PL159183B1 - Sposób wytwarzania polipeptydu podobnego do pollpeptydu naczelnych IL-3 PL PL PL - Google Patents
Sposób wytwarzania polipeptydu podobnego do pollpeptydu naczelnych IL-3 PL PL PLInfo
- Publication number
- PL159183B1 PL159183B1 PL1987266802A PL26680287A PL159183B1 PL 159183 B1 PL159183 B1 PL 159183B1 PL 1987266802 A PL1987266802 A PL 1987266802A PL 26680287 A PL26680287 A PL 26680287A PL 159183 B1 PL159183 B1 PL 159183B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- dna sequence
- polypeptide
- dna
- expression
- sequence
- Prior art date
Links
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 73
- 108010002386 Interleukin-3 Proteins 0.000 title claims abstract description 61
- 241000288906 Primates Species 0.000 title claims abstract description 34
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title description 4
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 111
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims abstract description 107
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims abstract description 107
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims abstract description 64
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims abstract description 34
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 claims abstract description 29
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims abstract description 3
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract 9
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 111
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 67
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 48
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 35
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 claims description 29
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 23
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 22
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 claims description 17
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 claims description 13
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 12
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 10
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 10
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 claims description 10
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 9
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 claims description 8
- 230000005757 colony formation Effects 0.000 claims description 6
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 claims description 5
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 claims description 3
- 230000004927 fusion Effects 0.000 claims description 2
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 claims 1
- 102000000646 Interleukin-3 Human genes 0.000 description 49
- 241000282620 Hylobates sp. Species 0.000 description 35
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 31
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 28
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 description 27
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 25
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 24
- 208000032791 BCR-ABL1 positive chronic myelogenous leukemia Diseases 0.000 description 21
- 208000010833 Chronic myeloid leukaemia Diseases 0.000 description 21
- 208000033761 Myelogenous Chronic BCR-ABL Positive Leukemia Diseases 0.000 description 21
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 20
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 20
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 19
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 19
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 16
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 16
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 13
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 11
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 11
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 11
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 10
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 10
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 9
- 102000004457 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 9
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 9
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 8
- 101001033279 Homo sapiens Interleukin-3 Proteins 0.000 description 8
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N acetic acid Substances CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 8
- 102000055276 human IL3 Human genes 0.000 description 8
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 8
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 7
- 102000012428 Hematopoietic Cell Growth Factors Human genes 0.000 description 7
- 108010022580 Hematopoietic Cell Growth Factors Proteins 0.000 description 7
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 7
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 7
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 description 7
- 230000007812 deficiency Effects 0.000 description 7
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 7
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 description 7
- 102000003951 Erythropoietin Human genes 0.000 description 6
- 108090000394 Erythropoietin Proteins 0.000 description 6
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 6
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 6
- 235000014680 Saccharomyces cerevisiae Nutrition 0.000 description 6
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 6
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 6
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 6
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 6
- 239000003636 conditioned culture medium Substances 0.000 description 6
- 102000004419 dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 6
- 229940105423 erythropoietin Drugs 0.000 description 6
- YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonyl fluoride Chemical compound FS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 YBYRMVIVWMBXKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N potassium;[2-butyl-5-chloro-3-[[4-[2-(1,2,4-triaza-3-azanidacyclopenta-1,4-dien-5-yl)phenyl]phenyl]methyl]imidazol-4-yl]methanol Chemical compound [K+].CCCCC1=NC(Cl)=C(CO)N1CC1=CC=C(C=2C(=CC=CC=2)C2=N[N-]N=N2)C=C1 OXCMYAYHXIHQOA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 6
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 6
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 101100007328 Cocos nucifera COS-1 gene Proteins 0.000 description 5
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 5
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 5
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 5
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 5
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 5
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 5
- 210000003979 eosinophil Anatomy 0.000 description 5
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 5
- 210000003000 inclusion body Anatomy 0.000 description 5
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 5
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 5
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 5
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 4
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 4
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 4
- 241001131785 Escherichia coli HB101 Species 0.000 description 4
- 108700024394 Exon Proteins 0.000 description 4
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- -1 G-CSF-1 Proteins 0.000 description 4
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 4
- 102000004889 Interleukin-6 Human genes 0.000 description 4
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 4
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 4
- 239000006146 Roswell Park Memorial Institute medium Substances 0.000 description 4
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 4
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 4
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 4
- 210000003969 blast cell Anatomy 0.000 description 4
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 4
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 4
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 4
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 4
- 125000000151 cysteine group Chemical class N[C@@H](CS)C(=O)* 0.000 description 4
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 4
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 4
- 230000000925 erythroid effect Effects 0.000 description 4
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 4
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 4
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 4
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 4
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 4
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 229920002271 DEAE-Sepharose Polymers 0.000 description 3
- 102000004594 DNA Polymerase I Human genes 0.000 description 3
- 108010017826 DNA Polymerase I Proteins 0.000 description 3
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 3
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 3
- OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN OTXBNHIUIHNGAO-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 3
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 3
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 3
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 3
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 3
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 3
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 3
- 108010057821 leucylproline Proteins 0.000 description 3
- 208000032839 leukemia Diseases 0.000 description 3
- 201000002364 leukopenia Diseases 0.000 description 3
- 231100001022 leukopenia Toxicity 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 3
- YPJUNDFVDDCYIH-UHFFFAOYSA-N perfluorobutyric acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)F YPJUNDFVDDCYIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 210000005105 peripheral blood lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 3
- 230000003248 secreting effect Effects 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 3
- 241001515965 unidentified phage Species 0.000 description 3
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HDHZCEDPLTVHFZ-GUBZILKMSA-N Asn-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O HDHZCEDPLTVHFZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- 101100408682 Caenorhabditis elegans pmt-2 gene Proteins 0.000 description 2
- 108010042407 Endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 102000004533 Endonucleases Human genes 0.000 description 2
- 108010017080 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 2
- 102000004269 Granulocyte Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 2
- RNMNYMDTESKEAJ-KKUMJFAQSA-N His-Leu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 RNMNYMDTESKEAJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N Histamine Chemical compound NCCC1=CN=CN1 NTYJJOPFIAHURM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101000746367 Homo sapiens Granulocyte colony-stimulating factor Proteins 0.000 description 2
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 2
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 2
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 description 2
- 108010002616 Interleukin-5 Proteins 0.000 description 2
- 102000000743 Interleukin-5 Human genes 0.000 description 2
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N Leu-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- 102000000447 Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl) Asparagine Amidase Human genes 0.000 description 2
- 108010055817 Peptide-N4-(N-acetyl-beta-glucosaminyl) Asparagine Amidase Proteins 0.000 description 2
- GNUCSNWOCQFMMC-UFYCRDLUSA-N Phe-Arg-Phe Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 GNUCSNWOCQFMMC-UFYCRDLUSA-N 0.000 description 2
- 229920001213 Polysorbate 20 Polymers 0.000 description 2
- FKLSMYYLJHYPHH-UWVGGRQHSA-N Pro-Gly-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O FKLSMYYLJHYPHH-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N Pro-Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 CGSOWZUPLOKYOR-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 2
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 2
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108020005038 Terminator Codon Proteins 0.000 description 2
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 description 2
- 208000007502 anemia Diseases 0.000 description 2
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000011260 co-administration Methods 0.000 description 2
- 230000001143 conditioned effect Effects 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 2
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 2
- 230000029087 digestion Effects 0.000 description 2
- VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N dithiothreitol Chemical compound SC[C@@H](O)[C@H](O)CS VHJLVAABSRFDPM-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 2
- 239000003623 enhancer Substances 0.000 description 2
- 210000003743 erythrocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 2
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 2
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 2
- 238000002523 gelfiltration Methods 0.000 description 2
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 2
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 2
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 2
- 229940047122 interleukins Drugs 0.000 description 2
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 2
- 238000001155 isoelectric focusing Methods 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 108010034897 lentil lectin Proteins 0.000 description 2
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 2
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 2
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 2
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 2
- 108010072637 phenylalanyl-arginyl-phenylalanine Proteins 0.000 description 2
- PHEDXBVPIONUQT-RGYGYFBISA-N phorbol 13-acetate 12-myristate Chemical compound C([C@]1(O)C(=O)C(C)=C[C@H]1[C@@]1(O)[C@H](C)[C@H]2OC(=O)CCCCCCCCCCCCC)C(CO)=C[C@H]1[C@H]1[C@]2(OC(C)=O)C1(C)C PHEDXBVPIONUQT-RGYGYFBISA-N 0.000 description 2
- 239000000256 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Substances 0.000 description 2
- 235000010486 polyoxyethylene sorbitan monolaurate Nutrition 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 239000012460 protein solution Substances 0.000 description 2
- 239000002510 pyrogen Substances 0.000 description 2
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 2
- 210000000130 stem cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 2
- 206010043554 thrombocytopenia Diseases 0.000 description 2
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 2
- 238000013518 transcription Methods 0.000 description 2
- 230000035897 transcription Effects 0.000 description 2
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 2
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 2
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 description 2
- 210000005253 yeast cell Anatomy 0.000 description 2
- WHTVZRBIWZFKQO-AWEZNQCLSA-N (S)-chloroquine Chemical compound ClC1=CC=C2C(N[C@@H](C)CCCN(CC)CC)=CC=NC2=C1 WHTVZRBIWZFKQO-AWEZNQCLSA-N 0.000 description 1
- BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 2-diethylaminoethanol Chemical compound CCN(CC)CCO BFSVOASYOCHEOV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N Ala-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- WPWUFUBLGADILS-WDSKDSINSA-N Ala-Pro Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O WPWUFUBLGADILS-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- BHTBAVZSZCQZPT-GUBZILKMSA-N Ala-Pro-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](C)N BHTBAVZSZCQZPT-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- FFZJHQODAYHGPO-KZVJFYERSA-N Ala-Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](C)N FFZJHQODAYHGPO-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N Ala-Thr-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OEVCHROQUIVQFZ-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N Arg-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O OMLWNBVRVJYMBQ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N Arg-Arg-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@@H](N)CCCNC(N)=N HJVGMOYJDDXLMI-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- OVVUNXXROOFSIM-SDDRHHMPSA-N Arg-Arg-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O OVVUNXXROOFSIM-SDDRHHMPSA-N 0.000 description 1
- UPKMBGAAEZGHOC-RWMBFGLXSA-N Arg-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O UPKMBGAAEZGHOC-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- NMRHDSAOIURTNT-RWMBFGLXSA-N Arg-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N NMRHDSAOIURTNT-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 1
- 208000002109 Argyria Diseases 0.000 description 1
- SJUXYGVRSGTPMC-IMJSIDKUSA-N Asn-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O SJUXYGVRSGTPMC-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- DAPLJWATMAXPPZ-CIUDSAMLSA-N Asn-Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DAPLJWATMAXPPZ-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- TWXZVVXRRRRSLT-IMJSIDKUSA-N Asn-Cys Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O TWXZVVXRRRRSLT-IMJSIDKUSA-N 0.000 description 1
- IIFDPDVJAHQFSR-WHFBIAKZSA-N Asn-Glu Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O IIFDPDVJAHQFSR-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- OPEPUCYIGFEGSW-WDSKDSINSA-N Asn-Gly-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O OPEPUCYIGFEGSW-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- NLRJGXZWTKXRHP-DCAQKATOSA-N Asn-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O NLRJGXZWTKXRHP-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- JLNFZLNDHONLND-GARJFASQSA-N Asn-Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)N JLNFZLNDHONLND-GARJFASQSA-N 0.000 description 1
- RCFGLXMZDYNRSC-CIUDSAMLSA-N Asn-Lys-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O RCFGLXMZDYNRSC-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N Asp-Glu Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O CKAJHWFHHFSCDT-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- NVXLFIPTHPKSKL-UBHSHLNASA-N Asp-Trp-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CC(O)=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 NVXLFIPTHPKSKL-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- 201000008162 B cell deficiency Diseases 0.000 description 1
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 description 1
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 1
- 208000035143 Bacterial infection Diseases 0.000 description 1
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 101000583086 Bunodosoma granuliferum Delta-actitoxin-Bgr2b Proteins 0.000 description 1
- 241000282994 Cervidae Species 0.000 description 1
- 102000007644 Colony-Stimulating Factors Human genes 0.000 description 1
- 108010071942 Colony-Stimulating Factors Proteins 0.000 description 1
- 241000699800 Cricetinae Species 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- 108020003215 DNA Probes Proteins 0.000 description 1
- 239000003298 DNA probe Substances 0.000 description 1
- 239000006144 Dulbecco’s modified Eagle's medium Substances 0.000 description 1
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 1
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 1
- 229920001917 Ficoll Polymers 0.000 description 1
- 108010036162 GATC-specific type II deoxyribonucleases Proteins 0.000 description 1
- 108700039691 Genetic Promoter Regions Proteins 0.000 description 1
- GLWXKFRTOHKGIT-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O GLWXKFRTOHKGIT-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N Glu-Asn-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O YYOBUPFZLKQUAX-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- KJBGAZSLZAQDPV-KKUMJFAQSA-N Glu-Phe-Arg Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N KJBGAZSLZAQDPV-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- 108010024636 Glutathione Proteins 0.000 description 1
- 108010053070 Glutathione Disulfide Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102100039620 Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Human genes 0.000 description 1
- 101000987586 Homo sapiens Eosinophil peroxidase Proteins 0.000 description 1
- 101000920686 Homo sapiens Erythropoietin Proteins 0.000 description 1
- 101000746373 Homo sapiens Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor Proteins 0.000 description 1
- 101000916628 Homo sapiens Macrophage colony-stimulating factor 1 Proteins 0.000 description 1
- 102000003839 Human Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108090000144 Human Proteins Proteins 0.000 description 1
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 description 1
- 208000029462 Immunodeficiency disease Diseases 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N L-methotrexate Chemical compound C=1N=C2N=C(N)N=C(N)C2=NC=1CN(C)C1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1 FBOZXECLQNJBKD-ZDUSSCGKSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- YVKSMSDXKMSIRX-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O YVKSMSDXKMSIRX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- LCPYQJIKPJDLLB-UWVGGRQHSA-N Leu-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(C)C LCPYQJIKPJDLLB-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N Leu-Leu-Asp Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O PDQDCFBVYXEFSD-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N Leu-Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O QNBVTHNJGCOVFA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- VUZMPNMNJBGOKE-IHRRRGAJSA-N Leu-Leu-Val Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O VUZMPNMNJBGOKE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N Leu-Pro Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O VTJUNIYRYIAIHF-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N Leu-Thr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O LRKCBIUDWAXNEG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- AAORVPFVUIHEAB-YUMQZZPRSA-N Lys-Asp-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)NCC(O)=O AAORVPFVUIHEAB-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N Lys-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O UGTZHPSKYRIGRJ-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N Lys-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- 239000007987 MES buffer Substances 0.000 description 1
- 102000007651 Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 1
- 108010046938 Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 1
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 1
- YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N N-L-alpha-glutamyl-L-leucine Natural products CC(C)CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CCC(O)=O YBAFDPFAUTYYRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004988 N-glycosylation Effects 0.000 description 1
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 1
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 1
- 108010047620 Phytohemagglutinins Proteins 0.000 description 1
- NOXSEHJOXCWRHK-DCAQKATOSA-N Pro-Cys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 NOXSEHJOXCWRHK-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N Pro-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 ZKQOUHVVXABNDG-IUCAKERBSA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 239000012979 RPMI medium Substances 0.000 description 1
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 1
- 108010039491 Ricin Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000002105 Southern blotting Methods 0.000 description 1
- 201000001322 T cell deficiency Diseases 0.000 description 1
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N Thr-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O DSGIVWSDDRDJIO-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 1
- ZMYCLHFLHRVOEA-HEIBUPTGSA-N Thr-Thr-Ser Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O ZMYCLHFLHRVOEA-HEIBUPTGSA-N 0.000 description 1
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 description 1
- 108010031650 Thy-1 Antigens Proteins 0.000 description 1
- 102100033523 Thy-1 membrane glycoprotein Human genes 0.000 description 1
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 1
- XKTWZYNTLXITCY-QRTARXTBSA-N Trp-Val-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 XKTWZYNTLXITCY-QRTARXTBSA-N 0.000 description 1
- JOQSQZFKFYJKKJ-GUBZILKMSA-N Val-Arg-Cys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N JOQSQZFKFYJKKJ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- 241000269368 Xenopus laevis Species 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000011149 active material Substances 0.000 description 1
- 239000000853 adhesive Substances 0.000 description 1
- 230000001070 adhesive effect Effects 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 108010056243 alanylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010044940 alanylglutamine Proteins 0.000 description 1
- 108010087924 alanylproline Proteins 0.000 description 1
- 230000010056 antibody-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 1
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 description 1
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 1
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 1
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010038633 aspartylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 208000022362 bacterial infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 description 1
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 210000000601 blood cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 1
- 210000002798 bone marrow cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000001506 calcium phosphate Substances 0.000 description 1
- 229910000389 calcium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011010 calcium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 125000000837 carbohydrate group Chemical group 0.000 description 1
- 229910002091 carbon monoxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000006285 cell suspension Substances 0.000 description 1
- 239000001913 cellulose Substances 0.000 description 1
- 229920002678 cellulose Polymers 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 229940044683 chemotherapy drug Drugs 0.000 description 1
- 229960003677 chloroquine Drugs 0.000 description 1
- WHTVZRBIWZFKQO-UHFFFAOYSA-N chloroquine Natural products ClC1=CC=C2C(NC(C)CCCN(CC)CC)=CC=NC2=C1 WHTVZRBIWZFKQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000013599 cloning vector Substances 0.000 description 1
- 238000000975 co-precipitation Methods 0.000 description 1
- 229940047120 colony stimulating factors Drugs 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000013068 control sample Substances 0.000 description 1
- 238000002784 cytotoxicity assay Methods 0.000 description 1
- 231100000263 cytotoxicity test Toxicity 0.000 description 1
- NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N dTTP Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 NHVNXKFIZYSCEB-XLPZGREQSA-N 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000011026 diafiltration Methods 0.000 description 1
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 1
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- 210000001840 diploid cell Anatomy 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 238000001952 enzyme assay Methods 0.000 description 1
- 210000000267 erythroid cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000012894 fetal calf serum Substances 0.000 description 1
- 230000001605 fetal effect Effects 0.000 description 1
- 230000002538 fungal effect Effects 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N glutathione Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)NCC(O)=O RWSXRVCMGQZWBV-WDSKDSINSA-N 0.000 description 1
- YPZRWBKMTBYPTK-BJDJZHNGSA-N glutathione disulfide Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CSSC[C@@H](C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)CC[C@H](N)C(O)=O YPZRWBKMTBYPTK-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 230000002489 hematologic effect Effects 0.000 description 1
- 230000011132 hemopoiesis Effects 0.000 description 1
- 229960001340 histamine Drugs 0.000 description 1
- 102000053925 human CSF1 Human genes 0.000 description 1
- 102000044890 human EPO Human genes 0.000 description 1
- 125000001183 hydrocarbyl group Chemical group 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 1
- 208000026278 immune system disease Diseases 0.000 description 1
- 238000003018 immunoassay Methods 0.000 description 1
- 230000007813 immunodeficiency Effects 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 108010091798 leucylleucine Proteins 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 210000003593 megakaryocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 229960004452 methionine Drugs 0.000 description 1
- 229960000485 methotrexate Drugs 0.000 description 1
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000011206 morphological examination Methods 0.000 description 1
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 1
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 231100000219 mutagenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003505 mutagenic effect Effects 0.000 description 1
- 210000000066 myeloid cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000003472 neutralizing effect Effects 0.000 description 1
- 210000000287 oocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- YPZRWBKMTBYPTK-UHFFFAOYSA-N oxidized gamma-L-glutamyl-L-cysteinylglycine Natural products OC(=O)C(N)CCC(=O)NC(C(=O)NCC(O)=O)CSSCC(C(=O)NCC(O)=O)NC(=O)CCC(N)C(O)=O YPZRWBKMTBYPTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002741 palatine tonsil Anatomy 0.000 description 1
- 208000003154 papilloma Diseases 0.000 description 1
- 208000029211 papillomatosis Diseases 0.000 description 1
- 230000000737 periodic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 1
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 1
- 230000001885 phytohemagglutinin Effects 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 230000008488 polyadenylation Effects 0.000 description 1
- 230000006513 positive regulation of mast cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 239000002243 precursor Substances 0.000 description 1
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 1
- 108010090894 prolylleucine Proteins 0.000 description 1
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000002731 protein assay Methods 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000007974 sodium acetate buffer Substances 0.000 description 1
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 1
- 238000000638 solvent extraction Methods 0.000 description 1
- 150000003431 steroids Chemical class 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N tfa trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F.OC(=O)C(F)(F)F WROMPOXWARCANT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000011285 therapeutic regimen Methods 0.000 description 1
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 1
- 239000003053 toxin Substances 0.000 description 1
- 231100000765 toxin Toxicity 0.000 description 1
- 108700012359 toxins Proteins 0.000 description 1
- 230000010474 transient expression Effects 0.000 description 1
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 1
- QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H tricalcium bis(phosphate) Chemical compound [Ca+2].[Ca+2].[Ca+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O QORWJWZARLRLPR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 239000001226 triphosphate Substances 0.000 description 1
- 235000011178 triphosphate Nutrition 0.000 description 1
- 125000002264 triphosphate group Chemical class [H]OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])OP(=O)(O[H])O* 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 1
- 150000003672 ureas Chemical class 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 1
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
- C07K14/5403—IL-3
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P7/00—Drugs for disorders of the blood or the extracellular fluid
- A61P7/06—Antianaemics
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Public Health (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Hematology (AREA)
- Diabetes (AREA)
- Immunology (AREA)
- Virology (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Glass Compositions (AREA)
- External Artificial Organs (AREA)
- Crystals, And After-Treatments Of Crystals (AREA)
- Gas Separation By Absorption (AREA)
- Treating Waste Gases (AREA)
- Organic Low-Molecular-Weight Compounds And Preparation Thereof (AREA)
Abstract
1. Sposób wytwarzania polipeptydu podobnego do polipeptydu naczelnych IL-3 zasadni czo wolnego od polaczen z innymi polipeptydami naczelnych, znamienny tym, ze prowadzi sie hodowle linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierajacym sekwencje D N A kodu jaca ten polipeptyd, który ma sekwencje aminokwasów taka sama lub zasadniczo taka sama jak sekwencja przedstawiona w tabeli 1 lub w tabeli 2 i wykazuje co najmniej jedna wlasciwosc biologiczna podobna do wykazywanych przez polipeptyd naczelnych IL-3. PL PL PL
Description
Przedmiotem wynalazku jest sposób wytwarzania polipeptydu podobnego do polipeptydu naczelnych IL-3. Bardziej szczegółowo wynalazek dotyczy sposobu wytwarzania nowej rodziny hematopoetycznych czynników wzrostu naczelnych podobnych do IL-3 metodami inżynierii genetycznej.
Hematopoetyny, czyli hematopoetyczne czynniki wzrostu, są białkami, które pobudzają przeżywanie, wzrost i różnicowanie się komórek hematopoetycznych. Czynnki stymulujące kolonizację (CSF) stanowią podzbiór tych hematopoetycznych czynników wzrostu i charakteryzują się zdolnością do podtrzymywania wzrostu m vitro kolonii komórek hematopoetycznych pochodzących z komórek pierwotnych szpiku kostnego, wątroby płodowej i innych organów hematopoetycznych.
159 183
W biochemicznej i biologicznej identyfikacji oraz w charakterystyce określonych hematopoetyn przeszkadzają niewielkie ilości naturalnie występujących czynników możliwych do uzyskania ze źródeł naturalnych, np. krwi lub moczu. Ostatnie niektóre z tych hematopoetyn klonowano molekularnie, doprowadzono do ekspresji w układzie heterologicznym i oczyszczano do uzyskania homogeniczności [D. Metcalf, „The Molecular Biology and Functions of the GranulocyteMacrophage Colony Stimulating Factors, Blood, 67 /2/, 257-267 (1986)]. Do tych hematopoetyn zalicza się ludzki i mysi GM-CSF, ludzki G-CSF, ludzki CSF-1 i mysi IL-3, ludzki GM-CMF [R. Donahuei in., Naturę, 321,872-875 (1986)], mysi IL-3 [J. Kindler i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 83, 1001-1005 (1986); Metcalf i in., Blood, 68, 46-57 (1986)] oraz ludzki G-CSF [K. Welte i in., J. Exp. Med., 165,941-948 (1987)] wykazujące wpływ na hematopoezę in vivo. Mysie białko IL-3, jak dotychczas stwierdzono, nie tworzy kopii w układzie ludzkim [D. R. Coben i in., Nuci. Acids. Res., 14, 3641 (1986)].
Wynalazek dotyczy sposobu wytwarzania rodziny czynników wzrostu naczelnych podobnych do IL-3, zasadniczo wolnych od innych białek naczelnych i charakteryzujących się sekwencjami aminokwasów tymi samymi lub zasadniczo homologicznymi do sekwencji przedstawionych w poniższych tabelach 1 i 2. Sekwencje takie mogą być kodowane przez sekwencje DNA przedstawione w tabelach albo sekwencje zdolne do hybrydyzowania z nimi i kodujące polipeptydy o właściwościach biologicznych podobnych do wykazywanych przez IL-3, względnie mogą być innymi sekwencjami, w różny sposób modyfikowanymi, wykazującymi te właściwości. Polipeptydy te również charakteryzują się właściwościami biologicznymi podobnymi do wykazywanych przez IL-3.
Przykładowo, wynalazek dotyczy sposobu wytwarzania ludzkiego polipeptydu zasadniczo wolnego od połączeń z innymi ludzkimi polipeptydami, charakteryzującego się sekwencją peptydową tą samą, lub zasadniczo tą sarnę, co przedstawiona w tabeli 2 i wykazującego co najmniej ejdną właściwość biologiczną podobną do wykazywanych przez IL-3. Innym przykładem polipeptydów wytwarzanych sposobem według wynalazku jest polipeptyd gibbona zasadniczo wolny od połączeń z innymi białkami naczelnych i charakteryzujący się sekwencją peptydową tą samą, lub zasadniczo tą samą, co przedstawiona w tabeli 1 i wykazujący co najmniej jedną właściwość biologiczną podobną do wykazywanych przez IL-3.
Polipeptydy wytwarzane sposobem według wynalazku charakteryzują się co najmniej jedną właściwością, podobną do wykazywanych przez IL-3, wśród których znajdują się właściwości następujące:
a) pozorna masa cząsteczkowa w zakresie około 14 do około 35 kilodaltonów, oznaczona za pomocą redukującej elektroforezy w żelu SDS-poliakryloamidowym,
b) zdolność do stymulowania, w standardowym teście na ludzkim szpiku kostnym, w stężeniu 10 do 100 pikomolowym, tworzenie różnych typów kolonii hematopoetycznych należących do różnych linii,
c) zdolność do stymulowania, w teście CML, w stężeniu 10 do 100 pikomolowym, namnażania się komórek CML,
d) punkt izoelektryczny w zakresie pH 6,0-7,6
e) pojedynczy ostry pik przy 43 kilodaltonach w sączeniu żelowym na kolumnie Superose 6,
f) pojedyncze pasmo przy 20,5 kilodaltona w żelu po podzieleniu N-glikonazą, oraz
g) poziom zanieczyszczeń nie większy niż 2%, na podstawie N-końcowej analizy z zastosowaniem degradacji Edmana.
Polipeptydy wytwarzane sposobem według wynalazku nadają się do wytwarzania środków farmaceutycznych. Środki te można zastosować do leczenia wielu stanów chorobowych charakteryzujących się niedoborem ilościowym komórek .hematopoetycznych, takich jak leukopenia, trombocytopenia, anemia, niedobór komórek B, niedobór komórek T, zakażenia bakteryjne oraz zakażenia wirusowe, w tym niedobór komórek odpornościowych lub komórek hematopoetycznych po transplantacjach szpiku kostnego. Sposób leczenia polega na podawaniu jednego z polipeptydów wytwarzanych sposobem według wynalazku w skutecznej ilości. Taki sposób może także obejmować podawanie z polipeptydami podobnymi do IL-3, jednocześnie lub kolejno, co najmniej jednej innej hematopoetyny, interleukiny lub czynnika wzrostu, w ilości skutecznej. Do
159 183 przykładowych hematopoetyn nadających się do takiego zastosowania należą GM-CSF, G-CSF, G-CSF-1 lub erytropoetyna. Przykładowymi interleukinami są IL-1, IL-2, IL-4 lub IL-6. W sposobach tych można również stosować czynniki wzrostu, takie jak czynnik wzrostu komórek B, czynnik różnicowania się komórek B, albo czynnik zróżnicowania się eozynofilów.
Termin „właściwość biologiczna podobna do wykazywanych przez IL-3“ w niniejszym opisie odpowiada jednej, lub więcej niż jednej następującej biologicznej właściwości i aktywności in vivo i in vitro. Jedną z tych właściwości jest podtrzymanie wzrostu i różnicowania się komórek pierwotnych zaangażowanych w liniach erytroidalnych, limfoidalnych i szpikowych. I tak np. w standardowym teście na ludzkim szpiku kostnym właciwością biologiczną podobną do wykazywanych przez IL-3 jest stymulowanie kolonii typu granulocytowego oraz ekspansji komórek erytroidalnych. Inną taką właściwością jest interakcja z wczesnym i wielopotencjalnymi komórkami pnia. Biologiczną właściwością podobną do wykazywanych przez IL-3 jest podtrzymywanie wzrostu wieloczynnościowych komórek prekursorowych. Inną właściwością jest zdolność do stymulowania namnażania się komórek przewlekłej białaczki szpikowej (CML). Biologiczną właściwością podobną do wykazywanych przez IL-3 jest także stymulacja namnażania się komórek tucznych. Czynniki wzrostu podobne do IL-3 mogą również podtrzymywać wzrost rozmaitych czynnikozależnych linii komórkowych i/lub indukować ekspresję 20 σ-dehydrogenazy steroidowej (20 σ-SPH) i antygenu Thy-1. Dalej, właściwościami biologicznymi podobnymi do wykazywanych przez IL-3 są: stymulacje tworzenia kolonii przez komórki KG-1 i/lub stymulacja zwiększonej syntezy histaminy w hodowlach śledziony i szpiku kostnego. Jeszcze inną właściwością biologiczną IL-3 jest pozorna masa cząsteczkowa w zakresie około 14 do około 35 kilodaltonów w redukującej elektroforezie w żelu poliakryloamidowym z siarczanem sodowo-dodecylowym. Inne biologiczne właściwości IL-3 zostały ujawnione w tej dziedzinie techniki.
Specyficzne sekwencje peptydowe przedstawione w tabelach 1 i 2 stanowią dwa przykłady członków rodziny czynników wzrostu wytwarzanych sposobem według wynalazku. Sekwencję DNA o 865 parach zasad według tabeli 1 wyodrębnione ze zbioru ekspresyjnego cDNA z linii komórek T gibbona zakażonych wirusem białaczki małpiej (gibbona), UCD-144MLA [T. G. Kuwakami i in. Naturę, 235, 170 (1972)]. Sekwencja ta zawiera długą pojedynczą otwartą ramę odczytu o 456 nukleotydach, które koduje białko o około 152 aminokwasach, zwane CSF-80, oraz zawiera sekwencję zwykłego lidera wydzielniczego, wskazanego przez sekwencję w wysokim stopniu hydrofobową (Leu Leu Leu Leu Glu Leu Leu). Dojrzałe białko zaczyna się przy aminokwasie nr 20 (alaninie) w tabeli 1. Region kodujący zawiera trzy cysteiny, dwie w dojrzałym białku, sugerując istnienie jednego wiązania disiarczkowego. Istnieją dwa potencjalne, związane z asparaginą, miejsca glikozylacji przedstawione charakterystycznymi sekwencjami Asn-X-Sor lub Asn-XThr. Zarówno wielkość, jak i model glikozylacji ujawniony przez sekwencję kodującą są typowe dla białek podobnych do limfokin. Pozostałe niekodujące części regionu o 865 parach zasad mogą odgrywać rolę regulującą w transkrypcji z naturalnego gospodarza. Koniec 3' powtórek sekwencji ATTTA, co do której przyjmuje się, że odnosi się do stabilności RNA-przekazu. Patrz G. Shaw i N. Kamen, Celi, 46 (5), 659-677 (1986).
159 183
Tablica 1
20 30 49
OICGcGOEcO CTCAAOGAAA AAJAAAATCC AAAC ATC AGC TCC CIO CCC CTC CIO CTC
MET Ser Cys Leu Pro va Leu Leu
| CTC | 64 CTC | CAA | CTC | CTC | CTC | 79 AGC | CCC | GGA | CTC | CAA | 94 GCT | OCO | ATC | ACC | CAG | 109 ACA | ACG |
| Leu | Leu | Gin | Leu | Leu | Val | Ser | Pro | Gly | Leu | Gin | Ala | Pro | MET | Thr | Gin | Thr | Thr |
| TCC | TTC | AAG | 124 ACA | AGC | TCG | CTT | AAC | 139 TCT | TCT | AAC | AIO | ATC | 154 GAT | GAA | ATT | AIA | ACA |
| Ser | Leu | Lys | Thr | Ser | Trp | Val | Asn | cys | Ser | Asn | MET | He | Asp | Glu | Ile | Ile | Thr |
| 169 CAC | TTA | AAG | CAG | CCA | 184 CCT | TTC | CCC | TTC | CTC | 199 GAC | TTC | AAC | AAC | CTC | 214 AAT | GGG | GAA |
| His | Leu | Lys | Gin | Pro | Pro | Leu | Pro | Leu | Leu | Asp | Ehe | Asn | Asn | Leu | Asn | Gly | Glu |
| GAC | CAA | 229 GAC | ATT | CIO | ATC | GAA | 244 AAT | AAC | CTT | CGA | AGG | 259 CCA | AAC | CTC | GAG | GCA | 274 TTC |
| ASO | Gin | Asp | Ile | Leu | MET | Glu | Asn | Asn | Leu | Arg | Arg | Pro | Asn | Leu | Glu | Ala | Ehe |
| AAC | AAG | GCT | GTC | 289 AAG | ACT | TTA | CAG | AAT | 304 GCA | TCA | GCA | ATC | GAG | 319 AGC | ATT | CTT | AAG |
| Asn | Lys | Ala | Val | Lys | Ser | Leu' | Gin | Asn | Ala | Ser | Ala | Ile | Glu | Ser | Ile | Leu | Lys |
| AAT | 334 CTC | CCC | OCA | TCC | CIG | 349 CCC | ATC | GCC | ACA | GCC | 364 GCA | CCC | ACG | CGA | CAT | 379 CCA | ATC |
| Asn | leu | Pro | Pro | Cys | Leu | Pro | MET | Ala | Thr | Ala | ALa | Pro | Thr | Arg | His | Pro | Ile |
| CCT | ATC | AAG | 394 GAC | GCT | GAC | TGG | AAT | 409 GAA | TTC | CGG | AGG | AAA | 424 CTC | AAG | TTC | TAT | CTC |
| Arg | Ile | Lys | Asp | Gly Asp | Trp | Asn | Glu | Ehe | Arg Arg | Lys | Leu | Lys | Rie | Tyr | Leu | ||
| 439 AAA | ACC | CIT | GAG | 454 AAT GAG | CAA | GCT | CAA | CAG | 469 ATC | ACT | TTC | AGC | CTT | 484 GAG | ATC | TCT | |
| Lys | Thr | Leu | Glu | Asn Glu | Gin | Ala | Gin | Gin | MET | Thr | Leu | Ser | Leu | Glu | Ile | Ser |
| 500 | 510 | 520 | 530 | 540 | 550 | 560 |
| ,ImL□.oUA\AC | GTOCAGOJOΓ | OΓOIOTCGGO | OoTCIOCCOG | OAGCGCOJOA | GGACATCAAA | AAuAlCAGAA |
| 570 | 580 | 590 | 600 | 610 | 620 | 630 |
| CT^OTAAAC | CTOTOGOIOG | TCIOIOCCCC | COTOOCGGAC | CAGAAGCArr | TCCCCnTC | CTOCGGCdC |
| 640 | 650 | 660 | 670 | 680 | 690 | 700 |
| CGATCCCΓTG | TTAAnATCT | AA^llCTCAA | ATCIG^AG^ | OCCATTTOGO | GTTGTGIOOΓ | TCTOTTCJOC |
| 710 | 720 | 730 | 740 | 750 | 760 | 770 |
| ΊΊΊTTCTOCO | AΓTOAGACTA | TTTATCTATC | TCICTAnTA | ΤΤΤΑΠΤΑΓΤ | TCΠTCΠGO | OTTOJGGCGO |
| 780 | 790 | 800 | 810 | 820 | 830 | 840 |
| OTGCCGTCEC | THATTCAG | CAGAGGAGOC | CTOTOATCCT | GOΓTOTOOAA | CCACOIOCCG | COTGGGOTGG |
850 860
GGAGCATCT CAlTiGTACC TCGAG
159 183
Sekwencję DNA o 674 parach zasad według tabeli 2 otrzymano z ludzkiego zbioru genomowego [J. J. Toole i in., Naturę, 312, 342-346 (1984)] przez zastosowanie sekwencji według tabeli 1 jako sondy. Sekwencję DNA według tabeli 2 skonstruowano pierwotnie przez składanie razem egzonów z ludzkiej sekwencji genomowej, które zidentyfikowano przez porównanie z sekwencją DNA polipetydu gibbona podobnego do IL-3 według tabeli 1. Ta sekwencja ludzka potwierdzona przez analizę mRNA odpowiadającego klonowi ludzkiego cDNA również klonuje polipeptyd o około 152 aminokwasach także należący do powyższej rodziny białek naczelnych. Ten polipeptyd ludzki obejmuje sekwencję zwykłego lidera wydzielniczego wskazaną w wysokim stopniu hydrofobową sekwencją (Leu Leu Leu Gin Leu Leu). Dojrzały polipeptyd zaczyna się przy aminokwasie nr 20 (alaninie) w tabeli 2. Region kodujący zawiera dwie cysteiny w dojrzałym białku, sugerując jedno wiązanie disiarczkowe. Istnieją dwa potencjalne, związane z asparaginą, miejsca glikozylacji, przedstawione charakterystyczną sekwencją Asn-X-Ser. Pozostałe niekodujące części sekwencji o 674 parach zasad mogą wykazywać rolę regulującą w transkrypcji u naturalnego gospodarza.
Sekwencje nukleotydów egzonów genu z ludzkiego genomu (tabela 2) były w ponad 96% homologiczne z sekwencją DNA genu gibbona (tabela 1). Zmiany w sekwencji nukleotydów w 11 kodonach powodują różnice w aminokwasach między białkiem gibbona a ludzkim. Nukleotydy przedstawione ponad sekwencją w tabeli 2 wskazują miejsca, gdzie sekwencja gibbona różni się od pokrewnej sekwencji ludzkiej. Podobnie, aminokwasy przedstawione poniżej ludzkiej sekwencji aminokwasów wskazują, w których miejscach sekwencja gibbona różni się od sekwencji ludzkiej. Strzałki wskazują miejsca połączeń egzonów i intronów w ludzkiej sekwencji genomowej.
| Tablica | 2 | |||||||||||||
| C | 9 | T | 24 | 39 | A54 | |||||||||
| GCTCCCACC | ATS | AGC | CSC | CIG | COC. | .CTC CG CTC | CO | CTC | CCC | CTC | CIG | GTC | OSC | |
| MTT | Ser | Arg | Leu | Pro | Val Leu Leu | Leu | Leu | Hn | Leu | Leu | Val | Arg | ||
| Cys | Ser |
(27)
84 (CJ 99
CCC GGA CIC CAA GCT CCC AIG ACC CAG ACA AOG TCC TIG AAG ACA AGC TGG GTT
Pro Gly leu Gin Ala Pro MET Thr Gin Thr Thr Ser leu Lys Thr Ser Trp VłL
114
T 129 144 159
AAC TGC ΊΟ JAC JAT AAC CGA (GAA JAT? AU AA CAC TEA JAG GAG CCA CCT TG
Asn Cys Ssr Jasi JMT Ile dsi Glu He Ile Tur His leu Lys Gin Pro Pro leu
| C | 174 | 188> | 204 | |||||||||||||
| CCT | TIG | CCT | GGC HT | ACC | AAC | CCTC | JAA? | GGG | GAA GAC | CCA GA | JAT* | CIA | AA | GAA | ||
| Pro | Leu | Ilu | ds FTe | dn | ds | Lyei | dst | dly | Hu A?P Gln | Ile | Leu | MTT | Glu | |||
| 219 | 294 | 249 | A | 264 | ||||||||||||
| AAT | CCC | CTT | d JAG | GCA AA | CIG | GAG | GCA | HT? | AAC | Al | n? | HC | AAA | AST | TIA | |
| Asn | Csn | Leu djg drg | Po | Asn | Leu | Glu Ala | Phi | An | drj | da | Vd | Lyy | Ser | Leu | ||
| Lys | ||||||||||||||||
| T | 279 | C | 294 | G | 300 | oc | c | 924 | ||||||||
| CAG | CCC | GCA | TTC GGC | JAT? | GAG | JAGC | ATT | GT1 | JAA | AAT | cct: | CCG | CCA | TCC | CIG | CCC |
| Gin | Csn | Ala | Ssu da | He | Glu | ^uj | He | Lua | Lyyi | An | leu | IhOl | Pro | CCs | leu | Pro |
| 100 | Pro | |||||||||||||||
| A | A | 339 | 304 | G | 969 | |||||||||||
| CIG | GOC | AOG | !H GGC | GCC | AOG | GAA | CCT | GCC | ATC | CCT | JAIC | MA | GAC | CCI | GAC | TGG |
| Leu da | Utt da JAa | Po | TBir | Arg | Hśa | Po | Ile | Hs | Ile | Lyy ds Gly A? Trp | ||||||
| MTT | Arg |
159 183
c.d. Tablicy 2
429 }
384 399 A 414 AA
AAT GAA 1TC CCG AGG WAA CTO AO5 TTC ΌΓ CTC AAA ACC CTT GAG AAT GCG CAS
Asn Glu Iłie Alg Arg Dys Leu Thr Ree iyr leu Lys ThU4 Leu Glu Asn Ala Gin
130 Lys Glu
| 444 | 459 | 485 | |||
| T | T A | C C | 445 | TC | 495 |
GCT CAA GCA GOS AAC TTG AGC CTC GCG ATC ΊΤΓ TA^ACCCAACCG CCCAGCTOCT CCTCTGGCCC
Ala GLn Gis Tłu: Thr Llu Sse Ilu Ala Iie The
MET 147 Clu Ser
| 505 | 515 | 555 | |||||
| c | C A | A | 525 | 535 | 545 | G | 565 |
TTOTOCCOCO ASCGCCTOGC CCCCΓCACCC CCCCCACCCC TTC]CACACC TCTCCCTCAT CTCTCCCCCA
C 575 585 595 605 615 625 635
TTCCAGGACC AGAAGCATTT CACCTTITCC TCOSGCATCA GATCAATTCT TAATTATCTA ATITCTGAAA
645 655 T 665
TCICCAGCTC OGATITCCCC 'rTCCCSCrT CTCITCTCA
Badania komputerowe prowadzone przez National Biomedical Services of Washington, D. C. dowiodły, że sekwencje gibbona i ludzka odpowiadające polipeptydowi podobnemu do IL-3 wykazują w przybliżeniu 29% homologii na poziomie aminokwasów i 45% homologii na poziomie nukleotydów z mysią sekwencją DNA IL-3,jak opublikowali M. C. Fung i in., Naturę, 307,233-237 (1984). Podobnie porównano strukturę egzonów ludzkiego genu polipeptydu podobnego do IL-3 z kodującymi regionami mysiego IL-3.
Nową sekwencję cDN A o 865 parach zasad przedstawioną w tabeli 1, zawartą w plazmidzie w
E. coli HB101, zdeponowano w American Type Culture Collection, 12301 Parklawn Dr., Rockville, MD, dnia 11 lipca 1986 pod numerem rejestracyjnym ATCC 67154. Nową sekwencję genomową, do której odnosi się sekwencja cDNA przedstawiona w tabeli 2, zawartą w bakteriofagu podobnie zdeponowano dnia 7 sierpnia 1986 pod numerem rejestracyjnym ATCC 40246. Ludzki DNA IL-3, zawarty w plazmidzie pSHIL-3-1 w E. coli HB101 zdeponowano w ATCC dnia 24 lutego 1987 pod numerem rejestracyjnym ATCC 67326.
Przykładowe polipeptydy, ludzki i gibbona, podobne do IL-3, charakteryzowano dalej za pomocą analizy w żelu SDS-poliakryloamidowym, stosując białka znakowane 35S z transfekowanych komórek COS, jak to opisano w przykładach w poniższej części niniejszego opisu. Obydwa polipeptydy nie są jednolite co do wielkości, stanowiąc typy molekularne o pozornej masie cząsteczkowej w zakresie około 14 kilodaltonów do 35 kilodaltonów. Przyjmuje się, że ten zakres masy cząsteczkowej powyższych przykładowych czynników podobnych do IL-3 jest wynikiem wariacji w glikozylacji oczyszczonych, wytworzonych przez komórkę COS cząsteczek. Oczyszczone białka w stężeniu 10 do 100 pikomolowym powodują tworzenie małych kolonii typu granulocytowego w testach na ludzkim szpiku kostnym in vitro. Oprócz tego, w obecności erytropoetyny w tych badaniach na ludzkim szpiku kostnym, obydwa polipeptydy podtrzymują wzrost komórek pierwotnych typu erytroidalnego lub szpikowego, przy porównywalnym poziomie aktywności. Tak więc, te podobne IL-3 czynniki stanowią multi-CSF. Te czynniki podobne do IL-3 powodują również namnażanie się białaczkowych komórek blastycznych od pacjentów z CML. Polipeptydy te mogą być także zdolne do stymulowania komórek dodatkowych i dojrzałych, takich jak np. monocyty, do wytwarzania innych czynników podobnych do hematopoetycznych, które z kolei stymulują tworzenie kolonii innych komórek hematopoetycznych, jak również pojawienie się innych rodzajów aktywności typu hematopoetycznego.
Rodzina czynników wzrostu podobnych do IL-3 wytwarzana sposobem według wynalazku obejmuje także czynniki kodowane przez sekwencje podobne do sekwencji według tabel 1 i 2, ale w których modyfikacje pojawiły się naturalnie lub zostały wprowadzone rozmyślnie. I tak np., jedną taką zmodyfikowaną sekwencję ludzką jest ludzka sekwencja cDNA przedstawiona w tabeli 2 z
159 183 modyfikacją dotyczącą proliny kodowanej przez tryplet CCC w pozycji aminokwasowej nr 27 zamiast seryny kodowanej przez tryplet TCC, który pojawia się w tabeli w tej pozycji. Tę przykładową zmodyfikowaną sekwencję podobną do IL-3, która daje aktywny ludzki czynnik podobny do IL-3, zawartą w E. coli HB101 jako pHucIL3-2, zdeponowano w ATCC dnia 13 lutego 1987 pod numerem rejestracyjnym ATCC 67319.
Inne modyfikacje w peptydzie lub sekwencji fachowiec w tej dziedzinie techniki może przeprowadzić znanymi metodami. Specyficzne modyfikacje, o które chodzi w tych sekwencjach czynników pokrewnych, podobnych do IL-3, mogą obejmować zastąpienie innymi aminokwasami jednej lub obydwu z dwóch reszt cysteiny w każdej sekwencji kodującej. Korzystnie, obydwie cysteiny zastępuje się innym aminokwasem, takim jak np. seryna, w celu eliminacji mostka disiarczkowego. Mutagenne metody tej zamiany są dobrze znane fachowcom w tej dziedzinie techniki. Patrz np. opis patentowy Stanów Zjednoczonych Ameryki nr 4 518 584.
Inne specyficzne mutacje sekwencji czynników podobnych do IL-3 opisanych w niniejszym opisie obejmują modyfikacje jednego lub obydwóch miejsc glikozylacji. Nieistnienie glikozylacji lub glikozylacja tylko częściowa wynika z subss;^^ucji aminokwasów albo delecji przy jednym lub obydwóch miejscach glikozylacji związanych z asparaginą obecnych w sekwencjach czynników podobnych do IL-3 przedstawionych w tabelach 1 i 2. Związane z asparaginą miejsca rozpoznawania dotyczące glikozylacji obejmują tripeptydowe sekwencje specyficznie rozpoznawane przez odpowiednie enzymy komórkowe związane z glikozylacją. Taką tripeptydową sekwencją jest albo asparagino-X-treonina, albo asparagino^-seryna, gdzie X jest zwykle jakimkolwiek aminokwasem. Różne substytucje lub delecje aminokwasów w jednej lub obydwu, pierwszej i trzeciej pozycji miejsca glikozylacji (i/lub delecje w pozycji drugiej) powodują niewystąpienie glikozylacji, co dotyczy zmodyfikowanej sekwencji tripeptydowej.
I tak np. Asn34 w sekwencji według tabeli 1 można zastąpić w jednym ze zmodyfikowanych czynników podobnych do IL-3 glutaminą. Utworzony czynnik (GI1134) powinien zawierać tylko jedno ugrupowanie węglowodorowe związane z asparaginą (przy Asne9) zamiast dwóch takich ugrupowań. Fachowcy w tej dziedzinie techniki zdadzą sobie sprawę z tego, że analogiczne glikoproteiny z tą samą Asne9 - monoglikozylacją można wytworzyć przez substytucję w pozycji 34 z udziałem innego aminokwasu i/lub przez substytucję odnoszącą się do innego aminokwasu w innych pozycjach miejsca rozpoznawania dotyczącego glikozylacji, np. wprowadzając walinę przy Ser36. Podobnie, Asn w pozycji 89 i/lub Ser w pozycji 91 można zmienić metodami mutagenezy na inne aminokwasy w celu deglikozylacji czynnika w tym miejscu. Alternatywnie, można zmieniać oba miejsca, jak wyżej. Te modyfikacje miejsc glikozylacji można również przeprowadzić w celu wytworzenia modyfikacji sekwencji według tabeli 2. Patrz np. A. Miyajina i in., EMBO J., 5 (6), 11193-1197 (1986) oraz przykład IV zamieszczony w poniższej części niniejszego opisu. Inne analogi i pochodne sekwencji według tabel 1 i 2 mogą być skonstruowane przez fachowca w tej dziedzinie techniki, do której odnoszą się ujawnienia z niniejszego opisu, i to w łatwy sposób.
Według wynalazku sposób wytwarzania należących do nowej rodziny czynników wzrostu naczelnych podobnych do IL-3 polega na prowadzeniu hodowli odpowiedniej komórki lub linii komórkowej, transformowanej wektorem zawierającym sekwencję DNA kodującą z ekspresją nowy polipeptyd naczelnych podobny do IL-3, pod kontrolą znanych sekwencji kontrolnych. Odpowiednimi komórkami lub liniami komórkowymi mogą być komórki ssaków, takie jak komórki jajnika chomika chińskiego (CHO). Sdekcja odpowiednich komórek-gospodarzy ssaków i metody transformacji, hodowli, amplifikacji, screeningu i wytwarzania oraz oczyszczania produktu, są znane. Patrz np. Gething i Sembrook, Naturę, 239, 620-625 (1981), albo alternatywnie Kaufman i in., Mol. Celi. Biol., 5 (7), 1750-1759 (1985) lub Howley i in., opis patentowy Stanów Zjednoczonych Ameryki nr 4419446. Inną odpowiednią linią komórek ssaków, opisaną w załączonych przykładach, jest mysia lima komórkowa COS-1. Podobnie użyteczną linią komórek ssaków jest linia komórkowa CV-1.
Podobnie użytecznymi jako komórki-gospodarze nadające się do użycia w sposobie według wynalazku są komórtki bakteryjne. I tak np., różne szczepy E. coli (takie jak np. HB101, MC1061 oraz szczepy zastosowane w następujących przykładach) są dobrze znane jako komórki10
159 183 gospodarze w dziedzinie biotechnologii. W sposobie według wynalazku można także zastosować rozmaite szczepy B. subtilis, Pseudomonas, inne laseczki itp.
Także liczne szczepy komórek drożdży znane fachowcom w tej dziedzinie techniki dostępne są jako komórki-gospodarze do ekspresji polipeptydów wytwarzanych sposobem według wynalazku. Dodatkowo, jeżeli jest to pożądane, można użyć komórek owadzich jako komórek-gospodarzy w sposobie według wynalazku. Patrz np. Miller i in., Genetic Engineering, 8, 277-298 (Plenum Press, 1986) i cytowane tam odnośniki.
W sposobie według wynalazku stosuje się nowe sekwencje DNA wolne od połączeń z sekwencjami DNA kodującymi inne białka naczelnych, kodujące z ekspresją polipeptydy lub czynniki wzrostu naczelnych podobne do IL-3. Sekwencje te obejmują sekwencje DNA przedstawione w tabeli 1 i tabeli 2 w kierunku od 5' do 3' i także sekwencje, które hybrydyzują z sekwencjami DNA według tabeli 1i 2 w ostrych warunkach hybrydyzacji [patrzT. Maniakis i in., Molecular Cloning (A Laboratory Mannual), Cold Spring Harbor Laboratory (1982), strony 387 do 389]. Przykładowo hybrydyzacja w ostrych warunkach przebiega w 4XSSC w temperaturze 65°C z następującym potem przemyciem 0,1 X SSC w temperaturze 65°C w ciągu godziny. Alternatywnie, przykładowa hybrydyzacja w ostrych warunkach może zachodzić w 50% formamidzie, 4XSSC w temperaturze 42°C.
Sekwencje DNA hybrydyzujące z sekwencjami według tabel 1i 2 w złagodzonych warunkach hybrydyzacji i które kodują z ekspresją czynniki wzrostu wykazujące właściwości biologiczne podobne do wykazywanych przez IL-3, kodują także czynmki należące do tej rodziny nowych czynników wzrostu. Przykładowo nieostre warunki hybrydyzacji obejmują: 4 X SSC w temperaturze 50°C lub z 30-40% formamidem w temperaturze 42°C. I tak np. sekwencja DNA, w której regiony o znacznej homologii (takie jak miejsca glikozylacji lub wiązania disiarczkowe) są takie same jak w sekwencjach według tabeli 1 i/lub 2, i która koduje białko naczelnych wykazujące jedną, lub więcej niż jedną właściwość biologiczną wykazywaną przez białko podobne do IL-3, w oczywisty sposób koduje białko należące do tej nowej rodziny czynników wzrostu, nawet jeżeli ta sekwencja DNA nie hybrydyzowałaby silnie z sekwencją według tabeli 1 lub 2.
Podobnie, sekwencje DNA kodujące polipeptydy naczelnych podobne do IL-3 kodowane przez sekwencje według tabeli 1 lub 2, ale wykazujące różnice w sekwencji kodonów wynikające z degeneracji kodu genetycznego lub wariacji allelicznych (naturalnie zachodzące wymiany zasad w populacji stanowiącej gatunek, które mogą, lub nie mogą, powodować zmian aminokwasów) również kodują nowe czynniki wzrostu z rodziny opisanej w niniejszym opisie. Wariacje w sekwencjach DNA według tabel 1 i 2 spowodowane mutacjami punktowymi lub modyfikacjami wprowadzonymi w celu wzmożenia aktywności lub wytwarzania, względnie półokresu trwania polipeptydów kodowanych przez wspomniane sekwencje, także są objęte zakresem niniejszego wynalazku.
Czynniki należące do nowej rodziny czynników wzrostu naczelnych, podobne do IL-3, można stosować w leczeniu szeregu stanów chorobowych, a w szczególności chorób charakteryzujących się obniżonym poziomem komórek albo szpikowych, erytroidalnych, limfoidalnych albo megakariocytów należących do układu hematopoetycznego, względnie kombinacji tych komórek. Oprócz tego, można ich użyć do aktywowania komórek szpikowych dojrzałych i/lub limfoidalnych. Do stanów chorobowych podatnych na leczenie polipeptydami, wytwarzanymi sposobem według wynalazku należy lekuopenia, w której następuje zmniejszenie się ilości krążących leukocytów (białych ciałek) w krwi obwodowej. Leukopenia może powstać w wyniku ekspozycji na pewne wirusy lub na promieniowanie. Często jest ona skutkiem ubocznym leczenia nowotworu, np. skutkiem ekspozycji na leki chemoterapeutyczne. W przypadku leczenia leukopenii środkami zawierającymi polipeptyd podobny do IL-3 można uniknąć niepożądanych wpływów ubocznych spowodowanych działaniem leków obecnie dostępnych.
Na różnego rodzaju niedobory odpornościowe, np. limfocytów T i/lub B, względnie zaburzenia immunologiczne, takie jak np. gościec przewlekły postępujący, także można dobroczynnie wpływać leczeniem polipeptydami wytworzonymi sposobem według wynalazku. Czynniki te, same lub w połączeniu z innymi reżimami leczniczymi, mogą być użyteczne w leczeniu lub korygowaniu niedoborów odpornościowych, które są wynikiem zakażenia wirusowego, np. HTLVI, HTLVII, HIV, poważnej ekspozycji na promieniowanie, leczenia nowotworu lub też które powstają w
159 183 rezultacie innych działań leczniczych. Polipeptydów według wynalazku można także użyć, samych lub w połączeniu z innymi hematopoetynami, w leczeniu innych niedoborów dotyczących komórek krwi, w tym trombocytopenii (niedobór płytek) lub anemii (niedobór krwinek czerwonych). Do innych zastosowań tych nowych polipeptydów należy leczenie pacjentów powracających do zdrowia w związku z transplantacjami szpiku kostnego, oraz zastosowanie związane z tworzeniem się monoklonalnych lub poliklonalnych przeciwciał wytworzonych zwykłymi metodami do użytku diagnostycznego lub leczniczego.
Środki lecznicze, które stosuje się do leczenia stanów chorobowych wyżej przedstawionych, zawierają leczniczo skuteczną ilość jednego, lub więcej niż jednego polipeptydu należącego do rodziny polipeptydów naczelnych podobnych do IL-3 wytwarzanych sposobem według wynalazku, w mieszaninie z farmaceutycznie dozwolonym nośnikiem. Środki te można systematycznie podawać pozajelitowo. Alternatywnie, środki te można podawać dożylnie. Jeżeli jest to pożądane, środki można podawać podskórnie. Przy podawaniu ciągłym środek leczniczy ma postać wolnego od pirogenów pozajelitowo dozwolonego roztworu wodnego. Otrzymywanie takiego pozajelitowo dozwolonego roztworu białka ze zwróceniem należytej uwagi na pH, izotoniczność, stabilność, itp. znajduje się w zakresie możliwości fachowca w tej dziedzinie techniki.
Reżim podawania związany ze sposobem leczenia wyżej opisanych stanów chorobowych może być ustalony przez lekarza leczącego przy uwzględnieniu rozmaitych czynników modyfikujących działanie leków, takich jak np. stan, waga ciała, płeć i dieta pacjenta, stopień ciężkości danego zakażenia, czas podawania i inne czynniki kliniczne. Ogólnie, reżim dzienny powinien obejmować zakres 200-1000//g polipeptydu do 50 do 5000 jednostek polipeptydu na kilogram wagi ciała (odnosi się to do jednostki odpowiadającej stężeniu polipeptydu wywołującemu pobudzenie, stanowiące połowę pobudzenia maksymalnego w standardowym teście na ludzkim szpiku kostnym).
Sposoby leczenia mogą także obejmować podawanie wspólne z innymi czynnikami ludzkimi. Lista (nie wykluczająca innych) pozostałych odpowiednich hematopoetyn, CSF i interleukin do jednoczesnego lub wspólnego podawania z polipeptydami wytwarzanymi sposobem według wynalazku obejmuje GM-CSF, CSF-1, G-CSF, Meg-CSF, erytropoetynę (EPO), IL-1, IL-4, IL-2, czynnik wzrostowy komórek B, czynnik różnicowania się komórek B i czynnik różnicowania się eozynofilów. Szczególne zainteresowanie może budzić połączenie IL-3 z IL-6 (znanym również w tej dziedzinie wiedzy jako czynnik 2 stymulujący komórki B) wykazujące zdolność w teście na ludzkich komórkach blastycznych do wywoływania namnażania się w koloniach ludzkich wczesnych komórek pnia. Oprócz tego, polipeptydy podobne do IL-3 można podawać łącznie, lub w połączeniu chemicznym z monoklonalnymi lub poliklonalnymi przeciwciałami w przypadku zastosowania leczniczego. Alternatywnie, te czynnki wzrostu można przyłączyć do pewnych toksyn, takich jak rycyna, w reżimie leczniczym. Dawkowanie w powyżej przytoczonych przypadkach powinno być przystosowane do uzupełnienia tych dodatkowych składników w środku leczniczym. Postęp w leczeniu pacjenta można kontrolować za pomocą okresowej oceny profilu hematologicznego, np. liczby białych ciałek itp.
Następujące przykłady objaśniająco opisują czynniki należące do nowej rodziny polipeptydów naczelnych podobnych do IL-3 oraz sposoby według wynalazku.
Przykład I. Wyodrębnienie genu gibbona kodującego czynnik podobny do IL-3.
Linię komórek T gibbona zakażonych wirusem białaczki małpiej (gibbona) UCD-144MLA, i dostępnych z National Institute of Health Laboratories indukuje się fitohemagłutyniną i mirystynianooctanem forbolu (PHA/PMA). Całkowity RNA otrzymuje się z tych komórek metodami J. M. Chirgwina i in., Biochem., 18, 5294 (1979). Poli A+ mRNA selekcjonuje się i frakcjonuje w gradiencie sacharozy 10% do 30%. W celu zidentyfikowania mRNA kodującego ten nowy czynnik hematopoetyczny, 16 próbek mRNA z linii komórkowej UCD-144-MLA frakcjonowanego w gradiencie sacharozy wprowadza się na drodze mikroiniekcji do oocytów Xenopus laevis i powstałe kondycjonowane podłoże bada pod względem zdolności do stymulowania namnażania się białaczkowych komórek blastycznych w obecności przeciwciała przeciw ludzkim GM-CSF jak przedstawiono w teście CML z przykładu V w poniższej części niniejsczego opisu. mRNA we frakcjach z gradientu sacharozy zidentyfikowany jako obejmujący przekaz polegający na kodowaniu aktyw12
159 183 nego czynnika wzrostu podobnego do IL-3, przeprowadza się w dwuniciowy cDNA metodą U. Gublera i B. J. Hoffmana, Gene, 25, 263 (1983).
Wektor ekspresyjny komórek COS, pXM, zawierający wzmacniacz SV40, główny promotor późny adenowirusa, sekwencję kodującą DHFR, miejsce dodawnia poli A późnego przekazu SV40 i gen Val przeprowadza się w postać liniową enzymem stanowiącym endonukleazę Xhol, działa na niego dużym fragmentem polimerazy DNA I w obecności dTTP i liguje z równomolowymi ilościami cDNA, przy końcowym stężeniu DNA 100pg/ml. Produkty ligacji utworzone w wyniku trawienia pXM z użyciem Xhol i wprowadzenia sekwencji cDNA zaadaptowanej Xhol stosuje się do transformowania E. coli szczep HB101, którą wysiewa się na płytki L+ Amp z wytworzeniem zbioru około 30· 103 kolonii. Można także użyć innych funkcjonalnie podobnych wektorów ekspresyjnych znanych w tej dziedzinie techniki, jako alternatywy wobec pXM.
Tworzy się repliki zbioru cDNA w pXM na filtrach celulozowych. Kolonie z każdego filtra zdrapuje się do bulionu L i wyodrębnia się plazmidowy DNA. Każdą próbkę DNA otrzymuje się z puli 200-300 kolonii bakteryjnych. DNA oczyszcza się metodą J. A. Meyersai in., J. Bacteriol., 127, 1529 (1976). Małpie komórki COS (ATCC CRL 1650) transfekuje się około 5pg plazmidowego DNA na 106 komórek COS na drodze transfekcji DNA z udziałem DEAE i traktuje chlorochiną zgodnie z metodami opisanymi przez G. G. Wonga i in., Science, 228, 810-815 (1985) oraz R. J. Kaufmana i in., Mol. Celi Biol., 2, 1304 (1982).
Po upływie 72 godzin od transfekcji zbiera się podłoże i bada w ludzkim teście CML, jak opisano w przykładzie V w poniższej części niniejszego opisu. Wyselekcjonowuje się jedną pulę kondycjonowanego podłoża z aktywnością stymulowania kolonizacji i aktywnością dotyczącą namnażania CML całkowicie oporną na neutralizującą surowicę odpornościową przeciw GMCSF, do dalszej analizy. Otrzymuje się plazmidowy DNA z indywidualnych kolonii pobranych z pierwotnej aktywnej puli i stosuje transfekcji w celu otrzymania kondycjonowanego podłoża, które to podłoże bada się pod względem aktywności CSF i namnażania CML. Wyodrębnia się pojedynczy klon odpowiedzialny za tę aktywność. Insert cDNA z tego klonu subklonuje się do M13 i poddaje analizie sekwencji metodą Sangera dotyczącą dideoksy-zakończenia łańcucha. (Patrz tabela 1).
Przykład II. Wyodrębnianie ludzkiego genu czynnika podobnego do IL-3.
Z użyciem sekwencji według tabeli 1 jako sondy, poddaje się screeningowi 1 · 1(0 klonów z ludzkiego zbioru genomowego (mieszanina po częściowym trawieniu Sau3AI ludzkiego DNA klonowanego do miejsca BamHI w wektorze λ JI) (J. J. Toole i in., jak wyżej). Identyfikuje się trzy łysinki zawierające sekwencje hybrydyzujące silnie z sondą cDNA. DNA z dwóch z tych trzech fagów trawi się całkowicie enzymem stanowiącym endonukleazę Sau3AI i subklonuje do miejsca BamHI do klonującego wektora mp9 bakteriofaga > Μ13. Subklony zawierające sekwencje egzonu identyfikuje się przez hybrydyzację z cDNA gibbona. Jeden subklon, ACSF-16 zawierający sekwencję ludzkiego genomowego DNA jako insert Bg 1II o około 10 kilodaltonach zdeponowano w ATCC jak opisano w powyższej części niniejszego opisu. Całkowitą sekwencję wszystkich egzonów genu ludzkiego określa się stosując analizę sekwencji DNA dotyczącą dideoksy-zakończenia łańcucha z użyciem baterii primerów oligonukleotydowych o sekwencjach przyjętych na podstawie sekwencj genu gibbona opisanej w przykładzie I w powyższej części niniejszego opisu. Ponieważ sekwencje nukleotydów egzonów z ludzkiego genu wykazują ponad 96% homologii z sekwencją cDNA gibbona, można zrekonstruować sekwencję nukleotydów odpowiedniego ludzkiego cDNA. Zmiany w sekwencjach nukleotydów w 11 kodonach powodują zmiany nukleotydów w polipeptydach z tych dwóch gatunków. (Patrz tabela 2).
Ludzką sekwencję genomową można wyciąć z Λ CSF-16 i wprowadzić do wektora ekspresyjnego. Liczne typy wektorów tego rodzaju są znane w tej dziedzinie techniki. Służą one do ekspresji ssaków, owadziej, drożdży, grzybów i bakteryjnej. I tak np., ludzką sekwencję genomową wycina się ze zdeponowanego bakteriofaga za pomocą trawienia endonukleazami Smal i Xhol, które rozszczepiają region ludzkiego genu przy nukleotydach, odpowiednio, 629 i 3183. Utworzony fragment o 2,5 kilozasady zawiera całkowite sekwencje ludzkiego genu polipeptydu podobnego do IL-3 i zawiera sekwencję „pokrewną TATAA w regionie promotorowym, jednak brakuje mu sekwencji „pokrewnych CAT“ i sygnału poliadenylacji przy końcu 3' genu. Koniec Smal tego fragmentu przekształca się w Xhol za pomocą handlowo dostępnej sekwencj łącznika. Fragment
159 183 ten subklonuje się standardowymi metodami biologii molekularnej [patrz np.: Y-C. Yang i in., Celi, 47, 3-10 (1986)], do strawionego Xhol plazmidowego wektora ekspresyjnego, pXM, z uzyskaniem plazmidu pY3.
Następnie amplifikuje się pY3 w bateriach i stosuje do transfekcji małpich komórek COS-1, gdzie gen ludzki ulega transkrypcji i RNA składaniu. Podłoża transfekowanych komórek dają wynik dodatni w badaniach aktywności biologicznej podobnej do wykazywanej przez IL-3 w teście na ludzkim szpiku kostnym i w teście CML jak to opisano w poniższej części niniejszego opisu. Hybrydyzacja metodą Northerna z sondą cDNA gibbona wskazuje na obecność pojedynczego mRNA o 1 kilozasadzie, który otrzymuje się z tych komórek i który ma tę samą wielkość co RNA otrzamany z limfocytów krwi obwodowej, jak opisano w poniższej części niniejszego opisu. cDNA syntetyzuje się na podstawie mRNA zwykłymi metodami i identyfikuje klon o aktywności CML. Z niego wyodrębnia się cDNA nowego czynnika wzrostu podobnego do IL-3.
Przykład III. Ludzki czynnik wzrostu podobny do IL-3.
Sekwencję cDNA według tabeli 2 kodującą ludzki polipeptyd podobny do IL-3 można także otrzymać sposobami innymi niz opisane w powyższym przykładzie II. I tak np. sekwencję według tabeli 2 można zsyntetyzować chemicznie metodami dobrze znanymi fachowcom w tej dziedzinie techniki. Jedna z tych metod syntezy chemicznej związana jest z rekonstrukcją genu gibbona kodującego IL-3, w celu zapewnienia sekwencji kodującej ludzki IL-3. Pierwsza różnica dotycząca aminokwasów między dojrzałymi postaciami białka IL-3 ludzkiego i gibbona występuje przy aminokwasie 82. Sekwencję kodującą IL-3 w genie gibbona od aminokwasu 82 do końca genu 3' można zastąpić chemicznie zsyntetyzowanymi sekwencjami DNA kodującymi ludzki L-3, dzięki czemu uzyskuje się funkcjonalny gen zdolny do wytwarzania ludzkiego IL-3 w odpowiednim układzie ekspresyjnym.
Można użyć dwóch pojedynczych miejsc restrykcyjnych w sekwencji gibbona do klonowania syntetycznych segmentów DNA: miejsca AsulI przy aminokwasie 73 i miejsca EcoRI przy aminokwasie 125. „Kasetę DNA do wprowadzania do genu gibbona syntetyzuje się od miejsca AsulI do miejsca EcoRI za pomocą dostarczenia na drodze enzymatycznej dupleksu DNA o około 160 parach zasad z dwóch oligonukleotydów, które są wzajemnie kompelmentarne w ponad 21 parach zasad. Kompletny duplex tworzy się za pomocą uzupełnienia komplementarnego regionu do końca oligonukleotydów z zastosowaniem trifosforanów deoksynukleozydów i fragmentu Klenowa polimerazy DNA I. Kompletny dupleks trawi się AsulI i/lub EcoRI w celu zapewnienia lepkich końców do następującego później klonowania.
Druga „kaseta syntetycznego DNA składa się z dwóch oligonukleotydów, kompelmentarnych wzajemnie w swojej długości, od miejsca EcoRI przy aminokwasie 125 do, włącznie, kodonu terminacyjnego następującego po aminowkasie 152 przy końcu genu. Te oligony konstruuje się z lepkim końcem EcoRI i odpowiednimi miejscami restrykcyjnymi lub lepkimi końcami przy, albo bezpośrednio za kodonem terminacyjnym, a to w celu klonowania do różnych wektorów ekspresyjnych.
Syntetyzuje się dwa zessawy tych kaset, jeden do ekspresji u ssaków, a drugi do ekspresji bakteryjnej, odpowiednio do różnic między Procaryota a Eucaryota co do użyteczności dla nich kodonów, oraz występowania dubletów CpG w genach eukariotycznych w niewielkim rozmiarze i zachowania różnych miejsc restrykcyjnych do klonowania lub zapotrzebowania na nie. Te preferencje dotyczące kodonów znane są fachowcom w tej dziedzinie techniki. Patrz np. T. Maruyama i in., Nuci. Acids Res., 14, r 151 (1986). Przykładowe zmiany kodonów i lepkie końce dla tych kaset pokazane są w poniższej tabeli 3. Następnie kasety klonuje się do wektora pCSF-MLA w celu przeniesienia go do wektora niosącego gen kodujący ludzki czynnik podobny do IL-3. Utworzonego wektora używa się następnie do ekspresji czynnika ludzkiego.
159 183
Tabela 3 I. Zmiany kodonów
| Aminokwas nr | Ekspresja bakteryjna | Ekspresja u ssaków |
| 1 | 2 | 3 |
| 73 | CGT | |
| 74 | CGT | |
| 75 | CCC | |
| 82 | CGT | |
| 86 | AGC | |
| 87 | CTG | CTG |
| 88 | CAA | CAA |
| 89 | AAT | |
| 91 | AGC | |
| 97 | CTG | CTG |
| 100 | CTG | CTG |
| 102 | CGT | |
| 105 | CCG | |
| 108 | ACC | ACA |
| 109 | GCT | |
| 111 | CCG | |
| 112 | ACC | ACC |
| 113 | CGT | AGG |
| 115 | CCG | |
| 120 | GAT | |
| 127 | CCC | AGG |
| 128 | CGC | |
| 131 | ACC | ACC |
| 137 | CTG | CTG |
| 140 | GCT | GCT |
| 143 | CAG | CAG |
| 145 | ACC | ACC |
| 146 | ACC | ACC |
| 147 | CTG | CTG |
| 152 | TTC | TTC |
II. Zakończenia kaset
| Kaseta nr | Ekspresja bakteryjna | |
| I | 73 | 125 |
| Arg Arg | ... Glu Phe Arg | |
| T CGT | .. GAA TTC CGT | |
| A GCA . | ... CTT AAG GCA Ekspresja u ssaków | |
| 71 | 125 | |
| Asn Leu | Arg Arg ... Glu Phe Arg | |
| AAC CTT CGA AGG GAA TCC CGTC | ||
| TTG GAA GCT TCC ... CTT AGG GCAG Ekspresja bakteryjna | ||
| 11 | 126 | 152 |
| Phe Arg | Phe | |
| AA TTC | CGC . ... TTC TGA AACTCGAGACTGCA | |
| G GCG | ..... AAG ATC TTGAGCTCTG Ekspresja u ssaków | |
| II | 126 | 152 |
| Phe Arg | Phe | |
| AA TTC | AGG ... TTC TAG AACTCGAGA | |
| G TCC . | AAG ATC TTGAGCTCTTTAA |
Alternatywnie, otrzymanie sekwencji cDNA ludzkiego czynnika wzrostu podobnego do IL-3 może być związane z klonowaniem cDNA ze źródła tkankowego. Stosuje się sekwencję cDNA gibbona według tabeli 1 jako sondę, według: T. Maniatis i in., jak wyżej, i zidentyfikowane limfocyty krwi obwodowej jako ludzkie źródło do wyodrębniania mRNA kodującego ten ludzki polipeptyd podobny do IL-3. Poli A+ RN A otrzymuje się ze źródła stanowiącego limfocyty krwi obwodowej, przeprowadza w cDNA i klonuje jako albo fagowy, albo plazmidowy zbiór cDNA.
159 183
Ludzki zbiór cDNA można zidentyfikować przez hybrydyzację z sekwencją kodującą gibbona według tabeli 1 jako sondą DNA i przez ustalenie właściwości biologicznych jako podobnych do wykazywanych przez IL-3.
Dodatkowymi źródłami tkankowymi, które również można poddawać screeningowi pod względem cDNA kodującego ludzki polipeptyd podobny do IL-3, są takie źródła jak śledziona, wątroba, grasica, migdałki, nerka i inne świeże tkanki dostępne w wyniku biopsji, albo trupie. Specjalne zainteresowanie budzą przypadki w których za zwiększoną ilość komórek hematopoetycznych może być odpowiedzialny nowotwór, takie jak białaczka. Dodatkowymi źródłami są linie komórkowe zdeponowane do powszechnego użytku w instytucjach do tego powołanych, np. ATCC, albo dostępne w agencjach rządowych lub z pewnych źródeł prywatnych. Do przykładowych linii komórkowych należą linie transformowanych komórek T i B, oraz linie komórek pochodzenia niehematopoetycznego, ale wytwarzających homatopoetyny.
W celu ekspresji tego ludzkiego polipeptydu podobnego do IL-3 przenosi się kodujący go cDNA do odpowiedniego wektora ekspresyjnego, np. pCD lub pXM i wprowadza do wybranych komórek-gospodarzy zwykłymi metodami inżynierii genetycznej, jak opisano w powyższej części niniejszego opisu. Jednym z układów ekspresyjnych ssaków dla biologicznie aktywnego, rekombinantowego, ludzkiego polipeptydu podobnego do IL-3, są stabilnie transformowane komórki CHO. Tym niemniej, aktywny polipeptyd może być wytworzony, wewnątrzkomórkowo lub zewnątrzkomórkowo, przez E. coli i inne bakterie. Można też zastosować komórki drożdży lub owadzie jako układy ekspresyjne, jak to opisano w poniższym przykładzie IV.
Innym alternatywnym sposobem ekspresji tego ludzkiego polipeptydu podobnego do IL-3 jest zastosowanie fragmentu Bg III z ACSF-16, zawierającego kompletny gen z ludzkiego genomu, do skonstruowania linii komórkowych ssaków przeprowadzających ekspresję polipeptydu, np. sposobem opisanym w PCT Wo85/20610 odnośnie do ludzkiej erytropoetyny. Oprócz tego, ten gen z ludzkiego genomu można skonstruować z odpowiednim promotorem i sygnałami przetwarzania do ekspresji w pewnych innych układach heterologicznych, np. z promotorami owadzimi w celu otrzymania linii komórek owadzich w hodowli. Podobnie, tego genu z genomu można użyć do ekspresji w drożdżach lub innych eukariotycznych układach komórkowych.
Przykład IV. Ekspresja czynników wzrostu podobnych do IL-3.
Konstrukcji plazmidu pCSF-MLA dokonuje się w prosty sposób przez wprowadzenie sekwencji gibbona według tabeli 1 do pXM strawionego Xhol jak opisano w powyższej części niniejszego opisu. Plazmid z sekwencją ludzką, pSHIL-3-1, konstruuje się syntetycznie w celu ekspresji u ssaków, jak to opisano w powyższym przykładzie III. Inny plazmid, pY3, wytwarza się sposobem opisanym w powyższej części niniejszego opisu. Każdy z tych plazmidów niosących DNA kodujący czynnik wzrostu naczelnych podobny do IL-3 stosowany jest następnie do transformowania zwykłymi metodami wybranych komórek-gospodarzy dla ekspresji polipeptydu.
A. Ekspresja w komórkach ssaków. W cclu uzyskanńa ekspresjj ccynmków podobnych do IL-3 do użycia w badaniach poniżej opisanych, transfekuje się pSHIL-3-1 i pCSF-MLA komórki COS. Kondycjonowane podłoże transfekowanych komórek COS wykazuje aktywność czynnika wzrostu na wysokim poziomie, jak to opisano.
Przedstawione w niniejszym opisie wektory ekspresyjne dla komórek ssaków można syntetyzować metodami dobrze znanymi fachowcom w tej dziedzinie techniki. Składniki tych wektorów, takie jak np. replikony, geny selekcyjne, wzmacniacze, promotory itp. można otrzymać ze źródeł naturalnych lub zsyntetyzować metodami znanymi. Patrz: Kaufman i in., J. Mol. Biol., 159, 511-521 (1982), oraz Kaufman, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82,689-693(1985). Do przykładowych komórek ssaków jako gospodarzy należą w szczególności linie komórek naczelnych i linie komórek gryzoni, w tym linie komórek transformowanych. Odpowiednie są także normalne komórki diploidalne, szczepy komórek otrzymane z hodowli pierwotnej tkanki in vitro, jak również pierwotne eksplanty. Kandydujące komórki nie muszą być genowo deficytowe w genie selekcyjnym w takim zakresie, w jakim gen selekcyjny działa w sposób dominujący. W celu stabilnej integracji wektorowego DNA i następnie amplifikacji zintegrowanego wektorowego DNA, można zastosować komórki CHO i użyć, tak do integracji, jak i do amplifikacji, zwykłych metod. Alternatywnie, wektorowy DNA może obejmować całość lub część genomu wirusa brodawczakowatości bydła
159 183 [Lusky i in., Celi, 36, 391-401 (1984)] i może być niesiony jako stabilny element episomalny przez linie komórkowe, takie jak linia komórek mysich C127. Do innych odpowiednich linii komórek ssaków należą, ale nie tylko one, HeLa, komórki małpie COS-1, mysie komórki L-929, linie 3T3 otrzymane z myszy Swiss, Balb-c lub NIH, linie komórek chomika BHK lub HaK.
Stabilne transformanty poddaje się następnie screeningowi pod względem ekspresji produktu zwykłymi testami immunologicznymi lub enzymatycznymi. Obecność DNA kodującego białka wariantowe można wykryć zwykłymi metodami, takimi jak hybrydyzacja metodą Southerna. Przejściową ekspresją DNA kodującego warianty podczas kilku dni po wprowadzeniu DNA wektora ekspresyjnego do odpowiednich komórek-gospodarzy, takich jak małpie komórki COS-1, ocenia się bez selekcji za pomocą badań aktywności lub immunologicznych białek w podłożu hodowli.
Fachowiec w tej dziedzinie techniki może łatwo skonstruować inne wektory ekspersyjne ssaków porównywalne z pCSF-MLA i pSHJL-3-1 przez np. wycięcie Xhol sekwencji DNA według tabeli 1 lub tabeli 2 z odpowiednich plazmidów i zastosowanie dobrze znanych rekombinantowych metod inżynierii genetycznej i innych znanych wektorów, takich jak pJL3 i pJL4 [Gough i in., EMBO J., 4, 645-653 (1985)] oraz pMT2 (zaczynając od pMT2-VWF, ATCC nr 67 122, patrz zgłoszenie patentowe PCT nr PCT/UJS87/00033). Transformacja tymi wektorami odpowiednich komórek-gospodarzy może wywołać ekspresję czynników wzrostu podobnych do IL-3.
B. Bakteryjne układy ekspresyjne. Podobnie, fachowiec w uj dziedzinie techmki może mampulować sekwencjami według tabel 1 i 2 przez eliminację lub zastąpienie sekwencji regulatorowych ssaków flankujących sekwencje kodujące sekwencjam- bakteryjnymi, w celu wytworzenia wektorów bakteryjnych do wewnątrzkomórkowej lub zewnątrzkomórkowej ekspresji czynników podobnych do IL-3, wytwarzanych sposobem według wynalazku, przez komórki bakteryjne. DNA kodujący czynnik można dalej zmodyfikować, jak opisano w powyższym przykładzie III, aby zawierał inne kodony, do ekspresji bakteryjnej, jak to jest znane w tej dziedzinie techniki. Korzystnie sekwencja jest operatywnie połączona·, w ramie, z sekwencją nukleotydów kodującą lider wydzielniczy polipeptydu pozwalający na ekspresję bakteryjną, wydzielanie i przetwarzanie dojrzałego wariantu białka, jak to również jest znane w tej dziedzinie techniki. Związki powstające w wyniku ekspresji w komórkach bakteryjnych jako gospodarzach, można następnie odzyskać, oczyścić i/lub scharakteryzować w odniesieniu do fizykochemicznych, biochemicznych i klinicznych parametrów, w każdym przypadku metodami znanymi.
W celu skonstruowania takiego bakteryjnego wektora do ekspresji bakteryjnej, konstruuje się częściowo syntetyczną sekwencję DNA ludzkiego polipeptydu podobnego do IL-3, wychodząc z cDNA gibbona i syntetycznych kaset bakteryjnych opisanych w powyższym przykładzie III. Sekwencję tę umieszcza się w wektorze pa 1183 strawionym Nde e/XbaI, który zdeponowany jest w ATCC pod numerem rejestracyjnym 40134. Powstałym wektorem pPLHIL-3-181 transfekuje się E. coli GL400 i prowadzi się hodowlę w warunkach opisanych dla GM-CSF w opublikowanym zgłoszeniu patentowym PCT nr 86/00639.
Czynnik podobny do IL-3 jest w E. coli tworzony jako nierozpuszczalne ciałka inkulzyjne. W celu solubilizowania ich i otrzymania z nich białka, stosuje się następujący sposób postępowania. Około 50 g komórek jako zamrożoną pastę zawiesza się ponownie w 120 ml 50 mM Tris-HCl, pH 7,5,' 0,1 mM fluorku fenylometylosulfonylu (PMSF) i 2mM ditiotreitolu (DDT) (bufor A). Komórki rozbija się za pomocą przepuszczenia przez prasę (French press) lub zawór (Matin Gaulin valve) pod ciśnieniem 68947 kPa lub wyższym. Następnie rozbite komórki odwirowuje się przy 20000 Xg w ciągu 30 minut w celu osadzenia komórkowego debris, zawierającego ciałka inkluzyjne.
Otrzymany osad ponownie zawiesza się w 55% sacharozie w buforze A z przepuszczeniem przez prasę (French press) i ponownie wiruje przy 30000 X g w ciągu 30 minut. Osad zawierający ciałka inkluzyjne z czynnikiem podobnym do IL-3 ponownie zawiesza się w 55% sacharozie w buforze A i nawarstwia na gradiencie stopniowym z 60, 65 i 70% sacharozy. Następnie gradient poddaje się wirowaniu przy 150000 X g w ciągu 2 godzin. Ciałka inkluzyjne z czynnikiem podobnym do IL-3 osiadają w 65% warstwie, którą się zbiera.
159 183
W celu rekonstytucji i ponownego sfałdowania czynnika podobnego do IL-3 o czystości w przybliżeniu około 80%, omawiane ciałka inkluzyjne zawiesza się ponownie w 8 M moczniku przy 2-3 mg białka/ml roztworu mocznika. Roztwór mocznika zawierający białko rozcieńcza się 50 mM Tris-HCl, pH 8,0, 0,1 mM PMSF, 2mM DTT i 0,1 mM kwasem etylenodiaminotetraoctowym (EDTA) (bufor B) do końcowego stężenia mocznika 3 M (w którym to roztworze stężenie IL-3 wynosi w przybliżeniu 1 yg/ml). Do tego roztworu zawierającego mocznik dodaje się bufor redukująco-utleniający zawierający 6mM zredukowany glutation i 6mM utleniony glutation i całość inkubuje się w ciągu 2 godzin w temperaturze 20°C. Roztwór, 3 M pod względem mocznika, ' poddaje się przez noc dializie wobec buforu B w celu usunięcia mocznika. Roztwór białka IL-3 odwirowuje się następnie w celu usunięcia jakiegokolwiek strątu. W tym stadium czynnik podobny do IL-3 jest ponownie sfałdowany, a jego czystość wynosi około 85%.
Ponownie sfałdowany czynnik podobny do IL-3 dializuje się znów wobec 50 mM buforu MES o pH 6,0, zawierającego 0,1 mM EDTA i nanosi na kolumnę z DEAE-Sepharose zrównoważoną tym samym buforem. Czynnik podobny do IL-3 odpowiada, w płynie przepływającym przez DEAE-Sepharose około 99% czytości. W stadium tym usuwane są też wszystkie pirogeny. pH IL-3 z płynu przepływającego przez DEAE-Sepharose doprowadza się do 5,0 za pomocą 200 mM buforu zawierającego octan sodowy o pH 4,0. Czynnik podobny do IL-3 nanosi się na kolumnę z suIfonylopropylo-Sepharose, gdzie wiąże się on z SP-Sepharose i zostaje eluowany buforem zawierającym octan sodowy. W tym stadium czystość i sfałdowanie czynnika podobnego do IL-3 jest prawidłowa. W teście CML ten ludzki czynnik podobny do IL-3 wykazuje aktywność właściwą 1do 3· 107jednostek CML/^g.
Podobnie, sekwencję kodującą według tabeli 1 lub tabeli 2 można wyciąć Xhol z pCSF-MLA lub pSHIL-3-1 i dalej nią manipulować, np. ligować z innymi znanymi łącznikami, albo zmodyfikować przez delecję z niej sekwencji niekodujących, względnie przeprowadzenie w niej zmian nukleotydów innymi znanymi metodami. Zmodyfikowaną sekwencję kodującą polipeptyd podobny do IL-3 można następnie wprowadzić do znanego wektora bakteryjnego stosując metody takie jak opisali T. Taniguchi i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77, 5230-5233 (1980). Takim przykładowym wektorem bakteryjnym można następnie transformować bakteryjne komórkigospodarze, doprowadzając przez to do ekspresji czynnika podobnego do IL-3. Co do strategii doprowadzania do zewnątrzkomórkowej ekspresji czynników podobnych do IL-3 w komórkach bakteryjnych patrz np. zgłoszenie patentu europejskiego nr EPA 177 343.
C. Ekspresja w komórkach owadzich. Podobne manipulacje można przeprowadzić w celu konstrukcji wektora owadziego (patrz np. sposoby opisane w opublikowanym zgłoszeniu patentu europejskiego nr 155 476) do ekspresji w komórkach owadzich. Można skonstruować także wektor drożdżowy, stosując sekwencje regulatorowe drożdży, do wewnątrzkomórkowej lub zewnątrzkomórkowej ekspresji białek wytwarzanych sposobem według wynalazku w komórkach drożdży. Patrz np. sposoby opisane w opublikowanym zgłoszeniu patentowym PCT nr WO 8 600 639 oraz w zgłoszeniu patentu europejskiego nr EP 123 289.
Przykład V. Konstrukcja linii komórek CHO wykazujących na wysokim poziomie ekspresję czynnika wzrostu naczelnych podobnego do IL-3.
Sposób wytwarzania na wysokim poziomie polipeptydów należących do nowej rodziny polipeptydów naczelnych podobnych do IL-3, których dotyczy niniejszy wynalazek, w komórkach ssaków, polega na konstrukcji komórek zawierających liczne kopie heterologicznego genu polipeptydu podobnego do IL-3. Heterologiczny gen może być połączony ze zdolnym do amplifikacji markerem, takim jak np. gen reduktazy dihydrofolianowej (DHFR). W oparciu o ten marker można wyselekcjonować komórki zawierające zwiększoną ilość kopii genu do namnażania się przy zwiększających się stężeniach methotrexate (ΜΤΧ) metodą Kaufmana i Sharpa, J. Mol. Biol. (1982), jak wyżej.
Tego rodzaju podejście do zagadnienia można przyjąć w odniesieniu do szeregu rozmaitych typów komórek. I tak np., pY3 zawiera ludzki gen polipeptydu podobnego do IL-3 w operatywnym połączeniu z innymi sekwencjami plazmidowymi umożliwiającymi jego ekspresję. pY3 i plazmid ekspresyjny DHFR pAdA26SV(A)3 [Kaufman i Sharp, Mol. Cell Biol., 3 (9), 1598-1608 (1983)] można wspólnie wprowadzić do komórek COS deficytowych pod względem DHFR, DUKX-BII, za pomocą koprecypitacji fosforanem wapnia i transfekcji. Alternatywnie, gen można wprowadzić
159 183 do pMT2 jak poprzednio wspomniano i utworzonego wektora użyć zamiast pY3 i pAdA26SV(A)3. Transformanty wykazujące ekspresję DHFR selekcjonuje się pod względem wzrostu w podłożach a z dializowaną płodową surowicą cielęcą, a następnie sełekcjonuje się w związku z amplifikacją przez wzrost przy zwiększających się stężeniach ΜΤΧ (kolejne stadia w 0,02,0,2,1,0 i 5 μΜ ΜΤΧ), jak to opisali Kaufman i in., Mol. Celi Biol., 5, 1750 (1983). Transformanty klonuje się i ekspresję biologicznie aktywnego polipeptydu podobnego do IL-3 kontroluje w testach CML. Ekspresja polipeptydu podobnego do IL-3 powinna wzrastać ze wzrastającym poziomem oporności na ΜΤΧ. Podobne sposoby postępowania można następnie wykorzystać do wytworzenia innych należących do tej rodziny polipeptydów podobnych do IL-3, włącznie zpolipeptydami gibbona podobnymi do IL-3.
Przykład VI. Aktywność biologiczna różnego rodzaju wykazywana przez polipeptyd podobny do IL-3.
Następujące badania przeprowadza się z użyciem zarówno polipeptydu gibbona jak i polipeptydu ludzkiego jako reprezentatywnych polipeptydów należących do nowej rodziny polipeptydów naczelnych, podobnych do IL-3, wytworzonych sposobem według wynalazku. Tym niemniej, inne polipeptydy należące do tej rodziny wykazują właściwości biologiczne podobne do wykazywanych przez IL-3 w takich samych lub innych badaniach, w zależności od ilości właściwości biologicznych podobnych do wykazywanych przez IL-3, a przejawianych przez indywidualny polipeptyd.
A. Test CML. Test CML przeprowadza się zasadniczo zgodnie z metodami opisanymi w Blood, 63 (4), 904-111 (1984). Wyjściową zawiesinę komórek otrzymuje się z zamrożonej próbki krwi obwodowej pacjenta w fazie stałej. Próbkę tę rozmraża się, po czym ponownie zamraża w postaci 500 próbek z 15 - 10e komórek/fiolkę. Komórek tych, „CML 8-3“ używa się do badania aktywności podobnej do wykazywanej przez IL-3, a przejawianej przez polipeptydy podobne do IL-3. Jedną fiolkę rozmraża się szybko w temperaturze 37°C w dniu poprzedzającym dzień uruchomienia eksperymentu. Następnie zawartość fiolki przenosi się do 15 ml probówki i przemywa dwukrotnie 5% ludzką surowicą AB (Hi) w RPMI (GIBCO, RPMI 1640) [HAB/RPMI]. Komórki inkubuje się przez noc w 5% HiHAB/RPMI przy 5% CO2, w temperaturze 37°C. Następnego dnia komórki wyodrębnia się z hodowli, dodaje do nich Ficoll, przemywa, ponownie liczy i odstawia.
Do każdego dołka płytki do mikromiareczkowania dodaje się 100μ1 10% podłoża HIFCS2/RPMI zawierającego materiał, który ma być analizowany. Komórki przygotowane tak jak wyżej osadza się i ponownie zawiesza w 10% HIFCS/RPMI w stężeniu 1,3-2-105 komórek/μΙ. Do każdego dołka dodaje się 100 μΐ komórek i inkubuje w obecności, lub nieobecności, przeciwciał przeciw ludzkiemu GMCSF w temperaturze 37°C w 5% CO2, w ciągu 48 lub 72 godzin. Następnie dodaje się 0,5 μθ 3H-tymidyny na dołek i prowadzi inkubację w ciągu 6 godzin w temperaturze 37°C. Komórki zbiera się przy użyciu rozgałęzionego urządzenia filtracyjnego na bibułę GFC typu C (Schleicher-Schuller), przemywa roztworem soli buforowanym fosforanami i suszy. Następnie filtry zanurza się w płynie do scyntylacji i poddaje zliczaniu pod względem pobrania 3H.
W oparciu o pomiary pobrania tymidyny, uważa się zarówno pochodzący od gibbona czynnik wzrostu podobny do IL-3, jak i ludzki czynnik wzrostu podobny do IL-3, za aktywne w tym teście stymulowania namnażania się białaczkowych komórek blastycznych.
B. Testy na szpiku kostnym. Testy na ludzkim szpiku kostnym, przy stosowaniu nieprzyczepnych komórek szpiku kostnego, prowadzi się tak, jak to opisali G. G. Wongiin, wyżej. Kondycjonowane podłoża, dla czynników zarówno gibbona jak i ludzkiego, wykazują, jak stwierdzono, aktywność w tym teście, dając małe kolonie z linii oczywistego typu granulocytowego. Po morfologicznym badaniu zabarwionych hodowli agarowych stwierdzono również tworzenie kolonii makrofagów, granulocytów-makrofagów i eozynofilów. Gdy test przeprowadza się w obecności erytropoetyny, zdolność kondycjonowanego podłoża do podtrzymywania wzrostu erytroidalnych komórek pierwotnych wykazuje się za pomocą tworzenia kolonii erytrocytów. Gdy porównuje się w teście na ludzkim szpiku kostnym GM-CSF z polipeptydem podobnym do IL-3, polipeptyd podobny do IL-3 podtrzymuje tworzenie większej ilości kolonii niż GM-CSF, kiedy obydwa polipeptydy znajdują się w obecności erytropoetyny. Większość kolonii podtrzymywanych przez GM-CSF są to kolonie pojedynczych linii, podczas gdy polipeptyd wytworzony sposobem według
159 183 wynalazku podtrzymuje tworzenie kolonii różnych linii. Podobnie, w teście tworzenia kolonii na komórkach blastycznych, polipeptydy podobne do IL-3 tworzą większą ilość kolonii komórek blastycznych różnych linii. GM-CSF w tym samym teście tworzy bardzo niewiele kolonii wtórnych.
C. Test na komórkach KG-1. Test KG-1 przeprowadza się tak, jak to opisali G. G. Wongi in., wyżej. Polipeptyd gibbona podobny do IL-3 należący do nowej rodziny czynników wzrostu naczelnych podobnych do IL-3, wytwarzany sposobem według wynalazku, był w tym teście aktywny.
D. Testy różne. W teście cytotoksyczności komórkowej zależnej od przeciwciał, polipeptyd podobny do IL-3 wytworzony sposobem według wynalazku stymulował w sposób zależny od dawki eozynofile, tak, aby zabijały one nowotworowe komórki docelowe pokryte przeciwciałami. Polipeptyd dodatkowo stymulował eozynofile do fagocytozy opsonizowanych surowicą drożdży piekarnicznych i to na drodze bezpośredniego stymulowania tworzenia anionu nadtlenkowego przez eozynofile. W badaniach wstępnych, w których czynniki wytwarzane sposobem według wynalazku podobne do IL-3 podaje się zdrowym małpom w infuzji i oblicza ilość białych ciałek krwi, zaobserwowano powtarzalny wzrost zarówno ilości płytek krwi jak i eozynofilów. Te wstępne wyniki zaobserwowano tak dla ludzkiego czynnego podobnego do IL-3, jak i dla pochodzącego od gibbona czynnika podobnego do IL-3.
Przykład VII. Oczyszczanie polipeptydu podobnego do IL-3 z podłoża kondycjonowanego komórkami COS.
Następujące sposoby postępowania stosowane są obecnie w celu otrzymania jednorodnego białka podobnego do IL-3 z komórek COS, jak opisano w powyższym przykładzie IV.
A. Wymiana jonowa. Podłoża kondycjonowane komórkami COS (DMEM, 0,5% FBS w butlach obrotowych, przy całkowitym stężeniu białka 2^0m(^ml) zawierają ludzki polipeptyd podobny do IL-3 w stężeniu około 2-3pg/ml. Podłoża rozcieńcza się wodą do przewodności właściwej poniżej 8,0 ms/cm2. Ładunek jonitu (QAE Zeta Prep) równoważy się w temperaturze 4°C z użyciem około 500 ml 0,1 M Trsi-Cl, pH 8,0, a następnie 2 litrów 40 mM Tris-Cl, pH 7,4. Podłoża nanosi się z szybkością 40 ml/min, a następnie zbiera frakcję niezwiązaną. Ładunek przemywa się 40 mM Tris-Cl aż do ustania wymywania materiału aktywnego. Frakcję niezwiązaną zatęża się przy użyciu urządzenia do diafiltracji z membraną (Amicon YM-10).
B. Kolumna z lektyną z soczewicy. Kolumnę z lektyną z soczewicy równoważy się 20 mM Tris, pH 7,4, 0 ,05% Tween-20, w temperaturze 4°C (bufor I), a następnie poddaje nanoszeniu przy I objętości kolumny na godzinę. Kolumnę przemywa się buforem I w celu usunięcia niespecyficznie związanego białka, a następnie związane białko eluuje się buforem I z 0,2 M σ-metylomannopiranozydem. Zbiera się wyeluowane frakcje.
C. HPLC z odwróconymi fazami. Powyższy preparat polipeptydu podobnego do IL-3 poddaje się HPLC z odwróconymi fazami w temperaturze pokojowej jak poniżej opisano. Preparat polipeptydu podobnego do IL-3 wstrzykuje się na kolumnę RP HPLC (C4 Vydac) zrównoważoną I00% buforem A. Bufor A stanowi 0,1% kwas trifluorooctowy (TFA) w wodzie, a bufor B 0,I% TFA w 95% acetonitrylu. Gradient odpowiada 0,2%/minutę od 45 do 70% buforu B. Frakcje zebrane w tym gradiencie odpowiadają 46,8% do 47,5% buforu B. Frakcje poddaje się odpędzaniu pod zmniejszonym ciśnieniem w celu usunięcia aceeonitrylu. W drugim stadium HPLC z odwróconymi fazami bufor A stanowi 0,15% kwas heptafluoromasłowy (HFBA) w wodzie i 0,15% HFBA w 95% ac^eoi^iitrylu. Gradient odpowiada 0,2%/minutę od 45 do 70% buforu B. Frakcje zebrane w tym stadium odpowiadają 49-51% buforu B. Frakcje te eluowane z HPLC były wolne od pirogenów.
Przykład VIII. Analizy polipeptydów podobnych do IL-3.
A. SDS-PAGE. Według metody R. J. Kaufmana i P. A. Sharpa, [J. Mol. Biol., 159, 601^621 (1982)] 35S-metionina zostaje włączona do polipeptydów wytworzonych przez komórki COS transfekowane pCSFM-MLA i komórki COS transfekowane pY3. Elektroforeza w żelu SDSpoliakryloamidowym (warunki redukujące) [U. K. Laemmli, Naturę, 227,680-685 (1970)] znakowanych białek wydzielonych przez transfekowane komórki COS-1 ujawniła rozdział polipeptydów o pozornej masie cząsteczkowej w zakresie 14-35 kilodaltonów, tak dla czynnika gibbona jak i ludzkiego. Rozdziału takiego nie było w przypadku nie poddanej transfekcji próbki kontrolnej. Bardziej szczegółowo, ludzki czynnik podobny do IL-3 wytworzony przez CHO ujawnił rozdział w zakresie 21-32 kilodaltonów, co można objaśnić wyższym stopniem glikozylacji w stosunku do czynnika ludzkiego, wytworzonego przez komórki COS, wykazującego rozdział głównie w zakresie 21-28 kilodaltonów.
W wyniku barwienia srebrowego po oczyszczeniu metodami według przykładu VI ujawniły się dwa główne pasma o średniej masie cząsteczkowej 21000 i 25000 w równych w przybliżeniu ilościach w przypadku obu czynników. Różnice między dwoma pasmami przypisuje się obecnie różnicom w N-glikozylacji.
B. Ogniskowanie izoelektryczne. Proste ogniskowanie izoelektryczne polipeptydów oczyszczonych sposobem według powyższego przykładu VII ujawnia cztery rodzaje tak dla polipeptydów gibbona jak i ludzkich, w zakresie wartości Pi od pH 6,0 do pH 7,6.
C. Suprose 6 - szybka chfomatogrfia cieczowa białek. Oczyszczone frakcje z HPLC przenosi się na kolumnę do sączenia żelowego (Superose 6) w 20 mMTris, pH 7,4,200 mMNaCl i 0,05% M Tween-20. Rozdział na kolumnie ujawnia jeden ostry pik o pozornej masie cząsteczkowej 43 kilodaltonów dla obydwu czynników.
D. Aktywność właściwa w teście CML. Aktywność właściwa przykładowego czynnika gibbona podobnego do IL-3 w teście CML opisanym powyżej znajduje się w zakresie 2 · 10e - 1· 107 jednostek rozcieńczeniowych/mg polipeptydu, ze średnią 8 · 10e jednostek rozczeńczeniowych/mg. Stwierdzono, że wytworzony przez bakterie polipeptyd ludzki opisany w powyższym przykładzie IV (B) wykazuje aktywność właściwą 1-3 · 107jednostek rozcieńczernowych/mg polipeptydu. Ludzki czynnik podobny do IL-3 wytworzony przez komórki CHO wykazuje w powyższym teście aktywność właściwą około 2-3 · 10e jednostek/mg białka. Ludzki czynnik podobny do IL-3 wytworzony przez komórki COS wykazuje aktywność właściwą około 1-20· 107 jednostek/mg. Jednostkę rozcieńczeniową (lub jednostkę CML) definiuje się jako rozcieńczenie czynnika dające połowę maksymalnej stymulacji w teście CML.
E. Analiza N-końcowa. Analizę N-końcowej sekwencji polipeptydu gibbona przeprowadza się za pomocą automatycznej degradacji Edmana, która wykazała poziom czystości cennika 98%.
F. Działanie N-glikanazą. Na czynniki: gibbona i ludzki wytworzone przez komórki COS działa się enzymem N-glikanazą, który trawi N-związane ugrupowania węglowodanowe. Wykazano, że każdy z czynników został tą metodą oczyszczony. Rozmazany rozdział 14-35 kilodaltonów dla każdego czynnika w żelu został zredukowany do pojedynczego pasma odpowiadającego 15 kilodaltonom dla czynnika gibbona i 20,5 kilodaltona dla czynnika ludzkiego.
Przewiduje się, że fachowcom po rozważeniu powyższych opisów korzystnych sposobów realizacji niniejszego wynalazku przyjdą na myśl liczne modyfikacje i warianty jego praktycznego zastosowania. Przyjmuje się, że te modyfikacje i warianty objęte są zakresem załączonych zastrzeżeń.
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 90 egz. Cena 10 000 zł
Claims (11)
- Zastrzeżenia patentowe1. Sposób wytwarzania polipeptydu podobnego do polipeptydu naczelnych IL-3 zasadniczo wolnego od połączeń z innymi polipeptydami naczelnych, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję DNA kodującą ten polipeptyd, który ma sekwencję aminokwasów taką samą lub zasadniczo taką samą jak sekwencja przedstawiona w tabeli 1 lub w tabeli 2 i wykazuje co najmniej jedną właściwość biologiczną podobną do wykazywanych przez polipeptyd naczelnych IL-3.
- 2. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję cDNA kodującą to białko, które ma sekwencję aminokwasów zasadniczo taką samą jak sekwencja przedstawiona w tabeli 1 i wykazuje co najmniej jedną właściwość biologiczną podobną do wykazywanych przez białko naczelnych IL-3.
- 3. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję cDNA kodującą ten polipeptyd, który charakteryzuje:a) sekwencja aminokwasów zasadniczo taka sama jak przedstawiona jak w tabeli 1, b) pozorna masa cząsteczkowa w zakresie pomiędzy około 14 do około 35 kilodaltonów, oznaczona za pomocą redukującej elektroforezy w żelu poliakryloamidowym SDS, c) zdolność do stymulacji procesu tworzenia się małych kolonii typu granulocytów w standardowym teście na ludzkim szpiku kostnym w stężeniach 10-100 pikomoli, d) zdolność do stymulowania procesu proliferacji komórek CML w teście CML w stężeniach 10-100 pikomoli.
- 4. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję cDNA, wybraną z grupy składającej się z (i) sekwencji DNA według tabeli 1, (ii) sekwencji DNA, które hybrydyzują w ostrych warunkach hybrydyzacji z sekwencją DNA według tabeli 1 i które kodują ekspresję białka o aktywności hematopoetycznej, (iii) sekwencji DNA, które kodują ekspresję białka kodowanego przez sekwencję DNA określone w (i) i (ii).
- 5. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję cDNA kodującą ten polipeptyd, który charakteryzuje a) sekwencja aminokwasów zasadniczo jak przedstawiona w tabeli 1 i kodowana przez sekwencję DNA wybraną z grupy składającej się z (i) sekwencji DNA weług tabeli 1, (ii) sekwencji DNA, które hybrydyzują w ostrych warunkach hybrydyzacji z sekwencją DNA według tabeli 1 i które kodują ekspresję białka o aktywności hematopoetycznej, (iii) s^lkwei^<^ji DNA, które kodują ekspresję białka kodowanego przez sekwencje DNA określone w (i) i (ii), b) pozorna masa cząsteczkowa w zakresie pomiędzy około 14 do około 35 kilodaltonów, oznaczona za pomocą redukującej elektroforezy w żelu poliakryloamidowym SDS, c) zdolność do stymulacji procesu tworzenia się małych kolonii typu granulocytów w standardowym teście na ludzkim szpiku kostnym w stężeniach 10-100 pikomoli, d) zdolność do stymulowania procesu proliferacji komórek CML w teście CML w stężeniach 10-100 pikomoli.
- 6. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję DNA kodującą ekspresję polipeptydu naczelnych wykazującego co najmniej jedną właściwość biologiczną podobną do właściwości IL-3, przy czym sekwencja nukleotydów w kierunku 5' do 3' jest wybrana z grupy składającej się z sekwencji DNA według tabeli 1, sekwencji DNA według tabeli 2, sekwencji DNA, która hybrydyzuje w ostrych warunkach hybrydyzacji z sekwencją DNA według tabeli 1 lub 2, sekwencji DNA, która hybrydyzuje z sekwencją według tabeli 1 lub 2 i która koduje ekspresję białka wykazującego co najmniej jedną właściwość biologiczną podobną do właściwości IL-3 i ich allelicznych wariacji.
- 7. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję DNA kodującą ekspresję polipeptydu159 183 naczelnych, który charakteryzuje a) sekwencja aminokwasów zasadniczo taka sama jak przedstawiona w tabeli 1 lub 2 i kodowana przez sekwencję DNA wybraną z grupy składającej się z (i) sekwencji DNA według tabeli 1, (ii) sekwencji DNA według tabeli 2, (iii) sekwencji DNA, która hybrydyzuje w ostrych warunkach hybrydyzacji z sekwencją DNA według tabeli 1 lub 2, (v) sekwencja DNA, która koduje ekspresję polipeptydu kodowanego przez sekwencje DNA określone w (i), (ii) oraz (iii) i b) co najmniej jedna właściwość biologiczna podobna do właściwości IL-3.
- 8. Sposób według zastrz. 7, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję DNA kodującą ekspresję polipeptydu naczelnych wykazującego co najmniej jedną właściwość biologiczną podobną do właściwości IL-3, wybraną z grupy obejmującej a) pozorną masę cząsteczkową w zakresie od około 14 do około 35 kilodaltonów, oznaczoną za pomocą redukującej elektroforezy w żelu SDS-poliakryloamidowym,b) zdolność do stymulowania procesu tworzenia się licznych typów kolonii hematopoetycznych należących do różnych rodów w standardowym teście na ludzkim szpiku kostnym, w 10-100 stężeniu pikomolowym, c) zdolność do stymulowania procesu proliferacji komórek CML w teście CML w 10-100 stężeniu pikomolowym.
- 9. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję DNA kodującą polipeptyd zasadniczo wolny od połączeń z innymi polipeptydami naczelnych, który charakteryzuje: a) sekwencja aminokwasów zasadniczo taka sama jak przedstawiona w tabeli 1 lub 2 i kodowana przez sekwencję DNA wybraną z grupy składającej się z (i) sekwencji DNA według tabeli 1, (ii) sekwencji DNA tabeli 2, (iii) sekwencj DNA, która hybrydyzuje w ostrych warunkach hybrydyzacji z sekwencją DNA według tabeli 1 lub 2, (v) sekwencji DNA, która koduje ekspresję polipeptydu kodowanego przez sekwencje DNA określone w (i), (ii) oraz (iii) i b) co najmniej jedna właściwość biologiczna podobna do właściwości IL-3.
- 10. Sposób według zastrz. 9, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransformowanej wektorem zawierającym sekwencję DNA kodującą polipeptyd, który charakteryzuje właściwość wybrana z grupy obejmującej a) pozorną masę cząsteczkową w zakresie pomiędzy około 14 do około 35 kilodaltonów, oznaczoną za pomocą redukującej elektroforezy w żelu poliakryloamidowym SDS, b) zdolność do stymulacji procesu tworzenia się licznych typów kolonii hematopoetycznych różnych rodów w standardowym teście na ludzkim szpiku kostnym w stężeniach 10-100 pikomoli, c) zdolność do stymulowania procesu proliferacji komórek CML w teście CML w stężeniach 10-100 pikomoli.
- 11. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że prowadzi się hodowlę linii komórkowej stransforomowanej wektorem zawierającym sekwencję DNA kodującą polipeptyd zasadniczo wolny od połączeń z innymi polipeptydami naczelnych, który charakteryzuje sekwencja aminokwasów, która ma wspólne regiony o znaczącej homologii z sekwencjami aminokwasów według tabeli 1 lub 2 i jest kodowana przez sekwencję DNA, która hybrydyzuje z sekwencją DNA według tabeli 1 lub 2, i która koduje ekspresję białka o właściwościach biologicznych podobnych do właściwości IL-3.
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US88506086A | 1986-07-14 | 1986-07-14 | |
| US89376486A | 1986-08-06 | 1986-08-06 | |
| US06/916,335 US4877729A (en) | 1986-07-14 | 1986-10-07 | Recombinant DNA encoding novel family of primate hematopoietic growth factors |
| US07/021,865 US4959455A (en) | 1986-07-14 | 1987-03-04 | Primate hematopoietic growth factors IL-3 and pharmaceutical compositions |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL266802A1 PL266802A1 (en) | 1988-06-09 |
| PL159183B1 true PL159183B1 (pl) | 1992-11-30 |
Family
ID=27487045
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL1987266802A PL159183B1 (pl) | 1986-07-14 | 1987-07-13 | Sposób wytwarzania polipeptydu podobnego do pollpeptydu naczelnych IL-3 PL PL PL |
Country Status (23)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US5639453A (pl) |
| EP (2) | EP0314705B2 (pl) |
| JP (2) | JP2642942B2 (pl) |
| KR (1) | KR970003518B1 (pl) |
| CN (1) | CN1023901C (pl) |
| AT (2) | ATE433487T1 (pl) |
| AU (1) | AU606881B2 (pl) |
| CA (1) | CA1341489C (pl) |
| CZ (1) | CZ531387A3 (pl) |
| DE (2) | DE3751677T3 (pl) |
| DK (1) | DK173278B1 (pl) |
| ES (1) | ES2007642A6 (pl) |
| FI (1) | FI104903B (pl) |
| GR (1) | GR871029B (pl) |
| HU (1) | HU212518B (pl) |
| MY (1) | MY101578A (pl) |
| NO (1) | NO175825C (pl) |
| NZ (1) | NZ221046A (pl) |
| OA (1) | OA09226A (pl) |
| PH (1) | PH26757A (pl) |
| PL (1) | PL159183B1 (pl) |
| PT (1) | PT85323B (pl) |
| WO (1) | WO1988000598A1 (pl) |
Families Citing this family (26)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| NZ222939A (en) * | 1986-12-16 | 1991-03-26 | Gist Brocades Nv | Human interleukin-3, production using genetic engineering methods, antibodies to human interleukin-3 and screening of dna library with 3' untranslated region |
| US6238889B1 (en) | 1986-12-16 | 2001-05-29 | Dsm N.V. | Molecular cloning and expression of the Pro8 isoform of human IL-3 |
| EP0790307A1 (en) * | 1986-12-16 | 1997-08-20 | Gist-Brocades B.V. | Molecular cloning and expression of human IL-3 |
| OA09736A (en) * | 1987-02-18 | 1993-11-30 | Schering Biotech Corp | "Human interleukin-3 and muteins thereof". |
| US5304637A (en) * | 1987-07-13 | 1994-04-19 | Gist-Brocades N.V. | Expression and purification of human interleukin-3 and muteins thereof |
| GB2210883B (en) * | 1987-10-08 | 1992-01-02 | British Bio Technology | Synthetic interleukin-3 gene |
| AU2800489A (en) * | 1987-12-02 | 1989-07-05 | Tyndale Plains-Hunter Ltd. | Hydrophilic polyurethanes of improved strength |
| US6384194B1 (en) | 1987-12-16 | 2002-05-07 | Dsm N.V. | Expression and purification of human interleukin-3 and muteins thereof |
| NZ232913A (en) * | 1989-03-15 | 1992-08-26 | Gist Brocades Nv | Il-3 produced recombinantly and purified to homogeneity; vectors and pharmaceutical preparations |
| US5516512A (en) * | 1989-08-14 | 1996-05-14 | Gist-Brocades, N.V. | N- and C-terminal truncation and deletion mutants of human interleukin-3 |
| EP0810285A3 (en) | 1989-08-14 | 1998-07-08 | Gist-Brocades B.V. | Mutants of human Interleukin-3 |
| US5738849A (en) * | 1992-11-24 | 1998-04-14 | G. D. Searle & Co. | Interleukin-3 (IL-3) variant fusion proteins, their recombinant production, and therapeutic compositions comprising them |
| US6153183A (en) * | 1992-11-24 | 2000-11-28 | G. D. Searle & Company | Co-administration of interleukin-3 mutant polypeptides with CSF's or cytokines for multi-lineage hematopoietic cell production |
| EP1361273A3 (en) * | 1992-11-24 | 2004-02-11 | G.D. Searle & Co. | Interleukin-3 (IL-3) multiple mutation polypeptides |
| US6403076B1 (en) | 1992-11-24 | 2002-06-11 | S. Christopher Bauer | Compositions for increasing hematopoiesis with interleukin-3 mutants |
| US6361976B1 (en) | 1992-11-24 | 2002-03-26 | S. Christopher Bauer | Co-administration of interleukin-3 mutant polypeptides with CSF'S for multi-lineage hematopoietic cell production |
| US5772992A (en) * | 1992-11-24 | 1998-06-30 | G.D. Searle & Co. | Compositions for co-administration of interleukin-3 mutants and other cytokines and hematopoietic factors |
| DE69432787D1 (de) * | 1993-01-15 | 2003-07-10 | Inst Genetics Llc | Klonierung von Enterokinase und Verfahren zu deren Verwendung |
| US6746859B1 (en) | 1993-01-15 | 2004-06-08 | Genetics Institute, Llc | Cloning of enterokinase and method of use |
| US5501962A (en) * | 1993-06-21 | 1996-03-26 | G. D. Searle & Co. | Interleuken-3 (IL-3) human/murine hybrid polypeptides and recombinant production of the same |
| US6017523A (en) * | 1995-06-06 | 2000-01-25 | G.D. Searle & Co. | Therapeutic methods employing mutant human interleukin-3 (IL-3) polypeptides |
| AU2359900A (en) * | 1998-12-23 | 2000-07-31 | Edib Korkut M.D. Ph.D. | Protection of hematopoietic cells by the induction of post-mitotic quiescence |
| WO2002044410A1 (en) * | 2000-11-28 | 2002-06-06 | Genaissance Pharmaceuticals, Inc. | Drug target isogenes: polymorphisms in the interleukin 3 (colony-stimulating factor, multiple) gene |
| WO2005025489A2 (en) * | 2003-05-09 | 2005-03-24 | Curagen Corporation | Therapeutic use of g53135-05(fgf-20) in radiation protection |
| US7597884B2 (en) | 2004-08-09 | 2009-10-06 | Alios Biopharma, Inc. | Hyperglycosylated polypeptide variants and methods of use |
| JP6087506B2 (ja) * | 2012-01-31 | 2017-03-01 | キヤノン株式会社 | 描画方法及び物品の製造方法 |
Family Cites Families (24)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| US21865A (en) * | 1858-10-19 | moeison | ||
| US885060A (en) * | 1907-04-13 | 1908-04-21 | Alfred Leatherman | Ratchet-cylinder pulley. |
| US893764A (en) * | 1907-05-20 | 1908-07-21 | Cable Co | Supporting means for swinging parts of musical instruments. |
| US916335A (en) * | 1908-05-08 | 1909-03-23 | Klamath River Gold Mining Co | Aerial tramway. |
| US4419446A (en) | 1980-12-31 | 1983-12-06 | The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services | Recombinant DNA process utilizing a papilloma virus DNA as a vector |
| IN159327B (pl) * | 1982-09-02 | 1987-05-02 | Smidth & Co As F L | |
| JPS5962335A (ja) * | 1982-09-30 | 1984-04-09 | Kawasaki Steel Corp | グレ−トキルン法によるepダストの予備焼成法 |
| US4518584A (en) | 1983-04-15 | 1985-05-21 | Cetus Corporation | Human recombinant interleukin-2 muteins |
| US4588684A (en) | 1983-04-26 | 1986-05-13 | Chiron Corporation | a-Factor and its processing signals |
| US4695542A (en) * | 1983-10-04 | 1987-09-22 | Dnax Research Institute Of Molecular And Cellular Biology, Inc. | cDNA clones coding for polypeptides exhibiting multi-lineage cellular growth factor activity |
| NZ210501A (en) | 1983-12-13 | 1991-08-27 | Kirin Amgen Inc | Erythropoietin produced by procaryotic or eucaryotic expression of an exogenous dna sequence |
| WO1985002863A1 (en) * | 1983-12-23 | 1985-07-04 | The Australian National University | CLONING OF cDNA AND EXPRESSION OF MURINE-INTERLEUKIN-3 |
| ZA848495B (en) | 1984-01-31 | 1985-09-25 | Idaho Res Found | Production of polypeptides in insect cells |
| US4658018A (en) * | 1984-03-13 | 1987-04-14 | Immunex Corporation | Process for producing homogeneous colony stimulating factor |
| JPS60207595A (ja) * | 1984-03-30 | 1985-10-19 | Ajinomoto Co Inc | ヒトインタ−ロイキン3の製造法 |
| JPS60207594A (ja) * | 1984-03-30 | 1985-10-19 | Ajinomoto Co Inc | ヒトインタ−ロイキン3の製造方法 |
| UA39161C2 (uk) | 1984-07-06 | 2001-06-15 | Новартіс Аг | Рекомбінантний білок gm-csf для збільшення продукції гранулоцитів і макрофагів у пацієнтів, вектор і кднк, що його кодують |
| EP0177343B1 (en) | 1984-10-05 | 1992-07-22 | Genentech, Inc. | Dna, cell cultures and methods for the secretion of heterologous proteins and periplasmic protein recovery |
| DE3785102T2 (de) | 1986-01-03 | 1993-07-22 | Genetics Inst | Verfahren zur herstellung von faktor-viii:c-typ-proteinen. |
| US4877729A (en) * | 1986-07-14 | 1989-10-31 | Genetics Institute, Inc. | Recombinant DNA encoding novel family of primate hematopoietic growth factors |
| EP0790307A1 (en) * | 1986-12-16 | 1997-08-20 | Gist-Brocades B.V. | Molecular cloning and expression of human IL-3 |
| NZ222939A (en) * | 1986-12-16 | 1991-03-26 | Gist Brocades Nv | Human interleukin-3, production using genetic engineering methods, antibodies to human interleukin-3 and screening of dna library with 3' untranslated region |
| AU1496688A (en) * | 1987-01-20 | 1988-08-10 | Immunex Corporation | Human interleukin-3 proteins |
| OA09736A (en) * | 1987-02-18 | 1993-11-30 | Schering Biotech Corp | "Human interleukin-3 and muteins thereof". |
-
1987
- 1987-06-30 GR GR871029A patent/GR871029B/el unknown
- 1987-07-03 CA CA000541215A patent/CA1341489C/en not_active Expired - Fee Related
- 1987-07-09 PH PH35515A patent/PH26757A/en unknown
- 1987-07-10 ES ES8702042A patent/ES2007642A6/es not_active Expired
- 1987-07-13 EP EP87905074A patent/EP0314705B2/en not_active Expired - Lifetime
- 1987-07-13 EP EP95108668A patent/EP0691403B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1987-07-13 AT AT95108668T patent/ATE433487T1/de not_active IP Right Cessation
- 1987-07-13 AT AT87905074T patent/ATE133182T1/de not_active IP Right Cessation
- 1987-07-13 DE DE3751677T patent/DE3751677T3/de not_active Expired - Lifetime
- 1987-07-13 DE DE3752394T patent/DE3752394D1/de not_active Expired - Lifetime
- 1987-07-13 WO PCT/US1987/001702 patent/WO1988000598A1/en not_active Ceased
- 1987-07-13 CZ CS875313A patent/CZ531387A3/cs unknown
- 1987-07-13 KR KR1019880700288A patent/KR970003518B1/ko not_active Expired - Lifetime
- 1987-07-13 PL PL1987266802A patent/PL159183B1/pl unknown
- 1987-07-13 MY MYPI87000992A patent/MY101578A/en unknown
- 1987-07-13 HU HU874240A patent/HU212518B/hu unknown
- 1987-07-13 NZ NZ221046A patent/NZ221046A/xx unknown
- 1987-07-13 AU AU77593/87A patent/AU606881B2/en not_active Expired
- 1987-07-13 JP JP62504556A patent/JP2642942B2/ja not_active Expired - Lifetime
- 1987-07-14 PT PT85323A patent/PT85323B/pt unknown
- 1987-07-14 CN CN87104815A patent/CN1023901C/zh not_active Expired - Lifetime
-
1988
- 1988-03-10 NO NO881073A patent/NO175825C/no not_active IP Right Cessation
- 1988-03-11 DK DK198801354A patent/DK173278B1/da not_active IP Right Cessation
-
1989
- 1989-01-12 FI FI890153A patent/FI104903B/fi not_active IP Right Cessation
- 1989-01-13 OA OA59507A patent/OA09226A/xx unknown
-
1995
- 1995-01-10 US US08/370,277 patent/US5639453A/en not_active Expired - Lifetime
- 1995-01-11 JP JP7002454A patent/JP2655591B2/ja not_active Expired - Lifetime
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US4959455A (en) | Primate hematopoietic growth factors IL-3 and pharmaceutical compositions | |
| AU606881B2 (en) | A novel family of primate hematopoietic growth factors | |
| US4877729A (en) | Recombinant DNA encoding novel family of primate hematopoietic growth factors | |
| AU637620B2 (en) | A human cytokine, interleukin-9 | |
| EP0494268B1 (en) | Method for inhibiting growth of stem cells | |
| DE69527041T2 (de) | Gleichzeitige verarbeitung von interleukin-3 mutanten und kolonie stimulierungsfactor | |
| US5573763A (en) | Family of CSF-l proteins | |
| PT85285B (pt) | Processo para a preparacao de interleuquina-6 e de composicoes farmaceuticas que a contem | |
| US6433142B1 (en) | Megakaryocyte stimulating factors | |
| EP0549711A1 (en) | Natural killer stimulatory factor | |
| US20040044186A1 (en) | Antibodies to natural killer stimulatory factor | |
| US5414071A (en) | Human cytokine IL-9 | |
| US6348191B1 (en) | Production and use of IL-6 | |
| WO1991002001A1 (en) | A megakaryocytopoietic factor | |
| KR970004941B1 (ko) | 신규 영장류 조혈 성장 인자족(family) 발현용 벡터 및 형질전환체 | |
| IE70605B1 (en) | A novel family of primate hematopoietic growth factors |