297 B1 및 US 2007/0224633을 참조한다.
설계된 안키린 반복 단백질(DARPin)은 내재 막 단백질의 세포골격에 대한 부착을 매개하는 단백질의 패밀리인 안키린으로부터 유래된다. 단일 안키린 반복부는 2개의 알파-나선 및 베타-회전으로 이루어지는 33 잔기 모티프이다. 상기를 각 반복부의 제1 알파-나선 및 베타-회전 중의 잔기를 무작위화시킴으로써 상이한 표적 항원에 결합하도록 조작할 수 있다. 이들의 결합 접촉면은 모듈의 수를 증가시킴으로써 증가될 수 있다(친화도 성숙화 방법). 추가의 상세한 내용에 대해서 문헌[J. Mol. Biol. 332, 489-503 (2003), PNAS 100(4), 1700-1705 (2003)] 및 문헌[J. Mol. Biol. 369, 1015-1028 (2007)] 및 US 2004/0132028A1을 참조한다.
단일 도메인 항체는 단일 단량체성 가변 항체 도메인으로 이루어지는 항체 단편이다. 제1 단일 도메인은 카멜리드의 항체 중쇄의 가변 도메인으로부터 유래되었다(나노바디 또는 VHH 단편). 또한, 단일 도메인 항체란 용어는 자율적인 인간 중쇄 가변 도메인(aVH) 또는 상어로부터 유래된 VNAR 단편을 포함한다.
기준 분자와 "동일한 에피토프에 결합하는 항원 결합 분자"는 경쟁 분석에서 이의 항원에 대한 상기 기준 분자의 결합을 50% 이상만큼 차단하는 항원 결합 분자를 지칭한다, 환언하면 상기 기준 분자는 경쟁 분석에서 이의 항원에 대한 항원 결합 분자의 결합을 50% 이상만큼 차단한다.
"항원 결합 도메인"이란 용어는 항원의 일부 또는 전부에 특이적으로 결합하고 이에 상보성인 영역을 포함하는 항원 결합 분자의 부분을 지칭한다. 항원이 큰 경우, 항원 결합 분자는 단지 상기 항원의 특정 부분에만 결합할 수 있으며, 상기 부분을 에피토프라 칭한다. 항원 결합 도메인은 예를 들어 하나 이상의 가변 도메인(또한 가변 영역이라 칭한다)에 의해 제공될 수 있다. 바람직하게, 항원 결합 도메인은 항체 경쇄 가변 영역(VL) 및 항체 중쇄 가변 영역(VH)을 포함한다.
본원에 사용되는 바와 같이, "항원 결정 인자"란 용어는 "항원" 및 "에피토프"와 유의어이며, 항원 결합 모이어티가 결합하여, 항원 결합 모이어티-항원 복합체를 형성하는 폴리펩티드 거대분자상의 부위(예를 들어 아미노산의 연속적인 신장부 또는 비-연속적인 아미노산의 상이한 영역으로 구성된 입체형태적 배열)를 지칭한다. 유용한 항원 결정 인자는 예를 들어 종양 세포의 표면 상에서, 바이러스-감염된 세포의 표면 상에서, 다른 병든 세포의 표면 상에서, 면역 세포의 표면 상에서, 혈청 및/또는 세포외 기질(ECM) 중에서 자유롭게 발견될 수 있다. 본원에서 항원으로서 유용한 단백질은 달리 표시되지 않는 한, 임의의 척추동물 공급원, 예를 들어 포유동물, 예를 들어 영장류(예를 들어 인간) 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)로부터의 임의의 천연 형태의 단백질일 수 있다. 특정한 실시양태에서, 상기 항원은 인간 단백질이다. 본원에서 특정한 단백질을 참조하는 경우, 상기 용어는 "전장"의 가공되지 않은 단백질뿐만 아니라, 세포 중에서의 가공으로부터 생성되는 임의의 형태의 단백질을 포함한다. 상기 용어는 또한 상기 단백질의 천연 변이체, 예를 들어 스플라이스 변이체 또는 대립유전자 변이체를 포함한다.
"특이적 결합"은 결합이 항원에 대해 선택성이며 불필요하거나 비-특이적인 상호작용과 구별될 수 있음을 의미한다. 특정한 항원에 결합하는 항원 결합 분자의 능력은 효소-결합된 면역흡수 분석(ELISA) 또는 당분야의 숙련가에게 친숙한 다른 기법, 예를 들어 표면 플라스몬 공명(SPR) 기법(비아코어(BIAcore) 장비 상에서 분석된다)(문헌[Liljeblad et al., Glyco J 17, 323-329 (2000)]), 및 전통적인 결합 분석(문헌[Heeley, Endocr Res 28, 217-229 (2002)])을 통해 측정될 수 있다. 하나의 실시양태에서, 관련되지 않은 단백질에 대한 항원 결합 분자의 결합 정도는 예를 들어 SPR에 의해 측정되는 바와 같이 항원에 대한 항원 결합 분자의 결합의 약 10% 미만이다. 일부 실시양태에서, 항원에 결합하는 분자는 ≤1 μM, ≤100 nM, ≤10 nM, ≤1 nM, ≤0.1 nM, ≤0.01 nM, 또는 ≤0.001 nM(예를 들어 10-8 M 이하, 예를 들어 10-8 M 내지 10-13 M, 예를 들어 10-9 M 내지 10-13 M)의 해리 상수(Kd)를 갖는다.
"친화도" 또는 "결합 친화도"는 분자(예를 들어 항체)의 단일 결합 부위와 이의 결합 짝(예를 들어 항원)간의 비-공유 상호작용의 총 합의 강도를 지칭한다. 달리 표시되지 않는 한, 본원에 사용되는 바와 같이, "결합 친화도"는 결합 쌍의 구성원(예를 들어 항체와 항원)간의 1:1 상호작용을 반영하는 천연의 결합 친화도를 지칭한다. 분자 X의 이의 짝 Y에 대한 친화도를 일반적으로 해리 상수(Kd)에 의해 나타낼 수 있으며, 상기 상수는 해리속도 및 결합속도 상수(각각 koff 및 kon)의 비이다. 따라서, 균등한 친화도는 상기 속도 상수의 비가 동일하게 남아있는 한 상이한 속도 상수를 포함할 수도 있다. 친화도를 본원에 기재된 것을 포함하여 당분야에 공지된 통상적인 방법에 의해 측정할 수 있다. 친화도의 특정한 측정 방법은 표면 플라스몬 공명(SPR)이다.
"종양-연관된 항원(TAA)"이란 용어는 종양 세포에 의해 또는 종양 스트로마에서 고도로 발현되는 임의의 항원을 의미한다. 용어 "종양-연관된"은 TAA가 종양에 대해 완전히 특이적이지 않고, 오히려 종양 또는 이의 스트로마 상에서 과발현됨을 나타낸다. 특정 종양-연관된 항원은 CEA 또는 FAP뿐만 아니라, 다른 표적, 예컨대 폴레이트 수용체(FolR1), MCSP, EGFR 패밀리(HER2, HER3 및 EGFR/HER1), VEGFR, CD20, CD19, CD22, CD33, PD1, PD-L1, TenC, EpCAM, PSA, PSMA, STEAP1, MUC1(CA15-3) MUC16(CA125) 및 5T4(영양세포 당단백질)이다. 특정 TAA는 FAP, CEA 및 FolR1을 포함한다.
용어 "섬유아세포 활성화 단백질(FAP)"(프롤릴 엔도펩티다제 FAP 또는 세프라제(EC 3.4.21)로도 공지됨)은, 달리 지시되지 않는 한, 포유동물, 예컨대 영장류(예를 들어 인간), 비-인간 영장류(예를 들어 시노몰구스 원숭이) 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)를 포함하는 임의의 척추동물 공급원으로부터의 임의의 천연 FAP를 지칭한다. 상기 용어는 "전장"의 처리되지 않은 FAP, 및 세포에서의 처리로부터 야기된 임의의 형태의 FAP를 포괄한다. 상기 용어는 또한 FAP의 천연 변이체, 예를 들어 스플라이스 변이체 또는 대립유전자 변이체를 포괄한다. 한 실시양태에서, 본 발명의 항원 결합 분자는 인간, 마우스 및/또는 시노몰구스 FAP에 특이적으로 결합할 수 있다. 인간 FAP의 아미노산 서열은 UniProt(www.uniprot.org) 등록번호 Q12884(버전 149, 서열번호 120), 또는 NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov/) RefSeq NP_004451.2에 나타나 있다. 인간 FAP의 세포외 도메인(ECD)은 아미노산 위치 26에서 760까지이다. His-태그된 인간 FAP ECD의 아미노산 서열은 서열번호 121에 나타나 있다. 마우스 FAP의 아미노산 서열은 UniProt 등록번호 P97321(버전 126, 서열번호 122), 또는 NCBI RefSeq NP_032012.1에 나타나 있다. 마우스 FAP의 세포외 도메인(ECD)은 아미노산 위치 26에서 761까지이다. 서열번호 123는 His-태그된 마우스 FAP ECD의 아미노산 서열을 나타낸다. 서열번호 124는 His-태그된 시노몰구스 FAP ECD의 아미노산 서열을 나타낸다. 바람직하게는, 본 발명의 항-FAP 결합 분자는 FAP의 세포외 도메인에 결합한다. 예시적인 항-FAP 결합 분자는 WO 2012/020006 A2에 기재되어 있다.
"암배아 항원(CEA)"(암배아 항원-관련된 세포 부착 분자 5(CEACAM5)로도 공지됨)이란 용어는, 달리 지시되지 않는 한, 포유동물, 예컨대 영장류(예를 들어 인간), 비-인간 영장류(예를 들어 시노몰구스 원숭이) 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)를 포함하는 임의의 척추동물 공급원으로부터의 임의의 천연 CEA를 지칭한다. 인간 CEA의 아미노산 서열은 유니프롯 등록번호 P06731(버전 151, 서열번호 125)에 나타나 있다. CEA는 오랫동안 종양-연관된 항원으로 확인되어 왔다(문헌[Gold and Freedman, J Exp Med., 121:439-462, 1965]; [Berinstein N. L., J Clin Oncol., 20:2197-2207, 2002]). 태아 조직에서만 발현되는 단백질로 당초에 분류되었던 CEA는 현재는 여러 정상 성인 조직에서 확인되었다. 이들 조직은 위장관, 기도 및 비뇨생식로의 세포, 및 결장, 자궁경부, 땀샘 및 전립선의 세포를 포함하는, 일차 상피 기원의 것이다(문헌[Nap et al., Tumour Biol., 9(2-3):145-53, 1988]; [Nap et al., Cancer Res., 52(8):2329-23339, 1992]). 상피 기원의 종양 및 이의 전이는 CEA를 종양-연관된 항원으로서 함유한다. CEA 존재 자체는 암 세포로의 전환을 의미하지 않고, CEA의 분포가 나타낸다. 정상 조직에서, CEA는 일반적으로 세포의 선단 표면 상에 발현되고(문헌[Hammarstrom S., Semin Cancer Biol. 9(2):67-81 (1999)]), 이는 혈류에서 항체에 대한 접근을 어렵게 만든다. 정상 조직과 대조적으로, CEA는 암 세포의 전체 표면에 걸쳐 발현되는 경향이 있다(문헌[Hammarstrom S., Semin Cancer Biol. 9(2):67-81 (1999)]). 이러한 발현 패턴의 차이는 CEA가 암 세포에서 항체 결합에 대해 접근가능하도록 만든다. 또한, CEA 발현은 암 세포에서 증가한다. 또한, 증가된 CEA 발현은 증가된 세포간 부착을 촉진하고, 이는 전이를 야기할 수 있다(문헌[Marshall J., Semin Oncol., 30(a Suppl. 8):30-6, 2003]). 다양한 종양 독립체에서 CEA 발현의 유병률은 일반적으로 매우 높다. 공개된 데이터에 따라, 조직 샘플에서 수행된 자체 연구는 이의 매우 높은 유병률을 확인시켜주었고, 대장암(CRC)에서 약 95%, 췌장암에서 90%, 위암에서 80%, 비-소세포 폐암(NSCLC, 여기서, 이는 HER3와 공동-발현된다)에서 60%, 및 유방암에서 40%였고; 낮은 발현은 소세포 폐암 및 교아종에서 관찰되었다.
CEA는 용이하게 세포 표면으로부터 절단되고 직접 또는 림프관을 통해 종양으로부터 혈류 내로 떨어진다. 이러한 특성 때문에, 혈청 CEA의 수준은 암의 진단 및 암, 특히 대장암 재발의 스크리닝을 위한 임상적 마커로서 사용되어 왔다(문헌[Goldenberg D M., The International Journal of Biological Markers, 7:183-188, 1992]; [Chau I., et al., J Clin Oncol., 22:1420-1429, 2004]; [Flamini et al., Clin Cancer Res; 12(23):6985-6988, 2006]).
"FolR1"이라는 용어는 폴레이트 수용체 알파를 지칭하며, 많은 암의 잠재적 예후 및 치료 표적으로서 확인되었다. 이는, 달리 지시되지 않는 한, 포유동물, 예컨대 영장류(예를 들어 인간), 비-인간 영장류(예를 들어 시노몰구스 원숭이) 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)를 포함하는 임의의 척추동물 공급원으로부터의 임의의 천연 FolR1을 지칭한다. 인간 FolR1의 아미노산 서열은 유니프롯 등록번호 P15328(서열번호 126)에 나타나 있고, 뮤린 FolR1은 유니프롯 등록번호 P35846의 아미노산 서열(서열번호 127)을 가지며, 시노몰구스 FolR1은 유니프롯 등록번호 G7PR14에 나타낸 아미노산 서열(서열번호 128)을 갖는다. FolR1은 세포의 원형질 막 상에 발현되는 N-글리코실화된 단백질이다. FolR1은 폴산 및 여러 환원된 폴산 유도체에 대한 높은 친화도를 가지며, 생리학적 폴레이트(5-메틸테트라하이드로폴레이트)를 세포 내부로 전달하는 것을 조정한다. FOLR1은 FOLR1-유도된 암 요법에 대한 바람직한 표적인데, 이는 이것이 대다수의 난소암, 및 많은 자궁암, 자궁내막암, 췌장암, 신장암, 폐암 및 유방암에서 과발현되는 반면에, 정상 조직 상에서 FOLR1의 발현은 신장 근위 세뇨관, 폐의 폐포 세포, 방광, 고환, 맥락막망 및 갑상선의 상피 세포의 선단 막에 제한되기 때문이다. FolR1 발현이 삼중 음성 유방암에서 특히 높다는 최근 연구가 확인되었다(문헌[Necela et al. PloS One 2015, 10(3), e0127133]).
용어 "MCSP"는 흑색종-연관된 콘드로이틴 설페이트 프로테오글리칸(콘드로이틴 설페이트 프로테오글리칸 4(CSPG4)로도 공지됨)을 지칭한다. 이는, 달리 지시되지 않는 한, 포유동물, 예컨대 영장류(예를 들어 인간), 비-인간 영장류(예를 들어 시노몰구스 원숭이) 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)를 포함하는 임의의 척추동물로부터의 임의의 천연 FolR1을 지칭한다. 인간 MCSP의 아미노산 서열은 유니프롯 등록번호 Q6UVK1(서열번호 129)에 나타나 있다. MCSP는 세포 막 상에서 발현되는 N-연결된 280 kDa 당단백질 성분 및 450-kDa 콘드로이틴 설페이트 프로테오글리칸 성분으로 이루어진 고도로 글리코실화된 막 내재 콘드로이틴 설페이트 프로테오글리칸이다(문헌[Ross et al., Arch. Biochem. Biophys. 1983, 225:370-38]). MCSP는 많은 정상 세포 및 형질전환된 세포에 보다 넓게 분포된다. 특히, MCSP는 표피의 대부분 모든 기저 세포에서 발견되었다. MCSP는 흑색종 세포에서 상이하게 발현되고, 분석된 양성 모반 및 흑색종 중 90% 초과에서 발현된 것으로 밝혀졌다. 또한, MCSP는 기저 세포암을 포함하는 비멜라닌 세포 기원의 종양, 신경관 기원의 다양한 종양 및 유방암에서 발현되는 것으로 밝혀졌다.
본원에 사용된 "T 세포 항원"은 T 림프구, 특히 세포 독성 T 림프구의 표면 상에 제시되는 항원 결정인자를 지칭한다.
본원에 사용된 "T 세포 활성화 치료제"는 개체에서 T 세포 활성화를 유도할 수 있는 치료제, 특히 개체에서 T 세포 활성화를 유도하도록 설계된 치료제를 지칭한다. T 세포 활성화 치료제의 예는 활성화 T 세포 항원, 예컨대 CD3, 및 표적 세포 항원, 예컨대 CEA 또는 폴레이트 수용체에 특이적으로 결합하는 이중특이적 항체를 포함한다.
본원에 사용된 "활성화 T 세포 항원"은 T 림프구, 특히 세포 독성 T 림프구에 의해 발현되는 항원 결정인자를 지칭하고, 이는 항원 결합 분자와의 상호작용시 T 세포 활성화를 유도하거나 증진시킬 수 있다. 구체적으로, 항원 결합 분자와 활성화 T 세포 항원의 상호작용은 T 세포 수용체 복합체의 신호전달 캐스케이드를 촉발시킴으로써 T 세포 활성화를 유도할 수 있다. 예시적 활성화 T 세포 항원은 CD3이다.
"CD3"이라는 용어는, 달리 지시되지 않는 한, 포유동물, 예컨대 영장류(예를 들어 인간), 비-인간 영장류(예를 들어 시노몰구스 원숭이) 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)를 포함하는 임의의 척추동물 공급원으로부터의 임의의 천연 CD3을 지칭한다. 상기 용어는 "전장"의 가공되지 않은 CD3, 및 세포에서 가공으로부터 야기되는 임의의 형태의 CD3을 포괄한다. 또한, 상기 용어는 CD3의 자연 발생 변이체, 예를 들어 스플라이스 변이체 또는 대립유전자 변이체를 포괄한다. 한 실시양태에서, CD3은 인간 CD3, 특히 인간 CD3의 엡실론 서브유닛(CD3ε)이다. 인간 CD3ε의 아미노산 서열은 유니프롯(www.uniprot.org) 등록번호 P07766(버전 144), 또는 NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov/) RefSeq NP_000724.1에 나타나 있다. 또한, 서열번호 130을 참조한다. 시노몰구스[Macaca fascicularis] CD3ε의 아미노산 서열은 NCBI 유전자 은행 번호 BAB71849.1에 나타나 있다. 또한, 서열번호 131을 참조한다.
"가변 영역" 또는 "가변 도메인"이란 용어는 항원에 대한 항원 결합 분자의 결합에 관련된 항체 중쇄 또는 경쇄의 도메인을 지칭한다. 천연 항체의 중쇄 및 경쇄의 가변 도메인(각각 VH 및 VL)은 일반적으로 유사한 구조를 가지며, 이때 각 도메인은 4개의 보존된 골격 영역(FR) 및 3개의 초가변 영역(HVR)을 포함한다. 예를 들어 문헌[Kindt et al. Kuby Immunology, 6th ed., W.H. Freeman and Co., page 91 (2007)]을 참조한다. 단일의 VH 또는 VL 도메인이 항원 결합 특이성을 부여하기에 충분할 수 있다.
본원에 사용되는 바와 같은 "초가변 영역" 또는 "HVR"이란 용어는 서열이 초가변성이고/이거나 구조적으로 한정된 루프("초가변 루프")를 형성하는 항체 가변 도메인의 각 영역을 지칭한다. 일반적으로, 천연의 4-쇄 항체는 6개의 HVR; VH 중 3개(H1, H2, H3) 및 VL 중 3개(L1, L2, L3)를 포함한다. HVR은 일반적으로 상기 초가변 루프로부터 및/또는 "상보성 결정 영역"(CDR)으로부터의 아미노산 잔기를 포함하며, 후자는 최고의 서열 가변성을 갖고/갖거나 항원 인식에 관련된다. 예시적인 초가변 루프는 아미노산 잔기 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (H2), 및 96-101 (H3)에 존재한다. (문헌[Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)]). 예시적인 CDR(CDR-L1, CDR-L2, CDR-L3, CDR-H1, CDR-H2, 및 CDR-H3)은 L1의 24-34, L2의 50-56, L3의 89-97, H1의 31-35B, H2의 50-65, 및 H3의 95-102의 아미노산 잔기에 존재한다. (문헌[Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)]). 초가변 영역(HVR)은 또한 상보성 결정 영역(CDR)을 지칭하며, 이들 용어는 상기 항원 결합 영역을 형성하는 가변 영역의 부분을 참조하여 본원에서 호환적으로 사용된다. 상기 특정한 영역은 문헌[Kabat et al., U.S. Dept. of Health and Human Services, "Sequences of Proteins of Immunological Interest" (1983)] 및 문헌[Chothia et al., J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)]에 기재되었으며, 여기에서 정의는 서로에 대해 비교될 때 아미노산 잔기의 중복 또는 부분집합을 포함한다. 그럼에도 불구하고, 항체 또는 이의 변이체의 CDR을 지칭하기 위한 어느 한 정의의 적용은 본원에서 정의되고 사용되는 용어의 범위 내에 있도록 되어있다. 상기 인용된 각각의 참고문헌에 의해 정의되는 바와 같은 CDR을 포함하는 적합한 아미노산 잔기를 비교로서 하기 표 A에 제시한다. 특정한 CDR을 포함하는 정확한 잔기 숫자는 상기 CDR의 서열 및 크기에 따라 변할 것이다. 당분야의 숙련가는 어느 잔기가 상기 항체의 가변 영역 아미노산 서열을 제공한 특정한 CDR을 포함하는지를 통상적으로 결정할 수 있다.
[표 A]
CDR 정의1
카바트 등은 또한 임의의 항체에 적용할 수 있는 가변 영역 서열에 대한 넘버링 시스템을 한정한다. 당분야의 통상적인 숙련가는 상기 "카바트 넘버링" 시스템을 상기 서열 자체에서 벗어난 임의의 실험 데이터에 의존하지 않으면서 임의의 가변 영역 서열에 명확하게 할당할 수 있다. 본원에 사용되는 바와 같이, "카바트 넘버링"은 문헌[Kabat et al., U.S. Dept. of Health and Human Services, "Sequence of Proteins of Immunological Interest" (1983)]에 제시된 넘버링 시스템을 지칭한다. 달리 명시되지 않는 한, 항체 가변 영역 중의 특정한 아미노산 잔기 위치의 넘버링에 대한 참조는 상기 카바트 넘버링 시스템에 따른다.
VH의 CDR1을 제외하고, CDR은 일반적으로 초가변 루프를 형성하는 아미노산 잔기를 포함한다. CDR은 또한 항원과 접촉하는 잔기인 "특이적 결정 잔기" 또는 "SDR"을 포함한다. SDR은 약기된-CDR, 또는 a-CDR이라 칭하는 CDR의 영역 내에 함유된다. 예시적인 a-CDR(a-CDR-L1, a-CDR-L2, a-CDR-L3, a-CDR-H1, a-CDR-H2, 및 a-CDR-H3)은 L1의 31-34, L2의 50-55, L3의 89-96, H1의 31-35B, H2의 50-58, 및 H3의 95-102 아미노산 잔기에 존재한다. (문헌[Almagro and Fransson, Front. Biosci. 13:1619-1633 (2008)]을 참조한다). 달리 표시하지 않는 한, 가변 도메인의 HVR 잔기 및 다른 잔기(예를 들어 FR 잔기)를 본원에서 상기 카바트 등에 따라 넘버링한다.
본원에 사용된 바와 같이, 항원 결합 분자(예를 들어, 항체)에 있어서 "친화도 성숙된"이란 용어는, 기준 항원 결합 분자로부터 예를 들어 돌연변이에 의해 유래된 항원 결합 분자가 기준 항체와 동일한 항원, 바람직하게는 동일한 에피토프에 결합하고, 기준 항원 결합 분자의 것보다 높은 항원에 대한 친화도를 갖는 것을 지칭한다. 친화도 성숙은 일반적으로 항원 결합 분자의 하나 이상의 CDR의 하나 이상의 아미노산 잔기의 변형을 포함한다. 전형적으로, 친화도 성숙된 항원 결합 분자는 초기 기준 항원 결합 분자와 동일한 에피토프에 결합한다.
"골격" 또는 "FR"은 초가변 영역(HVR) 잔기 이외의 가변 도메인 잔기를 지칭한다. 가변 도메인의 FR은 일반적으로 4개의 FR 도메인, 즉 FR1, FR2, FR3 및 FR4로 이루어진다. 따라서, 상기 HVR 및 FR 서열은 일반적으로 VH(또는 VL)에서 하기의 순서로 존재한다: FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.
본원에 있어서 "수용자 인간 골격"은, 하기에 정의되는 인간 면역 글로불린 골격 또는 인간 컨센서스 골격으로부터 유래된 경쇄 가변 도메인(VL) 골격 또는 중쇄 가변 도메인(VH) 골격의 아미노산 서열을 포함하는 골격이다. 인간 면역 글로불린 골격 또는 인간 컨센서스 골격으로부터 "유래된" 수용자 인간 골격은 이의 동일한 아미노산 서열을 포함할 수 있거나, 이는 아미노산 서열 변화를 함유할 수 있다. 일부 실시양태에서, 아미노산 변화의 수는 10 이하, 9 이하, 8 이하, 7 이하, 6 이하, 5 이하, 4 이하, 3 이하 또는 2 이하이다. 일부 실시양태에서, VL 수용자 인간 골격은 VL 인간 면역 글로불린 골격 서열 또는 인간 컨센서스 골격 서열에 대한 서열과 동일하다.
"키메라" 항체란 용어는 중쇄 및/또는 경쇄의 일부가 특정 공급원 또는 종으로부터 유래하는 반면 상기 중쇄 및/또는 경쇄의 나머지는 상이한 공급원 또는 종으로부터 유래하는 항체를 지칭한다.
항체의 "클래스"는 상기 항체의 중쇄가 갖는 불변 도메인 또는 불변 영역의 유형을 지칭한다. 항체의 5개의 주요 클래스, 즉 IgA, IgD, IgE, IgG 및 IgM이 존재하며, 이들 중 다수는 서브클래스(동형), 예를 들어 IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 및 IgA2로 추가로 세분될 수 있다. 면역 글로불린의 상이한 클래스에 상응하는 중쇄 불변 도메인을 각각 α, δ, ε, γ 및 μ라 칭한다.
"인간화된" 항체는 비-인간 HVR로부터의 아미노산 잔기 및 인간 FR로부터의 아미노산 잔기를 포함하는 키메라 항체를 지칭한다. 특정 실시양태에서, 인간화된 항체는 하나 이상, 및 전형적으로는 2개의 가변 도메인을 실질적으로 모두 포함할 것이며, 여기에서 HVR(예를 들어 CDR)의 모두 또는 실질적으로 모두는 비-인간 항체의 것에 상응하며, FR의 모두 또는 실질적으로 모두는 인간 항체의 것에 상응한다. 인간화된 항체는 임의적으로 인간 항체로부터 유래된 항체 불변 영역의 적어도 일부를 포함할 수 있다. 항체, 예를 들어 비-인간 항체의 "인간화된 형태"는 인간화를 겪은 항체를 지칭한다. 본 발명에 의해 포함되는 "인간화된 항체"의 다른 형태는 불변 영역이 원래 항체의 경우로부터 추가로 변형되거나 변화되어, 특히 Clq 결합 및/또는 Fc 수용체(FcR) 결합에 관하여 본 발명에 따른 성질을 생성시키는 것이다.
"인간" 항체는 인간 또는 인간 세포에 의해 생산되거나, 인간 항체 레퍼토리 또는 다른 인간 항체-암호화 서열을 사용하는 비-인간 공급원으로부터 유래된 항체의 아미노산 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 것이다. 인간 항체의 이러한 정의는 비-인간 항원 결합 잔기를 포함하는 인간화된 항체를 특별히 제외시킨다.
본원에서 "Fc 도메인" 또는 "Fc 영역"이란 용어는 불변 영역의 적어도 일부를 함유하는 항체 중쇄의 C-말단 영역을 한정하는 데 사용된다. 상기 용어는 천연 서열 Fc 영역 및 변형 Fc 영역을 포함한다. IgG Fc 영역은 IgG CH2 및 IgG CH3 도메인을 포함한다. 인간 IgG Fc 영역의 "CH2 도메인"은 대개 약 231번 위치의 아미노산 잔기로부터 약 340번 위치의 아미노산 잔기까지 연장된다. 하나의 실시양태에서, 탄수화물 쇄가 CH2 도메인에 부착된다. 본원에서 CH2 도메인은 천연 서열 CH2 도메인 또는 변형 CH2 도메인일 수 있다. "CH3 도메인"은 Fc 영역의 CH2 도메인에 C-말단인 잔기의 신장부(즉 IgG의 약 341번 위치의 아미노산 잔기로부터 약 447번 위치의 아미노산 잔기까지)를 포함한다. 본원에서 CH3 영역은 천연 서열 CH3 도메인 또는 변형 CH3 도메인(예를 들어 이의 하나의 쇄 중에 도입된 "돌기"("놉") 및 이의 다른 쇄 중에 도입된 상응하는 "공동"("홀")을 갖는 CH3 도메인)일 수 있다; 명백히 본 발명에 참고로 인용된 미국특허 제5,821,333호를 참조한다). 상기와 같은 변형 CH3 도메인을 사용하여 본원에 기재된 바와 같은 2개의 일치하지 않는 항체 중쇄의 이종 이량체화를 촉진할 수 있다. 하나의 실시양태에서, 인간 IgG 중쇄 Fc 영역은 Cys226 또는 Pro230으로부터 상기 중쇄의 카복시-말단까지 연장된다. 그러나, 상기 Fc 영역의 C-말단 리신(Lys447)은 존재할 수도, 존재하지 않을 수도 있다. 본원에 달리 명시되지 않는 한, 상기 Fc 영역 또는 불변 영역의 아미노산 잔기의 넘버링은 문헌[Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991]에 기재된 바와 같은 EU 넘버링 시스템(또한 EU 지수라 칭한다)에 따른다.
"놉-인투-홀" 기술은 예를 들어 미국특허 제5,731,168호; 미국특허 제7,695,936호; 문헌[Ridgway et al., Prot Eng 9, 617-621 (1996)] 및 문헌[Carter, J Immunol Meth 248, 7-15 (2001)]에 기재되어 있다. 일반적으로, 상기 방법은 돌기가 이종이량체 형성을 촉진하고 동종이량체 형성을 방해하도록 공동 내에 위치할 수 있게 상기 돌기("놉")를 제1 폴리펩티드의 접촉면에 도입시키고 상응하는 공동("홀")을 제2 폴리펩티드의 접촉면에 도입시킴을 수반한다. 돌기는 제1 폴리펩티드의 접촉면으로부터의 작은 아미노산 측쇄를 보다 큰 측쇄(예를 들어 티로신 또는 트립토판)로 교체시킴으로써 구성된다. 상기 돌기와 동일하거나 유사한 크기의 보상 공동이, 큰 아미노산 측쇄를 보다 작은 것(예를 들어 알라닌 또는 트레오닌)으로 교체시킴으로써 제2 폴리펩티드의 접촉면에 생성된다. 돌기 및 공동을, 폴리펩티드를 암호화하는 핵산을, 예를 들어 부위-특이적 돌연변이 유도에 의해 또는 펩티드 합성에 의해 변경시킴으로써 생산할 수 있다. 특정한 실시양태에서, 놉 변형은 Fc 도메인의 2개 서브유닛 중 하나에 아미노산 치환 T366W를 포함하며, 홀 변형은 Fc 도메인의 2개 서브유닛 중 다른 하나에 아미노산 치환 T366S, L368A 및 Y407V를 포함한다. 추가의 특정한 실시양태에서, 놉 변형을 포함하는 Fc 도메인의 서브유닛은 아미노산 치환 S354C를 추가로 포함하고, 홀 변형을 포함하는 Fc 도메인의 서브유닛은 아미노산 치환 Y349C를 추가로 포함한다. 이들 2개의 시스테인 잔기의 도입은 Fc 영역의 2개 서브유닛 사이에 다이설파이드 가교를 형성시키고, 따라서 이량체를 더욱 안정화시킨다(문헌[Carter, J Immunol Methods 248, 7-15 (2001)]).
"면역 글로불린의 Fc 영역과 동등한 영역"은 면역 글로불린의 Fc 영역의 천연 대립유전자 변이체뿐만 아니라, 치환, 부가 또는 결실을 생성시키지만 효과기 기능(예를 들어 항체-의존성 세포 세포독성)을 매개하는 면역 글로불린의 능력을 실질적으로 감소시키지 않는 변경을 갖는 변이체를 포함한다. 예를 들어, 하나 이상의 아미노산을 생물학적 기능의 실질적인 상실 없이 면역 글로불린의 Fc 영역의 N-말단 또는 C-말단으로부터 결실시킬 수 있다. 상기와 같은 변이체를 활성에 대해 최소의 영향을 미치도록 당분야에 공지된 일반적인 법칙에 따라 선택할 수 있다(예를 들어 문헌[Bowie, J. U. et al., Science 247:1306-10 (1990)]을 참조한다).
"효과기 기능"이란 용어는, 항체 동형에 따라 변하는 항체의 Fc 영역에 기인할 수 있는 생물학적 활성을 지칭한다. 항체 효과기 기능의 예는 하기를 포함한다: C1q 결합 및 보체 의존적인 세포독성(CDC), Fc 수용체 결합, 항체-의존성 세포-매개된 세포독성(ADCC), 항체-의존성 세포 식작용(ADCP), 시토카인 분비, 항원 제시 세포에 의한 면역 복합체-매개된 항원 흡수, 세포 표면 수용체(예를 들어 B 세포 수용체)의 하향조절, 및 B 세포 활성화.
"활성화 Fc 수용체"는 항체의 Fc 영역에 의한 결합 후에 효과기 기능을 수행하도록 수용체-함유 세포를 자극하는 신호전달 사건을 유도하는 Fc 수용체이다. 활성화 Fc 수용체는 FcγRIIIa(CD16a), FcγRI(CD64), FcγRIIa(CD32), 및 FcαRI(CD89)를 포함한다. 특정한 활성화 Fc 수용체는 인간 FcγRIIIa이다(UniProt 등록번호 P08637, 버전 141을 참조한다).
"펩티드 링커"란 용어는 하나 이상의 아미노산, 전형적으로 약 2 내지 20개의 아미노산을 포함하는 펩티드를 지칭한다. 펩티드 링커는 당분야에 공지되어 있거나 본원에 기재되어 있다. 적합한, 비-면역원성 링커 펩티드는 예를 들어 (G4S)n, (SG4)n 또는 G4(SG4)n 펩티드 링커이며, 여기에서 "n"은 일반적으로 1 내지 10, 전형적으로 2 내지 4, 특히 2의 수이다, 즉 상기 펩티드는 GGGGS(서열번호 132), GGGGSGGGGS(서열번호 133), SGGGGSGGGG(서열번호 134) 및 GGGGSGGGGSGGGG(서열번호 135)로 이루어지는 군으로부터 선택될 뿐만 아니라 GSPGSSSSGS(서열번호 136), (G4S)3(서열번호 137), (G4S)4(서열번호 138), GSGSGSGS(서열번호 139), GSGSGNGS(서열번호 140), GGSGSGSG(서열번호 141), GGSGSG(서열번호 142), GGSG(서열번호 143), GGSGNGSG(서열번호 144), GGNGSGSG(서열번호 145) 및 GGNGSG(서열번호 146)를 포함한다. 특히 관심 펩티드 링커는 (G4S)(서열번호 132), (G4S)2(서열번호 133), (G4S)3(서열번호 137) 및 (G4S)4(서열번호 138)이다.
본원 내에 사용된 바와 같은 "아미노산"이란 용어는 알라닌(3문자 코드: ala, 1문자 코드: A), 아르기닌(arg, R), 아스파라긴(asn, N), 아스파르트산(asp, D), 시스테인(cys, C), 글루타민(gln, Q), 글루탐산(glu, E), 글리신(gly, G), 히스티딘(his, H), 이소류신(ile, I), 류신(leu, L), 리신(lys, K), 메티오닌(met, M), 페닐알라닌(phe, F), 프롤린(pro, P), 세린(ser, S), 트레오닌(thr, T), 트립토판(trp, W), 티로신(tyr, Y), 및 발린(val, V)을 포함하는 천연 카복시 α-아미노산의 군을 나타낸다.
"융합된" 또는 "연결된"은 성분(예를 들어 폴리펩티드 및 4-1BBL의 엑토도메인)이 펩티드 결합에 의해, 직접적으로 또는 하나 이상의 펩티드 링커를 통해 결합됨을 의미한다.
기준 폴리펩티드(단백질) 서열에 관한 "아미노산 서열 일치성 퍼센트(%)"는, 필요한 경우 최대의 서열 일치성 퍼센트를 성취하기 위해서, 및 상기 서열 일치성의 부분으로서 어떠한 보존적인 치환도 고려하지 않고, 서열을 정렬시킨고 갭을 도입한 후에, 기준 폴리펩티드 서열 중의 아미노산 잔기와 일치하는 후보 서열 중의 아미노산 잔기의 백분율로서 정의된다. 아미노산 서열 일치성 퍼센트를 측정하기 위한 정렬은 당분야의 기술 내에 있는 다양한 방식으로, 예를 들어 공개적으로 입수할 수 있는 컴퓨터 소프트웨어, 예를 들어 BLAST, BLAST-2, ALGN. SAWI 또는 메그얼라인(Megalign)(DNASTAR) 소프트웨어를 사용하여 성취될 수 있다. 당분야의 숙련가는 서열을 정렬시키기에 적합한 매개변수, 예를 들어 비교하는 서열의 전체길이에 대해 최대의 정렬을 성취하기 위해 필요한 임의의 연산을 결정할 수 있다. 그러나, 본 발명의 목적을 위해서, 아미노산 서열 일치성%를 서열 비교 컴퓨터 프로그램 ALIGN-2를 사용하여 생성시킨다. 상기 ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램은 제넨테크 인코포레이티드(Genentech, Inc.)에 의해 저술되었으며, 소스 암호는 미국 저작권 관청(미국 워싱톤 디씨 20559 소재)에 사용자 문서와 함께 제출되었다(이때 상기 코드는 미국 저작권 등록 번호 TXU510087로 등록되어 있다). 상기 ALIGN-2 프로그램은 미국 캘리포니아주 사우스 샌프란시스코 소재의 제넨테크 인코포레이티드로부터 공개적으로 입수할 수 있거나, 상기 소스 암호로부터 편집될 수 있다. 상기 ALIGN-2 프로그램을, 디지털 UNIX V4.0D를 포함하여, UNIX 실행 시스템상에서 사용하기 위해 편집해야 한다. 모든 서열 비교 매개변수는 상기 ALIGN-2 프로그램에 의해 설정되며 변하지 않는다. ALIGN-2를 아미노산 서열 비교를 위해 사용하는 경우에, 주어진 아미노산 서열 A의 주어진 아미노산 서열 B에의, 상기 B와의, 또는 상기 B에 대한 아미노산 서열 일치성%(이는 한편으로 주어진 아미노산 서열 B에, 상기 B와, 또는 상기 B에 대해 일정한 아미노산 서열 일치성%를 갖거나 포함하는 주어진 아미노산 서열 A로서 표현될 수 있다)를 하기와 같이 계산한다:
100 x X/Y
상기에서, X는 A 및 B의 서열 정렬 프로그램 ALIGN-2의 정렬에서 상기 프로그램에 의해 일치성 합치로서 채점되는 아미노산 잔기의 수이고, Y는 B 중 아미노산 잔기의 총수이다. 아미노산 서열 A의 길이가 아미노산 서열 B의 길이와 동일하지 않은 경우, A 대 B의 아미노산 서열 일치성%는 B 대 A의 아미노산 서열 일치성%와 동일하지 않음을 알 것이다. 달리 구체적으로 서술되지 않는 한, 본 발명에 사용된 모든 아미노산 서열 일치성% 값은 상기 ALIGN-2 컴퓨터 프로그램을 사용하여 바로 앞의 단락에 개시된 바와 같이 획득된다.
특정 실시양태에서, 본원에 제공된 항원 결합 분자의 아미노산 서열 변이체가 고려된다. 예를 들어, 항원 결합 분자의 결합 친화도 및/또는 다른 생물학적 특성을 개선시키는 것이 바람직할 수 있다. 항원 결합 분자의 아미노산 서열 변이체를, 상기 분자를 암호화하는 뉴클레오티드 서열에 적합한 변형을 도입시키거나, 펩티드 합성에 의해 생산할 수 있다. 상기와 같은 변형은 예를 들어 항체의 아미노산 서열로부터의 잔기의 결실 및/또는 서열 내로의 잔기의 삽입 및/또는 서열 내에서 잔기의 치환을 포함한다. 결실, 삽입 및 치환의 임의의 조합을 최종 구축물에 도달하도록 수행할 수 있으되, 최종 구축물은 목적하는 특징, 예를 들어 항원 결합성을 가져야 한다. 치환 돌연변이 유도를 위한 관심 부위는 HVR 및 골격(FR)를 포함한다. 보존적 치환을 표 B에서 "바람직한 치환"의 제목 하에 제공하고 아미노산 측쇄 클래스 (1) 내지 (6)을 참조하여 하기에 추가로 기재한다. 아미노산 치환을 관심 분자에 도입시키고 생성물을 목적하는 활성, 예를 들어 유지된/개선된 항원 결합, 감소된 면역원성, 또는 개선된 ADCC 또는 CDC에 대해 선별할 수 있다.
[표 B]
아미노산을 공통 측쇄 성질에 따라 분류할 수도 있다:
(1) 소수성: 노르류신, Met, Ala, Val, Leu, Ile;
(2) 중성 친수성: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
(3) 산성: Asp, Glu;
(4) 염기성: His, Lys, Arg;
(5) 쇄 배향에 영향을 미치는 잔기: Gly, Pro;
(6) 방향족: Trp, Tyr, Phe.
비-보존적인 치환은 이들 클래스 중 하나의 구성원을 또 다른 클래스에 대해 교환함을 수반할 것이다.
"아미노산 서열 변이체"란 용어는 모 항원 결합 분자(예를 들어 인간화된 항체 또는 인간 항체)의 하나 이상의 초가변 영역 잔기 중에 아미노산 치환이 존재하는 실질적인 변이체를 포함한다. 일반적으로, 추가의 연구를 위해 선택되는 상기 생성되는 변이체는 모 항원 결합 분자에 비해 몇몇 생물학적 특성(예를 들어 증가된 친화도, 감소된 면역원성)의 변형(예를 들어 개선)을 갖고/갖거나, 상기 모 항원 결합 분자의 몇몇 생물학적 특성을 실질적으로 유지할 것이다. 예시적인 치환 변이체는 친화도 성숙된 항체이며, 이는 편의상 예를 들어 파지 디스플레이-기반 친화도 성숙 기법, 예를 들어 본 발명에 개시된 것을 사용하여 생산될 수 있다. 간단히, 하나 이상의 CDR 잔기를 돌연변이시키고 변이체 항원 결합 분자를 파지상에 표시하고 특정한 생물학적 활성(예를 들어 결합 친화도)에 대해 선별한다. 특정 실시양태에서, 치환, 삽입 또는 결실이, 상기와 같은 변경이 항원에 결합하는 항원 결합 분자의 능력을 실질적으로 감소시키지 않는 한, 하나 이상의 CDR 내에서 발생할 수 있다. 예를 들어, 결합 친화도를 실질적으로 감소시키지 않는 보존적 변경(예를 들어 본 발명에 제공되는 바와 같은 보존적 치환)를 CDR에서 수행할 수 있다. 돌연변이 유도를 위해 표적화될 수 있는 항체의 잔기 또는 영역의 확인에 유용한 방법을 문헌[Cunningham and Wells(1989) Science 244: 1081-1085]에 기재된 바와 같이 "알라닌 주사 돌연변이 유도"라 칭한다. 상기 방법에서, 표적 잔기(예를 들어 하전된 잔기, 예를 들어 Arg, Asp, His, Lys 및 Glu)의 잔기 또는 기가 확인되며 이들을, 항원과 항체와의 상호작용이 영향을 받는지를 측정하기 위해 중성 또는 음으로 하전된 아미노산(예를 들어 알라닌 또는 폴리알라닌)에 의해 치환시킨다. 추가의 치환을 상기 아미노산 위치에 도입시켜 초기 치환에 대한 기능적 민감성을 입증할 수 있다. 대안적으로 또는 부가적으로, 상기 항원-항원 결합 분자 복합체의 결정 구조는 항체와 항원 사이의 접촉점을 확인한다. 이러한 접촉 잔기 및 이웃하는 잔기는 치환용 후보로서 표적화되거나 제거될 수 있다. 변이체를, 상기 변이체는, 목적하는 성질을 함유하는지를 측정하기 위해서 선별될 수 있다.
아미노산 서열 삽입은 하나의 잔기에서부터 100개 이상의 잔기를 함유하는 폴리펩티드까지의 길이 범위에 이르는 아미노- 및/또는 카복시-말단 융합뿐만 아니라 단일 또는 다수 아미노산 잔기의 서열 내 삽입을 포함한다. 말단 삽입의 예는 N-말단 메티오닐 잔기를 갖는 항원 결합 분자를 포함한다. 상기 분자의 다른 삽입 변이체는 항원 결합 분자의 혈청 반감기를 증가시키는 폴리펩티드에 대한 N- 또는 C-말단에의 융합을 포함한다.
특정 실시양태에서, 본원에 제공된 항원 결합 분자는 상기 항체가 글리코실화되는 정도를 증가시키거나 감소시키도록 변경된다. 상기 분자의 글리코실화 변이체를 편의상, 하나 이상의 글리코실화 부위가 생성되거나 제거되도록 아미노산 서열을 변경시킴으로써 획득할 수 있다. 항원 결합 분자가 Fc 영역을 포함하는 경우, 상기에 부착된 탄수화물을 변경시킬 수 있다. 포유동물 세포에 의해 생산된 천연 항체는 전형적으로 상기 Fc 영역의 CH2 도메인의 Asn297에 N-결합에 의해 일반적으로 부착되는 분지된, 이중촉각 올리고사카라이드를 포함한다. 예를 들어 문헌[Wright et al. TIBTECH 15:26-32 (1997)]을 참조한다. 올리고사카라이드는 다양한 탄수화물, 예를 들어 만노스, N-아세틸 글루코스아민(GlcNAc), 갈락토스, 및 시알산뿐만 아니라 상기 이중촉각 올리고사카라이드 구조의 "줄기" 중 GlcNAc에 부착된 퓨코스를 포함할 수 있다. 일부 실시양태에서, 항원 결합 분자에서 올리고사카라이드의 변형은 몇몇 개선된 특성을 갖는 변이체를 생산하기 위해 수행될 수도 있다. 하나의 양태에서, Fc 영역에 부착된(직접 또는 간접적으로) 퓨코스가 없는 탄수화물 구조를 갖는 항원 결합 분자의 변이체가 제공된다. 상기와 같은 퓨코실화 변이체는 개선된 ADCC 기능을 가질 수 있다. 예를 들어 미국 특허 공보 제 US 2003/0157108(Presta, L.) 또는 US 2004/0093621(교와 하코 고교 캄파니 리미티드(Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd))을 참조한다. 또한, 본 발명의 항원 결합 분자의 변이체는 이등분된 올리고사카라이드, 예를 들어 Fc 영역에 부착된 이중촉각 올리고사카라이드가 GlcNAc에 의해 이등분된 것을 포함한다. 상기와 같은 변이체는 감소된 퓨코실화 및/또는 개선된 ADCC 기능을 가질 수 있다. 예를 들어 WO 2003/011878(Jean-Mairet et al.); 미국특허 제6,602,684호(Umana et al.); 및 US 2005/0123546(Umana et al.)을 참조한다. Fc 영역에 부착된 올리고사카라이드 중에 하나 이상의 갈락토스 잔기를 갖는 변이체가 또한 제공된다. 상기와 같은 항체 변이체는 개선된 CDC 기능을 가질 수 있으며, 예를 들어 WO 1997/30087(Patel et al.); WO 1998/58964(Raju, S.); 및 WO 1999/22764(Raju, S.)에 개시되어 있다.
특정 실시양태에서, 본 발명의 항원 결합 분자의 시스테인 조작된 변이체, 예를 들어 상기 분자의 하나 이상의 잔기가 시스테인 잔기로 치환된 "티오MAb"를 생산하는 것이 바람직할 수 있다. 특정 실시양태에서, 치환된 잔기는 분자의 접근 가능한 부위에 존재한다. 이들 잔기를 시스테인으로 치환시킴으로써, 반응성 티올기가 항체의 접근 가능한 부위에 위치되며 이를 사용하여 본 발명에 추가로 개시된 바와 같이 항체를 다른 모이어티, 예컨대 약물 모이어티 또는 링커-약물 모이어티에 접합시켜 면역접합체를 생산할 수 있다. 특정 실시양태에서, 하기의 잔기 중 임의의 하나 이상을 시스테인으로 치환시킬 수도 있다: 경쇄의 V205(카바트 넘버링); 중쇄의 A118(EU 넘버링); 및 중쇄 Fc 영역의 S400(EU 넘버링). 시스테인 조작된 항원 결합 분자를 예를 들어 미국특허 제7,521,541호에 기재된 바와 같이 생산할 수 있다.
특정 양태에서, 본원에 제공된 항원 결합 분자는 당분야에 공지되어 있고 용이하게 이용가능한 추가적 비-단백성 모이어티를 함유하도록 추가로 변형될 수 있다. 항체의 유도체화에 적합한 모이어티는 비제한적으로 수용성 중합체를 포함한다. 수용성 중합체의 비제한적인 예는 비제한적으로 폴리에틸렌 글리콜(PEG), 에틸렌 글리콜/프로필렌 글리콜의 공중합체, 카복시메틸셀룰로스, 덱스트란, 폴리비닐 알코올, 폴리비닐 피롤리돈, 폴리-1,3-다이옥솔란, 폴리-1,3,6-트라이옥산, 에틸렌/말레산 무수물 공중합체, 폴리아미노산(단독중합체 또는 랜덤 공중합체), 및 덱스트란 또는 폴리(n-비닐 피롤리돈)폴리에틸렌 글리콜, 프로필렌 글리콜 단독중합체, 폴리프로필렌 옥사이드/에틸렌 옥사이드 공중합체, 폴리옥시에틸화된 폴리올(예를 들어, 글리세롤), 폴리비닐 알코올 및 이들의 혼합물을 포함한다. 폴리에틸렌 글리콜 프로피온알데하이드는 이의 수중 안정성 때문에 제조에서 유리점을 가질 수 있다. 중합체는 임의의 분자량의 것일 수 있고, 분지형이거나 비-분지형일 수 있다. 항체에 부착된 중합체의 수는 변할 수 있고, 하나 초과의 중합체가 부착되는 경우, 이는 동일하거나 상이한 분자일 수 있다. 일반적으로, 유도체화에 사용된 중합체의 수 및/또는 유형은 개선해야 할 항체의 특정 특성 및 기능, 이중특이적 항체 유도체가 한정된 조건 하에 요법에서 사용될 수 있는지 여부 등을 비제한적으로 포함하는 고려인자를 기반으로 결정될 수 있다. 또 다른 양태에서, 방사선에 노출시킴으로써 선택적으로 가열될 수 있는, 항체 및 비-단백성 모이어티의 접합체가 제공된다. 한 실시양태에서, 비-단백성 모이어티는 탄소 나노튜브이다(문헌[Kam, N.W. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 (2005) 11600-11605]). 방사선은 임의의 파장의 것일 수 있고, 비제한적으로, 정상 세포에 유해하지 않으나 비-단백성 모이어티를 항체-비-단백성 모이어티 근위의 세포가 사멸하는 온도로 가열하는 파장을 포함한다. 또 다른 양태에서, 본원에 제공된 4-1BBL-함유 항원 결합 분자의 면역 접합체가 수득될 수 있다. "면역 접합체"는, 비제한적으로 세포 독성제를 포함하는, 하나 이상의 이종 분자에 접합된 항체이다.
"폴리뉴클레오티드"란 용어는 단리된 핵산 분자 또는 구축물, 예를 들어 전령 RNA(mRNA), 바이러스-유래된 RNA 또는 플라스미드 DNA(pDNA)를 지칭한다. 폴리뉴클레오티드는 통상적인 포스포다이에스터 결합 또는 비-통상적인 결합(예를 들어 아미드 결합, 예컨대 펩티드 핵산(PNA)에서 발견되는 아미드 결합)을 포함할 수 있다. "핵산 분자"란 용어는 폴리뉴클레오티드에 존재하는 임의의 하나 이상의 핵산 분절, 예를 들어 DNA 또는 RNA 단편을 지칭한다.
"단리된" 핵산 분자 또는 폴리뉴클레오티드는 이의 천연 환경으로부터 제거된 핵산 분자, DNA 또는 RNA를 의미한다. 예를 들어, 본 발명의 목적을 위해 단리된 벡터 중에 함유된 폴리펩티드를 암호화하는 재조합 폴리뉴클레오티드가 고려된다. 단리된 폴리뉴클레오티드의 추가의 예는 이종 숙주 세포에서 유지된 재조합 폴리뉴클레오티드 또는 용액 중 정제된(부분적으로 또는 실질적으로) 폴리뉴클레오티드를 포함한다. 단리된 폴리뉴클레오티드는 상기 폴리뉴클레오티드 분자를 통상적으로 함유하는 세포 중에 함유된 폴리뉴클레오티드 분자를 포함하지만, 상기 폴리뉴클레오티드 분자는 염색체외에 존재하거나 이의 자연적인 염색체 위치와 상이한 염색체 위치에 존재한다. 단리된 RNA 분자는 본 발명의 생체내 또는 시험관내 RNA 전사물뿐만 아니라 양성 및 음성 가닥 형태, 및 이중-가닥 형태를 포함한다. 본 발명에 따른 단리된 폴리뉴클레오티드 또는 핵산은 합성적으로 생산된 분자를 추가로 포함한다. 또한, 폴리뉴클레오티드 또는 핵산은 프로모터, 리보솜 결합 부위 또는 전사 종결자와 같은 조절 요소일 수 있거나 프로모터, 리보솜 결합 부위 또는 전사 종결자와 같은 조절 요소를 포함할 수 있다.
본 발명의 기준 뉴클레오티드 서열에 적어도, 예를 들어 95% "일치하는" 뉴클레오티드 서열을 갖는 핵산 또는 폴리뉴클레오티드는, 상기 폴리뉴클레오티드의 뉴클레오티드 서열이, 상기 폴리뉴클레오티드 서열이 상기 기준 뉴클레오티드 서열의 각 100 뉴클레오티드당 5개 이하의 점 돌연변이를 포함할 수 있음을 제외하고, 상기 기준 서열과 일치함을 의미한다. 즉, 기준 뉴클레오티드 서열에 적어도 95% 일치하는 뉴클레오티드 서열을 갖는 폴리뉴클레오티드를 수득하기 위해서, 상기 기준 서열 중 뉴클레오티드의 5% 이하를 결실시키거나 또 다른 뉴클레오티드로 치환하거나 상기 기준 서열 중 전체 뉴클레오티드의 5% 이하의 뉴클레오티드의 수를 상기 기준 서열 내에 삽입할 수 있다. 기준 서열의 이러한 변경은 기준 서열의 잔기들간에 개별적으로 또는 기준 서열 내 하나 이상의 연속적인 그룹 중에 산재된, 상기 기준 뉴클레오티드 서열의 5' 또는 3' 말단 위치 또는 상기 말단 위치 사이의 어디에서나 발생할 수 있다. 실용적인 문제로서, 임의의 특정한 폴리뉴클레오티드 서열이 본 발명의 뉴클레오티드 서열에 적어도 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 일치하는지의 여부는 통상적으로 공지된 컴퓨터 프로그램, 예를 들어 폴리펩티드에 대해 상기 논의된 것(예를 들어 ALIGN-2)을 사용하여 측정될 수 있다.
"발현 카세트"란 용어는 표적 세포에서 특정 핵산의 전사를 허용하는 일련의 명시된 핵산 요소와 함께 재조합적으로 또는 합성적으로 생성되는 폴리뉴클레오티드를 지칭한다. 재조합 발현 카세트를 플라스미드, 염색체, 미토콘드리아 DNA, 플라스미드 DNA, 바이러스 또는 핵산 단편에 통합시킬 수 있다. 전형적으로, 발현 벡터의 재조합 발현 카세트 부분은 다른 서열 중에서도 전사되는 핵산 서열 및 프로모터를 포함한다. 특정 실시양태에서, 본 발명의 발현 카세트는 본 발명의 이중특이적 항원 결합 분자 또는 이의 단편을 암호화하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함한다.
"벡터" 또는 "발현 벡터"란 용어는 "발현 구축물"과 유의어이며 특정한 유전자를 상기가 표적 세포와 작동적으로 관련되도록 도입시키고 이의 발현을 지시하는 데 사용되는 DNA 분자를 지칭한다. 상기 용어는 자기-복제 핵산 구조물로서 벡터뿐만 아니라 상기 벡터가 도입된 숙주 세포의 게놈 내에 통합된 벡터를 포함한다. 본 발명의 발현 벡터는 발현 카세트를 포함한다. 발현 벡터는 다량의 안정한 mRNA의 전사를 허용한다. 일단 상기 발현 벡터가 표적 세포 내에 있으면, 상기 유전자에 의해 암호화되는 리보핵산 분자 또는 단백질이 상기 세포 전사 및/또는 번역 기구에 의해 생성된다. 하나의 실시양태에서, 본 발명의 발현 벡터는 본 발명의 이중특이적 항원 결합 분자 또는 이의 단편을 암호화하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 발현 카세트를 포함한다.
"숙주 세포", "숙주 세포주" 및 "숙주 세포 배양물"이란 용어는 호환적으로 사용되며 상기와 같은 세포의 자손을 포함하여, 외인성 핵산이 도입된 세포를 지칭한다. 숙주 세포는 "형질전환체" 및 "형질전환된 세포"를 포함하며, 이들은 계대의 수와 상관 없이 1차 형질전환된 세포 및 이로부터 유래된 자손을 포함한다. 자손은 모 세포와 핵산 함량이 완전히 동일할 필요는 없으나, 돌연변이를 함유할 수도 있다. 원래 형질전환된 세포에 대해 선별되거나 선택된 바와 동일한 기능 또는 생물 활성을 갖는 돌연변이 자손은 본 발명에 포함된다. 숙주 세포는 본 발명의 이중특이적 항원 결합 분자를 생산하는 데 사용될 수 있는 임의의 유형의 세포 시스템이다. 숙주 세포는 배양된 세포, 예를 들어 몇가지 언급하자면, 포유동물 배양된 세포, 예를 들어 CHO 세포, BHK 세포, NS0 세포, SP2/0 세포, YO 골수종 세포, P3X63 마우스 골수종 세포, PER 세포, PER.C6 세포 또는 하이브리도마 세포, 효모 세포, 곤충 세포, 및 식물 세포를 포함하나, 또한 트랜스제닉 동물, 트랜스제닉 식물 또는 배양된 식물 또는 동물 조직 내에 포함된 세포를 포함한다.
제제의 "유효량"은 제제가 투여되는 세포 또는 조직에서 생리학적 변화를 생성시키기에 필요한 양을 지칭한다.
본 발명에 따라 병용 요법은 상승작용성 효과를 갖는다. 2개의 화합물의 "상승작용성 효과"는 2개의 제제의 조합이 이들 각각의 효과의 합보다 크고 대조군 및 단일 약물과 통계상 상이한 것이다. 또 다른 실시양태에서, 본원에 개시된 병용 요법은 부가적 효과를 갖는다. 2개의 화합물의 "부가적 효과"는 2개의 제제의 조합의 효과가 이들 개별적 효과의 합이고 대조군 및/또는 단일 약물과 통계상 상이한 것이다.
제제, 예를 들어 약학 조성물의 "치료 유효량"은 필요한 투여량 및 기간 동안 목적하는 치료학적 또는 예방학적 결과를 성취하기에 유효한 양을 지칭한다. 제제의 치료 유효량은 예를 들어 질병의 부작용을 제거하거나 감소시키거나 지연시키거나 최소화하거나 방지한다.
"개체" 또는 "대상체"는 포유동물이다. 포유동물은 비제한적으로 가축(예를 들어 소, 양, 고양이, 개 및 말), 영장류(예를 들어 인간 및 비인간 영장류, 예를 들어 원숭이), 토끼 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)를 포함한다. 특히, 상기 개체 또는 대상체는 인간이다.
"약학 조성물"이란 용어는, 함유된 활성 성분의 생물학적 활성을 유효하게 하는 형태이고 제형이 투여되는 개체에게 허용되지 않는 독성인 추가적인 성분을 함유하지 않는 제제를 지칭한다.
"약학적으로 허용되는 담체"는 활성 성분 외에, 개체에게 무독성인 약학 조성물의 성분을 지칭한다. 약학적으로 허용되는 부형제는 비제한적으로 완충제, 안정화제 또는 보존제를 포함한다.
"패키지 삽입물"은 치료 제품의 사용에 관한 적응증, 용법, 투여량, 투여, 복합 요법, 금기 및/또는 경고에 관한 정보를 함유하는, 치료 제품의 상업적인 패키지에 통상적으로 포함되는 설명서를 지칭하는 데 사용된다.
본원에 사용된 바와 같이, "치료"(및 "치료하다" 및 "치료하는"과 같은 이의 문법상 어미변화)는 치료 중인 개인의 자연적인 과정을 변경시키고자 하는 임상적 중재를 지칭하며, 예방을 위해서 또는 임상적 병리 과정 동안 수행될 수 있다. 치료의 바람직한 효과는 비제한적으로 질병의 발생 또는 재발 방지, 증상의 완화, 상기 질병의 임의의 직접적이거나 간접적인 병리학적 결과의 감소, 전이 방지, 질병 진행 속도의 감소, 질병 상태의 개선 또는 완화, 및 진정 또는 개선된 예후를 포함한다. 일부 실시양태에서, 본 발명의 분자를 사용하여 질병의 발생을 지연시키거나 질병의 진행을 늦춘다.
본원에 사용된 "암"이란 용어는 증식성 질병, 예컨대 고형 종양 또는 흑색종을 지칭한다.
본 발명에서 사용하기 위한 예시적 표적화된 OX40 작용제
특히, 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체와 병용으로 사용되는, 표적화된 OX40 작용제는 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체이다.
특히, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체는 항-섬유아세포 활성화 단백질(FAP)/항-OX40 이중특이적 항체이다. 한 양태에서, 항-FAP/항-OX40 항체는 OX40 작용제이다. 한 양태에서, 항-FAP/항-OX40 항체는 Fc 도메인을 포함하는 항원 결합 분자이다. 특정 양태에서, 항-FAP/항-OX40 항체는, Fcγ 수용체 결합 및/또는 효과기 기능을 감소시키는 변형을 갖는 Fc 도메인을 포함하는 항원 결합 분자이다. 종양-연관된 항원에 의한 가교결합은 특이적이지 않은 FcγR 매개된 가교결합을 피하는 것을 가능하게 하여 OX40 항체와 비교하여 보다 높고 보다 효과적인 투여량의 항-FAP/항-OX40 항체가 투여될 수 있다.
한 양태에서, 본 발명은, 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 특히 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체를 제공하되, 여기서 상기 이중특이적 OX40 항체는 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체와 조합으로 사용되고, 상기 이중특이적 OX40 항체는 하기를 포함하는 FAP에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다:
(a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHFAP), 및 (iv) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLFAP), 또는
(b) (i) 서열번호 9의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 10의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHFAP), 및 (iv) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLFAP).
추가적 양태에서, 본원 상기에 정의된 바와 같은, 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 특히 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체가 제공되되, 여기서 상기 이중특이적 OX40 항체는, 서열번호 7의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 중쇄 가변 영역(VHFAP) 및 서열번호 8의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 경쇄 가변 영역(VLFAP)을 포함하는 FAP에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인, 또는 서열번호 15의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 중쇄 가변 영역(VHFAP) 및 서열번호 16의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 경쇄 가변 영역(VLFAP)을 포함하는 FAP에 특이적으로 결합할 수 있는 항원 결합 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 이중특이적 OX40 항체는, 서열번호 7의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHFAP) 및 서열번호 8의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLFAP)을 포함하는 FAP에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다. 또 다른 양태에서, 이중특이적 OX40 항체는, 서열번호 15의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHFAP) 및 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLFAP)을 포함하는 FAP에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다.
추가적 양태에서, 본원 상기에 정의된 바와 같은, 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 특히 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체가 제공되되, 여기서 상기 이중특이적 OX40 항체는 하기를 포함하는 OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다:
(a) (i) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40), 및 (iv) 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 35의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(b) (i) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40), 및 (iv) 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(c) (i) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 23의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40), 및 (iv) 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 36의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(d) (i) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40), 및 (iv) 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(e) (i) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 20의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40), 및 (iv) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(f) (i) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 20의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40), 및 (iv) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40), 또는
(g) (i) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 20의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 27의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40), 및 (iv) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 39의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40).
보다 특히, 이중특이적 OX40 항체는 하기를 포함하는 OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다:
(a) (i) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H1, (ii) 서열번호 19의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H2, 및 (iii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-H3을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40), 및 (iv) 서열번호 28의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L1, (v) 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L2, 및 (vi) 서열번호 35의 아미노산 서열을 포함하는 CDR-L3을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40).
추가적 양태에서, 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 특히 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체가 제공되되, 여기서 상기 이중특이적 OX40 항체는 하기를 포함하는 OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다:
(a) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40) 및 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(b) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40) 및 서열번호 43의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(c) 서열번호 44의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40) 및 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(d) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40) 및 서열번호 47의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(e) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40) 및 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40),
(f) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40) 및 서열번호 51의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40), 또는
(g) 서열번호 52의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40) 및 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40).
특정 양태에서, 이중특이적 OX40 항체는 하기를 포함하는 OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다:
(a) 서열번호 40의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 중쇄 가변 영역(VHOX40) 및 서열번호 41의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 경쇄 가변 영역(VLOX40).
보다 특히, 이중특이적 OX40 항체는, 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHOX40) 및 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLOX40)을 포함하는 OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함한다.
한 양태에서, 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 특히 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체가 제공되되, 여기서 상기 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체는, 안정하게 회합할 수 있는 제1 및 제2 서브유닛으로 구성된 Fc 도메인을 추가로 포함하는 항원 결합 분자이다. 특히, 이중특이적 OX40 항체는 IgG Fc 도메인, 구체적으로 IgG1 Fc 도메인 또는 IgG4 Fc 도메인을 포함하는 항원 결합 분자이다. 보다 특히, 이중특이적 OX40 항체는, Fc 수용체에 대한 결합 및/또는 효과기 기능을 감소시키는 하나 이상의 아미노산 치환을 포함하는 Fc 도메인을 포함하는 항원 결합 분자이다. 특정 양태에서, 이중특이적 OX40 항체는 아미노산 치환 L234A, L235A 및 P329G를 포함하는 IgG1 Fc 도메인을 포함한다.
본 발명의 또 다른 양태에서, 본원 상기에 기재된 바와 같은, 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 특히 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체가 제공되되, 여기서 상기 이중특이적 OX40 항체는 종양-연관된 표적에 대한 일가 결합 및 OX40에 대한 적어도 이가 결합을 포함한다. 한 양태에서, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체는 종양-연관된 표적에 대한 일가 결합 및 OX40에 대한 이가 결합을 포함한다. 특정 양태에서, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체는 종양-연관된 표적에 대한 일가 결합 및 OX40에 대한 사가 결합을 포함한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은, 본원 상기에 기재된 바와 같은, 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 특히 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체를 제공하되, 여기서 상기 이중특이적 OX40 항체는, CH1 도메인의 C-말단에서 OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 제2 Fab 단편의 VH 도메인에 융합된 OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 제1 Fab 단편, 및 CH1 도메인의 C-말단에서 OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 제4 Fab 단편의 VH 도메인에 융합된 OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 제3 Fab 단편을 포함한다.
한 양태에서, 본원 상기에 기재된 바와 같은, 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 특히 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체가 제공되되, 여기서 상기 이중특이적 OX40 항체는 하기를 포함한다:
(i) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 55의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 4개의 경쇄,
(ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 4개의 경쇄,
(iii) 서열번호 59의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 60의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 4개의 경쇄, 또는
(iv) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 4개의 경쇄.
하나의 특정한 양태에서, 본원에 기재된 바와 같은, 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 특히 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체가 제공되되, 여기서 상기 이중특이적 OX40 항체는 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 55의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 4개의 경쇄를 포함한다.
본 발명에서 사용하기 위한 예시적 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체
본 발명은 표적화된 OX40 작용제, 및 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체와의 조합에서 이의 용도, 특히 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법, 보다 특히 고형 종양을 치료하거나 고형 종양의 진행을 지연시키는 방법에서 이의 용도에 관한 것이다. 특히, 종양-연관된 항원는 CEA이다. 본원에 사용된 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, CD3에 결합하는 제1 항원 결합 도메인 및 CEA에 결합하는 제2 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 항체이다.
따라서, 본원에 사용된 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 중쇄 가변 영역(VHCD3) 및 경쇄 가변 영역(VLCD3)을 포함하는 제1 항원 결합 도메인, 및 중쇄 가변 영역(VHCEA) 및 경쇄 가변 영역(VLCEA)을 포함하는 제2 항원 결합 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 조합으로 사용하기 위한 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는 서열번호 63의 CDR-H1 서열, 서열번호 64의 CDR-H2 서열 및 서열번호 65의 CDR-H3 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCD3); 및/또는 서열번호 66의 CDR-L1 서열, 서열번호 67의 CDR-L2 서열 및 서열번호 68의 CDR-L3 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCD3)을 포함하는 제1 항원 결합 도메인을 포함한다. 보다 특히, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 69의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 중쇄 가변 영역(VHCD3)을 포함하는 제1 항원 결합 도메인 및/또는 서열번호 70의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 경쇄 가변 영역(VLCD3)을 포함한다. 추가적 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는 서열번호 69의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCD3) 및/또는 서열번호 70의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCD3)을 포함한다.
한 양태에서, CD3에 특이적으로 결합하는 항체는 전장 항체이다. 한 양태에서, CD3에 특이적으로 결합하는 항체는 인간 IgG 클래스의 항체, 특히 인간 IgG1 클래스의 항체이다. 한 양태에서, CD3에 특이적으로 결합하는 항체는 항체 단편, 특히 Fab 분자 또는 scFv 분자, 보다 특히 Fab 분자이다. 특정 양태에서, CD3에 특이적으로 결합하는 항체는, Fab 중쇄 및 경쇄의 가변 도메인 또는 불변 도메인이 교환된(즉, 서로 대체된) 크로스오버 Fab 분자이다. 한 양태에서, CD3에 특이적으로 결합하는 항체는 인간화된 항체이다.
또 다른 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는 하기를 포함하는 제2 항원 결합 도메인을 포함한다:
(a) 서열번호 71의 CDR-H1 서열, 서열번호 72의 CDR-H2 서열 및 서열번호 73의 CDR-H3 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCEA), 및/또는 서열번호 74의 CDR-L1 서열, 서열번호 75의 CDR-L2 서열 및 서열번호 76의 CDR-L3 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCEA), 또는
(b) 서열번호 79의 CDR-H1 서열, 서열번호 80의 CDR-H2 서열 및 서열번호 81의 CDR-H3 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCEA), 및/또는 서열번호 82의 CDR-L1 서열, 서열번호 83의 CDR-L2 서열 및 서열번호 84의 CDR-L3 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCEA).
보다 특히, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 77의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 중쇄 가변 영역(VHCEA) 및/또는 서열번호 78의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 경쇄 가변 영역(VLCEA)을 포함하는 제2 항원 결합 도메인을 포함한다. 추가적 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 77의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCEA) 및/또는 서열번호 78의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCEA)을 포함하는 제2 항원 결합 도메인을 포함한다. 또 다른 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 85의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 중쇄 가변 영역(VHCEA) 및/또는 서열번호 86의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 경쇄 가변 영역(VLCEA)을 포함하는 제2 항원 결합 도메인을 포함한다. 추가적 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 85의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCEA) 및/또는 서열번호 86의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCEA)을 포함하는 제2 항원 결합 도메인을 포함한다.
또 다른 특정 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는 CEA에 결합하는 제3 항원 결합 도메인을 포함한다. 특히, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는 하기를 포함하는 제3 항원 결합 도메인을 포함한다:
(a) 서열번호 71의 CDR-H1 서열, 서열번호 72의 CDR-H2 서열 및 서열번호 73의 CDR-H3 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCEA), 및/또는 서열번호 74의 CDR-L1 서열, 서열번호 75의 CDR-L2 서열 및 서열번호 76의 CDR-L3 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCEA), 또는
(b) 서열번호 79의 CDR-H1 서열, 서열번호 80의 CDR-H2 서열 및 서열번호 81의 CDR-H3 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCEA), 및/또는 서열번호 82의 CDR-L1 서열, 서열번호 83의 CDR-L2 서열 및 서열번호 84의 CDR-L3 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCEA).
보다 특히, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 77이 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 중쇄 가변 영역(VHCEA) 및/또는 서열번호 78의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 경쇄 가변 영역(VLCEA)을 포함하는 제3 항원 결합 도메인을 포함한다. 추가적 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 77의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCEA) 및/또는 서열번호 78의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCEA)을 포함하는 제3 항원 결합 도메인을 포함한다. 또 다른 특정 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 85의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 중쇄 가변 영역(VHCEA) 및/또는 서열번호 86의 아미노산 서열과 적어도 90%, 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 경쇄 가변 영역(VLCEA)을 포함하는 제3 항원 결합 도메인을 포함한다. 추가적 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 85의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCEA) 및/또는 서열번호 86의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄 가변 영역(VLCEA)을 포함하는 제3 항원 결합 도메인을 포함한다.
추가적 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 제1 항원 결합 도메인이 Fab 중쇄 및 경쇄의 가변 도메인 또는 불변 도메인이 교환된 크로스-Fab 분자이고, 제2 및 제3(존재하는 경우) 항원 결합 도메인이 통상적 Fab 분자인, 이중특이적 항체이다.
또 다른 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, (i) 제2 항원 결합 도메인이 Fab 중쇄의 C-말단에서 제1 항원 결합 도메인의 Fab 중쇄의 N-말단에 융합되고, 제1 항원 결합 도메인이 Fab 중쇄의 C-말단에서 Fc 도메인의 제1 서브유닛의 N-말단에 융합되고, 제3 항원 결합 도메인이 Fab 중쇄의 C-말단에서 Fc 도메인의 제2 서브유닛의 N-말단에 융합되거나, (ii) 제1 항원 결합 도메인이 Fab 중쇄의 C-말단에서 제2 항원 결합 도메인의 Fab 중쇄의 N-말단에 융합되고, 제2 항원 결합 도메인이 Fab 중쇄의 C-말단에서 Fc 도메인의 제1 서브유닛의 N-말단에 융합되고, 제3 항원 결합 도메인이 Fab 중쇄의 C-말단에서 Fc 도메인의 제2 서브유닛의 N-말단에 융합되는, 이중특이적 항체이다.
Fab 분자는 Fc 도메인에 또는 서로, 직접 또는 하나 이상의 아미노산, 전형적으로 약 2 내지 20개의 아미노산을 포함하는 펩티드 링커를 통해 융합될 수 있다. 펩티드 링커는 당분야에 공지되어 있고 본원에 기재되어 있다. 적합한 비-면역원성 펩티드 링커는 예를 들어 (G4S)n, (SG4)n, (G4S)n 또는 G4(SG4)n 펩티드 링커를 포함한다. "n"은 일반적으로 1 내지 10, 전형적으로 2 내지 4의 정수이다. 한 실시양태에서, 상기 펩티드 링커는 5개 이상의 아미노산의 길이, 한 실시양태에서 5 내지 100개의 아미노산의 길이, 추가적 실시양태에서 10 내지 50개의 아미노산의 길이를 갖는다. 한 실시양태에서, 상기 펩티드 링커는 (GxS)n 또는 (GxS)nGm이되, 여기서 G는 글리세린이고; S는 세린이고; x는 3이고, n은 3, 4, 5 또는 6이고, m은 0, 1, 2 또는 3이거나; x는 4이고, n은 2, 3, 4 또는 5이고, m은 0, 1, 2 또는 3이고, 한 실시양태에서 x는 4이고 n은 2 또는 3이고, 추가적 실시양태에서 x는 4이고 n은 2이다. 한 실시양태에서, 상기 펩티드 링커는 (G4S)2이다. 제1 및 제2 Fab 분자의 Fab 경쇄를 서로 융합시키기에 특히 적합한 펩티드 링커는 (G4S)2이다. 제1 및 제2 Fab 단편의 Fab 중쇄를 연결시키기에 적합한 예시적 펩티드 링커는 서열 (D)-(G4S)2를 포함한다. 또 다른 적합한 상기 링커는 서열 (G4S)4를 포함한다. 또한, 링커는 면역 글로불린 힌지 영역(의 일부)을 포함할 수 있다. 특히, Fab 분자가 Fc 도메인 서브유닛의 N-말단에 융합되는 경우, 이는 면역 글로불린 힌지 영역 또는 이의 일부를 통해 추가적 펩티드 링커의 존재 또는 부재 하에 융합될 수 있다.
추가적 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, Fc 수용체에 대한 결합 및/또는 효과기 기능을 감소시키는 하나 이상의 아미노산 치환을 포함하는 Fc 도메인을 포함한다. 특히, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는 아미노산 치환 L234A, L235A 및 P329G를 포함하는 IgG1 Fc 도메인을 포함한다.
특정 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 87의 서열과 적어도 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 2개의 폴리펩티드, 서열번호 88의 서열과 적어도 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 폴리펩티드, 서열번호 89의 서열과 적어도 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 폴리펩티드, 및 서열번호 90의 서열과 적어도 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 폴리펩티드를 포함한다. 추가적 특정 실시양태에서, 이중특이적 항체는 서열번호 87의 2개의 폴리펩티드, 서열번호 88의 폴리펩티드, 서열번호 89의 폴리펩티드 및 서열번호 90의 폴리펩티드를 포함한다(CEA CD3 TCB).
추가적 특정 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 서열번호 91의 서열과 적어도 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 2개의 폴리펩티드, 서열번호 92의 서열과 적어도 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 폴리펩티드, 서열번호 93의 서열과 적어도 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 폴리펩티드, 및 서열번호 94의 서열과 적어도 95%, 96%, 97%, 98% 또는 99% 동일한 폴리펩티드를 포함한다. 추가적 특정 실시양태에서, 이중특이적 항체는 서열번호 91의 2개의 폴리펩티드, 서열번호 92의 폴리펩티드, 서열번호 93의 폴리펩티드 및 서열번호 94의 폴리펩티드를 포함한다(CEACAM5 CD3 TCB).
특정 이중특이적 항체가 WO 2014/131712 A1에 기재되어 있다.
추가적 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는 또한 이중특이적 T 세포 관여자(BiTE(등록상표))를 포함할 수 있다. 추가적 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는 WO 2007/071426 또는 WO 2014/131712에 기재된 이중특이적 항체이다. 또 다른 양태에서, 이중특이적 항체는 MEDI565(AMG211)이다.
본 발명에서 사용하기 위한 예시적 항-FolR1/항-CD3 이중특이적 항체
본 발명은 또한 항-FolR1/항-CD3 이중특이적 항체, 및 표적화된 OX40 작용제와의 조합에서 이의 용도, 특히 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법, 보다 특히 고형 종양을 치료하거나 고형 종양의 진행을 지연시키는 방법에서 이의 용도에 관한 것이다. 본원에 사용된 항-FolR1/항-CD3 이중특이적 항체는, CD3에 결합하는 제1 항원 결합 도메인 및 FolR1에 결합하는 제2 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 항체이다. 특히, 본원에 사용된 항-FolR1/항-CD3 이중특이적 항체는 FolR1에 결합하는 제3 항원 결합 도메인을 포함한다.
한 양태에서, T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체는, 중쇄 가변 영역(VHCD3)을 포함하는 제1 항원 결합 도메인, 중쇄 가변 영역(VHFolR1)을 포함하는 제2 항원 결합 도메인, 중쇄 가변 영역(VHFolR1)을 포함하는 제3 항원 결합 도메인, 및 3개의 공통 경쇄 가변 영역을 포함한다.
또 다른 양태에서, 제1 항원 결합 도메인은 서열번호 95의 CDR-H1 서열, 서열번호 96의 CDR-H2 서열 및 서열번호 97의 CDR-H3 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCD3)을 포함하고; 제2 항원 결합 도메인은 서열번호 98의 CDR-H1 서열, 서열번호 99의 CDR-H2 서열 및 서열번호 100의 CDR-H3 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHFolR1)을 포함하고; 제3 항원 결합 도메인은 서열번호 98의 CDR-H1 서열, 서열번호 99의 CDR-H2 서열 및 서열번호 100의 CDR-H3 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHFolR1)을 포함하고; 공통 경쇄는 서열번호 101의 CDR-L1 서열, 서열번호 102의 CDR-L2 서열 및 서열번호 103의 CDR-L3 서열을 포함한다. 또 다른 양태에서, 제1 항원 결합 도메인은 서열번호 104의 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHCD3)을 포함하고; 제2 항원 결합 도메인은 서열번호 105의 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHFolR1)을 포함하고; 제3 항원 결합 도메인은 서열번호 105의 서열을 포함하는 중쇄 가변 영역(VHFolR1)을 포함하고; 공통 경쇄는 서열번호 106의 서열을 포함한다.
특정 양태에서, 항-FolR1/항-CD3 이중특이적 항체는 서열번호 107의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 108의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄 3개의 서열번호 109의 공통 경쇄를 포함한다.
본 발명에서 사용하기 위한 PD-L1/PD-1 상호작용 차단제
본 발명의 한 양태에서, 표적화된 OX40 작용제, 특히 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체는 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법에서 사용하기 위한 것으로서, 여기서 상기 표적화된 OX40 작용제는 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 특히 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 또는 항-FolR1/항-CD3 이중특이적 항체와 조합으로 사용되고, 추가적으로 이는 PD-L1/PD-1 상호작용 차단제와 조합으로 사용된다. 한 양태에서, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 PD-L1 결합 길항제 또는 PD-1 결합 길항제이다. 특히, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 항-PD-L1 항체 또는 항-PD-1 항체이다.
용어 "PD-L1"(CD274 또는 B7-H1로도 공지됨)은, 포유동물, 예컨대 영장류(예를 들어 인간), 비-인간 영장류(예를 들어 시노몰구스 원숭이) 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)를 포함하는 임의의 척추동물 공급원으로부터의 임의의 천연 PD-L1, 특히 "인간 PD-L1"을 지칭한다. 완전한 인간 PD-L1의 아미노산 서열은 유니프롯(www.uniprot.org) 등록번호 Q9NZQ7(서열번호 110)에 나타나 있다. 용어 "PD-L1 결합 길항제"는, PD-L1과 이의 결합 파트너 중 하나 이상, 예컨대 PD-1 또는 B7-1의 상호작용으로부터 야기된 신호 전달을 감소시키거나 차단하거나 억제하거나 폐지하거나 간섭하는 분자를 지칭한다. 일부 실시양태에서, PD-L1 결합 길항제는, PD-L1이 이의 결합 파트너에 결합하는 것을 억제하는 분자이다. 구체적 양태에서, PD-L1 결합 길항제는 PD-L1이 PD-1 및/또는 B7-1에 결합하는 것을 억제한다. 일부 실시양태에서, PD-L1 결합 길항제는, 항-PD-L1 항체, 이의 항원 결합 단편, 면역 접합체, 융합 단백질, 올리고펩티드, 및 PD-L1과 이의 결합 파트너 중 하나 이상, 예컨대 PD-1 또는 B7-1의 상호작용으로부터 야기된 신호 전달을 감소시키거나 차단하거나 억제하거나 폐지하거나 간섭하는 다른 분자를 포함한다. 한 실시양태에서, PD-L1 결합 길항제는, 기능 장애성 T 세포를 덜 기능 장애성이도록 만들기 위해, PD-L1를 통해 신호 전달을 매개하는 T 림프구 상에서 발현되는 세포 표면 단백질에 의해 매개되거나 이를 통한 음성 공-자극 신호를 감소시킨다(예를 들어, 항원 인식에 대한 효과기 반응을 증진시킴). 특히, PD-L1 결합 길항제는 항-PD-L1 항체이다. 용어 "항-PD-L1 항체", "인간 PD-L1에 결합하는 항체" 또는 "인간 PD-L1에 특이적으로 결합하는 항체" 또는 "길항성 항-PD-L1"은, 1.0 x 10-8 mol/l 이하의 KD-값, 한 양태에서 1.0 x10-9 mol/l 이하의 KD-값의 결합 친화도에 의해 인간 PD-L1 항원에 특이적으로 결합하는 항체를 지칭한다. 결합 친화도는 표준 결합 분석, 예컨대 표면 플라스몬 공명 기술(비아코어(등록상표), 지이-헬쓰케어(GE-Healthcare, 스웨덴 웁살라 소재))에 의해 결정된다.
특정 양태에서, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 항-PD-L1 항체이다. 구체적 양태에서, 항-PD-L1 항체는 아테졸리주맙(MPDL3280A, RG7446), 두르발루맙(MEDI4736), 아벨루맙(avelumab)(MSB0010718C) 및 MDX-1105로 이루어진 군으로부터 선택된다. 구체적 양태에서, 항-PD-L1 항체는 본원에 기재된 YW243.55 S70이다. 또 다른 특정 양태에서, 항-PD-L1 항체는 본원에 기재된 MDX-1105이다. 또 다른 특정 양태에서, 항-PD-L1 항체는 MEDI4736(두르발루맙)이다. 또 다른 추가적 양태에서, 항-PD-L1 항체는 MSB0010718C(아벨루맙)이다. 보다 특히, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 아테졸리주맙(MPDL3280A)이다. 또 다른 양태에서, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 서열번호 112의 중쇄 가변 도메인 VH(PDL-1) 및 서열번호 113의 경쇄 가변 도메인 VL(PDL-1)을 포함하는 항-PD-L1 항체이다. 또 다른 양태에서, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 서열번호 114의 중쇄 가변 도메인 VH(PDL-1) 및 서열번호 115의 경쇄 가변 도메인 VL(PDL-1)을 포함하는 항-PD-L1 항체이다.
용어 "PD-1"(CD279, PD1 또는 프로그래밍된 세포 사멸 단백질 1로도 공지됨)은, 포유동물, 예컨대 영장류(예를 들어 인간), 비-인간 영장류(예를 들어 시노몰구스 원숭이) 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)를 포함하는 임의의 척추동물 공급원으로부터의 임의의 천연 PD-L1, 특히 유니프롯(www.uniprot.org) 등록번호 Q15116(서열번호 111)에 나타낸 아미노산 서열을 갖는 인간 단백질 PD-1을 지칭한다. 용어 "PD-1 결합 길항제"는 PD-1이 이의 리간드 결합 파트너에 결합하는 것을 억제하는 분자를 지칭한다. 일부 실시양태에서, PD-1 결합 길항제는 PD-L1에 대한 PD-1의 결합을 억제한다. 일부 실시양태에서, PD-1 결합 길항제는 PD-L2에 대한 PD-1의 결합을 억제한다. 일부 실시양태에서, PD-1 결합 길항제는 PD-L1 및 PD-L2 둘 모두에 대한 PD-1의 결합을 억제한다. 특히, PD-L1 결합 길항제는 항-PD-L1 항체이다. 용어 "항-PD-1 항체", "인간 PD-1에 결합하는 항체", "인간 PD-1에 특이적으로 결합하는 항체" 또는 "길항성 항-PD-1"은, 1.0 x 10-8 mol/l 이하의 KD-값, 한 양태에서 1.0 x10-9 mol/l 이하의 KD-값의 결합 친화도에 의해 인간 PD1 항원에 특이적으로 결합하는 항체를 지칭한다. 결합 친화도는 표준 결합 분석, 예컨대 표면 플라스몬 공명 기술(비아코어(등록상표), 지이-헬쓰케어(스웨덴 웁살라 소재))에 의해 결정된다.
한 양태에서, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 항-PD-1 항체이다. 구체적 양태에서, 항-PD-1 항체는 MDX 1106(니볼루맙), MK-3475(펨브롤리주맙), CT-011(피딜리주맙(pidilizumab)), MEDI-0680(AMP-514), PDR001, REGN2810 및 BGB-108로 이루어진 군으로부터, 특히 펨브롤리주맙 및 니볼루맙으로부터 선택된다. 또 다른 양태에서, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 서열번호 116의 중쇄 가변 도메인 VH(PD-1) 및 서열번호 117의 경쇄 가변 도메인 VL(PD-1)을 포함하는 항-PD-1 항체이다. 또 다른 양태에서, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 서열번호 118의 중쇄 가변 도메인 VH(PD-1) 및 서열번호 119의 경쇄 가변 도메인 VL(PD-1)을 포함하는 항-PD-1 항체이다.
본 발명에서 사용하기 위한 이중특이적 항체의 생산
특정 양태에서, 조합으로 사용되는 치료제는 다중특이적 항체, 예를 들어 이중특이적 항체를 포함한다. 다중특이적 항체는 2개 이상의 상이한 부위에 대한 결합 특이성을 갖는 단클론 항체이다. 특정 양태에서, 결합 특이성은 상이한 항원에 대한 것이다. 특정 양태에서, 결합 특이성은 동일한 항원 상의 상이한 에피토프에 대한 것이다. 이중특이적 항체는 전장 항체 또는 항체 단편으로서 생산될 수 있다.
다중특이적 항체의 생산 기술은 비제한적으로 상이한 특이성을 갖는 2개의 면역 글로불린 중쇄-경쇄 쌍의 재조합 공-발현(문헌[Milstein and Cuello, Nature 305: 537 (1983)], WO 93/08829 및 문헌[Traunecker et al., EMBO J. 10: 3655 (1991)] 참조), 및 "놉-인-홀" 조작(예를 들어 US 5,731,168 참조)을 포함한다. 다중특이적 항체는, 정전기 스티어링 효과를 조작함으로써 항체 Fc-이종이량체 분자를 생산함(WO 2009/089004A1); 2개 이상의 항체 또는 단편을 가교결합시킴(예를 들어 US 4,676,980, 및 문헌[Brennan et al., Science, 229: 81 (1985)] 참조); 류신 지퍼를 사용하여 이중특이적 항체를 생산함(예를 들어 문헌[Kostelny et al., J. Immunol., 148(5):1547-1553 (1992)] 참조); 이중특이적 항체 단편을 생산하기 위한 "다이아바디(diabody)" 기술을 사용함(예를 들어 문헌[Hollinger et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 90:6444-6448 (1993)] 참조); 단쇄 Fv(sFv) 이량체를 사용함(예를 들어 문헌[Gruber et al., J. Immunol., 152:5368 (1994)] 참조); 및 예를 들어 문헌[Tutt et al. J. Immunol. 147: 60 (1991)]에 기재된 삼중특이적 항체를 생산함에 의해 생산될 수 있다.
3개 이상의 기능적 항원 결합 부위를 갖는 조작된 항체("옥토퍼스(Octopus) 항체"를 포함함)가 또한 본원에 포함된다(예를 들어 US 2006/0025576A1 참조).
본원에서 항체 또는 단편은 또한 2개의 상이한 항원에 결합하는 항원 결합 부위를 포함하는 "이중 작용 FAb" 또는 "DAF"를 포함한다(예를 들어 US 2008/0069820 참조). "Crossmab" 항체가 또한 본원에 포함된다(예를 들어 WO 2009/080251, WO 2009/080252, WO2009/080253 또는 WO2009/080254 참조).
이중특이적 항체 단편을 생산하는 또 다른 기술은 "이중특이적 T 세포 관여자" 또는 BiTE(등록상표) 접근법이다(예를 들어 WO2004/106381, WO2005/061547, WO2007/042261 및 WO2008/119567 참조). 이러한 접근법은 단일 폴리펩티드 상에 배열된 2개의 항체 가변 도메인을 사용한다. 예를 들어, 단일 폴리펩티드 쇄는 2개의 단쇄 Fv(scFv) 단편을 포함하며, 각각은 가변 중쇄(VH) 및 가변 경쇄(VL) 도메인(이는 2개의 상기 도메인의 분자내 회합을 가능하게 하기에 충분한 길이의 폴리펩티드 링커에 의해 분리됨)을 갖는다. 이러한 단일 폴리펩티드는 2개의 scFv 단편 사이에 폴리펩티드 스페이서 서열을 추가로 포함한다. 각각의 scFv는 상이한 에피토프를 인식하고, 이들 에피토프는 상이한 세포 유형에 대해 특이적일 수 있어, 2개의 상이한 세포 유형의 세포는, 각각의 scFv가 이의 동족 에피토프에 관여할 때 근접하거나 매인다. 이러한 접근법의 하나의 특정 실시양태는 표적 세포, 예컨대 악성 또는 종양 세포에 의해 발현되는 세포-표면 항원을 인식하는 또 다른 scFv에 연결된, 면역 세포에 의해 발현되는 세포-표면 항원, 예를 들어 T 세포 상의 CD3 폴리펩티드를 인식하는 scFv를 포함한다.
단일 폴리펩티드이기 때문에, 이중특이적 T 세포 관여자는 당분야에 공지된 임의의 원핵 또는 진핵 세포 발현 시스템, 예를 들어 CHO 세포주를 사용하여 발현될 수 있다. 그러나, 특정 정제 기술(예를 들어 EP1691833 참조)이, 단량체성 이중특이적 T 세포 관여자를, 단량체의 의도된 활성 이외의 생물할적 활성을 가질 수 있는 다량체성 종으로부터 분리하는 데 필요할 수 있다. 하나의 예시적 정제 방법에서, 분비된 폴리펩티드를 함유하는 용액을 먼저 금속 친화도 크로마토그래피시키고, 폴리펩티드를 이미다졸 농도 구배에 의해 용리시킨다. 이러한 용리액은 음이온 교환 크로마토그래피를 사용하여 추가로 정제되고, 폴리펩티드는 염화 나트륨 농도 구배에 의해 용리된다. 마지막으로, 이러한 용리액을 크기 배제 크로마토그래피시켜 단량체를 다량체성 종으로부터 분리한다. 한 양태에서, 본 발명에서 사용된 이중특이적 항체는, 펩티드 링커에 의해 서로 융합된 2개의 단쇄 FV 단편(scFV)을 포함하는 단일 폴리펩티드 쇄로 구성된다.
Fc 수용체 결합 및/또는 효과기 기능을 감소시키는 Fc 도메인 변형
본 발명의 항원 결합 분자의 Fc 도메인은, 면역 글로불린 분자의 중쇄 도메인을 포함하는 폴리펩티드 쇄의 쌍으로 이루어진다. 예를 들어, 면역 글로불린 G(IgG) 분자의 Fc 도메인은 이량체이고, 이의 각각의 서브유닛은 CH2 및 CH3 IgG 중쇄 불변 도메인을 포함한다. Fc 도메인의 2개의 서브유닛은 서로 안정하게 회합할 수 있다.
Fc 도메인은, 표적 조직에서의 양호한 축적 및 유리한 조직-혈액 분포비에 기여하는 긴 혈청 반감기를 포함하는 유리한 약동학적 특성을 본 발명의 항원 결합 분자에 부여한다. 그러나, 동시에, 이는 본 발명의 이중특이적 항체를 바람직한 항원-함유 세포보다는 Fc 수용체를 발현하는 세포에 바람직하지 않게 표적화시키는 것을 야기할 수 있다. 따라서, 특정 양태에서, 본 발명의 항원 결합 분자의 Fc 도메인은, 천연 IgG1 Fc 도메인과 비교하여, Fc 수용체에 대해 감소된 결합 친화도 및/또는 감소된 효과기 기능을 나타낸다. 한 양태에서, Fc는 실질적으로 Fc 수용체에 결합하지 않고/않거나 효과기 기능을 유도하지 않는다. 특정 양태에서, Fc 수용체는 Fcγ 수용체이다. 한 양태에서, Fc 수용체는 인간 Fc 수용체이다. 구체적 양태에서, Fc 수용체는 활성화 인간 Fcγ 수용체, 보다 구체적으로 인간 FcγRIIIa, FcγRI 또는 FcγRIIa, 가장 구체적으로 인간 FcγRIIIa이다. 한 양태에서, Fc 도메인은 효과기 기능을 유도하지 않는다. 감소된 효과기 기능은 비제한적으로 하기 중 하나 이상을 포함할 수 있다: 감소된 보체 의존적 세포 독성(CDC), 감소된 항체 의존적 세포 매개된 세포 독성(ADCC), 감소된 항체 의존적 세포 식균 작용(ADCP), 감소된 시토카인 분비, 항원 제시 세포에 의한 감소된 면역 복합체 매개된 항원 흡수, NK 세포에 대한 감소된 결합, 대식세포에 대한 감소된 결합, 단핵구에 대한 감소된 결합, 다형핵 세포에 대한 감소된 결합, 세포자멸을 유도하는 감소된 직접 신호 전달, 감소된 수지상 세포 성숙 또는 감소된 T 세포 프라이밍.
특정 양태에서, 하나 이상의 아미노산 변형은 본원에 제공된 항체의 Fc 영역 내로 도입되어 Fc 영역 변이체를 생산할 수 있다. Fc 영역 변이체는 하나 이상의 아미노산 위치에서 아미노산 변형(예를 들어 치환)을 포함하는 인간 Fc 영역 서열(예를 들어, 인간 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4 Fc 영역)을 포함할 수 있다.
특정 양태에서, 본 발명은, Fc 도메인이 Fc 수용체, 특히 Fcγ 수용체에 대한 결합을 감소시키는 하나 이상의 아미노산 치환을 포함하는, 항체를 제공한다.
한 양태에서, 본 발명의 항체의 Fc 도메인은 Fc 수용체에 대한 Fc 도메인의 결합 친화도 및/또는 효과기 기능을 감소시키는 하나 이상의 아미노산 돌연변이를 포함한다. 전형적으로, 동일한 하나 이상의 아미노산 돌연변이는 Fc 도메인의 2개의 서브유닛 각각에 존재한다. 특히, Fc 도메인은 위치 E233, L234, L235, N297, P331 및 P329(EU 넘버링)에서 아미노산 치환을 포함한다. 특히, Fc 도메인은 IgG 중쇄의 위치 234 및 235(EU 넘버링) 및/또는 329(EU 넘버링)에서 아미노산 치환을 포함한다. 보다 특히, IgG 중쇄에 아미노산 치환 L234A, L235A 및 P329G("P329G LALA", EU 넘버링)을 갖는 Fc 도메인을 포함하는 본 발명에 따른 항체가 제공된다. 아미노산 치환 L234A 및 L235A는 소위 LALA 돌연변이를 지칭한다. 아미노산 치환의 "P329G LALA" 조합은 인간 IgG1 Fc 도메인의 Fcγ 수용체를 거의 완전히 폐지하고 WO 2012/130831 A1(이는 또한 이러한 돌연변이체 Fc 도메인의 생산 방법, 및 이의 특성, 예컨대 Fc 수용체 결합 또는 효과기 기능을 결정하는 방법을 기재함)에 기재되어 있다.
또한, 감소된 Fc 수용체 결합 및/또는 효과기 기능을 갖는 Fc 도메인은 Fc 도메인 잔기 238, 265, 269, 270, 297, 327 및 329 중 하나 이상의 치환을 갖는 것을 포함한다(US 6,737,056). 이러한 Fc 돌연변이체는 아미노산 위치 265, 269, 270, 297 및 327 중 2개 이상에서의 치환을 갖는 Fc 돌연변이체(알라닌으로의 잔기 265 및 297의 치환을 갖는 "DANA" Fc 돌연변이체를 포함함)를 포함한다(US 7,332,581).
또 다른 양태에서, Fc 도메인은 IgG4 Fc 도메인이다. IgG4 항체는, IgG1 항체와 비교하여, Fc 수용체에 대한 감소된 결합 친화도 및 감소된 효과기 기능을 나타낸다. 보다 특정한 양태에서, Fc 도메인은 위치 S228(Kabat 넘버링)에서 아미노산 치환, 특히 아미노산 치환 S228P를 포함하는 IgG4 Fc 도메인이다. 보다 특정한 양태에서, Fc 도메인은 아미노산 치환 L235E, S228P 및 P329G(EU 넘버링)를 포함하는 IgG4 Fc 도메인이다. 이러한 IgG4 Fc 도메인 돌연변이체 및 이의 Fcγ 수용체 결합 특성이 또한 WO 2012/130831에 기재되어 있다.
돌연변이체 Fc 도메인은 당분야에 주지된 유전적 또는 화학적 방법을 사용하여 아미노산 결실, 치환, 삽입 또는 변형에 의해 생산될 수 있다. 유전적 방법은 암호화 DNA 서열의 부위-특이적 돌연변이 유발, PCR, 유전자 합성 등을 포함할 수 있다. 정확한 뉴클레오티드 변화는 예를 들어 서열분석에 의해 확인될 수 있다.
Fc 수용체에 대한 결합을 예를 들어 ELISA에 의해서 또는 비아코어 장비(지이 헬쓰케어)와 같은 표준 장비를 사용하는 표면 플라스몬 공명(SPR)에 의해서 쉽게 측정할 수 있으며 Fc 수용체 자체를 재조합 발현에 의해 수득할 수 있다. 대안적으로, Fc 수용체에 대한 Fc 도메인 또는 Fc 도메인을 포함하는 세포 활성화 항체의 결합 친화도를 특정한 Fc 수용체, 예를 들어 인간 NK 세포 발현 FcγIIIa 수용체를 발현하는 것으로 공지된 세포주를 사용하여 평가할 수 있다.
Fc 도메인, 또는 Fc 도메인을 포함하는 본 발명의 항체의 효과기 기능을 당분야에 공지된 방법에 의해 측정할 수 있다. ADCC를 측정하기에 적합한 분석은 본원에 기재되어 있다. 관심 분자의 ADCC 활성을 평가하기 위한 시험관내 분석의 다른 예는 미국특허 제5,500,362호; 문헌[Hellstrom et al. Proc Natl Acad Sci USA 83, 7059-7063 (1986)] 및 문헌[Hellstrom et al., Proc Natl Acad Sci USA 82, 1499-1502 (1985)]; 미국특허 제5,821,337호; 문헌[Bruggemann et al., J Exp Med 166, 1351-1361 (1987)]에 기재되어 있다. 대안적으로, 비-방사성 분석 방법이 사용될 수 있다(예를 들어 유식 세포측정을 위한 ACTI(상표) 비-방사성 세포독성 분석(셀테크놀로지 인코포레이티드(CellTechnology, Inc.) 미국 캘리포니아주 마운틴뷰 소재); 및 사이토톡스(CytoTox) 96(등록상표) 비-방사성 세포독성 분석(프로메가(Promega), 미국 위스콘신주 매디슨 소재)을 참조한다). 상기와 같은 분석에 유용한 효과기 세포는 말초 혈액 단핵세포(PBMC) 및 천연 살해(NK) 세포를 포함한다. 대안적으로 또는 부가적으로, 상기 관심 분자의 ADCC 활성을 생체내에서, 예를 들어 문헌[Clynes et al., Proc Natl Acad Sci USA 95, 652-656 (1998)]에 개시된 바와 같은 동물 모델에서 평가할 수 있다.
일부 양태에서, 보체 성분, 구체적으로 C1q에 대한 Fc 도메인의 결합은 감소된다. 따라서, Fc 도메인이 감소된 효과기 기능을 갖도록 조작되는 일부 실시양태에서, 상기 감소된 효과기 기능은 감소된 CDC를 포함한다. C1q 결합 분석은 수행되어, 본 발명의 이중특이적 항체가 C1q에 결합할 수 있고 이에 따라 CDC 활성을 갖는지가 결정된다. 예를 들어, WO 2006/029879 및 WO 2005/100402의 C1q 및 C3c 결합 ELISA를 참조한다. 보체 활성화를 평가하기 위해, CDC 분석을 수행할 수 있다(예를 들어 문헌[Gazzano-Santoro et al., J Immunol Methods 202, 163 (1996)]; [Cragg et al., Blood 101, 1045-1052 (2003)]; 및 [Cragg and Glennie, Blood 103, 2738-2743 (2004)] 참조).
이종 이량체화를 촉진하는 Fc 도메인 변형
본 발명의 이중특이적 항원 결합 분자는 상기 Fc 도메인의 2개의 서브유닛 중 하나 또는 다른 하나에 융합된 상이한 항원 결합 부위를 포함하며, 따라서, 상기 Fc 도메인의 2개의 서브유닛은 2개의 동일하지 않은 폴리펩티드 쇄 중에 포함될 수 있다. 이들 폴리펩티드의 재조합 공-발현 및 후속 이량체화는 상기 두 폴리펩티드의 다수의 가능한 조합을 도출한다. 따라서, 재조합체 생성에서 본 발명의 이항체의 수율 및 순도를 개선시키기 위해서, 본 발명의 이중특이적 항원 결합 분자의 Fc 도메인에 목적하는 폴리펩티드의 결합을 촉진하는 변형을 도입시키는 것이 유리할 것이다.
따라서, 특정한 양태에서, 본 발명은 (a) 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인, (b) OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인, 및 (c) 안정하게 회합할 수 있는 제1 및 제2 서브유닛으로 구성된 Fc 도메인을 포함하는 이중특이적 항원 결합 분자에 관한 것으로서, 여기서 Fc 도메인은 Fc 도메인의 제1 및 제2 서브유닛의 회합을 촉진하는 변형을 포함한다. 인간 IgG Fc 도메인의 2개 서브유닛간의 가장 광범위한 단백질-단백질 상호작용 부위는 Fc 도메인의 CH3 도메인에 있다. 따라서, 하나의 양태에서, 상기 변형은 상기 Fc 도메인의 CH3 도메인에 있다.
구체적 양태에서, 상기 변형은 소위 "놉-인투-홀" 변형으로, 상기 Fc 도메인의 2개의 서브유닛 중 하나에 "놉" 변형 및 상기 Fc 도메인의 2개의 서브유닛 중 다른 하나에 "홀" 변형을 포함한다. 따라서, 본 발명은 (a) 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인, (b) OX40에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인, 및 (c) 안정하게 회합할 수 있는 제1 및 제2 서브유닛으로 구성된 Fc 도메인을 포함하는 항원 결합 분자에 관한 것으로서, 여기서 놉-인투-홀 방법에 따라 Fc 도메인의 제1 서브유닛은 놉을 포함하고 Fc 도메인의 제2 서브유닛은 홀을 포함한다. 특정한 양태에서, 상기 Fc 도메인의 제1 서브유닛은 아미노산 치환 S354C 및 T366W(EU 넘버링)를 포함하고 상기 Fc 도메인의 제2 서브유닛은 아미노산 치환 Y349C, T366S 및 Y407V(카바트 EU 지수에 따른 넘버링)를 포함한다.
놉-인투-홀 기술은 예를 들어 미국특허 제5,731,168호; 미국특허 제7,695,936호; 문헌[Ridgway et al., Prot Eng 9, 617-621 (1996)] 및 문헌[Carter, J Immunol Meth 248, 7-15 (2001)]에 기재되어 있다. 일반적으로, 상기 방법은 돌기가 이종이량체 형성을 촉진하고 동종이량체 형성을 방해하도록 공동 내에 위치할 수 있게 상기 돌기("놉")를 제1 폴리펩티드의 접촉면에 도입시키고 상응하는 공동("홀")을 제2 폴리펩티드의 접촉면에 도입시킴을 수반한다. 돌기는 제1 폴리펩티드의 접촉면으로부터의 작은 아미노산 측쇄를 보다 큰 측쇄(예를 들어 티로신 또는 트립토판)로 교체시킴으로써 구축된다. 돌기와 동일하거나 유사한 크기의 보상 공동이, 큰 아미노산 측쇄를 보다 작은 것(예를 들어 알라닌 또는 트레오닌)으로 교체시킴으로써 제2 폴리펩티드의 접촉면에 생성된다.
따라서, 하나의 양태에서, 본 발명의 이중특이적 항원 결합 분자의 Fc 도메인의 제1 서브유닛의 CH3 도메인에서 아미노산 잔기를 보다 큰 측쇄 부피를 갖는 아미노산 잔기로 교체시키고, 이에 의해 제2 서브유닛의 CH3 도메인내의 공동에 위치할 수 있는 제1 서브유닛의 CH3 도메인 내에 돌기를 생성시키고, 상기 Fc 도메인의 제2 서브유닛의 CH3 도메인에서 아미노산 잔기를 보다 작은 측쇄 부피를 갖는 아미노산 잔기로 교체시키고, 이에 의해 제1 서브유닛의 CH3 도메인내의 돌기가 위치할 수 있는 제2 서브유닛의 CH3 도메인 내에 공동을 생성시킨다. 상기 돌기 및 공동은, 예를 들어 부위-특이적 돌연변이 유도에 의해서, 또는 펩티드 합성에 의해서 상기 폴리펩티드를 암호화하는 핵산을 변경시킴으로써 생산될 수 있다. 특정한 양태에서, 상기 Fc 도메인의 제1 서브유닛의 CH3 도메인에서 366번 위치의 트레오닌 잔기를 트립토판 잔기로 교체시키고(T366W), 상기 Fc 도메인의 제2 서브유닛의 CH3 도메인에서 407번 위치의 티로신 잔기를 발린 잔기로 교체시킨다(Y407V). 하나의 양태에서, 상기 Fc 도메인의 제2 서브유닛에서, 추가로 366번 위치의 트레오닌 잔기를 세린 잔기로 교체시키고(T366S) 368번 위치의 류신 잔기를 알라닌 잔기로 교체시킨다(L368A).
또 다른 추가의 양태에서, Fc 도메인의 제1 서브유닛에서 추가로 354번 위치의 세린 잔기를 시스테인 잔기로 교체시키고(S354C), Fc 도메인의 제2 서브유닛에서 추가로 349번 위치의 티로신 잔기를 시스테인 잔기로 교체시킨다(Y349C). 이들 두 시스테인 잔기의 도입은 Fc 도메인의 2개 서브유닛간에 다이설파이드 가교를 형성시키며, 이는 상기 이량체를 추가로 안정화시킨다(문헌[Carter (2001), J Immunol Methods 248, 7-15]). 특정한 양태에서, Fc 도메인의 제1 서브유닛은 아미노산 치환 S354C 및 T366S(EU 넘버링)를 포함하고 Fc 도메인의 제2 서브유닛은 아미노산 치환 Y349C, T366S 및 Y407V(카바트 EU 지수에 따른 넘버링)를 포함한다.
대안적 양태에서, Fc 도메인의 제1 및 제2 서브유닛의 결합을 촉진하는 변형은 예를 들어 WO 2009/089004에 기재된 바와 같은 정전기적 스티어링 효과를 매개하는 변형을 포함한다. 일반적으로, 상기 방법은 2개의 Fc 도메인 서브유닛의 접촉면에서, 하나 이상의 아미노산 잔기를 하전된 아미노산 잔기에 의해 교체시킴을 수반함으로써 동종이량체 형성은 정전기적으로 불리하게 되지만 이종 이량체화는 정전기적으로 유리하게 된다.
본원에 보고된 바와 같은 이중특이적 항체의 중쇄의 C-말단은 아미노산 잔기 PGK로 종결되는 완전한 C-말단일 수 있다. 중쇄의 C-말단은 C-말단 아미노산 잔기 중 하나 또는 2개가 제거된 단축된 C-말단일 수 있다. 하나의 바람직한 양태에서, 중쇄의 C-말단은 PG로 종결되는 단축된 C-말단이다. 본원에 보고된 바와 같은 모든 양태 중 하나의 양태에서, 본원에 명시된 바와 같은 C-말단 CH3 도메인을 포함하는 중쇄를 포함하는 이중특이적 항체는 C-말단 글리신-리신 다이펩티드(G446 및 K447, 카바트 EU 지수에 따른 넘버링)를 포함한다. 본원에 보고된 바와 같은 모든 양태 중 하나의 실시양태에서, 본원에 명시된 바와 같은 C-말단 CH3 도메인을 포함하는 중쇄를 포함하는 이중특이적 항체는 C-말단 글리신 잔기(G446, 카바트 EU 지수에 따른 넘버링)를 포함한다.
Fab 도메인의 변형
한 양태에서, 본 발명은, VH 및 VL의 가변 도메인 또는 CH1 및 CL의 불변 도메인이 교환된, 하나 이상의 Fab 단편을 포함하는 이중특이적 항체에 관한 것이다. 이중특이적 항체는 Crossmab 기술에 따라 생산된다.
하나의 결합 아암에 도메인 교체/교환을 갖는 다중특이적 항체(CrossMabVH-VL 또는 CrossMabCH-CL)가 WO 2009/080252 및 문헌[Schaefer, W. et al, PNAS, 108 (2011) 11187-1191]에 상세히 기재되어 있다. 이는 제1 항원에 대한 경쇄와 제2 항원에 대한 틀린 중쇄와의 오합치에 의해 야기되는 부산물을 명백히 감소시킨다(상기와 같은 도메인 교환이 없는 접근법에 비해).
한 양태에서, 본 발명은, 불변 도메인 CL 및 CH1이 서로 대체되어, CH1 도메인이 경쇄의 부분이고, CL 도메인이 중쇄의 부분인, Fab 단편을 포함하는 이중특이적 항원 결합 분자에 관한 것이다.
또 다른 양태에서, 본 발명은, 가변 도메인 VL 및 VH이 서로 대체되어, VH 도메인이 경쇄의 부분이고, VL 도메인이 중쇄의 부분인, Fab 단편을 포함하는 이중특이적 항원 결합 분자에 관한 것이다.
또 다른 양태에서, 정확한 페어링을 추가로 개선하기 위해, 이중특이적 항원 결합은 상이한 하전된 아미노산 치환(소위 "하전된 잔기")를 함유할 수 있다. 이들 변형은 교차되거나 교차되지 않은 CH1 및 CL 도메인에 도입될 수 있다. 특정 양태에서, 본 발명은, 위치 123(EU 넘버링)의 아미노산이 아르기닌(R)으로 대체되고, 위치 124(EU 넘버링)의 아미노산이 리신(K)으로 치환되고, CH1 도메인 중 하나에서 위치 147(EU 넘버링) 및 위치 213(EU 넘버링)의 아미노산이 글루탐산(E)으로 치환된, 이중특이적 항원 결합 분자에 관한 것이다.
폴리뉴클레오티드
본 발명은 본원에 기재된 항체 또는 이의 단편을 암호화하는 단리된 폴리뉴클레오티드를 추가로 제공한다.
본 발명의 항체를 암호화하는 단리된 폴리뉴클레오티드를 전체 항원 결합 분자를 암호화하는 단일 폴리뉴클레오티드로서 또는 공-발현되는 다수의(예를 들어 2개 이상의) 폴리뉴클레오티드로서 발현시킬 수 있다. 공-발현되는 폴리뉴클레오티드에 의해 암호화되는 폴리펩티드는 예를 들어 다이설파이드 결합 또는 다른 수단을 통해 회합하여 기능성 항원 결합 분자를 형성시킬 수 있다. 예를 들어, 면역 글로불린의 경쇄 부분은 상기 면역 글로불린의 중쇄 부분으로부터 별도의 폴리뉴클레오티드에 의해 암호화될 수 있다. 공-발현시, 상기 중쇄 폴리펩티드는 상기 경쇄 폴리펩티드와 회합하여 면역 글로불린을 형성할 것이다.
일부 양태에서, 단리된 폴리뉴클레오티드는 본원에 기재된 본 발명에 따른 전체 항체를 암호화한다. 다른 실시양태에서, 단리된 폴리뉴클레오티드는 본원에 기재된 본 발명에 따른 항체에 포함되는 폴리펩티드를 암호화한다.
특정 실시양태에서, 상기 폴리뉴클레오티드 또는 핵산은 DNA이다. 다른 실시양태에서, 본 발명의 폴리뉴클레오티드는 RNA, 예를 들어 전령 RNA(mRNA)의 형태의 RNA이다. 본 발명의 RNA는 단일 가닥 또는 이중 가닥일 수 있다.
재조합 방법
본 발명에 사용된 이중특이적 항체는 예를 들어 고상 펩티드 합성(예를 들어 메리필드(Merrifield) 고상 합성) 또는 재조합 생산에 의해 수득할 수 있다. 재조합체 생산을 위해서 예를 들어 상기에 기재된 바와 같이 항체를 암호화하는 하나 이상의 폴리뉴클레오티드 또는 이의 폴리펩티드 단편은 단리되고, 숙주 세포에서 추가적 클로닝 및/또는 발현을 위해 하나 이상의 벡터 내로 삽입된다. 이러한 폴리뉴클레오티드는 종래의 절차를 사용하여 용이하게 단리되고 서열분석될 수 있다. 본 발명의 하나의 양태에서, 본 발명의 폴리뉴클레오티드 중 하나 이상을 포함하는 벡터, 바람직하게는 발현 벡터를 제공한다. 당분야의 숙련가에게 주지된 방법을 사용하여 적합한 전사/번역 조절 신호와 함께 상기 항체(단편)의 암호화 서열을 함유하는 발현 벡터를 구축할 수 있다. 상기 방법은 시험관내 재조합 DNA 기법, 합성 기법 및 생체내 재조합/유전자 재조합을 포함한다. 예를 들어 문헌[Maniatis et al., MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. (1989)]; 및 문헌[Ausubel et al., CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, Greene Publishing Associates and Wiley Interscience, N.Y. (1989)]에 기재된 기법을 참조한다. 발현 벡터는 플라스미드, 바이러스의 부분 또는 핵산 단편일 수 있다. 상기 발현 벡터는 발현 카세트를 포함하며, 카세트 내로 항체 또는 이의 폴리펩티드 단편을 암호화하는 폴리뉴클레오티드(즉 암호화 영역)가 프로모터 및/또는 다른 전사 또는 번역 조절 요소와 함께 작동가능하게 회합되어 클로닝된다. 본원에 사용되는 바와 같이, "암호화 영역"은 아미노산으로 번역된 코돈으로 이루어지는 핵산의 일부이다. "정지 코돈"(TAG, TGA 또는 TAA)은 아미노산으로 번역되지 않지만, (존재하는 경우) 암호화 영역의 부분인 것으로 간주될 수 있고, 임의의 인접 서열, 예를 들어 프로모터, 리보솜 결합 부위, 전사 종결자, 인트론, 5' 및 3' 번역되지 않은 영역 등은 암호화 영역의 부분이 아니다. 2개 이상의 암호화 영역이 단일 폴리뉴클레오티드 구축물에, 예를 들어 단일 벡터 상에, 또는 별도의 폴리뉴클레오티드 구축물에, 예를 들어 별도의(상이한) 벡터 상에 존재할 수 있다. 더욱 또한, 임의의 벡터는 단일 암호화 영역을 함유하거나 2개 이상의 암호화 영역을 포함할 수 있고, 예를 들어 본 발명의 벡터는 하나 이상의 폴리펩티드를 암호화할 수 있으며, 이는 단백질 분해 절단을 통해 최종 단백질로 번역-후 또는 번역과 함께 분리된다. 또한, 본 발명의 벡터, 폴리뉴클레오티드 또는 핵산은 본 발명의 항체 또는 이의 폴리펩티드 단편을 암호화하는 폴리뉴클레오티드, 또는 이의 변이체 또는 유도체에 융합되거나 융합되지 않은 이종 암호화 영역을 암호화할 수 있다. 이종 암호화 영역은 비제한적으로 전문화된 요소 또는 모티프, 예를 들어 분비 신호 펩티드 또는 이종 기능성 도메인을 포함한다. 작동성 회합은 유전자 산물의 암호화 영역, 예를 들어 폴리펩티드가, 상기 유전자 산물의 발현을 조절 서열의 영향 또는 통제 하에 두는 방식으로 하나 이상의 조절 서열과 회합하는 경우이다. 2개의 DNA 단편(예를 들어 폴리펩티드 암호화 영역 및 상기와 회합된 프로모터)은 프로모터 기능의 유도가 목적하는 유전자 산물을 암호화하는 mRNA의 전사를 생성시키고 상기 두 DNA 단편간의 결합의 성질이 유전자 산물의 발현을 지시하는 발현 조절 서열의 능력을 방해하지 않거나 DNA 주형이 전사되는 능력을 방해하지 않는 경우 "작동적으로 회합된다". 따라서, 프로모터 영역은 프로모터가 핵산의 전사를 실행할 수 있는 경우 폴리펩티드를 암호화하는 핵산과 작동적으로 회합될 것이다. 프로모터는 오직 예정된 세포에서만 DNA의 실질적인 전사를 지시하는 세포-특이적 프로모터일 수 있다. 프로모터 외에, 다른 전사 조절 요소, 예를 들어 인핸서, 오퍼레이터, 리프레서, 및 전사 종결 신호가 폴리뉴클레오티드와 작동적으로 회합되어 세포-특이적 전사를 지시할 수 있다.
적합한 프로모터 및 다른 전사 조절 영역을 본원에 개시한다. 다양한 전사 조절 영역이 당분야의 숙련가에게 공지되어 있다. 여기에는 비제한적으로 척추동물 세포에서 기능하는 전사 조절 영역, 예를 들어 비제한적으로 거대세포 바이러스로부터의 프로모터 및 인핸서 분절(예를 들어 인트론-A와 함께, 전초기 프로모터), 유인원 바이러스 40(예를 들어 초기 프로모터), 및 레트로바이러스(예를 들어 라우스 육종 바이러스)를 포함한다. 다른 전사 조절 영역은 척추동물 유전자로부터 유래된 것, 예를 들어 액틴, 열충격 단백질, 소 성장 호르몬 및 토끼 a-글로빈뿐만 아니라 진핵생물 세포에서 유전자 발현을 조절할 수 있는 다른 서열을 포함한다. 추가의 적합한 전사 조절 영역은 조직-특이적 프로모터 및 인핸서뿐만 아니라 유도성 프로모터(예를 들어 프로모터 유도성 테트라사이클린)를 포함한다. 유사하게, 다양한 번역 조절 요소가 당분야의 통상적인 숙련가에게 공지되어 있다. 여기에는 비제한적으로 리보솜 결합 부위, 번역 개시 및 종결 코돈, 및 바이러스 시스템으로부터 유래된 요소(특히 내부 리보솜 진입 부위, 또는 IRES, 또한 CITE 서열로서 지칭됨)가 있다. 상기 발현 카세트는 또한 다른 특징, 예를 들어 복제 기원, 및/또는 염색체 통합 요소, 예를 들어 레트로바이러스 긴 말단 반복부(LTR), 또는 아데노-회합된 바이러스(AAV) 반전 말단 반복부(ITR)를 포함할 수 있다.
본 발명의 폴리뉴클레오티드 및 핵산 암호화 영역을 분비 또는 신호 펩티드(본 발명의 폴리뉴클레오티드에 의해 암호화된 폴리펩티드의 분비를 지시한다)를 암호화하는 추가적인 암호화 영역과 회합시킬 수 있다. 예를 들어, 항체 또는 이의 폴리펩티드 단편의 분비를 원하는 경우, 신호 서열을 암호화하는 DNA를 상기 핵산 본 발명의 항체 또는 이의 폴리펩티드 단편의 상류에 둘 수 있다. 상기 신호 가설에 따라, 포유동물 세포에 의해 분비된 단백질은, 일단 거친 소포체를 가로질러 성장하는 단백질 쇄의 수출이 개시되었으면, 성숙한 단백질로부터 절단된 신호 펩티드 또는 분비 리더 서열을 갖는다. 당분야의 통상적인 숙련가는 척추동물 세포에 의해 분비된 폴리펩티드가 일반적으로 폴리펩티드의 N-말단에 융합된 신호 펩티드(이는 번역된 폴리펩티드로부터 절단되어 폴리펩티드의 분비된 또는 "성숙한" 형태를 생성시킨다)를 가짐을 안다. 일부 실시양태에서, 천연의 신호 펩티드, 예를 들어 면역 글로불린 중쇄 또는 경쇄 신호 펩티드, 또는 상기와 작동적으로 회합된 폴리펩티드의 분비를 지시하는 능력을 유지하는 서열의 기능성 유도체가 사용된다. 대안적으로, 이종 포유동물 신호 펩티드, 또는 이의 기능성 유도체를 사용할 수 있다. 예를 들어, 상기 야생형 리더 서열을 인간 조직 플라스미노겐 활성제(TPA) 또는 마우스 β-글루쿠로니다제의 리더 서열로 치환시킬 수 있다.
나중의 정제를 촉진하거나(예를 들어 히스티딘 태그) 또는 융합 단백질의 라벨링을 지원하는 데 사용될 수 있는 짧은 단백질 서열을 암호화하는 DNA를, 본 발명의 항체 또는 이의 폴리펩티드 단편을 암호화하는 폴리뉴클레오티드 내에 또는 상기의 단부에 포함시킬 수 있다.
본 발명의 추가의 양태에서, 본 발명의 하나 이상의 폴리뉴클레오티드를 포함하는 숙주 세포가 제공된다. 특정 실시양태에서, 본 발명의 하나 이상의 벡터를 포함하는 숙주 세포가 제공된다. 폴리뉴클레오티드 및 벡터는 각각 폴리뉴클레오티드 및 벡터와 관련하여 본원에 기재된 특징 중 어느 하나를 단독으로 또는 함께 통합할 수 있다. 하나의 양태에서, 숙주 세포는 본 발명의 항체(의 부분)를 암호화하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 벡터를 포함한다(예를 들어 상기 벡터로 형질전환되거나 형질감염되었다). 본원에 사용되는 바와 같이, "숙주 세포"란 용어는 본 발명의 융합 단백질 또는 이의 단편을 생산하도록 조작될 수 있는 임의의 종류의 세포계를 지칭한다. 항원 결합 분자를 복제하고 이의 발현을 지지하기에 적합한 숙주 세포는 당분야에 주지되어 있다. 상기와 같은 세포를 특정한 발현 벡터로 적합하게 형질감염시키거나 형질도입시킬 수 있으며 다량의 벡터-함유 세포를 대규모 발효기의 시딩을 위해 증식시켜 임상용으로 충분한 양의 항원 결합 분자를 수득할 수 있다. 적합한 숙주 세포는 원핵 미생물, 예를 들어 에스케리키아 콜라이, 또는 다양한 진핵생물 세포, 예를 들어 중국 햄스터 난소 세포(CHO), 곤충 세포 등을 포함한다. 예를 들어 폴리펩티드를, 특히 글리코실화가 필요하지 않은 경우, 세균 중에 생산할 수 있다. 발현 후에, 상기 폴리펩티드를 용액 분획 중 세균 세포 페이스트로부터 단리하고 추가로 정제할 수 있다. 원핵생물 외에, 진핵 미생물, 예를 들어 섬유상 진균 또는 효모, 예를 들어 글리코실화 경로가 "인간화되어" 부분적이거나 완전한 인간 글리코실화 패턴을 갖는 폴리펩티드를 생산하는 진균 및 효모 균주가 폴리펩티드-암호화 벡터에 적합한 클로닝 또는 발현 숙주이다. 문헌[Gerngross, Nat Biotech 22, 1409-1414 (2004)], 및 문헌[Li et al., Nat Biotech 24, 210-215 (2006)]을 참조한다.
(글리코실화된) 폴리펩티드의 발현에 적합한 숙주 세포는 또한 다세포 유기체(무척추동물 및 척추동물)로부터 유래된다. 무척추동물 세포의 예는 식물 및 곤충 세포이다. 특히 스포도프테라 프루기페르다(Spodoptera frugiperda) 세포의 형질감염을 위해, 곤충 세포와 함께 사용될 수 있는 다수의 바큘로바이러스 균주가 동정되었다. 식물 세포 배양물을 또한 숙주로서 사용할 수 있다. 예를 들어 미국특허 제5,959,177호, 미국특허 제6,040,498호, 미국특허 제6,420,548호, 미국특허 제7,125,978호 및 미국특허 제6,417,429호(트랜스제닉 식물에서 항체를 생성시키기 위한 플랜티바디스(PLANTIBODIES)(상표) 기술을 개시한다)를 참조한다. 척추동물 세포를 또한 숙주로서 사용할 수 있다. 예를 들어, 현탁액에서 증식시키기에 적합한 포유동물 세포주가 유용할 수 있다. 유용한 포유동물 숙주 세포주의 다른 예는 SV40(COS-7)에 의해 형질전환된 원숭이 신장 CV1 계통; 인간 배아 신장 계통(예를 들어 문헌[Graham et al., J Gen Virol 36, 59 (1977)]에 기재된 바와 같은 293 또는 293T 세포), 아기 햄스터 신장세포(BHK), 마우스 세르톨리 세포(예를 들어 문헌[Mather, Biol Reprod 23, 243-251 (1980)]에 기재된 바와 같은 TM4 세포), 원숭이 신장세포(CV1), 아프리카 녹색 원숭이 신장세포(VERO-76), 인간 경부암종 세포(HELA), 개 신장세포(MDCK), 버팔로 래트 간세포(BRL 3A), 인간 폐세포(W138), 인간 간세포(Hep G2), 마우스 유방 종양세포(MMT 060562), TRI 세포(예를 들어 문헌[Mather et al., Annals N.Y. Acad Sci 383, 44-68 (1982)]에 기재된 바와 같은), MRC 5 세포, 및 FS4 세포이다. 다른 유용한 포유동물 숙주 세포주는 중국 햄스터 난소(CHO) 세포, 예를 들어 dhfr- CHO 세포(문헌[Urlaub et al., Proc Natl Acad Sci USA 77, 4216 (1980)]); 및 골수종 세포주, 예를 들어 YO, NS0, P3X63 및 Sp2/0을 포함한다. 단백질 생산에 적합한 몇몇 포유동물 숙주 세포주의 리뷰를 위해서, 예를 들어 문헌[Yazaki and Wu, Methods in Molecular Biology, Vol. 248 (B.K.C. Lo, ed., Humana Press, Totowa, NJ), pp. 255-268 (2003)]을 참조한다. 숙주 세포는 배양된 세포, 예를 들어 단지 몇 개를 언급하자면, 포유동물 배양된 세포, 효모 세포, 곤충 세포, 세균 세포 및 식물 세포뿐만 아니라, 트랜스제닉 동물, 트랜스제닉 식물 또는 배양된 식물 또는 동물 조직 내에 포함된 세포를 포함한다. 하나의 실시양태에서, 상기 숙주 세포는 진핵생물 세포, 바람직하게는 포유동물 세포, 예를 들어 중국 햄스터 난소(CHO) 세포, 인간 배신장(HEK) 세포 또는 림프양 세포(예를 들어 Y0, NS0, Sp20 세포)이다. 이들 시스템에서 외래 유전자를 발현시키는 표준 기술은 당분야에 공지되어 있다. 면역 글로불린의 중쇄 또는 경쇄를 포함하는 폴리펩티드를 발현하는 세포를, 상기 발현된 생성물이 중쇄 및 경쇄를 모두 갖는 면역 글로불린이도록 상기 면역 글로불린 쇄의 다른 하나를 또한 발현하도록 조작할 수 있다.
하나의 양태에서, 본 발명의 항체 또는 이의 폴리펩티드 단편의 생산 방법을 제공하며, 여기에서 상기 방법은 본 발명의 항체 또는 이의 폴리펩티드 단편을 암호화하는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 숙주 세포를, 본 발명의 항체 또는 이의 폴리펩티드 단편의 발현에 적합한 조건하에서 본원에 제공된 바와 같이 배양하고, 상기 숙주 세포(또는 숙주 세포 배양 배지)로부터 본 발명의 항체 또는 이의 폴리펩티드 단편을 회수함을 포함한다.
특정 실시양태에서, 항원 결합 분자의 부분을 형성할 수 있는 표적 세포 항원(예를 들어 Fab 단편)에 특이적으로 결합할 수 있는 모이어티는 항원에 결합할 수 있는 면역 글로불린 가변 영역을 적어도 포함한다. 가변 영역은 자연 또는 비-자연 발생 항체 또는 이의 단편의 부분을 형성할 수 있거나 이로부터 유래될 수 있다. 다클론 항체 및 단클론 항체의 생산 방법은 당분야에 주지되어 있다(예를 들어 문헌[Harlow and Lane, "Antibodies, a laboratory manual", Cold Spring Harbor Laboratory, 1988] 참조). 비-자연 발생 항체는 고상-펩티드 합성을 사용하여 구축될 수 있거나, 재조합으로 생산될 수 있거나(예를 들어 US 4,186,567에 기재됨) 가변 중쇄 및 가변 경쇄를 포함하는 조합 라이브러리를 스크리닝함으로써 수득될 수 있다(예를 들어 US 5,969,108(McCafferty) 참조).
임의의 동물 종의 면역 글로불린이 본 발명에 사용될 수 있다. 본 발명에서 유용한 비제한적인 면역 글로불린은 뮤린, 영장류 또는 인간 기원의 것일 수 있다. 융합 단백질이 인간 용도를 위해 의도되는 경우, 면역 글로불린의 키메라 형태가 사용될 수 있고, 여기서 면역 글로불린의 불변 영역이 인간으로부터 기원한 것이다. 또한, 인간화되거나 완전한 인간 형태의 면역 글로불린이 당분야에 주지된 방법에 따라 생산될 수 있다(예를 들어 US 5,565,332(Winter) 참조). 인간화는 비제한적으로 하기를 포함하는 다양한 방법에 의해 달성될 수 있다: (a) 중요한 골격 잔기(예를 들어 양호한 항원 결합 친화도 또는 항체 기능을 유지하는 데 중요한 것)를 유지하거나 유지하지 않으면서, 비-인간(예를 들어, 공여자 항체) CDR을 인간(예를 들어 수용자 항체) 골격 및 불변 영역에 그래프팅함, (b) 단지 비-인간 특이성-결정 영역(SDR 또는 a-CDR; 항체-항원 상호작용에 중요한 잔기)을 인간 골격 및 불변 영역에 그래프팅함, 또는 (c) 전체 비-인간 가변 도메인을 이식하나 이를 인간-유사 절편으로 표면 잔기의 대체에 의해 "클로킹함(cloaking)". 인간화된 항체 및 이의 생산 방법은 예를 들어 문헌[Almagro and Fransson, Front Biosci 13, 1619-1633 (2008)]에 검토되어 있고, 예를 들어 문헌[Riechmann et al., Nature 332, 323-329 (1988)]; [Queen et al., Proc Natl Acad Sci USA 86, 10029-10033 (1989)]; US 5,821,337, 7,527,791, 6,982,321 및 7,087,409; 문헌[Jones et al., Nature 321, 522-525 (1986)]; [Morrison et al., Proc Natl Acad Sci 81, 6851-6855 (1984)]; [Morrison and Oi, Adv Immunol 44, 65-92 (1988)]; [Verhoeyen et al., Science 239, 1534-1536 (1988)]; [Padlan, Molec Immun 31(3), 169-217 (1994)]; [Kashmiri et al., Methods 36, 25-34 (2005) (describing SDR (a-CDR) grafting)]; [Padlan, Mol Immunol 28, 489-498 (1991) (describing "resurfacing")]; [Dall'Acqua et al., Methods 36, 43-60 (2005) (describing "FR shuffling")]; 및 [Osbourn et al., Methods 36, 61-68 (2005) and Klimka et al., Br J Cancer 83, 252-260 (2000) (describing the "guided selection" approach to FR shuffling)]에 추가로 기재되어 있다. 본 발명에 따른 특정 면역 글로불린은 인간 면역 글로불린이다. 인간 항체 및 인간 가변 영역은 당분야에 공지된 다양한 기술을 사용하여 생산될 수 있다. 인간 항체는 일반적으로 문헌[van Dijk and van de Winkel, Curr Opin Pharmacol 5, 368-74 (2001)] 및 [Lonberg, Curr Opin Immunol 20, 450-459 (2008)]에 기재되어 있다. 인간 가변 영역은, 하이브리도마 방법에 의해 생산된 인간 단클론 항체의 일부를 형성할 수 있거나 이로부터 유래될 수 있다(예를 들어 문헌[Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, pp. 51-63 (Marcel Dekker, Inc., New York, 1987)] 참조). 또한, 인간 항체 및 인간 가변 영역은, 항원 챌린지에 대한 반응으로 완전 인간 항체 또는 인간 가변 영역을 갖는 완전 항체를 생산하도록 변형된 형질전환된 동물에게 면역원을 투여함으로써 생산될 수 있다(예를 들어 문헌[Lonberg, Nat Biotech 23, 1117-1125 (2005)] 참조). 또한, 인간 항체 및 인간 가변 영역은, 인간-유래된 파지 디스플레이 라이브러리로부터 선택된 Fv 클론 가변 영역 서열을 단리시킴으로써 생산될 수 있다(예를 들어 문헌[Hoogenboom et al. in Methods in Molecular Biology 178, 1-37 (O'Brien et al., ed., Human Press, Totowa, NJ, 2001)]; 및 [McCafferty et al., Nature 348, 552-554; Clackson et al., Nature 352, 624-628 (1991)] 참조). 파지는 전형적으로 항체 단편을 단쇄 Fv(scFv) 단편 또는 Fab 단편으로서 나타낸다.
특정 양태에서, 항체는, WO 2012/020006(친화도 성숙에 관한 실시예 참조) 또는 US 2004/0132066에 개시된 방법에 따라 증진된 결합 친화도를 갖도록 조작된다. 특정 항원 결정인자에 결합하는 본 발명의 항원 결합 분자의 능력은 효소-결합된 면역 흡착 분석(ELISA)또는 당업자에게 친숙한 다른 기술, 예를 들어 표면 플라스몬 공명 기술(문헌[Liljeblad, et al., Glyco J 17, 323-329 (2000)]), 및 종래의 결합 분석(문헌[Heeley, Endocr Res 28, 217-229 (2002)])을 통해 측정될 수 있다. 경쟁 분석은 특정 항원에 대한 결합에 대해 기준 항체와 경쟁하는 항원 결합 분자를 확인하는 데 사용될 수 있다. 특정 실시양태에서, 이러한 경쟁하는 항원 결합 분자는 기준 항원 결합 분자에 의해 결합되는, 동일한 에피토프(예를 들어 선형 또는 형태 에피토프)에 결합한다. 항원 결합 분자가 결합하는 에피토프를 맵핑하는 상세한 예시적 방법은 문헌[Morris (1996) "Epitope Mapping Protocols", in Methods in Molecular Biology vol. 66 (Humana Press, Totowa, NJ)]에 제공된다. 예시적 경쟁 분석에서, 고정된 항원은 항원에 결합하는 라벨링된 제1 항원 결합 분자, 및 항원에 대한 결합에 대해 제1 항원 결합 분자와 경쟁하는 능력에 대해 시험할 라벨링되지 않은 제2 항원 결합 분자를 포함하는 용액에서 항온처리된다. 제2 항원 결합 분자는 하이브리도마 상청액에 존재할 수 있다. 대조군으로서, 고정된 항원은 라벨링된 제1 항원 결합 분자를 포함하나 라벨링되지 않은 제2 항원 결합 분자를 포함하지 않는 용액에서 항온처리된다. 항원에 대한 제1 항체의 결합에 대해 관대한 조건 하에 항온처리 후에, 과량의 미결합된 항체가 제거되고, 고정된 항원에 결합된 라벨의 양을 측정한다. 고정된 항원에 결합된 라벨의 양이 대조군 샘플과 비교하여 시험 샘플에서 실질적으로 감소된 경우, 이는 제2 항원 결합 분자가 항원에 대한 결합에 대해 제1 항원 결합 분자와 경쟁적임을 시사한다. 문헌[Harlow and Lane (1988) Antibodies: A Laboratory Manual ch.14 (Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY)]을 참조한다.
본원에 기재된 바와 같이 생산된 본 발명의 항체를 당분야에 공지된 기법, 예를 들어 고성능 액체 크로마토그래피, 이온 교환 크로마토그래피, 젤 전기영동, 친화도 크로마토그래피, 크기 배제 크로마토그래피 등에 의해 정제할 수 있다. 특정 단백질의 정제에 사용되는 실제 조건은 부분적으로, 순 전하, 소수성, 친수성 등과 같은 인자에 의존할 것이며, 이는 당분야의 숙련가에게 자명할 것이다. 친화도 크로마토그래피 정제를 위해서 상기 항원 결합 분자가 결합하는 항체, 리간드, 수용체 또는 항원을 사용할 수 있다. 예를 들어 본 발명의 이중특이적 항체의 친화도 크로마토그래피 정제를 위해서, 단백질 A 또는 단백질 G를 갖는 기질을 사용할 수 있다. 연속적인 단백질 A 또는 G 친화도 크로마토그래피 및 크기 배제 크로마토그래피를 사용하여 필수적으로 실시예에 기재된 바와 같이 항원 결합 분자를 단리할 수 있다. 상기 항원 결합 분자 또는 이의 단편의 순도를 젤 전기영동, 고압 액체 크로마토그래피 등을 포함한 임의의 다양한 주지된 분석 방법에 의해 측정할 수 있다. 예를 들어, 상기 실시예에 기재된 바와 같은 항체는 환원 및 비-환원 SDS-PAGE에 의해 입증된 바와 같이 온전하며 적합하게 조립된 것으로 나타났다.
분석
본원에 제공된 항원 결합 분자는 당분야에 공지된 다양한 분석에 의해 이의 물리적/화학적 특성 및/또는 생물학적 활성에 대해 확인되거나 스크리닝되거나 특성규명될 수 있다.
1. 친화도 분석
상응하는 수용체에 대한 본원에 제공된 이중특이적 항원 결합 분자의 친화도는 표준 기기, 예컨대 비아코어 기기(지이 헬쓰케어)를 사용하여 표면 플라스몬 공명(SPR)에 의해 실시예에 제시된 방법에 따라 결정될 수 있고, 수용체 또는 표적 단백질은 재조합 발현에 의해 생산될 수 있다. 또한, 표적 세포 항원에 대한 이중특이적 항원 결합 분자의 친화도는 표준 기기, 예컨대 비아코어 기기(지이 헬쓰케어)를 사용하는 표면 플라스몬 공명(SPR)에 의해 결정될 수 있고, 수용체 또는 표적 단백질은 재조합 발현에 의해 생산될 수 있다. FAP-OX40 이중특이적 항체의 경우, 상기 방법은 WO 2017/055398 A2 또는 WO 2017/060144 A1에 보다 상세히 기재되어 있다. 한 양태에 따라, KD는 25℃에서 비아코어(등록상표) T100 기계(지이 헬쓰케어)를 사용하여 표면 플라스몬 공명에 의해 측정된다.
2. 결합 분석 및 기타 분석
한 양태에서, 본원에 보고된 FAP-OX40 이중특이적 항체는, WO 2017/055398 A2 또는 WO 2017/060144 A1에 보다 상세히 기재된 바와 같이 이의 항원 결합 활성에 대해 시험된다.
3. 활성 분석
한 양태에서, 표적화된 OX40 이중특이적 항원 결합 분자의 생물학적 활성을 확인하기 위한 분석이 제공된다.
특정 실시양태에서, 본원에 보고된 항체는 이러한 생물학적 활성에 대해 시험된다.
약학 조성물, 제형 및 투여 경로
추가적 양태에서, 본 발명은, 임의의 하기 치료 방법에서 사용하기 위해 본원에 제공된, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 및 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 특히 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 또는 항-FolR1/항-CD3 이중특이적 항체를 포함하는 약학 조성물을 제공한다. 한 실시양태에서, 약학 조성물은 본원에 제공된 항체 및 하나 이상의 약학적으로 허용되는 부형제를 포함한다. 또 다른 실시양태에서, 약학 조성물은 본원에 제공된 항체 및 하나 이상의 추가적 치료제(예를 들어 하기에 기재된 것)를 포함한다.
한 양태에서, 본 발명은, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체, 및 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 특히 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 또는 항-FolR1/항-CD3 이중특이적 항체를 포함하는 약학 조성물을 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 발명은, 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 및 PD-L1/PD-1 상호작용 차단제를 포함하는 약학 조성물을 제공한다. 특히, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 길항성 항-PD-L1 항체 또는 길항성 항-PD1 항체이다. 보다 특히, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 아테졸리주맙, 두르발루맙, 펨브롤리주맙 및 니볼루맙으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 구체적 양태에서, PD-L1/PD-1 상호작용 차단제는 아테졸리주맙이다.
본 발명의 약학 조성물은 치료 유효량의, 약학적으로 허용되는 부형제 중에 용해되거나 분산된 하나 이상의 항체를 포함한다. "약학적으로 또는 약물학적으로 허용되는"이란 어구는 사용되는 투여량 및 농도에서 수용자에게 일반적으로 무독성인, 즉 적합한 대로 동물, 예를 들어 인간에게 투여시 불리하거나, 알러지성이거나 다른 부적합한 반응을 생성시키지 않는 분자 독립체 및 조성물을 지칭한다. 활성 성분(예를 들어 종양-연관된 항원에 특이적으로 결합할 수 있는 하나 이상의 항원 결합 도메인을 포함하는 이중특이적 OX40 항체, 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체 및/또는 PD-L1/PD-1 상호작용 차단제)을 포함하는 약학 조성물의 제조는 본원에 참고로 인용된 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences, 18th Ed. Mack Printing Company, 1990]에 예시된 바와 같이 본원에 비추어 당업자에게 공지될 것이다. 특히, 상기 조성물은 동결건조된 제형 또는 수용액이다. 본원에 사용되는 바와 같이, "약학적으로 허용되는 부형제"는 당분야의 통상적인 숙련가에게 공지된 바와 같은 모든 용매, 완충제, 분산 매질, 코팅제, 계면활성제, 산화방지제, 보존제(예를 들어 항균제, 항진균제), 등장성제, 염, 안정화제 및 이들의 조합을 포함한다.
비경구 조성물은 주사에 의해, 예를 들어 피하, 피내, 병변내, 정맥내, 동맥내, 근육내, 경막내 또는 복강내 주사에 의해 투여하기 위해 설계된 것을 포함한다. 주사용으로, 본 발명의 항원 결합 분자를 수용액 중에, 바람직하게는 생리학적으로 적합한 완충제, 예를 들어 행크 용액, 링거액, 또는 생리식염수 완충제 중에서 제형화할 수 있다. 상기 용액은 제형화제, 예를 들어 현탁, 안정화 및/또는 분산제를 함유할 수 있다. 대안적으로, 융합 단백질은 사용 전에 적합한 비히클, 예를 들어 멸균 발열성 물질 제거수로 조성되는 분말 형태 중에 존재할 수 있다. 멸균 주사액은 본 발명의 융합 단밸질을 필요에 따라, 하기에 열거되는 다양한 다른 성분과 함께 적합한 용매 중에 필요한 양으로 혼입시킴으로써 제조된다. 멸균은 예를 들어 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 쉽게 수행될 수 있다. 일반적으로, 분산액은 다양한 멸균된 활성 성분을 기본 분산 매질 및/또는 다른 성분을 함유하는 멸균 비히클 중에 혼입시킴으로써 제조된다. 멸균 주사액, 현탁액 또는 유화액의 제조에 사용하기 위한 멸균 분말의 경우에, 바람직한 제조 방법은 앞서 멸균-여과된 액체 매질로부터 활성 성분 및 임의의 추가적인 목적하는 성분의 분말을 제공하는 진공-건조 또는 동결-건조이다. 상기 액체 매질을 필요한 경우 적합하게 완충시켜야 하며 상기 액체 희석제를 주사전에 먼저 충분한 염수 또는 글루코스로 등장성으로 만들어야 한다. 상기 조성물은 제조 및 보관 조건하에서 안정해야 하며, 미생물, 예를 들어 세균 및 진균의 오염 작용에 대해 보존되어야 한다. 내독소 오염을, 예를 들어 0.5 ng/㎎ 단백질 미만의 안전 수준에서 최소로 유지시켜야 함을 알 것이다. 적합한 약학적으로 허용되는 희석제는 비제한적으로 완충제, 예를 들어 포스페이트, 시트레이트 및 다른 유기산; 아스코르브산 및 메티오닌을 포함한 산화방지제; 보존제(예를 들어 옥타데실다이메틸벤질 암모늄 클로라이드; 헥사메토늄 클로라이드; 벤즈알코늄 클로라이드; 벤즈에토늄 클로라이드; 페놀, 부틸 또는 벤질 알콜; 알킬 파라벤, 예를 들어 메틸 또는 프로필 파라벤; 카테콜; 레소르시놀; 사이클로헥산올; 3-펜탄올; 및 m-크레졸); 저분자량(약 10 잔기 미만) 폴리펩티드; 단백질, 예를 들어 혈청 알부민, 젤라틴, 또는 면역 글로불린; 친수성 중합체, 예를 들어 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예를 들어 글리신, 글루타민, 아스파라긴, 히스티딘, 아르기닌, 또는 리신; 모노사카라이드, 다이사카라이드, 및 다른 탄수화물, 예를 들어 글루코스, 만노스, 또는 덱스트린; 킬레이트화제, 예를 들어 EDTA; 당, 예를 들어 슈크로스, 만니톨, 트레할로스 또는 솔비톨; 염-형성 대이온, 예를 들어 나트륨; 금속 착체(예를 들어 Zn-단백질 착체); 및/또는 비-이온성 계면활성제, 예를 들어 폴리에틸렌 글리콜(PEG)을 포함한다. 수성 주사 현탁액은 상기 현탁액의 점도를 개선시키는 화합물, 예를 들어 나트륨 카복시메틸 셀룰로스, 솔비톨, 덱스트란 등을 함유할 수 있다. 임의적으로, 상기 현탁액은 또한 적합한 안정화제 또는 고도로 농축된 용액의 제조를 허용하도록 상기 화합물의 용해도를 증가시키는 제제를 함유할 수 있다. 추가로, 상기 활성 화합물의 현탁액을 적합한 대로 유성 주사 현탁액으로서 제조할 수 있다. 적합한 친지성 용매 또는 비히클은 지방 오일, 예를 들어 참깨 오일, 또는 합성 지방산 에스터, 예를 들어 에틸 클리에이트 또는 트라이글리세라이드, 또는 리포솜을 포함한다.
활성 성분을 예를 들어 코아세르베이션 기법에 의해서 또는 계면 중합에 의해서 제조된 미세캡슐, 예를 들어 콜로이드 약물 전달 시스템(예를 들어 리포솜, 알부민 미소구, 미세유화액, 나노-입자 및 나노캡슐) 중의 또는 거대유화액 중의 각각의 하이드록시메틸셀룰로스 또는 젤라틴-미세캡슐 및 폴리-(메틸메트아크릴레이트) 미세캡슐 중에 포집할 수 있다. 상기와 같은 기법은 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences(18th Ed. Mack Printing Company, 1990)]에 개시되어 있다. 서방성 제제를 제조할 수도 있다. 서방성 제제의 적합한 예는 상기 폴리펩티드를 함유하는 고체 소수성 중합체의 반투과성 기질(상기 기질은 성형품, 예를 들어 필름 또는 미세캡슐의 형태이다)을 포함한다. 특정한 실시양태에서, 주사성 조성물의 연장된 흡수는 상기 조성물 중에 흡수를 지연시키는 제제, 예를 들어 알루미늄 모노스테아레이트, 젤라틴 또는 이들의 조합의 사용에 의해 발생될 수 있다.
본원에서 예시적인 약학적으로 허용되는 부형제는 간질성 약물 분산제, 예를 들어 용해성 중성-활성 히알루로니다제 당단백질(sHASEGP), 예를 들어 인간 용해성 PH-20 히알루로니다제 당단백질, 예를 들어 rHuPH20(하이레넥스(HYLENEX)(등록상표), 박스터 인터내셔널 인코포레이티드(Baxter International, Inc.)를 추가로 포함한다. rHuPH20을 포함한 몇몇 예시적인 sHASEGP 및 사용 방법이 미국 특허 공보 2005/0260186 및 2006/0104968에 개시되어 있다. 하나의 양태에서, sHASEGP를 하나 이상의 추가적인 글리코스아미노글리카나제, 예를 들어 콘드로이티나제와 조합된다.
예시적인 동결건조된 항체 제형이 미국특허 제6,267,958호에 개시되어 있다. 수성 항체 제형은 미국특허 제6,171,586호 및 WO 2006/044908에 개시된 것을 포함하며, 후자의 제형은 히스티딘-아세테이트 완충제를 포함한다.
앞서 기재된 조성물 외에, 활성 성분을 또한 데포 제제로서 제형화할 수 있다. 상기와 같은 장기간 작용하는 제형은 이식(예를 들어 피하 또는 근육내)에 의해 또는 근육내 주사에 의해 투여될 수 있다. 따라서, 예를 들어 상기 융합 단백질을 적합한 중합체성 또는 소수성 물질(예를 들어 허용되는 오일 중의 유화액으로서) 또는 이온 교환 수지와, 또는 드물게 용해성인 유도체, 예를 들어 드물게 용해성인 염으로서 제형화할 수 있다.
본 발명의 활성 성분을 포함하는 약학 조성물을 통상적인 혼합, 용해, 유화, 캡슐화, 포집 또는 동결건조 공정에 의해 제조할 수 있다. 약학 조성물을 하나 이상의 생리학적으로 허용되는 담체, 희석제, 부형제, 또는 상기 단백질의, 약학적으로 사용될 수 있는 제제로의 가공을 용이하게 하는 보조제를 사용하여 통상적인 방식으로 제형화할 수 있다. 적합한 제형화는 선택된 투여 경로에 따라 변한다.
본 발명의 항체를 유리 산 또는 유리 염기, 중성 또는 염 형태의 조성물로 제형화할 수 있다. 약학적으로 허용되는 염은 상기 유리 산 또는 유리 염기의 생물학적 활성을 실질적으로 유지시키는 염이다. 상기는 산 부가염, 예를 들어 단백질성 조성물의 유리 아미노 기에 의해 형성되거나 무기산(예를 들어 염산 또는 인산) 또는 유기산(예컨대 아세트산, 옥살산, 타르타르산 또는 만델산)에 의해 형성되는 것을 포함한다. 유리 카복시 기에 의해 염은 또한 무기염기, 예를 들어 나트륨, 칼륨, 암모늄, 칼슘 또는 철 수산화물; 또는 이소프로필아민, 트라이메틸아민, 히스티딘 또는 프로카인과 같은 유기염기로부터 유도될 수 있다. 약학적 염은 상응하는 유리 염기 형태보다 수성 및 다른 양성자성 용매 중에서 더 용해성으로 되는 성향이 있다.
본원의 조성물은 또한 치료되는 특정한 적응증에 필요한 바와 같은 하나 초과의 활성 성분, 바람직하게는 서로 불리한 영향을 미치지 않는 상보성 활성을 갖는 것을 함유할 수 있다. 상기와 같은 활성 성분은 적합하게는 의도하는 목적에 유효한 양으로 함께 존재한다.
생체내 투여에 사용되는 제형은 일반적으로 멸균성이다. 멸균은 예를 들어 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 쉽게 수행될 수 있다.
항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 특히 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 투여
항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 특히 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 둘 모두(모두 본원에서 물질로 지칭됨)는 비경구, 폐내 및 비강내 투여, 및 국소 치료가 바람직한 경우에는 병소내 투여를 포함하는 임의의 적합한 방법에 의해 투여될 수 있다. 그러나, 본 발명의 방법은 비경구, 특히 정맥내 주입에 투여되는 치료제와 관련하여 특히 유용하다.
비경구 주입은 근육내, 정맥내, 동맥내, 복강내 또는 피하 투여를 포함한다. 투여는, 부분적으로 투여가 짧은지 또는 만성적인지에 따라, 임의의 적합한 경로에 의해, 예를 들어 주사, 예컨대 정맥내 또는 피하 주사에 의해 수행될 수 있다. 비제한적으로 단일 투여 또는 다양한 시점에 걸친 다중 투여, 볼루스 투여 및 펄스 주입을 포함하는 다양한 투여 일정이 본원에서 고려된다. 한 실시양태에서, 치료제는 비경구적으로, 특히 정맥내로 투여된다. 특정 실시양태에서, 치료제는 정맥내 주입에 의해 투여된다.
항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 특히 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 둘 모두는 타당한 의료 행위에 일치하는 방식으로 제형화되고 투여되고 투약될 수 있다. 본원에 있어서 고려 인자는 치료할 특정 장애, 치료 받을 특정 포유동물, 개별적 환자의 임상적 상태, 장애의 원인, 제제의 전달 부위, 투여 방법, 투여 일정, 및 의사에게 공지된 기타 인자를 포함한다. 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 특히 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 둘 모두는, 당해 장애를 예방하거나 치료하는 데 현재 사용되는 하나 이상의 제제와 함께 필수적인 것은 아니나 임의적으로 제형화된다. 이러한 다른 제제의 유효량은 제형에 존재하는 치료제의 양, 장애 또는 치료의 유형, 및 상기에 논의된 다른 인자에 좌우된다. 이는 일반적으로 본원에 기재된 바와 동일한 투여량 및 투여 경로로 사용되거나, 본원에 기재된 투여량의 약 1 내지 99%로, 또는 적합한 것으로 경험상/임상적으로 결정된 임의의 투여량으로 임의의 경로에 의해 사용된다.
질병의 예방 또는 치료를 위해, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 특히 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 적절한 투여량(이들의 조합으로 사용되거나 하나 이상의 다른 추가적 치료제와 사용되는 경우)은, 치료할 질병의 유형, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체의 유형, 질병의 중증도 및 추이, 둘 모두의 제제가 예방 목적으로 사용되는지 또는 치료 목적으로 사용되는지 여부, 이전 요법, 환자의 병력 및 치료제에 대한 반응, 및 담당의의 재량에 좌우될 것이다. 각각의 물질은 적합하게는 환자에게 1회 또는 일련의 치료에 걸쳐 투여된다. 질병의 유형 및 중증도에 따라, 약 1 μg/kg 내지 15 mg/kg(예를 들어 0.1 내지 10 mg/kg)의 물질이 예를 들어 1회 이상의 개별적 투여 또는 연속 주입에 의해 개체에게 투여하기 위한 초기 후보자일 수 있다. 하나의 전형적인 1일 투여량은 상기에 언급된 인자에 따라 약 1 μg/kg 내지 100 mg/kg 이상 범위일 수 있다. 며칠 이상에 걸친 반복 투여의 경우, 상태에 따라, 치료는 일반적으로 질병 증상의 목적하는 억제가 발생할 때까지 지속될 수 있다. 각각의 물질의 하나의 예시적 투여량은 약 0.05 내지 약 10 mg/kg 범위일 수 있다. 따라서, 약 0.5 mg/kg, 2.0 mg/kg, 4.0 mg/kg 또는 10 mg/kg(또는 이들의 임의의 조합)의 하나 이상의 투여량이 개체에게 투여될 수 있다. 이러한 투여량은 (예를 들어 개체가 약 2 내지 약 12회의 투여량, 또는 약 6회의 투여량의 치료제를 제공받도록) 간헐적으로, 예를 들어 1주일마다, 2주일마다 또는 3주일마다 투여될 수 있다. 초기 고 적재량 투여량 후에 1회 이상의 저 투여량, 또는 초기 저 투여량 후에 1회 이상의 고 투여량이 투여될 수 있다. 예시적 투여 양생법은, 약 10 mg의 초기 투여량 투여 후에 약 20 mg의 격주 투여량의 치료제를 투여하는 것을 포함한다. 그러나, 다른 투여 양생법이 유용할 수 있다. 이러한 요법의 진행은 종래 기술 및 분석에 의해 용이하게 모니터링된다.
한 양태에서, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 종양-연관된 항원에 특이적인 T 세포 활성화 항-CD3 이중특이적 항체, 특히 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 둘 모두의 투여는 단일 투여이다. 특정 양태에서, 치료제의 투여는 2회 이상의 투여이다. 이러한 한 양태에서, 물질은 1주일마다, 2주일마다 또는 3주일마다, 특히 2주일마다 투여된다. 한 양태에서, 물질은 치료적 유효량으로 투여된다. 한 양태에서, 물질은 약 50 μg/kg, 약 100 μg/kg, 약 200 μg/kg, 약 300 μg/kg, 약 400 μg/kg, 약 500 μg/kg, 약 600 μg/kg, 약 700 μg/kg, 약 800 μg/kg, 약 900 μg/kg 또는 약 1000 μg/kg의 투여량으로 투여된다. 한 실시양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체는, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체의 투여 없는 상응하는 치료 양생법에서 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 투여량보다 높은 투여량으로 투여된다. 한 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 투여는 제1 투여량의 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 초기 투여, 및 제2 투여량의 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 1회 이상의 후속 투여를 포함하되, 제2 투여량은 제1 투여량보다 높다. 한 양태에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 투여는 제1 투여량의 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 초기 투여, 및 제2 투여량의 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 1회 이상의 후속 투여를 포함하되, 제1 투여량은 제2 투여량보다 낮지 않다.
한 양태에서, 본 발명에 따른 치료 양생법에서 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 투여는 개체에게 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 제1 투여(적어도 동일한 치료 과정 내에서)이다. 한 양태에서, 개체에게 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체의 투여는 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 투여 전에 이루어지지 않는다.
본 발명에서, 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 및 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체의 조합은 요법에서 추가적 제제와 조합으로 사용될 수 있다. 예를 들어, 하나 이상의 추가적 치료제가 공동-투여될 수 있다. 특정 양태에서, 추가적 치료제는 면역 치료제이다.
한 양태에서, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 조합은 PD-1 축 결합 길항제와 조합으로 사용될 수 있다. 한 양태에서, PD-1 축 결합 길항제는 PD-1 결합 길항제, PD-L1 결합 길항제 및 PD-L2 결합 길항제로 이루어진 군으로부터 선택된다. 특정 양태에서, PD-1 축 결합 길항제는 PD-1 결합 길항제, 특히 길항성 PD-1 항체이다. 한 양태에서, PD-1 축 결합 길항제는 MDX 1106(니볼루맙, CAS 등록번호 946414-94-4), MK-3475(펨브롤리주맙), CT-011(피딜리주맙), MEDI-0680(AMP-514), PDR001, REGN2810 및 BGB-108로부터 선택된다. 또 다른 특정 양태에서, PD-1 축 결합 길항제는 PD-L1 결합 길항제, 특히 길항성 PD-L1 항체이다. 한 양태에서, PD-1 축 결합 길항제는 MPDL3280A(아테졸리주맙), YW243.55.S70, MDX-1105, MEDI4736(두르발루맙) 및 MSB0010718C(아벨루맙)로부터 선택된다. 한 양태에서, PD-L1 길항성 항체는 아테졸리주맙, 두르발루맙 및 아벨루맙으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 보다 특히, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체의 조합은 MPDL3280A(아테졸리주맙)와 조합으로 사용될 수 있다. 일부 양태에서, 아테졸리주맙은 약 800 내지 약 1500 mg의 투여량으로 3주일마다(예를 들어, 3주일마다 약 1000 내지 약 1300 mg, 예를 들어 3주일마다 약 1100 내지 약 1200 mg) 투여될 수 있다. 하나의 특정한 양태에서, 아테졸리주맙은 약 1200 mg의 투여량으로 3주일마다 투여된다.
PD-1 축 결합 길항제의 투여와 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 및 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체를 포함하는 병용 요법의 투여 사이의 기간 및 투여량은 예컨대 병용 요법의 투여 전에 개체의 종양을 효과적으로 줄어들게 하도록 선택된다.
상기에 언급된 이러한 병용 요법은 병용 투여(여기서 2개 이상의 치료제가 동일하거나 별개인 제형에 포함됨), 및 개별적 투여(이 경우, 치료제의 투여가 추가적 치료제의 투여 전에 및/또는 동시에 및/또는 후에 발생할 수 있다)를 포함한다. 한 실시양태에서, 치료제의 투여 및 추가적 치료제의 투여는 서로 약 1개월 이내에, 약 1, 2 또는 3주일 이내에, 또는 약 1, 2, 3, 4, 5 또는 6일 이내에 발생한다.
치료 방법 및 조성물
상이한 세포 집단 상의 2개의 세포 표면 단백질을 인식하는 이중특이적 항체는 병원성 표적 세포의 파괴를 위한 세포 독성 면역 세포를 재유도하는 가능성을 갖는다.
한 양태에서, 개체에서 암을 치료하거나 암의 진행을 지연시키는 방법을 제공하되, 이는 상기 개체에게 유효량의 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항-CEA/항-CD3 항체를 투여하는 단계를 포함한다.
하나의 이러한 양태에서, 상기 방법은 개체에게 유효량의 하나 이상의 추가적 치료제를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 추가적 실시양태에서, 개체에게 유효량의 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항-CEA/항-CD3 항체를 투여하는 단계를 포함하는 종양 축소 방법이 제공된다. 상기 양태 중 어느 하나에 따라 "개체" 또는 "대상체"는 바람직하게는 인간이다.
추가적 양태에서, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항-CEA/항-CD3 항체를 포함하는, 암 면역 요법에서 사용하기 위한 조성물이 제공된다. 특정 실시양태에서, 암 면역 요법의 방법에서 사용하기 위한 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항-CEA/항-CD3 항체를 포함하는 조성물이 제공된다.
추가적 양태에서, 약제의 제조 또는 생산에서 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항-CEA/항-CD3 항체를 포함하는 조성물의 용도가 제공된다. 한 실시양태에서, 약제는 고형 종양의 치료를 위한 것이다. 추가적 실시양태에서, 약제는, 고형 종양을 갖는 개채에게 유효량의 약제를 투여하는 단계를 포함하는 종양 축소 방법에서 사용하기 위한 것이다. 하나의 이러한 실시양태에서, 상기 방법은 개체에게 유효량의 하나 이상의 추가적 치료제를 투여하는 단계를 추가로 포함한다. 추가적 실시양태에서, 약제는 고형 종양을 치료하기 위한 것이다. 일부 양태에서, 개체는 CEA 양성 암을 앓는다. 일부 양태에서, CEA 양성 암은 결장암, 폐암, 난소암, 위암, 방광암, 췌장암, 자궁내막암, 유방암, 신장암, 식도암 또는 전립선암이다. 일부 양태에서, 유방암은 유방 암종 또는 유방 선암종이다. 일부 양태에서, 유방 암종은 침윤성 관 암종이다. 일부 양태에서, 폐암은 폐 선암종이다. 일부 실시양태에서, 결장암은 대장 선암종이다. 상기 실시양태 중 어느 하나에 따른 "개체"는 인간일 수있다.
상기에 언급된 병용 요법은 병용 투여(여기서 2개 이상의 치료제가 동일하거나 별개인 제형에 포함됨), 및 개별적 투여(이 경우, 본원에 보고된 항체의 투여가 추가적 치료제의 투여 전에 및/또는 동시에 및/또는 후에 발생할 수 있다)를 포함한다. 한 양태에서, 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항- CEA/항-CD3 항체의 투여, 및 임의적으로 추가적 치료제의 투여는 서로 약 1개월 이내에, 약 1, 2 또는 3주일 이내에, 또는 약 1, 2, 3, 4, 5 또는 6일 이내에 발생한다.
본원에 보고된 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 (및 임의의 추가적 치료제) 모두는 비경구, 폐내 및 비강내 투여, 및 국소 치료가 바람직한 경우에는 병소내 투여를 포함하는 임의의 적합한 방법에 의해 투여될 수 있다. 비경구 주입은 근육내, 정맥내, 동맥내, 복강내 또는 피하 투여를 포함한다. 투여는, 부분적으로 투여가 짧은지 또는 만성적인지에 따라, 임의의 적합한 경로에 의해, 예를 들어 주사, 예컨대 정맥내 또는 피하 주사에 의해 수행될 수 있다. 비제한적으로 단일 투여 또는 다양한 시점에 걸친 다중 투여, 볼루스 투여 및 펄스 주입을 포함하는 다양한 투여 일정이 본원에서 고려된다.
본원에 보고된 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체 및 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 둘 모두는 타당한 의료 행위에 일치하는 방식으로 제형화되고 투여되고 투약될 수 있다. 본원에 있어서 고려 인자는 치료할 특정 장애, 치료 받을 특정 포유동물, 개별적 환자의 임상적 상태, 장애의 원인, 제제의 전달 부위, 투여 방법, 투여 일정, 및 의사에게 공지된 기타 인자를 포함한다. 항체는 당해 장애를 예방하거나 치료하는 데 현재 사용되는 하나 이상의 제제와 함께 필수적인 것은 아니나 임의적으로 제형화된다. 이러한 다른 제제의 유효량은 제형에 존재하는 항체의 양, 장애 또는 치료의 유형, 및 상기에 논의된 다른 인자에 좌우된다. 이는 일반적으로 본원에 기재된 바와 동일한 투여량 및 투여 경로로 사용되거나, 본원에 기재된 투여량의 약 1 내지 99%로, 또는 적합한 것으로 경험상/임상적으로 결정된 임의의 투여량으로 임의의 경로에 의해 사용된다.
제조 물품(키트)
본 발명의 또 다른 양태에서, 상술한 장애의 치료, 예방 및/또는 진단에 유용한 물질을 함유하는 키트를 제공한다. 상기 키트는 하나 이상의 용기 및 상기 용기 상의 또는 상기 용기와 결합된 라벨 또는 패키지 삽입물을 포함한다. 적합한 용기는 예를 들어 병, 바이알, 주사기, IV 용액 주머니 등을 포함한다. 상기 용기는 다양한 물질, 예를 들어 유리 또는 플라스틱으로부터 형성될 수 있다. 상기 용기는 조성물을 단독으로, 또는 상태의 치료, 예방 및/또는 진단에 유효한 또 다른 조성물과 함께 유지하며 멸균 출입구를 가질 수 있다(예를 들어 상기 용기는 정맥내 용액 주머니 또는 피하주사 바늘에 의해 관통될 수 있는 마개를 갖는 바이알일 수 있다). 한 양태에서, 키트의 2개 이상의 활성제는 본 발명의 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 및 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체이다.
특정 양태에서, (A) 활성 성분으로서 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체, 및 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 제1 조성물, (B) 활성 성분으로서 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 및 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 제2 조성물, 및 (C) 병용 요법에서 상기 조성물들의 사용에 대한 지시서를 포함하는 패키지를 포함하는, 개체에서 암을 치료하거나 이의 진행을 지연시키기 위한 키트가 제공된다.
하나의 추가적 양태에서, (A) 활성 성분으로서 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체, 및 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 제1 조성물, (B) 활성 성분으로서 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체 및 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 제2 조성물, (C) 활성 성분으로서 PD-L1/PD-1 상호작용 차단제 및 약학적으로 허용되는 부형제를 포함하는 제3 조성물, 및 (D) 병용 요법에서 상기 조성물들의 사용에 대한 지시서를 포함하는 패키지를 포함하는, 개체에서 암을 치료하거나 이의 진행을 지연시키기 위한 키트가 제공된다.
상기 라벨 또는 패키지 삽입물은 어떻게 상기 조성물이 선택된 질환의 치료에 사용되는 지를 지시하며 병용 요법에서 상기 조성물의 사용에 대한 지시서를 제공한다. 또한, 상기 키트는 (a) 내부에 조성물이 함유된 제1 용기(여기서, 상기 조성물은 본 발명의 항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체를 포함한다); 및 (b) 내부에 조성물이 함유된 제2 용기(여기서, 상기 조성물은 본 발명의 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체를 포함한다)를 포함할 수 있다. 또한, 상기 키트는 조합으로 사용될 수 있는 추가적 활성 성분을 포함하는 하나 이상의 추가적 용기를 포함할 수 있다. 본 발명의 상기 실시양태에서 제조 물품은 조성물이 특정 질환을 치료할 수 있음을 지시하는 패키지 삽입물을 추가로 포함할 수 있다.
대안적으로 또는 부가적으로, 상기 키트는 약학적으로 허용되는 완충제, 예를 들어 주사용 정균수(BWFI), 포스페이트-완충된 염수, 링거액 및 덱스트로스 용액을 포함하는 제2(또는 제3) 용기를 추가로 포함할 수 있다. 상기 물품은 상업적 및 사용자 관점에서 바람직할 수 있는 다른 물질, 예를 들어 다른 완충제, 희석제, 필터, 바늘 및 주사기를 추가로 포함할 수도 있다.
[표 C]
인간 면역 글로불린 경쇄 및 중쇄의 뉴클레오티드 서열에 관한 일반적 정보는 문헌[Kabat, E.A., et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)]에 제공된다. 항체 쇄의 아미노산은 상기에 정의된 바와 같이 카바트에 따른 넘버링 시스템에 따라 넘버링되고 지칭된다(문헌[Kabat, E.A., et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)]).
실시예
하기는 본 발명의 방법 및 조성물의 실시예이다. 상기에 제공된 일반적 설명을 고려하여 다양한 다른 실시양태를 실행할 수 있음이 이해된다.
재조합 DNA 기법
문헌[Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A laboratory manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989]에 기재된 바와 같은 표준 방법을 사용하여 DNA를 조작하였다. 분자 생물학 시약을 제조사의 설명서에 따라 사용하였다. 인간 면역 글로불린 경쇄 및 중쇄의 뉴클레오티드 서열에 관한 일반적인 정보는 문헌[Kabat, E.A. et al., (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Fifth Ed., NIH Publication No 91-3242]에 제공되어 있다.
DNA 서열분석
DNA 서열을 이중 가닥 서열분석에 의해 결정하였다.
유전자 합성
목적하는 유전자 분절을 적합한 주형을 사용하여 PCR에 의해 생성시키거나, 자동화된 유전자 합성에 의해 합성 올리고뉴클레오티드 및 PCR 산물로부터 진아트 아게(Geneart AG, 독일 로젠스부르크 소재)에 의해 합성하였다. 정확한 유전자 서열을 입수할 수 없는 경우에, 올리고뉴클레오티드 프라이머를 가장 가까운 상동체로부터의 서열에 기반하여 설계하고 적합한 조직으로부터 기원하는 RNA로부터 RT-PCR에 의해 유전자를 단리하였다. 단일 제한 엔도뉴클레아제 절단 부위가 측면에 인접한 유전자 분절을 표준 클로닝/서열분석 벡터 내에 클로닝하였다. 상기 플라스미드 DNA를 형질전환된 세균으로부터 정제하고 UV 분광학에 의해 농도를 측정하였다. 서브클로닝된 유전자 단편의 DNA 서열을 DNA 서열분석에 의해 확인하였다. 유전자 분절을 각각의 발현 벡터 내로의 서브클로닝을 허용하기에 적합한 제한 부위로 설계하였다. 모든 구축물을 진핵생물 세포에서의 분비를 위해 단백질을 표적화하는 리더 펩티드를 암호화하는 5'-단부 DNA 서열로 설계하였다.
세포 배양 기술
표준 세포 배양 기술을 문헌[Current Protocols in Cell Biology (2000), Bonifacino, J.S., Dasso, M., Harford, J.B., Lippincott-Schwartz, J. and Yamada, K.M. (eds.), John Wiley & Sons, Inc]에 기재된 바와 같이 사용하였다.
단백질 정제
단백질을 표준 프로토콜을 참조하여 여과된 세포 배양 상청액으로부터 정제하였다. 간단히, 항체를 단백질 A 세파로스(Sepharose) 컬럼(지이 헬쓰케어)에 적용시키고 PBS로 세척하였다. 항체의 용출을 pH 2.8에서 성취한 다음 샘플을 즉시 중화시켰다. 응집된 단백질을 PBS 중에서 또는 20 mM 히스티딘, 150 mM NaCl pH 6.0 중에서 크기 배제 크로마토그래피(수퍼덱스(Superdex) 200, 지이 헬쓰케어)에 의해 단량체성 항체로부터 분리시켰다. 단량체성 항체 분획을 모으고, 예를 들어 밀리포어 아미콘 울트라(MILLIPORE Amicon Ultra)(30 MWCO) 원심분리 농축기를 사용하여 농축시키고(필요한 경우), 동결시키고 -20℃ 또는 -80℃에서 저장하였다. 상기 샘플의 부분을 예를 들어 SDS-PAGE, 크기 배제 크로마토그래피(SEC) 또는 질량 분광분석법에 의한 후속의 단백질 분석 및 분석학적 특성규명을 위해 제공하였다.
SDS-PAGE
NuPAGE(등록상표) Pre-Cast 젤 시스템(인비트로젠(Invitrogen))을 제조사의 지시에 따라 사용하였다. 특히, 10% 또는 4 내지 12% NuPAGE(등록상표) 노벡스(Novex, 등록상표) 비스-트리스 Pre-Cast 젤(pH 6.4) 및 NuPAGE(등록상표) MES(환원된 젤, NuPAGE(등록상표) 산화방지제 러닝 완충제 첨가제와 함께) 또는 MOPS(환원되지 않은 젤) 러닝 완충제를 사용하였다.
분석학적 크기 배제 크로마토그래피
항체의 응집 및 올리고머성 상태의 측정을 위한 크기 배제 크로마토그래피(SEC)를 HPLC 크로마토그래피에 의해 수행하였다. 간단히, 단백질 A 정제된 항체를 에이질런트(Agilent) HPLC 1100 시스템 상에서 300 mM NaCl, 50 mM KH2PO4/K2HPO4, pH 7.5 중의 토소(Tosoh) TSKgel G3000SW 컬럼에 또는 다이오넥스(Dionex) HPLC-시스템 상에서 2xPBS 중의 수퍼덱스(수퍼덱스) 200 컬럼(지이 헬쓰케어)에 적용시켰다. 상기 용출된 단백질을 UV 흡광도 및 피크 면적의 적분에 의해 정량분석하였다. 바이오라드(BioRad) 젤 여과 표준 151-1901은 표준으로서 작용하였다.
질량 분광분석법
본 섹션은 올바른 조립체를 강조하면서 VH/VL 교환을 갖는 다중특이적 항체(VH/VL CrossMab)의 특성규명을 기재한다. 예상되는 1차 구조물을 탈글리코실화된 완전한 CrossMab 및 탈글리코실화된/플라스민 절단된 또는 대안적으로 탈글리코실화된/제한된 LysC 절단된 CrossMab의 전기분무 이온화 질량 분광분석법(ESI-MS)에 의해 분석하였다.
VH/VL CrossMab를 1 ㎎/㎖의 단백질 농도에서 17시간 이하 동안 37℃에서 포스페이트 또는 트리스 완충제 중의 N-글리코시다제 F로 탈글리코실화시켰다. 플라스민 또는 제한된 LysC(로슈(Roche)) 절단을 각각 실온에서 120시간 동안 및 37℃에서 40분 동안 트리스 완충제(pH 8) 중의 100 μg의 탈글리코실화된 VH/VL CrossMab를 사용하여 수행하였다. 질량 분광분석에 앞서, 상기 샘플을 세파덱스(Sephadex) G25 컬럼(지이 헬쓰케어) 상에서 HPLC를 통해 탈염시켰다. 총 질량을 트라이벌사 나노메이트(TriVersa NanoMate) 소스(애드비온(Advion))가 구비된 maXis 4G UHR-QTOF MS 시스템(브루커 달토닉(Bruker Daltonik)) 상에서 ESI-MS를 통해 측정하였다.
표면 플라스몬 공명(SPR)(비아코어)을 사용한, 각각의 항원에 대한 다중특이적 항체의 결합 및 결합 친화도의 결정
각각의 항원에 대한 생산된 항체의 결합을 비아코어 기기(지이 헬쓰케어 바이오사이언시즈 에이비(스웨덴 웁살라 소재))를 사용하여 표면 플라스몬 공명에 의해 조사하였다. 간략히, 친화도 측정을 위해, 염소-항-인간 IgG, JIR 109-005-098 항체를 각각의 항원에 대한 항체의 제시를 위해 아민 커플링을 통해 CM5 칩 상에 고정시킨다. 결합을 HBS 완충제(HBS-P(10 mM HEPES, 150 mM NaCl, 0.005% 트윈 20, ph 7.4)에서 25℃에서 (또는 대안적으로 37℃에서) 측정한다. 항원(알앤디 시스템즈(R&D Systems) 또는 사내 정제됨)을 다양한 농도로 용액에 첨가한다. 결합을 80초 내지 3분의 항원 주사에 의해 측정하였다; 해리를 칩 표면을 HBS 완충제로 3 내지 10분 동안 세척함으로써 측정하고, KD 값을 1:1 랭뮤어(Langmuir) 결합 모델을 사용하여 추산하였다. 음성 대조군 데이터(예를 들어 완충제 곡선)를, 시스템 내재 기선 드리프트의 보정을 위해 및 노이즈 신호 감소를 위해 샘플 곡선으로부터 감하였다. 각각의 비아코어 평가 소프트웨어를 센서그램의 분석 및 친화도 데이터의 계산을 위해 사용하였다.
실시예 1
항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체의 생산, 정제 및 특성규명
항-FAP/항-OX40 이중특이적 항체를 WO 2017/055398 A2 또는 WO 2017/060144 A1에 기재된 바와 같이 생산하였다.
특히, OX40에 대한 사가 결합 및 FAP에 대한 일가 결합을 갖는, WO 2017/060144 A1의 실시예 4.4에 따른 분자를 생산하였다. 놉-인투-홀 기술을 적용하여 2개의 상이한 중쇄의 조립을 가능하게 하였다. 4+1 포맷의 이중특이적 항체의 개략도를 도 1A에 나타냈다.
분자 A에서, 제1 중쇄(HC 1)는, 항-OX40 바인더 49B4의 2개의 Fab 유닛(VHCH1_VHCH1)에 뒤따르는, (G4S) 링커에 의해 항-FAP 바인더 4B9 VH 도메인에 융합된 Fc 놉 쇄로 구성되었다. 구축물의 제2 중쇄(HC 2)는 항-OX40 바인더 49B4의 2개의 Fab 유닛(VHCH1_VHCH1)에 뒤따르는, (G4S) 링커에 의해 항-FAP 바인더 4B9의 VL 도메인에 융합된 Fc 홀 쇄로 구성되었다. 따라서, 분자 A(FAP OX40 iMAB)는, 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 55의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 4개의 서열번호 56의 경쇄를 포함한다.
분자 B를 분자 A와 유사하게 생산하였으나, FAP 바인더 4B9를 FAP 바인더 28H1로 대체하였다. 분자 B는 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 4개의 서열번호 56의 경쇄를 포함한다.
분자 C에서, 제1 중쇄(HC 1)는, 항-OX40 바인더 49B4의 2개의 Fab 유닛(VHCH1_VHCH1)에 뒤따르는, (G4S) 링커에 의해 항-FAP 바인더 4B9의 VL 도메인에 융합된 Fc 놉 쇄로 구성되었다. 구축물의 제2 중쇄(HC 2)는, 항-OX40 바인더 49B4의 2개의 Fab 유닛(VHCH1_VHCH1)에 뒤따르는, (G4S) 링커에 의해 항-FAP 바인더 4B9의 VH 도메인에 융합된 Fc 홀 쇄로 구성되었다. 분자 C는 서열번호 59의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 60의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 4개의 서열번호 56의 경쇄를 포함한다.
이들 모든 분자에서 Pro329Gly, Leu234Ala 및 Leu235Ala 돌연변이가 WO 2012/130831에 기재된 방법에 따라 Fc 감마 수용체에 대한 결합을 제거하도록 놉 및 홀 중쇄의 불변 영역에 도입된 반면에, 분자 D에서는 놉-인투-홀 돌연변이를 갖는 야생형 인간 IgG1 Fc 도메인이 사용되었다. 분자 D는 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 4개의 서열번호 56의 경쇄를 포함한다.
분자의 생산 및 특성규명은 WO 2017/060144 A1에 상세히 기재되어 있다.
실시예 2
T 세포 이중특이적(TCB) 항체의 생산, 정제 및 특성규명
TCB 분자를 WO 2014/131712 A1 또는 WO 2016/079076 A1에 기재된 방법에 따라 생산하였다.
실험에 사용된 항-CEA/항-CD3 이중특이적 항체(CEA CD3 TCB 또는 CEA TCB)의 생산은 WO 2014/131712 A1의 실시예 3에 기재되어 있다. CEA CD3 TCB는 "2+1 IgG CrossFab" 항체이고, 2개의 상이한 중쇄 및 2개의 상이한 경쇄(이들 중 하나는 분자에 2회 존재함)로 구성된다. CH3 도메인의 점 돌연변이("놉-인투-홀")를 2개의 상이한 중쇄의 조립을 촉진하도록 도입하였다. CD3 결합 Fab에서 VH 및 VL 도메인의 교환은 2개의 상이한 경쇄의 정확한 조립을 촉진하기 위해 이루어졌다. 2+1은, 분자가 CEA에 특이적인 2개의 항원 결합 도메인 및 CD3에 특이적인 1개의 항원 결합 도메인을 갖는 것을 의미한다. CEACAM5 CD3 TCB는 유사한 포맷을 가지나, 또 다른 CEA 바인더를 포함하고, 경쇄의 정확한 페어링을 지지하기 위해 CD3 바인더의 CH 및 CL 도메인에서 점 돌연변이를 포함한다.
CEA CD3 TCB는 서열번호 87의 아미노산 서열의 2개의 경쇄, 서열번호 88의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄, 서열번호 89의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄, 및 서열번호 90의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄를 포함한다. 2+1 포맷의 이중특이적 항체의 개략도가 도 1C에 도시되어 있다. CEACAM5 CD TCB는 서열번호 91의 아미노산 서열의 2개의 경쇄, 서열번호 92의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄, 서열번호 93의 아미노산 서열을 포함하는 중쇄, 및 서열번호 94의 아미노산 서열을 포함하는 경쇄를 포함한다. 2+1 포맷의 이중특이적 항체의 개략도는 도 1B에 도시되어 있다.
실험에 사용된 항-FolR1/항-CD3 이중특이적 항체(FolR1 CD3 TCB 또는 FolR1 TCB)의 생산은 WO 2016/079076 A1에 기재되어 있다. FolR1 CD3 TCB는 WO 2016/079076의 도 1D에 "FolR1 TCB 2+1 클래지컬(공통 경쇄)"로 도시되어 있고, 2개의 상이한 중쇄 및 3개의 동일한 VLCL 경쇄(공통 경쇄)로 구성된다. CH3 도메인의 점 돌연변이("놉-인투-홀")가 2개의 상이한 중쇄의 조립을 촉진하기 위해 도입되었다. 2+1은, 분자가 FolR1에 특이적인 2개의 항원 결합 도메인 및 CD3에 특이적인 1개의 항원 결합 도메인을 갖는 것을 의미한다. CD3 바인더는 Fab 중쇄의 C-말단에서 놉 돌연변이를 포함하는 Fc 도메인의 제1 서브유닛의 N-말단에 융합된다.
FolR1 CD3 TCB는 서열번호 107의 아미노산 서열을 포함하는 제1 중쇄, 서열번호 108의 아미노산 서열을 포함하는 제2 중쇄, 및 3개의 서열번호 109의 공통 경쇄를 포함한다.
실시예 3
인간 면역 효과기 세포를 사용한 시험관내 공동-배양 분석
T 세포의 면역 기능을 TCB(CEA CD3 TCB, CEACAM5 CD3 TCB 및 FolR1 CD3 TCB) 및 FAP OX40 iMab의 존재 하에 인간 면역 효과기 세포(휴지 중인 PBMC, CD4 또는 CD8 T 세포), 표적 항원 양성 종양 세포 및 FAP 양성 섬유아세포를 사용하여 시험관내 공동-배양 분석에서 시험하였다. 평가한 종양 세포주는 위암 세포주 MKN-45, 난소 선암종 세포주 SK-OV-3 및 자궁경부암 세포주 HeLa였다. 인간 FAP를 발현하도록 형질전환된 마우스 배아 섬유아세포 세포주 NIH/3T3을 FAP 양성 섬유아세포로서 사용하였다. 효과기 세포는 휴지 중인 인간 PBMC 및 단리된 휴지 중인 CD4 또는 CD8 T 세포였다. 일부 분석에서, TNF-α 센서 세포를 첨가하여 TNF-α 유도를 모니터링하였다. 종양 세포 용해(동적 고 컨텐츠 라이프 이미징, 종점 유세포 분석법), 세포 표면 활성화 및 성숙 마커의 발현(종점 유세포 분석법) 및 시토카인 분비(동적 고 컨텐츠 라이프 이미징, 종점 혈구계산 비드 어레이)를 사용하여, TCB에 의해 유도되고 FAP OX40 iMAB(분자 A)에 의해 조절된 T 세포 기능의 정도를 모니터링하였다.
a) 표적 세포주 및 섬유아세포
SK-OV-3 세포(ATCC, 카탈로그 번호 HTP-77)는 자연히 폴레이트 수용체를 발현한다. HeLa NLR 세포(에쎈바이오사이언스, 카탈로그 번호 4489)는 자연히 폴레이트 수용체를 발현하고, MKN45 NLR 세포는 자연히 CEA를 발현한다. 세포주 모두는, 핵에 제한된 NucLight Red 형광 단백질을 안정하게 발현하는 에쎈 셀플레이어(Essen CellPlayer) NucLight Red 렌티 바이러스(에쎈바이오사이언스, 카탈로그 번호 4476; EF1α, 푸로마이신(Puromycin))의 온상이다. 이는 비-형광 효과기 T 세포 또는 섬유아세포로부터의 용이한 분리를 가능하게 한다. 측정한 적색 형광이 적핵의 수, 및 따라서 건강한 종양 세포의 수에 정비례하기 때문에, 고 처리량 라이프 형광 현미경 검사에 의한 종양 세포 용해 또는 증식의 실시간 평가가 가능하다.
HeLa NucLight Red(NLR) 세포를 10% 소태아 혈청(FBS, 깁코 바이 라이프 테크놀로지(깁코 바이 라이프 테크놀로지), 카탈로그 번호 16000-044, Lot 941273, 감마-조사됨, 무-마이코플라스마, 56℃에서 35분 동안 열 불활성화됨), 1% (v/v) GlutaMAX I(깁코 바이 라이프 테크놀로지스, 카탈로그 번호 35050 038) 및 1 mM 나트륨-피루베이트(시그마(시그마), 카탈로그 번호 S8636)를 함유하는 DMEM(깁코(GIBCO), 카탈로그 번호 42430-082)에서 배양하였다.
MKN45 NucLight Red(NLR) 세포는 자연히 CEA를 발현한다. MKN45 NucLight Red 세포를, 10% 소태아 혈청(FBS, 깁코 바이 라이프 테크놀로지, 카탈로그 번호 16000-044, 감마-조사됨, 무-마이코플라스마, 및 56℃에서 35분 동안 열 불활성화됨), 1% (v/v) GlutaMAX I(깁코 바이 라이프 테크놀로지스, 카탈로그 번호 35050 038), 1 mM 나트륨 피루베이트(시그마, 카탈로그 번호 S8636) 및 0.5 μg/mL 푸로마이신(시그마-알드리치(Sigma-Aldrich), 카탈로그 번호 ant-pr-1)을 함유하는 DMEM(깁코, 카탈로그 번호 42430-082)에서 배양하였다. MKN-45(DSMZ; ACC409)를 에쎈 셀플레이어 NucLight Red 렌티 바이러스 시약(에쎈바이오사이언스, 카탈로그 번호 4476; EF1α, 푸로마이신)에 의해 5의 MOI(TU/세포)에서 8 μg/mL 폴리브렌의 존재 하에 제조사의 지시에 따라 형질도입시켜 핵-제한된 NucLight Red 형광 단백질을 안정하게 발현하였다. 이는 비-형광 효과기 T 세포 또는 섬유아세포로부터의 용이한 분리 및 고 처리량 라이프 형광 현미경 검사에 의한 종양 세포 성장의 모니터링을 가능하게 하였다. 따라서, 시간에 따른 웰 당 정량화는 종양 세포 용해 또는 증식의 실시간 평가를 가능하게 하였다.
세포 표면 FAP에 의한 FAP 결합 항체의 가교결합은 인간 섬유아세포 활성화 단백질(huFAP) 발현 NIH/3T3-huFAP 클론 19에 의해 제공되었다. 이러한 세포주를, huFAP를 발현하도록 발현 벡터 pETR4921에 의해 마우스 배아 섬유아세포 NIH/3T3 세포주(ATCC CRL-1658)를 형질감염시킴으로써 생산하였다. 세포를 10% 송아지 혈청(시그마-알드리치, 카탈로그 번호 C8056-500ml, 감마-조사됨, 무-마이코플라스마, 및 56℃에서 35분 동안 열 불활성화됨) 및 1.5 μg/mL 푸로마이신(시그마-알드리치, 카탈로그 번호 ant-pr-1)을 함유하는 DMEM(깁코, 카탈로그 번호 42430-082)에서 배양하였다.
b) 효과기 세포의 생산
버피 코트를 취리히 헌혈 센터로부터 입수하였다. 신선한 말초혈 단핵 세포(PBMC)를 단리하기 위해, 상기 버피 코트를 동일 부피의 DPBS(깁코 바이 라이프 테크놀로지스, 카탈로그 번호 14190 326)로 희석하였다. 50 mL 폴리프로필렌 원심분리 튜브(TPP, 카탈로그 번호 91050)를 15 mL 히스토패크(Histopaque) 1077(시그마 라이프 사이언스(SIGMA Life Science), 카탈로그 번호 10771, 폴리슈크로스 및 나트륨 다이아트라이조에이트, 1.077 g/mL의 밀도로 조정됨)로 보충하고, 상기 버피 코트 용액을 상기 히스토패크 1077 상에 적층하였다. 상기 튜브를 30분 동안 400 x g에서 실온에서 저 가속화와 함께 쉬는 시간 없이 원심분리하였다. 이후, PBMC를 계면으로부터 수집하고 3회 DPBS로 세척하고, 10% 소태아 혈청(FBS, 깁코 바이 라이프 테크놀로지, 카탈로그 번호 16000-044, Lot 941273, 감마-조사됨, 무-마이코플라스마, 및 56℃에서 35분 동안 열 불활성화됨), 1% (v/v) GlutaMAX I(깁코 바이 라이프 테크놀로지스, 카탈로그 번호 35050 038), 1 mM 나트륨 피루베이트(시그마, 카탈로그 번호 S8636), 1% (v/v) MEM 비필수 아미노산(시그마, 카탈로그 번호 M7145) 및 50 μM β-머캅토에탄올(시그마, M3148)로 보충된 RPMI 1640 배지(깁코 바이 라이프 테크놀로지, 카탈로그 번호 42401-042)로 이루어진 T 세포 배지에 재현탁하였다. 일부 경우에, RPMI1640을, 백그라운드 형광이 감소된, 개선된 고 컨텐츠 라이브 현미경 검사를 위해 플루오로브라이트(FluoroBrite) DMEM 배지(깁코, 인비트로젠, 카탈로그 번호 A18967-01)로 대체하였다.
휴지 중인 CD4 T 세포 또는 CD8 T 세포를 각각 제조사의 지시에 따라, 본래 그대로의 인간 CD4+ T 세포 단리 키트(밀테나이(Miltenyi), 카탈로그 번호 130-096-533) 및 본래 그대로의 인간 CD8+ T 세포 단리 키트(밀테나이, 카탈로그 번호 130-096-495)를 사용하여 단리하는 동안에, PBMC를 단리 직후 효과기 세포(휴지 중인 인간 PBMC) 또는 소분획물로서 사용하였다. 간략히, 인간 PBMC를 8분 동안 400 x g에서 4℃에서 원심분리하고, 1회 MACS 완충제(PBS + BSA(0.5% v/w, 시그마-알드리치, 카탈로그 번호 A9418) + EDTA([2 nM], Ambion, AM9261))로 세척하였다. 펠릿을 각각의 제공된 스트렙타비딘 라벨링된 음성 항체 칵테일에 의해 재현탁하고 5분 동안 4℃에서 항온처리한 후에(1*107 세포 당 40 μL MACS 완충제 및 10 μL 항체 믹스), 10분 동안 4℃에서 비오티닐화된 자성 포착 비드와 함께 후속 항온처리가 뒤따랐다(1*107 세포 당 30 μL MACS 완충제 및 20 μL 비드 믹스). 라벨링된 비-CD4 또는 비-C8 T 세포를, 제조사의 지시에 따라 LS 컬럼(밀테나이, 카탈로그 번호 130-042-401)을 사용하여 자성 분리에 의해 제거하였다. 각각 라벨링되지 않은 휴지 중인 CD4 및 CD8 T 세포를 함유하는 컬럼 통과액을 원심분리하고 상기에 기재된 바와 같은 MACS 완충제로 1회 세척하였다. 세포를 RPMI1640 또는 플루오로브라이트(Fuorobright) DMEM 기반 T 세포 배지에서 2 mio 세포/mL로 조정하였다.
c) TNF-α 센서 세포
TNF-α 센서 세포는, NFκB 민감성 프로모터 요소의 제어 하에 녹색 형광 단백질(GFP)을 암호화하는 리포터 플라스미드 pETR14327에 의해 형질도입된 HEK 293T 세포(ATCC, 카탈로그 번호 xxx)였다. HEK 293T 세포는 활성화된 T 세포에 의해 분비된 TNF-α가 결합할 수 있는 TNF 수용체를 자연히 발현한다. 이는 NFκB의 투여량 의존성 활성화 및 핵의 전좌를 야기하고, 이는 차례로 투여량 의존성 GFP 생산을 스작동시킨다. GFP 형광은 시간에 따른 고 처리량 라이프 형광 현미경 검사에 의해 정량화될 수 있고, 따라서 TNF-α 분비의 실시간 평가를 가능하게 한다.
TNF-α 센서 세포주는, HEK293T 세포(ATCC; CRL-3216)의 렌티 바이러스 형질도입에 의해 생산된다. 렌티 바이러스-기반 바이러스 벡터를, 렌티 바이러스 패키징 플라스미드, 및 최소 시토메갈로 바이러스(mCMV) 프로모터에 커플링된 녹색 형광 단백질(GFP)을 암호화하는 렌티 바이러스 발현 벡터(pETR14372)에 의해 NFκB 컨센서스 전사 반응 요소와 함께 HEK293T 세포의 공동-형질감염시킴으로써 생산하였다. HEK293T 세포 내로 플라스미드 형질감염을 제조사의 지시에 따라 리포펙타민 LTX(라이프 테크놀로지스(Life Technologies))를 사용하여 수행하였다. 형질감염을 형질감염 전날에 6 × 105 세포/웰로 시딩된 6-웰 플레이트에서 2.5 μg의 플라스미드 DNA를 사용하여 수행하였다. 렌티 바이러스 벡터-함유 상청액을 48시간 후에 수집하고 0.45 μm 공극-크기의 폴리에터설폰 막을 통해 여과하였다. 안정한 발현 세포주를 생산하기 위해, HEK293T 세포를 6-웰 플레이트에 1.0 × 106 세포/웰로 시딩하고 1 mL의 바이러스 벡터-함유 상청액으로 덮어씌웠다. 형질도입을 800 x g에서 32℃에서 30분 동안 에펜도르프(Eppendorf) 원심분리 5810 테이블-탑(table-top) 원심분리기(에펜도르프)에서 회전접종에 의해 수행하였다. TNF-α 유도성 세포 클론을 FACS 분류(FACS ARIA, 벡튼, 디킨슨 앤 컴패니(Becton, Dickinson and Company))에 의해 수득하였다.
d) 세포 독성 및 T 세포 활성화 분석
마우스 배아 섬유아세포 NIH/3T3-huFAP 세포, TNF-α 센서 세포 및 MKN45 NLR 세포를 10분 동안 37℃에서 세포 해리 완충제(인비트로젠, 카탈로그 번호 13151-014)를 사용하여 채취하였다. 세포를 1회 DPBS로 세척하였다. TNF-α 센서 세포 또는 섬유아세포를 4500 RAD의 용량을 사용하여 X-선 조사기에서 조사시켜 효과기 또는 종양 세포주의 후속 과성장을 방지하였다. 표적 세포주, NIH/3T3-huFAP 및 일부 분석에서 TNF-α 센서 세포를 0.1*105 세포/웰의 밀도로 T 세포 배지에서 멸균 96-웰 평저 부착 조직 배양 플레이트(TPP, 카탈로그 번호 92097)에서 밤새 37℃에서 및 5% CO2에서 항온처리기(Hera Cell 150)에서 배양하였다.
휴지 중인 인간 PBMC, 인간 CD4 T 세포, 인간 CD8 T 세포 또는 NLV-특이적 T 세포를 상기에 기재된 바와 같이 생산하고, 0.5*105 세포/웰의 밀도로 첨가하였다. 연속 희석물 열의 TCB(CEA CD3 TCB 또는 CEA CD3 TCB(2)) 및 고정된 농도의 FAP OX40 iMab(2 nM)를 웰 당 200 uL의 총 부피까지 첨가하였다. 세포를 72시간 이하 동안 37℃ 및 5% CO2에서 항온처리기(Hera Cell 150)에서 공동-배양하였다.
일부 분석에서, 플레이트를 3시간의 간격으로 72시간 이하 동안 37℃ 및 5% CO2에서 인큐사이트 줌 시스템(에쎈바이오사이언스, HD 위상차, 녹색 형광 및 적색 형광, 10 x 대물렌즈)을 사용하여 형광 현미경 검사 고 컨텐츠 라이프 이미징에 의해 모니터링하였다. NLR+ 세포/웰의 양에 비례하는 건강한 종양 세포의 통합된 적색 형광(RCUxum2/이미지)을 인큐사이트줌 소프트웨어를 사용하여 정량화하여 종양 세포 성장 대 T 세포에 의한 용해를 모니터링하였다. 값을 사용된 TCB 농도에 대해 각각의 시점 및 조건에 대하여 플롯팅하여 T 세포의 세포 용해 가능성에 대한 영향을 분석하였다.
TNF-α 센서 세포가 존재하는 일부 분석에서, 통합된 녹색 RCUxum2/이미지를 인큐사이트줌 소프트웨어를 사용하여 정량화하여 TNF-α 센서 세포에 의한 GFP의 TNF-α 유도된 생산을 모니터링하였다. 값을 사용된 TCB 농도에 대해 각각의 시점 및 조건에 대하여 플롯팅하여 T 세포에 의한 TNF-α 분비에 대한 효과를 분석하였다.
72시간 후에, 상청액을, 제조사의 지시에 따라 혈구계산 비드 어레이를 사용하여, 선택된 시토카인의 후속 분석을 위해 수집하였다. 평가한 시토카인은 IL-2(인간 IL-2 CBA Flex- set (비드 A4), 비디 바이오사이언스(BD Bioscience), 카탈로그 번호 558270), IL-17A(인간 IL-17A CBA Flex- set (비드 B5), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 560383), TNF-α(인간 TNF-α CBA Flex- set (비드 C4), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 560112), IFN-γ(IFN-γ CBA Flex- set (비드 E7), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 558269), IL-4(인간 IL-4 CBA Flex- set (비드 A5), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 558272), IL-10(인간 IL-10 CBA Flex- set (비드 B7), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 558274) 및 IL-9(인간 IL-9 CBA Flex- set (비드 B6), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 558333)였다.
이후, 모든 세포를, 세포 해리 완충제에 의해 10분 동안 37℃에서 항온처리한 후에 400xg에서 4℃에서 원심분리함으로써 웰로부터 탈착시켰다. 펠릿을 BSA(0.1% v/w, 시그마-알드리치, 카탈로그 번호 A9418)를 함유하는 매우 찬 FACS 완충제(DPBS (깁코 바이 라이프 테크놀로지스, 카탈로그 번호 14190 326)로 세척하였다. 세포를, 형광 염료-접합된 항체 항-인간 CD4(클론 RPA-T4, 바이오레전드(BioLegend), 카탈로그 번호 300532), CD8(클론 RPa-T8, 바이오레전드, 카탈로그 번호 3010441), CD62L(클론 DREG-56, 바이오레전드, 카탈로그 번호 304834), CD127(클론 019D5, 바이오레전드, 카탈로그 번호 A019D5), CD134(클론 Ber-ACT35, 바이오레전드, 카탈로그 번호 350008), CD137(클론 4B4-1, 바이오레전드, 카탈로그 번호 309814), GITR(클론 621, 바이오레전드, 카탈로그 번호 3311608) 및 CD25(클론 M-A251, 바이오레전드, 카탈로그 번호 356112)에 의해 20분 동안 4℃에서 FACS 완충제에서 표면-염색시켰다. 이어서, 이를 1회 FACS 완충제로 세척한 후에, 0.2 μg/mL DAPI(산타 크루즈 바이오텍(Santa Cruz Biotec), 카탈로그 번호 Sc-3598)를 함유하는 85 μL/웰 FACS 완충제에 재현탁한 후에, 이를 5-레이저 LSR-Fortessa(비디 바이오사이언스, DIVA 소프트웨어를 사용함)를 사용하여 동일한 날에 획득하였다. 살아있는 CD4 및 CD8 T 세포를 게이팅하고(DAPI-, NucLight RED-, CD4 또는 CD8+) 계수하고, 활성화 마커(CD134, CD137, GITR, CD25) 또는 성숙 마커(CD127, CD62L)의 평균 형광 강도(MFI) 또는 양성 세포의 백분율을 사용된 TCB 농도에 대해 각각의 조건에 대하여 플롯팅하여 T 활성화에 대한 효과를 분석하였다.
결과
3.1 T 세포 이중특이적 항체는 CD8 및 CD4 T 세포 상의 OX40의 투여량 의존성 상향조절을 유도한다.
상이한 인간 면역 효과기 세포 제제(휴지 중인 PBMC, CD4 또는 CD8 T 세포, NLV 특이적 CD8 T 효과기 기억 세포)를 CEACAM5 CD3 TCB의 연속 희석물 열의 존재 하에 48시간 동안 MKN-45 NucLight Red 세포 및 조사된 NIH/3T3 huFAP와 함께 공동-배양하였다. 살아있는 종양 세포의 양을 인큐사이트 줌 시스템을 사용하여 형광 현미경 검사 고 컨텐츠 라이프 이미징에 의해 정량화하고, 건강한 종양 세포의 통합된 적색 형광을 사용하여 특이적 용해를 계산하였다(도 2). OX40의 발현을 CD4 및 CD8 양성 T 세포에 대한 유세포 분석법에 의해 평가하였다(도 3A 내지 3D).
CEACAM5 CD3 TCB는, 도 2에 나타낸 바와 같이 42시간의 시점 동안에 모든 사용된 면역 효과기 세포 제제에서 MKN45 NucLight red 세포의 용해를 유도할 수 있었다. EC50 값 및 용해의 규모는 상이한 효과기 세포 제제 사이에 약간 달랐으며, 단리된 CD8 T 세포의 경우 최고치를 나타냈다. 종양 세포 용해에 수반하여, T 세포는 OX40을 포함하는 활성화 마커의 표면 발현을 증가시켰다(도 3A 내지 3D). OX40의 표면 발현은 CD4 양성 T 세포 상에서 최고였으나, 또한 CD8 양성 T 세포 상에서 보다 낮은 정도로 검출되었다. OX40 발현의 정도는 헬퍼 세포의 존재에 의존적이지 않았다(CD4 또는 CD8 T 세포의 경우 PBMC 대 단리된 집단에서의 발현 수준의 차이 없음).
3.2 FAP-표적화된 OX40 작용제의 존재는 T 세포의 세포 용해 가능성에 영향을 미치지 않는다.
다음으로, TCB 매개된 종양 세포 용해에 대한 OX40 공자극의 영향을 평가하였다. 3.1에 기재된 바와 같이, T 세포를 CEACAM5 CD3 TCB의 연속 희석물 열의 존재 하에, 각각 고정된 농도의 FAP OX40 iMAB의 존재 또는 부재 하에, MKN-45 NucLight Red 세포 및 조사된 NIH/3T3 huFAP와 함께 48시간 동안 공동-배양하였다.
살아있는 종양 세포의 양을 3시간의 간격으로 인큐사이트 줌 시스템을 사용하여 형광 현미경 검사 고 컨텐츠 라이프 이미징에 의해 정량화하고 건강한 종양 세포의 통합된 적색 형광을 사용하여 특이적 용해를 계산하였다.
종양 세포 용해의 정도에 대한 FAP OX40 iMAB 공자극의 영향 없음이 모든 평가된 시점에서 FolR1 CD3 TCB에 대해 관찰되었다(도 4A 내지 4C). 보다 용이한 시간에 따른 비교를 위해, 곡선 아래 면적(AUC)을 FAP OX40 iMAB 공자극의 존재 또는 부재 하에 각각의 시점에 대해 계산하고 시간에 대해 플롯팅하였다. 종양 세포가 TCB의 부재 하에 증식한 것과 같이 AUC는 시간에 따라 증가하였으나, AUC의 공자극 의존성 차이는 명확히 발견되지 않았다.
OX40 공자극의 존재는 또한 종양 세포 용해를 가속화시키지 않고 CEACAM5 CD3 TCB에 의한 종양 세포 용해의 규모를 증가시키지 않고 특정 백분율의 종양 세포의 용해를 달성하는 데 필요한 TCB 농도(예를 들어 EC50 값의 변화)를 증가시키지 않았다. 이는 모든 평가된 효과기 세포에 대해 해당하였고, 도 5A 내지 5C에서 42시간의 시점에 대한 예시로 나타나 있다.
유사한 결과가 CEA CD3 TCB를 사용하여 수득되었다(데이터는 나타나지 않음).
3.3 FAP 표적화된 OX40 작용제의 존재는 시토카인의 분비에 영향을 미친다.
일부 분석에서, TNF-α 센서 세포를 상기에 기재된 세팅에 부가적으로 배양하였다. TNF-α 센서 세포는 자연히 TNF-α 수용체를 발현하며, 이를 NFκB 민감성 프로모터 요소의 제어 하에 GFP에 의해 유전적으로 변형시켰다. 활성화된 T 세포에 의해 분비된 TNF-α의 결합은 NFκB의 투여량 의존성 활성화 및 후속적으로 GFP의 발현을 야기한다. GFP 형광은 시간에 따른 고 처리량 라이프 형광 현미경 검사에 의해 정량화될 수 있고, 따라서 TNF-α 분비의 실시간 평가를 가능하게 한다. 상기 3.1에 기재된 바와 같이, CD4 T 세포를 고정된 농도의 FAP OX40 iMAB, 및 각각 CEACAM5 CD3 TCB, FolR1 CD3 TCB 및 CEA CD3 TCB의 연속 희석물 열의 존재 하에 표적 세포MKN-45 NucLight Red 세포 및 조사된 NIH/3T3 huFAP와 함께 48시간 동안 공동-배양하였다.
존재하는 TCB에 의한 T 세포의 활성화는 TNF-α의 투여량 의존성 방출을 야기하였고, 이는 TNF-α 센서 세포에서 시간에 따라 GFP 형광의 투여량 의존성 증가를 야기하였다. FAP OX40 iMab에 의한 추가적 공자극은 GFP 형광, 및 이에 따른 활성화된 T 세포에 의한 TNF-α 분비를 추가로 증가시켰다(도 6A 내지 6D 및 7A 내지 7D). 이러한 효과는 대부분 TCB 매개된 TNF-α 분비의 정도에 작용하나, TNF-α 분비가 유도되는 TCB 농도(EC50 값의 변화)를 낮추지는 않았다. 또한, 작용성 TCR 자극이 시토카인 분비에 대한 이러한 양성 영향을 관찰하는 데 필요하였고, 비특이적 TNF-α 분비는 대조군 TCB 처리된 샘플에서 발견되지 않았다.
보다 용이한 시간에 따른 비교를 위해, 곡선 아래 면적(AUC)을 OX40 공자극의 존재 또는 부재 하에 각각의 시점에 대해 계산하고 시간에 대해 플롯팅하였다(도 8A 내지 8D). 증가된 AUC가 모든 시험된 TCB(CEA CD3 TCB, FolR1 TCB 및 CEACAM5 CD3 TCB)에서 및 상이한 종양 세포주(MKN45 NLR, HeLa NLR red, Skov-3)의 존재 하에 관찰되었다.
모든 샘플의 상청액을 종점(48시간)에서 혈구계산 비드 어레이 시스템(비디 바이오사이언스)을 사용하여 평가하여 TNF-α 이상의 여러 시토카인의 분자에 대한 효과를 정량화하였다. 평가한 시토카인은 일반적 T 세포 활성화에 대한 마커로서 IL-2 및 TNF-α, 특정 Th 서브클래스로의 분화를 모니터링하기 위한 IFN-γ(Th1 시토카인), IL-4(Th2 시토카인), IL-9(Th9 시토카인) 및 IL-17A(Th17 시토카인), 및 면역 억제성 시토카인으로서 IL-10이었다.
존재하는 TCB에 의한 T 세포의 활성화는, TNF-α와 비교하여, 모든 평가한 시토카인, 즉 IL-2, IL-4, IFN-γ, IL-17a 및 IL-10의 투여량 의존성 방출을 야기하였다(도 9A 내지 9D, 도 10A 내지 10D, 도 11A 내지 11D 및 도 12A 내지 12D). 이러한 시토카인 방출의 정도는 동일한 표적 세포주가 사용되었을 때 TCB에 대해 상이하였다. 이는 도 9A 내지 9D(CEACAM5 CD3 TCB) 및 도 10A 내지 10D(CEA CD3 TCB)의 비교로부터 알 수 있다. 그러나, 또한, 동일한 TCB(FolR CD3 TCB)가 사용되었을 때, 상이한 표적 세포주가 사용된 경우 차이가 관찰될 수 있었다. 도 11A 내지 11D는 HeLa NLR 세포에 의한 시토카인 방출을 보여주는 반면에, Skov-3 세포는 도 12A 내지 12D에서 사용되었다.
FAP OX40 iMab에 의한 추가적 공자극은 투여량 의존성 시토카인 분비의 정도를 조절하였으나, 시토카인 분비에 필요한 TCB 역치 농도를 낮추지는 않았다. 이로써, 전염증성 IL-2, TNF-α 및 IFN-γ 분비의 증가가 관찰되었고, 면역 억제성 IL-10의 농도가 낮아졌다. 보다 용이한 비교를 위해, OX40 공자극을 받은 샘플에서 시토카인 농도의 변화를 공자극을 받지 않은 것과 비교하여 TCB 안정기 농도에 대해 계산하였다(도 13).
이로써, 전염증성 IL-2, TNF-α 및 IFN-γ 분비의 증가는 분명하였고, 면역 억제성 IL-10의 농도는 동일한 표적 세포/TCB 조합에서만 낮아졌다. 보다 확실한 T 세포 활성화와 강한 투여량 의존성 시토카인 분비가 또한 OX40 공자극에 의해 보다 강하게 조절되었다는 뚜렷한 경향이 있다. 특히, 면역 억제성 IL-10 방출의 감소는 강한 T 세포 활성화와 연결된다.
휴지 중인 CD4 및 CD8 T 세포 및 휴지 중인 인간 PBMC의 시토카인 분비를 조절하는 OX40 공자극의 능력을 시험하였다. 3.1에 기재된 바와 같이, 휴지 중인 인간 PBMC, 단리된 CD4 또는 CD8 T 세포를, CEACAM5 CD3 TCB의 연속 희석물 열의 존재 하에 고정된 농도의 FAP OX40 iMAB의 존재 또는 부재 하에 MKN-45 NucLight Red 세포 및 조사된 NIH/3T3 huFAP와 함께 72시간 동안 공동-배양하였다. 상청액을 상기에 기재된 바와 같이 혈구계산 비드 어레이(CBA)를 사용하여 72시간에서 평가하였다.
OX40 공자극은 휴지 중인 인간 PBMC에서 및 CD8 T 세포 상에서 또한 적은 정도로 전염증성 시토카인의 분비를 지원하였다(투여량 의존성, 휴지 중인 CD4 T 세포의 경우 도 14A 내지 14H, 휴지 중인 CD8 T 세포의 경우 도 15A 내지 15H, 및 휴지 중인 PBMC의 경우 도 16A 내지 16H 참조). 최고 TCB 농도에 대한 비교를 도 17에 나타냈다. 휴지 중인 CD8 T 세포에 의한 IL-2 및 TNF-α 생산에 대한 영향이 특히 현저하였다.
따라서, OX40을 통한 공자극은 시험관내 세포 독성 분석에서 48 내지 72시간 내에 T 세포의 세포 용해 가능성을 직접적으로 증가시키지 않으나, 이는 시토카인을 분비하고 시토카인 미세 환경을 조절하는 능력을 증가시켰다. 종양에서 보다 전염증성인 시토카인 환경은 종양 미세 환경을 보다 면역 활성이고 덜 면역 억제성인 상태로 변화시킬 수 있고, 예를 들어 보다 낮은 수준의 IL-10 및 증가된 농도의 IFN-γ는 종양에서 골수 세포가 Th1, 및 항원 제시 세포를 지원하는 세포 독성 T 세포로 성숙하는 것을 가능하게 한다. 지지 시토카인 네트워크로의 이동은 종양이 면역 조절을 벗어나기 전에 성공적이고 지속된 종양 세포 제거를 회복시킬 것이다. CD4 T 세포 상에서 OX40의 우선적 발현에 따라, 보다 강한 조절이 CD8 T 세포 상에서 시토카인 분비와 대조적으로 CD4 T 세포 상에서 시토카인 분비에 대해 관찰되었다. 그러나, 세포 유형 모두는 영향을 받았다.
실시예 4
생체내 FAP OX40 iMab 및 CEACAM5 TCB의 병용 요법
4.1 방법
하기 실시예에서, TCB 및 FAP Ox40 iMAb의 조합이 각각의 단일 요법과 비교하여 생체내 우수한 항종양 효능을 야기하는지를 시험하였다.
인간 일가 FAP 표적화된, 사가 OX40 이중특이적 항체(FAP OX40 iMab)를, 비히클 및 CEACAM5 CD3 TCB 단일 처리된 동물과 비교하여, 단일 제제로서 및 인간 CEACAM5 CD3 TCB(CEA CD3 TCB(2))와의 조합으로 시험하였다. 인간 MKN45 위암 세포를, NOG 인간화된 마우스에서 마우스 섬유아세포 세포주(3T3)와 함께 피하 이식하였다.
4.2 세포주 및 종양 모델
인간 MKN45 세포(인간 위 암종)를 본래 ATCC로부터 입수하였고, 확장 후에 글리카트(Glycart) 내부 세포 은행에 예치하였다. 세포를 37℃에서 수-포화된 대기에서 5% CO2에서 10% FCS를 함유하는 DMEM에서 배양하였다. 시험관내 관 7을 98%의 생존능에서 피하 주사를 위해 사용하였다. 인간 섬유아세포 NIH-3T3을 본래 ATCC로부터 입수하였고, 인간 FAP를 발현하도록 로슈 너틀리(Roche Nutley)에서 조작하였고, 10% 송아지 혈청, 1x 나트륨 피루베이트 및 1.5 ug/ml 푸로마이신을 함유하는 DMEM에서 배양하였다. 클론 39를 각각 98.8% 및 98.4%의 생존능에서 각각 시험관내 관 번호 9(실험 1, 표 1) 및 7(실험 2, 표 2)에서 사용하였다.
50 μL 매트리겔과 혼합된 50 μL 세포 현탁액(1x106 MKN45 세포 + 1x106 3T3-huFAP)을 22G 내지 30G 바늘에 의해 마취된 마우스의 옆구리에 피하 주사하였다.
4.3 마우스 모델
NOG 암컷 마우스가 타코닉(Taconic)에 의해 전달되었고 인간 줄기 세포와 함께 사내 이동되었다. 마우스를 약속된 가이드라인에 따라(GV-Solas; Felasa; TierschG) 12시간 명/12시간 암의 1일 주기로 특정 병원체 부재 조건 하에 사육하였다. 실험 연구 프로토콜을 지방 정부(P ZH193/2014)가 검토하고 승인하였다. 도착 후에, 동물을 1주일 동안 새로운 환경에 적응시키고 관찰하기 위해 사육하였다. 연속식 건강 모니터링을 정기적으로 수행하였다.
4.4 실험 1의 처리 및 실험 조작
OX40에 대한 사가 결합을 갖는, 인간 일가 FAP-표적화된 OX40 이중특이적 항체(FAP OX40 iMab, 실시예 1에 기재된 분자 A)를 단일 제제로서 및 인간 CEACAM5 CD3 TCB와의 조합으로 시험하였다. FAP OX40 iMab 구축물에서 사용한 FAP 바인더는 4B9였다. 인간 MKN45 위암 세포를 NOG 인간화된 마우스에 마우스 섬유아세포 세포주(3T3)와 함께 피하 이식하였다.
세포 주사 7일 전에, 마우스를 채혈하고 혈액 내 인간 T 세포의 양에 대해 스크리닝하였다. 마우스에게 연구 제0일에 1x106 3T3 섬유아세포와 혼합된 1x106 MKN45 세포로 피하 주사하였다. 종양을 전체 실험 동안 1주일에 2 내지 3회 캘리퍼에 의해 측정하였다. 제10일에 마우스를 종양 크기 및 인간 T 세포 수에 대해 무작위화시키고, 이때 평균 T 세포 수/μl 혈액은 140이었고, 평균 종양 크기는 170 mm3였다. 무작위화 날에, 마우스에게 비히클, CEACAM5 CD3 TCB, FAP(4B9) OX40 iMab, 또는 FAP(4B9) OX40 iMab와 CEACAM5 CD3 TCB의 조합을 5주 동안 정맥내 주사하였다.
모든 마우스에게 200 μl의 적절한 용액으로 정맥내 주사하였다. 비히클 군의 마우스에게 히스티딘 완충제를 주사하고, 처리군에게 OX40 작용성 구축물, CEACAM5 CD3 TCB 또는 조합을 주사하였다. 200 μl 당 적절한 양의 화합물을 수득하기 위해 스톡 용액을 필요에 따라 히스티딘 완충제로 희석하였다. CEACAM5 TCB에 대해 사용되는 투여량 및 일정은 0.5 mg/kg 1회/1주일인 반면에, FAP OX40 iMAb는 12.5 mg/kg의 투여량으로 1회/1주일 제공된다.
제1 요법 10분, 4시간, 72시간 및 168시간 후에 2마리 마우스/군을 채혈하여 제1주 동안 화합물의 노출을 결정하였다. 인간 OX40에 대한 구축물의 결합 및 huCH1-도메인의 검출에 대해 FAP OX40 iMab를 샌드위치 ELISA에 의해 측정하였다. 항-CD3-CDR 특이적 항체에 대한 TCB의 결합 및 인간 Fc의 검출에 대해 CEACAM5 CD3 TCB를 샌드위치 ELISA에 의해 검출하였다(도 18A 및 18B 참조).
실험을 연구 제44일에 종결하였다. 종양, 혈액 및 비장을 PBS에 채취하고, 단일 세포 현탁액을 생산하고 상이한 면역 세포 마커에 대해 염색시키고 FACS에 의해 분석하였다. 전혈 샘플의 적혈구 용해를 3분 동안 실온에서 제조사의 지시에 따라 비디 팜(BD Pharm) 용해 완충제(BD, 카탈로그 번호 555899)를 사용하여 수행하였다. 비장 세포를 세포 여과기(나일론 필터 70 um, 비디 팔콘(BD Falcon)))를 통해 비장의 균질화에 의해 단리한 후에 상기에 기재된 바와 같이 적혈구 용해를 수행하였다. 종양 단일 세포 현탁액을 gentleMACS Dissociator(밀테나이)를 사용하여 생산하고 30분 동안 37℃에서 DNAse I([0.025mG/mL], 로슈다이어그노스틱스, 카탈로그 번호 11284932001) 및 콜라게나제 D([1 mG/mL], 로슈다이어그노스틱스(RocheDiagnostics), 카탈로그 번호 11088882001)를 사용하여 균질액을 절단하였다. 이후, 세포 현탁액을 세포 여과기(나일론 필터 70 um, 비디 팔콘)를 통해 여과하여 잔해를 제거하였다. 모든 제제를 과량의 매우 찬 FACS 완충제로 세척하였다. 세포를 정제된 래트 항-마우스 CD16/CD32(클론 2.4G2, BD, 카탈로그 번호 553142)의 존재 하에 30분 동안 4℃에서 암에서 FACS 완충제에서 형광 염료-접합된 항체 항-마우스 CD4(클론 GK 1.5, 바이오레전드, 카탈로그 번호 100422), CD8(클론 53-6.7, 바이오레전드, 카탈로그 번호 100730), CD45(클론 30-F11, 바이오레전드, 카탈로그 번호 103116) 및 CD3(클론 145-2C11, 바이오레전드, 카탈로그 번호 100351)에 의해 표면-염색시켰다. 샘플을 0.2 μg/mL DAPI(산타 크루즈 바이오텍, 카탈로그 번호 Sc-3598)를 함유하는 FACS 완충제에 재현탁시킨 후에, 이를 동일한 날에 5-레이저 LSR-Fortessa(비디 바이오사이언스, DIVA 소프트웨어 사용)를 사용하여 획득하였다. 살아있는 CD4 및 CD8 T 세포를 게이팅하고(DAPI-, CD45+, CD3+, CD4 또는 CD8+), (uL 혈액, mg 비장 또는 mg 종양 당) 정규화된 수를 계산하고, 값을 각각의 처리군에 대해 플롯팅하였다.
[표 1]
생체내 실험에 사용된 조성물
4.5 실험 2의 처리 및 실험 조작
인간 일가 항-FAP(4B9)/항-OX40 이중특이적 항체(FAP OX40 iMab)를 3개의 상이한 투여량으로 단일 제제로서 및 인간 CEACAM5 CD3 TCB와 조합으로 시험하였다. 인간 MKN45 위암 세포를 상기에 기재된 바와 같이 인간 줄기 세포를 갖는 NOG 인간화된 마우스에게 마우스 섬유아세포 세포주(3T3)와 함께 피하 이식하였다.
세포 주사 7일 전에 마우스를 채혈하고 혈액 내 인간 T 세포의 양에 대해 스크리닝하였다. 마우스에게 연구 제0일에 1x106 3T3 섬유아세포와 혼합된 1x106 MKN45 세포를 피하 주사하였다. 종양을 전체 실험 동안 캘리퍼에 의해 1주일 당 2 내지 3회 측정하였다. 제26일에, 마우스를 종양 크기 및 인간 T 세포 수에 대해 무작위화시켰고, 이때 평균 T 세포 수/μl 혈액은 115였고, 평균 종양 크기는 490 mm3였다. 무작위화 1일 후에 마우스에게 비히클, CEACAM5 CD3 TCB, FAP OX40 iMab, 또는 FAP OX40 iMab와 CEACAM5 CD3 TCB의 조합을 4주 동안 정맥내 주사하였다.
모든 마우스에게 200 μl의 적절한 용액으로 정맥내 주사하였다. 비히클 군의 마우스에게 히스티딘 완충제를 주사하고, 처리군에게는 OX40 작용성 구축물, CEACAM5 CD3 TCB 또는 조합을 주사하였다. 200 μl 당 적절한 양의 화합물을 수득하기 위해 스톡 용액을 필요에 따라 히스티딘 완충제로 희석하였다. CEACAM5 CD3 TCB에 대해 사용된 용량 및 일정은 0.5 mg/kg 1회/1주일이었던 반면에, FAP OX40 iMab는 12.5 mg/kg, 4.2 mg/kg 또는 1.4 mg/kg의 용량으로 1회/1주일 제공되었다.
실험을 연구 제50일에 종결하였다. 종양, 혈액 및 비장을 PBS에 채취하고, 단일 세포 현탁액을 생산하고 상이한 면역 세포 마커로 염색시키고 FACS에 의해 분석하였다.
군 당 모든 남아있는 마우스의 비장 및 종양을 종결시 유세포 분석법에 의해 분석하였다. 단일 세포 현탁액을 CD45, CD3, CD4 및 CD8에 대해 염색시키고, 세포의 양을 분석하였다. 종결시 및 실험 동안 동물로부터의 종양의 부분을 포르말린 고정시키고, 이후 파라핀에 내장시켰다. 샘플을 절단하고 CD3 및 CD8에 대해 염색시켰다. 비장 및 종양의 부분뿐만 아니라 혈장을 시토카인 분석을 위해 멀티플렉스(Multiplex)를 통해 동결시켰다. 종결시 종양의 부분을 포르말린 고정시키고, 이후 파라핀에 내장시켰다. 샘플을 절단하고 CD3 및 CD8에 대해 염색시켰다.
[표 2]
생체내 실험에서 사용된 조성물
제1주 동안 주사한 화합물의 약동학적 프로필을 결정하기 위해, 군 당 2마리의 마우스를 제1 요법 10분, 4시간, 72시간 및 7일 후에 채혈하고, 주사한 화합물을 ELISA에 의해 분석하였다. OX40 iMAb를 OX40 결합을 통해 검출한 반면에(A), CEACAM5 CD3 TCB를 항-CD3 CDR 항체에 대한 결합을 통해 검출하였다(B).
(A) 비오티닐화된 인간 OX40, 시험 샘플, 디곡시게닌 라벨링된 항-huCH1 항체 및 항-디곡시게닌 검출 항체(POD)를 96-웰 스트렙타비딘-코팅된 마이크로타이터 플레이트에 단계적으로 첨가하고, 매 단계 후에 1시간 동안 실온에서 항온처리하였다. 플레이트를 각각의 단계 후에 3회 세척하여 미결합 물질을 제거하였다. 마지막으로, 퍼옥시다제-결합된 복합물을 ABTS 기질 용액을 첨가하여 착색된 반응 생성물을 형성함으로써 시각화하였다. 반응 생성물 강도를 405 nm에서 결정하였고(490 nm의 기준 파장 사용), 이는 혈청 샘플 내 분석물 농도에 비례하였다.
(B) 비오티닐화된 항-huCD3 -CDR 항체, 시험 샘플, 디곡시게닌 라벨링된 항-huFc 항체 및 항-디곡시게닌 검출 항체(POD)를 96-웰 스트렙타비딘-코팅된 마이크로타이터 플레이트에 단계적으로 첨가하고, 매 단계 후에 1시간 동안 실온에서 항온처리하였다. 플레이트를 각각의 단계 후에 3회 세척하여 미결합 물질을 제거하였다. 마지막으로, 퍼옥시다제-결합된 복합물을 ABTS 기질 용액을 첨가하여 착색된 반응 생성물을 형성함으로써 시각화하였다. 반응 생성물 강도를 405 nm에서 결정하였고(490 nm의 기준 파장 사용), 이는 혈청 샘플 내 분석물 농도에 비례하였다.
4.6 종양, 비장 및 혈청 샘플의 시토카인 분석
혈청을 수집하고, 피하 종양 및 비장을 종결시(제50일), 마지막 Ab 투여 2일 후에 동물로부터 채취하였다. 20 내지 30 mg의 스냅-동결된 비장 및 종양 조직을 연구 종결시 완전체 단백질 단리를 위해 처리하였다. 간략히, 조직 샘플을 150 μl의 총 부피의 용해 완충제에서 조직 라이서(Tissue Lyser) 시스템 및 스테인리스 강 비드를 사용하여 파쇄하였다. 파쇄된 샘플을 원심분리에 의해 제거하고 완전체 단백질 함량을 제조사의 지시에 따라 상청액에서 BCA 단백질 분석 키트(피셔 써모 사이언티픽(Fischer Thermo Scientific))에 의해 분석하였다. 제조사의 지시에 따라(바이오-플렉스 프로(상표) 인간 시토카인 17-플렉스 분석, 바이오라드) 바이오-플렉스 시스템에 의해 상이한 시토카인/케모카인의 분석을 위해 총 200 μg의 종양 및 비장 용해물의 완전체 단백질 및 혈청 샘플의 1:10 희석물이 사용되었다.
4.7 면역 조직 화학
면역 조직 화학 분석을, 인간화된 NOG 마우스에서 지시된 처리군으로부터 유래된 3T3 뮤린 섬유아세포와 함께 이식된 인간 MKN45 위 피하 종양에 대해 수행하였다. 피하 종양을 종결시, 마지막 Ab 투여 2일 후에 동물로부터 채취하고, 포르말린 10%(시그마, 독일)에서 고정하고 나중에 FFPET에 대해 처리하였다(레이카(Leica) 1020, 독일). 이어서, 4 μm 파라핀 절편을 마이크로톰(레이카 RM2235, 독일)에서 절단하였다. HuCD8 및 HuCD3 면역 조직 화학을, 제조사의 프로토콜에 따라 레이카 오토스테이너(레이카 ST5010, 독일)에서 항-인간 CD8(셀 마크 코포레이션(Cell Marque Corporation), 캘리포니아) 및 항-인간 CD3(써모피셔 사이언티픽(ThermoFischer Scientific), 미국))을 사용하여 수행하였다. huCD3 및 huCD8 양성 T 세포의 정량화를 디피니엔스(Definiens) 소프트웨어(디피니엔스, 독일)에 의해 수행하였다. 통계를 다중 비교 검정으로 1-원 ANOVA에 의해 분석하였다.
4.8 실험 1의 결과
FAP OX40 iMAb가 T 세포 활성화 상태 및 시토카인 방출을 변화시킬 수 있음이 이미 시험관내 실험에서 알 수 있다. 또한, OX40의 영향이 CD8 양성 T 세포보다 CD4 양성 T 세포에 대해 강한 것으로 보이는 것이 확인되었다.
FAP OX40 iMAb가 또한 면역 상태를 보다 유익한 결과로 생체내 변화시킬 수 있다는 것을 시험하기 위해, 인간 줄기 세포를 면역 결핍된 마우스 내로 이동시켜 주로 T 및 B 세포로 이루어진 부분적 인간 면역계를 생성한 인간화된 마우스 모델을 사용하였다. MKN45, CEA 발현 인간 위암 세포주 및 3T3 섬유아세포를 공동-주사하였고, 이는 종양에서 스트로마 성분 및 FAP 발현을 개선한다. CEA는 CEACAM5 CD3 TCB에 의해 표적화되어 T 세포를 종양 세포와 가교결합시키고 종양 세포의 T 세포 매개된 사멸 및 T 세포 활성화를 유도한다. T 세포 활성화시 OX40은 상향조절된다. FAP OX40 iMAb는 FAP 발현 섬유아세포 및 OX40 발현 T 세포를 가교결합시켜 OX40 신호 전달을 유도한다. 이는 개선된 T 세포 생존 및 시토카인 방출을 야기한다.
본 연구에서 FAP OX40 iMAb 및 CEACAM5 CD3 TCB의 병용 요법이 단일 요법과 비교하여 개선된 효능을 야기함을 입증할 수 있다. 또한, FAP OX40 iMAb 단일 요법은 비히클과 비교하여 유의미하게 개선된 효능을 나타냈다.
효능 차이의 원인으로서 노출 차이를 배제하기 위해 각각의 단일 요법으로 및 병용 군으로 제1 처리시 CEACAM5 CD3 TCB 및 FAPOX40 iMAb의 혈청 농도를 평가하였다. 오류에 나타낸 바와 같다. 기준 소스를 찾을 수 없다. A 및 18B에서는, 모든 구축물에 대한 노출이 단일 요법 및 병용 요법에서 비슷하였다.
도 19에 나타낸 바와 같이, FAP OX40 iMAb 단일 요법 처리된 동물은 약간 지연된 종양의 진행을 나타냈고, CEACAM5 CD3 TCB는 보다 뚜렷했다. 그러나, 병용 요법에서만, 피하 종양의 퇴화가 달성되었다(표 3 참조).
[표 3]
연구 제41일 및 제43일의 종양 성장 억제(TGI)
4.9 실험 2의 결과
제2 연구에서, 단일 요법으로서 및 CEACAM5 CD3 TCB(CEA CD3 TCB(2))와의 조합으로서 상이한 투여량의 FAPOX40 iMAb를 시험하였다. 여기서, 또한, 제1 연구의 170 mm3와 비교하여, 490 mm3의 중간 종양 크기에 도달할 때까지 실험 개시를 지연하였다.
화합물로 주사한 모든 군은 상이한 군, OX40 표적화된 화합물 또는 TCB 사이에 분자의 비슷한 최대 농도를 나타냈다. 도 20A 및 20B에서는, 제1주 동안 주사한 화합물의 약동학적 프로필을 나타냈다.
도 21A 내지 21C에 플롯팅한 바와 같이, 다시 한번, 단일 요법에 비해 병용 요법의 우수한 항종양 효능을 확인할 수 있었다. 임의의 시험된 투여량의 FAP OX40 iMAb 및 단일 요법의 CEACAM5 CD3 TCB는 모두 종양 성장의 진행을 느리게 만들 수 없었고, 이는 아마도 치료 개시시 상당한 종양 부담 때문이었다. 병용 치료만이 유의미하게 전체 연구 기간 동안 종양 성장의 진행을 방지하였다(표 4). 강한 지효성이 12.5 mg/kg 투여량의 FAP OX40 iMAB에서 관찰되었으나, 낮은 투여량(4.2 및 1.4 mg/kg)은 CEACAM5 CD3 TCB 단일 요법과 비교하여 단지 일시적으로 진행을 감소시킬 수 있었다(도 22). 분명한 투여량 의존성이 관찰되었다. 도 20A 및 20B에 나타낸 바와 같이, 모든 구축물에 대한 노출은 단일 요법 및 병용 요법에서 비슷하였다.
중간값을 기반으로 하는 종양 성장 억제를 연구 제40일 및 제49일에 계산하였다. 값은 하기 표 4에서 찾아볼 수 있다.
[표 4]
연구 제40일 및 제49일의 종양 성장 억제(TGI)
다중 비교에서 군 평균의 유의미한 차이를 시험하기 위해, 분산의 표준 분석(ANOVA)을 던넷 방법(Dunnett's method)을 사용하여 자동으로 생성하였다. 던넷 방법은 평균이 대조군의 평균과 상이한지를 시험한다.
[표 5]
p 값: 던넷 방법을 사용한 대조군과의 비교(AUC=곡선 아래 면적)
유세포 분석(도 23A 내지 23D) 및 병리조직학(도 25A 및 25B) 평가는 침윤이 증가한 종양 덩어리 및 인간 백혈구를 나타냈다. 이는 CEACAM5 CD3 TCB 단일 요법에 대해 이미 관찰되었으나, CEACAM5 CD3 TCB와 4.2 또는 12.5 mg/kg FAP OX40 iMAB의 조합에서 강하게 증진되었다. FAP OX40 iMAB 단일 요법 자체는 종양내 백혈구 수를 단지 최소로 증가시켰다. 검출된 세포 유형은 인간 CD4 및 CD8 T 세포, 뿐만 아니라 비-T 세포(예를 들어 B 세포 또는 골수 유래된 세포)였다. 흥미롭게도, CEACAM5 CD3 TCB 단일 요법과 비교한 병용 요법의 증가 배수는 CD8 T 세포 수보다 CD4 T 세포의 경우 뚜렷하였고, 이는 주로 CD4 T 세포 상에 발현되는 OX40의 생물학에 일치한다. 말초에서, 세포 수의 유의미한 변경이 검출되지 않았으며, 모든 화합물의 종양 표적화된 성질을 강조하였다(도 24A 및 24B).
또한, 비장, 혈액 및 종양내 시토카인의 농도를 평가하였다(바이오-플렉스 프로(상표) 인간 시토카인 17-플렉스 분석, 바이오라드). 또한, 최고 항종양 효능을 갖는 군은 종양내 시토카인(예를 들어 IL-6, IL-8, IFN-γ, TNF-α, MCP-1, MIP-1β)의 최대 전체 증가를 나타냈고(도 26A 내지 26C), 이는 FAP Ox40 iMAB(12.5 mg/kg) 및 CEACAM5 CD3 TCB의 조합이었다. 유의미한 변화가 말초(비장 또는 혈액)에서 관찰되지 않았다. 따라서, FAP OX40 iMAB 및 CEACAM5 CD3 TCB 처리에 의해 촉발된 면역 변화는 종양-특이적이었고, 이는 인간 T 세포의 가교결합 및 활성화가 CEA 발현 종양에서 배타적으로 발생하고 CEA에 대해 음성인 다른 영역, 예컨대 혈액 및 비장에서는 발생하지 않음을 시사한다.
또한, 조합 처리된 동물에 대한 종양내 백혈구수 사이에 대한 것이 아닌, 종양 진행과 종양내 시토카인 농도의 양 사이의 직접적인 음의 상관관계를 밝혔다(도 27A 내지 27F). 존재하는 시토카인의 양은 모든 동물에 대하여 침윤성 백혈구의 수와 엄밀히 상관관계에 있지 않았다. 특히, CEACAM5 CD3 TCB 단일 요법 처리된 동물을 조합 처리된 동물과 비교하였을 때, 유사한 백혈구수는 동일한 항종양 효능 또는 시토카인 함량이 존재함을 반드시 의미하는 것은 아니였다. 이는, 단지 증가된 종양 내 T 세포의 수를 넘어서, 세포 당 더 높은 종양내 T 세포의 시토카인을 분비시키는 기능 및 가능성이 FAP OX40 iMAB 및 CEACAM5 CD3 TCB의 조합의 증진된 항종양 활성에 대한 원인이라는 가정을 유도한다.
개선된 시토카인 환경은 항종양 효능을 조정하는 데 있어서 주요 역할을 한다. 이는 보다 많은 림프구를 종양에 모집하여 증식을 지원하고 이들 T 세포의 생존을 증가시킬 수 있고 억제 및 고갈의 확립을 방지한다. FAP OX40 iMAb가 상이한 종양 세포주, 효과기 집단 및 종양 표적에 대해 시험관내 시토카인의 TCB 매개된 분비를 보다 염증성이고 덜 억제성인 쪽으로 향하게 조절할 수 있음을 보여줄 수 있었다. 또한, 인간 면역계를 모의실험하는 인간화된 마우스 모델에서 개선된 항종양 효능으로 번역되었음을 보여줄 수 있다.
실시예 5
FAP OX40 iMab, CEA TCB 및 PD-L1 항체의 생체내 병용 요법
5.1 실험 절차
하기 실시예에서, 인간 FAP 표적화된 OX40 작용제 FAP OX40 iMAb(FAP 바인더 4B9)를 인간 MKN45 위암 모델에서 인간 CEA CD3 TCB 및 항-PD-L1 항체(a-PD-L1)와의 조합으로 12.5 mg/kg의 농도에서 시험하였다. MKN45 세포를 NSG 인간화된 마우스에게 마우스 섬유아세포 세포주(3T3)와 함께 피하 이식하였다.
인간 MKN45 세포(인간 위 암종)를 본래 DSMZ로부터 입수하고, 확장 후에 글리카트 내부 세포 은행에 예치하였다. 세포를 37℃에서 수-포화된 대기에서 5% CO2에서 10% FCS를 함유하는 DMEM에서 배양하였다. 시험관내 관 13을 99.1%의 생존능에서 피하 주사를 위해 사용하였다. 인간 섬유아세포 NIH-3T3을 본래 ATCC로부터 입수하고, 호프만-라 로슈 인코포레이티드(Hoffmann-La Roche Inc.)에서 인간 FAP를 발현하도록 조작하고, 10% 송아지 혈청, 1x 나트륨 피루베이트 및 1.5 μg/ml 푸로마이신을 함유하는 DMEM에서 배양하였다. 클론 39를 시험관내 관 번호 8에서 및 97.6%의 생존능에서 사용하였다.
50 μL 매트리겔과 혼합된 50 μL 세포 현탁액(1x106 MKN45 세포 + 1x106 3T3-huFAP)을 22G 내지 30G 바늘에 의해 마취된 마우스의 옆구리에 피하 주사하였다. NSG 암컷 마우스(찰스 리버(Charles River)로부터 구매)(실험 개시시 5주령)를, 약속된 가이드라인에 따라(GV-Solas; Felasa; TierschG) 12시간 명/12시간 암의 1일 주기를 사용하여 특이적 병원체 부재 조건 하에 사육하였다. 실험 연구 프로토콜을 지방 정부당국에서 검토하고 승인하였다. 도착 후에, 동물을 1주일 동안 새로운 환경에 적응시키고 관찰하기 위해 사육하였다. 연속식 건강 모니터링을 매일 수행하였다.
인간화를 위해, 마우스에게 부설판(Busulfan, 20 mg/kg)을 주사하고, 24시간 후에 100,000 인간 HSC(스팀셀 테크놀로지스(StemCell Technologies)로부터 구매)를 주사하였다.
세포 주사 7 내지 14일 전에 마우스를 채혈하고 혈액 내 인간 T 세포의 양에 대해 스크리닝하였다. 마우스를 인간 T 세포에 대해 무작위화시키고, 이때 평균 T 세포 수/ul 혈액은 131이었다. 마우스에게 연구 제0일에 1x106 3T3 섬유아세포와 혼합된 1x106 MKN45 세포를 피하 주사하였다. 종양을 전체 실험 동안에 캘리퍼에 의해 1주일에 2 내지 3회 측정하였다. 제17일에, 마우스를 종양 크기에 대해 무작위화시켰고, 이때 평균 종양 크기는 205 mm3였다. 무작위화 날에, 마우스에게 비히클, CEA CD3 TCB, CEA CD3 TCB + a-PD-L1, CEA CD3 TCB + FAP OX40 iMAb, 또는 CEA CD3 TCB, a-PD-L1 및 FAP OX40 iMAb의 삼중 조합을 4주 이하 동안 매주 정맥내 주사하였다. 모든 마우스에게 200 μl의 적절한 용액으로 정맥내 주사하였다. 비히클 군의 마우스에게 히스티딘 완충제를 주사하고, 처리군에게는 CEA CD3 TCB, 및 CEA CD3 TCB 및/또는 FAP OX40 iMAb의 조합을 주사하였다. 200 μl 당 적절한 양의 화합물을 수득하기 위해 스톡 용액을 필요에 따라 히스티딘 완충제로 희석하였다. CEA CD3 TCB에 대해 사용된 투여량 및 일정은 2.5 mg/kg 2회/1주일이었던 반면에, FAP OX40 iMAb는 12.5 mg/kg의 투여량으로 제공되었고 a-PD-L1은 10 mg/kg의 투여량으로 1회/1주일 제공되었다(표 7). 실험을 연구 제44일에 종결하였다. 일부 마우스는 실험 동안 좋지 않은 건강 상태로 인해 희생시켜야 했다.
[표 6]
제44일에 살아있는 마우스
종양 및 혈액을 PBS에 채취하고, 단일 세포 현탁액을 생산하고 상이한 면역 세포 마커에 대해 염색시키고, FACS에 의해 분석하였다. 종양의 부분뿐만 아니라 혈장을 시토카인 분석을 위해 멀티플렉스를 통해 동결시켰다. 종결시 종양의 부분을 포르말린 고정시키고, 이후 파라핀에 내장시켰다. 샘플을 절단하고 CD3 및 CD8에 대해 염색시켰다.
[표 7]
생체내 실험에서 사용한 조성물
5.2 결과
본 연구에서, 처음으로 FAP OX40 iMAb가 CEA CD3 TCB 및 a-PD-L1의 조합에 의해 매개된 효능을 개선할 수 있음을 입증하고자 하였다. a-PD-L1은 면역 체크포인트 억제제이고, 암 면역 요법 분야에 확립되어 있다. a-PD-L1 바인더는 마우스 PD-L1에 교차반응성이고 뮤린 IgG 포맷으로 생산되었다. CEA CD3 TCB는 암 세포 상에 발현되는 CEA를 표적화하고, FAP OX40 iMAb는 종양 스트로마에서 FAP 발현 섬유아세포에 결합한다. FAP OX40 iMAb는 매주 12.5 mg/kg의 투여량으로 제공되었고, a-PD-L1은 10 mg/kg의 투여량으로 제공된 반면에, CEA CD3 TCB는 2.5 mg/kg의 투여량으로 2회/1주일 제공되었다.
인간 구축물을 시험하기 위해, 인간 면역 세포, 구체적으로 T 세포는 마우스 시스템에 존재해야 한다. 이런 이유로, 인간화된 마우스(인간 줄기 세포를 제공받은 마우스를 의미함)를 사용하였다. 이들 마우스는 주로 T 및 B 세포로 이루어진 부분적 인간 면역계를 시간에 따라 발달시켰다.
MKN45, CEA 발현 인간 위암 세포주 및 3T3 섬유아세포를 공동-주사하였고, 이는 종양에서 스트로마 성분을 개선한다. CEA는 CEA CD3 TCB에 의해 표적화되어, T 세포를 종양 세포와 가교결합시키고 종양 세포의 T 세포 매개된 사멸 및 T 세포 활성화를 유도한다. T 세포 활성화시 PD-1뿐만 아니라 OX40이 상향조절된다. FAP OX40 iMAb는 FAP 발현 스트로마 세포 및 OX40 발현 T 세포를 가교결합시켜 OX40 신호 전달을 유도한다. 이는 개선된 시토카인 분비, 및 T 세포의 생존 및 증식을 야기한다. PD-L1은 주로 종양 세포에 의해 발현되고, PD-L1의 차단은 PD-1 발현 T 세포와의 가교결합을 방지하고 T 세포의 활성화에 있어서 PD-1 의존성을 방지한다.
본 연구에서, a-PD-L1 및 FAP OX40 iMAb와 조합된 CEA CD3 TCB가 비히클 군과 비교하여 종양 성장 억제에 있어서 개선된 효능을 매개함을 입증할 수 있다(도 28A 및 28B). 중간값을 기반으로 하는 종양 성장 억제를 제36일, 제38일, 제41일 및 제43일에 계산하였다. CEA CD3 TCB + a-PD-L1 + FAP OX40 iMAb로 처리된 군은 종양 성장의 최강 억제를 나타냈다.
[표 8]
제36일, 제38일, 제41일 및 제43일의 종양 성장 억제(TGI)
제43일까지 곡선 아래 면적(AUC)을 고려하면, CEA CD3 TCB + a-PD-L1 + FAP OX40 iMAb의 조합만이 비히클 단일 요법과 유의미하게 상이하였다.
[표 9]
비히클과 비교한 제43일까지 종양 부피(AUC)의 1-원 분석
[표 10]
비히클과 비교한 제43일의 종양 부피(AUC)의 1-원 분석
모든 다른 군(단일 요법 및 이중 요법)은 비히클과 비교하여 유의미하게 효능을 개선하지 않았다.
제1주 동안 주사한 화합물의 약동학적 프로필을 실시예 4에 기재된 바와 같이 연구하였다. 또한 a-PD-L1 비오티닐화된 항-인간 Fc를 검출하기 위해, PD-L1-huFc, 시험 샘플 및 다클론 항-뮤린 IgG(HRP)를 96-웰 스트렙타비딘-코팅된 마이크로타이터 플레이트에 단계적으로 첨가하고 매 단계 후에 1시간 동안 실온에서 항온처리하였다. 플레이트를 각각의 단계 후에 3회 세척하여 미결합 물질을 제거하였다. 마지막으로, 마지막으로, 퍼옥시다제-결합된 복합물을 ABTS 기질 용액을 첨가하여 착색된 반응 생성물을 형성함으로써 시각화하였다. 반응 생성물 강도를 405 nm에서 결정하였고(490 nm의 기준 파장 사용), 이는 혈청 샘플 내 분석물 농도에 비례하였다. 군 당 2마리의 마우스를 제1 및 제3 요법 1시간 및 72시간 후에 채혈하고, 주사한 화합물을 ELISA에 의해 분석하였다. 화합물로 주사한 모든 군은 상이한 군, FAP OX40 iMAb, CEA CD3 TCB 또는 a-PD-L1 사이에 분자의 비슷한 노출을 나타냈다(도 29A, 29B 및 29C 참조).
제44일에 IHC(면역 조직 화학)에 의한 종결시 종양에서 T 세포 침윤은 모든 다른 군과 비교하여 삼중 조합 군에서 유의미하게 증가하였다(도 30A 및 30B 참조).
실시예 6
FAP OX40 iMab, CEA TCB 및 PD-L1 항체의 시험관내 병용 요법
6.1 실험 절차
본 분석에서, 실시예 5에 기재된 바와 유사하게, FAP OX40 iMAb를, CEA CD3 TCB 및 아테졸리주맙(Tecentriq, 항-인간 PD-L1-특이적 인간화된 인간 IgG1κ 항체)의 존재 또는 부재 하에 인간 PBMC(버피 코트로부터 단리되고, 동결되고 액체 질소에서 저장됨)를 활성화시키는 가능성에 대하여 시험하였다. 종양 환경을 모방하기 위해, 6명의 상이한 공여자의 PBMC를 FAP-발현 NIH/3T3-huFAP 섬유아세포 세포주와 함께 및 CEA-발현 MKN45-FolR1-PDL1 위암 세포주와 함께 4일 동안 2 nM FAP OX40 iMab 및/또는 100 nM CEA CD3 TCB 및/또는 80 nM 아테졸리주맙의 존재 또는 부재 하에 항온처리하였다. PBMC 활성화를 결정하기 위해, CD4 및 CD8 T 세포를, 증식(CFSE-희석), CD25(IL-2Rα), 4-1BB(CD137), OX-40(CD134), T-bet(T-box 전사 인자), Eomes(에오메소더민(Eomesodermin)), 그랜자임 B 및 PD-1 발현에 대해 유세포 분석법에 의해 분석하였다. 상청액을 멀티플렉스에 의해 IFNγ, TNF-α, GM-CSF, 그랜자임 B, IL-2, IL-8 및 IL-10에 대해 분석하였다.
a) PBMC의 생산
버피 코트를 취리히 헌혈 센터로부터 입수하였다. 신선한 말초혈 단핵 세포(PBMC)를 단리하기 위해, 버피 코트를 동일 부피의 DPBS(깁코 바이 라이프 테크놀로지스, 카탈로그 번호14190326)로 희석하였다. 50 mL 팔콘 원심분리 튜브(TPP, 카탈로그 번호 91050)를 15 mL 히스토패크 1077(시그마 라이프 사이언스, 카탈로그 번호 10771, 폴리슈크로스 및 나트륨 다이아트라이조에이트, 1.077 g/mL의 밀도로 조정됨)로 보충하고, 버피 코트 용액을 15 mL 히스토패크 1077에 적층하였다. 상기 튜브를 30분 동안 400 x g에서 실온에서 저 가속화와 함께 쉬는 시간 없이 원심분리하였다. 이후, PBMC를 계면으로부터 수집하고 3회 DPBS로 세척하고, 90% (v/v) 소태아 혈청(FBS, 깁코 바이 라이프 테크놀로지, 카탈로그 번호 16000-044, Lot 941273, 감마-조사됨, 무-마이코플라스마, 및 56℃에서 35분 동안 열 불활성화됨) 및 10% 다이메틸 설폭사이드(시그마, 카탈로그 번호 D2650) 10% (v/v)로 이루어진 T 세포 동결 배지에 재현탁하였다. 1 mL를 멸균 저온 바이알에 신속히 옮기고 저온 박스에 옮기고 24시간 동안 -80℃에서 저장하였다. 이후, 바이알을 액체 질소 용기 또는 기상 용기에 옮겼다.
6명의 공여자로부터의 바이알을 37℃에서 수욕에서 해동시키고, 10% (v/v) 소태아 혈청(FBS), 1% (v/v) GlutaMAX I, 1 mM 나트륨 피루베이트(시그마, 카탈로그 번호 S8636), 1% (v/v) MEM 비필수 아미노산(시그마, 카탈로그 번호 M7145) 및 50 μM β-머캅토에탄올(시그마, M3148)로 보충된 RPMI 1640 배지로 이루어진 분석 배지에서 세척하였다. 해동 후에, 세포를 2시간 동안 세포 항온처리기에서 37℃ 및 5% CO2에서 휴지시켰다. 세포를 계수하고 DPBS로 세척하고 37℃ DPBS에 1x106 세포/mL로 재현탁하였다. CFDA-SE를 200 nM의 최종 농도로 첨가하고 10분 동안 37℃에서 항온처리하였다. 이후, FBS를 첨가하고, 세포를 세척하고 분석 배지에서 2 x 106 세포/mL로 설정하였다.
b) 표적 세포주
NIH/3T3-huFAP 클론 19를 함유하는 T150 플라스크를 DPBS로 세척하고 효소-미함유 PBS-기반 해리 완충제와 함께 8분 동안 37℃에서 항온처리하였다. 세포를 수집하고 세척하고 분석 배지에 재현탁하고 X-선 조사기 RS 2000을 사용하여 50 Gy로 조사하였다. 세포를 분석 배지에 1 x 106 세포/mL로 설정하였다.
MKN45-FolR1-PDL1 위암 세포주를 함유하는 T150 플라스크를 DPBS로 세척하고 효소-미함유 PBS-기반 해리 완충제와 함께 8분 동안 37℃에서 항온처리하였다. 세포를 수집하고 DPBS로 세척하고 C 희석제에 재현탁하였다(적어도 250 μL, 8 x 107 세포/mL 이하). 동일한 양의 C 희석제를 4 μL/mL PKH-26 염료로 보충하고 완전히 혼합하였다. 이러한 염료 용액을 세포에 첨가하고 완전히 즉시 혼합하였다. 세포를 5분 동안 실온에서 항온처리하였다. 이후, FBS를 첨가하고, 세포를 분석 중 세척하고 분석 배지에 재현탁하고 X-선 조사기 RS 2000(라드 소스(Rad source))을 사용하여 50 Gy로 조사하였다. 세포를 분석 배지에 1 x 106 세포/mL로 설정하였다.
c) 분석 설정
화합물을 시험하기 위해, 각각의 성분으로 이루어진 마스터 용액을 분석 배지 내에 하기와 같이 제조하였다: 16 nM FAP OX40 iMAB, 800 nM CEA CD3 TCB 및 640 nM 아테졸리주맙. 세포 및 성분을 96-웰 환저 조직 배양 플레이트(TTP, 카탈로그 번호 92097)에서 50 μL의 PKH-26 레드 라벨링된 MKN45-FolR1-PD-L1(10,000 세포/웰), 50 μL의 NIH/3T3-huFAP 클론 19(10,000 세포/웰), 25 μL의 1명의 공여자의 PBMC(50,000 세포/웰), 25 μL의 16 nM FAP OX40 iMAB 용액 또는 분석 배지(최종 농도 2 nM), 25 μL의 800 nM CEA CD3 TCB 용액 또는 분석 배지(최종 농도 100 nM), 및 25 μL의 640 nM 아테졸리주맙 용액 또는 분석 배지(최종 농도 80 nM)의 양으로 합하였다. 이어서, 플레이트를 4일 동안 37℃에서 및 5% CO2에서 가습된 세포 항온처리기에서 항온처리하였다.
4일 후에, 50 μL 상청액을 제거하고 -80℃에서 저장하여 나중에 시토카인 함량을 분석하였다(하기 참조). T 세포 증식 및 T 세포 활성화 마커의 표면 발현의 유세포 분석법 분석을 수행하기 위해, 플레이트를 원심분리하고 1회 찬 DPBS로 세척하였다. 샘플을, 2개의 개별적 염색 패널을 위해 동일한 부피로 2개의 96-웰 플레이트에 나누었다. 염색 패널 1의 경우, 세포를 15분 동안 실온(RT)에서 1:800 희석된 LIVE/DEAD 픽서블 아쿠아 데드 셀 스테인(Fixable Aqua Dead Cell Stain)으로 보충된 50 μL/웰 DPBS에서 염색시켰다. 세포를 1회 200 μL/웰 FACS 완충제로 세척하였다(350 x g 4 분 4℃에서 원심분리, 플리크 오프(flick off)). 이후, 이를 항체 항-인간 CD4(클론 A161A1, 바이오레전드, 카탈로그 번호- 357410), CD8(클론 RPA-T8, 바이오레전드, 카탈로그 번호 301040), CD25(클론 BC96, 바이오레전드, 카탈로그 번호 302636), PD-1(클론 EH12.2H7, 바이오레전드, 카탈로그 번호329920), CD134(클론 Ber-ACT35, 바이오레전드, 카탈로그 번호-350008), CD137(클론 4B4-1, 바이오레전드, 카탈로그 번호- 309814)을 함유하는 FACS 완충제로 구성된 25μ L/웰 염색 용액으로 재현탁시키고 20분 동안 4℃에서 항온처리하였다. 세포를 1회 200 μL/웰 FACS 완충제로 세척하고(350 x g 4분 4℃ 원심분리, 플리크 오프), 120 μL/웰 FACS 완충제에 재현탁시킨 후에, 이를 4-레이저 LSRII(비디 바이오사이언스, DIVA 소프트웨어 사용)를 사용하여 동일한 날에 획득하였다.
염색 패널 2의 경우, 세포를 15분 동안 실온(RT)에서 1:800 희석된 LIVE/DEAD 픽서블 아쿠아 데드 셀 스테인으로 보충된 50 μL/웰 DPBS에서 염색시키고 1회 200 μL/웰 FACS 완충제로 세척하였다(350 x g 4분 4℃ 원심분리, 플리크 오프). 세포를, 항체 항-인간 CD4(클론 RPA-T4, 바이오레전드, 카탈로그 번호 300558), CD8(SK-1, 바이오레전드, 카탈로그 번호 344710), CCR7(클론 G043H7, 바이오레전드, 카탈로그 번호353204), CD45RO(클론 BC96, 바이오레전드, 카탈로그 번호 304236)를 함유한 FACS 완충제로 구성된 25 μL/웰 염색 용액에 재현탁시키고 20분 동안 4℃에서 항온처리하였다. 세포를 1회 200 μL/웰 FACS 완충제로 세척하고(350 x g 4분 4℃ 원심분리, 플리크 오프), 60분 동안 RT에서 1부의 Foxp3 고정/투과화 농축물을 3부의 Foxp3 고정/투과화 희석제(FoxP3/전사 인자 염색 완충제 세트, 이바이오사이언시즈(eBiosciences), 카탈로그 번호-005523-00)와 혼합함에 의한 100 μL/웰의 Foxp3 고정/투과화 작업 용액에 재현탁시켰다. 이어서, 세포를 1부의 투과화 완충제를 9부의 물과 혼합함에 의한 투과화 완충제 작업 용액(FoxP3/전사 인자 염색 완충제 세트, 이바이오사이언시즈, 카탈로그 번호-005523-00)으로 1회 세척하고, 항체 항-인간 EOMES(클론 Dan11mag, 이바이오사이언시즈, 카탈로그 번호-25-4857-80), T-bet(클론 4B10, 바이오레전드, 카탈로그 번호-644815) 및 그랜자임 B(클론 GB11, 바이오레전드, 카탈로그 번호515406)을 함유하는 투과화 완충제 작업 용액으로 구성된 50 μL/웰 염색 용액에 40분 동안 RT에서 재현탁하였다. 이어서, 세포를 2회 200 μL/웰 투과화 완충제 작업 용액으로 세척하고, 120 μL/웰 FACS 완충제에 재현탁시킨 후에, 4-레이저 LSRII(비디 바이오사이언스, DIVA 소프트웨어 사용)를 사용하여 동일한 날에 획득하였다. 데이터를 PC용 플로우조(FlowJo) v10.3(플로우조 엘엘씨), 마이크로소프트 엑셀(Microsoft Excel)(프로페셔널 플러스(professional Plus) 2010) 및 그래프패드 프리즘(GraphPad Prism) v6.07(그래프패드 소프트웨어 인코포레이티드)을 사용하여 분석하였다. 살아있는 CD4 및 CD8 T 세포를 게이팅하고(좀비 아쿠아(Zombie Aqua)-, CD4 또는 CD8+), 계수하고, 활성화 마커(CD134, CD137, CD25, PD-1), 성숙 마커(CCR7, CD45RO), 전사 인자(T-bet, Eomes) 또는 시토카인(그랜자임 B)의 평균 형광 강도(MFI) 및 양성 세포의 백분율 또는 평균 형광 강도(MFI)를 각각의 조건에 대해 플롯팅하였다.
상청액에 방출된 시토카인을 분석하기 위해, 이전에 동결된 샘플을 가져와 제조사의 지시에 따라 혈구계산 비드 어레이를 사용하여 IFNγ, GM-CSF, TNF-α, IL-2, 그랜자임 B, IL-8 및 IL-10에 대해 분석하였다. 평가한 시토카인은 IL-2(인간 IL-2 CBA Flex- set (비드 A4), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 558270), TNF-α(인간 TNF-α CBA Flex- set (비드 C4), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 560112), IFN-γ(IFN-γ CBA Flex- set (비드 E7), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 558269), IL-10(인간 IL-10 CBA Flex- set (비드 B7), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 558274), TNF(인간 TNF CBA Flex- set (비드 C4), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 560112), IL-8(인간 IL-8 CBA Flex- set (비드 A9), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 558277), 그랜자임 B(인간 그랜자임 B CBA Flex- set (비드 D7), 비디 바이오사이언스, 카탈로그 번호 560304)였다.
6.2 결과
6.2.1 CEA CD3 TCB 및 FAP OX40 iMAb의 조합은 a-PD-L1과의 조합보다 우수하였다.
도 31A 및 31B에 나타낸 바와 같이, 100 nM CEA CD3 TCB의 첨가(점으로 채워진 막대, 채워진 삼각형)는 활성화 마커 CD25의 발현, 및 CD4 및 CD8 T 세포의 증식을 증가시킬 수 있었으나, 2 nM FAP OX40 iMAb 단독(빈 막대, 빈 원)은 그렇지 않았다. FAP OX40 iMAb와 CEA CD3 TCB(회색 막대, 빈 정사각형)의 조합 및/또는 FAP OX40 iMAb와 a-PD-L1의 조합(흑색 막대, 채워진 회색 정사각형)은, 도 31A 및 31B에 나타낸 바와 같이 CEA CD3 TCB 및 a-PD-L1의 병용 치료와 비교하여(빈 막대, 채워진 흑색 원), 최고 활성화 및 CD4 및 CD8 T 세포의 증식을 야기하였다. 또한, FAP OX40 iMAB 및 CEA CD3 TCB 조합은 CD4 T 세포 상의 T 세포 전사 인자(T-bet)의 보다 높은 백분율 및 CD8 T 세포 상의 T-bet의 보다 높은 발현을 야기하였다(도 32A 및 32B). T-bet 발현은 T 헬퍼 1 세포 혈통 위탁을 조절하고, 이들 결과는 FAP OX40 iMAb 처리가 Th1 T 세포 반응 유도를 야기함을 보여준다. 또한, 도 33A 내지 33D에 나타낸 바와 같이, FAP OX40 iMAB 및 CEA CD3 TCB 조합 처리가 그랜자임 B 발현 CD4 및 CD4 T 세포의 보다 높은 백분율을 야기하고, 이는 T 세포의 보다 높은 세포 독성 가능성을 시사한다. 실험의 종점에서 상청액의 시토카인 분석은 CEA CD3 TCB 및 a-PD-L1 처리와 비교하여, CEA CD3 TCB 및 FAP OX40 iMAb 처리에서 전염증성 시토카인 IFN-γ 및 그랜자임 B의 보다 많은 양을 나타냈으나, 공여자 대 공여자의 높은 가변성 때문에, 차이는 통계적으로 유의하지 않았다. 종합해보면, CEA CD3 TCB와 FAP OX40 iMAb의 조합은 CD4 및 CD8 T 세포 둘 모두에서 우수한 활성화, 증식 및 Th1 분화를 야기하였다.
6.2.2 CEA CD3 TCB, FAP OX40 iMAb 및 PD-L1의 삼중 조합은 최고 시토카인 분비를 야기한다.
도 34A 내지 34C에 나타낸 바와 같이, CEA CD3 TCB, FAP OX40 iMAb 및 PD-L1의 삼중 조합(흑색 막대, 채워진 회색 정사각형)은 모든 다른 처리군과 비교하여 면역 세포-활성화 전염증성 시토카인, 예컨대 IFN-γ, 그랜자임 B 및 IL-8 방출에 있어서 가장 효과적이었다. 도 34C에 나타낸 바와 같이, 삼중 조합 처리는 또한, 분비된 시토카인 측정 결과와 일치하여, CD4 및 CD8 T 세포 상의 세포 용해성 효소 그랜자임 B의 최고 세포내 발현을 야기하였다. 삼중 조합을 CEA CD3 TCB 및 a-PD-L1의 조합과 비교한 시토카인의 증가 배수를 도 35A 내지 35C에 나타냈다. 상이한 공여자 사이에 시토카인 분비 수준의 큰 차이에도 불구하고, 삼중 조합은 대부분의 시험된 공여자에서 2배 초과의 차이를 야기하였다. 최고 변화 배수는 IL-8 및 IFNγ에 대해 관찰되었다. 도 31A 및 31B에 나타낸 바와 같이, 삼중 조합(흑색 막대, 채워진 회색 원)은, CEA CD3 TCB 및 FAP OX40 iMAb 조합 처리와 비교하여 CD4 및 CD8 T 세포의 증식 및 활성화에서 변화를 야기하지 않았다. 종합해보면, CEA CD3 TCB와 조합될 때 FAP OX40 iMAB 공자극은 T 세포 활성화, Th1 혈통의 증식 및 세포내 발현, 전사 인자 T-bet 및 그랜자임 B 발현의 자극에 있어서 강한 효과를 야기한다. 이러한 조합에 PD-L1의 첨가는, 세포내 증가된 발현 및 분비된 그랜자임 B 및 전염증성 시토카인 IFN-γ에 의해 알 수 있는 바와 같이, CD4 및 CD8 T 세포 둘 모두에 대한 세포 독성 가능성을 추가로 증진시킨다.