PL188738B1 - Rekombinowana muteina ludzkiej interleukiny-4, transformowana komórka, kompozycja farmaceutyczna, oczyszczona i wyizolowana sekwencja polinukleotydowa, komórka gospodarza eukariotycznego, zastosowanie kompozycji farmaceutycznej, test oraz rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4 - Google Patents
Rekombinowana muteina ludzkiej interleukiny-4, transformowana komórka, kompozycja farmaceutyczna, oczyszczona i wyizolowana sekwencja polinukleotydowa, komórka gospodarza eukariotycznego, zastosowanie kompozycji farmaceutycznej, test oraz rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4Info
- Publication number
- PL188738B1 PL188738B1 PL97331253A PL33125397A PL188738B1 PL 188738 B1 PL188738 B1 PL 188738B1 PL 97331253 A PL97331253 A PL 97331253A PL 33125397 A PL33125397 A PL 33125397A PL 188738 B1 PL188738 B1 PL 188738B1
- Authority
- PL
- Poland
- Prior art keywords
- mutein
- substitution
- recombinant human
- replacement
- leu
- Prior art date
Links
- 102000004388 Interleukin-4 Human genes 0.000 title claims abstract description 223
- 108090000978 Interleukin-4 Proteins 0.000 title claims abstract description 223
- 229940028885 interleukin-4 Drugs 0.000 title description 210
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims abstract description 64
- 101001002709 Homo sapiens Interleukin-4 Proteins 0.000 claims abstract description 50
- 102000055229 human IL4 Human genes 0.000 claims abstract description 50
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims abstract description 44
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 31
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 claims abstract description 30
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims abstract description 15
- 108091033319 polynucleotide Chemical group 0.000 claims abstract description 9
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 claims abstract description 9
- 239000002157 polynucleotide Chemical group 0.000 claims abstract description 9
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 claims description 35
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 claims description 25
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 23
- 125000003295 alanine group Chemical group N[C@@H](C)C(=O)* 0.000 claims description 23
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims description 21
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 claims description 21
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 17
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 17
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims description 14
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 14
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims description 13
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 9
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 9
- 206010020751 Hypersensitivity Diseases 0.000 claims description 7
- 230000007815 allergy Effects 0.000 claims description 7
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 7
- 208000006673 asthma Diseases 0.000 claims description 6
- 230000000172 allergic effect Effects 0.000 claims description 5
- 208000010668 atopic eczema Diseases 0.000 claims description 5
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 5
- 208000027866 inflammatory disease Diseases 0.000 claims description 5
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 4
- AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N isoleucine Natural products CCC(C)C(N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229960000310 isoleucine Drugs 0.000 claims description 4
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 4
- OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N tyrosine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 claims description 3
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 102220040112 rs587778184 Human genes 0.000 claims description 3
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 claims description 2
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims description 2
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 238000011067 equilibration Methods 0.000 claims description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000004474 valine Substances 0.000 claims description 2
- 125000000741 isoleucyl group Chemical group [H]N([H])C(C(C([H])([H])[H])C([H])([H])C([H])([H])[H])C(=O)O* 0.000 claims 2
- 125000000637 arginyl group Chemical group N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)* 0.000 claims 1
- 229940009098 aspartate Drugs 0.000 claims 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-L aspartate group Chemical group N[C@@H](CC(=O)[O-])C(=O)[O-] CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-L 0.000 claims 1
- 125000000404 glutamine group Chemical group N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)* 0.000 claims 1
- 125000000487 histidyl group Chemical group [H]N([H])C(C(=O)O*)C([H])([H])C1=C([H])N([H])C([H])=N1 0.000 claims 1
- 125000001909 leucine group Chemical group [H]N(*)C(C(*)=O)C([H])([H])C(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 claims 1
- 125000000341 threoninyl group Chemical group [H]OC([H])(C([H])([H])[H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 claims 1
- 125000001493 tyrosinyl group Chemical group [H]OC1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 claims 1
- 125000002987 valine group Chemical group [H]N([H])C([H])(C(*)=O)C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 claims 1
- 108040006852 interleukin-4 receptor activity proteins Proteins 0.000 abstract description 4
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 abstract 1
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 42
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 35
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 30
- 235000013351 cheese Nutrition 0.000 description 29
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 29
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 26
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 24
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 24
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 15
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 15
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N aspartic acid group Chemical group N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-N 0.000 description 14
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 13
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 13
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 12
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 12
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 12
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 12
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 11
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 11
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 10
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 10
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 10
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 9
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 9
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 9
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 8
- 102000003816 Interleukin-13 Human genes 0.000 description 8
- 108090000176 Interleukin-13 Proteins 0.000 description 8
- AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N L-threonine Chemical compound C[C@@H](O)[C@H](N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-GBXIJSLDSA-N 0.000 description 8
- OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N L-tyrosine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 OUYCCCASQSFEME-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 8
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 8
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 8
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 8
- 241000701161 unidentified adenovirus Species 0.000 description 8
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 7
- 108010076504 Protein Sorting Signals Proteins 0.000 description 7
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 7
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 6
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 6
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 6
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 6
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 6
- 108010050848 glycylleucine Proteins 0.000 description 6
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 6
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 6
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 6
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 5
- DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN DKEXFJVMVGETOO-LURJTMIESA-N 0.000 description 5
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 5
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 5
- 230000008485 antagonism Effects 0.000 description 5
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 5
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 5
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 5
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 5
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 5
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 5
- 239000002953 phosphate buffered saline Substances 0.000 description 5
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 5
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 4
- 241000238631 Hexapoda Species 0.000 description 4
- 102000010787 Interleukin-4 Receptors Human genes 0.000 description 4
- 108010038486 Interleukin-4 Receptors Proteins 0.000 description 4
- XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N L-Cysteine Chemical compound SC[C@H](N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-REOHCLBHSA-N 0.000 description 4
- AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N L-isoleucine Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(O)=O AGPKZVBTJJNPAG-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 4
- QUCDKEKDPYISNX-HJGDQZAQSA-N Lys-Asn-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O QUCDKEKDPYISNX-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 4
- RFCVXVPWSPOMFJ-STQMWFEESA-N Phe-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 RFCVXVPWSPOMFJ-STQMWFEESA-N 0.000 description 4
- 108010090804 Streptavidin Proteins 0.000 description 4
- LHEZGZQRLDBSRR-WDCWCFNPSA-N Thr-Glu-Leu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O LHEZGZQRLDBSRR-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 4
- ODXKUIGEPAGKKV-KATARQTJSA-N Thr-Leu-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)N)O ODXKUIGEPAGKKV-KATARQTJSA-N 0.000 description 4
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 4
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 4
- 235000003704 aspartic acid Nutrition 0.000 description 4
- OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N beta-carboxyaspartic acid Natural products OC(=O)C(N)C(C(O)=O)C(O)=O OQFSQFPPLPISGP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 230000006870 function Effects 0.000 description 4
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 4
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 4
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 4
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 4
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 4
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 4
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 4
- 108010073101 phenylalanylleucine Proteins 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 238000001525 receptor binding assay Methods 0.000 description 4
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 4
- 241000701447 unidentified baculovirus Species 0.000 description 4
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N Ala-Ala-Ser Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YYSWCHMLFJLLBJ-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- YNJBLTDKTMKEET-ZLUOBGJFSA-N Cys-Ser-Ser Chemical compound SC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O YNJBLTDKTMKEET-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 3
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 description 3
- QSDKBRMVXSWAQE-BFHQHQDPSA-N Gly-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)CN QSDKBRMVXSWAQE-BFHQHQDPSA-N 0.000 description 3
- 108010051696 Growth Hormone Proteins 0.000 description 3
- CTGZVVQVIBSOBB-AVGNSLFASA-N His-His-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O CTGZVVQVIBSOBB-AVGNSLFASA-N 0.000 description 3
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 3
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 3
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 3
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 3
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 3
- KDYPMIZMXDECSU-JYJNAYRXSA-N Phe-Leu-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 KDYPMIZMXDECSU-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 102100038803 Somatotropin Human genes 0.000 description 3
- 230000006052 T cell proliferation Effects 0.000 description 3
- IJKNKFJZOJCKRR-GBALPHGKSA-N Thr-Trp-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)[C@H](O)C)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)=CNC2=C1 IJKNKFJZOJCKRR-GBALPHGKSA-N 0.000 description 3
- 206010067584 Type 1 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 3
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 208000026935 allergic disease Diseases 0.000 description 3
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 238000001516 cell proliferation assay Methods 0.000 description 3
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 3
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 3
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 239000000122 growth hormone Substances 0.000 description 3
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 3
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 3
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 3
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 3
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 3
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 3
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 3
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 2
- DECCMEWNXSNSDO-ZLUOBGJFSA-N Ala-Cys-Ala Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DECCMEWNXSNSDO-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 2
- LJFNNUBZSZCZFN-WHFBIAKZSA-N Ala-Gly-Cys Chemical compound N[C@@H](C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O LJFNNUBZSZCZFN-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 2
- 208000002267 Anti-neutrophil cytoplasmic antibody-associated vasculitis Diseases 0.000 description 2
- DBKNLHKEVPZVQC-LPEHRKFASA-N Arg-Ala-Pro Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(O)=O DBKNLHKEVPZVQC-LPEHRKFASA-N 0.000 description 2
- OGUPCHKBOKJFMA-SRVKXCTJSA-N Arg-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N OGUPCHKBOKJFMA-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- HPSVTWMFWCHKFN-GARJFASQSA-N Arg-Glu-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O HPSVTWMFWCHKFN-GARJFASQSA-N 0.000 description 2
- UPKMBGAAEZGHOC-RWMBFGLXSA-N Arg-His-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CN=CN2)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N)C(=O)O UPKMBGAAEZGHOC-RWMBFGLXSA-N 0.000 description 2
- YBZMTKUDWXZLIX-UWVGGRQHSA-N Arg-Leu-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(O)=O YBZMTKUDWXZLIX-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 2
- DATSKXOXPUAOLK-KKUMJFAQSA-N Asn-Tyr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DATSKXOXPUAOLK-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- RYEWQKQXRJCHIO-SRVKXCTJSA-N Asp-Asn-Tyr Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 RYEWQKQXRJCHIO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- PXLNPFOJZQMXAT-BYULHYEWSA-N Asp-Asp-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O PXLNPFOJZQMXAT-BYULHYEWSA-N 0.000 description 2
- JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N Asp-Thr-Leu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O JSNWZMFSLIWAHS-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 101100069857 Caenorhabditis elegans hil-4 gene Proteins 0.000 description 2
- 101100177113 Caenorhabditis elegans his-74 gene Proteins 0.000 description 2
- 108010005939 Ciliary Neurotrophic Factor Proteins 0.000 description 2
- 102100031614 Ciliary neurotrophic factor Human genes 0.000 description 2
- 102100022641 Coagulation factor IX Human genes 0.000 description 2
- SZQCDCKIGWQAQN-FXQIFTODSA-N Cys-Arg-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O SZQCDCKIGWQAQN-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 241000233866 Fungi Species 0.000 description 2
- YKLNMGJYMNPBCP-ACZMJKKPSA-N Glu-Asn-Asp Chemical compound C(CC(=O)O)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC(=O)O)C(=O)O)N YKLNMGJYMNPBCP-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 2
- YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N Glu-Pro Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O YBTCBQBIJKGSJP-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 2
- DXMOIVCNJIJQSC-QEJZJMRPSA-N Glu-Trp-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N DXMOIVCNJIJQSC-QEJZJMRPSA-N 0.000 description 2
- JVWPPCWUDRJGAE-YUMQZZPRSA-N Gly-Asn-Leu Chemical compound [H]NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O JVWPPCWUDRJGAE-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 2
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 2
- KAXZXLSXFWSNNZ-XVYDVKMFSA-N His-Ser-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O KAXZXLSXFWSNNZ-XVYDVKMFSA-N 0.000 description 2
- 101000878605 Homo sapiens Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Proteins 0.000 description 2
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 2
- 108090001005 Interleukin-6 Proteins 0.000 description 2
- 102000015696 Interleukins Human genes 0.000 description 2
- 108010063738 Interleukins Proteins 0.000 description 2
- 208000008839 Kidney Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N L-alanine-L-arginine Natural products CC(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCNC(N)=N SITWEMZOJNKJCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ZTLGVASZOIKNIX-DCAQKATOSA-N Leu-Gln-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N ZTLGVASZOIKNIX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- FOBUGKUBUJOWAD-IHPCNDPISA-N Leu-Leu-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 FOBUGKUBUJOWAD-IHPCNDPISA-N 0.000 description 2
- OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N Leu-Lys-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O OVZLLFONXILPDZ-VOAKCMCISA-N 0.000 description 2
- HGLKOTPFWOMPOB-MEYUZBJRSA-N Leu-Thr-Tyr Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 HGLKOTPFWOMPOB-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 2
- 102100038007 Low affinity immunoglobulin epsilon Fc receptor Human genes 0.000 description 2
- IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N Lys-Asp-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IWWMPCPLFXFBAF-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 2
- KWUKZRFFKPLUPE-HJGDQZAQSA-N Lys-Asp-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KWUKZRFFKPLUPE-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 2
- GJJQCBVRWDGLMQ-GUBZILKMSA-N Lys-Glu-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O GJJQCBVRWDGLMQ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 2
- GOVDTWNJCBRRBJ-DCAQKATOSA-N Lys-Met-Asn Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N GOVDTWNJCBRRBJ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 2
- 241000829100 Macaca mulatta polyomavirus 1 Species 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- WTHGNAAQXISJHP-AVGNSLFASA-N Met-Lys-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O WTHGNAAQXISJHP-AVGNSLFASA-N 0.000 description 2
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 2
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 2
- WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N N-L-alanyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)C)C(O)=O)=CNC2=C1 WUGMRIBZSVSJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108700026244 Open Reading Frames Proteins 0.000 description 2
- JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N Penicillin G Chemical compound N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 JGSARLDLIJGVTE-MBNYWOFBSA-N 0.000 description 2
- LGBVMDMZZFYSFW-HJWJTTGWSA-N Phe-Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC1=CC=CC=C1)N LGBVMDMZZFYSFW-HJWJTTGWSA-N 0.000 description 2
- SWCOXQLDICUYOL-ULQDDVLXSA-N Phe-His-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O SWCOXQLDICUYOL-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 2
- LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N Phe-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)Cc1ccccc1)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(O)=O LRBSWBVUCLLRLU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 2
- FSXRLASFHBWESK-HOTGVXAUSA-N Phe-Tyr Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-HOTGVXAUSA-N 0.000 description 2
- APKRGYLBSCWJJP-FXQIFTODSA-N Pro-Ala-Asp Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O APKRGYLBSCWJJP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- KWMZPPWYBVZIER-XGEHTFHBSA-N Pro-Ser-Thr Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KWMZPPWYBVZIER-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 2
- IALSFJSONJZBKB-HRCADAONSA-N Pro-Tyr-Pro Chemical compound C1C[C@H](NC1)C(=O)N[C@@H](CC2=CC=C(C=C2)O)C(=O)N3CCC[C@@H]3C(=O)O IALSFJSONJZBKB-HRCADAONSA-N 0.000 description 2
- 241000125945 Protoparvovirus Species 0.000 description 2
- 239000012980 RPMI-1640 medium Substances 0.000 description 2
- 206010038389 Renal cancer Diseases 0.000 description 2
- 229920002684 Sepharose Polymers 0.000 description 2
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 2
- UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M Sodium bicarbonate Chemical compound [Na+].OC([O-])=O UIIMBOGNXHQVGW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 241000256251 Spodoptera frugiperda Species 0.000 description 2
- DHPPWTOLRWYIDS-XKBZYTNZSA-N Thr-Cys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O DHPPWTOLRWYIDS-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 2
- HJOSVGCWOTYJFG-WDCWCFNPSA-N Thr-Glu-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O HJOSVGCWOTYJFG-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 2
- DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N Trifluoroacetic acid Chemical compound OC(=O)C(F)(F)F DTQVDTLACAAQTR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007983 Tris buffer Substances 0.000 description 2
- RPVDDQYNBOVWLR-HOCLYGCPSA-N Trp-Gly-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RPVDDQYNBOVWLR-HOCLYGCPSA-N 0.000 description 2
- HSVPZJLMPLMPOX-BPNCWPANSA-N Tyr-Arg-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O HSVPZJLMPLMPOX-BPNCWPANSA-N 0.000 description 2
- CYDVHRFXDMDMGX-KKUMJFAQSA-N Tyr-Asn-His Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N)O CYDVHRFXDMDMGX-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- AUEJLPRZGVVDNU-STQMWFEESA-N Tyr-Leu Chemical group CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 AUEJLPRZGVVDNU-STQMWFEESA-N 0.000 description 2
- NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N Tyr-Ser-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 NHOVZGFNTGMYMI-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 2
- ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N Uracil Chemical compound O=C1C=CNC(=O)N1 ISAKRJDGNUQOIC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CXWJFWAZIVWBOS-XQQFMLRXSA-N Val-Lys-Pro Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N1CCC[C@@H]1C(=O)O)N CXWJFWAZIVWBOS-XQQFMLRXSA-N 0.000 description 2
- DEGUERSKQBRZMZ-FXQIFTODSA-N Val-Ser-Ala Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O DEGUERSKQBRZMZ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 2
- 108010000134 Vascular Cell Adhesion Molecule-1 Proteins 0.000 description 2
- 102100023543 Vascular cell adhesion protein 1 Human genes 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 108010078114 alanyl-tryptophyl-alanine Proteins 0.000 description 2
- 108010047495 alanylglycine Proteins 0.000 description 2
- 108010050025 alpha-glutamyltryptophan Proteins 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 108010038850 arginyl-isoleucyl-tyrosine Proteins 0.000 description 2
- 108010043240 arginyl-leucyl-glycine Proteins 0.000 description 2
- 108010093581 aspartyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 2
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000002131 composite material Substances 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 2
- ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N cyanogen bromide Chemical compound BrC#N ATDGTVJJHBUTRL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000002950 deficient Effects 0.000 description 2
- FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N dipeptide phenylalanyl-tyrosine Natural products C=1C=C(O)C=CC=1CC(C(O)=O)NC(=O)C(N)CC1=CC=CC=C1 FSXRLASFHBWESK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 210000003527 eukaryotic cell Anatomy 0.000 description 2
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 2
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 2
- YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N glycylglycine Chemical compound [NH3+]CC(=O)NCC([O-])=O YMAWOPBAYDPSLA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000012010 growth Effects 0.000 description 2
- 239000003102 growth factor Substances 0.000 description 2
- 108010025306 histidylleucine Proteins 0.000 description 2
- 230000002519 immonomodulatory effect Effects 0.000 description 2
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 2
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 2
- 229940047124 interferons Drugs 0.000 description 2
- 108040006849 interleukin-2 receptor activity proteins Proteins 0.000 description 2
- 229940047122 interleukins Drugs 0.000 description 2
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 2
- 201000010982 kidney cancer Diseases 0.000 description 2
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 2
- 108010009298 lysylglutamic acid Proteins 0.000 description 2
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 2
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 2
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 2
- 201000006417 multiple sclerosis Diseases 0.000 description 2
- 238000002703 mutagenesis Methods 0.000 description 2
- 231100000350 mutagenesis Toxicity 0.000 description 2
- 230000004983 pleiotropic effect Effects 0.000 description 2
- 230000010287 polarization Effects 0.000 description 2
- 108010077112 prolyl-proline Proteins 0.000 description 2
- 108010004914 prolylarginine Proteins 0.000 description 2
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- 230000000284 resting effect Effects 0.000 description 2
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 2
- 206010039073 rheumatoid arthritis Diseases 0.000 description 2
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 2
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 2
- 238000010572 single replacement reaction Methods 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 2
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 2
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 2
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 2
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001430294 unidentified retrovirus Species 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N (2s)-1-[(2s)-2-[[(2s)-2-amino-4-methylpentanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]pyrrolidine-2-carboxylic acid Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 1-prop-2-ynoxypropan-2-ol Chemical compound CC(O)COCC#C GZCWLCBFPRFLKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WEEMDRWIKYCTQM-UHFFFAOYSA-N 2,6-dimethoxybenzenecarbothioamide Chemical compound COC1=CC=CC(OC)=C1C(N)=S WEEMDRWIKYCTQM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KZDCMKVLEYCGQX-UDPGNSCCSA-N 2-(diethylamino)ethyl 4-aminobenzoate;(2s,5r,6r)-3,3-dimethyl-7-oxo-6-[(2-phenylacetyl)amino]-4-thia-1-azabicyclo[3.2.0]heptane-2-carboxylic acid;hydrate Chemical compound O.CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1.N([C@H]1[C@H]2SC([C@@H](N2C1=O)C(O)=O)(C)C)C(=O)CC1=CC=CC=C1 KZDCMKVLEYCGQX-UDPGNSCCSA-N 0.000 description 1
- 102000013563 Acid Phosphatase Human genes 0.000 description 1
- 108010051457 Acid Phosphatase Proteins 0.000 description 1
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 1
- JBVSSSZFNTXJDX-YTLHQDLWSA-N Ala-Ala-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)N JBVSSSZFNTXJDX-YTLHQDLWSA-N 0.000 description 1
- HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N Ala-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(N)=O HJCMDXDYPOUFDY-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- RXTBLQVXNIECFP-FXQIFTODSA-N Ala-Gln-Gln Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O RXTBLQVXNIECFP-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PCIFXPRIFWKWLK-YUMQZZPRSA-N Ala-Gly-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CNC(=O)[C@H](C)N PCIFXPRIFWKWLK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- IETUUAHKCHOQHP-KZVJFYERSA-N Ala-Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@H](C)N)[C@@H](C)O)C(O)=O IETUUAHKCHOQHP-KZVJFYERSA-N 0.000 description 1
- ZVWXMTTZJKBJCI-BHDSKKPTSA-N Ala-Trp-Ala Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)=CNC2=C1 ZVWXMTTZJKBJCI-BHDSKKPTSA-N 0.000 description 1
- XSLGWYYNOSUMRM-ZKWXMUAHSA-N Ala-Val-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O XSLGWYYNOSUMRM-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 1
- 108010005853 Anti-Mullerian Hormone Proteins 0.000 description 1
- OLDOLPWZEMHNIA-PJODQICGSA-N Arg-Ala-Trp Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=C1C=CC=C2)C(O)=O OLDOLPWZEMHNIA-PJODQICGSA-N 0.000 description 1
- IGULQRCJLQQPSM-DCAQKATOSA-N Arg-Cys-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O IGULQRCJLQQPSM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- UZGFHWIJWPUPOH-IHRRRGAJSA-N Arg-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)N UZGFHWIJWPUPOH-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- UGZUVYDKAYNCII-ULQDDVLXSA-N Arg-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O UGZUVYDKAYNCII-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- ISVACHFCVRKIDG-SRVKXCTJSA-N Arg-Val-Arg Chemical compound NC(N)=NCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(O)=O ISVACHFCVRKIDG-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SPIPSJXLZVTXJL-ZLUOBGJFSA-N Asn-Cys-Ser Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O SPIPSJXLZVTXJL-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N Asn-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O HXWUJJADFMXNKA-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- HZZIFFOVHLWGCS-KKUMJFAQSA-N Asn-Phe-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O HZZIFFOVHLWGCS-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- KYQJHBWHRASMKG-ZLUOBGJFSA-N Asn-Ser-Cys Chemical compound NC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O KYQJHBWHRASMKG-ZLUOBGJFSA-N 0.000 description 1
- MYTHOBCLNIOFBL-SRVKXCTJSA-N Asn-Ser-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O MYTHOBCLNIOFBL-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- XOQYDFCQPWAMSA-KKHAAJSZSA-N Asn-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XOQYDFCQPWAMSA-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- QHAJMRDEWNAIBQ-FXQIFTODSA-N Asp-Arg-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O QHAJMRDEWNAIBQ-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- PYXXJFRXIYAESU-PCBIJLKTSA-N Asp-Ile-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O PYXXJFRXIYAESU-PCBIJLKTSA-N 0.000 description 1
- SPWXXPFDTMYTRI-IUKAMOBKSA-N Asp-Ile-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SPWXXPFDTMYTRI-IUKAMOBKSA-N 0.000 description 1
- WOKXEQLPBLLWHC-IHRRRGAJSA-N Asp-Tyr-Met Chemical compound CSCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 WOKXEQLPBLLWHC-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 description 1
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 1
- 108091003079 Bovine Serum Albumin Proteins 0.000 description 1
- 241000701822 Bovine papillomavirus Species 0.000 description 1
- 102100021943 C-C motif chemokine 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710155857 C-C motif chemokine 2 Proteins 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 241000282552 Chlorocebus aethiops Species 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- 241000699802 Cricetulus griseus Species 0.000 description 1
- RRJOQIBQVZDVCW-SRVKXCTJSA-N Cys-His-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](CS)N RRJOQIBQVZDVCW-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NXTYATMDWQYLGJ-BQBZGAKWSA-N Cys-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CS NXTYATMDWQYLGJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- XBELMDARIGXDKY-GUBZILKMSA-N Cys-Pro-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](CS)N XBELMDARIGXDKY-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IWVNIQXKTIQXCT-SRVKXCTJSA-N Cys-Tyr-Asn Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N)O IWVNIQXKTIQXCT-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- LPBUBIHAVKXUOT-FXQIFTODSA-N Cys-Val-Ser Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N LPBUBIHAVKXUOT-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 201000003883 Cystic fibrosis Diseases 0.000 description 1
- 241000701022 Cytomegalovirus Species 0.000 description 1
- 238000001712 DNA sequencing Methods 0.000 description 1
- 241000450599 DNA viruses Species 0.000 description 1
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 1
- 241000702421 Dependoparvovirus Species 0.000 description 1
- 102100024746 Dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 1
- 102000016607 Diphtheria Toxin Human genes 0.000 description 1
- 108010053187 Diphtheria Toxin Proteins 0.000 description 1
- 101710091045 Envelope protein Proteins 0.000 description 1
- 241000701959 Escherichia virus Lambda Species 0.000 description 1
- 241001524679 Escherichia virus M13 Species 0.000 description 1
- 108010076282 Factor IX Proteins 0.000 description 1
- PZVJDMJHKUWSIV-AVGNSLFASA-N Gln-Cys-Tyr Chemical compound C1=CC(=CC=C1C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)O PZVJDMJHKUWSIV-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- BYKZWDGMJLNFJY-XKBZYTNZSA-N Gln-Ser-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCC(=O)N)N)O BYKZWDGMJLNFJY-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- SZXSSXUNOALWCH-ACZMJKKPSA-N Glu-Ala-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SZXSSXUNOALWCH-ACZMJKKPSA-N 0.000 description 1
- TUTIHHSZKFBMHM-WHFBIAKZSA-N Glu-Asn Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O TUTIHHSZKFBMHM-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- LVCHEMOPBORRLB-DCAQKATOSA-N Glu-Gln-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](NC(=O)[C@H](CCC(N)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)C(O)=O LVCHEMOPBORRLB-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N Glu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O NJCALAAIGREHDR-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- BCYGDJXHAGZNPQ-DCAQKATOSA-N Glu-Lys-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O BCYGDJXHAGZNPQ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- AQNYKMCFCCZEEL-JYJNAYRXSA-N Glu-Lys-Tyr Chemical compound OC(=O)CC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 AQNYKMCFCCZEEL-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- SWDNPSMMEWRNOH-HJGDQZAQSA-N Glu-Pro-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O SWDNPSMMEWRNOH-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- CQGBSALYGOXQPE-HTUGSXCWSA-N Glu-Thr-Phe Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O CQGBSALYGOXQPE-HTUGSXCWSA-N 0.000 description 1
- JVACNFOPSUPDTK-QWRGUYRKSA-N Gly-Asn-Phe Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JVACNFOPSUPDTK-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- XLFHCWHXKSFVIB-BQBZGAKWSA-N Gly-Gln-Gln Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O XLFHCWHXKSFVIB-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N Gly-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)CN KGVHCTWYMPWEGN-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- GLACUWHUYFBSPJ-FJXKBIBVSA-N Gly-Pro-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)CN GLACUWHUYFBSPJ-FJXKBIBVSA-N 0.000 description 1
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 1
- 102000009465 Growth Factor Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010009202 Growth Factor Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102100036242 HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain Human genes 0.000 description 1
- IDNNYVGVSZMQTK-IHRRRGAJSA-N His-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC2=CN=CN2)C(=O)O)N IDNNYVGVSZMQTK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- CZVQSYNVUHAILZ-UWVGGRQHSA-N His-Lys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 CZVQSYNVUHAILZ-UWVGGRQHSA-N 0.000 description 1
- LYDKQVYYCMYNMC-SRVKXCTJSA-N His-Lys-Cys Chemical compound NCCCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 LYDKQVYYCMYNMC-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 1
- 101000993364 Homo sapiens Ciliary neurotrophic factor Proteins 0.000 description 1
- 101000930801 Homo sapiens HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain Proteins 0.000 description 1
- 101001033279 Homo sapiens Interleukin-3 Proteins 0.000 description 1
- CSQNHSGHAPRGPQ-YTFOTSKYSA-N Ile-Ile-Lys Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N CSQNHSGHAPRGPQ-YTFOTSKYSA-N 0.000 description 1
- YBHKCXNNNVDYEB-SPOWBLRKSA-N Ile-Trp-Ser Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)N YBHKCXNNNVDYEB-SPOWBLRKSA-N 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 108010064593 Intercellular Adhesion Molecule-1 Proteins 0.000 description 1
- 102100037877 Intercellular adhesion molecule 1 Human genes 0.000 description 1
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 description 1
- 108090000467 Interferon-beta Proteins 0.000 description 1
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 1
- 102000003814 Interleukin-10 Human genes 0.000 description 1
- 108090000174 Interleukin-10 Proteins 0.000 description 1
- 102000004559 Interleukin-13 Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108010017511 Interleukin-13 Receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000003812 Interleukin-15 Human genes 0.000 description 1
- 108090000172 Interleukin-15 Proteins 0.000 description 1
- 108010002386 Interleukin-3 Proteins 0.000 description 1
- 102000000646 Interleukin-3 Human genes 0.000 description 1
- 108010002586 Interleukin-7 Proteins 0.000 description 1
- 102000000704 Interleukin-7 Human genes 0.000 description 1
- 108010002335 Interleukin-9 Proteins 0.000 description 1
- 102000000585 Interleukin-9 Human genes 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N L-Proline Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- 229930182816 L-glutamine Natural products 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N L-isoleucyl-L-alanine Natural products CCC(C)C(N)C(=O)NC(C)C(O)=O RCFDOSNHHZGBOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N L-phenylalanine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 COLNVLDHVKWLRT-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- 125000000174 L-prolyl group Chemical group [H]N1C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[C@@]1([H])C(*)=O 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 206010024229 Leprosy Diseases 0.000 description 1
- GRZSCTXVCDUIPO-SRVKXCTJSA-N Leu-Arg-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O GRZSCTXVCDUIPO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- UILIPCLTHRPCRB-XUXIUFHCSA-N Leu-Arg-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(C)C)N UILIPCLTHRPCRB-XUXIUFHCSA-N 0.000 description 1
- MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N Leu-Asn Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O MLTRLIITQPXHBJ-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- YKNBJXOJTURHCU-DCAQKATOSA-N Leu-Asp-Arg Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YKNBJXOJTURHCU-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O DLCOFDAHNMMQPP-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N Leu-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O NFNVDJGXRFEYTK-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- YVKSMSDXKMSIRX-GUBZILKMSA-N Leu-Glu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O YVKSMSDXKMSIRX-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- OXRLYTYUXAQTHP-YUMQZZPRSA-N Leu-Gly-Ala Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](C)C(O)=O OXRLYTYUXAQTHP-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N Leu-Leu-Pro Natural products CC(C)CC(N)C(=O)NC(CC(C)C)C(=O)N1CCCC1C(O)=O XVZCXCTYGHPNEM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N Leu-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IEWBEPKLKUXQBU-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- LVTJJOJKDCVZGP-QWRGUYRKSA-N Leu-Lys-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)NCC(O)=O LVTJJOJKDCVZGP-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- LFSQWRSVPNKJGP-WDCWCFNPSA-N Leu-Thr-Glu Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCC(O)=O LFSQWRSVPNKJGP-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- AIQWYVFNBNNOLU-RHYQMDGZSA-N Leu-Thr-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O AIQWYVFNBNNOLU-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- CNWDWAMPKVYJJB-NUTKFTJISA-N Leu-Trp-Ala Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(O)=O)=CNC2=C1 CNWDWAMPKVYJJB-NUTKFTJISA-N 0.000 description 1
- 208000016604 Lyme disease Diseases 0.000 description 1
- 241000763212 Lype Species 0.000 description 1
- QBGPXOGXCVKULO-BQBZGAKWSA-N Lys-Cys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CS)C(O)=O QBGPXOGXCVKULO-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N Lys-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O WGLAORUKDGRINI-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N Lys-Gly Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O HGNRJCINZYHNOU-LURJTMIESA-N 0.000 description 1
- FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N Lys-Gly-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O FHIAJWBDZVHLAH-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- CNGOEHJCLVCJHN-SRVKXCTJSA-N Lys-Pro-Glu Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O CNGOEHJCLVCJHN-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N Lys-Thr Chemical compound C[C@@H](O)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CCCCN ZOKVLMBYDSIDKG-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N Lys-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RPWTZTBIFGENIA-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- ZNAPAUSAUBHENO-IHPCNDPISA-N Lys-Trp-His Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC3=CN=CN3)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCCN)N ZNAPAUSAUBHENO-IHPCNDPISA-N 0.000 description 1
- 102000043131 MHC class II family Human genes 0.000 description 1
- 108091054438 MHC class II family Proteins 0.000 description 1
- QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N Met-Gly Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)NCC(O)=O QXOHLNCNYLGICT-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- 125000001429 N-terminal alpha-amino-acid group Chemical group 0.000 description 1
- BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N Nalpha-L-Leucyl-L-tryptophan Natural products C1=CC=C2C(CC(NC(=O)C(N)CC(C)C)C(O)=O)=CNC2=C1 BQVUABVGYYSDCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 208000015914 Non-Hodgkin lymphomas Diseases 0.000 description 1
- BJEYSVHMGIJORT-NHCYSSNCSA-N Phe-Ala-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 BJEYSVHMGIJORT-NHCYSSNCSA-N 0.000 description 1
- CDQCFGOQNYOICK-IHRRRGAJSA-N Phe-Glu-Gln Chemical compound NC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 CDQCFGOQNYOICK-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N Phe-Gly-Gly Chemical compound OC(=O)CNC(=O)CNC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=CC=C1 NAXPHWZXEXNDIW-JTQLQIEISA-N 0.000 description 1
- OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N Phe-His Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1N=CNC=1)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 OHUXOEXBXPZKPT-STQMWFEESA-N 0.000 description 1
- BNRFQGLWLQESBG-YESZJQIVSA-N Phe-Lys-Pro Chemical compound C1C[C@@H](N(C1)C(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)O BNRFQGLWLQESBG-YESZJQIVSA-N 0.000 description 1
- APMXLWHMIVWLLR-BZSNNMDCSA-N Phe-Tyr-Ser Chemical compound C([C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC=1C=CC(O)=CC=1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)C1=CC=CC=C1 APMXLWHMIVWLLR-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- FXEKNHAJIMHRFJ-ULQDDVLXSA-N Phe-Val-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N FXEKNHAJIMHRFJ-ULQDDVLXSA-N 0.000 description 1
- 102220489100 Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform_N89L_mutation Human genes 0.000 description 1
- 102000004861 Phosphoric Diester Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- 108090001050 Phosphoric Diester Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 1
- 108010021757 Polynucleotide 5'-Hydroxyl-Kinase Proteins 0.000 description 1
- 102000008422 Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase Human genes 0.000 description 1
- RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N Pro-Pro Chemical compound OC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H]1NCCC1 RWCOTTLHDJWHRS-YUMQZZPRSA-N 0.000 description 1
- WVXQQUWOKUZIEG-VEVYYDQMSA-N Pro-Thr-Asn Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O WVXQQUWOKUZIEG-VEVYYDQMSA-N 0.000 description 1
- MDAWMJUZHBQTBO-XGEHTFHBSA-N Pro-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1)O MDAWMJUZHBQTBO-XGEHTFHBSA-N 0.000 description 1
- IIRBTQHFVNGPMQ-AVGNSLFASA-N Pro-Val-Lys Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@@H]1CCCN1 IIRBTQHFVNGPMQ-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N Proline Natural products OC(=O)C1CCCN1 ONIBWKKTOPOVIA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000001253 Protein Kinase Human genes 0.000 description 1
- 101710188315 Protein X Proteins 0.000 description 1
- 241000589516 Pseudomonas Species 0.000 description 1
- 201000004681 Psoriasis Diseases 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- IDCKUIWEIZYVSO-WFBYXXMGSA-N Ser-Ala-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CO)C)C(O)=O)=CNC2=C1 IDCKUIWEIZYVSO-WFBYXXMGSA-N 0.000 description 1
- UICKAKRRRBTILH-GUBZILKMSA-N Ser-Glu-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CO)N UICKAKRRRBTILH-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N Ser-Leu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O MUJQWSAWLLRJCE-KATARQTJSA-N 0.000 description 1
- 241000700584 Simplexvirus Species 0.000 description 1
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 description 1
- 102100021696 Syncytin-1 Human genes 0.000 description 1
- PZVGOVRNGKEFCB-KKHAAJSZSA-N Thr-Asn-Val Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)O)N)O PZVGOVRNGKEFCB-KKHAAJSZSA-N 0.000 description 1
- LCCSEJSPBWKBNT-OSUNSFLBSA-N Thr-Ile-Met Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)N LCCSEJSPBWKBNT-OSUNSFLBSA-N 0.000 description 1
- BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N Thr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O BQBCIBCLXBKYHW-CSMHCCOUSA-N 0.000 description 1
- IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N Thr-Leu-Asn Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O IMDMLDSVUSMAEJ-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- RRRRCRYTLZVCEN-HJGDQZAQSA-N Thr-Leu-Asp Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O RRRRCRYTLZVCEN-HJGDQZAQSA-N 0.000 description 1
- VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N Thr-Leu-Glu Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O VTVVYQOXJCZVEB-WDCWCFNPSA-N 0.000 description 1
- MECLEFZMPPOEAC-VOAKCMCISA-N Thr-Leu-Lys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)N)O MECLEFZMPPOEAC-VOAKCMCISA-N 0.000 description 1
- JAWUQFCGNVEDRN-MEYUZBJRSA-N Thr-Tyr-Leu Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(C=C1)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)O)N)O JAWUQFCGNVEDRN-MEYUZBJRSA-N 0.000 description 1
- CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N Thr-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C([O-])=O)NC(=O)[C@@H]([NH3+])[C@@H](C)O CKHWEVXPLJBEOZ-VQVTYTSYSA-N 0.000 description 1
- CURFABYITJVKEW-QTKMDUPCSA-N Thr-Val-His Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N)O CURFABYITJVKEW-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N Thr-Val-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O KZTLZZQTJMCGIP-ZJDVBMNYSA-N 0.000 description 1
- 108010022394 Threonine synthase Proteins 0.000 description 1
- KZIQDVNORJKTMO-WDSOQIARSA-N Trp-Arg-His Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)N[C@@H](CC3=CN=CN3)C(=O)O)N KZIQDVNORJKTMO-WDSOQIARSA-N 0.000 description 1
- AWEGFIJXYWGBCA-XIRDDKMYSA-N Trp-His-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(=C1)C(=CN2)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC3=CN=CN3)C(=O)N[C@@H](CC(=O)N)C(=O)O)N AWEGFIJXYWGBCA-XIRDDKMYSA-N 0.000 description 1
- LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N Trp-Leu Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)=CNC2=C1 LYMVXFSTACVOLP-ZFWWWQNUSA-N 0.000 description 1
- MYVYPSWUSKCCHG-JQWIXIFHSA-N Trp-Ser Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)=CNC2=C1 MYVYPSWUSKCCHG-JQWIXIFHSA-N 0.000 description 1
- KBKTUNYBNJWFRL-UBHSHLNASA-N Trp-Ser-Asn Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O)=CNC2=C1 KBKTUNYBNJWFRL-UBHSHLNASA-N 0.000 description 1
- JRXKIVGWMMIIOF-YDHLFZDLSA-N Tyr-Asn-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)N)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N JRXKIVGWMMIIOF-YDHLFZDLSA-N 0.000 description 1
- OGPKMBOPMDTEDM-IHRRRGAJSA-N Tyr-Met-Ser Chemical compound CSCC[C@@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)N OGPKMBOPMDTEDM-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- WITCOKQIPFWQQD-FSPLSTOPSA-N Val-Asn Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CC(N)=O WITCOKQIPFWQQD-FSPLSTOPSA-N 0.000 description 1
- YLHLNFUXDBOAGX-DCAQKATOSA-N Val-Cys-His Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)O)N YLHLNFUXDBOAGX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- PTFPUAXGIKTVNN-ONGXEEELSA-N Val-His-Gly Chemical compound CC(C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CN=CN1)C(=O)NCC(=O)O)N PTFPUAXGIKTVNN-ONGXEEELSA-N 0.000 description 1
- ZIGZPYJXIWLQFC-QTKMDUPCSA-N Val-His-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CN=CN1)NC(=O)[C@H](C(C)C)N)O ZIGZPYJXIWLQFC-QTKMDUPCSA-N 0.000 description 1
- OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N Val-Leu-Arg Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCN=C(N)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N OTJMMKPMLUNTQT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- IJGPOONOTBNTFS-GVXVVHGQSA-N Val-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O IJGPOONOTBNTFS-GVXVVHGQSA-N 0.000 description 1
- SIIZPVYVXNXXQG-KGXOGWRBSA-N [(2r,3r,4r,5r)-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-[[(3s,4r)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2r,4r,5r)-2-(6-aminopurin-9-yl)-4-hydroxy-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers C1=NC2=C(N)N=CN=C2N1[C@@H]1O[C@H](COP(O)(=O)OC2[C@@H](O[C@H](COP(O)(O)=O)[C@H]2O)N2C3=NC=NC(N)=C3N=C2)[C@@H](O)[C@H]1OP(O)(=O)OCC([C@@H](O)[C@H]1O)OC1N1C(N=CN=C2N)=C2N=C1 SIIZPVYVXNXXQG-KGXOGWRBSA-N 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 1
- 230000008484 agonism Effects 0.000 description 1
- 150000001294 alanine derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000012867 alanine scanning Methods 0.000 description 1
- 108010069020 alanyl-prolyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010044940 alanylglutamine Proteins 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 230000003042 antagnostic effect Effects 0.000 description 1
- 239000000868 anti-mullerian hormone Substances 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 1
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 1
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 1
- 108010036533 arginylvaline Proteins 0.000 description 1
- 108010077245 asparaginyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 230000001363 autoimmune Effects 0.000 description 1
- 108010058966 bacteriophage T7 induced DNA polymerase Proteins 0.000 description 1
- 210000003651 basophil Anatomy 0.000 description 1
- 238000004166 bioassay Methods 0.000 description 1
- 230000003115 biocidal effect Effects 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 238000006664 bond formation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 208000015100 cartilage disease Diseases 0.000 description 1
- 125000002091 cationic group Chemical group 0.000 description 1
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 1
- 230000003915 cell function Effects 0.000 description 1
- BJDCWCLMFKKGEE-CMDXXVQNSA-N chembl252518 Chemical compound C([C@@](OO1)(C)O2)C[C@H]3[C@H](C)CC[C@@H]4[C@@]31[C@@H]2O[C@H](O)[C@@H]4C BJDCWCLMFKKGEE-CMDXXVQNSA-N 0.000 description 1
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 1
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 description 1
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 1
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 230000027326 copulation Effects 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 1
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 1
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 1
- 239000013078 crystal Substances 0.000 description 1
- 208000035250 cutaneous malignant susceptibility to 1 melanoma Diseases 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 108010060199 cysteinylproline Proteins 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001627 detrimental effect Effects 0.000 description 1
- 238000011161 development Methods 0.000 description 1
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 1
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 1
- 102000004419 dihydrofolate reductase Human genes 0.000 description 1
- 108020001096 dihydrofolate reductase Proteins 0.000 description 1
- LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I dipotassium trisodium dihydrogen phosphate hydrogen phosphate dichloride Chemical compound P(=O)(O)(O)[O-].[K+].P(=O)(O)([O-])[O-].[Na+].[Na+].[Cl-].[K+].[Cl-].[Na+] LOKCTEFSRHRXRJ-UHFFFAOYSA-I 0.000 description 1
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 1
- 230000003511 endothelial effect Effects 0.000 description 1
- 210000003038 endothelium Anatomy 0.000 description 1
- 239000002158 endotoxin Substances 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 210000000416 exudates and transudate Anatomy 0.000 description 1
- 229960004222 factor ix Drugs 0.000 description 1
- 239000012091 fetal bovine serum Substances 0.000 description 1
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 1
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 102000034238 globular proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091005896 globular proteins Proteins 0.000 description 1
- 108010049041 glutamylalanine Proteins 0.000 description 1
- 230000002414 glycolytic effect Effects 0.000 description 1
- VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N glycyl-DL-alpha-alanine Natural products OC(=O)C(C)NC(=O)CN VPZXBVLAVMBEQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009036 growth inhibition Effects 0.000 description 1
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 description 1
- 208000009429 hemophilia B Diseases 0.000 description 1
- 210000003494 hepatocyte Anatomy 0.000 description 1
- 238000005734 heterodimerization reaction Methods 0.000 description 1
- 210000003630 histaminocyte Anatomy 0.000 description 1
- 108010036413 histidylglycine Proteins 0.000 description 1
- 108010028295 histidylhistidine Proteins 0.000 description 1
- 108010092114 histidylphenylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010085325 histidylproline Proteins 0.000 description 1
- 102000055276 human IL3 Human genes 0.000 description 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000003917 human chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 210000005104 human peripheral blood lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 1
- 208000026278 immune system disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 1
- 230000006054 immunological memory Effects 0.000 description 1
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 description 1
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 description 1
- 230000002584 immunomodulator Effects 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 230000028709 inflammatory response Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 238000002743 insertional mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 1
- 230000017307 interleukin-4 production Effects 0.000 description 1
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 1
- 238000007918 intramuscular administration Methods 0.000 description 1
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010073472 leucyl-prolyl-proline Proteins 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 229920006008 lipopolysaccharide Polymers 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 108010064235 lysylglycine Proteins 0.000 description 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 201000001441 melanoma Diseases 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N methamphetamine Chemical compound CN[C@@H](C)CC1=CC=CC=C1 MYWUZJCMWCOHBA-VIFPVBQESA-N 0.000 description 1
- 108010005942 methionylglycine Proteins 0.000 description 1
- 239000003226 mitogen Substances 0.000 description 1
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 1
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 1
- 210000002850 nasal mucosa Anatomy 0.000 description 1
- 239000006199 nebulizer Substances 0.000 description 1
- 210000002569 neuron Anatomy 0.000 description 1
- 230000007935 neutral effect Effects 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 231100001222 nononcogenic Toxicity 0.000 description 1
- 231100000590 oncogenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002246 oncogenic effect Effects 0.000 description 1
- 201000008482 osteoarthritis Diseases 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000036961 partial effect Effects 0.000 description 1
- 229940056360 penicillin g Drugs 0.000 description 1
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000008177 pharmaceutical agent Substances 0.000 description 1
- 108010070409 phenylalanyl-glycyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010024607 phenylalanylalanine Proteins 0.000 description 1
- 108010012581 phenylalanylglutamate Proteins 0.000 description 1
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 1
- 239000013600 plasmid vector Substances 0.000 description 1
- 230000004492 positive regulation of T cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 231100000683 possible toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 210000004986 primary T-cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000001236 prokaryotic cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000012846 protein folding Effects 0.000 description 1
- 108060006633 protein kinase Proteins 0.000 description 1
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 1
- 230000003362 replicative effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000004044 response Effects 0.000 description 1
- 230000001177 retroviral effect Effects 0.000 description 1
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 description 1
- 102220128896 rs376207606 Human genes 0.000 description 1
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 1
- 108010048818 seryl-histidine Proteins 0.000 description 1
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 230000007781 signaling event Effects 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- AWUCVROLDVIAJX-GSVOUGTGSA-N sn-glycerol 3-phosphate Chemical compound OC[C@@H](O)COP(O)(O)=O AWUCVROLDVIAJX-GSVOUGTGSA-N 0.000 description 1
- 235000017557 sodium bicarbonate Nutrition 0.000 description 1
- 229910000030 sodium bicarbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 1
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 1
- 229960002385 streptomycin sulfate Drugs 0.000 description 1
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 230000002459 sustained effect Effects 0.000 description 1
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 description 1
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 description 1
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 1
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000014616 translation Effects 0.000 description 1
- 108010080629 tryptophan-leucine Proteins 0.000 description 1
- 208000035408 type 1 diabetes mellitus 1 Diseases 0.000 description 1
- 241001529453 unidentified herpesvirus Species 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 229940035893 uracil Drugs 0.000 description 1
- 108010073969 valyllysine Proteins 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6863—Cytokines, i.e. immune system proteins modifying a biological response such as cell growth proliferation or differentiation, e.g. TNF, CNF, GM-CSF, lymphotoxin, MIF or their receptors
- G01N33/6869—Interleukin
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/52—Cytokines; Lymphokines; Interferons
- C07K14/54—Interleukins [IL]
- C07K14/5406—IL-4
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
- C07K14/715—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for cytokines; for lymphokines; for interferons
- C07K14/7155—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for cytokines; for lymphokines; for interferons for interleukins [IL]
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
- G01N33/543—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor with an insoluble carrier for immobilising immunochemicals
- G01N33/54306—Solid-phase reaction mechanisms
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Zoology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Public Health (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Pathology (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
1. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 numerowana zgodnie z IL-4 typu dzikie- go, która obejmuje przynajmniej jedno zastapienie aminokwasu na powierzchni wiazania helisy-a A albo C IL-4 typu dzikiego. 18. Transformowana komórka eukariotycznego gospodarza zdolna do wyrazania re- kombinowanej muteiny ludzkiej IL-4 okreslonej w zastrz. 17. 19. Kompozycja farmaceutyczna, znamienna tym, ze obejmuje rekombinowana muteine ludzkiej IL-4 okreslona w zastrz. 1, w polaczeniu z nosnikiem dopuszczalnym farmaceutycznie. 23. Test do okreslania zdolnosci muteiny do wiazania sie z receptorem, znamienny tym, ze obejmuje etapy: (a) wprowadzania do FlashPlate pokrytej streptowidyna czesci wiazacej lancucha receptora, przy czym czesc wiazaca lancucha receptora posiada przylaczony znacznik peptydowy mozliwy do zwiazania przez streptawidyne; (b) wprowadzania do FlashPlate natywnego liganda znakowanego radioaktywnie, wykazujacego powinowactwo do czesci wiazacej lancucha receptora; (c) wprowadzania do FlashPlate muteiny jako liganda o powinowactwie do czesci wiazacej lancucha receptora; (d) mierzenia ilosci sygnalu emitowanego przez FlashPlate po zrównowazeniu; i (e) obliczenia wzglednego powinowactwa muteiny jako liganda w stosunku do na- tywnego liganda. PL PL PL PL
Description
Przedmiotem wynalazku jest rekombinowaną muteina ludzkiej interleukiny-4, transformowana komórka, kompozycja farmaceutyczna, oczyszczona i wyizolowana sekwencja polinukleotydowa, komórka gospodarza eukariotycznego, zastosowanie kompozycji farmaceutycznej, test oraz rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4.
Wynalazek ogólnie dotyczy dziedziny farmakologii i immunologii. Konkretniej, wynalazek dotyczy nowych odmian rodziny cytokin, w szczególności ludzkiej interleukiny-4 (IL-4).
Interleukina 4 jest glikoproteiną wielkości 15 kDa wydzielaną przez aktywowane limfocyty T (Howard i in., J. Exp. Med. 155:914 (1982)), komórki tuczne (Brown i in., Cell 50:809 (1987)) i bazofile (Seder i in., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:2835 (1991)), która reguluje szerokie spektrum funkcji komórkowych w komórkach hematopoetycznych i innych. Interleukina 4 (IL-4) jest plejotropową cytokiną, wykazującą aktywności wobec komórek układu odpornościowego, śródbłonka i komórek fibroblastoidalnych. Opisywane efekty podawania IL-4 in vitro obejmują proliferację limfocytów B, przełączenie klas immunoglobulin w limfocytach B. Interleukina 4 aktywuje proliferację limfocytów T po uprzedniej aktywacji mitogenami i ujemnie reguluje wytwarzanie IFN-γ. W monocytach, IL-4 indukuje ekspresję cząsteczek MHC klasy II, uwolnienie tPA indukowanego lipopolisacharydem i ekspresję CD23. W komórkach śródbłonka (EC) IL-4 indukuje ekspresję VCAM-1 i uwolnienie IL-6 oraz zmniejsza ekspresję ICAM-1 (Maher i in., Human Interleukin-4: An Immunomodulator with Potential Therapeutic Applications, Progres in Growth Factor Research, 3:43-56 (1991)).
Z powodu swej zdolności do pobudzania proliferacji limfocytów T aktywowanych przez ekspozycję na IL-2, proponuje się leczenie przy użyciu IL-4. Przykładowo, IL-4 wykazuje działanie przeciwnowotworowe w modelu zwierzęcym raka nerki, oraz wywołuje zmniejszenie guza u myszy (Bosco i in., Low doses of IL-4 injected perilymphatically in tumour-bearing mice inhibits the growth of poorly and apparently nonimmunogenic tumors and induce a tumour specific immune memory, J. Immunol. 145:3136-43 (1990)). Jednakże jej toksyczność ogranicza stosowanie u ludzi (Margolin i in., Phase II studies of humanrecombinant interleukin-4 in advanced renal cancer and malignant melanoma, J. Immunother. 15:147-153 (1994)).
Obecnie, znana jest ogólna budowa i funkcja IL-4 i pokrewnych ligandów monomerycznych obejmuje 4 przeciwrównoległe domeny α-helikalne (A-D). Trójwymiarowa budowa IL-4 została opisana (Powers i in., Science 256:1673, 1992). Białko zawiera 4 lewoskrętne helisy α i dwie płachty β.
Receptor IL-4 obejmuje przynajmniej dwa łańcuchy. Pierwszy łańcuch IL-4R, IL-4Ra wykazuje istotną homologię z łańcuchem β IL-2R i innymi członkami nadrodziny receptorów czynników wzrostowych (Ldzerda i in., J. Exp. Med. 171:861 (1990)). Określono również drugi łańcuch IL-4R, łańcuch IL-2R, znany również jak „wspólny łańcuch” γο (Russell i in., Science 262:1877 (1993)). Dwa miejsca wiązania są prawdopodobnie związane z sekwencyjnym, zjawiskiem wiązania, które daje trzeciorzędowy kompleks 1:1:1. Regionem IL-4 prawdopodobnie odpowiedzialnym za wiązanie z IL-4Ra jest położony na jednej albo obu helisach A i C, podczas gdy region oddziałujący z γο położony jest na helisie D. Obecna teoria utrzymuje, że pierwsze zjawisko wiązania obejmuje kontakt liganda z IL-4Ra, pierwotnym składnikiem wiązania. Ze zjawiskiem tym nie jest związana żadna aktywność sygnałowa. Drugie zjawisko wiązania następuje, gdy kompleks IL-4/IL-4Ra rekrutuje drugi łańcuch, γο. Po tym drugim zjawisku wiązania następuje przekazanie sygnału i następuje aktywność komórkowa. Antagonizm IL-4 typu dzikiego spotyka się gdy aktywność wiązania za pośrednictwem drugiego regionu (koniecznego do aktywności komórkowej) jest zmniejszona albo wyeliminowana, przy zachowaniu wiązania z IL-4Ra. Antagonizm występuje gdy potencjalny ligand oddziałuje przestrzennie, przez pierwszy i drugi region, z oboma składnikami receptora.
W literaturze opisano antagonistów IL-4. Muteiny IL-4, które działają jako antagoniści obejmują muteinę IL-4/Y124D (Kruse i in., EMBO J. 11:3237-44, 1992) i podwójnego mutanta IL-4[R121D/Y124D] (Tony i in., Eur. J. Biochem. 225:659-664 (1994)). Pojedyncza muteina obejmuje zastąpienie tyrozyny kwasem asparaginowym w pozycji 124 w helisie D. Podwójna muteina jest zastąpieniem argininy przez kwas asparaginowy w pozycji 121 i tyrozyny kwasem asparaginowym w pozycji 124 helisy D. Odmiany w tej części helisy D pozytywnie koreluj ą ze zmianami w oddziaływaniu w drugim regionie wiązania.
188 738
Zmutowane odmiany IL-4 wykazujące agonizm albo antagonizm wobec IL-4 typu dzikiego mogą być przydatne do leczenia stanów związanych z jednym z plejotropowych działań IL-4. Przykładowo, antagoniści IL-4 mogą być przydatni w leczeniu stanów zaostrzanych przez wytwarzanie IL-4, takich jak astma, alergia albo inne choroby związane z reakcją zapalną. Agoniści IL-4 mogą być przydatni w leczeniu stanów, w których obecność IL-4 związana jest ze złagodzeniem choroby, przykładowo, choroby autoagresyjnej takiej jak reumatoidalne zapalenie stawów, stwardnienie rozsiane, cukrzyca insulino-zależna itp. Choroby te charakteryzują się polaryzacją wytwarzania populacji limfocytów T pomocniczych, typu 1 i 2 (Thl, Th2). Naiwne limfocyty T CD4+ różnicują się w podtypy Thl albo Th2, zależnie od cytokiny obecnej w trakcie pobudzenia. Agonista IL-4 powinien przesunąć wytwarzanie w stronę pożądanych limfocytów T pomocniczych, tj. w stronę Th2, wykazując efekt terapeutyczny.
PCT/US93/03613 ujawnia odmiany IL-4 posiadające sekwencje Phe-Leu albo Tyr-Leu w domenie helisy a i ujemnie naładowane aminokwasy w dwóch pozycjach aminokwasowych bezpośrednio powyżej albo poniżej sekwencji Phe-Leu albo Tyr-Leu, odmiany które wykazują zwiększone powinowactwo do receptora IL-4 dzięki obojętnym aminokwasom zastąpionym przez ujemnie naładowane aminokwasy. Ujawnia również, że swoiste zastąpienie Trp-Leu albo Phe-Leu w helisie a IL-4 dwiema ujemnie naładowanymi powoduje zwiększone powinowactwo. Odmianąjest białko fuzyjne IL-4 (z toksyną błoniczą).
Streszczenie wynalazku
Wynalazek dotyczy rekombinowanej muteiny ludzkiej IL-4 numerowanej zgodnie IL-4 typu dzikiego obejmującej przynajmniej jedno zastąpienie aminokwasu na powierzchni wiązania helisy a A albo C IL-4 typu dzikiego. Korzystnie rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według wynalazku jest kodowana przez sekwencję o Id. Sekw. nr 8.
Zastąpienie korzystnie wybrane jest z grupy obejmującej, w helisie A pozycję 5,11, 13 i 16, zaś w helisie C pozycję 77, 78, 81, 84, 85 (z wyjątkiem R85Q) i 89.
W korzystnym wykonaniu rekombinowanej muteiny ludzkiej IL-4 według wynalazku zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na alaninę, korzystniej zamiana seryny na histydynę, izoleucynę, leucynę, glutaminę, argininę, treoninę, walinę, tyrozynę, lizynę, lub izoleucynę.
W innym korzystnym wykonaniu rekombinowanej muteiny ludzkiej IL-4 według wynalazku zastąpieniem w pozycji 13 jest zamiana Thr na Asp, korzystnie taka rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 jest kodowana przez sekwencję DNA o Id. Sekw. nr 9 albo jego odmianę zdolną do stabilnej hybrydyzacji.
W zakres wynalazku wchodzi również transformowana komórką eukariotycznego gospodarza zdolna do wyrażania rekombinowanej muteiny ludzkiej IL-4 według wynalazku.
Kompozycja farmaceutyczna obejmująca rekombinowana muteinę ludzkiej IL-4 według wynalazku oraz jej zastosowanie do wytwarzania leku do leczenia alergii i alergicznych chorób zapalnych obejmujących astmę, oczyszczone i wyizolowane sekwencje polinukleotydowe kodujące muteinę według wynalazku oraz transformowane komórki gospodarza eukariotycznego również wchodzą w zakres wynalazku.
Wynalazek dotyczy także testu do określania zdolności muteiny do wiązania receptora, obejmującego etapy:
(a) wprowadzania do FlashPlate pokrytej streptowidyną części wiążącej łańcucha receptora, przy czym część wiążąca łańcucha receptora posiada przyłączony znacznik peptydowy możliwy do związania przez streptawidynę;
(b) wprowadzania do FlashPlate natywnego liganda znakowanego radioaktywnie, wykazującego powinowactwo do części wiążącej łańcucha receptora;
(c) wprowadzania do FlashPlate muteiny jako liganda o powinowactwie do części wiążącej łańcucha receptora;
(d) mierzenia ilości sygnału emitowanego przez FlashPlate po zrównoważeniu; i (e) obliczenia względnego powinowactwa muteiny jako liganda w stosunku do natywnego liganda.
W korzystnych wykonaniach, sposób wykorzystuje łańcuch IL-4Ra receptora, znacznik peptydowy obejmuje sekwencję o Id. Sekw. nr 6 albo jego zdegenerowaną odmianę, korzystniej znacznik peptydowy usunięto z łańcucha receptora, zaś łańcuch receptora biotynylowano,
188 738 jeszcze korzystniej część wiążąca łańcucha receptora jest kodowana przez sekwencję o Id. Sekw. nr 7 albo jego zdegenerowaną odmianę.
Wynalazek dotyczy również rekombinowanej antagonistycznej muteiny ludzkiej IL-4, numerowanej według IL-4 typu dzikiego, w której mutacje obejmują:
(a) zastąpienie R121D i Y124D w helisie D IL-4 typu dzikiego; i (b) przynajmniej jedno zastąpienie aminokwasowe na powierzchni wiążącej helisy a A albo C IL-4 typu dzikiego, przy czym, gdy zastąpienie dotyczy alaniny zmienia się powinowactwo od około 2 do około 100-krotnie a muteina wiąże się z receptorem IL-4Ra z powinowactwem, co najmniej większym niż natywna IL-4.
Zastąpienie korzystnie wybrane jest z grupy pozycji obejmujących, w helisie A pozycje 5, 11,13 i 16, zaś w helisie C pozycję 77, 78, 8184, 85 (z wyjątkiem R85Q) i 89.
Korzystnym wykonaniem jest rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4, w której zastąpieniem w pozycji 13 jest zamiana Thr na Asp, korzystniej jest kodowana przez DNA o sekwencji Id. Sekw. nr 9 albo jego odmianę zdolną do stabilnej hybrydyzacji.
Kompozycja farmaceutyczna obejmująca rekombinowaną antagonistyczną muteinę ludzkiej IL-4 według wynalazku oraz jej zastosowanie do wytwarzania leku do leczenia alergii i alergicznych chorób zapalnych obejmujących astmę także wchodzi w zakres wynalazku.
Komórka gospodarza eukariotycznego zdolna do wyrażania rekombinowanej antagonistycznej muteiny ludzkiej IL-4 według wynalazku, oczyszczona i wyizolowana sekwencja polinukleotydowa kodująca rekombinowaną antagonistyczną muteinę ludzkiej IL-4 oraz transformowana komórka gospodarza eukariotycznego oczyszczoną i wyizolowana sekwencją polinukleotydową według wynalazku również wchodzą w zakres wynalazku.
Krótki opis rysunków
Figura 1 stanowi schemat architektury wiązania ligand/receptor dla IL-4. IL-4 jest białkiem globularnym obejmującym cztery helisy, i pokazana jest tu „od spodu” czterech helis (A, B, C i D, od końca N do C). Pierwotnym składnikiem wiązania receptora IL-4 jest IL-4Ra, który oddziałuje z ligandem IL-4 przez helisy A i C IL-4. Tworzenie trzeciorzędowego kompleksu IL-4/lL-4Ra/IL-4Ry wywołuje przekazanie sygnału w komórce docelowej.
Figura 2 jest wykresem X-Y kompetecyjnego wiązania T13D-IL-4[R121D/Y124D]. Zdolność T13D-IL-4[R121D/Y124D], ©, do współzawodnictwa z 125I-IL-4 w teście wiązania na podłożu stałym pokazana jest względem zdolności IL-4 [R121D/Y124D],°. Kd określona przy użyciu tego testu dla T13D-IL-4[R121D/Y124D] wynosi 0,28 nM, zaś dla IL-4[R-121D-/Y124D] 5,0 nM..
Figura 3 jest podobnym wykresem przedstawiającym antagonizm IL-4 przez T13D-IL4[R121D/Y124D],°. Zdolność T13D-IL-4[R121D/Y124D] do współzawodnictwa w proliferacji blastów PHA wywołanej IL-4 pokazano w odniesieniu do IL-4[R121D/Y124D], ®. IC50 określone w tym teście wynosi dla T13D-IL-4[R121D/Y124D] 2 nM, zaś dla T13D-IL4[R121D/Y124D], 13 nM.
Figura 4 jest sekwencją aminokwasową sIL-4Ra-STX.
Figura 5 jest złożoną listą sekwencji muteiny T13D-IL-4.
Figurą 6 jest złożoną listą sekwencji muteiny T13D-IL-4[R121D/Y124D].
Opis korzystnych wykonań
Opisano tu nowe muteiny i mechanizm otrzymywania nowych mutein IL-4 o wyższym powinowactwie do receptora IL-4 typu dzikiego.
W znaczeniu tu zastosowanym, „IL-4 typu dzikiego” oznacza ludzką IL-4 natywną albo rekombinowaną posiadającą sekwencję 129 normalnie występujących aminokwasów natywnej IL-4, jak ujawniono w patencie USA nr 5,017,691, załączonym tu jako odnośnik.
W znaczeniu tu zastosowanym „muteina IL-4” oznacza polipeptyd, w którym dokonano swoistych zastąpień białka ludzkiej dojrzałej IL-4, zwłaszcza w helisie A albo C, zaś konkretniej w aminokwasach ich powierzchni wiążących. Powierzchnia wiążąca helisy A znajduje się głównie od około aminokwasu pozycji 5 do około 16; zaś w helisie C od około pozycji 77 do około 89. Zmiany te w którejś z helis powodują albo wzrost powinowactwa powstałej muteiny do IL-4Ra, przy czym muteina może być albo agonistą albo antagonistą IL-4 typu dzikiego zależnie od końcowej natury dodatkowych zastąpień w cząsteczce.
188 738
W znaczeniu tu zastosowanym, „antagonistyczna muteina IL-4” oznacza polipeptyd, w którym dokonano swoistych zastąpień aminokwasowych w dojrzałym białku ludzkiej IL-4. Konkretnie, przedstawione tu antagonistyczne muteiny zawierają przynajmniej trzy osobne zastąpienia. Pary zastąpień ,,IL-4[R121D/Y124D]” występują we wszystkich przedstawionych tu antagonistycznych muteinach i dotyczą podstawowej pary zastąpień w helisie D, R121D (Arg na Asp) i Y124D (Tyr na Asp). Oprócz tego, wprowadzono trzecie zastąpienie w powierzchniach wiążących helisy A albo C w pozycjach, które zwiększają powinowactwo wiązania muteiny z łańcuchem alfa receptora. Oprócz tych zmian, najkorzystniejsze antagonistyczne muteiny IL-4 mają sekwencję aminokwasową identyczną z IL-4 typu dzikiego w innych nie zastępowanych resztach.
Muteiny IL-4 według wynalazku mogą się również charakteryzować insercjami, delecjami, zastąpieniami i modyfikacjami w jednym albo wielu miejscach w innych resztach natywnego łańcucha polipeptydowego IL-4. Według wynalazku, dowolna z takich insercji, delecji, zastąpień albo modyfikacji daje muteinę IL-4, która zachowuje aktywność IL-4.
Korzystne są konserwatywne modyfikacje i zastąpienia w innych pozycjach IL-4 (tj . takich, które wywierają minimalny wpływ na drugorzędową albo trzeciorzędową strukturę muteiny). Takie zakonserwowane zastąpienia obejmują opisane przez Dayhoffa w The Atlas of Protein Sequence and Structure 5 (1978) oraz Argos EMBO J., 8:779-785 (1989). Przykładowo, aminokwasy należące do jednej z poniższych grup stanowią zmiany zakonserwowane:
- ala, pro, gly, gin, asn, ser, thr;
- cys, ser, tyr, thr;
- val, ile, leu, met, ala, phe;
- lys, arg, his;
- phe, tyr, trp, his; i
- asp, glu.
Korzystne są również modyfikacje i zastąpienia, które usuwają miejsca dodatkowego sieciowania międzycząsteczkowego albo nieprawidłowego tworzenia mostków disiarczkowych. Przykładowo, wiadomo, że IL-4 posiada sześć reszt cys, w pozycjach 3, 24, 46, 65, 99 i 127 sekwencji typu dzikiego, z których jedna albo więcej może być związanych z oddziaływaniem sieciującym. Zastąpienia powinny być wybrane w taki sposób, aby zachować trzeciorzędową strukturę białka typu dzikiego, o ile to możliwe.
Przez „numerację według IL-4 typu dzikiego” rozumie się identyfikację wybranych aminokwasów w odniesieniu do pozycji, w której aminokwas normalnie występuje w IL-4 typu dzikiego. Gdy w muteinie IL-4 dokonuje się insercji albo delecji, specjalista zauważy, że ser (S) normalnie występująca w pozycji 125, przy numeracji według IL-4 typu dzikiego ulegnie przesunięciu w muteinie. Jednakże, położenie przesuniętej ser (S) można łatwo stwierdzić przez badanie i korelację otaczających aminokwasów z otaczającymi ser w IL-4 typu dzikiego.
Muteiny IL-4 według wynalazku można wytworzyć dowolną odpowiednią metodą znaną w dziedzinie wiedzy. Metody takie obejmują konstruowanie sekwencji DNA kodujących muteiny IL-4 według wynalazku i wyrażanie tych sekwencji w odpowiednio transformowanym gospodarzu. Sposób ten powinien pozwolić uzyskać rekombinowane muteiny według wynalazku. Jednakże, muteiny według wynalazku można również wytworzyć, jakkolwiek mniej korzystnie, przez syntezę chemiczną albo kombinację syntezy chemicznej i techniki rekombinacji DNA.
W jednym wykonaniu rekombinacyjnej metody wytwarzania muteiny według wynalazku, konstruuje się sekwencję DNA przez izolowanie albo syntezę sekwencji DNA kodującej IL-4 typu dzikiego, a następnie zmianę koaonu dla treoniny-13 na kodon dla kwasu asparaginowego, przez kierowaną mutagenezę. Technika ta jest znana. Patrz, np. Mark i in., Sitespecific Mutagenesis of the Human Fibroblast Interferon Gene, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81: 5662-5666 (1984); patent USA nr 4,588,585, załączone tu jako odnośnik.
Inny sposób konstruowania sekwencji DNA kodującej muteiny IL-4 według wynalazku obejmuje syntezę chemiczną. Przykładowo, gen który koduje pożądaną muteinę IL-4 można syntetyzować sposobem chemicznym stosując syntetyzer oligonukleotydów. Takie oligonukleotydy projektuje się w oparciu o sekwencję aminokwasową pożądanej muteiny IL-4 i ko8
188 738 rzystnie selekcjonuje kodony, które są korzystne w komórce gospodarza, w którym będzie wytwarzana rekombinowana muteina. W tym względzie, wiadomo powszechnie, że kod genetyczny jest zdegenerowany, tzn. aminokwas może być kodowany przez więcej niż jeden kodon. Przykładowo, phe (F) kodowana jest przez dwa kodony, TTC albo TTT, tyr (Y) kodowana jest przez TAC albo TAT, zaś his (H) kodowana jest przez CAC albo CAT. Trp (W) kodowany jest przez pojedynczy kodon, TGG. Nawiązując, wiadomo, że dla danej sekwencji DNA kodującej konkretną muteinę IL-4, będzie wiele zdegenerowanych sekwencji DNA, które kodują tę muteinę. Przykładowo, wiadomo, że oprócz korzystnej sekwencji DNA dla muteiny T13D-IL-4[R121D/Y124D] pokazanej na Id. Sekw. nr 9, istnieje wiele zdegenerowanych sekwencji DNA które kodują pokazaną muteinę. Te zdegenerowane sekwencje DNA uważane są za pozostające w zakresie wynalazku. Stąd, „zdegenerowane odmiany” w kontekście wynalazku oznaczają wszystkie sekwencje DNA, które kodują konkretną muteinę.
Sekwencja DNA kodująca muteinę IL-4 według wynalazku, wytworzona przez ukierunkowaną mutagenezę, syntezę albo innym sposobem, może ale nie musi obejmować sekwencji DNA, które kodują sekwencję sygnałową. Taka sekwencja sygnałowa, jeżeli występuje, powinna być rozpoznawana przez komórkę wybraną do ekspresji muteiny IL-4. Może ona być prokariotyczna, eukariotyczna albo może być kombinacją tych dwóch. Może być również sekwencją sygnałową natywnej IL-4. Włączenie sekwencji sygnałowej zależy od tego, czy jest pożądane aby muteina iL-4 była wydzielona z rekombinowanej komórki w której jest wytwarzana. Jeżeli wybrana komórka jest prokariotyczna, ogólnie korzystne jest aby sekwencja DNA nie kodowała sekwencji sygnałowej, ale obejmowała metioninę końca N w celu kierowania ekspresją. Jeżeli wybrana komórka jest eukariotyczna, jest korzystne aby sekwencja sygnałowa była kodowana, zaś szczególnie korzystne jest, żeby była to sekwencja sygnałowa natywnej IL-4.
W celu syntezy genu kodującego muteinę IL-4 według wynalazku można zastosować standardowe sposoby. Przykładowo, w celu skonstruowania genu ulegającego translacji wstecznej można zastosować kompletną sekwencję aminokwasową. Oligomer DNA zawierający sekwencję nukleotydową kodującą muteinę IL-4 można zsyntetyzować. Przykładowo, można syntetyzować kilka małych oligonukleotydów kodujących części pożądanego polipeptydu, po czym poddać je ligacji. Poszczególne oligonukleotydy zwykle zawierają dodatkowe zasady na końcach 5' i 3' zapewniające komplementamość.
Po połączeniu (przez syntezę, ukierunkowaną, mutagenezę albo innym sposobem), sekwencje DnA kodujące muteinę IL-4 według wynalazku wprowadza się do wektora ekspresyjnego i łączy funkcjonalnie z sekwencją kontrolującą ekspresję odpowiednią do ekspresji muteiny IL-4 w pożądanym transformowanym gospodarzu. Prawidłowe łączenie można potwierdzić przez sekwencjonowanie nukleotydów, mapowanie restrykcyjne i ekspresję biologicznie czynnego polipeptydu w odpowiednim gospodarzu. Wiadomo, że w celu uzyskania wysokiego poziomu ekspresji transfekowanego genu w gospodarzu, gen musi być połączony funkcjonalnie z sekwencjami kontrolującymi transkrypcję i translację, które działają w wybranym gospodarzu ekspresyjnym.
Wybór sekwencji kontrolujących ekspresję i wektora ekspresyjnego zależeć będzie od wyboru gospodarza. Można wykorzystać wiele kombinacji wektora ekspresyjnego/gospodarza. Przydatne wektory ekspresyjne dla gospodarzy eukariotycznych obejmują przykładowo, wektory obejmujące sekwencje kontrolujące ekspresję z SV40, bydlęcego wirusa brodawczaków, adenowirusa i cytomegalowirusa. Przydatne wektory ekspresyjne dla gospodarzy bakteryjnych obejmują znane plazmidy bakteryjne, takie jak pochodzące z E. coli, w tym col El, pCRl, pER32z, pMB9 oraz ich pochodne szeroki zakres plazmidów takich jak RP4, DNA fagowe, takie jak Ml 3 i jednoniciowe DNA fagów nitkowatych. Przydatne wektory dla komórek owadów obejmują pVL941. Korzystny jest pFasiBae™ (Gibco BRL, Gaithersburg, MD). Cate i in., Isolation of the Bovine and Human Genes for Mullerian Inhibiting Substance and Expresion of the Human Gene in Animal Cells, Celi 45:685-98 (1986).
Oprócz tego, można zastosować w tych wektorach dowolną spośród szerokiego zakresu sekwencji kontrolujących. Takie przydatne sekwencje kontrolujące ekspresję obejmują sekwencje kontrolujące ekspresję związane z genami strukturalnymi po wyższych wektorów ekspresyjnych. Przykłady przydatnych sekwencji kontrolujących ekspresję obejmują, przykładowo, wczesne i późne promotory SV40 albo adenowirusa, układ lac, układ trp, układ TAC
188 738 albo TRC, główny operator i główny promotor faga lambda, przykładowo PL, regiony kontrolne białka otoczki fd, promotor kinazy 3-fosfoglicerynowej albo innych enzymów glikolitycznych, promotory fosfatazy kwaśnej, np. PhoA, promotory układu kopulacyjnego A drożdży, promotor poliedrozy Baculowirusów i inne sekwencje, o których wiadomo, że kontrolują ekspresję genów komórek prokariotycznych albo eukariotycznych albo ich wirusów i ich różnych kombinacji.
Do wytwarzania mutein IL-4 według wynalazku można wykorzystać dowolnego przydatnego gospodarza, w tym bakterie, grzyby (również drożdże), rośliny owady, ssaki albo inne odpowiednie komórki zwierzęce albo linie komórkowe, jak również transgeniczne zwierzęta albo rośliny. Konkretniej, gospodarze ci mogą obejmować dobrze znanych gospodarzy prokariotycznych albo eukariotycznych, takich jak E. coli, Pseudomonas, Bacillus, Streptomyces, grzyby, drożdże, komórki owadów takie jak Spodoptera frugiperda (Sf9), komórki zwierzęce takie jak komórki jajnika chomika chińskiego (CHO) i komórki mysie takie jak NS/0, komórki afrykańskiej małpy zielonej takie jak COS 1, COS 7, BSC 1, BSC 40 i BNT 10, oraz komórki ludzkie, jak również komórki roślinne w hodowli. Do ekspresji w komórkach zwierzęcych, korzystne są komórki CHO i COS 7 w hodowli, zaś szczególnie linia komórek CHO (DHFR-).
Należy oczywiście rozumieć, że nie wszystkie wektory i sekwencje kontrolujące ekspresję będą działały równie dobrze przy ekspresji opisanych tu sekwencji DNA. Podobnie, nie wszyscy gospodarze będą działali równie dobrze z danym układem ekspresyjnym. Jednakże, specjalista może dokonać samodzielnie wyboru wśród wektorów, sekwencji kontrolujących ekspresję i gospodarzy bez niepotrzebnych doświadczeń. Przykładowo, przy wyborze wektora należy uwzględnić gospodarza ponieważ wektor musi się w nim namnażać, Należy również uwzględniać liczbę kopii wektora, zdolność do kontrolowania liczby kopii, oraz ekspresję innych białek kodowanych przez wektor takich jak znaczniki oporności na antybiotyki. Przy kładowo, korzystne wektory do zastosowania według wynalazku obejmują takie, które umożliwiają amplifikację znacznej liczby kopii DNA kodującego muteiny IL-4. Takie wektory zdolne do amplifikacji są znane. Obejmują one, przykładowo, wektory zdolne do namnożenia się przez amplifikację DHFR (patrz, Kaufman, patent USA nr 4,470,461, Kaufman i Sharp, Construction of a modular dihydrofolate reductase cDNA gene: Analysis of signals utilized fo efficient expression, Mol. Cell. Biol. 2:1304-19 (1982)) albo amplifikację syntazy glutaminowej (GS) (patrz, patenr USA nr 5,122,464 oraz europejskie opublikowane zgłoszenie 338,841).
Przy wyborze sekwencji kontrolującej ekspresję, można rozważać różne czynniki. Obejmują one, przykładowo, względną siłę sekwencji, możliwości jej kontrolowania oraz jej zgodność z aktualną sekwencją DNA kodującą muteinę IL-4 według wynalazku, szczególnie w odniesieniu do potencjalnych struktur drugorzędowych. Gospodarzy należy wybierać przy uwzględnieniu ich zgodności z wybranym wektorem, toksyczności produktu kodowanego przez sekwencje DNA według wynalazku, ich charakterystyki wydzielania, ich zdolności do prawidłowego fałdowania polipeptydów, ich wymagań dotyczących fermentacji albo hodowli oraz łatwości oczyszczania produktu kodowanego przez sekwencje DNA.
W obrębie tych parametrów, specjalista może wybrać różne kombinacje wektora/sekwencji kontrolującej ekspresję/gospodarza, która będzie wyrażać pożądane sekwencje DNA podczas fermentacji albo hodowli komórek na wielką skalę, przykładowo z użyciem komórek COS 7 albo CHO.
Muteiny IL-4 otrzymane według wynalazku mogą być glikozylowane albo nie glikozylowane, zależnie od organizmu gospodarza zastosowanego do wytwarzania muteiny. Jeżeli jako gospodarz zostanie wybrana bakteria, wtedy wytwarzana muteina IL-4 będzie nie glikozylowana. Komórki eukariotyczne będą glikozylowały muteinę IL-4, jakkolwiek niekoniecznie w ten sam sposób co natywnąIL-4.
Muteinę IL-4 wytworzoną przez transformowanego gospodarza można oczyszczać dowolnym sposobem. Znane są różne metody oczyszczania IL-4, patrz, np. patent USA nr 5,013,824, 5,017,691 i WO 96/04306-A2. Korzystne jest oczyszczanie przez powinowactwo immunologiczne. Patrz, np. Okamura i in., Human fibroblastoid interferon: immunosor10
188 738 bent column chromatography and N-terminal amino acid sequence, Biochem. 19:3831-35 (1980).
Aktywność biologiczną mutein IL-4 według wynalazku można ocenić dowolną znaną przydatną metodą. Testy takie obejmują neutralizację przeciwciałami aktywności przeciwwirusowej, indukcję kinazy białkowej, aktywności oligoadenylano 2,5-A syntazy albo fosfodiesterazy, jak to opisano w EP-B1-41313. Takie testy obejmują również testy immunomodulujące (patrz, patent USA nr 4,753,795), testy zahamowania wzrostu, testy proliferacji limfocytów T, indukcji IL-6 (MCP-1 albo VCAM-1) na EC i pomiar wiązania z komórkami, które wyrażają receptory IL-4. Patrz również, Spits i in., Recombinant interleukin-4 promotes the growth of human T cells, J. Immunol. 139:1142-47 (1987).
Muteinę IL-4 według wynalazku podaje się w dawkach w przybliżeniu równych albo wyższych od stosowanych w terapii przy użyciu natywnej albo rekombinowanej lL-4. Korzystnie podaje się skuteczną ilość muteiny IL-4. Określenie „skuteczna ilość” oznacza ilość zdolną do zapobieżenia albo osłabienia ciężkości albo rozprzestrzenienia się leczonej choroby albo stanu. Oczywiste dla specjalisty jest, że skuteczna ilość muteiny IL-4 zależeć będzie, między innymi, od choroby, dawki, schematu podawania muteiny IL-4, czy muteina IL-4 podawana jest sama czy w połączeniu z innymi środkami terapeutycznymi, od okresu półtrwania kompozycji oraz od stanu ogólnego pacjenta.
Muteinę IL-4 korzystnie podaje się w kompozycji obejmującej nośnik dopuszczalny farmaceutycznie. „Nośnik dopuszczalny farmaceutycznie” oznacza nośnik, który nie powoduje żadnego niepożądanego efektu u pacjenta, któremu go się podaje. Takie nośniki dopuszczalne farmaceutycznie są dobrze znane. Korzystny jest 2% HSA/PBS, pH 7,0.
Muteiny lL-4 według wynalazku można wytwarzać w postaci kompozycji farmaceutycznej znanymi sposobami. Patrz, np. Remington's Pharmaceutical Science, Martin, załączone tu jako odnośnik. Kompozycja farmaceutyczna muteiny IL-4 może przybierać różne postacie, w tym płynne, żelowe, liofilizowane, albo inne przydatne postacie. Przydatna postać będzie zależała od konkretnego leczonego wskazania i jest oczywista dla specjalisty.
Kompozycję farmaceutyczną muteiny IL-4 można podawać do ustnie, w rozpylaczu, dożylnie, domięśniowo, dootrzewnowe, śródskómie albo podskórnie albo w dowolny inny dopuszczalny sposób. Korzystny sposób podawania zależy od konkretnego wskazania i jest oczywisty dla specjalisty. Kompozycję farmaceutyczną muteiny IL-4 można podawać w połączeniu z innym środkiem farmaceutycznym. Środki te można włączać jako części tej samej kompozycji farmaceutycznej albo można podawać oddzielnie z muteiną IL-4, równocześnie albo według innego dopuszczalnego schematu leczenia. Oprócz tego, kompozycję farmaceutyczną IL-4 można zastosować w celu wspomagania innych terapii.
Nawiązując, wynalazek dostarcza kompozycji i sposobów leczenia chorób odpornościowych, raków i nowotworów, nienormalnego wzrostu komórek, albo immunomodulacji u dowolnego zwierzęcia, korzystnie ssaka, najkorzystniej człowieka. Jak uprzednio zaznaczono, IL-4 wywiera szereg efektów. Niektórymi z nich jest stymulacja proliferacji limfocytów T, różnicowa nie limfocytów T pomocniczych, indukcja aktywacji i proliferacji ludzkich limfocytów B oraz kierowane limfokiną przełączenie klas immunoglobulin. Wpływ na układ odpornościowy obejmuje zwiększenie ekspresji antygenu MHC klasy II (Noelle i in., Increased expression od la antigen on resting B cells: a new role for B cell growth factor, PNAS USA 81:6149-53 (1984), i CD23 na limfocytach B (Kikutani i in., Molecular structure of human lymphocyte receptor for immunoglobulin, Cell 47:657-61 (1986)). Tak więc, biologia IL-4 wskazuje, że może ona odgrywać istotną rolę w rozwoju alergii i alergicznych chorób zapalnych takich jak astma. Limfocyty T pomocnicze typu 1 (Thl) i typu 2 (Th2) związane są z reakcją odpornościową. Pobudzone limfocyty Th2 wydzielają IL-4 i blokują progresję Thl. Tak więc, dowolną chorobę związaną z Thl można leczyć IL-4 i jej analogami, podobnie, dowolną chorobę związaną z Th2 można leczyć agonistami IL-4.
Uwzględniane jest również zastosowanie sekwencji DNA kodujących muteiny IL-4 według wynalazku do terapii genowej. Uwzględniane zastosowanie w terapii genowej obejmuje leczenie tych chorób, w których oczekuje się, że IL-4 powoduje zaostrzenie stanu klinicznego, np. w chorobie związanej ze stanem zapalnym (astma) albo w alergiach. Wskazania do zastosowania agonistów będą obejmować takie choroby autoagresyjne jak stwardnienie rozsiane,
188 738 cukrzyca insulino-zależna, reumatoidalne zapalenie stawów. Te choroby autoagresyjne charakteryzują się polaryzacją wytwarzania populacji limfocytów pomocniczych T w kierunku typu 1 (Thl).
Miejscowe dostarczanie mutein IL-4, zarówno agonistów jak i antagonistów, przy użyciu terapii genowej może dostarczyć środek terapeutyczny do obszaru docelowego, unikając potencjalnej toksyczności związanej z nieswoistym podaniem agonistów. Uwzględniane są metodologie terapii genowej in vitro i in vivo. Znanych jest kilka sposobów przenoszenia potencjalnie terapeutycznych genów do określonej populacji komórkowej, patrz, Mulligan, The basie science of gene therapy, Science 260:926-31 (1993). Sposoby te obejmują:
1) bezpośredni transfer genu, patrz, np. Wolff i in., Direct gene transfer into mouse muscle in vivo, Science 247:1465-68 (1990);
2) transfer genu za pośrednictwem liposomów, patrz, np. Caplen i in., Liposomemediated SFTR gene transfer to the nasal epithelium of patients with cystic fibrosis, Nature Med. 3:39-46 (1995); Crystal, The gene as a drug, Nature Med. 1:15-17 (1995); Gao i Huang, A novel cationic liposome reagent for efficient transfection of mammalian cells, Biochem. Biophys. Res. Comm. 179:280-85 (1991);
3) transfer DNA za pośrednictwem retrowirusa, patrz, np. Kay i in., In vivo gene therapy of hemophilia B: sustained partial correction in factor IX-deficient dogs, Science 262:117-19 (1993); Anderson, Human gene therapy, Science 256:808-13 (1992).
4) transfer DNA za pośrednictwem wirusów. Takie wirusy obejmują adenowirusy (korzystnie, wektory oparte na Ad-2 albo Ad-5), wirusy herpes (korzystnie wektory oparte na wirusie herpes simplex) i parwowirusy (korzystnie wektory oparte na parwowirusach „defektywnych” albo nieautonomicznych. jeszcze korzystniej wektory oparte na wirusach towarzyszących adenowirusom, najkorzystniej wektory oparte na AAV-2). Patrz, np. Ali i in., The use of DNA viruses as vectors for gene therapy, Gene Therapy 1:367-84 (1994); patent USA nr 4,797,368, załączony tu jako odnośnik oraz patent USA nr 5,139,941, załączony tu jako odnośnik.
Wybór konkretnego układu wektora do przeniesienia interesującego genu zależeć będzie od różnych czynników. Jednym z istotnych czynników jest natura docelowej populacji komórkowej. Jakkolwiek wektory retrowirusowe bada się intensywnie i stosuje w wielu zastosowaniach terapii genowej, wektory te ogólnie nie nadają się do zakażania komórek nie dzielących się. Oprócz tego, retrowirusy są potencjalnie onkogenne.
Adenowirusy mają zaletę szerokiego zakresu gospodarzy, mogą zakażać komórki spoczynkowe i zróżnicowane końcowo, takie jak neurony albo hepatocyty, i wydają się być zasadniczo nie onkogenne, patrz, np. Ali i in., wyżej. Adenowirusy prawdopodobnie nie integrują się z genomem gospodarza. Ponieważ bytują pozachromosomalnie, ryzyko mutagenezy insercyjnej jest znacznie zmniejszone, Ali i in., wyżej.
Wirusy związane z adenowirusami wykazuje podobne zalety co wektory oparte na adenowirusach. Jednakże, AAV wykazują swoistą miejscowo integrację z ludzkim chromosomem 19, Ali i in., wyżej.
W najkorzystniejszym wykonaniu, DNA kodujący muteinę IL-4 według wynalazku stosuje się w terapii genowej chorób autoagresyjnych takich jak SM, IDDM i RA, chorób zakaźnych takich jak choroba z Lyme i trąd, nowotworów takich jak chłoniak nie-Hodgkinowski i ALL, chorób chrząstki takich jak zapalenie kostno-stawowe i łuszczycy.
Według tego wykonania, terapia genowa przy użyciu DNA kodującego muteiny IL-4 według wynalazku dostarczany jest potrzebującemu pacjentowi równocześnie z albo bezpośrednio po diagnozie.
Podejście to korzysta z wybiórczej aktywności mutein IL-4 według wynalazku do zapobiegania niepożądanemu pobudzeniu autoagresyjnemu. Specjalista zauważy, że zgodnie z tym wykonaniem można zastosować dowolny przydatny wektor zawierający DNA dla muteiny IL-4. Techniki konstruowania takich wektorów są znane. Patrz, np. Ohno i in., wyżej; Chang i in., wyżej. Wprowadzenie wektora zawierającego DNA kodującego muteinę IL-4 można osiągnąć przy użyciu znanych technik, np. jak opisano w Ohno i in., wyżej.
188 738
W celu lepszego zrozumienia wynalazku podano poniższe przykłady. Przykłady te podane są jedynie w celu zilustrowania i nie są uwzględniane w żaden sposób jako ograniczenie zakresu wynalazku.
Przykłady
Ogólnie. Zastąpienia alaniną wprowadzono do sekwencji IL-4 typu dzikiego metodą kierowanej mutagenezy w pozycjach odpowiadających resztom określonym jako znajdujące się na powierzchni helis A i C IL-4 (Smith i in., j. Mol. Biol. 224(4):899-904 (1992)). Reszty te prawdopodobnie pośredniczą w oddziaływaniu IL-4 z IL-4Ra (fig. 1); wpływ na powinowactwo wiązania mutein IL-4 z zastąpieniami alaniną wobec IL-4Ra wskazujią że zastępowane reszty mogą mieć związek z oddziaływaniem wiązania. Reszty, które po zastąpieniu alaniną, dawały efekty pośrednie wobec powinowactwa były dalej szeroko zastępowane w celu identyfikacji zmian, które polepszały powinowactwo. Mutacje, które poprawiały powinowactwo mogą po połączeniu dawać kombinatoryjny wzrost powinowactwa IL-4 (albo peptydów pokrewnych z IL-4) wobec IL-4Ra. Wzrost powinowactwa powinien korelować z ze zwiększoną siłą.
Muteiny wytwarzano przez ukierunkowaną mutagenezę, wyrażano w układzie bakulowirusowym, oczyszczano do homogenności, badano jakościowo analizą aminokwasową i badano w testach wiązania receptora. Sekwencję aminokwasową dojrzałej IL-4 (Id. Sekw. nr 1) zastosowaną w tym badaniu pokazano niżej; His w pozycji 1 oznacza koniec N dojrzałego polipeptydu. Helisy A, C i D zaznaczono powyżej ich odpowiednich punktów początkowych i podkreślono. Aminokwasy, których odpowiednie za stąpienie daje odmiany o wyższym powinowactwie zaznaczono wytłuszczoną czcionką:
A
His Lys Cys Asp Ile Thr Leu Gln Glu Ile Ile Lys Thr Leu Asn
10 15
Ser Leu Thr Glu Gln Lys Thr Leu Cys Thr Glu Leu Thr Val Thr 20 25 30
Asp Ile Phe Ala Ala Ser Lys Asn Thr Thr Glu Lys Glu Thr Phe 35 40 45
Cys Arg Ala Ala Thr Val Leu Arg Gln Phe Tyr Ser His His Glu 50 55 C-—66
Lys Asp Thr Arg Cys Leu Gly Ala Thr Ala Gln Gln Phe His Arg 65 70 75
His Lys Gln Leu Ile Arg Phe Leu Lys Arg Leu Asp Arg Asn Leu
85 90
Trp Gly Leu Ala Gly Leu Asn Ser Cys Pro Val Lys Glu Ala Asn 95D—6 100 105
Gln Ser Thr Leu Glu Asn Phe Leu Glu Arg Leu Lys Thr Ile Met 110 115 120
Arg Glu Lys Tyr Ser Lys Cys Ser Ser
125 Id. Sekw. Nr 1
Mutacje badane w tym badaniu wprowadzano do znanej odmiany antagonistycznej ludzkiej IL-4 zawierającej dwa zastąpienia w helisie D, R121D i Y124D (Tony i in., Eur. J. Biochem. 225:659-664 (1994)). Muteinę tę oznaczono ,,IL-4[R121D/Y124D]”. Muteiny te wyrażano w układzie bakulowirusowym, oczyszczano do homogenności i badano w testach wiązania receptora IL-4Ra. Znaczenie biologiczne polepszonego powinowactwa do receptora IL-4Ra badano w teście proliferacji limfocytów T. Ponieważ muteina IL-4[R121D/Y124D] jest antagonistą IL-4, polepszone powinowactwo do IL-4Ra powinno spowodować zmniejszenie IC50 dla antagonistycznych mutein o wyższym powinowactwie (IC50 określone jest jako stężenie antagonisty konieczne do zahamowania określonej reakcji na agonistę w 50%).
Przykład 1. Wytwarzanie mutein. Muteiny wytwarzano przez ukierunkowana mutagenezę, stosując startery zawierające kodony odpowiadające pożądanej mutacji zasadniczo
188 738 jak to opisano w Kunkel i in., Rapid and efficient site-specific mutagenesis without phenotype selection (1987) Methods Enzymol. 154:367-382. Pokrótce, cDNA dla ludzkiej IL-4 zawierający miejsce enzymu restrykcyjnego BamHI i XbaI klonowano do wektora fagowego M13 mp19 (New England Biolabs, Beverly, MA) stosując to samo miejsce. cDNA IL-4 typu dzikiego otrzymano stosując reakcję łańcuchową polimerazy (PCR) z puli cDNA wytworzonej z mRNA izolowanego z ludzkich limfocytów krwi obwodowej, indukowanych 24 godziny PMA (10 ng/ml). Zastosowanymi starterami były, dla końca 5' otwartej ramki odczytu IL-4
5'-CGC GGA TCC ATG GGT CTC ACC TCC-3' (Id. Sekw. nr 2); i dla końca 3' otwartej ramki odczytu IL-4
5'-CGC TCT AGA CTA GCT CGA ACA CTT TGA AT-3' (Id. Sekw. nr 3).
Do każdego oligonukleotydu włączono miejsca restrykcyjne BamHI (koniec 5') i XbaI (koniec 3') co zaznaczono kursywą. Zastosowane warunki PCR: 1 minuta w 94°C, 1 minuta w 58,7°C i 1 minuta w 72°C przez 25 cykli. Prawidłowość sekwencji cDNA IL-4 potwierdzono przez sekwencjonowanie stosując zestaw Sequenase® (Amersham Life Sciences, Arlington Heights, IL) jak opisano przez producenta. Pojedynczą nić DNA zawierającą uracyl (U-DNA) otrzymano przez transformowanie E. coli szczepu CJ236 (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA) M13mp19 zawierającym cDNA dla IL-4. Ukierunkowana mutageneza wykorzystywała ogólnie startery zawierające po 15 nukleotydów homologicznych z matrycą U-DNA 5' od kodonu docelowego dla mutagenezy, nukleotydy obejmujące pożądaną zmianę dodatkowe 10 nukleotydów homologicznych do matrycy U-DNA 3' od zmienionego nukleotydu. Mutacje helisy D Arg-121 do Asp oraz Tyr-124 do Asp wprowadzono do sekwencji IL-4 typu dzikiego. U-DNA dla tego wariantu, określonego IL-4[R121D/Y124D] wytworzono jak to opisano wyżej. Wszystkie mutacje wytworzone w tym badaniu wytworzono stosując IL-4[R121D/Y124D] jako matrycę. Startery fosforylowano przy użyciu kinazy polinukleotydowej T4 (New England Biolabs, Beverly, MA) według instrukcji producenta. Po przyłączeniu startera do matrycy U-DNA i wydłużeniu polimerazą DNA T7 (Bio-Rad Laboratories, Hercules, CA) komórki E. coli szczepu DH5a™ (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) transformowano 5 pl mieszaniny reakcyjnej i wysiano na podłoże LB zawierające 0,7% agar. Po inkubacji w 37°C, kolonie namnożono przez pobranie pojedynczych kolonii i przeniesienie do ml pożywki LB i hodowanie przez noc w 37°C. Jednoniciowy DNA wyizolowano stosując zestaw do oczyszczania M13 (Qiagen Inc., Chatsworth, CA) według instrukcji producenta, po czym klony zawierające pożądaną mutację zidentyfikowano przez sekwencjonowanie jednoniciowego DNA przy użyciu zestawu Seqenase® (Amersham Life Sciences, Arlington Heights, IL) według instrukcji producenta. cDNA muteiny IL-4 w postaci replikujące go DNA odpowiadającego koloniom zawierającym prawidłową zmutowaną sekwencję wyizolowano stosując zestaw do izolacji plazmidów Qiagen (Qiagen Inc. Chatsworth, CA). cDNA muteiny IL-4 wyizolowano stosując BamHII i XbaI i klonowano do wektora plazmidowego pFastBac™l (Gibco BRL, Gaithersburg, MD). Po klonowaniu, wytworzono rekombinowany bakulowirusowy DNA (określany dalej jako Bacmid) przez transformowanie pFast-Bac™l zawierający cDNA muteiny do E. coli szczepu DH10Bac™ (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) według instrukcji producenta. Muteiny wyrażano w komórkach Spodoptera frugiperda (Sf) 9, stosując układ ekspresji Bac-to-Bac (Gibco BRL, Gaithersburg, MD) według instrukcji producenta. Wszystkie inkubacje komórek owadów prowadzono w 28°C. Pokrótce, 2 ml hodowli komórek Sf9 transfekowano 5 pl rekombinowanego Bacmidu przy użyciu Cell-FECTIN (Gibco BRL, Gaithersburg, MD). Nadsącz zebrano 60 godzin po transfekcji i zastosowano do zakażenia 100-200 ml hodowli 1x106 komórek Sf9/ml w pożywce Grace'a (Gibco BRL, Gaithersburg, MD). Nadsącz zebrano, według instrukcji producenta, w 48-60 godzin po zakażeniu, odwirowano przy 5000 obrotach na minutę w wirówce Sorvall® RC-5B przy użyciu rotora GSA (DuPont Instrument Co., Willmington, DE) i badano na miano wirusa (zwykle otrzymywano >1x108 pfu/ml). W celu wytwarzania białka, 2-3x106 komórek Sf9/ml w 500 ml pożywki SF900 II (Gibco BRL. Gaithersburg, MD) zakażano w wielokrotności zakażenia równej 4-10 i zbierano nadsącz po 60-72 godzinach od zakażenia, przez odwirowanie przy 5000 obrotach na minutę w wirówce Sorvall® RC-5B przy użyciu rotora GSA (DuPont Instrument Co., Willmington, DE) i filtrowano przez sterylny filtr 0,2 pm.
188 738
Przykład 2. Oczyszczanie mutein. Przeciwciała monoklonalne przeciwko ludzkiej IL-4 C400.1 i C400.17 wytworzono stosując standardowy protokół, na myszach przy użyciu ludzkiej rekombinowanej IL-4 (Genzyme Diagnostics, Cambridge, MA) jako immunogen, wytworzono jako płyn wysiękowy, oczyszczono i sprzęgnięto z Sepharozą aktywowaną CNBr (Pharmacia, Uppsala, Szwecją) według instrukcji producenta. Nadsącz komórek Sf9 wytworzony przez zakażenie komórek Sf9 rekombinowanym baculowirusem zawierającym odpowiednią muteinę IL-4 wprowadzono do 1 ml kolumny złoża o powinowactwie do IL-4, płukano 100 mM NaHCO3, 500 mM NaCl, pH 8,3, płukano wodą w celu usunięcia soli i eluowano 8 objętościami kolumny 100 mM Glicyny, pH 3,0. Frakcje zebrano do silikonowanych probówek zawierających 0,1 objętość 1 M Tris, pH 8,0. Białko muteiny dalej oczyszczano przez chromatografię w odwróconych fazach stosując kolumnę Dynamax®-300 A C18 (Rainin Instrument Co. Woburn, MA) z gradientem 0-100% Bufora A do Bufora B (Bufor A, woda; Bufor B, acetonitryl, 0,1% kwas trifluorooctowy). Frakcje badano przez SDS-Page i liofilizowano frakcje zawierające muteinę w celu dalszego przechowywania, i rozpuszczano w sterylnym roztworze soli buforowanym fosforanem do testów. Oczyszczona w ten sposób muteina w SDS-PAGE stanowiła zwykle pojedynczy prążek (barwiony srebrem) i oznaczano ją ilościowo przez analizę aminokwasów (dokładność zwykle >90%).
Przykład 3.Test wiązania receptora. W celu określenia wpływu zastąpienia na zdolność mutein IL-4 do wiązania IL-4Ra (Ldzerda i in., J. Exp. Med. 171:861-873(1990)), opracowano test wiązania receptora na podłożu stały,. Pokrótce, powinowactwo mutein mierzono przez ich zdolność do wypierania znakowanej radioaktywnie IL-4 z IL-4Ra związanego z powierzchniią stałą. Figura 2 pokazuje zdolność T13D-IL-4[R121D/Y124D] do współzawodnictwa z 125I-IL-4 w teście na podłożu stałym, względem zdolności IL-4[R121D./Y124D]. Test przeprowadzano w formacie 96-studzienkowym, stosując płytki FlashPlates® (Du-Pont NEN®, Boston, MA), pokryte streptawidyną; zewnątrzkomórkową domenę IL-4Ra wiązano z tymi płytkami przez znacznik peptydowy wprowadzony do domeny zewnątrzkomórkowej IL-4Ra, który wiązał się ze streptawidyną. FlashPlates zawierają substancję scyntylacyjną impregnowaną w plastiku płytek, która ma właściwość emisji scyntylącji jedynie wtedy, gdy związek radioaktywny znajdzie się w jej bliskim sąsiedztwie. Próbki zawierające znakowaną radioaktywnie IL-4 i antagonistyczną muteinę IL-4 dodawano do każdej ze studzienek i inkubowano do uzyskania zrównoważenia. Ponieważ nie związany związek radioaktywny nie wywołuje scyntylacji, nie jest konieczny etap płukania przez oznaczeniem radioaktywności związanej w każdej ze studzienek. Zmierzona w ten sposób radioaktywność odzwierciedla ilość znakowanej radioaktywnie IL-4 związanej z IL-4Ra, zaś po uwzględnieniu dodanej ilości nie znakowanej antagonistycznej muteiny IL-4, umożliwia obliczenie powinowactwa nie znakowanej antagonistycznej muteiny IL-4 wobec IL-4Ra. Wewnętrzny standard w każdym teście wytworzono przez pomiar powinowactwa IL-4[R121D/Y124D] równolegle z każdą z mutein. Tak więc, można otrzymać swoisty pomiar względnego powinowactwa, który umożliwia ocenę wpływu poszczególnych zastąpień na powinowactwo wobec IL-4Ra.
Domenę zewnątrzkomórkową lL-4Ra otrzymano przez PCR z biblioteki Xgt11 w komórkach Jurkat (Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA). Startery PCR zastosowane do wyizolowania domeny zewnątrzkomórkowej IL-4Ra, dla końca 5' ramki odczytu IL-4Ra:
5'GGCATGGATCCATGGGGTGGCTTTGCTCTGG3' (Id. Sekw. nr 4) oraz dla końca 3' domeny zewnątrzkomórkowej IL-4Ra 5 'AAGCCGCTAGCGCTGTGCTGCTCGAAGGGC3' (Id. Sekw. nr 5).
Warunki PCR obejmowały 1 minutę w 94°C, 1 minutę w 65,8°C i 1 minutę w 72°C, przez 30 cykli. Powstały produkt PCR trawiono enzymami restrykcyjnymi BamHl i Eco47III i klonowano do wektora pBluescript (Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA), zawierającego DNA o kodonach odpowiadających sekwencji Ser-Ala-Trp-Arg-His-Pro-Gln-Phe-Gly-Gly (Id. Sekw. nr 6) trawionego tymi samymi enzymami. Sekwencja ta była opisywana jako wiążąca stereptawidynę (Schmidt i Skerra, Protein Eng. 6(1): 109-122 (1992)). Domenę zewnątrzkomórkową IL-4Ra wytworzono również w taki sposób, że kodowała sekwencję Ser-Ala-Trp-Arg-His-Pro-Gln-Phe-Gly-Gly (Id. Sekw. nr 6) na końcu C domeny ze188 738 wnątrzkomórkowej, i określano ją jako sIL-4Ra-STX (Met w pozycji 1 na końcu N dojrzałego IL-4Ra (Id. Sekw. nr 7)).
Białko sIL-4Ra-STX wytworzono w układzie bakulowirusowym w sposób identyczny do zastosowanego w przypadku antagonistycznych mutein IL-4, oczyszczono przez chromatografię powinowactwa z matrycą połączoną z IL-4, jak to opisano (Kruse i in., EMBO J., 12 (13): 5121-9 (1993)) i przechowywano w PBS. Matrycę IL-4 wytworzono przez sprzęgnięcie IL-4 wytworzonej w E. coli z CNBr Sepharose 4B, według instrukcji producenta (Pharmacia, Szwecja). FlasEPlates® (DuPont NEN®, Boston, Ma) pokryte streptawidyną pokryto 100 pl 2 pg/ml sIL-4Ra-STX w 1 00 mM Tris, 0,l%BSA, pH 7,0prrez 2 ggozinn w 20°Ć, płukaao PBS, 0,1% BSA, pH 7,6 i inkubowano z 200 pM I25I-Il-4 (DuPont NEN®, Boston, MA) i różnymi stężeniami a.otagonistyczoej muteiny IL-4 w 100 pl PBS, 0,1% BSA, pH 7,6 przez 15 godzin w 20°C w poczwórnym powtórzeniu. Testy powtarzano przynajmniej dwukrotnie. Jako wewnętrzny standard, IL-4[R121D/Y124D] miareczkowano równolegle z każdą z mutein na tej samej płytce FlashPlate®. Związana radioaktywność mierzono w liczniku scyntylacyjnym TopCount (Packard Instruments Co., Meriden, CT), zaś wartości Kd obliczano stosując program Ligand (Muosoo i Roabard, Meth. Enzymol. 92:543-576 (1983)); błąd wartości Kd, wyrażany jako %CV wynosił 2-20%. Wyniki wyrażano jako stosunek Kd muteiny/Kd IL-4[R121D/Y124D] stosując dane pochodzące z każdej z płytek. Różnice pomiędzy zmierzonymi wartościami Kd odzwierciedlały względny wzrost powinowactwa odpowiedniej muteiny wobec IL-4Ra (tj. Kd muteiny/Kd IL-4[R121D/Y104D] <1), albo względne zmniejszenie powinowactwa odpowiedniej muteiny wobec IL-4Ra (tj. Kd muteiny/Kd IL-4-[R121D-/Y124D] >1).
Przykład 4. Test proliferacji 1° limfocytów T. Pierwotne limfocyty T otrzymano ze świeżej krwi normalnych dawców i oczyszczano przez odwirowanie z użyciem Ficoll-Paquz® Plus (Pharmacia, Upsalla, Szwecja) zasadniczo jak to opisano w Kruse i in., Coiwersion of human interlzukin-4 into a high affinity antagonist by single amino acid replacement, EMBO J. 11:3237-44 (1992)). Oczyszczone komórki jednojądrzaste krwi obwodowej inkubowano przez 7 dni z 10 pg/ml fitohemdglutyniny (Sigma Chemical Co., St. Louis, MO), zebrano przez odwirowanie i płukano w pożywce RPMI 1640 (Gibco BRL, Gaithersburg, MD). 5x104 aktywowanych limfocytów T/studzienkę (blasty PHA) ^u^wano w różnych ilościach IL-4 albo muteiny, w pożywce RPMI 1640 zawierającej 10Bo surowicę płodową bydlęcą, pH 1, 5, 2 mM L-glutaminę, 100 jednostek/ml penicyliny G i 100 pg/ml siarczanu streptomycyny w 96studzieoaowych płytkach przez 72 godziny w 37°C, pulsowano 1 pCi 3H-tymidyny (DuPont NEN®, Boston, MA)/studeieoaę przez 6 godzin, zebrano i mierzono radioaktywność w liczniku scyntylacyjnym TopCount™ (Packard Instrument Co., Meriden, CT). ,
Przykład 5. Wpływ zastąpienia alaniną na powinowactwo IL-4 wobec IL-4Ra. Wpływ zastępowania alaniną reszt eksponowanych na powierzchni helis A i C IL-4 na powinowactwo IL-4 wobec IL-4Ra pokazano na tabeli I.
Tabela I.
Wyniki skanowania alaniną reszt eksponowanych na powierzchni helis A i C IL-4*
| Mutacja | Kd muteiny/Kd IL-4 [R1210^1240] |
| 1 | 2 |
| Helisa A | |
| Ile-8 Ala | |
| Gln.-8 Ala | |
| Glu-9 Ala | |
| Ile-11 Ala | |
| Lys-12 Ala | |
| Thr-13 Ala |
188 738 cd. tabeli I
| 1 | 2 |
| Asn-15 Ala | |
| Ser-16 Ala | |
| Helisa C | |
| His-74 Ala | |
| Lys-77 Ala | |
| Gln-78 Ala | |
| Arg-81 Ala | |
| Phe-82 Ala | |
| Lys-84 Ala | |
| Arg-85 Ala | |
| Arg-88 Ala | |
| Asn-89 Ala | |
| Trp-91 Ala |
Wszystkie mutacje wprowadzono do szkieletu IL-4[R121D/Y124D].
Zastąpienie alaniną generalnie nie powodowało zmian strukturalnych w pofałdowaniu białka, wpływ na aktywność, w tym wypadku powinowactwo, można opisać jako utratę bocznych łańcuchów (Cunningham i in., Science 244(4908): 1081-5 (1989)). Nominalne zmiany w powinowactwie (np. około 2-krotne), które występują w następstwie zastąpienia alaniną, sugerują. że reszta/pozycja zastąpienia nie jest związana z oddziaływaniem; znaczne efekty (tj. >100-krotne) sugerują, że reszta/pozycja jest kluczową dla oddziaływania (Lowman i in., Biochem. 30(45): 10832-8 (1991)). Lowman i in. stwierdzili, że reszty wykazujące pośredni wpływ na wiązanie w następstwie zastąpienia alaniną były, oprócz reszt wrażliwszych, związane z badanymi oddziaływaniami.
Stosując te wnioski do wyników skanowania alaniną helis A i C IL-4, najbardziej kluczowymi resztami dla oddziaływania IL-4 z IL-4Ra są Glu-9 i Arg-88; reszty pośrednie obejmują Ile-5>Asn89>Lys-84~Arg-81>Thr-13~Gln-78~Arg-85~Lys-77; resztami prawdopodobnie nie związanymi z oddziaływaniem są Bln-8, Ile-11, Lys-12, Asn-15, His-74, Phe-82 i Trp-91. Ser-16 dzięki obserwowanemu wzrostowi powinowactwa po zastąpieniu alaniną, znajduje się na powierzchni styku IL-4 i IL-4Ra. Wyniki te określają prawdopodobną powierzchnię wiązania pomiędzy IL-4 i IL-4a, która w odniesieniu do kontekstu budowy IL-4 (Smi-th i in., J. Mol. Biol. 224 (4): 899-904 (1992)) obejmuje sąsiadujące części helis A i C IL-4 i ciągnie się przez około trzy skręty każdej z helis, tj. w pozycjach 5-16 helisy A i 77-89 helisy C. Najprawdopodobniej, resztami związanymi z kontaktem z receptorem IL-4Ra są w helisie A: Ile-5, Glu-9, Thr-13 i Ser-16; zaś w helisie C: Lys-77, Gln-78, Arg-81, Lys-84, Arg-85, Arg88 i Asn-89. Strukturalnie, krytycznym środkiem oddziaływania wydają się być reszty Glu-9, Arg-88 i Asn-89, zaś obserwowany wpływ alaniny ogólnie zmniejsza się wraz ze zwiększaniem odległości od tej części cząsteczki. Analiza opisuje więc powierzchnię wiązania IL-4 z IL-4Ra.
Przykład 6: Muteiny z zastąpieniami w konkretnych pozycjach. W poprzedzającej analizie hormonu wzrostu, zastąpienia reszt, które po zastąpieniu alaniną wykazywały pośredni wpływ na powinowactwo poprawiały powinowactwo hormonu wzrostu do jego receptora (Lowman i in., Biochem. 30(45): 10832-8 (1991)). Stwierdzono, że nie sposób przewidzieć natury zastąpienia danej reszty, która daje poprawę powinowactwa. Tak więc, w prezentowanej tu analizie wszystkie zastąpienia, które mogą nie mieć efektu strukturalnego (tj. wyłącznie
188 738
Cys, Gly i Pro) albo ulegają reakcjom utleniania (tj. wyłącznie Met) wprowadzono do docelowych pozycji:
Tabela II.
Reszty docelowe i ich zastąpienia*
| Reszta | Wpływ Ala | Zastąpienie |
| Ile-5 | 71 | D, E, F, H, K, L, N, Q, R, S, T, V, W, Y |
| Thr-13 | 6,4 | D, E, F, H, I, K, L, N, Q, R, S, V, W, Y |
| Ser-16 | 0,43 | D, E, F, H, I, K, L, N, Q, R, T, V, W, Y |
| Arg-81 | 8,9 | D, E, F, H, I, K, L, N, Q, S, T, V, W, Y |
| Asn-89 | 51 | D, E, F, H, I, K, L, Q, R, S, T, V, W, Y |
*Wszystkie mutacje wykonywano w oparciu o szkielet IL-4[R121D/Y124D]
Tak więc, cysteinę, glicynę, metioninę i prolinę wykluczono z dalszej analizy zastąpień. Reszty wybrano do dalszej analizy jeżeli, po podstawieniu alaniną, powinowactwo zmniejszało się od 5- do 80-krotnie albo zwiększało się w jakikolwiek sposób; zakres ten wybrano na podstawie wyników otrzymanych przez Lowman i in. (wyżej). Oprócz tego, do dalszej analizy wybrano Ser-16 z powodu obserwowanego wzrostu powinowactwa, spowodowanego zastąpieniem przez alaninę, sugeruje to, że inne zastąpienia w tej pozycji mogą również dać poprawę powinowactwa.
Przykład 7. Zastąpienia, które dają zwiększone powinowactwo do IL-4Ra. Muteiny obejmujące zastąpienia w konkretnych pozycjach helis A i C wytworzono w oparciu o szkielet IL-4[R121D/Y124D]; testy wiązania kompetycyjnego przeprowadzono w taki sposób, że każdą muteinę porównywano równolegle z IL-4[R121D/Y124D]. Umożliwiło to bezpośrednie porównanie, a w ten sposób wnioskowanie o wpływie każdego zastąpienia na powinowactwo konkretnej muteiny do IL-4Ra.
Wszystkie zastąpienia o polepszonym powinowactwie pokazano w tabeli III. Stosunek „Kd IL-4[R121D/Y124D]/Kd muteiny” wskazuje względny wzrost powinowactwa obserwowany w wyniku każdego z zastąpień.
| Zastąpienie | KD IL-4 [R121D/Y124D]/Kd muteiny |
| T13D-IL-4 [R121D/Y124D] | 18 |
| S16A-IL-4 [R121D/Y124D] | 2,5 |
| S16D-IL-4 [R121D/Y124D] | 3,1 |
| S16H-IL-4 [R121D/Y124D] | 1,5 |
| S16I-IL-4 [R121D/Y124D] | 1,8 |
| S16L-IL-4 [R121D/Y124D] | 2,9 |
| S16Q-IL-4 [R121D/Y124D] | 2,3 |
| S16R-IL-4 [R121D/Y124D] | 1,8 |
| S16T-IL-4 [R121D/Y124D] | 2,4 |
| S16Y-IL-4 [R121D/Y124D] | 2,0 |
| S16Y-IL-4 [R121D/Y124D] | 1,8 |
| R81K-IL-4[R121DYT44D] | 1,8 |
| N89I-IL-4 [R121D/Y124D] | 2,0 |
188 738
Większość zastąpień miała wpływ szkodliwy albo żaden, na powinowactwo do IL-4Ra (dane nie pokazane). Jednakże, niektóre zastąpienia polepszały powinowactwo, z czego najwyraźniej zastąpienie Thr-13 przez Asp, które spowodowało 18-krotny wzrost powinowactwa do IL-4Ra (figura 2). Aminokwas Ser-16 był unikalny w tym badaniu, podczas gdy większość zastąpień powodowała umiarkowany wzrost powinowactwa. Podobne profile wiązania kompetycyjnego otrzymano dla tych innych mutein w odniesieniu do ich względnego powinowactwa (dane nie pokazane).
Polepszenie powinowactw jest względne w stosunku do wyjściowego białka IL-4[R-121D/Y124D]. Oczekuje się, że kombinacja tych zastąpień w jednym białku może spowodować kombinatoryjny wzrost powinowactwa, np. [T13D/N89L|-IL-4[R121D/Y124D] może dać muteinę o 36-kiOtnie większym powinowactwie niż IL-4|R121D/Y 124D].
Reszty Thr-13 i Ser-16 dały najlepsze polepszenie powinowactwa, gdy określono najlepsze zastąpienie. To sugeruje, że inne reszty, które po zastąpieniu alaniną dawały podobny efekt jak muteina T13A albo S16A (odpowiednio, 6,4-krotne zmniejszenie i 2,5-krotne zwiększenie) powinno również dać wyższe powinowactwo odmian IL-4, po odpowiednim zastąpieniu. Dla obecnej serii reszt zastępowanych alaniną powinno to obejmować: Ile-11, Lys-77, Gln-78, Lys-84 i Arg-85.
Dla hormonu wzrostu, który szeroko badano, pojedyncze zastąpienie, które powoduje wzrost powinowactwa, znajduje się w zakresie 1,5- do 5-krotności (Lowman i in., J. Mol. Biol. 234(3):564-78 (1993)). Jednakże ostatnio, zidentyfikowano zastąpienia, które spowodowały istotną poprawę aktywności (ludzka IL-3 (Olins i in., J. Biol. Chem. 270 (40):23758-60 (1995)) albo powinowactwa (ludzki rzęskowy czynnik neurotroficzny (CNTF) (Saggio i in., EMBO J. 14 (13):3045-54 (1995)). Dla IL-3 jedna mutacja zwiększała aktywność biologiczną in vivo ~26-krotnie; dla CNTF, pojedyncze zastąpienie zwiększało powinowactwo ~13-krotnie. Dla innych cytokin w literaturze, większość zastąpień zwykle nie wykazuje wpływu albo powoduje spadek powinowactwa/aktywności. Tak wiec, całkowity wpływ do wolnego danego zastąpienia na powinowactwo i/lub aktywność jest niemożliwy do przewidzenia.
Przykład 8. Wpływ zastąpienia T13D na aktywność biologiczną. Antagonistyczna muteina IL-4, IL-4[R121D/Y124D] jest antagon.ist1 IL-4 (Tony i in., Eur. J. Biochem. 225 (2):659-65 (1994)), i zastosowano ją jako podstawowy peptyd w tym badaniu z powodu jej niezdolności do pobudzania aktywności IL-4. Ta antagonistyczna muteina uważana jest za antagonistę z powodu jej zdolności do wiązania IL-4Ra, ale braku zdolności do włączania yc w sposób wywołujący sygnalizację, blokując w ten sposób IL-4 przez związaniem się z kompleksem receptora. Tak więc, działania biologiczne IL-4[R121D/Y124D] (antagonizm IL-4) jest ograniczony do oddziaływania, mierzonego powinowactwem, z IL-4Ra.
W celu wykazania, że powinowactwo receptora koreluje z aktywnością biologiczną muteinę T13D-IL-4[R121D/Y124D] badano pod względem zdolności do hamowania wywołanej IL-4 proliferacji blastów PHA (figura 3). Obserwowany IC50 (stężenie, przy którym obserwowano 50% zahamowanie) względem IL-4[R121D/Y124D] określono jako proporcjonalne do obserwowanej względnej zmiany powinowactwa receptorów.
Podsumowując, jakkolwiek wiąże się z wyższym powinowactwem wobec IL-4Ra, T13D-IL-4[R121D/Y124D] pozostaje antagonistą IL-4. IC50 dla T13D-IL-4[R121D/Y124D] w stosunku do IL-4[R121D/Y124D] jest mniej więcej proporcjonalne do względnych wartości Kd (zmierzonych testem wiązania na podłożu stałym) otrzymanych dla tych dwóch białek: Kd dla T13D-IL-4[R121D/Y124D] jest ~18-krotnie niższa niż Kd dla IL-4[R121D/Y124D] (odpowiednio, 0,28 nM i 5,0 nM) ; IC50 dla T13D-IL-4[R121D/Y124D] jest ~5-10-krotnie niższe niż IC50 dla IL-4[R121D/Y124D] (odpowiednio, 2 nM i 13 nM,). Konkretne różnice numeryczne mogą być wynikiem konkretnych warunków zastosowanych w teście: 1,5 godzinna inkubacja w teście wiązania na podłożu stałym w 20°C, 48-godzinna inkubacja w 37°C w teście proliferacji. Zdolność innych mutein badanych w tym teście do współzawodniczenia z IL-4 w testach biologicznych była również proporcjonalna do ich względnych wartości Kd względem IL-4[R121D/Y124D] (dane nie pokazane). Wyniki te wskazują że wiązanie IL-4Ra jest zjawiskiem odrębnym od aktywacji receptora IL-4; ta aktywacja wymaga heterodimeryzacji IL-4Ra i przynajmniej jednej podjednostki (np. yc). Tak więc modyfikacja
188 738
IL-4 w helisie A i C moduluje aktywność IL-4 wobec IL-4Ra, i czyni to w sposób proporcjonalny do zdolności muteiny do antagonizowania IL-4 w kontekście biologicznym. Ten wpływ na powinowactwo, dzięki mechanizmowi oddziaływania IL-4 z jej receptorem, powinien również tłumaczyć siłę peptydów agonistycznych pochodzących z IL-4.
Teorie według wynalazku można również zaadaptować do innych cytokin. Najpowszechniejszym celem jest IL-13 z powodu faktu, że kompleks receptora IL-13 również wykorzystuje IL-4Ra (Żurawski i in., J. Biol. Chem. 270:13869-78 (1995), stąd, imitowanie helis A i C IL-13 w sposób przypominający IL-4 powinno spowodować wzrost powinowactwa wiązania z IL-4Ra.
Przyrównanie dwóch interleukin umożliwia identyfikację pozycji, które mogą być analogiczne z miejscami mutacji docelowych, przykładowo, Thr13 na IL-4. Powierzchnie wiązania dwóch interleukin porównano w tabeli IV.
| Pozycja reszty | Sekwencja | |
| Helisa A | ...ITLQEIIKTLNSL... | |
| hIL-4 | 5-17 | |
| hIL-13 | 4-16 | ...TALRELIEELVNT... |
| Helisa C | ||
| hIL-4 | 74-91 | ...HKQLIRFLKRLDRNLW... |
| hIL-13 | 59-74 | . ..TQRMLSGFCPHKVSAG... |
*Przyrównanie z Bamborough i in., Prot. Eng. 7:1007-82 (1994)
Najbardziej krytyczne reszty dla pośredniczenia przez IL-4 w oddziaływaniu z IL-R4a zidentyfikowano podczas skanowania alaniną, Glu-9 i Arg-88, które pokazano wytłuszczoną czcionką, jak sąsiadujące reszty odpowiadające IL-13 w oparciu o listy. Jak uprzednio wspomniano IL-13 wykorzystuje IL-4Ra, jako kompleks receptora (Żurawski i in., wyżej). Tak więc, zmiana helis A i C IL-13 na bardziej przypominające IL-4-powinno spowodować wzrost powinowactwa wiązania wobec IL-4a.Oprócz tego, zastąpienie równoważnych co do położenia reszt IL-13 resztami, co do których stwierdzono, że zwiększa ją powinowactwo IL-4 wobec IL-4Ra (pozycje pokazane podwójnie podkreślone dla IL-4 i IL-13), co powinno spowodować wzrost powinowactwa IL-13 wobec jej kompleksu receptora, a w ten sposób zwiększyć siłę.
Sekwencje. W opisie zawarto następujące sekwencje
Id. Sekw. nr 1: sekwencja aminokwasową, dojrzała ludzka hIL-4
Id. Sekw. nr 2: sekwencja nukleotydowa, starter PCR
Id. Sekw. nr 3: sekwencja nukleotydowa, starter PCR
Id. Sekw. nr 4: sekwencja nukleotydowa, starter PCR
Id. Sekw. nr 5: sekwencja nukleotydowa, starter PCR
Id. Sekw. nr 6: sekwencja aminokwasową znacznika peptydowego dla streptawidyny
Id. Sekw. nr 7: sekwencja aminokwasową dla sIL-4Ra-STx
Id. Sekw. nr 8: sekwencja aminokwasową, nukleotydowa T13D-IL-4 i
Id. Sekw. nr 9: sekwencja aminokwasową, nukleotydowa T13D-IL-4[R121D/Y124D],
Inne wykonania wynalazku staną się oczywiste dla specjalisty. Pomysł i podejścia doświadczalne opisane tu powinny być możliwe do zastosowania w innych cytokinach wykorzystujących multimerowy układ receptorów, w szczególności IL-2 i po krewnych (np. IL-7, IL-9, IL-10, IL-13 i IL-15), interferonie a i interferonie γ.
188 738
LISTA SEKWENCJI (1) INFORMACJE OGÓLNE:
(1) ZGŁASZAJĄCY:Shanefelt, Armen; Greve, Jeffrey; Gundel, Robert (ii) TYTUŁ WYNALAZKU:
(iii) LICZBA SEKWENCJI: 9 (iv) ADRES DO KORESPONDENCJI:
(A) ADRESAT: Bayer Corporation, Pharmaceutical Division (B) ULICA: 400 Morgan Lane (C) MIASTO: West Haven (D) STAN: CT (E) KRAJ: Stany Zjednoczone Ameryki (F) KOD: 06516-4175 (v) POSTAĆ MOŻLIWA DO ODCZYTANIA PRZEZ KOMPUTER:
(A) TYP NlEŚNUA: Diskette, 3.5, 1.44 Mb (B) KOMPUTER: IBM PC kompatybilny (C) SYSTEM OPERACYJNY: Windows 95 (D) OPROGRAMOWANIE: Microsoft Word 7.0 (vi) DANE DOTYCZĄCE OBECNEGO ZGŁOSZENIA: 08/687,803 (B) FIL ING I^TE : 19-.TOL-1966 (viii) INFORMACJA O RZECZNIKU::
(A) NAZWA:
(B) NUMER REJESTRACYJNY:
(C) NUMER SPRAWY:
(ix) INFORMACJE TELEKOMUNIKACYJNE:
(A) TELEFON: (203) 812-2317 (B) TELEFAX: (203) 812-5492 (2) INFOIRMlTION FOR SEQ ID NO: 1:
(i) SEQTUENCE CJHARACTERISTICS:
(A) LENGTH : 129 (B) ΤΥΡΕ: ćuuino acid (C) J^T^J^^EDMES: : single (D) 'TO^<^!^<G^Y: lirnear (ii) MDLECULE LYPE: E:otein (A) DESCRIPTOON: tuman: Interleukin-4 protein (iii) HYPOEHETICAUE no (iv) ADEI-SEDSE: no (xi) SYQUYDEE EESERIPTICD: SEQ ID NO: 1:
| His 1 | Lys | Cys | Aap | P1u 5 | Thr | Leu | Gln | Glu | Ile 10 | Ile | Lys | Thr | Leu | Asn 15 |
| Ser | Leu | Thi: | Glu | Pll 20 | Pys | Thr | Leu | Cys | Thr 25 | Glu | Leu | Thr | Val | TTr 30 |
| Asp | Ile | Phe | Ala | Ala 35 | Ser | Lys | Asn | Thr | Thr 40 | Glu | Lys | Glu | Thr | Phh 45 |
| Cys | Arg | Ala | Ala | Thr 50 | Val | Leu | Arg | Gln | Phe 55 | Tyr | Ser | His | His | G1u 60 |
| Lys | Asp | Thr | Arr | Pys 65 | Leu | Gly | Ala | Thr | Ala 70 | Gln | Gln | Phe | His | JAg 75 |
| His | Lys | Gln | Leu | Ile 80 | Arg | Phe | Leu | Lys | Arg 85 | Leu | Asp | Arg | Asn | Llu 90 |
| Trp | Gly | Leu | Ala | Gly 95 | Leu | Asn | ero | Sso | roo 100 | Val | Lys | Glu | Ala | Asn 105 |
| Gln | Ser | Thr | Leu Glu 110 | Asn | Phe | Leu | Glu | Arg 115 | Leu | Lys | Thr | Ile | Met 120 |
Arg Glu Lys Tyr Ser Lys Cys Ser Ser 125
188 738 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 2:
(X) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) LENGTH: 24 (Β) ΤΥΡΕ: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE ΤΥΡΕ: cDNA (A) DESCRIPTION: 5' PCR Primer,
IL-4 (iii) HYPOTHETICAL: no (iv) ANTI-SENSE: no (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 2: CGCGGATCCA TGGGTCTCAC CTCC (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 3:
(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) LENGTH: 29 (Β) ΤΥΡΕ: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE ΤΥΡΕ: cDNA (A) DESCRIPTION: 3’ PCR Primer, IL-4 (iii) HYPOTHETICAL: no (iv) ANTI-SENSE: no (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 3: CGCTCTAGAC TAGCTCGAAC ACTTTGAAT 29 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 4:
(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) LENGTH: 31 (Β) ΤΥΡΕ: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE ΤΥΡΕ: cDNA (A) DESCRIPTION: 5' PCR Primer, IL-4Ra (ED) (iii) HYPOTHETICAL: no (iv) ANTI-SENSE: no (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 4:
GGCATGGATC CATGGGGTGG CTTTGCTCTG G 31 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 5:
(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) LENGTH: 30 (Β) ΤΥΡΕ: nucleic acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE ΤΥΡΕ: cDNA (A) DESCRIPTION: 3' PCR Primer, (iii) HYPOTHETICAL: no (iv) ANTI-SENSE: no (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 5: AAGCCGCTAG CGCTGTGCTG CTCGAAGGGC
IL-4Ra (ED) on (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 6:
(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
(A) LENGTH: 10 (Β) ΤΥΡΕ: amino acid (C) STRANDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear
188 738 (ii) MOLECULE ΤΥΡΕ: peptide (A) DESCRIPTION: tag for streptavidin (iii) HYPOTHETICAL: no (iv) ANTI-SENSE: no (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 6:
Ser Ala Trp Arg His Pro Gin Phe Gly Gly 10
10 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 7:
(i) SEQUENCE CHARACTERISTICS:
| (A) | LENGTH: 197 | |
| (B) | ΤΥΡΕ: amino acid | |
| (C) | STRANDEDNESS: single | |
| (D) | TOPOLOGY: linear | |
| (ii) | MOLECULE ΤΥΡΕ: protein | |
| (A) | DESCRIPTION: sIL-4Ra-STX | |
| (iii) | HYPOTHETICAL: no | |
| <iv) | ΑΝΤΙ | -SENSE: no |
| (xi) | SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: |
| Met Lys Val Leu Gin Glu Pro Thr Cys Val Ser Asp Tyr Met Ser | |||
| 1 | 5 | 10 | 15 |
| Ile | Ser Thr Cys Glu Trp | Lys Met Asn Gly Pro | Thr Asn Cys Ser |
| 20 | 25 | 30 | |
| Thr | Glu Leu Arg Leu Gly | Ala Gly Cys Val Cys | His Leu Leu Met |
| 35 | 40 | 45 | |
| Asp | Asp Val Val Ser Ala | Asp Asn Tyr Thr Leu | Asp Leu Trp Ala |
| 50 | 55 | 60 | |
| Gly | Gin Gin Leu Leu Trp | Lys Gly Ser Phe Lys | Pro Ser Glu His |
| 65 | 70 | 75 | |
| Val | Lys Pro Arg Ala Pro | Gly Asn Leu Thr Val | His Thr Asn Val |
| 80 | 85 | 90 | |
| Ser | Asp Thr Leu Leu Leu | Thr Trp Ser Asn Pro | Tyr Pro Pro Asp |
| 95 | 100 | 105 | |
| Asn | Tyr Leu Tyr Asn His | Leu Thr Tyr Ala Val | Asn Ile Trp Ser |
| 110 | 115 | 120 | |
| Glu | Asn Asp Pro Ala Asp | Phe Arg Ile Tyr Asn | Val Thr Tyr Leu |
| 125 | 130 | 135 | |
| Glu | Pro Ser Leu Arg Ile | Ala Ala Ser Thr Leu | Lys Ser Gly Ile |
| 140 | 145 | 150 | |
| Ser | Tyr Arg Ala Arg Val | Arg Ala Trp Ala Gin | Cys Tyr Asn Thr |
| 155 | 160 | 165 | |
| Thr | Trp Ser Glu Trp Ser | Pro Ser Thr Lys Trp | His Asn Ser Tyr |
| 170 | 175 | 180 | |
| Arg | Glu Pro Phe Glu Gin | His Ser Ala Trp Arg | His Pro Gin Phe |
| 185 | 190 | 195 | |
| Gly | Gly | 197 | |
| (2) | INFORMATION FOR | SEQ ID NO: 8: | |
| (i) SEQUENCE CHARACTERISTICS: |
188 738 (A) LINGGTH: 462 (B) TYPE: nucleic acid (C) STRANDDEDNESS: single (D) TOPOLOGY: linear (ii) MOLECULE TYPE: cDNA (A) DESCRIPTION :
(iii) HYPOTHETICAI·: no (iv) ANTI-SENSE: no (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 8:
| ATG GGT CTC | ACC Thr | TCC CAA CTG CTT CCC CCC CTG TTC TTC CTG | CTA Leu 15 | 45 | |||||||||||
| Met Gly 1 | Leu | Ser 5 | Gln | Leu Llu | Pro | Pro 10 | Leu | PhL | Phe | Leu | |||||
| GCA | TGT | GCC | GGC | ACC | ATC | GTC | CAC | dA | dC | AAG | TGC | CGAA | ATC | ACC | 90 |
| Ala | Cys | Ala | Gly | Asn | Phe | Val | His | Gly | His | Lls | Cts | Asp | He | Thr | |
| 20 | :25 | 30 | |||||||||||||
| TTA | CAG | GAG | ATC | ATC | AAA | GAT | ATG | AAC | AGC | CCC | Ad | dG | dG | AAG | 115 |
| Leu | Gln | Glu | Ile | Ile | Lys | Asp | Leu | AAsn | Ssl | Leu | Thr | Glu | Gln | Lys | |
| 35 | 40 | 45 | |||||||||||||
| ACT | CTG | TGC | ACC | dC | TGC | ACC | GTA | Ad | GAC | ATC | TTT | GGA | GCC | TCC | 180 |
| Thr | Leu | Cys | Thr | Glu | Leu | Thr | Val | Tłhc | CAp | He | PPh | Ala | Ala | Ser | |
| 50 | 50 | 60 | |||||||||||||
| AAG | AAC | ACA | ACT | AGA | AGC | OA | ACC | TTC | TAG | AdG | GCT | GCG | ACT | GTG | 225 |
| Lys | Asn | Thr | Thr | Glu | Lys | Glu | Ahr | Phe | Ccs | AArg | Ada | Ada | Thr | Val | |
| 65 | 70 | 75 | |||||||||||||
| CTC | CGG | CAG | TTC | AAC | ACC | dC | dA | GAG | AAG | dC | ACT | CAG | Td; | CTG | 220 |
| Leu | Arg | Gln | Phe | Tyr | Ser | His | His | Glu | Lys | Asp | Tho | Aog | Cys | Leu | |
| 80 | 80 | 90 | |||||||||||||
| GGT | GCG | ACT | GCA | AGC | dC | TTC | TAC | AGG | de | CAG | dG | CTG | ATC | CHA | 331 |
| Gly | Ala | Thr | Ala | Gln | Gln | PhL | His | Arg | His | Lys | Gln | Leu | Ile | AOg | |
| 95 | 100 | 105 | |||||||||||||
| TTC | CTG | AAA | CGG | ATC | dC | AdG | AAC | CTC | TCG | «SC | CTG | CGC | d>C | TTG | 360 |
| Phe | Leu | Lys | Arg | LeC | Asc | AArg | Asn | Leu | Tt? | Gly | Leu | Ada | Gly | Leu | |
| 110 | 110 | 110 | |||||||||||||
| AAT | TCC | TGT | CCT | AGC | AGC | GU | GCT | ZAAC | CAG | AGT | ACG | TAG | CGAA | AAC | 40(5 |
| Asn | Ser | Cys | Pro | Val | Lys | Glu | Ala | AAsn | GG.n | SSr | Thh | Leu | Glu | AAsn | |
| 125 | 130 | 113 | |||||||||||||
| TTC | TTG | GAA | AGG | TAA | AGA | ACG | ATT | ATG | Ad | dG | AAA | TAA | T<AA | AAG | 440 |
| Phe | Leu | Glu | AArg | Leu | Lys | Thr | IlL | Met | AArg | Glu | Lys | Tyr | Ser | Lys | |
| 140 | 140 | 110 | |||||||||||||
| TGT | TCG | AGC | TAG | 062 | |||||||||||
| Cys | Ser | Ser | End |
| (2) | INFORMATION | FOR SEQ ID NO: 9: |
| (i) SEQUENCE THARATAERISTICS: | ||
| (A) | LINGGTH: 4 62 | |
| (B) | ΤΥΡΕ: ηιτοίβχο acid | |
| (T) | STRANDDEDNESS: single | |
| (D) | TOPOLOGY: linear | |
| (ii) MOLECULE AYPE: cDNA | ||
| (A) | DESCRIPTION: IL-4/T13D[R121D/Y204D] |
188 738 (iii) HYPOTHETICAL: no (iv) ANTI-SENSE: no (xi) SEQUENCE DESCRIPTION: SEQ ID NO: 9:
| ATG | GGT | CTC | ACC | TCC | AC | CTG | CTT | CCC | CCT | CCG | TTC | TTT | CCG | CTA | 45 |
| Met 1 | Gly | Leu | Thh | Ser 5 | Gln | Leu | Leu | Pro | Pro IT | Leu | Phh | Piw | Leu | Leu 15 | |
| GCA | TGT | GCC | GCG | TAC | TOT | GTC | AC | GA | AC | AG | TGC | AA | ATC | TCCC | 90 |
| Ala | Cys | Ala | GGy | Asn 20 | Phe | Val | His | Gly | His 2T | Lls | Ccs | Ap | Hi: | Thr 30 | |
| TTA | CAG | GAG | ACT | ATC | AA | GAT | TTC | AAC | AGC | CTC | ACA | gag | AG | AG | 135 |
| Leu | Gin | Glu | I ll | Ile 35 | Lys | Asp | Leu | Asn | Ser 4T | Leu | Tłu: | Glu | Gln | Lls 45 | |
| ACT | CTG | TGC | AAC | AG | TTG | ACC | GTA | ACA | CGAC | ATC | TTT | GCT | GCC | TCC | 180 |
| Thr | Leu | Cys | TT.h | Glu 50 | Leu | Thr | Val | Thr | Asp 5T | Ul | Phh | Ala | Ala | SSr 60 | |
| AAG | AAC | AAC | AAC | TAG | AAG | GA | ACC | TTC | TGC | ACG | GGT | GCG | ACT | GTG | 205 |
| Lys | Asn | Thr | Tłih | Glu 65 | Lys | Glu | Thr | Phe | Cys 7T | Arg | Ala | Ala | Thr | Val 75 | |
| CTC | CGG | GAG | TTT | TAC | AGC | CAC | CAT | AG | AG | AC | ACC | CGC | TCCC | CTG | 270 |
| Leu | Arg | Gln | Phe | Tyr 80 | Ser | His | His | Glu | Lys 8T | TAp | Tlh: | Ag | Cyy | Leu 90 | |
| GGT | GCG | ACT | GGA | AG | AG | TTC | CAC | accc | CAC | ag | AG | CTG | ATC | CA | 315 |
| Gly | Ala | Thr | ACu | Gln 95 | Gln | Phe | His | Arg | His 100 | Lls | Gln | Leu | Ul | TCrg 100 | |
| TTC | CTG | AAC | CCC | TTC | AC | AGG | AAC | CTC | ttgc | GGC | CCG | gcg | TOC | TTG | 360 |
| Phe | Leu | Lys | AAg | Leu 110 | Asp | Arg | Asn | Leu | Tjo? 115 | Gly | Leu | TCLa | Gly | Leu 110 | |
| AAT | TCC | TGT | CCC | GTG | AAG | GA | GCC | AC | <0X3 | AGT | ACG | TTG | GCCC | AC | 405 |
| Asn | Ser | Cys | Ppo | Val 125 | Lys | Glu | Ala | An | Gln 130 | SSr | Tłh: | Llu | Glu | Asn 113 | |
| TTC | TTG | GA | AGG | TTA | AG | ACG | ATC | ATG | AC | GCA | SCCc | GAC | TA | AG | 450 |
| Phe | Leu | Glu | aao | Leu 140 | Lys | Thr | Ile | Met | TAp 145 | GCu | Tls | Ap | TSr | Lls 115 |
462
TGT TCG AGC TAG Cys Ser Ser End
188 738 wiązania o\o
FIG. 2
188 738 proliferacj i o\o
ίο42 ισ11 icr10 ισ9 nr8 ισ7 ισ6 [stęż, muteiny], M
FIG. 3
188 738
| slL-4Rn-STX (Id. | Sekw. | Nr 7) | |
| Met Lys Val Leu Gln Glu i’· S | Pro Thr Cys Val 10 | Ser Asp | Tyr Met Ser 15 |
| Ile Ser Thr Cys Glu Trp 20 | Lys Met Asn Gly 25 | Pro Thr | Asn Cys Ser 30 |
| Thr Glu Leu Arg Leu Gly 35 | Ala Gly Cys Val 40 | Cys His | Leu Leu Met 45 |
| Asp Asp Val Val Ser Ala 50 | Asp Asn Tyr Thr 55 | Leu Asp | Leu Trp Ala 60 |
| Gly Gln Gln Leu Leu Trp 65 | Lys Gly Ser Phe 70 | Lys Pro | Ser Glu His 75 |
| Val Lys Pro Arg Ala Pro 80 | Gly Asn Leu Thr 85 | Val His | Thr Asn Val 90 |
| Ser Asp Thr Leu Leu Leu 95 | Thr Trp Ser Asn 100 | Pro Tyr | Pro Pro Asp 105 |
| Asn Tyr Leu Tyr Asn His 110 | Leu Thr Tyr Ala 115 | Val Asn | Ile Trp Ser 120 |
| Glu Asn Asp Pro Ala Asp 125 | Phe Arg Ile Tyr 130 | Asn Val | Thr Tyr Leu 135 |
| Glu Pro Ser Leu Arg Ile 140 | Ala Ala Ser Thr 145 | Leu Lys | Ser Gly Ile 150 |
| Ser Tyr Arg Ala Arg Val 155 | Arg Ala Trp Ala 160 | Gln Cys | Tyr Asn Thr 165 |
| Thr Trp Ser Glu Trp Ser 170 | Pro Ser Thr Lys 175 | Trp His | Asn Ser Tyr 180 |
| Arg Glu Pro Phe Glu Gln 185 | His Ser Ala Trp 190 | Arg His | Pro Gln Phe 195 |
Gly Gly
FIG. 4
188 738
T13D-H.4 (Id. Sekw. Nr 8)
ATGGGTCTCACCTCCCAACTGCTTCCCCCTCTGTTCTTCCTGCTAGCATGTGCCGGCAAC 1------+---------+---------+---------+----------------------TACCCAGAGTGGAGGGTTGACGAAGGGGGAGACAAGAAGGACGATCGTACACGGCCGTTG a: MecGlyŁeuThrSerGlnŁeuX.euProProLeuPhePheX»euLeuAlaCyjsAIaG2yAsn
TTTGTCCACGOACACAAGTGCGATATCACCTTACAGGAGATCATCAAAGATTTGAACAGC 61------+---------+---------+---------+---------+-......--+--AAACAGGTGCCTGTGTTCACGCTATAGTGGAATGTCCTCTAGTAGTTTCTAAACTTGTCG a: Ρίΐ£ν3ΐΗΪ5θ.Ιν&ί5ΐΛ'5θν3Α3Ρΐ1βΤ1ιτ1^ιισΐπσ1αΙ1^Ι1βΙιν5ΑΞΕϋβαΑ5ΐι3ΒΓ
CTCACAGAGCAGAAGACTCTGTGCACCGAGTTGACCGTAACAGACATCTTTGCTGCCTCC 121------+---------+---------+---------+---------+---------+--GAGTGTCTCGTCTTCTGAGACACGTGGCTCAACTGGCATTGTCTGTAGAAACGACGGAGG a: LeuThrGluGlnLysThrLeuCysThrGluLeuThrValThrAspIlePheAlaAlaSer
AAGAACACAACTGAGAAGGAAACCTTCTGCAGGGCTGCGACTGTGCTCCGGCAGTTCTAC 181------+---------+---------+---------+---------+---------+--TTCTTGTGTTGACTCTTCCTTTGGAAGACGTCCCGACGCTGACACGAGGCCGTCAAGATG a: LysAsnThrThrGluLysGluThrPh.eCysArgAlaAlaThrValLeuArgGlnPheTy±·
AGCCACCATGAGAAGGACACTCGCTGCCTGGGTGCGACTGCACAGCAGTTCCACAGGCAC 241------+---------+---------+---------+---------+---------+--TCGGTGGTACTCTTCCTGTGAGCGACGGACCCACGCTGACGTGTCGTCAAGGTGTCCGTG a: SerHisHisGluLysAspThrArgCysLeuGlyAlaThrAlaGlnGlnPheHisArgHis
AAGCAGCTGATCCGATTCCTGAAACGGCTCGACAGGAACCTCTGGGGCCTGGCGGGCTTG 301 ------+---------+---------+---------+---------+---------+--TTCGTCGACTAGGCTAAGGACTTTGCCGAGCTGTCCTTGGAGACCCCGGACCGCCCGAAC a ·- LysGlnLeuIleArgPheLeuLysArgLeuAspArgAsnŁeuTrpGlyLeuAlaGlyLeu
AATTCCTGTCCTGTGAAGGAAGCCAKCCAGAGTACGTTGGAAAACTTCTTGGAAAGGCTA 361 ---------4-----TTAAGGACAGGACACTTCCTTCGGTTGGTCTCATGCAACCTTTTGAAGAACCTTTCCGAT a: AsnSerCysProValLysGluAlaAsnGlnSerThrLeuGluAsnPheLeuGluArgLeu
AAGACGATCATGAGAGAGAAATATTCAAAGTGTTCGAGCTAG 421 ------+---------+---------+---------+----- 464
TTCTGCTAGTACTCTCTCTTTATAAGTTTCACAAGCTCGATC a: LysThrlleMetArgGluLysTyrSerLysCysSerSerEnd FIG. 5
188 738
T13D-IL4lRi2io/ri24Dl (id. Sekw. Nr 9)
ATGGGTCTCACCTCCCAACTGCTTCCCCCTCTGTTCTTCCTGCTAGCATGTGCCGGCARC 1------+---------+---------+---------+---------+---------+--- 60
TACCCAGAGTGGAGGGTTGACGAAGGGGGAGACAAGAAGGACGATCGTACACGGCCGTTG a: MetGlyLeuThrSerGlnŁeuŁeuProProLeuPhePheLeuLeuAlaCysAlaGlyAsn TTTGTCCACGGACACAAGTGCGATATCACCTTACAGGAGATCATCAAAGATTTCAACAGC 61 -—+- 120
AAACAGGTGCCTGTGTTCACGCTATAGTGGAATGTCCTCTAGTAGTTTCTAAACTTGTCG a: PheValKisGJyHisLysCy8AspIleThrLeuGlnGluIleIleLysięęLeuAsnSer CTCACAGAGCAGAAGACTCTGTGCACCGAGTTGACCGTAACAGACATCTTTGCTGCCTCC 121------+........-+---------+---------+---------+---------+---180
GAGTGTCTCGTCTTCTGAGACACGTGGCTCAACTGGCATTGTCTGTAGAAACGACGGAGG a: LeuThrGluGlnLysThrLeuCysThrGluLeuThrValThrAspIlePheAlaAlaSer AAGAACACAACTGAGAAGGAAACCTTCTGCAGGGCTGCGACTGTGCTCCGGCAGTTCTAC 181 ------+---------+----— ---+-------.-^—-- — ,---240
TTCTTGTGTTGACTCTTCCTTTGGAAGACGTCCCGACGCTGACACGAGGCCGTCAAGATG a: LysAsnThrThrGluLysGluThrPheCysArgAlaAlaThrValLeuArgGliiPheTyr AGCCACCATGAGAAGGACACTCGCTGCCTGGGTGCGACTGCACAGCAGTTCCACAGGCAC 241 ------+---------+---------+---------+---------+---------+--- 300
TCGGTGGTACTCTTCCTGTGAGCGACGGACCCACGCTGACGTGTCGTCAAGGTGTCCGTG a: SerHisHisGluLysAspThrArgCyeLeuGlyAlaThrAlaGlnGlnPheHisArgHis AAGCAGCTGATCCGATTCCTGAAACGGCTCGACAGGAACCTCTGGGGCCTGGCGGGCTTG 301 ------+---------+---------+---------+.........+---------+--- 360
TTCGTCGACTAGGCTAAGGACTTTGCCGAGCTGTCCTTGGAGACCCCGGACCGCCCGAAC a: LysGlnLeuIleArgPheLeuLysArgLeuAspArgAsnLeuTrpGlyLeuAlaGlyLeu AATTCCTGTCCTGTGAAGGAAGCCAACCAGKGTACGTTGGAAAACTTCTTGGAAAGGCTA 361 ------+-......--+---------+-........+.........+-........+--- 420
TTAAGGACAGGACACTTCCTTCGGTTGGTCTCATGCAACCTTTTGAAGAACCTTTCCGAT a: AsnSerCysProValLysGluAlaAsnGlnSerThrLeuGluAsnPheLeuGluArgLeu AAGACGATCATGGACGAGAAAGACTCAAAGTGTTCGAGCTAG 421 ---+.........+---------+--.......+-------- 464
TTCTGCTAGTACCTGCTCTTTCTGAGTTTCACAAGCTCGATC a: ŁvsThrIleMetAspjluLv8AscSerLvsCvsSerSerEnd BIG 6
188 738
FIG. 1
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 50 egz. Cena 4,00 zł.
Claims (37)
- Zastrzeżenia patentowe1. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 numerowana zgodnie z IL-4 typu dzikiego, która obejmuje przynajmniej jedno zastąpienie aminokwasu na powierzchni wiązania helisy-α A albo C IL-4 typu dzikiego.
- 2. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 1, znamienna tym, że jest kodowana przez sekwencję o Id. Sekw. nr 8.
- 3. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 1, znamienna tym, że zastąpienie wybrane jest z grupy pozycji, obejmującej, w helisie A pozycję 5, 11, 13 i 16, zaś w helisie C pozycję 77, 78, 81, 84, 85 (z wyjątkiem R85Q) i 89.
- 4. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na alaninę.
- 5. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na asparaginian.
- 6. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na histydynę.
- 7. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na izoleucynę.
- 8. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na leucynę.
- 9. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na glutaminę.
- 10. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na argininę.
- 11. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na treoninę.
- 12. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na walinę.
- 13. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na tyrozynę.
- 14. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na lizynę.
- 15. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 16 jest zamiana seryny na izoleucynę.
- 16. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 3, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 13 jest zamiana Thr na Asp.
- 17. Rekombinowana muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 16, znamienna tym, że jest kodowana przez sekwencję DNA o Id. Sekw. nr 9 albo jego odmianę zdolną do stabilnej hybrydyzacji.
- 18. Transformowana komórka eukariotycznego gospodarza zdolna do wyrażania rekombinowanej muteiny ludzkiej IL-4 określonej w zastrz. 17.
- 19. Kompozycja farmaceutyczna, znamienna tym, że obejmuje rekombinowaną muteinę ludzkiej IL-4 określoną w zastrz. 1, w połączeniu z nośnikiem dopuszczalnym farmaceutycznie.
- 20. Oczyszczona i wyizolowana sekwencja polinukleotydowa kodująca rekombinowaną muteinę ludzkiej IL-4 określona w zastrz. 1.188 738
- 21. Komórka gospodarza eukariotycznego transformowana oczyszczoną i wyizolowaną sekwencj ą polinukleotydową określoną w zastrz. 21.
- 22. Zastosowanie kompozycji farmaceutycznej określonej w zastrz. 19 do wytwarzania leku do leczenia alergii i alergicznych chorób zapalnych obejmujących astmę.
- 23. Test do określania zdolności muteiny do wiązania się z receptorem, - znamienny tym, że obejmuje etapy:(a) wprowadzania do FlashPlate pokrytej streptowidyną części wiążącej łańcucha receptora, przy czym część wiążąca łańcucha receptora posiada przyłączony znacznik peptydowy możliwy do związania przez streptawidynę;(b) wprowadzania do FlashPlate natywnego liganda znakowanego radioaktywnie, wykazującego powinowactwo do części wiążącej łańcucha receptora;(c) wprowadzania do FlashPlate muteiny jako liganda o powinowactwie do części wiążącej łańcucha receptora;(d) mierzenia ilości sygnału emitowanego przez FlashPlate po zrównoważeniu; i (e) obliczenia względnego powinowactwa muteiny jako liganda w stosunku do natywnego liganda.
- 24. Sposób według zastrz. 23, znamienny tym, że łańcuchem receptora jest Il-4Ra.
- 25. Sposób według zastrz. 23, znamienny tym, że znacznik peptydowy obejmuje sekwencję o Id. Sekw. nr 6 albo jego zdegenerowaną odmianę.
- 26. Sposób według zastrz. 23, znamienny tym, że znacznik peptydowy usunięto z łańcucha receptora, zaś łańcuch receptora biotynylowano.
- 27. Sposób według zastrz. 23, znamienny tym, że część wiążąca łańcucha receptora jest kodowana przez sekwencję o Id. Sekw nr 7 albo jego zdegenerowaną odmianę.
- 28. Rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4 numerowana według IL-4 typu dzikiego, obejmująca:(a) zastąpienie R121D i Y124D w helisie D IL-4 typu dzikiego; i (b) przynajmniej jedno zastąpienie aminokwasowe na powierzchni wiążącej helisy a A albo C IL-4 typu dzikiego, przy czym, gdy zastąpienie dotyczy alaniny zmienia się powinowactwo od około 2 do około 100-krotnie a muteina wiąże się z receptorem IL-4Ra z powinowactwem co najmniej większym niż natywna IL-4.
- 29. Rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 28, znamienna tym, że zastąpienie wybrane jest z grupy pozycji, obejmującej, w helisie A pozycje 5, 11, 13 i 16, zaś w helisie C pozycję 77, 78, 81, 84, 85 (z wyjątkiem R85q) i 89.
- 30. Rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 29, znamienna tym, że zastąpieniem w pozycji 13 jest zamiana Thr na Asp.
- 31. Rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4 według zastrz. 30, znamienna tym, że jest kodowana przez DNA o sekwencji Id. Sekw. nr 9.
- 32. Komórka gospodarza eukariotycznego zdolna do wyrażania rekombinowanej muteiny ludzkiej IL-4 określonej w zastrz. 31.
- 33. Oczyszczona i wyizolowana sekwencja polinukleotydowa kodująca rekombinowaną antagonistycznąmuteinę ludzkiej IL-4 określoną w zastrz. 28.
- 34. Transformowana komórka gospodarza eukariotycznego transformowana oczyszczoną i wyizolowana sekwencją polinukleotydową określoną w zastrz. 33.
- 35. Rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4 określona w zastrz. 28, znamienna tym, że jest kodowana przez sekwencję o Id. Sekw. nr 9 albo jego odmianę zdolną do stabilnej hybrydyzacji.
- 36. Kompozycja farmaceutyczna obejmująca rekombinowaną antagonistyczna muteinę ludzkiej IL-4 określoną w zastrz. 28, w połączeniu z nośnikiem dopuszczalnym farmaceutycznie.
- 37. Zastosowanie kompozycji farmaceutycznej określonej w zastrz. 36. do wytwarzania leku do leczenia alergii i alergicznych chorób zapalnych obejmujących astmę.188 738
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US68780396A | 1996-07-19 | 1996-07-19 | |
| PCT/US1997/011909 WO1998003654A2 (en) | 1996-07-19 | 1997-07-09 | High-affinity interleukin-4 muteins |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| PL331253A1 PL331253A1 (en) | 1999-07-05 |
| PL188738B1 true PL188738B1 (pl) | 2005-04-29 |
Family
ID=24761912
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| PL97331253A PL188738B1 (pl) | 1996-07-19 | 1997-07-09 | Rekombinowana muteina ludzkiej interleukiny-4, transformowana komórka, kompozycja farmaceutyczna, oczyszczona i wyizolowana sekwencja polinukleotydowa, komórka gospodarza eukariotycznego, zastosowanie kompozycji farmaceutycznej, test oraz rekombinowana antagonistyczna muteina ludzkiej IL-4 |
Country Status (23)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0939817B1 (pl) |
| JP (1) | JP2000515016A (pl) |
| KR (1) | KR100468553B1 (pl) |
| CN (1) | CN1201006C (pl) |
| AR (2) | AR007917A1 (pl) |
| AT (1) | ATE310821T1 (pl) |
| AU (1) | AU718794B2 (pl) |
| BR (1) | BR9710733B1 (pl) |
| CA (1) | CA2259940C (pl) |
| DE (1) | DE69734723T2 (pl) |
| DK (1) | DK0939817T3 (pl) |
| ES (1) | ES2252786T3 (pl) |
| HU (1) | HU224973B1 (pl) |
| ID (1) | ID17491A (pl) |
| IL (2) | IL127934A0 (pl) |
| MY (1) | MY124565A (pl) |
| NZ (2) | NZ333748A (pl) |
| PL (1) | PL188738B1 (pl) |
| RU (1) | RU2202364C2 (pl) |
| TR (1) | TR199900100T2 (pl) |
| TW (1) | TW496871B (pl) |
| WO (1) | WO1998003654A2 (pl) |
| ZA (1) | ZA976368B (pl) |
Families Citing this family (13)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| EP0911401A1 (en) * | 1997-10-21 | 1999-04-28 | Bayer Ag | Muteins of interleukin 4 showing low-affinity and short-term interaction with the common gamma chain |
| EP1022337B1 (en) * | 1999-01-20 | 2006-07-26 | Bayer HealthCare AG | Plasmids, their construction and their use in the manufacture of interleukin-4 and interleukin-4 muteins |
| DE69929638T2 (de) | 1999-01-20 | 2006-09-21 | Bayer Healthcare Ag | Plasmide, deren Konstruktion und Anwendung zur Herstellung von Interleukin-4 und dessen Muteine |
| CN1306030C (zh) * | 2001-09-28 | 2007-03-21 | 中山大学 | 一种人白细胞介素-10基因序列及含该基因序列的大肠杆菌 |
| WO2004064860A1 (en) * | 2003-01-17 | 2004-08-05 | Children's Hospital Medical Center | Use of tff2, or agents inducing tff2, in the therapy of allergies |
| RU2389796C2 (ru) * | 2003-08-29 | 2010-05-20 | Аэровэнс, Инк. | Модифицированный антагонист рецептора il-4 и предназначенный для его получения очищенный полинуклеотид |
| US7404957B2 (en) * | 2003-08-29 | 2008-07-29 | Aerovance, Inc. | Modified IL-4 mutein receptor antagonists |
| US7785580B2 (en) | 2003-08-29 | 2010-08-31 | Aerovance, Inc. | Modified IL-4 mutein receptor antagonists |
| CA2604222A1 (en) * | 2005-04-18 | 2006-10-26 | Novo Nordisk A/S | Il-21 variants |
| WO2017001568A1 (en) | 2015-07-01 | 2017-01-05 | Universitat De Lleida | Treatment and prevention of amyotrophic lateral sclerosis |
| JP7360742B2 (ja) * | 2018-12-19 | 2023-10-13 | バイオファーマ トランスレーションズインスティテュート デッサウ フォルシュングス ゲーエムベーハー | 酵素特性が改善したトリプシン変異体およびその使用ならびに基質の直交二重修飾のための方法 |
| CN113527485B (zh) | 2020-04-17 | 2024-11-15 | 湖南麦济生物技术股份有限公司 | 抗人白细胞介素-4受体α抗体及其制备方法和应用 |
| CN112442504B (zh) * | 2020-12-10 | 2023-01-24 | 电子科技大学 | 一种重组草鱼白介素-12活性蛋白的制备方法 |
Family Cites Families (4)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO1988004667A1 (en) * | 1986-12-19 | 1988-06-30 | Immunex Corporation | Human interleukin-4 muteins |
| DE4137333A1 (de) * | 1991-11-13 | 1993-05-19 | W Prof Dr Sebald | Therapeutische mittel, die antagonisten oder partielle agonisten des humanen interleukin 4 sind oder diese enthalten, hil-4-mutantenproteine sowie vefahren zu deren herstellung |
| WO1993021308A1 (en) * | 1992-04-17 | 1993-10-28 | The University Hospital | Mutant cytokines having increased receptor affinity |
| JP2000515007A (ja) * | 1996-06-14 | 2000-11-14 | バイエル・コーポレーシヨン | T細胞選択的インターロイキン―4アゴニスト |
-
1997
- 1997-07-04 MY MYPI97003051A patent/MY124565A/en unknown
- 1997-07-09 ES ES97933333T patent/ES2252786T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1997-07-09 EP EP97933333A patent/EP0939817B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1997-07-09 CN CNB971979596A patent/CN1201006C/zh not_active Expired - Fee Related
- 1997-07-09 AU AU36545/97A patent/AU718794B2/en not_active Ceased
- 1997-07-09 WO PCT/US1997/011909 patent/WO1998003654A2/en not_active Ceased
- 1997-07-09 DE DE69734723T patent/DE69734723T2/de not_active Expired - Lifetime
- 1997-07-09 BR BRPI9710733-6A patent/BR9710733B1/pt not_active IP Right Cessation
- 1997-07-09 NZ NZ333748A patent/NZ333748A/xx not_active IP Right Cessation
- 1997-07-09 DK DK97933333T patent/DK0939817T3/da active
- 1997-07-09 RU RU99103688/14A patent/RU2202364C2/ru not_active IP Right Cessation
- 1997-07-09 KR KR10-1999-7000371A patent/KR100468553B1/ko not_active Expired - Fee Related
- 1997-07-09 HU HU0000248A patent/HU224973B1/hu not_active IP Right Cessation
- 1997-07-09 CA CA002259940A patent/CA2259940C/en not_active Expired - Fee Related
- 1997-07-09 NZ NZ505238A patent/NZ505238A/en not_active IP Right Cessation
- 1997-07-09 AT AT97933333T patent/ATE310821T1/de active
- 1997-07-09 PL PL97331253A patent/PL188738B1/pl not_active IP Right Cessation
- 1997-07-09 IL IL12793497A patent/IL127934A0/xx not_active IP Right Cessation
- 1997-07-09 TR TR1999/00100T patent/TR199900100T2/xx unknown
- 1997-07-09 JP JP10506976A patent/JP2000515016A/ja not_active Ceased
- 1997-07-15 TW TW086109934A patent/TW496871B/zh not_active IP Right Cessation
- 1997-07-18 ZA ZA9706368A patent/ZA976368B/xx unknown
- 1997-07-18 AR ARP970103229A patent/AR007917A1/es active IP Right Grant
- 1997-07-21 ID IDP972537A patent/ID17491A/id unknown
-
2007
- 2007-04-12 IL IL182509A patent/IL182509A/en not_active IP Right Cessation
- 2007-04-24 AR ARP070101757A patent/AR060630A2/es active IP Right Grant
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| US6313272B1 (en) | DNA encoding high affinity interleukin-4 muteins | |
| IL182509A (en) | A method for determining an affinity between a mutine and a receptor | |
| Pestka et al. | Interleukin-10 and related cytokines and receptors | |
| ES2333385T3 (es) | Proteina del tipo de interleuquina-17. | |
| US6797263B2 (en) | Compositions and methods for achieving immune suppression | |
| CN111615396A (zh) | 白介素-2的部分激动剂 | |
| US6433157B1 (en) | Polynucleotides encoding T-cell selective interleukin-4 agonists | |
| AU2001261585A1 (en) | Compositions and methods for achieving immune suppression | |
| MXPA97008528A (en) | Chemiosine bata-13 hum | |
| US20030004314A1 (en) | T-cell selective interleukin-4 agonists | |
| RU2235728C2 (ru) | Мутеин человеческого il-4, полинуклеотидная молекула, вектор, линия sf9, трансформированная вектором, способ выбора мутеина, фармацевтическая композиция для активирования т-клеток, способ лечения пациента, страдающего заболеванием, поддающимся лечению il-4 | |
| AU742384B2 (en) | High affinity interleukin-4 muteins | |
| KR100479143B1 (ko) | T-세포선택적인터루킨-4아고니스트 | |
| MXPA99000688A (en) | Muleines de interleuquina-4 de gran afini | |
| Raval et al. | Characterization of the 5′ flanking region and gene encoding the mouse interferon-gamma receptor | |
| ES2368814T3 (es) | Composiciones útiles como ligandos para el receptor de tipo receptor 1 de péptidos formilados y métodos de uso de las mismas. | |
| MXPA98009494A (en) | Agingists of interleuquina 4 selectiva para celula | |
| JP2002136294A (ja) | ヒトケモカインポリペプチド |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| LAPS | Decisions on the lapse of the protection rights |
Effective date: 20140709 |